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Reference ( gi|2 )            :                                                      GTCCCTATACG---ATTTCT-GTCGT--GTGAC------------CT-----------GG---TCG----TGT-GATG----------------CGACTTG-CCTGT-TC--G-T-G-G--ATTTCCTG----T-GATGTGAC--T--CT---TATT----CATT-----GAATT--CCAGTGATGTGAC---T-------T-T-CTGTTTGTGGATTTCCCGTGCTTT---GTGACTGTGAGT-TTTCGCGA--TGT--GAATT-GCCC-TTTTTGGA-CTG-TTAAATTTGCTA-TGAATTAT-TAG-AGTAAAGTTTA-TTATATT-GTAAA-CAATC--ATA----T--ATTCA-----------GTAAAATG-CATTGC-ATTGATTGTAAGCCACAGTGC------T--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT----TT---ACGGT-TTCCGGT-CGG-G--CTAG--GTGTACT-CCGA-GCTCCCA-C---GTG-C--TG--T--TCTTTCTC-TCT-T-CCCGCGGAC--TCT-C-AAAG--G--ATGTGG---A--CGT-AT-GT-T---A--T-------AGAGCTCGGCAC-TG--CGG-C-A-T---TGTA-TT-TGTA-GAAC--GTGAA--TTGTAAATCTCT-GTC--T-TTA--TTTGT-TAA-T-A-------CATGTTGT--TAAAAGT-G-G--TTGTC----TT-GTGGATTTG-A-TATATAAAAT
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                 cgtttgcgaGTGATGTGGC---T-------TGC-CTGTTCGTGGATTTCC--TGTTAT---GCGACTttctgttcgt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                               cctagacaattcacatcctgtgacgtggtcgtGCAA--TGT--GAATG-ACCC-TTTTTGGA-CTG-TTAAATTTGCTA-TGATTTAT-TAG-AGTAAAG--TA-TTGTATT-GTA----AATC--ATAAGG-TTAAATCA-----------ATAAATTG--ATTGC-ATCTATTGTAAGCTACAGTGC------T--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTTG---TTTTGGCGGT-TTTCGTT-CGG-G--CTCG--GTCTACT-CCGA-GCTCGCA-C---GTG-CA-TG--TA-TAT----------------CGGAC--TTT-C-AAAG--GGAACAT-----A--CGT-GT-TT-T---T--T-------AGGGCTCGGCAC-TG--TGG-T-T-G---TGTA-TT-TCT-----CTGGT-AT--TTGTAAGTCTTT-GTC--G-TTC--TTTGT-TAA-T-AGATCACTCATGTAAT--TCTAAGT-G-G--TTTTT----CT-GTGGGTTTcctattcatgg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -GTATA-CAATC--AGA----T--TTTTTT----------GTAAAATT-TATTGC-ATTGATTGTAAGCCACAGTGC------T--TAAGGTCTGTTTATAGGATTGGGAACATTCCTCAAAAGGGGGGGGTGGGAGTGTATTTGGGGGGTTGAT--T----TT---ACGGT-TTCCGGTTCGG-G--CTCG--GTGTACT-CCGA-GCTCGCA-C---GTGGCGATG--T--CCTCTCTC-TC-------GCGGAC--TGT-C-GAAG--G---TGCGG---AA-TGT-TT-TT-T---A--T-------AGAGCTCGGCAC-TG--CTG-C-A-T---TGTA-TT-TGT-----CTGGT-AT--TTGT---TATCTGGTA--T-GTA--TTTG--GAA-T-A-------CATGTTCT--TTTAAGTGG-G--TTTTC----TT-GT---CTTG---TATATAGttttatgtaaagaaaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  taatttaaatcaaggTAAATCAATC--ATA----T--ATTTT-----------GTAAAATT-TATTGC-ATTGATCGTAAGC---AGTGC------T--GAAGATCTGGTCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGAAGAGGGGTGGGGGTT---ACGGT-TTCCTGT-CGG-G--CTCG--GTGTACT-CCGA-GCTCGCA-T---GTG-A--TA--TTGTCTCTCTC-TCT-T-CCCGCGGAC--TCT-C-AAAG--G--GTGCGGTCTA--CG---T-GT-T---A--T-------ga
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tattgtattgtaatcatagggtT----TT---GTGGT-TTTTGGT-CGG-G--CTCG--GTGTACT-CCGA-GCTCGCA-T---GTG-C--AA--T--TGTCTCTC-TCT-T-CCCGCGGAC--TGT-C-GAAG--G--GTGCGG---A--TGT-GT-TT-T---A--T-------AGAGCTCGGCAC-TG--CGG-C-A-T---TGTA-TT-TGT-----CTGGT-AT--TTGTTAGTCTGT-GTA--T-GTA--TTTGT-GAA-T-A-------TATGTTCT--TATAAGTAA-G--TTTTC----TT-G-GTCTTTG---TATATAGttgttaatacatgttattcaagtgggtcatttttgagtgtttgtatatagagaatcactt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ggggggttgatT----TT---GCGGT-TTCCGGT-CGG-G--CTCG--GTGTACT-CCGA-GCTCGCA-C---GTG-C--TA--T--TATCTCTC-TCT-T-CCCGCGGAC--ACT-C-AAAG--G--GTACAG---A--CGT-GT-TT-T---A--C-------AGAACTGGGCAA-TG--CGG-T-A-C---AGTA-TT-TGT-----CTGGT-AT--TTGTAAGTTTTT-GTC--T-GCA--TTTGT-TAA-C-A-------CACGTTGT--TATACGT-GTT--TTTTC----TTAGTG--TTTG-g
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gtagtgatttggggggttgatT----TT---GCGGT-TTCCGGT-CGG-G--CTCT--GTGTACT-CCGAGGCTCGCT-C---GTG-C--GGA-T--TATCTCTC-TCT-T-CCCGCGGAC--TGT-CGAAGG--G--AAACAC---A--CGT-GT--T-T---A--TC------AGAGCTCGGCAC-TA--CGG-C-C-T---TGTA-TTGTGTT-G-----GT-AT--TTGTTAGTCTGT-GTA--A-GTA--TTTGTGGAA-T-A-------TATGTTTT--TATAAGT-G-G--TT-TT----TC-TTGGTCTTG-A-TATATAGt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            attttggggggttgttT----TT---GCG-T-TTCCGGT-TCG-G--CTCG--GTGTACT-CCGA-G-TCGCATC---GTG-C--TAA-TAATCTCTTTC--CT-T-CCCGCGGAC--TTT-A-AAGG--G--TTGCGG---A--CG---T-GT-T---AATT-------AGAGCTCGGCAC-TG--g
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gaT----TT---ACGGTGTTCCGTC-TGG-GATCCGGTTGTTTACTACCGA-GCTC----------G-C------------TTCTC-TCT-T-CTTGCCGAC--TCT-C-TAAG--GT-TTGTGG---A--CGTGATAGT-T------T-------AAAGCTCGGCACTTGTCTGG-CTA-T---TG----T-TAT----AC--TT--A--TTTTAAATCTTT-G----G-TGA--TTTGT-TAA-T-A-------Cta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttggagtttgttT---GCGGT-TTACGAT-CGG-G--CTCG--GTGTACT-CCGA-GCTCGCA-C---GTG-C--GA--A--TGTCTCTC-TCT-T-CCCGCGGAC--TGT-C-GAAG--G--GTGCGG---A--TGT-GT-TT-T---A--T-------AGAGCTCAGCAT-TA--CGG-C-A-ttttatgcaaaggttttttctgatgtctttatacagagaa
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TTT---T-ACGGTGTTCCGT-CTGG-GATCCGGTTGTTTACTACCGAG--CTCGC----------------------TTCTC-TC-TT-CTTGCCGACTCT-CT--AAG--GTT-TG-TGG---A--CGTGATAGTT--T-AA------AGCTCGGCACTTGTCTGG-CTA-T---TG----T-T--ATA---CT---T-A-T---TT-TAAATCTTT-G-G--T-G-A--TTTGT-TAA-T-A-------C----T---TTTATGCAAA--G-G--TT--TT-TT-CTGATGTCTTT-A-TACAGAGAA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttggagtttgt--GGGTGGTG-TTTG--T-GCGGT-TTACGA-TCGG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTCGCA-C-GTGC-GA--A--T--G-TCTCTC-TC-TT-CCCGCGGACTGT-CG--AAG--G-G-TG-CGG---A--TGTG-TTTTA--T-AG------AGCTCAGCAT-TA--CGG-C-A-
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TT---T-GCG-T-TTCCGG-TTCG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGAG---TCGCATC-GTGC-TA--A--T--AATCTCTT-TCCTT-CCCGCGGACTTT--A--AAG--G-GTTG-CGG---A--CGTG---TTAATT-AG------AGCTCGGCAC-TG--
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                               gaTGTAGA-----TGTG-------TTG-T-TGT-TT--G-C-G-A-------CTG----T-GATGTGAC--TT---CCCTATTGAAGTAT--T--AGTG-GA--TTTCCAGTGATGTGAC---T-------TTCCTATTGGTGGATTTta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GG-C-A-T---TGTA-C-----GT----CT------------TGTGAGATTTT-GTA--T-GTG--TTTGT-GAA-T-A-------CATGTT---CTTAT--AAGT-G-G--TT--TTCTT-GTGA-GT-GTT-A-TACATAGA
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                            GTCCCTATACGATTTCTG-TCGT--GTGAC--CT-----------GG---TCGTGT-GA-----TGCG-----ACTTG-CCTGT-TC--G-T-G-G--ATTTCCTG----T-GATGTGAC--TC---T----------TAT--T--CATT-GA--ATTCCAGTGATGTGAC---T-------TT-CTGTTTGTGGATTTCCCGTGCTTT---GTGACTGTGAGT-TTTCGCG-AT-GT--G-AATT-GCCC-TTTTTG-GA-CTG-TTAAATTTGCTA-T-GAA-TTAT-TAGAGTAAAGTTTA-TTATATT-GTAAACAATC--ATA----T------ATTCA-----------GTAAAATGCATTGC-ATTGATTGTAAGCCACAGTGCT---NNNNNNNNNNNNN---NN-NNN-NNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNN-NTT---T-ACGGT-TTCCGG-TCGG-GCTA-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTCCCA-C-GTGC-TG--T--T--C-TTTCTC-TC-TT-CCCGCGGACTCT-CA--AAG--G-A-TG-TGG---A--CGTA-TGTTA--T-AG------AGCTCGGCAC-TG--CGG-C-A-T---TGTA-TT-T--GTAGAAC--G-TGA-A---TTGTAAATCTCT-GTC--T-TTA--TTTGT-TAA-T-A-------CATGTT---GTTAA--AAGT-G-G--TT--GTCTT-GTGG-AT-TTG-A-TATATAAAATgg
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgaTT-CCTGTCTT--GAT-GTG--ATTCCC-G----TAGGTGTGAC--TTTCGC----------TAT--T--CGTG-GA--TTTCCCGTGAT-TGCT---T-------TT-CTGTTTGTG-ATTTTCCGTGCTTT---GTGACTGTGACT-TTCC-CT-AC-GT--G-AATG-CCCA-TCTTTG-GA-CTG-TAAAATTTGCTA-T-G-A-TTAT-TAGAG---AATGTA-TTGTATTTGTAAA-AATCTCATAGGAGT------AATCAAGATTTATTT-GTAAAATA-ATTGCTATTGATTGGAAGCCACAGTCTT---GAAGGTCGGTTTA---TTTGAA-TTTGGACCATTCCCTCCTCAAAATGGGGG-----AGAGTGTAGTGATTG--GGGGGTTG-TTT---T-GCGGT-TTCCGG-TCGG-GCTC-GGT--T--ACT-CCGGG---TCGCACC-GTGC-TGGAT--T--A-TCTCTC-TC-TT--CCGCGGACTGT-CGCAAGG--G-G-TG-CGA---T--GGTG-TTCTA--T-AG------AGCTCGGCAC-TG--CGG-C-ATT---TGTATTT-T--GT----CT-G-T-ATT---TTGTTAGTCTGT-GTA--TGGTAATTTTGT-GAA-T-A-------TAT-TT---CTTAT--AAGT-G-GTTTT--TTCTTGGTCG-GG-TTG---TATATAGA
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cgcGCA-AT-GT--G-AATG-ACCC-TTTTTG-GA-CTG-TTAAATTTGCTA-T-G-ATTTAT-TAGAGTAAAG--TA-TTGTATT-GTA---AATC--ATAAG-GTTA----AATCA-----------AT-AAATTGATTGC-ATCTATTGTAAGCTACAGTGCTNNNNNNNNNNNNNNNN---NN-NNN-NNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNGGGTTG-TTT---TGGCGGT-TTTCGT-TCGG-GCTC-GGT-CT--ACT-CCGAG--CTCGCA-C-GTGCATG--TA-T--A-T----------------CGGACTTT-CA--AAG--G-G-AA-CAT---A--CGTG-TTTTT--T-AG------GGCTCGGCAC-TG--TGG-T-T-G---TGTA-TT-T--CT----CTGG-T-A-T---TTGTAAGTCTTT-GTC--G-TTC--TTTGT-TAA-T-AGATCACTCATGTA---ATTCT--AAGT-G-G--TT--TTTCT-GTGG-GT-TT
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                atT--GTGAT--GT-----------GGAGTTCCCGT-GG-----TGTG-----ACGTT-CCTAT-TC--G-T-T-G--ATTTCCTG----T-GGTGTGACGTTC---C----------TAT--T--CGTG-GA--TTTCCAGTGATGTGAC---TATGAATGTTACTGTT-GTGGATTTTCCG-GCTTT---GTGACTGTGACTGTTTCGCGAACAAT--G-AATT--CCC-TTTTT--GA-CTG-TTAAA-TGGCTA-TGG-A-TTATATA-AGTAGA-TGTA-Tgactgtttcgcgaacaatgaattccctttttgactgttaaatggctatggattatataagtagatgtat
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): TTATTTGTTAATACATGTAGTTCAAAGTGGTTTTTCTGAGTGTTTGTTGTTTATATGAGAATCACTTT






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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aAGTG-ATTT---GGGGGGTTGATT-T---T-GCGGT-TTCCGG-TCGG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTCGCA-C-GTGC-TA--T--T--A-TCTCTC-TC-TT-CCCGCGGACACT-CA--AAG--G-G-TA-CAG---ACGTGT-T--TTA--C-AG------AACTGGGCAA-TG--CGG-T-A-C---AGTA-TT-T--GT----CTGG-T-A-T---TTGTAAGTTTTT-GTC--T-GCA--TTTGT-TAA-C-A-------CACGTT---GTTAT--ACGT-GTT--TT--TTCTT-A-GT-GT-TTG-g
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtGGGGGGTTGATT-T---T-GTGGT-TTTTGG-TCGG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTCGCA-T-GTGC-AA--T--T--G-TCTCTC-TC-TT-CCCGCGGACTGT-CG--AAG--G-G-TG-CGG---ATGTGT-T--TTA--T-AG------AGCTCGGCAC-TG--CGG-C-A-T---TGTA-TT-T--GT----CTGG-T-A-T---TTGTTAGTCTGT-GTA--T-GTA--TTTGT-GAA-T-A-------TATGTT---CTTAT--AAGTAA-G--TT--TTCTT-G-GT-CT-TTG---TATATAGAt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGGTTG-TT--------CGGTATTCCGG-TCGG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGGG--CTCGCA-C-GTGC-GGA-T--T--A-TCTCTCTTC-TT-CCCGCAGACTGT-CG--AAATTG-T-TG-CGC---ATGTGTGTG-TTA--T-AG------AGCTC-GCAC-TG--CGG---A-T---TGTA-TT-T--GT----CT-G-T-A-T---TTGT-AGTCTGT-GTA--T-GTT--TTTGT-GAA-T----------ATATT---CTTAT--AAGT-G-T--TT--TTCTT-GGTC-GT-TTG---TATATAGAg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GGAGTTTG-TT-T---TTACGGTGTTCCGT-CTGG-GATCCGGTTGTTTACTACCGAG--CTCGC----------------------TTCTC-TC-TT-CTTGCCGACTCT-CT--AAG--GTT-TG-TGG---ACGTGA-TAGTT---T-AA------AGCTCGGCACTTGTCTGG-CTA-T---TG----T-T--ATA---CT---T-A-T---TT-TAAATCTTT-G-G--T-G-A--TTTGT-TAA-T-A-------C----T---TTTATGCAAA--G-G--TT--TT-TT-CTGATGTCTTT-A-TACAGAGAA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttGGGTGGTG-TT-TG--T-GCGGT-TTACGA-TCGG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTCGCA-C-GTGC-GA--A--T--G-TCTCTC-TC-TT-CCCGCGGACTGT-CG--AAG--G-G-TG-CGG---ATGTGT-T--TTA--T-AG------AGCTCAGCAT-TA--CGG-C-A-
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         T-T---T-GCG-T-TTCCGG-TTCG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGAG---TCGCATC-GTGC-TA--A--T--AATCTCTT-TCCTT-CCCGCGGACTTT--A--AAG--G-GTTG-CGG---ACGTGT-T--AAT--T-AG------AGCTCGGCAC-TG--
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ga-GATGTG----------TTG-T-----------TGTT-T--GC-GA-------CTG----TGA--TGTGAC--TT-CCCTATTGAAGTAT--T--AG-TG-GATTT-CCAGTGATGTGAC---TTTCCTATTGGTGGATTTta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgta-G----T-GATGTG-----AC---TTC-C--CTATTGAAGTATT-A--GT-GG--ATTTCCAG----TGA--TGTGACTTTC-C----------TAT--T--GG-TG-GATTT-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgtagatgtgttgttgtttgcgactGG-C-A-T---TGTA-C-----GT----CT------------TGTGAGATTTT-GTA--T-GTG--TTTGT-GAA-T-A-------CATGTT---CTTAT--AAGT-G-G--TT--TTCTT-GTGA-GT-GTT-A-TACATAGA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                               CCTAG--ACAATTCA-CA-TCCT---GTGACGT--------G--G---------T-CGT-G----T-GATGTG-----GC---TTG-C--C--------TGTT-C--GT-GG--ATTTCCTG----TTA--TGCGAC--TC-C----------TAT--T--CA-TG-Ggaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                            GTCCCTAT--ACGATTTC-TG-TCGT---GTGACCT--------G--G---------T-CGT-G----T-GATGCG-----AC---TTG-C--C--------TGTT-C--GT-GG--ATTTCCTG----TGA--TGTGAC--TC-T----------TAT--T--CA-TT-GAATT-CCAGTGATGTGAC---TTT-CTGTTTGTGGATTTCCCGTGCTTT---GTGACTGTGAGT-TTTCGCG-AT-GT--GAATT-GCCC-TTTTTG-GA-CTG-TTAAATTTGCTA-T-GAA-TTAT-TAGAGTAAAGTTTA-TTATATT-GTAAACAATC--ATA----T-AT-----TCA----------------GTAAAATGCATTGC-ATTGATTGTAAGCCACAGTGCT---NNNNNNNNNNNNN---NN-NNN-NNNNNNNNNNNNN-NNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NT-T---T-ACGGT-TTCCGG-TCGG-GCTA-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTCCCA-C-GTGC-TG--T--T--C-TTTCTC-TC-TT-CCCGCGGACTCT-CA--AAG--G-A-TG-TGG---ACGTAT-G--TTA--T-AG------AGCTCGGCAC-TG--CGG-C-A-T---TGTA-TT-T--GTAGAAC--G-TGA-A---TTGTAAATCTCT-GTC--T-TTA--TTTGT-TAA-T-A-------CATGTT---GTTAA--AAGT-G-G--TT--GTCTT-GTGG-AT-TTG-A-TATATAAAAT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -G----T-GATGTG-----AC---TTT-C--C--------TATT-C--GT-GG--------TG----TGA--CGT-----TC-C----------TAT--T--GG-TG-GATTT-CCAGTGATGTGAC---TTT-CTGTTCGT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cgtttgcgactTG-AT-T---T-G-GAT-TTTCGG-TCGG-GTTT-GGA-GT--CCT-CTGAT--ATCGCA-C-GTGC-TA--C--T--G-TTTCTC-T--TA-CTCACGAAC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                             TCCCTAGGGACGATTCC-TG-TCTT---G--ATGT--------G---A-------TT-CCC-G----TAGGTGTG-----AC---T-----------------TT-C--G----------------------------------C----------TAT--T--CG-TG-GATTT-CCCGTGAT-TGCT---TTT-CTGTTTGTG-ATTTTCCGTGCTTT---GTGACTGTGACT-TTCC-CT-AC-GT--GAATG-CCCA-TCTTTG-GA-CTG-TAAAATTTGCTA-T-G-A-TTAT-TAGAG---AATGTA-TTGTATTTGTAAA-AATCTCATAGGAGT-AA-----TCAAGATTTA-T-----TTGTAAAATA-ATTGCTATTGATTGGAAGCCACAGTCTT---GAAGGTCGGTTTA---TTTGAA-TTTGGACCATTCCCTCCTCAA-AATGGGGG-----AGAGTGTAGTGATTGGGGGGTTG-TT-T---T-GCGGT-TTCCGG-TCGG-GCTC-GGT--T--ACT-CCGGG---TCGCACC-GTGC-TGGAT--T--A-TCTCTC-TC-TT--CCGCGGACTGT-CGCAAGG--G-G-TG-CGA---TGGTGT-T--CTA--T-AG------AGCTCGGCAC-TG--CGG-C-ATT---TGTATTT-T--GT----CT-G-T-ATT---TTGTTAGTCTGT-GTA--TGGTAATTTTGT-GAA-T-A-------TAT-TT---CTTAT--AAGT-G-GTTTT--TTCTTGGTCG-GG-TTG---TATATAGA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                   tCT---GTGAC-T--------G------------T-CGT-G----T-GATGCG-----AC---TTG-C--C--------TGTT-CCGGTCGG--ATTTCCTG----T-A--TGTGAC--TC------------TAT--TTCCA-TT-GCATT-CCAGTTGTGTGAC---TTT-C-GTTTGTGGATTTCCCGTGCTTT---GTG-CTGTGAGT-TTTCGCG-AT-GT--GAATTGGCCC-TTTTTG-GATCTG-TTAATTCTGCTA-T-GAA-TTAT-T-GAGCAAGTTTTATTTATATT-GTAAAC-ATC--ATA----T-AT-----TCA----------------GTAAATGCCATTGC-ATTGATTGTAG--CACAGTGCT-------NNNNNNNNN---NN-NNN-NNNNNNNNNNNNN-NNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TT-TAAAT-ACGG--TTCCGG--CGGTGC-A-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTC-CA-C-GTGC-TG--T--T--C-TTTCTC-TC-TTCCCCGCGGACTCTGCA--AAG--G-A-TG-T-----ACGTA--T--GTA--TAAG------AGCCTCGCAC-TG--CGG-C-A-T---TGTA-TC-TTAGA----ACGG-A-A-A---TTGTAA-TCTTC-GTCCTT-TTA---TTGT-TAA-TAA-------CATG-------TGT--AAGT-G-G--TT--GTCTT-GT-G-AT-TTG-ACTATAgag
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cgGCA-AT-GT--GAATG-ACCC-TTTTTG-GA-CTG-TTAAATTTGCTA-T-G-ATTTAT-TAGAGTAAAG--TA-TTGTATT-GTA---AATC--ATAAGGTTAAA-----TCA--------A-----T----AAATTGATTGC-ATCTATTGTAAGCTACAGTGCTNNNNNNNNNNNNNNNN---NN-NNN-NNNNNNNNNNNNN-NNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTTG-TT-T---TGGCGGT-TTTCGT-TCGG-GCTC-GGT-CT--ACT-CCGAG--CTCGCA-C-GTGCATG--TA-T--A-T----------------CGGACTTT-CA--AAG--G-G-AA-CAT---ACGTGT-T--TTT--T-AG------GGCTCGGCAC-TG--TGG-T-T-G---TGTA-TT-T--CT----CTGG-T-A-T---TTGTAAGTCTTT-GTC--G-TTC--TTTGT-TAA-T-AGATCACTCATGTA---ATTCT--AAGT-G-G--TT--TTTCT-GTGG-GT-TT
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taatttaaatcaaggTA-TTGTATT-GTAA----TC--ATAGGGTT-AAATCAATCA--------TATATTTTGTAAAATTTATTGC-ATTGATCGTAAGC---AGTGCT---GAAGATCTGGTCAANNNN-NNN-NNNNNNNNNNNNN-NNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGAAGAGGGGTGG-GGGT---T-ACGGT-TTCCTG-TCGG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTCGCA-T-GTGA-TA--TTGT--C-TCTCTC-TC-TT-CCCGCGGACTCT-CA--AAG--G-G-TG-CGGTCTACGTGT-T--ga
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGGTTG-TT--------CGGTATTCCGG-TCGG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGGG--CTCGCA-C-GTGC-GGA-T--T--A-TCTCTCTTC-TT-CCCGCAGACTGT-CG--AAATTG-T-TG-CGC---ATGTGTGTG-TTA--T-AG------AGCTC-GCAC-TG--CGG---A-T---TGTA-TT-T--GT----CT-G-T-A-T---TTGT-AGTCTGT-GTA--T-GTT--TTTGT-GAA-T----------ATATT---CTTAT--AAGT-G-T--TT--TTCTT-GGTC-GT-TTG---TATATAGAg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGAGTTTG-TT-T---TTACGGTGTTCCGT-CTGG-GATCCGGTTGTTTACTACCGAG--CTCGC----------------------TTCTC-TC-TT-CTTGCCGACTCT-CT--AAG--GTT-TG-TGG---ACGTGA-TAGTT---T-AA------AGCTCGGCACTTGTCTGG-CTA-T---TG----T-T--ATA---CT---T-A-T---TT-TAAATCTTT-G-G--T-G-A--TTTGT-TAA-T-A-------C----T---TTTATGCAAA--G-G--TT--TT-TT-CTGATGTCTTT-A-TACAGAGAA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttGGGTGGTG-TT-TG--T-GCGGT-TTACGA-TCGG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTCGCA-C-GTGC-GA--A--T--G-TCTCTC-TC-TT-CCCGCGGACTGT-CG--AAG--G-G-TG-CGG---ATGTGT-T--TTA--T-AG------AGCTCAGCAT-TA--CGG-C-A-
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T-T---T-GCG-T-TTCCGG-TTCG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGAG---TCGCATC-GTGC-TA--A--T--AATCTCTT-TCCTT-CCCGCGGACTTT--A--AAG--G-GTTG-CGG---ACGTGT-T--AAT--T-AG------AGCTCGGCAC-TG--
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ga-GATGTG----------TTG-T---TGTT-T--------GC-GA-------CTG----TGA--TGTGAC--TT-CCCTATTGAAGTAT--T--AG-TG-GATTT-CCAGTGATGTG-----AC---TTTC-CTATTGGTGGATTTta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgta-G----T-GATGTG-----AC---TTC-C--CTATT-GAAGTATTAGT-GG--ATTTCCAG----TGA--TGTGACTTTC-C----------TAT--T--GG-TG-GATTT-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgtagatgtgttgttgtttgcgactGG-C-A-T---TGTA-C-----GT----CT------------TGTGAGATTTT-GTA--T-GTG--TTTGT-GAA-T-A-------CATGTT---CTTAT--AAGT-G-G--TT--TTCTT-GTGA-GT-GTT-A-TACATAGA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                               CCTAG--ACAATTCA-CA-TCCT---GTGACGT--------G--G---------T-CGT-G----T-GATGTG-----GC---TTG-C--CTGTT-C--------GT-GG--ATTTCCTG----TTA--TGCGAC--TC-C----------TAT--T--CA-TG-Ggaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                            GTCCCTAT--ACGATTTC-TG-TCGT---GTGACCT--------G--G---------T-CGT-G----T-GATGCG-----AC---TTG-C--CTGTT-C--------GT-GG--ATTTCCTG----TGA--TGTGAC--TC-T----------TAT--T--CA-TT-GAATT-CCAGTGATGTG-----AC---TTT--CTGTTTGTGGATTTCCCGTGCTTT---GTGACTGTGAGT-TTTCGCG-AT-GT--G-AATT-GCCC-TTTTTG-GA-CTG-TTAAATTTGCTA-T-GAA-TTAT-TAGAGTAAAGTTTA-TTATATT-GTAAACAATC--ATA----T-AT-----TCA----------------GTAAAATGCATTGC-ATTGATTGTAAGCCACAGTGCT---NNNNNNNNNNNNN---NN-NNN-NNNNNNNNNNNNN-NNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NT-T---T-ACGGT-TTCCGG-TCGG-GCTA-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTCCCA-C-GTGC-TG--T--T--C-TTTCTC-TC-TT-CCCGCGGACTCT-CA--AAG--G-A-TG-TGG---ACGTAT-G--TTA--T-AG------AGCTCGGCAC-TG--CGG-C-A-T---TGTA-TT-T--GTAGAAC--G-TGA-A---TTGTAAATCTCT-GTC--T-TTA--TTTGT-TAA-T-A-------CATGTT---GTTAA--AAGT-G-G--TT--GTCTT-GTGG-AT-TTG-A-TATATAAAAT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -G----T-GATGTG-----AC---TTT-C--CTATT-C--------GT-GG--------TG----TGA--CGT-----TC-C----------TAT--T--GG-TG-GATTT-CCAGTGATGTG-----AC---TTT--CTGTTCGT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cgtttgcgactTG-AT-T---T-G-GAT-TTTCGG-TCGG-GTTT-GGA-GT--CCT-CTGAT--ATCGCA-C-GTGC-TA--C--T--G-TTTCTC-T--TA-CTCACGAAC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                             TCCCTAGGGACGATTCC-TG-TCTT---G--ATGT--------G---A-------TT-CCC-G----TAGGTGTG-----AC---T---------TT-C--------G----------------------------------C----------TAT--T--CG-TG-GATTT-CCCGTGAT-TG-----CT---TTT--CTGTTTGTG-ATTTTCCGTGCTTT---GTGACTGTGACT-TTCC-CT-AC-GT--G-AATG-CCCA-TCTTTG-GA-CTG-TAAAATTTGCTA-T-G-A-TTAT-TAGAG---AATGTA-TTGTATTTGTAAA-AATCTCATAGGAGT-AA-----TCAAGATTTA-T-----TTGTAAAATA-ATTGCTATTGATTGGAAGCCACAGTCTT---GAAGGTCGGTTTA---TTTGAA-TTTGGACCATTCCCTCCTCAA-AATGGGGG-----AGAGTGTAGTGATTGGGGGGTTG-TT-T---T-GCGGT-TTCCGG-TCGG-GCTC-GGT--T--ACT-CCGGG---TCGCACC-GTGC-TGGAT--T--A-TCTCTC-TC-TT--CCGCGGACTGT-CGCAAGG--G-G-TG-CGA---TGGTGT-T--CTA--T-AG------AGCTCGGCAC-TG--CGG-C-ATT---TGTATTT-T--GT----CT-G-T-ATT---TTGTTAGTCTGT-GTA--TGGTAATTTTGT-GAA-T-A-------TAT-TT---CTTAT--AAGT-G-GTTTT--TTCTTGGTCG-GG-TTG---TATATAGA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                   tCT---GTGAC-T--------G------------T-CGT-G----T-GATGCG-----AC---TTG-C--CTGTT-CCG------GTCGG--ATTTCCTG----T-A--TGTGAC--TC------------TAT--TTCCA-TT-GCATT-CCAGTTGTGTG-----AC---TTT--C-GTTTGTGGATTTCCCGTGCTTT---GTG-CTGTGAGT-TTTCGCG-AT-GT--G-AATTGGCCC-TTTTTG-GATCTG-TTAATTCTGCTA-T-GAA-TTAT-T-GAGCAAGTTTTATTTATATT-GTAAAC-ATC--ATA----T-AT-----TCA----------------GTAAATGCCATTGC-ATTGATTGTAG--CACAGTGCT-------NNNNNNNNN---NN-NNN-NNNNNNNNNNNNN-NNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TT-TAAAT-ACGG--TTCCGG--CGGTGC-A-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTC-CA-C-GTGC-TG--T--T--C-TTTCTC-TC-TTCCCCGCGGACTCTGCA--AAG--G-A-TG-T-----ACGTA--T--GTA--TAAG------AGCCTCGCAC-TG--CGG-C-A-T---TGTA-TC-TTAGA----ACGG-A-A-A---TTGTAA-TCTTC-GTCCTT-TTA---TTGT-TAA-TAA-------CATG-------TGT--AAGT-G-G--TT--GTCTT-GT-G-AT-TTG-ACTATAgag
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cgGCA-AT-GT--G-AATG-ACCC-TTTTTG-GA-CTG-TTAAATTTGCTA-T-G-ATTTAT-TAGAGTAAAG--TA-TTGTATT-GTA---AATC--ATAAGGTTAAA-----TCA--------A-----T----AAATTGATTGC-ATCTATTGTAAGCTACAGTGCTNNNNNNNNNNNNNNNN---NN-NNN-NNNNNNNNNNNNN-NNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTTG-TT-T---TGGCGGT-TTTCGT-TCGG-GCTC-GGT-CT--ACT-CCGAG--CTCGCA-C-GTGCATG--TA-T--A-T----------------CGGACTTT-CA--AAG--G-G-AA-CAT---ACGTGT-T--TTT--T-AG------GGCTCGGCAC-TG--TGG-T-T-G---TGTA-TT-T--CT----CTGG-T-A-T---TTGTAAGTCTTT-GTC--G-TTC--TTTGT-TAA-T-AGATCACTCATGTA---ATTCT--AAGT-G-G--TT--TTTCT-GTGG-GT-TT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -GTATACAATC--A---GATT--T-----T----------T-----TTGTAAAATTTATTGC-ATTGATTGTAAGCCACAGTGCT---TAAGGTCTGTTTA---TA-GGA-TTGGGAACATTCC-TCA-----AAAGGGGGGGGTGGGAGTGTATTT---GGGGGGTTGATT-T---T-ACGGT-TTCCGGTTCGG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTCGCA-C-GTGG-CG--A--T--G-TC-CTC-TC--T-CTCGCGGACTGT-CG--AA---G-G-TG-CGGA--ATGTTT-T--TTA--T-AG------AGCTCGGCAC-TG--CTG-C-A-T---TGTA-TT-T--GT----CTGG-T-A-T---TTGTTA-TCTG--GTA--T-GTA--TTTG--GAA-T-A-------CATGTT---CTTTT--AAGTGG-G--TT--TTCTT-GT----C-TTG---TATATAGAttttatgtaaagaaaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taatttaaatcaaggTA-TTGTATT-GTAA----TC--ATAGGGTT-AAATCAATCA--------TATATTTTGTAAAATTTATTGC-ATTGATCGTAAGC---AGTGCT---GAAGATCTGGTCAANNNN-NNN-NNNNNNNNNNNNN-NNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGAAGAGGGGTGG-GGGT---T-ACGGT-TTCCTG-TCGG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTCGCA-T-GTGA-TA--TTGT--C-TCTCTC-TC-TT-CCCGCGGACTCT-CA--AAG--G-G-TG-CGGTCTACGTGT-T--ga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTCTAC-GTG--T--TA--TTTGT-TAA-T-A-------CATGTT---ATT-C--AAGT-G-G--GTCATTTTT-GAGT-GT-TTGTA-TATAGAGAATatttgttaatacatgttattcaagtgggtcatttttgagtgtttgtatatagagaatcactt
gi|8                          : tattgtattgtaatcatagggttaaatcaatcatatattttgtaaaatttattgcattgatcgtaagcagtgctgaagatctggtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaagaggggtgggggttacggtttcctgtcgggctcggtgtactccgagctcgcatgtgatattgtctctctctcttcccgcggactctcaaagggtgcgGTCCCTAG--GCGATTCC-TG-TCCT---GTGACG-------------------------AC-G----A-GGTGTA-----ACCGTTTG-TGACTGTGAT--------GT-GG--AGTTCCCG----TGG--TGTGACGTTC-C----------TAT--T--CG-TT-GATTT-CCTGTGGTGTG-----ACG--TTC--CTATTCGTGGATTTCCAGTGA--T---GTGACTATGAAT-GTTACTG-TT-GT--G-GATT-TTCCGGCTTTGTGA-CTG-Tcactt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                        atTTCC-CG-TGGT---GTGACGTTCCTATTCGTTGA-------TT-TCCTG----T-GGTGTG-----AC---GTT-C--CTATT-C--------GT-GG--ATTTCCAG----TGA--TGTGA------C----------TAT-----------GA----------ATGTT-----A---------CTGTT-GTGGATTTTCCG-GCTTT---GTGACTGTGACTGTTTCGCGAACAAT--G-AATT--CCC-TTTTT--GA-CTG-TTAAA-TGGCTA-TGG-A-TTATATA-AGTAGA-TGTA-Tgactgtttcgcgaacaatgaattccctttttgactgttaaatggctatggattatataagtagatgtat
gi|9                          :                                                                                                                                                                              atgtccctaggcgattcctgtcctgtgacgacgaggtgtaaccgtttgtgactgtgatgtggagCCCAAG--ACGATTCTTCT-TCCTTGGGGGAC-T--------G--GAGTGTTACTT-TGC-GATTGT-GATGTA-----AC---TTT-C--CTAT--C--------GT-GG--ACTTCTTGGTTGTGG--CGTACC--TC-T----------TATATT--CG-TGAGATTT-CCTGTGA-GTG-----ACCCTTTC--CTGTTTGTGGAAT-CTCGTGCTTTATCGTGA---TGACC-TTTTGCA-AT-GT--GGAATT-ATCC-TTATTG-GA-CTGATTAATTTCGCTA-T-G-A-TT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): TTATTTGTTAATACATGTAGTTCAAAGTGGTTTTTCTGAGTGTTTGTTGTTTATATGAGAATCACTTT






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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aAGTG-ATTT---GGGGGGTTGATT-T---T-GCGGT-TTCCGG-TCGG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTCGCA-C-GTGC-TA--T--T--A-TCTCTC-TC-TT-CCCGCGGACACT-CA--AAG--G-G-TA-CAG---ACGTGT-T--TTA--C-AG------AACTGGGCAA-TG--CGG-T-A-C---AGTA-TT-T--GT----CTGG-T-A-T---TTGTAAGTTTTT-GTC--T-GCA--TTTGT-TAA-C-A-------CACGTT---GTTAT--ACGT-GTT--TT--TTCTT-A-GT-GT-TTG-g
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtGGGGGGTTGATT-T---T-GTGGT-TTTTGG-TCGG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTCGCA-T-GTGC-AA--T--T--G-TCTCTC-TC-TT-CCCGCGGACTGT-CG--AAG--G-G-TG-CGG---ATGTGT-T--TTA--T-AG------AGCTCGGCAC-TG--CGG-C-A-T---TGTA-TT-T--GT----CTGG-T-A-T---TTGTTAGTCTGT-GTA--T-GTA--TTTGT-GAA-T-A-------TATGTT---CTTAT--AAGTAA-G--TT--TTCTT-G-GT-CT-TTG---TATATAGAt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGGTTG-TT--------CGGTATTCCGG-TCGG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGGG--CTCGCA-C-GTGC-GGA-T--T--A-TCTCTCTTC-TT-CCCGCAGACTGT-CG--AAATTG-T-TG-CGC---ATGTGTGTG-TTA--T-AG------AGCTC-GCAC-TG--CGG---A-T---TGTA-TT-T--GT----CT-G-T-A-T---TTGT-AGTCTGT-GTA--T-GTT--TTTGT-GAA-T----------ATATT---CTTAT--AAGT-G-T--TT--TTCTT-GGTC-GT-TTG---TATATAGAg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGAGTTTG-TT-T---TTACGGTGTTCCGT-CTGG-GATCCGGTTGTTTACTACCGAG--CTCGC----------------------TTCTC-TC-TT-CTTGCCGACTCT-CT--AAG--GTT-TG-TGG---ACGTGA-TAGTT---T-AA------AGCTCGGCACTTGTCTGG-CTA-T---TG----T-T--ATA---CT---T-A-T---TT-TAAATCTTT-G-G--T-G-A--TTTGT-TAA-T-A-------C----T---TTTATGCAAA--G-G--TT--TT-TT-CTGATGTCTTT-A-TACAGAGAA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttGGGTGGTG-TT-TG--T-GCGGT-TTACGA-TCGG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTCGCA-C-GTGC-GA--A--T--G-TCTCTC-TC-TT-CCCGCGGACTGT-CG--AAG--G-G-TG-CGG---ATGTGT-T--TTA--T-AG------AGCTCAGCAT-TA--CGG-C-A-
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T-T---T-GCG-T-TTCCGG-TTCG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGAG---TCGCATC-GTGC-TA--A--T--AATCTCTT-TCCTT-CCCGCGGACTTT--A--AAG--G-GTTG-CGG---ACGTGT-T--AAT--T-AG------AGCTCGGCAC-TG--
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ga-GATGTG----------TTG-T---TGTT-T--------GC-GA-------CTG----TGA--TGTGAC--TT-CCCTATTGAAGTAT--T--AG-TG-GATTT-CCAGTGATGTG-----AC---TTTC-CTATTGGTGGATTTta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgta-G----T-GATGTG-----AC---TTC-C--CTATT-GAAGTATTAGT-GG--ATTTCCAG----TGA--TGTGACTTTC-C----------TAT--T--GG-TG-GATTT-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgtagatgtgttgttgtttgcgactGG-C-A-T---TGTA-C-----GT----CT------------TGTGAGATTTT-GTA--T-GTG--TTTGT-GAA-T-A-------CATGTT---CTTAT--AAGT-G-G--TT--TTCTT-GTGA-GT-GTT-A-TACATAGA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                               CCTAG--ACAATTCA-CA-TCCT---GTGACGT--------G--G---------T-CGT-G----T-GATGTG-----GC---TTG-C--CTGTT-C--------GT-GG--ATTTCCTG----TTA--TGCGAC--TC-C----------TAT--T--CA-TG-Ggaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                            GTCCCTAT--ACGATTTC-TG-TCGT---GTGACCT--------G--G---------T-CGT-G----T-GATGCG-----AC---TTG-C--CTGTT-C--------GT-GG--ATTTCCTG----TGA--TGTGAC--TC-T----------TAT--T--CA-TT-GAATT-CCAGTGATGTG-----AC---TTT--CTGTTTGTGGATTTCCCGTGCTTT---GTGACTGTGAGT-TTTCGCG-AT-GT--G-AATT-GCCC-TTTTTG-GA-CTG-TTAAATTTGCTA-T-GAA-TTAT-TAGAGTAAAGTTTA-TTATATT-GTAAACAATC--ATA----T-AT-----TCA----------------GTAAAATGCATTGC-ATTGATTGTAAGCCACAGTGCT---NNNNNNNNNNNNN---NN-NNN-NNNNNNNNNNNNN-NNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NT-T---T-ACGGT-TTCCGG-TCGG-GCTA-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTCCCA-C-GTGC-TG--T--T--C-TTTCTC-TC-TT-CCCGCGGACTCT-CA--AAG--G-A-TG-TGG---ACGTAT-G--TTA--T-AG------AGCTCGGCAC-TG--CGG-C-A-T---TGTA-TT-T--GTAGAAC--G-TGA-A---TTGTAAATCTCT-GTC--T-TTA--TTTGT-TAA-T-A-------CATGTT---GTTAA--AAGT-G-G--TT--GTCTT-GTGG-AT-TTG-A-TATATAAAAT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -G----T-GATGTG-----AC---TTT-C--CTATT-C--------GT-GG--------TG----TGA--CGT-----TC-C----------TAT--T--GG-TG-GATTT-CCAGTGATGTG-----AC---TTT--CTGTTCGT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cgtttgcgactTG-AT-T---T-G-GAT-TTTCGG-TCGG-GTTT-GGA-GT--CCT-CTGAT--ATCGCA-C-GTGC-TA--C--T--G-TTTCTC-T--TA-CTCACGAAC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                             TCCCTAGGGACGATTCC-TG-TCTT---G--ATGT--------G---A-------TT-CCC-G----TAGGTGTG-----AC---T---------TT-C--------G----------------------------------C----------TAT--T--CG-TG-GATTT-CCCGTGAT-TG-----CT---TTT--CTGTTTGTG-ATTTTCCGTGCTTT---GTGACTGTGACT-TTCC-CT-AC-GT--G-AATG-CCCA-TCTTTG-GA-CTG-TAAAATTTGCTA-T-G-A-TTAT-TAGAG---AATGTA-TTGTATTTGTAAA-AATCTCATAGGAGT-AA-----TCAAGATTTA-T-----TTGTAAAATA-ATTGCTATTGATTGGAAGCCACAGTCTT---GAAGGTCGGTTTA---TTTGAA-TTTGGACCATTCCCTCCTCAA-AATGGGGG-----AGAGTGTAGTGATTGGGGGGTTG-TT-T---T-GCGGT-TTCCGG-TCGG-GCTC-GGT--T--ACT-CCGGG---TCGCACC-GTGC-TGGAT--T--A-TCTCTC-TC-TT--CCGCGGACTGT-CGCAAGG--G-G-TG-CGA---TGGTGT-T--CTA--T-AG------AGCTCGGCAC-TG--CGG-C-ATT---TGTATTT-T--GT----CT-G-T-ATT---TTGTTAGTCTGT-GTA--TGGTAATTTTGT-GAA-T-A-------TAT-TT---CTTAT--AAGT-G-GTTTT--TTCTTGGTCG-GG-TTG---TATATAGA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                   tCT---GTGAC-T--------G------------T-CGT-G----T-GATGCG-----AC---TTG-C--CTGTT-CCG------GTCGG--ATTTCCTG----T-A--TGTGAC--TC------------TAT--TTCCA-TT-GCATT-CCAGTTGTGTG-----AC---TTT--C-GTTTGTGGATTTCCCGTGCTTT---GTG-CTGTGAGT-TTTCGCG-AT-GT--G-AATTGGCCC-TTTTTG-GATCTG-TTAATTCTGCTA-T-GAA-TTAT-T-GAGCAAGTTTTATTTATATT-GTAAAC-ATC--ATA----T-AT-----TCA----------------GTAAATGCCATTGC-ATTGATTGTAG--CACAGTGCT-------NNNNNNNNN---NN-NNN-NNNNNNNNNNNNN-NNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TT-TAAAT-ACGG--TTCCGG--CGGTGC-A-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTC-CA-C-GTGC-TG--T--T--C-TTTCTC-TC-TTCCCCGCGGACTCTGCA--AAG--G-A-TG-T-----ACGTA--T--GTA--TAAG------AGCCTCGCAC-TG--CGG-C-A-T---TGTA-TC-TTAGA----ACGG-A-A-A---TTGTAA-TCTTC-GTCCTT-TTA---TTGT-TAA-TAA-------CATG-------TGT--AAGT-G-G--TT--GTCTT-GT-G-AT-TTG-ACTATAgag
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cgGCA-AT-GT--G-AATG-ACCC-TTTTTG-GA-CTG-TTAAATTTGCTA-T-G-ATTTAT-TAGAGTAAAG--TA-TTGTATT-GTA---AATC--ATAAGGTTAAA-----TCA--------A-----T----AAATTGATTGC-ATCTATTGTAAGCTACAGTGCTNNNNNNNNNNNNNNNN---NN-NNN-NNNNNNNNNNNNN-NNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTTG-TT-T---TGGCGGT-TTTCGT-TCGG-GCTC-GGT-CT--ACT-CCGAG--CTCGCA-C-GTGCATG--TA-T--A-T----------------CGGACTTT-CA--AAG--G-G-AA-CAT---ACGTGT-T--TTT--T-AG------GGCTCGGCAC-TG--TGG-T-T-G---TGTA-TT-T--CT----CTGG-T-A-T---TTGTAAGTCTTT-GTC--G-TTC--TTTGT-TAA-T-AGATCACTCATGTA---ATTCT--AAGT-G-G--TT--TTTCT-GTGG-GT-TT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -GTATACAATC--A---GATT--T-----T----------T-----TTGTAAAATTTATTGC-ATTGATTGTAAGCCACAGTGCT---TAAGGTCTGTTTA---TA-GGA-TTGGGAACATTCC-TCA-----AAAGGGGGGGGTGGGAGTGTATTT---GGGGGGTTGATT-T---T-ACGGT-TTCCGGTTCGG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTCGCA-C-GTGG-CG--A--T--G-TC-CTC-TC--T-CTCGCGGACTGT-CG--AA---G-G-TG-CGGA--ATGTTT-T--TTA--T-AG------AGCTCGGCAC-TG--CTG-C-A-T---TGTA-TT-T--GT----CTGG-T-A-T---TTGTTA-TCTG--GTA--T-GTA--TTTG--GAA-T-A-------CATGTT---CTTTT--AAGTGG-G--TT--TTCTT-GT----C-TTG---TATATAGAttttatgtaaagaaaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taatttaaatcaaggTA-TTGTATT-GTAA----TC--ATAGGGTT-AAATCAATCA--------TATATTTTGTAAAATTTATTGC-ATTGATCGTAAGC---AGTGCT---GAAGATCTGGTCAANNNN-NNN-NNNNNNNNNNNNN-NNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGAAGAGGGGTGG-GGGT---T-ACGGT-TTCCTG-TCGG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTCGCA-T-GTGA-TA--TTGT--C-TCTCTC-TC-TT-CCCGCGGACTCT-CA--AAG--G-G-TG-CGGTCTACGTGT-T--ga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTCTAC-GTG--T--TA--TTTGT-TAA-T-A-------CATGTT---ATT-C--AAGT-G-G--GTCATTTTT-GAGT-GT-TTGTA-TATAGAGAATatttgttaatacatgttattcaagtgggtcatttttgagtgtttgtatatagagaatcactt
gi|8                          : tattgtattgtaatcatagggttaaatcaatcatatattttgtaaaatttattgcattgatcgtaagcagtgctgaagatctggtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaagaggggtgggggttacggtttcctgtcgggctcggtgtactccgagctcgcatgtgatattgtctctctctcttcccgcggactctcaaagggtgcgGTCCCTAG--GCGATTCC-TG-TCCT---GTGACG-------------------------AC-G----A-GGTGTA-----ACCGTTTG-TGACTGTGAT--------GT-GG--AGTTCCCG----TGG--TGTGACGTTC-C----------TAT--T--CG-TT-GATTT-CCTGTGGTGTG-----ACG--TTC--CTATTCGTGGATTTCCAGTGA--T---GTGACTATGAAT-GTTACTG-TT-GT--G-GATT-TTCCGGCTTTGTGA-CTG-Tcactt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                        atTTCC-CG-TGGT---GTGACGTTCCTATTCGTTGA-------TT-TCCTG----T-GGTGTG-----AC---GTT-C--CTATT-C--------GT-GG--ATTTCCAG----TGA--TGTGA------C----------TAT-----------GA----------ATGTT-----A---------CTGTT-GTGGATTTTCCG-GCTTT---GTGACTGTGACTGTTTCGCGAACAAT--G-AATT--CCC-TTTTT--GA-CTG-TTAAA-TGGCTA-TGG-A-TTATATA-AGTAGA-TGTA-Tgactgtttcgcgaacaatgaattccctttttgactgttaaatggctatggattatataagtagatgtat
gi|9                          :                                                                                                                                                                              atgtccctaggcgattcctgtcctgtgacgacgaggtgtaaccgtttgtgactgtgatgtggagCCCAAG--ACGATTCTTCT-TCCTTGGGGGAC-T--------G--GAGTGTTACTT-TGC-GATTGT-GATGTA-----AC---TTT-C--CTAT--C--------GT-GG--ACTTCTTGGTTGTGG--CGTACC--TC-T----------TATATT--CG-TGAGATTT-CCTGTGA-GTG-----ACCCTTTC--CTGTTTGTGGAAT-CTCGTGCTTTATCGTGA---TGACC-TTTTGCA-AT-GT--GGAATT-ATCC-TTATTG-GA-CTGATTAATTTCGCTA-T-G-A-TT


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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                    .         .  .    .       TGGAGTGTTACTT             G . .    .      .      .    G  .      . CG        .  AT      T .      .       TTTCC              ATTC   .  .     .  A        .      G     .      G                  .              .    G  AC    .  .    A    .      .  .   .    A       . . A .    . A   C   ATG  .       .   TACA   .    GGAGTAATCAAGATTTATTT                   CC     .                      N               TTT      .             .   .            NNNNNN     T    NNN         A  . G   T     G      .    .    .   .  .    .     .       C .    ATGTATA            .  .  .          C . G     .  . .  .  GA        . G    .  A  .               .  .    . . . .      .  . .   CTG     . . T        A     T .  A   .   .      T   . . .            G       .     G . .   .      GGTCGG  .   TA 
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                    .         .  .    .       GTGATT                    C . .    .      .      .    G  .      . .         .  AT      T .      .       TCC                TG     .  .     .  A        .      .     .      C                  .              .    G  AC    .  .    C    .      .  .   .    A       . . . .    . A   T   TG   .       .   AAC    .    GATTTTTTT                              TT     .                      T               NN       .             .   .            GGGTGG     N    NNN         .  . .   .     .      .    .    .   .  .    .     .       . .    GGATTA             .  .  .          G . G     .  . .  .  G         . .    .  .  .               .  .    . . . .      .  . .   ACT     . . T        A     G .  A   .   .      G   . . .            C       .     . . .   .      GTGAG   .   A  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                    .         .  .    .       GTGGT                     G . .    .      .      .    G  .      . .         .  AT      T .      .       TCT                TC     .  .     .  C        .      .     .      T                  .              .    C  AT    .  .    A    .      .  .   .    A       . . . .    . .   .   G    .       .   A      .    TATTCA                                 TT     .                      G               NN       .             .   .            NNNNNN     T    NNN         .  . .   .     .      .    .    .   .  .    .     .       . .    GGATTA             .  .  .          C . G     .  . .  .  G         . .    .  .  .               .  .    . . . .      .  . .   ACG     . . T        G     T .  A   .   .      T   . . .            T       .     . . .   .      GTGGA   .   A  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                              .  .    .       CTGGT                     A . .    .      .      .    T  .      . .         .  AG      T .      .       TCC                TC     .  .     .  A        .      .     .      T                  .              .    G  AT    .  .    T    .      .  .   .    T       . . . .                   .       .   A      .    TATTCA                                 A      .                      .               TA       .             .   .            A          N    GAA         .  . .   .     .      .    .    .   .  .    .     .       . .    TAATAA             .  .  .          G . T     .  . .  .  C         . .    .  .  .               .  .    . . . .      .  . .   CTG     . . T        A     T .  G   .   .      G   . . .            C       .     . . .   .      GTGGG   .   A  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                 .    .       TGT                       C . .    .      .      .    G  .      . .         .  AT      T .      .       TCT                TG     .  .     .  T        .      .     .      C                  .              .    G  TT    .  .    A    .      .  .   .                                                                                                                                                                                                      .    .           .  . .   .     .      .    .    .   .  .    .     .       . .    TATTA              .  .  .          T . G     .  . .  .  G         . .    .  .  .               .  .    . . . .      .  . .   CTG     . . A        T     C .  A   .   .      T   . . .            G       .     . . .   .      GAGTG   .   .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                      .       G                         G . .    .      .      .    G  .      . .         .  AC      C .      .       TC                 TC     .  .     .  T        .      .     .      T                                      .  AT    .  .    .    .                                                                                                                                                                                                                         .           .  . .   .     .      .    .    .   .  .    .     .       . .    AATTG              .  .  .          C . A     .  . .  .  G         . .    .  .  .               .  .    . . . .      .  . .   TG      . . A        A     G .  C   .   .      G   . . .            C       .     . . .   .      TGGT    .   .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          . .    .      .      .    T  .      . .         .  .       A .      .       C                  TC     .  .     .  .        .      .     .      .                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .  . .   .     .      .    .    .   .  .    .     .       . .    GAATG              .  .  .          G . A     .  . .  .  G         . .    .  .  .               .  .    . . . .      .  . .   CT      . . T        A     T .  A   .   .      T   . . .            A       .     . . .   .      AGTG    .   .  
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Unaligned ( gi|22 ): TTATTTGTTAATACATGTAGTTCAAAGTGGTTTTTCTGAGTGTTTGTTGTTTATATGAGAATCACTTT






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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aAGTG-ATTT---GGGGGGTTGATT-T---T-GCGGT-TTCCGG-TCGG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTCGCA-C-GTGC--T--ATTA--TCTCTC-TC-TT-CCCGCGGACACT-CA--AAG--G-G-TA-CAG---ACGTGT-T--TTA--C-AG------AACTGGGCAA-TG--CGG-T-A-C---AGTA-TT-T--GT----CTGG-T-A-T---TTGTAAGTTTTT-GTC--T-GCA--TTTGT-TAA-C-A-------CACGTT---GTTAT--ACGT-GTT--TT--TTCT-T-A--GTGT-TTG----g
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GGAGTTTG-TT-T---TTACGGTGTTCCGT-CTGG-GATCCGGTTGTTTACTACCGAG--CTCGC--------------------TTCTC-TC-TT-CTTGCCGACTCT-CT--AAG--GTT-TG-TGG---ACGTGA-TAGTT---T-AA------AGCTCGGCACTTGTCTGG-CTA-T---TG----T-T--ATA---CT---T-A-T---TT-TAAATCTTT-G-G--T-G-A--TTTGT-TAA-T-A-------C----T---TTTATGCAAA--G-G--TT--TTTTCT-GATGTCT-TT-----A-TACAG-AGAA
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    T-T---T-GCG-T-TTCCGG-TTCG-GCTC-GGT-GT--ACT-CCGAG---TCGCATC-GTGC--T--AATAA-TCTCTT-TCCTT-CCCGCGGACTTT--A--AAG--G-GTTG-CGG---ACGTGT-T--AAT--T-AG------AGCTCGGCAC-TG--
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                   gaT---GTGTTGTTG--------TTTGCGACTGT-GATGTG-----AC---TTC-C--CTATTGAAGTATT-A--GT-GG--ATTTCCAG----TGA--TGTGACTTTC-CTAT--T--GG-TG-GATTT-ta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tgtagaGG-C-A-T---TGTA-C-----GT----CT------------TGTGAGATTTT-GTA--T-GTG--TTTGT-GAA-T-A-------CATGTT---CTTAT--AAGT-G-G--TT--TTCT-T-G-TGAGT-GTT----A-TACAT-AGA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                               CCTAG--ACAATTCA-CA-TCCT---GTGACGTGG--------T-CGTG----T-GATGTG-----GC---TTG-C--C--------TGTT-C--GT-GG--ATTTCCTG----TTA--TGCGAC--TC-CTAT--T--CA-TG-Ggaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                            GTCCCTAT--ACGATTTC-TG-TCGT---GTGACCTGG--------T-CGTG----T-GATGCG-----AC---TTG-C--C--------TGTT-C--GT-GG--ATTTCCTG----TGA--TGTGAC--TC-TTAT--T--CA-TT-GAATT-CCAGTGATGTG-----AC---T-------TT--CTGTTTGTGGATTTCCCGTGCTTT---GTGACTGTGAGT-TTTCGCG-AT-GT--G-AATT-GCCC-TTTTTG-GA-CTG-TTAAATTTGCTA-T-GAA-TTAT-TAGAGTAAAGTTTA-TTATA-TTGTAAACAA--TCAT---------------------A--TA----T---TCAGTAAAATGCATTGC-ATTGATTGTAAGCCACAGTGCT---NNNNNNNNNNNNN---NNNNN-NNNNNNNNNNN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NT-T---T-ACGGT-TTCCGG-TCGG-GCTA-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTCCCA-C-GTGC--T--GTTC--TTTCTC-TC-TT-CCCGCGGACTCT-CA--AAG--G-A-TG-TGG---ACGTAT-G--TTA--T-AG------AGCTCGGCAC-TG--CGG-C-A-T---TGTA-TT-T--GTAGAAC--G-TGA-A---TTGTAAATCTCT-GTC--T-TTA--TTTGT-TAA-T-A-------CATGTT---GTTAA--AAGT-G-G--TT--GTCT-T-G-TGGAT-TTG----A-TATAT-AAAAT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 G--------TTTGCGACTGT-GATGTG-----AC---TTT-C--C--------TATT-C--GT-GG--------TG----TGA--CGT-----TC-CTAT--T--GG-TG-GATTT-CCAGTGATGTG-----AC---T-------TT--CTGTTCGT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cTG-AT-T---T-G-GAT-TTTCGG-TCGG-GTTT-GGA-GT--CCT-CTGAT--ATCGCA-C-GTGC--T--ACTG--TTTCTC-T--TA-CTCACGAAC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TA--TTTGT-TAA-T-A-------CATGTA---GTTCA--AAGT-G-G--TT--TTTC-T-G-AGTGT-TTGTTGTT-TATATGAGAAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                            tTCCCTAGGGACGATTCC-TG-TCTT---G--ATGTGA--------TTCCCG----TAGGTGTG-----AC---T-----------------TT-C--G----------------------------------CTAT--T--CG-TG-GATTT-CCCGTGAT-TG-----CT---T-------TT--CTGTTTGT-GATTTTCCGTGCTTT---GTGACTGTGACT-TTCC-CT-AC-GT--G-AATG-CCCA-TCTTTG-GA-CTG-TAAAATTTGCTA-T-G-A-TTAT-TAGAG---AATGTA-TTGTATTTGTAAA-AATCTCATAGGAG---T-AA-----TCA-A--GA----TTTATTTGTAAAA-TAATTGCTATTGATTGGAAGCCACAGTCTT---GAAGGTCGGTTTAT--TTGAA-TTTGGACCATTCCCTCCTCAA-AATGGGG-----GAGAGTGTAGTGATTGGGGGGTTG-TT-T---T-GCGGT-TTCCGG-TCGG-GCTC-GGT--T--ACT-CCGGG---TCGCACC-GTGC--TGGATTA--TCTCTC-TC-TT--CCGCGGACTGT-CGCAAGG--G-G-TG-CGA---TGGTGT-T--CTA--T-AG------AGCTCGGCAC-TG--CGG-C-ATT---TGTATTT-T--GT----CT-G-T-ATT---TTGTTAGTCTGT-GTA--TGGTAATTTTGT-GAA-T-A-------TAT-TT---CTTAT--AAGT-G-GTTTT--TTCT-TGG-TCGGG-TTG------TATAT-AGAcacttt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                   tCT---GTGAC-TG----------TCGTG----T-GATGCG-----AC---TTG-C--C--------TGTT-CCGGTCGG--ATTTCCTG----T-A--TGTGAC--TC--TAT--TTCCA-TT-GCATT-CCAGTTGTGTG-----AC---T-------TT--C-GTTTGTGGATTTCCCGTGCTTT---GTG-CTGTGAGT-TTTCGCG-AT-GT--G-AATTGGCCC-TTTTTG-GATCTG-TTAATTCTGCTA-T-GAA-TTAT-T-GAGCAAGTTTTATTTATA-TTGTAAAC-A--TCAT---------------------A--TA----T---TCAGTAAATGCCATTGC-ATTGATTGTAG--CACAGTGCT-------NNNNNNNNN---NNNNN-NNNNNNNNNNN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TT-TAAAT-ACGG--TTCCGG--CGGTGC-A-GGT-GT--ACT-CCGAG--CTC-CA-C-GTGC--T--GTTC--TTTCTC-TC-TTCCCCGCGGACTCTGCA--AAG--G-A-TG-T-----ACGTA--T--GTA--TAAG------AGCCTCGCAC-TG--CGG-C-A-T---TGTA-TC-TTAGA----ACGG-A-A-A---TTGTAA-TCTTC-GTCCTT-TTA---TTGT-TAA-TAA-------CATG-------TGT--AAGT-G-G--TT--GTCT-T-G-TGA-T-TTG----ACTATAgag
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cgGCA-AT-GT--G-AATG-ACCC-TTTTTG-GA-CTG-TTAAATTTGCTA-T-G-ATTTAT-TAGAGTAAAG--TA-TTGTA-TTGTA---AA--TCATAAGGT---TAAA-----TCA-A--T---------------AAATTGATTGC-ATCTATTGTAAGCTACAGTGCTNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNN-NNNNNNNNNNN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTTG-TT-T---TGGCGGT-TTTCGT-TCGG-GCTC-GGT-CT--ACT-CCGAG--CTCGCA-C-GTGC-----A-TG--TATAT------------CGGACTTT-CA--AAG--G-G-AA-CAT---ACGTGT-T--TTT--T-AG------GGCTCGGCAC-TG--TGG-T-T-G---TGTA-TT-T--CT----CTGG-T-A-T---TTGTAAGTCTTT-GTC--G-TTC--TTTGT-TAA-T-AGATCACTCATGTA---ATTCT--AAGT-G-G--TT--TTTC-T-G-TGGGT-TT
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