lowQualScore                  :                                                  0 0   0 0 0  0 22 0 0 0 000 00 0 111 1 2222222 1 0 0 7777 111 1 11 111  0 0   1 0 0  0 0  0 0   0   00 00  1    0  0  22   1111 11 333 0 0    
lowQualScore                  :                                                  . .   . . .  . .. . . . ... .. . ... . ....... . . . .... ... . .. ...  . .   . . .  . .  . .   .   .. ..  .    .  .  ..   .... .. ... . .    
lowQualScore                  :                                                  4 9   4 4 8  4 11 4 4 8 777 99 4 555 2 0000000 2 8 4 2222 444 6 44 333  8 4   2 4 4  4 4  8 4   4   55 55  2    8  8  33   2222 00 555 4 9    
consensus                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--N-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
Reference ( gi|113150 )       :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113154                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TATG
gi|113153                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-TT--C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113151                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-A---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113149                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--T-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113148                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--T-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113156                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-C-GT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113158                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--CCTGT-G-TCTG
gi|113157                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-CCTGT--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113160                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T-----T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113159                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT--T-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113146                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--C-T---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113166                     :                                              CTGT-CCTGT-C-T-GT-CC-T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113165                     :                                              CTGTTC-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGTGCT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113147                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--T-C---TTG--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113170                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-TTC---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC-----GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113248                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-
gi|113172                     :   tctgtctgtctgtctgatgactgtaaatatacacaggaacattCTGT-C-TGT---T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TATG
gi|113161                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-T-------G-A-T-G--A-----T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113152                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-TG------G-A-T-G----C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113174                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----
gi|113163                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--T-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GTCCTGT-CT-GTC-CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113162                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-C-TTC---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--T-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113175                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-ACT-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-A----GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113145                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-G-G--C-T---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTT--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113155                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-T-------G-G-C-G--T-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113176                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-T-------G-A-T-G--A-----T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-AAA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113171                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-----T-GT-T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTGT---T--C---T-G-TCTG
gi|113167                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-TGGTC-T-------G-A-T-G--T-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TATG
gi|113173                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T----A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-AC--TTT--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113189                     :                                              CTGT-C-T-T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----
gi|113169                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-CC-T-G-T-C---T--G-T---A-T-------G-G-C-G--T-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113192                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T----A-A-TAT-A-C-AC-A-GG---ACA-TTC--TTCGT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113193                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T----T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACT-GTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----TG-C---T-G-TCTG
gi|113195                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG----CA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C-----G-TCTG
gi|113194                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAA-T-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T------T-G-T
gi|113177                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T-----T-------G-G-C-G--T-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTC----T--C---T-G-TCTG
gi|113200                     :                                              CTGT---TGT-CCT-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--
gi|113178                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---CAT-------G-A-T-G----C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT---TG----T--C---A-G-TCTG
gi|113186                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C---------------G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACATTTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-T
gi|113184                     :                                              CTGT-C--GT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-ATT-G--A-----T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG---ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113259                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-
gi|113251                     :        tctgtctgtctgtgactgtaaatatacacaggaacattCTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-
gi|113168                     : tctgtctgtctgtctgtgactgtggtaaatatacacaggaacattCTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-T--C-T---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTGATGAT--C---T-G-T
gi|113188                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---CTT-------G-A-T-G--T-C---T-G--T------A-TAT-A-C-ACAA-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113179                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---CAT-------GTA-T-G--G-CGTCT-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-
gi|113185                     :                                              CTGT-C-TCT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--T-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GTC-CTG----T--A---T-G-
gi|113191                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-T---G-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG---ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--
gi|113180                     :                                              CTGT-C--GT-C-T-GT----T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--GTC---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-
gi|113204                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT----T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-----T-G--T---AA---TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-ACT
gi|113203                     :                                          ctgtCTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-TCGTCA-C---T-G--T---AA---TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-C------CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113190                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GTGC--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G---T-G--T-C---T-G--T---AA-A-TATAA-C-AC-A-GG-A-ACA-TT---T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113196                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--G-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--T-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-CAAC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-C---T--CTG----T--C---T-G-
gi|113207                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-A--T----A-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT--TGT-CT-GT--CTG----
gi|113201                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--T-C---T-GTAT---AA-A-TAT-A-C--C-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT--TGTCCT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113182                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-----T--G-T---C-T-------G-A-T-G----T---T-G--T---AA---TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACT-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113208                     :                                          ctgtCTGT-C-TGT-C-TCGT----T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TATAA-C-AC-A-GG---ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-
gi|113258                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-
gi|113183                     :      tctgtctgtcttgatgcttgtaaatatacacaggaacattCTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-T-------G---C-G--T-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GTCCTGT-CT-GT--C-G----T--C---T-G-TCTG
gi|113181                     :                                              CTGT-C-TGT-C-TCGT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-G---G--T-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-ACAC--TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113164                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-GGT-C---T--G-T---C-T-------G-A---G--T-C---TTG--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-A-A-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CGG----T--C---T-G-TCTG
gi|113216                     :                                              CTGT-CCTGT-C-T-GT-C----G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA---TAT-A-C-AC-A-GG-A--CA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--CTGAT-G-TCTG
gi|113199                     :                                              CTGT-C-TGTGC-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--------T-G--T---AA---TAT-AAC-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CTCGT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113198                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------GTA-C-G--T-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT--TGT-CT-GT--CT-----T--C---T-G-
gi|113197                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T--T-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---TTG--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-
gi|113202                     :                                          ctgtCTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-T-------G-G-C-G--T-C---T-G--T---AATA-TAT---C-AC-A-GG-A-ACA-TTCTGT--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113187                     :                                              CTGT-C-TGT---T-GT-C--T-G-T-C---TCTG-T-----T-------G-A-T-G--C-T---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T------T-G-TCTG
gi|113206                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-TA--G-T-------G-G-C-G--T-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC---GG-A-ACA-TTC--T--GT-CT-T-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113211                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-TTGTTCTGG-A-T-G--T-C---T-G--T---AA-A-T-T-A-A-AC-AAGG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TATG
gi|113209                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T------C---T-G--T---AA-A-TAT---C-AC-A-GG-A-A-A-TTC--T--GT-C-GT-CT-GT---TG----T--C---T-G-TCTG
gi|113205                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--GTT---C-T-------G---T-G----T---T-G--T---AA-A-TATCA-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----
gi|113210                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C------G-T---C-T-------G-G-C-G--T-C---T-G--T---AA-A-TAT-A---AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GTTCCTG-------A---T-G-TCTG
gi|113212                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-G-C-G--T-C---T-G--T----A-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-A-A-TTC--T--GT-CTGT-CT-G---ATG----T--C---T-G-T
gi|113213                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT----T-G-T-C---A--G-T---C-T-------G-G-C-G--T-C---T-G--T---AA-A-TAT-A---AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CT-----T--C---T-G-TATG
gi|113215                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-TGTC-G-T-C---T--G-T---C-T-------G----------C---T-C--T---GA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--CTGAT-G-TCTG
gi|113214                     :                                              CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-T-------G-G-C-G--T-C---T----T---AATA-TA--A-C-AC-A-GGAA-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-T
gi|113224                     :                                                GT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G----C---T-G--TGT-AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C-----G-TCTG
gi|113226                     :                                                 T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--T-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113230                     :                                                 T-C-TGT-C-T-GT-CC-T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--CTGAT-G-TCTG
gi|113231                     :                                                 T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG---ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---TGG-TCTG
gi|113228                     :                                                 T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--T-C---T-G--T---AA-A-TA----C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113234                     :                                                 T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-G-GA-A-AAT-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113227                     :                                                 T-C-TG--C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--T-C---T-GG-T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113225                     :                                                 T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-C------T---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113229                     :                                                 T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G----C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--T---T-A-T
gi|113235                     :                                                 T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA--TC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----
gi|113237                     :                                                 T-C-TGT-C-T-GT-C--TTG-T-C---TT-G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GGAA-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-T
gi|113239                     :                                                 T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T-----T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT---C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-
gi|113238                     :                                                 T-C-TGT-C-T-GT-CT-T-G-T-C---T--G-----C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GTC-CTG----T--C---T-G-TATG
gi|113233                     :                                                 T-C-TGT-C-T-GT-C--T-----C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G----C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT--TGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113232                     :                                                 T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---T-T---------A-T-G--G-CGTCT-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-
gi|113236                     :                                                 T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--T-C---T-G--T---AA-AATAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CTGGT--CTG----T--
gi|113240                     :                                                 T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T----T---C-T-------GTA-T-G--T-C---T-G--T---AA---TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-T
gi|113241                     :                                                 T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-----T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A---A-TTC--T--GT-CTGT-CT-GTGACTG----T--
gi|113247                     :                                                  -C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G---T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GTCCTGT-CT-GT--CTG----T--TA--T-GATCTG
gi|113248                     :                                                       T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113249                     :                                                       T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---TTG--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-GTTCTG
gi|113251                     :                                                       T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G---T-G--A-C---T-G--TGGTAA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113250                     :                                                       T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--------C-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCT
gi|113253                     :                                                       T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-A-T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG---ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----TGAC---T-G-T
gi|113252                     :                                                       T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-G-C-G--T-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-T-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CAGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113259                     :                                                              T-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G---T-G--A-C---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113258                     :                                                              T-C--T-G-T-C---T--G-T---C-TT------G-A-T-G--C-T---T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113260                     :                                                              T-C--T-G-T-C---T--G-T---C-T-------G-G-C-A--T-C---T-G--T---GA-A-TAT-A-T-AC-A-GG-A-ACA-TTC--T--GT-CAGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113174                     :                                                                                                                                                     C--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113191                     :                                                                                                                                                     C--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTGatgactgtaaatatacacaggaacattctgtctgtctgtctg
gi|113207                     :                                                                                                                                                     C--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTGatgatggtaaatatacacaggacattctgtctgtctgtctgt





Alignments
lowQualScore                  :         0 0   0 0 0  0 22 0 0 0 000 11 0 111 11111 2222222 1 0 0 33 11 1 11 000  0 0   1 0 0  0 0  0    0   00 00  1    0  0  22   1111 11 333 0 0    
lowQualScore                  :         . .   . . .  . .. . . . ... .. . ... ..... ....... . . . .. .. . .. ...  . .   . . .  . .  .    .   .. ..  .    .  .  ..   .... .. ... . .    
lowQualScore                  :         4 9   4 4 8  4 22 4 4 8 777 00 4 555 88888 7777777 2 4 4 66 33 6 33 777  4 4   2 8 4  4 4  8    8   55 55  2    8  8  33   3333 00 666 4 9    
consensus                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GN-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
Reference ( family-227 )      :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GN-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113145                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-G-GC-T--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTT--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113146                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GC-T--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113147                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--TTG--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113148                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113149                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113150                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113151                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-A--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113152                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----TG------G-A-T-G--C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113153                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-TT--C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113154                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TATG
gi|113155                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113156                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-C-GT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113157                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-CCTGT--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113158                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--CCTGT-G-TCTG
gi|113159                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT--T-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113160                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---------T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113161                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-----T-------G-A-T-GA----T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113162                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-C-TTC---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113163                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GTCCTGT-CT-GTC-CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113164                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-GGT-C---T--G-T---C-----T-------G-A---GT-C--TTG--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AA-A-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CGG----T--C---T-G-TCTG
gi|113165                     :     CTGTTC-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGTGCT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113166                     :     CTGT-CCTGT-C-T-GT-CC-T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113167                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-TGGTC-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TATG
gi|113168                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-TC-T--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTGATGAT--C---T-G-T
gi|113169                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-CC-T-G-T-C---T--G-T---A-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113170                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-TTC---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC-----GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113171                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA----T-GT-T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTGT---T--C---T-G-TCTG
gi|113172                     :     CTGT-C-TGT---T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TATG
gi|113173                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T--A-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AAC--TTT--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113174                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----
gi|113175                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-ACT-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-A----GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113176                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-----T-------G-A-T-GA----T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AAAA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113177                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---------T-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTC----T--C---T-G-TCTG
gi|113178                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---CA----T-------G-A-T-G--C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT---TG----T--C---A-G-TCTG
gi|113179                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---CATGTAT-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-
gi|113180                     :     CTGT-C--GT-C-T-GT----T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GGTC--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-
gi|113181                     :     CTGT-C-TGT-C-TCGT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-G---GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG--ACACTTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113182                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-----T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT----T-G--T---AA---TAT-A-C-AC-A-GG-AACT-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113183                     : ctgtCTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-----T-------G---C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GTCCTGT-CT-GT--C-G----T--C---T-G-TCTG
gi|113184                     :     CTGT-C--GT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-TG-A--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG--ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113185                     :     CTGT-C-TCT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GTC-CTG----T--A---T-G-
gi|113186                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-------------------GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACATTTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-T
gi|113187                     :     CTGT-C-TGT---T-GT-C--T-G-T-C---TCTG-T---------T-------G-A-T-GC-T--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T------T-G-TCTG
gi|113188                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---CT----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T------A-TAT-A-C-ACAA-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113189                     :     CTGT-C-T-T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----
gi|113190                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GTGC--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G---T-GT-C--T-G--T---AA-A-TATAA-C-AC-A-GG-AACA-TT---T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113191                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-T--G-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG--ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--
gi|113192                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T----A-A-TAT-A-C-AC-A-GG--ACA-TTC--TTCGT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113193                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T----T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACT-GTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----TG-C---T-G-TCTG
gi|113194                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAA-T-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T------T-G-T
gi|113195                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG---CA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C-----G-TCTG
gi|113196                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--G-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-CAAC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-C---T--CTG----T--C---T-G-
gi|113197                     :     CTGT-C-TGT-C-T--T-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--TTG--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-
gi|113198                     : ctgtCTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------GTA-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT--TGT-CT-GT--CT-----T--C---T-G-
gi|113199                     :     CTGT-C-TGTGC-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-G-----T-G--T---AATA-TA--A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CTCGT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113200                     :     CTGT---TGT-CCT-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--
gi|113201                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-GTAT---AA-A-TAT-A-C--C-A-GG-AACA-TTC--T--GT--TGTCCT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113202                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T----A-A-TAT-ATC-AC-A-GG-AACA-TTCTGT--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113203                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-TCGT-CACT-G--T---AA---TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-C------CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113204                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT----T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA----T-G--T---AA---TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-ACT
gi|113205                     : ctgtCTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--GTT---C-----T-------G---T-GT----T-G--T---AA-A-TATCA-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----
gi|113206                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-TA--G-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC---GG-AACA-TTC--T--GT-CT-T-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113207                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-A--T----A-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT--TGT-CT-GT--CTG----
gi|113208                     :     CTGT-C-TGT-C-TCGT----T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-AAC-AC-A-GG-A-CA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-
gi|113209                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T----C--T-G--T---AA-A-TAT---C-AC-A-GG-AA-A-TTC--T--GT-C-GT-CT-GT---TG----T--C---T-G-TCTG
gi|113210                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C------G-T---C-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A---AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GTTCCTG-------A---T-G-TCTG
gi|113211                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----TTGTTCTGG-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-T-T-A-A-AC-AAGG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TATG
gi|113212                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T----A-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AA-A-TTC--T--GT-CTGT-CT-G---ATG----T--C---T-G-T
gi|113213                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT----T-G-T-C---A--G-T---C-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A---AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CT-----T--C---T-G-TATG
gi|113214                     :         -C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------GTA-T-GG-CG-T-C--T---TA-A-TATAA-C-AC-A-GGAAACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-T
gi|113215                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-TGTC-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G--------C--T-C--T---GA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--CTGAT-G-TCTG
gi|113216                     :     CTGT-CCTGT-C-T-GT-C----G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA---TAT-A-C-AC-A-GG-A-CA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--CTGAT-G-TCTG
gi|113224                     :       GT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GC-TG-T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C-----G-TCTG
gi|113225                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A----C-T--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113226                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113227                     :        T-C-TG--C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-GG-T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113228                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TA----C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113229                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-G--C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--T---T-A-T
gi|113230                     :        T-C-TGT-C-T-GT-CC-T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--CTGAT-G-TCTG
gi|113231                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG--ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---TGG-TCTG
gi|113232                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---T-----TAT-----G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-
gi|113233                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-----C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-G--C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT--TGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113234                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-G-GA-AAAT-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113235                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA--TC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----
gi|113236                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-AATAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CTGGT--CTG----T--
gi|113237                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--TTG-T-C---TT-G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GGAAACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-T
gi|113238                     :        T-C-TGT-C-T-GT-CT-T-G-T-C---T--G-----C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GTC-CTG----T--C---T-G-TATG
gi|113239                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---------T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT---C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-
gi|113240                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T----T---C-----T-------GTA-T-GT-C--T-G--T---AA---TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-T
gi|113241                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA----T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A--A-TTC--T--GT-CTGT-CT-GTGACTG----T--
gi|113247                     :         -C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G---T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GTCCTGT-CT-GT--CTG----T--TA--T-GATCTG
gi|113248                     :              T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113249                     :              T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--TTG--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-GTTCTG
gi|113250                     :              T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GC------G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCT
gi|113251                     :              T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G---T-GA-C--T-G--TGGTAA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113252                     :              T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-T-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CAGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113253                     :              T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG--ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----TGAC---T-G-T
gi|113258                     :                     T-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----TT------G-A-T-GC-T--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113259                     :                     T-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G---T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113260                     :                     T-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-G-C-AT-C--T-G--T---GA-A-TAT-A-T-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CAGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG





Alignments
lowQualScore                  :         0 0   0 0 0  0 22 0 0 0 000 11 0 111 11111 2222222 1 0 0 33 11 1 11 000  0 0   1 0 0  0 0  0    0   00 00  1    0  0  22   1111 11 333 0 0    
lowQualScore                  :         . .   . . .  . .. . . . ... .. . ... ..... ....... . . . .. .. . .. ...  . .   . . .  . .  .    .   .. ..  .    .  .  ..   .... .. ... . .    
lowQualScore                  :         4 9   4 4 8  4 22 4 4 8 777 00 4 555 88888 7777777 2 4 4 66 33 6 33 777  4 4   2 8 4  4 4  8    8   55 55  2    8  8  33   3333 00 666 4 9    
consensus                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GN-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
Reference ( family-227 )      :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GN-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113145                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-G-GC-T--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTT--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113146                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GC-T--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113147                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--TTG--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113148                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113149                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113150                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113151                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-A--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113152                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----TG------G-A-T-G--C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113153                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-TT--C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113154                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TATG
gi|113155                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113156                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-C-GT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113157                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-CCTGT--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113158                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--CCTGT-G-TCTG
gi|113159                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT--T-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113160                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---------T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113161                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-----T-------G-A-T-GA----T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113162                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-C-TTC---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113163                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GTCCTGT-CT-GTC-CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113164                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-GGT-C---T--G-T---C-----T-------G-A---GT-C--TTG--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AA-A-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CGG----T--C---T-G-TCTG
gi|113165                     :     CTGTTC-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGTGCT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113166                     :     CTGT-CCTGT-C-T-GT-CC-T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113167                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-TGGTC-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TATG
gi|113168                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-TC-T--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTGATGAT--C---T-G-T
gi|113169                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-CC-T-G-T-C---T--G-T---A-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113170                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-TTC---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC-----GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113171                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA----T-GT-T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTGT---T--C---T-G-TCTG
gi|113172                     :     CTGT-C-TGT---T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TATG
gi|113173                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T--A-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AAC--TTT--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113174                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----
gi|113175                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-ACT-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-A----GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113176                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-----T-------G-A-T-GA----T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AAAA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113177                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---------T-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTC----T--C---T-G-TCTG
gi|113178                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---CA----T-------G-A-T-G--C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT---TG----T--C---A-G-TCTG
gi|113179                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---CATGTAT-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-
gi|113180                     :     CTGT-C--GT-C-T-GT----T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GGTC--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-
gi|113181                     :     CTGT-C-TGT-C-TCGT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-G---GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG--ACACTTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113182                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-----T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT----T-G--T---AA---TAT-A-C-AC-A-GG-AACT-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113183                     : ctgtCTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-----T-------G---C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GTCCTGT-CT-GT--C-G----T--C---T-G-TCTG
gi|113184                     :     CTGT-C--GT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-TG-A--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG--ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113185                     :     CTGT-C-TCT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GTC-CTG----T--A---T-G-
gi|113186                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-------------------GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACATTTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-T
gi|113187                     :     CTGT-C-TGT---T-GT-C--T-G-T-C---TCTG-T---------T-------G-A-T-GC-T--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T------T-G-TCTG
gi|113188                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---CT----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T------A-TAT-A-C-ACAA-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113189                     :     CTGT-C-T-T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----
gi|113190                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GTGC--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G---T-GT-C--T-G--T---AA-A-TATAA-C-AC-A-GG-AACA-TT---T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113191                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-T--G-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG--ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--
gi|113192                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T----A-A-TAT-A-C-AC-A-GG--ACA-TTC--TTCGT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113193                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T----T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACT-GTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----TG-C---T-G-TCTG
gi|113194                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAA-T-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T------T-G-T
gi|113195                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG---CA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C-----G-TCTG
gi|113196                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--G-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-CAAC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-C---T--CTG----T--C---T-G-
gi|113197                     :     CTGT-C-TGT-C-T--T-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--TTG--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-
gi|113198                     : ctgtCTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------GTA-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT--TGT-CT-GT--CT-----T--C---T-G-
gi|113199                     :     CTGT-C-TGTGC-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-G-----T-G--T---AATA-TA--A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CTCGT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113200                     :     CTGT---TGT-CCT-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--
gi|113201                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-GTAT---AA-A-TAT-A-C--C-A-GG-AACA-TTC--T--GT--TGTCCT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113202                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T----A-A-TAT-ATC-AC-A-GG-AACA-TTCTGT--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113203                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-TCGT-CACT-G--T---AA---TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-C------CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113204                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT----T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA----T-G--T---AA---TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-ACT
gi|113205                     : ctgtCTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--GTT---C-----T-------G---T-GT----T-G--T---AA-A-TATCA-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----
gi|113206                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-TA--G-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC---GG-AACA-TTC--T--GT-CT-T-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113207                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-A--T----A-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT--TGT-CT-GT--CTG----
gi|113208                     :     CTGT-C-TGT-C-TCGT----T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-AAC-AC-A-GG-A-CA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-
gi|113209                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T----C--T-G--T---AA-A-TAT---C-AC-A-GG-AA-A-TTC--T--GT-C-GT-CT-GT---TG----T--C---T-G-TCTG
gi|113210                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C------G-T---C-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A---AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GTTCCTG-------A---T-G-TCTG
gi|113211                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----TTGTTCTGG-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-T-T-A-A-AC-AAGG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TATG
gi|113212                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T----A-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AA-A-TTC--T--GT-CTGT-CT-G---ATG----T--C---T-G-T
gi|113213                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT----T-G-T-C---A--G-T---C-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A---AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CT-----T--C---T-G-TATG
gi|113214                     :         -C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------GTA-T-GG-CG-T-C--T---TA-A-TATAA-C-AC-A-GGAAACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-T
gi|113215                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-TGTC-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G--------C--T-C--T---GA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--CTGAT-G-TCTG
gi|113216                     :     CTGT-CCTGT-C-T-GT-C----G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA---TAT-A-C-AC-A-GG-A-CA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--CTGAT-G-TCTG
gi|113224                     :       GT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GC-TG-T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C-----G-TCTG
gi|113225                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A----C-T--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113226                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113227                     :        T-C-TG--C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-GG-T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113228                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TA----C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113229                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-G--C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--T---T-A-T
gi|113230                     :        T-C-TGT-C-T-GT-CC-T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--CTGAT-G-TCTG
gi|113231                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG--ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---TGG-TCTG
gi|113232                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---T-----TAT-----G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-
gi|113233                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-----C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-G--C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT--TGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113234                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-G-GA-AAAT-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113235                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA--TC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----
gi|113236                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-AATAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CTGGT--CTG----T--
gi|113237                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--TTG-T-C---TT-G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GGAAACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-T
gi|113238                     :        T-C-TGT-C-T-GT-CT-T-G-T-C---T--G-----C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GTC-CTG----T--C---T-G-TATG
gi|113239                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---------T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT---C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-
gi|113240                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T----T---C-----T-------GTA-T-GT-C--T-G--T---AA---TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-T
gi|113241                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA----T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A--A-TTC--T--GT-CTGT-CT-GTGACTG----T--
gi|113247                     :         -C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G---T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GTCCTGT-CT-GT--CTG----T--TA--T-GATCTG
gi|113248                     :              T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113249                     :              T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--TTG--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-GTTCTG
gi|113250                     :              T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GC------G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCT
gi|113251                     :              T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G---T-GA-C--T-G--TGGTAA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113252                     :              T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-T-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CAGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113253                     :              T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG--ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----TGAC---T-G-T
gi|113258                     :                     T-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----TT------G-A-T-GC-T--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113259                     :                     T-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G---T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113260                     :                     T-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-G-C-AT-C--T-G--T---GA-A-TAT-A-T-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CAGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG


blockSeqs                     :                        GT                GGT ATGTA TGTTCTG T     GT AC T TA            A                           C          TC   ATGA GA CTG
blockSeqs                     :                        C                 T   A     AT      T     C  G  T T             C                           C          GA   T    G  TGA
blockSeqs                     :                        C                 A   T     G       T     T  G  T G             A                           C          C    .    .  TGA
blockSeqs                     :                        C                 .   .     T       .     T  .  T .             .                           .          C    .    .  TGA
blockSeqs                     :                        T                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          C    .    .  A  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     C  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     G  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     C  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     G  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     C  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     C  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     C  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .  .  
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     C  .  . .             .                           .          .    .    .     
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     A  .  . .             .                           .          .    .    .     
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     T  .  . .             .                           .          .    .    .     
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     .  .  . .             .                           .          .    .    .     
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     .  .  . .             .                           .          .    .          
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     .  .  . .             .                           .          .    .          
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     .  .  . .             .                           .          .    .          
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     .  .  . .             .                           .          .    .          
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     .  .  . .             .                           .          .    .          
blockSeqs                     :                        .                 .   .     .       .     .  .  . .             .                           .                          


blockSeqCons                  :     
originalCons                  :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GN-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
finalCons                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GN-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG





Alignments
lowQualScore                  :         0 0   0 0 0  0 22 0 0 0 000 11 0 111 11111 2222222 1 0 0 33 11 1 11 000  0 0   1 0 0  0 0  0    0   00 00  1    0  0  22   1111 11 333 0 0    
lowQualScore                  :         . .   . . .  . .. . . . ... .. . ... ..... ....... . . . .. .. . .. ...  . .   . . .  . .  .    .   .. ..  .    .  .  ..   .... .. ... . .    
lowQualScore                  :         4 9   4 4 8  4 22 4 4 8 777 00 4 555 88888 7777777 2 4 4 66 33 6 33 777  4 4   2 8 4  4 4  8    8   55 55  2    8  8  33   3333 00 666 4 9    
consensus                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GN-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
Reference ( family-227 )      :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GN-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113145                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-G-GC-T--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTT--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113146                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GC-T--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113147                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--TTG--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113148                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113149                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113150                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113151                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-A--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113152                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----TG------G-A-T-G--C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113153                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-TT--C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113154                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TATG
gi|113155                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113156                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-C-GT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113157                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-CCTGT--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113158                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--CCTGT-G-TCTG
gi|113159                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT--T-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113160                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---------T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113161                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-----T-------G-A-T-GA----T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113162                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-C-TTC---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113163                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GTCCTGT-CT-GTC-CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113164                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-GGT-C---T--G-T---C-----T-------G-A---GT-C--TTG--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AA-A-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CGG----T--C---T-G-TCTG
gi|113165                     :     CTGTTC-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGTGCT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113166                     :     CTGT-CCTGT-C-T-GT-CC-T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113167                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-TGGTC-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TATG
gi|113168                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-TC-T--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTGATGAT--C---T-G-T
gi|113169                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-CC-T-G-T-C---T--G-T---A-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113170                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-TTC---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC-----GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113171                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA----T-GT-T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTGT---T--C---T-G-TCTG
gi|113172                     :     CTGT-C-TGT---T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TATG
gi|113173                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T--A-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AAC--TTT--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113174                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----
gi|113175                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-ACT-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-A----GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113176                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-----T-------G-A-T-GA----T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AAAA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113177                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---------T-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTC----T--C---T-G-TCTG
gi|113178                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---CA----T-------G-A-T-G--C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT---TG----T--C---A-G-TCTG
gi|113179                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---CATGTAT-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-
gi|113180                     :     CTGT-C--GT-C-T-GT----T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GGTC--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-
gi|113181                     :     CTGT-C-TGT-C-TCGT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-G---GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG--ACACTTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113182                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-----T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT----T-G--T---AA---TAT-A-C-AC-A-GG-AACT-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113183                     : ctgtCTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-----T-------G---C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GTCCTGT-CT-GT--C-G----T--C---T-G-TCTG
gi|113184                     :     CTGT-C--GT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-TG-A--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG--ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113185                     :     CTGT-C-TCT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GTC-CTG----T--A---T-G-
gi|113186                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-------------------GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACATTTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-T
gi|113187                     :     CTGT-C-TGT---T-GT-C--T-G-T-C---TCTG-T---------T-------G-A-T-GC-T--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T------T-G-TCTG
gi|113188                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---CT----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T------A-TAT-A-C-ACAA-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113189                     :     CTGT-C-T-T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----
gi|113190                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GTGC--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G---T-GT-C--T-G--T---AA-A-TATAA-C-AC-A-GG-AACA-TT---T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113191                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-T--G-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG--ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--
gi|113192                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T----A-A-TAT-A-C-AC-A-GG--ACA-TTC--TTCGT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113193                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T----T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACT-GTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----TG-C---T-G-TCTG
gi|113194                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAA-T-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T------T-G-T
gi|113195                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG---CA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C-----G-TCTG
gi|113196                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--G-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-CAAC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-C---T--CTG----T--C---T-G-
gi|113197                     :     CTGT-C-TGT-C-T--T-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--TTG--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-
gi|113198                     : ctgtCTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------GTA-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT--TGT-CT-GT--CT-----T--C---T-G-
gi|113199                     :     CTGT-C-TGTGC-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-G-----T-G--T---AATA-TA--A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CTCGT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113200                     :     CTGT---TGT-CCT-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--
gi|113201                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-GTAT---AA-A-TAT-A-C--C-A-GG-AACA-TTC--T--GT--TGTCCT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113202                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---A-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T----A-A-TAT-ATC-AC-A-GG-AACA-TTCTGT--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113203                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-TCGT-CACT-G--T---AA---TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-C------CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113204                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT----T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA----T-G--T---AA---TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-ACT
gi|113205                     : ctgtCTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--GTT---C-----T-------G---T-GT----T-G--T---AA-A-TATCA-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----
gi|113206                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-TA--G-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC---GG-AACA-TTC--T--GT-CT-T-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113207                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-A--T----A-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT--TGT-CT-GT--CTG----
gi|113208                     :     CTGT-C-TGT-C-TCGT----T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-AAC-AC-A-GG-A-CA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-
gi|113209                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T----C--T-G--T---AA-A-TAT---C-AC-A-GG-AA-A-TTC--T--GT-C-GT-CT-GT---TG----T--C---T-G-TCTG
gi|113210                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C------G-T---C-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A---AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GTTCCTG-------A---T-G-TCTG
gi|113211                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----TTGTTCTGG-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-T-T-A-A-AC-AAGG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TATG
gi|113212                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T----A-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AA-A-TTC--T--GT-CTGT-CT-G---ATG----T--C---T-G-T
gi|113213                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT----T-G-T-C---A--G-T---C-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A---AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CT-----T--C---T-G-TATG
gi|113214                     :         -C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------GTA-T-GG-CG-T-C--T---TA-A-TATAA-C-AC-A-GGAAACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-T
gi|113215                     :     CTGT-C-TGT-C-T-GT-TGTC-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G--------C--T-C--T---GA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--CTGAT-G-TCTG
gi|113216                     :     CTGT-CCTGT-C-T-GT-C----G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA---TAT-A-C-AC-A-GG-A-CA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--CTGAT-G-TCTG
gi|113224                     :       GT-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GC-TG-T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C-----G-TCTG
gi|113225                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A----C-T--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113226                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113227                     :        T-C-TG--C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-GG-T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113228                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-A-TA----C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113229                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-G--C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--T---T-A-T
gi|113230                     :        T-C-TGT-C-T-GT-CC-T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--CTGAT-G-TCTG
gi|113231                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG--ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---TGG-TCTG
gi|113232                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---T-----TAT-----G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-
gi|113233                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-----C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-G--C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT--TGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113234                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-G-GA-AAAT-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113235                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA--TC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----
gi|113236                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GT-C--T-G--T---AA-AATAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CTGGT--CTG----T--
gi|113237                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--TTG-T-C---TT-G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GGAAACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-T
gi|113238                     :        T-C-TGT-C-T-GT-CT-T-G-T-C---T--G-----C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GTC-CTG----T--C---T-G-TATG
gi|113239                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---------T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT---C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-
gi|113240                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T----T---C-----T-------GTA-T-GT-C--T-G--T---AA---TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-T
gi|113241                     :        T-C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA----T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-A--A-TTC--T--GT-CTGT-CT-GTGACTG----T--
gi|113247                     :         -C-TGT-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G---T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GTCCTGT-CT-GT--CTG----T--TA--T-GATCTG
gi|113248                     :              T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113249                     :              T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--TTG--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-GTTCTG
gi|113250                     :              T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GC------G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCT
gi|113251                     :              T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G---T-GA-C--T-G--TGGTAA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113252                     :              T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-G-C-GT-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-T-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CAGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113253                     :              T-C-T-GT-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-A-T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG--ACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----TGAC---T-G-T
gi|113258                     :                     T-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----TT------G-A-T-GC-T--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113259                     :                     T-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G---T-GA-C--T-G--T---AA-A-TAT-A-C-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CTGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG
gi|113260                     :                     T-C--T-G-T-C---T--G-T---C-----T-------G-G-C-AT-C--T-G--T---GA-A-TAT-A-T-AC-A-GG-AACA-TTC--T--GT-CAGT-CT-GT--CTG----T--C---T-G-TCTG