lowQualScore                  :                                 11111111111                                                                           
lowQualScore                  :     0 11 0  0  2222    0  0 777 66666666666 0 0  0   00 1 5555555  0 0 0 0 0  0 0 0 00 0 00 0 0 0  0 0 0 00 0 0 0     
lowQualScore                  :     . .. .  .  ....    .  . ... ........... . .  .   .. . .......  . . . . .  . . . .. . .. . . .  . . . .. . . .     
lowQualScore                  :     9 22 9  6  0000    5  5 222 99999999999 4 7  7   55 1 6666666  7 4 6 2 6  4 4 2 55 4 55 9 2 9  9 2 4 33 2 4 2     
consensus                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG-AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
Reference ( gi|125079 )       : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG-AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125082                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG-AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--G-G-A-GCAG
gi|125080                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG-AA----------A-G-CG-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125081                     : TCTC-G--C-TC-AAC---CAGT-CA-TGG-AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125083                     : TCTC-G--C-GC-AAC---CAGT-CA-TGG-AA----------A-A-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125084                     : TCTC-G--C-CC-AAA---CAGT-CA-TGG-AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-A-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125088                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG-AG----------A-G-CA-ATC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-A-AA-C-T-T--A-G-AGGCAGA
gi|125085                     : TCTC-G--T-CC-AAC---CAGT-CA-TGG-AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-G-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-A-A-GCAGA
gi|125086                     : TTTC-G--T-CC-AAT---CAGT-CA-TGG-AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GT-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125087                     : TCTC-G--C-CC-AGC---CAGT-CA-TGG-AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-G-T-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GAAGA
gi|125090                     : TCTC-G--C-AA-AAC---CAGT-CA-TGG-AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AA-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--A-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125091                     : TCTC-G--C-C--AAC---CAG--CA-TGG-AA----------G-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125096                     : TCTCTG--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG-AG----------A-G-CA-GTC----T-----G-AG-A-A-C-TCGC-T-C-T----A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125098                     : TCTC-C--C-GC-AAC---CA-T-CA-TGG-AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AACC-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125092                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGA-AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----A-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--G-A--G-T-T-AA-T-T-T--A-G-G-TCAGA
gi|125089                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG-AA----------A-A-CA-GTC--A-T-----G-AT-A-A-C-T-GC-T-T-T--A-A--G-T-A-AA-C-T-T--A-A-A-GCAG
gi|125101                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG-AG----------A-G-TG-GTC--A-T-----G-GG-A-A-C-T-AC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A---A-GC
gi|125093                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG-AA----------A-G-GA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-
gi|125095                     : TCTC-G--C-CC-AGG---CAGT-CG-TGG-AA----------A-G-CA-GTC--G-T-----G-AG-A-A-C-T-GT-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-A-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125102                     : TCTC-G--A-CA-AAC---CAGT-CA-TGG-TT----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-C-G--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAAA
gi|125103                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG-AG----------A-G-CA-GTC--A-TG----G-AG-A-A---T-GC-T-C-TA-A-A--G-T-T-AA-C-T-T--C-GAA-GCAG
gi|125104                     : TCTC-G--CACCGAAC---CAGT-CA--GA-AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AA-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-TCT--A-G-A-GCAGA
gi|125099                     : TCTC-G--C-CC-AAC----AGT-CA-TCA-A-----------A-G-CA-GTC--A-T-----GCAG-A-A-C-T-GC-T-C-C--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125100                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG-AG----------A-G-CG-TCC--A-T-----GAAG-A-ATC-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--GCG-A-GCAG
gi|125094                     : TCTC-G--C-C--AAC---CAGT-CA-TGG-AA----------A-G-CA-GCC--A-C-------AG-A-A-C-T-GT-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-A-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125106                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGGTGG----------A-GACA-GTC--A-T-----G-AG-AGA-C-T-GC---C-T--A-A--G-TGT-TA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125097                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG-AA----------A-G-CG-GCA--G-G-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-TTAA-A-G-GCAG
gi|125105                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CTGTCCA-TAG-AA----------A-G-CA-ATA--A-T-------AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-G-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125107                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CAGTGG-A-----------A-G-CA-GTC--A-GGGAGAG-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-T-TGT--G-G-A-GCAG
gi|125109                     : TCTC-G--C-CC-AAC--------CA-TGG-AA----------A-G-CAGGTC--A-T-----G-AG-A-A-C-TCGC-T-C-T--A------T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCGGA
gi|125108                     : TCTC-G--C-CC-CATG--CAGT-CA-TGG-AAC---------A-G-CA--TC--A-TT----G-AG-A-A-C-T-GC-C-C-A--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125110                     : TCTC-C--C-CC-AAG---CAGT-CG-TGC-AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----A-AG-A-C-A-T-GT-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-C-A-ATAGA
gi|125111                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CACT-CA-TGG-AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-
gi|125112                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGC-AA----------A-G-CA-------------------A-A-G-T-G------T--A-C--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125115                     :  CTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG-AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-TGGC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--G-G-A-GCAG
gi|125114                     :  CTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG-AA----------A-G--A-GCC--A-T-----G-AG-A-A-T-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125116                     :  CTC-GTCC-CC-AAC---CAGT-CA-TGG-A-----------A-G-CA-GCC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A----T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125119                     :  CTC-T--C-CC-AAC---CAGT-CA-T-G-AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----T-AGAA-A-C-T-GC-T-C-T--A-AACA-T-T-AA---T-T--A-G-A-GCA
gi|125117                     :  CTC-G--C-C--AAC---CAGT--A-TGG-AA----------A-G-CC-GCC--A-C-------AG-A-A-C-T-GT-T-C-T--A-A--G-T----A-CAT-T--A-G-A-GCAGA
gi|125113                     :  CTC-T--C-TA-AAG---CAGT-CG-T---AA----------A-G-CA-GCT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125120                     :   TC-A--C-CC-TACGTACAGT-CA-TAG-AA----------A-A-CA-GTC--A-T-----A-GA-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCTGA
gi|125121                     :    C-G--C-CA-AAG---CGGC-CA-T---AA----------A-G-CA-G-C--A-T-----G-AG-A-AAC-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125122                     :    C-G--C-CC-AAC---CAGG-CA-TGG-A-----------A-A-CA-GTC--AGT-----G-AG-A-A-CTT-GCAT-T-T--A-A--G-T-T--A-C-C-T--A-G-A-GCAGA
gi|125123                     :     -G--C-GC-AATT--CGGT-CA-T---AA----------A-A-CA-GTC--G-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-TA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125124                     :       --C-CC-A-----CAGT-CA-TGG-AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G--G-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125125                     :            C-AAG---CTGT-CA-TA--------------A-G-CA-GTC--A-T-------AG-A-C-C-T-GT-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-C-T--A-G-A-GCAG
gi|125130                     :             -AAG---CGGT-CA-T---AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-AC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125127                     :             -AAG---CGGT-C---GC-AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125138                     :             -AAG---CGGC-CA-TGA-AG--------------CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-C-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125151                     :             -AAG---CGGT-CA-T---AA----------A-G-CA-GTC--G-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-T-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125133                     :             -AAG---CAGT-CA-TGG-AGCAGCTCTAG-A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125147                     :             -AGC---CGGT-CA-CA--AT----------A-G-CA-GTA--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125132                     :             -AAG---CGGT-CA-C---AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AA-A-G-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125144                     :             -AAG---CAGT-CA-TGG-AGCATCTCTAG-A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-G-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125154                     :             -AAA---CGGT-CA-T---AA----------A-G-CA-GTC--A-T-------AG-A-A-C-T-GT-T-C-T--A-A--G-T-T-AT-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125148                     :             -AAC---CAGT-CA-TAA-AGCAGTTCTAG-A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T--A-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125134                     :             -AAG---CGGT-CA-C---AA----------G-G-TA-GTC--A-T-----G-AA-A-G-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125140                     :             -AAG---CGGT-CA-C---AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-GG-A-A-C-T-GA-T-T-T--A-A--G-T-T-GA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125156                     :             -AAG---CAGT-CG-T---AG----------A-G-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125129                     :             -AAG---CGGT-CA-TGC-AG--------------CA-ATC--A-T-----G-AG-A-T-C-T-GA-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GTAGA
gi|125158                     :             -AAC---CAGT-CG-T---AG----------A-A-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-ACAG
gi|125143                     :             -AAC---CGGT-CA-TA--------------A-G-CA-GTC--A-T-------AG-A-A-C-T-GT-TTC-T--A-A--G-T---AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125153                     :             -AAC---CA---CA-TGA-AA--------------CA-GTC--A-T-----G-AGAA-A-C-T--C-T-T-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125149                     :             -AAG---CAGT-CG-T---AA----------A-G-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125142                     :             -AAA---CAGT-CG-T---AA----------A-G-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125155                     :             -AAG---CAGT-CG-TAA-AGCA--------A-G-CA-GCT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125146                     :             -AAG---CGGT-CA-T---AA----------A-A-CA-ACC--A-T-----A-AG-A-A-C-T-GT-T-C-T--A-A--G---T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125135                     :             -AAG---CAGT-CG-T---AA----------A-G-CA-GCT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125131                     :             -AAG---CAGT-CA-T---AA----------A-G-CA-ACC--A-T-------AC-A-G-C-T-GT-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-T-T-T--A-G-A-GCAAA
gi|125145                     :             -AAG---CAGT-CG-T---AA----------A-G-CA-GCT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AATC-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125162                     :                 ---CAGT-CA-TGG-AGCAGCTCTAG-A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125171                     :                 ---CAGT-CG-T---AG----------A-G-CA-GTC--G-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125161                     :                 ---CAGT-CA-TGG-AGCAGCTCTAG-A-G-CA-GTC--AGC-----A-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCA
gi|125168                     :                 ---CGGT-CA-C---AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-TAAA-C-T-T--A-G-A-GCA
gi|125165                     :                 ---CAGT-CA-TGG-AGGCAGCTCTAGA-GTCA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125170                     :                 ---CAGT-CA-TGG-AGCAGCTCTAG-A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--GAT-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125167                     :                 ---CAGT-CA-TGG-AGCAGCTCTAG-A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-C-A--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125173                     :                 ---CAGT-CA-TGG-AGCAGCTCTAG-A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A---T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125174                     :                 ---CAGT-CG-TGG-AG--------------CA-GTC--G-T-----G--G-A-C-C-T-GT-T-C-T--A-A--G-T-G-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125172                     :                 ---CGGT-CA-T---AA----------A-G-CA-GTC--A-T-------AG-A-A-C-T-GA-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-T-T-T--A-G-A-GCTGA
gi|125164                     :                 ---CAGT-CA-T---AA----------A-G-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-T-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125179                     :                     AGT-CG-T---AG----------A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-G-C-T-GT-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125182                     :                      GT-CA-TGG-AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-G-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-
gi|125180                     :                      GT-CA-C---AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--G-A--A-T-T-AA-C-T-A--A-G-A-GCAGA
gi|125183                     :                      GC-CA-T---AA----------A-G-CA-GCC--A-T-------AG-A-A-C-T-GC-C-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125185                     :                       T-CA-TGG-AGGGCTTAG---A-G-CA-GTCCAG-C-----A-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125186                     :                        -CA-TGG-AA----------A-G-CT-GTC--A-T-----G-AG-A-G-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125188                     :                           -TGC-AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-AG-G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125189                     :                           -TGG-AA----------A-G-CAAGTC--A-T-------AG-A-G-C-T-GT-T-C-T--A-C--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125187                     :                              G-AG----------AAG-CA-GTG--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--G-G-A-GCAAA
gi|125195                     :                             ac-AA----------A-G-CA-GTC--A-------G-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125201                     :                               -AG----------A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125190                     :                               -AG----------A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125202                     :                               -AG----------A-G-CA-GTC--A-G-----A-AA-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125196                     :                               -AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-AAC-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-TTAA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125193                     :                               -AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----GGAG-A-A-C-T-GC-TTC-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125198                     :                               -AG----------A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-G-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125203                     :                               -AG----------A-G-CA-GTC--A-G-----A-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GAAG
gi|125156                     :                               -AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----T-AG-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-
gi|125158                     :                      aagcagtcg-AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----T-AG-A-A-C-T-GT-T-C-T--A-aagttaacttagagcag
gi|125192                     :                      aaccagtcg-AA----------A-G-CA-GTC--AGT-----A-AA-A-A-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-A-A-GCAGaagttaacttagaacag
gi|125149                     :                               -AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----T-AG-A-A-C-T-GC-T-T-T--A-
gi|125142                     :                      aagcagtcg-AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----T-AG-A-A-C-T-GC-T-T-T--A-aagttaacttagagcag
gi|125164                     :                      aaacagtcg-AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----T-AG-A-A-C-T-GC-T-T-T--A-aagttaacttagagcag
gi|125113                     :                         cagtca-AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----T-AG-A-G-C-T-GC-T-T-T--A-C--GAC-T-GC-T-T-T--A-G-A-Gaagttaacttagagcag
gi|125155                     :                             ct-AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----T-AG-A-G-C-T-GC-T-aagttaacttagagcag
gi|125135                     :               aagcagtcgtaaagca-AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----T-AG-A-G-C-T-GC-T-T-T--A-aagttaacttagagcag
gi|125145                     :                      aagcagtcg-AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----T-AG-A-G-C-T-GC-T-T-T--A-aagttaacttagagcag
gi|125137                     :                                    aagcagtcg-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-T-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-A-A-GCAGAaagttaatcttagagcag
gi|125082                     :                                                           aagcggtcacaac-C-T-GC-T-C-C--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125080                     :                                    tctcgcccaaccagtcatggagagcagtcatgagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125081                     :                                    tctcgcccaaccagtcatggaaagcggtcatgagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125083                     :                                    tctcgctcaaccagtcatggaaagcagtcatgagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125115                     :                                    tctcgcgcaaccagtcatggaaaacagtcatgagaa-C-T-GC-T-C-C--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCa
gi|125084                     :                                  ctcgcccaaccagtcatggagagcagtcatgagaactg-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-T-A-GCAG
gi|125088                     :                                    tctcgcccaaacagtcatggaaagcagtcatgagaa-C-T-GCCT-C-T--A-A--G-T-T-TA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125085                     :                                    tctcgcccaaccagtcatggagagcaatcatgagaa-C-T-GC-T-T-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-C-A-GCAGa
gi|125086                     :                                    tctcgtccaaccagtcatggaaagcagtcatgagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-ACAGa
gi|125114                     :                                    tttcgtccaatcagtcatggaaagcagtcatgagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAa
gi|125087                     :                                     ctcgcccaaccagtcatggaaagagccatgagaat-C-T-TC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-A-C-GCAGa
gi|125090                     :                                    tctcgcccagccagtcatggaaagcagtcatgagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-T-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125091                     :                                    tctcgcaaaaccagtcatggaaagcagtcatgaaaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125096                     :                                      tctcgccaaccagcatggaaggcagtcatgagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C---T--A-G-A-GCa
gi|125098                     :                                 tctctgcccaaccagtcatggagagcagtctgagaactc-C-T-GC-T-C-T--A-A--GGT-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125092                     :                                     tctcccgcaaccatcatggagagcagtcatgagaa-C-T-GA-C-C-T--A-A--A-T-T-AA-C-T-C--A-G-A-GCAG
gi|125095                     :                                    tctcgcccaaccagtcatgaaaagcagtcataagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--T-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-ACAGa
gi|125116                     :                                    tctcgcccaggcagtcgtggaaagcagtcgtgagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA---T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125104                     :                                    ctcgtccccaaccagtcatggaagcagccatgagaa-C-T-GC-T-C-T--AGA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125124                     :                                   tctcgcaccgaaccagtcagaagagcagtcatgaaaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125099                     :                                            cccacagtcatggaaagcagtcatggaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--G-G-A-GCAGa
gi|125100                     :                                     tctcgcccaacagtcatcaaagcagtcatgcagaa-C-T-GC-T-CGC--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGAa
gi|125094                     :                                   tctcgcccaaccagtcatggagagcgtccatgaagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--T-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-ACAG
gi|125097                     :                                      tctcgccaaccagtcatggaaagcagccacagaa-C-T-GC-C-T-TTAA-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125105                     :                                    tctcgcccaaccagtcatggaaagcggcagggagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--C-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125107                     :                                    tctcgcccaacctgtccatagaaagcaataatagaa-C-T-GC-T-C-C--ACA--A-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125186                     :                               tctcgcccaaccagtcagtggaagcagtcagggagagagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125108                     :                                                   catggaaagctgtcatgagag-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--T-G-G-GCAGa
gi|125130                     :                                  tctcgccccatgcagtcatggaacagcatcattgagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GTAGa
gi|125127                     :                                              aagcggtcataaagcagtcatgagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125138                     :                                              aagcggtcgcaaagcagtcatgagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-G-GCAGa
gi|125151                     :                                              aagcggccatgaagcagtcatgagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-A-A-GCAGa
gi|125162                     :                                              aagcggtcataaagcagtcgtgagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125133                     :                                      cagtcatggagcagctctagagcagtcagcagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125147                     :                                   aagcagtcatggagcagctctagagcagtcagcagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125188                     :                                             agccggtcacaatagcagtaatgagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AACC-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125121                     :                                                     tgcaaagcagtcatgagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125132                     :                                         cgccaaagcggccataaagcagcatgagaaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125171                     :                                              aagcggtcacaaagcagtcatgaaag-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125123                     :                                                 cagtcgtagagcagtcggcagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-A-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125144                     :                                         gcgcaattcggtcataaaacagtcgtgagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-CA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125195                     :                                   aagcagtcatggagcatctctagagcagtcagcagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125201                     :                                                         aaagcagtcagagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125190                     :                                                        agagcagtcagcagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125137                     :                                                        agagcagtcagcagaa-C-T-GC-T-T-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCA
gi|125165                     :                                             aagcggtcacaacgcagtcatgagaat-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125170                     :                                    cagtcatggaggcagctctagagtcagtcagcagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AATC-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125167                     :                                      cagtcatggagcagctctagagcagtcagcagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--T-G-A-GCAG
gi|125202                     :                                      cagtcatggagcagctctagagcagtcagcagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125196                     :                                                        agagcagtcagaaaaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-TAAA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125193                     :                                                       aaagcagtcatgagaaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-GAA-GCAGa
gi|125180                     :                                                       aaagcagtcatggagaa-C-T-GC-T-C-T--T-A--G-T-T-AA-T-T-C--A-G-A-GCAGa
gi|125198                     :                                                   gtcacaaagcagtcatgagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125203                     :                                                        agagcagtcagcagag-C-T-TC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125173                     :                                                        agagcagtcagaagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCA
gi|125154                     :                                      cagtcatggagcagctctagagcagtcagcagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-A-T-AA-C-T-T--A-G-A-ACAG
gi|125148                     :                                               aaacggtcataaagcagtcatagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T---AA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125179                     :                                   aaccagtcataaagcagttctagagcagtcagcagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-ACAG
gi|125134                     :                                                  agtcgtagagcagtcagcagag-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125183                     :                                              aagcggtcacaaggtagtcatgaaag-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-G-GCAG
gi|125185                     :                                                    gccataaagcagccatagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125140                     :                                         tcatggagggcttagagcagtccagcaagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-C-AA-C-T-T--A-A-A-TCAG
gi|125156                     :                                              aagcggtcacaaagcagtcatgggaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125129                     :                                              aagcagtcgtagagcagttctaatga-C-T-AC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-TCAGA
gi|125158                     :                                               aagcggtcatgcagcaatcatgaga-C-T-GT-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125174                     :                                              aaccagtcgtagaacagttctaatga-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-CA-C-T-T--A-G-A-ACAG
gi|125153                     :                                                  cagtcgtggagcagtcgtggac-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-A-A-G
gi|125192                     :                                             aaccacatgaaacagtcatgagaaact-C-T-GC-T-T-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125149                     :                                                       aaagcagtcagtaaaaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125142                     :                                              aagcagtcgtaaagcagttctaatga-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125164                     :                                              aaacagtcgtaaagcagttctaatga-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-A-A-GCAG
gi|125189                     :                                                 cagtcataaagcagttctaatga-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-G-T--A-G-A-ACAG
gi|125125                     :                                                     tggaaagcaagtcatagag-C-T-GC-T-C-T--A-G--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-ACAGa
gi|125113                     :                                               caagctgtcataagcagtcatagac-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125155                     :                                       ctctctaaagcagtcgtaaagcagctctaatga-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125146                     :                                          aagcagtcgtaaagcaagcagctctaatga-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T--A-C-T-T--A-G-A-ACAG
gi|125135                     :                                              aagcggtcataaaacaaccataagaa-C-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGa
gi|125145                     :                                              aagcagtcgtaaagcagctctaatga-C-T-GC-T-C-T--A-A--GAT-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125102                     :                                                aagcagtcgtaaagcagctctaatga-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--C-G-A-GCAG
gi|125161                     :                                      tctcgacaaaccagtcatggttagcagtcatgagaa-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGaa
gi|125168                     :                                       cagtcatggagcagctctagagcagtcagcaagaa-T-GC-T-C-T--A-A--G-T-TTAA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125187                     :                                                   cggtcacaaagcagtcatgagaa-T-GC-T-C-C--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125131                     :                                                      acgagaagcagtgatgagaa-T-GC-T-C-T--A-A--A-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-ACAGaa
gi|125101                     :                                                   aagcagtcataaagcaaccatacag-GC-T---T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GTAGaa
gi|125120                     :                                        tctcgcccaaccagtcatggagagtggtcatgggaa-GC-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125172                     :                                       tcaccctacgtacagtcatagaaaacagtcatagaaa-GC-T-C-T--A-A--A-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-TCAGtga
gi|125182                     :                                                         cggtcataaagcagtcatagaa-T-C-T--A-A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAtga





Alignments
lowQualScore                  :                              11111111111111111111111                                                                        
lowQualScore                  :      0 11 0  0   111    0  0 77777777777777777777777 0 0  0   00 1 4444444  0 0 1 0 1  0 0  0  11 0 0 0  0 0 0 00 0 0 0     
lowQualScore                  :      . .. .  .   ...    .  . ....................... . .  .   .. . .......  . . . . .  . .  .  .. . . .  . . . .. . . .     
lowQualScore                  :      9 22 9  6   999    5  4 77777777777777777777777 4 8  8   66 2 6666666  8 4 2 4 2  4 8  4  00 4 4 8  8 4 8 66 4 4 4     
consensus                     :  TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG---------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
Reference ( family-222 )      :  TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG---------AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125079                     :  TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG---------AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125080                     :  TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG---------AA----------A-G-CG-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125081                     :  TCTC-G--C-TC-AAC---CAGT-CA-TGG---------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125082                     :  TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG---------AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--G-G-A-GCAG
gi|125083                     :  TCTC-G--C-GC-AAC---CAGT-CA-TGG---------AA----------A-A-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125084                     :  TCTC-G--C-CC-AAA---CAGT-CA-TGG---------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-AT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125085                     :  TCTC-G--T-CC-AAC---CAGT-CA-TGG---------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-GT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-A-A-GCAGA
gi|125086                     :  TTTC-G--T-CC-AAT---CAGT-CA-TGG---------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125087                     :  TCTC-G--C-CC-AGC---CAGT-CA-TGG---------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-G-TT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GAAGA
gi|125088                     :  TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG---------AG----------A-G-CA-ATC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-A-AA-C-T-T--A-G-AGGCAGA
gi|125089                     :  TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG---------AA----------A-A-CA-GTC--A-T-----G-AT-A-A-C-T-GC-T-TT-AA--G-T-A-AA-C-T-T--A-A-A-GCAG
gi|125090                     :  TCTC-G--C-AA-AAC---CAGT-CA-TGG---------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AA-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--A-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125091                     :  TCTC-G--C-C--AAC---CAG--CA-TGG---------AA----------G-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125092                     :  TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGA---------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----A-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-GA--G-T-T-AA-T-T-T--A-G-G-TCAGA
gi|125093                     :  TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG---------AA----------A-G-GA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-
gi|125094                     :  TCTC-G--C-C--AAC---CAGT-CA-TGG---------AA----------A-G-CA-GCC--A-C-------AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-A-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125095                     :  TCTC-G--C-CC-AGG---CAGT-CG-TGG---------AA----------A-G-CA-GTC--G-T-----G-AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-A-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125096                     :  TCTCTG--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG---------AG----------A-G-CA-GTC----T-----G-AG-A-A-C-TCGC-T-CT--A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125097                     :  TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG---------AA----------A-G-CG-GCA--G-G-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-TTAA-A-G-GCAG
gi|125098                     :  TCTC-C--C-GC-AAC---CA-T-CA-TGG---------AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AACC-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125099                     :  TCTC-G--C-CC-AAC----AGT-CA-TCA---------A-----------A-G-CA-GTC--A-T-----GCAG-A-A-C-T-GC-T-CC-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125100                     :  TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG---------AG----------A-G-CG-TCC--A-T-----GAAG-A-ATC-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--GCG-A-GCAG
gi|125101                     :  TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG---------AG----------A-G-TG-GTC--A-T-----G-GG-A-A-C-T-AC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A---A-GC
gi|125102                     :  TCTC-G--A-CA-AAC---CAGT-CA-TGG---------TT----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CG-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAAA
gi|125103                     :  TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG---------AG----------A-G-CA-GTC--A-TG----G-AG-A-A---T-GC-T-CTAAA--G-T-T-AA-C-T-T--C-GAA-GCAG
gi|125104                     :  TCTC-G--CACCGAAC---CAGT-CA--GA---------AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AA-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-TCT--A-G-A-GCAGA
gi|125105                     :  TCTC-G--C-CC-AAC---CTGTCCA-TAG---------AA----------A-G-CA-ATA--A-T-------AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-G-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125106                     :  TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGGT--------GG----------A-GACA-GTC--A-T-----G-AG-AGA-C-T-GC---CT-AA--G-TGT-TA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125107                     :  TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CAGTGG---------A-----------A-G-CA-GTC--A-GGGAGAG-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-T-TGT--G-G-A-GCAG
gi|125108                     :  TCTC-G--C-CC-CATG--CAGT-CA-TGG---------AAC---------A-G-CA--TC--A-TT----G-AG-A-A-C-T-GC-C-CA-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125109                     :  TCTC-G--C-CC-AAC--------CA-TGG---------AA----------A-G-CAGGTC--A-T-----G-AG-A-A-C-TCGC-T-CT-A-----T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCGGA
gi|125110                     :  TCTC-C--C-CC-AAG---CAGT-CG-TGC---------AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----A-AG-A-C-A-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-C-A-ATAGA
gi|125111                     :  TCTC-G--C-CC-AAC---CACT-CA-TGG---------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-
gi|125112                     :  TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGC---------AA----------A-G-CA-------------------A-A-G-T-G-----T-AC--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125113                     :   CTC-T--C-TA-AAG---CAGT-CG-T-----------AA----------A-G-CA-GCT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125114                     :   CTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG---------AA----------A-G--A-GCC--A-T-----G-AG-A-A-T-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125115                     :   CTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGG---------AG----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-TGGC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--G-G-A-GCAG
gi|125116                     :   CTC-GTCC-CC-AAC---CAGT-CA-TGG---------A-----------A-G-CA-GCC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA----T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125117                     :   CTC-G--C-C--AAC---CAGT--A-TGG---------AA----------A-G-CC-GCC--A-C-------AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G-T----A-CAT-T--A-G-A-GCAGA
gi|125119                     :   CTC-T--C-CC-AAC---CAGT-CA-T-G---------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----T-AGAA-A-C-T-GC-T-CT-AAACA-T-T-AA---T-T--A-G-A-GCA
gi|125120                     :    TC-A--C-CC-TACGTACAGT-CA-TAG---------AA----------A-A-CA-GTC--A-T-----A-GA-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCTGA
gi|125121                     :     C-G--C-CA-AAG---CGGC-CA-T-----------AA----------A-G-CA-G-C--A-T-----G-AG-A-AAC-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125122                     :     C-G--C-CC-AAC---CAGG-CA-TGG---------A-----------A-A-CA-GTC--AGT-----G-AG-A-A-CTT-GCAT-TT-AA--G-T-T--A-C-C-T--A-G-A-GCAGA
gi|125123                     :      -G--C-GC-AATT--CGGT-CA-T-----------AA----------A-A-CA-GTC--G-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-TA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125124                     :        --C-CC-A-----CAGT-CA-TGG---------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G--G-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125125                     :             C-AAG---CTGT-CA-TA----------------------A-G-CA-GTC--A-T-------AG-A-C-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-C-T--A-G-A-GCAG
gi|125127                     :              -AAG---CGGT-C---GC---------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125129                     :              -AAG---CGGT-CA-TGC---------AG--------------CA-ATC--A-T-----G-AG-A-T-C-T-GA-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GTAGA
gi|125130                     :              -AAG---CGGT-CA-T-----------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-AC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125131                     :              -AAG---CAGT-CA-T-----------AA----------A-G-CA-ACC--A-T-------AC-A-G-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-T-T-T--A-G-A-GCAAA
gi|125132                     :              -AAG---CGGT-CA-C-----------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AA-A-G-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125133                     :              -AAG---CAGT-CA-TGG---------AGCAGCTCTAG-A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125134                     :              -AAG---CGGT-CA-C-----------AA----------G-G-TA-GTC--A-T-----G-AA-A-G-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125135                     :              -AAG---CAGT-CG-T-----------AA----------A-G-CA-GCT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125137                     :                                                      -G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-T-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-A-A-GCAGA
gi|125138                     : aagcggtcacaac-AAG---CGGC-CA-TGA---------AG--------------CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-C-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125140                     :              -AAG---CGGT-CA-C-----------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-GG-A-A-C-T-GA-T-TT-AA--G-T-T-GA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125142                     :              -AAA---CAGT-CG-T-----------AA----------A-G-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125143                     :              -AAC---CGGT-CA-TA----------------------A-G-CA-GTC--A-T-------AG-A-A-C-T-GT-TTCT-AA--G-T---AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125144                     :              -AAG---CAGT-CA-TGG---------AGCATCTCTAG-A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-G-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125145                     :              -AAG---CAGT-CG-T-----------AA----------A-G-CA-GCT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AATC-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125146                     :              -AAG---CGGT-CA-T-----------AA----------A-A-CA-ACC--A-T-----A-AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G---T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125147                     :              -AGC---CGGT-CA-CA----------AT----------A-G-CA-GTA--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125148                     :              -AAC---CAGT-CA-TAAAGCAGTTCTAG----------A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T--A-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125149                     :              -AAG---CAGT-CG-T-----------AA----------A-G-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125151                     :              -AAG---CGGT-CA-T-----------AA----------A-G-CA-GTC--G-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-TT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125153                     :              -AAC---CA---CA-TGA---------AA--------------CA-GTC--A-T-----G-AGAA-A-C-T--C-T-TT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125154                     :              -AAA---CGGT-CA-T-----------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-------AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AT-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125155                     :              -AAG---CAGT-CG-TAA---------AGCA--------A-G-CA-GCT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125156                     :              -AAG---CAGT-CG-T-----------AG----------A-G-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125158                     :              -AAC---CAGT-CG-T-----------AG----------A-A-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-ACAG
gi|125161                     :                  ---CAGT-CA-TGG---------AGCAGCTCTAG-A-G-CA-GTC--AGC-----A-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCA
gi|125162                     :                  ---CAGT-CA-TGG---------AGCAGCTCTAG-A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125164                     :                  ---CAGT-CA-T-----------AA----------A-G-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-TT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125165                     :                  ---CAGT-CA-TGG---------AGGCAGCTCTAGA-GTCA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125167                     :                  ---CAGT-CA-TGG---------AGCAGCTCTAG-A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CA-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125168                     :                  ---CGGT-CA-C-----------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-TAAA-C-T-T--A-G-A-GCA
gi|125170                     :                  ---CAGT-CA-TGG---------AGCAGCTCTAG-A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--GAT-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125171                     :                  ---CAGT-CG-T-----------AG----------A-G-CA-GTC--G-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125172                     :                  ---CGGT-CA-T-----------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-------AG-A-A-C-T-GA-T-CT-AA--G-T-T-AA-T-T-T--A-G-A-GCTGA
gi|125173                     :                  ---CAGT-CA-TGG---------AGCAGCTCTAG-A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A---T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125174                     :                  ---CAGT-CG-TGG---------AG--------------CA-GTC--G-T-----G--G-A-C-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-G-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125179                     :                      AGT-CG-T-----------AG----------A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-G-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125180                     :                       GT-CA-C-----------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-GA--A-T-T-AA-C-T-A--A-G-A-GCAGA
gi|125182                     :                       GT-CA-TGG---------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-G-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-
gi|125183                     :                       GC-CA-T-----------AA----------A-G-CA-GCC--A-T-------AG-A-A-C-T-GC-C-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125185                     :                        T-CA-TGG---------AGGGCTTAG---A-G-CA-GTCCAG-C-----A-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125186                     :                         -CA-TGG---------AA----------A-G-CT-GTC--A-T-----G-AG-A-G-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125187                     :                               G---------AG----------AAG-CA-GTG--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--G-G-A-GCAAA
gi|125188                     :                          ac-TGC---------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AAG-G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125189                     :                            -TGG---------AA----------A-G-CAAGTC--A-T-------AG-A-G-C-T-GT-T-CT-AC--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125190                     :                                ---------AG----------A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125192                     :                                ---------AA----------A-G-CA-GTC--AGT-----A-AA-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-A-A-GCAG
gi|125193                     :                                ---------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----GGAG-A-A-C-T-GC-TTCT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125195                     :                                ---------AA----------A-G-CA-GTC--A-------G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125196                     :                                ---------AA----------A-G-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-AAC-T-GC-T-CT-AA--G-T-TTAA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125198                     :                                ---------AG----------A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-G-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125201                     :                                ---------AG----------A-G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125202                     :                                ---------AG----------A-G-CA-GTC--A-G-----A-AA-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125203                     :                                ---------AG----------A-G-CA-GTC--A-G-----A-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GAAG





Alignments
lowQualScore                  :                                              1111111111                                                                       
lowQualScore                  :     0 11 0  0  2222    0  0 7777777777777 00 5555555555  0  0   00 1 4444444  1 0 0 0 1  0 0  0  11 0 0 0  0 0 0 00 0 0 0     
lowQualScore                  :     . .. .  .  ....    .  . ............. .. ..........  .  .   .. . .......  . . . . .  . .  .  .. . . .  . . . .. . . .     
lowQualScore                  :     9 22 9  6  0000    5  4 7777777777777 66 0000000000  4  8   66 2 6666666  2 4 8 4 2  4 8  4  00 8 4 4  8 4 8 66 4 4 4     
consensus                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
Reference ( family-222 )      : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125079                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125080                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CG-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125081                     : TCTC-G--C-TC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125082                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--G-G-A-GCAG
gi|125083                     : TCTC-G--C-GC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AA-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125084                     : TCTC-G--C-CC-AAA---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-AT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125085                     : TCTC-G--T-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-GT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-A-A-GCAGA
gi|125086                     : TTTC-G--T-CC-AAT---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125087                     : TCTC-G--C-CC-AGC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-G-TT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GAAGA
gi|125088                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-CA-ATC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-A-AA-C-T-T--A-G-AGGCAGA
gi|125089                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AA-CA-GTC--A-T-----G-AT-A-A-C-T-GC-T-TT-AA--G-T-A-AA-C-T-T--A-A-A-GCAG
gi|125090                     : TCTC-G--C-AA-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AA-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--A-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125091                     : TCTC-G--C-C--AAC---CAG--CA-TG--G---------A--A----------GG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125092                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--A---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----A-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-GA--G-T-T-AA-T-T-T--A-G-G-TCAGA
gi|125093                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-GA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-
gi|125094                     : TCTC-G--C-C--AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GCC--A-C-------AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-A-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125095                     : TCTC-G--C-CC-AGG---CAGT-CG-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--G-T-----G-AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-A-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125096                     : TCTCTG--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-CA-GTC----T-----G-AG-A-A-C-TCGC-T-CT--A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125097                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CG-GCA--G-G-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-TTAA-A-G-GCAG
gi|125098                     : TCTC-C--C-GC-AAC---CA-T-CA-TG--G---------A--G----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AACC-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125099                     : TCTC-G--C-CC-AAC----AGT-CA-TC------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----GCAG-A-A-C-T-GC-T-CC-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125100                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-CG-TCC--A-T-----GAAG-A-ATC-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--GCG-A-GCAG
gi|125101                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-TG-GTC--A-T-----G-GG-A-A-C-T-AC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A---A-GC
gi|125102                     : TCTC-G--A-CA-AAC---CAGT-CA-TG--G---------T--T----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CG-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAAA
gi|125103                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-CA-GTC--A-TG----G-AG-A-A---T-GC-T-CTAAA--G-T-T-AA-C-T-T--C-GAA-GCAG
gi|125104                     : TCTC-G--CACCGAAC---CAGT-CA--G--A---------A--G----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AA-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-TCT--A-G-A-GCAGA
gi|125105                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CTGTCCA-TA--G---------A--A----------AG-CA-ATA--A-T-------AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-G-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125106                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGGTG---------G--A----------GA-CA-GTC--A-T-----G-AG-AGA-C-T-GC---CT-AA--G-TGT-TA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125107                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CAGTG--G------------A----------AG-CA-GTC--A-GGGAGAG-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-T-TGT--G-G-A-GCAG
gi|125108                     : TCTC-G--C-CC-CATG--CAGT-CA-TG--G---------A--AC---------AG-CA--TC--A-TT----G-AG-A-A-C-T-GC-C-CA-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125109                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CA------TG--G---------A--A----------AG-CAGGTC--A-T-----G-AG-A-A-C-TCGC-T-CT-A-----T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCGGA
gi|125110                     : TCTC-C--C-CC-AAG---CAGT-CG-TG--C---------A--G----------AG-CA-GTC--A-T-----A-AG-A-C-A-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-C-A-ATAGA
gi|125111                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CACT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-
gi|125112                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--C---------A--A----------AG-CA-------------------A-A-G-T-G-----T-AC--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125113                     :  CTC-T--C-TA-AAG---CAGT-CG-T-------------A--A----------AG-CA-GCT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125114                     :  CTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG--A-GCC--A-T-----G-AG-A-A-T-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125115                     :  CTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-TGGC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--G-G-A-GCAG
gi|125116                     :  CTC-GTCC-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A-----------G-CA-GCC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA----T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125117                     :  CTC-G--C-C--AAC---CAGT--A-TG--G---------A--A----------AG-CC-GCC--A-C-------AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G-T----A-CAT-T--A-G-A-GCAGA
gi|125119                     :  CTC-T--C-CC-AAC---CAGT-CA-T---G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----T-AGAA-A-C-T-GC-T-CT-AAACA-T-T-AA---T-T--A-G-A-GCA
gi|125120                     :   TC-A--C-CC-TACGTACAGT-CA-TA--G---------A--A----------AA-CA-GTC--A-T-----A-GA-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCTGA
gi|125121                     :    C-G--C-CA-AAG---CGGC-CA-T-------------A--A----------AG-CA-G-C--A-T-----G-AG-A-AAC-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125122                     :    C-G--C-CC-AAC---CAGG-CA-TG--G---------A--A----------A--CA-GTC--AGT-----G-AG-A-A-CTT-GCAT-TT-AA--G-T-T--A-C-C-T--A-G-A-GCAGA
gi|125123                     :     -G--C-GC-AATT--CGGT-CA-T-------------A--A----------AA-CA-GTC--G-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-TA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125124                     :       --C-CC-A-----CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G--G-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125125                     :            C-AAG---CTGT-CA-T----------------A----------AG-CA-GTC--A-T-------AG-A-C-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-C-T--A-G-A-GCAG
gi|125127                     :             -AAG---CGGT-C---G--C---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125129                     :             -AAG---CGGT-CA-TG--C---------A--------------G-CA-ATC--A-T-----G-AG-A-T-C-T-GA-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GTAGA
gi|125130                     :             -AAG---CGGT-CA-T-------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-AC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125131                     :             -AAG---CAGT-CA-T-------------A--A----------AG-CA-ACC--A-T-------AC-A-G-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-T-T-T--A-G-A-GCAAA
gi|125132                     :             -AAG---CGGT-CA-C-------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AA-A-G-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125133                     :             -AAG---CAGT-CA-TG--G---------A--GCAGCTCTAG-AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125134                     :             -AAG---CGGT-CA-C-------------A--A----------GG-TA-GTC--A-T-----G-AA-A-G-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125135                     :             -AAG---CAGT-CG-T-------------A--A----------AG-CA-GCT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125137                     :             -AAG---CGGT-CA-C-------------A--A----------CG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-T-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-A-A-GCAGA
gi|125138                     :             -AAG---CGGC-CA-TG---------------A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-C-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125140                     :             -AAG---CGGT-CA-C-------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-GG-A-A-C-T-GA-T-TT-AA--G-T-T-GA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125142                     :             -AAA---CAGT-CG-T-------------A--A----------AG-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125143                     :             -AAC---CGGT-CA-T----------------A----------AG-CA-GTC--A-T-------AG-A-A-C-T-GT-TTCT-AA--G-T---AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125144                     :             -AAG---CAGT-CA-TG--G---------A--GCATCTCTAG-AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-G-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125145                     :             -AAG---CAGT-CG-T-------------A--A----------AG-CA-GCT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AATC-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125146                     :             -AAG---CGGT-CA-T-------------A--A----------AA-CA-ACC--A-T-----A-AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G---T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125147                     :             -AGC---CGGT-CA-C-------------A--AT---------AG-CA-GTA--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125148                     :             -AAC---CAGT-CA-TA--AAGCAGTTCTA--G----------AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T--A-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125149                     :             -AAG---CAGT-CG-T-------------A--A----------AG-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125151                     :             -AAG---CGGT-CA-T-------------A--A----------AG-CA-GTC--G-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-TT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125153                     :             -AAC---CA---CA-TG--A---------A--A-------------CA-GTC--A-T-----G-AGAA-A-C-T--C-T-TT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125154                     :             -AAA---CGGT-CA-T-------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-------AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AT-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125155                     :             -AAG---CAGT-CG-TA--A---------AGCA----------AG-CA-GCT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125156                     :             -AAG---CAGT-CG-TA--G---------A--------------G-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125158                     :             -AAC---CAGT-CG-TA--G---------A--A-------------CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-ACAG
gi|125161                     :                 ---CAGT-CA-TG--G---------A--GCAGCTCTAG-AG-CA-GTC--AGC-----A-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCA
gi|125162                     :                 ---CAGT-CA-TG--G---------A--GCAGCTCTAG-AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125164                     :                 ---CAGT-CA-T-------------A--A----------AG-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-TT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125165                     :                 ---CAGT-CA-TG--G---------A--GGCAGCTCTAGAGTCA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125167                     :                 ---CAGT-CA-TG--G---------A--GCAGCTCTAG-AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CA-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125168                     :                 ---CGGT-CA-C-------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-TAAA-C-T-T--A-G-A-GCA
gi|125170                     :                 ---CAGT-CA-TG--G---------A--GCAGCTCTAG-AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--GAT-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125171                     :                 ---CAGT-CG-TA--G---------A--------------G-CA-GTC--G-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125172                     :                 ---CGGT-CA-T-------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-------AG-A-A-C-T-GA-T-CT-AA--G-T-T-AA-T-T-T--A-G-A-GCTGA
gi|125173                     :                 ---CAGT-CA-TG--G---------A--GCAGCTCTAG-AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A---T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125174                     :                 ---CAGT-CG-TG--G---------A--------------G-CA-GTC--G-T-----G--G-A-C-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-G-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125179                     :                     AGT-CG-TA--G---------A--------------G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-G-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125180                     :                      GT-CA-C-------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-GA--A-T-T-AA-C-T-A--A-G-A-GCAGA
gi|125182                     :                      GT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-G-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-
gi|125183                     :                      GC-CA-T-------------A--A----------AG-CA-GCC--A-T-------AG-A-A-C-T-GC-C-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125185                     :                       T-CA-TG--G---------A--GGGCTTAG---AG-CA-GTCCAG-C-----A-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125186                     :                        -CA-TG--G---------A--A----------AG-CT-GTC--A-T-----G-AG-A-G-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125187                     :                          A-CG--A---------G--A----------AG-CA-GTG--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--G-G-A-GCAAA
gi|125188                     :                           -TG--C---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AAG-G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125189                     :                           -TG--G---------A--A----------AG-CAAGTC--A-T-------AG-A-G-C-T-GT-T-CT-AC--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125190                     :                                 ---------A--G----------AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125192                     :                                 ---------A--A----------AG-CA-GTC--AGT-----A-AA-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-A-A-GCAG
gi|125193                     :                                 ---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----GGAG-A-A-C-T-GC-TTCT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125195                     :                                 ---------A--A----------AG-CA-GTC--A-------G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125196                     :                                 ---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AGAA-A-C-T-GC-T-CT-AA--GTT-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125198                     :                                 ---------A--G----------AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-G-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125201                     :                                 ---------A--G----------AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125202                     :                                 ---------A--G----------AG-CA-GTC--A-G-----A-AA-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125203                     :                                 ---------A--G----------AG-CA-GTC--A-G-----A-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GAAG





Alignments
lowQualScore                  :                                              1111111111                                                                       
lowQualScore                  :     0 11 0  0  2222    0  0 7777777777777 00 5555555555  0  0   00 1 4444444  1 0 0 0 1  0 0  0  11 0 0 0  0 0 0 00 0 0 0     
lowQualScore                  :     . .. .  .  ....    .  . ............. .. ..........  .  .   .. . .......  . . . . .  . .  .  .. . . .  . . . .. . . .     
lowQualScore                  :     9 22 9  6  0000    5  4 7777777777777 66 0000000000  4  8   66 2 6666666  2 4 8 4 2  4 8  4  00 8 4 4  8 4 8 66 4 4 4     
consensus                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
Reference ( family-222 )      : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125079                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125080                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CG-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125081                     : TCTC-G--C-TC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125082                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--G-G-A-GCAG
gi|125083                     : TCTC-G--C-GC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AA-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125084                     : TCTC-G--C-CC-AAA---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-AT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125085                     : TCTC-G--T-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-GT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-A-A-GCAGA
gi|125086                     : TTTC-G--T-CC-AAT---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125087                     : TCTC-G--C-CC-AGC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-G-TT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GAAGA
gi|125088                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-CA-ATC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-A-AA-C-T-T--A-G-AGGCAGA
gi|125089                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AA-CA-GTC--A-T-----G-AT-A-A-C-T-GC-T-TT-AA--G-T-A-AA-C-T-T--A-A-A-GCAG
gi|125090                     : TCTC-G--C-AA-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AA-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--A-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125091                     : TCTC-G--C-C--AAC---CAG--CA-TG--G---------A--A----------GG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125092                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--A---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----A-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-GA--G-T-T-AA-T-T-T--A-G-G-TCAGA
gi|125093                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-GA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-
gi|125094                     : TCTC-G--C-C--AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GCC--A-C-------AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-A-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125095                     : TCTC-G--C-CC-AGG---CAGT-CG-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--G-T-----G-AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-A-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125096                     : TCTCTG--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-CA-GTC----T-----G-AG-A-A-C-TCGC-T-CT--A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125097                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CG-GCA--G-G-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-TTAA-A-G-GCAG
gi|125098                     : TCTC-C--C-GC-AAC---CA-T-CA-TG--G---------A--G----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AACC-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125099                     : TCTC-G--C-CC-AAC----AGT-CA-TC------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----GCAG-A-A-C-T-GC-T-CC-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125100                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-CG-TCC--A-T-----GAAG-A-ATC-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--GCG-A-GCAG
gi|125101                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-TG-GTC--A-T-----G-GG-A-A-C-T-AC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A---A-GC
gi|125102                     : TCTC-G--A-CA-AAC---CAGT-CA-TG--G---------T--T----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CG-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAAA
gi|125103                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-CA-GTC--A-TG----G-AG-A-A---T-GC-T-CTAAA--G-T-T-AA-C-T-T--C-GAA-GCAG
gi|125104                     : TCTC-G--CACCGAAC---CAGT-CA--G--A---------A--G----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AA-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-TCT--A-G-A-GCAGA
gi|125105                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CTGTCCA-TA--G---------A--A----------AG-CA-ATA--A-T-------AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-G-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125106                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGGTG---------G--A----------GA-CA-GTC--A-T-----G-AG-AGA-C-T-GC---CT-AA--G-TGT-TA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125107                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CAGTG--G------------A----------AG-CA-GTC--A-GGGAGAG-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-T-TGT--G-G-A-GCAG
gi|125108                     : TCTC-G--C-CC-CATG--CAGT-CA-TG--G---------A--AC---------AG-CA--TC--A-TT----G-AG-A-A-C-T-GC-C-CA-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125109                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CA------TG--G---------A--A----------AG-CAGGTC--A-T-----G-AG-A-A-C-TCGC-T-CT-A-----T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCGGA
gi|125110                     : TCTC-C--C-CC-AAG---CAGT-CG-TG--C---------A--G----------AG-CA-GTC--A-T-----A-AG-A-C-A-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-C-A-ATAGA
gi|125111                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CACT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-
gi|125112                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--C---------A--A----------AG-CA-------------------A-A-G-T-G-----T-AC--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125113                     :  CTC-T--C-TA-AAG---CAGT-CG-T-------------A--A----------AG-CA-GCT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125114                     :  CTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG--A-GCC--A-T-----G-AG-A-A-T-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125115                     :  CTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-TGGC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--G-G-A-GCAG
gi|125116                     :  CTC-GTCC-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A-----------G-CA-GCC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA----T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125117                     :  CTC-G--C-C--AAC---CAGT--A-TG--G---------A--A----------AG-CC-GCC--A-C-------AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G-T----A-CAT-T--A-G-A-GCAGA
gi|125119                     :  CTC-T--C-CC-AAC---CAGT-CA-T---G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----T-AGAA-A-C-T-GC-T-CT-AAACA-T-T-AA---T-T--A-G-A-GCA
gi|125120                     :   TC-A--C-CC-TACGTACAGT-CA-TA--G---------A--A----------AA-CA-GTC--A-T-----A-GA-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCTGA
gi|125121                     :    C-G--C-CA-AAG---CGGC-CA-T-------------A--A----------AG-CA-G-C--A-T-----G-AG-A-AAC-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125122                     :    C-G--C-CC-AAC---CAGG-CA-TG--G---------A--A----------A--CA-GTC--AGT-----G-AG-A-A-CTT-GCAT-TT-AA--G-T-T--A-C-C-T--A-G-A-GCAGA
gi|125123                     :     -G--C-GC-AATT--CGGT-CA-T-------------A--A----------AA-CA-GTC--G-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-TA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125124                     :       --C-CC-A-----CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G--G-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125125                     :            C-AAG---CTGT-CA-T----------------A----------AG-CA-GTC--A-T-------AG-A-C-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-C-T--A-G-A-GCAG
gi|125127                     :             -AAG---CGGT-C---G--C---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125129                     :             -AAG---CGGT-CA-TG--C---------A--------------G-CA-ATC--A-T-----G-AG-A-T-C-T-GA-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GTAGA
gi|125130                     :             -AAG---CGGT-CA-T-------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-AC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125131                     :             -AAG---CAGT-CA-T-------------A--A----------AG-CA-ACC--A-T-------AC-A-G-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-T-T-T--A-G-A-GCAAA
gi|125132                     :             -AAG---CGGT-CA-C-------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AA-A-G-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125133                     :             -AAG---CAGT-CA-TG--G---------A--GCAGCTCTAG-AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125134                     :             -AAG---CGGT-CA-C-------------A--A----------GG-TA-GTC--A-T-----G-AA-A-G-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125135                     :             -AAG---CAGT-CG-T-------------A--A----------AG-CA-GCT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125137                     :             -AAG---CGGT-CA-C-------------A--A----------CG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-T-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-A-A-GCAGA
gi|125138                     :             -AAG---CGGC-CA-TG---------------A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-C-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125140                     :             -AAG---CGGT-CA-C-------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-GG-A-A-C-T-GA-T-TT-AA--G-T-T-GA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125142                     :             -AAA---CAGT-CG-T-------------A--A----------AG-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125143                     :             -AAC---CGGT-CA-T----------------A----------AG-CA-GTC--A-T-------AG-A-A-C-T-GT-TTCT-AA--G-T---AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125144                     :             -AAG---CAGT-CA-TG--G---------A--GCATCTCTAG-AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-G-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125145                     :             -AAG---CAGT-CG-T-------------A--A----------AG-CA-GCT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AATC-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125146                     :             -AAG---CGGT-CA-T-------------A--A----------AA-CA-ACC--A-T-----A-AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G---T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125147                     :             -AGC---CGGT-CA-C-------------A--AT---------AG-CA-GTA--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125148                     :             -AAC---CAGT-CA-TA--AAGCAGTTCTA--G----------AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T--A-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125149                     :             -AAG---CAGT-CG-T-------------A--A----------AG-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125151                     :             -AAG---CGGT-CA-T-------------A--A----------AG-CA-GTC--G-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-TT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125153                     :             -AAC---CA---CA-TG--A---------A--A-------------CA-GTC--A-T-----G-AGAA-A-C-T--C-T-TT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125154                     :             -AAA---CGGT-CA-T-------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-------AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AT-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125155                     :             -AAG---CAGT-CG-TA--A---------AGCA----------AG-CA-GCT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125156                     :             -AAG---CAGT-CG-TA--G---------A--------------G-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125158                     :             -AAC---CAGT-CG-TA--G---------A--A-------------CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-ACAG
gi|125161                     :                 ---CAGT-CA-TG--G---------A--GCAGCTCTAG-AG-CA-GTC--AGC-----A-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCA
gi|125162                     :                 ---CAGT-CA-TG--G---------A--GCAGCTCTAG-AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125164                     :                 ---CAGT-CA-T-------------A--A----------AG-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-TT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125165                     :                 ---CAGT-CA-TG--G---------A--GGCAGCTCTAGAGTCA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125167                     :                 ---CAGT-CA-TG--G---------A--GCAGCTCTAG-AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CA-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125168                     :                 ---CGGT-CA-C-------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-TAAA-C-T-T--A-G-A-GCA
gi|125170                     :                 ---CAGT-CA-TG--G---------A--GCAGCTCTAG-AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--GAT-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125171                     :                 ---CAGT-CG-TA--G---------A--------------G-CA-GTC--G-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125172                     :                 ---CGGT-CA-T-------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-------AG-A-A-C-T-GA-T-CT-AA--G-T-T-AA-T-T-T--A-G-A-GCTGA
gi|125173                     :                 ---CAGT-CA-TG--G---------A--GCAGCTCTAG-AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A---T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125174                     :                 ---CAGT-CG-TG--G---------A--------------G-CA-GTC--G-T-----G--G-A-C-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-G-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125179                     :                     AGT-CG-TA--G---------A--------------G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-G-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125180                     :                      GT-CA-C-------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-GA--A-T-T-AA-C-T-A--A-G-A-GCAGA
gi|125182                     :                      GT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-G-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-
gi|125183                     :                      GC-CA-T-------------A--A----------AG-CA-GCC--A-T-------AG-A-A-C-T-GC-C-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125185                     :                       T-CA-TG--G---------A--GGGCTTAG---AG-CA-GTCCAG-C-----A-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125186                     :                        -CA-TG--G---------A--A----------AG-CT-GTC--A-T-----G-AG-A-G-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125187                     :                          A-CG--A---------G--A----------AG-CA-GTG--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--G-G-A-GCAAA
gi|125188                     :                           -TG--C---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AAG-G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125189                     :                           -TG--G---------A--A----------AG-CAAGTC--A-T-------AG-A-G-C-T-GT-T-CT-AC--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125190                     :                                 ---------A--G----------AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125192                     :                                 ---------A--A----------AG-CA-GTC--AGT-----A-AA-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-A-A-GCAG
gi|125193                     :                                 ---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----GGAG-A-A-C-T-GC-TTCT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125195                     :                                 ---------A--A----------AG-CA-GTC--A-------G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125196                     :                                 ---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AGAA-A-C-T-GC-T-CT-AA--GTT-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125198                     :                                 ---------A--G----------AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-G-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125201                     :                                 ---------A--G----------AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125202                     :                                 ---------A--G----------AG-CA-GTC--A-G-----A-AA-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125203                     :                                 ---------A--G----------AG-CA-GTC--A-G-----A-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GAAG


blockSeqs                     :       TC       CGTA         AAAGCAGTTCT      GCAGCTCTAG            G GGAGAG   A       C
blockSeqs                     :       .        TG           GGTG             CAGCTCTAG             G GC       A       C
blockSeqs                     :       .        TT           GG               CATCTCTAG             G GA       A       G
blockSeqs                     :       .        C            GG               CAGCTCTAG             . GG       .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               CAGCTCTAG             . TG       .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               CAGCTCTAG             . GG       .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               CAGCTCTAG             . G        .       .
blockSeqs                     :       .        A            GG               CAGCTCTAG             . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               GGCTTAG               . G        .       .
blockSeqs                     :       .        T            GG               C                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               T                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GA               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        G            GG               .                     . A        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GA               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            AG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . A        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GC               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . A        .       .
blockSeqs                     :       .        G            GC               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        G            GG               .                     . T        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . A        .       .
blockSeqs                     :       .        C            AG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GC               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        G            GC               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        C            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :       .        G            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :                G            GA               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :                G            AA               .                     . C        .       .
blockSeqs                     :                G            AG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :                G            AG               .                     . A        .       .
blockSeqs                     :                G            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :                G            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :                G            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :                G            GG               .                     . A        .       .
blockSeqs                     :                G            GG               .                     . C        .       .
blockSeqs                     :                G            AG               .                     . A        .       .
blockSeqs                     :                G            GG               .                     . A        .       .
blockSeqs                     :                A            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :                C            AG               .                     . C        .       .
blockSeqs                     :                G            GG               .                     . A        .       .
blockSeqs                     :                G            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :                G            GG               .                     . G        .       .
blockSeqs                     :                C            GA               .                     . A        .       .
blockSeqs                     :                C            GC               .                     . A        .       .
blockSeqs                     :                G            GG               .                     . A        .       .
blockSeqs                     :                G            C                .                     . A        .       .
blockSeqs                     :                C            G                .                     . C        .       .
blockSeqs                     :                A            G                .                     . A        .       .
blockSeqs                     :                G            .                .                     . C        .       .
blockSeqs                     :                G            .                .                     . C        .       .
blockSeqs                     :                C            .                .                     . G        .       .
blockSeqs                     :                .            .                .                     . C        .       .
blockSeqs                     :                             .                .                     . C        .       .
blockSeqs                     :                             .                .                     . C        .       .
blockSeqs                     :                             .                .                     . G        .       .
blockSeqs                     :                             .                .                     . C        .       .
blockSeqs                     :                             .                .                     . G        .       .
blockSeqs                     :                             .                .                     . G        .       .
blockSeqs                     :                             .                .                     . A        .       .
blockSeqs                     :                             .                .                     . G        .       .
blockSeqs                     :                             .                .                     . G        .       .
blockSeqs                     :                             .                .                     . G        .       .
blockSeqs                     :                             .                .                     . C        .       .
blockSeqs                     :                             .                .                     . A        .       .
blockSeqs                     :                             .                .                     . G        .       .
blockSeqs                     :                             .                .                     . G        .       .
blockSeqs                     :                             .                .                     . C        .       .
blockSeqs                     :                             .                .                     . C        .       .
blockSeqs                     :                             .                .                     . A        .       .
blockSeqs                     :                             .                .                     . A        .       .
blockSeqs                     :                             .                .                     . .        .       .
blockSeqs                     :                             .                .                     . .        .       .
blockSeqs                     :                                              .                     . .        .       .
blockSeqs                     :                                              .                     . .        .       .
blockSeqs                     :                                              .                     . .        .       .
blockSeqs                     :                                              .                     . .        .       .
blockSeqs                     :                                              .                     . .        .       .
blockSeqs                     :                                              .                     . .        .       .
blockSeqs                     :                                              .                     . .        .       .
blockSeqs                     :                                              .                     . .        .       .
blockSeqs                     :                                              .                     . .        .       .


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
finalCons                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA





Alignments
lowQualScore                  :                                              1111111111                                                                       
lowQualScore                  :     0 11 0  0  2222    0  0 7777777777777 00 5555555555  0  0   00 1 4444444  1 0 0 0 1  0 0  0  11 0 0 0  0 0 0 00 0 0 0     
lowQualScore                  :     . .. .  .  ....    .  . ............. .. ..........  .  .   .. . .......  . . . . .  . .  .  .. . . .  . . . .. . . .     
lowQualScore                  :     9 22 9  6  0000    5  4 7777777777777 66 0000000000  4  8   66 2 6666666  2 4 8 4 2  4 8  4  00 8 4 4  8 4 8 66 4 4 4     
consensus                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
Reference ( family-222 )      : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125079                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125080                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CG-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125081                     : TCTC-G--C-TC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125082                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--G-G-A-GCAG
gi|125083                     : TCTC-G--C-GC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AA-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125084                     : TCTC-G--C-CC-AAA---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-AT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125085                     : TCTC-G--T-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-GT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-A-A-GCAGA
gi|125086                     : TTTC-G--T-CC-AAT---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125087                     : TCTC-G--C-CC-AGC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-G-TT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GAAGA
gi|125088                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-CA-ATC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-A-AA-C-T-T--A-G-AGGCAGA
gi|125089                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AA-CA-GTC--A-T-----G-AT-A-A-C-T-GC-T-TT-AA--G-T-A-AA-C-T-T--A-A-A-GCAG
gi|125090                     : TCTC-G--C-AA-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AA-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--A-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125091                     : TCTC-G--C-C--AAC---CAG--CA-TG--G---------A--A----------GG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125092                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--A---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----A-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-GA--G-T-T-AA-T-T-T--A-G-G-TCAGA
gi|125093                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-GA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-
gi|125094                     : TCTC-G--C-C--AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GCC--A-C-------AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-A-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125095                     : TCTC-G--C-CC-AGG---CAGT-CG-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--G-T-----G-AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-A-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125096                     : TCTCTG--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-CA-GTC----T-----G-AG-A-A-C-TCGC-T-CT--A--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125097                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CG-GCA--G-G-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-TTAA-A-G-GCAG
gi|125098                     : TCTC-C--C-GC-AAC---CA-T-CA-TG--G---------A--G----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AACC-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125099                     : TCTC-G--C-CC-AAC----AGT-CA-TC------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----GCAG-A-A-C-T-GC-T-CC-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125100                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-CG-TCC--A-T-----GAAG-A-ATC-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--GCG-A-GCAG
gi|125101                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-TG-GTC--A-T-----G-GG-A-A-C-T-AC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A---A-GC
gi|125102                     : TCTC-G--A-CA-AAC---CAGT-CA-TG--G---------T--T----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CG-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAAA
gi|125103                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-CA-GTC--A-TG----G-AG-A-A---T-GC-T-CTAAA--G-T-T-AA-C-T-T--C-GAA-GCAG
gi|125104                     : TCTC-G--CACCGAAC---CAGT-CA--G--A---------A--G----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AA-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-TCT--A-G-A-GCAGA
gi|125105                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CTGTCCA-TA--G---------A--A----------AG-CA-ATA--A-T-------AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-G-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125106                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TGGTG---------G--A----------GA-CA-GTC--A-T-----G-AG-AGA-C-T-GC---CT-AA--G-TGT-TA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125107                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CAGTG--G------------A----------AG-CA-GTC--A-GGGAGAG-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-T-TGT--G-G-A-GCAG
gi|125108                     : TCTC-G--C-CC-CATG--CAGT-CA-TG--G---------A--AC---------AG-CA--TC--A-TT----G-AG-A-A-C-T-GC-C-CA-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125109                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CA------TG--G---------A--A----------AG-CAGGTC--A-T-----G-AG-A-A-C-TCGC-T-CT-A-----T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCGGA
gi|125110                     : TCTC-C--C-CC-AAG---CAGT-CG-TG--C---------A--G----------AG-CA-GTC--A-T-----A-AG-A-C-A-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-C-A-ATAGA
gi|125111                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CACT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-
gi|125112                     : TCTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--C---------A--A----------AG-CA-------------------A-A-G-T-G-----T-AC--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125113                     :  CTC-T--C-TA-AAG---CAGT-CG-T-------------A--A----------AG-CA-GCT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125114                     :  CTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG--A-GCC--A-T-----G-AG-A-A-T-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125115                     :  CTC-G--C-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--G----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-TGGC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--G-G-A-GCAG
gi|125116                     :  CTC-GTCC-CC-AAC---CAGT-CA-TG--G---------A--A-----------G-CA-GCC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA----T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125117                     :  CTC-G--C-C--AAC---CAGT--A-TG--G---------A--A----------AG-CC-GCC--A-C-------AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G-T----A-CAT-T--A-G-A-GCAGA
gi|125119                     :  CTC-T--C-CC-AAC---CAGT-CA-T---G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----T-AGAA-A-C-T-GC-T-CT-AAACA-T-T-AA---T-T--A-G-A-GCA
gi|125120                     :   TC-A--C-CC-TACGTACAGT-CA-TA--G---------A--A----------AA-CA-GTC--A-T-----A-GA-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCTGA
gi|125121                     :    C-G--C-CA-AAG---CGGC-CA-T-------------A--A----------AG-CA-G-C--A-T-----G-AG-A-AAC-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125122                     :    C-G--C-CC-AAC---CAGG-CA-TG--G---------A--A----------A--CA-GTC--AGT-----G-AG-A-A-CTT-GCAT-TT-AA--G-T-T--A-C-C-T--A-G-A-GCAGA
gi|125123                     :     -G--C-GC-AATT--CGGT-CA-T-------------A--A----------AA-CA-GTC--G-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-TA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125124                     :       --C-CC-A-----CAGT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G--G-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125125                     :            C-AAG---CTGT-CA-T----------------A----------AG-CA-GTC--A-T-------AG-A-C-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-C-T--A-G-A-GCAG
gi|125127                     :             -AAG---CGGT-C---G--C---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125129                     :             -AAG---CGGT-CA-TG--C---------A--------------G-CA-ATC--A-T-----G-AG-A-T-C-T-GA-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GTAGA
gi|125130                     :             -AAG---CGGT-CA-T-------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-AC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125131                     :             -AAG---CAGT-CA-T-------------A--A----------AG-CA-ACC--A-T-------AC-A-G-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-T-T-T--A-G-A-GCAAA
gi|125132                     :             -AAG---CGGT-CA-C-------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AA-A-G-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125133                     :             -AAG---CAGT-CA-TG--G---------A--GCAGCTCTAG-AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125134                     :             -AAG---CGGT-CA-C-------------A--A----------GG-TA-GTC--A-T-----G-AA-A-G-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125135                     :             -AAG---CAGT-CG-T-------------A--A----------AG-CA-GCT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125137                     :             -AAG---CGGT-CA-C-------------A--A----------CG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-T-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-A-A-GCAGA
gi|125138                     :             -AAG---CGGC-CA-TG---------------A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-C-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125140                     :             -AAG---CGGT-CA-C-------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-GG-A-A-C-T-GA-T-TT-AA--G-T-T-GA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125142                     :             -AAA---CAGT-CG-T-------------A--A----------AG-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125143                     :             -AAC---CGGT-CA-T----------------A----------AG-CA-GTC--A-T-------AG-A-A-C-T-GT-TTCT-AA--G-T---AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125144                     :             -AAG---CAGT-CA-TG--G---------A--GCATCTCTAG-AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-G-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125145                     :             -AAG---CAGT-CG-T-------------A--A----------AG-CA-GCT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AATC-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125146                     :             -AAG---CGGT-CA-T-------------A--A----------AA-CA-ACC--A-T-----A-AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G---T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125147                     :             -AGC---CGGT-CA-C-------------A--AT---------AG-CA-GTA--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125148                     :             -AAC---CAGT-CA-TA--AAGCAGTTCTA--G----------AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T--A-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125149                     :             -AAG---CAGT-CG-T-------------A--A----------AG-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125151                     :             -AAG---CGGT-CA-T-------------A--A----------AG-CA-GTC--G-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-TT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125153                     :             -AAC---CA---CA-TG--A---------A--A-------------CA-GTC--A-T-----G-AGAA-A-C-T--C-T-TT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125154                     :             -AAA---CGGT-CA-T-------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-------AG-A-A-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AT-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125155                     :             -AAG---CAGT-CG-TA--A---------AGCA----------AG-CA-GCT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125156                     :             -AAG---CAGT-CG-TA--G---------A--------------G-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125158                     :             -AAC---CAGT-CG-TA--G---------A--A-------------CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-ACAG
gi|125161                     :                 ---CAGT-CA-TG--G---------A--GCAGCTCTAG-AG-CA-GTC--AGC-----A-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCA
gi|125162                     :                 ---CAGT-CA-TG--G---------A--GCAGCTCTAG-AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125164                     :                 ---CAGT-CA-T-------------A--A----------AG-CA-GTT--C-T-----A-AT-G-A-C-T-GC-T-TT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125165                     :                 ---CAGT-CA-TG--G---------A--GGCAGCTCTAGAGTCA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125167                     :                 ---CAGT-CA-TG--G---------A--GCAGCTCTAG-AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CA-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125168                     :                 ---CGGT-CA-C-------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-TAAA-C-T-T--A-G-A-GCA
gi|125170                     :                 ---CAGT-CA-TG--G---------A--GCAGCTCTAG-AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--GAT-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125171                     :                 ---CAGT-CG-TA--G---------A--------------G-CA-GTC--G-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125172                     :                 ---CGGT-CA-T-------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-------AG-A-A-C-T-GA-T-CT-AA--G-T-T-AA-T-T-T--A-G-A-GCTGA
gi|125173                     :                 ---CAGT-CA-TG--G---------A--GCAGCTCTAG-AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A---T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125174                     :                 ---CAGT-CG-TG--G---------A--------------G-CA-GTC--G-T-----G--G-A-C-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-G-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125179                     :                     AGT-CG-TA--G---------A--------------G-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-G-C-T-GT-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125180                     :                      GT-CA-C-------------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-GA--A-T-T-AA-C-T-A--A-G-A-GCAGA
gi|125182                     :                      GT-CA-TG--G---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-G-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-
gi|125183                     :                      GC-CA-T-------------A--A----------AG-CA-GCC--A-T-------AG-A-A-C-T-GC-C-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125185                     :                       T-CA-TG--G---------A--GGGCTTAG---AG-CA-GTCCAG-C-----A-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125186                     :                        -CA-TG--G---------A--A----------AG-CT-GTC--A-T-----G-AG-A-G-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125187                     :                          A-CG--A---------G--A----------AG-CA-GTG--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--G-G-A-GCAAA
gi|125188                     :                           -TG--C---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AAG-G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125189                     :                           -TG--G---------A--A----------AG-CAAGTC--A-T-------AG-A-G-C-T-GT-T-CT-AC--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125190                     :                                 ---------A--G----------AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125192                     :                                 ---------A--A----------AG-CA-GTC--AGT-----A-AA-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-A-A-GCAG
gi|125193                     :                                 ---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----GGAG-A-A-C-T-GC-TTCT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125195                     :                                 ---------A--A----------AG-CA-GTC--A-------G-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125196                     :                                 ---------A--A----------AG-CA-GTC--A-T-----G-AGAA-A-C-T-GC-T-CT-AA--GTT-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAGA
gi|125198                     :                                 ---------A--G----------AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-G-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125201                     :                                 ---------A--G----------AG-CA-GTC--A-G-----C-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125202                     :                                 ---------A--G----------AG-CA-GTC--A-G-----A-AA-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GCAG
gi|125203                     :                                 ---------A--G----------AG-CA-GTC--A-G-----A-AG-A-A-C-T-GC-T-CT-AA--G-T-T-AA-C-T-T--A-G-A-GAAG