lowQualScore                  :                                                                                                     111111                        
lowQualScore                  :        5   0   0 0     0 1111   00  0  222222 2222222  11 2222  22222 11 0000 11 0000 111 999 11  0 555555  0000  00 11 1 1 1     
lowQualScore                  :        .   .   . .     . ....   ..  .  ...... .......  .. ....  ..... .. .... .. .... ... ... ..  . ......  ....  .. .. . . .     
lowQualScore                  :        5   4   4 4     4 8888   66  4  777777 3333333  11 1111  22222 00 9999 00 9999 111 000 00  4 555555  9999  66 77 8 5 0     
consensus                     :    CGTGAAGC-GTC-G-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA--AA-T-G----AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
Reference ( gi|67364 )        :    CGTGGAGC-GTT-G-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--GA--AA-T-T----AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67397                      :    CGTGCAGC-GAT-G-CAGTT-C----ATA--TC-TT------C-------AT--G----TC-----T--T----T--T----C---A--GA--AA---T----AA----AT--T--T-A-T-TTTT
gi|67365                      :    CATAAAGT-GTT-G-CAGTT-C----ATA--AC-CT------C-------AT--G----TA-----TG-T----T--T----T---A--AA--AA-T-G----AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67375                      :    CGTGGAGT-GCC-G-CGTTT-CTT--ATA--CC-CT------C-------GT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA--AA-T-G----AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67367                      :    CGTGAAAT-GTT-G-CAGTT-CT---GTA--CT-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----T---A--AA--AA-T-G----AA----AT--T--T-A-T-TTTTT
gi|67371                      :    CGTGAAGC-GTT-G-CAGTG-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----TTAT----T---A--AA--AA-TAA----AA----AT--C--C-A-T-TTCTT
gi|67366                      :    CGTGAAGC-GTT-G-CTGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AC--G----TA-----C--T----T--T----C---A--AAAGAG-G-T----AATACTAT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67372                      :    CGTAACGT-GTC-G-CAGTT-C----ATA--CA-CT------C-------AT--G----TA-----C--T----T--C----C---A--AA--AG-T-G----AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67393                      :    CGAGAAGC-GTC-G-CAATT-C----ATA--GC-CT------C-------AT--G----CA-----T--T----T--C----C---A--GA--AA-T-G----GA----AT--T--T-A-G-TTC
gi|67376                      :    CGTGACAT-GTT-G-CAATT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----C--T----T--T----C---A--AG--AC-T-G----AA----AT--T--T-A-T-TCCT
gi|67385                      :    CGTGAAGC-GTT-G-CAGTT-C----ATA--CT-CT------T-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--
gi|67374                      :    CGTGACTC-GCT-G-CTGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----CA-----T--T----T--T----C---A--AA--AA-T-G----AA----AT--T--T-A-C-Ta
gi|67377                      :    CGTGAAGC-GAC-G-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--C----T--T----C---A--AA--AC-T-G----AA----A
gi|67379                      :    CGTGAAGC-TGC-G-CAGTT-C----ATA--CA-TT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A---A--AA-T-G----AA----AT--T--T-A-T-T
gi|67391                      :    CATGAAGT-GTT-G-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AC--------------T--T----T--T----C---A--TA--AA-T-G----AA----AT--T--T-A-T-GCCTT
gi|67403                      :    CGTAGAG---TT-G-CAGTT-C----ATT--CC-TT------C-------AT--G----TG-----T--T----T--T----C---A--TA--AA-T-G----AA----GT--T--A-A-T-TTCTT
gi|67383                      :    CGTCAAGT-GTT-G-TAGTT-C----ATA--TC-AT------C-------AT--C----TA-----T--T----G--T----C---A--AA--AA-T-G----AA----GT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67388                      :    CGTGAAGC-GTC-G-CAGTC-C----ATA--TC-AT------C-------AT--G----CA-----T--T----T--T----C---A--AA--AA-T-G----AA----AA--TAGT-A-T-TT
gi|67396                      :    CGTGAAGC-GTT-G-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----------------------------------AA--AA-T-A----AA----AT--T--T-A-CGTTCT
gi|67387                      :    CATGAATC-ATT-G-CAGTT-C----ATA--CT-CT------G-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---C--TA--AA---T----GA----AT--T--T-A-T-TTTTT
gi|67370                      :    CGTGAAGT-AGT-G-CAGCT-C----ATG--CG-CT------T-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA--AA-T-G----AA----GT--A--T-A-T-TTCTT
gi|67399                      :    CATGAAAC-GTT-G-CAGGT-T----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TAT----T--T----T--T----C---A--AA--AC-T-A----AA----AT--T--T-
gi|67381                      :    CATAAAGC-ATC-G-CCATT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA--------T----T--T----C---A--AA--AC-T-A----AA----AT--C--T-A-T-TTCTT
gi|67389                      :    CATAAAGG-GTC-A-CAGTT-C----ATG--CC-TC------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA--AA-T-G----AA----AT--T--TAA-T-TT
gi|67404                      :    CGTGAATA-GTT-T-CAGTT-C----ATA--TC-CT------C-------AT--G----TATTGTTT--T----T--T----T---A--AA--AA-C-TG---AA----AT--T--T-A-T-TTTTT
gi|67402                      :    CGTGAAGC-ATT-G-TAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----C--T----T--G----C---A--
gi|67401                      :    CGTGAAGC-ATT-G-TAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----C--T----T--G----C---A--
gi|67386                      :    CATGAAGC-ACT-G-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--GTT--TA-----T--T----T--T----T---C--AA--AA-G-T----GA----GT--T--TGA-T-TTCCT
gi|67405                      :    CGTGAAGC-GTT-G-CA---------ATG--CC-CT------C-------AA--G----CA-----T--T----T--A----T---A--AA--AA-T-G----AA----GT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67400                      :    CATGAAGC-GTC-G-CAATT-C----ATA--AC-CT------C-------AT--G----AA-----T--T----T--T----T---G--AA--AA-T-G----AA----ATAATTAT-A-T-TTCTT
gi|67398                      :    CATGAAAC-ATC-C-CAGTT-C----ATG--TC-CTTAAGAAC-------AT--G----TA-----T--T----T-------C---A--AA--AA-T-T----AA----GT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67382                      :    CATGAAAT-ATT-A-CAGTT-T----AGA--TC-CT------C-------GT--G----TA-----T--T----T--T----T---A--AA--AA-T-G----AA----AT--T--T-A-T-TT
gi|67406                      :    CGTAAAGC-GTC-G-CAGTT-C----ATC--TT-CC------C-------AT--G----TG-----T--T----T--T----T---A--AA--AA-T-G----AA----GT--T--G-A-T-GTCTT
gi|67417                      :    CATGAAGA-GTT-G-CAGTT-T----ATA--CC-CT------C-------AT--G----GA-----T--T----C--T----C---A--AT--AA-T-A----TA----AT--T--T-
gi|67408                      :    CGTAAAGG-GTC-G-CAGTG-C----CTG--CT-AT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA--AA-T-G----AA----AC--T--T-ATT-TTCTT
gi|67373                      :    CGTGAGGC-TTT-G-CAGTT-T----ACA--CC-CT------C-------AT--C----TA-----T--T----T--C----C---A--AA--AA-C-G----AT----AT--TA-T-A-T-TT
gi|67395                      :    CATAAAGC-ATT-T-CAGTT-C----ATA--CC-CT------T-------GT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA--GA-T-
gi|67411                      :    CGTGAAGA-GTT-G-CCATT-C----ATA--CC-TT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----T------GA--AA-A-A----GA----GG--T--T-A-T-TTCTgatat
gi|67410                      :    CATAAAGC-ATT-G-CAGTTTC----TTG--CC-TT------T-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---T--GA--AA-A-G----AA----AT--T--T-A-T-TTTT
gi|67413                      :    CGTGAAAT-GTT-G-CAGTT-C----ACC--CC-CC------CCCCCCAAAT--G----TT-----T--T----T--T----C---A--AA--AA-C-G----AA----AT--T--T-A-T-TT
gi|67392                      :    CATGAAGC-AT--G-CAGTT-CTAATATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AC--GA-T-G----AC----AT--T--T-T-T-TTTTT
gi|67415                      :    CGTGAATA-GTT-G-CAGTT-C----ATA--TC-TC------A-------AT--G----TAT----T--T----T--T----C---A--AT--AA-T-G----AA----AT--T--C-A-T-TTTT
gi|67384                      :    CGTGAAGC-AT------G---C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----CG-----T--T----T--T----C---A--AA--AA-T-G----AA----AT--T--C-A-T-TCC
gi|67409                      :    CGTCAAGC-TTC-G-CGGTT-A----ATA--CT-CT------T-------ATATG----TA-----T--T----T--T----C---A--AA--AA-T-G----AA----AT--T--T-CTT-TTCTT
gi|67414                      :    CGTGAAGC-CTC-G-CAGTT-C----AGA--TC-CC------------------------------T--T----T--T----C---A---A--AA-T-TG---AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67407                      :    CGTGAAGC-ATC-A-CAGTT-C----ATA--TC-ATCATGTAC-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AAC-AA-T-G----AC----AT--T--C-A-T-TT
gi|67412                      :    CATGAAGC-ATC-A-TAGG--C----ATG--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----CAAAA--AA--AA-T-G----AA----AT--T--T-
gi|67418                      :    CGTGAAGC-ACA-A-CAGCT-C----AAG--CA-CT------C-------TG--G----TG-----T--T----T--T----C---A--AA--GA-T-G----AA----AT--T--T-A-T-TTC
gi|67425                      :     GTGAAGC-ACT-G-CGGTT-C----ATA--CG-CT------C-------GT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--GA--AA-T-T----AA----AT--T--T-A-T-TT
gi|67423                      :     GTGAGGT-GTC-G-CAGTT-C----ATA--CT-GT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA--AA-T-G----AA----AT--T--C-A-T-TTCTT
gi|67424                      :     GTAAAGC-GTC-G-CAGTT-C----ATG--CC-CT------C-------AT--A----TA--------T----T--T----C---A--AA--AA-T-G----AA----AC--T--T-A-T-TTCTT
gi|67433                      :     GTGAAGC-GTT-G-CAGTT-C----ATA--CT-CC------C-------AT--G----TA--------T----T--T----C---A--AA--AA-T-T----TA----AT--T--T-
gi|67428                      :     GTGAAGC-GTC-A-CAATT-C----ATA--CT-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--C----C---A--CA--AA-T-G----AA----AT--T--C-A-T-TTTT
gi|67429                      :     GTAAAGT-GTT-G-CAGTT-C----ATG--AT-CT------C-------AT--G----CA-----C--T----T--T----C---A--AA--AA-T-G----AA----AT--T--T-A-T-TTTT
gi|67426                      :     GTAAAGC-ATT-G-TAGTT-C----ATG--TC-CT------C-------AT--G----TG-----T--T----T--T----C---A---A--AA-T-G----AA----AT--T--TTA-T-TTCTT
gi|67431                      :     GTGAAGCTATTCA-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----AA-----T--T----T--T----C---A--AA--AA-T-TTA--AA----AT--T--T-A-T-T
gi|67436                      :     GTGACGT-GAT-G-CAGGT-T----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA--------T----T--G----C---A--AA--AA-T-A----AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67439                      :     GTGAAGC-TTT-G-CAGTT-C----ATA--CC-CT------CTG-----AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--
gi|67437                      :     GTGAGGC-GTT-G-TAGTT-C----AAA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AG--AG-T-A----AA----AA--T--T-C-T-T
gi|67427                      :     GTGAAGT-ATT-G-CAGTT-C----ATA--CT-CC------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A---A--AA-C------------GT--T--T-A-C-TTC
gi|67446                      :     GTAAAGC-CTC-G-CAGTT-C----ATA--CCTCT------CA------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA--AA--------AA----AT--T--
gi|67430                      :     GTGAAAC-ATC-G-CAGTT-C----ACA--CT-CT------C-------AT--T----TA-----C--T----T--TAAAAA---A--AA--AA-T-G----AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67442                      :     GTGAAAC-GTT-A-CAGTT-C----ATA--TC-TT------C-------AT--G----TA-----T--T----TA-T----C---AATAA--AA-T-G----AA----A
gi|67440                      :     GTGAAAC-CCT-C-CAGTT-T----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--C----C---A--AA--AA---T----AA----A
gi|67441                      :     GTGAAGC-GTC-A-CAGTT-C----ATA--CC-AT------C-------AT--G----CA--------T----T--T----G---A--AA--AA-T-G----AA----AT--A--T---T-TTCT
gi|67447                      :     GTGAAGC-GTC-A-CAGTG-C----ATG--AT-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----T---A--AA--AA-G-G----CA----AT--T--T-A-T-TT
gi|67445                      :     GTAAAAC-ATC-A-CAGTT-C----ATG--CA-TT------G-------AT--A----TA-----T--T----T--T----TA--A--AA--AA-T-G----AA----AT--T--T-A-T-TTC
gi|67449                      :      TGAAGC-TTT-G-CAGTT-C----ATA--CC-CG------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA--AA-C-G----AA----GT--T--T-A-T-ATCTT
gi|67453                      :      TGAAGC-GTT-G-CATTT-C----AAA--TT-CT------T-------GT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA--AA-T-A----AA----GT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67450                      :      TGAAAC-ATT-G-CTATC-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----CA-----T--T----T--T----C---A--AT--AA-T-G----AA----AT--T--C-A-T-TTCTT
gi|67456                      :      TGAATT-GTT-G-CAGAT-C----ATA--CC-CC------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A---A--AA-T-G----AA----AT--T--C-A-T-
gi|67455                      :      TGAAGT-GTT-AACAGTT-C----ATA--TC-TG------C-------AT--G----TA-----T--T----T-------C---A--AA--AA-T-G----AA----AT--T--T-A-T-TTTTT
gi|67459                      :       GAAGC-ATT-G-CAGTT-C----CTA--CC-AT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA--GG-T-A----AA----AT--T--G-A-C-TT
gi|67460                      :       GAAGC-CAT-G-TAATT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----C--T----T--T----C---A--AT--AA-T-G----AA----GT--T--C-A-T-CTCTT
gi|67461                      :       GAAGC-ATC-C-TAGTT-C----ATA--CC--T------C-------ATATG----TA-----T--T----T--T----C---A--AA--AA-T-G----AA----AT--T--T-
gi|67462                      :       GAAAC-ATC-G-CAGTT------ATAAGCC-CT------C-------A---G----TA-----T--T----T--T----C---C--AA--AA-T-G----AA----AT--T--G-A-T-TTTTT
gi|67444                      :        GAGC--TG-G-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--T----AA-----T--TTTCAT--T----C---A--AA--AA-T-G----AA----AT--T--T-A-TGTTCT
gi|67464                      :    gtgacAGC-GTT-G-CTGTT-C----ATA--AA-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA--AA-T-A----AA----AT--T--T-A-T-TTGTT
gi|67470                      :        aAGC-CTT-G-CAGTT-C----ATT--CT-AT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA--AA-T-A----AA----AT--T--T-A-T-TTTTT
gi|67451                      :         AGC-GTC-A-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--ACCC-TA-----TAGT----T--T----C---A--AA--AA-T-G----AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67465                      :      taaAGC-GCG-G-CTGTT-T----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA--AG-T-A----AA----GT--T--T-A-T-TTTT
gi|67469                      :        aAGC-ATT-G-CAGTT-C----ATA--CA-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--A----C---A--AA--AA-A-G----AA----AT--T--C-T-T-TTCTT
gi|67454                      :         AGC-ACT-G-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--A----TA-----T--T----T--T----C---A--AA--A
gi|67468                      :      taaAGT-ATT-G-CCATT-C----ACG--CC-CT------C-------AT--G----TA-----G--T----T--C----C---A--AA--AA-T-G----AA----CT--T--T-A-T-TTCT
gi|67466                      :         AGC-ATT-G-TGGTT-C----ATA--CC-TTT-----C-------A---G----TA-----T--A----C--T----C---A--AA--AA-T-G----AA----AT--T--T-A-T-TTTT
gi|67394                      :         aGC-GTT-G-CAGTT-C----ATA--CT-CT--------------AT--G----TA-----G--T----T--T----C---A---A--AA-T-TG---AA----AT--T--T-A-T-TT
gi|67452                      :   cgtcaacGC-ATT-G-CAATT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C-----------A-T-TTAGGAA----AT--T--C-A-T-TTCTT
gi|67435                      :      tgacGC-GTT-G-CAGTT-C----ATA--CC-GT------C-------AT--A----TA-----T--T----T--T----T---A---A--AA-T-G----AA----AT--T--
gi|67434                      :     gttagGC-GTT-G-CAGTT-C----ATA--CC-GT------C-------AT--A----TA-----T--T----T--T----T---A---A--AA-T-G----AA----AT--T--
gi|67473                      :     gttagGC-GTC-A-CAGCT-C----ATA--CC-AT------T-------AT--A----TA-----T--T----T--T----C---A--AA--AA-T-G----AA----AT--T--C-ATT-TTCTT
gi|67438                      :          GC-CTT-G-CAGTT-C----ATG--CC-GA------C-------AT--G----TA--------T----T--T----C---G--AA--AA-T-G----AT----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67390                      :       gtaat-GTT-G-CACTT-C----ATA--CC-CC------C-------AT--G----CA-----T--T----T--T----C---A--AA--AA-C-G----AA----AG--T--T-A-T-TTCT
gi|67475                      :         cgtgaTT-G-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----C--T----C---A--AA--AC-C-G----AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67476                      :              TT-G-CAGTT-C----ATA--CA-CA------C-------AT--GACTGTA-----T--T----T--T----C---A--GA--AA-T-G----AA----AT--T--C-A-T-TTCTT
gi|67432                      :               T-G-TAGTC-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----CA-----T--T----T--T----C---A--AA--AA-T-A----GA----AT--T--T-A-T-TTTT
gi|67480                      : gtgatgcattgtaca-G-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--T----TA-----T--T----C--T----C---A--AA--AA-T-A----AA----GT--T--T-A-T-T
gi|67380                      :                -G-CAATT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----C--T----C---A--AA--AA-A-G----AA----AT--T--TAA-T-TTCT
gi|67443                      :    catgaagattgg-G-CAGTT-T----ACT--CC-CT------C-------AT--G----TAC----T--T----T--T----C----------AA-T-G----AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67416                      :          gtaaatcatgAGTT-G----ATG--AC-AT------C-------GT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA--AAAT-G----AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67481                      :         catgaagaatcaaTT-C----ATG--CC-CT------C-------AT--A----TA-----T--T----T--T----C---A--AA--AA-T-G----AG----AT--T--T-A-T-TTC





Alignments
lowQualScore                  :                     00 0   00 2 0     0 1111   00  0  222222 2222222  11 2222  22222 11 0000 11 0000 111 00  0 0 11 0 00  0000  00 11 1 1 1     
lowQualScore                  :                     .. .   .. . .     . ....   ..  .  ...... .......  .. ....  ..... .. .... .. .... ... ..  . . .. . ..  ....  .. .. . . .     
lowQualScore                  :                     66 4   66 1 4     4 8888   66  4  777777 3333333  11 1111  66666 00 9999 00 9999 111 66  4 4 00 4 66  9999  66 66 4 4 0     
consensus                     :                CGTGA--A-GCG--TCG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
Reference ( family-235 )      :                CGTGA--A-GCG--TCG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67364                      :                CGTGG--A-GCG--TTG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--GA-A-A--T-T--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67365                      :                CATAA--A-GTG--TTG-CAGTT-C----ATA--AC-CT------C-------AT--G----TA-----TG-T----T--T----T---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67366                      :                CGTGA--A-GCG--TTG-CTGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AC--G----TA-----C--T----T--T----C---A--AA-A-G--A-GGTAATACTAT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67367                      :                CGTGA--A-ATG--TTG-CAGTT-CT---GTA--CT-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----T---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTTTT
gi|67370                      :                CGTGA--A-GTA--GTG-CAGCT-C----ATG--CG-CT------T-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----GT--A--T-A-T-TTCTT
gi|67371                      :                CGTGA--A-GCG--TTG-CAGTG-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----TTAT----T---A--AA-A-A--TAA--AA----AT--C--C-A-T-TTCTT
gi|67372                      :                CGTAA--C-GTG--TCG-CAGTT-C----ATA--CA-CT------C-------AT--G----TA-----C--T----T--C----C---A--AA-A-G--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67373                      :                CGTGA--G-GCT--TTG-CAGTT-T----ACA--CC-CT------C-------AT--C----TA-----T--T----T--C----C---A--AA-A-A--C-G--AT----AT--TA-T-A-T-TT
gi|67374                      :                CGTGA--C-TCG--CTG-CTGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----CA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-C-T
gi|67375                      :                CGTGG--A-GTG--CCG-CGTTT-CTT--ATA--CC-CT------C-------GT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67376                      :                CGTGA--C-ATG--TTG-CAATT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----C--T----T--T----C---A--AG-A-C--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TCCT
gi|67377                      :                CGTGA--A-GCG--ACG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--C----T--T----C---A--AA-A-C--T-G--AA----A
gi|67379                      :                CGTGA--A-GCT--GCG-CAGTT-C----ATA--CA-TT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C------AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-T
gi|67380                      :                                G-CAATT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----C--T----C---A--AA-A-A--A-G--AA----AT--T--TAA-T-TTCT
gi|67381                      :    catgaagattggCATAA--A-GCA--TCG-CCATT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA--------T----T--T----C---A--AA-A-C--T-A--AA----AT--C--T-A-T-TTCTT
gi|67382                      :                CATGA--A-ATA--TTA-CAGTT-T----AGA--TC-CT------C-------GT--G----TA-----T--T----T--T----T---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TT
gi|67383                      :                CGTCA--A-GTG--TTG-TAGTT-C----ATA--TC-AT------C-------AT--C----TA-----T--T----G--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----GT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67384                      :                CGTGA--A-GCA--T-----G---C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----CG-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--C-A-T-TCC
gi|67385                      :                CGTGA--A-GCG--TTG-CAGTT-C----ATA--CT-CT------T-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--A
gi|67386                      :                CATGA--A-GCA--CTG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--GTT--TAT----T--T----T--T----C---A--AA-A-G--T-G--AG----TT--T--G-A-T-TTCCT
gi|67387                      :                CATGA--A-TCA--TTG-CAGTT-C----ATA--CT-CT------G-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---C--TA-A-A--T-G---A----AT--T--T-A-T-TTTTT
gi|67388                      :                CGTGA--A-GCG--TCG-CAGTC-C----ATA--TC-AT------C-------AT--G----CA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AA--TAGT-A-T-TT
gi|67389                      :                CATAA--A-GGG--TCA-CAGTT-C----ATG--CC-TC------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--TAA-T-TT
gi|67390                      :                CGTGA------G--TTG-CACTT-C----ATA--CC-CC------C-------AT--G----CA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--C-G--AA----AG--T--T-A-T-TTCT
gi|67391                      :                CATGA--A-GTG--TTG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AC--------------T--T----T--T----C---A--TA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-GCCTT
gi|67392                      :                CATGA--A-GCA--T-G-CAGTT-CTAATATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AC-G-A--T-G--AC----AT--T--T-T-T-TTTTT
gi|67393                      :                CGAGA--A-GCG--TCG-CAATT-C----ATA--GC-CT------C-------AT--G----CA-----T--T----T--C----C---A--GA-A-A--T-G--GA----AT--T--T-A-G-TTC
gi|67394                      :                CGTCA--ACGCG--TTG-CAGTT-C----ATA--CT-CT--------------AT--G----TA-----G--T----T--T----C---A--AA-A-T--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TT
gi|67395                      :                CATAA--A-GCA--TTT-CAGTT-C----ATA--CC-CT------T-------GT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-G-A--T-G--AT----AT--
gi|67396                      :                CGTGA--A-GCG--TTG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----------------------------------AA-A-A--T-A--AA----AT--T--T-A-CGTTCT
gi|67397                      :                CGTGC--A-GCG--ATG-CAGTT-C----ATA--TC-TT------C-------AT--G----TC-----T--T----T--T----C---A--GA-A-A--T----AA----AT--T--T-A-T-TTTT
gi|67398                      :                CATGA--A-ACA--TCC-CAGTT-C----ATG--TC-CTTAAGAAC-------AT--G----TA-----T--T----T-------C---A--AA-A-A--T-T--AA----GT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67399                      :                CATGA--A-ACG--TTG-CAGGT-T----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TAT----T--T----T--T----C---A--AA-A-C--T-A--AA----AT--T--T-
gi|67400                      :                CATGA--A-GCG--TCG-CAATT-C----ATA--AC-CT------C-------AT--G----AA-----T--T----T--T----T---G--AA-A-A--T-G--AA----ATAATTAT-A-T-TTCTT
gi|67401                      :                CGTGA--A-GCA--TTG-TAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----C--T----T--G----C---A--
gi|67402                      :                CGTGA--A-GCA--TTG-TAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----C--T----T--G----C---A--
gi|67403                      :                     --A-GAG--TTG-CAGTT-C----ATT--CC-TT------C-------AT--G----TG-----T--T----T--T----C---A--TA-A-A--T-G--AA----GT--T--A-A-T-TTCTT
gi|67404                      :             cgtCGTGA--A-TAG--TTT-CAGTT-C----ATA--TC-CT------C-------AT--G----TATTGTTT--T----T--T----T---A--AA-A-AC-T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTTTT
gi|67405                      :                CGTGA--A-GCG--TTG-CA---------ATG--CC-CT------C-------AA--G----CA-----T--T----T--A----T---A--AA-A-A--T-G--AA----GT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67406                      :                CGTAA--A-GCG--TCG-CAGTT-C----ATC--TT-CC------C-------AT--G----TG-----T--T----T--T----T---A--AA-A-A--T-G--AA----GT--T--G-A-T-GTCTT
gi|67407                      :                CGTGA--A-GCA--TCA-CAGTT-C----ATA--TC-ATCATGTAC-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AACA-A--T-G--AC----AT--T--C-A-T-TT
gi|67408                      :                CGTAA--A-GGG--TCG-CAGTG-C----CTG--CT-AT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AC--T--T-ATT-TTCTT
gi|67409                      :                CGTCA--A-GCT--TCG-CGGTT-A----ATA--CT-CT------T-------ATATG----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-CTT-TTCTT
gi|67410                      :                CATAA--A-GCA--TTG-CAGTTTC----TTG--CC-TT------T-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---T--GA-A-A--A-G--AA----AT--T--T-A-T-TTTT
gi|67411                      :                CGTGA--A-GAG--TTG-CCATT-C----ATA--CC-TT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----T---G--AA-A-A--A-G--AG----G---T--T-A-T-TTCT
gi|67412                      :                CATGA--A-GCA--TCA-TAGG--C----ATG--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----CAAAA--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-
gi|67413                      :                CGTGA--A-ATG--TTG-CAGTT-C----ACC--CC-CC------CCCCCCAAAT--G----TT-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--C-G--AA----AT--T--T-A-T-TT
gi|67414                      :                CGTGA--A-GCC--TCG-CAGTT-C----AGA--TC-CC------------------------------T--T----T--T----C---A--AA-A-T--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67415                      :                CGTGA--A-TAG--TTG-CAGTT-C----ATA--TC-TC------A-------AT--G----TAT----T--T----T--T----C---A--AT-A-A--T-G--AA----AT--T--C-A-T-TTTT
gi|67416                      :                CATGA--A-GAA--TCA-AAGTT-G----ATG--AC-AT------C-------GT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-AAA--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67417                      :                CATGA--A-GAG--TTG-CAGTT-T----ATA--CC-CT------C-------AT--G----GA-----T--T----C--T----C---A--AT-A-A--T-A--TA----AT--T--T-
gi|67418                      :                CGTGA--A-GCA--CAA-CAGCT-C----AAG--CA-CT------C-------TG--G----TG-----T--T----T--T----C---A--AA-G-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTC
gi|67423                      :                 GTGA--G-GTG--TCG-CAGTT-C----ATA--CT-GT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--C-A-T-TTCTT
gi|67424                      :                 GTAA--A-GCG--TCG-CAGTT-C----ATG--CC-CT------C-------AT--A----TA--------T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AC--T--T-A-T-TTCTT
gi|67425                      :                 GTGA--A-GCA--CTG-CGGTT-C----ATA--CG-CT------C-------GT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--GA-A-A--T-T--AA----AT--T--T-A-T-TT
gi|67426                      :                 GTAA--A-GCA--TTG-TAGTT-C----ATG--TC-CT------C-------AT--G----TG-----T--T----T--T----C---A--AA-A----T-G--AA----AT--T--TTA-T-TTCTT
gi|67427                      :                 GTGA--A-GTA--TTG-CAGTT-C----ATA--CT-CC------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C------AA-A-A--C-G---------T--T--T-A-C-TTC
gi|67428                      :                 GTGA--A-GCG--TCA-CAATT-C----ATA--CT-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--C----C---A--CA-A-A--T-G--AA----AT--T--C-A-T-TTTT
gi|67429                      :                 GTAA--A-GTG--TTG-CAGTT-C----ATG--AT-CT------C-------AT--G----CA-----C--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTTT
gi|67430                      :                 GTGA--A-ACA--TCG-CAGTT-C----ACA--CT-CT------C-------AT--T----TA-----C--T----T--TAAAAA---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67431                      :                 GTGA--A-GCTATTCA-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----AA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-ATTT-A--AA----AT--T--T-A-T-T
gi|67432                      :                                G-TAGTC-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----CA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-A--GA----AT--T--T-A-T-TTTT
gi|67433                      : gtgatgcattgtacatGTGA--A-GCG--TTG-CAGTT-C----ATA--CT-CC------C-------AT--G----TA--------T----T--T----C---A--AA-A-A--T-T--TA----AT--T--T-
gi|67434                      :                 GTTA--G-GCG--TTG-CAGTT-C----ATA--CC-GT------C-------AT--A----TA-----T--T----T--T----T------AA-A-A--T-G--AA----AT--T--
gi|67435                      :                 GTTA--G-GCG--TTG-CAGTT-C----ATA--CC-GT------C-------AT--A----TA-----T--T----T--T----T------AA-A-A--T-G--AA----AT--T--
gi|67436                      :                 GTGA--C-GTG--ATG-CAGGT-T----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA--------T----T--G----C---A--AA-A-A--T-A--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67437                      :                 GTGA--G-GCG--TTG-TAGTT-C----AAA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AG-A-G--T-A--AA----AA--T--T-C-T-T
gi|67438                      :                 GTAA--T-GCC--TTG-CAGTT-C----ATG--CC-GA------C-------AT--G----TA--------T----T--T----C---G--AA-A-A--T-G--AT----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67439                      :                 GTGA--A-GCT--TTG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------CTG-----AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--
gi|67440                      :                 GTGA--A-ACC--CTC-CAGTT-T----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--C----C---A--AA-A-A--T-A--AA----
gi|67441                      :                 GTGA--A-GCG--TCA-CAGTT-C----ATA--CC-AT------C-------AT--G----CA--------T----T--T----G---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--A--T---T-TTCT
gi|67442                      :                 GTGA--A-ACG--TTA-CAGTT-C----ATA--TC-TT------C-------AT--G----TA-----T--T----TA-T----C---AATAA-A-A--T-G--AA----A
gi|67443                      :                 GTAA--A-TCA--TGG-CAGTT-T----ACT--CC-CT------C-------AT--G----TAC----T--T----T--T----C---------A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67444                      :                 GTGACGA-GC---TGG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--T----AA-----T--TTTCAT--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-TGTTCT
gi|67445                      :                 GTAA--A-ACA--TCA-CAGTT-C----ATG--CA-TT------G-------AT--A----TA-----T--T----T--T----TA--A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTC
gi|67446                      :                 GTAA--A-GCC--TCG-CAGTT-C----ATA--CCTCT------CA------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A-------AA----AT--T--
gi|67447                      :                 GTGA--A-GCG--TCA-CAGTG-C----ATG--AT-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----T---A--AA-A-A--G-G--CA----AT--T--T-A-T-TT
gi|67449                      :                  TGA--A-GCT--TTG-CAGTT-C----ATA--CC-CG------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--C-G--AA----GT--T--T-A-T-ATCTT
gi|67450                      :                  TGA--A-ACA--TTG-CTATC-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----CA-----T--T----T--T----C---A--AT-A-A--T-G--AA----AT--T--C-A-T-TTCTT
gi|67451                      :                  TAA--A-GCG--TCA-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--ACCC-TA-----TAGT----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67452                      :                  TGA--C-GCA--TTG-CAATT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--TT-T-A--G-G--AA----AT--T--C-A-T-TTCTT
gi|67453                      :                  TGA--A-GCG--TTG-CATTT-C----AAA--TT-CT------T-------GT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-A--AA----GT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67454                      :                  TAA--A-GCA--CTG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--A----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-
gi|67455                      :                  TGA--A-GTG--TTAACAGTT-C----ATA--TC-TG------C-------AT--G----TA-----T--T----T-------C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTTTT
gi|67456                      :                  TGA--A-TTG--TTG-CAGAT-C----ATA--CC-CC------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C------AA-A-A--T-G--AA----AT--T--C-A-T-
gi|67459                      :                   GA--A-GCA--TTG-CAGTT-C----CTA--CC-AT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-G-G--T-A--AA----AT--T--G-A-C-TT
gi|67460                      :                   GA--A-GCC--ATG-TAATT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----C--T----T--T----C---A--AT-A-A--T-G--AA----GT--T--C-A-T-CTCTT
gi|67461                      :                   GA--A-GCA--TCC-TAGTT-C----ATA--CC--T------C-------ATATG----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-
gi|67462                      :                   GA--A-ACA--TCG-CAGTT------ATAAGCC-CT------C-------A---G----TA-----T--T----T--T----C---C--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--G-A-T-TTTTT
gi|67464                      :                    A--A-GCG--TTG-CTGTT-C----ATA--AA-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-A--AA----AT--T--T-A-T-TTGTT
gi|67465                      :                    A--A-GCG--CGG-CTGTT-T----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-G--T-A--AA----GT--T--T-A-T-TTTT
gi|67466                      :                    A--A-GCA--TTG-TGGTT-C----ATA--CC-TTT-----C-------A---G----TA-----T--A----C--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTTT
gi|67468                      :                     --A-GTA--TTG-CCATT-C----ACG--CC-CT------C-------AT--G----TA-----G--T----T--C----C---A--AA-A-A--T-G--AA----CT--T--T-A-T-TTCT
gi|67469                      :                     --A-GCA--TTG-CAGTT-C----ATA--CA-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--A----C---A--AA-A-A--A-G--AA----AT--T--C-T-T-TTCTT
gi|67470                      :                     --A-GCC--TTG-CAGTT-C----ATT--CT-AT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-A--AA----AT--T--T-A-T-TTTTT
gi|67473                      :                        -GCG--TCA-CAGCT-C----ATA--CC-AT------T-------AT--A----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--C-ATT-TTCTT
gi|67475                      :                            --TTG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----C--T----C---A--AA-A-C--C-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67476                      :                            --TTG-CAGTT-C----ATA--CA-CA------C-------AT--GACTGTA-----T--T----T--T----C---A--GA-A-A--T-G--AA----AT--T--C-A-T-TTCTT
gi|67480                      :                                G-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--T----TA-----T--T----C--T----C---A--AA-A-A--T-A--AA----GT--T--T-A-T-T
gi|67481                      :                                     TT-C----ATG--CC-CT------C-------AT--A----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AG----AT--T--T-A-T-TTC





Alignments
lowQualScore                  :                     00 0   00 2 0     0 1111   00  0  222222 2222222  11 2222  22222 11 0000 11 0000 111 00  0 0 11 0 00  0000  00 11 1 1 1     
lowQualScore                  :                     .. .   .. . .     . ....   ..  .  ...... .......  .. ....  ..... .. .... .. .... ... ..  . . .. . ..  ....  .. .. . . .     
lowQualScore                  :                     66 4   66 1 4     4 8888   66  4  777777 3333333  11 1111  66666 00 9999 00 9999 111 66  4 4 00 4 66  9999  66 66 4 4 0     
consensus                     :                CGTGA--A-GCG--TCG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
Reference ( family-235 )      :                CGTGA--A-GCG--TCG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67364                      :                CGTGG--A-GCG--TTG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--GA-A-A--T-T--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67365                      :                CATAA--A-GTG--TTG-CAGTT-C----ATA--AC-CT------C-------AT--G----TA-----TG-T----T--T----T---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67366                      :                CGTGA--A-GCG--TTG-CTGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AC--G----TA-----C--T----T--T----C---A--AA-A-G--A-GGTAATACTAT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67367                      :                CGTGA--A-ATG--TTG-CAGTT-CT---GTA--CT-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----T---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTTTT
gi|67370                      :                CGTGA--A-GTA--GTG-CAGCT-C----ATG--CG-CT------T-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----GT--A--T-A-T-TTCTT
gi|67371                      :                CGTGA--A-GCG--TTG-CAGTG-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----TTAT----T---A--AA-A-A--TAA--AA----AT--C--C-A-T-TTCTT
gi|67372                      :                CGTAA--C-GTG--TCG-CAGTT-C----ATA--CA-CT------C-------AT--G----TA-----C--T----T--C----C---A--AA-A-G--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67373                      :                CGTGA--G-GCT--TTG-CAGTT-T----ACA--CC-CT------C-------AT--C----TA-----T--T----T--C----C---A--AA-A-A--C-G--AT----AT--TA-T-A-T-TT
gi|67374                      :                CGTGA--C-TCG--CTG-CTGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----CA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-C-T
gi|67375                      :                CGTGG--A-GTG--CCG-CGTTT-CTT--ATA--CC-CT------C-------GT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67376                      :                CGTGA--C-ATG--TTG-CAATT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----C--T----T--T----C---A--AG-A-C--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TCCT
gi|67377                      :                CGTGA--A-GCG--ACG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--C----T--T----C---A--AA-A-C--T-G--AA----A
gi|67379                      :                CGTGA--A-GCT--GCG-CAGTT-C----ATA--CA-TT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C------AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-T
gi|67380                      :                                G-CAATT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----C--T----C---A--AA-A-A--A-G--AA----AT--T--TAA-T-TTCT
gi|67381                      :    catgaagattggCATAA--A-GCA--TCG-CCATT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA--------T----T--T----C---A--AA-A-C--T-A--AA----AT--C--T-A-T-TTCTT
gi|67382                      :                CATGA--A-ATA--TTA-CAGTT-T----AGA--TC-CT------C-------GT--G----TA-----T--T----T--T----T---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TT
gi|67383                      :                CGTCA--A-GTG--TTG-TAGTT-C----ATA--TC-AT------C-------AT--C----TA-----T--T----G--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----GT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67384                      :                CGTGA--A-GCA--T-----G---C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----CG-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--C-A-T-TCC
gi|67385                      :                CGTGA--A-GCG--TTG-CAGTT-C----ATA--CT-CT------T-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--A
gi|67386                      :                CATGA--A-GCA--CTG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--GTT--TAT----T--T----T--T----C---A--AA-A-G--T-G--AG----TT--T--G-A-T-TTCCT
gi|67387                      :                CATGA--A-TCA--TTG-CAGTT-C----ATA--CT-CT------G-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---C--TA-A-A--T-G---A----AT--T--T-A-T-TTTTT
gi|67388                      :                CGTGA--A-GCG--TCG-CAGTC-C----ATA--TC-AT------C-------AT--G----CA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AA--TAGT-A-T-TT
gi|67389                      :                CATAA--A-GGG--TCA-CAGTT-C----ATG--CC-TC------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--TAA-T-TT
gi|67390                      :                CGTGA------G--TTG-CACTT-C----ATA--CC-CC------C-------AT--G----CA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--C-G--AA----AG--T--T-A-T-TTCT
gi|67391                      :                CATGA--A-GTG--TTG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AC--------------T--T----T--T----C---A--TA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-GCCTT
gi|67392                      :                CATGA--A-GCA--T-G-CAGTT-CTAATATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AC-G-A--T-G--AC----AT--T--T-T-T-TTTTT
gi|67393                      :                CGAGA--A-GCG--TCG-CAATT-C----ATA--GC-CT------C-------AT--G----CA-----T--T----T--C----C---A--GA-A-A--T-G--GA----AT--T--T-A-G-TTC
gi|67394                      :                CGTCA--ACGCG--TTG-CAGTT-C----ATA--CT-CT--------------AT--G----TA-----G--T----T--T----C---A--AA-A-T--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TT
gi|67395                      :                CATAA--A-GCA--TTT-CAGTT-C----ATA--CC-CT------T-------GT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-G-A--T-G--AT----AT--
gi|67396                      :                CGTGA--A-GCG--TTG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----------------------------------AA-A-A--T-A--AA----AT--T--T-A-CGTTCT
gi|67397                      :                CGTGC--A-GCG--ATG-CAGTT-C----ATA--TC-TT------C-------AT--G----TC-----T--T----T--T----C---A--GA-A-A--T----AA----AT--T--T-A-T-TTTT
gi|67398                      :                CATGA--A-ACA--TCC-CAGTT-C----ATG--TC-CTTAAGAAC-------AT--G----TA-----T--T----T-------C---A--AA-A-A--T-T--AA----GT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67399                      :                CATGA--A-ACG--TTG-CAGGT-T----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TAT----T--T----T--T----C---A--AA-A-C--T-A--AA----AT--T--T-
gi|67400                      :                CATGA--A-GCG--TCG-CAATT-C----ATA--AC-CT------C-------AT--G----AA-----T--T----T--T----T---G--AA-A-A--T-G--AA----ATAATTAT-A-T-TTCTT
gi|67401                      :                CGTGA--A-GCA--TTG-TAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----C--T----T--G----C---A--
gi|67402                      :                CGTGA--A-GCA--TTG-TAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----C--T----T--G----C---A--
gi|67403                      :                     --A-GAG--TTG-CAGTT-C----ATT--CC-TT------C-------AT--G----TG-----T--T----T--T----C---A--TA-A-A--T-G--AA----GT--T--A-A-T-TTCTT
gi|67404                      :             cgtCGTGA--A-TAG--TTT-CAGTT-C----ATA--TC-CT------C-------AT--G----TATTGTTT--T----T--T----T---A--AA-A-AC-T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTTTT
gi|67405                      :                CGTGA--A-GCG--TTG-CA---------ATG--CC-CT------C-------AA--G----CA-----T--T----T--A----T---A--AA-A-A--T-G--AA----GT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67406                      :                CGTAA--A-GCG--TCG-CAGTT-C----ATC--TT-CC------C-------AT--G----TG-----T--T----T--T----T---A--AA-A-A--T-G--AA----GT--T--G-A-T-GTCTT
gi|67407                      :                CGTGA--A-GCA--TCA-CAGTT-C----ATA--TC-ATCATGTAC-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AACA-A--T-G--AC----AT--T--C-A-T-TT
gi|67408                      :                CGTAA--A-GGG--TCG-CAGTG-C----CTG--CT-AT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AC--T--T-ATT-TTCTT
gi|67409                      :                CGTCA--A-GCT--TCG-CGGTT-A----ATA--CT-CT------T-------ATATG----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-CTT-TTCTT
gi|67410                      :                CATAA--A-GCA--TTG-CAGTTTC----TTG--CC-TT------T-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---T--GA-A-A--A-G--AA----AT--T--T-A-T-TTTT
gi|67411                      :                CGTGA--A-GAG--TTG-CCATT-C----ATA--CC-TT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----T---G--AA-A-A--A-G--AG----G---T--T-A-T-TTCT
gi|67412                      :                CATGA--A-GCA--TCA-TAGG--C----ATG--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----CAAAA--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-
gi|67413                      :                CGTGA--A-ATG--TTG-CAGTT-C----ACC--CC-CC------CCCCCCAAAT--G----TT-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--C-G--AA----AT--T--T-A-T-TT
gi|67414                      :                CGTGA--A-GCC--TCG-CAGTT-C----AGA--TC-CC------------------------------T--T----T--T----C---A--AA-A-T--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67415                      :                CGTGA--A-TAG--TTG-CAGTT-C----ATA--TC-TC------A-------AT--G----TAT----T--T----T--T----C---A--AT-A-A--T-G--AA----AT--T--C-A-T-TTTT
gi|67416                      :                CATGA--A-GAA--TCA-AAGTT-G----ATG--AC-AT------C-------GT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-AAA--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67417                      :                CATGA--A-GAG--TTG-CAGTT-T----ATA--CC-CT------C-------AT--G----GA-----T--T----C--T----C---A--AT-A-A--T-A--TA----AT--T--T-
gi|67418                      :                CGTGA--A-GCA--CAA-CAGCT-C----AAG--CA-CT------C-------TG--G----TG-----T--T----T--T----C---A--AA-G-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTC
gi|67423                      :                 GTGA--G-GTG--TCG-CAGTT-C----ATA--CT-GT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--C-A-T-TTCTT
gi|67424                      :                 GTAA--A-GCG--TCG-CAGTT-C----ATG--CC-CT------C-------AT--A----TA--------T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AC--T--T-A-T-TTCTT
gi|67425                      :                 GTGA--A-GCA--CTG-CGGTT-C----ATA--CG-CT------C-------GT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--GA-A-A--T-T--AA----AT--T--T-A-T-TT
gi|67426                      :                 GTAA--A-GCA--TTG-TAGTT-C----ATG--TC-CT------C-------AT--G----TG-----T--T----T--T----C---A--AA-A----T-G--AA----AT--T--TTA-T-TTCTT
gi|67427                      :                 GTGA--A-GTA--TTG-CAGTT-C----ATA--CT-CC------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C------AA-A-A--C-G---------T--T--T-A-C-TTC
gi|67428                      :                 GTGA--A-GCG--TCA-CAATT-C----ATA--CT-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--C----C---A--CA-A-A--T-G--AA----AT--T--C-A-T-TTTT
gi|67429                      :                 GTAA--A-GTG--TTG-CAGTT-C----ATG--AT-CT------C-------AT--G----CA-----C--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTTT
gi|67430                      :                 GTGA--A-ACA--TCG-CAGTT-C----ACA--CT-CT------C-------AT--T----TA-----C--T----T--TAAAAA---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67431                      :                 GTGA--A-GCTATTCA-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----AA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-ATTT-A--AA----AT--T--T-A-T-T
gi|67432                      :                                G-TAGTC-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----CA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-A--GA----AT--T--T-A-T-TTTT
gi|67433                      : gtgatgcattgtacatGTGA--A-GCG--TTG-CAGTT-C----ATA--CT-CC------C-------AT--G----TA--------T----T--T----C---A--AA-A-A--T-T--TA----AT--T--T-
gi|67434                      :                 GTTA--G-GCG--TTG-CAGTT-C----ATA--CC-GT------C-------AT--A----TA-----T--T----T--T----T------AA-A-A--T-G--AA----AT--T--
gi|67435                      :                 GTTA--G-GCG--TTG-CAGTT-C----ATA--CC-GT------C-------AT--A----TA-----T--T----T--T----T------AA-A-A--T-G--AA----AT--T--
gi|67436                      :                 GTGA--C-GTG--ATG-CAGGT-T----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA--------T----T--G----C---A--AA-A-A--T-A--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67437                      :                 GTGA--G-GCG--TTG-TAGTT-C----AAA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AG-A-G--T-A--AA----AA--T--T-C-T-T
gi|67438                      :                 GTAA--T-GCC--TTG-CAGTT-C----ATG--CC-GA------C-------AT--G----TA--------T----T--T----C---G--AA-A-A--T-G--AT----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67439                      :                 GTGA--A-GCT--TTG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------CTG-----AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--
gi|67440                      :                 GTGA--A-ACC--CTC-CAGTT-T----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--C----C---A--AA-A-A--T-A--AA----
gi|67441                      :                 GTGA--A-GCG--TCA-CAGTT-C----ATA--CC-AT------C-------AT--G----CA--------T----T--T----G---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--A--T---T-TTCT
gi|67442                      :                 GTGA--A-ACG--TTA-CAGTT-C----ATA--TC-TT------C-------AT--G----TA-----T--T----TA-T----C---AATAA-A-A--T-G--AA----A
gi|67443                      :                 GTAA--A-TCA--TGG-CAGTT-T----ACT--CC-CT------C-------AT--G----TAC----T--T----T--T----C---------A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67444                      :                 GTGACGA-GC---TGG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--T----AA-----T--TTTCAT--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-TGTTCT
gi|67445                      :                 GTAA--A-ACA--TCA-CAGTT-C----ATG--CA-TT------G-------AT--A----TA-----T--T----T--T----TA--A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTC
gi|67446                      :                 GTAA--A-GCC--TCG-CAGTT-C----ATA--CCTCT------CA------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A-------AA----AT--T--
gi|67447                      :                 GTGA--A-GCG--TCA-CAGTG-C----ATG--AT-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----T---A--AA-A-A--G-G--CA----AT--T--T-A-T-TT
gi|67449                      :                  TGA--A-GCT--TTG-CAGTT-C----ATA--CC-CG------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--C-G--AA----GT--T--T-A-T-ATCTT
gi|67450                      :                  TGA--A-ACA--TTG-CTATC-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----CA-----T--T----T--T----C---A--AT-A-A--T-G--AA----AT--T--C-A-T-TTCTT
gi|67451                      :                  TAA--A-GCG--TCA-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--ACCC-TA-----TAGT----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67452                      :                  TGA--C-GCA--TTG-CAATT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--TT-T-A--G-G--AA----AT--T--C-A-T-TTCTT
gi|67453                      :                  TGA--A-GCG--TTG-CATTT-C----AAA--TT-CT------T-------GT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-A--AA----GT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67454                      :                  TAA--A-GCA--CTG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--A----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-
gi|67455                      :                  TGA--A-GTG--TTAACAGTT-C----ATA--TC-TG------C-------AT--G----TA-----T--T----T-------C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTTTT
gi|67456                      :                  TGA--A-TTG--TTG-CAGAT-C----ATA--CC-CC------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C------AA-A-A--T-G--AA----AT--T--C-A-T-
gi|67459                      :                   GA--A-GCA--TTG-CAGTT-C----CTA--CC-AT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-G-G--T-A--AA----AT--T--G-A-C-TT
gi|67460                      :                   GA--A-GCC--ATG-TAATT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----C--T----T--T----C---A--AT-A-A--T-G--AA----GT--T--C-A-T-CTCTT
gi|67461                      :                   GA--A-GCA--TCC-TAGTT-C----ATA--CC--T------C-------ATATG----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-
gi|67462                      :                   GA--A-ACA--TCG-CAGTT------ATAAGCC-CT------C-------A---G----TA-----T--T----T--T----C---C--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--G-A-T-TTTTT
gi|67464                      :                    A--A-GCG--TTG-CTGTT-C----ATA--AA-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-A--AA----AT--T--T-A-T-TTGTT
gi|67465                      :                    A--A-GCG--CGG-CTGTT-T----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-G--T-A--AA----GT--T--T-A-T-TTTT
gi|67466                      :                    A--A-GCA--TTG-TGGTT-C----ATA--CC-TTT-----C-------A---G----TA-----T--A----C--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTTT
gi|67468                      :                     --A-GTA--TTG-CCATT-C----ACG--CC-CT------C-------AT--G----TA-----G--T----T--C----C---A--AA-A-A--T-G--AA----CT--T--T-A-T-TTCT
gi|67469                      :                     --A-GCA--TTG-CAGTT-C----ATA--CA-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--A----C---A--AA-A-A--A-G--AA----AT--T--C-T-T-TTCTT
gi|67470                      :                     --A-GCC--TTG-CAGTT-C----ATT--CT-AT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-A--AA----AT--T--T-A-T-TTTTT
gi|67473                      :                        -GCG--TCA-CAGCT-C----ATA--CC-AT------T-------AT--A----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--C-ATT-TTCTT
gi|67475                      :                            --TTG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----C--T----C---A--AA-A-C--C-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67476                      :                            --TTG-CAGTT-C----ATA--CA-CA------C-------AT--GACTGTA-----T--T----T--T----C---A--GA-A-A--T-G--AA----AT--T--C-A-T-TTCTT
gi|67480                      :                                G-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--T----TA-----T--T----C--T----C---A--AA-A-A--T-A--AA----GT--T--T-A-T-T
gi|67481                      :                                     TT-C----ATG--CC-CT------C-------AT--A----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AG----AT--T--T-A-T-TTC


blockSeqs                     :                               T         TAAT          TAAGAA CCCCCAA  AT ACTG  TTGTT                 AAA         TT                AG A T
blockSeqs                     :                               T         TT            CATGTA TG       AT CCC   T                     A           C                 TA A T
blockSeqs                     :                               T         T             T      A        .  TT    T                     .           .                 A  T T
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     T                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     C                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               A         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               G         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               G         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  . .
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  .  
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  .  
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  .  
blockSeqs                     :                               G         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  .  
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .  .  
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .     
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .     
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                 .     
blockSeqs                     :                               C         .             .      .        .  .     .                     .           .                       
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                       
blockSeqs                     :                               T         .             .      .        .  .     .                     .           .                       
blockSeqs                     :                               .         .             .      .        .  .     .                     .           .                       
blockSeqs                     :                               .         .             .      .        .  .     .                     .                                   
blockSeqs                     :                                         .             .      .        .  .     .                     .                                   
blockSeqs                     :                                         .             .      .        .  .     .                     .                                   
blockSeqs                     :                                         .             .      .        .  .     .                     .                                   
blockSeqs                     :                                         .             .      .        .  .     .                     .                                   


blockSeqCons                  :                
originalCons                  :                CGTGA--A-GCG--TCG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
finalCons                     :                CGTGA--A-GCG--TCG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT





Alignments
lowQualScore                  :                     00 0   00 2 0     0 1111   00  0  222222 2222222  11 2222  22222 11 0000 11 0000 111 00  0 0 11 0 00  0000  00 11 1 1 1     
lowQualScore                  :                     .. .   .. . .     . ....   ..  .  ...... .......  .. ....  ..... .. .... .. .... ... ..  . . .. . ..  ....  .. .. . . .     
lowQualScore                  :                     66 4   66 1 4     4 8888   66  4  777777 3333333  11 1111  66666 00 9999 00 9999 111 66  4 4 00 4 66  9999  66 66 4 4 0     
consensus                     :                CGTGA--A-GCG--TCG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
Reference ( family-235 )      :                CGTGA--A-GCG--TCG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67364                      :                CGTGG--A-GCG--TTG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--GA-A-A--T-T--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67365                      :                CATAA--A-GTG--TTG-CAGTT-C----ATA--AC-CT------C-------AT--G----TA-----TG-T----T--T----T---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67366                      :                CGTGA--A-GCG--TTG-CTGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AC--G----TA-----C--T----T--T----C---A--AA-A-G--A-GGTAATACTAT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67367                      :                CGTGA--A-ATG--TTG-CAGTT-CT---GTA--CT-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----T---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTTTT
gi|67370                      :                CGTGA--A-GTA--GTG-CAGCT-C----ATG--CG-CT------T-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----GT--A--T-A-T-TTCTT
gi|67371                      :                CGTGA--A-GCG--TTG-CAGTG-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----TTAT----T---A--AA-A-A--TAA--AA----AT--C--C-A-T-TTCTT
gi|67372                      :                CGTAA--C-GTG--TCG-CAGTT-C----ATA--CA-CT------C-------AT--G----TA-----C--T----T--C----C---A--AA-A-G--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67373                      :                CGTGA--G-GCT--TTG-CAGTT-T----ACA--CC-CT------C-------AT--C----TA-----T--T----T--C----C---A--AA-A-A--C-G--AT----AT--TA-T-A-T-TT
gi|67374                      :                CGTGA--C-TCG--CTG-CTGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----CA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-C-T
gi|67375                      :                CGTGG--A-GTG--CCG-CGTTT-CTT--ATA--CC-CT------C-------GT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67376                      :                CGTGA--C-ATG--TTG-CAATT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----C--T----T--T----C---A--AG-A-C--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TCCT
gi|67377                      :                CGTGA--A-GCG--ACG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--C----T--T----C---A--AA-A-C--T-G--AA----A
gi|67379                      :                CGTGA--A-GCT--GCG-CAGTT-C----ATA--CA-TT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C------AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-T
gi|67380                      :                                G-CAATT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----C--T----C---A--AA-A-A--A-G--AA----AT--T--TAA-T-TTCT
gi|67381                      :    catgaagattggCATAA--A-GCA--TCG-CCATT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA--------T----T--T----C---A--AA-A-C--T-A--AA----AT--C--T-A-T-TTCTT
gi|67382                      :                CATGA--A-ATA--TTA-CAGTT-T----AGA--TC-CT------C-------GT--G----TA-----T--T----T--T----T---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TT
gi|67383                      :                CGTCA--A-GTG--TTG-TAGTT-C----ATA--TC-AT------C-------AT--C----TA-----T--T----G--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----GT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67384                      :                CGTGA--A-GCA--T-----G---C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----CG-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--C-A-T-TCC
gi|67385                      :                CGTGA--A-GCG--TTG-CAGTT-C----ATA--CT-CT------T-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--A
gi|67386                      :                CATGA--A-GCA--CTG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--GTT--TAT----T--T----T--T----C---A--AA-A-G--T-G--AG----TT--T--G-A-T-TTCCT
gi|67387                      :                CATGA--A-TCA--TTG-CAGTT-C----ATA--CT-CT------G-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---C--TA-A-A--T-G---A----AT--T--T-A-T-TTTTT
gi|67388                      :                CGTGA--A-GCG--TCG-CAGTC-C----ATA--TC-AT------C-------AT--G----CA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AA--TAGT-A-T-TT
gi|67389                      :                CATAA--A-GGG--TCA-CAGTT-C----ATG--CC-TC------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--TAA-T-TT
gi|67390                      :                CGTGA------G--TTG-CACTT-C----ATA--CC-CC------C-------AT--G----CA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--C-G--AA----AG--T--T-A-T-TTCT
gi|67391                      :                CATGA--A-GTG--TTG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AC--------------T--T----T--T----C---A--TA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-GCCTT
gi|67392                      :                CATGA--A-GCA--T-G-CAGTT-CTAATATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AC-G-A--T-G--AC----AT--T--T-T-T-TTTTT
gi|67393                      :                CGAGA--A-GCG--TCG-CAATT-C----ATA--GC-CT------C-------AT--G----CA-----T--T----T--C----C---A--GA-A-A--T-G--GA----AT--T--T-A-G-TTC
gi|67394                      :                CGTCA--ACGCG--TTG-CAGTT-C----ATA--CT-CT--------------AT--G----TA-----G--T----T--T----C---A--AA-A-T--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TT
gi|67395                      :                CATAA--A-GCA--TTT-CAGTT-C----ATA--CC-CT------T-------GT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-G-A--T-G--AT----AT--
gi|67396                      :                CGTGA--A-GCG--TTG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----------------------------------AA-A-A--T-A--AA----AT--T--T-A-CGTTCT
gi|67397                      :                CGTGC--A-GCG--ATG-CAGTT-C----ATA--TC-TT------C-------AT--G----TC-----T--T----T--T----C---A--GA-A-A--T----AA----AT--T--T-A-T-TTTT
gi|67398                      :                CATGA--A-ACA--TCC-CAGTT-C----ATG--TC-CTTAAGAAC-------AT--G----TA-----T--T----T-------C---A--AA-A-A--T-T--AA----GT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67399                      :                CATGA--A-ACG--TTG-CAGGT-T----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TAT----T--T----T--T----C---A--AA-A-C--T-A--AA----AT--T--T-
gi|67400                      :                CATGA--A-GCG--TCG-CAATT-C----ATA--AC-CT------C-------AT--G----AA-----T--T----T--T----T---G--AA-A-A--T-G--AA----ATAATTAT-A-T-TTCTT
gi|67401                      :                CGTGA--A-GCA--TTG-TAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----C--T----T--G----C---A--
gi|67402                      :                CGTGA--A-GCA--TTG-TAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----C--T----T--G----C---A--
gi|67403                      :                     --A-GAG--TTG-CAGTT-C----ATT--CC-TT------C-------AT--G----TG-----T--T----T--T----C---A--TA-A-A--T-G--AA----GT--T--A-A-T-TTCTT
gi|67404                      :             cgtCGTGA--A-TAG--TTT-CAGTT-C----ATA--TC-CT------C-------AT--G----TATTGTTT--T----T--T----T---A--AA-A-AC-T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTTTT
gi|67405                      :                CGTGA--A-GCG--TTG-CA---------ATG--CC-CT------C-------AA--G----CA-----T--T----T--A----T---A--AA-A-A--T-G--AA----GT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67406                      :                CGTAA--A-GCG--TCG-CAGTT-C----ATC--TT-CC------C-------AT--G----TG-----T--T----T--T----T---A--AA-A-A--T-G--AA----GT--T--G-A-T-GTCTT
gi|67407                      :                CGTGA--A-GCA--TCA-CAGTT-C----ATA--TC-ATCATGTAC-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AACA-A--T-G--AC----AT--T--C-A-T-TT
gi|67408                      :                CGTAA--A-GGG--TCG-CAGTG-C----CTG--CT-AT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AC--T--T-ATT-TTCTT
gi|67409                      :                CGTCA--A-GCT--TCG-CGGTT-A----ATA--CT-CT------T-------ATATG----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-CTT-TTCTT
gi|67410                      :                CATAA--A-GCA--TTG-CAGTTTC----TTG--CC-TT------T-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---T--GA-A-A--A-G--AA----AT--T--T-A-T-TTTT
gi|67411                      :                CGTGA--A-GAG--TTG-CCATT-C----ATA--CC-TT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----T---G--AA-A-A--A-G--AG----G---T--T-A-T-TTCT
gi|67412                      :                CATGA--A-GCA--TCA-TAGG--C----ATG--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----CAAAA--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-
gi|67413                      :                CGTGA--A-ATG--TTG-CAGTT-C----ACC--CC-CC------CCCCCCAAAT--G----TT-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--C-G--AA----AT--T--T-A-T-TT
gi|67414                      :                CGTGA--A-GCC--TCG-CAGTT-C----AGA--TC-CC------------------------------T--T----T--T----C---A--AA-A-T--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67415                      :                CGTGA--A-TAG--TTG-CAGTT-C----ATA--TC-TC------A-------AT--G----TAT----T--T----T--T----C---A--AT-A-A--T-G--AA----AT--T--C-A-T-TTTT
gi|67416                      :                CATGA--A-GAA--TCA-AAGTT-G----ATG--AC-AT------C-------GT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-AAA--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67417                      :                CATGA--A-GAG--TTG-CAGTT-T----ATA--CC-CT------C-------AT--G----GA-----T--T----C--T----C---A--AT-A-A--T-A--TA----AT--T--T-
gi|67418                      :                CGTGA--A-GCA--CAA-CAGCT-C----AAG--CA-CT------C-------TG--G----TG-----T--T----T--T----C---A--AA-G-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTC
gi|67423                      :                 GTGA--G-GTG--TCG-CAGTT-C----ATA--CT-GT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--C-A-T-TTCTT
gi|67424                      :                 GTAA--A-GCG--TCG-CAGTT-C----ATG--CC-CT------C-------AT--A----TA--------T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AC--T--T-A-T-TTCTT
gi|67425                      :                 GTGA--A-GCA--CTG-CGGTT-C----ATA--CG-CT------C-------GT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--GA-A-A--T-T--AA----AT--T--T-A-T-TT
gi|67426                      :                 GTAA--A-GCA--TTG-TAGTT-C----ATG--TC-CT------C-------AT--G----TG-----T--T----T--T----C---A--AA-A----T-G--AA----AT--T--TTA-T-TTCTT
gi|67427                      :                 GTGA--A-GTA--TTG-CAGTT-C----ATA--CT-CC------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C------AA-A-A--C-G---------T--T--T-A-C-TTC
gi|67428                      :                 GTGA--A-GCG--TCA-CAATT-C----ATA--CT-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--C----C---A--CA-A-A--T-G--AA----AT--T--C-A-T-TTTT
gi|67429                      :                 GTAA--A-GTG--TTG-CAGTT-C----ATG--AT-CT------C-------AT--G----CA-----C--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTTT
gi|67430                      :                 GTGA--A-ACA--TCG-CAGTT-C----ACA--CT-CT------C-------AT--T----TA-----C--T----T--TAAAAA---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67431                      :                 GTGA--A-GCTATTCA-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----AA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-ATTT-A--AA----AT--T--T-A-T-T
gi|67432                      :                                G-TAGTC-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----CA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-A--GA----AT--T--T-A-T-TTTT
gi|67433                      : gtgatgcattgtacatGTGA--A-GCG--TTG-CAGTT-C----ATA--CT-CC------C-------AT--G----TA--------T----T--T----C---A--AA-A-A--T-T--TA----AT--T--T-
gi|67434                      :                 GTTA--G-GCG--TTG-CAGTT-C----ATA--CC-GT------C-------AT--A----TA-----T--T----T--T----T------AA-A-A--T-G--AA----AT--T--
gi|67435                      :                 GTTA--G-GCG--TTG-CAGTT-C----ATA--CC-GT------C-------AT--A----TA-----T--T----T--T----T------AA-A-A--T-G--AA----AT--T--
gi|67436                      :                 GTGA--C-GTG--ATG-CAGGT-T----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA--------T----T--G----C---A--AA-A-A--T-A--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67437                      :                 GTGA--G-GCG--TTG-TAGTT-C----AAA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AG-A-G--T-A--AA----AA--T--T-C-T-T
gi|67438                      :                 GTAA--T-GCC--TTG-CAGTT-C----ATG--CC-GA------C-------AT--G----TA--------T----T--T----C---G--AA-A-A--T-G--AT----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67439                      :                 GTGA--A-GCT--TTG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------CTG-----AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--
gi|67440                      :                 GTGA--A-ACC--CTC-CAGTT-T----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--C----C---A--AA-A-A--T-A--AA----
gi|67441                      :                 GTGA--A-GCG--TCA-CAGTT-C----ATA--CC-AT------C-------AT--G----CA--------T----T--T----G---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--A--T---T-TTCT
gi|67442                      :                 GTGA--A-ACG--TTA-CAGTT-C----ATA--TC-TT------C-------AT--G----TA-----T--T----TA-T----C---AATAA-A-A--T-G--AA----A
gi|67443                      :                 GTAA--A-TCA--TGG-CAGTT-T----ACT--CC-CT------C-------AT--G----TAC----T--T----T--T----C---------A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67444                      :                 GTGACGA-GC---TGG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--T----AA-----T--TTTCAT--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-TGTTCT
gi|67445                      :                 GTAA--A-ACA--TCA-CAGTT-C----ATG--CA-TT------G-------AT--A----TA-----T--T----T--T----TA--A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTC
gi|67446                      :                 GTAA--A-GCC--TCG-CAGTT-C----ATA--CCTCT------CA------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A-------AA----AT--T--
gi|67447                      :                 GTGA--A-GCG--TCA-CAGTG-C----ATG--AT-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----T---A--AA-A-A--G-G--CA----AT--T--T-A-T-TT
gi|67449                      :                  TGA--A-GCT--TTG-CAGTT-C----ATA--CC-CG------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--C-G--AA----GT--T--T-A-T-ATCTT
gi|67450                      :                  TGA--A-ACA--TTG-CTATC-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----CA-----T--T----T--T----C---A--AT-A-A--T-G--AA----AT--T--C-A-T-TTCTT
gi|67451                      :                  TAA--A-GCG--TCA-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--ACCC-TA-----TAGT----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67452                      :                  TGA--C-GCA--TTG-CAATT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--TT-T-A--G-G--AA----AT--T--C-A-T-TTCTT
gi|67453                      :                  TGA--A-GCG--TTG-CATTT-C----AAA--TT-CT------T-------GT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-A--AA----GT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67454                      :                  TAA--A-GCA--CTG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--A----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-
gi|67455                      :                  TGA--A-GTG--TTAACAGTT-C----ATA--TC-TG------C-------AT--G----TA-----T--T----T-------C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTTTT
gi|67456                      :                  TGA--A-TTG--TTG-CAGAT-C----ATA--CC-CC------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C------AA-A-A--T-G--AA----AT--T--C-A-T-
gi|67459                      :                   GA--A-GCA--TTG-CAGTT-C----CTA--CC-AT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-G-G--T-A--AA----AT--T--G-A-C-TT
gi|67460                      :                   GA--A-GCC--ATG-TAATT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----C--T----T--T----C---A--AT-A-A--T-G--AA----GT--T--C-A-T-CTCTT
gi|67461                      :                   GA--A-GCA--TCC-TAGTT-C----ATA--CC--T------C-------ATATG----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-
gi|67462                      :                   GA--A-ACA--TCG-CAGTT------ATAAGCC-CT------C-------A---G----TA-----T--T----T--T----C---C--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--G-A-T-TTTTT
gi|67464                      :                    A--A-GCG--TTG-CTGTT-C----ATA--AA-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-A--AA----AT--T--T-A-T-TTGTT
gi|67465                      :                    A--A-GCG--CGG-CTGTT-T----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-G--T-A--AA----GT--T--T-A-T-TTTT
gi|67466                      :                    A--A-GCA--TTG-TGGTT-C----ATA--CC-TTT-----C-------A---G----TA-----T--A----C--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--T-A-T-TTTT
gi|67468                      :                     --A-GTA--TTG-CCATT-C----ACG--CC-CT------C-------AT--G----TA-----G--T----T--C----C---A--AA-A-A--T-G--AA----CT--T--T-A-T-TTCT
gi|67469                      :                     --A-GCA--TTG-CAGTT-C----ATA--CA-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--A----C---A--AA-A-A--A-G--AA----AT--T--C-T-T-TTCTT
gi|67470                      :                     --A-GCC--TTG-CAGTT-C----ATT--CT-AT------C-------AT--G----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-A--AA----AT--T--T-A-T-TTTTT
gi|67473                      :                        -GCG--TCA-CAGCT-C----ATA--CC-AT------T-------AT--A----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AA----AT--T--C-ATT-TTCTT
gi|67475                      :                            --TTG-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--G----TA-----T--T----C--T----C---A--AA-A-C--C-G--AA----AT--T--T-A-T-TTCTT
gi|67476                      :                            --TTG-CAGTT-C----ATA--CA-CA------C-------AT--GACTGTA-----T--T----T--T----C---A--GA-A-A--T-G--AA----AT--T--C-A-T-TTCTT
gi|67480                      :                                G-CAGTT-C----ATA--CC-CT------C-------AT--T----TA-----T--T----C--T----C---A--AA-A-A--T-A--AA----GT--T--T-A-T-T
gi|67481                      :                                     TT-C----ATG--CC-CT------C-------AT--A----TA-----T--T----T--T----C---A--AA-A-A--T-G--AG----AT--T--T-A-T-TTC