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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-571 )      :                           AAGACAAGAAA-CATTTAAA-GTATGTTGAT-----ATTTATATAAAT-A--GA-T-T-TTTTTACCTATC--TATATATTCATTG-GG-TAAA------A-----------TA------TAT-----CTTGATACNCTGT----GGATGAA-C-C--T-GTCCAA-NTTT---AAATGATCAAATA--AAAAGAGTAATTTTTCAACCTTCAATTTCAAATCTATTACAAC-ATATTATTAATCTGTTACTACAG-ATTATATCAATTTGTTTTTTAAAAAGGCTTATTTTAAATAAATTCT-AATTTG---TTATAGGGTAAAGTGATCGTGAG-TCGGACA-CCCTG-CTCTTTCCTTTTCG--TATGCAGATTTC-TTCCGACTTTTTCCCC---TATAGT----A-TTT-GGTGTTGCCCGAAA
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Reference ( family-571 )      :                           AAGACAAGAAA-CATTTAAA-GTATGTTGAT-----ATTTATATAAAT-A--GA-T-T-TTTTTACCTATC--TATATATTCATTG-GG-TAAA------A-----------TA------TAT----CTNGATACNCTGT----GGATGAA-C-C--T-GTCCAA-NTTT---AAATGATCAAATA--AAAAGAGTAATTTTTCAACCTTCAATTTCAAATCTATTACAAC-ATATTATTAATCTGTTACTACAG-ATTATATCAATTTGTTTTTTAAAAAGGCTTATTTTAAATAA-TTCT-AATTTG---TTATAGGGTAAAGTGATCGTGAG-TCGGACA-CCCTG-CTCTTTCCTTTTCG--TATGCAGATTTC-TTCCGACTTTTTCCCC---TATAGT----A-TTT-GGTGTTGCCCGAAA
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gi|2                          : gttcataagttggacacatttgatatAAGACCAAAAA-CAC--AAA-GTATGGTAAT-----ATTTATAAAAAT----GA-T-T-TTT--AA-TATC--AAT---TCCATTG-GGCTAAA------A-----------TA------TATAATACCATGTACCTGGT----GGA--AATC-C--T-GTCCAA-CTT----AAATGATTAAATA--AAAAGATTAATTTT-CAACCTTCAATTTCAAATCTATTACAAC-AT-TTATTAATCTGTTACTACAG-ATTATATCAAATT-TTTTTTAAAAAGGCTTATTTTAAATAA-TTCTAAATTTG---TTATAGGGTAAAGTGATCGTGAGTTCGGACA-CCTTG-CTCTTTCCTTTTTGATTATGCAGATTTC-TTCCGA--TGTTCCCC---AAAAGT----A--TT-GGTG-TGCCCGAAAatgtgttattatgaatt
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lowQualScore                  :                                      7        7          11111            0000000 7 7    4  0    99     9 1     7  7    77777777777777777777777777   1111  0    111   1111    222222222 7      33  0000             88              2                            3  3                    3             7                           3    77     333                       7       7     7            0 22            7      0000  2   777      2222 7   7              
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Reference ( family-571 )      :                           AAGACAAGAAA-CATTTAAA-GTATGTTGAT-----ATTTATATAAAT-A--GA-T-T-TTTTTACCTATC--TATATATTCATTG-GG-TAAA------A-----------TA------TAT----CTNGATACNCTGT----GGATGAA-C-C--T-GTCCAA-NTTT---AAATGATCAAATA--AAAAGAGTAATTTTTCAACCTTCAATTTCAAATCTATTACAAC-ATATTATTAATCTGTTACTACAG-ATTATATCAATTTGTTTTTTAAAAAGGCTTATTTTAAATAA-TTCT-AATTTG---TTATAGGGTAAAGTGATCGTGAG-TCGGACA-CCCTG-CTCTTTCCTTTTCG--TATGCAGATTTC-TTCCGACTTTTTCCCC---TATAGT----A-TTT-GGTGTTGCCCGAAA
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blockSeqs                     :                                      .        .          TA               TAGAG   . .    T  C    .      A       .  .    TTTTAAATAGCCTAT              .     T    CAC   .       AATCC     .      C   T                .               T                            .  A                    .             G                           .    A      .                         .       .     .            G .             .      CTTT  C   .        .    .   .
blockSeqs                     :                                      .        .          .                AGAC    . .    T  T    .      A       .  .    ATA                          .     A    TAC   .       GAACC     .      C   T                .               T                                                                                                                                    .       .     .            C .             .      TG    C   .        .    .   .
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Reference ( family-571 )      :                           AAGACAAGAAA-CATTTAAA-GTATGTTGAT-----ATTTATATAAATN-GA----T-T-TTTTTACCTATC--TATATATTCATTG-GG-TAAA-TTTTAA----------TAT-ATCTNGATACACTG----TGGATG-A---C-CT-GTCCAA-NTTT---AAATGATCAAATA--AAAAGAGTAATTTTTCAACCTTCAATTTCAAATCTATTACAAC-ATATTATTAATCTGTTACTACAG-ATTATATCAATTTGTTTTTTAAAAAGGCTTATTTTAAATAA-TTCT-AATTTG---TTATAGGGTAAAGTGATCGTGAG-TCGGACA-CCCTG-CTCTTTCCTTTTCG--TATGCAGATTTC-TTCCGACTTTTTCCCC---TATAGT----A-TTT-GGTGTTGCCCGAAA
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