lowQualScore                  :    0   0 00 1 0 00 00 11 222 6  2222222222 00 222222 1 0 11 222  0 11 11  0 22222 000 0 1111 0 0 111111 11 11 11 0 444444444444444 11111 1 33333 22 55555 0 0 0  2222222222 33333333 0 11 11 11 11 6666 11111  2 11 0  0  0 0   
lowQualScore                  :    .   . .. . . .. .. .. ... .  .......... .. ...... . . .. ...  . .. ..  . ..... ... . .... . . ...... .. .. .. . ............... ..... . ..... .. ..... . . .  .......... ........ . .. .. .. .. .... .....  . .. .  .  . .   
lowQualScore                  :    4   7 88 0 3 44 44 22 666 1  5555555555 99 555555 3 6 44 999  3 22 22  3 55555 666 6 5555 6 6 666666 33 00 00 8 999999999999999 66666 2 11111 66 44444 4 4 8  2222222222 11111111 4 44 88 44 88 0000 11111  1 66 9  9  6 6   
consensus                     : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CC-G--T-CA-TT-C-CGT
Reference ( gi|72074 )        : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72075                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72077                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-TT-C-TGT
gi|72079                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--A--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72078                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--A---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72083                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GA-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-TT-C-CAT
gi|72084                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-A---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-GTTT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72086                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------ACA-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--CTT---C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72087                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CC-G--T-CA-T
gi|72089                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GA-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CC-TT-C-CG
gi|72091                      : TTT-TTA-T--C-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-T
gi|72092                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------G-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------T--------C-G--T--C--A--T----T-----TT-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72085                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-A---------------T-----T-A--------C-----C-T-G-TT----------C--------C----T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72098                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TC----------C--------T-G--T--C--A--T----T-----CC-G--T-CA-T
gi|72097                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----G-T-G-TT----------C--------T-G--T--C--C--T----T-----CT-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72099                      : TTT-TTA-T--G-T-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-AG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CC-G--T-CA-T
gi|72101                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------T-G--T--C--A--T----T-----CC-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72100                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----------C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CC-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72103                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--T--C---G-CT----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-A-----G---G-C----A-T-A------TGTA--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-A--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72104                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-TT-C-
gi|72106                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---A-CC----------A--T------A-A-T--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CC-G--T-CA-T
gi|72107                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-TC----------A--T------A-A-A--A---TG-A--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----T-T-G-TT----------C--------C-G--C--C--A--T----T-----CC-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72109                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TTTCCGTCATTTC--------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72110                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-T--T--C--T--T----T-----CC-G--T-CA-T
gi|72111                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-C-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------T-G--T--C--A--T----T-----CC-G--T-CC-TT-T-CAT
gi|72113                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--CT----C-T-G-T--------------------C-G--T--C--A--T----T-----CC-G--T-CA-TT-C-
gi|72114                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A-A------TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-T
gi|72115                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--TCA--T-----TTGG--T----TT-C-CGT
gi|72080                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--A--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T-----G--T-G---------------T-----T-------C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--CA-A--T----T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72116                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A------TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A--------C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CC-G--T-CA-T
gi|72081                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--CA-C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T-----G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-------------------C-G--T--C--A-------T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72117                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG----CC-GG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CC-G--T-CA-T
gi|72118                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C------A-TC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----CA-C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-T
gi|72119                      : TTT-CTA-T--G-T-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-T-A--T---TG-G--TC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CC-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72120                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-C--A---AG-G--CC-GG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CC-G--T-CA-T
gi|72121                      : TTT-GTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-ATACATGT--A--G--T-G---------------T-----T-A-----A--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CC-G--T-CC-TT-T-CGT
gi|72122                      : TTT-GTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--GG-GG-G-----GGGGG-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--CATA--T----T-----CT-A--T-CA-TT-C-CGT
gi|72123                      : TTT-TTT-T--G-C-C--C---------A-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-GG-CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----TTA-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-TT-C-CAT
gi|72124                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-C-A--A---TG-G--CC--G-G-----G---G-C----A-T-A------T--A-------G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----C--G--T-CA-TT-C-TGT
gi|72082                      : TTT-TTA-T--G-C-C--A--C------G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-------C--C-----C-T-G-TT-------------------C-G--T--C--A--A----T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72126                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-------------------C-G--T--CT-A--T----T-----TG-G--T----TT-C-CG
gi|72127                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-
gi|72128                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G--C----------A--T------A-ACA--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A---A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------CT-------C-G--T--C--A--T----T-----CC-G--T-CC-TT-C-CG
gi|72129                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--T--TAATG-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--T--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------T-A--T--C--A--T----T-----CT-G--T-GA-TT-C-CGT
gi|72076                      : TTT-TAA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC----------G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--CTCTGAC-T-G-TTG---------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72088                      : TTT-TTA-T--GGC-C--C--C--CA--G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A--------C-----C-T-GTTT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CC-G--T-CA-T
gi|72130                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G---C-GG-T-----G---G-C----ATT-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T---TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CC-TT-C-
gi|72131                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CCC---------A--T------A-A-A--AA--TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------------T-A-----C--C-----C-T-G--T----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CC-G--T-CA-T
gi|72133                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-GC----G---G-CA---A-T-A---------A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G--T----------C--------C-G--T--C--A--T-----------T-G--T-CA-TT-C-CAT
gi|72132                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--T---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TA-G--CT-GG-G-----G---A-C----T-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------T--------T-G--T--C--C--T----T-----CC-G--T-CA-TT-C-CAT
gi|72093                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--TT-----G-A-A--A---TG-G--CC-CG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-AC----C--C-----C-T-G-TT----------T--------C-G-----C--A--T----T-----TT-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72134                      : TTT-TTA-TTGG-C-C--C--C--C------C----------A--T------A-A-AT-A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T--------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-A-TT----------CG-------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72135                      : TTT-TTAGT--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GGCGC----G---G-C----A-T-AC-----T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A-------T-----CC-G--TCCC-TT-C-CGT
gi|72136                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC--G-G-----G---G-C----A-T-A------T-----G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------T-G--T--C--AG-T----T-----CTGG--T-CA-TT-C-
gi|72137                      : TTT-TTA-T--G-C-T--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G------A-T-A---------A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--TCA--T-----TG-G--T----TT-C-CGT
gi|72139                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A------------------------------G-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-TT-T-CGT
gi|72140                      : TTT-TTA-T--G-T-C--C--C--T---G-TC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-G-----C--A-----T-C-A-GT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CC-G--T-CAGTT-C-C
gi|72141                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC-------------T------ACA-A--A---TG-G--CC-CG-G-----G---G-C----A---A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----CCTC-----C-T-G-TT----------C--------C-GT-T--C--A--T----T-----CC-A--T-CA-TT-C-TGT
gi|72094                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--CT--G-CC----------A--T--------G-A--A---TG-G--CC--G-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-AT----C--C-----C-T-G-TT----------T--------C-G--T--C--A--T----T-----TT-G--T-CC-TT-C-
gi|72142                      : TTG-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--C------A-A-A--AA--TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-GT--------------T-----T-AT----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--TCAA-T-----TT-G--G-TT-TT-C-CGT
gi|72125                      : TTT-TTA-A--G-C-C--C--C--T---G-CC----------A--T------A-A-A--AA--TG-G--CC-GG-G-----G---C-T----A-TTA------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--CTGTCTC-T-G-TT----------C--------T-G--T--C--A--T----T-----CC-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72143                      : TTT-TTA-T--G-CGC--C--C--C---G-CC----------AAAT------A-A-A--AGTCTG-GACCC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-GT--------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------CG-------C-G--T--C--A--T----T-----CC-G--TGCA-TT-
gi|72144                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-T-A------TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-T
gi|72145                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-TC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GG-G-----G---G-A----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-G-----CA-C-----C-T-G--T----------C--------C-A--T--C--A--TTTAGT-----CT-G--T-C
gi|72108                      : TTT-TTA-TT-G-C-C--C--T--C---G-TC----------A--T------T-A-A--A---TG-A--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-----------------T-----T-A-----C--C-----T-T-G-TT----------C--------C-G--C--C--A--T----T-----C--G--T-CC-TT-CTCGT
gi|72147                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------G--T------A-A-A--A---TG-G--CC-AG-AGT---G---G-C----A-T-A------T--A-------G---------------T-----T-A-----CG-C-----C-T-G-TT-------------------C-G--T--C--ATTT----T-----CT-G--T-CA-TT-
gi|72146                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---C-CCCCCCCCCCCCA--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GG-G-----G---A-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--TCA--T-----TTGG--T----TT-C-CGT
gi|72148                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--G---G-CC----------A--TTTCCATA-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-GTAGGGCATATACGTCT-----T-A-----C--C-----CTT-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CT-GCTT-CATTT-C-CG
gi|72149                      : TTT-TTA-T--G-A-C--C--C--C---A-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GG-G-----G---G-C----T-T-A------T--A--G--A-G---------------T-----T-G-----CA-C-----C-T-G-TT-------------------C-A--T--C--A--T----TCTGTCCT-G--T-CA-TT-C-CAT
gi|72151                      : TTTATTA-T--G-C-C--A--T--T------T----------A--T------G-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--C--T----T-----CC-G--T-TA-T
gi|72150                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C------A-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GG-G-----G---G-C----T-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-G-----C--A-----C-C-A-TT----------C--------C-A--T--C--C--T----T-----CC-G--T-CA-T
gi|72153                      : TTG-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--C------A-A-A--A---T--G--CC-GG-G------------------C-A------T--A--G--T-----------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G--T----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-TT-C-C
gi|72152                      : TTT-TGA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--GC-T-G---------------T-----T-A--------C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--------G--T----C-----TT-G--T-C--TT-C-CGT
gi|72155                      : TTT-TTA-T--G-C-CACC--C--C---G-CCT---------A--T------A-AGA--A---TG-G--CC-GG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--G--T-GT--------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--TCA--T-----TTGG--T----TT-C-CGT
gi|72154                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CCCC--------A--T------A-A-A--A---T--G--CC-GG-G-----G---GCC----A-T-A------T--A--G--T-GC--------------T-----T-A--------C-----C-T-G-TT----------C--------C-GT-T--C--A--T----T-----CT-
gi|72156                      : TTT-TTAAT--G-C-C--C--CACT---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-GA----G---G-CAA--A-TAA------T--A--G--TCG---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--TA---T-----CC-T--T-CA-TTGC-CGT
gi|72157                      : TTT-TCA-T--G-C-C--C--T--T---G-CC----------A--T------T-A-A--A---TG-A--CC-AG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------A-----T-A-----T--C-----C-T-G-TT----------C--------C-A--T--C--A--T----
gi|72158                      : TTT-TGA-T--G-C-C--C--C--C---GGCC----------A--T------AGA-A--A---TG-G--CCGGG-G-----G---G-C----A-T-AG-----T--A--G--T-G---------------TAACCCTGA-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--TC-C--A--T----T-----CC-G--T-CA-T
gi|72095                      : TTT-TTT-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--G------GTA-A--A---TGTG--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-GT--------------T-----T-A-----C--CCT---C-T-G-TT----------T--------C-G-----C--AT-T----T-----TT-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72159                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A--------TG-G--CC-GG-GA----G---G-C----A-T-A------C--A--G--T-G---------------T-----T-AAACCCT--C-----C-T-G-TT----------C--------CGG--T--C--A--TTA--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72161                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--T--T---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----
gi|72160                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---A-CC----------A--C------A-A-A--G---TG-G--TT-AG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--G--T-T---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-T-TT----------C--------C-G--T--C--C--T----T-----TC-G--T-
gi|72163                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---A-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-A--CC-AG-G-----C---G-CATATA-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----TGA-----G--C-----C-A-G--T----------C--------T-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-
gi|72164                      : TTT-TGA-T--G-C-C--C--CCCC---G-CC----------A--T------A-A-A--AATGCG-GGCCC-GG-GGTTAAG---G-C----A---A------T--AATG--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------CT-------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-T
gi|72165                      : TTT-TTA-T--G-A-C--C--C--C---G-CC----------A--C------A-A-A--A---TG-G--TC--A-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-T---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-T-TT----------C--------T-A--T--C--C--T----T-----C
gi|72112                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CA----------C--T------A-A-ACAG---TG-G--CC-GG-G-----G-----C----A-T-A------TT-A--G--T-G---------------T-----T-G-----CA-C-----C-T-G-TT----------CGTCATTTCT-G--T--C--A--T----T-----CC-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72138                      : TTT-TTA----G-C-C--C---------G-C-----------A--TG-----A-A-A--A---TG-G--CG-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--GCCT-G---------------T-----T-A-----C--C-----A-T-A-TT----------C--------C-G--T--C--C--T----T-----CC-G--T-CA-T
gi|72166                      : TTG-TTA-C--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--C------A-A-A--G---TG-G--T--AG-G-----G---T-C----A-T-A------C--A--G--T-T---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-T-GT----------C--------C-G--T--T--C--T----T-----CT-G--T-CC-TT-C-CG
gi|72213                      :  TT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--CCGT--C-T-G-TT----------C--------C-G--TA-C--A--T----T-----CC-G--T-CA-T
gi|72220                      :   T-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--CCGT--C-T-G-TT-------------------C-G--T--C--A--T----T-----CC-G--T-CA-T
gi|72221                      :   T-TTA-T--GGC-T--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--TCA--T-----TT-G----GG-TT-C-CGT
gi|72222                      :   T-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------ACAT------A-A-A--A---TG-G--TC-AG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------T--------C-G--T--C--A--TCA--T-----TTGG--T----TT-C-CGT
gi|72223                      :   T-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G--C----------A--T------A-A-A--AT--TG-G--C---G-G-----G---G-C----A-G-A------T--A--G--T-G---------------TTC---T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--TG-C--A--T----T-----CT-GCTT-CA-TT-C-C
gi|72224                      :   T-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------T--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---C-A----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-ACCGC-C--C-----C-TAG-TT----------C--------T-G--T--C--AT-T----T-----CC-G--T-CA-T
gi|72225                      :   T-TTA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A-A--AAA-TG-G--C--GG-G-----G---G-C----AGT-A------T--AA-G--T-----------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-GTTT--C--A--T----T-----CC-G--T-CA-T
gi|72227                      :    -TTA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A-AC-A---TG-G--CC-GG-G-----------C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-------------------C-G--T--C--A--T-----------C-G--T-CA-TT-
gi|72228                      :    -TTA-T--GGC-C--C--C--C---G-CA----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-GT--------------T-----T-A-----C--CA----C-T-G-TT-------------------C-G--TCAC--A--T----T-----TG-G--T----TT-C-CGT
gi|72075                      :      TA-T--G-C-C--C--C--C---GGCC----------A--T------T-T-T--A---TG-G--C--GG-G-----G---G-C----A-T-A------
gi|72077                      :  ttttTA-T--G-C-C--C--C--C---GGCC----------A--T------T-T-T--A---TG-G--C--GG-G-----G---G-C----A-T-A------tagtgttaccctgttccgtcattctgtcattccgt
gi|72084                      :  ttttTA-T--G-C-C--C--C--C---GGCC----------A--T------T-T-T--A---TG-G--C--GG-G-----G---G-C----A-T-A------tagtgttaccctgttccgtcattctgtcattctgt
gi|72087                      :  ttttTA-T--G-C-C--C--C--C---GGCC----------A--T------T-T-T--A---TG-G--C--GG-G-----G---G-C----A-T-A------tagtattaccctgtttccgtcattctgtcattccgt
gi|72092                      :  ttttTA-T--G-C-C--C--C--C---GGCC----------A--T------T-T-C--A---TG-G--C--GG-G-----G---G-C----A-T-A------tagtgttaccctgttccgtcattccgtcat
gi|72085                      :  ttttTA-T--G-C-C--C--C--C---GGCC----------A--T------T-T-T--A---TG-G--C--GG-G-----G---G-C----A-T-A------tagtgttaccctgtttcgtcattttgtccttccgt
gi|72098                      :  ttttTA-T--G-C-C--C--C--C---GGCC----------A--T------T-T-T--A---TG-G--C--GG-G-----G---G-C----A-T-A------tagtattacctgttcctcattctgtcattccgt
gi|72097                      :  ttttTA-T--G-C-C--C--C--C---GGCC----------A--T------T-T-T--A---TG-G--C--GG-G-----G---G-C----A-T-A------tagtgttaccctgtcctgtcattccgtcat
gi|72101                      :  ttttTA-T--G-C-C--C--C--G---G-CC----------A--T------T-T-T--A---TG-G---C-GG-G-----G---G-C----A-T-A------tagtgttaccgtgttctgtccttctgtccttccgt
gi|72106                      :  ttttTA-T--G-C-C--C--C--CG--G-CC----------A--T------A-T-T--A---TG-G---T-GG-G-----G---G-C----A-T-A------tagtgttaccctgttctgtcattccgtccttccgt
gi|72110                      :  ttttTA-T--G-C-C--C--C--C---GGCC----------A--T------T-T-T--A---TG-G--C--GG-G-----G---G-C----A-T-A------tagtgttaccctgttccgtcattccgtcat
gi|72113                      :  ttttTA-T--G-C-C--C--C--C---GGCC----------A--T------T-T-T--A---TG-G--C--GG-G-----G---G-C----A-T-A------tagtgttaccctgttccttctttccgtcat
gi|72115                      :  ttttTA-T--G-C-C--C--C--C---GGCC----------A--T------T-T-T--A---TG-G--C--GG-G-----G---G-C----A-T-A------tagtgttacctctgtcgtcattccgtcattc
gi|72213                      :  ttttTA-T--G-C-C--C--C--C---GGCC----------A--T------T-T-T--A---TG-G--C--GG-G-----G---G-C----A-T-A------tagtgttaccctgttccgtcatcatttggtttccgt
gi|72116                      :   tttTA-T--G-C-C--C--C--C---GGCC----------A--T------T-T-A------TG-G--C--GG-G-----G---G-C----A-T-A------tagtgttacccgtctgttccgtacattccgtcat
gi|72220                      :  ttttTA-T--G-C-C--C--C--C---GGCC----------A--T------T-T-T--A---TG-G--C--GG-G-----G---G-C----A-T-A------tagtgttacctgttccgtcattccgtcat
gi|72121                      :    ttTA-T--G-C-C--C--C--C---GGCC----------A--T------T-T-T--A---TG-G--C--GG-G-----G---G-C----A-T-A------C--A--tagtgttacccgtctgttcgtcattccgtcat
gi|72124                      :    ttTA-T--G-C-C--C--C--G---G-CC----------A--T------T-G-T--A---TG-G---C-GG-G-----G---G-C----A-T-A------tacatgtagtgttaacctgttccgtcattccgtcctttcgt
gi|72126                      :  ttttTA-T--G-C-C--C--C--C---GGCC----------A--T------T-T-T--A---TG-G--C--GG-G-----G---G-C----A-T-A------tagttaccctgttccgtcattcgtcattctgt
gi|72127                      :  ttttTA-T--G-C-C--C--C--C---GGCC----------A--T------T-T-T--A---TG-G--C--GG-G-----G---G-C----A-T-A------tagtgttaccctgttcgtctatttggtttccg
gi|72088                      :  ttttTA-T--G-C-C--C--C--CG--G-CC----------A--T------T-T-T--A---TG-G--CT-GG-G-----G---GCC----A-T-A------tagtgttaccctgttcc
gi|72234                      :  ttttTA-T--G-C-C--C--C--C---G-TC----------A--T------A-A-A--A---TG-A--CT-GG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--A--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CC-GA-T-CA-Ttagtgttacctgtttccgtcattccgtcat
gi|72094                      :      TA-T--G-C-C--C--C--G---G-CC----------A--T------T-C-A------TG-G--CA-GG-G-----G---G-C----A-T-A------
gi|72144                      :  ttttTA-T--G-C-C--C--C--CG--G-CC----------A--T--------A-T--A---TG-G---C-GG-G-----G---G-C----A-T-A------tagtgttatccctgtttcgtcattttgtccttc
gi|72148                      :  ttttTA-T--G-C-C--C--C--C---GGCC----------A--TTTTATGG-A-A--A---TG-G--CC--G-G-----G---G-C----A-T-A------tagtgttaccctgt
gi|72158                      :  ttttTA-T--G-C-C--C--C--CCG-G-CC----------A--T------T-T-CT-A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-tagtgtagggcatatacgtcttacccttgttccgtcattctgcttcatttccg
gi|72236                      :   ttttg-T--G-C-C--CGCC--C---G-CC----------A--T------T-A-A--A---TG-G--CCCGG-G-----A---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----TC-T--T-CA-TT-C-CGTgtagtgtaaccctgaccctgttccgtccattccgtcat
gi|72237                      :             -C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A------TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------TT-A--G--TTG---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C--------C-G--T--C--A--T----T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT

lowQualScore                  :    0   0 11 1 0 00 00 11 111 0  3333333333 11 222222 1 0 11 333  0 11  0  0 33333 000 0 1111 0 0 222222 11 00 00 0 444444444444444 11111 1 33333 22 55555 0 0 1  0 33333333 0 11 11 11 22 11 11111  0 11 0  0  0 0   
lowQualScore                  :    .   . .. . . .. .. .. ... .  .......... .. ...... . . .. ...  . ..  .  . ..... ... . .... . . ...... .. .. .. . ............... ..... . ..... .. ..... . . .  . ........ . .. .. .. .. .. .....  . .. .  .  . .   
lowQualScore                  :    4   8 00 2 4 66 66 55 555 4  1111111111 11 000000 6 8 33 666  4 55  8  4 22222 777 4 4444 8 8 000000 88 99 99 8 999999999999999 55555 2 11111 66 44444 4 4 2  4 11111111 8 44 88 44 22 55 11111  5 77 9  9  7 7   
consensus                     : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-TT-C-CGT
Reference ( family-192 )      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72074                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72075                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72076                      : TTT-TAA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC----------G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--CTCTGAC-T-G-TTGC--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72077                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-TGT
gi|72078                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--A---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72079                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--A--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72080                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--A--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T-----G--T-G---------------T-----T-------C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--CA-A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72081                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--CA-C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T-----G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C-G--T--C--A-----T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72082                      : TTT-TTA-T--G-C-C--A--C------G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-------C--C-----C-T-G-TT----------C-G--T--C--A--A--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72083                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GA-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CAT
gi|72084                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-A---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-GTTT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72085                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-A---------------T-----T-A--------C-----C-T-G-TT-C--------C----T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72086                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------ACA-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--CTT---C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72087                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72088                      : TTT-TTA-T--GGC-C--C--C--CA--G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A--------C-----C-T-GTTT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72089                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GA-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CC-TT-C-CG
gi|72091                      : TTT-TTA-T--C-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-T
gi|72092                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------G-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-T--------C-G--T--C--A--T--T-----TT-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72093                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--TT-----G-A-A--A---TG-G--CC-CG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-AC----C--C-----C-T-G-TT-T--------C-G-----C--A--T--T-----TT-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72094                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--CT--G-CC----------A--T------G-A-A------TG-G--CC-GG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-AT----C--C-----C-T-G-TT-T--------C-G--T--C--A--T--T-----TT-G--T-CC-TT-C-
gi|72095                      : TTT-TTT-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--G------GTA-A--A---TGTG--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-GT--------------T-----T-A-----C--CCT---C-T-G-TT-T--------C-G-----C--AT-T--T-----TT-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72097                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----G-T-G-TT-C--------T-G--T--C--C--T--T-----CT-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72098                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TC-C--------T-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72099                      : TTT-TTA-T--G-T-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-AG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72100                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----------C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72101                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------T-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72103                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--T--C---G-CT----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-A-----G---G-C----A-T-A------TGTA--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-A--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72104                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-
gi|72106                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---A-CC----------A--T------A-A-T--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72107                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-TC----------A--T------A-A-A--A---TG-A--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----T-T-G-TT-C--------C-G--C--C--A--T--T-----CC-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72108                      : TTT-TTA-TT-G-C-C--C--T--C---G-TC----------A--T------T-A-A--A---TG-A--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-----------------T-----T-A-----C--C-----T-T-G-TT-C--------C-G--C--C--A--T--T------C-G--T-CC-TT-CTCGT
gi|72109                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-GTTT-C--------C-G--T--C--AT-T--T-----CC-G--T-CA-TT-C-TGT
gi|72110                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-T--T--C--T--T--T-----CC-G--T-CA-Tcattccgt
gi|72111                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-C-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------T-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CC-TT-T-CAT
gi|72112                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CA----------C--T------A-A-ACAG---TG-G--CC-GG-G-----G-----C----A-T-A------TT-A--G--T-G---------------T-----T-G-----CA-C-----C-T-G-TT-CGTCATTTCT-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72113                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--CT----C-T-G-T-----------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-TT-C-
gi|72114                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A-A------TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-T
gi|72115                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--
gi|72116                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A------TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A--------C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-Tcatttggtttccgt
gi|72117                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG----CC-GG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72118                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C------A-TC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----CA-C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-T
gi|72119                      : TTT-CTA-T--G-T-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-T-A--T---TG-G--TC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72120                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-C--A---AG-G--CC-GG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72121                      : TTT-GTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-ATACATGT--A--G--T-G---------------T-----T-A-----A--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CC-TT-T-CGT
gi|72122                      : TTT-GTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--GG-GG-G-----GGGGG-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--CATA--T--T-----CT-A--T-CA-TT-C-CGT
gi|72123                      : TTT-TTT-T--G-C-C--C---------A-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-GG-CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----TTA-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CAT
gi|72124                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-C-A--A---TG-G--CC--G-G-----G---G-C----A-T-A------T--A-------G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T------C-G--T-CA-TT-C-TGT
gi|72125                      : TTT-TTA-A--G-C-C--C--C--T---G-CC----------A--T------A-A-A--AA--TG-G--CC-GG-G-----G---C-T----A-TTA------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--CTGTCTC-T-G-TT-C--------T-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72126                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C-G--T--CT-A--T--T-----TG-G--T----TT-C-CG
gi|72127                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-
gi|72128                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G--C----------A--T------A-ACA--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A---A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-CT-------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CC-TT-C-CG
gi|72129                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--T--TAATG-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--T--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------T-A--T--C--A--T--T-----CT-G--T-GA-TT-C-CGT
gi|72130                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G---C-GG-T-----G---G-C----ATT-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T---TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CC-TT-C-
gi|72131                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CCC---------A--T------A-A-A--AA--TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------------T-A-----C--C-----C-T-G--T-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72132                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--T---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TA-G--CT-GG-G-----G---A-C----T-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-T--------T-G--T--C--C--T--T-----CC-G--T-CA-TT-C-CAT
gi|72133                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-GC----G---G-C----A---A------TA-A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G--T-C--------C-G--T--C--A--T--T--------G--T-CA-TT-C-CAT
gi|72134                      : TTT-TTA-TTGG-C-C--C--C--C------C----------A--T------A-A-AT-A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T--------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-A-TT-CG-------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72135                      : TTT-TTAGT--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GGCGC----G---G-C----A-T-AC-----T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A-----T-----CC-G--TCCC-TT-C-CGT
gi|72136                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC--G-G-----G---G-C----A-T-A------T-----G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------T-G--T--C--AG-T--T-----CTGG--T-CA-TT-C-
gi|72137                      : TTT-TTA-T--G-C-T--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G------A-T-A---------A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--TCAT-----TG-G--T----TT-C-CGT
gi|72138                      : TTT-TTA----G-C-C--C---------G-C-----------A--TG-----A-A-A--A---TG-G--CG-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--GCCT-G---------------T-----T-A-----C--C-----A-T-A-TT-C--------C-G--T--C--C--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72139                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A------------------------------G-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-T-CGT
gi|72140                      : TTT-TTA-T--G-T-C--C--C--T---G-TC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-G-----C--A-----T-C-A-GT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CAGTT-C-C
gi|72141                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC-------------T------ACA-A--A---TG-G--CC-CG-G-----G---G-C----A---A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----CCTC-----C-T-G-TT-C--------C-GT-T--C--A--T--T-----CC-A--T-CA-TT-C-TGT
gi|72142                      : TTG-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--C------A-A-A--AA--TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-GT--------------T-----T-AT----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--
gi|72143                      : TTT-TTA-T--G-CGC--C--C--C---G-CC----------AAAT------A-A-A--AGTCTG-GACCC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-GT--------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-CG-------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--TGCA-TT-caatttggttttccgt
gi|72144                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-T-A------TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-T
gi|72145                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-TC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GG-G-----G---G-A----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-G-----CA-C-----C-T-G--T-C--------C-A--T--C--A--T--T-----TA-G--T-C
gi|72146                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---C-CCCCCCCCCCCCA--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GG-G-----G---A-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--tgtc
gi|72147                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------G--T------A-A-A--A---TG-G--CC-AG-AGT---G---G-C----A-T-A------T--A-------G---------------T-----T-A-----CG-C-----C-T-G-TT----------C-G--T--C--ATTT--T-----CT-G--T-CA-TT-catttggtttccgt
gi|72148                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--G---G-CC----------A--TTTCCATA-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-GTAGGGCATATACGTCT-----T-A-----C--C-----CTT-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-GCTT-CATTT-C-CG
gi|72149                      : TTT-TTA-T--G-A-C--C--C--C---A-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GG-G-----G---G-C----T-T-A------T--A--G--A-G---------------T-----T-G-----CA-C-----C-T-G-TT----------C-A--T--C--A--T--TCTGTCCT-G--T-CA-TT-C-CAT
gi|72150                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C------A-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GG-G-----G---G-C----T-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-G-----C--A-----C-C-A-TT-C--------C-A--T--C--C--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72151                      : TTTATTA-T--G-C-C--A--T--T------T----------A--T------G-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--C--T--T-----CC-G--T-TA-T
gi|72152                      : TTT-TGA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--GC-T-G---------------T-----T-A--------C-----C-T-G-TT-C--------CGG--T--C-----T--T--------G--T-C--TT-C-CGT
gi|72153                      : TTG-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--C------A-A-A--A---T--G--CC-GG-G------------------C-A------T--A--G--T-----------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G--T-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-C
gi|72154                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CCCC--------A--T------A-A-A--A---T--G--CC-GG-G-----G---GCC----A-T-A------T--A--G--T-GC--------------T-----T-A--------C-----C-T-G-TT-C--------C-GT-T--C--A--T--T-----C
gi|72155                      : TTT-TTA-T--G-C-CACC--C--C---G-CCT---------A--T------A-AGA--A---TG-G--CC-GG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--G--T-GT--------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--t
gi|72156                      : TTT-TTAAT--G-C-C--C--CACT---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-GA----G---G-CAA--A-TAA------T--A--G--TCG---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--TA-T-----CC-T--T-CA-TTGC-CGTcatttggtttccgt
gi|72157                      : TTT-TCA-T--G-C-C--C--T--T---G-CC----------A--T------T-A-A--A---TG-A--CC-AG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------A-----T-A-----T--C-----C-T-G-TT-C--------C-A--T--C--A--T--
gi|72158                      : TTT-TGA-T--G-C-C--C--C--C---GGCC----------A--T------AGA-A--A---TG-G--CCGGG-G-----G---G-C----A-T-AG-----T--A--G--T-G---------------TAACCCTGA-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--TC-C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72159                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A--------TG-G--CC-GG-GA----G---G-C----A-T-A------C--A--G--T-G---------------T-----T-AAACCCT--C-----C-T-G-TT-C--------CGG--T--C--A--TTAT-----CC-G--T-CA-T
gi|72160                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---A-CC----------A--C------A-A-A--G---TG-G--TT-AG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--G--T-T---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-T-TT-C--------C-G--T--C--C--T--T-----TC-G--T-
gi|72161                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--T--T---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----
gi|72163                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---A-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-A--CC-AG-G-----C---G-CATATA-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----TGA-----G--C-----C-A-G--T-C--------T-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-
gi|72164                      : TTT-TGA-T--G-C-C--C--CCCC---G-CC----------A--T------A-A-A--AATGCG-GGCCC-GG-GGTTAAG---G-C----A---A------T--AATG--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-CT-------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-T
gi|72165                      : TTT-TTA-T--G-A-C--C--C--C---G-CC----------A--C------A-A-A--A---TG-G--TC--A-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-T---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-T-TT-C--------T-A--T--C--C--T--T-----C
gi|72166                      : TTG-TTA-C--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--C------A-A-A--G---TG-G--T--AG-G-----G---T-C----A-T-A------C--A--G--T-T---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-T-GT-C--------C-G--T--T--C--T--T-----CT-G--T-CC-TT-C-CG
gi|72213                      :  TT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--CCGT--C-T-G-TT-C--------C-G--TA-C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72220                      :   T-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--CCGT--C-T-G-TT----------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72221                      :   T-TTA-T--GGC-T--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--
gi|72222                      :   T-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------ACAT------A-A-A--A---TG-G--TC-AG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-T--------C-G--T--C--A--T--catttgggttccgt
gi|72223                      :   T-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G--C----------A--T------A-A-A--AT--TG-G--C---G-G-----G---G-C----A-G-A------T--A--G--T-G---------------TTC---T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--TG-C--A--T--T-----CT-GCTT-CA-TT-C-Ccatttggtttccgt
gi|72224                      :   T-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------T--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---C-A----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-ACCGC-C--C-----C-TAG-TT-C--------T-G--T--C--AT-T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72225                      :   T-TTA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A-A--AAA-TG-G--C--GG-G-----G---G-C----AGT-A------T--AA-G--T-----------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-GTTT--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72227                      :    -TTA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A-AC-A---TG-G--CC-GG-G-----------C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C-G--T--C--A--T---------C-G--T-CA-TT-
gi|72228                      :    -TTA-T--GGC-C--C--C--C---G-CA----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-GT--------------T-----T-A-----C--CA----C-T-G-TT----------C-G--TCAC--A--T--T-----TG-G--T----TT-C-CGT
gi|72234                      :      TA-T--G-C-C--C--C--C---G-TC----------A--T------A-A-A--A---TG-A--CT-GG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--A--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-GA-T-CA-T
gi|72236                      :        -T--G-C-C--CGCC--C---G-CC----------A--T------T-A-A--A---TG-G--CCCGG-G-----A---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----TC-T--T-CA-TT-C-CGT
gi|72237                      :             -C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A------TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------TT-A--G--TTG---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT

lowQualScore                  :    0   0 11 1 0 00 00 11 111 0  3333333333 11 222222 1 0 11 333  0 11  0  0 33333 000 0 1111 0 0 222222 11 00 00 0 444444444444444 11111 1 33333 22 55555 0 0 1  0 33333333 0 11 11 11 22 11 11111  0 11 0  0  0 0   
lowQualScore                  :    .   . .. . . .. .. .. ... .  .......... .. ...... . . .. ...  . ..  .  . ..... ... . .... . . ...... .. .. .. . ............... ..... . ..... .. ..... . . .  . ........ . .. .. .. .. .. .....  . .. .  .  . .   
lowQualScore                  :    4   8 00 2 4 66 66 55 555 4  1111111111 11 000000 6 8 33 666  4 55  8  4 22222 777 4 4444 8 8 000000 88 99 99 8 999999999999999 55555 2 11111 66 44444 4 4 2  4 11111111 8 44 88 44 22 55 11111  5 77 9  9  7 7   
consensus                     : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-TT-C-CGT
Reference ( family-192 )      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72074                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72075                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72076                      : TTT-TAA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC----------G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--CTCTGAC-T-G-TTGC--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72077                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-TGT
gi|72078                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--A---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72079                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--A--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72080                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--A--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T-----G--T-G---------------T-----T-------C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--CA-A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72081                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--CA-C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T-----G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C-G--T--C--A-----T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72082                      : TTT-TTA-T--G-C-C--A--C------G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-------C--C-----C-T-G-TT----------C-G--T--C--A--A--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72083                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GA-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CAT
gi|72084                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-A---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-GTTT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72085                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-A---------------T-----T-A--------C-----C-T-G-TT-C--------C----T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72086                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------ACA-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--CTT---C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72087                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72088                      : TTT-TTA-T--GGC-C--C--C--CA--G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A--------C-----C-T-GTTT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72089                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GA-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CC-TT-C-CG
gi|72091                      : TTT-TTA-T--C-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-T
gi|72092                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------G-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-T--------C-G--T--C--A--T--T-----TT-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72093                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--TT-----G-A-A--A---TG-G--CC-CG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-AC----C--C-----C-T-G-TT-T--------C-G-----C--A--T--T-----TT-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72094                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--CT--G-CC----------A--T------G-A-A------TG-G--CC-GG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-AT----C--C-----C-T-G-TT-T--------C-G--T--C--A--T--T-----TT-G--T-CC-TT-C-
gi|72095                      : TTT-TTT-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--G------GTA-A--A---TGTG--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-GT--------------T-----T-A-----C--CCT---C-T-G-TT-T--------C-G-----C--AT-T--T-----TT-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72097                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----G-T-G-TT-C--------T-G--T--C--C--T--T-----CT-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72098                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TC-C--------T-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72099                      : TTT-TTA-T--G-T-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-AG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72100                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----------C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72101                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------T-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72103                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--T--C---G-CT----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-A-----G---G-C----A-T-A------TGTA--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-A--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72104                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-
gi|72106                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---A-CC----------A--T------A-A-T--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72107                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-TC----------A--T------A-A-A--A---TG-A--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----T-T-G-TT-C--------C-G--C--C--A--T--T-----CC-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72108                      : TTT-TTA-TT-G-C-C--C--T--C---G-TC----------A--T------T-A-A--A---TG-A--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-----------------T-----T-A-----C--C-----T-T-G-TT-C--------C-G--C--C--A--T--T------C-G--T-CC-TT-CTCGT
gi|72109                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-GTTT-C--------C-G--T--C--AT-T--T-----CC-G--T-CA-TT-C-TGT
gi|72110                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-T--T--C--T--T--T-----CC-G--T-CA-Tcattccgt
gi|72111                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-C-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------T-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CC-TT-T-CAT
gi|72112                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CA----------C--T------A-A-ACAG---TG-G--CC-GG-G-----G-----C----A-T-A------TT-A--G--T-G---------------T-----T-G-----CA-C-----C-T-G-TT-CGTCATTTCT-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72113                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--CT----C-T-G-T-----------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-TT-C-
gi|72114                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A-A------TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-T
gi|72115                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--
gi|72116                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A------TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A--------C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-Tcatttggtttccgt
gi|72117                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG----CC-GG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72118                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C------A-TC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----CA-C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-T
gi|72119                      : TTT-CTA-T--G-T-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-T-A--T---TG-G--TC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72120                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-C--A---AG-G--CC-GG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72121                      : TTT-GTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-ATACATGT--A--G--T-G---------------T-----T-A-----A--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CC-TT-T-CGT
gi|72122                      : TTT-GTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--GG-GG-G-----GGGGG-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--CATA--T--T-----CT-A--T-CA-TT-C-CGT
gi|72123                      : TTT-TTT-T--G-C-C--C---------A-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-GG-CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----TTA-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CAT
gi|72124                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-C-A--A---TG-G--CC--G-G-----G---G-C----A-T-A------T--A-------G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T------C-G--T-CA-TT-C-TGT
gi|72125                      : TTT-TTA-A--G-C-C--C--C--T---G-CC----------A--T------A-A-A--AA--TG-G--CC-GG-G-----G---C-T----A-TTA------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--CTGTCTC-T-G-TT-C--------T-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CC-TT-C-CGT
gi|72126                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C-G--T--CT-A--T--T-----TG-G--T----TT-C-CG
gi|72127                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-
gi|72128                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G--C----------A--T------A-ACA--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A---A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-CT-------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CC-TT-C-CG
gi|72129                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--T--TAATG-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--T--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------T-A--T--C--A--T--T-----CT-G--T-GA-TT-C-CGT
gi|72130                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G---C-GG-T-----G---G-C----ATT-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T---TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CC-TT-C-
gi|72131                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CCC---------A--T------A-A-A--AA--TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------------T-A-----C--C-----C-T-G--T-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72132                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--T---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TA-G--CT-GG-G-----G---A-C----T-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-T--------T-G--T--C--C--T--T-----CC-G--T-CA-TT-C-CAT
gi|72133                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-GC----G---G-C----A---A------TA-A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G--T-C--------C-G--T--C--A--T--T--------G--T-CA-TT-C-CAT
gi|72134                      : TTT-TTA-TTGG-C-C--C--C--C------C----------A--T------A-A-AT-A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T--------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-A-TT-CG-------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT
gi|72135                      : TTT-TTAGT--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GGCGC----G---G-C----A-T-AC-----T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A-----T-----CC-G--TCCC-TT-C-CGT
gi|72136                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC--G-G-----G---G-C----A-T-A------T-----G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------T-G--T--C--AG-T--T-----CTGG--T-CA-TT-C-
gi|72137                      : TTT-TTA-T--G-C-T--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G------A-T-A---------A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--TCAT-----TG-G--T----TT-C-CGT
gi|72138                      : TTT-TTA----G-C-C--C---------G-C-----------A--TG-----A-A-A--A---TG-G--CG-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--GCCT-G---------------T-----T-A-----C--C-----A-T-A-TT-C--------C-G--T--C--C--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72139                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A------------------------------G-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-T-CGT
gi|72140                      : TTT-TTA-T--G-T-C--C--C--T---G-TC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-G-----C--A-----T-C-A-GT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CAGTT-C-C
gi|72141                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC-------------T------ACA-A--A---TG-G--CC-CG-G-----G---G-C----A---A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----CCTC-----C-T-G-TT-C--------C-GT-T--C--A--T--T-----CC-A--T-CA-TT-C-TGT
gi|72142                      : TTG-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--C------A-A-A--AA--TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-GT--------------T-----T-AT----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--
gi|72143                      : TTT-TTA-T--G-CGC--C--C--C---G-CC----------AAAT------A-A-A--AGTCTG-GACCC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-GT--------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-CG-------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--TGCA-TT-caatttggttttccgt
gi|72144                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-T-A------TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-T
gi|72145                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-TC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GG-G-----G---G-A----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-G-----CA-C-----C-T-G--T-C--------C-A--T--C--A--T--T-----TA-G--T-C
gi|72146                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---C-CCCCCCCCCCCCA--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GG-G-----G---A-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--tgtc
gi|72147                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------G--T------A-A-A--A---TG-G--CC-AG-AGT---G---G-C----A-T-A------T--A-------G---------------T-----T-A-----CG-C-----C-T-G-TT----------C-G--T--C--ATTT--T-----CT-G--T-CA-TT-catttggtttccgt
gi|72148                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--G---G-CC----------A--TTTCCATA-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-GTAGGGCATATACGTCT-----T-A-----C--C-----CTT-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-GCTT-CATTT-C-CG
gi|72149                      : TTT-TTA-T--G-A-C--C--C--C---A-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GG-G-----G---G-C----T-T-A------T--A--G--A-G---------------T-----T-G-----CA-C-----C-T-G-TT----------C-A--T--C--A--T--TCTGTCCT-G--T-CA-TT-C-CAT
gi|72150                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C------A-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GG-G-----G---G-C----T-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-G-----C--A-----C-C-A-TT-C--------C-A--T--C--C--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72151                      : TTTATTA-T--G-C-C--A--T--T------T----------A--T------G-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--C--T--T-----CC-G--T-TA-T
gi|72152                      : TTT-TGA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--GC-T-G---------------T-----T-A--------C-----C-T-G-TT-C--------CGG--T--C-----T--T--------G--T-C--TT-C-CGT
gi|72153                      : TTG-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--C------A-A-A--A---T--G--CC-GG-G------------------C-A------T--A--G--T-----------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G--T-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-C
gi|72154                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CCCC--------A--T------A-A-A--A---T--G--CC-GG-G-----G---GCC----A-T-A------T--A--G--T-GC--------------T-----T-A--------C-----C-T-G-TT-C--------C-GT-T--C--A--T--T-----C
gi|72155                      : TTT-TTA-T--G-C-CACC--C--C---G-CCT---------A--T------A-AGA--A---TG-G--CC-GG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--G--T-GT--------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--t
gi|72156                      : TTT-TTAAT--G-C-C--C--CACT---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-GA----G---G-CAA--A-TAA------T--A--G--TCG---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--TA-T-----CC-T--T-CA-TTGC-CGTcatttggtttccgt
gi|72157                      : TTT-TCA-T--G-C-C--C--T--T---G-CC----------A--T------T-A-A--A---TG-A--CC-AG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------A-----T-A-----T--C-----C-T-G-TT-C--------C-A--T--C--A--T--
gi|72158                      : TTT-TGA-T--G-C-C--C--C--C---GGCC----------A--T------AGA-A--A---TG-G--CCGGG-G-----G---G-C----A-T-AG-----T--A--G--T-G---------------TAACCCTGA-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--TC-C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72159                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A--------TG-G--CC-GG-GA----G---G-C----A-T-A------C--A--G--T-G---------------T-----T-AAACCCT--C-----C-T-G-TT-C--------CGG--T--C--A--TTAT-----CC-G--T-CA-T
gi|72160                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---A-CC----------A--C------A-A-A--G---TG-G--TT-AG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--G--T-T---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-T-TT-C--------C-G--T--C--C--T--T-----TC-G--T-
gi|72161                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--T--T---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CT-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----
gi|72163                      : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---A-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-A--CC-AG-G-----C---G-CATATA-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----TGA-----G--C-----C-A-G--T-C--------T-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-
gi|72164                      : TTT-TGA-T--G-C-C--C--CCCC---G-CC----------A--T------A-A-A--AATGCG-GGCCC-GG-GGTTAAG---G-C----A---A------T--AATG--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-CT-------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-T
gi|72165                      : TTT-TTA-T--G-A-C--C--C--C---G-CC----------A--C------A-A-A--A---TG-G--TC--A-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-T---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-T-TT-C--------T-A--T--C--C--T--T-----C
gi|72166                      : TTG-TTA-C--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--C------A-A-A--G---TG-G--T--AG-G-----G---T-C----A-T-A------C--A--G--T-T---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-T-GT-C--------C-G--T--T--C--T--T-----CT-G--T-CC-TT-C-CG
gi|72213                      :  TT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--CCGT--C-T-G-TT-C--------C-G--TA-C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72220                      :   T-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--CCGT--C-T-G-TT----------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72221                      :   T-TTA-T--GGC-T--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--
gi|72222                      :   T-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------ACAT------A-A-A--A---TG-G--TC-AG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-T--------C-G--T--C--A--T--catttgggttccgt
gi|72223                      :   T-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G--C----------A--T------A-A-A--AT--TG-G--C---G-G-----G---G-C----A-G-A------T--A--G--T-G---------------TTC---T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--TG-C--A--T--T-----CT-GCTT-CA-TT-C-Ccatttggtttccgt
gi|72224                      :   T-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------T--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---C-A----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-ACCGC-C--C-----C-TAG-TT-C--------T-G--T--C--AT-T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72225                      :   T-TTA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A-A--AAA-TG-G--C--GG-G-----G---G-C----AGT-A------T--AA-G--T-----------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-GTTT--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-T
gi|72227                      :    -TTA-T--G-C-C--C--C------G-CC----------A--T------A-A-AC-A---TG-G--CC-GG-G-----------C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT----------C-G--T--C--A--T---------C-G--T-CA-TT-
gi|72228                      :    -TTA-T--GGC-C--C--C--C---G-CA----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-GT--------------T-----T-A-----C--CA----C-T-G-TT----------C-G--TCAC--A--T--T-----TG-G--T----TT-C-CGT
gi|72234                      :      TA-T--G-C-C--C--C--C---G-TC----------A--T------A-A-A--A---TG-A--CT-GG-G-----G-----C----A-T-A------T--A--A--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-GA-T-CA-T
gi|72236                      :        -T--G-C-C--CGCC--C---G-CC----------A--T------T-A-A--A---TG-G--CCCGG-G-----A---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----TC-T--T-CA-TT-C-CGT
gi|72237                      :             -C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A------TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------TT-A--G--TTG---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CT-G--T-CA-TT-C-CGT


blockSeqs                     :             G         AC AAT    CCCCCCCCCC AA TTCCAT C   CA GTC    AC       GTTAA       ATAT     TACATG GT         TAGGGCATATACGTC AACCC T AACCC CT TCTGA     T    GTCATTTC   TT CA AT TT CA CTGTC    CT
blockSeqs                     :             G         CC A      CC         CA T      T   T  ATG    GC       GT          AA       C      T          T               TC    G CCGC  A  TGTCT     T    T          T  C  A  T  TA .        CT
blockSeqs                     :             G         A  T      C          .  G      C   C  AA     G        C           .        G      A          T               .     G C     A  CGT       T    G          T  A  T  T  A  .        A 
blockSeqs                     :             .         .  .      T          .  .      G   .  A      .        C           .        .      T          T               .     . T     A  CGT       .    G          .  G  .  G  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  A      .        A           .        .      .          C               .     . T     G  TT        .    T          .  .  .  T  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  A      .        A           .        .      .          T               .     . .     A  CT        .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  T      .        .           .        .      .          T               .     . .     .  T         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  A         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .        . 
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .          
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .  .          
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .             
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .             
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .             
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .             
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .             
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .             
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .          .  .  .  .  .             
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .    .                                    
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .     . .     .  .         .                                         
blockSeqs                     :             .         .  .      .          .  .      .   .  .      .        .           .        .      .          .               .                                                                    


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-TT-C-CGT
finalCons                     : TTT-TTA-T--G-C-C--C--C--C---G-CC----------A--T------A-A-A--A---TG-G--CC-GG-G-----G---G-C----A-T-A------T--A--G--T-G---------------T-----T-A-----C--C-----C-T-G-TT-C--------C-G--T--C--A--T--T-----CC-G--T-CA-TT-C-CGT