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Reference ( gi|20763 )        :              GAC-G-A-C--G--C----AAGA-C--G--A-CT--A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20764                      :              GAC-G-A-C--G--C----AAGA-C--G--A-CT--A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
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gi|20818                      :                C-G-A-C--G--C----CAGA-T--------------------A--G--T-G-A-TT-C-C-T--A-T-A---T-T-TTGCC-------------T-T-------T-A--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---A--C-A-A--C-ACAATAA
gi|20801                      :                C-G-A-C-----------AGA-C--G--A--T--A-A------A--G--TTG-A-TC-C-C-T--ACT-A---T-G-TCGCC-------------T---------C-G--C--C--A-A-C-G-C---AGAGC-A-GT--G--C-G-A--A-ACAA
gi|20820                      :          gacggcC-A-A-C--G--C----A-GA-C--A--A-A---A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-A-A---T-G-TTGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-CG--AG-GCAA-G---G--C---A--C-ACA
gi|20832                      :                C-A-A-C--A--C----AAGA-T--------------------A--G--T-G-A-TT-C-C-T--A-A-A---T-G-TCACC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-A-C---AG-GC-A-G---G--C-A-A--C-A
gi|20819                      : gacgccgaatgccacC-G-A-A--G--C----TGGA-C--G--A-CT--A-A------A--G--T-G-A-TC-C-TAT--A-TAA---T-G-TCGC----------------T-------C-A--C-----A-A-C-G-----AG-GC-A-G---G--A-G-A--C-ACAATAA
gi|20821                      :                C-G-A-C--C--C------GA-C--GC-A-CT--A-A------A--G--T-G-A-TC-C---T--A-T-A---G-T-TCGCC-------------T-C-------C-G--C-----------------------A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20822                      :                C-G-A-T--G--C----CAGG-C--G--A-CTC-A-A------A--G--T-G------C-T-T--G-G-A---A-----------------------C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--T-G-A--C-ACAATAA
gi|20823                      :                 -G-A-C--G--C----C-GA-C--G--A-CT--A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20789                      :                 -G-A-C--G--C----AAAA-C--G--A-CT--A-A------T--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-AATAT-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATGA
gi|20825                      :       gacgacgcca-G-A-C--G--C----C-GA-C--G--A-CT--A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC---------------C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-AGG---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20826                      :                 -G-A-C--G--C----CAGA-C--G--A-CT--A-A------A--G--T-A-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C----------GC-A-G---G--T-G-A--C-ACAA
gi|20827                      :                 -G-A-C--G--C----C-GA-C--A--A-CT--A-A------A--G--T-G-A-TT-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-G-------C-G--C--T--G-A-T-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAAAA
gi|20828                      :                 -G-A-C--G--C------GA-C--A--G-CT--C-A------A--A--T-G-A-TC-C---T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-CCGCCCTCC-G--C--T--A-A-C-G-C---GG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20829                      :                 -G-A-C--G--C---------C--G--A-CTCTA-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---C---TCGCC-------------T-C-------C-G--CATT--A-AAC-GGC---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAT
gi|20831                      :                 -G-A-C--G--CCG--AAGA-C--G--A-CG--G-AC-----A--G--T-G-A-CC-T-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C----------GC-A-G---G--C-G-A--C-TCAGTAA
gi|20833                      :                   -A-C--G--CCG--ACGA-T--G--A-CT--A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TTGCT-------------T-C-------CCG--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATA
gi|20835                      :                   -A-C--A--C----AAGA-T--A--A-CA--G-AT-----A--G--T---A-TT-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-T-G-C---AG-GC-A-G---G--C-A-A--C-ACAAGAA
gi|20837                      :                       --G--C----CAGA-C--G--A-CT--A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-GTTCGCC-------------T-C-------C-G--C--TA-A-A-C-G-C---AG-GC-AGG---G--C-G-A--C-ACA
gi|20838                      :                          --C----AGAA-C--GG-A-CT--T-A------T--G--T---A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCTTCA----------T-C-------C-G--CT-T--A-A-C-G-TCAGAG-AC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAT
gi|20840                      :                                gcAGA-C--G--A-CT--A-A------A--G--T-G-A-T--C-C-T--A-A-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------CTG--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A--------C-G-A--C-ACAATAA
gi|20839                      :                                ccAGA-C--G--A-CT--A-A------A--G--T-G---TC-C-T-T----T-A---T-G-TCGCCAC-----------T-CAT-----C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-A-A--C-ACAATAAtgcaggcaggcgacacaataa
gi|20841                      :                                ccAGA----G--A-CTC-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TTGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-AGCAG-C---AG-GC-A-G---G----G-A--C-ACAATAA
gi|20842                      :                                  AGA-T--G--AACT--A-A------A--AGTT-G-A-TC-C-CCT--A-T-A---T-G-TCGCCATATTAATAGATTT-CTA-----C-G--C--T--A-A-C-G-C----G-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACA
gi|20824                      :                                   GA-C--G--A-CT--A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-A--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20830                      :                             gacaccGA-C--A--A-CT--A-----------G--T-G-A-TC-C-C-T--A-A-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C----------GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAA
gi|20834                      :                             gatgccGA-CT-G--A-CTT-A-A------A--G--T-G-AGTC-C-C-T--AAT-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--ACA-C-G-C---A--GC-A-G---G--CGG-A--C-ACAATAA
gi|20844                      :                                acgcc-C--G--A-CT--C-AT-----A--G--T-G-A-TC-C-T-T--A-T-A---G-G-TTGCC-------------T-C-------T-G--C--T--G-A-T-A-C---AG-GC-A-G---G--T-T-A--C-ATAATGA
gi|20843                      :                                     -C--G--A-CT--C-AT-----A--G--T-G-A-TC-C-C-T--G-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-------------------------GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATGA
gi|20845                      :                                               T--A-T------A--A--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-C-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAT
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gi|20846                      :                              gacggcccagtaccgagttta-A------A--A--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-T-------C-A--C--T--A-A-C-A-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAAAA
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gi|20848                      :                                                               --T-G-A-TC-C-C-T--A-C-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---A--C-G-A--C-ACAATA
gi|20849                      :                                                               --T-G-A-TC-C-C-T--A-C-A---T-A-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---A--C-A-A--C-ACAATA
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gi|20852                      :                                                                                          -G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AA-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACA

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Reference ( family-276 )      :                      GAC-G-A-C--G--CN--A-----GA---C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20762                      :                      GAC-G-A-C--G--CC--A-----GA---C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATGA
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gi|20769                      :                      GAC-G-A-C--G--CC--A-----GA---C--A--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-----G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20770                      :                      GAC-G-A-C--G--CA--A-----GA---C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-A-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATGA
gi|20771                      :                      GAC-G-A-C--G--CC--A-----GA---C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-AC-A-GC--G--G-G-A--C-ACAATAA
gi|20772                      :                      GAC-GGA-C--G--CA--A-----GA---C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAT
gi|20773                      :                      GAC-G-A-C--G--CA--A-----GA---C--A--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAAAA
gi|20774                      :                      GAC-G-A-C--G--CC--A-----GA---C--G--A-TTTA-A------A--A--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATGA
gi|20775                      :                      GAC-G-A-C--G--C---A-----GA---C--G--A-TT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--G-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAAAA
gi|20776                      :                      GAC-A-T-C--G--CA--A-----GA---C--G--A-CTCA-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20777                      :                      GAC-A-A-C--G--CC--A-----GA---C--T--A-C-----------A--G--T-C-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-T-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATGA
gi|20778                      :                      GACAG-A-C--G--CC--A-----GA---C--G--A-CT-A-AC-----A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-----T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-AC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20779                      :                      GAC-G-A-C--G--CC--A-----GA---C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-T---------------------------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20780                      :                      GAC-G-A-C--A--CA--A-----GA---T--G--A-TT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-A-A--C-ACAA
gi|20781                      :                      GAC-G-A-C--G--CC--A-----GG---C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TTGCC-------------A-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-----G--C-G-A--T-ACAATAA
gi|20782                      :                      GAC-G-C-C--G--AC--A-----GA---C--G--A-CTCA-A------A--G--T-G-A-TC-C-T-T--C-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20783                      :                      GAC-G-G-C--C--GA--A-----GA---C--G--C-TC-A-A------A--G--T-GGA-TC-C-TGT--C-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-C------GC-A-G---G--C-GAA--C-ACAATA
gi|20784                      :                      GAT-G-A-C--G--CA--A-----GA---C--G--A-CT-CTA------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-T-G-C---AG-GC-A-G---G--T-G-A--C-ACAACAA
gi|20785                      :                      GAT-G-A-C--G--CC--A-----GA---CACG--A-CT-C-AT-----A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-T-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAT
gi|20786                      :                      GAC-G-A-C--G--CC--A-----GAG--C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-C-CT-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AGCGC-A-G---G--C-G-A--CAACAATA
gi|20787                      :                      GAC-G-A-C--G--CA--A-----GA---C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-CAC-T----T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-G----A---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20788                      :                      GAC-G-AGC--G--CC--A-----GAT--C--G--A-CT-T-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A---A---C-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAT
gi|20789                      :                         -G-A-C--G--CA--A-----AA---C--G--A-CT-A-A------T--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-AATAT-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATGA
gi|20790                      :            gacgacgccaGAC-G-A-C--G--CA--A-----GA---C--G--A-CT-A-ACTTAAAAT-G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-TT------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAACAA
gi|20791                      :                      GAC-G-G-T--G--TA--A-----GA---C--G--A-CT-C-AT-----A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-C---TG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20792                      :                      GAC-G-A-C--G--CA--A-----GA---C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--TA-A-A-C-G-C---AG-GC-A-
gi|20793                      :                      GAC-G-A-C--G--CA--G-----GA---C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-T-A--A-T-A---T-G-TCGCCG------------T-C-------C-G--C--G--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--CTG-A--C-ACAAT
gi|20794                      :                      GAC-G-A-C--G--CC--A-----GA---C--G--A-CT-A-A------A--GG-T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G--CG-C-------------T-C-------C-GT-C--T--A-ACC-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACA
gi|20795                      :                      GAT-G-A-C--G--CA--A------A---C--G--A-CT-C-A------A-----T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T----A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C--CAATAA
gi|20796                      :                      GAC-G-A-T--G--CA--A-----GA---C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C------T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-CGG-C---TG-GC---G---G--C-G-A--C-ACAAAAA
gi|20797                      :                      GAT-G-A-CCAA--CA--A-----GA---C--GGAA-CT-A-A------A--G--T-A-A-TC-C-C-T--A-C-A---T-G-TCGCC-------------TGC-------C-GGGC--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAACAA
gi|20798                      :                      GAC-G-AAC--G--CC--A-----GA---C--G--A-CT-A-A------A--A----G-A----C-T-T--A---A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-GA-C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATGA
gi|20799                      :                      GAC-G-A-C--G--CC--A-----GAA--C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-TA-A-T-C---T-G-TCACC-------------T-C-------C-G--C--CTAA-A-C-G-C---A--GC-A-GC--G--C-G-A--C-ACA
gi|20800                      :                      GAG-G-A-C--G--CA--A-----GA---C--G--A-CT-G-A------------T---A-TC-T-C-T--A-T-A---T-G-CCATC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-A-A--C-ACAACAA
gi|20801                      :                      GAC-G-G-CC-G--AC--A-----GA---C--G--A--T-A-A------A--G--TTG-A-TC-C-C-T--ACT-A---T-G-TCGCC-------------T---------C-G--C--C--A-A-C-G-C---AGAGC-A-GT--G--C-G-A--A-ACAA
gi|20802                      :                                                             -A-A------A--G--T-G-A-TCTC-C-T--T-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C----C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-GCGAA--C-G-A--C-ACAAT
gi|20803                      : gacggcccagtaccgagtttaGAC-G-C-C--G--CC--------GA---C--G--A-CT----------------------------------T-A---T-G-TCGCC-------------T-T-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-AC
gi|20804                      :                       AC-G-A-C--G--CC--A-----GA---C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TA-G-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAT
gi|20805                      :                       AC-G-A-C--G--C---A-----GA---CA-G--A-CT-A-A------A-----T-G-A-TC-C-TAT--A-T-A---TTG-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20806                      :                       AC-G-C-C--G--CA--A-----GA---C--G--A-TT-T-G------ACCG--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-A---A--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20807                      :                       AC-G-A-C--G--CC--A-----GA---C--GCGA-CT-A-A------A--A--T-G-A-TT-C-C-T--A-T-A---T-T-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-G----A---G--C-G-A--C-ACA
gi|20808                      :                       AC-G-A-C--G--CG--ACTAAGAA---C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCG-C-------------T-CAGT----C-G--C--CTAA-A-C-G-C---AG-G--A-G---G--C-G-A--C-ACA
gi|20809                      :                       AC-G-A-T--G--CA--G-----GA---------A-CG-A-A------A--G--T-G-G-AT-C-C-T--A-TTA---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---GATC-G-AACT-ACAAT
gi|20810                      :                       AT-G-A-C--G--CA--A-----GA---C--G--A-CT-A-T------A--G--T-G-A-TC-C-C------T-A---T-G-TCACC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-G-G-C---
gi|20811                      :                        C-G-A-C--G--CC--A-----GA---C--G--A-CT-C-A------G--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20812                      :                        C-G-A-T--G--CC--A-----GA---C--G--A-CT-A-A---------G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCACC-------------T-C-------C-A--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAACAA
gi|20813                      :                        C-G-A-C--G--CC--------GA---C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T---------C-G--C--T--A-A-C---C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAACAA
gi|20814                      :                        C-G-A-C--G--C--------------C--G--C-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAAAA
gi|20815                      :                        C-G-A-C--G--CC--A-----GAAGAC--G--AACT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T----A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAA
gi|20816                      :                        C-G-C-C--G--CC--A-----GAG--C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G---TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------CTG--T--A--A-A-C-G-C----G-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20817                      :                        C-G-A-C--G--GC--A-----GA---C--G--A-CT-A-T------A--G--T-A-A-TC-C-C-TATA-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-A--CTAT--A-A-C-G-C---AG-AC-A-G---G--C-G-A--C-ACA
gi|20818                      :                        C-G-A-C--G--CC--A-----GA---T-------------------A--G--T-G-A-TT-C-C-T--A-T-A---T-T-TTGCC-------------T-T-------T-A--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---A--C-A-A--C-ACAATAA
gi|20819                      :                        C-G-A-A--G--CT--G-----GA---C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-TAT--A-TAA---T-G-TCGC----------------T-------C-A--C-----A-A-C-G-----AG-GC-A-G---G--A-G-A--C-ACAATAA
gi|20820                      :                        C-A-A-C--G--C---A-----GA---C--A--A-A--A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-A-A---T-G-TTGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-CG--AG-GCAA-G---G--C---A--C-ACA
gi|20821                      :                        C-G-A-C--C--C---------GA---C--GC-A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C---T--A-T-A---G-T-TCGCC-------------T-C-------C-G--C-----------------------A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20822                      :                        C-G-A-T--G--CC--A-----GG---C--G--A-CTCA-A------A--G--T-G------C-T-T--G-G-A---A-----------------------C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--T-G-A--C-ACAATAA
gi|20823                      :                         -G-A-C--G--CC--------GA---C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20824                      :                         -G-A-C--A--CC--------GA---C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-A--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20825                      :                         -G-A-C--G--CC--------GA---C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC---------------C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-AGG---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20826                      :                         -G-A-C--G--CC--A-----GA---C--G--A-CT-A-A------A--G--T-A-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C----------GC-A-G---G--T-G-A--C-ACAA
gi|20827                      :                         -G-A-C--G--CC--------GA---C--A--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TT-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-G-------C-G--C--T--G-A-T-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAAAA
gi|20828                      :                         -G-A-C--G--C---------GA---C--A--G-CT-C-A------A--A--T-G-A-TC-C---T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-CCGCCCTCC-G--C--T--A-A-C-G-C---GG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20829                      :                         -G-A-C--G--CC--------GA---C--T----CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---C---TCGCC-------------T-C-------C-G--CATT--A-AAC-GGC---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAT
gi|20830                      :                         -G-A-T--G--CC--------GA---C--A--A-CT-A-----------G--T-G-A-TC-C-C-T--A-A-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C----------GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAA
gi|20831                      :                         -G-A-C--G--CCGAA-----GA---C--G--A-CG-G-AC-----A--G--T-G-A-CC-T-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C----------GC-A-G---G--C-G-A--C-TCAGTAA
gi|20832                      :                                                                 ------A--G--T-G-A-TT-C-C-T--A-A-A---T-G-TCACC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-A-C---AG-GC-A-G---G--C-A-A--C-A
gi|20833                      : gacgccgaatgccaccaacacaagat-A-C--G--CC--GAC---GA---T--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TTGCT-------------T-C-------CCG--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATA
gi|20834                      :                           -A-C--G--CC--------GA---CT-G--A-CTTA-A------A--G--T-G-AGTC-C-C-T--AAT-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--ACA-C-G-C---A--GC-A-G---G--CGG-A--C-ACAATAA
gi|20835                      :                           -A-C--A--CA--A-----GA---T--A--A-CA-G-AT-----A--G--T---A-TT-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-T-G-C---AG-GC-A-G---G--C-A-A--C-ACAAGAA
gi|20836                      :                             -C--G--AC--A-----GA---C--G--A-CT-C-A------A--G--T-G-A-TC-C---T--A-T-A---T-G-TC-CC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-GGC---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20837                      :                               --G--CC--A-----GA---C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-GTTCGCC-------------T-C-------C-G--C--TA-A-A-C-G-C---AG-GC-AGG---G--C-G-A--C-ACA
gi|20838                      :                               --G--CC--A-----GAA--C--GG-A-CT-T-A------T--G--T---A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCTTCA----------T-C-------C-G--CT-T--A-A-C-G-TCAGAG-AC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAT
gi|20839                      :                                  --CC--A-----GA---C--G--A-CT-A-A------A--G--T-G---TC-C-T-T----T-A---T-G-TCGCCAC-----------T-CAT-----C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-A-A--C-ACAATAA
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gi|20841                      :                                      --A-----GA------G--A-CTCA-A------A--G--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TTGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-AGCAG-C---AG-GC-A-G---G----G-A--C-ACAATAAtgcaggcaggcgacacaataa
gi|20842                      :                                      --A-----GA---T--G--AACT-A-A------A--AGTT-G-A-TC-C-CCT--A-T-A---T-G-TCGCCATATTAATAGATTT-CTA-----C-G--C--T--A-A-C-G-C----G-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACA
gi|20843                      :                                                ---C--G--A-CT-C-AT-----A--G--T-G-A-TC-C-C-T--G-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-------------------------GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATGA
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gi|20846                      :                                                               -A------A--A--T-G-A-TC-C-C-T--A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-T-------C-A--C--T--A-A-C-A-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAAAA
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lowQualScore                  :    . . . .. .. ..... .. . ... .. ....... .  ... . ........ .. .. . . .  . . .. . . . ... . .     ............. . ....... . .. .. .. . . . . ...  .  . . ... .. . . .. .       
lowQualScore                  :    6 5 1 22 77 11111 77 5 777 11 5555555 0  222 5 44444444 11 11 5 5 5  5 5 44 4 9 9 444 9 4     2222222222222 9 8888888 3 55 66 11 4 8 9 9 222  9  4 9 111 66 9 4 66 4       
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Reference ( family-276 )      : GAC-G-A-C--G--C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
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gi|20777                      : GAC-A-A-C--G--C--C--A--G-A---C--T-------A-C---------------A--G--T-C-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-T-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATGA
gi|20778                      : GACAG-A-C--G--C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-AC-------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-----T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-AC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20779                      : GAC-G-A-C--G--C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-T---------------------------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20780                      : GAC-G-A-C--A--C--A--A--G-A---T--G-------A-TT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-A-A--C-ACAA
gi|20781                      : GAC-G-A-C--G--C--C--A--G-G---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TTGCC-------------A-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-----G--C-G-A--T-ACAATAA
gi|20782                      : GAC-G-C-C--G--A--C--A--G-A---C--G-------A-CTC--A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-T--T-C-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20783                      : GAC-G------G--C--CGAA--G-A---C--G-------C-TC---A-A--------A--G--T-GGA-TC-C-TG-T-C-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-C------GC-A-G---G--C-GAA--C-ACAATA
gi|20784                      : GAT-G-A-C--G--C--A--A--G-A---C--G-------A-CT---CTA--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-T-G-C---AG-GC-A-G---G--T-G-A--C-ACAACAA
gi|20785                      : GAT-G-A-C--G--C--C--A--G-A---CACG-------A-CT---C-AT-------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-T-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAT
gi|20786                      : GAC-G-A-C--G--C--C--A--G-AG--C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-C-CT-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AGCGC-A-G---G--C-G-A--CAACAATA
gi|20787                      : GAC-G-A-C--G--C--A--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-CAC--T---T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-G----A---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20788                      : GAC-G-AGC--G--C--C--A--G-AT--C--G-------A-CT---T-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A---A---C-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAT
gi|20789                      : GAC-G-A-C--G--C--C--A--G-A---C--GCAAAACGA-CT---A-A--------T--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-AATAT-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATGA
gi|20790                      : GAC-G-A-C--G--C--A--A--G-A---C--G-------A-CT---A-ACTTAAA--AT-G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-TT------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAACAA
gi|20791                      : GAC-G-G-T--G--T--A--A--G-A---C--G-------A-CT---C-AT-------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-C---TG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20792                      : GAC-G-A-C--G--C--A--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--TA-A-A-C-G-C---AG-GC-A-
gi|20793                      : GAC-G-A-C--G--C--A--G--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-T--A-A-T-A---T-G-TCGCCG------------T-C-------C-G--C--G--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--CTG-A--C-ACAAT
gi|20794                      : GAC-G-A-C--G--C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--GG-T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G--CG-C-------------T-C-------C-GT-C--T--A-ACC-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACA
gi|20795                      : GAT-G-A-C--G--C-----A--A-A---C--G-------A-CT---C-A--------A-----T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T----A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C--CAATAA
gi|20796                      : GAC-G-A-T--G--C--A--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C------T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-CGG-C---TG-GC---G---G--C-G-A--C-ACAAAAA
gi|20797                      : GAT-G-A-CCAA--C--A--A--G-A---C--GGA-----A-CT---A-A--------A--G--T-A-A-TC-C-C--T-A-C-A---T-G-TCGCC-------------TGC-------C-GGGC--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAACAA
gi|20798                      : GAC-G-AAC--G--C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--A----G-A----C-T--T-A---A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-GA-C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATGA
gi|20799                      : GAC-G-A-C--G--C--C--A--G-AA--C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--TAA-T-C---T-G-TCACC-------------T-C-------C-G--C--CTAA-A-C-G-C---A--GC-A-GC--G--C-G-A--C-ACA
gi|20800                      : GAG-G-A-C--G--C--A--A--G-A---C--G-------A-CT---G-A--------------T---A-TC-T-C--T-A-T-A---T-G-CCATC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-A-A--C-ACAACAA
gi|20801                      : GAC-G-G-CC-G--A--C--A--G-A---C--G-------A--T---A-A--------A--G--TTG-A-TC-C-C--T-ACT-A---T-G-TCGCC-------------T---------C-G--C--C--A-A-C-G-C---AGAGC-A-GT--G--C-G-A--A-ACAA
gi|20802                      : GAC-G-G-C-----C--C--A--GTA---CC-G-------A-GTTTAA-A--------A--G--T-G-A-TCTC-C--T-T-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C----C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-GCGAA--C-G-A--C-ACAAT
gi|20803                      : GAC-G-C-C--G--C--C-----G-A---C--G-------A-CT--------------------------------------T-A---T-G-TCGCC-------------T-T-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-AC
gi|20804                      :  AC-G-A-C--G--C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TA-G-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAT
gi|20805                      :  AC-G-A-C--G--C-----A--G-A---CA-G-------A-CT---A-A--------A-----T-G-A-TC-C-TA-T-A-T-A---TTG-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20806                      :  AC-G-C-C--G--C--A--A--G-A---C--G-------A-TT---T-G--------ACCG--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-A---A--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20807                      :  AC-G-A-C--G--C--C--A--G-A---C--GCG-----A-CT---A-A--------A--A--T-G-A-TT-C-C--T-A-T-A---T-T-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-G----A---G--C-G-A--C-ACA
gi|20808                      :  AC-G-A-C--G--CGACTAA--G-AA--C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCG-C-------------T-CAGT----C-G--C--CTAA-A-C-G-C---AG-G--A-G---G--C-G-A--C-ACA
gi|20809                      :  AC-G-A-T--G--C--A--G--G-A--------------A-CG---A-A--------A--G--T-G-G-AT-C-C--T-A-TTA---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---GATC-G-AACT-ACAAT
gi|20810                      :  AT-G-A-C--G--C--A--A--G-A---C--G-------A-CT---A-T--------A--G--T-G-A-TC-C-C------T-A---T-G-TCACC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-G-G-C---
gi|20811                      :   C-G-A-C--G--C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---C-A--------G--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20812                      :   C-G-A-T--G--C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A-----------G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCACC-------------T-C-------C-A--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAACAA
gi|20813                      :   C-G-A-C--G--C--C-----G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T---------C-G--C--T--A-A-C---C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAACAA
gi|20814                      :   C-G-A-C--G--C--C--------------G-------C-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAAAA
gi|20815                      :   C-G-A-C--G--C--C--A--G-AAGAC--G-------AACT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T----A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAA
gi|20816                      :   C-G-C-C--G--C--C--A--G-AG--C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G---TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------CTG--T--A--A-A-C-G-C----G-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20817                      :   C-G-A-C--G--G--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-T--------A--G--T-A-A-TC-C-CTAT-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-A--CTAT--A-A-C-G-C---AG-AC-A-G---G--C-G-A--C-ACA
gi|20818                      :   C-G-A-C--G--C--C--A--G-A---T----------------------------A--G--T-G-A-TT-C-C--T-A-T-A---T-T-TTGCC-------------T-T-------T-A--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---A--C-A-A--C-ACAATAA
gi|20819                      :   C-G-A-A--G--C--T--G--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-TA-T-A-TAA---T-G-TCGC----------------T-------C-A--C-----A-A-C-G-----AG-GC-A-G---G--A-G-A--C-ACAATAA
gi|20820                      :   C-A-A-C--G--C-----A--G-A---C--A-------A-A----A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-A-A---T-G-TTGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-CG--AG-GCAA-G---G--C---A--C-ACA
gi|20821                      :   C-G-A-C-----C--C-----G-A---C--GC------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C----T-A-T-A---G-T-TCGCC-------------T-C-------C-G--C-----------------------A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20822                      :   C-G-A-T--G--C--C--A--G-G---C--G-------A-CTC--A-A--------A--G--T-G------C-T--T-G-G-A---A-----------------------C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--T-G-A--C-ACAATAA
gi|20823                      :    -G-A-C--G--C--C-----G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20824                      :    -G-A-C--A--C--C-----G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-A--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20825                      :    -G-A-C--G--C--C-----G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC---------------C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-AGG---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20826                      :    -G-A-C--G--C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-A-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C----------GC-A-G---G--T-G-A--C-ACAA
gi|20827                      :    -G-A-C--G--C--C-----G-A---C--A-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TT-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-G-------C-G--C--T--G-A-T-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAAAA
gi|20828                      :    -G-A-C--G--C--------G-A---C--A-------G-CT---C-A--------A--A--T-G-A-TC-C----T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-CCGCCCTCC-G--C--T--A-A-C-G-C---GG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20829                      :    -G-A-C--G--C--C-----G-A---C--T---------CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---C---TCGCC-------------T-C-------C-G--CATT--A-AAC-GGC---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAT
gi|20830                      :    -G-A-T--G--C--C-----G-A---C--A-------A-CT---A-------------G--T-G-A-TC-C-C--T-A-A-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C----------GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAA
gi|20831                      :    -G-A-C--G--C--CGAA--G-A---C--G-------A-CG---G-AC-------A--G--T-G-A-CC-T-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C----------GC-A-G---G--C-G-A--C-TCAGTAA
gi|20832                      :    -G-A-C--G--C--C--G--A-A---T--GCC-----A-CC---A-ACACAAGATA--G--T-G-A-TT-C-C--T-A-A-A---T-G-TCACC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-A-C---AG-GC-A-G---G--C-A-A--C-A
gi|20833                      :      -A-C--G--C--C--GACG-A---T--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TTGCT-------------T-C-------CCG--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATA
gi|20834                      :      -A-C--G--C--C-----G-A---CT-G-------A-CTT--A-A--------A--G--T-G-AGTC-C-C--T-AAT-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--ACA-C-G-C---A--GC-A-G---G--CGG-A--C-ACAATAA
gi|20835                      :      -A-C--A--C--A--A--G-A---T--A-------A-CA---G-AT-------A--G--T---A-TT-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-T-G-C---AG-GC-A-G---G--C-A-A--C-ACAAGAA
gi|20836                      :        -C--G--A--C--A--G-A---C--G-------A-CT---C-A--------A--G--T-G-A-TC-C----T-A-T-A---T-G-TC-CC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-GGC---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20837                      :          --G--C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-GTTCGCC-------------T-C-------C-G--C--TA-A-A-C-G-C---AG-GC-AGG---G--C-G-A--C-ACA
gi|20838                      :          --G--C--C--A--G-AA--C--GG------A-CT---T-A--------T--G--T---A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCTTCA----------T-C-------C-G--CT-T--A-A-C-G-TCAGAG-AC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAT
gi|20839                      :             --C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G---TC-C-T--T---T-A---T-G-TCGCCAC-----------T-CAT-----C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-A-A--C-ACAATAA
gi|20840                      :             --C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-T--C-C--T-A-A-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------CTG--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A--------C-G-A--C-ACAATAA
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gi|20843                      :                           ---C--G-------A-CT---C-AT-------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-G-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-------------------------GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATGA
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gi|20845                      :                                            T---A-T--------A--A--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-C-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAT
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Reference ( family-276 )      : GAC-G-A-C--G--C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
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gi|20796                      : GAC-G-A-T--G--C--A--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C------T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-CGG-C---TG-GC---G---G--C-G-A--C-ACAAAAA
gi|20797                      : GAT-G-A-CCAA--C--A--A--G-A---C--GGA-----A-CT---A-A--------A--G--T-A-A-TC-C-C--T-A-C-A---T-G-TCGCC-------------TGC-------C-GGGC--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAACAA
gi|20798                      : GAC-G-AAC--G--C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--A----G-A----C-T--T-A---A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-GA-C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATGA
gi|20799                      : GAC-G-A-C--G--C--C--A--G-AA--C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--TAA-T-C---T-G-TCACC-------------T-C-------C-G--C--CTAA-A-C-G-C---A--GC-A-GC--G--C-G-A--C-ACA
gi|20800                      : GAG-G-A-C--G--C--A--A--G-A---C--G-------A-CT---G-A--------------T---A-TC-T-C--T-A-T-A---T-G-CCATC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-A-A--C-ACAACAA
gi|20801                      : GAC-G-G-CC-G--A--C--A--G-A---C--G-------A--T---A-A--------A--G--TTG-A-TC-C-C--T-ACT-A---T-G-TCGCC-------------T---------C-G--C--C--A-A-C-G-C---AGAGC-A-GT--G--C-G-A--A-ACAA
gi|20802                      : GAC-G-G-C-----C--C--A--GTA---CC-G-------A-GTTTAA-A--------A--G--T-G-A-TCTC-C--T-T-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C----C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-GCGAA--C-G-A--C-ACAAT
gi|20803                      : GAC-G-C-C--G--C--C-----G-A---C--G-------A-CT--------------------------------------T-A---T-G-TCGCC-------------T-T-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-AC
gi|20804                      :  AC-G-A-C--G--C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TA-G-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAT
gi|20805                      :  AC-G-A-C--G--C-----A--G-A---CA-G-------A-CT---A-A--------A-----T-G-A-TC-C-TA-T-A-T-A---TTG-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20806                      :  AC-G-C-C--G--C--A--A--G-A---C--G-------A-TT---T-G--------ACCG--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-A---A--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20807                      :  AC-G-A-C--G--C--C--A--G-A---C--GCG-----A-CT---A-A--------A--A--T-G-A-TT-C-C--T-A-T-A---T-T-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-G----A---G--C-G-A--C-ACA
gi|20808                      :  AC-G-A-C--G--CGACTAA--G-AA--C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCG-C-------------T-CAGT----C-G--C--CTAA-A-C-G-C---AG-G--A-G---G--C-G-A--C-ACA
gi|20809                      :  AC-G-A-T--G--C--A--G--G-A--------------A-CG---A-A--------A--G--T-G-G-AT-C-C--T-A-TTA---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---GATC-G-AACT-ACAAT
gi|20810                      :  AT-G-A-C--G--C--A--A--G-A---C--G-------A-CT---A-T--------A--G--T-G-A-TC-C-C------T-A---T-G-TCACC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-G-G-C---
gi|20811                      :   C-G-A-C--G--C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---C-A--------G--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20812                      :   C-G-A-T--G--C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A-----------G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCACC-------------T-C-------C-A--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAACAA
gi|20813                      :   C-G-A-C--G--C--C-----G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T---------C-G--C--T--A-A-C---C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAACAA
gi|20814                      :   C-G-A-C--G--C--C--------------G-------C-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAAAA
gi|20815                      :   C-G-A-C--G--C--C--A--G-AAGAC--G-------AACT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T----A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAA
gi|20816                      :   C-G-C-C--G--C--C--A--G-AG--C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G---TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------CTG--T--A--A-A-C-G-C----G-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20817                      :   C-G-A-C--G--G--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-T--------A--G--T-A-A-TC-C-CTAT-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-A--CTAT--A-A-C-G-C---AG-AC-A-G---G--C-G-A--C-ACA
gi|20818                      :   C-G-A-C--G--C--C--A--G-A---T----------------------------A--G--T-G-A-TT-C-C--T-A-T-A---T-T-TTGCC-------------T-T-------T-A--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---A--C-A-A--C-ACAATAA
gi|20819                      :   C-G-A-A--G--C--T--G--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-TA-T-A-TAA---T-G-TCGC----------------T-------C-A--C-----A-A-C-G-----AG-GC-A-G---G--A-G-A--C-ACAATAA
gi|20820                      :   C-A-A-C--G--C-----A--G-A---C--A-------A-A----A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-A-A---T-G-TTGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-CG--AG-GCAA-G---G--C---A--C-ACA
gi|20821                      :   C-G-A-C-----C--C-----G-A---C--GC------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C----T-A-T-A---G-T-TCGCC-------------T-C-------C-G--C-----------------------A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20822                      :   C-G-A-T--G--C--C--A--G-G---C--G-------A-CTC--A-A--------A--G--T-G------C-T--T-G-G-A---A-----------------------C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--T-G-A--C-ACAATAA
gi|20823                      :    -G-A-C--G--C--C-----G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20824                      :    -G-A-C--A--C--C-----G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-A--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20825                      :    -G-A-C--G--C--C-----G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC---------------C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-AGG---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20826                      :    -G-A-C--G--C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-A-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C----------GC-A-G---G--T-G-A--C-ACAA
gi|20827                      :    -G-A-C--G--C--C-----G-A---C--A-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TT-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-G-------C-G--C--T--G-A-T-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAAAA
gi|20828                      :    -G-A-C--G--C--------G-A---C--A-------G-CT---C-A--------A--A--T-G-A-TC-C----T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-CCGCCCTCC-G--C--T--A-A-C-G-C---GG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20829                      :    -G-A-C--G--C--C-----G-A---C--T---------CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---C---TCGCC-------------T-C-------C-G--CATT--A-AAC-GGC---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAT
gi|20830                      :    -G-A-T--G--C--C-----G-A---C--A-------A-CT---A-------------G--T-G-A-TC-C-C--T-A-A-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C----------GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAA
gi|20831                      :    -G-A-C--G--C--CGAA--G-A---C--G-------A-CG---G-AC-------A--G--T-G-A-CC-T-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C----------GC-A-G---G--C-G-A--C-TCAGTAA
gi|20832                      :    -G-A-C--G--C--C--G--A-A---T--GCC-----A-CC---A-ACACAAGATA--G--T-G-A-TT-C-C--T-A-A-A---T-G-TCACC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-A-C---AG-GC-A-G---G--C-A-A--C-A
gi|20833                      :      -A-C--G--C--C--GACG-A---T--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TTGCT-------------T-C-------CCG--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATA
gi|20834                      :      -A-C--G--C--C-----G-A---CT-G-------A-CTT--A-A--------A--G--T-G-AGTC-C-C--T-AAT-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--ACA-C-G-C---A--GC-A-G---G--CGG-A--C-ACAATAA
gi|20835                      :      -A-C--A--C--A--A--G-A---T--A-------A-CA---G-AT-------A--G--T---A-TT-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-T-G-C---AG-GC-A-G---G--C-A-A--C-ACAAGAA
gi|20836                      :        -C--G--A--C--A--G-A---C--G-------A-CT---C-A--------A--G--T-G-A-TC-C----T-A-T-A---T-G-TC-CC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-GGC---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20837                      :          --G--C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-GTTCGCC-------------T-C-------C-G--C--TA-A-A-C-G-C---AG-GC-AGG---G--C-G-A--C-ACA
gi|20838                      :          --G--C--C--A--G-AA--C--GG------A-CT---T-A--------T--G--T---A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCTTCA----------T-C-------C-G--CT-T--A-A-C-G-TCAGAG-AC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAT
gi|20839                      :             --C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G---TC-C-T--T---T-A---T-G-TCGCCAC-----------T-CAT-----C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-A-A--C-ACAATAA
gi|20840                      :             --C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-T--C-C--T-A-A-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------CTG--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A--------C-G-A--C-ACAATAA
gi|20841                      :                   --A--G-A------G-------A-CTC--A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TTGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-AGCAG-C---AG-GC-A-G---G----G-A--C-ACAATAAtgcaggcaggcgacacaataa
gi|20842                      :                   --A--G-A---T--G-------AACT---A-A--------A--AGTT-G-A-TC-C-CC-T-A-T-A---T-G-TCGCCATATTAATAGATTT-CTA-----C-G--C--T--A-A-C-G-C----G-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACA
gi|20843                      :                           ---C--G-------A-CT---C-AT-------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-G-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-------------------------GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATGA
gi|20844                      :                           ---C--G-------A-CT---C-AT-------A--G--T-G-A-TC-C-T--T-A-T-A---G-G-TTGCC-------------T-C-------T-G--C--T--G-A-T-A-C---AG-GC-A-G---G--T-T-A--C-ATAATGA
gi|20845                      :                                            T---A-T--------A--A--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-C-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAT
gi|20846                      :                                                 -A--------A--A--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-T-------C-A--C--T--A-A-C-A-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAAAAA
gi|20847                      :                                                            --G--T-G-A-CC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGC--------------T-C-------C-G--G-----G-G-C---C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
gi|20848                      :                                                               --T-G-A-TC-C-C--T-A-C-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---A--C-G-A--C-ACAATA
gi|20849                      :                                                               --T-G-A-TC-C-C--T-A-C-A---T-A-TCGCC-------------T-C-------T-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---A--C-A-A--C-ACAATA
gi|20850                      :                                                                                -A-T-A-----G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-T---AG-GC-A-G---G--C-G-A--T-ACAATAA
gi|20851                      :                                                                                    -A---T-G-TCGC--------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--T-ACAATAA
gi|20852                      :                                                                                          -G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AA-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACA


blockSeqs                     :        G CA    GACTA      AGA AC CAAAACG    TTA   CACAAGAT CC GT            TA       ATA         ATATTAATAGATT   CGCCCTC T GG TA TA   A     CAG         CGA
blockSeqs                     :        A C     CGA        G   C  GA         C     CTTAAA   T  G             G        AG          TCA             AGT     C T  AT TA   C     G           C  
blockSeqs                     :        . .     CGA        T   A  CG         T     C        .  .             A        .           AC              AT      T A  T  A    A     .           C  
blockSeqs                     :        . .     A          A   T  CC         C     T        .  .             A        .           G               TA      . .  .  A    G     .           T  
blockSeqs                     :        . .     A          A   .  C          C     T        .  .             C        .           .               T       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          G   .  G          C     C        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          A   .  .          T     T        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     A          .   .  .          C     T        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     A          .   .  .          .     T        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     A          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     A          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     A          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     A          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     A          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     A          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     A          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     A          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     A          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     A          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     A          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     A          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     A          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     A          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     A          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     A          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     A          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     T          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     A          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     C          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :        . .     .          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :          .     .          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :          .     .          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :                .          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :                .          .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :                           .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :                           .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :                           .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :                           .   .  .          .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :                                             .     .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :                                                   .        .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :                                                            .  .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :                                                               .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :                                                               .             .        .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :                                                                                      .           .               .       . .  .  .    .     .           .  
blockSeqs                     :                                                                                      .           .               .       . .  .  .    .     .              
blockSeqs                     :                                                                                                  .               .       . .  .  .    .     .              


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : GAC-G-A-C--G--C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA
finalCons                     : GAC-G-A-C--G--C--C--A--G-A---C--G-------A-CT---A-A--------A--G--T-G-A-TC-C-C--T-A-T-A---T-G-TCGCC-------------T-C-------C-G--C--T--A-A-C-G-C---AG-GC-A-G---G--C-G-A--C-ACAATAA