lowQualScore : 11111111 11111111
lowQualScore : 1 0 111111 1 0 111 2 1 444444444 0 11 0 11 22222222 11111 1 55555555 0 888 11 0 0 000 0 77777 000 8888 0000 0 0 0 1111111 0 1
lowQualScore : . . ...... . . ... . . ......... . .. . .. ........ ..... . ........ . ... .. . . ... . ..... ... .... .... . . . ....... . .
lowQualScore : 3 7 999999 3 6 111 5 2 333333333 6 77 6 55 33333333 55555 2 66666666 5 000 22 4 4 888 9 88888 888 8888 9999 4 4 4 5555555 9 0
consensus : AATAAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-GG------C--T-TT--C-A--G-N------CA-----AA-GG---TC--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G-T-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
Reference ( gi|130667 ) : AATAAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-GG------C--T-TT--C-A--G-T------CA-----AA-GA---TG--AC-T-T-AAGGT--CA-T-T---T-T-G-T-A---A--G-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130663 : AATAAG-T-A------A-C-AAG---TAAA-T-GG------C--T-TT--C-A--G-T------TA-----AA-GT---TT--A--T-C-AAGGT--CA-T-T---T-A-G-T-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATAT
gi|130679 : AGTAAA-T-A------A-G-ATG---CAAA-T-TG------C--T-TT--C-A--G-T------CA-----AA-GG---AG--AT-T-C-AAGGT--AA-T-T---T-T-G-T-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130686 : AACAAG-T-A------A-C-AAG---CAAA-T-GG------C--T-TT--C-A--G-A------CA-----AA-GG---TA--AC-C-C-AAGGT--TC-G-T---T-T-G-T-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAAGATAT
gi|130661 : AATAAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-GG------T--T-TT--C-A--G-G------CA-----AA-AA---TT--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---C-T-C-G-A---A--T-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGACCATAT
gi|130676 : AATAAG-T-A------A-C-AGG---CATA-T-GG------C--T-TT--C-A--A-A------CA-----AA-GG---TC--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-T-T-A---A--A-GA----T-C-AAG-G-------T-CATTCAACATAT
gi|130682 : AATAAG-T-A------G-C-AGG---TGAA-T-GG------C--T-TT--C-A--G-A------CA-----AA-GG---TC--AC-T-C-AAGAT--CA-T-T---T-T-G-T-A---A--A-GG----T-C-AAG-GTTAAAGAT-TACTCAGAACAT
gi|130689 : AAGAAG-T-A------A-T-AGG---CAAA-T-GA------C--T-TT--C-A--G-A------CA-----AA-GT---TC--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G-T-A---A--A-AG----T-C-AAG-G-------T-CACg
gi|130673 : AATAGG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-GG------C--T-TT--C-G--G--------CA-----AA-AG---TT--AC-T-TCAAGGT--CA-T-T---T-TGG-C-A---A-----G----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGATCATAT
gi|130677 : AAGAAG-T-A------A-C-AGG---CATA-TTGG------C--T-TC--C-A--G-G------TA-----AA-GG---TC--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G-G-A---A--A-GG----T-TAAAG-G-------T-CACTTAGAATATAT
gi|130655 : AATAAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-GG------G--T-TT--C-A--G-G------CA-----AA-AT---TT--AC-T-C-AAGGT--CA-T-C---T-T-G-G-A---A--A-TG----G-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130662 : AATAAG-T-A------A-T-AGG---CATA-T-GA------T--T-TT--C-A--G-G------CA-----AA-AT---TT--AT-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-T-G-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-TACTCAGAACATAT
gi|130666 : AATAAT-T-A------A-C-AGG---CAA--T-GG------G--T-TT--C-A--G-T------TA-----AA-G----TT--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-A-G-A---A--G-G-----T-C-GAG-G-------T-CACTGAGAACATAT
gi|130654 : AATAAT-T-A------A-C-AAG---CAAA-T-TA------C--T-TT--T-A--G-T------CA-----AA-GG---TG--AC-T-T-AAGGT--CA-T-T---T-T-G-TGA---A--G-GG----T-C-A
gi|130674 : AATAAG-T-A------A-C-ATG---CAAG-T-GG------T--A-TT--C-A--G-G------CA-----AA-CG---TT--AC-T-C-AAGGT--TA-T-T---T-T-G-A-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-TACTCAGAAAAT
gi|130681 : AATAAG-T-A------A-C-AGG---CGAA-T-AA------C--T-TT--C-A--G-A------CA-----AA-GA---TC--AC-C-C-ATGCT--CA-T-T---T-T-G-G-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACT
gi|130672 : AATAAT-T-A------A-C-GAA---GAAA-T-TA------C--T-TT--T-A--T-T------CA-----AA-GG---TT--AC-T-T-AAGGT--CA-T-T---T-T-G-T-G---A--A-GG----T-G-AAG-G-------T-CACTTAAAATATAT
gi|130687 : AGTAAG-T-A------A-T-AGG---CAAG-T-GG------C--A-T---C-A--G-A------CA-----AA-GG---CT--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G-T-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------C-CACT
gi|130691 : AATAAG-T-A------A-T-AGG---CAAA-T-GG------C--T-TT--C-A--GAC------CAAGATCAA-GA---TC--AC-T-C-AAGGT--AA-T-T---T-T-A-T-A---A--A-GG----T-A-AAG-G-------T-CA
gi|130653 : AATAAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-AG------G--T-TT--C-AG-G-T------AA-----AA-GC---T---AC-T-C-AAGGT--TA-T-T---T-T---T-G---A--A-AG----T-T-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130664 : AATAAG-T-A------A-T-AAG---CAAA-T-GA------C--T-AT--T-G--G-A------CA-----AA-GG---TC--AC-T-C-AAGAT--CA-T-T---T-T-G-T-A---A--A-GGTTAAT-T-AAG-G-------T-TACTC--AATATAT
gi|130690 : AATAAG-A-A------A-C-AGG---CAAA-T-GG------C--C-TT----A--G-A------AA-----AA-GG---TC--AC-T-C-GGGGT--CA-T-T---T-T-G-A-A---A--A-GG----T-T-AAA-G-------T-CACTCAGg
gi|130657 : AACAAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-GG------G--T-TT--C-A--G-G------TA-----AA-AT---TT--AC-C-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G---A---A--A-GG----T-C--AG-G-------T-C-CTGAGAACATGT
gi|130678 : AGTAAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-GT------T--T-TA--C-A--G-G------CA-----AA-AG---TT--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G---A---A--A-AA----T-C-AAG-G-------T-AACTCA
gi|130658 : AACAAG-T-A------A-C-AGG---C-AA-T-GG------G--T-TT--C-A--G-G------TA-----AA-AT---TT--AC-TCC-AAGGT--CA-T-T---T-T-G---A---A--A-GG----T-C-CAG-G-------T-CACTGAGAACATGTcagca
gi|130675 : AATAAG-G-A------A-T-AGG---CAAA-T-GA------C--T-GA--C-A--G-G------CA-----AA-GG---TC--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-G-G-T-A---A--A-GG----TAG-GGG-G-------T-CACTCAATATACAT
gi|130684 : AATAAG-A-A------A-C-AGG---CAAA-T-GG------C--T-T------------------------------------AC-----AAGGT--CC-T-T---T-T-G-T-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAACATATgt
gi|130683 : AATAAG-A-A------A-C-AGG---CAAA-T-GG------C--T-T------------------------------------AC-----AAGGT--CC-T-T---T-T-G-T-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAACATAT
gi|130656 : AACAAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-TGGG------T--T-TT--C-A--G-G------GT-----AA-AA---TT--AC-TCC-AAGGT--CA---T---T-T-G---A---A--A-GG----T-C-CAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130695 : AATAAG-TTA------A-C-GAG---CAAA-A-AG------C--T-TT--C-A--G-TC-----CA-----AA-GG---T---AC-T-CAAAGAT--CA-T-T---TGT-G-T-A---A----AG----T-C-AGG-T-------T-CACTCAGGATATGT
gi|130668 : AATAAG-G-A------A-C-AGG---CAAA-T-GA------G--T-TT--C-A--A-G------CA-----AA-AG---TT--GC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-TGG-T-A---ACTA-GG----T-C-AAT-G-------T-TACGGAGAACATGT
gi|130659 : AACAAG-T-A------A-C-AGG---CAAT-G-GG------T--T-TT--C-A--G---------G-----AA-AA---TT--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---------T-G---A--A-GG----T-C--AG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130665 : AATAGG-T-T------A-C-AGA---CTAA-T--------------------A--G-G------CA-----AA-GG---TC--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G-T-A---A--A-GG----T-T-GAG-G-------T-CACTCTGAAGATAT
gi|130688 : AATAAA-A-A------A-C--GA---CAAA-T-GG---------T-CT--C-A--G-A------CA-----AA-GG---TC--AC-T-C-AAGGT--CA-TCT---T-T-G---A---A--A-AG----T-C-AAA-G-------C-TGCTCAGAATAT
gi|130692 : AATAAA-T-A------T-C-AGG---TAAA-T-AA------C--T-TT--T-A--G-A------CA-----GG-AG---TT--AC-T-C-AAGGT--CA---T---T-T-G-T-A---A--A-GG----T-C-AAA-G-------T-TACT
gi|130660 : AACAAG-G-A------A-T-AGG---CAAA-T-GA------C--T-AA--C-T--G-G------CA-----AA-GG---TC--AC-A-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G-T-A---A--A-AG----T-T-GAG-G-------T-CACTgggga
gi|130685 : AATAAG-T-A------A-T-AGA---CAAA-T-GA------C--T-TT--A-A--T-A------CA-----AAGGG---TC--AC-T-T-GAAGT--CATT-T---T-T-A-T-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-
gi|130669 : AATGAA-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-AA------G--T-TT----A--G-TATGAGGCA-----AA-AG---TT--AC-T-C-AAGGT--CA-C-T---T-T-G-G-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CA--GAGAACATGT
gi|130680 : AATAAG-T-T------A-C-A-----CAAA-T-GG------CGGC-TT--T-A--G-G------TA-----AA------TT--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GAT-C---A----GG----T-C-AAG-A-------T-CACTGAAAACATGT
gi|130671 : AATAAGGT-A------A---AGG---CAAA-T-GG------G--T-TTTCC-A--G-G------TA-----AA-AAGAGTT--AC-TAC-AAGGT--CA-T-T---T-T-T-G-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------TCCACTGAAAA
gi|130670 : AATAAGGT-A------A---AGG---CAAA-T-GG------G--T-TTTCC-A--G-G------TA-----AA-AAGAGTT--AC-TAC-AAGGT--CA-T-T---T-T-T-G-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------TCCACTGAAAA
gi|130693 : AATAAG-T-A------A-T-AGG---CAAA-C-AA------T--T-TT--C-G--G----------------G-GA--------------AAGGT--TA-T-T---T-A-G-G-A---A--A-AG----T-C-AAG-G-------T-CGCCCAGAACATGT
gi|130696 : AATAAA-T-A------A-C-AGG---TAAA---GG------A--T-TT--C-A------------------AA-GG---TT--AC-A-C-AAAAT--CA-T-T---T-T-G-G-A---A--A-AG----T-G-AGG-G-------C-TACTTAAAATA
gi|130697 : ATAAG-A-A------A-C-AAG---CAAT-T-GA------C--T-TT--C-G--G-T------CA-----AA-GG---TG--AC-T-T-AAGGT--CA-T-T---T-T-G-T-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTTAAAATATAT
gi|130702 : ATATA-T-A------A-C-AGA---CAAA-T-GG------C--T-TT--C-A--G-T------CA-----AA-GG---TC--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G-T-A---A--A-TG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAACATAT
gi|130701 : ATAAG-T-A------A-T-AGA---CAAA-T-GA------C--T-TT--C-A--G-A------TG-----AA-GA---TC--AC-T-C-AAGAT--CA-T-T---T-T-G-T-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------A-CACT
gi|130699 : ACAAA-T-G------A-T-AGA---CAAA-T-GA------C--T-TT--C-A--G-G------CA-----AA-GA---TC--AC-T-C-AAGGT--TA-T-T---T-T-G-T-A---A--A-GG----T-C-AAG-A-------T-CA
gi|130703 : ATAAG-T-A------A-T-AAG---CAAA-T-GG------T--C-TT--C-A--G-A------CA-----AC-GG---CC--TC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G-T-ATTTA----GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAACATAT
gi|130704 : ATAAG-T-A------A-A-ATG---CAAA-T-AG------T--T-TT--TTA--G-A------CA-----AA-GA---TC--AC-T-G-AAGGT--TG-T-T---T-T-A-T-A---A--A-GA----C-C-AAG-G-------C-CACTCAGAACATGT
gi|130700 : ATACG-T-A------A-C-AGG---CAAAAT-GG---------T-TT--C-A--G-G------CT-----AA--A---TT--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-A-G-A-A---A--A-GG----T-C-AAGCG-------T-CACT
gi|130698 : ATAAG-T-A------A-T-AGG---CAAA-T-GA------T--T-AA--C-G--G-G------CA-----AA-GG---TC--AC-T-C-AAAGT--CA-A-T---T-T-G-T-G---A--A-GG----C-T-GAG-A-------T-CACTCAga
gi|130709 : TAAG-T-A------A-T-TGG---TAAA-T-GG------C--T-TT--C-A--G-T------CA-----AG-GG---TC--AC-T-C-AAGGT--CA---T---C-T-G-T-G---A--A-AG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATATacat
gi|130711 : TAAG-T-A------A-C-AGG---TAAA----G------C--T-TT--C-A--G-T------CA-----AA-AG---TC--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G-T-A---A--T-GG----T-C-TAT-G-------T-CACTCAGAATATGT
gi|130708 : TAAA-T-A------AAC-AAG---CAAAAT-GG------C--C-TT--C-A--G-T------TA-----AA-AG---TT--AC-T-C-AAGGTTTCA-T-T---T-TTG-T-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130707 : TAAA-T-A------AAC-AAG---CAAAAT-GG------C--C-TT--C-A--G-T------TA-----AA-AG---TT--AC-T-C-AAGGTTTCA-T-T---T-TTG-T-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130706 : TAAG-T-ACATGTTA-C-AAG---CAAA-T-GGCCATGGC--T-TT--C-A--G-T------CA-----AA-GG---TG--AC-T-T-AATGT--CA-T-T---T-T-T-T-A---A--A-GA----T-C-AAT-G-------T-CACTTAGAGTATAT
gi|130705 : TAAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-GG------G--T-TT--C-A--G-G------TA-----AA-AA----GCTAC-T-C-AA-GT--CA-T-T---T-T-T-G-A---A--A-AG----T-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130712 : TAAG-G-A------A-T-AGG---CAAA-T-GA------C--T-GA--T-A--G-G------CA-----AA-GG---TC--AC-T-C-ATGTT--CA-T-T---T-T-G-T-A---A--A-GG----T-T-AGG-G-------T-CAC
gi|130710 : TAAG-T-A------A-C-AGGATTCAAAAT-GG------G--TGTT--C-ATGG-T------AA-----AAAGC---TGT-AC-T-C-AAGTT--CA-T-TCTTT-T-G-A-A---A--ATGG----T-T-AAG-G-------T-CACTGAGAAT
gi|130713 : AAG-T-A------A-CCAGG---CAAA-T-GG------G--T-TC--C-A--G-G------TA-----AA-AG---TG---C-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-T-TGA---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGTctgt
gi|130714 : AAG-T-A------A-C-CGA---CAAA-T-AT------C--T-TT--C-A--AAT------TA-----AA-GG---TT--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G-T-A---A--A-GG----T-C-AGG-G-------T-CAATGAGAA
gi|130715 : -T-A------A-C-AGG---CAAA-T-GG------G--T-TC--C-G--G-T------AA-----AA-GGCT-TG---C-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-T-TGA---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130716 : -AAG---CAAA-T-GG------T--T-TT--C-A--A-A------CA-----AC-GG---CT--AC-T-C-AAGAG--CA-T-T---T-T-G-T-G---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CGCTCAGCATGT
gi|130717 : ---CAAA-T-AGTGT---C--A-TT--C-A--G-T------CA-----AA-GG---TT--AC-T-C-AAGGT--CA-G-T---T-T-G-T-A---A--C-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130718 : ---CAAA-T------------T-TT--C-A--T-T------GG-----GA-CA---TG--ATAC-C-AAGGT--CA-T-T---T-T---C-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAAAGCATAT
gi|130719 : -T-GG------T--T-TT--C-A--G-T------TA-----AA-AAG--TC--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-G-G-G-A---A--T-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130720 : ------CA-----AA-GG---TA--TC-T-C-AAGGT--CA-T-C---T-T-A-A-A---A--A-GG----T-C-AAG-C-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130721 : gga-----AA-GA---TT--TC-T-C-AACAT--TA-T-T---T-T-G---A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130722 : -----AA-GA---TC--TC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G---A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CATCAAGAAGATAT
gi|130724 : --AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T---T-A---A--G-G-----T-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130723 : tC-T-C-AAGGA--CA-T-T---T-T-G-G-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTAGGAACATAT
gi|130726 : tttC-T-C-AAAGT--CA-T-T---T-T-T-G-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CATTTGGAATATAT
gi|130725 : C-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-T-A-A---A--T-GG----T-C-A---G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130727 : C-T-C-AGGGT--CA-T-T---TCT-G---A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-TACTCGGAAGATAT
gi|130732 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G-A-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACAT
gi|130735 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-A-A-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAA
gi|130733 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G-G-A---G--A-GG----T-G-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130730 : -T-C-AAGAT--CA-T-T---T-T-G-G-A---A--G-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCTGAACATGT
gi|130728 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-TGG-T-A---A----GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAA
gi|130736 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T---C-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAAAGCATATc
gi|130729 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T---C-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAAAGCATAT
gi|130738 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G-G-A---T--A-GG----T-C-AAG-G-------G-CACTCAGAA
gi|130731 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G-G-A---A--A-GA----C-C-AAG-G-------T-CATTGAGAACATATcttgt
gi|130737 : -T-T-AAGAT--CA-T-T---T-TTG-G-A---A--A-GG----C-C-AAT-G-------T-CACTCAGAACATGT
gi|130739 : -T-C-AATGT--CA-T-T---T-T-GGT-A---A--G-G-----T-C-AAG-G-------T-CACTCATAACATGT
gi|130740 : -AAGGT--CA-T-T---T-T-G-G-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CATTCAGAACAT
gi|130743 : c-AAGGT--CA-T-T---T-T-A-G-G---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTTAGAATATAT
gi|130741 : -AAGGT--CA-T-T---T-T-C-G-A---A--G-GG----T-C-AAG-G-------T-CGTTCAAAATATGT
gi|130742 : c-AAGGT--CA-T-T---T-T-T-G-A---A--A-GG----A-C-AAG-G-------T-CACTCAGAA
gi|130744 : AGGT--CA-T-T---T-T-G-G-A---A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACCCAGAACAT
gi|130734 : GT--CA-T-T---T---G-T-A---A--AAGG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|130694 ): AATGAAATAACAGGTCAAATAAGTTTAGTATGAGGGAAATTACTACAGGTCACTTTGGAAGGTCAAGATAAGAGAACATGT
Alignments
lowQualScore : 0 1 0 111111 1 0 111 2 1 1 333333333 0 2222 11 0 00 22 3333 00 0 222 0 333 0 1 0 11 0 0 000 0 7777 00 00 1 0000 0 0 0 1111111 0
lowQualScore : . . . ...... . . ... . . . ......... . .... .. . .. .. .... .. . ... . ... . . . .. . . ... . .... .. .. . .... . . . ....... .
lowQualScore : 6 3 6 888888 3 6 777 4 2 2 888888888 6 6666 77 6 88 22 1111 88 6 666 6 444 5 3 9 22 4 4 888 9 4444 66 66 3 9999 4 4 4 4444444 9
consensus : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-GC----A--AA-G---G-TT--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
Reference ( family-274 ) : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-NC----A--AA-G---G-TC--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130653 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-A-G------G--T-T----T--C-A--G-GT----A--AA-A---G-CT--AC-T-C-AAGGT--TA-T-T---T-T--T-G--A--A-AG----T-T-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130654 : AAT-AAT-T-A------A-C-AAG---CAAA-T-T-A------C--T-T----T--T-A--G-TC----A--AA-G---G-TG--AC-T-T-AAGGT--CA-T-T---T-T-GTGA--A--G-GG----T-C-A
gi|130655 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----T--C-A--G-GC----A--AA-A---T-TT--AC-T-C-AAGGT--CA-T-C---T-T-GG-A--A--A-TG----G-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130656 : AAC-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-TGG-G------T--T-T----T--C-A--G-GG----T--AA-A---A-TT--AC-TCC-AAGGT--CA---T---T-T-G--A--A--A-GG----T-C-CAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130657 : AAC-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----T--C-A--G-GT----A--AA-A---T-TT--AC-C-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G--A--A--A-GG----T-C--AG-G-------T-C-CTGAGAACATGT
gi|130658 : AAC-AAG-T-A------A-C-AGG---CAA--T-G-G------G--T-T----T--C-A--G-GT----A--AA-A---T-TT--AC-T-CCAAGGT--CA-T-T---T-T-G--A--A--A-GG----T-C-CAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130659 : AAC-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAT-G-G-G------T--T-T----T--C-A--G-GA----A--AA-------TT--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T--------T-G--A--A-GG----T-C--AG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130660 : AAC-AAG-G-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-A------C--T-A----A--C-T--G-GC----A--AA-G---G-TC--AC-A-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-AG----T-T-GAG-G-------T-CACT
gi|130661 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------T--T-T----T--C-A--G-GC----A--AA-A---A-TT--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---C-T-CG-A--A--T-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGACCATAT
gi|130662 : AAT-AAG-T-A------A-T-AGG---CATA-T-G-A------T--T-T----T--C-A--G-GC----A--AA-A---T-TT--AT-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-TG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-TACTCAGAACATAT
gi|130663 : AAT-AAG-T-A------A-C-AAG---TAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-TT----A--AA-G---T-TT--A--T-C-AAGGT--CA-T-T---T-A-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATAT
gi|130664 : AAT-AAG-T-A------A-T-AAG---CAAA-T-G-A------C--T-A----T--T-G--G-AC----A--AA-G---G-TC--AC-T-C-AAGAT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GGTTAAT-T-AAG-G-------T-TACTC--AATATAT
gi|130665 : AAT-AGG-T-T------A-C-AGA---CTAA-T-------------------------A--G-GC----A--AA-G---G-TC--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-T-GAG-G-------T-CACTCTGAAGATATg
gi|130666 : AAT-AAT-T-A------A-C-AGG---CAA--T-G-G------G--T-T----T--C-A--G-TT----A--AA-G-----TT--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-A--G--A--A-GG----T-C-GAG-G-------T-CACTGAGAACATAT
gi|130667 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-TC----A--AA-G---A-TG--AC-T-T-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--G-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130668 : AAT-AAG-G-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-A------G--T-T----T--C-A--A-GC----A--AA-A---G-TT--GC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-TGGT-A--ACTA-GG----T-C-AAT-G-------T-TACGGAGAACATGT
gi|130669 : AAT-GAA-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-AAG------T--T-TAGTAT--G-A--G-GC----A--AA-A---G-TT--AC-T-C-AAGGT--CA-C-T---T-T-GG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CA--GAGAACATGT
gi|130670 : AAT-AAGGT-A------A---AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----TTCC-A--G-GT----A--AA-AAGAG-TT--AC-TAC-AAGGT--CA-T-T---T-T-TG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------TCCACTGAAAA
gi|130671 : AAT-AAGGT-A------A---AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----TTCC-A--G-GT----A--AA-AAGAG-TT--AC-TAC-AAGGT--CA-T-T---T-T-TG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------TCCACTGAAAA
gi|130672 : AAT-AAT-T-A------A-C-GAA---GAAA-T-T-A------C--T-T----T--T-A--T-TC----A--AA-G---G-TT--AC-T-T-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-G--A--A-GG----T-G-AAG-G-------T-CACTTAAAATATAT
gi|130673 : AAT-AGG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C----G-GC----A--AA-A---G-TT--ACTT-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GG-C--A--A--G----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGATCATAT
gi|130674 : AAT-AAG-T-A------A-C-ATG---CAAG-T-G-G------T--A-T----T--C-A--G-GC----A--AA-C---G-TT--AC-T-C-AAGGT--TA-T-T---T-T-GA-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-TACTCAGAAAAT
gi|130675 : AAT-AAG-G-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-A------C--T-G----A--C-A--G-GC----A--AA-G---G-TC--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-G-GT-A--A--A-GG----TAG-GGG-G-------T-CACTCAATATACAT
gi|130676 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CATA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--A-AC----A--AA-G---G-TC--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-TT-A--A--A-GA----T-C-AAG-G-------T-CATTC--AACATATgt
gi|130677 : AAG-AAG-T-A------A-C-AGG---CATA-TTG-G------C--T-T----C--C-A--G-GT----A--AA-G---G-TC--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GG-A--A--A-GG----T-TAAAG-G-------T-CACTTAGAATATAT
gi|130678 : AGT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-T------T--T-T----A--C-A--G-GC----A--AA-A---G-TT--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G--A--A--A-AA----T-C-AAG-G-------T-AACTCACAGCA
gi|130679 : AGT-AAA-T-A------A-G-ATG---CAAA-T-T-G------C--T-T----T--C-A--G-TC----A--AA-G---G-AG--AT-T-C-AAGGT--AA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130680 : AAT-AAG-T-T------A-C-A-----CAAA-T-G-G------CGGC-T----T--T-A--G-GT----A--AA-------TT--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GA-T--C--A-GG----T-C-AAG-A-------T-CACTGAAAACATGT
gi|130681 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CGAA-T-A-A------C--T-T----T--C-A--G-AC----A--AA-G---A-TC--AC-C-C-ATGCT--CA-T-T---T-T-GG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACT
gi|130682 : AAT-AAG-T-A------G-C-AGG---TGAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-AC----A--AA-G---G-TC--AC-T-C-AAGAT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-GTTAAAGAT-TACTCAGAACAT
gi|130683 : AAT-AAG-A-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T------------------------------------AC-----AAGGT--CC-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTC--AACATATg
gi|130684 : AAT-AAG-A-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T------------------------------------AC-----AAGGT--CC-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTC--AACATAT
gi|130685 : AAT-AAG-T-A------A-T-AGA---CAAA-T-G-A------C--T-T----T--A-A--T-AC----A--AAGG---G-TC--AC-T-T-GAAGT--CATT-T---T-T-AT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-
gi|130686 : AAC-AAG-T-A------A-C-AAG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-AC----A--AA-G---G-TA--AC-C-C-AAGGT--TC-G-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAAGATAT
gi|130687 : AGT-AAG-T-A------A-T-AGG---CAAG-T-G-G------C--A-T-------C-A--G-AC----A--AA-G---G-CT--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------C-CACT
gi|130688 : AAT-AAA-A-A------A-C--GA---CAAA-T-G-G---------T-C----T--C-A--G-AC----A--AA-G---G-TC--AC-T-C-AAGGT--CA-TCT---T-T-G--A--A--A-AG----T-C-AAA-G-------C-TGCTCAGAATAT
gi|130689 : AAG-AAG-T-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-A------C--T-T----T--C-A--G-AC----A--AA-G---T-TC--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-AG----T-C-AAG-G-------T-CAC
gi|130690 : AAT-AAG-A-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--C-T----T----A--G-AA----A--AA-G---G-TC--AC-T-C-GGGGT--CA-T-T---T-T-GA-A--A--A-GG----T-T-AAA-G-------T-CACTCAG
gi|130691 : AAT-AAG-T-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-ACCAAGATCAA-G---A-TC--AC-T-C-AAGGT--AA-T-T---T-T-AT-A--A--A-GG----T-A-AAG-G-------T-CA
gi|130692 : AAT-AAA-T-A------T-C-AGG---TAAA-T-A-A------C--T-T----T--T-A--G-AC----A--GG-A---G-TT--AC-T-C-AAGGT--CA---T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAA-G-------T-TACT
gi|130693 : AAT-AAG-T-A------A-T-AGG---CAAA-C-A-A------T--T-T----T--C-G--G-GG----A--AA-G---G-TT--AT-T-T-AGG--------------------A--A--A-AG----T-C-AAG-G-------T-CGCCCAGAACATGTgggga
gi|130694 : AATGAAA-T-A------A-C-AGGT--CAAA-T-AAG------T--T-TAGTAT--G-A--G-GG----A--AA-------TT--AC-T-A-CAGGT--CA-C-T---T-T-G--G--A--A-GG----T-C-AAG-A-------T-AA--GAGAACATGT
gi|130695 : AAT-AAG-TTA------A-C-GAG---CAAA-A-A-G------C--T-T----T--C-A--GTCC----A--AA-G---G-T---AC-T-CAAAGAT--CA-T-T---TGT-GT-A--A--A--G----T-C-AGG-T-------T-CACTCAGGATATGT
gi|130696 : AAT-AAA-T-A------A-C-AGG---TAAA---G-G------A--T-T----T--C-A-------------AA-G---G-TT--AC-A-C-AAAAT--CA-T-T---T-T-GG-A--A--A-AG----T-G-AGG-G-------C-TACTTAAAATA
gi|130697 : AT-AAG-A-A------A-C-AAG---CAAT-T-G-A------C--T-T----T--C-G--G-TC----A--AA-G---G-TG--AC-T-T-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTTAAAATATAT
gi|130698 : AT-AAG-T-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-A------T--T-A----A--C-G--G-GC----A--AA-G---G-TC--AC-T-C-AAAGT--CA-A-T---T-T-GT-G--A--A-GG----C-T-GAG-A-------T-CACTC--AACAT
gi|130699 : AC-AAA-T-G------A-T-AGA---CAAA-T-G-A------C--T-T----T--C-A--G-GC----A--AA-G---A-TC--AC-T-C-AAGGT--TA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-A-------T-CA
gi|130700 : AT-ACG-T-A------A-C-AGG---CAAAAT-G-G---------T-T----T--C-A--G-GCT---A--AA-------TT--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-A-GA-A--A--A-GG----T-C-AAGCG-------T-CACT
gi|130701 : AT-AAG-T-A------A-T-AGA---CAAA-T-G-A------C--T-T----T--C-A--G-AT----G--AA-G---A-TC--AC-T-C-AAGAT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------A-CACTga
gi|130702 : AT-ATA-T-A------A-C-AGA---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-TC----A--AA-G---G-TC--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-TG----T-C-AAG-G-------T-CACTC--AACATAT
gi|130703 : AT-AAG-T-A------A-T-AAG---CAAA-T-G-G------T--C-T----T--C-A--G-AC----A--AC-G---G-CC--TC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-ATTT--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTC--AACATAT
gi|130704 : AT-AAG-T-A------A-A-ATG---CAAA-T-A-G------T--T-T----T--TTA--G-AC----A--AA-G---A-TC--AC-T-G-AAGGT--TG-T-T---T-T-AT-A--A--A-GA----C-C-AAG-G-------C-CACTCAGAACATGT
gi|130705 : T-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----T--C-A--G-GTA---A--AA-A---G-CT--AC-T-C-AA-GT--CA-T-T---T-T-TG-A--A--A-AG----T-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130706 : T-AAG-T-ACATGTTA-C-AAG---CAAA-T-G-GCCATGGC--T-T----T--C-A--G-TC----A--AA-G---G-TG--AC-T-T-AATGT--CA-T-T---T-T-TT-A--A--A-GA----T-C-AAT-G-------T-CACTTAGAGTATAT
gi|130707 : T-AAA-T-A------AAC-AAG---CAAAAT-G-G------C--C-T----T--C-A--G-TT----A--AA-A---G-TT--AC-T-C-AAGGTTTCA-T-T---T-TTGT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130708 : T-AAA-T-A------AAC-AAG---CAAAAT-G-G------C--C-T----T--C-A--G-TT----A--AA-A---G-TT--AC-T-C-AAGGTTTCA-T-T---T-TTGT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130709 : T-AAG-T-A------A-T-TGG---TAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-TC----A--AG-G---G-TC--AC-T-C-AAGGT--CA---T---C-T-GT-G--A--A-AG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130710 : T-AAG-T-A------A-C-AGGATTCAAAAT-G-G------G--TGT----T--C-ATGG-TA----A--AA-A---G-CTGTAC-T-C-AAGTT--CA-T-TCTTT-T-GA-A--A--ATGG----T-T-AAG-G-------T-CACTGAGAA
gi|130711 : T-AAG-T-A------A-C-AGG---TAAA-----G------C--T-T----T--C-A--G-TC----A--AA-A---G-TC--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--T-GG----T-C-TAT-G-------T-CACTCAGAATATGTtctgt
gi|130712 : T-AAG-G-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-A------C--T-G----A--T-A--G-GC----A--AA-G---G-TC--AC-T-C-ATGTT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-T-AGG-G-------T-CAC
gi|130713 : -AAG-T-A------A-CCAGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----C--C-A--G-GT----A--AA-A---G-T---GC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-TTGA--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130714 : -AAG-T-A------A-C-CGA---CAAA-T-A-T------C--T-T----T--C-A--A-ATT---A--AA-G---G-TT--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AGG-G-------T-CAATGAGAA
gi|130715 : -T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----C--C-G--G-TA----A--AA-G---GCTT--GC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-TTGA--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130716 : -AAG---CAAA-T-G-G------T--T-T----T--C-A--A-AC----A--AC-G---G-CT--AC-T-C-AAGAG--CA-T-T---T-T-GT-G--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CGCTCAG--CATGT
gi|130717 : ---CAAA-T-A-GTGT---C--A-T----T--C-A--G-TC----A--AA-G---G-TT--AC-T-C-AAGGT--CA-G-T---T-T-GT-A--A--C-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130718 : -C-AAGGT--CA-T-T---T-T--C-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAAAGCATAT
gi|130719 : caaattttcattgggacatgatac-T-G-G------T--T-T----T--C-A--G-TT----A--AA-AA--G-TC--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-G-GG-A--A--T-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130720 : --G-AC----A--AA-G---G-TA--TC-T-C-AAGGT--CA-T-C---T-T-AA-A--A--A-GG----T-C-AAG-C-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130721 : g--AA-G---A-TT--TC-T-C-AACAT--TA-T-T---T-T-G--A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130722 : --AA-G---A-TC--TC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G--A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CATCAAGAAGATAT
gi|130723 : C-T-C-AAGGA--CA-T-T---T-T-GG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTAGGAACATAT
gi|130724 : ttt--AC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T--T-A--A----GG----T-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130725 : tC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T--T-A--A--ATGG----T-C-A---G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130726 : C-T-C-AAAGT--CA-T-T---T-T-TG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CATTTGGAATATAT
gi|130727 : C-T-C-AGGGT--CA-T-T---TCT-G--A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-TACTCGGAAGATAT
gi|130728 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GG-T--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAAC
gi|130729 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T--C-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAAAGCATAT
gi|130730 : -T-C-AAGAT--CA-T-T---T-T-GG-A--A--G-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCTGAACATGT
gi|130731 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GG-A--A--A-GA----C-C-AAG-G-------T-CATTGAGAACATAT
gi|130732 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GA-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACAT
gi|130733 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GG-A--G--A-GG----T-G-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130734 : -T-C-AGAGT--CA-T-T---T---GT-A--A--AAGG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130735 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-AA-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAA
gi|130736 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T--C-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAAAGCATAT
gi|130737 : -T-T-AAGAT--CA-T-T---T-TTGG-A--A--A-GG----C-C-AAT-G-------T-CACTCAGAACATGT
gi|130738 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GG-A--T--A-GG----T-C-AAG-G-------G-CACTCAGAAC
gi|130739 : -T-C-AATGT--CA-T-T---T-T-GG-T--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCATAACATGTttgt
gi|130740 : -C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CATTCAGAACAT
gi|130741 : -C-AAGGT--CA-T-T---T-T-CG-A--A--G-GG----T-C-AAG-G-------T-CGTTCAAAATATGT
gi|130742 : -AAGGT--CA-T-T---T-T-TG-A--A--A-GG----A-C-AAG-G-------T-CACTCAGAA
gi|130743 : -AAGGT--CA-T-T---T-T-AG-G--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTTAGAATATAT
gi|130744 : AGGT--CA-T-T---T-T-GG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACCCAGAACAT
Alignments
lowQualScore : 0 1 0 111111 1 0 111 2 1 1 444444444 0 2222 11 0 11 222 1 11111 222222 0 0 0 1 0 11 0 0 000 0 7777 00 00 1 0000 0 0 0 1111111 0
lowQualScore : . . . ...... . . ... . . . ......... . .... .. . .. ... . ..... ...... . . . . . .. . . ... . .... .. .. . .... . . . ....... .
lowQualScore : 6 3 6 888888 3 6 777 4 2 2 000000000 6 5555 66 6 44 888 8 44444 888888 6 6 5 3 9 22 4 4 888 9 4444 66 66 3 9999 4 4 4 4444444 9
consensus : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--G---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
Reference ( family-274 ) : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--G---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130653 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-A-G------G--T-T----T--C-A--G-G-T-A-----AA--A---G-C-TAC-T-C-AAGGT--TA-T-T---T-T--T-G--A--A-AG----T-T-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130654 : AAT-AAT-T-A------A-C-AAG---CAAA-T-T-A------C--T-T----T--T-A--G-T-C-A-----AA--G---G-T-GAC-T-T-AAGGT--CA-T-T---T-T-GTGA--A--G-GG----T-C-A
gi|130655 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--A---T-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-C---T-T-GG-A--A--A-TG----G-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130656 : AAC-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-TGG-G------T--T-T----T--C-A--G-G-G-T-----AA--A---A-T-TAC-TCC-AAGGT--CA---T---T-T-G--A--A--A-GG----T-C-CAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130657 : AAC-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----T--C-A--G-G-T-A-----AA--A---T-T-TAC-C-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G--A--A--A-GG----T-C--AG-G-------T-C-CTGAGAACATGT
gi|130658 : AAC-AAG-T-A------A-C-AGG---CAA--T-G-G------G--T-T----T--C-A--G-G-T-A-----AA--A---T-T-TAC-T-CCAAGGT--CA-T-T---T-T-G--A--A--A-GG----T-C-CAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130659 : AAC-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAT-G-G-G------T--T-T----T--C-A--G-G-A-A-----AA--------T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T--------T-G--A--A-GG----T-C--AG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130660 : AAC-AAG-G-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-A------C--T-A----A--C-T--G-G-C-A-----AA--G---G-T-CAC-A-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-AG----T-T-GAG-G-------T-CACT
gi|130661 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------T--T-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--A---A-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---C-T-CG-A--A--T-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGACCATAT
gi|130662 : AAT-AAG-T-A------A-T-AGG---CATA-T-G-A------T--T-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--A---T-T-TAT-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-TG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-TACTCAGAACATAT
gi|130663 : AAT-AAG-T-A------A-C-AAG---TAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-T-T-A-----AA--G---T-T-TA--T-C-AAGGT--CA-T-T---T-A-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATAT
gi|130664 : AAT-AAG-T-A------A-T-AAG---CAAA-T-G-A------C--T-A----T--T-G--G-A-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGAT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GGTTAAT-T-AAG-G-------T-TACTC--AATATAT
gi|130665 : AAT-AGG-T-T------A-C-AGA---CTAA-T-------------------------A--G-G-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-T-GAG-G-------T-CACTCTGAAGATATg
gi|130666 : AAT-AAT-T-A------A-C-AGG---CAA--T-G-G------G--T-T----T--C-A--G-T-T-A-----AA--G-----T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-A--G--A--A-GG----T-C-GAG-G-------T-CACTGAGAACATAT
gi|130667 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-T-C-A-----AA--G---A-T-GAC-T-T-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--G-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130668 : AAT-AAG-G-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-A------G--T-T----T--C-A--A-G-C-A-----AA--A---G-T-TGC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-TGGT-A--ACTA-GG----T-C-AAT-G-------T-TACGGAGAACATGT
gi|130669 : AAT-GAA-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-AAG------T--T-TAGTAT--G-A--G-G-C-A-----AA--A---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-C-T---T-T-GG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CA--GAGAACATGT
gi|130670 : AAT-AAGGT-A------A---AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----TTCC-A--G-G-T-A-----AA--AAGAG-T-TAC-TAC-AAGGT--CA-T-T---T-T-TG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------TCCACTGAAAA
gi|130671 : AAT-AAGGT-A------A---AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----TTCC-A--G-G-T-A-----AA--AAGAG-T-TAC-TAC-AAGGT--CA-T-T---T-T-TG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------TCCACTGAAAA
gi|130672 : AAT-AAT-T-A------A-C-GAA---GAAA-T-T-A------C--T-T----T--T-A--T-T-C-A-----AA--G---G-T-TAC-T-T-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-G--A--A-GG----T-G-AAG-G-------T-CACTTAAAATATAT
gi|130673 : AAT-AGG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C----G-G-C-A-----AA--A---G-T-TACTT-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GG-C--A--A--G----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGATCATAT
gi|130674 : AAT-AAG-T-A------A-C-ATG---CAAG-T-G-G------T--A-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--C---G-T-TAC-T-C-AAGGT--TA-T-T---T-T-GA-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-TACTCAGAAAAT
gi|130675 : AAT-AAG-G-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-A------C--T-G----A--C-A--G-G-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-G-GT-A--A--A-GG----TAG-GGG-G-------T-CACTCAATATACAT
gi|130676 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CATA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--A-A-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-TT-A--A--A-GA----T-C-AAG-G-------T-CATTC--AACATATgt
gi|130677 : AAG-AAG-T-A------A-C-AGG---CATA-TTG-G------C--T-T----C--C-A--G-G-T-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GG-A--A--A-GG----T-TAAAG-G-------T-CACTTAGAATATAT
gi|130678 : AGT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-T------T--T-T----A--C-A--G-G-C-A-----AA--A---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G--A--A--A-AA----T-C-AAG-G-------T-AACTCACAGCA
gi|130679 : AGT-AAA-T-A------A-G-ATG---CAAA-T-T-G------C--T-T----T--C-A--G-T-C-A-----AA--G---G-A-GAT-T-C-AAGGT--AA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130680 : AAT-AAG-T-T------A-C-A-----CAAA-T-G-G------CGGC-T----T--T-A--G-G-T-A-----AA--------T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GA-T--C--A-GG----T-C-AAG-A-------T-CACTGAAAACATGT
gi|130681 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CGAA-T-A-A------C--T-T----T--C-A--G-A-C-A-----AA--G---A-T-CAC-C-C-ATGCT--CA-T-T---T-T-GG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACT
gi|130682 : AAT-AAG-T-A------G-C-AGG---TGAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-A-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGAT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-GTTAAAGAT-TACTCAGAACAT
gi|130683 : AAT-AAG-A-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T-------------------------------------AC-----AAGGT--CC-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTC--AACATATg
gi|130684 : AAT-AAG-A-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T-------------------------------------AC-----AAGGT--CC-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTC--AACATAT
gi|130685 : AAT-AAG-T-A------A-T-AGA---CAAA-T-G-A------C--T-T----T--A-A--T-A-C-A-----AAG-G---G-T-CAC-T-T-GAAGT--CATT-T---T-T-AT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-
gi|130686 : AAC-AAG-T-A------A-C-AAG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-A-C-A-----AA--G---G-T-AAC-C-C-AAGGT--TC-G-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAAGATAT
gi|130687 : AGT-AAG-T-A------A-T-AGG---CAAG-T-G-G------C--A-T-------C-A--G-A-C-A-----AA--G---G-C-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------C-CACT
gi|130688 : AAT-AAA-A-A------A-C--GA---CAAA-T-G-G---------T-C----T--C-A--G-A-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-TCT---T-T-G--A--A--A-AG----T-C-AAA-G-------C-TGCTCAGAATAT
gi|130689 : AAG-AAG-T-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-A------C--T-T----T--C-A--G-A-C-A-----AA--G---T-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-AG----T-C-AAG-G-------T-CAC
gi|130690 : AAT-AAG-A-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--C-T----T----A--G-A-A-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-GGGGT--CA-T-T---T-T-GA-A--A--A-GG----T-T-AAA-G-------T-CACTCAG
gi|130691 : AAT-AAG-T-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-ACC-AAGATCAA--G---A-T-CAC-T-C-AAGGT--AA-T-T---T-T-AT-A--A--A-GG----T-A-AAG-G-------T-CA
gi|130692 : AAT-AAA-T-A------T-C-AGG---TAAA-T-A-A------C--T-T----T--T-A--G-A-C-A-----GG--A---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA---T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAA-G-------T-TACT
gi|130693 : AAT-AAG-T-A------A-T-AGG---CAAA-C-A-A------T--T-T----T--C-G--G-G-G-A-----AA--G---G-T-TAT-T-T-AGG--------------------A--A--A-AG----T-C-AAG-G-------T-CGCCCAGAACATGTgggga
gi|130694 : AATGAAA-T-A------A-C-AGGT--CAAA-T-AAG------T--T-TAGTAT--G-A--G-G-G-A-----AA--------T-TAC-T-A-CAGGT--CA-C-T---T-T-G--G--A--A-GG----T-C-AAG-A-------T-AA--GAGAACATGT
gi|130695 : AAT-AAG-TTA------A-C-GAG---CAAA-A-A-G------C--T-T----T--C-A--GTC-C-A-----AA--G---G---TAC-T-CAAAGAT--CA-T-T---TGT-GT-A--A--A--G----T-C-AGG-T-------T-CACTCAGGATATGT
gi|130696 : AAT-AAA-T-A------A-C-AGG---TAAA---G-G------A--T-T----T--C-A--------------AA--G---G-T-TAC-A-C-AAAAT--CA-T-T---T-T-GG-A--A--A-AG----T-G-AGG-G-------C-TACTTAAAATA
gi|130697 : AT-AAG-A-A------A-C-AAG---CAAT-T-G-A------C--T-T----T--C-G--G-T-C-A-----AA--G---G-T-GAC-T-T-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTTAAAATATAT
gi|130698 : AT-AAG-T-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-A------T--T-A----A--C-G--G-G-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAAGT--CA-A-T---T-T-GT-G--A--A-GG----C-T-GAG-A-------T-CACTC--AACAT
gi|130699 : AC-AAA-T-G------A-T-AGA---CAAA-T-G-A------C--T-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--G---A-T-CAC-T-C-AAGGT--TA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-A-------T-CA
gi|130700 : AT-ACG-T-A------A-C-AGG---CAAAAT-G-G---------T-T----T--C-A--G-G-CTA-----AA--------T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-A-GA-A--A--A-GG----T-C-AAGCG-------T-CACT
gi|130701 : AT-AAG-T-A------A-T-AGA---CAAA-T-G-A------C--T-T----T--C-A--G-A-T-G-----AA--G---A-T-CAC-T-C-AAGAT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------A-CACTga
gi|130702 : AT-ATA-T-A------A-C-AGA---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-T-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-TG----T-C-AAG-G-------T-CACTC--AACATAT
gi|130703 : AT-AAG-T-A------A-T-AAG---CAAA-T-G-G------T--C-T----T--C-A--G-A-C-A-----AC--G---G-C-CTC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-ATTT--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTC--AACATAT
gi|130704 : AT-AAG-T-A------A-A-ATG---CAAA-T-A-G------T--T-T----T--TTA--G-A-C-A-----AA--G---A-T-CAC-T-G-AAGGT--TG-T-T---T-T-AT-A--A--A-GA----C-C-AAG-G-------C-CACTCAGAACATGT
gi|130705 : T-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----T--C-A--G-G-TAA-----AA--A---G-C-TAC-T-C-AA-GT--CA-T-T---T-T-TG-A--A--A-AG----T-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130706 : T-AAG-T-ACATGTTA-C-AAG---CAAA-T-G-GCCATGGC--T-T----T--C-A--G-T-C-A-----AA--G---G-T-GAC-T-T-AATGT--CA-T-T---T-T-TT-A--A--A-GA----T-C-AAT-G-------T-CACTTAGAGTATAT
gi|130707 : T-AAA-T-A------AAC-AAG---CAAAAT-G-G------C--C-T----T--C-A--G-T-T-A-----AA--A---G-T-TAC-T-C-AAGGTTTCA-T-T---T-TTGT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130708 : T-AAA-T-A------AAC-AAG---CAAAAT-G-G------C--C-T----T--C-A--G-T-T-A-----AA--A---G-T-TAC-T-C-AAGGTTTCA-T-T---T-TTGT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130709 : T-AAG-T-A------A-T-TGG---TAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-T-C-A-----AG--G---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA---T---C-T-GT-G--A--A-AG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130710 : T-AAG-T-A------A-C-AGGATTCAAAAT-G-G------G--TGT----T--C-AT-G-G-T-A-----AAAAG---C-TGTAC-T-C-AAGTT--CA-T-TCTTT-T-GA-A--A--ATGG----T-T-AAG-G-------T-CACTGAGAA
gi|130711 : T-AAG-T-A------A-C-AGG---TAAA-----G------C--T-T----T--C-A--G-T-C-A-----AA--A---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--T-GG----T-C-TAT-G-------T-CACTCAGAATATGTtctgt
gi|130712 : T-AAG-G-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-A------C--T-G----A--T-A--G-G-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-ATGTT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-T-AGG-G-------T-CAC
gi|130713 : -AAG-T-A------A-CCAGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----C--C-A--G-G-T-A-----AA--A---G---TGC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-TTGA--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130714 : -AAG-T-A------A-C-CGA---CAAA-T-A-T------C--T-T----T--C-A--A-A-TTA-----AA--G---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AGG-G-------T-CAATGAGAA
gi|130715 : -T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----C--C-G--G-T-A-A-----AA--G---GCT-TGC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-TTGA--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130716 : -AAG---CAAA-T-G-G------T--T-T----T--C-A--A-A-C-A-----AC--G---G-C-TAC-T-C-AAGAG--CA-T-T---T-T-GT-G--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CGCTCAG--CATGT
gi|130717 : ---CAAA-T-A-GTGT---C--A-T----T--C-A--G-T-C-A-----AA--G---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-G-T---T-T-GT-A--A--C-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130718 : ---CAAA-T-------------T-T----T--C-ATTG-G-G-A-----CA--T---G-A-TAC---C-AAGGT--CA-T-T---T-T--C-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAAAGCATAT
gi|130719 : -T-G-G------T--T-T----T--C-A--G-T-T-A-----AA--AA--G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-G-GG-A--A--T-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130720 : --G-A-C-A-----AA--G---G-T-ATC-T-C-AAGGT--CA-T-C---T-T-AA-A--A--A-GG----T-C-AAG-C-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130721 : g-----AA--G---A-T-TTC-T-C-AACAT--TA-T-T---T-T-G--A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130722 : -----AA--G---A-T-CTC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G--A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CATCAAGAAGATAT
gi|130723 : -T-TTC-T-C-AAGGA--CA-T-T---T-T-GG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTAGGAACATAT
gi|130724 : -TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T--T-A--A----GG----T-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130725 : C-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T--T-A--A--ATGG----T-C-A---G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130726 : C-T-C-AAAGT--CA-T-T---T-T-TG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CATTTGGAATATAT
gi|130727 : C-T-C-AGGGT--CA-T-T---TCT-G--A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-TACTCGGAAGATAT
gi|130728 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GG-T--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAAC
gi|130729 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T--C-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAAAGCATAT
gi|130730 : -T-C-AAGAT--CA-T-T---T-T-GG-A--A--G-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCTGAACATGT
gi|130731 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GG-A--A--A-GA----C-C-AAG-G-------T-CATTGAGAACATAT
gi|130732 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GA-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACAT
gi|130733 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GG-A--G--A-GG----T-G-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130734 : -T-C-AGAGT--CA-T-T---T---GT-A--A--AAGG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130735 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-AA-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAA
gi|130736 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T--C-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAAAGCATAT
gi|130737 : -T-T-AAGAT--CA-T-T---T-TTGG-A--A--A-GG----C-C-AAT-G-------T-CACTCAGAACATGT
gi|130738 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GG-A--T--A-GG----T-C-AAG-G-------G-CACTCAGAAC
gi|130739 : -T-C-AATGT--CA-T-T---T-T-GG-T--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCATAACATGTttgt
gi|130740 : -C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CATTCAGAACAT
gi|130741 : -C-AAGGT--CA-T-T---T-T-CG-A--A--G-GG----T-C-AAG-G-------T-CGTTCAAAATATGT
gi|130742 : -AAGGT--CA-T-T---T-T-TG-A--A--A-GG----A-C-AAG-G-------T-CACTCAGAA
gi|130743 : -AAGGT--CA-T-T---T-T-AG-G--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTTAGAATATAT
gi|130744 : AGGT--CA-T-T---T-T-GG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACCCAGAACAT
Alignments
lowQualScore : 0 1 0 111111 1 0 111 2 1 1 444444444 0 2222 11 0 11 222 1 11111 222222 0 0 0 1 0 11 0 0 000 0 7777 00 00 1 0000 0 0 0 1111111 0
lowQualScore : . . . ...... . . ... . . . ......... . .... .. . .. ... . ..... ...... . . . . . .. . . ... . .... .. .. . .... . . . ....... .
lowQualScore : 6 3 6 888888 3 6 777 4 2 2 000000000 6 5555 66 6 44 888 8 44444 888888 6 6 5 3 9 22 4 4 888 9 4444 66 66 3 9999 4 4 4 4444444 9
consensus : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--G---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
Reference ( family-274 ) : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--G---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130653 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-A-G------G--T-T----T--C-A--G-G-T-A-----AA--A---G-C-TAC-T-C-AAGGT--TA-T-T---T-T--T-G--A--A-AG----T-T-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130654 : AAT-AAT-T-A------A-C-AAG---CAAA-T-T-A------C--T-T----T--T-A--G-T-C-A-----AA--G---G-T-GAC-T-T-AAGGT--CA-T-T---T-T-GTGA--A--G-GG----T-C-A
gi|130655 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--A---T-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-C---T-T-GG-A--A--A-TG----G-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130656 : AAC-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-TGG-G------T--T-T----T--C-A--G-G-G-T-----AA--A---A-T-TAC-TCC-AAGGT--CA---T---T-T-G--A--A--A-GG----T-C-CAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130657 : AAC-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----T--C-A--G-G-T-A-----AA--A---T-T-TAC-C-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G--A--A--A-GG----T-C--AG-G-------T-C-CTGAGAACATGT
gi|130658 : AAC-AAG-T-A------A-C-AGG---CAA--T-G-G------G--T-T----T--C-A--G-G-T-A-----AA--A---T-T-TAC-T-CCAAGGT--CA-T-T---T-T-G--A--A--A-GG----T-C-CAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130659 : AAC-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAT-G-G-G------T--T-T----T--C-A--G-G-A-A-----AA--------T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T--------T-G--A--A-GG----T-C--AG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130660 : AAC-AAG-G-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-A------C--T-A----A--C-T--G-G-C-A-----AA--G---G-T-CAC-A-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-AG----T-T-GAG-G-------T-CACT
gi|130661 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------T--T-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--A---A-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---C-T-CG-A--A--T-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGACCATAT
gi|130662 : AAT-AAG-T-A------A-T-AGG---CATA-T-G-A------T--T-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--A---T-T-TAT-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-TG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-TACTCAGAACATAT
gi|130663 : AAT-AAG-T-A------A-C-AAG---TAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-T-T-A-----AA--G---T-T-TA--T-C-AAGGT--CA-T-T---T-A-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATAT
gi|130664 : AAT-AAG-T-A------A-T-AAG---CAAA-T-G-A------C--T-A----T--T-G--G-A-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGAT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GGTTAAT-T-AAG-G-------T-TACTC--AATATAT
gi|130665 : AAT-AGG-T-T------A-C-AGA---CTAA-T-------------------------A--G-G-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-T-GAG-G-------T-CACTCTGAAGATATg
gi|130666 : AAT-AAT-T-A------A-C-AGG---CAA--T-G-G------G--T-T----T--C-A--G-T-T-A-----AA--G-----T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-A--G--A--A-GG----T-C-GAG-G-------T-CACTGAGAACATAT
gi|130667 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-T-C-A-----AA--G---A-T-GAC-T-T-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--G-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130668 : AAT-AAG-G-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-A------G--T-T----T--C-A--A-G-C-A-----AA--A---G-T-TGC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-TGGT-A--ACTA-GG----T-C-AAT-G-------T-TACGGAGAACATGT
gi|130669 : AAT-GAA-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-AAG------T--T-TAGTAT--G-A--G-G-C-A-----AA--A---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-C-T---T-T-GG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CA--GAGAACATGT
gi|130670 : AAT-AAGGT-A------A---AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----TTCC-A--G-G-T-A-----AA--AAGAG-T-TAC-TAC-AAGGT--CA-T-T---T-T-TG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------TCCACTGAAAA
gi|130671 : AAT-AAGGT-A------A---AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----TTCC-A--G-G-T-A-----AA--AAGAG-T-TAC-TAC-AAGGT--CA-T-T---T-T-TG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------TCCACTGAAAA
gi|130672 : AAT-AAT-T-A------A-C-GAA---GAAA-T-T-A------C--T-T----T--T-A--T-T-C-A-----AA--G---G-T-TAC-T-T-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-G--A--A-GG----T-G-AAG-G-------T-CACTTAAAATATAT
gi|130673 : AAT-AGG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C----G-G-C-A-----AA--A---G-T-TACTT-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GG-C--A--A--G----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGATCATAT
gi|130674 : AAT-AAG-T-A------A-C-ATG---CAAG-T-G-G------T--A-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--C---G-T-TAC-T-C-AAGGT--TA-T-T---T-T-GA-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-TACTCAGAAAAT
gi|130675 : AAT-AAG-G-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-A------C--T-G----A--C-A--G-G-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-G-GT-A--A--A-GG----TAG-GGG-G-------T-CACTCAATATACAT
gi|130676 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CATA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--A-A-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-TT-A--A--A-GA----T-C-AAG-G-------T-CATTC--AACATATgt
gi|130677 : AAG-AAG-T-A------A-C-AGG---CATA-TTG-G------C--T-T----C--C-A--G-G-T-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GG-A--A--A-GG----T-TAAAG-G-------T-CACTTAGAATATAT
gi|130678 : AGT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-T------T--T-T----A--C-A--G-G-C-A-----AA--A---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G--A--A--A-AA----T-C-AAG-G-------T-AACTCACAGCA
gi|130679 : AGT-AAA-T-A------A-G-ATG---CAAA-T-T-G------C--T-T----T--C-A--G-T-C-A-----AA--G---G-A-GAT-T-C-AAGGT--AA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130680 : AAT-AAG-T-T------A-C-A-----CAAA-T-G-G------CGGC-T----T--T-A--G-G-T-A-----AA--------T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GA-T--C--A-GG----T-C-AAG-A-------T-CACTGAAAACATGT
gi|130681 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CGAA-T-A-A------C--T-T----T--C-A--G-A-C-A-----AA--G---A-T-CAC-C-C-ATGCT--CA-T-T---T-T-GG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACT
gi|130682 : AAT-AAG-T-A------G-C-AGG---TGAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-A-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGAT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-GTTAAAGAT-TACTCAGAACAT
gi|130683 : AAT-AAG-A-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T-------------------------------------AC-----AAGGT--CC-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTC--AACATATg
gi|130684 : AAT-AAG-A-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T-------------------------------------AC-----AAGGT--CC-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTC--AACATAT
gi|130685 : AAT-AAG-T-A------A-T-AGA---CAAA-T-G-A------C--T-T----T--A-A--T-A-C-A-----AAG-G---G-T-CAC-T-T-GAAGT--CATT-T---T-T-AT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-
gi|130686 : AAC-AAG-T-A------A-C-AAG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-A-C-A-----AA--G---G-T-AAC-C-C-AAGGT--TC-G-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAAGATAT
gi|130687 : AGT-AAG-T-A------A-T-AGG---CAAG-T-G-G------C--A-T-------C-A--G-A-C-A-----AA--G---G-C-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------C-CACT
gi|130688 : AAT-AAA-A-A------A-C--GA---CAAA-T-G-G---------T-C----T--C-A--G-A-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-TCT---T-T-G--A--A--A-AG----T-C-AAA-G-------C-TGCTCAGAATAT
gi|130689 : AAG-AAG-T-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-A------C--T-T----T--C-A--G-A-C-A-----AA--G---T-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-AG----T-C-AAG-G-------T-CAC
gi|130690 : AAT-AAG-A-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--C-T----T----A--G-A-A-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-GGGGT--CA-T-T---T-T-GA-A--A--A-GG----T-T-AAA-G-------T-CACTCAG
gi|130691 : AAT-AAG-T-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-ACC-AAGATCAA--G---A-T-CAC-T-C-AAGGT--AA-T-T---T-T-AT-A--A--A-GG----T-A-AAG-G-------T-CA
gi|130692 : AAT-AAA-T-A------T-C-AGG---TAAA-T-A-A------C--T-T----T--T-A--G-A-C-A-----GG--A---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA---T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAA-G-------T-TACT
gi|130693 : AAT-AAG-T-A------A-T-AGG---CAAA-C-A-A------T--T-T----T--C-G--G-G-G-A-----AA--G---G-T-TAT-T-T-AGG--------------------A--A--A-AG----T-C-AAG-G-------T-CGCCCAGAACATGTgggga
gi|130694 : AATGAAA-T-A------A-C-AGGT--CAAA-T-AAG------T--T-TAGTAT--G-A--G-G-G-A-----AA--------T-TAC-T-A-CAGGT--CA-C-T---T-T-G--G--A--A-GG----T-C-AAG-A-------T-AA--GAGAACATGT
gi|130695 : AAT-AAG-TTA------A-C-GAG---CAAA-A-A-G------C--T-T----T--C-A--GTC-C-A-----AA--G---G---TAC-T-CAAAGAT--CA-T-T---TGT-GT-A--A--A--G----T-C-AGG-T-------T-CACTCAGGATATGT
gi|130696 : AAT-AAA-T-A------A-C-AGG---TAAA---G-G------A--T-T----T--C-A--------------AA--G---G-T-TAC-A-C-AAAAT--CA-T-T---T-T-GG-A--A--A-AG----T-G-AGG-G-------C-TACTTAAAATA
gi|130697 : AT-AAG-A-A------A-C-AAG---CAAT-T-G-A------C--T-T----T--C-G--G-T-C-A-----AA--G---G-T-GAC-T-T-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTTAAAATATAT
gi|130698 : AT-AAG-T-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-A------T--T-A----A--C-G--G-G-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAAGT--CA-A-T---T-T-GT-G--A--A-GG----C-T-GAG-A-------T-CACTC--AACAT
gi|130699 : AC-AAA-T-G------A-T-AGA---CAAA-T-G-A------C--T-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--G---A-T-CAC-T-C-AAGGT--TA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-A-------T-CA
gi|130700 : AT-ACG-T-A------A-C-AGG---CAAAAT-G-G---------T-T----T--C-A--G-G-CTA-----AA--------T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-A-GA-A--A--A-GG----T-C-AAGCG-------T-CACT
gi|130701 : AT-AAG-T-A------A-T-AGA---CAAA-T-G-A------C--T-T----T--C-A--G-A-T-G-----AA--G---A-T-CAC-T-C-AAGAT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------A-CACTga
gi|130702 : AT-ATA-T-A------A-C-AGA---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-T-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-TG----T-C-AAG-G-------T-CACTC--AACATAT
gi|130703 : AT-AAG-T-A------A-T-AAG---CAAA-T-G-G------T--C-T----T--C-A--G-A-C-A-----AC--G---G-C-CTC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-ATTT--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTC--AACATAT
gi|130704 : AT-AAG-T-A------A-A-ATG---CAAA-T-A-G------T--T-T----T--TTA--G-A-C-A-----AA--G---A-T-CAC-T-G-AAGGT--TG-T-T---T-T-AT-A--A--A-GA----C-C-AAG-G-------C-CACTCAGAACATGT
gi|130705 : T-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----T--C-A--G-G-TAA-----AA--A---G-C-TAC-T-C-AA-GT--CA-T-T---T-T-TG-A--A--A-AG----T-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130706 : T-AAG-T-ACATGTTA-C-AAG---CAAA-T-G-GCCATGGC--T-T----T--C-A--G-T-C-A-----AA--G---G-T-GAC-T-T-AATGT--CA-T-T---T-T-TT-A--A--A-GA----T-C-AAT-G-------T-CACTTAGAGTATAT
gi|130707 : T-AAA-T-A------AAC-AAG---CAAAAT-G-G------C--C-T----T--C-A--G-T-T-A-----AA--A---G-T-TAC-T-C-AAGGTTTCA-T-T---T-TTGT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130708 : T-AAA-T-A------AAC-AAG---CAAAAT-G-G------C--C-T----T--C-A--G-T-T-A-----AA--A---G-T-TAC-T-C-AAGGTTTCA-T-T---T-TTGT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130709 : T-AAG-T-A------A-T-TGG---TAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-T-C-A-----AG--G---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA---T---C-T-GT-G--A--A-AG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130710 : T-AAG-T-A------A-C-AGGATTCAAAAT-G-G------G--TGT----T--C-AT-G-G-T-A-----AAAAG---C-TGTAC-T-C-AAGTT--CA-T-TCTTT-T-GA-A--A--ATGG----T-T-AAG-G-------T-CACTGAGAA
gi|130711 : T-AAG-T-A------A-C-AGG---TAAA-----G------C--T-T----T--C-A--G-T-C-A-----AA--A---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--T-GG----T-C-TAT-G-------T-CACTCAGAATATGTtctgt
gi|130712 : T-AAG-G-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-A------C--T-G----A--T-A--G-G-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-ATGTT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-T-AGG-G-------T-CAC
gi|130713 : -AAG-T-A------A-CCAGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----C--C-A--G-G-T-A-----AA--A---G---TGC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-TTGA--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130714 : -AAG-T-A------A-C-CGA---CAAA-T-A-T------C--T-T----T--C-A--A-A-TTA-----AA--G---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AGG-G-------T-CAATGAGAA
gi|130715 : -T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----C--C-G--G-T-A-A-----AA--G---GCT-TGC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-TTGA--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130716 : -AAG---CAAA-T-G-G------T--T-T----T--C-A--A-A-C-A-----AC--G---G-C-TAC-T-C-AAGAG--CA-T-T---T-T-GT-G--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CGCTCAG--CATGT
gi|130717 : ---CAAA-T-A-GTGT---C--A-T----T--C-A--G-T-C-A-----AA--G---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-G-T---T-T-GT-A--A--C-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130718 : ---CAAA-T-------------T-T----T--C-ATTG-G-G-A-----CA--T---G-A-TAC---C-AAGGT--CA-T-T---T-T--C-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAAAGCATAT
gi|130719 : -T-G-G------T--T-T----T--C-A--G-T-T-A-----AA--AA--G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-G-GG-A--A--T-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130720 : --G-A-C-A-----AA--G---G-T-ATC-T-C-AAGGT--CA-T-C---T-T-AA-A--A--A-GG----T-C-AAG-C-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130721 : g-----AA--G---A-T-TTC-T-C-AACAT--TA-T-T---T-T-G--A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130722 : -----AA--G---A-T-CTC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-G--A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CATCAAGAAGATAT
gi|130723 : -T-TTC-T-C-AAGGA--CA-T-T---T-T-GG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTAGGAACATAT
gi|130724 : -TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T--T-A--A----GG----T-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130725 : C-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T--T-A--A--ATGG----T-C-A---G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130726 : C-T-C-AAAGT--CA-T-T---T-T-TG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CATTTGGAATATAT
gi|130727 : C-T-C-AGGGT--CA-T-T---TCT-G--A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-TACTCGGAAGATAT
gi|130728 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GG-T--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAAC
gi|130729 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T--C-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAAAGCATAT
gi|130730 : -T-C-AAGAT--CA-T-T---T-T-GG-A--A--G-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCTGAACATGT
gi|130731 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GG-A--A--A-GA----C-C-AAG-G-------T-CATTGAGAACATAT
gi|130732 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GA-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACAT
gi|130733 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GG-A--G--A-GG----T-G-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130734 : -T-C-AGAGT--CA-T-T---T---GT-A--A--AAGG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130735 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-AA-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAA
gi|130736 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T--C-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAAAGCATAT
gi|130737 : -T-T-AAGAT--CA-T-T---T-TTGG-A--A--A-GG----C-C-AAT-G-------T-CACTCAGAACATGT
gi|130738 : -T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GG-A--T--A-GG----T-C-AAG-G-------G-CACTCAGAAC
gi|130739 : -T-C-AATGT--CA-T-T---T-T-GG-T--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCATAACATGTttgt
gi|130740 : -C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CATTCAGAACAT
gi|130741 : -C-AAGGT--CA-T-T---T-T-CG-A--A--G-GG----T-C-AAG-G-------T-CGTTCAAAATATGT
gi|130742 : -AAGGT--CA-T-T---T-T-TG-A--A--A-GG----A-C-AAG-G-------T-CACTCAGAA
gi|130743 : -AAGGT--CA-T-T---T-T-AG-G--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTTAGAATATAT
gi|130744 : AGGT--CA-T-T---T-T-GG-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACCCAGAACAT
blockSeqs : G CATGTT A ATT A G A CCATGGC AGTA TC TT AC T AGATC AAGA C TT GTG T TTAAAGA
blockSeqs : G . A T A T A TGTC AGTA TC T TC A . AAGA A TT GGT T .
blockSeqs : . . . . A . . CGG . . . T T . AAG A . TGT A .
blockSeqs : . . . . A . . C . . . G . . GG . . TGT . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . G . . AA . . TTG . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . G . . G . . TTG . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . G . . A . . TGG . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . G . . A . . GG . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . G . . A . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . G . . A . . CG . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . G . . G . . TG . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . T . . A . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . A . . A . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . G . . G . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . T . . G . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . T . . G . . GG . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . G . . G . . TG . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . G . . G . . TG . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . G . . A . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . G . . A . . GG . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . T . . G . . GA . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . G . . A . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . G . . C . . TT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . G . . G . . GG . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . A . . G . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . G . . G . . GA . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . G . . A . . GG . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . T . . G . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . G . . G . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . A . . G . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . A . . G . . AT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . A . . G . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . A . . G . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . A . . G . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . A . . G . . GA . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . A . . G . . AT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . A . . A . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . A . . G . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . G . . G . . GG . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . G . . G . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . T . . G . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . G . . G . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . G . . G . . GA . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . G . . G . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . A . . G . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . T . . G . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . A . . G . . AT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . A . . A . . TG . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . G . . G . . TT . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . T . . A . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . T . . A . . GA . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . T . . G . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . T . . A . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . G . . G . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . T . . A . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . G . . G . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . G . . G . . GG . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . A . . G . . AA . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . T . . G . . GG . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . A . . T . . TG . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . T . . G . . GG . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . G . . G . . GG . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . G . . GG . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . . GA . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . GG . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . GT . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . .
blockSeqs : . . . . GG . .
blockSeqs : . . . . GG . .
blockSeqs : . . GG . .
blockSeqs : . . CG . .
blockSeqs : . . TG . .
blockSeqs : . . AG . .
blockSeqs : . . GG . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . C . .
blockSeqs : . C . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : GN**
originalCons : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--G---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-T-GT-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
finalCons : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--G---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-T-T---T-TGN--A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
Alignments
lowQualScore : 0 1 0 111111 1 0 111 2 1 1 444444444 0 2222 11 0 11 222 1 11111 222222 0 0 0 1 0 11 0 000 0 44444 00 00 0 0000 0 0 0 1111111 0
lowQualScore : . . . ...... . . ... . . . ......... . .... .. . .. ... . ..... ...... . . . . . .. . ... . ..... .. .. . .... . . . ....... .
lowQualScore : 6 3 6 888888 3 6 777 4 2 2 000000000 6 5555 66 6 44 888 8 44444 888888 6 6 5 3 9 22 9 888 4 22222 66 66 4 9999 4 4 4 4444444 9
consensus : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--G---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-G-N-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
Reference ( family-274 ) : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--G---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-G-N-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130653 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-A-G------G--T-T----T--C-A--G-G-T-A-----AA--A---G-C-TAC-T-C-AAGGT--TA-TT---T-T-T-G-A--A--A--G----T-T-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130654 : AAT-AAT-T-A------A-C-AAG---CAAA-T-T-A------C--T-T----T--T-A--G-T-C-A-----AA--G---G-T-GAC-T-T-AAGGT--CA-TT---T-T-GTG-A--A--G-GG----T-C-A
gi|130655 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--A---T-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-TC---T-T-G-G-A--A--A-TG----G-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130656 : AAC-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-TGG-G------T--T-T----T--C-A--G-G-G-T-----AA--A---A-T-TAC-TCC-AAGGT--CA-TT---T-----G-A--A--A-GG----T-C-CAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130657 : AAC-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----T--C-A--G-G-T-A-----AA--A---T-T-TAC-C-C-AAGGT--CA-TT---T-T-G---A--A--A-GG----T-C--AG-G-------T-C-CTGAGAACATGT
gi|130658 : AAC-AAG-T-A------A-C-AGG---CAA--T-G-G------G--T-T----T--C-A--G-G-T-A-----AA--A---T-T-TAC-T-CCAAGGT--CA-TT---T-T-G---A--A--A-GG----T-C-CAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130659 : AAC-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAT-G-G-G------T--T-T----T--C-A--G-G-A-A-----AA--------T-TAC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-------G--A--A-GG----T-C--AG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130660 : AAC-AAG-G-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-A------C--T-A----A--C-T--G-G-C-A-----AA--G---G-T-CAC-A-C-AAGGT--CA-TT---T-T-G-T-A--A--A-AG----T-T-GAG-G-------T-CACT
gi|130661 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------T--T-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--A---A-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-TT---C-T-C-G-A--A--T-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGACCATAT
gi|130662 : AAT-AAG-T-A------A-T-AGG---CATA-T-G-A------T--T-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--A---T-T-TAT-T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-T-G-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-TACTCAGAACATAT
gi|130663 : AAT-AAG-T-A------A-C-AAG---TAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-T-T-A-----AA--G---T-T-TA--T-C-AAGGT--CA-TT---T-A-G-T-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATAT
gi|130664 : AAT-AAG-T-A------A-T-AAG---CAAA-T-G-A------C--T-A----T--T-G--G-A-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGAT--CA-TT---T-T-G-T-A--A--A-GGTTAAT-T-AAG-G-------T-TACTC--AATATAT
gi|130665 : AAT-AGG-T-T------A-C-AGA---CTAA-T-------------------------A--G-G-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-G-T-A--A--A-GG----T-T-GAG-G-------T-CACTCTGAAGATATg
gi|130666 : AAT-AAT-T-A------A-C-AGG---CAA--T-G-G------G--T-T----T--C-A--G-T-T-A-----AA--G-----T-TAC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-A-G-A--A----GG----T-C-GAG-G-------T-CACTGAGAACATAT
gi|130667 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-T-C-A-----AA--G---A-T-GAC-T-T-AAGGT--CA-TT---T-T-G-T-A--A--G-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130668 : AAT-AAG-G-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-A------G--T-T----T--C-A--A-G-C-A-----AA--A---G-T-TGC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-TGG-T-A--ACTA-GG----T-C-AAT-G-------T-TACGGAGAACATGT
gi|130669 : AAT-GAA-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-AAG------T--T-TAGTAT--G-A--G-G-C-A-----AA--A---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-CT---T-T-G-G-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CA--GAGAACATGT
gi|130670 : AAT-AAGGT-A------A---AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----TTCC-A--G-G-T-A-----AA--AAGAG-T-TAC-TAC-AAGGT--CA-TT---T-T-T-G-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------TCCACTGAAAA
gi|130671 : AAT-AAGGT-A------A---AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----TTCC-A--G-G-T-A-----AA--AAGAG-T-TAC-TAC-AAGGT--CA-TT---T-T-T-G-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------TCCACTGAAAA
gi|130672 : AAT-AAT-T-A------A-C-GAA---GAAA-T-T-A------C--T-T----T--T-A--T-T-C-A-----AA--G---G-T-TAC-T-T-AAGGT--CA-TT---T-T-G-T-G--A--A-GG----T-G-AAG-G-------T-CACTTAAAATATAT
gi|130673 : AAT-AGG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C----G-G-C-A-----AA--A---G-T-TACTT-C-AAGGT--CA-TT---T-T-G-G-C--A--A--G----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGATCATAT
gi|130674 : AAT-AAG-T-A------A-C-ATG---CAAG-T-G-G------T--A-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--C---G-T-TAC-T-C-AAGGT--TA-TT---T-T-G-A-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-TACTCAGAAAAT
gi|130675 : AAT-AAG-G-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-A------C--T-G----A--C-A--G-G-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-G-G-T-A--A--A-GG----TAG-GGG-G-------T-CACTCAATATACAT
gi|130676 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CATA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--A-A-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-T-T-A--A--A-GA----T-C-AAG-G-------T-CATTC--AACATATgt
gi|130677 : AAG-AAG-T-A------A-C-AGG---CATA-TTG-G------C--T-T----C--C-A--G-G-T-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-G-G-A--A--A-GG----T-TAAAG-G-------T-CACTTAGAATATAT
gi|130678 : AGT-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-T------T--T-T----A--C-A--G-G-C-A-----AA--A---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-G-A-A--A--A--A----T-C-AAG-G-------T-AACTCACAGCA
gi|130679 : AGT-AAA-T-A------A-G-ATG---CAAA-T-T-G------C--T-T----T--C-A--G-T-C-A-----AA--G---G-A-GAT-T-C-AAGGT--AA-TT---T-T-G-T-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130680 : AAT-AAG-T-T------A-C-A-----CAAA-T-G-G------CGGC-T----T--T-A--G-G-T-A-----AA--------T-TAC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-G-A-T--C--A-GG----T-C-AAG-A-------T-CACTGAAAACATGT
gi|130681 : AAT-AAG-T-A------A-C-AGG---CGAA-T-A-A------C--T-T----T--C-A--G-A-C-A-----AA--G---A-T-CAC-C-C-ATGCT--CA-TT---T-T-G-G-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACT
gi|130682 : AAT-AAG-T-A------G-C-AGG---TGAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-A-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGAT--CA-TT---T-T-G-T-A--A--A-GG----T-C-AAG-GTTAAAGAT-TACTCAGAACAT
gi|130683 : AAT-AAG-A-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T-------------------------------------AC-----AAGGT--CC-TT---T-T-G-T-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTC--AACATATg
gi|130684 : AAT-AAG-A-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T-------------------------------------AC-----AAGGT--CC-TT---T-T-G-T-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTC--AACATAT
gi|130685 : AAT-AAG-T-A------A-T-AGA---CAAA-T-G-A------C--T-T----T--A-A--T-A-C-A-----AAG-G---G-T-CAC-T-T-GAAGT--CATTT---T-T-A-T-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-
gi|130686 : AAC-AAG-T-A------A-C-AAG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-A-C-A-----AA--G---G-T-AAC-C-C-AAGGT--TC-GT---T-T-G-T-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAAGATAT
gi|130687 : AGT-AAG-T-A------A-T-AGG---CAAG-T-G-G------C--A-T-------C-A--G-A-C-A-----AA--G---G-C-TAC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-G-T-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------C-CACT
gi|130688 : AAT-AAA-A-A------A-C--GA---CAAA-T-G-G---------T-C----T--C-A--G-A-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-TC---T-T-T-G-A--A--A-AG----T-C-AAA-G-------C-TGCTCAGAATAT
gi|130689 : AAG-AAG-T-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-A------C--T-T----T--C-A--G-A-C-A-----AA--G---T-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-G-T-A--A--A-AG----T-C-AAG-G-------T-CAC
gi|130690 : AAT-AAG-A-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------C--C-T----T----A--G-A-A-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-GGGGT--CA-TT---T-T-G-A-A--A--A-GG----T-T-AAA-G-------T-CACTCAG
gi|130691 : AAT-AAG-T-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-ACC-AAGATCAA--G---A-T-CAC-T-C-AAGGT--AA-TT---T-T-A-T-A--A--A-GG----T-A-AAG-G-------T-CA
gi|130692 : AAT-AAA-T-A------T-C-AGG---TAAA-T-A-A------C--T-T----T--T-A--G-A-C-A-----GG--A---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA--T---T-T-G-T-A--A--A-GG----T-C-AAA-G-------T-TACT
gi|130693 : AAT-AAG-T-A------A-T-AGG---CAAA-C-A-A------T--T-T----T--C-G--G-G-G-A-----AA--G---G-T-T---------------A-TT---T-A-G-G-A--A--A-AG----T-C-AAG-G-------T-CGCCCAGAACATGTgggga
gi|130694 : AATGAAA-T-A------A-C-AGGT--CAAA-T-AAG------T--T-TAGTAT--G-A--G-G-G-A-----AA--------T-TAC-T-A-CAGGT--CA-CT---T-T-G-G-A--A----GG----T-C-AAG-A-------T-AA--GAGAACATGT
gi|130695 : AAT-AAG-TTA------A-C-GAG---CAAA-A-A-G------C--T-T----T--C-A--GTC-C-A-----AA--G---G---TAC-T-CAAAGAT--CA-TT---TGT-G-T-A--A--A--G----T-C-AGG-T-------T-CACTCAGGATATGT
gi|130696 : AAT-AAA-T-A------A-C-AGG---TAAA---G-G------A--T-T----T--C-A--------------AA--G---G-T-TAC-A-C-AAAAT--CA-TT---T-T-G-G-A--A--A-AG----T-G-AGG-G-------C-TACTTAAAATA
gi|130697 : AT-AAG-A-A------A-C-AAG---CAAT-T-G-A------C--T-T----T--C-G--G-T-C-A-----AA--G---G-T-GAC-T-T-AAGGT--CA-TT---T-T-G-T-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTTAAAATATAT
gi|130698 : AT-AAG-T-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-A------T--T-A----A--C-G--G-G-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAAGT--CA-AT---T-T-G-T-G--A--A-GG----C-T-GAG-A-------T-CACTC--AACAT
gi|130699 : AC-AAA-T-G------A-T-AGA---CAAA-T-G-A------C--T-T----T--C-A--G-G-C-A-----AA--G---A-T-CAC-T-C-AAGGT--TA-TT---T-T-G-T-A--A--A-GG----T-C-AAG-A-------T-CA
gi|130700 : AT-ACG-T-A------A-C-AGG---CAAAAT-G-G---------T-T----T--C-A--G-G-CTA-----AA--------T-TAC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-A-G-A-A--A--A-GG----T-C-AAGCG-------T-CACT
gi|130701 : AT-AAG-T-A------A-T-AGA---CAAA-T-G-A------C--T-T----T--C-A--G-A-T-G-----AA--G---A-T-CAC-T-C-AAGAT--CA-TT---T-T-G-T-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------A-CACTga
gi|130702 : AT-ATA-T-A------A-C-AGA---CAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-T-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-G-T-A--A--A-TG----T-C-AAG-G-------T-CACTC--AACATAT
gi|130703 : AT-AAG-T-A------A-T-AAG---CAAA-T-G-G------T--C-T----T--C-A--G-A-C-A-----AC--G---G-C-CTC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-G-T-ATTT--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTC--AACATAT
gi|130704 : AT-AAG-T-A------A-A-ATG---CAAA-T-A-G------T--T-T----T--TTA--G-A-C-A-----AA--G---A-T-CAC-T-G-AAGGT--TG-TT---T-T-A-T-A--A--A-GA----C-C-AAG-G-------C-CACTCAGAACATGT
gi|130705 : T-AAG-T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----T--C-A--G-G-TAA-----AA--A---G-C-TAC-T-C-AA-GT--CA-TT---T-T-T-G-A--A--A-AG----T-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130706 : T-AAG-T-ACATGTTA-C-AAG---CAAA-T-G-GCCATGGC--T-T----T--C-A--G-T-C-A-----AA--G---G-T-GAC-T-T-AATGT--CA-TT---T-T-T-T-A--A--A-GA----T-C-AAT-G-------T-CACTTAGAGTATAT
gi|130707 : T-AAA-T-A------AAC-AAG---CAAAAT-G-G------C--C-T----T--C-A--G-T-T-A-----AA--A---G-T-TAC-T-C-AAGGTTTCA-TT---T-TTG-T-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130708 : T-AAA-T-A------AAC-AAG---CAAAAT-G-G------C--C-T----T--C-A--G-T-T-A-----AA--A---G-T-TAC-T-C-AAGGTTTCA-TT---T-TTG-T-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130709 : T-AAG-T-A------A-T-TGG---TAAA-T-G-G------C--T-T----T--C-A--G-T-C-A-----AG--G---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA--T---C-T-G-T-G--A--A-AG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130710 : T-AAG-T-A------A-C-AGGATTCAAAAT-G-G------G--TGT----T--C-AT-G-G-T-A-----AAAAG---C-TGTAC-T-C-AAGTT--CA-TTCTTT-T-G-A-A--A--ATGG----T-T-AAG-G-------T-CACTGAGAA
gi|130711 : T-AAG-T-A------A-C-AGG---TAAA-----G------C--T-T----T--C-A--G-T-C-A-----AA--A---G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-G-T-A--A--T-GG----T-C-TAT-G-------T-CACTCAGAATATGTtctgt
gi|130712 : T-AAG-G-A------A-T-AGG---CAAA-T-G-A------C--T-G----A--T-A--G-G-C-A-----AA--G---G-T-CAC-T-C-ATGTT--CA-TT---T-T-G-T-A--A--A-GG----T-T-AGG-G-------T-CAC
gi|130713 : -AAG-T-A------A-CCAGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----C--C-A--G-G-T-A-----AA--A---G---TGC-T-C-AAGGT--CATTT---T-T-T-G-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130714 : -AAG-T-A------A-C-CGA---CAAA-T-A-T------C--T-T----T--C-A--A-A-TTA-----AA--G---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-G-T-A--A--A-GG----T-C-AGG-G-------T-CAATGAGAA
gi|130715 : -T-A------A-C-AGG---CAAA-T-G-G------G--T-T----C--C-G--G-T-A-A-----AA--G---GCT-TGC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-T-TGA--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130716 : -AAG---CAAA-T-G-G------T--T-T----T--C-A--A-A-C-A-----AC--G---G-C-TAC-T-C-AAGAG--CA-TT---T-T-G-T-G--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CGCTCAG--CATGT
gi|130717 : ---CAAA-T-A-GTGT---C--A-T----T--C-A--G-T-C-A-----AA--G---G-T-TAC-T-C-AAGGT--CA-GT---T-T-G-T-A--A--C-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAATATAT
gi|130718 : ---CAAA-T-------------T-T----T--C-ATTG-G-G-A-----CA--T---G-A-TAC---C-AAGGT--CA-TT---T-T---C-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAAAGCATAT
gi|130719 : -T-G-G------T--T-T----T--C-A--G-T-T-A-----AA--AA--G-T-CAC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-G-G-G-A--A--T-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130720 : --G-A-C-A-----AA--G---G-T-ATC-T-C-AAGGT--CA-TC---T-T-A-A-A--A--A-GG----T-C-AAG-C-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130721 : g-----AA--G---A-T-TTC-T-C-AACAT--TA-TT---T-T-G---A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130722 : -----AA--G---A-T-CTC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-G---A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CATCAAGAAGATAT
gi|130723 : -T-TTC-T-C-AAGGA--CA-TT---T-T-G-G-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTAGGAACATAT
gi|130724 : -TAC-T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-T------A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTGAGAACATGT
gi|130725 : C-T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-T-A-A--A--T-GG----T-C-A---G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130726 : C-T-C-AAAGT--CA-TT---T-T-T-G-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CATTTGGAATATAT
gi|130727 : C-T-C-AGGGT--CA-TT---T-C-T-G-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-TACTCGGAAGATAT
gi|130728 : -T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-G-G-T--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAAC
gi|130729 : -T-C-AAGGT--CA-TT---T-T---C-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAAAGCATAT
gi|130730 : -T-C-AAGAT--CA-TT---T-T-G-G-A--A--G-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCTGAACATGT
gi|130731 : -T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-G-G-A--A--A-GA----C-C-AAG-G-------T-CATTGAGAACATAT
gi|130732 : -T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-G-A-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACAT
gi|130733 : -T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-G-G-A--G--A-GG----T-G-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130734 : -T-C-AGAGT--CA-TT---T-G-T-A-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAACATAT
gi|130735 : -T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-A-A-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAGAA
gi|130736 : -T-C-AAGGT--CA-TT---T-T---C-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCAAAGCATAT
gi|130737 : -T-T-AAGAT--CA-TT---T-TTG-G-A--A--A-GG----C-C-AAT-G-------T-CACTCAGAACATGT
gi|130738 : -T-C-AAGGT--CA-TT---T-T-G-G-A--T--A-GG----T-C-AAG-G-------G-CACTCAGAAC
gi|130739 : -T-C-AATGT--CA-TT---T-T-G-G-T--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTCATAACATGTttgt
gi|130740 : -C-AAGGT--CA-TT---T-T-G-G-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CATTCAGAACAT
gi|130741 : -C-AAGGT--CA-TT---T-T-C-G-A--A--G-GG----T-C-AAG-G-------T-CGTTCAAAATATGT
gi|130742 : -AAGGT--CA-TT---T-T-T-G-A--A--A-GG----A-C-AAG-G-------T-CACTCAGAA
gi|130743 : -AAGGT--CA-TT---T-T-A-G-G--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACTTAGAATATAT
gi|130744 : AGGT--CA-TT---T-T-G-G-A--A--A-GG----T-C-AAG-G-------T-CACCCAGAACAT