lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 111111 11 11111 2 1 111 11 33333 1 2 2222 2222222 11111 222222 1111 5555555555555 1111 1 1111111 111 1 1111 11111111 1 111 11111 1111 333 4444444444444 11111 111 22222222222222222222222222222222 1111 2222222222 1111111 11111111 11111111111 2222 11111 11111111111111 11 1111111111111111111111111111111111111111 111 22 1111 11111 111111 111111 11111 2222222 1111 111 333 66666666666666666666666666 222222222222222222222222222222222 11111111111 1111 111 1111111 111111 111 2222 11 333333333333 1
lowQualScore : 3 2 11 2 2 2 111111 9999999 555 1 3 3 66 66666 3 0 6 6 1 6 6 6 111 55 6 44444 6 6 3 0 6 6 3333 1 6 5 77 5 5 9999999 44444 77 77 222222 5 7777 5 77 5555555555555 77 9999 5 1 77 77 5 3333333 888 000 77 5 1 5 2222 7 66666666 1 5 000 3 5 5 5 33333 1111 111 2222222222222 00000 000 5 99999999999999999999999999999999 0000 1111111111 0 4 4 4 4 66 0000000 4 4 66 77777777 55555555555 6666 44444 5 66666666666666 77 0 00 5 5 5 5 1111111111111111111111111111111111111111 111 44 6 3 4444 22 6 6 11111 444444 6 6 6 6 6 111111 6 11111 8888888 4444 99 6 7 111 66 5 66 66 5 5 5 66 5 555 9999 777 4 4 8 11111111111111111111111111 4 555555555555555555555555555555555 66 8 4 77777777777 8 777777 777 66 66 9999 4 4 4 4 777 4 4 4 4 4 6666 4 4 111 4444444 55 0 4 4 55 55 4 777 0 7777 777 777777 7777 2 44 3 6 3 3 3 888 6 6 0 999 6666 7 3 3 000 3 3 55 2222 4 99 1 6666 55 777 11 333333333333 4 55 2 4 7777 4 99 8 4 44 4 4 4 4 4
lowQualScore : . . .. . . . ...... ....... ... . . . .. ..... . . . . . . . . ... .. . ..... . . . . . . .... . . . .. . . ....... ..... .. .. ...... . .... . .. ............. .. .... . . .. .. . ....... ... ... .. . . . .... . ........ . . ... . . . . ..... .... ... ............. ..... ... . ................................ .... .......... . . . . . .. ....... . . .. ........ ........... .... ..... . .............. .. . .. . . . . ........................................ ... .. . . .... .. . . ..... ...... . . . . . ...... . ..... ....... .... .. . . ... .. . .. .. . . . .. . ... .... ... . . . .......................... . ................................. .. . . ........... . ...... ... .. .. .... . . . . ... . . . . . .... . . ... ....... .. . . . .. .. . ... . .... ... ...... .... . .. . . . . . ... . . . ... .... . . . ... . . .. .... . .. . .... .. ... .. ............ . .. . . .... . .. . . .. . . . . .
lowQualScore : 6 9 11 9 9 9 000000 3333333 000 4 6 6 99 77777 5 0 7 7 7 7 7 7 777 88 7 22222 7 7 3 0 0 7 2222 0 7 7 99 7 7 3333333 33333 99 99 999999 7 4444 7 99 0000000000000 99 4444 7 4 99 99 7 0000000 999 000 99 7 4 7 1111 9 66666666 4 7 000 0 7 7 7 77777 6666 777 1111111111111 44444 000 7 66666666666666666666666666666666 6666 9999999999 4 4 4 4 4 11 9999999 4 4 11 44444444 44444444444 6666 44444 0 33333333333333 99 1 99 7 7 7 7 6666666666666666666666666666666666666666 777 00 7 2 2222 00 7 7 88888 333333 7 7 7 7 7 888888 7 88888 3333333 2222 22 7 3 777 22 0 99 99 0 0 0 99 0 666 6666 888 4 4 9 99999999999999999999999999 4 999999999999999999999999999999999 11 9 4 77777777777 9 222222 888 11 11 4444 4 4 0 0 000 0 0 0 0 0 5555 0 0 000 9999999 55 7 0 0 55 55 0 000 9 8888 000 666666 7777 3 66 3 7 3 3 3 888 7 7 2 222 1111 3 6 6 000 6 6 00 8888 0 55 6 1111 55 000 00 999999999999 0 55 0 0 2222 0 55 0 0 88 0 0 0 0 0
consensus : GCTA-TT-CCAGAAAT-GA-ATG-T-A----C-GGGG-------GGG---TCGGACGG-C-AC-CTCA-----ATTAAAATTTTATG-CT-TGGTTGTTGTT-GA-AAA-TTTATTA---TTTC--A-TACCTT--G-TGGG-T-CG-CCGGTT-AAATTTAATTTT-GT--ACCTGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGCGG-G----TTG-A-T--TAACA-AT--AAA-----------CAA--CAAACAN-A-GCAGC-C-ATGC--TT--TC-ACTT-TC----AGCATC-C-AT---T--TT-TCAGAACGG-AA-GAGCAAT----ACATGCGTG-----T--TG-CG-C---ATGCC-CGAT-A-C--A--AAATC-A--ATAC-AAGC--G------G---AGA-T---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----AT--AGA-C-T-AGA----TAAT----------GTATA-T-A-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GT--ACAT--AGAC----TA-----GATAA---TGTATG-TA-AGCGGGAGA-TAA-C-T---C--TA-AGTA--CATAGAC-TA-GAT-A-AT-GTA--------------GAT---------------TATC----AT---TTGAATTTNTTTTA-TTAAAG----GGCC-AATA-TCA--A--ATA--T---AAAACATTTCTT-GAAGG-AATAG-CCA-TT-TAGG---T--CAG-T---T-TTTTTTTT-------ACA----GA--T-CTGTT---TTTGNGTTTTTTT-AAC--TTTA--A-AAA-C-AAACGT--C-AC--TTTANTAAA---TG-A-TT-CT-G--------GG----TA-GG-T-A-TA-ATAC---------AGT---A---TT-AT---T---A-TTTTAT--GT-C-AAT----T------TAAT-GTAAA-AT-A-T---GA--CT--TCCA----GTGG-C-AA-T-TCT---TGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--A-C--TT--TCAA-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AACT---AC---G-AAAT----CAAATTTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-A-T-TG-TT-ACA---TT-A--ACA-GG-CAA-A---CTT-C-CA--ACAA--CTG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TAC--T---A-----A-T--CCGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTTT
Reference ( gi|8 ) : GCTA-TT-CCAGAAAT-GA-ATG-T-A----C-GGGG-------GGG---TCGGACGG-C-A--TTCA-----ATTAAAATTT-ATG-CT-TGGTTGCTGTT-GA-AAA-TTTATTA---TTTC--A-TACCT---G-TGGG-T-CG-CCGGTT-AAATTTGATTTT-GT--CCCTGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGCGG-G----TTG-A-T--TAACA-AT--A-------------CAA--CAAACAC-A-GCAGC-C-ATGC--TT--TC-ACTT-TC----AGCATC-T-AT---T--TT-TCAGAACGG-AA-GAGCAAT----ACATGCGTG-----T--TG-CG-C---ATGTC-CGAT-A-C--A--AAATC-A--AT-T-AAGC--G------G---AGA-T---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----AT--AGA-C-T-AGA----TAAT----------GTATA-T-A-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GT--ACAT--AGAC----TA-----GATAA---CGTATG-TA-AGCGGGAGA-TAA-C-T---C--TA-AGTA--CATAGAT-TA-GAT-A-AT-GTA--------------GAT---------------TA-C----AT---TTGAATTTTATTTA-TTAAAG----GGCC-AATA-TCA--A--ATA--T---AAAACATTTCTT-GAAGG-AATAG-CCA-TT-TAGG---T--CAG-T---T-TTTTTTTT-------ACA----GA--T-CTGTT---TTTGGGTTTTTTT-AAC--TTTA--A-AAA-C-AAACGT--C-A---TTCATTAAA---TG-A-TT-CT-G--------GG----TA-GA-T-A-TA-ATAC---------AGT---A---TT-AT---T---A-TTTTAT--GT-C-AAT----T------TAAT-GTAAA-AT-A-T---GA--CT--TCCA----GTGG-C-AA-T-TCT---TGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--A-C--TT--TCAA-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AACT---AT---G-AAAT----CAAATTTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-A-T-TG-TT-ACA---TT-A--ACA-GG-CAA-A---CTT-C-CA--AC-A--CTG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TAC--T---A-----A-T--CTGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTTT
gi|5 : GCTA-TT-CCAGAAAT-GA-ATG-TTA----C-GGGG-------GG----TCGGACGG-C-AC-TTCA-----ATTAAAATTTTATG-CT-TGGTTGTTGTT-GAGAAA-ATTAT-A---TTTC--A-TACCTT--G-TGGG-T-CGGCCGGTT-AAATT-AATTTT-GT--ACCTG-T-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---T-CC-----GCA--G--GATGGCGA-G----TTG-A-T--TAACA-AT--AAA-----------CAA--CAAACAC-A-GCAGC-C-ATGC--TT--TC-ACTT-TC----AGCGTC-T-AT---T--TT-TCAGAACGG-AA-GAACAAT----ACATGCGTG-----T--TG-CG-C---ATGTC-C-AT-A-C--A--AAATC-A--ATAC-AAGC--G------GG--AGA-A---TA---CT-CTA-A--------G---AC----A-------------A----TAAT----------G-ATA-TTA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GT--ACAT--AGAC----TA-----GA-AA---TATATG-TT-AGCGG-AGA-TAA-CAT---C--TA--GTA--CATAGAC-TA-GAT-A-AT-GTA--------------GATAAACAAAACAATT--TATC----AT---TTGAATTTT-TTTA-TTAAAG----GGCC-AATA-TCA--A--ATA--T---AAAACATTTCTT-GAAGG-AATAG-CCA-TT-TAGG---T--CAG-T---T-TTTTTTTTA------ACA----GA--T-CTG-T---TTTGGGTTTTTTT-AAC--TTTA--A-AAA-C-AAACGC--C-AC--TTTAATAAA---TG-A--T-CT-G--------G--------GA-T-ATTA-ATAC---------A-T---A---TT-AT---TA--A-TTTCAT--GT-G-AAT----T------TAAT-GTAAA-AT-A-T---GA--CT--T-CA----GT-G-C-AA-T-TCT---TGA-T-T-A-T-G----C-C-T---TA--A-C--TT--C--A-AA-A--TC--TT-CATAA---CAGAA--AACT---AT---G-AAAT----CAAA-TTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-A-T-TG-TT-ACA---TT-A--ACA-GA-CAA-A---CTT-C-CA--ACAA--CTG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TAC--T---A-----A-T--CTGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-A--C-ATA-GACCTTT
gi|7 : tagGCTA-TT-CCAGAAA---A-ATGAT-A----C-GGGG-------G-----TCGGACGG-C-ACTTTCA-----ATTAAATTTT-ATG-CT-TG--TGTTGTT-GA-AAA-TTTATTA---TTTTCAA-TACCT-----TGTG-TTCG-CCGGTTTAAATTTAATTTG-A----CCTGGG-GGGTTTTGATGT-ATTT--T-G-GGCGTT--G---TACC-----GCA--G--GAATGCGGTG----TTG-A-GA-TAACA-AT--AAA-----------CAA--CCAACAC-A-GCAGC-C-ATGC--TT--TC-ACTTGTC----AGCATCTT-AT---T--TC-TCAGAACGGCAA-GAGCAAT----ACATGGTTG-----T--TG-GC-C---ATGTC-CGAT-ACC--A--AAATC-A--ATAC-AAGC---------G---AGATT---AA---CT-CT--A--------GT--AC----AT--TGA-CTT-AGA----TAAT----------GTATA-T-A-AG-CGGGAG--ATTTAA---ACT-CG-AA--GT--ACA---AGAC----TA-----GATAA---TGT-------------AGA-TAA----------------A--CA------TA-AAC-A-AT--------------------T---------------TATC----AT---TTGTATTTATTTTA-TTAAAA----GG-C-AATATTCA--A--ATA--T---AAAACATTTCTT-GAA-G-AATAGTCCA-TTCTAGG---TCCCAGTT---T-TTTTTTTT-------ACA----GAACT-CTG-T---TTTGGATTTGTTT-AAC---TTA--A-AAA-C-AAACGT--CTAC--TTTAATAAA---TG-A-TT-CT-GAAATACACGG----TA------A-TA-ATAC---------AGT---A---TT--T---TAACA-ATATAT--GT-C-AA-----T------TAAT-GTAAA-AT-A-T---GA--CT--TCCC----ATGG-CAAA-TATCT---TGACT-T-ACT-GA---C-T-TA--AA--A-C--TT--TCCA-AA-T--TC--TTCCATAA---CAG----AACT---AC---GAAAAT----CAAATTTTTAAAA----C-T-T-AC-AGG-A---TG-TTAACA---TT-A--ACAGGG-CAAGA---CTTCC-CA--AC-AATCTG-AT--GCTT--TATT--TC---A--TAC------A-----A-T--CTGA-TG-GC-A---CT----GGAT-TGCA-C--TG-GTT-AC-CAATA-G-CCTTTtaattataatgcgagct
gi|9 : taggGCTA-TT-CCAGAAAT-GA-ATG-T-A----C-GGGG-------GG----TCGGACGG-CCAC-TTCA-----ATTAAAATTT-TTGGCT-TGGTTGTTGTTTGA-AAA-TTTATTT---TTTC--A-TACCTT--G-TGGG-T-CG-CCGGTT-GAATTTAATTTTTGT--ACCTGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGCGG------TTG-AGT--TAACA-AT--AAA-----------CAA--CAAACAA-AAGCAGC-C-ATGC--TT--TC-ACTT-TC----AGCATC-C-AT---T--TT-TCAGAACGG-AA-GAGCAAT----ACATGCGTG-----T--TGTCG-C---ATGCC-CGAT-A-C-----AAATC-A--ATAT-AAGCG-G------G---AGA-T---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----AT--AGA-C-T-AGA----TAAT----------GTATA-T-A-AG-CGGG-G--AT---A---ACT-CT-AA--GT---TAC--AGAC----TA-----GATAA------ATG-TA-
gi|3 : GCTA-TTTCCAGAAAT-GA-ATG-T-A----C-GGGGACTTGTGGGG---TCGGACGGGC-A--CTTATACAAATTAAAATTTTATG-CCATGGTTG-TGTT-GA-AAA-TTTATTA---TTTC--ATTACCT---GTTGGGCT-CGCCCGGTT-AAATTTAATTTT-GTTACCTTGGTGGGGTACTGATGTAATTT--T-GTTGCGTCTAGTTTTACC-----GCA--GGCGATGGC-G-G----TTG-A-T--TAACA-AT--A-------------AAA--CTAACA--A-GGATT-CAAAGC--TTAGCCGACTG-T-------CTTC-T-AC---T--TTGGCAGAACGG--A-GAGCAAT----A-ATGC-TG-----T--TG-CG-CTAAATGCC-CGAT-A-CAGA--GAATC-A--ATATAAAGC--GAAGGGAG---AGA-T---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----ATAAAGA-C-TGAGA----TAAT----------GTATA-T-A-AA-CGGCCG-------------T-CC-AA--G---------AGAT----TAGGGCCGATAA---TGTATACTACAGCGGGAGA-Tgataaacaaaacatttctttgaagaactagccatttaggtcagttttttttttacacaccgatcctgttttgcggtttttttaactttaacaaacaacgtcagctttgataatgaattctgggggccagggtaataatacaagtatttattaattctatgggtcatttaatgtaaaattgacttccagtggcaattcttgattatgccttaaacgtttcaaaatcttcataacagaacaagaaatcaaatttttaaaaaacttttacaggattgttaacattaaacagggcaaatttccaacagtgatcgattttttcataatattaatctgatggcagctagatatgcactggttaccatagacctttcatgttaactgcgaggtttctaaaatggaaagggga
gi|14 : tagGCTA-TT-CCAGAAATTGA-ATG-T-A----C-GGGG-------GGG---TCG--CGG-C-A--TTCA-----ATTAATATTTTATG-CT-TGGTTGTTGTT-GA-AAAATTTATTAAATTTCC--A-TACCT---T-GGGG-T-CG-CCGGTTTAAATTTAATTTT-G---ACCTGGT-GGGTATTGATGT-AATT--T-G-TGCGT---GTT-TACC-----GCAAGG--AATGGCGG-G----TAGAA-TTATAACA-ATAAA-------------CAA--CAAAAAC-ACGCAGCAC-ATGCCTTT--TC-ACTT-TCCTCAGGCATC-C-AT---TAAAT-TCAGAACGGTAA-GAGCAAT----ACATGCGTGTGAAAT--TGCCGTC---ATGCCTCGAT-A-C--AGTATATC-AATAT-T-AAGCG-G------G---AGA-T---AACTTCT-CCACA--------GTAAAC----AT--AGATC-T-AGA----TAAT----------GTATA-T-A-AG-C-GGAG--AT---A---ACT-CT-AA--ggagactactgatagtttacactcaggcaccatagataaacatgtatgaagcgggagataactccctatgcacatagactagatataggtacttataaacaaaacaattttatgcattgaatttattttatgaaaggccaatatcaccaatattataaaacatttcttgaagggaatagccatttaagatgtcagttcttttttttacagatctgttggttttgtattttttttaaccttttaaaaacaaacgtcactttaataaatgattctgggggttaataattttttaagtcaatttaatgtaaaattatgacttccatgtagtggcaaattctaattgattatgcttaactttcaaaaatcgatctataaactacggaaatcagaattttaaaaactttacaggaattgttacaattaacaggcaaaaaacttccaggacaacttgatgcttaattttcatactaatctgatggcagctgaggattgcaccttgcgttaccataggaccttttttatgtttaactgcgagc
gi|15 : aggGCTA-TT-CCAGAAAT-AA-ATG-T-A----T-GGGG-------AGG---TCGGAAGG-C-A--CT
gi|23 : aaccatttttgtaaaagacatgtatatggaaaccatatttcccttagtttctgcatcttccataatgatcatagaagaatactgattttctgaactccagcttttacacttgaagcatcaacatacatacaaaagtccacacatcacattgctctgagatgaaaacaaaagggctaaaaaaaaacacccaaatccttaactatcaaatttttttaattttatgcatggcaccatataaaacaaattatattttcttcattgtggggtattttctaaatgaaattttatgggtggtgggttgggaaaaaGCTA-TT-CCAGAAAT-AA-ATG-T-A----T--GGG-------GGG---TCGGAAGG-C-A--CT
gi|22 : tttttttttttattttatgcatggcacatttacaacatatttaatattttcttcgttggggttttctaaataaattttatggtggtggttgggaaaataaaaGCTAGCC-CCAGAAAT-AA-ATG-T-A----G-GGGG-------GGG---
gi|20 : tttatttttggagggggattttcaacaaattaatattttcttcgttgtggggtattttctacttaaattttatgggtggtggtttgaaaaaaaaagtgcttccaacaccacacaccccCTA-TT-CCAGAAAT-AA-ATG-T-A----T---GG-------GGG---TCGGA
gi|4 : atcattttttttattttagcatgcaccattttacaacaaattatatatttttttttttttttttttgtttttttcttcgtttgtggggtttttcttaataaaattttatgggtggtgggttgggataaaaaaagttgccttTA-TT-CCAGAAAT-GAGATG-T-AACGGC-GGGG-------GGGGGGTCGGACGG-C-A--CTCA-----ATTAAA-TTT-ATG-CT-TGGTTGTTGTT-GA-AAA-TTTATTT---TTTCC-A-TACCTTGTG-TGGG-T-C---CGGTTGAAATTTA--TTT-GT--CC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--TTG-TGTGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGCGG-GCT--TTG-A-T--TAACATAA--A-------------CAA--CAAACAG-C-GCAGC-CCATGC--TT--TC-ACTT-TC----CGCATC-C-AT---T--TT-TCAGAACGG-AATGAGCAACTTGAACATTCGTG-----TATTG-CG-C---ATGCC-CGATCA-C--A--AAATCCA--ATAT-AAGCCGG------G---AGA-TTAGAA---CTTCTA-ACTAGCGGGAT--ACCTCAAT--A-A-C-G-AGAGTACTAATACATGTATTAGTATA-C-A-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-A---GT--CAAT---GAC----T------GATAAA--TGTATAATA-AGCGGGAGAGTAAAC-T---C--TA-AGTA--ATTAGAC-TAAGAT-A-ATCGTA--------------GATAACACAAAACAATTTTATC----AT---TTGAATTT-ATTTA-TTAAAG----GGCCCAATA-TCA--ACAGTA--T---AAAACATTTCTT-GAAGG-ATAAG-CCAATT-TAGG---T--CAG-T---C-TTTTTTTTTTTTTCCAGA----GA--T-CTGTT---TTGGCGTTTTTTA-AAC--TTTATAA-AAA-C-AA-CGT--C-AC--TTGACTAAA---TG-A-TTTCT-G--------GGGCCATG-GGGT-A-TATATAC---------AGT---A---TT-AT---T---AATTCTAT--GT-CCAAT----T------TAAT-GTAAA-A--A-T---AATGCT--TCCA----GTGGGC-AA-T-TCT---TGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--AAC--TT--TCAA-AAAA--TC--TT-CATAA---CAG-A--AACT---AA---G-AAAT----CAAA-TTTCAAAAA--CT-T-TAAC-AGG-A-T-TGTTT-AAA---TT-A--ACA-GG-CAA-AT--TTT-C-CA--ACAA--GTG-AT--GTTT--T-TCAATA---A--TAT--TA--A-----A-T--CTGAGTG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-AC-C-ATA-GACCT
gi|21 : agggct-TT-CCAGAAAT-AA-ATA-T-G----T-ATGG-------GGG---TCGGAatt
gi|12 : aatttttttatttatgtttaatgcatgggctaccatttacaactaattagtaattttcttcgttgtgggtttttctaaataaaattttatgggtggtgggttggaaaaaaagtgcctacT-CCATGAAC--A-ATG-T-A----CTGGGG-------GGG---TCGGAAGG-C-
gi|11 : ataatgacccttttccaagcacaatcagtaactatactacttcaactgactttcttgggcattaaatattttcagatgtcccatcatgcaattccagcttaaaaaaatgctgtcccagttatcgagtgaaggcgtcgtattgaagacaaccgctagctatacattttatctttacacatttctcaaggagatgagaagagattattttttaagaagcaatgaggtcattgtaatcggaataggtaatgagttctagcagggaatatgcggataaaaatctttatgagggaaccattttttggtaaacgacatggtaataacgatggtaaccgatatttctcgttgtctaggaacatctcagttgataaatgattctattaagaccatagaagaatactgtttttgctgaactccagcttctgagactattgaagcatcaacatacatgataaagagctccacatgtcacattgctccgagctgaagaacacaaaaatggttaaaaagaagccaaatccttcactatcaaatcttttattaattttatgcatggcaccatttcaacaaaattatattttccttcattgtgggtaaattttctaataaaattttaatgtggtgcgtggttggaaaaaaagtgT-CCATGAAC--A-ATG-T-A----CTGGGG-------GGG---TCGGAAGG-C-tatgg
gi|10 : ataatgacccttttccaagcacaatcagtaactatactacttcaactgactttcttgggcattaaatattttcagatgtcccatcatgcaattccagcttaaaaaaatgctgtcccagttatcgagtgaaggcgtcgtattgaagacaaccgctagctatacattttatctttacacatttctcaaggagatgagaagagattattttttaagaagcaatgaggtcattgtaatcggaataggtaatgagttctagcagggaatatgcggataaaaatctttatgagggaaccattttttggtaaacgacatggtaataacgatggtaaccgatatttctcgttgtctaggaacatctcagttgataaatgattctattaagaccatagaagaatactgtttttgctgaactccagcttctgagactattgaagcatcaacatacatgataaagagctccacatgtcacattgctccgagctgaagaacacaaaaatggttaaaaagaagccaaatccttcactatcaaatcttttattaattttatgcatggcaccatttcaacaaaattatattttccttcattgtgggtaaattttctaataaaattttaatgtggtgcgtggttggaaaaaaagtgT-CCATGAAC--A-ATG-T-A----CTGGGG-------GGG---TCGGAAGG-C-tatgg
gi|19 : ataatgacccttttccaagcacaatcagtaactatactacttcaactgactttcttgggcattaaatattttcagatgtcccatcatgcaattccagcttaaaaaaatgctgtcccagttatcgagtgaaggcgtcgtattgaagacaaccgctagctatacattttatctttacacatttctcaaggagatgagaagagattattttttaagaagcaatgaggtcattgtaatcggaataggtaatgagttctagcagggaatatgcggataaaaatctttatgagggaaccattttttggtaaacgacatggtaataacgatggtaaccgatatttctcgttgtctaggaacatctcagttgataaatgattctattaagaccatagaagaatactgtttttgctgaactccagcttctgagactattgaagcatcaacatacatgataaagagctccacatgtcacattgctccgagctgaagaacacaaaaatggttaaaaagaagccaaatccttcactatcaaatcttttattaattttatgcatggcaccatttcaacaaaattatattttccttcattgtgggtaaattttctaataaaattttaatgtggtgcgtggttggaaaaaaagtgGT-ATTTATC-G-TGCGT---GA--TACCAAGGAGCA--G--AAGGTCGA-GAGAGTTG-A-A--TAACA-AT--AAAAGTAAGAAAAACAAAACAAACAAGA-GCAGC-C-ATGC---T--TC-A-----G----AGCATC-TAATATAT--AT-GCAAAACGG-AA-AAGC-AC----ACAAGA-----------TG-AG-C---A------GAT-G-T--A--GGGTC-----C-C-ATGC--T------GTCTATA-T---GA---CA-CTA-C--------G---AA----AA--AGA-T-C-AAA----T-AT----------AAATA-C-A-AGTCGGAAGGAAT---A---ACT-CTAAA--GT--Atatgg
gi|3 : GA----TAAT----------GTATACT-ACAG-CGGGAG--AT---GGAGACTACT-GATAGTTTACACTCAGGCACCATA-----GATAAACATGTATG--A-AGCGGGAGA-TAA-C-T---CCCTA-TGCA--CATAGAC-TA-GAT-ATAG-GTACTTATAAACAAAACAAT---------------TT-T----ATGCATTGAATTTATTTTA-TGAAAG----G-CC-AATA-TCACCA--ATA--TTATAAAACATTTCTT-GAAGGGAATAG-CCA-TT-TAAGATGT--CAG-T---TCTTTTTTTT-------ACA----GA--T-CTGTTGGTTTTGTATTTTTTTTAACCTTTTA--A-AAA-C-AAACGT--C-AC--TTTAATAAA---TG-A-TT-CT-G--------GG-------GG-T---TA-ATA-----------------------AT---T-----TTTTAA--GT-C-AAT----T------TAAT-GTAAA-ATTA-T---GA--CT--TCCATGTAGTGG-C-AAAT-TCTAATTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA----C--TT--TCAA-AA-A--TCGATC-TATAA-----------ACT---AC---GGAAAT----CAGAATTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AAT-TG-TT-ACAA--TT-A--ACA-GG-CAA-AAAACTT-C-CAGGAC-AACTTG-AT--GCTTAAT-TT--TC---A--TAC--T---A-----A-T--CTGA-TG-GC-A--GCTGA--GGAT-TGCACC-TTGCGTT-AC-C-ATAGGACCTTTttatattaatatgactag
gi|9 : taggctatttccagaaatgaatgtacggggacttgtggggtcggacgggcacttatacaaattaaaattttatgccatggttgtgttgaaaatttattatttcattacctgttgggctcgcccggttaaatttaattttgttaccttggtggggtactgatgtaattttgttgcgtctagttttaccgcaggcgatggcggttgattaacaataaaactaacaaggattcaaagcttagccgactgtcttctactttggcagaacggagagcaataatgctgttgcgctaaatgcccgatacagagaatcaatataaagcgaagggagagataactctaagtacataaagactgagataatgtatataaacggccgtccaagagattagggccATA-T-A-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GT--ACAT--AGAC----TA-----GATAA---TGTATA-TA-AGCGGG-GA-TAA-C-T---C--TA-AGT---TACAGAC-TA-GATAA-AT-GTA--------------GAT---------------tttatgtttaactgcgagc
gi|14 : gctattccagaaatgaatgtacggggggtcggacggccacttcaattaaaatttttggcttggttgttgtttgaaaatttattttttcataccttgtgggtcgccggttgaatttaatttttgtacctggtgggtattgatgtattttgtgcgtgtaccgcaggatggcggttgagttaacaataaacaacaaacaaaagcagccatgctttcactttcagcatccatttttcagaacggaagagcaatacatgcgtgttgtcgcatgcccgatacaaatcaTAT--TA-AGCGGGAGA-TAA-C-TTCTC--CACAGTAAACATAGATCTA-GAT-A-AT-GTA--------------TAT---------------aaacaaaacatttctttgaagaactagccatttaggtcagttttttttttacacaccgatcctgttttgcggtttttttaactttaacaaacaacgtcagctttgataatgaattctgggggccagggtaataatacaagtatttattaattctatgggtcatttaatgtaaaattgacttccagtggcaattcttgattatgccttaaacgtttcaaaatcttcataacagaacaagaaatcaaatttttaaaaaacttttacaggattgttaacattaaacagggcaaatttccaacagtgatcgattttttcataatattaatctgatggcagctagatatgcactggttaccatagacctttcatgttaactgcgaggtttctaaaatggaaagggga
gi|9 : agggctattccagaaattgaatgtacgggggggtcgcggcattcaattaatattttatgcttggttgttgttgaaaaatttattaaatttccataccttggggtcgccggtttaaatttaattttgacctggtgggtattgatgtaatttgtgcgtgtttaccgcaaggaatggcgggtagaattataacaataaacaacaaaaacacgcagcacatgccttttcactttcctcaggcatccattaaattcagaacggtaagagcaatacatgcgtgtgaaattgccgtcatgcctcgatacagtatatcaaATA-TA-AGCGGGAGA-TAA-C-T---C--TA-AGTA--CATAGAC-TA-GAT-A-AT-GTA--------------TAT---------------AAGCGGGGAT------AACTCTA---AGTTACAGACTAGATA-AATG-T-A--G--ATAAAC---AAAACATTTCTTTGAAGA-ACTAG-CCA-TT-TAGG---T--CAG-T---T-TTTTTTTT-------ACACACCGA--TCCTGTT---TTGCGGTTTTTTT-AAC--TTTA--ACAAA-C--AACGT--C-AGCTTTGAT--AA---TGAA-TT-CT-G--------GGGGC-CAGGG-TAA-TA-ATACA--------AGT---AT--TT-AT---TA--A-TTCTATGGGT-C--AT----T------TAAT-GTAAA-AT---T---GA--CT--TCCA----GTGG-C-AA-T-TCT---TGA-T-T-A-T-GC---C-T-T---AA--A-CG-TT--TC-A-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--A--C---AA---G-AAAT----CAAATTTTTAAAAAACTT-T-T-AC-AGG-A-T-TG-TTAACA---TTAA--ACAGGG-CAA-A---TTT-C-CA--AC-A--GTG-ATC-GATT--T-TT--TCATAA--TAT--T---A-----A-T--CTGA-TG-GC-A--GCT-A---GATATGCA-C--TG-GTT-AC-C-ATA-GACCTTTaagcggagataactctaa
gi|16 : gctattccagaaatgaatgtacggggggtcggacggccacttcaattaaaatttttggcttggttgttgtttgaaaatttattttttcataccttgtgggtcgccggttgaatttaatttttgtacctggtgggtattgatgtattttgtgcgtgtaccgcaggatggcggttgagttaacaataaacaacaaacaaaagcagccatgctttcactttcagcatccatttttcagaacggaagagcaatacatgcgtgttgtcgcatgcccgatacaaatcaT---------------TATC----AT---TTGAATTTGTTGTA-GTA-------GGCC-AATA-TCA--A--ATA--T---AAAACATTTCTT-GAAGG-AATCG-CCA-TT-TAGG---T--CAA-TATTT-TTTTTTTT-------TCA----GA--T-CTGTT---TTTTT-TTTTTTT-AAC--TTTA--A-AAA-C-AAACGT--C-ACT-TTCAT-AAA---TG-A-TT-CTAG--------GG----TA------A-TA-ATAC---------AGT---A---TT-AT---T---A-TTTTA---GT-C-AAT----T------TAAT-GTAAA--T-A-T---GA--CT--TCCA----GTGG-C-AA-T-TCT---TGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--A-A--TT--TCAA-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AACT---AC---C-AAAT----CCAATTTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-A-T-TG-TT-ACA---TT-catgttaactgcgaggtttctaaaatggaaagggga
gi|2 : gtgtagataaccaaaacaattTT-AAC--TTTA--A-AA--C-AAACGTAAC-C---TGTATAAAA---TG-AGTT-CTCG--------GG----TA------A-TA-ATAC---------AGT---ACATTT-CT---T---A-TTTCAT--GT-C-AATCGTTT------TAAT-GTAAA-AT-AAT---GA--CT--TCCA----GTGG-C-AA-T-TCT---CGA-T-T-G---G----C-TAT---AA--A----TG--CCAA-AA-A-------T-CATGC---C---A--AACT---AT---GCAAAT----AATATGTTTCAAAA--CT-T-T-ACAAGG-A-C-TG-TT-ATA---TT-C--ACA-GG-C-A-A---CTT-C-CA--GCAA--CTGAATAAGCTC--A-TT--TC---GTTTACTTT---AAT---A-T--CCAACTA-GC-T--GCA-A--GGAT-GGCA-C-TT--GTT-AC-C-AT--GACCTTT
gi|1 : actgtctatattgttcaggataaggtatttacctttacatgccatatttaacagctttcagaatatcctcgaacgtaccaaaaaattcacacgccatactgaagggtcactgtgac-AAC--TTTA--A-AAAACGAAACGT--C-A---CTTTTTAGAATATG-A-TTTCTCG--------GG----TA------A-TA-ATAC---------AGTTACA---TT-AT---TC--A-TTTCAT--TTTC-GAT----TCGTTTTTGATAGTAAATAT-A-T---GA--CTATTCCA----GTG--C-A--T-TCT---CGA-AAT-A-TCG----C-T-T---AT--A-A--TT--TCAA-AG-A--TC------ATAA---CTG-A-----T---AT-------AT-------ATGTTTCAAAA--CT-TCT-AC-AGG-A-C-TG-TT-A-----TT-ATCACA-GG-CAA-C---CTT-C-----AG-A--ATG-AA--AGCT--C-AT--TC---A--TACTTT---AAT---A-T--CCAA-TA-GC-GTCGCA-AT-GGACGGGCA-CTTTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTCTtatgttactgtgaggcttccaaagtttaaacggaatatagtggataacgacgcatttcccacaacatgaacattactcaactgacctttcttacttaaaattttcacttcccattcatcagattctgcttcaaaaatgctgtccagttatctatgaaagggtctatttagcaaccctagctatatttcatctttacacattttctcaggagagagagaagattaatatttagagcaatgagtcataatcaaataaataatatatctagaggtatgaaaacaatctttaaaaacatttttgtaaaacacatgtatatgtaaccattatttctcgtttctgcctcttcattttgattctataagaccaagaagaaatacgttttcttgactccagcttttacccattgaagcatcaaaatacatcaaaagctccacatgccacattgcttccgagctgaaaaaaatggtaaaaagagaccatttcgtttcactacgaaatcttttgtaattgttgagcatggcaccaattcaacaattgtatttcttcattgtgggtatttctcttaataagaattttaatgggtggtgggtgaaaaaaatgcctctcgacccccatacattatttc
gi|18 : aactgtcttatgtatcgttcatagtaaggtatttaccttttacattgcatttattacagctttaaaatatcctcaaacgttaaccaaaatcctaggagcacacaattacacaccgccattactgaacagggtcaaccgtgaactaAA---TG-A-TT-TC-T--------GG----TG-GG-T-A-TT-ATACTAATAACTAGGT---A---TTTATGTAT---A-TTGTAT--GTTC-AATC---T------TAATCGTAAA-TT-G-TTCTGA--CT--TCCA----GTGG-C-AA-T-TCT---TGA-T---A-T-GAGTTCAT-T---AAGTA-CCTTT--TCAATAA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AACT---AC---G-AAAT----CAAATTTTTAAAAA--C--T-T-AC-A-G-A-T-TGTTT-ACA----T-A--ACA-GG-CAC-A---CTT-C-CA--ACAA--CTG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TAC--T---A-----ATT--CTGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-G-T-AC-C-ATA-GACTTTtttatgttaactgttgaggctgccaaaatagttaaacggaatttaacggtgaacgagcatttcccacaaactaacattactcaactgaactttactacattaaaattttcacatttcccagtgcatgcaaattccagcttcaaaaatgctgtcccatgtatcatgaaagggtctatttcgaaaccctagcatatatttcatcttttcacagacattttcagtgagagagaaggattaaggcaatgaagtcatgtaaatcaaatataaatagttctatgcaggtatcgaaaaaatcttacttaaaccaatttttgtaaatgaccatgtatatggtaaccatatttctcgatttctgcatcttccttgtatgattctataatgaaccatcgagatagaatactgttttctgaatccagcttttacagtttgaggcatcaacacaatacagtaatagaaagctccacatgtcacattgctccagagctgaaaacaattgttaataaagcagaccaagatcctttaaaaaaaatttaattttatgcatgtaccatttcaacaaattgatattatttctcgttgtgggtattttctctaataaaattttaatgggtggtggcgttgaaaaaagtagccttccgaccccccatacattatttttc
gi|13 : A-T-TC-----GA-T-TTA-T-G----C-T-TTCTAG--A-C--TTAGTAAA-AA-AAATC--TT-CACAATAGCAG-ATCAACCTGCATACAG-TAATATTCCAATTTCTTAAAAA--ATATAT-AC-AGGGA-TGTG-TT-ACAAACTT-A--GGA-GGGCAA-A---CTT---CA--ACAA--CTG-AT--GCTA--T-TT--TC---AGTTACA-T---AGATCGA-T--CAGATTGTGCGA--GCT-AGCGAAT-TGCA-C-TAG-GTTCACAC-GAA-GACCT
gi|28 : aactctactaaattacaggtactatggcgaatcacgtgaaatagatctcatatataaactcaatttcagggcaattttcattgtgaataccaagttattattaagggcgcttcaatcatggaatcttaagattaaggcaatttcttcgcacaggggataacagcatagccatttaggtgtcagggattatgttttttacagatctggtttatgcgtcttttttactttctacatggacacacaaacatgtcactggtaataatgatttgcctgccgtcggatgttcggggaataatacagagtctcacttggattaattgtgtctatgtcaaactgactgtttaatatgtaaaagctataattggtattaaactaatcatacgggttgagtgcagtccacgctc-AAAT----CAAATTTTTCAAAA--CT-T-T-AC-AGG-T-T-TG-TT-ATA---TT-T--ACA-GG-CAA-A---TTT-C-CA--AC-A--atttcaatgagaatgacttgcgaggcttc
gi|6 : cTACAAA--CT-T-T-AC-AGG-A-CGTG-TT-ATA---TT-C--ACA-GG---A-A---CTT-CTCA--GC-AG-CTG-AA--G--T--C-AT--TC---A--TAC--TTCTA-----A-TACCCAA-TT-GC-T--GCA-A--GG-T-T-CA---TTG-GTT-AC-C-TAA-GACCTTTa
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TCTCGTTTCTGCATCTTCCATTGTATGATTCCTATAATGACCATAGAAGAATACTGTTTTTCTGAACTCCAGTTTTACATTTGAAGCATCAACAAACATACAAAAGCTCACATGCCACATTGCTCCGAGCTGAAAACAAAATGGTTAAAAAGAACCATTTCGTTCACTATCAAAATTTTTTAATTTTATGCATGGCACCATTTCAACAAATTATATTTCTTCAATTGTGGGGTATTTTCTTAATAAAATTTTATGGGTGGTGGGTTGGAAAAAAAGTGCCTTCGACCCCCCCAACATATGTTGGAATA
Unaligned ( gi|24 ): GCATCGGGCACAATTTGAGCAGGAGCGAGATGGGGTATATTTTCTTCGTTGGTGGGTTTTTCTAAATAAATTTATTATGTGGTGGGTTTGGGAAAAAAAAGTGCCTTCCGACCTCCCATACATTTTATTTGAATGT
Unaligned ( gi|25 ): CAATTTTTTTTTATTTTATGCATGGCACCATTTACAACAAATTATATTCTTCGTTGTGGGGTTTTTCTAAATAAAATTTATGGGTGGTGGGTTGGGAAAAAAAGTGCCTTCGACCCCCCCCATACAT
Unaligned ( gi|26 ): CACAATATACAGCATATTGAGTTTTCTTGGTGGTGGGGATTTTCTGATTTTTTTCCCAAGGAGGGGATCTAAAAATCAGTGGCCTTCTACCCCTCCCAGATAACTTTTACTGGAATAGTCCT
Unaligned ( gi|27 ): ACATGTCACATTGCTCTGAGCTGAAAACAATATGGTTAAAAAGAATCAAATCCTTCACTATCAAATTTTTTTTATTTTATGCATGGCACTATTTCAGCAAATTATATTTTCTTCGTTGTGG
Unaligned ( gi|29 ): AATATCAACTGCCTTCCCACCCCCCAGAAGTTTTTTGCTGGAATAGCCCTCAT
Unaligned ( gi|30 ): ATTTTCACATTCCCAATTAATTCCAGCATAAAAAATGCTGTCCCAGTT
Alignments
lowQualScore : 11 88888888888888888888888888888888888888888888 111 11 1 1 111 2222222 11111 1111 1111 33333333333 1111 1111 11 1111111 1 1111 11111111 1 11111 1111 3333333333333 111 22222222222222 1111 1 1111111111 1111111 11111111 11111111111 111 111111 111 888888888888888888888888888888888888888888888 111111 1111 1111 111111 11111 1 1111 1111111 111111111 1111111 1111 11111111 111 55555555555555555555555555555 2222222222222222222222222 111111111111 22222222222222222222 1111 1111 111 1111 1111 11 2222222222 1
lowQualScore : 3 2 11 2 2 2 999999 8888888 444 2 888 2 44444444444444444444444444444444444444444444 5 0 5 5 5 000 33 5 1 77 5 1 5 1 5 222 5 5 5 66 5 5 4444444 22222 66 66 2 5 7777 5 4444 00000000000 66 0000 5 66 5 66 5 5 66 5 66 5 0000 11 0000000 0 5 0000 5 33333333 0 5 888 5 5 55555 5 0000 4444444444444 333 888 5 55555555555555 0000 777 5 0 9999 9999999999 4 4 4 4 66 0000000 4 4 66 77777777 55555555555 5 555 333333 5 222 77 55 5 999999999999999999999999999999999999999999999 5 55 444444 5 22 66 0 0000 5 1111 444444 00000 88888 66 888 5 0 0000 5 6666666 5 5 5 66 888 66 666666666 6666666 5 0000 66 5 0 888 88 11 4 55 44444444 55 4 4 4 55 4 4 4 4 55 1 0 3 3 333 22222222222222222222222222222 3 3 9999999999999999999999999 777777777777 3 55 7 3 11111111111111111111 55 7 0000 3 666 55 55 8888 4 8 3 666 3 3 3 3 3 5555 3 3 000 55 1111 55 3 3 55 55 3 666 3 55 99999 1111 7777 1 44 3 6 3 3 6 6 6 6 3 555 4444 6 3 555 3 3 3 3 44 555 3 88 55 3 55 666 00 666 2222222222 3 55 2 0 3 5555 3 88 7 3 3 3 3 3 3 3
lowQualScore : . . .. . . . ...... ....... ... . ... . ............................................ . . . . . ... .. . . .. . . . . . ... . . . .. . . ....... ..... .. .. . . .... . .... ........... .. .... . .. . .. . . .. . .. . .... .. ....... . . .... . ........ . . ... . . ..... . .... ............. ... ... . .............. .... ... . . .... .......... . . . . .. ....... . . .. ........ ........... . ... ...... . ... .. .. . ............................................. . .. ...... . .. .. . .... . .... ...... ..... ..... .. ... . . .... . ....... . . . .. ... .. ......... ....... . .... .. . . ... .. .. . .. ........ .. . . . .. . . . . .. . . . . ... ............................. . . ......................... ............ . .. . . .................... .. . .... . ... .. .. .... . . . ... . . . . . .... . . ... .. .... .. . . .. .. . ... . .. ..... .... .... . .. . . . . . . . . . ... .... . . ... . . . . .. ... . .. .. . .. ... .. ... .......... . .. . . . .... . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 1 5 66 5 5 5 444444 1111111 444 7 777 7 77777777777777777777777777777777777777777777 7 1 7 7 7 000 66 7 4 99 7 4 7 4 7 111 7 7 0 99 0 0 4444444 55555 99 99 5 0 5555 0 1111 66666666666 99 6666 0 00 0 99 0 0 99 0 99 0 6666 11 1111111 0 0 6666 6 44444444 0 0 888 0 0 99999 0 1111 4444444444444 888 888 0 44444444444444 6666 222 0 0 4444 4444444444 4 4 4 4 11 9999999 4 4 11 44444444 44444444444 7 777 666666 0 111 99 99 7 555555555555555555555555555555555555555555555 0 11 444444 9 11 99 1 6666 0 2222 444444 00000 55555 99 888 0 0 6666 0 2222222 0 0 0 99 888 99 444444444 2222222 0 6666 99 0 1 888 11 22 0 55 55555555 55 0 0 0 55 0 0 0 0 55 0 8 6 6 666 00000000000000000000000000000 6 6 6666666666666666666666666 555555555555 6 00 3 6 55555555555555555555 00 3 1111 6 444 00 00 5555 0 0 6 444 6 6 6 6 6 0000 6 6 000 00 4444 00 6 6 00 00 6 444 6 00 11111 1111 1111 3 22 1 2 1 1 2 2 2 2 1 444 8888 7 3 888 3 3 3 3 66 222 6 66 00 6 00 444 00 444 8888888888 6 00 5 9 6 7777 6 66 3 6 6 6 6 6 6 6
consensus : GCTA-TT-CCAGAAAT-GA-ATG-T-A----C-GGGG-------GGG---TCGG-A--NGG-C-------------ACT-----T------CA-A-T----------TAAAATTTTATGCT-TGGTTGTTGTT-G-A-AAATTTATTA---TTTC--A-TACCTTGTG--GG-TCG-CCGG-TT-AAATTTAATTTT-G-TACC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGCGG-G----TTG-A-T--TAACAATAAA-----------CAA--CAAA----C-AN-A-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TC----GGCATCC-AT---T--TTTCAGAACGG-AA-GAGCAAT----ACATGCGTG-----T--TG-CG-C---ATGCC-CGAT-AC--A--AAATC-AATA-T-AAGC--G------G---AGAT---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----AT--AGA-CT-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GT--ACAT--AGAC----TA-----GAT-AA---TGTATG-TA-AGCGGGAGA-TAA-C-TC--TAAGTACATAGACTA-GAT---A-----A--T-GTAGA----------T---------------TAT-CATT-TGAAT------TTATTTTA--TTAAAG----G-GC--C-AAT------AT-C---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAG---T---T-TTTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGTT---TT-TGNGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A-CT-T-T--AATAAATG-A-TT---CT------G-GG----T-----A---GG-T-AT-A-ATAC---------AGT---------A---TT-AT---T---A-T-TTTAT--GT-C-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA-A--TA-T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--A-C--TT--TCAA-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAC-G-AAAT----CAAATTTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TT-A--ACA-GG-C---AA-A-CTT-C-CA--ACAA-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---C--T-A-----A-T--CCGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTTT
Reference ( family-824 ) : GCTA-TT-CCAGAAAT-GA-ATG-T-A----C-GGGG-------GGG---TCGG-A--CGG-C-------------ACC-----T------CA-A-T----------TAAAATTTTATGCT-TGGTTGTTGTT-G-A-AAATTTATTA---TTTC--A-TACCTTGTG--GG-TCG-CCGG-TT-AAATTTAATTTT-G-TACC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGCGG-G----TTG-A-T--TAACAATAAA-----------CAA--CAAA----C-AN-A-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TC----AGCATCC-AT---T--TTTCAGAACGG-AA-GAGCAAT----ACATGCGTG-----T--TG-CG-C---ATGCC-CGAT-AC--A--AAATC-AATA-C-AAGC--G------G---AGAT---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----AT--AGA-CT-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GT--ACAT--AGAC----TA-----GAT-AA---TGTATG-TA-AGCGGGAGA-TAA-C-TC--TAAGTACATAGACTA-GAT---A-----A--T-GTAGA----------T---------------TAT-CATT-TGAAT------TTNTTTTA--TTAAAG----G-GC--C-AAT------AT-C---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAG---T---T-TTTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGTT---TT-TGNGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A-CT-T-T--ANTAAATG-A-TT---CT------G-GG----T-----A---GG-T-AT-A-ATAC---------AGT---------A---TT-AT---T---A-T-TTTAT--GT-C-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA-A--TA-T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--A-C--TT--TCAA-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAC-G-AAAT----CAAATTTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TT-A--ACA-GG-C---AA-A-CTT-C-CA--ACAA-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---C--T-A-----A-T--CCGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTTT
gi|1 : -AAC--TTT--------A--A-AAAACGAAAC--GTC-A-CT-T-TTTAGAATATG-A-TTT--CTC-----G-GG----T-----A--------AT-A-ATAC---------AGTTAC------A---TT-AT---TC--A-T-TTCAT--TTTC-GA--------T----TCGTTTTTG--ATAGTAAATA--TA-T---GA--CTATTCC----AGTG--C-A-T-TC---TCGA-AAT-A-TCG----C-T-T---AT--A-A--TT--TCAA-AG-A--TC------ATAA---CTG-A----------TAT-----AT-------ATGTTTCAAAA--CT-TCT-AC-AGG-AC-TG-TT-A------TT-ATCACA-GG-C---AA-C-CTT-C-----AGAA-T-GA-AA--GC-T--C-AT--TC---A--TA---CTTT-AAT---A-T--CCAA-TA-GC-GTCGCA-AT-GGACGGGCA-CTTTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTCT
gi|10 : aactgtcttatgtatcgttcatagtaaggtatttaccttttacattgcatttattacagctttaaaatatcctcaaacgttaaccaaaatcctaggagcacacaattacacaccgccattactgaacagggtcaaccgtgaactaT-CCATGAAC--A-ATG-T-A----CTGGGG-------GGG---TCGG-A--AGG-CCACTTTTTTTCCAACCACGCAC------CACA-T----------TAAAATTTTATtttatgttaactgttgaggctgccaaaatagttaaacggaatttaacggtgaacgagcatttcccacaaactaacattactcaactgaactttactacattaaaattttcacatttcccagtgcatgcaaattccagcttcaaaaatgctgtcccatgtatcatgaaagggtctatttcgaaaccctagcatatatttcatcttttcacagacattttcagtgagagagaaggattaaggcaatgaagtcatgtaaatcaaatataaatagttctatgcaggtatcgaaaaaatcttacttaaaccaatttttgtaaatgaccatgtatatggtaaccatatttctcgatttctgcatcttccttgtatgattctataatgaaccatcgagatagaatactgttttctgaatccagcttttacagtttgaggcatcaacacaatacagtaatagaaagctccacatgtcacattgctccagagctgaaaacaattgttaataaagcagaccaagatcctttaaaaaaaatttaattttatgcatgtaccatttcaacaaattgatattatttctcgttgtgggtattttctctaataaaattttaatgggtggtggcgttgaaaaaagtagccttccgaccccccatacattatttttc
gi|11 : ataatgacccttttccaagcacaatcagtaactatactacttcaactgactttcttgggcattaaatattttcagatgtcccatcatgcaattccagcttaaaaaaatgctgtcccagttatcgagtgaaggcgtcgtattgaagacaaccgctagctatacattttatctttacacatttctcaaggagatgagaagagattattttttaagaagcaatgaggtcattgtaatcggaataggtaatgagttctagcagggaatatgcggataaaaatctttatgagggaaccattttttggtaaacgacatggtaataacgatggtaaccgatatttctcgttgtctaggaacatctcagttgataaatgattctattaagaccatagaagaatactgtttttgctgaactccagcttctgagactattgaagcatcaacatacatgataaagagctccacatgtcacattgctccgagctgaagaacacaaaaatggttaaaaagaagccaaatccttcactatcaaatcttttattaattttatgcatggcaccatttcaacaaaattatattttccttcattgtgggtaaattttctaT-CCATGAAC--A-ATG-T-A----CTGGGG-------GGG---TCGG-A--AGG-CCACTTTTTTTCCAACCACGCAC------CACA-T----------TAAAATTTTATtatgg
gi|12 : ataatgacccttttccaagcacaatcagtaactatactacttcaactgactttcttgggcattaaatattttcagatgtcccatcatgcaattccagcttaaaaaaatgctgtcccagttatcgagtgaaggcgtcgtattgaagacaaccgctagctatacattttatctttacacatttctcaaggagatgagaagagattattttttaagaagcaatgaggtcattgtaatcggaataggtaatgagttctagcagggaatatgcggataaaaatctttatgagggaaccattttttggtaaacgacatggtaataacgatggtaaccgatatttctcgttgtctaggaacatctcagttgataaatgattctattaagaccatagaagaatactgtttttgctgaactccagcttctgagactattgaagcatcaacatacatgataaagagctccacatgtcacattgctccgagctgaagaacacaaaaatggttaaaaagaagccaaatccttcactatcaaatcttttattaattttatgcatggcaccatttcaacaaaattatattttccttcattgtgggtaaattttctaT-CCATGAAC--A-ATG-T-A----CTGGGG-------GGG---TCGG-A--AGG-CCACTTTTTTTCCAACCACGCAC------CACA-T----------TAAAATTTTATtatgg
gi|13 : ataatgacccttttccaagcacaatcagtaactatactacttcaactgactttcttgggcattaaatattttcagatgtcccatcatgcaattccagcttaaaaaaatgctgtcccagttatcgagtgaaggcgtcgtattgaagacaaccgctagctatacattttatctttacacatttctcaaggagatgagaagagattattttttaagaagcaatgaggtcattgtaatcggaataggtaatgagttctagcagggaatatgcggataaaaatctttatgagggaaccattttttggtaaacgacatggtaataacgatggtaaccgatatttctcgttgtctaggaacatctcagttgataaatgattctattaagaccatagaagaatactgtttttgctgaactccagcttctgagactattgaagcatcaacatacatgataaagagctccacatgtcacattgctccgagctgaagaacacaaaaatggttaaaaagaagccaaatccttcactatcaaatcttttattaattttatgcatggcaccatttcaacaaaattatattttccttcattgtgggtaaattttctaCGTGAAA-TAG-A-TC--TCA-TATATAAACTC-AATTTCA-----G--G-GCA-A----------T---------------TTT-CATTGTGAATACCAAGTTATT--A--TTAAGG----GCGCTTC-AATCATGGAAT-CTTAA--G--AT---T---AAGGCAATTTCTTCGCACAGGGG-ATAACAGCATAG-CCA-TT-TAGGTG---T--CAGGGAT---TATGTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGGT---TTATGCGTCTTTTT-TAC--TTTCTACATGGA--C-ACA-C-AAACATGTC-A-CTGG-T--AAT-AATG-A-TTTGCCTGCCGTCG-GA----TGTTCGG---GG-A-AT-A-ATACAG-------AGTCTCACTTGGA---TTAAT---T---G-TGTCTAT--GT-C-AAACTGACTGT----T------TAATAT-GTAAA-AGCTA-T---AA--TT--tatgg
gi|13 : aactctactaaattacaggtactatggcgaatcaAT-TC-----GA-T-TTA-T-G----C-T-TTCTAG--A-C--TTAGTAAA-AA-AAATC--TT-CACAATAGCAG-ATCAACCTGCATACAG-TAATATTCCAATTTCTTAAAAA--ATATAT-AC-AGGGATGTG-TT-AC-AAACTT-A--GGA-GGGC---AA-A-CTT-C--A--ACAA-C-TG-AT--GCTA--T-TT--TC---AGTTA---CA-T-AGATCGA-T--CAGATTGTGCGA--GCT-AGCGAAT-TGCA-C-TAG-GTTCACAC-GAA-GACCTggtattaaactaatcatacgggttgagtgcagtccacgctcattcgatttatgctttctagacttagtaaaaaaaatcttcacaatagcagatcaacctgcatacagtaatattccaatttcttaaaaaatatatacagggatgtgttacaaacttaggagggcaaacttcaacaactgatgctattttcagttacatagatcgatcagattgtgcgagctagcgaattgcactaggttcacacgaagacctatttcaatgagaatgacttgcgaggcttc
gi|14 : aactctactaaattacaggtactatggcgaatcacgtgaaatagatctcatatataaactcaatttcagggcaattttcattgtgaataccaagttattattaagggcgcttcaatcatggaatcttaagattaaggcaatttcttcgcacaggggataacagcatagccatttaggtgtcagggattatgttttttacagatctggtttatgcgtcttttttactttctacatggacacacaaacatgtcactggtaataatgatttgcctgccgtcggatgttcggggaataatacagagtctcacttggattaattgtgtctatgtcaaactgactgtttaatatgtaaaagctataattggtattaaactaatcatacgggttgagtgcagtccacgctcGCTA-TT-CCAGAAATTGA-ATG-T-A----C-GGGG-------GGG---TCG-----CGG-C-------------AT------T------CA-A-T----------TAATATTTTATGCT-TGGTTGTTGTT-GAA-AAATTTATTAAATTTCC--A-TACCTTG-G--GG-TCG-CCGGTTT-AAATTTAATTTT-G--ACC-TGGT-GGGTATTGATGT-AATT--T-G-TGCGT---GTT-TACC-----GCAAGG--AATGGCGG-G----TAGAA-TTATAACAATAAA-----------CAA--CAAA----A-AC-ACGC--AGCAC-A--TG-CCTTTTCACTT-TCCTCAGGCATCC-AT---TAAATTCAGAACGGTAA-GAGCAAT----ACATGCGTGTGAAAT--TGCCGTC---ATGCCTCGAT-AC--AGTATATC-AATATT-AAGCG-G------G---AGAT---AACTTCT-CCACA--------GTAAAC----AT--AGATCT-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-C-GGAG--AT---A---ACT-CT-AA--atttcaatgagaatgacttgcgaggcttc
gi|15 : aggGCTA-TT-CCAGAAAT-AA-ATG-T-A----T-GGGG-------AGG---TCGG-A--AGG-C-------------ACT-----T------
gi|16 : aaccatttttgtaaaagacatgtatatggaaaccatatttcccttagtttctgcatcttccataatgatcatagaagaatactgattttctgaactccagcttttacacttgaagcatcaacatacatacaaaagtccacacatcacattgctctgagatgaaaacaaaagggctaaaaaaaaacacccaaatccttaactatcaaatttttttaattttatgcatggcaccatataaaacaaattatattttcttcattgtggggtattttctaaatgaaattttatgggtggtgggttgggaaaa----------T---------------TAT-CATT-TGAAT------TTGTTGTA--GTA-------G-GC--C-AAT------AT-C---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATCG-CCA-TT-TAG--G---T--CAA---TATTT-TTTTTTTT-------T-CA----GA--T-CTGTT---TT-TTT-TTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A-CT-T-T--CATAAATG-A-TT---CTA-----G-GG----T-----A--------AT-A-ATAC---------AGT---------A---TT-AT---T---A-T-TTTA---GT-C-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA----TA-T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--A-A--TT--TCAA-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAC-C-AAAT----CCAATTTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TT-
gi|17 : gtgtagataaccaaaacaattTA-TT-CCA-ACAT----ATG-T------T-GGGG-------GGG---TCGA-A---GG-C-------------ACT-----TTTTTTCCA-A-CCCACCACCCATAAAATTTTAT
gi|18 : tctcgtttctgcatcttccattgtatgattcctataatgaccatagaagaatactgtttttctgaactccagttttacatttgaagcatcaacaaacatacaaaagctcacatgccacattgctccgagctgaaaacaaaatggttaaaaagaaccatttcgttcactatcaaaattttttaattttatgcatggcaccatttcaacaaattatatttcttcaattgtggggtattttcttaAATG-A-TT---TC------T-GG----T-----G---GG-T-AT-T-ATACTAATAACTAGGT---------A---TTTATGTAT---A-T-TGTAT--GTTC-AA--------TC---T------TA--ATCGTAAA-T--TG-TTCTGA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T---A-T-GAGTTCAT-T---AAGTA-CCTTT--TCAATAA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAC-G-AAAT----CAAATTTTTAAAAA--C--T-T-AC-A-G-AT-TGTTT-AC-A----T-A--ACA-GG-C---AC-A-CTT-C-CA--ACAA-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---C--T-A-----ATT--CTGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-G-T-AC-C-ATA-GACTTT
gi|19 : GT-ATTTATC-G-TGCGT---GA--TACCAAGGAGCA--G--AAGGTCGA-GAGAGTTG-A-A--TAACAATAAAAGTAAGAAAAACAAAACAAA----C-AAGA-GC--AGC-C-A--TG-C---TTCA-----G----AGCATCTAATATAT--ATGCAAAACGG-AA-AAGC-AC----ACAAGA-----------TG-AG-C---A------GAT-GT--A--GGGTC----C-C-ATGC--T------GTCTATAT---GA---CA-CTA-C--------G---AA----AA--AGA-TC-AAA----T-AT----------A-AATA-CA-AGTCGGAAGGAAT---A---ACT-CTAAA--GT--A
gi|2 : TT-AAC--TTT--------A--A-AA--C-AAAC--GTA-A-CC-TGT--ATAAAATG-AGTT---CTC-----G-GG----T-----A--------AT-A-ATAC---------AGT---------ACATTT-CT---T---A-T-TTCAT--GT-C-AA--------TCGTTT------TA--AT-GTAAA-A--TAAT---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TCGA-T-T-G---G----C-TAT---AA--A----TG--CCAA-AA-A-------T-CATGC---C---A--AAC-----TAT-GCAAAT----AATATGTTTCAAAA--CT-T-T-ACAAGG-AC-TG-TT-AT-A---TT-C--ACA-GG-C----A-A-CTT-C-CA--GCAA-C-TGAATAAGCTC--A-TT--TC---GTTTA---CTTT-AAT---A-T--CCAACTA-GC-T--GCA-A--GGAT-GGCA-C-TT--GTT-AC-C-AT--GACCTTTttatattaatatgactag
gi|20 : actgtctatattgttcaggataaggtatttacctttacatgccatatttaacagctttcagaatatcctcgaacgtaccaaaaaattcacacgccatactgaagggtcactgtgacCTA-TT-CCAGAAAT-AA-ATG-T-A----T---GG-------GGG---TCGGAA--AGG-C-------------AAC-----T------tatgttactgtgaggcttccaaagtttaaacggaatatagtggataacgacgcatttcccacaacatgaacattactcaactgacctttcttacttaaaattttcacttcccattcatcagattctgcttcaaaaatgctgtccagttatctatgaaagggtctatttagcaaccctagctatatttcatctttacacattttctcaggagagagagaagattaatatttagagcaatgagtcataatcaaataaataatatatctagaggtatgaaaacaatctttaaaaacatttttgtaaaacacatgtatatgtaaccattatttctcgtttctgcctcttcattttgattctataagaccaagaagaaatacgttttcttgactccagcttttacccattgaagcatcaaaatacatcaaaagctccacatgccacattgcttccgagctgaaaaaaatggtaaaaagagaccatttcgtttcactacgaaatcttttgtaattgttgagcatggcaccaattcaacaattgtatttcttcattgtgggtatttctcttaataagaattttaatgggtggtgggtgaaaaaaatgcctctcgacccccatacattatttc
gi|21 : atcattttttttattttagcatgcaccattttacaacaaattatatatttttttttttttttttttgtttttttcttcgtttgtggggtttttcttaataaaattttatgggtggtgggttgggataaaaaa-TT-CCAGAAAT-AA-ATA-T-G----T-ATGG-------GGG---TCGG-AGTAGG-C-------------ACT-----TTTTTTCCA-A-CCCACCACCCATAAAATTTTAT
gi|22 : aatttttttatttatgtttaatgcatgggctaccatttacaactaattagtaattttcttcgttgtgggtttttctaaGCTAGCC-CCAGAAAT-AA-ATG-T-A----G-GGGG-------GGG---
gi|23 : tttatttttggagggggattttcaacaaattaatattttcttcgttgtggggtattttctacttaaattttatgggtggtggtttgaaaaaaaaagtgcttccaacaccacacaccccGCTA-TT-CCAGAAAT-AA-ATG-T-A----T--GGG-------GGG---TCGG-A--AGG-C-------------ACT-----T------
gi|28 : tttttttttttattttatgcatggcacatttacaacatatttaatattttcttcgttggggttttctaaataaattttatggtggtggttgggaaaataaa-AAAT----CAAATTTTTCAAAA--CT-T-T-AC-AGG-TT-TG-TT-AT-A---TT-T--ACA-GG-C---AA-A-TTT-C-CA--ACAA-
gi|3 : cGCTA-TTTCCAGAAAT-GA-ATG-T-A----C-GGGGACTTGTGGGG---TCGG-A--CGGGC-------------ACT-----TATA---CA-AAT----------TAAAATTTTATGCCATGGTTG-TGTT-G-A-AAATTTATTA---TTTC--ATTACCTGTTG--GGCTCGCCCGG-TT-AAATTTAATTTT-GTTACCTTGGTGGGGTACTGATGTAATTT--T-GTTGCGTCTAGTTTTACC-----GCA--GGCGATGGC-G-G----TTG-A-T--TAACAATAAAAC---------TAA--CAAGGATTC-AA-A-GCTTAGC-C-GACTGTC--TTCTACTT-T-----GG-----------------CAGAACGG--A-GAGCAAT----A-ATGC-TG-----T--TG-CG-CTAAATGCC-CGAT-ACAGA--GAATC-AATA-TAAAGC--GAAGGGAG---AGAT---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----ATAAAGA-CTGAGA----TAAT----------G-TATA-TA-AA-CGGCCG-------------T-CC-AA--G---------AGAT----TAGGGCCGAT-AA---TGTATACTACAGCGGGAGA-T
gi|3 : tagGA----TAAT----------G-TATACTACAG-CGGGAG--AT---GGAGACTACT-GATAGTTTACACTCAGGCACCATA-----GAT-AAACATGTATG--A-AGCGGGAGA-TAA-C-TCCCTATGCACATAGACTA-GAT---ATAGGTACTT-ATAAACAAAACAATTT---------------TATGCATT--GAAT------TTATTTTA--TGAAAG----G--C--C-AAT------AT-C---ACCA--ATA--TTATAAAAC-ATTTCTT-GAA----GGGA-------ATAG-CCA-TT-TAA--GATGT--CAG---T---TCTTTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGTTGGTTT-TGTATTTTTTTTAACCTTTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A-CT-T-T--AATAAATG-A-TT---CT------G-GG--------------GG-T--T-A-ATA----------------------A---TT------------T-TTTAA--GT-C-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA-AT-TA-T---GA--CT--TCCATGTAGTGG-CAAAT-TCTAATTGA-T-T-A-T-G----C-T-T----A--A-C--TT--TCAA-AA-A--TCGATC-TAT---------A--AAC-----TACGG-AAAT----CAGAATTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGGAAT-TG-TT-ACAA---TT-A--ACA-GG-CAAAAA-A-CTT-C-CAGGACAA-CTTG-AT--GCTTAAT-TT--TC---A--TA---C--T-A-----A-T--CTGA-TG-GC-A--GCTGA--GGAT-TGCACC-TTGCGTT-AC-C-ATAGGACCTTTggagactactgatagtttacactcaggcaccatagataaacatgtatgaagcgggagataactccctatgcacatagactagatataggtacttataaacaaaacaattttatgcattgaatttattttatgaaaggccaatatcaccaatattataaaacatttcttgaagggaatagccatttaagatgtcagttcttttttttacagatctgttggttttgtattttttttaaccttttaaaaacaaacgtcactttaataaatgattctgggggttaataattttttaagtcaatttaatgtaaaattatgacttccatgtagtggcaaattctaattgattatgcttaactttcaaaaatcgatctataaactacggaaatcagaattttaaaaactttacaggaattgttacaattaacaggcaaaaaacttccaggacaacttgatgcttaattttcatactaatctgatggcagctgaggattgcaccttgcgttaccataggaccttttttatgtttaactgcgagc
gi|4 : taggctatttccagaaatgaatgtacggggacttgtggggtcggacgggcacttatacaaattaaaattttatgccatggttgtgttgaaaatttattatttcattacctgttgggctcgcccggttaaatttaattttgttaccttggtggggtactgatgtaattttgttgcgtctagttttaccgcaggcgatggcggttgattaacaataaaactaacaaggattcaaagcttagccgactgtcttctactttggcagaacggagagcaataatgctgttgcgctaaatgcccgatacagagaatcaatataaagcgaagggagagataactctaagtacataaagactgagataatgtatataaacggccgtccaagagattagggccTA-TT-CCAGAAAT-GAGATG-T-AACGGC-GGGG-------GGGGGGTCGG-A--CGG-C-------------AC------T------CA-A-T----------TAAA--TTTATGCT-TGGTTGTTGTT-G-A-AAATTTATTT---TTTCC-A-TACCTTGTGTGGG-TC---CGG-TTGAAATTTA--TTT-G-T-CC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--TTG-TGTGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGCGG-GCT--TTG-A-T--TAACA-TAAA-----------CAA--CAAA----C-AG-C-GC--AGC-CCA--TG-C--TTTCACTT-TC----CGCATCC-AT---T--TTTCAGAACGG-AATGAGCAACTTGAACATTCGTG-----TATTG-CG-C---ATGCC-CGATCAC--A--AAATCCAATA-T-AAGCCGG------G---AGATTAGAA---CTTCTA-ACTAGCGGGAT--ACCTCAAT--A-A-CG-AGAGTACTAATACATGTATTAG-TATA-CA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-A---GT--CAAT---GAC----T------GAT-AAA--TGTATAATA-AGCGGGAGAGTAAAC-TC--TAAGTAATTAGACTAAGAT---A-----A--TCGTAGA----------TAACACAAAACAATTTTAT-CATT-TGAAT------TTATTT-A--TTAAAG----G-GC--CCAAT------AT-C---A--ACAGTA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------TAAG-CCAATT-TAG--G---T--CAG---T---C-TTTTTTTTTTTTTCCA-GA----GA--T-CTGTT---TT-GGCGTTTTTTA-AAC--TTT--------ATAA-AAA-C-AA-C--GTC-A-CT-T-G--ACTAAATG-A-TTT--CT------G-GGGCCAT-----G---GGGT-AT-ATATAC---------AGT---------A---TT-AT---T---AAT-TCTAT--GT-CCAA--------T----T------TA--AT-GTAAA-A---A-T---AATGCT--TCC----AGTGGGC-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--AAC--TT--TCAA-AAAA--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAA-G-AAAT----CAAA-TTTCAAAAA--CT-T-TAAC-AGG-AT-TGTTT-AA-A---TT-A--ACA-GG-C---AA-ATTTT-C-CA--ACAA-G-TG-AT--GTTT--T-TCAATA---A--TA---T--TAA-----A-T--CTGAGTG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTtttatgtttaactgcgagc
gi|5 : agggctGCTA-TT-CCAGAAAT-GA-ATG-TTA----C-GGGG-------GG----TCGG-A--CGG-C-------------ACT-----T------CA-A-T----------TAAAATTTTATGCT-TGGTTGTTGTT-G-AGAAAATTAT-A---TTTC--A-TACCTTGTG--GG-TCGGCCGG-TT-AAATT-AATTTT-G-TACC-TG-T-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---T-CC-----GCA--G--GATGGCGA-G----TTG-A-T--TAACAATAAA-----------CAA--CAAA----C-AC-A-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TC----AGCGTCT-AT---T--TTTCAGAACGG-AA-GAACAAT----ACATGCGTG-----T--TG-CG-C---ATGTC-C-AT-AC--A--AAATC-AATA-C-AAGC--G------GG--AGAA---TA---CT-CTA-A--------G---AC----A------------A----TAAT----------GATAT--TA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GT--ACAT--AGAC----TA-----GA--AA---TATATG-TT-AGCGG-AGA-TAA-CATC--TA-GTACATAGACTA-GAT---A-----A--T-GTAGA----------TAAACAAAACAATT--TAT-CATT-TGAAT------TT-TTTTA--TTAAAG----G-GC--C-AAT------AT-C---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAG---T---T-TTTTTTTT-------AACA----GA--T-CTGTT---TT--GGGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GCC-A-CT-T-T--AATAAATG-A-T----CT------G-GG---------------A-T-ATTA-ATAC---------A-T---------A---TT-AT---T---AAT-TTCAT--GT-G-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA-A--TA-T---GA--CT--TC-----AGTG--C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-C-T---TA--A-C--TT--C--A-AA-A--TC--TT-CATAA---CAGAA--AAC-----TAT-G-AAAT----CAAA-TTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TT-A--ACA-GA-C---AA-A-CTT-C-CA--ACAA-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---C--T-A-----A-T--CTGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-A--C-ATA-GACCTTTatt
gi|6 : tagTACAAA--CT-T-T-AC-AGG-ACGTG-TT-AT-A---TT-C--ACA-GG------A-A-CTT-CTCA--GCAG-C-TG-AA--G--T--C-AT--TC---A--TACTTC--T-A-----A-TACCCAA-TT-GC-T--GCA-A--GG-T-T-CA---TTG-GTT-AC-C-TAA-GACCTTTtaattataatgcgagct
gi|7 : aacgaacaagagcacataaGCTA-TT-CCAGAAA---A-ATGAT-A----C-GGGG-------G-----TCGG-A--CGG-C-------------ACT-----TT-----CA-A-T----------TAAA-TTTTATGCT-TG--TGTTGTT-G-A-AAATTTATTA---TTTTCAA-TACCTTGTG--T--TCG-CCGG-TTTAAATTTAATTT--G--ACC-TGGG-GGGTTTTGATGT-ATTT--T-G-GGCGTT--G---TACC-----GCA--G--GAATGCGGTG----TTG-A-GA-TAACAATAAA-----------CAA--CCAA----C-AC-A-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTTGTC----AGCATCTTAT---T--TCTCAGAACGGCAA-GAGCAAT----ACATGGTTG-----T--TG-GC-C---ATGTC-CGAT-ACC-A--AAATC-AATA-C-AAGC--G----------AGATT--AA---CT-CTA----------GT--AC----AT--TGA-CTTAGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGGAG--ATTTAA---ACT-CG-AA--GT--ACA---AGAC----TA-----GAT-AA---TGTA-------------GA-TAA------------ACATAAAC---------A-----A--T----------------T---------------TAT-CATT-TGTAT------TTATTTTA--TTAAAA----G-GC----AAT------ATTC---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA-----G-A-------ATAGTCCA-TTCTAG--G---TCCCAGT--T---T-TTTTTTTT-------A-CA----GAACT-CTG-T---TT-TGGATTTGTTT-AAC---TT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTCTA-CT-T-T--AATAAATG-A-TT---CT------GAAA----T-----ACACGG-TAAT-A-ATAC---------AGT---------A---TT--T---TAACA-A-TATAT--GT-C-AA-------------T------TA--AT-GTAAA-A--TA-T---GA--CT--TCC----CATGG-CAAATATC---TTGACT-T-ACT-GA---C-T-TA--AA--A-C--TT--TCCA-AA-T--TC--TTCCATAA---CAG----AAC-----TAC-GAAAAT----CAAATTTTTAAAA----C-T-T-AC-AGG-A--TG-TTAAC-A---TT-A--ACAGGG-C---AAGA-CTTCC-CA--ACAATC-TG-AT--GCTT--TATT--TC---A--TA---C----A-----A-T--CTGA-TG-GC-A---CT----GGAT-TGCA-C--TG-GTT-AC-CAATA-G-CCTTTtatttaatctggtgaggctcccaaaaggtaaaatggaattaagtggaaagcagccatttcccacaactacattcactcaactgactttgtcttaccggtacattcccattcatgcaattccacttcaaaaatgctgtccagtgttcgatgaaaggtcattgagaacctactaattcggatctgtttacaacatttcgactgagatagagaagaggaagacgtcaagatgagctatgtaagatcatcttctataagcatggaagtaaactgaggtatagcgcgaataatggtcgcgacacaattaatcaaaagttacagagcattgttggtaaacacatgtataggtaagcaatttcgttctgcatcttccatggtaatgatgtctctaatgcataagacggacaaaaaacgcaccccttgggggggtagattggcgaaccccagcttacaaatgcggaaagcatcaaatcagtacaaaagctccacatgtcacattgcgcagctgaaaacaaaatggtaaaaagaagccaaatccttcacggatcaatttttaatttatgcatggcaccttcaacaaattatttctcgtttgggctttttcttataaaatttggggtggtgggtggggaaaaaaaaagtggccttcgcaccgacccccccaccttatttcgat
gi|8 : taggGCTA-TT-CCAGAAAT-GA-ATG-T-A----C-GGGG-------GGG---TCGG-A--CGG-C-------------AT------T------CA-A-T----------TAAAATTT-ATGCT-TGGTTGCTGTT-G-A-AAATTTATTA---TTTC--A-TACCT-GTG--GG-TCG-CCGG-TT-AAATTTGATTTT-G-TCCC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGCGG-G----TTG-A-T--TAACAATA-------------CAA--CAAA----C-AC-A-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TC----AGCATCT-AT---T--TTTCAGAACGG-AA-GAGCAAT----ACATGCGTG-----T--TG-CG-C---ATGTC-CGAT-AC--A--AAATC-AAT--T-AAGC--G------G---AGAT---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----AT--AGA-CT-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GT--ACAT--AGAC----TA-----GAT-AA---CGTATG-TA-AGCGGGAGA-TAA-C-TC--TAAGTACATAGATTA-GAT---A-----A--T-GTAGA----------T---------------TA--CATT-TGAAT------TTTATTTA--TTAAAG----G-GC--C-AAT------AT-C---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAG---T---T-TTTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGTT---TT-TGGGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A--T-T-C--ATTAAATG-A-TT---CT------G-GG----T-----A---GA-T-AT-A-ATAC---------AGT---------A---TT-AT---T---A-T-TTTAT--GT-C-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA-A--TA-T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--A-C--TT--TCAA-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAT-G-AAAT----CAAATTTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TT-A--ACA-GG-C---AA-A-CTT-C-CA--AC-A-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---C--T-A-----A-T--CTGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTTT
gi|9 : GCTA-TT-CCAGAAAT-GA-ATG-T-A----C-GGGG-------GG----TCGG-A--CGG-CC------------ACT-----T------CA-A-T----------TAAAATTTTTGGCT-TGGTTGTTGTTTG-A-AAATTTATTT---TTTC--A-TACCTTGTG--GG-TCG-CCGG-TT-GAATTTAATTTTTG-TACC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGC-G-G----TTG-AGT--TAACAATAAA-----------CAA--CAAA----CAAA-A-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TC----AGCATCC-AT---T--TTTCAGAACGG-AA-GAGCAAT----ACATGCGTG-----T--TGTCG-C---ATGCC-CGAT-AC-----AAATC-AATA-T-AAGCG-G------G---AGAT---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----AT--AGA-CT-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGG-G--AT---A---ACT-CT-AA--GT---TAC--AGAC----TA-----GATAAA---TGTAGA-TA-AAC
gi|9 : ATA-TA-AGCGGGAGA-TAA-C-TC--TAAGTACATAGACTA-GAT---A-----A--T-GTA----------------------------TAT-AAGC-GGGGA------TAACTCTAAGTTACAGACTAG-AT--A-AAT------GT-----A--G--ATAAAC---AAAAC-ATTTCTTTGAA----GA-A-------CTAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAG---T---T-TTTTTTTT-------A-CACACCGA--TCCTGTT---TT-GCGGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--ACAAA-C--AAC--GTC-AGCT-T-T--GAT-AATGAA-TT---CT------G-GGGGC-C-----AG--GG-TAAT-A-ATACA--------AGT---------AT--TT-AT---TA--A-T-TCTATGGGT-C--A--------T----T------TA--AT-GTAAA-A--T--T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-GC---C-T-T---AA--A-CG-TT--TC-A-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--A-------CAA-G-AAAT----CAAATTTTTAAAAAACTT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TTAAC-A---TTAA--ACAGGG-C---AA-A-TTT-C-CA--ACAG---TG-ATC-GATT--T-TT--TCATAA--TA---T--T-A-----A-T--CTGA-TG-GC-A--GCT-A---GATATGCA-C--TG-GTT-AC-C-ATA-GACCTTTaaaacatttctttgaagaactagccatttaggtcagttttttttttacacaccgatcctgttttgcggtttttttaactttaacaaacaacgtcagctttgataatgaattctgggggccagggtaataatacaagtatttattaattctatgggtcatttaatgtaaaattgacttccagtggcaattcttgattatgccttaaacgtttcaaaatcttcataacagaacaagaaatcaaatttttaaaaaacttttacaggattgttaacattaaacagggcaaatttccaacagtgatcgattttttcataatattaatctgatggcagctagatatgcactggttaccatagacctttcatgttaactgcgaggtttctaaaatggaaagggga
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): GCATCGGGCACAATTTGAGCAGGAGCGAGATGGGGTATATTTTCTTCGTTGGTGGGTTTTTCTAAATAAATTTATTATGTGGTGGGTTTGGGAAAAAAAAGTGCCTTCCGACCTCCCATACATTTTATTTGAATGT
Unaligned ( gi|25 ): CAATTTTTTTTTATTTTATGCATGGCACCATTTACAACAAATTATATTCTTCGTTGTGGGGTTTTTCTAAATAAAATTTATGGGTGGTGGGTTGGGAAAAAAAGTGCCTTCGACCCCCCCCATACAT
Unaligned ( gi|26 ): CACAATATACAGCATATTGAGTTTTCTTGGTGGTGGGGATTTTCTGATTTTTTTCCCAAGGAGGGGATCTAAAAATCAGTGGCCTTCTACCCCTCCCAGATAACTTTTACTGGAATAGTCCT
Unaligned ( gi|27 ): ACATGTCACATTGCTCTGAGCTGAAAACAATATGGTTAAAAAGAATCAAATCCTTCACTATCAAATTTTTTTTATTTTATGCATGGCACTATTTCAGCAAATTATATTTTCTTCGTTGTGG
Unaligned ( gi|29 ): AATATCAACTGCCTTCCCACCCCCCAGAAGTTTTTTGCTGGAATAGCCCTCAT
Unaligned ( gi|30 ): ATTTTCACATTCCCAATTAATTCCAGCATAAAAAATGCTGTCCCAGTT
Alignments
lowQualScore : 11 999999999999999999999999999999999 111 11 1 1 111 2222222 11111 1111 1111 33333333333 111111 111111 11 1111111 1 1111 11111111 1 11111 3333333333333 111 22222222222222 1111 1 1111111111 1111111 11111111 11111111111 111 111111 111 888888888888888888888888888888888888888888888 111111 1111 1111 111111 11111 1 1111 1111111 111111111 1111111 1111 11111111 111 55555555555555555555555555555 2222222222222222222222222 111111111111 22222222222222222222 1111 1111 111 1111 1111 11 2222222222 1
lowQualScore : 2 2 22 2 2 2 2 888888 6666666 333 2 444 8 6 4444 666666666666666666666666666666666 5 0 5 5 5 000 33 5 1 77 5 1 5 1 5 222 5 5 5 66 5 5 4444444 22222 66 66 2 5 7777 5 4444 00000000000 66 333333 1 5 66 5 5 66 5 66 5 666666 11 0000000 0 5 0000 5 33333333 0 5 888 5 5 55555 5 5 5 4444444444444 333 888 5 55555555555555 0000 777 5 0 9999 9999999999 4 4 4 4 66 0000000 4 4 66 77777777 55555555555 5 555 333333 5 222 77 55 5 999999999999999999999999999999999999999999999 5 55 444444 2 22 66 0 0000 5 1111 444444 00000 88888 66 888 5 0 0000 5 6666666 5 5 5 66 888 66 666666666 6666666 5 0000 66 5 0 888 88 11 4 55 44444444 55 4 4 4 55 4 4 4 8888 0 3 3 3 333 22222222222222222222222222222 3 3 9999999999999999999999999 777777777777 3 55 7 3 11111111111111111111 55 7 0000 3 666 55 55 8888 4 8 3 666 3 3 3 3 3 5555 3 3 000 55 1111 55 3 3 55 55 3 666 3 55 99999 1111 7777 1 44 3 6 3 3 6 6 6 6 3 555 4444 6 3 555 3 3 3 3 44 555 3 88 55 3 55 666 00 666 2222222222 3 55 2 0 3 5555 3 88 7 3 3 3 3 3 3 3
lowQualScore : . . .. . . . . ...... ....... ... . ... . . .... ................................. . . . . . ... .. . . .. . . . . . ... . . . .. . . ....... ..... .. .. . . .... . .... ........... .. ...... . . .. . . .. . .. . ...... .. ....... . . .... . ........ . . ... . . ..... . . . ............. ... ... . .............. .... ... . . .... .......... . . . . .. ....... . . .. ........ ........... . ... ...... . ... .. .. . ............................................. . .. ...... . .. .. . .... . .... ...... ..... ..... .. ... . . .... . ....... . . . .. ... .. ......... ....... . .... .. . . ... .. .. . .. ........ .. . . . .. . . . .... . . . . ... ............................. . . ......................... ............ . .. . . .................... .. . .... . ... .. .. .... . . . ... . . . . . .... . . ... .. .... .. . . .. .. . ... . .. ..... .... .... . .. . . . . . . . . . ... .... . . ... . . . . .. ... . .. .. . .. ... .. ... .......... . .. . . . .... . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 7 2 55 1 1 1 1 000000 8888888 777 2 111 9 7 7777 444444444444444444444444444444444 7 1 7 7 7 000 66 7 4 99 7 4 7 4 7 111 7 7 0 99 0 0 4444444 55555 99 99 5 0 5555 0 1111 66666666666 99 888888 0 0 99 0 0 99 0 99 0 888888 11 1111111 0 0 6666 6 44444444 0 0 888 0 0 99999 0 0 0 4444444444444 888 888 0 44444444444444 6666 222 0 0 4444 4444444444 4 4 4 4 11 9999999 4 4 11 44444444 44444444444 7 777 666666 0 111 99 99 7 555555555555555555555555555555555555555555555 0 11 444444 2 11 99 1 6666 0 2222 444444 00000 55555 99 888 0 0 6666 0 2222222 0 0 0 99 888 99 444444444 2222222 0 6666 99 0 1 888 11 22 0 55 55555555 55 0 0 0 55 0 0 0 5555 8 6 6 6 666 00000000000000000000000000000 6 6 6666666666666666666666666 555555555555 6 00 3 6 55555555555555555555 00 3 1111 6 444 00 00 5555 0 0 6 444 6 6 6 6 6 0000 6 6 000 00 4444 00 6 6 00 00 6 444 6 00 11111 1111 1111 3 22 1 2 1 1 2 2 2 2 1 444 8888 7 3 888 3 3 3 3 66 222 6 66 00 6 00 444 00 444 8888888888 6 00 5 9 6 7777 6 66 3 6 6 6 6 6 6 6
consensus : GCTA-TT-CCAGAAAT-GA-A-TG-T-A----C-GGGG-------GGG---TCGG-A--AGG-C-AC----TT------CA------------A-T----------TAAAATTTTATGCT-TGGTTGTTGTT-G-A-AAATTTATTA---TTTC--A-TACCTTGTG--GG-TCG-CCGG-TT-AAATTTAATTTT-G-TACC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGCGG-G----TTG-A-T--TAACAATAAA-----------CAA--CAAA----C-ANA-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TC----G-GCATCC-AT---T--TTTCAGAACGG-AA-GAGCAAT----ACATGCGTG-----T--TG-CG-C---ATGCC-CGAT-AC--A--AAATC-AATA-T-AAGC--G------G---AGAT---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----AT--AGA-CT-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GT--ACAT--AGAC----TA-----GAT-AA---TGTATG-TA-AGCGGGAGA-TAA-C-TC--TAAGTACATAGACTA-GAT---A-----A--T-GTAGA----------T---------------TAT-CATT-TGAAT------TTATTTTA--TTAAAG----G-GC--C-AAT------AT-C---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAG---T---T-TTTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGTT---TT-TGNGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A-CT-TT----AATAAA-TG-A-TT---CT------G-GG----T-----A---GG-T-AT-A-ATAC---------AGT---------A---TT-AT---T---A-T-TTTAT--GT-C-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA-A--TA-T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--A-C--TT--TCAA-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAC-G-AAAT----CAAATTTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TT-A--ACA-GG-C---AA-A-CTT-C-CA--ACAA-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---C--T-A-----A-T--CCGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTTT
Reference ( family-824 ) : GCTA-TT-CCAGAAAT-GA-A-TG-T-A----C-GGGG-------GGG---TCGG-A--NGG-C-AC----TT------CA------------A-T----------TAAAATTTTATGCT-TGGTTGTTGTT-G-A-AAATTTATTA---TTTC--A-TACCTTGTG--GG-TCG-CCGG-TT-AAATTTAATTTT-G-TACC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGCGG-G----TTG-A-T--TAACAATAAA-----------CAA--CAAA----C-ANA-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TC----G-GCATCC-AT---T--TTTCAGAACGG-AA-GAGCAAT----ACATGCGTG-----T--TG-CG-C---ATGCC-CGAT-AC--A--AAATC-AATA-T-AAGC--G------G---AGAT---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----AT--AGA-CT-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GT--ACAT--AGAC----TA-----GAT-AA---TGTATG-TA-AGCGGGAGA-TAA-C-TC--TAAGTACATAGACTA-GAT---A-----A--T-GTAGA----------T---------------TAT-CATT-TGAAT------TTATTTTA--TTAAAG----G-GC--C-AAT------AT-C---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAG---T---T-TTTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGTT---TT-TGNGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A-CT-TT----AATAAA-TG-A-TT---CT------G-GG----T-----A---GG-T-AT-A-ATAC---------AGT---------A---TT-AT---T---A-T-TTTAT--GT-C-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA-A--TA-T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--A-C--TT--TCAA-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAC-G-AAAT----CAAATTTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TT-A--ACA-GG-C---AA-A-CTT-C-CA--ACAA-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---C--T-A-----A-T--CCGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTTT
gi|1 : -AAC--TTT--------A--A-AAAACGAAAC--GTC-A-CT-TTTTAGAATA---TG-A-TTT--CTC-----G-GG----T-----A--------AT-A-ATAC---------AGTTAC------A---TT-AT---TC--A-T-TTCAT--TTTC-GA--------T----TCGTTTTTG--ATAGTAAATA--TA-T---GA--CTATTCC----AGTG--C-A-T-TC---TCGA-AAT-A-TCG----C-T-T---AT--A-A--TT--TCAA-AG-A--TC------ATAA---CTG-A----------TAT-----AT-------ATGTTTCAAAA--CT-TCT-AC-AGG-AC-TG-TT-A------TT-ATCACA-GG-C---AA-C-CTT-C-----AGAA-T-GA-AA--GC-T--C-AT--TC---A--TA---CTTT-AAT---A-T--CCAA-TA-GC-GTCGCA-AT-GGACGGGCA-CTTTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTCT
gi|1 : aactgtcttatgtatcgttcatagtaaggtatttaccttttacattgcatttattacagctttaaaatatcctcaaacgttaaccaaaatcctaggagcacacaattacacaccgccattactgaacagggtcaaccgtgaactaAAAAAT--A-A-TG-T-A----T-GGGG--------GG---TCGG-A--AGG-CTACTTTTTT------CAACGCCACCACCCA-T----------TAAAATTTTATtttatgttaactgttgaggctgccaaaatagttaaacggaatttaacggtgaacgagcatttcccacaaactaacattactcaactgaactttactacattaaaattttcacatttcccagtgcatgcaaattccagcttcaaaaatgctgtcccatgtatcatgaaagggtctatttcgaaaccctagcatatatttcatcttttcacagacattttcagtgagagagaaggattaaggcaatgaagtcatgtaaatcaaatataaatagttctatgcaggtatcgaaaaaatcttacttaaaccaatttttgtaaatgaccatgtatatggtaaccatatttctcgatttctgcatcttccttgtatgattctataatgaaccatcgagatagaatactgttttctgaatccagcttttacagtttgaggcatcaacacaatacagtaatagaaagctccacatgtcacattgctccagagctgaaaacaattgttaataaagcagaccaagatcctttaaaaaaaatttaattttatgcatgtaccatttcaacaaattgatattatttctcgttgtgggtattttctctaataaaattttaatgggtggtggcgttgaaaaaagtagccttccgaccccccatacattatttttc
gi|10 : aactgtcttatgtatcgttcatagtaaggtatttaccttttacattgcatttattacagctttaaaatatcctcaaacgttaaccaaaatcctaggagcacacaattacacaccgccattactgaacagggtcaaccgtgaactaaactttaaaaaacgaaacgtcactttttagaatatgatttctcgggtaataatacagttacattattcatttcattttcgattcgtttttgatagtaaatatatgactattccagtgcattctcgaaatatcgcttataatttcaaagatcataactgatatatatgtttcaaaacttctacaggactgttattatcacaggcaaccttcagaatgaaagctcattcatactttaatatccaatagcgtcgcaatggacgggcactttggttaccatagacctcttttatgttaactgttgaggctgccaaaatagttaaacggaatttaacggtgaacgagcatttcccacaaactaacattactcaactgaactttactacattaaaattttcacatttcccagtgcatgcaaattccagcttcaaaaatgctgtcccatgtatcatgaaagggtctatttcgaaaccctagcatatatttcatcttttcacagacattttcagtgagagagaaggattaaggcaatgaagtcatgtaaatcaaatataaatagttctatgcaggtatcgaaaaaatcttacttaaaccaatttttgtaaatgaccatgtatatggtaaccatatttctcgatttctgcatcttccttgtatgattctataatgaaccatcgagatagaatactgttttctgaatccagcttttacagtttgaggcatcaacacaatacagtaatagaaagctccacatgtcacattgctccagagctgaaaacaattgttaataaagcagaccaagatcctttaaaaaaaatttaattttatgcatgtaccatttcaacaaattgatattatttctcgttgtgggtattttctctaT-CCATGAAC--A-A-TG-T-A----CTGGGG-------GGG---TCGG-A--AGGCC-AC----TTTTTTTCCAACCACGCACCACA-T----------TAAAATTTTATc
gi|11 : ataatgacccttttccaagcacaatcagtaactatactacttcaactgactttcttgggcattaaatattttcagatgtcccatcatgcaattccagcttaaaaaaatgctgtcccagttatcgagtgaaggcgtcgtattgaagacaaccgctagctatacattttatctttacacatttctcaaggagatgagaagagattattttttaagaagcaatgaggtcattgtaatcggaataggtaatgagttctagcagggaatatgcggataaaaatctttatgagggaaccattttttggtaaacgacatggtaataacgatggtaaccgatatttctcgttgtctaggaacatctcagttgataaatgattctattaagaccatagaagaatactgtttttgctgaactccagcttctgagactattgaagcatcaacatacatgataaagagctccacatgtcacattgctccgagctgaagaacacaaaaatggttaaaaagaagccaaatccttcactatcaaatcttttattaattttatgcatggcaccatttcaacaaaattatattttccttcattgtgggtaaattttctaT-CCATGAAC--A-A-TG-T-A----CTGGGG-------GGG---TCGG-A--AGGCC-AC----TTTTTTTCCAACCACGCACCACA-T----------TAAAATTTTATtatgg
gi|12 : ataatgacccttttccaagcacaatcagtaactatactacttcaactgactttcttgggcattaaatattttcagatgtcccatcatgcaattccagcttaaaaaaatgctgtcccagttatcgagtgaaggcgtcgtattgaagacaaccgctagctatacattttatctttacacatttctcaaggagatgagaagagattattttttaagaagcaatgaggtcattgtaatcggaataggtaatgagttctagcagggaatatgcggataaaaatctttatgagggaaccattttttggtaaacgacatggtaataacgatggtaaccgatatttctcgttgtctaggaacatctcagttgataaatgattctattaagaccatagaagaatactgtttttgctgaactccagcttctgagactattgaagcatcaacatacatgataaagagctccacatgtcacattgctccgagctgaagaacacaaaaatggttaaaaagaagccaaatccttcactatcaaatcttttattaattttatgcatggcaccatttcaacaaaattatattttccttcattgtgggtaaattttctaT-CCATGAAC--A-A-TG-T-A----CTGGGG-------GGG---TCGG-A--AGGCC-AC----TTTTTTTCCAACCACGCACCACA-T----------TAAAATTTTATtatgg
gi|13 : ataatgacccttttccaagcacaatcagtaactatactacttcaactgactttcttgggcattaaatattttcagatgtcccatcatgcaattccagcttaaaaaaatgctgtcccagttatcgagtgaaggcgtcgtattgaagacaaccgctagctatacattttatctttacacatttctcaaggagatgagaagagattattttttaagaagcaatgaggtcattgtaatcggaataggtaatgagttctagcagggaatatgcggataaaaatctttatgagggaaccattttttggtaaacgacatggtaataacgatggtaaccgatatttctcgttgtctaggaacatctcagttgataaatgattctattaagaccatagaagaatactgtttttgctgaactccagcttctgagactattgaagcatcaacatacatgataaagagctccacatgtcacattgctccgagctgaagaacacaaaaatggttaaaaagaagccaaatccttcactatcaaatcttttattaattttatgcatggcaccatttcaacaaaattatattttccttcattgtgggtaaattttctaCGTGAAA-TAG-A-TC--TCA-TATATAAACTC-AATTTCA-----G--G-GCA-A----------T---------------TTT-CATTGTGAATACCAAGTTATT--A--TTAAGG----GCGCTTC-AATCATGGAAT-CTTAA--G--AT---T---AAGGCAATTTCTTCGCACAGGGG-ATAACAGCATAG-CCA-TT-TAGGTG---T--CAGGGAT---TATGTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGGT---TTATGCGTCTTTTT-TAC--TTTCTACATGGA--C-ACA-C-AAACATGTC-A-CTGGT----AAT-AA-TG-A-TTTGCCTGCCGTCG-GA----TGTTCGG---GG-A-AT-A-ATACAG-------AGTCTCACTTGGA---TTAAT---T---G-TGTCTAT--GT-C-AAACTGACTGT----T------TAATAT-GTAAA-AGCTA-T---AA--TT--tatgg
gi|13 : aactctactaaattacaggtactatggcgaatcaAT-TC-----GA-T-TTA-T-G----C-T-TTCTAG--A-C--TTAGTAAA-AA-AAATC--TT-CACAATAGCAG-ATCAACCTGCATACAG-TAATATTCCAATTTCTTAAAAA--ATATAT-AC-AGGGATGTG-TT-AC-AAACTT-A--GGA-GGGC---AA-A-CTT-C--A--ACAA-C-TG-AT--GCTA--T-TT--TC---AGTTA---CA-T-AGATCGA-T--CAGATTGTGCGA--GCT-AGCGAAT-TGCA-C-TAG-GTTCACAC-GAA-GACCTggtattaaactaatcatacgggttgagtgcagtccacgctcattcgatttatgctttctagacttagtaaaaaaaatcttcacaatagcagatcaacctgcatacagtaatattccaatttcttaaaaaatatatacagggatgtgttacaaacttaggagggcaaacttcaacaactgatgctattttcagttacatagatcgatcagattgtgcgagctagcgaattgcactaggttcacacgaagacctatttcaatgagaatgacttgcgaggcttc
gi|14 : aactctactaaattacaggtactatggcgaatcacgtgaaatagatctcatatataaactcaatttcagggcaattttcattgtgaataccaagttattattaagggcgcttcaatcatggaatcttaagattaaggcaatttcttcgcacaggggataacagcatagccatttaggtgtcagggattatgttttttacagatctggtttatgcgtcttttttactttctacatggacacacaaacatgtcactggtaataatgatttgcctgccgtcggatgttcggggaataatacagagtctcacttggattaattgtgtctatgtcaaactgactgtttaatatgtaaaagctataattggtattaaactaatcatacgggttgagtgcagtccacgctcGCTA-TT-CCAGAAATTGA-A-TG-T-A----C-GGGG-------GGG---TCG-----CGG-C-A-----TT------CA------------A-T----------TAATATTTTATGCT-TGGTTGTTGTT-GAA-AAATTTATTAAATTTCC--A-TACCTTG-G--GG-TCG-CCGGTTT-AAATTTAATTTT-G--ACC-TGGT-GGGTATTGATGT-AATT--T-G-TGCGT---GTT-TACC-----GCAAGG--AATGGCGG-G----TAGAA-TTATAACAATAAA-----------CAA--CAAA----A-ACACGC--AGCAC-A--TG-CCTTTTCACTT-TCCTCAG-GCATCC-AT---TAAATTCAGAACGGTAA-GAGCAAT----ACATGCGTGTGAAAT--TGCCGTC---ATGCCTCGAT-AC--AGTATATC-AATATT-AAGCG-G------G---AGAT---AACTTCT-CCACA--------GTAAAC----AT--AGATCT-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-C-GGAG--AT---A---ACT-CT-AA--atttcaatgagaatgacttgcgaggcttc
gi|15 : aggGCTA-TT-CCAGAAAT-AA-A-TG-T-A----T-GGGG-------AGG---TCGG-A--AGG-C-AC----TT------
gi|16 : aaccatttttgtaaaagacatgtatatggaaaccatatttcccttagtttctgcatcttccataatgatcatagaagaatactgattttctgaactccagcttttacacttgaagcatcaacatacatacaaaagtccacacatcacattgctctgagatgaaaacaaaagggctaaaaaaaaacacccaaatccttaactatcaaatttttttaattttatgcatggcaccatataaaacaaattatattttcttcattgtggggtattttctaaatgaaattttatgggtggtgggttgggaaaa----------T---------------TAT-CATT-TGAAT------TTGTTGTA--GTA-------G-GC--C-AAT------AT-C---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATCG-CCA-TT-TAG--G---T--CAA---TATTT-TTTTTTTT-------T-CA----GA--T-CTGTT---TT-TTT-TTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A-CT-TT----CATAAA-TG-A-TT---CTA-----G-GG----T-----A--------AT-A-ATAC---------AGT---------A---TT-AT---T---A-T-TTTA---GT-C-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA----TA-T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--A-A--TT--TCAA-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAC-C-AAAT----CCAATTTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TT-
gi|17 : gtgtagataaccaaaacaattTA-TT-CCA-ACAT----A-TG-T------T-GGGG-------GGG---TC-G-A--AGG-C-AC----TTTTTTTCCA------------A-CCCACCACCCATAAAATTTTAT
gi|18 : tctcgtttctgcatcttccattgtatgattcctataatgaccatagaagaatactgtttttctgaactccagttttacatttgaagcatcaacaaacatacaaaagctcacatgccacattgctccgagctgaaaacaaaatggttaaaaagaaccatttcgttcactatcaaaattttttaattttatgcatggcaccatttcaacaaattatatttcttcaattgtggggtattttcttaAA-TG-A-TT---TC------T-GG----T-----G---GG-T-AT-T-ATACTAATAACTAGGT---------A---TTTATGTAT---A-T-TGTAT--GTTC-AA--------TC---T------TA--ATCGTAAA-T--TG-TTCTGA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T---A-T-GAGTTCAT-T---AAGTA-CCTTT--TCAATAA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAC-G-AAAT----CAAATTTTTAAAAA--C--T-T-AC-A-G-AT-TGTTT-AC-A----T-A--ACA-GG-C---AC-A-CTT-C-CA--ACAA-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---C--T-A-----ATT--CTGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-G-T-AC-C-ATA-GACTTT
gi|19 : GT-ATTTATC-G-TGCGT---GA--TACCAAGGAGCA--G--AAGGTCGA-GAGAGTTG-A-A--TAACAATAAAAGTAAGAAAAACAAAACAAA----CAAGA-GC--AGC-C-A--TG-C---TTCA----------GAGCATCTAATATAT--ATGCAAAACGG-AA-AAGC-AC----ACAAGA-----------TG-AG-C---A------GAT-GT--A--GGGTC--CCA-T---GC--T------GTCTATAT---GA---CA-CTA-C--------G---AA----AA--AGA-TC-AAA----T-AT----------A-AATA-CA-AGTCGGAAGGAAT---A---ACT-CTAAA--GT--A
gi|2 : TT-AAC--TTT--------A--A-AA--C-AAAC--GTA-A-CC-TG----TATAAAATG-AGTT---CTC-----G-GG----T-----A--------AT-A-ATAC---------AGT---------ACATTT-CT---T---A-T-TTCAT--GT-C-AA--------TCGTTT------TA--AT-GTAAA-A--TAAT---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TCGA-T-T-G---G----C-TAT---AA--A----TG--CCAA-AA-A-------T-CATGC---C---A--AAC-----TAT-GCAAAT----AATATGTTTCAAAA--CT-T-T-ACAAGG-AC-TG-TT-AT-A---TT-C--ACA-GG-C----A-A-CTT-C-CA--GCAA-C-TGAATAAGCTC--A-TT--TC---GTTTA---CTTT-AAT---A-T--CCAACTA-GC-T--GCA-A--GGAT-GGCA-C-TT--GTT-AC-C-AT--GACCTTTttatattaatatgactag
gi|20 : actgtctatattgttcaggataaggtatttacctttacatgccatatttaacagctttcagaatatcctcgaacgtaccaaaaaattcacacgccatactgaagggtcactgtgacCTA-TT-CCAGAAAT-AA-A-TG-T-A----T---GG-------GGG---TCGGAA--AGG-CAAC----TT------tatgttactgtgaggcttccaaagtttaaacggaatatagtggataacgacgcatttcccacaacatgaacattactcaactgacctttcttacttaaaattttcacttcccattcatcagattctgcttcaaaaatgctgtccagttatctatgaaagggtctatttagcaaccctagctatatttcatctttacacattttctcaggagagagagaagattaatatttagagcaatgagtcataatcaaataaataatatatctagaggtatgaaaacaatctttaaaaacatttttgtaaaacacatgtatatgtaaccattatttctcgtttctgcctcttcattttgattctataagaccaagaagaaatacgttttcttgactccagcttttacccattgaagcatcaaaatacatcaaaagctccacatgccacattgcttccgagctgaaaaaaatggtaaaaagagaccatttcgtttcactacgaaatcttttgtaattgttgagcatggcaccaattcaacaattgtatttcttcattgtgggtatttctcttaataagaattttaatgggtggtgggtgaaaaaaatgcctctcgacccccatacattatttc
gi|21 : atcattttttttattttagcatgcaccattttacaacaaattatatatttttttttttttttttttgtttttttcttcgtttgtggggtttttcttaataaaattttatgggtggtgggttgggataaaaa-TT-CCAGAAAT-AA-A-TA-T-G----T-ATGG-------GGG---TCGG-AGTAGG-C-AC----TTTTTTTCCA------------A-CCCACCACCCATAAAATTTTAT
gi|22 : aatttttttatttatgtttaatgcatgggctaccatttacaactaattagtaattttcttcgttgtgggtttttctaaGCTAGCC-CCAGAAAT-AA-A-TG-T-A----G-GGGG-------GGG---
gi|23 : tttatttttggagggggattttcaacaaattaatattttcttcgttgtggggtattttctacttaaattttatgggtggtggtttgaaaaaaaaagtgcttccaacaccacacaccccGCTA-TT-CCAGAAAT-AA-A-TG-T-A----T--GGG-------GGG---TCGG-A--AGG-C-AC----TT------
gi|24 : tttttttttttattttatgcatggcacatttacaacatatttaatattttcttcgttggggttttctaaataaattttatggtggtggttgggaaaataaaA-TT-C---AAAT-AA-AATG-T-A----T-GGGA-------GG----TCGG-A--AGG-C-AC----TT------
gi|28 : gcatcgggcacaatttgagcaggagcgagatggggtatattttcttcgttggtgggtttttctaaataaatttattatgtggtgggtttgggaaaaaa-AAAT----CAAATTTTTCAAAA--CT-T-T-AC-AGG-TT-TG-TT-AT-A---TT-T--ACA-GG-C---AA-A-TTT-C-CA--ACAA-gt
gi|29 : cGCTA-TT-CCAGCAAA-AA-A-CT-T------C-TGGG-------GGG---TGGG-A--AGG-C-AG----TT------
gi|3 : aatatcGCTA-TTTCCAGAAAT-GA-A-TG-T-A----C-GGGGACTTGTGGGG---TCGG-A--CGGGC-AC----TTATA---CA------------AAT----------TAAAATTTTATGCCATGGTTG-TGTT-G-A-AAATTTATTA---TTTC--ATTACCTGTTG--GGCTCGCCCGG-TT-AAATTTAATTTT-GTTACCTTGGTGGGGTACTGATGTAATTT--T-GTTGCGTCTAGTTTTACC-----GCA--GGCGATGGC-G-G----TTG-A-T--TAACAATAAAAC---------TAA--CAAGGATTC-AAA-GCTTAGC-C-GACTGTC--TTCTACTT-T-----G-G-----------------CAGAACGG--A-GAGCAAT----A-ATGC-TG-----T--TG-CG-CTAAATGCC-CGAT-ACAGA--GAATC-AATA-TAAAGC--GAAGGGAG---AGAT---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----ATAAAGA-CTGAGA----TAAT----------G-TATA-TA-AA-CGGCCG-------------T-CC-AA--G---------AGAT----TAGGGCCGAT-AA---TGTATACTACAGCGGGAGA-Tcctcat
gi|3 : tagGA----TAAT----------G-TATACTACAG-CGGGAG--AT---GGAGACTACT-GATAGTTTACACTCAGGCACCATA-----GAT-AAACATGTATG--A-AGCGGGAGA-TAA-C-TCCCTATGCACATAGACTA-GAT---ATAGGTACTT-ATAAACAAAACAATTT---------------TATGCATT--GAAT------TTATTTTA--TGAAAG----G--C--C-AAT------AT-C---ACCA--ATA--TTATAAAAC-ATTTCTT-GAA----GGGA-------ATAG-CCA-TT-TAA--GATGT--CAG---T---TCTTTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGTTGGTTT-TGTATTTTTTTTAACCTTTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A-CT-TT----AATAAA-TG-A-TT---CT------G-GG--------------GG-T--T-A-ATA----------------------A---TT------------T-TTTAA--GT-C-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA-AT-TA-T---GA--CT--TCCATGTAGTGG-CAAAT-TCTAATTGA-T-T-A-T-G----C-T-T----A--A-C--TT--TCAA-AA-A--TCGATC-TAT---------A--AAC-----TACGG-AAAT----CAGAATTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGGAAT-TG-TT-ACAA---TT-A--ACA-GG-CAAAAA-A-CTT-C-CAGGACAA-CTTG-AT--GCTTAAT-TT--TC---A--TA---C--T-A-----A-T--CTGA-TG-GC-A--GCTGA--GGAT-TGCACC-TTGCGTT-AC-C-ATAGGACCTTTggagactactgatagtttacactcaggcaccatagataaacatgtatgaagcgggagataactccctatgcacatagactagatataggtacttataaacaaaacaattttatgcattgaatttattttatgaaaggccaatatcaccaatattataaaacatttcttgaagggaatagccatttaagatgtcagttcttttttttacagatctgttggttttgtattttttttaaccttttaaaaacaaacgtcactttaataaatgattctgggggttaataattttttaagtcaatttaatgtaaaattatgacttccatgtagtggcaaattctaattgattatgcttaactttcaaaaatcgatctataaactacggaaatcagaattttaaaaactttacaggaattgttacaattaacaggcaaaaaacttccaggacaacttgatgcttaattttcatactaatctgatggcagctgaggattgcaccttgcgttaccataggaccttttttatgtttaactgcgagc
gi|4 : taggctatttccagaaatgaatgtacggggacttgtggggtcggacgggcacttatacaaattaaaattttatgccatggttgtgttgaaaatttattatttcattacctgttgggctcgcccggttaaatttaattttgttaccttggtggggtactgatgtaattttgttgcgtctagttttaccgcaggcgatggcggttgattaacaataaaactaacaaggattcaaagcttagccgactgtcttctactttggcagaacggagagcaataatgctgttgcgctaaatgcccgatacagagaatcaatataaagcgaagggagagataactctaagtacataaagactgagataatgtatataaacggccgtccaagagattagggccTA-TT-CCAGAAAT-GAGA-TG-T-AACGGC-GGGG-------GGGGGGTCGG-A--CGG-C-AC----T-------CA------------A-T----------TAAA--TTTATGCT-TGGTTGTTGTT-G-A-AAATTTATTT---TTTCC-A-TACCTTGTGTGGG-TC---CGG-TTGAAATTTA--TTT-G-T-CC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--TTG-TGTGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGCGG-GCT--TTG-A-T--TAACA-TAAA-----------CAA--CAAA----C-AGC-GC--AGC-CCA--TG-C--TTTCACTT-TC----C-GCATCC-AT---T--TTTCAGAACGG-AATGAGCAACTTGAACATTCGTG-----TATTG-CG-C---ATGCC-CGATCAC--A--AAATCCAATA-T-AAGCCGG------G---AGATTAGAA---CTTCTA-ACTAGCGGGAT--ACCTCAAT--A-A-CG-AGAGTACTAATACATGTATTAG-TATA-CA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-A---GT--CAAT---GAC----T------GAT-AAA--TGTATAATA-AGCGGGAGAGTAAAC-TC--TAAGTAATTAGACTAAGAT---A-----A--TCGTAGA----------TAACACAAAACAATTTTAT-CATT-TGAAT------TTATTT-A--TTAAAG----G-GC--CCAAT------AT-C---A--ACAGTA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------TAAG-CCAATT-TAG--G---T--CAG---T---C-TTTTTTTTTTTTTCCA-GA----GA--T-CTGTT---TT-GGCGTTTTTTA-AAC--TTT--------ATAA-AAA-C-AA-C--GTC-A-CT-TG----ACTAAA-TG-A-TTT--CT------G-GGGCCAT-----G---GGGT-AT-ATATAC---------AGT---------A---TT-AT---T---AAT-TCTAT--GT-CCAA--------T----T------TA--AT-GTAAA-A---A-T---AATGCT--TCC----AGTGGGC-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--AAC--TT--TCAA-AAAA--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAA-G-AAAT----CAAA-TTTCAAAAA--CT-T-TAAC-AGG-AT-TGTTT-AA-A---TT-A--ACA-GG-C---AA-ATTTT-C-CA--ACAA-G-TG-AT--GTTT--T-TCAATA---A--TA---T--TAA-----A-T--CTGAGTG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTtttatgtttaactgcgagc
gi|5 : agggctGCTA-TT-CCAGAAAT-GA-A-TG-TTA----C-GGGG-------GG----TCGG-A--CGG-C-AC----TT------CA------------A-T----------TAAAATTTTATGCT-TGGTTGTTGTT-G-AGAAAATTAT-A---TTTC--A-TACCTTGTG--GG-TCGGCCGG-TT-AAATT-AATTTT-G-TACC-TG-T-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---T-CC-----GCA--G--GATGGCGA-G----TTG-A-T--TAACAATAAA-----------CAA--CAAA----C-ACA-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TC----A-GCGTCT-AT---T--TTTCAGAACGG-AA-GAACAAT----ACATGCGTG-----T--TG-CG-C---ATGTC-C-AT-AC--A--AAATC-AATA-C-AAGC--G------GG--AGAA---TA---CT-CTA-A--------G---AC----A------------A----TAAT----------GATAT--TA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GT--ACAT--AGAC----TA-----GA--AA---TATATG-TT-AGCGG-AGA-TAA-CATC--TA-GTACATAGACTA-GAT---A-----A--T-GTAGA----------TAAACAAAACAATT--TAT-CATT-TGAAT------TT-TTTTA--TTAAAG----G-GC--C-AAT------AT-C---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAG---T---T-TTTTTTTT-------AACA----GA--T-CTGTT---TT--GGGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GCC-A-CT-TT----AATAAA-TG-A-T----CT------G-GG---------------A-T-ATTA-ATAC---------A-T---------A---TT-AT---T---AAT-TTCAT--GT-G-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA-A--TA-T---GA--CT--TC-----AGTG--C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-C-T---TA--A-C--TT--C--A-AA-A--TC--TT-CATAA---CAGAA--AAC-----TAT-G-AAAT----CAAA-TTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TT-A--ACA-GA-C---AA-A-CTT-C-CA--ACAA-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---C--T-A-----A-T--CTGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-A--C-ATA-GACCTTTatt
gi|6 : tagTACAAA--CT-T-T-AC-AGG-ACGTG-TT-AT-A---TT-C--ACA-GG------A-A-CTT-CTCA--GCAG-C-TG-AA--G--T--C-AT--TC---A--TACTTC--T-A-----A-TACCCAA-TT-GC-T--GCA-A--GG-T-T-CA---TTG-GTT-AC-C-TAA-GACCTTTtaattataatgcgagct
gi|7 : aacgaacaagagcacataaGCTA-TT-CCAGAAA---A-A-TGAT-A----C-GGGG-------G-----TCGG-A--CGG-C-AC----TTT-----CA------------A-T----------TAAA-TTTTATGCT-TG--TGTTGTT-G-A-AAATTTATTA---TTTTCAA-TACCTTGTG--T--TCG-CCGG-TTTAAATTTAATTT--G--ACC-TGGG-GGGTTTTGATGT-ATTT--T-G-GGCGTT--G---TACC-----GCA--G--GAATGCGGTG----TTG-A-GA-TAACAATAAA-----------CAA--CCAA----C-ACA-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTTGTC----A-GCATCTTAT---T--TCTCAGAACGGCAA-GAGCAAT----ACATGGTTG-----T--TG-GC-C---ATGTC-CGAT-ACC-A--AAATC-AATA-C-AAGC--G----------AGATT--AA---CT-CTA----------GT--AC----AT--TGA-CTTAGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGGAG--ATTTAA---ACT-CG-AA--GT--ACA---AGAC----TA-----GAT-AA---TGTA-------------GA-TAA------------ACATAAAC---------A-----A--T----------------T---------------TAT-CATT-TGTAT------TTATTTTA--TTAAAA----G-GC----AAT------ATTC---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA-----G-A-------ATAGTCCA-TTCTAG--G---TCCCAGT--T---T-TTTTTTTT-------A-CA----GAACT-CTG-T---TT-TGGATTTGTTT-AAC---TT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTCTA-CT-TT----AATAAA-TG-A-TT---CT------GAAA----T-----ACACGG-TAAT-A-ATAC---------AGT---------A---TT--T---TAACA-A-TATAT--GT-C-AA-------------T------TA--AT-GTAAA-A--TA-T---GA--CT--TCC----CATGG-CAAATATC---TTGACT-T-ACT-GA---C-T-TA--AA--A-C--TT--TCCA-AA-T--TC--TTCCATAA---CAG----AAC-----TAC-GAAAAT----CAAATTTTTAAAA----C-T-T-AC-AGG-A--TG-TTAAC-A---TT-A--ACAGGG-C---AAGA-CTTCC-CA--ACAATC-TG-AT--GCTT--TATT--TC---A--TA---C----A-----A-T--CTGA-TG-GC-A---CT----GGAT-TGCA-C--TG-GTT-AC-CAATA-G-CCTTTtatttaatctggtgaggctcccaaaaggtaaaatggaattaagtggaaagcagccatttcccacaactacattcactcaactgactttgtcttaccggtacattcccattcatgcaattccacttcaaaaatgctgtccagtgttcgatgaaaggtcattgagaacctactaattcggatctgtttacaacatttcgactgagatagagaagaggaagacgtcaagatgagctatgtaagatcatcttctataagcatggaagtaaactgaggtatagcgcgaataatggtcgcgacacaattaatcaaaagttacagagcattgttggtaaacacatgtataggtaagcaatttcgttctgcatcttccatggtaatgatgtctctaatgcataagacggacaaaaaacgcaccccttgggggggtagattggcgaaccccagcttacaaatgcggaaagcatcaaatcagtacaaaagctccacatgtcacattgcgcagctgaaaacaaaatggtaaaaagaagccaaatccttcacggatcaatttttaatttatgcatggcaccttcaacaaattatttctcgtttgggctttttcttataaaatttggggtggtgggtggggaaaaaaaaagtggccttcgcaccgacccccccaccttatttcgat
gi|8 : taggGCTA-TT-CCAGAAAT-GA-A-TG-T-A----C-GGGG-------GGG---TCGG-A--CGG-C-A-----TT------CA------------A-T----------TAAAATTT-ATGCT-TGGTTGCTGTT-G-A-AAATTTATTA---TTTC--A-TACCT-GTG--GG-TCG-CCGG-TT-AAATTTGATTTT-G-TCCC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGCGG-G----TTG-A-T--TAACAATA-------------CAA--CAAA----C-ACA-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TC----A-GCATCT-AT---T--TTTCAGAACGG-AA-GAGCAAT----ACATGCGTG-----T--TG-CG-C---ATGTC-CGAT-AC--A--AAATC-AAT--T-AAGC--G------G---AGAT---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----AT--AGA-CT-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GT--ACAT--AGAC----TA-----GAT-AA---CGTATG-TA-AGCGGGAGA-TAA-C-TC--TAAGTACATAGATTA-GAT---A-----A--T-GTAGA----------T---------------TA--CATT-TGAAT------TTTATTTA--TTAAAG----G-GC--C-AAT------AT-C---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAG---T---T-TTTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGTT---TT-TGGGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A--T-TC----ATTAAA-TG-A-TT---CT------G-GG----T-----A---GA-T-AT-A-ATAC---------AGT---------A---TT-AT---T---A-T-TTTAT--GT-C-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA-A--TA-T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--A-C--TT--TCAA-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAT-G-AAAT----CAAATTTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TT-A--ACA-GG-C---AA-A-CTT-C-CA--AC-A-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---C--T-A-----A-T--CTGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTTT
gi|9 : GCTA-TT-CCAGAAAT-GA-A-TG-T-A----C-GGGG-------GG----TCGG-A--CGG-CCAC----TT------CA------------A-T----------TAAAATTTTTGGCT-TGGTTGTTGTTTG-A-AAATTTATTT---TTTC--A-TACCTTGTG--GG-TCG-CCGG-TT-GAATTTAATTTTTG-TACC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGC-G-G----TTG-AGT--TAACAATAAA-----------CAA--CAAA----CAAAA-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TC----A-GCATCC-AT---T--TTTCAGAACGG-AA-GAGCAAT----ACATGCGTG-----T--TGTCG-C---ATGCC-CGAT-AC-----AAATC-AATA-T-AAGCG-G------G---AGAT---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----AT--AGA-CT-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGG-G--AT---A---ACT-CT-AA--GT---TAC--AGAC----TA-----GATAAA---TGTAGA-TA-AAC
gi|9 : ATA-TA-AGCGGGAGA-TAA-C-TC--TAAGTACATAGACTA-GAT---A-----A--T-GTA----------------------------TAT-AAGC-GGGGA------TAACTCTAAGTTACAGACTAG-AT--A-AAT------GT-----A--G--ATAAAC---AAAAC-ATTTCTTTGAA----GA-A-------CTAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAG---T---T-TTTTTTTT-------A-CACACCGA--TCCTGTT---TT-GCGGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--ACAAA-C--AAC--GTC-AGCT-TT----GAT-AA-TGAA-TT---CT------G-GGGGC-C-----AG--GG-TAAT-A-ATACA--------AGT---------AT--TT-AT---TA--A-T-TCTATGGGT-C--A--------T----T------TA--AT-GTAAA-A--T--T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-GC---C-T-T---AA--A-CG-TT--TC-A-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--A-------CAA-G-AAAT----CAAATTTTTAAAAAACTT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TTAAC-A---TTAA--ACAGGG-C---AA-A-TTT-C-CA--ACAG---TG-ATC-GATT--T-TT--TCATAA--TA---T--T-A-----A-T--CTGA-TG-GC-A--GCT-A---GATATGCA-C--TG-GTT-AC-C-ATA-GACCTTTaaaacatttctttgaagaactagccatttaggtcagttttttttttacacaccgatcctgttttgcggtttttttaactttaacaaacaacgtcagctttgataatgaattctgggggccagggtaataatacaagtatttattaattctatgggtcatttaatgtaaaattgacttccagtggcaattcttgattatgccttaaacgtttcaaaatcttcataacagaacaagaaatcaaatttttaaaaaacttttacaggattgttaacattaaacagggcaaatttccaacagtgatcgattttttcataatattaatctgatggcagctagatatgcactggttaccatagacctttcatgttaactgcgaggtttctaaaatggaaagggga
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): CAATTTTTTTTTATTTTATGCATGGCACCATTTACAACAAATTATATTCTTCGTTGTGGGGTTTTTCTAAATAAAATTTATGGGTGGTGGGTTGGGAAAAAAAGTGCCTTCGACCCCCCCCATACAT
Unaligned ( gi|26 ): CACAATATACAGCATATTGAGTTTTCTTGGTGGTGGGGATTTTCTGATTTTTTTCCCAAGGAGGGGATCTAAAAATCAGTGGCCTTCTACCCCTCCCAGATAACTTTTACTGGAATAGTCCT
Unaligned ( gi|27 ): ACATGTCACATTGCTCTGAGCTGAAAACAATATGGTTAAAAAGAATCAAATCCTTCACTATCAAATTTTTTTTATTTTATGCATGGCACTATTTCAGCAAATTATATTTTCTTCGTTGTGG
Unaligned ( gi|30 ): ATTTTCACATTCCCAATTAATTCCAGCATAAAAAATGCTGTCCCAGTT
Alignments
lowQualScore : 11 999999999999999999999999999999999 111 11 1 1 111 2222222 11111 1111 1111 33333333333 111111 111111 11 1111111 1 1111 11111111 1 11111 3333333333333 111 22222222222222 1111 1 1111111111 1111111 11111111 11111111111 111 111111 111 888888888888888888888888888888888888888888888 111111 1111 1111 111111 11111 1 1111 1111111 111111111 1111111 1111 11111111 111 55555555555555555555555555555 2222222222222222222222222 111111111111 22222222222222222222 1111 1111 111 1111 1111 11 2222222222 1
lowQualScore : 2 2 22 2 2 2 2 777777 6666666 555 2 55 6 6 4444 444444444444444444444444444444444 5 0 5 5 5 000 33 5 1 77 5 1 5 1 5 222 5 5 5 66 5 5 4444444 22222 66 66 2 5 7777 5 4444 00000000000 66 333333 1 5 66 5 5 66 5 66 5 666666 11 0000000 0 5 0000 5 33333333 0 5 888 5 5 55555 5 5 5 4444444444444 333 888 5 55555555555555 0000 777 5 0 9999 9999999999 4 4 4 4 66 0000000 4 4 66 77777777 55555555555 5 555 333333 5 222 77 55 5 999999999999999999999999999999999999999999999 5 55 444444 2 22 66 0 0000 5 1111 444444 00000 88888 66 888 5 0 0000 5 6666666 5 5 5 66 888 66 666666666 6666666 5 0000 66 5 0 888 88 11 4 55 44444444 55 4 4 4 55 4 4 4 8888 0 3 3 3 333 22222222222222222222222222222 3 3 9999999999999999999999999 777777777777 3 55 7 3 11111111111111111111 55 7 0000 3 666 55 55 8888 4 8 3 666 3 3 3 3 3 5555 3 3 000 55 1111 55 3 3 55 55 3 666 3 55 99999 1111 7777 1 44 3 6 3 3 6 6 6 6 3 555 4444 6 3 555 3 3 3 3 44 555 3 88 55 3 55 666 00 666 2222222222 3 55 2 0 3 5555 3 88 7 3 3 3 3 3 3 3
lowQualScore : . . .. . . . . ...... ....... ... . .. . . .... ................................. . . . . . ... .. . . .. . . . . . ... . . . .. . . ....... ..... .. .. . . .... . .... ........... .. ...... . . .. . . .. . .. . ...... .. ....... . . .... . ........ . . ... . . ..... . . . ............. ... ... . .............. .... ... . . .... .......... . . . . .. ....... . . .. ........ ........... . ... ...... . ... .. .. . ............................................. . .. ...... . .. .. . .... . .... ...... ..... ..... .. ... . . .... . ....... . . . .. ... .. ......... ....... . .... .. . . ... .. .. . .. ........ .. . . . .. . . . .... . . . . ... ............................. . . ......................... ............ . .. . . .................... .. . .... . ... .. .. .... . . . ... . . . . . .... . . ... .. .... .. . . .. .. . ... . .. ..... .... .... . .. . . . . . . . . . ... .... . . ... . . . . .. ... . .. .. . .. ... .. ... .......... . .. . . . .... . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 7 2 55 0 0 0 0 999999 5555555 555 1 00 3 3 5555 444444444444444444444444444444444 7 1 7 7 7 000 66 7 4 99 7 4 7 4 7 111 7 7 0 99 0 0 4444444 55555 99 99 5 0 5555 0 1111 66666666666 99 888888 0 0 99 0 0 99 0 99 0 888888 11 1111111 0 0 6666 6 44444444 0 0 888 0 0 99999 0 0 0 4444444444444 888 888 0 44444444444444 6666 222 0 0 4444 4444444444 4 4 4 4 11 9999999 4 4 11 44444444 44444444444 7 777 666666 0 111 99 99 7 555555555555555555555555555555555555555555555 0 11 444444 2 11 99 1 6666 0 2222 444444 00000 55555 99 888 0 0 6666 0 2222222 0 0 0 99 888 99 444444444 2222222 0 6666 99 0 1 888 11 22 0 55 55555555 55 0 0 0 55 0 0 0 5555 8 6 6 6 666 00000000000000000000000000000 6 6 6666666666666666666666666 555555555555 6 00 3 6 55555555555555555555 00 3 1111 6 444 00 00 5555 0 0 6 444 6 6 6 6 6 0000 6 6 000 00 4444 00 6 6 00 00 6 444 6 00 11111 1111 1111 3 22 1 2 1 1 2 2 2 2 1 444 8888 7 3 888 3 3 3 3 66 222 6 66 00 6 00 444 00 444 8888888888 6 00 5 9 6 7777 6 66 3 6 6 6 6 6 6 6
consensus : GCTA-TT-CCAGAAAT-GA-A-TG-T-A----C-GGGG-------GGG---TCGG-A--AGG-C-AC----TT------CA------------A-T----------TAAAATTTTATGCT-TGGTTGTTGTT-G-A-AAATTTATTA---TTTC--A-TACCTTGTG--GG-TCG-CCGG-TT-AAATTTAATTTT-G-TACC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGCGG-G----TTG-A-T--TAACAATAAA-----------CAA--CAAA----C-ANA-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TC----G-GCATCC-AT---T--TTTCAGAACGG-AA-GAGCAAT----ACATGCGTG-----T--TG-CG-C---ATGCC-CGAT-AC--A--AAATC-AATA-T-AAGC--G------G---AGAT---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----AT--AGA-CT-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GT--ACAT--AGAC----TA-----GAT-AA---TGTATG-TA-AGCGGGAGA-TAA-C-TC--TAAGTACATAGACTA-GAT---A-----A--T-GTAGA----------T---------------TAT-CATT-TGAAT------TTATTTTA--TTAAAG----G-GC--C-AAT------AT-C---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAG---T---T-TTTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGTT---TT-TGNGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A-CT-TT----AATAAA-TG-A-TT---CT------G-GG----T-----A---GG-T-AT-A-ATAC---------AGT---------A---TT-AT---T---A-T-TTTAT--GT-C-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA-A--TA-T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--A-C--TT--TCAA-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAC-G-AAAT----CAAATTTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TT-A--ACA-GG-C---AA-A-CTT-C-CA--ACAA-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---C--T-A-----A-T--CCGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTTT
Reference ( family-824 ) : GCTA-TT-CCAGAAAT-GA-A-TG-T-A----C-GGGG-------GGG---TCGG-A--AGG-C-AC----TT------CA------------A-T----------TAAAATTTTATGCT-TGGTTGTTGTT-G-A-AAATTTATTA---TTTC--A-TACCTTGTG--GG-TCG-CCGG-TT-AAATTTAATTTT-G-TACC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGCGG-G----TTG-A-T--TAACAATAAA-----------CAA--CAAA----C-ANA-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TC----G-GCATCC-AT---T--TTTCAGAACGG-AA-GAGCAAT----ACATGCGTG-----T--TG-CG-C---ATGCC-CGAT-AC--A--AAATC-AATA-T-AAGC--G------G---AGAT---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----AT--AGA-CT-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GT--ACAT--AGAC----TA-----GAT-AA---TGTATG-TA-AGCGGGAGA-TAA-C-TC--TAAGTACATAGACTA-GAT---A-----A--T-GTAGA----------T---------------TAT-CATT-TGAAT------TTATTTTA--TTAAAG----G-GC--C-AAT------AT-C---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAG---T---T-TTTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGTT---TT-TGNGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A-CT-TT----AATAAA-TG-A-TT---CT------G-GG----T-----A---GG-T-AT-A-ATAC---------AGT---------A---TT-AT---T---A-T-TTTAT--GT-C-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA-A--TA-T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--A-C--TT--TCAA-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAC-G-AAAT----CAAATTTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TT-A--ACA-GG-C---AA-A-CTT-C-CA--ACAA-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---C--T-A-----A-T--CCGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTTT
gi|1 : -AAC--TTT--------A--A-AAAACGAAAC--GTC-A-CT-TTTTAGAATA---TG-A-TTT--CTC-----G-GG----T-----A--------AT-A-ATAC---------AGTTAC------A---TT-AT---TC--A-T-TTCAT--TTTC-GA--------T----TCGTTTTTG--ATAGTAAATA--TA-T---GA--CTATTCC----AGTG--C-A-T-TC---TCGA-AAT-A-TCG----C-T-T---AT--A-A--TT--TCAA-AG-A--TC------ATAA---CTG-A----------TAT-----AT-------ATGTTTCAAAA--CT-TCT-AC-AGG-AC-TG-TT-A------TT-ATCACA-GG-C---AA-C-CTT-C-----AGAA-T-GA-AA--GC-T--C-AT--TC---A--TA---CTTT-AAT---A-T--CCAA-TA-GC-GTCGCA-AT-GGACGGGCA-CTTTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTCT
gi|1 : aactgtcttatgtatcgttcatagtaaggtatttaccttttacattgcatttattacagctttaaaatatcctcaaacgttaaccaaaatcctaggagcacacaattacacaccgccattactgaacagggtcaaccgtgaactaAAAAAT--A-A-TG-T-A----T-GGGG--------GG---TCGG-A--AGG-CTACTTTTTT------CAACGCCACCACCCA-T----------TAAAATTTTATtttatgttaactgttgaggctgccaaaatagttaaacggaatttaacggtgaacgagcatttcccacaaactaacattactcaactgaactttactacattaaaattttcacatttcccagtgcatgcaaattccagcttcaaaaatgctgtcccatgtatcatgaaagggtctatttcgaaaccctagcatatatttcatcttttcacagacattttcagtgagagagaaggattaaggcaatgaagtcatgtaaatcaaatataaatagttctatgcaggtatcgaaaaaatcttacttaaaccaatttttgtaaatgaccatgtatatggtaaccatatttctcgatttctgcatcttccttgtatgattctataatgaaccatcgagatagaatactgttttctgaatccagcttttacagtttgaggcatcaacacaatacagtaatagaaagctccacatgtcacattgctccagagctgaaaacaattgttaataaagcagaccaagatcctttaaaaaaaatttaattttatgcatgtaccatttcaacaaattgatattatttctcgttgtgggtattttctctaataaaattttaatgggtggtggcgttgaaaaaagtagccttccgaccccccatacattatttttc
gi|10 : aactgtcttatgtatcgttcatagtaaggtatttaccttttacattgcatttattacagctttaaaatatcctcaaacgttaaccaaaatcctaggagcacacaattacacaccgccattactgaacagggtcaaccgtgaactaaactttaaaaaacgaaacgtcactttttagaatatgatttctcgggtaataatacagttacattattcatttcattttcgattcgtttttgatagtaaatatatgactattccagtgcattctcgaaatatcgcttataatttcaaagatcataactgatatatatgtttcaaaacttctacaggactgttattatcacaggcaaccttcagaatgaaagctcattcatactttaatatccaatagcgtcgcaatggacgggcactttggttaccatagacctcttttatgttaactgttgaggctgccaaaatagttaaacggaatttaacggtgaacgagcatttcccacaaactaacattactcaactgaactttactacattaaaattttcacatttcccagtgcatgcaaattccagcttcaaaaatgctgtcccatgtatcatgaaagggtctatttcgaaaccctagcatatatttcatcttttcacagacattttcagtgagagagaaggattaaggcaatgaagtcatgtaaatcaaatataaatagttctatgcaggtatcgaaaaaatcttacttaaaccaatttttgtaaatgaccatgtatatggtaaccatatttctcgatttctgcatcttccttgtatgattctataatgaaccatcgagatagaatactgttttctgaatccagcttttacagtttgaggcatcaacacaatacagtaatagaaagctccacatgtcacattgctccagagctgaaaacaattgttaataaagcagaccaagatcctttaaaaaaaatttaattttatgcatgtaccatttcaacaaattgatattatttctcgttgtgggtattttctctaT-CCATGAAC--A-A-TG-T-A----CTGGGG-------GGG---TCGG-A--AGGCC-AC----TTTTTTTCCAACCACGCACCACA-T----------TAAAATTTTATc
gi|11 : ataatgacccttttccaagcacaatcagtaactatactacttcaactgactttcttgggcattaaatattttcagatgtcccatcatgcaattccagcttaaaaaaatgctgtcccagttatcgagtgaaggcgtcgtattgaagacaaccgctagctatacattttatctttacacatttctcaaggagatgagaagagattattttttaagaagcaatgaggtcattgtaatcggaataggtaatgagttctagcagggaatatgcggataaaaatctttatgagggaaccattttttggtaaacgacatggtaataacgatggtaaccgatatttctcgttgtctaggaacatctcagttgataaatgattctattaagaccatagaagaatactgtttttgctgaactccagcttctgagactattgaagcatcaacatacatgataaagagctccacatgtcacattgctccgagctgaagaacacaaaaatggttaaaaagaagccaaatccttcactatcaaatcttttattaattttatgcatggcaccatttcaacaaaattatattttccttcattgtgggtaaattttctaT-CCATGAAC--A-A-TG-T-A----CTGGGG-------GGG---TCGG-A--AGGCC-AC----TTTTTTTCCAACCACGCACCACA-T----------TAAAATTTTATtatgg
gi|12 : ataatgacccttttccaagcacaatcagtaactatactacttcaactgactttcttgggcattaaatattttcagatgtcccatcatgcaattccagcttaaaaaaatgctgtcccagttatcgagtgaaggcgtcgtattgaagacaaccgctagctatacattttatctttacacatttctcaaggagatgagaagagattattttttaagaagcaatgaggtcattgtaatcggaataggtaatgagttctagcagggaatatgcggataaaaatctttatgagggaaccattttttggtaaacgacatggtaataacgatggtaaccgatatttctcgttgtctaggaacatctcagttgataaatgattctattaagaccatagaagaatactgtttttgctgaactccagcttctgagactattgaagcatcaacatacatgataaagagctccacatgtcacattgctccgagctgaagaacacaaaaatggttaaaaagaagccaaatccttcactatcaaatcttttattaattttatgcatggcaccatttcaacaaaattatattttccttcattgtgggtaaattttctaT-CCATGAAC--A-A-TG-T-A----CTGGGG-------GGG---TCGG-A--AGGCC-AC----TTTTTTTCCAACCACGCACCACA-T----------TAAAATTTTATtatgg
gi|13 : ataatgacccttttccaagcacaatcagtaactatactacttcaactgactttcttgggcattaaatattttcagatgtcccatcatgcaattccagcttaaaaaaatgctgtcccagttatcgagtgaaggcgtcgtattgaagacaaccgctagctatacattttatctttacacatttctcaaggagatgagaagagattattttttaagaagcaatgaggtcattgtaatcggaataggtaatgagttctagcagggaatatgcggataaaaatctttatgagggaaccattttttggtaaacgacatggtaataacgatggtaaccgatatttctcgttgtctaggaacatctcagttgataaatgattctattaagaccatagaagaatactgtttttgctgaactccagcttctgagactattgaagcatcaacatacatgataaagagctccacatgtcacattgctccgagctgaagaacacaaaaatggttaaaaagaagccaaatccttcactatcaaatcttttattaattttatgcatggcaccatttcaacaaaattatattttccttcattgtgggtaaattttctaCGTGAAA-TAG-A-TC--TCA-TATATAAACTC-AATTTCA-----G--G-GCA-A----------T---------------TTT-CATTGTGAATACCAAGTTATT--A--TTAAGG----GCGCTTC-AATCATGGAAT-CTTAA--G--AT---T---AAGGCAATTTCTTCGCACAGGGG-ATAACAGCATAG-CCA-TT-TAGGTG---T--CAGGGAT---TATGTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGGT---TTATGCGTCTTTTT-TAC--TTTCTACATGGA--C-ACA-C-AAACATGTC-A-CTGGT----AAT-AA-TG-A-TTTGCCTGCCGTCG-GA----TGTTCGG---GG-A-AT-A-ATACAG-------AGTCTCACTTGGA---TTAAT---T---G-TGTCTAT--GT-C-AAACTGACTGT----T------TAATAT-GTAAA-AGCTA-T---AA--TT--tatgg
gi|13 : aactctactaaattacaggtactatggcgaatcaAT-TC-----GA-T-TTA-T-G----C-T-TTCTAG--A-C--TTAGTAAA-AA-AAATC--TT-CACAATAGCAG-ATCAACCTGCATACAG-TAATATTCCAATTTCTTAAAAA--ATATAT-AC-AGGGATGTG-TT-AC-AAACTT-A--GGA-GGGC---AA-A-CTT-C--A--ACAA-C-TG-AT--GCTA--T-TT--TC---AGTTA---CA-T-AGATCGA-T--CAGATTGTGCGA--GCT-AGCGAAT-TGCA-C-TAG-GTTCACAC-GAA-GACCTggtattaaactaatcatacgggttgagtgcagtccacgctcattcgatttatgctttctagacttagtaaaaaaaatcttcacaatagcagatcaacctgcatacagtaatattccaatttcttaaaaaatatatacagggatgtgttacaaacttaggagggcaaacttcaacaactgatgctattttcagttacatagatcgatcagattgtgcgagctagcgaattgcactaggttcacacgaagacctatttcaatgagaatgacttgcgaggcttc
gi|14 : aactctactaaattacaggtactatggcgaatcacgtgaaatagatctcatatataaactcaatttcagggcaattttcattgtgaataccaagttattattaagggcgcttcaatcatggaatcttaagattaaggcaatttcttcgcacaggggataacagcatagccatttaggtgtcagggattatgttttttacagatctggtttatgcgtcttttttactttctacatggacacacaaacatgtcactggtaataatgatttgcctgccgtcggatgttcggggaataatacagagtctcacttggattaattgtgtctatgtcaaactgactgtttaatatgtaaaagctataattggtattaaactaatcatacgggttgagtgcagtccacgctcGCTA-TT-CCAGAAATTGA-A-TG-T-A----C-GGGG-------GGG---TCGC-----GG-C-A-----TT------CA------------A-T----------TAATATTTTATGCT-TGGTTGTTGTT-GAA-AAATTTATTAAATTTCC--A-TACCTTG-G--GG-TCG-CCGGTTT-AAATTTAATTTT-G--ACC-TGGT-GGGTATTGATGT-AATT--T-G-TGCGT---GTT-TACC-----GCAAGG--AATGGCGG-G----TAGAA-TTATAACAATAAA-----------CAA--CAAA----A-ACACGC--AGCAC-A--TG-CCTTTTCACTT-TCCTCAG-GCATCC-AT---TAAATTCAGAACGGTAA-GAGCAAT----ACATGCGTGTGAAAT--TGCCGTC---ATGCCTCGAT-AC--AGTATATC-AATATT-AAGCG-G------G---AGAT---AACTTCT-CCACA--------GTAAAC----AT--AGATCT-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-C-GGAG--AT---A---ACT-CT-AA--atttcaatgagaatgacttgcgaggcttc
gi|15 : aggGCTA-TT-CCAGAAAT-AA-A-TG-T-A----T-GGGG-------AGG---TCGG-A--AGG-C-AC----TT------
gi|16 : aaccatttttgtaaaagacatgtatatggaaaccatatttcccttagtttctgcatcttccataatgatcatagaagaatactgattttctgaactccagcttttacacttgaagcatcaacatacatacaaaagtccacacatcacattgctctgagatgaaaacaaaagggctaaaaaaaaacacccaaatccttaactatcaaatttttttaattttatgcatggcaccatataaaacaaattatattttcttcattgtggggtattttctaaatgaaattttatgggtggtgggttgggaaaa----------T---------------TAT-CATT-TGAAT------TTGTTGTA--GTA-------G-GC--C-AAT------AT-C---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATCG-CCA-TT-TAG--G---T--CAA---TATTT-TTTTTTTT-------T-CA----GA--T-CTGTT---TT-TTT-TTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A-CT-TT----CATAAA-TG-A-TT---CTA-----G-GG----T-----A--------AT-A-ATAC---------AGT---------A---TT-AT---T---A-T-TTTA---GT-C-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA----TA-T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--A-A--TT--TCAA-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAC-C-AAAT----CCAATTTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TT-
gi|17 : gtgtagataaccaaaacaattTA-TT-CCA-ACAT----A-TG-T------T-GGGG-------GGG---TCG--A--AGG-C-AC----TTTTTTTCCA------------A-CCCACCACCCATAAAATTTTAT
gi|18 : tctcgtttctgcatcttccattgtatgattcctataatgaccatagaagaatactgtttttctgaactccagttttacatttgaagcatcaacaaacatacaaaagctcacatgccacattgctccgagctgaaaacaaaatggttaaaaagaaccatttcgttcactatcaaaattttttaattttatgcatggcaccatttcaacaaattatatttcttcaattgtggggtattttcttaAA-TG-A-TT---TC------T-GG----T-----G---GG-T-AT-T-ATACTAATAACTAGGT---------A---TTTATGTAT---A-T-TGTAT--GTTC-AA--------TC---T------TA--ATCGTAAA-T--TG-TTCTGA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T---A-T-GAGTTCAT-T---AAGTA-CCTTT--TCAATAA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAC-G-AAAT----CAAATTTTTAAAAA--C--T-T-AC-A-G-AT-TGTTT-AC-A----T-A--ACA-GG-C---AC-A-CTT-C-CA--ACAA-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---C--T-A-----ATT--CTGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-G-T-AC-C-ATA-GACTTT
gi|19 : GT-ATTTATC-G-TGCGT---GA--TACCAAGGAGCA--G--AAGGTCGA-GAGAGTTG-A-A--TAACAATAAAAGTAAGAAAAACAAAACAAA----CAAGA-GC--AGC-C-A--TG-C---TTCA----------GAGCATCTAATATAT--ATGCAAAACGG-AA-AAGC-AC----ACAAGA-----------TG-AG-C---A------GAT-GT--A--GGGTC--CCA-T---GC--T------GTCTATAT---GA---CA-CTA-C--------G---AA----AA--AGA-TC-AAA----T-AT----------A-AATA-CA-AGTCGGAAGGAAT---A---ACT-CTAAA--GT--A
gi|2 : TT-AAC--TTT--------A--A-AA--C-AAAC--GTA-A-CC-TG----TATAAAATG-AGTT---CTC-----G-GG----T-----A--------AT-A-ATAC---------AGT---------ACATTT-CT---T---A-T-TTCAT--GT-C-AA--------TCGTTT------TA--AT-GTAAA-A--TAAT---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TCGA-T-T-G---G----C-TAT---AA--A----TG--CCAA-AA-A-------T-CATGC---C---A--AAC-----TAT-GCAAAT----AATATGTTTCAAAA--CT-T-T-ACAAGG-AC-TG-TT-AT-A---TT-C--ACA-GG-C----A-A-CTT-C-CA--GCAA-C-TGAATAAGCTC--A-TT--TC---GTTTA---CTTT-AAT---A-T--CCAACTA-GC-T--GCA-A--GGAT-GGCA-C-TT--GTT-AC-C-AT--GACCTTTttatattaatatgactag
gi|20 : actgtctatattgttcaggataaggtatttacctttacatgccatatttaacagctttcagaatatcctcgaacgtaccaaaaaattcacacgccatactgaagggtcactgtgacCTA-TT-CCAGAAAT-AA-A-TG-T-A----T---GG-------GGG---TCGGAA--AGG-CAAC----TT------tatgttactgtgaggcttccaaagtttaaacggaatatagtggataacgacgcatttcccacaacatgaacattactcaactgacctttcttacttaaaattttcacttcccattcatcagattctgcttcaaaaatgctgtccagttatctatgaaagggtctatttagcaaccctagctatatttcatctttacacattttctcaggagagagagaagattaatatttagagcaatgagtcataatcaaataaataatatatctagaggtatgaaaacaatctttaaaaacatttttgtaaaacacatgtatatgtaaccattatttctcgtttctgcctcttcattttgattctataagaccaagaagaaatacgttttcttgactccagcttttacccattgaagcatcaaaatacatcaaaagctccacatgccacattgcttccgagctgaaaaaaatggtaaaaagagaccatttcgtttcactacgaaatcttttgtaattgttgagcatggcaccaattcaacaattgtatttcttcattgtgggtatttctcttaataagaattttaatgggtggtgggtgaaaaaaatgcctctcgacccccatacattatttc
gi|21 : atcattttttttattttagcatgcaccattttacaacaaattatatatttttttttttttttttttgtttttttcttcgtttgtggggtttttcttaataaaattttatgggtggtgggttgggataaaaa-TT-CCAGAAAT-AA-A-TA-T-G----T-ATGG-------GGG---TCGG-AGTAGG-C-AC----TTTTTTTCCA------------A-CCCACCACCCATAAAATTTTAT
gi|22 : aatttttttatttatgtttaatgcatgggctaccatttacaactaattagtaattttcttcgttgtgggtttttctaaGCTAGCC-CCAGAAAT-AA-A-TG-T-A----G-GGGG-------GGG---
gi|23 : tttatttttggagggggattttcaacaaattaatattttcttcgttgtggggtattttctacttaaattttatgggtggtggtttgaaaaaaaaagtgcttccaacaccacacaccccGCTA-TT-CCAGAAAT-AA-A-TG-T-A----T--GGG-------GGG---TCGG-A--AGG-C-AC----TT------
gi|24 : tttttttttttattttatgcatggcacatttacaacatatttaatattttcttcgttggggttttctaaataaattttatggtggtggttgggaaaataaaA-TT-C---AAAT-AA-AATG-T-A----T-GGGA-------GG----TCGG-A--AGG-C-AC----TT------
gi|25 : gcatcgggcacaatttgagcaggagcgagatggggtatattttcttcgttggtgggtttttctaaataaatttattatgtggtgggtttgggaaaaaa-A-TG-T-A----T-GGGG-------GGGG--TCG--A--AGG-C-AC----TT------gt
gi|28 : caatttttttttattttatgcatggcaccatttacaacaaattatattcttcgttgtggggtttttctaaataaaatttatgggtggtgggttgggaaaaa-AAAT----CAAATTTTTCAAAA--CT-T-T-AC-AGG-TT-TG-TT-AT-A---TT-T--ACA-GG-C---AA-A-TTT-C-CA--ACAA-
gi|29 : cGCTA-TT-CCAGCAAA-AA-A-CT-T------C-TGGG-------GGG---TGGG-A--AGG-C-AG----TT------
gi|3 : aatatcGCTA-TTTCCAGAAAT-GA-A-TG-T-A----C-GGGGACTTGTGGGG---TCGG-AC-GGG-C-AC----TTATA---CA------------AAT----------TAAAATTTTATGCCATGGTTG-TGTT-G-A-AAATTTATTA---TTTC--ATTACCTGTTG--GGCTCGCCCGG-TT-AAATTTAATTTT-GTTACCTTGGTGGGGTACTGATGTAATTT--T-GTTGCGTCTAGTTTTACC-----GCA--GGCGATGGC-G-G----TTG-A-T--TAACAATAAAAC---------TAA--CAAGGATTC-AAA-GCTTAGC-C-GACTGTC--TTCTACTT-T-----G-G-----------------CAGAACGG--A-GAGCAAT----A-ATGC-TG-----T--TG-CG-CTAAATGCC-CGAT-ACAGA--GAATC-AATA-TAAAGC--GAAGGGAG---AGAT---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----ATAAAGA-CTGAGA----TAAT----------G-TATA-TA-AA-CGGCCG-------------T-CC-AA--G---------AGAT----TAGGGCCGAT-AA---TGTATACTACAGCGGGAGA-Tcctcat
gi|3 : tagGA----TAAT----------G-TATACTACAG-CGGGAG--AT---GGAGACTACT-GATAGTTTACACTCAGGCACCATA-----GAT-AAACATGTATG--A-AGCGGGAGA-TAA-C-TCCCTATGCACATAGACTA-GAT---ATAGGTACTT-ATAAACAAAACAATTT---------------TATGCATT--GAAT------TTATTTTA--TGAAAG----G--C--C-AAT------AT-C---ACCA--ATA--TTATAAAAC-ATTTCTT-GAA----GGGA-------ATAG-CCA-TT-TAA--GATGT--CAG---T---TCTTTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGTTGGTTT-TGTATTTTTTTTAACCTTTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A-CT-TT----AATAAA-TG-A-TT---CT------G-GG--------------GG-T--T-A-ATA----------------------A---TT------------T-TTTAA--GT-C-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA-AT-TA-T---GA--CT--TCCATGTAGTGG-CAAAT-TCTAATTGA-T-T-A-T-G----C-T-T----A--A-C--TT--TCAA-AA-A--TCGATC-TAT---------A--AAC-----TACGG-AAAT----CAGAATTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGGAAT-TG-TT-ACAA---TT-A--ACA-GG-CAAAAA-A-CTT-C-CAGGACAA-CTTG-AT--GCTTAAT-TT--TC---A--TA---C--T-A-----A-T--CTGA-TG-GC-A--GCTGA--GGAT-TGCACC-TTGCGTT-AC-C-ATAGGACCTTTggagactactgatagtttacactcaggcaccatagataaacatgtatgaagcgggagataactccctatgcacatagactagatataggtacttataaacaaaacaattttatgcattgaatttattttatgaaaggccaatatcaccaatattataaaacatttcttgaagggaatagccatttaagatgtcagttcttttttttacagatctgttggttttgtattttttttaaccttttaaaaacaaacgtcactttaataaatgattctgggggttaataattttttaagtcaatttaatgtaaaattatgacttccatgtagtggcaaattctaattgattatgcttaactttcaaaaatcgatctataaactacggaaatcagaattttaaaaactttacaggaattgttacaattaacaggcaaaaaacttccaggacaacttgatgcttaattttcatactaatctgatggcagctgaggattgcaccttgcgttaccataggaccttttttatgtttaactgcgagc
gi|4 : taggctatttccagaaatgaatgtacggggacttgtggggtcggacgggcacttatacaaattaaaattttatgccatggttgtgttgaaaatttattatttcattacctgttgggctcgcccggttaaatttaattttgttaccttggtggggtactgatgtaattttgttgcgtctagttttaccgcaggcgatggcggttgattaacaataaaactaacaaggattcaaagcttagccgactgtcttctactttggcagaacggagagcaataatgctgttgcgctaaatgcccgatacagagaatcaatataaagcgaagggagagataactctaagtacataaagactgagataatgtatataaacggccgtccaagagattagggccTA-TT-CCAGAAAT-GAGA-TG-T-AACGGC-GGGG-------GGGGGGTCGG-A--CGG-C-AC----T-------CA------------A-T----------TAAA--TTTATGCT-TGGTTGTTGTT-G-A-AAATTTATTT---TTTCC-A-TACCTTGTGTGGG-TC---CGG-TTGAAATTTA--TTT-G-T-CC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--TTG-TGTGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGCGG-GCT--TTG-A-T--TAACA-TAAA-----------CAA--CAAA----C-AGC-GC--AGC-CCA--TG-C--TTTCACTT-TC----C-GCATCC-AT---T--TTTCAGAACGG-AATGAGCAACTTGAACATTCGTG-----TATTG-CG-C---ATGCC-CGATCAC--A--AAATCCAATA-T-AAGCCGG------G---AGATTAGAA---CTTCTA-ACTAGCGGGAT--ACCTCAAT--A-A-CG-AGAGTACTAATACATGTATTAG-TATA-CA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-A---GT--CAAT---GAC----T------GAT-AAA--TGTATAATA-AGCGGGAGAGTAAAC-TC--TAAGTAATTAGACTAAGAT---A-----A--TCGTAGA----------TAACACAAAACAATTTTAT-CATT-TGAAT------TTATTT-A--TTAAAG----G-GC--CCAAT------AT-C---A--ACAGTA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------TAAG-CCAATT-TAG--G---T--CAG---T---C-TTTTTTTTTTTTTCCA-GA----GA--T-CTGTT---TT-GGCGTTTTTTA-AAC--TTT--------ATAA-AAA-C-AA-C--GTC-A-CT-TG----ACTAAA-TG-A-TTT--CT------G-GGGCCAT-----G---GGGT-AT-ATATAC---------AGT---------A---TT-AT---T---AAT-TCTAT--GT-CCAA--------T----T------TA--AT-GTAAA-A---A-T---AATGCT--TCC----AGTGGGC-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--AAC--TT--TCAA-AAAA--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAA-G-AAAT----CAAA-TTTCAAAAA--CT-T-TAAC-AGG-AT-TGTTT-AA-A---TT-A--ACA-GG-C---AA-ATTTT-C-CA--ACAA-G-TG-AT--GTTT--T-TCAATA---A--TA---T--TAA-----A-T--CTGAGTG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTtttatgtttaactgcgagc
gi|5 : agggctGCTA-TT-CCAGAAAT-GA-A-TG-TTA----C-GGGG-------GG----TCGG-A--CGG-C-AC----TT------CA------------A-T----------TAAAATTTTATGCT-TGGTTGTTGTT-G-AGAAAATTAT-A---TTTC--A-TACCTTGTG--GG-TCGGCCGG-TT-AAATT-AATTTT-G-TACC-TG-T-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---T-CC-----GCA--G--GATGGCGA-G----TTG-A-T--TAACAATAAA-----------CAA--CAAA----C-ACA-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TC----A-GCGTCT-AT---T--TTTCAGAACGG-AA-GAACAAT----ACATGCGTG-----T--TG-CG-C---ATGTC-C-AT-AC--A--AAATC-AATA-C-AAGC--G------GG--AGAA---TA---CT-CTA-A--------G---AC----A------------A----TAAT----------GATAT--TA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GT--ACAT--AGAC----TA-----GA--AA---TATATG-TT-AGCGG-AGA-TAA-CATC--TA-GTACATAGACTA-GAT---A-----A--T-GTAGA----------TAAACAAAACAATT--TAT-CATT-TGAAT------TT-TTTTA--TTAAAG----G-GC--C-AAT------AT-C---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAG---T---T-TTTTTTTT-------AACA----GA--T-CTGTT---TT--GGGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GCC-A-CT-TT----AATAAA-TG-A-T----CT------G-GG---------------A-T-ATTA-ATAC---------A-T---------A---TT-AT---T---AAT-TTCAT--GT-G-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA-A--TA-T---GA--CT--TC-----AGTG--C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-C-T---TA--A-C--TT--C--A-AA-A--TC--TT-CATAA---CAGAA--AAC-----TAT-G-AAAT----CAAA-TTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TT-A--ACA-GA-C---AA-A-CTT-C-CA--ACAA-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---C--T-A-----A-T--CTGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-A--C-ATA-GACCTTTatt
gi|6 : tagTACAAA--CT-T-T-AC-AGG-ACGTG-TT-AT-A---TT-C--ACA-GG------A-A-CTT-CTCA--GCAG-C-TG-AA--G--T--C-AT--TC---A--TACTTC--T-A-----A-TACCCAA-TT-GC-T--GCA-A--GG-T-T-CA---TTG-GTT-AC-C-TAA-GACCTTTtaattataatgcgagct
gi|7 : aacgaacaagagcacataaGCTA-TT-CCAGAAA---A-A-TGAT-A----C-GGGG-------G-----TCGG-A--CGG-C-AC----TTT-----CA------------A-T----------TAAA-TTTTATGCT-TG--TGTTGTT-G-A-AAATTTATTA---TTTTCAA-TACCTTGTG--T--TCG-CCGG-TTTAAATTTAATTT--G--ACC-TGGG-GGGTTTTGATGT-ATTT--T-G-GGCGTT--G---TACC-----GCA--G--GAATGCGGTG----TTG-A-GA-TAACAATAAA-----------CAA--CCAA----C-ACA-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTTGTC----A-GCATCTTAT---T--TCTCAGAACGGCAA-GAGCAAT----ACATGGTTG-----T--TG-GC-C---ATGTC-CGAT-ACC-A--AAATC-AATA-C-AAGC--G----------AGATT--AA---CT-CTA----------GT--AC----AT--TGA-CTTAGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGGAG--ATTTAA---ACT-CG-AA--GT--ACA---AGAC----TA-----GAT-AA---TGTA-------------GA-TAA------------ACATAAAC---------A-----A--T----------------T---------------TAT-CATT-TGTAT------TTATTTTA--TTAAAA----G-GC----AAT------ATTC---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA-----G-A-------ATAGTCCA-TTCTAG--G---TCCCAGT--T---T-TTTTTTTT-------A-CA----GAACT-CTG-T---TT-TGGATTTGTTT-AAC---TT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTCTA-CT-TT----AATAAA-TG-A-TT---CT------GAAA----T-----ACACGG-TAAT-A-ATAC---------AGT---------A---TT--T---TAACA-A-TATAT--GT-C-AA-------------T------TA--AT-GTAAA-A--TA-T---GA--CT--TCC----CATGG-CAAATATC---TTGACT-T-ACT-GA---C-T-TA--AA--A-C--TT--TCCA-AA-T--TC--TTCCATAA---CAG----AAC-----TAC-GAAAAT----CAAATTTTTAAAA----C-T-T-AC-AGG-A--TG-TTAAC-A---TT-A--ACAGGG-C---AAGA-CTTCC-CA--ACAATC-TG-AT--GCTT--TATT--TC---A--TA---C----A-----A-T--CTGA-TG-GC-A---CT----GGAT-TGCA-C--TG-GTT-AC-CAATA-G-CCTTTtatttaatctggtgaggctcccaaaaggtaaaatggaattaagtggaaagcagccatttcccacaactacattcactcaactgactttgtcttaccggtacattcccattcatgcaattccacttcaaaaatgctgtccagtgttcgatgaaaggtcattgagaacctactaattcggatctgtttacaacatttcgactgagatagagaagaggaagacgtcaagatgagctatgtaagatcatcttctataagcatggaagtaaactgaggtatagcgcgaataatggtcgcgacacaattaatcaaaagttacagagcattgttggtaaacacatgtataggtaagcaatttcgttctgcatcttccatggtaatgatgtctctaatgcataagacggacaaaaaacgcaccccttgggggggtagattggcgaaccccagcttacaaatgcggaaagcatcaaatcagtacaaaagctccacatgtcacattgcgcagctgaaaacaaaatggtaaaaagaagccaaatccttcacggatcaatttttaatttatgcatggcaccttcaacaaattatttctcgtttgggctttttcttataaaatttggggtggtgggtggggaaaaaaaaagtggccttcgcaccgacccccccaccttatttcgat
gi|8 : taggGCTA-TT-CCAGAAAT-GA-A-TG-T-A----C-GGGG-------GGG---TCGG-A--CGG-C-A-----TT------CA------------A-T----------TAAAATTT-ATGCT-TGGTTGCTGTT-G-A-AAATTTATTA---TTTC--A-TACCT-GTG--GG-TCG-CCGG-TT-AAATTTGATTTT-G-TCCC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGCGG-G----TTG-A-T--TAACAATA-------------CAA--CAAA----C-ACA-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TC----A-GCATCT-AT---T--TTTCAGAACGG-AA-GAGCAAT----ACATGCGTG-----T--TG-CG-C---ATGTC-CGAT-AC--A--AAATC-AAT--T-AAGC--G------G---AGAT---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----AT--AGA-CT-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GT--ACAT--AGAC----TA-----GAT-AA---CGTATG-TA-AGCGGGAGA-TAA-C-TC--TAAGTACATAGATTA-GAT---A-----A--T-GTAGA----------T---------------TA--CATT-TGAAT------TTTATTTA--TTAAAG----G-GC--C-AAT------AT-C---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAG---T---T-TTTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGTT---TT-TGGGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A--T-TC----ATTAAA-TG-A-TT---CT------G-GG----T-----A---GA-T-AT-A-ATAC---------AGT---------A---TT-AT---T---A-T-TTTAT--GT-C-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA-A--TA-T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--A-C--TT--TCAA-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAT-G-AAAT----CAAATTTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TT-A--ACA-GG-C---AA-A-CTT-C-CA--AC-A-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---C--T-A-----A-T--CTGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTTT
gi|9 : GCTA-TT-CCAGAAAT-GA-A-TG-T-A----C-GGGG-------GG----TCGG-A--CGG-CCAC----TT------CA------------A-T----------TAAAATTTTTGGCT-TGGTTGTTGTTTG-A-AAATTTATTT---TTTC--A-TACCTTGTG--GG-TCG-CCGG-TT-GAATTTAATTTTTG-TACC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGC-G-G----TTG-AGT--TAACAATAAA-----------CAA--CAAA----CAAAA-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TC----A-GCATCC-AT---T--TTTCAGAACGG-AA-GAGCAAT----ACATGCGTG-----T--TGTCG-C---ATGCC-CGAT-AC-----AAATC-AATA-T-AAGCG-G------G---AGAT---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----AT--AGA-CT-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGG-G--AT---A---ACT-CT-AA--GT---TAC--AGAC----TA-----GATAAA---TGTAGA-TA-AAC
gi|9 : ATA-TA-AGCGGGAGA-TAA-C-TC--TAAGTACATAGACTA-GAT---A-----A--T-GTA----------------------------TAT-AAGC-GGGGA------TAACTCTAAGTTACAGACTAG-AT--A-AAT------GT-----A--G--ATAAAC---AAAAC-ATTTCTTTGAA----GA-A-------CTAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAG---T---T-TTTTTTTT-------A-CACACCGA--TCCTGTT---TT-GCGGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--ACAAA-C--AAC--GTC-AGCT-TT----GAT-AA-TGAA-TT---CT------G-GGGGC-C-----AG--GG-TAAT-A-ATACA--------AGT---------AT--TT-AT---TA--A-T-TCTATGGGT-C--A--------T----T------TA--AT-GTAAA-A--T--T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-GC---C-T-T---AA--A-CG-TT--TC-A-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--A-------CAA-G-AAAT----CAAATTTTTAAAAAACTT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TTAAC-A---TTAA--ACAGGG-C---AA-A-TTT-C-CA--ACAG---TG-ATC-GATT--T-TT--TCATAA--TA---T--T-A-----A-T--CTGA-TG-GC-A--GCT-A---GATATGCA-C--TG-GTT-AC-C-ATA-GACCTTTaaaacatttctttgaagaactagccatttaggtcagttttttttttacacaccgatcctgttttgcggtttttttaactttaacaaacaacgtcagctttgataatgaattctgggggccagggtaataatacaagtatttattaattctatgggtcatttaatgtaaaattgacttccagtggcaattcttgattatgccttaaacgtttcaaaatcttcataacagaacaagaaatcaaatttttaaaaaacttttacaggattgttaacattaaacagggcaaatttccaacagtgatcgattttttcataatattaatctgatggcagctagatatgcactggttaccatagacctttcatgttaactgcgaggtttctaaaatggaaagggga
blockSeqs : G T TG G A A T ACGGC ACTTGTG GGG A GT C A . TTTTTCCAACCACGCACCACAT A T . G . CA T G TG C C . G T TTA T G A AT T T CTAGTTT AAGGA . GC G T AGAG . GA AGTAAGAAAAA AA GATTC G . TT . C AC T . G GA TA ATATA C T TTGA G TAT T . TAA . C AGA C . A GAAGGGAG TAG . T ACTAGCGGGAT CTCA TAA . G GTAC ACATGTATTA A C C T GA GGAG A A TA TTACACTC ACCATA A ACA TAATA G AC CC TG A ATAGGTACTTATAAACAAAACAATTT G T . G GT AG ACTA . CC . TC CCA AA TAT . T . G . T A C . ATG CC TATTT TTTTTCC A CACC AC C GGT T TA T CT CTACATGG TA C . . AT T G G . A A G TGC GCCGTCGGATGTTCGGGGA T T AGAGTCTCACTTGGA TATGTATA G GG T C ACTGACTGTT AT C AGC A TCT TG . ATGT G A A TAA C . T C . AGTT A A TCT GT CCT AG T A AA GA C TAG A TC CTGCA CAG ATTC T AC A A A A G G T A A AAC AA G G AAA G T C T GG CT A AA AA A AA ATA GT CTT ATAGATCG T AC A T T GA G GC A C . C C A A G
blockSeqs : . . A . . . . CT . G . C C C . TTTTTCCAACCACGCACCACAT . . . . . C . T . . G . T . TA . . . . . . GA . . . G . CT . GT AC . CA A . . . . . . . . G TT TT . . . G T . . . . . CA . . . TGTCT T . . AGT . A . T . . . . . . . TTAA . . . CAAT TA . A TGTT . CA . AG . AATCGTAGATAACACAAAACAATTT . T . A TT . . . C . C ACA . . . . . . . . . . . . . TTC . . . . . . T CG . . . . . . . . . . . . . . . T GGGGCCATGGGGT . . TAATAACTAGGTA TTAACA . . . . TCGTTT . . AT . . . . . . A . . . . . . . A . . A . AC . . . . . . . . . . TGC . T . . . . . A G T A . . A G . . . . . . . TC . C . . . . TT . TTTAAT . . T C . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . CT . . . . C . . TTTTTCCAACCACGCACCACAT . . . . . . . T . . . . . . TC . . . . . . TG . . . G . . . A . . CA G . . . . . . . . C C TT . . . T T . . . . . A . . . CGGG . . . AGT . T . . . . . . . . . A . . . ACAT TA . . TGTA . C . AG . AATGTAGATAAACAAAACAATT . T . A TT . . . C . C A . . . . . . . . . . . . . TTT . . . . . . G GG . . . . . . . . . . . . . . . . GAAATACACGGTA . . AGTACAT AATTG . . . . TCT . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . CG . . . . . . . . . . CGG . T . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . C . . . . . . . . TAA . . C G . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . CT . . . . . . . TTTTTCCAACCCACCACCCA . . . . . . . T . . . . . . TA . . . . . . G . . . G . . . T . . C C . . . . . . . . A T TT . . . G T . . . . . A . . . GGG . . . AGT . T . . . . . . . . . A . . . ACAT TA . . GATA . C . AG . AATGTAGAT . T . A TT . . . C . C A . . . . . . . . . . . . . TC . . . . . . T GA . . . . . . . . . . . . . . . . GGGGGCCAGGGTA . . AAGTAT ATTAA . . . . TT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . CGA . T . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . C . . . . . . . . TA . . T . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . C . . . . . . . TTTTTCCAACCCACCACCCA . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . G . . . G . . . T . . C C . . . . . . . . A T TT . . . G T . . . . . A . . . GGG . . . CG . T . . . . . . . . . A . . . ACA TA . . TATA . C . G . AATGTA . T . T TT . . . C . C A . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . T GG . . . . . . . . . . . . . . . . TGGTGGGT . . AGTA ATTAA . . . . TT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . CC . T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . C . . . . . . . . TA . . T . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . T . . . . . . . ATACAAAT . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . G . . . . . . . T . . C C . . . . . . . . A C TT . . . . T . . . . . A . . . GG . . . AG . T . . . . . . . . . A . . . TAC T . . TGA . . . . . AATT . G . A CT . . . A . C A . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . G GG . . . . . . . . . . . . . . . . GGGTAGAT . . AGTA ATTAA . . . . TT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . CG . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . G . . . . . . . . TA . . T . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . T . . . . . . . TCAAT . . . . G . . . . . . . T . . C A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . GT . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . T . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . AGGGTA . . AGTA ATTA . . . . TT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . AG . T . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . C . . . . . . . . TA . . C . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . T . . . . . . . CAAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CGGGTA . . AGTA CTTA . . . . TT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . TG . T . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . C . . . . . . . . TA . . T . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . T . . . . . . . CAAT . . . . . . . . . . . . . . . . GGGGGT . . ATA ATTA . . . . TT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . TG . T . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . C . . . . . . . . TA . . T . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . G . . . . . . . CAAT . . . . GGGAT . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . T . . . . . . . CAAT . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . T . . . . . . . CAAT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . .
blockSeqCons : A* **** TTCCAACCCACCACT****************** *** TA* G****** ** T*** ** A***** TT***** T******* A**** *** AGT*********** ACAC**** TA********* TGTA** AG AATGTAGATAAACAAAACAATTT********************** T* ****** TT C*** ****** C**** **** ******* ** TT******* T* **** *** GGGGGT*********************** AGTA********************* TT****************** A*** ** CG** A*** TA******** A*** **
originalCons : GCTA-TT-CCAGAAAT-GA-A-TG-T-A----C-GGGG-------GGG---TCGG-A--AGG-C-AC----TT------CA------------A-T----------TAAAATTTTATGCT-TGGTTGTTGTT-G-A-AAATTTATTA---TTTC--A-TACCTTGTG--GG-TCG-CCGG-TT-AAATTTAATTTT-G-TACC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGCGG-G----TTG-A-T--TAACAATAAA-----------CAA--CAAA----C-ANA-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TC----G-GCATCC-AT---T--TTTCAGAACGG-AA-GAGCAAT----ACATGCGTG-----T--TG-CG-C---ATGCC-CGAT-AC--A--AAATC-AATA-T-AAGC--G------G---AGAT---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----AT--AGA-CT-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GT--ACAT--AGAC----TA-----GAT-AA---TGTATG-TA-AGCGGGAGA-TAA-C-TC--TAAGTACATAGACTA-GAT---A-----A--T-GTAGA----------T---------------TAT-CATT-TGAAT------TTATTTTA--TTAAAG----G-GC--C-AAT------AT-C---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAG---T---T-TTTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGTT---TT-TGNGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A-CT-TT----AATAAA-TG-A-TT---CT------G-GG----T-----A---GG-T-AT-A-ATAC---------AGT---------A---TT-AT---T---A-T-TTTAT--GT-C-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA-A--TA-T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--A-C--TT--TCAA-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAC-G-AAAT----CAAATTTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TT-A--ACA-GG-C---AA-A-CTT-C-CA--ACAA-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---C--T-A-----A-T--CCGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTTT
finalCons : GCTA-TT-CCAGAAATA-A-A-TG-T-A----C-GGGG-------GGG---TCGG-A--AGG-C-AC----TTTTCCAACCCACCACT------------------TAAAATTTTATGCT-TGGTTGTTGTT-G-A-AAATTTATTA---TTTC--A-TACCTTGTG--GG-TCG-CCGG-TT-AAATTTAATTTT-GTA-CC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGTG------TACC-----GCA--G--GATGGCGG-G----TTG-AT---TAACAATAAA-----------CAA--CAAA----C-ANA-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TCA-----GCATCC-ATTT-----TTCAGAACGG-AA-GAGCAAT----ACATGCGTGT-------TG-CG-C---ATGCC-CGAT-ACA----AAATC-AATA-T-AAGC--G------G---AGAT---AA---CT-CTAAGT-----------AC----AT--AGA-CT-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GTACAC----AGACTA---------GAT-AA---TGTATGTA--AGCGGGAGA-TAA-C-TC--TAAGTACATAGACTA-GATAATGTAGATAAACAAAACAATTT----------------------TAT-CATTT-GAAT------TTATTTTA--TTAAAG----G-GCC---AAT------ATC----A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAGTT-------TTTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGTT---TTT-GNGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A-CT-TT----AATAAA-TG-A-TT---CTGGGGGT-----------------------AT-A-ATACAGTA---------------------TT-AT---T---A-T-TTTAT--GT-C-AATT------------------TA--AT-GTAAAA---TA-T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--A-C--TT--TCAA-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TACG--AAAT----CAAATTTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TTA---ACA-GG-C---AA-A-CTT-C-CA--ACAA-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---CTA--------A-T--CCGA-TG-GCA---GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTTT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): CACAATATACAGCATATTGAGTTTTCTTGGTGGTGGGGATTTTCTGATTTTTTTCCCAAGGAGGGGATCTAAAAATCAGTGGCCTTCTACCCCTCCCAGATAACTTTTACTGGAATAGTCCT
Unaligned ( gi|27 ): ACATGTCACATTGCTCTGAGCTGAAAACAATATGGTTAAAAAGAATCAAATCCTTCACTATCAAATTTTTTTTATTTTATGCATGGCACTATTTCAGCAAATTATATTTTCTTCGTTGTGG
Unaligned ( gi|30 ): ATTTTCACATTCCCAATTAATTCCAGCATAAAAAATGCTGTCCCAGTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111 5555555555555555555555555555555555555555555 111 11 1 1 111 2222222 11111 1111 1111 33333333333 1111 1111 111 1111111 1 1111 11111111 1 11111 3333333333333 222222222222 1111 1111111111 1111111 22222222 11111111111 111 11111 111111111111 111 1111 11 2222222222222 111111 1 1111 1111111 111111111 1111111 1111 11111111 111 444444444444444444444444444444444444444 2222222222222222222222222 111111111111 22222222222222222222 1111 1111 111 1111 1111 11 2222222222 1
lowQualScore : 2 2 1 666 1 88888888 5555555 5555555555555 5555 44 7 5 2222222222222222222222222222222222222222222 1 1 1 5 0 5 5 5 000 33 5 1 77 5 1 5 1 5 222 5 5 5 66 5 5 4444444 22222 66 66 2 5 7777 5 4444 00000000000 66 0000 5 66 5 66 5 5 66 5 66 5 0000 111 0000000 0 5 0000 5 33333333 0 5 888 5 5 5 00000 5 5 5 4444444444444 5 888 888 5 5 000000000000 0000 777 99999 9999 9999999999 4 4 4 4 66 0000000 4 4 66 00000000 55555555555 5 555 33333 5 888 000000000000 5 000 5 4 9999 1111 999 11 5 3333333333333 3 88888 5 444444 5 888 88888 66 888 5 0 0000 5 6666666 5 5 5 66 888 66 666666666 6666666 5 0000 66 5 0 888 88 11 4 55 44444444 55 4 4 4 55 4 4 4 8888 0 3 3 3 777 555555555555555555555555555555555555555 3 3 9999999999999999999999999 777777777777 3 55 7 3 11111111111111111111 55 7 0000 3 666 55 55 8888 4 8 3 666 3 3 3 3 3 5555 3 3 000 55 1111 55 3 3 55 55 3 666 3 55 99999 1111 7777 1 44 3 6 3 3 6 6 6 6 3 555 4444 6 3 555 3 3 3 3 44 555 3 88 55 3 55 666 00 666 2222222222 3 55 2 0 3 5555 3 88 7 3 3 3 3 3 3 3
lowQualScore : . . . ... . ........ ....... ............. .... .. . . ........................................... . . . . . . . . ... .. . . .. . . . . . ... . . . .. . . ....... ..... .. .. . . .... . .... ........... .. .... . .. . .. . . .. . .. . .... ... ....... . . .... . ........ . . ... . . . ..... . . . ............. . ... ... . . ............ .... ... ..... .... .......... . . . . .. ....... . . .. ........ ........... . ... ..... . ... ............ . ... . . .... .... ... .. . ............. . ..... . ...... . ... ..... .. ... . . .... . ....... . . . .. ... .. ......... ....... . .... .. . . ... .. .. . .. ........ .. . . . .. . . . .... . . . . ... ....................................... . . ......................... ............ . .. . . .................... .. . .... . ... .. .. .... . . . ... . . . . . .... . . ... .. .... .. . . .. .. . ... . .. ..... .... .... . .. . . . . . . . . . ... .... . . ... . . . . .. ... . .. .. . .. ... .. ... .......... . .. . . . .... . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 7 2 9 555 8 33333333 9999999 0000000000000 7777 33 3 5 2222222222222222222222222222222222222222222 9 9 9 7 1 7 7 7 000 66 7 4 99 7 4 7 4 7 111 7 7 0 99 0 0 4444444 55555 99 99 5 0 5555 0 1111 66666666666 99 6666 0 00 0 99 0 0 99 0 99 0 6666 111 1111111 0 0 6666 6 44444444 0 0 888 0 0 0 99999 0 0 0 4444444444444 0 888 888 0 0 222222222222 6666 222 00000 4444 4444444444 4 4 4 4 11 9999999 4 4 11 11111111 44444444444 7 777 55555 0 888 222222222222 0 111 0 4 1111 3333 666 22 0 4444444444444 2 44444 0 444444 0 888 55555 99 888 0 0 6666 0 2222222 0 0 0 99 888 99 444444444 2222222 0 6666 99 0 1 888 11 22 0 55 55555555 55 0 0 0 55 0 0 0 5555 8 6 6 6 333 444444444444444444444444444444444444444 6 6 6666666666666666666666666 555555555555 6 00 3 6 55555555555555555555 00 3 1111 6 444 00 00 5555 0 0 6 444 6 6 6 6 6 0000 6 6 000 00 4444 00 6 6 00 00 6 444 6 00 11111 1111 1111 3 22 1 2 1 1 2 2 2 2 1 444 8888 7 3 888 3 3 3 3 66 222 6 66 00 6 00 444 00 444 8888888888 6 00 5 9 6 7777 6 66 3 6 6 6 6 6 6 6
consensus : GCTA-TT-CCAGAAAT-AA-A-TG-T-A----C-GGGG-------GGG-------------TCGG----A--AGG-C-AC----TTTT-------C----C--AAC-C---CACCAC---T--TA-A-AATT-TTATGCT-TGGTTGTTG-TTG-A-AAATTTATTA---TTTC--A-TACCTTGTG--GG-TCG-CCGG-TT-AAATTTAA-TTTTG-TACC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGCGG-G----TTG-A-T--TAACAATAAA-----------CAA--CAAA----C-AN-A-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TC----GGCATC-C-AT---T--TTTCAGAACGG-AA-GAGCAAT----ACATGCGTG-----T--TG-CG-C---ATGCC-CGAT-A-C--A--AAATC-AATA-T-AAGC--G------G---AGA-T---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----AT--AGA-C-T-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GT--ACAC--AGAC----TA-----GAT-AA---TGTATG-TA-AGCGGGAGA-T---AA-C-T-C--TAAGTA-CATAGACT-A-GATA-AT-GTAG--ATAA-ACAAA-ACAATTTTAT-CATT-TGAAT------TTATTTTATTAAAGG-GC--C-AAT------A-TC---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAG---T---T-TTTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGTT---TT-TGNGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A-CT-TT----AATAAA-TG-A-TT---CTG-------------G-G------G-------GN-------AT-A-ATAC---------AGT---------A---TT-AT---T---A-T-TTTAT--GT-C-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA-A--TA-T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--A-C--TT--TCAA-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAC-G-AAAT----CAAATTTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TT-A--ACA-GG-C---AA-A-CTT-C-CA--ACAA-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---C--T-A-----A-T--CCGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTTT
Reference ( family-824 ) : GCTA-TT-CCAGAAAT-AA-A-TG-T-A----C-GGGG-------GGG-------------TCGG----A--AGG-C-AC----TTTT-------C----C--AAC-C---CACCAC---T--TA-A-AATT-TTATGCT-TGGTTGTTG-TTG-A-AAATTTATTA---TTTC--A-TACCTTGTG--GG-TCG-CCGG-TT-AAATTTAA-TTTTG-TACC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGCGG-G----TTG-A-T--TAACAATAAA-----------CAA--CAAA----C-AN-A-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TC----AGCATC-C-AT---T--TTTCAGAACGG-AA-GAGCAAT----ACATGCGTG-----T--TG-CG-C---ATGCC-CGAT-A-C--A--AAATC-AATA-T-AAGC--G------G---AGA-T---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----AT--AGA-C-T-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GT--ACAC--AGAC----TA-----GAT-AA---TGTATG-TA-AGCGGGAGA-T---AA-C-T-C--TAAGTA-CATAGACT-A-GATA-AT-GTAG--ATAA-ACAAA-ACAATTTTAT-CATT-TGAAT------TTATTTTATTAAAGG-GC--C-AAT------A-TC---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAG---T---T-TTTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGTT---TT-TGNGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A-CT-TT----AATAAA-TG-A-TT---CTG-------------G-G------G-------GT-------AT-A-ATAC---------AGT---------A---TT-AT---T---A-T-TTTAT--GT-C-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA-A--TA-T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--A-C--TT--TCAA-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAC-G-AAAT----CAAATTTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TT-A--ACA-GG-C---AA-A-CTT-C-CA--ACAA-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---C--T-A-----A-T--CCGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTTT
gi|1 : -AAC--TTT--------A--A-AAAACGAAAC--GTC-A-CT-TTTTAGAATA---TG-A-TTT--CTC-------------G-G------G-------TA-------AT-A-ATAC---------AGTTAC------A---TT-AT---TC--A-T-TTCAT--TTTC-GA--------T----TCGTTTTTG--ATAGTAAATA--TA-T---GA--CTATTCC----AGTG--C-A-T-TC---TCGA-AAT-A-TCG----C-T-T---AT--A-A--TT--TCAA-AG-A--TC------ATAA---CTG-A----------TAT-----AT-------ATGTTTCAAAA--CT-TCT-AC-AGG-AC-TG-TT-A------TT-ATCACA-GG-C---AA-C-CTT-C-----AGAA-T-GA-AA--GC-T--C-AT--TC---A--TA---CTTT-AAT---A-T--CCAA-TA-GC-GTCGCA-AT-GGACGGGCA-CTTTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTCT
gi|1 : aactgtcttatgtatcgttcatagtaaggtatttaccttttacattgcatttattacagctttaaaatatcctcaaacgttaaccaaaatcctaggagcacacaattacacaccgccattactgaacagggtcaaccgtgaactaAAAAAT-AA---TG-T-A----T-GGGG--------GG-------------TCGG----A--AGG-CTACT---TTTT-------T----C--AACGC---CACCACCCAT--TA-A-AATT-TTATtttatgttaactgttgaggctgccaaaatagttaaacggaatttaacggtgaacgagcatttcccacaaactaacattactcaactgaactttactacattaaaattttcacatttcccagtgcatgcaaattccagcttcaaaaatgctgtcccatgtatcatgaaagggtctatttcgaaaccctagcatatatttcatcttttcacagacattttcagtgagagagaaggattaaggcaatgaagtcatgtaaatcaaatataaatagttctatgcaggtatcgaaaaaatcttacttaaaccaatttttgtaaatgaccatgtatatggtaaccatatttctcgatttctgcatcttccttgtatgattctataatgaaccatcgagatagaatactgttttctgaatccagcttttacagtttgaggcatcaacacaatacagtaatagaaagctccacatgtcacattgctccagagctgaaaacaattgttaataaagcagaccaagatcctttaaaaaaaatttaattttatgcatgtaccatttcaacaaattgatattatttctcgttgtgggtattttctctaataaaattttaatgggtggtggcgttgaaaaaagtagccttccgaccccccatacattatttttc
gi|10 : aactgtcttatgtatcgttcatagtaaggtatttaccttttacattgcatttattacagctttaaaatatcctcaaacgttaaccaaaatcctaggagcacacaattacacaccgccattactgaacagggtcaaccgtgaactaaactttaaaaaacgaaacgtcactttttagaatatgatttctcgggtaataatacagttacattattcatttcattttcgattcgtttttgatagtaaatatatgactattccagtgcattctcgaaatatcgcttataatttcaaagatcataactgatatatatgtttcaaaacttctacaggactgttattatcacaggcaaccttcagaatgaaagctcattcatactttaatatccaatagcgtcgcaatggacgggcactttggttaccatagacctcttttatgttaactgttgaggctgccaaaatagttaaacggaatttaacggtgaacgagcatttcccacaaactaacattactcaactgaactttactacattaaaattttcacatttcccagtgcatgcaaattccagcttcaaaaatgctgtcccatgtatcatgaaagggtctatttcgaaaccctagcatatatttcatcttttcacagacattttcagtgagagagaaggattaaggcaatgaagtcatgtaaatcaaatataaatagttctatgcaggtatcgaaaaaatcttacttaaaccaatttttgtaaatgaccatgtatatggtaaccatatttctcgatttctgcatcttccttgtatgattctataatgaaccatcgagatagaatactgttttctgaatccagcttttacagtttgaggcatcaacacaatacagtaatagaaagctccacatgtcacattgctccagagctgaaaacaattgttaataaagcagaccaagatcctttaaaaaaaatttaattttatgcatgtaccatttcaacaaattgatattatttctcgttgtgggtattttctctaT-CCATGAAC-AA---TG-T-A----CTGGGG-------GGG-------------TCGG----A--AGGCC-ACTTT-TTTT-------C----C--AAC-CACGCACCACA--T--TA-A-AATT-TTATc
gi|11 : ataatgacccttttccaagcacaatcagtaactatactacttcaactgactttcttgggcattaaatattttcagatgtcccatcatgcaattccagcttaaaaaaatgctgtcccagttatcgagtgaaggcgtcgtattgaagacaaccgctagctatacattttatctttacacatttctcaaggagatgagaagagattattttttaagaagcaatgaggtcattgtaatcggaataggtaatgagttctagcagggaatatgcggataaaaatctttatgagggaaccattttttggtaaacgacatggtaataacgatggtaaccgatatttctcgttgtctaggaacatctcagttgataaatgattctattaagaccatagaagaatactgtttttgctgaactccagcttctgagactattgaagcatcaacatacatgataaagagctccacatgtcacattgctccgagctgaagaacacaaaaatggttaaaaagaagccaaatccttcactatcaaatcttttattaattttatgcatggcaccatttcaacaaaattatattttccttcattgtgggtaaattttctaT-CCATGAAC-AA---TG-T-A----CTGGGG-------GGG-------------TCGG----A--AGGCC-ACTTT-TTTT-------C----C--AAC-CACGCACCACA--T--TA-A-AATT-TTATtatgg
gi|12 : ataatgacccttttccaagcacaatcagtaactatactacttcaactgactttcttgggcattaaatattttcagatgtcccatcatgcaattccagcttaaaaaaatgctgtcccagttatcgagtgaaggcgtcgtattgaagacaaccgctagctatacattttatctttacacatttctcaaggagatgagaagagattattttttaagaagcaatgaggtcattgtaatcggaataggtaatgagttctagcagggaatatgcggataaaaatctttatgagggaaccattttttggtaaacgacatggtaataacgatggtaaccgatatttctcgttgtctaggaacatctcagttgataaatgattctattaagaccatagaagaatactgtttttgctgaactccagcttctgagactattgaagcatcaacatacatgataaagagctccacatgtcacattgctccgagctgaagaacacaaaaatggttaaaaagaagccaaatccttcactatcaaatcttttattaattttatgcatggcaccatttcaacaaaattatattttccttcattgtgggtaaattttctaT-CCATGAAC-AA---TG-T-A----CTGGGG-------GGG-------------TCGG----A--AGGCC-ACTTT-TTTT-------C----C--AAC-CACGCACCACA--T--TA-A-AATT-TTATtatgg
gi|13 : ataatgacccttttccaagcacaatcagtaactatactacttcaactgactttcttgggcattaaatattttcagatgtcccatcatgcaattccagcttaaaaaaatgctgtcccagttatcgagtgaaggcgtcgtattgaagacaaccgctagctatacattttatctttacacatttctcaaggagatgagaagagattattttttaagaagcaatgaggtcattgtaatcggaataggtaatgagttctagcagggaatatgcggataaaaatctttatgagggaaccattttttggtaaacgacatggtaataacgatggtaaccgatatttctcgttgtctaggaacatctcagttgataaatgattctattaagaccatagaagaatactgtttttgctgaactccagcttctgagactattgaagcatcaacatacatgataaagagctccacatgtcacattgctccgagctgaagaacacaaaaatggttaaaaagaagccaaatccttcactatcaaatcttttattaattttatgcatggcaccatttcaacaaaattatattttccttcattgtgggtaaattttctaCGTGAAA-T---AG-A-T-C--TCA-TA-TATAAACT-----CA-AT-TT----------CAGG-GCAATTTT---CATTGTGAATACCAAGTTATT--ATTAAGGGCGCTTC-AATCATGGAA-TCTTAA--G--AT---T---AAGGCAATTTCTTCGCACAGGGG-ATAACAGCATAG-CCA-TT-TAGGTG---T--CAGGGAT---TATGTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGGT---TTATGCGTCTTTTT-TAC--TTTCTACATGGA--C-ACA-C-AAACATGTC-A-CTGGT----AAT-AA-TG-A-TTTGCCTGCCGTCGGATGTTCG-G------G-------GA-------AT-A-ATACAG-------AGTCTCACTTGGA---TTAAT---T---G-TGTCTAT--GT-C-AAACTGACTGT----T------TAATAT-GTAAA-AGCTA-T---AA--TT--tatgg
gi|13 : aactctactaaattacaggtactatggcgaatcaAT-TC-----GA-T-TTA-T-G----C-T-TTCTAG--A-C--TTAGTAAA-AA-AAATC--TT-CACAATAGCAG-ATCAACCTGCATACAG-TAATATTCCAATTTCTTAAAAA--ATATAT-AC-AGGGATGTG-TT-AC-AAACTT-A--GGA-GGGC---AA-A-CTT-C--A--ACAA-C-TG-AT--GCTA--T-TT--TC---AGTTA---CA-T-AGATCGA-T--CAGATTGTGCGA--GCT-AGCGAAT-TGCA-C-TAG-GTTCACAC-GAA-GACCTggtattaaactaatcatacgggttgagtgcagtccacgctcattcgatttatgctttctagacttagtaaaaaaaatcttcacaatagcagatcaacctgcatacagtaatattccaatttcttaaaaaatatatacagggatgtgttacaaacttaggagggcaaacttcaacaactgatgctattttcagttacatagatcgatcagattgtgcgagctagcgaattgcactaggttcacacgaagacctatttcaatgagaatgacttgcgaggcttc
gi|14 : aactctactaaattacaggtactatggcgaatcacgtgaaatagatctcatatataaactcaatttcagggcaattttcattgtgaataccaagttattattaagggcgcttcaatcatggaatcttaagattaaggcaatttcttcgcacaggggataacagcatagccatttaggtgtcagggattatgttttttacagatctggtttatgcgtcttttttactttctacatggacacacaaacatgtcactggtaataatgatttgcctgccgtcggatgttcggggaataatacagagtctcacttggattaattgtgtctatgtcaaactgactgtttaatatgtaaaagctataattggtattaaactaatcatacgggttgagtgcagtccacgctcGCTA-TT-CCAGAAATTGA-A-TG-T-A----C-GGGG-------GGG-------------TCG--------CGG-C-A--------T-------T----C--AA---------------T--TA-A-TATT-TTATGCT-TGGTTGTTG-TTGAA-AAATTTATTAAATTTCC--A-TACCTTG-G--GG-TCG-CCGGTTT-AAATTTAA-TTTTG--ACC-TGGT-GGGTATTGATGT-AATT--T-G-TGCGT---GTT-TACC-----GCAAGG--AATGGCGG-G----TAGAA-TTATAACAATAAA-----------CAA--CAAA----A-AC-ACGC--AGCAC-A--TG-CCTTTTCACTT-TCCTCAGGCATC-C-AT---TAAATTCAGAACGGTAA-GAGCAAT----ACATGCGTGTGAAAT--TGCCGTC---ATGCCTCGAT-A-C--AGTATATC-AATATT-AAGCG-G------G---AGA-T---AACTTCT-CCACA--------GTAAAC----AT--AGATC-T-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-C-GGAG--AT---A---ACT-CT-AA--atttcaatgagaatgacttgcgaggcttc
gi|15 : aggGCTA-TT-CCAGAAAT-AA-A-TG-T-A----T-GGGG-------AGG-------------TCGG----A--AGG-C-AC----TTTTTTC----C----C--AAC-C---CACCAC---CCATA-A-AATT-TCAT
gi|16 : aaccatttttgtaaaagacatgtatatggaaaccatatttcccttagtttctgcatcttccataatgatcatagaagaatactgattttctgaactccagcttttacacttgaagcatcaacatacatacaaaagtccacacatcacattgctctgagatgaaaacaaaagggctaaaaaaaaacacccaaatccttaactatcaaatttttttaattttatgcatggcaccatataaaacaaattatattttcttcattgtggggtattttctaaT-GTAG--ATAA-CCAAA-ACAATTTTAT-CATT-TGAAT------TTGTTGTAGTA---G-GC--C-AAT------A-TC---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATCG-CCA-TT-TAG--G---T--CAA---TATTT-TTTTTTTT-------T-CA----GA--T-CTGTT---TT-TTT-TTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A-CT-TT----CATAAA-TG-A-TT---CTA-------------G-G------G-------TA-------AT-A-ATAC---------AGT---------A---TT-AT---T---A-T-TTTA---GT-C-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA----TA-T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--A-A--TT--TCAA-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAC-C-AAAT----CCAATTTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TT-
gi|17 : gTA-TT-CCA---AC-AT-A-TG-T------T-GGGG-------GGG-------------TCG-----A--AGG-C-AC----TTTTTTT----C----C--AAC-C---CACCAC---CCATA-A-AATT-TTAT
gi|18 : tctcgtttctgcatcttccattgtatgattcctataatgaccatagaagaatactgtttttctgaactccagttttacatttgaagcatcaacaaacatacaaaagctcacatgccacattgctccgagctgaaaacaaaatggttaaaaagaaccatttcgttcactatcaaaattttttaattttatgcatggcaccatttcaacaaattatatttcttcaattgtggggtattttcttaAA-TG-A-TTT--CTG-------------GTG------G-------GT-------AT-T-ATACTAATAACTAGGT---------A---TTTATGTAT---A-T-TGTAT--GTTC-AA--------TC---T------TA--ATCGTAAA-T--TG-TTCTGA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T---A-T-GAGTTCAT-T---AAGTA-CCTTT--TCAATAA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAC-G-AAAT----CAAATTTTTAAAAA--C--T-T-AC-A-G-AT-TGTTT-AC-A----T-A--ACA-GG-C---AC-A-CTT-C-CA--ACAA-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---C--T-A-----ATT--CTGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-G-T-AC-C-ATA-GACTTT
gi|19 : GT-ATTTATC-G-TGCGT---GA--TACCAAGGAGCA--G--AAGGTCGA-GAGAGTTG-A-A--TAACAATAAAAGTAAGAAAAACAAAACAAA----C-AAGA-GC--AGC-C-A--TG-C---TTCA-----G----AGCATC-TAATATAT--ATGCAAAACGG-AA-AAGC-AC----ACAAGA-----------TG-AG-C---A------GAT-G-T--A--GGGTC--CCA-T---GC--T------GTCTATA-T---GA---CA-CTA-C--------G---AA----AA--AGA-T-C-AAA----T-AT----------A-AATA-CA-AGTCGGAAGGAAT---A---ACT-CTAAA--GT--A
gi|2 : TT-AAC--TTT--------A--A-AA--C-AAAC--GTA-A-CC-TG----TATAAAATG-AGTT---CTC-------------G-G------G-------TA-------AT-A-ATAC---------AGT---------ACATTT-CT---T---A-T-TTCAT--GT-C-AA--------TCGTTT------TA--AT-GTAAA-A--TAAT---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TCGA-T-T-G---G----C-TAT---AA--A----TG--CCAA-AA-A-------T-CATGC---C---A--AAC-----TAT-GCAAAT----AATATGTTTCAAAA--CT-T-T-ACAAGG-AC-TG-TT-AT-A---TT-C--ACA-GG-C----A-A-CTT-C-CA--GCAA-C-TGAATAAGCTC--A-TT--TC---GTTTA---CTTT-AAT---A-T--CCAACTA-GC-T--GCA-A--GGAT-GGCA-C-TT--GTT-AC-C-AT--GACCTTTttatattaatatgactag
gi|2 : actgtctatattgttcaggataaggtatttacctttacatgccatatttaacagctttcagaatatcctcgaacgtaccaaaaaattcacacgccatactgaagggtcactgtgacGAAAT-AA---TG-T-A----T-GGGG-------G---------------TCGA----G--AGG-C-AT----TTTT-------T----T--CAC-C---CACCACCCAT--TA-A-AATTCTTATtatgttactgtgaggcttccaaagtttaaacggaatatagtggataacgacgcatttcccacaacatgaacattactcaactgacctttcttacttaaaattttcacttcccattcatcagattctgcttcaaaaatgctgtccagttatctatgaaagggtctatttagcaaccctagctatatttcatctttacacattttctcaggagagagagaagattaatatttagagcaatgagtcataatcaaataaataatatatctagaggtatgaaaacaatctttaaaaacatttttgtaaaacacatgtatatgtaaccattatttctcgtttctgcctcttcattttgattctataagaccaagaagaaatacgttttcttgactccagcttttacccattgaagcatcaaaatacatcaaaagctccacatgccacattgcttccgagctgaaaaaaatggtaaaaagagaccatttcgtttcactacgaaatcttttgtaattgttgagcatggcaccaattcaacaattgtatttcttcattgtgggtatttctcttaataagaattttaatgggtggtgggtgaaaaaaatgcctctcgacccccatacattatttc
gi|20 : actgtctatattgttcaggataaggtatttacctttacatgccatatttaacagctttcagaatatcctcgaacgtaccaaaaaattcacacgccatactgaagggtcactgtgacttaactttaaaacaaacgtaacctgtataaaatgagttctcgggtaataatacagtacatttcttatttcatgtcaatcgttttaatgtaaaataatgacttccagtggcaattctcgattggctataaatgccaaaaatcatgccaaactatgcaaataatatgtttcaaaactttacaaggactgttatattcacaggcaacttccagcaactgaataagctcatttcgtttactttaatatccaactagctgcaaggatggcacttgttaccatgaccttttatgttactgtgaggcttccaaagtttaaacggaatatagtggataacgacgcatttcccacaacatgaacattactcaactgacctttcttacttaaaattttcacttcccattcatcagattctgcttcaaaaatgctgtccagttatctatgaaagggtctatttagcaaccctagctatatttcatctttacacattttctcaggagagagagaagattaatatttagagcaatgagtcataatcaaataaataatatatctagaggtatgaaaacaatctttaaaaacatttttgtaaaacacatgtatatgtaaccattatttctcgtttctgcctcttcattttgattctataagaccaagaagaaatacgttttcttgactccagcttttacccattgaagcatcaaaatacatcaaaagctccacatgccacattgcttccgagctgaaaaaaatggtaaaaagagaccatttcgtttcactacgaaatcttttgtaattgttgagcatggcaccaattcaacaattgtatttcttcattgtgggtatttctcttaCTA-TT-CCAGAAAT-AA-A-TG-T-A----T---GG-------GGG-------------TCGGA---A--AGG-CAAC----TTTTTTTATC-C----C--AAC-C---CACCAC---CCATA-A-AATT-TTAT
gi|21 : atcattttttttattttagcatgcaccattttacaacaaattatatatttttttttttttttttttgtttttttcttcgtttgtggggtttttctta-TT-CCAGAAAT-AA-A-TA-T-G----T-ATGG-------GGG-------------TCGG----AGTAGG-C-ACTTT-TTTT-------C----C--AAC-C---CACCAC---CCATA-A-AATT-TTAT
gi|22 : aatttttttatttatgtttaatgcatgggctaccatttacaactaattagtaattttcttcgttgtgggtttttctaaGCTAGCC-CCAGAAAT-AA-A-TG-T-A----G-GGGG-------GGGGGGGTGTGTGGTGTTGG----A--AG--C-AC----TTTT-------TTTTTC--AAA-C---CACCAC---CCATA-A-AATT-T
gi|23 : tttatttttggagggggattttcaacaaattaatattttcttcgttgtggggtattttctacttGCTA-TT-CCAGAAAT-AA-A-TG-T-A----T--GGG-------GGG-------------TCGG----A--AGG-C-AC----TTTTTATTTTCC----C--AA--C---CACCAC---CA-TA-A-AATT-T
gi|24 : tttttttttttattttatgcatggcacatttacaacatatttaatattttcttcgttggggttttctaaatA-TT-C---AAAT-AA-AATG-T-A----T-GGGA-------GG--------------TCGG----A--AGG-C-ACTTTTTTTT-------C----CCAAAC-C---CACCAC---A--TA-ATAAAT-TTAT
gi|25 : gcatcgggcacaatttgagcaggagcgagatggggtatattttcttcgttggtgggtttttctaa-A-TG-T-A----T-GGGG-------GGGG------------TCG-----A--AGG-C-AC----TTTTTTTC---C----C--AAC-C---CACCAC---C--CATA-AATT-TTATgt
gi|28 : caatttttttttattttatgcatggcaccatttacaacaaattatattcttcgttgtggggtttttctaa-AAAT----CAAATTTTTCAAAA--CT-T-T-AC-AGG-TT-TG-TT-AT-A---TT-T--ACA-GG-C---AA-A-TTT-C-CA--ACAA-
gi|29 : cGCTA-TT-CCAGCAAA-AA-A-CT-T------C-TGGG-------GGG-------------TGGG----A--AGG-C-AG----TT
gi|3 : aatatcGCTA-TTTCCAGAAAT-GA-A-TG-T-A----C-GGGGACTTGTGGGG-------------TCGG----AC-GGG-C-AC----TTAT-------A----C--AA----------A----T--TA-A-AATT-TTATGCCATGGTTG-TG-TTG-A-AAATTTATTA---TTTC--ATTACCTGTTG--GGCTCGCCCGG-TT-AAATTTAA-TTTTGTTACCTTGGTGGGGTACTGATGTAATTT--T-GTTGCGTCTAGTTTTACC-----GCA--GGCGATGGC-G-G----TTG-A-T--TAACAATAAAAC---------TAA--CAAGGATTC-AA-A-GCTTAGC-C-GACTGTC--TTCTACTT-T-----GG------------------CAGAACGG--A-GAGCAAT----A-ATGC-TG-----T--TG-CG-CTAAATGCC-CGAT-A-CAGA--GAATC-AATA-TAAAGC--GAAGGGAG---AGA-T---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----ATAAAGA-C-TGAGA----TAAT----------G-TATA-TA-AA-CGGCCG-------------T-CC-AA--G---------AGAT----TAGGGCCGAT-AA---TGTATACTACAGCGGGAGA-TGGAGA-C-TAC--TGA-TAGTTTACACTCA-GGCA-CC-ATAG--ATAA-ACAcctcat
gi|3 : tagGA----TAAT----------G-TATACTACAG-CGGGAG--AT---GGAGACTACT-GATAGTTTACACTCAGGCACCATA-----GAT-AAACATGTATG--A-AGCGGGAGA-T---AA-C-T-CCCTATGCA-CATAGACT-A-GATATAG-GTACTTATAA-ACAAA-ACAATTTTATGCATT--GAAT------TTATTTTATGAAAGG--C--C-AAT------A-TC---ACCA--ATA--TTATAAAAC-ATTTCTT-GAA----GGGA-------ATAG-CCA-TT-TAA--GATGT--CAG---T---TCTTTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGTTGGTTT-TGTATTTTTTTTAACCTTTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A-CT-TT----AATAAA-TG-A-TT---CTG-------------G-G------G-------GT--------T-A-ATA----------------------A---TT------------T-TTTAA--GT-C-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA-AT-TA-T---GA--CT--TCCATGTAGTGG-CAAAT-TCTAATTGA-T-T-A-T-G----C-T-T----A--A-C--TT--TCAA-AA-A--TCGATC-TAT---------A--AAC-----TACGG-AAAT----CAGAATTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGGAAT-TG-TT-ACAA---TT-A--ACA-GG-CAAAAA-A-CTT-C-CAGGACAA-CTTG-AT--GCTTAAT-TT--TC---A--TA---C--T-A-----A-T--CTGA-TG-GC-A--GCTGA--GGAT-TGCACC-TTGCGTT-AC-C-ATAGGACCTTTtgtatgaagcgggagataactccctatgcacatagactagatataggtacttataaacaaaacaattttatgcattgaatttattttatgaaaggccaatatcaccaatattataaaacatttcttgaagggaatagccatttaagatgtcagttcttttttttacagatctgttggttttgtattttttttaaccttttaaaaacaaacgtcactttaataaatgattctgggggttaataattttttaagtcaatttaatgtaaaattatgacttccatgtagtggcaaattctaattgattatgcttaactttcaaaaatcgatctataaactacggaaatcagaattttaaaaactttacaggaattgttacaattaacaggcaaaaaacttccaggacaacttgatgcttaattttcatactaatctgatggcagctgaggattgcaccttgcgttaccataggaccttttttatgtttaactgcgagc
gi|4 : taggctatttccagaaatgaatgtacggggacttgtggggtcggacgggcacttatacaaattaaaattttatgccatggttgtgttgaaaatttattatttcattacctgttgggctcgcccggttaaatttaattttgttaccttggtggggtactgatgtaattttgttgcgtctagttttaccgcaggcgatggcggttgattaacaataaaactaacaaggattcaaagcttagccgactgtcttctactttggcagaacggagagcaataatgctgttgcgctaaatgcccgatacagagaatcaatataaagcgaagggagagataactctaagtacataaagactgagataatgtatataaacggccgtccaagagattagggccTA-TT-CCAGAAAT-GAGA-TG-T-AACGGC-GGGG-------GGGGGG----------TCGG----A--CGG-C-AC----T---------------C--AA---------------T--TA-A-A--T-TTATGCT-TGGTTGTTG-TTG-A-AAATTTATTT---TTTCC-A-TACCTTGTGTGGG-TC---CGG-TTGAAATTTA---TTTG-T-CC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--TTG-TGTGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGCGG-GCT--TTG-A-T--TAACA-TAAA-----------CAA--CAAA----C-AG-C-GC--AGC-CCA--TG-C--TTTCACTT-TC----CGCATC-C-AT---T--TTTCAGAACGG-AATGAGCAACTTGAACATTCGTG-----TATTG-CG-C---ATGCC-CGATCA-C--A--AAATCCAATA-T-AAGCCGG------G---AGA-TTAGAA---CTTCTA-ACTAGCGGGAT--ACCTCAAT--A-A-C-G-AGAGTACTAATACATGTATTAG-TATA-CA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-A---GT---CAA--TGAC----T------GAT-AAA--TGTATAATA-AGCGGGAGAGT---AAAC-T-C--TAAGTA-ATTAGACT-AAGATA-ATCGTAG--ATAACACAAA-ACAATTTTAT-CATT-TGAAT------TTATTT-ATTAAAGG-GC--CCAAT------A-TC---A--ACAGTA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------TAAG-CCAATT-TAG--G---T--CAG---T---C-TTTTTTTTTTTTTCCA-GA----GA--T-CTGTT---TT-GGCGTTTTTTA-AAC--TTT--------ATAA-AAA-C-AA-C--GTC-A-CT-TG----ACTAAA-TG-A-TTT--CTG-------------G-G------GCCATGGGGT-------AT-ATATAC---------AGT---------A---TT-AT---T---AAT-TCTAT--GT-CCAA--------T----T------TA--AT-GTAAA-A---A-T---AATGCT--TCC----AGTGGGC-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--AAC--TT--TCAA-AAAA--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAA-G-AAAT----CAAA-TTTCAAAAA--CT-T-TAAC-AGG-AT-TGTTT-AA-A---TT-A--ACA-GG-C---AA-ATTTT-C-CA--ACAA-G-TG-AT--GTTT--T-TCAATA---A--TA---T--TAA-----A-T--CTGAGTG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTtttatgtttaactgcgagc
gi|5 : agggctGCTA-TT-CCAGAAAT-GA-A-TG-TTA----C-GGGG-------GG--------------TCGG----A--CGG-C-AC----TT--------------C--AA---------------T--TA-A-AATT-TTATGCT-TGGTTGTTG-TTG-AGAAAATTAT-A---TTTC--A-TACCTTGTG--GG-TCGGCCGG-TT-AAATT-AA-TTTTG-TACC-TG-T-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---T-CC-----GCA--G--GATGGCGA-G----TTG-A-T--TAACAATAAA-----------CAA--CAAA----C-AC-A-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TC----AGCGTC-T-AT---T--TTTCAGAACGG-AA-GAACAAT----ACATGCGTG-----T--TG-CG-C---ATGTC-C-AT-A-C--A--AAATC-AATA-C-AAGC--G------GG--AGA-A---TA---CT-CTA-A--------G---AC----A-------------A----TAAT----------GATAT--TA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GT--ACAT--AGAC----TA-----GA--AA---TATATG-TT-AGCGG-AGA-T---AA-CAT-C--TA-GTA-CATAGACT-A-GATA-AT-GTAG--ATAA-ACAAA-ACAATTT-AT-CATT-TGAAT------TT-TTTTATTAAAGG-GC--C-AAT------A-TC---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAG---T---T-TTTTTTTT-------AACA----GA--T-CTGTT---TT--GGGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GCC-A-CT-TT----AATAAA-TG-A-T----CTG-------------G-G------A--------T-------ATTA-ATAC---------A-T---------A---TT-AT---T---AAT-TTCAT--GT-G-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA-A--TA-T---GA--CT--TC-----AGTG--C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-C-T---TA--A-C--TT--C--A-AA-A--TC--TT-CATAA---CAGAA--AAC-----TAT-G-AAAT----CAAA-TTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TT-A--ACA-GA-C---AA-A-CTT-C-CA--ACAA-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---C--T-A-----A-T--CTGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-A--C-ATA-GACCTTTatt
gi|6 : tagTACAAA--CT-T-T-AC-AGG-ACGTG-TT-AT-A---TT-C--ACA-GG------A-A-CTT-CTCA--GCAG-C-TG-AA--G--T--C-AT--TC---A--TACTTC--T-A-----A-TACCCAA-TT-GC-T--GCA-A--GG-T-T-CA---TTG-GTT-AC-C-TAA-GACCTTTtaattataatgcgagct
gi|6 : aacgaacaagagcacataaGAAAT-AA-G--G-T--------GGGG-------GGG-------------TCGGTGCGA--AGG-CCAC----TTTTTTTTTC-C----C--CAC-C---CACCAC---C--CC-A-AATT-TTATtatttaatctggtgaggctcccaaaaggtaaaatggaattaagtggaaagcagccatttcccacaactacattcactcaactgactttgtcttaccggtacattcccattcatgcaattccacttcaaaaatgctgtccagtgttcgatgaaaggtcattgagaacctactaattcggatctgtttacaacatttcgactgagatagagaagaggaagacgtcaagatgagctatgtaagatcatcttctataagcatggaagtaaactgaggtatagcgcgaataatggtcgcgacacaattaatcaaaagttacagagcattgttggtaaacacatgtataggtaagcaatttcgttctgcatcttccatggtaatgatgtctctaatgcataagacggacaaaaaacgcaccccttgggggggtagattggcgaaccccagcttacaaatgcggaaagcatcaaatcagtacaaaagctccacatgtcacattgcgcagctgaaaacaaaatggtaaaaagaagccaaatccttcacggatcaatttttaatttatgcatggcaccttcaacaaattatttctcgtttgggctttttcttataaaatttggggtggtgggtggggaaaaaaaaagtggccttcgcaccgacccccccaccttatttcgat
gi|7 : aacgaacaagagcacataatacaaactttacaggacgtgttatattcacaggaacttctcagcagctgaagtcattcatacttctaatacccaattgctgcaaggttcattggttacctaagaccttttatttaatctggtgaggctcccaaaaggtaaaatggaattaagtggaaagcagccatttcccacaactacattcactcaactgactttgtcttaccggtacattcccattcatgcaattccacttcaaaaatgctgtccagtgttcgatgaaaggtcattgagaacctactaattcggatctgtttacaacatttcgactgagatagagaagaggaagacgtcaagatgagctatgtaagatcatcttctataagcatggaagtaaactgaggtatagcgcgaataatggtcgcgacacaattaatcaaaagttacagagcattgttggtaaacacatgtataggtaagcaatttcgttctgcatcttccatggtaatgatgtctctaatgcataagacggacaaaaaacgcaccccttgggggggtagattggcgaaccccagcttacaaatgcggaaagcatcaaatcagtacaaaagctccacatgtcacattgcgcagctgaaaacaaaatggtaaaaagaagccaaatccttcacggatcaatttttaatttatgcatggcaccttcaacaaattatttctcgtttgggctttttcttGCTA-TT-CCAGAAA---A-A-TGAT-A----C-GGGG-------G---------------TCGG----A--CGG-C-AC----TTT-------------C--AA---------------T--TA-A-A-TT-TTATGCT-TG--TGTTG-TTG-A-AAATTTATTA---TTTTCAA-TACCTTGTG--T--TCG-CCGG-TTTAAATTTAA-TTT-G--ACC-TGGG-GGGTTTTGATGT-ATTT--T-G-GGCGTT--G---TACC-----GCA--G--GAATGCGGTG----TTG-A-GA-TAACAATAAA-----------CAA--CCAA----C-AC-A-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTTGTC----AGCATCTT-AT---T--TCTCAGAACGGCAA-GAGCAAT----ACATGGTTG-----T--TG-GC-C---ATGTC-CGAT-ACC--A--AAATC-AATA-C-AAGC---------G---AGATT---AA---CT-CT--A--------GT--AC----AT--TGA-CTT-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGGAG--ATTTAA---ACT-CG-AA--GT--ACA---AGAC----TA-----GAT-AA---TGT-------------AGA-T---AA-------------A-CATAAAC-------A-AT-TT----AT----CA--------TTTGT--ATT-T--AT------T----TTATTAAAAG-G---C-AAT------ATTC---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA-----G-A-------ATAGTCCA-TTCTAG--G---TCCCAGT--T---T-TTTTTTTT-------A-CA----GAACT-CTG-T---TT-TGGATTTGTTT-AAC---TT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTCTA-CT-TT----AATAAA-TG-A-TT---CTG-------------A-AATACACG-------GTA------AT-A-ATAC---------AGT---------A---TT--T---TAACA-A-TATAT--GT-C-AA-------------T------TA--AT-GTAAA-A--TA-T---GA--CT--TCC----CATGG-CAAATATC---TTGACT-T-ACT-GA---C-T-TA--AA--A-C--TT--TCCA-AA-T--TC--TTCCATAA---CAG----AAC-----TAC-GAAAAT----CAAATTTTTAAAA----C-T-T-AC-AGG-A--TG-TTAAC-A---TT-A--ACAGGG-C---AAGA-CTTCC-CA--ACAATC-TG-AT--GCTT--TATT--TC---A--TA---C----A-----A-T--CTGA-TG-GC-A---CT----GGAT-TGCA-C--TG-GTT-AC-CAATA-G-CCTTTgat
gi|8 : taggGCTA-TT-CCAGAAAT-GA-A-TG-T-A----C-GGGG-------GGG-------------TCGG----A--CGG-C-AT----T---------------C--AA---------------T--TA-A-AATT-T-ATGCT-TGGTTGCTG-TTG-A-AAATTTATTA---TTTC--A-TACCT-GTG--GG-TCG-CCGG-TT-AAATTTGA-TTTTG-TCCC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGCGG-G----TTG-A-T--TAACAATA-------------CAA--CAAA----C-AC-A-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TC----AGCATC-T-AT---T--TTTCAGAACGG-AA-GAGCAAT----ACATGCGTG-----T--TG-CG-C---ATGTC-CGAT-A-C--A--AAATC-AAT--T-AAGC--G------G---AGA-T---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----AT--AGA-C-T-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGGAG--AT---A---ACT-CT-AA--GT--ACAT--AGAC----TA-----GAT-AA---CGTATG-TA-AGCGGGAGA-T---AA-C-T-C--TAAGTA-CATAGATT-A-GATA-AT-GTAG--AT----------------TA--CATT-TGAAT------TTTATTTATTAAAGG-GC--C-AAT------A-TC---A--A--ATA--T---AAAAC-ATTTCTT-GAA----GG-A-------ATAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAG---T---T-TTTTTTTT-------A-CA----GA--T-CTGTT---TT-TGGGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--A-AAA-C-AAAC--GTC-A--T-TC----ATTAAA-TG-A-TT---CTG-------------G-GTA----G-------AT-------AT-A-ATAC---------AGT---------A---TT-AT---T---A-T-TTTAT--GT-C-AA--------T----T------TA--AT-GTAAA-A--TA-T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-G----C-T-T---AA--A-C--TT--TCAA-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--AAC-----TAT-G-AAAT----CAAATTTTTAAAAA--CT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TT-AC-A---TT-A--ACA-GG-C---AA-A-CTT-C-CA--AC-A-C-TG-AT--GCTT--T-TT--TC---A--TA---C--T-A-----A-T--CTGA-TG-GC-A--GCT-A--GGAT-TGCA-C-TTG-GTT-AC-C-ATA-GACCTTT
gi|9 : GCTA-TT-CCAGAAAT-GA-A-TG-T-A----C--GGG-------GGG-------------TCGG----A--CGGCC-AC----TT--------------C--AA---------------T--TA-A-AATT-TTTGGCT-TGGTTGTTGTTTG-A-AAATTTATTT---TTTC--A-TACCTTGTG--GG-TCG-CCGG-TT-GAATTTAATTTTTG-TACC-TGGT-GGGTATTGATGT-ATTT--T-G-TGCGT---G---TACC-----GCA--G--GATGGC-G-G----TTG-AGT--TAACAATAAA-----------CAA--CAAA----CAAA-A-GC--AGC-C-A--TG-C--TTTCACTT-TC----AGCATC-C-AT---T--TTTCAGAACGG-AA-GAGCAAT----ACATGCGTG-----T--TGTCG-C---ATGCC-CGAT-A-C-----AAATC-AATA-T-AAGCG-G------G---AGA-T---AA---CT-CTA-A--------GT--AC----AT--AGA-C-T-AGA----TAAT----------G-TATA-TA-AG-CGGG-G--AT---A---ACT-CT-AA--GT---TAC--AGAC----TA-----GATAAA---TGTAGA-TA-AAC
gi|9 : ATA-TA-AGCGGGAGA-T---AA-C-T-C--TAAGTA-CATAGACT-A-GATA-AT-GTAT--ATAA-GCGGGGATAACTCTA---AGT-TACAG-------------ACTA---G-AT--A-AAT------G-T----A--G--ATAAAC---AAAAC-ATTTCTTTGAA----GA-A-------CTAG-CCA-TT-TAG--G---T--CAG---T---T-TTTTTTTT-------A-CACACCGA--TCCTGTT---TT-GCGGTTTTTTT-AAC--TTT--------A--ACAAA-C--AAC--GTC-AGCT-TT----GAT-AA-TGAA-TT---CTG-------------G-G------G-------GCCAGGGTAAT-A-ATACA--------AGT---------AT--TT-AT---TA--A-T-TCTATGGGT-C--A--------T----T------TA--AT-GTAAA-A--T--T---GA--CT--TCC----AGTGG-C-AAT-TC---TTGA-T-T-A-T-GC---C-T-T---AA--A-CG-TT--TC-A-AA-A--TC--TT-CATAA---CAG-A--A-------CAA-G-AAAT----CAAATTTTTAAAAAACTT-T-T-AC-AGG-AT-TG-TTAAC-A---TTAA--ACAGGG-C---AA-A-TTT-C-CA--ACAG---TG-ATC-GATT--T-TT--TCATAA--TA---T--T-A-----A-T--CTGA-TG-GC-A--GCT-A---GATATGCA-C--TG-GTT-AC-C-ATA-GACCTTTaaaacatttctttgaagaactagccatttaggtcagttttttttttacacaccgatcctgttttgcggtttttttaactttaacaaacaacgtcagctttgataatgaattctgggggccagggtaataatacaagtatttattaattctatgggtcatttaatgtaaaattgacttccagtggcaattcttgattatgccttaaacgtttcaaaatcttcataacagaacaagaaatcaaatttttaaaaaacttttacaggattgttaacattaaacagggcaaatttccaacagtgatcgattttttcataatattaatctgatggcagctagatatgcactggttaccatagacctttcatgttaactgcgaggtttctaaaatggaaagggga
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): CACAATATACAGCATATTGAGTTTTCTTGGTGGTGGGGATTTTCTGATTTTTTTCCCAAGGAGGGGATCTAAAAATCAGTGGCCTTCTACCCCTCCCAGATAACTTTTACTGGAATAGTCCT
Unaligned ( gi|27 ): ACATGTCACATTGCTCTGAGCTGAAAACAATATGGTTAAAAAGAATCAAATCCTTCACTATCAAATTTTTTTTATTTTATGCATGGCACTATTTCAGCAAATTATATTTTCTTCGTTGTGG
Unaligned ( gi|30 ): ATTTTCACATTCCCAATTAATTCCAGCATAAAAAATGCTGTCCCAGTT