lowQualScore : 0 0 333 11 1111 11 1 0 0 222222 1111111111 00 000 0 00 0 0 0 2 0 0 00 111 0
lowQualScore : . . ... .. .... .. . . . ...... .......... .. ... . .. . . . . . . .. ... .
lowQualScore : 9 4 444 00 3333 88 2 4 8 444444 8888888888 66 777 8 66 8 8 4 4 4 4 66 111 8
consensus : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AGACGCCA
Reference ( gi|24989 ) : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AGACGCCA
gi|24988 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AGACGCCA
gi|24990 : CAGA-C-A---G--A----GAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AGACGCCA
gi|24994 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AGACATCA
gi|24993 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AGACATCA
gi|24992 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AGACATCA
gi|24991 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AGACATCA
gi|24995 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACTG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TA-T-ATA-TT--TA---C-AGACGCCA
gi|25003 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25002 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25001 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25000 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|24999 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|24998 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|24997 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|24996 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25006 : CATA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AGACATCA
gi|25005 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---CAAGACATCA
gi|25004 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TAC--C-AGACATCA
gi|25008 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AAGCATCA
gi|25007 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AAGCATCA
gi|25011 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-A
gi|25010 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-A
gi|25009 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-A
gi|25012 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-A-AG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC--G-TG-T-ATA-TT--TA---C-AGACGCCA
gi|25015 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACTG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TA-T-ATA-TT--CA---C-AGATGCCA
gi|25014 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-
gi|25013 : CAGA-C-A---G--A----C-G--AC-A-G-ACAGG-----A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AGACGC
gi|25016 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG----TA-TT--TA---C-AGACATCA
gi|25019 : CATA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25018 : CATA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25017 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-GCACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25020 : CAGA-C-A---G--A----CAGG-AC-A-G-ACAGG-----A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AGACATCA
gi|25021 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---AAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-A
gi|25022 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-AC-G------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25025 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--AGACGAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25024 : CAGA-C-ACAGG--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25023 : CAGA-C-ATCAG--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25029 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACA-------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25028 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--T-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-A
gi|25027 : CAGAAC-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-A
gi|25026 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A---ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25030 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A----AA-T--G-TTCC-TG-TGTT-ATA-TT--TA---C-AGACAC
gi|25031 : CATA-C-A---G--A-----AG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-T--T-ATA-TT--TA---C-AGACGCCA
gi|25033 : CAGA-C-----G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-A
gi|25032 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAAGT--G--TCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AGAC-CCA
gi|25034 : CAGA-C-A------A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AAGCATCA
gi|25035 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G--TCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-A
gi|25037 : CAGA-C-----G--C----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--C-TTCC-TG-TG-T-ATA-TA--TA---C-AGACGCCA
gi|25036 : CATA-C-A---G--A----CAGG-AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25039 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------ACAGACAGGAGC--A---GAA-T--G--TCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AGACGCCA
gi|25038 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC----TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25040 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---AAA----G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25041 : CAGA-C-A---G--AA---CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---
gi|25042 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCCTTG-TG-T-ATA-----TA---C-AGACATCA
gi|25043 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAGACAGACA----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TGAT-ATA--T--TA---C-AGACGCCA
gi|25044 : CAGA-CCA---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G--TCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25045 : CAGA-C-T---G--A----CA---AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25046 : CAGA-C-A---T-------CAGGAAC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-T--T-ATA-TT--TA---C-AGACGCCA
gi|25048 : CAGA-C-A---G--A----CCG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T----TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---CAAGAC
gi|25047 : CAGA-C-ATCAG--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--CAGAGC-AGAC
gi|25049 : CAGA-C-----G--C----CAG--AC-A-G-ACAG------C----------C--A---TAA-T--G-TTCC-TG-TC-T-ATA-TT--TA---C-AGACGCCA
gi|25051 : CAGA-C-A---GC-A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAC-A--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25050 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-A--G-TTCC-TG-TG-T-ATA--T--TA---C-A-ACATCA
gi|25052 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-A--T-TTTC-CG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25053 : CAGA-C-----G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G---CC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25054 : CAGA-C-A---G--A----CA---ACGA-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG----TA-TT--TA---C-AGACATCA
gi|25055 : CAGATC-AT--A--A----CAG--AC-A-G-ACAGG-----A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25056 : CATA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCCTTG-TT-T-A-A-TT--TA---C-AGAC
gi|25057 : CAGA-C-A---G--A----CAG--ACGA-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TGTT-ATA--T--TA---C-A
gi|25058 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------CGAA---GAA-T--G--TCC-TG-TG-T-ATA--T--TA---C-AG
gi|25059 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-AGG-ACA-------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG--G-T-ATA-TTTATA---C-AGACATCA
gi|25060 : CAGA-C-ATCAG--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G--TCC-TG-TG-T-ATA--T--TA---C-AG
gi|25067 : AGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-
gi|25068 : AGT-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA--T--TA---C-A
gi|25069 : GA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-TGAG-TTCC-TG-TGAT-AT--TT--TA---C-AGA
gi|25071 : A-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA--T--TA---C-AGAC
gi|25072 : A-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAAAT--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AGTCGACA
gi|25073 : A-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--GTTTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25074 : A-T-A---A--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25075 : A-C-A---G--ATCATCAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-A
gi|25076 : A-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--GTTTCC-TG-TGTT-ATA--T--TA-----AGACGCCA
gi|25077 : A-C-A---GTCA----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G--TCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25078 : A-C-A---G--A----CAT---C-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T----TTCC-TG-TG-T-ATA--T--TA---C-AGACGCCA
gi|25083 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AGACGCCA
gi|25082 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AGACGCCA
gi|25084 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AGAC
gi|25085 : -C-A---T--A----CAGG-AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AGACATCA
gi|25086 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG---ATA-TT--TA---C-AG
gi|25087 : -C-A---G--A-----AG--AC-A-G-ACA-------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AGACG
gi|25088 : -C-A---G--A----CAG--A----G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TGTTG-T-ATA-TT--TA---C-AGACATCA
gi|25090 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G--TCC-TG-TGTT-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25089 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-GGACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA--T--TA---C-AG
gi|25093 : -A---G--A----CAG--AC-A---ACAG------A----------C--A---GAA----G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AGACATCA
gi|25094 : --A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25095 : --A----CAG--ACCA-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATATTT--TA---C-AGACATCA
gi|25101 : ----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25100 : ----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25102 : ----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GA--T--G-TTCC-TG-TG-T-ATA-TT--TA---C-AG
gi|25103 : ----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-TTCC-TG-TG-TGATA-TT--TA---C-A
Alignments
lowQualScore : 0 0 333 11 1111 11 1 0 0 222222 1111111111 00 000 0 00 0 0 0 0 0 0 0 1 00 111 0
lowQualScore : . . ... .. .... .. . . . ...... .......... .. ... . .. . . . . . . . . .. ... .
lowQualScore : 9 4 444 00 2222 88 2 4 8 444444 8888888888 66 777 4 66 8 4 8 4 8 4 8 2 55 111 8
consensus : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
Reference ( family-234 ) : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|24988 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|24989 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|24990 : CAGA-C-A---G--A----GAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|24991 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|24992 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|24993 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|24994 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|24995 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACTG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TA-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|24996 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|24997 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|24998 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|24999 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25000 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25001 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25002 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25003 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25004 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TAC--C-AGACATCA
gi|25005 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---CAAGACATCA
gi|25006 : CATA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|25007 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AAGCATCA
gi|25008 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AAGCATCA
gi|25009 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25010 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25011 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25012 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-A-AG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC--G-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|25013 : CAGA-C-A---G--A----C-G--AC-A-G-ACAGG-----A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGC
gi|25014 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-
gi|25015 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACTG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TA-T-ATA-T-T--CA---C-AGATGCCA
gi|25016 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG----TA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|25017 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-GCACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25018 : CATA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25019 : CATA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25020 : CAGA-C-A---G--A----CAGG-AC-A-G-ACAGG-----A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|25021 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---AAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25022 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-AC-G------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25023 : CAGA-C-ATCAG--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25024 : CAGA-C-ACAGG--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25025 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--AGACGAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25026 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A---ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25027 : CAGAAC-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25028 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--T-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25029 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACA-------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25030 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A----AA-T--G-T-TCC-TG-TGTT-ATA-T-T--TA---C-AGACAC
gi|25031 : CATA-C-A---G--A-----AG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-T--T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|25032 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA----G-TGTCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGAC-CCA
gi|25033 : CAGA-C-----G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25034 : CAGA-C-A------A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AAGCATCA
gi|25035 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G---TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25036 : CATA-C-A---G--A----CAGG-AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25037 : CAGA-C-----G--C----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--C-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-A--TA---C-AGACGCCA
gi|25038 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC----TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25039 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------ACAGACAGGAGC--A---GAA-T--G---TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|25040 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---AAA----G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25041 : CAGA-C-A---G--AA---CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---
gi|25042 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCCTTG-TG-T-ATA------TA---C-AGACATCA
gi|25043 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAGACAGACA----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG---ATA-TAT--TA---C-AGACGCCA
gi|25044 : CAGA-CCA---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G---TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25045 : CAGA-C-T---G--A----CA---AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25046 : CAGA-C-A---T-------CAGGAAC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-T--T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|25047 : CAGA-C-ATCAG--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--CAGAGC-AGAC
gi|25048 : CAGA-C-A---G--A----CCG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T----T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---CAAGAC
gi|25049 : CAGA-C-----G--C----CAG--AC-A-G-ACAG------C----------C--A---TAA-T--G-T-TCC-TG-TC-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|25050 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-A--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA---T--TA---C-A-ACATCA
gi|25051 : CAGA-C-A---GC-A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAC-A--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25052 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-A--T-T-TTC-CG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25053 : CAGA-C-----G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G----CC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25054 : CAGA-C-A---G--A----CA---ACGA-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG----TA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|25055 : CAGATC-AT--A--A----CAG--AC-A-G-ACAGG-----A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25056 : CATA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCCTTG-TT-T-A-A-T-T--TA---C-AGAC
gi|25057 : CAGA-C-A---G--A----CAG--ACGA-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T--TA-TAT--TA---C-A
gi|25058 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------CGAA---GAA-T--G---TCC-TG-TG-T-ATA---T--TA---C-AG
gi|25059 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-AGG-ACA-------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG--G-T-ATA-T-TTATA---C-AGACATCA
gi|25060 : CAGA-C-ATCAG--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G---TCC-TG-TG-T-ATA---T--TA---C-AG
gi|25067 : AGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-
gi|25068 : AGT-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA---T--TA---C-A
gi|25069 : GA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-TGAG-T-TCC-TG-TG---ATATT-T--TA---C-AGA
gi|25071 : A-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA---T--TA---C-AGAC
gi|25072 : A-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAAAT--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGTCGACA
gi|25073 : A-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--GTT-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25074 : A-T-A---A--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25075 : A-C-A---G--ATCATCAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25076 : A-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--GTT-TCC-TG-TG-T--TA-TAT--TA-----AGACGCCA
gi|25077 : A-C-A---GTCA----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G---TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25078 : A-C-A---G--A----CAT---C-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T----T-TCC-TG-TG-T-ATA---T--TA---C-AGACGCCA
gi|25082 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|25083 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|25084 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGAC
gi|25085 : -C-A---T--A----CAGG-AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|25086 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG---ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25087 : -C-A---G--A-----AG--AC-A-G-ACA-------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACG
gi|25088 : -C-A---G--A----CAG--A----G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TGTTG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|25089 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-GGACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA---T--TA---C-AG
gi|25090 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G---TCC-TG-TGTT-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25093 : -A---G--A----CAG--AC-A---ACAG------A----------C--A---GAA----G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|25094 : --A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25095 : --A----CAG--ACCA-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATATT-T--TA---C-AGACATCA
gi|25100 : ----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25101 : ----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25102 : ----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GA--T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25103 : ----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-TGATA-T-T--TA---C-A
Alignments
lowQualScore : 0 0 333 11 1111 11 1 0 0 222222 1111111111 00 000 0 00 0 0 0 0 0 0 0 1 00 111 0
lowQualScore : . . ... .. .... .. . . . ...... .......... .. ... . .. . . . . . . . . .. ... .
lowQualScore : 9 4 444 00 2222 88 2 4 8 444444 8888888888 66 777 4 66 8 4 8 4 8 4 8 2 55 111 8
consensus : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
Reference ( family-234 ) : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|24988 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|24989 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|24990 : CAGA-C-A---G--A----GAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|24991 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|24992 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|24993 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|24994 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|24995 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACTG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TA-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|24996 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|24997 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|24998 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|24999 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25000 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25001 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25002 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25003 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25004 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TAC--C-AGACATCA
gi|25005 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---CAAGACATCA
gi|25006 : CATA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|25007 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AAGCATCA
gi|25008 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AAGCATCA
gi|25009 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25010 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25011 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25012 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-A-AG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC--G-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|25013 : CAGA-C-A---G--A----C-G--AC-A-G-ACAGG-----A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGC
gi|25014 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-
gi|25015 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACTG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TA-T-ATA-T-T--CA---C-AGATGCCA
gi|25016 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG----TA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|25017 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-GCACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25018 : CATA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25019 : CATA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25020 : CAGA-C-A---G--A----CAGG-AC-A-G-ACAGG-----A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|25021 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---AAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25022 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-AC-G------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25023 : CAGA-C-ATCAG--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25024 : CAGA-C-ACAGG--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25025 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--AGACGAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25026 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A---ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25027 : CAGAAC-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25028 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--T-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25029 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACA-------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25030 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A----AA-T--G-T-TCC-TG-TGTT-ATA-T-T--TA---C-AGACAC
gi|25031 : CATA-C-A---G--A-----AG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-T--T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|25032 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA----G-TGTCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGAC-CCA
gi|25033 : CAGA-C-----G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25034 : CAGA-C-A------A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AAGCATCA
gi|25035 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G---TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25036 : CATA-C-A---G--A----CAGG-AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25037 : CAGA-C-----G--C----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--C-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-A--TA---C-AGACGCCA
gi|25038 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC----TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25039 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------ACAGACAGGAGC--A---GAA-T--G---TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|25040 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---AAA----G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25041 : CAGA-C-A---G--AA---CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---
gi|25042 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCCTTG-TG-T-ATA------TA---C-AGACATCA
gi|25043 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAGACAGACA----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG---ATA-TAT--TA---C-AGACGCCA
gi|25044 : CAGA-CCA---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G---TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25045 : CAGA-C-T---G--A----CA---AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25046 : CAGA-C-A---T-------CAGGAAC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-T--T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|25047 : CAGA-C-ATCAG--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--CAGAGC-AGAC
gi|25048 : CAGA-C-A---G--A----CCG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T----T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---CAAGAC
gi|25049 : CAGA-C-----G--C----CAG--AC-A-G-ACAG------C----------C--A---TAA-T--G-T-TCC-TG-TC-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|25050 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-A--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA---T--TA---C-A-ACATCA
gi|25051 : CAGA-C-A---GC-A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAC-A--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25052 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-A--T-T-TTC-CG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25053 : CAGA-C-----G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G----CC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25054 : CAGA-C-A---G--A----CA---ACGA-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG----TA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|25055 : CAGATC-AT--A--A----CAG--AC-A-G-ACAGG-----A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25056 : CATA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCCTTG-TT-T-A-A-T-T--TA---C-AGAC
gi|25057 : CAGA-C-A---G--A----CAG--ACGA-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T--TA-TAT--TA---C-A
gi|25058 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------CGAA---GAA-T--G---TCC-TG-TG-T-ATA---T--TA---C-AG
gi|25059 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-AGG-ACA-------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG--G-T-ATA-T-TTATA---C-AGACATCA
gi|25060 : CAGA-C-ATCAG--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G---TCC-TG-TG-T-ATA---T--TA---C-AG
gi|25067 : AGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-
gi|25068 : AGT-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA---T--TA---C-A
gi|25069 : GA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-TGAG-T-TCC-TG-TG---ATATT-T--TA---C-AGA
gi|25071 : A-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA---T--TA---C-AGAC
gi|25072 : A-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAAAT--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGTCGACA
gi|25073 : A-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--GTT-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25074 : A-T-A---A--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25075 : A-C-A---G--ATCATCAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25076 : A-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--GTT-TCC-TG-TG-T--TA-TAT--TA-----AGACGCCA
gi|25077 : A-C-A---GTCA----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G---TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25078 : A-C-A---G--A----CAT---C-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T----T-TCC-TG-TG-T-ATA---T--TA---C-AGACGCCA
gi|25082 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|25083 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|25084 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGAC
gi|25085 : -C-A---T--A----CAGG-AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|25086 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG---ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25087 : -C-A---G--A-----AG--AC-A-G-ACA-------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACG
gi|25088 : -C-A---G--A----CAG--A----G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TGTTG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|25089 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-GGACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA---T--TA---C-AG
gi|25090 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G---TCC-TG-TGTT-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25093 : -A---G--A----CAG--AC-A---ACAG------A----------C--A---GAA----G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|25094 : --A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25095 : --A----CAG--ACCA-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATATT-T--TA---C-AGACATCA
gi|25100 : ----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25101 : ----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25102 : ----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GA--T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25103 : ----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-TGATA-T-T--TA---C-A
blockSeqs : TCA TCAT GA G ACAGAC CAGACAGGAG A GAG
blockSeqs : CAG A G G G . A C
blockSeqs : TCA . G C G . A .
blockSeqs : TCA . G . G . . .
blockSeqs : T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
finalCons : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
Alignments
lowQualScore : 0 0 333 11 1111 11 1 0 0 222222 1111111111 00 000 0 00 0 0 0 0 0 0 0 1 00 111 0
lowQualScore : . . ... .. .... .. . . . ...... .......... .. ... . .. . . . . . . . . .. ... .
lowQualScore : 9 4 444 00 2222 88 2 4 8 444444 8888888888 66 777 4 66 8 4 8 4 8 4 8 2 55 111 8
consensus : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
Reference ( family-234 ) : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|24988 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|24989 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|24990 : CAGA-C-A---G--A----GAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|24991 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|24992 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|24993 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|24994 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|24995 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACTG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TA-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|24996 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|24997 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|24998 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|24999 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25000 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25001 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25002 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25003 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25004 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TAC--C-AGACATCA
gi|25005 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---CAAGACATCA
gi|25006 : CATA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|25007 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AAGCATCA
gi|25008 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AAGCATCA
gi|25009 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25010 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25011 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25012 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-A-AG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC--G-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|25013 : CAGA-C-A---G--A----C-G--AC-A-G-ACAGG-----A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGC
gi|25014 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-
gi|25015 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACTG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TA-T-ATA-T-T--CA---C-AGATGCCA
gi|25016 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG----TA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|25017 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-GCACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25018 : CATA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25019 : CATA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25020 : CAGA-C-A---G--A----CAGG-AC-A-G-ACAGG-----A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|25021 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---AAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25022 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-AC-G------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25023 : CAGA-C-ATCAG--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25024 : CAGA-C-ACAGG--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25025 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--AGACGAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25026 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A---ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25027 : CAGAAC-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25028 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--T-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25029 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACA-------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25030 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A----AA-T--G-T-TCC-TG-TGTT-ATA-T-T--TA---C-AGACAC
gi|25031 : CATA-C-A---G--A-----AG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-T--T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|25032 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA----G-TGTCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGAC-CCA
gi|25033 : CAGA-C-----G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25034 : CAGA-C-A------A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AAGCATCA
gi|25035 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G---TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25036 : CATA-C-A---G--A----CAGG-AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25037 : CAGA-C-----G--C----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--C-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-A--TA---C-AGACGCCA
gi|25038 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC----TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25039 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------ACAGACAGGAGC--A---GAA-T--G---TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|25040 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---AAA----G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25041 : CAGA-C-A---G--AA---CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---
gi|25042 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCCTTG-TG-T-ATA------TA---C-AGACATCA
gi|25043 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAGACAGACA----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG---ATA-TAT--TA---C-AGACGCCA
gi|25044 : CAGA-CCA---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G---TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25045 : CAGA-C-T---G--A----CA---AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25046 : CAGA-C-A---T-------CAGGAAC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-T--T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|25047 : CAGA-C-ATCAG--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--CAGAGC-AGAC
gi|25048 : CAGA-C-A---G--A----CCG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T----T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---CAAGAC
gi|25049 : CAGA-C-----G--C----CAG--AC-A-G-ACAG------C----------C--A---TAA-T--G-T-TCC-TG-TC-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|25050 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-A--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA---T--TA---C-A-ACATCA
gi|25051 : CAGA-C-A---GC-A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAC-A--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25052 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-A--T-T-TTC-CG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25053 : CAGA-C-----G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G----CC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25054 : CAGA-C-A---G--A----CA---ACGA-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG----TA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|25055 : CAGATC-AT--A--A----CAG--AC-A-G-ACAGG-----A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25056 : CATA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCCTTG-TT-T-A-A-T-T--TA---C-AGAC
gi|25057 : CAGA-C-A---G--A----CAG--ACGA-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T--TA-TAT--TA---C-A
gi|25058 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------CGAA---GAA-T--G---TCC-TG-TG-T-ATA---T--TA---C-AG
gi|25059 : CAGA-C-A---G--A----CAG--AC-AGG-ACA-------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG--G-T-ATA-T-TTATA---C-AGACATCA
gi|25060 : CAGA-C-ATCAG--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G---TCC-TG-TG-T-ATA---T--TA---C-AG
gi|25067 : AGA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-
gi|25068 : AGT-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA---T--TA---C-A
gi|25069 : GA-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-TGAG-T-TCC-TG-TG---ATATT-T--TA---C-AGA
gi|25071 : A-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA---T--TA---C-AGAC
gi|25072 : A-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAAAT--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGTCGACA
gi|25073 : A-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--GTT-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25074 : A-T-A---A--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25075 : A-C-A---G--ATCATCAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-A
gi|25076 : A-C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--GTT-TCC-TG-TG-T--TA-TAT--TA-----AGACGCCA
gi|25077 : A-C-A---GTCA----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G---TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25078 : A-C-A---G--A----CAT---C-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T----T-TCC-TG-TG-T-ATA---T--TA---C-AGACGCCA
gi|25082 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|25083 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACGCCA
gi|25084 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGAC
gi|25085 : -C-A---T--A----CAGG-AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|25086 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG---ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25087 : -C-A---G--A-----AG--AC-A-G-ACA-------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACG
gi|25088 : -C-A---G--A----CAG--A----G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TGTTG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|25089 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-GGACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA---T--TA---C-AG
gi|25090 : -C-A---G--A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G---TCC-TG-TGTT-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25093 : -A---G--A----CAG--AC-A---ACAG------A----------C--A---GAA----G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AGACATCA
gi|25094 : --A----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25095 : --A----CAG--ACCA-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATATT-T--TA---C-AGACATCA
gi|25100 : ----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25101 : ----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25102 : ----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GA--T--G-T-TCC-TG-TG-T-ATA-T-T--TA---C-AG
gi|25103 : ----CAG--AC-A-G-ACAG------A----------C--A---GAA-T--G-T-TCC-TG-TG-TGATA-T-T--TA---C-A