lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 44444444444444 22222222 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 222222222222 222222222 11 11 111
lowQualScore : 88 55555555555555 4 1 3 999999 3 77777777 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 444 2 444 2 5 2 22 4444 4444 2 333 9999999 2 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 5 000000000000 111111111 22 66 0 111 77 2 8
lowQualScore : .. .............. . . . ...... . ........ ........................................................................... ... . ... . . . .. .... .... . ... ....... . ................................................................................................................................................... . ............ ......... .. .. . ... .. . .
lowQualScore : 33 55555555555555 4 8 3 666666 3 00000000 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 444 5 444 1 2 1 99 5555 5555 1 777 4444444 4 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 111111111111 555555555 77 33 8 888 88 2 3
consensus : NNNNAAGCG--TATTGCTGCCAG--CATATTA-TTTTG-TACG-TCGTACGTAC------GA-GAT-ANTT---AAGTCGTA--NATAA-G--A-------N--A--TG--N--TAAGT----C--GT----------T-----------A-T-T--ACGA---GA-TA---AT-ANG-TC--G----T----ACGTACG---AC------A-TA-C--T---AAGT--CG-T-T-NTA-CGAG----ATAA--TA---NGTCGT----ACGCACGAGATAAT---------------AAGT-C-GTACGAAC----GACATA--CAAGAATA---TG--TCGTACGNACGANAT----AT-AAGTC-GT----CNTA----ACGAGATGA---T---AAGTC-GTANNAACGAGATA--TTAAGTCGTAA
Reference ( gi|1 ) : ACATAAGCG--TATTGCTGGCAATTCATATT--TTTTG-TATG-TCGTACGTAC------GA-GAT-AGTT---AAGTCGTA--TATAA-A--A-------A--A--TG--C--TAAGT----C--GC----------T-----------A-T-C--ACGA---GA-TA---AT-ATG-TC--G----T----ACGTACG---AT------A-TA-C--T---AAGT--CG-T-T-TTC-CGAG----ATAA--TA---TGTAGT----ACACACGAAATAAT---------------AAGT-C-GTACGAAT----GACATACTTAAGAATAAACTA--TCGGATGTACGACAT---CAG-AAGTC-GT----TTTA----ACGAGATGA---T---AAGTT-GTATTAACGAGATA--TTAAGTTGAAA
gi|9 : AAGCG--TATTGCTG------C-TATT--TTTGC-TATG-TCGTACGTAC------GA-GAT--GTTTAAAAGTCGTA--TAAAC-G--A-------G--A--TA--CTTTAAGT----C--G-----------T-----------A-CAC--ACGA---GA-TA---AT-
gi|12 : tacggAAGCG--TATTGCTGCCAAAATATATTATTTTTG-TATT-TCGTACGTAC------GA-
gi|11 : acggAGCGAATATTGCTGCCAGTTCAAAATAATTTTGCTATG-TCGTACGTAC------GA-
gi|7 : ggACT--TCTTG-TTTC-TCGTACGTAC------GA-TAT--TTT---ATCTCGT---TATCA-CT-A-------C--A--TA--T--TATTT----C--GT----------T-----------A-T-T--ACGA----C-TT---AT-ATG-TC--G----T----TCGTACG---Ac
gi|10 : acgagatgataagTT--CTTTG--ATAATCGTATGTAC------AA-GGT-ACTT---AAGTCGTA--GGTGC-A--A-------T--A--CA--T--TAAGT----A--GT----------T-----------A-C-C--ACGA---GA-TA---AT-TTG-TC--G----T----TCGTACG---AA------A-TA-cctaagaacgacataataagtcgt
gi|4 : G-TAAG-TCGTACTTAC------GA-GAT-AA-T---ATGTCGTA--TATAT-A--T-------ACGA--TGCAC--TAAGT----C--GCACGAACAACATAATAATTCGTAA-T-T--ATGA---GC-TA---GT-A-G-TC--G----T----ACGAACG---ACATATAGA-TA-C--C---AAGT--CG-TAC-GTA-CGAT----GTAG--CA---AGTCATTCTAACGTACGAGATGAT---------------CAG--C-GTACGAAC----AACGTA
gi|4 : ggata-TACG-TTGTTCGTAC------GCTGAT-CATC------TCGTA--CGTTA-G--A-------ATGACTTG--C--TACAT----C--G-----------T-----------A-CGT--ACGACTTGG-TATCTAT-ATG-TC--G----T----TCGTACG---AC--------TA-C--T---AGCT--CA-TAA-TTA-CGAA----TTAT--TA---TGTTGT----TCGTGCGACTTAGT---------------GCAT-C-GTATATATATACGACATA-TTA---------TC--TCGTAAGTACGACgtaggtcgtaa
gi|7 : ggatagtaa-TAAG-TCGTACGAAC------GA-CAT-A--T---AAGTCGTA---ATAACG--A-------A--A--TA--A--TATGT----A--GT----------G-----------A-T-A--ACGA---GA-TA---AA-ATA-TC--G----T----ACGTACG---AG------A-AA-CAAG---AAGT--C--------C-TAAG----A------------------------ACGACATAAT---------------AAGT-C-GTgtaggtcgtaa
gi|5 : acgagatga-TAAG-TCATACGTAC------GG-GATGAG-----AACTTGTA--ATTAA-ACTA-------T--A--TA--G--CAAGT----C--GT----------A-----------A-T-A--ACGA---G--TA---AT-ATA-TTCAA----T----A---ACG---AT------A-TC-C--T---AAATC-CG-T-TATAA-CGAG----ATAA--TA---AGT
gi|5 : gataacgtcatatttacgacatactACG-TCATATTTAC------GA-CAT-ACTT---AAGTCATA--CGTAC-G--G-------G--A--TG--A--GAACT----T--GT----------A-----------A-T-TAAACTA---TA-TA---GC-AAG-TC--G----TAATAACGAGTA---AT------A-TA-T--T---CAATAACG-A-T-ATC-CTA-------AA--TC---CGT--T----ATA-ACGAGATAAT---------------AAGT-CGGTAGGAAC----Gcggtaggaacggatcttttaaaagtcgcagt
gi|2 : gataG-TCGTATGAAG------AA-GAT-AAT----AAGTCGTA---ATAA-CT-G-------G--A--TG--A--TAATT----C--GT----------A-----------A-T-A--ACGA---GA-TA---AT-AAG-TC--G----T----ANNNNNN---NN------N-NN-N--N---NNNN--NN-N-N-NNN-NNNN----NNNN--NN---NNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAGT-C-GTACGGAC----GAGA----TAAGAA------G--TCGTACGAATGAGAT----AGTAAGTC-GTAATGCATA----ACGAGATCA---T---AAATC-GTAATAACGgatcttttaaaagtcgcagt
gi|6 : G-CCGTATGCACATAAATGA-GAT-AACT---AAGTCGTA--GATAG-A--GCTTAATTA--G--TA--C--TAAGT----CCTGC----------G-----------A------ACAA---GATTA---AT-AAA-TC--G----T----ATGGACG---AC------ATTA-C--TAC-AAGT--CGAA-T-TTA-TGAG-------A--TA---TGTAgaa
gi|8 : aa---AAATCGTACTTGTAA-A--C-------A--A---G-----TAAATATCTC--GT----------T-----------A-T-C--ACGA---GA-TA---AT-AAGTTC--G----T----GCG-ACGAGAAT------A-TATC--T----------G-T-T-TCA-CGAG----ATAA--TA---AGTCGT----GCGCA
gi|10 : --TG--A--TAA-T----C--G-----------T-----------A-TGT--ACAA---GG-TA---CTTAAG-TC--G----T----AGGTGCA---AT------A-CA-T--T---AAGT--AG-T-T-ACCACGAG----ATAA--TT---TGTCGT----TCGTACGAAATA
gi|4 : ttctt--TAAGT----C--G-----------T-----------ACT-T--ACGA---GA-TA---AT-ATG-TC--GTATAT----ATATACG---AT------G-CA-C--T---AAGT--CG-------CACGAACAACATAA--TA---ATTCGT----AATTATGAGCTAGT----------------AGT-C-GTACGAAC----GACATAT---AG-AT--ACCAAGTCGTACGTACGATGT----AGCAAGTC-AT----TCTAACGTACGAGATGA---T---CAG-C-GTACGAACAACGTA--GTAGGTCGTAA
gi|3 : ggatagT----C--GT----------T-----------A-T-T--ACGC---AA-TA---CT-AAG-TC--A----T----AATAACG---AT------A-T------------T--TG-T-A-TGC-C-------ATGA--TA-----------------ACGAAATATC---------------AAGT-A-GTAATAAC----GACATA-TCAAG-ACAAAC-G--TAAGA-----GACAT----AT-A-----------CTTA----ACGGCATAC---T---TAGTC-GTAATAACGATATA--CTGAGTCGTAA
gi|7 : atgataagtcgtaataacgatataaaattctttgatacaaaatatagtaaattgcacgaacgacgtaca--ACGA---GA-TG---AT-AAG-TC--G----T----ACGAACG---AC------A-TA----T---AAGT--CG-T-A-ATAACGAA----ATAA--TA---TGTAGTG---ATA-ACGAGATAAA---------------ATAT-C-GTACGTAC----GAGAAAC--AAGAA------G--TCCTAAGAACGACAT---AAT-AAGTC-GT----
gi|5 : ---GA-TA---AC---G-TC--A----T----ATTTACG---AC------A-TA-C--TT--AAGT--CA-TAC-GTA-CGGG----ATGA--GAACTTGTAAT-----TAAACTATATAGC---------------AAGT-C-GTA---AT----AAC--------GAGTAATATA--TTCAATA-ACGATAT---CCT-AAATCCGT----TATA----ACGAGATAA---T---AAGTCGGTAGGAACG-GATC--TT---TTAAAA
gi|9 : T-ATG-TC--G----T----ACGTACG---AG------A-TG-T--TTAAAAGT--CG-TAT-AAA-CGAG----ATACTTTA---AGTCGT----ACACACGAGATAAT---------------gtcgcagt
gi|9 : tacggaagcgtattgctgctatttttgcT-ATG-TC--G----T----ACGTACG---AG------A-TG-T--TTAAAAGT--CG-T---------------ATAA---------------------ACGAGATACTTT-------------AAGT-C-GTACACAC----GAGATA
gi|11 : tacggaagcgtattgctgctatttttgcT-ATG-TC--G----T----ACGTACG---Aat
gi|11 : ggagcgaatattgctgccagttcaaaataattttgcG-TC--G----T----ACGTACG---AC------A-TAGC--A---AAAT--TA-T-T-TTc
gi|8 : ggagcgaatattgctgccagttcCACGAGATAAT---------------AAGTTC-GTGCGA--------------CGAGAATA---TA--TCTGTTTCACGAGAT---AAT-AAGTC-GT----
gi|9 : aaatcgtacttgtaaacaagtaaatatctcgttatTG--TCGTACGTACGAGATGTTTAA-AAGTC-GT----ATAA----ACGAGAT-ACTTT---AAGTC-GTACACACGAGATA--gcgca
gi|9 : tacggaagcgtattgctgctatttttgcta----ACGAGATGT---TTAAAAGTC-GTATAAACGAGATACTTTAAGTCGat
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): ATAACGAGATCATAAATCGTTATAACGGAAATGAATGAC
Unaligned ( gi|14 ): ATTACGTATGGTGGCATATTTCTGCCATCTAGATAA
Unaligned ( gi|15 ): AATTCATCTTGATTTTTGCTATGTCGAAGGTAC
Unaligned ( gi|16 ): CTGCACATTAATATAATTTATGTCCATACTA
Alignments
lowQualScore : 11 55555555555 22 2 111111 333333333333333333333 111 1111 111111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5555555555555555555 222 111111 1111 2222
lowQualScore : 33 33333333333 55 0 6 666666 1 99 888888888888888888888 44 66 11 333 4 55 1 4 9999 6 0 8 4444 1 5 555555555 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666 6 6666666666666666666 99 9 3 1 888 6 444444 7777 1 1 0 8 22 55 0 1111 1
lowQualScore : .. ........... .. . . ...... . .. ..................... .. .. .. ... . .. . . .... . . . .... . . ......... . ........................................................ . ................... .. . . . ... . ...... .... . . . . .. .. . .... .
lowQualScore : 88 00000000000 55 0 0 444444 0 22 111111111111111111111 11 99 44 999 0 55 0 4 4444 0 3 9 1111 4 0 222222222 0 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 3333333333333333333 22 3 3 0 333 7 888888 0000 4 0 8 0 00 88 8 2222 2
consensus : NNNNAAGCG--TATTGCTGCC--AA--T---ATATTA-TTTTGCTATGTCGTACGTAC------GAGATANTT--AAGTCGTANATA--A--G-A--------NATANTAAGTC--GTTAT-CACGAGA-TA--ATANGT-CG----TACGNACGACA-TACT--AAGTC-G-T-TNT-A-CGAGATAATAAGTC---------------GTA--CGC-------ACGAGATAGC---------------AAGTCGTACGAACGACATA-C--AAGA-ATA---T---GTC--GTACGAACGACAT-A-TAAGTC-GT----TNTA----ACGAGATGATAAGTC-GTANTAACGANATATT----AAGTCGTAA
Reference ( family-699 ) : NNNNAAGCG--TATTGCTGCC--AG--C---ATATTA-TTTTG-TACGTCGTACGTAC------GAGATANTT--AAGTCGTANATA--A--G-A--------NATGNTAAGTC--GTTAT-TACGAGA-TA--ATANGT-CG----TACGTACGACA-TACT--AAGTC-G-T-TNT-A-CGAGATAATANGTC---------------GTA--CGC-------ACGAGATAAT---------------AAGTCGTACGAACGACATA-C--AAGA-ATA---T---GTC--GTACGNACGANAT-A-TAAGTC-GT----CNTA----ACGAGATGATAAGTC-GTANNAACGAGATATT----AAGTCGTAA
gi|1 : AAGCG--TATTGCTGGC--AATTC---ATATT--TTTTG-TATGTCGTACGTAC------GAGATAGTT--AAGTCGTATATA--A--A-A--------AATGCTAAGTC--GCTAT-CACGAGA-TA--ATATGT-CG----TACGTACGATA-TACT--AAGTC-G-T-TTT-C-CGAGATAATATGTA---------------GTA--CAC-------ACGAAATAAT---------------AAGTCGTACGAATGACATA-CTTAAGA-ATAAACT---ATC--GGATGTACGACATCA-GAAGTC-GT----TTTA----ACGAGATGATAAGTT-GTATTAACGAGATATT----AAGTTGAAA
gi|10 : acatTCGTATGTAC------AAGGTACTT--AAGTCGTAGGTG--C--A-A--------TACATTAAGTA--GTTAC-CACGAGA-TA--ATTTGT-CG----TTCGTACGAAA-TA
gi|11 : ttctttgataaAGCGAATATTGCTGCC--AG--TTCAAAATAA-TTTTGCTATGTCGTACGTAC------GA
gi|12 : ggAAGCG--TATTGCTGCCAAAA--T---ATATTATTTTTG-TATTTCGTACGTAC------GAc
gi|2 : acggGTCGTATGAAG------AAGATAAT---AAGTCGTA-ATA--ACTG----------GATGATAATTC--GTAAT-AACGAGA-TA--ATAAGT-CG----TANNNNNNNNN-NNNN--NNNNN-N-N-NNN-N-NNNNNNNNNNNNNN---------------NNN--NNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAGTCGTACGGACGAGAT-----AAGA-A---------GTC--GTACGAATGAGAT-AGTAAGTC-GTAATGCATA----ACGAGATCATAAATC-GTAATAACG
gi|3 : T--AAGTCGTA-ATA--AC-G-A--------TATAA-AATTC--TTTGA-TACAAAA-TATAGTAAAT-TG----CACGAACGACG-TAC-----ATC-G-T-TATTA-CGCAATACTAAGTCATAATAACGATATTTGTA--TGCCATGATAACGAAATATC---------------AAGTAGTAATAACGACATATC--AAGACAAA---------C--GTAAGA--GACAT-A-TA-----------CTTA----ACGGCATACTTAGTC-GTAATAACGATATACT----GAGTCGTAAgaa
gi|4 : atgaATAGTAAGTC--GTACT-TACGAGA-TA--ATATGT-CGTATATATATACGATG-CACT--AAGTC-G-CACGA-A-CAACATAATAATTC---------------GTA--ATT-------ATGAGCTAGT----------------AGTCGTACGAACGACATA-T--A--G-ATA---CCAAGTC--GTACGTACGATGT-AGCAAGTC-AT----TCTAACGTACGAGATGATCAG-C-GTACGAACAACGTAGT----AGGTCGTAA
gi|5 : ggGA-TA--A--CGT-CA----TATTTACGACA-TACTT-AAGTC-A-TACGT-A-CGGGATGAGAACTT---------------GTAATTAA-------ACTATATAGC---------------AAGTCGTAATAACGA-GTA---------ATA---T---ATTCAATA---ACGATAT-CCTAAATCCGT----TATA----ACGAGATAATAAGTCGGTAGGAACG-GATCTTTTAAAAGTCGC
gi|6 : GCCGTATGCACATAAATGAGATAACT--AAGTCGTAGAT---A--G-AGCTTAATTAGTACTAAGTCCTGCGA---ACAAGATTA--ATAAAT-CG----TATGGACGACATTACTACAAGTC-GAA-TTT-A-TGAGATAgt
gi|7 : aaACGAGA-TG--ATAAGT-CG----TACGAACGACA-TA-T--AAGTC-G-T-AAT-AACGAAATAATATGTA---------------GTG--ATA-------ACGAGATAAA---------------ATATCGTACGTACGAGAAA-C--AAGA-A---------GTC--CTAAGAACGACATAA-TAAGTC-GT----tgta
gi|8 : TTGTAAACA--A--GTA--------AATATC---TC--GTTAT-CACGAGA-TA--ATAAGTTCG----TGCG-ACGAGAATA-T--A--TCTG-T-TTC-A-CGAGATAATAAGTC---------------GTG--CGC-------A
gi|9 : aaatcgtacAAGCG--TATTGCTGC------------TATT---TTTGCTATGTCGTACGTAC------GAGATGTTTAAAAGTCGTATAAACGA--G-A--------TACTTTAAGTC--G-TACACACGAGA-TA--AT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): ATAACGAGATCATAAATCGTTATAACGGAAATGAATGAC
Unaligned ( gi|14 ): ATTACGTATGGTGGCATATTTCTGCCATCTAGATAA
Unaligned ( gi|15 ): AATTCATCTTGATTTTTGCTATGTCGAAGGTAC
Unaligned ( gi|16 ): CTGCACATTAATATAATTTATGTCCATACTA
Alignments
lowQualScore : 11 4444444 1 1 111111 3333333333333333333 111111 1111 2222222 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5555555555555555555 222 1111 1111 2222
lowQualScore : 33 2 2222222 5 0 0 666666 1 99 3333333333333333333 777 66 111111 4 1 4 9999 5 0 8 4444 1 5 0000000 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6 6666666666666666666 2 5 888 6 4444 1 7777 1 1 0 8 11 44 0 1111 1
lowQualScore : .. . ....... . . . ...... . .. ................... ... .. ...... . . . .... . . . .... . . ....... ........................................................ . ................... . . ... . .... . .... . . . . .. .. . .... .
lowQualScore : 88 5 8888888 5 0 8 444444 0 22 7777777777777777777 999 99 222222 0 0 4 4444 3 3 9 1111 4 0 0000000 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777 7 3333333333333333333 5 2 333 7 2222 0 0000 4 0 8 0 66 88 8 2222 2
consensus : NNNNAAGCG--TATTGCTGCCAA--TTC-ATATTATTTTGNTATGTCGTACGTAC------GAGATANTT--AAGTCGTANATAA--G-A--------NATA--NTAAGTC--GTT-AT-CACGAGA-TAATANGT-CG----TACGNACGACA-TACT--AAGTC-G-T-TNT-ACGAGATAATAAGTC---------------GTA--CGC-------ACGAGATAGC---------------AAGTCGTACGAACGACATA-C--AAGA-ATA---T---GTCGTANGAACGACAT-A-TAAGTC-GT----TNTA----ACGAGATGATAAGTC-GTANTAACGANATATT----AAGTCGTAA
Reference ( family-699 ) : NNNNAAGCG--TATTGCTGCCAA--T---ATATTATTTTGCTATGTCGTACGTAC------GAGATANTT--AAGTCGTANATAA--G-A--------NATA--NTAAGTC--GTT-AT-CACGAGA-TAATANGT-CG----TACGNACGACA-TACT--AAGTC-G-T-TNT-ACGAGATAATAAGTC---------------GTA--CGC-------ACGAGATAGC---------------AAGTCGTACGAACGACATA-C--AAGA-ATA---T---GTCGTACGAACGACAT-A-TAAGTC-GT----TNTA----ACGAGATGATAAGTC-GTANTAACGANATATT----AAGTCGTAA
gi|1 : AAGCG--TATTGCTGGCAA--TTC-ATATT-TTTTG-TATGTCGTACGTAC------GAGATAGTT--AAGTCGTATATAA--A-A--------AATG--CTAAGTC--GCT-AT-CACGAGA-TAATATGT-CG----TACGTACGATA-TACT--AAGTC-G-T-TTT-CCGAGATAATATGTA---------------GTA--CAC-------ACGAAATAAT---------------AAGTCGTACGAATGACATA-CTTAAGA-ATAAACT---ATCGGATGTACGACATCA-GAAGTC-GT----TTTA----ACGAGATGATAAGTT-GTATTAACGAGATATT----AAGTTGAAA
gi|10 : acatTTTGATA-ATCGTATGTAC------AAGGTACTT--AAGTCGTAGGTGC--A-A--------TACA--TTAAGTA--GTT-AC-CACGAGA-TAATTTGT-CG----TTCGTACGAAA-TA
gi|11 : ttcAGCGAATATTGCTGCCAG--TTCAAAATAATTTTGCTATGTCGTACGTAC------GA
gi|12 : ggAAGCG--TATTGCTGCCAAAAT---ATATTATTTTTGTATTTCGTACGTAC------GAc
gi|2 : acggGTCGTATGAAG------AAGATAAT---AAGTCGTA-ATAACTG----------GATG--ATAATTC--GTA-AT-AACGAGA-TAATAAGT-CG----TANNNNNNNNN-NNNN--NNNNN-N-N-NNN-NNNNNNNNNNNNNNN---------------NNN--NNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAGTCGTACGGACGAGAT-----AAGA-A---------GTCGTACGAATGAGAT-AGTAAGTC-GTAATGCATA----ACGAGATCATAAATC-GTAATAACGGAA
gi|3 : T--AAGTCGTA-ATAAC-G-A--------TATA--A-AATTC--TTTGATACAAAATA-TAGTAAAT-TG----CACGAACGACG-TAC-----ATC-G-T-TATTACGCAATACTAAGTCATAATAACGATATTTGTA--TGCCATGATAACGAAATATC---------------AAGTAGTAATAACGACATATC--AAGACAAA---------CGTAAGA--GACAT-A-TA-----------CTTA----ACGGCATACTTAGTC-GTAATAACGATATACT----GAGTCGTAA
gi|4 : atgaATA--GTAAGTC--GTA-CT-TACGAGA-TAATATGT-CGTATATATATACGATG-CACT--AAGTC-G-CACGA-ACAACATAATAATTC---------------GTA--ATT-------ATGAGCTAGT----------------AGTCGTACGAACGACATA-T--A--G-ATA---CCAAGTCGTACGTACGATGT-AGCAAGTC-AT----TCTAACGTACGAGATGATCAG-C-GTACGAACAACGTAGT----AGGTCGTAA
gi|5 : ggGA-TAA--CGT-CA----TATTTACGACA-TACTT-AAGTC-A-TACGT-ACGGGATGAGAACTT---------------GTAATTAA-------ACTATATAGC---------------AAGTCGTAATAACGA-GTA---------ATA---T---ATT-CAATAACGATAT-CCTAAATCCGT----TATA----ACGAGATAATAAGTCGGTAGGAACG-GATCTTTTAAAAGTCGC
gi|6 : GCCGTATGCACATAAATGAGATAACT--AAGTCGTAGAT-A--G-AGCTTAATTAGTA--CTAAGTCCTGCG-A---ACAAGATTAATAAAT-CG----TATGGACGACATTACTACAAGTC-GAA-TTT-ATGAGATAgt
gi|7 : aaACGAGA-TGATAAGT-CG----TACGAACGACA-TA-T--AAGTC-G-T-AATAACGAAATAATATGTA---------------GTG--ATA-------ACGAGATAAA---------------ATATCGTACGTACGAGAAA-C--AAGA-A---------GTCCTAAGAACGACATAA-TAAGTC-GT----tgta
gi|8 : TTGTAAACAA--GTA--------AATA--TC---TC--GTT-AT-CACGAGA-TAATAAGTTCG----TGCG-ACGAGAATA-T--A--TCTG-T-TTC-ACGAGATAATAAGTC---------------GTG--CGC-------A
gi|9 : aaatcgtacAAGCG--TATTGCTGC----------TATT--TTTGCTATGTCGTACGTAC------GAGATGTTTAAAAGTCGTATAAAC--G-A--------GATACTTTAAGTC--G-T-ACACACGAGA-TAAT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): ATAACGAGATCATAAATCGTTATAACGGAAATGAATGAC
Unaligned ( gi|14 ): ATTACGTATGGTGGCATATTTCTGCCATCTAGATAA
Unaligned ( gi|15 ): AATTCATCTTGATTTTTGCTATGTCGAAGGTAC
Unaligned ( gi|16 ): CTGCACATTAATATAATTTATGTCCATACTA
Alignments
lowQualScore : 11 22 111111 3333333333333333333 111111 1111 2222222 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5555555555555555555 222 1111 1111 2222
lowQualScore : 33 2 8888 55 8 0 666666 1 99 3333333333333333333 777 66 111111 4 1 4 9999 5 0 8 4444 1 5 0000000 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6 6666666666666666666 2 1 888 6 4444 1 7777 1 1 0 8 11 44 0 1111 1
lowQualScore : .. . .... .. . . ...... . .. ................... ... .. ...... . . . .... . . . .... . . ....... ........................................................ . ................... . . ... . .... . .... . . . . .. .. . .... .
lowQualScore : 88 5 0000 55 8 8 444444 0 22 7777777777777777777 999 99 222222 0 0 4 4444 3 3 9 1111 4 0 0000000 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777 7 3333333333333333333 5 0 333 7 2222 0 0000 4 0 8 0 66 88 8 2222 2
consensus : NNNNAAGCG--TATTGCTGCCAATTCATATTA-TTTTGNTATGTCGTACGTAC------GAGATANTT--AAGTCGTANATAA--G-A--------NATA--NTAAGTC--GTT-AT-CACGAGA-TAATANGT-CG----TACGNACGACA-TACT--AAGTC-G-T-TNT-ACGAGATAATAAGTC---------------GTA--CGC-------ACGAGATAGC---------------AAGTCGTACGAACGACATA-C--AAGA-ATA---T---GTCGTANGAACGACAT-A-TAAGTC-GT----TNTA----ACGAGATGATAAGTC-GTANTAACGANATATT----AAGTCGTAA
Reference ( family-699 ) : NNNNAAGCG--TATTGCTGCCAATTCATATTA-TTTTGNTATGTCGTACGTAC------GAGATANTT--AAGTCGTANATAA--G-A--------NATA--NTAAGTC--GTT-AT-CACGAGA-TAATANGT-CG----TACGNACGACA-TACT--AAGTC-G-T-TNT-ACGAGATAATAAGTC---------------GTA--CGC-------ACGAGATAGC---------------AAGTCGTACGAACGACATA-C--AAGA-ATA---T---GTCGTANGAACGACAT-A-TAAGTC-GT----TNTA----ACGAGATGATAAGTC-GTANTAACGANATATT----AAGTCGTAA
gi|1 : AAGCG--TATTGCTGGCAATTCATATT--TTTTG-TATGTCGTACGTAC------GAGATAGTT--AAGTCGTATATAA--A-A--------AATG--CTAAGTC--GCT-AT-CACGAGA-TAATATGT-CG----TACGTACGATA-TACT--AAGTC-G-T-TTT-CCGAGATAATATGTA---------------GTA--CAC-------ACGAAATAAT---------------AAGTCGTACGAATGACATA-CTTAAGA-ATAAACT---ATCGGATGTACGACATCA-GAAGTC-GT----TTTA----ACGAGATGATAAGTT-GTATTAACGAGATATT----AAGTTGAAA
gi|10 : acatTTTGATA-ATCGTATGTAC------AAGGTACTT--AAGTCGTAGGTGC--A-A--------TACA--TTAAGTA--GTT-AC-CACGAGA-TAATTTGT-CG----TTCGTACGAAA-TA
gi|11 : ttcAGCGAATATTGCTGCCAGTTCAAAATAATTTTGCTATGTCGTACGTAC------GA
gi|12 : ggAAGCG--TATTGCTGCCAAAATATATTA-TTTTTGTATTTCGTACGTAC------GAc
gi|2 : acggGTCGTATGAAG------AAGATAAT---AAGTCGTA-ATAACTG----------GATG--ATAATTC--GTA-AT-AACGAGA-TAATAAGT-CG----TANNNNNNNNN-NNNN--NNNNN-N-N-NNN-NNNNNNNNNNNNNNN---------------NNN--NNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAGTCGTACGGACGAGAT-----AAGA-A---------GTCGTACGAATGAGAT-AGTAAGTC-GTAATGCATA----ACGAGATCATAAATC-GTAATAACGGAA
gi|3 : T--AAGTCGTA-ATAAC-G-A--------TATA--A-AATTC--TTTGATACAAAATA-TAGTAAAT-TG----CACGAACGACG-TAC-----ATC-G-T-TATTACGCAATACTAAGTCATAATAACGATATTTGTA--TGCCATGATAACGAAATATC---------------AAGTAGTAATAACGACATATC--AAGACAAA---------CGTAAGA--GACAT-A-TA-----------CTTA----ACGGCATACTTAGTC-GTAATAACGATATACT----GAGTCGTAA
gi|4 : atgaATA--GTAAGTC--GTA-CT-TACGAGA-TAATATGT-CGTATATATATACGATG-CACT--AAGTC-G-CACGA-ACAACATAATAATTC---------------GTA--ATT-------ATGAGCTAGT----------------AGTCGTACGAACGACATA-T--A--G-ATA---CCAAGTCGTACGTACGATGT-AGCAAGTC-AT----TCTAACGTACGAGATGATCAG-C-GTACGAACAACGTAGT----AGGTCGTAA
gi|5 : ggGA-TAA--CGT-CA----TATTTACGACA-TACTT-AAGTC-A-TACGT-ACGGGATGAGAACTT---------------GTAATTAA-------ACTATATAGC---------------AAGTCGTAATAACGA-GTA---------ATA---T---ATT-CAATAACGATAT-CCTAAATCCGT----TATA----ACGAGATAATAAGTCGGTAGGAACG-GATCTTTTAAAAGTCGC
gi|6 : GCCGTATGCACATAAATGAGATAACT--AAGTCGTAGAT-A--G-AGCTTAATTAGTA--CTAAGTCCTGCG-A---ACAAGATTAATAAAT-CG----TATGGACGACATTACTACAAGTC-GAA-TTT-ATGAGATAgt
gi|7 : aaACGAGA-TGATAAGT-CG----TACGAACGACA-TA-T--AAGTC-G-T-AATAACGAAATAATATGTA---------------GTG--ATA-------ACGAGATAAA---------------ATATCGTACGTACGAGAAA-C--AAGA-A---------GTCCTAAGAACGACATAA-TAAGTC-GT----tgta
gi|8 : TTGTAAACAA--GTA--------AATA--TC---TC--GTT-AT-CACGAGA-TAATAAGTTCG----TGCG-ACGAGAATA-T--A--TCTG-T-TTC-ACGAGATAATAAGTC---------------GTG--CGC-------A
gi|9 : aaatcgtacAAGCG--TATTGCTGC-------TATT---TTTGCTATGTCGTACGTAC------GAGATGTTTAAAAGTCGTATAAAC--G-A--------GATACTTTAAGTC--G-T-ACACACGAGA-TAAT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): ATAACGAGATCATAAATCGTTATAACGGAAATGAATGAC
Unaligned ( gi|14 ): ATTACGTATGGTGGCATATTTCTGCCATCTAGATAA
Unaligned ( gi|15 ): AATTCATCTTGATTTTTGCTATGTCGAAGGTAC
Unaligned ( gi|16 ): CTGCACATTAATATAATTTATGTCCATACTA
Alignments
lowQualScore : 11 22 111111 3333333333333333333 111111 1111 2222222 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5555555555555555555 222 1111 1111 2222
lowQualScore : 33 2 8888 55 8 0 666666 1 99 3333333333333333333 777 66 111111 4 1 4 9999 5 0 8 4444 1 5 0000000 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6 6666666666666666666 2 1 888 6 4444 1 7777 1 1 0 8 11 44 0 1111 1
lowQualScore : .. . .... .. . . ...... . .. ................... ... .. ...... . . . .... . . . .... . . ....... ........................................................ . ................... . . ... . .... . .... . . . . .. .. . .... .
lowQualScore : 88 5 0000 55 8 8 444444 0 22 7777777777777777777 999 99 222222 0 0 4 4444 3 3 9 1111 4 0 0000000 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777 7 3333333333333333333 5 0 333 7 2222 0 0000 4 0 8 0 66 88 8 2222 2
consensus : NNNNAAGCG--TATTGCTGCCAATTCATATTA-TTTTGNTATGTCGTACGTAC------GAGATANTT--AAGTCGTANATAA--G-A--------NATA--NTAAGTC--GTT-AT-CACGAGA-TAATANGT-CG----TACGNACGACA-TACT--AAGTC-G-T-TNT-ACGAGATAATAAGTC---------------GTA--CGC-------ACGAGATAGC---------------AAGTCGTACGAACGACATA-C--AAGA-ATA---T---GTCGTANGAACGACAT-A-TAAGTC-GT----TNTA----ACGAGATGATAAGTC-GTANTAACGANATATT----AAGTCGTAA
Reference ( family-699 ) : NNNNAAGCG--TATTGCTGCCAATTCATATTA-TTTTGNTATGTCGTACGTAC------GAGATANTT--AAGTCGTANATAA--G-A--------NATA--NTAAGTC--GTT-AT-CACGAGA-TAATANGT-CG----TACGNACGACA-TACT--AAGTC-G-T-TNT-ACGAGATAATAAGTC---------------GTA--CGC-------ACGAGATAGC---------------AAGTCGTACGAACGACATA-C--AAGA-ATA---T---GTCGTANGAACGACAT-A-TAAGTC-GT----TNTA----ACGAGATGATAAGTC-GTANTAACGANATATT----AAGTCGTAA
gi|1 : AAGCG--TATTGCTGGCAATTCATATT--TTTTG-TATGTCGTACGTAC------GAGATAGTT--AAGTCGTATATAA--A-A--------AATG--CTAAGTC--GCT-AT-CACGAGA-TAATATGT-CG----TACGTACGATA-TACT--AAGTC-G-T-TTT-CCGAGATAATATGTA---------------GTA--CAC-------ACGAAATAAT---------------AAGTCGTACGAATGACATA-CTTAAGA-ATAAACT---ATCGGATGTACGACATCA-GAAGTC-GT----TTTA----ACGAGATGATAAGTT-GTATTAACGAGATATT----AAGTTGAAA
gi|10 : acatTTTGATA-ATCGTATGTAC------AAGGTACTT--AAGTCGTAGGTGC--A-A--------TACA--TTAAGTA--GTT-AC-CACGAGA-TAATTTGT-CG----TTCGTACGAAA-TA
gi|11 : ttcAGCGAATATTGCTGCCAGTTCAAAATAATTTTGCTATGTCGTACGTAC------GA
gi|12 : ggAAGCG--TATTGCTGCCAAAATATATTA-TTTTTGTATTTCGTACGTAC------GAc
gi|2 : acggGTCGTATGAAG------AAGATAAT---AAGTCGTA-ATAACTG----------GATG--ATAATTC--GTA-AT-AACGAGA-TAATAAGT-CG----TANNNNNNNNN-NNNN--NNNNN-N-N-NNN-NNNNNNNNNNNNNNN---------------NNN--NNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAGTCGTACGGACGAGAT-----AAGA-A---------GTCGTACGAATGAGAT-AGTAAGTC-GTAATGCATA----ACGAGATCATAAATC-GTAATAACGGAA
gi|3 : T--AAGTCGTA-ATAAC-G-A--------TATA--A-AATTC--TTTGATACAAAATA-TAGTAAAT-TG----CACGAACGACG-TAC-----ATC-G-T-TATTACGCAATACTAAGTCATAATAACGATATTTGTA--TGCCATGATAACGAAATATC---------------AAGTAGTAATAACGACATATC--AAGACAAA---------CGTAAGA--GACAT-A-TA-----------CTTA----ACGGCATACTTAGTC-GTAATAACGATATACT----GAGTCGTAA
gi|4 : atgaATA--GTAAGTC--GTA-CT-TACGAGA-TAATATGT-CGTATATATATACGATG-CACT--AAGTC-G-CACGA-ACAACATAATAATTC---------------GTA--ATT-------ATGAGCTAGT----------------AGTCGTACGAACGACATA-T--A--G-ATA---CCAAGTCGTACGTACGATGT-AGCAAGTC-AT----TCTAACGTACGAGATGATCAG-C-GTACGAACAACGTAGT----AGGTCGTAA
gi|5 : ggGA-TAA--CGT-CA----TATTTACGACA-TACTT-AAGTC-A-TACGT-ACGGGATGAGAACTT---------------GTAATTAA-------ACTATATAGC---------------AAGTCGTAATAACGA-GTA---------ATA---T---ATT-CAATAACGATAT-CCTAAATCCGT----TATA----ACGAGATAATAAGTCGGTAGGAACG-GATCTTTTAAAAGTCGC
gi|6 : GCCGTATGCACATAAATGAGATAACT--AAGTCGTAGAT-A--G-AGCTTAATTAGTA--CTAAGTCCTGCG-A---ACAAGATTAATAAAT-CG----TATGGACGACATTACTACAAGTC-GAA-TTT-ATGAGATAgt
gi|7 : aaACGAGA-TGATAAGT-CG----TACGAACGACA-TA-T--AAGTC-G-T-AATAACGAAATAATATGTA---------------GTG--ATA-------ACGAGATAAA---------------ATATCGTACGTACGAGAAA-C--AAGA-A---------GTCCTAAGAACGACATAA-TAAGTC-GT----tgta
gi|8 : TTGTAAACAA--GTA--------AATA--TC---TC--GTT-AT-CACGAGA-TAATAAGTTCG----TGCG-ACGAGAATA-T--A--TCTG-T-TTC-ACGAGATAATAAGTC---------------GTG--CGC-------A
gi|9 : aaatcgtacAAGCG--TATTGCTGC-------TATT---TTTGCTATGTCGTACGTAC------GAGATGTTTAAAAGTCGTATAAAC--G-A--------GATACTTTAAGTC--G-T-ACACACGAGA-TAAT
blockSeqs : AA C GTTC AA A ATAAAT C AA GATAGAGCTTAATTA CTT CT TTGATA T T T TATA T T CTAC N T TTATT CATAATAACGATATTTGTATGCCATGATAACGAAATATC G TCAAGACAAA G C AG C AATG A ACGT C A G AT GA TTAA T
blockSeqs : . C AAAT A C . A . AACAAGTAA T . TTAC . A . . N A CTT A . CACGA NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG C TAGATACCAA G A AG . . T . A T . AT AT . T
blockSeqs : . . . . G . A . GGTGCAAT A . TAAT . A . . A . NN A . TACGT TGTAATTAAACTATATAGC C CAAGAA G C CC . . C . G C . CG AC . C
blockSeqs : C . T . ATAACTGG A . TACT . T . . T . CT A . AATTT CGTAATTATGAGCTAGT G AAGAA C A AA . . A . A A . GG G
blockSeqs : . . ATAACGAT G . TTAT . C . . T . C A . TAATA AGTGATAACGAGATAAA . ATAT . A A . .
blockSeqs : . TAAACGAG C . TACA . A . . G . T . . NNNN
blockSeqs : T . CGA . A . . A . T . . TTTC
blockSeqs : . A . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : CT** TANTT** CAAGAA*************
originalCons : NNNNAAGCG--TATTGCTGCCAATTCATATTA-TTTTGNTATGTCGTACGTAC------GAGATANTT--AAGTCGTANATAA--G-A--------NATA--NTAAGTC--GTT-AT-CACGAGA-TAATANGT-CG----TACGNACGACA-TACT--AAGTC-G-T-TNT-ACGAGATAATAAGTC---------------GTA--CGC-------ACGAGATAGC---------------AAGTCGTACGAACGACATA-C--AAGA-ATA---T---GTCGTANGAACGACAT-A-TAAGTC-GT----TNTA----ACGAGATGATAAGTC-GTANTAACGANATATT----AAGTCGTAA
finalCons : NNNNAAGCG--TATTGCTGCCAATTCATATTA-TTTTGNTATGTCGTACGTAC------GAGATANTT--AAGTCGTANATAA--G-A--------NATA--NTAAGTC--GTT-AT-CACGAGA-TAATANGT-CG----TACGNACGACA-TACT--AAGTC-GTANTT--ACGAGATAATAAGTC---------------GTA--CGC-------ACGAGATAGC---------------AAGTCGTACGAACGACATACAAGAA-------------GTCGTANGAACGACAT-A-TAAGTC-GT----TNTA----ACGAGATGATAAGTC-GTANTAACGANATATT----AAGTCGTAA
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): ATAACGAGATCATAAATCGTTATAACGGAAATGAATGAC
Unaligned ( gi|14 ): ATTACGTATGGTGGCATATTTCTGCCATCTAGATAA
Unaligned ( gi|15 ): AATTCATCTTGATTTTTGCTATGTCGAAGGTAC
Unaligned ( gi|16 ): CTGCACATTAATATAATTTATGTCCATACTA
Alignments
lowQualScore : 11 22 111111 3333333333333333333 111111 11111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 33333333333333333333 222 1111 1111 2222
lowQualScore : 33 2 8888 55 8 0 666666 1 99 3333333333333333333 777 66 111111 4 1 4 9999 5 44 4 44444 1 5 88 0 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222 6 33333333333333333333 2 1 888 6 4444 1 7777 1 1 0 8 11 44 0 1111 1
lowQualScore : .. . .... .. . . ...... . .. ................... ... .. ...... . . . .... . .. . ..... . . .. . ....................................................... . .................... . . ... . .... . .... . . . . .. .. . .... .
lowQualScore : 88 5 0000 55 8 8 444444 0 22 7777777777777777777 999 99 222222 0 0 4 4444 3 88 4 11111 4 0 88 6 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 55555555555555555555 5 0 333 7 2222 0 0000 4 0 8 0 66 88 8 2222 2
consensus : NNNNAAGCG--TATTGCTGCCAATTCATATTA-TTTTGNTATGTCGTACGTAC------GAGATANTT--AAGTCGTANATAA--G-A--------NATA--NTAAGTC--GTT-AT-CACGAGA-TAATANG-TCG----TACGNACGA-CA-TAC-T--AAGTC-GTANTTACGAGATAATAAGTC---------------GTA--CGC-------ACGAGATAGC--------------AAGTCGTACGAACGACATA-C--AAG----A-A------GTCGTANGAACGACAT-A-TAAGT-CGT----TNTA----ACGAGATGATAAGTC-GTANTAACGANATATT----AAGTCGTAA
Reference ( family-699 ) : NNNNAAGCG--TATTGCTGCCAATTCATATTA-TTTTGNTATGTCGTACGTAC------GAGATANTT--AAGTCGTANATAA--G-A--------NATA--NTAAGTC--GTT-AT-CACGAGA-TAATANG-TCG----TACGNACGA-CA-TAC-T--AAGTC-GTANTTACGAGATAATAAGTC---------------GTA--CGC-------ACGAGATAGC--------------AAGTCGTACGAACGACATA-C--AAG----A-A------GTCGTANGAACGACAT-A-TAAGT-CGT----TNTA----ACGAGATGATAAGTC-GTANTAACGANATATT----AAGTCGTAA
gi|1 : AAGCG--TATTGCTGGCAATTCATATT--TTTTG-TATGTCGTACGTAC------GAGATAGTT--AAGTCGTATATAA--A-A--------AATG--CTAAGTC--GCT-AT-CACGAGA-TAATATG-TCG----TACGTACGA-TA-TAC-T--AAGTC-GT-TTTCCGAGATAATATGTA---------------GTA--CAC-------ACGAAATAAT--------------AAGTCGTACGAATGACATA-CTTAAG----A-ATAAACTATCGGATGTACGACATCA-GAAGT-CGT----TTTA----ACGAGATGATAAGTT-GTATTAACGAGATATT----AAGTTGAAA
gi|10 : acatTTTGATA-ATCGTATGTAC------AAGGTACTT--AAGTCGTAGGTGC--A-A--------TACA--TTAAGTA--GTT-AC-CACGAGA-TAATTTG-TCG----TTCGTACGA-AA-TA
gi|11 : ttcAGCGAATATTGCTGCCAGTTCAAAATAATTTTGCTATGTCGTACGTAC------GA
gi|12 : ggAAGCG--TATTGCTGCCAAAATATATTA-TTTTTGTATTTCGTACGTAC------GAc
gi|2 : acggGTCGTATGAAG------AAGATAAT---AAGTCGTA-ATAACTG----------GATG--ATAATTC--GTA-AT-AACGAGA-TAATAAG-TCG----TANNNNNNN-NN-NNN-N--NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------------NNN--NNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAGTCGTACGGACGAGATA-----AG----A-A------GTCGTACGAATGAGAT-AGTAAGT-CGTAATGCATA----ACGAGATCATAAATC-GTAATAACGGAA
gi|3 : T--AAGTCGTA-ATAAC-G-A--------TATA--A-AATTC--TTTGATACAAAATA-TAGTAAA-TTG----CACGAACGA-CG-TAC------ATC-GTTATTACGCAATACTAAGTCATAATAACGATATTTGTA--TGCCATGATAACGAAATATC--------------AAGTAGTAATAACGACATATC--AAG----ACA------AACGTAAGA--GACAT-A-TA-----------CTTA----ACGGCATACTTAGTC-GTAATAACGATATACT----GAGTCGTAA
gi|4 : atgaATA--GTAAGTC--GTA-CT-TACGAGA-TAATATG-TCGTATATATATACGA-TG-CAC-T--AAGTC-GCACGAACAACATAATAATTC---------------GTA--ATT-------ATGAGCTAGT---------------AGTCGTACGAACGACATA-T--AGATACCA-A------GTCGTACGTACGATGT-AGCAAGT-CAT----TCTAACGTACGAGATGATCAG-C-GTACGAACAACGTAGT----AGGTCGTAA
gi|5 : ggGA-TAA--CG-TCA----TATTTACGA-CA-TACTT--AAGTC-ATACGTACGGGATGAGAACTT---------------GTAATTAA-------ACTATATAGC--------------AAGTCGTAATAACGA---G-T--AAT----ATA------TTC--AATAACGATATCC-TAAATCCGT----TATA----ACGAGATAATAAGTCGGTAGGAACG-GATCTTTTAAAAGTCGC
gi|6 : GCCGTATGCACATAAATGAGATAACT--AAGTCGTAGAT-A--G-AGCTTAATTAGTA--CTAAGTCCTGCG-A---ACAAGATTAATAAA-TCG----TATGGACGA-CATTAC-TACAAGTC-GAATTTATGAGATAgt
gi|7 : aaACGAGA-TGATAAG-TCG----TACGAACGA-CA-TA--T--AAGTC-GTAATAACGAAATAATATGTA---------------GTG--ATA-------ACGAGATAAA--------------ATATCGTACGTACGAGAAA-C--AAG----A-A------GTCCTAAGAACGACATAA-TAAGT-CGT----tgta
gi|8 : TTGTAAACAA--GTA--------AATA--TC---TC--GTT-AT-CACGAGA-TAATAAGTTCG----TGCG-ACGAGAA-TA--T--A--TCTGT-TTCACGAGATAATAAGTC---------------GTG--CGC-------A
gi|9 : aaatcgtacAAGCG--TATTGCTGC-------TATT---TTTGCTATGTCGTACGTAC------GAGATGTTTAAAAGTCGTATAAAC--G-A--------GATACTTTAAGTC--G-T-ACACACGAGA-TAAT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): ATAACGAGATCATAAATCGTTATAACGGAAATGAATGAC
Unaligned ( gi|14 ): ATTACGTATGGTGGCATATTTCTGCCATCTAGATAA
Unaligned ( gi|15 ): AATTCATCTTGATTTTTGCTATGTCGAAGGTAC
Unaligned ( gi|16 ): CTGCACATTAATATAATTTATGTCCATACTA