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Reference ( gi|2 )            :    ATTGAACTTATGAAC--GTTTA---CT---TT--AGCAGAGTAT-AGG--CCA---CCGAC--CGACT-GTCTCC-ATCTC-CTGCTGT-TCTGAGCGT----G-C-GCAACCATGA-A-TG---CC--AG----TG-GTAT-CCT--C-GCTTT-CAATCTCGTTG--TC-G--AGA---A---T-TTC--TACAGG-TGT-----TTTTCAG--GTC--TCC-G---TTTCTATTCCCCTGTG-GATTTCCA-TTTT--AG-GG--CATGGTCT-GTGT-AT-ATGTCATGGA--CTTAT--TCAGTTG--T-------GCG--CT---A--TC---CAGGTCTCACTGTTCTTGTCTT--A-TT----TGACATTG--AAG-GA---GG-TAGC-----TGGGTT-GTTGT-T---CTCCAG-------G--TCCTTGTTTG-TGA-TCGGTT--TGGCCAATAA-GTTTCACGA-T-CTAGCGTAG--ATCTGTTGATGAA-----CT-TG-C-ACTGGATGCGTT-CTGTT--GC-T-CTG-----TGT----CGTCATGTTTCTGAT-CCG-AT-TA-AG---AACA-------GCCTTT----GTTTGAG--TGAAG-TCTTTGGTTCTTGGTGTTTCT-GC--TGA--TTT---TC----GCTTCCA-TACTTT--T--TCAGGAGTTCGAA-TGCT-----TCGCC-TACCTAC--CTG-TTGT-GAT-TCA-TTTTC-GAG--C-GCC--TGGTGGT--TGACTATACTGCCAAGATAT
gi|4                          :     TTGA-CTTATGCCT--GTTTATG-CT---TT--AGCAGAGTAT-AGG--CCA---CTGA----AATTGGTCTCC-ATCTC-T--CTGT-TCTGAGCGT----G-C-GCA--CATGG-ACTG---CC--AGTT--TG-GT-T-CCG--CAGCTTT-C-ATCTCGTTT--TC-A--AGAG--A---TCTTC--T--AGG-TGT-----TTCT-AG--GTCGTCCC-GT--TTTCTATT-CCCTGTG-GATT--CA-TTTT--A--GT--CAT-GTTT-GT----T-ATTTTCTGGATCCTTCC--TCAGTTT--G-------GTG--CT------TT---CAGG--TCAT--TTCTTTTCTTTAA-TT----TGCTATTG--GAG------AG-TAAT-----T-GGTT-TTTGTAT---CTCCAGA------G--TTCTTTTTTG-CGATTCAGTT--TGGCCAATAATGTTT--GGATT-CTA-CATAGGCAT-TGTTGATGAATGGTTCT-TG----CTGAAT---TT-CTCTG--GC-T-
gi|6                          : ttacTTGGACTCATGGCCCTGTTTATCTCT---TT--GACAAAGTAT-AGG--CCA---CCGAC--ATGCT-GTCTCA-ATCTA-CTCTTGT-TCTGAGTGTCGCTG-C-ACAA--ATGGTA-TGGACCT--AGCAGCTGAGCCTGCCT--G-GCTTTACATTCTCGATG--TCCG--AGAG--A---TCTTC--TCCAAGCTGT-----TT--CAG--GCG--TCC-ACGTTTTCTAT-CCCGTGTGAGGGTTCCA-TTTT--AGCTG--CATGCCTT-GTGT-ATAATTCCTTGGAGTCCTGTCGTCAGTTGGCT-------GCC--CT---AGGTC---CAGGTC-CACT-TTCTT-TTTT--AGCT----TGAt
gi|9                          :  gacTTGA-TTTATGCCT--GTTTG---CTCT-TT--AGCAGAGTAT-AGG--CCA---CCGAC--AATCT-GTCTCC-ATCTCACT-CTGT-TCTGAGCGT----GCC-GC-ACCTTGG-ACTG---CC--AG----TT-GTAT-CCTGCC-GCTTT-C-ATCTCGTTGTCTC-G--AGA----------TC--------------------------GTC--CAC-GT--TTTCTATTCCCCTGT
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gi|14                         :     TTGA-CTTATGCCT--GTTTA---CT---TTTTAGCAGAGTAT-AGG--CCA---CCGAC--tgac
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Reference ( family-6652 )     :                                          NTTGA-CTTATG--CCTGTTTA-CTC-TTTAGCAGAGTAT-AGG--CCA---CCGACAAT--CTGTCTCCATCTCAC-T-CT-GT-TCTGAGCG-T----G-C-GCAACC---ATGGAC-TGCC--AGTTGTATCCTGCC-AGC-TTT-C-AT-CTCGTTGTC-G--AG-A--GATCTTC--TCCAGG-TGTTTCCTAGGTCG-CC--CGC-TTTCTATTCCCCTGTG-GANTTCCA-TTTT--AGCGG--CA-TGNCTTGTGT-ATATTTCC-TGGA-T-CCT-TCC-TCA--GTT---G--TGCGC----TA--TC---CAGGTCCCACT-TTCTTTTCTT--ATT----TGNCATTG-G-AG-GA---GG-TAA-----TTGGTTT-GTTGT-T---CTCCGGAG------TCCTTGTTTGC-GATTCGGT-TTGGCCA------ATAATGT---TT--GGA-----TTTCTA-CN-----------TAGNCATCT---G--TTGAT-GAATGGTTCTATGACGACTGGATGCGTT------CTGTTGC-TCTGCCGATTGTTTTCCGCCGTGTTTCTGATACCGTATANAGAGGAAAACACAGCTCAGCCTTTNCACGTTTGANGTTNAGGATNNCTGATTTTTNGTGTTTC-TGC--TGAATT---TCCC--GCTTT-C--TACTT--TTTC--AGGAGGT-G-AA-TGCT-T-G------TTCTTG-------------TTTTT--GATGNCA-TTTTCTGAG--C-GCCTGTGGT-GTTGACTTTACTGCCAAGATAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                      -TGCTTTCTAG-TCG-TC--CACGTTTCTATTCCCCTGTG---CTCTCA-TTTTTTAGTGGTTCAGTGTCTTGTGTGAT-TTTCC-TGGA-TTCCT-TCCGTCGTTGTTTCGG--TG-GCCTTGTA--TCGAGTAGATCCCGCTCTTCTTTTCTG--ATTGATGTGGCATTG-G-AGCGAAGTGG-TAACATTTTTGGTTT-GTTTT-TTAACTCCAGAGGTGATGTCCTTGTTTGTTGATTCGGA-TTGGCCATTATTAATGATATCAATT--AGAGATGGTCTCAA-CGAGGTATGTGACTGACCATCTTTGGATTTGATTGAATTGACATGTGATG--TGGA-GCGCTTGTCCTCTGTTGAATCTGCCGATTGTTTTCCGCCGTGTTTCTGATACCGTATA-AGAG---AACACAGCTCAGCCTTTCTACGTTTGAAGTTGA-GATATCTGA-TTTTGGTGTTTCTTGCATTGAATTATCTCCT--GGCTT-C--TACTTTATTTC--AGGAGGT-GAAA-TGCT-T-G------TTCTTG-------------TTTTT--GATG-CA-TTTTCTGAGGCC-GCTTGTGGT-GTTGA-TTTACTGCCAAGATAT
gi|10                         : tttgtccgttagtcaagataatacttctttctgcatgcgtatTTGA-CTTATG--CCTGTTTA-CTC-TTTAGCAGAGTCT-AGG--CCA---CTGACAAT--CTGTCTTCATCTCAC-T-CT-GT-TCTGAGCG-T----GCC-GC-ACC---ATGGAC-TCCC--AGTTGTATCCTG-C-AGC-TTT-C-AT-CTCGTgtgaactctcatctttcgtcaattagttccccatttggtttgattgattgtggcatttggtgtttgattctgtcatatcctttggtttctctctgttatctgagtccggatgtggcgggtttctctagggcttgatgtttttcgtctgcatgtggctttgctattgggagaatcagggccaaatcatcgcgaattcag
gi|11                         :                                          ttacA-CTTATG--CCTGTTTA-CTC-TTTGACAGAGTAT-AG---CCA---CCGACAAT--CTGTCTC-ATCTAAC-T-CT-GT-TCTGGGCG-T----G-CTGC-ACC---ATGGAC-TACC--AGCTGTAGCCTGCT-GCT-TTT-C-AT-
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acttTTG-------------TTTT---GATGTCA-TTTTCTGAG--CCGCCTGTGGT-GTTGACTTTACTGCCAAGATAT
gi|13                         :                                           TTGA-CTTATG--CCTGTTTA-CTC-TTTAGCAGAGTAT-AGG--CCA---CCGACAAT--CTGTCTCCATCTttgaactcctctacttcatc
gi|14                         :                                           TTGA-CTTATG--CCTGTTTA-CTT-TTTAGCAGAGTAT-AGG--CCA---CCGACtgac
gi|15                         :                                        gacTTGA-TCTATG--CCTATTTA-CTC-TTTAGCAGAGTAT-AGG--
gi|16                         :                                                  TATG--CCTGTTTA-CTC-TTTAGCAGAGTAT-A
gi|2                          :                                    ttacttgTTGAACTTATG--AACGTTTA-CT---TTAGCAGAGTAT-AGG--CCA---CCGACCGA--CTGTCTCCATCTC-C-TGCT-GT-TCTGAGCG-T----G-C-GCAACC---ATGAA--TGCC--AGTGGTATCCT-C---GC-TTT-CAAT-CTCGTTGTC-G--AG-A---AT-TTC--TACAGG-TGTTTTTCAGGTC--TC--CG--TTTCTATTCCCCTGTG-GATTTCCA-TTTT--AG-GG--CA-TGGTCTGTGT-ATATGTCA-TGGA----CT-TAT-TCA--GTT---G--TGCGC----TA--TC---CAGGTCTCACTGTTCTTGTCTT--ATT----TGACATTG-A-AG-GA---GG-TAG-----CTGGGTT-GTTGT-T---CTCCAG-G------TCCTTGTTTGT-GA-TCGGT-TTGGCCA------ATAA-GT---TTCACGA-------TCTAGCG-----------TAG--ATCT---G--TTGAT-GAA-----CT-TG-C-ACTGGATGCGTT------CTGTTGC-TCTG-----TGT----CGTCATGTTTCTGAT-CCG-ATTAAGAA------------CAGCCTTT----GTTTGA-GTGAAG--TCTTTGGTTCTTGGTGTTTC-TGC--TGATTT---T--C--GCTTC-CA-TACTT--TTTC--AGGAGTTCG-AA-TGCT-TCGCCTACCTACCTG--------------TTGT--GAT-TCA-TTTTC-GAG--C-GCC--TGGTGGTTGACTATACTGCCAAGATAT
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gi|6                          :                                             GA-CTCATGGCCCTGTTTATCTC-TTTGACAAAGTAT-AGG--CCA---CCGACATG--CTGTCTCAATCT-AC-T-CTTGT-TCTGAGTG-TCGCTG-C-ACAAATGGTATGGACCTAGC--AGCTG-AGCCTGCCTGGC-TTTAC-ATTCTCGATGTCCG--AG-A--GATCTTC--TCCAAGCTGTTTC--AGG-CG-TCCACGT-TTTCTA-TCCCGTGTGAGGGTTCCA-TTTT--AGCTG--CA-TGCCTTGTGT-ATAATTCCTTGGAGT-CCTGTCG-TCA--GTT---GGCTGCCC----TAGGTC---CAGGT-CCACT-TTCTTTTTTgtgatatatctattcgtcaattgttccccatttggtttgattgattggtggcatttggtgtttgatttcataacttggttttctctctgttatctgagtccgatgtggcggtgtttcttctagggcttgatgtttttgtctgcatgtggctttgcttgttgggagaataggcctaaatcatcggcgaagtcaggt
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Reference ( family-6652 )     :                                          NTTGA-CTTATG--CCTGTTTA-CTC-TTTAGCAGAGTAT-AGG--CCA---CCGACAAT--CTGTCTCCATCTCAC-T-CT-GT-TCTGAGCGT----G-C-GCAACC---ATGGAC-TGCC--AGTTGTATCCTGCC-GGCTTT-C-AT-CTCGTTGTC-G--AG-A--GATCTTC--TCCAGG-TGTTTCCTAGGTCGT-C--CGT-TTTCTATTCCCCTGTG-GATTTCCA-TTTT--AGTGG--CA-TGTCTTGTGT-ATATTTCC-TGGA-T-CCT-TCC-TCA--GTT---G--TGCGC----TA--TC---CAGGTCCCACT-TTCTTTTCTT--ATT----TGNCATTG-G-AG-GA---GG-TAA-----TTGGTTT-GTTGT-T---CTCCAGAG----T-TCCTTGTTTGT-GATTCGGT-TTGGCCA------ATAATGT---TT--NGA-----TTTC-------TA-CGT-----A-GCATCT---G--TTGAT-GAAT--GCCTGTGACGACTGGATGCGTTT-----CTGTTGC-TCTGCC-ATTGTT---CGCCGTGTTTCTGAT-CCG-ATA---AGAGAACAC----CAGCCTTT--ACGTTTGA-GTTNAGGATCTTTGATTTTTGGTGTTTCT-GC--TGAATT-TCTC---GCTTTCA-TACTTT--TTC--AGGAGNT-GAA-TGCT-T-G------TTCTTG-------------TTTTT--GATGTCA-TTTTCTGAG--C-GCCTGTGGT-GTTGACTTTACTGCCAAGATAT
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Reference ( family-6652 )     :                                          NTTGA-CTTATG--CCTGTTTA-CTC-TTTAGCAGAGTAT-AGG--CCA---CCGACAAT--CTGTCTCCATCTCAC-T-CT-GT-TCTGAGCGT----G-C-GCAACC---ATGGAC-TGCC--AGTTGTATCCTGCC-GGCTTT-C-AT-CTCGTTGTC-G--AG-A--GATCTTC--TCCAGG-TGTTTCCTAGGTCGT-C--CGT-TTTCTATTCCCCTGTG-GATTTCCA-TTTT--AGTGG--CA-TGTCTTGTGT-ATATTTCC-TGGA-T-CCT-TCC-TCA--GTT---G--TGCGC----TA--TC---CAGGTCCCACT-TTCTTTTCTT--ATT----TGNCATTG-G-AG-GA---GG-TAA-----TTGGTTT-GTTGT-T---CTCCAGAG----T-TCCTTGTTTGT-GATTCGGT-TTGGCCA------ATAATGT---TT--NGA-----TTTC-------TA-CGT-----A-GCATCT---G--TTGAT-GAAT--G---CNTGCGACGACTGGATGCGCTT-----CTGTTG--TCTGCC-ATTGTT---CGCCGTGTTTCTGAT-CCG-ATA---AGAGAACAC----CAGCCTTT--ACGTTTGA-GTTNAGATCTTTGATTTTTGGTGTTTCT-GC--TGAATT-TCTCC--G-CTTCCA-TACTTT--TTC--AGGAGNT-GAA-TGCT-T-G------TTCTTG-------------TTTTT--GATGTCA-TTTTCTGAG--C-GCCTGTGGT-GTTGACTTTACTGCCAAGATAT
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Reference ( family-6652 )     :                                          NTTGA-CTTATG--CCTGTTTA-CTC-TTTAGCAGAGTAT-AGG--CCA---CCGACAAT--CTGTCTCCATCTCAC-T-CT-GT-TCTGAGCGT----G-C-GCAACC---ATGGAC-TGCC--AGTTGTATCCTGCC-GGCTTT-C-AT-CTCGTTGTC-G--AG-A--GATCTTC--TCCAGG-TGTTTCCTAGGTCGT-C--CGT-TTTCTATTCCCCTGTG-GATTTCCA-TTTT--AGTGG--CA-TGTCTTGTGT-ATATTTCC-TGGA-T-CCT-TCC-TCA--GTT---G--TGCGC----TA--TC---CAGGTCCCACT-TTCTTTTCTT--ATT----TGNCATTG-G-AG-GA---GG-TAA-----TTGGTTT-GTTGT-T---CTCCAGAG----T-TCCTTGTTTGT-GATTCGGT-TTGGCCA------ATAATGT---TT--NGA-----TTTC-------TA-CGT-----A-GCATCT---G--TTGAT-GAAT--G---CTTGCGACGACTGGATGCGCTT-----CTGTTG--TCTGCC-ATTGTT---CGCCGTGTTTCTGAT-CCG-ATA---AGAGAACAC----CAGCCTTT--ACGTTTGA-GTTAAGATCTTTGATTTTTGGTGTTTCT-GC--TGAATT-TCTCC--G-CTTCCA-TACTTT--TTC--AGGAGNT-GAA-TGCT-T-G------TTCTTG-------------TTTTT--GATGTCA-TTTTCTGAG--C-GCCTGTGGT-GTTGACTTTACTGCCAAGATAT
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gi|2                          :                                    ttacttgTTGAACTTATG--AACGTTTA-CT---TTAGCAGAGTAT-AGG--CCA---CCGACCGA--CTGTCTCCATCTC-C-TGCT-GT-TCTGAGCGT----G-C-GCAACC---ATGAA--TGCC--AGTGGTATCCT-C---GCTTT-CAAT-CTCGTTGTC-G--AG-A---AT-TTC--TACAGG-TGTTTTTCAGGTC-T-C--CG--TTTCTATTCCCCTGTG-GATTTCCA-TTTT--AG-GG--CA-TGGTCTGTGT-ATATGTCA-TGGA----CT-TAT-TCA--GTT---G--TGCGC----TA--TC---CAGGTCTCACTGTTCTTGTCTT--ATT----TGACATTG-A-AG-GA---GG-TAG-----CTGGGTT-GTTGT-T---CTCCAGG-------TCCTTGTTTGT-GA-TCGGT-TTGGCCA------ATAA-GT---TTCACGA-------TC-------TAGCGT-----A-G-ATCT---G--TTGAT-GAA-------CTTGC----ACTGGATGCG-TT-----CTGTTGC-TCTG-----TG-T---CGTCATGTTTCTGAT-CCG-ATT---A-AGAA-------CAGCCTTT----GTTTGA-GTGAAG-TCTTTGGTTCTTGGTGTTTCT-GC--TGATTT-T---C--G-CTTCCA-TACTTT--TTC--AGGAGTTCGAA-TGCT-TCGCCTACCTACCTG--------------TTGT--GAT-TCA-TTTTC-GAG--C-GCC--TGGTGGTTGACTATACTGCCAAGATAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aCACT-TTCTTTTTAT--ATT----TG-CATTGTGCAG-GA---GGGTAA-----TTGGTTTTGTTGT-T---CTC-AGAGC---T-TCGTTGTTTGT-GATTCATTATTGGCCA------ATAA-AT--------GA-----TT-C-------TA-CTT-----A-GCATCT---G--TT--T-GA---------CTATGACGACTGGATGCGTTT-----CTGTT----CTGCT-ATTGTT---CGCCATGTTT---AT-CCG-ATATAAAGAAAACAC----C----TTT--ACGTTTGA-TTTAAGATCATTGATTTTTTGTCGTTCT-GC--TGAATC-TCT-C--G-CTTTCATTACTTA--TT---AGGA-TT-GAATTGCTCT-G-------TCTTGCCTTACTTATTACTTTTTTAGATGTCACTTTTCTGAGC-C-GCCT-T-GT-GTT-ACTTTACTGCCAA
gi|4                          :                                           TTGA-CTTATG--CCTGTTTA-TGC-TTTAGCAGAGTAT-AGG--CCA---CTGA-AAT--TGGTCTCCATCT--C-T-CT-GT-TCTGAGCGT----G-C-GCA--C---ATGGAC-TGCC--AGTTTGGTTCCG-C-AGCTTT-C-AT-CTCGTTTTC-A--AG-A--GATCTTC--T--AGG-TGTTT-CTAGGTCGTCC--CGT-TTTCTATT-CCCTGTG-GATT--CA-TTTT--AGT----CA-TGT-TTGT----TATTTTC-TGGA-T-CCT-TCC-TCA--GTT---T--GGTGC----T---TT---CAGGT--CA-T-TTCTTTTCTTTAATT----TGCTATTG-G-AG------AG-TAA-----TTGGTTT--TTGTAT---CTCCAGAG----T-TCTTT-TTTGC-GATTCAGT-TTGGCCA------ATAATGT---TT--GGA------TTC-------TA-CAT-----AGGCAT-T---G--TTGAT-GAAT--GGTTCTTGCccatattaaactcctctacttctctatttccccccatttagtttattggattggtttgcttgttatatacttacaacacctctgtttttctcttttatcttgagtccgatcgtggcatctgtttctctaggctatgatttttgtctggcattacttgcttttgagttaggcaactcattgcaagtccagt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttacGTTCTT-GC--TGAATT-TCTCT--GGCTTTTC-TACTTT--TTCTCAGTAGGT-GAA-TGCT-T-G------TTCTTG-------------TTTTT--GATG-CA-TTTTCTGAG--C-GCTTGTGGT-GTTGA-TTTACTGCC-AGATATtgaatttctctggctt
gi|6                          :                                             GA-CTCATGGCCCTGTTTATCTC-TTTGACAAAGTAT-AGG--CCA---CCGACATG--CTGTCTCAATCT-AC-T-CTTGT-TCTGAGTGTCGCTG-C-ACAAATGGTATGGACCTAGC--AGCTG-AGCCTGCCTGGCTTTAC-ATTCTCGATGTCCG--AG-A--GATCTTC--TCCAAGCTGTTTC--AGG-CGT-CCACGT-TTTCTA-TCCCGTGTGAGGGTTCCA-TTTT--AGCTG--CA-TGCCTTGTGT-ATAATTCCTTGGAGT-CCTGTCG-TCA--GTT---GGCTGCCC----TAGGTC---CAGGT-CCACT-TTCTTTTTTgtgatatatctattcgtcaattgttccccatttggtttgattgattggtggcatttggtgtttgatttcataacttggttttctctctgttatctgagtccgatgtggcggtgtttcttctagggcttgatgtttttgtctgcatgtggctttgcttgttgggagaataggcctaaatcatcggcgaagtcaggt
gi|7                          :                                                                      gacttgGAGTAT-AAGGCCCA---CCGACAAT--CTGTCTCC-TCTCAC-T-CT-GT-TCTGAGCGT----T-CCGCA-CC---TTGGAC-TGCC--AGT-GTATCCTGCC--GCTTT-C-AT-CTCGTTGTC-G--AGAA--GATCTTC--TCAAGG-TGTTTCCTAGGTCGT-CCACGT-TTTCTATTCCCCTGTG-GA-TTCCATTTTT--AGT-G--CA-TGTCTTGT-T-ATATTTCC-TGGA-T-CCT-TTC-TCA--GTT---G--TGCCC----TA--agcttga
gi|8                          :                                          cTTGA-CTTATG--CCTGTTTA-CTCTTTTAGCAGAGTATCAGG--CCATATCCGACAATGGCTGTCTCCAATCCACGT-CT-GTCTCTGGGCGT----G-C--CGACC---ATGGAC-TGCCCAAGTTGTAT-CTGCA-GCTTTT-C-AT-TCCG-AGTC-GGAAG-ACCGATCTTCTTTCCAGG-TGTTT-CTAGGTCGT-C--CAG-TGTC-ATTTCCCTCTG-
gi|9                          :                                       ttacTTGA-TTTATG--CCTGTTTG-CTC-TTTAGCAGAGTAT-AGG--CCA---CCGACAAT--CTGTCTCCATCTCAC-T-CT-GT-TCTGAGCGT----GCC-GC-ACC---TTGGAC-TGCC--AGTTGTATCCTGCC--GCTTT-C-AT-CTCGTTGTC-T--CG-A--GATC--G--TCCA----------------------CGT-TTTCTATTCCCCTGTt


blockSeqs                     :                                               A      GC        T   T             C   GC   TAT        GG            AA G G  T  C         CGCTGCACAA    GGT      C    CA            CCTG     A A  T    T    GGA   A CC       TT C  G C     TT   GT   C CA  T                 AGGG T   T    .   CTG    .   T    GT         T    GT    G   .   .    GGC     C  TAGGTC            CT    G          TA   .     A     TGC  GA      G   .           TG    AT      C   GCT         G     .  T     A       .         TGTTTGGATTCTACATAGGCATTGTTGATGAATGGTT                                  T   GACGA     T   T  .         GC     CTATTGTT              C    .   .   TAA G    CAC     A      A         .      A           T         .  .       TCTCT    G    CAT      .   CTC    GT C   T    TCGCCTACCT      CCTTACTTATTACT   TTA    T  C         C  C   TG    G     C
blockSeqs                     :                                               .      .         .   .             .   .    .          .             CA . .  .  .         GCTGCA        .        .    .             CTG      . .  .    T    CG    . .        .  C  A .     CC   GT   . CA  T                 GAT  T   .    .   GG     .   C    GT         .    T     .   .   .    G       T  TATC              C     .          .    .     C     A    GA      .   .           G     T       C   GT          G     .  T     .       .         GTTTCACGATCTAGCGTAGATCTGTTGATGAA                                       C   A         T   .  .         .      TGT                   .    .   .   .   .    .       .      .         .      .           T         .  .       TCTC     .    CA       .   C      GG .   .    CTG             T                T      T  .         .  .   TG    .     C
blockSeqs                     :                                               .      .         .   .             .   .    .          .             CA . .  .  .         GCGCAA        .        .    .             CAG      . .  .    A    A     . .        .  C  G .     C    GT   . .   T                 GAT  T   .    .   TG     .   C    T          .    T     .   .   .    T       C  TTT               .     .          .    .     .     G    .       .   .           .     T       .   .           .     .  .     .       .         ATGATTCTACTTAGCATCTGTTTGA                                              T                                                                                                                                       .  .       TC       .    TC       .   .      T  .   .    TGT             T                T      T  .         .  .   T     .     C
blockSeqs                     :                                               .      .         .   .             .   .    .          .             CA . .  .  .         TCCGCA        .        .    .             CA       . .  .    T    G     . .        .  C  G .     C    GT   . .   G                 GA   .   .    .   T      .   .    .          .    .     .   .   .    G       C                          .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .                .      .  .         .  .   .     .     .
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Reference ( family-6652 )     :                                             NTTGA-CTTATG--CCTGTTTA-CTC-TTTAGCAGAGTAT-AGG--CCA---CCGACAAT--CTGTCTCCATCTCAC-T-C-TGT-TCTGAGCG----TG-C-GCAA---CCATGGA-CTGCC--AGTTGTATCCTGCC-GGCTTT-C-A-TCTCGTTGT-CG--AGA--GATCTTC--TCCAGG-TGTTTC-T-AGGTCGT-C--C--GT-TTTCTATTCCCCTGT--GGA-TTC-CATTTT--AG-TG---CA-TGTCTTGT-T-ATATTTCC-TGGA-T-CCT-TCC-TCA--GTT---G--TGCGC----TA--TC---CAGGTCCCACT-TTCTTTTCTT--ATT----TGNCATTG-G-AG-GA---GG-TAA-----TTGGTTT-GTTGT-T---CTCCAGAG----T-TCCTTGTTTGT-GATTCGGT-TTGGCCA------ATAATGT---TT--NGA-----TTTC-------TA-CGT-----A-GCATCT---G--TTGAT-GAAT--G---CTTGCGACGACTGGATGCGCTT-----CTGTTG--TCTGCC-ATTGTT---CGCCGTGTTTCTGAT-CCG-ATA---AGAGAACAC----CAGCCTTT--ACGTTTGA-GTTAAGATCTTTGATTTTTGGTGTTTCT-GC--TGAATT-TCTCC--G-CTTCCA-TACTTT--TTC--AGGAGNT-GAA-TGCT-T-G------TTCTTG-------------TTTTT--GATGTCA-TTTTCTGAG--C-GCCTGTGGT-GTTGACTTTACTGCCAAGATAT
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gi|2                          :                                       ttacttgTTGAACTTATG--AACGTTTA-CT---TTAGCAGAGTAT-AGG--CCA---CCGACCGA--CTGTCTCCATCTC-C-TGC-TGT-TCTGAGCG----TG-C-GCAA---CCATGAA--TGCC--AGTGGTATCCT-C---GCTTT-CAA-TCTCGTTGT-CG--AGA---AT-TTC--TACAGG-TGTTTT-TCAGGTC-T-C--C--G--TTTCTATTCCCCTGT--GGATTTC-CATTTT--AG-GG---CA-TGGTCTGTGT-ATATGTCA-TGGA----CT-TAT-TCA--GTT---G--TGCGC----TA--TC---CAGGTCTCACTGTTCTTGTCTT--ATT----TGACATTG-A-AG-GA---GG-TAG-----CTGGGTT-GTTGT-T---CTCCAGG-------TCCTTGTTTGT-GA-TCGGT-TTGGCCA------ATAA-GT---TTCACGA-------TC-------TAGCGT-----A-G-ATCT---G--TTGAT-GAA-------CTTGC----ACTGGATGCG-TT-----CTGTTGC-TCTG-----TG-T---CGTCATGTTTCTGAT-CCG-ATT---A-AGAA-------CAGCCTTT----GTTTGA-GTGAAG-TCTTTGGTTCTTGGTGTTTCT-GC--TGATTT-T---C--G-CTTCCA-TACTTT--TTC--AGGAGTTCGAA-TGCT-TCGCCTACCTACCTG--------------TTGT--GAT-TCA-TTTTC-GAG--C-GCC--TGGTGGTTGACTATACTGCCAAGATAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aCACT-TTCTTTTTAT--ATT----TG-CATTGTGCAG-GA---GGGTAA-----TTGGTTTTGTTGT-T---CTC-AGAGC---T-TCGTTGTTTGT-GATTCATTATTGGCCA------ATAA-AT--------GA-----TT-C-------TA-CTT-----A-GCATCT---G--TT--T-GA---------CTATGACGACTGGATGCGTTT-----CTGTT----CTGCT-ATTGTT---CGCCATGTTT---AT-CCG-ATATAAAGAAAACAC----C----TTT--ACGTTTGA-TTTAAGATCATTGATTTTTTGTCGTTCT-GC--TGAATC-TCT-C--G-CTTTCATTACTTA--TT---AGGA-TT-GAATTGCTCT-G-------TCTTGCCTTACTTATTACTTTTTTAGATGTCACTTTTCTGAGC-C-GCCT-T-GT-GTT-ACTTTACTGCCAA
gi|4                          :                                              TTGA-CTTATG--CCTGTTTA-TGC-TTTAGCAGAGTAT-AGG--CCA---CTGA-AAT--TGGTCTCCATCT--C-T-C-TGT-TCTGAGCG----TG-C-GCA-----CATGGA-CTGCC--AGTTTGGTTCCG-C-AGCTTT-C-A-TCTCGTTTT-CA--AGA--GATCTTC--T--AGG-TGTTTC-T-AGGTCGTCC--C--GT-TTTCTATT-CCCTGT--GGA-TT--CATTTT--AG-T----CA-TGT-TTGT----TATTTTC-TGGA-T-CCT-TCC-TCA--GTT---T--GGTGC----T---TT---CAGGT--CA-T-TTCTTTTCTTTAATT----TGCTATTG-G-AG------AG-TAA-----TTGGTTT--TTGTAT---CTCCAGAG----T-TCTTT-TTTGC-GATTCAGT-TTGGCCA------ATAATGT---TT--GGA------TTC-------TA-CAT-----AGGCAT-T---G--TTGAT-GAAT--GGTTCTTGCccatattaaactcctctacttctctatttccccccatttagtttattggattggtttgcttgttatatacttacaacacctctgtttttctcttttatcttgagtccgatcgtggcatctgtttctctaggctatgatttttgtctggcattacttgcttttgagttaggcaactcattgcaagtccagt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttacGTTCTT-GC--TGAATT-TCTCT--GGCTTTTC-TACTTT--TTCTCAGTAGGT-GAA-TGCT-T-G------TTCTTG-------------TTTTT--GATG-CA-TTTTCTGAG--C-GCTTGTGGT-GTTGA-TTTACTGCC-AGATATtgaatttctctggctt
gi|6                          :                                                GA-CTCATGGCCCTGTTTATCTC-TTTGACAAAGTAT-AGG--CCA---CCGACATG--CTGTCTCAATCT-AC-T-CTTGT-TCTGAGTGTCGCTG-C-ACAAATGGTATGGACCTAGC--AGCTG-AGCCTGCCTGGCTTTAC-ATTCTCGATGTCCG--AGA--GATCTTC--TCCAAGCTGTTTC---AGG-CGT-CCAC--GT-TTTCTA-TCCCGTGTGAGGG-TTC-CATTTT--AGCTG---CA-TGCCTTGTGT-ATAATTCCTTGGAGT-CCTGTCG-TCA--GTT---GGCTGCCC----TAGGTC---CAGGT-CCACT-TTCTTTTTTgtgatatatctattcgtcaattgttccccatttggtttgattgattggtggcatttggtgtttgatttcataacttggttttctctctgttatctgagtccgatgtggcggtgtttcttctagggcttgatgtttttgtctgcatgtggctttgcttgttgggagaataggcctaaatcatcggcgaagtcaggt
gi|7                          :                                                                         gacttgGAGTAT-AAGGCCCA---CCGACAAT--CTGTCTCC-TCTCAC-T-C-TGT-TCTGAGCG----TT-CCGCA----CCTTGGA-CTGCC--AGT-GTATCCTGCC-G-CTTT-C-A-TCTCGTTGT-CG--AGAA-GATCTTC--TCAAGG-TGTTTCCT-AGGTCGT-C--CACGT-TTTCTATTCCCCTGT--GGA-TTC-CATTTTT-AG-TG---CA-TGTCTTGT-T-ATATTTCC-TGGA-T-CCT-TTC-TCA--GTT---G--TGCCC----TA--agcttga
gi|8                          :                                             cTTGA-CTTATG--CCTGTTTA-CTCTTTTAGCAGAGTATCAGG--CCATATCCGACAATGGCTGTCTCCAATCCACGT-C-TGTCTCTGGGCG----TG-C--CGA---CCATGGA-CTGCCCAAGTTGTAT-CTGCA-GCTTTT-C-A-TTCCG-AGT-CGGAAGACCGATCTTCTTTCCAGG-TGTTTC-T-AGGTCGT-C--C--AG-TGTC-ATTTCCCTCT--G
gi|9                          :                                          ttacTTGA-TTTATG--CCTGTTTG-CTC-TTTAGCAGAGTAT-AGG--CCA---CCGACAAT--CTGTCTCCATCTCAC-T-C-TGT-TCTGAGCG----TGCC-GC-A---CCTTGGA-CTGCC--AGTTGTATCCTGCC--GCTTT-C-A-TCTCGTTGT-CT--CGA--GATC--G--TCCA-----------------------C--GT-TTTCTATTCCCCTGT--t