lowQualScore : 0 0 00 0 1 0 11111 00 0 0 0 0 0 0 11 0 0 0 2 00 00 11 11 0 1 1 0 2 222 1 00 1
lowQualScore : . . .. . . . ..... .. . . . . . . .. . . . . .. .. .. .. . . . . . ... . .. .
lowQualScore : 4 8 66 8 6 4 66666 66 8 4 4 4 8 4 44 4 4 4 4 66 66 88 55 6 2 2 6 9 555 2 88 2
consensus : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
Reference ( gi|19257 ) : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19266 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19265 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAT-GGAATG
gi|19259 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19273 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19284 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GT--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19256 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GGA-AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19288 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19297 : TTTGC-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--T--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19303 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACAGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19300 : TTTGA-GATT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19313 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T---AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19322 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19320 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19316 : TTTGA-G-TT--GAA-TTG-TG-----T--G-CCA-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19324 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-T-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19327 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--T--GG--AAA--T-C-A-A-A-T---G-A--TGAT-GGAATG
gi|19337 : TTTGA-G-TT--AAA-T-G-TG-----T--G-C-A-AAAGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19336 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-AGAATG
gi|19328 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19304 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C---A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19346 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-AC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAA--C-C-A-T-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19353 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19294 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--A-C---A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19354 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-ATAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19280 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-TGGC-AGAGA--TAA-AT-G-AA--C--GGA-AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19356 : TTTGA-G-TT--AAA-T-G-TGCACTGT--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-AGAATG
gi|19358 : TTTAA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19361 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C---ACCGTAT-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC--GAATG
gi|19329 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-ATT---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19364 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TCAC-GGAA
gi|19373 : TTTAA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--T--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-AGAATG
gi|19367 : TTTGA-A-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A--CCGT-T-GC-AGAGA--T---AT-G-AA--C--GG--AAA--C-CGA-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19383 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TA-----T--G-C-A-ACCGT-T-GCAAGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C---A-A-T---G-A--TGACAAGAATG
gi|19388 : TTGGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-CT-G-AA--C--GG--AAT--C-C-A-ACA-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19268 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-
gi|19390 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGC--T-A-TT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19375 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--T---G--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19392 : TTTGA-G-T---GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19397 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAA--C-C-A-A-C-G---GAA--GGAC-GGAATG
gi|19405 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G----TGAC-GAA
gi|19406 : TTTGA-G-TT--GAA-T-T-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-GA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GAAA
gi|19267 : TTTGA-G-T---GAA-T-GGTG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGAC-T-A-AT-G-AA--C--GG--AAAACC-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19366 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-A-GA--C--GG--AAAACC-C-A-A-A-T---G-ACCTGA--GGAATG
gi|19407 : TTTGA-G-TT--GAA-T-A-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-A-A-T-A-TACGA-A--TGAC-GGAATG
gi|19422 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACC-T-T-GC-AGAGA--T-A-AT-A-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-ATT---G-A--T-AC-GAAA
gi|19436 : TTGGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-AGACCGT-T-GC-AGAGGATT-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-AGA-A-TCG-G-A--TGAC-GGAATG
gi|19382 : TTTGA-G-TT--CAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGACAG-T-A-AT-G-AA--C--GGAAAAA--C-C-AGA-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19437 : TTTGACG-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-GGAGA--T-AGAT-A-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19439 : TTTGA-G-TT--GAT-T-G-TA-----T--T-G-A-ATGGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19430 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-TGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-G-A-A-
gi|19410 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AC--T--GG--AAA----C-A-A-A-T-----C--TGAC-GGAA
gi|19445 : TTTTA-G-TT--CAT-T-G-TA-----T--T-G-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19377 : TTTGA-G-TT--GAA-TTG-CG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GGA-AAA--C-C-A-A-ATT---G-A--TGAC-GGAA
gi|19274 : TTTGA-A-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-G-A-A-
gi|19447 : TTTGA-G-TT--GTA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-TC--A-A--TGGC-GGt
gi|19429 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19421 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19420 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19419 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19417 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19398 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19394 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19393 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19374 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19357 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19355 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19317 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19298 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19290 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19289 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19395 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AA-----C-A-A-A-
gi|19318 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AA
gi|19347 : TTTGA-G-CT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19321 : TTTGA-G-TT--GAG-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19442 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AAAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19418 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19391 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--T--GG--AAA--
gi|19359 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19269 : TTTGA-G-TT--GAA-T-A-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19260 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19376 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-C-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19338 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-CCCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19305 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-CA--C--GG--AAA--
gi|19299 : TTTGC-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19291 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAA--
gi|19413 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TGTT---T--G---A-ACCGT-T-GC-A-AGA--T-A-AT-G-AA--CCGGA--AAA--C-C-A-A-ATT---G-A--TGAC-GAAATG
gi|19510 : TTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C---A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19514 : TTTA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C---A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19509 : TTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG---AA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGACAGGAATG
gi|19512 : TTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-AC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAA--C-C-A-T-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19504 : TTGA-G-TT--GAA-TCG-TG-----T--GGC-A-ACCGT-T-GC-TGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19503 : TTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-G-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--A-C-C-A-A-T---G-A--TGAC-GGGA
gi|19519 : TTGA-G-TT--GAAAT-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAC--C-A-A-A-A-T---GAA--TGAC-GGAATG
gi|19520 : TTGA-G-TTTTGAA-T-G-TG-----CTCG-C-A-ACCGT-TTGC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-A-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19505 : TTGA-GCTT--GAA-TCG-TG-----T--GGC-A-ACCGT-T-GC-TGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-CAA-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19518 : TTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19538 : TGA-G-TT--GGAGT-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-ATGG-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19540 : TGA-G-T---GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG---AA--C-C-A-A-AGT---G-A--TGAC-AGAATG
gi|19551 : GA-G-TT--GAG-T-G-TG-----A--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AAGGC--GG--AAAG-CGC-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
Alignments
lowQualScore : 0 0 00 0 1 0 11111 00 0 0 0 0 0 0 11 0 0 0 2 00 00 11 11 0 1 1 0 2 222 1 00 1
lowQualScore : . . .. . . . ..... .. . . . . . . .. . . . . .. .. .. .. . . . . . ... . .. .
lowQualScore : 4 8 66 8 6 4 66666 66 8 4 4 4 8 4 33 4 4 4 4 55 55 88 55 6 1 1 6 9 555 2 88 2
consensus : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
Reference ( family-126 ) : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19256 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GGA-AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19257 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19259 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19260 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19265 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAT-GGAATG
gi|19266 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19267 : TTTGA-G-T---GAA-T-GGTG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGAC-T-A-AT-G-AA--C--GG--AAAACC-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19268 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-
gi|19269 : TTTGA-G-TT--GAA-T-A-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19273 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19274 : TTTGA-A-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-G-A-A-
gi|19280 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-TGGC-AGAGA--TAA-AT-G-AA--C--GGA-AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATGt
gi|19284 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GT--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19288 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19289 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19290 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19291 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAA--
gi|19294 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--A-C---A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19297 : TTTGC-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--T--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19298 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19299 : TTTGC-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19300 : TTTGA-GATT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19303 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACAGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19304 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C---A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19305 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-CA--C--GG--AAA--
gi|19313 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T---AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19316 : TTTGA-G-TT--GAA-TTG-TG-----T--G-CCA-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19317 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19318 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AA
gi|19320 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19321 : TTTGA-G-TT--GAG-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19322 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19324 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-T-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19327 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--T--GG--AAA--T-C-A-A-A-T---G-A--TGAT-GGAATG
gi|19328 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19329 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-ATT---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19336 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-AGAATG
gi|19337 : TTTGA-G-TT--AAA-T-G-TG-----T--G-C-A-AAAGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19338 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-CCCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19346 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-AC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAA--C-C-A-T-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19347 : TTTGA-G-CT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19353 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19354 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-ATAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19355 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19356 : TTTGA-G-TT--AAA-T-G-TGCACTGT--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-AGAATG
gi|19357 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19358 : TTTAA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19359 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19361 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C---ACCGTAT-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC--GAATG
gi|19364 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TCAC-GGAA
gi|19366 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-A-GA--C--GG--AAAACC-C-A-A-A-T---G-ACCTGA--GGAATG
gi|19367 : TTTGA-A-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A--CCGT-T-GC-AGAGA--T---AT-G-AA--C--GG--AAA--C-CGA-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19373 : TTTAA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--T--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-AGAATG
gi|19374 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19375 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--T---G--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19376 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-C-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19377 : TTTGA-G-TT--GAA-TTG-CG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GGA-AAA--C-C-A-A-ATT---G-A--TGAC-GGAA
gi|19382 : TTTGA-G-TT--CAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGACAG-T-A-AT-G-AA--C--GGAAAAA--C-C-AGA-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19383 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TA-----T--G-C-A-ACCGT-T-GCAAGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C---A-A-T---G-A--TGACAAGAATG
gi|19388 : TTGGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-CT-G-AA--C--GG--AAT--C-C-A-ACA-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19390 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGC--T-A-TT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19391 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--T--GG--AAA--
gi|19392 : TTTGA-G-T---GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19393 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19394 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19395 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AA-----C-A-A-A-
gi|19397 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAA--C-C-A-A-C-G---GAA--GGAC-GGAATG
gi|19398 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19405 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G----TGAC-GAA
gi|19406 : TTTGA-G-TT--GAA-T-T-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-GA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GAAA
gi|19407 : TTTGA-G-TT--GAA-T-A-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-A-A-T-A-TACGA-A--TGAC-GGAATG
gi|19410 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AC--T--GG--AAA----C-A-A-A-T-----C--TGAC-GGAA
gi|19413 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TGTT---T--G---A-ACCGT-T-GC-A-AGA--T-A-AT-G-AA--CCGGA--AAA--C-C-A-A-ATT---G-A--TGAC-GAAATG
gi|19417 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19418 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19419 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19420 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19421 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19422 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACC-T-T-GC-AGAGA--T-A-AT-A-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-ATT---G-A--T-AC-GAAA
gi|19429 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19430 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-TGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-G-A-A-
gi|19436 : TTGGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-AGACCGT-T-GC-AGAGGATT-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-AGA-A-TCG-G-A--TGAC-GGAATG
gi|19437 : TTTGACG-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-GGAGA--T-AGAT-A-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19439 : TTTGA-G-TT--GAT-T-G-TA-----T--T-G-A-ATGGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19442 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AAAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19445 : TTTTA-G-TT--CAT-T-G-TA-----T--T-G-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19447 : TTTGA-G-TT--GTA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-TC--A-A--TGGC-GG
gi|19503 : TTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-G-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--A-C-C-A-A-T---G-A--TGAC-GGGA
gi|19504 : TTGA-G-TT--GAA-TCG-TG-----T--GGC-A-ACCGT-T-GC-TGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19505 : TTGA-GCTT--GAA-TCG-TG-----T--GGC-A-ACCGT-T-GC-TGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-CAA-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19509 : TTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG---AA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGACAGGAATG
gi|19510 : TTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C---A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19512 : TTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-AC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAA--C-C-A-T-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19514 : TTTA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C---A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19518 : TTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19519 : TTGA-G-TT--GAAAT-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAC--C-A-A-A-A-T---GAA--TGAC-GGAATG
gi|19520 : TTGA-G-TTTTGAA-T-G-TG-----CTCG-C-A-ACCGT-TTGC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-A-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19538 : TGA-G-TT--GGAGT-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-ATGG-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19540 : TGA-G-T---GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG---AA--C-C-A-A-AGT---G-A--TGAC-AGAATG
gi|19551 : GA-G-TT--GAG-T-G-TG-----A--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AAGGC--GG--AAAG-CGC-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
Alignments
lowQualScore : 0 0 00 0 1 0 11111 00 0 0 0 0 0 0 11 0 0 0 2 00 00 11 11 0 1 1 0 2 222 1 00 1
lowQualScore : . . .. . . . ..... .. . . . . . . .. . . . . .. .. .. .. . . . . . ... . .. .
lowQualScore : 4 8 66 8 6 4 66666 66 8 4 4 4 8 4 33 4 4 4 4 55 55 88 55 6 1 1 6 9 555 2 88 2
consensus : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
Reference ( family-126 ) : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19256 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GGA-AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19257 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19259 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19260 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19265 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAT-GGAATG
gi|19266 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19267 : TTTGA-G-T---GAA-T-GGTG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGAC-T-A-AT-G-AA--C--GG--AAAACC-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19268 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-
gi|19269 : TTTGA-G-TT--GAA-T-A-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19273 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19274 : TTTGA-A-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-G-A-A-
gi|19280 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-TGGC-AGAGA--TAA-AT-G-AA--C--GGA-AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATGt
gi|19284 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GT--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19288 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19289 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19290 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19291 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAA--
gi|19294 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--A-C---A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19297 : TTTGC-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--T--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19298 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19299 : TTTGC-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19300 : TTTGA-GATT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19303 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACAGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19304 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C---A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19305 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-CA--C--GG--AAA--
gi|19313 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T---AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19316 : TTTGA-G-TT--GAA-TTG-TG-----T--G-CCA-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19317 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19318 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AA
gi|19320 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19321 : TTTGA-G-TT--GAG-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19322 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19324 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-T-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19327 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--T--GG--AAA--T-C-A-A-A-T---G-A--TGAT-GGAATG
gi|19328 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19329 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-ATT---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19336 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-AGAATG
gi|19337 : TTTGA-G-TT--AAA-T-G-TG-----T--G-C-A-AAAGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19338 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-CCCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19346 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-AC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAA--C-C-A-T-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19347 : TTTGA-G-CT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19353 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19354 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-ATAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19355 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19356 : TTTGA-G-TT--AAA-T-G-TGCACTGT--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-AGAATG
gi|19357 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19358 : TTTAA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19359 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19361 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C---ACCGTAT-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC--GAATG
gi|19364 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TCAC-GGAA
gi|19366 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-A-GA--C--GG--AAAACC-C-A-A-A-T---G-ACCTGA--GGAATG
gi|19367 : TTTGA-A-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A--CCGT-T-GC-AGAGA--T---AT-G-AA--C--GG--AAA--C-CGA-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19373 : TTTAA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--T--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-AGAATG
gi|19374 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19375 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--T---G--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19376 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-C-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19377 : TTTGA-G-TT--GAA-TTG-CG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GGA-AAA--C-C-A-A-ATT---G-A--TGAC-GGAA
gi|19382 : TTTGA-G-TT--CAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGACAG-T-A-AT-G-AA--C--GGAAAAA--C-C-AGA-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19383 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TA-----T--G-C-A-ACCGT-T-GCAAGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C---A-A-T---G-A--TGACAAGAATG
gi|19388 : TTGGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-CT-G-AA--C--GG--AAT--C-C-A-ACA-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19390 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGC--T-A-TT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19391 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--T--GG--AAA--
gi|19392 : TTTGA-G-T---GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19393 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19394 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19395 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AA-----C-A-A-A-
gi|19397 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAA--C-C-A-A-C-G---GAA--GGAC-GGAATG
gi|19398 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19405 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G----TGAC-GAA
gi|19406 : TTTGA-G-TT--GAA-T-T-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-GA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GAAA
gi|19407 : TTTGA-G-TT--GAA-T-A-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-A-A-T-A-TACGA-A--TGAC-GGAATG
gi|19410 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AC--T--GG--AAA----C-A-A-A-T-----C--TGAC-GGAA
gi|19413 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TGTT---T--G---A-ACCGT-T-GC-A-AGA--T-A-AT-G-AA--CCGGA--AAA--C-C-A-A-ATT---G-A--TGAC-GAAATG
gi|19417 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19418 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19419 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19420 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19421 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19422 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACC-T-T-GC-AGAGA--T-A-AT-A-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-ATT---G-A--T-AC-GAAA
gi|19429 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19430 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-TGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-G-A-A-
gi|19436 : TTGGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-AGACCGT-T-GC-AGAGGATT-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-AGA-A-TCG-G-A--TGAC-GGAATG
gi|19437 : TTTGACG-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-GGAGA--T-AGAT-A-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19439 : TTTGA-G-TT--GAT-T-G-TA-----T--T-G-A-ATGGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19442 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AAAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19445 : TTTTA-G-TT--CAT-T-G-TA-----T--T-G-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19447 : TTTGA-G-TT--GTA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-TC--A-A--TGGC-GG
gi|19503 : TTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-G-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--A-C-C-A-A-T---G-A--TGAC-GGGA
gi|19504 : TTGA-G-TT--GAA-TCG-TG-----T--GGC-A-ACCGT-T-GC-TGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19505 : TTGA-GCTT--GAA-TCG-TG-----T--GGC-A-ACCGT-T-GC-TGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-CAA-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19509 : TTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG---AA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGACAGGAATG
gi|19510 : TTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C---A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19512 : TTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-AC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAA--C-C-A-T-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19514 : TTTA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C---A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19518 : TTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19519 : TTGA-G-TT--GAAAT-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAC--C-A-A-A-A-T---GAA--TGAC-GGAATG
gi|19520 : TTGA-G-TTTTGAA-T-G-TG-----CTCG-C-A-ACCGT-TTGC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-A-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19538 : TGA-G-TT--GGAGT-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-ATGG-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19540 : TGA-G-T---GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG---AA--C-C-A-A-AGT---G-A--TGAC-AGAATG
gi|19551 : GA-G-TT--GAG-T-G-TG-----A--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AAGGC--GG--AAAG-CGC-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
blockSeqs : T CACTG AT A AA AC G G T ACG A A
blockSeqs : T TT C A A AC A G T CG A A
blockSeqs : C . G A A G . . T C . .
blockSeqs : C . . A . . . . T . . .
blockSeqs : . . . A . . . . G . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons : **
originalCons : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
finalCons : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
Alignments
lowQualScore : 0 0 00 0 1 0 11111 00 0 0 0 0 0 0 11 0 0 0 2 00 00 11 11 0 1 1 0 2 222 1 00 1
lowQualScore : . . .. . . . ..... .. . . . . . . .. . . . . .. .. .. .. . . . . . ... . .. .
lowQualScore : 4 8 66 8 6 4 66666 66 8 4 4 4 8 4 33 4 4 4 4 55 55 88 55 6 1 1 6 9 555 2 88 2
consensus : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
Reference ( family-126 ) : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19256 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GGA-AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19257 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19259 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19260 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19265 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAT-GGAATG
gi|19266 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19267 : TTTGA-G-T---GAA-T-GGTG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGAC-T-A-AT-G-AA--C--GG--AAAACC-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19268 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-
gi|19269 : TTTGA-G-TT--GAA-T-A-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19273 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19274 : TTTGA-A-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-G-A-A-
gi|19280 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-TGGC-AGAGA--TAA-AT-G-AA--C--GGA-AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATGt
gi|19284 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GT--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19288 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19289 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19290 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19291 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAA--
gi|19294 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--A-C---A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19297 : TTTGC-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--T--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19298 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19299 : TTTGC-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19300 : TTTGA-GATT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19303 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACAGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19304 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C---A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19305 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-CA--C--GG--AAA--
gi|19313 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T---AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19316 : TTTGA-G-TT--GAA-TTG-TG-----T--G-CCA-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19317 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19318 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AA
gi|19320 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19321 : TTTGA-G-TT--GAG-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19322 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19324 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-T-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19327 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--T--GG--AAA--T-C-A-A-A-T---G-A--TGAT-GGAATG
gi|19328 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19329 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-ATT---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19336 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-AGAATG
gi|19337 : TTTGA-G-TT--AAA-T-G-TG-----T--G-C-A-AAAGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19338 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-CCCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19346 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-AC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAA--C-C-A-T-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19347 : TTTGA-G-CT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19353 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19354 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-ATAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19355 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19356 : TTTGA-G-TT--AAA-T-G-TGCACTGT--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-AGAATG
gi|19357 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19358 : TTTAA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19359 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19361 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C---ACCGTAT-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC--GAATG
gi|19364 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TCAC-GGAA
gi|19366 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-A-GA--C--GG--AAAACC-C-A-A-A-T---G-ACCTGA--GGAATG
gi|19367 : TTTGA-A-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A--CCGT-T-GC-AGAGA--T---AT-G-AA--C--GG--AAA--C-CGA-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19373 : TTTAA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--T--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-AGAATG
gi|19374 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19375 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--T---G--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19376 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-C-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19377 : TTTGA-G-TT--GAA-TTG-CG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GGA-AAA--C-C-A-A-ATT---G-A--TGAC-GGAA
gi|19382 : TTTGA-G-TT--CAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGACAG-T-A-AT-G-AA--C--GGAAAAA--C-C-AGA-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19383 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TA-----T--G-C-A-ACCGT-T-GCAAGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C---A-A-T---G-A--TGACAAGAATG
gi|19388 : TTGGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-CT-G-AA--C--GG--AAT--C-C-A-ACA-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19390 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGC--T-A-TT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19391 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--T--GG--AAA--
gi|19392 : TTTGA-G-T---GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19393 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19394 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19395 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AA-----C-A-A-A-
gi|19397 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAA--C-C-A-A-C-G---GAA--GGAC-GGAATG
gi|19398 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19405 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G----TGAC-GAA
gi|19406 : TTTGA-G-TT--GAA-T-T-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-GA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GAAA
gi|19407 : TTTGA-G-TT--GAA-T-A-TG-----T--G-C-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-A-A-T-A-TACGA-A--TGAC-GGAATG
gi|19410 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AC--T--GG--AAA----C-A-A-A-T-----C--TGAC-GGAA
gi|19413 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TGTT---T--G---A-ACCGT-T-GC-A-AGA--T-A-AT-G-AA--CCGGA--AAA--C-C-A-A-ATT---G-A--TGAC-GAAATG
gi|19417 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19418 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19419 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19420 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19421 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19422 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACC-T-T-GC-AGAGA--T-A-AT-A-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-ATT---G-A--T-AC-GAAA
gi|19429 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19430 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-TGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-G-A-A-
gi|19436 : TTGGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-AGACCGT-T-GC-AGAGGATT-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-AGA-A-TCG-G-A--TGAC-GGAATG
gi|19437 : TTTGACG-TT--GAA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-GGAGA--T-AGAT-A-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19439 : TTTGA-G-TT--GAT-T-G-TA-----T--T-G-A-ATGGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19442 : TTTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AAAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19445 : TTTTA-G-TT--CAT-T-G-TA-----T--T-G-A-ACTGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19447 : TTTGA-G-TT--GTA-T-G-TG-----T--T-G-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-TC--A-A--TGGC-GG
gi|19503 : TTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-G-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--A-C-C-A-A-T---G-A--TGAC-GGGA
gi|19504 : TTGA-G-TT--GAA-TCG-TG-----T--GGC-A-ACCGT-T-GC-TGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19505 : TTGA-GCTT--GAA-TCG-TG-----T--GGC-A-ACCGT-T-GC-TGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-CAA-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19509 : TTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG---AA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGACAGGAATG
gi|19510 : TTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C---A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19512 : TTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-AC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAA--C-C-A-T-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19514 : TTTA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-C---A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19518 : TTGA-G-TT--GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--
gi|19519 : TTGA-G-TT--GAAAT-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-GAAA--C--GG--AAC--C-A-A-A-A-T---GAA--TGAC-GGAATG
gi|19520 : TTGA-G-TTTTGAA-T-G-TG-----CTCG-C-A-ACCGT-TTGC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG--AAA--C-A-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAATG
gi|19538 : TGA-G-TT--GGAGT-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-ATGG-AA--C--GG--AAA--C-C-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA
gi|19540 : TGA-G-T---GAA-T-G-TG-----T--G-C-A-ACCGT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AA--C--GG---AA--C-C-A-A-AGT---G-A--TGAC-AGAATG
gi|19551 : GA-G-TT--GAG-T-G-TG-----A--G-C-A-ACCAT-T-GC-AGAGA--T-A-AT-G-AAGGC--GG--AAAG-CGC-A-A-A-T---G-A--TGAC-GGAA