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consensus : CAGACGTGA-CCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-----A--AG-A-AAA--T-ATAT
Reference ( gi|10831 ) : CAGATGTGA-CCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT-----A-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-----A--AG-G-AAA--T-ATAT
gi|10832 : CAGATGTGACCCCC-A---A-G-G-G--C-C-TC-CA------C----AT-A-------T--A----T--G----T--C----AAT-----A-AA----C--------TG-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-----A--AG-G-AAA--
gi|10834 : CAGACATGA-CCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----TT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT-----A-AA----G--------TT-G-T-A-TC-CA-CA-C-AA-GG-AA-C-----A--AG-A-AAA--T-ACAT
gi|10837 : CAGACATGA-CCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----C--------AT-G-T-C-TC-AA-CA-C-TA-GA-TT-C-----A--AG-A-AAA--T-ATAT
gi|10843 : CAGACGTGA-TCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------CTTATATCA-------T--G----T--G----T--C----AAT-----A-AA----G--------TT-G-T-A-TC-CA-CA-C-AA-GG-AA-C-----A--AG-A-AAA--T-ACAT
gi|10842 : CAGTCGTGA-CCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AC-A-------T--G----T--G----T--T----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-G-TCAAA-TACC-AA-GG-AA-C-----A--AC-G-AAA--T-ATAT
gi|10848 : CAGCCATGA-CCCCCA---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--T----T--C----AAT-----G-AATGAAC--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-----A--AG-A-AAA--T-GTA
gi|10853 : CAGAAGTGA-CCCT-A---A---------------------------------------T--G----T--G----T--C----AAT-----A-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-----A--AG-G-AAA--T-ATAT
gi|10864 : CAGTCGTGA-CCCT-------G-G-G-CC-C--A-CA------C----GC-A-------T--A----T--G----T--C----AAT-----T-AA----C--------TT-G-T-T-TC-AA--A-C-AA-GG-AG-A-----A--AA-G-AAA--T-GTAT
gi|10871 : AGACGTGA-TCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------T----AT-A-------C--A----T--G----T--C----AAT-----A-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-AA-C-AA-GA-AA-C-----T--AG-A-AAA--T-ATAT
gi|10876 : AGACGTAA-CCCC-A---A-T-G-G-----------------------------------------T--G----T--C----AAT-----G-AT----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AG-C-----A--AG-A-AAA--T-ATAT
gi|10896 : GTGA-CCCC-ATTTA-G-G---CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AATGAACGA-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AGTAA-T-----A--AG-G-AAAATT-ATA
gi|10882 : cTGA-CCCC-G---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--T----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-TG-C-AA-GG-AT-C-----A--AG-G-AAA--T-ATAT
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gi|10840 : cagtcaTGA-TCCC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--A----T--G----T--C----AAT-----A-AA----T--------TT-G-T-C-TC-AC-CA-C-AA-GG-AT-C-----A--AG-A-AAA--T-ATAT
gi|10883 : cagtcaTGA-CCCC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT------------G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AT-C-----A--AG-A-AAA--T-ATAT
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gi|10879 : caTGA-CCCC-A---G-G-G-G-CC-A-TC-CG------C----AC-A-------T--G----T--G----T--C----TAT-----A-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-C-----A--AG-A-AAA--T-GTAT
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gi|10902 : cagtcaTGA-CCCC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AC-A-------T--A----T--A----T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-T-AA-GA-AA-C-----T--AG-A-AAA--T-ATAT
gi|10836 : TGA-CCCA-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AC-A-------T--G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-----A--AG-A-ACA--T-ACAT
gi|10888 : cagtcaTGA-GCCC-A---G-G-G-G-TC-A-TC-CA------C----AT------------G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-----A--AA-G-AAA--T-ATAT
gi|10845 : caTGA-CCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-AA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AATGAAC-A-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-----A--AG-A-AAA--
gi|10849 : cagtcaTGA-CCCCCA---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AC------------G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-T-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-C-----A--AG-G-AGA--T-ATAT
gi|10855 : cagtcaTGA-CAAC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AC-A-------T--A----T--A----T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-A-AA-GG-AA-C-----A--AA-G-AAA--T-ATAT
gi|10847 : cagtcaTGA-CCCC-A---A-G-A-G-CC---TC-CA------C----AT------------G----T--G----T--C----AAT-----A-AA----C--------TT-G-T-T-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-----A--A--A-AAA--T-ATAT
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gi|10856 : TGA-CCCT-A---A-T-A-A-CT-C-TC-CA------C----AT-G-------C--G----T--G----T--C----AAT-----A-AA----C--------TT---T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-----A--AG-G-AAA--T-AT
gi|10833 : cagtcaTGA-CCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A---------------T--G----C--C----AAT-----A-AA----C--------TT-G-----TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-----A--AG-A-AAA--T-ACAT
gi|10846 : cagtcaTGA-CCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T----------C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-G-TC-AA-TA-C-AA-GG-AT-G-----A--AG-A-AAA--T-ATAT
gi|10903 : cagtcaTGA-CCCC-A---A-G-G---CC-C-TC-CA------C----AT-AA------T--G----T--G----T--C----AATGAAC-A-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-AG-AA-T-----A--AG-A-AAA--T-ATA
gi|10873 : TGA-CCCC-A---A-G-G-A-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--CTATGAAC-----G-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AT-CA-C-AA-AG-AA-T-----A--AG-A-AAA--T-ACA
gi|10894 : agtcaTGA-ATCC-A---T-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----GC-A-------A--G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-C-----A--AC-G-AAA--T-AT
gi|10851 : caTGA-CCGT-A---A-G-G-G-CC-T-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--G----AATTAAC-G-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-----A--AG-A-AAA--T-ATA
gi|10852 : cagtcaTGA-CCCC-A---A-G-G-G-CT-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T----------T----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-G-CC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-----A--AG-A-AAA--T-ATGT
gi|10887 : cagtcaTGA-CCCC-A---G-G-G-G-CT-C-TC-CA--------------A----------G----T--G----C--C----AAT-----T-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-----A--AG-G-GAA--T-ATAT
gi|10892 : caTGG-CCCC-A---A-T-G-G-GC-C-TC-CA------C----TT-A-------T--G----T--G----TAAC----AAT-----A-A-----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-----A--AG-A-AAA--T-AT
gi|10890 : caTGA-CACC-A-----G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------A--G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-A-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-CAACTTA--AG-GTAAA--T-ATAT
gi|10893 : caTGA-TCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C-------A-------T--G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----CGAACT---TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-----A--AG-A-AAA--A-ATA
gi|10858 : caTAA-CCCA-A---A-G-G-A-CC-C-TC-CA------C----AC-A-------T--G----T--G----T--C----AATGAAC-G-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AA-AA-T-----A--GG-A-AAA--T-ATA
gi|10874 : cagtcaTGA-CCCT-A---A-A-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--A----T-------T--C----AAT-----A-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-TC-AT-C-----A--AA-A-AAA--TCATAT
gi|10884 : agtcaTGA-CCCC-A---G-G-G-G-TC-A-TC-CA------C----AC-A-------T--AATTAT--G----T--C----AAT-----G-AA----A--------TT-G-T-T-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-----A--AT-A-AAA--T-ATAT
gi|10857 : caTGA-CCC------A-G-G-A-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T----------C----AAT-----G-AA----T--------TT-G-T-A-TC-AA-CA-C-AA-AG-AT-C-----A--AG-A-AAA--T-ATAT
gi|10859 : cagtcaTGA-CCTC-A---T-G-G-G-TC-C-TC-CA------C----AT-G-------T--G----TCAA----T--G----AAT-----G-AA----C--------TT-G-C-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-----A--AG-A-AAA--T-ATA
gi|10839 : cagtcaTGA-TCCT-A---A-G-G-G-TC-C-TC-CA------C----GT-A-------T--G----T--G----T--C----AA------A-AT----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GT-AA-C-----A--A--A-AAA--T-GT
gi|10875 : cagtcaTGA-CCT--A---A-G-G-C-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--A----T-------T--C----AAT-----A-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-TC-AT-C-----A--AA-A-AAA--T-ATAT
gi|10901 : agtcaTGA-CCCT-A---G-C-G-A-TC-C-TC-CT------C----GT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT-----G-AC----C--------CT-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AT-C-----A--AG-A-AAA--T-ATAT
gi|10885 : TGA-CCCT-A---G-G-G-G-CC-C-TC-AA------C----AT-A-------A--A----T--G----T--T----AAT-------------------------G-T-T-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-----A--AG-G-AAA--T-ATAT
gi|10895 : caTGA-CCCC-A---G-G-A-G-CT-C-TC-CA--------------A----------G----T--G-------C----AAT-----G-AA----C--------TA-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-----A--AG-G-GAA--T-ATAT
gi|10889 : caTGA-ACCC-A---GCG-G-G-TC-CATC-CA------C----AA-A-------T--G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----C---------T-G-T-C-TCAAA-CA-CAAA-GG-AA-C-----A--AA-G-AAA--T-ATA
gi|10898 : caTGA-CCCC-A---G-A-A-G-CC---TC-CA------C----AC------------G----T--G----T--C----AAT-----A-AA----C--------T--G-C-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-A-----A--AT-G-AAA--T-ATAT
gi|10861 : caTAA-CCCT-A---T-G-G-A-CA-C-TC-CA------C----GC-A-------T--A----T--G----T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-A-T-C-TC-AA-CG-C-AA-GG-AA-C-----AACAA-T-AAA--T-ATAT
gi|10878 : cagtcaTGA-CCCC-CT--A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AA-A-------T--G----T----------C----CAT-----A-AA----C--------TT-G-T-G-TC-AA-CA---AA-GG-AA-TG----A--AG-A-AAA--T-ATAT
gi|10838 : caTGA-CCTC-A---G-T-G-G-CC-C-TC-CAAATACAT----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT-----A-AA----C--------TT-C-T-T-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-----T--A--G-AAA--T-AT
gi|10862 : cagtcaTGA-CCCC-A---A-G-C-G-CC-C-TC-TA------C----AT-G----------G----T-------C--C----AAT-----A-AA----T--------TT-G-T-C-TC-AA-CT-C-AA-GG-GA-C-----A-------AAA--T-ATAT
gi|10897 : cagtcaTGA-CTCC-A---G-G-G-A-CC-C-TC-CC------C----AT-A-------T--G----T--GTCACT--C----AAT-----G-AA----T--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AT-GG-A----------------AAA--T-ATAT
gi|10865 : caTGA-CCCC-A---A-G-G-G-CC-C-AC-GA------C----AT-AATTA---T--G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----CGAAC----TT-G-T-C-GC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-----A--AG-T-AAA--
gi|10863 : cagtcaTGA-CCCC-A---A-G-G-A-GC-C-TG--------------AC-A-------T--G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----CGAACTTAATT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-----A--AG-A-AAA--T-ATctaatata
gi|10906 : cagtcaTGA-CTTC-A---A-A-G-G-CC-C-TC-CA------C----GT-A-------T--G----T--G----T--CAATGAAT-----G-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-
gi|10880 : TGA-CCCC-A---G-G-G-G-TC-A-TC-GA------C----AC-A-------T--G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-T-TC-AA-CA-C-A
gi|10867 : caTGA-CCCC-A---C-G-G-G-CC-T-TC-CA------C----AA-A-------T--T----T--G----T--C----AATGAGC-G-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-
gi|10850 : cagtcaTGA-CCCC-A---T-G-T-G-CC-------A------T----AT---------T--G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-C-T--------C-GA-GG-AA-C-----A--AG-G-AAA--T-ATAT
gi|10854 : cagtcaTGA-CCCC-A---A-G-GCG-CT-C-TC-CA------C----TT-A-------T---------------T--T----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-G-CC-AAACA-C-AA-GG-AT-C-----A--AG-A-AAA--T-ATGT
gi|10881 : cagtcaTGA-CCCA-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----A--------AT-G-T-C-TC-A
gi|10911 : caTGA-CTCC-A---G-G-G-G-TC-C-TG-CA----------------------T--G----T--A----T--C----A-T-----AGAA----C--------TT-G-T-C-TA-AA-CA-C-AA-TG-AA-C-----A--AG-G-GAA--T-GTAT
gi|10908 : TGA-CCCC-A-------G-G-CC-C-TT-CC------C----AT-A-------T--G----T--G----T--CAATGAAT-----G-AA----C--------TTGG-T-CTTC-AA-CA-C-AA-AG-AATT-----A--AG-A-AAA--T-
gi|10872 : TAA-CCCC-A---G-G-A-T-CC-T-TC-CA------C----AT-AAAAATCAT--A----T--G----T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-C-C-TC-AA-GA-C-AT-GG-AA-C-----T--TG-G-AAA--T-ATA
gi|10905 : agccaTGA-CCCTTA---A-GCA-G-TT-C-TC-CT------C----AT-A-------T--T----T--G----T--C----AAT-----G-AC----G--------CT-G-T-C-TC-AA-CA-A-AA-GG-AT-C-----A--AG-A-AAA--T-ATAT
gi|10877 : TGA-CCCC-A---A-A-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--A---------------------------------------------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AT-AT-C-----A--TG-A-AAA--T-ATAT
gi|10900 : agtcaTGA-CCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AG-A-------T--G----T--C----T--A----AAT-----G-TA----C--------TT-G-T-C-TC--A-TA-C----------T-----A--AG-A-AAA--T-ACAT
gi|10909 : caTGA-CCCC-A---A-A-G-G-TC-T-TT-CA------C----AC-A-------T--G----T--G----A--C----AAG-----G-AA----T--------GT-G-T-T-TT-AA-CA-T-AA-GG-AA-C-----A--A----AAT--T-ATAT
gi|10891 : TGA-CCCC-T-----G-G-G-CC-CATC-CA------C----AC-A-------T--G----T--G-------A----AAT-----G-AA----C--------TT-G-TTC-TC-A--CA-C-AAAGG-AA-C-----A--AG-A-AAA----ATAat
gi|10907 : caTGA-CCCC-T---T-G-G-G-CT-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-
gi|10899 : TGA-CCC------A-G-C-G-CC-C-TC-CA------C-------A-------T--G----T--G----T--C----AAT-----G-AA-------------TA-G-T-A-TC-AA-CA-C-AA-TG-AT-C-----A--A--G-AAA--T-ACAT
gi|10910 : caTGA-CCCT-A---G-C-G-G-TC-T-TC-CT------C----AT-G-------TT-A----T--G----G--C----AAA-----G-AC----C--------TT-G-T-C-TC-AT-CA-C-AA-GG-AT-C-----A--AG-A-AAA--T-ATAT
gi|10870 : TGA-CCTC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------T----AC-A-------T---------------------------------------------------G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-C-----A--AA-G-AAA--T-TTAT
gi|10869 : cagtcaTGG-CCCC-T---A-G-C-A-CC-A-TT-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----GAT-----A-AA----C--------TT-G-T-C-TA-AA-
gi|10913 : cagtcaGA-CCCT-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-----A--AG-G-AAA--T-ATATa
gi|10914 : GA-CCCC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------T----AT-A-------A--A----T--G----T--C----AAG-----C-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-----G--AA-G-AAA--T-ATAT
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gi|10917 : GA-CCCC-A---T-G-G-A-CA-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT-----A-AG----C--------TT-G-T-C-TT-AA------GG-GG-AA-C-----A--
gi|10866 : GA-CACC-A---A-C-G-G-CCTC-CC-CA------C----AT-A-------TATG----T--G----T--C----AAT-----A-AA----C--------TT-G-T-A-TC-TA-TG-C-AA-GG-AA-C-----A--AA-A-AAttgatagacaagccaaaaata
gi|10835 : cagtcagA-CCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-----A--AG-A-ACA--T-ACAT
gi|10919 : cagtcattA-CCCC-A---G-G-G-G-CT-C-TC-CA--------------A----------G----T--G----C--C----AAT-----G-A-----C--------TA-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-----A--AG-G-GAA--T-ATAT
gi|10868 : -CCCC-T---A-G-A-G-CC-C-TC-CA------C----AT-C-------T--G----T----------C----AAT-----G-AT----T--------TT-G-T-G-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-----A--AT-A-AAA--T-ATAT
gi|10921 : cagtcatgaccc-CTCC-A---A-G-A-A-CC-C-TC-CA------T----AT-A-------T--G----T--G----G--C----AAT-----G-AA----C--------TTCA-T-T-GC-CA-CA-T-A---G-AA-C-----A--AG-A-AAA--T-ATA
gi|10923 : CCC-A---A-GAG-G-CT-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-C-GC-AA-CA-C-AA-GT-AT-G-----A--AG-A-AAA--T-ATAT
gi|10922 : CCT-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A----------A----T-------T--C----ACT-----G-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-TG-AT-C-----A--AG-A-AAA--T-ATAT
gi|10924 : CCC-A---A-T-A-G-CC-C-TC-CA------C----AC-T-------T--G----T--G----T--C----AAT-----A-AG----C--------TT-G-T-C-TT-AA-C-----T-GG-AT-C-----A--A----AAA--T-ATAT
gi|10925 : CTC-A---T-G-G-G-GC-C-TCGCA------C----AC-A-------T--G----T--G----T--C----AAG-----A-AA----CG-------TT-GTT-C-TC-CA-TA-C-AA-GG-AA-CAAG--A--AG-G-AAA--T-A
gi|10860 : CC-T---A-G-G-G-CT-C-TC-CC------C----AT-A-------T--G----T--GC---T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-CCTC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-----A--AGAA-AAA--T-ATA
gi|10927 : cagtcatgaa-A---A-T-G-G-CC-C-T---A------C----AT-G-------T--G-------G----T--C----AAT-----A-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-----A--AG-GAAAA--T-ATAT
gi|10928 : -G-G-CC-T-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAA-----A-AA----C-----------G-T-C-TC-AA-TA-T-AA-AA-AT-C-----A--AG-A-CAC--T-ATAT
gi|10929 : -CC-C-TC-CA------C----AG-A-------T--A----T--G----T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-C-TA-AA-AA-C-AT-GG-GA-C-----T--TG-G-AAA--T-ATA
gi|10930 : C-C-TC-CA------C----AT-A-------T--A----T--G----T--C----AAT-----A-AA----T--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-
gi|10931 : T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AG-GG-AT-G-----A--AG-A-AAA--T-ATATatataaaat
gi|10932 : T-A-------A--G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AG-GG-AT-C-----A--AG-A-AAA--T-ATAT
gi|10933 : T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT-----G-AA----C--------TT-G-T-C-TC-AA-AA-T----TG-AT-C-----A--AG-A-AAA--T-ATAT
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 2 3 1 22222 0 0 0 0 0 0 111111 0000 0 2222222 11 0000 00 2222 00 2222 3333333333 0 44444444 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 11 0 0 111111 0 111 000 00 0
lowQualScore : . . . ..... . . . . . . ...... .... . ....... .. .... .. .... .. .... .......... . ........ . . . . . . . . . . .. . . ...... . ... ... .. .
lowQualScore : 5 9 7 55555 8 4 4 4 8 4 222222 9999 4 6666666 55 9999 66 0000 66 5555 8888888888 4 66666666 8 4 8 2 8 4 4 4 8 4 11 4 4 777777 9 333 888 66 4
consensus : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
Reference ( family-252 ) : CAGACGTGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10831 : CAGATGTGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10832 : CAGATGTGACCCCCA---A-G-G-G-CC---TC-CA------C----AT-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TG-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--
gi|10833 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A---------------T--G----C--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-----TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ACAT
gi|10834 : CAGACATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----TT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-G--------TT-G-T-A-TC-CA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-ACAT
gi|10835 : CAGTCATTACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---CA--T-ACAT
gi|10836 : CAGTCATGACCCA-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AC-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---CA--T-ACAT
gi|10837 : CAGACATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------AT-G-T-C-TC-AA-CA-C-TA-GA-TT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10838 : CAGTCATGACCTC-A---G-T-G-G-CC-C-TC-CAAATACAT----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-C-T-T-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-T-A------G-----A---AA--T-AT
gi|10839 : CAGTCATGATCCT-A---A-G-G-G-TC-C-TC-CA------C----GT-A-------T--G----T--G----T--C----AA-----------AATC--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GT-AA-C-A-A--------A---A---AA--T-GT
gi|10840 : CAGTCATGATCCC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----A-----AA-T--------TT-G-T-C-TC-AC-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10841 : CAGTCATGATCCC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----A-----AA-T--------TT-G-T-C-TC-AC-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10842 : CAGTCGTGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AC-A-------T--G----T--G----T--T----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-G-TCAAA-TACC-AA-GG-AA-C-A-A------C-G---A---AA--T-ATAT
gi|10843 : CAGACGTGATCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------CTTATATCA-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-G--------TT-G-T-A-TC-CA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-ACAT
gi|10844 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-T-------T--G----T--G----T--C----AAA----A-----AC-C--------TT-G-C-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ACAT
gi|10845 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-AA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----GAACA-AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--
gi|10846 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T----------C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-G-TC-AA-TA-C-AA-GG-AT-G-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10847 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-A-G-CC---TC-CA------C----AT------------G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-T-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A--------A---A---AA--T-ATAT
gi|10848 : CAGCCATGACCCCCA---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--T----T--C----AAT----GAATG-AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--T-GTA
gi|10849 : CAGTCATGACCCCCA---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AC------------G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-T-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---GA--T-ATAT
gi|10850 : CAGTCATGACCCC-A---T-G-T-G-CC-------A------T----AT---------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-T--------C-GA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10851 : CAGTCATGACCGT-A---A-G-G-G-CC-T-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--G----AATTAACG-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--T-ATA
gi|10852 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CT-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T----------T----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-G-CC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATGT
gi|10853 : CAGAAGTGACCCT-A---A---------------------------------------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10854 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-GCG-CT-C-TC-CA------C----TT-A-------T---------------T--T----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-G-CC-AAACA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATGT
gi|10855 : CAGTCATGACAAC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AC-A-------T--A----T--A----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-A-AA-GG-AA-C-A-A------A-G---A---AA--T-ATAT
gi|10856 : CAGTCATGACCCT-A---A-T-A-A-CT-C-TC-CA------C----AT-G-------C--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT---T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--T-AT
gi|10857 : CAGTCATGACCC------A-G-G-A-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T----------C----AAT----G-----AA-T--------TT-G-T-A-TC-AA-CA-C-AA-AG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10858 : CAGTCATAACCCA-A---A-G-G-A-CC-C-TC-CA------C----AC-A-------T--G----T--G----T--C----AATGAACG-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AA-AA-T-A-G------G-A---A---AA--T-ATA
gi|10859 : CAGTCATGACCTC-A---T-G-G-G-TC-C-TC-CA------C----AT-G-------T--G----TCAA----T--G----AAT----G-----AA-C--------TT-G-C-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--T-ATA
gi|10860 : CAGTCATGAACCT-A-----G-G-G-CT-C-TC-CC------C----AT-A-------T--G----T--GC---T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-CCTC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA----ATAT
gi|10861 : CAGTCATAACCCT-A---T-G-G-A-CA-C-TC-CA------C----GC-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-A-T-C-TC-AA-CG-C-AA-GG-AA-C-A-A------C-AAT-A---AA--T-ATATa
gi|10862 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-C-G-CC-C-TC-TA------C----AT-G----------G----T-------C--C----AAT----A-----AA-T--------TT-G-T-C-TC-AA-CT-C-AA-GG-GA-C------------A---A---AA--T-ATAT
gi|10863 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-A-GC-C-TG--------------AC-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-CGAACTTAATT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--T-AT
gi|10864 : CAGTCGTGACCCT-------G-G-G-CC-C--A-CA------C----GC-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----T-----AA-C--------TT-G-T-T-TC-AA--A-C-AA-GG-AG-A-A-A------A-G---A---AA--T-GTAT
gi|10865 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-AC-GA------C----AT-AATTA---T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-CGAAC----TT-G-T-C-GC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------GTA---AACTAA--T-ATA
gi|10866 : CAGTCAGGACACC-A---A-C-G-G-CCTC-CC-CA------C----AT-A-------TATG----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-A-TC-TA-TG-C-AA-GG-AA-C-A-A------A-A---A---A
gi|10867 : CAGTCATGACCCC-A---C-G-G-G-CC-T-TC-CA------C----AA-A-------T--T----T--G----T--C----AATGAGCG-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-
gi|10868 : CAGTCATGACCCC-CCCTA-G-A-G-CC-C-TC-CA------C----AT-C-------T--G----T----------C----AAT----G-----AT-T--------TT-G-T-G-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------T-A---A---AA--T-ATAT
gi|10869 : CAGTCATGGCCCC-T---A-G-C-A-CC-A-TT-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----GAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TA-AA-
gi|10870 : CAGTCATGACCTC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------T----AC-A---------------------------------------------------------T-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-C-A-A------A-G---A---AA--T-TTATa
gi|10871 : AGACGTGATCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------T----AT-A-------C--A----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-AA-C-AA-GA-AA-C-T-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10872 : AGCCATAACCCC-A---G-G-A-T-CC-T-TC-CA------C----AT-AAAAATCAT--A----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-C-C-TC-AA-GA-C-AT-GG-AA-C-T-T------G-G---A---AA--T-ATA
gi|10873 : AGTCATGACCCC-A---A-G-G-A-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--CTATGAAC----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AT-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--T-ACA
gi|10874 : AGTCATGACCCT-A---A-A-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--A----T-------T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-TC-AT-C-A-A------A-A---A---AA--TCATAT
gi|10875 : AGTCATGACCT--A---A-G-G-C-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--A----T-------T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-TC-AT-C-A-A------A-A---A---AA--T-ATAT
gi|10876 : AGACGTAACCCC-A---A-T-G-G-----------------------------------------T--G----T--C----AAT----G-----AT-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AG-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10877 : AGTCATGACCCC-A---A-A-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--A----T-----------------------------------------T-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AT-AT-C-A-T------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10878 : CATGACCCC-CT--A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AA-A-------T--G----T----------C----CAT----A-----AA-C--------TT-G-T-G-TC-AA-CA---AA-GG-AA-TGA-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10879 : CATGACCCC-A---G-G-G-G-CC-A-TC-CG------C----AC-A-------T--G----T--G----T--C----TAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-GTAT
gi|10880 : CATGACCCC-A---G-G-G-G-TC-A-TC-GA------C----AC-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-T-TC-AA-CA-C-A
gi|10881 : CATGACCCA-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-A--------AT-G-T-C-TC-A
gi|10882 : CATGACCCC-G---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--T----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-TG-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10883 : CATGACCCC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT------------G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10884 : CATGACCCC-A---G-G-G-G-TC-A-TC-CA------C----AC-A-------T--AATTAT--G----T--C----AAT----G-----AA-A--------TT-G-T-T-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------T-A---A---AA--T-ATAT
gi|10885 : CATGACCCT-A---G-G-G-G-CC-C-TC-AA------C----AT-A-------A--A----T--G----T--T----AAT----G----------------------T-T-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10886 : CATGACCCC-A---A-G-G-G-CT-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----GAACA-AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-CA-T-A-A------G-A---A---AA--T-ATA
gi|10887 : CATGACCCC-A---G-G-G-G-CT-C-TC-CA--------------A----------G----T--G----C--C----AAT----T-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-A-A------G-G---G---AA--T-ATAT
gi|10888 : CATGAGCCC-A---G-G-G-G-TC-A-TC-CA------C----AT------------G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------A-G---A---AA--T-ATAT
gi|10889 : CATGAACCC-A---GCG-G-G-TC-CATC-CA------C----AA-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C---------T-G-T-C-TCAAA-CA-CAAA-GG-AA-C-A-A------A-G---A---AA--T-ATA
gi|10890 : CATGACACC-A-----G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------A--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-A-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-C-A-ACTTAAGG-T---A---AA--T-ATAT
gi|10891 : CATGACCCC-T-----G-G-G-CC-CATC-CA------C----AC-A-------T--G----T--G-------A----AAT----G-----AA-C--------TT-G-TTC-TC-A--CA-C-AAAGG-AA-C-A-A------G-A---A---AA----ATA
gi|10892 : CATGGCCCC-A---A-T-G-G-GC-C-TC-CA------C----TT-A-------T--G----T--G----TAAC----AAT----------AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-AT
gi|10893 : CATGATCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C-------A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-CGAACT---TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--A-ATA
gi|10894 : CATGAATCC-A---T-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----GC-A-------A--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-C-A-A------C-G---A---AA--T-AT
gi|10895 : CATGACCCC-A---G-G-A-G-CT-C-TC-CA--------------A----------G----T--G-------C----AAT----G-----AA-C--------TA-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-A-A------G-G---G---AA--T-ATAT
gi|10896 : CGTGACCCC-ATTTA-G-G---CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----GAACGAAA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AGTAA-T-A-A------G-G---A---AAATT-ATA
gi|10897 : CATGACTCC-A---G-G-G-A-CC-C-TC-CC------C----AT-A-------T--G----T--GTCACT--C----AAT----G-----AA-T--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AT-G----------------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10898 : CATGACCCC-A---G-A-A-G-CC---TC-CA------C----AC------------G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------T--G-C-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-A-A-A------T-G---A---AA--T-ATAT
gi|10899 : CATGACCC------A-G-C-G-CC-C-TC-CA------C----AT------------G----T--G----T--C----AAT----G-----AA----------TA-G-T-A-TC-AA-CA-C-AA-TG-AT-C-A-A------G-----A---AA--T-ACAT
gi|10900 : CATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AG-A-------T--G----T--C----T--A----AAT----G-----TA-C--------TT-G-T-C-TC--A-TA-C----------T-A-A------G-A---A---AA--T-ACAT
gi|10901 : TGACCCT-A---G-C-G-A-TC-C-TC-CT------C----GT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AC-C--------CT-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10902 : TGACCCC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AC-A-------T--A----T--A----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-T-AA-GA-AA-C-T-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10903 : TGACCCC-A---A-G-G---CC-C-TC-CA------C----AT-AA------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-CAAAC----TT-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--T-ATA
gi|10904 : TGACCCT-A---T-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AC-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-C-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------ATA---A---AA--T-ACAT
gi|10905 : TGACCCTTA---A-GCA-G-TT-C-TC-CT------C----AT-A-------T--T----T--G----T--C----AAT----G-----AC-G--------CT-G-T-C-TC-AA-CA-A-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10906 : TGACTTC-A---A-A-G-G-CC-C-TC-CA------C----GT-A-------T--G----T--G----T--CAATGAAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-
gi|10907 : TGACCCC-T---T-G-G-G-CT-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-
gi|10908 : TGACCCC-A-------G-G-CC-C-TT-CC------C----AT-A-------T--G----T--G----T--CAATGAAT----G-----AA-C--------TTGG-T-CTTC-AA-CA-C-AA-AG-AATT-A-A------G-A---A---AA--T-
gi|10909 : TGACCCC-A---A-A-G-G-TC-T-TT-CA------C----AC-A-------T--G----T--G----A--C----AAG----G-----AA-T--------GT-G-T-T-TT-AA-CA-T-AA-GG-AA-C-A-A------A-A---T---TA--T-ATAT
gi|10910 : TGACCCT-A---G-C-G-G-TC-T-TC-CT------C----AT-G-------TT-A----T--G----G--C----AAA----G-----AC-C--------TT-G-T-C-TC-AT-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10911 : TGACTCC-A---G-G-G-G-TC-C-TG-CA----------------------T--G----T--A----T--C----ATA----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TA-AA-CA-C-AA-TG-AA-C-A-A------G-G---G---AA--T-GTAT
gi|10913 : GACCCT-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10914 : GACCCC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------T----AT-A-------A--A----T--G----T--C----AAG----C-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-G-A------A-G---A---AA--T-ATAT
gi|10915 : GACCCC-A---G-G-G-T-CA-C-TC-TA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----C-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CT-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---TA--T-
gi|10916 : GACCCT-A---G-G-G-G-CT-C-TC-CA------C----AT-A-------TATG----T--G----T--C----CAT----G-----AA-T--------TT-T-T-C-TC-GA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10917 : GACCCC-A---T-G-G-A-CA-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AG-C--------TT-G-T-C-TT-AA------GG-GG-AA-C-A-
gi|10918 : GACCCC-A---A-G-G-GCCC-C-TC-TA------C----AT-A-------T-------T--GATT-T--C----AATAAACA-----AA-C--------TT-GCT-CGTC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-ATA------A-G---A---AA--T-ATttgatagacaagccaaaaata
gi|10919 : ACCCC-A---G-G-G-G-CT-C-TC-CA--------------A----------G----T--G----C--C----AAT----G-----A--C--------TA-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-A-A------G-G---G---AA--T-ATAT
gi|10921 : CTCC-A---A-G-A-A-CC-C-TC-CA------T----AT-A-------T--G----T--G----G--C----AAT----G-----AA-C--------TTCA-T-T-GC-CA-CA-T-A---G-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATA
gi|10922 : CCT-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----AT-A----------A----T-------T--C----ACT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-TG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10923 : CCC-A---A-GAG-G-CT-C-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-GC-AA-CA-C-AA-GT-AT-G-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10924 : CCC-A---A-T-A-G-CC-C-TC-CA------C----AC-T-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AG-C--------TT-G-T-C-TT-AA-C-----T-GG-AT-C-A----------A---A---AA--T-ATAT
gi|10925 : CTC-A---T-G-G-G-GC-C-TCGCA------C----AC-A-------T--G----T--G----T--C----AAG----A-----AA-CG-------TT-G-TTC-TC-CA-TA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-AAGGA---AA--T-A
gi|10927 : -A---A-T-G-G-CC-C-T---A------C----AT-G-------T--G-------G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-AG-----G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10928 : -G-G-CC-T-TC-CA------C----AT-A-------T--G----T--G----T--C----AAA----A-----AA-C-----------G-T-C-TC-AA-TA-T-AA-AA-AT-C-A-A------G-A---C---AC--T-ATAT
gi|10929 : -CC-C-TC-CA------C----AG-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TA-AA-AA-C-AT-GG-GA-C-T-T------G-G---A---AA--T-ATA
gi|10930 : C-C-TC-CA------C----AT-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----A-----AA-T--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-A-T-A------T-A---A---AA--T-
gi|10931 : T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AG-GG-AT-G-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10932 : T-A-------A--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AG-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10933 : T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA------AATTG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
Alignments
lowQualScore : 1 22222 0 0 0 0 0 0 111111 0000 0000 0 1111111 11 0000 00 2222 00 2222 4444444444 0 33333333 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 11 0 0 111111 0 111 000 00 0
lowQualScore : . ..... . . . . . . ...... .... .... . ....... .. .... .. .... .. .... .......... . ........ . . . . . . . . . . .. . . ...... . ... ... .. .
lowQualScore : 7 77777 9 4 4 4 8 4 222222 9999 9999 4 7777777 55 9999 66 0000 66 5555 7777777777 4 77777777 8 4 8 2 8 4 4 4 8 4 11 4 4 777777 9 333 888 66 4
consensus : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
Reference ( family-252 ) : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10831 : TGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10832 : cagatgTGACCCCCA---A-G-G-G-CC---TC-CA------C----A----T-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TG-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--
gi|10833 : cagatgCAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A---------------T--G----C--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-----TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ACAT
gi|10834 : CAGACATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----T----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-G--------TT-G-T-A-TC-CA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-ACAT
gi|10835 : CAGTCATTACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---CA--T-ACAT
gi|10836 : CAGTCATGACCCA-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----C-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---CA--T-ACAT
gi|10837 : CAGACATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------AT-G-T-C-TC-AA-CA-C-TA-GA-TT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10838 : CAGTCATGACCTC-A---G-T-G-G-CC-C-TC-CAAATACAT----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-C-T-T-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-T-A------G-----A---AA--T-AT
gi|10839 : CAGTCATGATCCT-A---A-G-G-G-TC-C-TC-CA------C----G----T-A-------T--G----T--G----T--C----AA-----------AATC--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GT-AA-C-A-A--------A---A---AA--T-GT
gi|10840 : CAGTCATGATCCC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----A-----AA-T--------TT-G-T-C-TC-AC-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10841 : CAGTCATGATCCC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----A-----AA-T--------TT-G-T-C-TC-AC-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10842 : CAGTCGTGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----C-A-------T--G----T--G----T--T----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-G-TCAAA-TACC-AA-GG-AA-C-A-A------C-G---A---AA--T-ATAT
gi|10843 : CAGACGTGATCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------CTTATA----TCA-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-G--------TT-G-T-A-TC-CA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-ACAT
gi|10844 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-T-------T--G----T--G----T--C----AAA----A-----AC-C--------TT-G-C-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ACAT
gi|10845 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-AA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----GAACA-AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--
gi|10846 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T----------C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-G-TC-AA-TA-C-AA-GG-AT-G-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10847 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-A-G-CC---TC-CA------C----A----T------------G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-T-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A--------A---A---AA--T-ATAT
gi|10848 : CAGCCATGACCCCCA---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--T----T--C----AAT----GAATG-AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--T-GTA
gi|10849 : CAGTCATGACCCCCA---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----C------------G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-T-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---GA--T-ATAT
gi|10850 : CAGTCATGACCCC-A---T-G-T-G-CC-------A------T----A----T---------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-T--------C-GA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10851 : CAGTCATGACCGT-A---A-G-G-G-CC-T-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--G----AATTAACG-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--T-ATA
gi|10852 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CT-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T----------T----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-G-CC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATGT
gi|10853 : -A-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10854 : cagaagtgaccctaCAGTCATGACCCC-A---A-G-GCG-CT-C-TC-CA------C----T----T-A-------T---------------T--T----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-G-CC-AAACA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATGT
gi|10855 : CAGTCATGACAAC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----C-A-------T--A----T--A----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-A-AA-GG-AA-C-A-A------A-G---A---AA--T-ATAT
gi|10856 : CAGTCATGACCCT-A---A-T-A-A-CT-C-TC-CA------C----A----T-G-------C--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT---T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--T-AT
gi|10857 : CAGTCATGACCC------A-G-G-A-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T----------C----AAT----G-----AA-T--------TT-G-T-A-TC-AA-CA-C-AA-AG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10858 : CAGTCATAACCCA-A---A-G-G-A-CC-C-TC-CA------C----A----C-A-------T--G----T--G----T--C----AATGAACG-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AA-AA-T-A-G------G-A---A---AA--T-ATA
gi|10859 : CAGTCATGACCTC-A---T-G-G-G-TC-C-TC-CA------C----A----T-G-------T--G----TCAA----T--G----AAT----G-----AA-C--------TT-G-C-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--T-ATA
gi|10860 : CAGTCATGAACCT-A-----G-G-G-CT-C-TC-CC------C----A----T-A-------T--G----T--GC---T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-CCTC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA----ATAT
gi|10861 : CAGTCATAACCCT-A---T-G-G-A-CA-C-TC-CA------C----G----C-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-A-T-C-TC-AA-CG-C-AA-GG-AA-C-A-A------C-AAT-A---AA--T-ATATa
gi|10862 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-C-G-CC-C-TC-TA------C----A----T-G----------G----T-------C--C----AAT----A-----AA-T--------TT-G-T-C-TC-AA-CT-C-AA-GG-GA-C------------A---A---AA--T-ATAT
gi|10863 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-A-GC-C-TG--------------A----C-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-CGAACTTAATT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--T-AT
gi|10864 : CAGTCGTGACCCT-------G-G-G-CC-C--A-CA------C----G----C-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----T-----AA-C--------TT-G-T-T-TC-AA--A-C-AA-GG-AG-A-A-A------A-G---A---AA--T-GTAT
gi|10865 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-AC-GA------C----ATAATT-A-------T--G----T--G----T--C----AATGAACG-----AA-C--------TT-G-T-C-GC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------GTA---AACTAA--T-ATA
gi|10866 : CAGTCAGGACACC-A---A-C-G-G-CCTC-CC-CA------C----A----T-A-------TATG----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-A-TC-TA-TG-C-AA-GG-AA-C-A-A------A-A---A---A
gi|10867 : CAGTCATGACCCC-A---C-G-G-G-CC-T-TC-CA------C----A----A-A-------T--T----T--G----T--C----AATGAGCG-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-
gi|10868 : CAGTCATGACCCC-CCCTA-G-A-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-C-------T--G----T----------C----AAT----G-----AT-T--------TT-G-T-G-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------T-A---A---AA--T-ATAT
gi|10869 : CAGTCATGGCCCC-T---A-G-C-A-CC-A-TT-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----GAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TA-AA-
gi|10870 : CAGTCATGACCTC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------T----A----C-A---------------------------------------------------------T-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-C-A-A------A-G---A---AA--T-TTATa
gi|10871 : AGACGTGATCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------T----A----T-A-------C--A----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-AA-C-AA-GA-AA-C-T-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10872 : AGCCATAACCCC-A---G-G-A-T-CC-T-TC-CA------C----A----T-AAAAATCAT--A----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-C-C-TC-AA-GA-C-AT-GG-AA-C-T-T------G-G---A---AA--T-ATA
gi|10873 : AGTCATGACCCC-A---A-G-G-A-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--CTATGAAC----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AT-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--T-ACA
gi|10874 : AGTCATGACCCT-A---A-A-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--A----T-------T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-TC-AT-C-A-A------A-A---A---AA--TCATAT
gi|10875 : AGTCATGACCT--A---A-G-G-C-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--A----T-------T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-TC-AT-C-A-A------A-A---A---AA--T-ATAT
gi|10876 : --G----T--G----T--C----AAT----G-----AT-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AG-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10877 : agacgtaaccccaatgAGTCATGACCCC-A---A-A-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--A----T-----------------------------------------T-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AT-AT-C-A-T------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10878 : CATGACCCC-CT--A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----A-A-------T--G----T----------C----CAT----A-----AA-C--------TT-G-T-G-TC-AA-CA---AA-GG-AA-TGA-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10879 : CATGACCCC-A---G-G-G-G-CC-A-TC-CG------C----A----C-A-------T--G----T--G----T--C----TAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-GTAT
gi|10880 : CATGACCCC-A---G-G-G-G-TC-A-TC-GA------C----A----C-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-T-TC-AA-CA-C-A
gi|10881 : CATGACCCA-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-A--------AT-G-T-C-TC-A
gi|10882 : CATGACCCC-G---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--T----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-TG-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10883 : CATGACCCC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T------------G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10884 : CATGACCCC-A---G-G-G-G-TC-A-TC-CA------C----A----C-A-------T--AATTAT--G----T--C----AAT----G-----AA-A--------TT-G-T-T-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------T-A---A---AA--T-ATAT
gi|10885 : CATGACCCT-A---G-G-G-G-CC-C-TC-AA------C----A----T-A-------A--A----T--G----T--T----AAT----G----------------------T-T-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10886 : CATGACCCC-A---A-G-G-G-CT-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----GAACA-AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-CA-T-A-A------G-A---A---AA--T-ATA
gi|10887 : CATGACCCC-A---G-G-G-G-CT-C-TC-CA------------------A----------G----T--G----C--C----AAT----T-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-A-A------G-G---G---AA--T-ATAT
gi|10888 : CATGAGCCC-A---G-G-G-G-TC-A-TC-CA------C----A----T------------G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------A-G---A---AA--T-ATAT
gi|10889 : CATGAACCC-A---GCG-G-G-TC-CATC-CA------C----A----A-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C---------T-G-T-C-TCAAA-CA-CAAA-GG-AA-C-A-A------A-G---A---AA--T-ATA
gi|10890 : CATGACACC-A-----G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------A--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-A-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-C-A-ACTTAAGG-T---A---AA--T-ATAT
gi|10891 : CATGACCCC-T-----G-G-G-CC-CATC-CA------C----A----C-A-------T--G----T--G-------A----AAT----G-----AA-C--------TT-G-TTC-TC-A--CA-C-AAAGG-AA-C-A-A------G-A---A---AA----ATA
gi|10892 : CATGGCCCC-A---A-T-G-G-GC-C-TC-CA------C----T----T-A-------T--G----T--G----TAAC----AAT----------AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-AT
gi|10893 : CATGATCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C-----------A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-CGAACT---TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--A-ATA
gi|10894 : CATGAATCC-A---T-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----G----C-A-------A--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-C-A-A------C-G---A---AA--T-AT
gi|10895 : CATGACCCC-A---G-G-A-G-CT-C-TC-CA------------------A----------G----T--G-------C----AAT----G-----AA-C--------TA-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-A-A------G-G---G---AA--T-ATAT
gi|10896 : CGTGACCCC-ATTTA-G-G---CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----GAACGAAA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AGTAA-T-A-A------G-G---A---AAATT-ATA
gi|10897 : CATGACTCC-A---G-G-G-A-CC-C-TC-CC------C----A----T-A-------T--G----T--GTCACT--C----AAT----G-----AA-T--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AT-G----------------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10898 : CATGACCCC-A---G-A-A-G-CC---TC-CA------C----A----C------------G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------T--G-C-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-A-A-A------T-G---A---AA--T-ATAT
gi|10899 : CATGACCC------A-G-C-G-CC-C-TC-CA------C----A----T------------G----T--G----T--C----AAT----G-----AA----------TA-G-T-A-TC-AA-CA-C-AA-TG-AT-C-A-A------G-----A---AA--T-ACAT
gi|10900 : CATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----G-A-------T--G----T--C----T--A----AAT----G-----TA-C--------TT-G-T-C-TC--A-TA-C----------T-A-A------G-A---A---AA--T-ACAT
gi|10901 : TGACCCT-A---G-C-G-A-TC-C-TC-CT------C----G----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AC-C--------CT-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10902 : TGACCCC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----C-A-------T--A----T--A----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-T-AA-GA-AA-C-T-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10903 : TGACCCC-A---A-G-G---CC-C-TC-CA------C----A----T-AA------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-CAAAC----TT-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--T-ATA
gi|10904 : TGACCCT-A---T-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----C-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-C-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------ATA---A---AA--T-ACAT
gi|10905 : TGACCCTTA---A-GCA-G-TT-C-TC-CT------C----A----T-A-------T--T----T--G----T--C----AAT----G-----AC-G--------CT-G-T-C-TC-AA-CA-A-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10906 : TGACTTC-A---A-A-G-G-CC-C-TC-CA------C----G----T-A-------T--G----T--G----T--CAATGAAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-
gi|10907 : TGACCCC-T---T-G-G-G-CT-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-
gi|10908 : TGACCCC-A-------G-G-CC-C-TT-CC------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--CAATGAAT----G-----AA-C--------TTGG-T-CTTC-AA-CA-C-AA-AG-AATT-A-A------G-A---A---AA--T-
gi|10909 : TGACCCC-A---A-A-G-G-TC-T-TT-CA------C----A----C-A-------T--G----T--G----A--C----AAG----G-----AA-T--------GT-G-T-T-TT-AA-CA-T-AA-GG-AA-C-A-A------A-A---T---TA--T-ATAT
gi|10910 : TGACCCT-A---G-C-G-G-TC-T-TC-CT------C----A----T-G-------TT-A----T--G----G--C----AAA----G-----AC-C--------TT-G-T-C-TC-AT-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10911 : TGACTCC-A---G-G-G-G-TC-C-TG-CA--------------------------T--G----T--A----T--C----ATA----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TA-AA-CA-C-AA-TG-AA-C-A-A------G-G---G---AA--T-GTAT
gi|10913 : GACCCT-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10914 : GACCCC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------T----A----T-A-------A--A----T--G----T--C----AAG----C-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-G-A------A-G---A---AA--T-ATAT
gi|10915 : GACCCC-A---G-G-G-T-CA-C-TC-TA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----C-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CT-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---TA--T-
gi|10916 : GACCCT-A---G-G-G-G-CT-C-TC-CA------C----A----T-A-------TATG----T--G----T--C----CAT----G-----AA-T--------TT-T-T-C-TC-GA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10917 : GACCCC-A---T-G-G-A-CA-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AG-C--------TT-G-T-C-TT-AA------GG-GG-AA-C-A-
gi|10918 : GACCCC-A---A-G-G-GCCC-C-TC-TA------C----A----T-A-------T-------T--GATT-T--C----AATAAACA-----AA-C--------TT-GCT-CGTC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-ATA------A-G---A---AA--T-ATttgatagacaagccaaaaata
gi|10919 : ACCCC-A---G-G-G-G-CT-C-TC-CA------------------A----------G----T--G----C--C----AAT----G-----A--C--------TA-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-A-A------G-G---G---AA--T-ATAT
gi|10921 : CTCC-A---A-G-A-A-CC-C-TC-CA------T----A----T-A-------T--G----T--G----G--C----AAT----G-----AA-C--------TTCA-T-T-GC-CA-CA-T-A---G-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATA
gi|10922 : CCT-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A----------A----T-------T--C----ACT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-TG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10923 : CCC-A---A-GAG-G-CT-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-GC-AA-CA-C-AA-GT-AT-G-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10924 : CCC-A---A-T-A-G-CC-C-TC-CA------C----A----C-T-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AG-C--------TT-G-T-C-TT-AA-C-----T-GG-AT-C-A----------A---A---AA--T-ATAT
gi|10925 : CTC-A---T-G-G-G-GC-C-TCGCA------C----A----C-A-------T--G----T--G----T--C----AAG----A-----AA-CG-------TT-G-TTC-TC-CA-TA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-AAGGA---AA--T-A
gi|10927 : -A---A-T-G-G-CC-C-T---A------C----A----T-G-------T--G-------G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-AG-----G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10928 : -G-G-CC-T-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAA----A-----AA-C-----------G-T-C-TC-AA-TA-T-AA-AA-AT-C-A-A------G-A---C---AC--T-ATAT
gi|10929 : -CC-C-TC-CA------C----A----G-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TA-AA-AA-C-AT-GG-GA-C-T-T------G-G---A---AA--T-ATA
gi|10930 : C-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----A-----AA-T--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-A-T-A------T-A---A---AA--T-
gi|10931 : ----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AG-GG-AT-G-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10932 : ----T-A-------A--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AG-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10933 : ----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA------AATTG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
Alignments
lowQualScore : 1 22222 0 0 0 0 0 0 111111 0000 0000 0 1111111 11 0000 00 2222 00 2222 4444444444 0 33333333 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 11 0 0 111111 0 111 000 00 0
lowQualScore : . ..... . . . . . . ...... .... .... . ....... .. .... .. .... .. .... .......... . ........ . . . . . . . . . . .. . . ...... . ... ... .. .
lowQualScore : 7 77777 9 4 4 4 8 4 222222 9999 9999 4 7777777 55 9999 66 0000 66 5555 7777777777 4 77777777 8 4 8 2 8 4 4 4 8 4 11 4 4 777777 9 333 888 66 4
consensus : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
Reference ( family-252 ) : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10831 : TGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10832 : cagatgTGACCCCCA---A-G-G-G-CC---TC-CA------C----A----T-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TG-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--
gi|10833 : cagatgCAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A---------------T--G----C--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-----TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ACAT
gi|10834 : CAGACATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----T----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-G--------TT-G-T-A-TC-CA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-ACAT
gi|10835 : CAGTCATTACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---CA--T-ACAT
gi|10836 : CAGTCATGACCCA-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----C-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---CA--T-ACAT
gi|10837 : CAGACATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------AT-G-T-C-TC-AA-CA-C-TA-GA-TT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10838 : CAGTCATGACCTC-A---G-T-G-G-CC-C-TC-CAAATACAT----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-C-T-T-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-T-A------G-----A---AA--T-AT
gi|10839 : CAGTCATGATCCT-A---A-G-G-G-TC-C-TC-CA------C----G----T-A-------T--G----T--G----T--C----AA-----------AATC--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GT-AA-C-A-A--------A---A---AA--T-GT
gi|10840 : CAGTCATGATCCC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----A-----AA-T--------TT-G-T-C-TC-AC-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10841 : CAGTCATGATCCC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----A-----AA-T--------TT-G-T-C-TC-AC-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10842 : CAGTCGTGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----C-A-------T--G----T--G----T--T----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-G-TCAAA-TACC-AA-GG-AA-C-A-A------C-G---A---AA--T-ATAT
gi|10843 : CAGACGTGATCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------CTTATA----TCA-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-G--------TT-G-T-A-TC-CA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-ACAT
gi|10844 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-T-------T--G----T--G----T--C----AAA----A-----AC-C--------TT-G-C-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ACAT
gi|10845 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-AA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----GAACA-AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--
gi|10846 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T----------C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-G-TC-AA-TA-C-AA-GG-AT-G-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10847 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-A-G-CC---TC-CA------C----A----T------------G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-T-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A--------A---A---AA--T-ATAT
gi|10848 : CAGCCATGACCCCCA---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--T----T--C----AAT----GAATG-AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--T-GTA
gi|10849 : CAGTCATGACCCCCA---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----C------------G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-T-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---GA--T-ATAT
gi|10850 : CAGTCATGACCCC-A---T-G-T-G-CC-------A------T----A----T---------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-T--------C-GA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10851 : CAGTCATGACCGT-A---A-G-G-G-CC-T-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--G----AATTAACG-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--T-ATA
gi|10852 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CT-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T----------T----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-G-CC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATGT
gi|10853 : -A-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10854 : cagaagtgaccctaCAGTCATGACCCC-A---A-G-GCG-CT-C-TC-CA------C----T----T-A-------T---------------T--T----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-G-CC-AAACA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATGT
gi|10855 : CAGTCATGACAAC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----C-A-------T--A----T--A----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-A-AA-GG-AA-C-A-A------A-G---A---AA--T-ATAT
gi|10856 : CAGTCATGACCCT-A---A-T-A-A-CT-C-TC-CA------C----A----T-G-------C--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT---T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--T-AT
gi|10857 : CAGTCATGACCC------A-G-G-A-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T----------C----AAT----G-----AA-T--------TT-G-T-A-TC-AA-CA-C-AA-AG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10858 : CAGTCATAACCCA-A---A-G-G-A-CC-C-TC-CA------C----A----C-A-------T--G----T--G----T--C----AATGAACG-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AA-AA-T-A-G------G-A---A---AA--T-ATA
gi|10859 : CAGTCATGACCTC-A---T-G-G-G-TC-C-TC-CA------C----A----T-G-------T--G----TCAA----T--G----AAT----G-----AA-C--------TT-G-C-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--T-ATA
gi|10860 : CAGTCATGAACCT-A-----G-G-G-CT-C-TC-CC------C----A----T-A-------T--G----T--GC---T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-CCTC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA----ATAT
gi|10861 : CAGTCATAACCCT-A---T-G-G-A-CA-C-TC-CA------C----G----C-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-A-T-C-TC-AA-CG-C-AA-GG-AA-C-A-A------C-AAT-A---AA--T-ATATa
gi|10862 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-C-G-CC-C-TC-TA------C----A----T-G----------G----T-------C--C----AAT----A-----AA-T--------TT-G-T-C-TC-AA-CT-C-AA-GG-GA-C------------A---A---AA--T-ATAT
gi|10863 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-A-GC-C-TG--------------A----C-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-CGAACTTAATT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--T-AT
gi|10864 : CAGTCGTGACCCT-------G-G-G-CC-C--A-CA------C----G----C-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----T-----AA-C--------TT-G-T-T-TC-AA--A-C-AA-GG-AG-A-A-A------A-G---A---AA--T-GTAT
gi|10865 : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-AC-GA------C----ATAATT-A-------T--G----T--G----T--C----AATGAACG-----AA-C--------TT-G-T-C-GC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------GTA---AACTAA--T-ATA
gi|10866 : CAGTCAGGACACC-A---A-C-G-G-CCTC-CC-CA------C----A----T-A-------TATG----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-A-TC-TA-TG-C-AA-GG-AA-C-A-A------A-A---A---A
gi|10867 : CAGTCATGACCCC-A---C-G-G-G-CC-T-TC-CA------C----A----A-A-------T--T----T--G----T--C----AATGAGCG-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-
gi|10868 : CAGTCATGACCCC-CCCTA-G-A-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-C-------T--G----T----------C----AAT----G-----AT-T--------TT-G-T-G-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------T-A---A---AA--T-ATAT
gi|10869 : CAGTCATGGCCCC-T---A-G-C-A-CC-A-TT-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----GAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TA-AA-
gi|10870 : CAGTCATGACCTC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------T----A----C-A---------------------------------------------------------T-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-C-A-A------A-G---A---AA--T-TTATa
gi|10871 : AGACGTGATCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------T----A----T-A-------C--A----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-AA-C-AA-GA-AA-C-T-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10872 : AGCCATAACCCC-A---G-G-A-T-CC-T-TC-CA------C----A----T-AAAAATCAT--A----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-C-C-TC-AA-GA-C-AT-GG-AA-C-T-T------G-G---A---AA--T-ATA
gi|10873 : AGTCATGACCCC-A---A-G-G-A-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--CTATGAAC----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AT-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--T-ACA
gi|10874 : AGTCATGACCCT-A---A-A-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--A----T-------T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-TC-AT-C-A-A------A-A---A---AA--TCATAT
gi|10875 : AGTCATGACCT--A---A-G-G-C-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--A----T-------T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-TC-AT-C-A-A------A-A---A---AA--T-ATAT
gi|10876 : --G----T--G----T--C----AAT----G-----AT-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AG-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10877 : agacgtaaccccaatgAGTCATGACCCC-A---A-A-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--A----T-----------------------------------------T-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AT-AT-C-A-T------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10878 : CATGACCCC-CT--A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----A-A-------T--G----T----------C----CAT----A-----AA-C--------TT-G-T-G-TC-AA-CA---AA-GG-AA-TGA-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10879 : CATGACCCC-A---G-G-G-G-CC-A-TC-CG------C----A----C-A-------T--G----T--G----T--C----TAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-GTAT
gi|10880 : CATGACCCC-A---G-G-G-G-TC-A-TC-GA------C----A----C-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-T-TC-AA-CA-C-A
gi|10881 : CATGACCCA-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-A--------AT-G-T-C-TC-A
gi|10882 : CATGACCCC-G---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--T----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-TG-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10883 : CATGACCCC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T------------G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10884 : CATGACCCC-A---G-G-G-G-TC-A-TC-CA------C----A----C-A-------T--AATTAT--G----T--C----AAT----G-----AA-A--------TT-G-T-T-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------T-A---A---AA--T-ATAT
gi|10885 : CATGACCCT-A---G-G-G-G-CC-C-TC-AA------C----A----T-A-------A--A----T--G----T--T----AAT----G----------------------T-T-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10886 : CATGACCCC-A---A-G-G-G-CT-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----GAACA-AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-CA-T-A-A------G-A---A---AA--T-ATA
gi|10887 : CATGACCCC-A---G-G-G-G-CT-C-TC-CA------------------A----------G----T--G----C--C----AAT----T-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-A-A------G-G---G---AA--T-ATAT
gi|10888 : CATGAGCCC-A---G-G-G-G-TC-A-TC-CA------C----A----T------------G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------A-G---A---AA--T-ATAT
gi|10889 : CATGAACCC-A---GCG-G-G-TC-CATC-CA------C----A----A-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C---------T-G-T-C-TCAAA-CA-CAAA-GG-AA-C-A-A------A-G---A---AA--T-ATA
gi|10890 : CATGACACC-A-----G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------A--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-A-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-C-A-ACTTAAGG-T---A---AA--T-ATAT
gi|10891 : CATGACCCC-T-----G-G-G-CC-CATC-CA------C----A----C-A-------T--G----T--G-------A----AAT----G-----AA-C--------TT-G-TTC-TC-A--CA-C-AAAGG-AA-C-A-A------G-A---A---AA----ATA
gi|10892 : CATGGCCCC-A---A-T-G-G-GC-C-TC-CA------C----T----T-A-------T--G----T--G----TAAC----AAT----------AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-AT
gi|10893 : CATGATCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C-----------A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-CGAACT---TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--A-ATA
gi|10894 : CATGAATCC-A---T-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----G----C-A-------A--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-C-A-A------C-G---A---AA--T-AT
gi|10895 : CATGACCCC-A---G-G-A-G-CT-C-TC-CA------------------A----------G----T--G-------C----AAT----G-----AA-C--------TA-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-A-A------G-G---G---AA--T-ATAT
gi|10896 : CGTGACCCC-ATTTA-G-G---CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----GAACGAAA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AGTAA-T-A-A------G-G---A---AAATT-ATA
gi|10897 : CATGACTCC-A---G-G-G-A-CC-C-TC-CC------C----A----T-A-------T--G----T--GTCACT--C----AAT----G-----AA-T--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AT-G----------------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10898 : CATGACCCC-A---G-A-A-G-CC---TC-CA------C----A----C------------G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------T--G-C-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-A-A-A------T-G---A---AA--T-ATAT
gi|10899 : CATGACCC------A-G-C-G-CC-C-TC-CA------C----A----T------------G----T--G----T--C----AAT----G-----AA----------TA-G-T-A-TC-AA-CA-C-AA-TG-AT-C-A-A------G-----A---AA--T-ACAT
gi|10900 : CATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----G-A-------T--G----T--C----T--A----AAT----G-----TA-C--------TT-G-T-C-TC--A-TA-C----------T-A-A------G-A---A---AA--T-ACAT
gi|10901 : TGACCCT-A---G-C-G-A-TC-C-TC-CT------C----G----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AC-C--------CT-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10902 : TGACCCC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----C-A-------T--A----T--A----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-T-AA-GA-AA-C-T-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10903 : TGACCCC-A---A-G-G---CC-C-TC-CA------C----A----T-AA------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-CAAAC----TT-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--T-ATA
gi|10904 : TGACCCT-A---T-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----C-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-C-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------ATA---A---AA--T-ACAT
gi|10905 : TGACCCTTA---A-GCA-G-TT-C-TC-CT------C----A----T-A-------T--T----T--G----T--C----AAT----G-----AC-G--------CT-G-T-C-TC-AA-CA-A-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10906 : TGACTTC-A---A-A-G-G-CC-C-TC-CA------C----G----T-A-------T--G----T--G----T--CAATGAAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-
gi|10907 : TGACCCC-T---T-G-G-G-CT-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-
gi|10908 : TGACCCC-A-------G-G-CC-C-TT-CC------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--CAATGAAT----G-----AA-C--------TTGG-T-CTTC-AA-CA-C-AA-AG-AATT-A-A------G-A---A---AA--T-
gi|10909 : TGACCCC-A---A-A-G-G-TC-T-TT-CA------C----A----C-A-------T--G----T--G----A--C----AAG----G-----AA-T--------GT-G-T-T-TT-AA-CA-T-AA-GG-AA-C-A-A------A-A---T---TA--T-ATAT
gi|10910 : TGACCCT-A---G-C-G-G-TC-T-TC-CT------C----A----T-G-------TT-A----T--G----G--C----AAA----G-----AC-C--------TT-G-T-C-TC-AT-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10911 : TGACTCC-A---G-G-G-G-TC-C-TG-CA--------------------------T--G----T--A----T--C----ATA----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TA-AA-CA-C-AA-TG-AA-C-A-A------G-G---G---AA--T-GTAT
gi|10913 : GACCCT-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10914 : GACCCC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------T----A----T-A-------A--A----T--G----T--C----AAG----C-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-G-A------A-G---A---AA--T-ATAT
gi|10915 : GACCCC-A---G-G-G-T-CA-C-TC-TA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----C-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CT-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---TA--T-
gi|10916 : GACCCT-A---G-G-G-G-CT-C-TC-CA------C----A----T-A-------TATG----T--G----T--C----CAT----G-----AA-T--------TT-T-T-C-TC-GA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10917 : GACCCC-A---T-G-G-A-CA-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AG-C--------TT-G-T-C-TT-AA------GG-GG-AA-C-A-
gi|10918 : GACCCC-A---A-G-G-GCCC-C-TC-TA------C----A----T-A-------T-------T--GATT-T--C----AATAAACA-----AA-C--------TT-GCT-CGTC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-ATA------A-G---A---AA--T-ATttgatagacaagccaaaaata
gi|10919 : ACCCC-A---G-G-G-G-CT-C-TC-CA------------------A----------G----T--G----C--C----AAT----G-----A--C--------TA-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-A-A------G-G---G---AA--T-ATAT
gi|10921 : CTCC-A---A-G-A-A-CC-C-TC-CA------T----A----T-A-------T--G----T--G----G--C----AAT----G-----AA-C--------TTCA-T-T-GC-CA-CA-T-A---G-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATA
gi|10922 : CCT-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A----------A----T-------T--C----ACT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-TG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10923 : CCC-A---A-GAG-G-CT-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-GC-AA-CA-C-AA-GT-AT-G-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10924 : CCC-A---A-T-A-G-CC-C-TC-CA------C----A----C-T-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AG-C--------TT-G-T-C-TT-AA-C-----T-GG-AT-C-A----------A---A---AA--T-ATAT
gi|10925 : CTC-A---T-G-G-G-GC-C-TCGCA------C----A----C-A-------T--G----T--G----T--C----AAG----A-----AA-CG-------TT-G-TTC-TC-CA-TA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-AAGGA---AA--T-A
gi|10927 : -A---A-T-G-G-CC-C-T---A------C----A----T-G-------T--G-------G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-AG-----G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10928 : -G-G-CC-T-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAA----A-----AA-C-----------G-T-C-TC-AA-TA-T-AA-AA-AT-C-A-A------G-A---C---AC--T-ATAT
gi|10929 : -CC-C-TC-CA------C----A----G-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TA-AA-AA-C-AT-GG-GA-C-T-T------G-G---A---AA--T-ATA
gi|10930 : C-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----A-----AA-T--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-A-T-A------T-A---A---AA--T-
gi|10931 : ----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AG-GG-AT-G-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10932 : ----T-A-------A--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AG-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10933 : ----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA------AATTG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
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Reference ( family-252 ) : CAGTCATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
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gi|10873 : AGTCATGACCCC-A---A-G-G-A-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--CTATGAAC----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AT-CA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--T-ACA
gi|10874 : AGTCATGACCCT-A---A-A-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--A----T-------T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-TC-AT-C-A-A------A-A---A---AA--TCATAT
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gi|10876 : --G----T--G----T--C----AAT----G-----AT-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AG-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
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gi|10894 : CATGAATCC-A---T-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----G----C-A-------A--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-C-A-A------C-G---A---AA--T-AT
gi|10895 : CATGACCCC-A---G-G-A-G-CT-C-TC-CA------------------A----------G----T--G-------C----AAT----G-----AA-C--------TA-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-A-A------G-G---G---AA--T-ATAT
gi|10896 : CGTGACCCC-ATTTA-G-G---CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----GAACGAAA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AGTAA-T-A-A------G-G---A---AAATT-ATA
gi|10897 : CATGACTCC-A---G-G-G-A-CC-C-TC-CC------C----A----T-A-------T--G----T--GTCACT--C----AAT----G-----AA-T--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AT-G----------------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10898 : CATGACCCC-A---G-A-A-G-CC---TC-CA------C----A----C------------G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------T--G-C-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AA-A-A-A------T-G---A---AA--T-ATAT
gi|10899 : CATGACCC------A-G-C-G-CC-C-TC-CA------C----A----T------------G----T--G----T--C----AAT----G-----AA----------TA-G-T-A-TC-AA-CA-C-AA-TG-AT-C-A-A------G-----A---AA--T-ACAT
gi|10900 : CATGACCCC-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----G-A-------T--G----T--C----T--A----AAT----G-----TA-C--------TT-G-T-C-TC--A-TA-C----------T-A-A------G-A---A---AA--T-ACAT
gi|10901 : TGACCCT-A---G-C-G-A-TC-C-TC-CT------C----G----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AC-C--------CT-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10902 : TGACCCC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----C-A-------T--A----T--A----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-T-AA-GA-AA-C-T-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10903 : TGACCCC-A---A-G-G---CC-C-TC-CA------C----A----T-AA------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-CAAAC----TT-G-T-C-TC-AA-TA-C-AA-AG-AA-T-A-A------G-A---A---AA--T-ATA
gi|10904 : TGACCCT-A---T-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----C-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-C-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------ATA---A---AA--T-ACAT
gi|10905 : TGACCCTTA---A-GCA-G-TT-C-TC-CT------C----A----T-A-------T--T----T--G----T--C----AAT----G-----AC-G--------CT-G-T-C-TC-AA-CA-A-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10906 : TGACTTC-A---A-A-G-G-CC-C-TC-CA------C----G----T-A-------T--G----T--G----T--CAATGAAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-
gi|10907 : TGACCCC-T---T-G-G-G-CT-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-
gi|10908 : TGACCCC-A-------G-G-CC-C-TT-CC------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--CAATGAAT----G-----AA-C--------TTGG-T-CTTC-AA-CA-C-AA-AG-AATT-A-A------G-A---A---AA--T-
gi|10909 : TGACCCC-A---A-A-G-G-TC-T-TT-CA------C----A----C-A-------T--G----T--G----A--C----AAG----G-----AA-T--------GT-G-T-T-TT-AA-CA-T-AA-GG-AA-C-A-A------A-A---T---TA--T-ATAT
gi|10910 : TGACCCT-A---G-C-G-G-TC-T-TC-CT------C----A----T-G-------TT-A----T--G----G--C----AAA----G-----AC-C--------TT-G-T-C-TC-AT-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10911 : TGACTCC-A---G-G-G-G-TC-C-TG-CA--------------------------T--G----T--A----T--C----ATA----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TA-AA-CA-C-AA-TG-AA-C-A-A------G-G---G---AA--T-GTAT
gi|10913 : GACCCT-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10914 : GACCCC-A---G-G-G-G-CC-C-TC-CA------T----A----T-A-------A--A----T--G----T--C----AAG----C-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-G-A------A-G---A---AA--T-ATAT
gi|10915 : GACCCC-A---G-G-G-T-CA-C-TC-TA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----C-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CT-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-G---A---TA--T-
gi|10916 : GACCCT-A---G-G-G-G-CT-C-TC-CA------C----A----T-A-------TATG----T--G----T--C----CAT----G-----AA-T--------TT-T-T-C-TC-GA-CA-C-AA-GG-AT-C-A-A------G-G---A---AA--T-ATAT
gi|10917 : GACCCC-A---T-G-G-A-CA-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AG-C--------TT-G-T-C-TT-AA------GG-GG-AA-C-A-
gi|10918 : GACCCC-A---A-G-G-GCCC-C-TC-TA------C----A----T-A-------T-------T--GATT-T--C----AATAAACA-----AA-C--------TT-GCT-CGTC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-ATA------A-G---A---AA--T-ATttgatagacaagccaaaaata
gi|10919 : ACCCC-A---G-G-G-G-CT-C-TC-CA------------------A----------G----T--G----C--C----AAT----G-----A--C--------TA-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-AG-AA-C-A-A------G-G---G---AA--T-ATAT
gi|10921 : CTCC-A---A-G-A-A-CC-C-TC-CA------T----A----T-A-------T--G----T--G----G--C----AAT----G-----AA-C--------TTCA-T-T-GC-CA-CA-T-A---G-AA-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATA
gi|10922 : CCT-A---A-G-G-G-CC-C-TC-CA------C----A----T-A----------A----T-------T--C----ACT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-TG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10923 : CCC-A---A-GAG-G-CT-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-GC-AA-CA-C-AA-GT-AT-G-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10924 : CCC-A---A-T-A-G-CC-C-TC-CA------C----A----C-T-------T--G----T--G----T--C----AAT----A-----AG-C--------TT-G-T-C-TT-AA-C-----T-GG-AT-C-A----------A---A---AA--T-ATAT
gi|10925 : CTC-A---T-G-G-G-GC-C-TCGCA------C----A----C-A-------T--G----T--G----T--C----AAG----A-----AA-CG-------TT-G-TTC-TC-CA-TA-C-AA-GG-AA-C-A-A------G-AAGGA---AA--T-A
gi|10927 : -A---A-T-G-G-CC-C-T---A------C----A----T-G-------T--G-------G----T--C----AAT----A-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-C-A-AG-----G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10928 : -G-G-CC-T-TC-CA------C----A----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAA----A-----AA-C-----------G-T-C-TC-AA-TA-T-AA-AA-AT-C-A-A------G-A---C---AC--T-ATAT
gi|10929 : -CC-C-TC-CA------C----A----G-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TA-AA-AA-C-AT-GG-GA-C-T-T------G-G---A---AA--T-ATA
gi|10930 : C-C-TC-CA------C----A----T-A-------T--A----T--G----T--C----AAT----A-----AA-T--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AA-GG-AA-A-T-A------T-A---A---AA--T-
gi|10931 : ----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AG-GG-AT-G-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10932 : ----T-A-------A--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA-CA-C-AG-GG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT
gi|10933 : ----T-A-------T--G----T--G----T--C----AAT----G-----AA-C--------TT-G-T-C-TC-AA------AATTG-AT-C-A-A------G-A---A---AA--T-ATAT