lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       2222222222222222222222222222222222222222222222222222                                                                                                                                      
lowQualScore                  :           11                111111      1111                  11    333333333333333                        1111111  1111111      111111111111111        1111   99999999999999999999999999999999                    1111111111     11111              11   22222        11111   4444444444444444444444444444444                                333333333333             1111111111    11      111    8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888              44444444444            111111       11111      33333      2222222    1                1      111  11        3333333333           111           11  111             3333            11  22222   111      11  2222222222          11   11111   1  33333                      111111           1111111                                                 33         3333333333333333333                                                                                                                             4444444444444    2         444444444  1                         1          1        1                                  3333333333333333333333333333333333333333333333333333                                                1    1111            2            1       11          6666                            
lowQualScore                  :           88     6      1   222222      2222            9  3  77    777777777777777 4 4 4 4      5  4  777 3333333  7777777  4   999999999999999 55     8888   99999999999999999999999999999999  4   2 777 4 4  3  5555555555     77777   77  8888   33   44444     77 44444   5555555555555555555555555555555       0        6   6      99 6 444444444444       666   9999999999    55      000    7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777      6 1 6   44444444444     99  6  999999   99  66666    5 11111      3333333    5  6    5 8      3   5  444  11        4444444444     66    000  8    66  33  444    3 8      6666            11  22222   444   8  44  7777777777 6 6  5   55   66666   1  55555  5 55  5     4 99    666666 4 55  4   5555555      66 6 3    3    4    3     4 4  3  66   66  33      4  4444444444444444444    4    4 66           5 5       1   5 1         5                99      99            6       2          6         5  1   5555555555555    0         000000000  0 8                       5          0        6 6                 3              9999999999999999999999999999999999999999999999999999                6              6             0  1    7777    8   0   0    0       0  3    33          6666    2       3               
lowQualScore                  :           ..     .      .   ......      ....            .  .  ..    ............... . . . .      .  .  ... .......  .......  .   ............... ..     ....   ................................  .   . ... . .  .  ..........     .....   ..  ....   ..   .....     .. .....   ...............................       .        .   .      .. . ............       ...   ..........    ..      ...    ..............................................................................................      . . .   ...........     ..  .  ......   ..  .....    . .....      .......    .  .    . .      .   .  ...  ..        ..........     ..    ...  .    ..  ..  ...    . .      ....            ..  .....   ...   .  ..  .......... . .  .   ..   .....   .  .....  . ..  .     . ..    ...... . ..  .   .......      .. . .    .    .    .     . .  .  ..   ..  ..      .  ...................    .    . ..           . .       .   . .         .                ..      ..            .       .          .         .  .   .............    .         .........  . .                       .          .        . .                 .              ....................................................                .              .             .  .    ....    .   .   .    .       .  .    ..          ....    .       .               
lowQualScore                  :           00     7      1   111111      1111            3  3  55    000000000000000 0 0 0 0      5  0  000 0000000  5555555  0   999999999999999 55     9999   66666666666666666666666666666666  4   0 888 4 4  0  4444444444     11111   99  3333   66   33333     99 33333   8888888888888888888888888888888       7        0   7      22 7 888888888888       888   4444444444    66      000    0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000      7 0 7   88888888888     22  7  222222   22  77777    7 88888      0000000    0  8    0 0      2   2  000  00        4444444444     88    222  0    88  00  000    2 0      2222            00  66666   000   0  66  0000000000 7 7  7   77   99999   4  33333  0 66  6     0 55    666666 9 55  0   8888888      11 0 6    6    0    4     4 4  9  11   11  99      4  4444444444444444444    4    4 11           0 0       4   7 4         7                88      88            7       5          7         0  4   5555555555555    0         000000000  0 2                       0          0        0 5                 2              8888888888888888888888888888888888888888888888888888                0              7             8  8    0000    0   8   0    8       0  2    88          2222    5       2               
consensus                     : AGATAAACAT-NTCCCTGCGCCCACGCC-ATGCGCATGTTCG--TGACTCATCAAAACA-CACCTATATA-------------A-A-C-A-GGTCACTTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---T-A---------A--TCGTG----TCGTTT-NAACG-NCA-CA-CGT--ATAACG-G--AT-ACGGG---G-A-CTGGG-A---TG--ATGAAA----ATGG--GG-TGATCC--TGT-----GTGGC--T-----ATTNCC-ATGG-AC---CT-TGGC----------GCAAATGTTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-ACT-CGACA----AACA-NAAGTGG---ATAG---------------AGAAATTGGCTNAG----CTG--ANGTT-T---N-AT--CC-----CT---TTG--------NCTN---NAA-A--NT-TTGTGG-TCA-CAC---T---GAAGAACCC--TG-GT------TAG--AC-----TGTAAGGTG-CCCGCAG--CATC-TGTACCACCACGGC-CGAAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AC-----TGCACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAG-TG---GAGAGA-GCGCTG-GA-TTCAGAGATCGT--TTGATC-CCC---GGC-TG-ATT-------C--A-A-CA-TTG--TCC---TTACAGTC-A--AAA-CTCTGTTCAAC-G--TGTA-----ACTG--TG-AGA-----TTTGTCAAN-CAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGAGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGCNACCCGACAACCTTTAG---GACGAGAGAAATTT---------AG-CCATAGAAGCCGATCGAGGGATACC-GGTACTGTGC-GTATTATGCCNCATTCCACTCATCCTGATGTGATCTGTTTGTT-----------------AGCGCAATGGGATTACGGG----------------AGAGGCACTCAACGCCTACCCCTGTATGCAG-ATAGCCCCGAACAACGAGAAC----TTTG-GTTTCAACAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTCTTAC-CAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTG
Reference ( gi|4 )            : AGATAAACAT-TTCCCTCCGCCCATGCC-GTGTGCATGTTTA--TGACTCATCAAAACA-CACCTATATG-------------A-A-C-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCG------TT-TTT---T-A---------A--TCATG----TCGATT-AAACA-GCG-GA-CGT--ATGACA-G--AT-ACGAG---G-A-CTGGG-A---TG--ATGAAA----GTGG--GG-TGCTCC--TGT-----GTAGC--T-----ATTGTG-GTGG-AC---GT-TGGC----------GCAAATGCTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-ACT-CGACA----AACA-AAAGTGG---ATAG---------------AGTATTTGGCTCAG----CTG--GAGTT-T---T-AT--CC-----CT---TTG--------ACTA---TAA-A--GT-TTGTGG-TTA-CAC---T---GACAAACCC--TG-GT------TAG--AC-----TGTAAGGTT-TCCGCAG--CAT--TGTATCATCACGCC-TGAAGACGAAACA---GC--GCATAAGG---AC-----TGTACTTGTGAGA-TC-TGTCAGGAG-TG---GAGAGA-GCGCTG-G--TTCAGAGATCAT--TTCATC-CCC---GGC-TG-TTT-------C--A-A-CA-TTG--TCC---TGACACTC-A--CAA-CCCTGGTCAAC-G--TGTA-----CCTG--TG-AGA-----CCTGTCAAC-CGC-CATG-TCGG-TAACAGATAT-A-CGCGG--AGA--TGTTATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGCGACCCGA-AACCTTTAC---GACG-GAGAAATTT---------AG-CTATAGAAGCTGATCGAGGGATACCGGGTACTGTGC-GTATTATGACCCATTCTACTCATCCTGATGTGATCTGTTTGTT-----------------AG----------------G----------------AGAGGCACTCAACGCTCACCCCTGTATGCAG-ATAGCCCCGAACAACGTGAAC----TTTG-GTTTCAAGAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTCT----CAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTG
gi|3                          : AGATAAACAT-CTCCCTGCGACCAACCC-ATGCGCATGCTTG--TGACTCATCAAA-CA-CACCTATATA-------------A-A-CCA-GGATACTTG-TC---A-------CCA------TT-TTT---C-A---------A--TCATG----TTGTTT-GAACG-GCA-CA-CGT--ATAA------------------------------------TGAAA----ATGG--GG--GCTACG-TGT-----GTGGG--T-----ATTCCT-ATCG-AC---AC-TGGG----------CCAGATGCAACTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-GCT-CAAGA----AACA-GAAGTGG---ATAG---------------AAAAATTGGCTCAGATGACGG--GAG---------AA--CC----------TTG--------GGTC---GAACA--CTGTTGTGG-TCA-CTC---T---GAAAAACCC--TG-GT------TAG--AC-----TGTAAG-TG-TCTGCAG--CAT--TGTACCACCACGGC-CGAAGAAGAAGCA---GC--GCTTAAGG---AC-----TGTACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAG-TG---GAAAGA-GCGCTG-GA-TTCAGAGATCGT--TTGATC-CCC---GGC-TG-ATT-------C--A-A-CA-TTG--TCC---TCACAGTCTA--AAA-ATCTGTTCAAG-G--TGTA-----ACTG--TG-AGA-----TTTGTCAAG-CAC-CATG-TCGC-TAACGGATAT-A-CGAGG--AGA--TGT-ATTATA-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAT-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAAGTTCCCTGGACTAA-TCTGCATGCCACCCGACAACCTTTAG---GACG-GAGACATTT---------AG-CCATAGAAGCCGATCGAGGGATACCTGGTACTGCGC-GTATTATGCCACATTCTACCCATCCTGATGTGATATGTTTGTT-----------------AG----------------GGCAATGAGATTACGGCAGAGGCACTCAACGCCTTCCCCTGTATGCAG-ATACCCGTGAACAACGAGAAC----TTTG-GTTTCAACAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTCTTAC-CAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTG
gi|7                          : AGATAAACAT-CCCCTTGCGCCCACGCC-GTG--------------ACTCATCAAAACA-CGCCTGCATA-------------A-A-C-A-GGTAACCTG-TC---A-------CCA------TT-TTT---C-A---------A--TCATG----TCGTTT-GAACG-GCA-CA-CGT--ATAATG-A--AT-ATGGG---G-G-CT----A---TG---TG--------TGT--GGCTATTCC--TATCGACAGTGGC--T-----ATTCCT-ATCG-AT---AT-TGGG----------GCAGATGCAACTGTTTCCAT-TGTAAA--A-A------------GAAAACA-C-AAT-------------------TGG---TTAG---------------AGAAATTGGCTGAG----GCG--AAGGG-A---G-AA--CC-----TTGGCTTG--------AGTA---C------TT-TTGTGG-TCA-CAC---T-------AACCC--TG-GT------TAG--AC-----TGTA-GGTG-CCCGCAG--CAT--TGTACCACCACGGC-CGAAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AT-----TGTACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAG-TG---GAGAGA-GCGCTG-GA-TTCAGAGATCGT--TTGATC-CCC---GGC-TG-ATT-------C--A-A-CA-TTG--TCC---TTGCAGTCAA--AAA-CTCTGTTCAAG-G--TGTA-----AC----TG-AGA-----TTTGTGAAG-CAC-CATG-TCGG-TGACCGATAT-A-CGAGG--AGA--TG-AATTATA-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCg
gi|10                         : AGCTAGACAT-ATCCCTCCGCCCATGCCAACGT-CATGTTCA--TGACTCATCAA---A-CACCTATATA-------------A-A-G-AGGGTCACTTG-TT---A-------CCA------TT-TCT---T-A---------A--TCATG----TCG---------------------------A-G--AT-ACGGG---G-A-CTGGG-G---TG--ATGAGA----ATGG--GG-TGATCC--TGT-----GTAGC--T-----ATTGCC-ATGG-AC---CT-TGG
gi|18                         : AGATAAACTTATTCCCTGCGCCCATGCC-AACTTCATGTTCA--TGACTCATCAAAACA-C
gi|19                         : AGATAAACTTATCCCCTGCGCCCATGCC-AACTTCATGTTCA--TGACTCATC-AAACA-C
gi|2                          :       ACAT-ATCCCTCCGCCAACGTC-ATGGG-----------AACTCATCAAAAC-----CTATATA-------------A-AAC-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---TTC---------A--TCATG----TCGTTTTCAACG-CCA-CA-CGT--ATGATAAG--AT-ATGGG---GGA-CGAGG-A---TG--ATGAAA----ATGG--GG-TGCTCC--TGT-----GTAGC--T-----ATTCCC-ACGGAAC---CT-T-GC----------GGAAATGTTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACATT-ACT---GCA----AACA-TAAGTGGTTAAGAG---------------AG-ATTGGAAGAAG----CTG--ACGTT-TAACA-AT--CC-----CT---TTG--------TCTA---TAA-A--TG-TTGTG---CACCAC---TAAAGAAAAACCC--TG-GT------TAGGAGC-----TGTAAGTTG-CCCGCAGT-CAT--TGTAATATCACGCC-TGAAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AC-----TGCACCTGTGAAA-TC-TGT---GAGATT---GAGAGA-GCGCTG-GGATTCAGAGATCATTGTTTA----CT---GGCATGCTTT-------CAAA-A-CA-TTGTTTCC---TTACA-TC-AAGAAA-CTCTGTTCAGC-GT-TGTA-----CCTG--TGTAGA------CTGTCAAC-CAC-CATG-T-GG-TAACGGATAT-A-CGCGGAAAGA--TG-TATTATG-CT-------------------TACC-CTGGTG--TGGATGGTATT-GTTACAACAATGTAAACTGTTTAAC-GGTGAGACCTCATGGA--TAAGTC-AACGTATTGCAGACCCAATT--CTT-GGCTAA-TTTGTATGCGACTCGA-CA-----AG---GACGAGAGAAATTT---------AG-CCATAGAAGCTGATCGCGGGATACC--GTACTGTGTAGTATTATGCCTCATTCTACTCATCCTGA-GTGATCTGTTTGTTAGCGCAATGGGAGTTACAG----------------G----------------AGAGGCACTCAACGCTTA-CCTTGTATGCAG-ATAG-CCCGAACAACGAGAAC----TTTGCGTTTCAACAATG-TTACAGGAAATTAGG--AACTTTATCTTTACCAGACTTTAGCG-TTCCTTATCGTATTG
gi|15                         :                   gGCCCACGCT-GTGTGCATGTTCATTTGACTCATC-AAACA-CA--TAT----------------A-A-C-A-GGT-ACCTG--C---A-------CCA------TT-TTT---CAA---------A--TCATg
gi|6                          :                           CC-ATGCGCATGTTTG--TGACTCATCAAA-CA-CA--TATA-A-------------A-A-C-G-GGTCACTTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---T-A---------A--TCATG----TCGA----------------------------G--AT-ACGAA---G-A-CTGAG-A---AG--ATGAAC----ATGG--GG-TGATCC--TGT-----GTGGC--T-----ATTGCC-ATGG-AC---CT-TGGC----------GCAAATGTTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------CGAAAACA-T-ACT-CAACA----AATAGGAAGTGG---ATAG---------------AGAAATTGGCTCAG----CTG--
gi|1                          :                                           tcaacCTCATAAAAACAGCACCTATATACATAACATTAGTCACA-C-A-GGTCACATGATT---AGGACAACCCACGGAGATT-TTT---T-ACCCACACCGA--TCTGG----TCGTTT-CAAC--GCA-CAGCGT--ATGATC-G---T-GTGGGCGTG-A-CTGGG-GAGTTGGGATGAAATGGAGTGGATGG-GGATCTAGTGT-----GCAGAAAT-----ATTAAA-ATGG-GCCAGGT----C----------GCAAATGTTGGTGTTTACATCTGTAAATAATA-----------AGAAAACA-T-ACTTCGACAGCAGAACA-TAAGTCG---ACAGCCATCTACGTCCTTGAG-ATTTGGA--AG----ATGCTACGTTAT---C-ATGCCC-----CT---TTGG-------ATTC---TAATACCAT-TAGTGG-TTA-TACCTCT---AATGAACCTGTTGTGTCACATATAT--ACGTATGCGTAGGG----CCGCGGGCCGTCTTGTA-CG-CACAGC-TGGGGATAAAACATAGACTGGCATAAGG---AGA----TGCACC-GTGAA-----TGTCAGGA--TG---GAGAAAAGCGCTG-GA-TTCAGATATCAT--TTGTTA-CCTAGTGGC-TG-TTT-------C--ATA-CACTTG--TTCAATTGACAGTA-A--GAA-CG-TGGTAAACAG--TGTAAAAAATCCGACTA-GAA-----CCTGTCAAC-CACGCATGCTCGGATAACAGATATTATCGCGG--AGAATTGT-ATTATGGCCGATGTTTACTTGCTGCACACACCGCTGG-GACTGGAGGCTATTTG-TACAACA-CGT-A-CTGTTTAACCGGTGAAACCTCACGGATTTAAGTC--GAGTATTGCAGA-CCAAATT--TTGGGCTAATTTTGTATG-----CGA-AATC--GACAGGGACGAGATAAATTT---------AGTCCATAGAAACCGacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattgtccttacactcggcaaccctggtcagtgtgtaactgtgagacctgtcaaccaccatgtcggtaacagatatacgcggagatgtattatgcctaccctgggtgaacgctattgtacaacaatgtaactgtttaacg
gi|8                          :                                                   ATCAAA-CA-CA--TATA-A-------------A-A-C-A-GGTCACTTG-TT---A-------CCA------AC-GTG---T-A---------A--CTGTGAGATTTG-TT-AAGCA-CC---A-TGTCGGTAACG-GATAT-ACGAG---G-A-ccccatgactcagagacgtggaaagggaggttcctacccccgcgcgatccagctggatgtattaatgcccctgattctactctgcccatccgtgatcgttgtattttttagtaatagcactagcgagcaatggaggtttacagagagcgcgacttcacgacaacttaacgtgtgttgcagtatagccctgaacacgagaacgttctttggttcacatgtttacttgaaagggaaactttgtctgtaaactttagggtttccttatcgagattgg
gi|12                         :                                                tctATCAAA-CA-CA--TATA-A-------------A-A-C-A-GGTCACTTG-TT---A-------CCA------AC-GTG---T-A---------A--CTGTGAGATTTG-TT-AAGCA-CC---A-TGTCGGTAACG-GATAT-ACGAG---G-A-gatgtattatgcctaccctgggtggatgctattgtacaactaacggtgaaacctcacggattaagtcaaagtattgcagaccaatttccttgggctaatttgtatgctacccgacaacctttagacggagaaattttggaaatttagcgatagaagctgatcgagggatatcgggtactgtgcgtattatgtcacattccactaatcctgatgtgatctgtttgttagcgcaatgggattacgggagaggcactcaacgcctacccctgtatgcagatagccctgaacaacgagaattttagtttcaatagtgtttacaggaattaggaacttcgtcttaccagacgttttcttatcattttgg
gi|5                          :                                                 tctTCAAAA----AC-TA-ATA-------------A-A-C-A-GGTCAC--G-CTTAAA-------CCA------TTATTTCCAT-A---------AAGCCATG----TCGTTTCAAACATACACAA-CAT--ATAAAG-A--ATGATGGG---G-ATCTGGGCA---TG--ATGAAA----ATGG--TG-TAATAA--TAACAA--ATAGC--TGAATAATTATGAGTGA-GC---CCATGGCCCTGTGGTCAACAAATGTTGGTGTTT-CAT-TGCCCA--A-ATTATTATCACCAGAAAACA-TTACT-CGACA----AACA-TAAG-GG---TTAG---------------AGAGATTGGAAGAG----CTG--ACGTT-T---TCAT--TCGCCTACT---TTGTGTCCCGAACTGACTTAG-A--AT-GTGTGGGTTA-CAC---TAAAGA-GAACCC--TG-GC-------AG--AC-----TGTACTGCCCTCCGCAG---ATC-TGTACCATCACGCCGTGAAGAAGAATCA---GC--CCATAAGGTAAATTTCTATGCACCTGTGACAGTCTTGTCA-GAT-TGTTTGAGA-A-GCGCTGTA--TTCAGAGATCAG--TTTGTTACCT---GGA-CA-ATTAATAATAC--A-ACCA-TTGCCTCCT--TTACAGTCAA--GAA-CT----TCAGC-GATTGTA-----CA-A--TA-AGACAATCCTTGTCATCTCAC-CATG-TCgatgtattatgcctaccctgggtggatgctattgtac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ccctcatgtgacgtcatactagtA----AACA-AAAGTGG---ATAG---------------AGAAATTGGCTCGG----CTG--GATTT-T---T-AT--CC-----CT---TTG--------TCTT---AAA-A--GT-GTGTGG-TCA-CAC---T---AAAGAAGCC--TG-GT------TAG--AC-----TGTAAG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -A-CA-TTG--TCT---TACCACTC-A--AAAACTCTGTTGAAC-G--TGTA-----ACAG--TG-AGA-----TTTGTCAAG-CAC-CATG-TCGG-TAACt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gA-TTG--TCC---TTACACTC-GG-CAA-CCCTGGTCAGT-G--TGTA-----ACTG--TG-AGA-----CCTGTCAAC-CAC-CATG-TCGG-TAACAGATAT-A-CGCGG--AGA--TG-TATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGAACGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-G
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tcaacccatgcgcatgtttgtgactcatcaaacacatataaaacgggtcacttgttaccattttttaatcatgtcgagatacgaagactgagaagatgaacatggggtgatcctgtgtggctattgccatggaccttggcgcaaatgttggtgttttcattgtaaaaacgaaaacatactcaacaaataggaagtggatagagaaattggctcagctgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntAA-CCCTGGTCAAC-G--TGCA-----CCTG--TG-AGA-----TTTGTCAAC-CAC-CATG-TCGG-
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atataaacaaagCAAC-G--TGTA-----ACTG--TG-AGA-----TTTGTTAAG-CAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGAGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAAC-------------TAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGCTACCCGACAACCTTTA----GACG-GAGAAATTTTGGAAATTTAG-CGATAGAAGCTGATCGAGGGATATCGGGTACTGTGC-GTATTATGTCACATTCCACTAATCCTGATGTGATCTGTTTGTT-----------------AGCGCAATGGGATTACGGG----------------AGAGGCACTCAACGCCTACCCCTGTATGCAG-ATAGCCCTGAACAACGAGAAT----TTTA-GTTTCAATAGTGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTCGTCTTAC-CAGA------CGTTTTCTTATCATTTTG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tctatcaaacacatataaaacaggtcacttgttacCAAC-G--TGTA-----ACTG--TG-AGA-----TTTGTTAAG-CAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGAGG--AGA--TG-TATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tctatcaaacacatataaaacaggtcacttgttac-CAC-CCTG-TCGG-AAACGGATAT-A-CGAGG--AAA--TGT-ATTATG-CT-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACACCAATGT-AAATGTTTAAC-GGTGAAAACTCACAGA-TTAAGTCAAAAGTATTGCAGA-CCGATTTCCTTGGGCTAA-
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gGATAT-A-CGCGG--AGA--TGT-ATTATG-CT-------------------TACC--TGG-A--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTCTTTAAC-G----------------------------TATTGCAGA-CCAATTTCCCTGGGCTAA-TTTGTATGCGACTCGA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaggcactcaacgcctacccctgtatgcagat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTACTGTGC-GTATTATGTCCCATTCCACTCATCCTGATGTGATCTGTTTGTT-----------------AGCGCAATGGGATTACGGG----------------AGAGGCACTCAACGCTTACCCCTGTATGCAA-ATAGCCCCGATCAACGTGAAC----TTTG-GTTTCAACAGTGTTTAcaag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AGGCACTCAACGCCTACCCCTGTATGCAG-AT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gcaccctgtcggaaacggatatacgaggaaatgtattatgcttaccctgggtggatgctattgtacaccaatgtaaatgtttaacggtgaaaactcacagattaagtcaaaagtattgcagaccgatttccttgggctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntTGT-TGCAGTATAGCCCTGAACA-CGAGAACGTTCTTTG-GTT-CAC--ATGTTTACTTG-AA--AGGGAAACTTTGTCTG---TAAACTTTAGGGTTTCCTTATCG





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              11111                            11    222222222222222                        1111111   111111            111111111        1111   3333333333333333333333333333333                    11111                  333333333333333333333     11111     11111                                                              222222222222                   1111                 22222222222222                       111111111      111111               3333333333333333   111         1111111111111                          11   333333      11   2                              111            2222222222                         1  111                                      111         22222222222          11   11          111111          11                             111111                                                             3333333333333333333                                                                                                                                            11  2222222                                   1111                                 11111         1111             22222222                                               111                                  1111                                 11           11                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1 5   5 0      1    00000      8888            7  3  44    111111111111111 3 3 3 3      3  3  666 1111111   000000  3   666 3 444444444 55  3  7777   9999999999999999999999999999999  4     777 4 4  1  11111  777     2       222222222222222222222 5   22222     22222   888 9999 0    5  5  5    77                3   5      77 5 888888888888       555   66  0 0000    66      0 5  11111111111111      5  8888     66 1 666666666  77  888888  77  1  22 77 0000000000000000   000     5   9999999999999     77  5     77  5    1 55   000000      55   3 6      2   1   99            111  99        5555555555             6  6    3   0  111    1 6     6             6     4 1   111   6  3  66666666666 5 5  5   33   11  5  5 5  555555  3 77    00    3 88     99999 1 55  3   000000      3 1   3    3    3          4 4  3  55   55   4      4  1111111111111111111    4    4 55           4 4       0   5 0         5                77      77            5       0          5         77        999999      88  6666666         8                         8888        6      6    1 99    0    66666    6    4444             44444444   2 99      99999      2    5  5              000       5    5                     4444    6         4          8  0    11         8 11             0               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          . .   . .      .    .....      ....            .  .  ..    ............... . . . .      .  .  ... .......   ......  .   ... . ......... ..  .  ....   ...............................  .     ... . .  .  .....  ...     .       ..................... .   .....     .....   ... .... .    .  .  .    ..                .   .      .. . ............       ...   ..  . ....    ..      . .  ..............      .  ....     .. . .........  ..  ......  ..  .  .. .. ................   ...     .   .............     ..  .     ..  .    . ..   ......      ..   . .      .   .   ..            ...  ..        ..........             .  .    .   .  ...    . .     .             .     . .   ...   .  .  ........... . .  .   ..   ..  .  . .  ......  . ..    ..    . ..     ..... . ..  .   ......      . .   .    .    .          . .  .  ..   ..   .      .  ...................    .    . ..           . .       .   . .         .                ..      ..            .       .          .         ..        ......      ..  .......         .                         ....        .      .    . ..    .    .....    .    ....             ........   . ..      .....      .    .  .              ...       .    .                     ....    .         .          .  .    ..         . ..             .               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          0 7   7 7      1    44444      7777            9  1  11    111111111111111 6 6 6 6      3  6  444 8888888   555555  6   444 6 555555555 00  7  0000   3333333333333333333333333333333  0     000 0 0  4  55555  000     0       222222222222222222222 0   55555     55555   888 8888 2    0  0  0    99                9   7      99 7 666666666666       999   44  7 6666    00      8 0  66666666666666      0  8888     99 0 666666666  99  666666  99  0  00 99 0000000000000000   000     7   3333333333333     99  7     99  7    4 00   888888      88   3 7      2   0   22            777  22        5555555555             7  7    7   8  777    0 7     7             7     0 0   777   7  7  00000000000 7 7  0   88   99  0  0 6  222222  6 66    00    6 66     11111 5 00  6   000000      6 0   3    3    6          0 0  0  55   55   0      0  0000000000000000000    0    0 55           4 4       1   0 1         0                11      11            7       7          7         77        111111      66  0000000         0                         5555        7      7    0 22    7    77777    7    2222             22222222   5 22      33333      5    7  7              000       7    7                     2222    7         2          0  8    00         0 22             8               
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACATAT-CCC-TGCGCCCACGCCATGCG-CATGTTCG--TGACTCATCAAAACA-CACCTATATA-------------A-A-C-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---T-A---------A--TCGTG----TCGTTTN-AA-CGN-CACG-CGTATAA-CG-G--AT-ACGGG---G-A-CTGGG-A---TG--ATGAAAATGGGGTG-------AT-----C------C-TGT-----GTGGC-----TAT---TG---CCATGG-AC-CT-TGGC--GCAAATGCTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-ACT-CGACA----AACA-NAAGTGGAT-AG------A-------GAAATT-GG-CTNAGCTG--ACG-TT-T---NAT--CC-----CTT--TGNCTCGA--A---AN----T-T----TGT---GGTCA-CAC---T---GA--AGAACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAG-NTGC------CCGCAG--CAT-T-GTACCATCACGGCC--GAAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AC-----TGCACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGNTCCCC---GGC-TGNTT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TT-AC-AGTC-A--A-AA-CTCTGTT--CAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-ANCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGNGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGC-GACCCGACAACCTTTAGGACG-AGA-------GAAATTTAG-CCATAGAAGCCGATCGAGGGATACC-GGGTACTGTGC-GTATTA-TGCCCC--ATTCTACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GA-TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCCGAACAACGAGAAC----TTTG-GTTTCAACAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-TTACCAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTG
Reference ( family-9207 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACATNT-CCC-TGCGCCCACGCCATGCG-CATGTTCG--TGACTCATCAAAACA-CACCTATATA-------------A-A-C-A-GGTCACTTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---T-A---------A--TCGTG----TCGTTTN-AA-CGN-CACA-CGTATAA-CG-G--AT-ACGGG---G-A-CTGGG-A---TG--ATGAAAATGGGGTG-------AT-----C------C-TGT-----GTGGC-----TAT---TN---CCATGG-AC-CT-TGGC--GCAAATGTTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-ACT-CGACA----AACA-NAAGTGGAT-AG------A-------GAAATT-GG-CTNAGCTG--ANG-TT-T---NAT--CC-----CTT--TGNCTNNA--A---AN----T-T----TGT---GGTCA-CAC---T---GA--AGAACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAG-GTGC------CCGCAG--CATCT-GTACCACCACGGCC--GAAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AC-----TGCACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGATCCCC---GGC-TGATT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TT-AC-AGTC-A--A-AA-CTCTGTT--CAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-ANCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGAGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGC-NACCCGACAACCTTTAGGACG-AGA-------GAAATTTAG-CCATAGAAGCCGATCGAGGGATACC-GG-TACTGTGC-GTATTA-TGCCNC--ATTCCACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GA-TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCCGAACAACGAGAAC----TTTG-GTTTCAACAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-TTACCAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTCATAAAAACAGCACCTATATACATAACATTAGTCACA-C-A-GGTCACATGATT---AGGACAACCCACGGAGATT-TTT---T-ACCCACACCGA--TCTGG----TCGTTTC-AA-CG--CACAGCGTATGATCG-----T-GTGGGCGTG-A-CTGGG-GAGTTGGGATGAAA-TGGAGTGGATGGGGAT-----C------T-AGT-----GTG-CAGAAATAT---TA---AAATGG-GC-CA-GGTC--GCAAATGTTGGTGTTTACATCTGTAAATAATA-----------AGAAAACA-T-ACTTCGACAGCAGAACA-TAAGTCGAC-AGCCATCTACGTCCTTGAGATTTGG---AAGATGCTACG-TTAT---CATGCCC-----CTT--TGGATTCT--A---ATACCAT-T----AGT---GGTTA-TACCTCT---AA--TGAACCTGTTGTGTCAC--ATATATACGTATGCGTAGGGCCGCGGGCCGTCTTGTACG--CACAGCT--GGGGATAAAACATAGACTGGCATAAGG---AGA----TGCACC-GTGAA-----TGTCAGGA-TG---GAGAAAAGCGCT-GGATTCAGATATC-ATTTGTTACCTAGTGGC-TGTTT-------C---ATA-CACTTG--TTCAATTGAC-AGTA-A--G-AA-CG-TGGT--AAACAG--TGTAAAAAATCCGACTA-GAA-----CCTGTCA-ACCACGCATGCTCGGATAACAGATATTATCGCGG--AGAATTGT-ATTATGGCCGATGTTTACTTGCTGCACACACCGCTGG-GACTGGAGGCTATTTG-TACAACA-CGT-A-CTGTTTAACCGGTGAAACCTCACGGATTTAAGTC--GAGTATTGCAGA-CCAAATT--TTGGGCTAATTTTGTATGCGAAATCGACA------GGGACG-AGA-------TAAATTTAGTCCATAGAAACCG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTGGAT-GTATTAATGCCCCTGATTCTACTCTGCCCATCCGTGATCGTTGT-ATTTTTTAGTAATAGCACTAGCGAGCAATGGAGGT-TTACAG-AGAGCGCGACTTCACGACAACTTAACGTGTGTTGCAGTATAGCCCTGAACA-CGAGAACGTTCTTTG-GTTC--ACA-TGTTTACTTG-AA--AGGGAAACTTTGTC-TG--TAAACTTTAGGGTTTCCTTATCGccccatgactcagagacgtggaaagggaggttcctacccccgcgcgatccagctggatgtattaatgcccctgattctactctgcccatccgtgatcgttgtattttttagtaatagcactagcgagcaatggaggtttacagagagcgcgacttcacgacaacttaacgtgtgttgcagtatagccctgaacacgagaacgttctttggttcacatgtttacttgaaagggaaactttgtctgtaaactttagggtttccttatcgagattgg
gi|10                         : ctcataaaaacagcacctatatacataacattagtcacacaggtcacatgattaggacaacccacggagattttttacccacaccgatctggtcgtttcaacgcacagcgtatgatcgtgtgggcgtgactggggagttgggatgaaatggagtggatggggatctagtgtgcagaaatattaaaatgggccaggtcgcaaatgttggtgtttacatctgtaaataataagaaaacatacttcgacagcagaacataagtcgacagccatctacgtccttgagatttggaagatgctacgttatcatgcccctttggattctaataccattagtggttatacctctaatgaacctgttgtgtcacatatatacgtatgcgtagggccgcgggccgtcttgtacgcacagctggggataaaacatagactggcataaggagatgcaccgtgaatgtcaggatggagaaaagcgctggattcagatatcatttgttacctagtggctgtttcatacacttgttcaattgacagtaagaacgtggtaaacagtgtaaaaaatccgactagaacctgtcaaccacgcatgctcggataacagatattatcgcggagaattgtattatggccgatgtttacttgctgcacacaccgctgggactggaggctatttgtacaacacgtactgtttaaccggtgaaacctcacggatttaagtcgagtattgcagaccaaattttgggctaattttgtatgcgaaatcgacagggacgagataaatttagtccatagaaaccgccccatgactcagagacgtggaaagggaggttcctacccccgcgcgatccagAGCTAGACATAT-CCC-TCCGCCCATGCCA-ACGTCATGTTCA--TGACTCATCAA---A-CACCTATATA-------------A-A-G-AGGGTCACTTG-TT---A-------CCA------TT-TCT---T-A---------A--TCATG----TCG--------------------------A-G--AT-ACGGG---G-A-CTGGG-G---TG--ATGAGAATGGGGTG-------AT-----C------C-TGT-----GTAGC-----TAT---TG---CCATGG-AC-CT-TGGagattgg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          G-TACTGTGC-GTATTA-TGTCCC--ATTCCACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GA-TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCTTACC---CCTGTAT-GCAA-ATAGCCCCGATCAACGTGAAC----TTTG-GTTTCAACAGTGTTTA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATCAAA-CA-CA--TATA-A-------------A-A-C-A-GGTCACTTG-TT---A-------CCA------AC-GTG---T-A---------A--CTGTGAGATTTG-TTA-AG-CAC-CATGTCG-GTAA-CG-GATAT-ACGAG---G-A-
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tctA-CT-TGTTACCAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTTA-AGCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGAGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACgatgtattatgcctaccctgggtggatgctattgtac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tctatcaaacacatataaaacaggtcGATAT-A-CGCGG--AGA--TGT-ATTATG-CT-------------------TACC--TGG-A--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTCTTTAAC-----------------------------GTATTGCAGA-CCAATTTCCCTGGGCTAA-TTTGTATGC-GACTCGACAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A----AACA-AAAGTGGAT-AG------A-------GAAATT-GG-CTCGGCTG--GAT-TT-T---TAT--CC-----CTT--TGTCTTAA--A---AG----T-G----TGT---GGTCA-CAC---T---AA--AGAAGCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAG-g
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCCCACGCTGTGTG-CATGTTCATTTGACTCATC-AAACA-CA--TAT----------------A-A-C-A-GGT-ACCTG--C---A-------CCA------TT-TTT---C-A---------A--t
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -A-CA-TTG--TC---TT-ACCACTC-A--A-AAACTCTGTT--GAAC-G--TGTAA-----CAG--TG-AGA-----TTTGTCA-AGCAC-CATG-TCGG-TAACatcat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        g-A--G-AA-CCCTGGT--CAAC-G--TGCAC-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-ACCAC-CATG-TCGG-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atataaacaaAGATAAACTTATTCCC-TGCGCCCATGCCAACTT-CATGTTCA--TGACTCATCAAAACA-C
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACTTAT-CCCCTGCGCCCATGCCAACTT-CATGTTCA--TGACTCATC-AAACA-C
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACATAT-CCC-TCCGCCAACGTCATGGG------------AACTCATCAAAAC-----CTATATA-------------A-AAC-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---TTC---------A--TCATG----TCGTTTTCAA-CGC-CACA-CGTATGA-TAAG--AT-ATGGG---GGA-CGAGG-A---TG--ATGAAAATGGGGTG-------CT-----C------C-TGT-----GTAGC-----TAT---TC---CCACGGAAC-CT-T-GC--GGAAATGTTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACATT-ACT---GCA----AACA-TAAGTGGTTAAG------A-------GAGATT-GGAAGAAGCTG--ACG-TT-TAACAAT--CC-----CTT--TGTCTATA--A---AT----G-T----TGT---G--CACCAC---TAAAGA--AAAACCC--TG-GTTAGGAGC-TGTAAG-TTGC------CCGCAGT-CAT-T-GTAATATCACGCCT--GAAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AC-----TGCACCTGTGAAA-TC-TGT-GAGA-TT---GAGAGA-GCGCTGGGATTCAGAGATC-A-TTGTTTACT---GGCATGCTT-------TCAAA-A-CA-TTGTTTCC--TT-AC-A-TC-AAGA-AA-CTCTGTT--CAGC-GT-TGTAC-----CTG--TGTAGA------CTGTCA-ACCAC-CATG-T-GG-TAACGGATAT-A-CGCGGAAAGA--TGT-ATTATG-CT-------------------TACC-CTGGTG--TGGATGGTATT-GTTACAACAATGTAAACTGTTTAAC-GGTGAGACCTCATGGA--TAAGTC-AACGTATTGCAGACCCAATT--CTT-GGCTAA-TTTGTATGC-GACTCGACA------AGGACG-AGA-------GAAATTTAG-CCATAGAAGCTGATCGCGGGATACC--G-TACTGTGTAGTATTA-TGCCTC--ATTCTACTC-----ATCC-TGA-----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GAGTTACAGGAGAG-GC-ACTCAACGCTTA-C---CTTGTAT-GCAG-ATAG-CCCGAACAACGAGAAC----TTTGCGTTTCAACAATG-TTACAGGAAATTAGG--AACTTTATCTTTACCAGACTTTAGCG-TTCCTTATCGTATTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gAGATAAACATCT-CCC-TGCGACCAACCCATGCG-CATGCTTG--TGACTCATCAAA-CA-CACCTATATA-------------A-A-CCA-GGATACTTG-TC---A-------CCA------TT-TTT---C-A---------A--TCATG----TTGTTTG-AA-CGG-CACA-CGTATAA-------------------------------------TGAAAATGGGG-G-------CT-----A------CGTGT-----GTGGG-----TAT---TC---CTATCG-ACACT-GGGC---CAGATGCAACTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-GCT-CAAGA----AACA-GAAGTGGAT-AG------A-------AAAATT-GG-CTCAGATG--ACG-GG-A---GAA--CC-------T--TGGGTCGA--AC--AC----TGT----TGT---GGTCA-CTC---T---GA--AAAACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAG--TGT------CTGCAG--CAT-T-GTACCACCACGGCC--GAAGAAGAAGCA---GC--GCTTAAGG---AC-----TGTACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAAAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGATCCCC---GGC-TGATT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TC-AC-AGTCTA--A-AA-ATCTGTT--CAAG-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-AGCAC-CATG-TCGC-TAACGGATAT-A-CGAGG--AGA--TGT-ATTATA-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAT-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAAGTTCCCTGGACTAA-TCTGCATGC-CACCCGACAACCTTTAGGACG--GA-------GACATTTAG-CCATAGAAGCCGATCGAGGGATACCTGG-TACTGCGC-GTATTA-TGCCAC--ATTCTACCC-----ATCC-TGAT----GTGATATGTTTGT--------TAGGG--CAATGA--GA-TTACGGCAGAG-GC-ACTCAACGCCTTCC---CCTGTAT-GCAG-ATACCCGTGAACAACGAGAAC----TTTG-GTTTCAACAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-TTACCAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTGg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACATTT-CCC-TCCGCCCATGCCGTGTG-CATGTTTA--TGACTCATCAAAACA-CACCTATATG-------------A-A-C-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCG------TT-TTT---T-A---------A--TCATG----TCGATTA-AA-CAG-CGGA-CGTATGA-CA-G--AT-ACGAG---G-A-CTGGG-A---TG--ATGAAAGTGGGGTG-------CT-----C------C-TGT-----GTAGC-----TAT---TG---TGGTGG-AC-GT-TGGC--GCAAATGCTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-ACT-CGACA----AACA-AAAGTGGAT-AG------A-------GTATTT-GG-CTCAGCTG--GAG-TT-T---TAT--CC-----CTT--TGACTATA--A---AG----T-T----TGT---GGTTA-CAC---T---GA--CAAACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAG-GTTT------CCGCAG--CAT-T-GTATCATCACGCCT--GAAGACGAAACA---GC--GCATAAGG---AC-----TGTACTTGTGAGA-TC-TGTCAGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GG-TTCAGAGATC-ATTTCATCCCC---GGC-TGTTT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TG-AC-ACTC-A--C-AA-CCCTGGT--CAAC-G--TGTAC-----CTG--TG-AGA-----CCTGTCA-ACCGC-CATG-TCGG-TAACAGATAT-A-CGCGG--AGA--TGTTATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGC-GACCCGA-AACCTTTACGACG--GA-------GAAATTTAG-CTATAGAAGCTGATCGAGGGATACC-GGGTACTGTGC-GTATTA-TGACCC--ATTCTACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAG---------------------GAGAG-GC-ACTCAACGCTCACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCCGAACAACGTGAAC----TTTG-GTTTCAAGAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-T---CAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTGg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCAAAA----AC-TA-ATA-------------A-A-C-A-GGTCAC--G-CTTAAA-------CCA------TTATTTCCAT-A---------AAGCCATG----TCGTTTC-AAACATACACAACATATAA-AG-A--ATGATGGG---G-ATCTGGGCA---TG--ATGAAAATGGTGTA-------ATAATAACAAATAGC-TGA-----ATAAT-----TATGAGTGAGCCCATGG-CC-CTGTGGTCAACAAATGTTGGTGTTT-CAT-TGCCCA--A-ATTATTATCACCAGAAAACA-TTACT-CGACA----AACA-TAAG-GGTT-AG------A-------GAGATT-GG-AAGAGCTG--ACGTTT-T---CAT--TCGCCTACTTTGTGTCCCGA--ACTGAC----T-TAGAATGTGTGGGTTA-CAC---T---AAAGAGAACCC--TG-G-CAG--AC-TGTA---CTGCCCT---CCGCAG---ATCT-GTACCATCAC-GCCGTGAAGAAGAATCA---GC--CCATAAGGTAAATTTCTATGCACCTGTGACAGTCTTGTC-AGATTGTTTGAGA-A-GCGCT-GTATTCAGAGATCAGTTTGTTACCT---GGA-CAATTAATAATAC---A-ACCA-TTGCCTCCT-TT-AC-AGTC-A--AGAA-C----TT--CAGC-GATTGT-A-----CAA--TA-AGACAATCCTTGTCATCTCAC-CATG-TC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccctcatgtgacgtcatactagtCCATGCG-CATGTTTG--TGACTCATCAAA-CA-CA--TATA-A-------------A-A-C-G-GGTCACTTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---T-A---------A--TCATG----TCG--------------------------A-G--AT-ACGAA---G-A-CTGAG-A---AG--ATGAACATGGGGTG-------AT-----C------C-TGT-----GTGGC-----TAT---TG---CCATGG-AC-CT-TGGC--GCAAATGTTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------CGAAAACA-T-ACT-CAACA----AATAGGAAGTGGAT-AG------A-------GAAATT-GG-CTCAGCTG--A
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tcaacA-TTG--TCC--TT-AC-ACTC-G--GCAA-CCCTGGT--CAGT-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----CCTGTCA-ACCAC-CATG-TCGG-TAACAGATAT-A-CGCGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGAACGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-Gcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattgtccttacactcggcaaccctggtcagtgtgtaactgtgagacctgtcaaccaccatgtcggtaacagatatacgcggagatgtattatgcctaccctgggtgaacgctattgtacaacaatgtaactgtttaacg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tcaacccatgcgcatgtttgtgactcatcaaacacatataaaacgggtcacttgttaccattttttaatcatgtcgagatacgaagactgagaagatgaacatggggtgatcctgtgtggctattgccatggaccttggcgcaaatgttggtgttttcattgtaaaaacgaaaacatactcaacaaataggaagtggatagagaaattggctcagctgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntAGATAAACATCC-CCT-TGCGCCCACGCC-------------G--TGACTCATCAAAACA-CGCCTGCATA-------------A-A-C-A-GGTAACCTG-TC---A-------CCA------TT-TTT---C-A---------A--TCATG----TCGTTTG-AA-CGG-CACA-CGTATAA-TG-A--AT-ATGGG---G-G-CT----A---TG---TG----TGTGGCT-------ATT----C------C-TATCGACAGTGGC-----TAT---TC---CTATCG-AT-AT-TGGG--GCAGATGCAACTGTTTCCAT-TGTAAA--A-A---------------------------GA-A----AACA-CAATTGGTT-AG------A-------GAAATT-GG-CTGAGGCG--AAG-GG-A---GAA--CC-------T--TGGCTTGAGTA---CT----T-T----TGT---GGTCA-CAC---T---------AACCC--TG-GTTAG--AC-TGT-AG-GTGC------CCGCAG--CAT-T-GTACCACCACGGCC--GAAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AT-----TGTACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGATCCCC---GGC-TGATT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TT-GC-AGTCAA--A-AA-CTCTGTT--CAAG-G--TGTAA-----C----TG-AGA-----TTTGTGA-AGCAC-CATG-TCGG-TGACCGATAT-A-CGAGG--AGA--TGA-ATTATA-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATCAAA-CA-CA--TATA-A-------------A-A-C-A-GGTCACTTG-TT---A-------CCA------AC-GTG---T-A---------A--CTGTGAGATTTG-TTA-AG-CAC-CATGTCG-GTAA-CG-GATAT-ACGAG---G-A-
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tctA-CT-TGTTACCAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTTA-AGCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGAGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAAC-------------TAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGC-TACCCGACAACCTTTAG-ACGGAGAAATTTTGGAAATTTAG-CGATAGAAGCTGATCGAGGGATATC-GGGTACTGTGC-GTATTA-TGTCAC--ATTCCACTA-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GA-TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCTGAACAACGAGAAT----TTTA-GTTTCAATAGTGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTCGTC-TTACCAGA------CGTTTTCTTATCATTTTGgatgtattatgcctaccctgggtggatgctattgtacaactaacggtgaaacctcacggattaagtcaaagtattgcagaccaatttccttgggctaatttgtatgctacccgacaacctttagacggagaaattttggaaatttagcgatagaagctgatcgagggatatcgggtactgtgcgtattatgtcacattccactaatcctgatgtgatctgtttgttagcgcaatgggattacgggagaggcactcaacgcctacccctgtatgcagatagccctgaacaacgagaattttagtttcaatagtgtttacaggaattaggaacttcgtcttaccagacgttttcttatcattttgg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tctatcaaacacatataaaacaggtcCAC-CCTG-TCGG-AAACGGATAT-A-CGAGG--AAA--TGT-ATTATG-CT-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACACCAATGT-AAATGTTTAAC-GGTGAAAACTCACAGA-TTAAGTCAAAAGTATTGCAGA-CCGATTTCCTTGGGCTAA-g
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaggcactcaacgcctacccctgtatgcagat





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              11111                            11    222222222222222                        1111111   111111            111111111        1111   44444444444444444444444444444444                    11111                  333333333333333333333     11111     11111       1111                                                   222222222222                   1111                 22222222222222                         2222222      111111    111        3333333333333333             11111111                             1111   111111  111    11   11                             111            2222222222                         1  111                                      111         22222222222          11   11          111111          11                             111111                                                             3333333333333333333                                                                                                                                            11  2222222                                                                       11111         1111             22222222                                               111                                  1111                                 11           11                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1 5   5 0      1    00000      8888            7  3  44    111111111111111 3 3 3 3      4  3  666 1111111   000000  3   666 3 444444444 55  3  7777   33333333333333333333333333333333  4     777 4 4  1  11111  777     2       222222222222222222222 5   22222     22222   888 0000 0    5  5  5    77                3   5      77 5 888888888888       555   66  0 0000    66      0 5  11111111111111      5  8888     66     0000000  77  888888    444  44 77 5555555555555555     5   5   55555555 22 77    77  5  0  77  5    6666   999999  111    55   55            6   99           111  99        5555555555             6  6    3   0  111    1 6     6             6     1 1   111   6  1  66666666666 5 5  5   33   11  5  5 5  555555  3 77    00    3 88     99999 1 55  3   000000      3 1   3    3    3          4 4  1  55   55   4      4  1111111111111111111    4    4 55           4 4       0   5 0         5                77      77            5       0          5          6        999999      88  6666666         8                         8          6      6    1 99         66666    6    4444             44444444   2 99      99999      2    5  5              000       5    5                     4444    6         4          8  0    11         8 11             0               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          . .   . .      .    .....      ....            .  .  ..    ............... . . . .      .  .  ... .......   ......  .   ... . ......... ..  .  ....   ................................  .     ... . .  .  .....  ...     .       ..................... .   .....     .....   ... .... .    .  .  .    ..                .   .      .. . ............       ...   ..  . ....    ..      . .  ..............      .  ....     ..     .......  ..  ......    ...  .. .. ................     .   .   ........ .. ..    ..  .  .  ..  .    ....   ......  ...    ..   ..            .   ..           ...  ..        ..........             .  .    .   .  ...    . .     .             .     . .   ...   .  .  ........... . .  .   ..   ..  .  . .  ......  . ..    ..    . ..     ..... . ..  .   ......      . .   .    .    .          . .  .  ..   ..   .      .  ...................    .    . ..           . .       .   . .         .                ..      ..            .       .          .          .        ......      ..  .......         .                         .          .      .    . ..         .....    .    ....             ........   . ..      .....      .    .  .              ...       .    .                     ....    .         .          .  .    ..         . ..             .               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          6 7   7 7      1    44444      7777            9  1  11    111111111111111 6 6 6 6      1  6  444 8888888   555555  6   444 6 555555555 00  7  0000   55555555555555555555555555555555  0     000 0 0  4  55555  000     0       222222222222222222222 0   55555     55555   888 1111 2    0  0  0    99                9   7      99 7 666666666666       999   44  7 6666    00      8 0  66666666666666      0  8888     99     9999999  99  666666    666  77 99 7777777777777777     7   7   00000000 00 99    99  7  1  99  7    2222   222222  777    88   88            7   22           777  22        5555555555             7  7    7   8  777    0 7     7             7     0 0   777   7  0  00000000000 7 7  0   88   99  0  0 6  222222  6 66    00    6 66     11111 5 00  6   000000      6 0   3    3    6          0 0  0  55   55   0      0  0000000000000000000    0    0 55           4 4       1   0 1         0                11      11            7       7          7          7        111111      66  0000000         0                         8          7      7    0 22         77777    7    2222             22222222   5 22      33333      5    7  7              000       7    7                     2222    7         2          0  8    00         0 22             8               
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACATAT-CCC-TGCGCCCACGCCATGCG-CATGTTCG--TGACTCATCAAAACA-CACCTATATA-------------A-A-C-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---T-A---------A--TCGTG----TCGTTTN-AA-CGN-CAC-G-CGTATAA-CG-G--AT-ACGGG---G-A-CTGGG-A---TG--ATGAAAATGGGGTG-------AT-----C------C-TGT-----GTGGC-----TAT---TG---CCATGG-AC-CT-TGGC--GCAAATGCTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-ACT-CGACA----AACA-NAAGTGGAT-AG------A-------GAAATT-GG-CTNAGCTG--ACGTT-T---N-AT--CC-----CTTTGN--CTCGA--A---AC--T-T------TGTGG-TCA-CAC---T---GAAGA--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAGN-TGC------CC---GCAG--CAT--TGTACCATCACGGCCG--AAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AC-----TGCACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGNTCCCC---GGC-TGNTT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TT-AC-AGTC-A--A-AA-CTCTGTT--CAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-ANCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGNGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGCG-ACCCGACAACCTTTAGGACG-AGA-------GAAATTTAG-CCATAGAAGCCGATCGAGGGATACCGGGTACTGTGC-GTATTA-TGCCCC--ATTCTACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GA-TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCCGAACAACGAGAAC----TTTG-GTTTCAACAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-TTACCAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTG
Reference ( family-9207 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACATAT-CCC-TGCGCCCACGCCATGCG-CATGTTCG--TGACTCATCAAAACA-CACCTATATA-------------A-A-C-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---T-A---------A--TCGTG----TCGTTTN-AA-CGN-CAC-G-CGTATAA-CG-G--AT-ACGGG---G-A-CTGGG-A---TG--ATGAAAATGGGGTG-------AT-----C------C-TGT-----GTGGC-----TAT---TG---CCATGG-AC-CT-TGGC--GCAAATGCTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-ACT-CGACA----AACA-NAAGTGGAT-AG------A-------GAAATT-GG-CTNAGCTG--ACGTT-T---N-AT--CC-----CTTTGN--CTCGA--A---AN--T-T------TGTGG-TCA-CAC---T---GAAGA--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAGN-TGC------CC---GCAG--CAT--TGTACCATCACGGCCG--AAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AC-----TGCACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGNTCCCC---GGC-TGNTT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TT-AC-AGTC-A--A-AA-CTCTGTT--CAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-ANCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGNGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGCG-ACCCGACAACCTTTAGGACG-AGA-------GAAATTTAG-CCATAGAAGCCGATCGAGGGATACCGGGTACTGTGC-GTATTA-TGCCCC--ATTCTACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GA-TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCCGAACAACGAGAAC----TTTG-GTTTCAACAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-TTACCAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTCATAAAAACAGCACCTATATACATAACATTAGTCACA-C-A-GGTCACATGATT---AGGACAACCCACGGAGATT-TTT---T-ACCCACACCGA--TCTGG----TCGTTTC-AA-CG--CACAG-CGTATGATCG-----T-GTGGGCGTG-A-CTGGG-GAGTTGGGATGAAA-TGGAGTGGATGGGGAT-----C------T-AGT-----GTG-CAGAAATAT---TA---AAATGG-GC-CA-GGTC--GCAAATGTTGGTGTTTACATCTGTAAATAATA-----------AGAAAACA-T-ACTTCGACAGCAGAACA-TAAGTCGAC-AGCCATCTACGTCCTTGAGATTTGG---AAGATGCTACGTTAT---C-ATGCCC-----CTTTGGA-TTCTA--AT--ACCAT-T------AGTGG-TTA-TACCTCT---AATGA--ACCTGTTGTGTCAC--ATATATACGTATGCGTAGGGCC---GCGGGCCGTCTTGTACG--CACAGCTG--GGGATAAAACATAGACTGGCATAAGG---AGA----TGCACC-GTGAA-----TGTCAGGA-TG---GAGAAAAGCGCT-GGATTCAGATATC-ATTTGTTACCTAGTGGC-TGTTT-------C---ATA-CACTTG--TTCAATTGAC-AGTA-A--G-AA-CG-TGGT--AAACAG--TGTAAAAAATCCGACTA-GAA-----CCTGTCA-ACCACGCATGCTCGGATAACAGATATTATCGCGG--AGAATTGT-ATTATGGCCGATGTTTACTTGCTGCACACACCGCTGG-GACTGGAGGCTATTTG-TACAACA-CGT-A-CTGTTTAACCGGTGAAACCTCACGGATTTAAGTC--GAGTATTGCAGA-CCAAATT--TTGGGCTAATTTTGTATGCGAAATCGACA------GGGACG-AGA-------TAAATTTAGTCCATAGAAACCG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTGGAT-GTATTAATGCCCCTGATTCTACTCTGCCCATCCGTGATCGTTGT-ATTTTTTAGTAATAGCACTAGCGAGCAATGGAGGT-TTACAG-AGAGCGCGACTTCACGACAACTTAACGTGTGTTGCAGTATAGCCCTGAACA-CGAGAACGTTCTTTG-GTTC--ACA-TGTTTACTTG-AA--AGGGAAACTTTGTC-TG--TAAACTTTAGGGTTTCCTTATCGccccatgactcagagacgtggaaagggaggttcctacccccgcgcgatccagctggatgtattaatgcccctgattctactctgcccatccgtgatcgttgtattttttagtaatagcactagcgagcaatggaggtttacagagagcgcgacttcacgacaacttaacgtgtgttgcagtatagccctgaacacgagaacgttctttggttcacatgtttacttgaaagggaaactttgtctgtaaactttagggtttccttatcgagattgg
gi|10                         : ctcataaaaacagcacctatatacataacattagtcacacaggtcacatgattaggacaacccacggagattttttacccacaccgatctggtcgtttcaacgcacagcgtatgatcgtgtgggcgtgactggggagttgggatgaaatggagtggatggggatctagtgtgcagaaatattaaaatgggccaggtcgcaaatgttggtgtttacatctgtaaataataagaaaacatacttcgacagcagaacataagtcgacagccatctacgtccttgagatttggaagatgctacgttatcatgcccctttggattctaataccattagtggttatacctctaatgaacctgttgtgtcacatatatacgtatgcgtagggccgcgggccgtcttgtacgcacagctggggataaaacatagactggcataaggagatgcaccgtgaatgtcaggatggagaaaagcgctggattcagatatcatttgttacctagtggctgtttcatacacttgttcaattgacagtaagaacgtggtaaacagtgtaaaaaatccgactagaacctgtcaaccacgcatgctcggataacagatattatcgcggagaattgtattatggccgatgtttacttgctgcacacaccgctgggactggaggctatttgtacaacacgtactgtttaaccggtgaaacctcacggatttaagtcgagtattgcagaccaaattttgggctaattttgtatgcgaaatcgacagggacgagataaatttagtccatagaaaccgccccatgactcagagacgtggaaagggaggttcctacccccgcgcgatccagAGCTAGACATAT-CCC-TCCGCCCATGCCA-ACGTCATGTTCA--TGACTCATCAA---A-CACCTATATA-------------A-A-G-AGGGTCACTTG-TT---A-------CCA------TT-TCT---T-A---------A--TCATG----TCG---------------------------A-G--AT-ACGGG---G-A-CTGGG-G---TG--ATGAGAATGGGGTG-------AT-----C------C-TGT-----GTAGC-----TAT---TG---CCATGG-AC-CT-TGGagattgg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTACTGTGC-GTATTA-TGTCCC--ATTCCACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GA-TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCTTACC---CCTGTAT-GCAA-ATAGCCCCGATCAACGTGAAC----TTTG-GTTTCAACAGTGTTTA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATCAAA-CA-CA--TATA-A-------------A-A-C-A-GGTCACTTG-TT---A-------CCA------AC-GTG---T-A---------A--CTGTGAGATTTG-TTA-AG-CAC-CAT-GTCG-GTAA-CG-GATAT-ACGAG---G-A-
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tctA-CT-TGTTACCAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTTA-AGCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGAGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACgatgtattatgcctaccctgggtggatgctattgtac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tctatcaaacacatataaaacaggtcGATAT-A-CGCGG--AGA--TGT-ATTATG-CT-------------------TACC--TGG-A--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTCTTTAAC-----------------------------GTATTGCAGA-CCAATTTCCCTGGGCTAA-TTTGTATGCG-ACTCGACAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A----AACA-AAAGTGGAT-AG------A-------GAAATT-GG-CTCGGCTG--GATTT-T---T-AT--CC-----CTTTGT--CTTAA--A---AG--T-G------TGTGG-TCA-CAC---T---AAAGA--AGCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAGg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCCCACGCTGTGTG-CATGTTCATTTGACTCATC-AAACA-CA--TAT----------------A-A-C-A-GGT-ACCTG--C---A-------CCA------TT-TTT---C-A---------A--t
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -A-CA-TTG--TC---TT-ACCACTC-A--A-AAACTCTGTT--GAAC-G--TGTAA-----CAG--TG-AGA-----TTTGTCA-AGCAC-CATG-TCGG-TAACatcat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          g-A--G-AA-CCCTGGT--CAAC-G--TGCAC-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-ACCAC-CATG-TCGG-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atataaacaaAGATAAACTTATTCCC-TGCGCCCATGCCAACTT-CATGTTCA--TGACTCATCAAAACA-C
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACTTAT-CCCCTGCGCCCATGCCAACTT-CATGTTCA--TGACTCATC-AAACA-C
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACATAT-CCC-TCCGCCAACGTCATGGG------------AACTCATCAAAAC-----CTATATA-------------A-AAC-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---TTC---------A--TCATG----TCGTTTTCAA-CGC-CAC-A-CGTATGA-TAAG--AT-ATGGG---GGA-CGAGG-A---TG--ATGAAAATGGGGTG-------CT-----C------C-TGT-----GTAGC-----TAT---TC---CCACGGAAC-CT-T-GC--GGAAATGTTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACATT-ACT---GCA----AACA-TAAGTGGTTAAG------A-------GAGATT-GGAAGAAGCTG--ACGTT-TAACA-AT--CC-----CTTTGT--CTATA--A---AT--G-T------TGTG---CACCAC---TAAAGAAAA--ACCC--TG-GTTAGGAGC-TGTAAGT-TGC------CC---GCAGT-CAT--TGTAATATCACGCCTG--AAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AC-----TGCACCTGTGAAA-TC-TGT-GAGA-TT---GAGAGA-GCGCTGGGATTCAGAGATC-A-TTGTTTACT---GGCATGCTT-------TCAAA-A-CA-TTGTTTCC--TT-AC-A-TC-AAGA-AA-CTCTGTT--CAGC-GT-TGTAC-----CTG--TGTAGA------CTGTCA-ACCAC-CATG-T-GG-TAACGGATAT-A-CGCGGAAAGA--TGT-ATTATG-CT-------------------TACC-CTGGTG--TGGATGGTATT-GTTACAACAATGTAAACTGTTTAAC-GGTGAGACCTCATGGA--TAAGTC-AACGTATTGCAGACCCAATT--CTT-GGCTAA-TTTGTATGCG-ACTCGACA------AGGACG-AGA-------GAAATTTAG-CCATAGAAGCTGATCGCGGGATACC--GTACTGTGTAGTATTA-TGCCTC--ATTCTACTC-----ATCC-TGA-----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GAGTTACAGGAGAG-GC-ACTCAACGCTTA-C---CTTGTAT-GCAG-ATAG-CCCGAACAACGAGAAC----TTTGCGTTTCAACAATG-TTACAGGAAATTAGG--AACTTTATCTTTACCAGACTTTAGCG-TTCCTTATCGTATTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gAGATAAACATCT-CCC-TGCGACCAACCCATGCG-CATGCTTG--TGACTCATCAAA-CA-CACCTATATA-------------A-A-CCA-GGATACTTG-TC---A-------CCA------TT-TTT---C-A---------A--TCATG----TTGTTTG-AA-CGG-CAC-A-CGTATAA-------------------------------------TGAAAATGGGG-G-------CT-----A------CGTGT-----GTGGG-----TAT---TC---CTATCG-ACACT-GGGC---CAGATGCAACTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-GCT-CAAGA----AACA-GAAGTGGAT-AG------A-------AAAATT-GG-CTCAGATG--ACGGG-A---G-AA--CC-------TTGG--GTCGA--AC--AC--TGT------TGTGG-TCA-CTC---T---GAAAA--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAG--TGT------CT---GCAG--CAT--TGTACCACCACGGCCG--AAGAAGAAGCA---GC--GCTTAAGG---AC-----TGTACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAAAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGATCCCC---GGC-TGATT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TC-AC-AGTCTA--A-AA-ATCTGTT--CAAG-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-AGCAC-CATG-TCGC-TAACGGATAT-A-CGAGG--AGA--TGT-ATTATA-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAT-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAAGTTCCCTGGACTAA-TCTGCATGCC-ACCCGACAACCTTTAGGACG--GA-------GACATTTAG-CCATAGAAGCCGATCGAGGGATACCTGGTACTGCGC-GTATTA-TGCCAC--ATTCTACCC-----ATCC-TGAT----GTGATATGTTTGT--------TAGGG--CAATGA--GA-TTACGGCAGAG-GC-ACTCAACGCCTTCC---CCTGTAT-GCAG-ATACCCGTGAACAACGAGAAC----TTTG-GTTTCAACAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-TTACCAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTGg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACATTT-CCC-TCCGCCCATGCCGTGTG-CATGTTTA--TGACTCATCAAAACA-CACCTATATG-------------A-A-C-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCG------TT-TTT---T-A---------A--TCATG----TCGATTA-AA-CAG-CGG-A-CGTATGA-CA-G--AT-ACGAG---G-A-CTGGG-A---TG--ATGAAAGTGGGGTG-------CT-----C------C-TGT-----GTAGC-----TAT---TG---TGGTGG-AC-GT-TGGC--GCAAATGCTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-ACT-CGACA----AACA-AAAGTGGAT-AG------A-------GTATTT-GG-CTCAGCTG--GAGTT-T---T-AT--CC-----CTTTGA--CTATA--A---AG--T-T------TGTGG-TTA-CAC---T---GACAA--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAGG-TTT------CC---GCAG--CAT--TGTATCATCACGCCTG--AAGACGAAACA---GC--GCATAAGG---AC-----TGTACTTGTGAGA-TC-TGTCAGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GG-TTCAGAGATC-ATTTCATCCCC---GGC-TGTTT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TG-AC-ACTC-A--C-AA-CCCTGGT--CAAC-G--TGTAC-----CTG--TG-AGA-----CCTGTCA-ACCGC-CATG-TCGG-TAACAGATAT-A-CGCGG--AGA--TGTTATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGCG-ACCCGA-AACCTTTACGACG--GA-------GAAATTTAG-CTATAGAAGCTGATCGAGGGATACCGGGTACTGTGC-GTATTA-TGACCC--ATTCTACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAG---------------------GAGAG-GC-ACTCAACGCTCACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCCGAACAACGTGAAC----TTTG-GTTTCAAGAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-T---CAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTGg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCAAAA----AC-TA-ATA-------------A-A-C-A-GGTCAC--G-CTTAAA-------CCA------TTATTTCCAT-A---------AAGCCATG----TCGTTTC-AAACATACAC-AACATATAA-AG-A--ATGATGGG---G-ATCTGGGCA---TG--ATGAAAATGGTGTA-------ATAATAACAAATAGC-TGA-----ATAAT-----TATGAGTGAGCCCATGG-CC-CTGTGGTCAACAAATGTTGGTGTTT-CAT-TGCCCA--A-ATTATTATCACCAGAAAACA-TTACT-CGACA----AACA-TAAG-GGTT-AG------A-------GAGATT-GG-AAGAGCTG--ACGTT-T---TCAT--TCGCCTACTTTGTGTCCCGA--ACTGAC--T-TAGAATGTGTGGGTTA-CAC---T---AAAGAGAACCC--TG-GC-AG--AC-TGTA--C-TGC------CCTCCGCAG---ATC-TGTACCATCACG-CCGTGAAGAAGAATCA---GC--CCATAAGGTAAATTTCTATGCACCTGTGACAGTCTTGTC-AGATTGTTTGAGA-A-GCGCT-GTATTCAGAGATCAGTTTGTTACCT---GGA-CAATTAATAATAC---A-ACCA-TTGCCTCCT-TT-AC-AGTC-A--AGAA-C----TT--CAGC-GATTGT-A-----CAA--TA-AGACAATCCTTGTCATCTCAC-CATG-TC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccctcatgtgacgtcatactagtCCATGCG-CATGTTTG--TGACTCATCAAA-CA-CA--TATA-A-------------A-A-C-G-GGTCACTTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---T-A---------A--TCATG----TCG---------------------------A-G--AT-ACGAA---G-A-CTGAG-A---AG--ATGAACATGGGGTG-------AT-----C------C-TGT-----GTGGC-----TAT---TG---CCATGG-AC-CT-TGGC--GCAAATGTTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------CGAAAACA-T-ACT-CAACA----AATAGGAAGTGGAT-AG------A-------GAAATT-GG-CTCAGCTG--AC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcaacA-TTG--TCC--TT-AC-ACTC-G--GCAA-CCCTGGT--CAGT-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----CCTGTCA-ACCAC-CATG-TCGG-TAACAGATAT-A-CGCGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGAACGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattgtccttacactcggcaaccctggtcagtgtgtaactgtgagacctgtcaaccaccatgtcggtaacagatatacgcggagatgtattatgcctaccctgggtgaacgctattgtacaacaatgtaactgtttaacg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tcaacccatgcgcatgtttgtgactcatcaaacacatataaaacgggtcacttgttaccattttttaatcatgtcgagatacgaagactgagaagatgaacatggggtgatcctgtgtggctattgccatggaccttggcgcaaatgttggtgttttcattgtaaaaacgaaaacatactcaacaaataggaagtggatagagaaattggctcagctgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntAGATAAACATCC-CCT-TGCGCCCACGCC-------------G--TGACTCATCAAAACA-CGCCTGCATA-------------A-A-C-A-GGTAACCTG-TC---A-------CCA------TT-TTT---C-A---------A--TCATG----TCGTTTG-AA-CGG-CAC-A-CGTATAA-TG-A--AT-ATGGG---G-G-CT----A---TG---TG----TGTGGCT-------ATT----C------C-TATCGACAGTGGC-----TAT---TC---CTATCG-AT-AT-TGGG--GCAGATGCAACTGTTTCCAT-TGTAAA--A-A---------------------------GA-A----AACA-CAATTGGTT-AG------A-------GAAATT-GG-CTGAGGCG--AAGGG-A---G-AA--CC-------TTGG--CTTGAGTA---CT--T-T------TGTGG-TCA-CAC---T-------A--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTA-GG-TGC------CC---GCAG--CAT--TGTACCACCACGGCCG--AAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AT-----TGTACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGATCCCC---GGC-TGATT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TT-GC-AGTCAA--A-AA-CTCTGTT--CAAG-G--TGTAA-----C----TG-AGA-----TTTGTGA-AGCAC-CATG-TCGG-TGACCGATAT-A-CGAGG--AGA--TGA-ATTATA-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATCAAA-CA-CA--TATA-A-------------A-A-C-A-GGTCACTTG-TT---A-------CCA------AC-GTG---T-A---------A--CTGTGAGATTTG-TTA-AG-CAC-CAT-GTCG-GTAA-CG-GATAT-ACGAG---G-A-
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tctA-CT-TGTTACCAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTTA-AGCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGAGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAAC-------------TAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGCT-ACCCGACAACCTTTAG-ACGGAGAAATTTTGGAAATTTAG-CGATAGAAGCTGATCGAGGGATATCGGGTACTGTGC-GTATTA-TGTCAC--ATTCCACTA-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GA-TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCTGAACAACGAGAAT----TTTA-GTTTCAATAGTGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTCGTC-TTACCAGA------CGTTTTCTTATCATTTTGgatgtattatgcctaccctgggtggatgctattgtacaactaacggtgaaacctcacggattaagtcaaagtattgcagaccaatttccttgggctaatttgtatgctacccgacaacctttagacggagaaattttggaaatttagcgatagaagctgatcgagggatatcgggtactgtgcgtattatgtcacattccactaatcctgatgtgatctgtttgttagcgcaatgggattacgggagaggcactcaacgcctacccctgtatgcagatagccctgaacaacgagaattttagtttcaatagtgtttacaggaattaggaacttcgtcttaccagacgttttcttatcattttgg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tctatcaaacacatataaaacaggtcCAC-CCTG-TCGG-AAACGGATAT-A-CGAGG--AAA--TGT-ATTATG-CT-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACACCAATGT-AAATGTTTAAC-GGTGAAAACTCACAGA-TTAAGTCAAAAGTATTGCAGA-CCGATTTCCTTGGGCTAA-g
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaggcactcaacgcctacccctgtatgcagat





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              11111                            11    222222222222222                        1111111   111111            111111111        1111   44444444444444444444444444444444                    11111                  333333333333333333333     11111     11111       1111                                                   222222222222                   1111                 22222222222222                         2222222      111111    111      333333333333333333            11111111                             1111   111111  111    11   11                             111            2222222222                         1  111                                      111         22222222222          11   11          111111          11                             111111                                                             3333333333333333333                                                                                                                                            11  2222222                                                                       11111         1111             22222222                                               111                                  1111                                 11           11                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1 5   5 0      1    00000      8888            7  3  44    111111111111111 3 3 3 3      4  3  666 1111111   000000  3   666 3 444444444 55  3  7777   33333333333333333333333333333333  4     777 4 4  1  11111  777     2       222222222222222222222 5   22222     22222   888 0000 0    5  5  5    77                3   5      77 5 888888888888       555   66  0 0000    66      0 5  11111111111111      5  8888     66     0000000  77  888888    444  44  666666666666666666    5   5   55555555 22 77    77  5  0  77  5    6666   999999  111    55   55            6   99           111  99        5555555555             6  6    3   0  111    1 6     6             6     1 1   111   6  1  66666666666 5 5  5   33   11  5  5 5  555555  3 77    00    3 88     99999 1 55  3   000000      3 1   3    3    3          4 4  1  55   55   4      4  1111111111111111111    4    4 55           4 4       0   5 0         5                77      77            5       0          5          6        999999      88  6666666         8                         8          6      6    1 99         66666    6    4444             44444444   2 99      99999      2    5  5              000       5    5                     4444    6         4          8  0    11         8 11             0               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          . .   . .      .    .....      ....            .  .  ..    ............... . . . .      .  .  ... .......   ......  .   ... . ......... ..  .  ....   ................................  .     ... . .  .  .....  ...     .       ..................... .   .....     .....   ... .... .    .  .  .    ..                .   .      .. . ............       ...   ..  . ....    ..      . .  ..............      .  ....     ..     .......  ..  ......    ...  ..  ..................    .   .   ........ .. ..    ..  .  .  ..  .    ....   ......  ...    ..   ..            .   ..           ...  ..        ..........             .  .    .   .  ...    . .     .             .     . .   ...   .  .  ........... . .  .   ..   ..  .  . .  ......  . ..    ..    . ..     ..... . ..  .   ......      . .   .    .    .          . .  .  ..   ..   .      .  ...................    .    . ..           . .       .   . .         .                ..      ..            .       .          .          .        ......      ..  .......         .                         .          .      .    . ..         .....    .    ....             ........   . ..      .....      .    .  .              ...       .    .                     ....    .         .          .  .    ..         . ..             .               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          6 7   7 7      1    44444      7777            9  1  11    111111111111111 6 6 6 6      1  6  444 8888888   555555  6   444 6 555555555 00  7  0000   55555555555555555555555555555555  0     000 0 0  4  55555  000     0       222222222222222222222 0   55555     55555   888 1111 2    0  0  0    99                9   7      99 7 666666666666       999   44  7 6666    00      8 0  66666666666666      0  8888     99     9999999  99  666666    666  77  999999999999999999    7   7   00000000 00 99    99  7  1  99  7    2222   222222  777    88   88            7   22           777  22        5555555555             7  7    7   8  777    0 7     7             7     0 0   777   7  0  00000000000 7 7  0   88   99  0  0 6  222222  6 66    00    6 66     11111 5 00  6   000000      6 0   3    3    6          0 0  0  55   55   0      0  0000000000000000000    0    0 55           4 4       1   0 1         0                11      11            7       7          7          7        111111      66  0000000         0                         8          7      7    0 22         77777    7    2222             22222222   5 22      33333      5    7  7              000       7    7                     2222    7         2          0  8    00         0 22             8               
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACATAT-CCC-TGCGCCCACGCCATGCG-CATGTTCG--TGACTCATCAAAACA-CACCTATATA-------------A-A-C-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---T-A---------A--TCGTG----TCGTTTN-AA-CGN-CAC-G-CGTATAA-CG-G--AT-ACGGG---G-A-CTGGG-A---TG--ATGAAAATGGGGTG-------AT-----C------C-TGT-----GTGGC-----TAT---TG---CCATGG-AC-CT-TGGC--GCAAATGCTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-ACT-CGACA----AACA-NAAGTGGAT-AG------A-------GAAATT-GG-CTNAGCTG--ACGTT-T---N-AT--CC-----CTTTGN--CTCGAAC--AC--T-T------T-GTGG-TCA-CAC---T---GAAGA--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAGN-TGC------CC---GCAG--CAT--TGTACCATCACGGCCG--AAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AC-----TGCACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGNTCCCC---GGC-TGNTT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TT-AC-AGTC-A--A-AA-CTCTGTT--CAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-ANCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGNGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGCG-ACCCGACAACCTTTAGGACG-AGA-------GAAATTTAG-CCATAGAAGCCGATCGAGGGATACCGGGTACTGTGC-GTATTA-TGCCCC--ATTCTACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GA-TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCCGAACAACGAGAAC----TTTG-GTTTCAACAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-TTACCAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTG
Reference ( family-9207 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACATAT-CCC-TGCGCCCACGCCATGCG-CATGTTCG--TGACTCATCAAAACA-CACCTATATA-------------A-A-C-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---T-A---------A--TCGTG----TCGTTTN-AA-CGN-CAC-G-CGTATAA-CG-G--AT-ACGGG---G-A-CTGGG-A---TG--ATGAAAATGGGGTG-------AT-----C------C-TGT-----GTGGC-----TAT---TG---CCATGG-AC-CT-TGGC--GCAAATGCTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-ACT-CGACA----AACA-NAAGTGGAT-AG------A-------GAAATT-GG-CTNAGCTG--ACGTT-T---N-AT--CC-----CTTTGN--CTCGAA---AC--T-T------T-GTGG-TCA-CAC---T---GAAGA--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAGN-TGC------CC---GCAG--CAT--TGTACCATCACGGCCG--AAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AC-----TGCACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGNTCCCC---GGC-TGNTT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TT-AC-AGTC-A--A-AA-CTCTGTT--CAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-ANCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGNGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGCG-ACCCGACAACCTTTAGGACG-AGA-------GAAATTTAG-CCATAGAAGCCGATCGAGGGATACCGGGTACTGTGC-GTATTA-TGCCCC--ATTCTACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GA-TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCCGAACAACGAGAAC----TTTG-GTTTCAACAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-TTACCAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTCATAAAAACAGCACCTATATACATAACATTAGTCACA-C-A-GGTCACATGATT---AGGACAACCCACGGAGATT-TTT---T-ACCCACACCGA--TCTGG----TCGTTTC-AA-CG--CACAG-CGTATGATCG-----T-GTGGGCGTG-A-CTGGG-GAGTTGGGATGAAA-TGGAGTGGATGGGGAT-----C------T-AGT-----GTG-CAGAAATAT---TA---AAATGG-GC-CA-GGTC--GCAAATGTTGGTGTTTACATCTGTAAATAATA-----------AGAAAACA-T-ACTTCGACAGCAGAACA-TAAGTCGAC-AGCCATCTACGTCCTTGAGATTTGG---AAGATGCTACGTTAT---C-ATGCCC-----CTTTGGA-TTCTAAT--ACCAT-T------A-GTGG-TTA-TACCTCT---AATGA--ACCTGTTGTGTCAC--ATATATACGTATGCGTAGGGCC---GCGGGCCGTCTTGTACG--CACAGCTG--GGGATAAAACATAGACTGGCATAAGG---AGA----TGCACC-GTGAA-----TGTCAGGA-TG---GAGAAAAGCGCT-GGATTCAGATATC-ATTTGTTACCTAGTGGC-TGTTT-------C---ATA-CACTTG--TTCAATTGAC-AGTA-A--G-AA-CG-TGGT--AAACAG--TGTAAAAAATCCGACTA-GAA-----CCTGTCA-ACCACGCATGCTCGGATAACAGATATTATCGCGG--AGAATTGT-ATTATGGCCGATGTTTACTTGCTGCACACACCGCTGG-GACTGGAGGCTATTTG-TACAACA-CGT-A-CTGTTTAACCGGTGAAACCTCACGGATTTAAGTC--GAGTATTGCAGA-CCAAATT--TTGGGCTAATTTTGTATGCGAAATCGACA------GGGACG-AGA-------TAAATTTAGTCCATAGAAACCG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTGGAT-GTATTAATGCCCCTGATTCTACTCTGCCCATCCGTGATCGTTGT-ATTTTTTAGTAATAGCACTAGCGAGCAATGGAGGT-TTACAG-AGAGCGCGACTTCACGACAACTTAACGTGTGTTGCAGTATAGCCCTGAACA-CGAGAACGTTCTTTG-GTTC--ACA-TGTTTACTTG-AA--AGGGAAACTTTGTC-TG--TAAACTTTAGGGTTTCCTTATCGccccatgactcagagacgtggaaagggaggttcctacccccgcgcgatccagctggatgtattaatgcccctgattctactctgcccatccgtgatcgttgtattttttagtaatagcactagcgagcaatggaggtttacagagagcgcgacttcacgacaacttaacgtgtgttgcagtatagccctgaacacgagaacgttctttggttcacatgtttacttgaaagggaaactttgtctgtaaactttagggtttccttatcgagattgg
gi|10                         : ctcataaaaacagcacctatatacataacattagtcacacaggtcacatgattaggacaacccacggagattttttacccacaccgatctggtcgtttcaacgcacagcgtatgatcgtgtgggcgtgactggggagttgggatgaaatggagtggatggggatctagtgtgcagaaatattaaaatgggccaggtcgcaaatgttggtgtttacatctgtaaataataagaaaacatacttcgacagcagaacataagtcgacagccatctacgtccttgagatttggaagatgctacgttatcatgcccctttggattctaataccattagtggttatacctctaatgaacctgttgtgtcacatatatacgtatgcgtagggccgcgggccgtcttgtacgcacagctggggataaaacatagactggcataaggagatgcaccgtgaatgtcaggatggagaaaagcgctggattcagatatcatttgttacctagtggctgtttcatacacttgttcaattgacagtaagaacgtggtaaacagtgtaaaaaatccgactagaacctgtcaaccacgcatgctcggataacagatattatcgcggagaattgtattatggccgatgtttacttgctgcacacaccgctgggactggaggctatttgtacaacacgtactgtttaaccggtgaaacctcacggatttaagtcgagtattgcagaccaaattttgggctaattttgtatgcgaaatcgacagggacgagataaatttagtccatagaaaccgccccatgactcagagacgtggaaagggaggttcctacccccgcgcgatccagAGCTAGACATAT-CCC-TCCGCCCATGCCA-ACGTCATGTTCA--TGACTCATCAA---A-CACCTATATA-------------A-A-G-AGGGTCACTTG-TT---A-------CCA------TT-TCT---T-A---------A--TCATG----TCG---------------------------A-G--AT-ACGGG---G-A-CTGGG-G---TG--ATGAGAATGGGGTG-------AT-----C------C-TGT-----GTAGC-----TAT---TG---CCATGG-AC-CT-TGGagattgg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTACTGTGC-GTATTA-TGTCCC--ATTCCACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GA-TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCTTACC---CCTGTAT-GCAA-ATAGCCCCGATCAACGTGAAC----TTTG-GTTTCAACAGTGTTTA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATCAAA-CA-CA--TATA-A-------------A-A-C-A-GGTCACTTG-TT---A-------CCA------AC-GTG---T-A---------A--CTGTGAGATTTG-TTA-AG-CAC-CAT-GTCG-GTAA-CG-GATAT-ACGAG---G-A-
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tctA-CT-TGTTACCAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTTA-AGCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGAGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACgatgtattatgcctaccctgggtggatgctattgtac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tctatcaaacacatataaaacaggtcGATAT-A-CGCGG--AGA--TGT-ATTATG-CT-------------------TACC--TGG-A--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTCTTTAAC-----------------------------GTATTGCAGA-CCAATTTCCCTGGGCTAA-TTTGTATGCG-ACTCGACAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A----AACA-AAAGTGGAT-AG------A-------GAAATT-GG-CTCGGCTG--GATTT-T---T-AT--CC-----CTTTGT--CTTAAA---AG--T-G------T-GTGG-TCA-CAC---T---AAAGA--AGCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAGg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCCCACGCTGTGTG-CATGTTCATTTGACTCATC-AAACA-CA--TAT----------------A-A-C-A-GGT-ACCTG--C---A-------CCA------TT-TTT---C-A---------A--t
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -A-CA-TTG--TC---TT-ACCACTC-A--A-AAACTCTGTT--GAAC-G--TGTAA-----CAG--TG-AGA-----TTTGTCA-AGCAC-CATG-TCGG-TAACatcat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         g-A--G-AA-CCCTGGT--CAAC-G--TGCAC-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-ACCAC-CATG-TCGG-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atataaacaaAGATAAACTTATTCCC-TGCGCCCATGCCAACTT-CATGTTCA--TGACTCATCAAAACA-C
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACTTAT-CCCCTGCGCCCATGCCAACTT-CATGTTCA--TGACTCATC-AAACA-C
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACATAT-CCC-TCCGCCAACGTCATGGG------------AACTCATCAAAAC-----CTATATA-------------A-AAC-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---TTC---------A--TCATG----TCGTTTTCAA-CGC-CAC-A-CGTATGA-TAAG--AT-ATGGG---GGA-CGAGG-A---TG--ATGAAAATGGGGTG-------CT-----C------C-TGT-----GTAGC-----TAT---TC---CCACGGAAC-CT-T-GC--GGAAATGTTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACATT-ACT---GCA----AACA-TAAGTGGTTAAG------A-------GAGATT-GGAAGAAGCTG--ACGTT-TAACA-AT--CC-----CTTTGT--CTATAA---AT--G-T------T-GTG---CACCAC---TAAAGAAAA--ACCC--TG-GTTAGGAGC-TGTAAGT-TGC------CC---GCAGT-CAT--TGTAATATCACGCCTG--AAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AC-----TGCACCTGTGAAA-TC-TGT-GAGA-TT---GAGAGA-GCGCTGGGATTCAGAGATC-A-TTGTTTACT---GGCATGCTT-------TCAAA-A-CA-TTGTTTCC--TT-AC-A-TC-AAGA-AA-CTCTGTT--CAGC-GT-TGTAC-----CTG--TGTAGA------CTGTCA-ACCAC-CATG-T-GG-TAACGGATAT-A-CGCGGAAAGA--TGT-ATTATG-CT-------------------TACC-CTGGTG--TGGATGGTATT-GTTACAACAATGTAAACTGTTTAAC-GGTGAGACCTCATGGA--TAAGTC-AACGTATTGCAGACCCAATT--CTT-GGCTAA-TTTGTATGCG-ACTCGACA------AGGACG-AGA-------GAAATTTAG-CCATAGAAGCTGATCGCGGGATACC--GTACTGTGTAGTATTA-TGCCTC--ATTCTACTC-----ATCC-TGA-----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GAGTTACAGGAGAG-GC-ACTCAACGCTTA-C---CTTGTAT-GCAG-ATAG-CCCGAACAACGAGAAC----TTTGCGTTTCAACAATG-TTACAGGAAATTAGG--AACTTTATCTTTACCAGACTTTAGCG-TTCCTTATCGTATTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gAGATAAACATCT-CCC-TGCGACCAACCCATGCG-CATGCTTG--TGACTCATCAAA-CA-CACCTATATA-------------A-A-CCA-GGATACTTG-TC---A-------CCA------TT-TTT---C-A---------A--TCATG----TTGTTTG-AA-CGG-CAC-A-CGTATAA-------------------------------------TGAAAATGGGG-G-------CT-----A------CGTGT-----GTGGG-----TAT---TC---CTATCG-ACACT-GGGC---CAGATGCAACTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-GCT-CAAGA----AACA-GAAGTGGAT-AG------A-------AAAATT-GG-CTCAGATG--ACGGG-A---G-AA--CC-------TTGG--GTCGAAC--AC--TGT------T-GTGG-TCA-CTC---T---GAAAA--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAG--TGT------CT---GCAG--CAT--TGTACCACCACGGCCG--AAGAAGAAGCA---GC--GCTTAAGG---AC-----TGTACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAAAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGATCCCC---GGC-TGATT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TC-AC-AGTCTA--A-AA-ATCTGTT--CAAG-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-AGCAC-CATG-TCGC-TAACGGATAT-A-CGAGG--AGA--TGT-ATTATA-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAT-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAAGTTCCCTGGACTAA-TCTGCATGCC-ACCCGACAACCTTTAGGACG--GA-------GACATTTAG-CCATAGAAGCCGATCGAGGGATACCTGGTACTGCGC-GTATTA-TGCCAC--ATTCTACCC-----ATCC-TGAT----GTGATATGTTTGT--------TAGGG--CAATGA--GA-TTACGGCAGAG-GC-ACTCAACGCCTTCC---CCTGTAT-GCAG-ATACCCGTGAACAACGAGAAC----TTTG-GTTTCAACAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-TTACCAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTGg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACATTT-CCC-TCCGCCCATGCCGTGTG-CATGTTTA--TGACTCATCAAAACA-CACCTATATG-------------A-A-C-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCG------TT-TTT---T-A---------A--TCATG----TCGATTA-AA-CAG-CGG-A-CGTATGA-CA-G--AT-ACGAG---G-A-CTGGG-A---TG--ATGAAAGTGGGGTG-------CT-----C------C-TGT-----GTAGC-----TAT---TG---TGGTGG-AC-GT-TGGC--GCAAATGCTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-ACT-CGACA----AACA-AAAGTGGAT-AG------A-------GTATTT-GG-CTCAGCTG--GAGTT-T---T-AT--CC-----CTTTGA--CTATAA---AG--T-T------T-GTGG-TTA-CAC---T---GACAA--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAGG-TTT------CC---GCAG--CAT--TGTATCATCACGCCTG--AAGACGAAACA---GC--GCATAAGG---AC-----TGTACTTGTGAGA-TC-TGTCAGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GG-TTCAGAGATC-ATTTCATCCCC---GGC-TGTTT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TG-AC-ACTC-A--C-AA-CCCTGGT--CAAC-G--TGTAC-----CTG--TG-AGA-----CCTGTCA-ACCGC-CATG-TCGG-TAACAGATAT-A-CGCGG--AGA--TGTTATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGCG-ACCCGA-AACCTTTACGACG--GA-------GAAATTTAG-CTATAGAAGCTGATCGAGGGATACCGGGTACTGTGC-GTATTA-TGACCC--ATTCTACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAG---------------------GAGAG-GC-ACTCAACGCTCACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCCGAACAACGTGAAC----TTTG-GTTTCAAGAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-T---CAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTGg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCAAAA----AC-TA-ATA-------------A-A-C-A-GGTCAC--G-CTTAAA-------CCA------TTATTTCCAT-A---------AAGCCATG----TCGTTTC-AAACATACAC-AACATATAA-AG-A--ATGATGGG---G-ATCTGGGCA---TG--ATGAAAATGGTGTA-------ATAATAACAAATAGC-TGA-----ATAAT-----TATGAGTGAGCCCATGG-CC-CTGTGGTCAACAAATGTTGGTGTTT-CAT-TGCCCA--A-ATTATTATCACCAGAAAACA-TTACT-CGACA----AACA-TAAG-GGTT-AG------A-------GAGATT-GG-AAGAGCTG--ACGTT-T---TCAT--TCGCCTACTTTGTGTCCCGAACTGAC--T-TAGAATGT-GTGGGTTA-CAC---T---AAAGAGAACCC--TG-GC-AG--AC-TGTA--C-TGC------CCTCCGCAG---ATC-TGTACCATCACG-CCGTGAAGAAGAATCA---GC--CCATAAGGTAAATTTCTATGCACCTGTGACAGTCTTGTC-AGATTGTTTGAGA-A-GCGCT-GTATTCAGAGATCAGTTTGTTACCT---GGA-CAATTAATAATAC---A-ACCA-TTGCCTCCT-TT-AC-AGTC-A--AGAA-C----TT--CAGC-GATTGT-A-----CAA--TA-AGACAATCCTTGTCATCTCAC-CATG-TC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccctcatgtgacgtcatactagtCCATGCG-CATGTTTG--TGACTCATCAAA-CA-CA--TATA-A-------------A-A-C-G-GGTCACTTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---T-A---------A--TCATG----TCG---------------------------A-G--AT-ACGAA---G-A-CTGAG-A---AG--ATGAACATGGGGTG-------AT-----C------C-TGT-----GTGGC-----TAT---TG---CCATGG-AC-CT-TGGC--GCAAATGTTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------CGAAAACA-T-ACT-CAACA----AATAGGAAGTGGAT-AG------A-------GAAATT-GG-CTCAGCTG--AC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tcaacA-TTG--TCC--TT-AC-ACTC-G--GCAA-CCCTGGT--CAGT-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----CCTGTCA-ACCAC-CATG-TCGG-TAACAGATAT-A-CGCGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGAACGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattgtccttacactcggcaaccctggtcagtgtgtaactgtgagacctgtcaaccaccatgtcggtaacagatatacgcggagatgtattatgcctaccctgggtgaacgctattgtacaacaatgtaactgtttaacg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tcaacccatgcgcatgtttgtgactcatcaaacacatataaaacgggtcacttgttaccattttttaatcatgtcgagatacgaagactgagaagatgaacatggggtgatcctgtgtggctattgccatggaccttggcgcaaatgttggtgttttcattgtaaaaacgaaaacatactcaacaaataggaagtggatagagaaattggctcagctgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntAGATAAACATCC-CCT-TGCGCCCACGCC-------------G--TGACTCATCAAAACA-CGCCTGCATA-------------A-A-C-A-GGTAACCTG-TC---A-------CCA------TT-TTT---C-A---------A--TCATG----TCGTTTG-AA-CGG-CAC-A-CGTATAA-TG-A--AT-ATGGG---G-G-CT----A---TG---TG----TGTGGCT-------ATT----C------C-TATCGACAGTGGC-----TAT---TC---CTATCG-AT-AT-TGGG--GCAGATGCAACTGTTTCCAT-TGTAAA--A-A---------------------------GA-A----AACA-CAATTGGTT-AG------A-------GAAATT-GG-CTGAGGCG--AAGGG-A---G-AA--CC-------TTGG--CTTGAGT--AC--T-T------TTGTGG-TCA-CAC---T-------A--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTA-GG-TGC------CC---GCAG--CAT--TGTACCACCACGGCCG--AAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AT-----TGTACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGATCCCC---GGC-TGATT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TT-GC-AGTCAA--A-AA-CTCTGTT--CAAG-G--TGTAA-----C----TG-AGA-----TTTGTGA-AGCAC-CATG-TCGG-TGACCGATAT-A-CGAGG--AGA--TGA-ATTATA-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATCAAA-CA-CA--TATA-A-------------A-A-C-A-GGTCACTTG-TT---A-------CCA------AC-GTG---T-A---------A--CTGTGAGATTTG-TTA-AG-CAC-CAT-GTCG-GTAA-CG-GATAT-ACGAG---G-A-
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tctA-CT-TGTTACCAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTTA-AGCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGAGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAAC-------------TAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGCT-ACCCGACAACCTTTAG-ACGGAGAAATTTTGGAAATTTAG-CGATAGAAGCTGATCGAGGGATATCGGGTACTGTGC-GTATTA-TGTCAC--ATTCCACTA-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GA-TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCTGAACAACGAGAAT----TTTA-GTTTCAATAGTGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTCGTC-TTACCAGA------CGTTTTCTTATCATTTTGgatgtattatgcctaccctgggtggatgctattgtacaactaacggtgaaacctcacggattaagtcaaagtattgcagaccaatttccttgggctaatttgtatgctacccgacaacctttagacggagaaattttggaaatttagcgatagaagctgatcgagggatatcgggtactgtgcgtattatgtcacattccactaatcctgatgtgatctgtttgttagcgcaatgggattacgggagaggcactcaacgcctacccctgtatgcagatagccctgaacaacgagaattttagtttcaatagtgtttacaggaattaggaacttcgtcttaccagacgttttcttatcattttgg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tctatcaaacacatataaaacaggtcCAC-CCTG-TCGG-AAACGGATAT-A-CGAGG--AAA--TGT-ATTATG-CT-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACACCAATGT-AAATGTTTAAC-GGTGAAAACTCACAGA-TTAAGTCAAAAGTATTGCAGA-CCGATTTCCTTGGGCTAA-g
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaggcactcaacgcctacccctgtatgcagat





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              11111                            11    222222222222222                        1111111   111111            111111111        1111   44444444444444444444444444444444                    11111                  333333333333333333333     11111     11111       1111                                                   222222222222                   1111                 22222222222222                         2222222      111111    111      333333333333333333            11111111                             1111   111111  111    11   11                             111            2222222222                         1  111                                      111         22222222222          11   11          111111          11                             111111                                                             3333333333333333333                                                                                                                                            11  2222222                                                                       11111         1111             22222222                                               111                                  1111                                 11           11                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1 5   5 0      1    00000      8888            7  3  44    111111111111111 3 3 3 3      4  3  666 1111111   000000  3   666 3 444444444 55  3  7777   33333333333333333333333333333333  4     777 4 4  1  11111  777     2       222222222222222222222 5   22222     22222   888 0000 0    5  5  5    77                3   5      77 5 888888888888       555   66  0 0000    66      0 5  11111111111111      5  8888     66     0000000  77  888888    444  44  333333333333333333    5   5   55555555 22 77    77  5  0  77  5    6666   999999  111    55   55            6   99           111  99        5555555555             6  6    3   0  111    1 6     6             6     1 1   111   6  1  66666666666 5 5  5   33   11  5  5 5  555555  3 77    00    3 88     99999 1 55  3   000000      3 1   3    3    3          4 4  1  55   55   4      4  1111111111111111111    4    4 55           4 4       0   5 0         5                77      77            5       0          5          6        999999      88  6666666         8                         8          6      6    1 99         66666    6    4444             44444444   2 99      99999      2    5  5              000       5    5                     4444    6         4          8  0    11         8 11             0               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          . .   . .      .    .....      ....            .  .  ..    ............... . . . .      .  .  ... .......   ......  .   ... . ......... ..  .  ....   ................................  .     ... . .  .  .....  ...     .       ..................... .   .....     .....   ... .... .    .  .  .    ..                .   .      .. . ............       ...   ..  . ....    ..      . .  ..............      .  ....     ..     .......  ..  ......    ...  ..  ..................    .   .   ........ .. ..    ..  .  .  ..  .    ....   ......  ...    ..   ..            .   ..           ...  ..        ..........             .  .    .   .  ...    . .     .             .     . .   ...   .  .  ........... . .  .   ..   ..  .  . .  ......  . ..    ..    . ..     ..... . ..  .   ......      . .   .    .    .          . .  .  ..   ..   .      .  ...................    .    . ..           . .       .   . .         .                ..      ..            .       .          .          .        ......      ..  .......         .                         .          .      .    . ..         .....    .    ....             ........   . ..      .....      .    .  .              ...       .    .                     ....    .         .          .  .    ..         . ..             .               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          6 7   7 7      1    44444      7777            9  1  11    111111111111111 6 6 6 6      1  6  444 8888888   555555  6   444 6 555555555 00  7  0000   55555555555555555555555555555555  0     000 0 0  4  55555  000     0       222222222222222222222 0   55555     55555   888 1111 2    0  0  0    99                9   7      99 7 666666666666       999   44  7 6666    00      8 0  66666666666666      0  8888     99     9999999  99  666666    666  77  666666666666666666    7   7   00000000 00 99    99  7  1  99  7    2222   222222  777    88   88            7   22           777  22        5555555555             7  7    7   8  777    0 7     7             7     0 0   777   7  0  00000000000 7 7  0   88   99  0  0 6  222222  6 66    00    6 66     11111 5 00  6   000000      6 0   3    3    6          0 0  0  55   55   0      0  0000000000000000000    0    0 55           4 4       1   0 1         0                11      11            7       7          7          7        111111      66  0000000         0                         8          7      7    0 22         77777    7    2222             22222222   5 22      33333      5    7  7              000       7    7                     2222    7         2          0  8    00         0 22             8               
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACATAT-CCC-TGCGCCCACGCCATGCG-CATGTTCG--TGACTCATCAAAACA-CACCTATATA-------------A-A-C-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---T-A---------A--TCGTG----TCGTTTN-AA-CGN-CAC-G-CGTATAA-CG-G--AT-ACGGG---G-A-CTGGG-A---TG--ATGAAAATGGGGTG-------AT-----C------C-TGT-----GTGGC-----TAT---TG---CCATGG-AC-CT-TGGC--GCAAATGCTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-ACT-CGACA----AACA-NAAGTGGAT-AG------A-------GAAATT-GG-CTNAGCTG--ACGTT-T---N-AT--CC-----CTTTGN--CTCGAAC--AC--T-T------T-GTGG-TCA-CAC---T---GAAGA--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAGN-TGC------CC---GCAG--CAT--TGTACCATCACGGCCG--AAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AC-----TGCACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGNTCCCC---GGC-TGNTT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TT-AC-AGTC-A--A-AA-CTCTGTT--CAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-ANCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGNGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGCG-ACCCGACAACCTTTAGGACG-AGA-------GAAATTTAG-CCATAGAAGCCGATCGAGGGATACCGGGTACTGTGC-GTATTA-TGCCCC--ATTCTACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GA-TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCCGAACAACGAGAAC----TTTG-GTTTCAACAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-TTACCAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTG
Reference ( family-9207 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACATAT-CCC-TGCGCCCACGCCATGCG-CATGTTCG--TGACTCATCAAAACA-CACCTATATA-------------A-A-C-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---T-A---------A--TCGTG----TCGTTTN-AA-CGN-CAC-G-CGTATAA-CG-G--AT-ACGGG---G-A-CTGGG-A---TG--ATGAAAATGGGGTG-------AT-----C------C-TGT-----GTGGC-----TAT---TG---CCATGG-AC-CT-TGGC--GCAAATGCTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-ACT-CGACA----AACA-NAAGTGGAT-AG------A-------GAAATT-GG-CTNAGCTG--ACGTT-T---N-AT--CC-----CTTTGN--CTCGAAC--AC--T-T------T-GTGG-TCA-CAC---T---GAAGA--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAGN-TGC------CC---GCAG--CAT--TGTACCATCACGGCCG--AAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AC-----TGCACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGNTCCCC---GGC-TGNTT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TT-AC-AGTC-A--A-AA-CTCTGTT--CAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-ANCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGNGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGCG-ACCCGACAACCTTTAGGACG-AGA-------GAAATTTAG-CCATAGAAGCCGATCGAGGGATACCGGGTACTGTGC-GTATTA-TGCCCC--ATTCTACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GA-TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCCGAACAACGAGAAC----TTTG-GTTTCAACAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-TTACCAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTCATAAAAACAGCACCTATATACATAACATTAGTCACA-C-A-GGTCACATGATT---AGGACAACCCACGGAGATT-TTT---T-ACCCACACCGA--TCTGG----TCGTTTC-AA-CG--CACAG-CGTATGATCG-----T-GTGGGCGTG-A-CTGGG-GAGTTGGGATGAAA-TGGAGTGGATGGGGAT-----C------T-AGT-----GTG-CAGAAATAT---TA---AAATGG-GC-CA-GGTC--GCAAATGTTGGTGTTTACATCTGTAAATAATA-----------AGAAAACA-T-ACTTCGACAGCAGAACA-TAAGTCGAC-AGCCATCTACGTCCTTGAGATTTGG---AAGATGCTACGTTAT---C-ATGCCC-----CTTTGGA-TTCTAAT--ACCAT-T------A-GTGG-TTA-TACCTCT---AATGA--ACCTGTTGTGTCAC--ATATATACGTATGCGTAGGGCC---GCGGGCCGTCTTGTACG--CACAGCTG--GGGATAAAACATAGACTGGCATAAGG---AGA----TGCACC-GTGAA-----TGTCAGGA-TG---GAGAAAAGCGCT-GGATTCAGATATC-ATTTGTTACCTAGTGGC-TGTTT-------C---ATA-CACTTG--TTCAATTGAC-AGTA-A--G-AA-CG-TGGT--AAACAG--TGTAAAAAATCCGACTA-GAA-----CCTGTCA-ACCACGCATGCTCGGATAACAGATATTATCGCGG--AGAATTGT-ATTATGGCCGATGTTTACTTGCTGCACACACCGCTGG-GACTGGAGGCTATTTG-TACAACA-CGT-A-CTGTTTAACCGGTGAAACCTCACGGATTTAAGTC--GAGTATTGCAGA-CCAAATT--TTGGGCTAATTTTGTATGCGAAATCGACA------GGGACG-AGA-------TAAATTTAGTCCATAGAAACCG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTGGAT-GTATTAATGCCCCTGATTCTACTCTGCCCATCCGTGATCGTTGT-ATTTTTTAGTAATAGCACTAGCGAGCAATGGAGGT-TTACAG-AGAGCGCGACTTCACGACAACTTAACGTGTGTTGCAGTATAGCCCTGAACA-CGAGAACGTTCTTTG-GTTC--ACA-TGTTTACTTG-AA--AGGGAAACTTTGTC-TG--TAAACTTTAGGGTTTCCTTATCGccccatgactcagagacgtggaaagggaggttcctacccccgcgcgatccagctggatgtattaatgcccctgattctactctgcccatccgtgatcgttgtattttttagtaatagcactagcgagcaatggaggtttacagagagcgcgacttcacgacaacttaacgtgtgttgcagtatagccctgaacacgagaacgttctttggttcacatgtttacttgaaagggaaactttgtctgtaaactttagggtttccttatcgagattgg
gi|10                         : ctcataaaaacagcacctatatacataacattagtcacacaggtcacatgattaggacaacccacggagattttttacccacaccgatctggtcgtttcaacgcacagcgtatgatcgtgtgggcgtgactggggagttgggatgaaatggagtggatggggatctagtgtgcagaaatattaaaatgggccaggtcgcaaatgttggtgtttacatctgtaaataataagaaaacatacttcgacagcagaacataagtcgacagccatctacgtccttgagatttggaagatgctacgttatcatgcccctttggattctaataccattagtggttatacctctaatgaacctgttgtgtcacatatatacgtatgcgtagggccgcgggccgtcttgtacgcacagctggggataaaacatagactggcataaggagatgcaccgtgaatgtcaggatggagaaaagcgctggattcagatatcatttgttacctagtggctgtttcatacacttgttcaattgacagtaagaacgtggtaaacagtgtaaaaaatccgactagaacctgtcaaccacgcatgctcggataacagatattatcgcggagaattgtattatggccgatgtttacttgctgcacacaccgctgggactggaggctatttgtacaacacgtactgtttaaccggtgaaacctcacggatttaagtcgagtattgcagaccaaattttgggctaattttgtatgcgaaatcgacagggacgagataaatttagtccatagaaaccgccccatgactcagagacgtggaaagggaggttcctacccccgcgcgatccagAGCTAGACATAT-CCC-TCCGCCCATGCCA-ACGTCATGTTCA--TGACTCATCAA---A-CACCTATATA-------------A-A-G-AGGGTCACTTG-TT---A-------CCA------TT-TCT---T-A---------A--TCATG----TCG---------------------------A-G--AT-ACGGG---G-A-CTGGG-G---TG--ATGAGAATGGGGTG-------AT-----C------C-TGT-----GTAGC-----TAT---TG---CCATGG-AC-CT-TGGagattgg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTACTGTGC-GTATTA-TGTCCC--ATTCCACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GA-TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCTTACC---CCTGTAT-GCAA-ATAGCCCCGATCAACGTGAAC----TTTG-GTTTCAACAGTGTTTA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATCAAA-CA-CA--TATA-A-------------A-A-C-A-GGTCACTTG-TT---A-------CCA------AC-GTG---T-A---------A--CTGTGAGATTTG-TTA-AG-CAC-CAT-GTCG-GTAA-CG-GATAT-ACGAG---G-A-
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tctA-CT-TGTTACCAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTTA-AGCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGAGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACgatgtattatgcctaccctgggtggatgctattgtac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tctatcaaacacatataaaacaggtcGATAT-A-CGCGG--AGA--TGT-ATTATG-CT-------------------TACC--TGG-A--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTCTTTAAC-----------------------------GTATTGCAGA-CCAATTTCCCTGGGCTAA-TTTGTATGCG-ACTCGACAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A----AACA-AAAGTGGAT-AG------A-------GAAATT-GG-CTCGGCTG--GATTT-T---T-AT--CC-----CTTTGT--CTTAAA---AG--T-G------T-GTGG-TCA-CAC---T---AAAGA--AGCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAGg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCCCACGCTGTGTG-CATGTTCATTTGACTCATC-AAACA-CA--TAT----------------A-A-C-A-GGT-ACCTG--C---A-------CCA------TT-TTT---C-A---------A--t
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -A-CA-TTG--TC---TT-ACCACTC-A--A-AAACTCTGTT--GAAC-G--TGTAA-----CAG--TG-AGA-----TTTGTCA-AGCAC-CATG-TCGG-TAACatcat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         g-A--G-AA-CCCTGGT--CAAC-G--TGCAC-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-ACCAC-CATG-TCGG-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atataaacaaAGATAAACTTATTCCC-TGCGCCCATGCCAACTT-CATGTTCA--TGACTCATCAAAACA-C
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACTTAT-CCCCTGCGCCCATGCCAACTT-CATGTTCA--TGACTCATC-AAACA-C
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACATAT-CCC-TCCGCCAACGTCATGGG------------AACTCATCAAAAC-----CTATATA-------------A-AAC-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---TTC---------A--TCATG----TCGTTTTCAA-CGC-CAC-A-CGTATGA-TAAG--AT-ATGGG---GGA-CGAGG-A---TG--ATGAAAATGGGGTG-------CT-----C------C-TGT-----GTAGC-----TAT---TC---CCACGGAAC-CT-T-GC--GGAAATGTTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACATT-ACT---GCA----AACA-TAAGTGGTTAAG------A-------GAGATT-GGAAGAAGCTG--ACGTT-TAACA-AT--CC-----CTTTGT--CTATAA---AT--G-T------T-GTG---CACCAC---TAAAGAAAA--ACCC--TG-GTTAGGAGC-TGTAAGT-TGC------CC---GCAGT-CAT--TGTAATATCACGCCTG--AAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AC-----TGCACCTGTGAAA-TC-TGT-GAGA-TT---GAGAGA-GCGCTGGGATTCAGAGATC-A-TTGTTTACT---GGCATGCTT-------TCAAA-A-CA-TTGTTTCC--TT-AC-A-TC-AAGA-AA-CTCTGTT--CAGC-GT-TGTAC-----CTG--TGTAGA------CTGTCA-ACCAC-CATG-T-GG-TAACGGATAT-A-CGCGGAAAGA--TGT-ATTATG-CT-------------------TACC-CTGGTG--TGGATGGTATT-GTTACAACAATGTAAACTGTTTAAC-GGTGAGACCTCATGGA--TAAGTC-AACGTATTGCAGACCCAATT--CTT-GGCTAA-TTTGTATGCG-ACTCGACA------AGGACG-AGA-------GAAATTTAG-CCATAGAAGCTGATCGCGGGATACC--GTACTGTGTAGTATTA-TGCCTC--ATTCTACTC-----ATCC-TGA-----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GAGTTACAGGAGAG-GC-ACTCAACGCTTA-C---CTTGTAT-GCAG-ATAG-CCCGAACAACGAGAAC----TTTGCGTTTCAACAATG-TTACAGGAAATTAGG--AACTTTATCTTTACCAGACTTTAGCG-TTCCTTATCGTATTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gAGATAAACATCT-CCC-TGCGACCAACCCATGCG-CATGCTTG--TGACTCATCAAA-CA-CACCTATATA-------------A-A-CCA-GGATACTTG-TC---A-------CCA------TT-TTT---C-A---------A--TCATG----TTGTTTG-AA-CGG-CAC-A-CGTATAA-------------------------------------TGAAAATGGGG-G-------CT-----A------CGTGT-----GTGGG-----TAT---TC---CTATCG-ACACT-GGGC---CAGATGCAACTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-GCT-CAAGA----AACA-GAAGTGGAT-AG------A-------AAAATT-GG-CTCAGATG--ACGGG-A---G-AA--CC-------TTGG--GTCGAAC--AC--TGT------T-GTGG-TCA-CTC---T---GAAAA--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAG--TGT------CT---GCAG--CAT--TGTACCACCACGGCCG--AAGAAGAAGCA---GC--GCTTAAGG---AC-----TGTACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAAAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGATCCCC---GGC-TGATT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TC-AC-AGTCTA--A-AA-ATCTGTT--CAAG-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-AGCAC-CATG-TCGC-TAACGGATAT-A-CGAGG--AGA--TGT-ATTATA-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAT-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAAGTTCCCTGGACTAA-TCTGCATGCC-ACCCGACAACCTTTAGGACG--GA-------GACATTTAG-CCATAGAAGCCGATCGAGGGATACCTGGTACTGCGC-GTATTA-TGCCAC--ATTCTACCC-----ATCC-TGAT----GTGATATGTTTGT--------TAGGG--CAATGA--GA-TTACGGCAGAG-GC-ACTCAACGCCTTCC---CCTGTAT-GCAG-ATACCCGTGAACAACGAGAAC----TTTG-GTTTCAACAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-TTACCAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTGg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACATTT-CCC-TCCGCCCATGCCGTGTG-CATGTTTA--TGACTCATCAAAACA-CACCTATATG-------------A-A-C-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCG------TT-TTT---T-A---------A--TCATG----TCGATTA-AA-CAG-CGG-A-CGTATGA-CA-G--AT-ACGAG---G-A-CTGGG-A---TG--ATGAAAGTGGGGTG-------CT-----C------C-TGT-----GTAGC-----TAT---TG---TGGTGG-AC-GT-TGGC--GCAAATGCTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-ACT-CGACA----AACA-AAAGTGGAT-AG------A-------GTATTT-GG-CTCAGCTG--GAGTT-T---T-AT--CC-----CTTTGA--CTATAA---AG--T-T------T-GTGG-TTA-CAC---T---GACAA--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAGG-TTT------CC---GCAG--CAT--TGTATCATCACGCCTG--AAGACGAAACA---GC--GCATAAGG---AC-----TGTACTTGTGAGA-TC-TGTCAGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GG-TTCAGAGATC-ATTTCATCCCC---GGC-TGTTT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TG-AC-ACTC-A--C-AA-CCCTGGT--CAAC-G--TGTAC-----CTG--TG-AGA-----CCTGTCA-ACCGC-CATG-TCGG-TAACAGATAT-A-CGCGG--AGA--TGTTATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGCG-ACCCGA-AACCTTTACGACG--GA-------GAAATTTAG-CTATAGAAGCTGATCGAGGGATACCGGGTACTGTGC-GTATTA-TGACCC--ATTCTACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAG---------------------GAGAG-GC-ACTCAACGCTCACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCCGAACAACGTGAAC----TTTG-GTTTCAAGAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-T---CAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTGg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCAAAA----AC-TA-ATA-------------A-A-C-A-GGTCAC--G-CTTAAA-------CCA------TTATTTCCAT-A---------AAGCCATG----TCGTTTC-AAACATACAC-AACATATAA-AG-A--ATGATGGG---G-ATCTGGGCA---TG--ATGAAAATGGTGTA-------ATAATAACAAATAGC-TGA-----ATAAT-----TATGAGTGAGCCCATGG-CC-CTGTGGTCAACAAATGTTGGTGTTT-CAT-TGCCCA--A-ATTATTATCACCAGAAAACA-TTACT-CGACA----AACA-TAAG-GGTT-AG------A-------GAGATT-GG-AAGAGCTG--ACGTT-T---TCAT--TCGCCTACTTTGTGTCCCGAACTGAC--T-TAGAATGT-GTGGGTTA-CAC---T---AAAGAGAACCC--TG-GC-AG--AC-TGTA--C-TGC------CCTCCGCAG---ATC-TGTACCATCACG-CCGTGAAGAAGAATCA---GC--CCATAAGGTAAATTTCTATGCACCTGTGACAGTCTTGTC-AGATTGTTTGAGA-A-GCGCT-GTATTCAGAGATCAGTTTGTTACCT---GGA-CAATTAATAATAC---A-ACCA-TTGCCTCCT-TT-AC-AGTC-A--AGAA-C----TT--CAGC-GATTGT-A-----CAA--TA-AGACAATCCTTGTCATCTCAC-CATG-TC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccctcatgtgacgtcatactagtCCATGCG-CATGTTTG--TGACTCATCAAA-CA-CA--TATA-A-------------A-A-C-G-GGTCACTTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---T-A---------A--TCATG----TCG---------------------------A-G--AT-ACGAA---G-A-CTGAG-A---AG--ATGAACATGGGGTG-------AT-----C------C-TGT-----GTGGC-----TAT---TG---CCATGG-AC-CT-TGGC--GCAAATGTTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------CGAAAACA-T-ACT-CAACA----AATAGGAAGTGGAT-AG------A-------GAAATT-GG-CTCAGCTG--AC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tcaacA-TTG--TCC--TT-AC-ACTC-G--GCAA-CCCTGGT--CAGT-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----CCTGTCA-ACCAC-CATG-TCGG-TAACAGATAT-A-CGCGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGAACGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattgtccttacactcggcaaccctggtcagtgtgtaactgtgagacctgtcaaccaccatgtcggtaacagatatacgcggagatgtattatgcctaccctgggtgaacgctattgtacaacaatgtaactgtttaacg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tcaacccatgcgcatgtttgtgactcatcaaacacatataaaacgggtcacttgttaccattttttaatcatgtcgagatacgaagactgagaagatgaacatggggtgatcctgtgtggctattgccatggaccttggcgcaaatgttggtgttttcattgtaaaaacgaaaacatactcaacaaataggaagtggatagagaaattggctcagctgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntAGATAAACATCC-CCT-TGCGCCCACGCC-------------G--TGACTCATCAAAACA-CGCCTGCATA-------------A-A-C-A-GGTAACCTG-TC---A-------CCA------TT-TTT---C-A---------A--TCATG----TCGTTTG-AA-CGG-CAC-A-CGTATAA-TG-A--AT-ATGGG---G-G-CT----A---TG---TG----TGTGGCT-------ATT----C------C-TATCGACAGTGGC-----TAT---TC---CTATCG-AT-AT-TGGG--GCAGATGCAACTGTTTCCAT-TGTAAA--A-A---------------------------GA-A----AACA-CAATTGGTT-AG------A-------GAAATT-GG-CTGAGGCG--AAGGG-A---G-AA--CC-------TTGG--CTTGAGT--AC--T-T------TTGTGG-TCA-CAC---T-------A--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTA-GG-TGC------CC---GCAG--CAT--TGTACCACCACGGCCG--AAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AT-----TGTACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGATCCCC---GGC-TGATT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TT-GC-AGTCAA--A-AA-CTCTGTT--CAAG-G--TGTAA-----C----TG-AGA-----TTTGTGA-AGCAC-CATG-TCGG-TGACCGATAT-A-CGAGG--AGA--TGA-ATTATA-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATCAAA-CA-CA--TATA-A-------------A-A-C-A-GGTCACTTG-TT---A-------CCA------AC-GTG---T-A---------A--CTGTGAGATTTG-TTA-AG-CAC-CAT-GTCG-GTAA-CG-GATAT-ACGAG---G-A-
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tctA-CT-TGTTACCAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTTA-AGCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGAGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAAC-------------TAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGCT-ACCCGACAACCTTTAG-ACGGAGAAATTTTGGAAATTTAG-CGATAGAAGCTGATCGAGGGATATCGGGTACTGTGC-GTATTA-TGTCAC--ATTCCACTA-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GA-TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCTGAACAACGAGAAT----TTTA-GTTTCAATAGTGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTCGTC-TTACCAGA------CGTTTTCTTATCATTTTGgatgtattatgcctaccctgggtggatgctattgtacaactaacggtgaaacctcacggattaagtcaaagtattgcagaccaatttccttgggctaatttgtatgctacccgacaacctttagacggagaaattttggaaatttagcgatagaagctgatcgagggatatcgggtactgtgcgtattatgtcacattccactaatcctgatgtgatctgtttgttagcgcaatgggattacgggagaggcactcaacgcctacccctgtatgcagatagccctgaacaacgagaattttagtttcaatagtgtttacaggaattaggaacttcgtcttaccagacgttttcttatcattttgg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tctatcaaacacatataaaacaggtcCAC-CCTG-TCGG-AAACGGATAT-A-CGAGG--AAA--TGT-ATTATG-CT-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACACCAATGT-AAATGTTTAAC-GGTGAAAACTCACAGA-TTAAGTCAAAAGTATTGCAGA-CCGATTTCCTTGGGCTAA-g
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaggcactcaacgcctacccctgtatgcagat


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          A T   C        C    TGTG       CATT            A  .  CC    TA              . A C G      T  .  TAA .         .       A   CCA T .         AG  A  AGAT   TTTCAAACATACACAACATATAAAGA        G     .   G T  G  CA     A       A       ATAATAACAAATAG        G   CGACA     .       GAG GAGC      A  A  G    CA                T   .      .  . TTATTATCACCA       TT    C     .       GG        A  A                   .  AAGA     .      TAACA    .   GCCTAC    TGT  TA  CTGACTTAGAATGT        G   C   TAAAG    AG GA    .   .     GA  .    AGT    .       TCC    T    C             C   TG           .    .         TAAATTTCTA             G  T    G   G  TTT    G .     G             A     T T   .     A  C  AATAATAC    . C  .   TT   T   .  C C  AAGA    A TC    AC    . AT     .     T .   T   CAATCC      T G   .    .    .          . .  A  AA   .    T      .  .                      .    T .            . T           A           .                T       AA            C                  .          .        ACCTTT      GA  AATTTTG         .                         T          A      .    C .          .        .    .                .          C .       GAG        G    .  .              .         .    .                     .       C         G          A       .          T TA
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          A .   .        T    ACTT       CA              A  .  CC    TA              . . . .      T  .  .   .         .       .   .   . .         .   G  AGAT   TTTTCAACGCCACACGTATGATAAG         .     .   . .  A  G      A       A       ATTC                  .   .         .       .   G         .  .  .    .                 T   .      .  . A                  TT    C     .       A         .  A                   .  CTC      .      TTC      .   C         T    AT  CACTGTT               .   .   TA       AA .     .   .     .   .    AGG    .       .      .    .             G   .            .    .         AC                     .  .    G   G  .      G .     .             .     A C   .     .  A  TCAA        . .  .   CC   .   .  . G  TAA     . CC    AC    . T      .     A .   .   T           . G   .    .    .          . .  C  .    .    .      .  .                      .    . .            . .           .           .                T       A             .                  .          .        ACCTTT      A   .               .                         G          .      .    T .          .        .    .                .          C .       GA         G    .  .              .         .    .                     .       .         A          .       .          . TA
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          A .   .        T    ACTT       CA              A  .  CC    TA              . . . .      C  .  .   .         .       .   .   . .         .   A  .      TTAAGCACCATGTCGGTAACGGAT          .     .   . .  G  A      A       A       ATC                   .   .         .       .   C         .  .  .    .                 T   .      .  . A                  T     C     .       T         .  A                   .  CTC      .      TT       .   C         T    CG  TACTTTT               .   .   TG       AA .     .   .     .   .    AG     .       .      .    .             C   .            .    .         AC                     .  .    A   T  .      G .     .             .     A C   .     .  T  C           . .  .   .    .   .  . C  AAG     . TC    .     . .      .     T .   .   T           . C   .    .    .          . .  C  .    .    .      .  .                      .    . .            . .           .           .                T       A             .                  .          .        ACCTTT      .   .               .                         G          .      .    A .          .        .    .                .          G .       GA         C    .  .              .         .    .                     .       .         A          .       .          . TA
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C .   .        C    TGGG       TG              A  .  CC    TG              . . . .      C  .  .   .         .       .   .   . .         .   A  .      TTAAGCACCATGTCGGTAACGGAT          .     .   . .  G  A      A       G       CTC                   .   .         .       .   C         .  .  .    .                 T   .      .  . A                  T     C     .       G         .  A                   .  CTC      .      AG       .   C         G    AT  AGTGT                 .   .   TG       CA .     .   .     .   .    GG     .       .      .    .             G   .            .    .         AC                     .  .    G   G  .      G .     .             .     T A   .     .  A  C           . .  .   .    .   .  . G  GGC     . TC    .     . .      .     T .   .   T           . C   .    .    .          . .  A  .    .    .      .  .                      .    . .            . .           .           .                T       A             .                  .          .        .           .   .               .                                    .      .    C .          .        .    .                .          C .       GA         G    .  .              .         .    .                     .       .         A          .       .          . . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          T .   .        A    TGCG       TA              A  .  C     TA              . . . .      T  .  .   .         .       .   .   . .         .   A  .      ATTAAACAGCGGACGTATGACAG           .     .   . .  G  A      A       A       CTA                   .   .         .       .   G         .  .  .    .                 C   .      .  . C                  T     .     .       A         .  A                   .  AAG      .      TT       .   .         A    CG  ATGTT                 .   .   TA       AG .     .   .     .   .    C      .       .      .    .             .   .            .    .         AT                     .  .    .   .  .      . .     .             .     A C   .     .  A  C           . .  .   .    .   .  . C  AAA     . CC    .     . .      .     T .   .   T           . G   .    .    .          . .  C  .    .    .      .  .                      .    . .            . .           .           .                .       A             .                  .          .                                                                             .      .    A .          .        .    .                .          . .       .          G    .  .              .         .    .                     .       .         G                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C .   .        T    TGTG       TG              A  .  C     TA              . . . .      C  .  .   .         .       .   .   . .         .   A  .      TTTGAACGGCACACGTATAATGA           .     .   . .  .  A      .       A       CTC                   .   .         .       .   G         .  .  .    .                 .   .      .  . .                  .     .     .       T         .  A                   .  CTC      .      AG       .   .         G    TG  AGTTT                 .   .   T        .  .     .   .     .   .                                                                                                                                                                                    . .  .   .    .   .  . G  AA      . CC    .     . .      .     T .   .   C           . C   .    .    .          . .  C  .    .    .      .  .                      .    . .            . .           .           .                .       .             .                  .                                                                                                                                                                                     .  .              .         .    .                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         C    TGCG       G               A  .  .     A               . . . .      T  .  .   .         .       .   .   . .         .   A  .      TTTGAACGGCACACGTATAA              .     .   . .  .  .      .       .       ATC                   .   .         .       .   C         .  .  .                                                                     .       C         .  A                   .  CTG      .                                                                                                                                                                                                                                                                                              .   .    .   .  . .  AG      . TC    .     . .      .     A .   .   C           . T   .    .    .          . .  A  .    .    .      .  .                      .    . .            . .           .           .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .          .               .  .  .     A               . . . .      C  .  .   .         .       .   .   . .         .   A  .      AG                                .     .   . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AC      . T     .     . .      .     T .   .   T           . C   .    .    .          . .  A  .    .    .      .  .                      .    . .            . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .  .  .     A               . . . .      T  .  .   .         .       .   .   . .         .   G  .      AG                                .     .   . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   . T     .     . .      .     T .   .   T           . G   .    .    .          . .  A  .    .    .      .  .                      .    . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .  .  .     .               . . . .      .  .  .   .         .       .   .   . .         .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               . .     .     . .      .     . .   .   .           . G   .    .    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               C*    TA*************                        *******   ******            *********                                                       ***         A****  A**             CTC******************               *****                                                         **                            C*    ****                 A*************         CTC*     **     NN*****  **            N**      ANTGTT************            TG******          **                 AG**   ******         **   **                             ***  **        AC********                                                                     ***                                   **          AAN***    CC                   *****   **                                                          **             *******************           **                                                      T*      A*                                                   ACCTTT      G*                                                                     **         *****         ****             ********     **      GA***                             ***                                  ****                                 **           TA
originalCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACATAT-CCC-TGCGCCCACGCCATGCG-CATGTTCG--TGACTCATCAAAACA-CACCTATATA-------------A-A-C-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---T-A---------A--TCGTG----TCGTTTN-AA-CGN-CAC-G-CGTATAA-CG-G--AT-ACGGG---G-A-CTGGG-A---TG--ATGAAAATGGGGTG-------AT-----C------C-TGT-----GTGGC-----TAT---TG---CCATGG-AC-CT-TGGC--GCAAATGCTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-ACT-CGACA----AACA-NAAGTGGAT-AG------A-------GAAATT-GG-CTNAGCTG--ACGTT-T---N-AT--CC-----CTTTGN--CTCGAAC--AC--T-T------T-GTGG-TCA-CAC---T---GAAGA--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAGN-TGC------CC---GCAG--CAT--TGTACCATCACGGCCG--AAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AC-----TGCACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGNTCCCC---GGC-TGNTT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TT-AC-AGTC-A--A-AA-CTCTGTT--CAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-ANCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGNGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGCG-ACCCGACAACCTTTAGGACG-AGA-------GAAATTTAG-CCATAGAAGCCGATCGAGGGATACCGGGTACTGTGC-GTATTA-TGCCCC--ATTCTACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GA-TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCCGAACAACGAGAAC----TTTG-GTTTCAACAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-TTACCAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTG
finalCons                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACATAT-CCC-TGCGCCCACGCCATGCG-CATGTTCG--TGACTCATCAAAACA-CAC-TATATA-------------A-A-C-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---T-A---------A--TCGTG----TCGTTTN-AA-CGN-CAC-G-CGTATAA-CG-G--AT-ACGGG---G-A-CTGGGA----TGA--TGAAAATGGGGTGCTC------------------C-TGT-----GTGGC-----TAT---TG---CCATGG-AC-CT-TGGC--GCAAATGCTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-ACTC-GACA----AACA-NAAGTGGAT-AGA-------------GAAATT-GGCTC-AGCTG--ACGTTNN-----AT--CC-----CTTTGN--CTCGAAANTGTT------------GTGG-TCA-CACTG------AAGA--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAG--TGC------CC---GCAG--CAT--TGTACCATCACGGCCG--AAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGGAC--------TGCACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGNTCCCC---GGC-TGNTT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TT-AC-AGTCAAN---AA-CCCTGTT--CAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-ANCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGNGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-GGTGAAACCTCACGGAT-TAAGTCA-AAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGCG-ACCCGACAACCTTTAGGACGG-GA-------GAAATTTAG-CCATAGAAGCCGATCGAGGGATACCGGGTACTGTGC-GTATTA-TGCCCC--ATTCTACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGGGA---TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCCGAACAACGAGAAC----TTTG-GTTTCAACAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-TTACCAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTG





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              11111                            2222222       1111111111                      1111111   111111            111111111        1111   44444444444444444444444444444444                    11111          11111111           222222222222    11111              1111                                                   222222222222                   1111                 22222222222222         1111            222222      111111    111      444444444                   11111111                               1     111111  111    11   11                             111            2222222222                         1  111                                      111         22222222222          11   11                       11                             111111                                                             3333333333333333333                                                                                                                                                2222222                                                                       11111         1111             22222222                                               111                                  1111                                 11           11                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1 5   5 0      1    00000      8888         2  55  3 8888888    6  5555555555 3 3 3      4  3  666 1111111   000000  3   666 3 444444444 55  3  7777   55555555555555555555555555555555  4     777 4 4  1  11111  66      88888888      55 1 555555555555    22222     66   888 0000 0    5  5  5    77                3   5      77 5 888888888888       555   66  0 0000    66      0 5  11111111111111      5  0000     66     333333  77  888888    444  44  000000000 6 666 5       5   55555555 22 77    77  5  0  77  5      1 77  999999  111    55   55            6   99           111  99        5555555555             6  6    3   0  111    1 6     6             6     1 1   111   6  1  66666666666 5 5  5   33   11  5  5 5    55   2     00    3 88     99999 1 55  3   000000      3 1   3    3    3          4 4  1  55   55   4      4  1111111111111111111    4    4 55           4 4       0   5 0         5                77      77            5       0          5          6        999999       8  6666666         8                         8          6      6    1 99         66666    6    4444             44444444   2 99      99999      2    5  5              000       5    5                     4444    6         4          8  0    11         8 11             0               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          . .   . .      .    .....      ....         .  ..  . .......    .  .......... . . .      .  .  ... .......   ......  .   ... . ......... ..  .  ....   ................................  .     ... . .  .  .....  ..      ........      .. . ............    .....     ..   ... .... .    .  .  .    ..                .   .      .. . ............       ...   ..  . ....    ..      . .  ..............      .  ....     ..     ......  ..  ......    ...  ..  ......... . ... .       .   ........ .. ..    ..  .  .  ..  .      . ..  ......  ...    ..   ..            .   ..           ...  ..        ..........             .  .    .   .  ...    . .     .             .     . .   ...   .  .  ........... . .  .   ..   ..  .  . .    ..   .     ..    . ..     ..... . ..  .   ......      . .   .    .    .          . .  .  ..   ..   .      .  ...................    .    . ..           . .       .   . .         .                ..      ..            .       .          .          .        ......       .  .......         .                         .          .      .    . ..         .....    .    ....             ........   . ..      .....      .    .  .              ...       .    .                     ....    .         .          .  .    ..         . ..             .               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          6 7   7 7      1    44444      7777         3  44  1 0000000    5  9999999999 6 6 6      1  6  444 8888888   555555  6   444 6 555555555 00  7  0000   99999999999999999999999999999999  0     000 0 0  4  55555  99      11111111      44 4 000000000000    55555     99   888 1111 2    0  0  0    99                9   7      99 7 666666666666       999   44  7 6666    00      8 0  66666666666666      0  2222     99     444444  99  666666    666  77  000000000 6 777 7       7   00000000 00 99    99  7  1  99  7      4 99  222222  777    88   88            7   22           777  22        5555555555             7  7    7   8  777    0 7     7             7     0 0   777   7  0  00000000000 7 7  0   88   99  0  0 6    44   6     00    6 66     11111 5 00  6   000000      6 0   3    3    6          0 0  0  55   55   0      0  0000000000000000000    0    0 55           4 4       1   0 1         0                11      11            7       7          7          7        111111       0  0000000         0                         8          7      7    0 22         77777    7    2222             22222222   5 22      33333      5    7  7              000       7    7                     2222    7         2          0  8    00         0 22             8               
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACATAT-CCC-TGCGCCCACGCCATGCG-CATGTTCG--TGACTCATCAAA-ACA-CAC-----TATATAA----------A-C-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---T-A---------A--TCGTG----TCGTTTN-AA-CGN-CAC-G-CGTATAA-CG-G--AT-ACGGG---G-A-CTGGG-A---TG--ATGAAA--------ATGGGG-TGCT-----C------CTGT-----GTAGC--TAT---TG---CCATGG-AC-CT-TGGC--GCAAATGCTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-ACT-CGACA----AACA-NAAGTGGAT-AG------A-------GAAATT-GG-CTCAGCTG--ACGTT---NT-AT--CC-----CTTTGN--CTCGAAC--------ANTGT-T-GTGGTCA-CAC---T---GAAGA--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAG-T--GC------CC---GCAG--CAT--TGTACCATCACGGCCG--AAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AC-----TGCACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGNTCCCC---GGC-TGNTT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TT-AC-AGTCAA-GAACCCTGTT--CAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-ANCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGNGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGCG-ACCCGACAACCTTTAGGACGG-GA-------GAAATTTAG-CCATAGAAGCCGATCGAGGGATACCGGGTACTGTGC-GTATTA-TGCCCC--ATTCTACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GA-TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCCGAACAACGAGAAC----TTTG-GTTTCAACAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-TTACCAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTG
Reference ( family-9207 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACATAT-CCC-TGCGCCCACGCCATGCG-CATGTTCG--TGACTCATCAAA-ACA-CAC-----TATATAA----------A-C-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---T-A---------A--TCGTG----TCGTTTN-AA-CGN-CAC-G-CGTATAA-CG-G--AT-ACGGG---G-A-CTGGG-A---TG--ATGAAA--------ATGGGG-TGCT-----C------CTGT-----GTGGC--TAT---TG---CCATGG-AC-CT-TGGC--GCAAATGCTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-ACT-CGACA----AACA-NAAGTGGAT-AG------A-------GAAATT-GG-CTCAGCTG--ACGTT---NN-AT--CC-----CTTTGN--CTCGAA---------ANTGT-T-GTGGTCA-CAC---T---GAAGA--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAG-T--GC------CC---GCAG--CAT--TGTACCATCACGGCCG--AAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AC-----TGCACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGNTCCCC---GGC-TGNTT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TT-AC-AGTCAA-NAACCCTGTT--CAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-ANCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGNGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGCG-ACCCGACAACCTTTAGGACGG-GA-------GAAATTTAG-CCATAGAAGCCGATCGAGGGATACCGGGTACTGTGC-GTATTA-TGCCCC--ATTCTACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GA-TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCCGAACAACGAGAAC----TTTG-GTTTCAACAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-TTACCAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTCATAAAA-ACAGCACCTATATACATAACATTAGTCACA-C-A-GGTCACATGATT---AGGACAACCCACGGAGATT-TTT---T-ACCCACACCGA--TCTGG----TCGTTTC-AA-CG--CACAG-CGTATGATCG-----T-GTGGGCGTG-A-CTGGG-GAGTTGGGATGAAATGGAGTGGATGGGG-ATCT-----A------GTGT-----GCAGAAATAT---TA---AAATGG-GC-CA-GGTC--GCAAATGTTGGTGTTTACATCTGTAAATAATA-----------AGAAAACA-T-ACTTCGACAGCAGAACA-TAAGTCGAC-AGCCATCTACGTCCTTGAGATTTGG-A--AGATGCTACGTT---ATCATGCCC-----CTTTGGA-TTCTAAT--------ACCAT-TAGTGGTTA-TACCTCT---AATGA--ACCTGTTGTGTCAC--ATATATACG-TATGCGTAGGGCC---GCGGGCCGTCTTGTACG--CACAGCTG--GGGATAAAACATAGACTGGCATAAGG---AGA----TGCACC-GTGAA-----TGTCAGGA-TG---GAGAAAAGCGCT-GGATTCAGATATC-ATTTGTTACCTAGTGGC-TGTTT-------C---ATA-CACTTG--TTCAATTGAC-AGT-AA-GAACG-TGGT--AAACAG--TGTAAAAAATCCGACTA-GAA-----CCTGTCA-ACCACGCATGCTCGGATAACAGATATTATCGCGG--AGAATTGT-ATTATGGCCGATGTTTACTTGCTGCACACACCGCTGG-GACTGGAGGCTATTTG-TACAACA-CGT-A-CTGTTTAACCGGTGAAACCTCACGGATTTAAGTC--GAGTATTGCAGA-CCAAATT--TTGGGCTAATTTTGTATGCGAAATCGACA------GGGACGA-GA-------TAAATTTAGTCCATAGAAACCG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTGGAT-GTATTAATGCCCCTGATTCTACTCTGCCCATCCGTGATCGTTGT-ATTTTTTAGTAATAGCACTAGCGAGCAATGGAGGT-TTACAG-AGAGCGCGACTTCACGACAACTTAACGTGTGTTGCAGTATAGCCCTGAACA-CGAGAACGTTCTTTG-GTTC--ACA-TGTTTACTTG-AA--AGGGAAACTTTGTC-TG--TAAACTTTAGGGTTTCCTTATCGccccatgactcagagacgtggaaagggaggttcctacccccgcgcgatccagctggatgtattaatgcccctgattctactctgcccatccgtgatcgttgtattttttagtaatagcactagcgagcaatggaggtttacagagagcgcgacttcacgacaacttaacgtgtgttgcagtatagccctgaacacgagaacgttctttggttcacatgtttacttgaaagggaaactttgtctgtaaactttagggtttccttatcgagattgg
gi|10                         : ctcataaaaacagcacctatatacataacattagtcacacaggtcacatgattaggacaacccacggagattttttacccacaccgatctggtcgtttcaacgcacagcgtatgatcgtgtgggcgtgactggggagttgggatgaaatggagtggatggggatctagtgtgcagaaatattaaaatgggccaggtcgcaaatgttggtgtttacatctgtaaataataagaaaacatacttcgacagcagaacataagtcgacagccatctacgtccttgagatttggaagatgctacgttatcatgcccctttggattctaataccattagtggttatacctctaatgaacctgttgtgtcacatatatacgtatgcgtagggccgcgggccgtcttgtacgcacagctggggataaaacatagactggcataaggagatgcaccgtgaatgtcaggatggagaaaagcgctggattcagatatcatttgttacctagtggctgtttcatacacttgttcaattgacagtaagaacgtggtaaacagtgtaaaaaatccgactagaacctgtcaaccacgcatgctcggataacagatattatcgcggagaattgtattatggccgatgtttacttgctgcacacaccgctgggactggaggctatttgtacaacacgtactgtttaaccggtgaaacctcacggatttaagtcgagtattgcagaccaaattttgggctaattttgtatgcgaaatcgacagggacgagataaatttagtccatagaaaccgccccatgactcagagacgtggaaagggaggttcctacccccgcgcgatccagAGCTAGACATAT-CCC-TCCGCCCATGCCA-ACGTCATGTTCA--TGACTCATC-AA-ACA-C-C-----TATATAA----------A-G-AGGGTCACTTG-TT---A-------CCA------TT-TCT---T-A---------A--TCATG----TCG---------------------------A-G--AT-ACGGG---G-A-CTGGG-G---TG--ATGAGA--------ATGGGG-TGAT-----C------CTGT-----GTAGC--TAT---TG---CCATGG-AC-CT-TGGagattgg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTACTGTGC-GTATTA-TGTCCC--ATTCCACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GA-TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCTTACC---CCTGTAT-GCAA-ATAGCCCCGATCAACGTGAAC----TTTG-GTTTCAACAGTGTTTA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATCAAA--CA-CA------TATA-AA----------A-C-A-GGTCACTTG-TT---A-------CCA------AC-GTG---T-A---------A--CTGTGAGATTTG-TTA-AG-CAC-CAT-GTCG-GTAA-CG-GATAT-ACGAG---G-A-
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tctCTTGTTACCAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTTA-AGCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGAGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACgatgtattatgcctaccctgggtggatgctattgtac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tctatcaaacacatataaaacaggtcaGATAT-A-CGCGG--AGA--TGT-ATTATG-CT-------------------TACC--TGG-A--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTCTTTAAC-----------------------------GTATTGCAGA-CCAATTTCCCTGGGCTAA-TTTGTATGCG-ACTCGACAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A----AACA-AAAGTGGAT-AG------A-------GAAATT-GG-CTCGGCTG--GATTT---TT-AT--CC-----CTTTGT--CTTAAA---------AGTG--T-GTGGTCA-CAC---T---AAAGA--AGCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAG-T--g
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCCCACGCTGTGTG-CATGTTCATTTGACTCATC-AA-ACA-CA------TAT---A----------A-C-A-GGT-ACCTG--C---A-------CCA------TT-TTT---C-A---------A--
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -A-CA-TTG--TC---TT-ACCACTCAA-AAACTCTGTT--GAAC-G--TGTAA-----CAG--TG-AGA-----TTTGTCA-AGCAC-CATG-TCGG-TAACatcat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gAA-GAACCCTGGT--CAAC-G--TGCAC-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-ACCAC-CATG-TCGG-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atataaacaAGATAAACTTATTCCC-TGCGCCCATGCCAACTT-CATGTTCA--TGACTCATCAAA-ACA-C
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACTTAT-CCCCTGCGCCCATGCCAACTT-CATGTTCA--TGACTCATC-AA-ACA-C
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACATAT-CCC-TCCGCCAACGTCATGGG------------AACTCATCAAA-AC----C-----TATATAA----------AAC-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---TTC---------A--TCATG----TCGTTTTCAA-CGC-CAC-A-CGTATGA-TAAG--AT-ATGGG---GGA-CGAGG-A---TG--ATGAAA--------ATGGGG-TGCT-----C------CTGT-----GTAGC--TAT---TC---CCACGGAAC-CT-T-GC--GGAAATGTTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACATT-ACT---GCA----AACA-TAAGTGGTTAAG------A-------GAGATT-GGAAGAAGCTG--ACGTTTAACA-AT--CC-----CTTTGT--CTATAA---------A-TGT-T-GTG--CACCAC---TAAAGAAAA--ACCC--TG-GTTAGGAGC-TGTAAGTT--GC------CC---GCAGT-CAT--TGTAATATCACGCCTG--AAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AC-----TGCACCTGTGAAA-TC-TGT-GAGA-TT---GAGAGA-GCGCTGGGATTCAGAGATC-A-TTGTTTACT---GGCATGCTT-------TCAAA-A-CA-TTGTTTCC--TT-AC-A-TCAAGAAACTCTGTT--CAGC-GT-TGTAC-----CTG--TGTAGA------CTGTCA-ACCAC-CATG-T-GG-TAACGGATAT-A-CGCGGAAAGA--TGT-ATTATG-CT-------------------TACC-CTGGTG--TGGATGGTATT-GTTACAACAATGTAAACTGTTTAAC-GGTGAGACCTCATGGA--TAAGTC-AACGTATTGCAGACCCAATT--CTT-GGCTAA-TTTGTATGCG-ACTCGACA------AGGACGA-GA-------GAAATTTAG-CCATAGAAGCTGATCGCGGGATACC--GTACTGTGTAGTATTA-TGCCTC--ATTCTACTC-----ATCC-TGA-----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GAGTTACAGGAGAG-GC-ACTCAACGCTTA-C---CTTGTAT-GCAG-ATAG-CCCGAACAACGAGAAC----TTTGCGTTTCAACAATG-TTACAGGAAATTAGG--AACTTTATCTTTACCAGACTTTAGCG-TTCCTTATCGTATTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gAGATAAACATCT-CCC-TGCGACCAACCCATGCG-CATGCTTG--TGACTCATCAAACACA-C-C-----TATATAA----------A-CCA-GGATACTTG-TC---A-------CCA------TT-TTT---C-A---------A--TCATG----TTGTTTG-AA-CGG-CAC-A-CGTATA-------------------------------------ATGAAA--------ATGGGG--GCTA----C------GTGT-----GTGGG--TAT---TC---CTATCG-ACACT-GGGC---CAGATGCAACTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-GCT-CAAGA----AACA-GAAGTGGAT-AG------A-------AAAATT-GG-CTCAGATG--ACGGG---AG-AA--CC-------TTGG--GTCGAAC--------ACTGT-T-GTGGTCA-CTC---T---GAAAA--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAG-T--GT------CT---GCAG--CAT--TGTACCACCACGGCCG--AAGAAGAAGCA---GC--GCTTAAGG---AC-----TGTACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAAAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGATCCCC---GGC-TGATT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TC-AC-AGTCTA-AAAATCTGTT--CAAG-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTCA-AGCAC-CATG-TCGC-TAACGGATAT-A-CGAGG--AGA--TGT-ATTATA-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAT-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAAGTTCCCTGGACTAA-TCTGCATGCC-ACCCGACAACCTTTAGGAC-G-GA-------GACATTTAG-CCATAGAAGCCGATCGAGGGATACCTGGTACTGCGC-GTATTA-TGCCAC--ATTCTACCC-----ATCC-TGAT----GTGATATGTTTGT--------TAGGG--CAATGA--GA-TTACGGCAGAG-GC-ACTCAACGCCTTCC---CCTGTAT-GCAG-ATACCCGTGAACAACGAGAAC----TTTG-GTTTCAACAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-TTACCAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTGg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGATAAACATTT-CCC-TCCGCCCATGCCGTGTG-CATGTTTA--TGACTCATCAAA-ACA-CACC----TATATGA----------A-C-A-GGTCACCTG-TT---A-------CCG------TT-TTT---T-A---------A--TCATG----TCGATTA-AA-CAG-CGG-A-CGTATGA-CA-G--AT-ACGAG---G-A-CTGGG-A---TG--ATGAAA--------GTGGGG-TGCT-----C------CTGT-----GTAGC--TAT---TG---TGGTGG-AC-GT-TGGC--GCAAATGCTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------AGAAAACA-T-ACT-CGACA----AACA-AAAGTGGAT-AG------A-------GTATTT-GG-CTCAGCTG--GAGTT---TT-AT--CC-----CTTTGA--CTATAA---------AGT-T-T-GTGGTTA-CAC---T---GACAA--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAAGGT--TT------CC---GCAG--CAT--TGTATCATCACGCCTG--AAGACGAAACA---GC--GCATAAGG---AC-----TGTACTTGTGAGA-TC-TGTCAGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GG-TTCAGAGATC-ATTTCATCCCC---GGC-TGTTT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TG-AC-ACTCA--CAACCCTGGT--CAAC-G--TGTAC-----CTG--TG-AGA-----CCTGTCA-ACCGC-CATG-TCGG-TAACAGATAT-A-CGCGG--AGA--TGTTATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGCG-ACCCGA-AACCTTTACGACGG--A-------GAAATTTAG-CTATAGAAGCTGATCGAGGGATACCGGGTACTGTGC-GTATTA-TGACCC--ATTCTACTC-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAG---------------------GAGAG-GC-ACTCAACGCTCACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCCGAACAACGTGAAC----TTTG-GTTTCAAGAATGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTTGTC-T---CAGACTTTAGCGTTTCCTTATCGTATTGg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCAAA-A----AC-----TA-ATAA----------A-C-A-GGTCAC--G-CTTAAA-------CCA------TTATTTCCAT-A---------AAGCCATG----TCGTTTC-AAACATACAC-AACATATAA-AG-A--ATGATGGG---G-ATCTGGGCA---TG--ATGAAA--------ATGGTG-TAATAATAACAAATAGCTGA-----ATAAT--TATGAGTGAGCCCATGG-CC-CTGTGGTCAACAAATGTTGGTGTTT-CAT-TGCCCA--A-ATTATTATCACCAGAAAACA-TTACT-CGACA----AACA-TAAG-GGTT-AG------A-------GAGATT-GG-AAGAGCTG--ACGTT---TTCAT--TCGCCTACTTTGTGTCCCGAACTGACTTAGAATGTGT-G-GGTTA-CAC---T---AAAGAGAACCC--TG-GC-AG--AC-TGTAC--T--GC------CCTCCGCAG---ATC-TGTACCATCACG-CCGTGAAGAAGAATCA---GC--CCATAAGGTAAATTTCTATGCACCTGTGACAGTCTTGTC-AGATTGTTTGAGA-A-GCGCT-GTATTCAGAGATCAGTTTGTTACCT---GGA-CAATTAATAATAC---A-ACCA-TTGCCTCCT-TT-AC-AGTCAA-GAAC----TT--CAGC-GATTGT-A-----CAA--TA-AGACAATCCTTGTCATCTCAC-CATG-TC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccctcatgtgacgtcatactagtCCATGCG-CATGTTTG--TGACTCATCAAA--CA-CA------TATA-AA----------A-C-G-GGTCACTTG-TT---A-------CCA------TT-TTT---T-A---------A--TCATG----TCG---------------------------A-G--AT-ACGAA---G-A-CTGAG-A---AG--ATGAAC--------ATGGGG-TGAT-----C------CTGT-----GTGGC--TAT---TG---CCATGG-AC-CT-TGGC--GCAAATGTTGGTGTTTTCAT-TGTAAA--A-A-----------CGAAAACA-T-ACT-CAACA----AATAGGAAGTGGAT-AG------A-------GAAATT-GG-CTCAGCTG--AC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcaacA-TTG--TCC--TT-AC-ACTCGG-CAACCCTGGT--CAGT-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----CCTGTCA-ACCAC-CATG-TCGG-TAACAGATAT-A-CGCGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGAACGCTATT-G-TACAACAATGT-AACTGTTTAAC-Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattgtccttacactcggcaaccctggtcagtgtgtaactgtgagacctgtcaaccaccatgtcggtaacagatatacgcggagatgtattatgcctaccctgggtgaacgctattgtacaacaatgtaactgtttaacg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tcaacccatgcgcatgtttgtgactcatcaaacacatataaaacgggtcacttgttaccattttttaatcatgtcgagatacgaagactgagaagatgaacatggggtgatcctgtgtggctattgccatggaccttggcgcaaatgttggtgttttcattgtaaaaacgaaaacatactcaacaaataggaagtggatagagaaattggctcagctgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntAGATAAACATCC-CCT-TGCGCCCACGCC-------------G--TGACTCATCAAA-ACA-CGCC----TGCATAA----------A-C-A-GGTAACCTG-TC---A-------CCA------TT-TTT---C-A---------A--TCATG----TCGTTTG-AA-CGG-CAC-A-CGTATAA-TG-A--AT-ATGGG---G-G-CT----A---TG---TG------------TGTGGCTATT-----C------CTATCGACAGTGGC--TAT---TC---CTATCG-AT-AT-TGGG--GCAGATGCAACTGTTTCCAT-TGTAAA--A-A---------------------------GA-A----AACA-CAATTGGTT-AG------A-------GAAATT-GG-CTGAGGCG--AAGGG---AG-AA--CC-------TTGG--CTTGAGT--------ACTTT-T-GTGGTCA-CAC---T-------A--ACCC--TG-GTTAG--AC-TGTAGG-T--GC------CC---GCAG--CAT--TGTACCACCACGGCCG--AAGAAGAAGCA---GC--GCATAAGG---AT-----TGTACCTGTGAGA-TC-TGTCGGGAGTG---GAGAGA-GCGCT-GGATTCAGAGATC-GTTTGATCCCC---GGC-TGATT-------C---A-A-CA-TTG--TCC--TT-GC-AGTCAA-AAACTCTGTT--CAAG-G--TGTAA-----C----TG-AGA-----TTTGTGA-AGCAC-CATG-TCGG-TGACCGATAT-A-CGAGG--AGA--TGA-ATTATA-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATCAAA--CA-CA------TATA-AA----------A-C-A-GGTCACTTG-TT---A-------CCA------AC-GTG---T-A---------A--CTGTGAGATTTG-TTA-AG-CAC-CAT-GTCG-GTAA-CG-GATAT-ACGAG---G-A-
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tctCTTGTTACCAAC-G--TGTAA-----CTG--TG-AGA-----TTTGTTA-AGCAC-CATG-TCGG-TAACGGATAT-A-CGAGG--AGA--TGT-ATTATG-CC-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACAAC-------------TAAC-GGTGAAACCTCACGGA-TTAAGTC-AAAGTATTGCAGA-CCAATTTCCTTGGGCTAA-TTTGTATGCT-ACCCGACAACCTTTAG-ACGGAGAAATTTTGGAAATTTAG-CGATAGAAGCTGATCGAGGGATATCGGGTACTGTGC-GTATTA-TGTCAC--ATTCCACTA-----ATCC-TGAT----GTGATCTGTTTGT--------TAGCG--CAATGG--GA-TTACGGGAGAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATAGCCCTGAACAACGAGAAT----TTTA-GTTTCAATAGTGTTTACAGG-AATTAGG--AACTTCGTC-TTACCAGA------CGTTTTCTTATCATTTTGgatgtattatgcctaccctgggtggatgctattgtacaactaacggtgaaacctcacggattaagtcaaagtattgcagaccaatttccttgggctaatttgtatgctacccgacaacctttagacggagaaattttggaaatttagcgatagaagctgatcgagggatatcgggtactgtgcgtattatgtcacattccactaatcctgatgtgatctgtttgttagcgcaatgggattacgggagaggcactcaacgcctacccctgtatgcagatagccctgaacaacgagaattttagtttcaatagtgtttacaggaattaggaacttcgtcttaccagacgttttcttatcattttgg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tctatcaaacacatataaaacaggtcaCAC-CCTG-TCGG-AAACGGATAT-A-CGAGG--AAA--TGT-ATTATG-CT-------------------TACC-CTGG-G--TGGATGCTATT-G-TACACCAATGT-AAATGTTTAAC-GGTGAAAACTCACAGA-TTAAGTCAAAAGTATTGCAGA-CCGATTTCCTTGGGCTAA-g
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gAG-GC-ACTCAACGCCTACC---CCTGTAT-GCAG-ATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaggcactcaacgcctacccctgtatgcagat