lowQualScore : 0 0 0 22 2 0 33 222 0 00 0 0 0 22 11 0 0 0 0 22 0 22 1 11 3 888
lowQualScore : . . . .. . . .. ... . .. . . . .. .. . . . . .. . .. . .. . ...
lowQualScore : 8 4 8 88 0 4 66 111 4 66 4 4 4 44 00 4 4 4 4 99 4 33 6 00 3 888
consensus : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AACATT
Reference ( gi|11146 ) : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-A-AACATT
gi|11264 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-CG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TTAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-G-AACATT
gi|11139 : GGTAT-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AGCATT
gi|11176 : GGTAT-C-A-A-CA-TTTT-T--C---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--T-TT-A-AACATT
gi|11225 : GGTAC-C-A-A-AA-TGTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AACATT
gi|11183 : GGTAC---A-A-CA-TTAT-T--G---ACT-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-A-AACATT
gi|11208 : GGTAC-C-A-A-CA-TTGT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA
gi|11156 : GGTAC-C-A-A-CA-TTGT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA
gi|11215 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA
gi|11188 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA
gi|11187 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTCAAAAAA--C-TT-T-AA
gi|11270 : GGTAC-C-A-A-CA-TATT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACT-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-TAAAA--C-TT-G-AACATT
gi|11152 : GGTAC-C-A-A-TA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAGAA--C-TT-T-AACAT
gi|11177 : GGTAC-C-A-A--A-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGTGT-TGAC-TT--A-C--TTTTC-AAAAA--T-TT-A-AACATT
gi|11138 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CA--A-C--TTTTC-AAAAC--T-TT-T-AACATT
gi|11214 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GGAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-ATAAA--C-TT-T-AA
gi|11201 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACT-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTATC-AAAAA--C-TT-T-AA
gi|11180 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-T--G---ATC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-GT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TTAA-AACATT
gi|11219 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGA--CT--A----TTTTC--AAAA--C-TT-A-AACATT
gi|11189 : GGTAC-C-A-A-CA-TTGT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTATC-AAAAA--C-TT-T-AA
gi|11149 : GGTAC-C-A-A-CATTTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-G-AGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--CTTT-A-AACCTT
gi|11142 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC---------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-A-AACATT
gi|11207 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TG-C-CT--A-C--TTTTC-AAAAC--T-TT-A-
gi|11191 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT----G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTATC--AAAA--C-TT-T-AACATT
gi|11234 : GGTAC-C-A-A-AT-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGATCTT-GAACT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AACATT
gi|11253 : GGTGC-C-A-A-AC-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-CGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAG--C-TT-T-AACATT
gi|11248 : GGTAC-C-A-A--A-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGA--CT--A-CT-TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AACATT
gi|11259 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TT-GCC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTATC-AAAAA--C-TT-T-AA
gi|11245 : GGTAC-C-A-A--A-TTTT-T--G---ACT-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTCA-AAAAA--C-TT-T-AACAT
gi|11205 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGACTTT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA
gi|11244 : GGTAC-C-A-A-AAATTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-GCC-T--TGACCTT-GA-GT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AACATT
gi|11209 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT----G---ACC-T--C-C-TG-GCC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA
gi|11254 : GGTAC-C-A-A-AC-TTGT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA
gi|11169 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--T---ACC-G--C-C-TG-ACA-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-
gi|11229 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTTTT--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGAACTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTCAAAAAA--C-TT-T-AAttaacact
gi|11143 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC---------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AACATT
gi|11202 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-A-TG-AC--T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-CT-TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA
gi|11155 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--T-ACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AGAAA--A-TT-C-AACA
gi|11167 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-CG-ACC-T--TGAC-------GT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AACATT
gi|11262 : GGTAC-C-A-A-AA-TGTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTT-AAAAA--C-TT-T-AA
gi|11206 : GGTAC-A-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC---------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-A-AATATT
gi|11160 : GGTAC-C-A-C-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-A-C-T--TGACCTT-GAAGT-TGTGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAG--C-TT-T-AACATT
gi|11153 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-C--G---ACC-T--C-C-CG-ACC-T---GACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAGAA--C-TT-T-AACATT
gi|11242 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--A---ACC-T--C-C-TG-GTC-T--TAACCTT-GAACT-T-TGAC-CT--A-C--TTTCC-AAAAA--C-TT-T-AACATT
gi|11233 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C----------T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AACATT
gi|11279 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT----G---ACC-T--C-C-TG-ATC-T--TGACCTT-CAAGT-T-TGAC-TT--A-A--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AACATT
gi|11247 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--T------ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA
gi|11231 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--T---ACC-T--C-C-TG-AC---------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-A-
gi|11269 : GGTAC-T-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC------C-T----C-C--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AACATT
gi|11265 : GGTAC-C-A-G-AA-TTTT-T--TTTTACC-T--C-C-TG-ACT-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA
gi|11237 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--TT--ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGATATT-GAACT-T-TAAC-CT--A-C--TTTTCAAAAAA--T-TT-A-AACATT
gi|11227 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT----G---TTC-C--T-C-TG-ATC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTT-AAAAC--T-TT-A-AACATT
gi|11276 : GGTAC-C-A-A-TAATTTT-G--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGATCTT-AAAGT-T-TGAC-CT--A-C---TTTC-AAAAT--C-TT-T-AACATT
gi|11151 : GGTAC-C-ACA-CA-TTTT----G---ACC-T--C---TG-AC--T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAT--T-TT-A-AACA
gi|11162 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC---------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTA-AAAAA--C-TT-T-AACATT
gi|11147 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT----G---ACC-T--CGC-TG---C-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAC--A-TT-A-AA
gi|11211 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC---------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA
gi|11150 : GGTACAC-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C----------T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CTA-A-C--TTTTC-AAAAG--T-TT-A-AACATT
gi|11249 : GGTACGC-A-T-AA-TTTT-T--G---ATT-T--C-CCTG-AC--T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--CTTT-A-AACATT
gi|11192 : GGTAC---A-A-CA-TTTT----G---ACC-T--C-C-TG-AC--T--TGACCTT-GAAGT-T--GAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-AACATT
gi|11154 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-T------C-C--TGACCTT-GACGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA
gi|11182 : GGTAC-C-A-A--A-TGTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-A------TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAA-----TT-T-AACATT
gi|11148 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T-----------C-T--TGACTTT-GAAGT-T-TGAC-CC--A-C---TTTC-AAAAA--C-TT-T-AACATT
gi|11197 : GGTAC-C-A-AACA-TTTT----G---ACC-T--C----------T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAAC-C-TT-A-AACAT
gi|11175 : GGTAC-C-A-A-CT-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ATC-T--TGAT-------GT-T-TGAC-TT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-C-AACATT
gi|11194 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-TTGA---ACC-TTTC-C-TG-ACC-C--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAC--T-TT-A-
gi|11137 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-TTGG---ACC-T--C-C-TGGACC-T--TGACTTTTGAAAG-T-TGAC--T--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-A-AACATT
gi|11224 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--T---ACC-T--C-C-TG-AC---------CTT-GAAGT-T-TGAC-TT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA
gi|11240 : GGTAC-CCA-A-CA-TTTT-T------ACC-T--C-C-T---------TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTTAAAAAA--C-TT-A-AACAT
gi|11281 : GGTAC-C-A-A-AA-TTGT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC---------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA
gi|11235 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---AC------------ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAC--T-TT-A-
gi|11145 : GGTAC-C-A-A-CA-TTGT-T--GG--ACC-T--C-C-TG---------GACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-CT-TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA
gi|11158 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-G--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGATC-------T-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--T-TT-ATAACATT
gi|11257 : GGTAC-C-A-C-AA-TTTT-T--G---GAC-T--C-C-TG-ACC-TTATGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CTC-A-CTTTTTTC-AAAAA--CATT-T-AACATT
gi|11256 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--T------ACTAT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CA--A-C--TTTTC-AAAAC--C-TT-T-AACATT
gi|11232 : GGTAC-A-A-A--A-CTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC---------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--CTTT-T-AACATT
gi|11216 : GGTAC-C-A-A-AT-TTTT-T--G---ACC-T--C----------T--TGACCTT-GAAGT-T-TGCC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA
gi|11212 : GGTAC-C-ATA-TA-TATT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TGGAC-----AGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TTAA-AACATT
gi|11164 : GGTAC-C-A-A-CAATTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG---------GACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTA-AAAA
gi|11223 : GGTAC-T-A-A-CA-TTTT-T------ACC-T--C-C-TG-AC---------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTG-AAAAC--T-TT-A-ACCATT
gi|11200 : GGTAA-C-A-A-CA-TTCT-T--G---AAC-T--C-C-TG-ACC-T--TGAT-------GT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-AACAT
gi|11251 : GGTAC---A-A-CA-TTGT-T--G---AAC-T--C-C-TG-AC---------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-A-AA
gi|11277 : GGT-C-C-A-A-CA-TTTT-TT-G---ACCAT--C-C-TG-ACC-T--TGA------AAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAC--T-TT-A-ac
gi|11136 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-TTGG---ACC-T--C-C-TG---------GACCTT-GATGT-T-TGAC-CTTAA-C--TTTCC-AAAAC--T-TT-A-AACATT
gi|11135 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-TTGG---ACC-T--C-C-TG---------GACCTT-GATGT-T-TGAC-CTTAA-C--TTTCC-AAAAC--T-TT-A-AACATT
gi|11134 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-TTGG---ACC-T--C-C-TG---------GACCTT-GATGT-T-TGAC-CTTAA-C--TTTCC-AAAAC--T-TT-A-AACATT
gi|11226 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-T--G---ACC-T--C----------T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAT-CT--A-CTTTTTTC-AAAAAACT-TT-T-AACATT
gi|11220 : GGTAC-C-A-A-AT-TTTT-T--G---ACC-T--C-T-T--ACC-T--T-----T-GAAGT-T-TGAC-CT--T-C--TTTTC--AAAA--C-TT-A-AACATT
gi|11221 : GGTAC-T-A-T-AA-GTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC--------CTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA
gi|11199 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-G--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--TCAT-------GT-T-TCAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--CTTT-A-AACCTT
gi|11168 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-TA-G---ATC-T--C-C-TG-ACC-T--T-----T-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTC----AAAA--C-TT-T-AACATT
gi|11280 : GATAC-C-A-A-AAATTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-T--GGAC--------T-T-TGAC-CT--A-C---TTTC-AAAAA--CTTT-A-AACATT
gi|11241 : GGTAC-C-A-G-AA-TTTT-T--C---GCC-T--C-C-TG-ACC-T--TGAC-------AT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAC--CTTT-A-AA
gi|11273 : GGTAC-A-A-A-AC-TTTT-T--G---ACT-C--C-T-TG-ACC-T--TGAGTTT-GAACT-T-AAAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-AACATT
gi|11159 : GGTAC-C-A-T-AA-TTTT-C--G---------------G-ACC-TC-TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CTA-A-C--TTTTT-CAAAA--C-TT-T-AA
gi|11230 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-T--GGG-ACT-T--C-C-TG-CCC-T-----------AAAT-T-TGAC-CT--TTC--TTTTC-AAAAA--CTTT-A-AA
gi|11362 : GTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--T-C-TG-ACC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AACATT
gi|11359 : GTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-CG-ACC-T--TGACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAGAA--C-TT-T-AACAT
gi|11358 : GTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-CG-ACC-T--TGACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAGAA--C-TT-T-AACAT
gi|11360 : GTAC-C-A-A-AC-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC---------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAC--C-TT-T-AACATT
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 22 2 0 33 222 0 00 0 0 0 2 00 0 0 0 0 22 0 22 11 00 1 1 3 0
lowQualScore : . . . .. . . .. ... . .. . . . . .. . . . . .. . .. .. .. . . . .
lowQualScore : 8 4 8 66 0 4 55 555 4 66 8 4 4 2 66 4 4 4 4 88 4 33 44 66 2 2 3 4
consensus : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
Reference ( family-135 ) : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11134 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-TTGG---ACC-T--C-C-TG--------GACCTT-GATGT-T-TGAC-CTTAA-C--TTTCC--AAAA--C-TT-TAAA-CATT
gi|11135 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-TTGG---ACC-T--C-C-TG--------GACCTT-GATGT-T-TGAC-CTTAA-C--TTTCC--AAAA--C-TT-TAAA-CATT
gi|11136 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-TTGG---ACC-T--C-C-TG--------GACCTT-GATGT-T-TGAC-CTTAA-C--TTTCC--AAAA--C-TT-TAAA-CATT
gi|11137 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-TTGG---ACC-T--C-C-TGGACCT--TGACTTTTGAAAG-T-TGAC--T--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-A-AA-CATT
gi|11138 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CA--A-C--TTTTC-AAAAC--T-TT-T-AA-CATT
gi|11139 : GGTAT-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AG-CATT
gi|11142 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-A-AA-CATT
gi|11143 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11145 : GGTAC-C-A-A-CA-TTGT-T--GG--ACC-T--C-C-TG--------GACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-CT-TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11146 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-A-AA-CATT
gi|11147 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT----G---ACC-T--CGC-TG---CT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-AT-T-AA-
gi|11148 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T-----------CT--TGACTTT-GAAGT-T-TGAC-CC--A-C---TTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATTa
gi|11149 : GGTAC-C-A-A-CATTTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-G-AGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11150 : GGTACAC-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C---------T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CTA-A-C--TTTTC-AAAAG--T-TT-A-AA-CATTacctt
gi|11151 : GGTAC-C-ACA-CA-TTTT----G---ACC-T--C---TG-AC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAT--T-TT-A-AA-CA
gi|11152 : GGTAC-C-A-A-TA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAGAA--C-TT-T-AA-CAT
gi|11153 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-C--G---ACC-T--C-C-CG-ACCT---GACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAGAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11154 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-T------CC--TGACCTT-GACGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11155 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--T-ACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AGAAA--A-TT-C-AA-CA
gi|11156 : GGTAC-C-A-A-CA-TTGT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11158 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-G--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGATC-------T-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--T-TTAT-AA-CATT
gi|11159 : GGTAC-C-A-T-AA-TTTT-C--GG--ACC-T--C------------TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CTA-A-C--TTTTT-CAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11160 : GGTAC-C-A-C-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-A-CT--TGACCTT-GAAGT-TGTGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAG--C-TT-T-AA-CATT
gi|11162 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTA-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11164 : GGTAC-C-A-A-CAATTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG--------GACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTA-AAAA
gi|11167 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-CG-ACCT--TGAC-------GT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11168 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-TA-G---ATC-T--C-C-TG-ACCT--T-----T-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTC----AAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11169 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--T---ACC-G--C-C-TG-ACAT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--CTTT-T-AA-CACT
gi|11175 : GGTAC-C-A-A-CT-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ATCT--TGAT-------GT-T-TGAC-TT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-C-AA-CATT
gi|11176 : GGTAT-C-A-A-CA-TTTT-T--C---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--T-TT-A-AA-CATT
gi|11177 : GGTAC-C-A-A--A-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGTGT-TGAC-TT--A-C--TTTTC-AAAAA--T-TT-A-AA-CATT
gi|11180 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-T--G---ATC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-GT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TTAA-AA-CATT
gi|11182 : GGTAC-C-A-A--A-TGTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-A-----TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAA-----TT-T-AA-CATT
gi|11183 : GGTAC---A-A-CA-TTAT-T--G---ACT-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-A-AA-CATT
gi|11187 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTCAAAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11188 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11189 : GGTAC-C-A-A-CA-TTGT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTATC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11191 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT----G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTATC--AAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11192 : GGTAC---A-A-CA-TTTT----G---ACC-T--C-C-TG-AC-T--TGACCTT-GAAGT-T--GAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11194 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-TTGA---ACC-TTTC-C-TG-ACCC--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-
gi|11197 : GGTAC-C-A-AACA-TTTT----G---ACC-T--C---------T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-CT-TAAA-CAT
gi|11199 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-G--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TCAT-------GT-T-TCAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11200 : GGTAA-C-A-A-CA-TTCT-T--G---AAC-T--C-C-TG-ACCT--TGAT-------GT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-AA-CATacctt
gi|11201 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACTT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTATC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11202 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-A-TG-AC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-CT-TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11205 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGACTTT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11206 : GGTAC-A-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-A-AA-TATT
gi|11207 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TG-C-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-AA-
gi|11208 : GGTAC-C-A-A-CA-TTGT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11209 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT----G---ACC-T--C-C-TG-GCCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11211 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11212 : GGTAC-C-ATA-TA-TATT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGGAC-----AGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TTAA-AA-CATT
gi|11214 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GGAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-ATAAA--C-TT-T-AA-
gi|11215 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11216 : GGTAC-C-A-A-AT-TTTT-T--G---ACC-T--C---------T--TGACCTT-GAAGT-T-TGCC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11219 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGA--CT--A----TTTTC--AAAA--C-TT-A-AA-CATT
gi|11220 : GGTAC-C-A-A-AT-TTTT-T--G---ACC-T--C-T-T--ACCT--T-----T-GAAGT-T-TGAC-CT--T-C--TTTTC--AAAA--C-TT-A-AA-CATT
gi|11221 : GGTAC-T-A-T-AA-GTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-------CTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11223 : GGTAC-T-A-A-CA-TTTT-T------ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTT--GAAAA--C-TT-T-AACCATT
gi|11224 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--T---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-TT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11225 : GGTAC-C-A-A-AA-TGTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11226 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-T--G---ACC-T--C---------T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAT-CT--A-CTTTTTTC-AAAAAACT-TT-T-AA-CATT
gi|11227 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT----G---TTC-C--T-C-TG-ATCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTT--AAAA--C-TT-TAAA-CATT
gi|11229 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTTTT--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGAACTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTCAAAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11230 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-T--GGG-ACT-T--C-C-TG-CCCT-----------AAAT-T-TGAC-CT--TTC--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11231 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--T---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-a
gi|11232 : GGTAC-A-A-A--A-CTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--CTTT-T-AA-CATTaa
gi|11233 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C---------T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11234 : GGTAC-C-A-A-AT-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGATCTT-GAACT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11235 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---AC------------ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-AA-
gi|11237 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--TT--ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGATATT-GAACT-T-TAAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--A-TT-TAAA-CATT
gi|11240 : GGTAC-CCA-A-CA-TTTT-T------ACC-T--C-C-T--------TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTTAAAAAA--C-TT-A-AA-CAT
gi|11241 : GGTAC-C-A-G-AA-TTTT-T--C---GCC-T--C-C-TG-ACCT--TGAC-------AT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAC--C-TT-T-AA-
gi|11242 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--A---ACC-T--C-C-TG-GTCT--TAACCTT-GAACT-T-TGAC-CT--A-C--TTTCC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATTa
gi|11244 : GGTAC-C-A-A-AAATTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-GCCT--TGACCTT-GA-GT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11245 : GGTAC-C-A-A--A-TTTT-T--G---ACT-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTCA-AAAAA--C-TT-T-AA-CAT
gi|11247 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--T------ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11248 : GGTAC-C-A-A--A-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGA--CT--A-CT-TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11249 : GGTACGC-A-T-AA-TTTT-T--G---ATT-T--C-CCTG-AC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-TAAA-CATT
gi|11251 : GGTAC---A-A-CA-TTGT-T--G---AAC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-A-AA-
gi|11253 : GGTGC-C-A-A-AC-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-CGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAG--C-TT-T-AA-CATTac
gi|11254 : GGTAC-C-A-A-AC-TTGT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11256 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--TAC-TA----T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CA--A-C--TTTTC-AAAAC--C-TT-T-AA-CATT
gi|11257 : GGTAC-C-A-C-AA-TTTT-T--G---GAC-T--C-C-TG-ACCTTATGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CTC-A-CTTTTTTC-AAAAA--CATT-T-AA-CATT
gi|11259 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TT-GCCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTATC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11262 : GGTAC-C-A-A-AA-TGTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTT-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11264 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-CG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TTAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-G-AA-CATT
gi|11265 : GGTAC-C-A-G-AA-TTTT-T--TTTTACC-T--C-C-TG-ACTT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11269 : GGTAC-T-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC------C-T----CC--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11270 : GGTAC-C-A-A-CA-TATT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACTT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-TAAAA--C-TT-G-AA-CATT
gi|11273 : GGTAC-A-A-A-AC-TTTT-T--G---ACT-C--C-T-TG-ACCT--TGAGTTT-GAACT-T-AAAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11276 : GGTAC-C-A-A-TAATTTT-G--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGATCTT-AAAGT-T-TGAC-CT--A-C---TTTC-AAAAT--C-TT-T-AA-CATT
gi|11277 : GGT-C-C-A-A-CA-TTTT-TT-G---ACCAT--C-C-TG-ACCT--TGA------AAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-AA-
gi|11279 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT----G---ACC-T--C-C-TG-ATCT--TGACCTT-CAAGT-T-TGAC-TT--A-A--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11280 : GATAC-C-A-A-AAATTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--GGAC--------T-T-TGAC-CT--A-C---TTTC-AAAAA--C-TT-TAAA-CATT
gi|11281 : GGTAC-C-A-A-AA-TTGT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11358 : GTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-CG-ACCT--TGACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAGAA--C-TT-T-AA-CAT
gi|11359 : GTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-CG-ACCT--TGACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAGAA--C-TT-T-AA-CAT
gi|11360 : GTAC-C-A-A-AC-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAC--C-TT-T-AA-CATT
gi|11362 : GTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--T-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 22 2 0 33 222 0 00 0 0 0 2 00 0 0 0 0 22 0 22 11 00 1 1 3 0
lowQualScore : . . . .. . . .. ... . .. . . . . .. . . . . .. . .. .. .. . . . .
lowQualScore : 8 4 8 66 0 4 55 555 4 66 8 4 4 2 66 4 4 4 4 88 4 33 44 66 2 2 3 4
consensus : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
Reference ( family-135 ) : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11134 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-TTGG---ACC-T--C-C-TG--------GACCTT-GATGT-T-TGAC-CTTAA-C--TTTCC--AAAA--C-TT-TAAA-CATT
gi|11135 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-TTGG---ACC-T--C-C-TG--------GACCTT-GATGT-T-TGAC-CTTAA-C--TTTCC--AAAA--C-TT-TAAA-CATT
gi|11136 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-TTGG---ACC-T--C-C-TG--------GACCTT-GATGT-T-TGAC-CTTAA-C--TTTCC--AAAA--C-TT-TAAA-CATT
gi|11137 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-TTGG---ACC-T--C-C-TGGACCT--TGACTTTTGAAAG-T-TGAC--T--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-A-AA-CATT
gi|11138 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CA--A-C--TTTTC-AAAAC--T-TT-T-AA-CATT
gi|11139 : GGTAT-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AG-CATT
gi|11142 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-A-AA-CATT
gi|11143 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11145 : GGTAC-C-A-A-CA-TTGT-T--GG--ACC-T--C-C-TG--------GACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-CT-TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11146 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-A-AA-CATT
gi|11147 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT----G---ACC-T--CGC-TG---CT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-AT-T-AA-
gi|11148 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T-----------CT--TGACTTT-GAAGT-T-TGAC-CC--A-C---TTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATTa
gi|11149 : GGTAC-C-A-A-CATTTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-G-AGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11150 : GGTACAC-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C---------T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CTA-A-C--TTTTC-AAAAG--T-TT-A-AA-CATTacctt
gi|11151 : GGTAC-C-ACA-CA-TTTT----G---ACC-T--C---TG-AC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAT--T-TT-A-AA-CA
gi|11152 : GGTAC-C-A-A-TA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAGAA--C-TT-T-AA-CAT
gi|11153 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-C--G---ACC-T--C-C-CG-ACCT---GACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAGAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11154 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-T------CC--TGACCTT-GACGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11155 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--T-ACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AGAAA--A-TT-C-AA-CA
gi|11156 : GGTAC-C-A-A-CA-TTGT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11158 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-G--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGATC-------T-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--T-TTAT-AA-CATT
gi|11159 : GGTAC-C-A-T-AA-TTTT-C--GG--ACC-T--C------------TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CTA-A-C--TTTTT-CAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11160 : GGTAC-C-A-C-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-A-CT--TGACCTT-GAAGT-TGTGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAG--C-TT-T-AA-CATT
gi|11162 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTA-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11164 : GGTAC-C-A-A-CAATTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG--------GACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTA-AAAA
gi|11167 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-CG-ACCT--TGAC-------GT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11168 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-TA-G---ATC-T--C-C-TG-ACCT--T-----T-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTC----AAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11169 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--T---ACC-G--C-C-TG-ACAT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--CTTT-T-AA-CACT
gi|11175 : GGTAC-C-A-A-CT-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ATCT--TGAT-------GT-T-TGAC-TT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-C-AA-CATT
gi|11176 : GGTAT-C-A-A-CA-TTTT-T--C---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--T-TT-A-AA-CATT
gi|11177 : GGTAC-C-A-A--A-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGTGT-TGAC-TT--A-C--TTTTC-AAAAA--T-TT-A-AA-CATT
gi|11180 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-T--G---ATC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-GT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TTAA-AA-CATT
gi|11182 : GGTAC-C-A-A--A-TGTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-A-----TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAA-----TT-T-AA-CATT
gi|11183 : GGTAC---A-A-CA-TTAT-T--G---ACT-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-A-AA-CATT
gi|11187 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTCAAAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11188 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11189 : GGTAC-C-A-A-CA-TTGT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTATC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11191 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT----G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTATC--AAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11192 : GGTAC---A-A-CA-TTTT----G---ACC-T--C-C-TG-AC-T--TGACCTT-GAAGT-T--GAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11194 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-TTGA---ACC-TTTC-C-TG-ACCC--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-
gi|11197 : GGTAC-C-A-AACA-TTTT----G---ACC-T--C---------T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-CT-TAAA-CAT
gi|11199 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-G--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TCAT-------GT-T-TCAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11200 : GGTAA-C-A-A-CA-TTCT-T--G---AAC-T--C-C-TG-ACCT--TGAT-------GT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-AA-CATacctt
gi|11201 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACTT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTATC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11202 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-A-TG-AC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-CT-TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11205 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGACTTT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11206 : GGTAC-A-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-A-AA-TATT
gi|11207 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TG-C-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-AA-
gi|11208 : GGTAC-C-A-A-CA-TTGT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11209 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT----G---ACC-T--C-C-TG-GCCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11211 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11212 : GGTAC-C-ATA-TA-TATT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGGAC-----AGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TTAA-AA-CATT
gi|11214 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GGAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-ATAAA--C-TT-T-AA-
gi|11215 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11216 : GGTAC-C-A-A-AT-TTTT-T--G---ACC-T--C---------T--TGACCTT-GAAGT-T-TGCC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11219 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGA--CT--A----TTTTC--AAAA--C-TT-A-AA-CATT
gi|11220 : GGTAC-C-A-A-AT-TTTT-T--G---ACC-T--C-T-T--ACCT--T-----T-GAAGT-T-TGAC-CT--T-C--TTTTC--AAAA--C-TT-A-AA-CATT
gi|11221 : GGTAC-T-A-T-AA-GTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-------CTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11223 : GGTAC-T-A-A-CA-TTTT-T------ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTT--GAAAA--C-TT-T-AACCATT
gi|11224 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--T---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-TT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11225 : GGTAC-C-A-A-AA-TGTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11226 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-T--G---ACC-T--C---------T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAT-CT--A-CTTTTTTC-AAAAAACT-TT-T-AA-CATT
gi|11227 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT----G---TTC-C--T-C-TG-ATCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTT--AAAA--C-TT-TAAA-CATT
gi|11229 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTTTT--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGAACTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTCAAAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11230 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-T--GGG-ACT-T--C-C-TG-CCCT-----------AAAT-T-TGAC-CT--TTC--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11231 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--T---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-a
gi|11232 : GGTAC-A-A-A--A-CTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--CTTT-T-AA-CATTaa
gi|11233 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C---------T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11234 : GGTAC-C-A-A-AT-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGATCTT-GAACT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11235 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---AC------------ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-AA-
gi|11237 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--TT--ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGATATT-GAACT-T-TAAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--A-TT-TAAA-CATT
gi|11240 : GGTAC-CCA-A-CA-TTTT-T------ACC-T--C-C-T--------TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTTAAAAAA--C-TT-A-AA-CAT
gi|11241 : GGTAC-C-A-G-AA-TTTT-T--C---GCC-T--C-C-TG-ACCT--TGAC-------AT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAC--C-TT-T-AA-
gi|11242 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--A---ACC-T--C-C-TG-GTCT--TAACCTT-GAACT-T-TGAC-CT--A-C--TTTCC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATTa
gi|11244 : GGTAC-C-A-A-AAATTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-GCCT--TGACCTT-GA-GT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11245 : GGTAC-C-A-A--A-TTTT-T--G---ACT-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTCA-AAAAA--C-TT-T-AA-CAT
gi|11247 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--T------ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11248 : GGTAC-C-A-A--A-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGA--CT--A-CT-TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11249 : GGTACGC-A-T-AA-TTTT-T--G---ATT-T--C-CCTG-AC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-TAAA-CATT
gi|11251 : GGTAC---A-A-CA-TTGT-T--G---AAC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-A-AA-
gi|11253 : GGTGC-C-A-A-AC-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-CGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAG--C-TT-T-AA-CATTac
gi|11254 : GGTAC-C-A-A-AC-TTGT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11256 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--TAC-TA----T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CA--A-C--TTTTC-AAAAC--C-TT-T-AA-CATT
gi|11257 : GGTAC-C-A-C-AA-TTTT-T--G---GAC-T--C-C-TG-ACCTTATGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CTC-A-CTTTTTTC-AAAAA--CATT-T-AA-CATT
gi|11259 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TT-GCCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTATC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11262 : GGTAC-C-A-A-AA-TGTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTT-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11264 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-CG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TTAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-G-AA-CATT
gi|11265 : GGTAC-C-A-G-AA-TTTT-T--TTTTACC-T--C-C-TG-ACTT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11269 : GGTAC-T-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC------C-T----CC--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11270 : GGTAC-C-A-A-CA-TATT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACTT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-TAAAA--C-TT-G-AA-CATT
gi|11273 : GGTAC-A-A-A-AC-TTTT-T--G---ACT-C--C-T-TG-ACCT--TGAGTTT-GAACT-T-AAAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11276 : GGTAC-C-A-A-TAATTTT-G--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGATCTT-AAAGT-T-TGAC-CT--A-C---TTTC-AAAAT--C-TT-T-AA-CATT
gi|11277 : GGT-C-C-A-A-CA-TTTT-TT-G---ACCAT--C-C-TG-ACCT--TGA------AAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-AA-
gi|11279 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT----G---ACC-T--C-C-TG-ATCT--TGACCTT-CAAGT-T-TGAC-TT--A-A--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11280 : GATAC-C-A-A-AAATTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--GGAC--------T-T-TGAC-CT--A-C---TTTC-AAAAA--C-TT-TAAA-CATT
gi|11281 : GGTAC-C-A-A-AA-TTGT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11358 : GTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-CG-ACCT--TGACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAGAA--C-TT-T-AA-CAT
gi|11359 : GTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-CG-ACCT--TGACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAGAA--C-TT-T-AA-CAT
gi|11360 : GTAC-C-A-A-AC-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAC--C-TT-T-AA-CATT
gi|11362 : GTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--T-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
blockSeqs : AC T TG TTT C TA TT AA T A A
blockSeqs : C A TG GG C TA TT AA T A A
blockSeqs : C A TG G C A T AA A A A
blockSeqs : C A TG G C A T A . . A
blockSeqs : C A A T C C T A . . A
blockSeqs : C . T . C . . A . . A
blockSeqs : C . . . C . . A . . A
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : T . . . C . . A . . .
blockSeqs : A . . . A . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : A . . . C . . C . . .
blockSeqs : A . . . C . . A . . .
blockSeqs : A . . . C . . A . . .
blockSeqs : A . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . T . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : A . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : A . . . C . . A . . .
blockSeqs : A . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : A . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : A . . . C . . A . . .
blockSeqs : A . . . C . . G . . .
blockSeqs : T . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : A . . . C . . A . . .
blockSeqs : A . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : A . . . C . . A . . .
blockSeqs : A . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : A . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . T . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . T . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : A . . . C . . A . . .
blockSeqs : A . . . C . . A . . .
blockSeqs : A . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : C . . . C . . A . . .
blockSeqs : A . . . C . . A . . .
blockSeqs : A . . . C . . A . . .
blockSeqs : A . . . . . . A . . .
blockSeqs : A . . . . . . A . . .
blockSeqs : A . . . . . . A . . .
blockSeqs : C . . . . . . T . . .
blockSeqs : A . . . . . . A . . .
blockSeqs : A . . . . . . A . . .
blockSeqs : A . . . . . . A . . .
blockSeqs : A . . . . . . A . . .
blockSeqs : C . . . . . . A . . .
blockSeqs : A . . . . . . A . . .
blockSeqs : C . . . . . . A . . .
blockSeqs : A . . . . . . A . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqCons : ** ** A*
originalCons : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
finalCons : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTCA-AAAA--C-TT-T-AA-CATT
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 22 2 0 33 222 0 00 0 0 0 2 00 0 0 0 0 22 0 22 11 00 1 1 3 0
lowQualScore : . . . .. . . .. ... . .. . . . . .. . . . . .. . .. .. .. . . . .
lowQualScore : 8 4 8 66 0 4 55 555 4 66 8 4 4 2 66 4 4 4 4 88 4 33 44 66 2 2 3 4
consensus : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
Reference ( family-135 ) : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11134 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-TTGG---ACC-T--C-C-TG--------GACCTT-GATGT-T-TGAC-CTTAA-C--TTTCC--AAAA--C-TT-TAAA-CATT
gi|11135 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-TTGG---ACC-T--C-C-TG--------GACCTT-GATGT-T-TGAC-CTTAA-C--TTTCC--AAAA--C-TT-TAAA-CATT
gi|11136 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-TTGG---ACC-T--C-C-TG--------GACCTT-GATGT-T-TGAC-CTTAA-C--TTTCC--AAAA--C-TT-TAAA-CATT
gi|11137 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-TTGG---ACC-T--C-C-TGGACCT--TGACTTTTGAAAG-T-TGAC--T--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-A-AA-CATT
gi|11138 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CA--A-C--TTTTC-AAAAC--T-TT-T-AA-CATT
gi|11139 : GGTAT-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AG-CATT
gi|11142 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-A-AA-CATT
gi|11143 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11145 : GGTAC-C-A-A-CA-TTGT-T--GG--ACC-T--C-C-TG--------GACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-CT-TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11146 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-A-AA-CATT
gi|11147 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT----G---ACC-T--CGC-TG---CT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-AT-T-AA-
gi|11148 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T-----------CT--TGACTTT-GAAGT-T-TGAC-CC--A-C---TTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATTa
gi|11149 : GGTAC-C-A-A-CATTTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-G-AGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11150 : GGTACAC-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C---------T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CTA-A-C--TTTTC-AAAAG--T-TT-A-AA-CATTacctt
gi|11151 : GGTAC-C-ACA-CA-TTTT----G---ACC-T--C---TG-AC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAT--T-TT-A-AA-CA
gi|11152 : GGTAC-C-A-A-TA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAGAA--C-TT-T-AA-CAT
gi|11153 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-C--G---ACC-T--C-C-CG-ACCT---GACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAGAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11154 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-T------CC--TGACCTT-GACGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11155 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--T-ACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AGAAA--A-TT-C-AA-CA
gi|11156 : GGTAC-C-A-A-CA-TTGT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11158 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-G--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGATC-------T-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--T-TTAT-AA-CATT
gi|11159 : GGTAC-C-A-T-AA-TTTT-C--GG--ACC-T--C------------TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CTA-A-C--TTTTT-CAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11160 : GGTAC-C-A-C-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-A-CT--TGACCTT-GAAGT-TGTGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAG--C-TT-T-AA-CATT
gi|11162 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTA-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11164 : GGTAC-C-A-A-CAATTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG--------GACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTA-AAAA
gi|11167 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-CG-ACCT--TGAC-------GT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11168 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-TA-G---ATC-T--C-C-TG-ACCT--T-----T-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTC----AAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11169 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--T---ACC-G--C-C-TG-ACAT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--CTTT-T-AA-CACT
gi|11175 : GGTAC-C-A-A-CT-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ATCT--TGAT-------GT-T-TGAC-TT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-C-AA-CATT
gi|11176 : GGTAT-C-A-A-CA-TTTT-T--C---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--T-TT-A-AA-CATT
gi|11177 : GGTAC-C-A-A--A-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGTGT-TGAC-TT--A-C--TTTTC-AAAAA--T-TT-A-AA-CATT
gi|11180 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-T--G---ATC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-GT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TTAA-AA-CATT
gi|11182 : GGTAC-C-A-A--A-TGTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-A-----TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAA-----TT-T-AA-CATT
gi|11183 : GGTAC---A-A-CA-TTAT-T--G---ACT-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-A-AA-CATT
gi|11187 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTCAAAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11188 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11189 : GGTAC-C-A-A-CA-TTGT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTATC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11191 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT----G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTATC--AAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11192 : GGTAC---A-A-CA-TTTT----G---ACC-T--C-C-TG-AC-T--TGACCTT-GAAGT-T--GAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11194 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-TTGA---ACC-TTTC-C-TG-ACCC--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-
gi|11197 : GGTAC-C-A-AACA-TTTT----G---ACC-T--C---------T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-CT-TAAA-CAT
gi|11199 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-G--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TCAT-------GT-T-TCAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11200 : GGTAA-C-A-A-CA-TTCT-T--G---AAC-T--C-C-TG-ACCT--TGAT-------GT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-AA-CATacctt
gi|11201 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACTT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTATC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11202 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-A-TG-AC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-CT-TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11205 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGACTTT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11206 : GGTAC-A-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-A-AA-TATT
gi|11207 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TG-C-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-AA-
gi|11208 : GGTAC-C-A-A-CA-TTGT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11209 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT----G---ACC-T--C-C-TG-GCCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11211 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11212 : GGTAC-C-ATA-TA-TATT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGGAC-----AGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TTAA-AA-CATT
gi|11214 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GGAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-ATAAA--C-TT-T-AA-
gi|11215 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11216 : GGTAC-C-A-A-AT-TTTT-T--G---ACC-T--C---------T--TGACCTT-GAAGT-T-TGCC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11219 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGA--CT--A----TTTTC--AAAA--C-TT-A-AA-CATT
gi|11220 : GGTAC-C-A-A-AT-TTTT-T--G---ACC-T--C-T-T--ACCT--T-----T-GAAGT-T-TGAC-CT--T-C--TTTTC--AAAA--C-TT-A-AA-CATT
gi|11221 : GGTAC-T-A-T-AA-GTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACC-------CTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11223 : GGTAC-T-A-A-CA-TTTT-T------ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTT--GAAAA--C-TT-T-AACCATT
gi|11224 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--T---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-TT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11225 : GGTAC-C-A-A-AA-TGTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11226 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-T--G---ACC-T--C---------T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAT-CT--A-CTTTTTTC-AAAAAACT-TT-T-AA-CATT
gi|11227 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT----G---TTC-C--T-C-TG-ATCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTT--AAAA--C-TT-TAAA-CATT
gi|11229 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTTTT--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGAACTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTCAAAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11230 : GGTAC-C-A---CA-TTTT-T--GGG-ACT-T--C-C-TG-CCCT-----------AAAT-T-TGAC-CT--TTC--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11231 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--T---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-a
gi|11232 : GGTAC-A-A-A--A-CTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--CTTT-T-AA-CATTaa
gi|11233 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C---------T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11234 : GGTAC-C-A-A-AT-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGATCTT-GAACT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11235 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---AC------------ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-AA-
gi|11237 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--TT--ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGATATT-GAACT-T-TAAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--A-TT-TAAA-CATT
gi|11240 : GGTAC-CCA-A-CA-TTTT-T------ACC-T--C-C-T--------TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTTAAAAAA--C-TT-A-AA-CAT
gi|11241 : GGTAC-C-A-G-AA-TTTT-T--C---GCC-T--C-C-TG-ACCT--TGAC-------AT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAC--C-TT-T-AA-
gi|11242 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--A---ACC-T--C-C-TG-GTCT--TAACCTT-GAACT-T-TGAC-CT--A-C--TTTCC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATTa
gi|11244 : GGTAC-C-A-A-AAATTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-GCCT--TGACCTT-GA-GT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11245 : GGTAC-C-A-A--A-TTTT-T--G---ACT-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTCA-AAAAA--C-TT-T-AA-CAT
gi|11247 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--T------ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11248 : GGTAC-C-A-A--A-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGA--CT--A-CT-TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11249 : GGTACGC-A-T-AA-TTTT-T--G---ATT-T--C-CCTG-AC-T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-TAAA-CATT
gi|11251 : GGTAC---A-A-CA-TTGT-T--G---AAC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-A-AA-
gi|11253 : GGTGC-C-A-A-AC-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-CGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAG--C-TT-T-AA-CATTac
gi|11254 : GGTAC-C-A-A-AC-TTGT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11256 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--TAC-TA----T--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CA--A-C--TTTTC-AAAAC--C-TT-T-AA-CATT
gi|11257 : GGTAC-C-A-C-AA-TTTT-T--G---GAC-T--C-C-TG-ACCTTATGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CTC-A-CTTTTTTC-AAAAA--CATT-T-AA-CATT
gi|11259 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TT-GCCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTATC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11262 : GGTAC-C-A-A-AA-TGTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTT-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11264 : GGTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-CG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TTAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-G-AA-CATT
gi|11265 : GGTAC-C-A-G-AA-TTTT-T--TTTTACC-T--C-C-TG-ACTT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11269 : GGTAC-T-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC------C-T----CC--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11270 : GGTAC-C-A-A-CA-TATT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACTT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-TAAAA--C-TT-G-AA-CATT
gi|11273 : GGTAC-A-A-A-AC-TTTT-T--G---ACT-C--C-T-TG-ACCT--TGAGTTT-GAACT-T-AAAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11276 : GGTAC-C-A-A-TAATTTT-G--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--TGATCTT-AAAGT-T-TGAC-CT--A-C---TTTC-AAAAT--C-TT-T-AA-CATT
gi|11277 : GGT-C-C-A-A-CA-TTTT-TT-G---ACCAT--C-C-TG-ACCT--TGA------AAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC--AAAA--C-TT-T-AA-
gi|11279 : GGTAC-C-A-A-AA-TTTT----G---ACC-T--C-C-TG-ATCT--TGACCTT-CAAGT-T-TGAC-TT--A-A--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT
gi|11280 : GATAC-C-A-A-AAATTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-ACCT--GGAC--------T-T-TGAC-CT--A-C---TTTC-AAAAA--C-TT-TAAA-CATT
gi|11281 : GGTAC-C-A-A-AA-TTGT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-
gi|11358 : GTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-CG-ACCT--TGACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAGAA--C-TT-T-AA-CAT
gi|11359 : GTAC-C-A-A-AA-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-CG-ACCT--TGACCTT-GATGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAGAA--C-TT-T-AA-CAT
gi|11360 : GTAC-C-A-A-AC-TTTT-T--G---ACC-T--C-C-TG-AC--------CTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAC--C-TT-T-AA-CATT
gi|11362 : GTAC-C-A-A-CA-TTTT-T--G---ACC-T--T-C-TG-ACCT--TGACCTT-GAAGT-T-TGAC-CT--A-C--TTTTC-AAAAA--C-TT-T-AA-CATT