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Reference ( gi|40927 )        : TGGTGTCC-C--TT-AT--TTC-TA-GTTCG-CT---GGG-ATA------T-------------------AT-T-GAATCGACA--TAT---G-AAT-G-AA-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA-ATG---TCGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
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gi|40979                      : TGGTGTCC-T--TT-AT--TTC-TA-GTTCG-TT---GGA-TTA------TGTTGGCTTCGCCTTTTTGTAT-T-GAATCGACA--TAT---G-AAT-G-GA-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA-ACG---TTGT-CA----A---CATA-TC-GAAATGTCG
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gi|40974                      : TGGTGTCC-T--TT-AT--TTC-TA-GTTCT-TT---GGG-ATA------T-------------------AT-T-GAATCGACA--TAT---G-AAT-G-GA-A-----A-T------A----AT--T-A------TC----AT------T----G-A-TA-----TA-T--AAA-ACG---TC--------------ATA-TC-GAAATGTCG
gi|40996                      : TGGTGTCT-T--TT-AT--TTC-TA-GTTCA-CT---GGG-ATA------T-------------------AT-T-GAATCGATA--TATTATG-AAT-G-AA-A-----T-T------G----AT--T-A------TC----GT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA-ACG---TCAT-CG----G---TATA-TC-GAAATGTCG
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gi|40994                      : TGGTGTCC-T--TT-AT--TTC-TA-GTTCG-TT---GGGGATA------T-------------------AT-T-GATGTGACA--TAT---G-AAT-G-GA-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----GAA-TT-----GATT--AAA-ACA---TCAT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattaaaag
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gi|40988                      : TGGTTTCC-C--TTTAT--TTC-TA-GTTCGGTT---GGG-ATA------T-------------------AT-T-GAATCGACA--TAT---G-AAT-G-GA-A-----A-T------C----AT--T-G------TT-----T------T----G-A-TA-----GA-T--AAA-ACA---TC-T-CA----A---TATATTC-GAAATG
gi|40987                      : TGGTTTCC-C--TTTAT--TTC-TA-GTTCGGTT---GGG-ATA------T-------------------AT-T-GAATCGACA--TAT---G-AAT-G-GA-A-----A-T------C----AT--T-G------TT-----T------T----G-A-TA-----GA-T--AAA-ACA---TC-T-CA----A---TATATTC-GAAATG
gi|41004                      : TGGTGTCT-T--AT-AT--GTT-TA-GTTCA-CT---GGA-ATA------T-------------------AT-C-GAATCGACA--TTT---G-AAT-G-AA-A-----A-T------A----AT--T-A------TT----AT------C----A-A-TG-----GA-T--AAA-ACG---CCAT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40961                      : TGGTGTCC-T--TT-AT--TTC-TA-GTTCG-CT---GGG-ATA------T-------------------AC-T-GAATAGACA--TTT---G-AAT-G-AA-A-----A-T------A----AT--T-A------TC----AT------T----A-A-TA-----AA-T--AAA-AT------GT-CA----A---TATA-TC-AAAaatcaaaaggc
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gi|40914                      : TGGTTTCC-T--AT-AT--TTC-TA-GTTCG-TT---GGG-ATA------T-------------------TC-T-GAATCGACA--TAT---G-AAT-G-GA-A-----A-TTATTACC----AT--T-A------CC----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA-ACG---TTTT-CA----A---TATA-TC-GAAATGCCGttcgagatgaaaaggcga
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gi|41002                      : TGGCGTCT-T--TT-CT--TTC-TAAGTTTA-CT---GGG-ATA------T-------------------AT-C-GAATCAACA--TAT---G-AAT-G-AA-A-----G-T------T----AT--T-A------TT----ATCA----T----C-ATTA-----GA-T--AAA-ACG---TTGT-CG----A---TATA-TC-GAAATGCC
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gi|41143                      :   GTGTCC-T--TT-AT--TTC-TA-GTTCG-TT---GGG-ATA------T-------------------AT-T-GAATCGACA--TAT---G-AAT-G-GA-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T---AA-ACA---TCGT-CA----A---TATA-TC-GAAAAGTCGaaattaaaaggc
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gi|41169                      :      TCC-T--TT-AC--TTC-TA-GTTCG-TT---GGG-ATG------T-------------------AT-T-GAGTCGACA--TAT---G-AAT-G-AA-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------C----A-A-TA-----GA-TA-AAA-ACG---TCGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTC
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Alignments
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Reference ( family-113 )      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
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gi|40926                      :   TGGTGTC-----TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-CGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------T----AT--C-A------TC----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CAT-CG----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40927                      :   TGGTGTCC-C--TTAT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ATGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40928                      :   TGATGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------TA------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AAT--G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40929                      :   TGGT-TCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTTG-T-T---GGG-ATA------T-------------------C-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-G------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATG
gi|40930                      :   TGGT-TCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTTG-T-T---GGG-ATA------T-------------------C-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-G------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATG
gi|40931                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCAACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----A-A-AA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TACA-TC-GAAATGTCG
gi|40932                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T--------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATATCG
gi|40933                      :   TGGTGTTC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-GTA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-C------C----AT--T-A------TT----AT------C----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACTT-AGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40934                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-A-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---AGGT-CGT-CA----T---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40935                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TT-GAA
gi|40936                      :   TGGTGTCC-C--CCAT--T-C-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGGATCGACA--CAT---G-AATG-G-A-T-----A-T------C----AT--T-A------TC----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CAT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40937                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TTC-TA-GTTCA-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-CGAATCGAGA--TAT---T-AATG-A-ACATTATCA-T------T----AT--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40938                      :   TGATGTCC-T--TTAT--TTCATA-GTTCA-T-T---GGG-ATA------T-------------------C-T-TGAATCGAAA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----AA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40939                      :   TGATGTCC-T--TTAT--TTA-TA-GTTCA-T-T---GGG-ATA------T-------------------C-T-TGAATCGAAA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----AA-TA-AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40940                      :   TGGTGTCC-G--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-G-TGAATCGACA--TAT---A-ATTG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TC----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTC
gi|40941                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------A----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-AAAATGTTG
gi|40943                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TGT---A-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----AA-T--AAA---CCGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAaatgaaa
gi|40944                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAG---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----CT--T-G------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGtattgaccgctagagat
gi|40945                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-CA-GTCCG-T-T---TGG-ATA------T-------------------A-T-CGAATTGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40948                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--T--------ATG-G-A-A-----A-T------C----AG--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-AGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattaaaag
gi|40949                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--T--------ATG-G-A-A-----A-T------C----AG--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-AGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40950                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--T--------ATG-G-A-A-----A-T------C----AG--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-AGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40951                      :   TGGTGTCC-T--TTGT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TAAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---AGAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATG
gi|40953                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ACA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TC----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---G-GT-CGC-CA----G---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40954                      :   TGGCTTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGTCA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TC----AT------T----G-A-TA-----TA-T--TAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAA
gi|40955                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---CGG-TTA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GG-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-AAAATTTCG
gi|40956                      :   TGGTGTCC-T--TTCT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GGG-ACA------T-------------------A-C-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------T----AT--T-A------TT----AT------C----A-C-TA-----GA-T--AAT---ACGT-CGT-CA----G---TATA-TC-GAAATGTaagtattaaggc
gi|40957                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TC----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---AGGG-TGT-CA----AT--TATA-TT--AAATGTCGagatttaaaggc
gi|40958                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCA-T-T---GGG-ATA------T---------------------T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-A--TAA---ACAT-CAT-CA----A---TA-A-TC-GAAATGTCG
gi|40960                      :   TGGTGTCC-TGTTTAT--TTC-TG-TTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGTCCAC---A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40961                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-C-TGAATAGACA--TTT---G-AATG-A-A-A-----A-T------A----AT--T-A------TC----AT------T----A-A-TA-----AA-T--AAA---A----TGT-CA----A---TATA-TC-AAA
gi|40962                      :   TGGTGTAC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-AGAATTGACA--TAT---G-CATG-G-A-A-----A-G------C----AT--T-A------TC----AT------T----G-G-TA-----GA-T--AAA---ACGT-TGT-CT----A---TATA-TC-GAAATGTCGggccaccgctagagatg
gi|40963                      :   TGGTATCC-T--TCAT--TTC-TA-GTTCG-T-TAATGGG-ATA------T-------------------C-T-TGAATCGACA--TAT---G-AAGG-A-A-A-----A-T------C----AA--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---TCGT-CGT-CA----A---TGTA-TC-GAAATG
gi|40964                      :   TGGTATCC-T--TTAT--TCA-TA-GTTCG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATTGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ATGT-CGT-CA----A---TATA-TC-AAAATGTCGctgaattcaa
gi|40965                      :   TGGTGTTC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GTG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAC---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------G----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACTT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40966                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-CGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AG--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----AA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAA
gi|40967                      :   TGGTGTCC-T--TCCT--TTC-TA-ATTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGTGTCGACA--TTT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TC----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAAAGTCG
gi|40970                      :   TGGTGTCT-T--TCAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TTAATCGATA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------AT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAC---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattaaaggcga
gi|40971                      :   TGGTGTCC-TC-TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T--GAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------T-----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---CATA-TC-GAAATG
gi|40972                      :   TGGTGTC--T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGA-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----ATATTATA-TC-GAAATGgtgaaattaaaggc
gi|40973                      :   TGGTGTCC-T--TTAT----C-TA-GTTCG-T-T---GGA-ATA------TTAT----------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-C--AAA---ACGT-C-T-CA----A---TATA-TC-AAAA-GTCG
gi|40974                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCT-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------A----AT--T-A------TC----AT------T----G-A-TA-----TA-T--AAA---ACGT-C--------------ATA-TC-GAAATGTCGt
gi|40975                      :   TGGTGTCC-T--TTAG--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-GTA------T-------------------A-T-TGAATTGACA--TAT---G-AATG-G---A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------C----G-A-TA-----GA-TAAAAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40976                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACAT-TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----T-A-TATTATTGA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAA
gi|40977                      :   TGGTGCCC-T--TTGT--CTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TACC-TC-GAAAT
gi|40978                      :   TGGTGTC-----TTAT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GAG-ATA------T-------------------G-T-TGAATTGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TC----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----T---TATA-TC-GAATTG
gi|40979                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGA-TTA------TGTTGGCTTCGCCTTTTTGTA-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-TGT-CA----A---CATA-TC-GAAATGTCG
gi|40980                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-CGAATCAACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-C------T----A---T-A------TT----AT------T----A-A-TC-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----G---TATA-TC-GAAATGTCGaattaaatggc
gi|40981                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---T-AAT--G-A-A-----A-T------C----AT--T-ATTTAATTT----AT------T----G-A-TA-----GA-TA-AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA----GAAATGTCG
gi|40982                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TTC-TA-GTTTA-C-T---GGG-AAA------T-------------------A-T-TGAGTCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------CATTAAT--T-A------TT----AT------T----A-G-TA-----GATT--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TGTA-TT-GAAATGTCGagttaaaggc
gi|40983                      :   TGGTGTCC-T--TTAA--TTT-TA-GTTCG-T-TTT-GGG-ATA------T-------------------A-T-TGATTCGACA--TAT---G-AATC-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGC-AA----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattgaaaggc
gi|40984                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATAA-----T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----A-------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-C-----A---TATATTC-GAAATGTCaaataaaggc
gi|40985                      :   TGGTGCTT-C--CCAT--TTC-TG-TTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACAGCTAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-G------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---AT-T-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAAT
gi|40987                      :   TGGTTTCCCT--TTAT--TTC-TA-GTTCGGT-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-G------TT-----T------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-C-T-CA----A---TATATTC-GAAATGtgttcgatataaaggc
gi|40988                      :   TGGTTTCCCT--TTAT--TTC-TA-GTTCGGT-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-G------TT-----T------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-C-T-CA----A---TATATTC-GAAATG
gi|40989                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-TAT---G---ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-GAA-A-----A-T------T----AT--T-A------TT-----T------T----G-A-TT-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----G---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40990                      :   TGGTGCCC-T--TTAT--TTT-TA-ATTTA-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGAC----AT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TTTATCAT------T----G-A-TA-----TA-T--AAA---ACGT-CTT-CA----A---TATA-TG-GAAATG
gi|40991                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTT-TA-GTTTG-C-T---AGG-ATT------T-------------------A-T-TGAATCAACA--TAT---G-AATGAA-A-A-----A-T------T----AC--C-A------TT----AT------T----G-T-TA-----AA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAAGGTCG
gi|40992                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-CGAATCGACA--TAA---G-AATG-A-A-A-----A-T------T----AT--A-G------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-TG----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattaaaag
gi|40994                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGGGATA------T-------------------A-T-TGATGTGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----GAA-TT-----GATT--AAA---ACAT-CAT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattagag
gi|40995                      :   TGGTGTCT-T--TCAT--TTC-TA-GTTTC-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAC---G-AATT-A-T-A-----A-T------C----AT--G-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattaaagggc
gi|40996                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TTC-TA-GTTCA-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGATA--TATTATG-AATG-A-A-A-----T-T------G----AT--T-A------TC----GT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CAT-CG----G---TATA-TC-GAAATGTCGaaaccgctagagat
gi|40997                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TAC-TA-GTTTG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATTGACA--CAT---G-GATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------C----A-A-TA-----AA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTC
gi|41000                      :   TGGTGCCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----A-G-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CAT-CA----G---TAGA-
gi|41001                      :   TGGTGCCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GAG-ATA------T-------------------A-T-CGAATCGACA--TAT---G-AAT--G-A-A-----A-T------T----AT--T-A------T----------------------TA-----GA-T--AAA---ACGT-CTT-CG----A---TATC-TC-GAAATGTCG
gi|41002                      :   TGGCGTCT-T--TTCT--TTC-TAAGTTTA-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-CGAATCAACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----G-T------T----AT--T-A------TT----ATCA----T----C-ATTA-----GA-T--AAA---ACGT-TGT-CG----A---TATA-TC-GAAATGCC
gi|41003                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TTC-TA-GTTTG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCAACA--TAT---G-AATA-A-A-A-----A-G------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----G---TATA-TA-GAAATATCG
gi|41004                      :   TGGTGTCT-T--ATAT--GTT-TA-GTTCA-C-T---GGA-ATA------T-------------------A-T-CGAATCGACA--TTT---G-AATG-A-A-A-----A-T------A----AT--T-A------TT----AT------C----A-A-TG-----GA-T--AAA---ACGC-CAT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|41005                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--CTC-TA-GTTCG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T------CGACA--TAT---G-AAAG-A-A-A-----A-T------T----AC--T-A------TT----AT------C----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAAAGTCGaatcaaaaggc
gi|41006                      :   TGATGTCT-T--TTAT--TTT-TA-GTTTG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AGGG-A-A-A-----A-T------A----AT--G-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-AAAATGTCG
gi|41127                      :    GGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-G------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATG
gi|41132                      :    GGTGTCCCT--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A---TGAATCGACA--TAT---GAAATG-G-A-A-----ATT------C----AT--T-G------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAATATACATCCGT-CA----A---TATA-TCAAAAATGTTG
gi|41141                      :     GTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TAT--TC-GAAATGTCGaatgtaaaggc
gi|41142                      :      TGTCC-T--TTAT--TTC-TA-CTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-G--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCGaaattaaaaggc
gi|41143                      :   gtGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T---AA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAAAGTCG
gi|41145                      :      TGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCTACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TC-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATG
gi|41146                      :       gtCC-T--TTTT--TTC-TA-AGTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATTGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CG----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|41147                      : gctcGTGTCC-T--G-AT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------ATT-TGAATCGGCA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A-------T----AT------T----G-A-AA-----GATT--AAA---ACGT-CGT-CA----AG--TATA-TC-GAAATGACGaaatattaaaggc
gi|41161                      :        TTC-T--TTAT--TTC-TT-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-CAAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------T----AT--T-A------TT----AT------TTCAAA-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----T---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|41168                      :        TCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGA-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----GC------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATG
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gi|41171                      :        TCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATAG-----T-------------------A-TGTGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------------AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TA-A-TT-GAAATGTCG
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Alignments
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lowQualScore                  :           . ..    ..   .  .     . . ...   .   ...... ................... . .          ..   ... .    . . . ..... . ...... ....  .. . ......  ....  ...... .... . .  .....  . ..   ...    .   .  .... ...    .  .         
lowQualScore                  :           3 00    66   4  4     8 4 333   4   000000 2222222222222222222 4 4          99   777 4    4 4 4 00000 4 444444 8888  55 4 111111  8888  777777 8888 8 4  00000  2 88   777    4   4  2222 555    2  4         
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Reference ( family-113 )      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
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gi|40937                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TTC-TA-GTTCA-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-CGAATCGAGA--TAT---T-AATG-A-ACATTATCA-T------T----AT--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40938                      :   TGATGTCC-T--TTAT--TTCATA-GTTCA-T-T---GGG-ATA------T-------------------C-T-TGAATCGAAA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----AA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40939                      :   TGATGTCC-T--TTAT--TTA-TA-GTTCA-T-T---GGG-ATA------T-------------------C-T-TGAATCGAAA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----AA-TA-AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40940                      :   TGGTGTCC-G--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-G-TGAATCGACA--TAT---A-ATTG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TC----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTC
gi|40941                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------A----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-AAAATGTTG
gi|40943                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TGT---A-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----AA-T--AAA---CCGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAaatgaaa
gi|40944                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAG---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----CT--T-G------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGtattgaccgctagagat
gi|40945                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-CA-GTCCG-T-T---TGG-ATA------T-------------------A-T-CGAATTGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40948                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--T--------ATG-G-A-A-----A-T------C----AG--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-AGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattaaaag
gi|40949                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--T--------ATG-G-A-A-----A-T------C----AG--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-AGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40950                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--T--------ATG-G-A-A-----A-T------C----AG--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-AGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40951                      :   TGGTGTCC-T--TTGT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TAAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---AGAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATG
gi|40953                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ACA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TC----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---G-GT-CGC-CA----G---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40954                      :   TGGCTTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGTCA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TC----AT------T----G-A-TA-----TA-T--TAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAA
gi|40955                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---CGG-TTA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GG-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-AAAATTTCG
gi|40956                      :   TGGTGTCC-T--TTCT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GGG-ACA------T-------------------A-C-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------T----AT--T-A------TT----AT------C----A-C-TA-----GA-T--AAT---ACGT-CGT-CA----G---TATA-TC-GAAATGTaagtattaaggc
gi|40957                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TC----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---AGGG-TGT-CA----AT--TATA-TT--AAATGTCGagatttaaaggc
gi|40958                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCA-T-T---GGG-ATA------T---------------------T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-A--TAA---ACAT-CAT-CA----A---TA-A-TC-GAAATGTCG
gi|40960                      :   TGGTGTCC-TGTTTAT--TTC-TG-TTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGTCCAC---A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40961                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-C-TGAATAGACA--TTT---G-AATG-A-A-A-----A-T------A----AT--T-A------TC----AT------T----A-A-TA-----AA-T--AAA---A----TGT-CA----A---TATA-TC-AAA
gi|40962                      :   TGGTGTAC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-AGAATTGACA--TAT---G-CATG-G-A-A-----A-G------C----AT--T-A------TC----AT------T----G-G-TA-----GA-T--AAA---ACGT-TGT-CT----A---TATA-TC-GAAATGTCGggccaccgctagagatg
gi|40963                      :   TGGTATCC-T--TCAT--TTC-TA-GTTCG-T-TAATGGG-ATA------T-------------------C-T-TGAATCGACA--TAT---G-AAGG-A-A-A-----A-T------C----AA--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---TCGT-CGT-CA----A---TGTA-TC-GAAATG
gi|40964                      :   TGGTATCC-T--TTAT--TCA-TA-GTTCG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATTGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ATGT-CGT-CA----A---TATA-TC-AAAATGTCGctgaattcaa
gi|40965                      :   TGGTGTTC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GTG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAC---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------G----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACTT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40966                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-CGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AG--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----AA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAA
gi|40967                      :   TGGTGTCC-T--TCCT--TTC-TA-ATTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGTGTCGACA--TTT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TC----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAAAGTCG
gi|40970                      :   TGGTGTCT-T--TCAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TTAATCGATA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------AT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAC---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattaaaggcga
gi|40971                      :   TGGTGTCC-TC-TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T--GAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------T-----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---CATA-TC-GAAATG
gi|40972                      :   TGGTGTC--T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGA-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----ATATTATA-TC-GAAATGgtgaaattaaaggc
gi|40973                      :   TGGTGTCC-T--TTAT----C-TA-GTTCG-T-T---GGA-ATA------TTAT----------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-C--AAA---ACGT-C-T-CA----A---TATA-TC-AAAA-GTCG
gi|40974                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCT-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------A----AT--T-A------TC----AT------T----G-A-TA-----TA-T--AAA---ACGT-C--------------ATA-TC-GAAATGTCGt
gi|40975                      :   TGGTGTCC-T--TTAG--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-GTA------T-------------------A-T-TGAATTGACA--TAT---G-AATG-G---A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------C----G-A-TA-----GA-TAAAAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40976                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACAT-TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----T-A-TATTATTGA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAA
gi|40977                      :   TGGTGCCC-T--TTGT--CTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TACC-TC-GAAAT
gi|40978                      :   TGGTGTC-----TTAT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GAG-ATA------T-------------------G-T-TGAATTGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TC----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----T---TATA-TC-GAATTG
gi|40979                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGA-TTA------TGTTGGCTTCGCCTTTTTGTA-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-TGT-CA----A---CATA-TC-GAAATGTCG
gi|40980                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-CGAATCAACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-C------T----A---T-A------TT----AT------T----A-A-TC-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----G---TATA-TC-GAAATGTCGaattaaatggc
gi|40981                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---T-AAT--G-A-A-----A-T------C----AT--T-ATTTAATTT----AT------T----G-A-TA-----GA-TA-AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA----GAAATGTCG
gi|40982                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TTC-TA-GTTTA-C-T---GGG-AAA------T-------------------A-T-TGAGTCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------CATTAAT--T-A------TT----AT------T----A-G-TA-----GATT--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TGTA-TT-GAAATGTCGagttaaaggc
gi|40983                      :   TGGTGTCC-T--TTAA--TTT-TA-GTTCG-T-TTT-GGG-ATA------T-------------------A-T-TGATTCGACA--TAT---G-AATC-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGC-AA----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattgaaaggc
gi|40984                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATAA-----T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----A-------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-C-----A---TATATTC-GAAATGTCaaataaaggc
gi|40985                      :   TGGTGCTT-C--CCAT--TTC-TG-TTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACAGCTAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-G------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---AT-T-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAAT
gi|40987                      :   TGGTTTCCCT--TTAT--TTC-TA-GTTCGGT-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-G------TT-----T------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-C-T-CA----A---TATATTC-GAAATGtgttcgatataaaggc
gi|40988                      :   TGGTTTCCCT--TTAT--TTC-TA-GTTCGGT-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-G------TT-----T------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-C-T-CA----A---TATATTC-GAAATG
gi|40989                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-TAT---G---ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-GAA-A-----A-T------T----AT--T-A------TT-----T------T----G-A-TT-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----G---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40990                      :   TGGTGCCC-T--TTAT--TTT-TA-ATTTA-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGAC----AT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TTTATCAT------T----G-A-TA-----TA-T--AAA---ACGT-CTT-CA----A---TATA-TG-GAAATG
gi|40991                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTT-TA-GTTTG-C-T---AGG-ATT------T-------------------A-T-TGAATCAACA--TAT---G-AATGAA-A-A-----A-T------T----AC--C-A------TT----AT------T----G-T-TA-----AA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAAGGTCG
gi|40992                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-CGAATCGACA--TAA---G-AATG-A-A-A-----A-T------T----AT--A-G------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-TG----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattaaaag
gi|40994                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGGGATA------T-------------------A-T-TGATGTGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----GAA-TT-----GATT--AAA---ACAT-CAT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattagag
gi|40995                      :   TGGTGTCT-T--TCAT--TTC-TA-GTTTC-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAC---G-AATT-A-T-A-----A-T------C----AT--G-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattaaagggc
gi|40996                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TTC-TA-GTTCA-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGATA--TATTATG-AATG-A-A-A-----T-T------G----AT--T-A------TC----GT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CAT-CG----G---TATA-TC-GAAATGTCGaaaccgctagagat
gi|40997                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TAC-TA-GTTTG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATTGACA--CAT---G-GATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------C----A-A-TA-----AA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTC
gi|41000                      :   TGGTGCCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----A-G-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CAT-CA----G---TAGA-
gi|41001                      :   TGGTGCCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GAG-ATA------T-------------------A-T-CGAATCGACA--TAT---G-AAT--G-A-A-----A-T------T----AT--T-A------T----------------------TA-----GA-T--AAA---ACGT-CTT-CG----A---TATC-TC-GAAATGTCG
gi|41002                      :   TGGCGTCT-T--TTCT--TTC-TAAGTTTA-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-CGAATCAACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----G-T------T----AT--T-A------TT----ATCA----T----C-ATTA-----GA-T--AAA---ACGT-TGT-CG----A---TATA-TC-GAAATGCC
gi|41003                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TTC-TA-GTTTG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCAACA--TAT---G-AATA-A-A-A-----A-G------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----G---TATA-TA-GAAATATCG
gi|41004                      :   TGGTGTCT-T--ATAT--GTT-TA-GTTCA-C-T---GGA-ATA------T-------------------A-T-CGAATCGACA--TTT---G-AATG-A-A-A-----A-T------A----AT--T-A------TT----AT------C----A-A-TG-----GA-T--AAA---ACGC-CAT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|41005                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--CTC-TA-GTTCG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T------CGACA--TAT---G-AAAG-A-A-A-----A-T------T----AC--T-A------TT----AT------C----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAAAGTCGaatcaaaaggc
gi|41006                      :   TGATGTCT-T--TTAT--TTT-TA-GTTTG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AGGG-A-A-A-----A-T------A----AT--G-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-AAAATGTCG
gi|41127                      :    GGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-G------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATG
gi|41132                      :    GGTGTCCCT--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A---TGAATCGACA--TAT---GAAATG-G-A-A-----ATT------C----AT--T-G------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAATATACATCCGT-CA----A---TATA-TCAAAAATGTTG
gi|41141                      :     GTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TAT--TC-GAAATGTCGaatgtaaaggc
gi|41142                      :      TGTCC-T--TTAT--TTC-TA-CTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-G--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCGaaattaaaaggc
gi|41143                      :   gtGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T---AA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAAAGTCG
gi|41145                      :      TGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCTACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TC-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATG
gi|41146                      :       gtCC-T--TTTT--TTC-TA-AGTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATTGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CG----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|41147                      : gctcGTGTCC-T--G-AT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------ATT-TGAATCGGCA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A-------T----AT------T----G-A-AA-----GATT--AAA---ACGT-CGT-CA----AG--TATA-TC-GAAATGACGaaatattaaaggc
gi|41161                      :        TTC-T--TTAT--TTC-TT-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-CAAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------T----AT--T-A------TT----AT------TTCAAA-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----T---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|41168                      :        TCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGA-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----GC------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATG
gi|41169                      :        TCC-T--TTAC--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATG------T-------------------A-T-TGAGTCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------C----A-A-TA-----GA-TA-AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTC
gi|41170                      :        TCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GAG-GTA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AG--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ATGT-CAT-CA----A---TATA-TC-GAAACGTCG
gi|41171                      :        TCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATAG-----T-------------------A-TGTGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------------AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TA-A-TT-GAAATGTCG
gi|41189                      :                TAT--TTC-TA-GTTTG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-C-TGAATCAACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CAATATA---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|41192                      :                TAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GAG-ATA------T-------------------A-A-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------G----ATGATAA------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--ACA---ACAT-TAT-CG----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattaaaag
gi|41193                      :                TAC--TTC-CA-GTTTG-T-T---GAG-ATA------T-------------------A-T-CGAATCAACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------T----AT--C-A------TT----ATATGTAGT----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-TGT-CG----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattaaaag
gi|41194                      :                TAT--TTC-TA-GCTCG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-AGCATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------T----AT--T-A------TC----AT------T----T-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-TA----A---TATA-TC-GAAATGTC
gi|41212                      :                  T--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATACTAGTAT-------------------A-T-TGAATCGACA--CAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ATGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|41220                      :                   --TTC-TA-GTTGG-T-T---GGG-ATA------C-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TT-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|41226                      :                           -GTTTG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----GAA-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CCT-CA----A---TATA-TC-AAAATGTCG
gi|41230                      :                               CG-C-T---GAG-ATA------T-------------------T-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A--------C----AT--T-A------TG----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG


blockSeqs                     :           C GT                      AAT       CTAGTA GTTGGCTTCGCCTTTTTGT                                          TATTAC            TTTAAT        ATGTAG                  T AA                 ATAT TAT    T
blockSeqs                     :           C C                       TT        A      TAT                                                          TATTAC            .             CA                      T A                  C    T      T
blockSeqs                     :           C .                       .         G      A                                                            .                 .             .                       T A                  .    G      T
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . A                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :           . .                       .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :                                     .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :                                     .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
blockSeqs                     :                                     .         .      .                                                            .                 .             .                       . .                  .    .      .
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gi|40960                      :   TGGTGTCC-TGTTTAT--TTC-TG-TTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGTCCAC---A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40961                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-C-TGAATAGACA--TTT---G-AATG-A-A-A-----A-T------A----AT--T-A------TC----AT------T----A-A-TA-----AA-T--AAA---A----TGT-CA----A---TATA-TC-AAA
gi|40962                      :   TGGTGTAC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-AGAATTGACA--TAT---G-CATG-G-A-A-----A-G------C----AT--T-A------TC----AT------T----G-G-TA-----GA-T--AAA---ACGT-TGT-CT----A---TATA-TC-GAAATGTCGggccaccgctagagatg
gi|40963                      :   TGGTATCC-T--TCAT--TTC-TA-GTTCG-T-TAATGGG-ATA------T-------------------C-T-TGAATCGACA--TAT---G-AAGG-A-A-A-----A-T------C----AA--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---TCGT-CGT-CA----A---TGTA-TC-GAAATG
gi|40964                      :   TGGTATCC-T--TTAT--TCA-TA-GTTCG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATTGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ATGT-CGT-CA----A---TATA-TC-AAAATGTCGctgaattcaa
gi|40965                      :   TGGTGTTC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GTG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAC---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------G----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACTT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40966                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-CGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AG--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----AA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAA
gi|40967                      :   TGGTGTCC-T--TCCT--TTC-TA-ATTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGTGTCGACA--TTT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TC----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAAAGTCG
gi|40970                      :   TGGTGTCT-T--TCAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TTAATCGATA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------AT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAC---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattaaaggcga
gi|40971                      :   TGGTGTCC-TC-TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T--GAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------T-----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---CATA-TC-GAAATG
gi|40972                      :   TGGTGTC--T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGA-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----ATATTATA-TC-GAAATGgtgaaattaaaggc
gi|40973                      :   TGGTGTCC-T--TTAT----C-TA-GTTCG-T-T---GGA-ATA------TTAT----------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-C--AAA---ACGT-C-T-CA----A---TATA-TC-AAAA-GTCG
gi|40974                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCT-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------A----AT--T-A------TC----AT------T----G-A-TA-----TA-T--AAA---ACGT-C--------------ATA-TC-GAAATGTCGt
gi|40975                      :   TGGTGTCC-T--TTAG--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-GTA------T-------------------A-T-TGAATTGACA--TAT---G-AATG-G---A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------C----G-A-TA-----GA-TAAAAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40976                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACAT-TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----T-A-TATTATTGA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAA
gi|40977                      :   TGGTGCCC-T--TTGT--CTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TACC-TC-GAAAT
gi|40978                      :   TGGTGTC-----TTAT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GAG-ATA------T-------------------G-T-TGAATTGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TC----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----T---TATA-TC-GAATTG
gi|40979                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGA-TTA------TGTTGGCTTCGCCTTTTTGTA-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-TGT-CA----A---CATA-TC-GAAATGTCG
gi|40980                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-CGAATCAACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-C------T----A---T-A------TT----AT------T----A-A-TC-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----G---TATA-TC-GAAATGTCGaattaaatggc
gi|40981                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---T-AAT--G-A-A-----A-T------C----AT--T-ATTTAATTT----AT------T----G-A-TA-----GA-TA-AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA----GAAATGTCG
gi|40982                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TTC-TA-GTTTA-C-T---GGG-AAA------T-------------------A-T-TGAGTCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------CATTAAT--T-A------TT----AT------T----A-G-TA-----GATT--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TGTA-TT-GAAATGTCGagttaaaggc
gi|40983                      :   TGGTGTCC-T--TTAA--TTT-TA-GTTCG-T-TTT-GGG-ATA------T-------------------A-T-TGATTCGACA--TAT---G-AATC-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGC-AA----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattgaaaggc
gi|40984                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATAA-----T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----A-------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-C-----A---TATATTC-GAAATGTCaaataaaggc
gi|40985                      :   TGGTGCTT-C--CCAT--TTC-TG-TTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACAGCTAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-G------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---AT-T-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAAT
gi|40987                      :   TGGTTTCCCT--TTAT--TTC-TA-GTTCGGT-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-G------TT-----T------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-C-T-CA----A---TATATTC-GAAATGtgttcgatataaaggc
gi|40988                      :   TGGTTTCCCT--TTAT--TTC-TA-GTTCGGT-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-G------TT-----T------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-C-T-CA----A---TATATTC-GAAATG
gi|40989                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-TAT---G---ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-GAA-A-----A-T------T----AT--T-A------TT-----T------T----G-A-TT-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----G---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|40990                      :   TGGTGCCC-T--TTAT--TTT-TA-ATTTA-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGAC----AT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TTTATCAT------T----G-A-TA-----TA-T--AAA---ACGT-CTT-CA----A---TATA-TG-GAAATG
gi|40991                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTT-TA-GTTTG-C-T---AGG-ATT------T-------------------A-T-TGAATCAACA--TAT---G-AATGAA-A-A-----A-T------T----AC--C-A------TT----AT------T----G-T-TA-----AA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAAGGTCG
gi|40992                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-CGAATCGACA--TAA---G-AATG-A-A-A-----A-T------T----AT--A-G------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-TG----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattaaaag
gi|40994                      :   TGGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGGGATA------T-------------------A-T-TGATGTGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----GAA-TT-----GATT--AAA---ACAT-CAT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattagag
gi|40995                      :   TGGTGTCT-T--TCAT--TTC-TA-GTTTC-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAC---G-AATT-A-T-A-----A-T------C----AT--G-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattaaagggc
gi|40996                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TTC-TA-GTTCA-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGATA--TATTATG-AATG-A-A-A-----T-T------G----AT--T-A------TC----GT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CAT-CG----G---TATA-TC-GAAATGTCGaaaccgctagagat
gi|40997                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TAC-TA-GTTTG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATTGACA--CAT---G-GATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------C----A-A-TA-----AA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTC
gi|41000                      :   TGGTGCCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----A-G-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CAT-CA----G---TAGA-
gi|41001                      :   TGGTGCCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GAG-ATA------T-------------------A-T-CGAATCGACA--TAT---G-AAT--G-A-A-----A-T------T----AT--T-A------T----------------------TA-----GA-T--AAA---ACGT-CTT-CG----A---TATC-TC-GAAATGTCG
gi|41002                      :   TGGCGTCT-T--TTCT--TTC-TAAGTTTA-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-CGAATCAACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----G-T------T----AT--T-A------TT----ATCA----T----C-ATTA-----GA-T--AAA---ACGT-TGT-CG----A---TATA-TC-GAAATGCC
gi|41003                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--TTC-TA-GTTTG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCAACA--TAT---G-AATA-A-A-A-----A-G------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----G---TATA-TA-GAAATATCG
gi|41004                      :   TGGTGTCT-T--ATAT--GTT-TA-GTTCA-C-T---GGA-ATA------T-------------------A-T-CGAATCGACA--TTT---G-AATG-A-A-A-----A-T------A----AT--T-A------TT----AT------C----A-A-TG-----GA-T--AAA---ACGC-CAT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|41005                      :   TGGTGTCT-T--TTAT--CTC-TA-GTTCG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T------CGACA--TAT---G-AAAG-A-A-A-----A-T------T----AC--T-A------TT----AT------C----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAAAGTCGaatcaaaaggc
gi|41006                      :   TGATGTCT-T--TTAT--TTT-TA-GTTTG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AGGG-A-A-A-----A-T------A----AT--G-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-AAAATGTCG
gi|41127                      :    GGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-G------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATG
gi|41132                      :    GGTGTCCCT--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A---TGAATCGACA--TAT---GAAATG-G-A-A-----ATT------C----AT--T-G------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAATATACATCCGT-CA----A---TATA-TCAAAAATGTTG
gi|41141                      :     GTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TAT--TC-GAAATGTCGaatgtaaaggc
gi|41142                      :      TGTCC-T--TTAT--TTC-TA-CTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-G--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCGaaattaaaaggc
gi|41143                      :   gtGTGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T---AA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAAAGTCG
gi|41145                      :      TGTCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCTACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TC-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATG
gi|41146                      :       gtCC-T--TTTT--TTC-TA-AGTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATTGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CG----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|41147                      : gctcGTGTCC-T--G-AT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------ATT-TGAATCGGCA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A-------T----AT------T----G-A-AA-----GATT--AAA---ACGT-CGT-CA----AG--TATA-TC-GAAATGACGaaatattaaaggc
gi|41161                      :        TTC-T--TTAT--TTC-TT-GTTCG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-CAAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------T----AT--T-A------TT----AT------TTCAAA-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----T---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|41168                      :        TCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGA-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----GC------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATG
gi|41169                      :        TCC-T--TTAC--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATG------T-------------------A-T-TGAGTCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------C----A-A-TA-----GA-TA-AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTC
gi|41170                      :        TCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-C-T---GAG-GTA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AG--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ATGT-CAT-CA----A---TATA-TC-GAAACGTCG
gi|41171                      :        TCC-T--TTAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATAG-----T-------------------A-TGTGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------------AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TA-A-TT-GAAATGTCG
gi|41189                      :                TAT--TTC-TA-GTTTG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-C-TGAATCAACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CAATATA---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|41192                      :                TAT--TTC-TA-GTTCG-T-T---GAG-ATA------T-------------------A-A-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------G----ATGATAA------TT----AT------T----A-A-TA-----GA-T--ACA---ACAT-TAT-CG----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattaaaag
gi|41193                      :                TAC--TTC-CA-GTTTG-T-T---GAG-ATA------T-------------------A-T-CGAATCAACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------T----AT--C-A------TT----ATATGTAGT----A-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-TGT-CG----A---TATA-TC-GAAATGTCGaattaaaag
gi|41194                      :                TAT--TTC-TA-GCTCG-C-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-AGCATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------T----AT--T-A------TC----AT------T----T-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-TA----A---TATA-TC-GAAATGTC
gi|41212                      :                  T--TTC-TA-GTTCG-T-T---GGG-ATACTAGTAT-------------------A-T-TGAATCGACA--CAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ATGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|41220                      :                   --TTC-TA-GTTGG-T-T---GGG-ATA------C-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-A-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----G-A-TT-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG
gi|41226                      :                           -GTTTG-T-T---GGG-ATA------T-------------------A-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A-T------C----AT--T-A------TT----AT------T----GAA-TA-----GA-T--AAA---ACAT-CCT-CA----A---TATA-TC-AAAATGTCG
gi|41230                      :                               CG-C-T---GAG-ATA------T-------------------T-T-TGAATCGACA--TAT---G-AATG-G-A-A-----A--------C----AT--T-A------TG----AT------T----G-A-TA-----GA-T--AAA---ACGT-CGT-CA----A---TATA-TC-GAAATGTCG