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gi|1 : tgtcgccgagaggaagatttgacaagaaaataacagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggggatgctatccgcctcgcagttccaaaaatagtatctccccttgccgccctgttactatactgatgtatAAGAGGTCA-CGCTGTCCC----ACCGGCTA--AGTT-GCGTT-AAGAACCAGCGGATACTTTCAAAC-GCA-TA-CTGA-----GAGAATA-CCAA-GGTAAGAC-AATG--AAAGC--AATCC-CTG--AGACAGC--AATGAGCCTTAATAGTG---AGCGCCATCGACAAA---CA-CTTGCGC-TG-CATTCCTCATGCTAGCCAAAAAGCACCAAATTCTCGAGTCATATGCCCCACGTCGCAGCCTTCCTACT-CTCCTTGAGTGCACCATAAG------TGGCCATGAACCGGCAGTCAATGAGACCGTCG---TGAA-------GAA----TGCTGATGG-------AACATCTTGACT-CCTGGACAGACCACCCCGT-GGTCACTTCTTGATCCAGCTCACCTCTTGATTTTGC-AAACAGATACAATGGAAGTGGCCA-AGA---CTATG-TGACAGATCA-ATAA-AGTGATG-TTTGATGGCCCTCC-AAGTAGAAGATG-CGAGCACTGAA-ACACTGG-GA-ACTGGCTGTCAATGAGG--GTTGCGGTGCA-GC---GCC-GA----GTAGA-------CT----------------TTGCT-CAGCTAGGGA-CA-------GCA--AGTCATTCTGCAAGCATCCCATGTCCTG----CAC------------AC-----AAA----GGGCACATGGCA--GT--GAACCTGTGCTGC---CAGC--CTGTAAGCACATTCCTGCAACCAATC-GAGTGCCCTACAAAGCACTACTGGTCTTGTG--AAAACACCAGGGATATA-TGAGTAAAACCATATC--C-A-AGGTTGAGAGCTGGTGTTGCCAAGAGAGAA-GA-ATACACCATTCTTTAGCAAC-TGGGCCAAGCCGTATTCGGAC-CTAGATCAGTCTAT--GT-CATAGTGTACGTTGGCGTTCTCACTAT--AGCCATGGCAATCGTTAATAGCGATTGTACCTCCGGT-CT-CTGA-CA---GAGTA-GTTCCATTGCGTTC-AC-GCACTGGACAA-C--AATCC--------CACTATGCTA-GTG-GAT-----ATC---AGTT-CAGTCCT-TGAAGGAAA--TGTT-AATCCA---CA--C----AC----CAAC--AC---CAG-A-GT-A-TT----AGA-A-ATC----G----GCAG----GTCA---CTTCCACTCC-G---T---------------T--CCG---AAA-CAC--AGA--GAGTG-TTGTCTT--T--------------CAAAGTCCCGCATGACCAGCGC-----ACCCTGC-GACAG--AATACAGACTGC---AT--TCAAAGAAGATGCGT--GGAGC------GTCT--GT-CTCA--TG-ACAACCAAATCAAAAACA----TGCC--TTCACGTGGC-----AGGATG--TGCG-GGA-CCGAGAA-T-TGTTA---AAAGTTGATCGAAGAA-TT-CA-GG--TGAAG---CAACAACTCC-ACCG--GAC---------GC-AGATA----CACA--TCA--T--ATGCA--TCAGGAC-------CTAAG-GGT-CA-G-G-CTCA-T--TGT--AAAGAGGTTCG--CTTTC-TCGTC-TGGT-GTGCATAGA-GAGA--TGGCCAA----A-TCATTCGAGG--------AGGAGAGTGGG-CAT-C-TAGT-------AAGCTGGA-----CGCAAAGG---AGA--TTA-----CA--AGTC-CGTGATGA-C-T-G-GCCAAG-A-GAGTTG--TG----------------------------CAA-------------G-G-------------CAAGTTTTGA-GACTTCCAAAC-------------------------CAGAGAGTGCTGTTGAACAGAGCA-AAGG-CAGAGG--ACAACCC-----CAT--CCCG-T-G----AC-AGCTGCAAGGTGT---TCAGCA--C--TTCAATT--C-GAAAACGCCCCCAGG-C-AAGG----TAG-CAACC-------AGCTT-G-TTTCATCAAGACGACCAAACA-A--CAAGCA-CA-ATCACAC-TT---CGCACGCACATAG---TACAAATT-GG-C---------TGCCA---GA--C-----AGCGAT--GGAAA-CCTT------G----G-----T-------C-TTTTCGTCACTGA-GAATCAGA-GTGT--CTC---TTGCA-----TGAC--T--GATGA--TGAACGCAACAAACCACACACAA-ACAC-ACACTCGGTACCAGG--A-TGATCTTC----T-ACAT---T--------GCATC-----C--A--GACACGCTACTCGATCCTGTCACG-CCTGTAATGT---------GCTACTGATGTG--GGCT-GC-CA---TTTGTCCAGAATC-----------TGAAGCCAGCCCCATAAC-------------ATC-AAGAT--ATTTGAATCTATTA------------CATATAGATCGCATTCCAT-TATT---TGTCCACGAAACTGGCGCAACACT--GTACCAC---CCTGGCT-CCTG-ATCTGGGA-TA-CTTAC---TTCTGTCATTCA--CTGAAATCTTGGC---T----ACACATC--CAAGATGGGGACAAGGCAT--CGGA-GAGTGTGG-TGCGCTCATAGCT-CCGC-GCCATACCCAGAAACTTG-CA-GAGACTTCCCTATGA----GGAAAGCAACAA-ACTGAG-CTGTTCAGG---TCACCACCC
gi|10 : tCAAAAGCCACCAAATTCTTGAGTCATCTG-TCCACGTCGCTCCTTCC--TCT-GTTACTGGAGATTGCCCACACAG---TGACCATTATCAGGCACTCAATGG--ACGTCG---TGAA-------GAA----TGCTGTGAGACATTTGAA---------T-CCTGGACAGAC-ACAA-AT-GGTCTCTT-CTGATC-AG-TCACTCTTTGATTTGACCAAACAGATACAGTGGAAGTGGCCAGAGAG--CTATGGTGA-CGACCAGATAGTGGTGATG-TTTGATGG----CCAACATAGA-GATGGCG-GCACTGAAGACA--AG-G-------CTA-CAAGGGAGTGGTTG-GGTACAGGCCGAAATTGTGACAGCAGGCTTATTTCTGCGAGCACCCCGTGTCTTGCG-CA-C-AAGAA-GA-------GCA--CATCA-------AG-------------T----GACT-----------GC-----A------G-----------------------------C-AGC----ACTGTA----CAT-TCTGCAAC--CCCGTG----CCTA-CAAGCACTACTG-TCTGG-G--AGtcgtcaggcaacctcttatggcaatgttcttgatcagcagtgacaaaaccaactcagtcaacttcacgatgcgaagaggcagtgcctcagcaaaaccgcaatgcccagctccgactcaattgcccatgtaagccccacgaaacagcacattcccatccaggtatgttgttgctgcaatgcaatacaacagcccagcataagtatactatccatgcaatatacttcatcccggtgtagaatcacccatagattgtgcggatgtcgggcagtgtccctttgccacgacacacagcccacatgcacataaagaccaaaaccctgtggttgatcattataggaacaggctagaccaccacccatttcaagatcgatccctagtcagccaccaccacccccggaaatcacccagctcacgccccatcgcgttatgatagaaagattcattgcgatacgaaatgttccacgcctcactgttgattgtgacactctgtctagtttctatatcttggcaagatgactggtcctaggcaacatctaaattggtacattgtccagaactcagccgagttgcgctacttactgtcattttgcaccgcgtgacattacaggacgatgtgaatatcttgcgcatcatcgagaggtttctgctgattctcttctgtctgcgttgtgataccagagcaaaatgcaacagacattgacaaggccagagagaaaacttcgcaaggaagaacgctattgtcagctcatccttccaacgaaggtcagtctggaggaacaatatactaagggtgcatgtttatcaaggacgcgcatagttggggtgagattacttgccctaatcaccagagctttctatccaccaacccaagatcatgggttggtcgagcggactagtgaaggcagtctatacacttgctgtgacaccaggcgcttaacactgattcagcttacagctgcttggagctggttttttttgcaagagcaagaaaggggttgagacgctgcaagcgcaaaaaaggcctgccgcttcagtgtcaacaggcctctgtgtattttgaaggggacctgcacatgtttgatcggagcacaaagaaatttacaacacgtaacgtgtggcatgatgctcacattcggttgaacatgacactcatttgtgtacatggtatatctcagtatcgtaatactcccaacaagaccattgatatgaagtcattat
gi|20 : TACTG-TCTGG-G--AGAA-AACAGGGATGCA-GATA-------ACCTC--CCAGAGTTTGAAGACTAGTGTTGCCA-GAGAAAA-GACATACACCATT-TTCA-CTAC-TGGGC--AA
gi|4 : -T--AGGCAGAC--ATCGTTAAT-GA---TGTACCTC-GATGCT-CTGA-CA---GAGCT-AGTCCACTG-ATTCCAC-GCACTGGGTCA-C--A--CT--------CACTATGCTAGGTG-GAT-----ACC---AGTA-CAC---C-TGAAGGACA--TGGT-CG--AA---CT--C----GCCACCAAAC--ACC--CAG-ATGT-A-TTCA--GGA-A-ATTCTG-T----GAAG----GCAA---CTT-CA--CC-G---T---------------T--CAGA--AAA-CAC--AGA--GGGTG-T--TTTCT-T--------------CAA--TCCCAATTGACCAG-GC-----A-CATGA-A-CAG--AATAATGGCTAC---A---TCAAAGGAGACG-GT--GGAGCA-----GTTG--GT-CTCA-ATG-ACAACC----CTA----A----TGCC--CT-ACATTGC-----TGGATG------------------GT-TGCTA---GGG--TGATTGAAGAA-TTCCA-GGATGGGAG---C--CAA---C-ACTGGAGACAGCA-AACAGC-AGATA----CATG--TCA--TC-ATG-A--TCAGAGG-------CCAAG-TATACAGG-C-CTCA-T-TTGTG-AAAGATGTTCG--CTCTC-TCGT--TGGT-GT-CATA---GAGA--TGGGCAA----C-CCATTCGAGG--------AGGAGAGTCAG-AAT-A-TAGT------TAAACTGGA-----CACAAAGG---AGA--TCG-----CA--GGTC-C-TGCTGC-CGT-G-G---AG-A-CCGTGA--TGAA----------TG-------------CCAATTGAATTGGCCAAGGG-------------CAG--TTCGA-GGCTTTC--ACCAAAGAATGTCTGTTGGACAGAA--CA-----------------------AAGG-CAGTGG--ACGACCC-----CATCCTTCG-T-A----ACAAGCTG-AAGGTGT---TCAGCA--T--TTCCATT-TT-AAGAATC----CAGAGC-AAAG-GT-CAG-CAA-C-------AGCTC-ACCTCCGTCAAG-------AACG-A--C---CG-TG-A--ACTC-TT---TGCA-T-GTAT-G---TAC--ATG-GG-C---------TACCA---GA-CG-----AGAGAT--GGAAA-TCTT------GA---GGAGTTT-------T-TTTTTGTCAC-GA-GAATCAGGCGTGTC-CTC---CGGCA-T---TGTC--T--GAAGG--TAGA-----------------AG-CCTCTGCACT-GGTACGAAG--AGTGATCTTCTTAATTACATGCTTGGAAG-AAGTCTCCGAAGCAAA--GACA-AAGA----ATCCTATCACGACCTGTATTGT---------GCT-------TG--ATGG-AG-CAGCCATTGTCCAGATGCTGACGCCAGT-TG---------------C-------------ATCAAAGAT--CATTGAA--GAGTATGCACAACAGATTGT--------CATTCCAT----TT-ATGTCCACAAAACTG-CA-AACA----GTGCCACT--CCT--GGATCTG-ATCTTGGA-TA-CT-----------------A--TTGAAA----GGTA-GT----ACACGGG--CAAAGCGGGGACAAGGCGT-GCGGA-GA----CG-TGTG---TTATCTGCCGCTGCCACACCAGGAAACTGG-CA-GAA--CTTCCTACGA-GT-GGACAGCAACAAGACTAAG-CTGTTCAGG---TT-CCTCTCAGCAGCTCT
gi|8 : ccagatcattttagcgtcatagtaattagtcagatattgggccattatagccaTC-GATGCTACTGG-AACAGAAGCTAGGCTCACT----TTCAC-GAACTGGGTCAAC--A--CCTCGTACTTATCTAGACTAGATGTGATGCACTACCGATAGTAACAC---C-TGCAAG-CAAGTGGCTCG--AAACGCT--CGCGCAC----CAACCAACC--CAGGATGTTA-TTCA--GGACATATTCTGTG----AATG----G-CAAACCTT-CA--CCTGCC-T---------------T--CCGAC-AAA-CACCAGGA--GGGTG-T--T-TTC-TACGTAAAGACGTAACGA--TCCCAATTGACCAG-GCCCACCA-ACCGATG-CAACAGACAATGGGCTACATA---CAAACGGAGACG-GT--GC-GCATACACGTTGC-GTACTCA-ATG-AGCACC----CTA----A----TGCCTACC-ACGTGAC-----TG------TGCATGGA-----------TGCCATACGG---TGATTGAAAAATTTCCACGGACTGGAGAGCC--CAA---CAATTGGTTACGACGCAACAGCAAGGCATAGCTATG--CTATGTCGATG-AACTCAGA-GACAGAACCCAAG--GTATAAG-CACTCA-TATTGTGAAAAGATGTCAGTTCTATCATCGTGGTGGTCGT-CAT--AGCAGACCTCGGCCA----CGCAATTCGAGGGCGCGGCAAAAGAAGT-AG-AAT-ACTAGT------TTAAGACTGAGAC-CAAAGAGG---AGAC-TCGC----CAGTGGTTCC-TGCTGCACGTCGCG---AG-C-CCGTGA--CTGC----------TG-------------CCAA-------------catggaatggtttgaccggcaagacgagcaactcgtcaatactgatgaagaggcaatgctcagcaagccactactgccagatcttacttcaatcgc
gi|14 : G-GTTCCTCAGCA-TGGACCA-C--C--AC--------AACTATGCTCGCTG-GAT-----CCC---TGTA-CAC---A-TAAGGGGCA--TGGG-AA--AT---CTGCC----TC----CAAC--GATCACAG-AAGA-A-TTT----GA-A----CA--G----CATG----GACA---CTT-GG--TT-GTGTT---------------T--AAGACCACA-AAC--AGA-----------TTTTCGG--------------CAA--TCCTAATCGACTAG-GC-----T-TATAA-T-AAG--AACAATGAC------ATTTTAGAAGGGTCTG-AT--AGTGCT-----GTTA--GA-CTCA-CTG-AAAACA----C------G----T-----CA-ACATTTCTAAAGTGGGTGTTTGCA-GAA-C
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gi|6 : TAGGTG-GAT-----ACC---AGTA-AAC---C-TGAAGGACA--TGGC-TG--AA---CT--C----GCCACCAAAC--ACC--CTG-ATGT-A-TTCA--GAA-A-ATTCAG-G----GAAGACGCGCCA---CTT-CA--CC-A---T---------------T--CAGA--AAA-CAC--AGATCGGGTG-T--TCTCT-T--------------CAA--TCCCGATTGACCAG-GC-----A-CATGA-G-CAG--AACAATAGCTGT---A---TCAAAGGAGACG-GT--GGAGCA-----GTCG--GT-CTCA-CTG-ACAACC----CTA----GCTAGTGTC--CT-ACGTCAC-----TGGATGGTTGTG-GGG-CC-AGAAGT-TGCCA---GGG--TGATC-AAGAA-TTCCA-GGATGGGAA---C--CAA---C-ACTGGAGACGCAA-AACAGC-AGATA----CACG--TCA--TC-ATG-A--TCAGACA-------CTAAA-TGTGCAGG-C-CTCA-T-TTGTG-AAAGATGTTTG--CTCTC-TCGT--TGGT-GT-TATAGAGGAGA--TGGGCAA----A-CCATTCAAGG--------AGGA--------------------------------------CACAAAGG---AGA--TTG-----CA--TGTC-C-TGCTGC-TTT-G-G---AG-A-CCGTAA--TGAA----------TGCCAAGAGGTTTGACCAA-------------GAG-------------CAG--TTCAA-GACTTTC--ACCAGAAAGCGTCTATTGGACAATAA-CA-----------------------AAGG-CATTGG--ACGATCC-----CATTCCTGGTT-G----ATAAGCTG-AAGGTGT---TCAGCAC-A--T-CAATTGGC-AAGAAGC----CAGAGC-AAAA-GA-AAG-AAA-C-------AGCTC-GCTTTCTTCAAG-------AACG-A--C---TG-TG-A--ACTC-TT---CGCA-C-GCAC-G---TGC--ATT-GG-G---------TGCAA---GA-CG-----AGAGAT--GGAAA-CCTT------GA---G-----T-------T-CTTTCATCAC-GA-GAATCAGG-GTGTC-CTC---CTGCA-T---TGTC--T--GATGG--TAGG-----------------GG-CCTCTGCACT-GGTACCAAG--AGTGATCTTC----TTACATGCTTGAAAG-AAGTCTTTGACACAAA--GACA-AAGA----GTCCTGTCACAACCTGTATTGT---------GTT-------TGATGGAGCAG-CA---ATTGTCCAGA--------------TG---------------C-------------
gi|19 : t-T--------------CAA--TCCCGATTGACCAG-GC-----A-CGTGA-G-CAG--AATAATGGCTTC---A---TCAAAGGAGACA-GT--GGGGCA-----GTTG--GT-CTCA-CTG-ACAACT----CTA----G----TGTC--CT-ACGTCGC-----TGGATGGTtgaagccagctgc
gi|17 : tgtctAAA--TGGGCAAAACAC-CA-TTCGAGG--------AGGGGAGTCAGCAATCATTAGTTCGTAACAA---CTGAGTGACACAAAAGGCCAGATGTTGGAATCCA--GGCT-C-TAGTGC-T-T-G-G---AGAA-CGGTGGGATGAC----------TG-------------CGAA-------------AAA-------------CA
gi|16 : -----CACAAAGG---AGA--TTA-----CA--GGTC-C-TGCTGC-TGT-G-G---AG-A-CCGTGA--TGAA----------TG-------------CCAA-------------GAGTAATGGTAAAGAGCAG--TTCGA-GACTTTC--AC-------------------------CAGAGAGTGTCTGTTGGACAGAACAAAGT-CAGCAG--ACGACCC-----CATTCCTCG-T-G----ACATGCGG-AAGGTGT---TCAGCA--C--T-TCA------AACAAGC----CAGAGC-AAGG-GT-CAG-CAA-C-------AGCTaaggaattggcaaag
gi|12 : gaggaA-----------------------AAGG-CAGTGGGAAC-ACCCTAAATCATT-GTCG-T-ATAACACAGTCTG-AAAGTGCATATCAGCATTA--T-CCATT-TT-AAGAATC----C--GACTAAGGAGTGCAG-CCA-CAGAAAAGAGCTC-ACCT-CGTC-AG-------AACAGG--C---CG-TGAA--ACTCATTGTGCACT-G--TAT-GGA-TACAAATG-GGAC---------TACTC---GA-GACGAGTAAAGATCGGGAAATTCTTTGTAGGGA---G-----TGTTTAAAT-TTTTTGTCCC-GA-GAATCA-GCGTGTCACTC---AGGCATT---TGTCATT--GACAGTATAGA-----------------AGCCTTCTGCAC
gi|9 : cagttcagagaagatctcaccaaaagaagaaatgatctgttttggacaggacaga---CA-TG-A--ACTC-TT---CGTA---CCAT-GGTATAA--ACT-GG-C----------GCTATTCGA-G------AGAGAT--GAAAA-C
gi|5 : tccgtatcacagatacccgaA---GA-CG-----AGAGAT--TAAAA-CCTT------GA---G-----T-------T-CTTTGATCAC-GA-AAATCAGGCGTGTC-CTT---CTGCA-T---TGTC--T--GATGG--TAGA-----------------AG-A--CTGCACT-GGTACCAAG--AGTGCTATTC----TTACATGCTTGGAAG-AAGTCTCTGACGC--AAAGACA-AATA----TTCCTGTCACGACCTGTATTGT---------GCT-------TG----AC-GG-CC---ATTGTCCAGG--------------TG---------------CTGAAGACATCTGCATCAAAGAC--CTTTGAA--GGGTATGCATAACAGATCGT--------CATTCCATAT-----ATGTCCATAAAACTG-CA-AACA----GTGTCATG--CC---TGATCTG-ATCCGATA-TA-CTTACC-TTCCCG--ATTCA--CTGAAA----CGTA-GT----ATACGGG--CAAAGCGGGGACAAGACGT-GTGGA-AA----CG-TTTG---ATGGCTGCCGCTGCCATACTAGGAAATAGG-CA-GAT--CTTCCTATAA-GT-GGAAAGCAAGAAAATTGAG-CTTTTCATA---TT-CCTCTCGGC-GCTCTacaacatatgagctattatataaagtgggagaatcagagatgtggtgtgttgctcaattatggacgaagcattgagttctgtaaatagtgtaataaaagccctgtgtcttacactggtaccacaatgcaaaatagaaaaaaaagctatgccattcttaaacagcatcagctttgcgaagtgaaaagttaagtcatactcagcgaaccgcaaagaacagaagaattcctttctacacgaactgtaatatatagctctgatggagcagccaacttagcgtccagtcaacgtgcttatgagcccagcatatcacaacagtcacaaaagacccttatgaaaaagagtaaaattacaaaaacaaggatcgtcatttccataatatgtgtccacgaaactgc
gi|9 : CAAAAAC-------AA--GGAT-------------CGT--------CATTTC-CATAATATGTGTCCACGAAACTGCcatggaatggtttcaccaggaggacaagcaacacgtcattactgatggagatgcagtgatcagcaagccactactgccagatctgacttcaatcgcgccatgtaacaacaaaaaagctgacagtcgggtgttgctgcatgcataaatacgcagcccagcatggacaccatgcaatacttatcgaaactgttgacaccgatgttgtggttctggcagtgtcccttgcacaggagttgcaaccagaagacaaactgtggttgacatttggaacaggctagaatttcatatacctagcagcacatgaaatagctcgtgcgctacaaatgttccaagctctcactggatgtgacactgtgtctagttttgctagacgtggcaagaagactgcatggacaatctggacggtactgccagaactcaccaaggcgctgctgctgctgtcatttgcacc
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|18 ): ACTACTGCCAGATCTTACTTCAATCGCCCCATGTAACCACTAAAAAGCTGACAGTCGGACTCGACGTTACTGTATGCAAAAATACGCAGCCCAACATGGACACCATGCAATACTTATCCGGAC
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Reference ( family-6471 ) : GGAGATGCACGGTCCAGGTCCAAGGGAAGTNTCNCCC-TTGCCGCACTCCTA-C---------G-----C----------CC--C---CACT-AGCA----GCATCAAGAGGTCA-C-CTGTCCCAN----CCGCTAG-AGTG-GCGTC-ATTGACCA-T-GGATACCT-CAGACAGCA-TA-CTGAT--G-AAGAATACT-AATGGCTAGAC-AAT-GCAAAGC--AAGTC-CTGGAAGACAGCCA-TTGGT----ATAGTGGACAATGNCAACAG-C-ATCTTGGGC-TG-CATT--TCATGCCAGTCGAAANCCACCAAATTCTCGAGTCATCTGCCCCACGTCGC-TCCTTCC-ACT-CTTCCTGGAGANTGC-CCACAC---A-TGGCCATGATCCGGCACTCAATG-GAC-GCCGTGAA-GAATGCTG-TGAGACAT-TTGAAT-CCTGGACAGAC-ACCC-GTGGTCGCTT-TTGATC-AG-TCACTCTTTGATTTGGCCAAACAGATACAGTGGAAGTGGCCAGA-GAG-CTATGGTGAC-GACCAGATAGTGGTGATG-TTTGATGGCC-TCCACATNGA-GATGGCG-GCACTGAAGACACTAG-GGGACTGGCTGCAAGGGAGTGGTTG-GGTGCA-GCGC--GTGCAGGCCGAGATTGCGACAGC-AGGAA-CA-------GNA--------------CATCCGANG----G-A-CGC-----AA-GAGCACAT--C-AAGT--GA-------CTGC-AGCAG-CACTGTAA---CAT-CCTGCAAC--ACCG--TGCC-TANAA-GCACTACTG-TCTGG-GAGAA-ACCAGGGATGCA-NANG----AC--C---TCC--A-AGTTTGAAGACTGGTGTTGCCA-GAGAG-AAGACATACACCATT-TTCA-CT-ACTGGGC--AACNNTACTCGGANACNAGATCAGTCTATTGGTTCATAGT-----GT---ACGTTGGCGCTCTCA----CT-T--AGGCAGGG--ATCGTTAAT---GA-TGTACCT-CGGTGCT-CTG--A-NAGA-GCT-GGTCCACTG-GTTCCAC-GCACTGGATCA-C--A--CCC---ACT-AT----GCTAGGTG-G----AT-----ACC---AGTA-CA---CCTG-AAGGACATGGC-CGAA---CTC-GC-C-A-C-AAAC--ACC-CAG-ATGT-A-TTC--AGGA-A-ATTCNGGG----AA-G----GCCA--CTT-CA--C--C-G--TTCAG-A-AAACAC--AG---------------A--GGGTG-TTCTC-T---T----------CAA--TCCCGATTGACCAG-G--CA-C------ATG-AG-CAGAATAAT-GGCT-GCA-T-CAAA-GGAGAC-G-GT--GGAGCA-----GTT--G-GT-CTC-ACT-GACAACC----CTA----G----TGCC--CT-ACGTCGCTGGATGGTTGC-G-GGACC-AGAAGT-TGCC--AGGGTGATCGAAGAA-TTCCA-GGATGGGAG---C--CAAC-ACCGGAGACGGCA-AACAGCAG---A------TA--CACGTCA--TC-ATG-A--TC--A-GACG----CTAAG-TGTGCAGGC-CTCA-T-TTGTG-AAAGATGTTCGCTC--TC-TCGT--TGGT-GT-CATAGAGGAGATGGGCAA--C-CCATTCGAGG-------AGGAG-AGT-AG-A-AT-A-TAGT---TAA------A----G--------CACAAAGG---AGA--TT-----G-----CAGGTCC-TGCTGC-CGT-G-G---A-G-ACCGT--GA-TGAA----------TGCC-------------AA-------------GAG-------------CAG--TTC-GA-GAC--TTTC--ACCAGA---------GAGC-G-TCT-TTGGACA-A-AACA---AAGG-CAGTGG--ACGACCC-----CATTCCTCG-TG----ACAAGCTG-AAGGTGT---T-CAGCANT-TCCATT--C-AAGAA----NCCAGAGCAAGG-GT-CAG-CAA-CAG-------CTC-GCCTTCGTCAAG-------AAC-GA--C---CG-TGA--A-CTCTT-CGCA----GGCAC-------GTAC-AATT-GG--C---------TGCN--A---GACGA-G---AGAT--GGAAAC-CTT------GA---G-----T-------T-CTTTCGTCAC-GA-GAATCAGGCGTGTC-CTC---CTGCA-T---TGTC--T--GATGG--T-------AGAAGCC-TC---------TGCACT-GGTACCAAG--AGTGATCTTCTTA----CATGCTTGGAAG-AAGTCTCTGACGCAAAGA-CA-AAGAAT-CCTGTC---ACGACCTGTATTG--T---G-CT----TG----GGGCGG-----C-AA-TT----GTCCAG--------------AATCT--A--GC---------C-AGT-TGCAT--CA--AAGAC--CNTTG-----AAGAGTA----TGCA-AA--CA--GATCGTCATT-CCATA-T-ATAATGTCCACGAAACT---G-CAA-ACA----GTGCCACG--CCCGGAT-CTG-ATCTGGGA-TAC-TTACC--T-CCCG--ATTCA--CTGAAA----GGTA-GT----ACACGGG--CAAAGCGGGGACAAGGCGT-GCGGA-GACG-TNTGATG-GCT----G--CCGCTGCCATACCAGGAAACTGG-CA-GA-AC-TCCCTACGA-GT-GGANAGCAACAAGACTG-AGCTGTTCAGG---TT-C--CTCTCGGCAGCTCT
gi|1 : AAGAGGTCA-CGCTGTCCCAC----CGGCTA--AGTT-GCGTT-AAGAACCAGC-GGATACTTTCAAAC-GCA-TA-CTGA-----GAGAATACC-AA-GGTAAGAC-AAT-G-AAAGC--AATCC-CTG--AGACAGCAA-TGAGCCTTAATAGTGAGCGCCATCGACAAAC-A-CTTGCGC-TG-CATTCCTCATGCTAGCCAAAAAGCACCAAATTCTCGAGTCATATGCCCCACGTCGCAGCCTTCCTACT-CTCCTTG---AGTGCACCATAA---G-TGGCCATGAACCGGCAGTCAATGAGACCGTCGTGAA-GAATGCTGATGGAACATCTTGACT-CCTGGACAGACCACCCCGTGGTCACTTCTTGATCCAGCTCACCTCTTGATTTTGC-AAACAGATACAATGGAAGTGGCCA-A-GA--CTATG-TGACAGATCA-ATAA-AGTGATG-TTTGATGGCCCTCCAAGTAGAAGATG-CGAGCACTGAA-ACACT-G-GGAACTGGCTGTCAATGAG-GGTTGCGGTGCA-GCGCC-GAGTAGACT----TTGCT-CAGCTAGGGA-CA-------GCAAGTCATTCTGCAAGCATCCCATGTCCTGCA-CAC-----AAAGGGCACATGGC-A-GT--GAACCTGTGCTGC---CAG-C-CTGTAAGCACATTCCTGCAACCAATCGAGTGCCCTACAAAGCACTACTGGTCTTGTGAAAACACCAGGGATATA-TGAGTAAAAC--CATATCC--A-AGGTTGAGAGCTGGTGTTGCCAAGAGAG-AAGA-ATACACCATTCTTTAGCA-ACTGGGCCAAGCCGTATTCGGAC-CTAGATCAGTCTAT--GT-CATAGT-----GT---ACGTTGGCGTTCTCA----CTAT--AGCCATGGCAATCGTTAATAGCGATTGTACCTCCGGT-CT-CTG--A-CAGA-GTA-GTTCCATTGCGTT-CAC-GCACTGGACAA-C--AATCCC---ACT-AT----GCTA-GTG-G----AT-----ATC---AGTT-CAGTCCTTG-AAGGAAATG---TTAA---TCC-ACAC-A-C-CAAC--A-C-CAG-A-GT-A-TT----AGA-A-ATC---GG----CA-G----GTCA--CTTCCACTC--C-G--TTCCG---AAACAC--AG---------------A--GAGTG-TTGTCTT---T----------CAAAGTCCCGCATGACCAGCG--CACC------CTG-CGACAGAATACA-GACT-GCATT-CAAA-GAAGAT-GCGT--GGAGC------GTC--T-GT-CTC-A-T-GACAACCAAATCAAAAACA----TGCC--TTCACGTGGCAGGATG--TGC-G-GGACCGAGAA-T-TGTTAAAAGTTGATCGAAGAA-TT-CA-GG-T-GAAG---CAACAAC-TCC----AC--CG-GAC-GCAG---A------TA--CACATCA--T--ATGCA--TC--AGGAC-----CTAAG-GGT-CAGG--CTCA---TTGT--AAAGAGGTTCGCTT--TC-TCGTC-TGGT-GTGCATAGA-GAGATGGCCAA--A-TCATTCGAGG-------AGGAG-AGT-GG-GCAT-C-TAGT-----A------A----GCTGGA---CGCAAAGG---AGA--TT-----A-----CAAGTCCGTGATGA-C-T-G-GCCAA-G-AGAGT--TG-TG---------------C-------------AA-------------G-G-------------CAAGTTTT-GA-GAC--TTCCAAACCAGA---------GAGT-G-CTG-TTGAACA-G-AGCA---AAGG-CAGAGG--ACAACCC-----CAT--CCCG-TG----AC-AGCTGCAAGGTGT---T-CAGCACT-TCAATT--C-GAAAACGCCCCCAG-GCAAGG----TAG-CAACCAG-------CTT-G-TTTCATCAAGACGACCAAAC-AA--CAAGCA-CAATCA-CACTT-CGCA----CGCACATA----GTACAAATT-GG--C---------TGCC--A---GAC-A-G---CGAT--GGAAAC-CTT------G----G-----T-------C-TTTTCGTCACTGA-GAATCAGA-GTGT--CTC---TTGCA-----TGAC--T--GATGA--TGAACGCAACAAACC-ACACACAAACACACACTCGGTACCAGG--A-TGATCTTC-TA----CA---TTGCA------TC-CAGACAC---GC-TA-CTCGAT-CCTGTC---ACG-CCTGTAATG--T---G-CTAC--TGATGTGGGCTG-----C-CATTT----GTCCAG--------------AATCTGAA--GC---------C-AGC-CCCATAACATCAAGAT--ATTTG-----AAT-CTAT---TACA-TA--TA--GATCG-CATT-CCAT--T-AT-TTGTCCACGAAACTGGCG-CAACACT----GTACCAC---CCTGGCTCCTG-ATCTGGGA-TAC-TTA-C--T-TCTGTCATTCA--CTGAAATCTTGGC---T----ACACATC--CAAGATGGGGACAAGGCAT--CGGA-GA-G-TGTGGTGCGCTCATAGCTCCGC-GCCATACCCAGAAACTTG-CA-GAGACTTCCCTATGA----GGAAAGCAACAA-ACTG-AGCTGTTCAGG---TCACCACCCTCGTCAG
gi|1 : tA-TT----GTCCAG--------------AACTC--A--GC---------CGAGT-TGCgcaacctcttatggcaatgttcttgatcagcagtgacaaaaccaactcagtcaacttcacgatgcgaagaggcagtgcctcagcaaaaccgcaatgcccagctccgactcaattgcccatgtaagccccacgaaacagcacattcccatccaggtatgttgttgctgcaatgcaatacaacagcccagcataagtatactatccatgcaatatacttcatcccggtgtagaatcacccatagattgtgcggatgtcgggcagtgtccctttgccacgacacacagcccacatgcacataaagaccaaaaccctgtggttgatcattataggaacaggctagaccaccacccatttcaagatcgatccctagtcagccaccaccacccccggaaatcacccagctcacgccccatcgcgttatgatagaaagattcattgcgatacgaaatgttccacgcctcactgttgattgtgacactctgtctagtttctatatcttggcaagatgactggtcctaggcaacatctaaattggtacattgtccagaactcagccgagttgcgctacttactgtcattttgcaccgcgtgacattacaggacgatgtgaatatcttgcgcatcatcgagaggtttctgctgattctcttctgtctgcgttgtgataccagagcaaaatgcaacagacattgacaaggccagagagaaaacttcgcaaggaagaacgctattgtcagctcatccttccaacgaaggtcagtctggaggaacaatatactaagggtgcatgtttatcaaggacgcgcatagttggggtgagattacttgccctaatcaccagagctttctatccaccaacccaagatcatgggttggtcgagcggactagtgaaggcagtctatacacttgctgtgacaccaggcgcttaacactgattcagcttacagctgcttggagctggttttttttgcaagagcaagaaaggggttgagacgctgcaagcgcaaaaaaggcctgccgcttcagtgtcaacaggcctctgtgtattttgaaggggacctgcacatgtttgatcggagcacaaagaaatttacaacacgtaacgtgtggcatgatgctcacattcggttgaacatgacactcatttgtgtacatggtatatctcagtatcgtaatactcccaacaagaccattgatatgaagtcattat
gi|10 : taagaggtcacgctgtcccaccggctaagttgcgttaagaaccagcggatactttcaaacgcatactgagagaataccaaggtaagacaatgaaagcaatccctgagacagcaatgagccttaatagtgagcgccatcgacaaacacttgcgctgcattcctcatgctagccaaaaagcaccaaattctcgagtcatatgccccacgtcgcagccttcctactctccttgagtgcaccataagtggccatgaaccggcagtcaatgagaccgtcgtgaagaatgctgatggaacatcttgactcctggacagaccaccccgtggtcacttcttgatccagctcacctcttgattttgcaaacagatacaatggaagtggccaagactatgtgacagatcaataaagtgatgtttgatggccctccaagtagaagatgcgagcactgaaacactgggaactggctgtcaatgagggttgcggtgcagcgccgagtagactttgctcagctagggacagcaagtcattctgcaagcatcccatgtcctgcacacaaagggcacatggcagtgaacctgtgctgccagcctgtaagcacattcctgcaaccaatcgagtgccctacaaagcactactggtcttgtgaaaacaccagggatatatgagtaaaaccatatccaaggttgagagctggtgttgccaagagagaagaatacaccattctttagcaactgggccaagccgtattcggacctagatcagtctatgtcatagtgtacgttggcgttctcactatagccatggcaatcgttaatagcgattgtacctccggtctctgacagagtagttccattgcgttcacgcactggacaacaatcccactatgctagtggatatcagttcagtccttgaaggaaatgttaatccacacaccaacaccagagtattagaaatcggcaggtcacttccactccgttccgaaacacagagagtgttgtctttcaaagtcccgcatgaccagcgcaccctgcgacagaatacagactgcattcaaagaagatgcgtggagcgtctgtctcatgacaaccaaatcaaaaacatgccttcacgtggcaggatgtgcgggaccgagaattgttaaaagttgatcgaagaattcaggtgaagcaacaactccaccggacgcagatacacatcatatgcatcaggacctaagggtcaggctcattgtaaagaggttcgctttctcgtctggtgtgcatagagagatggccaaatcattcgaggaggagagtgggcatctagtaagctggacgcaaaggagattacaagtccgtgatgactggccaagagagttgtgcaaggcaagttttgagacttccaaaccagagagtgctgttgaacagagcaaaggcagaggacaaccccatcccgtgacagctgcaaggtgttcagcacttcaattcgaaaacgcccccaggcaaggtagcaaccagcttgtttcatcaagacgaccaaacaacaagcacaatcacacttcgcacgcacatagtacaaattggctgccagacagcgatggaaaccttggtcttttcgtcactgagaatcagagtgtctcttgcatgactgatgatgaacgcaacaaaccacacacaaacacacactcggtaccaggatgatcttctacattgcatccagacacgctactcgatcctgtcacgcctgtaatgtgctactgatgtgggctgccatttgtccagaatctgaagccagccccataacatcaagatatttgaatctattacatatagatcgcattccattatttgtccacgaaactggcgcaacactgtaccaccctggctcctgatctgggatacttacttctgtcattcactgaaatcttggctacacatccaagatggggacaaggcatcggagagtgtggtgcgctcatagctccgcgccatacccagaaacttgcagagacttccctatgaggaaagcaacaaactgagctgttcaggtcaccaccctcgtcaggcaacctcttatggcaatgttcttgatcagcagtgacaaaaccaactcagtcaacttcacgatgcgaagaggcagtgcctcagcaaaaccgcaatgcccagctccgactcaattgcccatgtaagccccacgaaacagcacattcccatccaggtatgttgttgctgcaatgcaatacaacagcccagcataagtatactatccatgcaatatacttcatcccggtgtagaatcacccatagattgtgcggatgtcgggcagtgtccctttgccacgacacacagcccacatgcacataaagaccaaaaccctgtggttgatcattataggaacaggctagaccaccacccatttcaagatcgatccctagtcagccaccaccacccccggaaatcacccagctcacgccccatcgcgttatgatagaaagattcattgcgatacgaaatgttccacgcctcactgttgattgtgacactctgtctagtttctatatcttggcaagatgactggtcctaggcaacatctaaattggtacCAAAAGCCACCAAATTCTTGAGTCATCTG-TCCACGTCGC-TCCTTCC-TCT-GTTACTGGAGATTGC-CCACAC---AGTGACCATTATCAGGCACTCAATG-GAC-GTCGTGAA-GAATGCTG-TGAGACAT-TTGAAT-CCTGGACAGAC-ACAA-ATGGTCTCTT-CTGATC-AG-TCACTCTTTGATTTGACCAAACAGATACAGTGGAAGTGGCCAGA-GAG-CTATGGTGAC-GACCAGATAGTGGTGATG-TTTGATGGC---CAACATAGA-GATGGCG-GCACTGAAGACA--A--------GGCTACAAGGGAGTGGTTG-G------------GTACAGGCCGAAATTGTGACAGC-AGGCT-TATTTCTGCGAG--------------CACCCCGTGTCTTG---CGCACAAGAA-GAGCACAT--C-AAGT--GA-------CTGC-AGCAG-CACTGT-A---CAT-TCTGCAAC--CCCG--TGCC-TACAA-GCACTACTG-TCTGG-GAGgctacttactgtcattttgcaccgcgtgacattacaggacgatgtgaatatcttgcgcatcatcgagaggtttctgctgattctcttctgtctgcgttgtgataccagagcaaaatgcaacagacattgacaaggccagagagaaaacttcgcaaggaagaacgctattgtcagctcatccttccaacgaaggtcagtctggaggaacaatatactaagggtgcatgtttatcaaggacgcgcatagttggggtgagattacttgccctaatcaccagagctttctatccaccaacccaagatcatgggttggtcgagcggactagtgaaggcagtctatacacttgctgtgacaccaggcgcttaacactgattcagcttacagctgcttggagctggttttttttgcaagagcaagaaaggggttgagacgctgcaagcgcaaaaaaggcctgccgcttcagtgtcaacaggcctctgtgtattttgaaggggacctgcacatgtttgatcggagcacaaagaaatttacaacacgtaacgtgtggcatgatgctcacattcggttgaacatgacactcatttgtgtacatggtatatctcagtatcgtaatactcccaacaagaccattgatatgaagtcattat
gi|11 : CAGTTCCAAAAATAGTATCTCCCCTTGCCGCCCTGTTA-CTATACTGATGTATCTC----------CT--T---CACT-AGCAACTAGCATCAAGAAGTCAGC-CTGTCCCAAATTGCTGCTAG-AGTG-GCGTCGATTGACCA-T-GGATACCT-CAGACAGCA-TA-CTGAT--GAAAGAATACTAAATG--TAGACAAAT-GTAAAGCAAAAGTC-CTGGAAA--AGCTA-TTGG-----ATAGTGGCAAATGGGA--AA-C-ATCTTTGGC-TGTTATT--TCATGCCAGTCTA------------TATCGA-TCA---GTCCCACG-CGC-TCTTTCC-ACTGCTTCCTGGAGAATGC-CCACAC---A-TGGTCATGATCTAGCACT
gi|12 : tgtcgccgagaggaagatttgacaagaaaataacagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggggatgctatccgcctcg-------------CAG--TTCAGA-GAAGATCTC--ACCAAAAGAAGAAATGATCTG-T-T-TTGGACA-G-GACAGAAAAGG-CAGTGGGAAC-ACCCTAAATCATTG-TCG-TATAACACAGTCTG-AAAGTGCATAT-CAGCATTATCCATT--TTAAGAA----TCC-GACTAAGGAGTGCAG-CCA-CAGAAAAGAGCTC-ACCT-CGTCA-G-------AACAGG--C---CG-TGA--AACTCAT-TGT------GCACTGTATGGATAC-AAAT-GGGAC---------TACTCGA---GACGA-GTAAAGATCGGGAAATTCTTTGTAGGGA---G-----TGTTTAAAT-TTTTTGTCCC-GA-GAATCA-GCGTGTCACTC---AGGCATT---TGTCATT--GACAGTAT-------AGAAGCCTTC---------TGCAC
gi|14 : G-GTTCCTCAGCA-TGGACCA-C--C--ACA---ACT-AT----GCTCGCTG-G----AT-----CCC---TGTA-CA---CATA-AGGGGCATGG---GAA---ATCTGC-C-T-C-CAACG-ATCACAG-AAGA-A-TTT----GA-A-----CAGC----AT-G----GACA--CTT-GG--TTGT-G--TTTA--A-GACCAC--AA---------------A--CAG-A-TTTTC-G---G----------CAA--TCCTAATCGACTAG-G--CT-T------ATA-AT-AAGAACAAT-GAC--ATT-T-TAGA-AGGGTCTG-AT--AGTGCT-----GTT--A-GA-CTC-ACT-GAAAAC
gi|15 : ----GCTAGGTG-G----AT-----ACC---AGTG-CA---CCAG-AAAGACATGAC-CAAA---CTC-AC-CTA-T-AAAC--ACC-CAG-ATGT-A-TCC--AGGC-A-ATTCCGGG----AA-G----CCCA--CTT-CA--C--C-G--TTCAA-A-AGACAC--AGAGTCAGAAAACACAAA--GGATGTTTCTT-T---T----------CAA--TCCCGATTGACAAG-G--CA-C------ATG-CG-TAGAATAAT-GACT-GCA-T-CAAA-GGAAAC-G-GCTAGGAAC-------TT--G-GG-CTC-ACT-GACAACC----CTacgtcaacatttctaaagtgggtgtttgcagaacttg
gi|16 : --------CACAAAGG---AGA--TT-----A-----CAGGTCC-TGCTGC-TGT-G-G---A-G-ACCGT--GA-TGAA----------TGCC-------------AA-------------GAGTAATGGTAAAGAGCAG--TTC-GA-GAC--TTTC--ACCAGA---------GAGT-G-TCTGTTGGACA-G-AACA---AAGT-CAGCAG--ACGACCC-----CATTCCTCG-TG----ACATGCGG-AAGGTGT---T-CAGCACT-T-CA------AACAA----GCCAGAGCAAGG-GT-CAG-CAA-CAG-------CT
gi|17 : gaggaAAATGGGCAAAACACCATTCGAGG-------AGGGG-AGTCAGCA-ATCATTAGTTCGTAACAACTGA----GTGA-----CACAAAAGGCCAGATGTT-----GGAATCCAGGCTC-TAGTGC-T-T-G-G---A-GAACGGTGGGA-TGAC----------TGCG-------------AA-------------AAA-------------CA
gi|19 : TC-T---T----------CAA--TCCCGATTGACCAG-G--CA-C------GTG-AG-CAGAATAAT-GGCT-TCA-T-CAAA-GGAGAC-A-GT--GGGGCA-----GTT--G-GT-CTC-ACT-GACAACT----CTA----G----TGTC--CT-ACGTCGCTGGATGGTaaggaattggcaaag
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Reference ( family-6471 ) : GGGGATGC-A-CGGTC---CAGGTCCAAGAGA-AGTNTCTCCC-TTGCCGCACT---ACTA-CGCTGATGTACCCC---C----ACT-AGCA----GCATCAAGAGGTCA-C-CTGTCCCAN----CTGCTAG-AGTG-GCGTC-ATTGACCATAGGATACCT-CAGACAGCA-TA-CTGAT--G-AAGAATACT-AATGGCTAGAC-AAT-GCAAAGC--AAGTC-CTGGAAGACAGC--ATTG-GC----ATAGTGGACAATGNCAACA-A-CATCTTGGGC-TG-CATT--TCATGCCAGTCGAAAGCCACCAAATTCTCGAGTCATCTGCCCCACGTCGC-TCCTTCC-ACT-CTTCCTGGAGAGTGC-CCACAC---G-TGGCCATGATCCGGCACTCAATG-GA-CGTCGTGAA-GAATGCTG-TGGAACAT-TTGAAT-CCTGGACAGA-C-A-CCAGTGGTCGCTT-TTGAT-CAG-TCACTNTTTGATTTGGCCAAACAGATACAGTGGAAGTGGCCAGA-GAG-CTATGGTGAC-GACCAGATAGTGGTGATG-TTTGATGG-CCTCCACATAG-AGATGGCG-GCACTGAAGACACTAG-GGGACTGGCTGCAAGGGAGTGGTTG-GGTG----CA--GCCGTGCAG-----GCCGAGATTGCGACAGCAGGG-NCATTCCTGCGAGCATCCCATGTCTTGACGCACAAGAAGAGCACAT--C-AAGT--GA-------CTGC-AGCAG-CACTGTAA-CA---TCCTGCAAC--ACC--GTG-CCTAC-AAGCACTACT-GTC-TGG-GAGAA-ACCAGGGATGCA-G---ANGAC--C---TCC--A-AGTTTGAAGACTGGTGTTGCC-AGAGAG-AAGACATACNCCATT-TTCA-CT-ACTGGGC--AACCGTACT-GG-ANCTAGATCATTCTATCGGTTCATAGT-----GT---ATGTTGGCGCTCTCA----CT-T--AGGCAGGG--ATCGTTAAT---GA-TGTACCT-CGGTGCT-CTG--AC-AGA-GCT-GGTCCACTG-GTTCCAC-GCACTGGATCA-C--A--CCC---ACT-AT----GCTAGGTG-G----AT-----ACC---AGTA-CA---CCTG-AAGGACATGGC-CGAA---CTC-GC-C-A-C-AAAC--ACC-CAG-ATGT-A-TTC--AGGA-A-ATTCCGGG----AA-G----GCCA--CTT-CA--C--C-G--TTCAG-A-AAACAC--AG---------------A--GGGTG-TTCTC-T---T----------CAA--TCCCGATTGACCAG-G--CA-C------ATG-AG-CAGAATAAT-GGCT-GCA-T-CAAA-GGAGAC-G-GT--GGAGCA-----GTT--G-GT-CTC-ACT-GACAACC----CTA----G----TGCC--CT-ACGTCGCTGGATGGTTGC-G-GGACC-AGAAGT-TGCC--AGGGTGATCGAAGAA-TTCCA-GGATGGGAG---C--CAAC-ACCGGAGACGGCG-AACAGCAG---A------TA--CACGTCA--TC-ATG-A--TC--A-GACG----CCAAG-TGTACAGGC-CTCA-T-TTGTG-AAAGATGTTCGCTC--TC-TCGT--TGGT-GT-CATAGAGGAGATGGGCAA--C-CCATTCGAGG-------AGGAGAGTCAG-AAT-A-TAGT---TAA------A----G--------CACAAAGG---AGA--TT-----G-----CAGGTCC-TGCTGC-CGT-G-G---A-G-ACCGT--GA-TGAA----------TGCC-------------AA-------------GA-------------GCAG--TTC-GA-GAC--TTTC--ACCA------GAGAGCG-TCTGTT--GGACAG-AA-CA---AAGG-CAGTGG--ACGACCC-----CATTCCTCG-TG----ACAAGCTG-AAGGTGT---TCAGCACT-T-CCATT-GC-AAGAA-G---CCAGAGCAAGG-GT-CAG-CAA-CAG-------CTC-GCCTCCGTCAAG-------AAC-GA--C---CG-TGA--A-CTC-TT-CGCAC-GCAC---G--TAC-AATT-GG--C---------TGCC--A---GACGA-G---AGAT--GGAAAC-CTT------GA---G-----T-------T-CTTTCGTCAC-GA-GAATCAGGCGTGTC-CTC---CTGCA-T---TGTC--T--GATGG--T-------AGAAGCC-TC---------TGCACT-GGTACCAAG--AGTGATCTTCTTA----CATGCTTGGAAG-AAGTCTCC-GACGCAAAGA-CA-AAGAAT-CCTGTC---ACGACCTGTATTG--T---G-CT----TG----GAGCGG-----C-AATT----GTCCAG-----ANNCT---GAAGCCAG-C----TGCA----T--CA---AAGAC--CNTTG-----AAGAGTA----TGCA-AA--CA--GATCGTCATT-CCATA-T-A-T--TGTCCACGAAACT---G-CAA-ACA----GTGTCACG--CCTGGAT-CTG-ATCTGGGA-TAC-TTACC--TCCTG--ATTCA--CTGAAA----GGTA-GT----ACACGGG--CAAAGCGGGGACAAGGCGT-GCGGA-AACG-TGTGGTG-GCT----G--CCGCTGCCATACCAGGAAACTGG-CA-GA-ACTT-CCTACGA-GT-GGACAGCAACAAGACTG-AGCTGTTCAGG---TT-C--CTCTCGGCAGCTCT
gi|1 : AAGAGGTCA-CGCTGTCCCAC----CGGCTA--AGTT-GCGTT-AAGAACCAGCGGATACTTTCAAAC-GCA-TA-CTGA-----GAGAATACC-AA-GGTAAGAC-AAT-G-AAAGC--AATCC-CTG--AGACAGC--AATGAGCCTTAATAGTGAGCGCCATCGACA-AACA-CTTGCGC-TG-CATTCCTCATGCTAGCCAAAAAGCACCAAATTCTCGAGTCATATGCCCCACGTCGCAGCCTTCCTACT-CTCCTT---GAGTGCACCATAA---G-TGGCCATGAACCGGCAGTCAATGAGACCGTCGTGAA-GAATGCTGATGGAACATCTTGACT-CCTGGACAGACC-ACCCCGTGGTCACTTCTTGATCCAGCTCACCTCTTGATTTTG-CAAACAGATACAATGGAAGTGGCCA-A-GA--CTAT-GTGACAGATCA-ATAA-AGTGATG-TTTGATGGCCCTCCAAGTAGAAGAT-GCGAGCACTGAA-ACACT-G-GGAACTGGCTGTCAATGAG-GGTTGCGGTG----CAGCGCCGAGTAGACTTTGCTCAGCTAGGGACAGCA-AG-TCATT-CTGCAAGCATCCCATGTCCTG-CACACA--AAGGGCACATGGC--AGT--GAACCTGTGCTGC---CAG-C-CTGTAAGCACATTCCTGCAACCAATCGAGTGCCCTACAAAGCACTACTGGTCTTGT-GAAAACACCAGGGATATATGAGTAAAAC--CATATCC--A-AGGTTGAGAGCTGGTGTTGCCAAGAGAG-AAGA-ATACACCATTCTTTAGCA-ACTGGGCCAAGCCGTATTCGG-ACCTAGATCAGTCTAT-G--TCATAGT-----GT---ACGTTGGCGTTCTCA----CTAT--AGCCATGGCAATCGTTAATAGCGATTGTACCTCCGGT-CT-CTG--AC-AGA-GTA-GTTCCATTGCGTT-CAC-GCACTGGACAA-C--AATCCC---ACT-AT----GCTA-GTG-G----AT-----ATC---AGTT-CAGTCCTTG-AAGGAAATG---TTAA---TCC-ACAC-A-C-CAAC--A-C-CAG-A-GT-A-TT----AGA-A-ATC---GG----CA-G----GTCA--CTTCCACTC--C-G--TTCCG---AAACAC--AG---------------A--GAGTG-TTGTCTT---T----------CAAAGTCCCGCATGACCAGCG--CACC------CTG-CGACAGAATACA-GACT-GCATT-CAAA-GAAGAT-GCGT--GGAGC------GTC--T-GT-CTC-A-T-GACAACCAAATCAAAAACA----TGCC--TTCACGTGGCAGGATG--TGC-G-GGACCGAGAA-T-TGTTAAAAGTTGATCGAAGAA-TT-CA-GG-T-GAAG---CAACAAC-TCC----AC--CG-GAC-GCAG---A------TA--CACATCA--T--ATGCA--TC--AGGAC-----CTAAG-GGT-CAGG--CTCA---TTGT--AAAGAGGTTCGCTT--TC-TCGTC-TGGT-GTGCATAGA-GAGATGGCCAA--A-TCATTCGAGG-------AGGAGAGTGGG-CAT-C-TAGT-----A------A----GCTGGA---CGCAAAGG---AGA--TT-----A-----CAAGTCCGTGATGA-C-T-G-GCCAA-G-AGAGT--TG-TG---------------C-------------AA-------------G--------------GCAAGTTTT-GA-GAC--TTCCAAACCA------GAGAGTG--CTGTT--GAACAG-AG-CA---AAGG-CAGAGG--ACAACCC-----CAT--CCCG-TG----AC-AGCTGCAAGGTGT---TCAGCACT-T-CAATT-CG-AAAAC-GCCCCCAG-GCAAGG----TAG-CAACCAG-------CTT-G-TTTCATCAAGACGACCAAAC-AA--CAAGCA-CAATCA-CAC-TT-CGCAC-GCACATAG--TACAAATT-GG--C---------TGCC--A---GAC-A-G---CGAT--GGAAAC-CTT------G----G-----T-------C-TTTTCGTCACTGA-GAATCAGA-GTGT--CTC---TTGCA-----TGAC--T--GATGA--TGAACGCAACAAACC-ACACACAAACACACACTCGGTACCAGG--A-TGATCTTC-TA----CA---TTGCA--------TCCAGACAC---GC-TA-CTCGAT-CCTGTC---ACG-CCTGTAATG--T---G-CTAC--TG----ATGTGGGCTGCC-ATTT----GTCCAG-----AATCT---GAAGCCAG-C----CCCA----TAACATC-AAGAT--ATTTG-----AAT-CTAT---TACA-TA--TA--GATCG-CATT-CCAT--T-ATT--TGTCCACGAAACTGGCG-CAACACT----GTACCAC---CCTGGCTCCTG-ATCTGGGA-TAC-TTA-C--TTCTGTCATTCA--CTGAAATCTTGGC---T----ACACATC--CAAGATGGGGACAAGGCAT--CGGA-GA-G-TGTGGTGCGCTCATAGCTCCGC-GCCATACCCAGAAACTTG-CA-GAGACTTCCCTATGA----GGAAAGCAACAA-ACTG-AGCTGTTCAGG---TCACCACCCTCGTCAG
gi|10 : tCAAAAGCCACCAAATTCTTGAGTCATCTG-TCCACGTCGC-TCCTTCC-TCT-GTTACTGGAGATTGC-CCACACA--G-TGACCATTATCAGGCACTCAATG-GA-CGTCGTGAA-GAATGCTG-TGAGACAT-TTGAAT-CCTGGACAGA-C-A-CAAATGGTCTCTT-CTGAT-CAG-TCACTCTTTGATTTGACCAAACAGATACAGTGGAAGTGGCCAGA-GAG-CTATGGTGAC-GACCAGATAGTGGTGATG-TTTGATGG-C--CAACATAG-AGATGGCG-GCACTGAAGACA--A--------GGCTACAAGGGAGTGGTTG-G--------------GTACAG-----GCCGAAATTGTGACAGCAGGC-TTATTTCTGCGAGCACCCCGTGTCTTG-CGCACAAGAAGAGCACAT--C-AAGT--GA-------CTGC-AGCAG-CACTGT-A-CA---TTCTGCAAC--CCC--GTG-CCTAC-AAGCACTACT-GTC-TGG-GAGgcaacctcttatggcaatgttcttgatcagcagtgacaaaaccaactcagtcaacttcacgatgcgaagaggcagtgcctcagcaaaaccgcaatgcccagctccgactcaattgcccatgtaagccccacgaaacagcacattcccatccaggtatgttgttgctgcaatgcaatacaacagcccagcataagtatactatccatgcaatatacttcatcccggtgtagaatcacccatagattgtgcggatgtcgggcagtgtccctttgccacgacacacagcccacatgcacataaagaccaaaaccctgtggttgatcattataggaacaggctagaccaccacccatttcaagatcgatccctagtcagccaccaccacccccggaaatcacccagctcacgccccatcgcgttatgatagaaagattcattgcgatacgaaatgttccacgcctcactgttgattgtgacactctgtctagtttctatatcttggcaagatgactggtcctaggcaacatctaaattggtacattgtccagaactcagccgagttgcgctacttactgtcattttgcaccgcgtgacattacaggacgatgtgaatatcttgcgcatcatcgagaggtttctgctgattctcttctgtctgcgttgtgataccagagcaaaatgcaacagacattgacaaggccagagagaaaacttcgcaaggaagaacgctattgtcagctcatccttccaacgaaggtcagtctggaggaacaatatactaagggtgcatgtttatcaaggacgcgcatagttggggtgagattacttgccctaatcaccagagctttctatccaccaacccaagatcatgggttggtcgagcggactagtgaaggcagtctatacacttgctgtgacaccaggcgcttaacactgattcagcttacagctgcttggagctggttttttttgcaagagcaagaaaggggttgagacgctgcaagcgcaaaaaaggcctgccgcttcagtgtcaacaggcctctgtgtattttgaaggggacctgcacatgtttgatcggagcacaaagaaatttacaacacgtaacgtgtggcatgatgctcacattcggttgaacatgacactcatttgtgtacatggtatatctcagtatcgtaatactcccaacaagaccattgatatgaagtcattat
gi|11 : GGGGATGCTATCCGCCTCGCAGTTCCAAAAAT-AGTATCTCCCCTTGCCGCCCTGTTACTA-TACTGATGTATCTC---CTTC-ACT-AGCAACTAGCATCAAGAAGTCAGC-CTGTCCCAAATTGCTGCTAG-AGTG-GCGTCGATTGACCAT-GGATACCT-CAGACAGCA-TA-CTGAT--GAAAGAATACTAAATG--TAGACAAAT-GTAAAGCAAAAGTC-CTGGAAA--AGCT-ATTG-G-----ATAGTGGCAAATGGGA--A-A-CATCTTTGGC-TGTTATT--TCATGCCAGTCTA------------TATCGA-TCA---GTCCCACG-CGC-TCTTTCC-ACTGCTTCCTGGAGAATGC-CCACAC---A-TGGTCATGATCTAGCACT
gi|12 : tgtcgccgagaggaagatttgacaagaaaataacagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAG--TTCAGA-GAAGATCTC--ACCAAAAGAAGAAATGA-TCTGTTTTGGACAG-GA-CAGAAAAGG-CAGTGGGAAC-ACCCTAAATCATTG-TCG-TATAACACAGTCTG-AAAGTGCATATCAGCATTAT-CCATT-TT-AAGAA-T---CC-GACTAAGGAGTGCAG-CCA-CAGAAAAGAGCTC-ACCTC-GTCA-G-------AACAGG--C---CG-TGA--AACTCATTGTGCACTGTAT---GGATAC-AAAT-GGGAC---------TACTCGA---GACGA-GTAAAGATCGGGAAATTCTTTGTAGGGA---G-----TGTTTAAAT-TTTTTGTCCC-GA-GAATCA-GCGTGTCACTC---AGGCATT---TGTCATT--GACAGTAT-------AGAAGCCTTC---------TGCAC
gi|14 : G-GTTCCTCAGCA-TGGACCA-C--C--ACA---ACT-AT----GCTCGCTG-G----AT-----CCC---TGTA-CA---CATA-AGGGGCATGG---GAA---ATCTGC-C-T-C-CAACG-ATCACAG-AAGA-A-TTT----GA-A-----CAGC----AT-G----GACA--CTT-GG--TTGT-G--TTTA--A-GACCAC--AA---------------A--CAG-A-TTTTC-G---G----------CAA--TCCTAATCGACTAG-G--CT-T------ATA-AT-AAGAACAAT-GAC--ATT-T-TAGA-AGGGTCTG-AT--AGTGCT-----GTT--A-GA-CTC-ACT-GAAAAC
gi|15 : ----GCTAGGTG-G----AT-----ACC---AGTG-CA---CCAG-AAAGACATGAC-CAAA---CTC-AC-CTA-T-AAAC--ACC-CAG-ATGT-A-TCC--AGGC-A-ATTCCGGG----AA-G----CCCA--CTT-CA--C--C-G--TTCAA-A-AGACAC--AGAGTCAGAAAACACAAA--GGATGTTTCTT-T---T----------CAA--TCCCGATTGACAAG-G--CA-C------ATG-CG-TAGAATAAT-GACT-GCA-T-CAAA-GGAAAC-G-GCTAGGAAC-------TT--G-GG-CTC-ACT-GACAACC----CTacgtcaacatttctaaagtgggtgtttgcagaacttg
gi|16 : --------CACAAAGG---AGA--TT-----A-----CAGGTCC-TGCTGC-TGT-G-G---A-G-ACCGT--GA-TGAA----------TGCC-------------AA-------------GAGTAATGGTAAAGAGCAG--TTC-GA-GAC--TTTC--ACCA------GAGAGTG-TCTGTT--GGACAG-AA-CA---AAGT-CAGCAG--ACGACCC-----CATTCCTCG-TG----ACATGCGG-AAGGTGT---TCAGCACT-T--CA------AACAA-G---CCAGAGCAAGG-GT-CAG-CAA-CAG-------CT
gi|17 : gaggaAAATGGGCAAAACACCATTCGAGG-------AGGGGAGTCAGCAATCATTAGTTCGTAACAACTGA----GTGA-----CACAAAAGGCCAGATGTT-----GGAATCCAGGCTC-TAGTGC-T-T-G-G---A-GAACGGTGGGA-TGAC----------TGCG-------------AA-------------AA-------------ACA
gi|19 : TC-T---T----------CAA--TCCCGATTGACCAG-G--CA-C------GTG-AG-CAGAATAAT-GGCT-TCA-T-CAAA-GGAGAC-A-GT--GGGGCA-----GTT--G-GT-CTC-ACT-GACAACT----CTA----G----TGTC--CT-ACGTCGCTGGATGGTaaggaattggcaaag
gi|2 : tgTCCAAGGGA-AGTCTCACCC-TTGCCGCACT---ACTAACACTGATGTACCTC---CGTCCACTCAGCA----TCATCAAG-GGTCA-C-CTGTCCCAA----GCGCTAGCAGTGTGTGGC--TTGACCATAGGAGAC-T-CA-ACAGAAATAGCCGATTGA-AAGAATACT-AATGGCTAGAC-AATTGCAAAGC--A-GTCGCTGGAAGACAGCCAGTTG-G------TAGTGGACAATGACAGCTTC-CATCTTGGGCCTG-CATT---CATGCCAGTCGAAACCCATCAAAT-CTCTAGCCATCTGTCCCACGTCGC-TC-TTCC-ACT-CTTCGTGGAGAATGCGCCACACCCAG-TGGCCTTAATCCATCAC-CAATG-GA-CGCCG-GAGCGAATGCTG-TGGAACAT-TTGAATTCCTGGACAGA-CAA-CCAGTGAT-GCTT-TTGAT-CAG-TCACTATTTGATTCGCCCAAACCGA-ACAGGGGAAGTGGCCAGAGGAGCCTATGGTGAG-AACCAG-TAGTGGTAATGCTTTGATGA-CCTCCACATTG-A-ATGGCG-CCACTAAAGACACTAGCGGGACTGG-TACAAGGGAGTGGTGA-GGGA----CA----------------GCCGAGATTGTGACAGCAGGACTCA-TCCGGCGAGCATCCCATGTCTTG-CTCATAAGAAGAG---AT--TAAAGTTGGA-------CTGCGAGTAGCCACTGTAA-CA---GTCCGCAAC--ACC--GTC-TCTAA-CAGCA-TACT-GTC-TGGTTAGAA-ACCAGAGATGTACG---ATGACCTC---TCC--A-AGTTGGAAGACTGGTGTTGCC-AGAGAGAAAGACATACCCCA---TTCA-CTAAATGGGC--AACACTACT-GGAAACAAGA--ATT---TTGGTTC--AAT------T---ATGT--GTGCTCT------CT-TGAAGGCAGGG--GTCGTTAAT---GA-TGTACCT-CAGTGCT-CTG--ACGAGA-GCT-AGTCTACT---TTCCAC-GCACT-GATCA-CCAA--CCC---ACT--T----GCTAGG-G-GATCTAT-----ACC---AGTACCA---CCTG-AAGGAAATGGC-TGAAG--CTC-GC-C-ATC-AAAC--ATC-CAA-ATGT-AGTTCGAGGGA-A-ATTCTGGGGACAAA-G----GCCA--CTT-TA--C--C-ATTTTCAGAA-AAACAC--AG---------------A--GGGTG--TCTC-T---T----------CAA--TCCCGATTGACCA--G--CA-C------ATG-AG-TA-AATAAT-GGCTGGCA-T-CAAA-GGAGAC-G-G---GGAGCA-----GTTGCG-AT-CTCAACTGGACA----------------------------ACGTCATCGGATGGTTGCGG-GGGCC-AGAAGTAAGCC--A-GGTGATTGAAGAA-TTCCA-GAATGGGAAT--C--CAAC-ACCGGAGACGGCA-AACAACAG---ATACTAGTA--CACTTCA--TC-ATG-A--TC--A-GACA----CTAAATTGGGCAGGCTTTCATT-TTGTT-AAAGATGTTTGCTT--TC-TCGT--T--T-GG-CCTAGAGGAGATGGCAAA--T-CCATTC-AAG-------AGGA--------------------------------------------CACAAAGG---AGA--TT-----------CA-GTCC-TGGCGC-TGT-G-G---AGG-ACCTT--GATTGAAGCCAAAGGATTGCC-------------AA-------------GA-------------GCAG---TC-GATTAC--GTTC--ACCA------GAGAGTGACCTGTT--GGACAG-AAGCA---AAGGACAGTGT--ACGACCC-----CATTCCT-G-TGA---ATAAGCTG-AAGG-GT---TACG-ACT-TCCCATT-GCAAAGAAGG---CCAGAGCAAAA-GT-CAGAAAA-CAG-------CTCGGCCTACGTCAAG-------AAC-AAACT---CGTTTA--A-CTC-TTGCGC-C-GCAC---G--TAC-AATTGGG--CGTATTACGGTGCA--A---GACGAGG---AGAT--GGAAAC-CTT------GAAGTG-----C-------TACTTTCATCAC-GATGAATCAGGCGTGCC-CCCCTACTGCA-TCCCTGTC--TTCGATGGCCT-------GGAAGCC-TC---------TGCACT-GGTA-TAAGCCAGTGATCTTCTTA----CATGCCTGGAAACACGTCCCT-GACGCAAAGA-CA-CAGAAT-TTTTTC---ACGATATGTATTGCCT---GCCC----TGAGGTGAGCAGC----C-AATT----ACCCAG-----AATCT---AATGCCAGTC----TGCA----T--CA---AAGACCACATTG-----AAGAGTA----TGCA-GA---A--GACTGTAATT-CTAT--T-A-CA-TATCCACGAAATT---G-CAA-ACA----GTGTCACGTTCCCGGAT-CTGTATCTGGGAGTACTTTACCGGTCCTG--ATTCATCCGGAAA----GGTATATATTAACACGGGCCCAAAGCGGGGACAAGACGTCGCGGACAACACTTTGGTG-GCT----G--CC-CTGCCATACCAGAAAATTAGCCACGA-ACTC-CTTACAAGGTGGGACAGCAGCAAGACTGAAGCTGTTGAGGCCCTT-C--CTCTCAGCAACTCT
gi|20 : TACT-GTC-TGG-GAGAA-AACAGGGATGCA-G---ATAAC--C---TCCCAG-AGTTTGAAGACTAGTGTTGCC-AGAGAA-AAGACATACACCATT-TTCA-CT-ACTGGGC--AAcactggagtggtgggaccaggaggacaagcaacttccgtccacctcactgatccgcagtgactgaataagagatattggcagtgctcagcatgccaa
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Reference ( family-6471 ) : GGGGATGC-A-CGGTC---CAG-T-CCAAGAGAAGTNTCTCCC-TTGCCGCACT---ACTA-CACTGATGTACCTCC--T-CACT-AGCA----GCATCAAGAGGTCA-C-CTGTCCCAN----CTGCTAG-AGTG-GCGTC-ATTGACCATAGGATACCT-CAGACAGCA-TA-CTGAT--G-AAGAATACT-AATGGCTAGAC-AAT-GCAAAGC--AAGTC-CTGGAAGACAGC--ATTG-GC----ATAGTGGACAATGNCAACA-A-CATCTTGGGC-TG-CATT--TCATGCCAGTCGAAAGCCACCAAATTCTCGAGTCATCTGCCCCACGTCGC-TCCTTCC-ACT-CTTCCTGGAGAGTGC-CCACAC---G-TGGCCATGATCCGGCACTCAATG-GA-CGTCGTGAA-GAATGCTG-TGGAACAT-TTGAAT-CCTGGACAGA-CA-CCAGTGGTCGCTT-TTGAT-CAG-TCACTNTTTGATTTGGCCAAACAGATACAGTGGAAGTGGCCAGAG-AGC-TATGGTGAC-GACCAGATAGTGGTGATG-TTTGATGG-CCTCCACATAG-AGATGGCG-GCACTGAAGACACTAG-GGGACTGGCTGCAAGGGAGTGGTTG-GGTG----CA---GTGC--AG--------GCCGAGATTGTGACAGCAGGG-TCATTCCTGCGAGCATCCCATGTCTTG-CGCACAAGAAGAGCACAT--C-AAGT--GA-------CTGC-AGCAG-CACTGTAA-CA---TCCTGCAAC--ACC--GTG-CCTAC-AAGCACTACT-GTC-TGG-GAGAA-ACCAGGGATGCA-G---ANGAC--C---TCC--A-AGTTTGAAGACTGGTGTTGCC-AGAGAG-AAGACATACNCCATT-TTCA-CT-ACTGGGC--AACCGTACT-GG-ANCTAGATCATTCTATCGGTTCATAGT-----GT---ATGTTGGCGCTCTCA----CT-T--AGGCAGGG--ATCGTTAAT---GA-TGTACCT-CGGTGCT-CTG--AC-AGA-GCT-GGTCCACTG-GTTCCAC-GCACTGGATCA-C--A--CCC---ACT-AT----GCTAGGTG-G----AT-----ACC---AGTA-CA---CCTG-AAGGACATGGC-CGAA---CTC-GC-C-A-C-AAAC--ACC-CAG-ATGT-A-TTC--AGGA-A-ATTCCGGG----AA-G----GCCA--CTT-CA--C--C-G--TTCAG-A-AAACAC--AG---------------A--GGGTG-TTCTC-T---T----------CAA--TCCCGATTGACCAG-G--CA-C------ATG-AG-CAGAATAAT-GGCT-GCA-T-CAAA-GGAGAC-G-GT--GGAGCA-----GTT--G-GT-CTC-ACT-GACAACC----CTA----G----TGCC--CT-ACGTCGCTGGATGGTTGC-G-GGACC-AGAAGT-TGCC--AGGGTGATCGAAGAA-TTCCA-GGATGGGAG---C--CAAC-ACCGGAGACGGCG-AACAGCAG---A------TA--CACGTCA--TC-ATG-A--TC--A-GACG----CCAAG-TGTACAGGC-CTCA-T-TTGTG-AAAGATGTTCGCTC--TC-TCGT--TGGT-GT-CATAGAGGAGATGGGCAA--C-CCATTCGAGG-------AGGAGAGTCAG-AAT-A-TAGT---TAA------A----G--------CACAAAGG---AGA--TT-----G-----CAGGTCC-TGCTGC-CGT-G-G---A-G-ACCGT--GA-TGAA----------TGCC-------------AA-------------GA-------------GCAG--TTC-GA-GAC--TTTC--ACCAGAG-----AGTG-TCTGTT--GGACAG-AA-CA---AAGG-CAGTGG--ACGACCC-----CATTCCTCG-TG----ACAAGCTG-AAGGTGT---TCAGCACT-T-CCATT-NC-AAGAA-G---CCAGAGCAAGG-GT-CAG-CAA-CAG-------CTC-GCCTCCGTCAAG-------AAC-GA--C---CG-TGA--A-CTC-TT-CGCAC-GCAC---G--TAC-AATT-GG--C---------TGCC--A---GACGA-G---AGAT--GGAAAC-CTT------GA---G-----T-------T-CTTTCGTCAC-GA-GAATCAGGCGTGTC-CTC---CTGCA-T---TGTC--T--GATGG--T-------AGAAGCC-TC---------TGCACT-GGTACCAAG--AGTGATCTTCTTA----CATGCTTGGAAG-AAGTCTCC-GACGCAAAG-ACA-AAGAA-TCCTGT---CACGACCTGTATTG--T---G-CT----TG----GAGCGG-----CAATT----GTCCAG-----ATGC---TGANGCCAG-C----CGCA----T--C---A--AAGAC--CNTT-----GAAGAGTA----TGC--A-AACA--GATCGTCA-TTCCAT-AT-AT-ATGTCCACGAAACT---G-CAA-ACA----GTGTCACG--CCTGGAT-CTG-ATCTGGGA-TAC-TTACC-TTCCTG--ATTCA--CTGAAA----GGTA-GT----ACACGGG--CAAAGCGGGGACAAGGCGT-GCGGA-AACG-TGTGGTG-GCT----G--CCGCTGCCATACCAGGAAACTGG-CA-GA-ACTT-CCTACGA-GT-GGACAGCAACAAGACTG-AGCTGTTCAGG---TT-C--CTCTCGGCAGCTCT
gi|1 : AAGAGGTCA-CGCTGTCCCAC----CGGCTA--AGTT-GCGTT-AAGAACCAGCGGATACTTTCAAAC-GCA-TA-CTGA-----GAGAATACC-AA-GGTAAGAC-AAT-G-AAAGC--AATCC-CTG--AGACAGC--AATGAGCCTTAATAGTGAGCGCCATCGACA-AACA-CTTGCGC-TG-CATTCCTCATGCTAGCCAAAAAGCACCAAATTCTCGAGTCATATGCCCCACGTCGCAGCCTTCCTACT-CTCCTT---GAGTGCACCATAA---G-TGGCCATGAACCGGCAGTCAATGAGACCGTCGTGAA-GAATGCTGATGGAACATCTTGACT-CCTGGACAGACCACCCCGTGGTCACTTCTTGATCCAGCTCACCTCTTGATTTTG-CAAACAGATACAATGGAAGTGGCCA-AG-A-C-TAT-GTGACAGATCA-ATAA-AGTGATG-TTTGATGGCCCTCCAAGTAGAAGAT-GCGAGCACTGAA-ACACT-G-GGAACTGGCTGTCAATGAG-GGTTGCGGTG----CA---GCGCCGAGTAGACTTTGCTCAGCTAGGGACAGCA-AG-TCATT-CTGCAAGCATCCCATGTCCTG-CACACA--AAGGGCACATGGC--AGT--GAACCTGTGCTGC---CAG-C-CTGTAAGCACATTCCTGCAACCAATCGAGTGCCCTACAAAGCACTACTGGTCTTGT-GAAAACACCAGGGATATATGAGTAAAAC--CATATCC--A-AGGTTGAGAGCTGGTGTTGCCAAGAGAG-AAGA-ATACACCATTCTTTAGCA-ACTGGGCCAAGCCGTATTCGG-ACCTAGATCAGTCTAT-G--TCATAGT-----GT---ACGTTGGCGTTCTCA----CTAT--AGCCATGGCAATCGTTAATAGCGATTGTACCTCCGGT-CT-CTG--AC-AGA-GTA-GTTCCATTGCGTT-CAC-GCACTGGACAA-C--AATCCC---ACT-AT----GCTA-GTG-G----AT-----ATC---AGTT-CAGTCCTTG-AAGGAAATG---TTAA---TCC-ACAC-A-C-CAAC--A-C-CAG-A-GT-A-TT----AGA-A-ATC---GG----CA-G----GTCA--CTTCCACTC--C-G--TTCCG---AAACAC--AG---------------A--GAGTG-TTGTCTT---T----------CAAAGTCCCGCATGACCAGCG--CACC------CTG-CGACAGAATACA-GACT-GCATT-CAAA-GAAGAT-GCGT--GGAGC------GTC--T-GT-CTC-A-T-GACAACCAAATCAAAAACA----TGCC--TTCACGTGGCAGGATG--TGC-G-GGACCGAGAA-T-TGTTAAAAGTTGATCGAAGAA-TT-CA-GG-T-GAAG---CAACAAC-TCC----AC--CG-GAC-GCAG---A------TA--CACATCA--T--ATGCA--TC--AGGAC-----CTAAG-GGT-CAGG--CTCA---TTGT--AAAGAGGTTCGCTT--TC-TCGTC-TGGT-GTGCATAGA-GAGATGGCCAA--A-TCATTCGAGG-------AGGAGAGTGGG-CAT-C-TAGT-----A------A----GCTGGA---CGCAAAGG---AGA--TT-----A-----CAAGTCCGTGATGA-C-T-G-GCCAA-G-AGAGT--TG-TG---------------C-------------AA-------------G--------------GCAAGTTTT-GA-GAC--TTCCAAACCAGAG-----AGTG--CTGTT--GAACAG-AG-CA---AAGG-CAGAGG--ACAACCC-----CAT--CCCG-TG----AC-AGCTGCAAGGTGT---TCAGCACT-T-CAATT-CG-AAAAC-GCCCCCAG-GCAAGG----TAG-CAACCAG-------CTT-G-TTTCATCAAGACGACCAAAC-AA--CAAGCA-CAATCA-CAC-TT-CGCAC-GCACATAG--TACAAATT-GG--C---------TGCC--A---GAC-A-G---CGAT--GGAAAC-CTT------G----G-----T-------C-TTTTCGTCACTGA-GAATCAGA-GTGT--CTC---TTGCA-----TGAC--T--GATGA--TGAACGCAACAAACC-ACACACAAACACACACTCGGTACCAGG--A-TGATCTTC-TA----CA---TTGCA--------TCCAGACAC---G-CTA-CTCGA-TCCTGT---CACG-CCTGTAATG--T---G-CTAC--TG----ATGTGGGCTGCCATTT----GTCCAG-----AATC---TGAAGCCAG-C----CCCA----TAAC---ATCAAGAT--ATTT-----GAAT-CTAT---TAC--A-TATA--GATCG-CA-TTCCAT--T-AT-TTGTCCACGAAACTGGCG-CAACACT----GTACCAC---CCTGGCTCCTG-ATCTGGGA-TAC-TTAC---TTCTGTCATTCA--CTGAAATCTTGGC---T----ACACATC--CAAGATGGGGACAAGGCAT--CGGA-GA-G-TGTGGTGCGCTCATAGCTCCGC-GCCATACCCAGAAACTTG-CA-GAGACTTCCCTATGA----GGAAAGCAACAA-ACTG-AGCTGTTCAGG---TCACCACCCTCGTCAG
gi|10 : tCAAAAGCCACCAAATTCTTGAGTCATCTG-TCCACGTCGC-TCCTTCC-TCT-GTTACTGGAGATTGC-CCACACA--G-TGACCATTATCAGGCACTCAATG-GA-CGTCGTGAA-GAATGCTG-TGAGACAT-TTGAAT-CCTGGACAGA-CA-CAAATGGTCTCTT-CTGAT-CAG-TCACTCTTTGATTTGACCAAACAGATACAGTGGAAGTGGCCAGAG-AGC-TATGGTGAC-GACCAGATAGTGGTGATG-TTTGATGG-C--CAACATAG-AGATGGCG-GCACTGAAGACA--A--------GGCTACAAGGGAGTGGTTG-G------------GTAC--AG--------GCCGAAATTGTGACAGCAGGC-TTATTTCTGCGAGCACCCCGTGTCTTG-CGCACAAGAAGAGCACAT--C-AAGT--GA-------CTGC-AGCAG-CACTGT-A-CA---TTCTGCAAC--CCC--GTG-CCTAC-AAGCACTACT-GTC-TGG-GAGgcaacctcttatggcaatgttcttgatcagcagtgacaaaaccaactcagtcaacttcacgatgcgaagaggcagtgcctcagcaaaaccgcaatgcccagctccgactcaattgcccatgtaagccccacgaaacagcacattcccatccaggtatgttgttgctgcaatgcaatacaacagcccagcataagtatactatccatgcaatatacttcatcccggtgtagaatcacccatagattgtgcggatgtcgggcagtgtccctttgccacgacacacagcccacatgcacataaagaccaaaaccctgtggttgatcattataggaacaggctagaccaccacccatttcaagatcgatccctagtcagccaccaccacccccggaaatcacccagctcacgccccatcgcgttatgatagaaagattcattgcgatacgaaatgttccacgcctcactgttgattgtgacactctgtctagtttctatatcttggcaagatgactggtcctaggcaacatctaaattggtacattgtccagaactcagccgagttgcgctacttactgtcattttgcaccgcgtgacattacaggacgatgtgaatatcttgcgcatcatcgagaggtttctgctgattctcttctgtctgcgttgtgataccagagcaaaatgcaacagacattgacaaggccagagagaaaacttcgcaaggaagaacgctattgtcagctcatccttccaacgaaggtcagtctggaggaacaatatactaagggtgcatgtttatcaaggacgcgcatagttggggtgagattacttgccctaatcaccagagctttctatccaccaacccaagatcatgggttggtcgagcggactagtgaaggcagtctatacacttgctgtgacaccaggcgcttaacactgattcagcttacagctgcttggagctggttttttttgcaagagcaagaaaggggttgagacgctgcaagcgcaaaaaaggcctgccgcttcagtgtcaacaggcctctgtgtattttgaaggggacctgcacatgtttgatcggagcacaaagaaatttacaacacgtaacgtgtggcatgatgctcacattcggttgaacatgacactcatttgtgtacatggtatatctcagtatcgtaatactcccaacaagaccattgatatgaagtcattat
gi|11 : GGGGATGCTATCCGCCTCGCAG-TTCCAAAAATAGTATCTCCCCTTGCCGCCCTGTTACTA-TACTGATGTATCTCC--TTCACT-AGCAACTAGCATCAAGAAGTCAGC-CTGTCCCAAATTGCTGCTAG-AGTG-GCGTCGATTGACCAT-GGATACCT-CAGACAGCA-TA-CTGAT--GAAAGAATACTAAATG--TAGACAAAT-GTAAAGCAAAAGTC-CTGGAAA--AGCT-ATTG-G-----ATAGTGGCAAATGGGA--A-A-CATCTTTGGC-TGTTATT--TCATGCCAGTCTA------------TATCGA-TCA---GTCCCACG-CGC-TCTTTCC-ACTGCTTCCTGGAGAATGC-CCACAC---A-TGGTCATGATCTAGCACT
gi|12 : tgtcgccgagaggaagatttgacaagaaaataacagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAG--TTCAGA-GAAGATCTC--ACCAAAAGAAGAAATGATCTGTTTTGGACAG-GA-CAGAAAAGG-CAGTGGGAAC-ACCCTAAATCATTG-TCG-TATAACACAGTCTG-AAAGTGCATATCAGCATTAT-CCATT-TT-AAGAA-T---CC-GACTAAGGAGTGCAG-CCA-CAGAAAAGAGCTC-ACCTC-GTCA-G-------AACAGG--C---CG-TGA--AACTCATTGTGCACTGTAT---GGATAC-AAAT-GGGAC---------TACTCGA---GACGA-GTAAAGATCGGGAAATTCTTTGTAGGGA---G-----TGTTTAAAT-TTTTTGTCCC-GA-GAATCA-GCGTGTCACTC---AGGCATT---TGTCATT--GACAGTAT-------AGAAGCCTTC---------TGCAC
gi|14 : G-GTTCCTCAGCA-TGGACCA-C--C--ACA---ACT-AT----GCTCGCTG-G----AT-----CCC---TGTA-CA---CATA-AGGGGCATGG---GAA---ATCTGC-C-T-C-CAACG-ATCACAG-AAGA-A-TTT----GA-A-----CAGC----AT-G----GACA--CTT-GG--TTGT-G--TTTA--A-GACCAC--AA---------------A--CAG-A-TTTTC-G---G----------CAA--TCCTAATCGACTAG-G--CT-T------ATA-AT-AAGAACAAT-GAC--ATT-T-TAGA-AGGGTCTG-AT--AGTGCT-----GTT--A-GA-CTC-ACT-GAAAAC
gi|15 : ----GCTAGGTG-G----AT-----ACC---AGTG-CA---CCAG-AAAGACATGAC-CAAA---CTC-AC-CTA-T-AAAC--ACC-CAG-ATGT-A-TCC--AGGC-A-ATTCCGGG----AA-G----CCCA--CTT-CA--C--C-G--TTCAA-A-AGACAC--AGAGTCAGAAAACACAAA--GGATGTTTCTT-T---T----------CAA--TCCCGATTGACAAG-G--CA-C------ATG-CG-TAGAATAAT-GACT-GCA-T-CAAA-GGAAAC-G-GCTAGGAAC-------TT--G-GG-CTC-ACT-GACAACC----CTacgtcaacatttctaaagtgggtgtttgcagaacttg
gi|16 : --------CACAAAGG---AGA--TT-----A-----CAGGTCC-TGCTGC-TGT-G-G---A-G-ACCGT--GA-TGAA----------TGCC-------------AA-------------GAGTAATGGTAAAGAGCAG--TTC-GA-GAC--TTTC--ACCAGAG-----AGTG-TCTGTT--GGACAG-AA-CA---AAGT-CAGCAG--ACGACCC-----CATTCCTCG-TG----ACATGCGG-AAGGTGT---TCAGCACT-T--CA------AACAA-G---CCAGAGCAAGG-GT-CAG-CAA-CAG-------CT
gi|17 : gaggaAAATGGGCAAAACACCATTCGAGG-------AGGGGAGTCAGCAATCATTAGTTCGTAACAACTGA----GTGA-----CACAAAAGGCCAGATGTT-----GGAATCCAGGCTC-TAGTGC-T-T-G-G---A-GAACGGTGGGA-TGAC----------TGCG-------------AA-------------AA-------------ACA
gi|19 : TC-T---T----------CAA--TCCCGATTGACCAG-G--CA-C------GTG-AG-CAGAATAAT-GGCT-TCA-T-CAAA-GGAGAC-A-GT--GGGGCA-----GTT--G-GT-CTC-ACT-GACAACT----CTA----G----TGTC--CT-ACGTCGCTGGATGGTaaggaattggcaaag
gi|2 : tg-T-CCAAGGGAAGTCTCACCC-TTGCCGCACT---ACTAACACTGATGTACCTCCGTC-CACTCAGCA----TCATCAAG-GGTCA-C-CTGTCCCAA----GCGCTAGCAGTGTGTGGC--TTGACCATAGGAGAC-T-CA-ACAGAAATAGCCGATTGA-AAGAATACT-AATGGCTAGAC-AATTGCAAAGC--A-GTCGCTGGAAGACAGCCAGTTG-G------TAGTGGACAATGACAGCTTC-CATCTTGGGCCTG-CATT---CATGCCAGTCGAAACCCATCAAAT-CTCTAGCCATCTGTCCCACGTCGC-TC-TTCC-ACT-CTTCGTGGAGAATGCGCCACACCCAG-TGGCCTTAATCCATCAC-CAATG-GA-CGCCG-GAGCGAATGCTG-TGGAACAT-TTGAATTCCTGGACAGA-CAACCAGTGAT-GCTT-TTGAT-CAG-TCACTATTTGATTCGCCCAAACCGA-ACAGGGGAAGTGGCCAGAGGAGCCTATGGTGAG-AACCAG-TAGTGGTAATGCTTTGATGA-CCTCCACATTG-A-ATGGCG-CCACTAAAGACACTAGCGGGACTGG-TACAAGGGAGTGGTGA-GGGA----CA---G----------------CCGAGATTGTGACAGCAGGACTCA-TCCGGCGAGCATCCCATGTCTTG-CTCATAAGAAGAG---AT--TAAAGTTGGA-------CTGCGAGTAGCCACTGTAA-CA---GTCCGCAAC--ACC--GTC-TCTAA-CAGCA-TACT-GTC-TGGTTAGAA-ACCAGAGATGTACG---ATGACCTC---TCC--A-AGTTGGAAGACTGGTGTTGCC-AGAGAGAAAGACATACCCCA---TTCA-CTAAATGGGC--AACACTACT-GGAAACAAGA--ATT---TTGGTTC--AAT------T---ATGT--GTGCTCT------CT-TGAAGGCAGGG--GTCGTTAAT---GA-TGTACCT-CAGTGCT-CTG--ACGAGA-GCT-AGTCTACT---TTCCAC-GCACT-GATCA-CCAA--CCC---ACT--T----GCTAGG-G-GATCTAT-----ACC---AGTACCA---CCTG-AAGGAAATGGC-TGAAG--CTC-GC-C-ATC-AAAC--ATC-CAA-ATGT-AGTTCGAGGGA-A-ATTCTGGGGACAAA-G----GCCA--CTT-TA--C--C-ATTTTCAGAA-AAACAC--AG---------------A--GGGTG--TCTC-T---T----------CAA--TCCCGATTGACCA--G--CA-C------ATG-AG-TA-AATAAT-GGCTGGCA-T-CAAA-GGAGAC-G-G---GGAGCA-----GTTGCG-AT-CTCAACTGGACA----------------------------ACGTCATCGGATGGTTGCGG-GGGCC-AGAAGTAAGCC--A-GGTGATTGAAGAA-TTCCA-GAATGGGAAT--C--CAAC-ACCGGAGACGGCA-AACAACAG---ATACTAGTA--CACTTCA--TC-ATG-A--TC--A-GACA----CTAAATTGGGCAGGCTTTCATT-TTGTT-AAAGATGTTTGCTT--TC-TCGT--T--T-GG-CCTAGAGGAGATGGCAAA--T-CCATTC-AAG-------AGGA--------------------------------------------CACAAAGG---AGA--TT-----------CA-GTCC-TGGCGC-TGT-G-G---AGG-ACCTT--GATTGAAGCCAAAGGATTGCC-------------AA-------------GA-------------GCAG---TC-GATTAC--GTTC--ACCAGAG-----AGTGACCTGTT--GGACAG-AAGCA---AAGGACAGTGT--ACGACCC-----CATTCCT-G-TGA---ATAAGCTG-AAGG-GT---TACG-ACT-TCCCATT-GCAAAGAAGG---CCAGAGCAAAA-GT-CAGAAAA-CAG-------CTCGGCCTACGTCAAG-------AAC-AAACT---CGTTTA--A-CTC-TTGCGC-C-GCAC---G--TAC-AATTGGG--CGTATTACGGTGCA--A---GACGAGG---AGAT--GGAAAC-CTT------GAAGTG-----C-------TACTTTCATCAC-GATGAATCAGGCGTGCC-CCCCTACTGCA-TCCCTGTC--TTCGATGGCCT-------GGAAGCC-TC---------TGCACT-GGTA-TAAGCCAGTGATCTTCTTA----CATGCCTGGAAACACGTCCCT-GACGCAAAG-ACA-CAGAA-TTTTTT---CACGATATGTATTGCCT---GCCC----TGAGGTGAGCAGC----CAATT----ACCCAG-----AATC---TAATGCCAGTC----TGCA----T--C---A--AAGACCACATT-----GAAGAGTA----TGC--A-GA-A--GACTGTAA-TTCTAT--T-AC-ATATCCACGAAATT---G-CAA-ACA----GTGTCACGTTCCCGGAT-CTGTATCTGGGAGTACTTTACCGGTCCTG--ATTCATCCGGAAA----GGTATATATTAACACGGGCCCAAAGCGGGGACAAGACGTCGCGGACAACACTTTGGTG-GCT----G--CC-CTGCCATACCAGAAAATTAGCCACGA-ACTC-CTTACAAGGTGGGACAGCAGCAAGACTGAAGCTGTTGAGGCCCTT-C--CTCTCAGCAACTCT
gi|20 : TACT-GTC-TGG-GAGAA-AACAGGGATGCA-G---ATAAC--C---TCCCAG-AGTTTGAAGACTAGTGTTGCC-AGAGAA-AAGACATACACCATT-TTCA-CT-ACTGGGC--AAcactggagtggtgggaccaggaggacaagcaacttccgtccacctcactgatccgcagtgactgaataagagatattggcagtgctcagcatgccaa
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Reference ( family-6471 ) : GGGGATGC-A--CG-CC---CAG-T-CCAAGANAAGTNTCTCCC-TTGCCGCACT---ACTA-CACTGATGTACCTCCGTC-ACT-AGCA----GCATCAAGAGGTCA-C-CTGTCCCAN----CTGCTAG-AGTG-GCGTC-ATTGACCATAGGATACCT-CAGACAGCA-TA-CTGAT--G-AAGAATACT-AATGGCTAGAC-AAT-GCAAAGC--AAGTC-CTGGAAGACAGC--ATTG-GC----ATAGTGGACAATGNCAACA-A-CATCTTGGGC-TG-CATT--TCATGCCAGTCGAAAGCCACCAAATTCTCGAGTCATCTGCCCCACGTCGC-TCCTTCC-ACT-CTTCCTGGAGAGTGC-CCACAC---G-TGGCCATGATCCGGCACTCAATG-GA-CGTCGTGAA-GAATGCTG-TGGAACAT-TTGAAT-CCTGGACAGA-CA-CCAGTGGTCGCTT-TTGAT-CAG-TCACTNTTTGATTTGGCCAAACAGATACAGTGGAAGTGGCCAGAG-AGC-TATGGTGAC-GACCAGATAGTGGTGATG-TTTGATGG-CCTCCACATAG-AGATGGCG-GCACTGAAGACACTAG-GGGACTGGCTGCAAGGGAGTGGTTG-GGTG----CA---GTGC--AG--------GCCGAGATTGTGACAGCAGGG-TCATTCCTGCGAGCATCCCATGTCTTG-CGCACAAGAAGAGCACAT--C-AAGT--GA-------CTGC-AGCAG-CACTGTAA-CA---TCCTGCAAC--ACC--GTG-CCTAC-AAGCACTACT-GTC-TGG-GAGAA-ACCAGGGATGCA-G---ANGAC--C---TCC--A-AGTTTGAAGACTGGTGTTGCC-AGAGAG-AAGACATACNCCATT-TTCA-CT-ACTGGGC--AACCGTACT-GG-ANCTAGATCATTCTATCGGTTCATAGT-----GT---ATGTTGGCGCTCTCA----CT-T--AGGCAGGG--ATCGTTAAT---GA-TGTACCT-CGGTGCT-CTG--AC-AGA-GCT-GGTCCACTG-GTTCCAC-GCACTGGATCA-C--A--CCC---ACT-AT----GCTAGGTG-G----AT-----ACC---AGTA-CA---CCTG-AAGGACATGGC-CGAA---CTC-GC-C-A-C-AAAC--ACC-CAG-ATGT-A-TTC--AGGA-A-ATTCCGGG----AA-G----GCCA--CTT-CA--C--C-G--TTCAG-A-AAACAC--AG---------------A--GGGTG-TTCTC-T---T----------CAA--TCCCGATTGACCAG-G--CA-C------ATG-AG-CAGAATAAT-GGCT-GCA-T-CAAA-GGAGAC-G-GT--GGAGCA-----GTT--G-GT-CTC-ACT-GACAACC----CTA----G----TGCC--CT-ACGTCGCTGGATGGTTGC-G-GGACC-AGAAGT-TGCC--AGGGTGATCGAAGAA-TTCCA-GGATGGGAG---C--CAAC-ACCGGAGACGGCG-AACAGCAG---A------TA--CACGTCA--TC-ATG-A--TC--A-GACG----CCAAG-TGTACAGGC-CTCA-T-TTGTG-AAAGATGTTCGCTC--TC-TCGT--TGGT-GT-CATAGAGGAGATGGGCAA--C-CCATTCGAGG-------AGGAGAGTCAG-AAT-A-TAGT---TAA------A----G--------CACAAAGG---AGA--TT-----G-----CAGGTCC-TGCTGC-CGT-G-G---A-G-ACCGT--GA-TGAA----------TGCC-------------AA-------------GA-------------GCAG--TTC-GA-GAC--TTTC--ACCAGAG-----AGTG-TCTGTT--GGACAG-AA-CA---AAGG-CAGTGG--ACGACCC-----CATTCCTCG-TG----ACAAGCTG-AAGGTGT---TCAGCACT-T-CCATT-NC-AAGAA-G---CCAGAGCAAGG-GT-CAG-CAA-CAG-------CTC-GCCTCCGTCAAG-------AAC-GA--C---CG-TGA--A-CTC-TT-CGCAC-GCAC---G--TAC-AATT-GG--C---------TGCC--A---GACGA-G---AGAT--GGAAAC-CTT------GA---G-----T-------T-CTTTCGTCAC-GA-GAATCAGGCGTGTC-CTC---CTGCA-T---TGTC--T--GATGG--T-------AGAAGCC-TC---------TGCACT-GGTACCAAG--AGTGATCTTCTTA----CATGCTTGGAAG-AAGTCTCC-GACGCAAAGA-CA-AAGAAT-CCTGTC---ACGACCTGTATTG--T---G-CT----TG----GAGCGG-----C-AATT----GTCCAG-----ATGCTGANG---CCAG-C----CGCA----T--CA---AAGAC--CNTTG-----AAGAGTA----TGCA-AA--CA--GATCGTCATT-CCATA-T-AT-ATGTCCACGAAACT---G-CAA-ACA----GTGTCACG--CCTGGAT-CTG-ATCTGGGA-TAC-TTACC-TTCCTG--ATTCA--CTGAAA----GGTA-GT----ACACGGG--CAAAGCGGGGACAAGGCGT-GCGGA-AACG-TGTGGTG-GCT----G--CCGCTGCCATACCAGGAAACTGG-CA-GA-ACTT-CCTACGA-GT-GGACAGCAACAAGACTG-AGCTGTTCAGG---TT-C--CTCTCGGCAGCTCT
gi|1 : AAGAGGTCA-CGCTGTCCCAC----CGGCTA--AGTT-GCGTT-AAGAACCAGCGGATACTTTCAAAC-GCA-TA-CTGA-----GAGAATACC-AA-GGTAAGAC-AAT-G-AAAGC--AATCC-CTG--AGACAGC--AATGAGCCTTAATAGTGAGCGCCATCGACA-AACA-CTTGCGC-TG-CATTCCTCATGCTAGCCAAAAAGCACCAAATTCTCGAGTCATATGCCCCACGTCGCAGCCTTCCTACT-CTCCTT---GAGTGCACCATAA---G-TGGCCATGAACCGGCAGTCAATGAGACCGTCGTGAA-GAATGCTGATGGAACATCTTGACT-CCTGGACAGACCACCCCGTGGTCACTTCTTGATCCAGCTCACCTCTTGATTTTG-CAAACAGATACAATGGAAGTGGCCA-AG-A-C-TAT-GTGACAGATCA-ATAA-AGTGATG-TTTGATGGCCCTCCAAGTAGAAGAT-GCGAGCACTGAA-ACACT-G-GGAACTGGCTGTCAATGAG-GGTTGCGGTG----CA---GCGCCGAGTAGACTTTGCTCAGCTAGGGACAGCA-AG-TCATT-CTGCAAGCATCCCATGTCCTG-CACACA--AAGGGCACATGGC--AGT--GAACCTGTGCTGC---CAG-C-CTGTAAGCACATTCCTGCAACCAATCGAGTGCCCTACAAAGCACTACTGGTCTTGT-GAAAACACCAGGGATATATGAGTAAAAC--CATATCC--A-AGGTTGAGAGCTGGTGTTGCCAAGAGAG-AAGA-ATACACCATTCTTTAGCA-ACTGGGCCAAGCCGTATTCGG-ACCTAGATCAGTCTAT-G--TCATAGT-----GT---ACGTTGGCGTTCTCA----CTAT--AGCCATGGCAATCGTTAATAGCGATTGTACCTCCGGT-CT-CTG--AC-AGA-GTA-GTTCCATTGCGTT-CAC-GCACTGGACAA-C--AATCCC---ACT-AT----GCTA-GTG-G----AT-----ATC---AGTT-CAGTCCTTG-AAGGAAATG---TTAA---TCC-ACAC-A-C-CAAC--A-C-CAG-A-GT-A-TT----AGA-A-ATC---GG----CA-G----GTCA--CTTCCACTC--C-G--TTCCG---AAACAC--AG---------------A--GAGTG-TTGTCTT---T----------CAAAGTCCCGCATGACCAGCG--CACC------CTG-CGACAGAATACA-GACT-GCATT-CAAA-GAAGAT-GCGT--GGAGC------GTC--T-GT-CTC-A-T-GACAACCAAATCAAAAACA----TGCC--TTCACGTGGCAGGATG--TGC-G-GGACCGAGAA-T-TGTTAAAAGTTGATCGAAGAA-TT-CA-GG-T-GAAG---CAACAAC-TCC----AC--CG-GAC-GCAG---A------TA--CACATCA--T--ATGCA--TC--AGGAC-----CTAAG-GGT-CAGG--CTCA---TTGT--AAAGAGGTTCGCTT--TC-TCGTC-TGGT-GTGCATAGA-GAGATGGCCAA--A-TCATTCGAGG-------AGGAGAGTGGG-CAT-C-TAGT-----A------A----GCTGGA---CGCAAAGG---AGA--TT-----A-----CAAGTCCGTGATGA-C-T-G-GCCAA-G-AGAGT--TG-TG---------------C-------------AA-------------G--------------GCAAGTTTT-GA-GAC--TTCCAAACCAGAG-----AGTG--CTGTT--GAACAG-AG-CA---AAGG-CAGAGG--ACAACCC-----CAT--CCCG-TG----AC-AGCTGCAAGGTGT---TCAGCACT-T-CAATT-CG-AAAAC-GCCCCCAG-GCAAGG----TAG-CAACCAG-------CTT-G-TTTCATCAAGACGACCAAAC-AA--CAAGCA-CAATCA-CAC-TT-CGCAC-GCACATAG--TACAAATT-GG--C---------TGCC--A---GAC-A-G---CGAT--GGAAAC-CTT------G----G-----T-------C-TTTTCGTCACTGA-GAATCAGA-GTGT--CTC---TTGCA-----TGAC--T--GATGA--TGAACGCAACAAACC-ACACACAAACACACACTCGGTACCAGG--A-TGATCTTC-TA----CA---TTGCA--------TCCAGACAC---GC-TA-CTCGAT-CCTGTC---ACG-CCTGTAATG--T---G-CTAC--TG----ATGTGGGCTGCC-ATTT----GTCCAG-----AATCTGAAG---CCAG-C----CCCA----TAACATC-AAGAT--ATTTG-----AAT-CTAT---TACA-TA--TA--GATCG-CATT-CCAT--T-AT-TTGTCCACGAAACTGGCG-CAACACT----GTACCAC---CCTGGCTCCTG-ATCTGGGA-TAC-TTAC---TTCTGTCATTCA--CTGAAATCTTGGC---T----ACACATC--CAAGATGGGGACAAGGCAT--CGGA-GA-G-TGTGGTGCGCTCATAGCTCCGC-GCCATACCCAGAAACTTG-CA-GAGACTTCCCTATGA----GGAAAGCAACAA-ACTG-AGCTGTTCAGG---TCACCACCCTCGTCAG
gi|10 : tCAAAAGCCACCAAATTCTTGAGTCATCTG-TCCACGTCGC-TCCTTCC-TCT-GTTACTGGAGATTGC-CCACACA--G-TGACCATTATCAGGCACTCAATG-GA-CGTCGTGAA-GAATGCTG-TGAGACAT-TTGAAT-CCTGGACAGA-CA-CAAATGGTCTCTT-CTGAT-CAG-TCACTCTTTGATTTGACCAAACAGATACAGTGGAAGTGGCCAGAG-AGC-TATGGTGAC-GACCAGATAGTGGTGATG-TTTGATGG-C--CAACATAG-AGATGGCG-GCACTGAAGACA--A--------GGCTACAAGGGAGTGGTTG-G------------GTAC--AG--------GCCGAAATTGTGACAGCAGGC-TTATTTCTGCGAGCACCCCGTGTCTTG-CGCACAAGAAGAGCACAT--C-AAGT--GA-------CTGC-AGCAG-CACTGT-A-CA---TTCTGCAAC--CCC--GTG-CCTAC-AAGCACTACT-GTC-TGG-GAGgcaacctcttatggcaatgttcttgatcagcagtgacaaaaccaactcagtcaacttcacgatgcgaagaggcagtgcctcagcaaaaccgcaatgcccagctccgactcaattgcccatgtaagccccacgaaacagcacattcccatccaggtatgttgttgctgcaatgcaatacaacagcccagcataagtatactatccatgcaatatacttcatcccggtgtagaatcacccatagattgtgcggatgtcgggcagtgtccctttgccacgacacacagcccacatgcacataaagaccaaaaccctgtggttgatcattataggaacaggctagaccaccacccatttcaagatcgatccctagtcagccaccaccacccccggaaatcacccagctcacgccccatcgcgttatgatagaaagattcattgcgatacgaaatgttccacgcctcactgttgattgtgacactctgtctagtttctatatcttggcaagatgactggtcctaggcaacatctaaattggtacattgtccagaactcagccgagttgcgctacttactgtcattttgcaccgcgtgacattacaggacgatgtgaatatcttgcgcatcatcgagaggtttctgctgattctcttctgtctgcgttgtgataccagagcaaaatgcaacagacattgacaaggccagagagaaaacttcgcaaggaagaacgctattgtcagctcatccttccaacgaaggtcagtctggaggaacaatatactaagggtgcatgtttatcaaggacgcgcatagttggggtgagattacttgccctaatcaccagagctttctatccaccaacccaagatcatgggttggtcgagcggactagtgaaggcagtctatacacttgctgtgacaccaggcgcttaacactgattcagcttacagctgcttggagctggttttttttgcaagagcaagaaaggggttgagacgctgcaagcgcaaaaaaggcctgccgcttcagtgtcaacaggcctctgtgtattttgaaggggacctgcacatgtttgatcggagcacaaagaaatttacaacacgtaacgtgtggcatgatgctcacattcggttgaacatgacactcatttgtgtacatggtatatctcagtatcgtaatactcccaacaagaccattgatatgaagtcattat
gi|11 : GGGGATGCTATCCG-CCTCGCAG-TTCCAAAAATAGTATCTCCCCTTGCCGCCCTGTTACTA-TACTGATGTATCTCCTTC-ACT-AGCAACTAGCATCAAGAAGTCAGC-CTGTCCCAAATTGCTGCTAG-AGTG-GCGTCGATTGACCAT-GGATACCT-CAGACAGCA-TA-CTGAT--GAAAGAATACTAAATG--TAGACAAAT-GTAAAGCAAAAGTC-CTGGAAA--AGCT-ATTG-G-----ATAGTGGCAAATGGGA--A-A-CATCTTTGGC-TGTTATT--TCATGCCAGTCTA------------TATCGA-TCA---GTCCCACG-CGC-TCTTTCC-ACTGCTTCCTGGAGAATGC-CCACAC---A-TGGTCATGATCTAGCACT
gi|12 : tgtcgccgagaggaagatttgacaagaaaataacagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAG--TTCAGA-GAAGATCTC--ACCAAAAGAAGAAATGATCTGTTTTGGACAG-GA-CAGAAAAGG-CAGTGGGAAC-ACCCTAAATCATTG-TCG-TATAACACAGTCTG-AAAGTGCATATCAGCATTAT-CCATT-TT-AAGAA-T---CC-GACTAAGGAGTGCAG-CCA-CAGAAAAGAGCTC-ACCTC-GTCA-G-------AACAGG--C---CG-TGA--AACTCATTGTGCACTGTAT---GGATAC-AAAT-GGGAC---------TACTCGA---GACGA-GTAAAGATCGGGAAATTCTTTGTAGGGA---G-----TGTTTAAAT-TTTTTGTCCC-GA-GAATCA-GCGTGTCACTC---AGGCATT---TGTCATT--GACAGTAT-------AGAAGCCTTC---------TGCAC
gi|14 : G-GTTCCTCAGCA-TGGACCA-C--C--ACA---ACT-AT----GCTCGCTG-G----AT-----CCC---TGTA-CA---CATA-AGGGGCATGG---GAA---ATCTGC-C-T-C-CAACG-ATCACAG-AAGA-A-TTT----GA-A-----CAGC----AT-G----GACA--CTT-GG--TTGT-G--TTTA--A-GACCAC--AA---------------A--CAG-A-TTTTC-G---G----------CAA--TCCTAATCGACTAG-G--CT-T------ATA-AT-AAGAACAAT-GAC--ATT-T-TAGA-AGGGTCTG-AT--AGTGCT-----GTT--A-GA-CTC-ACT-GAAAAC
gi|15 : ----GCTAGGTG-G----AT-----ACC---AGTG-CA---CCAG-AAAGACATGAC-CAAA---CTC-AC-CTA-T-AAAC--ACC-CAG-ATGT-A-TCC--AGGC-A-ATTCCGGG----AA-G----CCCA--CTT-CA--C--C-G--TTCAA-A-AGACAC--AGAGTCAGAAAACACAAA--GGATGTTTCTT-T---T----------CAA--TCCCGATTGACAAG-G--CA-C------ATG-CG-TAGAATAAT-GACT-GCA-T-CAAA-GGAAAC-G-GCTAGGAAC-------TT--G-GG-CTC-ACT-GACAACC----CTacgtcaacatttctaaagtgggtgtttgcagaacttg
gi|16 : --------CACAAAGG---AGA--TT-----A-----CAGGTCC-TGCTGC-TGT-G-G---A-G-ACCGT--GA-TGAA----------TGCC-------------AA-------------GAGTAATGGTAAAGAGCAG--TTC-GA-GAC--TTTC--ACCAGAG-----AGTG-TCTGTT--GGACAG-AA-CA---AAGT-CAGCAG--ACGACCC-----CATTCCTCG-TG----ACATGCGG-AAGGTGT---TCAGCACT-T--CA------AACAA-G---CCAGAGCAAGG-GT-CAG-CAA-CAG-------CT
gi|17 : gaggaAAATGGGCAAAACACCATTCGAGG-------AGGGGAGTCAGCAATCATTAGTTCGTAACAACTGA----GTGA-----CACAAAAGGCCAGATGTT-----GGAATCCAGGCTC-TAGTGC-T-T-G-G---A-GAACGGTGGGA-TGAC----------TGCG-------------AA-------------AA-------------ACA
gi|19 : TC-T---T----------CAA--TCCCGATTGACCAG-G--CA-C------GTG-AG-CAGAATAAT-GGCT-TCA-T-CAAA-GGAGAC-A-GT--GGGGCA-----GTT--G-GT-CTC-ACT-GACAACT----CTA----G----TGTC--CT-ACGTCGCTGGATGGTaaggaattggcaaag
gi|2 : tg-T-CCAAGGGAAGTCTCACCC-TTGCCGCACT---ACTAACACTGATGTACCTCCGTCCACTCAGCA----TCATCAAG-GGTCA-C-CTGTCCCAA----GCGCTAGCAGTGTGTGGC--TTGACCATAGGAGAC-T-CA-ACAGAAATAGCCGATTGA-AAGAATACT-AATGGCTAGAC-AATTGCAAAGC--A-GTCGCTGGAAGACAGCCAGTTG-G------TAGTGGACAATGACAGCTTC-CATCTTGGGCCTG-CATT---CATGCCAGTCGAAACCCATCAAAT-CTCTAGCCATCTGTCCCACGTCGC-TC-TTCC-ACT-CTTCGTGGAGAATGCGCCACACCCAG-TGGCCTTAATCCATCAC-CAATG-GA-CGCCG-GAGCGAATGCTG-TGGAACAT-TTGAATTCCTGGACAGA-CAACCAGTGAT-GCTT-TTGAT-CAG-TCACTATTTGATTCGCCCAAACCGA-ACAGGGGAAGTGGCCAGAGGAGCCTATGGTGAG-AACCAG-TAGTGGTAATGCTTTGATGA-CCTCCACATTG-A-ATGGCG-CCACTAAAGACACTAGCGGGACTGG-TACAAGGGAGTGGTGA-GGGA----CA---G----------------CCGAGATTGTGACAGCAGGACTCA-TCCGGCGAGCATCCCATGTCTTG-CTCATAAGAAGAG---AT--TAAAGTTGGA-------CTGCGAGTAGCCACTGTAA-CA---GTCCGCAAC--ACC--GTC-TCTAA-CAGCA-TACT-GTC-TGGTTAGAA-ACCAGAGATGTACG---ATGACCTC---TCC--A-AGTTGGAAGACTGGTGTTGCC-AGAGAGAAAGACATACCCCA---TTCA-CTAAATGGGC--AACACTACT-GGAAACAAGA--ATT---TTGGTTC--AAT------T---ATGT--GTGCTCT------CT-TGAAGGCAGGG--GTCGTTAAT---GA-TGTACCT-CAGTGCT-CTG--ACGAGA-GCT-AGTCTACT---TTCCAC-GCACT-GATCA-CCAA--CCC---ACT--T----GCTAGG-G-GATCTAT-----ACC---AGTACCA---CCTG-AAGGAAATGGC-TGAAG--CTC-GC-C-ATC-AAAC--ATC-CAA-ATGT-AGTTCGAGGGA-A-ATTCTGGGGACAAA-G----GCCA--CTT-TA--C--C-ATTTTCAGAA-AAACAC--AG---------------A--GGGTG--TCTC-T---T----------CAA--TCCCGATTGACCA--G--CA-C------ATG-AG-TA-AATAAT-GGCTGGCA-T-CAAA-GGAGAC-G-G---GGAGCA-----GTTGCG-AT-CTCAACTGGACA----------------------------ACGTCATCGGATGGTTGCGG-GGGCC-AGAAGTAAGCC--A-GGTGATTGAAGAA-TTCCA-GAATGGGAAT--C--CAAC-ACCGGAGACGGCA-AACAACAG---ATACTAGTA--CACTTCA--TC-ATG-A--TC--A-GACA----CTAAATTGGGCAGGCTTTCATT-TTGTT-AAAGATGTTTGCTT--TC-TCGT--T--T-GG-CCTAGAGGAGATGGCAAA--T-CCATTC-AAG-------AGGA--------------------------------------------CACAAAGG---AGA--TT-----------CA-GTCC-TGGCGC-TGT-G-G---AGG-ACCTT--GATTGAAGCCAAAGGATTGCC-------------AA-------------GA-------------GCAG---TC-GATTAC--GTTC--ACCAGAG-----AGTGACCTGTT--GGACAG-AAGCA---AAGGACAGTGT--ACGACCC-----CATTCCT-G-TGA---ATAAGCTG-AAGG-GT---TACG-ACT-TCCCATT-GCAAAGAAGG---CCAGAGCAAAA-GT-CAGAAAA-CAG-------CTCGGCCTACGTCAAG-------AAC-AAACT---CGTTTA--A-CTC-TTGCGC-C-GCAC---G--TAC-AATTGGG--CGTATTACGGTGCA--A---GACGAGG---AGAT--GGAAAC-CTT------GAAGTG-----C-------TACTTTCATCAC-GATGAATCAGGCGTGCC-CCCCTACTGCA-TCCCTGTC--TTCGATGGCCT-------GGAAGCC-TC---------TGCACT-GGTA-TAAGCCAGTGATCTTCTTA----CATGCCTGGAAACACGTCCCT-GACGCAAAGA-CA-CAGAAT-TTTTTC---ACGATATGTATTGCCT---GCCC----TGAGGTGAGCAGC----C-AATT----ACCCAG-----AATCTAATG---CCAGTC----TGCA----T--CA---AAGACCACATTG-----AAGAGTA----TGCA-GA---A--GACTGTAATT-CTAT--T-AC-ATATCCACGAAATT---G-CAA-ACA----GTGTCACGTTCCCGGAT-CTGTATCTGGGAGTACTTTACCGGTCCTG--ATTCATCCGGAAA----GGTATATATTAACACGGGCCCAAAGCGGGGACAAGACGTCGCGGACAACACTTTGGTG-GCT----G--CC-CTGCCATACCAGAAAATTAGCCACGA-ACTC-CTTACAAGGTGGGACAGCAGCAAGACTGAAGCTGTTGAGGCCCTT-C--CTCTCAGCAACTCT
gi|20 : TACT-GTC-TGG-GAGAA-AACAGGGATGCA-G---ATAAC--C---TCCCAG-AGTTTGAAGACTAGTGTTGCC-AGAGAA-AAGACATACACCATT-TTCA-CT-ACTGGGC--AAcactggagtggtgggaccaggaggacaagcaacttccgtccacctcactgatccgcagtgactgaataagagatattggcagtgctcagcatgccaa
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Reference ( family-6471 ) : GGGGATGC-A--CG-CC---CAG-T-CCAAGANAAGTNTCTCCC-TTGCCGCACT---ACTA-CACTGATGTACCTCCGTC-ACT-AGCA----GCATCAAGAGGTCA-C-CTGTCCCAN----CTGCTAG-AGTG-GCGTC-ATTGACCATAGGATACCT-CAGACAGCA-TA-CTGAT--G-AAGAATACT-AATGGCTAGAC-AAT-GCAAAGC--AAGTC-CTGGAAGACAGC--ATTG-GC----ATAGTGGACAATGNCAACA-A-CATCTTGGGC-TG-CATT--TCATGCCAGTCGAAAGCCACCAAATTCTCGAGTCATCTGCCCCACGTCGC-TCCTTCC-ACT-CTTCCTGGAGAGTGC-CCACAC---G-TGGCCATGATCCGGCACTCAATG-GA-CGTCGTGAA-GAATGCTG-TGGAACAT-TTGAAT-CCTGGACAGA-CA-CCAGTGGTCGCTT-TTGAT-CAG-TCACTNTTTGATTTGGCCAAACAGATACAGTGGAAGTGGCCAGAG-AGC-TATGGTGAC-GACCAGATAGTGGTGATG-TTTGATGG-CCTCCACATAG-AGATGGCG-GCACTGAAGACACTAG-GGGACTGGCTGCAAGGGAGTGGTTG-GGTG----CA---GTGC--AG--------GCCGAGATTGTGACAGCAGGG-TCATTCCTGCGAGCATCCCATGTCTTG-CGCACAAGAAGAGCACAT--C-AAGT--GA-------CTGC-AGCAG-CACTGTAA-CA---TCCTGCAAC--ACC--GTG-CCTAC-AAGCACTACT-GTC-TGG-GAGAA-ACCAGGGATGCA-G---ANGAC--C---TCC--A-AGTTTGAAGACTGGTGTTGCC-AGAGAG-AAGACATACNCCATT-TTCA-CT-ACTGGGC--AACCGTACT-GG-ANCTAGATCATTCTATCGGTTCATAGT-----GT---ATGTTGGCGCTCTCA----CT-T--AGGCAGGG--ATCGTTAAT---GA-TGTACCT-CGGTGCT-CTG--AC-AGA-GCT-GGTCCACTG-GTTCCAC-GCACTGGATCA-C--A--CCC---ACT-AT----GCTAGGTG-G----AT-----ACC---AGTA-CA---CCTG-AAGGACATGGC-CGAA---CTC-GC-C-A-C-AAAC--ACC-CAG-ATGT-A-TTC--AGGA-A-ATTCCGGG----AA-G----GCCA--CTT-CA--C--C-G--TTCAG-A-AAACAC--AG---------------A--GGGTG-TTCTC-T---T----------CAA--TCCCGATTGACCAG-G--CA-C------ATG-AG-CAGAATAAT-GGCT-GCA-T-CAAA-GGAGAC-G-GT--GGAGCA-----GTT--G-GT-CTC-ACT-GACAACC----CTA----G----TGCC--CT-ACGTCGCTGGATGGTTGC-G-GGACC-AGAAGT-TGCC--AGGGTGATCGAAGAA-TTCCA-GGATGGGAG---C--CAAC-ACCGGAGACGGCG-AACAGCAG---A------TA--CACGTCA--TC-ATG-A--TC--A-GACG----CCAAG-TGTACAGGC-CTCA-T-TTGTG-AAAGATGTTCGCTC--TC-TCGT--TGGT-GT-CATAGAGGAGATGGGCAA--C-CCATTCGAGG-------AGGAGAGTCAG-AAT-A-TAGT---TAA------A----G--------CACAAAGG---AGA--TT-----G-----CAGGTCC-TGCTGC-CGT-G-G---A-G-ACCGT--GA-TGAA----------TGCC-------------AA-------------GA-------------GCAG--TTC-GA-GAC--TTTC--ACCAGAG-----AGTG-TCTGTT--GGACAG-AA-CA---AAGG-CAGTGG--ACGACCC-----CATTCCTCG-TG----ACAAGCTG-AAGGTGT---TCAGCACT-T-CCATT-NC-AAGAA-G---CCAGAGCAAGG-GT-CAG-CAA-CAG-------CTC-GCCTCCGTCAAG-------AAC-GA--C---CG-TGA--A-CTC-TT-CGCAC-GCAC---G--TAC-AATT-GG--C---------TGCC--A---GACGA-G---AGAT--GGAAAC-CTT------GA---G-----T-------T-CTTTCGTCAC-GA-GAATCAGGCGTGTC-CTC---CTGCA-T---TGTC--T--GATGG--T-------AGAAGCC-TC---------TGCACT-GGTACCAAG--AGTGATCTTCTTA----CATGCTTGGAAG-AAGTCTCC-GACGCAAAGA-CA-AAGAAT-CCTGTC---ACGACCTGTATTG--T---G-CT----TG----GAGCGG-----C-AATT----GTCCAG-----ATGCTGANG---CCAG-C----CGCA----T--CA---AAGAC--CNTTG-----AAGAGTA----TGCA-AA--CA--GATCGTCATT-CCATA-T-AT-ATGTCCACGAAACT---G-CAA-ACA----GTGTCACG--CCTGGAT-CTG-ATCTGGGA-TAC-TTACC-TTCCTG--ATTCA--CTGAAA----GGTA-GT----ACACGGG--CAAAGCGGGGACAAGGCGT-GCGGA-AACG-TGTGGTG-GCT----G--CCGCTGCCATACCAGGAAACTGG-CA-GA-ACTT-CCTACGA-GT-GGACAGCAACAAGACTG-AGCTGTTCAGG---TT-C--CTCTCGGCAGCTCT
gi|1 : AAGAGGTCA-CGCTGTCCCAC----CGGCTA--AGTT-GCGTT-AAGAACCAGCGGATACTTTCAAAC-GCA-TA-CTGA-----GAGAATACC-AA-GGTAAGAC-AAT-G-AAAGC--AATCC-CTG--AGACAGC--AATGAGCCTTAATAGTGAGCGCCATCGACA-AACA-CTTGCGC-TG-CATTCCTCATGCTAGCCAAAAAGCACCAAATTCTCGAGTCATATGCCCCACGTCGCAGCCTTCCTACT-CTCCTT---GAGTGCACCATAA---G-TGGCCATGAACCGGCAGTCAATGAGACCGTCGTGAA-GAATGCTGATGGAACATCTTGACT-CCTGGACAGACCACCCCGTGGTCACTTCTTGATCCAGCTCACCTCTTGATTTTG-CAAACAGATACAATGGAAGTGGCCA-AG-A-C-TAT-GTGACAGATCA-ATAA-AGTGATG-TTTGATGGCCCTCCAAGTAGAAGAT-GCGAGCACTGAA-ACACT-G-GGAACTGGCTGTCAATGAG-GGTTGCGGTG----CA---GCGCCGAGTAGACTTTGCTCAGCTAGGGACAGCA-AG-TCATT-CTGCAAGCATCCCATGTCCTG-CACACA--AAGGGCACATGGC--AGT--GAACCTGTGCTGC---CAG-C-CTGTAAGCACATTCCTGCAACCAATCGAGTGCCCTACAAAGCACTACTGGTCTTGT-GAAAACACCAGGGATATATGAGTAAAAC--CATATCC--A-AGGTTGAGAGCTGGTGTTGCCAAGAGAG-AAGA-ATACACCATTCTTTAGCA-ACTGGGCCAAGCCGTATTCGG-ACCTAGATCAGTCTAT-G--TCATAGT-----GT---ACGTTGGCGTTCTCA----CTAT--AGCCATGGCAATCGTTAATAGCGATTGTACCTCCGGT-CT-CTG--AC-AGA-GTA-GTTCCATTGCGTT-CAC-GCACTGGACAA-C--AATCCC---ACT-AT----GCTA-GTG-G----AT-----ATC---AGTT-CAGTCCTTG-AAGGAAATG---TTAA---TCC-ACAC-A-C-CAAC--A-C-CAG-A-GT-A-TT----AGA-A-ATC---GG----CA-G----GTCA--CTTCCACTC--C-G--TTCCG---AAACAC--AG---------------A--GAGTG-TTGTCTT---T----------CAAAGTCCCGCATGACCAGCG--CACC------CTG-CGACAGAATACA-GACT-GCATT-CAAA-GAAGAT-GCGT--GGAGC------GTC--T-GT-CTC-A-T-GACAACCAAATCAAAAACA----TGCC--TTCACGTGGCAGGATG--TGC-G-GGACCGAGAA-T-TGTTAAAAGTTGATCGAAGAA-TT-CA-GG-T-GAAG---CAACAAC-TCC----AC--CG-GAC-GCAG---A------TA--CACATCA--T--ATGCA--TC--AGGAC-----CTAAG-GGT-CAGG--CTCA---TTGT--AAAGAGGTTCGCTT--TC-TCGTC-TGGT-GTGCATAGA-GAGATGGCCAA--A-TCATTCGAGG-------AGGAGAGTGGG-CAT-C-TAGT-----A------A----GCTGGA---CGCAAAGG---AGA--TT-----A-----CAAGTCCGTGATGA-C-T-G-GCCAA-G-AGAGT--TG-TG---------------C-------------AA-------------G--------------GCAAGTTTT-GA-GAC--TTCCAAACCAGAG-----AGTG--CTGTT--GAACAG-AG-CA---AAGG-CAGAGG--ACAACCC-----CAT--CCCG-TG----AC-AGCTGCAAGGTGT---TCAGCACT-T-CAATT-CG-AAAAC-GCCCCCAG-GCAAGG----TAG-CAACCAG-------CTT-G-TTTCATCAAGACGACCAAAC-AA--CAAGCA-CAATCA-CAC-TT-CGCAC-GCACATAG--TACAAATT-GG--C---------TGCC--A---GAC-A-G---CGAT--GGAAAC-CTT------G----G-----T-------C-TTTTCGTCACTGA-GAATCAGA-GTGT--CTC---TTGCA-----TGAC--T--GATGA--TGAACGCAACAAACC-ACACACAAACACACACTCGGTACCAGG--A-TGATCTTC-TA----CA---TTGCA--------TCCAGACAC---GC-TA-CTCGAT-CCTGTC---ACG-CCTGTAATG--T---G-CTAC--TG----ATGTGGGCTGCC-ATTT----GTCCAG-----AATCTGAAG---CCAG-C----CCCA----TAACATC-AAGAT--ATTTG-----AAT-CTAT---TACA-TA--TA--GATCG-CATT-CCAT--T-AT-TTGTCCACGAAACTGGCG-CAACACT----GTACCAC---CCTGGCTCCTG-ATCTGGGA-TAC-TTAC---TTCTGTCATTCA--CTGAAATCTTGGC---T----ACACATC--CAAGATGGGGACAAGGCAT--CGGA-GA-G-TGTGGTGCGCTCATAGCTCCGC-GCCATACCCAGAAACTTG-CA-GAGACTTCCCTATGA----GGAAAGCAACAA-ACTG-AGCTGTTCAGG---TCACCACCCTCGTCAG
gi|10 : tCAAAAGCCACCAAATTCTTGAGTCATCTG-TCCACGTCGC-TCCTTCC-TCT-GTTACTGGAGATTGC-CCACACA--G-TGACCATTATCAGGCACTCAATG-GA-CGTCGTGAA-GAATGCTG-TGAGACAT-TTGAAT-CCTGGACAGA-CA-CAAATGGTCTCTT-CTGAT-CAG-TCACTCTTTGATTTGACCAAACAGATACAGTGGAAGTGGCCAGAG-AGC-TATGGTGAC-GACCAGATAGTGGTGATG-TTTGATGG-C--CAACATAG-AGATGGCG-GCACTGAAGACA--A--------GGCTACAAGGGAGTGGTTG-G------------GTAC--AG--------GCCGAAATTGTGACAGCAGGC-TTATTTCTGCGAGCACCCCGTGTCTTG-CGCACAAGAAGAGCACAT--C-AAGT--GA-------CTGC-AGCAG-CACTGT-A-CA---TTCTGCAAC--CCC--GTG-CCTAC-AAGCACTACT-GTC-TGG-GAGgcaacctcttatggcaatgttcttgatcagcagtgacaaaaccaactcagtcaacttcacgatgcgaagaggcagtgcctcagcaaaaccgcaatgcccagctccgactcaattgcccatgtaagccccacgaaacagcacattcccatccaggtatgttgttgctgcaatgcaatacaacagcccagcataagtatactatccatgcaatatacttcatcccggtgtagaatcacccatagattgtgcggatgtcgggcagtgtccctttgccacgacacacagcccacatgcacataaagaccaaaaccctgtggttgatcattataggaacaggctagaccaccacccatttcaagatcgatccctagtcagccaccaccacccccggaaatcacccagctcacgccccatcgcgttatgatagaaagattcattgcgatacgaaatgttccacgcctcactgttgattgtgacactctgtctagtttctatatcttggcaagatgactggtcctaggcaacatctaaattggtacattgtccagaactcagccgagttgcgctacttactgtcattttgcaccgcgtgacattacaggacgatgtgaatatcttgcgcatcatcgagaggtttctgctgattctcttctgtctgcgttgtgataccagagcaaaatgcaacagacattgacaaggccagagagaaaacttcgcaaggaagaacgctattgtcagctcatccttccaacgaaggtcagtctggaggaacaatatactaagggtgcatgtttatcaaggacgcgcatagttggggtgagattacttgccctaatcaccagagctttctatccaccaacccaagatcatgggttggtcgagcggactagtgaaggcagtctatacacttgctgtgacaccaggcgcttaacactgattcagcttacagctgcttggagctggttttttttgcaagagcaagaaaggggttgagacgctgcaagcgcaaaaaaggcctgccgcttcagtgtcaacaggcctctgtgtattttgaaggggacctgcacatgtttgatcggagcacaaagaaatttacaacacgtaacgtgtggcatgatgctcacattcggttgaacatgacactcatttgtgtacatggtatatctcagtatcgtaatactcccaacaagaccattgatatgaagtcattat
gi|11 : GGGGATGCTATCCG-CCTCGCAG-TTCCAAAAATAGTATCTCCCCTTGCCGCCCTGTTACTA-TACTGATGTATCTCCTTC-ACT-AGCAACTAGCATCAAGAAGTCAGC-CTGTCCCAAATTGCTGCTAG-AGTG-GCGTCGATTGACCAT-GGATACCT-CAGACAGCA-TA-CTGAT--GAAAGAATACTAAATG--TAGACAAAT-GTAAAGCAAAAGTC-CTGGAAA--AGCT-ATTG-G-----ATAGTGGCAAATGGGA--A-A-CATCTTTGGC-TGTTATT--TCATGCCAGTCTA------------TATCGA-TCA---GTCCCACG-CGC-TCTTTCC-ACTGCTTCCTGGAGAATGC-CCACAC---A-TGGTCATGATCTAGCACT
gi|12 : tgtcgccgagaggaagatttgacaagaaaataacagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAG--TTCAGA-GAAGATCTC--ACCAAAAGAAGAAATGATCTGTTTTGGACAG-GA-CAGAAAAGG-CAGTGGGAAC-ACCCTAAATCATTG-TCG-TATAACACAGTCTG-AAAGTGCATATCAGCATTAT-CCATT-TT-AAGAA-T---CC-GACTAAGGAGTGCAG-CCA-CAGAAAAGAGCTC-ACCTC-GTCA-G-------AACAGG--C---CG-TGA--AACTCATTGTGCACTGTAT---GGATAC-AAAT-GGGAC---------TACTCGA---GACGA-GTAAAGATCGGGAAATTCTTTGTAGGGA---G-----TGTTTAAAT-TTTTTGTCCC-GA-GAATCA-GCGTGTCACTC---AGGCATT---TGTCATT--GACAGTAT-------AGAAGCCTTC---------TGCAC
gi|14 : G-GTTCCTCAGCA-TGGACCA-C--C--ACA---ACT-AT----GCTCGCTG-G----AT-----CCC---TGTA-CA---CATA-AGGGGCATGG---GAA---ATCTGC-C-T-C-CAACG-ATCACAG-AAGA-A-TTT----GA-A-----CAGC----AT-G----GACA--CTT-GG--TTGT-G--TTTA--A-GACCAC--AA---------------A--CAG-A-TTTTC-G---G----------CAA--TCCTAATCGACTAG-G--CT-T------ATA-AT-AAGAACAAT-GAC--ATT-T-TAGA-AGGGTCTG-AT--AGTGCT-----GTT--A-GA-CTC-ACT-GAAAAC
gi|15 : ----GCTAGGTG-G----AT-----ACC---AGTG-CA---CCAG-AAAGACATGAC-CAAA---CTC-AC-CTA-T-AAAC--ACC-CAG-ATGT-A-TCC--AGGC-A-ATTCCGGG----AA-G----CCCA--CTT-CA--C--C-G--TTCAA-A-AGACAC--AGAGTCAGAAAACACAAA--GGATGTTTCTT-T---T----------CAA--TCCCGATTGACAAG-G--CA-C------ATG-CG-TAGAATAAT-GACT-GCA-T-CAAA-GGAAAC-G-GCTAGGAAC-------TT--G-GG-CTC-ACT-GACAACC----CTacgtcaacatttctaaagtgggtgtttgcagaacttg
gi|16 : --------CACAAAGG---AGA--TT-----A-----CAGGTCC-TGCTGC-TGT-G-G---A-G-ACCGT--GA-TGAA----------TGCC-------------AA-------------GAGTAATGGTAAAGAGCAG--TTC-GA-GAC--TTTC--ACCAGAG-----AGTG-TCTGTT--GGACAG-AA-CA---AAGT-CAGCAG--ACGACCC-----CATTCCTCG-TG----ACATGCGG-AAGGTGT---TCAGCACT-T--CA------AACAA-G---CCAGAGCAAGG-GT-CAG-CAA-CAG-------CT
gi|17 : gaggaAAATGGGCAAAACACCATTCGAGG-------AGGGGAGTCAGCAATCATTAGTTCGTAACAACTGA----GTGA-----CACAAAAGGCCAGATGTT-----GGAATCCAGGCTC-TAGTGC-T-T-G-G---A-GAACGGTGGGA-TGAC----------TGCG-------------AA-------------AA-------------ACA
gi|19 : TC-T---T----------CAA--TCCCGATTGACCAG-G--CA-C------GTG-AG-CAGAATAAT-GGCT-TCA-T-CAAA-GGAGAC-A-GT--GGGGCA-----GTT--G-GT-CTC-ACT-GACAACT----CTA----G----TGTC--CT-ACGTCGCTGGATGGTaaggaattggcaaag
gi|2 : tg-T-CCAAGGGAAGTCTCACCC-TTGCCGCACT---ACTAACACTGATGTACCTCCGTCCACTCAGCA----TCATCAAG-GGTCA-C-CTGTCCCAA----GCGCTAGCAGTGTGTGGC--TTGACCATAGGAGAC-T-CA-ACAGAAATAGCCGATTGA-AAGAATACT-AATGGCTAGAC-AATTGCAAAGC--A-GTCGCTGGAAGACAGCCAGTTG-G------TAGTGGACAATGACAGCTTC-CATCTTGGGCCTG-CATT---CATGCCAGTCGAAACCCATCAAAT-CTCTAGCCATCTGTCCCACGTCGC-TC-TTCC-ACT-CTTCGTGGAGAATGCGCCACACCCAG-TGGCCTTAATCCATCAC-CAATG-GA-CGCCG-GAGCGAATGCTG-TGGAACAT-TTGAATTCCTGGACAGA-CAACCAGTGAT-GCTT-TTGAT-CAG-TCACTATTTGATTCGCCCAAACCGA-ACAGGGGAAGTGGCCAGAGGAGCCTATGGTGAG-AACCAG-TAGTGGTAATGCTTTGATGA-CCTCCACATTG-A-ATGGCG-CCACTAAAGACACTAGCGGGACTGG-TACAAGGGAGTGGTGA-GGGA----CA---G----------------CCGAGATTGTGACAGCAGGACTCA-TCCGGCGAGCATCCCATGTCTTG-CTCATAAGAAGAG---AT--TAAAGTTGGA-------CTGCGAGTAGCCACTGTAA-CA---GTCCGCAAC--ACC--GTC-TCTAA-CAGCA-TACT-GTC-TGGTTAGAA-ACCAGAGATGTACG---ATGACCTC---TCC--A-AGTTGGAAGACTGGTGTTGCC-AGAGAGAAAGACATACCCCA---TTCA-CTAAATGGGC--AACACTACT-GGAAACAAGA--ATT---TTGGTTC--AAT------T---ATGT--GTGCTCT------CT-TGAAGGCAGGG--GTCGTTAAT---GA-TGTACCT-CAGTGCT-CTG--ACGAGA-GCT-AGTCTACT---TTCCAC-GCACT-GATCA-CCAA--CCC---ACT--T----GCTAGG-G-GATCTAT-----ACC---AGTACCA---CCTG-AAGGAAATGGC-TGAAG--CTC-GC-C-ATC-AAAC--ATC-CAA-ATGT-AGTTCGAGGGA-A-ATTCTGGGGACAAA-G----GCCA--CTT-TA--C--C-ATTTTCAGAA-AAACAC--AG---------------A--GGGTG--TCTC-T---T----------CAA--TCCCGATTGACCA--G--CA-C------ATG-AG-TA-AATAAT-GGCTGGCA-T-CAAA-GGAGAC-G-G---GGAGCA-----GTTGCG-AT-CTCAACTGGACA----------------------------ACGTCATCGGATGGTTGCGG-GGGCC-AGAAGTAAGCC--A-GGTGATTGAAGAA-TTCCA-GAATGGGAAT--C--CAAC-ACCGGAGACGGCA-AACAACAG---ATACTAGTA--CACTTCA--TC-ATG-A--TC--A-GACA----CTAAATTGGGCAGGCTTTCATT-TTGTT-AAAGATGTTTGCTT--TC-TCGT--T--T-GG-CCTAGAGGAGATGGCAAA--T-CCATTC-AAG-------AGGA--------------------------------------------CACAAAGG---AGA--TT-----------CA-GTCC-TGGCGC-TGT-G-G---AGG-ACCTT--GATTGAAGCCAAAGGATTGCC-------------AA-------------GA-------------GCAG---TC-GATTAC--GTTC--ACCAGAG-----AGTGACCTGTT--GGACAG-AAGCA---AAGGACAGTGT--ACGACCC-----CATTCCT-G-TGA---ATAAGCTG-AAGG-GT---TACG-ACT-TCCCATT-GCAAAGAAGG---CCAGAGCAAAA-GT-CAGAAAA-CAG-------CTCGGCCTACGTCAAG-------AAC-AAACT---CGTTTA--A-CTC-TTGCGC-C-GCAC---G--TAC-AATTGGG--CGTATTACGGTGCA--A---GACGAGG---AGAT--GGAAAC-CTT------GAAGTG-----C-------TACTTTCATCAC-GATGAATCAGGCGTGCC-CCCCTACTGCA-TCCCTGTC--TTCGATGGCCT-------GGAAGCC-TC---------TGCACT-GGTA-TAAGCCAGTGATCTTCTTA----CATGCCTGGAAACACGTCCCT-GACGCAAAGA-CA-CAGAAT-TTTTTC---ACGATATGTATTGCCT---GCCC----TGAGGTGAGCAGC----C-AATT----ACCCAG-----AATCTAATG---CCAGTC----TGCA----T--CA---AAGACCACATTG-----AAGAGTA----TGCA-GA---A--GACTGTAATT-CTAT--T-AC-ATATCCACGAAATT---G-CAA-ACA----GTGTCACGTTCCCGGAT-CTGTATCTGGGAGTACTTTACCGGTCCTG--ATTCATCCGGAAA----GGTATATATTAACACGGGCCCAAAGCGGGGACAAGACGTCGCGGACAACACTTTGGTG-GCT----G--CC-CTGCCATACCAGAAAATTAGCCACGA-ACTC-CTTACAAGGTGGGACAGCAGCAAGACTGAAGCTGTTGAGGCCCTT-C--CTCTCAGCAACTCT
gi|20 : TACT-GTC-TGG-GAGAA-AACAGGGATGCA-G---ATAAC--C---TCCCAG-AGTTTGAAGACTAGTGTTGCC-AGAGAA-AAGACATACACCATT-TTCA-CT-ACTGGGC--AAcactggagtggtgggaccaggaggacaagcaacttccgtccacctcactgatccgcagtgactgaataagagatattggcagtgctcagcatgccaa
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|10 : tCAAAAGCCACCAAATTCTTGAGTCATCTGTCC-ACGTCGC-TCCTTCC-TCT-GTTACTGGAGATTGC-CCACAC--AGTGACCATTATCAGGCACTCAATG-GA-CGTCGTGAA-GAATGCTG-TGAGACAT-TTGAAT-CCTGGACAGA-CA-CAAATGGTCTCTT-CTGAT-CAG-TCACTCTTTGATTTGACCAAACAGATACAGTGGAAGTGGCCAGA-GAG-CTATGGTGAC-GACCAGATAGTGGTGATG-TTTGATGG-C--CAACATAG-AGATGGCG-GCACTGAAGACA--A--------GGCTACAAGGGAGTGGTTG-GGTA------------CAG-GCCGAA-A----TTGT---------GACAGCAGG-CTTATTTCTGCGAGCACCCCGTGTCTTG-CGCACAAGAAGAGCACAT--C-AAGT--GA-------CTGC-AGCAG-CACTGT-A--CA---TTCTGCAAC--CCC--GTG-CCTAC-AAGCACTACT-GTC-TGG-GAGgcaacctcttatggcaatgttcttgatcagcagtgacaaaaccaactcagtcaacttcacgatgcgaagaggcagtgcctcagcaaaaccgcaatgcccagctccgactcaattgcccatgtaagccccacgaaacagcacattcccatccaggtatgttgttgctgcaatgcaatacaacagcccagcataagtatactatccatgcaatatacttcatcccggtgtagaatcacccatagattgtgcggatgtcgggcagtgtccctttgccacgacacacagcccacatgcacataaagaccaaaaccctgtggttgatcattataggaacaggctagaccaccacccatttcaagatcgatccctagtcagccaccaccacccccggaaatcacccagctcacgccccatcgcgttatgatagaaagattcattgcgatacgaaatgttccacgcctcactgttgattgtgacactctgtctagtttctatatcttggcaagatgactggtcctaggcaacatctaaattggtacattgtccagaactcagccgagttgcgctacttactgtcattttgcaccgcgtgacattacaggacgatgtgaatatcttgcgcatcatcgagaggtttctgctgattctcttctgtctgcgttgtgataccagagcaaaatgcaacagacattgacaaggccagagagaaaacttcgcaaggaagaacgctattgtcagctcatccttccaacgaaggtcagtctggaggaacaatatactaagggtgcatgtttatcaaggacgcgcatagttggggtgagattacttgccctaatcaccagagctttctatccaccaacccaagatcatgggttggtcgagcggactagtgaaggcagtctatacacttgctgtgacaccaggcgcttaacactgattcagcttacagctgcttggagctggttttttttgcaagagcaagaaaggggttgagacgctgcaagcgcaaaaaaggcctgccgcttcagtgtcaacaggcctctgtgtattttgaaggggacctgcacatgtttgatcggagcacaaagaaatttacaacacgtaacgtgtggcatgatgctcacattcggttgaacatgacactcatttgtgtacatggtatatctcagtatcgtaatactcccaacaagaccattgatatgaagtcattat
gi|11 : GGGGATGCTATCCG-CCTCGCAG-TTCCAAAAATAGTATCTCCCCTTGCCGCCCTGTTACTA-TACTGATGTATCTCCTTC-ACT-AGCAACTAGCATCAAGAAGTCAGC-CTGTCCCAAATTGCTGCTAG-AGTG-GCGTCGATTGA-CCAT-GGATACCT-CAGACAGCA-TA-CTGAT--GAAAGAATACTAAATG--TAGACAAAT-GTAAAGCAAAAGTC-CTGGAAA--AGCT-A-------TTGGA-TA--GTG---GCAAATGGGAA---ACATCTTTGGC-TGTTATT--TCATGCCAGTCTA------------TATCGA-TCA---GTCCCACG-CGC-TCTTTCC-ACTGCTTCCTGGAGAATGC-CCACAC--A-TGGTCATGATCTAGCACT
gi|12 : tgtcgccgagaggaagatttgacaagaaaataacagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAG--TTCAGA-GAAGATCTC--ACCAAAAGAAGAAATGATCTGTTTTGGACAG-GA-CAGAAAAGG-CAGTGGGAAC-ACCCTAAATCATTG-TCGT-ATAACACAGTCTG-AAAGTGCATATCAGCATTAT-CCATTT-T-AAGAA-T---CC-GACTAAGGAGTGCAG-CCA-CAGAAAAGAGCTC-ACCTC-GTCA-G-------AACAGG--C---CG-TGA--AACTCATTGTGCACTGTAT---GGATAC-AAAT-GGGAC---------TACTCGA---GACGA-GTAAAGATCGGGAAATTCTTTGTAGGGA---G-----TGTTTAAAT-TTTTTGTCCC-GA-GAATCA-GCGTGTCACTC---AGGCATT---TGTCATT--GACAGTAT-------AGAAGCCTTC---------TGCAC
gi|14 : G-GTTCCTCAGCA-TGGACCA-C--C--ACA---ACT-AT----GCTCGCTG-G----AT-----CCC---TGTA-CA---CATA-AGGGGCATGG---GAA---ATCTGC-C-T-C-CAACG-ATCACAG-AAGA-A-TTT----GA-A-----CAGC----AT-G----GACA--CTT-GG--TTGT-G--TTTA--A-GACCAC--AA---------------A--CAG-A-TTTTC-G---G----------CAA--TCCTAATCGACTAG-G--CT-T------ATA-AT-AAGAACAAT-GAC--ATT-T-TAGA-AGGGTCTG-AT--AGTGCT-----GTT--A-GA-CTC-ACT-GAAAAC
gi|15 : ----GCTAGGTG-G----AT-----ACC---AGTG-CA---CCAG-AAAGACATGAC-CAAA---CTC-AC-CTA-T-AAAC--ACC-CAG-ATGT-A-TCC--AGGC-A-ATTCCGGG----AA-G----CCCA--CTT-CA--C--C-G--TTCAA-A-AGACAC--AGAGTCAGAAAACACAAA--GGATGTTTCTT-T---T----------CAA--TCCCGATTGACAAG-G--CA-C------ATG-CG-TAGAATAAT-GACT-GCA-T-CAAA-GGAAAC-G-GCTAGGAAC-------TT--G-GG-CTC-ACT-GACAACC----CTacgtcaacatttctaaagtgggtgtttgcagaacttg
gi|16 : --GACACAA--AGG---AGA--TT-----A-----CAGGTCCTGCTGC-TGT-G-GA-G-ACCGT--GA-TGAAT-GCC-AA--G-AGTAA----TGGTAAAGAGCAG--TTC-GA-GAC--TTTC--ACCAGAG-----AGTG-TCTGTT--GGACAG-AA-CA---AAGT-CAGCAG--ACGACCC-----CATTCCTCGT-G----ACATGCGG-AAGGTGT---TCAGCACT-T--CA------AACAA-G---CCAGAGCAAGG-GT-CAG-CAA-CAG-------CT
gi|17 : gagAAATGGGCAAAACACCATTCGAGG-------AGGGGAGTCAGCAATCATTAGTTCGT--AACAACTGAGTGACACAA--AAGGCCAGATGTT-----GGAATCCAGGCTCTAGTGC-T-T-G-GA-GAACGGTGGGA-TGACT-GCG-AA--A-A---A----CAA--AGGA
gi|19 : TC-T---T----------CAA--TCCCGATTGACCAG-G--CA-C------GTG-AG-CAGAATAAT-GGCT-TCA-T-CAAA-GGAGAC-A-GT--GGGGCA-----GTT--G-GT-CTC-ACT-GACAACT----CTA----G----TGTC--CT-ACGTCGCTG-G-ATGGTattggcaaag
gi|2 : tg-T-CCAAGGGAAGTCTCACCC-TTGCCGCACT---ACTAACACTGATGTACCTCCGTCCACTCAGCA----TCATCAAG-GGTCA-C-CTGTCCCAA----GCGCTAGCAGTGTGTGGC--TTGA-CCATAGGAGAC-T-CA-ACAGAAATAGCCGATTGA-AAGAATACT-AATGGCTAGAC-AATTGCAAAGC--A-GTCGCTGGAAGACAGCCAG-------TTGG--TA--GTG---GACAATGACAGCTTCCATCTTGGGCCTG-CATT---CATGCCAGTCGAAACCCATCAAAT-CTCTAGCCATCTGTCCCACGTCGC-TC-TTCC-ACT-CTTCGTGGAGAATGCGCCACACCCAGTGGCCTTAATCCATCAC-CAATG-GA-CGCCG-GAGCGAATGCTG-TGGAACAT-TTGAATTCCTGGACAGA-CAACCAGTGAT-GCTT-TTGAT-CAG-TCACTATTTGATTCGCCCAAACCGA-ACAGGGGAAGTGGCCAGAGGAGCCTATGGTGAG-AACCAG-TAGTGGTAATGCTTTGATGA-CCTCCACATTG-A-ATGGCG-CCACTAAAGACACTAGCGGGACTGG-TACAAGGGAGTGGTGA-GGGA------------CA--GCCGAG-A----TTGT---------GACAGCAGGACTCA-TCCGGCGAGCATCCCATGTCTTG-CTCATAAGAAGAG---AT--TAAAGTTGGA-------CTGCGAGTAGCCACTGTAA--CA---GTCCGCAAC--ACC--GTC-TCTAA-CAGCA-TACT-GTC-TGGTTAGAA-ACCAGAGATGTACGATG-------ACCTCTCC--A-AGTTGGAAGACTGGTGTTGCC-AGAGAGAAAGACATACCCCA---TTCA-CTAAATGGGC--AACACTACT-GGAAACAAGA--ATT---TTGGTTC--AAT------T---ATGT--GTGCTCT------CT-TGAAGGCAGGG--GTCGTTAAT---GA-TGTACCT-CAGTGCT-CTG--ACGAGA-GCT-AGTCTACT---TTCCAC-GCACT-GATCA-CCAA--CCC---ACT--T----GCTAGG-G-GATCTAT-----ACC---AGTACCA---CCTG-AAGGAAATGGC-TGAAG--CTC-GC-C-ATC-AAAC--ATC-CAA-ATGT-AGTTCGAGGGA-A-ATTCTGGGGACAAA-G----GCCA--CTT-TA--C--C-ATTTTCAGAA-AAACAC--AG---------------A--GGGTG--TCTC-T---T----------CAA--TCCCGATTGACCA--G--CA-C------ATG-AG-TA-AATAAT-GGCTGGCA-T-CAAA-GGAGAC-G-G---GGAGCA-----GTTGCG-AT-CTCAACTGGACA----------------------------ACGTCATCG-G-ATGGTTGCGGGGGCC-AGAAGTAAGCC--A-GGTGATTGAAGAA-TTCCA-GAATGGGAAT--C--CAAC-ACCGGAGACGGCA-AACAACAG---ATACTAGTA--CACTTCA--TC-ATG-A--TC--A-GACA----CTAAATTGGGCAGGCTTTCATT-TTGTT-AAAGATGTTTGCTT--TC-TCGT--T--T-GG-CCTAGAGGAGATGGCAAA--T-CCATTC-AAG-------AGG-------------------------------------ACACAA--AGG---AGA--TT-----------CA-GTCCTGGCGC-TGT-G-GAGG-ACCTT--GATTGAA--GCCAAA--G-G---A----TTGCCAAGAGCAG---TC-GATTAC--GTTC--ACCAGAG-----AGTGACCTGTT--GGACAG-AAGCA---AAGGACAGTGT--ACGACCC-----CATTCCT-GT-GA---ATAAGCTG-AAGG-GT---TACG-ACT-TCCCATTG-CAAAGAAGG---CCAGAGCAAAA-GT-CAGAAAA-CAG-------CTCGGCCTACGTCAAG-------AAC-AAACT---CGTTTA--A-CTC-TTGCGC-C-GCAC---G--TAC-AATTGGG--CGTATTACGGTGCA--A---GACGAGG---AGAT--GGAAAC-CTT------GAAGTG-----C-------TACTTTCATCAC-GATGAATCAGGCGTGCC-CCCCTACTGCA-TCCCTGTC--TTCGATGGCCT-------GGAAGCC-TC---------TGCACT-GGTA-TAAGCCAGTGATCTTC----TTACATGCCTGGAAACACGTCCCT-GACGCAAAGA-CA-CAGAAT-TTTTTC---ACGATATGTATTGCCT---GCCC--TGAGGTGAGCAGCCAA-TT----ACCCAG-----AATC---TAATGCCAGTC----TGCA----T--C---A--AAGACCACATT-----GAAGAGTA----TGC--A-GA-A--GACTGTAA-TTCTAT--T-AC-ATATCCACGAAATT---G-CAA-ACA----GTGTCACGTTCCCGGAT-CTGTATCTGGGAGTACTTTACCGGTCCTG--ATTCATCCGGAAA----GGTATATATTAACACGGGCCCAAAGCGGGGACAAGACGTCGCGGACAACACTTTGGTG-GCT----G--CC-CTGCCATACCAGAAAATTAGCCACGA-ACTC-CTTACAAGGTGGGACAGCAGCAAGACTGAAGCTGTTGAGGCCCTT-C--CTCTCAGCAACTCT
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gi|8 : gtgtctcgagagaaattgataagtaataacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngT-CGATGCTACTGGAAC-AGAAGCTAGGCTCACT----TTCAC-GAACTGGGTCAAC--A--CCTCGTACTTATCTAGACTAGATGTG----ATGCACTACCGATAGTAACA---CCTGCAAGCAAGTGGCTCGAAACGCTC-GCGC-A-C-CAACCAACC-CAGGATGTTA-TTC--AGGACATATTCTGTG----AATG----GCAAACCTT-CA--C--CTGCCTTCCG-ACAAACACCAGG---------------A--GGGTG-TTTTC-TACGTAAAGACGTAACGA--TCCCAATTGACCAG-GCCCA-CCAACCGATGCAA-CAG-ACAATGGGCT-ACA-TACAAACGGAGAC-G-GT---GCGCATACACGTT--GCGTACTC-AAT-GAGCACC----CTA----A----TGCCTACC-ACGTGACTGTGCATGGAT------GCC-A------TAC-----GGTGATTGAAAAATTTCCACGGACTGGAGAGCC--CAACAATTGGTTACGACGCAACAGCAAGGCA------TAGCTATGCTATGTCGATG-AACTCAGA-GACAGAACCCAAG--GTATAAGCACTCA-TATTGTGAAAAGATGTCAGTTCTATCATCGTGGTGGTCGT-CATAGCAGACCTCGGCCA--CGCAATTCGAGGGCGCGGCAAAAGAAGTAG-AAT-ACTAGT---TTAA--GACTGA--GAC-CAAAGAGG---AGA--CTCGCCAG-----TGGTTCCTGCTGCACGTCGCGA-G-CCCGT--GA-CTGCT-GCC-AA--c
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): GCATAGATGACGAACACCGAGTGGATTGACATTTTTGGAACAGGCTGAAATTCCAAATACCTGATGGAATTAAGCAAGCAAAATTGAAAGTAGCGCAGCATATCGTATTTGGACGATAGAAGGCTCAATATGCACTACCTATGTTAGATTCTAGCGTCTCTCAACTGACGTGAATCTACCTGCGTCTAATTATGCGGAAAGTGCAATCTGTAAGGTACTAGCAATAGATTCAAACTTGGACGCGTATGCAATAACTCACTGAGGGCGCTGCCTTTGCTGTGCTGGGGCTGCTGCTGTCATTTGC
Unaligned ( gi|18 ): ACTACTGCCAGATCTTACTTCAATCGCCCCATGTAACCACTAAAAAGCTGACAGTCGGACTCGACGTTACTGTATGCAAAAATACGCAGCCCAACATGGACACCATGCAATACTTATCCGGAC