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originalCons : CGTCGG-T-GAC------CCACGG-GTGCTT---CT--T----ATCGAT--TC-TCTCC-ATCA-TC--AC----TTTG-AGGG-----AG---C--G--TA-T-GTG-GA-CTC-AAAACCGTG--G-TTTGCGACG
finalCons : CGTCGG-T-GAC------CCACGG-GTGCTT---CT--T----ATCGAT--TC-TCTCC-ATCATCACG-----------AGGG-----AG---C--G--TA-T-GTG-GA-CTC-AAAACCGTG--G-TTTGCGACG
14 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-5573 ) : CGTCGG-T-GAC------CCACGG-GTGCTT---CT--T----ATCGAT--T-CTCT-CC-AT-CA-TCA------C-------G-----AG-GG-----AG-C--G--TAT-GTG-GA-CTC-AAAACCGTG--G-TTTGCGACG
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14 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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