lowQualScore                  :                                                     111111                                                             33333333333333333333333333333333333333        11111111111111111                                                             
lowQualScore                  :       2  1 0     0   00  1 0 222  44 11111 44444444 777777 0 0  111111 2222222222 22222222222 222222222 0 1 0 33333333 22222222222222222222222222222222222222  1 111 77777777777777777 0 1 0   3333333  0   2222  0   22222  777    111 1 0 0  99  
lowQualScore                  :       .  . .     .   ..  . . ...  .. ..... ........ ...... . .  ...... .......... ........... ......... . . . ........ ......................................  . ... ................. . . .   .......  .   ....  .   .....  ...    ... . . .  ..  
lowQualScore                  :       5  1 5     5   77  6 5 555  88 88888 11111111 333333 5 5  555555 9999999999 99999999999 999999999 5 0 5 44444444 33333333333333333333333333333333333333  1 000 55555555555555555 6 1 6   0000000  6   6666  6   22222  777    444 6 8 8  77  
consensus                     : TATATGTTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----N-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C-A--A----AA-G---T-A-----C---C---N-T-G-T-CCC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-T-GATC---A-A-T-TATGAT
Reference ( gi|24059 )        : TATATGCTT-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C-G--A----AA-G---T-A-----C---C---A-T-G-T-CCC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-C-GATC---A-A-T-TACAAT
gi|24063                      : TATATGCAT-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CT--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C----A----AA-G---T-A-----T---C---A-T-G-T-CCC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-T-GATC---A-A-T-TATGAT
gi|24065                      : TATATGCTT-T-GAATG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------T-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C-A--A----AA-G---T-A-----C---G---C-T-G-T-CCC-------AA-GGA----AT-ATT-----TT-T-GATC---A-A-A-TA
gi|24061                      : TATATGCTT-T-GAGTG-AC----T-G-A---CC--T-----T--------T----G-C-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------C-A--A----AA-G---T-A-----C---C---C-T-G-T-CCC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-T-TATC---A-G-T-TATGATtga
gi|24068                      : TATATGCTT-T-GAGTG-ACC--AT-G-A---CC--T-----T--------T----A-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-C-C--------G--------A----------T-C------C-A--A----AG-G---T-G-----C---C---C-T-G-T-GCC-------AA-GGA----AT-ACT-----TG-T-GATC---A-A-C-TATGAT
gi|24066                      : TATATG--T-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------T-A--A----AA-A---T-A-----C---C---C-T-G-T-CTCA------AA-AAA----AT-ATT-----TG-T-GATC---A-A-T-TATGAT
gi|24077                      : TATATGCTT-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C----A----AA-G---T-A-----T---C---A-T-G-T-CCC-------CATTGA----AA-AAT-----CA-A-GATC---A-A-T-TATGAT
gi|24069                      : TATATGTTT-T-GAGTG-ACC--TT-G-G---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------T-C-T-T--------T--------G----------T-C------C-A--A----TT-G---T-A-----C---C---T-T-G-T-ACC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-T-GAAC---A-A-T-TATGAT
gi|24067                      : TATATGTTC-T-GAGTA-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-A-------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------A--------G----------T-T------G-A--A----AA-G---T-A-----T---C---C-T-A-T-CCC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-A-GATC---A-A-T-TATGAT
gi|24072                      : TATATGTTT-T-GGGTG-ACC--TT-G-AA--CT--T-----T--------T----C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------C-A--A----AA-G---T-------C---C---ATT-G-T-CCA-------AG-GGA----AT-ATT-----TG-T-GATT---A-A-T-CATGAT
gi|24073                      : TAAATATTT-T-GATTG-ACC--TT-G-A---CC--A-----T--------T----G-A-A-A-------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------C-A--A----AA-G---T-A-----C---C---A-T-G-C-CTA-------AA-TGA----AT-ATT-----TG-T-GATC---A-A-T-TA
gi|24081                      : TATATGCTT-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G-----------------------------------------G---T-A-----T---C---A-T-G-T-CCC-------AA-TGA----AA-ATT-----TG-A-GATG---C-A-T-TATGATtga
gi|24079                      : TATCTGCTT-TTGTGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C-A--AC---CA-G---T-C-----C---A---A-T-G-TGCCC-------AC-AGG----AT-ATT-----TG-T-GATC---A-A-T-TATGAT
gi|24089                      : TATAT-CTT-T-GA-TG-ATC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G---A-AA------T----------G-----------A---------C-C-A-T--------G--------A----------T-C------C----A----AA-G---T-A-----T---C---A-T-G-T-CCC--------A-GGA----AT-ATT-----TG-A-GATC---A-
gi|24078                      : TATATGCTT-T-CAGTG-ACC--AT-C-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------G-C-TGT--------AGAC-----A----------T-C------G-A--A----AA-G---T-A-----A---C---A-T-G-T-CCC-------AA-GGA----GT-ATT-----TG-G-GATC---A-A-G-TATGATtatatatgat
gi|24087                      : TATATGCTT-T-GAGTG-ACC--TT-GCA---CCT-T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------GA----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C-A--A----AA-G---TAA-----C---C---C-T-G-T-CTC-------AA-AGA----TT-AT
gi|24083                      : TGTATGTTT-T-GAGTG-ACT--CT-G-G---CC--T-----T--------T----A-A-A-AA------T----------G-----------G---------T-C-T-T--------T--------G----------T-C------C-A--A----AA-G---T-G-----C---C---C-T-G-T-TCC-------AA-GGA----AT-AT-----------GATG---A-A-TCTATAAT
gi|24085                      : TATATGTTG-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------TC---C-A-A-AA------T----------G-----------C---------A-C-T-T--------G--------G----------T-C------C-A--A----AAGG---T-C-----T---C---C-T-G-T-CTC-------AA-GGA----AT-ATT-----TT-T-GATC---A-G-T-
gi|24084                      : TATATA--T-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----ACA-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------C---------AA-G-----------C---C---T-T-G-T-CCA-------AA-GGA----AT-ATC-----TA-T-GGTC---A-A-G-TATGAT
gi|24080                      : TATATGTCT-T-GAAGG-ACC--TT-G-G---CC--C-----T--------T----G-A-A-A-------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-T------T-A--A----AA-G---T-A-----C---C---C-T-G-C-CAC-------AA-GGA----AT-AAT-----TA-T-GATC---A-
gi|24094                      : TATATGTTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CT--T-----TTTAATTAAT----A-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C-A--A----AA-G---T-T-----T---C-----T-A-T-CCC-------AA-AGAT---AT--TT-----TG-T-GATC---C-A-T-Tctgatgat
gi|24082                      : TACATATTT-T-GAACG-ACC--TT-G-AC--CC--T-----T--------C----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------C-A--A----AC-G---T-------C---C---C-T-G-T-TGC-------AA-GAA----AT-ATT-----TG-T-GAT
gi|24088                      : TATATGTTC-T-GAGTG-ACC--TT-C-A---CC--T-----C--------T----CCA-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAGACCCTTGGT-C------C-A--C----AA-G---T-------C---C---T-T-G-T-CTA-------AA-GGA----AT-ACT-----TG-T-GATC---A-A-T-TAaacttctgat
gi|24091                      : TATACATTC-A-GAGTG-ACA--TT-G-A---CT--T-----T--------TC---G-A-A-AG------T----------G-----------A---------C-A-T-C--------G--------G----------T-C------C-A--A----AA-G---T-C-----C---T---C-T-G-T-CCC-------AA-GGA----AA-ATT-----TA-G-GACC---A-G-T-TATAATt
gi|24095                      : TATATGTTC-T-GAGTG-ACA--TT-G-G---TCA-T-----T--------C----C-A-A-CA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------C-A--C----AA-G---T-C-----C---C---A-T------CC-------AA-G-A----AT-ATT-----TG-T-GATT---A-A-T-TATGAT
gi|24103                      : TATATGCTT-T-GAGTA-GCC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C-A--A----A
gi|24070                      : TGTATGTTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CCT-T-----T--------T----C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGCCCTTGGT-T------C-A--C----AA-G---C-------T---C---T-T-G-T-CTT-------AA-GGA----AC-ATT-----TG-T-GATA---A-A-T-T
gi|24090                      : TAT-TACTT-T-GGATGGATC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-G-A-AA------TGG--------G-----------A---------C-C-A-T--------G--------A----------T-C------C----A----AT-A---T-A-----T---C---A-T-G-T-CCC-------A---GG----AT-ATT-----TG-A-GATC---A-
gi|24098                      : TAGATGCTT-T-GAGTG-ACT--TC-G-A---CC--T-----T--------T------A-A-AT------T----------G-----------A-----------A-T-T--------G-------------------T-C------CAA--A----AA-G---T-A-----C---C---C-T-GTT-CCC-------AA-GGA----AT-ATtatatatgat
gi|24097                      : TAGATGCTT-T-GAGTG-ACT--TC-G-A---CC--T-----T--------T------A-A-AT------T----------G-----------A-----------A-T-T--------G-------------------T-C------CAA--A----AA-G---T-A-----C---C---C-T-GTT-CCC-------AA-GGA----AT-ATgagtaacatatgat
gi|24101                      : TATGTGTTC-A-AAGTG-ACC--TTCA-A---CT--T-----T--------C----C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------C-A--A----AA-G---T-T-----T---C---C-T-G-T--CC-------AA-AGA----GT-ATT-----TG-T-GAgagtaacatatgat
gi|24092                      : TATATGTTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---TC--TACCTAT--------C----C-A-A-AA------A----------G-----------A---------C-C-T-T--------A--------A----------T-C------C-A--C----AA-T---T-------T---T---T-T-G-T-CTC-------AA-GGA----AC-ATT-----TG-T-GGTA---A-A-T-
gi|24105                      : TATAAGTTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------TCTTCT-A-A-AT------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGCC-----T-T------T-G--ATCACAA-G---C-------C---C---T-T-G-T-CTC-------AA-GGA----AC-ATT-----TG-T-GGTA---A-A-T-Tgat
gi|24102                      : TATATATTC-T-GAATG-GCC--TT-G-A---CC--T-----T--------TCC--C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-A-T-C--------GGTCCAATTG----------T-C------C-A--A----AA-G---T-C-----C---C---C-T-G-T-CCCA------AA-AAA----AT-ATCTATGATG-C-GATC---A-A-T-T
gi|24086                      : TATATATTC-T-AAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----TC-------C----T-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-TTAAA----G--------A----------C-CTTTGGTC-A--C----AA-G---T-------C---C---T-T-G-T-TTC-------AA-GGA----AC-ATT-----TG-T-TTTC---A-A-T-TA
gi|24060                      : TATAAGTTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------TC---C-A-A-AATTACATT----------G-----------AAAG------C-C-T-T--------G--------G----------T-T------C-A--C----AA-G---C-------C---C---T-C-G-T-CTC-------AA-GAA----AC-ATT-----TG-T-GATA---A-A-T-Ttg
gi|24107                      : TATATGTTC-T-GAGTG-AC----T-G-A---CCA-T-----T--------T----A-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AGAGACCATGGT-C------C-A--C----AA-G---T-------C---C---T-T-G-T-CTC-------AA-AGA----AC-ATA-----T--C-GAT
gi|24100                      : TACATGTTT-T-G-GTG-ACC--TTTG-G---CC--T-----T--------T----C-G-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-T------C-A--C----AA-G---C-------C---C---T-C-G-T-CTC-------AA-CGA----AC-ATT-----Tt
gi|24099                      : TACATGTTT-T-G-GTG-ACC--TTTG-G---CC--T-----T--------T----C-G-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-T------C-A--C----AA-G---C-------C---C---T-C-G-T-CTC-------AA-CGA----AC-ATT-----Ttgtg
gi|24108                      : TATATGTTC-T-CAATG-ACC--TT-G-G---TC--T-----T--------TC---C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGAACTTGGT-C------C-A--C----AA-G---C-------T---C---G-T-G-T-ATC-------AA-GGA----AC-ATT-----TG-T-GATtgtg
gi|24075                      : TACATGTTC-A-GAGTG-ACC--TT-G-AC--CC--T-----T--------C----C-A-A-AA------TGATCTTGAAAG-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------C-T------C-A--C----AA-G---C-------C---C---T-T-G-T-CTC-------AA-GGA----AC-ATT-----TG-
gi|24106                      : TATATGTTC-T-GAGTG-ACA--CT-G-AGGGAC--T-----TCC------C----G------A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------C-A--G----AA-G---T-C-----C---C---T-T-G-T-CCC-------AG-GGAGTATGT-ATC-----TG-T-AATT---A-A-T-Tttat
gi|24074                      : TATATTATC-T-GAGTG-ACC--TT-C-A---CC--T-----T--------T----C-C-ATAA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGG------C-C------T-G--G----AA-T---C-AAGAGCC---C---T-T-A-T-CTC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-
gi|24093                      : TATATGTTC-T-GAGTG-AGC--TT-G-A---CCT-T-----T--------T----T-A-A-GA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A---------------------G--A-----------T-A-----C---CT--T-T-G-T-CCA-------AA-AGA----ttat
gi|24071                      : TATATATTT-T-AAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----ACA-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------A--------A----------
gi|24062                      : TATATGTTC-T-GAGTA-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------TC---A-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------gtc
gi|24104                      : TATGTATTT-T-AAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------C----ACA-A-AA------T----------G-----------A---------C-CTT-T--------G--------A------------C------T-A--A----AA-G---T-A-----
gi|24076                      : TATATATTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--C-----T--------T----ACA-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------A--------A----------
gi|24064                      : TATATATTT-T-AAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------C----ACA-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------A--------A----------gtc
gi|24096                      : TATGTATAT-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CCTTT-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------gtcactctgactaagagtaatttgttgttaattat
gi|24113                      :  ATATGTAT-T-GAGTG-ACC--TT-G-T---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------T-----------G---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C-A--A----AA-------------------------G-T-CCC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-T-GATC---A-A-T-TATGAT
gi|24116                      :  ATACATTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CA--T-----T--------T----C-C-A-AA------T----------GGATCTCGAGTGA---------C-C-T-T--------T--------G----------T-C------C-A--A----AA-G---T-C-----C---C---C-T-G-T-CCA-------AA-GGA----GT-ATT-----TG-T-AATC---A-A-T-TATGAT
gi|24114                      :  ATAAGTTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----TA-------C----C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGCC-----T-T------G-G--ATCACAA-G---C-------C---C---T-T-G-T-CTC-------AA-GGA----AC-ATT-----TG-T-GATA---A-A-T-T
gi|24109                      :  ACATGTTC-T-GAGTG-ACA--TT-G-G---CC--T-----T--------TCC--A-A-A-AA------T----------G-----------ATCTTAAAAGC-C-T-T--------G--------G----------T-T------C-A--C----AA-G---T-------C---C---T-T-G-T-CTC-------AA-GGA----AC-ATT-----TG-T-GGTA---A-A-T-T
gi|24115                      :  ATATGATC-T-GAATG-ACC--TT-G-A---GC--T-----T--------T----C-C-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGACTTGGGT-T------C-A--C----AA-G---C-A-----C---T-----C-G-T-CTC-------AA-GGA----AC-ATT-----TG-T-GGTA---A-A-T-T
gi|24111                      :  ATATGTTT-T-GAATG-ACC--TT-G-A---TC--T-----TC-------C----C-A-A-AA------T----------G-----------A---------CAT-T-T--------A--------A----------T-T------C-G--C----AA-G-----------C---C---ATT-G-T-CTC-------GA-GGA----AC-TTT-----Tgt
gi|24117                      :  ATATGGTC-T-GAATG-ACC--TT-A-A---AC--T-----T--------TC---T-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AGAGACCTTGGT-C------C-A--C----AA-A---T-------C---T---T-T-G-T-CTC-------AA-GAA----CC-ATT-----TG-C-AATA---A-A-T-ctggt
gi|24110                      :  ATATGGTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CCA-T-----T--------C----G-A-G-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------gat
gi|24112                      :  ATATGCTC-T-GAATT-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------TC---T-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------gt
gi|24118                      :   TATGCTT-T-TAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------C---------C-C-T-T--------G--------A----------T-A------C-A--C----CA-G---T-A-----C---CCCTG-T-G-T-TCC-------AA-GGA----AT-ATT-----TGTT-GATC---A-A-T-TATGATcaaaggtccacaag
gi|24120                      :   TATGCTT-T-GAGTG-ACCAGTT-G-G---AC--C-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C---T--------G--------A----------C-C------C-GTCA----GA-G---T-A-----G---C---A-----T-TCC-------AA-GGA----AT-AT
gi|24119                      :   TATGTTTCT-GAG---ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----C-C-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-TG-------G--------A----------T-T------T-A--ACTATAA-T---T-A-----CATGT---A-T-G-T-CCCCTGTCAAAA-GGA----AT-ATC-----TG-T-GATC---A-A-T-TATGAT
gi|24121                      :   TATGTTC-T-GAGTG-ACC--TT-G-G---CC--TA----T--------C----C-A-A-AT------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGTCCTTGGT-C------T-A--A----AC-G---T-------C---C---T-T-G-C-ATC-------AT-GGA----AC-ATT-----TC-C-GATC---A-A-T-
gi|24125                      :    ATGCTT---GA-TG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-T-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C----A----AA-G---T-A-----T---C---A-T---T-CCC-------AA--GA----AT-ATT-----TG-A-GATC---CTA-T-TATGAT
gi|24124                      :    ATGCTT---GA-TG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-T-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------T-C------C----A----AA-G---T-A-----T---C---A-T---T-CCC-------AA--GA----AT-ATT-----TG-A-GATC---CTA-T-TATGAT
gi|24122                      :    ATGTTC-T-GAATG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------TC---C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-G------C-A--A----AA-G---C-------C---C---C-T-G-T-CCC-------AA-GGA----AT-ATC-----GG-T-GCTT---A-A-T-TATGAT
gi|24123                      :    ATGCTT---GAGTG-ACC--T--G-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G-----------------------------------------G---T-A-----T---C---A-T-G-T-CCC-------AA-TGA----AA-ATT-----TG-A-GA
gi|24126                      :    ATGCTT-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CCT-T-----T--------T----G-A-A-A------------------------------A---------C-CGT-T--------G--------A----------TGC------A-G--A----CA-GATTT-A-----T---T---A-TCG-T-CAG-------AA-GGA----ATAATTA----TG-TGGATC---A-AGT-TATGAT
gi|24127                      :    ATGTTC-T-CAGTG-ATC--TT-G-T---TC--C-----T--------T----C-ATA-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-------------------A----------T-CT-----C-T--A----AACG---T-------C---C---A-T-G-T-CCC-------AA-GGA----AT-A
gi|24128                      :     TGCTTAT-AAAT--ATC--TT-------CC--T-----T--------C----C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------C-A--A----AA-G---T-------C---C---C-T-G-T-CCC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-cccctgtccaaagtaatatttgtgatcaataat
gi|24129                      :      GTTC-T-GAGTG-ACC--TG-A-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-T-T-T--------A--------A----------T-C------C-A--A----GA-G---T-A-----C---C---C-T-G-T-CTC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-T-GATC---A-A-T-Tatga
gi|24132                      :        TC-T-GAGTG-ACC--TT-G-T---CC--T-----T--------TC---A-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-TACTCAAATG--------G----------T-T------T-A--A----AA-G---T-C-----T---C---T-T-G-T-TTC-------AA-GGA----AT-ATT-----TT-T-GATC---A-A-T-TAttgat
gi|24130                      :        TC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CCT-T-----T--------T----T-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGCC-----T-T------G-G--ATCACAA-G---C-------C---C---T-T-G-T-CTC-------AA-TGA----AC-ATT-----TG-T-GGTA---A-A-T-Tt
gi|24131                      :        TC-T-GAGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T------A-A-AA------T----------------------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGCC-----T-T------G-G--ATCACAA-G---C-------C---C---T-T-G-T-CTC-------AA-TGAAC--AT-ATT-----TG-gt
gi|24134                      :          -T-GAGTG-ATC--TC-G-A---CC--T-----T--------TC---C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-T------T----A----CA-A---C-C-----T---C---T-T-G-T-CTC-------AA-GGA----AC-ATT-----TT-C-AATA---A-A-T-Tgtaaattgtatcaaatttatgat
gi|24133                      :          -T-AAGTG-ACC--TT-G-A---GC--T-----T--------TC---C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGACCAGGGT-T------C-T--T----AA-G---C-------C---C---T-T-G-T-CTC-------AA-GGA----AC-ATT-----TG-gt
gi|24135                      :          -T-GTGTG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------TC---C-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-A-T--------G--------AGACACCATGGT-C------C-A--C----AA-G---T-------C---C---T-T-T-T-GTA-------AA-AGA----AC-ATT-----TG-T-GATC---G-A-T-TAt
gi|24136                      :                TG-ACC--TT-G-A---CC--T-----T--------T----G-A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------A-A--A----AA-G---T-G-----C---C---C-A-G---CCC-------AA-GGA----AT-ATT-----TG-T-GATC---A-A-T-TATGATt
gi|24137                      :                                  C--T-----T--------T--------A-AG------T----------G-----------A---------C-C-A-T--------G--------G----------T-C------C-A--A----AA-G---T-A-----G---T---C-T-G-T-CCC-------AA-AGA----AT-ACT-----TG-T-GATCTGTA-A-T-TACAAT
gi|24138                      :                                                          -A-A-AA------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------T-C------C-T--C----AA-G---T-C-----T---C---C-T-G-T-TC--------AA-GGA----AT-ATT-----TG-T-GATC---A-A-T-TATGAT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                   1111111                                                              2222222222222222222                              11                                                                                                
lowQualScore                  :                     0  11         00  1 0 1 000 33 11111 33333333 4444444 0 0 0 333333 2222222222 22222222222 333333333 0 1 0 33333333 6666666666666666666  777777 1 4444444444 0 0 000 44 111 3333 0 1 0   2222222  0  444444444444444444 1111  1 1  22222  222222 0 0   111 2 11 2      
lowQualScore                  :                     .  ..         ..  . . . ... .. ..... ........ ....... . . . ...... .......... ........... ......... . . . ........ ...................  ...... . .......... . . ... .. ... .... . . .   .......  .  .................. ....  . .  .....  ...... . .   ... . .. .      
lowQualScore                  :                     6  77         77  5 5 0 999 22 88888 44444444 5555555 5 5 5 333333 9999999999 99999999999 888888888 5 0 5 99999999 4444444444444444444  777777 1 7777777777 5 5 999 55 000 3333 6 1 6   9999999  6  111111111111111111 9999  1 7  00000  888888 6 6   222 7 66 0      
consensus                     :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--N----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---NT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
Reference ( family-295 )      :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--N----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---NT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24059                      :               TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C-G--A-------A-A-G---T-AC---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------C-G-ATC---A-A--T-TACAAT
gi|24060                      :               TATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC-C----A-A-A-ATTACATT----------G-----------AAAG------C-C-T-T--------G--------G----------TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-GA------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24061                      :               TATATG-CT-TTGAGTGAC----T-G-A-C---C--T-----T--------T--G----C-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-T-ATC---A-G--T-TATGAT
gi|24062                      :               TATATG-TT-CTGAGTAACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC-A----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------
gi|24063                      :               TATATG-CA-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---T--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24064                      :               TATATA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------CA-C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T-------------------------------------------------A-A-G---TCAC---T---CT-G-A-CT---------A-AG------------------A----GTAA-TT-----TG------T-T-GTT---A-A--T-TAT
gi|24065                      :               TATATG-CT-TTGAATGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------T-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---G---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-A--A-TATGA
gi|24066                      :               TATATG-TT---GAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------T-A--A-------A-A-A---T-AC---C---CT-G-T-CTCA------AA-AA------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24067                      :               TATATG-TT-CTGAGTAACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A--------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------A--------G----------TT------G-A--A-------A-A-G---T-AT---C---CT-A-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24068                      :               TATATG-CT-TTGAGTGACC--AT-G-A-C---C--T-----T--------T--A----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-C-C--------G--------A----------TC------C-A--A-------A-G-G---T-GC---C---CT-G-T-GCC-------AA-GG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATC---A-A--C-TATGAT
gi|24069                      :               TATATG-TT-TTGAGTGACC--TT-G-G-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------T-C-T-T--------T--------G----------TC------C-A--A-------T-T-G---T-AC---C---TT-G-T-ACC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-AAC---A-A--T-TATGAT
gi|24070                      :               TGTATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--TC---A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGCCCTTGGTT------C-A--C-------A-A-G---C--T---C---TT-G-T-CTT-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24071                      :               TATATA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TA-C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------A--------A----------
gi|24072                      :               TATATG-TT-TTGGGTGACC--TT-G-AAC---T--T-----T--------T--C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---A---TT-G-T-CCA-------AG-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATT---A-A--T-CATGATgtc
gi|24073                      :               TAAATA-TT-TTGATTGACC--TT-G-A-C---C--A-----T--------T--G----A-A-A--------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---AT-G-C-CTA-------AA-TG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGA
gi|24074                      :               TATATT-AT-CTGAGTGACC--TT-C-A-C---C--T-----T--------T--C----C-ATA-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGG------CCTGGAATC-A--A-------G-A-G---C--C---C---TT-A-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-T-AT
gi|24075                      :               TACATG-TT-CAGAGTGACC--TT-G-ACC---C--T-----T--------C--C----A-A-A-A------TGATCTTGAAAG-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------CT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-T-AT
gi|24076                      :               TATATA-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--C-----T--------TA-C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------A--------A----------
gi|24077                      :               TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------CATTG------------------A----AA-A-AT-----CA------A-G-ATC---A-A--T-TATGATgtc
gi|24078                      :               TATATG-CT-TTCAGTGACC--AT-C-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------G-C-TGT--------AGAC-----A----------TC------G-A--A-------A-A-G---T-AA---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----GT-A-TT-----TG------G-G-ATC---A-A--G-TATGAT
gi|24079                      :               TATCTGCTT-TTGTGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C-A--AC------C-A-G---T-CC---A---AT-G-TGCCC-------AC-AG------------------G----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24080                      :               TATATG-TC-TTGAAGGACC--TT-G-G-C---C--C-----T--------T--G----A-A-A--------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TT------T-A--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-G-C-CAC-------AA-GG------------------A----AT-A-AT-----TA------T-G-ATC---A-C--T-GATGAT
gi|24081                      :               TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------------------------------------------G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-TG------------------A----AA-A-TT-----TG------A-G-ATG---C-A--T-TATGAT
gi|24082                      :               TACATA-TT-TTGAACGACC--TT-G-A-C---C--C-----T--------T--CG---A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--A-------A-C-G---T--C---C---CT-G-T-TGC-------AA-GA------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-C--T-TCTGAT
gi|24083                      :               TGTATG-TT-TTGAGTGACT--CT-G-G-C---C--T-----T--------T--A----A-A-A-A------T----------G-----------G---------T-C-T-T--------T--------G----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-GC---C---CT-G-T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A----------------T-G-ATG---A-A--TCTATAAT
gi|24084                      :               TATATA-TT---GAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--AC---A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--A-------G----------C---C---TT-G-T-CCA-------AA-GG------------------A----AT-A-TC-----TA------T-G-GTC---A-A--G-TATGAT
gi|24085                      :               TATATG-TT-GTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC-C----A-A-A-A------T----------G-----------C---------A-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--A-------A-AGG---T-CT---C---CT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-G--T-
gi|24086                      :               TATATA-TT-CTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----TC-------C--T----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-TTAAA----G--------A----------CCTTTGGTC-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-TTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-T-TTC---A-A--T-TATG
gi|24087                      :               TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-GCA-C---CT-T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------GA----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C-A--A-------A-A-G---TAAC---C---CT-G-T-CTC-------AA-AG------------------A----TT-A-T
gi|24088                      :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-C-A-C---C--T-----C--------T--CC---A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAGACCCTTGGTC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTA-------AA-GG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TAT
gi|24089                      :               TATATC-TT--TGA-TGATC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A--------T----------G-----------A---------C-C-A-T--------G--------A----------TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT-G-T-CCC--------A-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---ATA--TATATGAT
gi|24090                      :                               GATC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----G-A-A-A------TGG--------G-----------A---------C-C-A-T--------G--------A----------TC------C-A--A-------T-A-----T-AT---C---AT-G-T-CCC-------A---G------------------G----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---ATA--TATATGAT
gi|24091                      : tattactttggatgTATACA-TT-CAGAGTGACA--TT-G-A-C---T--T-----T--------T--C----G-A-A-AG-----T----------G-----------A---------C-A-T-C--------G--------G----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---T---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AA-A-TT-----TA------G-G-ACC---A-G--T-TATAAT
gi|24092                      :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-T---C--TACCTAT--------C--C----A-A-A-A------A----------G-----------A---------C-C-T-T--------A--------A----------TC------C-A--C-------A-A-T---T--T---T---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-GAT
gi|24093                      :               TATATG-TT-CTGAGTGAGC--TT-G-A-C---CT-T-----T--------T--T----A-A-G-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G----------------------------------------A-G-A---T-AC---CT--TT-G-T-CCA-------AA-AG------------------A----
gi|24094                      :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---T--T-----TTTAATTAAT--A----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C-A--A-------A-A-G---T--T---T---CT-A-T-CCC-------AA-AG-----------------------AT-ATTT-----TG------T-G-ATC---C-A--T-
gi|24095                      :               TATATG-TT-CTGAGTGACA--TT-G-G-T---CA-T-----T--------C--C----A-A-C-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--C-------A-A-G---T-CC---C---AT------CC-------AA-G-------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATT---A-A--T-TATGAT
gi|24096                      :               TATGTA-TA-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---CTTT-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------
gi|24097                      :               TAGATG-CT-TTGAGTGACT--TC-G-A-C---C--T-----T--------T-------A-A-A-T------T----------G-----------A-----------A-T-T--------G-------------------TC------CAA--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-GTT-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TG-----AG------T-A-A-C---A------TATGAT
gi|24098                      :               TAGATG-CT-TTGAGTGACT--TC-G-A-C---C--T-----T--------T-------A-A-A-T------T----------G-----------A-----------A-T-T--------G-------------------TC------CAA--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-GTT-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TG-----AG------T-A-A-C---A------TATGAT
gi|24099                      :               TACATG-TT-TTG-GTGACC--TTTG-G-C---C--T-----T--------T--C----G-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-CG------------------A----AC-ATTT-----TG------T-G-
gi|24100                      :               TACATG-TT-TTG-GTGACC--TTTG-G-C---C--T-----T--------T--C----G-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-CG------------------A----AC-ATTT-----TG------T-G-
gi|24101                      :               TATGTG-TT-CAAAGTGACC--TTCA-A-C---T--T-----T--------C--C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-TT---C---CT-G-T--CC-------AA-AG------------------A----GT-A-TT-----TG------T-G-A
gi|24102                      :               TATATA-TT-CTGAATGGCC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TCCC----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-A-T-C--------GGTCCAATTG----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---C---CT-G-T-CCCA------AA-AA------------------A----AT-A-TCTATGATG------C-G-ATC---A-A--T-
gi|24103                      :               TATATG-CT-TTGAGTAGCC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C-A--A-------A-
gi|24104                      :               TATGTA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------CA-C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-CTT-T--------G--------A-----------C------T-A--A-------A-A-G---T-A
gi|24105                      :               TATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--CTTCTA-A-A-T------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAG-------CCTTTGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-
gi|24106                      :               TATATG-TT-CTGAGTGACA--CT-G-A-GGGAC--T-----T--------C--C----C-G-A--------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--G-------A-A-G---T-CC---C---TT-G-T-CCC-------AG-GG------------------AGTATGT-A-TC-----TG------T-A-ATT---A-A--T-
gi|24107                      :               TATATG-TT-CTGAGTGAC----T-G-A-C---CA-T-----T--------T--A----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AGAGACCATGGTC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-AG------------------A----AC-A-T------------------ATC---G-A--T-
gi|24108                      :               TATATG-TT-CTCAATGACC--TT-G-G-T---C--T-----T--------TC-C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGAACTTGGTC------C-A--C-------A-A-G---C--T---C---GT-G-T-ATC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-AT
gi|24109                      :                ACATG-TT-CTGAGTGACA--TT-G-G-C---C--T-----T--------TCCA----A-A-A-A------T----------G-----------ATCTTAAAAGC-C-T-T--------G--------G----------TT------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-
gi|24110                      :                ATATG-GT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---CA-T-----T--------C--G----A-G-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------
gi|24111                      :                ATATG-TT-TTGAATGACC--TT-G-A-T---C--T-----TC-------C--C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------CAT-T-T--------A--------A----------TT------C-G--C-------A-A-G------C---CA--TT-G-T-CTC-------GA-GG------------------A----AC-T-TT-----TC------T-G-GTgt
gi|24112                      :                ATATG-CT-CTGAATTACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC-T----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-TCAAA----G--------G----------TC------C-A--C-------A-A-G---
gi|24113                      :                ATATG-TA-TTGAGTGACC--TT-G-T-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------T-----------G---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C-A--A-------A-A-------------------G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24114                      :                ATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----TA-------C--C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAG-------CCTTGGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24115                      :                ATATG-AT-CTGAATGACC--TT-G-A-G---C--T-----T--------T--C----C-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGACTTGGGTT------C-A--C-------A-A-G---C-A----C---TC-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-TGT
gi|24116                      :                ATACA-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---A--T-----T--------T--C----C-A-A-A------T----------GGATCTCGAGTGA---------C-C-T-T--------T--------G----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---C---CT-G-T-CCA-------AA-GG------------------A----GT-A-TT-----TG------T-A-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24117                      :                ATATG-GT-CTGAATGACC--TT-A-A-A---C--T-----T--------TC-T----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AGAGACCTTGGTC------C-A--C-------A-A-A---T--C---T---TT-G-T-CTC-------AA-GA------------------A----CC-A-TT-----TG------C-A-ATA---A-A--T-GAT
gi|24118                      :                 TATG-CT-TTTAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------C---------C-C-T-T--------G--------A----------TA------C-A--C-------C-A-G---T-AC---CCCTGT-G-T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TGT-----T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24119                      :                 TATG-TTTCTGAG--ACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--C----C-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------GG-------A----------TT------T-A--ACTAT---A-A-T---T-ACATGT---AT-G-T-CCCCTGTCAAAA-GG------------------A----AT-A-TC-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24120                      :                 TATG-CT-TTGAGTGACCAGTT-G-G-A---C--C-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C---T--------G--------A----------CC------C-GTCA-------G-A-G---T-AG---C---A----T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A-T
gi|24121                      :                 TATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-G-C---C--TA----T--------C--C----A-A-A-T------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAGTCCTTGGTC------T-A--A-------A-C-G---T--C---C---TT-G-C-ATC-------AT-GG------------------A----AC-A-TT-----TC------C-G-ATC---A-A--T-
gi|24122                      :                  ATG-TT-CTGAATGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--CC---A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TG------C-A--A-------A-A-G---C--C---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TC-----GG------T-G-CTT---A-A--T-TATGAT
gi|24123                      :                  ATG-CT--TGAGTGACC--T--G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------------------------------------------G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-TG------------------A----AA-A-TT-----TG------A-G-A
gi|24124                      :                  ATG-CT--TGA-TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----T-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT---T-CCC-------AA--G------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---CTA--T-TATGAT
gi|24125                      :                  ATG-CT--TGA-TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----T-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------A----------TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT---T-CCC-------AA--G------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---CTA--T-TATGAT
gi|24126                      :                  ATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--T----G-A-A-A-----------------------------A---------C-CGT-T--------G--------A----------TG------C-A--G-------ACA-GATTT-AT---T---ATCG-T-CAG-------AA-GG------------------A----ATAA-TTA----TG------TGG-ATC---A-AG-T-TATGAT
gi|24127                      :                  ATG-TT-CTCAGTGATC--TT-G-T-T---C--C-----T--------T--C----ATA-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-A--------T--------C----------TC------T-A--A-------A-C-G---T--C---C---AT-G-T-CCC-------AA-GGAATACCCCTGTCCAAAGTA----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-AAT
gi|24128                      :                                ATC--TT-----C---C--T-----T--------C--C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-A--A-------A-A-G---T--C---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TGA-----T-G-A
gi|24129                      :         tgcttataaatG-TT-CTGAGTGACC--TG-A-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-T-T-T--------A--------A----------TC------C-A--A-------G-A-G---T-AC---C---CT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TTTGAT
gi|24130                      :                       T-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--TT---A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAG-------CCTTGGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-TG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-TGT
gi|24131                      :                       T-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--A----A-A-ATACCT---T----------G-----------AAAG------C-C-T-T--------G--------G----------AT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-TG------------------AAC--AT-A-TT-----TGGTAAATT-GTATC---A-AATT-TATGAT
gi|24132                      :                       T-CTGAGTGACC--TT-G-T-C---C--T-----T--------T--C----A-A-A-AA-----T----------G-----------A---------C-C-T-TACTCAAATG--------G----------TT------T-A--A-------A-A-G---T-CT---C---TT-G-T-TTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-A--T-TAT
gi|24133                      :                          TAAGTGACC--TT-G-A-G---C--T-----T--------TC-C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------AAAG-------AC------C-A--GGGTTCTTA-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-
gi|24134                      :                          TGAGTGATC--TC-G-A-C---C--T-----T--------TC-C----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TT------T-A--C-------A-A-----C-CT---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TT------C-A-ATA---A-A--T-TGT
gi|24135                      :                          TGTGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--CC---A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-A-T--------G--------AGACACCATGGTC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-T-T-GTA-------AA-AG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATC---G-A--T-TAT
gi|24136                      :                              TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T--G----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------A-A--A-------A-A-G---T-GC---C---CA-G---CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24137                      :                                             ---C--T-----T--------T---------A-A-G------T----------G-----------A---------C-C-A-T--------G--------G----------TC------C-A--A-------A-A-G---T-AG---T---CT-G-T-CCC-------AA-AG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATCTGTA-A--T-TACAAT
gi|24138                      :                                                                      ----A-A-A-A------T----------G-----------A---------C-C-T-T--------G--------G----------TC------C-T--C-------A-A-G---T-CT---C---CT-G-T-TC--------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                   111111                                                                                                                                         11                                                                                                
lowQualScore                  :                     0  11         00  1 0 1 000 44 11111 33333333 333333 0 0 0 333333 5555555555 22222222222 8888888888 2222222222 33333333333 4444444444 888888888888888888888 111  666666 1 4444444444 0 0 000 44 111 3333 0 1 0   2222222  0  444444444444444444 1111  1 1  22222  222222 0 0   111 2 11 2      
lowQualScore                  :                     .  ..         ..  . . . ... .. ..... ........ ...... . . . ...... .......... ........... .......... .......... ........... .......... ..................... ...  ...... . .......... . . ... .. ... .... . . .   .......  .  .................. ....  . .  .....  ...... . .   ... . .. .      
lowQualScore                  :                     6  77         77  5 5 0 999 22 88888 44444444 555555 5 5 5 333333 1111111111 99999999999 1111111111 7777777777 44444444444 7777777777 000000000000000000000 555  111111 1 7777777777 5 5 999 55 000 3333 6 1 6   9999999  6  111111111111111111 9999  1 7  00000  888888 6 6   222 7 66 0      
consensus                     :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----N-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---NT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
Reference ( family-295 )      :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----N-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---NT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24059                      :               TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-G--A-------A-A-G---T-AC---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------C-G-ATC---A-A--T-TACAAT
gi|24060                      :               TATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-ATTACATT----------G-----------AAAG-------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-GA------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24061                      :               TATATG-CT-TTGAGTGAC----T-G-A-C---C--T-----T--------T----G-C-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-T-ATC---A-G--T-TATGAT
gi|24062                      :               TATATG-TT-CTGAGTAACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24063                      :               TATATG-CA-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---T--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A---G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24064                      :               TATATA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------CA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------------------------------------------A-A-G---TCAC---T---CT-G-A-CT---------A-AG------------------A----GTAA-TT-----TG------T-T-GTT---A-A--T-TAT
gi|24065                      :               TATATG-CT-TTGAATGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------T-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---G---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-A--A-TATGA
gi|24066                      :               TATATG-TT---GAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------T-A--A-------A-A-A---T-AC---C---CT-G-T-CTCA------AA-AA------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24067                      :               TATATG-TT-CTGAGTAACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------A----------G---TT------G-A--A-------A-A-G---T-AT---C---CT-A-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24068                      :               TATATG-CT-TTGAGTGACC--AT-G-A-C---C--T-----T--------T----A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------C----------C----------G----------A---TC------C-A--A-------A-G-G---T-GC---C---CT-G-T-GCC-------AA-GG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATC---A-A--C-TATGAT
gi|24069                      :               TATATG-TT-TTGAGTGACC--TT-G-G-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------T----------C-----------T----------T----------T----------G---TC------C-A--A-------T-T-G---T-AC---C---TT-G-T-ACC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-AAC---A-A--T-TATGAT
gi|24070                      :               TGTATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---CT-T-----T--------T----C-A-A-A-A------T----------G-----------ACCTTGAAAGCC----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--T---C---TT-G-T-CTT-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24071                      :               TATATA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24072                      :               TATATG-TT-TTGGGTGACC--TT-G-AAC---T--T-----T--------T----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---A---TT-G-T-CCA-------AG-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATT---A-A--T-CATGATaagtc
gi|24073                      :               TAAATA-TT-TTGATTGACC--TT-G-A-C---C--A-----T--------T----G-A-A-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---AT-G-C-CTA-------AA-TG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGA
gi|24074                      :               TATATT-AT-CTGAGTGACC--TT-C-A-C---C--T-----T--------T----C-C-ATA-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TGAAA------G----------G---CCTGGAATC-A--A-------G-A-G---C--C---C---TT-A-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-T-AT
gi|24075                      :               TACATG-TT-CAGAGTGACC--TT-G-ACC---C--T-----T--------C----C-A-A-A-A------TGATCTTGAAAG-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---CT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-T-AT
gi|24076                      :               TATATA-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--C-----T--------TA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24077                      :               TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------CATTG------------------A----AA-A-AT-----CA------A-G-ATC---A-A--T-TATGATaagtc
gi|24078                      :               TATATG-CT-TTCAGTGACC--AT-C-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------G----------C-----------TG---------T----------A----------GACATC------G-A--A-------A-A-G---T-AA---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----GT-A-TT-----TG------G-G-ATC---A-A--G-TATGAT
gi|24079                      :               TATCTGCTT-TTGTGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--AC------C-A-G---T-CC---A---AT-G-TGCCC-------AC-AG------------------G----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24080                      :               TATATG-TC-TTGAAGGACC--TT-G-G-C---C--C-----T--------T----G-A-A-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------T-A--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-G-C-CAC-------AA-GG------------------A----AT-A-AT-----TA------T-G-ATC---A-C--T-GATGAT
gi|24081                      :               TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G---------------------------------------G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-TG------------------A----AA-A-TT-----TG------A-G-ATG---C-A--T-TATGAT
gi|24082                      :               TACATA-TT-TTGAACGACC--TT-G-A-C---C--C-----T--------T----CGA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-C-G---T--C---C---CT-G-T-TGC-------AA-GA------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-C--T-TCTGAT
gi|24083                      :               TGTATG-TT-TTGAGTGACT--CT-G-G-C---C--T-----T--------T----A-A-A-A-A------T----------G-----------G----------T----------C-----------T----------T----------T----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-GC---C---CT-G-T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A----------------T-G-ATG---A-A--TCTATAAT
gi|24084                      :               TATATA-TT---GAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----ACA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------G----------C---C---TT-G-T-CCA-------AA-GG------------------A----AT-A-TC-----TA------T-G-GTC---A-A--G-TATGAT
gi|24085                      :               TATATG-TT-GTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-A------T----------G-----------C----------A----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-AGG---T-CT---C---CT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-G--T-
gi|24086                      :               TATATA-TT-CTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----TC-------C----T-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------CTTTAAAGACCTT----------T----------G----------G---T-------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-TTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-T-TTC---A-A--T-TATG
gi|24087                      :               TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-GCA-C---CT-T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------GA----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-G---TAAC---C---CT-G-T-CTC-------AA-AG------------------A----TT-A-T
gi|24088                      :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-C-A-C---C--T-----C--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAGACCCTTGG---TC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTA-------AA-GG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TAT
gi|24089                      :               TATATC-TT--TGA-TGATC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G---A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------A----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT-G-T-CCC--------A-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---ATA--TATATGAT
gi|24090                      :                               GATC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-G-A-A-A------TGG--------G-----------A----------C----------C-----------A----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------T-A-----T-AT---C---AT-G-T-CCC-------A---G------------------G----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---ATA--TATATGAT
gi|24091                      : tattactttggatgTATACA-TT-CAGAGTGACA--TT-G-A-C---T--T-----T--------T----C-G-A-A-AG-----T----------G-----------A----------C----------A-----------T----------C----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---T---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AA-A-TT-----TA------G-G-ACC---A-G--T-TATAAT
gi|24092                      :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-T---C--TACCTAT--------C----C-A-A-A-A------A----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------A----------A---TC------C-A--C-------A-A-T---T--T---T---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-GAT
gi|24093                      :               TATATG-TT-CTGAGTGAGC--TT-G-A-C---CT-T-----T--------T----T-A-A-G-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G-----------------------------------A-G-A---T-AC---CT--TT-G-T-CCA-------AA-AG------------------A----
gi|24094                      :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---T--T-----TTTAATTAAT----A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-G---T--T---T---CT-A-T-CCC-------AA-AG-----------------------AT-ATTT-----TG------T-G-ATC---C-A--T-
gi|24095                      :               TATATG-TT-CTGAGTGACA--TT-G-G-T---CA-T-----T--------C----C-A-A-C-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---T-CC---C---AT------CC-------AA-G-------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATT---A-A--T-TATGAT
gi|24096                      :               TATGTA-TA-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---CTTT-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24097                      :               TAGATG-CT-TTGAGTGACT--TC-G-A-C---C--T-----T--------T------A-A-A-T------T----------G-----------A----------A----------T-----------T--------------------------------G---TC------CAA--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-GTT-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TG-----AG------T-A-A-C---A------TATGAT
gi|24098                      :               TAGATG-CT-TTGAGTGACT--TC-G-A-C---C--T-----T--------T------A-A-A-T------T----------G-----------A----------A----------T-----------T--------------------------------G---TC------CAA--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-GTT-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TG-----AG------T-A-A-C---A------TATGAT
gi|24099                      :               TACATG-TT-TTG-GTGACC--TTTG-G-C---C--T-----T--------T----C-G-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-CG------------------A----AC-ATTT-----TG------T-G-
gi|24100                      :               TACATG-TT-TTG-GTGACC--TTTG-G-C---C--T-----T--------T----C-G-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-CG------------------A----AC-ATTT-----TG------T-G-
gi|24101                      :               TATGTG-TT-CAAAGTGACC--TTCA-A-C---T--T-----T--------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-TT---C---CT-G-T--CC-------AA-AG------------------A----GT-A-TT-----TG------T-G-A
gi|24102                      :               TATATA-TT-CTGAATGGCC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TCC--C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------A-----------T----------C----------GGTCCAATT--G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---C---CT-G-T-CCCA------AA-AA------------------A----AT-A-TCTATGATG------C-G-ATC---A-A--T-
gi|24103                      :               TATATG-CT-TTGAGTAGCC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-
gi|24104                      :               TATGTA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------CA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------T----------G---AC------T-A--A-------A-A-G---T-A
gi|24105                      :               TATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TCTTCT-A-A-A-T------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---CCTTTGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-
gi|24106                      :               TATATG-TT-CTGAGTGACA--CT-G-A-GGGAC--T-----T--------C----C-C-G-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--G-------A-A-G---T-CC---C---TT-G-T-CCC-------AG-GG------------------AGTATGT-A-TC-----TG------T-A-ATT---A-A--T-
gi|24107                      :               TATATG-TT-CTGAGTGAC----T-G-A-C---CA-T-----T--------T----A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------TTGAGAGACCAT----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-AG------------------A----AC-A-T------------------ATC---G-A--T-
gi|24108                      :               TATATG-TT-CTCAATGACC--TT-G-G-T---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------CCTTGAAAGAAC-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---C--T---C---GT-G-T-ATC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-AT
gi|24109                      :                ACATG-TT-CTGAGTGACA--TT-G-G-C---C--T-----T--------TCC--A-A-A-A-A------T----------G-----------ATCTTAAAAG-C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-
gi|24110                      :                ATATG-GT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---CA-T-----T--------C----G-A-G-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------
gi|24111                      :                ATATG-TT-TTGAATGACC--TT-G-A-T---C--T-----TC-------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------CA---------T-----------T----------T----------A----------A---TT------C-G--C-------A-A-G------C---CA--TT-G-T-CTC-------GA-GG------------------A----AC-T-TT-----TC------T-G-GTagt
gi|24112                      :                ATATG-CT-CTGAATTACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---T-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TCAAA------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---
gi|24113                      :                ATATG-TA-TTGAGTGACC--TT-G-T-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------T-----------G----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-------------------G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24114                      :                ATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----TA-------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---CCTTGGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24115                      :                ATATG-AT-CTGAATGACC--TT-G-A-G---C--T-----T--------T----C-C-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TGAAAGACTTGG----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C-A----C---TC-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-TGT
gi|24116                      :                ATACA-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---A--T-----T--------T----C-C-A-A-A------T----------GGATCTCGAGTGA----------C----------C-----------T----------T----------T----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---C---CT-G-T-CCA-------AA-GG------------------A----GT-A-TT-----TG------T-A-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24117                      :                ATATG-GT-CTGAATGACC--TT-A-A-A---C--T-----T--------TC---T-A-A-A-A------TGACCTTGAGAG-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-A---T--C---T---TT-G-T-CTC-------AA-GA------------------A----CC-A-TT-----TG------C-A-ATA---A-A--T-GAT
gi|24118                      :                 TATG-CT-TTTAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------C----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TA------C-A--C-------C-A-G---T-AC---CCCTGT-G-T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TGT-----T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24119                      :                 TATG-TTTCTGAG--ACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----C-C-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------GA--TT------T-A--ACTAT---A-A-T---T-ACATGT---AT-G-T-CCCCTGTCAAAA-GG------------------A----AT-A-TC-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24120                      :                 TATG-CT-TTGAGTGACCAGTT-G-G-A---C--C-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C----------------------T----------G----------A---CC------C-GTCA-------G-A-G---T-AG---C---A----T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A-T
gi|24121                      :                 TATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-G-C---C--TA----T--------C----C-A-A-A-T------T----------G-----------ACCTTGAAAGTC----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------T-A--A-------A-C-G---T--C---C---TT-G-C-ATC-------AT-GG------------------A----AC-A-TT-----TC------C-G-ATC---A-A--T-
gi|24122                      :                  ATG-TT-CTGAATGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TG------C-A--A-------A-A-G---C--C---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TC-----GG------T-G-CTT---A-A--T-TATGAT
gi|24123                      :                  ATG-CT--TGAGTGACC--T--G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G---------------------------------------G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-TG------------------A----AA-A-TT-----TG------A-G-A
gi|24124                      :                  ATG-CT--TGA-TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-T-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT---T-CCC-------AA--G------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---CTA--T-TATGAT
gi|24125                      :                  ATG-CT--TGA-TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-T-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT---T-CCC-------AA--G------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---CTA--T-TATGAT
gi|24126                      :                  ATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----T-G-A-A-A-----------------------------A----------C----------CG----------T----------T----------G----------A---TG------C-A--G-------ACA-GATTT-AT---T---ATCG-T-CAG-------AA-GG------------------A----ATAA-TTA----TG------TGG-ATC---A-AG-T-TATGAT
gi|24127                      :                  ATG-TT-CTCAGTGATC--TT-G-T-T---C--C-----T--------T----C-ATA-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------A----------T----------C---TC------T-A--A-------A-C-G---T--C---C---AT-G-T-CCC-------AA-GGAATACCCCTGTCCAAAGTA----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-AAT
gi|24128                      :                                ATC--TT-----C---C--T-----T--------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T--C---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TGA-----T-G-A
gi|24129                      :         tgcttataaatG-TT-CTGAGTGACC--TG-A-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------T-----------T----------T----------A----------A---TC------C-A--A-------G-A-G---T-AC---C---CT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TTTGAT
gi|24130                      :                       T-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---CT-T-----T--------T----T-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---CCTTGGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-TG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-TGT
gi|24131                      :                       T-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----A-A-A-ATACCT---T----------G-----------AAAG-------C----------C-----------T----------T----------G----------G---AT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-TG------------------AAC--AT-A-TT-----TGGTAAATT-GTATC---A-AATT-TATGAT
gi|24132                      :                       T-CTGAGTGACC--TT-G-T-C---C--T-----T--------T----C-A-A-A-AA-----T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TACTCAAAT--G----------G---TT------T-A--A-------A-A-G---T-CT---C---TT-G-T-TTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-A--T-TAT
gi|24133                      :                          TAAGTGACC--TT-G-A-G---C--T-----T--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---AC------C-A--GGGTTCTTA-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-
gi|24134                      :                          TGAGTGATC--TC-G-A-C---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------T-A--C-------A-A-----C-CT---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TT------C-A-ATA---A-A--T-TGT
gi|24135                      :                          TGTGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------CA----------TGAGACACCA-T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-T-T-GTA-------AA-AG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATC---G-A--T-TAT
gi|24136                      :                              TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------A-A--A-------A-A-G---T-GC---C---CA-G---CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24137                      :                                             ---C--T-----T--------T--------A-A-G------T----------G-----------A----------C----------C-----------A----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AG---T---CT-G-T-CCC-------AA-AG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATCTGTA-A--T-TACAAT
gi|24138                      :                                                                        -A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-T--C-------A-A-G---T-CT---C---CT-G-T-TC--------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                   111111                                                                                                                                         11                                                                                                
lowQualScore                  :                     0  11         00  1 0 1 000 44 11111 33333333 333333 0 0 0 333333 5555555555 22222222222 8888888888 2222222222 33333333333 4444444444 888888888888888888888 111  666666 1 4444444444 0 0 000 44 111 3333 0 1 0   2222222  0  444444444444444444 1111  1 1  22222  222222 0 0   111 2 11 2      
lowQualScore                  :                     .  ..         ..  . . . ... .. ..... ........ ...... . . . ...... .......... ........... .......... .......... ........... .......... ..................... ...  ...... . .......... . . ... .. ... .... . . .   .......  .  .................. ....  . .  .....  ...... . .   ... . .. .      
lowQualScore                  :                     6  77         77  5 5 0 999 22 88888 44444444 555555 5 5 5 333333 1111111111 99999999999 1111111111 7777777777 44444444444 7777777777 000000000000000000000 555  111111 1 7777777777 5 5 999 55 000 3333 6 1 6   9999999  6  111111111111111111 9999  1 7  00000  888888 6 6   222 7 66 0      
consensus                     :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----N-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---NT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
Reference ( family-295 )      :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----N-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---NT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24059                      :               TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-G--A-------A-A-G---T-AC---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------C-G-ATC---A-A--T-TACAAT
gi|24060                      :               TATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-ATTACATT----------G-----------AAAG-------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-GA------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24061                      :               TATATG-CT-TTGAGTGAC----T-G-A-C---C--T-----T--------T----G-C-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-T-ATC---A-G--T-TATGAT
gi|24062                      :               TATATG-TT-CTGAGTAACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24063                      :               TATATG-CA-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---T--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A---G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24064                      :               TATATA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------CA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------------------------------------------A-A-G---TCAC---T---CT-G-A-CT---------A-AG------------------A----GTAA-TT-----TG------T-T-GTT---A-A--T-TAT
gi|24065                      :               TATATG-CT-TTGAATGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------T-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---G---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-A--A-TATGA
gi|24066                      :               TATATG-TT---GAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------T-A--A-------A-A-A---T-AC---C---CT-G-T-CTCA------AA-AA------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24067                      :               TATATG-TT-CTGAGTAACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------A----------G---TT------G-A--A-------A-A-G---T-AT---C---CT-A-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24068                      :               TATATG-CT-TTGAGTGACC--AT-G-A-C---C--T-----T--------T----A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------C----------C----------G----------A---TC------C-A--A-------A-G-G---T-GC---C---CT-G-T-GCC-------AA-GG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATC---A-A--C-TATGAT
gi|24069                      :               TATATG-TT-TTGAGTGACC--TT-G-G-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------T----------C-----------T----------T----------T----------G---TC------C-A--A-------T-T-G---T-AC---C---TT-G-T-ACC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-AAC---A-A--T-TATGAT
gi|24070                      :               TGTATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---CT-T-----T--------T----C-A-A-A-A------T----------G-----------ACCTTGAAAGCC----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--T---C---TT-G-T-CTT-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24071                      :               TATATA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24072                      :               TATATG-TT-TTGGGTGACC--TT-G-AAC---T--T-----T--------T----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---A---TT-G-T-CCA-------AG-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATT---A-A--T-CATGATaagtc
gi|24073                      :               TAAATA-TT-TTGATTGACC--TT-G-A-C---C--A-----T--------T----G-A-A-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---AT-G-C-CTA-------AA-TG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGA
gi|24074                      :               TATATT-AT-CTGAGTGACC--TT-C-A-C---C--T-----T--------T----C-C-ATA-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TGAAA------G----------G---CCTGGAATC-A--A-------G-A-G---C--C---C---TT-A-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-T-AT
gi|24075                      :               TACATG-TT-CAGAGTGACC--TT-G-ACC---C--T-----T--------C----C-A-A-A-A------TGATCTTGAAAG-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---CT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-T-AT
gi|24076                      :               TATATA-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--C-----T--------TA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24077                      :               TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------CATTG------------------A----AA-A-AT-----CA------A-G-ATC---A-A--T-TATGATaagtc
gi|24078                      :               TATATG-CT-TTCAGTGACC--AT-C-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------G----------C-----------TG---------T----------A----------GACATC------G-A--A-------A-A-G---T-AA---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----GT-A-TT-----TG------G-G-ATC---A-A--G-TATGAT
gi|24079                      :               TATCTGCTT-TTGTGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--AC------C-A-G---T-CC---A---AT-G-TGCCC-------AC-AG------------------G----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24080                      :               TATATG-TC-TTGAAGGACC--TT-G-G-C---C--C-----T--------T----G-A-A-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------T-A--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-G-C-CAC-------AA-GG------------------A----AT-A-AT-----TA------T-G-ATC---A-C--T-GATGAT
gi|24081                      :               TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G---------------------------------------G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-TG------------------A----AA-A-TT-----TG------A-G-ATG---C-A--T-TATGAT
gi|24082                      :               TACATA-TT-TTGAACGACC--TT-G-A-C---C--C-----T--------T----CGA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-C-G---T--C---C---CT-G-T-TGC-------AA-GA------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-C--T-TCTGAT
gi|24083                      :               TGTATG-TT-TTGAGTGACT--CT-G-G-C---C--T-----T--------T----A-A-A-A-A------T----------G-----------G----------T----------C-----------T----------T----------T----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-GC---C---CT-G-T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A----------------T-G-ATG---A-A--TCTATAAT
gi|24084                      :               TATATA-TT---GAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----ACA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------G----------C---C---TT-G-T-CCA-------AA-GG------------------A----AT-A-TC-----TA------T-G-GTC---A-A--G-TATGAT
gi|24085                      :               TATATG-TT-GTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-A------T----------G-----------C----------A----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-AGG---T-CT---C---CT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-G--T-
gi|24086                      :               TATATA-TT-CTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----TC-------C----T-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------CTTTAAAGACCTT----------T----------G----------G---T-------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-TTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-T-TTC---A-A--T-TATG
gi|24087                      :               TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-GCA-C---CT-T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------GA----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-G---TAAC---C---CT-G-T-CTC-------AA-AG------------------A----TT-A-T
gi|24088                      :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-C-A-C---C--T-----C--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAGACCCTTGG---TC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTA-------AA-GG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TAT
gi|24089                      :               TATATC-TT--TGA-TGATC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G---A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------A----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT-G-T-CCC--------A-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---ATA--TATATGAT
gi|24090                      :                               GATC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-G-A-A-A------TGG--------G-----------A----------C----------C-----------A----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------T-A-----T-AT---C---AT-G-T-CCC-------A---G------------------G----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---ATA--TATATGAT
gi|24091                      : tattactttggatgTATACA-TT-CAGAGTGACA--TT-G-A-C---T--T-----T--------T----C-G-A-A-AG-----T----------G-----------A----------C----------A-----------T----------C----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---T---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AA-A-TT-----TA------G-G-ACC---A-G--T-TATAAT
gi|24092                      :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-T---C--TACCTAT--------C----C-A-A-A-A------A----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------A----------A---TC------C-A--C-------A-A-T---T--T---T---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-GAT
gi|24093                      :               TATATG-TT-CTGAGTGAGC--TT-G-A-C---CT-T-----T--------T----T-A-A-G-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G-----------------------------------A-G-A---T-AC---CT--TT-G-T-CCA-------AA-AG------------------A----
gi|24094                      :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---T--T-----TTTAATTAAT----A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-G---T--T---T---CT-A-T-CCC-------AA-AG-----------------------AT-ATTT-----TG------T-G-ATC---C-A--T-
gi|24095                      :               TATATG-TT-CTGAGTGACA--TT-G-G-T---CA-T-----T--------C----C-A-A-C-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---T-CC---C---AT------CC-------AA-G-------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATT---A-A--T-TATGAT
gi|24096                      :               TATGTA-TA-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---CTTT-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24097                      :               TAGATG-CT-TTGAGTGACT--TC-G-A-C---C--T-----T--------T------A-A-A-T------T----------G-----------A----------A----------T-----------T--------------------------------G---TC------CAA--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-GTT-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TG-----AG------T-A-A-C---A------TATGAT
gi|24098                      :               TAGATG-CT-TTGAGTGACT--TC-G-A-C---C--T-----T--------T------A-A-A-T------T----------G-----------A----------A----------T-----------T--------------------------------G---TC------CAA--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-GTT-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TG-----AG------T-A-A-C---A------TATGAT
gi|24099                      :               TACATG-TT-TTG-GTGACC--TTTG-G-C---C--T-----T--------T----C-G-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-CG------------------A----AC-ATTT-----TG------T-G-
gi|24100                      :               TACATG-TT-TTG-GTGACC--TTTG-G-C---C--T-----T--------T----C-G-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-CG------------------A----AC-ATTT-----TG------T-G-
gi|24101                      :               TATGTG-TT-CAAAGTGACC--TTCA-A-C---T--T-----T--------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-TT---C---CT-G-T--CC-------AA-AG------------------A----GT-A-TT-----TG------T-G-A
gi|24102                      :               TATATA-TT-CTGAATGGCC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TCC--C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------A-----------T----------C----------GGTCCAATT--G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---C---CT-G-T-CCCA------AA-AA------------------A----AT-A-TCTATGATG------C-G-ATC---A-A--T-
gi|24103                      :               TATATG-CT-TTGAGTAGCC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-
gi|24104                      :               TATGTA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------CA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------T----------G---AC------T-A--A-------A-A-G---T-A
gi|24105                      :               TATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TCTTCT-A-A-A-T------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---CCTTTGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-
gi|24106                      :               TATATG-TT-CTGAGTGACA--CT-G-A-GGGAC--T-----T--------C----C-C-G-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--G-------A-A-G---T-CC---C---TT-G-T-CCC-------AG-GG------------------AGTATGT-A-TC-----TG------T-A-ATT---A-A--T-
gi|24107                      :               TATATG-TT-CTGAGTGAC----T-G-A-C---CA-T-----T--------T----A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------TTGAGAGACCAT----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-AG------------------A----AC-A-T------------------ATC---G-A--T-
gi|24108                      :               TATATG-TT-CTCAATGACC--TT-G-G-T---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------CCTTGAAAGAAC-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---C--T---C---GT-G-T-ATC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-AT
gi|24109                      :                ACATG-TT-CTGAGTGACA--TT-G-G-C---C--T-----T--------TCC--A-A-A-A-A------T----------G-----------ATCTTAAAAG-C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-
gi|24110                      :                ATATG-GT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---CA-T-----T--------C----G-A-G-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------
gi|24111                      :                ATATG-TT-TTGAATGACC--TT-G-A-T---C--T-----TC-------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------CA---------T-----------T----------T----------A----------A---TT------C-G--C-------A-A-G------C---CA--TT-G-T-CTC-------GA-GG------------------A----AC-T-TT-----TC------T-G-GTagt
gi|24112                      :                ATATG-CT-CTGAATTACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---T-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TCAAA------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---
gi|24113                      :                ATATG-TA-TTGAGTGACC--TT-G-T-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------T-----------G----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-------------------G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24114                      :                ATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----TA-------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---CCTTGGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24115                      :                ATATG-AT-CTGAATGACC--TT-G-A-G---C--T-----T--------T----C-C-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TGAAAGACTTGG----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C-A----C---TC-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-TGT
gi|24116                      :                ATACA-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---A--T-----T--------T----C-C-A-A-A------T----------GGATCTCGAGTGA----------C----------C-----------T----------T----------T----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---C---CT-G-T-CCA-------AA-GG------------------A----GT-A-TT-----TG------T-A-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24117                      :                ATATG-GT-CTGAATGACC--TT-A-A-A---C--T-----T--------TC---T-A-A-A-A------TGACCTTGAGAG-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-A---T--C---T---TT-G-T-CTC-------AA-GA------------------A----CC-A-TT-----TG------C-A-ATA---A-A--T-GAT
gi|24118                      :                 TATG-CT-TTTAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------C----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TA------C-A--C-------C-A-G---T-AC---CCCTGT-G-T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TGT-----T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24119                      :                 TATG-TTTCTGAG--ACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----C-C-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------GA--TT------T-A--ACTAT---A-A-T---T-ACATGT---AT-G-T-CCCCTGTCAAAA-GG------------------A----AT-A-TC-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24120                      :                 TATG-CT-TTGAGTGACCAGTT-G-G-A---C--C-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C----------------------T----------G----------A---CC------C-GTCA-------G-A-G---T-AG---C---A----T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A-T
gi|24121                      :                 TATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-G-C---C--TA----T--------C----C-A-A-A-T------T----------G-----------ACCTTGAAAGTC----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------T-A--A-------A-C-G---T--C---C---TT-G-C-ATC-------AT-GG------------------A----AC-A-TT-----TC------C-G-ATC---A-A--T-
gi|24122                      :                  ATG-TT-CTGAATGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TG------C-A--A-------A-A-G---C--C---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TC-----GG------T-G-CTT---A-A--T-TATGAT
gi|24123                      :                  ATG-CT--TGAGTGACC--T--G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G---------------------------------------G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-TG------------------A----AA-A-TT-----TG------A-G-A
gi|24124                      :                  ATG-CT--TGA-TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-T-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT---T-CCC-------AA--G------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---CTA--T-TATGAT
gi|24125                      :                  ATG-CT--TGA-TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-T-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT---T-CCC-------AA--G------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---CTA--T-TATGAT
gi|24126                      :                  ATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----T-G-A-A-A-----------------------------A----------C----------CG----------T----------T----------G----------A---TG------C-A--G-------ACA-GATTT-AT---T---ATCG-T-CAG-------AA-GG------------------A----ATAA-TTA----TG------TGG-ATC---A-AG-T-TATGAT
gi|24127                      :                  ATG-TT-CTCAGTGATC--TT-G-T-T---C--C-----T--------T----C-ATA-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------A----------T----------C---TC------T-A--A-------A-C-G---T--C---C---AT-G-T-CCC-------AA-GGAATACCCCTGTCCAAAGTA----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-AAT
gi|24128                      :                                ATC--TT-----C---C--T-----T--------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T--C---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TGA-----T-G-A
gi|24129                      :         tgcttataaatG-TT-CTGAGTGACC--TG-A-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------T-----------T----------T----------A----------A---TC------C-A--A-------G-A-G---T-AC---C---CT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TTTGAT
gi|24130                      :                       T-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---CT-T-----T--------T----T-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---CCTTGGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-TG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-TGT
gi|24131                      :                       T-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----A-A-A-ATACCT---T----------G-----------AAAG-------C----------C-----------T----------T----------G----------G---AT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-TG------------------AAC--AT-A-TT-----TGGTAAATT-GTATC---A-AATT-TATGAT
gi|24132                      :                       T-CTGAGTGACC--TT-G-T-C---C--T-----T--------T----C-A-A-A-AA-----T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TACTCAAAT--G----------G---TT------T-A--A-------A-A-G---T-CT---C---TT-G-T-TTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-A--T-TAT
gi|24133                      :                          TAAGTGACC--TT-G-A-G---C--T-----T--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---AC------C-A--GGGTTCTTA-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-
gi|24134                      :                          TGAGTGATC--TC-G-A-C---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------T-A--C-------A-A-----C-CT---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TT------C-A-ATA---A-A--T-TGT
gi|24135                      :                          TGTGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------CA----------TGAGACACCA-T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-T-T-GTA-------AA-AG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATC---G-A--T-TAT
gi|24136                      :                              TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------A-A--A-------A-A-G---T-GC---C---CA-G---CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24137                      :                                             ---C--T-----T--------T--------A-A-G------T----------G-----------A----------C----------C-----------A----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AG---T---CT-G-T-CCC-------AA-AG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATCTGTA-A--T-TACAAT
gi|24138                      :                                                                        -A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-T--C-------A-A-G---T-CT---C---CT-G-T-TC--------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT


blockSeqs                     :                        TC             T   A     TT ACCTA TTAATTAA CTTCT        TTACAT GATCTTGAAA GATCTCGAGTG CCTTGAAAGC CTTGAAAGAA TTTAAAGACCT TGAGAGACCA GAAGACCCTTG           ACA  TGGAAT A GGGTTCTT           CA     CCTG   T     CTGTCAA     AATACCCCTGTCCAAAGT GTAT  A T  TATGA  GTAAAT       TGT T AT C
blockSeqs                     :                        C              T   C     T  A     C        CCC          CCT    GACCTTGAGA A           CCTTGAAAGT A          G           GAGACACCA  GAAAGACTTGG           A    TTTGAT A ACTAT              AA     TT     T     A           .                  AC    A T  A      T            .   T G  A
blockSeqs                     :                        T              C   .     T  .     C        CCA          G      GG         .           TCTTAAAAG  .          A           G          GGTCCAATT             .    TTGGAT . TCA                A      AT     .     A           .                  .     . T  .      A            .   T .  A
blockSeqs                     :                        C              .   .     T  .     A        CC           A      .          .           AAG        .          .           .          ACTCAAATG             .    TTGGAT . AC                 A      T      .     .           .                  .     . .  .      .            .   T .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     A  .     .        CA           .      .          .           AAG        .          .           .          GAAAG                 .    .      . C                  A      C      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     A  .     .        AC           .      .          .           .          .          .           .          CAAAG                 .    .      . A                  A      A      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     A  .     .        AC           .      .          .           .          .          .           .          GAAA                  .    .      . A                  A      C      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     T  .     .        AC           .      .          .           .          .          .           .          GAAA                  .    .      . A                  G      C      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        CG           .      .          .           .          .          .           .          GAAA                  .    .      . A                  A      C      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        AC           .      .          .           .          .          .           .          GAAA                  .    .      . A                  C      C      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        CC           .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  A      C      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        CC           .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  A      T      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        AC           .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . C                  A      T      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        CC           .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  C      T      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        CT           .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  A      A      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        CT           .      .          .           .          .          .           .          A                     .    .      . A                  A      T      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        CC           .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . C                  G      T      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        CC           .      .          .           .          .          .           .          T                     .    .      . A                  C      A      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        CC           .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  A      A      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        CC           .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  A      A      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  C      C      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  A      A      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  C      C      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          A                     .    .      . A                  A      C      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        G              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . C                  A      T      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        A            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  T      C      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . C                  C      T      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        C            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  A      C      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        C            .      .          .           .          .          .           .          T                     .    .      . A                  C      T      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  A      A      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        C            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . C                  C      A      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        C            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  A      C      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . C                  A      T      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  A      C      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  A      A      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . C                  A      C      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          A                     .    .      . C                  A      C      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        A            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  A      T      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        T            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  A      T      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  C      C      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  C      C      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . C                  G      T      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        C            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . G                  A      T      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        C            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . C                  C      T      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        T            .      .          .           .          .          .           .          T                     .    .      . C                  .      G      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        A            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . C                  .      T      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        C            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . C                  .      T      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . C                  .      T      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        C            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  .      C      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        C            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . C                  .      T      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        C            .      .          .           .          .          .           .          A                     .    .      . C                  .      A      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        C            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  .      A      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        C            .      .          .           .          .          .           .          T                     .    .      . C                  .      T      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        A            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . C                  .      C      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  .      A      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        C            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  .      A      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  .      A      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        C            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  .      A      .     .           .                  .     . .  .      .            .   . .  .
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        C            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . G                  .      A      .     .           .                  .     . .  .      .                      
blockSeqs                     :                        T              .   .     .  .     .        C            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  .      C      .     .           .                  .     . .  .      .                      
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  .      C      .     .           .                  .     . .  .      .                      
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        C            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  .      T      .     .           .                  .     . .  .      .                      
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . C                  .      T      .     .           .                  .     . .  .      .                      
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        C            .      .          .           .          .          .           .          T                     .    .      . C                  .      T      .     .           .                  .     . .  .      .                      
blockSeqs                     :                        C              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  .      T      .     .           .                  .     . .  .      .                      
blockSeqs                     :                        .              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          A                     .    .      . C                  .      T      .     .           .                  .     . .  .      .                      
blockSeqs                     :                        .              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . C                  .      T      .     .           .                  .     . .  .      .                      
blockSeqs                     :                        .              .   .     .  .     .        T            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  .      C      .     .           .                  .     . .  .      .                      
blockSeqs                     :                        .              .   .     .  .     .        C            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . A                  .      C      .     .           .                  .     . .                                
blockSeqs                     :                        .              .   .     .  .     .        C            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . C                  .      C      .     .           .                  .     . .                                
blockSeqs                     :                        .              .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . .                  .      .      .     .           .                  .                                        
blockSeqs                     :                                       .   .     .  .     .        T            .      .          .           .          .          .           .          G                     .    .      . .                  .                                                                                           
blockSeqs                     :                                       .   .     .  .     .        A            .      .          .           .          .          .           .          .                     .    .      . .                                                                                                              
blockSeqs                     :                                       .   .     .  .     .        C            .      .          .           .          .          .           .          .                     .    .      . .                                                                                                              
blockSeqs                     :                                       .   .     .  .     .        G            .      .          .           .          .          .           .          .                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                       .   .     .  .     .        .            .      .          .           .          .          .           .                                                                                                                                                             
blockSeqs                     :                                       .   .     .  .     .        .            .      .          .           .          .          .           .                                                                                                                                                             
blockSeqs                     :                                                 .  .     .        .            .      .          .           .          .          .           .                                                                                                                                                             
blockSeqs                     :                                                                                .      .          .           .          .          .           .                                                                                                                                                             


blockSeqCons                  :               
originalCons                  :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----N-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---NT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
finalCons                     :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----N-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---NT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                   111111                                                                                                                                         11                                                                                                
lowQualScore                  :                     0  11         00  1 0 1 000 44 11111 33333333 333333 0 0 0 333333 5555555555 22222222222 8888888888 2222222222 33333333333 4444444444 888888888888888888888 111  666666 1 4444444444 0 0 000 44 111 3333 0 1 0   2222222  0  444444444444444444 1111  1 1  22222  222222 0 0   111 2 11 2      
lowQualScore                  :                     .  ..         ..  . . . ... .. ..... ........ ...... . . . ...... .......... ........... .......... .......... ........... .......... ..................... ...  ...... . .......... . . ... .. ... .... . . .   .......  .  .................. ....  . .  .....  ...... . .   ... . .. .      
lowQualScore                  :                     6  77         77  5 5 0 999 22 88888 44444444 555555 5 5 5 333333 1111111111 99999999999 1111111111 7777777777 44444444444 7777777777 000000000000000000000 555  111111 1 7777777777 5 5 999 55 000 3333 6 1 6   9999999  6  111111111111111111 9999  1 7  00000  888888 6 6   222 7 66 0      
consensus                     :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----N-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---NT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
Reference ( family-295 )      :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----N-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---NT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24059                      :               TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-G--A-------A-A-G---T-AC---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------C-G-ATC---A-A--T-TACAAT
gi|24060                      :               TATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-ATTACATT----------G-----------AAAG-------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-GA------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24061                      :               TATATG-CT-TTGAGTGAC----T-G-A-C---C--T-----T--------T----G-C-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-T-ATC---A-G--T-TATGAT
gi|24062                      :               TATATG-TT-CTGAGTAACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24063                      :               TATATG-CA-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---T--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A---G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24064                      :               TATATA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------CA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------------------------------------------A-A-G---TCAC---T---CT-G-A-CT---------A-AG------------------A----GTAA-TT-----TG------T-T-GTT---A-A--T-TAT
gi|24065                      :               TATATG-CT-TTGAATGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------T-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---G---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-A--A-TATGA
gi|24066                      :               TATATG-TT---GAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------T-A--A-------A-A-A---T-AC---C---CT-G-T-CTCA------AA-AA------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24067                      :               TATATG-TT-CTGAGTAACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------A----------G---TT------G-A--A-------A-A-G---T-AT---C---CT-A-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24068                      :               TATATG-CT-TTGAGTGACC--AT-G-A-C---C--T-----T--------T----A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------C----------C----------G----------A---TC------C-A--A-------A-G-G---T-GC---C---CT-G-T-GCC-------AA-GG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATC---A-A--C-TATGAT
gi|24069                      :               TATATG-TT-TTGAGTGACC--TT-G-G-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------T----------C-----------T----------T----------T----------G---TC------C-A--A-------T-T-G---T-AC---C---TT-G-T-ACC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-AAC---A-A--T-TATGAT
gi|24070                      :               TGTATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---CT-T-----T--------T----C-A-A-A-A------T----------G-----------ACCTTGAAAGCC----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--T---C---TT-G-T-CTT-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24071                      :               TATATA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24072                      :               TATATG-TT-TTGGGTGACC--TT-G-AAC---T--T-----T--------T----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---A---TT-G-T-CCA-------AG-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATT---A-A--T-CATGATaagtc
gi|24073                      :               TAAATA-TT-TTGATTGACC--TT-G-A-C---C--A-----T--------T----G-A-A-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AC---C---AT-G-C-CTA-------AA-TG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGA
gi|24074                      :               TATATT-AT-CTGAGTGACC--TT-C-A-C---C--T-----T--------T----C-C-ATA-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TGAAA------G----------G---CCTGGAATC-A--A-------G-A-G---C--C---C---TT-A-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-T-AT
gi|24075                      :               TACATG-TT-CAGAGTGACC--TT-G-ACC---C--T-----T--------C----C-A-A-A-A------TGATCTTGAAAG-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---CT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-T-AT
gi|24076                      :               TATATA-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--C-----T--------TA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24077                      :               TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------CATTG------------------A----AA-A-AT-----CA------A-G-ATC---A-A--T-TATGATaagtc
gi|24078                      :               TATATG-CT-TTCAGTGACC--AT-C-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------G----------C-----------TG---------T----------A----------GACATC------G-A--A-------A-A-G---T-AA---C---AT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----GT-A-TT-----TG------G-G-ATC---A-A--G-TATGAT
gi|24079                      :               TATCTGCTT-TTGTGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--AC------C-A-G---T-CC---A---AT-G-TGCCC-------AC-AG------------------G----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24080                      :               TATATG-TC-TTGAAGGACC--TT-G-G-C---C--C-----T--------T----G-A-A-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------T-A--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-G-C-CAC-------AA-GG------------------A----AT-A-AT-----TA------T-G-ATC---A-C--T-GATGAT
gi|24081                      :               TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G---------------------------------------G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-TG------------------A----AA-A-TT-----TG------A-G-ATG---C-A--T-TATGAT
gi|24082                      :               TACATA-TT-TTGAACGACC--TT-G-A-C---C--C-----T--------T----CGA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-C-G---T--C---C---CT-G-T-TGC-------AA-GA------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-C--T-TCTGAT
gi|24083                      :               TGTATG-TT-TTGAGTGACT--CT-G-G-C---C--T-----T--------T----A-A-A-A-A------T----------G-----------G----------T----------C-----------T----------T----------T----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-GC---C---CT-G-T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A----------------T-G-ATG---A-A--TCTATAAT
gi|24084                      :               TATATA-TT---GAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----ACA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------G----------C---C---TT-G-T-CCA-------AA-GG------------------A----AT-A-TC-----TA------T-G-GTC---A-A--G-TATGAT
gi|24085                      :               TATATG-TT-GTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-A------T----------G-----------C----------A----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-AGG---T-CT---C---CT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-G--T-
gi|24086                      :               TATATA-TT-CTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----TC-------C----T-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------CTTTAAAGACCTT----------T----------G----------G---T-------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-TTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-T-TTC---A-A--T-TATG
gi|24087                      :               TATATG-CT-TTGAGTGACC--TT-GCA-C---CT-T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------GA----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-G---TAAC---C---CT-G-T-CTC-------AA-AG------------------A----TT-A-T
gi|24088                      :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-C-A-C---C--T-----C--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAGACCCTTGG---TC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTA-------AA-GG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TAT
gi|24089                      :               TATATC-TT--TGA-TGATC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G---A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------A----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT-G-T-CCC--------A-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---ATA--TATATGAT
gi|24090                      :                               GATC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-G-A-A-A------TGG--------G-----------A----------C----------C-----------A----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------T-A-----T-AT---C---AT-G-T-CCC-------A---G------------------G----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---ATA--TATATGAT
gi|24091                      : tattactttggatgTATACA-TT-CAGAGTGACA--TT-G-A-C---T--T-----T--------T----C-G-A-A-AG-----T----------G-----------A----------C----------A-----------T----------C----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---T---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AA-A-TT-----TA------G-G-ACC---A-G--T-TATAAT
gi|24092                      :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-T---C--TACCTAT--------C----C-A-A-A-A------A----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------A----------A---TC------C-A--C-------A-A-T---T--T---T---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-GAT
gi|24093                      :               TATATG-TT-CTGAGTGAGC--TT-G-A-C---CT-T-----T--------T----T-A-A-G-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G-----------------------------------A-G-A---T-AC---CT--TT-G-T-CCA-------AA-AG------------------A----
gi|24094                      :               TATATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---T--T-----TTTAATTAAT----A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-G---T--T---T---CT-A-T-CCC-------AA-AG-----------------------AT-ATTT-----TG------T-G-ATC---C-A--T-
gi|24095                      :               TATATG-TT-CTGAGTGACA--TT-G-G-T---CA-T-----T--------C----C-A-A-C-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---T-CC---C---AT------CC-------AA-G-------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATT---A-A--T-TATGAT
gi|24096                      :               TATGTA-TA-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---CTTT-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------
gi|24097                      :               TAGATG-CT-TTGAGTGACT--TC-G-A-C---C--T-----T--------T------A-A-A-T------T----------G-----------A----------A----------T-----------T--------------------------------G---TC------CAA--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-GTT-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TG-----AG------T-A-A-C---A------TATGAT
gi|24098                      :               TAGATG-CT-TTGAGTGACT--TC-G-A-C---C--T-----T--------T------A-A-A-T------T----------G-----------A----------A----------T-----------T--------------------------------G---TC------CAA--A-------A-A-G---T-AC---C---CT-GTT-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TG-----AG------T-A-A-C---A------TATGAT
gi|24099                      :               TACATG-TT-TTG-GTGACC--TTTG-G-C---C--T-----T--------T----C-G-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-CG------------------A----AC-ATTT-----TG------T-G-
gi|24100                      :               TACATG-TT-TTG-GTGACC--TTTG-G-C---C--T-----T--------T----C-G-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TC-G-T-CTC-------AA-CG------------------A----AC-ATTT-----TG------T-G-
gi|24101                      :               TATGTG-TT-CAAAGTGACC--TTCA-A-C---T--T-----T--------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-TT---C---CT-G-T--CC-------AA-AG------------------A----GT-A-TT-----TG------T-G-A
gi|24102                      :               TATATA-TT-CTGAATGGCC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TCC--C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------A-----------T----------C----------GGTCCAATT--G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---C---CT-G-T-CCCA------AA-AA------------------A----AT-A-TCTATGATG------C-G-ATC---A-A--T-
gi|24103                      :               TATATG-CT-TTGAGTAGCC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-
gi|24104                      :               TATGTA-TT-TTAAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------CA---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------T----------G---AC------T-A--A-------A-A-G---T-A
gi|24105                      :               TATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TCTTCT-A-A-A-T------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---CCTTTGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-
gi|24106                      :               TATATG-TT-CTGAGTGACA--CT-G-A-GGGAC--T-----T--------C----C-C-G-A--------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--G-------A-A-G---T-CC---C---TT-G-T-CCC-------AG-GG------------------AGTATGT-A-TC-----TG------T-A-ATT---A-A--T-
gi|24107                      :               TATATG-TT-CTGAGTGAC----T-G-A-C---CA-T-----T--------T----A-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------TTGAGAGACCAT----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-AG------------------A----AC-A-T------------------ATC---G-A--T-
gi|24108                      :               TATATG-TT-CTCAATGACC--TT-G-G-T---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------CCTTGAAAGAAC-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---C--T---C---GT-G-T-ATC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-AT
gi|24109                      :                ACATG-TT-CTGAGTGACA--TT-G-G-C---C--T-----T--------TCC--A-A-A-A-A------T----------G-----------ATCTTAAAAG-C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-
gi|24110                      :                ATATG-GT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---CA-T-----T--------C----G-A-G-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------
gi|24111                      :                ATATG-TT-TTGAATGACC--TT-G-A-T---C--T-----TC-------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------CA---------T-----------T----------T----------A----------A---TT------C-G--C-------A-A-G------C---CA--TT-G-T-CTC-------GA-GG------------------A----AC-T-TT-----TC------T-G-GTagt
gi|24112                      :                ATATG-CT-CTGAATTACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------TC---T-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TCAAA------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---
gi|24113                      :                ATATG-TA-TTGAGTGACC--TT-G-T-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------T-----------G----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C-A--A-------A-A-------------------G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24114                      :                ATAAG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----TA-------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---CCTTGGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATA---A-A--T-
gi|24115                      :                ATATG-AT-CTGAATGACC--TT-G-A-G---C--T-----T--------T----C-C-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TGAAAGACTTGG----------G---TT------C-A--C-------A-A-G---C-A----C---TC-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-TGT
gi|24116                      :                ATACA-TT-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---A--T-----T--------T----C-C-A-A-A------T----------GGATCTCGAGTGA----------C----------C-----------T----------T----------T----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-CC---C---CT-G-T-CCA-------AA-GG------------------A----GT-A-TT-----TG------T-A-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24117                      :                ATATG-GT-CTGAATGACC--TT-A-A-A---C--T-----T--------TC---T-A-A-A-A------TGACCTTGAGAG-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-A---T--C---T---TT-G-T-CTC-------AA-GA------------------A----CC-A-TT-----TG------C-A-ATA---A-A--T-GAT
gi|24118                      :                 TATG-CT-TTTAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------C----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TA------C-A--C-------C-A-G---T-AC---CCCTGT-G-T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TGT-----T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24119                      :                 TATG-TTTCTGAG--ACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----C-C-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------GA--TT------T-A--ACTAT---A-A-T---T-ACATGT---AT-G-T-CCCCTGTCAAAA-GG------------------A----AT-A-TC-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24120                      :                 TATG-CT-TTGAGTGACCAGTT-G-G-A---C--C-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C----------------------T----------G----------A---CC------C-GTCA-------G-A-G---T-AG---C---A----T-TCC-------AA-GG------------------A----AT-A-T
gi|24121                      :                 TATG-TT-CTGAGTGACC--TT-G-G-C---C--TA----T--------C----C-A-A-A-T------T----------G-----------ACCTTGAAAGTC----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------T-A--A-------A-C-G---T--C---C---TT-G-C-ATC-------AT-GG------------------A----AC-A-TT-----TC------C-G-ATC---A-A--T-
gi|24122                      :                  ATG-TT-CTGAATGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TG------C-A--A-------A-A-G---C--C---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TC-----GG------T-G-CTT---A-A--T-TATGAT
gi|24123                      :                  ATG-CT--TGAGTGACC--T--G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G---------------------------------------G---T-AT---C---AT-G-T-CCC-------AA-TG------------------A----AA-A-TT-----TG------A-G-A
gi|24124                      :                  ATG-CT--TGA-TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-T-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT---T-CCC-------AA--G------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---CTA--T-TATGAT
gi|24125                      :                  ATG-CT--TGA-TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-T-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------A---TC------C----A-------A-A-G---T-AT---C---AT---T-CCC-------AA--G------------------A----AT-A-TT-----TG------A-G-ATC---CTA--T-TATGAT
gi|24126                      :                  ATG-CT-TTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----T-G-A-A-A-----------------------------A----------C----------CG----------T----------T----------G----------A---TG------C-A--G-------ACA-GATTT-AT---T---ATCG-T-CAG-------AA-GG------------------A----ATAA-TTA----TG------TGG-ATC---A-AG-T-TATGAT
gi|24127                      :                  ATG-TT-CTCAGTGATC--TT-G-T-T---C--C-----T--------T----C-ATA-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------A----------T----------C---TC------T-A--A-------A-C-G---T--C---C---AT-G-T-CCC-------AA-GGAATACCCCTGTCCAAAGTA----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-AAT
gi|24128                      :                                ATC--TT-----C---C--T-----T--------C----C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T--C---C---CT-G-T-CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TGA-----T-G-A
gi|24129                      :         tgcttataaatG-TT-CTGAGTGACC--TG-A-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------T-----------T----------T----------A----------A---TC------C-A--A-------G-A-G---T-AC---C---CT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TTTGAT
gi|24130                      :                       T-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---CT-T-----T--------T----T-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---CCTTGGATC-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-TG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-GTA---A-A--T-TGT
gi|24131                      :                       T-CTGAGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----A-A-A-ATACCT---T----------G-----------AAAG-------C----------C-----------T----------T----------G----------G---AT------C-A--C-------A-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-TG------------------AAC--AT-A-TT-----TGGTAAATT-GTATC---A-AATT-TATGAT
gi|24132                      :                       T-CTGAGTGACC--TT-G-T-C---C--T-----T--------T----C-A-A-A-AA-----T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------TACTCAAAT--G----------G---TT------T-A--A-------A-A-G---T-CT---C---TT-G-T-TTC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TT------T-G-ATC---A-A--T-TAT
gi|24133                      :                          TAAGTGACC--TT-G-A-G---C--T-----T--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------GAAA-------G---AC------C-A--GGGTTCTTA-A-G---C--C---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-
gi|24134                      :                          TGAGTGATC--TC-G-A-C---C--T-----T--------TC---C-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TT------T-A--C-------A-A-----C-CT---C---TT-G-T-CTC-------AA-GG------------------A----AC-A-TT-----TT------C-A-ATA---A-A--T-TGT
gi|24135                      :                          TGTGTGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----CCA-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------CA----------TGAGACACCA-T----------G----------G---TC------C-A--C-------A-A-G---T--C---C---TT-T-T-GTA-------AA-AG------------------A----AC-A-TT-----TG------T-G-ATC---G-A--T-TAT
gi|24136                      :                              TGACC--TT-G-A-C---C--T-----T--------T----G-A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------A-A--A-------A-A-G---T-GC---C---CA-G---CCC-------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT
gi|24137                      :                                             ---C--T-----T--------T--------A-A-G------T----------G-----------A----------C----------C-----------A----------T----------G----------G---TC------C-A--A-------A-A-G---T-AG---T---CT-G-T-CCC-------AA-AG------------------A----AT-A-CT-----TG------T-G-ATCTGTA-A--T-TACAAT
gi|24138                      :                                                                        -A-A-A-A------T----------G-----------A----------C----------C-----------T----------T----------G----------G---TC------C-T--C-------A-A-G---T-CT---C---CT-G-T-TC--------AA-GG------------------A----AT-A-TT-----TG------T-G-ATC---A-A--T-TATGAT