lowQualScore                  :                2  000 1 22222 11 5 1   222 0 22 0 0 0 0 00 0  1111111 11 0  0 000  0 0 0 0 0 000 11 0   00  0 00000 0 0 0 1111 1111  00   4444444 00    0 0000      0 00  0 2   
lowQualScore                  :                .  ... . ..... .. . .   ... . .. . . . . .. .  ....... .. .  . ...  . . . . . ... .. .   ..  . ..... . . . .... ....  ..   ....... ..    . ....      . ..  . .   
lowQualScore                  :                4  888 7 00000 00 8 2   222 4 33 8 4 4 4 66 8  7777777 00 4  4 777  8 4 4 8 8 777 88 8   33  5 66666 5 2 2 0000 0000  33   9999999 33    7 5555      5 33  4 1   
consensus                     :           ACGAC-GA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
Reference ( gi|21808 )        :           ACGAC-GA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21702                      :           ACAAC-GA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----AA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21703                      :        acaACAAC-GA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--C-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21780                      :        acaACGAC-AA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------AGAA-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21704                      :         cgACAAC-AA---C-A-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21714                      :        acgACGAC-AA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--GGAC-------A--A-TT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21705                      :        acgACAAC-GA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-T-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-TATAGAC-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21706                      :        acaACAAA-GA---C-G-----C--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAG--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21711                      :        acaACAAC-GA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--G-C---TT-CA--GCTC-A----GGTGAG-C--TATA-AAA
gi|21713                      :        acaACAAC-GA---C-G-----C--C-G-ATA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-ACC-T----C----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21715                      :        acgACAAC-AA---C-A-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT---A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----T-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21712                      :        acgACAAC-GA---C-G-----A--C-G-A-A---G-A--C-A-A-C-A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-C---GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21716                      :        acaACAAC-AA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A--T-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GTG---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21707                      :        acgACAAA-GA---C-G-----C--C-G-ACA---G-AA-C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAG--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21721                      :        acaACGAC-GA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC----------A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--A-C---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21810                      :        acaACAAT-GA---C-A-----A--C-G-AC----G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AA---GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21724                      :           ACGAC-AA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--CCA-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TTTG-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-AG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-TAA
gi|21719                      :        acaACAAC-GA---C-G-----A--T-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--A-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----TTCAAGG--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AGA
gi|21812                      :        acgACGAC-GC---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A---C-G--G-A--------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----G---GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21813                      :           ACGAC-GA---C-A-----A--C-G-ACA---A-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC------CG--GCTC-A-----GTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21730                      :           ACGAC-GA---C-G-----A--C-G-AC---------C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TTTG-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----C----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--AA-A-AAA
gi|21811                      :    acaacagACAAC-AA---C-A-----A--C-T-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GTTGAG-T--TA-A-
gi|21718                      :           ACAAC-GA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---GA-A-AAA--GC-T-----C-A-C------T----GA--GCC---TT-CG--G-TC-A----GGTGAG-C--TA-A-
gi|21781                      :        acaACGCC-GA---C-A-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-ACA------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G----AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-TG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-TAA
gi|21727                      :   caacaacgACGAC-AA---C-GGACA-A--C-G-ACACACG-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AA---GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-TG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21728                      :           ACAAC-AA---C-A-----A--C-G-AC----G-A--C-A-A-C-A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----CAA-C-TG---T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21726                      :        acgACAAT-GA---C-G-----A--C-C-AAA---G-A--C-A-A-T-G--G-AG-------A--A-AT-T---AT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21732                      :        acaACAAC-AG---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-T-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CA--GCTC-A----AGTAAA-C--TA-ATAAA
gi|21737                      :        acgACGAC-AA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---GA-A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----TG---GA--GCC---T---G--GCTC-A-----GTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21722                      :        acgACGAC-GA---C-G-----A--C-G-ACA---G-AACC-A-A-CGG--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GCTT-----C-A-C-T----T----GA--A-C---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21733                      :        acaACGCC-GC---C-A-----A--C-A-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A--T-T---TT---A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-
gi|21734                      :     acaacaACAAC-GA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--CCA-A-C-G----AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-AACAG--A-AAA--GA-T-----C-A-C-TA---T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21814                      :        acgACAAC-GA-----G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G----AC-------A--A-AT-T---TT-T-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GAGTGCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-T--TA-A-AA
gi|21731                      :           ACAAC-GA---T-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--ACTC-A----
gi|21782                      :        acaACGCC-GA---C-A-----A--C-G-ACA---G-AAGC-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--ATATA--GC-T-----C---C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-
gi|21741                      :         cgACGAT-GA---C-G-----A--T-G-AC----G-A--C-A-A-C-GACG-AC-------G--A-AT-G---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-T-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTA-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21739                      :        acgACCAC-AA---C-G-----A--C-G-ACA---A-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-T-A-T-C-A---G--A-AAA--CC-T-----C-A-C-T----C----AA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGCGAG-C--TA-A-TAA
gi|21738                      :        acgACGAC-AAAAAC-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-T-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA---C-T-----C-A-C-T----T----G---------TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21816                      :           ACAAC-GA---C-A-----AA-C-G-ACAC--G-A--C-G-A---A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAAAAGC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21747                      :           ACGAC-GA---C-GCGACAA--C-G-ACA---G-AA-C-A-A-C-G--G-AC-------A--A--T-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----CAA-A-T----T----GA--G-C---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21742                      :           ACGAC-AA---C-G-----A--C-G-CCAAC-G-A--C-A-A-C-A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G----AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GC-------CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21736                      :           ACAAT-GA---C-G-----A--T-G-GCA---G-A--C-A-A-C-G--A-AC-------A--C-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GA-T-----A-A-C-T----T----GA--GCC---TT-TG--GATC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21740                      :        acaATGAC-GA---C-G-----A------ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--C-AT-T---T--G-A-TGC-A---GCAA-AAG--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21845                      :     acaaccATGAC-GA---C-A-----A--A-A-ACG---G----C-A-A-T-G--G-AC-------A--C-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-A----T----GA--GCT---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21744                      :           ACAAC-GA---C-G-----C--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-A---TT-G-ACT-C-A---G--AGAAA--GC-T-----C-A-C-T----------G--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-CAA
gi|21817                      :        acgACAAC-GA---C-G-----A--C-G-ACA-----A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---T----A-T---A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--G-C---TT-CG--GCTC-A-----GTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21723                      :           ACGAC-GA---C-G-----A--C-G-ACA---G-AA-C-A-A-C-G--GGAC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GCTT-----C-A-C-T----T----GA--A-C---TT-CG--GCTC-A-----GTGAGCC--TA-A-AAA
gi|21743                      :        acaACAAT-GA---C-G-----A--T-G-AGC---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-TAATTT-GTA-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GGC---CT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-ATAAA
gi|21746                      :        acaACAAC-AA---C-G-----A--T-T-ACT---G-A--C-A-A-C-G--G-GA-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-C-T----T----AA--GCA---TT-CG--GGTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21818                      :        acaACAAC-AA---C-G-----A--C-G-ATA---G-A--C-A-A-T-G--G-AT-------A--A-AT-T---TT-T-A-A-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCG---TT-TG--GCTG-A----GGTGAG-C--T
gi|21785                      :           ACAAC-AA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A----------------------AT-T---TT-G-A-T-CGA---A--A-AAA--GC-T-----C-A-CCT----T----GA--GCCA--TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21753                      :          aACGAC-GA---C-G-----G--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-GA-------A--A-AT-T---T--A-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-A----A----CG--GCC---TT-TG--GTTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21754                      :        acaACGAC-GA---C-G----------G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--A-AC-------AT-ATAT-T---TC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-------C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGT-AG-TAATA-A-AAA
gi|21708                      :       acaacCGAC-AA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21709                      :  acaacgacgcCGAC-AA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---GA-A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21720                      :  acaacgacgcCAAC-GA---C-A-----A--C-G-GCA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTT-A----GGTGAG-C--TA-ATAAA
gi|21735                      :        acacCGAC-GA---C-A-----G--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--C-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC----T-CA--GCTC-A----GTTGAG-C--TA-A-AA
gi|21729                      :      acaacacGAC-AA---C-A-----A--C-G-ACA---G-A--T-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C---C-T----T----GA--GCC---TT-CA--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21745                      :  acgacaacgagGAC-GA---C-A-----A--CCG-ACA---G-A--C-A-AAC-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-------A--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-C---GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21749                      : acaacgacgacgGAC-G----C-G-----A--C-GGACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21748                      :      acagacaGACAGA---CAG-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21752                      :          acaGACAGA---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-ACAG---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--ACC---TT-CG--GTTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21756                      :          acaGACAGA---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--ACC---TT-CG--GTTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21755                      :          acaGACAGA---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--ACC---TT-CG--GTTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21862                      :          acaGAC-G------G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-A-----------A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21786                      :             GAC-G------G-----A--C-GGACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-A-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CT--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21787                      :     aacagacaGAC-G------G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-C-T----TT---GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21757                      :     aacagacaGACAGA---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--ACC---TT-CA--GTTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21855                      :          acaGAC-G------G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--ACC---TT-CG--GTTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21868                      :             GAC-G------G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-T---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--A-C---TT-CG--GTTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21842                      :              AC-GA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-G-CTA---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---CT-CG--GCTC-A----GGTGAGCC--TA-A-AAA
gi|21843                      :              AC-AA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A--T-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GT-T-----C-A-C-T----T----GA--GCA---TT-C---GCTC-A----GGTGAG-A--TA-A-AA
gi|21844                      :              AC-AA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G----AC-------A--A-AT-T---T--G-A-TTC-A---G--A-AAA--GC-T-------A-C-T----T----GA--GCC---TTACG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21819                      :              AC-AA---C-G-----AGTC-G-ACA---G-A--C-A-A-A-G--G-AC-------A--A-AT-G---AT-A-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----A-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CT--GCTC-A----GGTGAA-C--TA-A-AA
gi|21846                      :              AC-GA-----G-----A--C-G-ACA-----A--C-G-A-C-A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-G-C-T----T----AA--GCC---TT-CG--GATA-A----TGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21848                      :              AC-GA---C-G-----A--C-G-GCA---C-A--C-A-A-------------------------T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAG--GC-------C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21809                      :               C-GA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-A--T-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GTC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21851                      :           acacC-GA---C-G-----A--C-A-ACA---GCG--C-A-A-T-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-A-A---G--A-AAT--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-TA--GCTC-A----GCTGAG-C---A-A-AAA
gi|21857                      :                -GA---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--C-AT-T---TT-G-A-T-C-C---G--A-ATA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CA--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21831                      :                -GA---CAG-----A--C-ATACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21858                      :             aaa-GA---CAG-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21860                      :                -GA---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--ACC---TT-CG--GTTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21859                      :                -GA---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--ACC---TT-CG--GTTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21861                      :                -GA---CAG-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-A-A-T-A-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21863                      :                -GA---C-C-----A--C-A-ACACC-G-A--C-A-A-C-A--G-AC-------A--C-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--TC-C-----C-A-C-T----A----GA--GCC---TT-CG--GTTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21866                      :                -GA---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--ACC---TT-CG--GTTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21906                      :                  A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-T-G--G-AT-------A--A-GT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-CAAAGT----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21914                      :                   ---C-G-----A--A-G-AT----G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------G--A-AT-T---T--G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GTC---TT-AG--GCTC-A----GGTAAG-C--TA-A-AAA
gi|21919                      :                       -G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21918                      :                       -G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21917                      :                       -G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21832                      :                       -G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCCT-A----AGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21920                      :                   aacg-G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-ATAAA
gi|21922                      :                       -G-----A--CAG-ACA---G-A--T-G-A-C-G--G-AT-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--ACC---TT-CG--GTTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21955                      :                                  -G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21956                      :                                  -G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----TGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21957                      :                                  -G-ACA---G-A--C-A-A-C-A--T-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-TG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-ATAAA
gi|21867                      :                                  -G-ACA---G-A--C-AGA-C-A--G-ACGAGGACAA--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--GCC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21986                      :                                    -ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA---------------GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|22004                      :                                       A---G-A--C-A-A-C-A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-A-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-C-T----T----GA--ACC---TT-CG--GCTC-A----GGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21842                      :                                                                                                       AG--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-GG--GCTC-A----AGTGAG-C--T
gi|21708                      :                                                                 acgacgacgacagacaacggacaaattttgagctagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21702                      :                                                      acaacgacgccgacaacgacgacagacaacggacaaattttgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTT-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21703                      :                                                            acaacaacgacgacgacagacaacggacaaattttgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21780                      :                                                            acaacaacgacgacgacagacaacggacaaattttgatcagcaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21709                      :                                                           cgacgacaacgacgacagacaacggacagaaattttgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21704                      :                                                     acaacgacgccgacaacgacgacagacaacggacaaattttgatcagaaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21714                      :                                                            acgacaacaacaacgacagacaacggacaaattttgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21706                      :                                                           acgacgacaacgacgacagacaacgggacaatttttgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--aaaaa
gi|21809                      :                                                           acaacaaagacgccgacagacaacggacaaattttgatcagaaagA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--ACTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21711                      :                                                               acaccgacgacgacagacaacatacaaattttgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GC----TG-AA--GCTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21713                      :                                                            acaacaacgacgacgacagacaacggacaaattttgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTCGA----GGTGAG-C--Tataaaa
gi|21715                      :                                                            acgacaacgacgccgatagacaacggacaaattttgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTAAG-C--Taaaaa
gi|21707                      :                                                             acgacaacaacaacgacagacaacggacaaattttatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--aaaaa
gi|21721                      :                                                          acaacaaagacgccgacagaacaacggacaaattttgatcagaaagA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GC-------CGAAGTTC-A----AGTGAG-C--TA-aaaaa
gi|21810                      :                                                              acaacgacgacgacgacagacaacggacaattttgatcagaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21724                      :                                                                 acaatgacaacgacgacaacggacaaattttgatcagaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---TA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21720                      :                                                          acaacgacaacgacgacagaccaacggacaaatttttgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----AA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taataa
gi|21813                      :                                                            acaccaacgacaacggcagacaacggacaaattgtgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-T---------GA--GCC---G---G--GCTC-A----AGTGAG-C--Taataaa
gi|21857                      :                                                               acgacgacaacgacaaacaacggacaaattttgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCT---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--TA-aaaaa
gi|21781                      :                                                                     gacgacgacagacaacggacacattttgatccgaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---AA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21727                      :                                                       caacaacgacgccgacaacgacagacaacggacaaaattttgatcagaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---AA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taataa
gi|21735                      :                                                         acgacaacggacaacgacacacgacaacggacaaattttgatcagaaA--GC-T-----C-A-A-C----T----GA--GC----TG-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21726                      :                                                         acaacaccgacgacagcgacagacaacggacaaattttgatcagcaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taaaa
gi|21732                      :                                                            acaacaatgacgaccaaagacaatggagaaattatgatcagaaaA--GT-T-----T-A-C-T----T----GA--GCT---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21733                      :                                                            acgacaacagcgacgacagacaacggacaaattttgattagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taataaa
gi|21906                      :                                                           acaacaacgccgccaacaacagacaacggacaattttatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-ACTTTGGTGAG-C--Taaa
gi|21782                      :                                                                     acgacgacagacaatggataagttttgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AG-GAG-C--TA-aaaa
gi|22004                      :                                                           cgacgccgacaacgacagaagcaacggacaaattttgatcagataA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GTTC-A----AGTGAG-C--Taa
gi|21816                      :                                                                             agacaacagacaaattttgataagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21742                      :                                                            acaacgacaaacgacacgacgaagacaaattttgatcagaaaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC-------G--GCTC-A----AGTGAG-C--Taaaa
gi|21740                      :                                                              acgacaacgacgccaacgacaacagacaaattttgatcagaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--aaaaa
gi|21844                      :                                                        acaaccatgacgacgaacagacaacggacacatttgatgcagcaaaagA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GTAAG--GCTC-A----AGT-AG-C--Taaaaa
gi|21845                      :                                                                   acaacgacgacagacaacgacaaatttgattcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AA--GCTC-A----TGTGAG-C--Taaaaa
gi|21749                      :                                                                atgacgacaaaaacggcaatggacacattttgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--TA-aaaaa
gi|21748                      :                                                           acagacagacgcgacggacagacgacggacaaaaggcgatcagaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--TA-aaaaa
gi|21831                      :                                                            acagacagacagacagacagacgacggacaaaaggtgatcagaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21743                      :                                                               aaagacagacatacagacgacggacaaaaggcgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-GG--CCTC-A----AGTGAG-C--Taaaa
gi|21752                      :                                                        acaacaatgacgatgagcgacaacggacaaattaatttgtatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--ACC---GA-AG--GTTC-A----AGTGAG-C--Taataaa
gi|21858                      :                                                              acagacagacggacagacgacggacaaacaggtgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--TA-aaaaa
gi|21919                      :                                                                   gacagacagacagacgacggacaaaaggcgatcagaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--TA-aaaaa
gi|21918                      :                                                                       gacagacagacgacggacaaaaggcgatcagaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--TA-aaaaa
gi|21917                      :                                                                       gacagacagacgacggacaaaaggcgatcagaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--TA-aaaaa
gi|21955                      :                                                                       gacagacagacgacggacaaaaggcgatcagaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--TA-aaaaa
gi|21756                      :                                                                           gacagacgacggacaaaaggcgatcagaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--ACC---GA-AG--GTTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21755                      :                                                               acagacagacggacagacgacggacaacaggtgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--ACC---GA-AG--GTTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21860                      :                                                               acagacagacggacagacgacggacaacaggtgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--ACC---GA-AG--GTTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21859                      :                                                                      gacggacagacgacggacaacaggtgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--ACC---GA-AG--GTTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21862                      :                                                                      gacggacagacgacggacaacaggtgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--TA-aaaaa
gi|21785                      :                                                                        gacggacagacagacgacggacaaaatcagaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCCGAAT---G--GCTCAA----GGTGAG-C--Taaaaa
gi|21861                      :                                                                    aacaacaacgacgacagacaaattttgatcgaaaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21786                      :                                                                  gacagacagacagacgacggacaaaaggcaataagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCA---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21914                      :                                                          aacagacagacggacggacagacgacggacaaaaggcaatcagaaaA--GC-T-----T-A-C-C----T----GA--GCC---TA-AG--ACTC-A----AGTGAG-C--Taaaa
gi|21787                      :                                                                        cgaagatgacaacggacgaatttgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTCAA----AGTGAG-C--TA-aaaaa
gi|21832                      :                                                           aacagacagacggacagacagacgacggacaaaaggcgatcagaaA--GC-T-----C-A-C-T----T----AG--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21855                      :                                                                  aacggacagacagacgacggacaaaaggcgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--ACC---GA-AG--GTTC-A----AGTGAG-C--TA-aaaaa
gi|21920                      :                                                                   gacggacagacagacgacggacaaaaggcgatcagaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--TA-aaaaa
gi|21866                      :                                                                       gacagacagacgacggacaaaaggcgatcagaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--ACC---GA-AG--GTTC-A----AGTGAG-C--Taataaa
gi|21956                      :                                                                      gacggacagacgacggacaacaggcgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-A----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--TA-aaaaa
gi|21922                      :                                                                           gacagacgacggacaaaaggcgatcagaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--ACC---GA-AG--GTTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21957                      :                                                                      gacagacagatgacggataaaaggcgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---AA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taaaaa
gi|21867                      :                                                                          gacagacaacatacaaaaggcgatcagaaaA--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-A----AGTGAG-C--Taataaa
gi|21730                      :                                                                   gacagacagacagacgaggacaaaaaggcgatcagaaa--GC-T-----C-A-C-C----T----GA--GCC---GA-AG--GCTC-G----AGTGAG-C--Taaaaa





Alignments
lowQualScore                  :                  2 0 000 1 22222 11 5 0   222 0 22 0 0 0 0 00 0  1111111 11 0  0 000  0 0 0 0 0 000 11 0   00  0 11111 0 0  1111 1111  00   0  0             0 00  0 2   
lowQualScore                  :                  . . ... . ..... .. . .   ... . .. . . . . .. .  ....... .. .  . ...  . . . . . ... .. .   ..  . ..... . .  .... ....  ..   .  .             . ..  . .   
lowQualScore                  :                  3 5 888 7 00000 00 7 8   222 4 33 8 4 4 4 66 8  7777777 00 4  4 777  8 4 4 8 8 777 88 8   66  8 00000 8 8  6666 6666  55   4  4             8 66  4 0   
consensus                     :             ACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
Reference ( family-114 )      :             ACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21702                      :             ACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----AA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21703                      :          acaACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--C-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21704                      :          acaACAAC-A-A---C-A-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21705                      :          acgACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-T-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-TATAGAC-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21706                      :          acaACAAA-G-A---C-G-----C--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAG--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21707                      :          acaACAAA-G-A---C-G-----C--C-G-ACA---G-AA-C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAG--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21708                      :           acaCGAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21709                      :    acaacgacgcCGAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---GA-A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21711                      :   acaacgacgcACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--G-C-TT-CAGCTCAGGTGAG-C--TATA-AAA
gi|21712                      :          acaACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-A-A---G-A--C-A-A-C-A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-C-GCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21713                      :          acaACAAC-G-A---C-G-----C--C-G-ATA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-ACCT----C----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21714                      :          acgACGAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--GGAC-------A--A-TT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21715                      :          acgACAAC-A-A---C-A-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT---A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----T-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21716                      :          acgACAAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A--T-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GTG-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21718                      :          acgACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---GA-A-AAA--GC-T-----C-A-C-----T----GA--GCC-TT-CGG-TCAGGTGAG-C--TA-A-
gi|21719                      :          acaACAAC-G-A---C-G-----A--T-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--A-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----TTCAAGG--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AGA
gi|21720                      :           acgCAAC-G-A---C-A-----A--C-G-GCA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTTAGGTGAG-C--TA-ATAAA
gi|21721                      :         acacACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC----------A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--A-C-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21722                      :          acaACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-AACC-A-A-CGG--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GCTT-----C-A-CT----T----GA--A-C-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21723                      :          acaACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-AA-C-A-A-C-G--GGAC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GCTT-----C-A-CT----T----GA--A-C-TT-CGGCTCA-GTGAGCC--TA-A-AAA
gi|21724                      :          acaACGAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--CCA-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TTTG-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-AGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-TAA
gi|21726                      :          acaACAAT-G-A---C-G-----A--C-C-AAA---G-A--C-A-A-T-G--G-AG-------A--A-AT-T---AT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21727                      :          acaACGAC-A-A---C-GGACA-A--C-G-ACACACG-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AA---GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-TGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21728                      :             ACAAC-A-A---C-A-----A--C-G-AC----G-A--C-A-A-C-A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----CAA-CTG---T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21729                      :            acgGAC-A-A---C-A-----A--C-G-ACA---G-A--T-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C---CT----T----GA--GCC-TT-CAGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21730                      :  acgacaacgagACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-AC---------C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TTTG-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----C----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--AA-A-AAA
gi|21731                      :      acaacagACAAC-G-A---T-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGACTCA
gi|21732                      :          acaACAAC-A-G---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-T-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CAGCTCAAGTAAA-C--TA-ATAAA
gi|21733                      :          acgACGCC-G-C---C-A-----A--C-A-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A--T-T---TT---A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-
gi|21734                      :       acaacaACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--CCA-A-C-G----AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-AACAG--A-AAA--GA-T-----C-A-CTA---T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21735                      :           acgCGAC-G-A---C-A-----G--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--C-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC--T-CAGCTCAGTTGAG-C--TA-A-AA
gi|21736                      :      acaacacACAAT-G-A---C-G-----A--T-G-GCA---G-A--C-A-A-C-G--A-AC-------A--C-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GA-T-----A-A-CT----T----GA--GCC-TT-TGGATCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21737                      :          acaACGAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---GA-A-AAA--GC-T-----C-A-CT----TG---GA--GCC-T---GGCTCA-GTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21738                      :          acgACGAC-A-AAAAC-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-T-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA---C-T-----C-A-CT----T----G-------TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21739                      :             ACCAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---A-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-T-A-T-C-A---G--A-AAA--CC-T-----C-A-CT----C----AA--GCC-TT-CGGCTCAGGCGAG-C--TA-A-TAA
gi|21740                      :          acgATGAC-G-A---C-G-----A------ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--C-AT-T---T--G-A-TGC-A---GCAA-AAG--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21741                      :       acaaccACGAT-G-A---C-G-----A--T-G-AC----G-A--C-A-A-C-GACG-AC-------G--A-AT-G---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-TT----T----GA--GCC-TT-CGGCTAAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21742                      :          acgACGAC-A-A---C-G-----A--C-G-CCAAC-G-A--C-A-A-C-A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G----AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GC-----CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21743                      :             ACAAT-G-A---C-G-----A--T-G-AGC---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-TAATTT-GTA-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GGC-CT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-ATAAA
gi|21744                      :          acaACAAC-G-A---C-G-----C--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-A---TT-G-ACT-C-A---G--AGAAA--GC-T-----C-A-CT----------G--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-CAA
gi|21745                      :            acgGAC-G-A---C-A-----A--CCG-ACA---G-A--C-A-AAC-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-------A--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-C-GCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21746                      : acaacgacgacgACAAC-A-A---C-G-----A--T-T-ACT---G-A--C-A-A-C-G--G-GA-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----AA--GCA-TT-CGGGTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21747                      :          acaACGAC-G-A---C-GCGACAA--C-G-ACA---G-AA-C-A-A-C-G--G-AC-------A--A--T-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----CAA-AT----T----GA--G-C-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21748                      :               GACAG-A---CAG-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21749                      :            acaGAC-G-----C-G-----A--C-GGACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21752                      :        acagacaGACAG-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-ACAG---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21753                      :          acaACGAC-G-A---C-G-----G--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-GA-------A--A-AT-T---T--A-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CA----A----CG--GCC-TT-TGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21754                      :          acaACGAC-G-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--A-AC-------AT-ATAT-T---TC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-------C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGT-AG-TAATA-A-AAA
gi|21755                      :          acaacGACAG-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21756                      :            acaGACAG-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21757                      :            acaGACAG-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CAGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21780                      :          acaACGAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------AGAA-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21781                      :           cgACGCC-G-A---C-A-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-ACA------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G----AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-TGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-TAA
gi|21782                      :     caacaacgACGCC-G-A---C-A-----A--C-G-ACA---G-AAGC-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--ATATA--GC-T-----C---CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-
gi|21785                      :           cgACAAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA-------------------G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-CGA---A--A-AAA--GC-T-----C-ACCT----T----GA--GCCATT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21786                      :              aGAC-GGA---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-A-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CTGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21787                      :       aacagacaGAC-G-------G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----TT---GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21808                      :     aacagacaACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21809                      :                 C-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-A--T-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GTC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21810                      :         acacACAAT-G-A---C-A-----A--C-G-AC----G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AA---GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21811                      :             ACAAC-A-A---C-A-----A--C-T-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGTTGAG-T--TA-A-
gi|21812                      :             ACGAC-G-C---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A---C-G--G-A--------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----G---GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21813                      :             ACGAC-G-A---C-A-----A--C-G-ACA---A-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC----CGGCTCA-GTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21814                      :             ACAAC-G-A-----G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G----AC-------A--A-AT-T---TT-T-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GAGTGCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-T--TA-A-AA
gi|21816                      :             ACAAC-G-A---C-A-----AA-C-G-ACAC--G-A--C-G-A---A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAAAAGC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21817                      :             ACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA-----A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---T----A-T---A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--G-C-TT-CGGCTCA-GTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21818                      :             ACAAC-A-A---C-G-----A--C-G-ATA---G-A--C-A-A-T-G--G-AT-------A--A-AT-T---TT-T-A-A-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCG-TT-TGGCTGAGGTGAG-C--T
gi|21819                      :                AC-A-A---C-G-----AGTC-G-ACA---G-A--C-A-A-A-G--G-AC-------A--A-AT-G---AT-A-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----A-A-CT----T----GA--GCC-TT-CTGCTCAGGTGAA-C--TA-A-AA
gi|21831                      :                  -G-A---CAG-----A--C-ATACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21832                      :                       aaa-G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCCTAAGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21842                      :            aacgAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-G-CTA---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-CT-CGGCTCAGGTGAGCC--TA-A-AAA
gi|21843                      :                AC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A--T-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GT-T-----C-A-CT----T----GA--GCA-TT-C-GCTCAGGTGAG-A--TA-A-AA
gi|21844                      :                AC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G----AC-------A--A-AT-T---T--G-A-TTC-A---G--A-AAA--GC-T-------A-CT----T----GA--GCC-TTACGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21845                      :             ATGAC-G-A---C-A-----A--A-A-ACG---G----C-A-A-T-G--G-AC-------A--C-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CA----T----GA--GCT-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21846                      :                AC-G-A-----G-----A--C-G-ACA-----A--C-G-A-C-A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-G-CT----T----AA--GCC-TT-CGGATAATGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21848                      :                AC-G-A---C-G-----A--C-G-GCA---C-A--C-A-A-------------------------T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAG--GC-------C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21851                      :                 C-G-A---C-G-----A--C-A-ACA---GCG--C-A-A-T-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-A-A---G--A-AAT--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-TAGCTCAGCTGAG-C---A-A-AAA
gi|21855                      :               GAC-G-------G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21857                      :                  -G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--C-AT-T---TT-G-A-T-C-C---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CAGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21858                      :                  -G-A---CAG-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21859                      :                  -G-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21860                      :                  -G-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21861                      :                  -G-A---CAG-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-A-A-T-A-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21862                      :               GAC-G-------G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-A-----------A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21863                      :                  -G-A---C-C-----A--C-A-ACACC-G-A--C-A-A-C-A--G-AC-------A--C-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--TC-C-----C-A-CT----A----GA--GCC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21866                      :                  -G-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21867                      :                                     -G-ACA---G-A--C-AGA-C-A--G-ACGAGGACAA--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21868                      :               GAC-G-------G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-T---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--A-C-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21906                      :                    -A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-T-G--G-AT-------A--A-GT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CCAAAGT----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21914                      :                      ---C-G-----A--A-G-AT----G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------G--A-AT-T---T--G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GTC-TT-AGGCTCAGGTAAG-C--TA-A-AAA
gi|21917                      :                          -G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21918                      :                          -G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21919                      :                          -G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21920                      :                          -G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-ATAAA
gi|21922                      :                          -G-----A--CAG-ACA---G-A--T-G-A-C-G--G-AT-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21955                      :                                     -G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21956                      :                                     -G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCATGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21957                      :                                     -G-ACA---G-A--C-A-A-C-A--T-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-TGGCTCAGGTGAG-C--TA-ATAAA
gi|21986                      :                                       -ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA-----------GCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|22004                      :                                          A---G-A--C-A-A-C-A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-A-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA





Alignments
lowQualScore                  :                  2 0 000 1 22222 11 5 0   222 0 22 0 0 0 0 00 0  1111111 11 0  0 000  0 0 0 0 0 000 11 0   00  0 11111 0 0  1111 1111  00   0  0             0 00  0 2   
lowQualScore                  :                  . . ... . ..... .. . .   ... . .. . . . . .. .  ....... .. .  . ...  . . . . . ... .. .   ..  . ..... . .  .... ....  ..   .  .             . ..  . .   
lowQualScore                  :                  3 5 888 7 00000 00 7 8   222 4 33 8 4 4 4 66 8  7777777 00 4  4 777  8 4 4 8 8 777 88 8   66  8 00000 8 8  6666 6666  55   4  4             8 66  4 0   
consensus                     :             ACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
Reference ( family-114 )      :             ACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21702                      :             ACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----AA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21703                      :          acaACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--C-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21704                      :          acaACAAC-A-A---C-A-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21705                      :          acgACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-T-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-TATAGAC-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21706                      :          acaACAAA-G-A---C-G-----C--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAG--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21707                      :          acaACAAA-G-A---C-G-----C--C-G-ACA---G-AA-C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAG--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21708                      :           acaCGAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21709                      :    acaacgacgcCGAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---GA-A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21711                      :   acaacgacgcACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--G-C-TT-CAGCTCAGGTGAG-C--TATA-AAA
gi|21712                      :          acaACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-A-A---G-A--C-A-A-C-A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-C-GCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21713                      :          acaACAAC-G-A---C-G-----C--C-G-ATA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-ACCT----C----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21714                      :          acgACGAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--GGAC-------A--A-TT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21715                      :          acgACAAC-A-A---C-A-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT---A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----T-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21716                      :          acgACAAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A--T-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GTG-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21718                      :          acgACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---GA-A-AAA--GC-T-----C-A-C-----T----GA--GCC-TT-CGG-TCAGGTGAG-C--TA-A-
gi|21719                      :          acaACAAC-G-A---C-G-----A--T-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--A-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----TTCAAGG--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AGA
gi|21720                      :           acgCAAC-G-A---C-A-----A--C-G-GCA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTTAGGTGAG-C--TA-ATAAA
gi|21721                      :         acacACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC----------A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--A-C-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21722                      :          acaACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-AACC-A-A-CGG--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GCTT-----C-A-CT----T----GA--A-C-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21723                      :          acaACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-AA-C-A-A-C-G--GGAC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GCTT-----C-A-CT----T----GA--A-C-TT-CGGCTCA-GTGAGCC--TA-A-AAA
gi|21724                      :          acaACGAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--CCA-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TTTG-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-AGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-TAA
gi|21726                      :          acaACAAT-G-A---C-G-----A--C-C-AAA---G-A--C-A-A-T-G--G-AG-------A--A-AT-T---AT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21727                      :          acaACGAC-A-A---C-GGACA-A--C-G-ACACACG-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AA---GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-TGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21728                      :             ACAAC-A-A---C-A-----A--C-G-AC----G-A--C-A-A-C-A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----CAA-CTG---T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21729                      :            acgGAC-A-A---C-A-----A--C-G-ACA---G-A--T-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C---CT----T----GA--GCC-TT-CAGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21730                      :  acgacaacgagACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-AC---------C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TTTG-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----C----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--AA-A-AAA
gi|21731                      :      acaacagACAAC-G-A---T-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGACTCA
gi|21732                      :          acaACAAC-A-G---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-T-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CAGCTCAAGTAAA-C--TA-ATAAA
gi|21733                      :          acgACGCC-G-C---C-A-----A--C-A-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A--T-T---TT---A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-
gi|21734                      :       acaacaACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--CCA-A-C-G----AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-AACAG--A-AAA--GA-T-----C-A-CTA---T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21735                      :           acgCGAC-G-A---C-A-----G--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--C-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC--T-CAGCTCAGTTGAG-C--TA-A-AA
gi|21736                      :      acaacacACAAT-G-A---C-G-----A--T-G-GCA---G-A--C-A-A-C-G--A-AC-------A--C-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GA-T-----A-A-CT----T----GA--GCC-TT-TGGATCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21737                      :          acaACGAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---GA-A-AAA--GC-T-----C-A-CT----TG---GA--GCC-T---GGCTCA-GTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21738                      :          acgACGAC-A-AAAAC-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-T-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA---C-T-----C-A-CT----T----G-------TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21739                      :             ACCAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---A-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-T-A-T-C-A---G--A-AAA--CC-T-----C-A-CT----C----AA--GCC-TT-CGGCTCAGGCGAG-C--TA-A-TAA
gi|21740                      :          acgATGAC-G-A---C-G-----A------ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--C-AT-T---T--G-A-TGC-A---GCAA-AAG--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21741                      :       acaaccACGAT-G-A---C-G-----A--T-G-AC----G-A--C-A-A-C-GACG-AC-------G--A-AT-G---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-TT----T----GA--GCC-TT-CGGCTAAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21742                      :          acgACGAC-A-A---C-G-----A--C-G-CCAAC-G-A--C-A-A-C-A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G----AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GC-----CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21743                      :             ACAAT-G-A---C-G-----A--T-G-AGC---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-TAATTT-GTA-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GGC-CT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-ATAAA
gi|21744                      :          acaACAAC-G-A---C-G-----C--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-A---TT-G-ACT-C-A---G--AGAAA--GC-T-----C-A-CT----------G--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-CAA
gi|21745                      :            acgGAC-G-A---C-A-----A--CCG-ACA---G-A--C-A-AAC-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-------A--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-C-GCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21746                      : acaacgacgacgACAAC-A-A---C-G-----A--T-T-ACT---G-A--C-A-A-C-G--G-GA-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----AA--GCA-TT-CGGGTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21747                      :          acaACGAC-G-A---C-GCGACAA--C-G-ACA---G-AA-C-A-A-C-G--G-AC-------A--A--T-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----CAA-AT----T----GA--G-C-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21748                      :               GACAG-A---CAG-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21749                      :            acaGAC-G-----C-G-----A--C-GGACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21752                      :        acagacaGACAG-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-ACAG---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21753                      :          acaACGAC-G-A---C-G-----G--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-GA-------A--A-AT-T---T--A-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CA----A----CG--GCC-TT-TGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21754                      :          acaACGAC-G-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--A-AC-------AT-ATAT-T---TC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-------C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGT-AG-TAATA-A-AAA
gi|21755                      :          acaacGACAG-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21756                      :            acaGACAG-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21757                      :            acaGACAG-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CAGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21780                      :          acaACGAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------AGAA-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21781                      :           cgACGCC-G-A---C-A-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-ACA------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G----AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-TGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-TAA
gi|21782                      :     caacaacgACGCC-G-A---C-A-----A--C-G-ACA---G-AAGC-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--ATATA--GC-T-----C---CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-
gi|21785                      :           cgACAAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA-------------------G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-CGA---A--A-AAA--GC-T-----C-ACCT----T----GA--GCCATT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21786                      :              aGAC-GGA---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-A-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CTGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21787                      :       aacagacaGAC-G-------G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----TT---GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21808                      :     aacagacaACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21809                      :                 C-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-A--T-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GTC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21810                      :         acacACAAT-G-A---C-A-----A--C-G-AC----G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AA---GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21811                      :             ACAAC-A-A---C-A-----A--C-T-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGTTGAG-T--TA-A-
gi|21812                      :             ACGAC-G-C---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A---C-G--G-A--------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----G---GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21813                      :             ACGAC-G-A---C-A-----A--C-G-ACA---A-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC----CGGCTCA-GTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21814                      :             ACAAC-G-A-----G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G----AC-------A--A-AT-T---TT-T-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GAGTGCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-T--TA-A-AA
gi|21816                      :             ACAAC-G-A---C-A-----AA-C-G-ACAC--G-A--C-G-A---A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAAAAGC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21817                      :             ACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA-----A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---T----A-T---A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--G-C-TT-CGGCTCA-GTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21818                      :             ACAAC-A-A---C-G-----A--C-G-ATA---G-A--C-A-A-T-G--G-AT-------A--A-AT-T---TT-T-A-A-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCG-TT-TGGCTGAGGTGAG-C--T
gi|21819                      :                AC-A-A---C-G-----AGTC-G-ACA---G-A--C-A-A-A-G--G-AC-------A--A-AT-G---AT-A-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----A-A-CT----T----GA--GCC-TT-CTGCTCAGGTGAA-C--TA-A-AA
gi|21831                      :                  -G-A---CAG-----A--C-ATACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21832                      :                       aaa-G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCCTAAGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21842                      :            aacgAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-G-CTA---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-CT-CGGCTCAGGTGAGCC--TA-A-AAA
gi|21843                      :                AC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A--T-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GT-T-----C-A-CT----T----GA--GCA-TT-C-GCTCAGGTGAG-A--TA-A-AA
gi|21844                      :                AC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G----AC-------A--A-AT-T---T--G-A-TTC-A---G--A-AAA--GC-T-------A-CT----T----GA--GCC-TTACGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21845                      :             ATGAC-G-A---C-A-----A--A-A-ACG---G----C-A-A-T-G--G-AC-------A--C-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CA----T----GA--GCT-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21846                      :                AC-G-A-----G-----A--C-G-ACA-----A--C-G-A-C-A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-G-CT----T----AA--GCC-TT-CGGATAATGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21848                      :                AC-G-A---C-G-----A--C-G-GCA---C-A--C-A-A-------------------------T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAG--GC-------C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21851                      :                 C-G-A---C-G-----A--C-A-ACA---GCG--C-A-A-T-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-A-A---G--A-AAT--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-TAGCTCAGCTGAG-C---A-A-AAA
gi|21855                      :               GAC-G-------G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21857                      :                  -G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--C-AT-T---TT-G-A-T-C-C---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CAGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21858                      :                  -G-A---CAG-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21859                      :                  -G-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21860                      :                  -G-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21861                      :                  -G-A---CAG-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-A-A-T-A-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21862                      :               GAC-G-------G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-A-----------A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21863                      :                  -G-A---C-C-----A--C-A-ACACC-G-A--C-A-A-C-A--G-AC-------A--C-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--TC-C-----C-A-CT----A----GA--GCC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21866                      :                  -G-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21867                      :                                     -G-ACA---G-A--C-AGA-C-A--G-ACGAGGACAA--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21868                      :               GAC-G-------G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-T---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--A-C-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21906                      :                    -A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-T-G--G-AT-------A--A-GT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CCAAAGT----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21914                      :                      ---C-G-----A--A-G-AT----G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------G--A-AT-T---T--G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GTC-TT-AGGCTCAGGTAAG-C--TA-A-AAA
gi|21917                      :                          -G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21918                      :                          -G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21919                      :                          -G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21920                      :                          -G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-ATAAA
gi|21922                      :                          -G-----A--CAG-ACA---G-A--T-G-A-C-G--G-AT-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21955                      :                                     -G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21956                      :                                     -G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCATGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21957                      :                                     -G-ACA---G-A--C-A-A-C-A--T-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-TGGCTCAGGTGAG-C--TA-ATAAA
gi|21986                      :                                       -ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA-----------GCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|22004                      :                                          A---G-A--C-A-A-C-A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-A-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA


blockSeqs                     :                  A       A CGACA GT C     CAC   AC               GAGGACA                            CA                      AAAG TCAA                                T
blockSeqs                     :                  A       A GACA  A  A     AC    AG               A                                  A                       G    G                                   T
blockSeqs                     :                  A       A .     .  A     CC    A                .                                  A                       A    T                                   T
blockSeqs                     :                  A       A .     .  A     C     A                .                                  A                       .    .                                   T
blockSeqs                     :                  A       . .     .  A     .     A                .                                  .                       .    .                                   T
blockSeqs                     :                  .       . .     .  A     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  A     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  A     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  A     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  A     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  A     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  A     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  A     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  A     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                  .       . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                          . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                          . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                          . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                          . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                          . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                          . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                          . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                          . .     .  .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                                     .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                                     .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                                     .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                                     .     .     .                .                                  .                       .    .                                   .
blockSeqs                     :                                           .     .                .                                  .                       .    .                                    
blockSeqs                     :                                           .     .                .                                  .                       .    .                                    


blockSeqCons                  :             
originalCons                  :             ACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
finalCons                     :             ACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA





Alignments
lowQualScore                  :                  2 0 000 1 22222 11 5 0   222 0 22 0 0 0 0 00 0  1111111 11 0  0 000  0 0 0 0 0 000 11 0   00  0 11111 0 0  1111 1111  00   0  0             0 00  0 2   
lowQualScore                  :                  . . ... . ..... .. . .   ... . .. . . . . .. .  ....... .. .  . ...  . . . . . ... .. .   ..  . ..... . .  .... ....  ..   .  .             . ..  . .   
lowQualScore                  :                  3 5 888 7 00000 00 7 8   222 4 33 8 4 4 4 66 8  7777777 00 4  4 777  8 4 4 8 8 777 88 8   66  8 00000 8 8  6666 6666  55   4  4             8 66  4 0   
consensus                     :             ACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
Reference ( family-114 )      :             ACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21702                      :             ACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----AA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21703                      :          acaACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--C-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21704                      :          acaACAAC-A-A---C-A-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21705                      :          acgACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-T-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-TATAGAC-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21706                      :          acaACAAA-G-A---C-G-----C--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAG--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21707                      :          acaACAAA-G-A---C-G-----C--C-G-ACA---G-AA-C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAG--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21708                      :           acaCGAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21709                      :    acaacgacgcCGAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---GA-A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21711                      :   acaacgacgcACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--G-C-TT-CAGCTCAGGTGAG-C--TATA-AAA
gi|21712                      :          acaACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-A-A---G-A--C-A-A-C-A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-C-GCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21713                      :          acaACAAC-G-A---C-G-----C--C-G-ATA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-ACCT----C----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21714                      :          acgACGAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--GGAC-------A--A-TT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21715                      :          acgACAAC-A-A---C-A-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT---A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----T-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21716                      :          acgACAAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A--T-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GTG-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21718                      :          acgACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---GA-A-AAA--GC-T-----C-A-C-----T----GA--GCC-TT-CGG-TCAGGTGAG-C--TA-A-
gi|21719                      :          acaACAAC-G-A---C-G-----A--T-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--A-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----TTCAAGG--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AGA
gi|21720                      :           acgCAAC-G-A---C-A-----A--C-G-GCA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTTAGGTGAG-C--TA-ATAAA
gi|21721                      :         acacACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC----------A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--A-C-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21722                      :          acaACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-AACC-A-A-CGG--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GCTT-----C-A-CT----T----GA--A-C-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21723                      :          acaACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-AA-C-A-A-C-G--GGAC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GCTT-----C-A-CT----T----GA--A-C-TT-CGGCTCA-GTGAGCC--TA-A-AAA
gi|21724                      :          acaACGAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--CCA-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TTTG-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-AGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-TAA
gi|21726                      :          acaACAAT-G-A---C-G-----A--C-C-AAA---G-A--C-A-A-T-G--G-AG-------A--A-AT-T---AT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21727                      :          acaACGAC-A-A---C-GGACA-A--C-G-ACACACG-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AA---GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-TGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21728                      :             ACAAC-A-A---C-A-----A--C-G-AC----G-A--C-A-A-C-A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----CAA-CTG---T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21729                      :            acgGAC-A-A---C-A-----A--C-G-ACA---G-A--T-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C---CT----T----GA--GCC-TT-CAGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21730                      :  acgacaacgagACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-AC---------C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TTTG-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----C----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--AA-A-AAA
gi|21731                      :      acaacagACAAC-G-A---T-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGACTCA
gi|21732                      :          acaACAAC-A-G---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-T-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CAGCTCAAGTAAA-C--TA-ATAAA
gi|21733                      :          acgACGCC-G-C---C-A-----A--C-A-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A--T-T---TT---A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-
gi|21734                      :       acaacaACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--CCA-A-C-G----AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-AACAG--A-AAA--GA-T-----C-A-CTA---T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21735                      :           acgCGAC-G-A---C-A-----G--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--C-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC--T-CAGCTCAGTTGAG-C--TA-A-AA
gi|21736                      :      acaacacACAAT-G-A---C-G-----A--T-G-GCA---G-A--C-A-A-C-G--A-AC-------A--C-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GA-T-----A-A-CT----T----GA--GCC-TT-TGGATCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21737                      :          acaACGAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---GA-A-AAA--GC-T-----C-A-CT----TG---GA--GCC-T---GGCTCA-GTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21738                      :          acgACGAC-A-AAAAC-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-T-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA---C-T-----C-A-CT----T----G-------TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21739                      :             ACCAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---A-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-T-A-T-C-A---G--A-AAA--CC-T-----C-A-CT----C----AA--GCC-TT-CGGCTCAGGCGAG-C--TA-A-TAA
gi|21740                      :          acgATGAC-G-A---C-G-----A------ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--C-AT-T---T--G-A-TGC-A---GCAA-AAG--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21741                      :       acaaccACGAT-G-A---C-G-----A--T-G-AC----G-A--C-A-A-C-GACG-AC-------G--A-AT-G---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-TT----T----GA--GCC-TT-CGGCTAAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21742                      :          acgACGAC-A-A---C-G-----A--C-G-CCAAC-G-A--C-A-A-C-A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G----AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GC-----CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21743                      :             ACAAT-G-A---C-G-----A--T-G-AGC---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-TAATTT-GTA-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GGC-CT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-ATAAA
gi|21744                      :          acaACAAC-G-A---C-G-----C--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-A---TT-G-ACT-C-A---G--AGAAA--GC-T-----C-A-CT----------G--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-CAA
gi|21745                      :            acgGAC-G-A---C-A-----A--CCG-ACA---G-A--C-A-AAC-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-------A--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-C-GCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21746                      : acaacgacgacgACAAC-A-A---C-G-----A--T-T-ACT---G-A--C-A-A-C-G--G-GA-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----AA--GCA-TT-CGGGTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21747                      :          acaACGAC-G-A---C-GCGACAA--C-G-ACA---G-AA-C-A-A-C-G--G-AC-------A--A--T-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----CAA-AT----T----GA--G-C-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21748                      :               GACAG-A---CAG-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21749                      :            acaGAC-G-----C-G-----A--C-GGACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21752                      :        acagacaGACAG-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-ACAG---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21753                      :          acaACGAC-G-A---C-G-----G--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-GA-------A--A-AT-T---T--A-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CA----A----CG--GCC-TT-TGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21754                      :          acaACGAC-G-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--A-AC-------AT-ATAT-T---TC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-------C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGT-AG-TAATA-A-AAA
gi|21755                      :          acaacGACAG-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21756                      :            acaGACAG-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21757                      :            acaGACAG-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CAGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21780                      :          acaACGAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------AGAA-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21781                      :           cgACGCC-G-A---C-A-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-ACA------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G----AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-TGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-TAA
gi|21782                      :     caacaacgACGCC-G-A---C-A-----A--C-G-ACA---G-AAGC-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--ATATA--GC-T-----C---CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-
gi|21785                      :           cgACAAC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA-------------------G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-CGA---A--A-AAA--GC-T-----C-ACCT----T----GA--GCCATT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21786                      :              aGAC-GGA---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-A-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CTGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21787                      :       aacagacaGAC-G-------G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----TT---GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21808                      :     aacagacaACGAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21809                      :                 C-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-A--T-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GTC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21810                      :         acacACAAT-G-A---C-A-----A--C-G-AC----G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AA---GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21811                      :             ACAAC-A-A---C-A-----A--C-T-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGTTGAG-T--TA-A-
gi|21812                      :             ACGAC-G-C---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A---C-G--G-A--------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----G---GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21813                      :             ACGAC-G-A---C-A-----A--C-G-ACA---A-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC----CGGCTCA-GTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21814                      :             ACAAC-G-A-----G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G----AC-------A--A-AT-T---TT-T-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GAGTGCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-T--TA-A-AA
gi|21816                      :             ACAAC-G-A---C-A-----AA-C-G-ACAC--G-A--C-G-A---A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAAAAGC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21817                      :             ACAAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA-----A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---T----A-T---A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--G-C-TT-CGGCTCA-GTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21818                      :             ACAAC-A-A---C-G-----A--C-G-ATA---G-A--C-A-A-T-G--G-AT-------A--A-AT-T---TT-T-A-A-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCG-TT-TGGCTGAGGTGAG-C--T
gi|21819                      :                AC-A-A---C-G-----AGTC-G-ACA---G-A--C-A-A-A-G--G-AC-------A--A-AT-G---AT-A-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----A-A-CT----T----GA--GCC-TT-CTGCTCAGGTGAA-C--TA-A-AA
gi|21831                      :                  -G-A---CAG-----A--C-ATACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21832                      :                       aaa-G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCCTAAGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21842                      :            aacgAC-G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-G-CTA---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-CT-CGGCTCAGGTGAGCC--TA-A-AAA
gi|21843                      :                AC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A--T-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GT-T-----C-A-CT----T----GA--GCA-TT-C-GCTCAGGTGAG-A--TA-A-AA
gi|21844                      :                AC-A-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G----AC-------A--A-AT-T---T--G-A-TTC-A---G--A-AAA--GC-T-------A-CT----T----GA--GCC-TTACGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21845                      :             ATGAC-G-A---C-A-----A--A-A-ACG---G----C-A-A-T-G--G-AC-------A--C-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CA----T----GA--GCT-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21846                      :                AC-G-A-----G-----A--C-G-ACA-----A--C-G-A-C-A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-G-CT----T----AA--GCC-TT-CGGATAATGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21848                      :                AC-G-A---C-G-----A--C-G-GCA---C-A--C-A-A-------------------------T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAG--GC-------C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21851                      :                 C-G-A---C-G-----A--C-A-ACA---GCG--C-A-A-T-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-A-A---G--A-AAT--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-TAGCTCAGCTGAG-C---A-A-AAA
gi|21855                      :               GAC-G-------G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21857                      :                  -G-A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--C-AT-T---TT-G-A-T-C-C---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CAGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21858                      :                  -G-A---CAG-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21859                      :                  -G-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21860                      :                  -G-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21861                      :                  -G-A---CAG-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-A-A-T-A-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21862                      :               GAC-G-------G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-A-----------A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21863                      :                  -G-A---C-C-----A--C-A-ACACC-G-A--C-A-A-C-A--G-AC-------A--C-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--TC-C-----C-A-CT----A----GA--GCC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21866                      :                  -G-A---C-G----------G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-CA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21867                      :                                     -G-ACA---G-A--C-AGA-C-A--G-ACGAGGACAA--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21868                      :               GAC-G-------G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-T---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--A-C-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21906                      :                    -A---C-G-----A--C-G-ACA---G-A--C-A-A-T-G--G-AT-------A--A-GT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CCAAAGT----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AA
gi|21914                      :                      ---C-G-----A--A-G-AT----G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------G--A-AT-T---T--G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GTC-TT-AGGCTCAGGTAAG-C--TA-A-AAA
gi|21917                      :                          -G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21918                      :                          -G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21919                      :                          -G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21920                      :                          -G-----A--CAG-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-ATAAA
gi|21922                      :                          -G-----A--CAG-ACA---G-A--T-G-A-C-G--G-AT-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGTTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21955                      :                                     -G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21956                      :                                     -G-ACA---G-A--C-G-A-C-G--G-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-ATA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-CGGCTCATGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|21957                      :                                     -G-ACA---G-A--C-A-A-C-A--T-AC-------A--A-AA-G---GC-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--GCC-TT-TGGCTCAGGTGAG-C--TA-ATAAA
gi|21986                      :                                       -ACA---G-A--C-A-A-C-G--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-C-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA-----------GCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA
gi|22004                      :                                          A---G-A--C-A-A-C-A--G-AC-------A--A-AT-T---TT-G-A-T-A-A---G--A-AAA--GC-T-----C-A-CT----T----GA--ACC-TT-CGGCTCAGGTGAG-C--TA-A-AAA