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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|45988 : CACTA--AA--T-A--A----------A----C-AAGCAA---------AAT-G-G------CCT----T-C-AG-TT-A-----A-A----A-G-TT----A--C-T-C-AAGGTTTCA-TTTTTG-T-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AATATAT
gi|45989 : CAC-A--AA--T-ATAAGT-A------A----A-ATGCAA---------A-T-A-G------TTT----T-TTAG-AC-A-----A-A----G-A-TC----A--C-T-G-AAGGT--TG-TTTT-A-T-A--A---AGA----C------C-AAGG-------C------CA--CTCA--G----AACATGTA
gi|45990 : CAC-A--AA--T-A--ATT-A------A----C-AGGCAA-----------T-G-G------GTT----T-C-AG-TT-A-----A-A----G---TT----A--C-T-C-AAGGT--CA-TTTT-A-G-A--A----GG----T------C-GAGG-------T------CA--CTGA--G----AACATATA
gi|45993 : CAC-A--AT--T-A--AGT-A------A----C-AGGCAA---------A-T-G-G------GTT----T-C-AG-GTAA-----A-A----A-G-CT----A--C-T-C-AA-GT--CA-TTTT-T-G-A--A---AAG----T------C-AAGG-------T------CA--CTGA--G----AACATGTA
gi|45994 : CAC-A--AA--T-A--AGT-A-----------C-ATGTAATATATACACA-T-G-G------CTT----T---GG-AC-A-----A-A----G-G-TT----A--C-T-C-AAGGG--AA-TTTT-G-T-A--A---AGG----T------C-AATG-------T------AA--CTCA--
gi|45995 : CAC-A--AA--C-A--AGT-A------A----C-AGGCAA---------A-T-G-G------GTT----T-C-AG-GT-A-----A-A----A-T-TT----A--C-C-C-AAGGT--CA-TTTT-G---A--A---AGG----T------C--AGG-------T------C---CTGA--G----AACATGT
gi|45996 : CAC-A--AA--C-A--AGT-A------A----C-AGGCAA---------A-TGG-G------TTT----T-C-AG-GG-T-----A-A----A-A-TT----A--C-TCC-AAGGT--CA-TTT----G-A--A---AGG----T------C-CAGG-------T------CA--CTGA--G----AACATGT
gi|45997 : CAC-A--AA--C-A--AGG-A------A----T-AGGCAA---------A-T-G-A------CTA----A-C-TG-GC-A-----A-A----G-G-TC----A--C-A-C-AAGGT--CA-TTTT-G-T-A--A---AAG----T------T-GAGG-------T------CA--CTTA--
gi|45998 : CAC-A--AA--TTG--AGTTA------A----C-AGGCAA---------A-T-G-G------GTT----C-C-GG-TA-A-----A-A----G-GCTT----G--C-T-C-AAGGT--CA-TTTT-T-TGA--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTGA--G----AACATGTA
gi|45999 : CAC-A--AA-------AGT-A------A----CCAGGCAA---------A-T-G-G------GTT----C-C-AG-GT-A-----A-A----A-G-T-----G--C-T-C-AAGGT--CATTTTT-T-G-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTGA--G----AACATGTA
gi|46000 : CAC-A--GA--T-A--AGT-A------A----T-AGGCAA---------A-T-G-A------TTA----A-C-GG-GC-A-----A-A----G-G-TC----A--C-T-C-AAAGT--CA-ATTT-G-T-G--A---AGG----C------T-GAGA-------T------CA--CTC--------AACATTTA
gi|46001 : CAC-A--AA--T-A--AAT-A------AATATC-AGGTAA---------A-T-A-A------CTT----T-T-AG-AC-A-----G-G----A-G-TT----A--C-T-C-AAGGT--CA--TTT-G-T-A--A---AGG----T------C-AAAG-------T------TA--CT
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gi|46035 : ------CTT----T-T-GA-TC-T-----A-A----G-G-TC----T--C-T-C-AAAGT--CA-TTTT-T-G-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--TTTG--G----AATATATA
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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lowQualScore : . .. .. . .. . ...... .... . ......... ... . ... ...... . ....... . . ..... . .... . . ....... . . .. . . ... .. ... .... ...... . ....... ...... .. .. ....
lowQualScore : 2 00 00 7 00 7 999999 4444 6 555555555 222 5 777 333333 4 0000000 4 9 11111 4 2222 4 4 6666666 4 8 11 8 0 777 66 333 9999 666666 4 3333333 222222 66 66 9999
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Reference ( family-191 ) : CAC-A--AA--T-A--AGT-A------A----C-AGGCAA---------A-T-G-G---C------TTT-C-G-----GNC-A-----A-A----G-G-TC----A--C-T-CAAGGT--CA-TTTT-G-N-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AACATATA
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gi|45957 : ttaC-A--AA--C-A--AGT-A------A----C-AGGC-A---------A-T-G-G---G------TTT-C-A-----GGT-A-----A-A----A-T-TT----A--C-TCCAAGGT--CA-TTTT-G---A--A---AGG----T------C-CAGG-------T------CA--CTGA--G----AACATGT
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gi|45963 : tattacaCAT-A--AT--T-A--AGT-ACATGTTA----C-AAGCAA---------A-T-G-G---CCATGGCTTT-C-A-----GTC-A-----A-A----G-G-TG----A--C-T-TAATGT--CA-TTTT-T-T-A--A---AGA----T------C-AATG-------T------CA--CTTA--G----AGTATAT
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gi|45974 : CAC-A--AA--T-A--AGT-A------A----T-AGGCAT---------A-T-G-A---T------TTT-C-A-----GGC-A-----A-A----A-T-TT----A--T-T-CAAGGT--CA-TTTT-T-G-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------TA--CTCA--G----AACATATA
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|45930 : attgatcAAGGT--CA-TTTT-T-G-A--A---AGG----A------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AA
gi|45932 : attgatcaaaaatattccttgaaacaagagacttttaaaccatttgagt-AGACAA---------G---G-G---C------TTG-T-G-----ATC-C-----A-A----G-G--C----T--T-T-CAAGGT--CA-TTTT-A-A-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AA
gi|45933 : atttaccacaaatgttcattg-AGACAA---------G---G-G---C------TTG-T-G-----ATC-C-----A-A----G-G--C----T--T-T-CAAGGT---A-TTTT-----A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AA
gi|45934 : atttaccaaatatgttcattgCAT-A--AA--T-A--ATT-A------A----C-GAAGAA---------A-T-T-A---C------TTT-T-A-----TTC-A-----A-A----G-G-TT----A--C-T-TAAGGT--CA-TTTT-G-T-G--A---AGG----T------G-AAGG-------T------CA--CTTA--A----AATATAT
gi|45935 : atatatcaCAT-A--AA--T-A--ATT-A------A----C-GAAGAA---------A-T-T-A---C------TTT-T-A-----TTC-A-----A-AA---G-G-TT----A--C-T-TAAGGT--CA-TTTT-G-T-G--A---AGG----T------G-AAGG-------T------CA--CTTA--A----AATATAT
gi|45938 : atatatca-AGACAA---------G---G-G---C------TTG-T-G-----ATC-A-----A-A----G-G--C----T--T-T-CAAGGT--CA-ATTT-A-G-A--AGAAAGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AACTTATA
gi|45939 : atttaccacaaatgttccttgCAT-A--TA--T-A--ATT-A------A----C-AA-CAA---------A-T-T-A---C------TCT-T-A-----GTC-A-----G-A----G---TG----A--C-T-TAAGGT--CA-TTTT-G-T-G--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTTA--A----AATATATA
gi|45940 : atatatcaGCAA---------G---G-A---C------GTT-T-A-----GAC-C-----A-A----G-G-AC----T--T-T-CAAGGT--CA-ATTT-G-G-A--T---AGG----C------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AACATA
gi|45941 : attgatcggaaatgttccatgatCACTA--AA--T-A--ATT-A------A----C-AAGCAT---------A-T-T-A---C------TTT-T-A-----GT--A-----A-A----G-G-TA----A--C-T-TAGAGG--CA-TTTT-G-T-G--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTTA--A----AA
gi|45944 : atatatC-A--AA--T-A--AGT-A------A----T-AGGCAA---------A-T-G-G---C------TTT-CAG-----ACC-AAGATCA-A----G-A-TC----A--C-T-CAAGGT--AA-TTTT-A-T-A--A---AGG----T------A-AAGG-------T------CA--
gi|45945 : atatatcatt-AGACAA---------G---G-A---C------TTG-T-G-----AAC-C-----A-A----G-G--C----T--T-T-TAAGAT--CA-TTTTTG-G-A--A---AGG----C------C-AATG-------T------CA--CTCA--G----AACATGT
gi|45947 : atttaccacaaatgttccttg-AGACGA---------G-T-G-----C------TTG-T-G-----AAC-C-----C-A----A-G-TC----T--T-T-CAAGGT--CA-TTT--G-G-A--A---AGC----T------C-AAGG-------T------CA--TTCA--G----ATCATAT
gi|45948 : atttaccacaaatgttccttgCAT-A--AA--T-A--ATT-A------A----C-AAGCAA---------A-T-T-A---C------TTT-T-A-----GTC-A-----A-A----G-G-------------------T--CA-TTTT-G-T-G--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTTA--A----AATACATA
gi|45949 : atatatca-AGGCAA-------------G-G---G------TTT-G-T-----GAC-T-----A-A----G-G-TC----T--T-C-CAAGGT--CA-TTT--G-G-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T-------A--CTCA--G----GATAT
gi|45952 : attctttacaaatgtcgtt-A------A----C-AG-TAA---------T-T-G-A---C------CTTAT-G-----GAC-C-----A-A----G-G-TC----TTTC-T-CAAGGA--CA-TTTT-G-G-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTAG--G----AACATATA
gi|45954 : tttatttcagcaatatttc-AGACAA---------G---G-A---C------TTG-T-G-----GAC-C-----A-T----G-G-TC----T--C-T-CAAGGT--CA-TTTT-T-A-A--A---TGG----T------C-A--G-------T------CA--CTCA--G----AACATATA
gi|45955 : ttcatcagaaatcgatatgttctttgA---------A-G-G-G---C------TCT-T-G-----ATT-C-----C-A----G-G-CC----T--T-T-CAAGGT--CA-TTAT-G-G-A--A---AGG----TGAAGGT--------------------CA--CTCA--G----ATAATATA
gi|45956 : ttataacaaatattccttgagatCAC-A--AG--T-A--AGT-A------A----T-AGGCAA---------G-T-G-G---C------AT--C-A-----GAC-A-----A-A----G-G-CT----A--C-T-CAAGGT--CA-TTTT-G-T-A--A---AGG----T------C-AAGG-------C------CA--CTTA--
gi|45957 : ttaC-A--AA--C-A--AGT-A------A----C-AGGC-A---------A-T-G-G---G------TTT-C-A-----GGT-A-----A-A----A-T-TT----A--C-TCCAAGGT--CA-TTTT-G---A--A---AGG----T------C-CAGG-------T------CA--CTGA--G----AACATGT
gi|45961 : ttattccCAC-A--CT--T-A--AGT-A------A----C-AGGTAA---------A-----G---C------TTT-C-A-----GTC-A-----A-A----A-G-TC----A--C-T-CAAGGT--CA-TTTT-G-T-A--A---TGG----T------C-TATG-------T------CA--CTCA--G----AATATGTA
gi|45962 : tatAT-A--GA--T-A--ATT-A------A----C-AAGCAA---------A-T-TTA---C------TTT-T-A-----GTA-A-----A-AA---G-G-TG----A--C-T---AAGT--CA-TTTT-G-T-G--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTTA--A----AATACATA
gi|45963 : tattacaCAT-A--AT--T-A--AGT-ACATGTTA----C-AAGCAA---------A-T-G-G---CCATGGCTTT-C-A-----GTC-A-----A-A----G-G-TG----A--C-T-TAATGT--CA-TTTT-T-T-A--A---AGA----T------C-AATG-------T------CA--CTTA--G----AGTATAT
gi|45964 : tatcaCAT-A--AA--T-G--AAT-A------A----C-AGGCAA---------A-T-A-A---G------TTT-A-GTATGAGGC-A-----A-A----A-G-TT----A--C-T-CAAGGT--CA-CTTT-G-G-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA----GA--G----AACATGTA
gi|45965 : tacC-A--CA--C-A--AAT-G------A----T-AGACAA---------A-T-G-A---C------TTT-C-A-----GGC-A-----A-A----G-A-TC----A--C-T-CAAGGT--TA-TTTT-G-T-A--A---AGG----T------C-AAGA-------T------CAAGGTCATTA----AACACATA
gi|45969 : atCAC-A--AA--T-A--AGT-A------A----C-ATGCAA---------G-T-G-G---T------ATT-C-A-----GGC-A-----A-A----C-G-TT----A--C-T-CAAGGT--TA-TTTT-G-A-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------TA--CTCA--G----AAAATACA
gi|45970 : t------A----C-AAATAAT--------A-T-G-T---C------TTT-C-A-----GAC-A-----A-A----G-G-TC----A--C-T-CAAGGT--AA-TTTT-G-T-T--C---TGG----T------C-AAGG-------C------CA--CTTA--AGTTCAACATATA
gi|45971 : tcCAC-A--AA--T-A--AGG-A------A----C-AGGCAA---------A-T-G-A---G------TTT-C-A-----AGC-A-----A-A----A-G-TT----G--C-T-CAAGGT--CA-TTTTGG-T-A--ACT-AGG----T------C-AATG-------T------TA--CGGA--G----AACATGTA
gi|45973 : tCAC-A--AA--T-A--AGT-A------A----C-AGGCAA---------A-T-G-G---C------TTT-C-A-----GTC-A-----A-A----G-A-TG----A--C-T-TAAGGT--CA-TTTT-G-T-A--A---GGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AATATATA
gi|45974 : CAC-A--AA--T-A--AGT-A------A----T-AGGCAT---------A-T-G-A---T------TTT-C-A-----GGC-A-----A-A----A-T-TT----A--T-T-CAAGGT--CA-TTTT-T-G-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------TA--CTCA--G----AACATATA
gi|45975 : CAC-A--AA--T-A--AGT-A------A----C-AAGTAA---------A-T-G-G---C------TTT-C-A-----GTT-A-----A-A----G-T-TT----A----T-CAAGGT--CA-TTTA-G-T-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AATATA
gi|45976 : CAC-A--GA--T-A--TAT-A------A----C-AGACAA---------A-T-G-G---C------TTT-C-A-----GTC-A-----A-A----G-G-TC----A--C-T-CAAGGT--CA-TTTT-G-T-A--A---ATG----T------C-AAGG-------T------CA--CTC--------AACATATA
gi|45977 : CAC-A--AA--C-A--AGT-A------A----C-AAGCAA---------A-T-G-G---C------TTT-C-A-----GAC-A-----A-A----G-G-TA----A--C-C-CAAGGT--TC-GTTT-G-T-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AAGATAT
gi|45978 : CAC-A--AA--T-A--AGT-A------G----C-AGGTGA---------A-T-G-G---C------TTT-C-A-----GAC-A-----A-A----G-G-TC----A--C-T-CAAGAT--CA-TTTT-G-T-A--A---AGG----T------C-AAGGTTAAAGAT------TA--CTCA--G----AACAT
gi|45979 : CAC-A--AA--T-A--AGT-A------A----T-AGACAA---------A-T-G-A---C------TTT-A-A-----TAC-A-----A-AG---G-G-TC----A--C-T-TGAAGT--CATTTTT-A-T-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------AA--TTC--------AACATA
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gi|45981 : CAC-A--AA--G-A--AGT-A------A----T-AGGCAA---------A-T-G-A---C------TTT-C-A-----GAC-A-----A-A----G-T-TC----A--C-T-CAAGGT--CA-TTTT-G-T-A--A---AAG----T------C-AAGG-------T------CA--CACA--A----TACA
gi|45982 : CAC-A--AA--T-A--AGT-A------A----C-AGGCGA---------A-T-A-A---C------TTT-C-A-----GAC-A-----A-A----G-A-TC----A--C-C-CATGCT--CA-TTTT-G-G-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--A----CTCATATA
gi|45983 : CAC-A--AA--T-A--AGG-A------A----T-AGGCAA---------A-T-G-A---C------TGA-C-A-----GGC-A-----A-A----G-G-TC----A--C-T-CAAGGT--CA-TTTG-G-T-A--A---AGG----TA-----G-GGGG-------T------CA--CTCA----------ATATA
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gi|45987 : CACTA--AA--T-A--A----------A----C-AAGCAA---------AAT-G-G---C------CTT-C-A-----GTT-A-----A-A----A-G-TT----A--C-T-CAAGGTTTCA-TTTTTG-T-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AATATAT
gi|45988 : CACTA--AA--T-A--A----------A----C-AAGCAA---------AAT-G-G---C------CTT-C-A-----GTT-A-----A-A----A-G-TT----A--C-T-CAAGGTTTCA-TTTTTG-T-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AATATAT
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gi|46029 : ---------A-T-G-G---C------TTT-T-G-----GAT-A-----A-A----G-G-TC----T--C-T-AAAGGT--AA-TTTT-G-T-A--A---ACG----T------G-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AACGTACA
gi|46030 : -T-G-G---T------TTT-C-A-----GTT-A-----A-A----AAG-TC----A--C-T-CAAGGT--CA-TTTG-G-G-A--A---TGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AACATATA
gi|46031 : -T-G-A---C------TTG-T-G-----GAC-C-----A-A----G-G-TC----T--C-T-CAGTGT--CA-TTTT-G-G-A----------------------AAGG-------T------CA--CTCG--G----AACATATA
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gi|46038 : -C-G-----AAC-C-----A-A----G-G-TC----T--T-T-CAATGT--CA-TTTT-G-G-T--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--T----AACATGTA
gi|46039 : cttatag---C------TTT-T-A-----GAC-C-----A-G----C-G-TC----T--C-T-CAAGGC--CA-TTTT-G-A-A--T---AGG----T------C-AAGG-------C------CA--CTTA--T----AATATATA
gi|46041 : ---C------CTT-T-G-----GAC-A-----A-G----G-C-TTGG--A--C---CAAGGT--CA-TTTT-G-T-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTC--------AATATATA
gi|46046 : TT-T-G-----AAC-T-----A-A----G-G-TC----T--C-T-CAAGGT--CA-TTTTCA-A-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--A----TATACATA
gi|46049 : -T-CAAGGT--CA-TTTT-G-G-A--T---AGG----T------C-AAGG-------G------CA--CTCA--G----AACTTGTA
gi|46057 : aaacaaggctt----G-G-TC----T--T-T-CAAGGT--CA-TTTT-G-G-A--A---AGC----T------C-AAGG-------T------CA--CTTA--
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gi|46069 : tttg-CAAGTG--CA-TTTT-G-G-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--C----AACATATA
gi|46070 : -CAAGGT--CA-TTTT-G-G-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--TTCA--G----AACAT
gi|46071 : -CAAGGT--CA-TTTC-G-G-A--A---AGT----T------C-AAGG-------T------CA--ATCA--G----AACACATA
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|45960 ): TATCACAAATGTTCCTTGATACACGAGCTTGTGGACCAAGTTCTTTCAAGGTCATTTTGGAAAGACCAAGGTCATTGAGAACATATA
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Reference ( family-191 ) : CAC-A--AA--T-A--AGT-A------A----C-AGGCAA---------A-T-G-G---C------TTT-C-G-----GNC-A-----A-A----G-G-TC----A--C-T-CAAGGT--CA-TTTT-G-N-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AACATATA
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gi|45915 : atttatcacaaatgttccttaCAA-A--AA--G-A--AGT-A------A----C-AGGCAT---------A-TTG-G---C------TTC-C-A-----GGT-A-----A-A----G-G-TC----A--C-T-CAAGGT--CA-TTTT-G-G-A--A---AGG----T------TAAAGG-------T------CA--CTTA--G----AATATATA
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gi|45925 : attgatcacaagtattccttt-G-G---C------TTG-T-G-----AAC-C-----A-A----G-G--C----T--T-T-CAATGT--AA-TTTT-G-G-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AACTTATA
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gi|45939 : atttaccacaaatgttccttgCAT-A--TA--T-A--ATT-A------A----C-AA-CAA---------A-T-T-A---C------TCT-T-A-----GTC-A-----G-A----G---TG----A--C-T-TAAGGT--CA-TTTT-G-T-G--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTTA--A----AATATATA
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gi|45957 : ttaC-A--AA--C-A--AGT-A------A----C-AGGC-A---------A-T-G-G---G------TTT-C-A-----GGT-A-----A-A----A-T-TT----A--C-TCCAAGGT--CA-TTTT-G---A--A---AGG----T------C-CAGG-------T------CA--CTGA--G----AACATGT
gi|45961 : ttattccCAC-A--CT--T-A--AGT-A------A----C-AGGTAA---------A-----G---C------TTT-C-A-----GTC-A-----A-A----A-G-TC----A--C-T-CAAGGT--CA-TTTT-G-T-A--A---TGG----T------C-TATG-------T------CA--CTCA--G----AATATGTA
gi|45962 : tatAT-A--GA--T-A--ATT-A------A----C-AAGCAA---------A-T-TTA---C------TTT-T-A-----GTA-A-----A-AA---G-G-TG----A--C-T---AAGT--CA-TTTT-G-T-G--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTTA--A----AATACATA
gi|45963 : tattacaCAT-A--AT--T-A--AGT-ACATGTTA----C-AAGCAA---------A-T-G-G---CCATGGCTTT-C-A-----GTC-A-----A-A----G-G-TG----A--C-T-TAATGT--CA-TTTT-T-T-A--A---AGA----T------C-AATG-------T------CA--CTTA--G----AGTATAT
gi|45964 : tatcaCAT-A--AA--T-G--AAT-A------A----C-AGGCAA---------A-T-A-A---G------TTT-A-GTATGAGGC-A-----A-A----A-G-TT----A--C-T-CAAGGT--CA-CTTT-G-G-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA----GA--G----AACATGTA
gi|45965 : tacC-A--CA--C-A--AAT-G------A----T-AGACAA---------A-T-G-A---C------TTT-C-A-----GGC-A-----A-A----G-A-TC----A--C-T-CAAGGT--TA-TTTT-G-T-A--A---AGG----T------C-AAGA-------T------CAAGGTCATTA----AACACATA
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gi|45970 : t------A----C-AAATAAT--------A-T-G-T---C------TTT-C-A-----GAC-A-----A-A----G-G-TC----A--C-T-CAAGGT--AA-TTTT-G-T-T--C---TGG----T------C-AAGG-------C------CA--CTTA--AGTTCAACATATA
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gi|45973 : tCAC-A--AA--T-A--AGT-A------A----C-AGGCAA---------A-T-G-G---C------TTT-C-A-----GTC-A-----A-A----G-A-TG----A--C-T-TAAGGT--CA-TTTT-G-T-A--A---GGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AATATATA
gi|45974 : CAC-A--AA--T-A--AGT-A------A----T-AGGCAT---------A-T-G-A---T------TTT-C-A-----GGC-A-----A-A----A-T-TT----A--T-T-CAAGGT--CA-TTTT-T-G-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------TA--CTCA--G----AACATATA
gi|45975 : CAC-A--AA--T-A--AGT-A------A----C-AAGTAA---------A-T-G-G---C------TTT-C-A-----GTT-A-----A-A----G-T-TT----A----T-CAAGGT--CA-TTTA-G-T-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AATATA
gi|45976 : CAC-A--GA--T-A--TAT-A------A----C-AGACAA---------A-T-G-G---C------TTT-C-A-----GTC-A-----A-A----G-G-TC----A--C-T-CAAGGT--CA-TTTT-G-T-A--A---ATG----T------C-AAGG-------T------CA--CTC--------AACATATA
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gi|45978 : CAC-A--AA--T-A--AGT-A------G----C-AGGTGA---------A-T-G-G---C------TTT-C-A-----GAC-A-----A-A----G-G-TC----A--C-T-CAAGAT--CA-TTTT-G-T-A--A---AGG----T------C-AAGGTTAAAGAT------TA--CTCA--G----AACAT
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gi|45980 : CAC-A--AA--T-A--GGT-A------A----C-AGGCAA---------A-T-G-G---C------TTT-C-G-----G-C-A-----A-A----A-G-TT----A--CTT-CAAGGT--CA-TTTT-G-G-C--A---A-G----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----ATCATATA
gi|45981 : CAC-A--AA--G-A--AGT-A------A----T-AGGCAA---------A-T-G-A---C------TTT-C-A-----GAC-A-----A-A----G-T-TC----A--C-T-CAAGGT--CA-TTTT-G-T-A--A---AAG----T------C-AAGG-------T------CA--CACA--A----TACA
gi|45982 : CAC-A--AA--T-A--AGT-A------A----C-AGGCGA---------A-T-A-A---C------TTT-C-A-----GAC-A-----A-A----G-A-TC----A--C-C-CATGCT--CA-TTTT-G-G-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--A----CTCATATA
gi|45983 : CAC-A--AA--T-A--AGG-A------A----T-AGGCAA---------A-T-G-A---C------TGA-C-A-----GGC-A-----A-A----G-G-TC----A--C-T-CAAGGT--CA-TTTG-G-T-A--A---AGG----TA-----G-GGGG-------T------CA--CTCA----------ATATA
gi|45984 : CAC-A--AA--T-A--AGT-A------A----C-AGGCAA---------A-T-G-G---G------TTT-C-A-----GGC-A-----A-A----A-T-TT----A--C-T-CAAGGT--CA-TCTT-G-G-A--A---ATG----G------C-AAGG-------T------CA--CTGA--G----AACATGT
gi|45986 : CAC-A--A---T-A--AGT-A------A----C-AGGCAA---------A-T-A-G---G------TTT-C-A-----GGT-A-----A-A----A-G-CT----A--C-T-CAAGGT--TA-TTTT-T-G-A--A---A-G----T------T-AAGG-------T------CA--CTGA--G----AACATGTA
gi|45987 : CACTA--AA--T-A--A----------A----C-AAGCAA---------AAT-G-G---C------CTT-C-A-----GTT-A-----A-A----A-G-TT----A--C-T-CAAGGTTTCA-TTTTTG-T-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AATATAT
gi|45988 : CACTA--AA--T-A--A----------A----C-AAGCAA---------AAT-G-G---C------CTT-C-A-----GTT-A-----A-A----A-G-TT----A--C-T-CAAGGTTTCA-TTTTTG-T-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AATATAT
gi|45989 : CAC-A--AA--T-ATAAGT-A------A----A-ATGCAA---------A-T-A-G---T------TTT-TTA-----GAC-A-----A-A----G-A-TC----A--C-T-GAAGGT--TG-TTTT-A-T-A--A---AGA----C------C-AAGG-------C------CA--CTCA--G----AACATGTA
gi|45990 : CAC-A--AA--T-A--ATT-A------A----C-AGGCAA-----------T-G-G---G------TTT-C-A-----GTT-A-----A-A----G---TT----A--C-T-CAAGGT--CA-TTTT-A-G-A--A----GG----T------C-GAGG-------T------CA--CTGA--G----AACATATA
gi|45993 : CAC-A--AT--T-A--AGT-A------A----C-AGGCAA---------A-T-G-G---G------TTT-CAG-----GTA-A-----A-A----A-G-CT----A--C-T-CAA-GT--CA-TTTT-T-G-A--A---AAG----T------C-AAGG-------T------CA--CTGA--G----AACATGTA
gi|45994 : CAC-A--AA--T-A--AGT-A-----------C-ATGTAATATATACACA-T-G-G---C------TTT---G-----GAC-A-----A-A----G-G-TT----A--C-T-CAAGGG--AA-TTTT-G-T-A--A---AGG----T------C-AATG-------T------AA--CTCA--
gi|45995 : CAC-A--AA--C-A--AGT-A------A----C-AGGCAA---------A-T-G-G---G------TTT-C-A-----GGT-A-----A-A----A-T-TT----A--C-C-CAAGGT--CA-TTTT-G---A--A---AGG----T------C--AGG-------T------C---CTGA--G----AACATGT
gi|45996 : CAC-A--AA--C-A--AGT-A------A----C-AGGCAA---------A-TGG-G---T------TTT-CAG-----GGT-A-----A-A------A-TT----A--C-TCCAAGGT--CA-TTT----G-A--A---AGG----T------C-CAGG-------T------CA--CTGA--G----AACATGT
gi|45997 : CAC-A--AA--C-A--AGG-A------A----T-AGGCAA---------A-T-G-A---C------TAA-C-T-----GGC-A-----A-A----G-G-TC----A--C-A-CAAGGT--CA-TTTT-G-T-A--A---AAG----T------T-GAGG-------T------CA--CTTA--
gi|45998 : CAC-A--AA--TTG--AGTTA------A----C-AGGCAA---------A-T-G-G---G------TTC-C-G-----GTA-A-----A-A----G-GCTT----G--C-T-CAAGGT--CA-TTTT-T-TGA--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTGA--G----AACATGTA
gi|45999 : CAC-A--AA-------AGT-A------A----CCAGGCAA---------A-T-G-G---G------TTC-C-A-----GGT-A-----A-A----A-G-T-----G--C-T-CAAGGT--CATTTTT-T-G-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTGA--G----AACATGTA
gi|46000 : CAC-A--GA--T-A--AGT-A------A----T-AGGCAA---------A-T-G-A---T------TAA-C-G-----GGC-A-----A-A----G-G-TC----A--C-T-CAAAGT--CA-ATTT-G-T-G--A---AGG----C------T-GAGA-------T------CA--CTC--------AACATTTA
gi|46001 : CAC-A--AA--T-A--AAT-A------AATATC-AGGTAA---------A-T-A-A---C------TTT-T-A-----GAC-A-----G-G----A-G-TT----A--C-T-CAAGGT--CA--TTT-G-T-A--A---AGG----T------C-AAAG-------T------TA--CT
gi|46008 : AC-A--AA--T-A--AGG-A------A----T-AGGTTA---------C-A-G-A---C------TAA-T-A-----GGC-A-----A-A----G-G-TC----A--C-T-CAAGGT--CA-TTTT-G-T-A--A---AGG----T------T-GAGG-------T------CA--CTCT--G----AAGATATA
gi|46009 : AT-A--AG--T-A--AGT-A------A----C-AGGCAA---------A-T-G-T---T------TTA-C-A-----GGC-A-----A-A----A-G-TT----A--C-T-CAAGGT--CA-TTTT-G-A-A--A---A-A----T------C-AAGG-------T------AA--CTCA--C----AGCAAAT
gi|46010 : A---------A-G-G-A---C------TTG-T-G-----ACC-A-----A-A----G-G-TC----T--T-T-AAAGGT--CA-TTTT-A-G-G--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTTA--G----AATATATA
gi|46011 : acaaatgttccttgaaacAC-A--AT--T-A--AGG-A------A----T-AGGCAA---------A-T-G-A---C------TGA-T-A-----GGC-A-----A-A----G-G-TC----A--C-T-CATGTT--CA-TTTT-G-T-A--A---AGG----T------T-AGGG-------T------CA--C----------AACGTAT
gi|46014 : CAA---------A-T-A-GTGTC------ATT-C-A-----GTC-A-----A-A----G-G-TT----A--C-T-CAAGGT--CA-GTTT-G-T-A--A---CGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AATATATA
gi|46015 : atatatcacaA--T-A--AGA-A------A----C-AAGCAA---------T-T-G-A---C------TTT-C-G-----GTC-A-----A-A----G-G-TG----A--C-T-TAAGGT--CA-TTTT-G-T-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTTA--A----AATATATA
gi|46016 : A--T-A--AGT-A------A----T-AAGCAA---------A-T-G-G---T------CTT-C-A-----GAC-A-----A-C----G-G-CC----T--C-T-CAAGGT--CA-TTTT-G-T-ATTT---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTC--------AACATATA
gi|46020 : -AAGCAA---------A-T-G-G---T------TTT-C-A-----AAC-A-----A-C----G-G-CT----A--C-T-CAAGAG--CA-TTTT-G-T-G--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CG--CTCA--G------CATGT
gi|46022 : AA---------A-T-G-TT--C------CTT-G-A-----GAC-A-----AGA----G-G-TTGTAAA--C---CAAGGT--CA-TTTT-G-G-A--A---AGG----T------C-GAGA-------T------CA--CTCA--
gi|46025 : gaAA---------A-T-A-T---C------TTT-C-A-----AATTA-----A-A----G-G-TT----A--C-T-CAAGGT--CA-TTTT-G-T-A--A---AGG----T------C-AGGG-------T------CA--ATGA--G----AAAGTATA
gi|46027 : A---------A-T-G-A---T------TTT-T-C-----GAC-A-----A-ATTAAG-G-TC----A--C-T-CGAGAT--CA-TTTT-GCA-A--A---AGG----C------C-AAGG-------T------CA--CACA--G----AAAAT
gi|46029 : ---------A-T-G-G---C------TTT-T-G-----GAT-A-----A-A----G-G-TC----T--C-T-AAAGGT--AA-TTTT-G-T-A--A---ACG----T------G-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AACGTACA
gi|46030 : -T-G-G---T------TTT-C-A-----GTT-A-----A-A----AAG-TC----A--C-T-CAAGGT--CA-TTTG-G-G-A--A---TGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AACATATA
gi|46031 : -T-G-A---C------TTG-T-G-----GAC-C-----A-A----G-G-TC----T--C-T-CAGTGT--CA-TTTT-G-G-A----------------------AAGG-------T------CA--CTCG--G----AACATATA
gi|46032 : -G-A---C------TTT-T-G-----GAC-A-----A-A----G-G-TC----A--C-T-CGAGAT--CC-ATTT-G-G-A--A---ATG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--G----AATGTAT
gi|46035 : ---C------TTT-T-G-----ATC-T-----A-A----G-G-TC----T--C-T-CAAAGT--CA-TTTT-T-G-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--TTTG--G----AATATATA
gi|46036 : ---C------TTT-T-G-----GAC-A-----A-A----G-G-TA----T--C-T-CAAGGT--CA-TCTT-A-A-A--A---AGG----T------C-AAGC-------T------CA--CTCA--G----AACATATA
gi|46037 : ---C------TTT-T-A-----GTC-A-----A-A----G-G-TA----A--C-T-TGAGGT--CA-TTTT-G-T-G--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--
gi|46038 : -C-G-----AAC-C-----A-A----G-G-TC----T--T-T-CAATGT--CA-TTTT-G-G-T--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--T----AACATGTA
gi|46039 : cttatag---C------TTT-T-A-----GAC-C-----A-G----C-G-TC----T--C-T-CAAGGC--CA-TTTT-G-A-A--T---AGG----T------C-AAGG-------C------CA--CTTA--T----AATATATA
gi|46041 : ---C------CTT-T-G-----GAC-A-----A-G----G-C-TTGG--A--C---CAAGGT--CA-TTTT-G-T-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTC--------AATATATA
gi|46046 : TT-T-G-----AAC-T-----A-A----G-G-TC----T--C-T-CAAGGT--CA-TTTTCA-A-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--A----TATACATA
gi|46049 : -T-CAAGGT--CA-TTTT-G-G-A--T---AGG----T------C-AAGG-------G------CA--CTCA--G----AACTTGTA
gi|46057 : aaacaaggctt----G-G-TC----T--T-T-CAAGGT--CA-TTTT-G-G-A--A---AGC----T------C-AAGG-------T------CA--CTTA--
gi|46062 : AGGT--CA-TTTT-G-G-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CCCA--G----AACATACA
gi|46069 : tttg-CAAGTG--CA-TTTT-G-G-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--CTCA--C----AACATATA
gi|46070 : -CAAGGT--CA-TTTT-G-G-A--A---AGG----T------C-AAGG-------T------CA--TTCA--G----AACAT
gi|46071 : -CAAGGT--CA-TTTC-G-G-A--A---AGT----T------C-AAGG-------T------CA--ATCA--G----AACACATA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|45960 ): TATCACAAATGTTCCTTGATACACGAGCTTGTGGACCAAGTTCTTTCAAGGTCATTTTGGAAAGACCAAGGTCATTGAGAACATATA