lowQualScore                  :     0 000 0 1 222 0  0 0 0    0 1  11 00   0   111    0     0 0   0 00000000 11111111  555555555555 00 0   0 00      00 0   2   
lowQualScore                  :     . ... . . ... .  . . .    . .  .. ..   .   ...    .     . .   . ........ ........  ............ .. .   . ..      .. .   .   
lowQualScore                  :     4 777 4 6 999 4  4 4 4    4 2  11 66   8   888    2     2 7   2 88888888 77777777  555555555555 99 7   2 33      33 2   8   
consensus                     : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
Reference ( gi|87759 )        : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87764                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87758                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87757                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87755                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87754                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87753                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87752                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87773                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-AG--C--AAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87772                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--A--G-TTC-A--GGTGAA--C-TAA-AAA
gi|87775                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-AAGG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87762                      : GACA-G---A-C-GG--A-CG-G-A-CAAA-A-GG--T--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87749                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--T--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87751                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87789                      : GACA-G---A-C-GGAGA-CG-G-A-CAAA-A-AG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87771                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-CTTTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87769                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87768                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--TGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87796                      : GAC--G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87795                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-AAAA-A-AG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-CC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87794                      : GACG-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAT---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87790                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A---------C------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-
gi|87761                      : GACA-G---A-T-G---A-CG-G-A-TAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87800                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-TG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A---------C------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87791                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A---------C------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-TAA
gi|87801                      : GACA-G---A-C-G---A-CA-G-A-CAAA-A-GG--C--AAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------TC------T-TC--G--A-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87748                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87747                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87744                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87743                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87806                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-A-AACAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-AC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87750                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAACA-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87776                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG----------A--------CC------TATC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87808                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A--AAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-ACTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-
gi|87767                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GTTGAG--C-TAA-AAA
gi|87813                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GTTTA-C-TTT-A--------A--------CC------T-TT--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87781                      : GACAAG---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--CTTAA-AAA
gi|87770                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--TAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87823                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG----------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGA-----TAA-AAA
gi|87822                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-AG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--T--T-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87756                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--A--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87786                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-G---C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTGAA--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87804                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-ATC-A--AGTGAG--C-TAATAAA
gi|87829                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGGGAGGCT-TAA-AAA
gi|87797                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GATTCAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-CAA
gi|87839                      : GATA-G---A-C-G---A-CA-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C--TG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87835                      : GACA-G---G-C-G---A-CG-G-A-CAAC-C-GG--C--AAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87841                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GATTCAG---AATA-GTCCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGGGAG--C-TAA-AAA
gi|87763                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--AAT-AAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87780                      : GACA-G---A-C-GG--A-CT-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87778                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GTTCA-C-TTC-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-ACTGGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87787                      : GACA-G---A-T-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTA-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TCC-A--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87766                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--AAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--T--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87765                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CCT-A--AGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87828                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-A-TTG-AGCCTTGGCG--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87774                      : GACA-G---A-C-G---A--G-G-A-CAAA-AAGG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87812                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A----------T-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87777                      : GACA-G---A-C-G---A-CG---A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-TCTCA-C-TTG-A--------AG-------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87788                      : GACA-G---A-T-G---A-CG-GGA-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTA-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TCC-A--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87818                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCT-C-TTG-A--------A--------AC------T-TC--G--T-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87827                      : GACA-G---A-C-G---ATCG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-ATG-A--------ACCT-----CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87792                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-TAAA-A-GG--T--GAT-CAG---AAGA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TG--A--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-CAA
gi|87831                      : GACG-G---A-C-A---A-CA-G-A-CGAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A---------C------T-TC--A--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87830                      : GACG-G---A-C-A---A-CA-G-A-CGAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A---------C------T-TC--A--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87840                      : GACA-GCATA-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-AGGCC--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87837                      : GACA-G---A-C-GCG-A-CGCG-A-CAAA-A-GG--T--GAT-CAAGAAAATA-GCTCA-C-TTG-A--------AA-------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87807                      : GACA-G---A-C-A---A-CA-T-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TT--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87809                      : GACA-G---A-C-GG--A-CG---A-CAAA-A-GG--C--AAT-CAG---AAAA-GCTCA-CTTTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87811                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAT-A-GA--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G---------C------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-CAA
gi|87842                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-AAGG--C--GAT-CAG---AA---GCTTA-C-T-G-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87816                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-ACAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC-----G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-CAA
gi|87824                      : GAGA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC---GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--T-TAT-AAA
gi|87820                      : GACA-G---A-CAG---A-CA-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------T--------CC------T-TC--A--G-CTC-A--GATGAG--C-TAA-AAA
gi|87784                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87783                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87782                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87826                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAGAA-AAAA-GC-CA-C-TTC-A--------G--------CC------T-TC--A--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87817                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-TGA---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CT------T-TC--A--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87834                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GC--T--GAT-CAGGA-AAAA-GCTCA-CTTTG-A--------A--------CC------T-TC--G--GTTTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87798                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAGA-A-AT--TTTGAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87802                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAG-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87805                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTA-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87810                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---CAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87785                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAAAGCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87821                      : GGCA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTT-A--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87803                      : GACA-G---AAC-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAG-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87977                      :  ACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87984                      :  ACG-G---A-C-GG--A-CA-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-G--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87985                      :  ACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-A---C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-G-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87983                      :  ACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--G-T-CAG---AATA-GCTTA-C-TGG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87980                      :  ACA-G---A-C-G---A-CA-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAT---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------TC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTTAG--C-TAA-AAA
gi|87986                      :  ACA-G---A-CAG---A-CG-G-A-CAAT-G-GG--C--TAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--A--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87981                      :  ACA-G---A-CAG---A-CA-G-A-CAGA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CC------T-TT--G--G-CTT-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87982                      :  ACA-G---A-CAG---A-CG-G-A-CAAT-C-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-CC--G--A-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88019                      :    A-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------AGTTGGAACCC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88025                      :     -G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-AGGCC--GAT-CAG---AAAA-GCTCAAC-TTG-A--------G--------CC------T-TC--G--G-CTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88045                      :             -G---A-CG-G-A-CAGA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GATGAG--C-TAA-AAA
gi|88041                      :             -G---A-CG-G-A-CAGA-C-GA--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88044                      :             -G---A-CA-G-A-CGAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GATCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88043                      :             -G---A-CA-G-A-CGAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GATCA-C-TTG-A--------A--------CC------T-TC--G--G-TTC-A--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87824                      :                                                    ATA-ACTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-T
gi|87764                      :                        gagagacgacggacaacggtgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-TAaaa
gi|87758                      :                        gacggacgacggacaaaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87757                      :                        gacagacgacggacaaaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87755                      :                        gacagacgacggacaaaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87754                      :                        gacagacgacggacaaaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87753                      :                        gacagacgacggacaaaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87752                      :                        gacagacgacggacaaaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87773                      :                        gacagacgacggacaaaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87772                      :                        gacagacgacggacaaaaagcaatcagaaTA-GTTCA-C-CTG-A--------A--------CT------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87775                      :                        gacagacgacggacaaaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87762                      :                       gacggacgacggacaaaaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87749                      :                       gacagacggacggacaaaaggtgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87751                      :                        gacagacgacggacaaaaggtgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|87789                      :                       gacagacgacggacaacaggcgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87771                      :                     gacagacggagacggacaaaaagcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTCAA--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87769                      :                        gacagacgacggacaaaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87768                      :                        gacagacgacggacaaaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-ATG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-TAataaa
gi|87796                      :                        gacagacgacggacaaaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87795                      :                         gacgacgacggacaaaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-GA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-TAataaa
gi|87794                      :                        gacagacgacggaaaaaaagcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87790                      :                        gacggacaacggacaaaaggcgatcataaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------C----------C--GAAG-TTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87761                      :                        gacagacgacggacaaaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-Ta
gi|87800                      :                       gacagatgacggataaaaggcgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------C----------C--GAAG-TTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87791                      :                        gacagacgacggacaaaatgcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------C----------C--GAAG-TTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87801                      :                        gacagacgacggacaaaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------TC------G-AA--G--A-TTC-A--AGTGAG--C-TAataa
gi|87748                      :                        gacagacgacagacaaaaggcaatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|87747                      :                       gacagacgacggacaacaggtgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|87744                      :                       gacagacgacggacaacaggtgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|87743                      :                       gacagacgacggacaacaggtgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|87806                      :                       gacagacgacggacaacaggtgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-TA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87750                      :                       gacagacgacgaaacaaaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|87776                      :                      gacagacgacggacaaacaggtgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AT--A--G-GTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87808                      :                        gacagacgacggacaaaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--T-TAaaaa
gi|87977                      :                         gacagacgacggaaaaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-Ta
gi|87767                      :                        acagacgacggacaaaaggcgatcagaaaTA-GCTCA-A-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-Taaa
gi|87984                      :                       gacagacgacggacaacaggcgatcagaaaTA-GCTCA-C-CCG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87770                      :                        acggacggacagacaaaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87756                      :                        gacagacgacggacaaaaggctatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CT------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-Tataaa
gi|87786                      :                       gacagacgacggacaacaggtgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--GTTTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87804                      :                         gacagacgacggacaacagcgatcagaaTA-GCTCA-C-TTG-A--------T--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87985                      :                        gacagacaacggacaaaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--ACTGAG--C-TAataaa
gi|88019                      :                          acagacgacggacaaaaacgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CCGAAGGGT-TCCAA--C-TTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87797                      :                           agacgacggacaaaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|88045                      :                       gacagacgacggacaacaggtgattcagaaTA-GCTCA-T-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-TAacaa
gi|87839                      :                               gacggacagaaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A---GTGAG--C-TAaaaa
gi|87835                      :                        gatagacgacagacaacaggcgatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87763                      :                        gacaggcgacggacaaccggcaatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|87780                      :                       gacagacgacggacaaaaggcaataagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|87787                      :                      gacagacggactgacaacaggcgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-G--------A--------CC------G-AA--G--G-TTT-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|87980                      :                       gacagatgacggacaacaggcgatcagaaaTA-GCTAA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--A-TTC-A--AGTGAG--C-Taaa
gi|87774                      :                        acagacgacagacaaaaggcgatcataaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|87812                      :                       gacagacgaggacaaaaaggcgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87788                      :                             gacagacgacggacaaaatcagaaTA-GCTCA-C-CTG-G--------A--------CC------G-AA--G--G-TTT-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|87827                      :                      gacagatgacgggacaacaggcgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CCGAA---G-GA--G--G-TTC-A--TGTGAG--C-Taaa
gi|87792                      :                      gacagacgatcggacaacaggcgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------C---------TCAAG--G-TTC-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|87831                      :                       gacggacgacggataaaaggtgatcagaagTA-GCTCA-C-CTG-A--------A---------C------T-GA--A--G-TTC-A--AGTGAG--C-Tacaa
gi|87830                      :                       gacggacaacagacgaaaggcgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A---------C------T-GA--A--G-TTC-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|88041                      :                       gacggacaacagacgaaaggcgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|87986                      :                              gacggacagacgacgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CT------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|88044                      :                       acagacagacggacaatgggctatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAT--C-Taaaa
gi|88043                      :                              gacagacgaaaggcgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAT--C-Taaaa
gi|87840                      :                              gacagacgaaaggcgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|87837                      :                  gacagcatacgacggacaaaaaggccgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--GTTTC-A--AGTGAG--C-TAataaa
gi|87807                      :                  gacagacgcgacgcgacaaaaggtgatcaagaaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------A-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|87982                      :                       gacagacaacatacaaaaggcgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------TC------G-GA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-Tataaa
gi|87784                      :                       acagacagacggacaatcggtgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|87783                      :                       gacagacaacggacaaattttgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|87782                      :                       gacagacaacggacaaattttgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|87798                      :                       gacagacaacggacaaattttgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|87802                      :                     gacagacaacggacagaaattttgatcagaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-aaaa
gi|87810                      :                      gacagacaacggacaaattttgatcagaaagTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|87785                      :                       gacagacaacggacaaattttgatcagcaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-Taaaa
gi|87803                      :                      gacagacaacggacaaattttgatcagaaaaTA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-aaaa
gi|87781                      :                      gacagaacaacggacaaattttgatcagaaagA-GCTCA-C-CTG-A--------G--------CC------G-AA--G--G-CTC-A--AGTGAG--C-TAaaaa
gi|87829                      :                           gacaagacgacggacaaaaggcgatcagaaCTCC-C-CTG-A--------A--------CC------G-AA--G--G-TTC-A--AGTGAG--C-TAtaaaaa





Alignments
lowQualScore                  :     0 000 0 1 222 0  0 0 0    0 1  11 00   0   111  4 0     0 77  0 11111111 22222222   0    0    00      00 0   2   
lowQualScore                  :     . ... . . ... .  . . .    . .  .. ..   .   ...  . .     . ..  . ........ ........   .    .    ..      .. .   .   
lowQualScore                  :     4 777 4 6 999 4  4 4 4    4 2  11 66   8   888  7 4     4 55  4 44444444 99999999   4    4    55      55 4   8   
consensus                     : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AANA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
Reference ( family-120 )      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-CTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87743                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87744                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87747                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87748                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87749                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--T--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87750                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAACA-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87751                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87752                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87753                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87754                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87755                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87756                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCAG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87757                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87758                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87759                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87761                      : GACA-G---A-T-G---A-CG-G-A-TAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87762                      : GACA-G---A-C-GG--A-CG-G-A-CAAA-A-GG--T--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87763                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--AAT-AAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87764                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87765                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CCTA--AGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87766                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--AAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCTG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87767                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GTTGAG--C-TAA-AAA
gi|87768                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--TGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87769                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87770                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--TAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87771                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-CTTTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87772                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCAG-TTCA--GGTGAA--C-TAA-AAA
gi|87773                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-AG--C--AAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87774                      : GACA-G---A-C-G---A--G-G-A-CAAA-AAGG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87775                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-AAGG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87776                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG----------A--------CCTATCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87777                      : GACA-G---A-C-G---A-CG---A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-TCTCA-C-TTG-A--------AG-------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87778                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GTTCA-C-TTC-A--------G--------CCT-TCGG-CTCACTGGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87780                      : GACA-G---A-C-GG--A-CT-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87781                      : GACAAG---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--CTTAA-AAA
gi|87782                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87783                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87784                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87785                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAAAGCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87786                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-G---C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTGAA--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87787                      : GACA-G---A-T-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTA-A--------A--------CCT-TCGG-TCCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87788                      : GACA-G---A-T-G---A-CG-GGA-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTA-A--------A--------CCT-TCGG-TCCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87789                      : GACA-G---A-C-GGAGA-CG-G-A-CAAA-A-AG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87790                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A---------CT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-
gi|87791                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A---------CT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-TAA
gi|87792                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-TAAA-A-GG--T--GAT-CAG---AAGA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TGAG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-CAA
gi|87794                      : GACG-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAT---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87795                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-AAAA-A-AG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-CCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87796                      : GAC--G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87797                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GATTCAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-CAA
gi|87798                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAGA-A-AT--TTTGAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87800                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-TG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A---------CT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87801                      : GACA-G---A-C-G---A-CA-G-A-CAAA-A-GG--C--AAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------TCT-TCGA-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87802                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAG-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87803                      : GACA-G---AAC-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAG-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87804                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-ATCA--AGTGAG--C-TAATAAA
gi|87805                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTA-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87806                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-A-AACAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-ACGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87807                      : GACA-G---A-C-A---A-CA-T-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TTGG-CTCA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87808                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A--AAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-ACTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-
gi|87809                      : GACA-G---A-C-GG--A-CG---A-CAAA-A-GG--C--AAT-CAG---AAAA-GCTCA-CTTTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87810                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---CAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87811                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAT-A-GA--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G---------CT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-CAA
gi|87812                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A----------T-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87813                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GTTTA-C-TTT-A--------A--------CCT-TTGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87816                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-ACAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TC-G-CTCA--GGTGAG--C-TAA-CAA
gi|87817                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-TGA---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CTT-TCAG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87818                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCT-C-TTG-A--------A--------ACT-TCGT-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87820                      : GACA-G---A-CAG---A-CA-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------T--------CCT-TCAG-CTCA--GATGAG--C-TAA-AAA
gi|87821                      : GGCA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTTA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87822                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-AG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCTT-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87823                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG----------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGA-----TAA-AAA
gi|87824                      : GAGA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC---GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--T-TAT-AAA
gi|87826                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAGAA-AAAA-GC-CA-C-TTC-A--------G--------CCT-TCAG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87827                      : GACA-G---A-C-G---ATCG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-ATG-A--------ACCT-----CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87828                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-A-TTG-AGCCTTGGCG--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87829                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGGGAGGCT-TAA-AAA
gi|87830                      : GACG-G---A-C-A---A-CA-G-A-CGAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A---------CT-TCAG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87831                      : GACG-G---A-C-A---A-CA-G-A-CGAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A---------CT-TCAG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87834                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GC--T--GAT-CAGGA-AAAA-GCTCA-CTTTG-A--------A--------CCT-TCGGTTTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87835                      : GACA-G---G-C-G---A-CG-G-A-CAAC-C-GG--C--AAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87837                      : GACA-G---A-C-GCG-A-CGCG-A-CAAA-A-GG--T--GAT-CAAGAAAATA-GCTCA-C-TTG-A--------AA-------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87839                      : GATA-G---A-C-G---A-CA-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA---CTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87840                      : GACA-GCATA-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-AGGCC--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87841                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GATTCAG---AATA-GTCCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGGGAG--C-TAA-AAA
gi|87842                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-AAGG--C--GAT-CAG---AA---GCTTA-C--TG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87977                      :  ACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87980                      :  ACA-G---A-C-G---A-CA-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAT---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------TCT-TCGG-TTCA--GGTTAG--C-TAA-AAA
gi|87981                      :  ACA-G---A-CAG---A-CA-G-A-CAGA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------G--------CCT-TTGG-CTTA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87982                      :  ACA-G---A-CAG---A-CG-G-A-CAAT-C-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-CCGA-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87983                      :  ACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--G-T-CAG---AATA-GCTTA-C-TGG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87984                      :  ACG-G---A-C-GG--A-CA-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCG--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87985                      :  ACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-A---C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-G-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87986                      :  ACA-G---A-CAG---A-CG-G-A-CAAT-G-GG--C--TAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCAG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88019                      :    A-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------AGTTGGAACCCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88025                      :     -G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-AGGCC--GAT-CAG---AAAA-GCTCAAC-TTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88041                      :             -G---A-CG-G-A-CAGA-C-GA--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88043                      :             -G---A-CA-G-A-CGAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GATCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88044                      :             -G---A-CA-G-A-CGAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GATCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88045                      :             -G---A-CG-G-A-CAGA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TTG-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GATGAG--C-TAA-AAA





Alignments
lowQualScore                  :     0 000 0 1 222 0  0 0 0    0 1  11 00   0   111  1 0     0 0  0 0 33333333333333333   0    0    00      00 0   2   
lowQualScore                  :     . ... . . ... .  . . .    . .  .. ..   .   ...  . .     . .  . . .................   .    .    ..      .. .   .   
lowQualScore                  :     4 777 4 6 999 4  4 4 4    4 2  11 66   8   888  4 4     4 8  4 8 99999999999999999   4    4    55      55 4   8   
consensus                     : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AANA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
Reference ( family-120 )      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AANA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87743                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87744                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87747                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87748                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87749                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--T--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87750                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAACA-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87751                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87752                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87753                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87754                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87755                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87756                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCAG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87757                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87758                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87759                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87761                      : GACA-G---A-T-G---A-CG-G-A-TAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87762                      : GACA-G---A-C-GG--A-CG-G-A-CAAA-A-GG--T--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87763                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--AAT-AAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87764                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87765                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CCTA--AGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87766                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--AAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCTG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87767                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GTTGAG--C-TAA-AAA
gi|87768                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--TGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87769                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87770                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--TAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87771                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-CTTT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87772                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCAG-TTCA--GGTGAA--C-TAA-AAA
gi|87773                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-AG--C--AAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87774                      : GACA-G---A-C-G---A--G-G-A-CAAA-AAGG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87775                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-AAGG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87776                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A-----------------CCTATCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87777                      : GACA-G---A-C-G---A-CG---A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-TCTCA-C-TT-GAA--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87778                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GTTCA-C-TT-C-A--------G--------CCT-TCGG-CTCACTGGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87780                      : GACA-G---A-C-GG--A-CT-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87781                      : GACAAG---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--CTTAA-AAA
gi|87782                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87783                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87784                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87785                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAAAGCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87786                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A--G--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-GAA--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87787                      : GACA-G---A-T-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-A-A--------A--------CCT-TCGG-TCCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87788                      : GACA-G---A-T-G---A-CG-GGA-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-A-A--------A--------CCT-TCGG-TCCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87789                      : GACA-G---A-C-GGAGA-CG-G-A-CAAA-A-AG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87790                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A---------CT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-
gi|87791                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A---------CT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-TAA
gi|87792                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-TAAA-A-GG--T--GAT-CAG---AAGA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TGAG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-CAA
gi|87794                      : GACG-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAT---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87795                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-AAAA-A-AG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-CCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87796                      : GAC--G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87797                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GATTCAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-CAA
gi|87798                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAGA-A-AT--TTTGAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87800                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-TG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A---------CT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87801                      : GACA-G---A-C-G---A-CA-G-A-CAAA-A-GG--C--AAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------TCT-TCGA-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87802                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAG-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87803                      : GACA-G---AAC-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAG-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87804                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-ATCA--AGTGAG--C-TAATAAA
gi|87805                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-A-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87806                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-A-AACAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-ACGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87807                      : GACA-G---A-C-A---A-CA-T-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TTGG-CTCA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87808                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A--AAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-ACTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-
gi|87809                      : GACA-G---A-C-GG--A-CG---A-CAAA-A-GG--C--AAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87810                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---CAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87811                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAT-A-GA--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G---------CT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-CAA
gi|87812                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A----------T-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87813                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GTTTA-C-TT-T-A--------A--------CCT-TTGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87816                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-ACAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TC-G-CTCA--GGTGAG--C-TAA-CAA
gi|87817                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-TGA---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CTT-TCAG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87818                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCT-C-TT-G-A--------A--------ACT-TCGT-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87820                      : GACA-G---A-CAG---A-CA-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------T--------CCT-TCAG-CTCA--GATGAG--C-TAA-AAA
gi|87821                      : GGCA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTTA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87822                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-AG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCTT-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87823                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A-----------------CCT-TCGG-TTCA--GGTGA-----TAA-AAA
gi|87824                      : GAGA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC---GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--T-TAT-AAA
gi|87826                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAGAA-AAAA-GC-CA-C-TT-C-A--------G--------CCT-TCAG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87827                      : GACA-G---A-C-G---ATCG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-AT-G-A--------ACCT-----CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87828                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-A-TT-G-AGCCTTGGCG--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87829                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGGGAGGCT-TAA-AAA
gi|87830                      : GACG-G---A-C-A---A-CA-G-A-CGAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A---------CT-TCAG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87831                      : GACG-G---A-C-A---A-CA-G-A-CGAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A---------CT-TCAG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87834                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GC--T--GAT-CAGGA-AAAA-GCTCA-CTTT-G-A--------A--------CCT-TCGGTTTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87835                      : GACA-G---G-C-G---A-CG-G-A-CAAC-C-GG--C--AAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87837                      : GACA-G---A-C-GCG-A-CGCG-A-CAAA-A-GG--T--GAT-CAAGAAAATA-GCTCA-C-TT-G-A--------AA-------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87839                      : GATA-G---A-C-G---A-CA-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C--T-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87840                      : GACA-GCATA-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-AGGCC--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87841                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GATTCAG---AATA-GTCCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGGGAG--C-TAA-AAA
gi|87842                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-AAGG--C--GAT-CAG---AA---GCTTA-C-T--G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87977                      :  ACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87980                      :  ACA-G---A-C-G---A-CA-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAT---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------TCT-TCGG-TTCA--GGTTAG--C-TAA-AAA
gi|87981                      :  ACA-G---A-CAG---A-CA-G-A-CAGA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TTGG-CTTA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87982                      :  ACA-G---A-CAG---A-CG-G-A-CAAT-C-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-CCGA-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87983                      :  ACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--G-T-CAG---AATA-GCTTA-C-TG-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87984                      :  ACG-G---A-C-GG--A-CA-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCG--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87985                      :  ACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-A---C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-G-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87986                      :  ACA-G---A-CAG---A-CG-G-A-CAAT-G-GG--C--TAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCAG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88019                      :    A-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------AGTTGGAACCCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88025                      :     -G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-AGGCC--GAT-CAG---AAAA-GCTCAAC-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88041                      :             -G---A-CG-G-A-CAGA-C-GA--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88043                      :             -G---A-CA-G-A-CGAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GATCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88044                      :             -G---A-CA-G-A-CGAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GATCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88045                      :             -G---A-CG-G-A-CAGA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GATGAG--C-TAA-AAA





Alignments
lowQualScore                  :     0 000 0 1 222 0  0 0 0    0 1  11 00   0   111  1 0     0 0  0 0 33333333333333333   0    0    00      00 0   2   
lowQualScore                  :     . ... . . ... .  . . .    . .  .. ..   .   ...  . .     . .  . . .................   .    .    ..      .. .   .   
lowQualScore                  :     4 777 4 6 999 4  4 4 4    4 2  11 66   8   888  4 4     4 8  4 8 99999999999999999   4    4    55      55 4   8   
consensus                     : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AANA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
Reference ( family-120 )      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AANA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87743                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87744                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87747                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87748                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87749                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--T--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87750                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAACA-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87751                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87752                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87753                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87754                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87755                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87756                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCAG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87757                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87758                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87759                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87761                      : GACA-G---A-T-G---A-CG-G-A-TAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87762                      : GACA-G---A-C-GG--A-CG-G-A-CAAA-A-GG--T--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87763                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--AAT-AAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87764                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87765                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CCTA--AGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87766                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--AAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCTG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87767                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GTTGAG--C-TAA-AAA
gi|87768                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--TGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87769                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87770                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--TAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87771                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-CTTT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87772                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCAG-TTCA--GGTGAA--C-TAA-AAA
gi|87773                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-AG--C--AAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87774                      : GACA-G---A-C-G---A--G-G-A-CAAA-AAGG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87775                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-AAGG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87776                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A-----------------CCTATCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87777                      : GACA-G---A-C-G---A-CG---A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-TCTCA-C-TT-GAA--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87778                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GTTCA-C-TT-C-A--------G--------CCT-TCGG-CTCACTGGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87780                      : GACA-G---A-C-GG--A-CT-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87781                      : GACAAG---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--CTTAA-AAA
gi|87782                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87783                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87784                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87785                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAAAGCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87786                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A--G--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-GAA--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87787                      : GACA-G---A-T-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-A-A--------A--------CCT-TCGG-TCCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87788                      : GACA-G---A-T-G---A-CG-GGA-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-A-A--------A--------CCT-TCGG-TCCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87789                      : GACA-G---A-C-GGAGA-CG-G-A-CAAA-A-AG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87790                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A---------CT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-
gi|87791                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A---------CT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-TAA
gi|87792                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-TAAA-A-GG--T--GAT-CAG---AAGA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TGAG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-CAA
gi|87794                      : GACG-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAT---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87795                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-AAAA-A-AG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-CCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87796                      : GAC--G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87797                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GATTCAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-CAA
gi|87798                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAGA-A-AT--TTTGAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87800                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-TG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A---------CT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87801                      : GACA-G---A-C-G---A-CA-G-A-CAAA-A-GG--C--AAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------TCT-TCGA-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87802                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAG-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87803                      : GACA-G---AAC-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAG-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87804                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-ATCA--AGTGAG--C-TAATAAA
gi|87805                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-A-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87806                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-A-AACAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-ACGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87807                      : GACA-G---A-C-A---A-CA-T-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TTGG-CTCA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87808                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A--AAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-ACTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-
gi|87809                      : GACA-G---A-C-GG--A-CG---A-CAAA-A-GG--C--AAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87810                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---CAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87811                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAT-A-GA--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G---------CT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-CAA
gi|87812                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A----------T-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87813                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GTTTA-C-TT-T-A--------A--------CCT-TTGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87816                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-ACAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TC-G-CTCA--GGTGAG--C-TAA-CAA
gi|87817                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-TGA---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CTT-TCAG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87818                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCT-C-TT-G-A--------A--------ACT-TCGT-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87820                      : GACA-G---A-CAG---A-CA-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------T--------CCT-TCAG-CTCA--GATGAG--C-TAA-AAA
gi|87821                      : GGCA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTTA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87822                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-AG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCTT-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87823                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A-----------------CCT-TCGG-TTCA--GGTGA-----TAA-AAA
gi|87824                      : GAGA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC---GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--T-TAT-AAA
gi|87826                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAGAA-AAAA-GC-CA-C-TT-C-A--------G--------CCT-TCAG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87827                      : GACA-G---A-C-G---ATCG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-AT-G-A--------ACCT-----CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87828                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-A-TT-G-AGCCTTGGCG--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87829                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGGGAGGCT-TAA-AAA
gi|87830                      : GACG-G---A-C-A---A-CA-G-A-CGAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A---------CT-TCAG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87831                      : GACG-G---A-C-A---A-CA-G-A-CGAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A---------CT-TCAG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87834                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GC--T--GAT-CAGGA-AAAA-GCTCA-CTTT-G-A--------A--------CCT-TCGGTTTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87835                      : GACA-G---G-C-G---A-CG-G-A-CAAC-C-GG--C--AAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87837                      : GACA-G---A-C-GCG-A-CGCG-A-CAAA-A-GG--T--GAT-CAAGAAAATA-GCTCA-C-TT-G-A--------AA-------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87839                      : GATA-G---A-C-G---A-CA-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C--T-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87840                      : GACA-GCATA-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-AGGCC--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87841                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GATTCAG---AATA-GTCCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGGGAG--C-TAA-AAA
gi|87842                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-AAGG--C--GAT-CAG---AA---GCTTA-C-T--G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87977                      :  ACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87980                      :  ACA-G---A-C-G---A-CA-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAT---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------TCT-TCGG-TTCA--GGTTAG--C-TAA-AAA
gi|87981                      :  ACA-G---A-CAG---A-CA-G-A-CAGA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TTGG-CTTA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87982                      :  ACA-G---A-CAG---A-CG-G-A-CAAT-C-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-CCGA-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87983                      :  ACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--G-T-CAG---AATA-GCTTA-C-TG-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87984                      :  ACG-G---A-C-GG--A-CA-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCG--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87985                      :  ACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-A---C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-G-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87986                      :  ACA-G---A-CAG---A-CG-G-A-CAAT-G-GG--C--TAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCAG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88019                      :    A-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------AGTTGGAACCCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88025                      :     -G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-AGGCC--GAT-CAG---AAAA-GCTCAAC-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88041                      :             -G---A-CG-G-A-CAGA-C-GA--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88043                      :             -G---A-CA-G-A-CGAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GATCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88044                      :             -G---A-CA-G-A-CGAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GATCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88045                      :             -G---A-CG-G-A-CAGA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GATGAG--C-TAA-AAA


blockSeqs                     :             A GAG               A  GC          GAA  A                GCCTTGGCG                                    T
blockSeqs                     :             A CG                A  GC          AA   A                AGTTGGAAC                                    T
blockSeqs                     :             A G                 A  .           GA   A                ACCT                                         T
blockSeqs                     :             A G                 .  .           .    T                AA                                           T
blockSeqs                     :             . G                 .  .           .    A                A                                            T
blockSeqs                     :             . G                 .  .           .    A                A                                            T
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            T
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    G                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                T                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                G                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    A                A                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    T                .                                            .
blockSeqs                     :             . .                 .  .           .    .                .                                            .


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AANA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
finalCons                     : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AANA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA





Alignments
lowQualScore                  :     0 000 0 1 222 0  0 0 0    0 1  11 00   0   111  1 0     0 0  0 0 33333333333333333   0    0    00      00 0   2   
lowQualScore                  :     . ... . . ... .  . . .    . .  .. ..   .   ...  . .     . .  . . .................   .    .    ..      .. .   .   
lowQualScore                  :     4 777 4 6 999 4  4 4 4    4 2  11 66   8   888  4 4     4 8  4 8 99999999999999999   4    4    55      55 4   8   
consensus                     : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AANA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
Reference ( family-120 )      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AANA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87743                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87744                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87747                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87748                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87749                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--T--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87750                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAACA-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87751                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87752                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87753                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87754                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87755                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87756                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCAG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87757                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87758                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87759                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87761                      : GACA-G---A-T-G---A-CG-G-A-TAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87762                      : GACA-G---A-C-GG--A-CG-G-A-CAAA-A-GG--T--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87763                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--AAT-AAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87764                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87765                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CCTA--AGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87766                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--AAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCTG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87767                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GTTGAG--C-TAA-AAA
gi|87768                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--TGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87769                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87770                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--TAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87771                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-CTTT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87772                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCAG-TTCA--GGTGAA--C-TAA-AAA
gi|87773                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-AG--C--AAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87774                      : GACA-G---A-C-G---A--G-G-A-CAAA-AAGG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87775                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-AAGG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87776                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A-----------------CCTATCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87777                      : GACA-G---A-C-G---A-CG---A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-TCTCA-C-TT-GAA--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87778                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GTTCA-C-TT-C-A--------G--------CCT-TCGG-CTCACTGGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87780                      : GACA-G---A-C-GG--A-CT-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87781                      : GACAAG---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--CTTAA-AAA
gi|87782                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87783                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87784                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87785                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAAAGCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87786                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A--G--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-GAA--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87787                      : GACA-G---A-T-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-A-A--------A--------CCT-TCGG-TCCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87788                      : GACA-G---A-T-G---A-CG-GGA-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-A-A--------A--------CCT-TCGG-TCCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87789                      : GACA-G---A-C-GGAGA-CG-G-A-CAAA-A-AG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87790                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A---------CT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-
gi|87791                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A---------CT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-TAA
gi|87792                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-TAAA-A-GG--T--GAT-CAG---AAGA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TGAG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-CAA
gi|87794                      : GACG-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAT---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87795                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-AAAA-A-AG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-CCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87796                      : GAC--G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87797                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--T--GATTCAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-CAA
gi|87798                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAGA-A-AT--TTTGAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87800                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-TG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A---------CT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87801                      : GACA-G---A-C-G---A-CA-G-A-CAAA-A-GG--C--AAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------TCT-TCGA-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87802                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAG-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87803                      : GACA-G---AAC-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAG-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87804                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-ATCA--AGTGAG--C-TAATAAA
gi|87805                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-A-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87806                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-A-AACAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-ACGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87807                      : GACA-G---A-C-A---A-CA-T-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TTGG-CTCA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87808                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A--AAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-ACTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-
gi|87809                      : GACA-G---A-C-GG--A-CG---A-CAAA-A-GG--C--AAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TTTG-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87810                      : GACA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TT--T--GAT-CAG---CAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87811                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAT-A-GA--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G---------CT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-CAA
gi|87812                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A----------T-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87813                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GTTTA-C-TT-T-A--------A--------CCT-TTGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87816                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-ACAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TC-G-CTCA--GGTGAG--C-TAA-CAA
gi|87817                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-TGA---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CTT-TCAG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87818                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCT-C-TT-G-A--------A--------ACT-TCGT-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87820                      : GACA-G---A-CAG---A-CA-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------T--------CCT-TCAG-CTCA--GATGAG--C-TAA-AAA
gi|87821                      : GGCA-G---A-C-A---A-CG-G-A-CAAA-T-TG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTTA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87822                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-AG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCTT-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87823                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A-----------------CCT-TCGG-TTCA--GGTGA-----TAA-AAA
gi|87824                      : GAGA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC---GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--T-TAT-AAA
gi|87826                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAGAA-AAAA-GC-CA-C-TT-C-A--------G--------CCT-TCAG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87827                      : GACA-G---A-C-G---ATCG-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-AT-G-A--------ACCT-----CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87828                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-A-TT-G-AGCCTTGGCG--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87829                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGGGAGGCT-TAA-AAA
gi|87830                      : GACG-G---A-C-A---A-CA-G-A-CGAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A---------CT-TCAG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87831                      : GACG-G---A-C-A---A-CA-G-A-CGAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A---------CT-TCAG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87834                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAC-A-GC--T--GAT-CAGGA-AAAA-GCTCA-CTTT-G-A--------A--------CCT-TCGGTTTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87835                      : GACA-G---G-C-G---A-CG-G-A-CAAC-C-GG--C--AAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87837                      : GACA-G---A-C-GCG-A-CGCG-A-CAAA-A-GG--T--GAT-CAAGAAAATA-GCTCA-C-TT-G-A--------AA-------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87839                      : GATA-G---A-C-G---A-CA-G-A-CAAC-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C--T-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87840                      : GACA-GCATA-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-AGGCC--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAATAAA
gi|87841                      : GACG-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GATTCAG---AATA-GTCCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGGGAG--C-TAA-AAA
gi|87842                      : GACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-AAGG--C--GAT-CAG---AA---GCTTA-C-T--G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87977                      :  ACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AA
gi|87980                      :  ACA-G---A-C-G---A-CA-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAT---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------TCT-TCGG-TTCA--GGTTAG--C-TAA-AAA
gi|87981                      :  ACA-G---A-CAG---A-CA-G-A-CAGA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------G--------CCT-TTGG-CTTA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87982                      :  ACA-G---A-CAG---A-CG-G-A-CAAT-C-GG--T--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-CCGA-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87983                      :  ACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--G-T-CAG---AATA-GCTTA-C-TG-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87984                      :  ACG-G---A-C-GG--A-CA-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCG--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87985                      :  ACA-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-A---C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-G-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|87986                      :  ACA-G---A-CAG---A-CG-G-A-CAAT-G-GG--C--TAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCAG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88019                      :    A-G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------AGTTGGAACCCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88025                      :     -G---A-C-G---A-CG-G-A-CAAA-A-AGGCC--GAT-CAG---AAAA-GCTCAAC-TT-G-A--------G--------CCT-TCGG-CTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88041                      :             -G---A-CG-G-A-CAGA-C-GA--C--GAT-CAG---AAAA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88043                      :             -G---A-CA-G-A-CGAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GATCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88044                      :             -G---A-CA-G-A-CGAA-A-GG--C--GAT-CAG---AAAA-GATCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GGTGAG--C-TAA-AAA
gi|88045                      :             -G---A-CG-G-A-CAGA-A-GG--C--GAT-CAG---AATA-GCTCA-C-TT-G-A--------A--------CCT-TCGG-TTCA--GATGAG--C-TAA-AAA