lowQualScore : 1111 1 222 22 11 0 00 0 0 11 0 00 11 0 22 0 22 0 0 55 11 1 0 1 0 0 111111 22
lowQualScore : .... . ... .. .. . .. . . .. . .. .. . .. . .. . . .. .. . . . . . ...... ..
lowQualScore : 6666 0 333 33 44 4 66 4 8 11 8 66 44 4 55 8 66 8 4 44 00 2 4 2 8 4 666666 00
consensus : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-T-CT-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
Reference ( gi|108137 ) : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-T-TT-C-TT-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108138 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A---TT-C-TT-A--GCTT-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108151 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-A-TT-C-TT-AATGC-C-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108139 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-G--G-C--T--A-AA----T-TT-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108148 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--G-G--T--A-AA--A-T-TT-C-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCTCC
gi|108149 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--C--T-AA--A-T-TT-C-TC-G--GC-T-T-CCGGG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108143 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-T-TT-C-TC-A--GC-T-T-CC-GC-G------GGCTT--CACCCC
gi|108152 : CCCCCC----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-T-TT-C-TC-A--GC-T-T-TC-TT-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108141 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-T-TT-C-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCTC
gi|108142 : CCCCCA----G-A---T-GC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-T-CT-C-TC-A--GC-T-T-CC-AG-G------GGTTT--CACCTC
gi|108140 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-T-CT-C-TC-A--GT-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108177 : CTCCCAT---G-A---CCGC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-T-TT-C-TTCA--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108150 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-CG--AAA-A-T--G-C--A--A-AA--A-T-CT-C-TC-A--GC-T-T-CT-GG-A------GGGTT--CGCCCC
gi|108156 : CCCCCA----G-A---T-GA--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-T-AT-C-TC-A--GT-T-T-CT-GG-G------GGCTT--TGCCCC
gi|108154 : CCCCAA----G-A---T-GC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A----T-C-TC-A--GC-T-T-TC-GG-G------GGCTT--CGCCC
gi|108145 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-C-CT-C-TC-G--GC-T-T-CT-GG-G------GGCTT--TGCCCC
gi|108179 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA---T--G-C--T--A-AA--A-T-TT-C-TT-A--GC-T-T-C---G-G------GTCTT--CGGCCC
gi|108146 : CCCCCT----G-A---C-GCC-AA-TG--AAA---T--G-C--T--A-AA--A-T-TT-C-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108171 : CCCCCA----T-A---C-GC--AA-TG--TAA-A-T--G-C--T--A-AA--AAT-TT-C-TC-A--GC-T-T-C--GG-G------GGCTT--CGCCTC
gi|108158 : CCCCCC----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-G-T--G-C--T--A-AT--A-T-CT-C-TC-A--GC-T-A-CC-GG-G------GGCTT--CTCCCC
gi|108157 : CCTCCA----G-A---C-CG--AA-TG--AAA-A-T--G-C--C--A-AA--A-T-AT-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-T------GGCTT--CGCCCC
gi|108159 : CCCCGA----G-A---C-GC--AA-TA--AAA-A-T--A-C--T--A-AA--A-C-T--C-TC-A--GC-T-TTCC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108155 : CCCCCA----GGA---C-GC--AA-TGTGAAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-T-T--C-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCC
gi|108162 : CCCCCA----G-A---C-GC--TA-TG--AAA-A-T--G-C--TT-A-CA--A-C-CT-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-A------GGTTT--CGCCCC
gi|108167 : CCCCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--G-T-TT---TC-A--GC-T-T-CT-GG-A------GGCTT--CG
gi|108164 : CCCCCC----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T----AA--A-T-CT-C-TC-A--GC-T-T-TC--G-G------GGCTT--CGTCCC
gi|108169 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A------A--T--ATAA--A-C-CT-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--TGCCCC
gi|108161 : CCCCCAATTTG-A---------AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-C-CT-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGTTT--CGCCC
gi|108163 : CCTCCA----G-A---C-CC--A--TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-T-CT-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GCCTT--CCCC
gi|108175 : CCCCCA----GGA---C-GC--CA-TG--AAA-A-T--G-T--T--A-AA--T-T-AT-C-TC-A--GC-T-T-TC-GGCG------GGCTT--CGCCCC
gi|108174 : CCCCCA----G-A---C-GC--A--TA--AAA-A-T--A-C--T--A-AA----C-CT-C-TC-A--GC-T-TTCC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108180 : CCCCCA----G-A---C-GC--AAATG--GAA-A-T--G-T--T--A-AC--A-T-CT-C-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--TGCTCC
gi|108168 : CCCTCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--C-C-CT-C-CC-G--GT-T-T-CC-GG-A------GGCTT--CGCCC
gi|108165 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TA--AAA-G-T--G-C--T--A-AA----C-CC-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-A------GGCTT--CGCCCC
gi|108185 : CCCGCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--A--A-AATGA-T-CT-C--T-A--GC-C-T-CC-GG-G------GGCTTG-CGTCCC
gi|108176 : CCTCCA----A-A---C-TC--CA-TG--AAA-A-T--G-CGTT--A-AA--G-T-CT-C-TC-A--AT-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108172 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG---AA-A-T--G-C--T--A-AA--A---TT-C-TC-A--GC-T-T--C-GG-G------GGC
gi|108160 : CCCCCA----G-AACGCAGC--AA-TG--AAA-A-T--G-T--T--A-AA--T-T-CT-C-TC-A--GC-T-T-C---G-G------GGCTT--CGCCC
gi|108178 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-C-CT-A-TC-A--GT-T-T-TT-AG-G------GGCTT--CACCCC
gi|108186 : CCTCCG----G-A---C-CC--CA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-T-AT-C-TC-A--GC-T-T-CC-AG-T------GGCTT--TTCCCC
gi|108181 : CCCCCA----G-C---C-AA--AA-TA--GGA-A-T--T-C--T--A-AA--A-C-CT-C-TC-A--GT-T-T-CC-GG-G------AGCTT--CGCCCC
gi|108187 : CCCCTA----G-G---C-TC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-C-CT-T-TC-A--AT-T-T-CC-GA-C------GCCTT--CGCCCC
gi|108166 : CCTCCA----G-A---C--C--AA-TA--AAA-AGT--G-C--T--A-AC--A-C-C--C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-A------GGCTT--CGCCC
gi|108184 : CCCCCA----T-A---TTAA--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-C-CT-C-TC-A--GT-T-T-CC-GG-G------GGTTC--CG
gi|108203 : CCCCA----G-AA--C-GC--AA-TG--AAA-A-T--G-A--T--A-AA--A-T-TT-C-TT-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108208 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-TG---AA-A-T--G-C--T--A-AA--A-T-TT-C-CT-A--GC-T-TCCC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108211 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA---T--G-C--T--A-AA--A-T-GT-C-TT-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108202 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-T-TT-CTTT-A--GCTT-T-CC-GG-G------GGCTA--AGCCC
gi|108216 : CCCCA----G-A---CCGC--AA-TG--GAA-A-T--G-C--T--A-AA--T-T-TC-C-TT-AG-GC-T-T-CC-GG-G------GGTTT--CGCCCC
gi|108219 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA---T--G-C--T--A-AAC-A-T-TT---TT-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108214 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-T---AAA-A-T--G-C--T--A-AA--T-T-TT-C-TC-A--GC-T-T--C-GG-G------GGCTT--CCCCC
gi|108204 : CCCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-C-CT-G-TC-G--GC-T-T-CC-AG-G------GGCTT--TGCCCC
gi|108213 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAG-A-T--G-C--T--A-AA--T-T-TT-C-TCAA--GC-T-T-CC-GG-G------G--CT--CGCCCC
gi|108206 : CCCTA----G-A---C-TC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--G-AA--A-C-CT-C-TC-A--GT-T-T-CC-GG-G------GATTT--CGCCCC
gi|108210 : CCCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--G-AA------CT-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CAC
gi|108205 : CCCCA----G-A---C-CCCTAA-CG--AAA---T--G-A--T--A-AA--A-T-CT-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108223 : CCCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-C--G-C--T----AA--A-T-TT-C-TTCA--GC-TGT-CC-AA-G------GGCTT--CGCTCC
gi|108217 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-TA--AAA-A-TAAA-C-----A-AA--A-TACT-C-TC-A--GC-T-T--C-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108215 : CCCCA----A-A---C-CC--AA-TG--AAAGA-T--G-C--T--A-AA--T-T-CT-C-CA-A--GC-T-T-CC-GG-G------AGCTT--CGC
gi|108220 : CCCCA----G-AGACC-G---AA-TG--AAA---T--G-C--T--A-AA--A-T-TT-C-TC-A--GC-T-T-TC-TG-G------GGCTT--CG
gi|108209 : CCCCA----G-A---C-GCC-AA-TG--AAA---T--G-C--T--A-AA--T-C-CA-C-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108222 : CCCTA------A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--G-AA--A-T-AT-C-TC-A--GT-T-T-CC-GG-G------GGTTT--TGCTCC
gi|108218 : CCCAA----G-A---T-CC--AA-AG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-C-CT-C-TC-A--AC-T-T-CTAGG-G------GGCTT--CGCCC
gi|108232 : CCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AAG-A-T-TT-C-TT-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108230 : CCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-T-TT-C-TC-A--GC-T-T--C-AG-G------GGCTT--CGCCC
gi|108229 : CCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T----T--T--A-AA--A-T-TT-C-TC-G--GC-T-T-CC----G------GGCTT--CGCCCC
gi|108234 : CCCC----G-A---C-CC--AA-TG--AAA---C--G-C--T--A-AA--A-T-CT-C-TC-A--AC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCTCC
gi|108239 : CCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-TTTG-C--T--A-AA--AAT-CT-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTTC-CGCCCC
gi|108245 : CCC----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T----C--T--A-AA--A-T-TT-C-TC-A--GCTT-T-CC-GT-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108243 : CCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--G-T--T--A-AA--A-C-CT-C-TT-A--GT-T-T-CC-GG-G------GGTTT--TACCCC
gi|108241 : CCA----G-A---C-AT--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-TA--A-C-AT-C-TC-A--GC-T-T-CT-GG-G------GCCTT--CGCCCC
gi|108244 : CCA----G-A---C-AC--CA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA-------T-C-CC-A--GC-T-T-CC-AG-A------GGCTT--TGCCCC
gi|108249 : CA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--T-C--T--A-AA--T-C-CT-C-TC-A--GC-T-T-CC-CG-G------GGCTT--CACCCC
gi|108254 : CA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GCC--T--A-TATTA-T-TTCC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTTTCCGCCCC
gi|108253 : CA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GCC--T--A-TATTA-T-TTCC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTTTCCGCCCC
gi|108251 : CA----G-A---C-CC--A--TG--AAA-A-T--G-C--TGAA-AA--A-T-CT-C-TC-A--GT-T-T-CC-GG-GA-----AGCTT--CGCCCC
gi|108256 : A----G-A---C-CC--TA-TG--AAA-A-T--G-C--TT-A-AA--A-T-TT-A-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GAATT--CGCCCC
gi|108250 : A----G-G---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-T-CT-C-TC-A--GC---T-CT-GG-G------GGCTT--
gi|108257 : cagaca----G-A---C-TT--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--G-AA--A-C-CT-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGATT--TGTCCC
gi|108258 : -A---C-GC--AA-TT--GAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-C-CT-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCTCC
gi|108264 : C--AA-TA--AAA-AAT--G-C--T--A-AA--A-C-CT-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108265 : aC--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-C-CT-C-TA-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGC
gi|108270 : --AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-C-CT-C-TC-A--AC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108269 : --AA-TG--AAA-A-T--G-T--C--A-AA--A-T-CT-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108212 : --AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-C-CT-C-TC-A--GC-T-T-GC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108268 : ccccatttaa--AA-TG--AAA-A-A--G-C--T--A-AA--A-C-CT-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108274 : --AA-TG--AAA-A-T--G----T--A-AA--A-C-CT-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CACCCC
gi|108275 : --AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-T-CT-C-TC-A--GC-C-T-CC-GG-G------GACTT--CACC
gi|108272 : --AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-T-AT-C-TC-A--GT-T-T-CC-AG-G------GGCTT--TGTCCC
gi|108276 : --AA-CG--AAA-A-T--A-C--T--A-AA--A-C-CT-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GACTT--CACCCC
gi|108173 : --AA-TG--AAA-A-T--G-C--C--A-AA--A-C-CT-C----A--GC-T-T-CC-GG-G------GACTT--CGCCCC
gi|108277 : cccccaatttcaa--AA-TG--AAA-A-T--G-T--T--A-AA--A-C-CT-C-TC-A--GC-T-G-CC-GG-G------GTCTT--CGCCCC
gi|108260 : --AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--C-AA--A-C-CT-C-TC-A--GC-T-T-TC-GG-G------GGCTT--TACCCC
gi|108279 : cat--AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-C-CT-C-CC-A--GT-T-T-CC-GG-GGGCGGTGGCTT--CGCCCC
gi|108278 : --AA-TG--AAA-A-T--G-C--C--A-AA----C-CT-C-TC-A--AC-T-T-CC-GG-G------GGTTT--CGCCCC
gi|108280 : --AA-TG--AAA-A-T--G-C--T--A-TA--A-C-CT-C-TC-A--GG-T-T-CC-GG-G------GGC-T--CGCCCC
gi|108293 : -TG--AAG-A-T--A-C--T--A-AA--A-C-CT-C-TC-A--GC-T-T-CC-AG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108298 : -TG--AAA-A-T--G-C--T--A-AA--A-C-CT-T-TC-A--GC-T-T-CC-GA-G------GACTT--CGCCCC
gi|108295 : -TG--AAG-A-T--A-C--T--A-AA--A-T-CT-C-TC-A--GC-T-T-CT-GG-G------GGCTT--TGCCCC
gi|108301 : AA-A-T--G-C--T--A-AA--A-C-CT-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-A------GGCTC--CGCCCC
Alignments
lowQualScore : 1111 1 222 22 11 0 00 0 0 11 11 11 0 22 0 0 1 0 11 1 0 1 0 0 111111 11
lowQualScore : .... . ... .. .. . .. . . .. .. .. . .. . . . . .. . . . . . ...... ..
lowQualScore : 6666 0 222 22 44 4 66 4 8 11 33 33 4 44 8 4 6 4 00 2 4 2 8 4 555555 99
consensus : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
Reference ( family-189 ) : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108137 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TT-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108138 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T--TC-TT-A--GCTT-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108139 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-G--GC--T--A-AA----T-TTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108140 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GT-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108141 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCTC
gi|108142 : CCCCCA----G-A---T-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-AG-G------GGTTT--CACCTC
gi|108143 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GC-T-T-CC-GC-G------GGCTT--CACCCC
gi|108145 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-G--GC-T-T-CT-GG-G------GGCTT--TGCCCC
gi|108146 : CCCCCT----G-A---C-GCC-AA-TG--AAA---T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108148 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GG--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCTCC
gi|108149 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--C--T-AA--A-T-TTC-TC-G--GC-T-T-CCGGG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108150 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-CG--AAA-A-T--GC--A--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CT-GG-A------GGGTT--CGCCCC
gi|108151 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-A-TTC-TT-AATGC-C-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108152 : CCCCCC----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GC-T-T-TC-TT-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108154 : CCCCAA----G-A---T-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A----TC-TC-A--GC-T-T-TC-GG-G------GGCTT--CGCCC
gi|108155 : CCCCCA----GGA---C-GC--AA-TGTGAAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T--TC-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCC
gi|108156 : CCCCCA----G-A---T-GA--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-ATC-TC-A--GT-T-T-CT-GG-G------GGCTT--TGCCCC
gi|108157 : CCTCCA----G-A---C-CG--AA-TG--AAA-A-T--GC--C--A-AA--A-T-ATC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-T------GGCTT--CGCCCC
gi|108158 : CCCCCC----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-G-T--GC--T--A-AT--A-T-CTC-TC-A--GC-T-A-CC-GG-G------GGCTT--CTCCCC
gi|108159 : CCCCGA----G-A---C-GC--AA-TA--AAA-A-T--AC--T--A-AA--A---CTC-TC-A--GC-T-TTCC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108160 : CCCCCA----G-AACGCAGC--AA-TG--AAA-A-T--GT--T--A-AA--T-T-CTC-TC-A--GC-T-T-C---G-G------GGCTT--CGCCC
gi|108161 : CCCCCAATTTG-A---------AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGTTT--CGCCC
gi|108162 : CCCCCA----G-A---C-GC--TA-TG--AAA-A-T--GC--TT-A-CA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-A------GGTTT--CGCCCC
gi|108163 : CCTCCA----G-A---C-CC--A--TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GCCTT--CCCC
gi|108164 : CCCCCC----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T----AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-TC--G-G------GGCTT--CGTCCC
gi|108165 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TA--AAA-G-T--GC--T--A-AA----C-CCC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-A------GGCTT--CGCCCC
gi|108166 : CCTCCA----G-A---C--C--AA-TA--AAA-AGT--GC--T--A-AC--A-C-C-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-A------GGCTT--CGCCC
gi|108167 : CCCCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--G-T--TT-TC-A--GC-T-T-CT-GG-A------GGCTT--CG
gi|108168 : CCCTCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--C-C-CTC-CC-G--GT-T-T-CC-GG-A------GGCTT--CGCCC
gi|108169 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-----A--T--ATAA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--TGCCCC
gi|108171 : CCCCCA----T-A---C-GC--AA-TG--TAA-A-T--GC--T--A-AA--AAT-TTC-TC-A--GC-T-T-C--GG-G------GGCTT--CGCCTC
gi|108172 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG---AA-A-T--GC--T--A-AA--A-T--TC-TC-A--GC-T-T--C-GG-G------GGC
gi|108173 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--C--A-AA--A-C-CTC----A--GC-T-T-CC-GG-G------GACTT--CGCCCC
gi|108174 : cccccaatttcaaCCCCCA----G-A---C-GC--A--TA--AAA-A-T--AC--T--A-AA----C-CTC-TC-A--GC-T-TTCC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108175 : CCCCCA----GGA---C-GC--CA-TG--AAA-A-T--GT--T--A-AA--T-T-ATC-TC-A--GC-T-T-TC-GGCG------GGCTT--CGCCCC
gi|108176 : CCTCCA----A-A---C-TC--CA-TG--AAA-A-T--GCGTT--A-AA--G-T-CTC-TC-A--AT-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108177 : CTCCCAT---G-A---CCGC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTCTTC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108178 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTA-TC-A--GT-T-T-TT-AG-G------GGCTT--CACCCC
gi|108179 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA---T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TT-A--GC-T-T-C---G-G------GTCTT--CGGCCC
gi|108180 : CCCCCA----G-A---C-GC--AAATG--GAA-A-T--GT--T--A-AC--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--TGCTCC
gi|108181 : CCCCCA----G-C---C-AA--AA-TA--GGA-A-T--TC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GT-T-T-CC-GG-G------AGCTT--CGCCCC
gi|108184 : CCCCCA----T-A---TTAA--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GT-T-T-CC-GG-G------GGTTC--CG
gi|108185 : CCCGCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--A--A-AATGA-T-CTC-T--A--GC-C-T-CC-GG-G------GGCTTG-CGTCCC
gi|108186 : CCTCCG----G-A---C-CC--CA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-ATC-TC-A--GC-T-T-CC-AG-T------GGCTT--TTCCCC
gi|108187 : CCCCTA----G-G---C-TC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTT-TC-A--AT-T-T-CC-GA-C------GCCTT--CGCCCC
gi|108202 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTCTTT-A--GCTT-T-CC-GG-G------GGCTA--AGCCC
gi|108203 : CCCCA----G-AA--C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GA--T--A-AA--A-T-TTC-TT-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108204 : CCCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTG-TC-G--GC-T-T-CC-AG-G------GGCTT--TGCCCC
gi|108205 : CCCCA----G-A---C-CCCTAA-CG--AAA---T--GA--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108206 : CCCTA----G-A---C-TC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--G-AA--A-C-CTC-TC-A--GT-T-T-CC-GG-G------GATTT--CGCCCC
gi|108208 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-TG---AA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-CT-A--GC-T-TCCC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108209 : CCCCA----G-A---C-GCC-AA-TG--AAA---T--GC--T--A-AA--T-C-CAC-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108210 : CCCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--G-AA------CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CAC
gi|108211 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA---T--GC--T--A-AA--A-T-GTC-TT-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108212 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-GC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108213 : ccccatttaaCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAG-A-T--GC--T--A-AA--T-T-TTC-TCAA--GC-T-T-CC-GG-G------G--CT--CGCCCC
gi|108214 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-T---AAA-A-T--GC--T--A-AA--T-T-TTC-TC-A--GC-T-T--C-GG-G------GGCTT--CCCCC
gi|108215 : CCCCA----A-A---C-CC--AA-TG--AAAGA-T--GC--T--A-AA--T-T-CTC-CA-A--GC-T-T-CC-GG-G------AGCTT--CGC
gi|108216 : CCCCA----G-A---CCGC--AA-TG--GAA-A-T--GC--T--A-AA--T-T-TCC-TT-AG-GC-T-T-CC-GG-G------GGTTT--CGCCCC
gi|108217 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-TA--AAA-A-TAAAC-----A-AA--A-TACTC-TC-A--GC-T-T--C-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108218 : CCCAA----G-A---T-CC--AA-AG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--AC-T-T-CTAGG-G------GGCTT--CGCCC
gi|108219 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA---T--GC--T--A-AAC-A-T-TTT-T--A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108220 : CCCCA----G-AGACC-G---AA-TG--AAA---T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GC-T-T-TC-TG-G------GGCTT--CG
gi|108222 : CCCTA------A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--G-AA--A-T-ATC-TC-A--GT-T-T-CC-GG-G------GGTTT--TGCTCC
gi|108223 : CCCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-C--GC--T--A-AA--T-T-TCT-TC-A--GC-TGT-CC-AA-G------GGCTT--CGCTCC
gi|108229 : CCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T---T--T--A-AA--A-T-TTC-TC-G--GC-T-T-CC----G------GGCTT--CGCCCC
gi|108230 : CCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GC-T-T--C-AG-G------GGCTT--CGCCC
gi|108232 : CCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AAG-A-T-TTC-TT-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108234 : CCCC----G-A---C-CC--AA-TG--AAA---C--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--AC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCTCC
gi|108239 : CCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-TTTGC--T--A-AA--AAT-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTTC-CGCCCC
gi|108241 : CCA----G-A---C-AT--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-TA--A-C-ATC-TC-A--GC-T-T-CT-GG-G------GCCTT--CGCCCC
gi|108243 : CCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GT--T--A-AA--A-C-CTC-TT-A--GT-T-T-CC-GG-G------GGTTT--TACCCC
gi|108244 : CCA----G-A---C-AC--CA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA-------TC-CC-A--GC-T-T-CC-AG-A------GGCTT--TGCCCC
gi|108245 : CCC----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T---C--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GCTT-T-CC-GT-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108249 : CA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--TC--T--A-AA--T-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-CG-G------GGCTT--CACCCC
gi|108250 : A----G-G---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC---T-CT-GG-G------GGCTT--
gi|108251 : cagacaCA----G-A---C-CC--A--TG--AAA-A-T--GC--TGAA-AA--A-T-CTC-TC-A--GT-T-T-CC-GG-GA-----AGCTT--CGCCCC
gi|108253 : CA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GCC-T--A-TATTA-T-TTCCTC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTTTCCGCCCC
gi|108254 : CA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GCC-T--A-TATTA-T-TTCCTC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTTTCCGCCCC
gi|108256 : A----G-A---C-CC--TA-TG--AAA-A-T--GC--TT-A-AA--A-T-TTA-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GAATT--CGCCCC
gi|108257 : ----G-A---C-TT--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--G-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGATT--TGTCCC
gi|108258 : -A---C-GC--AA-TT--GAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCTCC
gi|108260 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--T--C-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-TC-GG-G------GGCTT--TACCCC
gi|108264 : catC--AA-TA--AAA-AAT--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108265 : aC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TA-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGC
gi|108268 : --AA-TG--AAA-A-A--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108269 : --AA-TG--AAA-A-T--GT--C--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108270 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--AC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108272 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-ATC-TC-A--GT-T-T-CC-AG-G------GGCTT--TGTCCC
gi|108274 : --AA-TG--AAA-A-T--G---T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CACCCC
gi|108275 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-C-T-CC-GG-G------GACTT--CACC
gi|108276 : --AA-CG--AAA-A-T--AC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GACTT--CACCCC
gi|108277 : --AA-TG--AAA-A-T--GT--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-G-CC-GG-G------GTCTT--CGCCCC
gi|108278 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--C--A-AA----C-CTC-TC-A--AC-T-T-CC-GG-G------GGTTT--CGCCCC
gi|108279 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-CC-A--GT-T-T-CC-GG-GGGCGGTGGCTT--CGCCCC
gi|108280 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-TA--A-C-CTC-TC-A--GG-T-T-CC-GG-G------GGC-T--CGCCCC
gi|108293 : -TG--AAG-A-T--AC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-AG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108295 : -TG--AAG-A-T--AC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CT-GG-G------GGCTT--TGCCCC
gi|108298 : -TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTT-TC-A--GC-T-T-CC-GA-G------GACTT--CGCCCC
gi|108301 : AA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-A------GGCTC--CGCCCC
Alignments
lowQualScore : 1111 1 222 22 11 0 00 0 0 11 11 11 0 22 0 0 1 0 11 1 0 1 0 0 111111 11
lowQualScore : .... . ... .. .. . .. . . .. .. .. . .. . . . . .. . . . . . ...... ..
lowQualScore : 6666 0 222 22 44 4 66 4 8 11 33 33 4 44 8 4 6 4 00 2 4 2 8 4 555555 99
consensus : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
Reference ( family-189 ) : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108137 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TT-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108138 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T--TC-TT-A--GCTT-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108139 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-G--GC--T--A-AA----T-TTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108140 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GT-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108141 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCTC
gi|108142 : CCCCCA----G-A---T-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-AG-G------GGTTT--CACCTC
gi|108143 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GC-T-T-CC-GC-G------GGCTT--CACCCC
gi|108145 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-G--GC-T-T-CT-GG-G------GGCTT--TGCCCC
gi|108146 : CCCCCT----G-A---C-GCC-AA-TG--AAA---T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108148 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GG--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCTCC
gi|108149 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--C--T-AA--A-T-TTC-TC-G--GC-T-T-CCGGG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108150 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-CG--AAA-A-T--GC--A--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CT-GG-A------GGGTT--CGCCCC
gi|108151 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-A-TTC-TT-AATGC-C-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108152 : CCCCCC----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GC-T-T-TC-TT-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108154 : CCCCAA----G-A---T-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A----TC-TC-A--GC-T-T-TC-GG-G------GGCTT--CGCCC
gi|108155 : CCCCCA----GGA---C-GC--AA-TGTGAAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T--TC-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCC
gi|108156 : CCCCCA----G-A---T-GA--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-ATC-TC-A--GT-T-T-CT-GG-G------GGCTT--TGCCCC
gi|108157 : CCTCCA----G-A---C-CG--AA-TG--AAA-A-T--GC--C--A-AA--A-T-ATC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-T------GGCTT--CGCCCC
gi|108158 : CCCCCC----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-G-T--GC--T--A-AT--A-T-CTC-TC-A--GC-T-A-CC-GG-G------GGCTT--CTCCCC
gi|108159 : CCCCGA----G-A---C-GC--AA-TA--AAA-A-T--AC--T--A-AA--A---CTC-TC-A--GC-T-TTCC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108160 : CCCCCA----G-AACGCAGC--AA-TG--AAA-A-T--GT--T--A-AA--T-T-CTC-TC-A--GC-T-T-C---G-G------GGCTT--CGCCC
gi|108161 : CCCCCAATTTG-A---------AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGTTT--CGCCC
gi|108162 : CCCCCA----G-A---C-GC--TA-TG--AAA-A-T--GC--TT-A-CA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-A------GGTTT--CGCCCC
gi|108163 : CCTCCA----G-A---C-CC--A--TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GCCTT--CCCC
gi|108164 : CCCCCC----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T----AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-TC--G-G------GGCTT--CGTCCC
gi|108165 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TA--AAA-G-T--GC--T--A-AA----C-CCC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-A------GGCTT--CGCCCC
gi|108166 : CCTCCA----G-A---C--C--AA-TA--AAA-AGT--GC--T--A-AC--A-C-C-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-A------GGCTT--CGCCC
gi|108167 : CCCCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--G-T--TT-TC-A--GC-T-T-CT-GG-A------GGCTT--CG
gi|108168 : CCCTCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--C-C-CTC-CC-G--GT-T-T-CC-GG-A------GGCTT--CGCCC
gi|108169 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-----A--T--ATAA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--TGCCCC
gi|108171 : CCCCCA----T-A---C-GC--AA-TG--TAA-A-T--GC--T--A-AA--AAT-TTC-TC-A--GC-T-T-C--GG-G------GGCTT--CGCCTC
gi|108172 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG---AA-A-T--GC--T--A-AA--A-T--TC-TC-A--GC-T-T--C-GG-G------GGC
gi|108173 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--C--A-AA--A-C-CTC----A--GC-T-T-CC-GG-G------GACTT--CGCCCC
gi|108174 : cccccaatttcaaCCCCCA----G-A---C-GC--A--TA--AAA-A-T--AC--T--A-AA----C-CTC-TC-A--GC-T-TTCC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108175 : CCCCCA----GGA---C-GC--CA-TG--AAA-A-T--GT--T--A-AA--T-T-ATC-TC-A--GC-T-T-TC-GGCG------GGCTT--CGCCCC
gi|108176 : CCTCCA----A-A---C-TC--CA-TG--AAA-A-T--GCGTT--A-AA--G-T-CTC-TC-A--AT-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108177 : CTCCCAT---G-A---CCGC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTCTTC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108178 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTA-TC-A--GT-T-T-TT-AG-G------GGCTT--CACCCC
gi|108179 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA---T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TT-A--GC-T-T-C---G-G------GTCTT--CGGCCC
gi|108180 : CCCCCA----G-A---C-GC--AAATG--GAA-A-T--GT--T--A-AC--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--TGCTCC
gi|108181 : CCCCCA----G-C---C-AA--AA-TA--GGA-A-T--TC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GT-T-T-CC-GG-G------AGCTT--CGCCCC
gi|108184 : CCCCCA----T-A---TTAA--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GT-T-T-CC-GG-G------GGTTC--CG
gi|108185 : CCCGCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--A--A-AATGA-T-CTC-T--A--GC-C-T-CC-GG-G------GGCTTG-CGTCCC
gi|108186 : CCTCCG----G-A---C-CC--CA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-ATC-TC-A--GC-T-T-CC-AG-T------GGCTT--TTCCCC
gi|108187 : CCCCTA----G-G---C-TC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTT-TC-A--AT-T-T-CC-GA-C------GCCTT--CGCCCC
gi|108202 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTCTTT-A--GCTT-T-CC-GG-G------GGCTA--AGCCC
gi|108203 : CCCCA----G-AA--C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GA--T--A-AA--A-T-TTC-TT-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108204 : CCCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTG-TC-G--GC-T-T-CC-AG-G------GGCTT--TGCCCC
gi|108205 : CCCCA----G-A---C-CCCTAA-CG--AAA---T--GA--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108206 : CCCTA----G-A---C-TC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--G-AA--A-C-CTC-TC-A--GT-T-T-CC-GG-G------GATTT--CGCCCC
gi|108208 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-TG---AA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-CT-A--GC-T-TCCC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108209 : CCCCA----G-A---C-GCC-AA-TG--AAA---T--GC--T--A-AA--T-C-CAC-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108210 : CCCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--G-AA------CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CAC
gi|108211 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA---T--GC--T--A-AA--A-T-GTC-TT-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108212 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-GC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108213 : ccccatttaaCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAG-A-T--GC--T--A-AA--T-T-TTC-TCAA--GC-T-T-CC-GG-G------G--CT--CGCCCC
gi|108214 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-T---AAA-A-T--GC--T--A-AA--T-T-TTC-TC-A--GC-T-T--C-GG-G------GGCTT--CCCCC
gi|108215 : CCCCA----A-A---C-CC--AA-TG--AAAGA-T--GC--T--A-AA--T-T-CTC-CA-A--GC-T-T-CC-GG-G------AGCTT--CGC
gi|108216 : CCCCA----G-A---CCGC--AA-TG--GAA-A-T--GC--T--A-AA--T-T-TCC-TT-AG-GC-T-T-CC-GG-G------GGTTT--CGCCCC
gi|108217 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-TA--AAA-A-TAAAC-----A-AA--A-TACTC-TC-A--GC-T-T--C-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108218 : CCCAA----G-A---T-CC--AA-AG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--AC-T-T-CTAGG-G------GGCTT--CGCCC
gi|108219 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA---T--GC--T--A-AAC-A-T-TTT-T--A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108220 : CCCCA----G-AGACC-G---AA-TG--AAA---T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GC-T-T-TC-TG-G------GGCTT--CG
gi|108222 : CCCTA------A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--G-AA--A-T-ATC-TC-A--GT-T-T-CC-GG-G------GGTTT--TGCTCC
gi|108223 : CCCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-C--GC--T--A-AA--T-T-TCT-TC-A--GC-TGT-CC-AA-G------GGCTT--CGCTCC
gi|108229 : CCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T---T--T--A-AA--A-T-TTC-TC-G--GC-T-T-CC----G------GGCTT--CGCCCC
gi|108230 : CCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GC-T-T--C-AG-G------GGCTT--CGCCC
gi|108232 : CCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AAG-A-T-TTC-TT-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108234 : CCCC----G-A---C-CC--AA-TG--AAA---C--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--AC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCTCC
gi|108239 : CCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-TTTGC--T--A-AA--AAT-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTTC-CGCCCC
gi|108241 : CCA----G-A---C-AT--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-TA--A-C-ATC-TC-A--GC-T-T-CT-GG-G------GCCTT--CGCCCC
gi|108243 : CCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GT--T--A-AA--A-C-CTC-TT-A--GT-T-T-CC-GG-G------GGTTT--TACCCC
gi|108244 : CCA----G-A---C-AC--CA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA-------TC-CC-A--GC-T-T-CC-AG-A------GGCTT--TGCCCC
gi|108245 : CCC----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T---C--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GCTT-T-CC-GT-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108249 : CA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--TC--T--A-AA--T-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-CG-G------GGCTT--CACCCC
gi|108250 : A----G-G---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC---T-CT-GG-G------GGCTT--
gi|108251 : cagacaCA----G-A---C-CC--A--TG--AAA-A-T--GC--TGAA-AA--A-T-CTC-TC-A--GT-T-T-CC-GG-GA-----AGCTT--CGCCCC
gi|108253 : CA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GCC-T--A-TATTA-T-TTCCTC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTTTCCGCCCC
gi|108254 : CA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GCC-T--A-TATTA-T-TTCCTC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTTTCCGCCCC
gi|108256 : A----G-A---C-CC--TA-TG--AAA-A-T--GC--TT-A-AA--A-T-TTA-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GAATT--CGCCCC
gi|108257 : ----G-A---C-TT--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--G-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGATT--TGTCCC
gi|108258 : -A---C-GC--AA-TT--GAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCTCC
gi|108260 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--T--C-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-TC-GG-G------GGCTT--TACCCC
gi|108264 : catC--AA-TA--AAA-AAT--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108265 : aC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TA-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGC
gi|108268 : --AA-TG--AAA-A-A--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108269 : --AA-TG--AAA-A-T--GT--C--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108270 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--AC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108272 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-ATC-TC-A--GT-T-T-CC-AG-G------GGCTT--TGTCCC
gi|108274 : --AA-TG--AAA-A-T--G---T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CACCCC
gi|108275 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-C-T-CC-GG-G------GACTT--CACC
gi|108276 : --AA-CG--AAA-A-T--AC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GACTT--CACCCC
gi|108277 : --AA-TG--AAA-A-T--GT--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-G-CC-GG-G------GTCTT--CGCCCC
gi|108278 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--C--A-AA----C-CTC-TC-A--AC-T-T-CC-GG-G------GGTTT--CGCCCC
gi|108279 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-CC-A--GT-T-T-CC-GG-GGGCGGTGGCTT--CGCCCC
gi|108280 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-TA--A-C-CTC-TC-A--GG-T-T-CC-GG-G------GGC-T--CGCCCC
gi|108293 : -TG--AAG-A-T--AC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-AG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108295 : -TG--AAG-A-T--AC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CT-GG-G------GGCTT--TGCCCC
gi|108298 : -TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTT-TC-A--GC-T-T-CC-GA-G------GACTT--CGCCCC
gi|108301 : AA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-A------GGCTC--CGCCCC
blockSeqs : ATTT G ACG AG CT AA GT GA TG T T T GGCGGT TC
blockSeqs : T G GAC CG C TT C T TT T T T A TC
blockSeqs : . . A TA C . C T TT C T C . G
blockSeqs : . . . CG . . . . C C . . . C
blockSeqs : . . . G . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
finalCons : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
Alignments
lowQualScore : 1111 1 222 22 11 0 00 0 0 11 11 11 0 22 0 0 1 0 11 1 0 1 0 0 111111 11
lowQualScore : .... . ... .. .. . .. . . .. .. .. . .. . . . . .. . . . . . ...... ..
lowQualScore : 6666 0 222 22 44 4 66 4 8 11 33 33 4 44 8 4 6 4 00 2 4 2 8 4 555555 99
consensus : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
Reference ( family-189 ) : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108137 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TT-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108138 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T--TC-TT-A--GCTT-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108139 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-G--GC--T--A-AA----T-TTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108140 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GT-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108141 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCTC
gi|108142 : CCCCCA----G-A---T-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-AG-G------GGTTT--CACCTC
gi|108143 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GC-T-T-CC-GC-G------GGCTT--CACCCC
gi|108145 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-G--GC-T-T-CT-GG-G------GGCTT--TGCCCC
gi|108146 : CCCCCT----G-A---C-GCC-AA-TG--AAA---T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108148 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GG--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCTCC
gi|108149 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--C--T-AA--A-T-TTC-TC-G--GC-T-T-CCGGG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108150 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-CG--AAA-A-T--GC--A--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CT-GG-A------GGGTT--CGCCCC
gi|108151 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-A-TTC-TT-AATGC-C-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108152 : CCCCCC----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GC-T-T-TC-TT-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108154 : CCCCAA----G-A---T-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A----TC-TC-A--GC-T-T-TC-GG-G------GGCTT--CGCCC
gi|108155 : CCCCCA----GGA---C-GC--AA-TGTGAAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T--TC-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCC
gi|108156 : CCCCCA----G-A---T-GA--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-ATC-TC-A--GT-T-T-CT-GG-G------GGCTT--TGCCCC
gi|108157 : CCTCCA----G-A---C-CG--AA-TG--AAA-A-T--GC--C--A-AA--A-T-ATC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-T------GGCTT--CGCCCC
gi|108158 : CCCCCC----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-G-T--GC--T--A-AT--A-T-CTC-TC-A--GC-T-A-CC-GG-G------GGCTT--CTCCCC
gi|108159 : CCCCGA----G-A---C-GC--AA-TA--AAA-A-T--AC--T--A-AA--A---CTC-TC-A--GC-T-TTCC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108160 : CCCCCA----G-AACGCAGC--AA-TG--AAA-A-T--GT--T--A-AA--T-T-CTC-TC-A--GC-T-T-C---G-G------GGCTT--CGCCC
gi|108161 : CCCCCAATTTG-A---------AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGTTT--CGCCC
gi|108162 : CCCCCA----G-A---C-GC--TA-TG--AAA-A-T--GC--TT-A-CA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-A------GGTTT--CGCCCC
gi|108163 : CCTCCA----G-A---C-CC--A--TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GCCTT--CCCC
gi|108164 : CCCCCC----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T----AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-TC--G-G------GGCTT--CGTCCC
gi|108165 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TA--AAA-G-T--GC--T--A-AA----C-CCC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-A------GGCTT--CGCCCC
gi|108166 : CCTCCA----G-A---C--C--AA-TA--AAA-AGT--GC--T--A-AC--A-C-C-C-TC-A--GC-T-T-CC-GG-A------GGCTT--CGCCC
gi|108167 : CCCCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--G-T--TT-TC-A--GC-T-T-CT-GG-A------GGCTT--CG
gi|108168 : CCCTCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--C-C-CTC-CC-G--GT-T-T-CC-GG-A------GGCTT--CGCCC
gi|108169 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-----A--T--ATAA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--TGCCCC
gi|108171 : CCCCCA----T-A---C-GC--AA-TG--TAA-A-T--GC--T--A-AA--AAT-TTC-TC-A--GC-T-T-C--GG-G------GGCTT--CGCCTC
gi|108172 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG---AA-A-T--GC--T--A-AA--A-T--TC-TC-A--GC-T-T--C-GG-G------GGC
gi|108173 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--C--A-AA--A-C-CTC----A--GC-T-T-CC-GG-G------GACTT--CGCCCC
gi|108174 : cccccaatttcaaCCCCCA----G-A---C-GC--A--TA--AAA-A-T--AC--T--A-AA----C-CTC-TC-A--GC-T-TTCC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108175 : CCCCCA----GGA---C-GC--CA-TG--AAA-A-T--GT--T--A-AA--T-T-ATC-TC-A--GC-T-T-TC-GGCG------GGCTT--CGCCCC
gi|108176 : CCTCCA----A-A---C-TC--CA-TG--AAA-A-T--GCGTT--A-AA--G-T-CTC-TC-A--AT-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108177 : CTCCCAT---G-A---CCGC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTCTTC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108178 : CCTCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTA-TC-A--GT-T-T-TT-AG-G------GGCTT--CACCCC
gi|108179 : CCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA---T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TT-A--GC-T-T-C---G-G------GTCTT--CGGCCC
gi|108180 : CCCCCA----G-A---C-GC--AAATG--GAA-A-T--GT--T--A-AC--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--TGCTCC
gi|108181 : CCCCCA----G-C---C-AA--AA-TA--GGA-A-T--TC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GT-T-T-CC-GG-G------AGCTT--CGCCCC
gi|108184 : CCCCCA----T-A---TTAA--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GT-T-T-CC-GG-G------GGTTC--CG
gi|108185 : CCCGCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--A--A-AATGA-T-CTC-T--A--GC-C-T-CC-GG-G------GGCTTG-CGTCCC
gi|108186 : CCTCCG----G-A---C-CC--CA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-ATC-TC-A--GC-T-T-CC-AG-T------GGCTT--TTCCCC
gi|108187 : CCCCTA----G-G---C-TC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTT-TC-A--AT-T-T-CC-GA-C------GCCTT--CGCCCC
gi|108202 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTCTTT-A--GCTT-T-CC-GG-G------GGCTA--AGCCC
gi|108203 : CCCCA----G-AA--C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GA--T--A-AA--A-T-TTC-TT-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108204 : CCCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTG-TC-G--GC-T-T-CC-AG-G------GGCTT--TGCCCC
gi|108205 : CCCCA----G-A---C-CCCTAA-CG--AAA---T--GA--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108206 : CCCTA----G-A---C-TC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--G-AA--A-C-CTC-TC-A--GT-T-T-CC-GG-G------GATTT--CGCCCC
gi|108208 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-TG---AA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-CT-A--GC-T-TCCC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108209 : CCCCA----G-A---C-GCC-AA-TG--AAA---T--GC--T--A-AA--T-C-CAC-TC-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108210 : CCCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--G-AA------CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CAC
gi|108211 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA---T--GC--T--A-AA--A-T-GTC-TT-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108212 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-GC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108213 : ccccatttaaCCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAG-A-T--GC--T--A-AA--T-T-TTC-TCAA--GC-T-T-CC-GG-G------G--CT--CGCCCC
gi|108214 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-T---AAA-A-T--GC--T--A-AA--T-T-TTC-TC-A--GC-T-T--C-GG-G------GGCTT--CCCCC
gi|108215 : CCCCA----A-A---C-CC--AA-TG--AAAGA-T--GC--T--A-AA--T-T-CTC-CA-A--GC-T-T-CC-GG-G------AGCTT--CGC
gi|108216 : CCCCA----G-A---CCGC--AA-TG--GAA-A-T--GC--T--A-AA--T-T-TCC-TT-AG-GC-T-T-CC-GG-G------GGTTT--CGCCCC
gi|108217 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-TA--AAA-A-TAAAC-----A-AA--A-TACTC-TC-A--GC-T-T--C-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108218 : CCCAA----G-A---T-CC--AA-AG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--AC-T-T-CTAGG-G------GGCTT--CGCCC
gi|108219 : CCCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA---T--GC--T--A-AAC-A-T-TTT-T--A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108220 : CCCCA----G-AGACC-G---AA-TG--AAA---T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GC-T-T-TC-TG-G------GGCTT--CG
gi|108222 : CCCTA------A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--G-AA--A-T-ATC-TC-A--GT-T-T-CC-GG-G------GGTTT--TGCTCC
gi|108223 : CCCCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-C--GC--T--A-AA--T-T-TCT-TC-A--GC-TGT-CC-AA-G------GGCTT--CGCTCC
gi|108229 : CCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T---T--T--A-AA--A-T-TTC-TC-G--GC-T-T-CC----G------GGCTT--CGCCCC
gi|108230 : CCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GC-T-T--C-AG-G------GGCTT--CGCCC
gi|108232 : CCCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AAG-A-T-TTC-TT-A--GC-T-T-CC--G-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108234 : CCCC----G-A---C-CC--AA-TG--AAA---C--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--AC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCTCC
gi|108239 : CCA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-TTTGC--T--A-AA--AAT-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTTC-CGCCCC
gi|108241 : CCA----G-A---C-AT--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-TA--A-C-ATC-TC-A--GC-T-T-CT-GG-G------GCCTT--CGCCCC
gi|108243 : CCA----G-A---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GT--T--A-AA--A-C-CTC-TT-A--GT-T-T-CC-GG-G------GGTTT--TACCCC
gi|108244 : CCA----G-A---C-AC--CA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA-------TC-CC-A--GC-T-T-CC-AG-A------GGCTT--TGCCCC
gi|108245 : CCC----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T---C--T--A-AA--A-T-TTC-TC-A--GCTT-T-CC-GT-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108249 : CA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--TC--T--A-AA--T-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-CG-G------GGCTT--CACCCC
gi|108250 : A----G-G---C-CC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC---T-CT-GG-G------GGCTT--
gi|108251 : cagacaCA----G-A---C-CC--A--TG--AAA-A-T--GC--TGAA-AA--A-T-CTC-TC-A--GT-T-T-CC-GG-GA-----AGCTT--CGCCCC
gi|108253 : CA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GCC-T--A-TATTA-T-TTCCTC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTTTCCGCCCC
gi|108254 : CA----G-A---C-GC--AA-TG--AAA-A-T--GCC-T--A-TATTA-T-TTCCTC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTTTCCGCCCC
gi|108256 : A----G-A---C-CC--TA-TG--AAA-A-T--GC--TT-A-AA--A-T-TTA-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GAATT--CGCCCC
gi|108257 : ----G-A---C-TT--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--G-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGATT--TGTCCC
gi|108258 : -A---C-GC--AA-TT--GAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCTCC
gi|108260 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--T--C-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-TC-GG-G------GGCTT--TACCCC
gi|108264 : catC--AA-TA--AAA-AAT--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108265 : aC--AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TA-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGC
gi|108268 : --AA-TG--AAA-A-A--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108269 : --AA-TG--AAA-A-T--GT--C--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108270 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--AC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108272 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-ATC-TC-A--GT-T-T-CC-AG-G------GGCTT--TGTCCC
gi|108274 : --AA-TG--AAA-A-T--G---T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GGCTT--CACCCC
gi|108275 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-C-T-CC-GG-G------GACTT--CACC
gi|108276 : --AA-CG--AAA-A-T--AC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-G------GACTT--CACCCC
gi|108277 : --AA-TG--AAA-A-T--GT--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-G-CC-GG-G------GTCTT--CGCCCC
gi|108278 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--C--A-AA----C-CTC-TC-A--AC-T-T-CC-GG-G------GGTTT--CGCCCC
gi|108279 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-CC-A--GT-T-T-CC-GG-GGGCGGTGGCTT--CGCCCC
gi|108280 : --AA-TG--AAA-A-T--GC--T--A-TA--A-C-CTC-TC-A--GG-T-T-CC-GG-G------GGC-T--CGCCCC
gi|108293 : -TG--AAG-A-T--AC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-AG-G------GGCTT--CGCCCC
gi|108295 : -TG--AAG-A-T--AC--T--A-AA--A-T-CTC-TC-A--GC-T-T-CT-GG-G------GGCTT--TGCCCC
gi|108298 : -TG--AAA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTT-TC-A--GC-T-T-CC-GA-G------GACTT--CGCCCC
gi|108301 : AA-A-T--GC--T--A-AA--A-C-CTC-TC-A--GC-T-T-CC-GG-A------GGCTC--CGCCCC