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Reference ( gi|22824 )        : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TTC-TA-T-A-C--G--G--T-C---T-A-TC---AG--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
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gi|22924                      :  GT-GAA-A-TA------G-C-TT--------G--TA----AA--C--------A------CGT--TCTC--C-T-C-TA-TTA-C--G--G--T-C---T-A-TC---AG--A------T--AACC-T--GG-AA-ACTT
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gi|22930                      :   T-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTG--T-CCC-TA-T-A-T--G--G--C-T---T-A-TT---GA--A------T--AGCC-T--TA-AA-A
gi|22933                      :   T-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTCTTC-TTT-CG-T-A-CATG--G--C-A---T-A-CT---GG--A------T--AGCT-T--TG-AA-ATTT
gi|22934                      :   T-AAA-A-TA------T-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TTT-AA-T-A-T--G--GC-T-T---T-A--C---AG--G------T--AGAC-T--TG--A-ACTT
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Reference ( family-212 )      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TTC-TA-T-AC--G--G--C-C---T-A-T-C---G-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
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gi|22872                      : TGT-AAA-G-T------------T--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--TGTTC-TA-TTAC--G--G--TTC---T-A-T-C---A-G--A------T--AACC-T--CG-AA-ACTT
gi|22873                      : TGT-AAAGA-TA------G-TGCT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--T-TC--C-TTC-TA-T-AC--G--G--T-C-----A-T-C---A-G--A------T--AACC-T--TG-AA-ACTT
gi|22874                      : TGT-AAA-A-T-------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-G--TCTC--C-T----A-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22876                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------T-T--TCTT--C-TT--------C--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AA-C-T--TG-AA-ACTT
gi|22877                      : TGTCAAA-A-TA------G-C-TT--------G--TGA---AA--C--------A------C-T--TC-C--C-TTC-TA-C--C--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--AT-----T--AACC-T--TG-AA-ACTT
gi|22878                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--GA----AA--C--------A------C-T--TCTT--C-TAC-TA-T-AC-----G--T-C---T-A-T-C---A-A--A------T--AG-C-T--TG-AA-ACTT
gi|22879                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----GA--C--------A------C-T--TC----------TA-T-AC--G--G--A-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACT
gi|22881                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--ACTC--C-TT-----T-AT--G--G--C-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22882                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C--TC-TA-T--T--A--G--T-C---TAA-T-C---A-G--A------T--AACC-C--TC-GA-ACTT
gi|22883                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TA----AA--C--------AATG---C-T--TCTC--C-TCC-TA-T-AT--G--G--A-T---T-G-T-T---G-G--AT-----T--AGCC-T--TG-AA-AC
gi|22884                      : TGT-AGA-A-TA------G-C-TT--------G--AG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TCC-TT-A-AT--G--G--C-T---T-A-T-C---C-G--G------T--AGCC-T--TG-AA-ATTT
gi|22885                      : TGT-AAT-A-TA------G-C-TTTTGAACTCG--TG----AA--C--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-C-AC--T--G--C-T---T-A-A-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
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gi|22888                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC------C-TA-T-AT--G--G--C-T---T-T-TGT---G-A--A------T--AGCC-T--TG-AA-ATTT
gi|22889                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AG--C--------A------C-T--TCTC------C-TA-T-AT--G--G--T-T---T-A-T-C---G-G--A------T--AAAA-C--TG-AA-ATTT
gi|22890                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TAT---C-TCC-TA-T-----G--G--C-T---T-A-C-T---G-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22891                      : TAT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-C--CCTC--A-TCC-TA-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-T---T-G--A------T--AGAC-T--TG-
gi|22892                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--T-----C-TTC-TA-T-AC--A--A--C-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGAC-TTGTG-AA-ATTT
gi|22894                      : TGT-AAA---TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------G------C-T--T-----C-TTC-TA-T-AC--A--G--T-T---T-A-T-T---A-G--G------T--AGAT-T--TG-AA-ATTT
gi|22896                      : TGT-GAA-A-TA------G-C-TT--------G--TT----AA--C--------A------T-T--TCTT--T-TCC-TC-T-AC--A--G--T-T---A-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-C--TG-AA-ACT
gi|22897                      : TGT-AAT-A-TA------G-CATT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--A---C-TA-C-AC--G--A--G-C---T-ACT-C---A-G--A------T--AGCC----TG-AA-ACTT
gi|22899                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-T---------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCCC------C-TA-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGAC-T--TG-AC-ACTT
gi|22902                      : TGT-AAA-C-TA------A-T-TT--------G--TA----AA--C--------A------C-T--TCCC--C-TTG-TA-C-AT--G--G--C-T---C-A-T-T---G-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ATTT
gi|22903                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------A--TG----AA--C--------A------C----TCTC--T-TCC-TA-T-AT--G--G--C-C---T-A-T-TG--G-G--A------T--AGCT-T--T--AA-ATTT
gi|22904                      : TGT-ATATA-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCT---C-TTC-CATT-AT--G--A--C-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ATTT
gi|22905                      : TGT-TAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------G-T--TCTC------C-TA-T-AT--G--G--C-G---T-A-T-T---G-G--A------T--AGTC-T--TG-AA-A
gi|22906                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--CA----AA--T--------A------C-T--AATC--C-T----A-T-AT--G--G--A-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22908                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTA--A-ACC-TA-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGCC-
gi|22909                      : TGT-AAA-AATA------G-CGTT--------GCTTG----A---C--------AT-----C-T--TCTT--C-TTC-TA-T-AC--GCGG--T-C---C-A-T-C---A-A--A------T--AGCC-T--TC-GA-ACTT
gi|22910                      : TGT-AAT-A-TA------G---TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCT---C-TTC-TA-C-AT--GA-G--------T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC----TG-AA-ACTT
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gi|22924                      :  GT-GAA-A-TA------G-C-TT--------G--TA----AA--C--------A------CGT--TCTC--C--TC-TATT-AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AACC-T--GG-AA-ACTT
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gi|22927                      :   T-AAT-A-TA------G-C-TT--------G--TG----TG--C--------A------C-T--TTTC--C-ATC-TA-C-AC--G--A--G-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22929                      :   T-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--GG----AA--C--------A------C-T--T-----C-TTC-TATT-AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-A--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACCT
gi|22930                      :   T-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTG--T-CCC-TA-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-T---G-A--A------T--AGCC-T--TA-AA-A
gi|22931                      :   T-GAA-A-TA------G-C-AT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TTTT--C-TCC-TG-T-AC--G--G--C-T---G-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-AC
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gi|22963                      :                    -C-TT--------G--TG----AA--C--------G------C-T--TCTT--C-TCC-TA-T-AT--T--G--T-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
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gi|22965                      :                      -TT--------G--AG----AA--T--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACT
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Alignments
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lowQualScore                  :    9   7 7  444444 4 6  99999999 66  3333  66 33333333 333333 8 00    11 4 8 4  2 4  11 00 11111111 8 4 4 55555 66 999999 66  0 4 00  4  4    
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Reference ( family-212 )      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TTC-TA-T-AC--G--G--C-C---T-A-T-C---G-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22824                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TTC-TA-T-AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22825                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TTC-TA-T-AC-----G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AACC-T--CG-AA-ACTT
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gi|22834                      : TGT-AAA-A-TACATGTAG-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTT--C-TTC-TA-C-AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACT
gi|22835                      : TGT-AAA-AATA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TATC--C-TTC-TA-C-AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AGTC-T--TG-AA-ACT
gi|22836                      : TGT-AAA-A-TACATGTAA-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TATC--C-TTC-TA-C-AC--G--G--T-C---T-A-T-CT--GTG--A------G--AG---T--TG-AA-ACT
gi|22837                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------T-T--TCTC--C-TTC-TA-C-AC--T--G--T-G---T-A-T-C---A-C--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22838                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--CG----AA--C--------A------C-TAATCT---------TA-T-AC--G--G--A-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22839                      : TGTCAAA-A-AA------T-C-TC--------G--TG----AA--C--------G------C-T--TCTC--T-TCC-TA-T-AA--C--A--A-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22840                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-A--TCTC--T-TCT-TA-T-TT--G--G--C-A---T-A-C-T---G-G--A------T--AGCT-T--TG-AC-ATTT
gi|22841                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCCC--C-TTC-TA-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ATTT
gi|22842                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TA----AA--T--------C------T-T--TCTCTTC-TTG-TA-T-AC--A--G--C-T---T-A-T-C---A-GATA------T--AGGC-T--TG-AA-A
gi|22843                      : TGT-AAA-G-TA------G-A-TT--------A--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--T-TCT-TA-T-AT--G--G--C-T---T-A-C-T---G-G--A------T--AGCT-T--TG-AC-ATTT
gi|22844                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--CCC------A------C-T--TCTC--C-TTC-TA-T-AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--T------T--AACCTT--TG-TA-ACTT
gi|22845                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--GG----AA--C--------A------C-T--TTTT--C-TTC-TC-T-AC--G--G--T-T---T-A-T-C---G-A--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22847                      : TGT-AAA-AATA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T----TC--C-TTC-TA-T-AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------TAAAGCC-T--TGAAA-ACTT
gi|22848                      : TGT-AAA-A---------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TTC-TA-T-A---G--G--T-C-----A-T-------A--A------T--AACC-T--TG-AA-ACTT
gi|22849                      : TGT-GAA-A-TA------G-C-TT--------G--GG----AA--C--------A------C-T--------C-TTC-TA-T-AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-A--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22850                      : TGT-AAA---TA------G-C-TT--------G--TG----AA--CTGTGAAC-G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-A-AC--G--G----T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22851                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-CT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCT---C-TTC-TA-T--T--A--G--C-T---T-A-T-T-----G--A------T--AGCT-T--TG-GA-AATT
gi|22852                      : TGT-AAA---TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T---CTC--C-TTC-TA-C-AC--A--A--G-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22853                      : TGT-AAATA-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------G------C-T--TCTC--T-TTC-TA-C-GT--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------T--TGCT-T--TG-AA-ACTT
gi|22854                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--T-TTC-TA-T-AT--A--G--C-T---A-A-T-T---G-G--A------T--AGCT-T--TG-AA-ATTT
gi|22855                      : TGT-AAA---TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCT---C-TTC-TA-C-ACATA--G----C---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACCT
gi|22856                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--CG----AA--T--------A------C-T--AATC--C-T----A-T-AC--G--G--A-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22857                      : TGT-AAT-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------G------C-T--CATC--T-TTC-TA-C-GT--G--G--T-C---T-A-T-A---A-G--AT-----T--TGCT-T--TG-AA-ACTT
gi|22858                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G---G----AA--C--------A------C-T--TCTT--C-TT--TA-T-AC--G--T--T-C---T-A-T-C---A-A--A------T--AGCC-T--TG-AC-ACTT
gi|22859                      : TGT-AAT-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--CTCGTAAACG------C-T--TCTC--C-TCC-TA-A-AC--C--G--G-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22860                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--T-TTC-TA-T-AT--A--G--C-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGCT-T--TG-AA-A
gi|22863                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCT----------A-C-AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACT
gi|22864                      : TGT-AGA-A-TA------G-C-TT--------G--TGTATGAA--C--------A------C-T--TCTC--C-T----A-C-AC--G--G--C-C---T-A-T-C---A-G--ATACTAGT--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22865                      : TGT-ATA-A-TA------G-C-TT--------G--CA----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-T----A-C-AT--G--G--C-C---T-A-T-C---G-G--G------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22866                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------T--TG----AA--C--------A------T-T--TCTC------C-TA-C-AT--G--G--C-T---T-A-T-C---G-G--ATG----T--AGAC-G--TG-AA-ACTT
gi|22868                      : TGT-AAA-ACTA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------CTT--TCTC--C-TTCTTA-T-AC--G--GTTT-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AA-C-T--TG-AA-ACTT
gi|22869                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-T---------G--TC----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TCC-TA-T-AT--G--G--C-C---C-A-T-C---G-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22871                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------T-T--TCTC--C-TTT-TA-T-AC--G--G--T-A---T-A-T-CAANA-A--A------T--AGCT-TG-TG-AA-
gi|22872                      : TGT-AAA-G-T------------T--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--TGTTC-TA-TTAC--G--G--TTC---T-A-T-C---A-G--A------T--AACC-T--CG-AA-ACTT
gi|22873                      : TGT-AAAGA-TA------G-TGCT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--T-TC--C-TTC-TA-T-AC--G--G--T-C-----A-T-C---A-G--A------T--AACC-T--TG-AA-ACTT
gi|22874                      : TGT-AAA-A-T-------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-G--TCTC--C-T----A-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22876                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------T-T--TCTT--C-TT--------C--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AA-C-T--TG-AA-ACTT
gi|22877                      : TGTCAAA-A-TA------G-C-TT--------G--TGA---AA--C--------A------C-T--TC-C--C-TTC-TA-C--C--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--AT-----T--AACC-T--TG-AA-ACTT
gi|22878                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--GA----AA--C--------A------C-T--TCTT--C-TAC-TA-T-AC-----G--T-C---T-A-T-C---A-A--A------T--AG-C-T--TG-AA-ACTT
gi|22879                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----GA--C--------A------C-T--TC----------TA-T-AC--G--G--A-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACT
gi|22881                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--ACTC--C-TT-----T-AT--G--G--C-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22882                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C--TC-TA-T--T--A--G--T-C---TAA-T-C---A-G--A------T--AACC-C--TC-GA-ACTT
gi|22883                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TA----AA--C--------AATG---C-T--TCTC--C-TCC-TA-T-AT--G--G--A-T---T-G-T-T---G-G--AT-----T--AGCC-T--TG-AA-AC
gi|22884                      : TGT-AGA-A-TA------G-C-TT--------G--AG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TCC-TT-A-AT--G--G--C-T---T-A-T-C---C-G--G------T--AGCC-T--TG-AA-ATTT
gi|22885                      : TGT-AAT-A-TA------G-C-TTTTGAACTCG--TG----AA--C--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-C-AC--T--G--C-T---T-A-A-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22887                      : TGT-AAA-A-TA------G-T-TA--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TAC-AA-T-AG--G--G--C-A---T-A-T-C---A-G--A------T--GAAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22888                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC------C-TA-T-AT--G--G--C-T---T-T-TGT---G-A--A------T--AGCC-T--TG-AA-ATTT
gi|22889                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AG--C--------A------C-T--TCTC------C-TA-T-AT--G--G--T-T---T-A-T-C---G-G--A------T--AAAA-C--TG-AA-ATTT
gi|22890                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TAT---C-TCC-TA-T-----G--G--C-T---T-A-C-T---G-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22891                      : TAT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-C--CCTC--A-TCC-TA-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-T---T-G--A------T--AGAC-T--TG-
gi|22892                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--T-----C-TTC-TA-T-AC--A--A--C-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGAC-TTGTG-AA-ATTT
gi|22894                      : TGT-AAA---TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------G------C-T--T-----C-TTC-TA-T-AC--A--G--T-T---T-A-T-T---A-G--G------T--AGAT-T--TG-AA-ATTT
gi|22896                      : TGT-GAA-A-TA------G-C-TT--------G--TT----AA--C--------A------T-T--TCTT--T-TCC-TC-T-AC--A--G--T-T---A-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-C--TG-AA-ACT
gi|22897                      : TGT-AAT-A-TA------G-CATT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--A---C-TA-C-AC--G--A--G-C---T-ACT-C---A-G--A------T--AGCC----TG-AA-ACTT
gi|22899                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-T---------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCCC------C-TA-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGAC-T--TG-AC-ACTT
gi|22902                      : TGT-AAA-C-TA------A-T-TT--------G--TA----AA--C--------A------C-T--TCCC--C-TTG-TA-C-AT--G--G--C-T---C-A-T-T---G-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ATTT
gi|22903                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------A--TG----AA--C--------A------C----TCTC--T-TCC-TA-T-AT--G--G--C-C---T-A-T-TG--G-G--A------T--AGCT-T--T--AA-ATTT
gi|22904                      : TGT-ATATA-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCT---C-TTC-CATT-AT--G--A--C-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ATTT
gi|22905                      : TGT-TAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------G-T--TCTC------C-TA-T-AT--G--G--C-G---T-A-T-T---G-G--A------T--AGTC-T--TG-AA-A
gi|22906                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--CA----AA--T--------A------C-T--AATC--C-T----A-T-AT--G--G--A-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22908                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTA--A-ACC-TA-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGCC-
gi|22909                      : TGT-AAA-AATA------G-CGTT--------GCTTG----A---C--------AT-----C-T--TCTT--C-TTC-TA-T-AC--GCGG--T-C---C-A-T-C---A-A--A------T--AGCC-T--TC-GA-ACTT
gi|22910                      : TGT-AAT-A-TA------G---TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCT---C-TTC-TA-C-AT--GA-G--------T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC----TG-AA-ACTT
gi|22912                      : TGT-GAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------A-T--TCTC--T-TAC-TA-T-AT--A--G--C-A---TAA-T-A---A-G--A------A--AGCC-T--TG-GA-ATTT
gi|22921                      :  GC-AAA-A-T---------C-TC--------A--TA----AA--C--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-T-AC--C--A--C-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-A--TG-AA-ACTT
gi|22923                      :  GT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC------C-TA-T-AC--A--G--C-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-GCTT
gi|22924                      :  GT-GAA-A-TA------G-C-TT--------G--TA----AA--C--------A------CGT--TCTC--C--TC-TATT-AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AACC-T--GG-AA-ACTT
gi|22925                      :  GT-AAAGA-TA------TTC-TT--------G--TG----AA--C--------A------A-T---CTT--C-TTC-TA-T-AC--G--G--------T-A-T-C---A-G--A------T--AACC-T--TG-AA-ACTT
gi|22927                      :   T-AAT-A-TA------G-C-TT--------G--TG----TG--C--------A------C-T--TTTC--C-ATC-TA-C-AC--G--A--G-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22929                      :   T-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--GG----AA--C--------A------C-T--T-----C-TTC-TATT-AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-A--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACCT
gi|22930                      :   T-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTG--T-CCC-TA-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-T---G-A--A------T--AGCC-T--TA-AA-A
gi|22931                      :   T-GAA-A-TA------G-C-AT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TTTT--C-TCC-TG-T-AC--G--G--C-T---G-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-AC
gi|22933                      :   T-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTCTTC-TTT-CG-T-ACATG--G--C-A---T-A-C-T---G-G--A------T--AGCT-T--TG-AA-ATTT
gi|22934                      :   T-AAA-A-TA------T-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TTT-AA-T-AT--G--G--C-T---T-T-A-C---A-G--G------T--AGAC-T--TG--A-ACTT
gi|22937                      :    -AAA-A-T---------C-TC--------G--CG----AG--C--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-A-AC--C--G--C-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22939                      :    -AAA-A-T---------C-TC--------G--TG----AA--C--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-T-AC--C--G--C-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AG-ACTT
gi|22940                      :    -AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTT--C-TTC-TA-C-AC--A--A--T-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AG-ACTT
gi|22941                      :    -AAA-A-T---------C-TC--------G--TG----AA--C--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-A-AC--C--G--C-T---T-A-T-T---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22942                      :    -AAA-A-CA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------T-T--TATC--C-TTC-TA-T-AC--G--G--T-C---T-C-T-C---A-G--A------T--AACA-T--TG-AA-ACTT
gi|22943                      :    -AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--A--------A------C-T--T--------TC-TA-T-AT--T--G--T-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22947                      :    -AAA-A-AA------G-C-TT--------G--TA----AA--C--------A------C-T--CTTC--C-TCC-CA-T-AT--A--G--C-T---T-A-T-C---A-G--A------T--ATCC-T--TG-AA-ATTT
gi|22948                      :    -AAA-A-T---------C-TC--------G--TG----AA--C--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-A-AC--C--G--C-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22949                      :    -AAA-A-T---------C-TC--------G--TG----AA--C--------G------C-T--TCTC--T-TCC-TA-T-AC--T--G--C-T---T-A-C-C---A-G--A------T--CGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22950                      :    -AAA-A-T---------C-TC--------G--CG----AG--C--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-T-AC--C--G--C-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACT
gi|22951                      :    -AAA-A-T---------C-TC--------G--TG----AA--C--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-A-AC--C--G--C-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AAAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22956                      :      AA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------T-T--TCTC--C-TTT-TA-T-AC--T--G--T-A---T-A-T-C---A-A--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22961                      :        -A-TA------G-C-TC--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTT--C-TCC-TA-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-
gi|22963                      :                    -C-TT--------G--TG----AA--C--------G------C-T--TCTT--C-TCC-TA-T-AT--T--G--T-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22964                      :                    -C-TT--------G--TG----AA--T--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-T-AC--C--G--C-TTAAT-A-T-C---A-G--G------T--AGTC-T--TG-AA-ACTT
gi|22965                      :                      -TT--------G--AG----AA--T--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACT
gi|22966                      :                      -TT--------G--TG----AA--C--------A------C-C--TCTC--C-C-C-TA-T-AA--G--G--C-T---A-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ATTT


blockSeqs                     :        T A  CATGTA   C  TTGAACTC     TATG     TCGTAAAC TGAATG         TT   T    T    AT    CTTAA          AANA     TACTAG
blockSeqs                     :        G A  CATGTA   G  G            A        TGTGAAC  ATG            TT   T    T    AT    TTTC           TGT      TG    
blockSeqs                     :        T C  .        A  .            .        CC       T              .    T    T    .     TTC            GG       T     
blockSeqs                     :        G A  .        G  .            .        .        .              .    T    .    .     TC             A        T     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     TC             A        T     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     TC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     TC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     GC             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     TC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     TC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     TC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     TC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     TG             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     AT             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     AT             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CA             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CT             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CT             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     TC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     TT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     TC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     TC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     TC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CT             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     GC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     TC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     AT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     TC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     TC             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     GT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     TC             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CC             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CT             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    A    .    .     CC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     TA             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     TC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     TC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     TC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    A    .    .     TC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     AC             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     TC             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     AT             C        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     CA             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CT             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     TT             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CT             T        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CT             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    A    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     TT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     TT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     GC             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CT             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CT             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     CC             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CG             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     AT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     TC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CA             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     TC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     GC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     TC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     CT             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     CA             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    T    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     CC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     TT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    C    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    .    .    .     TC             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    .    .    .     TT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    .    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    .    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    .    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    .    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    .    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    .    .    .     TA             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    .    .    .     CT             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    .    .    .     TT             G        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    .    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :        . .  .        .  .            .        .        .              .    .    .    .     CT             A        .     
blockSeqs                     :                      .  .            .        .        .              .    .    .    .     T              A        .     
blockSeqs                     :                      .  .            .        .        .              .    .    .    .     C              .        .     
blockSeqs                     :                      .  .            .        .        .              .    .    .    .     .              .        .     
blockSeqs                     :                      .  .            .        .        .              .    .    .    .     .              .        .     


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TTC-TA-T-AC--G--G--C-C---T-A-T-C---G-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
finalCons                     : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TTC-TA-T-AC--G--G--C-C---T-A-T-C---G-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT





Alignments
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lowQualScore                  :    9   7 7  444444 4 6  99999999 66  3333  66 33333333 333333 8 00    11 4 8 4  2 4  11 00 11111111 8 4 4 55555 66 999999 66  0 4 00  4  4    
consensus                     : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TTC-TA-T-AC--G--G--C-C---T-A-T-C---G-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
Reference ( family-212 )      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TTC-TA-T-AC--G--G--C-C---T-A-T-C---G-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22824                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TTC-TA-T-AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22825                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TTC-TA-T-AC-----G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AACC-T--CG-AA-ACTT
gi|22826                      : TGT-AAA-A-TA------G-CCTT--------G--TG----AA--C--------A------C-TG-TCTC--C-TTC-TA---AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22827                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TTG-------G--TG----AA--C--------A------C----TCTC--C-TTC-TA---AC--G--G--T-C---T-A-T-C-----A--A------T--AACC-T--CG-AACACTT
gi|22829                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TT----AA--C--------A------C-T--TCTT--C-TTC-TA-T-AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-A--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACT
gi|22830                      : TGT-AAT-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-C-AC--C--G--C-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22831                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-C--T-----C-TTC-TA-C-AC--A--A--G-C---T-A-T-C---A-A--A------T--AGCT-T--TG-AA-ACTT
gi|22832                      : TGT-AAT-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AAATC--------ATGAATGC-T--TCTC--C-TCC-TA-A-AC--C--G--C-T---T-A-T-C---G-G--A------T--AGAC-T--TG-GA-ACTT
gi|22833                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------T-T--TCTC--C-TTC-TG-T-AC--C--G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AACC-T--TG-AA-ACTT
gi|22834                      : TGT-AAA-A-TACATGTAG-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTT--C-TTC-TA-C-AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACT
gi|22835                      : TGT-AAA-AATA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TATC--C-TTC-TA-C-AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AGTC-T--TG-AA-ACT
gi|22836                      : TGT-AAA-A-TACATGTAA-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TATC--C-TTC-TA-C-AC--G--G--T-C---T-A-T-CT--GTG--A------G--AG---T--TG-AA-ACT
gi|22837                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------T-T--TCTC--C-TTC-TA-C-AC--T--G--T-G---T-A-T-C---A-C--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22838                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--CG----AA--C--------A------C-TAATCT---------TA-T-AC--G--G--A-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22839                      : TGTCAAA-A-AA------T-C-TC--------G--TG----AA--C--------G------C-T--TCTC--T-TCC-TA-T-AA--C--A--A-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22840                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-A--TCTC--T-TCT-TA-T-TT--G--G--C-A---T-A-C-T---G-G--A------T--AGCT-T--TG-AC-ATTT
gi|22841                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCCC--C-TTC-TA-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ATTT
gi|22842                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TA----AA--T--------C------T-T--TCTCTTC-TTG-TA-T-AC--A--G--C-T---T-A-T-C---A-GATA------T--AGGC-T--TG-AA-A
gi|22843                      : TGT-AAA-G-TA------G-A-TT--------A--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--T-TCT-TA-T-AT--G--G--C-T---T-A-C-T---G-G--A------T--AGCT-T--TG-AC-ATTT
gi|22844                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--CCC------A------C-T--TCTC--C-TTC-TA-T-AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--T------T--AACCTT--TG-TA-ACTT
gi|22845                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--GG----AA--C--------A------C-T--TTTT--C-TTC-TC-T-AC--G--G--T-T---T-A-T-C---G-A--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22847                      : TGT-AAA-AATA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T----TC--C-TTC-TA-T-AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------TAAAGCC-T--TGAAA-ACTT
gi|22848                      : TGT-AAA-A---------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TTC-TA-T-A---G--G--T-C-----A-T-------A--A------T--AACC-T--TG-AA-ACTT
gi|22849                      : TGT-GAA-A-TA------G-C-TT--------G--GG----AA--C--------A------C-T--------C-TTC-TA-T-AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-A--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22850                      : TGT-AAA---TA------G-C-TT--------G--TG----AA--CTGTGAAC-G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-A-AC--G--G----T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22851                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-CT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCT---C-TTC-TA-T--T--A--G--C-T---T-A-T-T-----G--A------T--AGCT-T--TG-GA-AATT
gi|22852                      : TGT-AAA---TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T---CTC--C-TTC-TA-C-AC--A--A--G-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22853                      : TGT-AAATA-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------G------C-T--TCTC--T-TTC-TA-C-GT--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------T--TGCT-T--TG-AA-ACTT
gi|22854                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--T-TTC-TA-T-AT--A--G--C-T---A-A-T-T---G-G--A------T--AGCT-T--TG-AA-ATTT
gi|22855                      : TGT-AAA---TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCT---C-TTC-TA-C-ACATA--G----C---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACCT
gi|22856                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--CG----AA--T--------A------C-T--AATC--C-T----A-T-AC--G--G--A-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22857                      : TGT-AAT-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------G------C-T--CATC--T-TTC-TA-C-GT--G--G--T-C---T-A-T-A---A-G--AT-----T--TGCT-T--TG-AA-ACTT
gi|22858                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G---G----AA--C--------A------C-T--TCTT--C-TT--TA-T-AC--G--T--T-C---T-A-T-C---A-A--A------T--AGCC-T--TG-AC-ACTT
gi|22859                      : TGT-AAT-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--CTCGTAAACG------C-T--TCTC--C-TCC-TA-A-AC--C--G--G-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22860                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--T-TTC-TA-T-AT--A--G--C-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGCT-T--TG-AA-A
gi|22863                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCT----------A-C-AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACT
gi|22864                      : TGT-AGA-A-TA------G-C-TT--------G--TGTATGAA--C--------A------C-T--TCTC--C-T----A-C-AC--G--G--C-C---T-A-T-C---A-G--ATACTAGT--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22865                      : TGT-ATA-A-TA------G-C-TT--------G--CA----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-T----A-C-AT--G--G--C-C---T-A-T-C---G-G--G------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22866                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------T--TG----AA--C--------A------T-T--TCTC------C-TA-C-AT--G--G--C-T---T-A-T-C---G-G--ATG----T--AGAC-G--TG-AA-ACTT
gi|22868                      : TGT-AAA-ACTA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------CTT--TCTC--C-TTCTTA-T-AC--G--GTTT-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AA-C-T--TG-AA-ACTT
gi|22869                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-T---------G--TC----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TCC-TA-T-AT--G--G--C-C---C-A-T-C---G-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22871                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------T-T--TCTC--C-TTT-TA-T-AC--G--G--T-A---T-A-T-CAANA-A--A------T--AGCT-TG-TG-AA-
gi|22872                      : TGT-AAA-G-T------------T--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--TGTTC-TA-TTAC--G--G--TTC---T-A-T-C---A-G--A------T--AACC-T--CG-AA-ACTT
gi|22873                      : TGT-AAAGA-TA------G-TGCT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--T-TC--C-TTC-TA-T-AC--G--G--T-C-----A-T-C---A-G--A------T--AACC-T--TG-AA-ACTT
gi|22874                      : TGT-AAA-A-T-------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-G--TCTC--C-T----A-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22876                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------T-T--TCTT--C-TT--------C--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AA-C-T--TG-AA-ACTT
gi|22877                      : TGTCAAA-A-TA------G-C-TT--------G--TGA---AA--C--------A------C-T--TC-C--C-TTC-TA-C--C--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--AT-----T--AACC-T--TG-AA-ACTT
gi|22878                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--GA----AA--C--------A------C-T--TCTT--C-TAC-TA-T-AC-----G--T-C---T-A-T-C---A-A--A------T--AG-C-T--TG-AA-ACTT
gi|22879                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----GA--C--------A------C-T--TC----------TA-T-AC--G--G--A-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACT
gi|22881                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--ACTC--C-TT-----T-AT--G--G--C-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22882                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C--TC-TA-T--T--A--G--T-C---TAA-T-C---A-G--A------T--AACC-C--TC-GA-ACTT
gi|22883                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TA----AA--C--------AATG---C-T--TCTC--C-TCC-TA-T-AT--G--G--A-T---T-G-T-T---G-G--AT-----T--AGCC-T--TG-AA-AC
gi|22884                      : TGT-AGA-A-TA------G-C-TT--------G--AG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TCC-TT-A-AT--G--G--C-T---T-A-T-C---C-G--G------T--AGCC-T--TG-AA-ATTT
gi|22885                      : TGT-AAT-A-TA------G-C-TTTTGAACTCG--TG----AA--C--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-C-AC--T--G--C-T---T-A-A-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22887                      : TGT-AAA-A-TA------G-T-TA--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TAC-AA-T-AG--G--G--C-A---T-A-T-C---A-G--A------T--GAAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22888                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC------C-TA-T-AT--G--G--C-T---T-T-TGT---G-A--A------T--AGCC-T--TG-AA-ATTT
gi|22889                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AG--C--------A------C-T--TCTC------C-TA-T-AT--G--G--T-T---T-A-T-C---G-G--A------T--AAAA-C--TG-AA-ATTT
gi|22890                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TAT---C-TCC-TA-T-----G--G--C-T---T-A-C-T---G-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22891                      : TAT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-C--CCTC--A-TCC-TA-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-T---T-G--A------T--AGAC-T--TG-
gi|22892                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--T-----C-TTC-TA-T-AC--A--A--C-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGAC-TTGTG-AA-ATTT
gi|22894                      : TGT-AAA---TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------G------C-T--T-----C-TTC-TA-T-AC--A--G--T-T---T-A-T-T---A-G--G------T--AGAT-T--TG-AA-ATTT
gi|22896                      : TGT-GAA-A-TA------G-C-TT--------G--TT----AA--C--------A------T-T--TCTT--T-TCC-TC-T-AC--A--G--T-T---A-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-C--TG-AA-ACT
gi|22897                      : TGT-AAT-A-TA------G-CATT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--A---C-TA-C-AC--G--A--G-C---T-ACT-C---A-G--A------T--AGCC----TG-AA-ACTT
gi|22899                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-T---------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCCC------C-TA-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGAC-T--TG-AC-ACTT
gi|22902                      : TGT-AAA-C-TA------A-T-TT--------G--TA----AA--C--------A------C-T--TCCC--C-TTG-TA-C-AT--G--G--C-T---C-A-T-T---G-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ATTT
gi|22903                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------A--TG----AA--C--------A------C----TCTC--T-TCC-TA-T-AT--G--G--C-C---T-A-T-TG--G-G--A------T--AGCT-T--T--AA-ATTT
gi|22904                      : TGT-ATATA-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCT---C-TTC-CATT-AT--G--A--C-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ATTT
gi|22905                      : TGT-TAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------G-T--TCTC------C-TA-T-AT--G--G--C-G---T-A-T-T---G-G--A------T--AGTC-T--TG-AA-A
gi|22906                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--CA----AA--T--------A------C-T--AATC--C-T----A-T-AT--G--G--A-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22908                      : TGT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTA--A-ACC-TA-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGCC-
gi|22909                      : TGT-AAA-AATA------G-CGTT--------GCTTG----A---C--------AT-----C-T--TCTT--C-TTC-TA-T-AC--GCGG--T-C---C-A-T-C---A-A--A------T--AGCC-T--TC-GA-ACTT
gi|22910                      : TGT-AAT-A-TA------G---TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCT---C-TTC-TA-C-AT--GA-G--------T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC----TG-AA-ACTT
gi|22912                      : TGT-GAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------A-T--TCTC--T-TAC-TA-T-AT--A--G--C-A---TAA-T-A---A-G--A------A--AGCC-T--TG-GA-ATTT
gi|22921                      :  GC-AAA-A-T---------C-TC--------A--TA----AA--C--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-T-AC--C--A--C-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-A--TG-AA-ACTT
gi|22923                      :  GT-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC------C-TA-T-AC--A--G--C-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-GCTT
gi|22924                      :  GT-GAA-A-TA------G-C-TT--------G--TA----AA--C--------A------CGT--TCTC--C--TC-TATT-AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AACC-T--GG-AA-ACTT
gi|22925                      :  GT-AAAGA-TA------TTC-TT--------G--TG----AA--C--------A------A-T---CTT--C-TTC-TA-T-AC--G--G--------T-A-T-C---A-G--A------T--AACC-T--TG-AA-ACTT
gi|22927                      :   T-AAT-A-TA------G-C-TT--------G--TG----TG--C--------A------C-T--TTTC--C-ATC-TA-C-AC--G--A--G-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22929                      :   T-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--GG----AA--C--------A------C-T--T-----C-TTC-TATT-AC--G--G--T-C---T-A-T-C---A-A--A------T--AGCC-T--TG-AA-ACCT
gi|22930                      :   T-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTG--T-CCC-TA-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-T---G-A--A------T--AGCC-T--TA-AA-A
gi|22931                      :   T-GAA-A-TA------G-C-AT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TTTT--C-TCC-TG-T-AC--G--G--C-T---G-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-AC
gi|22933                      :   T-AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTCTTC-TTT-CG-T-ACATG--G--C-A---T-A-C-T---G-G--A------T--AGCT-T--TG-AA-ATTT
gi|22934                      :   T-AAA-A-TA------T-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTC--C-TTT-AA-T-AT--G--G--C-T---T-T-A-C---A-G--G------T--AGAC-T--TG--A-ACTT
gi|22937                      :    -AAA-A-T---------C-TC--------G--CG----AG--C--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-A-AC--C--G--C-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22939                      :    -AAA-A-T---------C-TC--------G--TG----AA--C--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-T-AC--C--G--C-C---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AG-ACTT
gi|22940                      :    -AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTT--C-TTC-TA-C-AC--A--A--T-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AG-ACTT
gi|22941                      :    -AAA-A-T---------C-TC--------G--TG----AA--C--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-A-AC--C--G--C-T---T-A-T-T---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22942                      :    -AAA-A-CA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------T-T--TATC--C-TTC-TA-T-AC--G--G--T-C---T-C-T-C---A-G--A------T--AACA-T--TG-AA-ACTT
gi|22943                      :    -AAA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--A--------A------C-T--T--------TC-TA-T-AT--T--G--T-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22947                      :    -AAA-A-AA------G-C-TT--------G--TA----AA--C--------A------C-T--CTTC--C-TCC-CA-T-AT--A--G--C-T---T-A-T-C---A-G--A------T--ATCC-T--TG-AA-ATTT
gi|22948                      :    -AAA-A-T---------C-TC--------G--TG----AA--C--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-A-AC--C--G--C-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22949                      :    -AAA-A-T---------C-TC--------G--TG----AA--C--------G------C-T--TCTC--T-TCC-TA-T-AC--T--G--C-T---T-A-C-C---A-G--A------T--CGCC-T--TG-AA-ACTT
gi|22950                      :    -AAA-A-T---------C-TC--------G--CG----AG--C--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-T-AC--C--G--C-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACT
gi|22951                      :    -AAA-A-T---------C-TC--------G--TG----AA--C--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-A-AC--C--G--C-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AAAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22956                      :      AA-A-TA------G-C-TT--------G--TG----AA--C--------A------T-T--TCTC--C-TTT-TA-T-AC--T--G--T-A---T-A-T-C---A-A--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22961                      :        -A-TA------G-C-TC--------G--TG----AA--C--------A------C-T--TCTT--C-TCC-TA-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-
gi|22963                      :                    -C-TT--------G--TG----AA--C--------G------C-T--TCTT--C-TCC-TA-T-AT--T--G--T-T---T-A-T-T---G-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACTT
gi|22964                      :                    -C-TT--------G--TG----AA--T--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-T-AC--C--G--C-TTAAT-A-T-C---A-G--G------T--AGTC-T--TG-AA-ACTT
gi|22965                      :                      -TT--------G--AG----AA--T--------G------C-T--TCTC--C-TCC-TA-T-AT--G--G--C-T---T-A-T-C---A-G--A------T--AGAC-T--TG-AA-ACT
gi|22966                      :                      -TT--------G--TG----AA--C--------A------C-C--TCTC--C-C-C-TA-T-AA--G--G--C-T---A-A-T-C---A-G--A------T--AGCC-T--TG-AA-ATTT