lowQualScore : 11111111111
lowQualScore : 0 1 22 0 22222 0 2222 0 1 111 33333333333 11 0 666666 11 33 222 1 0 33333333333 0 00 00 1 0 0 1 00 0 11 1111 0 222 000 222 11 0000 0 00 0 0 0 11111 4444444444 0 0 0 00 11 11
lowQualScore : . . .. . ..... . .... . . ... ........... .. . ...... .. .. ... . . ........... . .. .. . . . . .. . .. .... . ... ... ... .. .... . .. . . . ..... .......... . . . .. .. ..
lowQualScore : 7 4 22 6 77777 6 3333 6 9 111 88888888888 44 6 555555 44 55 444 1 6 22222222222 6 88 88 1 5 4 6 66 4 00 3333 8 222 777 666 11 8888 4 55 4 8 4 88888 1111111111 4 4 4 66 44 44
consensus : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA----------NT--T-CT-C---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
Reference ( gi|81402 ) : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA----------AT--T-CT-C---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81404 : AAA-ATTT-C--A-T-----C-TG----TT-TA-TGA---AAATTA----------AT--T-TT-C---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81406 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA----------AT--T-CT-C---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-T---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--AGGCCCG
gi|81403 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATCA----------AT--T-CT-C---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-TA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-CTATATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81408 : AAA-AATT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---ACATTA----------AT--T-CT-C---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TAG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81405 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TAA---AAATCA----------AT--T-CT-A---A--A--G---TT-A-GA-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCATG
gi|81407 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TA----TC-TA-TGA---AAATTA----------TG--T-CT-C---A--A--G---TT-A-AC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81409 : AAA-ATTT-C--A-A-----T-TC----TT-TA-TGA---AAATAA----------AT--T-CT-C---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAT-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCCG
gi|81410 : AAA-GTTT-C--A-T-----T-AA----AT-TA-TGA---AAATTA----------AT--T-CT-C---A--A--G---TT-A-AC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAT-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81411 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-CA----TT-TA-TGA---AAATTG----------TT--T-CA-A---A--A--A---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--AGGTCTG
gi|81415 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA----------AT--T-CT-A---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-----------------------------AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81420 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---GAATT-----------------CT-C---A--A--A---TTCA-GC-----------TG-GG--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-CAT-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81418 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TCA---AAATTA----------TT--T-TT-C---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-AT--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----AT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GAGCC
gi|81412 : AAA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-CA-TGA---AAATTA----------TT--T-CA-A---A--G--G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-G---T---T---CA--G----T-C--TACT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81413 : AAA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-CT-TGA---AAATTA----------TT--T-CA-G---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GC-C---TTAAT---AA--G----T-C--TACT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81416 : AAA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AATTTA----------TT--T-CA-A---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-GG--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---TTTAAA--G----T-C--TTTT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGTCTG
gi|81417 : AAA-ATTG-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA--------------T-TT-C---A--AACG---TT-A-GC-----------TG-AA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA-------T-T--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AAGCCTG
gi|81422 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---GAATTA----------TT--T-AA-A---A--A--G---TA-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAT-----TT----------T-A-TGA-TC--TT--G--AGACC
gi|81425 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA----------AT--T-TT-G---A--A--G---TT-A-GC-----------AG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GAGC---T---T---AA--G----T-C--TA-T-C-T-CGT-----TT----------C-ATTGG-TC--TT--GA-AGGCCT
gi|81419 : AAA-ATTT-T--G-T-----T-TG----TT-TT-TGA---AAATGA----------TT--T-TG-A---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-T-GAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81421 : AAA-GTTT-C--A-T-----T-TA----TA-AA-AGA---AAATTA----------TT--T-CT-C---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-AA--T--T-T-G-AAA-T--C-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATC-A-G-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81414 : AAA-ATTT-T--AAT-----T-TG----TT-TAATGG---AAAT-A----------AT--T-C--C---A--A--G---TT-A-GA-----------TG-GA--T--T-T-G-AAAAT--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC---T--G--AGGC
gi|81424 : AAA-ATGT-A--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA----------TT--T-CA-A---A--A--G---TT-A-GC-----------CA-AA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----AA-C---T---T---AC--G----T-C--AATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81427 : AAA-ATTT-CC-A-T-----T-AGGT--TT-TA-TGA---AAATTA----------AT--T-CTTC---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAATT--T-T--AGATCGA-C---T---TAA-AA--G----T-C--TA-T-C-T-CAG------T----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81429 : AAA-ATTT-G--A-T-----T--G----TT-TA-TGA---AAATTA----------TT--T-CC-C---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-AA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----G---------------A--G----T-C--TAAT-C-T-CAG-----GT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81428 : AAA-ATTT-C--A-T-----TAGG----TT-TA-TGA---AAATTA----------AT--T-CT-C---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA----------------------T-C--GA---C-T-TA------TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81426 : AAC-ATTT-C--A-T-----T-TG----TC-TA-TGA---AAATAA----------TT--T-CT-C---A--A--G---TT-A-GA-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-G--A----GA-C-------T---A----------C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TTGAG--AGGTCTG
gi|81437 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----CT-TA-TGA---AAATTA----------TG--T-TT-C---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-ACA-T--T-T--A----GA-A---T---G---AA--G----A-T--TATT-C-T-CAG-----TG----------T-A-TGG-TC--TT--G--TGGC
gi|81434 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---ATATCA----------TT--T-CT-C---A--C--G---TT-A-GT-----------TG-AA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATT-C-T-TAC-----TT----------T-G-TGG-TC--TT--G--
gi|81432 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TAA---AAATTAT---------TT--T-TT-C---A--A--G---TT-G-GC-----------TG-A------T-T-G-AAA-T--T-T--A----AA-C-------T---AA--G----T----TATC-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81423 : AAA-ATTT-TT-A-T-----T-TA----TT-TA-TGA---AAATTA----------TG--T-CT-T---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---TCA-AA--G----C-C--TTTT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--T
gi|81436 : AAA-ATTTTC--A-T-----T-TG----TT-TA-TAG---AAATTA----------TC--T-CT-CA--A--A--G---TT-A-AT-----------TG-GA--T--T-T-G-AAAGT--T-T--A----GA-A---C---T---AA--G----T-C--TA-T-C-T-CAGT----TT----------T-A-TGGATC--TT--G--AGGCCTG
gi|81438 : AAA-ATTT-G--T-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATGA----------AT--T-CT-C---A--A--G----T-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-CA--T---T---AA--G----TCC--TATT---T-C-G-----TT----------TAA-TGG-TCTTTT--G--AGGTCTG
gi|81431 : AAA-ATTTTC--A-T-----T-TG----TT-TAATGA---AAATCA----------AT--T-CTGC---A--AC-G---TT-A-GC-----------TG--A--T--T-T-G-AAAAT--T-T--A----GAGC---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TTACATAATATAT-A-TGG-TC--TT-----AGGCCTG
gi|81440 : AAA-ATTT-TCAA-T-----T-TG----TT-TA-CGAGAAAAATTA--------------T-TT-C---A--ATAG---AT-A-GC-----------TG-GA--T--T---G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A------C--TT--G--AGGCCTG
gi|81446 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TG-TGA---AAATTA----------TT--T-CA-A---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA---------A----GT-C---T--------A--G------C--TTTT-C-T-CAG-----TTTA--------T-A-TGG-TC--TC--G--GGGCCTG
gi|81445 : AAATATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA----------AT--T-CT-C---AG-A--G---TT-A-GC-----------TG-CA--T--TCT-GCAAA-T--T-T-------GA-C---T---T---AG--A----T-C--TTTC-C-T-CAG-----TT----------A-A-TGG-TG--TT-----AGGCC
gi|81444 : AAC-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-AA-TGA---AAATTA----------CT--T-CA-A---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-CA--T--T-T-G-AAA-T--T-C--A----GA-A---G---T---AA--G----T-C--TCTT-C-T-CAG-----TG----------T-A-TGG-TT--TT--G--GAGTC
gi|81442 : AAA-ATGT-C--A-C-----T-TG----TTATAATAA---AAATTAGA--------AT--T-CT-----A--A--G---T--A-G------------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-CTT-CAG-----TT----------T-A-T-G-TC--TT--G--ATACCTG
gi|81433 : AAA-ATCT-T--A-T-----T-TG----CT-CA-TGA---AAATTA----------TT--T-CA-A---A--A--G---TT-A-GT-----------TG-GA--T--T-G-A-AAA-T--T-T--A----GA-T---G---T---TC--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GAGACT
gi|81439 : AAA-ATTC-C--A-T-----G-TC----TT-TA-TCA---AATTCA----------TT--T-CA-A---A--A--G---TT-A--T-----------TGAGA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--A----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--AA--G--AGGCCTG
gi|81441 : AAA-ATTT-C--A-G-----T-TG----TT-TG-TGA---AAA---------------------------------------A-GC-----------TG-GA--T--T-T-T-AGA-T--T-TT-A----GA-C---T---T---A---G----T-C--TAAT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81435 : AAA-ATTC-T--A-T-----T-TG----GT-TA-TGA---AAGTTA----------TT--T-CA-A---A--A--G---TT-A-GT-----------TG-GA-------------------------------C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-CC--TT--G--ACGCCTG
gi|81452 : AAA-ATTT-T--A-G-----T-TC----TT-TA-TGA---AATTTACTTTGTGAAAATGAT-TT-C---A--A--GCA-TT-A-GC-----------TG-GG--T--T-T-G-----T--T-T--A----G------T---T---AA--G----T-C--TATC-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--AGGCCTG
gi|81453 : AAG-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TT-TGA---TAATTA-----------T--T-AA-A---A--A--G---TT-A-GC-----------TG--A--T--T-T-G-AA--T--T-T--A----GA-G---G---T---A---G----T----TATTTC-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81449 : AAA-ATTT-T--A-C-----T-TG----TT-TA-T-----AAATTA----------TT--T-TA-A---A--A--G---TT-A-GC-----------CG--A--T--T-T-G-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-
gi|81454 : AAA-ATGT----G-T-----T-TG----TT--A-TGA---AAATTA--------------T-CT-C---A--AC-G---TT-A-GC-----------TG-TT--A--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---TA--AA--G----T-C--TATT-G-T-CAG-----TC----------T-A-GTG-TC--TT--G--AG
gi|81451 : aAAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA----------TT--T-CA-A---A--A--G---TT-A-CCTCTTTTTTTTTTA-GA--T--T-T-T-AGA-C--T-T--A----A------T---T---AA--A----T-A--TATT-C-T-CAA-----TC----------A-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81448 : AAA-ATTT-C--A-T-----G-TG----T---A-TCA---AAATTA---------------------------------TT-G-A---------------GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-T--TATT-C-T-CAG-----TG----------T-A-TGG-TC--TT--C--AAGCC
gi|81458 : AA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA----------AT--TCCT-C---A--A--GT--TT-A-GC-----------TG-GA--C--T-T-T-AAA-T--T-T--AG---GA-C---T---C---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TTTA--------T-A-TGG-TC--TT--GA-AGGC
gi|81459 : AA-ATTT-C--A-TAAAATT-TACAACTT-TA-GGA---AAAT-A----------ATG-T-CT-C---A--A--T---TT-A-GC-----------TG-GG--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----CA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81461 : AA-ATTT-C--A-TATT--T-TG----TT-TA---A---AAATTA----------AT--T-CT-TTTAATTA--G---TT-A-AA-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-TTAA----GA-C---T---T---AA--T----C-T--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--CT--T--GGGCCTG
gi|81462 : AA-ATTT-C--A----------A----TT-TA--GA---AAAATA----------AT--G-TT-C---A--C--T---TTTA-GC-----------TG-GA--T--T-TTG-AAA-TGGT-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC---T--G--AGG
gi|81460 : AA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA----------TT--T-CA-A---A--A--G---TT-A-GC-----------T--------------------------------GA-C---T---T---A--------T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TT--TA--G--AGCCCTG
gi|81463 : A-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-CA-CGA---AAATTA----------TT--T-CT-C---A--A--G---TT-A-GG-----------TA-GA--T--T-T-G-AAA-T--C-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AAGCCCG
gi|81466 : -ATTT-T--T-T-----T-TG----TT-AA---A---AAACTATA--------AA--T-CT-T---A--A--G---AT-A-TA-----------AG-TA--A--T-C-A-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TC----------T-A-TGG-TC--TT--G--
gi|81469 : TTT-T--T-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA----------TT--T-CA-A---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-C-A-AAA-T--T-T--A----GA-C-------T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81470 : TTT-T--T-T-----T-TG----TT-TA-TG----AAATTA--------------T-TT-CAAAA--A--G---TT-AGGC-----------TG-GA--T--T-C-A-AAA-T--T-T--A----GA-C-------T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81471 : TTT-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TTA---ACATT------------T--T-TT-C---A--AAAG---TT-A-GT-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---G---C---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----AT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AG
gi|81472 : TTT-T--A-T-----T-T-----TT-AA-TGA---TAACTA----------TT--T-CA-A---A--A--G---TT-A----------------------------------T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-TAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81473 : --A-T-----T-TG----TT-T--TGA---TAATTA----------AT--T-CT-----A--A--G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--TCT-G-AAA-T--TCT--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TAT--C-T-CAG-----TT----------T-T-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81474 : --A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA----------TT--T-AT-C---A--A--A------A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-CAT-T---T---AAAAG----T-C--TATT-C-T-CAT-----GT----------T-A-TGA-TC--TT--G--AGGC
gi|81477 : -T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA----------TT--T-CA-A---A--A--G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--GTCGAT-C--TATT-C-T-CAG-----TTTTA-------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81478 : -TA-TGA---AAATTG----------CT--T-CA-A---A--A--G---TT-A-GC-----------CG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----AA-CGT-T---T---A--------T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGA-AT--TT--G--AGGC
gi|81482 : tcataAATCA----------TT--T-CA-C---A--A--G---TT-A-GG-----------TA-TAGTT--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGT-TC--TT--G--ATGCC
gi|81486 : TTA----------TT--T-CA-A---A--A--C---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-A-AAA-T--T-T--A----GA-T---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--
gi|81497 : TA----------TT--T-CT-C---A--A--G---AT-A-TA-----------AG-TA--A--T-C-A-AAA-T--T-T--A----AA-C---T---T---AA--A----T-C--GATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--T--AGGCCTG
gi|81492 : TA----------AA--T-CT-T---A--A--G------A-TC-----------TG-AG--TAAT-C-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-T--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGCC
gi|81500 : TA----------AA--T-CT-T---A--A--GATATT-A--C-----------TG-A------T-C-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---C---T---AA--A----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-G-TGG-TC--TT--C--AGGCCTG
gi|81505 : A----------AA--T-CT-T---A--A--G---AT-A-ATG----------TG-G------T-C-A-AAA-G--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--C--GGGCCTG
gi|81440 : -CT-C---A--A--G---TA-A-AC-----------TG-A----------G-AA-------T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TA
gi|81480 : aaaattttcaatttgtttacgagaaaaattatttcaatagatagctggattgaaattT-A-AC-----------TG-A------T-C-G-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---G---AA--A----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TTG-G--AGGCCgcctg
gi|81507 : tgaaacatatgcttaagatatacatgA--T--T-C-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---TC--AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-AC--TT--GGTGGGCC
gi|81483 : cttaagatataagta--T-T-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TGTT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81517 : atcaatcttgagatataagtaa-T-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGCC
gi|81481 : -AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81491 : aaagtaaatcgtaagatacaagtcatc-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81515 : taaatcttaagatataagtaatca-AAA-T--T-T--A----GA-T---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--GGGCCTG
gi|81487 : gtaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81509 : taaatctgaagatataagaaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-TTCAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81476 : tggattagtatatca-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TCG-TC--TT--G--ATACCTG
gi|81495 : tttatttttaaacatatgtgttataaatcttaagatataagtaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---C---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81511 : taaatcttaagatataagt-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--GGGCCTG
gi|81490 : agaagtgatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81513 : taaatcttaagatatatacgtaatca-AAA-T--T-T--T----GA-T---T---T---GA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGA-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81489 : gtaatca-AAA-T--T-T-------GA-C---T---T---AA--G----T-T--TATT-A-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81508 : taaatcttgagatataagtaataaa-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---G---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--C--AGGCC
gi|81494 : taagtacagtgtaatca-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAG-----TT----------C-A-TGG-TC--TT--G--AG
gi|81514 : taagtcttgagatataagcaatca-AAA-T--T-T--T----AA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81501 : gtaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--
gi|81493 : taaatattaagaaataggtaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--C--TGGTCT
gi|81498 : taaatcttaagatataagtaatca-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---C---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TA--TT--G--AGACTT
gi|81499 : taaatcttaagatataagtaataa-AAA-T--T-T--A----AA-CAATT---T---AAAAG----T-C--TATT-C-T-CAG-----TTTA--------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81484 : taaatcgtaagatataagtaatca-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATC-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TTG-G--AGG
gi|81502 : ttaaatctttataagtaatca-AAA-T--T-T--T----AA-A---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGCC
gi|81518 : tagttttaagaaattacatgcatgtgatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-T--CATT-C-T-CAGT----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGTCTG
gi|81516 : a-AAC-T--T-T--T----GA-C---T---T---GA--A------A--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81504 : gtaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAGTTAACTT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GAGCC
gi|81506 : aaatcttaaggtataagtaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---G---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-
gi|81488 : tcttaagatgtatgtaatcaAA-T--C-A--A----AA-T---T---T---AG--G----C-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81521 : taaatcttaagatataagt---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111
lowQualScore : 0 1 22 0 22222 0 2222 0 1 111 4444 00 0 222222222222222222 11 1 222 1 0 33333333333 0 00 00 1 0 0 1 00 0 11 1111 0 222 000 222 11 0000 0 00 0 0 0 11111 4444444444 0 0 0 00 11 11
lowQualScore : . . .. . ..... . .... . . ... .... .. . .................. .. . ... . . ........... . .. .. . . . . .. . .. .... . ... ... ... .. .... . .. . . . ..... .......... . . . .. .. ..
lowQualScore : 7 3 22 6 77777 6 2222 6 9 111 0000 88 6 000000000000000000 44 1 444 1 6 22222222222 6 88 88 1 5 4 6 66 4 00 3333 8 222 777 666 11 8888 4 55 4 8 4 88888 1111111111 4 4 4 66 44 44
consensus : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA-T--T--T-C------------T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
Reference ( family-232 ) : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA-N--T--T-C------------T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81402 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA-A--T--T-C------------T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81403 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATCA-A--T--T-C------------T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-TA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-CTATATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81404 : AAA-ATTT-C--A-T-----C-TG----TT-TA-TGA---AAATTA-A--T--T-T------------T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81405 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TAA---AAATCA-A--T--T-C------------T-A---A--A-G---TT-A-GA-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCATG
gi|81406 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA-A--T--T-C------------T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-T---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--AGGCCCG
gi|81407 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TA----TC-TA-TGA---AAATTA-T--G--T-C------------T-C---A--A-G---TT-A-AC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81408 : AAA-AATT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---ACATTA-A--T--T-C------------T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TAG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81409 : AAA-ATTT-C--A-A-----T-TC----TT-TA-TGA---AAATAA-A--T--T-C------------T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAT-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCCG
gi|81410 : AAA-GTTT-C--A-T-----T-AA----AT-TA-TGA---AAATTA-A--T--T-C------------T-C---A--A-G---TT-A-AC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAT-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81411 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-CA----TT-TA-TGA---AAATTG-T--T--T-C------------A-A---A--A-A---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--AGGTCTG
gi|81412 : AAA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-CA-TGA---AAATTA-T--T--T-C------------A-A---A--G-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-G---T---T---CA--G----T-C--TACT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81413 : AAA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-CT-TGA---AAATTA-T--T--T-C------------A-G---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GC-C---TTAAT---AA--G----T-C--TACT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81414 : AAA-ATTT-T--AAT-----T-TG----TT-TAATGG---AAAT-A-A--T--T-C--------------C---A--A-G---TT-A-GA-----------TG-GA--T--T-T-G-AAAAT--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC---T--G--AGGC
gi|81415 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA-A--T--T-C------------T-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-----------------------------AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81416 : AAA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AATTTA-T--T--T-C------------A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GG--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---TTTAAA--G----T-C--TTTT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGTCTG
gi|81417 : AAA-ATTG-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA-T--T--T-C------------A-A---A--C-G---TT-A-GC-----------TG-AA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA-------T-T--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AAGCCTG
gi|81418 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TCA---AAATTA-T--T--T-T------------T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-AT--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----AT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GAGCC
gi|81419 : AAA-ATTT-T--G-T-----T-TG----TT-TT-TGA---AAATGA-T--T--T-T------------G-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-T-GAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81420 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---GAATT----------C------------T-C---A--A-A---TTCA-GC-----------TG-GG--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-CAT-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81421 : AAA-GTTT-C--A-T-----T-TA----TA-AA-AGA---AAATTA-T--T--T-C------------T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-AA--T--T-T-G-AAA-T--C-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATC-A-G-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81422 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---GAATTA-T--T--T-A------------A-A---A--A-G---TA-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAT-----TT----------T-A-TGA-TC--TT--G--AGACC
gi|81423 : AAA-ATTT-TT-A-T-----T-TA----TT-TA-TGA---AAATTA-T--G--T-C------------T-T---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---TCA-AA--G----C-C--TTTT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--T
gi|81424 : AAA-ATGT-A--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA-T--T--T-C------------A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------CA-AA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----AA-C---T---T---AC--G----T-C--AATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81425 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA-A--T--T-T------------T-G---A--A-G---TT-A-GC-----------AG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GAGC---T---T---AA--G----T-C--TA-T-C-T-CGT-----TT----------C-ATTGG-TC--TT--GA-AGGCCT
gi|81426 : AAC-ATTT-C--A-T-----T-TG----TC-TA-TGA---AAATAA-T--T--T-C------------T-C---A--A-G---TT-A-GA-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-G--A----GA-C-------T---A----------C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TTGAG--AGGTCTG
gi|81427 : AAA-ATTT-CC-A-T-----T-AGGT--TT-TA-TGA---AAATTA-A--T--T-C------------TTC---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAATT--T-T--AGATCGA-C---T---TAA-AA--G----T-C--TA-T-C-T-CAG------T----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81428 : AAA-ATTT-C--A-T-----TAGG----TT-TA-TGA---AAATTA-A--T--T-C------------T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA----------------------T-C--GA---C-T-TA------TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81429 : AAA-ATTT-G--A-T-----T--G----TT-TA-TGA---AAATTA-T--T--T-C------------C-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-AA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----G---------------A--G----T-C--TAAT-C-T-CAG-----GT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81431 : AAA-ATTTTC--A-T-----T-TG----TT-TAATGA---AAATCA-A--T--T-C------------TGC---A--ACG---TT-A-GC-----------TG--A--T--T-T-G-AAAAT--T-T--A----GAGC---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TTACATAATATAT-A-TGG-TC--TT-----AGGCCTG
gi|81432 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TAA---AAATTATT--T--T-T------------T-C---A--A-G---TT-G-GC-----------TG-A------T-T-G-AAA-T--T-T--A----AA-C-------T---AA--G----T----TATC-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81433 : AAA-ATCT-T--A-T-----T-TG----CT-CA-TGA---AAATTA-T--T--T-C------------A-A---A--A-G---TT-A-GT-----------TG-GA--T--T-G-A-AAA-T--T-T--A----GA-T---G---T---TC--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GAGACT
gi|81434 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---ATATCA-T--T--T-C------------T-C---A--C-G---TT-A-GT-----------TG-AA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATT-C-T-TAC-----TT----------T-G-TGG-TC--TT--G--
gi|81435 : AAA-ATTC-T--A-T-----T-TG----GT-TA-TGA---AAGTTA-T--T--T-C------------A-A---A--A-G---TT-A-GT-----------TG-GA-------------------------------C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-CC--TT--G--ACGCCTG
gi|81436 : AAA-ATTTTC--A-T-----T-TG----TT-TA-TAG---AAATTA-T--C--T-C------------T-CA--A--A-G---TT-A-AT-----------TG-GA--T--T-T-G-AAAGT--T-T--A----GA-A---C---T---AA--G----T-C--TA-T-C-T-CAGT----TT----------T-A-TGGATC--TT--G--AGGCCTG
gi|81437 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----CT-TA-TGA---AAATTA-T--G--T-T------------T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-ACA-T--T-T--A----GA-A---T---G---AA--G----A-T--TATT-C-T-CAG-----TG----------T-A-TGG-TC--TT--G--TGGC
gi|81438 : AAA-ATTT-G--T-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATGA-A--T--T-C------------T-C---A--A-G----T-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-CA--T---T---AA--G----TCC--TATT---T-C-G-----TT----------TAA-TGG-TCTTTT--G--AGGTCTG
gi|81439 : AAA-ATTC-C--A-T-----G-TC----TT-TA-TCA---AATTCA-T--T--T-C------------A-A---A--A-G---TT-A--T-----------TGAGA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--A----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--AA--G--AGGCCTG
gi|81440 : AAA-ATTT-TCAA-T-----T-TG----TT-TA-CGAGAAAAATTA-T--T--T-C------------A-A---T--A-G---AT-A-GC-----------TG-GA--T--T---G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A------C--TT--G--AGGCCTG
gi|81441 : AAA-ATTT-C--A-G-----T-TG----TT-TG-TGA---AAA-------------------------------------------A-GC-----------TG-GA--T--T-T-T-AGA-T--T-TT-A----GA-C---T---T---A---G----T-C--TAAT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81442 : AAA-ATGT-C--A-C-----T-TG----TTATAATAA---AAATTA-GAAT--T-C------------T-----A--A-G---T--A-G------------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-CTT-CAG-----TT----------T-A-T-G-TC--TT--G--ATACCTG
gi|81444 : AAC-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-AA-TGA---AAATTA-C--T--T-C------------A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-CA--T--T-T-G-AAA-T--T-C--A----GA-A---G---T---AA--G----T-C--TCTT-C-T-CAG-----TG----------T-A-TGG-TT--TT--G--GAGTC
gi|81445 : AAATATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA-A--T--T-C------------T-C---AG-A-G---TT-A-GC-----------TG-CA--T--TCT-GCAAA-T--T-T-------GA-C---T---T---AG--A----T-C--TTTC-C-T-CAG-----TT----------A-A-TGG-TG--TT-----AGGCC
gi|81446 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TG-TGA---AAATTA-T--T--T-C------------A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA---------A----GT-C---T--------A--G------C--TTTT-C-T-CAG-----TTTA--------T-A-TGG-TC--TC--G--GGGCCTG
gi|81448 : AAA-ATTT-C--A-T-----G-TG----T---A-TCA---AAATTA-T--T-------------------------------------G-------------A-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-T--TATT-C-T-CAG-----TG----------T-A-TGG-TC--TT--C--AAGCC
gi|81449 : AAA-ATTT-T--A-C-----T-TG----TT-TA-T-----AAATTA-T--T--T-T------------A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------CG--A--T--T-T-G-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-
gi|81451 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA-T--T--T-C------------A-A---A--A-G---TT-A-CCTCTTTTTTTTTTA-GA--T--T-T-T-AGA-C--T-T--A----A------T---T---AA--A----T-A--TATT-C-T-CAA-----TC----------A-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81452 : AAA-ATTT-T--A-G-----T-TC----TT-TA-TGA---AATTTA-C--T--T-TGTGAAAATGATTT-C---A--A-GCA-TT-A-GC-----------TG-GG--T--T-T-G-----T--T-T--A----G------T---T---AA--G----T-C--TATC-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--AGGCCTG
gi|81453 : AAG-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TT-TGA---TAATTA----T--T-A------------A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG--A--T--T-T-G-AA--T--T-T--A----GA-G---G---T---A---G----T----TATTTC-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81454 : AAA-ATGT----G-T-----T-TG----TT--A-TGA---AAATTA-------T-C------------T-C---A--ACG---TT-A-GC-----------TG-TT--A--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---TA--AA--G----T-C--TATT-G-T-CAG-----TC----------T-A-GTG-TC--TT--G--AG
gi|81458 : aAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA-A--T--TCC------------T-C---A--A-GT--TT-A-GC-----------TG-GA--C--T-T-T-AAA-T--T-T--AG---GA-C---T---C---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TTTA--------T-A-TGG-TC--TT--GA-AGGC
gi|81459 : AA-ATTT-C--A-TAAAATT-TACAACTT-TA-GGA---AAATAA-T--G--T-C------------T-C---A--A-T---TT-A-GC-----------TG-GG--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----CA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81460 : AA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA-T--T--T-C------------A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------T--------------------------------GA-C---T---T---A--------T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TT--TA--G--AGCCCTG
gi|81461 : AA-ATTT-C--A-TATT--T-TG----TT-TA---A---AAATTA-A--T--T-C------------T-TTTAATTA-G---TT-A-AA-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-TTAA----GA-C---T---T---AA--T----C-T--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--CT--T--GGGCCTG
gi|81462 : AA-ATTT-C--A----------A----TT-TA--GA---AAAATA-A--T--G-T------------T-C---A--C-T---TTTA-GC-----------TG-GA--T--T-TTG-AAA-TGGT-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC---T--G--AGG
gi|81463 : A-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-CA-CGA---AAATTA-T--T--T-C------------T-C---A--A-G---TT-A-GG-----------TA-GA--T--T-T-G-AAA-T--C-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AAGCCCG
gi|81466 : -ATTT-T--T-T-----T-TG----TT-AA---A---AAACTA-T--AAAT-C------------T-T---A--A-G---AT-A-TA-----------AG-TA--A--T-C-A-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TC----------T-A-TGG-TC--TT--G--
gi|81469 : TTT-T--T-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA-T--T--T-C------------A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-C-A-AAA-T--T-T--A----GA-C-------T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81470 : TTT-T--T-T-----T-TG----TT-TA-TG----AAATTA-T--T--T-CA-----------A-A---A--A-G---TT-AGGC-----------TG-GA--T--T-C-A-AAA-T--T-T--A----GA-C-------T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81471 : TTT-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TTA---ACATTT-T--T--T-C------------A-A---A--A-G---TT-A-GT-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---G---C---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----AT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AG
gi|81472 : TTT-T--A-T-----T-T-----TT-AA-TGA---TAACTA-T--T--T-C------------A-A---A--A-G---TT-A----------------------------------T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-TAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81473 : --A-T-----T-TG----TT-T--TGA---TAATTA-A--T--T-C------------T-----A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--TCT-G-AAA-T--TCT--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TAT--C-T-CAG-----TT----------T-T-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81474 : --A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA-T--T--T-A------------T-C---A--A-A------A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-CAT-T---T---AAAAG----T-C--TATT-C-T-CAT-----GT----------T-A-TGA-TC--TT--G--AGGC
gi|81476 : -AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TCG-TC--TT--G--ATACCTG
gi|81477 : tttatttttaaacatatgtgttataaatcttaagatataagtaatca-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTA-T--T--T-C------------A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--GTCGAT-C--TATT-C-T-CAG-----TTTTA-------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81478 : -TA-TGA---AAATTG-C--T--T-C------------A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------CG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----AA-CGT-T---T---A--------T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGA-AT--TT--G--AGGC
gi|81480 : tcataT-A-AC-----------TG-A------T-C-G-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---G---AA--A----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TTG-G--AGGCC
gi|81481 : tgaaacatatgcttaagatatacatg-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81482 : aaagtaaatcgtaagatacaagtcatcAATCA-T--T--T-C------------A-C---A--A-G---TT-A-GG-----------TA-TAGTT--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGT-TC--TT--G--ATGCC
gi|81483 : --T-T-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TGTT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81484 : atcaatcttgagatataagtaa-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATC-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TTG-G--AGG
gi|81486 : ttaaatctttataagtaatcaTTA-T--T--T-C------------A-A---A--A-C---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-A-AAA-T--T-T--A----GA-T---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--
gi|81487 : -AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81488 : taaatctgaagatataagaaatcaAA-T--C-A--A----AA-T---T---T---AG--G----C-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81489 : taaatcttaagatataagt-AAA-T--T-T-------GA-C---T---T---AA--G----T-T--TATT-A-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81490 : taaatcttgagatataagtaataaa-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81491 : taaatcttaagatatatacgtaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81492 : taaatcttaagatataagtaatca--T-C------------T-T---A--A-G------A-TC-----------TG-AG--TAAT-C-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-T--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGCC
gi|81493 : taaa-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--C--TGGTCT
gi|81494 : taaatcttaagatataagtaatca-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAG-----TT----------C-A-TGG-TC--TT--G--AG
gi|81495 : taagtcttgagatataagcaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---C---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81497 : taaatcttaagatataagtTA-T--T--T-C------------T-C---A--A-G---AT-A-TA-----------AG-TA--A--T-C-A-AAA-T--T-T--A----AA-C---T---T---AA--A----T-C--GATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--T--AGGCCTG
gi|81498 : -AAA-T--T-T--A----GA-C---T---C---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TA--TT--G--AGACTT
gi|81499 : taaatcttaagatataagtaataa-AAA-T--T-T--A----AA-CAATT---T---AAAAG----T-C--TATT-C-T-CAG-----TTTA--------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81500 : taaatcgtaagatataagtaatca--T-C------------T-T---A--A-GATATT-A--C-----------TG-A------T-C-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---C---T---AA--A----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-G-TGG-TC--TT--C--AGGCCTG
gi|81501 : taaa-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--
gi|81502 : taaatattaagaaataggtaatca-AAA-T--T-T--T----AA-A---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGCC
gi|81504 : tagttttaagaaattacatgcatgtgatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAGTTAACTT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GAGCC
gi|81505 : aaatcttaaggtataagtaatca--T-C------------T-T---A--A-G---AT-A-ATG----------TG-G------T-C-A-AAA-G--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--C--GGGCCTG
gi|81506 : aaa-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---G---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-
gi|81507 : tcttaagatgtatgtaatcaA--T--T-C-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---TC--AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-AC--TT--GGTGGGCC
gi|81508 : cttaagatataagta-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---G---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--C--AGGCC
gi|81509 : taagtacagtgtaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-TTCAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81511 : tggattagtatatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--GGGCCTG
gi|81513 : agaagtgatca-AAA-T--T-T--T----GA-T---T---T---GA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGA-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81514 : gtaatca-AAA-T--T-T--T----AA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81515 : gtaatca-AAA-T--T-T--A----GA-T---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--GGGCCTG
gi|81516 : gtaatca-AAC-T--T-T--T----GA-C---T---T---GA--A------A--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81517 : gtaatca-T-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGCC
gi|81518 : -AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-T--CATT-C-T-CAGT----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGTCTG
gi|81521 : a---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
Alignments
lowQualScore : 1111111
lowQualScore : 0 1 22 0 22222 0 2222 0 1 111 0 0 00 00 0000000 11 1 222 1 0 33333333333 0 11 00 1 0 1 00 0 11 1111 0 222 000 222 11 0000 0 00 0 0 0 11111 4444444444 0 0 0 00 11 11
lowQualScore : . . .. . ..... . .... . . ... . . .. .. ....... .. . ... . . ........... . .. .. . . . .. . .. .... . ... ... ... .. .... . .. . . . ..... .......... . . . .. .. ..
lowQualScore : 7 4 22 6 77777 6 9999 6 9 111 6 6 88 88 8888888 44 1 444 1 6 22222222222 6 33 88 1 4 6 66 4 00 3333 8 222 777 666 11 8888 4 55 4 8 4 88888 1111111111 4 4 4 66 44 44
consensus : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC-T-N---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
Reference ( family-232 ) : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC-T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81402 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC-T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81403 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATC-A-A--T--TC-T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-TA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-CTATATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81404 : AAA-ATTT-C--A-T-----C-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TT-T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81405 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TAA---AAATC-A-A--T--TC-T-A---A--A-G---TT-A-GA-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCATG
gi|81406 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC-T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-T---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--AGGCCCG
gi|81407 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TA----TC-TA-TGA---AAATT-A-T--G--TC-T-C---A--A-G---TT-A-AC-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81408 : AAA-AATT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---ACATT-A-A--T--TC-T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TAG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81409 : AAA-ATTT-C--A-A-----T-TC----TT-TA-TGA---AAATA-A-A--T--TC-T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAT-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCCG
gi|81410 : AAA-GTTT-C--A-T-----T-AA----AT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC-T-C---A--A-G---TT-A-AC-----------TG-GA--T--T-TG-AAT-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81411 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-CA----TT-TA-TGA---AAATT-G-T--T--TC-A-A---A--A-A---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--AGGTCTG
gi|81412 : AAA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-CA-TGA---AAATT-A-T--T--TC-A-A---A--G-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-G---T---T---CA--G----T-C--TACT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81413 : AAA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-CT-TGA---AAATT-A-T--T--TC-A-G---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GC-C---TTAAT---AA--G----T-C--TACT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81414 : AAA-ATTT-T--AAT-----T-TG----TT-TAATGG---AAATA-A-T--T--CC-------A--A-G---TT-A-GA-----------TG-GA--T--T-TG-AAAAT--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC---T--G--AGGC
gi|81415 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC-T-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-----------------------------AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81416 : AAA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AATTT-A-T--T--TC-A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GG--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---TTTAAA--G----T-C--TTTT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGTCTG
gi|81417 : AAA-ATTG-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC-A-A---A--C-G---TT-A-GC-----------TG-AA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA-------T-T--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AAGCCTG
gi|81418 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TCA---AAATT-A-T--T--TT-T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-AT--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----AT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GAGCC
gi|81419 : AAA-ATTT-T--G-T-----T-TG----TT-TT-TGA---AAATG-A-T--T--TT-G-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TT-GAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81420 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---GAATT----------C-T-C---A--A-A---TTCA-GC-----------TG-GG--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-CAT-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81421 : AAA-GTTT-C--A-T-----T-TA----TA-AA-AGA---AAATT-A-T--T--TC-T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-AA--T--T-TG-AAA-T--C-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATC-A-G-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81422 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---GAATT-A-T--T--TA-A-A---A--A-G---TA-A-GC-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAT-----TT----------T-A-TGA-TC--TT--G--AGACC
gi|81423 : AAA-ATTT-TT-A-T-----T-TA----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--G--TC-T-T---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---TCA-AA--G----C-C--TTTT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--T
gi|81424 : AAA-ATGT-A--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC-A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------CA-AA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----AA-C---T---T---AC--G----T-C--AATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81425 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TT-T-G---A--A-G---TT-A-GC-----------AG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GAGC---T---T---AA--G----T-C--TA-T-C-T-CGT-----TT----------C-ATTGG-TC--TT--GA-AGGCCT
gi|81426 : AAC-ATTT-C--A-T-----T-TG----TC-TA-TGA---AAATA-A-T--T--TC-T-C---A--A-G---TT-A-GA-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-G--A----GA-C-------T---A----------C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TTGAG--AGGTCTG
gi|81427 : AAA-ATTT-CC-A-T-----T-AGGT--TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC-TTC---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TG-AAATT--T-T--AGATCGA-C---T---TAA-AA--G----T-C--TA-T-C-T-CAG------T----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81428 : AAA-ATTT-C--A-T-----TAGG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC-T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA----------------------T-C--GA---C-T-TA------TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81429 : AAA-ATTT-G--A-T-----T--G----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC-C-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-AA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----G---------------A--G----T-C--TAAT-C-T-CAG-----GT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81431 : AAA-ATTTTC--A-T-----T-TG----TT-TAATGA---AAATC-A-A--T--TC-TGC---A--ACG---TT-A-GC-----------TG--A--T--T-TG-AAAAT--T-T--A----GAGC---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TTACATAATATAT-A-TGG-TC--TT-----AGGCCTG
gi|81432 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TAA---AAATT-ATT--T--TT-T-C---A--A-G---TT-G-GC-----------TG-A------T-TG-AAA-T--T-T--A----AA-C-------T---AA--G----T----TATC-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81433 : AAA-ATCT-T--A-T-----T-TG----CT-CA-TGA---AAATT-A-T--T--TC-A-A---A--A-G---TT-A-GT-----------TG-GA--T--T-GA-AAA-T--T-T--A----GA-T---G---T---TC--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GAGACT
gi|81434 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---ATATC-A-T--T--TC-T-C---A--C-G---TT-A-GT-----------TG-AA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATT-C-T-TAC-----TT----------T-G-TGG-TC--TT--G--
gi|81435 : AAA-ATTC-T--A-T-----T-TG----GT-TA-TGA---AAGTT-A-T--T--TC-A-A---A--A-G---TT-A-GT-----------TG-GA------------------------------C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-CC--TT--G--ACGCCTG
gi|81436 : AAA-ATTTTC--A-T-----T-TG----TT-TA-TAG---AAATT-A-T--C--TC-T-CA--A--A-G---TT-A-AT-----------TG-GA--T--T-TG-AAAGT--T-T--A----GA-A---C---T---AA--G----T-C--TA-T-C-T-CAGT----TT----------T-A-TGGATC--TT--G--AGGCCTG
gi|81437 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----CT-TA-TGA---AAATT-A-T--G--TT-T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TG-ACA-T--T-T--A----GA-A---T---G---AA--G----A-T--TATT-C-T-CAG-----TG----------T-A-TGG-TC--TT--G--TGGC
gi|81438 : AAA-ATTT-G--T-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATG-A-A--T--TC-T-C---A--A-G----T-A-GC-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-CA--T---T---AA--G----TCC--TATT---T-C-G-----TT----------TAA-TGG-TCTTTT--G--AGGTCTG
gi|81439 : AAA-ATTC-C--A-T-----G-TC----TT-TA-TCA---AATTC-A-T--T--TC-A-A---A--A-G---TT-A--T-----------TGAGA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--A----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--AA--G--AGGCCTG
gi|81440 : AAA-ATTT-TCAA-T-----T-TG----TT-TA-CGAGAAAAATT-A-T--T--TC-A-A---T--A-G---AT-A-GC-----------TG-GA--T--T--G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A------C--TT--G--AGGCCTG
gi|81441 : AAA-ATTT-C--A-G-----T-TG----TT-TG-TGA---AAA--------------------------------A-GC-----------TG-GA--T--T-TT-AGA-T--T-TT-A----GA-C---T---T---A---G----T-C--TAAT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81442 : AAA-ATGT-C--A-C-----T-TG----TTATAATAA---AAATT-A-GAAT--TC-T-----A--A-G---T--A-G------------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-CTT-CAG-----TT----------T-A-T-G-TC--TT--G--ATACCTG
gi|81444 : AAC-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-AA-TGA---AAATT-A-C--T--TC-A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-CA--T--T-TG-AAA-T--T-C--A----GA-A---G---T---AA--G----T-C--TCTT-C-T-CAG-----TG----------T-A-TGG-TT--TT--G--GAGTC
gi|81445 : AAATATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC-T-C---AG-A-G---TT-A-GC-----------TG-CA--T--TCTGCAAA-T--T-T-------GA-C---T---T---AG--A----T-C--TTTC-C-T-CAG-----TT----------A-A-TGG-TG--TT-----AGGCC
gi|81446 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TG-TGA---AAATT-A-T--T--TC-A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TG-AAA---------A----GT-C---T--------A--G------C--TTTT-C-T-CAG-----TTTA--------T-A-TGG-TC--TC--G--GGGCCTG
gi|81448 : AAA-ATTT-C--A-T-----G-TG----T---A-TCA---AAATT-A-T--T-------------------------G-------------A-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-T--TATT-C-T-CAG-----TG----------T-A-TGG-TC--TT--C--AAGCC
gi|81449 : AAA-ATTT-T--A-C-----T-TG----TT-TA-T-----AAATT-A-T--T--TT-A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------CG--A--T--T-TG-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-
gi|81451 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC-A-A---A--A-G---TT-A-CCTCTTTTTTTTTTA-GA--T--T-TT-AGA-C--T-T--A----A------T---T---AA--A----T-A--TATT-C-T-CAA-----TC----------A-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81452 : --A-T-----T-TAC---TT-TG-TGA---AAATG-A-T--T--TC-------A--A-GCA-TT-A-GC-----------TG-GG--T--T-TG-----T--T-T--A----G------T---T---AA--G----T-C--TATC-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--AGGCCTG
gi|81453 : aaaattttagttctttatgaaAAG-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TT-TGA---TAATT-A-T--T--AA---A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG--A--T--T-TG-AA--T--T-T--A----GA-G---G---T---A---G----T----TATTTC-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81454 : AAA-ATGT----G-T-----T-TG----TT--A-TGA---AAATT-A-T------C-T-C---A--ACG---TT-A-GC-----------TG-TT--A--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---TA--AA--G----T-C--TATT-G-T-CAG-----TC----------T-A-GTG-TC--TT--G--AG
gi|81458 : aAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTAA-T--T--CC-T-C---A--A-GT--TT-A-GC-----------TG-GA--C--T-TT-AAA-T--T-T--AG---GA-C---T---C---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TTTA--------T-A-TGG-TC--TT--GA-AGGC
gi|81459 : AA-ATTT-C--A-TAAAATT-TACAACTT-TA-GGA---AAATA-A-T--G--TC-T-C---A--A-T---TT-A-GC-----------TG-GG--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----CA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81460 : AA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC-A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------T-------------------------------GA-C---T---T---A--------T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TT--TA--G--AGCCCTG
gi|81461 : AA-ATTT-C--A-TATT--T-TG----TT-TA---A---AAATT-A-A--T--TC-T-TTTAATTA-G---TT-A-AA-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-TTAA----GA-C---T---T---AA--T----C-T--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--CT--T--GGGCCTG
gi|81462 : AA-ATTT-C--A----------A----TT-TA-GAA---AAATA-A-T--G--T--T-C---A--C-T---TTTA-GC-----------TG-GAT-T--T-TG-AAA-TGGT-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC---T--G--AGG
gi|81463 : A-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-CA-CGA---AAATT-A-T--T--TC-T-C---A--A-G---TT-A-GG-----------TA-GA--T--T-TG-AAA-T--C-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AAGCCCG
gi|81466 : -ATTT-T--T-T-----T-TG----TT-AA---A---AAACT-A-T--AAATC-T-T---A--A-G---AT-A-TA-----------AG-TA--A--T-CA-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TC----------T-A-TGG-TC--TT--G--
gi|81469 : TTT-T--T-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC-A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-CA-AAA-T--T-T--A----GA-C-------T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81470 : TTT-T--T-T-----T-TG----TT-TA-TG----AAATT-A-T--T--TCAA-A---A--A-G---TT-AGGC-----------TG-GA--T--T-CA-AAA-T--T-T--A----GA-C-------T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81471 : TTT-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TTA---ACATT-T-T--T--TC-A-A---A--A-G---TT-A-GT-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---G---C---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----AT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AG
gi|81472 : TTT-T--A-T-----T-T-----TT-AA-TGA---TAACT-A-T--T--TC-A-A---A--A-G---TT-A---------------------------------T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-TAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81473 : --A-T-----T-TG----TT-T--TGA---TAATT-A-A--T--TC-T-----A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--TCTG-AAA-T--TCT--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TA-T-C-T-CAG-----TT----------T-T-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81474 : --A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TA-T-C---A--A-A------A-GC-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-CAT-T---T---AAAAG----T-C--TATT-C-T-CAT-----GT----------T-A-TGA-TC--TT--G--AGGC
gi|81476 : -AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TCG-TC--TT--G--ATACCTG
gi|81477 : tttatttttaaacatatgtgttataaatcttaagatataagtaatca-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC-A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--GTCGAT-C--TATT-C-T-CAG-----TTTTA-------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81478 : -TA-TGA---AAATT-G-C--T--TC-A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------CG-GA--T--T-TG-AAA-T--T-T--A----AA-CGT-T---T---A--------T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGA-AT--TT--G--AGGC
gi|81480 : tcataT-A-AC-----------TG-A------T-CG-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---G---AA--A----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TTG-G--AGGCC
gi|81481 : tgaaacatatgcttaagatatacatg-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81482 : aaagtaaatcgtaagatacaagtcatcAATC-A-T--T--TC-A-C---A--A-G---TT-A-GG-----------TA-TAGTT--T-TG-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGT-TC--TT--G--ATGCC
gi|81483 : --T-TA-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TGTT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81484 : atcaatcttgagatataagtaa-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATC-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TTG-G--AGG
gi|81486 : ttaaatctttataagtaatcaTT-A-T--T--TC-A-A---A--A-C---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TA-AAA-T--T-T--A----GA-T---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--
gi|81487 : -AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81488 : taaatctgaagatataagaaatcaAA-T--C-A--A----AA-T---T---T---AG--G----C-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81489 : taaatcttaagatataagt-AAA-T--T-T-------GA-C---T---T---AA--G----T-T--TATT-A-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81490 : taaatcttgagatataagtaataaa-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81491 : taaatcttaagatatatacgtaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81492 : taaatcttaagatataagtaatca--TC-T-T---A--A-G------A-TC-----------TG-AG--TAAT-CA-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-T--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGCC
gi|81493 : taaa-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--C--TGGTCT
gi|81494 : taaatcttaagatataagtaatca-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAG-----TT----------C-A-TGG-TC--TT--G--AG
gi|81495 : taagtcttgagatataagcaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---C---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81497 : taaatcttaagatataagtT-A-T--T--TC-T-C---A--A-G---AT-A-TA-----------AG-TA--A--T-CA-AAA-T--T-T--A----AA-C---T---T---AA--A----T-C--GATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--T--AGGCCTG
gi|81498 : -AAA-T--T-T--A----GA-C---T---C---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TA--TT--G--AGACTT
gi|81499 : taaatcttaagatataagtaataa-AAA-T--T-T--A----AA-CAATT---T---AAAAG----T-C--TATT-C-T-CAG-----TTTA--------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81500 : taaatcgtaagatataagtaatca--TC-T-T---A--A-GATATT-A--C-----------TG-A------T-CA-AAA-T--T-T--T----GA-C---C---T---AA--A----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-G-TGG-TC--TT--C--AGGCCTG
gi|81501 : taaa-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--
gi|81502 : taaatattaagaaataggtaatca-AAA-T--T-T--T----AA-A---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGCC
gi|81504 : tagttttaagaaattacatgcatgtgatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAGTTAACTT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GAGCC
gi|81505 : aaatcttaaggtataagtaatca--TC-T-T---A--A-G---AT-A-ATG----------TG-G------T-CA-AAA-G--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--C--GGGCCTG
gi|81506 : aaa-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---G---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-
gi|81507 : tcttaagatgtatgtaatcaA--T--T-CA-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---TC--AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-AC--TT--GGTGGGCC
gi|81508 : cttaagatataagta-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---G---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--C--AGGCC
gi|81509 : taagtacagtgtaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-TTCAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81511 : tggattagtatatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--GGGCCTG
gi|81513 : agaagtgatca-AAA-T--T-T--T----GA-T---T---T---GA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGA-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81514 : gtaatca-AAA-T--T-T--T----AA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81515 : gtaatca-AAA-T--T-T--A----GA-T---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--GGGCCTG
gi|81516 : gtaatca-AAC-T--T-T--T----GA-C---T---T---GA--A------A--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81517 : gtaatca-TA-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGCC
gi|81518 : -AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-T--CATT-C-T-CAGT----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGTCTG
gi|81521 : a---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
Alignments
lowQualScore : 11111111
lowQualScore : 0 1 22 0 22222 0 2222 0 1 111 0 0 11 00 00000000 11 0 222 0 0 33333333333 0 00 00 1 0 0 1 00 0 11 1111 0 222 000 222 11 0000 0 00 0 0 0 11111 4444444444 0 0 0 00 11 11
lowQualScore : . . .. . ..... . .... . . ... . . .. .. ........ .. . ... . . ........... . .. .. . . . . .. . .. .... . ... ... ... .. .... . .. . . . ..... .......... . . . .. .. ..
lowQualScore : 7 4 22 6 77777 6 9999 6 9 111 6 6 44 88 22222222 33 6 333 5 5 22222222222 5 77 77 1 5 4 6 66 4 00 3333 8 222 777 666 11 8888 4 55 4 8 4 88888 1111111111 4 4 4 66 44 44
consensus : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--T-N---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
Reference ( family-232 ) : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--T-N---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81402 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81403 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATC-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-TA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-CTATATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81404 : AAA-ATTT-C--A-T-----C-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TT--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81405 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TAA---AAATC-A-A--T--TC--T-A---A--A-G---TT-A-GA-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCATG
gi|81406 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-T---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--AGGCCCG
gi|81407 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TA----TC-TA-TGA---AAATT-A-T--G--TC--T-C---A--A-G---TT-A-AC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81408 : AAA-AATT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---ACATT-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TAG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81409 : AAA-ATTT-C--A-A-----T-TC----TT-TA-TGA---AAATA-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAT-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCCG
gi|81410 : AAA-GTTT-C--A-T-----T-AA----AT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-AC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAT-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81411 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-CA----TT-TA-TGA---AAATT-G-T--T--TC--A-A---A--A-A---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--AGGTCTG
gi|81412 : AAA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-CA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--G-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-G---T---T---CA--G----T-C--TACT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81413 : AAA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-CT-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-G---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GC-C---TTAAT---AA--G----T-C--TACT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81414 : AAA-ATTT-T--AAT-----T-TG----TT-TAATGG---AAATA-A-T--T--CC--------A--A-G---TT-A-GA-----------TG-GA--T--T-T-G-AAAAT--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC---T--G--AGGC
gi|81415 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC--T-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-----------------------------AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81416 : AAA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AATTT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GG--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---TTTAAA--G----T-C--TTTT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGTCTG
gi|81417 : AAA-ATTG-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--C-G---TT-A-GC-----------TG-AA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA-------T-T--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AAGCCTG
gi|81418 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TCA---AAATT-A-T--T--TT--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-AT--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----AT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GAGCC
gi|81419 : AAA-ATTT-T--G-T-----T-TG----TT-TT-TGA---AAATG-A-T--T--TT--G-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-T-GAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81420 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---GAATT----------C--T-C---A--A-A---TTCA-GC-----------TG-GG--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-CAT-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81421 : AAA-GTTT-C--A-T-----T-TA----TA-AA-AGA---AAATT-A-T--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-AA--T--T-T-G-AAA-T--C-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATC-A-G-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81422 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---GAATT-A-T--T--TA--A-A---A--A-G---TA-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAT-----TT----------T-A-TGA-TC--TT--G--AGACC
gi|81423 : AAA-ATTT-TT-A-T-----T-TA----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--G--TC--T-T---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---TCA-AA--G----C-C--TTTT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--T
gi|81424 : AAA-ATGT-A--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------CA-AA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----AA-C---T---T---AC--G----T-C--AATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81425 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TT--T-G---A--A-G---TT-A-GC-----------AG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GAGC---T---T---AA--G----T-C--TA-T-C-T-CGT-----TT----------C-ATTGG-TC--TT--GA-AGGCCT
gi|81426 : AAC-ATTT-C--A-T-----T-TG----TC-TA-TGA---AAATA-A-T--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GA-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-G--A----GA-C-------T---A----------C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TTGAG--AGGTCTG
gi|81427 : AAA-ATTT-CC-A-T-----T-AGGT--TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC--T-TC--A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAATT--T-T--AGATCGA-C---T---TAA-AA--G----T-C--TA-T-C-T-CAG------T----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81428 : AAA-ATTT-C--A-T-----TAGG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA----------------------T-C--GA---C-T-TA------TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81429 : AAA-ATTT-G--A-T-----T--G----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--C-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-AA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----G---------------A--G----T-C--TAAT-C-T-CAG-----GT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81431 : AAA-ATTTTC--A-T-----T-TG----TT-TAATGA---AAATC-A-A--T--TC--T-GC--A--ACG---TT-A-GC-----------TG--A--T--T-T-G-AAAAT--T-T--A----GAGC---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TTACATAATATAT-A-TGG-TC--TT-----AGGCCTG
gi|81432 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TAA---AAATT-ATT--T--TT--T-C---A--A-G---TT-G-GC-----------TG-A------T-T-G-AAA-T--T-T--A----AA-C-------T---AA--G----T----TATC-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81433 : AAA-ATCT-T--A-T-----T-TG----CT-CA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GT-----------TG-GA--T--T-G-A-AAA-T--T-T--A----GA-T---G---T---TC--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GAGACT
gi|81434 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---ATATC-A-T--T--TC--T-C---A--C-G---TT-A-GT-----------TG-AA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATT-C-T-TAC-----TT----------T-G-TGG-TC--TT--G--
gi|81435 : AAA-ATTC-T--A-T-----T-TG----GT-TA-TGA---AAGTT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GT-----------TG-GA-------------------------------C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-CC--TT--G--ACGCCTG
gi|81436 : AAA-ATTTTC--A-T-----T-TG----TT-TA-TAG---AAATT-A-T--C--TC--TCA---A--A-G---TT-A-AT-----------TG-GA--T--T-T-G-AAAGT--T-T--A----GA-A---C---T---AA--G----T-C--TA-T-C-T-CAGT----TT----------T-A-TGGATC--TT--G--AGGCCTG
gi|81437 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----CT-TA-TGA---AAATT-A-T--G--TT--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-ACA-T--T-T--A----GA-A---T---G---AA--G----A-T--TATT-C-T-CAG-----TG----------T-A-TGG-TC--TT--G--TGGC
gi|81438 : AAA-ATTT-G--T-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATG-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---T--A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-CA--T---T---AA--G----TCC--TATT---T-C-G-----TT----------TAA-TGG-TCTTTT--G--AGGTCTG
gi|81439 : AAA-ATTC-C--A-T-----G-TC----TT-TA-TCA---AATTC-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A--T-----------TGAGA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--A----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--AA--G--AGGCCTG
gi|81440 : AAA-ATTT-TCAA-T-----T-TG----TT-TA-CGAGAAAAATT-A-T--T--TC--A-A---T--A-G---AT-A-GC-----------TG-GA--T--T---G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A------C--TT--G--AGGCCTG
gi|81441 : AAA-ATTT-C--A-G-----T-TG----TT-TG-TGA---AAA---------------------------------A-GC-----------TG-GA--T--T-T-T-AGA-T--T-TT-A----GA-C---T---T---A---G----T-C--TAAT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81442 : AAA-ATGT-C--A-C-----T-TG----TTATAATAA---AAATT-A-GAAT--TC--T-----A--A-G---T--A-G------------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-CTT-CAG-----TT----------T-A-T-G-TC--TT--G--ATACCTG
gi|81444 : AAC-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-AA-TGA---AAATT-A-C--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-CA--T--T-T-G-AAA-T--T-C--A----GA-A---G---T---AA--G----T-C--TCTT-C-T-CAG-----TG----------T-A-TGG-TT--TT--G--GAGTC
gi|81445 : AAATATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC--T-C---AG-A-G---TT-A-GC-----------TG-CA--T--TCT-GCAAA-T--T-T-------GA-C---T---T---AG--A----T-C--TTTC-C-T-CAG-----TT----------A-A-TGG-TG--TT-----AGGCC
gi|81446 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TG-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA---------A----GT-C---T--------A--G------C--TTTT-C-T-CAG-----TTTA--------T-A-TGG-TC--TC--G--GGGCCTG
gi|81448 : AAA-ATTT-C--A-T-----G-TG----T---A-TCA---AAATT-A-T--T--------G---A-----------------------------GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-T--TATT-C-T-CAG-----TG----------T-A-TGG-TC--TT--C--AAGCC
gi|81449 : AAA-ATTT-T--A-C-----T-TG----TT-TA-T-----AAATT-A-T--T--TT--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------CG--A--T--T-T-G-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-
gi|81451 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-CCTCTTTTTTTTTTA-GA--T--T-T-T-AGA-C--T-T--A----A------T---T---AA--A----T-A--TATT-C-T-CAA-----TC----------A-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81452 : --A-T-----T-TAC---TT-TG-TGA---AAATG-A-T--T--TC--------A--A-GCA-TT-A-GC-----------TG-GG--T--T-T-G-----T--T-T--A----G------T---T---AA--G----T-C--TATC-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--AGGCCTG
gi|81453 : aaaattttagttctttatgaaAAG-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TT-TGA---TAATT-A-T--T--AA----A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG--A--T--T-T-G-AA--T--T-T--A----GA-G---G---T---A---G----T----TATTTC-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81454 : AAA-ATGT----G-T-----T-TG----TT--A-TGA---AAATT-A-T--C--TC----A---A--C-G---TT-A-GC-----------TG-TT--A--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---TA--AA--G----T-C--TATT-G-T-CAG-----TC----------T-A-GTG-TC--TT--G--AG
gi|81458 : aAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTAA-T--T--CC--T-C---A--A-GT--TT-A-GC-----------TG-GA--C--T-T-T-AAA-T--T-T--AG---GA-C---T---C---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TTTA--------T-A-TGG-TC--TT--GA-AGGC
gi|81459 : AA-ATTT-C--A-TAAAATT-TACAACTT-TA-GGA---AAATA-A-T--G--TC--T-C---A--A-T---TT-A-GC-----------TG-GG--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----CA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81460 : AA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------T--------------------------------GA-C---T---T---A--------T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TT--TA--G--AGCCCTG
gi|81461 : AA-ATTT-C--A-TATT--T-TG----TT-TA---A---AAATT-A-A--T--TC--T-TTTAATTA-G---TT-A-AA-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-TTAA----GA-C---T---T---AA--T----C-T--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--CT--T--GGGCCTG
gi|81462 : AA-ATTT-C--A----------A----TT-TA-GAA---AAATA-A-TG-T--TCACT-T------------TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TTG-AAA-TGGT-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC---T--G--AGG
gi|81463 : A-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-CA-CGA---AAATT-A-T--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GG-----------TA-GA--T--T-T-G-AAA-T--C-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AAGCCCG
gi|81466 : -ATTT-T--T-T-----T-TG----TT-AA---A---AAACT-A-T--AAATC--T-T---A--A-G---AT-A-TA-----------AG-TA--A--T-C-A-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TC----------T-A-TGG-TC--TT--G--
gi|81469 : TTT-T--T-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-C-A-AAA-T--T-T--A----GA-C-------T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81470 : TTT-T--T-T-----T-TG----TT-TA-TG----AAATT-A-T--T--TCA-A-A---A--A-G---TT-AGGC-----------TG-GA--T--T-C-A-AAA-T--T-T--A----GA-C-------T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81471 : TTT-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TTA---ACATT-T-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GT-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---G---C---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----AT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AG
gi|81472 : TTT-T--A-T-----T-T-----TT-AA-TGA---TAACT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A----------------------------------T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-TAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81473 : --A-T-----T-TG----TT-T--TGA---TAATT-A-A--T--TC--T-----A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--TCT-G-AAA-T--TCT--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TAT--C-T-CAG-----TT----------T-T-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81474 : --A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TA--T-C---A--A-A------A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-CAT-T---T---AAAAG----T-C--TATT-C-T-CAT-----GT----------T-A-TGA-TC--TT--G--AGGC
gi|81476 : -AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TCG-TC--TT--G--ATACCTG
gi|81477 : tttatttttaaacatatgtgttataaatcttaagatataagtaatca-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--GTCGAT-C--TATT-C-T-CAG-----TTTTA-------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81478 : -TA-TGA---AAATT-G-C--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------CG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----AA-CGT-T---T---A--------T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGA-AT--TT--G--AGGC
gi|81480 : tcataT-A-AC-----------TG-A------T-C-G-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---G---AA--A----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TTG-G--AGGCC
gi|81481 : tgaaacatatgcttaagatatacatg-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81482 : aaagtaaatcgtaagatacaagtcatcAATC-A-T--T--TC--A-C---A--A-G---TT-A-GG-----------TA-TAGTT--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGT-TC--TT--G--ATGCC
gi|81483 : --T-T-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TGTT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81484 : atcaatcttgagatataagtaa-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATC-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TTG-G--AGG
gi|81486 : ttaaatctttataagtaatcaTT-A-T--T--TC--A-A---A--A-C---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-A-AAA-T--T-T--A----GA-T---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--
gi|81487 : --TC--T-G---A--A-G---AT-A-TA-----------AG-AA--A--T-C-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81488 : taaaAA-T--C-A--A----AA-T---T---T---AG--G----C-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81489 : taaatcttaagatataagt-AAA-T--T-T-------GA-C---T---T---AA--G----T-T--TATT-A-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81490 : taaatcttgagatataagtaataaa-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81491 : taaatcttaagatatatacgtaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81492 : taaatcttaagatataagtaatca--TC--T-T---A--A-G------A-TC-----------TG-AG--TAAT-C-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-T--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGCC
gi|81493 : taaa-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--C--TGGTCT
gi|81494 : taaatcttaagatataagtaatca-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAG-----TT----------C-A-TGG-TC--TT--G--AG
gi|81495 : taagtcttgagatataagcaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---C---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81497 : taaatcttaagatataagtT-A-T--T--TC--T-C---A--A-G---AT-A-TA-----------AG-TA--A--T-C-A-AAA-T--T-T--A----AA-C---T---T---AA--A----T-C--GATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--T--AGGCCTG
gi|81498 : -AAA-T--T-T--A----GA-C---T---C---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TA--TT--G--AGACTT
gi|81499 : taaatcttaagatataagtaataa-AAA-T--T-T--A----AA-CAATT---T---AAAAG----T-C--TATT-C-T-CAG-----TTTA--------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81500 : taaatcgtaagatataagtaatca--TC--T-T---A--A-GATATT-A--C-----------TG-A------T-C-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---C---T---AA--A----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-G-TGG-TC--TT--C--AGGCCTG
gi|81501 : taaa-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--
gi|81502 : taaatattaagaaataggtaatca-AAA-T--T-T--T----AA-A---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGCC
gi|81504 : tagttttaagaaattacatgcatgtgatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAGTTAACTT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GAGCC
gi|81505 : aaatcttaaggtataagtaatca--TC--T-T---A--A-G---AT-A-ATG----------TG-G------T-C-A-AAA-G--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--C--GGGCCTG
gi|81506 : aaa--TC--T-T---A--A-G---AT-G-TA-----------TG-TA--A--T-C-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---G---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-
gi|81507 : A--T--T-C-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---TC--AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-AC--TT--GGTGGGCC
gi|81508 : cttaagatataagta-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---G---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--C--AGGCC
gi|81509 : taagtacagtgtaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-TTCAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81511 : tggattagtatatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--GGGCCTG
gi|81513 : agaagtgatca-AAA-T--T-T--T----GA-T---T---T---GA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGA-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81514 : gtaatca-AAA-T--T-T--T----AA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81515 : gtaatca-AAA-T--T-T--A----GA-T---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--GGGCCTG
gi|81516 : gtaatca-AAC-T--T-T--T----GA-C---T---T---GA--A------A--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81517 : gtaatca-T-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGCC
gi|81518 : -AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-T--CATT-C-T-CAGT----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGTCTG
gi|81521 : a---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
Alignments
lowQualScore : 11111111
lowQualScore : 0 1 22 0 22222 0 2222 0 1 111 0 0 11 00 00000000 11 0 222 0 0 33333333333 0 00 00 1 0 0 1 00 0 11 1111 0 222 000 222 11 0000 0 00 0 0 0 11111 4444444444 0 0 0 00 11 11
lowQualScore : . . .. . ..... . .... . . ... . . .. .. ........ .. . ... . . ........... . .. .. . . . . .. . .. .... . ... ... ... .. .... . .. . . . ..... .......... . . . .. .. ..
lowQualScore : 7 4 22 6 77777 6 9999 6 9 111 6 6 44 88 22222222 33 6 333 5 5 22222222222 5 77 77 1 5 4 6 66 4 00 3333 8 222 777 666 11 8888 4 55 4 8 4 88888 1111111111 4 4 4 66 44 44
consensus : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--T-N---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
Reference ( family-232 ) : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--T-N---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81402 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81403 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATC-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-TA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-CTATATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81404 : AAA-ATTT-C--A-T-----C-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TT--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81405 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TAA---AAATC-A-A--T--TC--T-A---A--A-G---TT-A-GA-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCATG
gi|81406 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-T---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--AGGCCCG
gi|81407 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TA----TC-TA-TGA---AAATT-A-T--G--TC--T-C---A--A-G---TT-A-AC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81408 : AAA-AATT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---ACATT-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TAG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81409 : AAA-ATTT-C--A-A-----T-TC----TT-TA-TGA---AAATA-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAT-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCCG
gi|81410 : AAA-GTTT-C--A-T-----T-AA----AT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-AC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAT-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81411 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-CA----TT-TA-TGA---AAATT-G-T--T--TC--A-A---A--A-A---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--AGGTCTG
gi|81412 : AAA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-CA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--G-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-G---T---T---CA--G----T-C--TACT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81413 : AAA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-CT-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-G---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GC-C---TTAAT---AA--G----T-C--TACT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81414 : AAA-ATTT-T--AAT-----T-TG----TT-TAATGG---AAATA-A-T--T--CC--------A--A-G---TT-A-GA-----------TG-GA--T--T-T-G-AAAAT--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC---T--G--AGGC
gi|81415 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC--T-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-----------------------------AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81416 : AAA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AATTT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GG--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---TTTAAA--G----T-C--TTTT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGTCTG
gi|81417 : AAA-ATTG-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--C-G---TT-A-GC-----------TG-AA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA-------T-T--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AAGCCTG
gi|81418 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TCA---AAATT-A-T--T--TT--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-AT--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----AT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GAGCC
gi|81419 : AAA-ATTT-T--G-T-----T-TG----TT-TT-TGA---AAATG-A-T--T--TT--G-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-T-GAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81420 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---GAATT----------C--T-C---A--A-A---TTCA-GC-----------TG-GG--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-CAT-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81421 : AAA-GTTT-C--A-T-----T-TA----TA-AA-AGA---AAATT-A-T--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-AA--T--T-T-G-AAA-T--C-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATC-A-G-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81422 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---GAATT-A-T--T--TA--A-A---A--A-G---TA-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAT-----TT----------T-A-TGA-TC--TT--G--AGACC
gi|81423 : AAA-ATTT-TT-A-T-----T-TA----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--G--TC--T-T---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---TCA-AA--G----C-C--TTTT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--T
gi|81424 : AAA-ATGT-A--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------CA-AA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----AA-C---T---T---AC--G----T-C--AATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81425 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TT--T-G---A--A-G---TT-A-GC-----------AG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GAGC---T---T---AA--G----T-C--TA-T-C-T-CGT-----TT----------C-ATTGG-TC--TT--GA-AGGCCT
gi|81426 : AAC-ATTT-C--A-T-----T-TG----TC-TA-TGA---AAATA-A-T--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GA-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-G--A----GA-C-------T---A----------C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TTGAG--AGGTCTG
gi|81427 : AAA-ATTT-CC-A-T-----T-AGGT--TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC--T-TC--A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAATT--T-T--AGATCGA-C---T---TAA-AA--G----T-C--TA-T-C-T-CAG------T----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81428 : AAA-ATTT-C--A-T-----TAGG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA----------------------T-C--GA---C-T-TA------TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81429 : AAA-ATTT-G--A-T-----T--G----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--C-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-AA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----G---------------A--G----T-C--TAAT-C-T-CAG-----GT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81431 : AAA-ATTTTC--A-T-----T-TG----TT-TAATGA---AAATC-A-A--T--TC--T-GC--A--ACG---TT-A-GC-----------TG--A--T--T-T-G-AAAAT--T-T--A----GAGC---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TTACATAATATAT-A-TGG-TC--TT-----AGGCCTG
gi|81432 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TAA---AAATT-ATT--T--TT--T-C---A--A-G---TT-G-GC-----------TG-A------T-T-G-AAA-T--T-T--A----AA-C-------T---AA--G----T----TATC-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81433 : AAA-ATCT-T--A-T-----T-TG----CT-CA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GT-----------TG-GA--T--T-G-A-AAA-T--T-T--A----GA-T---G---T---TC--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GAGACT
gi|81434 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---ATATC-A-T--T--TC--T-C---A--C-G---TT-A-GT-----------TG-AA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATT-C-T-TAC-----TT----------T-G-TGG-TC--TT--G--
gi|81435 : AAA-ATTC-T--A-T-----T-TG----GT-TA-TGA---AAGTT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GT-----------TG-GA-------------------------------C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-CC--TT--G--ACGCCTG
gi|81436 : AAA-ATTTTC--A-T-----T-TG----TT-TA-TAG---AAATT-A-T--C--TC--TCA---A--A-G---TT-A-AT-----------TG-GA--T--T-T-G-AAAGT--T-T--A----GA-A---C---T---AA--G----T-C--TA-T-C-T-CAGT----TT----------T-A-TGGATC--TT--G--AGGCCTG
gi|81437 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----CT-TA-TGA---AAATT-A-T--G--TT--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-ACA-T--T-T--A----GA-A---T---G---AA--G----A-T--TATT-C-T-CAG-----TG----------T-A-TGG-TC--TT--G--TGGC
gi|81438 : AAA-ATTT-G--T-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATG-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---T--A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-CA--T---T---AA--G----TCC--TATT---T-C-G-----TT----------TAA-TGG-TCTTTT--G--AGGTCTG
gi|81439 : AAA-ATTC-C--A-T-----G-TC----TT-TA-TCA---AATTC-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A--T-----------TGAGA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--A----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--AA--G--AGGCCTG
gi|81440 : AAA-ATTT-TCAA-T-----T-TG----TT-TA-CGAGAAAAATT-A-T--T--TC--A-A---T--A-G---AT-A-GC-----------TG-GA--T--T---G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A------C--TT--G--AGGCCTG
gi|81441 : AAA-ATTT-C--A-G-----T-TG----TT-TG-TGA---AAA---------------------------------A-GC-----------TG-GA--T--T-T-T-AGA-T--T-TT-A----GA-C---T---T---A---G----T-C--TAAT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81442 : AAA-ATGT-C--A-C-----T-TG----TTATAATAA---AAATT-A-GAAT--TC--T-----A--A-G---T--A-G------------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-CTT-CAG-----TT----------T-A-T-G-TC--TT--G--ATACCTG
gi|81444 : AAC-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-AA-TGA---AAATT-A-C--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-CA--T--T-T-G-AAA-T--T-C--A----GA-A---G---T---AA--G----T-C--TCTT-C-T-CAG-----TG----------T-A-TGG-TT--TT--G--GAGTC
gi|81445 : AAATATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC--T-C---AG-A-G---TT-A-GC-----------TG-CA--T--TCT-GCAAA-T--T-T-------GA-C---T---T---AG--A----T-C--TTTC-C-T-CAG-----TT----------A-A-TGG-TG--TT-----AGGCC
gi|81446 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TG-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA---------A----GT-C---T--------A--G------C--TTTT-C-T-CAG-----TTTA--------T-A-TGG-TC--TC--G--GGGCCTG
gi|81448 : AAA-ATTT-C--A-T-----G-TG----T---A-TCA---AAATT-A-T--T--------G---A-----------------------------GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-T--TATT-C-T-CAG-----TG----------T-A-TGG-TC--TT--C--AAGCC
gi|81449 : AAA-ATTT-T--A-C-----T-TG----TT-TA-T-----AAATT-A-T--T--TT--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------CG--A--T--T-T-G-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-
gi|81451 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-CCTCTTTTTTTTTTA-GA--T--T-T-T-AGA-C--T-T--A----A------T---T---AA--A----T-A--TATT-C-T-CAA-----TC----------A-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81452 : --A-T-----T-TAC---TT-TG-TGA---AAATG-A-T--T--TC--------A--A-GCA-TT-A-GC-----------TG-GG--T--T-T-G-----T--T-T--A----G------T---T---AA--G----T-C--TATC-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--AGGCCTG
gi|81453 : aaaattttagttctttatgaaAAG-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TT-TGA---TAATT-A-T--T--AA----A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG--A--T--T-T-G-AA--T--T-T--A----GA-G---G---T---A---G----T----TATTTC-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81454 : AAA-ATGT----G-T-----T-TG----TT--A-TGA---AAATT-A-T--C--TC----A---A--C-G---TT-A-GC-----------TG-TT--A--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---TA--AA--G----T-C--TATT-G-T-CAG-----TC----------T-A-GTG-TC--TT--G--AG
gi|81458 : aAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTAA-T--T--CC--T-C---A--A-GT--TT-A-GC-----------TG-GA--C--T-T-T-AAA-T--T-T--AG---GA-C---T---C---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TTTA--------T-A-TGG-TC--TT--GA-AGGC
gi|81459 : AA-ATTT-C--A-TAAAATT-TACAACTT-TA-GGA---AAATA-A-T--G--TC--T-C---A--A-T---TT-A-GC-----------TG-GG--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----CA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81460 : AA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------T--------------------------------GA-C---T---T---A--------T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TT--TA--G--AGCCCTG
gi|81461 : AA-ATTT-C--A-TATT--T-TG----TT-TA---A---AAATT-A-A--T--TC--T-TTTAATTA-G---TT-A-AA-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-TTAA----GA-C---T---T---AA--T----C-T--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--CT--T--GGGCCTG
gi|81462 : AA-ATTT-C--A----------A----TT-TA-GAA---AAATA-A-TG-T--TCACT-T------------TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TTG-AAA-TGGT-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC---T--G--AGG
gi|81463 : A-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-CA-CGA---AAATT-A-T--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GG-----------TA-GA--T--T-T-G-AAA-T--C-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AAGCCCG
gi|81466 : -ATTT-T--T-T-----T-TG----TT-AA---A---AAACT-A-T--AAATC--T-T---A--A-G---AT-A-TA-----------AG-TA--A--T-C-A-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TC----------T-A-TGG-TC--TT--G--
gi|81469 : TTT-T--T-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-C-A-AAA-T--T-T--A----GA-C-------T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81470 : TTT-T--T-T-----T-TG----TT-TA-TG----AAATT-A-T--T--TCA-A-A---A--A-G---TT-AGGC-----------TG-GA--T--T-C-A-AAA-T--T-T--A----GA-C-------T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81471 : TTT-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TTA---ACATT-T-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GT-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---G---C---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----AT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AG
gi|81472 : TTT-T--A-T-----T-T-----TT-AA-TGA---TAACT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A----------------------------------T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-TAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81473 : --A-T-----T-TG----TT-T--TGA---TAATT-A-A--T--TC--T-----A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--TCT-G-AAA-T--TCT--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TAT--C-T-CAG-----TT----------T-T-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81474 : --A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TA--T-C---A--A-A------A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-CAT-T---T---AAAAG----T-C--TATT-C-T-CAT-----GT----------T-A-TGA-TC--TT--G--AGGC
gi|81476 : -AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TCG-TC--TT--G--ATACCTG
gi|81477 : tttatttttaaacatatgtgttataaatcttaagatataagtaatca-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--GTCGAT-C--TATT-C-T-CAG-----TTTTA-------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81478 : -TA-TGA---AAATT-G-C--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------CG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----AA-CGT-T---T---A--------T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGA-AT--TT--G--AGGC
gi|81480 : tcataT-A-AC-----------TG-A------T-C-G-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---G---AA--A----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TTG-G--AGGCC
gi|81481 : tgaaacatatgcttaagatatacatg-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81482 : aaagtaaatcgtaagatacaagtcatcAATC-A-T--T--TC--A-C---A--A-G---TT-A-GG-----------TA-TAGTT--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGT-TC--TT--G--ATGCC
gi|81483 : --T-T-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TGTT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81484 : atcaatcttgagatataagtaa-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATC-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TTG-G--AGG
gi|81486 : ttaaatctttataagtaatcaTT-A-T--T--TC--A-A---A--A-C---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-A-AAA-T--T-T--A----GA-T---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--
gi|81487 : --TC--T-G---A--A-G---AT-A-TA-----------AG-AA--A--T-C-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81488 : taaaAA-T--C-A--A----AA-T---T---T---AG--G----C-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81489 : taaatcttaagatataagt-AAA-T--T-T-------GA-C---T---T---AA--G----T-T--TATT-A-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81490 : taaatcttgagatataagtaataaa-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81491 : taaatcttaagatatatacgtaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81492 : taaatcttaagatataagtaatca--TC--T-T---A--A-G------A-TC-----------TG-AG--TAAT-C-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-T--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGCC
gi|81493 : taaa-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--C--TGGTCT
gi|81494 : taaatcttaagatataagtaatca-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAG-----TT----------C-A-TGG-TC--TT--G--AG
gi|81495 : taagtcttgagatataagcaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---C---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81497 : taaatcttaagatataagtT-A-T--T--TC--T-C---A--A-G---AT-A-TA-----------AG-TA--A--T-C-A-AAA-T--T-T--A----AA-C---T---T---AA--A----T-C--GATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--T--AGGCCTG
gi|81498 : -AAA-T--T-T--A----GA-C---T---C---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TA--TT--G--AGACTT
gi|81499 : taaatcttaagatataagtaataa-AAA-T--T-T--A----AA-CAATT---T---AAAAG----T-C--TATT-C-T-CAG-----TTTA--------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81500 : taaatcgtaagatataagtaatca--TC--T-T---A--A-GATATT-A--C-----------TG-A------T-C-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---C---T---AA--A----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-G-TGG-TC--TT--C--AGGCCTG
gi|81501 : taaa-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--
gi|81502 : taaatattaagaaataggtaatca-AAA-T--T-T--T----AA-A---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGCC
gi|81504 : tagttttaagaaattacatgcatgtgatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAGTTAACTT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GAGCC
gi|81505 : aaatcttaaggtataagtaatca--TC--T-T---A--A-G---AT-A-ATG----------TG-G------T-C-A-AAA-G--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--C--GGGCCTG
gi|81506 : aaa--TC--T-T---A--A-G---AT-G-TA-----------TG-TA--A--T-C-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---G---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-
gi|81507 : A--T--T-C-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---TC--AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-AC--TT--GGTGGGCC
gi|81508 : cttaagatataagta-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---G---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--C--AGGCC
gi|81509 : taagtacagtgtaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-TTCAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81511 : tggattagtatatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--GGGCCTG
gi|81513 : agaagtgatca-AAA-T--T-T--T----GA-T---T---T---GA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGA-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81514 : gtaatca-AAA-T--T-T--T----AA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81515 : gtaatca-AAA-T--T-T--A----GA-T---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--GGGCCTG
gi|81516 : gtaatca-AAC-T--T-T--T----GA-C---T---T---GA--A------A--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81517 : gtaatca-T-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGCC
gi|81518 : -AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-T--CATT-C-T-CAGT----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGTCTG
gi|81521 : a---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
blockSeqs : T CA AAAAT CAAC A GAA AA TTTTA TT ATA TCTTTTTTTTT C A GATC AAT TTA AA TTAAC ACATAATATA GA GT
blockSeqs : T T ATT GT A . G ACTT G CA G C T G AT CA AA T TTA G A
blockSeqs : . C . C A . . TTC . T . . A . GT AA . T TA G A
blockSeqs : . . . . . . . TGC . . . . G . A A . . TA . .
blockSeqs : . . . . . . . TCA . . . . . . . C . . TA . .
blockSeqs : . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . CC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . TT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--T-N---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
finalCons : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--T-N---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
Alignments
lowQualScore : 11111111
lowQualScore : 0 1 22 0 22222 0 2222 0 1 111 0 0 11 00 00000000 11 0 222 0 0 33333333333 0 00 00 1 0 0 1 00 0 11 1111 0 222 000 222 11 0000 0 00 0 0 0 11111 4444444444 0 0 0 00 11 11
lowQualScore : . . .. . ..... . .... . . ... . . .. .. ........ .. . ... . . ........... . .. .. . . . . .. . .. .... . ... ... ... .. .... . .. . . . ..... .......... . . . .. .. ..
lowQualScore : 7 4 22 6 77777 6 9999 6 9 111 6 6 44 88 22222222 33 6 333 5 5 22222222222 5 77 77 1 5 4 6 66 4 00 3333 8 222 777 666 11 8888 4 55 4 8 4 88888 1111111111 4 4 4 66 44 44
consensus : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--T-N---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
Reference ( family-232 ) : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--T-N---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81402 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81403 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATC-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-TA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-CTATATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81404 : AAA-ATTT-C--A-T-----C-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TT--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81405 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TAA---AAATC-A-A--T--TC--T-A---A--A-G---TT-A-GA-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCATG
gi|81406 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-T---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--AGGCCCG
gi|81407 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TA----TC-TA-TGA---AAATT-A-T--G--TC--T-C---A--A-G---TT-A-AC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81408 : AAA-AATT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---ACATT-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TAG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81409 : AAA-ATTT-C--A-A-----T-TC----TT-TA-TGA---AAATA-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAT-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCCG
gi|81410 : AAA-GTTT-C--A-T-----T-AA----AT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-AC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAT-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81411 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-CA----TT-TA-TGA---AAATT-G-T--T--TC--A-A---A--A-A---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--AGGTCTG
gi|81412 : AAA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-CA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--G-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-G---T---T---CA--G----T-C--TACT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81413 : AAA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-CT-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-G---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GC-C---TTAAT---AA--G----T-C--TACT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81414 : AAA-ATTT-T--AAT-----T-TG----TT-TAATGG---AAATA-A-T--T--CC--------A--A-G---TT-A-GA-----------TG-GA--T--T-T-G-AAAAT--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC---T--G--AGGC
gi|81415 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC--T-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-----------------------------AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81416 : AAA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AATTT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GG--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---TTTAAA--G----T-C--TTTT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGTCTG
gi|81417 : AAA-ATTG-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--C-G---TT-A-GC-----------TG-AA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA-------T-T--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AAGCCTG
gi|81418 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TCA---AAATT-A-T--T--TT--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-AT--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----AT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GAGCC
gi|81419 : AAA-ATTT-T--G-T-----T-TG----TT-TT-TGA---AAATG-A-T--T--TT--G-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-T-GAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81420 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---GAATT----------C--T-C---A--A-A---TTCA-GC-----------TG-GG--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-CAT-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81421 : AAA-GTTT-C--A-T-----T-TA----TA-AA-AGA---AAATT-A-T--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-AA--T--T-T-G-AAA-T--C-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATC-A-G-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81422 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---GAATT-A-T--T--TA--A-A---A--A-G---TA-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAT-----TT----------T-A-TGA-TC--TT--G--AGACC
gi|81423 : AAA-ATTT-TT-A-T-----T-TA----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--G--TC--T-T---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---TCA-AA--G----C-C--TTTT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--T
gi|81424 : AAA-ATGT-A--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------CA-AA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----AA-C---T---T---AC--G----T-C--AATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81425 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TT--T-G---A--A-G---TT-A-GC-----------AG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GAGC---T---T---AA--G----T-C--TA-T-C-T-CGT-----TT----------C-ATTGG-TC--TT--GA-AGGCCT
gi|81426 : AAC-ATTT-C--A-T-----T-TG----TC-TA-TGA---AAATA-A-T--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GA-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-G--A----GA-C-------T---A----------C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TTGAG--AGGTCTG
gi|81427 : AAA-ATTT-CC-A-T-----T-AGGT--TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC--T-TC--A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAATT--T-T--AGATCGA-C---T---TAA-AA--G----T-C--TA-T-C-T-CAG------T----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81428 : AAA-ATTT-C--A-T-----TAGG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA----------------------T-C--GA---C-T-TA------TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81429 : AAA-ATTT-G--A-T-----T--G----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--C-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-AA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----G---------------A--G----T-C--TAAT-C-T-CAG-----GT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81431 : AAA-ATTTTC--A-T-----T-TG----TT-TAATGA---AAATC-A-A--T--TC--T-GC--A--ACG---TT-A-GC-----------TG--A--T--T-T-G-AAAAT--T-T--A----GAGC---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TTACATAATATAT-A-TGG-TC--TT-----AGGCCTG
gi|81432 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TAA---AAATT-ATT--T--TT--T-C---A--A-G---TT-G-GC-----------TG-A------T-T-G-AAA-T--T-T--A----AA-C-------T---AA--G----T----TATC-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81433 : AAA-ATCT-T--A-T-----T-TG----CT-CA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GT-----------TG-GA--T--T-G-A-AAA-T--T-T--A----GA-T---G---T---TC--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GAGACT
gi|81434 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---ATATC-A-T--T--TC--T-C---A--C-G---TT-A-GT-----------TG-AA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATT-C-T-TAC-----TT----------T-G-TGG-TC--TT--G--
gi|81435 : AAA-ATTC-T--A-T-----T-TG----GT-TA-TGA---AAGTT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GT-----------TG-GA-------------------------------C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-CC--TT--G--ACGCCTG
gi|81436 : AAA-ATTTTC--A-T-----T-TG----TT-TA-TAG---AAATT-A-T--C--TC--TCA---A--A-G---TT-A-AT-----------TG-GA--T--T-T-G-AAAGT--T-T--A----GA-A---C---T---AA--G----T-C--TA-T-C-T-CAGT----TT----------T-A-TGGATC--TT--G--AGGCCTG
gi|81437 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----CT-TA-TGA---AAATT-A-T--G--TT--T-C---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-ACA-T--T-T--A----GA-A---T---G---AA--G----A-T--TATT-C-T-CAG-----TG----------T-A-TGG-TC--TT--G--TGGC
gi|81438 : AAA-ATTT-G--T-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATG-A-A--T--TC--T-C---A--A-G---T--A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-CA--T---T---AA--G----TCC--TATT---T-C-G-----TT----------TAA-TGG-TCTTTT--G--AGGTCTG
gi|81439 : AAA-ATTC-C--A-T-----G-TC----TT-TA-TCA---AATTC-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A--T-----------TGAGA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--A----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--AA--G--AGGCCTG
gi|81440 : AAA-ATTT-TCAA-T-----T-TG----TT-TA-CGAGAAAAATT-A-T--T--TC--A-A---T--A-G---AT-A-GC-----------TG-GA--T--T---G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A------C--TT--G--AGGCCTG
gi|81441 : AAA-ATTT-C--A-G-----T-TG----TT-TG-TGA---AAA---------------------------------A-GC-----------TG-GA--T--T-T-T-AGA-T--T-TT-A----GA-C---T---T---A---G----T-C--TAAT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81442 : AAA-ATGT-C--A-C-----T-TG----TTATAATAA---AAATT-A-GAAT--TC--T-----A--A-G---T--A-G------------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-CTT-CAG-----TT----------T-A-T-G-TC--TT--G--ATACCTG
gi|81444 : AAC-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-AA-TGA---AAATT-A-C--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-CA--T--T-T-G-AAA-T--T-C--A----GA-A---G---T---AA--G----T-C--TCTT-C-T-CAG-----TG----------T-A-TGG-TT--TT--G--GAGTC
gi|81445 : AAATATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-A--T--TC--T-C---AG-A-G---TT-A-GC-----------TG-CA--T--TCT-GCAAA-T--T-T-------GA-C---T---T---AG--A----T-C--TTTC-C-T-CAG-----TT----------A-A-TGG-TG--TT-----AGGCC
gi|81446 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TG-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA---------A----GT-C---T--------A--G------C--TTTT-C-T-CAG-----TTTA--------T-A-TGG-TC--TC--G--GGGCCTG
gi|81448 : AAA-ATTT-C--A-T-----G-TG----T---A-TCA---AAATT-A-T--T--------G---A-----------------------------GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-T--TATT-C-T-CAG-----TG----------T-A-TGG-TC--TT--C--AAGCC
gi|81449 : AAA-ATTT-T--A-C-----T-TG----TT-TA-T-----AAATT-A-T--T--TT--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------CG--A--T--T-T-G-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-
gi|81451 : AAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-CCTCTTTTTTTTTTA-GA--T--T-T-T-AGA-C--T-T--A----A------T---T---AA--A----T-A--TATT-C-T-CAA-----TC----------A-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81452 : --A-T-----T-TAC---TT-TG-TGA---AAATG-A-T--T--TC--------A--A-GCA-TT-A-GC-----------TG-GG--T--T-T-G-----T--T-T--A----G------T---T---AA--G----T-C--TATC-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--AGGCCTG
gi|81453 : aaaattttagttctttatgaaAAG-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TT-TGA---TAATT-A-T--T--AA----A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG--A--T--T-T-G-AA--T--T-T--A----GA-G---G---T---A---G----T----TATTTC-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81454 : AAA-ATGT----G-T-----T-TG----TT--A-TGA---AAATT-A-T--C--TC----A---A--C-G---TT-A-GC-----------TG-TT--A--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---TA--AA--G----T-C--TATT-G-T-CAG-----TC----------T-A-GTG-TC--TT--G--AG
gi|81458 : aAA-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATTAA-T--T--CC--T-C---A--A-GT--TT-A-GC-----------TG-GA--C--T-T-T-AAA-T--T-T--AG---GA-C---T---C---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TTTA--------T-A-TGG-TC--TT--GA-AGGC
gi|81459 : AA-ATTT-C--A-TAAAATT-TACAACTT-TA-GGA---AAATA-A-T--G--TC--T-C---A--A-T---TT-A-GC-----------TG-GG--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----CA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81460 : AA-ATTT-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------T--------------------------------GA-C---T---T---A--------T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TT--TA--G--AGCCCTG
gi|81461 : AA-ATTT-C--A-TATT--T-TG----TT-TA---A---AAATT-A-A--T--TC--T-TTTAATTA-G---TT-A-AA-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-TTAA----GA-C---T---T---AA--T----C-T--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--CT--T--GGGCCTG
gi|81462 : AA-ATTT-C--A----------A----TT-TA-GAA---AAATA-A-TG-T--TCACT-T------------TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-TTG-AAA-TGGT-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC---T--G--AGG
gi|81463 : A-ATTT-C--A-T-----T-TG----TT-CA-CGA---AAATT-A-T--T--TC--T-C---A--A-G---TT-A-GG-----------TA-GA--T--T-T-G-AAA-T--C-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AAGCCCG
gi|81466 : -ATTT-T--T-T-----T-TG----TT-AA---A---AAACT-A-T--AAATC--T-T---A--A-G---AT-A-TA-----------AG-TA--A--T-C-A-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TC----------T-A-TGG-TC--TT--G--
gi|81469 : TTT-T--T-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-C-A-AAA-T--T-T--A----GA-C-------T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81470 : TTT-T--T-T-----T-TG----TT-TA-TG----AAATT-A-T--T--TCA-A-A---A--A-G---TT-AGGC-----------TG-GA--T--T-C-A-AAA-T--T-T--A----GA-C-------T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81471 : TTT-T--A-T-----T-TG----TT-TA-TTA---ACATT-T-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GT-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---G---C---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----AT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AG
gi|81472 : TTT-T--A-T-----T-T-----TT-AA-TGA---TAACT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A----------------------------------T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-TAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81473 : --A-T-----T-TG----TT-T--TGA---TAATT-A-A--T--TC--T-----A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--TCT-G-AAA-T--TCT--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TAT--C-T-CAG-----TT----------T-T-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81474 : --A-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TA--T-C---A--A-A------A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-CAT-T---T---AAAAG----T-C--TATT-C-T-CAT-----GT----------T-A-TGA-TC--TT--G--AGGC
gi|81476 : -AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TCG-TC--TT--G--ATACCTG
gi|81477 : tttatttttaaacatatgtgttataaatcttaagatataagtaatca-T-----T-TG----TT-TA-TGA---AAATT-A-T--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--GTCGAT-C--TATT-C-T-CAG-----TTTTA-------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCC
gi|81478 : -TA-TGA---AAATT-G-C--T--TC--A-A---A--A-G---TT-A-GC-----------CG-GA--T--T-T-G-AAA-T--T-T--A----AA-CGT-T---T---A--------T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGA-AT--TT--G--AGGC
gi|81480 : tcataT-A-AC-----------TG-A------T-C-G-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---G---AA--A----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TTG-G--AGGCC
gi|81481 : tgaaacatatgcttaagatatacatg-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81482 : aaagtaaatcgtaagatacaagtcatcAATC-A-T--T--TC--A-C---A--A-G---TT-A-GG-----------TA-TAGTT--T-T-G-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGT-TC--TT--G--ATGCC
gi|81483 : --T-T-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TGTT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81484 : atcaatcttgagatataagtaa-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATC-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TTG-G--AGG
gi|81486 : ttaaatctttataagtaatcaTT-A-T--T--TC--A-A---A--A-C---TT-A-GC-----------TG-GA--T--T-T-A-AAA-T--T-T--A----GA-T---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--
gi|81487 : --TC--T-G---A--A-G---AT-A-TA-----------AG-AA--A--T-C-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81488 : taaaAA-T--C-A--A----AA-T---T---T---AG--G----C-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81489 : taaatcttaagatataagt-AAA-T--T-T-------GA-C---T---T---AA--G----T-T--TATT-A-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81490 : taaatcttgagatataagtaataaa-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81491 : taaatcttaagatatatacgtaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81492 : taaatcttaagatataagtaatca--TC--T-T---A--A-G------A-TC-----------TG-AG--TAAT-C-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-T--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGCC
gi|81493 : taaa-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--C--TGGTCT
gi|81494 : taaatcttaagatataagtaatca-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAG-----TT----------C-A-TGG-TC--TT--G--AG
gi|81495 : taagtcttgagatataagcaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---C---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCC
gi|81497 : taaatcttaagatataagtT-A-T--T--TC--T-C---A--A-G---AT-A-TA-----------AG-TA--A--T-C-A-AAA-T--T-T--A----AA-C---T---T---AA--A----T-C--GATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--T--AGGCCTG
gi|81498 : -AAA-T--T-T--A----GA-C---T---C---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TA--TT--G--AGACTT
gi|81499 : taaatcttaagatataagtaataa-AAA-T--T-T--A----AA-CAATT---T---AAAAG----T-C--TATT-C-T-CAG-----TTTA--------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81500 : taaatcgtaagatataagtaatca--TC--T-T---A--A-GATATT-A--C-----------TG-A------T-C-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---C---T---AA--A----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-G-TGG-TC--TT--C--AGGCCTG
gi|81501 : taaa-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--
gi|81502 : taaatattaagaaataggtaatca-AAA-T--T-T--T----AA-A---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGCC
gi|81504 : tagttttaagaaattacatgcatgtgatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-C-T-CAGTTAACTT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GAGCC
gi|81505 : aaatcttaaggtataagtaatca--TC--T-T---A--A-G---AT-A-ATG----------TG-G------T-C-A-AAA-G--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--C--GGGCCTG
gi|81506 : aaa--TC--T-T---A--A-G---AT-G-TA-----------TG-TA--A--T-C-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---G---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-
gi|81507 : A--T--T-C-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---TC--AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-AC--TT--GGTGGGCC
gi|81508 : cttaagatataagta-AAA-T--T-T--A----GA-C---T---G---GA--G----T-C--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--C--AGGCC
gi|81509 : taagtacagtgtaatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-TTCAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81511 : tggattagtatatca-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---TA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--GGGCCTG
gi|81513 : agaagtgatca-AAA-T--T-T--T----GA-T---T---T---GA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGA-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81514 : gtaatca-AAA-T--T-T--T----AA-C---T---T---AA--G----T-A--TATT-T-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--GGGCCTG
gi|81515 : gtaatca-AAA-T--T-T--A----GA-T---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TC--G--GGGCCTG
gi|81516 : gtaatca-AAC-T--T-T--T----GA-C---T---T---GA--A------A--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG
gi|81517 : gtaatca-T-A-AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGCC
gi|81518 : -AAA-T--T-T--T----GA-C---T---T---AA--G----T-T--CATT-C-T-CAGT----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G---GGTCTG
gi|81521 : a---T---T---AA--G----T-C--TATT-C-T-CAG-----TT----------T-A-TGG-TC--TT--G--AGGCCTG