lowQualScore                  :  0     00  00 0 0  0     0   0 0000 11    11 00 0    0000 0 11     0  0 00 000         
lowQualScore                  :  .     ..  .. . .  .     .   . .... ..    .. .. .    .... . ..     .  . .. ...         
lowQualScore                  :  9     66  66 4 8  8     4   8 9999 00    44 66 8    9999 4 00     4  4 66 777         
consensus                     : TTTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-G--G---ACGGACGGA
Reference ( gi|128974 )       : TCTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-G--A---ACGGACGGA
gi|128976                     : TCTTGAG--TT--A-T-CG-TATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-G--A---ACGGACGGA
gi|128975                     : TCTTGAG--TT--A-T-CG-TATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-G--A---ACGGACGGA
gi|128962                     : TTTTGAG--TT--A-T-CA-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-G--A---ACGGACGGA
gi|128978                     : TCTTGAG--TT--A-T-CG-TATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACCG-AC-G--A---ACGGACGGA
gi|128973                     : TCTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGT----C-G--GACAG-AC-G--A---ACAGACGG
gi|129008                     : TCTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-TAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----T-G--GACAG-AC-G--A---ACAGATGGA
gi|129006                     : TTTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-TAA-T----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-G--A---ACGGATGGA
gi|129005                     : TTTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-TAA-T----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-G--A---ACAGACGGA
gi|129002                     : TTTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----A-A--GACAG-GC-G--A---ACGGACGGA
gi|129017                     : TTTCGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-A--GACAG-AC-G--A---ACGGACGGAcggacaga
gi|128979                     : TCTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----T-C--GACAA-AC-G--A---ACGGACAGA
gi|128971                     : TTTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-A--G---ACGGAC
gi|128968                     : TTTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAG-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-G--G---ATGGACAGAa
gi|129007                     : TTTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-TAA-T----G--AAAA--T--G-CTGA----C-G--GACAG-AC-G--A---ACGGATGGA
gi|128991                     : TCTCGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-A--AGCGACGGGCGGA
gi|129020                     : TCTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAT-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GCCAG-AT-G--A---ACGGACAGAcaga
gi|128977                     : TTTTGAG--TT--A-T-CT-CATCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-G--G---ACGGACGGA
gi|129010                     : TCTTGAG--TT--T-T-CG-CATCA-CAA-C----A--AAAA--T--A-TTGA----C-G--GACAG-TC-G--A---ACGGACGGA
gi|128996                     : TTTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-A--G---ACGGAcgga
gi|129009                     : TTTTGAG--TC--A-T-CG-CATCA-CAA-A----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-A--G---ACGGACGGA
gi|128961                     : TTTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--AACAG-AC-G--G---ACTGACAGA
gi|128980                     : TCTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-TAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-G--A---A
gi|128982                     : TTTTGAG--TT--A-T-CTTCATCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-G--A---ACGGACGGA
gi|128981                     : TTTTGAG--TT--A-T-CT-CATCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-G--A---TCGGACGGA
gi|129015                     : TCTTGAG--TT--A-T-CA-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACGA-AC-G--G---ATGGACAGAcgga
gi|128985                     : TCTTGAG--TT--A-A-CT-CATCA-CGA-T----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-G--A---ATGGACGGA
gi|128984                     : TCTTGAG--TT--A-A-CT-CATCA-CGA-T----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-G--A---ATGGACGGA
gi|129004                     : TTTTGAG--TT--A-T-CG-CTTCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----A-A--GACAG-GC-G--A---ACGGACGGA
gi|129016                     : TTTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAA-T----G--AAAT--T--GGTTGA----C-G--GACAG-AC-G--G---ACGGACGGAcggacaga
gi|128969                     : TCTTGAG--TT--A-T-TG-TATCA-CAA-C----A--AAAA--T--G-TTGA----C-G--AACAG-AC-G--A---ACGGA
gi|129028                     : TCTTGAG--TT--A-T-CG-AATCA-CAA-G----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GGCAG-AC-G--A---ACGGA
gi|128990                     : TCTTGAG--TT--A-T-CT-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--AACGG-AC-G--G---GCGGACAGA
gi|129021                     : TTTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CTA-T----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-A--A---ATGGACAGA
gi|129003                     : TTTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--G--T-TTGA----C-G--GACAG-AC-G--G---ACGGAC
gi|129018                     : TCTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAA-C----A--GAAA--T--G-TTGA----C----GACAG-AC-A--A---AGGGACGGAa
gi|128989                     : TTTTGAA--TT--A-T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAT-AC-G--G---ACAGACAGcgga
gi|129031                     : TTTTGAG--TT--A-T-CG-TAACA-CGA-C----A--AACA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-G--A---ACGGACGGA
gi|128983                     : TTTTGAG--TT--A-T-CT-CATCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AT-A--A---ACGGATGGA
gi|129036                     : TCTTGAG--TT--A-T-CA-CATCA-CAA-T----G--AAAA--T--G-TCAA----C-A--GACAG-AC-G--A---GAGGACGGAcgga
gi|128963                     : TTTTGAG--TA--A-T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----T-G--GACAG-AC-G--G---ATAGATGGAc
gi|129029                     : TCTTGAG--TT--A-A-CG-CATCA-CAAAC----G--AAAC--T--G-TTGT----C-G--GACAG-AC-G--A---ACAGACGG
gi|129024                     : TTTTTAG--TT--A-T-CG-CGTCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACGG-AC-A--G---ACGGACGGA
gi|128986                     : TCTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAA-C----G---AAA--T--GTTTGA----T-C--GACAA-AC-G--A---ACGGACAGA
gi|129019                     : TTTTGAG--TT--A-T-CG-TGTCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACGG-AT-G--G---ACAGAC
gi|128988                     : TTTTGAG--TT--A-TTCG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-A--G---ACa
gi|128964                     : TTTTAAG--TT--A-T-TG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--AACAG-AC-G--G---ATTGACAGA
gi|129000                     : TTTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAAT-T--G-TTGA----C-A--GACAG-AT-G--G---ACTGACTGA
gi|128972                     : TTTTGAG--TT--A-T-CA-CATCA-CAA-C----G--AAAA--C--G-TTGA----C-G--TACAG-AT-G--G---ACTGACAGA
gi|128967                     : TTTTGAG--TT--A-T-CA-CATCA-CAA-C----G----AA--T--G-TTGA----C-G--AACAG-AC-G--G---ACTGACAGA
gi|128966                     : TTTTGAG--TT--A-TTCG-CATCA-CAT-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-A--GACAG-AC-G--G---ACAGA
gi|129013                     : TTTTTAG--TT--A-T-CG-TATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-GC-G--G---AC
gi|128997                     : TTTTGAG--TT--A-T-AG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--AACAG-AC-G--G---AC
gi|128998                     : TTTTGAG--GT--A-T-CG-CATCA-CAA-C----T--AAAA--T--G-TTGG----C-G--GACGG-AC-A--G---ACGGACtaa
gi|129011                     : TTTTGA---TT--A-T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--AACAG-AC-G--G---Aa
gi|129001                     : TTTTGAG------A-T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACGG-AC-G--G---AC
gi|129022                     : TTTTGAG--TT--A-T-CG-CAGCA-CAA-C----GA-AAAA--T--A-TTGA----T-G--GACAG-AC-G------ACTGACAGA
gi|128965                     : TTTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAT-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C----AACAG-ACGG--A---ACAGA
gi|129023                     : TCTTGAG--TT--A-T-CT-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-T---------------AG-AC-G--A---ACGGACAGA
gi|129012                     : TTTTTAG--TT--A-T-CT-CATCA-CAA-C----G--AAAA--A--G-TTGA----C-A--GACGG-AC-G--G---ACTGACAGA
gi|129030                     : TTTTGAG--TT--A-T-CG-TGTCA-CAT-C----A--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACGG-AC-G--G---AC
gi|129014                     : TTTTGAG--TT--A-T-CG-CATCT-CAA-C----A--AAAA--T--G-TGGA----C-G--AAGAG-AC-A--G---ACGGA
gi|128987                     : TTTTGAG--TT--A-T-CT-CATCA-CTA-C----G----AA--T--G-TTGA----C-GAAGATAA-AC-G--G---ATGGACGGAttgatgga
gi|128993                     : TTTTGA---TA--A-T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACCT-AC-G------GCAGACAG
gi|129025                     : TTTTGAG--TT--A-T-TG-CGTCA-CAA-C----G---AAA--T--G-TTGATGGCC-G--GACAG-AC-
gi|128992                     : TTTTGAG--TT--A-T-CG-CAGTA-CAA-C----T---AAA--T--A-TTGA------G--GACAG-AC-G--G---ACTGACAGA
gi|128994                     : TTTTGAG--TT--A-T-GG-CGT-A-CAA-C----T--AAA---T--A-TTGA----T-G---ACAG-AC-G--G---ACTGACAGA
gi|129054                     :   TTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAA-C----A--AAAAA-T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-G--A---ACGGGCGGA
gi|129055                     :   TTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAA-C----A--AAAAAAT--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-G--A---ACGGGCGGA
gi|129051                     :   TTGAG--TT--A-T-CT-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--AACAG-AC-G--G---GCGGACAGA
gi|129058                     :   TTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAA-CTTGAGCTAAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AT-G--A---ACGGACGG
gi|129040                     :   TTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAG-C----G--AAAT--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-G--G---GCGGAC
gi|129039                     :  tTTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAG-C----G--AAAT--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-G--G---GCGGACa
gi|129062                     :  tTTCAG--TT--A-T-CG-CATCA-AGA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-T--A---ACGGACGGa
gi|129061                     :   TTCAG--TT--A-T-CG-CATCA-AGA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-T--A---ACGGACGGgcaga
gi|129059                     :   TTCAG--TT--A-T-CG-CATCA-TGT-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAA-AC-G--A---ACGGACGGAgcaga
gi|129041                     :   TTGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAA---------AAAA--T--G-TTGA----A-G--GACAG-AC-G--A---ACAGACGG
gi|129047                     :  tTTGAG--TT--AAT-CG-TATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGC----C-G--GACAGAAC-G--A---A-GGACGGA
gi|129044                     :  tTTGAGAATT--A-T-TG-CATCA-CAG-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-AC-A--G---ACcgacaga
gi|129053                     :  tTTGAA--TT--A-T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-A--AATAG-AC-G--G---ACTGA
gi|129048                     :   TTGAG--TT--A-T-TG-CGTCA-CAA-T----G--AAAA--T--G-TTGA----T-G--GACAG-AC-gaga
gi|129043                     :  tTTGAG--TTGTA-T-CG-CATCA-CAA------A--AAAA--T--G-TTGA----A-G--GACAG-AC-GGCA---ACAGACGG
gi|129052                     :  tTTGAG--T---A-T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--AACGG-AC-
gi|129046                     :   TCGAG--TT--A-T-CG-CATCA-CAA-A----A--CAAA--T--G-TTGA----C-G--GACGG-AC-
gi|129042                     :  tTTGAG--TT--A-T-CT-CATCA-CAA------G--AAAA--T--G-TTG-----C-GA-AACGG-AC-G--G---GCGGACAGAaga
gi|129045                     :   tTGAG--TT--A-T-CG-CATCAACAAAC----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--GACAG-GC-G--A---ACGGACAGA
gi|128999                     :  tcTGAG--TT--A-T-TG-CATCA-CAT-C----G--AAAA--T--G-TTGA----T-G--GACGG-AC-A--G---AC
gi|129027                     : ttaTGAG--TT--A-T-CA-CA----CAA-C----G--AAAA--C--G-CTGA----C-G--GACAG-AT-G--G---ACTGACAGA
gi|129066                     : ttgTGAA--TT--A-T-CG-CATCA-CGA-C----A--GAAA--T--G-TTGA----C-A--AATAG-AC-G--G---ACTGA
gi|129068                     :     GAG--TT--A-T-CG-CACCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--AACAG-AA-G--A---ACTGACGGAgaga
gi|129067                     :     GAG--TT--A-T-CGGCATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-G--AACAG-AC-G--G---AC
gi|129026                     :     GAG--T---A-T-CG-CGTCA-CAA-C----G--AAAA--TTGG-TTGA----C-G--GAC-G-AC-A--G---ACGGACtcgtagacaga
gi|129070                     : ttttaAG--TT--A-T-CG-CATCA-AGA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-A--GACAG-AC-G--A---ACGGACGGAa
gi|129069                     :      AG--TT--A-T-CG-CATCA-AGA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-A--GACAG-AC-G--A---ACGGACGGA
gi|129072                     :      AG--CT--A-T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----T-G--GACAG-AC-G--G---ACAGATAGA
gi|129074                     :       G--TT--A-T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----CAG--GACAG-AC-G--G---GCGGACGGA
gi|129075                     :       G--TT--A-T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAA---T--G-TTGA----C-G--AACGG-AC-G--G---GCGGACAGA
gi|129077                     :        --TT--A-T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-A--GACAA-AC-G--A---ACGGACGGA
gi|129076                     :        --TT--A-T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGA----C-A--GACAA-AC-G--A---ACGGACGGA
gi|128970                     :           T--A-T-CG-CATCA-CAA-C----A--AAAT--T--G-TTGA----C-A--TACAG-AC-G--G---ACGGGCAGA





Alignments
lowQualScore                  :     0   00  00 1111111 0  0     0   0 0000 11    11 00 0     0 00     1111 0000 0000 000 00         
lowQualScore                  :     .   ..  .. ....... .  .     .   . .... ..    .. .. .     . ..     .... .... .... ... ..         
lowQualScore                  :     4   55  66 7777777 8  8     4   8 9999 00    33 66 8     4 99     7777 8888 8888 777 66         
consensus                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--ACGGACGGA
Reference ( family-233 )      : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--ACGGACGGA
gi|128961                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---G--ACTGACAGA
gi|128962                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CA-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|128963                     : TTTT-GAG--TA--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAT-G--GACAG----A----C----G---G--ATAGATGGA
gi|128964                     : TTTT-AAG--TT--A-------T-TG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---G--ATTGACAGA
gi|128965                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAT-C----G--AAAA--T--G-TTGAC----AACAG----A----C----G---G--A
gi|128966                     : TTTT-GAG--TT--A-------TTCG-CATCA-CAT-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-A--GACAG----A----C----G---G--ACAGAacaga
gi|128967                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CA-CATCA-CAA-C----G----AA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---G--ACTGACAGA
gi|128968                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAG-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--ATGGACAGA
gi|128969                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-TG-TATCA-CAA-C----A--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---A--ACGGA
gi|128970                     : TTTT-GAA--TT--ACAATGTAT-CG-CATCA-CAA-C----A--AAAT--T--G-TTGAC-A--TACAG----A----C----G---G--ACGGGCAGA
gi|128971                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----A---G--ACGGAC
gi|128972                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CA-CATCA-CAA-C----G--AAAA--C--G-TTGAC-G--TACAG----A----T----G---G--ACTGACAGAa
gi|128973                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGTC-G--GACAG----A----C----G---A--ACAGACGG
gi|128974                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|128975                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-TATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|128976                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-TATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|128977                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--ACGGACGGA
gi|128978                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-TATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACCG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|128979                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAT-C--GACAA----A----C----G---A--ACGGACAGA
gi|128980                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-TAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--A
gi|128981                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----ACGATC----G---G--ACGGACGGA
gi|128982                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CTTCATCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|128983                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAGATAAA----C----G---G--ATGGACGGA
gi|128984                     : TCTT-GAG--TT--A-------A-CT-CATCA-CGA-T----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ATGGACGGA
gi|128985                     : TCTT-GAG--TT--A-------A-CT-CATCA-CGA-T----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ATGGACGGA
gi|128986                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G---AAA--T--GTTTGAT-C--GACAA----A----C----G---A--ACGGACAGA
gi|128987                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CTA-C----G----AA--T--G-TTGAC-GAAGATAA----A----C----G---G--ATGGACGGA
gi|128988                     : TTTT-GAG--TT--A-------TTCG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----A---G--AC
gi|128989                     : TTTT-GAA--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAT----A----C----G---G--ACAGACAG
gi|128990                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACGG----A----C----G---G--GCGGACAGA
gi|128991                     : TCTC-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----AAGCG--ACGGGCGGA
gi|128992                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CAGTA-CAA-C----T---AAA--T--A-TTGA--G--GACAG----A----C----G---G--ACTGACAGAcaga
gi|128993                     : TTTT-GA---TA--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACCT----A----C----G---G---CAGACAG
gi|128994                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-GG-CGT-A-CAA-C----T--AAA---T--A-TTGAT-G---ACAG----A----C----G---G--ACTGACAGA
gi|128996                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----A---G--ACGGA
gi|128997                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-AG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---G--AC
gi|128998                     : TTTT-GAG--GT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----T--AAAA--T--G-TTGGC-G--GACGG----A----C----A---G--ACGGACtaa
gi|128999                     : TTAT-GAG--TT--A-------T-TG-CATCA-CAT-C----G--AAAA--T--G-TTGAT-G--GACGG----A----C----A---G--ACa
gi|129000                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAAT-T--G-TTGAC-A--GACAG----A----T----G---G--ACTGACTGA
gi|129001                     : TTTT-GAG------A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACGG----A----C----G---G--AC
gi|129002                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAA-A--GACAG----G----C----G---A--ACGGACGGA
gi|129003                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--G--T-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--ACGGACcggacaga
gi|129004                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CTTCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAA-A--GACAG----G----C----G---A--ACGGACGGAa
gi|129005                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-TAA-T----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACAGACGGAcggacaga
gi|129006                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-TAA-T----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGATGGA
gi|129007                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-TAA-T----G--AAAA--T--G-CTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGATGGA
gi|129008                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-TAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAT-G--GACAG----A----C----G---A--ACAGATGGA
gi|129009                     : TTTT-GAG--TC--A-------T-CG-CATCA-CAA-A----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----A---G--ACGGACGGA
gi|129010                     : TCTT-GAG--TT--T-------T-CG-CATCA-CAA-C----A--AAAA--T--A-TTGAC-G--GACAGTCGAA----C----G---G--ACGGACGGA
gi|129011                     : TTTT-GA---TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---G--A
gi|129012                     : TTTT-TAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CAA-C----G--AAAA--A--G-TTGAC-A--GACGG----A----C----G---G--ACTGACAGA
gi|129013                     : TTTT-TAG--TT--A-------T-CG-TATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----G----C----G---G--AC
gi|129014                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCT-CAA-C----A--AAAA--T--G-TGGAC-G--AAGAG----A----C----A---G--ACGGA
gi|129015                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CA-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACGA----A----C----G---G--ATGGACAGAttgatgga
gi|129016                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-T----G--AAAT--T--GGTTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--ACGGACGGA
gi|129017                     : TTTC-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-A--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|129018                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----A--GAAA--T--G-TTGAC----GACAG----A----CAAAGG---G--ACGGACGGA
gi|129019                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-TGTCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACGG----A----T----G---G--ACAGAC
gi|129020                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAT-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GCCAG----A----T----G---A--ACGGACAGAa
gi|129021                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CTA-T----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----A---A--ATGGACAGA
gi|129022                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CAGCA-CAA-C----GA-AAAA--T--A-TTGAT-G--GACAG----A----C--------G--ACTGACAGA
gi|129023                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TAGAC-G--AACGG----A----C----A---G--A
gi|129024                     : TTTT-TAG--TT--A-------T-CG-CGTCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACGG----A----C----A---G--ACGGACGGA
gi|129025                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-TG-CGTCA-CAA-C----G---AAA--T--G-TTGAT-G--GCCGG----A----C----A---G--AC
gi|129026                     : TTTTAGAG--T---A-------T-CG-CGTCA-CAA-C----G--AAAA--TTGG-TTGAC-G--GAC-G----A----C----A---G--ACGGAC
gi|129027                     : TTGT-GAG--TT--A-------T-CA-CA----CAA-C----G--AAAA--C--G-CTGAC-G--GACAG----A----T----G---G--ACTGACAGAa
gi|129028                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-AATCA-CAA-G----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GGCAG----A----C----G---A--ACGGA
gi|129029                     : TCTT-GAG--TT--A-------A-CG-CATCA-CAAAC----G--AAAC--T--G-TTGTC-G--GACAG----A----C----G---A--ACAGACGG
gi|129030                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-TGTCA-CAT-C----A--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACGG----A----C----G---G--AC
gi|129031                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-TAACA-CGA-C----A--AACA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|129036                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CA-CATCA-CAA-T----G--AAAA--T--G-TCAAC-A--GACAG----A----C----G---A--GAGGACGGA
gi|129039                     :  TTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAG-C----G--AAAT--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--GCGGACc
gi|129040                     :  TTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAG-C----G--AAAT--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--GCGGACa
gi|129041                     :  TTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA---------AAAA--T--G-TTGAA-G--GACAG----A----C----G---A--ACAGACGGa
gi|129042                     :  TTT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CAA------G--AAAA--T--G-TTG-C-GA-AACGG----A----C----G---G--GCGGACAGA
gi|129043                     :  TTT-GAG--TTGTA-------T-CG-CATCA-CAA------A--AAAA--T--G-TTGAA-G--GACAG----A----C----G---GCAACAGACGG
gi|129044                     :  TTT-GAGAATT--A-------T-TG-CATCA-CAG-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----A---G--AC
gi|129045                     :  TCT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCAACAAAC----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----G----C----G---A--ACGGACAGA
gi|129046                     :  TTC-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-A----A--CAAA--T--G-TTGAC-G--GACGG----A----C----A---G--A
gi|129047                     :  TTT-GAG--TT--AA------T-CG-TATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGCC-G--GACAG----A----A----C---G--AAGGACGGA
gi|129048                     :  TTT-GAG--TT--A-------T-TG-CGTCA-CAA-T----G--AAAA--T--G-TTGAT-G--GACAG----A----C----cgacaga
gi|129051                     :   TT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---G--GCGGACAGA
gi|129052                     :   TT-GAG--T---A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACGG----A----C----
gi|129053                     :   TT-GAA--TT--A-------T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-A--AATAG----A----C----G---G--ACTGA
gi|129054                     :   TT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----A--AAAAA-T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGGCGGAgaga
gi|129055                     :   TT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----A--AAAAAAT--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGGCGGA
gi|129058                     :   TT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-CTTGAGCTAAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----T----G---A--ACGGACGG
gi|129059                     :   TT-CAG--TT--A-------T-CG-CATCA-TGT-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAA----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|129061                     :   TT-CAG--TT--A-------T-CG-CATCA-AGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----T---A--ACGGACGG
gi|129062                     :   TT-CAG--TT--A-------T-CG-CATCA-AGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----T---A--ACGGACGGgcaga
gi|129066                     :    T-GAA--TT--A-------T-CG-CATCA-CGA-C----A--GAAA--T--G-TTGAC-A--AATAG----A----C----G---G--ACTGAgcaga
gi|129067                     :     -GAG--TT--A-------T-CGGCATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---G--ACgaga
gi|129068                     :     -GAG--TT--A-------T-CG-CACCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----A----G---A--ACTGACGGAtcgtagacaga
gi|129069                     :       AG--TT--A-------T-CG-CATCA-AGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-A--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|129070                     :       AG--TT--A-------T-CG-CATCA-AGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-A--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|129072                     :       AG--CT--A-------T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAT-G--GACAG----A----C----G---G--ACAGATAGA
gi|129074                     :        G--TT--A-------T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGACAG--GACAG----A----C----G---G--GCGGACGGA
gi|129075                     :        G--TT--A-------T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAA---T--G-TTGAC-G--AACGG----A----C----G---G--GCGGACAGA
gi|129076                     :         --TT--A-------T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-A--GACAA----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|129077                     :         --TT--A-------T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-A--GACAA----A----C----G---A--ACGGACGGA





Alignments
lowQualScore                  :     0   00  00 1111111 0  0     0   0 0000 11    11 00 0     0 00     1111 0000 0000 000 00         
lowQualScore                  :     .   ..  .. ....... .  .     .   . .... ..    .. .. .     . ..     .... .... .... ... ..         
lowQualScore                  :     4   55  66 7777777 8  8     4   8 9999 00    33 66 8     4 99     7777 8888 8888 777 66         
consensus                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--ACGGACGGA
Reference ( family-233 )      : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--ACGGACGGA
gi|128961                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---G--ACTGACAGA
gi|128962                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CA-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|128963                     : TTTT-GAG--TA--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAT-G--GACAG----A----C----G---G--ATAGATGGA
gi|128964                     : TTTT-AAG--TT--A-------T-TG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---G--ATTGACAGA
gi|128965                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAT-C----G--AAAA--T--G-TTGAC----AACAG----A----C----G---G--A
gi|128966                     : TTTT-GAG--TT--A-------TTCG-CATCA-CAT-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-A--GACAG----A----C----G---G--ACAGAacaga
gi|128967                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CA-CATCA-CAA-C----G----AA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---G--ACTGACAGA
gi|128968                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAG-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--ATGGACAGA
gi|128969                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-TG-TATCA-CAA-C----A--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---A--ACGGA
gi|128970                     : TTTT-GAA--TT--ACAATGTAT-CG-CATCA-CAA-C----A--AAAT--T--G-TTGAC-A--TACAG----A----C----G---G--ACGGGCAGA
gi|128971                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----A---G--ACGGAC
gi|128972                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CA-CATCA-CAA-C----G--AAAA--C--G-TTGAC-G--TACAG----A----T----G---G--ACTGACAGAa
gi|128973                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGTC-G--GACAG----A----C----G---A--ACAGACGG
gi|128974                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|128975                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-TATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|128976                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-TATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|128977                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--ACGGACGGA
gi|128978                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-TATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACCG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|128979                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAT-C--GACAA----A----C----G---A--ACGGACAGA
gi|128980                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-TAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--A
gi|128981                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----ACGATC----G---G--ACGGACGGA
gi|128982                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CTTCATCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|128983                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAGATAAA----C----G---G--ATGGACGGA
gi|128984                     : TCTT-GAG--TT--A-------A-CT-CATCA-CGA-T----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ATGGACGGA
gi|128985                     : TCTT-GAG--TT--A-------A-CT-CATCA-CGA-T----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ATGGACGGA
gi|128986                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G---AAA--T--GTTTGAT-C--GACAA----A----C----G---A--ACGGACAGA
gi|128987                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CTA-C----G----AA--T--G-TTGAC-GAAGATAA----A----C----G---G--ATGGACGGA
gi|128988                     : TTTT-GAG--TT--A-------TTCG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----A---G--AC
gi|128989                     : TTTT-GAA--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAT----A----C----G---G--ACAGACAG
gi|128990                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACGG----A----C----G---G--GCGGACAGA
gi|128991                     : TCTC-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----AAGCG--ACGGGCGGA
gi|128992                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CAGTA-CAA-C----T---AAA--T--A-TTGA--G--GACAG----A----C----G---G--ACTGACAGAcaga
gi|128993                     : TTTT-GA---TA--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACCT----A----C----G---G---CAGACAG
gi|128994                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-GG-CGT-A-CAA-C----T--AAA---T--A-TTGAT-G---ACAG----A----C----G---G--ACTGACAGA
gi|128996                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----A---G--ACGGA
gi|128997                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-AG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---G--AC
gi|128998                     : TTTT-GAG--GT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----T--AAAA--T--G-TTGGC-G--GACGG----A----C----A---G--ACGGACtaa
gi|128999                     : TTAT-GAG--TT--A-------T-TG-CATCA-CAT-C----G--AAAA--T--G-TTGAT-G--GACGG----A----C----A---G--ACa
gi|129000                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAAT-T--G-TTGAC-A--GACAG----A----T----G---G--ACTGACTGA
gi|129001                     : TTTT-GAG------A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACGG----A----C----G---G--AC
gi|129002                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAA-A--GACAG----G----C----G---A--ACGGACGGA
gi|129003                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--G--T-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--ACGGACcggacaga
gi|129004                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CTTCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAA-A--GACAG----G----C----G---A--ACGGACGGAa
gi|129005                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-TAA-T----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACAGACGGAcggacaga
gi|129006                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-TAA-T----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGATGGA
gi|129007                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-TAA-T----G--AAAA--T--G-CTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGATGGA
gi|129008                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-TAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAT-G--GACAG----A----C----G---A--ACAGATGGA
gi|129009                     : TTTT-GAG--TC--A-------T-CG-CATCA-CAA-A----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----A---G--ACGGACGGA
gi|129010                     : TCTT-GAG--TT--T-------T-CG-CATCA-CAA-C----A--AAAA--T--A-TTGAC-G--GACAGTCGAA----C----G---G--ACGGACGGA
gi|129011                     : TTTT-GA---TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---G--A
gi|129012                     : TTTT-TAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CAA-C----G--AAAA--A--G-TTGAC-A--GACGG----A----C----G---G--ACTGACAGA
gi|129013                     : TTTT-TAG--TT--A-------T-CG-TATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----G----C----G---G--AC
gi|129014                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCT-CAA-C----A--AAAA--T--G-TGGAC-G--AAGAG----A----C----A---G--ACGGA
gi|129015                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CA-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACGA----A----C----G---G--ATGGACAGAttgatgga
gi|129016                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-T----G--AAAT--T--GGTTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--ACGGACGGA
gi|129017                     : TTTC-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-A--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|129018                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----A--GAAA--T--G-TTGAC----GACAG----A----CAAAGG---G--ACGGACGGA
gi|129019                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-TGTCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACGG----A----T----G---G--ACAGAC
gi|129020                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAT-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GCCAG----A----T----G---A--ACGGACAGAa
gi|129021                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CTA-T----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----A---A--ATGGACAGA
gi|129022                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CAGCA-CAA-C----GA-AAAA--T--A-TTGAT-G--GACAG----A----C--------G--ACTGACAGA
gi|129023                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TAGAC-G--AACGG----A----C----A---G--A
gi|129024                     : TTTT-TAG--TT--A-------T-CG-CGTCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACGG----A----C----A---G--ACGGACGGA
gi|129025                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-TG-CGTCA-CAA-C----G---AAA--T--G-TTGAT-G--GCCGG----A----C----A---G--AC
gi|129026                     : TTTTAGAG--T---A-------T-CG-CGTCA-CAA-C----G--AAAA--TTGG-TTGAC-G--GAC-G----A----C----A---G--ACGGAC
gi|129027                     : TTGT-GAG--TT--A-------T-CA-CA----CAA-C----G--AAAA--C--G-CTGAC-G--GACAG----A----T----G---G--ACTGACAGAa
gi|129028                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-AATCA-CAA-G----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GGCAG----A----C----G---A--ACGGA
gi|129029                     : TCTT-GAG--TT--A-------A-CG-CATCA-CAAAC----G--AAAC--T--G-TTGTC-G--GACAG----A----C----G---A--ACAGACGG
gi|129030                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-TGTCA-CAT-C----A--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACGG----A----C----G---G--AC
gi|129031                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-TAACA-CGA-C----A--AACA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|129036                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CA-CATCA-CAA-T----G--AAAA--T--G-TCAAC-A--GACAG----A----C----G---A--GAGGACGGA
gi|129039                     :  TTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAG-C----G--AAAT--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--GCGGACc
gi|129040                     :  TTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAG-C----G--AAAT--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--GCGGACa
gi|129041                     :  TTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA---------AAAA--T--G-TTGAA-G--GACAG----A----C----G---A--ACAGACGGa
gi|129042                     :  TTT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CAA------G--AAAA--T--G-TTG-C-GA-AACGG----A----C----G---G--GCGGACAGA
gi|129043                     :  TTT-GAG--TTGTA-------T-CG-CATCA-CAA------A--AAAA--T--G-TTGAA-G--GACAG----A----C----G---GCAACAGACGG
gi|129044                     :  TTT-GAGAATT--A-------T-TG-CATCA-CAG-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----A---G--AC
gi|129045                     :  TCT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCAACAAAC----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----G----C----G---A--ACGGACAGA
gi|129046                     :  TTC-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-A----A--CAAA--T--G-TTGAC-G--GACGG----A----C----A---G--A
gi|129047                     :  TTT-GAG--TT--AA------T-CG-TATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGCC-G--GACAG----A----A----C---G--AAGGACGGA
gi|129048                     :  TTT-GAG--TT--A-------T-TG-CGTCA-CAA-T----G--AAAA--T--G-TTGAT-G--GACAG----A----C----cgacaga
gi|129051                     :   TT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---G--GCGGACAGA
gi|129052                     :   TT-GAG--T---A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACGG----A----C----
gi|129053                     :   TT-GAA--TT--A-------T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-A--AATAG----A----C----G---G--ACTGA
gi|129054                     :   TT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----A--AAAAA-T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGGCGGAgaga
gi|129055                     :   TT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----A--AAAAAAT--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGGCGGA
gi|129058                     :   TT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-CTTGAGCTAAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----T----G---A--ACGGACGG
gi|129059                     :   TT-CAG--TT--A-------T-CG-CATCA-TGT-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAA----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|129061                     :   TT-CAG--TT--A-------T-CG-CATCA-AGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----T---A--ACGGACGG
gi|129062                     :   TT-CAG--TT--A-------T-CG-CATCA-AGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----T---A--ACGGACGGgcaga
gi|129066                     :    T-GAA--TT--A-------T-CG-CATCA-CGA-C----A--GAAA--T--G-TTGAC-A--AATAG----A----C----G---G--ACTGAgcaga
gi|129067                     :     -GAG--TT--A-------T-CGGCATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---G--ACgaga
gi|129068                     :     -GAG--TT--A-------T-CG-CACCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----A----G---A--ACTGACGGAtcgtagacaga
gi|129069                     :       AG--TT--A-------T-CG-CATCA-AGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-A--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|129070                     :       AG--TT--A-------T-CG-CATCA-AGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-A--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|129072                     :       AG--CT--A-------T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAT-G--GACAG----A----C----G---G--ACAGATAGA
gi|129074                     :        G--TT--A-------T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGACAG--GACAG----A----C----G---G--GCGGACGGA
gi|129075                     :        G--TT--A-------T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAA---T--G-TTGAC-G--AACGG----A----C----G---G--GCGGACAGA
gi|129076                     :         --TT--A-------T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-A--GACAA----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|129077                     :         --TT--A-------T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-A--GACAA----A----C----G---A--ACGGACGGA


blockSeqs                     :                CAATGTA                           AA                   ATAA
blockSeqs                     :                A                                 T                    TCGA
blockSeqs                     :                .                                 A                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   
blockSeqs                     :                .                                 .                    .   


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--ACGGACGGA
finalCons                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--ACGGACGGA





Alignments
lowQualScore                  :     0   00  00 1111111 0  0     0   0 0000 11    11 00 0     0 00     1111 0000 0000 000 00         
lowQualScore                  :     .   ..  .. ....... .  .     .   . .... ..    .. .. .     . ..     .... .... .... ... ..         
lowQualScore                  :     4   55  66 7777777 8  8     4   8 9999 00    33 66 8     4 99     7777 8888 8888 777 66         
consensus                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--ACGGACGGA
Reference ( family-233 )      : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--ACGGACGGA
gi|128961                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---G--ACTGACAGA
gi|128962                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CA-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|128963                     : TTTT-GAG--TA--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAT-G--GACAG----A----C----G---G--ATAGATGGA
gi|128964                     : TTTT-AAG--TT--A-------T-TG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---G--ATTGACAGA
gi|128965                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAT-C----G--AAAA--T--G-TTGAC----AACAG----A----C----G---G--A
gi|128966                     : TTTT-GAG--TT--A-------TTCG-CATCA-CAT-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-A--GACAG----A----C----G---G--ACAGAacaga
gi|128967                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CA-CATCA-CAA-C----G----AA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---G--ACTGACAGA
gi|128968                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAG-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--ATGGACAGA
gi|128969                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-TG-TATCA-CAA-C----A--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---A--ACGGA
gi|128970                     : TTTT-GAA--TT--ACAATGTAT-CG-CATCA-CAA-C----A--AAAT--T--G-TTGAC-A--TACAG----A----C----G---G--ACGGGCAGA
gi|128971                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----A---G--ACGGAC
gi|128972                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CA-CATCA-CAA-C----G--AAAA--C--G-TTGAC-G--TACAG----A----T----G---G--ACTGACAGAa
gi|128973                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGTC-G--GACAG----A----C----G---A--ACAGACGG
gi|128974                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|128975                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-TATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|128976                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-TATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|128977                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--ACGGACGGA
gi|128978                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-TATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACCG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|128979                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAT-C--GACAA----A----C----G---A--ACGGACAGA
gi|128980                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-TAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--A
gi|128981                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----ACGATC----G---G--ACGGACGGA
gi|128982                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CTTCATCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|128983                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAGATAAA----C----G---G--ATGGACGGA
gi|128984                     : TCTT-GAG--TT--A-------A-CT-CATCA-CGA-T----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ATGGACGGA
gi|128985                     : TCTT-GAG--TT--A-------A-CT-CATCA-CGA-T----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ATGGACGGA
gi|128986                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G---AAA--T--GTTTGAT-C--GACAA----A----C----G---A--ACGGACAGA
gi|128987                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CTA-C----G----AA--T--G-TTGAC-GAAGATAA----A----C----G---G--ATGGACGGA
gi|128988                     : TTTT-GAG--TT--A-------TTCG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----A---G--AC
gi|128989                     : TTTT-GAA--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAT----A----C----G---G--ACAGACAG
gi|128990                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACGG----A----C----G---G--GCGGACAGA
gi|128991                     : TCTC-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----AAGCG--ACGGGCGGA
gi|128992                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CAGTA-CAA-C----T---AAA--T--A-TTGA--G--GACAG----A----C----G---G--ACTGACAGAcaga
gi|128993                     : TTTT-GA---TA--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACCT----A----C----G---G---CAGACAG
gi|128994                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-GG-CGT-A-CAA-C----T--AAA---T--A-TTGAT-G---ACAG----A----C----G---G--ACTGACAGA
gi|128996                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----A---G--ACGGA
gi|128997                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-AG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---G--AC
gi|128998                     : TTTT-GAG--GT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----T--AAAA--T--G-TTGGC-G--GACGG----A----C----A---G--ACGGACtaa
gi|128999                     : TTAT-GAG--TT--A-------T-TG-CATCA-CAT-C----G--AAAA--T--G-TTGAT-G--GACGG----A----C----A---G--ACa
gi|129000                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAAT-T--G-TTGAC-A--GACAG----A----T----G---G--ACTGACTGA
gi|129001                     : TTTT-GAG------A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACGG----A----C----G---G--AC
gi|129002                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAA-A--GACAG----G----C----G---A--ACGGACGGA
gi|129003                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--G--T-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--ACGGACcggacaga
gi|129004                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CTTCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAA-A--GACAG----G----C----G---A--ACGGACGGAa
gi|129005                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-TAA-T----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACAGACGGAcggacaga
gi|129006                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-TAA-T----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGATGGA
gi|129007                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-TAA-T----G--AAAA--T--G-CTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGATGGA
gi|129008                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-TAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAT-G--GACAG----A----C----G---A--ACAGATGGA
gi|129009                     : TTTT-GAG--TC--A-------T-CG-CATCA-CAA-A----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----A---G--ACGGACGGA
gi|129010                     : TCTT-GAG--TT--T-------T-CG-CATCA-CAA-C----A--AAAA--T--A-TTGAC-G--GACAGTCGAA----C----G---G--ACGGACGGA
gi|129011                     : TTTT-GA---TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---G--A
gi|129012                     : TTTT-TAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CAA-C----G--AAAA--A--G-TTGAC-A--GACGG----A----C----G---G--ACTGACAGA
gi|129013                     : TTTT-TAG--TT--A-------T-CG-TATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----G----C----G---G--AC
gi|129014                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCT-CAA-C----A--AAAA--T--G-TGGAC-G--AAGAG----A----C----A---G--ACGGA
gi|129015                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CA-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACGA----A----C----G---G--ATGGACAGAttgatgga
gi|129016                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-T----G--AAAT--T--GGTTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--ACGGACGGA
gi|129017                     : TTTC-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-A--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|129018                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----A--GAAA--T--G-TTGAC----GACAG----A----CAAAGG---G--ACGGACGGA
gi|129019                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-TGTCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACGG----A----T----G---G--ACAGAC
gi|129020                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAT-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GCCAG----A----T----G---A--ACGGACAGAa
gi|129021                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CTA-T----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----A---A--ATGGACAGA
gi|129022                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-CAGCA-CAA-C----GA-AAAA--T--A-TTGAT-G--GACAG----A----C--------G--ACTGACAGA
gi|129023                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TAGAC-G--AACGG----A----C----A---G--A
gi|129024                     : TTTT-TAG--TT--A-------T-CG-CGTCA-CTA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACGG----A----C----A---G--ACGGACGGA
gi|129025                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-TG-CGTCA-CAA-C----G---AAA--T--G-TTGAT-G--GCCGG----A----C----A---G--AC
gi|129026                     : TTTTAGAG--T---A-------T-CG-CGTCA-CAA-C----G--AAAA--TTGG-TTGAC-G--GAC-G----A----C----A---G--ACGGAC
gi|129027                     : TTGT-GAG--TT--A-------T-CA-CA----CAA-C----G--AAAA--C--G-CTGAC-G--GACAG----A----T----G---G--ACTGACAGAa
gi|129028                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CG-AATCA-CAA-G----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GGCAG----A----C----G---A--ACGGA
gi|129029                     : TCTT-GAG--TT--A-------A-CG-CATCA-CAAAC----G--AAAC--T--G-TTGTC-G--GACAG----A----C----G---A--ACAGACGG
gi|129030                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-TGTCA-CAT-C----A--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACGG----A----C----G---G--AC
gi|129031                     : TTTT-GAG--TT--A-------T-CG-TAACA-CGA-C----A--AACA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|129036                     : TCTT-GAG--TT--A-------T-CA-CATCA-CAA-T----G--AAAA--T--G-TCAAC-A--GACAG----A----C----G---A--GAGGACGGA
gi|129039                     :  TTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAG-C----G--AAAT--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--GCGGACc
gi|129040                     :  TTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAG-C----G--AAAT--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---G--GCGGACa
gi|129041                     :  TTT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA---------AAAA--T--G-TTGAA-G--GACAG----A----C----G---A--ACAGACGGa
gi|129042                     :  TTT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CAA------G--AAAA--T--G-TTG-C-GA-AACGG----A----C----G---G--GCGGACAGA
gi|129043                     :  TTT-GAG--TTGTA-------T-CG-CATCA-CAA------A--AAAA--T--G-TTGAA-G--GACAG----A----C----G---GCAACAGACGG
gi|129044                     :  TTT-GAGAATT--A-------T-TG-CATCA-CAG-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----A---G--AC
gi|129045                     :  TCT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCAACAAAC----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----G----C----G---A--ACGGACAGA
gi|129046                     :  TTC-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-A----A--CAAA--T--G-TTGAC-G--GACGG----A----C----A---G--A
gi|129047                     :  TTT-GAG--TT--AA------T-CG-TATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGCC-G--GACAG----A----A----C---G--AAGGACGGA
gi|129048                     :  TTT-GAG--TT--A-------T-TG-CGTCA-CAA-T----G--AAAA--T--G-TTGAT-G--GACAG----A----C----cgacaga
gi|129051                     :   TT-GAG--TT--A-------T-CT-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---G--GCGGACAGA
gi|129052                     :   TT-GAG--T---A-------T-CG-CATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACGG----A----C----
gi|129053                     :   TT-GAA--TT--A-------T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-A--AATAG----A----C----G---G--ACTGA
gi|129054                     :   TT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----A--AAAAA-T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGGCGGAgaga
gi|129055                     :   TT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-C----A--AAAAAAT--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----G---A--ACGGGCGGA
gi|129058                     :   TT-GAG--TT--A-------T-CG-CATCA-CAA-CTTGAGCTAAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----T----G---A--ACGGACGG
gi|129059                     :   TT-CAG--TT--A-------T-CG-CATCA-TGT-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAA----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|129061                     :   TT-CAG--TT--A-------T-CG-CATCA-AGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----T---A--ACGGACGG
gi|129062                     :   TT-CAG--TT--A-------T-CG-CATCA-AGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--GACAG----A----C----T---A--ACGGACGGgcaga
gi|129066                     :    T-GAA--TT--A-------T-CG-CATCA-CGA-C----A--GAAA--T--G-TTGAC-A--AATAG----A----C----G---G--ACTGAgcaga
gi|129067                     :     -GAG--TT--A-------T-CGGCATCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----C----G---G--ACgaga
gi|129068                     :     -GAG--TT--A-------T-CG-CACCA-CAA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-G--AACAG----A----A----G---A--ACTGACGGAtcgtagacaga
gi|129069                     :       AG--TT--A-------T-CG-CATCA-AGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-A--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|129070                     :       AG--TT--A-------T-CG-CATCA-AGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-A--GACAG----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|129072                     :       AG--CT--A-------T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAT-G--GACAG----A----C----G---G--ACAGATAGA
gi|129074                     :        G--TT--A-------T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGACAG--GACAG----A----C----G---G--GCGGACGGA
gi|129075                     :        G--TT--A-------T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAA---T--G-TTGAC-G--AACGG----A----C----G---G--GCGGACAGA
gi|129076                     :         --TT--A-------T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-A--GACAA----A----C----G---A--ACGGACGGA
gi|129077                     :         --TT--A-------T-CG-CATCA-CGA-C----G--AAAA--T--G-TTGAC-A--GACAA----A----C----G---A--ACGGACGGA