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Reference ( gi|110959 )       :             GGGT-CCA-G-G-G-------C------GAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGGG-TG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---C--------A-----G--AG---T-----TTT--AA-A-G--A-TT---TT-G-T-A--GG-G----C---T--TG--A--A--AT-TTGT-C--TC---C-GA--AG-TA-GT---CATT-----T-T-C---ACTA----T---T---TTTCTG--TC--ATTT
gi|110958                     :             GGGT-CCA-G-G-G-------C------GAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG---CC-CA-GGGGG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---C--------A-----G--CG---T-----TTT--AG-A-G--A-TT---TT-G-T-A--GG-G----C---T--TG--A--A--AT-TTGT-C--TC---C-GA--AG-TA-GT---CATT-----T-T-C---ACTA----T---A---TTTCTG--TC--ATTT
gi|110960                     :             GGGT-CCG-G-G-G-------C------GAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG---CC-CA-GGGG--CG-A-AG----C-CC-C---G-G-AAGC-T-----------C---C--------A-----G--AG---T-----TTT--AG-A-G--A-TT---TT-----A--GG-G----C---T--TG--A--A--AT-TTGT-C-------C-GA--AG-TA-GT---AATT-----T-T-C---ACTA----T---A---TTTCTG--TC--ATTT
gi|110962                     :             GGGT-CCA-G-G-G-------C------GAAG--C--C---T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-TGGGG-CG-A-AG----C-CC-C-----G-GAGC-T-----------C---C--------A-----G--AG---T-----TTTTTAG-A-G---------CT-G-T-A--GG-G----C---T--TG--A--A--AT-TTGT-C--TC---C-GA--AG-TA-GT---CATT-----T-T-C---ACTA----T---A---TTTC-G--TC--ATTT
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gi|110987                     :             GGGT-CCA-G-G-G-------C------GATG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-TA-GGGGG-CA-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---C--------T-----G--GG---T-----TTT--Aacccaagtttggagattttgtagggctgaaataatgtctccgcaatcgtcattttcactatcatttctgtcattt
gi|110982                     :             GGGT-CCA-G-G-A-------C------AAAG--C--TC--T----G----------G--T-G-----G--GG--G------------TG-C-AG----C-CC-C--CA-G-AAGC-T---------------C--------ATT---G--A----T-----TTT--AC-T-G--A-TT---TC-A-T-A--CG-G----C---T--TG--A--T--GT-ATGT-C--TCGGGC-CA--TG-TA-GT---AATT-----T-T-A---AAAA----A---T---ATTTTG--TC--ATTT
gi|110979                     :             GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--C--CC--T----G----------T--T-A-----G--GG--GCC-AA-GGGGG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------G---G--------T-----G--CA---T-----TTT--AG-A-C--A-AT---TA-A-G-A--GA-GGTATT---T--TC--A--A--A----GT-C--TC---T-GA-----TA-CA---CATT-----T-T-C---TTTA----A---T---TTT
gi|110994                     :             GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--T--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGGG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------G---G--------C-----G--AG---T-----TTT--
gi|110986                     :             GGGT-TCA-G-T-G-------C------AACA--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG--CA-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---C--------T-----G--AA---T-----TTT--AC-T-G--A-TT---TT---T-G--GA-G-----------TA--A--A--AT-TT
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gi|110981                     :             GGGT-C-A-G-G-G-------C-------AAG--G--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGGG-CG-A-AG----C-CCAC--CG-G-AAGC-T-----------C---C--------T-----G--AA---T-----TTT--AG-CTG--A-TT---TT-
gi|110983                     :             GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAGG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-AA-GAGGG-CG-A---------CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---C--------T-----G--AA---T-----TTT--AG-T-G--A-TT---T
gi|110988                     :             GGGT-C-A-G-G-G-------C------AAGG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA--GGGG-CG---AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---C--------T-----GT-AA---T-----TTT--AG-GTG--A-TT---T----T-A--GG-A----A---G--TA--A--A--AT-TT
gi|110980                     :             GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAGG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--TTC-CA--GGGG-CG-A-AG----C-CC-C--C--G-AAGC-T-----------C---C--------T-----G--AA---T-----TTT--TA-G-T--G-TT---T----T-A--GGAG-----------TA--A--A--AT-T
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gi|110997                     :             GGGT-CCA-G-G-A-------C------AAAA--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-TT-GGGGG-CG-A-A----------------G-GAGC-T-----------C---T--------G-----G--AA---T-----TTT--AC-A-G--ATTT---TT-A-T-A--GG-G----C---T--TG--A--
gi|111009                     :             GGGT-CTG-G-G-A-------A------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-A-----G--GG--GCT-CA-GGCGG-TG-A-AA----C-CC-C--CG-G-AAGC-A-----------C---C--------T-----G--AGGGCT-----TTT--AA-A-G--C-TA---TT-T-T-A--GG-G----G---T--TATCA--A--AT-T
gi|110999                     :             GGGT-C-A-G-G-G-------C------AACA--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGTG-CG-A-AA----C-CC-C--CG-G-AAGT-T-----------C---A--------G-----G--AA---T-----TTT--TG-T-G--A-TT---T----T-A--GGAG----C-------A--A--A--AT-TT
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gi|111007                     :             GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGGG-CA-A-AG----T-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------
gi|111125                     :             GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAGG--C--C-------------------G--T-G-----G--GG-------A-GCGGG-T---------------C--TG-G-GA------------------------------------------T-----TTC--AC-A-G--A-TT---TT-A-T-A--GG-G----C---T--TG--A--A--AT-ATGT-C--TC---CTTA--TG-TC-GT---CATT-----T-T-TTAAAATA--------T---TTTCGG--TC--ATTT
gi|110998                     : gaggctcccagtGGGT-CTG-G-G-G-------A------AAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGGG-CG-A-AT----C-CC-T--CG-G-AACC-T-----------GGTAC--------A-------------T-----TTT--AG-ACA--A-TT---AA-G-A-G--GG-G----CATTT--TC--A--A--A----GT-A--TC---T-GA-----TA-CA---CATT-----T-T-C---TTTA----A---T---TTT
gi|111006                     :             GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--C--TT--T----ATATATAAATAG--T-G-----G--GG--ACC-CA-GGGAGCTATA-AA----C-CC-C--CG-G-GATC-T-----------C---C--------T-----G--GA---T-----TTA--AC-A-G--A-TT---TT-A-T-A--GG-G----C---G--TAT-A--G--AT-TAGG-C--C-------A--TG-TA-AT---CATT-----T-T-
gi|111010                     :             GGAT-CCA-G-G-A-------T------GG-G--C--CC--T----G----------G--T-T-----G--GG--GTC-CA-GGGGG-TG-A-AG----C-CC-C--GG-G-AAGC-T---------------G--------A-----G--AG---GA----TTT--AG-A----A-TT---TT-
gi|111003                     :             GGGT-CCA-GCG-G-------C------AGCG--C--CC--T----G----------A--T-G-----G--AG--GTC-CA-GGGGA-CG-A-AGAAACC-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---C--------C-----G--AT---T-----ATC--AG-T-G--A-TT---TT---T-G--GA-G-----------TA--A--G--AT-TT
gi|111008                     :             GGGC-CCA-G-G-A-------C------GG-G--C--CT--T----G----------G--T-A-----GA-GG--GTC-CA-GGGGG-CG-A-AG----T-CC-C--CG-G-AAGC-T------------------------------G--AG---G-----TTT--TG-G-C--A-TT---TTCA-T------------T---T--TG--A--A--AT-T
gi|111004                     :             GGGT-CCA-G-G-A-------C------AGAT--CATCT--T----G----------G--TAG-----G--GG--GTC-CA-AGGGG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-A-AAGC-T---------------G--------A-----G--AG---G-----TTT--GG-C-A--G-TT---TC-A-T------------T---T--TG--A--A--AT-
gi|111002                     :             GGGT-CCA-GAG-G-------C------AATG--C--C---T----G----------G--T-G-----G--GG---TT-CA-GGGG--CG-A-AG----TTCC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---A--------T-----G--AA---T-----ATT--AG-T-G--A-TT---TT---T-G--GA-G-----------TA--A--A--AT-TACC-C--TC---A-AA--GG-TA-
gi|111005                     :             GGGT-CCA-G-GCG-------C------G-----C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG---TC-CA-TTGG--CG-A-AG----C-CC-C--CC-G-AAGT-TC----------C---C--------A-----G--A----------TTC--AG-T-G--G-TT---TT-G-G-A--G-----------T--T---A--A--AT-TT
gi|111031                     :              GGT-CCA-G-G-G-------C------AACG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG----------------------------------CT-G-AAGC-T-----------C---C--------A-----G--AG---T-----TTA--AAGA-G--A-TT---TT-GTT-A--GG-G----C---TTATG--A--A--AT-TTGT-CT-TC---C-GA--AG-TA-------ATT-----T-T-C---ACTA----T---A---TTTCTA--TC--ATTT
gi|111032                     :              GGT-CCA-G-G-A-------C------AAAA--C--CA--T----T----------A--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGTAA-CA-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---C--------G-----G--TA---T-----TTT--AC-A-G--A------TT-A-T-A--GA-A----A---T--TG--A--A--GT-ATGT-C--TC---C-CG--TG-TA-GT---CATT-----T-T-T---GATA----C---T---TTTTTG--TCTAATTT
gi|111035                     :              GGT-CCA-G-G-G-------C------AACA--C--CT--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGAGG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---C--------C-----G--AA---T-----TTC--AG-T-G--A-TT---TT-T-T-G--AG-------------TA--A--A--AT-TT
gi|111047                     :              GAT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGGA-CG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---T--------C-----G--GG---T-----TTT--AA-A-G--T-TT---TT-
gi|111042                     :              GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGGG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---T--------C-----G--GG---T-----TTT--AT-A-G--C-TT---CT-
gi|111037                     :              GGT-CTA-G-A-A-------T------GAA---C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGGG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---T--------A-----G--GG---------TTT--AA-G-G--G-CT---TT-
gi|111039                     :              GGT-CTG-G-G-G-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--A-G-----G--GG--GCC-CA-GGGGG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGG-T-----------T---T--------C-----G--AG---T-----TTT--AG-A-G--C-TT---TT-t
gi|111040                     :              GGT-CTA-G-A-A-------T------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGGG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGT-T-----------C---T--------T-----G--GG---------TTT--AA-G-G--G-CT---TT-
gi|111041                     :              GGT-CTG-G-A-G-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--C-G-----G--GG--GCC-CA-GGGGG-CG-A-AG----C-CG-C--CG-G-AAGC-T-----------C---T--------C-----G--GG---T-----TTT--AG-A-G--C-TT---TT-A-A-A--GG-t
gi|111046                     :              GGT-ATG-G-G-G-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--C-G-----G--GG--GCA-CA-GGGGG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---T--------C-----G--GG---T-----TTT--AG-A-G--C-TT---TT-
gi|111052                     :              GGT-CTA-G-A-A-------T------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GA--GCC-CA-GGGGG-CA-A-AG----C-CC-C--TG-G-AAGC-T-----------C---TTGGGTTGAA-----G--GGC--T-----TTT--AA-A-GTTA-TT---TT---T-A--GG-G----G---T--T
gi|111048                     :              GGT-CTG-G-G-T-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--C-G-----G--GG--GCC-CA-GGGGG-CG-A-GG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---T--------C-----G--GG---T-----TTT--GG-A-G--C-TT---TT-
gi|111033                     :              GGT-CCA-G-G-G-------C------AGCG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTT-CA--GGGG-CG-A-AG----C-CC-C--CT-G-AAGT-T-----------C---C--------C-----G--AA---------TTC--AG-T-G--T-TT---TT-G-G-A--G-----------T--T---A--A--AT-TT
gi|111049                     :              GGTACTA-A-G-G-------C------AAAG--C--CA--T----G----------T--T-G-----G--AG--GTC-CA-GGGGG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-A-AAGC-T-----------C---C--------T-----GGAAG---T-----TTT--AC-A-A--A-TT---T
gi|111051                     :              GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--C-G-----G--GG--GCC-CA-GGGGG-CG-A-AG------CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---T--------C-----G--GG---T-----TTT--GG-A-G--C-TT---TT-
gi|111055                     :              GGT-CTG-G-A-A-------T------GAAC--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GG--CCC-CA-GGGGG-TG-A-AG----C-AC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---C--------T-----G--GA---T-----TT----A-A-G--A-GC---TT---T-A--GG-GAT--C---T------------AT-TTAT-C--T
gi|111057                     :              GGT-CTA-G-C-A-------T------AAAG--C--CA--A----A----------G--T-T-----G--GG--GCC-CA-GGGGG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---T--------C-----G--GG---------TTT--AA-A-G--C-TT---TT-
gi|111044                     :              GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG----C-CA-GGGAG-CG-A-AA----C-CC-C--CG-A-AAGC-T-----------C---T--------C-----G--AG---T-----TTT--AG-A-G--C-TT---TT-
gi|111045                     :              GGT-CTA-G-A-A-------T------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GG----C-CA-GGGGG-CG-A-AG----C-CC-C--TG-G-AAGC-T-----------C---T--------T-----G--GG---------TTT--AA-G-G--G-CT---TT-
gi|111050                     :              GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--TG--GCC-CA-GGGGG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAAC-T-----------C---T--------C-----G--GG---T-----TTT--AG-A-t
gi|111043                     :              GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG---CC-CA-GGAGG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-G-TAGC-T-----------A---T--------C-----G--GG---T-----TTT--AG-A-G--C-TT---TT-
gi|111087                     :               GT-CCA-G-G-G-------C-------AAG--G--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGGG-CG-A-AG----C-CC-C--C--G-AAGC-T-----------C---C--------T-----G--AA---T-----TTT--AG-T-G--A-TT---T----T-A--GGAG-----------TA--A--A--AT-TT
gi|111090                     :               GT-CCA-GAG-G-------C------AACG--CG-CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGGGGCG-A-AG----C-CC-C--CG-G--AGC-T-----------CA--C--------C-----G--AG---T-----TTC--AG-T-G--A-TT---TT---T-G--GA-G--------T--AA--A--A--AT-TT
gi|111091                     :               GT-CGA-G-A-A-------T------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--AG--GCC-CA-GGGGG-CG-A-AG----T-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---T--------T-----G--AG---------TTT--AA-G-G--G-CT---TT-
gi|111089                     :               GT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--C--CC--T----G----------G--T-A-----G--AG--GCC-CA-GGGAG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------
gi|111092                     :               GT-CTG-G-G-G-------T------CAAG--C--CCA-T----G----------A----G-----G--GG--GAC-CA-GGGGG-CG-A-AG----T-CC-C--CG-G-AAGT-T-----------T---C--------T-----G--GG---T-----TTT---A-G-G--G-CT---TT-G-T-A--AG-ggtgcatttaagacaattaagagaggtattttcaaagtctccgatacacattttc
gi|111093                     :               GT-TTA-T-G-A-------C------AAAG--C--TC--TTGAAA----------G--T-G-----G--GG---CC-AA-GGGGG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---T--------A-----G--GG---T-----TTT--GC-G-G--A-GT---TT-
gi|111094                     :               GT-CTA-G-G-GA------T------GAAG--T--CA-------A----------A--T-T-----G--GG--GTC-CA-GGGG--CG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---T--------C-----G--GG---T-----TTT--AG-T-G--C-TT---TT-taatag
gi|111104                     :                T-TCA-GAG-G-------C------AGGG--G--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-AG-GGGGG-CG-A-AG----C-CC-C---G-G-AAGC-T-----------C---C--------T-----G--AA---T-----TTT--AG-T-G--A-TT---T----T-A--GGAG-----------TA--A--A--AT-TTAT-
gi|111105                     :                T-CTG-G-G-A-------T------AAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG---CC-CA-GGGG--TG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---T--------C-----G--GG---T-----TTT--AG-A-G--C-TT---TT-
gi|111106                     :                T-CCA-G-G-G-------C------AACG--C--CT--C----T----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGGG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---C--------
gi|111111                     :                 -CCA-G-G-G-------C------GAAG--C--CCC-T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGGG-TGAA-AG----C-CC-CCGCG-A-AAGC-T-----------C---C--------C-----G--AG---T-----TTT--AA-A-G--ATTT---TT-G-TCA--GG-G----C---T--TG--AATA--AT-TTGT-C--CC---CTGA--AG-TATGT---CA-T-----T-T-C---AC-A----A---T---TTTCTG--TC--ATTttgaatattcgtgattttttggag
gi|111112                     :                 -CCA-G-G---------C------GAAG--C--CC--T----G----------GACT-G-----G--GGGGGCC-CA--GGGG-CG-AGAT----T-CC-C--CGAA-AAGC-T-----------C---C--------A-----G--AG---T-----TTT--AG-A-G--A--T---CT-G-T-A--GG-G----C---T--TG--A--A--AT-TGGT-C--TC---C-GA--GG-GA-GTGAGTATT-----TGT-C---ACTA----TA--A---TTTCTGTTTC--ATTT
gi|111113                     :                 -CCA-G-A-G----------------AG--C--T---T----G----------G--T-T-----G--GG--GTC-CA-GGAGG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-G-A-------------------------------------------T-----TTT--AC-A-G--A-TT---TT-A-T-G--TC-G----C---T--TG--A--A--G----AT-C--TC---T-GT--AG-TA-AT---CTTTAA---T-G-C---A-----------T---TTTCT---TC--ATTT
gi|111114                     :                   CA-G-G-GGTC----T------GAGG--C--TC--T------------------C-A-----G--GG--GCCTCA-GA----T--A-AG----C-AA-T--CG-G-AAGC-T-----------C---C--------T-----G--GA---T-----TTT--AG-A-G--A-TTCTATT-C-T-ATTGG-G----C---T--AG--A--A--GT-ATGT-C--TC---C-CA--TG-AA-GT---CATT-----T-T-----AATA----TCG-T---TTTCTG--TT--ATTT
gi|111118                     :                     -G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGGG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---T--------C-----G--GG---T-----TTT--AG-A-G--C-TT---TT-
gi|111119                     :                     -G-G-G-------T------GAAG--C--GA--A----A----------G--T-G-----G--GG---CC-CA-GGGGG-TG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---T--------T-----G--GG---T-----TTT--AG-A-G--C-TT---T
gi|111171                     :                       -G-G-------C------GAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--CTC-CA-G
gi|111124                     :                                   ------GAGG--C--CCCGT----G----------G--T-TTCCTTG--GG--GTC-CA-GGGGG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---T--------A-----GA-AG---T-----TTT--AG-A-G--A-TT---TT---T-A--GGCG----C---T--TG--A--A--AA-TTGG-CA-TA---C-GA--A--TA-GTA--CATT-----T-T-C---AC-A----T---A---TTTCTG--TC--ATTTagttttagagatattgtagggctt
gi|111136                     :                                            G--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC--A-TGGGG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-A-AAGC-T-----------C---C--------A-----G--AG---T-----TTT--AG-A-G--A-TT---TT-A-T-A--GG-G----T---T--TG--A--A--AT-TTGT-C--TC---C-GA--AG-TA-GT---CATT-----T-T-C---ACTA----T---G---TTTCTG--TC--ATTT
gi|111012                     :                                            G--C--CC--A----G----------G--G-G-----GCGGG--GCC-C--GGGGG-CG-A-AG----C-CC-C---G-G-AAGC-T-----------C---T--------C-----G--GG---T-----TTA--AG-A-G--C-TT---TT-A---A--CA-G----T---T------A--A--AT-TT-----------C-GA--GG-T--GT---TAAT-----T-T-A---GCTA----T---A---TATCTA--T
gi|111011                     :                                          ggG--C--CC--A----G----------G--G-G-----GCGGG--GCC-C--GGGGG-CG-A-AG----C-CC-C---G-G-AAGC-T-----------C---T--------C-----G--GG---T-----TTA--AG-A-G--C-TT---TT-A---A--CA-G----T---T------A--A--AT-TT-----------C-GA--GG-T--GT---TAAT-----T-T-A---GCTA----T---A---TATCTA--T
gi|111146                     :                                                     gg----G----------G--T-G-----G--GG---TC-CA-GGGGG-CA-A-A-------CC-C--CT-A-AA------------------------------------------T-----TTT--AC-A-C--G-TT---TT-A-T-A--GG-G----C---T--TG--A--A--GT-ATGT-C--TC---C-CA--TGTTA-GT---CATTATTTAT-T-C---ATTA----T---C---T
gi|111157                     :                                                                            -----G--GG--GCC-TA-GGGGG-TG-A-AT----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---T--------C-----C--AG---T-----TTT--AG-A-G--C-TT---TT-G----------------------------A--AT-TTAC-C--TT---T-----AG-GA-GT---TAAT-----T-T-T---GCTA----T---
gi|111158                     :                                                                            -----G--GG--GCC-TA-GGGGG-CG-A-AT----C-CC-T--CG-G-AAGC-T-----------C---T--------C-----G--AG---T-----TTT--AG-A-G--C-TT---TT---------------------------A--A--AT-TTAC-T--TT---T-----AG-GA-GT---TAAT-----T-T-T---GCTA----T---A---TATCTA--T
gi|111159                     :                                                                            -----G--GG--GCC-CA-GGGGG-CG-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------A---T--------ATC---G--GG---T-----TTT--AG-A-G--C-TT---TT-
gi|111120                     :                                                                            -----G--GG--GCC-CA-GGGG--CA-A-AG----C-CC-C--CG-G-AAGC-T-----------C---T--------T-----G--GG---T-----TTT--AG-A-G--C-TT---TT-
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Reference ( family-161 )      :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------GAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C--C-NG--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--A--TT---TT-GT-A--GG-G----C---TT--G--A--A--AT-TTGT-C--T-C---C-GA--AG-TA-GT---CATT-----T-T-C---ACTA----T---T---TTTCTG--TC--ATTT
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gi|110983                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAGG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-AA-GAGG-GCG-A----------CC-C--CG-G-AAGC---T---C--C-TG--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--A--TT---T
gi|110985                     :  GGGT-CCA-G-G-C-------C------AAGG--C--CCC-T----G----------G--T-G-----G--GG---TC-CA-GGGG-GCG-A--AG------CC-C--CG-G-AAGC---T------C-TG--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--A--GT---TT--T-A--GG-A----A----T--A--A--A--AT-T
gi|110986                     :  GGGT-TCA-G-T-G-------C------AACA--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG--CA-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C--C-TG--A---A---------T-----TTT--A-C-T-G--A--TT---TT--T-G--GA-G---------T--A--A--A--AT-TT
gi|110987                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------GATG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-TA-GGGG-GCA-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C--C-TG--G---G---------T-----TTT--A-
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gi|110990                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAGG--C--CC--T----G----------T--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCACA--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T------C-TG--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--T--TT---TA-GG-A--G------------T--A--A--A--AT-TT
gi|110992                     :  GAGT-CCA-G-G-G-------G------CAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG---TC-CA-GGGG-GCG-A--AG------CC-C--CG-G-AAGCT--T---C--C-TG--A---A---------T-----TTT--A-T-T-G--A--TT---T
gi|110993                     :  GAGT-CCA-G-G-G-------G------CAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG---TC-CA-GGGG-GCG-A--AG------CC-C--CG-G-AAGCT--T---C--C-TG--A---A---------T-----TTT--A-T-T-G--A--TT---T
gi|110994                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--T--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---G--G-CG--A---G---------T-----TTT--
gi|110997                     :  GGGT-CCA-G-G-A-------C------AAAA--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-TT-GGGG-GCG-A--A----------------G-GAGC---T---C--T-GG--A---A---------T-----TTT--A-C-A-G--AT-TT---TT-AT-A--GG-G----C---TT--G--A--
gi|110998                     :  GGGT-CTG-G-G-G-------A------AAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AT----C-CC-T--CG-G-AA---------C--C-TG--GTACA---------T-----TTT--A-G-ACA--A--TT---AA-GA-G--GG-G----CATTTT--C--A--A--A----GT-A--T-C---T-GA-----TA-CA---CATT-----T-T-C---TTTA----A---T---TTT
gi|110999                     :  GGGT-C-A-G-G-G-------C------AACA--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGT-GCG-A--AA----C-CC-C--CG-G-AAGT---T---C--A-GG--A---A---------T-----TTT--T-G-T-G--A--TT---T---T-A--GGAG----C-------A--A--A--AT-TT
gi|111000                     :  GGAT-CCA-G-G-GG------C------AAGG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CC-GGGG-GCT-A--AG----C-CC-C--C--G-AAGC---T------C-TG--A---A---------T-----TTTA-A-G-T-G--A--TT---TT--T-A--GGAG---------T--A--A--A--AT-T
gi|111001                     :  GGGT-CCATG-G-G-------C------AAGG--C--CCC-T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-CGG-A--AG----C-CC-C--CG-C-GAGC---T---C--C-TG--A---AAT-------T-----TTT--A-G-T-G--A--TT---TT-
gi|111002                     :  GGGT-CCA-GAG-G-------C------AATG--C--C---T----G----------G--T-G-----G--GG---TT-CA-GGGG--CG-A--AG----TTCC-C--CG-G-AAGC---T---C--A-TG--A---A---------T-----ATT--A-G-T-G--A--TT---TT--T-G--GA-G---------T--A--A--A--AT-TACC-C--T-C---A-AA--GG-TA-
gi|111003                     :  GGGT-CCA-GCG-G-------C------AGCG--C--CC--T----G----------A--T-G-----G--AG--GTC-CA-GGGG-ACG-A--AGAAACC-CC-C--CG-G-AAGC---T---C--C-CG--A---T---------T-----ATC--A-G-T-G--A--TT---TT--T-G--GA-G---------T--A--A--G--AT-TT
gi|111004                     :  GGGT-CCA-G-G-A-------C------AGAT--CATCT--T----G----------G--TAG-----G--GG--GTC-CA-AGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-A-AAGC---T------G-AG--A---G---------G-----TTT--G-G-C-A--G--TT---TC-AT------------T---TT--G--A--A--AT-
gi|111005                     :  GGGT-CCA-G-GCG-------C------G-----C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG---TC-CA-TTGG--CG-A--AG----C-CC-C--CC-G-AAGT---T---C--C-C---A---G---------A-----TTC--A-G-T-G--G--TT---TT-GG-A--G-----------TT-----A--A--AT-TT
gi|111006                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--C--TT--T----ATATATAAATAG--T-G-----G--GG--ACC-CA-GGGA-GCT-ATAAA----C-CC-C--CG-G-GATC---T---C--C-TG--G---A---------T-----TTA--A-C-A-G--A--TT---TT-AT-A--GG-G----C---GT--AT-A--G--AT-TAGG-C--C--------A--TG-TA-AT---CATT-----T-T-
gi|111007                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCA-A--AG----T-CC-C--CG-G-AAGC---T---
gi|111008                     :  GGGC-CCA-G-G-A-------C------GG-G--C--CT--T----G----------G--T-A-----GA-GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----T-CC-C--CG-G-AAGC---T---------G--A---G---------G-----TTT--T-G-G-C--A--TT---TTCAT------------T---TT--G--A--A--AT-T
gi|111009                     :  GGGT-CTG-G-G-A-------A------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-A-----G--GG--GCT-CA-GGCG-GTG-A--AA----C-CC-C--CG-G-AAGC---A---C--C-TG--A---GGGC------T-----TTT--A-A-A-G--C--TA---TT-TT-A--GG-G----G---TT--ATCA--A--AT-T
gi|111010                     :  GGAT-CCA-G-G-A-------T------GG-G--C--CC--T----G----------G--T-T-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GTG-A--AG----C-CC-C--GG-G-AAGC---T---G--A-GA--G---G---------A-----TTT--A-G-A----A--TT---TT-
gi|111011                     :                                 G--C--CC--A----G----------G--G-G-----GCGGG--GCC-C--GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C---G-G-AAGC---T---C--T-CG--G---G---------T-----TTA--A-G-A-G--C--TT---TT-A--A--CA-G----T---T------A--A--AT-TT------------C-GA--GG-T--GT---TAAT-----T-T-A---GCTA----T---A---TATCTA--T
gi|111012                     :                               ggG--C--CC--A----G----------G--G-G-----GCGGG--GCC-C--GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C---G-G-AAGC---T---C--T-CG--G---G---------T-----TTA--A-G-A-G--C--TT---TT-A--A--CA-G----T---T------A--A--AT-TT------------C-GA--GG-T--GT---TAAT-----T-T-A---GCTA----T---A---TATCTA--T
gi|111031                     : ggGGT-CCA-G-G-G-------C------AACG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG-----------------------------------CT-G-AAGC---T---C--C-AG--A---G---------T-----TTA--AAG-A-G--A--TT---TT-GTTA--GG-G----C---TTATG--A--A--AT-TTGT-C--TTC---C-GA--AG-TA-------ATT-----T-T-C---ACTA----T---A---TTTCTA--TC--ATTT
gi|111032                     :   GGT-CCA-G-G-A-------C------AAAA--C--CA--T----T----------A--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGTA-ACA-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C--C-GG--T---A---------T-----TTT--A-C-A-G--A-------TT-AT-A--GA-A----A---TT--G--A--A--GT-ATGT-C--T-C---C-CG--TG-TA-GT---CATT-----T-T-T---GATA----C---T---TTTTTG--TCTAATTT
gi|111033                     :   GGT-CCA-G-G-G-------C------AGCG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTT-CA--GGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CT-G-AAGT---T---C--C-CG--A---A---------------TTC--A-G-T-G--T--TT---TT-GG-A--G-----------TT-----A--A--AT-TT
gi|111035                     :   GGT-CCA-G-G-G-------C------AACA--C--CT--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGAG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C--C-CG--A---A---------T-----TTC--A-G-T-G--A--TT---TT-TT-G--AG-----------T--A--A--A--AT-TT
gi|111037                     :   GGT-CTA-G-A-A-------T------GAA---C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C--T-AG--G---G---------T-----TTA--A-G-G-G--C--TT---TT-
gi|111039                     :   GGT-CTG-G-G-G-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--A-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGG---T---T--T-CG--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111040                     :   GGT-CTA-G-A-A-------T------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGT---T---C--T-TG--G---G---------T-----TTA--A-G-G-G--C--TT---TT-
gi|111041                     :   GGT-CTG-G-A-G-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--C-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CG-C--CG-G-AAGC---T---C--T-CG--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-AA-A--GG-
gi|111042                     :   GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C--T-CG--G---G---------T-----TTT--A-T-A-G--C--TT---CT-
gi|111043                     :   GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG---CC-CA-GGAG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-TAGC---T---A--T-CG--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111044                     :   GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG----C-CA-GGGA-GCG-A--AA----C-CC-C--CG-A-AAGC---T---C--T-CG--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111045                     :   GGT-CTA-G-A-A-------T------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GG----C-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--TG-G-AAGC---T---C--T-TG--G---G---------T-----TTA--A-G-G-G--C--TT---TT-
gi|111046                     :   GGT-ATG-G-G-G-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--C-G-----G--GG--GCA-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C--T-CG--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111047                     :   GAT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-ACG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C--T-CG--G---G---------T-----TTT--A-A-A-G--T--TT---TT-
gi|111048                     :   GGT-CTG-G-G-T-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--C-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--GG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C--T-CG--G---G---------T-----TTT--G-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111049                     :   GGTACTA-A-G-G-------C------AAAG--C--CA--T----G----------T--T-G-----G--AG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-A-AAGC---T---C--C-TGGAA---G---------T-----TTT--A-C-A-A--A--TT---T
gi|111050                     :   GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--TG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAAC---T---C--T-CG--G---G---------T-----TTT--A-G-A-
gi|111051                     :   GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--C-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG------CC-C--CG-G-AAGC---T---C--T-CG--G---G---------T-----TTT--G-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111052                     :   GGT-CTA-G-A-A-------T------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GA--GCC-CA-GGGG-GCA-A--AG----C-CC-C--TG-G-AAGC---T---C--T-TG--G---GTTGAAGGGCT-----TTT--A-A-A-GTTA--TT---TT--T-A--GG-G----G---TT--
gi|111055                     :   GGT-CTG-G-A-A-------T------GAAC--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GG--CCC-CA-GGGG-GTG-A--AG----C-AC-C--CG-G-AAGC---T---C--C-TG--G---A---------T-----TTA--A-G-A-G--C--TT-------T-A--GG-GAT--C---T------------AT-TTAT-C--T-
gi|111057                     :   GGT-CTA-G-C-A-------T------AAAG--C--CA--A----A----------G--T-T-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C--T-CG--G---G---------------TTT--A-A-A-G--C--TT---TT-
gi|111087                     :    GT-CCA-G-G-G-------C-------AAG--G--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--C--G-AAGC---T---C--C-TG--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--A--TT---T---T-A--GGAG---------T--A--A--A--AT-TT
gi|111089                     :    GT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--C--CC--T----G----------G--T-A-----G--AG--GCC-CA-GGGA-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---G--G-TG--C---A---------T-----TTA--A-G-A-C--A--AT---TA-AG-A--GA-GGTATT---TT--C--A--A--A----GT-C--T-C---C-GA-----TA-CA---CATT-----T-T-C---
gi|111090                     :    GT-CCA-GAG-G-------C------AACG--CG-CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGGGGCG-A--AG----C-CC-C--CG-G--AGC---T---CA-C-CG--A---G---------T-----TTC--A-G-T-G--A--TT---TT--T-G--GA-G--------TA--A--A--A--AT-TT
gi|111091                     :    GT-CGA-G-A-A-------T------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--AG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----T-CC-C--CG-G-AAGC---T---C--T-TG--A---G---------T-----TTA--A-G-G-G--C--TT---T
gi|111092                     :    GT-CTG-G-G-G-------T------CAAG--C--CCA-T----G----------A----G-----G--GG--GAC-CA-GGGG-GCG-A--AG----T-CC-C--CG-G-AAGT---T---T--C-TG--G---G---------T-----TTT--A-G---G--G--CT---TT-GT-A--AG-
gi|111093                     :    GT-TTA-T-G-A-------C------AAAG--C--TC--TTGAAA----------G--T-G-----G--GG---CC-AA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C--T-AG--G---G---------T-----TTTGCG-G-A-G--T--TT---TA-AT-A--G
gi|111094                     :    GT-CTA-G-G-GA------T------GAAG--T--CA-------A----------A--T-T-----G--GG--GTC-CA-GGGG--CG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C--T-CG--G---G---------T-----TTT--A-G-T-G--C--TT---TT-
gi|111104                     :     T-TCA-GAG-G-------C------AGGG--G--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-AG-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C---G-G-AAGC---T---C--C-TG--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--A--TT---T---T-A--GGAG---------T--A--A--A--AT-TTAT-
gi|111105                     :     T-CTG-G-G-A-------T------AAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG---CC-CA-GGGG--TG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C--T-CG--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111106                     :     T-CCA-G-G-G-------C------AACG--C--CT--C----T----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C--CTTG--A---A---------T-----ATT--C-G-T-G--A--TT---TT-TT-G--GA-G----
gi|111111                     :      -CCA-G-G-G-------C------GAAG--C--CCC-T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GTGAA--AG----C-CC-CCGCG-A-AAGC---T---C--C-CG--A---G---------T-----TTT--A-A-A-G--AT-TT---TT-GTCA--GG-G----C---TT--G--AATA--AT-TTGT-C--C-C---CTGA--AG-TATGT---CA-T-----T-T-C---AC-A----A---T---TTTCTG--TC--ATT
gi|111112                     :      -CCA-G-G---------C------GAAG--C--CC--T----G----------GACT-G-----G--GGGGGCC-CA--GGG-GCG-AG-AT----T-CC-C--CGAA-AAGC---T---C--C-AG--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--A---T---CT-GT-A--GG-G----C---TT--G--A--A--AT-TGGT-C--T-C---C-GA--GG-GA-GTGAGTATT-----TGT-C---ACTA----TA--A---TTTCTGTTTC--ATTT
gi|111113                     :      -CCA-G-A-G----------------AG--C--T---T----G----------G--T-T-----G--GG--GTC-CA-GGAG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-A---------------------------------T-----TTT--A-C-A-G--A--TT---TT-AT-G--TC-G----C---TT--G--A--A--G----AT-C--T-C---T------G-TA-GT---AATC-----T-T-T---AATG----CA--T---TTTCT---TC--ATTT
gi|111114                     :        CA-G-G-GGTC----T------GAGG--C--TC--T------------------C-A-----G--GG--GCCTCA-GAT------A--AG----C-AA-T--CG-G-AAGC---T---C--C-TG--G---A---------T-----TTT--A-G-A-G--A--TTCTATT-CT-ATTGG-G----C---TA--G--A--A--GT-ATGT-C--T-C---C-CA--TG-AA-GT---CATT-----T-T-----AATA----TCG-T---TTTCTG--TT--ATTT
gi|111118                     :          -G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C--T-CG--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111119                     :          -G-G-G-------T------GAAG--C--GA--A----A----------G--T-G-----G--GG---CC-CA-GGGG-GTG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C--T-TG--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---T
gi|111120                     :                                                                 -----G--GG--GCC-CA-GGGG--CA-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C--T-TG--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111124                     :        ggatgaagccaaaagt------GAGG--C--CCCGT----G----------G--T-TTCCTTG--GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C--T-AGA-A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--A--TT---TT--T-A--GGCG----C---TT--G--A--A--AA-TTGG-CA-T-A---C-GA--A--TA-GTA--CATT-----T-T-C---AC-A----T---A---TTTCTG--TC--ATTT
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Alignments
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Reference ( family-161 )      :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------GAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-C-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--A--TT---TT-GT-A--GG-G----C---TT--G--A--A--AT-TTGT-C--T-C---C-GA--AG-TA-GT---CATT-----T-T-C---ACTA----T---T---TTTCTG--TC--ATTT
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gi|110980                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAGG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--TTC-CA--GGG-GCG-A--AG----C-CC-C--C--G-AAGC---TC--C-T-G--A---AT--------T-----TTT--A-G-T-G--T--TT---TA-GG-A--G------------T--A--A--A--AT-T
gi|110981                     :  GGGT-C-A-G-G-G-------C-------AAG--G--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CCAC--CG-G-AAGC---TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-G-CTG--A--TT---TT-
gi|110982                     :  GGGT-CCA-G-G-A-------C------AAAG--C--TC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GT----------GC-----AG----C-CC-C--CA-G-AAGC---TCA-T-T-G--A-------------T-----TTT--A-C-T-G--A--TT---TC-AT-A--CG-G----C---TT--G--A--T--GT-ATGT-C--T-CGGGC-CA--TG-TA-GT---AATT-----T-T-A---AAAA----A---T---ATTTTG--TC--ATTT
gi|110983                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAGG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-AA-GAGG-GCG-A----------CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--A--TT---T
gi|110985                     :  GGGT-CCA-G-G-C-------C------AAGG--C--CCC-T----G----------G--T-G-----G--GG---TC-CA-GGGG-GCG-A--AG------CC-C--CG-G-AAGC---T---C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--A--GT---TT--T-A--GG-A----A----T--A--A--A--AT-T
gi|110986                     :  GGGT-TCA-G-T-G-------C------AACA--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG--CA-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-C-T-G--A--TT---TT--T-G--GA-G---------T--A--A--A--AT-TT
gi|110987                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------GATG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-TA-GGGG-GCA-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-T-G--G---G---------T-----TTT--A-
gi|110988                     :  GGGT-C-A-G-G-G-------C------AAGG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA--GGG-GCG----AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-T-GT-A---A---------T-----TTT--A-G-GTG--A--TT---T---T-A--GG-A----A---GT--A--A--A--AT-TT
gi|110990                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAGG--C--CC--T----G----------T--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCACA--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--T--TT---TA-GG-A--G------------T--A--A--A--AT-TT
gi|110992                     :  GAGT-CCA-G-G-G-------G------CAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG---TC-CA-GGGG-GCG-A--AG------CC-C--CG-G-AAGCT--TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-T-T-G--A--TT---T
gi|110993                     :  GAGT-CCA-G-G-G-------G------CAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG---TC-CA-GGGG-GCG-A--AG------CC-C--CG-G-AAGCT--TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-T-T-G--A--TT---T
gi|110994                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--T--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TG--G-C-G--A---G---------T-----TTT--
gi|110997                     :  GGGT-CCA-G-G-A-------C------AAAA--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-TT-GGGG-GCG-A--A----------------G-GAGC---TC--T-G-G--A---A---------T-----TTT--A-C-A-G--AT-TT---TT-AT-A--GG-G----C---TT--G--A--
gi|110998                     :  GGGT-CTG-G-G-G-------A------AAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AT----C-CC-T--CG-G-AA------C--C-T-G--GTACA---------T-----TTT--A-G-ACA--A--TT---AA-GA-G--GG-G----CATTTT--C--A--A--A----GT-A--T-C---T-GA-----TA-CA---CATT-----T-T-C---TTTA----A---T---TTT
gi|110999                     :  GGGT-C-A-G-G-G-------C------AACA--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGT-GCG-A--AA----C-CC-C--CG-G-AAGT---TC--A-G-G--A---A---------T-----TTT--T-G-T-G--A--TT---T---T-A--GGAG----C-------A--A--A--AT-TT
gi|111000                     :  GGAT-CCA-G-G-GG------C------AAGG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CC-GGGG-GCT-A--AG----C-CC-C--C--G-AAGC---T---C-T-G--A---A---------T-----TTTA-A-G-T-G--A--TT---TT--T-A--GGAG---------T--A--A--A--AT-T
gi|111001                     :  GGGT-CCATG-G-G-------C------AAGG--C--CCC-T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-CGG-A--AG----C-CC-C--CG-C-GAGC---TC--C-T-G--A---AAT-------T-----TTT--A-G-T-G--A--TT---TT-
gi|111002                     :  GGGT-CCA-GAG-G-------C------AATG--C--C---T----G----------G--T-G-----G--GG---TT-CA-GGGG--CG-A--AG----TTCC-C--CG-G-AAGC---TC--A-T-G--A---A---------T-----ATT--A-G-T-G--A--TT---TT--T-G--GA-G---------T--A--A--A--AT-TACC-C--T-C---A-AA--GG-TA-
gi|111003                     :  GGGT-CCA-GCG-G-------C------AGCG--C--CC--T----G----------A--T-G-----G--AG--GTC-CA-GGGG-ACG-A--AGAAACC-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-C-G--A---T---------T-----ATC--A-G-T-G--A--TT---TT--T-G--GA-G---------T--A--A--G--AT-TT
gi|111004                     :  GGGT-CCA-G-G-A-------C------AGAT--CATCT--T----G----------G--TAG-----G--GG--GTC-CA-AGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-A-AAGC---T---G-A-G--A---G---------G-----TTT--G-G-C-A--G--TT---TC-AT------------T---TT--G--A--A--AT-
gi|111005                     :  GGGT-CCA-G-GCG-------C------G-----C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG---TC-CA-TTGG--CG-A--AG----C-CC-C--CC-G-AAGT---TC--C-C----A---G---------A-----TTC--A-G-T-G--G--TT---TT-GG-A--G-----------TT-----A--A--AT-TT
gi|111006                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--C--TT--T----ATATATAAATAG--T-G-----G--GG--ACC-CA-GGGA-GCT-ATAAA----C-CC-C--CG-G-GATC---TC--C-T-G--G---A---------T-----TTA--A-C-A-G--A--TT---TT-AT-A--GG-G----C---GT--AT-A--G--AT-TAGG-C--C--------A--TG-TA-AT---CATT-----T-T-
gi|111007                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCA-A--AG----T-CC-C--CG-G-AAGC---T
gi|111008                     :  GGGC-CCA-G-G-A-------C------GG-G--C--CT--T----G----------G--T-A-----GA-GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----T-CC-C--CG-G-AAGC---T-------G--A---G---------G-----TTT--T-G-G-C--A--TT---TTCAT------------T---TT--G--A--A--AT-T
gi|111009                     :  GGGT-CTG-G-G-A-------A------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-A-----G--GG--GCT-CA-GGCG-GTG-A--AA----C-CC-C--CG-G-AAGC---AC--C-T-G--A---GGGC------T-----TTT--A-A-A-G--C--TA---TT-TT-A--GG-G----G---TT--ATCA--A--AT-T
gi|111010                     :  GGAT-CCA-G-G-A-------T------GG-G--C--CC--T----G----------G--T-T-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GTG-A--AG----C-CC-C--GG-G-AAGC---T-------G--AGAGG---------A-----TTT--A-G-A----A--TT---TT-
gi|111011                     :                                 G--C--CC--A----G----------G--G-G-----GCGGG--GCC-C--GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C---G-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTA--A-G-A-G--C--TT---TT-A--A--CA-G----T---T------A--A--AT-TT------------C-GA--GG-T--GT---TAAT-----T-T-A---GCTA----T---A---TATCTA--T
gi|111012                     :                               ggG--C--CC--A----G----------G--G-G-----GCGGG--GCC-C--GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C---G-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTA--A-G-A-G--C--TT---TT-A--A--CA-G----T---T------A--A--AT-TT------------C-GA--GG-T--GT---TAAT-----T-T-A---GCTA----T---A---TATCTA--T
gi|111031                     : ggGGT-CCA-G-G-G-------C------AACG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG-----------------------------------CT-G-AAGC---TC--C-A-G--A---G---------T-----TTA--AAG-A-G--A--TT---TT-GTTA--GG-G----C---TTATG--A--A--AT-TTGT-C--TTC---C-GA--AG-TA-------ATT-----T-T-C---ACTA----T---A---TTTCTA--TC--ATTT
gi|111032                     :   GGT-CCA-G-G-A-------C------AAAA--C--CA--T----T----------A--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGTA-ACA-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-G-G--T---A---------T-----TTT--A-C-A-G--A-------TT-AT-A--GA-A----A---TT--G--A--A--GT-ATGT-C--T-C---C-CG--TG-TA-GT---CATT-----T-T-T---GATA----C---T---TTTTTG--TCTAATTT
gi|111033                     :   GGT-CCA-G-G-G-------C------AGCG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTT-CA--GGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CT-G-AAGT---TC--C-C-G--A---A---------------TTC--A-G-T-G--T--TT---TT-GG-A--G-----------TT-----A--A--AT-TT
gi|111035                     :   GGT-CCA-G-G-G-------C------AACA--C--CT--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGAG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-C-G--A---A---------T-----TTC--A-G-T-G--A--TT---TT-TT-G--AG-----------T--A--A--A--AT-TT
gi|111037                     :   GGT-CTA-G-A-A-------T------GAA---C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-A-G--G---G---------T-----TTA--A-G-G-G--C--TT---TT-
gi|111039                     :   GGT-CTG-G-G-G-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--A-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGG---TT--T-C-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111040                     :   GGT-CTA-G-A-A-------T------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGT---TC--T-T-G--G---G---------T-----TTA--A-G-G-G--C--TT---TT-
gi|111041                     :   GGT-CTG-G-A-G-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--C-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CG-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-AA-A--GG-
gi|111042                     :   GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-T-A-G--C--TT---CT-
gi|111043                     :   GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG---CC-CA-GGAG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-TAGC---TA--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111044                     :   GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG----C-CA-GGGA-GCG-A--AA----C-CC-C--CG-A-AAGC---TC--T-C-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111045                     :   GGT-CTA-G-A-A-------T------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GG----C-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--TG-G-AAGC---TC--T-T-G--G---G---------T-----TTA--A-G-G-G--C--TT---TT-
gi|111046                     :   GGT-ATG-G-G-G-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--C-G-----G--GG--GCA-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111047                     :   GAT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-ACG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-A-A-G--T--TT---TT-
gi|111048                     :   GGT-CTG-G-G-T-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--C-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--GG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--G-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111049                     :   GGTACTA-A-G-G-------C------AAAG--C--CA--T----G----------T--T-G-----G--AG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-A-AAGC---TC--C-T-GGAA---G---------T-----TTT--A-C-A-A--A--TT---T
gi|111050                     :   GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--TG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAAC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-
gi|111051                     :   GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--C-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG------CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--G-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111052                     :   GGT-CTA-G-A-A-------T------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GA--GCC-CA-GGGG-GCA-A--AG----C-CC-C--TG-G-AAGC---TC--T-T-G--G---GTTGAAGGGCT-----TTT--A-A-A-GTTA--TT---TT--T-A--GG-G----G---TT--
gi|111055                     :   GGT-CTG-G-A-A-------T------GAAC--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GG--CCC-CA-GGGG-GTG-A--AG----C-AC-C--CG-G-AAGC---TC--C-T-G--G---A---------T-----TTA--A-G-A-G--C--TT-------T-A--GG-GAT--C---T------------AT-TTAT-C--T-
gi|111057                     :   GGT-CTA-G-C-A-------T------AAAG--C--CA--A----A----------G--T-T-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------------TTT--A-A-A-G--C--TT---TT-
gi|111087                     :    GT-CCA-G-G-G-------C-------AAG--G--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--C--G-AAGC---TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--A--TT---T---T-A--GGAG---------T--A--A--A--AT-TT
gi|111089                     :    GT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--C--CC--T----G----------G--T-A-----G--AG--GCC-CA-GGGA-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TG--G-T-G--C---A---------T-----TTA--A-G-A-C--A--AT---TA-AG-A--GA-GGTATT---TT--C--A--A--A----GT-C--T-C---C-GA-----TA-CA---CATT-----T-T-C---
gi|111090                     :    GT-CCA-GAG-G-------C------AACG--CG-CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGGGGCG-A--AG----C-CC-C--CG-G--AGC---TCA-C-C-G--A---G---------T-----TTC--A-G-T-G--A--TT---TT--T-G--GA-G--------TA--A--A--A--AT-TT
gi|111091                     :    GT-CGA-G-A-A-------T------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--AG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----T-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-T-G--A---G---------T-----TTA--A-G-G-G--C--TT---T
gi|111092                     :    GT-CTG-G-G-G-------T------CAAG--C--CCA-T----G----------A----G-----G--GG--GAC-CA-GGGG-GCG-A--AG----T-CC-C--CG-G-AAGT---TT--C-T-G--G---G---------T-----TTT--A-G---G--G--CT---TT-GT-A--AG-
gi|111093                     :    GT-TTA-T-G-A-------C------AAAG--C--TC--TTGAAA----------G--T-G-----G--GG---CC-AA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-A-G--G---G---------T-----TTTGCG-G-A-G--T--TT---TA-AT-A--G
gi|111094                     :    GT-CTA-G-G-GA------T------GAAG--T--CA-------A----------A--T-T-----G--GG--GTC-CA-GGGG--CG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-T-G--C--TT---TT-
gi|111104                     :     T-TCA-GAG-G-------C------AGGG--G--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-AG-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C---G-G-AAGC---TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--A--TT---T---T-A--GGAG---------T--A--A--A--AT-TTAT-
gi|111105                     :     T-CTG-G-G-A-------T------AAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG---CC-CA-GGGG--TG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111106                     :     T-CCA-G-G-G-------C------AACG--C--CT--C----T----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--CTT-G--A---A---------T-----ATT--C-G-T-G--A--TT---TT-TT-G--GA-G----
gi|111111                     :      -CCA-G-G-G-------C------GAAG--C--CCC-T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GTGAA--AG----C-CC-CCGCG-A-AAGC---TC--C-C-G--A---G---------T-----TTT--A-A-A-G--AT-TT---TT-GTCA--GG-G----C---TT--G--AATA--AT-TTGT-C--C-C---CTGA--AG-TATGT---CA-T-----T-T-C---AC-A----A---T---TTTCTG--TC--ATT
gi|111112                     :      -CCA-G-G---------C------GAAG--C--CC--T----G----------GACT-G-----G--GGGGGCC-CA--GGG-GCG-AG-AT----T-CC-C--CGAA-AAGC---TC--C-A-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--A---T---CT-GT-A--GG-G----C---TT--G--A--A--AT-TGGT-C--T-C---C-GA--GG-GA-GTGAGTATT-----TGT-C---ACTA----TA--A---TTTCTGTTTC--ATTT
gi|111113                     :      -CCA-G-A-G----------------AG--C--T---T----G----------G--T-T-----G--GG--GTC-CA-GGAG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-A-------------------------------T-----TTT--A-C-A-G--A--TT---TT-AT-G--TC-G----C---TT--G--A--A--G----AT-C--T-C---T------G-TA-GT---AATC-----T-T-T---AATG----CA--T---TTTCT---TC--ATTT
gi|111114                     :        CA-G-G-GGTC----T------GAGG--C--TC--T------------------C-A-----G--GG--GCCTCA-GAT------A--AG----C-AA-T--CG-G-AAGC---TC--C-T-G--G---A---------T-----TTT--A-G-A-G--A--TTCTATT-CT-ATTGG-G----C---TA--G--A--A--GT-ATGT-C--T-C---C-CA--TG-AA-GT---CATT-----T-T-----AATA----TCG-T---TTTCTG--TT--ATTT
gi|111118                     :          -G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111119                     :          -G-G-G-------T------GAAG--C--GA--A----A----------G--T-G-----G--GG---CC-CA-GGGG-GTG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-T-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---T
gi|111120                     :                                                                 -----G--GG--GCC-CA-GGGG--CA-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-T-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111124                     :        ggatgaagccaaaagt------GAGG--C--CCCGT----G----------G--T-TTCCTTG--GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-A-GA-A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--A--TT---TT--T-A--GGCG----C---TT--G--A--A--AA-TTGG-CA-T-A---C-GA--A--TA-GTA--CATT-----T-T-C---AC-A----T---A---TTTCTG--TC--ATTT
gi|111125                     :                        ------GAGG--CT-CC--C----A----------G--T-G-----G--G----TC-CA-GGG---CA-A--GG----C-CG-T--GG-G-GAGCGGGTC--T-G-G--G---A---------T-----TTC--A-C-A-G--A--TT---TT-AT-A--GG-G----C---TT--G--A--A--AT-ATGT-C--T-C---CTTA--TG-TC-GT---CATT-----T-T-TTAAAATA--------T---TTTCGG--TC--ATTT
gi|111136                     :                                 G--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC--A-TGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-A-AAGC---TC--C-A-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--A--TT---TT-AT-A--GG-G----T---TT--G--A--A--AT-TTGT-C--T-C---C-GA--AG-TA-GT---CATT-----T-T-C---ACTA----T---G---TTTCTG--TC--ATTT
gi|111146                     :                                            ----G----------G--T-G-----G--GG---TC-CA-GGGG-GCA-A--A-------CC-C--CT-A-AA------------------------------T-----TTT--A-C-A-C--G--TT---TT-AT-A--GG-G----C---TT--G--A--A--GT-ATGT-C--T-C---C-CA--TGTTA-GT---CATTATTTAT-T-C---ATTA----T---C---T
gi|111149                     :                                                                 -----G--GG--GCC-CA-GGAA-GCG-A--AG----C-CC-CCCCG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111152                     :                                                                                                             gtG-G-CAGC---TC--C-C-G--G---A---------T-----TCA--A-A-A-A--AAGTT---TT--T-A--GG-A----G---TA--G--A--A--AT-TTGT-C--T-C---T-CA--TG-TA-GT---CATC-----T-T-T---AATA--------T---TTTCTG--TC--ATTT
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Alignments
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lowQualScore                  :      5   5 4 5 3333333 333333    66 55  1111111 9999999999 11 4 11111 66  666  4  4    8   8 00  9999 4  4 11  8 4    111  000000 44 444 999999999 00000   33 4 4 6 11111  777  77 2 88  6 11111111  99999 99 99  7    0 33 0 888 0  777 0  0  888    66666 0 00000 5  000000000000      22  00    
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Reference ( family-161 )      :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------GAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-C-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--A--TT---TT-GT-A--GG-G----C---TT--G--A--A--AT-TTGT-C--T-C---C-GA--AG-TA-GT---CATT-----T-T-C---ACTA----T---T---TTTCTG--TC--ATTT
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gi|110976                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------GAAG--C--CG--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCA-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--TG-T-AAGC---TC--C-A-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--A--
gi|110977                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AATG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCA-A--AG----C-CC-C--CA-G-AAGT---TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--A--TT---TT--T-G--GA-G---------T--A--A--A--AT-TT
gi|110978                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C-------AAG--G--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CA-G-AAGC---TC--C-T-G--A---A---------T-----TTG--A-G-ATG--A--TT---T---T-A--GGAG---------T--A--A--A--AT-TT
gi|110979                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--C--CC--T----G----------T--T-A-----G--GG--GCC-AA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TG--G-T-G--C---A---------T-----TTT--A-G-A-C--A--AT---TA-AG-A--GA-GGTATT---TT--C--A--A--A----GT-C--T-C---T-GA-----TA-CA---CATT-----T-T-C---TTTA----A---T---TTT
gi|110980                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAGG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--TTC-CA--GGG-GCG-A--AG----C-CC-C--C--G-AAGC---TC--C-T-G--A---AT--------T-----TTT--A-G-T-G--T--TT---TA-GG-A--G------------T--A--A--A--AT-T
gi|110981                     :  GGGT-C-A-G-G-G-------C-------AAG--G--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CCAC--CG-G-AAGC---TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-G-CTG--A--TT---TT-
gi|110982                     :  GGGT-CCA-G-G-A-------C------AAAG--C--TC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GT----------GC-----AG----C-CC-C--CA-G-AAGC---TCA-T-T-G--A-------------T-----TTT--A-C-T-G--A--TT---TC-AT-A--CG-G----C---TT--G--A--T--GT-ATGT-C--T-CGGGC-CA--TG-TA-GT---AATT-----T-T-A---AAAA----A---T---ATTTTG--TC--ATTT
gi|110983                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAGG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-AA-GAGG-GCG-A----------CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--A--TT---T
gi|110985                     :  GGGT-CCA-G-G-C-------C------AAGG--C--CCC-T----G----------G--T-G-----G--GG---TC-CA-GGGG-GCG-A--AG------CC-C--CG-G-AAGC---T---C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--A--GT---TT--T-A--GG-A----A----T--A--A--A--AT-T
gi|110986                     :  GGGT-TCA-G-T-G-------C------AACA--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG--CA-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-C-T-G--A--TT---TT--T-G--GA-G---------T--A--A--A--AT-TT
gi|110987                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------GATG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-TA-GGGG-GCA-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-T-G--G---G---------T-----TTT--A-
gi|110988                     :  GGGT-C-A-G-G-G-------C------AAGG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA--GGG-GCG----AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-T-GT-A---A---------T-----TTT--A-G-GTG--A--TT---T---T-A--GG-A----A---GT--A--A--A--AT-TT
gi|110990                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAGG--C--CC--T----G----------T--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCACA--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--T--TT---TA-GG-A--G------------T--A--A--A--AT-TT
gi|110992                     :  GAGT-CCA-G-G-G-------G------CAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG---TC-CA-GGGG-GCG-A--AG------CC-C--CG-G-AAGCT--TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-T-T-G--A--TT---T
gi|110993                     :  GAGT-CCA-G-G-G-------G------CAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG---TC-CA-GGGG-GCG-A--AG------CC-C--CG-G-AAGCT--TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-T-T-G--A--TT---T
gi|110994                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--T--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TG--G-C-G--A---G---------T-----TTT--
gi|110997                     :  GGGT-CCA-G-G-A-------C------AAAA--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-TT-GGGG-GCG-A--A----------------G-GAGC---TC--T-G-G--A---A---------T-----TTT--A-C-A-G--AT-TT---TT-AT-A--GG-G----C---TT--G--A--
gi|110998                     :  GGGT-CTG-G-G-G-------A------AAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AT----C-CC-T--CG-G-AA------C--C-T-G--GTACA---------T-----TTT--A-G-ACA--A--TT---AA-GA-G--GG-G----CATTTT--C--A--A--A----GT-A--T-C---T-GA-----TA-CA---CATT-----T-T-C---TTTA----A---T---TTT
gi|110999                     :  GGGT-C-A-G-G-G-------C------AACA--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGT-GCG-A--AA----C-CC-C--CG-G-AAGT---TC--A-G-G--A---A---------T-----TTT--T-G-T-G--A--TT---T---T-A--GGAG----C-------A--A--A--AT-TT
gi|111000                     :  GGAT-CCA-G-G-GG------C------AAGG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CC-GGGG-GCT-A--AG----C-CC-C--C--G-AAGC---T---C-T-G--A---A---------T-----TTTA-A-G-T-G--A--TT---TT--T-A--GGAG---------T--A--A--A--AT-T
gi|111001                     :  GGGT-CCATG-G-G-------C------AAGG--C--CCC-T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-CGG-A--AG----C-CC-C--CG-C-GAGC---TC--C-T-G--A---AAT-------T-----TTT--A-G-T-G--A--TT---TT-
gi|111002                     :  GGGT-CCA-GAG-G-------C------AATG--C--C---T----G----------G--T-G-----G--GG---TT-CA-GGGG--CG-A--AG----TTCC-C--CG-G-AAGC---TC--A-T-G--A---A---------T-----ATT--A-G-T-G--A--TT---TT--T-G--GA-G---------T--A--A--A--AT-TACC-C--T-C---A-AA--GG-TA-
gi|111003                     :  GGGT-CCA-GCG-G-------C------AGCG--C--CC--T----G----------A--T-G-----G--AG--GTC-CA-GGGG-ACG-A--AGAAACC-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-C-G--A---T---------T-----ATC--A-G-T-G--A--TT---TT--T-G--GA-G---------T--A--A--G--AT-TT
gi|111004                     :  GGGT-CCA-G-G-A-------C------AGAT--CATCT--T----G----------G--TAG-----G--GG--GTC-CA-AGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-A-AAGC---T---G-A-G--A---G---------G-----TTT--G-G-C-A--G--TT---TC-AT------------T---TT--G--A--A--AT-
gi|111005                     :  GGGT-CCA-G-GCG-------C------G-----C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG---TC-CA-TTGG--CG-A--AG----C-CC-C--CC-G-AAGT---TC--C-C----A---G---------A-----TTC--A-G-T-G--G--TT---TT-GG-A--G-----------TT-----A--A--AT-TT
gi|111006                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--C--TT--T----ATATATAAATAG--T-G-----G--GG--ACC-CA-GGGA-GCT-ATAAA----C-CC-C--CG-G-GATC---TC--C-T-G--G---A---------T-----TTA--A-C-A-G--A--TT---TT-AT-A--GG-G----C---GT--AT-A--G--AT-TAGG-C--C--------A--TG-TA-AT---CATT-----T-T-
gi|111007                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCA-A--AG----T-CC-C--CG-G-AAGC---T
gi|111008                     :  GGGC-CCA-G-G-A-------C------GG-G--C--CT--T----G----------G--T-A-----GA-GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----T-CC-C--CG-G-AAGC---T-------G--A---G---------G-----TTT--T-G-G-C--A--TT---TTCAT------------T---TT--G--A--A--AT-T
gi|111009                     :  GGGT-CTG-G-G-A-------A------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-A-----G--GG--GCT-CA-GGCG-GTG-A--AA----C-CC-C--CG-G-AAGC---AC--C-T-G--A---GGGC------T-----TTT--A-A-A-G--C--TA---TT-TT-A--GG-G----G---TT--ATCA--A--AT-T
gi|111010                     :  GGAT-CCA-G-G-A-------T------GG-G--C--CC--T----G----------G--T-T-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GTG-A--AG----C-CC-C--GG-G-AAGC---T-------G--AGAGG---------A-----TTT--A-G-A----A--TT---TT-
gi|111011                     :                                 G--C--CC--A----G----------G--G-G-----GCGGG--GCC-C--GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C---G-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTA--A-G-A-G--C--TT---TT-A--A--CA-G----T---T------A--A--AT-TT------------C-GA--GG-T--GT---TAAT-----T-T-A---GCTA----T---A---TATCTA--T
gi|111012                     :                               ggG--C--CC--A----G----------G--G-G-----GCGGG--GCC-C--GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C---G-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTA--A-G-A-G--C--TT---TT-A--A--CA-G----T---T------A--A--AT-TT------------C-GA--GG-T--GT---TAAT-----T-T-A---GCTA----T---A---TATCTA--T
gi|111031                     : ggGGT-CCA-G-G-G-------C------AACG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG-----------------------------------CT-G-AAGC---TC--C-A-G--A---G---------T-----TTA--AAG-A-G--A--TT---TT-GTTA--GG-G----C---TTATG--A--A--AT-TTGT-C--TTC---C-GA--AG-TA-------ATT-----T-T-C---ACTA----T---A---TTTCTA--TC--ATTT
gi|111032                     :   GGT-CCA-G-G-A-------C------AAAA--C--CA--T----T----------A--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGTA-ACA-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-G-G--T---A---------T-----TTT--A-C-A-G--A-------TT-AT-A--GA-A----A---TT--G--A--A--GT-ATGT-C--T-C---C-CG--TG-TA-GT---CATT-----T-T-T---GATA----C---T---TTTTTG--TCTAATTT
gi|111033                     :   GGT-CCA-G-G-G-------C------AGCG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTT-CA--GGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CT-G-AAGT---TC--C-C-G--A---A---------------TTC--A-G-T-G--T--TT---TT-GG-A--G-----------TT-----A--A--AT-TT
gi|111035                     :   GGT-CCA-G-G-G-------C------AACA--C--CT--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGAG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-C-G--A---A---------T-----TTC--A-G-T-G--A--TT---TT-TT-G--AG-----------T--A--A--A--AT-TT
gi|111037                     :   GGT-CTA-G-A-A-------T------GAA---C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-A-G--G---G---------T-----TTA--A-G-G-G--C--TT---TT-
gi|111039                     :   GGT-CTG-G-G-G-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--A-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGG---TT--T-C-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111040                     :   GGT-CTA-G-A-A-------T------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGT---TC--T-T-G--G---G---------T-----TTA--A-G-G-G--C--TT---TT-
gi|111041                     :   GGT-CTG-G-A-G-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--C-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CG-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-AA-A--GG-
gi|111042                     :   GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-T-A-G--C--TT---CT-
gi|111043                     :   GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG---CC-CA-GGAG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-TAGC---TA--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111044                     :   GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG----C-CA-GGGA-GCG-A--AA----C-CC-C--CG-A-AAGC---TC--T-C-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111045                     :   GGT-CTA-G-A-A-------T------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GG----C-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--TG-G-AAGC---TC--T-T-G--G---G---------T-----TTA--A-G-G-G--C--TT---TT-
gi|111046                     :   GGT-ATG-G-G-G-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--C-G-----G--GG--GCA-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111047                     :   GAT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-ACG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-A-A-G--T--TT---TT-
gi|111048                     :   GGT-CTG-G-G-T-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--C-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--GG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--G-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111049                     :   GGTACTA-A-G-G-------C------AAAG--C--CA--T----G----------T--T-G-----G--AG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-A-AAGC---TC--C-T-GGAA---G---------T-----TTT--A-C-A-A--A--TT---T
gi|111050                     :   GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--TG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAAC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-
gi|111051                     :   GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--C-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG------CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--G-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111052                     :   GGT-CTA-G-A-A-------T------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GA--GCC-CA-GGGG-GCA-A--AG----C-CC-C--TG-G-AAGC---TC--T-T-G--G---GTTGAAGGGCT-----TTT--A-A-A-GTTA--TT---TT--T-A--GG-G----G---TT--
gi|111055                     :   GGT-CTG-G-A-A-------T------GAAC--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GG--CCC-CA-GGGG-GTG-A--AG----C-AC-C--CG-G-AAGC---TC--C-T-G--G---A---------T-----TTA--A-G-A-G--C--TT-------T-A--GG-GAT--C---T------------AT-TTAT-C--T-
gi|111057                     :   GGT-CTA-G-C-A-------T------AAAG--C--CA--A----A----------G--T-T-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------------TTT--A-A-A-G--C--TT---TT-
gi|111087                     :    GT-CCA-G-G-G-------C-------AAG--G--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--C--G-AAGC---TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--A--TT---T---T-A--GGAG---------T--A--A--A--AT-TT
gi|111089                     :    GT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--C--CC--T----G----------G--T-A-----G--AG--GCC-CA-GGGA-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TG--G-T-G--C---A---------T-----TTA--A-G-A-C--A--AT---TA-AG-A--GA-GGTATT---TT--C--A--A--A----GT-C--T-C---C-GA-----TA-CA---CATT-----T-T-C---
gi|111090                     :    GT-CCA-GAG-G-------C------AACG--CG-CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGGGGCG-A--AG----C-CC-C--CG-G--AGC---TCA-C-C-G--A---G---------T-----TTC--A-G-T-G--A--TT---TT--T-G--GA-G--------TA--A--A--A--AT-TT
gi|111091                     :    GT-CGA-G-A-A-------T------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--AG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----T-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-T-G--A---G---------T-----TTA--A-G-G-G--C--TT---T
gi|111092                     :    GT-CTG-G-G-G-------T------CAAG--C--CCA-T----G----------A----G-----G--GG--GAC-CA-GGGG-GCG-A--AG----T-CC-C--CG-G-AAGT---TT--C-T-G--G---G---------T-----TTT--A-G---G--G--CT---TT-GT-A--AG-
gi|111093                     :    GT-TTA-T-G-A-------C------AAAG--C--TC--TTGAAA----------G--T-G-----G--GG---CC-AA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-A-G--G---G---------T-----TTTGCG-G-A-G--T--TT---TA-AT-A--G
gi|111094                     :    GT-CTA-G-G-GA------T------GAAG--T--CA-------A----------A--T-T-----G--GG--GTC-CA-GGGG--CG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-T-G--C--TT---TT-
gi|111104                     :     T-TCA-GAG-G-------C------AGGG--G--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-AG-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C---G-G-AAGC---TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--A--TT---T---T-A--GGAG---------T--A--A--A--AT-TTAT-
gi|111105                     :     T-CTG-G-G-A-------T------AAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG---CC-CA-GGGG--TG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111106                     :     T-CCA-G-G-G-------C------AACG--C--CT--C----T----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--CTT-G--A---A---------T-----ATT--C-G-T-G--A--TT---TT-TT-G--GA-G----
gi|111111                     :      -CCA-G-G-G-------C------GAAG--C--CCC-T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GTGAA--AG----C-CC-CCGCG-A-AAGC---TC--C-C-G--A---G---------T-----TTT--A-A-A-G--AT-TT---TT-GTCA--GG-G----C---TT--G--AATA--AT-TTGT-C--C-C---CTGA--AG-TATGT---CA-T-----T-T-C---AC-A----A---T---TTTCTG--TC--ATT
gi|111112                     :      -CCA-G-G---------C------GAAG--C--CC--T----G----------GACT-G-----G--GGGGGCC-CA--GGG-GCG-AG-AT----T-CC-C--CGAA-AAGC---TC--C-A-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--A---T---CT-GT-A--GG-G----C---TT--G--A--A--AT-TGGT-C--T-C---C-GA--GG-GA-GTGAGTATT-----TGT-C---ACTA----TA--A---TTTCTGTTTC--ATTT
gi|111113                     :      -CCA-G-A-G----------------AG--C--T---T----G----------G--T-T-----G--GG--GTC-CA-GGAG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-A-------------------------------T-----TTT--A-C-A-G--A--TT---TT-AT-G--TC-G----C---TT--G--A--A--G----AT-C--T-C---T------G-TA-GT---AATC-----T-T-T---AATG----CA--T---TTTCT---TC--ATTT
gi|111114                     :        CA-G-G-GGTC----T------GAGG--C--TC--T------------------C-A-----G--GG--GCCTCA-GAT------A--AG----C-AA-T--CG-G-AAGC---TC--C-T-G--G---A---------T-----TTT--A-G-A-G--A--TTCTATT-CT-ATTGG-G----C---TA--G--A--A--GT-ATGT-C--T-C---C-CA--TG-AA-GT---CATT-----T-T-----AATA----TCG-T---TTTCTG--TT--ATTT
gi|111118                     :          -G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111119                     :          -G-G-G-------T------GAAG--C--GA--A----A----------G--T-G-----G--GG---CC-CA-GGGG-GTG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-T-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---T
gi|111120                     :                                                                 -----G--GG--GCC-CA-GGGG--CA-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-T-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111124                     :        ggatgaagccaaaagt------GAGG--C--CCCGT----G----------G--T-TTCCTTG--GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-A-GA-A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--A--TT---TT--T-A--GGCG----C---TT--G--A--A--AA-TTGG-CA-T-A---C-GA--A--TA-GTA--CATT-----T-T-C---AC-A----T---A---TTTCTG--TC--ATTT
gi|111125                     :                        ------GAGG--CT-CC--C----A----------G--T-G-----G--G----TC-CA-GGG---CA-A--GG----C-CG-T--GG-G-GAGCGGGTC--T-G-G--G---A---------T-----TTC--A-C-A-G--A--TT---TT-AT-A--GG-G----C---TT--G--A--A--AT-ATGT-C--T-C---CTTA--TG-TC-GT---CATT-----T-T-TTAAAATA--------T---TTTCGG--TC--ATTT
gi|111136                     :                                 G--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC--A-TGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-A-AAGC---TC--C-A-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--A--TT---TT-AT-A--GG-G----T---TT--G--A--A--AT-TTGT-C--T-C---C-GA--AG-TA-GT---CATT-----T-T-C---ACTA----T---G---TTTCTG--TC--ATTT
gi|111146                     :                                            ----G----------G--T-G-----G--GG---TC-CA-GGGG-GCA-A--A-------CC-C--CT-A-AA------------------------------T-----TTT--A-C-A-C--G--TT---TT-AT-A--GG-G----C---TT--G--A--A--GT-ATGT-C--T-C---C-CA--TGTTA-GT---CATTATTTAT-T-C---ATTA----T---C---T
gi|111149                     :                                                                 -----G--GG--GCC-CA-GGAA-GCG-A--AG----C-CC-CCCCG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111152                     :                                                                                                             gtG-G-CAGC---TC--C-C-G--G---A---------T-----TCA--A-A-A-A--AAGTT---TT--T-A--GG-A----G---TA--G--A--A--AT-TTGT-C--T-C---T-CA--TG-TA-GT---CATC-----T-T-T---AATA--------T---TTTCTG--TC--ATTT
gi|111157                     :                                            tgaggcacacagggaggggat-----G--GG--GCC-TA-GGGG-GTG-A--AT----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-C--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-G---------------------------A--AT-TTAC-C--T-T---T-----AG-GA-GT---TAAT-----T-T-T---GCTA----T---
gi|111158                     :                                                                 -----G--GG--GCC-TA-GGGG-GCG-A--AT----C-CC-T--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT--------------------------A--A--AT-TTAC-T--T-T---T-----AG-GA-GT---TAAT-----T-T-T---GCTA----T---A---TATCTA--T
gi|111159                     :                                                                 -----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGCTA-TA--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111165                     :                                                                           --GCC-CA-GGGGGGCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-GA-A--G
gi|111167                     :                                                                               C-CA-GTGG-GCG-G--AG----T-TC-C--CG---AACC---ATGAC-T-G--A---A---------T-----TTT--A-ACA-G--A--TT---TT-AT-A--GG-G----CT--TT--G--A--T--AT-ATGT-T--T-C---C-TGTTGG-TG-GT---CATT-----T-T-TA--AATA----T---T---TTTTTG--CC--ATTT
gi|111171                     :                                                                                       G-GCG-A--AG----C-CC-T--GGTG-GGGC---TC--C-A-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--A--TA---TT-GT-A--GG-G----C---TT--
gi|111173                     :                                                                                                               G-G-GATC---TC--T-A-G--A---G---------A-----TTT--A-G-A-G--A--TT---TT-AT-A--GG-G----C---TT--G--A--A--AT-TTGT-C--T-C---C-GA--AG-TA-GT---CA---------------------------T---TTTCTG--TC--ATTT


blockSeqs                     :            A   GCCCCCT CGCCTT       AT  TTGAA   TATATAAATA AC   TCCTT CG  GGG                              CG         GGG  GACT   GA TAC GCTTCTAGA TTTAG   TT     T TTA         CA T     A GTATT     ATC                 CT   GGG G  TTG A  T  GAG    ATTTA G TTAA     GGCCTATAT         TT  TA
blockSeqs                     :            A   GTC     .            G   CGT     .          A    .     CG  G                                CC         TA   CCA    T  GAG TTGAAGGGC .       GC     T AAG         G  C     A GTATT     ATG                 A    .   T  A   T  .  C      .     . CA       TATTTA            T   . 
blockSeqs                     :            C   G       .            T   CT      .          .    .     A   A                                .          T    GTC    A  .   GGC       .       T      T AT          A  .     A CATT      AT                  .    .   T  A   .  .  A      .     . GC       TCGT              .   . 
blockSeqs                     :            A   A       .            .   CT      .          .    .     .   G                                .          T    ATT    .  .   AT        .       A      C AT          G  .     A ATC       G                   .    .   .  A   .  .  .      .     . CC       TCA               .   . 
blockSeqs                     :            A   .       .            .   CT      .          .    .     .   G                                .          .    ACC    .  .   T         .       A      . AT          G  .     A CT        G                   .    .   .  A   .  .  .      .     . TA       TAA               .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   AT      .          .    .     .   G                                .          .    CTT    .  .   .         .       .      . A           G  .     C C         G                   .    .   .  A   .  .  .      .     . C        CAT               .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   CT      .          .    .     .   T                                .          .    CA     .  .   .         .       .      . A           G  .     . C         G                   .    .   .  A   .  .  .      .     . C        TT                .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CA     .  .   .         .       .      . A           G  .     . C         G                   .    .   .  A   .  .  .      .     . C        TA                .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CA     .  .   .         .       .      . A           G  .     . C         G                   .    .   .  A   .  .  .      .     . C        TA                .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   T                                .          .    CA     .  .   .         .       .      . A           G  .     . C         G                   .    .   .  A   .  .  .      .     . C        TT                .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CA     .  .   .         .       .      . A           G  .     . C         G                   .    .   .  A   .  .  .      .     . T        TA                .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CA     .  .   .         .       .      . A           G  .     . C         G                   .    .   .  A   .  .  .      .     . C        TA                .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   G       .          .    .     .   G                                .          .    CA     .  .   .         .       .      . A           A  .     . C         G                   .    .   .  A   .  .  .      .     . C        TT                .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CA     .  .   .         .       .      . A           G  .     . C         G                   .    .   .  A   .  .  .      .     . C        CT                .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    AA     .  .   .         .       .      . A           G  .     . C         G                   .    .   .  A   .  .  .      .     . C        AT                .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   C       .          .    .     .   T                                .          .    CA     .  .   .         .       .      . A           G  .     . C         G                   .    .   .  A   .  .  .      .     . C        AT                .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CA     .  .   .         .       .      . A           A  .     . C         A                   .    .   .  T   .  .  .      .     . C        AT                .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CA     .  .   .         .       .      . A           G  .     . C         A                   .    .   .  T   .  .  .      .     . C        TA                .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CC     .  .   .         .       .      . A           A  .     . C         C                   .    .   .  G   .  .  .      .     . A        TA                .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CA     .  .   .         .       .      . A           G  .     . C         A                   .    .   .  T   .  .  .      .     . C        TA                .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . A           A  .     . C         G                   .    .   .  G   .  .  .      .     . A        CT                .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . A           G  .     . A         A                   .    .   .  G   .  .  .      .     . A        AT                .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    GT     .  .   .         .       .      . T           A  .     . A         A                   .    .   .  A   .  .  .      .     . C        TA                .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . A           G  .     . C         A                   .    .   .  T   .  .  .      .     . T        TG                .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . A           A  .     . C         A                   .    .   .  A   .  .  .      .     . C        TC                .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . A           T  .     . T         G                   .    .   .  G   .  .  .      .     . C        TA                .   . 
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . A           A  .     . C         C                   .    .   .  T   .  .  .      .     . C        TT                .     
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . A           A  .     . T         A                   .    .   .  A   .  .  .      .     . T        T                 .     
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . A           G  .     . G         A                   .    .   .  T   .  .  .      .     . C        T                 .     
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . T           A  .     . T         A                   .    .   .  A   .  .  .      .     . C        T                       
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . A           G  .     . T         A                   .    .   .  T   .  .  .      .     . C        T                       
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   A                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . A           T  .     . C         G                   .    .   .  T   .  .  .      .     . T        T                       
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . A           A  .     . A         G                   .    .   .  A   .  .  .      .     . T        .                       
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    GC     .  .   .         .       .      . A           A  .     . G         G                   .    .   .  A   .  .  .      .     . T                                
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    TG     .  .   .         .       .      . A           G  .     . C         A                   .    .   .  A   .  .  .      .     . .                                
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . A           A  .     . C         A                   .    .   .  .   .  .  .      .     . .                                
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    AG     .  .   .         .       .      . A           T  .     . C         C                   .    .   .  .   .  .  .      .     . .                                
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . A           G  .     . C         A                   .    .   .  .   .  .  .      .     .                                  
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . G           G  .     . C         A                   .    .   .  .   .  .                                                  
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    AT     .  .   .         .       .      . G           A  .     . C         G                   .                                                                     
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CC     .  .   .         .       .      . A           C  .     . T         G                                                                                         
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    GA     .  .   .         .       .      . A           A  .     . C         G                                                                                         
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CC     .  .   .         .       .      . C           A  .     . G         G                                                                                         
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . A           A  .     . C         G                                                                                         
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . C           G  .     . C         G                                                                                         
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    TC     .  .   .         .       .      . C           G  .     . .         G                                                                                         
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    TC     .  .   .         .       .      . A           A  .     . .         G                                                                                         
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   G                                .          .    CA     .  .   .         .       .      . A           G  .     . .         G                                                                                         
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CG     .  .   .         .       .      . T           A  .     . .         G                                                                                         
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   G                                .          .    CC     .  .   .         .       .      . A           .  .     . .         G                                                                                         
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   G                                .          .    CC     .  .   .         .       .      . C           .  .     . .         .                                                                                         
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    TA     .  .   .         .       .      . C           .  .     . .         .                                                                                         
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    TC     .  .   .         .       .      . C           .  .     . .         .                                                                                         
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   C                                .          .    TT     .  .   .         .       .      . C           .  .     . .         .                                                                                         
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    TC     .  .   .         .       .      . C           .  .     . .         .                                                                                         
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   G                                .          .    TC     .  .   .         .       .      . C           .  .     . .         .                                                                                         
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   G                                .          .    TC     .  .   .         .       .      . C           .  .     . .         .                                                                                         
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   G                                .          .    TC     .  .   .         .       .      . C           .  .     . .         .                                                                                         
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   G                                .          .    TT     .  .   .         .       .      . C           .  .     . .         .                                                                                         
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   G                                .          .    TC     .  .   .         .       .      . T           .  .     . .         .                                                                                         
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   G                                .          .    TC     .  .   .         .       .      . C           .  .     . .                                                                                                   
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   G                                .          .    TC     .  .   .         .       .      . A           .  .     . .                                                                                                   
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   G                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . C           .  .     .                                                                                                     
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   G                                .          .    TC     .  .   .         .       .      . C           .  .     .                                                                                                     
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   G                                .          .    TC     .  .   .         .       .      . C           .  .     .                                                                                                     
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   G                                .          .    TT     .  .   .         .       .      . A           .  .                                                                                                           
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . A           .  .                                                                                                           
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   G                                .          .    TC     .  .   .         .       .      . A                                                                                                                          
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   G                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . C                                                                                                                          
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   G                                .          .    GT     .  .   .         .       .      . G                                                                                                                          
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   G                                .          .    TT     .  .   .         .       .      . T                                                                                                                          
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   G                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . C                                                                                                                          
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    TA     .  .   .         .       .      . A                                                                                                                          
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    TC     .  .   .         .       .      . C                                                                                                                          
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   G                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . A                                                                                                                          
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   .                                .          .    TC     .  .   .         .       .      . A                                                                                                                          
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   .                                .          .    CC     .  .   .         .       .      . A                                                                                                                          
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   .                                .          .    CA     .  .   .         .       .      . A                                                                                                                          
blockSeqs                     :            .   .       .            .   C       .          .    .     .   .                                .          .    CT     .  .   .         .       .      . C                                                                                                                          
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   .                                .          .    TC     .  .   .         .       .      . C                                                                                                                          
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   .                                .          .    TT     .  .   .         .       .      . C                                                                                                                          
blockSeqs                     :            .   .       .            .   T       .          .    .     .   .                                .          .    TT     .  .   .         .       .      . A                                                                                                                          
blockSeqs                     :            .   .       .            .   A       .          .    .     .   .                                .          .    TA     .  .   .         .       .      . A                                                                                                                          
blockSeqs                     :                        .            .   A       .          .    .     .   .                                .          .    TG     .  .   .         .       .      . A                                                                                                                          
blockSeqs                     :                        .            .   C       .          .    .     .   .                                .          .    CA     .  .   .         .       .      . G                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                     .   T       .          .    .     .   .                                .          .    TC     .  .   .         .       .      . C                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                     .   .       .          .    .     .   .                                .          .    CC     .  .   .         .       .      . C                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                     .   .       .          .    .     .   .                                .          .    TC     .  .   .         .       .      . C                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                 .          .    .     .   .                                .          .    TC     .  .   .         .       .      . C                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                 .     .   .                                .          .    TC     .  .   .         .       .      . C                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                 .     .   .                                .          .    TC     .  .   .         .       .      . A                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                 .     .   .                                .          .    CA     .  .   .         .       .      . A                                                                                                                          
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originalCons                  :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------GAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-C-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--A--TT---TT-GT-A--GG-G----C---TT--G--A--A--AT-TTGT-C--T-C---C-GA--AG-TA-GT---CATT-----T-T-C---ACTA----T---T---TTTCTG--TC--ATTT
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Alignments
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lowQualScore                  :      5   5 4 5 3333333 333333    66 55  1111111 9999999999 11 4 11111 66  666  4  4    8   8 00  9999 4  4 11  8 4    111  000000 44 444 999999999 00000   33 4 4 6 11111  777  77 2 88  6 11111111  99999 99 99  7    0 33 0 888 0  777 0  0  888    66666 0 00000 5  000000000000      22  00    
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Reference ( family-161 )      :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------GAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-C-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--A--TT---TT-GT-A--GG-G----C---TT--G--A--A--AT-TTGT-C--T-C---C-GA--AG-TA-GT---CATT-----T-T-C---ACTA----T---T---TTTCTG--TC--ATTT
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gi|110965                     :  GGGT-CCA-A-G-G-------C------GAAG--C--CC--T----G----------A--T-G-----G--GG----C-CA-GGGG-GCG-A---G----C-CC-C--CG-A-AA-C---TC--C-A-G--A---G---------T-----TTT--A-A-A-G--A--TT---TT-GT-A--GG-G----C---TT--G--A--A--AT-TTGT-CCTC-C---C-GA--AG-TA-GT---CATT-----T-C-T---GTCA----T---T---TT
gi|110966                     :  GGGT-CCA-GAG-G-------C------AAAG--C--CC--T----G-------------T-G-----G--GG--TCC-CA-TGGG--CG-A--A-----T-CC-C--TG-G-AAGC---TC--C-A-G--A---G---------T-----TT---A-G-A-G--A--TT---TT-GT-A--GG------C---TT-----A--A--AT-TTGT-C--T-C---C-GA--AG-TA-GT---CATT-----T-TGC---AC----------T---TTTCTA--TC--ATTT
gi|110967                     :  GGGT-CTG-G-G-G-------CCGCCTTGAAGGCC--CC--C----A----------G--T-G-----G--G----TC-CT-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--TG-G-AAGC---TC--A-A-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--A--TT---TT-GT-A--GG-G----C---TT--G--A--A--AT-TTGT-C--T-C---C-GA--AG-TA-GT---CATT-----T-T-C---AGTA----T---
gi|110968                     :  GGAT-CCA-G-G-G-------C------GAAG--C--CC--T---------------G--T-A-----C--GG--GGT-CATGGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AACG---TC--C-------------------------------A-G-A-G------T---TT-GT-A---G-G----C---TT--G--A--A--AT-TT-T-C--T-C---C-GA--AG-TA-GT---AATT-----T-T-C---ACTA----T---A---TTTCTG--TC--ATTT
gi|110969                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------GAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--G-C-TA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-T--CG-G-GAAG---TC--C-A-G--A---G---------TTTTAGTTT--A-G-A-G--A--TT---AT-GT----TG-G----C---TT--G-----A--AT-TTGT-T--T-C---C-GA--AG-TA-GTC--CATT-----T-TCC---ACTA----
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gi|110971                     :  GGGT-CTG-G-G-G--------------GCTG--C--CT--T----G----------AA-T-G-----G--G----CC-CA-CGGG--CG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-CAG--A---A---------T-----TTTA-A-G-A-G--A--TT---TT-AT-A--GG-G----C---TT-----A--A--AT-TTGT-C--T-C---C-GA--AGATA-G----CA-T-----T-T-C---AATA--------T---TTTCTG--TC--ATTT
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gi|110975                     :  GGGT-CCA-G-G-A-------C------AAAG--C--A------------------------G-----G--GG--GTC-AA-GG----TG-A--AG----C-CT-C--CG-G-AAGC---TGG-T-C-G--A---AGCTTCTAGAT-----TTT--A-C-A-G--A--CT---TT-GT-A--GA-G----C---TT--G--A--AGTAC-ATGT-T--T-C---C-AA--TG-TA-GT---AATT-----T-T-C---GATA----C---T---TTTCAT--TC--ATTT
gi|110976                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------GAAG--C--CG--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCA-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--TG-T-AAGC---TC--C-A-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--A--
gi|110977                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AATG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCA-A--AG----C-CC-C--CA-G-AAGT---TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--A--TT---TT--T-G--GA-G---------T--A--A--A--AT-TT
gi|110978                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C-------AAG--G--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CA-G-AAGC---TC--C-T-G--A---A---------T-----TTG--A-G-ATG--A--TT---T---T-A--GGAG---------T--A--A--A--AT-TT
gi|110979                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--C--CC--T----G----------T--T-A-----G--GG--GCC-AA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TG--G-T-G--C---A---------T-----TTT--A-G-A-C--A--AT---TA-AG-A--GA-GGTATT---TT--C--A--A--A----GT-C--T-C---T-GA-----TA-CA---CATT-----T-T-C---TTTA----A---T---TTT
gi|110980                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAGG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--TTC-CA--GGG-GCG-A--AG----C-CC-C--C--G-AAGC---TC--C-T-G--A---AT--------T-----TTT--A-G-T-G--T--TT---TA-GG-A--G------------T--A--A--A--AT-T
gi|110981                     :  GGGT-C-A-G-G-G-------C-------AAG--G--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CCAC--CG-G-AAGC---TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-G-CTG--A--TT---TT-
gi|110982                     :  GGGT-CCA-G-G-A-------C------AAAG--C--TC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GT----------GC-----AG----C-CC-C--CA-G-AAGC---TCA-T-T-G--A-------------T-----TTT--A-C-T-G--A--TT---TC-AT-A--CG-G----C---TT--G--A--T--GT-ATGT-C--T-CGGGC-CA--TG-TA-GT---AATT-----T-T-A---AAAA----A---T---ATTTTG--TC--ATTT
gi|110983                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAGG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-AA-GAGG-GCG-A----------CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--A--TT---T
gi|110985                     :  GGGT-CCA-G-G-C-------C------AAGG--C--CCC-T----G----------G--T-G-----G--GG---TC-CA-GGGG-GCG-A--AG------CC-C--CG-G-AAGC---T---C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--A--GT---TT--T-A--GG-A----A----T--A--A--A--AT-T
gi|110986                     :  GGGT-TCA-G-T-G-------C------AACA--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG--CA-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-C-T-G--A--TT---TT--T-G--GA-G---------T--A--A--A--AT-TT
gi|110987                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------GATG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-TA-GGGG-GCA-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-T-G--G---G---------T-----TTT--A-
gi|110988                     :  GGGT-C-A-G-G-G-------C------AAGG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA--GGG-GCG----AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-T-GT-A---A---------T-----TTT--A-G-GTG--A--TT---T---T-A--GG-A----A---GT--A--A--A--AT-TT
gi|110990                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAGG--C--CC--T----G----------T--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCACA--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---T---C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--T--TT---TA-GG-A--G------------T--A--A--A--AT-TT
gi|110992                     :  GAGT-CCA-G-G-G-------G------CAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG---TC-CA-GGGG-GCG-A--AG------CC-C--CG-G-AAGCT--TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-T-T-G--A--TT---T
gi|110993                     :  GAGT-CCA-G-G-G-------G------CAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG---TC-CA-GGGG-GCG-A--AG------CC-C--CG-G-AAGCT--TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-T-T-G--A--TT---T
gi|110994                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--T--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TG--G-C-G--A---G---------T-----TTT--
gi|110997                     :  GGGT-CCA-G-G-A-------C------AAAA--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-TT-GGGG-GCG-A--A----------------G-GAGC---TC--T-G-G--A---A---------T-----TTT--A-C-A-G--AT-TT---TT-AT-A--GG-G----C---TT--G--A--
gi|110998                     :  GGGT-CTG-G-G-G-------A------AAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AT----C-CC-T--CG-G-AA------C--C-T-G--GTACA---------T-----TTT--A-G-ACA--A--TT---AA-GA-G--GG-G----CATTTT--C--A--A--A----GT-A--T-C---T-GA-----TA-CA---CATT-----T-T-C---TTTA----A---T---TTT
gi|110999                     :  GGGT-C-A-G-G-G-------C------AACA--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGT-GCG-A--AA----C-CC-C--CG-G-AAGT---TC--A-G-G--A---A---------T-----TTT--T-G-T-G--A--TT---T---T-A--GGAG----C-------A--A--A--AT-TT
gi|111000                     :  GGAT-CCA-G-G-GG------C------AAGG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CC-GGGG-GCT-A--AG----C-CC-C--C--G-AAGC---T---C-T-G--A---A---------T-----TTTA-A-G-T-G--A--TT---TT--T-A--GGAG---------T--A--A--A--AT-T
gi|111001                     :  GGGT-CCATG-G-G-------C------AAGG--C--CCC-T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-CGG-A--AG----C-CC-C--CG-C-GAGC---TC--C-T-G--A---AAT-------T-----TTT--A-G-T-G--A--TT---TT-
gi|111002                     :  GGGT-CCA-GAG-G-------C------AATG--C--C---T----G----------G--T-G-----G--GG---TT-CA-GGGG--CG-A--AG----TTCC-C--CG-G-AAGC---TC--A-T-G--A---A---------T-----ATT--A-G-T-G--A--TT---TT--T-G--GA-G---------T--A--A--A--AT-TACC-C--T-C---A-AA--GG-TA-
gi|111003                     :  GGGT-CCA-GCG-G-------C------AGCG--C--CC--T----G----------A--T-G-----G--AG--GTC-CA-GGGG-ACG-A--AGAAACC-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-C-G--A---T---------T-----ATC--A-G-T-G--A--TT---TT--T-G--GA-G---------T--A--A--G--AT-TT
gi|111004                     :  GGGT-CCA-G-G-A-------C------AGAT--CATCT--T----G----------G--TAG-----G--GG--GTC-CA-AGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-A-AAGC---T---G-A-G--A---G---------G-----TTT--G-G-C-A--G--TT---TC-AT------------T---TT--G--A--A--AT-
gi|111005                     :  GGGT-CCA-G-GCG-------C------G-----C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG---TC-CA-TTGG--CG-A--AG----C-CC-C--CC-G-AAGT---TC--C-C----A---G---------A-----TTC--A-G-T-G--G--TT---TT-GG-A--G-----------TT-----A--A--AT-TT
gi|111006                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--C--TT--T----ATATATAAATAG--T-G-----G--GG--ACC-CA-GGGA-GCT-ATAAA----C-CC-C--CG-G-GATC---TC--C-T-G--G---A---------T-----TTA--A-C-A-G--A--TT---TT-AT-A--GG-G----C---GT--AT-A--G--AT-TAGG-C--C--------A--TG-TA-AT---CATT-----T-T-
gi|111007                     :  GGGT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCA-A--AG----T-CC-C--CG-G-AAGC---T
gi|111008                     :  GGGC-CCA-G-G-A-------C------GG-G--C--CT--T----G----------G--T-A-----GA-GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----T-CC-C--CG-G-AAGC---T-------G--A---G---------G-----TTT--T-G-G-C--A--TT---TTCAT------------T---TT--G--A--A--AT-T
gi|111009                     :  GGGT-CTG-G-G-A-------A------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-A-----G--GG--GCT-CA-GGCG-GTG-A--AA----C-CC-C--CG-G-AAGC---AC--C-T-G--A---GGGC------T-----TTT--A-A-A-G--C--TA---TT-TT-A--GG-G----G---TT--ATCA--A--AT-T
gi|111010                     :  GGAT-CCA-G-G-A-------T------GG-G--C--CC--T----G----------G--T-T-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GTG-A--AG----C-CC-C--GG-G-AAGC---T-------G--AGAGG---------A-----TTT--A-G-A----A--TT---TT-
gi|111011                     :                                 G--C--CC--A----G----------G--G-G-----GCGGG--GCC-C--GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C---G-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTA--A-G-A-G--C--TT---TT-A--A--CA-G----T---T------A--A--AT-TT------------C-GA--GG-T--GT---TAAT-----T-T-A---GCTA----T---A---TATCTA--T
gi|111012                     :                               ggG--C--CC--A----G----------G--G-G-----GCGGG--GCC-C--GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C---G-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTA--A-G-A-G--C--TT---TT-A--A--CA-G----T---T------A--A--AT-TT------------C-GA--GG-T--GT---TAAT-----T-T-A---GCTA----T---A---TATCTA--T
gi|111031                     : ggGGT-CCA-G-G-G-------C------AACG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG-----------------------------------CT-G-AAGC---TC--C-A-G--A---G---------T-----TTA--AAG-A-G--A--TT---TT-GTTA--GG-G----C---TTATG--A--A--AT-TTGT-C--TTC---C-GA--AG-TA-------ATT-----T-T-C---ACTA----T---A---TTTCTA--TC--ATTT
gi|111032                     :   GGT-CCA-G-G-A-------C------AAAA--C--CA--T----T----------A--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGTA-ACA-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-G-G--T---A---------T-----TTT--A-C-A-G--A-------TT-AT-A--GA-A----A---TT--G--A--A--GT-ATGT-C--T-C---C-CG--TG-TA-GT---CATT-----T-T-T---GATA----C---T---TTTTTG--TCTAATTT
gi|111033                     :   GGT-CCA-G-G-G-------C------AGCG--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTT-CA--GGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CT-G-AAGT---TC--C-C-G--A---A---------------TTC--A-G-T-G--T--TT---TT-GG-A--G-----------TT-----A--A--AT-TT
gi|111035                     :   GGT-CCA-G-G-G-------C------AACA--C--CT--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGAG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--C-C-G--A---A---------T-----TTC--A-G-T-G--A--TT---TT-TT-G--AG-----------T--A--A--A--AT-TT
gi|111037                     :   GGT-CTA-G-A-A-------T------GAA---C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-A-G--G---G---------T-----TTA--A-G-G-G--C--TT---TT-
gi|111039                     :   GGT-CTG-G-G-G-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--A-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGG---TT--T-C-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111040                     :   GGT-CTA-G-A-A-------T------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGT---TC--T-T-G--G---G---------T-----TTA--A-G-G-G--C--TT---TT-
gi|111041                     :   GGT-CTG-G-A-G-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--C-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CG-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-AA-A--GG-
gi|111042                     :   GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-T-A-G--C--TT---CT-
gi|111043                     :   GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG---CC-CA-GGAG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-TAGC---TA--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111044                     :   GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG----C-CA-GGGA-GCG-A--AA----C-CC-C--CG-A-AAGC---TC--T-C-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111045                     :   GGT-CTA-G-A-A-------T------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GG----C-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--TG-G-AAGC---TC--T-T-G--G---G---------T-----TTA--A-G-G-G--C--TT---TT-
gi|111046                     :   GGT-ATG-G-G-G-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--C-G-----G--GG--GCA-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111047                     :   GAT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-ACG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-A-A-G--T--TT---TT-
gi|111048                     :   GGT-CTG-G-G-T-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--C-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--GG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--G-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111049                     :   GGTACTA-A-G-G-------C------AAAG--C--CA--T----G----------T--T-G-----G--AG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-A-AAGC---TC--C-T-GGAA---G---------T-----TTT--A-C-A-A--A--TT---T
gi|111050                     :   GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--TG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAAC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-
gi|111051                     :   GGT-CTG-G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--C-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG------CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--G-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111052                     :   GGT-CTA-G-A-A-------T------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GA--GCC-CA-GGGG-GCA-A--AG----C-CC-C--TG-G-AAGC---TC--T-T-G--G---GTTGAAGGGCT-----TTT--A-A-A-GTTA--TT---TT--T-A--GG-G----G---TT--
gi|111055                     :   GGT-CTG-G-A-A-------T------GAAC--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--GG--CCC-CA-GGGG-GTG-A--AG----C-AC-C--CG-G-AAGC---TC--C-T-G--G---A---------T-----TTA--A-G-A-G--C--TT-------T-A--GG-GAT--C---T------------AT-TTAT-C--T-
gi|111057                     :   GGT-CTA-G-C-A-------T------AAAG--C--CA--A----A----------G--T-T-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------------TTT--A-A-A-G--C--TT---TT-
gi|111087                     :    GT-CCA-G-G-G-------C-------AAG--G--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--C--G-AAGC---TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--A--TT---T---T-A--GGAG---------T--A--A--A--AT-TT
gi|111089                     :    GT-CCA-G-G-G-------C------AAAG--C--CC--T----G----------G--T-A-----G--AG--GCC-CA-GGGA-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TG--G-T-G--C---A---------T-----TTA--A-G-A-C--A--AT---TA-AG-A--GA-GGTATT---TT--C--A--A--A----GT-C--T-C---C-GA-----TA-CA---CATT-----T-T-C---
gi|111090                     :    GT-CCA-GAG-G-------C------AACG--CG-CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGGGGCG-A--AG----C-CC-C--CG-G--AGC---TCA-C-C-G--A---G---------T-----TTC--A-G-T-G--A--TT---TT--T-G--GA-G--------TA--A--A--A--AT-TT
gi|111091                     :    GT-CGA-G-A-A-------T------GAAG--C--CC--A----A----------G--T-G-----G--AG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----T-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-T-G--A---G---------T-----TTA--A-G-G-G--C--TT---T
gi|111092                     :    GT-CTG-G-G-G-------T------CAAG--C--CCA-T----G----------A----G-----G--GG--GAC-CA-GGGG-GCG-A--AG----T-CC-C--CG-G-AAGT---TT--C-T-G--G---G---------T-----TTT--A-G---G--G--CT---TT-GT-A--AG-
gi|111093                     :    GT-TTA-T-G-A-------C------AAAG--C--TC--TTGAAA----------G--T-G-----G--GG---CC-AA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-A-G--G---G---------T-----TTTGCG-G-A-G--T--TT---TA-AT-A--G
gi|111094                     :    GT-CTA-G-G-GA------T------GAAG--T--CA-------A----------A--T-T-----G--GG--GTC-CA-GGGG--CG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-T-G--C--TT---TT-
gi|111104                     :     T-TCA-GAG-G-------C------AGGG--G--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-AG-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C---G-G-AAGC---TC--C-T-G--A---A---------T-----TTT--A-G-T-G--A--TT---T---T-A--GGAG---------T--A--A--A--AT-TTAT-
gi|111105                     :     T-CTG-G-G-A-------T------AAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG---CC-CA-GGGG--TG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111106                     :     T-CCA-G-G-G-------C------AACG--C--CT--C----T----------G--T-G-----G--GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--CTT-G--A---A---------T-----ATT--C-G-T-G--A--TT---TT-TT-G--GA-G----
gi|111111                     :      -CCA-G-G-G-------C------GAAG--C--CCC-T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GTGAA--AG----C-CC-CCGCG-A-AAGC---TC--C-C-G--A---G---------T-----TTT--A-A-A-G--AT-TT---TT-GTCA--GG-G----C---TT--G--AATA--AT-TTGT-C--C-C---CTGA--AG-TATGT---CA-T-----T-T-C---AC-A----A---T---TTTCTG--TC--ATT
gi|111112                     :      -CCA-G-G---------C------GAAG--C--CC--T----G----------GACT-G-----G--GGGGGCC-CA--GGG-GCG-AG-AT----T-CC-C--CGAA-AAGC---TC--C-A-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--A---T---CT-GT-A--GG-G----C---TT--G--A--A--AT-TGGT-C--T-C---C-GA--GG-GA-GTGAGTATT-----TGT-C---ACTA----TA--A---TTTCTGTTTC--ATTT
gi|111113                     :      -CCA-G-A-G----------------AG--C--T---T----G----------G--T-T-----G--GG--GTC-CA-GGAG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-A-------------------------------T-----TTT--A-C-A-G--A--TT---TT-AT-G--TC-G----C---TT--G--A--A--G----AT-C--T-C---T------G-TA-GT---AATC-----T-T-T---AATG----CA--T---TTTCT---TC--ATTT
gi|111114                     :        CA-G-G-GGTC----T------GAGG--C--TC--T------------------C-A-----G--GG--GCCTCA-GAT------A--AG----C-AA-T--CG-G-AAGC---TC--C-T-G--G---A---------T-----TTT--A-G-A-G--A--TTCTATT-CT-ATTGG-G----C---TA--G--A--A--GT-ATGT-C--T-C---C-CA--TG-AA-GT---CATT-----T-T-----AATA----TCG-T---TTTCTG--TT--ATTT
gi|111118                     :          -G-G-A-------T------GAAG--C--CA--A----A----------G--T-G-----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111119                     :          -G-G-G-------T------GAAG--C--GA--A----A----------G--T-G-----G--GG---CC-CA-GGGG-GTG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-T-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---T
gi|111120                     :                                                                 -----G--GG--GCC-CA-GGGG--CA-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-T-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111124                     :        ggatgaagccaaaagt------GAGG--C--CCCGT----G----------G--T-TTCCTTG--GG--GTC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-A-GA-A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--A--TT---TT--T-A--GGCG----C---TT--G--A--A--AA-TTGG-CA-T-A---C-GA--A--TA-GTA--CATT-----T-T-C---AC-A----T---A---TTTCTG--TC--ATTT
gi|111125                     :                        ------GAGG--CT-CC--C----A----------G--T-G-----G--G----TC-CA-GGG---CA-A--GG----C-CG-T--GG-G-GAGCGGGTC--T-G-G--G---A---------T-----TTC--A-C-A-G--A--TT---TT-AT-A--GG-G----C---TT--G--A--A--AT-ATGT-C--T-C---CTTA--TG-TC-GT---CATT-----T-T-TTAAAATA--------T---TTTCGG--TC--ATTT
gi|111136                     :                                 G--C--CC--T----G----------G--T-G-----G--GG--GCC--A-TGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-A-AAGC---TC--C-A-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--A--TT---TT-AT-A--GG-G----T---TT--G--A--A--AT-TTGT-C--T-C---C-GA--AG-TA-GT---CATT-----T-T-C---ACTA----T---G---TTTCTG--TC--ATTT
gi|111146                     :                                            ----G----------G--T-G-----G--GG---TC-CA-GGGG-GCA-A--A-------CC-C--CT-A-AA------------------------------T-----TTT--A-C-A-C--G--TT---TT-AT-A--GG-G----C---TT--G--A--A--GT-ATGT-C--T-C---C-CA--TGTTA-GT---CATTATTTAT-T-C---ATTA----T---C---T
gi|111149                     :                                                                 -----G--GG--GCC-CA-GGAA-GCG-A--AG----C-CC-CCCCG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111152                     :                                                                                                             gtG-G-CAGC---TC--C-C-G--G---A---------T-----TCA--A-A-A-A--AAGTT---TT--T-A--GG-A----G---TA--G--A--A--AT-TTGT-C--T-C---T-CA--TG-TA-GT---CATC-----T-T-T---AATA--------T---TTTCTG--TC--ATTT
gi|111157                     :                                            tgaggcacacagggaggggat-----G--GG--GCC-TA-GGGG-GTG-A--AT----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-C--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-G---------------------------A--AT-TTAC-C--T-T---T-----AG-GA-GT---TAAT-----T-T-T---GCTA----T---
gi|111158                     :                                                                 -----G--GG--GCC-TA-GGGG-GCG-A--AT----C-CC-T--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT--------------------------A--A--AT-TTAC-T--T-T---T-----AG-GA-GT---TAAT-----T-T-T---GCTA----T---A---TATCTA--T
gi|111159                     :                                                                 -----G--GG--GCC-CA-GGGG-GCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGCTA-TA--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-
gi|111165                     :                                                                           --GCC-CA-GGGGGGCG-A--AG----C-CC-C--CG-G-AAGC---TC--T-C-G--G---G---------T-----TTT--A-G-A-G--C--TT---TT-GA-A--G
gi|111167                     :                                                                               C-CA-GTGG-GCG-G--AG----T-TC-C--CG---AACC---ATGAC-T-G--A---A---------T-----TTT--A-ACA-G--A--TT---TT-AT-A--GG-G----CT--TT--G--A--T--AT-ATGT-T--T-C---C-TGTTGG-TG-GT---CATT-----T-T-TA--AATA----T---T---TTTTTG--CC--ATTT
gi|111171                     :                                                                                       G-GCG-A--AG----C-CC-T--GGTG-GGGC---TC--C-A-G--A---G---------T-----TTT--A-G-A-G--A--TA---TT-GT-A--GG-G----C---TT--
gi|111173                     :                                                                                                               G-G-GATC---TC--T-A-G--A---G---------A-----TTT--A-G-A-G--A--TT---TT-AT-A--GG-G----C---TT--G--A--A--AT-TTGT-C--T-C---C-GA--AG-TA-GT---CA---------------------------T---TTTCTG--TC--ATTT