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Reference ( gi|111965 ) : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T------GT-------G------T------T----G------T--C-C-G-C----T-C--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TCT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
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gi|112038 : A-A-G--GT-CATA-T-CA---------C---T--G-AT-C-T---G-AAC--CAT-T----T------GT-------G------T------T----GGTG---T--T-T-G-C----T-C--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112039 : A-A-T--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-A-C--CCC-A----T------AT-------G------C------T----G------T--T-C-C-T----C-C--A-A-T-ATT-C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TCT-G----T-T-G-ATA-ACAA
gi|112042 : A-A-G--GT-CAAAGT-CAA--------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCA-A-----------GA-------G------T------T----G------T--C-C-G-C----T-C--A-A-T-AT--C--T-G-TC-GG--T-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-G
gi|112050 : A-A-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-TT-C-TA--T-AGA--CT--A----T------GT-------G------C------T----G------T--C-C-G-C----T-C--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112046 : A-A-G--GT-CA-------------------------GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T------GT-------GTTTGTGT------T----G------T--C-C-G-C----T-C--A-A-T-AT--A--T-T-TC-GA--T-C--CA---TTT-G--C-T-T-A-ATA-ACAA
gi|112040 : A-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---T--G-GT-C-T---TAAACG-CCC-ATT--T------GT-------G------T------T----G------TGCC-T-G-CT---T-C--G-A-A-AT--C--T-T-TT-GA--C-CTGCCCTTTTT-G--C-T-T-GAATAGACAA
gi|112048 : A-A-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-GT-C-T---G-TAG--ACT-A----T------GT-------G------C------T----G------TT-C-C-G-C----T-C--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--A-C--TC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112056 : -A-G--GT-CAAA-T-TA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCTTA----T------GT-------G------T------T----G------T--C-C-G-C----T-C--A-A-A-AT--C--T-T-TT-GA--C-T--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-A
gi|112051 : -A-G--GC-CAGA-C-TG---------T---T--G-GT-C-T---G-TAG--ACC-A----T------GT-------G------T------T----G------T--C-C-G-C----T-C--A-A-T-AT--A--T-T-TT-GA--C-C--CT---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112057 : -A-G--GT-CAA--C-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAT--CCT-AAT--T------GT-------G------G------T----G------T--C-C-G-C----C-T--C-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CCT--TCG-G--C-TCT-G-ATA-ACA
gi|112055 : -A-G--GT-CAAAAT-CA-------------T--G-GT-C-T-----AAA--CCC-A----T-------T-------G------T------T----G------T--CGC-G-C----T-C--A-A-TTAT--C--T-T-TTTGA--C-C--CC---CTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112058 : -G--GT-CAAA-T-TAAC-------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A-----------GT-------G------T------T----G------T--C-----C----T-C--A-A-TGAT--CT-T-T-TT-GA--C-C--CC---T-T-G----T-T-G-ATA-ACAA
gi|112060 : --GT-CAAA-T-AA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CC--A----T------GT-------G------T------T----G------T--T-T-G-C----T-C--A-A-A-AT--C----T-TT-GG--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112062 : AAA-T-TA---------C---T--G-GT-C-T---T-AA---CCC-A-----------GT-------G------T------T----G------T--C-C-G-C----T-C--A-A-A-AT--C--TGTGTT-GA--T-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-A
gi|112061 : AAA-C-TG---------T---C--G-GT-C-T---G-TAG--ACC-A----T------GT-------G------T------T----G------T--C-C-G-C----T-C--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-C--T-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112065 : --G-GT-C-T---T-CAC--CCC-A----T------GT-------G------T------T----G------T--C-C-G-C----T-C--A-A-T-AT--C--T-C-TT-GA--C-C--TC---TTT-G--C-T-T-T-ATA-TCAA
gi|112066 : --G-GT-C-T---T-AAG--ACC-AA---T------AT-------G------T------T----G------T--C-C-G-C----T-C--A-A-T-AT--C------TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112074 : CC-A----T------GT-------G------T------T----G------T--C-C-G-C----T-C--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TCT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112083 : CC-A----T------GT-------G------T------T----G------T--C-C-G-C----T-C--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112081 : CC-A----T------GT-------G------T------T----G------T--C-C-G-C----T-C--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GGC-C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112078 : CC-A----T------GT-------G------T------T----A------T--C-C-G-C----T-C--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112085 : CC-A----T------AT-------G------T------T----G------T--C-C-G-C----T-C--A-G-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112075 : CC-A----T------GT-------G------T------T----G------T--C-T-G-C----T-CC-A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--T-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112077 : CT-A----T------GT-------G------C------T----G------T--C-C-G-C----T-C--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--TC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCA
gi|112088 : CC-A----T------GT-------G------T------T----G------T--C-T---C----T-C--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--TC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-G
gi|112070 : CC-A----T------AT-------G------T------T----G------TT-C-C-G------T-C--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---T-T-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112091 : ggtctgtagaC-A----T------GT-------G------T------T----G------T--C-C-G-C----T-C--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA----C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112089 : C-A----T------GT-------G------T------TT---G------T--C-C-G-C----T-C--A-A-T-AA--C--T-T-TT-GA--C-C--CT---TTT-G--C-T-T-A-ATA-ACAA
gi|112076 : -A----T------GT-------G------T------T----G------T--T-C-G-C----T-C--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-T--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112095 : ccatgt----T------GT-------G------T------T----G------G--C-C-G-C----T-C--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CT---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112082 : ----T------GT-------G------T------T----G------T--T---G-C----T-C--A-AAT-AT--C--T-T-TT-GA--CAC--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112094 : ccatc------GT-------G------T------G----G------T--C-C-A-C----T-C--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
Alignments
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lowQualScore : . . .. . .............. ... .. . . . ... . .. . .... .. ....... ...... ...... . ...... .... . . . .... .. . . . .. .. . . . .. . .. ... . .. . . . . ..
lowQualScore : 5 5 44 0 44444444444444 888 11 5 4 4 222 9 22 4 9999 00 9999999 111111 333333 4 888888 2222 4 4 8 6666 33 4 4 6 99 99 4 4 8 99 8 55 777 8 55 4 8 8 0 11
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Reference ( family-214 ) : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
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gi|111958 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-TG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--AT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--A--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|111959 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-TG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--AT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--A--T-T-TT-GA--C-C--TC---GTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
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gi|111967 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-CG---------C---T--A-GT-C-T---C-AAC--ACC---------GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TG--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
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gi|111973 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-CG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----A--AT-------G------T------T-G------T----T-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-A-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-A
gi|111974 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-GT-T-T---T-AAC--CCC-A----T--AT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-C-AT--C--T-T-TT-CA--T-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-G
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gi|111983 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-TG---------C---T--G-GT-C-T---T-CAC--CCT-G----T--GT-------A------T------T-G------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T------------------TTT-G--C-T-T-G-AT
gi|111984 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-TG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC----A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-T--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|111985 : TCA-A-GCGGT-CAAA-TTCA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT--------------T------T-G------T----C-T-GCC----TC--A-A-T-AT--C--T-C-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-C-G-ATA-ACAA
gi|111986 : TCA-A-GCGGT-CAAA-TTCA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT--------------T------T-G------T----C-T-GCC----TC--A-A-T-AT--C--T-C-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-C-G-ATA-ACAA
gi|111987 : TCA-A-A--GG-CAAA-T-CA---------C---T--G-GT-CAT---T-AAC--CC--A----T--GTT------G------T------T-G------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C----T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-GAATA-ACAA
gi|111988 : TCA-A-A--GG-CAAA-T-CA---------C---T--G-GT-CAT---T-AAC--CC--A----T--GTT------G------T------T-G------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C----T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-GAATA-ACAA
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gi|111992 : TCA-A-G--GT-CAAG-T-CAAAACT----T---T--G-GTTC-T---T-AAG--CCT-A----T--GT-------G------T------T-G------T----A-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--A-C--CC---TTG-A--T-T-T-C-ATA-A
gi|111993 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-AT-C-T---T-AAC--CCC-A----A--GT-------G------T------T-G------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--A--T-T-TT-GA--T-G--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATT-ACAA
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gi|111995 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------A---T--G-GT-C-T---T-AAC--CC-------T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-A-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC----TT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|111996 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------A---T--G-GT-C-T---T-AAC--CC-------T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-A-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC----TT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|111997 : TCA-A-G--GT-TAAA-C-TG---------T---T--G-AT-C-T---T-AAC--CCC-A----TTAGT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GG--C-C--CC---ATT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|111998 : TCA-A-G--GT-GAAA-C-CG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CAC-A----T--GT-------T------T------T-A------T----T-C-A-T----TC--A-A-T-AT--C--C-T-TT-GA----C--CC---TTT-G--C-T-T-T-ATA-ACAA
gi|111999 : TTA-A-G--GT-CATA-T-AG---------C---T--G-GC-C-T---T-AAC--CTC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-AA--C-C--CC---ATT-G--C-T-T-G-GTA-ACA
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gi|112001 : TCA-A-T--GT-CAAA-T-CA---------A---T--G-GT-C-T---T-AAC--CC--A----T--GT-------G------T------T--------T----T-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA----C--CC---TAT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112002 : TCA-A-G--GT-CAAG-T-GGT--------C---C--A-GT-C-TG--T-AAC--T---A----T--GT-------G------T--------G------T----C---G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA----C--TC---TTT-G--C-T-T-GAATA-A
gi|112003 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---TG-G-GT-C-T---T-AA---CCC-A----T--GT-------G------T------T-GT-----T----C-C-G-C----TC--ATA-A-AT--C--T-T-TTCGA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-A-ATA-A
gi|112004 : TCA-A-G--GT-CAAACT-GG---------C---T--G-GT-C-T---T-AACGCCCC-A----TC-GT-------G------T------T-G------T----C-CCG-C----TT--C-A-T-AT--C--T-T-TT-GAATC-G--CC---TTTGG--C-TCT-G-AT
gi|112005 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-AA---------T---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCA-T----T--GT-------AT-----T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-G-----C--CC---TTC-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112006 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---T--G-AT---T---T-ACC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G-----------C-C-T-C----TCAGA-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-AAAA
gi|112007 : TCA-A-G--GTTCAAA-T-CA---------C---T--G-GT-C-TC--T-AAC--CCC-A----T--GT--------------T------T-GT-----T----C-T-G-C----TC--A-A-A-AT--C--T-T-TT--A--C-C--C-----TT-G--C-T-T-A-ATA-A
gi|112008 : TCA-A-G--TT-CAAA-T-TG---------C---T--G-CT-C-T---C-AAT--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-T-G-C----TC--A-T-T-AT--C--T-T-AT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112009 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-AGCTTT--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-T----TC--A-G-T-AT--A------TT-GA--C-T--CC---TTG-T--C-T-T-G-ATG-A
gi|112010 : TCA-A-G--GT-CAAA-T--A---------C--------GT-T-T---T-AAC--CCC------T--GT-------G------T------T-G------T----C---G------TC--A-A-A-AT--C--T-T-TT-G---C-C--CC---TTT-G--C-T-T-T-ATA-A
gi|112011 : TCA-A-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-GT-C-TG--T-AGA--C--------T--AT-------G------C------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112012 : TCA-A-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-GT-C-TG--T-AGA--C--------T--AT-------G------C------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--TT---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112016 : TCA-ATG--GT-CAAA-C-CG---------C---T--G-GT-C-T--------------G----T--GT-------G------T------T-G------T----T-C-G-CCAA-TC--A-A-T-AT--T--A-T-TT-GA--TTC--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112017 : TCAGA-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-GT-C-T---G-TAG--ACT-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--TC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112019 : TCA-A-G--GT-CAAG-G-GG---------T---C--A-GT-C-T---G-TAG--ACT-A----T--GT-------G------C------T-C------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112020 : TCA-A-G---T-CAAA-C-CG---------C---TTTG-GTTC-T---T-ACC--TTC-A----T--GT-------G------T------C-G------T----C-C-G-C----AC--A-G-T-AT-----T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-A-ATG-A
gi|112021 : TCA-A-A--GT-CAAG----G---------CAAGT--G-GT-CAT---C-TAG--ACT-A----T--GT-------G------C------T-G------T----C-C-G-C----TC--A---T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112022 : TCA-A-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-GT-C-T---G-TAG--ACT-A----T--GT-------G------C------T-G------T----C-C-T-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-T-ATA-TCAA
gi|112025 : CA-A-T--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-GT-C-T------AC--CCC-A----T--GC-------G------C------T-G------T----T-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112026 : CA-A-T--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-GT-C-C---T-AGC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-T-G-T----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-AA--C-C--CC---TTA-G--C-T-G-G-ATA-CCAA
gi|112027 : CA-A-T--GT-CAAA-C-AG---------C---T--G-GT-C-T---TTAAC--CCT------T--GT-------T------T------C-G------T----C-C-A-C----TC--A-C-T-AT--C--T-T-CT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ACA-A
gi|112028 : CA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---T--G-TT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----T-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-G--CC---TTC-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112033 : CA-G-G--GT-CAAA-T-CA---------A---T--G-GT-C-T---T-AA----CC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-A-C----T---A-A-T-AT-----T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-ATATC-ACAA
gi|112035 : CA-A-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-GT-C-T---G-TAG--ACT-A----T--GT-------G------C------T-G-----------C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--TC---TTT-G--C-A-T-G-ATA-TCAA
gi|112036 : CA-T-G--GC-CAAA-C-CGTGTTTTAAAC---T--G-GT-G-T---T-AAC--CTC-G----T--GT-------G------T------T-G------T----C-T-A-C----TC--A-A-T-GT--C--T-T-TT-AA--T-C--CC---TTT-G--C-T-A-G-ATA-G
gi|112038 : A-A-G--GT-CATA-T-CA---------C---T--G-AT-C-T---G-AAC--CAT-T----T--GT-------G------T------T-GGTG---T----T-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112039 : A-A-T--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-A-C--CCC-A----T--AT-------G------C------T-G------T----T-C-C-T----CC--A-A-T-ATT-C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TCT-G----T-T-G-ATA-ACAA
gi|112040 : A-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---T--G-GT-C-T---TAAACG-CCC-ATT--T--GT-------G------T------T-G------TGC--C-T-G-CT---TC--G-A-A-AT--C--T-T-TT-GA--C-CTGCCCTTTTT-G--C-T-T-GAATAGACAA
gi|112041 : A-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA----C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112042 : A-A-G--GT-CAAAGT-CAA--------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCA-A-------GA-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-G-TC-GG--T-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-G
gi|112043 : A-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---T--G-GT-C-T---G-AAC--CAT-A----C--GT-------G------T------T-GGTGTTGT----A-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-GCAA
gi|112044 : A-A-G--GT-CAAA---CG---------C---T--G-GT-T-TGGCC-AAC--TCC-A----T--GT-------G------T------T-T------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-GCAA
gi|112045 : A-A-G--GT-CAAA-C-AG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--TCC-A----T--GT-------G------TTGGTGTT-G------T----C-C-G-C----TC--A-G-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CT---TTT-G--C-A-T-A-ATA-ACAA
gi|112046 : A-A-G--GT-CA-------------------------GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------GTTTGTGT------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--A--T-T-TC-GA--T-C--CA---TTT-G--C-T-T-A-ATA-ACAA
gi|112048 : A-A-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-GT-C-T---G-TAG--ACT-A----T--GT-------G------C------T-G------TT---C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--A-C--TC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112050 : A-A-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-TT-C-TA--T-AGA--CT--A----T--GT-------G------C------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112051 : -A-G--GC-CAGA-C-TG---------T---T--G-GT-C-T---G-TAG--ACC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--A--T-T-TT-GA--C-C--CT---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112055 : -A-G--GT-CAAAAT-CA-------------T--G-GT-C-T-----AAA--CCC-A----T---T-------G------T------T-G------T----CGC-G-C----TC--A-A-TTAT--C--T-T-TTTGA--C-C--CC---CTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112056 : -A-G--GT-CAAA-T-TA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCTTA----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-A-AT--C--T-T-TT-GA--C-T--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-A
gi|112057 : -A-G--GT-CAA--C-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAT--CCT-AAT--T--GT-------G------G------T-G------T----C-C-G-C----CT--C-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTCGG--C-TCT-G-ATA-ACA
gi|112058 : -G--GT-CAAA-T-TAAC-------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A-------GT-------G------T------T-G------T----C-----C----TC--A-A-TGAT--CT-T-T-TT-GA--C-C--CC----TT-G----T-T-G-ATA-ACAA
gi|112060 : --GT-CAAA-T-AA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CC--A----T--GT-------G------T------T-G------T----T-T-G-C----TC--A-A-A-AT--C----T-TT-GG--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112061 : AAA-C-TG---------T---C--G-GT-C-T---G-TAG--ACC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-C--T-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112062 : AAA-T-TA---------C---T--G-GT-C-T---T-AA---CCC-A-------GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-A-AT--C--TGTGTT-GA--T-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-A
gi|112065 : --G-GT-C-T---T-CAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-C-TT-GA--C-C--TC---TTT-G--C-T-T-T-ATA-TCAA
gi|112066 : --G-GT-C-T---T-AAG--ACC-AA---T--AT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C------TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112070 : CC-A----T--AT-------G------T------T-G------TT---C-C-G------TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC----TT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112074 : ggtctgtagaCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TCT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112075 : CC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-T-G-C----TCC-A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--T-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112076 : -A----T--GT-------G------T------T-G------T----T-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-T--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112077 : ccatgtCT-A----T--GT-------G------C------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--TC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCA
gi|112078 : CC-A----T--GT-------G------T------T-A------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112081 : CC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GGC-C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112082 : ----T--GT-------G------T------T-G------T----T---G-C----TC--A-AAT-AT--C--T-T-TT-GA--CAC--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112083 : ccatcCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112085 : CC-A----T--AT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-G-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112088 : CC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-T---C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--TC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-G
gi|112089 : C-A----T--GT-------G------T------TTG------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AA--C--T-T-TT-GA--C-C--CT---TTT-G--C-T-T-A-ATA-ACAA
gi|112091 : C-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA----C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112094 : --GT-------G------T------G-G------T----C-C-A-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112095 : ----T--GT-------G------T------T-G------G----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CT---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
Alignments
lowQualScore : 0 0 11 1 88888888888888 000 11 0 1 1 333 0 22 0 2222 11 4444444 222222 222222 0 333333 2222 0 0 0 2222 11 0 0 1 00 00 0 0 0 00 0 00 000 0 00 0 0 0 2 11
lowQualScore : . . .. . .............. ... .. . . . ... . .. . .... .. ....... ...... ...... . ...... .... . . . .... .. . . . .. .. . . . .. . .. ... . .. . . . . ..
lowQualScore : 5 5 44 0 44444444444444 888 11 5 4 4 222 9 22 4 9999 00 9999999 111111 333333 4 888888 2222 4 4 8 6666 33 4 4 6 99 99 4 4 8 99 8 55 777 8 55 4 8 8 0 11
consensus : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
Reference ( family-214 ) : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|111957 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-T------T----C-C-G-C----TC--A-A-A-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CT---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|111958 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-TG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--AT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--A--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|111959 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-TG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--AT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--A--T-T-TT-GA--C-C--TC---GTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|111960 : TCA-A-G--GT-CAAA-A-CG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--ACC-A----T--GT-------G------TTGGTGTT-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-C-AT--C--T-T-TT-TA--G-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-AT
gi|111961 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------TACGTC-T-G-C----TC--A-A-C-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|111962 : TCA-A-A--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-GAC--CCC-A----T--AT-------G------C------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--A-T-TT-GA--C-C--CA---TTT-G--C-T-C-G-A-A-A
gi|111963 : TCA-A-G--GT-CAAA---CA---------C---T--GCGT-C-T---T-AACA-CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----A-C-G-TCTG-TC--A-A-C-AT--CGTT-T-TT-GA----C--CC---TGT-G----T-T-G-ATA-ACAA
gi|111965 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TCT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|111966 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--TCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TCT-G--C-T-T-G-ACA-ACAA
gi|111967 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-CG---------C---T--A-GT-C-T---C-AAC--ACC---------GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TG--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|111968 : TCA-A-A--GT-CAAA-A-TG---------C---T--G-GT-C-C---T-AAC--ACC-A----T--GTATTTGT-G------T------T-G------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-TA--C-T--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|111969 : TCA-A-G--GT-CAGA-G-CT---------T---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCT-A----T--GT-------G------T------T-GGTGTTGT----A-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CG---TTT-C--C-T-T-G-ATA-A
gi|111970 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-CG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----T-T-G-C----TT--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--T-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|111971 : TCA-A-G--GT-CAAC-A-CG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GTG------G------G------T-G------T----T-T-G-C----TC--T-A-C-ATAGT--T-C-TT-TA--T-C--CC---TTT-GGCT-T-T-G-ATA-
gi|111972 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-TG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-A------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--AC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACA
gi|111973 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-CG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----A--AT-------G------T------T-G------T----T-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-A-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-A
gi|111974 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-GT-T-T---T-AAC--CCC-A----T--AT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-C-AT--C--T-T-TT-CA--T-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-G
gi|111975 : TCA-A-G--GT-TAAA-C-TG---------C---T--G-GT-A-T---T-AAC--CAC-A----T--GT-------G------T------T-G------A----C-C-G-C----TC--A-A-T-AG--C--T-T-TT-GG--C-A--CC---TTT-G--C-T-T-T-ATA-G
gi|111976 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------A---T--G-TT-C-T---T-AAA--CCC-A----T--GT-------G------T------G-T------T----C-C-G-C----TCC-A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|111977 : TCA-A-G--GT-CAAATT-TA---------C---T--G-GT-C-T---T-AA---CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-A-AT--C--C-T-TT-GA--T-C--CC---TTT-G--CTT-T-G-ATA-ACAA
gi|111981 : TCA-A-G--GTTCAAA-CATG---------C---T--G-GT-T-C---A-AACAGCCC-AAG--T--GT-------GAT----T------C-G------T----C-C-G-CGGCCTC--A-A-T-AT--C--T-T-T--GA--A-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|111983 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-TG---------C---T--G-GT-C-T---T-CAC--CCT-G----T--GT-------A------T------T-G------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T------------------TTT-G--C-T-T-G-AT
gi|111984 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-TG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC----A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-T--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|111985 : TCA-A-GCGGT-CAAA-TTCA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT--------------T------T-G------T----C-T-GCC----TC--A-A-T-AT--C--T-C-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-C-G-ATA-ACAA
gi|111986 : TCA-A-GCGGT-CAAA-TTCA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT--------------T------T-G------T----C-T-GCC----TC--A-A-T-AT--C--T-C-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-C-G-ATA-ACAA
gi|111987 : TCA-A-A--GG-CAAA-T-CA---------C---T--G-GT-CAT---T-AAC--CC--A----T--GTT------G------T------T-G------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C----T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-GAATA-ACAA
gi|111988 : TCA-A-A--GG-CAAA-T-CA---------C---T--G-GT-CAT---T-AAC--CC--A----T--GTT------G------T------T-G------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C----T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-GAATA-ACAA
gi|111989 : TCA-A-A--GT-CAAA-A-CAA--------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--ACC-A----T--GTGTTGGGCG------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-CAAT--C--T-T-TT-TA--C-C--CC---TTT-G--C-T-TGG-ATA-TCAA
gi|111990 : TCA-A-A--GT-CAAA-A-CAA--------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--ACC-A----T--GTGTTGGGCG------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-CAAT--C--T-T-TT-TA--C-C--CC---TTT-G--C-T-TGG-ATA-TCAA
gi|111991 : TCA-A-G--GT-CAAG-T-CAAAACT----T---T--G-GTTC-T---T-AAG--CCT-A----T--GT-------G------T------T-G------T----A-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--A-C--CC---TTG-A--T-T-T-C-ATA-A
gi|111992 : TCA-A-G--GT-CAAG-T-CAAAACT----T---T--G-GTTC-T---T-AAG--CCT-A----T--GT-------G------T------T-G------T----A-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--A-C--CC---TTG-A--T-T-T-C-ATA-A
gi|111993 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-AT-C-T---T-AAC--CCC-A----A--GT-------G------T------T-G------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--A--T-T-TT-GA--T-G--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATT-ACAA
gi|111994 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------A---T--G-GT-C-T---T-AAC--CC-------T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-A-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC----TT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|111995 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------A---T--G-GT-C-T---T-AAC--CC-------T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-A-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC----TT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|111996 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------A---T--G-GT-C-T---T-AAC--CC-------T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-A-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC----TT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|111997 : TCA-A-G--GT-TAAA-C-TG---------T---T--G-AT-C-T---T-AAC--CCC-A----TTAGT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GG--C-C--CC---ATT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|111998 : TCA-A-G--GT-GAAA-C-CG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CAC-A----T--GT-------T------T------T-A------T----T-C-A-T----TC--A-A-T-AT--C--C-T-TT-GA----C--CC---TTT-G--C-T-T-T-ATA-ACAA
gi|111999 : TTA-A-G--GT-CATA-T-AG---------C---T--G-GC-C-T---T-AAC--CTC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-AA--C-C--CC---ATT-G--C-T-T-G-GTA-ACA
gi|112000 : TCA-A-G--GT-AAAC-C-CG---------G---T--A-GT-C-T---T-AAC--CAC-A----A--AT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-T--AC---TTT-G--C-T-T-G-ATG-ACAA
gi|112001 : TCA-A-T--GT-CAAA-T-CA---------A---T--G-GT-C-T---T-AAC--CC--A----T--GT-------G------T------T--------T----T-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA----C--CC---TAT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112002 : TCA-A-G--GT-CAAG-T-GGT--------C---C--A-GT-C-TG--T-AAC--T---A----T--GT-------G------T--------G------T----C---G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA----C--TC---TTT-G--C-T-T-GAATA-A
gi|112003 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---TG-G-GT-C-T---T-AA---CCC-A----T--GT-------G------T------T-GT-----T----C-C-G-C----TC--ATA-A-AT--C--T-T-TTCGA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-A-ATA-A
gi|112004 : TCA-A-G--GT-CAAACT-GG---------C---T--G-GT-C-T---T-AACGCCCC-A----TC-GT-------G------T------T-G------T----C-CCG-C----TT--C-A-T-AT--C--T-T-TT-GAATC-G--CC---TTTGG--C-TCT-G-AT
gi|112005 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-AA---------T---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCA-T----T--GT-------AT-----T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-G-----C--CC---TTC-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112006 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---T--G-AT---T---T-ACC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G-----------C-C-T-C----TCAGA-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-AAAA
gi|112007 : TCA-A-G--GTTCAAA-T-CA---------C---T--G-GT-C-TC--T-AAC--CCC-A----T--GT--------------T------T-GT-----T----C-T-G-C----TC--A-A-A-AT--C--T-T-TT--A--C-C--C-----TT-G--C-T-T-A-ATA-A
gi|112008 : TCA-A-G--TT-CAAA-T-TG---------C---T--G-CT-C-T---C-AAT--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-T-G-C----TC--A-T-T-AT--C--T-T-AT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112009 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-AGCTTT--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-T----TC--A-G-T-AT--A------TT-GA--C-T--CC---TTG-T--C-T-T-G-ATG-A
gi|112010 : TCA-A-G--GT-CAAA-T--A---------C--------GT-T-T---T-AAC--CCC------T--GT-------G------T------T-G------T----C---G------TC--A-A-A-AT--C--T-T-TT-G---C-C--CC---TTT-G--C-T-T-T-ATA-A
gi|112011 : TCA-A-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-GT-C-TG--T-AGA--C--------T--AT-------G------C------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112012 : TCA-A-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-GT-C-TG--T-AGA--C--------T--AT-------G------C------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--TT---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112016 : TCA-ATG--GT-CAAA-C-CG---------C---T--G-GT-C-T--------------G----T--GT-------G------T------T-G------T----T-C-G-CCAA-TC--A-A-T-AT--T--A-T-TT-GA--TTC--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112017 : TCAGA-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-GT-C-T---G-TAG--ACT-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--TC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112019 : TCA-A-G--GT-CAAG-G-GG---------T---C--A-GT-C-T---G-TAG--ACT-A----T--GT-------G------C------T-C------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112020 : TCA-A-G---T-CAAA-C-CG---------C---TTTG-GTTC-T---T-ACC--TTC-A----T--GT-------G------T------C-G------T----C-C-G-C----AC--A-G-T-AT-----T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-A-ATG-A
gi|112021 : TCA-A-A--GT-CAAG----G---------CAAGT--G-GT-CAT---C-TAG--ACT-A----T--GT-------G------C------T-G------T----C-C-G-C----TC--A---T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112022 : TCA-A-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-GT-C-T---G-TAG--ACT-A----T--GT-------G------C------T-G------T----C-C-T-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-T-ATA-TCAA
gi|112025 : CA-A-T--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-GT-C-T------AC--CCC-A----T--GC-------G------C------T-G------T----T-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112026 : CA-A-T--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-GT-C-C---T-AGC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-T-G-T----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-AA--C-C--CC---TTA-G--C-T-G-G-ATA-CCAA
gi|112027 : CA-A-T--GT-CAAA-C-AG---------C---T--G-GT-C-T---TTAAC--CCT------T--GT-------T------T------C-G------T----C-C-A-C----TC--A-C-T-AT--C--T-T-CT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ACA-A
gi|112028 : CA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---T--G-TT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----T-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-G--CC---TTC-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112033 : CA-G-G--GT-CAAA-T-CA---------A---T--G-GT-C-T---T-AA----CC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-A-C----T---A-A-T-AT-----T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-ATATC-ACAA
gi|112035 : CA-A-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-GT-C-T---G-TAG--ACT-A----T--GT-------G------C------T-G-----------C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--TC---TTT-G--C-A-T-G-ATA-TCAA
gi|112036 : CA-T-G--GC-CAAA-C-CGTGTTTTAAAC---T--G-GT-G-T---T-AAC--CTC-G----T--GT-------G------T------T-G------T----C-T-A-C----TC--A-A-T-GT--C--T-T-TT-AA--T-C--CC---TTT-G--C-T-A-G-ATA-G
gi|112038 : A-A-G--GT-CATA-T-CA---------C---T--G-AT-C-T---G-AAC--CAT-T----T--GT-------G------T------T-GGTG---T----T-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112039 : A-A-T--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-A-C--CCC-A----T--AT-------G------C------T-G------T----T-C-C-T----CC--A-A-T-ATT-C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TCT-G----T-T-G-ATA-ACAA
gi|112040 : A-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---T--G-GT-C-T---TAAACG-CCC-ATT--T--GT-------G------T------T-G------TGC--C-T-G-CT---TC--G-A-A-AT--C--T-T-TT-GA--C-CTGCCCTTTTT-G--C-T-T-GAATAGACAA
gi|112041 : A-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA----C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112042 : A-A-G--GT-CAAAGT-CAA--------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCA-A-------GA-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-G-TC-GG--T-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-G
gi|112043 : A-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---T--G-GT-C-T---G-AAC--CAT-A----C--GT-------G------T------T-GGTGTTGT----A-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-GCAA
gi|112044 : A-A-G--GT-CAAA---CG---------C---T--G-GT-T-TGGCC-AAC--TCC-A----T--GT-------G------T------T-T------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-GCAA
gi|112045 : A-A-G--GT-CAAA-C-AG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--TCC-A----T--GT-------G------TTGGTGTT-G------T----C-C-G-C----TC--A-G-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CT---TTT-G--C-A-T-A-ATA-ACAA
gi|112046 : A-A-G--GT-CA-------------------------GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------GTTTGTGT------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--A--T-T-TC-GA--T-C--CA---TTT-G--C-T-T-A-ATA-ACAA
gi|112048 : A-A-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-GT-C-T---G-TAG--ACT-A----T--GT-------G------C------T-G------TT---C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--A-C--TC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112050 : A-A-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-TT-C-TA--T-AGA--CT--A----T--GT-------G------C------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112051 : -A-G--GC-CAGA-C-TG---------T---T--G-GT-C-T---G-TAG--ACC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--A--T-T-TT-GA--C-C--CT---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112055 : -A-G--GT-CAAAAT-CA-------------T--G-GT-C-T-----AAA--CCC-A----T---T-------G------T------T-G------T----CGC-G-C----TC--A-A-TTAT--C--T-T-TTTGA--C-C--CC---CTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112056 : -A-G--GT-CAAA-T-TA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCTTA----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-A-AT--C--T-T-TT-GA--C-T--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-A
gi|112057 : -A-G--GT-CAA--C-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAT--CCT-AAT--T--GT-------G------G------T-G------T----C-C-G-C----CT--C-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTCGG--C-TCT-G-ATA-ACA
gi|112058 : -G--GT-CAAA-T-TAAC-------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A-------GT-------G------T------T-G------T----C-----C----TC--A-A-TGAT--CT-T-T-TT-GA--C-C--CC----TT-G----T-T-G-ATA-ACAA
gi|112060 : --GT-CAAA-T-AA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CC--A----T--GT-------G------T------T-G------T----T-T-G-C----TC--A-A-A-AT--C----T-TT-GG--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112061 : AAA-C-TG---------T---C--G-GT-C-T---G-TAG--ACC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-C--T-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112062 : AAA-T-TA---------C---T--G-GT-C-T---T-AA---CCC-A-------GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-A-AT--C--TGTGTT-GA--T-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-A
gi|112065 : --G-GT-C-T---T-CAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-C-TT-GA--C-C--TC---TTT-G--C-T-T-T-ATA-TCAA
gi|112066 : --G-GT-C-T---T-AAG--ACC-AA---T--AT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C------TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112070 : CC-A----T--AT-------G------T------T-G------TT---C-C-G------TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC----TT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112074 : ggtctgtagaCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TCT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112075 : CC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-T-G-C----TCC-A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--T-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112076 : -A----T--GT-------G------T------T-G------T----T-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-T--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112077 : ccatgtCT-A----T--GT-------G------C------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--TC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCA
gi|112078 : CC-A----T--GT-------G------T------T-A------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112081 : CC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GGC-C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112082 : ----T--GT-------G------T------T-G------T----T---G-C----TC--A-AAT-AT--C--T-T-TT-GA--CAC--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112083 : ccatcCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112085 : CC-A----T--AT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-G-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112088 : CC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-T---C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--TC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-G
gi|112089 : C-A----T--GT-------G------T------TTG------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AA--C--T-T-TT-GA--C-C--CT---TTT-G--C-T-T-A-ATA-ACAA
gi|112091 : C-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA----C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112094 : --GT-------G------T------G-G------T----C-C-A-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112095 : ----T--GT-------G------T------T-G------G----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CT---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
blockSeqs : CG CCGTGTTTTAAA TT T A GGC AG GCTT GTTGGGC TTTGTG TGGTGT GTGTTG ACGT GGCC AG A A GA
blockSeqs : CG TCAAAACT G T A G GC AG GTTGGGC AT TGGTGT GTGTTG GC CTG C A A T
blockSeqs : . TCAAAACT . T A C A TT ATTTGT T . GTG T CAA C T A T
blockSeqs : . GTCAA . . . G G AT G . . T T T . G T A
blockSeqs : . TTAAC . . . G . A T . . T . . . . A A
blockSeqs : . TTTA . . . A . . T . . . . . . . . A
blockSeqs : . CATG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TTCA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TTCA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . ACAA . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . ACAA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TGGT . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . CTGG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . ATCA . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . CTG . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . CTG . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . ACG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . CCA . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . CCA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TCG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TCA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . CCG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . ATG . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . GCT . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . CCG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . ACG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . CTG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . CCG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . CCA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . CTG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TCA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . CTG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . CTG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TCA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TCA . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . CCA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TCA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TCA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TCA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . CTG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . CCG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TAG . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . CCG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TCA . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . TCA . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . TAA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TCA . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . TCA . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . TTG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . CCA . . . . . . . . . . . . . . . C
blockSeqs : . TGG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TGG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . CCG . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . TGG . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . GGG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . CCG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TGG . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . CCA . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . CCA . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . CAG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TCA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TCA . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . TGG . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . TCA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . CCA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TCA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TCA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TCA . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . CAG . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TGG . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . TGG . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . CTG . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . TTA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . CCA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TAA . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . CTG . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . TTA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . CA . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . TA . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . CG . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : G . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
finalCons : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
Alignments
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Reference ( family-214 ) : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|111957 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-T------T----C-C-G-C----TC--A-A-A-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CT---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|111958 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-TG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--AT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--A--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|111959 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-TG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--AT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--A--T-T-TT-GA--C-C--TC---GTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|111960 : TCA-A-G--GT-CAAA-A-CG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--ACC-A----T--GT-------G------TTGGTGTT-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-C-AT--C--T-T-TT-TA--G-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-AT
gi|111961 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------TACGTC-T-G-C----TC--A-A-C-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|111962 : TCA-A-A--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-GAC--CCC-A----T--AT-------G------C------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--A-T-TT-GA--C-C--CA---TTT-G--C-T-C-G-A-A-A
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gi|111966 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--TCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TCT-G--C-T-T-G-ACA-ACAA
gi|111967 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-CG---------C---T--A-GT-C-T---C-AAC--ACC---------GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TG--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|111968 : TCA-A-A--GT-CAAA-A-TG---------C---T--G-GT-C-C---T-AAC--ACC-A----T--GTATTTGT-G------T------T-G------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-TA--C-T--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|111969 : TCA-A-G--GT-CAGA-G-CT---------T---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCT-A----T--GT-------G------T------T-GGTGTTGT----A-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CG---TTT-C--C-T-T-G-ATA-A
gi|111970 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-CG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----T-T-G-C----TT--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--T-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|111971 : TCA-A-G--GT-CAAC-A-CG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GTG------G------G------T-G------T----T-T-G-C----TC--T-A-C-ATAGT--T-C-TT-TA--T-C--CC---TTT-GGCT-T-T-G-ATA-
gi|111972 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-TG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-A------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--AC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACA
gi|111973 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-CG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----A--AT-------G------T------T-G------T----T-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-A-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-A
gi|111974 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-GT-T-T---T-AAC--CCC-A----T--AT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-C-AT--C--T-T-TT-CA--T-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-G
gi|111975 : TCA-A-G--GT-TAAA-C-TG---------C---T--G-GT-A-T---T-AAC--CAC-A----T--GT-------G------T------T-G------A----C-C-G-C----TC--A-A-T-AG--C--T-T-TT-GG--C-A--CC---TTT-G--C-T-T-T-ATA-G
gi|111976 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------A---T--G-TT-C-T---T-AAA--CCC-A----T--GT-------G------T------G-T------T----C-C-G-C----TCC-A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|111977 : TCA-A-G--GT-CAAATT-TA---------C---T--G-GT-C-T---T-AA---CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-A-AT--C--C-T-TT-GA--T-C--CC---TTT-G--CTT-T-G-ATA-ACAA
gi|111981 : TCA-A-G--GTTCAAA-CATG---------C---T--G-GT-T-C---A-AACAGCCC-AAG--T--GT-------GAT----T------C-G------T----C-C-G-CGGCCTC--A-A-T-AT--C--T-T-T--GA--A-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|111983 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-TG---------C---T--G-GT-C-T---T-CAC--CCT-G----T--GT-------A------T------T-G------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T------------------TTT-G--C-T-T-G-AT
gi|111984 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-TG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC----A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-T--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|111985 : TCA-A-GCGGT-CAAA-TTCA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT--------------T------T-G------T----C-T-GCC----TC--A-A-T-AT--C--T-C-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-C-G-ATA-ACAA
gi|111986 : TCA-A-GCGGT-CAAA-TTCA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT--------------T------T-G------T----C-T-GCC----TC--A-A-T-AT--C--T-C-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-C-G-ATA-ACAA
gi|111987 : TCA-A-A--GG-CAAA-T-CA---------C---T--G-GT-CAT---T-AAC--CC--A----T--GTT------G------T------T-G------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C----T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-GAATA-ACAA
gi|111988 : TCA-A-A--GG-CAAA-T-CA---------C---T--G-GT-CAT---T-AAC--CC--A----T--GTT------G------T------T-G------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C----T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-GAATA-ACAA
gi|111989 : TCA-A-A--GT-CAAA-A-CAA--------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--ACC-A----T--GTGTTGGGCG------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-CAAT--C--T-T-TT-TA--C-C--CC---TTT-G--C-T-TGG-ATA-TCAA
gi|111990 : TCA-A-A--GT-CAAA-A-CAA--------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--ACC-A----T--GTGTTGGGCG------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-CAAT--C--T-T-TT-TA--C-C--CC---TTT-G--C-T-TGG-ATA-TCAA
gi|111991 : TCA-A-G--GT-CAAG-T-CAAAACT----T---T--G-GTTC-T---T-AAG--CCT-A----T--GT-------G------T------T-G------T----A-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--A-C--CC---TTG-A--T-T-T-C-ATA-A
gi|111992 : TCA-A-G--GT-CAAG-T-CAAAACT----T---T--G-GTTC-T---T-AAG--CCT-A----T--GT-------G------T------T-G------T----A-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--A-C--CC---TTG-A--T-T-T-C-ATA-A
gi|111993 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-AT-C-T---T-AAC--CCC-A----A--GT-------G------T------T-G------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--A--T-T-TT-GA--T-G--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATT-ACAA
gi|111994 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------A---T--G-GT-C-T---T-AAC--CC-------T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-A-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC----TT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|111995 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------A---T--G-GT-C-T---T-AAC--CC-------T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-A-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC----TT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|111996 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------A---T--G-GT-C-T---T-AAC--CC-------T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-A-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC----TT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
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gi|111998 : TCA-A-G--GT-GAAA-C-CG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CAC-A----T--GT-------T------T------T-A------T----T-C-A-T----TC--A-A-T-AT--C--C-T-TT-GA----C--CC---TTT-G--C-T-T-T-ATA-ACAA
gi|111999 : TTA-A-G--GT-CATA-T-AG---------C---T--G-GC-C-T---T-AAC--CTC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-AA--C-C--CC---ATT-G--C-T-T-G-GTA-ACA
gi|112000 : TCA-A-G--GT-AAAC-C-CG---------G---T--A-GT-C-T---T-AAC--CAC-A----A--AT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-T--AC---TTT-G--C-T-T-G-ATG-ACAA
gi|112001 : TCA-A-T--GT-CAAA-T-CA---------A---T--G-GT-C-T---T-AAC--CC--A----T--GT-------G------T------T--------T----T-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA----C--CC---TAT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112002 : TCA-A-G--GT-CAAG-T-GGT--------C---C--A-GT-C-TG--T-AAC--T---A----T--GT-------G------T--------G------T----C---G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA----C--TC---TTT-G--C-T-T-GAATA-A
gi|112003 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---TG-G-GT-C-T---T-AA---CCC-A----T--GT-------G------T------T-GT-----T----C-C-G-C----TC--ATA-A-AT--C--T-T-TTCGA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-A-ATA-A
gi|112004 : TCA-A-G--GT-CAAACT-GG---------C---T--G-GT-C-T---T-AACGCCCC-A----TC-GT-------G------T------T-G------T----C-CCG-C----TT--C-A-T-AT--C--T-T-TT-GAATC-G--CC---TTTGG--C-TCT-G-AT
gi|112005 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-AA---------T---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCA-T----T--GT-------AT-----T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-G-----C--CC---TTC-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112006 : TCA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---T--G-AT---T---T-ACC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G-----------C-C-T-C----TCAGA-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-AAAA
gi|112007 : TCA-A-G--GTTCAAA-T-CA---------C---T--G-GT-C-TC--T-AAC--CCC-A----T--GT--------------T------T-GT-----T----C-T-G-C----TC--A-A-A-AT--C--T-T-TT--A--C-C--C-----TT-G--C-T-T-A-ATA-A
gi|112008 : TCA-A-G--TT-CAAA-T-TG---------C---T--G-CT-C-T---C-AAT--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-T-G-C----TC--A-T-T-AT--C--T-T-AT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112009 : TCA-A-G--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-AGCTTT--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-T----TC--A-G-T-AT--A------TT-GA--C-T--CC---TTG-T--C-T-T-G-ATG-A
gi|112010 : TCA-A-G--GT-CAAA-T--A---------C--------GT-T-T---T-AAC--CCC------T--GT-------G------T------T-G------T----C---G------TC--A-A-A-AT--C--T-T-TT-G---C-C--CC---TTT-G--C-T-T-T-ATA-A
gi|112011 : TCA-A-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-GT-C-TG--T-AGA--C--------T--AT-------G------C------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112012 : TCA-A-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-GT-C-TG--T-AGA--C--------T--AT-------G------C------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--TT---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112016 : TCA-ATG--GT-CAAA-C-CG---------C---T--G-GT-C-T--------------G----T--GT-------G------T------T-G------T----T-C-G-CCAA-TC--A-A-T-AT--T--A-T-TT-GA--TTC--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112017 : TCAGA-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-GT-C-T---G-TAG--ACT-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--TC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112019 : TCA-A-G--GT-CAAG-G-GG---------T---C--A-GT-C-T---G-TAG--ACT-A----T--GT-------G------C------T-C------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112020 : TCA-A-G---T-CAAA-C-CG---------C---TTTG-GTTC-T---T-ACC--TTC-A----T--GT-------G------T------C-G------T----C-C-G-C----AC--A-G-T-AT-----T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-A-ATG-A
gi|112021 : TCA-A-A--GT-CAAG----G---------CAAGT--G-GT-CAT---C-TAG--ACT-A----T--GT-------G------C------T-G------T----C-C-G-C----TC--A---T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112022 : TCA-A-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-GT-C-T---G-TAG--ACT-A----T--GT-------G------C------T-G------T----C-C-T-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-T-ATA-TCAA
gi|112025 : CA-A-T--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-GT-C-T------AC--CCC-A----T--GC-------G------C------T-G------T----T-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112026 : CA-A-T--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-GT-C-C---T-AGC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-T-G-T----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-AA--C-C--CC---TTA-G--C-T-G-G-ATA-CCAA
gi|112027 : CA-A-T--GT-CAAA-C-AG---------C---T--G-GT-C-T---TTAAC--CCT------T--GT-------T------T------C-G------T----C-C-A-C----TC--A-C-T-AT--C--T-T-CT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ACA-A
gi|112028 : CA-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---T--G-TT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----T-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-G--CC---TTC-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112033 : CA-G-G--GT-CAAA-T-CA---------A---T--G-GT-C-T---T-AA----CC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-A-C----T---A-A-T-AT-----T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-ATATC-ACAA
gi|112035 : CA-A-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-GT-C-T---G-TAG--ACT-A----T--GT-------G------C------T-G-----------C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--TC---TTT-G--C-A-T-G-ATA-TCAA
gi|112036 : CA-T-G--GC-CAAA-C-CGTGTTTTAAAC---T--G-GT-G-T---T-AAC--CTC-G----T--GT-------G------T------T-G------T----C-T-A-C----TC--A-A-T-GT--C--T-T-TT-AA--T-C--CC---TTT-G--C-T-A-G-ATA-G
gi|112038 : A-A-G--GT-CATA-T-CA---------C---T--G-AT-C-T---G-AAC--CAT-T----T--GT-------G------T------T-GGTG---T----T-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112039 : A-A-T--GT-CAAA-C-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-A-C--CCC-A----T--AT-------G------C------T-G------T----T-C-C-T----CC--A-A-T-ATT-C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TCT-G----T-T-G-ATA-ACAA
gi|112040 : A-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---T--G-GT-C-T---TAAACG-CCC-ATT--T--GT-------G------T------T-G------TGC--C-T-G-CT---TC--G-A-A-AT--C--T-T-TT-GA--C-CTGCCCTTTTT-G--C-T-T-GAATAGACAA
gi|112041 : A-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA----C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112042 : A-A-G--GT-CAAAGT-CAA--------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCA-A-------GA-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-G-TC-GG--T-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-G
gi|112043 : A-A-G--GT-CAAA-T-CA---------C---T--G-GT-C-T---G-AAC--CAT-A----C--GT-------G------T------T-GGTGTTGT----A-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-GCAA
gi|112044 : A-A-G--GT-CAAA---CG---------C---T--G-GT-T-TGGCC-AAC--TCC-A----T--GT-------G------T------T-T------T----C-T-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-GCAA
gi|112045 : A-A-G--GT-CAAA-C-AG---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--TCC-A----T--GT-------G------TTGGTGTT-G------T----C-C-G-C----TC--A-G-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CT---TTT-G--C-A-T-A-ATA-ACAA
gi|112046 : A-A-G--GT-CA-------------------------GT-C-T---T-AAC--CCC-A----T--GT-------GTTTGTGT------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--A--T-T-TC-GA--T-C--CA---TTT-G--C-T-T-A-ATA-ACAA
gi|112048 : A-A-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-GT-C-T---G-TAG--ACT-A----T--GT-------G------C------T-G------TT---C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--A-C--TC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112050 : A-A-G--GT-CAAG-T-GG---------T---C--A-TT-C-TA--T-AGA--CT--A----T--GT-------G------C------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112051 : -A-G--GC-CAGA-C-TG---------T---T--G-GT-C-T---G-TAG--ACC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--A--T-T-TT-GA--C-C--CT---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112055 : -A-G--GT-CAAAAT-CA-------------T--G-GT-C-T-----AAA--CCC-A----T---T-------G------T------T-G------T----CGC-G-C----TC--A-A-TTAT--C--T-T-TTTGA--C-C--CC---CTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112056 : -A-G--GT-CAAA-T-TA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCTTA----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-A-AT--C--T-T-TT-GA--C-T--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-A
gi|112057 : -A-G--GT-CAA--C-CA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAT--CCT-AAT--T--GT-------G------G------T-G------T----C-C-G-C----CT--C-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTCGG--C-TCT-G-ATA-ACA
gi|112058 : -G--GT-CAAA-T-TAAC-------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CCC-A-------GT-------G------T------T-G------T----C-----C----TC--A-A-TGAT--CT-T-T-TT-GA--C-C--CC----TT-G----T-T-G-ATA-ACAA
gi|112060 : --GT-CAAA-T-AA---------C---T--G-GT-C-T---T-AAC--CC--A----T--GT-------G------T------T-G------T----T-T-G-C----TC--A-A-A-AT--C----T-TT-GG--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112061 : AAA-C-TG---------T---C--G-GT-C-T---G-TAG--ACC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-C--T-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112062 : AAA-T-TA---------C---T--G-GT-C-T---T-AA---CCC-A-------GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-A-AT--C--TGTGTT-GA--T-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-A
gi|112065 : --G-GT-C-T---T-CAC--CCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-C-TT-GA--C-C--TC---TTT-G--C-T-T-T-ATA-TCAA
gi|112066 : --G-GT-C-T---T-AAG--ACC-AA---T--AT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C------TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112070 : CC-A----T--AT-------G------T------T-G------TT---C-C-G------TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC----TT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112074 : ggtctgtagaCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TCT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112075 : CC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-T-G-C----TCC-A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--T-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112076 : -A----T--GT-------G------T------T-G------T----T-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-T--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-
gi|112077 : ccatgtCT-A----T--GT-------G------C------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--TC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCA
gi|112078 : CC-A----T--GT-------G------T------T-A------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112081 : CC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GGC-C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112082 : ----T--GT-------G------T------T-G------T----T---G-C----TC--A-AAT-AT--C--T-T-TT-GA--CAC--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-ACAA
gi|112083 : ccatcCC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112085 : CC-A----T--AT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-G-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112088 : CC-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-T---C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--TC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-G
gi|112089 : C-A----T--GT-------G------T------TTG------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AA--C--T-T-TT-GA--C-C--CT---TTT-G--C-T-T-A-ATA-ACAA
gi|112091 : C-A----T--GT-------G------T------T-G------T----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA----C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112094 : --GT-------G------T------G-G------T----C-C-A-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CC---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA
gi|112095 : ----T--GT-------G------T------T-G------G----C-C-G-C----TC--A-A-T-AT--C--T-T-TT-GA--C-C--CT---TTT-G--C-T-T-G-ATA-TCAA