lowQualScore                  :                                                                                                    111111111111111                                                                                                         
lowQualScore                  :                0 111 666   0000 1111 1111 1111 22222 88888 0 1111 0 0 0   11  11111 00 11 2222 111 888888888888888 222 11 3333333 44444444444 5555555555555 88888888 0 333333  0 0 0 222  1 00 111 11111  000 0  000 00    
lowQualScore                  :                . ... ...   .... .... .... .... ..... ..... . .... . . .   ..  ..... .. .. .... ... ............... ... .. ....... ........... ............. ........ . ......  . . . ...  . .. ... .....  ... .  ... ..    
lowQualScore                  :                5 777 444   9999 8888 8888 5555 66666 11111 4 7777 4 4 4   88  99999 66 44 2222 777 333333333333333 999 00 8888888 11111111111 1111111111111 66666666 4 333333  4 4 4 777  3 66 666 11111  777 4  777 66    
consensus                     :          GGACGG-A---A--NGAC----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
Reference ( gi|130615 )       :          GGACGG-A---A--TGAC----G----G----A----C-----A---A-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130616                     :          GGACGA-A---A--TGAC----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--CT------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130586                     :          GGAAGG-A---A--TGAC----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---------GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130592                     :   gacggacGGACGG-A---A--TGAC----A----G----A----C-----A---A-A-G----A-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---T---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130618                     :       gatGGGCGG-A---A--TGAC----G----G----A----C-----T---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--T-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--A---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130617                     :          GGACGG-A---A--TGAT----G----G----A----C-----A---G-A-G----G-T-A-AAA--TA-----G--T--A----T---AACCCCCC--------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAtaa
gi|130570                     :          GGACGG-A---A--TGAC----G----G----ATGCAC-----A---A-A-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---AG--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------TT-T-C-G---GA-G--C---G-----GC---G-GT---A--TAAAaa
gi|130564                     :      ggacGGAAGG-A---A--TGAC----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---AC--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CA-T-C-G---GA-G--CG--G-----GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130609                     :  ggacggaaGGACGG-A---A--GGAC----G----G----A----C-----A---G-A-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--G----C---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130559                     :         cGGACGG-A---------C----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------AT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-AT---A--TAAA
gi|130608                     :  ggacacaaGGACGG-A---C--GGAC----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-C-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------CT----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GA---G-GT---A--TAAAaa
gi|130587                     :         cGGAAGG-A---A--TGAC----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--TA-A----T---A---------------CG--C--C-------C-----------C---T---------CT-------T-C------CT-T-C-G---GAGG--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130560                     :   gacggacGGACGG-A---A--TGAC----GA---A----A----C-----A---A---G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-CT-----CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130593                     :      ggacGGACAG-A---A--TAAC----G----G----A----C-----ATTTA-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---T--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-G-G---GA-G--T---G-----GG---A-GT---A--TAAga
gi|130556                     :       gacGGACGT-A---A--GAAC----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-------------------------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130619                     :      ggacGAACGG-A---A--TGAC----G---------A----C-----A---AAG-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--AA---T---AAC-------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--A---G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130554                     :          GGACGG-A---A--GGAC----A----G----A----C-----A---G-A-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---ATCC------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------AT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAa
gi|130555                     :      ggacGGACGG-A---AA-GGAC----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----TT--A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCT---T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130574                     :      ggacGGACGG-A---A--TGAT----G----G----G----C-----A---G-A-G----G-C-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------CT--C--C-------C-----------C---T---------T--------T-C------CT-T-C-G---TA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TA
gi|130614                     :      ggacGGACG--A---A--TGAC----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAAA-CA-----G--T--AA---T---AA--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--AAAA
gi|130569                     :          GGATGG-A---A--GGGC----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--TA-----G--T--A----T---A---------------C---C--CCCTT---C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-T-G---GA-G--C---A-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130563                     :      ggatGGACGG-ACG-A--AGAT----G----G----A----C-----A---G-A-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-C------CT-T-C-C---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAcaa
gi|130571                     :          GGACGG-A---A--TGACAGACG----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AA---CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCC----T-C------CT-T-C-A---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130562                     :          GGATAG-A---A--GGAC----G----G----A----C-----G---G-A-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-C------TT-T-C-G---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130558                     :      ggacGGACGG-A---A--GAAC----G----G----A----C-----A---G-G-G----A-T-A-AAA--CA-----G--T--A----TAACA---------------C---C--C-------C-----------C---T------------------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-TT---G--TAAA
gi|130561                     :      ggacGGACGG-A---A--TGAC----GA---A----A----C-----A---A---G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-C------TC-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT------TAAaa
gi|130572                     :      ggacGGACGG-A---A--GAAC----G----GTAGGA----C-----A---G-A-G----G-T-A-AAA--CA-----A--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T------------------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---A-GT---A--TAAgaa
gi|130596                     :      ggacGGACAG-A---A--TGAA----G----A----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---T--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--T---------GG---A-GT---A--Ttaaa
gi|130575                     :       gatGGGCGG-A------TGAC----G----G----A----CGGACAA---G-G-G----G-T-ATAAA--CA-----G--T--A----T---ATC-------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---------GG---G-GT---A--TAAA
gi|130595                     :          GGACGG-A---A--TGAC----G----G----A----CGGAC-A---T-G-G----G-T-A-AAA--CG-----G--T--A----T---AT--------------C---C--T-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-A--C---G-----GG---GTAT---A--TAA
gi|130612                     :       gacGGACGG-A-------GAC----G----G----A----C-----AG--A-G-GT---G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-C------CT---C-G---GA-G--C---G-----GG---G-AT---A--TAA
gi|130611                     :         cGGACGG-A---A--GGAC----G----G----A----C-----T---G-A-G----G-T-A-AAA--TA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-------------------------C--------T-C------CT-T-C-G---AA-A--C---A-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130622                     :         cGGACGT-A---A--TGAC----G----G----A----C-----A---T-A-G----G-T-A-AAA--TACTGTGG--T--A----T---A---------------T---C--C-------CT----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--Ttaaa
gi|130605                     :          GGACGG-A---A--GGAC----G----AGCGAA----C-----A---G-G-A----G-T-A-AAA--CA-----G--C--A----C---A---------------C---C--G-------C---------------T---------C--------T-C------CT-T-T-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130643                     :        acGGACGG-A---------C----G----G----A----C-----------G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-------------------------G--------T-C------CT-T-T-G---GA-G--C---G-----GA---G-GT---A--TAA
gi|130607                     :          GGACAA-A---A--TGAC----A----G----A----C-----A---G-G-G----A-T-A-AAA--CA-----G--T--G----C---T---------------C---C--CCTCAGGGC-----------C---T---------C--------T-G------CT-T-T-G---GA-G--C---A-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130621                     :        acGGATGG-ATTGA--GGAC----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--TCAG----T---A---------------C---C--C-------CGGCCATTAACCC---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---A-----GG---T-GT---A--TAAtaa
gi|130601                     :          GGACAG-A---A--TGAC----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--TA-----G--T--A----T-------------------C---A--A-------A-----------C---TA--------A--------T-C------CT-T-C-G---AA-G--A---A-----GG---G-GT---A--TAAtaaa
gi|130576                     :       gatGGATGG-A---G--GGAG----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C------------------------------------C-G---GT-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130591                     :      ggacGGACGGGA---A--TGAC----G---------A----C-----A---G-G-G----G---A-AAA--CA-----G--T--T----T---ATCCCCCC--------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-T-G---GG-G--T---G-----GG---G-GTAACA--TAAAtaaa
gi|130577                     :       gatGGACGG-A---C--ACAC----A----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T-------------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------CAC------CA-T-C-A---GA-G--C---A-----GGCCAG-GT---A--TAA
gi|130580                     :      ggatGGACAG-A---A--TAAC----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----A---A---------------C---C--T-------C-----------C---T---------T--------C-T------CT-T-
gi|130613                     :      ggacGGACGG-A---A----------G----G----A----C-----A---G-A-G----T-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---AACACACCCACCCACCCA--C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---G--TAA
gi|130582                     :         cGGACAG-A---A--GAAC----G----G----A----C-----A---A-G-G----G-T-A-AAA--CT-----G--T--A----T---G---------------A---C--C-------C-----------T---A---------C--------C-A------CT-T-T-G---TG-G--C---G-----GG---G-GC---G--TAA
gi|130581                     :      ggaaGGACGG-A---A--TAAC----A----G----A----C-----------G-G----G-T-A-AAAA-CA-----A--T--A--------ATTCCCC---------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------C-C------CT-T-T-A---GA-G--T---G-----GG---A-GT---A--TAAAcaa
gi|130620                     :      ggatGGA-GG-A---A----GC----G----G----A----C-----A---G-G-G----GAT-A-AAA--CA-----G-----A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCA---T-C------CT-TGC-G---AA-G--C---G-----GG---G--T---A--TAAAaa
gi|130602                     :          GGGCGG-A---C--AGAC----A----G----A----C-----A-----G-G----G-T-G-AAA--CCT----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------A--------A-A------CT-T-C-GTTTGC-G------G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130599                     :       gacGGACGG-A---C--AGAC----A----G----A----C-----A---G-A-G----G-T-G-AAA--CA-----C--T--A----T---ATACCG----------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------C-CAA----CT-T-C-GTTTG--G--C---G-----GG---G-G----G--TAAAaa
gi|130565                     :        gacGACAG-A---A--TGAC----G----G----A----C-----A---A-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---AC--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---T-----GG---G-GT---A--TAAa
gi|130590                     :  ggacggaatGACGG-A---A--TGAC----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---AC--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---A-GT---A---AAA
gi|130589                     :       gacaGACGG-A---A--GGAT----G----G----A----C-----A---G-A-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--TAAtaaa
gi|130610                     :       gacaGACGG-A---A--GGAC----G----G----A----C-----A---G-A-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--T----T---AACCCCCCC-------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAtaa
gi|130573                     :         caGATGG-A---A--GGAC----A----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---A---------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--C---------AG---G-GT---A--TAA
gi|130568                     :      gaactGAGGG-A---A--GGAC----G----G----A----C-----A---G-A-G----G-T-A-GAA--CA-----G--T--A----T---ACCCCC----------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---------GG---G-GT---A--TGAtaa
gi|130606                     :  ggacggacaGACTG-A---A--TGAC----A----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CG-----G--T--A----T---A---------------CA--C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---G
gi|130623                     :        acaGACAG-A---T--GGAC----A----G----A----C-----A---G-A-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---ACCCCC----------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-T-G---GA-C--C---G-----GG---G-GA---A--TAAA
gi|130578                     :           GACAG-A---AGGTGAC----G----G----A----T-----C---A-A-G----G-T-A-AAA--CA-----A--T--G----T---AAC-------------C---C--T-------C-----------C---T---------C----------C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAGAaa
gi|130579                     : ggacggagatGACGC-A---A--TGAT----G----G----A----C-----A---T-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------C-C------CC-C-CTG---GA-
gi|130585                     :      ggacaGACGG-A---C--AGAC----A----G----A----C-----A-----G-G----G-T-G-AAA--CCT----A--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------C-CCCCAAACT-T-C-GT--TT-G--C---G-----GG---G-CT---A--TAAA
gi|130583                     :  ggacagacaGACAG-A---C--AGAC----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAC--TT-----A--T--A----T---C---------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------C-CAA----CT-T-C-GT--TT-G--CA--G-----GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130603                     :      ggacaGACAG-A---G---GAC----A----G----A----C-----A---G-G-G----T-T-G-AAA--CT-----A--T--A----T---A---------------CTCAC--C-------C-----------C---C---------C--------C-CAA----CT-T-C-G---TTTG--C---G-----GG---G-GT---A--TAAtaa
gi|130557                     :        ggcaACGG-A---A--TGAC----GGACGG----A----C-----A---A-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---ACC-------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAtaa
gi|130625                     :  ggacggaaaaACGG-A---A----------G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-T-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--T-------C-----------C-------------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-AT---A--TAAaa
gi|130604                     :            ATGG-A---A--GGAC----G----G----A----C-----A---C-G-A----G-T-A-AA---CA-----G--T--A----T---A---------------T---C--C-------C-----------G---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---AATTAAA
gi|130597                     :        acgcACGG-A---A--TGAC----G---------A----C-----------G-G----G-TTA-AAA--TA-----A--T--A----T---A---------------C---C--C-------CC----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G------G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130627                     :   gacggaactACAG-A---C--CGAC----C----G----A----C-----A---G-G-T----G-C-A-AAA--CA-----A--T--A----T---G---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-T------TT-T-C-A---AA-G------G-----GG---G-GC---A--TAAAtaaa
gi|130626                     :            ACGA-A---A--GGAC----G----G----A----A-----A---A-G-G----G-T-A-AAA--C---------T--A----T---A---------------T---G--C-------C-----------C---TAA-------C--------C-A------CT-T-T-G---TG-G--T---G-----GG---G-GC---A--TAAAaa
gi|130584                     :             CGA-A---A--TGAC----G----G----A----C-----A---G-G-GT---G-T-A-AAAAGCA-----G--T--A----T---A---------------C---CCAC-------C-----------C---T---------CAA------T-C------CT-T-C-GA--GG-G--C---------GG---G-GT---A--TGAAaa
gi|130629                     :        gaacgCGG-A---T--GGAT----G----G----A----A-----G---G-A-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---CTCCCCCCCCC--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A---AAA
gi|130631                     :             CAG-A---A--GGAC----G----G----A----TGG---A---C-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--T-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-
gi|130630                     :             CGG-A---A--GGAC----G----G----A----C-----G---G-G-G----A-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---
gi|130600                     :              GG-G---A--TGAA----G----G----A----C-----G-----G-G----A-T-A-AAA--CA-----G--C--A----A---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-A---AA-A--C---A-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130566                     :         gacagaG-A---A--GGAC----G----G----A----C-----A---G-A-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-------------------------C--------T-C------CT-T-C-G---GAGG--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130567                     :      ggacagaaaG-A---A--GGAC----G----G----A----C-----A---G-A-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-------------------------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--G---C-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130588                     :      ggacagaaaG-A---A--TGA-----G----G----A----C-----A-----G-G----G-T-A-AAA--CA-----A--TT-A----T---AA--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---------GG---G-GT---A--TAAA
gi|130634                     :       gacggaaga-A---G--TGAC----A----G----A----C-----G---G-G-A----G-T-A-AAA--CA-----G--T--ACATGT---A---------------CAT-C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-C--C---G-----GG---G-GT---G--TAAa
gi|130637                     :                        aGAC----G----G----A----C-----A-----G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T-------------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAcaa
gi|130636                     :                        gGAC----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---CA-C-------C-----------C---C---------C--------C-T------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAtaaa
gi|130638                     :                        gGAC----G----G----A----A-----A---G-A-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCC---T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAtaaa
gi|130639                     :                        gGAC----G----G----A----------A---G-A-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCC---T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130641                     :                        gGAC----G----G----A----C-----G---G-G-ATTGTG-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------T-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---CA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130628                     :                        gGAT----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--G----T---A---------------C---T--C-------C-------------------------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130642                     :                   cagatgGAT----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---G---------------T---T--A-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--CCAGG-----GG---G-GT---A--TAAtaaa
gi|130640                     :                        gGAC----G----G----A----A-----A---G-A-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----TTT-A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCCC--T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130594                     :                        gGAC----G----G----AAC--C-----A---G-A-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---ACCCCCCC--------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-GACC---G-----AG---G-GT---A--TAAA
gi|130633                     :                     gacgGAC----A----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAAA-TA-----G--T--A----T---A---------------T---C--CG------C-----------C---T---------C--------T-G------CGAT-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130646                     :                     gacgGAT----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--AAT--T---AT--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-T-A---GA-G--T---G-----GA---A-GT---A--TGAaa
gi|130645                     :                         GAC----A----G----A----C-----------G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--T----C---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT---------GA-G--T---------GG---G-GT---A--TAAAtaaa
gi|130647                     :                        gGAT----G----G----A----------A---A-GTG----G-A-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--TCTTA---C-----------C---C---------C--------T-T------CT-T-C-G---GA-G--C---GGAGCAGG---G-GT---A--TAAa
gi|130644                     :                         GGC----G----G----A----C-----G---G-A-G----G-T-A-AAA--AA-----GGTT--C----T---C---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCCCCTT-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-CT---A--TAAAtaa
gi|130648                     :                         gAC----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---A-GT---A--TAAaa
gi|130649                     :                          AC----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-T-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------T---C--C-------C-----------C-------------C--------T-A------CT-T-T-A---GG-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAcaa
gi|130650                     :                          AC----C----G----A----C-----A---G-G-T----G-C-A-AAA--CA-----A--T--A----T---G---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-T------TT-T-C-A---AA-G------G-----GG---G-GC---A--TAAAgaa
gi|130651                     :                            ----G----G----A----C-----A---G-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------CCC---------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130598                     :                                      ----A----C-----A---A-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------A---C--C-------CG----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---------GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130632                     :                                       gacagacagggcaaaaaca-G-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---A-GT---A--TAAA
gi|130635                     :                                                    ggaaggat-G----G-T-A-AAA--CA-----G--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C-----------------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130652                     :                                                 agaatggatgt-G----A-T-A-AAA--CA-----G--T--A----A---A---------------C---C--C-------C-----------CCACT---------C--------T-C------CT-C-C-A---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--TAAtaa
gi|130618                     :                                                                                ataga--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CG-A-A-G---GA-G--A---G-----GA---G-GT---A--TAtaa
gi|130589                     :                                                        gggcggaatgacggactggggtaaaacag--T--A----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---A---------C--------T-C------CG-A-A-G---GA-G------G-----GG---G-GT---A--TAataa
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|130624 ): GACAGAAGGACAGACAGGACAAAAACCATATGCCCCCCGCTCTTCGATCACGGGGGCATAAAAA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                              111111111111111                                                                                                         
lowQualScore                  :                          0 111 2 11  0000  1111 2222 11111 000 3333  1111 0 00 0   11  11111 00 11 33333 111 777777777777777 222 11 3333333 44444444444 4444444444444 88888888 0 333333  0 0 0 333  0 00 111 11111  000 0  000 00    
lowQualScore                  :                          . ... . ..  ....  .... .... ..... ... ....  .... . .. .   ..  ..... .. .. ..... ... ............... ... .. ....... ........... ............. ........ . ......  . . . ...  . .. ... .....  ... .  ... ..    
lowQualScore                  :                          5 666 2 00  9999  8888 3333 00000 777 3333  3333 4 66 4   88  00000 66 44 77777 333 333333333333333 999 00 9999999 11111111111 9999999999999 77777777 4 333333  4 4 4 222  9 66 666 11111  888 4  888 66    
consensus                     :                    GGACGG-A---ANG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
Reference ( family-264 )      :                    GGACGG-A---ANG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130554                     :                    GGACGG-A---AGG--AC----AG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---ATCC------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------AT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130555                     :                ggacGGACGG-A---AAGG-AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--AT----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCT---T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130556                     :                ggacGGACGT-A---AGA--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-------------------------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130557                     :                  ggacACGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----G---GACAAGG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---ACC-------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130558                     :          ggacggaaaaGGACGG-A---AGA--AC----GG----A----C-----A---G----GG----A-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----TAACA---------------C---C--C-------C-----------C---T------------------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-TT---G--TAAAaa
gi|130559                     :                    ggacGG-A---CGG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------AT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-AT---A--TAAAaa
gi|130560                     :            ggacacaaGGACGG-A---ATG--AC----GA----AA---C-----A---A----GG------T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-CT-----CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130561                     :                ggacGGACGG-A---ATG--AC----GA----AA---C-----A---A----GG------T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-C------TC-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT------TAAga
gi|130562                     :                ggacGGATAG-A---AGG--AC----GG----A----C-----G---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-C------TT-T-C-G---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--TAAgaa
gi|130563                     :                ggacGGACGG-ACG-AAG--AT----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-C------CT-T-C-C---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130564                     :                    GGAAGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---AC--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CA-T-C-G---GA-G--CG--G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130565                     :             ggacggaaGACAG-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---A----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---AC--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---T-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130566                     :                ggacggaatG-A---AGG--AC----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-------------------------C--------T-C------CT-T-C-G---GAGG--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130567                     :                ggacagaaaG-A---AGG--AC----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-------------------------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--G---C-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130568                     :            ggacagaaaGAGGG-A---AGG--AC----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-GAA--CA-----G--T--A-----T---ACCCCC----------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---------GG---G-GT---A--TGA
gi|130569                     :           ggacggacaGGATGG-A---AGG--GC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--TA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--CCCTT---C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-T-G---GA-G--C---A-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130570                     :                ggatGGACGG-A---ATG--AC----GG----ATGCAC-----A---A----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---AG--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------TT-T-C-G---GA-G--C---G-----GC---G-GT---A--TAAAcaa
gi|130571                     :                ggacGGACGG-A---ATG--ACAGACGG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AA---CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCC----T-C------CT-T-C-A---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130572                     :                    GGACGG-A---AGA--AC----GGTAGGA----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----A--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T------------------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---A-GT---A--TAAaa
gi|130573                     :                 ggacGATGG-A---AGG--AC----AG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---A---------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--C---------AG---G-GT---A--TAAtaaa
gi|130574                     :               gaactGGACGG-A---ATG--AT----GG----G----C-----A---G----AG----G-C--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------CT--C--C-------C-----------C---T---------T--------T-C------CT-T-C-G---TA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAtaa
gi|130575                     :                ggacGGGCGG-A----TG--AC----GG----A----CGGACAA---G----GG----G-T--ATAAA--CA-----G--T--A-----T---ATC-------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---------GG---G-GT---A--TAAA
gi|130576                     :                    GGATGG-A---GGG--AG----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C------------------------------------C-G---GT-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130577                     :                ggacGGACGG-A---CAC--AC----AG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T-------------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------CAC------CA-T-C-A---GA-G--C---A-----GGCCAG-GT---A--TAAtaaa
gi|130578                     :                 ggatGACAG-A---AGGTGAC----GG----A----T-----C---A----AG----G-T--A-AAA--CA-----A--T--G-----T---AAC-------------C---C--T-------C-----------C---T---------C----------C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAGA
gi|130579                     :           ggacggagatGACGC-A---ATG--AT----GG----A----C-----A---T----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------C-C------CC-C-CTG---GA-
gi|130580                     :               ggacaGGACAG-A---ATA--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----A---A---------------C---C--T-------C-----------C---T---------T--------C-T------CT-T-
gi|130581                     :                ggacGGACGG-A---ATA--AC----AG----A----C--------------GG----G-T--A-AAAA-CA-----A--T--AATTCCC---C---------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------C-C------CT-T-T-A---GA-G--T---G-----GG---A-GT---A--TAAA
gi|130582                     :                ggatGGACAG-A---AGA--AC----GG----A----C-----A---A----GG----G-T--A-AAA--CT-----G--T--A-----T---G---------------A---C--C-------C-----------T---A---------C--------C-A------CT-T-T-G---TG-G--C---G-----GG---G-GC---G--TAAaa
gi|130583                     :                 ggaaGACAG-A---CAG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAC--TT-----A--T--A-----T---C---------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------C-CAA----CT-T-C-GT--TT-G--CA--G-----GG---G-GT---A--TAAcaa
gi|130584                     :                  ggacaCGA-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GGT---G-T--A-AAAAGCA-----G--T--A-----T---A---------------C---CCAC-------C-----------C---T---------CAA------T-C------CT-T-C-GA--GG-G--C---------GG---G-GT---A--TGAAtaa
gi|130585                     :                gaacgGACGG-A---CAG--AC----AG----A----C-----A---G----GG----T-G--A-AAC--CT-----A--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------C-CCCCAAACT-T-C-GT--TT-G--C---G-----GG---G-CT---A--TAAA
gi|130586                     :           ggacagacaGGAAGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---------GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130587                     :             gacggacGGAAGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--TA-A-----T---A---------------CG--C--C-------C-----------C---T---------CT-------T-C------CT-T-C-G---GAGG--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130588                     :                  gacggacG-A---ATG--A-----GG----A----C-----A---G----GG------T--A-AAA--CA-----A--TT-A-----T---AA--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---------GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130589                     :            gacggaagaGACGG-A---AGG--AT----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--TAAa
gi|130590                     :                 gacaGACGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---AC--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---A-GT---A---AAAtaa
gi|130591                     :                gacaGGACGGGA---ATG--AC----G-----A----C-----A---G----GG----G----A-AAA--CA-----G--T--T-----T---ATCCCCCC--------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-T-G---GG-G--T---G-----GG---G-GTAACA--TAAAtaaa
gi|130592                     :                 gatGGACGG-A---ATG--AC----AG----A----C-----A---A----AG----A-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---T---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130593                     :                 gatGGACAG-A---ATA--AC----GG----A----C-----ATTTA----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---T--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-G-G---GA-G--T---G-----GG---A-GT---A--TAA
gi|130594                     :                      gacG-A---CGG--AC----GG----AAC--C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---ACCCCCCC--------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-GACC---G-----AG---G-GT---A--TAAA
gi|130595                     :                    GGACGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----G---GACATGG----G-T--A-AAA--CG-----G--T--A-----T---AT--------------C---C--T-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-A--C---G-----GG---GTAT---A--TAA
gi|130596                     :                 gacGGACAG-A---ATG--AA----GA----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---T--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--T---------GG---A-GT---A--T
gi|130597                     :                   gatACGG-A---ATG--AC----G-----A----C---------G----GG----T-T--A-AAA--TA-----A--T--A-----T---A---------------C---C--C-------CC----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G------G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130598                     :                                   gacggaact----A----C-----A---A----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------A---C--C-------CG----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---------GG---G-GT---A--TAAtaaa
gi|130599                     : gacagacagggcaaaaacaGGACGG-A---CAG--AC----AG----A----C-----A---G----AG----G-T--G-AAA--CA-----C--T--A-----T---ATACCG----------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------C-CAA----CT-T-C-GTTTG--G--C---G-----GG---G-G----G--TAAA
gi|130600                     :                     gacGG-G---ATG--AA----GG----A----C---------G----GG----A-T--A-AAA--CA-----G--C--A-----A---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-A---AA-A--C---A-----GG---G-GT---A--TAAa
gi|130601                     :              gacagaGGACAG-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--TA-----G--T--A-----T-------------------C---A--A-------A-----------C---TA--------A--------T-C------CT-T-C-G---AA-G--A---A-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130602                     :                 gatGGGCGG-A---CAG--AC----AG----A----C-----A---G----GG----T-G--A-AAC--CT-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------A--------A-A------CT-T-C-GTTTGC-G------G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130603                     :                  gacGACAG-A----GG--AC----AG----A----C-----A---G----GG----T-T--G-AAA--CT-----A--T--A-----T---A---------------CTCAC--C-------C-----------C---C---------C--------C-CAA----CT-T-C-GT--TT-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130604                     :                  ggcaATGG-A---AGG--AC----GG----A----C-----A---C----GA----G-T--A-AA---CA-----G--T--A-----T---A---------------T---C--C-------C-----------G---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---AATTAAAtaa
gi|130605                     :                acgcGGACGG-A---AGG--AC----GAGCGAA----C-----A---G----GA----G-T--A-AAA--CA-----G--C--A-----C---A---------------C---C--G-------C---------------T---------C--------T-C------CT-T-T-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130606                     :                   acGACTG-A---ATG--AC----AG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CG-----G--T--A-----T---A---------------CA--C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---G
gi|130607                     :                 acaGGACAA-A---ATG--AC----AG----A----C-----A---G----GG----A-T--A-AAA--CA-----G--T--G-----C---T---------------C---C--CCTCAGGGC-----------C---T---------C--------T-G------CT-T-T-G---GA-G--C---A-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130608                     :                  acGGACGG-A---CGG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-C--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------CT----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GA---G-GT---A--TAAAtaa
gi|130609                     :                   cGGACGG-A---AGG--AC----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--G-----C---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130610                     :                    cGACGG-A---AGG--AC----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--T-----T---AACCCCCCC-------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130611                     :                  caGGACGG-A---AGG--AC----GG----A----C-----T---G----AG----G-T--A-AAA--TA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-------------------------C--------T-C------CT-T-C-G---AA-A--C---A-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130612                     :                   cGGACGG-A-----G--AC----GG----A----C-----A---G----AG----G-TGTA-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-C------CT---C-G---GA-G--C---G-----GG---G-AT---A--TAAtaaa
gi|130613                     :                   cGGACGG-A---A----------GG----A----C-----A---G----AG----T-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---AACACACCCACCCACCCA--C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---G--TAA
gi|130614                     :                   cGGACG--A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAAA-CA-----G--T--AA----T---AA--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--AAAA
gi|130615                     :                    GGACGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---A----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130616                     :                    GGACGA-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--CT------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130617                     :                    GGACGG-A---ATG--AT----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--TA-----G--T--A-----T---AACCCCCC--------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130618                     :                    GGGCGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----T---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--T-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--A---G-----GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130619                     :                    GAACGG-A---ATG--AC----G-----A----C-----A---AA---GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--AA----T---AAC-------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--A---G-----GG---G-GT---A--TAAAtaa
gi|130620                     :                    GGA-GG-A---AG----C----GG----A----C-----A---G----GG----GAT--A-AAA--CA-----G-----A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCA---T-C------CT-TGC-G---AA-G--C---------GG---G-GT---A--TAAAa
gi|130621                     :                    GGATGG-ATTGAGG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--TCAG-----T---A---------------C---C--C-------CGGCCATTAACCC---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---A-----GG---T-GT---A--TAAaa
gi|130622                     :                    GGACGT-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---T----AG----G-T--A-AAA--TACTGTGG--T--A-----T---A---------------T---C--C-------CT----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--Ttaaa
gi|130623                     :                     GACAG-A---TGG--AC----AG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---ACCCCC----------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-T-G---GA-C--C---G-----GG---G-GA---A--TAAA
gi|130625                     :                      ACGG-A---A----------GG----A----C-----A---G----GG----G-T--T-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--T-------C-----------C-------------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-AT---A--TAAaa
gi|130626                     :                      ACGA-A---AGG--AC----GG----A----A-----A---A----GG----G-T--A-AAA--C---------T--A-----T---A---------------T---G--C-------C-----------C---TAA-------C--------C-A------CT-T-T-G---TG-G--T---G-----GG---G-GC---A--TAAA
gi|130627                     :                      ACAG-A---CCG--AC----CG----A----C-----A---G----GT----G-C--A-AAA--CA-----A--T--A-----T---G---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-T------TT-T-C-A---AA-G------G-----GG---G-GC---A--TAAAaa
gi|130628                     :                       CAG-A---TGG--AT----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--G-----T---A---------------C---T--C-------C-------------------------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130629                     :                       CGG-A---TGG--AT----GG----A----A-----G---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---CTCCCCCCCCC--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A---AAAtaaa
gi|130630                     :                       CGG-A---AGG--AC----GG----A----C-----G---G----GG----A-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---
gi|130631                     :                       CAG-A---AGG--AC----GG----A----T-----G---GAC--GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--T-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-
gi|130632                     :                                                                ----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---A-GT---A--TAAA
gi|130633                     :                 ggaaggatG-A---CGG--AC----AG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAAA-TA-----G--T--A-----T---A---------------T---C--CG------C-----------C---T---------C--------T-G------CGAT-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130634                     :                          -A---GTG--AC----AG----A----C-----G---G----GA----G-T--A-AAA--CA-----G--T--ACATG-T---A---------------CAT-C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-C--C---G-----GG---G-GT---G--TAAaa
gi|130635                     :                                                                    aG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C-----------------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAcaa
gi|130636                     :                      agaatggatgtG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---CA-C-------C-----------C---C---------C--------C-T------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAtaa
gi|130637                     :                                gG--AC----GG----A----C-----A---G----GG------T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T-------------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAtaaa
gi|130638                     :                                gG--AC----GG----A----A-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCC---T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAtaaa
gi|130639                     :                                gG--AC----GG----A----------A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCC---T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130640                     :                                gG--AC----GG----A----A-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----TTT-A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCCC--T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130641                     :                                gG--AC----GG----A----C-----G---G----GATTGTG-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------T-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---CA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130642                     :                                gG--AT----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---G---------------T---T--A-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--CCAGG-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130643                     :                       gGG-A---CGG--AC----GG----A----C--------------GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-------------------------G--------T-C------CT-T-T-G---GA-G--C---G-----GA---G-GT---A--TAA
gi|130644                     :                                 G--GC----GG----A----C-----G---G----AG----G-T--A-AAA--AA-----GGTT--C-----T---C---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCCCCTT-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-CT---A--TAAA
gi|130645                     :                                     g----GG----A----C-----A---GAC--GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--T-----C---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT---------GA-G--T---------GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130646                     :                                 G--AT----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--AAT---T---AT--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-T-A---GA-G--T---G-----GA---A-GT---A--TGAa
gi|130647                     :                                 G--AT----GG----A----A-----A---G----TG----G-A--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--TCTTA---C-----------C---C---------C--------T-T------CT-T-C-G---GA-G--C---GGAGCAGG---G-GT---A--TAAtaaa
gi|130648                     :                                  --AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---A-GT---A--TAAtaa
gi|130649                     :                                  --AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--T-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------T---C--C-------C-----------C-------------C--------T-A------CT-T-T-A---GG-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAcaa
gi|130650                     :                                  --AC----CG----A----C-----A---G----GT----G-C--A-AAA--CA-----A--T--A-----T---G---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-T------TT-T-C-A---AA-G------G-----GG---G-GC---A--TAAAgaa
gi|130651                     :                                      ----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------CCC---------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130652                     :                                            ----A----T-----A---G----AG----A-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----A---A---------------C---C--C-------C-----------CCACT---------C--------T-C------CT-C-C-A---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--TAAaa
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|130624 ): GACAGAAGGACAGACAGGACAAAAACCATATGCCCCCCGCTCTTCGATCACGGGGGCATAAAAA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                              111111111111111                                                                                                         
lowQualScore                  :                          0 111 2 11  0000  1111 2222 11111 000 3333  1111 0 00 0   11  11111 00 11 33333 111 777777777777777 222 11 3333333 44444444444 4444444444444 88888888 0 333333  0 0 0 333  0 00 111 11111  000 0  000 00    
lowQualScore                  :                          . ... . ..  ....  .... .... ..... ... ....  .... . .. .   ..  ..... .. .. ..... ... ............... ... .. ....... ........... ............. ........ . ......  . . . ...  . .. ... .....  ... .  ... ..    
lowQualScore                  :                          5 666 2 00  9999  8888 3333 00000 777 3333  3333 4 66 4   88  00000 66 44 77777 333 333333333333333 999 00 9999999 11111111111 9999999999999 77777777 4 333333  4 4 4 222  9 66 666 11111  888 4  888 66    
consensus                     :                    GGACGG-A---ANG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
Reference ( family-264 )      :                    GGACGG-A---ANG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130554                     :                    GGACGG-A---AGG--AC----AG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---ATCC------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------AT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130555                     :                ggacGGACGG-A---AAGG-AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--AT----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCT---T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130556                     :                ggacGGACGT-A---AGA--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-------------------------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130557                     :                  ggacACGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----G---GACAAGG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---ACC-------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130558                     :          ggacggaaaaGGACGG-A---AGA--AC----GG----A----C-----A---G----GG----A-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----TAACA---------------C---C--C-------C-----------C---T------------------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-TT---G--TAAAaa
gi|130559                     :                    ggacGG-A---CGG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------AT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-AT---A--TAAAaa
gi|130560                     :            ggacacaaGGACGG-A---ATG--AC----GA----AA---C-----A---A----GG------T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-CT-----CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130561                     :                ggacGGACGG-A---ATG--AC----GA----AA---C-----A---A----GG------T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-C------TC-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT------TAAga
gi|130562                     :                ggacGGATAG-A---AGG--AC----GG----A----C-----G---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-C------TT-T-C-G---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--TAAgaa
gi|130563                     :                ggacGGACGG-ACG-AAG--AT----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-C------CT-T-C-C---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130564                     :                    GGAAGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---AC--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CA-T-C-G---GA-G--CG--G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130565                     :             ggacggaaGACAG-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---A----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---AC--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---T-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130566                     :                ggacggaatG-A---AGG--AC----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-------------------------C--------T-C------CT-T-C-G---GAGG--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130567                     :                ggacagaaaG-A---AGG--AC----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-------------------------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--G---C-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130568                     :            ggacagaaaGAGGG-A---AGG--AC----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-GAA--CA-----G--T--A-----T---ACCCCC----------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---------GG---G-GT---A--TGA
gi|130569                     :           ggacggacaGGATGG-A---AGG--GC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--TA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--CCCTT---C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-T-G---GA-G--C---A-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130570                     :                ggatGGACGG-A---ATG--AC----GG----ATGCAC-----A---A----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---AG--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------TT-T-C-G---GA-G--C---G-----GC---G-GT---A--TAAAcaa
gi|130571                     :                ggacGGACGG-A---ATG--ACAGACGG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AA---CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCC----T-C------CT-T-C-A---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130572                     :                    GGACGG-A---AGA--AC----GGTAGGA----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----A--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T------------------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---A-GT---A--TAAaa
gi|130573                     :                 ggacGATGG-A---AGG--AC----AG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---A---------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--C---------AG---G-GT---A--TAAtaaa
gi|130574                     :               gaactGGACGG-A---ATG--AT----GG----G----C-----A---G----AG----G-C--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------CT--C--C-------C-----------C---T---------T--------T-C------CT-T-C-G---TA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAtaa
gi|130575                     :                ggacGGGCGG-A----TG--AC----GG----A----CGGACAA---G----GG----G-T--ATAAA--CA-----G--T--A-----T---ATC-------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---------GG---G-GT---A--TAAA
gi|130576                     :                    GGATGG-A---GGG--AG----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C------------------------------------C-G---GT-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130577                     :                ggacGGACGG-A---CAC--AC----AG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T-------------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------CAC------CA-T-C-A---GA-G--C---A-----GGCCAG-GT---A--TAAtaaa
gi|130578                     :                 ggatGACAG-A---AGGTGAC----GG----A----T-----C---A----AG----G-T--A-AAA--CA-----A--T--G-----T---AAC-------------C---C--T-------C-----------C---T---------C----------C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAGA
gi|130579                     :           ggacggagatGACGC-A---ATG--AT----GG----A----C-----A---T----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------C-C------CC-C-CTG---GA-
gi|130580                     :               ggacaGGACAG-A---ATA--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----A---A---------------C---C--T-------C-----------C---T---------T--------C-T------CT-T-
gi|130581                     :                ggacGGACGG-A---ATA--AC----AG----A----C--------------GG----G-T--A-AAAA-CA-----A--T--AATTCCC---C---------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------C-C------CT-T-T-A---GA-G--T---G-----GG---A-GT---A--TAAA
gi|130582                     :                ggatGGACAG-A---AGA--AC----GG----A----C-----A---A----GG----G-T--A-AAA--CT-----G--T--A-----T---G---------------A---C--C-------C-----------T---A---------C--------C-A------CT-T-T-G---TG-G--C---G-----GG---G-GC---G--TAAaa
gi|130583                     :                 ggaaGACAG-A---CAG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAC--TT-----A--T--A-----T---C---------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------C-CAA----CT-T-C-GT--TT-G--CA--G-----GG---G-GT---A--TAAcaa
gi|130584                     :                  ggacaCGA-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GGT---G-T--A-AAAAGCA-----G--T--A-----T---A---------------C---CCAC-------C-----------C---T---------CAA------T-C------CT-T-C-GA--GG-G--C---------GG---G-GT---A--TGAAtaa
gi|130585                     :                gaacgGACGG-A---CAG--AC----AG----A----C-----A---G----GG----T-G--A-AAC--CT-----A--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------C-CCCCAAACT-T-C-GT--TT-G--C---G-----GG---G-CT---A--TAAA
gi|130586                     :           ggacagacaGGAAGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---------GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130587                     :             gacggacGGAAGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--TA-A-----T---A---------------CG--C--C-------C-----------C---T---------CT-------T-C------CT-T-C-G---GAGG--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130588                     :                  gacggacG-A---ATG--A-----GG----A----C-----A---G----GG------T--A-AAA--CA-----A--TT-A-----T---AA--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---------GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130589                     :            gacggaagaGACGG-A---AGG--AT----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--TAAa
gi|130590                     :                 gacaGACGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---AC--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---A-GT---A---AAAtaa
gi|130591                     :                gacaGGACGGGA---ATG--AC----G-----A----C-----A---G----GG----G----A-AAA--CA-----G--T--T-----T---ATCCCCCC--------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-T-G---GG-G--T---G-----GG---G-GTAACA--TAAAtaaa
gi|130592                     :                 gatGGACGG-A---ATG--AC----AG----A----C-----A---A----AG----A-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---T---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130593                     :                 gatGGACAG-A---ATA--AC----GG----A----C-----ATTTA----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---T--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-G-G---GA-G--T---G-----GG---A-GT---A--TAA
gi|130594                     :                      gacG-A---CGG--AC----GG----AAC--C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---ACCCCCCC--------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-GACC---G-----AG---G-GT---A--TAAA
gi|130595                     :                    GGACGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----G---GACATGG----G-T--A-AAA--CG-----G--T--A-----T---AT--------------C---C--T-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-A--C---G-----GG---GTAT---A--TAA
gi|130596                     :                 gacGGACAG-A---ATG--AA----GA----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---T--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--T---------GG---A-GT---A--T
gi|130597                     :                   gatACGG-A---ATG--AC----G-----A----C---------G----GG----T-T--A-AAA--TA-----A--T--A-----T---A---------------C---C--C-------CC----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G------G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130598                     :                                   gacggaact----A----C-----A---A----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------A---C--C-------CG----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---------GG---G-GT---A--TAAtaaa
gi|130599                     : gacagacagggcaaaaacaGGACGG-A---CAG--AC----AG----A----C-----A---G----AG----G-T--G-AAA--CA-----C--T--A-----T---ATACCG----------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------C-CAA----CT-T-C-GTTTG--G--C---G-----GG---G-G----G--TAAA
gi|130600                     :                     gacGG-G---ATG--AA----GG----A----C---------G----GG----A-T--A-AAA--CA-----G--C--A-----A---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-A---AA-A--C---A-----GG---G-GT---A--TAAa
gi|130601                     :              gacagaGGACAG-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--TA-----G--T--A-----T-------------------C---A--A-------A-----------C---TA--------A--------T-C------CT-T-C-G---AA-G--A---A-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130602                     :                 gatGGGCGG-A---CAG--AC----AG----A----C-----A---G----GG----T-G--A-AAC--CT-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------A--------A-A------CT-T-C-GTTTGC-G------G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130603                     :                  gacGACAG-A----GG--AC----AG----A----C-----A---G----GG----T-T--G-AAA--CT-----A--T--A-----T---A---------------CTCAC--C-------C-----------C---C---------C--------C-CAA----CT-T-C-GT--TT-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130604                     :                  ggcaATGG-A---AGG--AC----GG----A----C-----A---C----GA----G-T--A-AA---CA-----G--T--A-----T---A---------------T---C--C-------C-----------G---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---AATTAAAtaa
gi|130605                     :                acgcGGACGG-A---AGG--AC----GAGCGAA----C-----A---G----GA----G-T--A-AAA--CA-----G--C--A-----C---A---------------C---C--G-------C---------------T---------C--------T-C------CT-T-T-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130606                     :                   acGACTG-A---ATG--AC----AG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CG-----G--T--A-----T---A---------------CA--C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---G
gi|130607                     :                 acaGGACAA-A---ATG--AC----AG----A----C-----A---G----GG----A-T--A-AAA--CA-----G--T--G-----C---T---------------C---C--CCTCAGGGC-----------C---T---------C--------T-G------CT-T-T-G---GA-G--C---A-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130608                     :                  acGGACGG-A---CGG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-C--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------CT----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GA---G-GT---A--TAAAtaa
gi|130609                     :                   cGGACGG-A---AGG--AC----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--G-----C---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130610                     :                    cGACGG-A---AGG--AC----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--T-----T---AACCCCCCC-------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130611                     :                  caGGACGG-A---AGG--AC----GG----A----C-----T---G----AG----G-T--A-AAA--TA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-------------------------C--------T-C------CT-T-C-G---AA-A--C---A-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130612                     :                   cGGACGG-A-----G--AC----GG----A----C-----A---G----AG----G-TGTA-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-C------CT---C-G---GA-G--C---G-----GG---G-AT---A--TAAtaaa
gi|130613                     :                   cGGACGG-A---A----------GG----A----C-----A---G----AG----T-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---AACACACCCACCCACCCA--C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---G--TAA
gi|130614                     :                   cGGACG--A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAAA-CA-----G--T--AA----T---AA--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--AAAA
gi|130615                     :                    GGACGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---A----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130616                     :                    GGACGA-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--CT------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130617                     :                    GGACGG-A---ATG--AT----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--TA-----G--T--A-----T---AACCCCCC--------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130618                     :                    GGGCGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----T---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--T-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--A---G-----GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130619                     :                    GAACGG-A---ATG--AC----G-----A----C-----A---AA---GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--AA----T---AAC-------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--A---G-----GG---G-GT---A--TAAAtaa
gi|130620                     :                    GGA-GG-A---AG----C----GG----A----C-----A---G----GG----GAT--A-AAA--CA-----G-----A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCA---T-C------CT-TGC-G---AA-G--C---------GG---G-GT---A--TAAAa
gi|130621                     :                    GGATGG-ATTGAGG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--TCAG-----T---A---------------C---C--C-------CGGCCATTAACCC---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---A-----GG---T-GT---A--TAAaa
gi|130622                     :                    GGACGT-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---T----AG----G-T--A-AAA--TACTGTGG--T--A-----T---A---------------T---C--C-------CT----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--Ttaaa
gi|130623                     :                     GACAG-A---TGG--AC----AG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---ACCCCC----------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-T-G---GA-C--C---G-----GG---G-GA---A--TAAA
gi|130625                     :                      ACGG-A---A----------GG----A----C-----A---G----GG----G-T--T-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--T-------C-----------C-------------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-AT---A--TAAaa
gi|130626                     :                      ACGA-A---AGG--AC----GG----A----A-----A---A----GG----G-T--A-AAA--C---------T--A-----T---A---------------T---G--C-------C-----------C---TAA-------C--------C-A------CT-T-T-G---TG-G--T---G-----GG---G-GC---A--TAAA
gi|130627                     :                      ACAG-A---CCG--AC----CG----A----C-----A---G----GT----G-C--A-AAA--CA-----A--T--A-----T---G---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-T------TT-T-C-A---AA-G------G-----GG---G-GC---A--TAAAaa
gi|130628                     :                       CAG-A---TGG--AT----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--G-----T---A---------------C---T--C-------C-------------------------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130629                     :                       CGG-A---TGG--AT----GG----A----A-----G---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---CTCCCCCCCCC--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A---AAAtaaa
gi|130630                     :                       CGG-A---AGG--AC----GG----A----C-----G---G----GG----A-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---
gi|130631                     :                       CAG-A---AGG--AC----GG----A----T-----G---GAC--GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--T-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-
gi|130632                     :                                                                ----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---A-GT---A--TAAA
gi|130633                     :                 ggaaggatG-A---CGG--AC----AG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAAA-TA-----G--T--A-----T---A---------------T---C--CG------C-----------C---T---------C--------T-G------CGAT-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130634                     :                          -A---GTG--AC----AG----A----C-----G---G----GA----G-T--A-AAA--CA-----G--T--ACATG-T---A---------------CAT-C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-C--C---G-----GG---G-GT---G--TAAaa
gi|130635                     :                                                                    aG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C-----------------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAcaa
gi|130636                     :                      agaatggatgtG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---CA-C-------C-----------C---C---------C--------C-T------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAtaa
gi|130637                     :                                gG--AC----GG----A----C-----A---G----GG------T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T-------------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAtaaa
gi|130638                     :                                gG--AC----GG----A----A-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCC---T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAtaaa
gi|130639                     :                                gG--AC----GG----A----------A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCC---T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130640                     :                                gG--AC----GG----A----A-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----TTT-A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCCC--T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130641                     :                                gG--AC----GG----A----C-----G---G----GATTGTG-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------T-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---CA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130642                     :                                gG--AT----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---G---------------T---T--A-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--CCAGG-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130643                     :                       gGG-A---CGG--AC----GG----A----C--------------GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-------------------------G--------T-C------CT-T-T-G---GA-G--C---G-----GA---G-GT---A--TAA
gi|130644                     :                                 G--GC----GG----A----C-----G---G----AG----G-T--A-AAA--AA-----GGTT--C-----T---C---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCCCCTT-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-CT---A--TAAA
gi|130645                     :                                     g----GG----A----C-----A---GAC--GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--T-----C---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT---------GA-G--T---------GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130646                     :                                 G--AT----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--AAT---T---AT--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-T-A---GA-G--T---G-----GA---A-GT---A--TGAa
gi|130647                     :                                 G--AT----GG----A----A-----A---G----TG----G-A--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--TCTTA---C-----------C---C---------C--------T-T------CT-T-C-G---GA-G--C---GGAGCAGG---G-GT---A--TAAtaaa
gi|130648                     :                                  --AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---A-GT---A--TAAtaa
gi|130649                     :                                  --AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--T-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------T---C--C-------C-----------C-------------C--------T-A------CT-T-T-A---GG-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAcaa
gi|130650                     :                                  --AC----CG----A----C-----A---G----GT----G-C--A-AAA--CA-----A--T--A-----T---G---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-T------TT-T-C-A---AA-G------G-----GG---G-GC---A--TAAAgaa
gi|130651                     :                                      ----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------CCC---------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130652                     :                                            ----A----T-----A---G----AG----A-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----A---A---------------C---C--C-------C-----------CCACT---------C--------T-C------CT-C-C-A---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--TAAaa


blockSeqs                     :                            TTG A TG        TAGG TGCA GGACA     ACAA  TTGT          AG  CTGTG    CA ATTCC AAC ACACACCCACCCACC TCA    CTCAGGG GGCCATTAACC CTCCCCCCCC    CCCCCCCT   CCCAAA        TTT       CAG GAGCA
blockSeqs                     :                            CG  G G         GCGA AC   .         ACAT  T             A   .        A  CATG  TT  ACCCCCCC        AT     CCTT    CC          CACT          CCCCCC     AA            TTT       G   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    A    .         AC    .             A   .        T  AT    .   TCCCCCC         T      CTTA    C           TAA           CCCCT      AA            T         A   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    A    .         AC    .             A   .        .  T     .   CCCCCCC         G      T       G           TA            CCCCA      AA            A         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         A     .             .   .        .  A     .   ACCCCCC         A      G       T           C             CCCCC      T             T         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  A     .   CCCCC           A      .       T           T             CCCCC      .             T         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   TACCG           .      .       .           T             CCCC       .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   CCCCC           .      .       .           T             AA         .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   A .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   CC              .      .       .           T             T          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   TC              .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   AC              .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   AC              .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   C               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   C               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   G               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   A               .      .       .           A             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   C               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   T               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   A               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   T               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   A .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           A             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   A .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   A .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   A .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   A .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   C .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   T .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   G .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   . .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   . .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                            .   . .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           C             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                                  .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                                  .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                                  .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           T             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                                  .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           .             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                                  .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           .             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                                  .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           .             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                                  .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           .             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                                  .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           .             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                                  .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           .             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                                  .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           .             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                                  .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           .             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                                  .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           .             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                                  .         .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           .             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                                            .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           .             .          .             .         .   .    
blockSeqs                     :                                            .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           .             .          .             .                  
blockSeqs                     :                                            .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           .             .          .             .                  
blockSeqs                     :                                            .    .    .         .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           .             .          .                                
blockSeqs                     :                                                                .     .             .   .        .  .     .   .               .      .       .           .             .          .                                
blockSeqs                     :                                                                      .             .   .        .  .     .   .               .      .       .                                                                     


blockSeqCons                  :                                                                                                              ***************
originalCons                  :                    GGACGG-A---ANG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
finalCons                     :                    GGACGG-A---ANG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|130624 ): GACAGAAGGACAGACAGGACAAAAACCATATGCCCCCCGCTCTTCGATCACGGGGGCATAAAAA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                              111111111111111                                                                                                         
lowQualScore                  :                          0 111 2 11  0000  1111 2222 11111 000 3333  1111 0 00 0   11  11111 00 11 33333 111 777777777777777 222 11 3333333 44444444444 4444444444444 88888888 0 333333  0 0 0 333  0 00 111 11111  000 0  000 00    
lowQualScore                  :                          . ... . ..  ....  .... .... ..... ... ....  .... . .. .   ..  ..... .. .. ..... ... ............... ... .. ....... ........... ............. ........ . ......  . . . ...  . .. ... .....  ... .  ... ..    
lowQualScore                  :                          5 666 2 00  9999  8888 3333 00000 777 3333  3333 4 66 4   88  00000 66 44 77777 333 333333333333333 999 00 9999999 11111111111 9999999999999 77777777 4 333333  4 4 4 222  9 66 666 11111  888 4  888 66    
consensus                     :                    GGACGG-A---ANG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
Reference ( family-264 )      :                    GGACGG-A---ANG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130554                     :                    GGACGG-A---AGG--AC----AG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---ATCC------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------AT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130555                     :                ggacGGACGG-A---AAGG-AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--AT----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCT---T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130556                     :                ggacGGACGT-A---AGA--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-------------------------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130557                     :                  ggacACGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----G---GACAAGG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---ACC-------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130558                     :          ggacggaaaaGGACGG-A---AGA--AC----GG----A----C-----A---G----GG----A-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----TAACA---------------C---C--C-------C-----------C---T------------------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-TT---G--TAAAaa
gi|130559                     :                    ggacGG-A---CGG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------AT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-AT---A--TAAAaa
gi|130560                     :            ggacacaaGGACGG-A---ATG--AC----GA----AA---C-----A---A----GG------T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-CT-----CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130561                     :                ggacGGACGG-A---ATG--AC----GA----AA---C-----A---A----GG------T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-C------TC-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT------TAAga
gi|130562                     :                ggacGGATAG-A---AGG--AC----GG----A----C-----G---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-C------TT-T-C-G---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--TAAgaa
gi|130563                     :                ggacGGACGG-ACG-AAG--AT----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-C------CT-T-C-C---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130564                     :                    GGAAGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---AC--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CA-T-C-G---GA-G--CG--G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130565                     :             ggacggaaGACAG-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---A----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---AC--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---T-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130566                     :                ggacggaatG-A---AGG--AC----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-------------------------C--------T-C------CT-T-C-G---GAGG--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130567                     :                ggacagaaaG-A---AGG--AC----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-------------------------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--G---C-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130568                     :            ggacagaaaGAGGG-A---AGG--AC----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-GAA--CA-----G--T--A-----T---ACCCCC----------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---------GG---G-GT---A--TGA
gi|130569                     :           ggacggacaGGATGG-A---AGG--GC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--TA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--CCCTT---C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-T-G---GA-G--C---A-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130570                     :                ggatGGACGG-A---ATG--AC----GG----ATGCAC-----A---A----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---AG--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------TT-T-C-G---GA-G--C---G-----GC---G-GT---A--TAAAcaa
gi|130571                     :                ggacGGACGG-A---ATG--ACAGACGG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AA---CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCC----T-C------CT-T-C-A---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130572                     :                    GGACGG-A---AGA--AC----GGTAGGA----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----A--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T------------------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---A-GT---A--TAAaa
gi|130573                     :                 ggacGATGG-A---AGG--AC----AG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---A---------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--C---------AG---G-GT---A--TAAtaaa
gi|130574                     :               gaactGGACGG-A---ATG--AT----GG----G----C-----A---G----AG----G-C--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------CT--C--C-------C-----------C---T---------T--------T-C------CT-T-C-G---TA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAtaa
gi|130575                     :                ggacGGGCGG-A----TG--AC----GG----A----CGGACAA---G----GG----G-T--ATAAA--CA-----G--T--A-----T---ATC-------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---------GG---G-GT---A--TAAA
gi|130576                     :                    GGATGG-A---GGG--AG----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C------------------------------------C-G---GT-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130577                     :                ggacGGACGG-A---CAC--AC----AG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T-------------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------CAC------CA-T-C-A---GA-G--C---A-----GGCCAG-GT---A--TAAtaaa
gi|130578                     :                 ggatGACAG-A---AGGTGAC----GG----A----T-----C---A----AG----G-T--A-AAA--CA-----A--T--G-----T---AAC-------------C---C--T-------C-----------C---T---------C----------C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAGA
gi|130579                     :           ggacggagatGACGC-A---ATG--AT----GG----A----C-----A---T----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------C-C------CC-C-CTG---GA-
gi|130580                     :               ggacaGGACAG-A---ATA--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----A---A---------------C---C--T-------C-----------C---T---------T--------C-T------CT-T-
gi|130581                     :                ggacGGACGG-A---ATA--AC----AG----A----C--------------GG----G-T--A-AAAA-CA-----A--T--AATTCCC---C---------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------C-C------CT-T-T-A---GA-G--T---G-----GG---A-GT---A--TAAA
gi|130582                     :                ggatGGACAG-A---AGA--AC----GG----A----C-----A---A----GG----G-T--A-AAA--CT-----G--T--A-----T---G---------------A---C--C-------C-----------T---A---------C--------C-A------CT-T-T-G---TG-G--C---G-----GG---G-GC---G--TAAaa
gi|130583                     :                 ggaaGACAG-A---CAG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAC--TT-----A--T--A-----T---C---------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------C-CAA----CT-T-C-GT--TT-G--CA--G-----GG---G-GT---A--TAAcaa
gi|130584                     :                  ggacaCGA-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GGT---G-T--A-AAAAGCA-----G--T--A-----T---A---------------C---CCAC-------C-----------C---T---------CAA------T-C------CT-T-C-GA--GG-G--C---------GG---G-GT---A--TGAAtaa
gi|130585                     :                gaacgGACGG-A---CAG--AC----AG----A----C-----A---G----GG----T-G--A-AAC--CT-----A--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------C-CCCCAAACT-T-C-GT--TT-G--C---G-----GG---G-CT---A--TAAA
gi|130586                     :           ggacagacaGGAAGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---------GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130587                     :             gacggacGGAAGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--TA-A-----T---A---------------CG--C--C-------C-----------C---T---------CT-------T-C------CT-T-C-G---GAGG--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130588                     :                  gacggacG-A---ATG--A-----GG----A----C-----A---G----GG------T--A-AAA--CA-----A--TT-A-----T---AA--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---------GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130589                     :            gacggaagaGACGG-A---AGG--AT----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--TAAa
gi|130590                     :                 gacaGACGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---AC--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---A-GT---A---AAAtaa
gi|130591                     :                gacaGGACGGGA---ATG--AC----G-----A----C-----A---G----GG----G----A-AAA--CA-----G--T--T-----T---ATCCCCCC--------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-T-G---GG-G--T---G-----GG---G-GTAACA--TAAAtaaa
gi|130592                     :                 gatGGACGG-A---ATG--AC----AG----A----C-----A---A----AG----A-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---T---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130593                     :                 gatGGACAG-A---ATA--AC----GG----A----C-----ATTTA----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---T--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-G-G---GA-G--T---G-----GG---A-GT---A--TAA
gi|130594                     :                      gacG-A---CGG--AC----GG----AAC--C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---ACCCCCCC--------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-GACC---G-----AG---G-GT---A--TAAA
gi|130595                     :                    GGACGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----G---GACATGG----G-T--A-AAA--CG-----G--T--A-----T---AT--------------C---C--T-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-A--C---G-----GG---GTAT---A--TAA
gi|130596                     :                 gacGGACAG-A---ATG--AA----GA----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---T--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--T---------GG---A-GT---A--T
gi|130597                     :                   gatACGG-A---ATG--AC----G-----A----C---------G----GG----T-T--A-AAA--TA-----A--T--A-----T---A---------------C---C--C-------CC----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G------G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130598                     :                                   gacggaact----A----C-----A---A----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------A---C--C-------CG----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---------GG---G-GT---A--TAAtaaa
gi|130599                     : gacagacagggcaaaaacaGGACGG-A---CAG--AC----AG----A----C-----A---G----AG----G-T--G-AAA--CA-----C--T--A-----T---ATACCG----------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------C-CAA----CT-T-C-GTTTG--G--C---G-----GG---G-G----G--TAAA
gi|130600                     :                     gacGG-G---ATG--AA----GG----A----C---------G----GG----A-T--A-AAA--CA-----G--C--A-----A---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-A---AA-A--C---A-----GG---G-GT---A--TAAa
gi|130601                     :              gacagaGGACAG-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--TA-----G--T--A-----T-------------------C---A--A-------A-----------C---TA--------A--------T-C------CT-T-C-G---AA-G--A---A-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130602                     :                 gatGGGCGG-A---CAG--AC----AG----A----C-----A---G----GG----T-G--A-AAC--CT-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------A--------A-A------CT-T-C-GTTTGC-G------G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130603                     :                  gacGACAG-A----GG--AC----AG----A----C-----A---G----GG----T-T--G-AAA--CT-----A--T--A-----T---A---------------CTCAC--C-------C-----------C---C---------C--------C-CAA----CT-T-C-GT--TT-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130604                     :                  ggcaATGG-A---AGG--AC----GG----A----C-----A---C----GA----G-T--A-AA---CA-----G--T--A-----T---A---------------T---C--C-------C-----------G---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---AATTAAAtaa
gi|130605                     :                acgcGGACGG-A---AGG--AC----GAGCGAA----C-----A---G----GA----G-T--A-AAA--CA-----G--C--A-----C---A---------------C---C--G-------C---------------T---------C--------T-C------CT-T-T-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130606                     :                   acGACTG-A---ATG--AC----AG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CG-----G--T--A-----T---A---------------CA--C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---G
gi|130607                     :                 acaGGACAA-A---ATG--AC----AG----A----C-----A---G----GG----A-T--A-AAA--CA-----G--T--G-----C---T---------------C---C--CCTCAGGGC-----------C---T---------C--------T-G------CT-T-T-G---GA-G--C---A-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130608                     :                  acGGACGG-A---CGG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-C--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------CT----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GA---G-GT---A--TAAAtaa
gi|130609                     :                   cGGACGG-A---AGG--AC----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--G-----C---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130610                     :                    cGACGG-A---AGG--AC----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--T-----T---AACCCCCCC-------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130611                     :                  caGGACGG-A---AGG--AC----GG----A----C-----T---G----AG----G-T--A-AAA--TA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-------------------------C--------T-C------CT-T-C-G---AA-A--C---A-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130612                     :                   cGGACGG-A-----G--AC----GG----A----C-----A---G----AG----G-TGTA-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C-------------C--------T-C------CT---C-G---GA-G--C---G-----GG---G-AT---A--TAAtaaa
gi|130613                     :                   cGGACGG-A---A----------GG----A----C-----A---G----AG----T-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---AACACACCCACCCACCCA--C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---G--TAA
gi|130614                     :                   cGGACG--A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAAA-CA-----G--T--AA----T---AA--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--AAAA
gi|130615                     :                    GGACGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---A----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130616                     :                    GGACGA-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--CT------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130617                     :                    GGACGG-A---ATG--AT----GG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--TA-----G--T--A-----T---AACCCCCC--------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130618                     :                    GGGCGG-A---ATG--AC----GG----A----C-----T---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--T-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--A---G-----GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130619                     :                    GAACGG-A---ATG--AC----G-----A----C-----A---AA---GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--AA----T---AAC-------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--A---G-----GG---G-GT---A--TAAAtaa
gi|130620                     :                    GGA-GG-A---AG----C----GG----A----C-----A---G----GG----GAT--A-AAA--CA-----G-----A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCA---T-C------CT-TGC-G---AA-G--C---------GG---G-GT---A--TAAAa
gi|130621                     :                    GGATGG-ATTGAGG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--TCAG-----T---A---------------C---C--C-------CGGCCATTAACCC---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---A-----GG---T-GT---A--TAAaa
gi|130622                     :                    GGACGT-A---ATG--AC----GG----A----C-----A---T----AG----G-T--A-AAA--TACTGTGG--T--A-----T---A---------------T---C--C-------CT----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--Ttaaa
gi|130623                     :                     GACAG-A---TGG--AC----AG----A----C-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---ACCCCC----------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-T-G---GA-C--C---G-----GG---G-GA---A--TAAA
gi|130625                     :                      ACGG-A---A----------GG----A----C-----A---G----GG----G-T--T-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--T-------C-----------C-------------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-AT---A--TAAaa
gi|130626                     :                      ACGA-A---AGG--AC----GG----A----A-----A---A----GG----G-T--A-AAA--C---------T--A-----T---A---------------T---G--C-------C-----------C---TAA-------C--------C-A------CT-T-T-G---TG-G--T---G-----GG---G-GC---A--TAAA
gi|130627                     :                      ACAG-A---CCG--AC----CG----A----C-----A---G----GT----G-C--A-AAA--CA-----A--T--A-----T---G---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-T------TT-T-C-A---AA-G------G-----GG---G-GC---A--TAAAaa
gi|130628                     :                       CAG-A---TGG--AT----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--G-----T---A---------------C---T--C-------C-------------------------C--------T-C------CT-T-C-A---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAaa
gi|130629                     :                       CGG-A---TGG--AT----GG----A----A-----G---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---CTCCCCCCCCC--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A---AAAtaaa
gi|130630                     :                       CGG-A---AGG--AC----GG----A----C-----G---G----GG----A-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---
gi|130631                     :                       CAG-A---AGG--AC----GG----A----T-----G---GAC--GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--T-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-
gi|130632                     :                                                                ----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---A-GT---A--TAAA
gi|130633                     :                 ggaaggatG-A---CGG--AC----AG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAAA-TA-----G--T--A-----T---A---------------T---C--CG------C-----------C---T---------C--------T-G------CGAT-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130634                     :                          -A---GTG--AC----AG----A----C-----G---G----GA----G-T--A-AAA--CA-----G--T--ACATG-T---A---------------CAT-C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-C--C---G-----GG---G-GT---G--TAAaa
gi|130635                     :                                                                    aG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C-----------------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAcaa
gi|130636                     :                      agaatggatgtG--AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---CA-C-------C-----------C---C---------C--------C-T------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAtaa
gi|130637                     :                                gG--AC----GG----A----C-----A---G----GG------T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T-------------------C---C--C-------C-----------C---C---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAtaaa
gi|130638                     :                                gG--AC----GG----A----A-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCC---T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAtaaa
gi|130639                     :                                gG--AC----GG----A----------A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCC---T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130640                     :                                gG--AC----GG----A----A-----A---G----AG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----TTT-A---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCCC--T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130641                     :                                gG--AC----GG----A----C-----G---G----GATTGTG-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------T-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---CA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAA
gi|130642                     :                                gG--AT----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---G---------------T---T--A-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--CCAGG-----GG---G-GT---A--TAA
gi|130643                     :                       gGG-A---CGG--AC----GG----A----C--------------GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-------------------------G--------T-C------CT-T-T-G---GA-G--C---G-----GA---G-GT---A--TAA
gi|130644                     :                                 G--GC----GG----A----C-----G---G----AG----G-T--A-AAA--AA-----GGTT--C-----T---C---------------C---C--C-------C-----------C---C---------CCCCCCCCTT-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-CT---A--TAAA
gi|130645                     :                                     g----GG----A----C-----A---GAC--GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--T-----C---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT---------GA-G--T---------GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130646                     :                                 G--AT----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--AAT---T---AT--------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-T-A---GA-G--T---G-----GA---A-GT---A--TGAa
gi|130647                     :                                 G--AT----GG----A----A-----A---G----TG----G-A--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--TCTTA---C-----------C---C---------C--------T-T------CT-T-C-G---GA-G--C---GGAGCAGG---G-GT---A--TAAtaaa
gi|130648                     :                                  --AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---A-GT---A--TAAtaa
gi|130649                     :                                  --AC----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--T-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------T---C--C-------C-----------C-------------C--------T-A------CT-T-T-A---GG-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAcaa
gi|130650                     :                                  --AC----CG----A----C-----A---G----GT----G-C--A-AAA--CA-----A--T--A-----T---G---------------C---C--C-------C-----------C---T---------C--------T-T------TT-T-C-A---AA-G------G-----GG---G-GC---A--TAAAgaa
gi|130651                     :                                      ----GG----A----C-----A---G----GG----G-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----T---A---------------C---C--C-------CCC---------C---T---------C--------T-C------CT-T-C-G---GA-G--C---G-----GG---G-GT---A--TAAAaa
gi|130652                     :                                            ----A----T-----A---G----AG----A-T--A-AAA--CA-----G--T--A-----A---A---------------C---C--C-------C-----------CCACT---------C--------T-C------CT-C-C-A---GA-G--T---G-----GG---G-GT---A--TAAaa
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|130624 ): GACAGAAGGACAGACAGGACAAAAACCATATGCCCCCCGCTCTTCGATCACGGGGGCATAAAAA