lowQualScore : 111111 33333333333333333333333333333333333333 11111111111111111
lowQualScore : 2 1 0 0 00 1 0 222 44 11111 44444444 777777 0 0 111111 2222222222 22222222222 222222222 0 1 0 33333333 22222222222222222222222222222222222222 1 111 77777777777777777 0 1 0 3333333 0 2222 0 22222 777 111 1 0 0 99
lowQualScore : . . . . .. . . ... .. ..... ........ ...... . . ...... .......... ........... ......... . . . ........ ...................................... . ... ................. . . . ....... . .... . ..... ... ... . . . ..
lowQualScore : 5 1 5 5 77 6 5 555 88 88888 11111111 333333 5 5 555555 9999999999 99999999999 999999999 5 0 5 44444444 33333333333333333333333333333333333333 1 000 55555555555555555 6 1 6 0000000 6 6666 6 22222 777 444 6 8 8 77
consensus : TATATGTTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----N-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C-A--A----AA-G---T-A-----C---C---N-T-G-T-CCC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-T-GATC---A-A-T-TATGAT
Reference ( gi|24059 ) : TATATGCTT-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C-G--A----AA-G---T-A-----C---C---A-T-G-T-CCC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-C-GATC---A-A-T-TACAAT
gi|24063 : TATATGCAT-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CT--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C----A----AA-G---T-A-----T---C---A-T-G-T-CCC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-T-GATC---A-A-T-TATGAT
gi|24065 : TATATGCTT-T-GAATG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------T-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C-A--A----AA-G---T-A-----C---G---C-T-G-T-CCC-------AA-GGA----AT-ATT-----TT-T-GATC---A-A-A-TA
gi|24061 : TATATGCTT-T-GAGTG-AC----T-G-A---CC--T-----T--------T----G-C-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------C-A--A----AA-G---T-A-----C---C---C-T-G-T-CCC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-T-TATC---A-G-T-TATGATtga
gi|24068 : TATATGCTT-T-GAGTG-ACC--AT-G-A---CC--T-----T--------T----A-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-C-C--------G--------A----------T-C------C-A--A----AG-G---T-G-----C---C---C-T-G-T-GCC-------AA-GGA----AT-ACT-----TG-T-GATC---A-A-C-TATGAT
gi|24066 : TATATG--T-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------T-A--A----AA-A---T-A-----C---C---C-T-G-T-CTCA------AA-AAA----AT-ATT-----TG-T-GATC---A-A-T-TATGAT
gi|24077 : TATATGCTT-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C----A----AA-G---T-A-----T---C---A-T-G-T-CCC-------CATTGA----AA-AAT-----CA-A-GATC---A-A-T-TATGAT
gi|24069 : TATATGTTT-T-GAGTG-ACC--TT-G-G---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------T-C-T-T--------T--------G----------T-C------C-A--A----TT-G---T-A-----C---C---T-T-G-T-ACC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-T-GAAC---A-A-T-TATGAT
gi|24067 : TATATGTTC-T-GAGTA-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-A-------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------A--------G----------T-T------G-A--A----AA-G---T-A-----T---C---C-T-A-T-CCC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-A-GATC---A-A-T-TATGAT
gi|24072 : TATATGTTT-T-GGGTG-ACC--TT-G-AA--CT--T-----T--------T----C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------C-A--A----AA-G---T-------C---C---ATT-G-T-CCA-------AG-GGA----AT-ATT-----TG-T-GATT---A-A-T-CATGAT
gi|24073 : TAAATATTT-T-GATTG-ACC--TT-G-A---CC--A-----T--------T----G-A-A-A-------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------C-A--A----AA-G---T-A-----C---C---A-T-G-C-CTA-------AA-TGA----AT-ATT-----TG-T-GATC---A-A-T-TA
gi|24081 : TATATGCTT-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G-----------------------------------------G---T-A-----T---C---A-T-G-T-CCC-------AA-TGA----AA-ATT-----TG-A-GATG---C-A-T-TATGATtga
gi|24079 : TATCTGCTT-TTGTGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C-A--AC---CA-G---T-C-----C---A---A-T-G-TGCCC-------AC-AGG----AT-ATT-----TG-T-GATC---A-A-T-TATGAT
gi|24089 : TATAT-CTT-T-GA-TG-ATC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G---A-AA------T----------G-----------A---------C-C-A-T--------G--------A----------T-C------C----A----AA-G---T-A-----T---C---A-T-G-T-CCC--------A-GGA----AT-ATT-----TG-A-GATC---A-
gi|24078 : TATATGCTT-T-CAGTG-ACC--AT-C-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------G-C-TGT--------AGAC-----A----------T-C------G-A--A----AA-G---T-A-----A---C---A-T-G-T-CCC-------AA-GGA----GT-ATT-----TG-G-GATC---A-A-G-TATGATtatatatgat
gi|24087 : TATATGCTT-T-GAGTG-ACC--TT-GCA---CCT-T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------GA----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C-A--A----AA-G---TAA-----C---C---C-T-G-T-CTC-------AA-AGA----TT-AT
gi|24083 : TGTATGTTT-T-GAGTG-ACT--CT-G-G---CC--T-----T--------T----A-A-A-AA------T----------G-----------G---------T-C-T-T--------T--------G----------T-C------C-A--A----AA-G---T-G-----C---C---C-T-G-T-TCC-------AA-GGA----AT-AT-----------GATG---A-A-TCTATAAT
gi|24085 : TATATGTTG-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------TC---C-A-A-AA------T----------G-----------C---------A-C-T-T--------G--------G----------T-C------C-A--A----AAGG---T-C-----T---C---C-T-G-T-CTC-------AA-GGA----AT-ATT-----TT-T-GATC---A-G-T-
gi|24084 : TATATA--T-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----ACA-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------C---------AA-G-----------C---C---T-T-G-T-CCA-------AA-GGA----AT-ATC-----TA-T-GGTC---A-A-G-TATGAT
gi|24080 : TATATGTCT-T-GAAGG-ACC--TT-G-G---CC--C-----T--------T----G-A-A-A-------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-T------T-A--A----AA-G---T-A-----C---C---C-T-G-C-CAC-------AA-GGA----AT-AAT-----TA-T-GATC---A-
gi|24094 : TATATGTTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CT--T-----TTTAATTAAT----A-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C-A--A----AA-G---T-T-----T---C-----T-A-T-CCC-------AA-AGAT---AT--TT-----TG-T-GATC---C-A-T-Tctgatgat
gi|24082 : TACATATTT-T-GAACG-ACC--TT-G-AC--CC--T-----T--------C----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------C-A--A----AC-G---T-------C---C---C-T-G-T-TGC-------AA-GAA----AT-ATT-----TG-T-GAT
gi|24088 : TATATGTTC-T-GAGTG-ACC--TT-C-A---CC--T-----C--------T----CCA-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAGACCCTTGGT-C------C-A--C----AA-G---T-------C---C---T-T-G-T-CTA-------AA-GGA----AT-ACT-----TG-T-GATC---A-A-T-TAaacttctgat
gi|24091 : TATACATTC-A-GAGTG-ACA--TT-G-A---CT--T-----T--------TC---G-A-A-AG------T----------G-----------A---------C-A-T-C--------G--------G----------T-C------C-A--A----AA-G---T-C-----C---T---C-T-G-T-CCC-------AA-GGA----AA-ATT-----TA-G-GACC---A-G-T-TATAATt
gi|24095 : TATATGTTC-T-GAGTG-ACA--TT-G-G---TCA-T-----T--------C----C-A-A-CA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------C-A--C----AA-G---T-C-----C---C---A-T------CC-------AA-G-A----AT-ATT-----TG-T-GATT---A-A-T-TATGAT
gi|24103 : TATATGCTT-T-GAGTA-GCC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C-A--A----A
gi|24070 : TGTATGTTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CCT-T-----T--------T----C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGCCCTTGGT-T------C-A--C----AA-G---C-------T---C---T-T-G-T-CTT-------AA-GGA----AC-ATT-----TG-T-GATA---A-A-T-T
gi|24090 : TAT-TACTT-T-GGATGGATC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-G-A-AA------TGG--------G-----------A---------C-C-A-T--------G--------A----------T-C------C----A----AT-A---T-A-----T---C---A-T-G-T-CCC-------A---GG----AT-ATT-----TG-A-GATC---A-
gi|24098 : TAGATGCTT-T-GAGTG-ACT--TC-G-A---CC--T-----T--------T------A-A-AT------T----------G-----------A-----------A-T-T--------G-------------------T-C------CAA--A----AA-G---T-A-----C---C---C-T-GTT-CCC-------AA-GGA----AT-ATtatatatgat
gi|24097 : TAGATGCTT-T-GAGTG-ACT--TC-G-A---CC--T-----T--------T------A-A-AT------T----------G-----------A-----------A-T-T--------G-------------------T-C------CAA--A----AA-G---T-A-----C---C---C-T-GTT-CCC-------AA-GGA----AT-ATgagtaacatatgat
gi|24101 : TATGTGTTC-A-AAGTG-ACC--TTCA-A---CT--T-----T--------C----C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------C-A--A----AA-G---T-T-----T---C---C-T-G-T--CC-------AA-AGA----GT-ATT-----TG-T-GAgagtaacatatgat
gi|24092 : TATATGTTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---TC--TACCTAT--------C----C-A-A-AA------A----------G-----------A---------C-C-T-T--------A--------A----------T-C------C-A--C----AA-T---T-------T---T---T-T-G-T-CTC-------AA-GGA----AC-ATT-----TG-T-GGTA---A-A-T-
gi|24105 : TATAAGTTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------TCTTCT-A-A-AT------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGCC-----T-T------T-G--ATCACAA-G---C-------C---C---T-T-G-T-CTC-------AA-GGA----AC-ATT-----TG-T-GGTA---A-A-T-Tgat
gi|24102 : TATATATTC-T-GAATG-GCC--TT-G-A---CC--T-----T--------TCC--C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-A-T-C--------GGTCCAATTG----------T-C------C-A--A----AA-G---T-C-----C---C---C-T-G-T-CCCA------AA-AAA----AT-ATCTATGATG-C-GATC---A-A-T-T
gi|24086 : TATATATTC-T-AAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----TC-------C----T-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-TTAAA----G--------A----------C-CTTTGGTC-A--C----AA-G---T-------C---C---T-T-G-T-TTC-------AA-GGA----AC-ATT-----TG-T-TTTC---A-A-T-TA
gi|24060 : TATAAGTTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------TC---C-A-A-AATTACATT----------G-----------AAAG------C-C-T-T--------G--------G----------T-T------C-A--C----AA-G---C-------C---C---T-C-G-T-CTC-------AA-GAA----AC-ATT-----TG-T-GATA---A-A-T-Ttg
gi|24107 : TATATGTTC-T-GAGTG-AC----T-G-A---CCA-T-----T--------T----A-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AGAGACCATGGT-C------C-A--C----AA-G---T-------C---C---T-T-G-T-CTC-------AA-AGA----AC-ATA-----T--C-GAT
gi|24100 : TACATGTTT-T-G-GTG-ACC--TTTG-G---CC--T-----T--------T----C-G-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-T------C-A--C----AA-G---C-------C---C---T-C-G-T-CTC-------AA-CGA----AC-ATT-----Tt
gi|24099 : TACATGTTT-T-G-GTG-ACC--TTTG-G---CC--T-----T--------T----C-G-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-T------C-A--C----AA-G---C-------C---C---T-C-G-T-CTC-------AA-CGA----AC-ATT-----Ttgtg
gi|24108 : TATATGTTC-T-CAATG-ACC--TT-G-G---TC--T-----T--------TC---C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGAACTTGGT-C------C-A--C----AA-G---C-------T---C---G-T-G-T-ATC-------AA-GGA----AC-ATT-----TG-T-GATtgtg
gi|24075 : TACATGTTC-A-GAGTG-ACC--TT-G-AC--CC--T-----T--------C----C-A-A-AA------TGATCTTGAAAG-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------C-T------C-A--C----AA-G---C-------C---C---T-T-G-T-CTC-------AA-GGA----AC-ATT-----TG-
gi|24106 : TATATGTTC-T-GAGTG-ACA--CT-G-AGGGAC--T-----TCC------C----G------A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------C-A--G----AA-G---T-C-----C---C---T-T-G-T-CCC-------AG-GGAGTATGT-ATC-----TG-T-AATT---A-A-T-Tttat
gi|24074 : TATATTATC-T-GAGTG-ACC--TT-C-A---CC--T-----T--------T----C-C-ATAA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGG------C-C------T-G--G----AA-T---C-AAGAGCC---C---T-T-A-T-CTC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-
gi|24093 : TATATGTTC-T-GAGTG-AGC--TT-G-A---CCT-T-----T--------T----T-A-A-GA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A---------------------G--A-----------T-A-----C---CT--T-T-G-T-CCA-------AA-AGA----ttat
gi|24071 : TATATATTT-T-AAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----ACA-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------A--------A----------
gi|24062 : TATATGTTC-T-GAGTA-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------TC---A-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------gtc
gi|24104 : TATGTATTT-T-AAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------C----ACA-A-AA------T----------G-----------A---------C-CTT-T--------G--------A------------C------T-A--A----AA-G---T-A-----
gi|24076 : TATATATTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--C-----T--------T----ACA-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------A--------A----------
gi|24064 : TATATATTT-T-AAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------C----ACA-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------A--------A----------gtc
gi|24096 : TATGTATAT-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CCTTT-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------gtcactctgactaagagtaatttgttgttaattat
gi|24113 : ATATGTAT-T-GAGTG-ACC--TT-G-T---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------T-----------G---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C-A--A----AA-------------------------G-T-CCC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-T-GATC---A-A-T-TATGAT
gi|24116 : ATACATTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CA--T-----T--------T----C-C-A-AA------T----------GGATCTCGAGTGA---------C-C-T-T--------T--------G----------T-C------C-A--A----AA-G---T-C-----C---C---C-T-G-T-CCA-------AA-GGA----GT-ATT-----TG-T-AATC---A-A-T-TATGAT
gi|24114 : ATAAGTTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----TA-------C----C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGCC-----T-T------G-G--ATCACAA-G---C-------C---C---T-T-G-T-CTC-------AA-GGA----AC-ATT-----TG-T-GATA---A-A-T-T
gi|24109 : ACATGTTC-T-GAGTG-ACA--TT-G-G---CC--T-----T--------TCC--A-A-A-AA------T----------G-----------ATCTTAAAAGC-C-T-T--------G--------G----------T-T------C-A--C----AA-G---T-------C---C---T-T-G-T-CTC-------AA-GGA----AC-ATT-----TG-T-GGTA---A-A-T-T
gi|24115 : ATATGATC-T-GAATG-ACC--TT-G-A---GC--T-----T--------T----C-C-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGACTTGGGT-T------C-A--C----AA-G---C-A-----C---T-----C-G-T-CTC-------AA-GGA----AC-ATT-----TG-T-GGTA---A-A-T-T
gi|24111 : ATATGTTT-T-GAATG-ACC--TT-G-A---TC--T-----TC-------C----C-A-A-AA------T----------G-----------A---------CAT-T-T--------A--------A----------T-T------C-G--C----AA-G-----------C---C---ATT-G-T-CTC-------GA-GGA----AC-TTT-----Tgt
gi|24117 : ATATGGTC-T-GAATG-ACC--TT-A-A---AC--T-----T--------TC---T-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AGAGACCTTGGT-C------C-A--C----AA-A---T-------C---T---T-T-G-T-CTC-------AA-GAA----CC-ATT-----TG-C-AATA---A-A-T-ctggt
gi|24110 : ATATGGTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CCA-T-----T--------C----G-A-G-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------gat
gi|24112 : ATATGCTC-T-GAATT-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------TC---T-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------gt
gi|24118 : TATGCTT-T-TAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------C---------C-C-T-T--------G--------A----------T-A------C-A--C----CA-G---T-A-----C---CCCTG-T-G-T-TCC-------AA-GGA----AT-ATT-----TGTT-GATC---A-A-T-TATGATcaaaggtccacaag
gi|24120 : TATGCTT-T-GAGTG-ACCAGTT-G-G---AC--C-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C---T--------G--------A----------C-C------C-GTCA----GA-G---T-A-----G---C---A-----T-TCC-------AA-GGA----AT-AT
gi|24119 : TATGTTTCT-GAG---ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----C-C-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-TG-------G--------A----------T-T------T-A--ACTATAA-T---T-A-----CATGT---A-T-G-T-CCCCTGTCAAAA-GGA----AT-ATC-----TG-T-GATC---A-A-T-TATGAT
gi|24121 : TATGTTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-G---CC--TA----T--------C----C-A-A-AT------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGTCCTTGGT-C------T-A--A----AC-G---T-------C---C---T-T-G-C-ATC-------AT-GGA----AC-ATT-----TC-C-GATC---A-A-T-
gi|24125 : ATGCTT---GA-TG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-T-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C----A----AA-G---T-A-----T---C---A-T---T-CCC-------AA--GA----AT-ATT-----TG-A-GATC---CTA-T-TATGAT
gi|24124 : ATGCTT---GA-TG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-T-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C----A----AA-G---T-A-----T---C---A-T---T-CCC-------AA--GA----AT-ATT-----TG-A-GATC---CTA-T-TATGAT
gi|24122 : ATGTTC-T-GAATG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------TC---C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-G------C-A--A----AA-G---C-------C---C---C-T-G-T-CCC-------AA-GGA----AT-ATC-----GG-T-GCTT---A-A-T-TATGAT
gi|24123 : ATGCTT---GAGTG-ACC--T--G-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G-----------------------------------------G---T-A-----T---C---A-T-G-T-CCC-------AA-TGA----AA-ATT-----TG-A-GA
gi|24126 : ATGCTT-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CCT-T-----T--------T----G-A-A-A------------------------------A---------C-CGT-T--------G--------A----------TGC------A-G--A----CA-GATTT-A-----T---T---A-TCG-T-CAG-------AA-GGA----ATAATTA----TG-TGGATC---A-AGT-TATGAT
gi|24127 : ATGTTC-T-CAGTG-ATC--TT-G-T---TC--C-----T--------T----C-ATA-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-------------------A----------T-CT-----C-T--A----AACG---T-------C---C---A-T-G-T-CCC-------AA-GGA----AT-A
gi|24128 : TGCTTAT-AAAT--ATC--TT-------CC--T-----T--------C----C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------C-A--A----AA-G---T-------C---C---C-T-G-T-CCC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-cccctgtccaaagtaatatttgtgatcaataat
gi|24129 : GTTC-T-GAGTG-ACC--TG-A-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-T-T-T--------A--------A----------T-C------C-A--A----GA-G---T-A-----C---C---C-T-G-T-CTC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-T-GATC---A-A-T-Tatga
gi|24132 : TC-T-GAGTG-ACC--TT-G-T---CC--T-----T--------TC---A-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-TACTCAAATG--------G----------T-T------T-A--A----AA-G---T-C-----T---C---T-T-G-T-TTC-------AA-GGA----AT-ATT-----TT-T-GATC---A-A-T-TAttgat
gi|24130 : TC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CCT-T-----T--------T----T-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGCC-----T-T------G-G--ATCACAA-G---C-------C---C---T-T-G-T-CTC-------AA-TGA----AC-ATT-----TG-T-GGTA---A-A-T-Tt
gi|24131 : TC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T------A-A-AA------T----------------------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGCC-----T-T------G-G--ATCACAA-G---C-------C---C---T-T-G-T-CTC-------AA-TGAAC--AT-ATT-----TG-gt
gi|24134 : -T-GAGTG-ATC--TC-G-A---CC--T-----T--------TC---C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-T------T----A----CA-A---C-C-----T---C---T-T-G-T-CTC-------AA-GGA----AC-ATT-----TT-C-AATA---A-A-T-Tgtaaattgtatcaaatttatgat
gi|24133 : -T-AAGTG-ACC--TT-G-A---GC--T-----T--------TC---C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGACCAGGGT-T------C-T--T----AA-G---C-------C---C---T-T-G-T-CTC-------AA-GGA----AC-ATT-----TG-gt
gi|24135 : -T-GTGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------TC---C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-A-T--------G--------AGACACCATGGT-C------C-A--C----AA-G---T-------C---C---T-T-T-T-GTA-------AA-AGA----AC-ATT-----TG-T-GATC---G-A-T-TAt
gi|24136 : TG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------A-A--A----AA-G---T-G-----C---C---C-A-G---CCC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-T-GATC---A-A-T-TATGATt
gi|24137 : C--T-----T--------T--------A-AG------T----------G-----------A---------C-C-A-T--------G--------G----------T-C------C-A--A----AA-G---T-A-----G---T---C-T-G-T-CCC-------AA-AGA----AT-ACT-----TG-T-GATCTGTA-A-T-TACAAT
gi|24138 : -A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------C-T--C----AA-G---T-C-----T---C---C-T-G-T-TC--------AA-GGA----AT-ATT-----TG-T-GATC---A-A-T-TATGAT
Alignments
lowQualScore : 1111111 2222222222222222222 11
lowQualScore : 0 11 00 1 0 1 000 33 11111 33333333 4444444 0 0 0 333333 2222222222 22222222222 333333333 0 1 0 33333333 6666666666666666666 777777 1 4444444444 0 0 000 44 111 3333 0 1 0 2222222 0 444444444444444444 1111 1 1 22222 222222 0 0 111 2 11 2
lowQualScore : . .. .. . . . ... .. ..... ........ ....... . . . ...... .......... ........... ......... . . . ........ ................... ...... . .......... . . ... .. ... .... . . . ....... . .................. .... . . ..... ...... . . ... . .. .
lowQualScore : 6 77 77 5 5 0 999 22 88888 44444444 5555555 5 5 5 333333 9999999999 99999999999 888888888 5 0 5 99999999 4444444444444444444 777777 1 7777777777 5 5 999 55 000 3333 6 1 6 9999999 6 111111111111111111 9999 1 7 00000 888888 6 6 222 7 66 0
consensus : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--N----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---NT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
Reference ( family-295 ) : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--N----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---NT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24059 : TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C-G--A-------A-A-G---T-AC---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------C-G-ATC---A-A--T-TACAAT
gi|24060 : TATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC-C----A-A-A-ATTACATT----------G-----------AAAG------C-C-T-T--------G--------G----------TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-GA------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24061 : TATATG-CT-TTGAGTGAC----T-G-A-C---C--T-----T--------T--G----C-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-T-ATC---A-G--T-TATGAT
gi|24062 : TATATG-TT-CTGAGTAACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC-A----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------
gi|24063 : TATATG-CA-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---T--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24064 : TATATA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------CA-C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T-------------------------------------------------A-A-G---TCAC---T---CT-G-A-CT---------A-AG------------------A----GTAA-TT-----TG------T-T-GTT---A-A--T-TAT
gi|24065 : TATATG-CT-TTGAATGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------T-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---G---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-A--A-TATGA
gi|24066 : TATATG-TT---GAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------T-A--A-------A-A-A---T-AC---C---CT-G-T-CTCA------AA-AA------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24067 : TATATG-TT-CTGAGTAACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A--------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------A--------G----------TT------G-A--A-------A-A-G---T-AT---C---CT-A-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24068 : TATATG-CT-TTGAGTGACC--AT-G-A-C---C--T-----T--------T--A----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-C-C--------G--------A----------TC------C-A--A-------A-G-G---T-GC---C---CT-G-T-GCC-------AA-GG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATC---A-A--C-TATGAT
gi|24069 : TATATG-TT-TTGAGTGACC--TT-G-G-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------T-C-T-T--------T--------G----------TC------C-A--A-------T-T-G---T-AC---C---TT-G-T-ACC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-AAC---A-A--T-TATGAT
gi|24070 : TGTATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--TC---A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGCCCTTGGTT------C-A--C-------A-A-G---C--T---C---TT-G-T-CTT-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24071 : TATATA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TA-C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------A--------A----------
gi|24072 : TATATG-TT-TTGGGTGACC--TT-G-AAC---T--T-----T--------T--C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---A---TT-G-T-CCA-------AG-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATT---A-A--T-CATGATgtc
gi|24073 : TAAATA-TT-TTGATTGACC--TT-G-A-C---C--A-----T--------T--G----A-A-A--------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---AT-G-C-CTA-------AA-TG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGA
gi|24074 : TATATT-AT-CTGAGTGACC--TT-C-A-C---C--T-----T--------T--C----C-ATA-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGG------CCTGGAATC-A--A-------G-A-G---C--C---C---TT-A-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-T-AT
gi|24075 : TACATG-TT-CAGAGTGACC--TT-G-ACC---C--T-----T--------C--C----A-A-A-A------TGATCTTGAAAG-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------CT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-T-AT
gi|24076 : TATATA-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--C-----T--------TA-C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------A--------A----------
gi|24077 : TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------CATTG------------------A----AA-A-AT-----CA------A-G-ATC---A-A--T-TATGATgtc
gi|24078 : TATATG-CT-TTCAGTGACC--AT-C-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------G-C-TGT--------AGAC-----A----------TC------G-A--A-------A-A-G---T-AA---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----GT-A-TT-----TG------G-G-ATC---A-A--G-TATGAT
gi|24079 : TATCTGCTT-TTGTGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C-A--AC------C-A-G---T-CC---A---AT-G-TGCCC-------AC-AG------------------G----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24080 : TATATG-TC-TTGAAGGACC--TT-G-G-C---C--C-----T--------T--G----A-A-A--------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TT------T-A--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-G-C-CAC-------AA-GG------------------A----AT-A-AT-----TA------T-G-ATC---A-C--T-GATGAT
gi|24081 : TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------------------------------------------G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-TG------------------A----AA-A-TT-----TG------A-G-ATG---C-A--T-TATGAT
gi|24082 : TACATA-TT-TTGAACGACC--TT-G-A-C---C--C-----T--------T--CG---A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--A-------A-C-G---T--C---C---CT-G-T-TGC-------AA-GA------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-C--T-TCTGAT
gi|24083 : TGTATG-TT-TTGAGTGACT--CT-G-G-C---C--T-----T--------T--A----A-A-A-A------T----------G-----------G---------T-C-T-T--------T--------G----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-GC---C---CT-G-T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A----------------T-G-ATG---A-A--TCTATAAT
gi|24084 : TATATA-TT---GAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--AC---A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--A-------G----------C---C---TT-G-T-CCA-------AA-GG------------------A----AT-A-TC-----TA------T-G-GTC---A-A--G-TATGAT
gi|24085 : TATATG-TT-GTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC-C----A-A-A-A------T----------G-----------C---------A-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--A-------A-AGG---T-CT---C---CT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-G--T-
gi|24086 : TATATA-TT-CTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----TC-------C--T----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-TTAAA----G--------A----------CCTTTGGTC-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-TTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-T-TTC---A-A--T-TATG
gi|24087 : TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-GCA-C---CT-T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------GA----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C-A--A-------A-A-G---TAAC---C---CT-G-T-CTC-------AA-AG------------------A----TT-A-T
gi|24088 : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-C-A-C---C--T-----C--------T--CC---A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAGACCCTTGGTC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTA-------AA-GG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TAT
gi|24089 : TATATC-TT--TGA-TGATC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A--------T----------G-----------A---------C-C-A-T--------G--------A----------TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT-G-T-CCC--------A-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---ATA--TATATGAT
gi|24090 : GATC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----G-A-A-A------TGG--------G-----------A---------C-C-A-T--------G--------A----------TC------C-A--A-------T-A-----T-AT---C---AT-G-T-CCC-------A---G------------------G----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---ATA--TATATGAT
gi|24091 : tattactttggatgTATACA-TT-CAGAGTGACA--TT-G-A-C---T--T-----T--------T--C----G-A-A-AG-----T----------G-----------A---------C-A-T-C--------G--------G----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---T---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AA-A-TT-----TA------G-G-ACC---A-G--T-TATAAT
gi|24092 : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-T---C--TACCTAT--------C--C----A-A-A-A------A----------G-----------A---------C-C-T-T--------A--------A----------TC------C-A--C-------A-A-T---T--T---T---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-GAT
gi|24093 : TATATG-TT-CTGAGTGAGC--TT-G-A-C---CT-T-----T--------T--T----A-A-G-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G----------------------------------------A-G-A---T-AC---CT--TT-G-T-CCA-------AA-AG------------------A----
gi|24094 : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---T--T-----TTTAATTAAT--A----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C-A--A-------A-A-G---T--T---T---CT-A-T-CCC-------AA-AG-----------------------AT-ATTT-----TG------T-G-ATC---C-A--T-
gi|24095 : TATATG-TT-CTGAGTGACA--TT-G-G-T---CA-T-----T--------C--C----A-A-C-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--C-------A-A-G---T-CC---C---AT------CC-------AA-G-------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATT---A-A--T-TATGAT
gi|24096 : TATGTA-TA-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---CTTT-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------
gi|24097 : TAGATG-CT-TTGAGTGACT--TC-G-A-C---C--T-----T--------T-------A-A-A-T------T----------G-----------A-----------A-T-T--------G-------------------TC------CAA--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-GTT-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TG-----AG------T-A-A-C---A------TATGAT
gi|24098 : TAGATG-CT-TTGAGTGACT--TC-G-A-C---C--T-----T--------T-------A-A-A-T------T----------G-----------A-----------A-T-T--------G-------------------TC------CAA--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-GTT-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TG-----AG------T-A-A-C---A------TATGAT
gi|24099 : TACATG-TT-TTG-GTGACC--TTTG-G-C---C--T-----T--------T--C----G-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-CG------------------A----AC-ATTT-----TG------T-G-
gi|24100 : TACATG-TT-TTG-GTGACC--TTTG-G-C---C--T-----T--------T--C----G-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-CG------------------A----AC-ATTT-----TG------T-G-
gi|24101 : TATGTG-TT-CAAAGTGACC--TTCA-A-C---T--T-----T--------C--C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-TT---C---CT-G-T--CC-------AA-AG------------------A----GT-A-TT-----TG------T-G-A
gi|24102 : TATATA-TT-CTGAATGGCC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TCCC----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-A-T-C--------GGTCCAATTG----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---C---CT-G-T-CCCA------AA-AA------------------A----AT-A-TCTATGATG------C-G-ATC---A-A--T-
gi|24103 : TATATG-CT-TTGAGTAGCC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C-A--A-------A-
gi|24104 : TATGTA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------CA-C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-CTT-T--------G--------A-----------C------T-A--A-------A-A-G---T-A
gi|24105 : TATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--CTTCTA-A-A-T------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAG-------CCTTTGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-
gi|24106 : TATATG-TT-CTGAGTGACA--CT-G-A-GGGAC--T-----T--------C--C----C-G-A--------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--G-------A-A-G---T-CC---C---TT-G-T-CCC-------AG-GG------------------AGTATGT-A-TC-----TG------T-A-ATT---A-A--T-
gi|24107 : TATATG-TT-CTGAGTGAC----T-G-A-C---CA-T-----T--------T--A----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AGAGACCATGGTC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-AG------------------A----AC-A-T------------------ATC---G-A--T-
gi|24108 : TATATG-TT-CTCAATGACC--TT-G-G-T---C--T-----T--------TC-C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGAACTTGGTC------C-A--C-------A-A-G---C--T---C---GT-G-T-ATC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-AT
gi|24109 : ACATG-TT-CTGAGTGACA--TT-G-G-C---C--T-----T--------TCCA----A-A-A-A------T----------G-----------ATCTTAAAAGC-C-T-T--------G--------G----------TT------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-
gi|24110 : ATATG-GT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---CA-T-----T--------C--G----A-G-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------
gi|24111 : ATATG-TT-TTGAATGACC--TT-G-A-T---C--T-----TC-------C--C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------CAT-T-T--------A--------A----------TT------C-G--C-------A-A-G------C---CA--TT-G-T-CTC-------GA-GG------------------A----AC-T-TT-----TC------T-G-GTgt
gi|24112 : ATATG-CT-CTGAATTACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC-T----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-TCAAA----G--------G----------TC------C-A--C-------A-A-G---
gi|24113 : ATATG-TA-TTGAGTGACC--TT-G-T-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------T-----------G---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C-A--A-------A-A-------------------G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24114 : ATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----TA-------C--C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAG-------CCTTGGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24115 : ATATG-AT-CTGAATGACC--TT-G-A-G---C--T-----T--------T--C----C-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGACTTGGGTT------C-A--C-------A-A-G---C-A----C---TC-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-TGT
gi|24116 : ATACA-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---A--T-----T--------T--C----C-A-A-A------T----------GGATCTCGAGTGA---------C-C-T-T--------T--------G----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---C---CT-G-T-CCA-------AA-GG------------------A----GT-A-TT-----TG------T-A-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24117 : ATATG-GT-CTGAATGACC--TT-A-A-A---C--T-----T--------TC-T----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AGAGACCTTGGTC------C-A--C-------A-A-A---T--C---T---TT-G-T-CTC-------AA-GA------------------A----CC-A-TT-----TG------C-A-ATA---A-A--T-GAT
gi|24118 : TATG-CT-TTTAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------C---------C-C-T-T--------G--------A----------TA------C-A--C-------C-A-G---T-AC---CCCTGT-G-T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TGT-----T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24119 : TATG-TTTCTGAG--ACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--C----C-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------GG-------A----------TT------T-A--ACTAT---A-A-T---T-ACATGT---AT-G-T-CCCCTGTCAAAA-GG------------------A----AT-A-TC-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24120 : TATG-CT-TTGAGTGACCAGTT-G-G-A---C--C-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C---T--------G--------A----------CC------C-GTCA-------G-A-G---T-AG---C---A----T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A-T
gi|24121 : TATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-G-C---C--TA----T--------C--C----A-A-A-T------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGTCCTTGGTC------T-A--A-------A-C-G---T--C---C---TT-G-C-ATC-------AT-GG------------------A----AC-A-TT-----TC------C-G-ATC---A-A--T-
gi|24122 : ATG-TT-CTGAATGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--CC---A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TG------C-A--A-------A-A-G---C--C---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TC-----GG------T-G-CTT---A-A--T-TATGAT
gi|24123 : ATG-CT--TGAGTGACC--T--G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------------------------------------------G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-TG------------------A----AA-A-TT-----TG------A-G-A
gi|24124 : ATG-CT--TGA-TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----T-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT---T-CCC-------AA--G------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---CTA--T-TATGAT
gi|24125 : ATG-CT--TGA-TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----T-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT---T-CCC-------AA--G------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---CTA--T-TATGAT
gi|24126 : ATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--T----G-A-A-A-----------------------------A---------C-CGT-T--------G--------A----------TG------C-A--G-------ACA-GATTT-AT---T---ATCG-T-CAG-------AA-GG------------------A----ATAA-TTA----TG------TGG-ATC---A-AG-T-TATGAT
gi|24127 : ATG-TT-CTCAGTGATC--TT-G-T-T---C--C-----T--------T--C----ATA-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-A--------T--------C----------TC------T-A--A-------A-C-G---T--C---C---AT-G-T-CCC-------AA-GGAATACCCCTGTCCAAAGTA----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-AAT
gi|24128 : ATC--TT-----C---C--T-----T--------C--C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--A-------A-A-G---T--C---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TGA-----T-G-A
gi|24129 : tgcttataaatG-TT-CTGAGTGACC--TG-A-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-T-T-T--------A--------A----------TC------C-A--A-------G-A-G---T-AC---C---CT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TTTGAT
gi|24130 : T-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--TT---A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAG-------CCTTGGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-TG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-TGT
gi|24131 : T-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--A----A-A-ATACCT---T----------G-----------AAAG------C-C-T-T--------G--------G----------AT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-TG------------------AAC--AT-A-TT-----TGGTAAATT-GTATC---A-AATT-TATGAT
gi|24132 : T-CTGAGTGACC--TT-G-T-C---C--T-----T--------T--C----A-A-A-AA-----T----------G-----------A---------C-C-T-TACTCAAATG--------G----------TT------T-A--A-------A-A-G---T-CT---C---TT-G-T-TTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-A--T-TAT
gi|24133 : TAAGTGACC--TT-G-A-G---C--T-----T--------TC-C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAG-------AC------C-A--GGGTTCTTA-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-
gi|24134 : TGAGTGATC--TC-G-A-C---C--T-----T--------TC-C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TT------T-A--C-------A-A-----C-CT---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TT------C-A-ATA---A-A--T-TGT
gi|24135 : TGTGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--CC---A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-A-T--------G--------AGACACCATGGTC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-T-T-GTA-------AA-AG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATC---G-A--T-TAT
gi|24136 : TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------A-A--A-------A-A-G---T-GC---C---CA-G---CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24137 : ---C--T-----T--------T---------A-A-G------T----------G-----------A---------C-C-A-T--------G--------G----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-AG---T---CT-G-T-CCC-------AA-AG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATCTGTA-A--T-TACAAT
gi|24138 : ----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-T--C-------A-A-G---T-CT---C---CT-G-T-TC--------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
Alignments
lowQualScore : 111111 11
lowQualScore : 0 11 00 1 0 1 000 44 11111 33333333 333333 0 0 0 333333 5555555555 22222222222 8888888888 2222222222 33333333333 4444444444 888888888888888888888 111 666666 1 4444444444 0 0 000 44 111 3333 0 1 0 2222222 0 444444444444444444 1111 1 1 22222 222222 0 0 111 2 11 2
lowQualScore : . .. .. . . . ... .. ..... ........ ...... . . . ...... .......... ........... .......... .......... ........... .......... ..................... ... ...... . .......... . . ... .. ... .... . . . ....... . .................. .... . . ..... ...... . . ... . .. .
lowQualScore : 6 77 77 5 5 0 999 22 88888 44444444 555555 5 5 5 333333 1111111111 99999999999 1111111111 7777777777 44444444444 7777777777 000000000000000000000 555 111111 1 7777777777 5 5 999 55 000 3333 6 1 6 9999999 6 111111111111111111 9999 1 7 00000 888888 6 6 222 7 66 0
consensus : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----N-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---NT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
Reference ( family-295 ) : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----N-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---NT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24059 : TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-G--A-------A-A-G---T-AC---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------C-G-ATC---A-A--T-TACAAT
gi|24060 : TATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-ATTACATT----------G-----------AAAG-------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-GA------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24061 : TATATG-CT-TTGAGTGAC----T-G-A-C---C--T-----T--------T----G-C-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-T-ATC---A-G--T-TATGAT
gi|24062 : TATATG-TT-CTGAGTAACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24063 : TATATG-CA-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---T--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A---G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24064 : TATATA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------CA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------------------------------------------A-A-G---TCAC---T---CT-G-A-CT---------A-AG------------------A----GTAA-TT-----TG------T-T-GTT---A-A--T-TAT
gi|24065 : TATATG-CT-TTGAATGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------T-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---G---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-A--A-TATGA
gi|24066 : TATATG-TT---GAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------T-A--A-------A-A-A---T-AC---C---CT-G-T-CTCA------AA-AA------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24067 : TATATG-TT-CTGAGTAACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------A----------G---TT------G-A--A-------A-A-G---T-AT---C---CT-A-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24068 : TATATG-CT-TTGAGTGACC--AT-G-A-C---C--T-----T--------T----A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------C----------C----------G----------A---TC------C-A--A-------A-G-G---T-GC---C---CT-G-T-GCC-------AA-GG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATC---A-A--C-TATGAT
gi|24069 : TATATG-TT-TTGAGTGACC--TT-G-G-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------T----------C-----------T----------T----------T----------G---TC------C-A--A-------T-T-G---T-AC---C---TT-G-T-ACC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-AAC---A-A--T-TATGAT
gi|24070 : TGTATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---CT-T-----T--------T----C-A-A-A-A------T----------G-----------ACCTTGAAAGCC----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--T---C---TT-G-T-CTT-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24071 : TATATA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24072 : TATATG-TT-TTGGGTGACC--TT-G-AAC---T--T-----T--------T----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---A---TT-G-T-CCA-------AG-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATT---A-A--T-CATGATaagtc
gi|24073 : TAAATA-TT-TTGATTGACC--TT-G-A-C---C--A-----T--------T----G-A-A-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---AT-G-C-CTA-------AA-TG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGA
gi|24074 : TATATT-AT-CTGAGTGACC--TT-C-A-C---C--T-----T--------T----C-C-ATA-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TGAAA------G----------G---CCTGGAATC-A--A-------G-A-G---C--C---C---TT-A-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-T-AT
gi|24075 : TACATG-TT-CAGAGTGACC--TT-G-ACC---C--T-----T--------C----C-A-A-A-A------TGATCTTGAAAG-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---CT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-T-AT
gi|24076 : TATATA-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--C-----T--------TA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24077 : TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------CATTG------------------A----AA-A-AT-----CA------A-G-ATC---A-A--T-TATGATaagtc
gi|24078 : TATATG-CT-TTCAGTGACC--AT-C-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------G----------C-----------TG---------T----------A----------GACATC------G-A--A-------A-A-G---T-AA---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----GT-A-TT-----TG------G-G-ATC---A-A--G-TATGAT
gi|24079 : TATCTGCTT-TTGTGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--AC------C-A-G---T-CC---A---AT-G-TGCCC-------AC-AG------------------G----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24080 : TATATG-TC-TTGAAGGACC--TT-G-G-C---C--C-----T--------T----G-A-A-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------T-A--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-G-C-CAC-------AA-GG------------------A----AT-A-AT-----TA------T-G-ATC---A-C--T-GATGAT
gi|24081 : TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G---------------------------------------G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-TG------------------A----AA-A-TT-----TG------A-G-ATG---C-A--T-TATGAT
gi|24082 : TACATA-TT-TTGAACGACC--TT-G-A-C---C--C-----T--------T----CGA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-C-G---T--C---C---CT-G-T-TGC-------AA-GA------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-C--T-TCTGAT
gi|24083 : TGTATG-TT-TTGAGTGACT--CT-G-G-C---C--T-----T--------T----A-A-A-A-A------T----------G-----------G----------T----------C-----------T----------T----------T----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-GC---C---CT-G-T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A----------------T-G-ATG---A-A--TCTATAAT
gi|24084 : TATATA-TT---GAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----ACA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------G----------C---C---TT-G-T-CCA-------AA-GG------------------A----AT-A-TC-----TA------T-G-GTC---A-A--G-TATGAT
gi|24085 : TATATG-TT-GTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-A------T----------G-----------C----------A----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-AGG---T-CT---C---CT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-G--T-
gi|24086 : TATATA-TT-CTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----TC-------C----T-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------CTTTAAAGACCTT----------T----------G----------G---T-------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-TTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-T-TTC---A-A--T-TATG
gi|24087 : TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-GCA-C---CT-T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------GA----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-G---TAAC---C---CT-G-T-CTC-------AA-AG------------------A----TT-A-T
gi|24088 : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-C-A-C---C--T-----C--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAGACCCTTGG---TC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTA-------AA-GG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TAT
gi|24089 : TATATC-TT--TGA-TGATC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G---A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------A----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT-G-T-CCC--------A-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---ATA--TATATGAT
gi|24090 : GATC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-G-A-A-A------TGG--------G-----------A----------C----------C-----------A----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------T-A-----T-AT---C---AT-G-T-CCC-------A---G------------------G----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---ATA--TATATGAT
gi|24091 : tattactttggatgTATACA-TT-CAGAGTGACA--TT-G-A-C---T--T-----T--------T----C-G-A-A-AG-----T----------G-----------A----------C----------A-----------T----------C----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---T---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AA-A-TT-----TA------G-G-ACC---A-G--T-TATAAT
gi|24092 : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-T---C--TACCTAT--------C----C-A-A-A-A------A----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------A----------A---TC------C-A--C-------A-A-T---T--T---T---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-GAT
gi|24093 : TATATG-TT-CTGAGTGAGC--TT-G-A-C---CT-T-----T--------T----T-A-A-G-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G-----------------------------------A-G-A---T-AC---CT--TT-G-T-CCA-------AA-AG------------------A----
gi|24094 : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---T--T-----TTTAATTAAT----A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-G---T--T---T---CT-A-T-CCC-------AA-AG-----------------------AT-ATTT-----TG------T-G-ATC---C-A--T-
gi|24095 : TATATG-TT-CTGAGTGACA--TT-G-G-T---CA-T-----T--------C----C-A-A-C-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---T-CC---C---AT------CC-------AA-G-------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATT---A-A--T-TATGAT
gi|24096 : TATGTA-TA-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---CTTT-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24097 : TAGATG-CT-TTGAGTGACT--TC-G-A-C---C--T-----T--------T------A-A-A-T------T----------G-----------A----------A----------T-----------T--------------------------------G---TC------CAA--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-GTT-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TG-----AG------T-A-A-C---A------TATGAT
gi|24098 : TAGATG-CT-TTGAGTGACT--TC-G-A-C---C--T-----T--------T------A-A-A-T------T----------G-----------A----------A----------T-----------T--------------------------------G---TC------CAA--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-GTT-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TG-----AG------T-A-A-C---A------TATGAT
gi|24099 : TACATG-TT-TTG-GTGACC--TTTG-G-C---C--T-----T--------T----C-G-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-CG------------------A----AC-ATTT-----TG------T-G-
gi|24100 : TACATG-TT-TTG-GTGACC--TTTG-G-C---C--T-----T--------T----C-G-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-CG------------------A----AC-ATTT-----TG------T-G-
gi|24101 : TATGTG-TT-CAAAGTGACC--TTCA-A-C---T--T-----T--------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-TT---C---CT-G-T--CC-------AA-AG------------------A----GT-A-TT-----TG------T-G-A
gi|24102 : TATATA-TT-CTGAATGGCC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TCC--C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------A-----------T----------C----------GGTCCAATT--G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---C---CT-G-T-CCCA------AA-AA------------------A----AT-A-TCTATGATG------C-G-ATC---A-A--T-
gi|24103 : TATATG-CT-TTGAGTAGCC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-
gi|24104 : TATGTA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------CA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------T----------G---AC------T-A--A-------A-A-G---T-A
gi|24105 : TATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TCTTCT-A-A-A-T------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---CCTTTGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-
gi|24106 : TATATG-TT-CTGAGTGACA--CT-G-A-GGGAC--T-----T--------C----C-C-G-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--G-------A-A-G---T-CC---C---TT-G-T-CCC-------AG-GG------------------AGTATGT-A-TC-----TG------T-A-ATT---A-A--T-
gi|24107 : TATATG-TT-CTGAGTGAC----T-G-A-C---CA-T-----T--------T----A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------TTGAGAGACCAT----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-AG------------------A----AC-A-T------------------ATC---G-A--T-
gi|24108 : TATATG-TT-CTCAATGACC--TT-G-G-T---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------CCTTGAAAGAAC-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---C--T---C---GT-G-T-ATC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-AT
gi|24109 : ACATG-TT-CTGAGTGACA--TT-G-G-C---C--T-----T--------TCC--A-A-A-A-A------T----------G-----------ATCTTAAAAG-C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-
gi|24110 : ATATG-GT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---CA-T-----T--------C----G-A-G-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------
gi|24111 : ATATG-TT-TTGAATGACC--TT-G-A-T---C--T-----TC-------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------CA---------T-----------T----------T----------A----------A---TT------C-G--C-------A-A-G------C---CA--TT-G-T-CTC-------GA-GG------------------A----AC-T-TT-----TC------T-G-GTagt
gi|24112 : ATATG-CT-CTGAATTACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---T-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TCAAA------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---
gi|24113 : ATATG-TA-TTGAGTGACC--TT-G-T-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------T-----------G----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-------------------G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24114 : ATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----TA-------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---CCTTGGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24115 : ATATG-AT-CTGAATGACC--TT-G-A-G---C--T-----T--------T----C-C-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TGAAAGACTTGG----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C-A----C---TC-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-TGT
gi|24116 : ATACA-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---A--T-----T--------T----C-C-A-A-A------T----------GGATCTCGAGTGA----------C----------C-----------T----------T----------T----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---C---CT-G-T-CCA-------AA-GG------------------A----GT-A-TT-----TG------T-A-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24117 : ATATG-GT-CTGAATGACC--TT-A-A-A---C--T-----T--------TC---T-A-A-A-A------TGACCTTGAGAG-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-A---T--C---T---TT-G-T-CTC-------AA-GA------------------A----CC-A-TT-----TG------C-A-ATA---A-A--T-GAT
gi|24118 : TATG-CT-TTTAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------C----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TA------C-A--C-------C-A-G---T-AC---CCCTGT-G-T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TGT-----T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24119 : TATG-TTTCTGAG--ACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----C-C-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------GA--TT------T-A--ACTAT---A-A-T---T-ACATGT---AT-G-T-CCCCTGTCAAAA-GG------------------A----AT-A-TC-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24120 : TATG-CT-TTGAGTGACCAGTT-G-G-A---C--C-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C----------------------T----------G----------A---CC------C-GTCA-------G-A-G---T-AG---C---A----T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A-T
gi|24121 : TATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-G-C---C--TA----T--------C----C-A-A-A-T------T----------G-----------ACCTTGAAAGTC----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------T-A--A-------A-C-G---T--C---C---TT-G-C-ATC-------AT-GG------------------A----AC-A-TT-----TC------C-G-ATC---A-A--T-
gi|24122 : ATG-TT-CTGAATGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TG------C-A--A-------A-A-G---C--C---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TC-----GG------T-G-CTT---A-A--T-TATGAT
gi|24123 : ATG-CT--TGAGTGACC--T--G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G---------------------------------------G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-TG------------------A----AA-A-TT-----TG------A-G-A
gi|24124 : ATG-CT--TGA-TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-T-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT---T-CCC-------AA--G------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---CTA--T-TATGAT
gi|24125 : ATG-CT--TGA-TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-T-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT---T-CCC-------AA--G------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---CTA--T-TATGAT
gi|24126 : ATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----T-G-A-A-A-----------------------------A----------C----------CG----------T----------T----------G----------A---TG------C-A--G-------ACA-GATTT-AT---T---ATCG-T-CAG-------AA-GG------------------A----ATAA-TTA----TG------TGG-ATC---A-AG-T-TATGAT
gi|24127 : ATG-TT-CTCAGTGATC--TT-G-T-T---C--C-----T--------T----C-ATA-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------A----------T----------C---TC------T-A--A-------A-C-G---T--C---C---AT-G-T-CCC-------AA-GGAATACCCCTGTCCAAAGTA----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-AAT
gi|24128 : ATC--TT-----C---C--T-----T--------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T--C---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TGA-----T-G-A
gi|24129 : tgcttataaatG-TT-CTGAGTGACC--TG-A-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------T-----------T----------T----------A----------A---TC------C-A--A-------G-A-G---T-AC---C---CT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TTTGAT
gi|24130 : T-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---CT-T-----T--------T----T-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---CCTTGGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-TG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-TGT
gi|24131 : T-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----A-A-A-ATACCT---T----------G-----------AAAG-------C----------C-----------T----------T----------G----------G---AT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-TG------------------AAC--AT-A-TT-----TGGTAAATT-GTATC---A-AATT-TATGAT
gi|24132 : T-CTGAGTGACC--TT-G-T-C---C--T-----T--------T----C-A-A-A-AA-----T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TACTCAAAT--G----------G---TT------T-A--A-------A-A-G---T-CT---C---TT-G-T-TTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-A--T-TAT
gi|24133 : TAAGTGACC--TT-G-A-G---C--T-----T--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---AC------C-A--GGGTTCTTA-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-
gi|24134 : TGAGTGATC--TC-G-A-C---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------T-A--C-------A-A-----C-CT---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TT------C-A-ATA---A-A--T-TGT
gi|24135 : TGTGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------CA----------TGAGACACCA-T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-T-T-GTA-------AA-AG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATC---G-A--T-TAT
gi|24136 : TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------A-A--A-------A-A-G---T-GC---C---CA-G---CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24137 : ---C--T-----T--------T--------A-A-G------T----------G-----------A----------C----------C-----------A----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AG---T---CT-G-T-CCC-------AA-AG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATCTGTA-A--T-TACAAT
gi|24138 : -A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-T--C-------A-A-G---T-CT---C---CT-G-T-TC--------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
Alignments
lowQualScore : 111111 11
lowQualScore : 0 11 00 1 0 1 000 44 11111 33333333 333333 0 0 0 333333 5555555555 22222222222 8888888888 2222222222 33333333333 4444444444 888888888888888888888 111 666666 1 4444444444 0 0 000 44 111 3333 0 1 0 2222222 0 444444444444444444 1111 1 1 22222 222222 0 0 111 2 11 2
lowQualScore : . .. .. . . . ... .. ..... ........ ...... . . . ...... .......... ........... .......... .......... ........... .......... ..................... ... ...... . .......... . . ... .. ... .... . . . ....... . .................. .... . . ..... ...... . . ... . .. .
lowQualScore : 6 77 77 5 5 0 999 22 88888 44444444 555555 5 5 5 333333 1111111111 99999999999 1111111111 7777777777 44444444444 7777777777 000000000000000000000 555 111111 1 7777777777 5 5 999 55 000 3333 6 1 6 9999999 6 111111111111111111 9999 1 7 00000 888888 6 6 222 7 66 0
consensus : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----N-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---NT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
Reference ( family-295 ) : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----N-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---NT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24059 : TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-G--A-------A-A-G---T-AC---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------C-G-ATC---A-A--T-TACAAT
gi|24060 : TATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-ATTACATT----------G-----------AAAG-------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-GA------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24061 : TATATG-CT-TTGAGTGAC----T-G-A-C---C--T-----T--------T----G-C-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-T-ATC---A-G--T-TATGAT
gi|24062 : TATATG-TT-CTGAGTAACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24063 : TATATG-CA-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---T--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A---G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24064 : TATATA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------CA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------------------------------------------A-A-G---TCAC---T---CT-G-A-CT---------A-AG------------------A----GTAA-TT-----TG------T-T-GTT---A-A--T-TAT
gi|24065 : TATATG-CT-TTGAATGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------T-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---G---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-A--A-TATGA
gi|24066 : TATATG-TT---GAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------T-A--A-------A-A-A---T-AC---C---CT-G-T-CTCA------AA-AA------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24067 : TATATG-TT-CTGAGTAACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------A----------G---TT------G-A--A-------A-A-G---T-AT---C---CT-A-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24068 : TATATG-CT-TTGAGTGACC--AT-G-A-C---C--T-----T--------T----A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------C----------C----------G----------A---TC------C-A--A-------A-G-G---T-GC---C---CT-G-T-GCC-------AA-GG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATC---A-A--C-TATGAT
gi|24069 : TATATG-TT-TTGAGTGACC--TT-G-G-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------T----------C-----------T----------T----------T----------G---TC------C-A--A-------T-T-G---T-AC---C---TT-G-T-ACC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-AAC---A-A--T-TATGAT
gi|24070 : TGTATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---CT-T-----T--------T----C-A-A-A-A------T----------G-----------ACCTTGAAAGCC----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--T---C---TT-G-T-CTT-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24071 : TATATA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24072 : TATATG-TT-TTGGGTGACC--TT-G-AAC---T--T-----T--------T----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---A---TT-G-T-CCA-------AG-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATT---A-A--T-CATGATaagtc
gi|24073 : TAAATA-TT-TTGATTGACC--TT-G-A-C---C--A-----T--------T----G-A-A-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---AT-G-C-CTA-------AA-TG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGA
gi|24074 : TATATT-AT-CTGAGTGACC--TT-C-A-C---C--T-----T--------T----C-C-ATA-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TGAAA------G----------G---CCTGGAATC-A--A-------G-A-G---C--C---C---TT-A-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-T-AT
gi|24075 : TACATG-TT-CAGAGTGACC--TT-G-ACC---C--T-----T--------C----C-A-A-A-A------TGATCTTGAAAG-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---CT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-T-AT
gi|24076 : TATATA-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--C-----T--------TA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24077 : TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------CATTG------------------A----AA-A-AT-----CA------A-G-ATC---A-A--T-TATGATaagtc
gi|24078 : TATATG-CT-TTCAGTGACC--AT-C-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------G----------C-----------TG---------T----------A----------GACATC------G-A--A-------A-A-G---T-AA---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----GT-A-TT-----TG------G-G-ATC---A-A--G-TATGAT
gi|24079 : TATCTGCTT-TTGTGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--AC------C-A-G---T-CC---A---AT-G-TGCCC-------AC-AG------------------G----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24080 : TATATG-TC-TTGAAGGACC--TT-G-G-C---C--C-----T--------T----G-A-A-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------T-A--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-G-C-CAC-------AA-GG------------------A----AT-A-AT-----TA------T-G-ATC---A-C--T-GATGAT
gi|24081 : TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G---------------------------------------G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-TG------------------A----AA-A-TT-----TG------A-G-ATG---C-A--T-TATGAT
gi|24082 : TACATA-TT-TTGAACGACC--TT-G-A-C---C--C-----T--------T----CGA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-C-G---T--C---C---CT-G-T-TGC-------AA-GA------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-C--T-TCTGAT
gi|24083 : TGTATG-TT-TTGAGTGACT--CT-G-G-C---C--T-----T--------T----A-A-A-A-A------T----------G-----------G----------T----------C-----------T----------T----------T----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-GC---C---CT-G-T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A----------------T-G-ATG---A-A--TCTATAAT
gi|24084 : TATATA-TT---GAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----ACA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------G----------C---C---TT-G-T-CCA-------AA-GG------------------A----AT-A-TC-----TA------T-G-GTC---A-A--G-TATGAT
gi|24085 : TATATG-TT-GTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-A------T----------G-----------C----------A----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-AGG---T-CT---C---CT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-G--T-
gi|24086 : TATATA-TT-CTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----TC-------C----T-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------CTTTAAAGACCTT----------T----------G----------G---T-------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-TTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-T-TTC---A-A--T-TATG
gi|24087 : TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-GCA-C---CT-T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------GA----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-G---TAAC---C---CT-G-T-CTC-------AA-AG------------------A----TT-A-T
gi|24088 : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-C-A-C---C--T-----C--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAGACCCTTGG---TC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTA-------AA-GG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TAT
gi|24089 : TATATC-TT--TGA-TGATC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G---A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------A----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT-G-T-CCC--------A-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---ATA--TATATGAT
gi|24090 : GATC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-G-A-A-A------TGG--------G-----------A----------C----------C-----------A----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------T-A-----T-AT---C---AT-G-T-CCC-------A---G------------------G----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---ATA--TATATGAT
gi|24091 : tattactttggatgTATACA-TT-CAGAGTGACA--TT-G-A-C---T--T-----T--------T----C-G-A-A-AG-----T----------G-----------A----------C----------A-----------T----------C----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---T---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AA-A-TT-----TA------G-G-ACC---A-G--T-TATAAT
gi|24092 : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-T---C--TACCTAT--------C----C-A-A-A-A------A----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------A----------A---TC------C-A--C-------A-A-T---T--T---T---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-GAT
gi|24093 : TATATG-TT-CTGAGTGAGC--TT-G-A-C---CT-T-----T--------T----T-A-A-G-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G-----------------------------------A-G-A---T-AC---CT--TT-G-T-CCA-------AA-AG------------------A----
gi|24094 : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---T--T-----TTTAATTAAT----A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-G---T--T---T---CT-A-T-CCC-------AA-AG-----------------------AT-ATTT-----TG------T-G-ATC---C-A--T-
gi|24095 : TATATG-TT-CTGAGTGACA--TT-G-G-T---CA-T-----T--------C----C-A-A-C-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---T-CC---C---AT------CC-------AA-G-------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATT---A-A--T-TATGAT
gi|24096 : TATGTA-TA-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---CTTT-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24097 : TAGATG-CT-TTGAGTGACT--TC-G-A-C---C--T-----T--------T------A-A-A-T------T----------G-----------A----------A----------T-----------T--------------------------------G---TC------CAA--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-GTT-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TG-----AG------T-A-A-C---A------TATGAT
gi|24098 : TAGATG-CT-TTGAGTGACT--TC-G-A-C---C--T-----T--------T------A-A-A-T------T----------G-----------A----------A----------T-----------T--------------------------------G---TC------CAA--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-GTT-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TG-----AG------T-A-A-C---A------TATGAT
gi|24099 : TACATG-TT-TTG-GTGACC--TTTG-G-C---C--T-----T--------T----C-G-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-CG------------------A----AC-ATTT-----TG------T-G-
gi|24100 : TACATG-TT-TTG-GTGACC--TTTG-G-C---C--T-----T--------T----C-G-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-CG------------------A----AC-ATTT-----TG------T-G-
gi|24101 : TATGTG-TT-CAAAGTGACC--TTCA-A-C---T--T-----T--------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-TT---C---CT-G-T--CC-------AA-AG------------------A----GT-A-TT-----TG------T-G-A
gi|24102 : TATATA-TT-CTGAATGGCC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TCC--C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------A-----------T----------C----------GGTCCAATT--G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---C---CT-G-T-CCCA------AA-AA------------------A----AT-A-TCTATGATG------C-G-ATC---A-A--T-
gi|24103 : TATATG-CT-TTGAGTAGCC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-
gi|24104 : TATGTA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------CA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------T----------G---AC------T-A--A-------A-A-G---T-A
gi|24105 : TATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TCTTCT-A-A-A-T------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---CCTTTGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-
gi|24106 : TATATG-TT-CTGAGTGACA--CT-G-A-GGGAC--T-----T--------C----C-C-G-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--G-------A-A-G---T-CC---C---TT-G-T-CCC-------AG-GG------------------AGTATGT-A-TC-----TG------T-A-ATT---A-A--T-
gi|24107 : TATATG-TT-CTGAGTGAC----T-G-A-C---CA-T-----T--------T----A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------TTGAGAGACCAT----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-AG------------------A----AC-A-T------------------ATC---G-A--T-
gi|24108 : TATATG-TT-CTCAATGACC--TT-G-G-T---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------CCTTGAAAGAAC-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---C--T---C---GT-G-T-ATC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-AT
gi|24109 : ACATG-TT-CTGAGTGACA--TT-G-G-C---C--T-----T--------TCC--A-A-A-A-A------T----------G-----------ATCTTAAAAG-C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-
gi|24110 : ATATG-GT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---CA-T-----T--------C----G-A-G-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------
gi|24111 : ATATG-TT-TTGAATGACC--TT-G-A-T---C--T-----TC-------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------CA---------T-----------T----------T----------A----------A---TT------C-G--C-------A-A-G------C---CA--TT-G-T-CTC-------GA-GG------------------A----AC-T-TT-----TC------T-G-GTagt
gi|24112 : ATATG-CT-CTGAATTACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---T-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TCAAA------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---
gi|24113 : ATATG-TA-TTGAGTGACC--TT-G-T-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------T-----------G----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-------------------G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24114 : ATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----TA-------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---CCTTGGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24115 : ATATG-AT-CTGAATGACC--TT-G-A-G---C--T-----T--------T----C-C-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TGAAAGACTTGG----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C-A----C---TC-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-TGT
gi|24116 : ATACA-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---A--T-----T--------T----C-C-A-A-A------T----------GGATCTCGAGTGA----------C----------C-----------T----------T----------T----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---C---CT-G-T-CCA-------AA-GG------------------A----GT-A-TT-----TG------T-A-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24117 : ATATG-GT-CTGAATGACC--TT-A-A-A---C--T-----T--------TC---T-A-A-A-A------TGACCTTGAGAG-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-A---T--C---T---TT-G-T-CTC-------AA-GA------------------A----CC-A-TT-----TG------C-A-ATA---A-A--T-GAT
gi|24118 : TATG-CT-TTTAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------C----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TA------C-A--C-------C-A-G---T-AC---CCCTGT-G-T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TGT-----T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24119 : TATG-TTTCTGAG--ACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----C-C-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------GA--TT------T-A--ACTAT---A-A-T---T-ACATGT---AT-G-T-CCCCTGTCAAAA-GG------------------A----AT-A-TC-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24120 : TATG-CT-TTGAGTGACCAGTT-G-G-A---C--C-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C----------------------T----------G----------A---CC------C-GTCA-------G-A-G---T-AG---C---A----T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A-T
gi|24121 : TATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-G-C---C--TA----T--------C----C-A-A-A-T------T----------G-----------ACCTTGAAAGTC----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------T-A--A-------A-C-G---T--C---C---TT-G-C-ATC-------AT-GG------------------A----AC-A-TT-----TC------C-G-ATC---A-A--T-
gi|24122 : ATG-TT-CTGAATGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TG------C-A--A-------A-A-G---C--C---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TC-----GG------T-G-CTT---A-A--T-TATGAT
gi|24123 : ATG-CT--TGAGTGACC--T--G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G---------------------------------------G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-TG------------------A----AA-A-TT-----TG------A-G-A
gi|24124 : ATG-CT--TGA-TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-T-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT---T-CCC-------AA--G------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---CTA--T-TATGAT
gi|24125 : ATG-CT--TGA-TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-T-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT---T-CCC-------AA--G------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---CTA--T-TATGAT
gi|24126 : ATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----T-G-A-A-A-----------------------------A----------C----------CG----------T----------T----------G----------A---TG------C-A--G-------ACA-GATTT-AT---T---ATCG-T-CAG-------AA-GG------------------A----ATAA-TTA----TG------TGG-ATC---A-AG-T-TATGAT
gi|24127 : ATG-TT-CTCAGTGATC--TT-G-T-T---C--C-----T--------T----C-ATA-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------A----------T----------C---TC------T-A--A-------A-C-G---T--C---C---AT-G-T-CCC-------AA-GGAATACCCCTGTCCAAAGTA----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-AAT
gi|24128 : ATC--TT-----C---C--T-----T--------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T--C---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TGA-----T-G-A
gi|24129 : tgcttataaatG-TT-CTGAGTGACC--TG-A-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------T-----------T----------T----------A----------A---TC------C-A--A-------G-A-G---T-AC---C---CT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TTTGAT
gi|24130 : T-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---CT-T-----T--------T----T-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---CCTTGGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-TG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-TGT
gi|24131 : T-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----A-A-A-ATACCT---T----------G-----------AAAG-------C----------C-----------T----------T----------G----------G---AT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-TG------------------AAC--AT-A-TT-----TGGTAAATT-GTATC---A-AATT-TATGAT
gi|24132 : T-CTGAGTGACC--TT-G-T-C---C--T-----T--------T----C-A-A-A-AA-----T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TACTCAAAT--G----------G---TT------T-A--A-------A-A-G---T-CT---C---TT-G-T-TTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-A--T-TAT
gi|24133 : TAAGTGACC--TT-G-A-G---C--T-----T--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---AC------C-A--GGGTTCTTA-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-
gi|24134 : TGAGTGATC--TC-G-A-C---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------T-A--C-------A-A-----C-CT---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TT------C-A-ATA---A-A--T-TGT
gi|24135 : TGTGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------CA----------TGAGACACCA-T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-T-T-GTA-------AA-AG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATC---G-A--T-TAT
gi|24136 : TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------A-A--A-------A-A-G---T-GC---C---CA-G---CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24137 : ---C--T-----T--------T--------A-A-G------T----------G-----------A----------C----------C-----------A----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AG---T---CT-G-T-CCC-------AA-AG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATCTGTA-A--T-TACAAT
gi|24138 : -A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-T--C-------A-A-G---T-CT---C---CT-G-T-TC--------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
blockSeqs : TC T A TT ACCTA TTAATTAA CTTCT TTACAT GATCTTGAAA GATCTCGAGTG CCTTGAAAGC CTTGAAAGAA TTTAAAGACCT TGAGAGACCA GAAGACCCTTG ACA TGGAAT A GGGTTCTT CA CCTG T CTGTCAA AATACCCCTGTCCAAAGT GTAT A T TATGA GTAAAT TGT T AT C
blockSeqs : C T C T A C CCC CCT GACCTTGAGA A CCTTGAAAGT A G GAGACACCA GAAAGACTTGG A TTTGAT A ACTAT AA TT T A . AC A T A T . T G A
blockSeqs : T C . T . C CCA G GG . TCTTAAAAG . A G GGTCCAATT . TTGGAT . TCA A AT . A . . . T . A . T . A
blockSeqs : C . . T . A CC A . . AAG . . . ACTCAAATG . TTGGAT . AC A T . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : T . . A . . CA . . . AAG . . . GAAAG . . . C A C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . A . . AC . . . . . . . CAAAG . . . A A A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . A . . AC . . . . . . . GAAA . . . A A C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . T . . AC . . . . . . . GAAA . . . A G C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . CG . . . . . . . GAAA . . . A A C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . AC . . . . . . . GAAA . . . A C C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . CC . . . . . . . G . . . A A C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . CC . . . . . . . G . . . A A T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . AC . . . . . . . G . . . C A T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . CC . . . . . . . G . . . A C T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . CT . . . . . . . G . . . A A A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . CT . . . . . . . A . . . A A T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . CC . . . . . . . G . . . C G T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . CC . . . . . . . T . . . A C A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . CC . . . . . . . G . . . A A A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . CC . . . . . . . G . . . A A A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . G . . . . . . . G . . . A C C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . G . . . . . . . G . . . A A A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . G . . . . . . . G . . . A C C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . G . . . . . . . A . . . A A C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . G . . . . . . . G . . . C A T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . A . . . . . . . G . . . A T C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . G . . . . . . . G . . . C C T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . C . . . . . . . G . . . A A C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . C . . . . . . . T . . . A C T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . G . . . . . . . G . . . A A A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . C . . . . . . . G . . . C C A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . C . . . . . . . G . . . A A C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . G . . . . . . . G . . . C A T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . G . . . . . . . G . . . A A C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . G . . . . . . . G . . . A A A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . G . . . . . . . G . . . C A C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . G . . . . . . . A . . . C A C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . A . . . . . . . G . . . A A T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . T . . . . . . . G . . . A A T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . G . . . . . . . G . . . A C C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . G . . . . . . . G . . . A C C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . G . . . . . . . G . . . C G T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . C . . . . . . . G . . . G A T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . C . . . . . . . G . . . C C T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . T . . . . . . . T . . . C . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . A . . . . . . . G . . . C . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . C . . . . . . . G . . . C . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . G . . . . . . . G . . . C . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . C . . . . . . . G . . . A . C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . C . . . . . . . G . . . C . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . C . . . . . . . A . . . C . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . C . . . . . . . G . . . A . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . C . . . . . . . T . . . C . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . A . . . . . . . G . . . C . C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . G . . . . . . . G . . . A . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . C . . . . . . . G . . . A . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . G . . . . . . . G . . . A . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . C . . . . . . . G . . . A . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . C . . . . . . . G . . . G . A . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . C . . . . . . . G . . . A . C . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . G . . . . . . . G . . . A . C . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . C . . . . . . . G . . . A . T . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . G . . . . . . . G . . . C . T . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . C . . . . . . . T . . . C . T . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . G . . . . . . . G . . . A . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . . A . . . C . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . . G . . . C . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . G . . . A . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . G . . . A . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . G . . . C . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----N-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---NT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
finalCons : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----N-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---NT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
Alignments
lowQualScore : 111111 11
lowQualScore : 0 11 00 1 0 1 000 44 11111 33333333 333333 0 0 0 333333 5555555555 22222222222 8888888888 2222222222 33333333333 4444444444 888888888888888888888 111 666666 1 4444444444 0 0 000 44 111 3333 0 1 0 2222222 0 444444444444444444 1111 1 1 22222 222222 0 0 111 2 11 2
lowQualScore : . .. .. . . . ... .. ..... ........ ...... . . . ...... .......... ........... .......... .......... ........... .......... ..................... ... ...... . .......... . . ... .. ... .... . . . ....... . .................. .... . . ..... ...... . . ... . .. .
lowQualScore : 6 77 77 5 5 0 999 22 88888 44444444 555555 5 5 5 333333 1111111111 99999999999 1111111111 7777777777 44444444444 7777777777 000000000000000000000 555 111111 1 7777777777 5 5 999 55 000 3333 6 1 6 9999999 6 111111111111111111 9999 1 7 00000 888888 6 6 222 7 66 0
consensus : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----N-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---NT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
Reference ( family-295 ) : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----N-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---NT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24059 : TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-G--A-------A-A-G---T-AC---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------C-G-ATC---A-A--T-TACAAT
gi|24060 : TATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-ATTACATT----------G-----------AAAG-------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-GA------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24061 : TATATG-CT-TTGAGTGAC----T-G-A-C---C--T-----T--------T----G-C-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-T-ATC---A-G--T-TATGAT
gi|24062 : TATATG-TT-CTGAGTAACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24063 : TATATG-CA-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---T--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A---G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24064 : TATATA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------CA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------------------------------------------A-A-G---TCAC---T---CT-G-A-CT---------A-AG------------------A----GTAA-TT-----TG------T-T-GTT---A-A--T-TAT
gi|24065 : TATATG-CT-TTGAATGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------T-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---G---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-A--A-TATGA
gi|24066 : TATATG-TT---GAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------T-A--A-------A-A-A---T-AC---C---CT-G-T-CTCA------AA-AA------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24067 : TATATG-TT-CTGAGTAACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------A----------G---TT------G-A--A-------A-A-G---T-AT---C---CT-A-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24068 : TATATG-CT-TTGAGTGACC--AT-G-A-C---C--T-----T--------T----A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------C----------C----------G----------A---TC------C-A--A-------A-G-G---T-GC---C---CT-G-T-GCC-------AA-GG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATC---A-A--C-TATGAT
gi|24069 : TATATG-TT-TTGAGTGACC--TT-G-G-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------T----------C-----------T----------T----------T----------G---TC------C-A--A-------T-T-G---T-AC---C---TT-G-T-ACC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-AAC---A-A--T-TATGAT
gi|24070 : TGTATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---CT-T-----T--------T----C-A-A-A-A------T----------G-----------ACCTTGAAAGCC----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--T---C---TT-G-T-CTT-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24071 : TATATA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24072 : TATATG-TT-TTGGGTGACC--TT-G-AAC---T--T-----T--------T----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---A---TT-G-T-CCA-------AG-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATT---A-A--T-CATGATaagtc
gi|24073 : TAAATA-TT-TTGATTGACC--TT-G-A-C---C--A-----T--------T----G-A-A-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---AT-G-C-CTA-------AA-TG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGA
gi|24074 : TATATT-AT-CTGAGTGACC--TT-C-A-C---C--T-----T--------T----C-C-ATA-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TGAAA------G----------G---CCTGGAATC-A--A-------G-A-G---C--C---C---TT-A-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-T-AT
gi|24075 : TACATG-TT-CAGAGTGACC--TT-G-ACC---C--T-----T--------C----C-A-A-A-A------TGATCTTGAAAG-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---CT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-T-AT
gi|24076 : TATATA-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--C-----T--------TA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24077 : TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------CATTG------------------A----AA-A-AT-----CA------A-G-ATC---A-A--T-TATGATaagtc
gi|24078 : TATATG-CT-TTCAGTGACC--AT-C-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------G----------C-----------TG---------T----------A----------GACATC------G-A--A-------A-A-G---T-AA---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----GT-A-TT-----TG------G-G-ATC---A-A--G-TATGAT
gi|24079 : TATCTGCTT-TTGTGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--AC------C-A-G---T-CC---A---AT-G-TGCCC-------AC-AG------------------G----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24080 : TATATG-TC-TTGAAGGACC--TT-G-G-C---C--C-----T--------T----G-A-A-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------T-A--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-G-C-CAC-------AA-GG------------------A----AT-A-AT-----TA------T-G-ATC---A-C--T-GATGAT
gi|24081 : TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G---------------------------------------G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-TG------------------A----AA-A-TT-----TG------A-G-ATG---C-A--T-TATGAT
gi|24082 : TACATA-TT-TTGAACGACC--TT-G-A-C---C--C-----T--------T----CGA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-C-G---T--C---C---CT-G-T-TGC-------AA-GA------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-C--T-TCTGAT
gi|24083 : TGTATG-TT-TTGAGTGACT--CT-G-G-C---C--T-----T--------T----A-A-A-A-A------T----------G-----------G----------T----------C-----------T----------T----------T----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-GC---C---CT-G-T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A----------------T-G-ATG---A-A--TCTATAAT
gi|24084 : TATATA-TT---GAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----ACA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------G----------C---C---TT-G-T-CCA-------AA-GG------------------A----AT-A-TC-----TA------T-G-GTC---A-A--G-TATGAT
gi|24085 : TATATG-TT-GTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-A------T----------G-----------C----------A----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-AGG---T-CT---C---CT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-G--T-
gi|24086 : TATATA-TT-CTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----TC-------C----T-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------CTTTAAAGACCTT----------T----------G----------G---T-------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-TTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-T-TTC---A-A--T-TATG
gi|24087 : TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-GCA-C---CT-T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------GA----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-G---TAAC---C---CT-G-T-CTC-------AA-AG------------------A----TT-A-T
gi|24088 : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-C-A-C---C--T-----C--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAGACCCTTGG---TC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTA-------AA-GG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TAT
gi|24089 : TATATC-TT--TGA-TGATC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G---A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------A----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT-G-T-CCC--------A-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---ATA--TATATGAT
gi|24090 : GATC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-G-A-A-A------TGG--------G-----------A----------C----------C-----------A----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------T-A-----T-AT---C---AT-G-T-CCC-------A---G------------------G----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---ATA--TATATGAT
gi|24091 : tattactttggatgTATACA-TT-CAGAGTGACA--TT-G-A-C---T--T-----T--------T----C-G-A-A-AG-----T----------G-----------A----------C----------A-----------T----------C----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---T---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AA-A-TT-----TA------G-G-ACC---A-G--T-TATAAT
gi|24092 : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-T---C--TACCTAT--------C----C-A-A-A-A------A----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------A----------A---TC------C-A--C-------A-A-T---T--T---T---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-GAT
gi|24093 : TATATG-TT-CTGAGTGAGC--TT-G-A-C---CT-T-----T--------T----T-A-A-G-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G-----------------------------------A-G-A---T-AC---CT--TT-G-T-CCA-------AA-AG------------------A----
gi|24094 : TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---T--T-----TTTAATTAAT----A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-G---T--T---T---CT-A-T-CCC-------AA-AG-----------------------AT-ATTT-----TG------T-G-ATC---C-A--T-
gi|24095 : TATATG-TT-CTGAGTGACA--TT-G-G-T---CA-T-----T--------C----C-A-A-C-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---T-CC---C---AT------CC-------AA-G-------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATT---A-A--T-TATGAT
gi|24096 : TATGTA-TA-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---CTTT-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24097 : TAGATG-CT-TTGAGTGACT--TC-G-A-C---C--T-----T--------T------A-A-A-T------T----------G-----------A----------A----------T-----------T--------------------------------G---TC------CAA--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-GTT-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TG-----AG------T-A-A-C---A------TATGAT
gi|24098 : TAGATG-CT-TTGAGTGACT--TC-G-A-C---C--T-----T--------T------A-A-A-T------T----------G-----------A----------A----------T-----------T--------------------------------G---TC------CAA--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-GTT-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TG-----AG------T-A-A-C---A------TATGAT
gi|24099 : TACATG-TT-TTG-GTGACC--TTTG-G-C---C--T-----T--------T----C-G-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-CG------------------A----AC-ATTT-----TG------T-G-
gi|24100 : TACATG-TT-TTG-GTGACC--TTTG-G-C---C--T-----T--------T----C-G-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-CG------------------A----AC-ATTT-----TG------T-G-
gi|24101 : TATGTG-TT-CAAAGTGACC--TTCA-A-C---T--T-----T--------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-TT---C---CT-G-T--CC-------AA-AG------------------A----GT-A-TT-----TG------T-G-A
gi|24102 : TATATA-TT-CTGAATGGCC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TCC--C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------A-----------T----------C----------GGTCCAATT--G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---C---CT-G-T-CCCA------AA-AA------------------A----AT-A-TCTATGATG------C-G-ATC---A-A--T-
gi|24103 : TATATG-CT-TTGAGTAGCC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-
gi|24104 : TATGTA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------CA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------T----------G---AC------T-A--A-------A-A-G---T-A
gi|24105 : TATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TCTTCT-A-A-A-T------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---CCTTTGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-
gi|24106 : TATATG-TT-CTGAGTGACA--CT-G-A-GGGAC--T-----T--------C----C-C-G-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--G-------A-A-G---T-CC---C---TT-G-T-CCC-------AG-GG------------------AGTATGT-A-TC-----TG------T-A-ATT---A-A--T-
gi|24107 : TATATG-TT-CTGAGTGAC----T-G-A-C---CA-T-----T--------T----A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------TTGAGAGACCAT----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-AG------------------A----AC-A-T------------------ATC---G-A--T-
gi|24108 : TATATG-TT-CTCAATGACC--TT-G-G-T---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------CCTTGAAAGAAC-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---C--T---C---GT-G-T-ATC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-AT
gi|24109 : ACATG-TT-CTGAGTGACA--TT-G-G-C---C--T-----T--------TCC--A-A-A-A-A------T----------G-----------ATCTTAAAAG-C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-
gi|24110 : ATATG-GT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---CA-T-----T--------C----G-A-G-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------
gi|24111 : ATATG-TT-TTGAATGACC--TT-G-A-T---C--T-----TC-------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------CA---------T-----------T----------T----------A----------A---TT------C-G--C-------A-A-G------C---CA--TT-G-T-CTC-------GA-GG------------------A----AC-T-TT-----TC------T-G-GTagt
gi|24112 : ATATG-CT-CTGAATTACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---T-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TCAAA------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---
gi|24113 : ATATG-TA-TTGAGTGACC--TT-G-T-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------T-----------G----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-------------------G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24114 : ATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----TA-------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---CCTTGGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24115 : ATATG-AT-CTGAATGACC--TT-G-A-G---C--T-----T--------T----C-C-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TGAAAGACTTGG----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C-A----C---TC-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-TGT
gi|24116 : ATACA-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---A--T-----T--------T----C-C-A-A-A------T----------GGATCTCGAGTGA----------C----------C-----------T----------T----------T----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---C---CT-G-T-CCA-------AA-GG------------------A----GT-A-TT-----TG------T-A-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24117 : ATATG-GT-CTGAATGACC--TT-A-A-A---C--T-----T--------TC---T-A-A-A-A------TGACCTTGAGAG-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-A---T--C---T---TT-G-T-CTC-------AA-GA------------------A----CC-A-TT-----TG------C-A-ATA---A-A--T-GAT
gi|24118 : TATG-CT-TTTAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------C----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TA------C-A--C-------C-A-G---T-AC---CCCTGT-G-T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TGT-----T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24119 : TATG-TTTCTGAG--ACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----C-C-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------GA--TT------T-A--ACTAT---A-A-T---T-ACATGT---AT-G-T-CCCCTGTCAAAA-GG------------------A----AT-A-TC-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24120 : TATG-CT-TTGAGTGACCAGTT-G-G-A---C--C-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C----------------------T----------G----------A---CC------C-GTCA-------G-A-G---T-AG---C---A----T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A-T
gi|24121 : TATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-G-C---C--TA----T--------C----C-A-A-A-T------T----------G-----------ACCTTGAAAGTC----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------T-A--A-------A-C-G---T--C---C---TT-G-C-ATC-------AT-GG------------------A----AC-A-TT-----TC------C-G-ATC---A-A--T-
gi|24122 : ATG-TT-CTGAATGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TG------C-A--A-------A-A-G---C--C---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TC-----GG------T-G-CTT---A-A--T-TATGAT
gi|24123 : ATG-CT--TGAGTGACC--T--G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G---------------------------------------G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-TG------------------A----AA-A-TT-----TG------A-G-A
gi|24124 : ATG-CT--TGA-TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-T-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT---T-CCC-------AA--G------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---CTA--T-TATGAT
gi|24125 : ATG-CT--TGA-TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-T-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT---T-CCC-------AA--G------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---CTA--T-TATGAT
gi|24126 : ATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----T-G-A-A-A-----------------------------A----------C----------CG----------T----------T----------G----------A---TG------C-A--G-------ACA-GATTT-AT---T---ATCG-T-CAG-------AA-GG------------------A----ATAA-TTA----TG------TGG-ATC---A-AG-T-TATGAT
gi|24127 : ATG-TT-CTCAGTGATC--TT-G-T-T---C--C-----T--------T----C-ATA-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------A----------T----------C---TC------T-A--A-------A-C-G---T--C---C---AT-G-T-CCC-------AA-GGAATACCCCTGTCCAAAGTA----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-AAT
gi|24128 : ATC--TT-----C---C--T-----T--------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T--C---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TGA-----T-G-A
gi|24129 : tgcttataaatG-TT-CTGAGTGACC--TG-A-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------T-----------T----------T----------A----------A---TC------C-A--A-------G-A-G---T-AC---C---CT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TTTGAT
gi|24130 : T-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---CT-T-----T--------T----T-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---CCTTGGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-TG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-TGT
gi|24131 : T-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----A-A-A-ATACCT---T----------G-----------AAAG-------C----------C-----------T----------T----------G----------G---AT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-TG------------------AAC--AT-A-TT-----TGGTAAATT-GTATC---A-AATT-TATGAT
gi|24132 : T-CTGAGTGACC--TT-G-T-C---C--T-----T--------T----C-A-A-A-AA-----T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TACTCAAAT--G----------G---TT------T-A--A-------A-A-G---T-CT---C---TT-G-T-TTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-A--T-TAT
gi|24133 : TAAGTGACC--TT-G-A-G---C--T-----T--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---AC------C-A--GGGTTCTTA-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-
gi|24134 : TGAGTGATC--TC-G-A-C---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------T-A--C-------A-A-----C-CT---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TT------C-A-ATA---A-A--T-TGT
gi|24135 : TGTGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------CA----------TGAGACACCA-T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-T-T-GTA-------AA-AG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATC---G-A--T-TAT
gi|24136 : TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------A-A--A-------A-A-G---T-GC---C---CA-G---CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24137 : ---C--T-----T--------T--------A-A-G------T----------G-----------A----------C----------C-----------A----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AG---T---CT-G-T-CCC-------AA-AG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATCTGTA-A--T-TACAAT
gi|24138 : -A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-T--C-------A-A-G---T-CT---C---CT-G-T-TC--------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT