lowQualScore                  :              0 111 0 00   2222  00    11  0  0  0   0 1 0   0   111 11 2 333 777777 0 0 666666 11111 111 111 000 22222 111 111111 0 1111 0   0   
lowQualScore                  :              . ... . ..   ....  ..    ..  .  .  .   . . .   .   ... .. . ... ...... . . ...... ..... ... ... ... ..... ... ...... . .... .   .   
lowQualScore                  :              8 111 8 66   1111  66    44  4  4  4   4 2 8   4   777 00 0 666 000000 8 4 555555 88888 888 777 777 00000 888 666666 4 7777 8   4   
consensus                     :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
Reference ( gi|9145 )         :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9150                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9149                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9148                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9147                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9146                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9152                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AG
gi|9155                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-A
gi|9160                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----AGGAC-AGA
gi|9159                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---GA--A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9158                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---T---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9157                       :         CAGAC-A---GCA--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9156                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----AGGAC-AGA
gi|9151                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--CAA---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9163                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9162                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9161                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9166                       :         CAGAC-A---G-A--C-G----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9165                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGA---TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9168                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----AACAG---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9167                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----ACAGG------A-C----A-GAC-AGA
gi|9201                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A-------A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9171                       :     cagaCAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G------C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9169                       :         CAGAC-A-----A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9144                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T--CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9143                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T--CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9173                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---A---G--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9164                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--CAA---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9178                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-A-TTA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9181                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC---GAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---GA-----A-C----A-GAC-AGA
gi|9182                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---AC-C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AG
gi|9186                       :         CAGAC-A---G-A--CAGG---AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A--------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9185                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G------C-A-TC-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9184                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---GACCA---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9183                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A-------T--C-A-T------C-----A---T---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9154                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTTA--A--C-A-------T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9189                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---A---G--A-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9190                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAAA-TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-G-A------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9187                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTTAC-A--C-A---G------C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9193                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-G----------C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9195                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A--------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GA
gi|9196                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G---ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----AACAG---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9194                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---CAGAAGA---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9192                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTTACCA--C-A---G---T--C-A--------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9197                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G----TA-TTT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9177                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--CAA---G---T--C-A-GA-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9199                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-AGACG---C--C-A-TA-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9179                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TTTCC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---CA----A---G------A-CA---A-GAC-AGA
gi|9202                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---GA--C--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A--AC-AGA
gi|9200                       :         CAGACCA---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATATTTT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9153                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T--CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-C---A---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9191                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC---T-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-AGT------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9172                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG----CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---T---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9188                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AAAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---A---G--C-C-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9180                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--AT-TT-TC-CGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9205                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-AGACG---C--C-A-TAAA---C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9204                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAC--AG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---AAGAC-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9224                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAC--AG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---------A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9206                       :    cagcaCAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TT-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A-------T--C-A-T------C-----A---T---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9203                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AAAA---G-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T----A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9198                       :         CAGAC-A---G-A--CA-----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TT----A--T-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9170                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T--CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A-------T--CAA-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9209                       :         CAGAC-A---G-A--CTG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-A-T-ATA-TTT---A--C-A---G---A--C-G-C------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9208                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---A---G--C-A-T------CA----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GA
gi|9212                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---GACGC--C-A-TACATGAC-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9210                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-AGACG---C--C-A-TA-----C-----A---G---A---C-----AG--G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9174                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG--T-CC-TGT-GTT-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-CAACGA-GAC-AGA
gi|9219                       :         CAGAC-A---G-A--CA-----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G------C-A-T------C-----A---G---A---CAG---A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9175                       : cagacagaCAGAC-A---G-A--CAG----ACGAAGAA--TG--T-CC-TGT-G-T-ATA--TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9176                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG--T-CC-TGT-G-T-ATA--TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C------GAC-AGA
gi|9214                       :         CAGAC-A---G-AGACAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGTTG-T-ATA-TTT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----C-GAC-AGA
gi|9211                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA--TT---A--C-A-------T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A--AC-AGA
gi|9217                       :         CAGAC-A---GGA--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA--TT---A--C-A---G---TGACGA-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9218                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---A---G--C-A-T------CAACAGA---G---A---C-----A---G------A-C----A--AC-AGA
gi|9220                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA--TT---A--C-A---G---A--C-A-TA-----C-----A---G---A---------A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9216                       :         CAGAC-A-----A--CAG----AC--AGAA---G-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---GGA-A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9221                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CCTTGT-G-T-ATA---T---A--C-A---G---A--C-A-T------CA----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9226                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-TGATA-TTT---A--C-A---A------C-A-CAGAA--C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9223                       :         CAGAC-A---G-A--CAGGACAAC--AGAA--TG-TT-CC-TG--G-T-ATA-TTT---ATAC-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9230                       :         CAGACGA---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-GTT-ATA--TT---A--C-A----------C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AG
gi|9227                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--AG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TT----A--C-A---A------C-A-T------C-----A---G---A---C-----AACAG------A-C----A-GAC-AGA
gi|9207                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAAG-TG--T-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---A--C---C------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GACGAGAcaga
gi|9225                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAAAATG-TT-CC--GT-G-T-ATA-TT----A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G-----------------G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9222                       :         CAGAC-ATCAG-A--CAG----AC--AGAA--T--TT-CC-TGT-G-T-ATA-TT----A--C-A---G---A--C-G-C------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9213                       :         CAGAC-AA--G-A--CAG----AC--AGAA--TG--T-CC-TGT-G---ATA-TTT---A--C-AC--A---T--C-A-A------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9215                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TGTTT-CC-TGT-GTT-ATA-TTA---A--G-AC--G---C--C-A-TA-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9229                       :         CAGAC-A---G-A---AG----AC--AGAA--TG-TT-CC--GT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---GACGC--C-A-CTA----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9228                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTC---A--G-A---G-----------------C-----A---G---A---C-----A---GACGACAA-C----A-GAC-AGA
gi|9247                       :          AGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-AGACG---C--C-A-A------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9248                       :          AGAC-A---G-A--CA-----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---A--C-G-TA-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9254                       :           GAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9255                       :           GAC-A---G-A--CAGG---AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9256                       :           GAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G-------C-----A---G------A-CA---A-GAC-AGA
gi|9258                       :           GAC-A---G-A--CAGG---AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---GAC-G--C-A-TA-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9257                       :           GAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--T--TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--CAA---G---A--C---T------C-----A---G---A---C-----A---G------ACC----A-GAC-AGA
gi|9260                       :            AC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---G------C-A-T------C-----AT--G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9259                       :            AC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--T---T-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A-------T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9261                       :            AC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-TAATA--TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A--AC-AGA
gi|9265                       :              -A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-TT-CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--CAA---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GA--AGA
gi|9266                       :                ---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T--CC-TGT-G-T-ATA-TTT---A--C-A---GA--T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA





Alignments
lowQualScore                  :              0 111 0 00   2222  00    11  0 0 0  0   0 0 0   0 0  111 00 2 333 666666 0 0 666666 11111 111 111 000 11111 111 111111 0 1111 0   0   
lowQualScore                  :              . ... . ..   ....  ..    ..  . . .  .   . . .   . .  ... .. . ... ...... . . ...... ..... ... ... ... ..... ... ...... . .... .   .   
lowQualScore                  :              8 111 8 66   1111  66    00  4 4 4  4   4 8 4   4 8  666 99 0 666 888888 8 4 444444 88888 888 666 777 99999 888 555555 4 6666 8   4   
consensus                     :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
Reference ( family-226 )      :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9143                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T---CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9144                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T---CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9145                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9146                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9147                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9148                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9149                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9150                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9151                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--CAA---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9152                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AG
gi|9153                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T---CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-C---A---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9154                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TTA--A--C-A-------T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9155                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-A
gi|9156                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----AGGAC-AGA
gi|9157                       :         CAGAC-A---GCA--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9158                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---T---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9159                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---GA--A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9160                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----AGGAC-AGA
gi|9161                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9162                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9163                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9164                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--CAA---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9165                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGA---TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9166                       :         CAGAC-A---G-A--C-G----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9167                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----ACAGG------A-C----A-GAC-AGA
gi|9168                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----AACAG---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9169                       :         CAGAC-A-----A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9170                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T---CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A-------T--CAA-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9171                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G------C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9172                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-----CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---T---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9173                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---A---G--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9174                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG---T-CC-TGT-GTT-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-CAACGA-GAC-AGA
gi|9175                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----ACGAAGAA--TG---T-CC-TGT-G-T-ATA---TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9176                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG---T-CC-TGT-G-T-ATA---TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C------GAC-AGA
gi|9177                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--CAA---G---T--C-A-GA-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9178                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-A-TTA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9179                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-TTCC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---CA----A---G------A-CA---A-GAC-AGA
gi|9180                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--AT-T-T-TC-CGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9181                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC---GAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---GA-----A-C----A-GAC-AGA
gi|9182                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---AC-C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AG
gi|9183                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A-------T--C-A-T------C-----A---T---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9184                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---GACCA---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9185                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G------C-A-TC-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9186                       :         CAGAC-A---G-A--CAGG---AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A--------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9187                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TTAC-A--C-A---G------C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9188                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AAAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---A---G--C-C-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9189                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---A---G--A-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9190                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAAA-TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-G-A------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9191                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC---T-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-AGT------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9192                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TTACCA--C-A---G---T--C-A--------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9193                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-G----------C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9194                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---CAGAAGA---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9195                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A--------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GA
gi|9196                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G---ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----AACAG---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9197                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G----TA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9198                       :         CAGAC-A---G-A--CA-----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-T----A--T-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9199                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-AGACG---C--C-A-TA-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9200                       :         CAGACCA---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATATT-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9201                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A-------A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9202                       :     cagaCAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---GA--C--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A--AC-AGA
gi|9203                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AAAA---G-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T----A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9204                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAC--AG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---AAGAC-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9205                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-AGACG---C--C-A-TAAA---C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9206                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TT-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A-------T--C-A-T------C-----A---T---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9207                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA---G-TGT-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C---C------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GACGAGA
gi|9208                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---A---G--C-A-T------CA----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GA
gi|9209                       :         CAGAC-A---G-A--CTG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-A-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-G-C------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9210                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-AGACG---C--C-A-TA-----C-----A---G---A---C-----AG--G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9211                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA---TT---A--C-A-------T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A--AC-AGA
gi|9212                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---GACGC--C-A-TACATGAC-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9213                       :         CAGAC-AA--G-A--CAG----AC--AGAA--TG---T-CC-TGT-G---ATA-T-TT---A--C-AC--A---T--C-A-A------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9214                       :         CAGAC-A---G-AGACAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGTTG-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----C-GAC-AGA
gi|9215                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TGTT-T-CC-TGT-GTT-ATA-T-TA---A--G-AC--G---C--C-A-TA-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9216                       :         CAGAC-A-----A--CAG----AC--AGAA---G-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---GGA-A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9217                       :         CAGAC-A---GGA--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA---TT---A--C-A---G---TGACGA-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9218                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---A---G--C-A-T------CAACAGA---G---A---C-----A---G------A-C----A--AC-AGA
gi|9219                       :         CAGAC-A---G-A--CA-----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G------C-A-T------C-----A---G---A---CAG---A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9220                       : cagacagaCAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA---TT---A--C-A---G---A--C-A-TA-----C-----A---G---A---------A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9221                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CCTTGT-G-T-ATA----T---A--C-A---G---A--C-A-T------CA----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9222                       :         CAGAC-ATCAG-A--CAG----AC--AGAA--T--T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-T----A--C-A---G---A--C-G-C------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9223                       :         CAGAC-A---G-A--CAGGACAAC--AGAA--TG-T-T-CC-TG--G-T-ATA-T-TT---ATAC-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9224                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAC--AG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---------A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9225                       :    cagcaCAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAAAATG-T-T-CC--GT-G-T-ATA-T-T----A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G-----------------G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9226                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-TGATA-T-TT---A--C-A---A------C-A-CAGAA--C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9227                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--AG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-T----A--C-A---A------C-A-T------C-----A---G---A---C-----AACAG------A-C----A-GAC-AGA
gi|9228                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TC---A--G-A---G-----------------C-----A---G---A---C-----A---GACGACAA-C----A-GAC-AGAcaga
gi|9229                       :         CAGAC-A---G-A---AG----AC--AGAA--TG-T-T-CC--GT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---GACGC--C-A-CTA----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9230                       :         CAGACGA---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T--TA-TATT---A--C-A----------C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AG
gi|9247                       :          AGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-AGACG---C--C-A-A------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9248                       :          AGAC-A---G-A--CA-----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-G-TA-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9254                       :           GAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9255                       :           GAC-A---G-A--CAGG---AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9256                       :           GAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G-------C-----A---G------A-CA---A-GAC-AGA
gi|9257                       :           GAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--T--T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--CAA---G---A--C---T------C-----A---G---A---C-----A---G------ACC----A-GAC-AGA
gi|9258                       :           GAC-A---G-A--CAGG---AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---GAC-G--C-A-TA-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9259                       :            AC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--T----T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A-------T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9260                       :            AC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G------C-A-T------C-----AT--G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9261                       :            AC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-A-A-TATT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A--AC-AGA
gi|9265                       :              -A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--CAA---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GA--AGA
gi|9266                       :                ---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T---CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---GA--T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA





Alignments
lowQualScore                  :              0 111 0 00   2222  00    11  0 0 0  0   0 0 0   0 0  111 00 2 333 666666 0 0 666666 11111 111 111 000 11111 111 111111 0 1111 0   0   
lowQualScore                  :              . ... . ..   ....  ..    ..  . . .  .   . . .   . .  ... .. . ... ...... . . ...... ..... ... ... ... ..... ... ...... . .... .   .   
lowQualScore                  :              8 111 8 66   1111  66    00  4 4 4  4   4 8 4   4 8  666 99 0 666 888888 8 4 444444 88888 888 666 777 99999 888 555555 4 6666 8   4   
consensus                     :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
Reference ( family-226 )      :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9143                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T---CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9144                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T---CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9145                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9146                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9147                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9148                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9149                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9150                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9151                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--CAA---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9152                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AG
gi|9153                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T---CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-C---A---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9154                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TTA--A--C-A-------T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9155                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-A
gi|9156                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----AGGAC-AGA
gi|9157                       :         CAGAC-A---GCA--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9158                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---T---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9159                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---GA--A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9160                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----AGGAC-AGA
gi|9161                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9162                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9163                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9164                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--CAA---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9165                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGA---TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9166                       :         CAGAC-A---G-A--C-G----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9167                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----ACAGG------A-C----A-GAC-AGA
gi|9168                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----AACAG---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9169                       :         CAGAC-A-----A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9170                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T---CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A-------T--CAA-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9171                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G------C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9172                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-----CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---T---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9173                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---A---G--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9174                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG---T-CC-TGT-GTT-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-CAACGA-GAC-AGA
gi|9175                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----ACGAAGAA--TG---T-CC-TGT-G-T-ATA---TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9176                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG---T-CC-TGT-G-T-ATA---TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C------GAC-AGA
gi|9177                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--CAA---G---T--C-A-GA-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9178                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-A-TTA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9179                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-TTCC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---CA----A---G------A-CA---A-GAC-AGA
gi|9180                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--AT-T-T-TC-CGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9181                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC---GAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---GA-----A-C----A-GAC-AGA
gi|9182                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---AC-C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AG
gi|9183                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A-------T--C-A-T------C-----A---T---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9184                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---GACCA---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9185                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G------C-A-TC-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9186                       :         CAGAC-A---G-A--CAGG---AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A--------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9187                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TTAC-A--C-A---G------C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9188                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AAAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---A---G--C-C-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9189                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---A---G--A-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9190                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAAA-TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-G-A------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9191                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC---T-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-AGT------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9192                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TTACCA--C-A---G---T--C-A--------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9193                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-G----------C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9194                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---CAGAAGA---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9195                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A--------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GA
gi|9196                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G---ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----AACAG---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9197                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G----TA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9198                       :         CAGAC-A---G-A--CA-----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-T----A--T-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9199                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-AGACG---C--C-A-TA-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9200                       :         CAGACCA---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATATT-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9201                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A-------A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9202                       :     cagaCAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---GA--C--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A--AC-AGA
gi|9203                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AAAA---G-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T----A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9204                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAC--AG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---AAGAC-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9205                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-AGACG---C--C-A-TAAA---C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9206                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TT-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A-------T--C-A-T------C-----A---T---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9207                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA---G-TGT-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C---C------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GACGAGA
gi|9208                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---A---G--C-A-T------CA----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GA
gi|9209                       :         CAGAC-A---G-A--CTG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-A-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-G-C------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9210                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-AGACG---C--C-A-TA-----C-----A---G---A---C-----AG--G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9211                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA---TT---A--C-A-------T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A--AC-AGA
gi|9212                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---GACGC--C-A-TACATGAC-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9213                       :         CAGAC-AA--G-A--CAG----AC--AGAA--TG---T-CC-TGT-G---ATA-T-TT---A--C-AC--A---T--C-A-A------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9214                       :         CAGAC-A---G-AGACAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGTTG-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----C-GAC-AGA
gi|9215                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TGTT-T-CC-TGT-GTT-ATA-T-TA---A--G-AC--G---C--C-A-TA-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9216                       :         CAGAC-A-----A--CAG----AC--AGAA---G-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---GGA-A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9217                       :         CAGAC-A---GGA--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA---TT---A--C-A---G---TGACGA-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9218                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---A---G--C-A-T------CAACAGA---G---A---C-----A---G------A-C----A--AC-AGA
gi|9219                       :         CAGAC-A---G-A--CA-----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G------C-A-T------C-----A---G---A---CAG---A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9220                       : cagacagaCAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA---TT---A--C-A---G---A--C-A-TA-----C-----A---G---A---------A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9221                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CCTTGT-G-T-ATA----T---A--C-A---G---A--C-A-T------CA----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9222                       :         CAGAC-ATCAG-A--CAG----AC--AGAA--T--T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-T----A--C-A---G---A--C-G-C------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9223                       :         CAGAC-A---G-A--CAGGACAAC--AGAA--TG-T-T-CC-TG--G-T-ATA-T-TT---ATAC-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9224                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAC--AG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---------A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9225                       :    cagcaCAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAAAATG-T-T-CC--GT-G-T-ATA-T-T----A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G-----------------G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9226                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-TGATA-T-TT---A--C-A---A------C-A-CAGAA--C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9227                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--AG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-T----A--C-A---A------C-A-T------C-----A---G---A---C-----AACAG------A-C----A-GAC-AGA
gi|9228                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TC---A--G-A---G-----------------C-----A---G---A---C-----A---GACGACAA-C----A-GAC-AGAcaga
gi|9229                       :         CAGAC-A---G-A---AG----AC--AGAA--TG-T-T-CC--GT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---GACGC--C-A-CTA----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9230                       :         CAGACGA---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T--TA-TATT---A--C-A----------C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AG
gi|9247                       :          AGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-AGACG---C--C-A-A------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9248                       :          AGAC-A---G-A--CA-----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-G-TA-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9254                       :           GAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9255                       :           GAC-A---G-A--CAGG---AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9256                       :           GAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G-------C-----A---G------A-CA---A-GAC-AGA
gi|9257                       :           GAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--T--T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--CAA---G---A--C---T------C-----A---G---A---C-----A---G------ACC----A-GAC-AGA
gi|9258                       :           GAC-A---G-A--CAGG---AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---GAC-G--C-A-TA-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9259                       :            AC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--T----T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A-------T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9260                       :            AC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G------C-A-T------C-----AT--G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9261                       :            AC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-A-A-TATT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A--AC-AGA
gi|9265                       :              -A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--CAA---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GA--AGA
gi|9266                       :                ---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T---CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---GA--T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA


blockSeqs                     :                TCA        GACA                                    ACC    A GAC ACGC       ACATGA AACAG ACA ACC     AGAAG CAG ACGACA   AACG
blockSeqs                     :                A          G                                       AC     A GAC ACGC       AGAA   A     ACA GA      AG    ACA A        A   
blockSeqs                     :                .          G                                       A      A GAC TGA        AAA    A     T   A       A     G   .        A   
blockSeqs                     :                .          G                                       .      A GAC ACG        TA     .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      A C   AC         A      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . C   AT         C      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          A      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          A      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          A      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          A      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          A      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          A      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   A          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   A          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   A          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   A          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   G          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   A          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   A          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   G          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   G          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   A          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   A          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   C          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   A          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   C          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   A          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   G          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   A          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   C          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   A          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   C          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   A          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   G          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   A          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   A          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   A          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   A          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   C          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   A          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   A          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   A          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   A          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   T          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   .          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   .          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   .          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   .          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   .          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   .          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   .          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   .          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   .          .      .     .   .       .     .   .        .   
blockSeqs                     :                .          .                                       .      . .   .          .      .     .   .       .     .   .        .   


blockSeqCons                  :         
originalCons                  :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
finalCons                     :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA





Alignments
lowQualScore                  :              0 111 0 00   2222  00    11  0 0 0  0   0 0 0   0 0  111 00 2 333 666666 0 0 666666 11111 111 111 000 11111 111 111111 0 1111 0   0   
lowQualScore                  :              . ... . ..   ....  ..    ..  . . .  .   . . .   . .  ... .. . ... ...... . . ...... ..... ... ... ... ..... ... ...... . .... .   .   
lowQualScore                  :              8 111 8 66   1111  66    00  4 4 4  4   4 8 4   4 8  666 99 0 666 888888 8 4 444444 88888 888 666 777 99999 888 555555 4 6666 8   4   
consensus                     :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
Reference ( family-226 )      :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9143                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T---CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9144                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T---CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9145                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9146                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9147                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9148                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9149                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9150                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9151                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--CAA---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9152                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AG
gi|9153                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T---CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-C---A---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9154                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TTA--A--C-A-------T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9155                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-A
gi|9156                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----AGGAC-AGA
gi|9157                       :         CAGAC-A---GCA--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9158                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---T---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9159                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---GA--A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9160                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----AGGAC-AGA
gi|9161                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9162                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9163                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9164                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--CAA---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9165                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGA---TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9166                       :         CAGAC-A---G-A--C-G----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9167                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----ACAGG------A-C----A-GAC-AGA
gi|9168                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----AACAG---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9169                       :         CAGAC-A-----A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9170                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T---CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A-------T--CAA-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9171                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G------C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9172                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-----CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---T---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9173                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---A---G--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9174                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG---T-CC-TGT-GTT-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-CAACGA-GAC-AGA
gi|9175                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----ACGAAGAA--TG---T-CC-TGT-G-T-ATA---TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9176                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG---T-CC-TGT-G-T-ATA---TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C------GAC-AGA
gi|9177                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--CAA---G---T--C-A-GA-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9178                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-A-TTA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9179                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-TTCC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---CA----A---G------A-CA---A-GAC-AGA
gi|9180                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--AT-T-T-TC-CGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9181                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC---GAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---GA-----A-C----A-GAC-AGA
gi|9182                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---AC-C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AG
gi|9183                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A-------T--C-A-T------C-----A---T---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9184                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---GACCA---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9185                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G------C-A-TC-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9186                       :         CAGAC-A---G-A--CAGG---AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A--------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9187                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TTAC-A--C-A---G------C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9188                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AAAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---A---G--C-C-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9189                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---A---G--A-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9190                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAAA-TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-G-A------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9191                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC---T-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-AGT------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9192                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TTACCA--C-A---G---T--C-A--------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9193                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-G----------C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9194                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---CAGAAGA---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9195                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A--------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GA
gi|9196                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G---ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----AACAG---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9197                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G----TA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9198                       :         CAGAC-A---G-A--CA-----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-T----A--T-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9199                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-AGACG---C--C-A-TA-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9200                       :         CAGACCA---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATATT-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9201                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A-------A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9202                       :     cagaCAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---GA--C--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A--AC-AGA
gi|9203                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AAAA---G-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T----A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9204                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAC--AG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---AAGAC-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9205                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-AGACG---C--C-A-TAAA---C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9206                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TT-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A-------T--C-A-T------C-----A---T---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9207                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA---G-TGT-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C---C------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GACGAGA
gi|9208                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---A---G--C-A-T------CA----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GA
gi|9209                       :         CAGAC-A---G-A--CTG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-A-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-G-C------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9210                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-AGACG---C--C-A-TA-----C-----A---G---A---C-----AG--G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9211                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA---TT---A--C-A-------T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A--AC-AGA
gi|9212                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---GACGC--C-A-TACATGAC-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9213                       :         CAGAC-AA--G-A--CAG----AC--AGAA--TG---T-CC-TGT-G---ATA-T-TT---A--C-AC--A---T--C-A-A------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9214                       :         CAGAC-A---G-AGACAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGTTG-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----C-GAC-AGA
gi|9215                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TGTT-T-CC-TGT-GTT-ATA-T-TA---A--G-AC--G---C--C-A-TA-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9216                       :         CAGAC-A-----A--CAG----AC--AGAA---G-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---GGA-A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9217                       :         CAGAC-A---GGA--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA---TT---A--C-A---G---TGACGA-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9218                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---A---G--C-A-T------CAACAGA---G---A---C-----A---G------A-C----A--AC-AGA
gi|9219                       :         CAGAC-A---G-A--CA-----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G------C-A-T------C-----A---G---A---CAG---A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9220                       : cagacagaCAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA---TT---A--C-A---G---A--C-A-TA-----C-----A---G---A---------A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9221                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CCTTGT-G-T-ATA----T---A--C-A---G---A--C-A-T------CA----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9222                       :         CAGAC-ATCAG-A--CAG----AC--AGAA--T--T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-T----A--C-A---G---A--C-G-C------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9223                       :         CAGAC-A---G-A--CAGGACAAC--AGAA--TG-T-T-CC-TG--G-T-ATA-T-TT---ATAC-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9224                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAC--AG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---------A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9225                       :    cagcaCAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAAAATG-T-T-CC--GT-G-T-ATA-T-T----A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G-----------------G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9226                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-TGATA-T-TT---A--C-A---A------C-A-CAGAA--C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9227                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--AG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-T----A--C-A---A------C-A-T------C-----A---G---A---C-----AACAG------A-C----A-GAC-AGA
gi|9228                       :         CAGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TC---A--G-A---G-----------------C-----A---G---A---C-----A---GACGACAA-C----A-GAC-AGAcaga
gi|9229                       :         CAGAC-A---G-A---AG----AC--AGAA--TG-T-T-CC--GT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---GACGC--C-A-CTA----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9230                       :         CAGACGA---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T--TA-TATT---A--C-A----------C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AG
gi|9247                       :          AGAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-AGACG---C--C-A-A------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9248                       :          AGAC-A---G-A--CA-----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-G-TA-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9254                       :           GAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9255                       :           GAC-A---G-A--CAGG---AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---A--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9256                       :           GAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G-------C-----A---G------A-CA---A-GAC-AGA
gi|9257                       :           GAC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--T--T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--CAA---G---A--C---T------C-----A---G---A---C-----A---G------ACC----A-GAC-AGA
gi|9258                       :           GAC-A---G-A--CAGG---AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---GAC-G--C-A-TA-----C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9259                       :            AC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--T----T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A-------T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9260                       :            AC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---G------C-A-T------C-----AT--G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA
gi|9261                       :            AC-A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-A-A-TATT---A--C-A---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A--AC-AGA
gi|9265                       :              -A---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T-T-CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--CAA---G---T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GA--AGA
gi|9266                       :                ---G-A--CAG----AC--AGAA--TG-T---CC-TGT-G-T-ATA-T-TT---A--C-A---GA--T--C-A-T------C-----A---G---A---C-----A---G------A-C----A-GAC-AGA