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Reference ( gi|22417 )        :        AAAT-T-T-CT-CA--G---CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TACC-A---G---G-G-C---C-------CA---T---C-CT-GGATCCTCT
gi|22264                      :        AAAT-C-T-CT-CA--G---CTT-CC-----GGGG-GC-TT-CCG----C--C-C--CC-T----GGCA-C--C---------C-CC-TACC-A---G---G-G-C---C-------CA---T---C-CT-GGATCCTCT
gi|22419                      :       aAAAC-C-T-CT-CA--G---CTTTCC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TATC-A---G---G-G-C---C-------CA---T---C-CT-GGATCCTCTaggg
gi|22268                      :        AAAC-C-T-CT-CA--G---CTT-CC-----AGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TACT-A---G---G-G-C---C-------CA---T---C-CT-GGATTCTCTagg
gi|22280                      :       aAAAT-T-T-CT-CG--G---CTT-CC-----GGG---C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--A---------C-CC-TACC-A---G---G-G-C---C-------CA---T---C-CT-GGATCCTCTaggg
gi|22282                      :       aAAATAC-T-CT-CA--G---CTT-C------GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--C--T----GG-A-C--C---------C-CC-TATC-A---G---G-G-C---C-------CA---T---C-CT-GGATCCTCTaggg
gi|22271                      :       aAAAT-T-TACT-CA--G---CTT-TC-----TGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TACC-A---G---G-G-C---C-------AT---T---C-CT-GGATCCTCTaggg
gi|22275                      :       aAAAT-T-T-CT-CA--G---CTT-CC------GGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GA------C---------C-CC-TACC-A---G---G-G-C---C-------CA---T-----CT-GGATCCTCTaggg
gi|22424                      :       aAAAC-C-T-CT-CA--G---CTT-CC-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A-G--C---------C-CC-TACC-A---G---G-G-----C-------CA---T-----CT-GGATCCTCTaggg
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gi|22281                      :       aAAAC-C-T-CT-CG--G---CTT-CT-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TACC-A---G---A-G-C---C-------CA---T---T-CT-GAATCCTCT
gi|22305                      :       aAAAA-C-T-CT-CA--G---CTTTCC-----GGGG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A-C--CG--------C-CC-TACC-AG--G---G-G-C---C-------CA---T---C-CT-GGATCCTCTaggg
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gi|22283                      :       aAAAT-T-TGCT-CA--G---CTT-CC-----GGGG-AC-TTTC-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CCATACC-A---G---G-G-T---T-------AT---T---C-CT-AGACC
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gi|22347                      :        AAAC-C-T-CT-CA--G---CTT-GC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------CACC-TA-C-A---A---G-G-C---CTGGACAGCG---T---C-CT-GGAc
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gi|22331                      :       aAAAT-C-A-CC-CA--G---TTT-CCATGCAGGGG-AC-TT-C-G----C--TTC--CC-T----GG-A-C--T---------C-CC-TGCC-A---G---G-G-C---C-------CG---T---C-CT-GGACCCGCTaacttggg
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gi|22337                      :       aAAAT-T-T-CT-TA--G---CTT-C-------GGG-TC-TT-C-G----G--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TACC-A---G---G-G-T---T-------AT---T---C-CTCGGACCc
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gi|22363                      :       aAAAT-A-T-CT-CA--G---CT--CC-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--AC-T----GA-A-C--C---------C-CC-TACA-A---G---G-G-----C-------AA---TG--C-CT-GGACCagctgtgg
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gi|22313                      :       aAAAC-C-T-CT-CA--G---CTT-CA-----AGGG-GC-TT-C-G----C--C-T--CT-T----GG-A-C--C---------C-CC-TACC-A---A---G-A-----T-------CA---T---C-Cagctgtgg
gi|22351                      :       aAAAC-C-T-CT-CA--G---CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--T-C--CC-T----TG-A----C---------C-CC-TA-C-A---G---G-G-G---T-------TA---T---TGCT-GGACCctgtaccaactgtgg
gi|22345                      :       aAAAC-C-T-CT-AA--G---TTT-TC-----GGGG-GC-TT-T-G----T--C-C--CC-TCCCTGG-A-C--C---------C-CC-TACA-A---G---G-G-C---C-------TG---T---C-CT-AGA-CCTagctgtgg
gi|22348                      :       aAAAA-T-T-CT-TAATG---CCT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A----C---------C-CC-TACC-A---G---G-G-T---T-------AT---T---C-CT-GGACCctgg
gi|22323                      :        AAAT-T-C-CT-GA--A---CTT-CC-----GGGG-GT-TT-C-G----C--A-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--ACC-A---G---G-G-agctgg
gi|22340                      :       aAAAA-T-T-CA-GA--G---CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-C---ACC-A---G---G-G-G---C-------CT---TGG-C-CT-GGACCCtgttgccctgacccactgggg
gi|22269                      :        AAAT-T------CA--GGAACTT-CT-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--ACC-A---G---G-G-------------CA---TTGCC-CT-GGACCCACTaccactgggg
gi|22272                      :       aAAAA-T-T-CA-GA--G---CTT-CC-----GGGG-GC-TTGT-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--AAC-A---G---G-G-C---CT------TG---C---C-CT-GGACCCACTgggg
gi|22335                      :        AAAC-C-T-CT-CG--G---CTT----------------TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--ACC-A---G---G-G-C---T-------TG---C---C-CT-GGATCCACTagag
gi|22341                      :       aAAAA-T-T-CA-GA--G---CTT-C------GGGG-GC-TT-A-G----C--C-C--CC-G----GG-A-C--C---------C-CC--ACC-A---G---G-G-C---CTTG----C----C---C-CT-GGATCCgggg
gi|22326                      :        AAAC-C-T-CT-CA--G---CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--GC-T----GA-C-C--C---------T-CC-TACT-A---A---G-G-CTA-C-------GT---T---T-CT-GGACCCACTcactgggg
gi|22430                      :       aAAAT-T------CA--GGA-CTT-CC-----GGGG-GC-T--C-G----C--C-C--CC-T----GATA-C--C---------C-CC--ACC-A---G---G-G-C---C-------TT---TGC-T-CT-GGACCCACTgtgg
gi|22452                      :         AAT-C-T-TT-CA--G---CTT-CC-----GGGG-GT-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A-T--C---------C-CC-TACT-A---A---G-G-C---C-------TG---T---C-CT-GGATTCGCTgggg
gi|22291                      :          AT-T-T-CT-TA--T---CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TACC-A---G---G-G-T---T-------AT---T---C-CT-GGACCgggg
gi|22334                      :       aacAT-C-T-CT-CA--G---CCT-TC-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--GC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TACC-A-------G-G-C---T-------CAG--C---C-CT-GGACCagctgtgg
gi|22425                      :         aat-T-T-CT-CG--G---CTT-CT-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TACC-A---G---A-G-C---C-------atgcagctgggg
gi|22358                      :         aaacc-T-CT-CA--G---CTT-C------GGGG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-G-A--C---------C-CC-TACCGA---G---G-G-C---C-------TA---T---C-CT-GGATC
gi|22464                      :         aaaacgc-CT-CA--G---CTT-CC-----GGGG-AC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-TC-TACC-A---A---G-G-C---C-------CG---T---C-CT-GGGCCCGCT
gi|22296                      :                -CT-CA--G---TTT-TC-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TACC-A---G---G-C-C---C-------TG---T---C-CT-GGACC
gi|22321                      :          aaaaac-CT-CG--G---CTT-CT-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-ACC--C---------C-CC-TACC-A---G---A-G-----C-------CA---T---T-CT-GAATCCTCTtgatggg
gi|22433                      :        aaaacctg-CT-CA--G---TTT-CC-----GGGA-GC-TT-TTG----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-C--TACC-A---G---G-A-C---C-------AG---T---T-CT-GGACCCaggg
gi|22468                      :             aaacca-CA--G---CTT-CC-----GGGG-AC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--ACC-A---G---G-G-CT--T-------TG---C---C-CT-GGACCCgatgggg
gi|22312                      :                   -CA--G---CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CCTT----GG------C---------C-CC-TAAC-A---G---G-G-CT--T-------TG---C---C-CT-GGACCCattg
gi|22299                      :            aaaatgcacA--G---CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-G-C--C---------C-C---ACC-A---G---G-G-CT--T-------CG---C---C-CT-GGACCCACTattgggg
gi|22297                      :  aaaatctctaaaacgctggA--G---CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-A----C--C-C--CC-T----GG-G-C--C---------C-CC--ACC-A---G---G-G-CT--T-------CG---C---C-CT-GGACCCACTggg
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gi|22290                      :                     A--G---CTT-CT-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--ACC-A---G---G-C-C---T-------TG---C---C-CT-GGACCCACTgggg
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gi|22483                      :                     A--G---CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-C---ACC-A---G---G-G-CTTGC-------C--------C-CT-GGAtactgggg
gi|22482                      :                     A--G---CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-C---ACC-A---G---G-G-CTTGC-------C--------C-CT-GGActcactgggg
gi|22478                      :                     A--G---CTT-C------GGGG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A-A--C---------C-CC--ACC-A---G---G-G-C---CT------TG---C---C-CT-GGACCCACTctcactgggg
gi|22474                      :                     A--G---CTT-CC-----GGGG-GC--T-C-G-------C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--ACC-A---G---G-G-C---C-------gggg
gi|22330                      :                         ---CTA-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-G-C--C---------C-CC--ACC-C---G---G-G-CT--T-------TG---C---C-CT-GGACCCACTttgccctgacccactgggg
gi|22277                      :                                aaaatctggat-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TACC-A---G---G-G-C---C-------CA---T---C-CT-GGATCCTCTgggg





Alignments
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lowQualScore                  :                       0 0  1 0 0 0 00 00   1  22222    0  0  0 0 0000 00 0 11  0 1111  1 0 00 222222222 0  11 00 1111111 0 111 111  0 111111111111111111 11 0  0  0 0  0 1  
lowQualScore                  :                       . .  . . . . .. ..   .  .....    .  .  . . .... .. . ..  . ....  . . .. ......... .  .. .. ....... . ... ...  . .................. .. .  .  . .  . .  
lowQualScore                  :                       5 5  0 5 5 4 66 66   2  88888    8  4  8 8 9999 66 8 00  4 3333  2 4 66 000000000 4  99 55 3333333 8 111 666  4 333333333333333333 00 9  4  4 4  5 0  
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Reference ( family-150 )      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-A-CC-CNCT
gi|22264                      :                    AAA-T-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-CCG----C--C-C--CC-T----GGCA-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TC-CTCT
gi|22268                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----AGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------T-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TT-CTCTaggg
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gi|22291                      :       aaaatcatctcaaattcaggT-C-T-T-A--T--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-CC-AGCTgggg
gi|22292                      :              aacattAAA-T-TT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--T-C--C--T----CG-A-C--C---------C-C--TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-TG-A-TC-CTCTgtgg
gi|22293                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-G--G--CTT-CT-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A----C---------C-CC-TA--C-------C-A---C---AG-C-----C-------C--A-T--T-CT-Gaggg
gi|22294                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GT-TT-C-G----C--C-C--AT-T----GG-A-C--C---------T-CC-TA--C-------T-A---T---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TC-TGCT
gi|22295                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-A----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-TC-TA--G-------C-A---G---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-Ggggg
gi|22296                      :                   aAAA-C-CT-C-----A--G--TTT-TC-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GC-C-----C-------T--G-T--C-CT-GG-A-CC-
gi|22297                      :                  aaAAA-A-CT-C-T-GGA--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-A----C--C-C--CC-T----GG-G-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-CT----T-------C--G-C--C-CT-GG-A-CC-CACTtgatggg
gi|22299                      :                                  -A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-G-C--C---------C-C---A--C-------C-A---G---GG-CT----T-------C--G-C--C-CT-GG-A-CC-CACTgggg
gi|22300                      : aaaatctctaaaacgctggAAA-C-CT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GGGG-GT-TC-C-GGGCTT--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------T-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-CG-A-CC-ggg
gi|22301                      :                   aAAA-T-CA-C-T-C-A--G--CTT-CCATGCAGGGG-AC-TT-C-G----C--TTC--CC-T----GG-A-C--T---------C-CC-TG--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-A-CC-CGCTactgggg
gi|22302                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-A--G--CTT-C------AGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--TC-T----GG-A-C--C---------C-C--TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-gg
gi|22303                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-A--G--CTT-C------GGGG-GC-TT-C-G----C--C-T--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-TC-C-CT-GG-A-
gi|22304                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----AGGG-GT-TT---G----C--C-C--CC-A----GG-A-C--C---------C-CT-T---C-------C-A---G---GG-C-----C-------A--G-T--C-TT-GG-A-CC-CACT
gi|22305                      :                   aAAA-A-CT-C-T-C-A--G--CTTTCC-----GGGG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A-C--CG--------C-CC-TA--C-------C-AG--G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TC-CTCTggag
gi|22307                      :                           T-C-T-C-A--G--CTT-C------GGGG-GC-TT-C---------C-C--CC-T----GG-A-C--C---------T-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-CC-AGCTaggg
gi|22309                      :              aaatttAAA-C-CT-C-T-C-A--A--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----gtgg
gi|22310                      :                   aAAA-T-CT-C-T-C-A--A--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--T-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TT--C-------C-A---G---GG-C-----
gi|22312                      :                               a-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CCTT----GG------C---------C-CC-TA--A-------C-A---G---GG-CT----T-------T--G-C--C-CT-GG-A-CC-CATTgatctctaaactagctggag
gi|22313                      :           aaaatgcacAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CA-----AGGG-GC-TT-C-G----C--C-T--CT-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---A---GA-T-----C-------A--T-C--C-CT-GT-A-CC-AACTgggg
gi|22314                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-AC-TT-C-A----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TG--C-------C-ATGGG---GG-C-----C-------gtgg
gi|22315                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--CCCATACACTC-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--CACG-AG-A-CC-CGt
gi|22316                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-G--G--CTT-CT-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GA-C-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-T-----C-------A--G-C--C-CT-GG-A-CC-
gi|22318                      :                   aAAA-T-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----AGGG-GT-TT-C-A-------C-C--TC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-CC-AGCTagtctggg
gi|22319                      :                   aAAA-T-TT-C-C-T-A--G--CTT-CCC----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-TG---GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------CAA---G---GG-T-----TA------T--GTT--C-CT-GG-A-CC-AGCTgtgg
gi|22320                      :                   aAAA-A-TT-C-T-C-A--G--CTT-CC------GGG-GC-TT-C-G----C--C-CG-CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---CG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-Cgtgg
gi|22321                      :                    AAA-C-CTGC-T-C-G--G--CTT-CT-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-ACC--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---AG-------C-------C--A-T--T-CT-GA-A-TC-CTCT
gi|22323                      :                   aAAA-T-TC-C-T-G-A--A--CTT-CC-----GGGG-GT-TT-C-G----C--A-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-TG----T-------T--G-C--C-CT--G-A-CC-CACTaggg
gi|22324                      :                   aAAA-T-AT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----AGGG-GC-TT-T-G----T--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA----------C-A---G---GATC-----C-------C--G-T--C-CT-GGAA-CC-CACTgggg
gi|22326                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--GC-T----GA-C-C--C---------T-CC-TA--C-------T-A---A---GG-C-----TA------C--GTT--T-CT-GG-A-CC-CACTagag
gi|22327                      :                   aAAA-T-CT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GGGAAGC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--A-------C-A---G---GG-C-----gtgg
gi|22330                      :                                      a--CTA-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-G-C--C---------C-CC--A--C-------C-C---G---GG-CT----T-------T--G-C--C-CT-GG-A-CC-CACT
gi|22331                      :         aaaatctggatAAA-T-CA-C-C-C-A--G--TTT-CCATGCAGGGG-AC-TT-C-G----C--TTC--CC-T----GG-A-C--T---------C-CC-TG--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-A-CC-CGCTgggg
gi|22333                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--T--ATT-CC-----GGGG-GC-TT-C-A----CTCC-C--CC-T----AA-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---AG-G-----C-------T--G-T--C-CT-GG-A-CC-Cgg
gi|22334                      :                     aA-T-CT-C-T-C-A--G--CCT-TC-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--GC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GC-T-----C-------A--G-C--C-CT-GG-A-CC-a
gi|22335                      :                 aatAAA-C-CT-C-T-C-G--G--CTT----------------TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-C-----T-------T--G-C--C-CT-GG-A-TC-CACTatgcagctgggg
gi|22336                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-A--G--CTTTCC-----GTGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A-------GG-C-----C-------C--A-T--C-C--GG-A-TC-gggg
gi|22337                      :                   aAAA-T-TT-C-T-T-A--G--CTT-C-------GGG-TC-TT-C-G----G--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-T-----T-------A--T-T--C-CTCGG-A-CC-AGCTtctaggg
gi|22339                      :                   aAAA-T-TT-C-TTC-A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---GGC-GG-C-----CA------T--GCT--C-TT-GA-A-TC-Cgtgg
gi|22340                      :                                 a-A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-C---A--C-------C-A---G---GG-G-----C-------CTTG-G--C-CT-GG-A-CC-CAtgctaggg
gi|22341                      :                         aaaattcag-A--G--CTT-C------GGGG-GC-TT-A-G----C--C-C--CC-G----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-C-----CT------T--GCC--C-CT-GG-ATCC-CACTcactgggg
gi|22342                      :           aaaattcagAAA-T-GT-C-T-T-A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---Ggggg
gi|22345                      :                   aAAA-C-CT-C-T-A-A--G--TTT-TC-----GGGG-GC-TT-T-G----T--C-C--CC-TCCCTGG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------A-A---G---GG-C-----C-------T--G-T--C-CT-AG-A-CC-TCCTttattcctgaccagctg
gi|22346                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----CG-A----C---------C-CC-TA--C-------C---------GG-C-----C-------C--A-TTCC-TT-AG-A-TC-CTCTgg
gi|22347                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-GC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------CACC-TA----------C-A---A---GG-C-----CTGGACAGC--G-T--C-CT-GG-A-Cagg
gi|22348                      :                   aAAA-A-TT-C-T-T-AATG--CCT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A----C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-CC-AGCT
gi|22350                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----AGCG-GCTTT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TT--C-------C-A---G---AG-C-----C-------T--G-T--C-CT-GA-A-Cgg
gi|22351                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--T-C--CC-T----TG-A----C---------C-CC-TA--C-------A-G---G---GG-T-----T-------A--T-T--G-CT-GG-A-CC-AGCT
gi|22355                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--A--CTT-CTA----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-CGGCC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--T-------C-A---G---TG-C-----C-------A--G-C--C-TT-GG-A-TT-CCCTgtgg
gi|22356                      :                   aAAA-C-TT-C-T-C-A--T--CTT-C-------GGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A----C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-AC-Cgggg
gi|22358                      :                   aAAA-CGCT-C-T-C-A--G--CTT-C------GGGG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-G-A--C---------C-CC-TA--C-------CGA---G---GG-C-----C-------T--A-T--C-CT-GG-A-TC-agctgtgg
gi|22359                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GGGA-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TAGGCTACTATAT-A---G---GG-C-----A-------A--G-T--T-CT--G-A-CC-CACT
gi|22361                      :                   aAAA-T-TT-A-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-AA-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GA-A-C--C---------T-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----T-------A--A-C--C-CT-AG-A-Cggg
gi|22363                      :                   aAAA-T-AT-C-T-C-A--G--CT--CC-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--AC-T----GA-A-C--C---------C-CC-TA--C-------A-A---G---GG-C-----A-------A--T-G--C-CT-GG-A-CC-AGCTtagccgggg
gi|22364                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-G--G--CCT-CC-----CGGA-GC-TT-C-G----C--T-C--CC-T----GA-A-C--C---------C-CC-AA--C-------A-A---G---GG-------C-------C--A-T--CACT-GG-A-CC-AACTgtgg
gi|22365                      :                   aAAA-C-TT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GAGG-AT-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GA-A-C--C---------C-CC-TA--C-------T-A---G---TA-T-----C-------A--A-T--C-CT-GG-A-TC-CGCTtggg
gi|22417                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TC-CTCTgg
gi|22419                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTTTCC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--T-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TC-CTCT
gi|22421                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--A--CTT-CC-----GGGG-GT-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---A---GA-C-----A-------T--G-T--C-CT-GA-A-CCGCACTagg
gi|22422                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-TC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CT-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---AGATGA-T-----C-------T--G-T--C-CT-GG-A-CC-CGCTggag
gi|22424                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A-G--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-------C-------C--A-T----CT-GG-A-TC-CTCTggag
gi|22425                      :                    AAA-C-CTTC-T-C-G--G--CTT-CT-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---AG-C-----C-------
gi|22426                      :                    AAA-T-TT-C-T-C-G--G--CTT-CC-----GGGGGGC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GGCA-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---GA--GG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-CC-AGCT
gi|22428                      :                    AAA-T-CT-C-T-C-G--T--TTT-CT-----GGGG-GC-A--A-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-A-CC-AGCTgtgg
gi|22429                      :                    AAA-T-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----TGGG-GC-TT-T-G----C--T-C--CC-A----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-CAATAAT-------C-------C-CT-GG-A-CC-gggg
gi|22430                      :                              -T-C-A--GGACTT-CC-----GGGG-GC-T--C-G----C--C-C--CC-T----GATA-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-C-----CTT-----T--G-C--T-CT-GG-A-CC-CACTagatgggg
gi|22431                      :                aaatAAATC-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----CGGG-GC-TT-C-A----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CA--A--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TC-Cgggg
gi|22432                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GGGG-AT-TT-C-G----C--C-C--CC-T----TG-A-C--C---------C-AC-TG--C-------T-A---G---GA-C-----C-------A--G-T--C-CT-GG-A-CC-TACT
gi|22433                      :                    AAA-C-CA-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GGGA-GC-TT-TTG----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-C--TA--C-------C-A---G---GA-C-----C-------A--G-T--T-CT-GG-A-CC-Caagg
gi|22434                      :                    AAA-C-CC-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGAG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A-C--T---------C-CT-TA--C-------C-A---A---GG-T-----C-------C--G-T--T-CT-AG-A-TC-CGCTgatgggg
gi|22452                      :                     AA-T-CT-T-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GT-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A-T--C---------C-CC-TA--C-------T-A---A---GG-C-----C-------T--G-T--C-CT-GG-A-TT-CGCTgcgg
gi|22464                      :                            -C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-AC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-TC-TA--C-------C-A---A---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-G-CC-CGCTgggg
gi|22468                      :                                -C-A--G--CTT-CC-----GGGG-AC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-CT----T-------T--G-C--C-CT-GG-A-CC-CATT
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gi|22480                      :                                  -A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----AG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-CA----T-------C--G-C--C-CT-GG-A-CC-CACTgggg
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Alignments
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lowQualScore                  :                       . .  . . . . .. ..   .  .....    .  .  . . .... .. . ..  . ....  . . .. ......... .  .. .. ....... . ... ...  . .................. .. .  .  . .   .  
lowQualScore                  :                       5 5  0 5 5 4 66 66   2  88888    8  4  8 8 9999 66 8 00  4 3333  2 4 66 000000000 4  99 55 3333333 8 111 666  4 333333333333333333 00 9  4  9 9   8  
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Reference ( family-150 )      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-A-CCCGCT
gi|22264                      :                    AAA-T-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-CCG----C--C-C--CC-T----GGCA-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TCCTCT
gi|22268                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----AGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------T-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TTCTCTaggg
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gi|22299                      :                                  -A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-G-C--C---------C-C---A--C-------C-A---G---GG-CT----T-------C--G-C--C-CT-GG-A-CCCACTgggg
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gi|22301                      :                   aAAA-T-CA-C-T-C-A--G--CTT-CCATGCAGGGG-AC-TT-C-G----C--TTC--CC-T----GG-A-C--T---------C-CC-TG--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-A-CCCGCTactgggg
gi|22302                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-A--G--CTT-C------AGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--TC-T----GG-A-C--C---------C-C--TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-gg
gi|22303                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-A--G--CTT-C------GGGG-GC-TT-C-G----C--C-T--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-TC-C-CT-GG-A-
gi|22304                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----AGGG-GT-TT---G----C--C-C--CC-A----GG-A-C--C---------C-CT-T---C-------C-A---G---GG-C-----C-------A--G-T--C-TT-GG-A-CCCACT
gi|22305                      :                   aAAA-A-CT-C-T-C-A--G--CTTTCC-----GGGG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A-C--CG--------C-CC-TA--C-------C-AG--G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TCCTCTggag
gi|22307                      :                           T-C-T-C-A--G--CTT-C------GGGG-GC-TT-C---------C-C--CC-T----GG-A-C--C---------T-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-CCAGCTaggg
gi|22309                      :              aaatttAAA-C-CT-C-T-C-A--A--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----gtgg
gi|22310                      :                   aAAA-T-CT-C-T-C-A--A--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--T-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TT--C-------C-A---G---GG-C-----
gi|22312                      :                               a-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CCTT----GG------C---------C-CC-TA--A-------C-A---G---GG-CT----T-------T--G-C--C-CT-GG-A-CCCgatctctaaactagctggag
gi|22313                      :           aaaatgcacAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CA-----AGGG-GC-TT-C-G----C--C-T--CT-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---A---GA-T-----C-------A--T-C--C-CT-GT-A-CCattgggg
gi|22314                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-AC-TT-C-A----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TG--C-------C-ATGGG---GG-C-----C-------aactgtgg
gi|22315                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--CCCATACACTC-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--CACG-AG-A-CCCGt
gi|22316                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-G--G--CTT-CT-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GA-C-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-T-----C-------A--G-C--C-CT-GG-A-CC
gi|22318                      :                   aAAA-T-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----AGGG-GT-TT-C-A-------C-C--TC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-CCAGCTagtctggg
gi|22319                      :                   aAAA-T-TT-C-C-T-A--G--CTT-CCC----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-TG---GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------CAA---G---GG-T-----TA------T--GTT--C-CT-GG-A-CCAGCTgtgg
gi|22320                      :                   aAAA-A-TT-C-T-C-A--G--CTT-CC------GGG-GC-TT-C-G----C--C-CG-CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---CG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-Cgtgg
gi|22321                      :                    AAA-C-CTGC-T-C-G--G--CTT-CT-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-ACC--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---AG-------C-------C--A-T--T-CT-GA-A-TCCTCT
gi|22323                      :                   aAAA-T-TC-C-T-G-A--A--CTT-CC-----GGGG-GT-TT-C-G----C--A-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-TG----T-------T--G-C--C-CT--G-A-CCCACTaggg
gi|22324                      :                   aAAA-T-AT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----AGGG-GC-TT-T-G----T--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA----------C-A---G---GATC-----C-------C--G-T--C-CT-GGAA-CCCACTgggg
gi|22326                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--GC-T----GA-C-C--C---------T-CC-TA--C-------T-A---A---GG-C-----TA------C--GTT--T-CT-GG-A-CCCACTagag
gi|22327                      :                   aAAA-T-CT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GGGAAGC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--A-------C-A---G---GG-C-----gtgg
gi|22330                      :                                      a--CTA-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-G-C--C---------C-CC--A--C-------C-C---G---GG-CT----T-------T--G-C--C-CT-GG-A-CCCACT
gi|22331                      :         aaaatctggatAAA-T-CA-C-C-C-A--G--TTT-CCATGCAGGGG-AC-TT-C-G----C--TTC--CC-T----GG-A-C--T---------C-CC-TG--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-A-CCCGCTgggg
gi|22333                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--T--ATT-CC-----GGGG-GC-TT-C-A----CTCC-C--CC-T----AA-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---AG-G-----C-------T--G-T--C-CT-GG-A-CCCgg
gi|22334                      :                     aA-T-CT-C-T-C-A--G--CCT-TC-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--GC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GC-T-----C-------A--G-C--C-CT-GG-A-CCa
gi|22335                      :                 aatAAA-C-CT-C-T-C-G--G--CTT----------------TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-C-----T-------T--G-C--C-CT-GG-A-TCCACTatgcagctgggg
gi|22336                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-A--G--CTTTCC-----GTGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A-------GG-C-----C-------C--A-T--C-C--GG-A-TCgggg
gi|22337                      :                   aAAA-T-TT-C-T-T-A--G--CTT-C-------GGG-TC-TT-C-G----G--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-T-----T-------A--T-T--C-CTCGG-A-CCAGCTtctaggg
gi|22339                      :                   aAAA-T-TT-C-TTC-A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---GGC-GG-C-----CA------T--GCT--C-TT-GA-ATCCTGCTgtgg
gi|22340                      :                                 a-A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-C---A--C-------C-A---G---GG-G-----C-------CTTG-G--C-CT-GG-A-CCCAaggg
gi|22341                      :                         aaaattcag-A--G--CTT-C------GGGG-GC-TT-A-G----C--C-C--CC-G----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-C-----CT------T--GCC--C-CT-GG-ATCCCACTcactgggg
gi|22342                      :           aaaattcagAAA-T-GT-C-T-T-A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---Ggggg
gi|22345                      :                   aAAA-C-CT-C-T-A-A--G--TTT-TC-----GGGG-GC-TT-T-G----T--C-C--CC-TCCCTGG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------A-A---G---GG-C-----C-------T--G-T--C-CT-AG-A-CCttattcctgaccagctg
gi|22346                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----CG-A----C---------C-CC-TA--C-------C---------GG-C-----C-------C--A-TTCC-TT-AG-A-TCCTCTtcctgg
gi|22347                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-GC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------CACC-TA----------C-A---A---GG-C-----CTGGACAGC--G-T--C-CT-GG-A-Cagg
gi|22348                      :                   aAAA-A-TT-C-T-T-AATG--CCT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A----C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-CCAGCT
gi|22350                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----AGCG-GCTTT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TT--C-------C-A---G---AG-C-----C-------T--G-T--C-CT-GA-A-Cgg
gi|22351                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--T-C--CC-T----TG-A----C---------C-CC-TA--C-------A-G---G---GG-T-----T-------A--T-T--G-CT-GG-A-CCAGCT
gi|22355                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--A--CTT-CTA----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-CGGCC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--T-------C-A---G---TG-C-----C-------A--G-C--C-TT-GG-A-TTCCCTgtgg
gi|22356                      :                   aAAA-C-TT-C-T-C-A--T--CTT-C-------GGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A----C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GGAA-CCAGCTgggg
gi|22358                      :                   aAAA-CGCT-C-T-C-A--G--CTT-C------GGGG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-G-A--C---------C-CC-TA--C-------CGA---G---GG-C-----C-------T--A-T--C-CT-GG-A-TCgtgg
gi|22359                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GGGA-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TAGGCTACTATAT-A---G---GG-C-----A-------A--G-T--T-CT--G-A-CCCACT
gi|22361                      :                   aAAA-T-TT-A-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-AA-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GA-A-C--C---------T-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----T-------A--A-C--C-CT-AG-A-Cggg
gi|22363                      :                   aAAA-T-AT-C-T-C-A--G--CT--CC-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--AC-T----GA-A-C--C---------C-CC-TA--C-------A-A---G---GG-C-----A-------A--T-G--C-CT-GG-A-CCAGCTtagccgggg
gi|22364                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-G--G--CCT-CC-----CGGA-GC-TT-C-G----C--T-C--CC-T----GA-A-C--C---------C-CC-AA--C-------A-A---G---GG-------C-------C--A-T--CACT-GG-A-CCgtgg
gi|22365                      :                   aAAA-C-TT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GAGG-AT-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GA-A-C--C---------C-CC-TA--C-------T-A---G---TA-T-----C-------A--A-T--C-CT-GG-A-TCCGCTaacttggg
gi|22417                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TCCTCTgg
gi|22419                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTTTCC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--T-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TCCTCT
gi|22421                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--A--CTT-CC-----GGGG-GT-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---A---GA-C-----A-------T--G-T--C-CT-GA-A-CCagg
gi|22422                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-TC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CT-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---AGATGA-T-----C-------T--G-T--C-CT-GG-A-CCCGCTgcactggag
gi|22424                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A-G--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-------C-------C--A-T----CT-GG-A-TCCTCTggag
gi|22425                      :                    AAA-C-CTTC-T-C-G--G--CTT-CT-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---AG-C-----C-------
gi|22426                      :                    AAA-T-TT-C-T-C-G--G--CTT-CC-----GGGGGGC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GGCA-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---GA--GG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-CCAGCT
gi|22428                      :                    AAA-T-CT-C-T-C-G--T--TTT-CT-----GGGG-GC-A--A-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-A-CCAGCTgtgg
gi|22429                      :                    AAA-T-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----TGGG-GC-TT-T-G----C--T-C--CC-A----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-CAATAAT-------C-------C-CT-GG-A-CCgggg
gi|22430                      :                              -T-C-A--GGACTT-CC-----GGGG-GC-T--C-G----C--C-C--CC-T----GATA-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-C-----CTT-----T--G-C--T-CT-GG-A-CCCACTagatgggg
gi|22431                      :                aaatAAATC-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----CGGG-GC-TT-C-A----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CA--A--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TCCgggg
gi|22432                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GGGG-AT-TT-C-G----C--C-C--CC-T----TG-A-C--C---------C-AC-TG--C-------T-A---G---GA-C-----C-------A--G-T--C-CT-GG-A-CCTACT
gi|22433                      :                    AAA-C-CA-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GGGA-GC-TT-TTG----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-C--TA--C-------C-A---G---GA-C-----C-------A--G-T--T-CT-GG-A-CCCGaagg
gi|22434                      :                    AAA-C-CC-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGAG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A-C--T---------C-CT-TA--C-------C-A---A---GG-T-----C-------C--G-T--T-CT-AG-A-TCCGCTatgggg
gi|22452                      :                     AA-T-CT-T-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GT-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A-T--C---------C-CC-TA--C-------T-A---A---GG-C-----C-------T--G-T--C-CT-GG-A-TTCGCTgcgg
gi|22464                      :                            -C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-AC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-TC-TA--C-------C-A---A---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-G-CCCGCTgggg
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lowQualScore                  :                       5 5  0 5 5 4 66 66   2  88888    8  4  8 8 9999 66 8 00  4 3333  2 4 66 000000000 4  99 55 3333333 8 111 666  4 333333333333333333 00 9  4  9 9   8  
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Reference ( family-150 )      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-A-CCCGCT
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gi|22314                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-AC-TT-C-A----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TG--C-------C-ATGGG---GG-C-----C-------aactgtgg
gi|22315                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--CCCATACACTC-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--CACG-AG-A-CCCGt
gi|22316                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-G--G--CTT-CT-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GA-C-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-T-----C-------A--G-C--C-CT-GG-A-CC
gi|22318                      :                   aAAA-T-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----AGGG-GT-TT-C-A-------C-C--TC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-CCAGCTagtctggg
gi|22319                      :                   aAAA-T-TT-C-C-T-A--G--CTT-CCC----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-TG---GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------CAA---G---GG-T-----TA------T--GTT--C-CT-GG-A-CCAGCTgtgg
gi|22320                      :                   aAAA-A-TT-C-T-C-A--G--CTT-CC------GGG-GC-TT-C-G----C--C-CG-CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---CG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-Cgtgg
gi|22321                      :                    AAA-C-CTGC-T-C-G--G--CTT-CT-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-ACC--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---AG-------C-------C--A-T--T-CT-GA-A-TCCTCT
gi|22323                      :                   aAAA-T-TC-C-T-G-A--A--CTT-CC-----GGGG-GT-TT-C-G----C--A-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-TG----T-------T--G-C--C-CT--G-A-CCCACTaggg
gi|22324                      :                   aAAA-T-AT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----AGGG-GC-TT-T-G----T--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA----------C-A---G---GATC-----C-------C--G-T--C-CT-GGAA-CCCACTgggg
gi|22326                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--GC-T----GA-C-C--C---------T-CC-TA--C-------T-A---A---GG-C-----TA------C--GTT--T-CT-GG-A-CCCACTagag
gi|22327                      :                   aAAA-T-CT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GGGAAGC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--A-------C-A---G---GG-C-----gtgg
gi|22330                      :                                      a--CTA-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-G-C--C---------C-CC--A--C-------C-C---G---GG-CT----T-------T--G-C--C-CT-GG-A-CCCACT
gi|22331                      :         aaaatctggatAAA-T-CA-C-C-C-A--G--TTT-CCATGCAGGGG-AC-TT-C-G----C--TTC--CC-T----GG-A-C--T---------C-CC-TG--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-A-CCCGCTgggg
gi|22333                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--T--ATT-CC-----GGGG-GC-TT-C-A----CTCC-C--CC-T----AA-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---AG-G-----C-------T--G-T--C-CT-GG-A-CCCgg
gi|22334                      :                     aA-T-CT-C-T-C-A--G--CCT-TC-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--GC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GC-T-----C-------A--G-C--C-CT-GG-A-CCa
gi|22335                      :                 aatAAA-C-CT-C-T-C-G--G--CTT----------------TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-C-----T-------T--G-C--C-CT-GG-A-TCCACTatgcagctgggg
gi|22336                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-A--G--CTTTCC-----GTGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A-------GG-C-----C-------C--A-T--C-C--GG-A-TCgggg
gi|22337                      :                   aAAA-T-TT-C-T-T-A--G--CTT-C-------GGG-TC-TT-C-G----G--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-T-----T-------A--T-T--C-CTCGG-A-CCAGCTtctaggg
gi|22339                      :                   aAAA-T-TT-C-TTC-A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---GGC-GG-C-----CA------T--GCT--C-TT-GA-ATCCTGCTgtgg
gi|22340                      :                                 a-A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-C---A--C-------C-A---G---GG-G-----C-------CTTG-G--C-CT-GG-A-CCCAaggg
gi|22341                      :                         aaaattcag-A--G--CTT-C------GGGG-GC-TT-A-G----C--C-C--CC-G----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-C-----CT------T--GCC--C-CT-GG-ATCCCACTcactgggg
gi|22342                      :           aaaattcagAAA-T-GT-C-T-T-A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---Ggggg
gi|22345                      :                   aAAA-C-CT-C-T-A-A--G--TTT-TC-----GGGG-GC-TT-T-G----T--C-C--CC-TCCCTGG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------A-A---G---GG-C-----C-------T--G-T--C-CT-AG-A-CCttattcctgaccagctg
gi|22346                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----CG-A----C---------C-CC-TA--C-------C---------GG-C-----C-------C--A-TTCC-TT-AG-A-TCCTCTtcctgg
gi|22347                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-GC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------CACC-TA----------C-A---A---GG-C-----CTGGACAGC--G-T--C-CT-GG-A-Cagg
gi|22348                      :                   aAAA-A-TT-C-T-T-AATG--CCT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A----C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-CCAGCT
gi|22350                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----AGCG-GCTTT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TT--C-------C-A---G---AG-C-----C-------T--G-T--C-CT-GA-A-Cgg
gi|22351                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--T-C--CC-T----TG-A----C---------C-CC-TA--C-------A-G---G---GG-T-----T-------A--T-T--G-CT-GG-A-CCAGCT
gi|22355                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--A--CTT-CTA----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-CGGCC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--T-------C-A---G---TG-C-----C-------A--G-C--C-TT-GG-A-TTCCCTgtgg
gi|22356                      :                   aAAA-C-TT-C-T-C-A--T--CTT-C-------GGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A----C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GGAA-CCAGCTgggg
gi|22358                      :                   aAAA-CGCT-C-T-C-A--G--CTT-C------GGGG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-G-A--C---------C-CC-TA--C-------CGA---G---GG-C-----C-------T--A-T--C-CT-GG-A-TCgtgg
gi|22359                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GGGA-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TAGGCTACTATAT-A---G---GG-C-----A-------A--G-T--T-CT--G-A-CCCACT
gi|22361                      :                   aAAA-T-TT-A-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-AA-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GA-A-C--C---------T-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----T-------A--A-C--C-CT-AG-A-Cggg
gi|22363                      :                   aAAA-T-AT-C-T-C-A--G--CT--CC-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--AC-T----GA-A-C--C---------C-CC-TA--C-------A-A---G---GG-C-----A-------A--T-G--C-CT-GG-A-CCAGCTtagccgggg
gi|22364                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-G--G--CCT-CC-----CGGA-GC-TT-C-G----C--T-C--CC-T----GA-A-C--C---------C-CC-AA--C-------A-A---G---GG-------C-------C--A-T--CACT-GG-A-CCgtgg
gi|22365                      :                   aAAA-C-TT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GAGG-AT-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GA-A-C--C---------C-CC-TA--C-------T-A---G---TA-T-----C-------A--A-T--C-CT-GG-A-TCCGCTaacttggg
gi|22417                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TCCTCTgg
gi|22419                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTTTCC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--T-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TCCTCT
gi|22421                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--A--CTT-CC-----GGGG-GT-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---A---GA-C-----A-------T--G-T--C-CT-GA-A-CCagg
gi|22422                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-TC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CT-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---AGATGA-T-----C-------T--G-T--C-CT-GG-A-CCCGCTgcactggag
gi|22424                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A-G--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-------C-------C--A-T----CT-GG-A-TCCTCTggag
gi|22425                      :                    AAA-C-CTTC-T-C-G--G--CTT-CT-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---AG-C-----C-------
gi|22426                      :                    AAA-T-TT-C-T-C-G--G--CTT-CC-----GGGGGGC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GGCA-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---GA--GG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-CCAGCT
gi|22428                      :                    AAA-T-CT-C-T-C-G--T--TTT-CT-----GGGG-GC-A--A-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-A-CCAGCTgtgg
gi|22429                      :                    AAA-T-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----TGGG-GC-TT-T-G----C--T-C--CC-A----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-CAATAAT-------C-------C-CT-GG-A-CCgggg
gi|22430                      :                              -T-C-A--GGACTT-CC-----GGGG-GC-T--C-G----C--C-C--CC-T----GATA-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-C-----CTT-----T--G-C--T-CT-GG-A-CCCACTagatgggg
gi|22431                      :                aaatAAATC-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----CGGG-GC-TT-C-A----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CA--A--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TCCgggg
gi|22432                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GGGG-AT-TT-C-G----C--C-C--CC-T----TG-A-C--C---------C-AC-TG--C-------T-A---G---GA-C-----C-------A--G-T--C-CT-GG-A-CCTACT
gi|22433                      :                    AAA-C-CA-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GGGA-GC-TT-TTG----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-C--TA--C-------C-A---G---GA-C-----C-------A--G-T--T-CT-GG-A-CCCGaagg
gi|22434                      :                    AAA-C-CC-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGAG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A-C--T---------C-CT-TA--C-------C-A---A---GG-T-----C-------C--G-T--T-CT-AG-A-TCCGCTatgggg
gi|22452                      :                     AA-T-CT-T-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GT-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A-T--C---------C-CC-TA--C-------T-A---A---GG-C-----C-------T--G-T--C-CT-GG-A-TTCGCTgcgg
gi|22464                      :                            -C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-AC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-TC-TA--C-------C-A---A---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-G-CCCGCTgggg
gi|22468                      :                                -C-A--G--CTT-CC-----GGGG-AC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-CT----T-------T--G-C--C-CT-GG-A-CCC
gi|22474                      :                                  -A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-T--C-G----C--C-C--C--T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-C-----CT------T--G-C--C-CT--G-A-CCCACTattg
gi|22476                      :                                  -A--G--CTT-C------GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GC-C-----T-------T--G-C--C-CT-GG-A-CGCACTgggg
gi|22478                      :                                  -A--G--CTT-C------GGGG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A-A--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-C-----CT------T--G-C--C-CT-GG-A-CCCACTgggg
gi|22480                      :                                  -A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----AG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-CA----T-------C--G-C--C-CT-GG-A-CCCACTgggg
gi|22481                      :                                  -A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-T--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---A---GG-TG----T-------T--G-C--C-CT-GG-A-CCTACTgggg
gi|22482                      :                                  -A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-C---A--C-------C-A---G---GG-C-----T-------T--GCC--C-CT-GG-A-CTCACTgggg
gi|22483                      :                                  -A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-C---A--C-------C-A---G---GG-C-----T-------T--GCC--C-CT-GG-A-CTCACTgggg


blockSeqs                     :                                            T  ATGCA                              CCCT  C      CCATACACT    AT    TACTATA   TGG GAT    CTGGACAGCG         TC             T
blockSeqs                     :                                            T  ATGCA                              G     T      G            T     .         G   GC     AATAATC            C              A
blockSeqs                     :                                            T  C                                  .     .      .            T     .         .   A      TATGT              .              T
blockSeqs                     :                                            .  A                                  .     .      .            T     .         .   .      TACGT              .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CATGC              .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCTTG              .              T
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CTTGC              .              T
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CTTTG              .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      ATTG               .              T
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CTTG               .              T
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TTTG               .              T
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TTCG               .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TTCG               .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TTTG               .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      GTTG               .              T
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TTTG               .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TTTG               .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CTTG               .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CTTG               .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      ATCG               .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      GTTG               .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TTGC               .              T
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TTGC               .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCA                .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TAT                .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CAT                .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TAT                .              T
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCA                .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TAT                .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCA                .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TAT                .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCA                .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCA                .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCA                .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TAT                .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCG                .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TAA                .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCG                .              T
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TTG                .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TAT                .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCA                .              C
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCA                .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCA                .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCG                .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CTG                .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCA                .              T
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCG                .              T
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCA                .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCA                .              T
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CAG                .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCA                .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TAT                .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CAT                .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCA                .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CAG                .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TAT                .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TAT                .              G
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCA                .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCG                .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCG                .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            A     .         .   .      CTG                .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CAG                .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TTG                .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCA                .              A
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TAT                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CTG                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CCA                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TAT                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CTG                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TAT                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CAG                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TAT                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      CTA                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      AAG                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      TAA                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            T     .         .   .      AAT                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            .     .         .   .      CCA                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            .     .         .   .      CAA                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            .     .         .   .      CCA                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            .     .         .   .      CCA                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            .     .         .   .      ATG                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            .     .         .   .      CTG                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            .     .         .   .      CCA                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            .     .         .   .      TAT                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            .     .         .   .      CCG                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            .     .         .   .      CCA                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            .     .         .   .      CAG                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            .     .         .   .      CAG                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            .     .         .   .      CCG                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            .     .         .   .      CTG                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            .     .         .   .      CCG                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            .     .         .   .      TTG                .               
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            .     .         .   .                                         
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blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            .     .         .   .                                         
blockSeqs                     :                                            .  .                                  .     .      .            .     .         .   .                                         


blockSeqCons                  :                    
originalCons                  :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-A-CCCGCT
finalCons                     :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-A-CCCGCT





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lowQualScore                  :                       . .  . . . . .. ..   .  .....    .  .  . . .... .. . ..  . ....  . . .. ......... .  .. .. ....... . ... ...  . .................. .. .  .  . .   .  
lowQualScore                  :                       5 5  0 5 5 4 66 66   2  88888    8  4  8 8 9999 66 8 00  4 3333  2 4 66 000000000 4  99 55 3333333 8 111 666  4 333333333333333333 00 9  4  9 9   8  
consensus                     :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-A-CCCGCT
Reference ( family-150 )      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-A-CCCGCT
gi|22264                      :                    AAA-T-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-CCG----C--C-C--CC-T----GGCA-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TCCTCT
gi|22268                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----AGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------T-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TTCTCTaggg
gi|22269                      :                                 a-A--A--CTT-CT-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-CA----T-------T--G-C--C-CT-GG-A-CCCACTaggg
gi|22270                      :          aaaattcaggAAA-T-AT-C-T-C-A--G--TTT-CT-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A-CCAC---------C-TC-TA--C-------C-A---G---GG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-CCgggg
gi|22271                      :                           a-C-T-C-A--G--CTT-TC-----TGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------A--T-T--C-CT-GG-A-TCCTCT
gi|22272                      :                          aaaattta-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TTGT-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--A-------C-A---G---GG-C-----CT------T--G-C--C-CT-GG-A-CCCACTaggg
gi|22274                      :           aaaattcagAAA-T-TT-C-T-T-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A-------GG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-CCAGCTagag
gi|22275                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GA------C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T----CT-GG-A-TCCTCTg
gi|22276                      :                   aAAA-T-CT-C-T-C-A--G--CTT-CT-----GGAG-GG-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-G-----T-------A--T-T--C-CT-GA-A-CCaggg
gi|22277                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-------------------C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TCCTCTaactgtgg
gi|22279                      :                   aAAA-T-TT-C-T-T-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--C--T----GG-A-C--C---------T-CC-TA--C-------C-A---G---GG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-CCAGCTaggg
gi|22280                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-G--G--CTT-CC-----GGG---C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--A---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TCCTCTgtgg
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gi|22282                      :                        a-CT-C-T-C-A--G--CTT-C------GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--C--T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--T-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TCCTCTaggg
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gi|22284                      :            aaaatttgAAA-A-CT-CGC-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GA-CT----T-------T--G-C--C-CT-GG-A-CCCactg
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gi|22286                      :                   aAAA-T-CT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TG--C-------C-A---G---AG-C-----T-------A--A-C--T-CT-GG-A-CCgggg
gi|22288                      :                   aAAA-T-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A----C---------G-CC-TA--C-------T-A---A---GG-C-----C-------C--G-T--T-TT-GG-A-CCaaatgagg
gi|22289                      :                   aAAA-T-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----CG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GA-C-----aactgtgg
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gi|22291                      :       aaaatcatctcaaattcaggT-C-T-T-A--T--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-CCAGCTgggg
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gi|22295                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-A----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-TC-TA--G-------C-A---G---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-Ggggg
gi|22296                      :                   aAAA-C-CT-C-----A--G--TTT-TC-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GC-C-----C-------T--G-T--C-CT-GG-A-CCTG
gi|22297                      :                  aaAAA-A-CT-C-T-GGA--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-A----C--C-C--CC-T----GG-G-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-CT----T-------C--G-C--C-CT-GG-A-CCCACTatggg
gi|22299                      :                                  -A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-G-C--C---------C-C---A--C-------C-A---G---GG-CT----T-------C--G-C--C-CT-GG-A-CCCACTgggg
gi|22300                      : aaaatctctaaaacgctggAAA-C-CT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GGGG-GT-TC-C-GGGCTT--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------T-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-CG-A-CCggg
gi|22301                      :                   aAAA-T-CA-C-T-C-A--G--CTT-CCATGCAGGGG-AC-TT-C-G----C--TTC--CC-T----GG-A-C--T---------C-CC-TG--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-A-CCCGCTactgggg
gi|22302                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-A--G--CTT-C------AGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--TC-T----GG-A-C--C---------C-C--TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-gg
gi|22303                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-A--G--CTT-C------GGGG-GC-TT-C-G----C--C-T--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-TC-C-CT-GG-A-
gi|22304                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----AGGG-GT-TT---G----C--C-C--CC-A----GG-A-C--C---------C-CT-T---C-------C-A---G---GG-C-----C-------A--G-T--C-TT-GG-A-CCCACT
gi|22305                      :                   aAAA-A-CT-C-T-C-A--G--CTTTCC-----GGGG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A-C--CG--------C-CC-TA--C-------C-AG--G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TCCTCTggag
gi|22307                      :                           T-C-T-C-A--G--CTT-C------GGGG-GC-TT-C---------C-C--CC-T----GG-A-C--C---------T-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-CCAGCTaggg
gi|22309                      :              aaatttAAA-C-CT-C-T-C-A--A--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----gtgg
gi|22310                      :                   aAAA-T-CT-C-T-C-A--A--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--T-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TT--C-------C-A---G---GG-C-----
gi|22312                      :                               a-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CCTT----GG------C---------C-CC-TA--A-------C-A---G---GG-CT----T-------T--G-C--C-CT-GG-A-CCCgatctctaaactagctggag
gi|22313                      :           aaaatgcacAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CA-----AGGG-GC-TT-C-G----C--C-T--CT-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---A---GA-T-----C-------A--T-C--C-CT-GT-A-CCattgggg
gi|22314                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-AC-TT-C-A----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TG--C-------C-ATGGG---GG-C-----C-------aactgtgg
gi|22315                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--CCCATACACTC-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--CACG-AG-A-CCCGt
gi|22316                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-G--G--CTT-CT-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GA-C-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-T-----C-------A--G-C--C-CT-GG-A-CC
gi|22318                      :                   aAAA-T-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----AGGG-GT-TT-C-A-------C-C--TC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-CCAGCTagtctggg
gi|22319                      :                   aAAA-T-TT-C-C-T-A--G--CTT-CCC----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-TG---GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------CAA---G---GG-T-----TA------T--GTT--C-CT-GG-A-CCAGCTgtgg
gi|22320                      :                   aAAA-A-TT-C-T-C-A--G--CTT-CC------GGG-GC-TT-C-G----C--C-CG-CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---CG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-Cgtgg
gi|22321                      :                    AAA-C-CTGC-T-C-G--G--CTT-CT-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-ACC--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---AG-------C-------C--A-T--T-CT-GA-A-TCCTCT
gi|22323                      :                   aAAA-T-TC-C-T-G-A--A--CTT-CC-----GGGG-GT-TT-C-G----C--A-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-TG----T-------T--G-C--C-CT--G-A-CCCACTaggg
gi|22324                      :                   aAAA-T-AT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----AGGG-GC-TT-T-G----T--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA----------C-A---G---GATC-----C-------C--G-T--C-CT-GGAA-CCCACTgggg
gi|22326                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--GC-T----GA-C-C--C---------T-CC-TA--C-------T-A---A---GG-C-----TA------C--GTT--T-CT-GG-A-CCCACTagag
gi|22327                      :                   aAAA-T-CT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GGGAAGC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--A-------C-A---G---GG-C-----gtgg
gi|22330                      :                                      a--CTA-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-G-C--C---------C-CC--A--C-------C-C---G---GG-CT----T-------T--G-C--C-CT-GG-A-CCCACT
gi|22331                      :         aaaatctggatAAA-T-CA-C-C-C-A--G--TTT-CCATGCAGGGG-AC-TT-C-G----C--TTC--CC-T----GG-A-C--T---------C-CC-TG--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-A-CCCGCTgggg
gi|22333                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--T--ATT-CC-----GGGG-GC-TT-C-A----CTCC-C--CC-T----AA-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---AG-G-----C-------T--G-T--C-CT-GG-A-CCCgg
gi|22334                      :                     aA-T-CT-C-T-C-A--G--CCT-TC-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--GC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GC-T-----C-------A--G-C--C-CT-GG-A-CCa
gi|22335                      :                 aatAAA-C-CT-C-T-C-G--G--CTT----------------TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-C-----T-------T--G-C--C-CT-GG-A-TCCACTatgcagctgggg
gi|22336                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-A--G--CTTTCC-----GTGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A-------GG-C-----C-------C--A-T--C-C--GG-A-TCgggg
gi|22337                      :                   aAAA-T-TT-C-T-T-A--G--CTT-C-------GGG-TC-TT-C-G----G--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-T-----T-------A--T-T--C-CTCGG-A-CCAGCTtctaggg
gi|22339                      :                   aAAA-T-TT-C-TTC-A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---GGC-GG-C-----CA------T--GCT--C-TT-GA-ATCCTGCTgtgg
gi|22340                      :                                 a-A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-C---A--C-------C-A---G---GG-G-----C-------CTTG-G--C-CT-GG-A-CCCAaggg
gi|22341                      :                         aaaattcag-A--G--CTT-C------GGGG-GC-TT-A-G----C--C-C--CC-G----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-C-----CT------T--GCC--C-CT-GG-ATCCCACTcactgggg
gi|22342                      :           aaaattcagAAA-T-GT-C-T-T-A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---Ggggg
gi|22345                      :                   aAAA-C-CT-C-T-A-A--G--TTT-TC-----GGGG-GC-TT-T-G----T--C-C--CC-TCCCTGG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------A-A---G---GG-C-----C-------T--G-T--C-CT-AG-A-CCttattcctgaccagctg
gi|22346                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----CG-A----C---------C-CC-TA--C-------C---------GG-C-----C-------C--A-TTCC-TT-AG-A-TCCTCTtcctgg
gi|22347                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-GC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------CACC-TA----------C-A---A---GG-C-----CTGGACAGC--G-T--C-CT-GG-A-Cagg
gi|22348                      :                   aAAA-A-TT-C-T-T-AATG--CCT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A----C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-CCAGCT
gi|22350                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----AGCG-GCTTT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TT--C-------C-A---G---AG-C-----C-------T--G-T--C-CT-GA-A-Cgg
gi|22351                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--T-C--CC-T----TG-A----C---------C-CC-TA--C-------A-G---G---GG-T-----T-------A--T-T--G-CT-GG-A-CCAGCT
gi|22355                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--A--CTT-CTA----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-CGGCC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--T-------C-A---G---TG-C-----C-------A--G-C--C-TT-GG-A-TTCCCTgtgg
gi|22356                      :                   aAAA-C-TT-C-T-C-A--T--CTT-C-------GGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A----C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GGAA-CCAGCTgggg
gi|22358                      :                   aAAA-CGCT-C-T-C-A--G--CTT-C------GGGG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-G-A--C---------C-CC-TA--C-------CGA---G---GG-C-----C-------T--A-T--C-CT-GG-A-TCgtgg
gi|22359                      :                   aAAA-C-CT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GGGA-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TAGGCTACTATAT-A---G---GG-C-----A-------A--G-T--T-CT--G-A-CCCACT
gi|22361                      :                   aAAA-T-TT-A-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-AA-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GA-A-C--C---------T-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----T-------A--A-C--C-CT-AG-A-Cggg
gi|22363                      :                   aAAA-T-AT-C-T-C-A--G--CT--CC-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--AC-T----GA-A-C--C---------C-CC-TA--C-------A-A---G---GG-C-----A-------A--T-G--C-CT-GG-A-CCAGCTtagccgggg
gi|22364                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-G--G--CCT-CC-----CGGA-GC-TT-C-G----C--T-C--CC-T----GA-A-C--C---------C-CC-AA--C-------A-A---G---GG-------C-------C--A-T--CACT-GG-A-CCgtgg
gi|22365                      :                   aAAA-C-TT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GAGG-AT-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GA-A-C--C---------C-CC-TA--C-------T-A---G---TA-T-----C-------A--A-T--C-CT-GG-A-TCCGCTaacttggg
gi|22417                      :                   aAAA-T-TT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TCCTCTgg
gi|22419                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTTTCC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--T-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TCCTCT
gi|22421                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--A--CTT-CC-----GGGG-GT-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---A---GA-C-----A-------T--G-T--C-CT-GA-A-CCagg
gi|22422                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-TC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CT-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---AGATGA-T-----C-------T--G-T--C-CT-GG-A-CCCGCTgcactggag
gi|22424                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A-G--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-------C-------C--A-T----CT-GG-A-TCCTCTggag
gi|22425                      :                    AAA-C-CTTC-T-C-G--G--CTT-CT-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---AG-C-----C-------
gi|22426                      :                    AAA-T-TT-C-T-C-G--G--CTT-CC-----GGGGGGC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GGCA-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---GA--GG-T-----T-------A--T-T--C-CT-GG-A-CCAGCT
gi|22428                      :                    AAA-T-CT-C-T-C-G--T--TTT-CT-----GGGG-GC-A--A-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-A-CCAGCTgtgg
gi|22429                      :                    AAA-T-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----TGGG-GC-TT-T-G----C--T-C--CC-A----GG-A-C--C---------C-CC-TA--C-------C-A---G---GG-CAATAAT-------C-------C-CT-GG-A-CCgggg
gi|22430                      :                              -T-C-A--GGACTT-CC-----GGGG-GC-T--C-G----C--C-C--CC-T----GATA-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-C-----CTT-----T--G-C--T-CT-GG-A-CCCACTagatgggg
gi|22431                      :                aaatAAATC-CT-C-T-C-A--G--CTT-CC-----CGGG-GC-TT-C-A----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CA--A--C-------C-A---G---GG-C-----C-------C--A-T--C-CT-GG-A-TCCgggg
gi|22432                      :                    AAA-C-CT-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GGGG-AT-TT-C-G----C--C-C--CC-T----TG-A-C--C---------C-AC-TG--C-------T-A---G---GA-C-----C-------A--G-T--C-CT-GG-A-CCTACT
gi|22433                      :                    AAA-C-CA-C-T-C-A--G--TTT-CC-----GGGA-GC-TT-TTG----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-C--TA--C-------C-A---G---GA-C-----C-------A--G-T--T-CT-GG-A-CCCGaagg
gi|22434                      :                    AAA-C-CC-C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGAG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A-C--T---------C-CT-TA--C-------C-A---A---GG-T-----C-------C--G-T--T-CT-AG-A-TCCGCTatgggg
gi|22452                      :                     AA-T-CT-T-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-GT-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A-T--C---------C-CC-TA--C-------T-A---A---GG-C-----C-------T--G-T--C-CT-GG-A-TTCGCTgcgg
gi|22464                      :                            -C-T-C-A--G--CTT-CC-----GGGG-AC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-TC-TA--C-------C-A---A---GG-C-----C-------C--G-T--C-CT-GG-G-CCCGCTgggg
gi|22468                      :                                -C-A--G--CTT-CC-----GGGG-AC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-CT----T-------T--G-C--C-CT-GG-A-CCC
gi|22474                      :                                  -A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-T--C-G----C--C-C--C--T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-C-----CT------T--G-C--C-CT--G-A-CCCACTattg
gi|22476                      :                                  -A--G--CTT-C------GGGG-GC-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GC-C-----T-------T--G-C--C-CT-GG-A-CGCACTgggg
gi|22478                      :                                  -A--G--CTT-C------GGGG-GC-TT-C-G-------C-C--CC-T----GG-A-A--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-C-----CT------T--G-C--C-CT-GG-A-CCCACTgggg
gi|22480                      :                                  -A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-T-G----C--C-C--CC-T----AG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---G---GG-CA----T-------C--G-C--C-CT-GG-A-CCCACTgggg
gi|22481                      :                                  -A--G--CTT-CC-----GGGG-GC-TT-C-G----C--C-T--CC-T----GG-A-C--C---------C-CC--A--C-------C-A---A---GG-TG----T-------T--G-C--C-CT-GG-A-CCTACTgggg
gi|22482                      :                                  -A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-C---A--C-------C-A---G---GG-C-----T-------T--GCC--C-CT-GG-A-CTCACTgggg
gi|22483                      :                                  -A--G--CTT-CC-----GGGG--C-TT-C-G----C--C-C--CC-T----GG-A-C--C---------C-C---A--C-------C-A---G---GG-C-----T-------T--GCC--C-CT-GG-A-CTCACTgggg