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gi|28764 : TGTAAGC-A-G---TA-AATA---T-A--G-----G--TT-A----CA-T-----------CT-----G--G--TCA-C-CC-----A-TGC----A-G--T-GT--GT-AA----GC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----CTA-TC-T-C-------------TG--G-TCA-
gi|28768 : TGTAAGC-A-A---TA-C------T-A--G-----A--TT-A----CC-T-----------C------G--GG-TCA-C-CT-----A-T-C----A-G--T-GT--GG-AA----AC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-G-------------TG--G-TCA-CCCAT-AATGT
gi|28769 : TGTAAGC-A-G---TG-T------T-A--G-----G--TT-A----CC-T-----------C------G--GG-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-GT--GT-AA----AC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------GG--G-TCA-CCCATCAGTGTtttctaatttcacttctcaaacagaactatattttagggcgta
gi|28770 : TGTAAAC-A-G---TA-C------T-A--G-----G--TT-A----CC-T-----------C------G--GG-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-GT--GT-AA----GC-AGT-A---C--------------T-A-G-A----TTA-CC-T-C-------------GG--G-TCA--CCATCA
gi|28771 : TGTAAGC-A-G---TA-C------T-A--G-----A--TT-A----CC-T-----------CG-----G--G--TCA---CC-----A-T-C----A-G--T-GA--GT-AA----GT-AGTGA---G--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------TG--G-TCA-CCC-TCA
gi|28772 : TGTAAGC-A-GATATA-A------T-A--GA----G--TT-A----CC-C-----------G------G--G--TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-GA--GT-AA----GC-AGT-G---CACATTG--------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------TG--G-TCA-CCCATCA
gi|28774 : TGTAAGC-A-A---TA-A------A-A--G-----G--TT-A----CC-TG----------T------G--G--TCA-C-TC-----A-T-C----A-G--T-AT--GT-AG----GT-AAT-A---C--------------A-A-A-G----TTA-CT-T-C-------------TG--A-TCA-TCCAT
gi|28778 : TGTAAGC-A-G---GA-C------T-A--G-----G--TT-A----CC-TG----------T------G--G--TCA-C-CC-----A-T-G----A-G--T-GT--GT-AA----GC-AGT-A---T--------------T-A-G-G----TTA-CC-C-G-------------TG--G-TCA-CCCAT
gi|28779 : TGTAAGC-A-A---TA-C------C-A--G-----G--TT-A----CC-T-----------CT-----G--G--TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-TT--GT-AA----AG-AG--A---C--------------GAA-G-G----TTA-CC-T-G-------------TG--G-TCA-CCTAaaaattttctactttcacttctcaaatggaactatattttagggcgta
gi|28780 : TGTAAGC-A-G---TA-T------T-A--G-----G--TTTA----CC-TG----------T------G--G--TCA-C-CC-----A-T-C----AAG--T-GT--GT-AA----GC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TT--TC-T-G-------------TG--G-TCA-CCCATCActttcacttctcaaatggaactacattttagggcgta
gi|28781 : TGTAAGC-A-G---TA-C------T-A--G-----G--TT-AATTACC-T-----------GA-----G--G--TCA-C-CC-----A-T-CTGACA-G--T-GT--GT-AA----GC-AGT-A---C--------------T-A-G-GTTAATTA-CC-T-G-------------AG--G-TCA-CCCATCcgt
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gi|28786 : TGTAAGC-A-G---CA-C------T-A--G-----C--AT-A----TT-T-----------CA-----G--G--TCA-C-CC-----A-T-C----A-T--T-TT--GT-AA----AG-AGC-G---G--------------A-A-G-G----TTA-CC-T-G-------------TG--G-CCA-CCTAtttctattttcacttctcaaatggaaatatattttagggcgta
gi|28787 : TGTAAGC-A-G---TT-A------T-A--G-----A--TT-A----TC-T-----------C------GC-G--TCA-C-CC-----A-T-C----G-T--T-GT--GT-AA----GC-AG--A---C--------------GAA-G-G----TTA-CC-T-G-------------TG--G-TCA-CCAATCctttcacttcccaaatgacctaccatttagggcgt
gi|28788 : TGTAAGC-A-G---TA-C------T-G--GCATGGG--TT-A----CC-TA----------T------G--G--TTA-T-CT-----A-T-C----A-G--T-GT--GT-AA----GC-CGC-A---C--------------A-A-A-G----TTT-CC-T-C-------------TG--G-TCA-CCCATCAGTctattttctactttcacttcatataaggaactatattttacggcgta
gi|28788 : TGTAAGC-C-G---CA-C------A-A--A-----G--TT-T----CC-T-----------CT-----G--G--TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-TT--GT-A-------------------------------------G----TTA-CC-T-C-------------Tttgtagttacctctaaatag
gi|28789 : tgtaagcagtactggcatgggttacctatggttatctatcagtgTGTAAGC-A-G---TA-C------A-G--G-----G--TT-A----CC-T-----------CA-----G--G--TCA-C-CC-----A-T-C----A-A--T-AT--GT-AA----GC-AGA-A---G--------------A-A-G-G----TTA-CC-T-G-------------TG--T-TTA-CCCATCAaaatag
gi|28792 : TGAAAGC-A-G---TA-C------T-A--G-----G--TT-A----CC-T-----------CT-----G--G--CCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-TT--GT-AA----AG-AG--A---C--------------GAA-G-G----TTA-CC-T-G-------------TG--G-TTA-CCccatatcaccatttctactttcatttctctcttgcaacttttttacgacgta
gi|28793 : TGTAAGC-A-G---TA-C------T-A--G-----G--TC-A----CC-TGTGTNNNNNNNN------N--N--NNA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-AT--GT-AA----GC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CA-T-G-------------TG--T-TCA-CCCATCAtcctttcactttccaaagggaactacatattagggcata
gi|28794 : TGTAAGC-A-A---TA-C------T-A--G-----G--TT-A----TC-TA----------T------G--G--TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-TT--GA-AA----GC-AGT-G---C--------------T-A-C-T----TTA-CC-T-G-------------TG--C-TCA-CCCATCAGT
gi|28796 : TGTAAGC-A-G---TA-C------T-A--GCTAG-G--TT-A----CC-TG----------T------G--G--TCA-C-CC-----A-T-C----T-G--TCTT--GT-AA----GA-GATGA--------------------A-G-G----TTA-CC-T-G-------------TG--G-TCA-CCTAt
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gi|28799 : TGTAAGC-A-G---TA-C------T-A--G-----G--TT-A----CC-T-----------C------G--GG-CCA-C-CC-----A-T-C----C-G--T-GT--GT-TA----GC-AGA-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------GG--G-TCA-CCCATCCGTGT
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gi|28801 : TGTAAGC-A-G---TA-C------T-A--G-----G--TT-A----CC-T-----------CT-----G--G--TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-GT--GT-AA----AT-ACT-A---CTAGGTAAACAATATT-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------TG--G-TCA-CCCATCA
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gi|28804 : TGTTAGC-A-G---AA-C------T-A--G-----G--TT-A----CC-T-----------C------G--GG-TCA-C-CC-----A-T-C----C-G--T-GT--TT-AA----GT-AGT-A---A--------------C-A-G-G----CTA-CC-T-C-------------GG--G-TCA-CCCATC
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gi|28809 : TGTAAGG-A-G---TA-C------T-A--A-----G--TT-ATA--CC-T-----------CT-----G--G--TTA-T-CC-----A-T-C----A-A--T-GT--GT-AA----GC-AGT-A---T--------------A-A-A-G----TTG-CC-C-C-------------TG--G-TTA-tt
gi|28813 : TGTGAGC-A-G---TA-C------T-A--G-----G--TT-A----CA-T-------------------------------C-----A-T-C----A-G--T-AT--GT-AG----AT--GT-G---C--------------T---G-G----TTA-CC-T-CGCGTCACCCGATGTG--G-TCA-CCCATCA-TGT
gi|28816 : TGTAAGC-A-G---TA-C------T-A--G-----G--TT-A----CC-T-----------CT-----G--G--TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-GT--GT-AA----GC-AGT-A---C--------------C-A-T-G----TTA-TC-T-T-------------TG--G-TTA-CCCATCAtttgtactttcacttcttaaatggaactatatttcacggctta
gi|28817 : TGTAAGC-A-G---TA-C------T-A--G-----G--TT-A----CC-T-----------CT-----G--G--TTA-T-CA-----A-T-C----A-G--T-AT--GT-AA----GC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------TG--G-TCA-CCCATCAGTGT
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gi|28821 : TGTAAGC-A-G---AA-C------T-T--G-----G--TT-A----CC-T-----------C------G--G--CCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-GT--GT-AA----GC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------TG--G-TCA-CCCATCAGTGT
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gi|28824 : TGTAAGC-A-G---AA-C------T-T--G-----G--TT-A----CC-T-----------C------G--G--CCC-C-CC-----A-T-C----A-G--T-GT--GT-AA----GC-AGA-A---C--------------T-T-G-G----TTA-CC-T-C--------------G--G-CCC-CCCATCAGTGTttacttttttttaaa
gi|28825 : TGTAAGC-A-G---AA-C------T-T--G-----G--TT-A----CC-T-----------C------G--G--CCC-C-CC-----A-T-C----A-G--T-GT--GT-AA----GC-AGA-A---C--------------T-T-G-G----TTA-CC-T-C--------------G--G-CCC-CCCATCAGTGT
gi|28826 : TGTAAGC-A-G---AA-C------T-T--G-----G--TT-A----CC-T-----------C------G--G--CCC-C-CC-----A-T-C----A-G--T-GT--GT-AA----GC-AGA-A---C--------------T-T-G-G----TTA-CC-T-C--------------G--G-CCC-CCCATCAGTGT
gi|28827 : TGTAAGC-A-G---AA-C------T-T--G-----G--TT-A----CC-T-----------C------G--G--CCC-C-CC-----A-T-C----A-G--T-GT--GT-AA----GC-AGA-A---C--------------T-T-G-G----TTA-CC-T-C--------------G--G-CCC-CCCATCAGTGT
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gi|28839 : TGTAAGC-A-G---TA-T------T-A--T-----G--TT-A----CT-T-----------T------G--GA-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-GT--GT-AA----GC-AG
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gi|28844 : TGTAACC-ACG---TG-C------T-T--G-----G--T--A----CC-T-----------C------G-----TCA-A-CC-----A---C----A-GAAT-GT--GTTAA----GCTAGT-A---C--------------T-A-GCG----TTA-CC-T-C-------------TG--G-TTA-CCCAT
gi|28845 : TGTTAGC-A-G---TA-T------T-A--G-----G--TT-A----CC-T-----------TCT----GC-G--TCA-C-CC-----A-T-C----A-GG-T-GT--GT-AA----AC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------TGC-G-TCA-Ctgacaaggtttacctgttggtacctacttgttcacttctcaaatggaactacatttagggcgt
gi|28847 : GTAAGC-A-G---TA-C------T-ACCG-----G--T-----------------------------G--G--TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-GT--GT-AG----GC-AAT-A---C--------------G-A-A-G----TTA-CC-T-C-------------GG--G-TCA-CCCATCGGT
gi|28848 : GTAAGC-A-G---TA-C------T-A--G-----G--TT-A----CC-T-----------C------G--GGATCA-C-CCC----A-T-C----A-G--T-GT--GT-AA----GC-AGT-G---T--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------GG--G-TCA-CCCATCAGTGTtt
gi|28849 : GTAAGC-A-G---TG-CACATTGT-A--G-----G--TT-A----CC-T-----------CT-----G--G--TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-GA--GT-AA----GC-AGT-----C--------------TAA-G-G----TTA-CC-T-C-------------TG--G-TCA-CCCATCAGTGT
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gi|28851 : GTAAGC-A-G---T--C------T-AA-G-----G--TT-A----CC-T-----------CT-----G--G--TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-GT--GT-AA-----C-AG--A---C--------------T-A-G-G----TTA-TT-T-C-------------GG--G-TCA-CCCATCA
gi|28852 : GTAAGC-A-G---TT-C------T-A--A-----G--TT-A----CC-T-----------C------G--GA-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G----GT--GT-AA----GCAAGT-A---C--------------T-A-G-G----TTT-AC-T-C-------------TG--G-TCA--CCATCAGTGT
gi|28853 : GTAATC-A-G---TG-C------T-A--G--------TT-A----CC-T-----------C------TC-G--TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-GA--GT-AA----GC-AGT-T---C--------------T-A-A-G----TTA-CC-T-C-------------GG--A-TCA-CCCATCAG
gi|28854 : GTAAGC-A-G---TA-C------T-A--G-----G--TT-A----TC-TGT---------T------G--G--TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-GA--GT-AA----GC-AGTAA---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-G-------------TG--G-TCA-CCCATCAgt
gi|28855 : GTAAGC-A-G---TAAC------T-A--G-----G--TT-A----CC-TG----------T------G--G--TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-GA--GT-AA----GC-AGT-A---C--------------T-A---G----TTA-TC-T-G-------------TG--G-TCA-CCCATCA
gi|28856 : GTAAGC-A-G---TA-C------T-A--------G--TT-A----TC-TG----------T------G--G--TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-GA--GT-AA----GC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA----T-C-------------TGT-G-TCACCCCATCA
gi|28857 : GTAAGC-A-G---TA-C------T-A--G-----G--TT-A----TC-T-----------G------T--G--TCACC-CC-----A-T-C----A-G--T-GA--GT-AA----GC-AGT-A---CT-------------T-A-G-G----TTA-TCGT-G-------------TG--G-TCA-CTCACCA
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gi|28859 : GTAAGC-A-G---TA-C------T-A--G-----G--TT-AATTACC-T-----------GA-----G--G--TCA-C-CC-----A-T-CTGACA-G--T-GA--GT-AA----GC-AGT-A---C--------------T-A-G-GTTAATTA-CC-T-G-------------AG--G-TCA-CCCATC
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gi|28864 : GTAAGC-A-G---TA-C------T-A--A-----G--TT-A----CC-T-----------C------GAAG--TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-AT--GT-AA-----C-AG-----------------------A-G-G------A-TC-T-G-------------TG--G-TC
gi|28866 : TAAGC-A-G---TA-C------T-A--G-----G--TT-A----CC-T-----------C------G--GG-TCA-C-CC-----A-T-C----T-G--T-GT--GT-AT----GC-AGA-G---G--------------A-A-A-G----TTA-CC-T-G-------------TG--G-CCA-CCCATCA-TGT
gi|28867 : TAAGC-A-G---TA-C------T-A--G-----G--TT-A----CT-TG----------T------G--G--TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-GT--GT--A----GCAAGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T---------------GG--G-TCA-CCCATtttctaatttaactttataaatggaactatattttagggcgta
gi|28868 : TAAGC-A-G---TA-T------T-A--G-----G--TT-A----CC-T-----------CT-----G--A--TCA-C-TC-----AAT-C----------------T-AA----GC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CT-T-G-------------TG--G-TCA-CCCATCAGTGT
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gi|28886 : --TT-A----CC-T-----------C------G--GG-TCA-T-CC-----A-T-C----A-G--T-GT--GT-AA----GC-AA--A---G--------------G-A-G-T----TTA-CA-T---------------TGT-G-TCA-CCAATC-GTGgatgtttcttatatggaactatatttta
gi|28889 : T-A----CC-T------------------G--G--TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-GT--GT-AA----GC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-G-------------TG--G-TCA-CCCATCAGTGTgtcttaaatggaactatatatatttacggcgta
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blockSeqs : . . . . . .
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28898 ): AGATTACCTGTGTTCACCGAGCATGTTTCCTACTTTAACTTCTTTAATGGAATAGTATTTTACGGCGTA
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Reference ( family-215 ) : TGTAAGC-A-G---TA-C------T-A-G-----G--TT-A----CCT-CTG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------TG--G-TCA-CCCATCAGTGT
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gi|28794 : TGTAAGC-A-A---TA-C------T-A-G-----G--TT-A----TCT-ATG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-T--TG----A-AAGC-AGT-G---C--------------T-A-C-T----TTA-CC-T-G-------------TG--C-TCA-CCCATCAGT
gi|28796 : TGTAAGC-A-G---TA-C------T-A-GCTAG-G--TT-A----CCT-GTG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----T-G--TCT--TG----T-AAGA-GATGA--------------------A-G-G----TTA-CC-T-G-------------TG--G-TCA-CCTAt
gi|28797 : TGTA-GC-AAG---TA-C------T-A-G-----G--TT-A----CCT-G-G----------G-TCA-C-CC-----A-TTC----A-G--T-G--TG----T-AAAC-CAT-G---CA-------------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------GG--G-TCA-CCCATctttcacttctcaaatgtaaaagttctacattttagggcgta
gi|28799 : TGTAAGC-A-G---TA-C------T-A-G-----G--TT-A----CCT-CGG----------G-CCA-C-CC-----A-T-C----C-G--T-G--TG----T-TAGC-AGA-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------GG--G-TCA-CCCATCCGTGT
gi|28800 : TGTAAGC-A-G---TA-C------T-A-G-----G--TT-A----CCT-GTG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGT-A---A--------------C-A-G-A----TTA-TA-C-C-------------TG--G-TCA-CCCATCAGTGTtt
gi|28801 : TGTAAGC-A-G---TA-C------T-A-G-----G--TT-A----CCT-CTG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAAT-ACT-A---CTAGGTAAACAATATT-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------TG--G-TCA-CCCATCA
gi|28802 : TGTAAGC-A-G---TA-A------C-A-G-----A--TT-A----TAC-CTG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------TG--G-TCA-CCCATCAGTGT
gi|28803 : TGTAAGC-A-G---TA-C------T-A-G-----A--TT-A----CCT-GCG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AGGC-AAT-A---A----------------A-A-A----TTA-CT-T-C-------------TG--G-TCA-CCCACCAGTGT
gi|28804 : TGTTAGC-A-G---AA-C------T-A-G-----G--TT-A----CCT-CGG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----C-G--T-G--TT----T-AAGT-AGT-A---A--------------C-A-G-G----CTA-CC-T-C-------------GG--G-TCA-CCCATC
gi|28805 : TATAGGT-A-A---TA-C------A-A-A-----G--TT-A----CTT-CTA----------G-TCA-C-CT-----A-T-C----G-G--T-G--TG----T-AAGC-AGT-A---C--------------T-A-G-A----TTA-CC-T-G-------------CG--G-TCA-CCCATCAGTGT
gi|28807 : TGTAAGC-A-G---TA-C------T-A-G-----G--TT-A----CCT-CGG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----G-G--T-G--TT----T-AAGC-AGA-G---G--------------A-A-G-G----TTT-CC-T-C-------------GG--G-TCA-CCAGTCAGTGT
gi|28808 : TGTAAGC-G-G---TT-C------T-A-G-----G--TT-A----CCT-CGG----------G-TCA-C-CT-----A----------G--T-G--TG----T-AAGC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------GG--G-TCA-CCCATCGGTGT
gi|28809 : TGTAAGG-A-G---TA-C------T-A-A-----G--TT-ATA--CCT-CTG----------G-TTA-T-CC-----A-T-C----A-A--T-G--TG----T-AAGC-AGT-A---T--------------A-A-A-G----TTG-CC-C-C-------------TG--G-TTA-tt
gi|28813 : TGTGAGC-A-G---TA-C------T-A-G-----G--TT-A----CAT-----------------------C-----A-T-C----A-G--T-A--TG----T-AGAT--GT-G---C--------------T---G-G----TTA-CC-T-CGCGTCACCCGATGTG--G-TCA-CCCATCA-TGT
gi|28816 : TGTAAGC-A-G---TA-C------T-A-G-----G--TT-A----CCT-CTG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGT-A---C--------------C-A-T-G----TTA-TC-T-T-------------TG--G-TTA-CCCATCAtttgtactttcacttcttaaatggaactatatttcacggctta
gi|28817 : TGTAAGC-A-G---TA-C------T-A-G-----G--TT-A----CCT-CTG----------G-TTA-T-CA-----A-T-C----A-G--T-A--TG----T-AAGC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------TG--G-TCA-CCCATCAGTGT
gi|28818 : TGTAAGC-A-G---TA-C------T-A-G-----G--TT-A----CCT-CTG----------A-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-GTATG----T-AAGC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------TG--G-TTA-TCAATCA
gi|28819 : TGTAAGC-A-G---TA-C------C-A-T-----G--TT-A----TCT-TTG----------G-TTA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--AG----T-AAGC-AGT-A---C--------------T-A-A-G----TTA-CC-T-C--------------GAAG-TCA-CCCATCA
gi|28820 : TGTAAGC-A-G---TA-C------T-A-G-----G--TT-A----CCT-CTG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGA-A---C--------------T-T-G-G----TTA-CC-T-C--------------G--G-CCC-CCCATCAGTGT
gi|28821 : TGTAAGC-A-G---AA-C------T-T-G-----G--TT-A----CCT-C-G----------G-CCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------TG--G-TCA-CCCATCAGTGT
gi|28822 : TATAAGC-T-G---TA-C------T-A-G-----G--TT-G----CAT-CTG----------C-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGA-A---C--------------T-T-G-G----TTA-CC-T-C--------------G--G-CCA-CCCATCAGTGT
gi|28823 : TGTAAGC-T-G---TA-C------A-A-A-----A--TT-A----CCT-CAA----------A-TCA-C-CC-----A-T-C----AAG--T-G--TG----T-ACGC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------TG--G-TCA-CTCATCA
gi|28824 : TGTAAGC-A-G---AA-C------T-T-G-----G--TT-A----CCT-C-G----------G-CCC-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGA-A---C--------------T-T-G-G----TTA-CC-T-C--------------G--G-CCC-CCCATCAGTGTttacttttttttaaa
gi|28825 : TGTAAGC-A-G---AA-C------T-T-G-----G--TT-A----CCT-C-G----------G-CCC-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGA-A---C--------------T-T-G-G----TTA-CC-T-C--------------G--G-CCC-CCCATCAGTGT
gi|28826 : TGTAAGC-A-G---AA-C------T-T-G-----G--TT-A----CCT-C-G----------G-CCC-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGA-A---C--------------T-T-G-G----TTA-CC-T-C--------------G--G-CCC-CCCATCAGTGT
gi|28827 : TGTAAGC-A-G---AA-C------T-T-G-----G--TT-A----CCT-C-G----------G-CCC-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGA-A---C--------------T-T-G-G----TTA-CC-T-C--------------G--G-CCC-CCCATCAGTGT
gi|28828 : TGTAAGC-A-G---AA-C------T-T-G-----G--TT-A----CCT-C-G----------G-CCC-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGA-A---C--------------T-T-G-G----TTA-CC-T-C--------------G--G-CCC-CCCATCAGTGT
gi|28829 : TGTAAGC-A-G---AA-C------T-T-G-----G--TT-A----CCT-C-G----------G-CCC-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGA-A---C--------------T-T-G-G----TTA-CC-T-C--------------G--G-CCC-CCCATCAGTGT
gi|28830 : TGTAAGC-A-G---AA-C------T-T-G-----G--TT-A----CCT-C-G----------G-CCC-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGA-A---C--------------T-T-G-G----TTA-CC-T-C--------------G--G-CCC-CCCATCAGTGT
gi|28831 : TGTAAGC-A-G---AA-C------T-T-G-----G--TT-A----CCT-C-G----------G-CCC-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGA-A---C--------------T-T-G-G----TTA-CC-T-C--------------G--G-CCC-CCCATCAGTGT
gi|28832 : TGTAAGC-A-G---AA-C------T-T-G-----G--TT-A----CCT-C-G----------G-CCC-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGA-A---C--------------T-T-G-G----TTA-CC-T-C--------------G--G-CCC-CCCATCAGTGT
gi|28833 : TGTAAGC-A-G---AA-C------T-T-G-----G--TT-A----CCT-C-G----------G-CCC-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGA-A---C--------------T-T-G-G----TTA-CC-T-C--------------G--G-CCC-CCCATCAGTGT
gi|28834 : TGTAAGC-A-G---AA-C------T-T-G-----G--TT-A----CCT-C-G----------G-CCC-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGA-A---C--------------T-T-G-G----TTA-CC-T-C--------------G--G-CCC-CCCATCAGTGT
gi|28835 : TGTAAGC-A-G---AA-C------T-T-G-----G--TT-A----CCT-C-G----------G-CCC-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGA-A---C--------------T-T-G-G----TTA-CC-T-C--------------G--G-CCC-CCCATCAGTGT
gi|28836 : TGTAAGC-A-G---AA-C------T-T-G-----G--TT-A----CCT-C-G----------G-CCC-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-ATT-A---C--------------A-A-A-G----TTA-CC-T-C-------------AG--G-TCA-CCAATCAGTGT
gi|28837 : TGTAAGC-A-T---TA-C------A-A-A-----G--TT-A----CCT-CAG----------G-TCA-C-CA-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-TGT-A---C--------------A-A-A-A----TTA-CC-T-C-------------AA--A-TCA-CCCATCA
gi|28838 : TGCATGC-A-A---TA-C------T-A-G-----T--TT-T----TCT-GTG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TGTAATT-AAGC-AAG-A---C--------------A-A-A-G----TTA-CC-C-G-------------TG--G-TCA-CCCATCAagt
gi|28839 : TGTAAGC-A-G---TA-T------T-A-T-----G--TT-A----CTT-TGG----------A-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AG
gi|28840 : TGTAAGC-A-G---TA-C------T-A-T-----A--TT-A----CCA-CCG----------A-TCA-T-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-TGT-T---C--------------A-A-A-G----TTA-CT-T-C-------------TG--G-TCA-TGCAACAGTGTgggaaggt
gi|28844 : TGTAACC-ACG---TG-C------T-T-G-----G--T--A----CCT-C------------G-TCA-A-CC-----A---C----A-GAAT-G--TG----TTAAGCTAGT-A---C--------------T-A-GCG----TTA-CC-T-C-------------TG--G-TTA-CCCAT
gi|28845 : TGTTAGC-A-G---TA-T------T-A-G-----G--TT-A----CCTTCTGC---------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-GG-T-G--TG----T-AAAC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------TGC-G-TCA-Ctgacaaggtttacctgttggtacctacttgttcacttctcaaatggaactacatttagggcgt
gi|28847 : GTAAGC-A-G---TA-C------T-A------------------CCG-GTG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AGGC-AAT-A---C--------------G-A-A-G----TTA-CC-T-C-------------GG--G-TCA-CCCATCGGT
gi|28848 : GTAAGC-A-G---TA-C------T-A-G-----G--TT-A----CCT-CGG----------GATCA-C-CCC----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGT-G---T--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------GG--G-TCA-CCCATCAGTGTtt
gi|28849 : GTAAGC-A-G---TG-CACATTGT-A-G-----G--TT-A----CCT-CTG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--AG----T-AAGC-AGT-----C--------------TAA-G-G----TTA-CC-T-C-------------TG--G-TCA-CCCATCAGTGT
gi|28850 : GTAAGC-A-G---TA-C------T-A-G-----G--TT-A----CCT-TGG----------G-CCA-C-CC-----A-T-T----A-T--T-G--AG----T-AAGC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------GG--GATCACCCCATCAGTGT
gi|28851 : GTAAGC-A-G---T--C------T-AAG-----G--TT-A----CCT-CTG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AA-C-AG--A---C--------------T-A-G-G----TTA-TT-T-C-------------GG--G-TCA-CCCATCA
gi|28852 : GTAAGC-A-G---TT-C------T-A-A-----G--TT-A----CCT-CGG----------A-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G----G--TG----T-AAGCAAGT-A---C--------------T-A-G-G----TTT-AC-T-C-------------TG--G-TCA--CCATCAGTGT
gi|28853 : GTAATC-A-G---TG-C------T-A-G--------TT-A----CCT-CTC----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--AG----T-AAGC-AGT-T---C--------------T-A-A-G----TTA-CC-T-C-------------GG--A-TCA-CCCATCAG
gi|28854 : GTAAGC-A-G---TA-C------T-A-G-----G--TT-A----TCTGTTG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--AG----T-AAGC-AGTAA---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-G-------------TG--G-TCA-CCCATCAgt
gi|28855 : GTAAGC-A-G---TAAC------T-A-G-----G--TT-A----CCT-GTG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--AG----T-AAGC-AGT-A---C--------------T-A---G----TTA-TC-T-G-------------TG--G-TCA-CCCATCA
gi|28856 : GTAAGC-A-G---TA-C------T-A-G--------TT-A----TCT-GTG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--AG----T-AAGC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA----T-C-------------TGT-G-TCACCCCATCA
gi|28857 : GTAAGC-A-G---TA-C------T-A-G-----G--TT-A------T-CTGT---------G-TCACC-CC-----A-T-C----A-G--T-G--AG----T-AAGC-AGT-A---CT-------------T-A-G-G----TTA-TCGT-G-------------TG--G-TCA-CTCACCA
gi|28858 : GTAAGC-A-G---TA-C------T-A-G-----G--TT-AATTACCT-GAG----------G-TCA-C-CC-----A-T-CTGACA-G--T-G--AG----T-AAGC-AGT-A---C--------------T-A-G-GTTAATTA-CC-T-G-------------AG--G-TCA-CCCATC
gi|28859 : GTAAGC-A-G---TA-C------T-A-G-----G--TT-AATTACCT-GAG----------G-TCA-C-CC-----A-T-CTGACA-G--T-G--AG----T-AAGC-AGT-A---C--------------T-A-G-GTTAATTA-CC-T-G-------------AG--G-TCA-CCCATC
gi|28861 : GTAAAC-A-A---TA-T------T-A-G-----G--TT-A----CCT-CTG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-A--TG----T-AAGC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------GG--G-CCA-CCCATC
gi|28862 : GTAACCTA-G---TA-C------A-A-C-----G--TT-A----CCT-CTG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGA-G---G--------------A-A-G-G----TTA-CA-T-C-------------TG--A-TC
gi|28864 : GTAAGC-A-G---TA-C------T-A-A-----G--TT-A----CCT-C-GAA--------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-A--TG----T-AA-C-AG-----------------------A-G-G------A-TC-T-G-------------TG--G-TC
gi|28866 : TAAGC-A-G---TA-C------T-A-G-----G--TT-A----CCT-CGG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----T-G--T-G--TG----T-ATGC-AGA-G---G--------------A-A-A-G----TTA-CC-T-G-------------TG--G-CCA-CCCATCA-TGT
gi|28867 : TAAGC-A-G---TA-C------T-A-G-----G--TT-A----CTT-GTG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T--AGCAAGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T---------------GG--G-TCA-CCCATtttctaatttaactttataaatggaactatattttagggcgta
gi|28868 : TAAGC-A-G---TA-T------T-A-G-----G--TT-A----CCT-CTG----------A-TCA-C-TC-----AAT-C--------------------T-AAGC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CT-T-G-------------TG--G-TCA-CCCATCAGTGT
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gi|28874 : AGC-A-G----A-C------T-A-G--------TT-A----C-T-C-G----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----T-G--T-G--TG----T--AGC-AG--A---G--------------G-A-A-G----TT--CC-T-G-------------TG--G-CCA--CCATCAGT
gi|28876 : C-A-G---TA-C------T-A-G-----GT-TT-A----CC--GTG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGTAA---C--------------T---G-A----TTATTC-T-G-------------TG--GTTCA-CCGATCAGTtttctatttaactttataaatggaactatttttagggcgta
gi|28877 : -A-G---TA-C------T-G-G-----T--TT-A----CTT-GTG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAAC-AGT-A---C--------------T-A-G-A----TTA-CC-T-C-------------TG--G-TCA-CCCATCAGTGTtt
gi|28878 : -G---TA-C------TTA-G-----G--TT-A----CCT-CTGGTCTG-----G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGT-A---CTGGCA---------T-G-G-G----TTA-CC-T-A-------------TG--G-TTA-TCTATCAGTGT
gi|28879 : -G---TA-C------T-A-G-----G--TT-A----CCT-GTG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-C--T-T--TG----A-AAGC-AGT-T---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-G-------------TG--G-TCA-CCCATCAGT
gi|28880 : -G---TA-C------T-A-G-----AGTTT-A----CTT-GTG------------TCA-CACT-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGT-A---C--------------TTA-G-G----TTA-CC-T-G-------------TG--G-TCA-CCCATCTGTtt
gi|28882 : ------T-A-G-----C--TT-A----TTT-CGG----------A-TCA-C-CC-----A-T-C----A-C--T-G--TG----T-AAGC-AGA-G---G--------------A-A-G-A----TTA-CA-T-G-------------TG--G-TCA-CCCATt
gi|28886 : --TT-A----CCT-CGG----------G-TCA-T-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AA--A---G--------------G-A-G-T----TTA-CA-T---------------TGT-G-TCA-CCAATC-GTGgatgtttcttatatggaactatatttta
gi|28889 : -CTG----------G-TCA-C-CC-----A-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-G-------------TG--G-TCA-CCCATCAGTGTgtcttaaatggaactatatatatttacggcgta
gi|28894 : tacG----------G-TCA-C-CC-----G-T-C----A-G--T-G--TG----T-AAGC-AGT-A---C--------------T-A-G-G----TTA-CC-T-C-------------TG--A-TCA-CCCATCAGTGT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28898 ): AGATTACCTGTGTTCACCGAGCATGTTTCCTACTTTAACTTCTTTAATGGAATAGTATTTTACGGCGTA