lowQualScore : 111111111111 33333333333333333333333333333333 111111 111
lowQualScore : 5555 00 111 00 111 666666666666 00 22222 00 4444 11 44444444444444444444444444444444 44444444 22222222 33333333 00 00 0 0 0 222 33333333 11 111111 00 0 0000 0 00 00 111111 0 0 00 0 000 0 0 00 333 22222 0 0 0
lowQualScore : .... .. ... .. ... ............ .. ..... .. .... .. ................................ ........ ........ ........ .. .. . . . ... ........ .. ...... .. . .... . .. .. ...... . . .. . ... . . .. ... ..... . . .
lowQualScore : 2222 77 444 77 333 333333333333 66 11111 66 0000 77 00000000000000000000000000000000 55555555 66666666 88888888 66 66 4 4 8 111 44444444 33 777777 88 5 8888 2 33 33 111111 2 9 66 2 999 7 5 33 444 55555 5 5 5
consensus : ACACA-C--ACACAC--A---C--A---C--G------G--A--CA-----C--A----C--A---------N-----C----C-G---------CA--------C-G------G--------C--A--GC-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAAT
Reference ( gi|5929 ) : ACACA-T--ACACAC--A---C--A---C--G------G--A--CA-----C--A----C--A---------T-----C----T-G---------CA--------C-A------G--------C--A--GC-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAAT
gi|5931 : ACACA-A--ACACAC--A---C--A---C--G------G--A--CA-----C--A----C--ACACA-----T-----C----C-G---------CA--------C-G------G--------C--A--GC-G-G-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-T---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAAT
gi|5933 : ACACA-C--ATACAC--A---C--A---CATG------GACA--CA-----C--A----C--A---------T-----C----C-A---------CA--------C-A------G--------A--A--GC-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-A-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAAaa
gi|5930 : ACACA-C--ACACAC--A---C--A---C--A------C--A--CA-----C--A----C--A--------------------------------CA--------C-G------G--------C--A--GC-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---G-----A-T-GGG-ATAATaaa
gi|5972 : ACACACT--ACAT-C--A---C--A---C---------------CA-----C--G----C--A---------T-----GGA--T-G---------CA--------C-G------G--------C--A--GC-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-A---A-TT-G--T---G-----A-G-GGG-ATAAT
gi|5973 : ACACA-T--GCACAC--A---G--A---C--A------G-----CAG----T--A----C--A---------G-----A----T-G---------CA--------C-T------G--------C--A--GC-G-A-T---GC--------C--A------C--A-T----CCC-C--T--C----T-A-C-AAC--T-A---A-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAATaa
gi|5971 : acACACA-C--ACATAC--A---C--A---C------------A--CA-----C--T----C--A---------G-----C----C-A---------CA--------C-A------A--------C--A--AG-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-A-C-AAT--T-A---G-TT-G--C---A-----A-G-GGG-ATAAaa
gi|5936 : ACGCA-C--ACACAT--A---C--A---C--A------G--T--CG-----C--A----A--A---------GA----C----T-----------CA--------C-A------G--------C--A--GT-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCT-C--T--C----C-A-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GAG-ATAAcaa
gi|5946 : ACACA-TGGACACAC--A---C--A---C--G------G--A--CA-----C--A----T--A---------T-----C----C-G---------CA--------T-G------G--------C--A--GC-G-A-A---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-A---gaa
gi|5939 : acACACA-C--AAACAC--A---C--A---C------------A--TT-----C--G----C--A---------TGGA--C----T-----------CA--------C-A------G--------C--A--GT-A-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCT-C--T--C----C-A-C-AAC--T-A---A-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAA
gi|5977 : ACACA-G--ACACACTAA---C--A---C------------A--CA-----C--A----C--A---------G-----T----G-G---------CA--------C--------G--------C--A--GT-G-C-T---GC--------T--A------T--A-T----TCT-C--T--C----C-A-C-AGC--T-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGA-ATAAgaa
gi|5975 : ACGCG-C--ACACGC--A---C--A---C------------A--CA-----C--A----C--A---------G-----C----G-T---------CA--------C-G------A--------C--A--TC-G-A-T---GC--------T--G------T--A-T----GTC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---T-----A-G-GAG-ATAATgaa
gi|5989 : ACACA-A--ACATAT--G---C--A---T--G------G--A--C--------------------------------------T-----------CA--------C-A------G--------C--A--GT-G-A-T---GC--------T--A------C--A-T----CCT-C--T--C----T-A-C-AAC--C-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAA
gi|5941 : catACACG-T--ACACAC--A---C--A---C------------A--CA-----C--A----C--AG--------T-----CTCA-T-G---------GA--------CTC------G--------C--A--GC-A-G-T---GC--------CG-A------T--A-T----TCC-C--T--C----C-A-C-AAC--C-A---G-TT-G--C---G-----A-G-AGG-ATAAgaa
gi|5942 : acacACACA-T--ACACAC--A---C--A---C--A------C--A--CA-----C--AGT--C--A---------CAAGGAC----T-----------CG--------T-A------G--------C--A--GT-G-C-T---GC--------T--A------T--A-T----T------T--C----C-A-C-AAC--C-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAAgaa
gi|5940 : acACACA-C--ACACAC--A---C--A---C--A------C--A--CA-----C--A----C--AGTCGCATGGT-----C----T-----------CG--------C-A------G--------A--A--GT-G-C-T---GC--------T--A------T--A-T----TCT-T--T--C----T-A-C-AAC--C-A---G-TT-G--C---G-----A-G-AGG-ATAAgaa
gi|5947 : ACAAA-C--ACACAC--A---C--A---C--G------G--T--CT-----C--A----TGGA---------------C----T-----------CG--------C-A------G--------C--A--GT-G-C-T---GA--------T--A------T--A-T----TCT-C--T--C----C-A-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---G-----A-G-AGG-ATAAgaa
gi|5951 : acacacaaACACA-G--ACACAC--A---C--A---C--A------T--A--CA-----C--A----C--AG--------T-----C----T-----------CA--------T-A------GACCTGCATC--A--GT-G-C-T---GA--------T--A------T--A-T----TCT-C--T--C----C-A-A-AAC--C-A---G-TT-G--C---G-----A-G-AGG-ATAATgaa
gi|5944 : ACACA-C--ACACAC--A---C--A---C------------A--CA-----C--A----C--A---------TAG---T----C-G---------CATGGACTCGC-A------G--------C--A--GT-G-C-T---GC--------T--A------T--A-T----TCT-C--T--CATGAC-A-C-AAC--C-A---G-TT-G--T---G-----A-G-AGG-ATAA
gi|5952 : ACACA-C--ACACCC--A---T--A---C--A------G--A--CA-----C--A----C--A---------G-----C----T---------------------------------------------GC-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCA-A--T--C----C------AC--T-A---G-TT-G--T---G-----A-A-GGG-ATGAgaa
gi|5960 : ACAGA-C--ACAGAC--A---C--A---C--A------A--A--CA-----C--A----C--AGTC------T-----C----T-GACATGGACTCG--------C-A------G--------C--A--GT-G-C-T---GA--------T--A------T--A-T----TCT-C--T--C------A-C-AAC--C-A---G-TT-G--C---G-----A-G-AGG-ATAAaaa
gi|5953 : ACATA-C--ACACAC--A---C--A---C--GACAACAG--T--CA-----C--A----C--A---------T-----CA---C-G---------CA--------C-G------G--------C--AGCGC-G-ATT---GC--------T--A------TA-A-TTGTATCC-C--T--C----C-G-CAAAC--T-AAT-G-TTGG--C---G-----A-G-GGGAATAATgaa
gi|5959 : ACACA-A--ACACAC--G---C--A---C--A------CC-A--CA-----C--A----C--AGTC------T-----CA---T-GGACT-----CG--------C-A------G--------C--A--GT-G-C-T---GA--------T--A------T--A-T----TCT-C--T--C----CCA-C-AAC--C-A---G-TT-G--C---G-----A-G-AGG-ATAaa
gi|5958 : ACACA-C--ACACAC--A---C--A---C--A------C--A--CA-----C--A----C--AG--------T-----CTCATT-GGACT-----CA--------C-A------G--------T--A--GT-G-C-T---G---------T--A------T--A-T-----TC-T--T--C----C-A-C-AAC--C-A---GTTT-G--C---A-----A-G-AGG-ATAA
gi|5948 : ACAAA-C--ACACAC--A---C--A---C--G------G--T--CT-----C--A----------------------------T-G---------GA--------CTC------G--------C--A--GC-A-G-T---GCGA------T--A------T--A-T----TCT-C--T--C----C-A-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---G-----A---GAG-ATAAgaa
gi|5935 : acacacaaACACA-T--GCAC--------C--A---C--A------G--A--CAGCAAGT--A----C--A---------G-----A----T-G---------CA--------C-T------G--------C--A--GC-G-A-T---TC--------C--A------C--A-T----CCC----T--C----T-A-C-AAC--T-A---GATT-G--C---G-----A-G-GG---TAATgaa
gi|5934 : acACACA-T--TTAGAC--A---C--A---A--G------G--A--CA-----CTGA----C--A---------G-----C----C-GAATGGA---CG--------C-ATTATTGG--------C--A--GC-G-A-T---GC--------T--A------C--A-T----CCC-C--T--C----T-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--T---G-----A-a
gi|5954 : acACACA-C--ACACAC--A---T--G---C--A------G--A--CA-----A--AAGAAC--A--------------------------------CA--------C-A------A--------C--A--GT-A-A-T---AC--------T--A------T--A-T----CCC-A--T---------------C--T-A---G-TT-G--C---G-----G-G-GGG-ATAAaagattataa
gi|5956 : ACACA-C---CACAC--A---C--A---C--A------G--T--CT-----C--A----TGGA---------------C----T-----------CG--------C-A------G--------C--A--GT-G-C-T---GA--------T--A------T--A-T----TCT-C--T--C----C-A---AAC--C-A---G-TT-G--C---G-----A-G-AGG-ATAAcaa
gi|5967 : CACG-C--ACGCGC--G---C--G---C--G------G--A--CA-----C--A----C--A---------T-----C----C-G---------TA--------C-G------G--------A--C--GC-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-A--T--C----C-G-C-AAC--T-T---G-TT-G--C---A-----A-G-GGG-ATAATgaa
gi|5968 : CACA-C--ACACAT--AA--C--A---C--A-------------A-----C--A----C--A---------T-----T----TCG---------CATGACTCATC-A------G--------C--A--GT-A-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CTC----T--C----C-A-C-AAC--T-A---A-TT-G--C---G-----A-GTGGG-ATAAaa
gi|5969 : CACA-C--AAATAC--A---C--A---C--A------G--T--CA-----C--A----T--G---------GA----C----T-----------CA--------C-A------G--------C--A--GT-A-A-G---GC--------T--A------T--A-T----CCT-C--T--T----C-A-C-AAC--T-A---G-TT-G--T-----------G-GGG-ATAAgaa
gi|5949 : CACC-C--ACCCAC--A---C--A---C------------A--CA-----C--A----C--A---------G-----C----C-G---------CA--------A-G------A--------C--A--GC-G-A-T---GTTATAACTGT--A------T--A-T----TCC-C--T--C----C-G-C-AGC--T-A---G-TT-G--A---GAATTTA-A-GGG-ATAAgaa
gi|5970 : accACA-C--ACACAC--A---C--A---C--G------G--A--CA-----C--G----C--A---------T-----C----C-G---------CA--------C-G------G--------A--C--GC-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-C---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAA
gi|5937 : ACA-C--ACACAC--A---T--A---T--G------G--A--CA-----C--A----C--ACA-------T-----C----C-A---------CA--------T-G------G--------C--A--GT-G-A-T---GC--------T--A------T--ATT----CCC-T--T--C----C-G-A-AAC--T-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAA
gi|5974 : ACG-C--ACAGAC--A---T--A---C--G------G--A--CA-----C--A----C--A---------G-----C----C-G---------CA--------C-G------G--------C--A--GC-A-A-T---GC--------T--A-----------------------T--C----C-G-C-AAC--T-A---A-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAATcaa
gi|5979 : ACA-A--ACAC-C--AGTCC--A---C--G------T--A--CG-----C--A----C--A---------C-----G----T---------------------C-A------G--------C--A--GC-A-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-A-C-AAG--T-A---G-TT-G--T---G-----A-G-GGG-ATAAT
gi|5978 : ACA-C--ACACAC--A---C--A---C--A------G--T--CA-----C--A----TGGA---------C-----T----T-G-------------------C-A------G--------C--A--GT-G-G-C---GC--------T--A------T--C-T----CCT-C--T--C----T-A-C-AAC--T-A---G-TT-G--T---G-----A-G-GGG-ATAAaa
gi|6019 : ACA-T--ACACAC--A---C------C--G----------------------------------------------C----C-G---------CA--------C-G------G--------T--------G-A-T---GA--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----T-G-C-GAC--T-A---G-TT-G--C---G-----A-A-GGG-ATAATgaa
gi|5997 : ACA-T---CACAC--A---C--AA--C------------A--CA-----C--A----C--A---------T-----C----C-G---------CA--------C-G------G--------CTCA--GC-G-A-T---GC--------T--A------TC-A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAC--TAA---G-TT-
gi|5955 : ACA-C--ACAAAC--A---C--A---C------------A--CA-----A--G----C--G---------T-----A----T-GGACT-----CG--------C-A------G--------C--A--GT-G-C-T---GC--------T--A------T--A-T----GTCGC--T--C----C-AAC-AAC--C-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAA
gi|5988 : CA-G--ACACAC--A---C--A---C------------A--CA-----C--A----A--A---------G-----C----T-G---------CA--------C-G------A--------A--A--GC-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----ATC-CATT--C----C-A-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---C-----A-G-GGG-ATAA
gi|5982 : CA-T--ATACAC--A---C--A---C--A------G--T--CG-----C--A----T--G---------GA----C----T-----------CA--------C-A------G--------T--A--GT-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCT-C--T--C----C-A-C-AACTAT-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ACAAaaa
gi|5983 : CA-T--ACACAA--A---C--A---C--A------G--T--CG-----C--A----T--G---------GA----C----T-----------CA--------C-A------G--------C--A--GT-T-A-T---GC--------C--A------T--A-T----CCT-C--T--C----C-A-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATgaa
gi|5992 : CA-T--GCACAA--A---C--A---C------------A--CA-----C--ATTG-C--A---------TGA---C----T-----------CA--------C-A------G--------C--A--GT-G-A-T---GC--------T--A------T--G-T----TCT-T--T--C----C-A-C-GAG--T-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAA
gi|5950 : CA-T--ACACAC--A---C--A-------------G--C--CA-----C--T----C--A---------GA----CGA--T-G---------AT--------T-G------G--------C--A--GG-G-A-T---GC--------T--AAT----T--A-T----CTC-C--T--A----T-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---A-----A-G-GGG-ATAATgaa
gi|5984 : acacagtgtA-C--ACACAC--A---C--A---C--G------G--ATACA-----C--A----C--A---------G-----C----C-G---------CA--------C-G------G--------C--A--GA-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----T-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAAT
gi|5985 : A-C--ACACAC--A---C--A---C--G------G--A--CA-----C--A----C--A---------T-----C----C-G---------CA--------C-G------G--------C--A--GC-G-ATT---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--TCCC----C-G-C-AAC--G-C---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAAT
gi|5932 : A-C--ACACAC--A---C--A---C--G------G--A--TA-----C--A----C--AAACA-----T-----C----C-A---------CA--------C-G------G--------C--A--GC-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-T---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAAaa
gi|5995 : --ACACAC--A---C--A---C--G------G--A--CA-----C--A----C--A---------T-----C----C-G---------CA--------C-G------G--------C--A--GC-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAAaaa
gi|5996 : --ACACAC--A---C--A---C--G------G--A--TG-----C--A----C--A---------T-----C----C-G---------CA--------C-G------G--------C--A--AT-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGaaa
gi|5987 : --ACACAC--A---C--A---C--G------G--A--CA-----C--A----G--AA--------T-----C----C-G---------CA--------C-G------G--------C--A--GC-G-A-TT--GC--------T--A------T--A-T----CCC----T--C----C-G-C-CCC--G-C---G-TT-G--C---G-----A-G-GGGAATAAT
gi|5938 : c--ACACAC--A---C--A---C------------A--CA-----C--A----C--A---------T-----C----C-G---------CA--------C-G------GACTCACGGC--A--GC-G-A-T---GC--------TT-A------T--A-T----CCC-C--T--T----C-G-C-AAC--T-T---G-TT-G--T---G-----A-G-GGa
gi|5945 : --ACA-AC--A---C--A---C--A------A--A--CA-----C--AGCCGC--A---------TGGA--C----T-----------CG--------C-A------G--------C--A--GT-G-C-T---GC--------T--A------T--A-T----TCT-C--T--C----C-A-C-AAC--C-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAA
gi|6027 : --ACACAT--A---C--A---C--A------G--C--CA-----C--A----C--G---------T-----C-----------------------------------------------A--GT-G-A-T---TC--------T--A------T--A-C----CCC-C--T--C----C-A-T-AAC--T-A---G-TT-G--A---G-----A-G-GGG-ATAAgaa
gi|5998 : --ACAGAC--A---C--A---C--A------A--A--CA-----C--A----C--A---------G-----T----T-G---------CATGGACTCGC-A------G--------C--A--GCTG-C-T---GC--------T--A------T--ATT----CTC-T--T--C----C-A-C-AAC--C-AG--G-TT-G--C---A-----A-G-AGG-ATAAaaa
gi|5999 : CACAA--A---C--A---C--A------G--T--CA-----C--A----T--A---------GA----C----T-----------CA--------C-A------G--------C--A--GT-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCT-C--T--C----C------AC--T-A---G-TT-G--C---A-----A-G-GGG-ATAAgaa
gi|6004 : CACAC--A---A--A---C------------A--CA-----C--A----C--A---------T-----C----C-G---------CA--------C-GTT----G--------C--A--GC-G-A-TTTTGC--------T--A------T--A-T----CCC-T--C--T----C-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--T---G-----A-gaa
gi|6001 : ACAC--A---C--A---C--G------G--A--CA-----C--A----C--A---------C-----A----C-G---------CA--------C-G------G--------C--A--GC-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAT--T-A---G-TT-G--C---G-----A---TGG-ATAAT
gi|6008 : ATAC--A---C--A---C------------A--CA-----C--A----C--A---------G-----C----T-A---------CA--------C-G------G--------A--A--GT-G-A-T---GC--------A--A------T--A-T----CCC-C--T--C----T-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---A-----A-G-GGG-ATAATaa
gi|5943 : ACAC--A---C--A---C--A------A--A--CAGT---C--G----C--A---------TGGA--C----T-----------CG--------C-A------G--------C--A--GT-G-C-T---GC--------T--A------T--A-T----TCT-C--T--C----C-A-C-AAC--C-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAA
gi|6002 : acaaACAC--A---C--A---C--C------C--A--TA-----T--A----T--A---------G-----C----T-G---------GA--------C-G------G--------C--A--GC-A-A-T---GCCA------T--A------T--A-T----GCC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---G-----T-G-AGA-ATAATgaa
gi|6012 : CAG--A---C--A---C------------A--CA-----C--A----C--A---------G-----C----C-A---------CA--------T-G------G--------G--A--GT-G-A-TAT-GC--------T--T------T--A-T----CCC-C--T--C----C-A-C-AAC--T-A---G-TT-G--T---G-----A-G-GGG-ATAAT
gi|6013 : CAG--A---C--A---C------------A--CA-----A--A----C--A---------G-----C----C-A---------CA--------T-G------G--------C--T--GT-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-T--T--C----C-T-C-AAA--T-A---G-TT-G--C---C-----A-G-AGG-ATAAT
gi|5981 : CAC--A---C--A---C--A------A--A--CA-----C--AGTCTC--A---------TGGA--C----T-----------CG--------C-A------G--------C--A--G------T---GC--------TGAA------T--A-T----TCT-C--T--C----C-A-C-AAC--C-A---G-TT-G--C---G-----A-G-AGG-ATAAaa
gi|6015 : AC--A---C--A---C------------A--CA-----C--A----C--A---------T-----C----C-G---------CA--------C-A------G--------C--A--GT-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---A-----A-G-GGG-ATAATgaa
gi|6016 : AC--A---C--A---C------------A--CA-----C--A----C--A---------T-----C----C-G---------CA--------C-G------G--------C--A--GC-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-T---GTTT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAAga
gi|6024 : AC--A---C--A---C------------A--CA-----C--A----C-------------------------G---------CA--------C-G------G--------A--A--GC-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAaaa
gi|5986 : AC--A---C--A---C--A------A--A--CA-----C--A----T--A---------T------------A---------CA--------C-A------G--------C--C--GC-G-G-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-A-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---C-----A-G-GGG-ATAAtaa
gi|6017 : AC--A---C--A---C------------A--CA-----C--A----C--A---------G-----C----T-G---------CA--------C-G------G--------C--A--GC-G-A-T---GCGCTA----T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--T---G-----A-A-TGG-TTAAT
gi|6009 : AC--A---C--A---C--A------A--A--CA-----C--A----C--A---------T-----C----C-G---------CA--------A-G------GA-------C--A---C-G-A-T---GC--------T--ACATGTAT--A-T----CCC-T--T--C----C-G-C-AAC--C-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAAaa
gi|6018 : AC--A---C--A---C------------A--CA-----C--A----C--A---------G-----C----C-G---------CA--------C-A------G--------A--T--GC-A-G-T---GC--------T--A------T--A-T----TCC-C--A--C----C-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGA-ATAAaaa
gi|6010 : AC--A---C--A---C--A------G--T--CA-----C--A----C--G---------GA----C----T-----------CA--------C-A------G--------C--A--GT-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCT-C--T--C----C-A-C-AAC--T-A---G-TT-G--G---G-----A-A-GGG-AAAAaaa
gi|6007 : AC--A---CCAA---C--C------G--A--CA-----C--A----C-----------------------C-G---------CA--------C-G------G--------C--A--GT-GGA-T---GC--------T--A------T--A-C----CCC-C--T---------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---G-----A---GGG-ATAATgaa
gi|6011 : AC--A---C--A---T--A------A--A--CA-----C--A----A--A---------G-----C----C-A---------CA--------C-A------G--------C--A--GC-A-A-TT--GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----T-G-C-AA---T-AATTA-TT-G--T---G-----A-G-GGG-ATAAga
gi|6014 : C--A---C--AAGCC--G------G--A--CA-----C--A----C--A---------T-----C----C-G---------CA-------------------------------------A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-C---A-TT-GGCC---G-----A-G-GGG-ATcaa
gi|6005 : C--A---C--A---C--A------A--A--GT-----C--G----C--A---------TGGA--C----T-----------CG--------C-A------G--------C--A--GT-G-C-T---GT--------T--A------T--A-T----TCT-C--T--C----C-A-C-AAC--C-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAA
gi|6023 : --A---C--A---C------------A--CA-----C--A----C--A---------T-----C----C-G---------CA--------C-G------G--------C--A--GC-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-A---C-TT-G--C---A-----A-G-GGG-ATAAgaa
gi|6026 : --A---C--A---C------------A--CA-----C--A----C--A---------T-----C----T-G---------CA--------C-G------G--------A--A--GC-G-A-T---GT--------A--A------T--A-T----TCC-C--T--C----C-A-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAA
gi|6020 : --A---C--A---T--G------G--A--AA-----C--A----C--A---------G-----C----T-G----------A--------C-A------GG-------C--A--GC-A-C-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC----T--C----T-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---A-----A-G-GGG-ATAaaa
gi|6021 : --A---C--A---C--A------A--A--CA-----C--A----C--A---------GA----C----T-----------CA--------C-A------G--------C--A--TG-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCT-C--T--T----C---C--AC--T-A---G-TT-G--C---A-----A-G-GGG-ATAAtaa
gi|6025 : --A---C--A------A--A--CA-----C--A----C--A---------T-----C----C-G---------CA--------C-G------G--------C--A--GC-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-A---G-TT-gaa
gi|6028 : ---C--G------G--A--CA-----C--A----C--A---------T-----C----C-G---------CA--------C-G------G--------A--A--GC-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAC--A-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAAT
gi|6029 : ---C--G------G--A--CA-----C--A----C--A---------G-----C----C-A---------CA--------T-G------G--------C--A--GC-A-A-T---GC--------T--A------T--A-T----TCC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---A-----A-G-GGG-ATAaa
gi|6030 : ---C--G------G--A--CA-----C--A----C--A---------C------------A---------CA--------A-A------G--------A--C--GT-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----T-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---A-----A-A-GGG-ATAAT
gi|6003 : ---C--A------G--A--CA-----T--A----C--A---------C------------A---------CA--------C-A------G--------C--C--GC-T-A-T---GC--------T--ACATGTAT--A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAA
gi|6032 : ---C--A------G--A--CA-----C--A----C--A---------G-----C----C-A---------CA--------T-A------G--------C--A--AC-A-A-T---GC--------T--A------T--A-T-----CC-C--T--C----T-G-C-ATC--T-A---G-TA-G--C---G-----A-G-GGG-ATAAcaa
gi|6039 : ------G--A--CA-----C--A----C--A---------C------------A---------CA--------C-A------G--------C--A--GC-A-A-T---GC--------T--A------T--A-T----TCC-C--T--C----T-G-C-AAC--T-T---G-TT-G--C---G-----A-G-AGG-ATAAaaa
gi|6041 : --A--CA-----C--A----C--A---------T-----C----C-G---------CA--------C-G------G--------C--A--GC-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----T-G-C-AAC--T-A---G-CT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAA
gi|6042 : --A--CA-----C--A----C--A---------G-----C----T-G---------CA--------C-G------G--------C--A--GG-G-G-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----T-A-C-AAC--T-A---G-TT-G--T---G-----A-G-GGG-ATAATaaa
gi|6037 : --A--TA-----C--A----C--A---------G-----C----C-G---------CA--------C-G------G--------C--A--GT-G-A-T---AC--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----T-G-C-AAC--C-A---G-TT-G--C---T-----A-G-GGG-ATAATaa
gi|6046 : agac--A--TA-----C--A----C--A--------------------------------CA--------C-A------G--------C--G--GC-G-A-T---GC--------C--A------A--A-T----CCC-C--T--C----T-G-C-AAC--T-A---G-TTGG--C---G-----A-A-GGG-GTAATaa
gi|6044 : c--A--TA-----C--A----C--A--------------------------------CA--------C-A------G--------C--A--GC-A-A-T---TT--------T--A------T--A-TAT--CCA-C--T--C----T-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---A-----A-G-GGG-ACAATaa
gi|6043 : ac--A--CA-----C--A----C--A---------G-----C----C-A---------CA--------T-G------G--------C--A--GT-G-A-T---GC--------T--A------TAAA-T----CC---------------------C--T-A---G-TT-G--C---A-----A-G-GGG-ATAAT
gi|6033 : --A--CA-----C--A----T--A---------G-----C----C-C---------CA--------T-G------G--------A--C--GT-G-A-T---GC--------T--A------T--T-T----CCC-C--A--T----A-G-T-AAC--T-A---T-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAAaa
gi|6047 : caa--A----C--A---------T-----C----A-A---------CA--------C-A------G--------C--C--GC-G-A-T---AT--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C----T-G-C-AAC--T-A---G-TC-G--C---G-----A-G-GGG-ATAcaa
gi|6049 : -----C----C-G---------CA--------C-G------G--------C--A--GC-G-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-C-----A----C-G-C-AAC--T-C---G-TT-G--C---G-----A-G-GGG-ATAAT
gi|6052 : ---------CA--------C-A------G--------C--A--GC-A-T-T---TC--------T--A------T--A-T----CCT-T--T--C----C-A-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---A-----A-G-GGG-ATAA
gi|6053 : ------G--------C--A--GC-A-A-T---GC--------T--A------T--A-T----CCC-T--T--C----TGG-C-AAC--G-G---G-TT-G--C---GA----A-G-GGG-ATAATaaa
gi|6054 : g--A--GC-G-A-T---GC--------T--T------T--A-T----CCC-C--T--C----C-G-C-AAC--T-T---G-TT-G--C---A-----A-C-GGG-ATAATa
gi|6024 : --------T--A------T--A-T----CCC-C--T--C------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--CG--G-----A-G-GGG-ATA
gi|6020 : acacacacacacgcacggaagcgatgcta--------T--A------T--A-T----CCC-C--T--T------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---A-----G-A-GGG-ATAa
gi|5995 : acatggaaacacagctgacaggcagcactgcta------T--A-T----CCC-C--T--C------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--CG--G-----A-G-GGG-ATAa
gi|5931 : acacacacacggacacacatccgcacggcagcgatgcta------T--A-T----CCC-C--T--C------G-C-AAC--A-A---G-TT-G--CG--G-----A-G-GGG-ATAaaaa
gi|5970 : acacaaacacacacacggacacacacacatccgcacggcagcggtgcta------T--A-T----CCC-C--T--C------G-C-AAC--G-A---G-TT-G--CG--G-----A-G-GGG-ATAataa
gi|5984 : acacacacacacacggacacgcatccgcacggacgcgatgcta------T--A-T----CCC-C--T--C------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--CA--G-----A-G-GGG-ATAa
gi|5933 : acacacacacacggatacacacagccgcacggcagagatgcta------T--A-T----CCC-C--T--C------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--TG--G-----A-G-GGG-ATAat
gi|5985 : acacacatacacacacatggacacacacatccacacagaagcgatgcta------T--A-T----CCC-C--T--C------G-C-AAC--G-C---G-TT-G--C---GGGG--A-G-GGG-ATAaaaa
gi|6015 : acacacacacacggacacacatccgcacggcagcgattgcta------T--A-T----CCC-C--T--T------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--CG--G-----A-G-GGG-ATAataa
gi|5930 : acacacacacacatccgcacagcagtgatgcta------T--A-T----CCC-A--T--C------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--CG--G-----A-G-GGG-ATAatga
gi|5932 : acacacacacacacacacacacacacacggcagcgatgcta------T--A-T----CCC-C--T--C------G-C-AAC--A-A---G-TT-G--CG--G-----A-G-GGG-ATAat
gi|6028 : acacacacacacggatacacaaacatccacacggcagcgatgcta------T--A-T----CCC-C--T--C------G-C-AAC--T-T---G-TT-G--CG--G-----A-G-GGG-ATAaaaa
gi|6041 : cggacacacatccgcacggaagcgatgcta------T--A-T----CCC-C--T--C------G-C-AGC--T-A---G-TT-G--CA--G-----A-G-GGG-ATAataa
gi|6016 : acacacatccgcacggcagcgatgcta------T--A-T----CCC-C--T-------C-G-CAAAC--A-A---G-TT-G--CG--G-----A-G-GGG-ATAaaaa
gi|6023 : acacacacacacatccgcacggcagcgatgcta------T--A-T----CCC-C--T--T------G-C-AAG--T-A---G-TT-G--CG--G-----A-G-GGG-ATAaaaa
gi|5937 : acacacacacatccgcacggcagcgatgcta------T--A-T----CCC-C--T--C------G-C-AAC--T-A---G-TT-T--C---GGA---A-G-GGA-ATAa
gi|5972 : acacacacacatatggacacacacatccacatggcagtgatgcta------T--A-T----CCC-C--T--C------A-C-AAT--T-A---G-TT-G--CG--G-----A-G-GGG-ATAacaa
gi|5967 : acacactacatcacaccacgcatggatgcacggcagcgatgcta------T--A-T----CCC-C--T--T------G-C-AAC--A-A---G-TT-G--CG--G-----A-T-GGG-ATAataa
gi|6026 : cacgcacgcgcgcgcggacacacatccgtacggacgcgatgcta------T--A-T----CCC-C--T--C------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--TG--G-----A-G-GGA-ATAataa
gi|6029 : acacacacacatctgcacggaagcgatgtaa------T--A-T----CCC-C--T--T------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--CG--G-----A-G-GGA-ATAaaaa
gi|6042 : cggacacacagccacatggcagcaatgcta------T--A-T----CCC-C--T--C------A-C-AAC--T-A---G-TT-G--TA--G-----A-G-GGG-ATA
gi|5973 : acacacagctgcacggcaggggtgcta------T--A-T----CCC-C--T-------C-G-C-AAT--T-A---G-TT-G--TA--G-----A-G-GGG-ATataa
gi|5971 : acacacatgcacacagacagcagtacagatgcactgcagcgatgccac------T--A-T----CCC-C--T--T------G-C-AAC--T-A---A-TT-G--TG--G-----A-G-GGG-ATAataa
gi|6008 : acacacacatacacacacactcagccacacaacaaggatgcta------T--A-T----CCC-C--T--T------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--CA--G-----A-G-GGG-ATAacaa
gi|5986 : atacacacacacacagctacacggaagtgatgcaa------T--A-T----CCC-C--T--G------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--TG--G-----A-G-GGG-ATAat
gi|5936 : acacacaaacacatatacacagccgcggtgcta------T--A-T----CTC-C--T--C------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--TG--G-----A-G-AGG-ATAa
gi|5974 : acgcacacacatacacagtcgcaaagactcacagcagtgatgcta------T--A-T----CCC-C--T--C------G-C-AAT--T-A---G-TT-G--C---G-----agaa
gi|6037 : acgcacagacatacggacacacagccgcacggcagcaatgctatc------T--A-T----CCC-C--T--A------G-C-AAC--T-G---G-TT-G--CA--G-----A-G-GGG-ATAat
gi|5939 : agacatacacagccgcacggcagtgatacta------T--A-T----CCC-C--T-------C-G-C-AAT--T-A---G-TT-G--TG--G-----A-G-AGG-ATAataa
gi|5979 : acacacaaacacacacattcgcatggactcacagcagtaatgcta------T--A-T----CCC-C--T--C------A-C-AAC--T-A---C-TT-G--T---GG----A-G-GGG-ATAagaa
gi|6009 : acaaacaccagtccacgtacgcacacgtcagcagcaatgcta------T--A-T----CCC-C--T--C------G-C-AAC--T-G---G-TT-G--CG--G-----A-A-GGG-ATAataa
gi|6018 : acacacaaacacacatccgcaaggacacgatgctacatgta------T--A-T----TCC-C--T--C------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---G-----GTG-GGA-ATAaaaa
gi|5988 : acacacacacacagccgcacagatgcagtgcta------T--A-T----CCC-C--T--G------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--TG--G-----A-A-TGG-ATAaaaa
gi|6047 : cagacacacacacacacaaagctgcacgaaagcgatgctata------T--A-T----CCC-C--T--C------G-C-GAC--T-A---G-TT-G--CA--G-----A-G-GGG-ATAaaaa
gi|5982 : acatcaacacagccgcgatatta------T--G-T----CCC-C--T--C------G-C-AACTAT-A---G-TT-G--TG--G-----A-G-AGG-ATA
gi|5977 : catatacacacacagtcgcatggactcacagtagtgatgcta------T--A-T----TCC-C--T--C------G-C-AAC--T-A---G-CT-G--TG--G-----A-G-AGA-ATAagaa
gi|6049 : acacagacacactaacacacacacagtggcacgcagtgctgcta------T--A-T----CCC-C--T--C------G-C-AAC--G-A---G-TT-G--C---G-----T-G-GGG-ATAagaa
gi|5975 : ccgcacggcagcgatgcta------T--A-T----CTC-C--T--A------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---G-------G-AGG-ACAat
gi|5978 : acgcgcacacgcacacacacacagcgtcacgacatcgatgctgta------T--A-T----CCC-C--T--C------A-C-AAC--T-A---G-TT-G--TAGAG-----A-G-GAG-ATAat
gi|6030 : acacacacacacacagtcacatggacttgcagcagtggcgc------T--A-T----CCC-T--T--T------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--CA--G-----A-G-GGG-ATAagaa
gi|5943 : cggacacacacacaaagacgtgatgcta------T--A-T----CCC-C--T--C------G-C-AAC--T-G---G-TT-G--TG--G-----A-G-AGA-ATAat
gi|5989 : acaaacacacacaaacagtcgcatggactcgcagcagtgctgcta------T--A-T----CCC-C--T--C------G-C-AAC--T-G---G-TT-G--TA--G-----A-G-AGG-ATagaa
gi|6003 : catacacaaacatatgcatggactcacagcagtgatgctac------T--A-T----CCC-C--T--C------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--CG--G-----A-G-GGG-ATAagaa
gi|5999 : cagacatacacacacagccgctatgctacatgta------T--A-T----CCC-C--T--T------G-C-AAC--T-A---G--T-G------G-----A-G-AGG-ATAacaa
gi|5941 : cacaaacacagtcacatagactcacagcagtgatgcta------T--A-T----CCT-C--T--C------G-C-AAC--T-G---G-TT-G--TG--G-----A-G-GGA-ATAagaa
gi|6032 : acacacacgtacacacacacacacacagtctcatggactcgcagcagtgccga------T--A-T----CCC-C--T-------C-G-C-TAC--T-A---G-AT-G--C---A-----G-A-GGG-ATAagaa
gi|5945 : cagacacacagccacatagcaacaatgcta------T--A-T----CCC-C--T--C------G-C-AAC--T-G---G-TT-G--TG--G-----A-G-AGA-ATAaaaa
gi|6012 : acaacacacaaacacagccgcatggactcgcagcagtgctgcta------T--A-T----CCC-C--T--C------A-C-AAC--T-A---G-TT-G--TG--G-----A-G-GGG-ATAAagaa
gi|6007 : cagacacacacacagccacatgggagtgatatgct------T--A-T----CCC-T----------C-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---------A-G-GGG-GTAat
gi|5947 : acaccaaccgacacaccgcacggcagtggatgcta------T--A-T----CCT-C--T--C------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--TG--G-----A-G-AGA-ATAatga
gi|6019 : acacacaaacaaacacacacacacggtctcatggactcgcagcagtgctgata------T--A-T----CCC-T--T--C------G-C-AAC--T-A---G-TC-G--CA--G-----A-G-GGG-ATAagaa
gi|6027 : acatacacacaccgccgcacggtgatgata------T--A-T----CCC-C--T--C----T---C-AAC--T-A---G-TT-A--TG--G-----A-G-GGG-GTAat
gi|6021 : acacatacacagccacacgtcagtgattcta------T--A-T----CCC-C--T--T------G-C-AAC--T-A---G--T-G--G---A-----A-G-AGG-ATAaaaa
gi|6052 : acacaaacacacagactcacagcatggatgcta------T--A-T----CCC-C--T--T------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--TG--G-----A-A-AGG-ATAagaa
gi|6054 : cacagcagcatttcta------T--A-T----CCC-G--T--T------G-C-AAC--A-A---G-TT-G--CG--G-----A-G-GGG-ATAAaaaa
gi|5960 : agcgatgct------T--A-T----CCT-C--T--C------G-C-AAC--T-G---G-TT-G--T---G-----A-G-AGA-ATAat
gi|5969 : acagacacagacacacaaacacacagtctctgacatggactcgcagcagtgctgata------T--A-T----CCC-C------------A-C-AAC--T-A---G-TT-G--T---GA----A-G-AGG-ATAagaa
gi|6005 : cacacaaatacacacagtcacatggactcacagcagtaaggcta------T--A-T----CCC-C--T--C------G-C-AAC--T-G---G-TT-G--TG--G-----A-G-AGA-ATAagaa
gi|6044 : cacacaaagtcgcatggactcgcagcagtgctgtta------T--G-T----CCC-C--T--T------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--CA--G-----A-G-TGG-ATAagaa
gi|5950 : acatacacacacagcagcaattttata------T--A-T----CCC-C--T--T------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---AT----A-G-GAG-ATAATat
gi|5959 : acacagtgtcatacacacacagccactcagacgatgattggcagggatgcta------T--A-T----CCT-C--T--C------G-C-AAC--T-G---G-TT-G--T---G-------G-GAG-AGAATat
gi|5981 : acacaaacacacgcacaccacacacagtctcatggactcgcagcagtgctgatat------T--A-T----CCT-C--T--C------G-C-AAC--T-G---G-TT-G--TG--G-----A-G-AGA-ATA
gi|6053 : cacacacaaacacagtctcatggactcgcagcagtgctgaa------T--A-T----CCC-C--T--T----C-G-C-AAC--C-C---G-TT-G--CCA-G-----A-A-GGG-ATAagaa
gi|6033 : ggcagcaatgcta------T--A-T----CCC-C--T-------C-G-C-AAA--T-A---G-TT-A--C---T-----ATG-GGG-A-AATata
gi|5983 : caaacacatagccccatggacgtgatgct--A-T----CCC-C--T--C------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--TG--G-----A-G-AGG-ATAacaa
gi|6014 : catacacaaacacagtcgcatggactcacagcagttatgcca--A-T----CCC-C--T--C----G-G-CCAAT--G-A---G-TT-G--CG--G-----A-G-GGG-ATA
gi|6010 : cacaagccggacacacatccgcaatgcta-T----CCC-T--T--C----C---C-AAC--T-A---G-TT-G--TG--G-----A-G-AGG-ATA
gi|6046 : acacacagtcacacggactcacagcagtgatgcta----CCC-C--T--T----C-G-CCAAC--T-A---G-TT-G--CA--G-----A-G-GGG-ATaaagaa
gi|5996 : catacacacacagcggcgatgccaaCC-C--T--C------G-C-AAC--T-A---G-TT-G--CG--G-----A-G-GGG-ATAtaataa
gi|6017 : acacacacacggatgcacatccgcacggcaatgatgctaCC-A--T--T----C-A-C-AAC--T-A---G-TT-G--CG--G-----A-G-GGG-ATA
gi|5938 : acacacacacacagctgcacggcagcgatgcgctataCC-C--T--C------A-C-AAC--A-A---G-TT-G--C---GA----A-G-GGG-ATAttaataa
gi|5934 : acacacacacacacacatccgcacggactcacggcagcgatgcttaC-T--T--T----C-A-C-AAC--T-A---G-TT-G--CA--G-----A-G-GGG-AT
gi|6002 : acacacatttagacacaaggacactgacagccgaatggacgcattattggcagcgatgctac-C--T--CA---C-G-C-AAC--T-A---G-TT-G--CG--G-----A-G-GGC-ATAattataa
gi|6001 : acacacacccatatatagctggacggcagcaatgccata----C-G-C-AAC--T-A---A-TT-G--CG--G-----A-G-GGG-ATAaataat
gi|6004 : acacacacggacacacacacgcacggcagcgatgcta----C-A-C-AAC--T-A---G-TT-G--C---G-----A-GAGGG-ATAatggataataa
Alignments
lowQualScore : 111111111111
lowQualScore : 2222 1111 22 11 11 111 00 000 777777777777 11111 00 6666 33333333333 0 33333333 111111 66666666 55555555 22222222 00 0000 0 1 111 44444444 111 111111 11 0 2222 00 00 0000 1 0 00 0 111 1 0 00 11111 0 0
lowQualScore : .... .... .. .. .. ... .. ... ............ ..... .. .... ........... . ........ ...... ........ ........ ........ .. .... . . ... ........ ... ...... .. . .... .. .. .... . . .. . ... . . .. ..... . .
lowQualScore : 4444 4444 44 22 44 444 77 888 222222222222 99999 66 2222 00000000000 4 11111111 222222 55555555 99999999 00000000 66 9999 4 2 777 55555555 777 777777 33 8 2222 66 66 8888 2 4 55 4 666 2 8 66 44444 4 9
consensus : ACACA----CA----C--ACA--C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--ACAG-C-C----G------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
Reference ( family-218 ) : ACACA----CA----C--ACA--C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--ACAN-C-C----G------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|5929 : ACACA----TA----C--ACA--C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--ACAT-C-T----G------C-A--------C------A--------G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|5930 : ACACA----CA----C--ACA--C--A---C--A---C------------ACA-----C--ACA----C----A------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AT-GGG-ATAAT
gi|5931 : ACACA----AA----C--ACA--C--A---C--A---CG------GACACACA-----C--ACAT-C-C----G------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GC----G-G-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-T---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|5932 : ACACA----CA----C--ACA--CGGA---T--A---C------------ACA-----A--ACAT-C-C----A------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-T---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAaa
gi|5933 : ACACA----TA----C--ACA--C--A---C--A---TG------GAC--ACA-----C--ACAT-C-C----A------C-A--------C------A--------G--------A--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAaaa
gi|5934 : acACACA----CA----TTTAGA--C--A---C--A---AG------G----ACA-----CTGACAG-C-C----GAATGGAC-G--------CATTATTG--------G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------C--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----aaa
gi|5935 : ACACA----CA----T--GCA--C------C--A---CA------G----ACAGCAAGT--ACAG-A-T----G------C-A--------C------T--------G--------C--------A--GC----G-A-T---TC--------C---A------C--A-T----CCC---T--C----T-AC-AAC--T-A---GATT-G--CG-----AG-GG---TAATaagattataa
gi|5936 : ACGCA----CA----C--ACA--T--A---C--A---CA------G----TCG-----C--AAAG-A-C----T------C-A--------C------A--------G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GAG-ATAAa
gi|5937 : ACAC------A----C--ACA--C--A---T--A---TG------GAC--ACA-----C--ACAT-C-C----A------C-A--------T------G--------G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--ATT----CCCT--T--C----C-GA-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5938 : ACACA----CA----C--ACA--C--A---C--A---CA------T----CCG-----C--ACGG-A-C----T------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GC----G-A-T---GCT-------T---A------T--A-T----CCCC--T--T----C-GC-AAC--T-T---G-TT-G--TG-----AG-GGcaa
gi|5939 : ACACA----CA----A--ACA--C--A---C--A---CA------T----TCG-----C--ATGG-A-C----T------C-A--------C------A--------G--------C--------A--GT----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---A-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|5940 : ACACA----CA----C--ACA--C--A---C--A---CA------C----ACA-----C--ACAG-T-C----G------C-A--------T------G--------G--------TCTCGCAGAA--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T----TCTT--T--C----T-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAAgaa
gi|5941 : ACACA----CA----CGTACA--C--A---C--A---CA------C----ACA-----C--ACAG-T-C----T------C-A--------T------GGACTC---G--------C--------A--GC----A-G-T---GC--------CG--A------T--A-T----TCCC--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAAgaa
gi|5942 : ACACA----CA----T--ACA--C--A---C--A---CA------C----ACA-----C--ACAG-T-C----A------C-AAGGACT--C------GTA------G--------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T-------T--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5943 : ACAAA----CA----C--ACA--C--A---A--A---CA------G----TCG-----C--ATGG-A-C----T------C-G--------C------A--------G--------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5944 : ACACA----CA----C--ACA--C--A---C--A---CA------C----ACA-----C--ATAG-T-C----G------C-ATGGACTCGC------A--------G--------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T----TCTC--T--CATGAC-AC-AAC--C-A---G-TT-G--TG-----AG-AGG-ATAAgaa
gi|5945 : ACA-A----CA----C--ACA--A--A---C--A---CA------G----CCG-----C--ATGG-A-C----T------C-G--------C------A--------G--------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5946 : ACACA----CATGGAC--ACA--C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--ATAT-C-C----G------C-A--------T------G--------G--------C--------A--GC----G-A-A---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---gaa
gi|5947 : ACAAA----CA----C--ACA--C--A---C--A---CG------G----TCT-----C--ATGG-A-C----T------C-G--------C------A--------G--------C--------A--GT----G-C-T---GA--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAA
gi|5948 : acacacaaACACA----CA----A--ACA--A--A---C--A---CA------C----ACA-----C--ACGG-T-C----T------C-A--------T------G--------GACTCG---C--------A--GC----A-G-T---GCGA------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----A--GAG-ATAAgaa
gi|5949 : CACC----CA----C--CCA--C--A---C--A---C------------ACA-----C--ACAG-C-C----G------C-A--------A------G--------A--------C--------A--GC----G-A-T---GTTATAACTGT---A------T--A-T----TCCC--T--C----C-GC-AGC--T-A---G-TT-G--AGAATTTAA-GGG-ATAAgaa
gi|5950 : accACACAGTGTCA----T--ACA--C--A---C--A---CA------G----CCA-----C--TCAG-A-C----G--------A--------T------GATTG----G--------C--------A--GG----G-A-T---GC--------T---AAT----T--A-T----CTCC--T--A----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAAT
gi|5951 : ACACA----GA----C--ACA--C--A---C--A---CA------T----ACA-----C--ACAG-T-C----T------C-A--------T------A--------GACCTGCATC--------A--GT----G-C-T---GA--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AA-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAAT
gi|5952 : ACACA----CA----C--ACC--C--A---T--A---CA------G----ACA-----C--ACA-------------------------------------------G--------C--------T--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCAA--T--C----C-----AC--T-A---G-TT-G--TG-----AA-GGG-ATGA
gi|5953 : ACATA----CA----C--ACA--C--A---C--A---CGACAACAG----TCA-----C--ACAT-CAC----G------C-A--------C------G--------G--------C--------AGCGC----G-ATT---GC--------T---A------TA-A-TTGTATCCC--T--C----C-GCAAAC--T-AAT-G-TTGG--CG-----AG-GGGAATAATaaa
gi|5954 : ACACA----CA----C--ACA--C--A---T--G---CA------G----ACA-----A--AAGA-A-C----A------C-A--------C------A--------A--------C--------A--GT----A-A-T---AC--------T---A------T--A-T----CCCA--T--------------C--T-A---G-TT-G--CG-----GG-GGG-ATAAaa
gi|5955 : ACACA----CA----A--ACA--C--A---C--A---CA------A----GCG-----T--ATGG-A-C----T------C-G--------C------A--------G--------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-TG---TCGC--T--C----CAAC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAcaa
gi|5956 : ACACA----C-----C--ACA--C--A---C--A---CA------G----TCT-----C--ATGG-A-C----T------C-G--------C------A--------G--------C--------A--GT----G-C-T---GA--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-A--AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAA
gi|5958 : ACACA----CA----C--ACA--C--A---C--A---CA------C----ACA-----C--ACAG-T-C----T------C-AT-------T------G--------GACTCA---C--------A--GT----A-G-T---GC--------T---G------T--A-TA---TTCT--T--C----C-AC-AAC--C-A---GTTT-G--CA-----AG-AGG-ATAAgaa
gi|5959 : ACAAA----CA----C--ACG--C--A---C--A---CC-----------ACA-----C--ACAG-T-C----T------C-A--------T------G--------GACTCG---C--------A--GC----A-G-T---GC--------TGATA------T--A-T----TCTC--T--C----CCAC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAgaa
gi|5960 : acACAGA----CA----C--AGA--C--A---C--A---CA------A----ACA-----C--ACAG-T-CTCTGA------C-A--------T------GGACTC---G--------C--------A--GC----A-G-T---GCTGA-----T---A------T--A-T----TCTC--T-------C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAA
gi|5967 : CACG----CA----C--GCG--C--G---C--G---CG------G----ACA-----C--ACAT-C-C----G------T-A--------C------G--------G--------A--------C--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCA--T--C----C-GC-AAC--T-T---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAATgaa
gi|5968 : CACA----CA----C--ACA--T--AA--C--A---CA-----------ACA-----C--AT-T-T-C----G------C-A--------T------GACTCATCAG--------C--------A--GT----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CTC---T--C----C-AC-AAC--T-A---A-TT-G--CG-----AGTGGG-ATAAaa
gi|5969 : CACA----CA----A--ATA--C--A---C--A---CA------G----TCA-----C--ATGG-A-C----T------C-A--------C------A--------G--------C--------A--GT----A-A-G---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--T----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--T-------G-GGG-ATAAgaa
gi|5970 : ACA----CA----C--ACA--C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--GCAT-C-C----G------C-A--------C------G--------G--------A--------C--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-C---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5971 : ACACA----CA----C--ATA--C--A---C--A---C------------ACA-----C--TCAG-C-C----A------C-A--------C------A--------A--------C--------A--AG----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-AC-AAT--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAA
gi|5972 : ACA----CA----CT-ACAT-C--A---C--A---CC-----------ACG-----C--ATGG-A-T----G------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---A-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAATcaa
gi|5973 : ACA----CA----C--ATG--C--A---C--A---CA------G----ACAGCAG-T--ACAG-A-T----G------C-A--------C------T--------G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------C---A------C--A-T----CCCC--T--C----T-AC-AAC--T-A---A-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAATaa
gi|5974 : ACG----CA----C--AGA--C--A---T--A---CG------G----ACA-----C--ACAG-C-C----G------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GC----A-A-T---GC--------T---A----------------------T--C----C-GC-AAC--T-A---A-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAATaa
gi|5975 : ACGCG----CA----C--ACG--C--A---C--A---C------------ACA-----C--ACAG-C-G----T------C-A--------C------G--------A--------C--------A--TC----G-A-T---GC--------T---G------T--A-T----GTCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CT-----AG-GAG-ATAAT
gi|5977 : ACACA----GA----C--ACA--CTAA---C--A---C------------ACA-----C--ACAG-T-G----G------C-A--------C------G-----------------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AGC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGA-ATAA
gi|5978 : ACA----CA----C--ACA--C--A---C--A---CA------G----TCA-----C--ATGG-A-C----T------T-G--------C------A--------G--------C--------A--GT----G-G-C---GC--------T---A------T--C-T----CCTC--T--C----T-AC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5979 : ACA----AA----C--AC---C--AGTCC--A---CG------T----ACG-----C--ACA----C----G------T----------C------A--------G--------C--------A--GC----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-AC-AAG--T-A---G-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAATgaa
gi|5981 : CA--C--A---C--A---C------------AAA-----C--ACAG-T-C----T------C-A--------T------G--------GACTCG---C--------A--GC----A-G-T---GC--------TGA-A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAAaa
gi|5982 : CA----TA----T--ACA--C--A---C--A---CA------G----TCG-----C--ATGG-A-C----T------C-A--------C------A--------G--------T--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-AC-AACTAT-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ACAAgaa
gi|5983 : CA----TA----C--ACA--A--A---C--A---CA------G----TCG-----C--ATGG-A-C----T------C-A--------C------A--------G--------C--------A--GT----T-A-T---GC--------C---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATgaa
gi|5984 : ACA----C--------ACA--C--A---C--A---CG------GAT--ACA-----C--ACAG-C-C----G------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GA----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|5985 : A----CA----C--ACA--C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--ACAT-C-C----G------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GC----G-ATT---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--TCCC----C-GC-AAC--G-C---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|5986 : A--C--A---C--A---CA------A----ACA-----C--ATAT--------A------C-A--------C------A--------G--------C--------C--GC----G-G-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CC-----AG-GGG-ATAAaa
gi|5987 : ----CA----C--ACA--C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--AGAATC-C----G------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GC----G-ATT---GC--------T---A------T--A-T-----CCC--T--C----C-GC-CCC--G-C---G-TT-G--CG-----AG-GGGAATAAT
gi|5988 : CA----GA----C--ACA--C--A---C--A---C------------ACA-----C--AAAG-C-T----G------C-A--------C------G--------A--------A--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----ATCCATT--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CC-----AG-GGG-ATAAa
gi|5989 : ACACA----AA----C--ATA--T--G---C--A---TG------G----ACT-----C--ACA-------------------------------------------G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------C--A-T----CCTC--T--C----T-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAaaa
gi|5992 : catCACA----AA----C--ACA--C--A---C--A---TT------G------------C--ATGA-C-T-----------C-A--------C------A--------G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--G-T----TCTT--T--C----C-AC-GAG--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5995 : catgA----C--ACA--C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--ACAT-C-C----G------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5996 : A----C--ACA--C--A---C--A---CG------G----ATG-----C--ACAT-C-C----G------C-A--------C------G--------G--------C--------A--AT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGaaa
gi|5997 : ACAT---CA----C--ACA--C--A------A---C------------ACA-----C--ACAT-C-C----G------C-A--------C------G--------G--------CTC------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------TC-A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--TAA---G-TT-
gi|5998 : A----C--AGA--C--A---C--A---CA------A----ACA-----C--ACAG-T-T----G------C-A--------T------GGACTC---G--------C--------A--GCAGCTG-C-T---GC--------T---A------T--ATT----CTCT--T--C----C-AC-AAC--C-AG--G-TT-G--CA-----AG-AGG-ATAA
gi|5999 : ----C--ACA--A--A---C--A---CA------G----TCA-----C--ATAG-A-C----T------C-A--------C------A--------G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-----AC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|6001 : --ACA--C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--ACAC-A-C----G------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAT--T-A---G-TT-G--CG-----A--TGG-ATAATgaa
gi|6002 : --ACA--C--A---C--A---CC------C----ATA-----T--ATAG-C-T----G------G-A--------C------G--------G--------C--------A--GC----A-A-T---GCCA------T---A------T--A-T----GCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----TG-AGA-ATAATaa
gi|6003 : ----C--AGA--C--A---T--A---C------------ACA-----C--ACAG-C-C----G------CTA--------T------G--------C--------T--------A---C------A-T---G---------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6004 : ----C--ACA--C--A---A--A---C------------ACA-----C--ACAT-C-C----G------C-A--------C------GTT------G--------C--------A--GC----G-A-TTTTGC--------T---A------T--A-T----CCCT--C--T----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----caa
gi|6005 : CA----CA----C--AAAGTC--G---C--A---TG------G----AC--------------T-C----G------C-A------------------------G--------C--------A--GT----G-C-T---GT--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6007 : A--C--A---CCAA---CC------G----ACA-----C--AC-----C----G------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GT----GGA-T---GC--------T---A------T--A-C----CCCC--T---------GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----A--GGG-ATAATgaa
gi|6008 : --ATA--C--A---C--A---C------------ACA-----C--ACAG-C-T----A------C-A--------C------G--------G--------A--------A--GT----G-A-T---GC--------A---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAATga
gi|6009 : A--C--A---C--A---CA------A----ACA-----C--ACAT-C-C----G------C-A--------A------G--------GA-------C--------A---C----G-A-T---GC--------T---ACATGTAT--A-T----CCCT--T--C----C-GC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6010 : A--C--A---C--A---CA------G----TCA-----C--ACGG-A-C----T------C-A--------C------A--------G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--GG-----AA-GGG-AAAAaaa
gi|6011 : A--C--A---C--A---TA------A----ACA-----C--AAAG-C-C----A------C-A--------C------A--------G--------C--------A--GC----A-A-TT--GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AA---T-AATTA-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|6012 : CA--G--A---C--A---C------------ACA-----C--ACAG-C-C----A------C-A--------T------G--------G--------G--------A--GT----G-A-TAT-GC--------T---T------T--A-T----CCCC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAATcaa
gi|6013 : CA--G--A---C--A---C------------ACA-----A--ACAG-C-C----A------C-A--------T------G--------G--------C--------T--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCT--T--C----C-TC-AAA--T-A---G-TT-G--CC-----AG-AGG-ATAAT
gi|6014 : --C--A---C--AAGCCG------G----ACA-----C--ACAT-C-C----G------C-A-----------------------------------------------------A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-C---A-TT-GGCCG-----AG-GGG-ATaa
gi|6015 : A--C--A---C--A---C------------ACA-----C--ACAT-C-C----G------C-A--------C------A--------G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAAT
gi|6016 : A--C--A---C--A---C------------ACA-----C--ACAT-C-C----G------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-T---GTTT-G--CG-----AG-GGG-ATAAga
gi|6017 : A--C--A---C--A---C------------ACA-----C--ACAG-C-T----G------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GC----G-A-T---GCGCTA----T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----AA-TGG-TTAATaaa
gi|6018 : A--C--A---C--A---C------------ACA-----C--ACAG-C-C----G------C-A--------C------A--------G--------A--------T--GC----A-G-T---GC--------T---A------T--A-T----TCCC--A--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGA-ATAAaa
gi|6019 : A--C--A---T--A---C------------ACA-----C--ACCG-C-C----G------C-A--------C------G--------G--------T-----------------G-A-T---GA--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-GAC--T-A---G-TT-G--CG-----AA-GGG-ATAATaaa
gi|6020 : --A---C--A---TG------G----AAA-----C--ACAG-C-T----GA-----C-A---------------G--------G--------C--------A--GC----A-C-T---GC--------T---A------T--A-T----CCC---T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATA
gi|6021 : --A---C--A---CA------A----ACA-----C--ACAG-A-C----T------C-A--------C------A--------G--------C--------A--TG----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--T----C--C--AC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAAtaa
gi|6023 : --A---C--A---C------------ACA-----C--ACAT-C-C----G------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---C-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|6024 : ----ACA-----C--ACAC-A-C----G------C-A--------C------G--------G--------A--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATA
gi|6025 : ac--A---CA------A----ACA-----C--ACAT-C-C----G------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-taa
gi|6026 : --A---C--A---C------------ACA-----C--ACAT-C-T----G------C-A--------C------G--------G--------A--------A--GC----G-A-T---GT--------A---A------T--A-T----TCCC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6027 : --A---C--A---C------------ATA-----C--ACAG-C-C----A------C-A--------C------G--------T--------C--------A--GT----G-A-T---TC--------T---A------T--A-C----CCCC--T--C----C-AT-AAC--T-A---G-TT-G--AG-----AG-GGG-ATAAaaa
gi|6028 : ---CG------G----ACA-----C--ACAT-C-C----G------C-A--------C------G--------G--------A--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--A-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAATaaa
gi|6029 : ---CG------G----ACA-----C--ACAG-C-C----A------C-A--------T------G--------G--------C--------A--GC----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----TCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAaa
gi|6030 : ---CG------G----ACA-----C--ACA----C----A------C-A--------A------A--------G--------A--------C--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AA-GGG-ATAAT
gi|6032 : ---CA------G----ACA-----C--ACAG-C-C----A------C-A--------T------A--------G--------C--------A--AC----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T-----CCC--T--C----T-GC-ATC--T-A---G-TA-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6033 : ----ACA-----C--ATAG-C-C----C------C-A--------T------G--------G--------A--------C--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--T-T----CCCC--A--T----A-GT-AAC--T-A---T-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAaaa
gi|6037 : caa----ATA-----C--ACAG-C-C----G------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GT----G-A-T---AC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--C-A---G-TT-G--CT-----AG-GGG-ATAATcaa
gi|6039 : agac------G----ACA-----C--ACA----C----A------C-A--------C------A--------G--------C--------A--GC----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----TCCC--T--C----T-GC-AAC--T-T---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAAaa
gi|6041 : ----ACA-----C--ACAT-C-C----G------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-CT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6042 : ----ACA-----C--ACAG-C-T----G------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GG----G-G-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-AC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAATaaa
gi|6043 : ----ACA-----C--ACAG-C-C----A------C-A--------T------G--------G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------TAAA-T----CC-------------------C--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAATaa
gi|6044 : ----ACA-----T--ACA----C----A------C-A--------C------A--------G--------C--------A--GC----A-A-T---TT--------T---A------T--A-TAT--CCAC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ACAATaa
gi|6046 : CA-----T--ACA----C----A------C-A--------C------A--------G--------C--------G--GC----G-A-T---GC--------C---A------A--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TTGG--CG-----AA-GGG-GTAAT
gi|6047 : --ACAT-C-A----A------C-A--------C------A--------G--------C--------C--GC----G-A-T---AT--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TC-G--CG-----AG-GGG-ATAaa
gi|6049 : -C-C----G------C-A--------C------G--------G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC-----A----C-GC-AAC--T-C---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|6052 : ------C-A--------C------A--------G--------C--------A--GC----A-T-T---TC--------T---A------T--A-T----CCTT--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAA
gi|6053 : ------G--------G--------C--------A--GC----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCT--T--C----TGGC-AAC--G-G---G-TT-G--CGA----AG-GGG-ATAATaaa
gi|6054 : --------A--GC----G-A-T---GC--------T---T------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-T---G-TT-G--CA-----AC-GGG-ATAATa
Alignments
lowQualScore : 111111111111
lowQualScore : 2222 1111 22 0 11 111 00 000 888888888888 11111 00 11111 22222 44444444444 0 33333333 111111 55555 55555555 22222222 00 0000 0 1 111 44444444 111 111111 11 0 2222 00 00 0000 1 0 00 0 111 1 0 00 11111 0 0
lowQualScore : .... .... .. . .. ... .. ... ............ ..... .. ..... ..... ........... . ........ ...... ..... ........ ........ .. .... . . ... ........ ... ...... .. . .... .. .. .... . . .. . ... . . .. ..... . .
lowQualScore : 4444 4444 44 5 33 333 77 888 000000000000 99999 66 00000 11111 22222222222 4 55555555 222222 00000 99999999 00000000 66 9999 4 2 777 55555555 777 777777 33 8 2222 66 66 8888 2 4 55 4 666 2 8 66 44444 4 9
consensus : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
Reference ( family-218 ) : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|5929 : ACACA----TA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-T-C-T----G------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|5930 : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-----C----A------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AT-GGG-ATAAT
gi|5931 : ACACA----AA----C--ACA-C--A---C--A---CG------GACACACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-G-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-T---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|5932 : ACACA----CA----C--ACA-CGGA---T--A---C------------ACA-----A--A-----CA-T-C-C----A------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-T---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAaa
gi|5933 : ACACA----TA----C--ACA-C--A---C--A---TG------GAC--ACA-----C--A-----CA-T-C-C----A------C-A--------C------A-----G--------A--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAaaa
gi|5934 : acACACA----CA----TTTAGA-C--A---C--A---AG------G----ACA-----CTGA-----CA-G-C-C----GAATGGAC-G--------CATTATTG-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------C--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----aaa
gi|5935 : ACACA----CA----T--GCA-C------C--A---CA------G----ACAGCAAGT--A-----CA-G-A-T----G------C-A--------C------T-----G--------C--------A--GC----G-A-T---TC--------C---A------C--A-T----CCC---T--C----T-AC-AAC--T-A---GATT-G--CG-----AG-GG---TAATaagattataa
gi|5936 : ACGCA----CA----C--ACA-T--A---C--A---CA------G----TCG-----C--A-----AA-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GAG-ATAAa
gi|5937 : ACAC------A----C--ACA-C--A---T--A---TG------GAC--ACA-----C--A-----CA-T-C-C----A------C-A--------T------G-----G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--ATT----CCCT--T--C----C-GA-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5938 : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CA------T----CCG-----C--A-----CG-G-A-C----T------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GCT-------T---A------T--A-T----CCCC--T--T----C-GC-AAC--T-T---G-TT-G--TG-----AG-GGcaa
gi|5939 : ACACA----CA----A--ACA-C--A---C--A---CA------T----TCG-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---A-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|5940 : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CA------C----ACA-----C--A-----CA-G-T-C----G------C-A--------T------G-----G--------TCTCGCAGAA--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T----TCTT--T--C----T-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAAgaa
gi|5941 : ACACA----CA----CGTACA-C--A---C--A---CA------C----ACA-----C--A-----CA-G-T-C----T------C-A--------T------GGACTCG--------C--------A--GC----A-G-T---GC--------CG--A------T--A-T----TCCC--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAAgaa
gi|5942 : ACACA----CA----T--ACA-C--A---C--A---CA------C----ACA-----C--A-----CA-G-T-C----A------C-AAGGACT--C------GTA---G--------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T-------T--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5943 : ACAAA----CA----C--ACA-C--A---A--A---CA------G----TCG-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-G--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5944 : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CA------C----ACA-----C--A-----TA-G-T-C----G------C-ATGGACTCGC------A-----G--------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T----TCTC--T--CATGAC-AC-AAC--C-A---G-TT-G--TG-----AG-AGG-ATAAgaa
gi|5945 : ACA-A----CA----C--ACA-A--A---C--A---CA------G----CCG-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-G--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5946 : ACACA----CATGGAC--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----TA-T-C-C----G------C-A--------T------G-----G--------C--------A--GC----G-A-A---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---gaa
gi|5947 : ACAAA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----TCT-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-G--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-C-T---GA--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAA
gi|5948 : acacacaaACACA----CA----A--ACA-A--A---C--A---CA------C----ACA-----C--A-----CG-G-T-C----T------C-A--------T------G-----GACTCG---C--------A--GC----A-G-T---GCGA------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----A--GAG-ATAAgaa
gi|5949 : CACC----CA----C--CCA-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------A------G-----A--------C--------A--GC----G-A-T---GTTATAACTGT---A------T--A-T----TCCC--T--C----C-GC-AGC--T-A---G-TT-G--AGAATTTAA-GGG-ATAAgaa
gi|5950 : accACACAGTGTCA----T--ACA-C--A---C--A---CA------G----CCA-----C--T-----CA-G-A-C----G--------A--------T------GATTG-G--------C--------A--GG----G-A-T---GC--------T---AAT----T--A-T----CTCC--T--A----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAAT
gi|5951 : ACACA----GA----C--ACA-C--A---C--A---CA------T----ACA-----C--A-----CA-G-T-C----T------C-A--------T------A-----GACCTGCATC--------A--GT----G-C-T---GA--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AA-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAAT
gi|5952 : ACACA----CA----C--ACC-C--A---T--A---CA------G----ACA-----C--A-----CA-G-C-T--------------------------------------------------------GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCAA--T--C----C-----AC--T-A---G-TT-G--TG-----AA-GGG-ATGA
gi|5953 : ACATA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CGACAACAG----TCA-----C--A-----CA-T-CAC----G------C-A--------C------G-----G--------C--------AGCGC----G-ATT---GC--------T---A------TA-A-TTGTATCCC--T--C----C-GCAAAC--T-AAT-G-TTGG--CG-----AG-GGGAATAATaaa
gi|5954 : ACACA----CA----C--ACA-C--A---T--G---CA------G----ACA-----A--A-----AG-A-A-C----A------C-A--------C------A-----A--------C--------A--GT----A-A-T---AC--------T---A------T--A-T----CCCA--T--------------C--T-A---G-TT-G--CG-----GG-GGG-ATAAaa
gi|5955 : ACACA----CA----A--ACA-C--A---C--A---CA------A----GCG-----T--A-----TG-G-A-C----T------C-G--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-TG---TCGC--T--C----CAAC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAcaa
gi|5956 : ACACA----C-----C--ACA-C--A---C--A---CA------G----TCT-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-G--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-C-T---GA--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-A--AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAA
gi|5958 : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CA------C----ACA-----C--A-----CA-G-T-C----T------C-AT-------T------G-----GACTCA---C--------A--GT----A-G-T---GC--------T---G------T--A-TA---TTCT--T--C----C-AC-AAC--C-A---GTTT-G--CA-----AG-AGG-ATAAgaa
gi|5959 : ACAAA----CA----C--ACG-C--A---C--A---CC-----------ACA-----C--A-----CA-G-T-C----T------C-A--------T------G-----GACTCG---C--------A--GC----A-G-T---GC--------TGATA------T--A-T----TCTC--T--C----CCAC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAgaa
gi|5960 : acACAGA----CA----C--AGA-C--A---C--A---CA------A----ACA-----C--A-----CA-G-T-CTCTGA------C-A--------T------GGACTCG--------C--------A--GC----A-G-T---GCTGA-----T---A------T--A-T----TCTC--T-------C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAA
gi|5967 : CACG----CA----C--GCG-C--G---C--G---CG------G----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------T-A--------C------G-----G--------A--------C--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCA--T--C----C-GC-AAC--T-T---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAATgaa
gi|5968 : CACA----CA----C--ACA-T--AA--C--A---CA-----------ACA-----C--ATTTCGCATG-A-C----T------C-AT-------C------A-----G--------C--------A--GT----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CTC---T--C----C-AC-AAC--T-A---A-TT-G--CG-----AGTGGG-ATAAaa
gi|5969 : CACA----CA----A--ATA-C--A---C--A---CA------G----TCA-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----A-A-G---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--T----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--T-------G-GGG-ATAAgaa
gi|5970 : ACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--G-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------A--------C--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-C---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5971 : ACACA----CA----C--ATA-C--A---C--A---C------------ACA-----C--T-----CA-G-C-C----A------C-A--------C------A-----A--------C--------A--AG----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-AC-AAT--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAA
gi|5972 : ACA----CA----CT-ACATC--A---C--A---CC-----------ACG-----C--A-----TG-G-A-T----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---A-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAATcaa
gi|5973 : ACA----CA----C--ATG-C--A---C--A---CA------G----ACAGCAG-T--A-----CA-G-A-T----G------C-A--------C------T-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------C---A------C--A-T----CCCC--T--C----T-AC-AAC--T-A---A-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAATaa
gi|5974 : ACG----CA----C--AGA-C--A---T--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----A-A-T---GC--------T---A----------------------T--C----C-GC-AAC--T-A---A-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAATaa
gi|5975 : ACGCG----CA----C--ACG-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-C-G----T------C-A--------C------G-----A--------C--------A--TC----G-A-T---GC--------T---G------T--A-T----GTCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CT-----AG-GAG-ATAAT
gi|5977 : ACACA----GA----C--ACA-CTAA---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-T-G----G------C-A--------C------G--------------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AGC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGA-ATAA
gi|5978 : ACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CA------G----TCA-----C--A-----TG-G-A-C----T------T-G--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-G-C---GC--------T---A------T--C-T----CCTC--T--C----T-AC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5979 : ACA----AA----C--AC--C--AGTCC--A---CG------T----ACG-----C--A-----CA-----C----G------T----------C------A-----G--------C--------A--GC----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-AC-AAG--T-A---G-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAATgaa
gi|5981 : CA-C--A---C--A---C------------AAA-----C--A-----CA-G-T-C----T------C-A--------T------G-----GACTCG---C--------A--GC----A-G-T---GC--------TGA-A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAAaa
gi|5982 : CA----TA----T--ACA-C--A---C--A---CA------G----TCG-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------T--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-AC-AACTAT-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ACAAgaa
gi|5983 : CA----TA----C--ACA-A--A---C--A---CA------G----TCG-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----T-A-T---GC--------C---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATgaa
gi|5984 : ACA----C--------ACA-C--A---C--A---CG------GAT--ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GA----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|5985 : A----CA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-ATT---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--TCCC----C-GC-AAC--G-C---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|5986 : A----CA----C--ACA-A--A---C--A---CA------T----ATA-----C--A-----CA-G-C-C--------------------------------------------------------GC----G-G-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CC-----AG-GGG-ATAAaa
gi|5987 : ----CA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----GA-ATC-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-ATT---GC--------T---A------T--A-T-----CCC--T--C----C-GC-CCC--G-C---G-TT-G--CG-----AG-GGGAATAAT
gi|5988 : CA----GA----C--ACA-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----AA-G-C-T----G------C-A--------C------G-----A--------A--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----ATCCATT--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CC-----AG-GGG-ATAAa
gi|5989 : ACACA----AA----C--ATA-T--G---C--A---TG------G----ACT-----C--A-----CA-G-C-------------------------------------------------------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------C--A-T----CCTC--T--C----T-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAaaa
gi|5992 : catCACA----AA----C--ACA-C--A---C--A---TT------G------------C--A-----TG-A-C-T-----------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--G-T----TCTT--T--C----C-AC-GAG--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5995 : catgA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5996 : A----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ATG-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--AT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGaaa
gi|5997 : ACAT---CA----C--ACA-C--A------A---C------------ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------CTC------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------TC-A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--TAA---G-TT-
gi|5998 : A----C--AGA-C--A---C--A---CA------A----ACA-----C--A-----CA-G-T-T----G------C-A--------T------GGACTCG--------C--------A--GCAGCTG-C-T---GC--------T---A------T--ATT----CTCT--T--C----C-AC-AAC--C-AG--G-TT-G--CA-----AG-AGG-ATAA
gi|5999 : ----C--ACA-A--A---C--A---CA------G----TCA-----C--A-----TA-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-----AC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|6001 : --ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-C-A-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAT--T-A---G-TT-G--CG-----A--TGG-ATAATgaa
gi|6002 : --ACA-C--A---C--A---CC------C----ATA-----T--A-----TA-G-C-T----G------G-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----A-A-T---GCCA------T---A------T--A-T----GCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----TG-AGA-ATAATaa
gi|6003 : ----C--AGA-C--A---T--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------CTA--------T------G-----C--------T--------A---C------A-T---G---------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6004 : ----C--ACA-C--A---A--A---C------------ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------GTT---G--------C--------A--GC----G-A-TTTTGC--------T---A------T--A-T----CCCT--C--T----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----caa
gi|6005 : CA-C--A---C--A---AA------G----TCG-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-G--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-C-T---GT--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6007 : A-C--A---CCAA---CC------G----ACA-----C--A-----C------C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GT----GGA-T---GC--------T---A------T--A-C----CCCC--T---------GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----A--GGG-ATAATgaa
gi|6008 : --ATA-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-C-T----A------C-A--------C------G-----G--------A--------A--GT----G-A-T---GC--------A---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAATga
gi|6009 : A-C--A---C--A---CA------A----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------A------G-----GA-------C--------A---C----G-A-T---GC--------T---ACATGTAT--A-T----CCCT--T--C----C-GC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6010 : A-C--A---C--A---CA------G----TCA-----C--A-----CG-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--GG-----AA-GGG-AAAAaaa
gi|6011 : A-C--A---C--A---TA------A----ACA-----C--A-----AA-G-C-C----A------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GC----A-A-TT--GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AA---T-AATTA-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|6012 : CA-G--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-C-C----A------C-A--------T------G-----G--------G--------A--GT----G-A-TAT-GC--------T---T------T--A-T----CCCC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAATcaa
gi|6013 : CA-G--A---C--A---C------------ACA-----A--A-----CA-G-C-C----A------C-A--------T------G-----G--------C--------T--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCT--T--C----C-TC-AAA--T-A---G-TT-G--CC-----AG-AGG-ATAAT
gi|6014 : -C--A---C--AAGCCG------G----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------------------------------------------------A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-C---A-TT-GGCCG-----AG-GGG-ATaa
gi|6015 : A-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAAT
gi|6016 : A-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-T---GTTT-G--CG-----AG-GGG-ATAAga
gi|6017 : A-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-C-T----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GCGCTA----T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----AA-TGG-TTAATaaa
gi|6018 : A-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------C------A-----G--------A--------T--GC----A-G-T---GC--------T---A------T--A-T----TCCC--A--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGA-ATAAaa
gi|6019 : A-C--A---T--A---C------------ACA-----C--A-----CC-G-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------T-----------------G-A-T---GA--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-GAC--T-A---G-TT-G--CG-----AA-GGG-ATAATaaa
gi|6020 : --A---C--A---TG------G----AAA-----C--A-----CA-G-C-T----GA-----C-A---------------G-----G--------C--------A--GC----A-C-T---GC--------T---A------T--A-T----CCC---T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATA
gi|6021 : --A---C--A---CA------A----ACA-----C--A-----CA-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------C--------A--TG----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--T----C--C--AC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAAtaa
gi|6023 : --A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---C-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|6024 : --A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-----C----G------C-A--------C------G-----G--------A--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATA
gi|6025 : --A---CA------A----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-taa
gi|6026 : --A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-T-C-T----G------C-A--------C------G-----G--------A--------A--GC----G-A-T---GT--------A---A------T--A-T----TCCC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6027 : --A---C--A---C------------ATA-----C--A-----CA-G-C-C----A------C-A--------C------G-----T--------C--------A--GT----G-A-T---TC--------T---A------T--A-C----CCCC--T--C----C-AT-AAC--T-A---G-TT-G--AG-----AG-GGG-ATAAaaa
gi|6028 : ---CG------G----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------A--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--A-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAATaaa
gi|6029 : ---CG------G----ACA-----C--A-----CA-G-C-C----A------C-A--------T------G-----G--------C--------A--GC----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----TCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAaa
gi|6030 : ---CG------G----ACA-----C--A-----CA-----C----A------C-A--------A------A-----G--------A--------C--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AA-GGG-ATAAT
gi|6032 : ---CA------G----ACA-----C--A-----CA-G-C-C----A------C-A--------T------A-----G--------C--------A--AC----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T-----CCC--T--C----T-GC-ATC--T-A---G-TA-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6033 : ----ACA-----C--A-----TA-G-C-C----C------C-A--------T------G-----G--------A--------C--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--T-T----CCCC--A--T----A-GT-AAC--T-A---T-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAaaa
gi|6037 : caa----ATA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GT----G-A-T---AC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--C-A---G-TT-G--CT-----AG-GGG-ATAATcaa
gi|6039 : agac------G----ACA-----C--A-----CA-----C----A------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GC----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----TCCC--T--C----T-GC-AAC--T-T---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAAaa
gi|6041 : ----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-CT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6042 : ----ACA-----C--A-----CA-G-C-T----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GG----G-G-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-AC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAATaaa
gi|6043 : ----ACA-----C--A-----CA-G-C-C----A------C-A--------T------G-----G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------TAAA-T----CC-------------------C--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAATaa
gi|6044 : ----ACA-----T--A-----CA-----C----A------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GC----A-A-T---TT--------T---A------T--A-TAT--CCAC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ACAATaa
gi|6046 : CA-----T--A-----CA-----C----A------C-A--------C------A-----G--------C--------G--GC----G-A-T---GC--------C---A------A--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TTGG--CG-----AA-GGG-GTAAT
gi|6047 : --A-----CA-T-C-A----A------C-A--------C------A-----G--------C--------C--GC----G-A-T---AT--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TC-G--CG-----AG-GGG-ATAaa
gi|6049 : -C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC-----A----C-GC-AAC--T-C---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|6052 : ------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GC----A-T-T---TC--------T---A------T--A-T----CCTT--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAA
gi|6053 : ------G-----G--------C--------A--GC----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCT--T--C----TGGC-AAC--G-G---G-TT-G--CGA----AG-GGG-ATAATaaa
gi|6054 : --------A--GC----G-A-T---GC--------T---T------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-T---G-TT-G--CA-----AC-GGG-ATAATa
Alignments
lowQualScore : 111111111111
lowQualScore : 2222 1111 22 0 11 111 00 000 888888888888 11111 00 11111 22222 44444444444 0 33333333 111111 55555 55555555 22222222 00 0000 0 1 111 44444444 111 111111 11 0 2222 00 00 0000 1 0 00 0 111 1 0 00 11111 0 0
lowQualScore : .... .... .. . .. ... .. ... ............ ..... .. ..... ..... ........... . ........ ...... ..... ........ ........ .. .... . . ... ........ ... ...... .. . .... .. .. .... . . .. . ... . . .. ..... . .
lowQualScore : 4444 4444 44 5 33 333 77 888 000000000000 99999 66 00000 11111 22222222222 4 55555555 222222 00000 99999999 00000000 66 9999 4 2 777 55555555 777 777777 33 8 2222 66 66 8888 2 4 55 4 666 2 8 66 44444 4 9
consensus : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
Reference ( family-218 ) : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|5929 : ACACA----TA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-T-C-T----G------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|5930 : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-----C----A------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AT-GGG-ATAAT
gi|5931 : ACACA----AA----C--ACA-C--A---C--A---CG------GACACACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-G-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-T---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|5932 : ACACA----CA----C--ACA-CGGA---T--A---C------------ACA-----A--A-----CA-T-C-C----A------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-T---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAaa
gi|5933 : ACACA----TA----C--ACA-C--A---C--A---TG------GAC--ACA-----C--A-----CA-T-C-C----A------C-A--------C------A-----G--------A--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAaaa
gi|5934 : acACACA----CA----TTTAGA-C--A---C--A---AG------G----ACA-----CTGA-----CA-G-C-C----GAATGGAC-G--------CATTATTG-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------C--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----aaa
gi|5935 : ACACA----CA----T--GCA-C------C--A---CA------G----ACAGCAAGT--A-----CA-G-A-T----G------C-A--------C------T-----G--------C--------A--GC----G-A-T---TC--------C---A------C--A-T----CCC---T--C----T-AC-AAC--T-A---GATT-G--CG-----AG-GG---TAATaagattataa
gi|5936 : ACGCA----CA----C--ACA-T--A---C--A---CA------G----TCG-----C--A-----AA-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GAG-ATAAa
gi|5937 : ACAC------A----C--ACA-C--A---T--A---TG------GAC--ACA-----C--A-----CA-T-C-C----A------C-A--------T------G-----G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--ATT----CCCT--T--C----C-GA-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5938 : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CA------T----CCG-----C--A-----CG-G-A-C----T------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GCT-------T---A------T--A-T----CCCC--T--T----C-GC-AAC--T-T---G-TT-G--TG-----AG-GGcaa
gi|5939 : ACACA----CA----A--ACA-C--A---C--A---CA------T----TCG-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---A-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|5940 : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CA------C----ACA-----C--A-----CA-G-T-C----G------C-A--------T------G-----G--------TCTCGCAGAA--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T----TCTT--T--C----T-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAAgaa
gi|5941 : ACACA----CA----CGTACA-C--A---C--A---CA------C----ACA-----C--A-----CA-G-T-C----T------C-A--------T------GGACTCG--------C--------A--GC----A-G-T---GC--------CG--A------T--A-T----TCCC--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAAgaa
gi|5942 : ACACA----CA----T--ACA-C--A---C--A---CA------C----ACA-----C--A-----CA-G-T-C----A------C-AAGGACT--C------GTA---G--------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T-------T--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5943 : ACAAA----CA----C--ACA-C--A---A--A---CA------G----TCG-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-G--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5944 : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CA------C----ACA-----C--A-----TA-G-T-C----G------C-ATGGACTCGC------A-----G--------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T----TCTC--T--CATGAC-AC-AAC--C-A---G-TT-G--TG-----AG-AGG-ATAAgaa
gi|5945 : ACA-A----CA----C--ACA-A--A---C--A---CA------G----CCG-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-G--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5946 : ACACA----CATGGAC--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----TA-T-C-C----G------C-A--------T------G-----G--------C--------A--GC----G-A-A---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---gaa
gi|5947 : ACAAA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----TCT-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-G--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-C-T---GA--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAA
gi|5948 : acacacaaACACA----CA----A--ACA-A--A---C--A---CA------C----ACA-----C--A-----CG-G-T-C----T------C-A--------T------G-----GACTCG---C--------A--GC----A-G-T---GCGA------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----A--GAG-ATAAgaa
gi|5949 : CACC----CA----C--CCA-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------A------G-----A--------C--------A--GC----G-A-T---GTTATAACTGT---A------T--A-T----TCCC--T--C----C-GC-AGC--T-A---G-TT-G--AGAATTTAA-GGG-ATAAgaa
gi|5950 : accACACAGTGTCA----T--ACA-C--A---C--A---CA------G----CCA-----C--T-----CA-G-A-C----G--------A--------T------GATTG-G--------C--------A--GG----G-A-T---GC--------T---AAT----T--A-T----CTCC--T--A----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAAT
gi|5951 : ACACA----GA----C--ACA-C--A---C--A---CA------T----ACA-----C--A-----CA-G-T-C----T------C-A--------T------A-----GACCTGCATC--------A--GT----G-C-T---GA--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AA-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAAT
gi|5952 : ACACA----CA----C--ACC-C--A---T--A---CA------G----ACA-----C--A-----CA-G-C-T--------------------------------------------------------GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCAA--T--C----C-----AC--T-A---G-TT-G--TG-----AA-GGG-ATGA
gi|5953 : ACATA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CGACAACAG----TCA-----C--A-----CA-T-CAC----G------C-A--------C------G-----G--------C--------AGCGC----G-ATT---GC--------T---A------TA-A-TTGTATCCC--T--C----C-GCAAAC--T-AAT-G-TTGG--CG-----AG-GGGAATAATaaa
gi|5954 : ACACA----CA----C--ACA-C--A---T--G---CA------G----ACA-----A--A-----AG-A-A-C----A------C-A--------C------A-----A--------C--------A--GT----A-A-T---AC--------T---A------T--A-T----CCCA--T--------------C--T-A---G-TT-G--CG-----GG-GGG-ATAAaa
gi|5955 : ACACA----CA----A--ACA-C--A---C--A---CA------A----GCG-----T--A-----TG-G-A-C----T------C-G--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-TG---TCGC--T--C----CAAC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAcaa
gi|5956 : ACACA----C-----C--ACA-C--A---C--A---CA------G----TCT-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-G--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-C-T---GA--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-A--AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAA
gi|5958 : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CA------C----ACA-----C--A-----CA-G-T-C----T------C-AT-------T------G-----GACTCA---C--------A--GT----A-G-T---GC--------T---G------T--A-TA---TTCT--T--C----C-AC-AAC--C-A---GTTT-G--CA-----AG-AGG-ATAAgaa
gi|5959 : ACAAA----CA----C--ACG-C--A---C--A---CC-----------ACA-----C--A-----CA-G-T-C----T------C-A--------T------G-----GACTCG---C--------A--GC----A-G-T---GC--------TGATA------T--A-T----TCTC--T--C----CCAC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAgaa
gi|5960 : acACAGA----CA----C--AGA-C--A---C--A---CA------A----ACA-----C--A-----CA-G-T-CTCTGA------C-A--------T------GGACTCG--------C--------A--GC----A-G-T---GCTGA-----T---A------T--A-T----TCTC--T-------C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAA
gi|5967 : CACG----CA----C--GCG-C--G---C--G---CG------G----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------T-A--------C------G-----G--------A--------C--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCA--T--C----C-GC-AAC--T-T---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAATgaa
gi|5968 : CACA----CA----C--ACA-T--AA--C--A---CA-----------ACA-----C--ATTTCGCATG-A-C----T------C-AT-------C------A-----G--------C--------A--GT----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CTC---T--C----C-AC-AAC--T-A---A-TT-G--CG-----AGTGGG-ATAAaa
gi|5969 : CACA----CA----A--ATA-C--A---C--A---CA------G----TCA-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----A-A-G---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--T----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--T-------G-GGG-ATAAgaa
gi|5970 : ACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--G-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------A--------C--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-C---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5971 : ACACA----CA----C--ATA-C--A---C--A---C------------ACA-----C--T-----CA-G-C-C----A------C-A--------C------A-----A--------C--------A--AG----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-AC-AAT--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAA
gi|5972 : ACA----CA----CT-ACATC--A---C--A---CC-----------ACG-----C--A-----TG-G-A-T----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---A-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAATcaa
gi|5973 : ACA----CA----C--ATG-C--A---C--A---CA------G----ACAGCAG-T--A-----CA-G-A-T----G------C-A--------C------T-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------C---A------C--A-T----CCCC--T--C----T-AC-AAC--T-A---A-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAATaa
gi|5974 : ACG----CA----C--AGA-C--A---T--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----A-A-T---GC--------T---A----------------------T--C----C-GC-AAC--T-A---A-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAATaa
gi|5975 : ACGCG----CA----C--ACG-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-C-G----T------C-A--------C------G-----A--------C--------A--TC----G-A-T---GC--------T---G------T--A-T----GTCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CT-----AG-GAG-ATAAT
gi|5977 : ACACA----GA----C--ACA-CTAA---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-T-G----G------C-A--------C------G--------------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AGC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGA-ATAA
gi|5978 : ACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CA------G----TCA-----C--A-----TG-G-A-C----T------T-G--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-G-C---GC--------T---A------T--C-T----CCTC--T--C----T-AC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5979 : ACA----AA----C--AC--C--AGTCC--A---CG------T----ACG-----C--A-----CA-----C----G------T----------C------A-----G--------C--------A--GC----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-AC-AAG--T-A---G-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAATgaa
gi|5981 : CA-C--A---C--A---C------------AAA-----C--A-----CA-G-T-C----T------C-A--------T------G-----GACTCG---C--------A--GC----A-G-T---GC--------TGA-A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAAaa
gi|5982 : CA----TA----T--ACA-C--A---C--A---CA------G----TCG-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------T--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-AC-AACTAT-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ACAAgaa
gi|5983 : CA----TA----C--ACA-A--A---C--A---CA------G----TCG-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----T-A-T---GC--------C---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATgaa
gi|5984 : ACA----C--------ACA-C--A---C--A---CG------GAT--ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GA----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|5985 : A----CA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-ATT---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--TCCC----C-GC-AAC--G-C---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|5986 : A----CA----C--ACA-A--A---C--A---CA------T----ATA-----C--A-----CA-G-C-C--------------------------------------------------------GC----G-G-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CC-----AG-GGG-ATAAaa
gi|5987 : ----CA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----GA-ATC-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-ATT---GC--------T---A------T--A-T-----CCC--T--C----C-GC-CCC--G-C---G-TT-G--CG-----AG-GGGAATAAT
gi|5988 : CA----GA----C--ACA-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----AA-G-C-T----G------C-A--------C------G-----A--------A--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----ATCCATT--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CC-----AG-GGG-ATAAa
gi|5989 : ACACA----AA----C--ATA-T--G---C--A---TG------G----ACT-----C--A-----CA-G-C-------------------------------------------------------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------C--A-T----CCTC--T--C----T-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAaaa
gi|5992 : catCACA----AA----C--ACA-C--A---C--A---TT------G------------C--A-----TG-A-C-T-----------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--G-T----TCTT--T--C----C-AC-GAG--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5995 : catgA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5996 : A----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ATG-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--AT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGaaa
gi|5997 : ACAT---CA----C--ACA-C--A------A---C------------ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------CTC------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------TC-A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--TAA---G-TT-
gi|5998 : A----C--AGA-C--A---C--A---CA------A----ACA-----C--A-----CA-G-T-T----G------C-A--------T------GGACTCG--------C--------A--GCAGCTG-C-T---GC--------T---A------T--ATT----CTCT--T--C----C-AC-AAC--C-AG--G-TT-G--CA-----AG-AGG-ATAA
gi|5999 : ----C--ACA-A--A---C--A---CA------G----TCA-----C--A-----TA-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-----AC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|6001 : --ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-C-A-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAT--T-A---G-TT-G--CG-----A--TGG-ATAATgaa
gi|6002 : --ACA-C--A---C--A---CC------C----ATA-----T--A-----TA-G-C-T----G------G-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----A-A-T---GCCA------T---A------T--A-T----GCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----TG-AGA-ATAATaa
gi|6003 : ----C--AGA-C--A---T--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------CTA--------T------G-----C--------T--------A---C------A-T---G---------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6004 : ----C--ACA-C--A---A--A---C------------ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------GTT---G--------C--------A--GC----G-A-TTTTGC--------T---A------T--A-T----CCCT--C--T----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----caa
gi|6005 : CA-C--A---C--A---AA------G----TCG-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-G--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-C-T---GT--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6007 : A-C--A---CCAA---CC------G----ACA-----C--A-----C------C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GT----GGA-T---GC--------T---A------T--A-C----CCCC--T---------GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----A--GGG-ATAATgaa
gi|6008 : --ATA-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-C-T----A------C-A--------C------G-----G--------A--------A--GT----G-A-T---GC--------A---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAATga
gi|6009 : A-C--A---C--A---CA------A----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------A------G-----GA-------C--------A---C----G-A-T---GC--------T---ACATGTAT--A-T----CCCT--T--C----C-GC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6010 : A-C--A---C--A---CA------G----TCA-----C--A-----CG-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--GG-----AA-GGG-AAAAaaa
gi|6011 : A-C--A---C--A---TA------A----ACA-----C--A-----AA-G-C-C----A------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GC----A-A-TT--GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AA---T-AATTA-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|6012 : CA-G--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-C-C----A------C-A--------T------G-----G--------G--------A--GT----G-A-TAT-GC--------T---T------T--A-T----CCCC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAATcaa
gi|6013 : CA-G--A---C--A---C------------ACA-----A--A-----CA-G-C-C----A------C-A--------T------G-----G--------C--------T--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCT--T--C----C-TC-AAA--T-A---G-TT-G--CC-----AG-AGG-ATAAT
gi|6014 : -C--A---C--AAGCCG------G----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------------------------------------------------A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-C---A-TT-GGCCG-----AG-GGG-ATaa
gi|6015 : A-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAAT
gi|6016 : A-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-T---GTTT-G--CG-----AG-GGG-ATAAga
gi|6017 : A-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-C-T----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GCGCTA----T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----AA-TGG-TTAATaaa
gi|6018 : A-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------C------A-----G--------A--------T--GC----A-G-T---GC--------T---A------T--A-T----TCCC--A--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGA-ATAAaa
gi|6019 : A-C--A---T--A---C------------ACA-----C--A-----CC-G-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------T-----------------G-A-T---GA--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-GAC--T-A---G-TT-G--CG-----AA-GGG-ATAATaaa
gi|6020 : --A---C--A---TG------G----AAA-----C--A-----CA-G-C-T----GA-----C-A---------------G-----G--------C--------A--GC----A-C-T---GC--------T---A------T--A-T----CCC---T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATA
gi|6021 : --A---C--A---CA------A----ACA-----C--A-----CA-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------C--------A--TG----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--T----C--C--AC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAAtaa
gi|6023 : --A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---C-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|6024 : --A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-----C----G------C-A--------C------G-----G--------A--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATA
gi|6025 : --A---CA------A----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-taa
gi|6026 : --A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-T-C-T----G------C-A--------C------G-----G--------A--------A--GC----G-A-T---GT--------A---A------T--A-T----TCCC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6027 : --A---C--A---C------------ATA-----C--A-----CA-G-C-C----A------C-A--------C------G-----T--------C--------A--GT----G-A-T---TC--------T---A------T--A-C----CCCC--T--C----C-AT-AAC--T-A---G-TT-G--AG-----AG-GGG-ATAAaaa
gi|6028 : ---CG------G----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------A--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--A-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAATaaa
gi|6029 : ---CG------G----ACA-----C--A-----CA-G-C-C----A------C-A--------T------G-----G--------C--------A--GC----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----TCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAaa
gi|6030 : ---CG------G----ACA-----C--A-----CA-----C----A------C-A--------A------A-----G--------A--------C--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AA-GGG-ATAAT
gi|6032 : ---CA------G----ACA-----C--A-----CA-G-C-C----A------C-A--------T------A-----G--------C--------A--AC----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T-----CCC--T--C----T-GC-ATC--T-A---G-TA-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6033 : ----ACA-----C--A-----TA-G-C-C----C------C-A--------T------G-----G--------A--------C--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--T-T----CCCC--A--T----A-GT-AAC--T-A---T-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAaaa
gi|6037 : caa----ATA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GT----G-A-T---AC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--C-A---G-TT-G--CT-----AG-GGG-ATAATcaa
gi|6039 : agac------G----ACA-----C--A-----CA-----C----A------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GC----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----TCCC--T--C----T-GC-AAC--T-T---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAAaa
gi|6041 : ----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-CT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6042 : ----ACA-----C--A-----CA-G-C-T----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GG----G-G-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-AC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAATaaa
gi|6043 : ----ACA-----C--A-----CA-G-C-C----A------C-A--------T------G-----G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------TAAA-T----CC-------------------C--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAATaa
gi|6044 : ----ACA-----T--A-----CA-----C----A------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GC----A-A-T---TT--------T---A------T--A-TAT--CCAC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ACAATaa
gi|6046 : CA-----T--A-----CA-----C----A------C-A--------C------A-----G--------C--------G--GC----G-A-T---GC--------C---A------A--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TTGG--CG-----AA-GGG-GTAAT
gi|6047 : --A-----CA-T-C-A----A------C-A--------C------A-----G--------C--------C--GC----G-A-T---AT--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TC-G--CG-----AG-GGG-ATAaa
gi|6049 : -C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC-----A----C-GC-AAC--T-C---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|6052 : ------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GC----A-T-T---TC--------T---A------T--A-T----CCTT--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAA
gi|6053 : ------G-----G--------C--------A--GC----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCT--T--C----TGGC-AAC--G-G---G-TT-G--CGA----AG-GGG-ATAATaaa
gi|6054 : --------A--GC----G-A-T---GC--------T---T------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-T---G-TT-G--CA-----AC-GGG-ATAATa
blockSeqs : GTGT TGGA TT GG GTC GACAACAG GCAAG TTTCG TCA GAATGGA TGGACTCG ATTATT GACTC ACCTGCAT CTCGCAGA T TTT TATAACTG GAT CATGTA AA TGTA A ATT A AATTT
blockSeqs : T . GT TA A GGACAC GCAG . TGA TCTGA AGGACT . GACTC ACTCG TC T AT GCTA GA AT A AT C AT T A
blockSeqs : . . T . . GGAC . . ATC GA T . GACTC ACTCA . T T TGA G . C G G G T .
blockSeqs : . . . . . GGAC . . TC A T . ATTG ACTCG . . . GA . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . GGAT . . TC G . . TA ACTCG . . . CA . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GG . . TC A . . TT A . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AG . . GC A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AG . . GA G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AT . . GA T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AT . . TC A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AC . . GA T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AC . . GA T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AC . . GT G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AG . . GT T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AC . . GT A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AG . . GA T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GG . . GT G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GG . . GA T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AC . . TC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AG . . GA T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AT . . GT T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AG . . GC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AG . . GA G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AA . . GT T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AG . . GC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AC . . AA A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AA . . GA T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GG . . GA T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AG . . GT T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GG . . GT T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AG . . GT G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GG . . TC T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AG . . GA T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GT . . TC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AG . . GC A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AG . . GA G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GG . . GA G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AT . . GC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GG . . GC T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GG . . GT G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TG . . GA T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GG . . GT G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GG . . GA T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AA . . GA T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AG . . GC T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GG . . TC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CC . . GC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AG . . GC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CG . . GC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AA . . AC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AG . . TC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AA . . TC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . GG . . TC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . GG . . GT T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . AA . . GA G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . AA . . CA G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . GG . . GC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . GG . . GC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . GG . . TC T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . AG . . GA G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . GC A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . TC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . GA T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GC A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GC A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GC A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GC T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GA G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GC A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GC A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GC A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . GC A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . GC C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . TC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . GC A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . GC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . TC G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
finalCons : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111
lowQualScore : 2222 1111 22 0 11 111 00 000 888888888888 11111 00 11111 22222 44444444444 0 33333333 111111 55555 55555555 22222222 00 0000 0 1 111 44444444 111 111111 11 0 2222 00 00 0000 1 0 00 0 111 1 0 00 11111 0 0
lowQualScore : .... .... .. . .. ... .. ... ............ ..... .. ..... ..... ........... . ........ ...... ..... ........ ........ .. .... . . ... ........ ... ...... .. . .... .. .. .... . . .. . ... . . .. ..... . .
lowQualScore : 4444 4444 44 5 33 333 77 888 000000000000 99999 66 00000 11111 22222222222 4 55555555 222222 00000 99999999 00000000 66 9999 4 2 777 55555555 777 777777 33 8 2222 66 66 8888 2 4 55 4 666 2 8 66 44444 4 9
consensus : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
Reference ( family-218 ) : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|5929 : ACACA----TA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-T-C-T----G------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|5930 : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-----C----A------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AT-GGG-ATAAT
gi|5931 : ACACA----AA----C--ACA-C--A---C--A---CG------GACACACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-G-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-T---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|5932 : ACACA----CA----C--ACA-CGGA---T--A---C------------ACA-----A--A-----CA-T-C-C----A------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-T---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAaa
gi|5933 : ACACA----TA----C--ACA-C--A---C--A---TG------GAC--ACA-----C--A-----CA-T-C-C----A------C-A--------C------A-----G--------A--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAaaa
gi|5934 : acACACA----CA----TTTAGA-C--A---C--A---AG------G----ACA-----CTGA-----CA-G-C-C----GAATGGAC-G--------CATTATTG-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------C--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----aaa
gi|5935 : ACACA----CA----T--GCA-C------C--A---CA------G----ACAGCAAGT--A-----CA-G-A-T----G------C-A--------C------T-----G--------C--------A--GC----G-A-T---TC--------C---A------C--A-T----CCC---T--C----T-AC-AAC--T-A---GATT-G--CG-----AG-GG---TAATaagattataa
gi|5936 : ACGCA----CA----C--ACA-T--A---C--A---CA------G----TCG-----C--A-----AA-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GAG-ATAAa
gi|5937 : ACAC------A----C--ACA-C--A---T--A---TG------GAC--ACA-----C--A-----CA-T-C-C----A------C-A--------T------G-----G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--ATT----CCCT--T--C----C-GA-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5938 : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CA------T----CCG-----C--A-----CG-G-A-C----T------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GCT-------T---A------T--A-T----CCCC--T--T----C-GC-AAC--T-T---G-TT-G--TG-----AG-GGcaa
gi|5939 : ACACA----CA----A--ACA-C--A---C--A---CA------T----TCG-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---A-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|5940 : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CA------C----ACA-----C--A-----CA-G-T-C----G------C-A--------T------G-----G--------TCTCGCAGAA--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T----TCTT--T--C----T-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAAgaa
gi|5941 : ACACA----CA----CGTACA-C--A---C--A---CA------C----ACA-----C--A-----CA-G-T-C----T------C-A--------T------GGACTCG--------C--------A--GC----A-G-T---GC--------CG--A------T--A-T----TCCC--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAAgaa
gi|5942 : ACACA----CA----T--ACA-C--A---C--A---CA------C----ACA-----C--A-----CA-G-T-C----A------C-AAGGACT--C------GTA---G--------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T-------T--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5943 : ACAAA----CA----C--ACA-C--A---A--A---CA------G----TCG-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-G--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5944 : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CA------C----ACA-----C--A-----TA-G-T-C----G------C-ATGGACTCGC------A-----G--------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T----TCTC--T--CATGAC-AC-AAC--C-A---G-TT-G--TG-----AG-AGG-ATAAgaa
gi|5945 : ACA-A----CA----C--ACA-A--A---C--A---CA------G----CCG-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-G--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5946 : ACACA----CATGGAC--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----TA-T-C-C----G------C-A--------T------G-----G--------C--------A--GC----G-A-A---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---gaa
gi|5947 : ACAAA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----TCT-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-G--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-C-T---GA--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAA
gi|5948 : acacacaaACACA----CA----A--ACA-A--A---C--A---CA------C----ACA-----C--A-----CG-G-T-C----T------C-A--------T------G-----GACTCG---C--------A--GC----A-G-T---GCGA------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----A--GAG-ATAAgaa
gi|5949 : CACC----CA----C--CCA-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------A------G-----A--------C--------A--GC----G-A-T---GTTATAACTGT---A------T--A-T----TCCC--T--C----C-GC-AGC--T-A---G-TT-G--AGAATTTAA-GGG-ATAAgaa
gi|5950 : accACACAGTGTCA----T--ACA-C--A---C--A---CA------G----CCA-----C--T-----CA-G-A-C----G--------A--------T------GATTG-G--------C--------A--GG----G-A-T---GC--------T---AAT----T--A-T----CTCC--T--A----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAAT
gi|5951 : ACACA----GA----C--ACA-C--A---C--A---CA------T----ACA-----C--A-----CA-G-T-C----T------C-A--------T------A-----GACCTGCATC--------A--GT----G-C-T---GA--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AA-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAAT
gi|5952 : ACACA----CA----C--ACC-C--A---T--A---CA------G----ACA-----C--A-----CA-G-C-T--------------------------------------------------------GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCAA--T--C----C-----AC--T-A---G-TT-G--TG-----AA-GGG-ATGA
gi|5953 : ACATA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CGACAACAG----TCA-----C--A-----CA-T-CAC----G------C-A--------C------G-----G--------C--------AGCGC----G-ATT---GC--------T---A------TA-A-TTGTATCCC--T--C----C-GCAAAC--T-AAT-G-TTGG--CG-----AG-GGGAATAATaaa
gi|5954 : ACACA----CA----C--ACA-C--A---T--G---CA------G----ACA-----A--A-----AG-A-A-C----A------C-A--------C------A-----A--------C--------A--GT----A-A-T---AC--------T---A------T--A-T----CCCA--T--------------C--T-A---G-TT-G--CG-----GG-GGG-ATAAaa
gi|5955 : ACACA----CA----A--ACA-C--A---C--A---CA------A----GCG-----T--A-----TG-G-A-C----T------C-G--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-TG---TCGC--T--C----CAAC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAcaa
gi|5956 : ACACA----C-----C--ACA-C--A---C--A---CA------G----TCT-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-G--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-C-T---GA--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-A--AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAA
gi|5958 : ACACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CA------C----ACA-----C--A-----CA-G-T-C----T------C-AT-------T------G-----GACTCA---C--------A--GT----A-G-T---GC--------T---G------T--A-TA---TTCT--T--C----C-AC-AAC--C-A---GTTT-G--CA-----AG-AGG-ATAAgaa
gi|5959 : ACAAA----CA----C--ACG-C--A---C--A---CC-----------ACA-----C--A-----CA-G-T-C----T------C-A--------T------G-----GACTCG---C--------A--GC----A-G-T---GC--------TGATA------T--A-T----TCTC--T--C----CCAC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAgaa
gi|5960 : acACAGA----CA----C--AGA-C--A---C--A---CA------A----ACA-----C--A-----CA-G-T-CTCTGA------C-A--------T------GGACTCG--------C--------A--GC----A-G-T---GCTGA-----T---A------T--A-T----TCTC--T-------C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAA
gi|5967 : CACG----CA----C--GCG-C--G---C--G---CG------G----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------T-A--------C------G-----G--------A--------C--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCA--T--C----C-GC-AAC--T-T---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAATgaa
gi|5968 : CACA----CA----C--ACA-T--AA--C--A---CA-----------ACA-----C--ATTTCGCATG-A-C----T------C-AT-------C------A-----G--------C--------A--GT----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CTC---T--C----C-AC-AAC--T-A---A-TT-G--CG-----AGTGGG-ATAAaa
gi|5969 : CACA----CA----A--ATA-C--A---C--A---CA------G----TCA-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----A-A-G---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--T----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--T-------G-GGG-ATAAgaa
gi|5970 : ACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--G-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------A--------C--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-C---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5971 : ACACA----CA----C--ATA-C--A---C--A---C------------ACA-----C--T-----CA-G-C-C----A------C-A--------C------A-----A--------C--------A--AG----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-AC-AAT--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAA
gi|5972 : ACA----CA----CT-ACATC--A---C--A---CC-----------ACG-----C--A-----TG-G-A-T----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---A-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAATcaa
gi|5973 : ACA----CA----C--ATG-C--A---C--A---CA------G----ACAGCAG-T--A-----CA-G-A-T----G------C-A--------C------T-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------C---A------C--A-T----CCCC--T--C----T-AC-AAC--T-A---A-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAATaa
gi|5974 : ACG----CA----C--AGA-C--A---T--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----A-A-T---GC--------T---A----------------------T--C----C-GC-AAC--T-A---A-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAATaa
gi|5975 : ACGCG----CA----C--ACG-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-C-G----T------C-A--------C------G-----A--------C--------A--TC----G-A-T---GC--------T---G------T--A-T----GTCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CT-----AG-GAG-ATAAT
gi|5977 : ACACA----GA----C--ACA-CTAA---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-T-G----G------C-A--------C------G--------------C--------A--GT----G-C-T---GC--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AGC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGA-ATAA
gi|5978 : ACA----CA----C--ACA-C--A---C--A---CA------G----TCA-----C--A-----TG-G-A-C----T------T-G--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-G-C---GC--------T---A------T--C-T----CCTC--T--C----T-AC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5979 : ACA----AA----C--AC--C--AGTCC--A---CG------T----ACG-----C--A-----CA-----C----G------T----------C------A-----G--------C--------A--GC----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-AC-AAG--T-A---G-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAATgaa
gi|5981 : CA-C--A---C--A---C------------AAA-----C--A-----CA-G-T-C----T------C-A--------T------G-----GACTCG---C--------A--GC----A-G-T---GC--------TGA-A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAAaa
gi|5982 : CA----TA----T--ACA-C--A---C--A---CA------G----TCG-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------T--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-AC-AACTAT-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ACAAgaa
gi|5983 : CA----TA----C--ACA-A--A---C--A---CA------G----TCG-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----T-A-T---GC--------C---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATgaa
gi|5984 : ACA----C--------ACA-C--A---C--A---CG------GAT--ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GA----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|5985 : A----CA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-ATT---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--TCCC----C-GC-AAC--G-C---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|5986 : A----CA----C--ACA-A--A---C--A---CA------T----ATA-----C--A-----CA-G-C-C--------------------------------------------------------GC----G-G-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CC-----AG-GGG-ATAAaa
gi|5987 : ----CA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----GA-ATC-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-ATT---GC--------T---A------T--A-T-----CCC--T--C----C-GC-CCC--G-C---G-TT-G--CG-----AG-GGGAATAAT
gi|5988 : CA----GA----C--ACA-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----AA-G-C-T----G------C-A--------C------G-----A--------A--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----ATCCATT--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CC-----AG-GGG-ATAAa
gi|5989 : ACACA----AA----C--ATA-T--G---C--A---TG------G----ACT-----C--A-----CA-G-C-------------------------------------------------------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------C--A-T----CCTC--T--C----T-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAaaa
gi|5992 : catCACA----AA----C--ACA-C--A---C--A---TT------G------------C--A-----TG-A-C-T-----------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--G-T----TCTT--T--C----C-AC-GAG--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5995 : catgA----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|5996 : A----C--ACA-C--A---C--A---CG------G----ATG-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--AT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGaaa
gi|5997 : ACAT---CA----C--ACA-C--A------A---C------------ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------CTC------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------TC-A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--TAA---G-TT-
gi|5998 : A----C--AGA-C--A---C--A---CA------A----ACA-----C--A-----CA-G-T-T----G------C-A--------T------GGACTCG--------C--------A--GCAGCTG-C-T---GC--------T---A------T--ATT----CTCT--T--C----C-AC-AAC--C-AG--G-TT-G--CA-----AG-AGG-ATAA
gi|5999 : ----C--ACA-A--A---C--A---CA------G----TCA-----C--A-----TA-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-----AC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|6001 : --ACA-C--A---C--A---CG------G----ACA-----C--A-----CA-C-A-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAT--T-A---G-TT-G--CG-----A--TGG-ATAATgaa
gi|6002 : --ACA-C--A---C--A---CC------C----ATA-----T--A-----TA-G-C-T----G------G-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----A-A-T---GCCA------T---A------T--A-T----GCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----TG-AGA-ATAATaa
gi|6003 : ----C--AGA-C--A---T--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------CTA--------T------G-----C--------T--------A---C------A-T---G---------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6004 : ----C--ACA-C--A---A--A---C------------ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------GTT---G--------C--------A--GC----G-A-TTTTGC--------T---A------T--A-T----CCCT--C--T----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----caa
gi|6005 : CA-C--A---C--A---AA------G----TCG-----C--A-----TG-G-A-C----T------C-G--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-C-T---GT--------T---A------T--A-T----TCTC--T--C----C-AC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6007 : A-C--A---CCAA---CC------G----ACA-----C--A-----C------C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GT----GGA-T---GC--------T---A------T--A-C----CCCC--T---------GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----A--GGG-ATAATgaa
gi|6008 : --ATA-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-C-T----A------C-A--------C------G-----G--------A--------A--GT----G-A-T---GC--------A---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAATga
gi|6009 : A-C--A---C--A---CA------A----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------A------G-----GA-------C--------A---C----G-A-T---GC--------T---ACATGTAT--A-T----CCCT--T--C----C-GC-AAC--C-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6010 : A-C--A---C--A---CA------G----TCA-----C--A-----CG-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--GG-----AA-GGG-AAAAaaa
gi|6011 : A-C--A---C--A---TA------A----ACA-----C--A-----AA-G-C-C----A------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GC----A-A-TT--GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AA---T-AATTA-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|6012 : CA-G--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-C-C----A------C-A--------T------G-----G--------G--------A--GT----G-A-TAT-GC--------T---T------T--A-T----CCCC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAATcaa
gi|6013 : CA-G--A---C--A---C------------ACA-----A--A-----CA-G-C-C----A------C-A--------T------G-----G--------C--------T--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCT--T--C----C-TC-AAA--T-A---G-TT-G--CC-----AG-AGG-ATAAT
gi|6014 : -C--A---C--AAGCCG------G----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------------------------------------------------A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-C---A-TT-GGCCG-----AG-GGG-ATaa
gi|6015 : A-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAAT
gi|6016 : A-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-T---GTTT-G--CG-----AG-GGG-ATAAga
gi|6017 : A-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-C-T----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GCGCTA----T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----AA-TGG-TTAATaaa
gi|6018 : A-C--A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------C------A-----G--------A--------T--GC----A-G-T---GC--------T---A------T--A-T----TCCC--A--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGA-ATAAaa
gi|6019 : A-C--A---T--A---C------------ACA-----C--A-----CC-G-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------T-----------------G-A-T---GA--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-GAC--T-A---G-TT-G--CG-----AA-GGG-ATAATaaa
gi|6020 : --A---C--A---TG------G----AAA-----C--A-----CA-G-C-T----GA-----C-A---------------G-----G--------C--------A--GC----A-C-T---GC--------T---A------T--A-T----CCC---T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATA
gi|6021 : --A---C--A---CA------A----ACA-----C--A-----CA-G-A-C----T------C-A--------C------A-----G--------C--------A--TG----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCTC--T--T----C--C--AC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAAtaa
gi|6023 : --A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---C-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAAgaa
gi|6024 : --A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-----C----G------C-A--------C------G-----G--------A--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATA
gi|6025 : --A---CA------A----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-taa
gi|6026 : --A---C--A---C------------ACA-----C--A-----CA-T-C-T----G------C-A--------C------G-----G--------A--------A--GC----G-A-T---GT--------A---A------T--A-T----TCCC--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6027 : --A---C--A---C------------ATA-----C--A-----CA-G-C-C----A------C-A--------C------G-----T--------C--------A--GT----G-A-T---TC--------T---A------T--A-C----CCCC--T--C----C-AT-AAC--T-A---G-TT-G--AG-----AG-GGG-ATAAaaa
gi|6028 : ---CG------G----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------A--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--A-A---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAATaaa
gi|6029 : ---CG------G----ACA-----C--A-----CA-G-C-C----A------C-A--------T------G-----G--------C--------A--GC----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----TCCC--T--C----C-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAaa
gi|6030 : ---CG------G----ACA-----C--A-----CA-----C----A------C-A--------A------A-----G--------A--------C--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AA-GGG-ATAAT
gi|6032 : ---CA------G----ACA-----C--A-----CA-G-C-C----A------C-A--------T------A-----G--------C--------A--AC----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T-----CCC--T--C----T-GC-ATC--T-A---G-TA-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6033 : ----ACA-----C--A-----TA-G-C-C----C------C-A--------T------G-----G--------A--------C--GT----G-A-T---GC--------T---A------T--T-T----CCCC--A--T----A-GT-AAC--T-A---T-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAaaa
gi|6037 : caa----ATA-----C--A-----CA-G-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GT----G-A-T---AC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--C-A---G-TT-G--CT-----AG-GGG-ATAATcaa
gi|6039 : agac------G----ACA-----C--A-----CA-----C----A------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GC----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----TCCC--T--C----T-GC-AAC--T-T---G-TT-G--CG-----AG-AGG-ATAAaa
gi|6041 : ----ACA-----C--A-----CA-T-C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-CT-G--CG-----AG-GGG-ATAA
gi|6042 : ----ACA-----C--A-----CA-G-C-T----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GG----G-G-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-AC-AAC--T-A---G-TT-G--TG-----AG-GGG-ATAATaaa
gi|6043 : ----ACA-----C--A-----CA-G-C-C----A------C-A--------T------G-----G--------C--------A--GT----G-A-T---GC--------T---A------TAAA-T----CC-------------------C--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAATaa
gi|6044 : ----ACA-----T--A-----CA-----C----A------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GC----A-A-T---TT--------T---A------T--A-TAT--CCAC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ACAATaa
gi|6046 : CA-----T--A-----CA-----C----A------C-A--------C------A-----G--------C--------G--GC----G-A-T---GC--------C---A------A--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TTGG--CG-----AA-GGG-GTAAT
gi|6047 : --A-----CA-T-C-A----A------C-A--------C------A-----G--------C--------C--GC----G-A-T---AT--------T---A------T--A-T----CCCC--T--C----T-GC-AAC--T-A---G-TC-G--CG-----AG-GGG-ATAaa
gi|6049 : -C-C----G------C-A--------C------G-----G--------C--------A--GC----G-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCC-----A----C-GC-AAC--T-C---G-TT-G--CG-----AG-GGG-ATAAT
gi|6052 : ------C-A--------C------A-----G--------C--------A--GC----A-T-T---TC--------T---A------T--A-T----CCTT--T--C----C-AC-AAC--T-A---G-TT-G--CA-----AG-GGG-ATAA
gi|6053 : ------G-----G--------C--------A--GC----A-A-T---GC--------T---A------T--A-T----CCCT--T--C----TGGC-AAC--G-G---G-TT-G--CGA----AG-GGG-ATAATaaa
gi|6054 : --------A--GC----G-A-T---GC--------T---T------T--A-T----CCCC--T--C----C-GC-AAC--T-T---G-TT-G--CA-----AC-GGG-ATAATa