lowQualScore : 11 111 11111
lowQualScore : 0 00 4 00 0 0 4444444 11111 0 0 11 22 1111 000 11 0 444 0 22 222222 2222 0 11111 11 00 333 0 77 22 5555 3333 11 1111 0 0 0 00 0 0 0 22 1111 0 111111 55555 0 11 4 0
lowQualScore : . .. . .. . . ....... ..... . . .. .. .... ... .. . ... . .. ...... .... . ..... .. .. ... . .. .. .... .... .. .... . . . .. . . . .. .... . ...... ..... . .. . .
lowQualScore : 6 77 4 66 5 5 2222222 11111 5 5 77 77 0000 888 22 5 333 5 77 666666 3333 4 11111 11 66 333 9 22 22 8888 0000 11 0000 5 5 9 66 5 5 5 77 0000 5 999999 11111 5 77 6 6
consensus : CTTAT-CGGAT--AGCCTTGAAA--C-TT-TGTACA------AT-----G-C-T--TCA-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TG---T-C-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-NCAA----G-T------TA---C-G-GTGGATCC-AAGAGGG-GTG
Reference ( gi|78615 ) : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT-TGTACA------GT-----G-C-T--TCC-TT----GC---CAT--T-T-C-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TG---T-C-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCAA----G-T------TA---A-G-GTGGATCC-AACAGGG-GTG
gi|78602 : CTTAT-CGGAT--AGACTTGGAA--C-TT-TGTACA------GT-----G-C-T--TCC-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TG---T-C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCAA----G-T------TA---A-G-GTGGATCC-AACAGGG-GTG
gi|78622 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT-TGTACA------GT-----G-C-T--TCC-TT----AC---CAT--T-T-C-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA-----TG---T-C-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCAA----G-T------TA---T-G-GTGGATCC-AACAGAG-GTG
gi|78632 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT-TGTACA------GT-----G-C-T--TCC-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-T-----TA--T--TG---T-C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCAA----G-T------TA---T-G-GTGGGCCC-AACAGGG-ATG
gi|78627 : CTTAT-CAGAT--AAGCTTGAAA--C-TT-TGTACA------GT-----G-C-T--TCC-TT----GC---TAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TG---T-C-GGGC--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCCA----G-T------TA---T-G-GTGGATCC-AACAGGG-GTG
gi|78618 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT-TGTACA------AT-----G-C-T--TCC-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATA------T-G--C-A-----TA--T--TG---T-C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-TAAT-TAT--T-TT-TC-T-TCAA----G-T------TA---T-G-GTGGATCC-AACAAGG-GTG
gi|78623 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT-TGTACA------GT-----G-C-T--TCC-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GACG------T-G--T-A-----TA-----TG---T-C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCAA----G-T------TA---T-G-GTGGATCCAAACAGGG-GTG
gi|78635 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAAAAC-TT-TGTACA------GT-----G-C-T--TCC-TT----GC---CAT--T-TGT-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TG---T-T-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CCTT-TCAA----G-T------TA---T-GCGTGGATCC-AACAGGGAGTG
gi|78626 : CTTAT-TAGAT--AGACTTGAAA--C-TT-TGTACT------GT-----G-C-T--TCC-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TA---T-C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCAT----G-T------TA---T-G-ATGGATCC-AAGAGGG-GTG
gi|78601 : CTTAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT-TGTAGA------AT-----G-C-T--TTA-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TG---T-C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAGT-AAT--T-TT-CC-T-TCAA----G-T------TA---T-G-GTGGATCC-AACAGGG-GTG
gi|78596 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGCAT--T-TT-TGTACA------GT-----G-C-T--TCG-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TG---T-A-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-AAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCAA----G-TTACATGTA---A-G-GTGGATCC-AACAGGG-GTG
gi|78608 : CTTAT-TAGAT--AGACTTGAAA--C-TT-TGTACA------CA-----A-C-T--TCC-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--CG---T-C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TA-CAAT-TAT--T-T---C-T-TCAA----G-T------TA---T-G-GTGGATCC-AACAGGG-GTG
gi|78585 : CTTAT-CAGAT--GGCCTTGAAA--C-TA-TGTACA------AT-----G-C-T--TCA-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-A-----TTGTT--TG---T-C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TC-CC-T-TCAA----G-T------TA---T-G-GTGGATCC-AACAGGG-GTG
gi|78603 : CCTAT-CAGAT--AGCCTTGAGA--C-TT-TGTACG------AT-----G-C-T--TCA-TT----GT---CAT--T-T-G-C-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TG---T-C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-CCAA------T------TA---T-G-GTGGATCC-AACAGGG-GTG
gi|78619 : CTTAA-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT-TGTACA------AT-----G-C-T--TCA-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--T-A-----TA--TGTTT---T-C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TT-CGAT-TAT--T-TT-CC-T-TCAA----G-T------TA---T-G-GTGGATCC-AACAGGG-GTG
gi|78634 : CTTATTCAGAT--AGCCTTGAA---C-TT-TGTACA------AT-----G-C-TC-TCA-TT----GC----AT--T-T-G-T-A--GATG------TTG--C-A-----TA--T--TG---T-C-AGGA--A----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-CAT--T-TT-CC-T-TCAA----GTT------TA---T-G-GGGGATCC-AACAGGG-GTG
gi|78639 : CTTAT-CAGAT--AGATTTAAAA--C-TT-TGTTCA------AA-----G-T-T--TTA-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-A-----TT--T--TG---T-C-GGGG--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-GAT--T-TT-CC-T-TAAC----G-T------TA---T-G-TTGGATCT-AAGAGGG-GTG
gi|78579 : CTTTT-CAGAT--AGACTTCAAA--C-AT-TGTACA------AT-----A-C-T--TCA-CT----GA---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-A-----TC--T--TG---T-T-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-TAAA-TAT--T-TT-CC-C-ACAA----C-T------TA---T-G-GTGGATCT-AAGAGGG-GTG
gi|78580 : CTTAT-CGGAT--ACACTTGAAA--C-GT-CGTACA------GA-----G-C-T--TCA-CT----ACATGTAT--T-T-G-T-G--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TG---T-C-GG-A--T----AG----G--AGG----G-CC-CAAT-CAT--T-TT-CC-T-TCAA----G-T------TA---T-G-GTTGATCC-AAGAGGA-GTGt
gi|78642 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT-AGTACA------AT-----G-C-T--TC--TT----GT---CAT--T-T-----------G------T-A--C-A-----TA--T--TG--------GGA--C----AA----G--AGG----A-TT-CAAT-TAT--T-TT-CT-T-TACA----G-T------CA---T-G-GTGAATCC-AACAGGA-GTG
gi|78597 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAG--C-TT-TGTACA------AT-----G-C-T--TTA-CG----GA---TAT--T-T-G-T-A--GGTG------T-G--C-A-----TA--T--TG---T-T-GAGA--C----GG----A--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT--C-T-ACAA----G-T------TA---T-G-GTGGGTCT-TAGAGGG-
gi|78636 : CTTAT-CGGATGTAGACGTGAAA--C-TT-TGTACA------AT-----G-C-T--TCA-TTAATTGC---CGT--T-T-G-T-A--GGTG------T-G--C-A-----TA--T--TG---C-C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAGT-GAT--T-TT-CC-T-AATA----G-T------TA---C-A-GTGGATCT-AAGAGGG-CTGtgt
gi|78630 : CTTAT-CAGAT--AGCCATGAAA--C-TT-TGTACA------AT-----G-C-T--TCA-TT----GT---CAT--T-G---T-A--GATG------T-G--A-A-----TA--T--TG---T-C-AGAA--C----AG----A--AGT----A-TC-CAAT-GAT--T-TT-GT-T-ATAA----G-T------TA---T-G-GTTGCTCC-AACAGGG-GCGt
gi|78640 : CTTAT-CAGAT--AGACTGGAAA--C-TT-TGTACA------AT-----G-C-T--TCA-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATC------T-G--C-A-----TA--T--TA---T-C-AGGA--C----AG----G--GGG----A-TCAGAAT-TGT--TAAT-CC-T-AAAA----G-T------TA---T-A-GTGGATCT-AA
gi|78629 : CTTAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT-TGTACA------AT-----G-C-T--TCA-TT----AC---CAT--T-T-G-T-A--GATT------T-G--C-A-----AA--T--TC---T-T-AGGA--C----AG----G--AAG----A-TT-GAAC-CAT--T-CT-TC-T-TAAA----T-T------TA---T-G-GTGAATAT-AAGAGGG-GTGga
gi|78610 : CTTAT-TGGAT--AGACTTGAAA--C-TT-TGTAAA------AT-----G-C-T--GCA-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--T-A-----TA--T--TG---T-T-AGGA--C----AG----G--ATG----A-TT-AAAT-TAT--T-TT-TC-T-ACCG----A-T-----------A-G-G-GGATCT-AAGAGGA-GTG
gi|78617 : CTTAT-CAAAT--AGACTTGAAA--C-TT-TGTACA------AT-----G-T-C--TCA-TT----GT---CAT--T-T-A-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TA---T-C-AGGA--A----AG----G--A------A-TC-CAAT-TGT--T-AT-CA-T-AAAA----G-T------TA---T-A-GTGGATCT-AA
gi|78581 : CTGAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--CGTT-TGTATA------AT-----G-C-T--GTG-AT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATACCGGTAT-G--T-A-----TA--T--TG---T-C-G--A--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-ATAA----G-T------TA---T-G-GTGGATGT-AAGAGGA-GTGaa
gi|78604 : CTTAT-CAAAT--AGACTTTGAA--C-TT-CGTGCA------AT-----A-C-T--TTA-TT----AT---CAT--T-T-G-T-A--GATA------T-G--C-A-----CA--T--TT---C-C-AGGA--C----AG----T--AGG----G-TC-CAAT-CAT--T-TC-CC-T-TAAT----G-T------TA---C-G-ATGGATCA-AAGAGGG-GTG
gi|78583 : CTTAC-TGGAC--AGAATTGAAA--C-TT-TGTGCA------AT-----G-C-T---CA-AT----AC---TAT--T-T-G-T-A--AATG------T-A--C-A-----TA--T--TG---T-T-GGCA--C----AG----G--AAG----A-CA-CAAT-AGT--T-TT-CT-G-TAAA----A-T------TATC-ATG-GTGGATCT-AAGAGGG-GTG
gi|78578 : CTTAT-CAGAT--ATCCTTGAAA--T-TT-TGTTCA------AT-----A-C-T--TTA-TC----AT---CAT--T-T-A-A-T--GATG------T-T--C-A-----TA--T--TG---T-T-CGAA--CT---AG--------GG----A-TC-TAA--CAT--T-TT-CC-T-ACAA----T-T------CA---T-A-GTGGATCA-AAGAGGA-GTG
gi|78582 : CTTAT-TGGAT--AGCCTTGAAA--T-TT-TGTTCA------AT-----A-C-T--TTA-TC----AT---CAT--------T-A--GATGA-----T-GTTC-A-----CA--T--TGT--T-C-CGAC--C----AG--------GG----A-TC-TGA--TAT--T-TT-CC-T-ATAA----T-T------TA---C-A-GTGGATCA-AAGAGGA-GTGttt
gi|78598 : CTAAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--T-TT-TATACA------AT-----A-C-TTATCA-TT-----T---AAT--T-T---------ATG------T-T--C-A-----CA--T--TG---T-T-CTGA--C----CG----G--A-A----A-TC-TAA--TAT--T-TT--C-T-TCAA----T-T------TA---C-A-GTGGGTCA-AAGAGGA-Gttt
gi|78586 : CTTAT-TGGAT--AGCCTTGAAA--T-TT-TGTTCA------AT-----A-C-T--TTA-TT----AT---GAT--G-T-C-A-T--GATG------T-T--C-A-----CA--T--TG---T-T-TGAA--CT---AG--------GG----T-TC-TAA--TAT--T-TT-CC-T-ACAA----T-T------TA---C-A-GTAGATCagttt
gi|78584 : CTTAT-TGGAA--AGCGTTGAAA--G-TT-TGTTCA------AT-----A-C-T--TTA-TT----AT---CAT--T-T-C-A-T--GATG------T-T--C-A-----TA--T--TGAC-T-T-TGAA--CT---AG----G--A------A-TA-CAAT--AT--T-TT-CC-T-ACAA----T-T------TA---C-T-ATGGACCA-AGGAGGA-GTGaa
gi|78593 : CTTGT-TGGAT--AGCCTTGAAA--T-TT-TGGACA------AT-----T-T-T--TCA-TT----AG---CA---------T-A--AATGA-----T-GCTC-A-----CA--T--TG---T-T-CTGA--C----------C--AGG----A-TT-TAA--TAT--T-TT-CC-T-ACAA----T-T------CA---C-A-GTGGATCA-AAGAGCA-GTGttt
gi|78589 : CTTAT-TTGAT--AGCTTTGGAA--T-TT-TGTTCA------AT-----A-C-T--TTA-TT----AT---CAT--T-T-C-A-T--GACG------T-T--C-A-----TA--T--TGAC-T-T-TGAA--CT---AG----G----G----A-TA-TAAT--AT--T-TT-CC-T-ACAA----T-T------TG---C-A-ATGGACCC-Attt
gi|78588 : CTTAT-TGAAT--AGCCTTAAAA--T-GT-TGTTCA------CT-----A-C-T--TTA-TT----AT---CAT--T-T-TAT-A---ATG------T-C--C-A-----CA--T--TG---G-T-TGAA--C-----T----A--ATG----G-TA-TAAT--AT--T-TT-CC-T-ACAA----T-T------TA---T-A-GTGTATCA-AAGAGGA-GTGcgagtgttt
gi|78599 : CTTAT-CCGGT--AGCCTTGAAA--T-TT-TATGCA------AT-----A-C-T--T---TT----AT---CATTAT-T-C-A-AT-GATA------T-T--C-A-----CA--T--TG---T-T-TTGACCC----AG----G--A------A-TC-T-AC-CAT--T-GA-TC-T-ACAG----T-T------TA---A-A-GTATATCA-AAAAGGA-GTGttt
gi|78591 : CTAAT-TGGAT--AGCTTTGAAA--T-TT-TGTTCA------AT-----A-C-T--TTA-TT----AT---TAT--T-T-C-A-T--GATG------T-T--C-A-----TA--T--TGACTT-T-GAAT--T----AG--------GG----A-TT-TAA--TAT--T-TT-TT-T-TTA--------------CA---A----TGGACCA-AGGAGGA-GTGtt
gi|78590 : CTTAT-TTGAT--AGCTTTGGAA--T-TT-TGTTCA------AT-----A-C-T--T---TA----AT---CAT--T-T-C-A-T--GACG------T-T--C-A-----TA--T--TG---A-CTTTAA--CT---AG--------GG----A-TA-TAA--TAT--T-TT-CC-T-ACAA----T-T------TG---C-A-ATGGACCC-Attt
gi|78631 : CTTAT-TGGAT--AGCCTTGAAA----TG-TGCACA------GT-----G-C-T--TTA-TT----CT---CAT--T-TGA-T-A---ATG------T-T--C-A-----CA--T--TG---T-cgagtgttt
gi|78609 : CTCAT-TGGAT--AGCCTTGAAA--T-TT-TGTACG------AC-----A-C-TTATCA-TT----------AT--T-T-A-T-T--GATG------T-T--T-A-----TA--T--TG---T-T-CTGA--CCA--AG----GTTATA----A-TC-TAAT-Ttc
gi|78605 : CTCAT-TAAAT--AAACTTG--------T-TGTACA------AT-----A-C-T--T----T----A-----AT-------------GATG------T-T--C-A-----CA--T--TG---T-T-CTGA--C----AT----G---GA----A-TC-TAAT--AT--G-TT-GC-A-ACAA------T------TA---ACA-GTGGATCA-AAGTGGA-GTGtt
gi|78611 : CTTAC-TGGAT--AGCTTTGACA--T-TT-TGTTCA------AT-----A-C-T--TTTATT----AT---AAT--T-T-C-A-T--GATG------T-T--C-A-----TA--T--TG---T-ttt
gi|78606 : CTTAT-TGGAT--AGCC----GA--T-TT-AGTACA------GC-----A-T-T--TCA-TT----AT---CAT--G-T-A-T-T--GATG------A-T--C-A-----AA--C--TG---T-C-TAAT--C----AG----G----T----A-TA-TAAC--AT--T-TT-CC-T-ACAA----T-T------TG---C-A-GTGAATt
gi|78628 : CTTAC-TGAAT--AAATGCGAGA--C-TT-TGTACA------AT-----A-C-T--TTA-AT----AT---CAT--T-T-A-A-T--GATG------T-T--C-A-----CA--T--TA---T-
gi|78666 : TTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT-TGTACA------GT-----G-T-T--TCC-TT----GC---TAT--T-T-G-T-A--GATG------T-A--C-A-----TA--T--TG---T-C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CT-T-TCAA----G-T------TA---A-G-GTGGATCC-AACAAGG-GTGtctaaccaagga
gi|78657 : TTAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT-TGTACA------AT-----G-C-T--TCA-TT----GC---CAT--T-T-T-T-A--CATG------T-G--T-A-----TA--T--TG---T-C-TGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCAA----G-T------TATGCC-G-GTGGATCC-AACAGGG-GTG
gi|78661 : TTAT-CAGAT--AGCCTTGAGA--C-TT-TGTCCA------AT-----G-T-T--TCA-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA--G--TG---T-C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCAA----G-TC-----TA---T-G-GTGGATCT-AACAGGG-GTG
gi|78664 : TTAT-CGGAT--AGATTTGAAA--C-TC-TGTACA------AA-----G-C-T--TCA-TT----AC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TA---T-C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CT-T-TCAA----G-T------TA---T-G-GTGAATCC-CACAGGG-GTG
gi|78655 : TTAT-CAGAT--TGCCTTGAAA--C-TT-TGTACA------GT-----G-C-T--TCA-GT----GA---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-A--C-A-----TA--T--TG---T-C-AGGA--C----AGGATCG--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TC-CC-T-TCAA----G-T------TA---T-G-GTGGATCC-AACAAGG-GTG
gi|78654 : TTAT-CAGAT--TGCCTTGAAA--C-TT-TTTACA------AT-----G-C-T--TCA-TT----GA---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-A--C-A-----TA--T--TG---T-C-AGGA--C----AGGATCG--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TC-CC-T-TCAA----G-T------TA---T-G-GTGGATCC-AACAGGG-GTG
gi|78665 : TTAT-CGAAT--AGCCTTGAAA--C-TT-TGTACA------AT-----G-C-T--TCA-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TG---T-A-AGGA--C----AGGATCG--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TTAA----G-T------TA---T-G-G-GGATCC-AA
gi|78660 : TTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT-TGTACA------AT-----G-G-T--TTA-TT----AC---CAT--T-T-G-C-A--GATG------T-G--C-ATACTGTA--T--TG---T-C-AGGA--C----AG----G--AGGATTAA-TT-CAAT-TAT--T-TT-TC-T-CTTA----G-T------TAT--A-G---GGATCT-AAGAGGG-GTG
gi|78663 : TTAT-CAGAT--AGCCTTGAA---C-TT-AGTACA------AT-----G-C-T--TCA-TT----GC---CAT--T-T-G-TAA--GATG------T-T--C-A-----TA--T--TG---T-C-TGGA--C----------G--GGG----A-TC-C-AT-TAT--T-TT-CC-T-TCAA----
gi|78662 : TTAT-CAGAT--AGGCTTGAAA--C-TT-TGTCCA------AT-----GCC-T--TTA-TT----GC---CAT--T-T-TGT-T--GAGGT-----T-GC-C-A-----TT--T--TG---T-C---AA--A----AA----G--A-G----A-TC-CAAT-CAT--T-TT-CC-TAAAAA----G-T------TA---T-A-GTGGATCT-AGGAGGG-G
gi|78684 : TAT-CAAAT--AGACTTGAAA--C-TT-TGTACA------GT-----G-C-T--TCC-TT----GC---TAT--T-T-A-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TT---T-T-GGGA--C----TG----A--AGA----A-TC-CAAT-CAT--T-TT-CT-T-TCAA----G-C------TA---T-G-GTGGATCC-AACAGGG-GTG
gi|78677 : TAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT-TGTACA------AT-----G-C-T--TCA-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-A--C-A-----TA--T--TT---TTC-AGGG--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TGT--T-TT-CC-T-TCAA----G-T------TA---T-G-GTGGATCC-AACAGGG-GTG
gi|78676 : TAT-CAAAT--AGCTTTGAAA--C-TT-TGTACA------AT-----A-C-T--TCA-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TT---T-C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCAG----G-T------TA---T-G-GTGGATCC-AACAAGG-GTG
gi|78679 : TAT-CAGAT--AACCTCGAAA--C-TT-TGTACA------GG-----G-C-T--TCA-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-A-----TG--T--TG---T-C-TGGA--C----AG----G--GGG----A-TC-CAAT-TA---T-TT-CC-T-TCAT----G-T------TA---T-G-GTGGATCC-AACAGGG-GTG
gi|78670 : TAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TA-TGTACA------AT-----G-C-T--TCA-TT----GC---AAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TG---T-C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-TA-T-ACAA----G-T------TA---A-A-GTGGATCT-AAGAGGG-ATG
gi|78669 : TAT-CAGAT--TGCCTTGAAA--C-TT-TGTACA------GT-----G-C-T--TCA-TT----GA---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TG---T-C-AGAA--CTGGAAA----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCAA----G-T------TA---T-G-GGGGATCC-ATCAGGG-GTG
gi|78671 : TAT-CAGAT--TGCTTTGAAA--C-TT-TGTA-A------AT-----G-CCT--TTA-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TG---T-C-AGGAC-C----AG----GA-AGG----A-TC-CAAT-AAT--T-TT-CC-T-TCAA----G-T------TAT--ATG-GTGGATCC-AACAGG
gi|78672 : TAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT-TGTACA------AT-----G-C-T--TCA-TT----GT---CAT--T-T-G-T-A--GATG------A-G--C-A-----TAT-T--TG---T-C--AGA--C----A-----G--AGG----A-TC-CAAT-TA---T-TT-CC-T-TCAATGTTG-T------TG---A---GTGGATC
gi|78683 : TAT-CAGAT--AGCTTTGCAA--T-TT-TGTGCA------AT-----A-C-T--TCA-T----------CAT--C-T---T-AATGATG------T-T--T-A-----CA--T--TG---T-
gi|78689 : AT-TGGAT--AGACTTGAAA--C-TT-TGTGCA------AT-----G-C-A--TCA-TT----AT---CAT--T-T-G-T-A--AATG------T-G--C-A-----TA--T--TT---T-C-GGGA--A----AG----G--AGG----A-TT-TAAT-CGT--T-TT-CT-T-TGAA----G-T------TA---A-G-ATGGATCT-AAGAGGG-GTGtctgaccag
gi|78691 : AT-TGGAT--AGACT-GAAA--C-TT-TGTGCA------AT-----G-C-A--TCA-TT----AT---CAT--T-T-G-T-A--AATG------T-G--C-A-----TA--T--TT---T-C-GGAA-------AG----G--AGG----ATTT-TAAT-CGT--T-TT-CT-T-TGAA----G-T------TA---A-G-ATGGATCT-AAGAGGG-
gi|78690 : AT-TGGAT--AGACTTGAAA--C-TT--GTGCA------AT-----G-C-A--TCA-TT----AT---CAT--T-T-G-T-A--AATG------T-G--C-A-----TA--T--TT---T-C-GGAA-------AG----G--A-G----A-TT-TAAT-CGT--T-TT-CT-T-TGAA----G-T------TA---A-G-ATGGATCT-AAGAGGG-tg
gi|78692 : AT-CGGAT--AGACTTGAAA--C-TT-TGTACA------AT-----G-C-T--T---TT----A-----ATGAT-T-C-T-------------------C-T-----TG--T--TG---T-T-CTGA--C----CA----T--A-G----A-TC-T-AC-TAT--T-TT-CC-T-ACAA----T-T------TA---tg
gi|78695 : GAT--ATACTTAAAA--C-TT-TGTGCA------AT-----G-T-T--TCA-TT----GC---CAT--T-T-A-T-T--GAAG------T-G--C-A-----TA--A--TG---C-T-GGAA--C----AG----G--AGG----A-TT-CAAT-CAT--T-TTACT-T-TTAA----G-T------TA---C-A-GAGGATCT-AAGAGGG-GTGcagaattacagtggaacaaaaagaattgttt
gi|78673 : ttgGAT--AGCTTTGACA--T-TT-TGTCTA------AT-----A-T-T--TTA-TT----AT---CAT--T-T-C-A-T--GATG------C-T--C-A-----TA--T--TG---T-T-TGAA--C----TA----G--AG------------ATATAT--T-TT-CC-C-ACAA----T-T------TA---C-A-ATGGA-CC-AA
gi|78700 : tactgGGT--AGACTTGAAC--T-TT-TGCAAA------AT-----G-C-T--TCA-TT----AT---CAT--T-T-A-A-T--GATG------T-C--CGA-----CC--A--TG---T-C-CTGA--C----CA----G--GGG----A-TC-TAA--TAT--T-TT-TC-gaagaagtgttt
gi|78698 : GAT--AGCTTTGGAA--T-TTGTGTTTA------GT-----A-C-T--TTA-TT----AT---CAT--T-T-C-A-T--GATG------T-T--C-A-----TA--T--TGT--T-T-TGAA--CT---AG--------GG----A-TA-TA---TA---T-TT-CC-T-ACAA----T-A------TA---C-A-ATTGACCC-AAAAGGA-ATGgtacatactttatacagtgatcaaaagaggagttttt
gi|78675 : GAT--AGCTTTGAAA--T-TT-TGTTCA------AT-----G-C-T--TTA-CT----AT---CAT--T-C-C-A-T--GATG------T-T--C-A-----TA--T--TG---T-ttt
gi|78707 : tactgAT--AGCCTTGAAA--C-TT-TGTACA------AT-----G-C-T--TCA-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TG---T-C-AGGT--C----AG----G--AGG----A-TC-CAGT-TAT--T-TT-CC-T-TCAA----G-C------TA---T-G-GTGGATCC-AACAGGG-GTGttgatctagggatataattcacatgcacatttac
gi|78706 : AT--AGCCTTGAAA--C-TT-TGTACA------ATAAATTG-T-T--TCA-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--CA---T-A-AGGA--C----AG----G--GGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT--C-T-ACAA----G-T------TA---A-G-GTGGATCT-AAGAGGG-GTG
gi|78680 : AT--AGATTTGAGA--C-TT-TGTGCG------AT-----G-C-T--TCA-TT----GC---CAT--T-T-G-C-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TG---T-C-TGGA--C----AG----G--AAG----A-TC-CAAA-CAT--T-TT-CT-T-TAAA----G-A------TA---C-G-GTGGATCT-AAGAAGG-ATGt
gi|78696 : tattgatAT--AGCCTTGAAA--T-TT-TGTGTA------AT-----A-C-T--TCA-TT----AT---TAT--T-T-G-A-T--GATG------T-T--C-A-----CA--T--TGT--T-C-TGAA--C----A--------AGG----A-TC-TAA--TAA--T-TT-CC-T-ATAA----T-T------TA---C-A-GTGGATCA-AAGAGGA-GTGgtgt
gi|78709 : tgaT--AGCCTTGAAA--T-TG-TATACA------GT-----A-C-T--TTA-TT----AT---CAT--T-T-A-T-AATGATC------T-T--T-A-----CA--T--TA---C-T-CTGACTC----AG----G--A------A-TT-TAA--TA---T-TT-CC-T-ACAA----T-T------TC---C-A-TTGGATTG-AA-AGGA-GTGttt
gi|78710 : CTTCAAA--C-TT-TGTGCA------AT-----G-C-T--TCA-TT----AC---CAT--T-T-G-C-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TG---T-C-AGAA--C----AG----A--AGG----A-TC-CAGT-CAT--T-TT-CC-T-TAAA----G-T------TA---T-G-GTGGACCT-AAGAGGG-ATGtt
gi|78711 : CTTGAT---C-TT-TGTACA------AT-----A-C-T--TA--------GG---TAT--TGT-T-T-AATGATA------T-T--T-A-----CA--T--TG---T-T-CTGAT-C----AG----A----G----A-TC-AAAT-C-T--T-TT-CC-T-ACAA----T-T------TA---T-T-GTTGATCA-AAGAGGA-GCGt
gi|78715 : TTGAAA--C-TC-TGTACA------AT-----G-C-T--TCA-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-G--C-A-----TA--T--TG---T-C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCAA----G-T------TA---T-G-GTGGATCC-AACAAGG-GTGttt
gi|78714 : TTGAAA--C-TT-TGTACA------AT-----G-T-T--TCA-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--AATG------T-T--C-A-----TA--T--TG---T-T-GGAA--T----AG----G--AGG----A-TC-CAGT-TAT--T-TT-CC-A-TAAA----G-T------CA---A-G-GTGGATCT-AAGAGG
gi|78713 : TTGAAA--C-TT-TGTACA------AT-----G-T-T--TCA-TT----GC---CAT--T-T-G-T-A--AATG------T-T--C-A-----TA--T--TG---T-T-GGAA--T----AG----G--AGG----A-TC-CAGT-TAT--T-TT-CC-A-TAAA----G-T------CA---ATG-GTGGAT-C-AAGAGG
gi|78668 : TCGAAA--C-TT-TGTACATGTACAAT-----G-T-T--TCA-CT----GC---CAT--T-T-G-T-A--GATG------T-T--C-A-----TA--T--TG---T-T-AGGA--C----AG----G--AGA----C-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-C-ACAA----G-T------TA---C-G-GTGGATCT-AGGAGGG-GTG
gi|78720 : tatatggatcaA--C-TT-TGTACA------AT-----A-A-T--TAA-AT----AT---TAT--T-T-A-A-T--GATG------T-T--C-A-----CA--T--TG---T-T-CTGA--CT---AG----G----G----A-TC-TAGT--AT--T-TT-CC-T-ATAA----T-T------TA---C-A-GTGAATCG-AAt
gi|78721 : A--C-TT-TGTACA------AT-----A-A-T--TAA-AT----AT---TAT--T-T-A-A-T--GATG------T-T--C-A------A--T--TG---T-T-CTGA--C----------T--AGG----A-TC-TAG--TA---T-TT-CC-T-ATAA----T-T------TA---C-A-GTGAATCG-AAgtctatgaggagtat
gi|78726 : CT-TT----AT---CAT--T-T---T-AT-GATG------T-T--C-A-----CA--T--TG---T-T-TGAA--TT---AG----G----G----A-TA-TAAT--AT--T-TT-CC-T-ACAA----C-T------TA---C-A-GTGGATT---AGAGAG-GTGgtctatgaggagtat
gi|78725 : gctcaata--GATG------T-T--C-A-----TG--T--TG---TTC-TGAC--C----AG----G----G----A-TC-CAAT--AT--T-TT-CC-T-ACAA----T-T------TA---C-A-GTGGATCA-AAGAGGG-GTGttt
gi|78729 : gttcaactgtacttaaatatcatttaat--GATG------T-T--A-A-----CA--T--TG---T-T-CGAA--CT---AG----G----G----A-T----AT-TATATT-TT-CC-T-ACAA----T-T------TA---C-G-GTAGATCA-AAttt
gi|78723 : ttgatGA--C----AA----G---GG----A-T---AACATAT--T-TT-CC-T-ACAA----T-T------TA---C-A-ATGAATCCAAAGAGGA-GTGgaatagtgttt
8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|78592 ): CTCGCTGGATAGCTTTCAAATTTTGTTCAATACTTTATCATTTTATGGTGTTCACATTGTTCGAACTAGAGATATTTTGATAGTTTCCAACAATTTACAGTGGACCAAAGAGGAGTG
Unaligned ( gi|78595 ): CTTGTTAGATAGTTTTGAAATTTTGTCTAATACTTTATCATTTCATGATCTTCACATTGTTCGAATTTAATAGGAATATAATATATTCCTACAATTTACAGTGGACCAATTAGCAATGTTT
Unaligned ( gi|78674 ): TACTGGAAAGCTTGAAATTTTTTTTCATACTTTATTATCATTACATGTTGTTTATATTATTTCTGAACTAGGATATACTATTTTCCTACAATTTACAATGAACCAAGGAGGAAGTGTTT
Unaligned ( gi|78717 ): AAATTTGTATGTTTCCACAGTAATTATCATTTAATGATCTTGACATTATTTTGACCAGCGATCTAATATTTTCATACATTTAATTTACAGTGGATCAAAGAGGAGAGTTT
Unaligned ( gi|78612 ): CCTATTGGATAGCCTTGGGAATTTTTAAAAATGCGATGTATATACCTAATTATTATTTACATGTACATGTAATGATGTTTACATTGTTTTGACCAGAGATCTAATATTGTAGTACAATTTACATTAAATCAAAGAAGAGTGT
Unaligned ( gi|78701 ): GATAGCCTTTCAATTTCGTACAATGCTTACCATCAGTTAATGATGTTACTATTGGTGTGATTCAGGGATCTGATGATTTTGTACAATTTACAGTGGGTCA
Unaligned ( gi|78730 ): AATGATGTTTACATTGTTCTGATCAAAGATCTAATATTTTCACACAATTTTCTTTCGATCAAAGAAAAGTGTTT
Unaligned ( gi|78641 ): CTTATTGGATAGCCTTGGATTTTGAAAAAAATAATTCATTATCATTTGATGATGTTGGACATTGTTCTTGAATCCAGAGATCTGATATTTT
Alignments
lowQualScore : 0 00 0 00 0 11 00 111111 11111 0 0 11 111 0000 1111 0 0 111 2 0 4444 222222 11 0 11111 22 333 11 77 22 6666 2222 11 1111 0 0 11 11 0 0 0 11 1111 000 111 111 4444444444 0 222 00 0
lowQualScore : . .. . .. . .. .. ...... ..... . . .. ... .... .... . . ... . . .... ...... .. . ..... .. ... .. .. .. .... .... .. .... . . .. .. . . . .. .... ... ... ... .......... . ... .. .
lowQualScore : 5 77 8 66 4 00 66 333333 11111 9 4 66 333 9999 3333 4 4 222 2 4 9999 555555 44 4 11111 00 222 00 00 77 0000 8888 11 4444 4 4 00 11 4 4 9 99 4444 666 999 222 2222222222 4 222 99 6
consensus : CTTAT-CGGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-NCA----A-G-T---T---A---C------G-GTGGATC-C-AAG-AGGG-GTG
Reference ( family-204 ) : CTTAT-CGGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-NCA----A-G-T---T---A---C------G-GTGGATC-C-AAG-AGGG-GTG
gi|78578 : CTTAT-CAGAT--ATCCTTGAAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TATC----AT---CA-T-T---T-A-A-T--GATG------TT-C-A-----TA--TTG---T--T-CGAA--CT---AG--------GG----A-TC-TAA--CAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---C---A---T------A-GTGGATC-A-AAG-AGGA-GTG
gi|78579 : CTTTT-CAGAT--AGACTTCAAA--C-AT--TG--TACA------AT-----A-C-T--T---CACT----GA---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TC--TTG---T--T-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-TAAA-TAT--T-TT-CC-C-ACA----A-C-T---T---A---T------G-GTGGATC-T-AAG-AGGG-GTGttt
gi|78580 : CTTAT-CGGAT--ACACTTGAAA--C-GT--CG--TACA------GA-----G-C-T--T---CACT----ACATGTA-T-T---T-G-T-G--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-GG-A--T----AG----G--AGG----G-CC-CAAT-CAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTTGATC-C-AAG-AGGA-GTGt
gi|78581 : CTGAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--CGTT--TG--TATA------AT-----G-C-T--G---TGAT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATACCGGTATG-T-A-----TA--TTG---T--C-G--A--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-ATA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATG-T-AAG-AGGA-GTG
gi|78582 : CTTAT-TGGAT--AGCCTTGAAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TATC----AT---CA-T-T---A-G-A-T--GATG------TT-C-A-----CA--TTGT--T--C-CGAC--C----AG--------GG----A-TC-TGA--TAT--T-TT-CC-T-ATA----A-T-T---T---A---C------A-GTGGATC-A-AAG-AGGA-GTG
gi|78583 : CTTAC-TGGAC--AGAATTGAAA--C-TT--TG--TGCA------AT-----G-C-T------CAAT----AC---TA-T-T---T-G-T-A--AATG------TA-C-A-----TA--TTG---T--T-GGCA--C----AG----G--AAG----A-CA-CAAT-AGT--T-TT-CT-G-TAA----A-A-T---TATCA---T------G-GTGGATC-T-AAG-AGGG-GTGttt
gi|78584 : CTTAT-TGGAA--AGCGTTGAAA--G-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TATT----AT---CA-T-T---TCA-T----GATG------TT-C-A-----TA--TTGAC-T--T-TGAA--CT---AG----G--A------A-TA-CAAT--AT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---C------T-ATGGACC-A-AGG-AGGA-GTG
gi|78585 : CTTAT-CAGAT--GGCCTTGAAA--C-TA--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TTGTTTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TC-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTGttt
gi|78586 : CTTAT-TGGAT--AGCCTTGAAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TATT----AT---GA-TGT---C-A-T----GATG------TT-C-A-----CA--TTG---T--T-TGAA--CT---AG--------GG----T-TC-TAA--TAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---C------A-GTAGATC-
gi|78588 : CTTAT-TGAAT--AGCCTTAAAA--T-GT--TG--TTCA------CT-----A-C-T--T---TATT----AT---CA-T-T---T---T-AT-AATG------TC-C-A-----CA--TTG---G--T-TGAA--C-----T----A--ATG----G-TA-TAA--TAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---T------A-GTGTATC-A-AAG-AGGA-GTGaa
gi|78589 : CTTAT-TTGAT--AGCTTTGGAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TATT----AT---CA-T-T---TCA-T----GACG------TT-C-A-----TA--TTGAC-T--T-TGAA--CT---AG----G----G----A-TA-TAAT--AT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---G---C------A-ATGGACC-C-ACG-AGttt
gi|78590 : CTTAT-TTGAT--AGCTTTGGAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TAAT---------CA-T-T---TCA-T----GACG------TT-C-A-----TA--TTG---A--CTTTAA--CT---AG--------GG----A-TA-TAA--TAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---G---C------A-ATGGACC-C-ACG-AGtgttt
gi|78591 : CTAAT-TGGAT--AGCTTTGAAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TATT----AT---TA-T-T---T---C-AT-GATG------TT-C-A-----TA--TTGACTT--T-GAAT--T----AG--------GG----A-TT-TAA--TAT--T-TT-TT-T------------T---T---A---C------A-ATGGACC-A-AGG-AGGA-GTGtgttt
gi|78592 : GGAT--AGCTTTCAAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TAT----------CA-T-T---T---T-AT-GGTG------TT-C-A-----CA--TTG---T--T-CGAA--C----TA----G--AGAT---A-TT-TTGA-TAG--T-TT-CC-A-ACA----A-T-T---T---A---C------A-GTGGACC-A-AAG-AGGA-GTGttt
gi|78593 : ctcgctCTTGT-TGGAT--AGCCTTGAAA--T-TT--TG--GACA------AT-----T-T-T--T---CATT----AG---CA-T-A---A-A-T----GATG------CT-C-A-----CA--TTG---T--T-CTGA--C----------C--AGG----A-TT-TAA--TAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---C---A---C------A-GTGGATC-A-AAG-AGCA-GTG
gi|78596 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGCAT--T-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CGTT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--A-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-AAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---CATGTAAG-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTGttt
gi|78597 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAG--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---TACG----GA---TA-T-T---T-G-T-A--GGTG------TG-C-A-----TA--TTG---T--T-GAGA--C----GG----A--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT--C-T-ACA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGGTC-T-TAG-AGGG-
gi|78598 : CTAAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--T-TT--TA--TACA------AT-----A-C-TTAT---CATT-----T---AA-T-T---T---------ATG------TT-C-A-----CA--TTG---T--T-CTGA--C----CG----G--A-A----A-TC-TAA--TAT--T-TT--C-T-TCA----A-T-T---T---A---C------A-GTGGGTC-A-AAG-AGGA-Gtgt
gi|78599 : CTTAT-CCGGT--AGCCTTGAAA--T-TT--TA--TGCA------AT-----A-C-T--T-----TT----AT---CA-T-TA--T-T-C-AATGATA------TT-C-A-----CA--TTG---T--T-TTGACCC----AG----G--A------A-TC-T-AC-CAT--T-GA-TC-T-ACA----G-T-T---T---A---A------A-GTATATC-A-AAA-AGGA-GTGagttt
gi|78601 : CTTAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TAGA------AT-----G-C-T--T---TATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAGT-AAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTGtt
gi|78602 : CTTAT-CGGAT--AGACTTGGAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---A------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78603 : CCTAT-CAGAT--AGCCTTGAGA--C-TT--TG--TACG------AT-----G-C-T--T---CATT----GT---CA-T-T---T-G-C-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-CCA----A---T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78604 : CTTAT-CAAAT--AGACTTTGAA--C-TT--CG--TGCA------AT-----A-C-T--T---TATT----AT---CA-T-T---T-G-T-A--GATA------TG-C-A-----CA--TTT---C--C-AGGA--C----AG----T--AGG----G-TC-CAAT-CAT--T-TC-CC-T-TAA----T-G-T---T---A---C------G-ATGGATC-A-AAG-AGGG-GTG
gi|78605 : AAA--C-TTGTTG--TACA------AT-----A-C-T--T---TA------------A-T--------------GATG------TT-C-A-----CA--TTG---T--T-CTGA--C----AT----G---GA----A-TC-TAAT--AT--G-TT-GC-A-ACA----A-T-T---A---A---C------A-GTGGATC-A-AAG-TGGA-GTG
gi|78606 : ctcattaaatCTTAT-TGGAT--AGCC----GA--T-TT--AG--TACA------GC-----A-T-T--T---CATT----AT---CA-T-G---T-A-T-T--GATG------AT-C-A-----AA--CTG---T--C-TAAT--C----AG----G----T----A-TA-TAAC--AT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---G---C------A-GTGAATttt
gi|78608 : CTTAT-TAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------CA-----A-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TCG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TA-CAAT-TAT--T-T---C-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78609 : CTCAT-TGGAT--AGCCTTGAAA--T-TT--TG--TACG------AC-----A-C-TTAT---CATT----------A-T-T---T-A-T-T--GATG------TT-T-A-----TA--TTG---T--T-CTGA--CCA--AG----GTTATA----A-TC-TAAT-T
gi|78610 : CTTAT-TGGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TAAA------AT-----G-C-T--G---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-T-A-----TA--TTG---T--T-AGGA--C----AG----G--ATG----A-TT-AAAT-TAT--T-TT-TC-T-AC-----C-G-A---T---A----------G-G-GGATC-T-AAG-AGGA-GTGtt
gi|78611 : CTTAC-TGGAT--AGCTTTGACA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-CTT--T---TATT----AT---AA-T-T---T---C-AT-GATG------TT-C-A-----TA--TTG---T--
gi|78615 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-C-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---A------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTGt
gi|78617 : CTTAT-CAAAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-T-C--T---CATT----GT---CA-T-T---T-A-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTA---T--C-AGGA--A----AG----G--A------A-TC-CAAT-TGT--T-AT-CA-T-AAA----A-G-T---T---A---T------A-GTGGATC-T-AAA-A
gi|78618 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATA------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-TAAT-TAT--T-TT-TC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AAGG-GTG
gi|78619 : CTTAA-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-T-A-----TATGTTT---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TT-CGAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78622 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----AC---CA-T-T---T-C-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--T-G---T--C-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGAG-GTG
gi|78623 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GACG------TG-T-A-----TA--T-G---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAACAGGG-GTG
gi|78626 : CTTAT-TAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACT------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTA---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----T-G-T---T---A---T------G-ATGGATC-C-AAG-AGGG-GTG
gi|78627 : CTTAT-CAGAT--AAGCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---TA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-GGGC--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCC----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78628 : CTTAC-TGAAT--AAATGCGAGA--C-TT--TG--TACA------AT-----A-C-T--T---TAAT----AT---CA-T-T---T-A-A-T--GATG------TT-C-A-----CA--TTA---T--
gi|78629 : CTTAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----AC---CA-T-T---T-G-T-A--GATT------TG-C-A-----AA--TTC---T--T-AGGA--C----AG----G--AAG----A-TT-GAAC-CAT--T-CT-TC-T-TAA----A-T-T---T---A---T------G-GTGAATA-T-AAG-AGGG-GTGtctaaccaagga
gi|78630 : CTTAT-CAGAT--AGCCATGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GT---CA-T-T-----G-T-A--GATG------TG-A-A-----TA--TTG---T--C-AGAA--C----AG----A--AGT----A-TC-CAAT-GAT--T-TT-GT-T-ATA----A-G-T---T---A---T------G-GTTGCTC-C-AAC-AGGG-GCG
gi|78631 : CTTAT-TGGAT--AGCCTTGAAA----TG--TG--CACA------GT-----G-C-T--T---TATT----CT---CA-T-T---T-GAT-A---ATG------TT-C-A-----CA--TTG---T--
gi|78632 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-T-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGGCC-C-AAC-AGGG-ATGtc
gi|78634 : CTTATTCAGAT--AGCCTTG-AA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-TC-T---CATT----G----CA-T-T---T-G-T-A--GATGT-----TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--A----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-CAT--T-TT-CC-T-TCA----A-GTT---T---A---T------G-GGGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78635 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAAAAC-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-G-TTA--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--T-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CCTT-TCA----A-G-T---T---A---T------GCGTGGATC-C-AAC-AGGGAGTG
gi|78636 : CTTAT-CGGATGTAGACGTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATTAATTGC---CG-T-T---T-G-T-A--GGTG------TG-C-A-----TA--TTG---C--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAGT-GAT--T-TT-CC-T-AAT----A-G-T---T---A---C------A-GTGGATC-T-AAG-AGGG-CTG
gi|78639 : CTTAT-CAGAT--AGATTTAAAA--C-TT--TG--TTCA------AA-----G-T-T--T---TATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TT--TTG---T--C-GGGG--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-GAT--T-TT-CC-T-TAA----C-G-T---T---A---T------G-TTGGATC-T-AAG-AGGG-GTGt
gi|78640 : CTTAT-CAGAT--AGACTGGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATC------TG-C-A-----TA--TTA---T--C-AGGA--C----AG----G--GGG----A-TCAGAAT-TGT--TAAT-CC-T-AAA----A-G-T---T---A---T------A-GTGGATC-T-AAG-A
gi|78641 : CTTAT-TGGAT--AGCCTTG-GA--T-TT--TGAAAAAA------AT-----A-A-T--T---CATT----AT---CA-T-T---T-G-A-T--GATGT-----TG-G-A-----CA--TTG---T--
gi|78642 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--AG--TACA------AT-----G-C-T--T---C-TT----GT---CA-T-T---T-G-T-A---------------C-A-----TA--TTG---------GGA--C----AA----G--AGG----A-TT-CAAT-TAT--T-TT-CT-T-TAC----A-G-T---C---A---T------G-GTGAATC-C-AAC-AGGA-GTGtcttgaatccagagatctgatatttt
gi|78654 : TTAT-CAGAT--TGCCTTGAAA--C-TT--TT--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GA---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TA-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AGGATCG--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TC-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78655 : TTAT-CAGAT--TGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CAGT----GA---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TA-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AGGATCG--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TC-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AAGG-GTG
gi|78657 : TTAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-T-T-A--CATG------TG-T-A-----TA--TTG---T--C-TGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---ATGCC------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78660 : TTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-G-T--T---TATT----AC---CA-T-T---T-G-C-A--GATG------TG-C-ATACTGTA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGGATTAA-TT-CAAT-TAT--T-TT-TC-T-CTT----A-G-T---T---A---T------A-G-GGATC-T-AAG-AGGG-GTG
gi|78661 : TTAT-CAGAT--AGCCTTGAGA--C-TT--TG--TCCA------AT-----G-T-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--GTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-TC--T---A---T------G-GTGGATC-T-AAC-AGGG-GTG
gi|78662 : TTAT-CAGAT--AGGCTTGAAA--C-TT--TG--TCCA------AT-----GCC-T--T---TATT----GC---CATT-T---T-G-T-T--GAGGT-----TGCC-A-----TT--TTG---T--C---AA--A----AA----G--A-G----A-TC-CAAT-CAT--T-TT-CC-TAAAA----A-G-T---T---A---T------A-GTGGATC-T-AGG-AGGG-G
gi|78663 : TTAT-CAGAT--AGCCTTGAA---C-TT--AG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-TAA--GATG------TT-C-A-----TA--TTG---T--C-TGGA--C----------G--GGG----A-TC-C-AT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-
gi|78664 : TTAT-CGGAT--AGATTTGAAA--C-TC--TG--TACA------AA-----G-C-T--T---CATT----AC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTA---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CT-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGAATC-C-CAC-AGGG-GTG
gi|78665 : TTAT-CGAAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--A-AGGA--C----AGGATCG--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TTA----A-G-T---T---A---T------G-G-GGATC-C-AA
gi|78666 : TTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-T-T--T---CCTT----GC---TA-T-T---T-G-T-A--GATG------TA-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CT-T-TCA----A-G-T---T---A---A------G-GTGGATC-C-AAC-AAGG-GTG
gi|78668 : TAT--GGAT----CATCGAAA--C-TT--TG--TACATGTACAAT-----G-T-T--T---CACT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TT-C-A-----TA--TTG---T--T-AGGA--C----AG----G--AGA----C-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-C-ACA----A-G-T---T---A---C------G-GTGGATC-T-AGG-AGGG-GTG
gi|78669 : taTAT-CAGAT--TGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CATT----GA---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGAA--CTGGAAA----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GGGGATC-C-ATC-AGGG-GTGt
gi|78670 : TAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TA--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---AA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-TA-T-ACA----A-G-T---T---A---A------A-GTGGATC-T-AAG-AGGG-ATG
gi|78671 : TAT-CAGAT--TGCTTTGAAA--C-TT--TG--TA-A------AT-----GCC-T--T---TATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGAC-C----AG----GA-AGG----A-TC-CAAT-AAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-TTA-T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGG
gi|78672 : TAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GT---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------AG-C-A-----TAT-TTG---T--C--AGA--C----A-----G--AGG----A-TC-CAAT-TA---T-TT-CC-T-TCA----ATG-T---T---G---TTG----A-GTGGATC-
gi|78673 : TAC-TGGAT--AGCTTTGACA--T-TT--TG--TCTA------AT-----A-T-T--T---TATT----AT---CA-T-T---TCA-T----GATG------CT-C-A-----TA--TTG---T--T-TGAA--C----TA----G--AG------------ATATAT--T-TT-CC-C-ACA----A-T-T---T---A---C------A-ATGGA-C-C-AAG-AAG
gi|78674 : TAC-TGGAA--AGC-TTGAAA--T-TT--TT--TTTC------AT-----A-C-T--T---TATT----AT---CA-T-TACAT-G-T------TG------TT-T-A-----TA--TTA---TTTC-TGAA--CT---AG----G--AT-----A-T----AC-TAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---C------A-ATGAACC-A-AGG-AGGaagtgttt
gi|78675 : TAC-TGGAT--AGCTTTGAAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----G-C-T--T---TACT----AT---CA-T-T---C---C-AT-GATG------TT-C-A-----TA--TTG---T--aagtgttt
gi|78676 : TAT-CAAAT--AGCTTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----A-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTT---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----G-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AAGG-GTGttgatctagggatataattcacatgcacatttac
gi|78677 : TAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TA-C-A-----TAT-TTT---T--C-AGGG--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TGT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78679 : TAT-CAGAT--AACCTCGAAA--C-TT--TG--TACA------GG-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TG--TTG---T--C-TGGA--C----AG----G--GGG----A-TC-CAAT-TA---T-TT-CC-T-TCA----T-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78680 : AT--AGATTTGAGA--C-TT--TG--TGCG------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-C-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-TGGA--C----AG----G--AAG----A-TC-CAAA-CAT--T-TT-CT-T-TAA----A-G-A---T---A---C------G-GTGGATC-T-AAG-AAGG-ATG
gi|78684 : tattgatTAT-CAAAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---TA-T-T---T-A-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTT---T--T-GGGA--C----TG----A--AGA----A-TC-CAAT-CAT--T-TT-CT-T-TCA----A-G-C---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTGgtgt
gi|78689 : AT-TGGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TGCA------AT-----G-C-A--T---CATT----AT---CA-T-T---T-G-T-A--AATG------TG-C-A-----TA--TTT---T--C-GGGA--A----AG----G--AGG----A-TT-TAAT-CGT--T-TT-CT-T-TGA----A-G-T---T---A---A------G-ATGGATC-T-AAG-AGGG-GTG
gi|78690 : AT-TGGAT--AGACTTGAAA--C-TT---G--TGCA------AT-----G-C-A--T---CATT----AT---CA-T-T---T-G-T-A--AATG------TG-C-A-----TA--TTT---T--C-GGAA-------AG----G--A-G----A-TT-TAAT-CGT--T-TT-CT-T-TGA----A-G-T---T---A---A------G-ATGGATC-T-AAG-AGGG-
gi|78691 : AT-TGGAT--AGACT-GAAA--C-TT--TG--TGCA------AT-----G-C-A--T---CATT----AT---CA-T-T---T-G-T-A--AATG------TG-C-A-----TA--TTT---T--C-GGAA-------AG----G--AGG----ATTT-TAAT-CGT--T-TT-CT-T-TGA----A-G-T---T---A---A------G-ATGGATC-T-AAG-AGGG-tg
gi|78692 : AT-CGGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T-----TT----A-----A-T--------------GATT------CT-C-T-----TG--TTG---T--T-CTGA--C----CA----T--A-G----A-TC-T-AC-TAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---C------A-Gtg
gi|78695 : T-TGGAT--ATACTTAAAA--C-TT--TG--TGCA------AT-----G-T-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-A-T-T--GAAG------TG-C-A-----TA--ATG---C--T-GGAA--C----AG----G--AGG----A-TT-CAAT-CAT--T-TTACT-T-TTA----A-G-T---T---A---C------A-GAGGATC-T-AAG-AGGG-GTGaattacagtggaacaaaaagaattgttt
gi|78696 : GAAT--AGCCTTGAAA--T-TT--TG--TGTA------AT-----A-C-T--T---CATT----AT---TA-T-T---T-G-A-T--GATG------TT-C-A-----CA--TTGT--T--C-TGAA--C----A--------AGG----A-TC-TAA--TAA--T-TT-CC-T-ATA----A-T-T---T---A---C------A-GTGGATC-A-AAG-AGGA-GTG
gi|78698 : tGAT--AGCTTTGGAA--T-TTG-TG--TTTA------GT-----A-C-T--T---TATT----AT---CA-T-T---TCA-T----GATG------TT-C-A-----TA--TTGT--T--T-TGAA--CT---AG--------GG----A-T---A---TATA-T-TT-CC-T-ACA----A-T-A---T---A---C------A-ATTGACC-C-AAA-AGGA-ATGttt
gi|78700 : GGT--AGACTTGAAC--T-TT--TG--CAAA------AT-----G-C-T--T---CATT----AT---CA-T-T---T-A-A-T--GATG------TC-CGA-----CC--ATG---T--C-CTGA--C----CA----G--GGG----A-TC-TAA--TAT--T-TT-TCGT-ACAT---A-C-TTTAT---A---C------A-GT-GATCAA-AAG-AGGA-GTttt
gi|78701 : GAT--AGCCTTTCAA--T-TT--CG--TACA------AT-----G-C-T--TAC-CAT----------CA-G-T---T-A-A-T--GATG------TT-A-C-----TA--TTG---G--T-GTGATTC----AG--------GG----A-TC-TGAT-GAT--T-TT--G-T-ACA----A-T-T---T---A---C------A-GTGGGTC-tttt
gi|78706 : AT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------ATAAATTG-T-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TCA---T--A-AGGA--C----AG----G--GGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT--C-T-ACA----A-G-T---T---A---A------G-GTGGATC-T-AAG-AGGG-GTGa
gi|78707 : AT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGT--C----AG----G--AGG----A-TC-CAGT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-C---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTGt
gi|78709 : T--AGCCTTGAAA--T-TG--TA--TACA------GT-----A-C-T--T---TATT----AT---CA-T-T---T-A-T-AATGATC------TT-T-A-----CA--TTA---C--T-CTGACTC----AG----G--A------A-TT-TAA--TA---T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---C---C------A-TTGGATT-G-AA--AGGA-GTG
gi|78710 : CTTCAAA--C-TT--TG--TGCA------AT-----G-C-T--T---CATT----AC---CA-T-T---T-G-C-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGAA--C----AG----A--AGG----A-TC-CAGT-CAT--T-TT-CC-T-TAA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGACC-T-AAG-AGGG-ATGtt
gi|78711 : CTTGAT---C-TT--TG--TACA------AT-----A-C-T--TAGGTATT----G-------T-T---T-A-A-T--GATA------TT-T-A-----CA--TTG---T--T-CTGAT-C----AG----A----G----A-TC-AAAT-C-T--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---T------T-GTTGATC-A-AAG-AGGA-GCGt
gi|78713 : TTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-T-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--AATG------TT-C-A-----TA--TTG---T--T-GGAA--T----AG----G--AGG----A-TC-CAGT-TAT--T-TT-CC-A-TAA----A-G-T---CA--A---T------G-GTGGAT--C-AAG-AGGttt
gi|78714 : TTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-T-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--AATG------TT-C-A-----TA--TTG---T--T-GGAA--T----AG----G--AGG----A-TC-CAGT-TAT--T-TT-CC-A-TAA----A-G-T---C---A---A------G-GTGGATC-T-AAG-AGG
gi|78715 : TTGAAA--C-TC--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AAGG-GTG
gi|78717 : G----A-TC-TAAT--AT--T-TT-CA-T-ACATTTAA-T-T---T---A---C------A-GTGGATC-A-AAG-AGGA-G
gi|78720 : aaatttgtatgtttccacagtaattatcatttaatgatcttgacattattttgaccagcA--C-TT--TG--TACA------AT-----A-A-T--T---AAAT----AT---TA-T-T---T-A-A-T--GATG------TT-C-A-----CA--TTG---T--T-CTGA--CT---AG--------GG----A-TC-TAG--TAT--T-TT-CC-T-ATA----A-T-T---T---A---C------A-GTGAATC-G-AAG-agttt
gi|78721 : A--C-TT--TG--TACA------AT-----A-A-T--T---AAAT----AT---TA-T-T---T-A-A-T--GATG------TT-C-A------A--TTG---T--T-CTGA--C----------T--AGG----A-TC-TAG--TA---T-TT-CC-T-ATA----A-T-T---T---A---C------A-GTGAATC-G-AAG-tctatgaggagtat
gi|78723 : GA--C----AA----G---GG----A-T---AACATAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---C------A-ATGAATC-CAAAG-AGGA-GTGtctatgaggagtat
gi|78725 : tctatccgataactaaatatcatttaataatgttcggagtggtctT-----A-C-T--T---AAAT----AT---CA-T-T---T-A-A-T--GATG------TT-C-A-----TG--TTG---TT-C-TGAC--C----AG----G----G----A-TC-CAAT--AT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---C------A-GTGGATC-A-AAG-AGGG-GTGttt
gi|78726 : gttcaactgCA------AT-----A-C-T--T---TAT----------CA-T-T---T---T-AT-GATG------TT-C-A-----CA--TTG---T--T-TGAA--TT---AG----G----G----A-TA-TAAT--AT--T-TT-CC-T-ACA----A-C-T---T---A---C------A-GTGGATT----AG-AGAG-GTGttt
gi|78729 : gct--GATG------TT-A-A-----CA--TTG---T--T-CGAA--CT---AG----G----G----A-T----AT-TATATT-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---C------G-GTAGATC-A-AAG-AATA-GTGttt
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|78595 ): CTTGTTAGATAGTTTTGAAATTTTGTCTAATACTTTATCATTTCATGATCTTCACATTGTTCGAATTTAATAGGAATATAATATATTCCTACAATTTACAGTGGACCAATTAGCAATGTTT
Unaligned ( gi|78612 ): CCTATTGGATAGCCTTGGGAATTTTTAAAAATGCGATGTATATACCTAATTATTATTTACATGTACATGTAATGATGTTTACATTGTTTTGACCAGAGATCTAATATTGTAGTACAATTTACATTAAATCAAAGAAGAGTGT
Unaligned ( gi|78683 ): TATCAGATAGCTTTGCAATTTTGTGCAATACTTCATCATCTTAATGATGTTTACATTGTTCTGACCAG
Unaligned ( gi|78730 ): AATGATGTTTACATTGTTCTGATCAAAGATCTAATATTTTCACACAATTTTCTTTCGATCAAAGAAAAGTGTTT
Alignments
lowQualScore : 0 00 0 00 0 11 00 111111 11111 0 0 11 111 0000 1111 0 0 111 2 0 4444 222222 11 0 11111 22 333 11 77 22 6666 2222 11 1111 0 0 11 11 0 0 0 11 1111 000 111 111 4444444444 0 222 00 0
lowQualScore : . .. . .. . .. .. ...... ..... . . .. ... .... .... . . ... . . .... ...... .. . ..... .. ... .. .. .. .... .... .. .... . . .. .. . . . .. .... ... ... ... .......... . ... .. .
lowQualScore : 5 77 8 66 4 00 66 333333 11111 9 4 66 333 9999 3333 4 4 222 2 4 9999 555555 44 4 11111 00 222 00 00 77 0000 8888 11 4444 4 4 00 11 4 4 9 99 4444 666 999 222 2222222222 4 222 99 6
consensus : CTTAT-CGGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-NCA----A-G-T---T---A---C------G-GTGGATC-C-AAG-AGGG-GTG
Reference ( family-204 ) : CTTAT-CGGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-NCA----A-G-T---T---A---C------G-GTGGATC-C-AAG-AGGG-GTG
gi|78578 : CTTAT-CAGAT--ATCCTTGAAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TATC----AT---CA-T-T---T-A-A-T--GATG------TT-C-A-----TA--TTG---T--T-CGAA--CT---AG--------GG----A-TC-TAA--CAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---C---A---T------A-GTGGATC-A-AAG-AGGA-GTG
gi|78579 : CTTTT-CAGAT--AGACTTCAAA--C-AT--TG--TACA------AT-----A-C-T--T---CACT----GA---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TC--TTG---T--T-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-TAAA-TAT--T-TT-CC-C-ACA----A-C-T---T---A---T------G-GTGGATC-T-AAG-AGGG-GTGttt
gi|78580 : CTTAT-CGGAT--ACACTTGAAA--C-GT--CG--TACA------GA-----G-C-T--T---CACT----ACATGTA-T-T---T-G-T-G--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-GG-A--T----AG----G--AGG----G-CC-CAAT-CAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTTGATC-C-AAG-AGGA-GTGt
gi|78581 : CTGAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--CGTT--TG--TATA------AT-----G-C-T--G---TGAT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATACCGGTATG-T-A-----TA--TTG---T--C-G--A--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-ATA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATG-T-AAG-AGGA-GTG
gi|78582 : CTTAT-TGGAT--AGCCTTGAAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TATC----AT---CA-T-T---A-G-A-T--GATG------TT-C-A-----CA--TTGT--T--C-CGAC--C----AG--------GG----A-TC-TGA--TAT--T-TT-CC-T-ATA----A-T-T---T---A---C------A-GTGGATC-A-AAG-AGGA-GTG
gi|78583 : CTTAC-TGGAC--AGAATTGAAA--C-TT--TG--TGCA------AT-----G-C-T------CAAT----AC---TA-T-T---T-G-T-A--AATG------TA-C-A-----TA--TTG---T--T-GGCA--C----AG----G--AAG----A-CA-CAAT-AGT--T-TT-CT-G-TAA----A-A-T---TATCA---T------G-GTGGATC-T-AAG-AGGG-GTGttt
gi|78584 : CTTAT-TGGAA--AGCGTTGAAA--G-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TATT----AT---CA-T-T---TCA-T----GATG------TT-C-A-----TA--TTGAC-T--T-TGAA--CT---AG----G--A------A-TA-CAAT--AT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---C------T-ATGGACC-A-AGG-AGGA-GTG
gi|78585 : CTTAT-CAGAT--GGCCTTGAAA--C-TA--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TTGTTTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TC-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTGttt
gi|78586 : CTTAT-TGGAT--AGCCTTGAAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TATT----AT---GA-TGT---C-A-T----GATG------TT-C-A-----CA--TTG---T--T-TGAA--CT---AG--------GG----T-TC-TAA--TAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---C------A-GTAGATC-
gi|78588 : CTTAT-TGAAT--AGCCTTAAAA--T-GT--TG--TTCA------CT-----A-C-T--T---TATT----AT---CA-T-T---T---T-AT-AATG------TC-C-A-----CA--TTG---G--T-TGAA--C-----T----A--ATG----G-TA-TAA--TAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---T------A-GTGTATC-A-AAG-AGGA-GTGaa
gi|78589 : CTTAT-TTGAT--AGCTTTGGAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TATT----AT---CA-T-T---TCA-T----GACG------TT-C-A-----TA--TTGAC-T--T-TGAA--CT---AG----G----G----A-TA-TAAT--AT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---G---C------A-ATGGACC-C-ACG-AGttt
gi|78590 : CTTAT-TTGAT--AGCTTTGGAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TAAT---------CA-T-T---TCA-T----GACG------TT-C-A-----TA--TTG---A--CTTTAA--CT---AG--------GG----A-TA-TAA--TAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---G---C------A-ATGGACC-C-ACG-AGtgttt
gi|78591 : CTAAT-TGGAT--AGCTTTGAAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TATT----AT---TA-T-T---T---C-AT-GATG------TT-C-A-----TA--TTGACTT--T-GAAT--T----AG--------GG----A-TT-TAA--TAT--T-TT-TT-T------------T---T---A---C------A-ATGGACC-A-AGG-AGGA-GTGtgttt
gi|78592 : GGAT--AGCTTTCAAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TAT----------CA-T-T---T---T-AT-GGTG------TT-C-A-----CA--TTG---T--T-CGAA--C----TA----G--AGAT---A-TT-TTGA-TAG--T-TT-CC-A-ACA----A-T-T---T---A---C------A-GTGGACC-A-AAG-AGGA-GTGttt
gi|78593 : ctcgctCTTGT-TGGAT--AGCCTTGAAA--T-TT--TG--GACA------AT-----T-T-T--T---CATT----AG---CA-T-A---A-A-T----GATG------CT-C-A-----CA--TTG---T--T-CTGA--C----------C--AGG----A-TT-TAA--TAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---C---A---C------A-GTGGATC-A-AAG-AGCA-GTG
gi|78596 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGCAT--T-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CGTT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--A-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-AAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---CATGTAAG-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTGttt
gi|78597 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAG--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---TACG----GA---TA-T-T---T-G-T-A--GGTG------TG-C-A-----TA--TTG---T--T-GAGA--C----GG----A--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT--C-T-ACA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGGTC-T-TAG-AGGG-
gi|78598 : CTAAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--T-TT--TA--TACA------AT-----A-C-TTAT---CATT-----T---AA-T-T---T---------ATG------TT-C-A-----CA--TTG---T--T-CTGA--C----CG----G--A-A----A-TC-TAA--TAT--T-TT--C-T-TCA----A-T-T---T---A---C------A-GTGGGTC-A-AAG-AGGA-Gtgt
gi|78599 : CTTAT-CCGGT--AGCCTTGAAA--T-TT--TA--TGCA------AT-----A-C-T--T-----TT----AT---CA-T-TA--T-T-C-AATGATA------TT-C-A-----CA--TTG---T--T-TTGACCC----AG----G--A------A-TC-T-AC-CAT--T-GA-TC-T-ACA----G-T-T---T---A---A------A-GTATATC-A-AAA-AGGA-GTGagttt
gi|78601 : CTTAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TAGA------AT-----G-C-T--T---TATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAGT-AAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTGtt
gi|78602 : CTTAT-CGGAT--AGACTTGGAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---A------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78603 : CCTAT-CAGAT--AGCCTTGAGA--C-TT--TG--TACG------AT-----G-C-T--T---CATT----GT---CA-T-T---T-G-C-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-CCA----A---T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78604 : CTTAT-CAAAT--AGACTTTGAA--C-TT--CG--TGCA------AT-----A-C-T--T---TATT----AT---CA-T-T---T-G-T-A--GATA------TG-C-A-----CA--TTT---C--C-AGGA--C----AG----T--AGG----G-TC-CAAT-CAT--T-TC-CC-T-TAA----T-G-T---T---A---C------G-ATGGATC-A-AAG-AGGG-GTG
gi|78605 : AAA--C-TTGTTG--TACA------AT-----A-C-T--T---TA------------A-T--------------GATG------TT-C-A-----CA--TTG---T--T-CTGA--C----AT----G---GA----A-TC-TAAT--AT--G-TT-GC-A-ACA----A-T-T---A---A---C------A-GTGGATC-A-AAG-TGGA-GTG
gi|78606 : ctcattaaatCTTAT-TGGAT--AGCC----GA--T-TT--AG--TACA------GC-----A-T-T--T---CATT----AT---CA-T-G---T-A-T-T--GATG------AT-C-A-----AA--CTG---T--C-TAAT--C----AG----G----T----A-TA-TAAC--AT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---G---C------A-GTGAATttt
gi|78608 : CTTAT-TAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------CA-----A-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TCG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TA-CAAT-TAT--T-T---C-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78609 : CTCAT-TGGAT--AGCCTTGAAA--T-TT--TG--TACG------AC-----A-C-TTAT---CATT----------A-T-T---T-A-T-T--GATG------TT-T-A-----TA--TTG---T--T-CTGA--CCA--AG----GTTATA----A-TC-TAAT-T
gi|78610 : CTTAT-TGGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TAAA------AT-----G-C-T--G---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-T-A-----TA--TTG---T--T-AGGA--C----AG----G--ATG----A-TT-AAAT-TAT--T-TT-TC-T-AC-----C-G-A---T---A----------G-G-GGATC-T-AAG-AGGA-GTGtt
gi|78611 : CTTAC-TGGAT--AGCTTTGACA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-CTT--T---TATT----AT---AA-T-T---T---C-AT-GATG------TT-C-A-----TA--TTG---T--
gi|78615 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-C-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---A------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTGt
gi|78617 : CTTAT-CAAAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-T-C--T---CATT----GT---CA-T-T---T-A-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTA---T--C-AGGA--A----AG----G--A------A-TC-CAAT-TGT--T-AT-CA-T-AAA----A-G-T---T---A---T------A-GTGGATC-T-AAA-A
gi|78618 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATA------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-TAAT-TAT--T-TT-TC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AAGG-GTG
gi|78619 : CTTAA-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-T-A-----TATGTTT---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TT-CGAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78622 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----AC---CA-T-T---T-C-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--T-G---T--C-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGAG-GTG
gi|78623 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GACG------TG-T-A-----TA--T-G---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAACAGGG-GTG
gi|78626 : CTTAT-TAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACT------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTA---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----T-G-T---T---A---T------G-ATGGATC-C-AAG-AGGG-GTG
gi|78627 : CTTAT-CAGAT--AAGCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---TA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-GGGC--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCC----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78628 : CTTAC-TGAAT--AAATGCGAGA--C-TT--TG--TACA------AT-----A-C-T--T---TAAT----AT---CA-T-T---T-A-A-T--GATG------TT-C-A-----CA--TTA---T--
gi|78629 : CTTAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----AC---CA-T-T---T-G-T-A--GATT------TG-C-A-----AA--TTC---T--T-AGGA--C----AG----G--AAG----A-TT-GAAC-CAT--T-CT-TC-T-TAA----A-T-T---T---A---T------G-GTGAATA-T-AAG-AGGG-GTGtctaaccaagga
gi|78630 : CTTAT-CAGAT--AGCCATGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GT---CA-T-T-----G-T-A--GATG------TG-A-A-----TA--TTG---T--C-AGAA--C----AG----A--AGT----A-TC-CAAT-GAT--T-TT-GT-T-ATA----A-G-T---T---A---T------G-GTTGCTC-C-AAC-AGGG-GCG
gi|78631 : CTTAT-TGGAT--AGCCTTGAAA----TG--TG--CACA------GT-----G-C-T--T---TATT----CT---CA-T-T---T-GAT-A---ATG------TT-C-A-----CA--TTG---T--
gi|78632 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-T-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGGCC-C-AAC-AGGG-ATGtc
gi|78634 : CTTATTCAGAT--AGCCTTG-AA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-TC-T---CATT----G----CA-T-T---T-G-T-A--GATGT-----TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--A----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-CAT--T-TT-CC-T-TCA----A-GTT---T---A---T------G-GGGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78635 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAAAAC-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-G-TTA--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--T-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CCTT-TCA----A-G-T---T---A---T------GCGTGGATC-C-AAC-AGGGAGTG
gi|78636 : CTTAT-CGGATGTAGACGTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATTAATTGC---CG-T-T---T-G-T-A--GGTG------TG-C-A-----TA--TTG---C--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAGT-GAT--T-TT-CC-T-AAT----A-G-T---T---A---C------A-GTGGATC-T-AAG-AGGG-CTG
gi|78639 : CTTAT-CAGAT--AGATTTAAAA--C-TT--TG--TTCA------AA-----G-T-T--T---TATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TT--TTG---T--C-GGGG--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-GAT--T-TT-CC-T-TAA----C-G-T---T---A---T------G-TTGGATC-T-AAG-AGGG-GTGt
gi|78640 : CTTAT-CAGAT--AGACTGGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATC------TG-C-A-----TA--TTA---T--C-AGGA--C----AG----G--GGG----A-TCAGAAT-TGT--TAAT-CC-T-AAA----A-G-T---T---A---T------A-GTGGATC-T-AAG-A
gi|78641 : CTTAT-TGGAT--AGCCTTG-GA--T-TT--TGAAAAAA------AT-----A-A-T--T---CATT----AT---CA-T-T---T-G-A-T--GATGT-----TG-G-A-----CA--TTG---T--
gi|78642 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--AG--TACA------AT-----G-C-T--T---C-TT----GT---CA-T-T---T-G-T-A---------------C-A-----TA--TTG---------GGA--C----AA----G--AGG----A-TT-CAAT-TAT--T-TT-CT-T-TAC----A-G-T---C---A---T------G-GTGAATC-C-AAC-AGGA-GTGtcttgaatccagagatctgatatttt
gi|78654 : TTAT-CAGAT--TGCCTTGAAA--C-TT--TT--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GA---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TA-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AGGATCG--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TC-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78655 : TTAT-CAGAT--TGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CAGT----GA---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TA-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AGGATCG--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TC-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AAGG-GTG
gi|78657 : TTAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-T-T-A--CATG------TG-T-A-----TA--TTG---T--C-TGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---ATGCC------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78660 : TTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-G-T--T---TATT----AC---CA-T-T---T-G-C-A--GATG------TG-C-ATACTGTA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGGATTAA-TT-CAAT-TAT--T-TT-TC-T-CTT----A-G-T---T---A---T------A-G-GGATC-T-AAG-AGGG-GTG
gi|78661 : TTAT-CAGAT--AGCCTTGAGA--C-TT--TG--TCCA------AT-----G-T-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--GTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-TC--T---A---T------G-GTGGATC-T-AAC-AGGG-GTG
gi|78662 : TTAT-CAGAT--AGGCTTGAAA--C-TT--TG--TCCA------AT-----GCC-T--T---TATT----GC---CATT-T---T-G-T-T--GAGGT-----TGCC-A-----TT--TTG---T--C---AA--A----AA----G--A-G----A-TC-CAAT-CAT--T-TT-CC-TAAAA----A-G-T---T---A---T------A-GTGGATC-T-AGG-AGGG-G
gi|78663 : TTAT-CAGAT--AGCCTTGAA---C-TT--AG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-TAA--GATG------TT-C-A-----TA--TTG---T--C-TGGA--C----------G--GGG----A-TC-C-AT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-
gi|78664 : TTAT-CGGAT--AGATTTGAAA--C-TC--TG--TACA------AA-----G-C-T--T---CATT----AC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTA---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CT-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGAATC-C-CAC-AGGG-GTG
gi|78665 : TTAT-CGAAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--A-AGGA--C----AGGATCG--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TTA----A-G-T---T---A---T------G-G-GGATC-C-AA
gi|78666 : TTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-T-T--T---CCTT----GC---TA-T-T---T-G-T-A--GATG------TA-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CT-T-TCA----A-G-T---T---A---A------G-GTGGATC-C-AAC-AAGG-GTG
gi|78668 : TAT--GGAT----CATCGAAA--C-TT--TG--TACATGTACAAT-----G-T-T--T---CACT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TT-C-A-----TA--TTG---T--T-AGGA--C----AG----G--AGA----C-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-C-ACA----A-G-T---T---A---C------G-GTGGATC-T-AGG-AGGG-GTG
gi|78669 : taTAT-CAGAT--TGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CATT----GA---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGAA--CTGGAAA----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GGGGATC-C-ATC-AGGG-GTGt
gi|78670 : TAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TA--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---AA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-TA-T-ACA----A-G-T---T---A---A------A-GTGGATC-T-AAG-AGGG-ATG
gi|78671 : TAT-CAGAT--TGCTTTGAAA--C-TT--TG--TA-A------AT-----GCC-T--T---TATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGAC-C----AG----GA-AGG----A-TC-CAAT-AAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-TTA-T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGG
gi|78672 : TAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GT---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------AG-C-A-----TAT-TTG---T--C--AGA--C----A-----G--AGG----A-TC-CAAT-TA---T-TT-CC-T-TCA----ATG-T---T---G---TTG----A-GTGGATC-
gi|78673 : TAC-TGGAT--AGCTTTGACA--T-TT--TG--TCTA------AT-----A-T-T--T---TATT----AT---CA-T-T---TCA-T----GATG------CT-C-A-----TA--TTG---T--T-TGAA--C----TA----G--AG------------ATATAT--T-TT-CC-C-ACA----A-T-T---T---A---C------A-ATGGA-C-C-AAG-AAG
gi|78674 : TAC-TGGAA--AGC-TTGAAA--T-TT--TT--TTTC------AT-----A-C-T--T---TATT----AT---CA-T-TACAT-G-T------TG------TT-T-A-----TA--TTA---TTTC-TGAA--CT---AG----G--AT-----A-T----AC-TAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---C------A-ATGAACC-A-AGG-AGGaagtgttt
gi|78675 : TAC-TGGAT--AGCTTTGAAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----G-C-T--T---TACT----AT---CA-T-T---C---C-AT-GATG------TT-C-A-----TA--TTG---T--aagtgttt
gi|78676 : TAT-CAAAT--AGCTTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----A-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTT---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----G-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AAGG-GTGttgatctagggatataattcacatgcacatttac
gi|78677 : TAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TA-C-A-----TAT-TTT---T--C-AGGG--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TGT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78679 : TAT-CAGAT--AACCTCGAAA--C-TT--TG--TACA------GG-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TG--TTG---T--C-TGGA--C----AG----G--GGG----A-TC-CAAT-TA---T-TT-CC-T-TCA----T-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78680 : AT--AGATTTGAGA--C-TT--TG--TGCG------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-C-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-TGGA--C----AG----G--AAG----A-TC-CAAA-CAT--T-TT-CT-T-TAA----A-G-A---T---A---C------G-GTGGATC-T-AAG-AAGG-ATG
gi|78684 : tattgatTAT-CAAAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---TA-T-T---T-A-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTT---T--T-GGGA--C----TG----A--AGA----A-TC-CAAT-CAT--T-TT-CT-T-TCA----A-G-C---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTGgtgt
gi|78689 : AT-TGGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TGCA------AT-----G-C-A--T---CATT----AT---CA-T-T---T-G-T-A--AATG------TG-C-A-----TA--TTT---T--C-GGGA--A----AG----G--AGG----A-TT-TAAT-CGT--T-TT-CT-T-TGA----A-G-T---T---A---A------G-ATGGATC-T-AAG-AGGG-GTG
gi|78690 : AT-TGGAT--AGACTTGAAA--C-TT---G--TGCA------AT-----G-C-A--T---CATT----AT---CA-T-T---T-G-T-A--AATG------TG-C-A-----TA--TTT---T--C-GGAA-------AG----G--A-G----A-TT-TAAT-CGT--T-TT-CT-T-TGA----A-G-T---T---A---A------G-ATGGATC-T-AAG-AGGG-
gi|78691 : AT-TGGAT--AGACT-GAAA--C-TT--TG--TGCA------AT-----G-C-A--T---CATT----AT---CA-T-T---T-G-T-A--AATG------TG-C-A-----TA--TTT---T--C-GGAA-------AG----G--AGG----ATTT-TAAT-CGT--T-TT-CT-T-TGA----A-G-T---T---A---A------G-ATGGATC-T-AAG-AGGG-tg
gi|78692 : AT-CGGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T-----TT----A-----A-T--------------GATT------CT-C-T-----TG--TTG---T--T-CTGA--C----CA----T--A-G----A-TC-T-AC-TAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---C------A-Gtg
gi|78695 : T-TGGAT--ATACTTAAAA--C-TT--TG--TGCA------AT-----G-T-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-A-T-T--GAAG------TG-C-A-----TA--ATG---C--T-GGAA--C----AG----G--AGG----A-TT-CAAT-CAT--T-TTACT-T-TTA----A-G-T---T---A---C------A-GAGGATC-T-AAG-AGGG-GTGaattacagtggaacaaaaagaattgttt
gi|78696 : GAAT--AGCCTTGAAA--T-TT--TG--TGTA------AT-----A-C-T--T---CATT----AT---TA-T-T---T-G-A-T--GATG------TT-C-A-----CA--TTGT--T--C-TGAA--C----A--------AGG----A-TC-TAA--TAA--T-TT-CC-T-ATA----A-T-T---T---A---C------A-GTGGATC-A-AAG-AGGA-GTG
gi|78698 : tGAT--AGCTTTGGAA--T-TTG-TG--TTTA------GT-----A-C-T--T---TATT----AT---CA-T-T---TCA-T----GATG------TT-C-A-----TA--TTGT--T--T-TGAA--CT---AG--------GG----A-T---A---TATA-T-TT-CC-T-ACA----A-T-A---T---A---C------A-ATTGACC-C-AAA-AGGA-ATGttt
gi|78700 : GGT--AGACTTGAAC--T-TT--TG--CAAA------AT-----G-C-T--T---CATT----AT---CA-T-T---T-A-A-T--GATG------TC-CGA-----CC--ATG---T--C-CTGA--C----CA----G--GGG----A-TC-TAA--TAT--T-TT-TCGT-ACAT---A-C-TTTAT---A---C------A-GT-GATCAA-AAG-AGGA-GTttt
gi|78701 : GAT--AGCCTTTCAA--T-TT--CG--TACA------AT-----G-C-T--TAC-CAT----------CA-G-T---T-A-A-T--GATG------TT-A-C-----TA--TTG---G--T-GTGATTC----AG--------GG----A-TC-TGAT-GAT--T-TT--G-T-ACA----A-T-T---T---A---C------A-GTGGGTC-tttt
gi|78706 : AT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------ATAAATTG-T-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TCA---T--A-AGGA--C----AG----G--GGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT--C-T-ACA----A-G-T---T---A---A------G-GTGGATC-T-AAG-AGGG-GTGa
gi|78707 : AT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGT--C----AG----G--AGG----A-TC-CAGT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-C---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTGt
gi|78709 : T--AGCCTTGAAA--T-TG--TA--TACA------GT-----A-C-T--T---TATT----AT---CA-T-T---T-A-T-AATGATC------TT-T-A-----CA--TTA---C--T-CTGACTC----AG----G--A------A-TT-TAA--TA---T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---C---C------A-TTGGATT-G-AA--AGGA-GTG
gi|78710 : CTTCAAA--C-TT--TG--TGCA------AT-----G-C-T--T---CATT----AC---CA-T-T---T-G-C-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGAA--C----AG----A--AGG----A-TC-CAGT-CAT--T-TT-CC-T-TAA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGACC-T-AAG-AGGG-ATGtt
gi|78711 : CTTGAT---C-TT--TG--TACA------AT-----A-C-T--TAGGTATT----G-------T-T---T-A-A-T--GATA------TT-T-A-----CA--TTG---T--T-CTGAT-C----AG----A----G----A-TC-AAAT-C-T--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---T------T-GTTGATC-A-AAG-AGGA-GCGt
gi|78713 : TTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-T-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--AATG------TT-C-A-----TA--TTG---T--T-GGAA--T----AG----G--AGG----A-TC-CAGT-TAT--T-TT-CC-A-TAA----A-G-T---CA--A---T------G-GTGGAT--C-AAG-AGGttt
gi|78714 : TTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-T-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--AATG------TT-C-A-----TA--TTG---T--T-GGAA--T----AG----G--AGG----A-TC-CAGT-TAT--T-TT-CC-A-TAA----A-G-T---C---A---A------G-GTGGATC-T-AAG-AGG
gi|78715 : TTGAAA--C-TC--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AAGG-GTG
gi|78717 : G----A-TC-TAAT--AT--T-TT-CA-T-ACATTTAA-T-T---T---A---C------A-GTGGATC-A-AAG-AGGA-G
gi|78720 : aaatttgtatgtttccacagtaattatcatttaatgatcttgacattattttgaccagcA--C-TT--TG--TACA------AT-----A-A-T--T---AAAT----AT---TA-T-T---T-A-A-T--GATG------TT-C-A-----CA--TTG---T--T-CTGA--CT---AG--------GG----A-TC-TAG--TAT--T-TT-CC-T-ATA----A-T-T---T---A---C------A-GTGAATC-G-AAG-agttt
gi|78721 : A--C-TT--TG--TACA------AT-----A-A-T--T---AAAT----AT---TA-T-T---T-A-A-T--GATG------TT-C-A------A--TTG---T--T-CTGA--C----------T--AGG----A-TC-TAG--TA---T-TT-CC-T-ATA----A-T-T---T---A---C------A-GTGAATC-G-AAG-tctatgaggagtat
gi|78723 : GA--C----AA----G---GG----A-T---AACATAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---C------A-ATGAATC-CAAAG-AGGA-GTGtctatgaggagtat
gi|78725 : tctatccgataactaaatatcatttaataatgttcggagtggtctT-----A-C-T--T---AAAT----AT---CA-T-T---T-A-A-T--GATG------TT-C-A-----TG--TTG---TT-C-TGAC--C----AG----G----G----A-TC-CAAT--AT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---C------A-GTGGATC-A-AAG-AGGG-GTGttt
gi|78726 : gttcaactgCA------AT-----A-C-T--T---TAT----------CA-T-T---T---T-AT-GATG------TT-C-A-----CA--TTG---T--T-TGAA--TT---AG----G----G----A-TA-TAAT--AT--T-TT-CC-T-ACA----A-C-T---T---A---C------A-GTGGATT----AG-AGAG-GTGttt
gi|78729 : gct--GATG------TT-A-A-----CA--TTG---T--T-CGAA--CT---AG----G----G----A-T----AT-TATATT-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---C------G-GTAGATC-A-AAG-AATA-GTGttt
blockSeqs : GT TGTACA AAATT TA AGG CATG ACA C AAT CCGGTA GC TACTG GT ACT TT TT CC TGGA GATC TT ATTA AT AA TTTA TTA ATC CATGTAA AA
blockSeqs : G . . TA AC A A C AAT T G . TG AC T A TT CA GATC A T A A T TA A TGCC CA
blockSeqs : . . . C . C . C AT T G . T AC . G CT T GATC . . . T . C . TTG T
blockSeqs : . . . . . T . C AT T G . T T . G C T . . . . A . . . T C
blockSeqs : . . . . . C . C AT . T . . T . C T T . . . . A . . . T T
blockSeqs : . . . . . T . . AT . A . . T . G . T . . . . T . . . T A
blockSeqs : . . . . . C . . TA . T . . . . T . T . . . . A . . . C T
blockSeqs : . . . . . T . . AA . G . . . . A . T . . . . T . . . T A
blockSeqs : . . . . . T . . AT . T . . . . T . T . . . . A . . . C C
blockSeqs : . . . . . T . . AT . C . . . . T . T . . . . A . . . T A
blockSeqs : . . . . . T . . A . T . . . . T . T . . . . A . . . C C
blockSeqs : . . . . . G . . G . T . . . . G . . . . . . A . . . T C
blockSeqs : . . . . . C . . A . T . . . . C . . . . . . A . . . C A
blockSeqs : . . . . . A . . T . T . . . . C . . . . . . A . . . C A
blockSeqs : . . . . . T . . A . T . . . . G . . . . . . T . . . C A
blockSeqs : . . . . . T . . A . G . . . . G . . . . . . A . . . C C
blockSeqs : . . . . . C . . A . G . . . . C . . . . . . T . . . C T
blockSeqs : . . . . . C . . A . T . . . . T . . . . . . A . . . T A
blockSeqs : . . . . . T . . A . T . . . . A . . . . . . T . . . C A
blockSeqs : . . . . . T . . A . G . . . . A . . . . . . T . . . A C
blockSeqs : . . . . . T . . A . G . . . . A . . . . . . C . . . T C
blockSeqs : . . . . . C . . A . G . . . . A . . . . . . T . . . A C
blockSeqs : . . . . . C . . T . G . . . . C . . . . . . A . . . T A
blockSeqs : . . . . . T . . A . T . . . . T . . . . . . A . . . C A
blockSeqs : . . . . . C . . T . T . . . . A . . . . . . T . . . C C
blockSeqs : . . . . . T . . A . G . . . . C . . . . . . A . . . C T
blockSeqs : . . . . . C . . A . T . . . . A . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . C . . A . G . . . . G . . . . . . A . . . A T
blockSeqs : . . . . . C . . A . T . . . . A . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . C . . A . G . . . . A . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . C . . A . G . . . . A . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . C . . A . G . . . . G . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . T . . A . G . . . . A . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . C . . A . G . . . . A . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . T . . T . G . . . . G . . . . . . T . . . T T
blockSeqs : . . . . . T . . A . G . . . . A . . . . . . A . . . T C
blockSeqs : . . . . . C . . A . G . . . . A . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . C . . A . T . . . . A . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . C . . A . G . . . . A . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . C . . A . G . . . . G . . . . . . A . . . T T
blockSeqs : . . . . . C . . A . T . . . . A . . . . . . T . . . C T
blockSeqs : . . . . . T . . A . G . . . . G . . . . . . A . . . T T
blockSeqs : . . . . . T . . A . G . . . . A . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . A . . T . G . . . . A . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . A . . A . G . . . . A . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . C . . A . G . . . . T . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . C . . A . G . . . . A . . . . . . C . . . T T
blockSeqs : . . . . . C . . A . G . . . . A . . . . . . T . . . T T
blockSeqs : . . . . . C . . A . A . . . . T . . . . . . T . . . T T
blockSeqs : . . . . . C . . A . A . . . . A . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . C . . T . G . . . . A . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . C . . A . G . . . . A . . . . . . T . . . A C
blockSeqs : . . . . . C . . A . G . . . . A . . . . . . A . . . C T
blockSeqs : . . . . . C . . A . T . . . . A . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . A . . A . G . . . . A . . . . . . A . . . A T
blockSeqs : . . . . . C . . A . G . . . . A . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . C . . A . A . . . . T . . . . . . T . . . C C
blockSeqs : . . . . . T . . A . T . . . . T . . . . . . A . . . C A
blockSeqs : . . . . . T . . A . G . . . . A . . . . . . A . . . T C
blockSeqs : . . . . . T . . A . G . . . . A . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . T . . A . G . . . . T . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . C . . A . G . . . . T . . . . . . T . . . C T
blockSeqs : . . . . . C . . A . T . . . . G . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . C . . A . T . . . . G . . . . . . T . . . A T
blockSeqs : . . . . . C . . A . T . . . . G . . . . . . T . . . A T
blockSeqs : . . . . . C . . A . G . . . . G . . . . . . T . . . A T
blockSeqs : . . . . . T . . A . A . . . . C . . . . . . T . . . C T
blockSeqs : . . . . . T . . T . G . . . . G . . . . . . A . . . C A
blockSeqs : . . . . . T . . T . G . . . . T . . . . . . T . . . C C
blockSeqs : . . . . . C . . T . G . . . . T . . . . . . A . . . C T
blockSeqs : . . . . . T . . T . G . . . . C . . . . . . A . . . C C
blockSeqs : . . . . . T . . A . G . . . . G . . . . . . A . . . C G
blockSeqs : . . . . . T . . A . G . . . . A . . . . . . A . . . A T
blockSeqs : . . . . . C . . A . T . . . . A . . . . . . A . . . T A
blockSeqs : . . . . . C . . T . G . . . . C . . . . . . T . . . C C
blockSeqs : . . . . . T . . A . T . . . . A . . . . . . A . . . T T
blockSeqs : . . . . . C . . A . T . . . . C . . . . . . T . . . T C
blockSeqs : . . . . . C . . A . C . . . . G . . . . . . A . . . T A
blockSeqs : . . . . . C . . T . T . . . . G . . . . . . T . . . A G
blockSeqs : . . . . . C . . T . G . . . . A . . . . . . T . . . T G
blockSeqs : . . . . . T . . T . G . . . . C . . . . . . T . . . C A
blockSeqs : . . . . . T . . . . T . . . . C . . . . . . A . . . C A
blockSeqs : . . . . . T . . . . G . . . . T . . . . . . A . . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . A . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . A . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . A . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . A . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : ****
originalCons : CTTAT-CGGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-NCA----A-G-T---T---A---C------G-GTGGATC-C-AAG-AGGG-GTG
finalCons : CTTAT-CGGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-NCA----A-G-T---T---A---C------G-GTGGATC-C-AAG-AGGG-GTG
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|78595 ): CTTGTTAGATAGTTTTGAAATTTTGTCTAATACTTTATCATTTCATGATCTTCACATTGTTCGAATTTAATAGGAATATAATATATTCCTACAATTTACAGTGGACCAATTAGCAATGTTT
Unaligned ( gi|78612 ): CCTATTGGATAGCCTTGGGAATTTTTAAAAATGCGATGTATATACCTAATTATTATTTACATGTACATGTAATGATGTTTACATTGTTTTGACCAGAGATCTAATATTGTAGTACAATTTACATTAAATCAAAGAAGAGTGT
Unaligned ( gi|78683 ): TATCAGATAGCTTTGCAATTTTGTGCAATACTTCATCATCTTAATGATGTTTACATTGTTCTGACCAG
Unaligned ( gi|78730 ): AATGATGTTTACATTGTTCTGATCAAAGATCTAATATTTTCACACAATTTTCTTTCGATCAAAGAAAAGTGTTT
Alignments
lowQualScore : 0 00 0 00 0 11 00 111111 11111 0 0 11 111 0000 1111 0 0 111 2 0 4444 222222 11 0 11111 22 333 11 77 22 6666 2222 11 1111 0 0 11 11 0 0 0 11 1111 000 111 111 4444444444 0 222 00 0
lowQualScore : . .. . .. . .. .. ...... ..... . . .. ... .... .... . . ... . . .... ...... .. . ..... .. ... .. .. .. .... .... .. .... . . .. .. . . . .. .... ... ... ... .......... . ... .. .
lowQualScore : 5 77 8 66 4 00 66 333333 11111 9 4 66 333 9999 3333 4 4 222 2 4 9999 555555 44 4 11111 00 222 00 00 77 0000 8888 11 4444 4 4 00 11 4 4 9 99 4444 666 999 222 2222222222 4 222 99 6
consensus : CTTAT-CGGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-NCA----A-G-T---T---A---C------G-GTGGATC-C-AAG-AGGG-GTG
Reference ( family-204 ) : CTTAT-CGGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-NCA----A-G-T---T---A---C------G-GTGGATC-C-AAG-AGGG-GTG
gi|78578 : CTTAT-CAGAT--ATCCTTGAAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TATC----AT---CA-T-T---T-A-A-T--GATG------TT-C-A-----TA--TTG---T--T-CGAA--CT---AG--------GG----A-TC-TAA--CAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---C---A---T------A-GTGGATC-A-AAG-AGGA-GTG
gi|78579 : CTTTT-CAGAT--AGACTTCAAA--C-AT--TG--TACA------AT-----A-C-T--T---CACT----GA---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TC--TTG---T--T-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-TAAA-TAT--T-TT-CC-C-ACA----A-C-T---T---A---T------G-GTGGATC-T-AAG-AGGG-GTGttt
gi|78580 : CTTAT-CGGAT--ACACTTGAAA--C-GT--CG--TACA------GA-----G-C-T--T---CACT----ACATGTA-T-T---T-G-T-G--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-GG-A--T----AG----G--AGG----G-CC-CAAT-CAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTTGATC-C-AAG-AGGA-GTGt
gi|78581 : CTGAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--CGTT--TG--TATA------AT-----G-C-T--G---TGAT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATACCGGTATG-T-A-----TA--TTG---T--C-G--A--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-ATA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATG-T-AAG-AGGA-GTG
gi|78582 : CTTAT-TGGAT--AGCCTTGAAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TATC----AT---CA-T-T---A-G-A-T--GATG------TT-C-A-----CA--TTGT--T--C-CGAC--C----AG--------GG----A-TC-TGA--TAT--T-TT-CC-T-ATA----A-T-T---T---A---C------A-GTGGATC-A-AAG-AGGA-GTG
gi|78583 : CTTAC-TGGAC--AGAATTGAAA--C-TT--TG--TGCA------AT-----G-C-T------CAAT----AC---TA-T-T---T-G-T-A--AATG------TA-C-A-----TA--TTG---T--T-GGCA--C----AG----G--AAG----A-CA-CAAT-AGT--T-TT-CT-G-TAA----A-A-T---TATCA---T------G-GTGGATC-T-AAG-AGGG-GTGttt
gi|78584 : CTTAT-TGGAA--AGCGTTGAAA--G-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TATT----AT---CA-T-T---TCA-T----GATG------TT-C-A-----TA--TTGAC-T--T-TGAA--CT---AG----G--A------A-TA-CAAT--AT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---C------T-ATGGACC-A-AGG-AGGA-GTG
gi|78585 : CTTAT-CAGAT--GGCCTTGAAA--C-TA--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TTGTTTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TC-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTGttt
gi|78586 : CTTAT-TGGAT--AGCCTTGAAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TATT----AT---GA-TGT---C-A-T----GATG------TT-C-A-----CA--TTG---T--T-TGAA--CT---AG--------GG----T-TC-TAA--TAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---C------A-GTAGATC-
gi|78588 : CTTAT-TGAAT--AGCCTTAAAA--T-GT--TG--TTCA------CT-----A-C-T--T---TATT----AT---CA-T-T---T---T-AT-AATG------TC-C-A-----CA--TTG---G--T-TGAA--C-----T----A--ATG----G-TA-TAA--TAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---T------A-GTGTATC-A-AAG-AGGA-GTGaa
gi|78589 : CTTAT-TTGAT--AGCTTTGGAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TATT----AT---CA-T-T---TCA-T----GACG------TT-C-A-----TA--TTGAC-T--T-TGAA--CT---AG----G----G----A-TA-TAAT--AT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---G---C------A-ATGGACC-C-ACG-AGttt
gi|78590 : CTTAT-TTGAT--AGCTTTGGAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TAAT---------CA-T-T---TCA-T----GACG------TT-C-A-----TA--TTG---A--CTTTAA--CT---AG--------GG----A-TA-TAA--TAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---G---C------A-ATGGACC-C-ACG-AGtgttt
gi|78591 : CTAAT-TGGAT--AGCTTTGAAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TATT----AT---TA-T-T---T---C-AT-GATG------TT-C-A-----TA--TTGACTT--T-GAAT--T----AG--------GG----A-TT-TAA--TAT--T-TT-TT-T------------T---T---A---C------A-ATGGACC-A-AGG-AGGA-GTGtgttt
gi|78592 : GGAT--AGCTTTCAAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-C-T--T---TAT----------CA-T-T---T---T-AT-GGTG------TT-C-A-----CA--TTG---T--T-CGAA--C----TA----G--AGAT---A-TT-TTGA-TAG--T-TT-CC-A-ACA----A-T-T---T---A---C------A-GTGGACC-A-AAG-AGGA-GTGttt
gi|78593 : ctcgctCTTGT-TGGAT--AGCCTTGAAA--T-TT--TG--GACA------AT-----T-T-T--T---CATT----AG---CA-T-A---A-A-T----GATG------CT-C-A-----CA--TTG---T--T-CTGA--C----------C--AGG----A-TT-TAA--TAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---C---A---C------A-GTGGATC-A-AAG-AGCA-GTG
gi|78596 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGCAT--T-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CGTT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--A-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-AAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---CATGTAAG-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTGttt
gi|78597 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAG--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---TACG----GA---TA-T-T---T-G-T-A--GGTG------TG-C-A-----TA--TTG---T--T-GAGA--C----GG----A--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT--C-T-ACA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGGTC-T-TAG-AGGG-
gi|78598 : CTAAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--T-TT--TA--TACA------AT-----A-C-TTAT---CATT-----T---AA-T-T---T---------ATG------TT-C-A-----CA--TTG---T--T-CTGA--C----CG----G--A-A----A-TC-TAA--TAT--T-TT--C-T-TCA----A-T-T---T---A---C------A-GTGGGTC-A-AAG-AGGA-Gtgt
gi|78599 : CTTAT-CCGGT--AGCCTTGAAA--T-TT--TA--TGCA------AT-----A-C-T--T-----TT----AT---CA-T-TA--T-T-C-AATGATA------TT-C-A-----CA--TTG---T--T-TTGACCC----AG----G--A------A-TC-T-AC-CAT--T-GA-TC-T-ACA----G-T-T---T---A---A------A-GTATATC-A-AAA-AGGA-GTGagttt
gi|78601 : CTTAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TAGA------AT-----G-C-T--T---TATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAGT-AAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTGtt
gi|78602 : CTTAT-CGGAT--AGACTTGGAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---A------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78603 : CCTAT-CAGAT--AGCCTTGAGA--C-TT--TG--TACG------AT-----G-C-T--T---CATT----GT---CA-T-T---T-G-C-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-CCA----A---T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78604 : CTTAT-CAAAT--AGACTTTGAA--C-TT--CG--TGCA------AT-----A-C-T--T---TATT----AT---CA-T-T---T-G-T-A--GATA------TG-C-A-----CA--TTT---C--C-AGGA--C----AG----T--AGG----G-TC-CAAT-CAT--T-TC-CC-T-TAA----T-G-T---T---A---C------G-ATGGATC-A-AAG-AGGG-GTG
gi|78605 : AAA--C-TTGTTG--TACA------AT-----A-C-T--T---TA------------A-T--------------GATG------TT-C-A-----CA--TTG---T--T-CTGA--C----AT----G---GA----A-TC-TAAT--AT--G-TT-GC-A-ACA----A-T-T---A---A---C------A-GTGGATC-A-AAG-TGGA-GTG
gi|78606 : ctcattaaatCTTAT-TGGAT--AGCC----GA--T-TT--AG--TACA------GC-----A-T-T--T---CATT----AT---CA-T-G---T-A-T-T--GATG------AT-C-A-----AA--CTG---T--C-TAAT--C----AG----G----T----A-TA-TAAC--AT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---G---C------A-GTGAATttt
gi|78608 : CTTAT-TAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------CA-----A-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TCG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TA-CAAT-TAT--T-T---C-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78609 : CTCAT-TGGAT--AGCCTTGAAA--T-TT--TG--TACG------AC-----A-C-TTAT---CATT----------A-T-T---T-A-T-T--GATG------TT-T-A-----TA--TTG---T--T-CTGA--CCA--AG----GTTATA----A-TC-TAAT-T
gi|78610 : CTTAT-TGGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TAAA------AT-----G-C-T--G---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-T-A-----TA--TTG---T--T-AGGA--C----AG----G--ATG----A-TT-AAAT-TAT--T-TT-TC-T-AC-----C-G-A---T---A----------G-G-GGATC-T-AAG-AGGA-GTGtt
gi|78611 : CTTAC-TGGAT--AGCTTTGACA--T-TT--TG--TTCA------AT-----A-CTT--T---TATT----AT---AA-T-T---T---C-AT-GATG------TT-C-A-----TA--TTG---T--
gi|78615 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-C-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---A------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTGt
gi|78617 : CTTAT-CAAAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-T-C--T---CATT----GT---CA-T-T---T-A-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTA---T--C-AGGA--A----AG----G--A------A-TC-CAAT-TGT--T-AT-CA-T-AAA----A-G-T---T---A---T------A-GTGGATC-T-AAA-A
gi|78618 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATA------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-TAAT-TAT--T-TT-TC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AAGG-GTG
gi|78619 : CTTAA-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-T-A-----TATGTTT---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TT-CGAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78622 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----AC---CA-T-T---T-C-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--T-G---T--C-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGAG-GTG
gi|78623 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GACG------TG-T-A-----TA--T-G---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAACAGGG-GTG
gi|78626 : CTTAT-TAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACT------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTA---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----T-G-T---T---A---T------G-ATGGATC-C-AAG-AGGG-GTG
gi|78627 : CTTAT-CAGAT--AAGCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---TA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-GGGC--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCC----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78628 : CTTAC-TGAAT--AAATGCGAGA--C-TT--TG--TACA------AT-----A-C-T--T---TAAT----AT---CA-T-T---T-A-A-T--GATG------TT-C-A-----CA--TTA---T--
gi|78629 : CTTAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----AC---CA-T-T---T-G-T-A--GATT------TG-C-A-----AA--TTC---T--T-AGGA--C----AG----G--AAG----A-TT-GAAC-CAT--T-CT-TC-T-TAA----A-T-T---T---A---T------G-GTGAATA-T-AAG-AGGG-GTGtctaaccaagga
gi|78630 : CTTAT-CAGAT--AGCCATGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GT---CA-T-T-----G-T-A--GATG------TG-A-A-----TA--TTG---T--C-AGAA--C----AG----A--AGT----A-TC-CAAT-GAT--T-TT-GT-T-ATA----A-G-T---T---A---T------G-GTTGCTC-C-AAC-AGGG-GCG
gi|78631 : CTTAT-TGGAT--AGCCTTGAAA----TG--TG--CACA------GT-----G-C-T--T---TATT----CT---CA-T-T---T-GAT-A---ATG------TT-C-A-----CA--TTG---T--
gi|78632 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-T-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGGCC-C-AAC-AGGG-ATGtc
gi|78634 : CTTATTCAGAT--AGCCTTG-AA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-TC-T---CATT----G----CA-T-T---T-G-T-A--GATGT-----TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--A----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-CAT--T-TT-CC-T-TCA----A-GTT---T---A---T------G-GGGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78635 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAAAAC-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---CA-T-T---T-G-TTA--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--T-GGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CCTT-TCA----A-G-T---T---A---T------GCGTGGATC-C-AAC-AGGGAGTG
gi|78636 : CTTAT-CGGATGTAGACGTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATTAATTGC---CG-T-T---T-G-T-A--GGTG------TG-C-A-----TA--TTG---C--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAGT-GAT--T-TT-CC-T-AAT----A-G-T---T---A---C------A-GTGGATC-T-AAG-AGGG-CTG
gi|78639 : CTTAT-CAGAT--AGATTTAAAA--C-TT--TG--TTCA------AA-----G-T-T--T---TATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TT--TTG---T--C-GGGG--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-GAT--T-TT-CC-T-TAA----C-G-T---T---A---T------G-TTGGATC-T-AAG-AGGG-GTGt
gi|78640 : CTTAT-CAGAT--AGACTGGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATC------TG-C-A-----TA--TTA---T--C-AGGA--C----AG----G--GGG----A-TCAGAAT-TGT--TAAT-CC-T-AAA----A-G-T---T---A---T------A-GTGGATC-T-AAG-A
gi|78641 : CTTAT-TGGAT--AGCCTTG-GA--T-TT--TGAAAAAA------AT-----A-A-T--T---CATT----AT---CA-T-T---T-G-A-T--GATGT-----TG-G-A-----CA--TTG---T--
gi|78642 : CTTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--AG--TACA------AT-----G-C-T--T---C-TT----GT---CA-T-T---T-G-T-A---------------C-A-----TA--TTG---------GGA--C----AA----G--AGG----A-TT-CAAT-TAT--T-TT-CT-T-TAC----A-G-T---C---A---T------G-GTGAATC-C-AAC-AGGA-GTGtcttgaatccagagatctgatatttt
gi|78654 : TTAT-CAGAT--TGCCTTGAAA--C-TT--TT--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GA---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TA-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AGGATCG--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TC-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78655 : TTAT-CAGAT--TGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CAGT----GA---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TA-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AGGATCG--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TC-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AAGG-GTG
gi|78657 : TTAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-T-T-A--CATG------TG-T-A-----TA--TTG---T--C-TGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---ATGCC------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78660 : TTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-G-T--T---TATT----AC---CA-T-T---T-G-C-A--GATG------TG-C-ATACTGTA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGGATTAA-TT-CAAT-TAT--T-TT-TC-T-CTT----A-G-T---T---A---T------A-G-GGATC-T-AAG-AGGG-GTG
gi|78661 : TTAT-CAGAT--AGCCTTGAGA--C-TT--TG--TCCA------AT-----G-T-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--GTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-TC--T---A---T------G-GTGGATC-T-AAC-AGGG-GTG
gi|78662 : TTAT-CAGAT--AGGCTTGAAA--C-TT--TG--TCCA------AT-----GCC-T--T---TATT----GC---CATT-T---T-G-T-T--GAGGT-----TGCC-A-----TT--TTG---T--C---AA--A----AA----G--A-G----A-TC-CAAT-CAT--T-TT-CC-TAAAA----A-G-T---T---A---T------A-GTGGATC-T-AGG-AGGG-G
gi|78663 : TTAT-CAGAT--AGCCTTGAA---C-TT--AG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-TAA--GATG------TT-C-A-----TA--TTG---T--C-TGGA--C----------G--GGG----A-TC-C-AT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-
gi|78664 : TTAT-CGGAT--AGATTTGAAA--C-TC--TG--TACA------AA-----G-C-T--T---CATT----AC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTA---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CT-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGAATC-C-CAC-AGGG-GTG
gi|78665 : TTAT-CGAAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--A-AGGA--C----AGGATCG--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TTA----A-G-T---T---A---T------G-G-GGATC-C-AA
gi|78666 : TTAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-T-T--T---CCTT----GC---TA-T-T---T-G-T-A--GATG------TA-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CT-T-TCA----A-G-T---T---A---A------G-GTGGATC-C-AAC-AAGG-GTG
gi|78668 : TAT--GGAT----CATCGAAA--C-TT--TG--TACATGTACAAT-----G-T-T--T---CACT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TT-C-A-----TA--TTG---T--T-AGGA--C----AG----G--AGA----C-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-C-ACA----A-G-T---T---A---C------G-GTGGATC-T-AGG-AGGG-GTG
gi|78669 : taTAT-CAGAT--TGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CATT----GA---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGAA--CTGGAAA----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GGGGATC-C-ATC-AGGG-GTGt
gi|78670 : TAT-CAGAT--AGACTTGAAA--C-TA--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---AA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-TA-T-ACA----A-G-T---T---A---A------A-GTGGATC-T-AAG-AGGG-ATG
gi|78671 : TAT-CAGAT--TGCTTTGAAA--C-TT--TG--TA-A------AT-----GCC-T--T---TATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGAC-C----AG----GA-AGG----A-TC-CAAT-AAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-TTA-T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGG
gi|78672 : TAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GT---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------AG-C-A-----TAT-TTG---T--C--AGA--C----A-----G--AGG----A-TC-CAAT-TA---T-TT-CC-T-TCA----ATG-T---T---G---TTG----A-GTGGATC-
gi|78673 : TAC-TGGAT--AGCTTTGACA--T-TT--TG--TCTA------AT-----A-T-T--T---TATT----AT---CA-T-T---TCA-T----GATG------CT-C-A-----TA--TTG---T--T-TGAA--C----TA----G--AG------------ATATAT--T-TT-CC-C-ACA----A-T-T---T---A---C------A-ATGGA-C-C-AAG-AAG
gi|78674 : TAC-TGGAA--AGC-TTGAAA--T-TT--TT--TTTC------AT-----A-C-T--T---TATT----AT---CA-T-TACAT-G-T------TG------TT-T-A-----TA--TTA---TTTC-TGAA--CT---AG----G--AT-----A-T----AC-TAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---C------A-ATGAACC-A-AGG-AGGaagtgttt
gi|78675 : TAC-TGGAT--AGCTTTGAAA--T-TT--TG--TTCA------AT-----G-C-T--T---TACT----AT---CA-T-T---C---C-AT-GATG------TT-C-A-----TA--TTG---T--aagtgttt
gi|78676 : TAT-CAAAT--AGCTTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----A-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTT---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----G-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AAGG-GTGttgatctagggatataattcacatgcacatttac
gi|78677 : TAT-CAGAT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TA-C-A-----TAT-TTT---T--C-AGGG--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TGT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78679 : TAT-CAGAT--AACCTCGAAA--C-TT--TG--TACA------GG-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TG--TTG---T--C-TGGA--C----AG----G--GGG----A-TC-CAAT-TA---T-TT-CC-T-TCA----T-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTG
gi|78680 : AT--AGATTTGAGA--C-TT--TG--TGCG------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-C-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-TGGA--C----AG----G--AAG----A-TC-CAAA-CAT--T-TT-CT-T-TAA----A-G-A---T---A---C------G-GTGGATC-T-AAG-AAGG-ATG
gi|78684 : tattgatTAT-CAAAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------GT-----G-C-T--T---CCTT----GC---TA-T-T---T-A-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTT---T--T-GGGA--C----TG----A--AGA----A-TC-CAAT-CAT--T-TT-CT-T-TCA----A-G-C---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTGgtgt
gi|78689 : AT-TGGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TGCA------AT-----G-C-A--T---CATT----AT---CA-T-T---T-G-T-A--AATG------TG-C-A-----TA--TTT---T--C-GGGA--A----AG----G--AGG----A-TT-TAAT-CGT--T-TT-CT-T-TGA----A-G-T---T---A---A------G-ATGGATC-T-AAG-AGGG-GTG
gi|78690 : AT-TGGAT--AGACTTGAAA--C-TT---G--TGCA------AT-----G-C-A--T---CATT----AT---CA-T-T---T-G-T-A--AATG------TG-C-A-----TA--TTT---T--C-GGAA-------AG----G--A-G----A-TT-TAAT-CGT--T-TT-CT-T-TGA----A-G-T---T---A---A------G-ATGGATC-T-AAG-AGGG-
gi|78691 : AT-TGGAT--AGACT-GAAA--C-TT--TG--TGCA------AT-----G-C-A--T---CATT----AT---CA-T-T---T-G-T-A--AATG------TG-C-A-----TA--TTT---T--C-GGAA-------AG----G--AGG----ATTT-TAAT-CGT--T-TT-CT-T-TGA----A-G-T---T---A---A------G-ATGGATC-T-AAG-AGGG-tg
gi|78692 : AT-CGGAT--AGACTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T-----TT----A-----A-T--------------GATT------CT-C-T-----TG--TTG---T--T-CTGA--C----CA----T--A-G----A-TC-T-AC-TAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---C------A-Gtg
gi|78695 : T-TGGAT--ATACTTAAAA--C-TT--TG--TGCA------AT-----G-T-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-A-T-T--GAAG------TG-C-A-----TA--ATG---C--T-GGAA--C----AG----G--AGG----A-TT-CAAT-CAT--T-TTACT-T-TTA----A-G-T---T---A---C------A-GAGGATC-T-AAG-AGGG-GTGaattacagtggaacaaaaagaattgttt
gi|78696 : GAAT--AGCCTTGAAA--T-TT--TG--TGTA------AT-----A-C-T--T---CATT----AT---TA-T-T---T-G-A-T--GATG------TT-C-A-----CA--TTGT--T--C-TGAA--C----A--------AGG----A-TC-TAA--TAA--T-TT-CC-T-ATA----A-T-T---T---A---C------A-GTGGATC-A-AAG-AGGA-GTG
gi|78698 : tGAT--AGCTTTGGAA--T-TTG-TG--TTTA------GT-----A-C-T--T---TATT----AT---CA-T-T---TCA-T----GATG------TT-C-A-----TA--TTGT--T--T-TGAA--CT---AG--------GG----A-T---A---TATA-T-TT-CC-T-ACA----A-T-A---T---A---C------A-ATTGACC-C-AAA-AGGA-ATGttt
gi|78700 : GGT--AGACTTGAAC--T-TT--TG--CAAA------AT-----G-C-T--T---CATT----AT---CA-T-T---T-A-A-T--GATG------TC-CGA-----CC--ATG---T--C-CTGA--C----CA----G--GGG----A-TC-TAA--TAT--T-TT-TCGT-ACAT---A-C-TTTAT---A---C------A-GT-GATCAA-AAG-AGGA-GTttt
gi|78701 : GAT--AGCCTTTCAA--T-TT--CG--TACA------AT-----G-C-T--TAC-CAT----------CA-G-T---T-A-A-T--GATG------TT-A-C-----TA--TTG---G--T-GTGATTC----AG--------GG----A-TC-TGAT-GAT--T-TT--G-T-ACA----A-T-T---T---A---C------A-GTGGGTC-tttt
gi|78706 : AT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------ATAAATTG-T-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TCA---T--A-AGGA--C----AG----G--GGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT--C-T-ACA----A-G-T---T---A---A------G-GTGGATC-T-AAG-AGGG-GTGa
gi|78707 : AT--AGCCTTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGT--C----AG----G--AGG----A-TC-CAGT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-C---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AGGG-GTGt
gi|78709 : T--AGCCTTGAAA--T-TG--TA--TACA------GT-----A-C-T--T---TATT----AT---CA-T-T---T-A-T-AATGATC------TT-T-A-----CA--TTA---C--T-CTGACTC----AG----G--A------A-TT-TAA--TA---T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---C---C------A-TTGGATT-G-AA--AGGA-GTG
gi|78710 : CTTCAAA--C-TT--TG--TGCA------AT-----G-C-T--T---CATT----AC---CA-T-T---T-G-C-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGAA--C----AG----A--AGG----A-TC-CAGT-CAT--T-TT-CC-T-TAA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGACC-T-AAG-AGGG-ATGtt
gi|78711 : CTTGAT---C-TT--TG--TACA------AT-----A-C-T--TAGGTATT----G-------T-T---T-A-A-T--GATA------TT-T-A-----CA--TTG---T--T-CTGAT-C----AG----A----G----A-TC-AAAT-C-T--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---T------T-GTTGATC-A-AAG-AGGA-GCGt
gi|78713 : TTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-T-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--AATG------TT-C-A-----TA--TTG---T--T-GGAA--T----AG----G--AGG----A-TC-CAGT-TAT--T-TT-CC-A-TAA----A-G-T---CA--A---T------G-GTGGAT--C-AAG-AGGttt
gi|78714 : TTGAAA--C-TT--TG--TACA------AT-----G-T-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--AATG------TT-C-A-----TA--TTG---T--T-GGAA--T----AG----G--AGG----A-TC-CAGT-TAT--T-TT-CC-A-TAA----A-G-T---C---A---A------G-GTGGATC-T-AAG-AGG
gi|78715 : TTGAAA--C-TC--TG--TACA------AT-----G-C-T--T---CATT----GC---CA-T-T---T-G-T-A--GATG------TG-C-A-----TA--TTG---T--C-AGGA--C----AG----G--AGG----A-TC-CAAT-TAT--T-TT-CC-T-TCA----A-G-T---T---A---T------G-GTGGATC-C-AAC-AAGG-GTG
gi|78717 : G----A-TC-TAAT--AT--T-TT-CA-T-ACATTTAA-T-T---T---A---C------A-GTGGATC-A-AAG-AGGA-G
gi|78720 : aaatttgtatgtttccacagtaattatcatttaatgatcttgacattattttgaccagcA--C-TT--TG--TACA------AT-----A-A-T--T---AAAT----AT---TA-T-T---T-A-A-T--GATG------TT-C-A-----CA--TTG---T--T-CTGA--CT---AG--------GG----A-TC-TAG--TAT--T-TT-CC-T-ATA----A-T-T---T---A---C------A-GTGAATC-G-AAG-agttt
gi|78721 : A--C-TT--TG--TACA------AT-----A-A-T--T---AAAT----AT---TA-T-T---T-A-A-T--GATG------TT-C-A------A--TTG---T--T-CTGA--C----------T--AGG----A-TC-TAG--TA---T-TT-CC-T-ATA----A-T-T---T---A---C------A-GTGAATC-G-AAG-tctatgaggagtat
gi|78723 : GA--C----AA----G---GG----A-T---AACATAT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---C------A-ATGAATC-CAAAG-AGGA-GTGtctatgaggagtat
gi|78725 : tctatccgataactaaatatcatttaataatgttcggagtggtctT-----A-C-T--T---AAAT----AT---CA-T-T---T-A-A-T--GATG------TT-C-A-----TG--TTG---TT-C-TGAC--C----AG----G----G----A-TC-CAAT--AT--T-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---C------A-GTGGATC-A-AAG-AGGG-GTGttt
gi|78726 : gttcaactgCA------AT-----A-C-T--T---TAT----------CA-T-T---T---T-AT-GATG------TT-C-A-----CA--TTG---T--T-TGAA--TT---AG----G----G----A-TA-TAAT--AT--T-TT-CC-T-ACA----A-C-T---T---A---C------A-GTGGATT----AG-AGAG-GTGttt
gi|78729 : gct--GATG------TT-A-A-----CA--TTG---T--T-CGAA--CT---AG----G----G----A-T----AT-TATATT-TT-CC-T-ACA----A-T-T---T---A---C------G-GTAGATC-A-AAG-AATA-GTGttt
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|78595 ): CTTGTTAGATAGTTTTGAAATTTTGTCTAATACTTTATCATTTCATGATCTTCACATTGTTCGAATTTAATAGGAATATAATATATTCCTACAATTTACAGTGGACCAATTAGCAATGTTT
Unaligned ( gi|78612 ): CCTATTGGATAGCCTTGGGAATTTTTAAAAATGCGATGTATATACCTAATTATTATTTACATGTACATGTAATGATGTTTACATTGTTTTGACCAGAGATCTAATATTGTAGTACAATTTACATTAAATCAAAGAAGAGTGT
Unaligned ( gi|78683 ): TATCAGATAGCTTTGCAATTTTGTGCAATACTTCATCATCTTAATGATGTTTACATTGTTCTGACCAG
Unaligned ( gi|78730 ): AATGATGTTTACATTGTTCTGATCAAAGATCTAATATTTTCACACAATTTTCTTTCGATCAAAGAAAAGTGTTT