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lowQualScore                  :             .  ..  ...  ............ ..... . . ... . ... ..... . ..... . ... ... ............. . . ..  .  ... . ........... . .. . ... .. .. .. ..... ..  . . .. ...  .... . ... .. ................ .. ...    .... ..   .. .  .  .    
lowQualScore                  :             7  00  222  666666666666 22222 5 1 777 5 444 00000 5 11111 5 999 444 7777777777777 5 0 77  5  000 5 66666666666 4 99 5 666 11 11 88 22222 88  3 7 55 333  7777 7 444 88 7777777777777777 55 666    5555 55   88 3  3  0    
consensus                     :         AGAC-AG--AC---AG----N---A---A-----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
Reference ( gi|41244 )        :         AGAC-AG--AC---AG----T---A---A-----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41248                      :         AGAC-AG--AC---AG----G---A---A-----G-A-C---A-G---A-----A-A-----G-A---C---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41245                      :         AGAA-AG--AC---AG----A---T---A-----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-GC-TA-ACAA
gi|41247                      :         AGAC-AG--AC---AT----G---A---A-----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T----C----G-G---T--T---A-CAA--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41250                      :     agacAGAC-AG--AC---AT----G---A---A-----G-A-C---A-G---A-----CCA-----G-A---C---A--C----A-----A------GA-AG---G-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-AT
gi|41252                      :         AGAC-AG--AC---AG----G---A---A-----G-A-C---A-G---A-----C-G-----G-A---C---A--T----A-----C-ACA--AA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---ACGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41249                      :         AGAC-AG--AC---AAA---TG--A---A-----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--TC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C----------A--A---CCGG--C-A--GGG--G-AC-TA-AAAA
gi|41270                      :     agacAGAC-AG--AC---AT----G---A---A-----G-A-C---A-GG--A-----C-A-------A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--T-C---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ACAA
gi|41271                      :      gacAGAC-AG--AC---AG----G---A---A-----G-A-C---A-----------C-A-----G-A---C---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-T--------A--A---CCAG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41296                      :      gacAGAC-AG--AC---AG--------------------A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--C----A-----A-A----GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A---A--------C--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41251                      :         AGAC-AG--AC---AT----T---G---AAGACAG-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---A---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---ACC-A--------A--A---CCGG--T-A---GG--G-AC-TACATAA
gi|41259                      :         AGAC-AG--AG---AG----G---A---A-----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--A----C-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----TCCCC-C-C--C---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-
gi|41257                      :         AGAC-AG--AC---AGA---T---AG--A-----A-A-A---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC------G---T--T---A-C----------A--A---CCGG--G-A---GG--G-AC-TA-ATAA
gi|41256                      :     agacAGAC-AG--AC---AGA---T---AG--A-----A-A-A---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC------G---T--T---A-C----------A--A---CCGG--G-A---GG--G-AC-TA-ATAA
gi|41258                      :     agacAGAC-AG--AC---A-----T---A---A-----A-A-C---A-GCAGA-----C-A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AA---A-A-----------A-G--C-TA--A--T--A--GT----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A----CGG--T-A--GGG--G-ACTTA-ATA
gi|41253                      : agacagacAGAC-AG--AC---AG----A---C---A-----G-A-A---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T-----C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A---GA--G-AC--A-ATAA
gi|41246                      :         AGAC-AG--ACGAAAG----A---A---A-----G-A-C---A-G---ATAGACC-A-----G-A---C---AGCC----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--CCT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G--C-TA-
gi|41272                      :         AGAC-AG--AC---AT----G---A---A-----G-A-C---A-T---G-----C-------G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--T-T---A--T--A--G-----T--TC-C----T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC--A-ATAA
gi|41254                      :      gacAGAC-AG--AC---AG--------------------A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--C----A-----C-A-T--AA-GA---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--------T--CCGC-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41294                      :         AGACCAG--AC----G----T---A---------G-A-C---A-G---G-----C-A-----A-A---G---G-------A-----A-G-A--AA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-T---T--T---A-C-A--------A--A---CTGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41261                      :    caggaAGAC-AG--AC---AG----A---ATT-A-----G---C---A-GG--A-----C-AC----G-A---C---A--C----A-----A-A----GA-AG---A-A-----------A-GCCC-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-G--------A--AACGCGGG--TAA--GGG--G-AC-TA-
gi|41263                      :     agacAGAC-AG--GC---AT----G---A---A-----G-A-----A-G---A-----C-------G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-A--C-----A--T--A--A-----C--AC-C-C--T---C-----G-G---T------A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGC--G-AC-TA-ATAA
gi|41281                      :     aaacAGAC-AG--AC---AG----A---A---T-----G-A-----A-G---A-----C-AT----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------AAG--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---AC----G-G---T--T---A-
gi|41273                      :      gacAGAC-AG--AC---AT----G---A---A-----G-A-C---A-T---G-----C-A-----C-G---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG-----A-----------A-G--T-T---A--T--A--G-----T---T-C-C--T---CC----G--------T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A---GG--G-AC--A-ATAA
gi|41265                      :      gacAGAC-AG--AC----G----T---G---AAGCA-G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--A----C-----A-A-A--GA-AG-----A-----------A-G--C-T---A--TA-A--G-----TA-TC-C-A--A---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A----CGG--T-A---GG--G-AC-TA-
gi|41264                      :         AGAC-AG--GT---AGA---T---C---A-----G-AGC---A-G---------C-A-----G-A---A---A--G----A-----A-G-A--CA-AG---G-ATTTTTTTTTTTG-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC------T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41276                      :         AGAC-AG--AC---AG----G---A---A-----G-A-CTAGA-G---A-----C-A---------------A--C----A-----A-A-A--GA-A----A-A-----------A-GTAC-T---A-----A--G-----T---C-C-C--T---CC----G-G---T--T---A---A--------A--A---C--G--T-A--GGA--G-A--TA-AAAA
gi|41267                      :      gacAGAC-AG--AC---------T---G---ACT---G-A-G---G-G---A-----C-A-----G-A---C-----------------A-A-A--AA-CG---A-A-----------A-C--C-T---A--T--A--C-----T--CC-C-C--T---TC----A-A---T--T-----C-T--------A--A---CAGG--T-A--GGC--G-AC-TA-ACAA
gi|41268                      :          GAC-AG--AC---AT----G---A---A-----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GTG--G-AC-TG-ATAA
gi|41297                      :          GAC-AG--AC---A-----T---G---A-------------A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41298                      :          GAC-AG--AC---AG--------------------A-C-----G---A-----C-A-----G-A---C---A--T----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-
gi|41300                      :          GAC-AG--AC---AG--------------------A-C---A-G---A-----C-A-----G-A-------G--C----G-----A-C-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41260                      :          GAA-AG--AC---AT----G---A---A-----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--CCAA-ATT---A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CC-G--T-A--TGG--G-AC-TA-
gi|41299                      :    agacagGAC-AA--AC---AG--------------------A-C---A-G---A-----C-A-----G-G---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-GT--T--T---A-C-A--------A--A---CC----T-T--AGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41269                      :          GAC-AG--AC---A-------------A-----G-A-C---A-G---AAA---C-A-----G-A---C---A--TT---A-----A-A-A--GA-AGG--A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A-------CGG--T-AGGGGG--G-AC-TA-ACA
gi|41274                      :          GAC-AG--AC---AA----C---ATGAA-----G-A-C---A-A---A-----C-AAAACAG-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------AAG--C-TT--A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-----T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--A-TC-TA-ACAA
gi|41275                      :          GAC-AG--AC---TA----C---A---T-----G-A-A---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-TA--A--T--A--G-----T---C-C-C--T---C-------G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A---GG--G-AC-TA-AAAA
gi|41277                      :          GAC-AG--A-----A----T---A---A-----GGA-C---A-G---A-----C-G-----G-A---CTG-A--C----A-----A-A--------G---A-A-----------A-G--C-T---A--TCTA--G-----T--CC-C-T--T---CC----A-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGT--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41278                      :          GAC-AG--AC---AGAA--TG--A---A-----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---G---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G----T---A--T--G--------------C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-C--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41279                      :          GAC-AG--AC---AT----CGAAA---A-----G-AAC---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-A-------------G--C-T---AA-T--AA-G-----T--CC-C-C--T---CC----G-T---T--T---A-C-ATACCTACAA--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41280                      :          GAC-AG--A-----A----T---G---G-----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---CCAGA--C----AC----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T---C-C-C--T---CC----GCG---T--T---A-C-A--------A--A---C--G--T-A----G--G-AC-TA-
gi|41262                      :          GAC-AG--AC---AGAACATG--A---A-----G-A-----A-GC--A-----C-A-----G-A---C---A--C----------A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-TATAA--T--A--G-----T--AC-C-C--T---CC----G-T---T--T-----C-------------A---CCGG--T-A--GGG--A----TA-ATAA
gi|41284                      :    agacagGAC-AG--A-----G----T-------------G-A-T---A-G---A-----C-ATA---G-A---C---A--C----A-----C-A----GA-GG---G-A-----------A-G--C-T---A--T--T--G-----T--TC-T-C--T---CC----G-G---T--TGTTA-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGA--C-AA-TA-ATAA
gi|41283                      :          GAC-AG--AC---AGA---T---G---A-------A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---CGG-A--C----G-----G-A-A--GG-AGTGCA-A-----------A-C--C-T---A--A--A--G-----T--CT-T-C--T---TC----G-A---T--T---T-C-G---------------TCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41282                      :          GAC-AG--AC---AG----A---C---A-----G-A-C---ATG---A-------A-----G-AATGC---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-TG--A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---AC----G---------------------------------CGGT-T-A--GGG--G-AC-AA-ATA
gi|41286                      :          GAC-GG--AC---AG----A---C---A-----G-A-C---G-G---A-----C-G-----G-A---C---A---------------G-A--GT-GC---A-A-----------A-C--C-T---A--A--A--G-----T--CC-C-C--T---TC----G-A---C--T---T-C-G---------------TCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41285                      :          GAC-AG--AC---AG----A---C---G-----G-A-C---G-G---A-----C-G-----G-A---C---A---------------G-A--GT-GC---A-A-----------A-C--C-T---A--A--A--G-----T--CC-C-C--T---TC----G-A---C--T---T-C-G---------------TCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41287                      :          GAC-AG--AC---TG----A---C---A-----A-A-C---A-G---A-----G-G-----G-A---C---G--G----G-----A-A-ATGGA-GG---A-A-----------A-AACC-T---A--T--A--G-----T--CC-CAC--C---TC----G-G---T--TTT-A-C-A--------T--A---CCGG--T-A--GAG--C-AC-TG-ATGA
gi|41288                      :          GAC-TG--AC---GG----A---C---A-----G-A-C---A-G---A-----C-G-----G-A---C------------------------GG-AGTGCA-A-----------A-C--C-T---A--A--A--G-----T--CC-C-C--T---TC----G-A---C--T---T-C-G---------------TCGG--T-A--TGG--G-AC-TA-ATA
gi|41289                      :          GAC-TG--AC---AG----A---C---G-----G-A-C---G-G---A-----C-A-----G-A---C---A---------------G-A--GT-GC---A-A-----------A-C--C-T---A--A--A--G-----T--CA-C-C--T---TC----G-A---C--T---T-C-G--------A--G-----GG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41290                      :          GAC-AG--AC---GG----A---C---G-----G-A-C---G-G---A-----C-G-----G-A---C------------------------GG-AGTGCA-A-----------A-C--C-T---A--A--A--G-----T--TC-C-C--T---TT----G-A---C--T---T-C-G---------------TCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41291                      :           AC-AG--GC---AG----A---C---A-----G-A-C---G-G---A-----C-A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-T---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GTG--G-AC-TA-ATAA
gi|41302                      :           AC-AA--AC---AG------------------A-A-C---A-G---A-----C-A-----G-G---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------G-C--C-T---A--T--A--G-----T--CC-CTC--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41292                      :           AC-AG--AC---AG----A---A---C-----A-A-C---G-G---A-----C-A-----G-A---CA--A--C----A-----A-A-A--GA-AG-----A-----------A-G--C-T---AC-T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-GTAAT--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATGA
gi|41293                      :           AC-AGGAAC---AG--------A---A-----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---A---AA-T----G-----A-A-A--GA-AA---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----C--CC-C-C------------G-G---TA-T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ACAA
gi|41295                      :            C-AG--AC---GG----G---C---A-----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---C---T--C--------------A--GA-AA---A-A-----------A-C--A-T---A--T--C--G-----T--CC-C-T--T---TT----G-G---TTGT---A-C-A--------A--C---CCGA--T-A--AGT--G-AC-TA-ACAA
gi|41255                      :             -AG--AC---AT----G---A---A-----G-A-C---A-G---A-----C-ATACA-G-A---C---A--C----A-----A-A-G-----AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---C-----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41266                      :             -AG--GC---AG----A---G---G-----G-A-C---T-G---A-----C-A-----G-A---C---A--T----A-----CTC-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----------A-C--T---CC----A-G---T--TTT-A-C-A--------A--A---CCGG--T-T--GGG--G-AC-CA-ATAA
gi|41304                      :                                  ---A-----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--G----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41305                      :                               gac---A-----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-T
gi|41306                      :                               gac---A-----G-A-C---A-G---A-----C-A-----C-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--G--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41314                      :                               gac---A-----G-A-T---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--G----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--C---CT----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CGGG--T-A--GGG--G-AC-TA-
gi|41316                      :                                ac---A-----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---ATCT--A--G-----T---C-C-C--T---TC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---ACGG--G-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41303                      :                                  ---A-----G-A-C---A-G---------C-A-----G-A---C---A--C----A-----A------GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--A--A--G-----T--TC-C----T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41315                      :                             agagc---A-----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------AGG--C-T---G--T--A--G-----T---C-C-C--T---CC------G---T--T---A-C----------A--T---CCGG--T-A--GGG--GAAC-TA-
gi|41317                      :                                ac---A-----G-A-CTG-A-G---A-----C-A-----G-G---C---A--------------------GA-GA---A-A-----------A-G--C-T---A--T--ATAG-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--TTT-A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-CA-ATGA
gi|41318                      :                                      -----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41319                      :                                      -----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--G----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---T--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-A-A--------A--A---CCGG--A-A--GGA--G-AC-TA-ATAA
gi|41307                      :                                      -----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---CTG-A--C----A-----A-A----GA-AT---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---C-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-AA-ATAA
gi|41308                      :                                      -----G-A-C---A-G---A-----C-G-----G-A---CTG-A--C----A-----A-A----GA-AG---T-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-T--C---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-AT
gi|41309                      :                                      -----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---G---A--C----A-----C-ACA--GA-GG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----C--CC-C-C--T---CC----G-GTT-T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--A-AC-TA-ATAA
gi|41310                      :                                      -----G-A-C---A-G---A-----C-G-----G-A---CTG-A--C----A-----A-A--------G---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-T--C---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CTGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41311                      :                                      -----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---TGT-A--C----ACTGACA-A-C--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----C--CC-C-C--T---CC----G-G---A--T---A-C-A--------A--A---CCAG--T-A--GGG--G-GC-TA-ATAA
gi|41312                      :                                      -----G-A-C---A-G---A-----C-A-----G-A---C---A--------------------GACAG---A-A----------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--C---CCCCCCG-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-
gi|41301                      :                                      -----G-A-C---A-A---A-----C-A-----G-A---A---A--C----A-----C-A----GA-TG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--AC-A----T---CC----G-G---T--TTT-A-C-A--------A--A---CCTG--T-A--GGG--G-AC-TT-ATAA
gi|41320                      :                                      gatagagt-C---A-G---A-----C-A-----G-A---A---A--CTAGCA-----A-A-A--GA-AG---A-A-------------G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-CCTC---CC----G-G---T--T---A-C----------A--A---CCGGCCT-A--GGG--G-AC-TA-
gi|41321                      :                                                    -G---A-----C-A-----G-A---C---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-T-C------CT----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41322                      :                                                    -G---A-----T-A-----G-A---C---AG-C----A-----A-A-T--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C----T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--TGG--G-
gi|41323                      :                                                    -G---A-----C-A-----GGA---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---AGA-----------A-G--C-----A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C----------A--A---CC-G--T-A--GGGCCG-AA-TA-
gi|41313                      :                                                    -G---A-----C-A-----G-A---C---A--C----AT----G-C-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-G---A--T--T--G-----T--TC-C-C--T---TC----G-A---T--TT--A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--CAG--G-AC-TA-AT
gi|41324                      :                                                                gatagaat-A---C---A--T----A-----A-A-A--GA-AG---A-ATTTCAA-----A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-CTAA
gi|41325                      :                                                                          ---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-AT
gi|41326                      :                                                                                     ----A-----A-A-A--GC-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-A--------CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A----CGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41327                      :                                                                                                  -A--GA-AG---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--TACATTT--CC-C-C--T---GC----G-G---T--TTC-A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ACAA
gi|41328                      :                                                                                                          G---A-A-----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---C
gi|41329                      :                                                                                                                 -----------A-G--C-T---A--T--A--G-----T--CG-C-C--T---CC----A-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GTG--G-AC-TA-AT
gi|41268                      :                                                                                                                                  -T---A--TC-A--G-----T--CC-A-C--TA--CC----G-G---T--T---T-G-T--------A--A---CCGG----A--GGG--G-AC-TA-
gi|41251                      :                                                                                          gacagacatgaagacagacagacacaaaagaagaaagcta-T---G--T--A--G-----T--CC-C-T--A---CC----G-G---T--T---T-G-GT-------A--A---CCGG----A--GGG--G-AC-TA-a
gi|41248                      :                                                                                          agacagacattgaagacagacagacagaaacaaaagaagaaagcta--T--A--G-----T--CC-C-C--TA--CC----G-G---T--T---T-G-T--------A--A---CCGG----A--GGG--G-AC-TA-taa
gi|41318                      :                                                                                               agacagacaggaagacagaaagacagcaaagaagaaagcta--T--A--G-----T--CC-C-C--TA--CC----G-G---T--T---T-G-T--------A--A---CCGG----A--GGG--G-AC-TA-ataa
gi|41245                      :                                                                                                            gacagacagacacaaaagaagaaagcta--T--A--G-----C--CC-C-C--TA--CC----G-G---T--T---T-G-T--------A--A---CCGG----A--GGG--G-AC-TA-ataa
gi|41247                      :                                                                                               agaaagacagatagacagacagacacaaaagaagaaagcta--T--A--G-----T--CC-C-C--TA--CC----G-G---T--T---T-T-GT-------A--A---CCG-----A--GGG--G-AC-TA-acaa
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gi|41249                      :                                                                                              agacagacaggaagacagacggacatacacaaaagaaagcta--T--A--G-----T--CC-C-C--TG--CC----G-G---T--T---G-T----------A--A---CCGG----A--GGG--A-AC-TA-ataa
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gi|41270                      :                                                                                                     gacagacagacgacagacataaaagaagaaagcta--T--A--G-----T--CC-C-C--TA--CC----G-G---T--T---T-G-T--------A--A---CCGG----A--GGG--G-AC-TA-a
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gi|41302                      :                                                                                                     gacagacagacagacagagcgacagaagaaagcta--T--A--G-----T--CC-C-C--TA--CC----G-G---T--T---T-G-T--------A--A---CCGG--A-G--AGG--G-AC-TA-ataa
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gi|41257                      :                                                                                                                      cacaaaagaagaaagcta--T--A--G-----T--CC-C-T--C---CC----G-G---T--T---G-T-A--------A-------CGG----A--GGG--G-AC-TA-at
gi|41256                      :                                                                                         agacagacagacagatagaaaaagacagacacaaaagaagaaagcta--T--A--G-----T--CC-C-T--C---CC----G-G---T--T---G-T-A--------A-------CGG----A--GGG--G-AC-TA-ataa
gi|41255                      :                                                                                         agacagacagacagatagaaaaagacagacacaaaagaagaaagcta--T--A--G-----T--CC-C-C--TA--CC----G-G---T--T---T-G-T--------A--A---CCG-----A--GGG--G-AC-TA-ataa
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gi|41316                      :                                                                                                   acagacagaacaacggacagacaacaaaagaagaagc--T--A--G-----T--CC-C-C--T---CC----C-G---T--T---T-T-GT-------A--A---CCG-----A--AGG--G-AC-TAGATAatga
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gi|41309                      :                                                                                                           gacagacggactgacaaagaagtaagcta--T--A--G-----T--TC-C-C--TA--CC----G-G---T--TTGTA---A--------A--A---CCGG----A--GGG--G-GC-TA-at
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gi|41320                      :                                                                                                                agactgagacaggcagagaaaagc--T--A--G-----T--CC-C-C--TAGGCC----G-G---T--T---G-T-A--------A------CCGG--G-A--GGGG-G-AC-TA-atga
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gi|41330                      :                                                                                                                                gacagacagactgacaaagaataaagcta-C--T---CC----G-G---T--T---A-C-A--------A--A---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATaaataa





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Reference ( family-285 )      :          AGACAG--A-C---A---GN--A---AG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41244                      :          AGACAG--A-C---A---GT--A---AG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41245                      :          AGAAAG--A-C---A---GA--T---AG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-GC-TA-ACAA
gi|41246                      :          AGACAG--A-CGAAA---GA--A---AG--A-C--A-G-ATAGACC--A-----G-A---C---AGCC----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CCT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G--C-TA-
gi|41247                      :          AGACAG--A-C---A---TG--A---AG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T-C----G-G---T--T---A-CAA--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41248                      :      agacAGACAG--A-C---A---GG--A---AG--A-C--A-G-A-----A--A-----G-A---C---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41249                      :          AGACAG--A-C---A---AATGA---AG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--TC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C----------AA---CCGG--C-A--GGG--G-AC-TA-AAAA
gi|41250                      :      agacAGACAG--A-C---A---TG--A---AG--A-C--A-G-A-----CC-A-----G-A---C---A--C----A-----A------GA-AG---G-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-AT
gi|41251                      :          AGACAG--A-C---ATT-GA--AGACAG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---A---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---ACC-A--------AA---CCGG--T-A---GG--G-AC-TACATAA
gi|41252                      :          AGACAG--A-C---A---GG--A---AG--A-C--A-G-A-----C--G-----G-A---C---A--T----A-----C-ACA--AA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---ACGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41253                      :          AGACAG--A-C---A---GA--C---AG--A-A--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T-----C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A---GA--G-AC--A-ATAA
gi|41254                      :              AG--A-C---A---GA--C---AG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----C-A-T--AA-GA---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--------T--CCGC-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41255                      :              AG--A-C---A---TG--A---AG--A-C--A-G-A-----C--ATACA-G-A---C---A--C----A-----A-A-G-----AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TC-----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41256                      :          AGACAG--A-T---A---GA--A---AA--A------G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC------G---T--T---A-C----------AA---CCGG--G-A---GG--G-AC-TA-ATAA
gi|41257                      :  agacagacAGACAG--A-T---A---GA--A---AA--A------G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC------G---T--T---A-C----------AA---CCGG--G-A---GG--G-AC-TA-ATAA
gi|41258                      :  agacagacAGACAG--A-C---A---TA--A---AACAG-C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AA---A-----A------A-G---------------C-TA--A--T--A--GT----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA----CGG--T-A--GGG--G-ACTTA-ATA
gi|41259                      :  agacagacAGACAG--A-G---A---GG--A---AG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--A----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----TCCCC-C-C--CCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-
gi|41260                      :           GAAAG--A-C---A---TG--A---AG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--CCAA-ATT---A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CC-G--T-A--TGG--G-AC-TA-A
gi|41261                      :    agacagAGACAG--A-C---A---GA--ATT-AG----C--A-GGA-----C--AC----G-A---C---A--C----A-----A-A----GA-AG---A-----A------A-GCC-------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-G--------AAACGCGGG--TAA--GGG--G-AC-TA-
gi|41262                      :      agacAGACAG--AAC---A---TG--A---AG--A----A-GCA-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A----GA-AG---A-----A------A-G---------------C-TATAA--T--A--G-----T--AC-C-C--TCC----G-T---T--T-----C-----------A---CCGG--T-A--GGG--A----TA-ATAA
gi|41263                      : agacaggacAGACAG--G-C---A---TG--A---AG--A----A-G-A-----C--------G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-A---------------C-----A--T--A--A-----C--AC-C-C--TC-----G-G---T------A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGC--G-AC-TA-ATAA
gi|41264                      :          aaacAG--A-C---A---GG--T---AG--ATC--A-G-AG----C--A-----G-----C---A-------G-----A-A-A--GA-AG---AC----A------A-GGATTTTTTTTTTTGGC-T---A--T--A--G-----T--CC------TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41265                      :          AGACAG--A-C---GT--GA--AGC-AG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--A----C-----A-A-A--GA-AG---------A------A-G---------------C-T---A--TA-A--G-----TA-TC-C-A--ACC----G-G---T--T---A-C-A--------AA----CGG--T-A---GG--G-AC-TA-
gi|41266                      :              AG--G-C---A---GA--G---GG--A-C--T-G-A-----C--A-----G-A---C---A--T----A-----CTC-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----------A-C--TCC----A-G---T--TTT-A-C-A--------AA---CCGG--T-T--GGG--G-AC-CA-ATAA
gi|41267                      :          AGACAG--A-C---T---GA--C---TG--A-G--G-G-A-----C--A-----G-A---C-----------------A-A-A--AA-CG---A-----A------A-C---------------C-T---A--T--A--C-----T--CC-C-C--TTC----A-A---T--T-----C-T--------AA---CAGG--T-A--GGC--G-AC-TA-ACAA
gi|41268                      :           GACAG--A-C---A---TG--A---AG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GTG--G-AC-TG-ATAA
gi|41269                      :           GACAG--A-C---A-----------AG--A-C--A-G-AAA---C--A-----G-A---C---A--TT---A-----A-A-A--GA-AGG--A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------A-----CGG--T-AGGGGG--G-AC-TA-ACA
gi|41270                      :          AGACAG--A-C---A---TG--A---AG--A-C--A-GGA-----C--A-------A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------T-C---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ACAA
gi|41271                      :       gacAGACAG--A-C---A---GG--A---AG--A-C--A---------C--A-----G-A---C---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-T--------AA---CCAG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41272                      :       gacAGACAG--A-C---A---TG--A---AG--A-C--A-T-G-----C--------G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------T-T---A--T--A--G-----T--TC-C----TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC--A-ATAA
gi|41273                      :       gacAGACAG--A-C---A---TG--A---AG--A-C--A-T-G-----C--A-----C-G---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---------A------A-G---------------T-T---A--T--A--G-----T---T-C-C--TCC----G--------T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A---GG--G-AC--A-ATAA
gi|41274                      :       gacAGACA---A-C---A---TG--A---AG--A-C--A-A-A-----C--AAAACAG-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------AAG---------------C-TT--A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-----T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--A-TC-TA-ACAA
gi|41275                      :        gacGACAG--A-C---T---AC--A---TG--A-A--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-TA--A--T--A--G-----T---C-C-C--TC-------G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A---GG--G-AC-TA-AAAA
gi|41276                      :          AGACAG--A-C---A---GG--A---AG--A-CT-A-G----------A-----G-A---CA--A--C----A-----A-A-A--GA-A----A-----A------A-GTA-------------C-T---A-----A--G-----T---C-C-C--TCC----G-G---T--T---A---A--------AA---C--G--T-A--GGA--G-A--TA-AAAA
gi|41277                      :        gacGACAG--A-----A---TA--A---GG--A-C--A-G-A-----C--G-----G-A---CTG-A--C----A-----A-A--------G---A-----A------A-G---------------C-T---A--TCTA--G-----T--CC-C-T--TCC----A-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGT--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41278                      :           GACAG--A-C---A---GA--ATGAAG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---G---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G-----------------T---A--T--G--------------C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-C--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41279                      :           GACAG--A-C---ATCGAA--A---AG--AAC--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A--------G---------------C-T---AA-T--AA-G-----T--CC-C-C--TCC----G-T---T--T---A-C-ATACCTACAAA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41280                      :               G--A-C---A---GA--ATG-GG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---CCAGA--C----AC----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T---C-C-C--TCC----GCG---T--T---A-C-A--------AA---C--G--T-A----G--G-AC-TA-
gi|41281                      :          AGACAG--A-C---A---GA--A---TG--A----A-G-A-----C--AT----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------AAG---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TAC----G-G---T--T---A-
gi|41282                      :        gacGACAG--A-C---A---GA--C---AG--A-C--ATG-A--------A-----G-AATGC---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-TG--A--T--A--G-----T--CC-C-C--TAC----G-------------------------------CGGT-T-A--GGG--G-AC-AA-ATA
gi|41283                      :           GACAG--A-C---A---GA--T---GA--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---CGG-A--C----G-----G-A-A--GG-AGTGCA-----A------A-C---------------C-T---A--A--A--G-----T--CT-T-C--TTC----G-A---T--T---T-C-G-------------TCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41284                      :               G--A-C---A---GA--G---TG--A-T--A-G-A-----C--ATA---G-A---C---A--C----A-----C-A----GA-GG---G-----A------A-G---------------C-T---A--T--T--G-----T--TC-T-C--TCC----G-G---T--TGTTA-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGA--C-AA-TA-ATAA
gi|41285                      :           GACAG--A-C---A---GA--C---GG--A-C--G-G-A-----C--G-----G-A---C---A---------------G-A--GT-GC---A-----A------A-C---------------C-T---A--A--A--G-----T--CC-C-C--TTC----G-A---C--T---T-C-G-------------TCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41286                      :           GACGG--A-C---A---GA--C---AG--A-C--G-G-A-----C--G-----G-A---C---A---------------G-A--GT-GC---A-----A------A-C---------------C-T---A--A--A--G-----T--CC-C-C--TTC----G-A---C--T---T-C-G-------------TCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41287                      :           GACAG--A-C---T---GA--C---AA--A-C--A-G-A-----G--G-----G-A---C---G--G----G-----A-A-ATGGA-GG---A-----A------A-AAC-------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-CAC--CTC----G-G---T--TTT-A-C-A--------TA---CCGG--T-A--GAG--C-AC-TG-ATGA
gi|41288                      :           GACTG--A-C---G---GA--C---AG--A-C--A-G-A-----C--G-----G-A---C------------------------GG-AGTGCA-----A------A-C---------------C-T---A--A--A--G-----T--CC-C-C--TTC----G-A---C--T---T-C-G-------------TCGG--T-A--TGG--G-AC-TA-ATA
gi|41289                      :           GACTG--A-C---A---GA--C---GG--A-C--G-G-A-----C--A-----G-A---C---A---------------G-A--GT-GC---A-----A------A-C---------------C-T---A--A--A--G-----T--CA-C-C--TTC----G-A---C--T---T-C-G--------AG-----GG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41290                      :           GACAG--A-C---G---GA--C---GG--A-C--G-G-A-----C--G-----G-A---C------------------------GG-AGTGCA-----A------A-C---------------C-T---A--A--A--G-----T--TC-C-C--TTT----G-A---C--T---T-C-G-------------TCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41291                      :            ACAG--G-C---A---GA--C---AG--A-C--G-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-T---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GTG--G-AC-TA-ATAA
gi|41292                      :            ACAG--A-C---A---GA--A---CA--A-C--G-G-A-----C--A-----G-A---CA--A--C----A-----A-A-A--GA-AG---------A------A-G---------------C-T---AC-T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-GTAAT--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATGA
gi|41293                      :            ACAGGAA-C---A---G---A---AG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---A---AA-T----G-----A-A-A--GA-AA---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----C--CC-C-C---------G-G---TA-T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ACAA
gi|41294                      :                   -C---A---GG--A---AG--A-CC-A-G-A-----CGTA-----G-A---C---AGGC----A-----A-A-G--GA-AG---AAAAGAA------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-T---T--T---A-C-A--------AA---CTGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41295                      :             CAG--A-C---G---GG--C---AG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---T--C--------------A--GA-AA---A-----A------A-C---------------A-T---A--T--C--G-----T--CC-C-T--TTT----G-G---TTGT---A-C-A--------AC---CCGA--T-A--AGT--G-AC-TA-ACAA
gi|41296                      :              AG--A-C---A---GA--C---AG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A----GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A---A--------CA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41297                      :           GACAG--A-C---A---TG--A---AG--A-C---------------A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41298                      :               G--A-C---A---GA--C---AG--A-C----G-A-----C--A-----G-A---C---A--T----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-A
gi|41299                      :               G--A-C---A---AA--C---AG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-G---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-GT--T--T---A-C-A--------AA---CC----T-T--AGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41300                      :               G--A-C---A---GA--C---AG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A-------G--C----G-----A-C-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41301                      :               G--A-T---A---GA--G---TG--A-C--A-A-A-----C--A-----G-A---A---A--C----A-----C-A----GA-TG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--AC-A----TCC----G-G---T--TTT-A-C-A--------AA---CCTG--T-A--GGG--G-AC-TT-ATAA
gi|41302                      :            ACAA--A-C---A---GA--A---------C--A-G-A-----C--A-----G-G---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------G-C---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-CTC--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41303                      :                                 ---AG--A-C--A-G-------C--A-----G-A---C---A--C----A-----A------GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--A--A--G-----T--TC-C----TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41304                      :                            agagc---AG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--G----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41305                      :                              gac---AG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-T
gi|41306                      :                              gac---AG--A-C--A-G-A-----C--A-----C-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--G--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41307                      :                                  gacG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---CTG-A--C----A-----A-A----GA-AT---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---C-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-AA-ATAA
gi|41308                      :                                     G--A-C--A-G-A-----C--G-----G-A---CTG-A--C----A-----A-A----GA-AG---T-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-T--CCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-AT
gi|41309                      :                                     G--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---G---A--C----A-----C-ACA--GA-GG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----C--CC-C-C--TCC----G-GTT-T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--A-AC-TA-ATAA
gi|41310                      :                                     G--A-C--A-G-A-----C--G-----G-A---CTG-A--C----A-----A-A--------G---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-T--CCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CTGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41311                      :                                     G--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---TGT-A--C----ACTGACA-A-C--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----C--CC-C-C--TCC----G-G---A--T---A-C-A--------AA---CCAG--T-A--GGG--G-GC-TA-ATAA
gi|41312                      :                                     G--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--------------------GACAG---A-----A------------------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--CCCCCCCG-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-A
gi|41313                      :               G--A-T---A---GA--A---TG--A-C--A-G-A-----C--A-----C-A---T---G--C----A------------GA-AG---A-----A------A-G---------------C-G---A--T--T--G-----T--TC-C-C--TTC----G-A---T--TT--A-C-A--------AA---CCGG--T-A--CAG--G-AC-TA-AT
gi|41314                      :                                 ---AG--A-T--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--G----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--CCT----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CGGG--T-A--GGG--G-AC-TA-A
gi|41315                      :                               ac---AG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------AGG---------------C-T---G--T--A--G-----T---C-C-C--TCC------G---T--T---A-C----------AT---CCGG--T-A--GGG--GAAC-TA-A
gi|41316                      :                               ac---AG--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---ATCT--A--G-----T---C-C-C--TTC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---ACGG--G-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41317                      :                                 ---AG--A-CTGA-G-A-----C--A-----G-G---C---A--------------------GA-GA---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--ATAG-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--TTT-A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-CA-ATGA
gi|41318                      :                                     G--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41319                      :                                     G--A-C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--G----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---T--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-A-A--------AA---CCGG--A-A--GGA--G-AC-TA-ATAA
gi|41320                      :                                         -C--A-G-A-----C--A-----G-A---A---A--CTAGCA-----A-A-A--GA-AG---A-----A--------G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-CCTCCC----G-G---T--T---A-C----------AA---CCGGCCT-A--GGG--G-AC-TA-A
gi|41321                      :                                              -G-A-----C--A-----G-A---C---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-T-C---CT----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41322                      :                                              -G-A-----T--A-----G-A---C---AG-C----A-----A-A-T--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C----TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--TGG--G-
gi|41323                      :                                              -G-A-----C--A-----GGA---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---AG----A------A-G---------------C-----A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C----------AA---CC-G--T-A--GGGCCG-AA-TA-A
gi|41324                      :                                                                 -A---C---A--T----A-----A-A-A--GA-AG---A-----ATTTCAAA-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-CTAA
gi|41325                      :                                                                   ---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-AT
gi|41326                      :                                                                              ----A-----A-A-A--GC-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-A-----CC----G-G---T--T---A-C-A--------AA----CGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41327                      :                                                                                           -A--GA-AG---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--TACATTT--CC-C-C--TGC----G-G---T--TTC-A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ACAA
gi|41328                      :                                                                                                   G---A-----A------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---C
gi|41329                      :                                                                                                              ------A-G---------------C-T---A--T--A--G-----T--CG-C-C--TCC----A-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GTG--G-AC-TA-AT
gi|41330                      :                                                                                                                                                                  -C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-AT





Alignments
lowQualScore                  :              0 00  111 333  77777777  00 22222 11 1 1 22222 11 22222 0 000 555 3333333 22222 0 1 00  0  222 22222 111111 1 555555555555555  222 11 11 11 11111 11  0 0 00   1111 0 222 11 333 0 0 11111111  000    11 0 00   00 0  0  0    
lowQualScore                  :              . ..  ... ...  ........  .. ..... .. . . ..... .. ..... . ... ... ....... ..... . . ..  .  ... ..... ...... . ...............  ... .. .. .. ..... ..  . . ..   .... . ... .. ... . . ........  ...    .. . ..   .. .  .  .    
lowQualScore                  :              7 99  222 333  66666666  77 33333 88 0 0 44444 22 99999 5 999 999 5555555 33333 5 0 77  5  999 11111 333333 4 333333333333333  777 66 11 11 66666 11  5 9 66   0000 5 555 11 888 5 5 77777777  888    11 5 66   66 5  5  5    
consensus                     :         AGACA-G--AC---A---GA--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
Reference ( family-285 )      :         AGACA-G--AC---A---GA--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41244                      :         AGACA-G--AC---A---GT--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41245                      :         AGAAA-G--AC---A---GA--T-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-GC-TA-ACAA
gi|41246                      :         AGACA-G--ACGAAA---GA--A-----AG--A-----C--A-G-ATAGACC--A-----G-A---C---AGCC----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-GC--------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G--C-TA-
gi|41247                      :         AGACA-G--AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T-C----G-G---T--T---A-CAA--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41248                      :     agacAGACA-G--AC---A---GG--A-----AG--A-----C--A-G-A-----A--A-----G-A---C---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41249                      :         AGACA-G--AC---A---AATGA-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--TC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C----------AA---CCGG--C-A--GGG--G-AC-TA-AAAA
gi|41250                      :     agacAGACA-G--AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-G-A-----CC-A-----G-A---C---A--C----A-----A------GA-AG---G-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-AT
gi|41251                      :         AGACA-G--AC---ATT-GA--AGAC--AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---A---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---ACC-A--------AA---CCGG--T-A---GG--G-AC-TACATAA
gi|41252                      :         AGACA-G--AC---A---GG--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--G-----G-A---C---A--T----A-----C-ACA--AA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---ACGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41253                      :         AGACA-G--AC---A---GA--C-----AG--A-----A--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T-----C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A---GA--G-AC--A-ATAA
gi|41254                      :         AGACA-G--AC---A---GA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C----------A---C---A--C----A-----T-A-A--GA------A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--------T--CCGC-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41255                      :         AGACATG--A----A---GA--C-----AG--A-----C--A-T-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-G-----AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TC-----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41256                      :         AGACA-G--AT---A---GA--A-----AA--A----------G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC------G---T--T---A-C----------AA---CCGG--G-A---GG--G-AC-TA-ATAA
gi|41257                      : agacagacAGACA-G--AT---A---GA--A-----AA--A----------G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC------G---T--T---A-C----------AA---CCGG--G-A---GG--G-AC-TA-ATAA
gi|41258                      : agacagacAGACA-G--AC---A---TA--A-----AACAG-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AA---A-----A------A-G---------------CTA--A--T--A--GT----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA----CGG--T-A--GGG--G-ACTTA-ATA
gi|41259                      : agacagacAGACA-G--AG---A---GG--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--A----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----TCCCC-C-C--CCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-
gi|41260                      :          GAAA-G--AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--CCAA-ATT---A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CC-G--T-A--TGG--G-AC-TA-A
gi|41261                      :   agacagAGACA-G--AC---A---GA--C-----AG--AATTAGC--AGG-A-----C--AC----G-A---C---A--C----------A-A-A--GA-AG---A-----A------A-GCC-------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-G--------AAACGCGGG--TAA--GGG--G-AC-TA-
gi|41262                      :          GACA-G--AC---A---GA--ACATGAAG--A--------A-GCA-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A----GA-AG---A-----A------A-G---------------CTATAA--T--A--G-----T--AC-C-C--TCC----G-T---T--T-----C-----------A---CCGG--T-A--GGG--A----TA-ATAA
gi|41263                      :   agacagAGACA-G--GC---A---TG--A-----AG--A--------A-G-A-----C--------G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-A---------------C----A--T--A--A-----C--AC-C-C--TC-----G-G---T------A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGC--G-AC-TA-ATAA
gi|41264                      :         aaacA-G--AC---A---GG--T-----AG--AT----C--A-G-AG----C--A-----G-----C---A-------G-----A-A-A--GA-AG---AC----A------A-GGATTTTTTTTTTTGGCT---A--T--A--G-----T--CC------TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41265                      :         AGACA-G--AC---GT--GA--AGC---AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--A----C-----A-A-A--GA-AG---------A------A-G---------------CT---A--TA-A--G-----TA-TC-C-A--ACC----G-G---T--T---A-C-A--------AA----CGG--T-A---GG--G-AC-TA-
gi|41266                      :             A-G--GC---A---GA--G-----GG--A-----C--T-G-A-----C--A-----G-A---C---A--T----A-----CTC-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----------A-C--TCC----A-G---T--TTT-A-C-A--------AA---CCGG--T-T--GGG--G-AC-CA-ATAA
gi|41267                      :         AGACA-G--AC---T---GA--C-----TG--A-----G--G-G-A-----C--A-----G-A---C-----------------A-A-A--AA-CG---A-----A------A-C---------------CT---A--T--A--C-----T--CC-C-C--TTC----A-A---T--T-----C-T--------AA---CAGG--T-A--GGC--G-AC-TA-ACAA
gi|41268                      :          GACA-G--AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GTG--G-AC-TG-ATAA
gi|41269                      :              -G--AC---A---GAC-A-----AG--A-----C--A-G-AAA---C--A-----G-A---C---A--TT---A-----A-A-A--GA-AGG--A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------A-----CGG--T-AGGGGG--G-AC-TA-ACA
gi|41270                      :         AGACA-G--AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-GGA-----C--A-------A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------TC---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ACAA
gi|41271                      :      gacAGACA-G--AC---A---GG--A-----AG--A-----C--A---------C--A-----G-A---C---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-T--------AA---CCAG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41272                      :      gacAGACA-G--AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-T-G-----C--------G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------TT---A--T--A--G-----T--TC-C----TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC--A-ATAA
gi|41273                      :      gacAGACA-G--AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-T-G-----C--A-----C-G---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---------A------A-G---------------TT---A--T--A--G-----T---T-C-C--TCC----G--------T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A---GG--G-AC--A-ATAA
gi|41274                      :      gacAGACA----AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-A-A-----C--AAAACAG-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------AAG---------------CTT--A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-----T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--A-TC-TA-ACAA
gi|41275                      :       gacGACA-G--AC---T---AC--A-----TG--A-----A--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CTA--A--T--A--G-----T---C-C-C--TC-------G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A---GG--G-AC-TA-AAAA
gi|41276                      :         AGACA-G--AC---A---GG--A-----AG--A-----CT-A-G----------A-----G-A---CA--A--C----A-----A-A-A--GA-A----A-----A------A-GTA-------------CT---A-----A--G-----T---C-C-C--TCC----G-G---T--T---A---A--------AA---C--G--T-A--GGA--G-A--TA-AAAA
gi|41277                      :       gacGACA-G--A----A---TA--A-----GG--A-----C--A-G-A-----C--G-----G-A---CTG-A--C----A-----A-A--------G---A-----A------A-G---------------CT---A--TCTA--G-----T--CC-C-T--TCC----A-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGT--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41278                      :          GACA-G--AC---A---GA--ATGA--AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---G---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G----------------T---A--T--G--------------C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-C--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41279                      :          GACA-G--AC---ATCGAA--A-----AG--AA----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A--------G---------------CT---AA-T--AA-G-----T--CC-C-C--TCC----G-T---T--T---A-C-ATACCTACAAA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41280                      :              -G--AC---A---GA--ATG---GG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---CCAGA--C----AC----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T---C-C-C--TCC----GCG---T--T---A-C-A--------AA---C--G--T-A----G--G-AC-TA-
gi|41281                      :         AGACA-G--AC---A---GA--A-----TG--A--------A-G-A-----C--AT----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------AAG---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TAC----G-G---T--T---A-
gi|41282                      :       gacGACA-G--AC---A---GA--C-----AG--A-----C--ATG-A--------A-----G-AATGC---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CTG--A--T--A--G-----T--CC-C-C--TAC----G-------------------------------CGGT-T-A--GGG--G-AC-AA-ATA
gi|41283                      :          GACA-G--AC---A---GA--T-----GA--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---CGG-A--C----G-----G-A-A--GG-AGTGCA-----A------A-C---------------CT---A--A--A--G-----T--CT-T-C--TTC----G-A---T--T---T-C-----------G---TCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41284                      :              -G--AC---A---GA--G-----TG--A-----T--A-G-A-----C--ATA---G-A---C---A--C----A-----C-A----GA-GG---G-----A------A-G---------------CT---A--T--T--G-----T--TC-T-C--TCC----G-G---T--TGTTA-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGA--C-AA-TA-ATAA
gi|41285                      :          GACA-G--AC---A---GA--C-----GG--A-----C--G-G-A-----C--G-----G-A---C---A---------------G-A--GT-GC---A-----A------A-C---------------CT---A--A--A--G-----T--CC-C-C--TTC----G-A---C--T---T-C-G-------------TCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41286                      :          GACG-G--AC---A---GA--C-----AG--A-----C--G-G-A-----C--G-----G-A---C---A---------------G-A--GT-GC---A-----A------A-C---------------CT---A--A--A--G-----T--CC-C-C--TTC----G-A---C--T---T-C-G-------------TCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41287                      :          GACA-G--AC---T---GA--C-----AA--A-----C--A-G-A-----G--G-----G-A---C---G--G----G-----A-A-ATGGA-GG---A-----A------A-AAC-------------CT---A--T--A--G-----T--CC-CAC--CTC----G-GTT-T--T---A-C-A--------TA---CCGG--T-A--GAG--C-AC-TG-ATGA
gi|41288                      :          GACT-G--AC---G---GA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--G-----G-A---C------------------------GG-AGTGCA-----A------A-C---------------CT---A--A--A--G-----T--CC-C-C--TTC----G-A---C--T---T-C-----------G---TCGG--T-A--TGG--G-AC-TA-ATA
gi|41289                      :          GACT-G--AC---A---GA--C-----GG--A-----C--G-G-A-----C--A-----G-A---C-----------------A-G-A--GT-GC---A-----A------A-C---------------CT---A--A--A--G-----T--CA-C-C--TTC----G-A---C--T---T-C-G--------AG-----GG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41290                      :          GACA-G--AC---G---GA--C-----GG--A-----C--G-G-A-----C--G-----G-A---C------------------------GG-AGTGCA-----A------A-C---------------CT---A--A--A--G-----T--TC-C-C--TTT----G-A---C--T---T-C-G-------------TCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41291                      :           ACA-G--GC---A---GA--C-----AG--A-----C--G-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-T---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GTG--G-AC-TA-ATAA
gi|41292                      :           ACA-G--AC---A---GA--A-----CA--A-----C--G-G-A-----C--A-----G-A---CA--A--C----A-----A-A-A--GA-AG---------A------A-G---------------CT---AC-T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-GTAAT--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATGA
gi|41293                      :           ACA-GGAAC---A---GA--A------G--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---A---AA-T----G-----A-A-A--GA-AA---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----C--CC-C-C---------G-G---TA-T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ACAA
gi|41294                      :                   C---A---GG--A-----AG--A-----CC-A-G-A-----CGTA-----G-A---C---AGGC----A-----A-A-G--GA-AG---AAAAGAA------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-T---T--T---A-C-A--------AA---CTGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41295                      :            CA-G--AC---G---GG--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---T--C--------------A--GA-AA---A-----A------A-C---------------AT---A--T--C--G-----T--CC-C-T--TTT----G-G---TTGT---A-C-A--------AC---CCGA--T-A--AGT--G-AC-TA-ACAA
gi|41296                      :             A-G--AC---A---GA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A----GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A---A--------CA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41297                      :          GACA-G--AC---AT--GA--A--------------------G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41298                      :              -G--AC---A---GA--C-----AG--A-----C----G-A-----C--A-----G-A---C---A--T----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-A
gi|41299                      :              -G--AC---A---AA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-G---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-GT--T--T---A-C-A--------AA---CC----T-T--AGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41300                      :              -G--AC---A---GA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A-------G--C----G-----A-C-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41301                      :              -G--AT---A---GA--G-----TG--A-----C--A-A-A-----C--A-----G-A---A---A--C----A-----C-A----GA-TG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--AC-A----TCC----G-G---T--TTT-A-C-A--------AA---CCTG--T-A--GGG--G-AC-TT-ATAA
gi|41302                      :           ACA-A--AC---A---GA--A---------------C--A-G-A-----C--A-----G-G---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------G-C---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-CTC--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41303                      :                                -----AG--A-----C--A-G-------C--A-----G-A---C---A--C----A-----A------GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--A--A--G-----T--TC-C----TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41304                      :                   agagc---GA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--G----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41305                      :                        ---GA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-T
gi|41306                      :                        ---GA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----C-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--G--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41307                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---CTG-A--C----A-----A-A----GA-AT---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---C-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-AA-ATAA
gi|41308                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--G-----G-A---CTG-A--C----A-----A-A----GA-AG---T-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-T--CCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-AT
gi|41309                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---G---A--C----A-----C-ACA--GA-GG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----C--CC-C-C--TCC----G-GTT-T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--A-AC-TA-ATAA
gi|41310                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--G-----G-A---CTG-A--C----A-----A-A--------G---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-T--CCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CTGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41311                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---TGT-A--C----ACTGACA-A-C--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----C--CC-C-C--TCC----G-G---A--T---A-C-A--------AA---CCAG--T-A--GGG--G-GC-TA-ATAA
gi|41312                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--------------------GACAG---A-----A------------------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--CCCCCCCG-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-A
gi|41313                      :              -G--AT---A---GA--A-----TG--A-----C--A-G-A-----C--A-----C-A---T---G--C----A------------GA-AG---A-----A------A-G---------------CG---A--T--T--G-----T--TC-C-C--TTC----G-A---T--TT--A-C-A--------AA---CCGG--T-A--CAG--G-AC-TA-AT
gi|41314                      :                                -----AG--A-----T--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--G----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--CCT----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CGGG--T-A--GGG--G-AC-TA-A
gi|41315                      :                              ac-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------AGG---------------CT---G--T--A--G-----T---C-C-C--TCC------G---T--T---A-C----------AT---CCGG--T-A--GGG--GAAC-TA-A
gi|41316                      :                              ac-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---ATCT--A--G-----T---C-C-C--TTC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---ACGG--G-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41317                      :                                -----AG--A-----CTGA-G-A-----C--A-----G-G---C---A--------------------GA-GA---A-----A------A-G---------------CT---A--T--ATAG-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--TTT-A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-CA-ATGA
gi|41318                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41319                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--G----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---T--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-A-A--------AA---CCGG--A-A--GGA--G-AC-TA-ATAA
gi|41320                      :                                          -----C--A-G-A-----C--A-----G-A---A---A--CTAGCA-----A-A-A--GA-AG---A-----A--------G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-CCTCCC----G-G---T--T---A-C----------AA---CCGGCCT-A--GGG--G-AC-TA-A
gi|41321                      :                                                   -G-A-----C--A-----G-A---C---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-T-C---CT----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41322                      :                                                   -G-A-----T--A-----G-A---C---AG-C----A-----A-A-T--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C----TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--TGG--G-
gi|41323                      :                                                   -G-A-----C--A-----GGA---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---AG----A------A-G---------------C----A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C----------AA---CC-G--T-A--GGGCCG-AA-TA-A
gi|41324                      :                                                                      -A---C---A--T----A-----A-A-A--GA-AG---A-----ATTTCAAA-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-CTAA
gi|41325                      :                                                                        ---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-AT
gi|41326                      :                                                                                   ----A-----A-A-A--GC-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-A-----CC----G-G---T--T---A-C-A--------AA----CGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41327                      :                                                                                                -A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--TACATTT--CC-C-C--TGC----G-G---T--TTC-A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ACAA
gi|41328                      :                                                                                                        G---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---C
gi|41329                      :                                                                                                                   ------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CG-C-C--TCC----A-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GTG--G-AC-TA-AT
gi|41330                      :                                                                                                                                                                      -C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-AT





Alignments
lowQualScore                  :              0 00  111 333  77777777  00 22222 11 1 1 22222 11 22222 0 000 555 3333333 22222 0 1 00  0  222 22222 111111 1 555555555555555  222 11 11 11 11111 11  0 0 00   1111 0 222 11 333 0 0 11111111  000    11 0 00   00 0  0  0    
lowQualScore                  :              . ..  ... ...  ........  .. ..... .. . . ..... .. ..... . ... ... ....... ..... . . ..  .  ... ..... ...... . ...............  ... .. .. .. ..... ..  . . ..   .... . ... .. ... . . ........  ...    .. . ..   .. .  .  .    
lowQualScore                  :              7 99  222 333  66666666  77 33333 88 0 0 44444 22 99999 5 999 999 5555555 33333 5 0 77  5  999 11111 333333 4 333333333333333  777 66 11 11 66666 11  5 9 66   0000 5 555 11 888 5 5 77777777  888    11 5 66   66 5  5  5    
consensus                     :         AGACA-G--AC---A---GA--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
Reference ( family-285 )      :         AGACA-G--AC---A---GA--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41244                      :         AGACA-G--AC---A---GT--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41245                      :         AGAAA-G--AC---A---GA--T-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-GC-TA-ACAA
gi|41246                      :         AGACA-G--ACGAAA---GA--A-----AG--A-----C--A-G-ATAGACC--A-----G-A---C---AGCC----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-GC--------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G--C-TA-
gi|41247                      :         AGACA-G--AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T-C----G-G---T--T---A-CAA--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41248                      :     agacAGACA-G--AC---A---GG--A-----AG--A-----C--A-G-A-----A--A-----G-A---C---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41249                      :         AGACA-G--AC---A---AATGA-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--TC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C----------AA---CCGG--C-A--GGG--G-AC-TA-AAAA
gi|41250                      :     agacAGACA-G--AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-G-A-----CC-A-----G-A---C---A--C----A-----A------GA-AG---G-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-AT
gi|41251                      :         AGACA-G--AC---ATT-GA--AGAC--AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---A---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---ACC-A--------AA---CCGG--T-A---GG--G-AC-TACATAA
gi|41252                      :         AGACA-G--AC---A---GG--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--G-----G-A---C---A--T----A-----C-ACA--AA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---ACGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41253                      :         AGACA-G--AC---A---GA--C-----AG--A-----A--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T-----C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A---GA--G-AC--A-ATAA
gi|41254                      :         AGACA-G--AC---A---GA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C----------A---C---A--C----A-----T-A-A--GA------A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--------T--CCGC-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41255                      :         AGACATG--A----A---GA--C-----AG--A-----C--A-T-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-G-----AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TC-----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41256                      :         AGACA-G--AT---A---GA--A-----AA--A----------G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC------G---T--T---A-C----------AA---CCGG--G-A---GG--G-AC-TA-ATAA
gi|41257                      : agacagacAGACA-G--AT---A---GA--A-----AA--A----------G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC------G---T--T---A-C----------AA---CCGG--G-A---GG--G-AC-TA-ATAA
gi|41258                      : agacagacAGACA-G--AC---A---TA--A-----AACAG-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AA---A-----A------A-G---------------CTA--A--T--A--GT----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA----CGG--T-A--GGG--G-ACTTA-ATA
gi|41259                      : agacagacAGACA-G--AG---A---GG--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--A----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----TCCCC-C-C--CCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-
gi|41260                      :          GAAA-G--AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--CCAA-ATT---A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CC-G--T-A--TGG--G-AC-TA-A
gi|41261                      :   agacagAGACA-G--AC---A---GA--C-----AG--AATTAGC--AGG-A-----C--AC----G-A---C---A--C----------A-A-A--GA-AG---A-----A------A-GCC-------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-G--------AAACGCGGG--TAA--GGG--G-AC-TA-
gi|41262                      :          GACA-G--AC---A---GA--ACATGAAG--A--------A-GCA-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A----GA-AG---A-----A------A-G---------------CTATAA--T--A--G-----T--AC-C-C--TCC----G-T---T--T-----C-----------A---CCGG--T-A--GGG--A----TA-ATAA
gi|41263                      :   agacagAGACA-G--GC---A---TG--A-----AG--A--------A-G-A-----C--------G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-A---------------C----A--T--A--A-----C--AC-C-C--TC-----G-G---T------A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGC--G-AC-TA-ATAA
gi|41264                      :         aaacA-G--AC---A---GG--T-----AG--AT----C--A-G-AG----C--A-----G-----C---A-------G-----A-A-A--GA-AG---AC----A------A-GGATTTTTTTTTTTGGCT---A--T--A--G-----T--CC------TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41265                      :         AGACA-G--AC---GT--GA--AGC---AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--A----C-----A-A-A--GA-AG---------A------A-G---------------CT---A--TA-A--G-----TA-TC-C-A--ACC----G-G---T--T---A-C-A--------AA----CGG--T-A---GG--G-AC-TA-
gi|41266                      :             A-G--GC---A---GA--G-----GG--A-----C--T-G-A-----C--A-----G-A---C---A--T----A-----CTC-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----------A-C--TCC----A-G---T--TTT-A-C-A--------AA---CCGG--T-T--GGG--G-AC-CA-ATAA
gi|41267                      :         AGACA-G--AC---T---GA--C-----TG--A-----G--G-G-A-----C--A-----G-A---C-----------------A-A-A--AA-CG---A-----A------A-C---------------CT---A--T--A--C-----T--CC-C-C--TTC----A-A---T--T-----C-T--------AA---CAGG--T-A--GGC--G-AC-TA-ACAA
gi|41268                      :          GACA-G--AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GTG--G-AC-TG-ATAA
gi|41269                      :              -G--AC---A---GAC-A-----AG--A-----C--A-G-AAA---C--A-----G-A---C---A--TT---A-----A-A-A--GA-AGG--A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------A-----CGG--T-AGGGGG--G-AC-TA-ACA
gi|41270                      :         AGACA-G--AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-GGA-----C--A-------A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------TC---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ACAA
gi|41271                      :      gacAGACA-G--AC---A---GG--A-----AG--A-----C--A---------C--A-----G-A---C---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-T--------AA---CCAG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41272                      :      gacAGACA-G--AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-T-G-----C--------G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------TT---A--T--A--G-----T--TC-C----TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC--A-ATAA
gi|41273                      :      gacAGACA-G--AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-T-G-----C--A-----C-G---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---------A------A-G---------------TT---A--T--A--G-----T---T-C-C--TCC----G--------T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A---GG--G-AC--A-ATAA
gi|41274                      :      gacAGACA----AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-A-A-----C--AAAACAG-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------AAG---------------CTT--A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-----T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--A-TC-TA-ACAA
gi|41275                      :       gacGACA-G--AC---T---AC--A-----TG--A-----A--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CTA--A--T--A--G-----T---C-C-C--TC-------G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A---GG--G-AC-TA-AAAA
gi|41276                      :         AGACA-G--AC---A---GG--A-----AG--A-----CT-A-G----------A-----G-A---CA--A--C----A-----A-A-A--GA-A----A-----A------A-GTA-------------CT---A-----A--G-----T---C-C-C--TCC----G-G---T--T---A---A--------AA---C--G--T-A--GGA--G-A--TA-AAAA
gi|41277                      :       gacGACA-G--A----A---TA--A-----GG--A-----C--A-G-A-----C--G-----G-A---CTG-A--C----A-----A-A--------G---A-----A------A-G---------------CT---A--TCTA--G-----T--CC-C-T--TCC----A-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGT--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41278                      :          GACA-G--AC---A---GA--ATGA--AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---G---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G----------------T---A--T--G--------------C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-C--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41279                      :          GACA-G--AC---ATCGAA--A-----AG--AA----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A--------G---------------CT---AA-T--AA-G-----T--CC-C-C--TCC----G-T---T--T---A-C-ATACCTACAAA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41280                      :              -G--AC---A---GA--ATG---GG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---CCAGA--C----AC----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T---C-C-C--TCC----GCG---T--T---A-C-A--------AA---C--G--T-A----G--G-AC-TA-
gi|41281                      :         AGACA-G--AC---A---GA--A-----TG--A--------A-G-A-----C--AT----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------AAG---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TAC----G-G---T--T---A-
gi|41282                      :       gacGACA-G--AC---A---GA--C-----AG--A-----C--ATG-A--------A-----G-AATGC---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CTG--A--T--A--G-----T--CC-C-C--TAC----G-------------------------------CGGT-T-A--GGG--G-AC-AA-ATA
gi|41283                      :          GACA-G--AC---A---GA--T-----GA--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---CGG-A--C----G-----G-A-A--GG-AGTGCA-----A------A-C---------------CT---A--A--A--G-----T--CT-T-C--TTC----G-A---T--T---T-C-----------G---TCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41284                      :              -G--AC---A---GA--G-----TG--A-----T--A-G-A-----C--ATA---G-A---C---A--C----A-----C-A----GA-GG---G-----A------A-G---------------CT---A--T--T--G-----T--TC-T-C--TCC----G-G---T--TGTTA-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGA--C-AA-TA-ATAA
gi|41285                      :          GACA-G--AC---A---GA--C-----GG--A-----C--G-G-A-----C--G-----G-A---C---A---------------G-A--GT-GC---A-----A------A-C---------------CT---A--A--A--G-----T--CC-C-C--TTC----G-A---C--T---T-C-G-------------TCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41286                      :          GACG-G--AC---A---GA--C-----AG--A-----C--G-G-A-----C--G-----G-A---C---A---------------G-A--GT-GC---A-----A------A-C---------------CT---A--A--A--G-----T--CC-C-C--TTC----G-A---C--T---T-C-G-------------TCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41287                      :          GACA-G--AC---T---GA--C-----AA--A-----C--A-G-A-----G--G-----G-A---C---G--G----G-----A-A-ATGGA-GG---A-----A------A-AAC-------------CT---A--T--A--G-----T--CC-CAC--CTC----G-GTT-T--T---A-C-A--------TA---CCGG--T-A--GAG--C-AC-TG-ATGA
gi|41288                      :          GACT-G--AC---G---GA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--G-----G-A---C------------------------GG-AGTGCA-----A------A-C---------------CT---A--A--A--G-----T--CC-C-C--TTC----G-A---C--T---T-C-----------G---TCGG--T-A--TGG--G-AC-TA-ATA
gi|41289                      :          GACT-G--AC---A---GA--C-----GG--A-----C--G-G-A-----C--A-----G-A---C-----------------A-G-A--GT-GC---A-----A------A-C---------------CT---A--A--A--G-----T--CA-C-C--TTC----G-A---C--T---T-C-G--------AG-----GG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41290                      :          GACA-G--AC---G---GA--C-----GG--A-----C--G-G-A-----C--G-----G-A---C------------------------GG-AGTGCA-----A------A-C---------------CT---A--A--A--G-----T--TC-C-C--TTT----G-A---C--T---T-C-G-------------TCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41291                      :           ACA-G--GC---A---GA--C-----AG--A-----C--G-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-T---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GTG--G-AC-TA-ATAA
gi|41292                      :           ACA-G--AC---A---GA--A-----CA--A-----C--G-G-A-----C--A-----G-A---CA--A--C----A-----A-A-A--GA-AG---------A------A-G---------------CT---AC-T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-GTAAT--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATGA
gi|41293                      :           ACA-GGAAC---A---GA--A------G--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---A---AA-T----G-----A-A-A--GA-AA---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----C--CC-C-C---------G-G---TA-T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ACAA
gi|41294                      :                   C---A---GG--A-----AG--A-----CC-A-G-A-----CGTA-----G-A---C---AGGC----A-----A-A-G--GA-AG---AAAAGAA------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-T---T--T---A-C-A--------AA---CTGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41295                      :            CA-G--AC---G---GG--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---T--C--------------A--GA-AA---A-----A------A-C---------------AT---A--T--C--G-----T--CC-C-T--TTT----G-G---TTGT---A-C-A--------AC---CCGA--T-A--AGT--G-AC-TA-ACAA
gi|41296                      :             A-G--AC---A---GA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A----GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A---A--------CA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41297                      :          GACA-G--AC---AT--GA--A--------------------G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41298                      :              -G--AC---A---GA--C-----AG--A-----C----G-A-----C--A-----G-A---C---A--T----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-A
gi|41299                      :              -G--AC---A---AA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-G---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-GT--T--T---A-C-A--------AA---CC----T-T--AGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41300                      :              -G--AC---A---GA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A-------G--C----G-----A-C-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41301                      :              -G--AT---A---GA--G-----TG--A-----C--A-A-A-----C--A-----G-A---A---A--C----A-----C-A----GA-TG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--AC-A----TCC----G-G---T--TTT-A-C-A--------AA---CCTG--T-A--GGG--G-AC-TT-ATAA
gi|41302                      :           ACA-A--AC---A---GA--A---------------C--A-G-A-----C--A-----G-G---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------G-C---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-CTC--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41303                      :                                -----AG--A-----C--A-G-------C--A-----G-A---C---A--C----A-----A------GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--A--A--G-----T--TC-C----TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41304                      :                   agagc---GA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--G----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41305                      :                        ---GA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-T
gi|41306                      :                        ---GA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----C-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--G--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41307                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---CTG-A--C----A-----A-A----GA-AT---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---C-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-AA-ATAA
gi|41308                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--G-----G-A---CTG-A--C----A-----A-A----GA-AG---T-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-T--CCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-AT
gi|41309                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---G---A--C----A-----C-ACA--GA-GG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----C--CC-C-C--TCC----G-GTT-T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--A-AC-TA-ATAA
gi|41310                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--G-----G-A---CTG-A--C----A-----A-A--------G---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-T--CCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CTGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41311                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---TGT-A--C----ACTGACA-A-C--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----C--CC-C-C--TCC----G-G---A--T---A-C-A--------AA---CCAG--T-A--GGG--G-GC-TA-ATAA
gi|41312                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--------------------GACAG---A-----A------------------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--CCCCCCCG-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-A
gi|41313                      :              -G--AT---A---GA--A-----TG--A-----C--A-G-A-----C--A-----C-A---T---G--C----A------------GA-AG---A-----A------A-G---------------CG---A--T--T--G-----T--TC-C-C--TTC----G-A---T--TT--A-C-A--------AA---CCGG--T-A--CAG--G-AC-TA-AT
gi|41314                      :                                -----AG--A-----T--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--G----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--CCT----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CGGG--T-A--GGG--G-AC-TA-A
gi|41315                      :                              ac-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------AGG---------------CT---G--T--A--G-----T---C-C-C--TCC------G---T--T---A-C----------AT---CCGG--T-A--GGG--GAAC-TA-A
gi|41316                      :                              ac-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---ATCT--A--G-----T---C-C-C--TTC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---ACGG--G-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41317                      :                                -----AG--A-----CTGA-G-A-----C--A-----G-G---C---A--------------------GA-GA---A-----A------A-G---------------CT---A--T--ATAG-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--TTT-A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-CA-ATGA
gi|41318                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41319                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--G----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---T--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-A-A--------AA---CCGG--A-A--GGA--G-AC-TA-ATAA
gi|41320                      :                                          -----C--A-G-A-----C--A-----G-A---A---A--CTAGCA-----A-A-A--GA-AG---A-----A--------G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-CCTCCC----G-G---T--T---A-C----------AA---CCGGCCT-A--GGG--G-AC-TA-A
gi|41321                      :                                                   -G-A-----C--A-----G-A---C---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-T-C---CT----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41322                      :                                                   -G-A-----T--A-----G-A---C---AG-C----A-----A-A-T--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C----TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--TGG--G-
gi|41323                      :                                                   -G-A-----C--A-----GGA---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---AG----A------A-G---------------C----A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C----------AA---CC-G--T-A--GGGCCG-AA-TA-A
gi|41324                      :                                                                      -A---C---A--T----A-----A-A-A--GA-AG---A-----ATTTCAAA-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-CTAA
gi|41325                      :                                                                        ---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-AT
gi|41326                      :                                                                                   ----A-----A-A-A--GC-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-A-----CC----G-G---T--T---A-C-A--------AA----CGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41327                      :                                                                                                -A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--TACATTT--CC-C-C--TGC----G-G---T--TTC-A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ACAA
gi|41328                      :                                                                                                        G---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---C
gi|41329                      :                                                                                                                   ------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CG-C-C--TCC----A-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GTG--G-AC-TA-AT
gi|41330                      :                                                                                                                                                                      -C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-AT


blockSeqs                     :                    GAA TCG  ACATGA       ATTAG TG G C TAGAC GT AAACA       CAG CTAGC   CTGAC            TGC AAAGA TTTCAA A GATTTTTTTTTTTGG  ATA TC CT TA ACATT CC                  TAA TG GTT     TACCTACA         CC
blockSeqs                     :                    .   TT   AGAC         T     T  T G AA    C  TA          TG  CCAA    TT               TGC C     .      A CC               A   A  A  A  T     A                   TT  A  TT      .                T 
blockSeqs                     :                    .   T    ATGA         A     C  . . G     .  C           GG  GCC     C                TGC G     .      G TA               T   C  .  .  .     .                   TT  .  TT      .                . 
blockSeqs                     :                    .   T    TGA          .     .  . . .     .  T           TG  GGC     .                G   .     .      . AC               A   .  .  .  .     .                   T   .  TT      .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    AGC          .     .  . . .     .  .           TG  TT      .                .   .     .      . C                G   .  .  .  .     .                   .   .  TC      .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    ATG          .     .  . . .     .  .           TG  AT      .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  T       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    CA           .     .  . . .     .  .           GT  GC      .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    T            .     .  . . .     .  .           A   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           A   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   G       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    C            .     .  . . .     .  .           .   T       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    C            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    C            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   A       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    C            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    T            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    G            .     .  . . .     .  .           .   A       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    C            .     .  . . .     .  .           .   T       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   G       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   G       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   G       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    C            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    T            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    G            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    C            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    C            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    C            .     .  . . .     .  .           .   G       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    C            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    C            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    C            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    C            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   T       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    C            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    C            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    C            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    C            .     .  . . .     .  .           .   G       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    C            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    G            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    A            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                    .   .    C            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                        .    C            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                        .    C            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                        .    A            .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                          .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                          .     .  . . .     .  .           .   G       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                          .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                          .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                          .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                          .     .  . . .     .  .           .   G       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                          .     .  . . .     .  .           .   G       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                          .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                          .     .  . . .     .  .           .   T       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                          .     .  . . .     .  .           .   C       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                          .     .  . . .     .  .           .   .       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                          .     .  . . .     .  .           .   .       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                          .     .  . . .     .  .           .   .       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                          .     .  . . .     .  .           .   .       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                                   . . .     .  .           .   .       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                                   . . .     .  .           .   .       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                                   . . .     .  .           .   .       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                                                            .   .       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                                                            .   .       .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                                                                        .                .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                         .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                         .   .     .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                   .      . .                .   .  .  .  .     .                   .   .  .       .                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                    .   .  .                          


blockSeqCons                  :         
originalCons                  :         AGACA-G--AC---A---GA--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
finalCons                     :         AGACA-G--AC---A---GA--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA





Alignments
lowQualScore                  :              0 00  111 333  77777777  00 22222 11 1 1 22222 11 22222 0 000 555 3333333 22222 0 1 00  0  222 22222 111111 1 555555555555555  222 11 11 11 11111 11  0 0 00   1111 0 222 11 333 0 0 11111111  000    11 0 00   00 0  0  0    
lowQualScore                  :              . ..  ... ...  ........  .. ..... .. . . ..... .. ..... . ... ... ....... ..... . . ..  .  ... ..... ...... . ...............  ... .. .. .. ..... ..  . . ..   .... . ... .. ... . . ........  ...    .. . ..   .. .  .  .    
lowQualScore                  :              7 99  222 333  66666666  77 33333 88 0 0 44444 22 99999 5 999 999 5555555 33333 5 0 77  5  999 11111 333333 4 333333333333333  777 66 11 11 66666 11  5 9 66   0000 5 555 11 888 5 5 77777777  888    11 5 66   66 5  5  5    
consensus                     :         AGACA-G--AC---A---GA--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
Reference ( family-285 )      :         AGACA-G--AC---A---GA--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41244                      :         AGACA-G--AC---A---GT--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41245                      :         AGAAA-G--AC---A---GA--T-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-GC-TA-ACAA
gi|41246                      :         AGACA-G--ACGAAA---GA--A-----AG--A-----C--A-G-ATAGACC--A-----G-A---C---AGCC----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-GC--------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G--C-TA-
gi|41247                      :         AGACA-G--AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--T-C----G-G---T--T---A-CAA--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41248                      :     agacAGACA-G--AC---A---GG--A-----AG--A-----C--A-G-A-----A--A-----G-A---C---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41249                      :         AGACA-G--AC---A---AATGA-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--TC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C----------AA---CCGG--C-A--GGG--G-AC-TA-AAAA
gi|41250                      :     agacAGACA-G--AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-G-A-----CC-A-----G-A---C---A--C----A-----A------GA-AG---G-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-AT
gi|41251                      :         AGACA-G--AC---ATT-GA--AGAC--AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---A---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---ACC-A--------AA---CCGG--T-A---GG--G-AC-TACATAA
gi|41252                      :         AGACA-G--AC---A---GG--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--G-----G-A---C---A--T----A-----C-ACA--AA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---ACGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41253                      :         AGACA-G--AC---A---GA--C-----AG--A-----A--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T-----C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A---GA--G-AC--A-ATAA
gi|41254                      :         AGACA-G--AC---A---GA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C----------A---C---A--C----A-----T-A-A--GA------A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--------T--CCGC-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41255                      :         AGACATG--A----A---GA--C-----AG--A-----C--A-T-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-G-----AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TC-----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41256                      :         AGACA-G--AT---A---GA--A-----AA--A----------G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC------G---T--T---A-C----------AA---CCGG--G-A---GG--G-AC-TA-ATAA
gi|41257                      : agacagacAGACA-G--AT---A---GA--A-----AA--A----------G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC------G---T--T---A-C----------AA---CCGG--G-A---GG--G-AC-TA-ATAA
gi|41258                      : agacagacAGACA-G--AC---A---TA--A-----AACAG-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AA---A-----A------A-G---------------CTA--A--T--A--GT----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA----CGG--T-A--GGG--G-ACTTA-ATA
gi|41259                      : agacagacAGACA-G--AG---A---GG--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--A----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----TCCCC-C-C--CCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-
gi|41260                      :          GAAA-G--AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--CCAA-ATT---A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CC-G--T-A--TGG--G-AC-TA-A
gi|41261                      :   agacagAGACA-G--AC---A---GA--C-----AG--AATTAGC--AGG-A-----C--AC----G-A---C---A--C----------A-A-A--GA-AG---A-----A------A-GCC-------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-G--------AAACGCGGG--TAA--GGG--G-AC-TA-
gi|41262                      :          GACA-G--AC---A---GA--ACATGAAG--A--------A-GCA-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A----GA-AG---A-----A------A-G---------------CTATAA--T--A--G-----T--AC-C-C--TCC----G-T---T--T-----C-----------A---CCGG--T-A--GGG--A----TA-ATAA
gi|41263                      :   agacagAGACA-G--GC---A---TG--A-----AG--A--------A-G-A-----C--------G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-A---------------C----A--T--A--A-----C--AC-C-C--TC-----G-G---T------A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGC--G-AC-TA-ATAA
gi|41264                      :         aaacA-G--AC---A---GG--T-----AG--AT----C--A-G-AG----C--A-----G-----C---A-------G-----A-A-A--GA-AG---AC----A------A-GGATTTTTTTTTTTGGCT---A--T--A--G-----T--CC------TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41265                      :         AGACA-G--AC---GT--GA--AGC---AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--A----C-----A-A-A--GA-AG---------A------A-G---------------CT---A--TA-A--G-----TA-TC-C-A--ACC----G-G---T--T---A-C-A--------AA----CGG--T-A---GG--G-AC-TA-
gi|41266                      :             A-G--GC---A---GA--G-----GG--A-----C--T-G-A-----C--A-----G-A---C---A--T----A-----CTC-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----------A-C--TCC----A-G---T--TTT-A-C-A--------AA---CCGG--T-T--GGG--G-AC-CA-ATAA
gi|41267                      :         AGACA-G--AC---T---GA--C-----TG--A-----G--G-G-A-----C--A-----G-A---C-----------------A-A-A--AA-CG---A-----A------A-C---------------CT---A--T--A--C-----T--CC-C-C--TTC----A-A---T--T-----C-T--------AA---CAGG--T-A--GGC--G-AC-TA-ACAA
gi|41268                      :          GACA-G--AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GTG--G-AC-TG-ATAA
gi|41269                      :              -G--AC---A---GAC-A-----AG--A-----C--A-G-AAA---C--A-----G-A---C---A--TT---A-----A-A-A--GA-AGG--A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------A-----CGG--T-AGGGGG--G-AC-TA-ACA
gi|41270                      :         AGACA-G--AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-GGA-----C--A-------A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------TC---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ACAA
gi|41271                      :      gacAGACA-G--AC---A---GG--A-----AG--A-----C--A---------C--A-----G-A---C---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-T--------AA---CCAG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41272                      :      gacAGACA-G--AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-T-G-----C--------G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------TT---A--T--A--G-----T--TC-C----TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC--A-ATAA
gi|41273                      :      gacAGACA-G--AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-T-G-----C--A-----C-G---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---------A------A-G---------------TT---A--T--A--G-----T---T-C-C--TCC----G--------T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A---GG--G-AC--A-ATAA
gi|41274                      :      gacAGACA----AC---A---TG--A-----AG--A-----C--A-A-A-----C--AAAACAG-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------AAG---------------CTT--A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-----T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--A-TC-TA-ACAA
gi|41275                      :       gacGACA-G--AC---T---AC--A-----TG--A-----A--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CTA--A--T--A--G-----T---C-C-C--TC-------G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A---GG--G-AC-TA-AAAA
gi|41276                      :         AGACA-G--AC---A---GG--A-----AG--A-----CT-A-G----------A-----G-A---CA--A--C----A-----A-A-A--GA-A----A-----A------A-GTA-------------CT---A-----A--G-----T---C-C-C--TCC----G-G---T--T---A---A--------AA---C--G--T-A--GGA--G-A--TA-AAAA
gi|41277                      :       gacGACA-G--A----A---TA--A-----GG--A-----C--A-G-A-----C--G-----G-A---CTG-A--C----A-----A-A--------G---A-----A------A-G---------------CT---A--TCTA--G-----T--CC-C-T--TCC----A-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGT--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41278                      :          GACA-G--AC---A---GA--ATGA--AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---G---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G----------------T---A--T--G--------------C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-C--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41279                      :          GACA-G--AC---ATCGAA--A-----AG--AA----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A--------G---------------CT---AA-T--AA-G-----T--CC-C-C--TCC----G-T---T--T---A-C-ATACCTACAAA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41280                      :              -G--AC---A---GA--ATG---GG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---CCAGA--C----AC----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T---C-C-C--TCC----GCG---T--T---A-C-A--------AA---C--G--T-A----G--G-AC-TA-
gi|41281                      :         AGACA-G--AC---A---GA--A-----TG--A--------A-G-A-----C--AT----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------AAG---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TAC----G-G---T--T---A-
gi|41282                      :       gacGACA-G--AC---A---GA--C-----AG--A-----C--ATG-A--------A-----G-AATGC---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CTG--A--T--A--G-----T--CC-C-C--TAC----G-------------------------------CGGT-T-A--GGG--G-AC-AA-ATA
gi|41283                      :          GACA-G--AC---A---GA--T-----GA--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---CGG-A--C----G-----G-A-A--GG-AGTGCA-----A------A-C---------------CT---A--A--A--G-----T--CT-T-C--TTC----G-A---T--T---T-C-----------G---TCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41284                      :              -G--AC---A---GA--G-----TG--A-----T--A-G-A-----C--ATA---G-A---C---A--C----A-----C-A----GA-GG---G-----A------A-G---------------CT---A--T--T--G-----T--TC-T-C--TCC----G-G---T--TGTTA-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGA--C-AA-TA-ATAA
gi|41285                      :          GACA-G--AC---A---GA--C-----GG--A-----C--G-G-A-----C--G-----G-A---C---A---------------G-A--GT-GC---A-----A------A-C---------------CT---A--A--A--G-----T--CC-C-C--TTC----G-A---C--T---T-C-G-------------TCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41286                      :          GACG-G--AC---A---GA--C-----AG--A-----C--G-G-A-----C--G-----G-A---C---A---------------G-A--GT-GC---A-----A------A-C---------------CT---A--A--A--G-----T--CC-C-C--TTC----G-A---C--T---T-C-G-------------TCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41287                      :          GACA-G--AC---T---GA--C-----AA--A-----C--A-G-A-----G--G-----G-A---C---G--G----G-----A-A-ATGGA-GG---A-----A------A-AAC-------------CT---A--T--A--G-----T--CC-CAC--CTC----G-GTT-T--T---A-C-A--------TA---CCGG--T-A--GAG--C-AC-TG-ATGA
gi|41288                      :          GACT-G--AC---G---GA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--G-----G-A---C------------------------GG-AGTGCA-----A------A-C---------------CT---A--A--A--G-----T--CC-C-C--TTC----G-A---C--T---T-C-----------G---TCGG--T-A--TGG--G-AC-TA-ATA
gi|41289                      :          GACT-G--AC---A---GA--C-----GG--A-----C--G-G-A-----C--A-----G-A---C-----------------A-G-A--GT-GC---A-----A------A-C---------------CT---A--A--A--G-----T--CA-C-C--TTC----G-A---C--T---T-C-G--------AG-----GG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41290                      :          GACA-G--AC---G---GA--C-----GG--A-----C--G-G-A-----C--G-----G-A---C------------------------GG-AGTGCA-----A------A-C---------------CT---A--A--A--G-----T--TC-C-C--TTT----G-A---C--T---T-C-G-------------TCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41291                      :           ACA-G--GC---A---GA--C-----AG--A-----C--G-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-T---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GTG--G-AC-TA-ATAA
gi|41292                      :           ACA-G--AC---A---GA--A-----CA--A-----C--G-G-A-----C--A-----G-A---CA--A--C----A-----A-A-A--GA-AG---------A------A-G---------------CT---AC-T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-GTAAT--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATGA
gi|41293                      :           ACA-GGAAC---A---GA--A------G--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---A---AA-T----G-----A-A-A--GA-AA---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----C--CC-C-C---------G-G---TA-T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ACAA
gi|41294                      :                   C---A---GG--A-----AG--A-----CC-A-G-A-----CGTA-----G-A---C---AGGC----A-----A-A-G--GA-AG---AAAAGAA------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-T---T--T---A-C-A--------AA---CTGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41295                      :            CA-G--AC---G---GG--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---T--C--------------A--GA-AA---A-----A------A-C---------------AT---A--T--C--G-----T--CC-C-T--TTT----G-G---TTGT---A-C-A--------AC---CCGA--T-A--AGT--G-AC-TA-ACAA
gi|41296                      :             A-G--AC---A---GA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A----GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A---A--------CA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41297                      :          GACA-G--AC---AT--GA--A--------------------G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41298                      :              -G--AC---A---GA--C-----AG--A-----C----G-A-----C--A-----G-A---C---A--T----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-A
gi|41299                      :              -G--AC---A---AA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-G---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-GT--T--T---A-C-A--------AA---CC----T-T--AGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41300                      :              -G--AC---A---GA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A-------G--C----G-----A-C-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41301                      :              -G--AT---A---GA--G-----TG--A-----C--A-A-A-----C--A-----G-A---A---A--C----A-----C-A----GA-TG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--AC-A----TCC----G-G---T--TTT-A-C-A--------AA---CCTG--T-A--GGG--G-AC-TT-ATAA
gi|41302                      :           ACA-A--AC---A---GA--A---------------C--A-G-A-----C--A-----G-G---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------G-C---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-CTC--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41303                      :                                -----AG--A-----C--A-G-------C--A-----G-A---C---A--C----A-----A------GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--A--A--G-----T--TC-C----TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41304                      :                   agagc---GA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--G----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41305                      :                        ---GA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-T
gi|41306                      :                        ---GA--C-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----C-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--G--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41307                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---CTG-A--C----A-----A-A----GA-AT---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---C-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-AA-ATAA
gi|41308                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--G-----G-A---CTG-A--C----A-----A-A----GA-AG---T-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-T--CCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-AT
gi|41309                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---G---A--C----A-----C-ACA--GA-GG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----C--CC-C-C--TCC----G-GTT-T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--A-AC-TA-ATAA
gi|41310                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--G-----G-A---CTG-A--C----A-----A-A--------G---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-T--CCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CTGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41311                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---TGT-A--C----ACTGACA-A-C--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----C--CC-C-C--TCC----G-G---A--T---A-C-A--------AA---CCAG--T-A--GGG--G-GC-TA-ATAA
gi|41312                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--------------------GACAG---A-----A------------------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--CCCCCCCG-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-A
gi|41313                      :              -G--AT---A---GA--A-----TG--A-----C--A-G-A-----C--A-----C-A---T---G--C----A------------GA-AG---A-----A------A-G---------------CG---A--T--T--G-----T--TC-C-C--TTC----G-A---T--TT--A-C-A--------AA---CCGG--T-A--CAG--G-AC-TA-AT
gi|41314                      :                                -----AG--A-----T--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--G----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--CCT----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CGGG--T-A--GGG--G-AC-TA-A
gi|41315                      :                              ac-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------AGG---------------CT---G--T--A--G-----T---C-C-C--TCC------G---T--T---A-C----------AT---CCGG--T-A--GGG--GAAC-TA-A
gi|41316                      :                              ac-----AG--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---ATCT--A--G-----T---C-C-C--TTC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---ACGG--G-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41317                      :                                -----AG--A-----CTGA-G-A-----C--A-----G-G---C---A--------------------GA-GA---A-----A------A-G---------------CT---A--T--ATAG-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--TTT-A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-CA-ATGA
gi|41318                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41319                      :                                      G--A-----C--A-G-A-----C--A-----G-A---C---A--G----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---T--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-A-A--------AA---CCGG--A-A--GGA--G-AC-TA-ATAA
gi|41320                      :                                          -----C--A-G-A-----C--A-----G-A---A---A--CTAGCA-----A-A-A--GA-AG---A-----A--------G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-CCTCCC----G-G---T--T---A-C----------AA---CCGGCCT-A--GGG--G-AC-TA-A
gi|41321                      :                                                   -G-A-----C--A-----G-A---C---A--G----C-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-T-C---CT----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41322                      :                                                   -G-A-----T--A-----G-A---C---AG-C----A-----A-A-T--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C----TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--TGG--G-
gi|41323                      :                                                   -G-A-----C--A-----GGA---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---AG----A------A-G---------------C----A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C----------AA---CC-G--T-A--GGGCCG-AA-TA-A
gi|41324                      :                                                                      -A---C---A--T----A-----A-A-A--GA-AG---A-----ATTTCAAA-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-CTAA
gi|41325                      :                                                                        ---C---A--C----A-----A-A-A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-AT
gi|41326                      :                                                                                   ----A-----A-A-A--GC-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-A-----CC----G-G---T--T---A-C-A--------AA----CGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ATAA
gi|41327                      :                                                                                                -A--GA-AG---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--TACATTT--CC-C-C--TGC----G-G---T--TTC-A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-ACAA
gi|41328                      :                                                                                                        G---A-----A------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CC-C-C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---C
gi|41329                      :                                                                                                                   ------A-G---------------CT---A--T--A--G-----T--CG-C-C--TCC----A-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GTG--G-AC-TA-AT
gi|41330                      :                                                                                                                                                                      -C--TCC----G-G---T--T---A-C-A--------AA---CCGG--T-A--GGG--G-AC-TA-AT