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Reference ( gi|46077 )        :            TTTT---A--C-TGTGC--TT-G-G--C---TTT-C-CAAA-A-T-TT--T-G-G---GCTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-T--GAAA----A---A-ATT-A-T-T----T---T---T-------C---AAAA---T-------G-T---GT--CA-C--A------------TA--C------G------G-TGCA--CC-AAAA-TTGG---TA---T-C-A------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46076                      :            TTTT---A--T-TGTCT--TT-G-G--C---TTT-C-CAAA-C-T-TT--T-A-G---GTTT---C----AA--AC--A-TCGA-T-G-A-T--GAAA----ATA-A-ATT-A-T-T----T---T---T-------C---GAAA---T-------G-T---GT--CA-C--A------------TA--C------G------G-TGCA--CC-AAAA-TTAG---CA---T-C-A------C-AT--AT-----T-TTTAT
gi|46078                      :            TTTT---A--T-TGTCC--TT-G-G--C---TTT-C-CAAA---C-TT--T-A-G---GTTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-T--GAAA----A-----ATT-A-T-T----T---T---T-------A---GAAA---T-------G-T---GT--CA-C--A------------TA--G------G------G-TGCG--CT-AAAA-TTAG---TG---T-C-A------C-AT--AT-----T-TTCAT
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gi|46132                      :            TTCT---A--T-TGCAA--TT-T-G--C---TTT-A-TAAC---T-TT--T-A-G---TTTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-T--AAGA----A---ATATT-G-T-T----C---T---T-------C---GAAA---T-------T-T---GG--CA-C--A------------TG--C------A------A-TGAA--CC-AAAA-TTAG---TA-------A------C-ATCCAT-----T-TTCGT
gi|46128                      :            TTTT---A--T-TGTCC--TT-G--------CTT-C-CAAC---T-TT--T-A-G---GCTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-ATT--GGA---------------A-T-T----T---T---T-------T---CGAA---T-------G-T---GT--CA-A--A------------TA--G------A------G-T-CA--CC-AAAA-TT-A---TA---T-C-A------C-CT--A
gi|46126                      :            TTTG---A--T-TGTCC--TC-G-G--C---TTT-C-CAAA-C-T-TG--T-A-G---GTTT---T----------------GC-T-G-A-T--GAGA----A---A--TT-A-T-T----T---T---T-------C---CAAA---A-------G-T---GT--TA-C--A------------TA--C------G------T-TACATGCG-AAAC-TTAG---TA---T-C-A------C-AT--
gi|46118                      :            TTTT---A----TGTGTCTTT-G-G--C---TTT-TTCAAA-C-T-GT--T-A-GTTGGCTT---C----AA--GC--A-TGAC-T-GTA-T--GAGG----A---A-CTT-A-T-T----C---T---C-------------AA---T-------GGT---GT--CA-C--T------------TC--G------G------G-TGCA--CC-AAAG-TTAG---TA---T-T-A------C-AT--AT-----T-TCC
gi|46100                      :            TTTT---T--C-CGC-C--TT-G-G--T---TTTTC-CAAA-C-T-TT--T-A-G---GTTT---C----AA--GC--AGTCGC-T-G-A-T--TGAG----A---A-TTT-A-TGT----T---T---T-------CT--GAAA---T-------G-T---GT--CG-C--AT-----------TATTC------A------G-TGC---CC-AAAT-TCAG---TA---TGG-A------C-AT---T-----T-TTCAT
gi|46140                      :            TTTT---A--T-TGTCC--TT-G-G--A---TTT-G-CAAC-C-T-TT--T-A-G---ACTT---C----AA--GC--A-TCGC-C-G-A-T--G-AT----A---C-ATT-A-C-G----T---T---T-------T---AAAA---T-------A-T---TC--CA-C--T------------TG---------G------G-TGCA--CC-
gi|46119                      :            TTTT---A--T-TGT-C--TT-ATG--C---TTT-C-CAAA-C-C-TTC-T-A-G---GCTT---C----AA--GC--A-TCGA-TGG-A-T--G-AG----A---A-AT----T-T----T---T---T-------C---GAAA-----------------GT--CA-C--ATT----------TA--CA-----G------G-TG----CC-AGAA-TAGC---AA---T-T-AT-----T-AT--AT-----C-TTCAT
gi|46136                      :            TTAT---A--T-TGTCC--TT-G-G--C---TGT-C-AAAA-C-A-TG--T-A-G---TTTT---C----AA--GC--T-TTGT-T-G-A-A--GATA----A---T--TT-A-T-T----G---T---T-------T---GAAA---T-------G-T---GG--CA-C--A------------TA--C------A------A-AACA--TG-AAAA-TTAT---TA---T-C-A------A-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46285                      :             TTA---A--T-TGTAC--TT-G-G--C---CTT-T-CAAA-C-T-TT--T-A-G---GCTT---C----AG--GC--A-TCGC-T-G-A-T--GAGA----A---A--TT-A-A-T----T---T---T-------C---GAAA---T-------G-T---GT--CA-C--A------------TA--T------G------G-TGCA--CC-AAAA-TAAG---TA---T-C-G------C-AT--AT-----T-TTCA
gi|46286                      :             TTT---A--A-TGT----TT-T-G--C---TGT-C-CAAA-C-G-TT--T-A-G---GCTT---C----AA--AC--A-TCGC-T-G-A-T---AAG----A---A-ATT-A-T-T----T---T---T-------C---GAAA---T-------G-T---GT--CA-C--A------------CA--C------G------G-TGTA--CC-AAAA-TTAG---TA---T-C-A------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46287                      :             TTT---A--T-CGTCT--TT-G-G--C---TCT-T-CAAG-T-T-TT--T-A-G---GCCT---C----AA--GC--A-CCGC-T-G-A-T--GAAA----A---A--TT-A-T-T----T---T---TT------C---GAAA---T-------G-T---GT--CA-C--A------------TA--C------C------A-TGCA--CC-TAAA-TTAG---CA---T-C-A------C-AT--GT-----T-TTTAT
gi|46288                      :             TTT---A--T-CGTCC--TT-G-G--C---TAT-C-CAAA-C-T-TT--T-A-G---GCTT---C----AA--AC--A-TTGC-T-T-A-T--GAGA----A---A--TT-A-T-T----T---T---T-------C---GAAA---C-------G-T---GT--CA-C--C------------TA--C------A------G-TGCA--CC-AAAT-TTAC---TA---T-C-A------C-AT--AG-----T-T
gi|46289                      :             TTT---A--T-TCTCC--TT-T-A--C---TTT-C-CAAA-T-T-TT--T-A-G---ACTT---C----AA--GC--A-TCGT-T-G-A-T--G-AG----A---A-ACC-A-T-T----T---T---T-------C---GAAA---T-------G-T---GT--CA-C--A------------TT--C------A------G-TGCT--AC-AAAA-TCAA---TA---C-C-C------C-AT--A------T-TTCAT
gi|46291                      :             TTT---A--T-TGTCT--TT-G-A--A---TTT-C-CAAA-T-G-TT--T-A-G---ATTT---C----AA--GC--A-TCAC-T-G-A-T--G-AG----A---A-ATT-A-T-T----T---T---T-------C---GAAA---T-------A-T---GT--TA-A--A------------TA--C------G------A-TGCA--CT-AAAA-
gi|46300                      :              TT---A--C-TATCG--TT-G-A--C---TTT-C-CAAT-A-T-TT--T-A-A---GGTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-T-T--GAGA----A---T-TTT-T-A-T----T---T---T-------C---GAAT---T-------G-T---GT--CA-C--A------------TA--C------G------G-GGCA--CC-AAAA-TTAG---TA---T-T-G------C-AT--GT-----T-TTCAT
gi|46299                      :              TT---A--T-TGATC--AT-G-G--T---TTT-C-CAAG-C-T-TG--T-A-G---GCTT---C----GA--GC--A-TTGC-T-G-A-T---AAG----A---A-ATT-A-T-T----T---T---T-------C---GAAA---T-------G-T---TT--CA-C--A------------TA--C------A------A-TGAA--AC-ACAA-TCAG---TG---T-C-A------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46290                      :              TT---C--C-TGTCT--TT-G-G--C---TTT-C-ATAA-C-C-TC--T-A-G---GCTT---C----AA--AC--A-TCGC-T-G-A-T--GGGA----A---A--TT-A-T-T----T---T---T-------C---AAAA---T-------G-T---GT--CA-A--A------------TA--C------G------G-TGCA--CC-AAAT-TT
gi|46301                      :          tttaTT---A--T-TGTCA--TT-G-G--C---CTA-C-CAAA-C-G-TC--T-T-G---GCTT---C----AA--GT--A-TCGC-T-A-A-T----AA----G---A-ATT-A-T-T----T---T---T-------C---GAAA---T-------G-T---GT--TG-C--A------------CA--C------G------A-TGCA--CC-AGTC-TTAG---TA---T-T-A------C-AT--AT-----T-TTAAT
gi|46303                      :              TT---A--T-TGTCT--CT-G-A--T---TTT-T-CAAA-A-T-TT--T-A-G---AGTT---A----AA--AC--A-TTCT-T-G-A-C--G-AA----A---A-ATA-A-T-G----T---T---T-------C---GAAC---T-------A-TCCCG---CA-C--A------------TA--C------A------C-TGCA--AC-AAAT-TTAG---TA---A-C-T------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46311                      :               T---A--T-TGTTG--TT-G-C--C---TTT-C-CAAA-T-G-TT--T-A-G---GCTT---C----AG--GT--A-TAGT-A-G-A-T---AAT----A---A-ATT-T-T-T----T---T---C-------C---AGAA---T-------G-T---CT--CA-C--A------------TA--C------G------G-TACA--CC-AAAT-TCAG---T----T-------------T--AT-----T-TTC
gi|46310                      :               T---A--T-TGTCC--TT-G-G--G---TTT-C-CAAC---T-TC--T-A-G---GTTT---C----AA--GC--A-CCGG-T-G-G-T---AAG----A---A-ATT-G-TAT----A---TAA-T-------C---GAAA---T-------G-T---GT--CG-C--A------------TA--C------GTTATATGTTGCA--TC-AACA-TTAG---TA---T---A------C-A
gi|46316                      :                ---A--T-TGTCT--TT-G-T--C---TTT-C-GAAA-A-T-TG--T-A-G---GCTT---C----AA--AC--A-CCGC-T-G-A-T-----------------TT-T-T-T----T---T---TTAAATTTC---GAAA---T-------G-T---GT--CC-A--A------------TA--T------G------G-AACA--CC--TAA-TTAG---TA---T-C-A------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46319                      :                       -TGT-C--TT-T-G--T---TTT-C-CACA-C-T-TT--T-A-T----CTTA--C----AA--AC-----CTC-T-G-A-A--GAAA----T---G-TTT-T-T-T----T---T---T-------T---AAAT---T-------G-T---GT--CA-C--A------------TAA-C------A------G-TGCA--CC-AAAT-CTGG---TA---T-C-A------C-AT--AA-----T-TTCAT
gi|46101                      :                        tGTAT--TT-C-G--C---TTT-C-CAAA-C-A-TT--T-A-G---GCTT---C----AA--GC--A-TCGG-T-A-A-T--GATT----A---A--TT-A-T-T----T---T---T-------C---GAGA---T-------G-T---GT--CA-C--A------------TG--C------G------A-TGCG--CC-AAAA-TTAG---TA---T-C-A------C-AT--TT-----T-TT
gi|46130                      :             tttcattatgtaGTCC--TT-G-A--C---TTT-C-CAAT-C-C-TT--T-AAG---GTTT---C----AA--GC--A-TCCC-T-G-A-T--GAGA----A---A--TT-A-T-T----T---T---T-------C---AGAA---T-------G-T---GT--CA-C--A------------AA--C------G------A-TATA--C
gi|46312                      :                   ttttgttttg--TT-G-G--C---TTT-C-CAAA-A-T-TT--TTA-A---GTTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-T--G-AG----A---A-ATT-A-CAT----T---T---T-------C---AAAA---T-------G-T---GT--CA-C--G------------TG--C------T------A-TGCA--TC-AAAA-TTGG---TA---T-C-A------C-AC--A
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gi|46099                      :                      attgact--TT-G-G--C---TTT-C-TAAA-A-T-TT--T-A-G---GCTT---C----AA--GC--A-TCGC-T---A-T--G-AG----A---A-ATT-A-T-T----TTAAT---T-------C---GAAA---T-------G-T---GT--CA-C--A------------TT--C-------------G-TGAA--CC-AAAA-TTAG---TA---T-C-A------CTAT--AT-----
gi|46314                      : ttttattgtctttggctttccaaacttt--TT-G-G--C---TTT-C-CAAA-T-G-TT--T-A-G---ACCT---C----AC--GC--A-TCGC-T-G-A-T--GAGATACTA---ATATT-A-T-T----T---T---T-------C---GAAA---T-------G-T---GT--CA-T--A------------TA--CATGTACG------G-TGCA--CC-AAAA-TTAG---TA---T-A-A------C-AT--AT-----T-TT
gi|46094                      :                      attattt--TT-G-G--C---TTT-C-CAAA-C-T-TT--C-A-G---GTTC---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-T--G-AG----A---A-ATT-A-T-T----T---T---T-------C---GAAA---T-------G-TTCGAT--CA-C--A------------TA--C------G------A-GGCT--CC-AAAA-TTAG---TA---T-C-A------C-TT--A
gi|46315                      :                  tttgatagtct--TT-G-G--C---TTT-C-CAAA-C-T-TA--T-G-A---GCTT---T----AA--GC--A-CTGC-T-T-A-T--G-TG----A---A-ATT-A-T-T----T---TA--T-------T---GAAA---T-------G-T---GT--CA-C--A------------CA--C------G------G-TGAA--CC-AAAT-TCGA---TA---T-C-A------C-AT--AC-----T-TTCAT
gi|46356                      :                      attccct--TT-G-G--C---TTT-C-CAAA-C-T-TT--C-A-G---GATT---C----AA--GC--A-TCGC-T-----------------------------------T---T---T-------C---AAAA---T-------G-T---GG--CA-C--A------------TA--C------G------A-TGCA--CC-AAAA-TTGG---TA---T-C-A------C-GT--GT-----T-TCCAT
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gi|46323                      :                          tct--TT-G-G--C---TTT-C-CAAA-C-G-CT--T-A-G---ATTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-T--G-AA----A---A-ATT-A-T-T----T---T---T-------C---GAAA---T-------G-T---GT--CA-C----------------------------------------------AA-TTAG--------T-C-A------C-AT--AT-----T-TCCAT
gi|46309                      :                         tgtt--TT-G-G--C---TTT-A-CAAA------T--T-G-A----------T----AC--GC--T-TCGC-T-G-A-A--GAGA----A---A--TT-A-T-G----T---T---T-------C---TAAA---T-------G-T---GT--CA-C--A------------TA--T------G------G-TGCA--CC-AAAA-TTAG---AA---T-C-A------T-AT--AT-----T-ATC
gi|46345                      :                     tataatct--TT-G-G--CGTTTTT-C-CAAACA-T-TT--C-G-G-----TT---T----GA--GC--A-TCAC-T-G-A-A--GAGA----C---A--TA-A-T-T----T---G---T-------C---GAAA---T-------G-C---G------C--A------------TC--T------G------G-TGCA--TC-AAAA-TTGG---TA---C-C-G------T-AT--AT-----TATTTAT
gi|46320                      :                              ctT-G-T--C---TGT-C-CAAA-G-T-TT--T-A-G---TTTT---C----AA--GC--A----------------AAG----A---A-ATT-A-T-T----T---T---T-------C---GAAA---T-------G-T---GC--CA-C--A------------TA--C------G------G-TGCA--CT-AAAG-TTAG---TA---T-C-G------C-AT--AC-----T-TTCAT
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gi|46366                      :                                     --C---TTT-C-CAAC---T-TT--A-A-G---GTTT---C----AT--GC--A-TCGT-T-G-A-T--GAAA-----------TTCA-T-T----T---T---TT------C---GAAA---T-------G-T---AT--CA-C--A------------TG--C------A------G-CTAA--CC-AATG-TTAG---TA---T-C-A------C-A
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gi|46098                      :         TTTA---A--T-T-----GTTCCT-GG-C---TTT-C-CA-AA--CGTG-----------------TA--G---GCTT---C----AA--GC--A-TAAC-T-G-A-TGAGA----A---A---T-T-A-T-T----T---T---T-------C-A--AAA---T-------G-T---GG--C--A-T--A------------TA--C-G------A-TGCA--CC-CAAA-TTCG---T-A---C-T-A------C-AC--AT-----T-TTCAT
gi|46099                      :         TTTT---A--T-T-----GTCTTT-GG-C---TTT-C-CA-AA--CTTTTTGGCTTTCTAAAATTTTA--G---GCTT---C----AA--GC--A-TCGC-T---A-TGAG-----A---A--AT-T-A-T-T----TTAAT---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TT--C--------G-TGAA--CC-AAAA-TTAG---T-A---T-C-A------CTAT--AT-----
gi|46100                      :                             CCTT-GG-T---TTTTC-CA-AA--CTTT-----------------TA--G---GTTT---C----AA--GC--AGTCGC-T-G-ATTGAG-----A---A--TT-T-A-TGT----T---T---T-------CTG--AAA---T-------G-T---GT--C--G-C--AT-----------TATTC-A------G-TGC---CC-AAAT-TCAG---T-A---TGG-A------C-AT---T-----T-TTCAT
gi|46101                      : tttttccgTTTC---A--T-TATGTAGTATTT-CG-C---TTT-C-CA-AA--CATT-----------------TA--G---GCTT---C----AA--GC--A-TCGG-T-A-A-TGATT----A---A---T-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--AGA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TG--C-G------A-TGCG--CC-AAAA-TTAG---T-A---T-C-A------C-AT--TT-----T-TT
gi|46102                      :         TTTT---A--AAT-----GTCTTT-GG-T---TTT-C-CA-AG--ATTT-----------------TA--G---GCTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-C-A-TGAG-----A---A--AT-T-A---T----T---G---T-------C-G---AA---T-------A-T---GT--C--A-C--A------------TA--C-G------G-TGCA--CC-AA-----AG---T-A---T-T-A------T-AT--AT-----T-TTCA
gi|46104                      :         TTTC---A--T-T-----GTCCTT-GG-C---TTT-C-CA-AA--CTCT-----------------TT--G---GCTT---C----AA--AC--A-TCGC-T-G-G-TGAAA----AATTA--AT-T-G-T-T----T---T---T-------T-G--AAA---T-------G-T---GT----------------------------------------CA--CC-AAAA-TTAG---T-A---T-C-A------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46106                      :         TTTC---A--T-T-----GTCCTT-GA-C---TTT-C-CA-AA--CCTT-----------------TA--G---GCCT---C----AA--AC--T-TCGC-A-G-A-TGAGA----A---A-----T-ATT-T----T---T---T-------T-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-T--A------------T---T-G------G-TGCT--CC-CAAA-TTAG---T-G---T-C-A------C-AT--AT-----T-TT
gi|46107                      :         TTTT---A--T-T-----GTCCTT-GG-C---TTT-C-CA-AA--CTTT-----------------TA--A---GCT-------------------------------GAGA----A---A--AT---A-T-T----T---T-----------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--C-G------G-TGCA--CC-AAAA-TTAG---T-G---T-C-A------C-AT--AT-----T-T
gi|46108                      :         TTGT---A--T-T-----GTCCTC-GG-C---TTT-C-CA-AA--CTTT-----------------TA--A---GTTT---C----CA--GCTGA-TCGC-T-G-A-CGAG-------------T-T-A-T-C----A---T---T------------AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TG--C-A------A-TGCA--CC-ACAA-TCAG---T-A---G-C-A------C-GT--AT-----T-TTCAT
gi|46109                      :         TTTC---A--T-T-----GCCCTT-AA-C---TTT-C-CA-TA--CTTT-----------------TA--G---GAAT---C----AA--GC--A-TCGT-T-G-A-----G----A---A--AT-T-A-A-T----T---T---C-------A-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--T-G------G-TGCA--CC-AAAA-TTAG---T-A-------G------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46110                      :         TTTT---A--TCT-----GTCCTT-GG-C---TTT-C-CA-AA--CTGG-----------------TA--G---GCTTCAAC----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-TAAG-----A---A--AT-T-A-C-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-----GT--C--A-T--A------------CA--C-A------G-TGCA--CC-AAAA-T
gi|46112                      :         TTTT---A--T-T-----GTCTTA-GG-C---TTC-C-CA-AC--ATTT-----------------TG--G---AATT---C----AA--GC--A-TTGC-T-G-A-TGAG---------A--AT-T-A-T-T----T---T---T-------C-A--ACA---T-------A-T---GT--CATA-T--A------------TA--C-G------G-TGCA--CT-AAAA-ATAA---T-A---T-C-A------C-AT--AT-----T-
gi|46116                      :         TTTT---C--TGT-----GTCTTT-GG-A---TCT-C-CA-AA--TATG-----------------TA--G---GCT----A----AA--AC--A-TCGT-T-G-A-TGAGA----A---A---T-T-A-T-T----T---T---T-------C-A--AAA---T-------G-T---GA--C--A-A--A------------TA--C-G------G-TGCA--CC-AAAT-TTAG---C-A---T-A-A------C-AT--AA-----T-TTCAT
gi|46117                      :         TTTT------T-T-----GCCCTT-GG-C---TAT-T-CA-AG--CGTT-----------------TA--G-----TT---C----GA--GC--A-TCGC-T-G-A-TGAGA----A---A---T-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---TCGGAAATA-T---GG--C--A-C--A------------TA--C-G------A-TGCA--CC-AACA-TTAG---T-A---T-C-A------C-AC--GT-----T-CACAT
gi|46118                      :         TTTT---A--TGT-----GTCTTT-GG-C---TTT-TTCA-AA--CTGT-----------------TA--GTTGGCTT---C----AA--GC--A-TGAC-T-GTA-TGAGG----A---A--CT-T-A-T-T----C---T---C-------------AA---T-------GGT---GT--C--A-C--T------------TC--G-G------G-TGCA--CC-AAAG-TTAG---T-A---T-T-A------C-AT--AT-----T-TCC
gi|46119                      :         TTTT---A--T-T-----GTCTTA-TG-C---TTT-C-CA-AA--CCTTC----------------TA--G---GCTT---C----AA--GC--A-TCGA-TGG-A-TGAG-----A---A--AT-----T-T----T---T---T-------C-G--AAA-----------------GT--C--A-C--ATT----------TA--CAG------G-TG----CC-AGAA--TAG---CAA---T-T-AT-----T-AT--AT-----C-TTCAT
gi|46120                      :         TTTT---A--T-T-----GTTTTG-GG-G---TTT-C-CG-AA--AGTT-----------------TA--A---GCTT---C----AA--GT--A-TCGT-T-G-A-TGAAA----A---A--TT-T-A-C-C----T---T---T-------A-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--T-G------G-TGCA--CC-AAAT-TAAG---T-A---A-A-A------C-AT--AT-----T-GTCA
gi|46121                      :         TTTG---A--T-T-----ATCTTT-GG-C---TTT-C-CA-AA--CGTT-----------------TT--G---GCTT---C----AA--GC--A-TCGC-C-T-A-T-AGG----A---A--AT-T-A-A-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-C---GT--C--A-C--A------------TT--C-A------C-TGCA--CC-AAAC-GTTG---T-A---A-C-T------C-AT--AT-----T-TT
gi|46122                      :         TTTG---A--T-T-----CTACTT-GA-C---TTT-G-CA-AA--CCTT-----------------TA--G---GCTA---C----AA--GC--A-ACGC-T-G-A-TGTGG----A---A---T-T-A-T-T----T---T-----------C-A--TGA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--A-G------G-TGCA--CC-AAAA-TTAG---T-A-------A------C-AC--AT-----T-TCCAT
gi|46123                      :         TTTT---AA-T-T-----GTCCTT-GG-C---TTC-C-CA-AA--CTTT-----------------TA--G---GTTT---C----AA--AC--A-TCGC-C-G-A-TGAGA----A---A--A--C-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------T-T---GG--C--A-C--ATACATGTACATGTA--C-G------A-TGCA--CC---------G---T-A---T-T-G------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46125                      :         TCTT---A--T-T-----GTCGTT-GG-C---TTT-T-GA-AA--CTTT-----------------TA--A---ACTT---C----AA--GT---------T-G-A-TGA-A----A---A--AT-T-A-T-T----T---T-----------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--C-G------A-TGCA--TC-AAAA-TGAG---C-A---T-
gi|46126                      :         TTTG---A--T-T-----GTCCTC-GG-C---TTT-C-CA-AA--CTTG-----------------TA--G---GTT-------------------TTGC-T-G-A-TGAG-----A---A--AT-T-A-T-T----T---T---T-------C-C--AAA---A-------G-T---GT--T--A-C--A------------TA--C-G------T-TACATGCG-AAAC-TTAG---T-A---T-C-A------C-AT--
gi|46127                      :         TTTT---AAAT-T-----GTGCTT-GG-T---TCT-G-CC-AA--CTTT-----------------TA--G---GTTT---C----AA--AC--A-TCGC-T-G-A-TTAGA------------T-T-T-T-T----T---T---T-------T-T--AAA---T-------G-T---AT--C--A-C--G------------TA--C-G------A-TGCA--CA-AAAT-TTAG---T-A---T-C-A------C-AG--AT-----T-
gi|46128                      :         TTTT---A--T-T-----GTCCTT-G------CTT-C-CA-A---CTTT-----------------TA--G---GCTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-TTGG---------A--AT-----T-T----T---T---T-------C-G---AA---T-------G-T---GT--C--A-A--A------------TA--G-A------G-T-CA--CC-AAAA-TTA----T-A---T-C-A------C-CT--A
gi|46129                      :         TTTTGGCA--T-T-----GCCCTA-GG-C---TTT-T-CA-TA--CTTT-----------------TT--G---TTTT---C----AA--GC--A-TCGT-T-G-A-TGA-A----A---G--AT-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--CGA---T-------T-T---GT--C--A-TG-A------------T---C-G------A-TGCA--GC-AAAA-TTAG---T-A---T-C-T------T-AT--AT-----T-TTTA
gi|46130                      :         TTTT---G--T-TTTG--GTCCTT-GA-C---TTT-C-CA-AT--CCTT-----------------TAA-G---GTTT---C----AA--GC--A-TCCC-T-G-A-TGAGA----A---A---T-T-A-T-T----T---T---T-------C-A--GAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------AA--C-G------A-TATA--C
gi|46131                      :         TTTT---C--T-T-----GTCCTT-GG-C---TTC-C-CA-AA--CGTT-----------------TA--G---ATTT---C----AACGGC--A-TCACTT-G-A-TGAGA----A---A--AT-T-ATT-T----T---T---T-------C-GAAAAA---T-------A-T---GG--C--AGC--A------------TA--C-G------A-AATA--CC-AAAA-TTAG---T-A---T-A-A------T-TC--AT-----T-TTTA
gi|46132                      :         TTCT---A--T-T-----GCAATT-TG-C---TTT-A-TA-A---CTTT-----------------TA--G---TTTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-TAAGA----A---AT-AT-T-G-T-T----C---T---T-------C-G--AAA---T-------T-T---GG--C--A-C--A------------TG--C-A------A-TGAA--CC-AAAA-TTAG---T-A-------A------C-ATCCAT-----T-TTCGT
gi|46134                      :         TTTT---A--T-T-----GTTCTT-GA-C---TTT-T-CA-AA--CTAT-----------------TG--G---GCTT---C----AA--GT--A-TCGC-T-G-A-T--GA----A---A--ATAT-A-T-T----T---T---T-------C-T--AAA---T-------G-T---GT--T--A-C--A------------T
gi|46136                      :         TTAT---A--T-T-----GTCCTT-GG-C---TGT-C-AA-AA--CATG-----------------TA--G---TTTT---C----AA--GC--T-TTGT-T-G-A---AGA----T---A--AT-TTA-T-T----G---T---T-------T-G--AAA---T-------G-T---GG--C--A-C--A------------TA--C-A------A-AACA--TG-AAAA-TTAT---T-A---T-C-A------A-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46137                      :         TTTTGC-A--T-T-----GTCAAT-GG-C---TTT-C-TA-AA--CTTC-----------------TA--G---GTTT---C----AA--AC--A-TCGC-T-G-C-TGAG-----A---A--AT-T-A-T-T----T---T---A-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--
gi|46140                      :         TTTT---A--T-T-----GTCCTT-GG-A---TTT-G-CA-AC--CTTT-----------------TA--G---ACTT---C----AA--GC--A-TCGC-C-G-A-TGAT-----A---C--AT-T-A-C-G----T---T---T-------T-A--AAA---T-------A-T---TC--C--A-C--T------------TG----G------G-TGCA--CC-
gi|46285                      :          TTA---A--T-T-----GTACTT-GG-C---CTT-T-CA-AA--CTTT-----------------TA--G---GCTT---C----AG--GC--A-TCGC-T-G-A-TGAGA----A---A---T-T-A-A-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--T-G------G-TGCA--CC-AAAA-TAAG---T-A---T-C-G------C-AT--AT-----T-TTCA
gi|46286                      :          TTT---A--A-T-----GT--TT-TG-C---TGT-C-CA-AA--CGTT-----------------TA--G---GCTT---C----AA--AC--A-TCGC-T-G-A-TAAGA----A---A---T-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------CA--C-G------G-TGTA--CC-AAAA-TTAG---T-A---T-C-A------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46287                      :          TTT---A--T-C-----GTCTTT-GG-C---TCT-T-CA-AG--TTTT-----------------TA--G---GCCT---C----AA--GC--A-CCGC-T-G-A-TGA-A----A---A--AT-T-A-T-T----T---T---TT------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--C-C------A-TGCA--CC-TAAA-TTAG---C-A---T-C-A------C-AT--GT-----T-TTTAT
gi|46288                      :          TTT---A--T-C-----GTCCTT-GG-C---TAT-C-CA-AA--CTTT-----------------TA--G---GCTT---C----AA--AC--A-TTGC-T-T-A-TGAG-----A---A--AT-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---C-------G-T---GT--C--A-C--C------------TA--C-A------G-TGCA--CC-AAAT-TTAC---T-A---T-C-A------C-AT--AG-----T-T
gi|46289                      :          TTT---A--T-T-----CTCCTT-TA-C---TTT-C-CA-AA--TTTT-----------------TA--G---ACTT---C----AA--GC--A-TCGT-T-G-A-TGAG-----A---A--AC-C-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TT--C-A------G-TGCT--AC-AAAA-TCAA---T-A---C-C-C------C-AT--A------T-TTCAT
gi|46290                      :          TTT---A--T-TCCT--GTCTTT-GG-C---TTT-C-AT-AA--CCTC-----------------TA--G---GCTT---C----AA--AC--A-TCGC-T-G-A-TG-GG----A---A--AT-T-A-T-T----T---T---T-------C-A--AAA---T-------G-T---GT--C--A-A--A------------TA--C-G------G-TGCA--CC-AAAT-TT
gi|46291                      :          TTT---A--T-T-----GTCTTT-GA-A---TTT-C-CA-AA--TGTT-----------------TA--G---ATTT---C----AA--GC--A-TCAC-T-G-A-TGAG-----A---A--AT-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------A-T---GT--T--A-A--A------------TA--C-G------A-TGCA--CT-AAAA-
gi|46299                      :           TT---A--T-T-----GATCAT-GG-T---TTT-C-CA-AG--CTTG-----------------TA--G---GCTT---C----GA--GC--A-TTGC-T-G-A-TAAGA----A---A---T-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---TT--C--A-C--A------------TA--C-A------A-TGAA--AC-ACAA-TCAG---T-G---T-C-A------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46300                      :           TT---A--C-T-----ATCGTT-GA-C---TTT-C-CA-AT--ATTT-----------------TA--A---GGTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-T-TGAGA----A---T--TT-T-T-A-T----T---T---T-------C-G--AAT---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--C-G------G-GGCA--CC-AAAA-TTAG---T-A---T-T-G------C-AT--GT-----T-TTCAT
gi|46301                      :           TT---A--T-T-----GTCATT-GG-C---CTA-C-CA-AA--CGTC-----------------TT--G---GCTT---C----AA--GT--A-TCGC-T-A-A-TAAGA----A-------T-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--T--G-C--A------------CA--C-G------A-TGCA--CC-AGTC-TTAG---T-A---T-T-A------C-AT--AT-----T-TTAAT
gi|46303                      :           TT---A--T-T-----GTCTCT-GA-T---TTT-T-CA-AA--ATTT-----------------TA--G---AGTT---A----AA--AC--A-TTCT-T-G-A-CGA-A----A---A--AT-A-A-T-G----T---T---T-------C-G--AAC---T-------A-TCCCG---C--A-C--A------------TA--C-A------C-TGCA--AC-AAAT-TTAG---T-A---A-C-T------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46309                      :            T---A--T-A-----ATCTTT-GG-C---TTT-A-CA-AA--TTGA-----------------TA--C---GCTT---C----------------GC-T-G-A-AGAGA----A---A---T-T-A-T-G----T---T---T-------C-T--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--T-G------G-TGCA--CC-AAAA-TTAG---A-A---T-C-A------T-AT--AT-----T-ATC
gi|46310                      :            T---A--T-T-----GTCCTT-GG-G---TTT-C-CA-A---CTTC-----------------TA--G---GTTT---C----AA--GC--A-CCGG-T-G-G-TAAGA----A---A--TTGT-A-TAT----A---A---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--G-C--A------------TA--C-GTTATATGTTGCA--TC-AACA-TTAG---T-A---T---A------C-A
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Reference ( family-100 )      :         TTTT---A--T-T-----GTCCTT-GG-C---TTT-C-CA-AA--CTTT-----------------TA--G---GCTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-TGAGA----A---A--AT-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--C-G------G-TGCA--CC-AAAA-TTAG---T-A---T-C-A------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46075                      :         TTTT---A--T-T-----GTCTTT-GG-C---TTT-C-CA-AA--CTTT-----------------TA--G---TCTT---C----AA--GC--A-ACGC-T-G-A-TGAGA----A---A---T-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--T--A-C--A------------TA--C-G------G-TGCA--CC-AAAA-TTAG---A-A---T-C-A------C-AT--AT-----
gi|46076                      :         TTTT---A--T-T-----GTCTTT-GG-C---TTT-C-CA-AA--CTTT-----------------TA--G---GTTT---C----AA--AC--A-TCGA-T-G-A-TGAAA----ATA-A--AT-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--C-G------G-TGCA--CC-AAAA-TTAG---C-A---T-C-A------C-AT--AT-----T-TTTAT
gi|46077                      :         TTTT---A--C-T-----GTGCTT-GG-C---TTT-C-CA-AA--ATTT-----------------TG--G---GCTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-TGAAA----A---A--AT-T-A-T-T----T---T---T-------C-A--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--C-G------G-TGCA--CC-AAAA-TTGG---T-A---T-C-A------C-AT--AT-----T-TTCAT
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gi|46132                      :         TTCT---A--T-T-----GCAATT-TG-C---TTT-A-TA-A---CTTT-----------------TA--G---TTTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-TAAGA----A---AT-AT-T-G-T-T----C---T---T-------C-G--AAA---T-------T-T---GG--C--A-C--A------------TG--C-A------A-TGAA--CC-AAAA-TTAG---T-A-------A------C-ATCCAT-----T-TTCGT
gi|46134                      :         TTTT---A--T-T-----GTTCTT-GA-C---TTT-T-CA-AA--CTAT-----------------TG--G---GCTT---C----AA--GT--A-TCGC-T-G-A-T--GA----A---A--ATAT-A-T-T----T---T---T-------C-T--AAA---T-------G-T---GT--T--A-C--A------------T
gi|46136                      :         TTAT---A--T-T-----GTCCTT-GG-C---TGT-C-AA-AA--CATG-----------------TA--G---TTTT---C----AA--GC--T-TTGT-T-G-A---AGA----T---A--AT-TTA-T-T----G---T---T-------T-G--AAA---T-------G-T---GG--C--A-C--A------------TA--C-A------A-AACA--TG-AAAA-TTAT---T-A---T-C-A------A-AT--AT-----T-TTCAT
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gi|46140                      :         TTTT---A--T-T-----GTCCTT-GG-A---TTT-G-CA-AC--CTTT-----------------TA--G---ACTT---C----AA--GC--A-TCGC-C-G-A-TGAT-----A---C--AT-T-A-C-G----T---T---T-------T-A--AAA---T-------A-T---TC--C--A-C--T------------TG----G------G-TGCA--CC-
gi|46285                      :          TTA---A--T-T-----GTACTT-GG-C---CTT-T-CA-AA--CTTT-----------------TA--G---GCTT---C----AG--GC--A-TCGC-T-G-A-TGAGA----A---A---T-T-A-A-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--T-G------G-TGCA--CC-AAAA-TAAG---T-A---T-C-G------C-AT--AT-----T-TTCA
gi|46286                      :          TTT---A--A-T-----GT--TT-TG-C---TGT-C-CA-AA--CGTT-----------------TA--G---GCTT---C----AA--AC--A-TCGC-T-G-A-TAAGA----A---A---T-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------CA--C-G------G-TGTA--CC-AAAA-TTAG---T-A---T-C-A------C-AT--AT-----T-TTCAT
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gi|46289                      :          TTT---A--T-T-----CTCCTT-TA-C---TTT-C-CA-AA--TTTT-----------------TA--G---ACTT---C----AA--GC--A-TCGT-T-G-A-TGAG-----A---A--AC-C-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TT--C-A------G-TGCT--AC-AAAA-TCAA---T-A---C-C-C------C-AT--A------T-TTCAT
gi|46290                      :          TTT---A--T-TCCT--GTCTTT-GG-C---TTT-C-AT-AA--CCTC-----------------TA--G---GCTT---C----AA--AC--A-TCGC-T-G-A-TG-GG----A---A--AT-T-A-T-T----T---T---T-------C-A--AAA---T-------G-T---GT--C--A-A--A------------TA--C-G------G-TGCA--CC-AAAT-TT
gi|46291                      :          TTT---A--T-T-----GTCTTT-GA-A---TTT-C-CA-AA--TGTT-----------------TA--G---ATTT---C----AA--GC--A-TCAC-T-G-A-TGAG-----A---A--AT-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------A-T---GT--T--A-A--A------------TA--C-G------A-TGCA--CT-AAAA-
gi|46299                      :           TT---A--T-T-----GATCAT-GG-T---TTT-C-CA-AG--CTTG-----------------TA--G---GCTT---C----GA--GC--A-TTGC-T-G-A-TAAGA----A---A---T-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---TT--C--A-C--A------------TA--C-A------A-TGAA--AC-ACAA-TCAG---T-G---T-C-A------C-AT--AT-----T-TTCAT
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gi|46303                      :           TT---A--T-T-----GTCTCT-GA-T---TTT-T-CA-AA--ATTT-----------------TA--G---AGTT---A----AA--AC--A-TTCT-T-G-A-CGA-A----A---A--AT-A-A-T-G----T---T---T-------C-G--AAC---T-------A-TCCCG---C--A-C--A------------TA--C-A------C-TGCA--AC-AAAT-TTAG---T-A---A-C-T------C-AT--AT-----T-TTCAT
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gi|46310                      :            T---A--T-T-----GTCCTT-GG-G---TTT-C-CA-A---CTTC-----------------TA--G---GTTT---C----AA--GC--A-CCGG-T-G-G-TAAGA----A---A--TTGT-A-TAT----A---A---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--G-C--A------------TA--C-GTTATATGTTGCA--TC-AACA-TTAG---T-A---T---A------C-A
gi|46311                      :            T---A--T-T-----GTTGTT-GC-C---TTT-C-CA-AA--TGTT-----------------TA--G---GCTT---C----AG--GT--A-TAGT-A-G-A-TAATA----A---A--TT-T---T-T----T---T---C-------C-A--GAA---T-------G-T---CT--C--A-C--A------------TA--C-G------G-TACA--CC-AAAT-TCAG---T-----T-------------T--AT-----T-TTC
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gi|46314                      :             ---A--T-T-----ATTTTT-GG-C---TTT-C-CA-AA--TGTT-----------------TA--G---ACCT---C----AC--GC--A-TCGC-T-G-A-TGAGATACTA---AT-AT-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-T--ATACATG------TA--C-G------G-TGCA--CC-AAAA-TTAG---T-A---T-A-A------C-AT--AT-----T-TT
gi|46315                      :             ---A--T-T-----CCCTTT-GG-C---TTT-C-CA-AA--CTTA-----------------TG--A---GCTT---T----AA--GC--A-CTGC-T-T-A-TGTG-----A---A--AT-T-A-T-T----T---TA--T-------T-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------CA--C-G------G-TGAA--CC-AAAT-TCGA---T-A---T-C-A------C-AT--AC-----T-TTCAT
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gi|46388                      :                                                       TTT-----------------TA--T---ATTT---C----AA--GC--A-TAGC-T-A-A-T--------A---A--AT-T-A-T-T----T---T---T-------C-A--AAA---T-------T-T---GG--C--A-T--A------------TA--C-G------A-TGTA--CC-AAAA-TCAG---T-A---T-C-G------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46390                      :                                                        TT-----------------GA--G---GCTT---C----AA--GC--A-TCAC-T-G-A-TAAGA----A---------C-A-T-T----T---T---T-------T-A--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--C-T------G-TGCA--CA-AAAA-TTAG---T-A---T-C-C------T-CC--AT-----T-TTCAT
gi|46392                      :                                                         T-----------------TA--G---TTTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-T-AGA----A---A---T-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---C-------G-T---GG--C--A-C--T------------TA--C-T------G-TGCG--CC-AAAC-TTAG---T-A---T-C-C------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46396                      :                                                          -----------------TA--G---GTTT---C----AA--GC--A-TTGA-T-G-A-TGAGA----A---A---T-T-A-T-C----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GG--C--A-C--A------------GA--C-G------A-TGCA--CT-AAAA-TTAG---T-A---T-T-A------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46399                      :                                                                             --G---GTTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-AGAGA----A---A---T-T-A-T-T----T---T---T-------G-T--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--C-G------G-TCCA--TC-AAAT-ATAG---T-A---T-C-A------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46400                      :                                                                                ---GCTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-TGAGA----A---A---T-C-A-T-T----T---TAATT-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TT--T-G------G-TGAA--CC-AAAA-TTAG---T-A---T-C-ACATTATC-AT--AT-----T-TCCAT
gi|46403                      :                                                                                     TT---A----AA--TC--A-TAGC-T-G-A-TGAGA----A---A---T-T-A-T-T----C---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GG--C--A-C--A------------TA--T-G------A-TGCA--CT-GAAA-TTAG---T-A---T-A-A------C-AT--A------T-TTCAT
gi|46405                      :                                                                                     TT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-TGGGA----A---A---T-T-G-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GG--A--A-C--A------------TA--C-G------A-TGCA--CC-AAAA--TAG---T-A---T-C-A------C-----AT-----T-TCCAT
gi|46410                      :                                                                                      T---C----AA--GCC-A-TAGT-T-G-A-TGAGA----A---A---T-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---A-------G-T---GC--C--A-C--A------------TA--C-G------A-TGCA--CC-AAAA-TT
gi|46416                      :                                                                                                 --GT--A-TCGT-T-G-A-TGAGG----A---A---T-T-A-C-T----T---T---T-------G-G--AAT---T-------G-T---GT--C--T-C--A------------TA--C-G------G-TCCA--CC-AATG-TTGG---T-A---T-C-A------C-AT--AT-----C-TTCAT


blockSeqs                     :             GGC AA A ATGTA                         CC    TTGGCTTTCTAAAATTT  TT TTG    CAA                              ATACT ATT TGG     T G      TAA AAT TAAATTT            CGGAAAT   TCG          AT TACATGTACATG       TTATAT                          GTG     CATTAT    CC  GACGA
blockSeqs                     :             GC  AA C TTG                           A     C                  A  T      A                                AAAG  TA  TA      T A      G   AAT T                  T         CCC          A  TACATG             .                               C       T         TG  TATC 
blockSeqs                     :             .   A  G CCT                           .     .                  .  .      A                                A     .   TA      T A      .   AA  A                  .         A            G  TT                 .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  G T                             .     .                  .  .      .                                A     .   TG      T .      .   A   .                  .         .            .  T                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   T   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                G     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                T     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   T       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                G     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                G     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                G     .   C       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                G     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   T       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                G     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   T       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   T       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   T       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                G     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                G     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                G     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   A       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   .       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   .       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   .       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   .       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   .       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   .       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   .       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   .       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   .       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :             .   .  . .                             .     .                  .  .      .                                A     .   .       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :                 .  . .                             .     .                  .  .      .                                G     .   .       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :                 .  . .                             .     .                  .  .      .                                .     .   .       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :                                                    .     .                  .  .      .                                .     .   .       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :                                                    .     .                  .  .      .                                .     .   .       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
blockSeqs                     :                                                    .     .                  .  .      .                                .     .   .       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
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blockSeqs                     :                                                    .     .                  .  .      .                                .     .   .       . .      .   .   .                  .         .            .  .                  .                               .       .         .   .    
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finalCons                     :         TTTT---A--T-T-----GTCCTT-GG-C---TTT-C-CA-AA--CTTT-----------------TA--G---GCTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-TGAGA----A---AA--T-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--C-G------G-TGCA--CC-AAAA-TTAG---T-A---T-C-A------C-AT--AT-----T-TTCAT





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Reference ( family-100 )      :         TTTT---A--T-T-----GTCCTT-GG-C---TTT-C-CA-AA--CTTT-----------------TA--G---GCTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-TGAGA----A---A--AT-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--C-G------G-TGCA--CC-AAAA-TTAG---T-A---T-C-A------C-AT--AT-----T-TTCAT
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gi|46123                      :         TTTT---AA-T-T-----GTCCTT-GG-C---TTC-C-CA-AA--CTTT-----------------TA--G---GTTT---C----AA--AC--A-TCGC-C-G-A-TGAGA----A---A--A--C-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------T-T---GG--C--A-C--ATACATGTACATGTA--C-G------A-TGCA--CC---------G---T-A---T-T-G------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46125                      :         TCTT---A--T-T-----GTCGTT-GG-C---TTT-T-GA-AA--CTTT-----------------TA--A---ACTT---C----AA--GT---------T-G-A-TGA-A----A---A--AT-T-A-T-T----T---T-----------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--C-G------A-TGCA--TC-AAAA-TGAG---C-A---T-
gi|46126                      :         TTTG---A--T-T-----GTCCTC-GG-C---TTT-C-CA-AA--CTTG-----------------TA--G---GTT-------------------TTGC-T-G-A-TGAG-----A---A--AT-T-A-T-T----T---T---T-------C-C--AAA---A-------G-T---GT--T--A-C--A------------TA--C-G------T-TACATGCG-AAAC-TTAG---T-A---T-C-A------C-AT--
gi|46127                      :         TTTT---AAAT-T-----GTGCTT-GG-T---TCT-G-CC-AA--CTTT-----------------TA--G---GTTT---C----AA--AC--A-TCGC-T-G-A-TTAGA------------T-T-T-T-T----T---T---T-------T-T--AAA---T-------G-T---AT--C--A-C--G------------TA--C-G------A-TGCA--CA-AAAT-TTAG---T-A---T-C-A------C-AG--AT-----T-
gi|46128                      :         TTTT---A--T-T-----GTCCTT-G------CTT-C-CA-A---CTTT-----------------TA--G---GCTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-TTGG---------A--AT-----T-T----T---T---T-------C-G---AA---T-------G-T---GT--C--A-A--A------------TA--G-A------G-T-CA--CC-AAAA-TTA----T-A---T-C-A------C-CT--A
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gi|46130                      :         TTTT---G--T-TTTG--GTCCTT-GA-C---TTT-C-CA-AT--CCTT-----------------TAA-G---GTTT---C----AA--GC--A-TCCC-T-G-A-TGAGA----A---A---T-T-A-T-T----T---T---T-------C-A--GAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------AA--C-G------A-TATA--C
gi|46131                      :         TTTT---C--T-T-----GTCCTT-GG-C---TTC-C-CA-AA--CGTT-----------------TA--G---ATTT---C----AACGGC--A-TCACTT-G-A-TGAGA----A---A--AT-T-ATT-T----T---T---T-------C-GAAAAA---T-------A-T---GG--C--AGC--A------------TA--C-G------A-AATA--CC-AAAA-TTAG---T-A---T-A-A------T-TC--AT-----T-TTTA
gi|46132                      :         TTCT---A--T-T-----GCAATT-TG-C---TTT-A-TA-A---CTTT-----------------TA--G---TTTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-TAAGA----A---AT-AT-T-G-T-T----C---T---T-------C-G--AAA---T-------T-T---GG--C--A-C--A------------TG--C-A------A-TGAA--CC-AAAA-TTAG---T-A-------A------C-ATCCAT-----T-TTCGT
gi|46134                      :         TTTT---A--T-T-----GTTCTT-GA-C---TTT-T-CA-AA--CTAT-----------------TG--G---GCTT---C----AA--GT--A-TCGC-T-G-A-T--GA----A---A--ATAT-A-T-T----T---T---T-------C-T--AAA---T-------G-T---GT--T--A-C--A------------T
gi|46136                      :         TTAT---A--T-T-----GTCCTT-GG-C---TGT-C-AA-AA--CATG-----------------TA--G---TTTT---C----AA--GC--T-TTGT-T-G-A---AGA----T---A--AT-TTA-T-T----G---T---T-------T-G--AAA---T-------G-T---GG--C--A-C--A------------TA--C-A------A-AACA--TG-AAAA-TTAT---T-A---T-C-A------A-AT--AT-----T-TTCAT
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gi|46323                      :                    ttatcttataaTT-GG-C---TTT-C-CA-AA--CGCT-----------------TA--G---ATTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-TGA-A----A---A--AT-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C-----------------------------------------AA-TTAG---------T-C-A------C-AT--AT-----T-TCCAT
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gi|46366                      :                                    -C---TTT-C-CA-A---CTTT-----------------AA--G---GTTT---C----AT--GC--A-TCGT-T-G-A-TGA----------A--AT-TCA-T-T----T---TT--T-------C-G--AAA---T-------G-T---AT--C--A-C--A------------TG--C-A------G-CTAA--CC-AATG-TTAG---T-A---T-C-A------C-A
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gi|46380                      :                                              -CA-AA-----T-----------------TA--A---GTTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-TGA-A----A---A--AT-T---T-T----A---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--C-G------G-TGCA--CC-AAAA-TTAG---T-A---T-A-A------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46381                      :                                              -CA-AA--CATT-----------------TA--G---GCTT---C----AA--TC--A-TCGT-T-G-A-CGAG-----A---A--AT-T-A-T-T----T---T---T-------T-C--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--------------GCA--CC-AAAATTTAG---T-A---T-T-A------C-AT--A
gi|46382                      :                                                A-AA--ATTT-----------------CATTG---TCTT---CGTGAAA--GC--A-TCGC-T-G-A-TGAGA----A---A---T-T-A-T-T----T---TAATT-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--C-G------G-TGCA--CT-AAAA-TTAG---A-A---T-C-A------C-ATTGAT-----T-ATCAT
gi|46387                      :                                                    --CCTT-----------------TG--G---GTTT---C----AA--GC--A-TCAC-T-G-A-TGGGA----T-------T-T-T-T-T----T---T---T-------T-G--AAA---T-------G-T---GA--C--A-C--A------------CA--C-A------A-TGCT--CC-AAAA-TTAG---T-G---T-C-A------C-AG--GT-----T-TTCAT
gi|46388                      :                                                       TTT-----------------TA--T---ATTT---C----AA--GC--A-TAGC-T-A-A-T--------A---A--AT-T-A-T-T----T---T---T-------C-A--AAA---T-------T-T---GG--C--A-T--A------------TA--C-G------A-TGTA--CC-AAAA-TCAG---T-A---T-C-G------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46390                      :                                                        TT-----------------GA--G---GCTT---C----AA--GC--A-TCAC-T-G-A-TAAGA----A---------C-A-T-T----T---T---T-------T-A--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--C-T------G-TGCA--CA-AAAA-TTAG---T-A---T-C-C------T-CC--AT-----T-TTCAT
gi|46392                      :                                                         T-----------------TA--G---TTTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-T-AGA----A---A---T-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---C-------G-T---GG--C--A-C--T------------TA--C-T------G-TGCG--CC-AAAC-TTAG---T-A---T-C-C------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46396                      :                                                          -----------------TA--G---GTTT---C----AA--GC--A-TTGA-T-G-A-TGAGA----A---A---T-T-A-T-C----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GG--C--A-C--A------------GA--C-G------A-TGCA--CT-AAAA-TTAG---T-A---T-T-A------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46399                      :                                                                             --G---GTTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-AGAGA----A---A---T-T-A-T-T----T---T---T-------G-T--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TA--C-G------G-TCCA--TC-AAAT-ATAG---T-A---T-C-A------C-AT--AT-----T-TTCAT
gi|46400                      :                                                                                ---GCTT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-TGAGA----A---A---T-C-A-T-T----T---TAATT-------C-G--AAA---T-------G-T---GT--C--A-C--A------------TT--T-G------G-TGAA--CC-AAAA-TTAG---T-A---T-C-ACATTATC-AT--AT-----T-TCCAT
gi|46403                      :                                                                                     TT---A----AA--TC--A-TAGC-T-G-A-TGAGA----A---A---T-T-A-T-T----C---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GG--C--A-C--A------------TA--T-G------A-TGCA--CT-GAAA-TTAG---T-A---T-A-A------C-AT--A------T-TTCAT
gi|46405                      :                                                                                     TT---C----AA--GC--A-TCGC-T-G-A-TGGGA----A---A---T-T-G-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---T-------G-T---GG--A--A-C--A------------TA--C-G------A-TGCA--CC-AAAA--TAG---T-A---T-C-A------C-----AT-----T-TCCAT
gi|46410                      :                                                                                      T---C----AA--GCC-A-TAGT-T-G-A-TGAGA----A---A---T-T-A-T-T----T---T---T-------C-G--AAA---A-------G-T---GC--C--A-C--A------------TA--C-G------A-TGCA--CC-AAAA-TT
gi|46416                      :                                                                                                 --GT--A-TCGT-T-G-A-TGAGG----A---A---T-T-A-C-T----T---T---T-------G-G--AAT---T-------G-T---GT--C--T-C--A------------TA--C-G------G-TCCA--CC-AATG-TTGG---T-A---T-C-A------C-AT--AT-----C-TTCAT