lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666
lowQualScore : 111 11 3 111111 888888888888888888888 111 1111111 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2222222222222222222 2222222222 444444444444444444444444444444444444444444444444 2 22222222 33333333333333333 111111111 33333333333333333333333333333333 1111111 11111 2222222222 333 5555555555555555555555 1111 11111111 33333333 22 1111 333333333 2222 111 1111 333333 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111 1111111111 333333 3333333333 1111 222 2 222 1111 222222222 1111111 22222222222222 111111 222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 22 111 1 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 111111 11 333333 1 77777777777777777777777777777777777777777777777 11 3333333333 1111111 2222 333 1111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 22222 11111 111 222222222222 11 111111 22 11 2 66666666666 111 11 11111111111 111 1 11 222222 22 11111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 1 222222 666666666666666666 11 11111 222 55555555555555 3 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111111 1111 9999999999999999999999999 1 2222 222222 111 1111 11 11 444 1 111 999999999999999999999999999 3 4
lowQualScore : 777 11 4 4 4 4 4 1 4 555555 55 5 111111111111111111111 7777 2 444 2 33 2 8888888 2 66 6666 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 77 3 0000000000000000000 888 3 9999999999 44 1 3 3 3 888 44 9999 444444444444444444444444444444444444444444444444 6 555 3 888888 6 888 77 44 3 3 8 2 77777777 999 2 33 22222222222222222 2 999999999 2 55555555555555555555555555555555 0 99 3 1111111 3 22222 3 55 3 8888888888 4 8 4 4 4 000 777 5555555555555555555555 5555 3 44444444 66 0 11111111 33 0000 222222222 2222 5 555 55 5555 5 5 66 5 5 5 000000 66 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 3 444444 5555555555 77 888888 66 5 2222222222 0000 5 5 000 6 5 5 000 3333 5 88 333333333 6666666 5 5 66 888 00000000000000 444444 5 5 222 5 888 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00 333 555 5 1 77 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5 5 5 66 888 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 666666 5 5 5 77 5 33 666666 1 33333333333333333333333333333333333333333333333 5 5 5 11 66 9999999999 5 3333333 66 7777 0 5 5 5 1111 5 5 333 66 5 5555 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 4 4 8 4 4 11111 33333 66 4 4 8 888 4 66 777777777777 55 4 1 4 66 777 4 000000 66 8 88 4 33 4 66 4 4 4 4 4 2 5 0 8 55555555555 5 555 5 66 888 5 5 55555555555 5 777 66 5 5 0 88 5 666666 5 888 66 33333 1 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 3 0 66 333333 44 333333333333333333 4 00 1 55555 4 444 4 55555555555555 0 5 5 66666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333333 8888 77 5 5555555555555555555555555 0 8 5 5 3333 5 5 77 5 5 888888 777 5 7777 6 55 99 0 000 6 8 666 5 5 5 3 222222222222222222222222222 5 2 0 6
lowQualScore : ... .. . . . . . . . ...... .. . ..................... .... . ... . .. . ....... . .. .... ......................................................... .. . ................... ... . .......... .. . . . . ... .. .... ................................................ . ... . ...... . ... .. .. . . . . ........ ... . .. ................. . ......... . ................................ . .. . ....... . ..... . .. . .......... . . . . . ... ... ...................... .... . ........ .. . ........ .. .... ......... .... . ... .. .... . . .. . . . ...... .. .............................................................................................................................................................................................................. . . ...... .......... .. ...... .. . .......... .... . . ... . . . ... .... . .. ......... ....... . . .. ... .............. ...... . . ... . ... .......................................................... .. ... ... . . .. .............................................................. . . . .. ... ........................................................................................... . ...... . . . .. . .. ...... . ............................................... . . . .. .. .......... . ....... .. .... . . . . .... . . ... .. . .... ............................................................ . . . . . . ..... ..... .. . . . ... . .. ............ .. . . . .. ... . ...... .. . .. . .. . .. . . . . . . . . . ........... . ... . .. ... . . ........... . ... .. . . . .. . ...... . ... .. ..... . ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. . . . .. ...... .. .................. . .. . ..... . ... . .............. . . . ..................................................... ........ .... .. . ......................... . . . . .... . . .. . . ...... ... . .... . .. .. . ... . . ... . . . . ........................... . . . .
lowQualScore : 111 00 0 0 0 0 0 6 0 555555 55 0 666666666666666666666 2222 9 666 9 99 9 4444444 9 11 1111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 99 3 2222222222222222222 555 1 2222222222 22 5 1 1 1 555 22 3333 555555555555555555555555555555555555555555555555 7 888 3 888888 2 555 33 22 1 1 1 4 66666666 444 9 99 99999999999999999 9 888888888 9 66666666666666666666666666666666 2 00 3 2222222 6 55555 6 00 6 5555555555 4 9 4 4 4 000 888 4444444444444444444444 6666 2 99999999 99 1 11111111 99 6666 555555555 6666 0 111 11 6666 0 0 99 0 0 0 555555 99 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 0 777777 6666666666 99 999999 99 0 2222222222 6666 0 0 555 5 0 0 888 4444 0 22 222222222 2222222 0 0 99 888 44444444444444 444444 0 0 555 0 888 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 44 111 999 7 4 99 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 0 0 99 888 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 444444 7 7 7 99 7 11 111111 4 44444444444444444444444444444444444444444444444 0 0 0 99 99 9999999999 0 8888888 99 1111 4 0 0 0 5555 0 0 666 99 0 6666 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 4 4 9 4 4 77777 00000 11 4 4 9 222 4 11 888888888888 00 4 1 4 11 888 4 444444 11 9 33 4 77 4 11 4 4 4 4 4 5 0 0 8 11111111111 0 111 0 99 888 0 0 88888888888 0 444 99 0 0 0 44 0 222222 0 888 66 00000 9 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 8 2 0 11 111111 66 888888888888888888 4 99 9 33333 4 999 4 88888888888888 6 0 0 11111111111111111111111111111111111111111111111111111 00000000 0000 99 7 6666666666666666666666666 9 7 7 7 3333 1 7 99 7 7 666666 999 7 3333 7 88 00 8 000 0 0 888 7 7 7 0 999999999999999999999999999 7 9 0 7
consensus : TTAAAGA-A-TTT--CAA-C-A-T-T-CT-CGGA-TG------CT--ATGAA-GT---A--GCGCG--TTC--TATT--TCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AATA-AAA----TG----A-TA-------GTATC--------ACA--CA-TG----G--C--G---A----GT--T-ATT---G-----AA----A--TTA---T-GT-----T---C--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C--CAA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-T------T-T---TC--CA--G-C-A-GTCACAAA---AAC-NAGAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTA-AAATTCA---GAAA-AT--G-----GAAT-AAAN-----A-T-C------C-ACAG--AA--T--TGAAATG-GAAA-AC-A-CT-T-G---AA-T--T-TG-TATT----TCAG-A-T-GAA-AA-AT--GA---AGT-------T--------TGT-N-TTCAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AAT-GA--AG-AGGAA--TTTTT----ATAAA-AA-AAA--AGAA-CC-TGA-AA--TGGCCA-GT----AA-G-G--GT-C-TAAACT-C---GTATGCAA--TCC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TTC-----TG---T-TNAT--T------------ACA-NC-TT--C-T-AAAATTT------NA---T-T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT--TGT--C-TA----------A----------------AC-ATT-G-C-----------TTCGTCANG------G-AT--A-TCGTCTCT---T--TTAT-----T--A-A--ATA-A--A-TTTG--A-CG-----T-CG-TG----C-TG-TAA-ATCTA-GT-T-AGTT--AATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-CA-CC--A---AA---GTA--A-----GA------G-AAG-TT--A-AA---TGTACAC-A-A-GGG-A-----GATA-TAAT---CT--AG-TCC-CC---CCA-AA---GAAAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCG-CA---G--AC----AT-C--CTTA--CT-AT-----TGA-ACGTCAT-A-----------TAAA-GAA-AT-GG--C---TTCTCCATTTAT-TGACA--T-CACT-GA-TA---ATC--AGG-----AAA---CAA----TG-A--G--TGAA-CAGG------GT--GAAT--TC-AGGT-ACA------GTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGA-AG-AGGA-AAT------------------CTTATATAAATTTCACAACT---------C-CA-TAC-T--A--CCC-------TN-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACT-TA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTCA-GGCA-GTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTG-CTGC-CCCC-ATGCTTC-TGT--GGC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTAC---TA----ATCA-AT--AAAAAAT-TGT-TTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------ACACAC-C---AATGAACA-AAACA-A--TAACA-ATGCA----CACG---ACACGC---CACGNACAG----AA------CAGGCAC----------AACA-GGACA-C-ACAACA-GACCA---GA--CA-GA-------CACAN----ACAC--A--AC-CGA-------G--AC-C---C-ACC---GACCAGACAGACCAG--A---A-CG--ACAC--------GACACACGACAGA----C--C------ACA-ACACAC---CACAGACACCGA---CCG-CCG-A-CA-AC-C-ACACA-CAGCACCAGAA---CATACACACAC-CAC------CACGAC-CGA---C---C-----AC--AC-GACA---CACA---CACC-G-A--CA-GACAC--AC-ACAC-----ACACG-A-CACA-GA-CAG--CGA-CA-A--CACACAC----AC-CAC-A-CACA-ACA--G-CAGACA-----C--AACA-AGCA-GACAA---GACACA-G---CACANA------C----AGAC--C-------ACANAC---ACNACAACACAG-ATAGAACACAGA-CA-GCA--C-CA---CA-ACACA-CAC-A-AACAC-TAAAACTTGAAATGT--AAT-AAG--AAATGA-GGA------CTTGTCCAA---TCAA-AA-CATGAAACA--TCAG-AA-A-TGAGAATT-GGA--A-------CA-AACTTTTG-T-GGTAC----AA-AAACA-AT--G-C-AAATGATTATTTTCTCG--GCACTTCAC---CACAA--CC----CCCAATG-CTG--TGAAAAC-TT--CCGAC--A---TATATACTTN--CTGACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAAA---AAAATATT-GAGTAC--A-A-ACTTCATATTT--AAAG-TATAAAAACATCCTT-C-T-TAT-ACA-CTAAAAA-TCC---AAAATTT--CTGA-CCTG--A---AGAATTTC-AAAGTTC-AGGCCGAC-ATG-TGCTTA
Reference ( gi|3 ) : TTAAAGA-AATTT--CAA-C-A-T-T-CTGCGGA-TG------CT--ATGAAAGT---A--GCGCGGCTTCGGTATT--TCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AATA-TAA----TG----A-TA----A--GTATC--------ATA--C--TG----G--T--G---A----GT--T-ATT---G-----AA----A--TTA---T-GT-----T---C--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-AGC--CAA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-T------T-T---TC--CA--G-C-AAGTCACAAA---AAC-CAGAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTATAAATCCA---GAAA-AA--G-----GAAT-AAAC-----A-T-C------C-ACAG--AA--T--TGAAATG-GAAA-AC-A-CT-T-G---AA-T--T-TGTTATT----TCAG-A-T-GAA-AA-A---GA---AGT-------T--------TGT-T-TTCAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AATAGA--AGGAGGAA-ATTTTT----ATAAA-AATAAA--AGAA--C-TGA-AA--TGGCCA-GT----AA-G-G--GT-C-TAAACT-C---GTATGCAA--TCC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TTC-----TG---T-TAAT--T------------ACA-A--TT--C-T-AAAATTT------C----T-T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT--TG---C-TA----------A----------------AC-ATT-G-C-----------TTTG-CATA------G-AT--A-TCGTCTCT---T--TTAT-----T--A-A--ATA----A-TTTG--A-CG-----T-C--TG----C-TG-TAA-ATCTAAGT-T-AGTT-TAATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-CA-CC--A---AA---GTA--A-----GA------G-AAG-T---A-AA---TGTACACGA-A-GGG-A-----GATA-TAAT--GCT--AG-TCC-CC---CCA-AA---GAAAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCA-CA---G--AC----AT-C--CTTA--CT-AT-----TGA-ACGTCA--A-----------TAAA-GAA-AT-GG--C---TTCTCCAATTAT-TGACA--T-CACTCGACTA---ATC--AGG-----AA----CAA----TG-A--G--TGAAGCAAGA-----GT--GAAT--T--AGGT-ACA------GTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGATAG-AGGA-AAT------------------CCTGTATAAATTTCACAATT---------C-CA-TAC-T--A--CCC-------TAATGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACTCTA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTTATGGCA-GTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TT--CTGC-CCCCAATGCTTC-TGT--GGC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TG-TTGTA----TAA---ATCA-AT--AAAAAAT-TG--TTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------ACACAC-C---AATGAACA-AAACA-A--TAACA-ATGC-----CACG---ACGTGCTAATACGAACAG---TAG------CAGGTAC----------AACA-GGACA-C-ACAGCA-GACCA---GA--CA-G--------CACAG----ACAC--A--AC-CGAT------G--ACTC---C-ACT--AGATCAGACAGACCAG--A---G-CG--ACAC--------AACACACAACAGA----C--C------ACA-ACACAC---CACAGGTACCGATTTCCACCCG-A-CA-AC-C-ACACA-CAGCATCAGCC---CATGCACACAC-CAC------CACGAC-CGA--TC---C-----AT-TACCGACA---CACA---CACCTG-A--C--GACAC--AC-ACAC-----ACACA-A-CACA-GA-CAG--CGA-CA-A--CGCACAC----AC-CAC-AGTATA-ACA--G-CAGACA-----C--AACA-AGCA-GACTA--TGACACAAGATTCACAGAG-----C----AGAC--C-------ACAGAC--TACGACAACATAG-ATAGAACACTGA-CATGCA--C-CA--GCA-GCACATCAC-A-AACACATAAAACTTGAAATGT--AATTAAG--AAATGA-GGA----TGCATGTCCAAAGTTCAA-AA-CATGAAACA--TCAG-AATA-TGAGAATT-GG---A-------CATAACTGTTG-T-GGTAC--TCGA-AAACA-AT--G-C-AAATGATTATTGTCTCG--GCACTTCAC-GCCACAA--CC----CCCAGTG-CTG--TGAAAAC-TTTCCCGACTCA--TTACATACCTT--CTGACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAAA---AAAATATT-GAGTAC--A-A-ACTTCATATTT--AAA--TATAAGACCAT-CTT-C-T-TAT-ACA-CTAAAAA-TCCCAGAGAA--T--CTGAGTCT---A---AGAATTTC-AAAGTTCAAGGCCGACTATG-TGCTTA
gi|5 : TTAAAGA-A---T--CAA-C-A-T-TACTCCGAT-CG------AC--AT-AACGT---A--GCGCG--TTC--TATT--GCAAAA-AAAATA-G--AAGAT-TTC------G-AATA-AAA----TG----A-TA--------TATC--------AGA--CA-TG----G-----G---A----GTATT-ATT---G-----AC----A--ATA---T-GA-----T---C--TCGA-A-A-----GA--G-C--GAATCGC--TAA-A-A-TTG-A-TA--T---C--CCCAAT-A-----C--A-C---AGT------T-T---TT--CA--G-C-A-GTT-CAAA---AGC-AGGAGTGT-A-GTCCCCT--TGTAGTAAAAAGTCA---GAAA-T---G-----AAAT-AAAC-----G-A-C------T-ACAG--AT--T--TGAA-TGTGAAA-TA-A-CTCT-G---AA-T--T-TG--ATT----TCC--A-T-GAA-AA-AT--GA---AGT-------T---------GT-TATTCAA----GAT-TC-TG-G---TATGA------GA--AG-AGGAA---TTTT----ATAAA-AA---A--AGAA--C-TGA-A---TGGCCA-GT----AA-G-G--GT-C-TAAACT-C---A-ATGCAA--TCCATTGC-AGAG-T---TAT----CT--AT----TTCCTGCATG---T-TA-T--T------------CTA-A--TT--CCT-AAAATTT------TAA--T-T--TCA--CATAAGCGA--A-TT--TGT--C-TA----------A----------------A---TT-G-C-----------TTTGTCA-A------G-G---A-TCGTCTCT---C--TT-T-----T--A-A--ATA----AATTTG--A-CG-----T-C--TG----C-TG-TTA-ATCTA-GT-T-AGTT--AATGTT-AGTGT-CAAA-----------TA-------A-CA-CC--A---AA---GTA--AA----GA------G-AAG-T---A-AA---TGTAC-C-A-A-GGG-A----------TA-T--GCTGAAGATCTGCC---CCA-AG---TTAAAGGAGA-GCCAG-CAG-ATGGTC-A-CGTTGCG-CACTTG---C----ATGCG-CCTA--CT-ATCTCCATGA--CTCCA--AGAGTTACATACCAAA-GAA-A--GG--C---TTCTCCA-TTAT--GA-A--T-CACT-GA-TA---ATC--AGG-----AAA---CAAA---TG-A--G--TGAA-CAGG-------T--GAAT--TC-AGGT-ACA------GTT-A-AAG-T--AAGG-GG--AGGAAAG-AGGA-A-T------------------CTTA---GAATTTCACA--T---------C-CA-TAC-T--A--CCC-------TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--A-CTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTG-AA----GTTA-G---A--AGT---CAC-ATGT---AGCA-GTA-A------------------------T-CGCG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CCCAC-TCCCTCCAT--CAGGGA-AT--AA-----A-GCT-TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-A-GG---A--CC-TTG-CTGC-CCCC-ATGCTTC-TGT--GGC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTAC---T-----ATCA-AT----AAAAT-TG--TTG-A---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-TTCATT--T-TCTTGT-GT-CAATAGCAC-CAC------ACACAC-C---AATGAAC--AAAC--A--TAAC--ATG------CACG----CACGC----ACGCACAG-----A------CAGACA-----------AACA-GAACA-C-AGA-CA-GACCA---GA--CA-GACAT----CACAC----ACAC--AC-AC--------------AC-C---C-AC------CCAG-CCGACC-G--A---C-CGACACAC--------AACACGAGACAGA-------C------AC--ACACAC---CG-----ACCGA-------CCG-A-CACAC-C-ACACATCAG-A-CAGGA---CACACACACACACACAGAGAGCA-GAC-CGA--CCAGACACACAAT-TACCAATA---GACAG--CA---G-A--CA-GACACCAAC-ACAC-----ACACACA-CACA-G---AG--AGA-CA-GACCCCACAC----AC-CAC-A-CACA-G-A--A-TAGACA-----C--A--G-AGCA-GACAA--C-ACACA-----CACACA------C----AAACA-C-------ACAAAC--T
gi|1 : TTAACAG-AATTC--CAA-C---T-T-CT-CGGAATG------CT--ATGAAAGCTTCA--GCG----TTCATCACT--TCAAAA-A---TA-G--AAGATCTTC--CG-CG-AATA-AAA----TA----A-TA--------TATC--------ATA--CA-TG----G--C--G---A----GT--T-ATTCG-A-----AA----A--TTA---T-GTCT---T---G--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C--CAA-A-A-TTG-A-TAA-T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-T------T-TC--TC--CA--GGC-AGATCACAAA-----C-CAGAGT-T-AATTCCCCT--TG-GATA-AAATGCA---AGAA-AA--GA----GAAT-AAAC-----A-GAT------C-ACAG--AAATT--TGA--TG-GAAA-AC-A-CT-T-G---AA-TGAT-TG--ATC----TCAG-A-T-GAA-AACAT--GA---AGT-------T--------GCTAT-TTCAA----CAAATCATG-G--TTATGA--AAT-GA--AGAAGCGA-ATTTTT----ATAAA-A--AAA--AGAAGCC-TGA-AA--TGCGCA-AT----AA-G-G--GT-C-TAAACT-C---GC-TGCAA--TCC-TTG--AGAGAG---TCTC--ACT---T----CTC-----TG---T-T-AT--T------------ACA-AC-TT--C-T-TAAATTT------A----T-T--TCA--C-CAAT-GA--ATTT--TGTCCC-TA----------A----------------AC-AT----C-----------TTTG-CTTATTCAAGG-AT--ATTCGTCT-T---A--TAAT-----T--ATA--ATAAAC-A-TTTG--A-CG-----TACGATG----CATG-TAACATCT-AGT-TAAGCT-TAATGCTAAG-GT-CAAAA--------TATA-------A-CA-CCATA---AA---GTAAGA-----GA------G-AAGTT---A-AAAATTGT-TACCA----GG-A-----G--A-TAAT---CT--AG-TCC-CC---CCA-AA---G-AAAGGAG-AGCCCAGCAG-A-GGTC-A-C--TG---CA---G--AC----AT-C--CTTA--C---T-----TG--ACCTCA--T-----------AAAA-GAA-AT--G--C---TTCTCCATCTA--TGACA--CGCAACTGA-TA---ATC--AGGA----AA----CAA----TG-AAGG--TGAAGCAAGT-----GTTGAAAT--TCAAGGTGACA------GTTAA-AAG-T--AAGG-GGGAAG---AG-CAGG-AAT------------------CCTTTATAATTTACAC-ATT---------CACATTAC-T--A--CCC-------T--TGGA-ATG-----AAAA--AG-G--AACTAA--CTG-TGC---TTCGCTT-CCA--CTA--GTG-AA----GTT--A---G--AAT---CA-CATG-TATGCCA-GT--A------------------------T-C-CG-ATC-ATCA-C-----GGCC---A-T----CC-ACGTCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AC-----A-GC--TTTCAA-TTG-CGGACCG---AAA-G-GA---AACCC-TTG-CTGC-CCCCCATGCTTCTTGT---GC-C-TAGCATGTTCACATCATGTA-TG-TT-TG----TAACCTATCAGATA-AAAAAAT-TGT-TTGCA---T--T-CTAAAA-A-G--T----TG-T--TAT--T-TC-TGT-GT-CAATAGCAC-CACCA----ACACACTC---AAT-AAC--AAACA-A--TTATACATG------CACC---AC-TG-TCGCACGCACAGACACGA------CAA--AC----------AACACAGACAGA-ACAGAA-GACCA---CA--CA-A--------CACAG----ACGG--A--TC-CA--------------C---C-ACC--ACACCAGACACA-CAC--A---A-CG--ACTC--------AACAtgaaatgtaataagaaaatgaggaacttttgtccaatcaagaacatgaactcagaaaatgagaattggaacaaactttgtggtacataaacatgcaaaatgaatattttctggcactcacacaacaccccatagctgtgaaaacttccgacataaacttactgacctaataaccttaaatttcaatacgataaaaaaaaaatattgagtacaaacttcatatttaaaaatataaacatcctctataacatctaaaaatccaaatattctgacctgcaaggaatttcaaaagtttcaggccgacattgctta
gi|4 : ccttcatataatattaccaaaataaacaaatatgaaaaaagttttatgattacattcctaatattatttatcgttaactcctcgagtaattactttccgtattgcaaagggagggctaacacattgagaccTTAAAGA-ATCTT--CAA-C-A-TAT-CT-CGGA-TG------C---ATGAA-GT---A--GC----CTTT--CATT--TCAAAA-AC--TA-G--AAGAG-TTT--CC-CG-AATA-AAA----TG----A-TA--------TATC--------ATAATCA-TG----G--C--GTACG----GG--T-ATTTTGA-----AA----A--TTA---TTGT-----C---T--TTAA-A-A-TC--GA--G-C--GAA------CAACA-AATTG-AATA--T---T--CC-AAT----------A-C---A-T------TAT---TC--CA--G-C-C-GTCACAAA---G-C-AAGAGT---A-T-CACCT--TG-TTTA-AAATC-----GAAA-AT--G-----AAA--AAA------A-T-C--------ACAAGAAA--T--TGAA-TG-GAAA-AC-A-CT-T-GGGGAA-T--T-TGACTCT----CCAG-A-T-GAA-AA-A---AATGCAAT-------T--------T-T-G-TTCAA----GAA-TC-TG-GTAGT-TGA--AAT-GA--AG-AGGAC-TTTTTT----ATAAA-AA------AGAA--CCTGACAA--TGGTCC-AT----AA-G-G--GTGC-TAAACT-C----TATGCGA--TCC-T-G--AGAG------CT---ACT--AT----TT------TG---T-TA-T--T------------ACA-C--TT--C-A-AAAATT-------A----T-T--CGA--C-CAAG-GA--A-TT--TGT--C-CA----------A---------------------T-G-C-----------TTCG-CAGG------A-AT--A-T-GTCTAC---T--TTAT-----T--A-A--ATACAA-A-TTTG--A-CGA----T-CAGTG----C-TG-TA---TCTA-GT-T-AGT---AAC-T--AG-GTTCAAAACTTAAATATATA-------A-CA-CC--A---AA---GTA--ATAAGCGA------G-AAG-TTA-A-AA---TGTACA----A-GGG-A-----GATAATTAT--CTT--AG-TCC-CC---C----A---TAAAAGGA--AGCCAGCAAG-A-GGTC-AAC--TGC--CAC--G--AC----A--C--CTTA--C--AT-----CGA--CGTCAT-A-----------TAAA-GGA-AT-GG--C---TTCTCCA--TAA--GACA--T-CACT-GA-TA---ATC--AGAGGGGTAA----CAT----TG-AT-G--TGA-GCAGG-------T--GAAC------AGT-ACA------GTT-A-AAG-T--AAGG-GG--AGGA----AGGA-AAT------------------CTT---TAA--TTCACA-CT---------C-CA-TACAT--A--CCC-------CTATGGA-A-GGAAGAAAAA--GGAA--ACCTAAC-CTG-T-CGTTCTC-CTTTCCACT--A--GTG-------GTT--G---ATTCGTA--CAC------ATGGCAAGTA-A------------------------C-C----ATCCAT-A-CTG---GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCA-A-CAGG---AT--A------G-AT--TT--AA-T---CGG--CG---GAA-A--A---A--CC-T-----GCGCCCCA--GCTC----T--GGC-C-T-GC-T-TTC-CATCATTTACTG-TT-TG----TAACT-ATCA-AT--AAAAAATATG--TTGCA---T-GT-CTAAAA-AAG--T----TG-TC-ATT--T-TC-TGT-GATCAATAGCAC-AAC------ACACAC-C----ATGAACA-ACAC--------CA-ATAT------------ACATGC-ATTGC-AGCA-----AC------CA---AC----------GACGCAGACA-C-AAGACA-GA-CA---GA--CA----------CACCA----ACACCGA--GC-CG--------G--ACTC---C-TCC--CGA-CGNNNNNNNNNN--N---N-NN--NNNN--------NNNNNNNNNNNNN----N--N------NNN-NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-NN-NN-N-NNNNN-NNNNNNNNNNN---NNTCCCGACCC-GAC------C--GAC-CGA---C---C-----AC------ACA---CAC----CGCCCG-ACCC--GACCG--AC-ACAC-----ACACA-G--ACA-GA-C----CGA-CA-T--CTCCCCC----CC-CCC-CACACC-ACA----CAGACA--------GACA-GACA-GAC-A---GAT---AGA--CACAGA------C----AGAC--C-------ACACACA-CACAA-AACTTA------AACTTTGA-AATG----T-TA----------ATTA---------ATAAAAGAGGAAATGTCCAATCAAA--ACATGA---------------TCA----TCAG-A-----GAA--A--TGAG-AAT--------TT-GG---A-------AA-AACTTCTG-T-GGTAC---AAA-AAACA-----G-C-AAATGA-TATT-TCTC---GCAC-TCA----CACAA--CC----CCCCATG-CTG--TGAAAAC-TT--CCGAA-CA---TA-ATACTTA--CTGACT-AATAAC-C-TT----AAATTATCAAT--AC-GA-T-A----AAAA---AAAATATTGGAGTACAAA-A-ACTTCATATTT--AAAG-TATAAA--CAT-CTT-C---TAT-ACA-CTAAAAA-TCC---AGAATTT--CTGA-CCTG--A---AGAATTTC-AA--TTC-AGGCCGAC-ATG-TGCTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagatagacacagctaaacacagacacaacccaatgtacacacaccaaacactaacttgaaatgtaataagaaatgaaggacttgtcccaatgcaaaacatgaacatcagaaaatgagaagtggaacaaatctttgtggtacaaaacatgcaaatgatatttcctcgcactcacacaaatcacccatcctgtgaaaacttccggacatagatacttactgactaaataaccttgaaaatttcaatacgataaaaaaaaaatattgagtacaaaacttcatatttaaaatatagaacatccttcttatacactaaaaatccaaaatttctgacctgaatagaatttcaaagttcaggccgacatgtgctta
gi|7 : acataaatattaccaaataaaattattgaaaaatatgttgattcatttaagataactctcttaaataatttatatggttaaacctgggtaactacctttccgtatggcccaaggagggaagagttggaccTTAAAGA---TGT--CAAAC-A-T-T-CT-CGGA-TG------CT--ATGA--GT---A--G-GCCAATTC--TATT--CAGAAA-A---TA-G--A-GAT-TTC--C---G-GATA-AAA----TG----AGTA--------TATC--------ATA--C--AT----G--C--G---A----GT--T-ATT---G-----AA----AA-TTA---T-GT---------C--TTGA-A-T-T---GA--GGC--GAA---C--CAA-T-AATTG-A-TAA-T---CGTCCCAAATAT----C--AGC---A-T------T-T---TCTCCA--G-C-A-GTCACTAA---AAC-CAGAGT-T-A-TTCTC-T--TG-GTAATAA--TCA---GAAATGA--G-------AT-AAA------A-T-C--------ACAG--AA--T--TGAAATG-GAAA-AC-AACT-T-G---AA-T--T-TGTT--------CAG-A-T-GAA-AA-AT--GA---AGT-------T---------GT-AATTCAAT---GAAATC----A--GTATGATAAAT-GA--AG-AGGAA--TTTTT-----TAAA-AA------AGAA--C-CTG-AA--TGGCCAAGT----AA-G-G--GT-C-TAA-CT-C-----ATGTAA--TCC-TTG--AA---G---TCT---AC---AT----T-C-----TG---T---AT--T------------ACA-C--TT--C-T-AA---TT------T----T-T--TCA--CGCAAG-GGTAA-TTG-TC---C-TA----------T----------------AC-ATT-G-C-----------TTTGTCAAG------G-AT--AATCATCCTC---T--TTAT-----TTAA-AGTATA----A-TT-G--A-TG-----T-CG-TG----C-TG-TAA---TTA--T-T-AGT---AAT-T--AG-GT-CAAAA--------TATA-------ATCA-CC--A---AAAA-GTA--A-----GA------G-AA--T---ACAA---TGTACAT---A-GGGCA-----GATA---AT----T--AG-TCC-CC-----A-AA---GAAA-GGAGA-GC--AGCGA-C-GGTC-A-C--TGCA------G--AC----AT-C--CTTA--CT-AT-----TGA--CGTGC--A-----------TAAA-GA---T-GG--C---TT-TCCA--T-T-TGCCA--T-CAT--GA-TA---ATA--GGA-----AA----CAA----TG-A--G--TGAA-CAAG-----------------------------------T-A-AAG-T--AAGG-GGG-AG---AG-AGGA-AAT------------------C---TATAA--TTCACAACT---------C-CA-TAC-T--A--CCT-------CTATGGA-A-------AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTGGAA----GTT--G---A---GT---CAC--TGT----ACA-GTA-A------------------------TGC-CGGATC-A--A-C-----GACC---A-T--C-C--A--TCCCTTCATA---GGGA-AT--A--------GC--TT--AAATGG-CGG---A---AAA-G-GA---A--CC-TTG-CTGC-CC---ATGCTTC-TGT--GGC-C-T-GC-TGTTC-CATAATTTA-TG-TT-TG----TAC---TTCA-AT----AAAAT-TGT-TTGC----T-GT-CTAAAA------T----TG-T--CCT--TGTC---T-GTC--ATAG------C------ACACAC-CTAAAATTATCA-AAA
gi|26 : ctcctacttttctcagcgcagttttcgaatcgtaaaaggcctcatttaagtgcagattggcccaccgttcatataatttacaaaataaacaatattgaaaatattttgatatcctaaatactccttaatatattttatacgtgttactggtaactttactttcgtatgaagggaggtaaattggacTTAAAGA-A-TTT--CAA-C-A-T-T-CT-CGGA-TG------CT--ATGAA-GT---A--GC-CG--TTC--TATT---CAAAA-A---TA-G--AAGAT-TT---CC-CG-AATA-AAA----TG----A-Tagctgaatagggtcttagattctaagaatagaacgtgagaacaatatgcgtgaactgcaagttatacgttctaaaacagtttaaccaaaacaaacaataacatgcagcacaacaacagaccagaagacagacacacatcagaccgacaccaacagacgacacatcaccacagaagcagacagatatgaccacagccacacaaca
gi|27 : TTAAAGA-A-TTT--CAA-C-A-T-T-CT-CGGA-TG------CT--ATGAA-GT---A--GC-CG--TTC--TATT--C---AA-A---TA-G--AAGAT-TT---CC-CG-AATA-AAA----TG----A-Tttat
gi|16 : TTAAAGG-ACTTTGCCAA-A-AAT-T-CATCA-A-CA------CT--AT-AAAGT---ACTATGCGG---------T--TGAAAA-T---TA-A--AAGAC-TTG--CC-GGTCATA-AAA----GG----A-T--------GTATC--------ACA--C--AG----G--G--G---G----TT--T-ATC---G-----AA----AACCTA---T-GT---------C--T----A-A-T---AA--G----GA----T--TAG-G-AATGC-A--A--T---C-------TTAA----C--T-C---A-T------T-TGTTTT--CA--G-C-ATGTCAC--A---AAC-AAGAGT-TAA-TTCCCCTCCTT-GGT---AATTT----GGAA-AT--G-----GAAT-AAAA-----AGT-C------C--CA-----------AAAATG-G----AT-A-TT-T-AT--AG-C--C-TATTATTCTGATCAG-A-T-CAT-AT-A---GA---Attatc
gi|8 : AAAGAGAATTT--CAA-C-A-T-T-CT-CGGA-TGG-----CT--ATGAA-GT---A--GC-------CGTTACTGTTCAAAA-AAG-TA-G--AAGAT-TTC--C-----AAT--TAAAAATTG----A-TATATCA--GTAGC--------ATG-----TGCGACA--T--T---A----GT--TGATT---GC----AA----A--TTA---T-GTGCGATT---C--TTGA-A-A-T---GAATG-C--GAA-A-C--CAA-ATAGTTG-AATA--T---C--TCCAATAC-----C--ATC---A-T------T-T---TTT-CA--G-C-A-GTCACAAACGCAAC---GAGT-T-A-TTCCCTT-----GGTATATATT-A---GAAA-AT--T-----AAAA-AAAC----------------C-ACAG--AA--CACGGAAATA-GAAA-ACCA-CT-T-G---A--T--T-TG--ATT----CCAGGA-T-GAATAA-AT--GA---AGT-------TGATTAGTGTAT-T-GTTAA----GAAATC-TT-G--GTATGA--AAT-GA--A--AAGAA-TCTTTT----ATAAG----AAA--AGAATCC-TGA-AA--ATGCCA-GT----AA-A-T--TT-C-TAAACT-CATTGTCTGCAA--TTC-TCT--TGAG-GTATTCTG--ACTTAGT----TTC-----TGT--T-TTAT--TTTGTACCCCACCACA-C--CTACC-T-AAGATTT------A----T-T--TCAAGC-CAAG-AT--A-AT--TG---T-TA----------A----------------a
gi|9 : cgctagcttatccatctcctacttttctcgcgaagtgacagttcttttctgtaatcctggcataaaaggcactttcattcaatgctagatgtgccaacccttcatatagtatatgtaccaaataaacatagttaattttgagaaaagtcatatttataatttcatttaaatactctcttaatatatgtatgatgtttaacctctctggtttaaacaccgttattatctaattacggtttctaattataggacgataaaggcagagcgcctattgagattcctaAAGA-ATGTT--CAA-CCA-T-T-TCATCGA-TGGACTGGCT--AT---AGT---A--TGACG--TTC--TATT--CCAGAATAC--TA-G--AAGAA-TTC--TC-CG-AATA-AAA----TGTGATA-TA----T--ATACG--------ACA--T--TG----GGTTA-G---A----GTA-T-ATT---G-----AA----A----AG--T-GT-----TAGTC--TGGAGA-A-A---GA--G-G--CAG-AAC--CAA-T-A--TGTA-TA--TT--C--CCCAAT-A-----C--A-----A-T------T-T---TC--CA--G-C-A-GTCTCAAA---A---CAGAGT---A-TTCCCCT--TG-G-TAAAAATC-A---GAAA-TT--G-----AGAT-AAAC-----A-T-C--------ACAG--AT--T--TGAA-TG-GAAATAC-A-CT-TTG---AA-T--T-TG--ATC-----CAG-ACT-GAA-AA-AT--GA---AGT-------A--------TGT-A-TTCAA----GAAATC-CT-G--GTATGA--A-T-GA--AG-AGGAA--TTTTT----ATAAA-AA--AA--GGAA--CCTGA-AAG-TGGCC--GT----AA-A-GCGGT-C-TAAACT-C-----ATGCAA--TCG-T-G--ACGA-G---TCT---ACT--AT----TTCG----TG---G-TTAT--T-------------CA-AC-TT--C-T-AAACTCT------TAT--T-T--TCA--C-CAAGAGG--A-TT--TT---CCTA----------A----------------ACTATT-GGC-----------TTTGTCAAG------G-ACTAA-TCGTCTCT---TCTTTAT-----T--A-A---TAT---A-TTTG--AACG-----T-CA-TG----C-TGCTA---TCTA-GT-T-AGTT--AATGT--AG-GT-CAAA---------TATA-------A-CA-CC--A---AG---GT---A-----GA------GAAAG-T---A-AA---TGTGTACCAGA-GGG-AGTAGTGATA-GAATCAGTT--AGATCA-TT---AC---------AAAGGAG-AGCCA-GCAGAA-GGTC-ATC--TGCG--A---A--CC----ATCC--CTTA--CT-AT-------G-ACG-CATGA-----------CAAA-GAA-ATCGG--CCGTCTCTCCCTTTA--TGACA--T-CAtgccataatcatgcttgccggaagcatgttcggttgctctcggtatttagcgaatatcctgaagacatgaattttgacgcctcgtctgctgtgaatctacgtttttactgggttaacgtgttgcattaaacagatacgagagtttcaaatgtgagattaattatacaccagatatgaaaaagag
gi|6 : cttttctccgacatttcgaatccggtaaaaggcacttcattcataccgcgtaacttcactgcctcttatattagccaaataaacagaataattgaactaaaatattttattcatttaaatctttaatataagttaactggtaaacttgtatacattaccgtattggcataaaggtgaagggggtcttatatgagaccttagcA-GATTTTACAA-C-A-T---CT-CGGA-TG------CTGAATGAA-GT---A--G-GCCGTTTAG----T--TCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTCTTCC-CG-AATA-AAA----TG----A-TA----C---TATTTATGCGAAATA--CATTGAAC-G--TA-G---A----GT--T-ATT---G-----AACTAGA--TTA---T-GT---------CAGTTGA-ATA-TTTGGA--G-CTAGAT-ACCTACAA-A-AGATC-A-TT--TTCAC--CCCAAATATTCTCC--A-C---A-T------T-T---CA--CA--G-CCAAGTCACAAG-------CAGAGT-TTA-TTTTTCT--TTTGGTAAAATTTCAAATGAAA-AACCA-----GAATTAAAC-----A-T-GGTTAAAC-ACAC--CA--T--TAA-----GACA-AC-AACT-T------A-T--T-AGATACT-----CAG-AGTAGAA-AT-A---GA---AATGACATAGT--------TGT-A-T-CTA----GAGATC-TGTG--ATATGA--AAT-GA--ACGAGGCATACTTTTCTCAGTAAA-AACAAAGAAGAC--C-TGA-AAGTTGGCCA-GTTCGGAA-G-G--GT-CCTAAACT-T---ATGTGCAACTTCC-TTT--GGAG-----TCT---ACT--AT----TTC-----TGCCAT-TCATCGT------------ACATACTTT--C-TCAAAATCTTGCTATC----TAT--TCAGCC-CAAA-GGCAA-TTCTTG---T-TA----------ATAGCCGCATATTTACAACCATT-G-C-----------TTCT-TAAA------GGAT--A-T-GTCTCT---T--TAAT-----T--A-A--ATA----AATTTG--A-CG-----T-CG-TG----C-TG-TAA--TCTA-GTGT-AGTT-AAATGT--AG-G--CATAA--------TA-A-------A-CAACC--A---AA---GTA--A-----GA------G-AAG-T---A-AA---TGT-CACAA-AAGGG-A-----GA-A-TAAT---CT--AG-TCC-CC---CCA-AA-----AAAGGAGA-GCCCAGCAG-A-GGTC-A-C--TGCA-GA---TCTAA----AT-CAGCTTA--CTTAT-----TGG-ACGTCAG-A-----------TAAAAGAA-AT-GGAGC---TTCTCCA-TTAT---GCA--T-CACT-GATTA----TC--AGG-----AAA---CAA----TG-A--GGGTGGACTCAG------GT--GAATGTC--AGGTGACA------GTT-ACAAG-T--AAGGTGGAGAGGA-AG-AGGATAAT------------------CTTATA---ATTTCACA-CT---------C-CA-TAC-TTAA--CCC-------TG-TGGATA-G-----AAAA--GGAA--AACAAAC-CTG-T-C---CTC---T-CCACT-TA--GTG-AA----GTTG-G---A--AGT---CA-CA-GCTA--GCA-GTAGA------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-CG----GGCCAAAA-T--CACC-AC-TCCTCGCATC-GAGGGACAT--AA-----C-GT--TTA-AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CCGTTG-CTGC-CCCCATCGCTTC-TGT--GGCAC-T-GC-TGTTC-CATCA-TTA-TGTTTGTAC---T-----ATCA-ATAAAAAAAAT-TG--TTGCA---TGGT-CTAAAA-ATG--T----TGTT--ATT--T-TC-TGTGGTCTAATAGCAC-CAT------ACAC-C-C---AATGAAC--AAACA-A--TTAAA-CTGC-----ATCG----CACGC----ACAGACAG-----A------CAGACAA----------AACA--GACA-C-A-AACACGACCA---GA--CA-GACCCACAACACAC----ACAC--AC-AC-C-AC------GCCACAC---CGACCCAAGA-CAG-CAGGCAAGACA---GCCG--ACA---------GACACACACAAGA----CGAC------ACACACACACCCGCACGGACACCA-----CACC---A-CT-AC-CGAC-CA-CAGAGCCAACCAGACA-GCTCACATGCAT------CCCGAC-AGA--GA---C-----A---AC--ACA---GACA---GAC----A--C--GACAC--ACAACAG-----ATACG-ACCACAGGA-CA----GA-CACA--CACACAC----ACACACGACCACC-ACACGA-CCGACA-----CCGAACACAGCA-GCC-----GACACCCCCCCCCCACAC-----C----ACACAGC-------ACAGAC---A-GACAAC--AG-ATACAA----GA-CA-GCA--C---------ACACA-CACAA-AACAC-TAAAACTTGAAATGT--AATAAAGAAAAATGA-GAA------CTTGTCCAA
gi|18 : ttataT--TGAAAA-A---TT-G--AAGAC-TTG--C---G-AATA-AAA----GG----A-T--------GTATC--------ACA--CA-TG----G--A--G---G----TT--T-ATC---G-----AA----A--ACA---T-GT-----C---C--T-GA-A-A-T---AA--A-G--GA----T--TAG-A-AATGC-A--A--T---C-------TTA--------A-C---G-TCATTTGT-T---TT--CA--G-C-A-GTCACAAA-----C-AAGAGT-T-A-TCCCCCA--TT-GGT---AATTTT---GAAA-AT--G-----GAAT-AAAA-----T-T-C------C-A--------------AAATG-GAG--------T-T-A---AAGT--C-TATTATT----Ttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttttgtggtacaaaaatcagaaata
gi|15 : gcaaaattcttaaacactattaaatacctatgcagT--TTAAAA-A---CG-G--AAGAT-TT---TC-CG-AATA-AAA----TG-------A----G--GTATC--------ATA--CA-TA----G--TTAT---A----AT--T-ATT---G-----AT----A--ATA---T-G------T---C--TTGA-G-A-T---GA--G-T--GAA---C--C-A-G-AATTG-tgattcagaatcaattataga
gi|2 : cagtttcgaatctcataaaaagcactttatctaagcaaagtggcaaccttcatgtattaatacaaaataatcatattgaaatattcaattttttttaaattaaatacatgtatactttttaactttacttccatattagcagatggccaagtatatcggagaccttaaagtatgtcaaaatctttaaagctatgctgAAAA-G---TA-ATTATGAT-TTC--ACGCG-AATAATAA----TG----AATA----ACGGTAT---------ACA--T--CG----G--C--G---AAGTTGT--T-ATT---GTGAGTAATAC-A--TTAAAAT-GC-----T---C--TTAA-A-AAT---GA--AAC--GGA-TAC--CAA-A-A-TTG-A-TGATT---CGACCCAAT-A-----C--A-C---A-T------T-T---TC--CACAG-C-A-GTCAACAC---AACGCAGAGT-T-A-TTCCCCT--TT-GGTAAATATCCA---GAAA-AT--C-----GAAT-AAAA-----A-T-C------C--CAG--AA--T--T--AATG-GAAA--C-A-CT---G---AC-T--T-TG--ATTA---CCAG-A-T-GAA-AA-AAATGA---AGT-------T---------GT-A-TTCAAATATGAAA-C-TG-G---TATGC--AATAGACCAAGAGGAT-CTTATT----ATATCTAATAAA--AGAAACT-TGA-A----GGCCA-GTT---AACGCG--GT-C-AGAACTTC---ATAAGCAA--TCCCTTGCAAGAT-G---TCTTTAGCTGGATCGTGTTCGC---TG---TGTAAAAAT------------ACA-T--TT--C-T-AAAAATT------TAGAAT-TCCTCA--C-CAAG-GAC-A-TT--TA---T-TATAGCCCTAAAA----------------ACTATTAG-CACTAAAACGTTTTTG-CAT-------G-A---A-TCGATTCTACAT--ATATAGTACT--AGA--ATATAAAA-TTTGGTA-CG-----T-C--TGTCATC-CG-TAA-CTCTAGAT-T-AGCTATAATGT--AG-G---GAAA--------CATACTCAACCA-CA-CC--ATCCAA---GGT--A-----GATGTTATG-AAG-TTA-A-AA---TGTAC-CAA----GG-T-----GATA-TAAA--TCT--TA-TCA-CCTAACCACAA---AGAAAGGAGAAGCCAG-CAG-A-GGTCTA-C--CTCGTCA---A--ACGATCAT-T--CTTATTCC-ATCC---TGCCACGTCATAA-----------TAAG-GAAGAT-GG--C---T-CTCCATATATACGACAATC-CACTAG-CTATCCATCCCAGG-----AAAACCCAAAATTTGGA--G--TGAAAGAAAAAACAGGT--GAAT--TC-AGGT-ACAATGCTAGTT-A-AAGATGGAGAG-GGGGAGGAAAGCAGGACAATCTTCATACCCATCCCCCCCCCATACAAA----ACAAATACAAGCGGCC-CA-AAC-T--AACCCCGAATCTATAGTGGA-A-G-----GAAATAGGAAGGAACTAACACTAAT-C---CTC-CTC-CCAC-CTATGATG-AAC---GTT--GTGGA--AATATGCACAATGTCA--GCA-GTG-AATGTCTGTTTGACCAAATTACTATT-C-CG-ATCCAT-A-CTAGATGACCC--A-TTTC-CC-ACCTCCCTTCCTATCAGAAA-AA--AACAGCTG-GT--TA--AA-TCG-CCG--CGCCCAAACGCGACACG--CC-TTGCCTGT-CGCCCATGCTTC-TGTGCGGC-CAT-AC-TGTCC-AGTCATTTA-TGTTTGTACCTCT------TCA-AT--AAAAAAA-TGTTTTGCGAATT-GTGCTAAAAGA-G--TCTCGTG-C--ATTTAT-TC-TGTCGTCAATTAGCAC-CATATAACAACACAG-C---AATG-ACAGAGACATATCTAACG-AGGCACGGGCA-G---ACCCTCTTTCACAAAAAG----AGGCGGCTCAAGTACACGATTCAAGAACA-GACCA-CTACA--A-GACCAAGGGA--CA-GAT------CACAGCATCACAC--ATCACAGGATAGAACAG--ACAC---A-ATT---GGTGAAACAG-CAAG--A---A-AA--ATACCTCGGATAAATACACAACATC----C--T------AGA-TCAGAC---TAGAG---CAGAT------CCGAA-CA-ACAC-A-ACA-CAG-ACCAGAA---CAT---CGTAC-C-C------GATGACACGAGGGC---C-----ACAGACAGACA---CACAGTTCACATACA--C--GACAC--AC-ACCT-----ACA-G-A-CGCA-----AG--C-A-CA-G--GACATAA----AT-CAT-AG-ACA-AAA--GACAGACA-----C----CA-AGTATGATAA--TCACATGAGGTTGAAAAAAATATTCTAAAAGAC--C-------ACACA----ACCACAACc
gi|17 : acgaattctaaatgacaaaaaAAAA-A---TCTG--AAGAC-TTC--GC--G-AATA-AAA----T-----------------TATC--------ACA--CCATG----G---------G----GT--T-GTC---G-----AA----AA-CTA---T-G----------C--CTGA-A-A-T---AA--A-C--GGA---T--TAG-A-AAT---G-CA--T---C--------TA-----A--A-CGTGA-T------TGT---TT--CA--G-C-A-GTCACAAA-----C-AAGAGT-T-A--TCCCCT--T--GGT---AATTTT---GAAA-AT--G-----GAAT-AAAA-----G-T-C------CAACTG--AA--T--Tttgtaatcgtgagaagaggaaaataaagagcgaaactctgtactcaatccaaaagcatgaataatcagaaatgaaattggataacaaacttttgatgatacaaacaatcagaaataatctact
gi|22 : aaaaaactgcaaaaattcttaaaacaataaattactctatgcggttgaTA---T-GT---------C--TTGA-A-A-T---GA--G-C--AGA-A-C--CAA-A-A-TTG-A-TA--T---C--CCCAA-TA-----CAAA-C---A-T------T-T---TC--CA--G-C--AGTCAC--A---AAC-CAGAGTAT-A-TT-CCCT--TG-GTTA-AAAT-CA---GAAA-AA--GAAAATGAAT-TAACCAATAA-T-C------A-GCAG--AA--T--TGATGTG-TAAA-atagcctaattattctgatcaagaaatcaagttatagaaa
gi|24 : ------T-T---TT--CA--G-C-A-GTCACAAA-----C-AAAAGT-T-A-TCTCCCT--TG-G---TAATTTT-----GAA-AA--T-----GAAT-AAAA-----G-C-C------C-A--------------AAATG-GAA--------T-T-A---AA-T--CATATTATT----Tct
gi|25 : tgGAGT-T-A-TCCCCCT--TG-G----CAATTTT---GAAA-AT--G-----AAAT-AAGA-----G-T-C------C--CAA--AA-----TGAAtgattcagaatcaattttag
gi|8 : -TTTG--A-CGCCTCGT-C--TG----C-TG-TGA-ATCTACGT-T---TT-TACTG----G-GT-TAACG--------TGTT-------G-CA-TT--A---AACAGATA--C-----GA------G--AG-TTTCA-AA---TGT-----------G-A-----GAT--TAAT--TAT--A------CA---CCA-GATATGAAAAAGAGgcttagacctaccgggtagctattgttttgattcagaatcaaaatta
gi|11 : cgctagcttatccatctcctacttttctcgcgaagtgacagttcttttctgtaatcctggcataaaaggcactttcattcaatgctagatgtgccaacccttcatatagtatatgtaccaaataaacatagttaattttgagaaaagtcatatttataatttcatttaaatactctcttaatatatgtatgatgtttaacctctctggtttaaacaccgttattatctaattacggtttctaattataggacgataaaggcagagcgcctattgagattcctaaaagagaatttcaacattctcggatggctatgaagtagccgttactgttcaaaaaagtagaagatttccaattaaaaattgatatatcagtagcatgtgcgacattagttgattgcaaattatgtgcgattcttgaaatgaatgcgaaaccaaatagttgaatatctccaataccatcattttttcagcagtcacaaacgcaacgagttattcccttggtatatattagaaaattaaaaaaaccacagaacacggaaatagaaaaccacttgatttgattccaggatgaataaatgaagttgattagtgtattgttaagaaatcttggtatgaaatgaaaagaatcttttataagaaaagaatcctgaaaatgccagtaaatttctaaactcattgtctgcaattctcttgaggtattctgacttagtttctgttttattttgtaccccaccacacctacctaagatttatttcaagccaagataattgttaatgccataatcatgcttgccggaagcatgttcggttgctctcggtatttagcgaatatcctgaagacatgaatAAA-GAA-AT-GG--C---TTCTCCA-TTAT--GACA--T-CACT-GA-TA---ATC--AGG-----AAA---CAA----TG-A--C--TGAA-CAGG-------T--GAAT--TT-AGGT-ACA------ATT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAG------AGGA-AAT------------------C-TG-ATAA-TTTCACA-CT---------C-AA-TAC-T--A--CCC-------TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CAC-ATGT---AGCA-GTA-A------------------------T-T-TG-ATC-AT-A-C-----GGCC---C-T--C-CC-AC-TCCCTATAT--CAGGGC-AT--AA-----G-CT--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTG-CTGC-CCCC-ATGCTTC-TGT--GGC-C-T-GC-TGTTC-CATAATTTA-TGTTTGTAC---T-----ATCA-AT--AAAAAAA-TG--TTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-TC-ATT--T-TC-TGT-GT-CAATAGCAC-CAC------ACACAC-C---AATGAAC--AAACA-A--TAAC--ATGCAAA--CACGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNN------NNNNNNN----------NNNN-NNNNN-N-NNNNNA-GAGCA---CAACCACA--------CACAC----ACAC--A--CC-CG------------------C-ACT--CGACGCGACCGACCAC--ACACA-CA--AGAC--------AGCACACAACA
gi|10 : ttactcctacttttctctgcgacataTCACGCCT---------C-CA-CAC-TC-A--CCC-------TC-TAG----G-----ACAA--GCAA----C--AT-CTG-T-C---TTC-CT--CCACT--A--GTC-GATAACGTTTAG---A--AGTT--CACCATGTC----CA-GTA-A------------------------T-C-CG-AT--AT-AAC-----GGCC---AAT--C-CC-AC-TCCCTCCATC-AAGGGA-ATTGAA-----G-CCCTTT--AA-TGGGCGG--CG---AAG-G------A--CC-TT--GCGC-C----ACACTTT-TG--------------------CAT-ATTTG-T--TTGTAC---TA-----TCA-AT--AAAA--T-TG--TTGCA---T-GT-CTAAAA-A-AGTT----TG-T--TAT--T-TC-TGT-GT-CAATAGCACACACA-----ACA-AC-C---AATGAAC--AAACA-A--TAAC--ATGCAG---CACG---CCATGC-----------------A------CAGG-AC----------A-----GACA-C-G-AACA-GA-CA---GA--CA-GA-------CACAC----ACAC-----AC-CGA-----------------C-ACT----ACCA-ACCGACC-G--A---A-CG----AC--------GACACCCAACAGAAGAGA--C------ACAGACAGAC---CACA--CA-CGA---CCGACCG-A-CA-GA-C-ACACA-CA-CACAAGACAG-CATACACACA--CAC------CACAAC-AG-----------------------------ACA---GACCTG-A--CA-GACAC--AC-ACACAGAAGACACA-A-CCGA-GA-CA---CGACCG-A--CACACAC----AC-GAC---------CA--C-C---CA-----C--AACACAGCA-GAGAACCCGACACA-----CACA--------C----AG----C-------ACAG-----------GCACAG-ATAG-ACACAGA-CA-GCA--C-AA--ACA--CACAC------AACAC-T-AAACTTGAATTGT--AAGTAAG---AATGA-GGA-----ACTTGT-CAA---TCAA-AA-CATGAAGCA--TCAG-AA-A-TGAGAATT-GGA--A-------CGAAACT-TTG-TGGGTAC-----A-AAAC--AT--GTC-CAATAA-TATT---TCGC-GCAC-TCA----CACAA--CC----CCCA-TC-TTGAACGAAAAC-TT--CCGAC-------ATA-ATCTTA-CTGA-TAATAAAC-C-TT-----CATT-TCAAT---C-GAGT-A----AAAAAG-AAAATATT-GAGTAC----A-ACTTCATATTT--TAAGCTATAA---CAT-CTTCC-T-TATCACA-CTAAAAA-TCCATGAAAATTT--CTGA-CCT-------AGAATTTC-AAAGTC--AGGCCGAC-ATGTTGCTTA
gi|23 : ta------------------------T-C-CA-ATC-AT-A-C-----TGCC---C-T--C-AC-AC-TAC-TCCAT--CTGGGA-AT--AA-----ATAC--TTT-AA-TGG-CCG--GG---AAA-G-AA---A--CAATG--CTGC-ACC-AATGCTTC-TGC--GGT-A-T-GC-TGTTC-C
gi|5 : aaccaagtatccttccacccaatgatccagatgtagaacC----------AATA-GCAC--C-ACA-CA-CACCAAT-GA---------------ACAA----ACAT--A--AC---AT------GC-ACGCACGC-AC----GCACAGACAGACAA-------------ACAG--------AACACA-GACAGA----C--CAGACAGACA-TCACACA--CACACACACCCA--CCCAGCCG-ACCG-AC-CGACACA-CAACACGAG-A---CAGACACACA--CAC--------CGAC-CG------------------ACCGACACACCACA---CATCAG-A--CAGGACAC--AC-ACAC-----ACAC--A-CAGA-GAGCAGACCGA-CC-A--GACACACAATTAC-CA-----ATAGACA--G-CAGACAGACACC--AACA---CA-CAC------ACACA-----CACAGAGAGA--C----AGAC--C-------CCACAC---ACCAC-ACACAGAATAG-ACACAGAGCAGACA--A-CA---CACACACA-CAC-A-AACACAC-AAACTTGAAATGT--AATAAGA--AAATGA-GGAACTTT---TGTCCAA---TCAAGAA-CATG-AAC---TCAG-AAAA-TGAGAATT-GGA--A-------CA-AACT-TTG-T-GGTACA-T----AAAC--AT--G-CAAAATGAATATTTTCT-G--GCAC-TCAC-ACAACA----C----CCCATAG-CTG--TGAAAAC-TT--CCGAC-------ATAAACTTA--CTGACCTAATAAC-C-TT----AAATT-TCAAT--AC-GA-TAA----AAAA---AAAATATT-GAGTAC--A-A-ACTTCATATTT--AAA--AATATAAACAT-CCT-C-TATA--ACATCTAAAAA-T-CCAAATAT--T--CTGA-CCTGCAA---GGAATTTCAAAAGTTTCAGGCCGAC-AT--TGCTTAt
gi|13 : ttaaagaatcaacattactccgatcgacataacgtagcgcgttctattgcaaaaaaaatagaagatttcgaataaaatgatatatcagacatgggagtattattgacaatatgatctcgaaagagcgaatcgctaaaattgatatccccaatacacagtttttcagcagttcaaaagcaggagtgtagtccccttgtagtaaaaagtcagaaatgaaataaacgactacagatttgaatgtgaaataactctgaatttgatttccatgaaaaatgaagttgttattcaagattctggtatgagaagaggaattttataaaaaaagaactgaatggccagtaagggtctaaactcaatgcaatccattgcagagttatctatttcctgcatgttattctaattcctaaaattttaatttcacataagcgaatttgtctaaattgctttgtcaaggatcgtctctcttttaaataaatttgacgtctgctgttaatctagttagttaatgttagtgtcaaataacaccaaagtaaagagaagtaaatgtaccaagggatatgctgaagatctgccccaagttaaaggagagccagcagatggtcacgttgcgcacttgcatgcgcctactatctccatgactccaagagttacataccaaagaaaggcttctccattatgaatcactgataatcaggaaacaaatgagtgaacaggtgaattcaggtacagttaaagtaaggggaggaaagaggaatcttagaatttcacatccatactaccctatggaagaaaaggaaactaacctgtctccttccactagtgaagttagaagtcacatgtagcagtaatcgcgatcatacggccatccccactccctccatcagggaataaagctttaatggcggcgaaaaggaccttgctgcccccatgcttctgtggcctgctgttccatcatttatgtttgtactatcaataaaattgttgatgtctaaaaagttgttcattttcttgtgtATA-ACAT-G-CAG-CA-----C--AACA-A-CA-GACCA--GAAGACA-GA--CACACAT-----C----AGAC--CGACACCAACAGACGACACATCACCACAG-A-AGCAGACAGA-TATG-A--C-CA---CA-GC----CAC-ACAACAC-TAAA-CTTGAAA-GT--AAT-AAGC-AAATAG-CGA-----ACTTGTCCAA---TCAA-A--CATGAA-TA--T-AG-AA-A-TGAGAATT-GG---AA------CA-AACT-TTG-T-GGTAC----AA-AAACAGAT--G-C-AAATGAT-ATTTTC-----GCACT-CAC-----CAA--TC----CCCCATT-CT---TGAAAAC-TT--CCGA--------ATAAATCTTACTTGACTGA-TGAC-C-TTA--AA--TT-TCAATAAAC-GA-T-------AAA---CAAATATT-GAGTAC--AGA-ACTTCATATTT--AA
gi|1 : ccaaaacaaacaACACAG-CTA-AACACAGA-CA--CAACC-CAATGTA--CACA-CACCA-AACAC-TAA--CTTGAAATGT--AAT-AAG--AAATGAAGGA------CTTGTCCCAA-TGCAA-AA-CATGAA-CA--TCAG-AAAA-TGAGAAGT-GG---AA------CAAATCT-TTG-T-GGTAC-----A-AAACA--T--G-C-AAATGAT-ATTTCCTCG---CACT-CAC----ACAAATCA----CCCA-TC-CTG--TGAAAAC-TT-CCGGAC--A--T-AGATACTTA--CTGACTAAATAAC-C-TTG--AAAATT-TCAAT--AC-GA-TAA----AAAA---AAAATATT-GAGTACA-A-A-ACTTCATATTTA-AAA--TAT-AGAACATCCTT-C-T-TAT-ACA-CTAAAAA-TCC---AAAATTT--CTGA-CCT---GAATAGAATTTC-AAAGTTC-AGGCCGAC-ATG-TGCTTA
gi|12 : ccttcatataatattaccaaaataaacaaatatgaaaaaagttttatgattacattcctaatattatttatcgttaactcctcgagtaattactttccgtattgcaaagggagggctaacacattgagaccttaacagaattccaacttctcggaatgctatgaaagcttcagcgttcatcacttcaaaaatagaagatcttccgcgaataaaataatatatcatacatggcgagttattcgaaaattatgtcttgttgaaatgagcgaaaccaaaattgataatccccaattacacatttctccaggcagatcacaaaccagagttaattccccttggataaaatgcaagaaaagagaataaacagatcacagaaatttgatggaaaacacttgaatgattgatctcagatgaaaacatgaagttgctatttcaacaaatcatggttatgaaatgaagaagcgaatttttataaaaaaaagaagcctgaaatgcgcaataagggtctaaactcgctgcaatccttgagagagtctcacttctctgttattacaacttcttaaatttatttcaccaatgaattttgtccctaaacatctttgcttattcaaggatattcgtcttataattataataaacatttgacgtacgatgcatgtaacatctagttaagcttaatgctaaggtcaaaatataacaccataaagtaagagagaagttaaaaattgttaccaggagataatctagtccccccaaagaaaggagagcccagcagaggtcactgcagacatccttacttgacctcataaaagaaatgcttctccatctatgacacgcaactgataatcaggaaacaatgaaggtgaagcaagtgttgaaattcaaggtgacagttaaaagtaagggggaagagcaggaatcctttataatttacacattcacattactacccttggaatgaaaaaggaactaactgtgcttcgcttccactagtgaagttagaatcacatgtatgccagtatccgatcatcacggccatccacgtccctccatacagggaatacagctttcaattgcggaccgaaaggaaacccttgctgccccccatgcttcttgtgcctagcatgttcacatcatgtatgtttgtaacctatcagataaaaaaattgtttgcattctaaaaagttgttatttctgtgtcaatagcaccaccaacacactcaataacaaacaattatacatgcaccactgtcgcacgcacagacacgacaaacaacacagacagaacagaagaccacacaacacagacggatccaccaccacaccagacacacacaacgactcaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagatagAAGACAGA-CACACA--CACA---CA-ACACA---C-G-AACAC-TAAA-CTTGAAATGT--AATAAGA--AAATGA-GGA----ACTTTGTCCAATATGCAA-AA-CATGAAACA--TCAG-AA-A-TGAGAATT-GGA--A-------CA-AACT-TTG-T-GGTA----CAA-AAAC--AT--G-C-AAATGA-TATT-TCTCT--G-AC-TCA----CACAA--CC----CCCAATG-CTG--TG-AAAC-TT--CCGA--CA---TA-ATACTTA--CTGACT-AATAAC-C-TTA--AATTTT-TCAAT--ACGGA-T-------AAA---AAAATATT-GAGTAC--A-ATACTTCATATTTTAAAA--TATAAA--CATCCTT-CTT-TAT-ACA-CTAAAAA-TCC---AAAATTT--CTGA-CCTG--A---AGAA-TTC-AAAGTTC-AGGCCGAC-ATG-TGCT
gi|14 : cC-A-AACAC-TAAA--CTGAAATGT--AAT------AAGCCA-AGA----TGGAGGCGCAAACCTTCA-CT-CCTGAAATAATCCAGGAATAATGAGA-TT-GG---AGGAACTACA-AACTTCTG-T-AGAATCATCCATAAACG-TC--GTC-CAATGAT-ATTTCTTCATCGCACT-CACAGCTAGGA--CAAAAATCTAGCGACTG--TGAGAACATTTTCGGACTTAAATTATTTGATTT--CAGGCTAA-TAACGCATTATTAAAATT-TCAAT--AC-G--T-ATTTTGAAATGTAAAATATT-AGGTGC--A-
gi|19 : cACTTGAAATGT--AA-TAAGGAAAATGA-GGA-----ACTTGTCCAA---TCAA-AG-CATT-AATA--TCAG-GA-A-TGAGAATTAGA---A-------CA-AACTtgcaaacaaacattaagatatatattctataagagtaataacacgaaatctttcatatagatagcaat
gi|2 : AATCCAA-AAGCATGAATAA--TCAG-AA-A-TGA-AATT-GGATAA-------CA-AACTTTTGAT-GATAC-------AAACA-ATCAG---AAATAATccgaaaatcagaaataatcacagcacctggaaagtgtaatttatcataatttaagcttacaaatatctataatctgcaatttcgatatccttcatgaccgttacaggcgttgcgtcccacacatgttgtcagggaactattgacactggccggttccatagataaatggt
gi|31 : acgaattctaaatgacaaaaaaaaagtaattatgatttcacgcgaataataatgaataacggtatacatcggcgaagttgttattgtgagtaatacattaaaatgctcttaaaaatgaaacggataccaaaattgatgattcgacccaatacacattttccacagcagtcaacacaacgcagagttattcccctttggtaaatatccagaaaatcgaataaaaatcccagaattaatggaaacactgactttgattaccagatgaaaaaaatgaagttgtattcaaatatgaaactggtatgcaatagaccaagaggatcttattatatctaataaaagaaacttgaaggccagttaacgcggtcagaacttcataagcaatcccttgcaagatgtctttagctggatcgtgttcgctgtgtaaaaatacatttctaaaaatttagaattcctcaccaaggacatttattatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatataaaatttggtacgtctgtcatccgtaactctagattagctataatgtagggaaacatactcaaccacaccatccaaggtagatgttatgaagttaaaatgtaccaaggtgatataaatcttatcacctaaccacaaagaaaggagaagccagcagaggtctacctcgtcaaacgatcattcttattccatcctgccacgtcataataaggaagatggctctccatatatacgacaatccactagctatccatcccaggaaaacccaaaatttggagtgaaagaaaaaacaggtgaattcaggtacaatgctagttaaagatggagagggggaggaaagcaggacaatcttcatacccatcccccccccatacaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagtggaaggaaataggaaggaactaacactaatcctcctcccacctatgatgaacgttgtggaaatatgcacaatgtcagcagtgaatgtctgtttgaccaaattactattccgatccatactagatgacccatttcccacctcccttcctatcagaaaaaaacagctggttaaatcgccgcgcccaaacgcgacacgccttgcctgtcgcccatgcttctgtgcggccatactgtccagtcatttatgtttgtacctcttcaataaaaaaatgttttgcgaattgtgctaaaagagtctcgtgcatttattctgtcgtcaattagcaccatataacaacacagcaatgacagagacatatctaacgaggcacgggcagaccctctttcacaaaaagaggcggctcaagtacacgattcaagaacagaccactacaagaccaagggacagatcacagcatcacacatcacaggatagaacagacacaattggtgaaacagcaagaaaaatacctcggataaatacacaacatcctagatcagactagagcagatccgaacaacacaacacagaccagaacatcgtacccgatgacacgagggccacagacagacacacagttcacatacacgacacacacctacagacgcaagcacaggacataaatcatagacaaaagacagacaccaagtatgataatcacatgaggttgaaaaaaatattctaaaagaccacacaaccacaacttgtaatcgtgagaagaggaaaataaagagcgaaactctgtactcT-ACA-CTAAAAA-TAC---AAAA--TTTCTGA-CCTG--A---AGAATTTC-AAAGTTC-AGGCCGAC-ATG-TGCTTctact
gi|32 : -ACA-CTAAAAATTTCCAAAAAT--T--CT--ACCTG--A---AGAATTTC--AAGTTC-AGGCCGA
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): CTACTTATTTCTCAGGCGAAGTTATCGGAATCACCGGTAAAAAGAGCCACTTACATAACAATAGCAGATTGGCCACCTCACTGTATACATATTACCAACAAAAATAACAATATTGAAAATATTTTGATCATTTAAATAACTACTCTTAAGTATATTATATGTTAACCCTGGTAACTTTATTATCGTCATTAGCGAGCAAAAGGGAGAAAATTG
Unaligned ( gi|21 ): GCTGCTTCCGCTAACTCTTTCTCAGCGACAGTCTTCGATCTCGGTAAAACAAGGTCATGTCATTCAATGCGCAGATGGCCCGCTTACATATAATATACCAAATAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
Unaligned ( gi|28 ): CCTCTCCTATCTTTTCTCAGCACAGTTTCGATATCCGGTAAACAAGCACTTCATCAATCAGATTGGCCACC
Unaligned ( gi|29 ): TTATATATTAATGTTAATATCCCTGAGTAACTTACTTTGTATGCAAAGGGAGGGGTAAATCTGAGAC
Unaligned ( gi|30 ): AAATGGAATAAAATTCCCAAAATGGAGTTAATGTATATTATTTTGATTCAGAATCAATTATAGAAA
Alignments
lowQualScore : 2222222222222 1111 111 1111111 2222222 111111111111 333333333333333 111111111 111111111 2222222 1111111111 1111111111111111111111111 11 1111111111 11 1111111 333333333 22222222222 1111 1111 1111 11 111 11 222222 11 11111 111111111111111111111111 333333333333333333333333333333333 33333333 11 11111 555555555555555555555555555555555555555555555555 222222222222 11111111 22222 1111111 333333333333333333 11 11 2222 1111 1111 11 11111111 1111111 111 11111 111111 1111 111 2222 11111 11111111 222222222222222222222 11 1 22222222222222222222222222 11 333333333333333333 11 33333 1 1111 1111 11 3333333333333333333 1 111111 111 1 222222222 22 11 11 11111 1111 22 1111 2222222222222222222 444444444444444444444444444444444444 11111 111 11 222222222222 11 222222 111 11 11 11 111111 11 111 7777777777777777777777777777 11 11111 2222222 11 11111 111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 33333333333333333333333333333333333333333333333 1111111 111111111 2222 77777777777777777777777777777777 44444444444 11 111111 111111 1111111 2222222 1111111111111 2222 3333333333333333333333333 1111111 33333333333333333333333 22222222 222222222222222222 1 2222 3333333333 111 1 111111111 11111 22 22 11 111 33333333 2222222222 11 3333333333 1 1111111 11111 11111 11 11 1 111 111111
lowQualScore : 3 3 3 6 3 6666 3 3 3 3 77 3 555 8888 3 44 3 9999999999999 3 88 3333 33 2 333 2 33 2 4444444 2 33 2 2 33 8888888 222222222222 77 3 77 3 444444444444444 77 3 222222222 999999999 555 2 6666666 33 2 2 2 777 33 1111111111 2 555 2 2 3 2 6 9999999999999999999999999 6 555 3 888888 5 777 66 33 2 33 5 2 5 44 33 2 555 5 0 99999 4 2 5 2 7777 2 66666 66666 4444444444 444 55555 00 3 55 8 4 4 7777 4 777 4444444 66 555555555 4 4 8 4 66 4 9999 4 66 777 44444444444 66 3333 1 0000 666 66 4 9999 4 4 66 4 66 4 3333 9999 4 777 00 2 4 777 4 4 9999 4 00 4 4 4 444444 66 4 4 00 66666 888888888888888888888888 555555555555555555555555555555555 4 8 77777777 777 66 22 8 55555 4 000000000000000000000000000000000000000000000000 8 4 555555555555 66 1 55555555 66 0 55555 66 8888888 777 444444444444444444 00 00 4 3333 9999 4 4 1111 8 4 4 66 6666 1 00 4 66 66666666 4444444 4 4 66 777 333 66 55555 222222 4444 4 222 4 4 3333 0 11111 66666666 77777 2 3 777777777777777777777 55 8 5 5 5 0 66 44444444444444444444444444 66 00 444444444444444444 11 88 777 4 4 66 777 22222 66 4 4 0 5 888 66 0000 5 0000 5 888 88 7777777777777777777 88888 0 444444 5 5 5 66 5 11 555 777 0 777777777 11 777 4 11 5 5 00 4 4 11111 66 66 1 4 4 4 8888 4 4 11 55 4 2222 0000000000000000000 888888888888888888888888888888888888 4 4 4 8 4 4 99999 111 4 55 4 4 8 44 4 55 111111111111 33 4 4 55 777 4 777777 55 4 4 4 4 4 4 4 99 4 4 4 4 4 1 4 999999 4 222 4 11 7 777 4 4 4 555 66 9999 4 55 66 4 4 8 44 4 888888 4 33 4 777 77 4 5 66 5 666 8888888888888888888888888888 1 4 77 1 0 88888 4 6666666 00 6 66 5555 11111 4 111 66 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 999 9999 5 5 44444444444444444444444444444444444444444444444 3333333 5 222222222 1111 8 3 00000000000000000000000000000000 0 77 44444444444 5 77 5 33 5 5 666666 777777 888 6666666 6666666 5555555555555 4 5555 1 666 9999 9999999999999999999999999 4 1 8 4 4444444 1 66666666666666666666666 888888 5 33333333 4 4 666666666666666666 4 4 8 3 4 1 3 3 3 7 3 666 2222 7 3 3 3 4444444444 3 55 3 666 000 55 3 1 7 55 55 3 7 3 3 3 333333333 3 0 4 4 00000 55 2 4 00 8 66 4 00 00 444 99999999 66 1111111111 77 999 66 888 66 5 11 5 2222222222 1 5 0 2 5 5 2222222 5 66 5 5 33333 66666 5 777 5 77 5 33 88 1 1 6 0 5 66 777 3 5 000000 66 5 5 5 5
lowQualScore : . . . . . .... . . . . .. . ... .... . .. . ............. . .. .... .. . ... . .. . ....... . .. . . .. ....... ............ .. . .. . ............... .. . ......... ......... ... . ....... .. . . . ... .. .......... . ... . . . . . ......................... . ... . ...... . ... .. .. . .. . . . .. .. . ... . . ..... . . . . .... . ..... ..... .......... ... ..... .. . .. . . . .... . ... ....... .. ......... . . . . .. . .... . .. ... ........... .. .... . .... ... .. . .... . . .. . .. . .... .... . ... .. . . ... . . .... . .. . . . ...... .. . . .. ..... ........................ ................................. . . ........ ... .. .. . ..... . ................................................ . . ............ .. . ........ .. . ..... .. ....... ... .................. .. .. . .... .... . . .... . . . .. .... . .. . .. ........ ....... . . .. ... ... .. ..... ...... .... . ... . . .... . ..... ........ ..... . . ..................... .. . . . . . .. .......................... .. .. .................. .. .. ... . . .. ... ..... .. . . . . ... .. .... . .... . ... .. ................... ..... . ...... . . . .. . .. ... ... . ......... .. ... . .. . . .. . . ..... .. .. . . . . .... . . .. .. . .... ................... .................................... . . . . . . ..... ... . .. . . . .. . .. ............ .. . . .. ... . ...... .. . . . . . . . .. . . . . . . . ...... . ... . .. . ... . . . ... .. .... . .. .. . . . .. . ...... . .. . ... .. . . .. . ... ............................ . . .. . . ..... . ....... .. . .. .... ..... . ... .. ......................................................... ... .... . . ............................................... ....... . ......... .... . . ................................ . .. ........... . .. . .. . . ...... ...... ... ....... ....... ............. . .... . ... .... ......................... . . . . ....... . ....................... ...... . ........ . . .................. . . . . . . . . . . . ... .... . . . . .......... . .. . ... ... .. . . . .. .. . . . . . ......... . . . . ..... .. . . .. . .. . .. .. ... ........ .. .......... .. ... .. ... .. . .. . .......... . . . . . . ....... . .. . . ..... ..... . ... . .. . .. .. . . . . . .. ... . . ...... .. . . . .
lowQualScore : 3 3 3 7 1 5555 1 1 1 1 33 1 444 6666 1 22 1 0000000000000 1 55 1111 55 7 777 7 77 7 5555555 7 77 7 7 77 6666666 666666666666 33 1 33 1 333333333333333 33 1 888888888 888888888 000 9 8888888 99 9 9 9 999 99 8888888888 9 000 9 9 6 9 2 9999999999999999999999999 2 444 1 222222 7 999 88 99 9 99 7 9 1 88 99 7 555 3 5 99999 4 7 3 7 9999 5 77777 77777 2222222222 777 99999 88 6 00 0 4 4 0000 4 888 4444444 11 333333333 4 4 9 4 11 4 4444 4 11 888 33333333333 11 9999 9 9999 222 11 4 4444 4 4 11 4 11 4 9999 7777 4 777 66 9 4 999 4 4 4444 4 66 4 4 4 000000 11 4 4 66 11111 333333333333333333333333 666666666666666666666666666666666 4 9 44444444 888 11 22 9 66666 4 111111111111111111111111111111111111111111111111 9 4 111111111111 11 0 88888888 11 1 00000 11 1111111 888 333333333333333333 66 66 4 4444 4444 4 4 8888 9 4 4 11 9999 1 66 4 33 11111111 4444444 4 4 11 888 999 11 66666 888888 2222 4 222 4 4 4444 8 11111 88888888 11111 9 9 444444444444444444444 66 5 0 0 0 0 99 99999999999999999999999999 99 11 222222222222222222 33 00 888 4 4 11 888 66666 11 4 4 0 0 888 99 6666 0 6666 0 888 88 2222222222222222222 55555 0 444444 0 0 0 99 0 66 888 000 0 000000000 77 888 4 99 0 0 33 4 4 11111 11 11 8 4 4 4 0000 0 0 00 55 0 5555 8888888888888888888 000000000000000000000000000000000000 0 0 0 0 0 0 55555 000 0 55 0 0 0 55 0 55 111111111111 55 0 0 55 000 0 555555 55 0 0 0 0 0 0 0 55 0 0 0 0 0 1 4 000000 4 444 4 88 3 888 4 4 4 333 11 4444 4 00 11 4 4 9 11 4 999999 4 33 4 888 22 4 0 99 0 444 5555555555555555555555555555 0 5 44 4 8 44444 4 6666666 66 7 11 3333 11111 4 666 11 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 444 2222 0 0 11111111111111111111111111111111111111111111111 0000000 7 111111111 6666 4 1 00000000000000000000000000000000 7 99 33333333333 7 11 7 66 7 7 444444 444444 888 9999999 4444444 3333333333333 4 4444 8 000 4444 0000000000000000000000000 4 0 9 4 4444444 0 99999999999999999999999 444444 0 00000000 4 4 999999999999999999 4 4 0 2 0 0 6 6 6 3 6 444 7777 3 6 6 6 2222222222 6 00 6 444 000 00 6 3 9 00 00 6 3 6 6 6 111111111 6 8 0 0 00000 55 3 0 11 9 11 4 33 11 444 55555555 99 9999999999 00 444 99 888 99 0 99 0 5555555555 0 0 4 6 0 0 8888888 0 99 0 0 99999 66666 0 111 7 99 7 00 88 0 7 7 0 0 99 555 6 0 222222 99 0 0 0 7
consensus : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-C--G-CT--ATGAA-GTAGC-----C--G--TT-C--TAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA---GTATC--------A-T-A--C-AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-T------T-T---TC--CA--G-C--A-G-TCACAAAAACN-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTA-AA-A-TT-CA-GAAAATG-----GAAT-----AAAAA-T-C-C-ACA---GAA--T--TGAA-ATG-G--AAA-AC-A-C--T-T-G---A-------AT--TTG----AT-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------TGTA-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGGAA--CCTGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----TG---T-T---AT--T------------ACAA--CT-TCT-AAAATTT------A-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TGT-------C-------TA-AA---C-A---TT-GC-TT----CGT-----C--AAGGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTAT--T--A----AAT---A-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-TAA-ATCTA-G-T-TAG--T--T-AATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGTT--A-AA---TG-T-ACAC--AAGGGA-----GAT----A-T-AAT-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCG-CA---GA----C----AT-C--CTTA--C-TAT-----TG-AAC-------GTCAT-AT-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATTTAT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---AT--CAG----G-AAAC----AA-T---GA--GTGAA-C-AG--------G-GT--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGA-AG--AGGA-AATCTT-ATATAAATTTCACA-CTCCA---TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACT-TA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTCA-GGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA--CTAATCA-AT--AAAAAAT-TG-TTTGCA---T-GT-CT-AAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CAC--AC-C---AATGAACA-A-AACA-A--TA-ACA-ATGC--AC---C-G-------GCAC-GC---CACGNACAG--ACAGACACAACAGGAC-ACA---CA-ACA--GANCAGA--CA-GA-C-----A-CA--CACAC--A---ACCGA-GA--C-CCAC-C-G----ACC--AGACAGACCAG--AA------CG--ACACGACACAC--GAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGACACCG-A---CC--G-CCGAC-G-ACC-ACACA-CAGC--A--CCAGA--NCANACACACAC-CAC------C-CGA-CCGACC-ACA----CGACACACA--CACC-----------GA-CA-G-ACAC--A-C-ACAC------ACACGA----C---ACAGA-CAG--CGACA-A---C-ACACACA----C-CA-C---A-CACGACA-G-CAGACAC-AACA-AG-CAGAC---A--A---GACA----CA-----CA-CAGA-CAGAC-C-------ACANAC---A--C-------G-ACA--A-CA--C---AGA-TAGA------ACAC-AGA-CA-G-CAC-CA-CA-A----CA-CA-CAC-AAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-A-GG------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATGAA-CA--TCAGA--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CA-ATG-C--AAA-TGATTATTTTCTCG--GCACTTCA--CCACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA----AT---ACTTAC-TGACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-TA----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAA-TATAAAAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTA
Reference ( family-511 ) : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGAA-GTAGC----GC--G--TT-C--TAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA---GTATC--------A-C-A--C-AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-T------T-T---TC--CA--G-C--A-G-TCACAAAAACN-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTA-AA-A-TT-CA-GAAAATG-----GAAT-----AAANA-T-C-C-ACA---GAA--T--TGAA-ATG-G--AAA-AC-A-C--T-T-G---A-------AT--TTGT---AT-T-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------TGTN-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAAGAA--CCTGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----TG---T-T--NAT--T------------ACAN--CT-TCT-AAAATTT--N---A-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TGT-------C-------TA-AA---C-A---TT-GC-TT----CGT-----C--ANGGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTAT--T--A----AAT---A-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-TAA-ATCTA-G-T-TAG--T--T-AATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGTT--A-AA---TG-T-ACAC--AAGGGA-----GAT----A-T-AAT-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCG-CA---GA----C----AT-C--CTTA--C-TAT-----TG-AAC-------GTCAT-AT-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATTTAT-TGACA--T-C-ACT-GA-TA---AT--CAG----G-AAAC----AA-T---GA--GTGAA-C-AG--------G-GT--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGA-AG--AGGA-AATCTT-ATATAAATTTCACAACTCCA---TAC-T--ACC-C-TN-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACT-TA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTCA-GGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA--CTAATCA-AT--AAAAAAT-TG-TTTGCA---T-GT-CT-AAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CAC--AC-C---AATGAACA-A-AACA-A--TA-ACA-ATGC--AC--AC-G-------ACAC-GC---CACGNACAG-AACAGGCACAACAGGAC-ACA---CA-ACA--GACCAGA--CA-GA-C-----A-CA--NACAC--A---ACCGA-GA--C-CCAC-C-G----ACC--AGACAGACCAG--AA------CG--ACACGACACAC--GAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGACACCG-A---CC--G-CCGAC-A-ACC-ACACA-CAGC--A--CCAGA--ACATACACACAC-CAC------CACGA-CCGACC-ACA----CGACACACA--CACC-----------GA-CA-G-ACAC--A-C-ACAC------ACACGA----C---ACAGA-CAG--CGACA-A---C-ACACACA----C-CA-C---A-CACAACA-G-CAGACAC-AACA-AG-CAGAC---A--A---GACA----CAG----CA-CANA-CAGAC-C-------ACANAC---A--C-------N-ACA--A-CA--C---AGA-TAGA------ACAC-AGA-CA-G-CAC-CA-CA-A----CA-CA-CAC-AAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-A-GG------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATGAAACA--TCAGA--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CA-ATG-C--AAA-TGATTATTTTCTCG--GCACTTCA--CCACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA---TAT---ACTTNC-TGACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-TA----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAG-TATAAAAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTA
gi|1 : TTA-ACAGAA-T-TC-C----AA-C--T-T-C--T-CG---GAAT--G-CT--ATGAA---AGCTTCAGC--G--TT-CATCAC----TTCAAAA-A---TA-G--AAGATCTTC--CG-CG-AAT--AA-AAT-A--A-TA----TATC--------A-T-A--C-AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATTCG-A-----AA----A----TTA---T-GTCT---TG--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-A-TTG-A-TAA-T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-T------T-TC--TC--CA--GGC--A-GATCACAAA--CC-A-GAGT-T-AATTCCCCT--TG-GATA-AA-A-TG-CAAGAAAAGA-----GAAT-----AAACA-GAT-C-ACA---GAAATT--TGA---TG-G--AAA-AC-A-C--T-T-G---A-------ATGATTG----AT-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----ACA--TGA---AGTTGC----TAT--TT--CAA----CAAATCATG-G--TTATGA--AAT-G----AA-G-AAGCGAA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGAAG--CCTGA-AA--TGCGCA-A-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GC-TGCAA--T-CC-TTG--AGAGAG---TCTC--ACT---T----CT--C-----TG---T-T---AT--T------------ACAA--CT-TCT-TAAATTT------A-T---T--TCA--C-CAAT-GA--ATTT----------------TGTCC-----C-------TA-AA---C-ATCTTT-GC-TT----ATT-----C--AAGGAT--ATTC--GT--CT-T-----ATAAT--T--AT---AAT---A-----AACA---------TTTG--ACG--TAC-GA-TG----CATG-TAACATCTA-G-T-TAAGCT--T-AATGCTAAG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACCATA---AA---GTAAGA-----GA------GAAGTT--A-AAAATTGTT-AC-C--A--GGA-----G------A-T-AAT-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---G--------AAAGGAG-AGCCCAGCAG-A-GGTC-A-C--T--G-CA---GA----C----AT-C--CTTA--C---T-----TG--AC-------CTCAT-A--A---AAGAA-AT----GC---TTCTCCATCTA--TGACA--CGCAACT-GA-TA---AT--CAG----G-AAAC----AA-T---GAAGGTGAAGC-AA--------GTGTTGAAAT-TCAAGGTGAC------AGTTAA-AAG-T--AAGG-GGGAAG---AG--CAGG-AATCCT-TTATAATTTACACA--TTCACATTAC-T--ACC-C-T--TGGA-ATG-----AAAA--AG-G--AACTAA--CTG-TGC---TTCGCTT-CCAC--TA--GTG-AA----GTT--A---G--AAT---CA-CATGTAT-GCCAGT--A------------------------T-C-CG-ATC-ATCA-C-----GGCC---A-T----CC-ACGTCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AC-----A-GC--TTTCAA-TTG-CGGACCG---AAA-G-GA---AACCC-TTGC-TGCC-C-CCC-AT-GCTTCT-TGT-GC-C-TAGCATGTTCACATCATGTA-TGTTTGTAACCT-ATCAGATA-AAAAAAT-TG-TTTGCA---T--T-CT-AAAA-A-G--T----TG-T--TAT--T-TC-TGT-GT-CAATAGCAC-CACCA----A-CAC--ACTC---AAT-AAC--A-AACA-A--TT-ATACATGC--AC--------------CACTGT-----CGCAC-G-CACAGACACGACA-AACAACA---CAGACA--GAACAGA---A-GACC-----A-CAC-AACAC--A---GACG--GA--T-CCAC-C-ACCACACC--AGACACA-CAC--AA------CG--ACTCAACA
gi|1 : ccttcatataatattaccaaaataaacaaatatgaaaaaagttttatgattacattcctaatattatttatcgttaactcctcgagtaattactttccgtattgcaaagggagggctaacacattgagacc--A-CA--C---AGC-TA-A------ACAC-AGA-CA-C-AAC-C--CA-ATGTACA-CA-CACCAAACAC-TAA--CTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-AAGG------A---CT-TGT--CCCAA---TG--C--AA-AACATGAA-CA--TCAGA--A-AATGA-GA-AGT-GG--A------ACA-AATCTTTG-T-GG-----TA--CAAAA--CA--TG-C--AAA-TGAT-ATTTCCTCG---CACT-CA--C-ACAAATCA----------CCCA-T-C-CTG--TGAAAAC---TT--CCGGA--CA-TA---GAT---ACTTAC-TGACTAAATAAC-C-TTG--AAAATT-TCAAT--AC-GA-TA----AAAAA---AAAATATTG-AGTACAA-A-A--CTTCATA-TTTAAAA-TAT-AGAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--AATAGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagatagacacagctaaacacagacacaacccaatgtacacacaccaaacactaacttgaaatgtaataagaaatgaaggacttgtcccaatgcaaaacatgaacatcagaaaatgagaagtggaacaaatctttgtggtacaaaacatgcaaatgatatttcctcgcactcacacaaatcacccatcctgtgaaaacttccggacatagatacttactgactaaataaccttgaaaatttcaatacgataaaaaaaaaatattgagtacaaaacttcatatttaaaatatagaacatccttcttatacactaaaaatccaaaatttctgacctgaatagaatttcaaagttcaggccgacatgtgctta
gi|10 : ccttcatataatattaccaaaataaacaaatatgaaaaaagttttatgattacattcctaatattatttatcgttaactcctcgagtaattactttccgtattgcaaagggagggctaacacattgagaccttaacagaattccaacttctcggaatgctatgaaagcttcagcgttcatcacttcaaaaatagaagatcttccgcgaataaaataatatatcatacatggcgagttattcgaaaattatgtcttgttgaaatgagcgaaaccaaaattgataatccccaattacacatttctccaggcagatcacaaaccagagttaattccccttggataaaatgcaagaaaagagaataaacagatcacagaaatttgatggaaaacacttgaatgattgatctcagatgaaaacatgaagttgctatttcaacaaatcatggttatgaaatgaagaagcgaatttttataaaaaaaagaagcctgaaatgcgcaataagggtctaaactcgctgcaatccttgagagagtctcacttctctgttattacaacttcttaaatttatttcaccaatgaattttgtccctaaacatctttgcttattcaaggatattcgtcttataattataataaacatttgacgtacgatgcatgtaacatctagttaagcttaatgctaaggtcaaaatataacaccataaagtaagagagaagttaaaaattgttaccaggagataatctagtccccccaaagaaaggagagcccagcagaggtcactgcagacatccttacttgacctcataaaagaaatgcttctccatctatgacacgcaactgataatcaggaaacaatgaaggtgaagcaagtgttgaaattcaaggtgacagttaaaagtaagggggaagagcaggaatcctttataatttacacattcacattactacccttggaatgaaaaaggaactaactgtgcttcgcttccactagtgaagttagaatcacatgtatgccagtatccgatcatcacggccatccacgtccctccatacagggaatacagctttcaattgcggaccgaaaggaaacccttgctgccccccatgcttcttgtgcctagcatgttcacatcatgtatgtttgtaacctatcagataaaaaaattgtttgcattctaaaaagttgttatttctgtgtcaatagcaccaccaacacactcaataacaaacaattatacatgcaccactgtcgcacgcacagacacgacaaacaacacagacagaacagaagaccacacaacacagacggatccaccaccacaccagacacacacaacgactcaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagatagTCACGCCTCCA---CAC-TC-ACC-C-TC-TAG----G-----ACAA--GCAA----C--AT-CTG-T-C---TTC-CT--CCACT--A--GTC-GATAACGTTTAG---A--AGTT--CACCATGTC----CAGTA-A------------------------T-C-CG-AT--AT-AAC-----GGCC---AAT--C-CC-AC-TCCCTCCATC-AAGGGA-ATTGAA-----G-CCCTTT--AA-TGGGCGG--CG---AAG-G------A--CC-TTGC--G-C-C-----AC-ACTTTTG--------------------CAT-ATTT---GTTTGTA--CTA-TCA-AT--AAAA--T-TG-TT-GCA---T-GT-CT-AAAA-A-AGTT----TG-T--TAT--T-TC-TGT-GTC-AATAGCACACAC------AACA---AC-C---AATGAACA-A-A-CA-A--TA-ACA--TGC--A--------------GCAC-GC---CATGCACAG-GACAGACACGA----------------ACA--GAC-AGA--CA-GA-C-----A-CA--CACAC--A----CCGA-CA--C-T-AC-C-A----ACC-------GACC-G--AA------CG--AC--GACACCC--AAC-AG-AAGAGACACAGAC-------AGAC---CACA--CAC-G-A---CC--GACCGAC-A-GAC-ACACA-CA-C--A--CAAGACAGCATACACACAC-------------------ACC-ACA------ACAGACA--GACCT----------GA-CA-G-ACAC--A-C-ACAC------AGAAGA----C---ACA-A-CCG--AGACA-C---G-ACCGACA----C--A-C---A-CACGAC----CACCCAC-AACACAG-CAGAG---A--ACCCGACA----CA--------CACA-CAG---C-------ACAGGC---A--C------------------------AGA-TAGA-------CAC-AGA-CA-G-CAC--A--A-A----CA-CA-CAC-AA-CAC-TAAA-CTT-GAATT-GT-AAGT-A---AG----AA--T-G-A-GG------AA--CT-TGT--C--AA---T---C--AA-AACATGAAGCA--TCAGA--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACG-AAACTTTG-TGGG-----TA--C-AAAA-C--ATGTC--CAA-TAA-TATT---TCGC-GCAC-TCA---CACAA--CC----------CCC-AT-C-TTGAACGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA----AT----CTTAC-TGA-TAATAAAC-C-TT-----CATT-TCAAT---C-GAGTA----AAA-AAG-AAAATATTG-AGTAC---A-A--CTTCATA-TTTTAAGCTAT---AACATCTTCC-TTATCACA-CTAAAAAT--CCATGAAAATTTCTGA-CCT------AGAATTTCAAAG---TC-AGGCCG-AC-ATGTTGCTTA
gi|11 : taC-------GACAT-A--A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATT-AT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---AT--CAG----G-AAAC----AA-T---GA--CTGAA-C-AG--------G--T--GAAT-TT-AGGT-AC------AATT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAG-------AGGA-AATCTG-ATA---ATTTCACA-CTCAA---TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CAC-ATGT---AGCAGTA-A------------------------T-T-TG-ATC-AT-A-C-----GGCC---C-T--C-CC-AC-TCCCTATAT--CAGGGC-AT--AA-----G-CT--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATAATTTA-TGTTTGTA--CTA-TCA-AT--AAAAAAA-TG-TT-GCA---T-GT-CT-AAAA-A-G--T----TG-TC-ATT--T-TC-TGT-GTC-AATAGCAC-CAC------A-C--ACAC-C---AATGAAC--A-AACA-A--TA-AC--ATGCAAAC--AC-GCNNNNNNNNNN-NN---NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN---NN-NNA--GAGCACAACCA-CA-C-----A-CA--CACAC--A---CCCG---------CACTC-G----ACG--CGACCGACC----------------ACAC-ACACAA--GAC-AG-CA----CACA-AC-------A
gi|12 : ttactcctacttttctctgA------AGAC-AGA-CA---CACACA-CA-C----AA-CA-CAC-GAACAC-TAAA-CTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAAAT-G-A-GG------AAC-TT-TGT--CC-AA---TATGC--AA-AACATGAAACA--TCAGA--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTT-G-T-GG-----TA--CAAAAA-CA--TG-C--AAA-TGAT-ATTT-CTCT--G-ACT-CA--C-ACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAA-C---TT--CCG-A--CA-TA----AT---ACTTAC-TGACTAA-TAAC-C-TTA--AATTTT-TCAAT--ACGGA-T------AA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-ATA--CTTCATATTTTAAAA-TAT--AAACATCCTTCTTTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAA-TTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCT
gi|13 : cCA-A---A-ACAAACA----------------ATAACATG-CAG-CAC-AACA-A--CAGACCAGA--A---GACA----GA-----CA-CACATCAGAC-CGACACCAACAGACGACA--C-------A-TCA--C-CA--C---AGA--AGC------AGAC-AGA-TA-T-GAC-CA-CA-G----C--CA-CAC-AA-CAC-TAAA-CTT-GAAA--GT-AA-T-A---AGC---AAA-TAG-C-GA------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-A-CATGAA-TA--T-AGA--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AAC-TTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CAGATG-C--AAA-TGA-TATTTTC-----GCAC-TCA--C--CAA--TC----------CCCCAT-T-CT---TGAAAAC---TT--CCG-A---A-TA---AAT----CTTACTTGACT-GATGAC-C-TT----AAATT-TCAATAAAC-GA-T------AA-A---CAAATATTG-AGTAC-AGA-A--CTTCATA-TTTAA
gi|14 : cC-AAACAC-TAAA--CT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGCCA-AGA-T-GGA-GGCGCAA-A---CC-T----TC-AC---T---C-------C-TGAAATAATCCAGG--A-A-TAATGAGATT-GG--AGGAACTACA-AACTTCTG-T-AGAATCATC--CATAAA-CG-TCGTC--CAA-TGAT-ATTTCTTCATCGCACT------CACAG--CTAGGACAAAAATCTAGC-GACTG--TGAGAACATTTT--CGG-A--CT-TAAATTATTTGA-TTTC-AGGCTAA-TAACGCATTATTAAAATT-TCAAT--AC-G--TATTTTGAA-ATGTAAAATATTA-GGTGC-A-
gi|15 : cTTA-A-AGTA-T-GT-C----AA-A-AT-C-T--T-TA---AA----G-CT--ATG----------------------C--TGT----TT-AAAA-A---CG-G--AAGAT-TT---TC-CG-AAT--AA-AAT-G--A--G---GTATC--------A-T-A--C-AT--A-G--TTAT---A-----AT--T-ATT---G-----AT----A----ATA---T-G------TC--TTGA-G-A-T---GA--G-T--G-A-A-C-C----A-G-AATTG-tgcaaacaaacattaagatatatattctataagagtaataacacgaaatctttcatatagatagcaat
gi|16 : cagtttcgaatctcataaaaagcactttatctaagcaaagtggcaaccttcatgtattaatacaaaataatcatattgaaatattcaattttttttaaattaaatacatgtatactttttaactttacttccatattagcagatggccaagtatatcggagaccTTA-A-AGGA-C-TT-TGCCAAA-A-AT-T-CA-T-CA----A-C--A-CT--ATAAA-GTA----------------C--TATGCGGTTGAAAA-T---TA-A--AAGAC-TTG--CC-GGTCAT--AA-AAG-G--A-T----GTATC--------A-C-A--C-AG--G-G-----G---G-----TT--T-ATC---G-----AA----AAC--CTA---T-GT------C--T----A-A-T---AA--G------G-A-T-T---AG-G-AATGC-A--A--T---C-------TTAA----C--T-C---A-T------T-TGTTTT--CA--G-C--ATG-TCACAAA--CA-A-GAGT-T-AATTCCCCTCCTT-GGTA-A----TT-TG-GAAA-TG-----GAAT-----AAAAAGT-C-C--CA---AAA--A--TGGA-c
gi|17 : AAAA-A---TCTG--AAGAC-TTC--GC--G-AAT--AA-AAT------------TATC--------A-C-A--CCAT--G-G---------G-----GT--T-GTC---G-----AA----AA---CTA---T-G-------C--CTGA-A-A-T---AA--A-C--GGA---T-T---AG-A-AAT---G-CA--T---C--------TA-----A--A-CGTGA-T------TGT---TT--CA--G-C--A-G-TCACAAA--CA-A-GAGT-T-A-T-CCCCT--TG-G-TA-A----TT-TT-GAAAATG-----GAAT-----AAAAG-T-C-CAACT---GAA--T--Ttatttatagcctattattctgatcagatcatatagaaa
gi|18 : aaaaaactgcaaaaattcttaaaacaataaattactctatgcggttga-C----AA-A-AT-T-C--T-TA---AA-C--A-CT--ATTAA-ATA--------------C-C--TATGCAGTTGAAAA-A---TT-G--AAGAC-TTG--C---G-AAT--AA-AAG-G--A-T----GTATC--------A-C-A--C-AT--G-G--A--G---G-----TT--T-ATC---G-----AA----A----ACA---T-G------TC--CTGA-A-A-T---AA--A-G--G---A-T-T---AG-A-AATGC-A--A--T---C-------TTA--------A-C---G-TCATTTGT-T---TT--CA--G-C--A-G-TCAC--AAACA-A-GAGT-T-A-TCCCCCA--TT-GGT---A-A-TT-TT-GAAAATG-----GAAT-----AAAAT-T-C-C-A---------------AA-ATG-G--Aatagcctaattattctgatcaagaaatcaagttatagaaa
gi|19 : gACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGGA--AAA-T-G-A-GG------AA--CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AGCATTAA-TA--TCAGG--A-A-TGA-GA-ATT-AG--A------ACA-AACTgttaaagtctattattttgattcagaatcaattataga
gi|2 : AAAA-G---TA-ATTATGAT-TTC--ACGCG-AAT--AATAAT-G--AATAACGGTAT-------------A--C-ATC-G-G--C--G---AAGTT-GT--T-ATT---GTGAGTAATAC-A----TTAAAAT-GC-----TC--TTAA-A-AAT---GA--AAC--GGATA-C-C---AA-A-A-TTG-A-TGATT---CGACCCAAT-A-----C--A-C---A-T------T-T---TC--CACAG-C--A-G-TCAACACAACGCA-GAGT-T-A-TTCCCCT--TT-GGTA-AATA-TC-CA-GAAAATC-----GAAT-----AAAAA-T-C-C--CA---GAA--T--T--A-ATG-G---AA-AC-A-C----T-G---A-------CT--TTG----AT-TACC-AG-A-T-GAAAA-A----A-A--TGA---AG-T------TGTA-TT--CAAATATGAAA-C-T--G--GTATGC--AAT-AGACCAA-G-AGG--AT-C--TTATT----ATATCTAATA-AAAGAAA--CTTGA-A----GGCCA-GTT----AACGC-GGT-C-AGAACTTC---ATAAGCAA--TCCC-TTGCAAGAT-G---TCTTTAGCTGGATCGTGTTCGC-----TG---TGTAAAAA--T------------ACAT---T-TCTAAAAATTTAGA---A-T---TCCTCA--C-CAAG-GAC-A-TT----------------TATTATAGCCC-------TA-AAAACT-A---TTAGCACTAAAACGTTTTTGC--ATGA----A-TC--GA--TTCTACA--TATATAGT--ACTAGAATATAA-----A--A---------TTTGGTACG--T-C----TGTCATC-CG-TAA-CTCTA-GAT-TAG--CTAT-AATGT--AG-G---GAAA--------CATACTCAACCA-C-ACC--ATCCAA---GGT--A-----GATGTTATGAAGTTA-A-AA---TG-T-AC-C--AAGGT------GAT----A-TAAAT-C-T-TATCACCTAACCACAA---AG-------AAAGGAGAAGCCA-GCAG-A-GGTCTA-C--CTCGTCA---AACGATC----AT-T--CTTATTC-CATCC---TGCCAC-------GTCATAAT-A---AGGAAGAT-G--GC----TCTCCATATATACGACAATC-C-ACTAGC-TATCCATCCCAG----GAAAACCCAAAA-TTTGGA--GTGAA---AGAAAAAACAG-GT--GAAT-TC-AGGT-ACAATGCTAGTT-A-AAGATGGAGAG-GGGGAGGA-AAGCAGGACAATCTTCATACCCATCCCCC--CCCCA---TAC-ccgaaaatcagaaataatcacagcacctggaaagtgtaatttatcataatttaagcttacaaatatctataatctgcaatttcgatatccttcatgaccgttacaggcgttgcgtcccacacatgttgtcagggaactattgacactggccggttccatagataaatggt
gi|2 : acgaattctaaatgacaaaaa-TGGA-A-G-----GAAATAGGAAGGAACTAACACTAAT-C---CTC-CTC-CCACC-TATGATG-AAC---GTT--GTGGA--AATATGCACAATGTCA-G-CAGTG-AATGTCTGTTTGACCAAATTACTATT-C-CG-ATCCAT-A-CTAGATGACCC--A-TTTC-CC-ACCTCCCTTCCTATCAGAAA-AA--AACAGCTG-GT--TA--AA-TCG-CCG--CGCCCAAACGCGACACG--CC-TTGCCTG-T-CGCCC-AT-GCTTCTGTGCGGC-CAT-AC-TGTCC-AGTCATTTA-TGTTTGTAC-CTCTTCA-AT--AAAAAAA-TGTTTTGCGAATT-GTGCT-AAAAGA-G--TCTCGTG-C--ATTTAT-TC-TGTCGTCAATTAGCAC-CATATAACAA-CAC--AG-C---AATG-ACAGA-GACATATCTA-ACG-AGGC--ACGGGCAG-------ACCC-TCTTTCACAAAAAG-AGGCGGCTCA--AGTAC-ACGATTCA---A--GAACAGA--C-----C-----A-C---TACAA--G---ACCAA-G----------------------GGACAGATCAC--AG------CATCACACATCACAG--GAT-AGAACAGA-CACA-ATTGGTGAAACAG---CA-AGAAAAAT-A---CC--T-CGGAT-A-A---ATACA-CAAC--ATCCTAGA--TCAGAC-TAGAG-CA----------GATCCGA-----A----CAACACA-A--CACA-----------GACCA-G-A-AC--ATC-GTACCCGATGACACGAGGGCC---ACAGA-CAG--ACACACAGTTC-ACATACA----C-GA-C---A-CACACCT-A-CAGAC----GCA-AG-C--AC---A--G---GACA----TAAAT--CA-TAGA-CAAAA-G-------ACAGAC---A--CCAAGTATG-ATA--ATCA--CATGAGG-TTGA------A-AA-AAA-TA-T-T-C-TA-AA-A----GACCA-CAC-AACCAC----AACTT-GTAATCGT-GA-G-A---AGAGGAAAA-T-A-A-AGAGCGAAA---CTCTGTACTC-AA---T---CCAAA-AGCATGAATAA--TCAGA--A-A-TGA--A-ATT-GGATA------ACA-AACTTTTGAT-GA-----TA--C--AAA-CA-AT--CAGAAA-TAATaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagtggaaggaaataggaaggaactaacactaatcctcctcccacctatgatgaacgttgtggaaatatgcacaatgtcagcagtgaatgtctgtttgaccaaattactattccgatccatactagatgacccatttcccacctcccttcctatcagaaaaaaacagctggttaaatcgccgcgcccaaacgcgacacgccttgcctgtcgcccatgcttctgtgcggccatactgtccagtcatttatgtttgtacctcttcaataaaaaaatgttttgcgaattgtgctaaaagagtctcgtgcatttattctgtcgtcaattagcaccatataacaacacagcaatgacagagacatatctaacgaggcacgggcagaccctctttcacaaaaagaggcggctcaagtacacgattcaagaacagaccactacaagaccaagggacagatcacagcatcacacatcacaggatagaacagacacaattggtgaaacagcaagaaaaatacctcggataaatacacaacatcctagatcagactagagcagatccgaacaacacaacacagaccagaacatcgtacccgatgacacgagggccacagacagacacacagttcacatacacgacacacacctacagacgcaagcacaggacataaatcatagacaaaagacagacaccaagtatgataatcacatgaggttgaaaaaaatattctaaaagaccacacaaccacaacttgtaatcgtgagaagaggaaaataaagagcgaaactctgtactcaatccaaaagcatgaataatcagaaatgaaattggataacaaacttttgatgatacaaacaatcagaaataatctact
gi|22 : acgaattctaaatgacaaaaaaaaagtaattatgatttcacgcgaataataatgaataacggtatacatcggcgaagttgttattgtgagtaatacattaaaatgctcttaaaaatgaaacggataccaaaattgatgattcgacccaatacacattttccacagcagtcaacacaacgcagagttattcccctttggtaaatatccagaaaatcgaataaaaatcccagaattaatggaaacactgactttgattaccagatgaaaaaaatgaagttgtattcaaatatgaaactggtatgcaatagaccaagaggatcttattatatctaataaaagaaacttgaaggccagttaacgcggtcagaacttcataagcaatcccttgcaagatgtctttagctggatcgtgttcgctgtgtaaaaatacatttctaaaaatttagaattcctcaccaaggacatttattatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatataaaatttggtacgtctgtcatccgtaactctagattagctataatgtagggaaacatactcaaccacaccatccaaggtagatgttatgaagttaaaatgtaccaaggtgatataaatcttatcacctaaccacaaagaaaggagaagccagcagaggtctacctcgtcaaacgatcattcttattccatcctgccacgtcataataaggaagatggctctccatatatacgacaatccactagctatccatcccaggaaaacccaaaatttggagtgaaagaaaaaacaggtgaattcaggtacaatgctagttaaagatggagagggggaggaaagcaggacaatcttcatacccatcccccccccatacaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagTA---T-GT------C--TTGA-A-A-T---GA--G-C--AGA-A-C-C----A-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAA-TA-----CAAA-C---A-T------T-T---TC--CA--G-C--A-G-TCAC--AAACC-A-GAGTAT-A-TT-CCCT--TG-GTTA-AA-A--T-CA-GAAAAAGAAAATGAATTAACCAATAA-T-C-A-GCA---GAA--T--TGAT-GTG-T--AAA-ctact
gi|23 : TC-CTT-CCACC-CA--ATG-A-------T--C---C--AG--------ATGT------AGAA-C------------------------T-C-CA-ATC-AT-A-C-----TGCC---C-T--C-AC-AC-TAC-TCCAT--CTGGGA-AT--AA-----ATAC--TTT-AA-TGG-CCG--GG---AAA-G-AA---A--CA-ATGC-TG-C-A-CCA-AT-GCTTCTGCG--GT-A-T-GC-TGTTC-Cct
gi|24 : aaccaagta------T-T---TT--CA--G-C--A-G-TCAC--AAACA-A-AAGT-T-A-TCTCCCT--T--GGT---A-A-TT-TT-GAAAAT------GAAT-----AAAAG-C-C-C-AAAATGGAA--T--TAAA-t
gi|25 : tg-GAGT-T-A-TCCCCCT--TG-G----CA-A-TT-TT-GAAAATG-----AAAT-----AAGAG-T-C-C--CA---AAA-----TGAA-tcatattattttgattcagaatcaattttag
gi|26 : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGAA-GTAGC-----C--G--TT-C--TA-----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TT---CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-Tgcttagacctaccgggtagctattgttttgattcagaatcaaaatta
gi|27 : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGAA-GTAGC-----C--G--TT-C--TAT----TC---AA-A---TA-G--AAGAT-TT---CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-Tttat
gi|3 : TTA-A-AGAAAT-TT-C----AA-C-AT-T-C--TGCG---GA-T--G-CT--ATGAAAGTAGC----GC--GGCTT-CGGTAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AT-AAT-G--A-TAA--GTATC--------A-T-A--C--T--G-G--T--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-AGC-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-T------T-T---TC--CA--G-C--AAG-TCACAAAAACC-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTATAA-A-TC-CA-GAAAAAG-----GAAT-----AAACA-T-C-C-ACA---GAA--T--TGAA-ATG-G--AAA-AC-A-C--T-T-G---A-------AT--TTGTT--AT-T-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A---GA---AGTT------TGTT-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AATAG----AA-GGAGG--AAAT--TT-TT----ATA---AAAATAAAAGAA--C-TGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----TG---T-T--AAT--T------------ACAA---T-TCT-AAAATTT--C-----T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TG--------C-------TA-AA---C-A---TT-GC-TT----TG------C--ATAGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTAT--T--A----AAT---A-----A------------TTTG--ACG--T-C----TG----C-TG-TAA-ATCTAAG-T-TAG--T--TTAATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGT---A-AA---TG-T-ACACG-AAGGGA-----GAT----A-T-AATGC-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCA-CA---GA----C----AT-C--CTTA--C-TAT-----TG-AAC-------GTCA--AT-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCAATTAT-TGACA--T-C-ACTCGACTA---AT--CAG----G-AA-C----AA-T---GA--GTGAAGC-AA--------GAGT--GAAT-T--AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGATAG--AGGA-AATCCT-GTATAAATTTCACAATTCCA---TAC-T--ACC-C-TAATGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACTCTA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTTATGGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TT-C-TG-C-C-CCCAAT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TG-TTGTA--TAAATCA-AT--AAAAAAT-TG--TTGCA---T-GT-CT-AAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CAC--AC-C---AATGAACA-A-AACA-A--TA-ACA-ATGC---C--AC-G-------ACGT-GCTAATACGAACAGTAGCAGGTACAACAGGAC-ACA---CA-GCA--GACCAGA--CA-G--C-----A-CA--GACAC--A---ACCGATGA--CTCCAC-TAG----ATC--AGACAGACCAG--AG------CG--ACACAACACAC--AAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGGTACCG-ATTTCC--ACCCGAC-A-ACC-ACACA-CAGC--A--TCAGC--CCATGCACACAC-CAC------CACGA-CCGATC--CATTACCGACACACA--CACCT----------GA-C--G-ACAC--A-C-ACAC------ACACAA----C---ACAGA-CAG--CGACA-A---C-GCACACA----C-CA-C---AGTATAACA-G-CAGACAC-AACA-AG-CAGACT--A--T---GACA----CAAGATTCA-CAGAGCAGAC-C-------ACAGACT--A--C-------G-ACA--A-CA--T---AGA-TAGA------ACAC-TGA-CATG-CAC-CAGCA-G----CA-CATCAC-AAACACATAAAACTT-GAAAT-GT-AATT-A---AG----AAA-T-G-A-GG------ATG-CA-TGT--CC-AAAGTT---C--AA-AACATGAAACA--TCAGA--ATA-TGA-GA-ATT-GG---------ACATAACTGTTG-T-GG-----TACTCGAAAA-CA-ATG-C--AAA-TGATTATTGTCTCG--GCACTTCACGCCACAA--CC----------CCCAGT-G-CTG--TGAAAAC---TTTCCCG-ACTCATTA---CAT---ACCTTC-TGACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-TA----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAA--TATAAGACCAT-CTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CCCAGAGAA--TCTGAGTCT---A--AGAATTTCAAAG--TTCAAGGCCG-ACTATG-TGCTTAttatc
gi|31 : T-ACA-CTAAAAAT--AC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTT
gi|32 : -ACA-CTAAAAATTTCC---AAAAATTCT-A-CCTG--A--AGAATTTC-AAG--TTC-AGGCCGAAC-AT
gi|4 : TTA-A-AGAA-TCTT-C----AA-C-ATAT-C--T-CG---GA-T--G-C---ATGAA-GTAGC-----C--T--TT-C---AT----TTCAAAA-AC--TA-G--AAGAG-TTT--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA----TATC--------A-T-AATC-AT--G-G--C--GTACG-----GG--T-ATTTTGA-----AA----A----TTA---TTGT-----CT--TTAA-A-A-TC--GA--G-C--GAA-----C---AACA-AATTG-AATA--T---T--CC-AAT----------A-C---A-T------TAT---TC--CA--G-C--C-G-TCACAAAG-CA-A-GAGT---A-T-CACCT--TG-TTTA-AA-A-TC----GAAAATG-----AAA-------AAAA-T-CAC-AAG---AAA--T--TGAA--TG-G--AAA-AC-A-C--T-T-GGGGA-------AT--TTGA---CT-C-TCCAG-A-T-G--AA-A----A-AAATGC---AATT------T-TG-TT--CAA----GAA-TC-TG-GTAGT-TGA--AAT-G----AA-G-AGG--AC-T--TT-TTT---ATA---AAAA-A---GAA--CCTGACAA--TGGTCC-A-T----AA-G--GGTGC-TAAAC-TC----TATGCGA--T-CC-T-G--AGAG------CT---ACT--AT----TT--------TG---T-T---AT--T------------ACA---CT-TCA-AAAATT-------A-T---T--CGA--C-CAAG-GA--A-TT----------------TGT-------C-------CA-A-----------T-GC-TT----CG------C--AGGAAT--A-T---GT--CTAC-----TTTAT--T--A----AAT---ACA---A--A---------TTTG--ACGA-T-CAG--TG----C-TG-TA---TCTA-G-T-TAG--T----AAC-T--AG-GTTCAAAACTTAAATATATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--ATAAGCGA------GAAGTT--A-AAA--TG-T-ACA----AGGGA-----GAT----AAT-TAT-C-TTAGTCCCC---C----A---TA-------AAAGGA--AGCCAGCAAG-A-GGTC-AAC--TGC--CAC--GA----C----A--C--CTTA--C--AT-----CG-A-C-------GTCAT-AT-A---AAGGA-AT-G--GC---TTCTCCATA-A---GACA--T-C-ACT-GA-TA---AT--CAGAGGGG-TAAC----AT-T---GAT-GTGAG-C-AG--------G--T--GAA---C-AG-T-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GG--AGGA-AG----GA-AATCTT----TAA--TTCACA-CTCCA---TACAT--ACC-CCTA-TGGA-A-GGAAGAAAAA--GGAA--ACCTAAC-CTG-T-CGTTCTC-CTTTCCACT--A--GTG-------GTT--G---ATTCGTA--CAC-ATGGCA----AGTA-A------------------------C-C----ATCCAT-A-CTG---GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCA-A-CAGG---AT--A------G-AT--TT--AA-T---CGG--CG---GAA-A--A---A--CC-T-----G-CGC-CCC-A--GCTC---TG--GC-C-T-GC-T-TTC-CATCATTTACTGTTTGTAA-CTA-TCA-AT--AAAAAATATG-TT-GCA---T-GT-CTAAAAA-A-G--T----TG-TC-ATT--T-TC-TGT-GATCAATAGCAC-AAC------A-CAC--AC-C----ATGAACA-ACACCA-A--TATAC--ATGC--AT---T-G--------CA--GC---AACCAAC-------GACGCA----GAC-ACA--------A--GA-CAGA--CA-GA-C-----A-CACCAACACCGA---GCCG--GACTC-CTCC-C-G----AC----GNNNNNNNNN--NN------NN--NNNNNNNNNNN--NNN-NN-NN----NNNN-NN-------NNNN---NNNNNNNNNNN-N---NN--N-NNNNN-N-NNN-NNNNN-NNNN--N--NNNNN--NNNNNNNNTCCC-GAC------C-CGA-CCGACC-G-A----C--CACACA--CACC-----------GC-CC-G-ACCCG-A-C-CGAC------ACAC-A----C---ACAGA-CAGACCGACA-T---CTCCCCCCC----C-CC-C---A-CACCACA---CAGACA--GACA-GA-CAGAC------A---GATA----GA-----CA-CAGA-CAGAC-C-------ACACAC---A--C---------ACA--A-AA--C---
gi|4 : acataaatattaccaaataaaattattgaaaaatatgttgattcatttaagataactctcttaaataatttatatggttaaacctgggtaactacctttccgtatggcccaaggagggaagagttggaccCGA----CCCGACCGA-C----CGAC------C-ACACACA----C-CG-CCCGA-CCCGACC-GACACACAC-A-CA-GA-CAGAC---C------GACATCTCCCC----CC-CCCC-CACAC-C-------ACACAG---A--C-------AGACAG-A-CAGAC---AGA-TAGA-------CAC-AGA-CA-G--AC-CA-CA------CA-CA-CAC-AAA-AC-TTAAACTTTGAAAT-GTTAA-TTA---AT----AAA-A-G-A-GG------A---AA-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATGAT-CA--TCAGAGAA-A-TGA-GA-ATTTGG--A------A-A-AACTTCTG-T-GG-----TA--CAAAAAACA---G-C--AAA-TGAT-ATTT-CTCG---CACT-CA--C-ACAA--CC----------CCCCAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-AA-CA-TA----AT---ACTTAC-TGACTAA-TAAC-C-TTA--AA--TTATCAAT--AC-GA-TA----AAA-A---AAAATATTGGAGTAC-A-A-AAACTTCATA-TTTAAAG-TATAAA--CATC-TTC-T-AT-ACA-CTAAAAAT--CC---AGAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAA----TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTttaaactttgaaatgttaattaataaaagaggaaatgtccaatcaaaacatgatcatcagagaaatgagaatttggaaaaacttctgtggtacaaaaaacagcaaatgatatttctcgcactcacacaaccccccatgctgtgaaaacttccgaacataatacttactgactaataaccttaaattatcaatacgataaaaaaaaatattggagtacaaaaacttcatatttaaagtataaacatcttctatacactaaaaatccagaatttctgacctgaagaatttcaattcaggccgacatgtgctt
gi|5 : acataaatattaccaaataaaattattgaaaaatatgttgattcatttaagataactctcttaaataatttatatggttaaacctgggtaactacctttccgtatggcccaaggagggaagagttggaccttaaagaatcttcaacatatctcggatgcatgaagtagcctttcatttcaaaaactagaagagtttcccgaataaaatgatatatcataatcatggcgtacgggtattttgaaaattattgtctttaaaatcgagcgaacaacaaattgaatattccaatacattattccagccgtcacaaagcaagagtatcaccttgtttaaaatcgaaaatgaaaaaaatcacaagaaattgaatggaaaacacttggggaatttgactctccagatgaaaaaaatgcaattttgttcaagaatctggtagttgaaatgaagaggacttttttataaaaaagaacctgacaatggtccataagggtgctaaactctatgcgatcctgagagctactattttgttattacacttcaaaaattattcgaccaaggaatttgtccaatgcttcgcaggaatatgtctactttattaaatacaaatttgacgatcagtgctgtatctagttagtaactaggttcaaaacttaaatatataacaccaaagtaataagcgagaagttaaaatgtacaagggagataattatcttagtcccccataaaaggaagccagcaagaggtcaactgccacgacaccttacatcgacgtcatataaaggaatggcttctccataagacatcactgataatcagaggggtaacattgatgtgagcaggtgaacagtacagttaaagtaaggggaggaaggaaatctttaattcacactccatacatacccctatggaaggaagaaaaaggaaacctaacctgtcgttctcctttccactagtggttgattcgtacacatggcaagtaaccatccatactgggccatcccactccctccaacaggatagatttaatcggcggaaaaacctgcgccccagctctggcctgctttccatcatttactgtttgtaactatcaataaaaaatatgttgcatgtctaaaaaagttgtcattttctgtgatcaatagcacaacacacaccatgaacaacaccaatatacatgcattgcagcaaccaacgacgcagacacaagacagacagacacaccaacaccgagccggactcctcccgacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccTTA-A-AGAA-T----C----AA-C-AT-TAC--T-CC---GA-TC-G-AC--ATAAC-GTAGC----GC--G--TT-C--TAT----TGCAAAA-AAAATA-G--AAGAT-TTC------G-AAT--AA-AAT-G--A-TA----TATC--------A-G-A--C-AT--G-G-----G---A-----GTATT-ATT---G-----AC----A----ATA---T-GA-----TC--TCGA-A-A-----GA--G-C--GAA-T-CGC---TA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAAT-A-----C--A-C---AGT------T-T---TT--CA--G-C--A-G-TT-CAAAAGCA-G-GAGTGT-A-GTCCCCT--TGTAGTA-AA-AAGT-CA-GAAA-TG-----AAAT-----AAACG-A-C-T-ACA---GAT--T--TGAA--TGTG--AAA-TA-A-C--TCT-G---A-------AT--TTG----AT-T-TC-C--A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------GTTA-TT--CAA----GAT-TC-TG-G---TATGA------G----AA-G-AGG--AA-T--TT-T-----ATA---AAAA-AA--GAA--C-TGA-A---TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---A-ATGCAA--T-CCATTGC-AGAG-T---TAT----CT--AT----TT--CCTGCATG---T-T---AT--T------------CTAA--TT-CCT-AAAATTT--T---AAT---T--TCA--CATAAGCGA--A-TT----------------TGT-------C-------TA-AA---------TT-GC-TT----TGT-----C--AAGGAT-----C--GT--CTCT-----CTT-T--T--A----AAT---A-----A--A---------TTTG--ACG--T-C----TG----C-TG-TTA-ATCTA-G-T-TAG--T--T-AATGTT-AGTGT-CAAA-----------TA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--AA----GA------GAAGT---A-AA---TG-T-AC-C--AAGGGA-----TATGCTGA-A-GAT-C-T-G----CC---CCA-AG---TT-------AAAGGAGA-GCCAG-CAG-ATGGTC-A-CGTTGCG-CACTTG-----C----ATGCG-CCTA--C-TATCTCCATG-A-CTCCAAGAGTTAC-AT-ACCAAAGAA-A--G--GC---TTCTCCATT-AT--GA-A--T-C-ACT-GA-TA---AT--CAG----G-AAAC----AAAT---GA--GTGAA-C-AG--------G--T--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGAG-GAA-AG--AGGA-A-TCTT-A---GAATTTCACA--TCCA---TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--A-CTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTG-AA----GTTA-G---A--AGT---CAC-ATGT---AGCAGTA-A------------------------T-CGCG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CCCAC-TCCCTCCAT--CAGGGA-AT--AA-----A-GCT-TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-A-GG---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA--CT-ATCA-AT----AAAAT-TG--TTG-A---T-GT-CT-AAAA-A-G--T----TG-TTCATT--T-TCTTGT-GT-CAATAGCAC-CAC------A-CAC--AC-C---AATGAAC--A-AAC--A--TA-AC--ATGC--AC-------------GCAC-G----CACGCACAG--ACAGACA-AACAGAAC-ACA----G-ACA--GACCAGA--CA-GA-C-----ATCA--CACAC--AC--AC--A-CA--C-CCAC-C-C----AGC--CGACCGACC----GA------C---ACACAACACGA--GAC-AG-AC---------AC-------AC----------ACACCG-A---CC--GACCGAC-ACACC-ACACATCAG---A---CAGG--ACACACACACACACACAGAGAGCA-GA-CCGACC-A-------GACACACAATTACCAATAGACAGCAGA-CA-G-ACACCAA-C-ACAC------ACAC-A----C---ACACA-GAG--AGACA-GAC-C-CCACACA----C-CA-C---A-CACAG-A-A-TAGACAC-A--G-AG-CAGAC---A--A---CACA----CA-----CA-CACA-CAAACAC-------ACAAAC---
gi|5 : AC-ACA---CA-CCAATGAACAAA--CATAA-C-----A-TG--CACGC--A-----CGC--A--C-GCAC-A-G----AC---AGACAAAC-AG--AA------C---ACA-GACAGACCAGAC-AG-AC-----ATC-AC-------ACAC----ACACACACCC-A---CCCAG-CCGACCG-ACCGACACA-CAAC--A--CGAGA---CAGACACACAC--AC------C--GA-CCGACCGACA----C-AC-CACA--CATCA----------GA-CA-GGACAC--A-C-ACAC------ACAC-A----C---AGAGAGCAGACCGACC-A---G-ACACACAATTAC-CAAT---A-GACAGCA-GACAGACACCAACA-CA-CACAC---A--C----ACA----CAG-----A-GAGA-CAGAC-C-------CCACAC---A--C-------C-ACA----CA--C---AGAATAGA-------CAC-AGAGCA-GACAA-CA-CACA----CA-CA-CAC-AAACAC-ACAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAAAT-G-A-GG------AACTTT-TGT--CC-AA---T---C--AAGAACATGAA-C---TCAGA--A-AATGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTT-G-T-GG-----TA--CATAAA-CA--TG-C--AAAATGAATATTTTCT-G--GCACT-CA--C-ACAA--CA----------CCCCATAG-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA----A----ACTTAC-TGACCTAATAAC-C-TTA--AA--TT-TCAAT--AC-GA-TA----AAAAA---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAA--ATATAAACATCCT---CTATAACATCTAAAAAT--CC---AAATATTCTGA-CCTGCAA--GGAATTTCAAAAGTTTC-AGGCCG-AC-AT--TGCTTAttgaaatgtaataagaaaatgaggaacttttgtccaatcaagaacatgaactcagaaaatgagaattggaacaaactttgtggtacataaacatgcaaaatgaatattttctggcactcacacaacaccccatagctgtgaaaacttccgacataaacttactgacctaataaccttaaatttcaatacgataaaaaaaaaatattgagtacaaacttcatatttaaaaatataaacatcctctataacatctaaaaatccaaatattctgacctgcaaggaatttcaaaagtttcaggccgacattgctta
gi|6 : ttaaagaatcaacattactccgatcgacataacgtagcgcgttctattgcaaaaaaaatagaagatttcgaataaaatgatatatcagacatgggagtattattgacaatatgatctcgaaagagcgaatcgctaaaattgatatccccaatacacagtttttcagcagttcaaaagcaggagtgtagtccccttgtagtaaaaagtcagaaatgaaataaacgactacagatttgaatgtgaaataactctgaatttgatttccatgaaaaatgaagttgttattcaagattctggtatgagaagaggaattttataaaaaaagaactgaatggccagtaagggtctaaactcaatgcaatccattgcagagttatctatttcctgcatgttattctaattcctaaaattttaatttcacataagcgaatttgtctaaattgctttgtcaaggatcgtctctcttttaaataaatttgacgtctgctgttaatctagttagttaatgttagtgtcaaataacaccaaagtaaagagaagtaaatgtaccaagggatatgctgaagatctgccccaagttaaaggagagccagcagatggtcacgttgcgcacttgcatgcgcctactatctccatgactccaagagttacataccaaagaaaggcttctccattatgaatcactgataatcaggaaacaaatgagtgaacaggtgaattcaggtacagttaaagtaaggggaggaaagaggaatcttagaatttcacatccatactaccctatggaagaaaaggaaactaacctgtctccttccactagtgaagttagaagtcacatgtagcagtaatcgcgatcatacggccatccccactccctccatcagggaataaagctttaatggcggcgaaaaggaccttgctgcccccatgcttctgtggcctgctgttccatcatttatgtttgtactatcaataaaattgttgatgtctaaaaagttgttcattttcttgtgtcaatagcaccTTATA-AGAT-T-TTAC----AA-C-AT---C--T-CG---GA-T--G-CTGAATGAA-GTAGG----CC--G--TT----TAG----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTCTTCC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA---CTATTTATGCGAAA-T-A--C-AT--T-GAAC--GTAGA-----GT--T-ATT---G-----AACTAGA----TTA---T-GT------CAGTTGA-ATA-TTTGGA--G-CTAGAT-A-C-CTACAA-A-AGATC-A-TT--TTCAC--CCCAAATATTCTCC--A-C---A-T------T-T---CA--CA--G-CCAA-G-TCACAAG---C-A-GAGT-TTA-TTTTTCT--TTTGGTA-AA-A-TTTCA----AATG-----AAA-------AAC---------CA---GAA--T--TAAACATG-GTTAAACAC-A-CCAT-T-A---AGACAACAAC--TTATTAGATAC-TC-AG-AGTAG--AA-ATAGAA-A--TGACATAGTT-------GTA-T---CTA----GAGATC-TGTG--ATATGA--AAT-G----AACG-AGG--CA-TACTT-TTCTCAGTA---AAAA-CAAAGAAGACCTGA-AAGTTGGCCA-G-TTCGGAA-G--GGT-CCTAAAC-TT---ATGTGCAACTT-CC-TTT--GGAG-----TCT---ACT--AT----TT--C-----TGCCAT-T--CATCGT------------ACATACTT-TCTCAAAATCT--TGCTA-TCTAT--TCAGCC-CAAA-GGCAA-TTCTTGTTAATAGCCGCATAT-------T-------TACAA---CCA---TT-GC-TT----CTT-----A--AAGGAT--A-T---GT--CTCT-----TTAAT--T--A----AAT---A-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-T-A-ATCTA-G-TGTAG--T--TAAATGT--AG-G--CATAA--------TA-A-------A-CAACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAG-T--A-AA---TG-TCACAA--AAGGGA-----GA-----A-T-AAT-C-T-AGTCCCC---CCA-A-----A-------AAAGGAG-AGCCCAGCAG-A-GGTC-A-C--T--G-CA---GA----TCTAAAT-CAGCTTA--CTTAT-----TG-GAC-------GTCAG-ATAA---AAGAA-AT-GGAGC---TTCTCCA-TTAT---GCA--T-C-ACT-GA-TT---AT--CAG----G-AAAC----AA-T---GAGGGTGGA-CTCA--------G-GT--GAATGTC-AGGTGAC------AGTT-ACAAG-T--AAGGTGGAGAGGA-AG--AGGATAATCTT-AT---AATTTCAC-ACTCCA---TAC-TTAACC-C-TG-TGGATA-G-----AAAA--GGAA--AACAAAC-CTG-T-C---CTC---T-CCACT-TA--GTG-AA----GTTG-G---A--AGT---CA-CA-GCTA--GCAGTAGA------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-CG----GGCCAAAA-T--CACC-AC-TCCTCGCATC-GAGGGACAT--AA-----C-GT--TTA-AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CCGTTGC-TG-C-C-CCC-ATCGCTTCTGTG--GCAC-T-GC-TGTTC-CATCA-TTA-TGTTTGTA--CT-ATCA-ATAAAAAAAAT-TG--TTGCA---TGGT-CT-AAAA-ATG--T----TGTT--ATT--T-TC-TGTGGTCTAATAGCAC-CAT------A-CAC---C-C---AATGAAC--A-AACA-A--TT-AAA-CTGC--AT---C-G--------CAC-G----CACAGACAG--ACAGACAAAACA-GAC-ACA----A-ACAC-GACCAGA--CA-GA-CCCACAA-CA--CACAC--ACACACCAC-GC--C-ACAC-C-G----ACCCAAGACAG--CAGGCAAGACAGCCG--ACA-GACACAC---ACAAG-ACGA--CACACAC-------ACACCCGCACGGACACCACA---CC--A-CTACC-G-AC---CACA-GAGCCAA--CCAG---ACA-GCTCACATGCAT------CCCGA-CAG----AGA----CAACACAGA--CA-------------GA-CACG-ACAC--A-CAACAG------ATACGAC---C---ACAG--------GACAGA---C-ACACACA----CACA-C---A-CACGAC--------CAC-CACA-CGACCGAC---ACCG---AACA----CAG----CAGCCGA-CACCC-C-------CCCCCC---ACAC-------C-ACACAG-CA--C---AGA-CAGACAACAGATACAAGA-CA-G-CAC-------A----CA-CA-CACAAAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-AAAGAA----AAA-T-G-A-GA------A---CT-TGT--CC-AA---T---C---N-NNNNNNNNNNN--NNNNN--N-N-NNN-NN-NTT-------------------TTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-
gi|7 : TTA-A-AGA--T-GT-C----AAAC-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGA--GTAG-----GCCAA--TT-C--TAT----TCAGAAA-A---TA-G--A-GAT-TTC--C---G-GAT--AA-AAT-G--AGTA----TATC--------A-T-A--C-AT--G----C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----AA---TTA---T-GT------C--TTGA-A-T-T---GA--GGC--GAA---C-C---AA-T-AATTG-A-TAA-T---CGTCCCAAATAT----C--AGC---A-T------T-T---TCTCCA--G-C--A-G-TCACTAAAACC-A-GAGT-T-A-TTCTCTT-----GGTA-AT-A-AT-CA-GAAA-TG-----AGAT-----AAA-A-T-C---ACA---GAA--T--TGAA-ATG-G--AAA-AC-AAC--T-T-G---A-------AT--TTGT--------TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT-------GTAATT--CAAT---GAAATC----A--GTATGATAAAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT-----TA---AAAA-A---GAA--CCTGA-A---TGGCCAAG-T----AA-G--GGT-C-TAA-C-TC-----ATGTAA--T-CC-TTG--AA---G---TCT---AC---AT----T---C-----TG---T-----AT--T------------ACA---CT-TCT-AA--TTT--------T---T--TCA--CGCAAG-GGT-A-AT----------------TGT-------CC------TA-TA---C-A---TT-GC-TT----TGT-----C--AAGGAT--AATC--AT--CCTC-----TTTAT--TTAA----AGT---A-----T--A---------ATTG--ATG--T-C-G--TG----C-TG-TAA---TTA---T-TAG--T----AAT-T--AG-GT-CAAAA--------TATA-------ATC-ACC--A---AAAA-GTA--A-----GA------GAA--T--ACAA---TG-T-ACAT--AGGGCA-----GAT----A----AT---T-AGTCCCC-----A-AA---GA-------AA-GGAGA-GC--AGCGA-C-GGTC-A-C--TGC---A---GA----C----AT-C--CTTA--C-TAT-----TG-A-C-------GT-GC-AT-A---AAGA---T-G--GC---TT-TCCATTT----GCCA--T-C-A-T-GA-TA---AT---AG----G-AAAC----AA-T---GA--GTGAA-C-AA--------G-----------------------------T-A-AAG-T--AAGG-GGG-AG---AG--AGGA-AATCT----ATAA--TTCACAACTCCA---TAC-T--ACCTC-TA-TGGA-A-------AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTGGAA----GTT--G---A---GT---CAC--TGT----ACAGTA-A------------------------TGC-CGGATC-A--A-C-----GACC---A-T--C-C--A--TCCCTTCATA---GGGA-AT--A--------GC--TT--AAATGG-CGG---A---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-C---AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATAATTTA-TGTTTGTA--CT--TCA-AT----AAAAT-TG-TTTGC----T-GT-CT-AAAA------T----TG-T--CCT--TGTC---T-GTC--ATAG------C------A-CAC--AC-CTAAAATTATCA-A-AAtcagaaata
gi|8 : ctcctacttttctcagcgcagttttcgaatcgtaaaaggcctcatttaagtgcagattggcccaccgttcatataatttacaaaataaacaatattgaaaatattttgatatcctaaatactccttaatatattttatacgtgttactggtaactttactttcgtatgaagggaggtaaattggacA-G-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--GGCT--ATGAA-GTAGC-----C--G--TTAC--TGT----T-CAAAA-AAG-TA-G--AAGAT-TTC--C-----AATTAAA-AATTG--A-TA----TATC--------AGT-AG-C-AT--GTG--C--G---ACATTAGT--TGATT---GC----AA----A----TTA---T-GTGCGATTC--TTGA-A-A-T---GAATG-C--GAA-A-C-C---AA-ATAGTTG-AATA--T---C--TCCAATAC-----C--ATC---A-T------T-T---TTT-CA--G-C--A-G-TCACAAACGCA-ACGAGT-T-A-TTCCCTT-----GGTA-TATA-TT--A-GAAAATT-----AAAA-----AAA-----C-C-ACA---GAA--CACGGAA-ATA-G--AAA-ACCA-C--T-T-G---A--------T--TTG----AT-T-CC-AGGA-T-G--AATA----A-A--TGA---AGTTGATTAGTGTA-TTGTTAA----GAAATC-TT-G--GTATGA--AAT-G----AA-A-AGA--AT-C--TT-TT----AT-----AAG-AAAAGAAT-CCTGA-AA--ATGCCA-G-T----AA-A--TTT-C-TAAAC-TCATTGTCTGCAA--T-TC-TCT--TGAG-GTATTCTG--ACTTAGT----TT--C-----TGT--T-T--TAT--TTTGTACCCCACCACAC--CTACCT-AAGATTT------A-T---T--TCAAGC-CAAG-AT--A-AT----------------TGT-------TAATGCCATA-AT---C-A----T-GC-TT-----GC-----CGGAAGCAT--G-TTCGGTTGCTCTCGGTATTTAG--C--G----AAT---ATCCTGA--AGACATGAATTTTG--ACGCCT-C-GTCTG----C-TG-TGA-ATCTACG-T-T-T--T--T-ACTG----G-GT-TAACG--------TGTT-------G-C-ATT--A---AACAGATA--C-----GA------G-AGTTTCA-AA---TG-T-----------GA-----GAT------T-AAT-TAT-A----CA---CCA-GATATGA-------AAAAGAGagctgaatagggtcttagattctaagaatagaacgtgagaacaatatgcgtgaactgcaagttatacgttctaaaacagtttaaccaaaacaaacaataacatgcagcacaacaacagaccagaagacagacacacatcagaccgacaccaacagacgacacatcaccacagaagcagacagatatgaccacagccacacaaca
gi|9 : cgctagcttatccatctcctacttttctcgcgaagtgacagttcttttctgtaatcctggcataaaaggcactttcattcaatgctagatgtgccaacccttcatatagtatatgtaccaaataaacatagttaattttgagaaaagtcatatttataatttcatttaaatactctcttaatatatgtatgatgtttaacctctctggtttaaacaccgttattatctaattacggtttctaattataggacgataaaggcagagcgcctattgagattcctaaa-A-AGAA-TGTT-C----AA-CCAT-T-TCAT-CGATGGA-CTGG-CT--AT--A-GTATG----AC--G--TT-C--TAT----TCCAGAATAC--TA-G--AAGAA-TTC--TC-CG-AAT--AA-AAT-GTGA-TAT--ATAT---------A-CGA--C-ATTGG-G--TTAG---A-----GTA-T-ATT---G-----AA----AAGTGTTA-----GT------C--TGGAGA-A-A---GA--GGC--AGA-A-C-C---AA-T-A--TGTA-TA--TT--C--CCCAAT-A-----C--A-----A-T------T-T---TC--CA--G-C--A-G-TCTCAAAA--C-A-GAGT---A-TTCCCCT--TG-G-TA-AA-A-AT-CA-GAAATTG-----AGAT-----AAACA-T-C---ACA---GAT--T--TGAA--TG-G--AAATAC-A-C--T-TTG---A-------AT--TTG----AT-C--C-AG-ACT-G--AA-A----A-A--TGA---AGTA------TGTA-TT--CAA----GAAATC-CT-G--GTATG---AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----AT----AAAA-AAAGGAA--CCTGA-AAG-TGGCC--G-T----AA-AGCGGT-C-TAAAC-TC-----ATGCAA--T--C-GTG--ACGA-G---TCT---ACT--AT----TT--CG----TG---G-T--TAT--T-------------CAA--CT-TCT-AAACTCT--T---ATT---T--TCA--C-CAAGAGG--A-TT----------------TTC-------C-------TA-AA---CTA---TTGGC-TT----TGT-----C--AAGGACTAA-TC--GT--CTCTTC---TTTAT--T-------AAT---A-----T--A---------TTTGA-ACG--T-C-A--TG----C-TGCT---ATCTA-G-T-TAG--T--T-AATGT--AG-GT-C-AAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AG---GT---A-----GA------GAAAGT--A-AA---TG-T-GTACCAGAGGGAGTAGTGAT----A-G-AAT-C---AGTT-----------A---GATCATTACAAAGGAG-AGCCA-GCAGAA-GGTC-ATC--TGCG--A---AC----C----ATCC--CTTA--C-TAT--------GAC-------G-CATGAC-A---AAGAA-ATCG--GCCGTCTCTCCCTTTA--TGACA--T-C-A
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): CTACTTATTTCTCAGGCGAAGTTATCGGAATCACCGGTAAAAAGAGCCACTTACATAACAATAGCAGATTGGCCACCTCACTGTATACATATTACCAACAAAAATAACAATATTGAAAATATTTTGATCATTTAAATAACTACTCTTAAGTATATTATATGTTAACCCTGGTAACTTTATTATCGTCATTAGCGAGCAAAAGGGAGAAAATTG
Unaligned ( gi|21 ): GCTGCTTCCGCTAACTCTTTCTCAGCGACAGTCTTCGATCTCGGTAAAACAAGGTCATGTCATTCAATGCGCAGATGGCCCGCTTACATATAATATACCAAATAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
Unaligned ( gi|28 ): CCTCTCCTATCTTTTCTCAGCACAGTTTCGATATCCGGTAAACAAGCACTTCATCAATCAGATTGGCCACC
Unaligned ( gi|29 ): TTATATATTAATGTTAATATCCCTGAGTAACTTACTTTGTATGCAAAGGGAGGGGTAAATCTGAGAC
Unaligned ( gi|30 ): AAATGGAATAAAATTCCCAAAATGGAGTTAATGTATATTATTTTGATTCAGAATCAATTATAGAAA
Alignments
lowQualScore : 1111 1111111111111 111 1111111 22222 11111111 333333333333333 111111111 111111111 2222222 1111111111 1111111111111111111111111 11 1111 1111 111111111111 111 22222222 11 1111 1111 1111 111 111 11 222222 11 11111 111111111111111111111111 11111 333333333333 222222 11 11111 33333333333333333333333333333 111111 22222222 11111 1111 333333333333333333 11 11 2222 1111 11 11 11111111 1111111 111 11111 111111 111 2222 11111 1111111 222222222222222222222 11 1 2222222222222222222222 11 333333333333333333 111 11 1 1111 1111 11 333333333333333333 1 111111 111 1 222222222 111 11 11111 1111 22 1111 2222222222222222222 444444444444444444444444444444444444 11111 111 11 222222222222 11 222222 111 11 11111111111 11 11 111111 11 111 666666666666666666666666 111111 11 333333333333333333333 1 11111 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111 11111111 6666666666666666666666666666666 1 111111 11111111 222222222 2222222 11 3333333333333333333333333333333 666666666666666666666666666666 11111 4444444444444444444444 111111 2222222222222222 2222 3333333333 111 11 111111111 11111 111111111 22 11 111 33333333 2222222222 11 1 1 111 111111 111 1 11 1 111 111111
lowQualScore : 3 3 3 6 3 6666 3 3 3 3 77 3 555 4444 3 44 3 7777777777777 3 88 6666 33 2 333 2 33 2 4444444 2 33 2 2 33 44444 11111111 3 77 888 77 3 444444444444444 77 3 222222222 999999999 555 2 6666666 33 2 2 2 777 33 1111111111 2 555 2 2 3 2 6 9999999999999999999999999 6 555 3 888888 5 777 66 33 2 33 5 2 5 44 33 2 555 5 0 99999 2 2 5 2 7777 2 66666 66666 33 2 1111 77777 99 3 44 555 6 3 3 0000 3 666 999999999999 55 55 3 333 3 3 7 4 66 4 9999 4 66 777 11111111 4 00 3333 1 0000 666 66 4 9999 4 4 66 4 66 4 3333 777 8 222 4 4 2 4 777 4 4 9999 4 00 4 4 4 444444 66 4 4 00 66666 888888888888888888888888 4 66 00000 4 555555555555 99 4 4 8 4 666666 777 66 22 8 55555 4 66666666666666666666666666666 5 0 555555 5 888 66 11111111 66 1 99999 0000 444444444444444444 00 00 4 3333 9999 4 4 1111 8 4 4 66 00 66 1 00 4 66 66666666 4444444 4 4 66 777 333 66 55555 222222 9999 4 666 4 4 3333 0 11111 2222222 4 77777 2 3 777777777777777777777 55 77 5 5 5 0 66 4444444444444444444444 66 00 444444444444444444 66 222 777 4 4 66 777 55 00 66 4 4 0 5 888 66 0000 888 5555 5 88 777777777777777777 88888 0 444444 5 5 5 66 5 11 555 777 0 777777777 222 4 4 4 11 5 5 66 4 4 11111 66 66 1 4 4 4 8888 4 4 11 55 4 2222 0000000000000000000 888888888888888888888888888888888888 4 4 4 8 4 4 99999 111 4 55 4 4 8 44 4 55 111111111111 33 4 4 55 777 4 777777 55 4 4 4 4 4 4 4 99 4 4 4 4 4 1 4 999999 4 222 4 77 1 777 4 4 00000000000 4 55 66 4 4 8 44 4 888888 4 4 777 77 777 66 5 666 000000000000000000000000 111111 11 5 444444444444444444444 5 0 66 55 22222 5 11 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5 55 5 999999999999999999999999999999999999999999999999999 33333 6 66666666 9999 1 0 7777777777777777777777777777777 2 99 3 6 99 666 6 1 999999 5 77777777 111111111 0000000 00 888 5 2222222222222222222222222222222 888888888888888888888888888888 22222 5 888 1 5 2222222222222222222222 777 666666 8888888888888888 4 4 8 555 6 3 3 3 7 3 666 6666 3 3 3 3 4444444444 3 55 3 666 000 00 3 3 888 3 3 55 3 3 3 3 3 333333333 3 2 4 4 00000 55 2 4 888888888 00 00 444 99999999 66 1111111111 77 999 66 888 66 5 11 5 0 7777 5 5 888 0 2 5 5 888 3 5 66 5 5 888888 5 555 5 777 5 77 1 88 1 1 6 0 5 66 777 3 5 000000 66 5 5 5 5
lowQualScore : . . . . . .... . . . . .. . ... .... . .. . ............. . .. .... .. . ... . .. . ....... . .. . . .. ..... ........ . .. ... .. . ............... .. . ......... ......... ... . ....... .. . . . ... .. .......... . ... . . . . . ......................... . ... . ...... . ... .. .. . .. . . . .. .. . ... . . ..... . . . . .... . ..... ..... .. . .... ..... .. . .. ... . . . .... . ... ............ .. .. . ... . . . . .. . .... . .. ... ........ . .. .... . .... ... .. . .... . . .. . .. . .... ... . ... . . . . ... . . .... . .. . . . ...... .. . . .. ..... ........................ . .. ..... . ............ .. . . . . ...... ... .. .. . ..... . ............................. . . ...... . ... .. ........ .. . ..... .... .................. .. .. . .... .... . . .... . . . .. .. .. . .. . .. ........ ....... . . .. ... ... .. ..... ...... .... . ... . . .... . ..... ....... . ..... . . ..................... .. .. . . . . .. ...................... .. .. .................. .. ... ... . . .. ... .. .. .. . . . . ... .. .... ... .... . .. .................. ..... . ...... . . . .. . .. ... ... . ......... ... . . . .. . . .. . . ..... .. .. . . . . .... . . .. .. . .... ................... .................................... . . . . . . ..... ... . .. . . . .. . .. ............ .. . . .. ... . ...... .. . . . . . . . .. . . . . . . . ...... . ... . .. . ... . . ........... . .. .. . . . .. . ...... . . ... .. ... .. . ... ........................ ...... .. . ..................... . . .. .. ..... . .. ............................................................ . .. . ................................................... ..... . ........ .... . . ............................... . .. . . .. ... . . ...... . ........ ......... ....... .. ... . ............................... .............................. ..... . ... . . ...................... ... ...... ................ . . . ... . . . . . . ... .... . . . . .......... . .. . ... ... .. . . ... . . .. . . . . . ......... . . . . ..... .. . . ......... .. .. ... ........ .. .......... .. ... .. ... .. . .. . . .... . . ... . . . . ... . . .. . . ...... . ... . ... . .. . .. . . . . . .. ... . . ...... .. . . . .
lowQualScore : 3 3 3 7 1 5555 1 1 1 1 33 1 444 1111 1 22 1 2222222222222 1 55 5555 55 7 777 7 77 7 5555555 7 77 7 7 77 00000 22222222 1 33 555 33 1 333333333333333 33 1 888888888 888888888 000 9 8888888 99 9 9 9 999 99 8888888888 9 000 9 9 6 9 2 9999999999999999999999999 2 444 1 222222 7 999 88 99 9 99 7 9 1 88 99 7 555 3 5 99999 7 7 3 7 9999 5 77777 77777 77 7 5555 77777 44 3 66 888 7 6 6 1111 6 444 666666666666 00 00 6 666 6 6 3 4 11 4 4444 4 11 888 11111111 4 66 9999 9 9999 222 11 4 4444 4 4 11 4 11 4 9999 888 9 000 4 4 9 4 999 4 4 4444 4 66 4 4 4 000000 11 4 4 66 11111 333333333333333333333333 4 11 33333 4 666666666666 00 4 4 9 4 999999 888 11 22 9 66666 4 33333333333333333333333333333 0 4 999999 0 888 99 22222222 99 4 44444 9999 333333333333333333 66 66 4 4444 4444 4 4 8888 9 4 4 11 88 11 1 66 4 33 11111111 4444444 4 4 11 888 999 11 66666 888888 8888 4 777 4 4 4444 8 11111 3333333 4 11111 9 9 444444444444444444444 66 99 0 0 0 0 99 9999999999999999999999 99 11 222222222222222222 99 444 888 4 4 11 888 66 66 11 4 4 0 0 888 99 6666 888 6666 0 88 222222222222222222 55555 0 444444 0 0 0 99 0 66 888 000 0 000000000 444 4 4 4 99 0 0 44 4 4 11111 11 11 8 4 4 4 0000 0 0 00 55 0 5555 8888888888888888888 000000000000000000000000000000000000 0 0 0 0 0 0 55555 000 0 55 0 0 0 55 0 55 111111111111 55 0 0 55 000 0 555555 55 0 0 0 0 0 0 0 55 0 0 0 0 0 1 4 000000 4 444 4 22 9 888 4 4 99999999999 4 00 11 4 4 9 11 4 999999 4 4 888 22 111 99 0 444 222222222222222222222222 222222 99 0 000000000000000000000 0 8 99 11 55555 0 99 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 6 66 7 222222222222222222222222222222222222222222222222222 00000 7 88888888 3333 0 8 2222222222222222222222222222222 5 22 3 7 88 888 7 0 222222 2 99999999 999999999 2222222 66 888 0 0000000000000000000000000000000 555555555555555555555555555555 88888 0 222 0 0 0000000000000000000000 888 666666 0000000000000000 4 4 0 888 5 6 6 6 3 6 444 4444 6 6 6 6 2222222222 6 00 6 444 000 00 6 6 555 6 6 00 6 6 6 6 6 111111111 6 6 0 0 00000 55 3 0 666666666 33 11 444 55555555 99 9999999999 00 444 99 888 99 0 99 0 0 6666 0 0 888 4 6 0 0 111 4 0 99 0 0 999999 0 666 0 111 7 99 4 88 0 7 7 0 0 99 555 6 0 222222 99 0 0 0 7
consensus : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-C--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-T------T-T---TC--CA--G-C--A-G-TCACAAAAACN-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTA-AA-A-TT-CA-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------TGTA-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-AAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TGT--C-------TA-AAC-A---TT-GCTTCGTC--AAGGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-TAA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGTT--A-AA---TG-T-ACAC--AAGGGA-----GAT----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCG-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCAT-A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATTTAT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AGG-GT--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGA-AG--AGGA-AATCTT-ATATAAATTTCACA-C-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACT-TA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTCA-GGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA--CT-ATCA-AT--AAAAAAT-TG-TTTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCACCG--GCACGC-------------CAC----GCACAG--ACA-GACACAAC---AGGACACA----AACA-GANCAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A---ACCGA-GA--C-CCAC-C-G----ACC--AGACAGACCAG--AA------CG--ACACGACACACGAC-AG-A----C---CACA-AC-------ACAC---CACAGACACCG-A---CCG-CCGACA-ACCACACA-CAGC--A--CCAG--ANCACGCACACAC-CAC------C-CGA-CCGACCA-A----CGACACACA--CACC-GA-CA-GACAC-A-C-ACAC------ACACGA----C---ACAGACAG--CGACA-A---C-ACACACAC-CAC---A-CACGA-CAG-CA-------GACAC--AACA----AGCAGAC-A----GACA-------------CA-----CA-C-AGA-CAGACCACAGAC-A--C-------GACA----A-C-AC---AGATAGAACACAGACA-GCAC-CA-CAA----CA-CA-CAC-AAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-A-GG------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTTTCTCG--GCACTTCA--CCACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAATATAAAAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTA
Reference ( family-511 ) : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-C--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA-GTATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-T------T-T---TC--CA--G-C--A-G-TCACAAAAACN-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTA-AA-A-TT-CA-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------TGTA-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-AAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TGT--C-------TA-AAC-A---TT-GCTTCGTC--AAGGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-TAA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGTT--A-AA---TG-T-ACAC--AAGGGA-----GAT----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCG-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCAT-A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATTTAT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AGG-GT--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGA-AG--AGGA-AATCTT-ATATAAATTTCACA-C-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACT-TA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTCA-GGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA--CTAATCA-AT--AAAAAAT-TG-TTTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCACCG--GCACGC-------------CAC----GNACAG--ACA-GACACAAC---AGGACACA---CAACA-GANCAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A---ACCGA-GA--C-CCAC-C-G----ACC--AGACAGACCAG--AA------CG--ACACGACACACGAC-AG-A----C---CACA-AC-------ACAC---CACAGACACCG-A---CCG-CCGACG-ACCACACA-CAGC--A--CCAG--ANCANACACACAC-CAC------C-CGA-CCGACCACA----CGACACACA--CACC-GA-CA-GACAC-A-C-ACAC------ACACGA----C---ACAGACAG--CGACA-A---C-ACACACAC-CAC---A-CACGA-CAG-CA-------GACAC--AACA----AGCAGAC-AA---GACA-------------CA-----CA-C-AGA-CAGACCACANAC-A--C-------GACA----A-C-AC---AGATAGAACACAGACA-GCAC-CA-CAA----CA-CA-CAC-AAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-A-GG------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTTTCTCG--GCACTTCA--CCACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAATATAAAAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTA
gi|1 : TTA-ACAGAA-T-TC-C----AA-C--T-T-C--T-CG---GAAT--G-CT--ATGAA---A-G-CTTCAGCG--TT-CATCAC----TTCAAAA-A---TA-G--AAGATCTTC--CG-CG-AAT--AA-AAT-A--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATTCG-A-----AA----A----TTA---T-GTCT---TG--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-A-TTG-A-TAA-T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-T------T-TC--TC--CA--GGC--A-GATCACAAA--CC-A-GAGT-T-AATTCCCCT--TG-GATA-AA-A-TG-CAAGAAAAGA-----GAAT-----AAACAGA-TC---ACAGAAATT--TGA---TG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------ATGATTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----ACA--TGA---AGTT------GCTA-TTT-CAA----CAAATCATG-G--TTATGA--AAT-G----AA-G-AAGCGAA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGAA-G-CCTGA-AA--TGCGCA-A-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GC-TGCAA--T-CC-TTG--AGAGAG---TCTC--ACT---T----CT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-TAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAT-GA--ATTT----------------TGTCCC-------TA-AAC-ATCTTT-GCTTATTC--AAGGAT--ATTC--GT--CT-T-----ATAATT--ATAATA-----AACA---------TTTG--ACG--TAC-GA-TG----CATG-TAACATCTA-G-T-TAAGCTT-A--ATGCTAAG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACCATA---AA---GTAAGA-----GA------GAAGTT--A-AAAATTGTT-AC-C--A--GGA-----G------A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---G--------AAAGGAG-AGCCCAGCAG-A-GGTC-A-C--T--G-CA---GAC----AT-C--CTTA--C---T-----TG--AC-------CTCAT-A---A---AAGAA-AT----GC---TTCTCCATCTAT--GACA--CGCAACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-AAGGTGAAG-------C-AAGTGTTGAAAT-TCAAGGTGAC------AGTTAA-AAG-T--AAGG-GGGAAG---AG--CAGG-AATCCT-TTATAATTTACACA-T-TCACATTAC-T--ACC-C-T--TGGA-ATG-----AAAA--AG-G--AACTAA--CTG-TGC---TTCGCTT-CCAC--TA--GTG-AA----GTT--A---G--AAT---CA-CATGTAT-GCCAGT--A------------------------T-C-CG-ATC-ATCA-C-----GGCC---A-T----CC-ACGTCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AC-----A-GC--TTTCAA-TTG-CGGACCG---AAA-G-GA---AACCC-TTGC-TGCC-C-CCC-AT-GCTTCT-TGT-GC-C-TAGCATGTTCACATCATGTA-TGTTTGTAACCT-ATCAGATA-AAAAAAT-TG-TTTGCA---T--T-CTAAAA-A-G--T----TG-T--TAT--T-TC-TGT-GT-CAATAGCAC-CACCA----A-CACACTC---AAT-AAC--AAAC-A-A--TT-ATACATGCACCACTGT-CG--------------CAC----GCACAG--ACACGACA-AAC---A--ACACA----GACA-GAACAGA---AGACC-----A-CACA-ACAC--A---GACG--GA--T-CCAC-C-ACCACACC--AGACACA-CAC--AA------CG--ACTCAACA
gi|1 : ccttcatataatattaccaaaataaacaaatatgaaaaaagttttatgattacattcctaatattatttatcgttaactcctcgagtaattactttccgtattgcaaagggagggctaacacattgagacc----A-C-AC---AGCTA-AACACAGACA-CAAC-C--CAATGTACA-CA-CACCAAACAC-TAA--CTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-AAGG------A---CT-TGT--CCCAA---TG--C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-AATGA-GA-AGT-GG--A------ACA-AATCTTTG-T-GG-----TA--CAAAA--CA--TG-C--AAATGAT-ATTTCCTCG---CACT-CA--C-ACAAATCA----------CCCA-T-C-CTG--TGAAAAC---TT--CCGGA--CA-TAGA--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTG--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAAAA---AAAATATTG-AGTACAA-A-A--CTTCATA-TTTAAAATAT-AGAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--AATAGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagatagacacagctaaacacagacacaacccaatgtacacacaccaaacactaacttgaaatgtaataagaaatgaaggacttgtcccaatgcaaaacatgaacatcagaaaatgagaagtggaacaaatctttgtggtacaaaacatgcaaatgatatttcctcgcactcacacaaatcacccatcctgtgaaaacttccggacatagatacttactgactaaataaccttgaaaatttcaatacgataaaaaaaaaatattgagtacaaaacttcatatttaaaatatagaacatccttcttatacactaaaaatccaaaatttctgacctgaatagaatttcaaagttcaggccgacatgtgctta
gi|10 : ccttcatataatattaccaaaataaacaaatatgaaaaaagttttatgattacattcctaatattatttatcgttaactcctcgagtaattactttccgtattgcaaagggagggctaacacattgagaccttaacagaattccaacttctcggaatgctatgaaagcttcagcgttcatcacttcaaaaatagaagatcttccgcgaataaaataatatatcatacatggcgagttattcgaaaattatgtcttgttgaaatgagcgaaaccaaaattgataatccccaattacacatttctccaggcagatcacaaaccagagttaattccccttggataaaatgcaagaaaagagaataaacagatcacagaaatttgatggaaaacacttgaatgattgatctcagatgaaaacatgaagttgctatttcaacaaatcatggttatgaaatgaagaagcgaatttttataaaaaaaagaagcctgaaatgcgcaataagggtctaaactcgctgcaatccttgagagagtctcacttctctgttattacaacttcttaaatttatttcaccaatgaattttgtccctaaacatctttgcttattcaaggatattcgtcttataattataataaacatttgacgtacgatgcatgtaacatctagttaagcttaatgctaaggtcaaaatataacaccataaagtaagagagaagttaaaaattgttaccaggagataatctagtccccccaaagaaaggagagcccagcagaggtcactgcagacatccttacttgacctcataaaagaaatgcttctccatctatgacacgcaactgataatcaggaaacaatgaaggtgaagcaagtgttgaaattcaaggtgacagttaaaagtaagggggaagagcaggaatcctttataatttacacattcacattactacccttggaatgaaaaaggaactaactgtgcttcgcttccactagtgaagttagaatcacatgtatgccagtatccgatcatcacggccatccacgtccctccatacagggaatacagctttcaattgcggaccgaaaggaaacccttgctgccccccatgcttcttgtgcctagcatgttcacatcatgtatgtttgtaacctatcagataaaaaaattgtttgcattctaaaaagttgttatttctgtgtcaatagcaccaccaacacactcaataacaaacaattatacatgcaccactgtcgcacgcacagacacgacaaacaacacagacagaacagaagaccacacaacacagacggatccaccaccacaccagacacacacaacgactcaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagatagTCACG-CCTC-CA-CAC-TC-ACC-C-TC-TAG----G-----ACAA--GCAA----C--AT-CTG-T-C---TTC-CT--CCACT--A--GTC-GATAACGTTTAG---A--AGTT--CACCATGTC----CAGTA-A------------------------T-C-CG-AT--AT-AAC-----GGCC---AAT--C-CC-AC-TCCCTCCATC-AAGGGA-ATTGAA-----G-CCCTTT--AA-TGGGCGG--CG---AAG-G------A--CC-TTGC--G-C-C-----AC-ACTTTTG--------------------CAT-ATTT---GTTTGTA--CTA-TCA-AT--AAAA--T-TG-TT-GCA---T-GT-CTAAAA-A-AGTT----TG-T--TAT--T-TC-TGT-GTC-AATAGCACACAC------AACA-AC-C---AATGAACA-AA-C-A-A--TA-ACA--TGCA-----GCACGC-------------CAT----GCACAGG-ACA-GACACGA-----------------ACA-GA-CAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC------ACCGA-CA----CTAC-C-A----ACC-------GACC-G--AA------CG----ACGACACCCAAC-AG-AAGAGA---CACAGAC-------AGAC---CAC--ACA-CG-A---CCGACCGACA-GACACACA-CA-C--A--CAAGACAGCATACACACAC-------------------ACCACA------ACAGACA--GACCTGA-CA-GACAC-A-C-ACAC------AGAAGA----C---ACA-ACCG--AGACA-C---G-ACCGACA--CAC---A-CACGA-C---CA-------CCCAC--AACAC---AGCAGAG-AACCCGACA-------------CA-----CA-C---A-CAG--CACAG----------------------G-C-AC---AGATAG-ACACAGACA-GCA--CA--AA----CA-CA-CAC--AACAC-T-AAACTT-GAATT-GT-AAGT-A---AG-----AA-T-G-A-GGA-----A---CT-TGT---C-AA---T---C--AA-AACATG-AAGC-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACG-AAACTTTG-TGGG-----TA--C-AAAA-C--ATGTC--CAATAA-TATT---TCGC-GCAC-TCA---CACAA--CC----------CCC-AT-C-TTGAACGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--T-CTT-AC-T---GA-TAATAAAC-C-TT-----CATT-TCAAT---C-GAGT-A----AAA-AAG-AAAATATTG-AGTAC---A-A--CTTCATATTTTAAGCTAT---AACATCTTCC-TTATCACA-CTAAAAAT--CCATGAAAATTTCTGA-CCT------AGAATTTCAAAG---TC-AGGCCG-AC-ATGTTGCTTA
gi|11 : taC-------GACAT-A---A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATT-AT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--CTGAA--------C-AGG--T--GAAT-TT-AGGT-AC------AATT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAG-------AGGA-AATCTG-ATA---ATTTCACA-C-TC-AA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CAC-ATGT---AGCAGTA-A------------------------T-T-TG-ATC-AT-A-C-----GGCC---C-T--C-CC-AC-TCCCTATAT--CAGGGC-AT--AA-----G-CT--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATAATTTA-TGTTTGTA--CT-ATCA-AT--AAAAAAA-TG--TTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-TC-ATT--T-TC-TGT-GT-CAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAAC--AAAC-A-A--TA-AC--ATGCA--A--ACACGCNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNN--NNN-NNNNNNNN---NNNNNNNN---NNNNA-GAGCACAACCACA-C-----A-CAC--ACAC--A---CCCG---------CACTC-G----ACG--CGACCGACC----------------ACAC-ACACAAGAC-AG-C----A---CACA-AC-------A
gi|12 : ttactcctacttttctctgAAGACAGACA--CACACA-CAC----AA-CA-CAC-GAACAC-TAAA-CTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAAAT-G-A-GG------AAC-TT-TGT--CC-AA---TATGC--AA-AACATG-AAAC-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTT-G-T-GG-----TA--CAAAAA-CA--TG-C--AAATGAT-ATTT-CTCT--G-ACT-CA--C-ACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAA-C---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAA-TAAC-C-TTA--AATTTT-TCAAT--ACGGA-T-------AA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-ATA--CTTCATATTTTAAAATAT--AAACATCCTTCTTTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAA-TTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCT
gi|13 : cCA-A---A-ACAAACAA-TA----A-CATG--CAG-CA-------CA-AC--AACAGACCAGAAGAC-A----GACA-------------CA-----CATC-AGA-CCGAC-ACCAAC-AGAC-------GACACATCA-CCAC---AGA-AGCAGACAGATA-TGAC-CA-CAG----C--CA-CAC-AA-CAC-TAAA-CTT-GAAA--GT-AA-T-A---AGC---AAA-TAG-C-GA------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-A-CATG-AA-T-AT--AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AAC-TTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CAGATG-C--AAATGA-TATTTTC-----GCAC-TCA--C--CAA--TC----------CCCCAT-T-CT---TGAAAAC---TT--CCG-A---A-TA-A--ATCTT-ACTT---GACT-GATGAC-C-TT----AAATT-TCAATAAAC-GA-T-------AA-A---CAAATATTG-AGTAC-AGA-A--CTTCATA-TTTAA
gi|14 : cC-AAACAC-TAAA--CT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGCCA-AGA-T-GGA-GGCGCAA-A---CC-T----TC-AC---T---CCTGA-AATA--------ATCCAG-G--A-A-TAATGAGATT-GG--AGGAACTACA-AACTTCTG-T-AGAATCATC--CATAAA-CG-TCGTC--CAATGAT-ATTTCTTCATCGCACT------CACAG--CTAGGACAAAAATCTAGC-GACTG--TGAGAACATTTT--CGG-A--CT-TA-AATTATTTGAT-TTCAGGCTAA-TAACGCATTATTAAAATT-TCAAT--AC-G--T-ATTTTGAA-ATGTAAAATATTA-GGTGC-A-
gi|15 : cTTA-A-AGTA-T-GT-C----AA-A-AT-C-T--T-TA---AA----G-CT--ATG----------------------C--TGT----TT-AAAA-A---CG-G--AAGAT-TT---TC-CG-AAT--AA-AAT-G--A--G-GTATC--------A-TA--C---AT--A-G--TTAT---A-----AT--T-ATT---G-----AT----A----ATA---T-G------TC--TTGA-G-A-T---GA--G-T--G-A-A-C-C----A-G-AATTG-tgcaaacaaacattaagatatatattctataagagtaataacacgaaatctttcatatagatagcaat
gi|16 : cagtttcgaatctcataaaaagcactttatctaagcaaagtggcaaccttcatgtattaatacaaaataatcatattgaaatattcaattttttttaaattaaatacatgtatactttttaactttacttccatattagcagatggccaagtatatcggagaccTTA-A-AGGA-C-TT-TGCCAAA-A-AT-T-CA-T-CA----A-C--A-CT--ATAAA-GTA----------------C--TATGCGGTTGAAAA-T---TA-A--AAGAC-TTG--CC-GGTCAT--AA-AAG-G--A-T--GTATC--------A-CA--C---AG--G-G-----G---G-----TT--T-ATC---G-----AA----AAC--CTA---T-GT------C--T----A-A-T---AA--G------G-A-T-T---AG-G-AATGC-A--A--T---C-------TTAA----C--T-C---A-T------T-TGTTTT--CA--G-C--ATG-TCACAAA--CA-A-GAGT-T-AATTCCCCTCCTT-GGTA-A----TT-TG-GAAA-TG-----GAAT-----AAA--AAGTC-C--CAAAA--A--TGGA-c
gi|17 : AAAA-A---TCTG--AAGAC-TTC--GC--G-AAT--AA-AAT----------TATC--------A-CA--CC--AT--G-G---------G-----GT--T-GTC---G-----AA----AA---CTA---T-G-------C--CTGA-A-A-T---AA--A-C--GGA---T-T---AG-A-AAT---G-CA--T---C--------TA-----A--A-CGTGA-T------TGT---TT--CA--G-C--A-G-TCACAAA--CA-A-GAGT-T-A-T-CCCCT--TG-G-TA-A----TT-TT-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AG-TC-CAACTGAA--T--Ttatttatagcctattattctgatcagatcatatagaaa
gi|18 : aaaaaactgcaaaaattcttaaaacaataaattactctatgcggttga-C----AA-A-AT-T-C--T-TA---AA-C--A-CT--ATTAA-ATA-C-C-----TA--TG-C---AG----TTGAAAA-A---TT-G--AAGAC-TTG--C---G-AAT--AA-AAG-G--A-T--GTATC--------A-CA--C---AT--G-G--A--G---G-----TT--T-ATC---G-----AA----A----ACA---T-G------TC--CTGA-A-A-T---AA--A-G--G---A-T-T---AG-A-AATGC-A--A--T---C-------TTA--------A-C---G-TCATTTGT-T---TT--CA--G-C--A-G-TCAC--AAACA-A-GAGT-T-A-TCCCCCA--TT-GGT---A-A-TT-TT-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AT-TC-C-A------------AA-ATG-G--AGTTAA-AG-T-C--TAT-T---A-----------TT--TTG--A-T---TC-AG-A-atagcctaattattctgatcaagaaatcaagttatagaaa
gi|19 : gACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGGA--AAA-T-G-A-GG------AA--CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AGCATT-AA-T-ATC-AG-G--A-A-TGA-GA-ATT-AG--A------ACA-AACTatcaattataga
gi|2 : AAAA-G---TA-ATTATGAT-TTC--ACGCG-AAT--AATAAT-G--AATA-ACGGT--------A-TA--C---ATC-G-G--C--G---AAGTT-GT--T-ATT---GTGAGTAATAC-A----TTAAAAT-GC-----TC--TTAA-A-AAT---GA--AAC--GGATA-C-C---AA-A-A-TTG-A-TGATT---CGACCCAAT-A-----C--A-C---A-T------T-T---TC--CACAG-C--A-G-TCAACACAACGCA-GAGT-T-A-TTCCCCT--TT-GGTA-AATA-TC-CA-GAAAATC-----GAAT-----AAA--AA-TC-C--CAGAA--T--T--A-ATG-G------AA-AC-A-C----T-G---A-----------CT--TTG--A-T-TACC-AG-A-T-GAAAA-A----A-A--TGA---AG-T------TGTA-TT--CAAATATGAAA-C-T--G--GTATGC--AAT-AGACCAA-G-AGG--AT-C--TTATT----ATATCTAATA-AAAGAA-A-CTTGA-A----GGCCA-GTT----AACGC-GGT-C-AGAACTTC---ATAAGCAA--TCCC-TTGCAAGAT-G---TCTTTAGCTGGATCGTGTTCGC-----T-G--TGTAAAA-AT------------AC--ATT-T-CTAAAAAT-TTAGA-A-T---TCCTCA--C-CAAG-GAC-A-TT----------------TAT--ccgaaaatcagaaataatcacagcacctggaaagtgtaatttatcataatttaagcttacaaatatctataatctgcaatttcgatatccttcatgaccgttacaggcgttgcgtcccacacatgttgtcagggaactattgacactggccggttccatagataaatggt
gi|2 : acgaattctaaatgacaaaaaA-----A--A---------TTTGGTACG--T-C----TGTCATC-CG-TAA-CTCTA-GAT-TAG--CT-ATAATGT--AG-G---GAAA--------CATACTCAACCA-C-ACC--ATCCAA---GGT--A-----GATGTTATGAAGTT--A-AAA--TG-T-AC-C--AAGGT------GAT----A-TAAAT-C-T-TATCACCTAACCACAA---AG-------AAAGGAGAAGCCAG-CAG-A-GGTCTA-C--CTCGTCA---AACGATCAT-T--CTTATTC-CATCC---TGCCAC-------GTCAT-AAT-A---AGGAAGAT-G--GC---T-CTCCATATATACGACAATC-C-ACTAGC-TATCCATCCCAG----GAAAACCCAAAATTTGGA--GTGAAAGAAAAAAC-AGG--T--GAAT-TC-AGGT-ACAATGCTAGTT-A-AAGATGGAGAG-GGGGAGGA-AAGCAGGACAATCTTCATACCCATCCC-CC-C-CC-CA-TAC-tatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatataaaatttggtacgtctgtcatccgtaactctagattagctataatgtagggaaacatactcaaccacaccatccaaggtagatgttatgaagttaaaatgtaccaaggtgatataaatcttatcacctaaccacaaagaaaggagaagccagcagaggtctacctcgtcaaacgatcattcttattccatcctgccacgtcataataaggaagatggctctccatatatacgacaatccactagctatccatcccaggaaaacccaaaatttggagtgaaagaaaaaacaggtgaattcaggtacaatgctagttaaagatggagagggggaggaaagcaggacaatcttcatacccatcccccccccatacaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagtggaaggaaataggaaggaactaacactaatcctcctcccacctatgatgaacgttgtggaaatatgcacaatgtcagcagtgaatgtctgtttgaccaaattactattccgatccatactagatgacccatttcccacctcccttcctatcagaaaaaaacagctggttaaatcgccgcgcccaaacgcgacacgccttgcctgtcgcccatgcttctgtgcggccatactgtccagtcatttatgtttgtacctcttcaataaaaaaatgttttgcgaattgtgctaaaagagtctcgtgcatttattctgtcgtcaattagcaccatataacaacacagcaatgacagagacatatctaacgaggcacgggcagaccctctttcacaaaaagaggcggctcaagtacacgattcaagaacagaccactacaagaccaagggacagatcacagcatcacacatcacaggatagaacagacacaattggtgaaacagcaagaaaaatacctcggataaatacacaacatcctagatcagactagagcagatccgaacaacacaacacagaccagaacatcgtacccgatgacacgagggccacagacagacacacagttcacatacacgacacacacctacagacgcaagcacaggacataaatcatagacaaaagacagacaccaagtatgataatcacatgaggttgaaaaaaatattctaaaagaccacacaaccacaacttgtaatcgtgagaagaggaaaataaagagcgaaactctgtactcaatccaaaagcatgaataatcagaaatgaaattggataacaaacttttgatgatacaaacaatcagaaataatctact
gi|2 : acgaattctaaatgacaaaaaaaaagtaattatgatttcacgcgaataataatgaataacggtatacatcggcgaagttgttattgtgagtaatacattaaaatgctcttaaaaatgaaacggataccaaaattgatgattcgacccaatacacattttccacagcagtcaacacaacgcagagttattcccctttggtaaatatccagaaaatcgaataaaaatcccagaattaatggaaacactgactttgattaccagatgaaaaaaatgaagttgtattcaaatatgaaactggtatgcaatagaccaagaggatcttattatatctaataaaagaaacttgaaggccagttaacgcggtcagaacttcataagcaatcccttgcaagatgtctttagctggatcgtgttcgctgtgtaaaaatacatttctaaaaatttagaattcctcaccaaggacatttattatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatata-TGGA-A-G-----GAAATAGGAAGGAACTAACACTAAT-C---CTC-CTC-CCACC-TATGATG-AAC---GTT--GTGGA--AATATGCACAATGTCA-G-CAGTG-AATGTCTGTTTGACCAAATTACTATT-C-CG-ATCCAT-A-CTAGATGACCC--A-TTTC-CC-ACCTCCCTTCCTATCAGAAA-AA--AACAGCTG-GT--TA--AA-TCG-CCG--CGCCCAAACGCGACACG--CC-TTGCCTG-T-CGCCC-AT-GCTTCTGTGCGGC-CAT-AC-TGTCC-AGTCATTTA-TGTTTGTAC-CTCTTCA-AT--AAAAAAA-TGTTTTGCGAATT-GTGCTAAAAGA-G--TCTCGTG-C--ATTTAT-TC-TGTCGTCAATTAGCAC-CATATAACAA-CACAG-C---AATG-ACAGAGAC-ATATCTA-ACG-AGGCACGG--GCAGAC-------------C-CTCTTTCACAA--AAA-GAGGCGGCTCAAGTACACGATTCA--A-GAACAGA--C----C-----A-C-T--ACAA--G---ACCAA-G----------------------GGACAGATCAC--AG------CATCACACATCACAGGAT-AGAA----CAGACACA-ATTGGTGAAACAG---CA-AGAAAAAT-A---CCT-CGGATA-A--ATACA-CAAC--ATCCTAG--ATCAGAC-TAGAG-CA----------GATCCGA----A----CAACACA-A--CACA-GACCA-GA-AC-ATC-GTACCCGATGACACGAGGGCC---ACAGACAG--ACACACAGTTC-ACATACAC-GAC---A-CACAC-CTA-CA-------GAC-----GCA----AGC--AC-AG---GACA-------------TAAAT--CA-T-AGA-CAAAAGACAGAC-A--CCAAGTATGATA----ATC-ACATGAGGTTGAA-AAAAATA-TT-C-TA-AAA----GACCA-CAC-AACCAC----AACTT-GTAATCGT-GA-G-A---AGAGGAAAA-T-A-A-AGAGCGAAA---CTCTGTACTC-AA---T---CCAAA-AGCATG-AA-TAATC-AG-A--A-A-TGA--A-ATT-GGATA------ACA-AACTTTTGAT-GA-----TA--C--AAA-CA-AT--CAGAAATAATaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagtggaaggaaataggaaggaactaacactaatcctcctcccacctatgatgaacgttgtggaaatatgcacaatgtcagcagtgaatgtctgtttgaccaaattactattccgatccatactagatgacccatttcccacctcccttcctatcagaaaaaaacagctggttaaatcgccgcgcccaaacgcgacacgccttgcctgtcgcccatgcttctgtgcggccatactgtccagtcatttatgtttgtacctcttcaataaaaaaatgttttgcgaattgtgctaaaagagtctcgtgcatttattctgtcgtcaattagcaccatataacaacacagcaatgacagagacatatctaacgaggcacgggcagaccctctttcacaaaaagaggcggctcaagtacacgattcaagaacagaccactacaagaccaagggacagatcacagcatcacacatcacaggatagaacagacacaattggtgaaacagcaagaaaaatacctcggataaatacacaacatcctagatcagactagagcagatccgaacaacacaacacagaccagaacatcgtacccgatgacacgagggccacagacagacacacagttcacatacacgacacacacctacagacgcaagcacaggacataaatcatagacaaaagacagacaccaagtatgataatcacatgaggttgaaaaaaatattctaaaagaccacacaaccacaacttgtaatcgtgagaagaggaaaataaagagcgaaactctgtactcaatccaaaagcatgaataatcagaaatgaaattggataacaaacttttgatgatacaaacaatcagaaataatctact
gi|22 : acgaattctaaatgacaaaaaaaaagtaattatgatttcacgcgaataataatgaataacggtatacatcggcgaagttgttattgtgagtaatacattaaaatgctcttaaaaatgaaacggataccaaaattgatgattcgacccaatacacattttccacagcagtcaacacaacgcagagttattcccctttggtaaatatccagaaaatcgaataaaaatcccagaattaatggaaacactgactttgattaccagatgaaaaaaatgaagttgtattcaaatatgaaactggtatgcaatagaccaagaggatcttattatatctaataaaagaaacttgaaggccagttaacgcggtcagaacttcataagcaatcccttgcaagatgtctttagctggatcgtgttcgctgtgtaaaaatacatttctaaaaatttagaattcctcaccaaggacatttattatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatataaaatttggtacgtctgtcatccgtaactctagattagctataatgtagggaaacatactcaaccacaccatccaaggtagatgttatgaagttaaaatgtaccaaggtgatataaatcttatcacctaaccacaaagaaaggagaagccagcagaggtctacctcgtcaaacgatcattcttattccatcctgccacgtcataataaggaagatggctctccatatatacgacaatccactagctatccatcccaggaaaacccaaaatttggagtgaaagaaaaaacaggtgaattcaggtacaatgctagttaaagatggagagggggaggaaagcaggacaatcttcatacccatcccccccccatacaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagTA---T-GT------C--TTGA-A-A-T---GA--G-C--AGA-A-C-C----A-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAA-TA-----CAAA-C---A-T------T-T---TC--CA--G-C--A-G-TCAC--AAACC-A-GAGTAT-A-TT-CCCT--TG-GTTA-AA-A--T-CA-GAAAAAGAAAATGAATTAACCAAT--AA-TC-A-GCAGAA--T--TGAT-GTG-T--A---AA-ctact
gi|23 : TC-CTT-CCACC-CA--ATG-A-------T--C---C--AG--------ATGT------AGAA-C------------------------T-C-CA-ATC-AT-A-C-----TGCC---C-T--C-AC-AC-TAC-TCCAT--CTGGGA-AT--AA-----ATAC--TTT-AA-TGG-CCG--GG---AAA-G-AA---A--CA-ATGC-TG-C-A-CCA-AT-GCTTCTGCG--GT-A-T-GC-TGTTC-Cct
gi|24 : aaccaagta------T-T---TT--CA--G-C--A-G-TCAC--AAACA-A-AAGT-T-A-TCTCCCT--T--GGT---A-A-TT-TT-GAAAAT------GAAT-----AAA--AG-CC-C-A---AA--A--TGGA-AT--T--A---AA-TC-A-T--A-T-T---A-----------TT--TTG--A-T---TC-AG-A-t
gi|25 : tg-GAGT-T-A-TCCCCCT--TG-GC----A-A-TT-TT-GAAAATG-----AAAT-----AAG--AG-TC-C--CAAAA-----TGAA-atcaattttag
gi|26 : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TA-----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TT---CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-Tgcttagacctaccgggtagctattgttttgattcagaatcaaaatta
gi|27 : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TC---AA-A---TA-G--AAGAT-TT---CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-Tttat
gi|3 : TTA-A-AGAAAT-TT-C----AA-C-AT-T-C--TGCG---GA-T--G-CT--ATGAAAGTA-G-CG----CGGCTT-CGGTAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AT-AAT-G--A-TAAGTATC--------A-TA--C----T--G-G--T--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-AGC-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-T------T-T---TC--CA--G-C--AAG-TCACAAAAACC-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTATAA-A-TC-CA-GAAAAAG-----GAAT-----AAA--CA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTGTTA-T-T-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A---GA---AGTT------TGTT-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AATAG----AA-GGAGG--AAAT--TT-TT----ATA---AAAATAAAAGA-A-C-TGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---AATT------------ACA-A-T-T-CT-AAAAT-TT----C-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TG---C-------TA-AAC-A---TT-GCTTTG-C--ATAGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A------------TTTG--ACG--T-C----TG----C-TG-TAA-ATCTAAG-T-TAG--TTTA--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGT---A-AA---TG-T-ACACG-AAGGGA-----GAT----A-TAA-TGC-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCA-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCA--A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCAATTATT-GACA--T-C-ACTCGACTA---ATC--AG----GAA----CAA----TG-A--GTGAAG-------C-AAGAGT--GAAT-T--AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGATAG--AGGA-AATCCT-GTATAAATTTCACAAT-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TAATGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACTCTA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTTATGGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TT-C-TG-C-C-CCCAAT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TG-TTGTA--TAAATCA-AT--AAAAAAT-TG--TTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCCACG--ACGTGCTAA----------TAC----GAACAGTAGCA-GGTACAAC---AGGACACA---CAGCA-GACCAGA--CAG--C-----A-CAG--ACAC--A---ACCGATGA--CTCCAC-TAG----ATC--AGACAGACCAG--AG------CG--ACACAACACACAAC-AG-A----C---CACA-AC-------ACAC---CACAGGTACCG-ATTTCCACCCGACA-ACCACACA-CAGC--A--TCAG--CCCATGCACACAC-CAC------CACGA-CCGATC-CATTACCGACACACA--CACCTGA-C--GACAC-A-C-ACAC------ACACAA----C---ACAGACAG--CGACA-A---C-GCACACAC-CAC---AGTATAA-CAG-CA-------GACAC--AACA----AGCAGACTAT---GACA-------------CAAGATTCA-C-AGAGCAGACCACAGACTA--C-------GACA----A-C-AT---AGATAGAACACTGACATGCAC-CAGCAG----CA-CATCAC-AAACACATAAAACTT-GAAAT-GT-AATT-A---AG----AAA-T-G-A-GG------ATG-CA-TGT--CC-AAAGTT---C--AA-AACATGAAA-C-ATC-AG-A--ATA-TGA-GA-ATT-GG---------ACATAACTGTTG-T-GG-----TACTCGAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTGTCTCG--GCACTTCACGCCACAA--CC----------CCCAGT-G-CTG--TGAAAAC---TTTCCCG-ACTCATTACA--TACCT-TC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTT-AAATATAAGACCAT-CTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CCCAGAGAA--TCTGAGTCT---A--AGAATTTCAAAG--TTCAAGGCCG-ACTATG-TGCTTAttatc
gi|31 : T-ACA-CTAAAAAT--AC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTT
gi|32 : -ACA-CTAAAAATTTCC---AAAAATTCT-A-CCTG--A--AGAATTTC-AAG--TTC-AGGCCGAAC-AT
gi|4 : TTA-A-AGAA-TCTT-C----AA-C-ATAT-C--T-CG---GA-T--G-C---ATGAA-GTA-G-C-----CT--TT-C---AT----TTCAAAA-AC--TA-G--AAGAG-TTT--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TAATC---AT--G-G--C--GTACG-----GG--T-ATTTTGA-----AA----A----TTA---TTGT-----CT--TTAA-A-A-TC--GA--G-C--GAA-----C---AACA-AATTG-AATA--T---T--CC-AAT----------A-C---A-T------TAT---TC--CA--G-C--C-G-TCACAAAG-CA-A-GAGT---A-T-CACCT--TG-TTTA-AA-A-TC----GAAAATG-----AAA-------AA--AA-TCAC-AAGAAA--T--TGAA--TG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-GGGGA-----------AT--TTG--ACT-C-TCCAG-A-T-G--AA-A----A-AAATGC---AATT------T-TG-TT--CAA----GAA-TC-TG-GTAGT-TGA--AAT-G----AA-G-AGG--AC-T--TT-TTT---ATA---AAAA-A---GA-A-CCTGACAA--TGGTCC-A-T----AA-G--GGTGC-TAAAC-TC----TATGCGA--T-CC-T-G--AGAG------CT---ACT--AT----TT--------T-G--T-T---A-TT------------ACA--CT-T-CA-AAAAT-T-----A-T---T--CGA--C-CAAG-GA--A-TT----------------TGT--C-------CA-A--------T-GCTTCG-C--AGGAAT--A-T---GT--CTAC-----TTTATT--A-AATACA---A--A---------TTTG--ACGA-T-CAG--TG----C-TG-TA---TCTA-G-T-TAG--T--A--AC-T--AG-GTTCAAAACTTAAATATATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--ATAAGCGA------GAAGTT--A-AAA--TG-T-ACA----AGGGA-----GAT----AATTA-T-C-TTAGTCCCC---C----A---TA-------AAAGGA--AGCCAGCAAG-A-GGTC-AAC--TGC--CAC--GAC----A--C--CTTA--C--AT-----CGA--C-------GTCAT-A-T-A---AAGGA-AT-G--GC---TTCTCCAT--AA--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AGAGGGGTAA---CAT----TG-AT-GTGAG--------C-AGG--T--GAA---C-AG-T-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GG--AGGA-AG----GA-AATCTT----TAA--TTCACA-C-TC-CA-TACAT--ACC-CCTA-TGGA-A-GGAAGAAAAA--GGAA--ACCTAAC-CTG-T-CGTTCTC-CTTTCCACT--A--GTG-------GTT--G---ATTCGTA--CAC-ATGGCA----AGTA-A------------------------C-C----ATCCAT-A-CTG---GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCA-A-CAGG---AT--A------G-AT--TT--AA-T---CGG--CG---GAA-A--A---A--CC-T-----G-CGC-CCC-A--GCTC---TG--GC-C-T-GC-T-TTC-CATCATTTACTGTTTGTAA-CTA-TCA-AT--AAAAAATATG-TT-GCA---T-GT-CTAAAA-AAG--T----TG-TC-ATT--T-TC-TGT-GATCAATAGCAC-AAC------A-CACAC-C---A-TGAACA-ACACCA-A--TATACA--TGCATTG---CA-GC-------------AAC----CAAC--------GACGCA-------GACACA-------A-GA-CAGA--CAGA-C-----A-CACCAACACCGA---GCCG--GACTC-CTCC-C-G----AC----GNNNNNNNNN--NN------NN--NNNNNNNNNNNNNN-NN-N----N---NNNN-NN-------NNNN---NNNNNNNNNNN-N---NNN-NNNNNN-NNNNNNNN-NNNN--N--NNNN--NNNNNNNNNTCCC-GAC------C-CGA-CCGACCG-A----C--CACACA--CACC-GC-CC-GACCCGA-C-CGAC------ACAC-A----C---ACAGACAGACCGACA-T---CTCCCCCCCC-CCC---A-CACCA-CA--CA-------GACA---GACA----GACAGAC--A---GATA-------------GA-----CA-C-AGA-CAGACCACACAC-A--C--------ACA----A-A-AC---
gi|4 : acataaatattaccaaataaaattattgaaaaatatgttgattcatttaagataactctcttaaataatttatatggttaaacctgggtaactacctttccgtatggcccaaggagggaagagttggaccCGA----CCCGACCGAC----CGAC------C-ACACACAC-CGCCCGA-CCCGA-CCGACA-------CACAC--A-CA----GACAGAC-C----GACATCTCCCCCCCCCCCA-----CA-CCACA-CAGAC---AGAC-A----------GACA----G---AC---AGATAGA-CACAGACA-G-AC-CA-CA-----CA-CA-CAC-AAA-AC-TTAAACTTTGAAAT-GTTAA-TTA---AT----AAA-A-G-A-GG------A---AA-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AT-C-ATC-AG-AGAA-A-TGA-GA-ATTTGG--A------A-A-AACTTCTG-T-GG-----TA--CAAAAAACA---G-C--AAATGAT-ATTT-CTCG---CACT-CA--C-ACAA--CC----------CCCCAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-AA-CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAA-TAAC-C-TTA--AA--TTATCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTGGAGTAC-A-A-AAACTTCATA-TTTAAAGTATAAA--CATC-TTC-T-AT-ACA-CTAAAAAT--CC---AGAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAA----TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTttaaactttgaaatgttaattaataaaagaggaaatgtccaatcaaaacatgatcatcagagaaatgagaatttggaaaaacttctgtggtacaaaaaacagcaaatgatatttctcgcactcacacaaccccccatgctgtgaaaacttccgaacataatacttactgactaataaccttaaattatcaatacgataaaaaaaaatattggagtacaaaaacttcatatttaaagtataaacatcttctatacactaaaaatccagaatttctgacctgaagaatttcaattcaggccgacatgtgctt
gi|5 : acataaatattaccaaataaaattattgaaaaatatgttgattcatttaagataactctcttaaataatttatatggttaaacctgggtaactacctttccgtatggcccaaggagggaagagttggaccttaaagaatcttcaacatatctcggatgcatgaagtagcctttcatttcaaaaactagaagagtttcccgaataaaatgatatatcataatcatggcgtacgggtattttgaaaattattgtctttaaaatcgagcgaacaacaaattgaatattccaatacattattccagccgtcacaaagcaagagtatcaccttgtttaaaatcgaaaatgaaaaaaatcacaagaaattgaatggaaaacacttggggaatttgactctccagatgaaaaaaatgcaattttgttcaagaatctggtagttgaaatgaagaggacttttttataaaaaagaacctgacaatggtccataagggtgctaaactctatgcgatcctgagagctactattttgttattacacttcaaaaattattcgaccaaggaatttgtccaatgcttcgcaggaatatgtctactttattaaatacaaatttgacgatcagtgctgtatctagttagtaactaggttcaaaacttaaatatataacaccaaagtaataagcgagaagttaaaatgtacaagggagataattatcttagtcccccataaaaggaagccagcaagaggtcaactgccacgacaccttacatcgacgtcatataaaggaatggcttctccataagacatcactgataatcagaggggtaacattgatgtgagcaggtgaacagtacagttaaagtaaggggaggaaggaaatctttaattcacactccatacatacccctatggaaggaagaaaaaggaaacctaacctgtcgttctcctttccactagtggttgattcgtacacatggcaagtaaccatccatactgggccatcccactccctccaacaggatagatttaatcggcggaaaaacctgcgccccagctctggcctgctttccatcatttactgtttgtaactatcaataaaaaatatgttgcatgtctaaaaaagttgtcattttctgtgatcaatagcacaacacacaccatgaacaacaccaatatacatgcattgcagcaaccaacgacgcagacacaagacagacagacacaccaacaccgagccggactcctcccgacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccTTA-A-AGAA-T----C----AA-C-AT-TAC--T-CC---GATC--G-AC--ATAAC-GTA-G-CG----CG--TT-C--TAT----TGCAAAA-AAAATA-G--AAGAT-TTC------G-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-GA--C---AT--G-G-----G---A-----GTATT-ATT---G-----AC----A----ATA---T-GA-----TC--TCGA-A-A-----GA--G-C--GAA-T-CGC---TA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAAT-A-----C--A-C---AGT------T-T---TT--CA--G-C--A-G-TT-CAAAAGCA-G-GAGTGT-A-GTCCCCT--TGTAGTA-AA-AAGT-CA-GAAA-TG-----AAAT-----AAA--CG-AC-T-ACAGAT--T--TGAA--TGTG--A---AA-TA-A-C--TCT-G---A-----------AT--TTG--A-T-T-TC-C--A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------GTTA-TT--CAA----GAT-TC-TG-G---TATGA------G----AA-G-AGG--AA-T--TT-T-----ATA---AAAA-AA--GA-A-C-TGA-A---TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---A-ATGCAA--T-CCATTGC-AGAG-T---TAT----CT--AT----TT--CCTGCAT-G--T-T---A-TT------------CTA-ATT-C-CT-AAAAT-TTTA--A-T---T--TCA--CATAAGCGA--A-TT----------------TGT--C-------TA-AA------TT-GCTTTGTC--AAGGAT-----C--GT--CTCT-----CTT-TT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C----TG----C-TG-TTA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGTT-AGTGT-CAAA-----------TA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--AA----GA------GAAGT---A-AA---TG-T-AC-C--AAGGGA-----TATGCTGA-AGA-T-C-T-G----CC---CCA-AG---TT-------AAAGGAGA-GCCAG-CAG-ATGGTC-A-CGTTGCG-CACTTG-C----ATGCG-CCTA--C-TATCTCCATGA--CTCCAAGAGTTAC-A-T-ACCAAAGAA-A--G--GC---TTCTCCATT-AT--GA-A--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAAA---TG-A--GTGAA--------C-AGG--T--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGAG-GAA-AG--AGGA-A-TCTT-A---GAATTTCACA---TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--A-CTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTG-AA----GTTA-G---A--AGT---CAC-ATGT---AGCAGTA-A------------------------T-CGCG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CCCAC-TCCCTCCAT--CAGGGA-AT--AA-----A-GCT-TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-A-GG---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA--CT-ATCA-AT----AAAAT-TG--TTG-A---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-TTCATT--T-TCTTGT-GT-CAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAAC--AAAC---A--TA-AC--ATGCAC----GCACG--------------CAC----GCACAG--ACA-GACA-AAC---AGAACACA----GACA-GACCAGA--CAGA-C-----ATCAC--ACAC--AC--AC--A-CA--C-CCAC-C-C----AGC--CGACCGACC----GA------C---ACACAACACGAGAC-AG-A----C--------AC-------AC----------ACACCG-A---CCGACCGACACACCACACATCAG---A---CAG--GACACACACACACACACAGAGAGC-AGA-CCGACCA-------GACACACAATTACC-AA-TA-GACA--G-C-AGAC------A---GA----C---AC-----------CA-A---C-ACACACA--CAC---A-CAC-A-GAG--A-------GA---------------CAGAC--------CC-------------CA-----CA-C--------ACCACACAC-A--G-------AATAG---A-C-AC---AGA------GCAGACA-ACA--CA-C-A----CA-CA-CAC-AAACAC-ACAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGA---AAA-T-G-A-GG------AACTTT-TGT--CC-AA---T---C--AAGAACATG-AA-C--TC-AGAA--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AAC-TTTG-T-GG-----TA--CATAAA-C--ATG-CA-AAATGAATATTTTCT-G--GCAC-TCA---CACAA--CA----------CCCCATAG-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A---ACTT-AC-T---GACCTAATAAC-C-TT----AAATT-TCAAT--AC-GA-TAA----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAA-ATATAAACATCCT---CTATAACATCTAAAAAT--CC---AAATATTCTGA-CCTGCAA--GGAATTTCAAAAGTTTC-AGGCCG-AC-AT--TGCTTA
gi|6 : TTATA-AGAT-T-TTAC----AA-C-AT---C--T-CG---GA-T--G-CTGAATGAA-GTA-GGC-----CG--TT----TAG----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTCTTCC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA-CTATTTATGCGAAA-TA--C---AT--T-GAAC--GTAGA-----GT--T-ATT---G-----AACTAGA----TTA---T-GT------CAGTTGA-ATA-TTTGGA--G-CTAGAT-A-C-CTACAA-A-AGATC-A-TT--TTCAC--CCCAAATATTCTCC--A-C---A-T------T-T---CA--CA--G-CCAA-G-TCACAAG---C-A-GAGT-TTA-TTTTTCT--TTTGGTA-AA-A-TTTCA----AATG--------------AAA--AA-CC-----AGAA--T--TAAACATG-GTTA---AACAC-A-CCAT-T-A---AGACAACAACTTAT--TAG--A-TAC-TC-AG-AGTAG--AA-ATAGAA-A--TGACATAGTT-------GTA-T---CTA----GAGATC-TGTG--ATATGA--AAT-G----AACG-AGG--CA-TACTT-TTCTCAGTA---AAAACAAAGAAGA-CCTGA-AAGTTGGCCA-G-TTCGGAA-G--GGT-CCTAAAC-TT---ATGTGCAACTT-CC-TTT--GGAG-----TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--C-C---A-TTCATCGT------ACATACT-TTCTCAAAAT-CTTGCTA-TCTAT--TCAGCC-CAAA-GGCAA-TTCTTGTTAATAGCCGCATAT--T-------TACAACCA---TT-GCTTCTTA--AAGGAT--A-T---GT--CTCT-----TTAATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-T-A-ATCTA-G-TGTAG--TTAA--ATGT--AG-G--CATAA--------TA-A-------A-CAACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAG-T--A-AA---TG-TCACAA--AAGGGA-----GA-----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-A-----A-------AAAGGAG-AGCCCAGCAG-A-GGTC-A-C--T--G-CA---GATCTAAAT-CAGCTTA--CTTAT-----TGG-AC-------GTCAG-A-TAA---AAGAA-AT-GGAGC---TTCTCCA-TTAT--G-CA--T-C-ACT-GA-TT---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-AGGGTGGA--------CTCAG-GT--GAATGTC-AGGTGAC------AGTT-ACAAG-T--AAGGTGGAGAGGA-AG--AGGATAATCTT-AT---AATTTCACA-C-TC-CA-TAC-TTAACC-C-TG-TGGATA-G-----AAAA--GGAA--AACAAAC-CTG-T-C---CTC---T-CCACT-TA--GTG-AA----GTTG-G---A--AGT---CA-CA-GCTA--GCAGTAGA------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-CG----GGCCAAAA-T--CACC-AC-TCCTCGCATC-GAGGGACAT--AA-----C-GT--TTA-AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CCGTTGC-TG-C-C-CCC-ATCGCTTCTGTG--GCAC-T-GC-TGTTC-CATCA-TTA-TGTTTGTA--CT-ATCA-ATAAAAAAAAT-TG--TTGCA---TGGT-CTAAAA-ATG--T----TGTT--ATT--T-TC-TGTGGTCTAATAGCAC-CAT------A-CAC-C-C---AATGAAC--AAAC-A-A--TT-AAA-CTGCATC---GCACG--------------CAC----AGACAG--ACA-GACAAAAC---A-GACACA----AACACGACCAGA--CAGA-CCCACAA-CAC--ACAC--ACACACCAC-GC--C-ACAC-C-G----ACCCAAGACAG--CAGGCAAGACAGCCG--ACA-GACACAC-ACAAG-A----CGA-CACACAC-------ACACCCGCACGGACACCACA---CCA-CTACCG-AC--CACA-GAGCCAA--CCAG--ACAGCTCACATGC-ATC------C-CGA-CAG---AGA----CAACACAGA--CA---GA-CACGACAC-A-CAACAG------ATACGAC---C---ACAG-------GACAGA---C-ACACACACACAC---A-CACGACCAC-CACACGACCGACACCGAACAC---AGCAGCC------GACACCCCCCCCC----CA-----CACC-ACA-CAG--CACAGAC-A----------GACA--------AC---AGAT---ACA-AGACA-GCAC------A----CA-CA-CACAAAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-AAAGAA----AAA-T-G-A-GA------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--NN-NNNNNN-NN-N-NNN-NN-N--N-N-NNN-NN-NTT-------------------TTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-
gi|7 : TTA-A-AGA--T-GT-C----AAAC-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGA--GTA-GGC-----CAA-TT-C--TAT----TCAGAAA-A---TA-G--A-GAT-TTC--C---G-GAT--AA-AAT-G--AGTA--TATC--------A-TA--C---AT--G----C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----AA---TTA---T-GT------C--TTGA-A-T-T---GA--GGC--GAA---C-C---AA-T-AATTG-A-TAA-T---CGTCCCAAATAT----C--AGC---A-T------T-T---TCTCCA--G-C--A-G-TCACTAAAACC-A-GAGT-T-A-TTCTCTT-----GGTA-AT-A-AT-CA-GAAA-TG-----AGAT-----AAA--A---T-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-AAC--T-T-G---A-----------AT--TTG------T-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT-------GTAATT--CAAT---GAAATC----A--GTATGATAAAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT-----TA---AAAA-A---GA-A-CCTGA-A---TGGCCAAG-T----AA-G--GGT-C-TAA-C-TC-----ATGTAA--T-CC-TTG--AA---G---TCT---AC---AT----T---C-----T-G--T-----A-TT------------ACA--CT-T-CT-AA--T-TT------T---T--TCA--CGCAAG-GGT-A-AT----------------TGT--CC------TA-TAC-A---TT-GCTTTGTC--AAGGAT--AATC--AT--CCTC-----TTTATTTAA-AGTA-----T--A---------ATTG--ATG--T-C-G--TG----C-TG-TAA---TTA---T-TAG--T--A--AT-T--AG-GT-CAAAA--------TATA-------ATC-ACC--A---AAAA-GTA--A-----GA------GAA--T--ACAA---TG-T-ACAT--AGGGCA-----GAT----A---A-T---T-AGTCCCC-----A-AA---GA-------AA-GGAGA-GC--AGCGA-C-GGTC-A-C--TGC---A---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA--C-------GT-GC-A-T-A---AAGA---T-G--GC---TT-TCCATTT----GCCA--T-C-A-T-GA-TA---AT---AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AAG-----------------------------T-A-AAG-T--AAGG-GGG-AG---AG--AGGA-AATCT----ATAA--TTCACAAC-TC-CA-TAC-T--ACCTC-TA-TGGA-A-------AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTGGAA----GTT--G---A---GT---CAC--TGT----ACAGTA-A------------------------TGC-CGGATC-A--A-C-----GACC---A-T--C-C--A--TCCCTTCATA---GGGA-AT--A--------GC--TT--AAATGG-CGG---A---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-C---AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATAATTTA-TGTTTGTA--CT--TCA-AT----AAAAT-TG-TTTGC----T-GT-CTAAAA------T----TG-T--CCT--TGTC---T-GTC--ATAG------C------A-CACAC-CTAAAATTATCA-AAAtcagaaata
gi|8 : ctcctacttttctcagcgcagttttcgaatcgtaaaaggcctcatttaagtgcagattggcccaccgttcatataatttacaaaataaacaatattgaaaatattttgatatcctaaatactccttaatatattttatacgtgttactggtaactttactttcgtatgaagggaggtaaattggacA-G-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--GGCT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TTAC--TGT----T-CAAAA-AAG-TA-G--AAGAT-TTC--C-----AATTAAA-AATTG--A-TA--TATC--------AGTAG-C---AT--GTG--C--G---ACATTAGT--TGATT---GC----AA----A----TTA---T-GTGCGATTC--TTGA-A-A-T---GAATG-C--GAA-A-C-C---AA-ATAGTTG-AATA--T---C--TCCAATAC-----C--ATC---A-T------T-T---TTT-CA--G-C--A-G-TCACAAACGCA-ACGAGT-T-A-TTCCCTT-----GGTA-TATA-TT--A-GAAAATT-----AAA-------AA--AA--C-C-ACAGAA--CACGGAA-ATA-G--A---AA-ACCA-C--T-T-G---A------------T--TTG--A-T-T-CC-AGGA-T-G--AATA----A-A--TGA---AGTTGATTAGTGTA-TTGTTAA----GAAATC-TT-G--GTATGA--AAT-G----AA-A-AGA--AT-C--TT-TT----ATA---AGAA-AA--GA-ATCCTGA-AA--ATGCCA-G-T----AA-A--TTT-C-TAAAC-TCATTGTCTGCAA--T-TC-TCT--TGAG-GTATTCTG--ACTTAGT----TT--C-----T-GTTT-T---A-TTTTGTACCCCACCACA-CCTAC-CT-AAGAT-TT----A-T---T--TCAAGC-CAAG-AT--A-AT----------------TGT--TAATGCCATA-ATC-A----T-GCTT-GCCGGAAGCAT--G-TTCGGTTGCTCTCGGTATTTAGC--G-AATATCCTGA--AGACATGAATTTTG--ACGCCT-C-GTCTG----C-TG-TGA-ATCTACG-T-T-T--TT-A--CTG----G-GT-TAACG--------TGTT-------G-C-ATT--A---AACAGATA--C-----GA------G-AGTTTCA-AA---TG-T-----------GA-----GAT------TAA-T-TAT-A----CA---CCA-GATATGA-------AAAAGAGagctgaatagggtcttagattctaagaatagaacgtgagaacaatatgcgtgaactgcaagttatacgttctaaaacagtttaaccaaaacaaacaataacatgcagcacaacaacagaccagaagacagacacacatcagaccgacaccaacagacgacacatcaccacagaagcagacagatatgaccacagccacacaaca
gi|9 : cgctagcttatccatctcctacttttctcgcgaagtgacagttcttttctgtaatcctggcataaaaggcactttcattcaatgctagatgtgccaacccttcatatagtatatgtaccaaataaacatagttaattttgagaaaagtcatatttataatttcatttaaatactctcttaatatatgtatgatgtttaacctctctggtttaaacaccgttattatctaattacggtttctaattataggacgataaaggcagagcgcctattgagattcctaaa-A-AGAA-TGTT-C----AA-CCAT-T-TCAT-CGATGGA-CTGG-CT--AT--A-GTATG-A-----CG--TT-C--TAT----TCCAGAATAC--TA-G--AAGAA-TTC--TC-CG-AAT--AA-AAT-GTGA-TA--TAT---------A-TA--CGACATTGG-G--TTAG---A-----GTA-T-ATT---G-----AA----AAGTGTTA-----GT------C--TGGAGA-A-A---GA--GGC--AGA-A-C-C---AA-T-A--TGTA-TA--TT--C--CCCAAT-A-----C--A-----A-T------T-T---TC--CA--G-C--A-G-TCTCAAAA--C-A-GAGT---A-TTCCCCT--TG-G-TA-AA-A-AT-CA-GAAATTG-----AGAT-----AAA--CA-TC---ACAGAT--T--TGAA--TG-G--A---AATAC-A-C--T-TTG---A-----------AT--TTG--A-T-C--C-AG-ACT-G--AA-A----A-A--TGA---AGTA------TGTA-TT--CAA----GAAATC-CT-G--GTATG---AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----AT----AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AAG-TGGCC--G-T----AA-AGCGGT-C-TAAAC-TC-----ATGCAA--T--C-GTG--ACGA-G---TCT---ACT--AT----TT--CG----TGG--T-T---A-TT-------------CA-ACT-T-CT-AAACTCTT----ATT---T--TCA--C-CAAGAGG--A-TT----------------TTC--C-------TA-AACTA---TTGGCTTTGTC--AAGGACTAA-TC--GT--CTCTTC---TTTATT----AATA-----T--A---------TTTGA-ACG--T-C-A--TG----C-TGCT---ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-C-AAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AG---GT---A-----GA------GAAAGT--A-AA---TG-T-GTACCAGAGGGAGTAGTGAT----A-GAA-T-C---AGTT-----------A---GATCATTACAAAGGAG-AGCCA-GCAGAA-GGTC-ATC--TGCG--A---ACC----ATCC--CTTA--C-TAT-------G-AC-------G-CATGA-C-A---AAGAA-ATCG--GCCGTCTCTCCCTTTAT--GACA--T-C-A
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): CTACTTATTTCTCAGGCGAAGTTATCGGAATCACCGGTAAAAAGAGCCACTTACATAACAATAGCAGATTGGCCACCTCACTGTATACATATTACCAACAAAAATAACAATATTGAAAATATTTTGATCATTTAAATAACTACTCTTAAGTATATTATATGTTAACCCTGGTAACTTTATTATCGTCATTAGCGAGCAAAAGGGAGAAAATTG
Unaligned ( gi|21 ): GCTGCTTCCGCTAACTCTTTCTCAGCGACAGTCTTCGATCTCGGTAAAACAAGGTCATGTCATTCAATGCGCAGATGGCCCGCTTACATATAATATACCAAATAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
Unaligned ( gi|28 ): CCTCTCCTATCTTTTCTCAGCACAGTTTCGATATCCGGTAAACAAGCACTTCATCAATCAGATTGGCCACC
Unaligned ( gi|29 ): TTATATATTAATGTTAATATCCCTGAGTAACTTACTTTGTATGCAAAGGGAGGGGTAAATCTGAGAC
Unaligned ( gi|30 ): AAATGGAATAAAATTCCCAAAATGGAGTTAATGTATATTATTTTGATTCAGAATCAATTATAGAAA
Alignments
lowQualScore : 1111 1111111111111 111 1111111 11111111 333333333333333 111111111 111111111 2222222 1111111111 1111111111111111111111111 11 1111 1111 111111111111 111 22222222 11 1111 1111 1111 111 111 11 222222 11 11111 111111111111111111111111 11111 333333333333 222222 11 11111 33333333333333333333333333333 111111 22222222 11111 1111 333333333333333333 11 11 2222 1111 11 11 11111111 1111111 111 11111 111111 111 2222 11111 1111111 222222222222222222222 11 1 2222222222222222222222 11 333333333333333333 111 11 1 1111 1111 11 333333333333333333 1 111111 111 1 222222222 111 11 11111 1111 22 1111 2222222222222222222 444444444444444444444444444444444444 11111 111 11 222222222222 11 111 111 11 11111111111 11 11 111111 11 111 6666666666666666666666666666666666 111111 222222222 1111111 1 11111 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 11111111 444444444444444444444444444444 1 111111 11111111 222222222 2222222 333333333333333333333333333 11111111 55555555555555555555 1111111 33333333333333333333 111111 2222222222222222 1 2222 3333333333 111 11 111111111 11111 111111111 22 11 111 33333333 2222222222 11 1 1 111 111111 111 1 11 1 111 111111
lowQualScore : 3 3 3 6 3 6666 3 3 3 3 77 3 555 4444 3 44 3 7777777777777 3 88 6666 33 2 333 2 33 2 4444444 2 33 2 2 33 2 66 55555555 3 77 888 77 3 444444444444444 77 3 222222222 999999999 555 2 6666666 33 2 2 2 777 33 1111111111 2 555 2 2 3 2 6 9999999999999999999999999 6 555 3 888888 5 777 66 33 2 33 5 2 5 44 33 2 555 5 0 99999 2 2 5 2 7777 2 66666 66666 33 2 1111 77777 99 3 44 555 6 3 3 0000 3 666 999999999999 55 55 3 333 3 3 7 4 66 4 9999 4 66 777 11111111 4 00 3333 1 0000 666 66 4 9999 4 4 66 4 66 4 3333 777 8 222 4 4 2 4 777 4 4 9999 4 00 4 4 4 444444 66 4 4 00 66666 888888888888888888888888 4 66 00000 4 555555555555 99 4 4 8 4 666666 777 66 22 8 55555 4 66666666666666666666666666666 5 0 555555 5 888 66 11111111 66 1 99999 0000 444444444444444444 00 00 4 3333 9999 4 4 1111 8 4 4 66 00 66 1 00 4 66 66666666 4444444 4 4 66 777 333 66 55555 222222 9999 4 666 4 4 3333 0 11111 2222222 4 77777 2 3 777777777777777777777 55 77 5 5 5 0 66 4444444444444444444444 66 00 444444444444444444 66 222 777 4 4 66 777 55 00 66 4 4 0 5 888 66 0000 888 5555 5 88 777777777777777777 88888 0 444444 5 5 5 66 5 11 555 777 0 777777777 222 4 4 4 11 5 5 66 4 4 11111 66 66 1 4 4 4 8888 4 4 11 55 4 2222 0000000000000000000 888888888888888888888888888888888888 4 4 4 8 4 4 99999 111 4 55 4 4 8 44 4 55 111111111111 33 4 4 55 777 4 777777 55 4 4 4 4 4 4 4 99 4 4 4 4 4 1 4 888 888 4 222 4 77 1 777 4 4 00000000000 4 55 66 4 4 8 44 4 888888 4 4 777 77 777 66 5 666 4444444444444444444444444444444444 111111 888888888 0000000 5 0 66 55 22222 5 11 66 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 888 55 5 999999999999999999999999999999999999999999999999 0000 6 66666666 7 88 0 333333333333333333333333333333 2 99 3 6 99 666 6 1 999999 5 77777777 111111111 0000000 66 888 5 0 555 333333333333333333333333333 55555555 5 44444444444444444444 1111111 9999 5 77777777777777777777 777 666666 8888888888888888 4 4 8 3 4 1 3 3 3 7 3 666 6666 3 3 3 3 4444444444 3 55 3 666 000 00 3 3 888 3 3 55 3 3 3 3 3 333333333 3 2 4 4 00000 55 2 4 888888888 00 00 444 99999999 66 1111111111 77 999 66 888 66 5 11 5 0 7777 5 5 888 0 2 5 5 888 3 5 66 5 5 888888 5 555 5 777 5 77 1 88 1 1 6 0 5 66 777 3 5 000000 66 5 5 5 5
lowQualScore : . . . . . .... . . . . .. . ... .... . .. . ............. . .. .... .. . ... . .. . ....... . .. . . .. . .. ........ . .. ... .. . ............... .. . ......... ......... ... . ....... .. . . . ... .. .......... . ... . . . . . ......................... . ... . ...... . ... .. .. . .. . . . .. .. . ... . . ..... . . . . .... . ..... ..... .. . .... ..... .. . .. ... . . . .... . ... ............ .. .. . ... . . . . .. . .... . .. ... ........ . .. .... . .... ... .. . .... . . .. . .. . .... ... . ... . . . . ... . . .... . .. . . . ...... .. . . .. ..... ........................ . .. ..... . ............ .. . . . . ...... ... .. .. . ..... . ............................. . . ...... . ... .. ........ .. . ..... .... .................. .. .. . .... .... . . .... . . . .. .. .. . .. . .. ........ ....... . . .. ... ... .. ..... ...... .... . ... . . .... . ..... ....... . ..... . . ..................... .. .. . . . . .. ...................... .. .. .................. .. ... ... . . .. ... .. .. .. . . . . ... .. .... ... .... . .. .................. ..... . ...... . . . .. . .. ... ... . ......... ... . . . .. . . .. . . ..... .. .. . . . . .... . . .. .. . .... ................... .................................... . . . . . . ..... ... . .. . . . .. . .. ............ .. . . .. ... . ...... .. . . . . . . . .. . . . . . . . ... ... . ... . .. . ... . . ........... . .. .. . . . .. . ...... . . ... .. ... .. . ... .................................. ...... ......... ....... . . .. .. ..... . .. .. ......................................................... ... .. . ................................................ .... . ........ . .. . .............................. . .. . . .. ... . . ...... . ........ ......... ....... .. ... . . ... ........................... ........ . .................... ....... .... . .................... ... ...... ................ . . . . . . . . . . . ... .... . . . . .......... . .. . ... ... .. . . ... . . .. . . . . . ......... . . . . ..... .. . . ......... .. .. ... ........ .. .......... .. ... .. ... .. . .. . . .... . . ... . . . . ... . . .. . . ...... . ... . ... . .. . .. . . . . . .. ... . . ...... .. . . . .
lowQualScore : 3 3 3 7 1 5555 1 1 1 1 33 1 444 1111 1 22 1 2222222222222 1 55 5555 55 7 777 7 77 7 5555555 7 77 7 7 77 7 33 44444444 1 33 555 33 1 333333333333333 33 1 888888888 888888888 000 9 8888888 99 9 9 9 999 99 8888888888 9 000 9 9 6 9 2 9999999999999999999999999 2 444 1 222222 7 999 88 99 9 99 7 9 1 88 99 7 555 3 5 99999 7 7 3 7 9999 5 77777 77777 77 7 5555 77777 44 3 66 888 7 6 6 1111 6 444 666666666666 00 00 6 666 6 6 3 4 11 4 4444 4 11 888 11111111 4 66 9999 9 9999 222 11 4 4444 4 4 11 4 11 4 9999 888 9 000 4 4 9 4 999 4 4 4444 4 66 4 4 4 000000 11 4 4 66 11111 333333333333333333333333 4 11 33333 4 666666666666 00 4 4 9 4 999999 888 11 22 9 66666 4 33333333333333333333333333333 0 4 999999 0 888 99 22222222 99 4 44444 9999 333333333333333333 66 66 4 4444 4444 4 4 8888 9 4 4 11 88 11 1 66 4 33 11111111 4444444 4 4 11 888 999 11 66666 888888 8888 4 777 4 4 4444 8 11111 3333333 4 11111 9 9 444444444444444444444 66 99 0 0 0 0 99 9999999999999999999999 99 11 222222222222222222 99 444 888 4 4 11 888 66 66 11 4 4 0 0 888 99 6666 888 6666 0 88 222222222222222222 55555 0 444444 0 0 0 99 0 66 888 000 0 000000000 444 4 4 4 99 0 0 44 4 4 11111 11 11 8 4 4 4 0000 0 0 00 55 0 5555 8888888888888888888 000000000000000000000000000000000000 0 0 0 0 0 0 55555 000 0 55 0 0 0 55 0 55 111111111111 55 0 0 55 000 0 555555 55 0 0 0 0 0 0 0 55 0 0 0 0 0 1 4 333 000 4 444 4 22 9 888 4 4 99999999999 4 00 11 4 4 9 11 4 999999 4 4 888 22 111 99 0 444 5555555555555555555555555555555555 111111 444444444 8888888 0 8 99 11 55555 0 99 99 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 000 66 7 222222222222222222222222222222222222222222222222 5555 7 88888888 5 33 8 333333333333333333333333333333 5 22 3 7 88 888 7 0 222222 2 99999999 999999999 2222222 44 888 0 1 444 444444444444444444444444444 66666666 0 99999999999999999999 8888888 5555 0 77777777777777777777 888 666666 0000000000000000 4 4 0 2 0 0 6 6 6 3 6 444 4444 6 6 6 6 2222222222 6 00 6 444 000 00 6 6 555 6 6 00 6 6 6 6 6 111111111 6 6 0 0 00000 55 3 0 666666666 33 11 444 55555555 99 9999999999 00 444 99 888 99 0 99 0 0 6666 0 0 888 4 6 0 0 111 4 0 99 0 0 999999 0 666 0 111 7 99 4 88 0 7 7 0 0 99 555 6 0 222222 99 0 0 0 7
consensus : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-C--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-T------T-T---TC--CA--G-C--A-G-TCACAAAAACN-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTA-AA-A-TT-CA-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------TGTA-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-AAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TGT--C-------TA-AAC-A---TT-GCTTCGTC--AAGGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-TAA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGTT--A-AA---TG-T-ACAC--AAGGGA-----GAT----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCG-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCAT-A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATTTAT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AGG-GT--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGA-AG--AGGA-AATCTT-ATATAAATTTCACA-C-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACT-TA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTCA-GGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAAAAT-TG-TTTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCACCG--GCACGC--------------CAC----GCACAG--ACA-GACACAAC---AGGACACG-A---ACA-GANCAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A---ACCGA-GA--C-CCAC-C-G----ACC--AGACAGACCAG--AA------CG--ACACGACACACGAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGACACCG-A---CCG-CCGACA-ACCACACA-CAGC--A--CCAGACCACGCACACAC-CAC------C-CGA-CCGACC----GACGACACACA--CACC-GA-CA-GACAC-A-C-ACAC------ACACGA----C---ACAGACAG--CGACA-A---C-ACACACAC-CAC---A-CACGA-CAG-CA-------GACAC--AACA----AGCAGA----C-A-GA-CA-------------CA-----CA-C-AGA-CAGAC--CA-CAGAC---AC-------GACA-A-CAC---AGATAGAACACAGACA-GCAC-CA-CAA----CA-CA-CAC-AAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-A-GG------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTTTCTCG--GCACTTCA--CCACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAATATAAAAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTA
Reference ( family-511 ) : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-C--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-T------T-T---TC--CA--G-C--A-G-TCACAAAAACN-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTA-AA-A-TT-CA-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------TGTA-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-AAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TGT--C-------TA-AAC-A---TT-GCTTCGTC--AAGGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-TAA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGTT--A-AA---TG-T-ACAC--AAGGGA-----GAT----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCG-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCAT-A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATTTAT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AGG-GT--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGA-AG--AGGA-AATCTT-ATATAAATTTCACA-C-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACT-TA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTCA-GGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAAAAT-TG-TTTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCACCG--GCACGC--------------CAC----GCACAG--ACA-GACACAAC---AGGACACA-A---ACA-GANCAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A---ACCGA-GA--C-CCAC-C-G----ACC--AGACAGACCAG--AA------CG--ACACGACACACGAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGACACCG-A---CCG-CCGACA-ACCACACA-CAGC--A--CCAGANCACGCACACAC-CAC------C-CGA-CCGACC----AACGACACACA--CACC-GA-CA-GACAC-A-C-ACAC------ACACGA----C---ACAGACAG--CGACA-A---C-ACACACAC-CAC---A-CACGA-CAG-CA-------GACAC--AACA----AGCAGA----C-A-GA-CA-------------CA-----CA-C-AGA-CAGAC--CA-CAGAC---AC-------GACA-A-CAC---AGATAGAACACAGACA-GCAC-CA-CAA----CA-CA-CAC-AAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-A-GG------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTTTCTCG--GCACTTCA--CCACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAATATAAAAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTA
gi|1 : TTA-ACAGAA-T-TC-C----AA-C--T-T-C--T-CG---GAAT--G-CT--ATGAA---A-G-CTTCAGCG--TT-CATCAC----TTCAAAA-A---TA-G--AAGATCTTC--CG-CG-AAT--AA-AAT-A--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATTCG-A-----AA----A----TTA---T-GTCT---TG--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-A-TTG-A-TAA-T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-T------T-TC--TC--CA--GGC--A-GATCACAAA--CC-A-GAGT-T-AATTCCCCT--TG-GATA-AA-A-TG-CAAGAAAAGA-----GAAT-----AAACAGA-TC---ACAGAAATT--TGA---TG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------ATGATTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----ACA--TGA---AGTT------GCTA-TTT-CAA----CAAATCATG-G--TTATGA--AAT-G----AA-G-AAGCGAA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGAA-G-CCTGA-AA--TGCGCA-A-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GC-TGCAA--T-CC-TTG--AGAGAG---TCTC--ACT---T----CT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-TAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAT-GA--ATTT----------------TGTCCC-------TA-AAC-ATCTTT-GCTTATTC--AAGGAT--ATTC--GT--CT-T-----ATAATT--ATAATA-----AACA---------TTTG--ACG--TAC-GA-TG----CATG-TAACATCTA-G-T-TAAGCTT-A--ATGCTAAG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACCATA---AA---GTAAGA-----GA------GAAGTT--A-AAAATTGTT-AC-C--A--GGA-----G------A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---G--------AAAGGAG-AGCCCAGCAG-A-GGTC-A-C--T--G-CA---GAC----AT-C--CTTA--C---T-----TG--AC-------CTCAT-A---A---AAGAA-AT----GC---TTCTCCATCTAT--GACA--CGCAACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-AAGGTGAAG-------C-AAGTGTTGAAAT-TCAAGGTGAC------AGTTAA-AAG-T--AAGG-GGGAAG---AG--CAGG-AATCCT-TTATAATTTACACA-T-TCACATTAC-T--ACC-C-T--TGGA-ATG-----AAAA--AG-G--AACTAA--CTG-TGC---TTCGCTT-CCAC--TA--GTG-AA----GTT--A---G--AAT---CA-CATGTAT-GCCAGT--A------------------------T-C-CG-ATC-ATCA-C-----GGCC---A-T----CC-ACGTCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AC-----A-GC--TTTCAA-TTG-CGGACCG---AAA-G-GA---AACCC-TTGC-TGCC-C-CCC-AT-GCTTCT-TGT-GC-C-TAGCATGTTCACATCATGTA-TGTTTGTAAC-CT--ATCAGATA-AAAAAAT-TG-TTTGCA---T--T-CTAAAA-A-G--T----TG-T--TAT--T-TC-TGT-GT-CAATAGCAC-CACCA----A-CACACTC---AAT-AAC--AAAC-A-A--TT-ATACATGCACCACTGT-CG---------------CAC----GCACAG--ACACGACA-AAC---A--ACACA-G---ACA-GAACAGA---AGACC-----A-CACA-ACAC--A---GACG--GA--T-CCAC-C-ACCACACC--AGACACA-CAC--AA------CG--ACTCAACA
gi|1 : ccttcatataatattaccaaaataaacaaatatgaaaaaagttttatgattacattcctaatattatttatcgttaactcctcgagtaattactttccgtattgcaaagggagggctaacacattgagacc-A-CAC---AGCTA-AACACAGACA-CAAC-C--CAATGTACA-CA-CACCAAACAC-TAA--CTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-AAGG------A---CT-TGT--CCCAA---TG--C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-AATGA-GA-AGT-GG--A------ACA-AATCTTTG-T-GG-----TA--CAAAA--CA--TG-C--AAATGAT-ATTTCCTCG---CACT-CA--C-ACAAATCA----------CCCA-T-C-CTG--TGAAAAC---TT--CCGGA--CA-TAGA--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTG--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAAAA---AAAATATTG-AGTACAA-A-A--CTTCATA-TTTAAAATAT-AGAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--AATAGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagatagacacagctaaacacagacacaacccaatgtacacacaccaaacactaacttgaaatgtaataagaaatgaaggacttgtcccaatgcaaaacatgaacatcagaaaatgagaagtggaacaaatctttgtggtacaaaacatgcaaatgatatttcctcgcactcacacaaatcacccatcctgtgaaaacttccggacatagatacttactgactaaataaccttgaaaatttcaatacgataaaaaaaaaatattgagtacaaaacttcatatttaaaatatagaacatccttcttatacactaaaaatccaaaatttctgacctgaatagaatttcaaagttcaggccgacatgtgctta
gi|10 : ccttcatataatattaccaaaataaacaaatatgaaaaaagttttatgattacattcctaatattatttatcgttaactcctcgagtaattactttccgtattgcaaagggagggctaacacattgagaccttaacagaattccaacttctcggaatgctatgaaagcttcagcgttcatcacttcaaaaatagaagatcttccgcgaataaaataatatatcatacatggcgagttattcgaaaattatgtcttgttgaaatgagcgaaaccaaaattgataatccccaattacacatttctccaggcagatcacaaaccagagttaattccccttggataaaatgcaagaaaagagaataaacagatcacagaaatttgatggaaaacacttgaatgattgatctcagatgaaaacatgaagttgctatttcaacaaatcatggttatgaaatgaagaagcgaatttttataaaaaaaagaagcctgaaatgcgcaataagggtctaaactcgctgcaatccttgagagagtctcacttctctgttattacaacttcttaaatttatttcaccaatgaattttgtccctaaacatctttgcttattcaaggatattcgtcttataattataataaacatttgacgtacgatgcatgtaacatctagttaagcttaatgctaaggtcaaaatataacaccataaagtaagagagaagttaaaaattgttaccaggagataatctagtccccccaaagaaaggagagcccagcagaggtcactgcagacatccttacttgacctcataaaagaaatgcttctccatctatgacacgcaactgataatcaggaaacaatgaaggtgaagcaagtgttgaaattcaaggtgacagttaaaagtaagggggaagagcaggaatcctttataatttacacattcacattactacccttggaatgaaaaaggaactaactgtgcttcgcttccactagtgaagttagaatcacatgtatgccagtatccgatcatcacggccatccacgtccctccatacagggaatacagctttcaattgcggaccgaaaggaaacccttgctgccccccatgcttcttgtgcctagcatgttcacatcatgtatgtttgtaacctatcagataaaaaaattgtttgcattctaaaaagttgttatttctgtgtcaatagcaccaccaacacactcaataacaaacaattatacatgcaccactgtcgcacgcacagacacgacaaacaacacagacagaacagaagaccacacaacacagacggatccaccaccacaccagacacacacaacgactcaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagatagTCACG-CCTC-CA-CAC-TC-ACC-C-TC-TAG----G-----ACAA--GCAA----C--AT-CTG-T-C---TTC-CT--CCACT--A--GTC-GATAACGTTTAG---A--AGTT--CACCATGTC----CAGTA-A------------------------T-C-CG-AT--AT-AAC-----GGCC---AAT--C-CC-AC-TCCCTCCATC-AAGGGA-ATTGAA-----G-CCCTTT--AA-TGGGCGG--CG---AAG-G------A--CC-TTGC--G-C-C-----AC-ACTTTTG--------------------CAT-ATTT---GTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAA--T-TG-TT-GCA---T-GT-CTAAAA-A-AGTT----TG-T--TAT--T-TC-TGT-GTC-AATAGCACACAC------AACA-AC-C---AATGAACA-AA-C-A-A--TA-ACA--TGCA-----GCACGC--------------CAT----GCACAG------GACA---------GACACG-A---ACA-GA-CAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A----CCGA-CA--C-T-AC-C-A----ACC-------GACC-G--AA------CG--AC--GACACCCAAC-AG-AAGAGACACAGAC-------AGAC---CACA--CAC-G-A---CCGACCGACA-GACACACA-CA-C--A--CAAGA-CA-GCATACACACAC---------------ACC----A-CAACAGACA--GACCTGA-CA-GACAC-A-C-ACAC------AGAAGA----C---ACA-ACCG--AGACA-C---G-ACCGACAC--AC---A-CACGA-C---CA-------CCCAC--AACAC---AGCAGAGAACC-C-GA-CA-------------CA-----CA-C-A---CAG----CA-CAGGC---AC--------------------AGATAGA-CACAGACA-GCAC--A--AA----CA-CA-CAC-AA-CAC-TAAA-CTT-GAATT-GT-AAGT-A---AG----AA--T-G-A-GG------AA--CT-TGT--C--AA---T---C--AA-AACATG-AAGC-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACG-AAACTTTG-TGGG-----TA--C-AAAA-C--ATGTC--CAATAA-TATT---TCGC-GCAC-TCA---CACAA--CC----------CCC-AT-C-TTGAACGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--T-CTT-AC-T---GA-TAATAAAC-C-TT-----CATT-TCAAT---C-GAGT-A----AAA-AAG-AAAATATTG-AGTAC---A-A--CTTCATATTTTAAGCTAT---AACATCTTCC-TTATCACA-CTAAAAAT--CCATGAAAATTTCTGA-CCT------AGAATTTCAAAG---TC-AGGCCG-AC-ATGTTGCTTA
gi|11 : taC-------GACAT-A---A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATT-AT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--CTGAA--------C-AGG--T--GAAT-TT-AGGT-AC------AATT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAG-------AGGA-AATCTG-ATA---ATTTCACA-C-TC-AA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CAC-ATGT---AGCAGTA-A------------------------T-T-TG-ATC-AT-A-C-----GGCC---C-T--C-CC-AC-TCCCTATAT--CAGGGC-AT--AA-----G-CT--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATAATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAAAAA-TG--TTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-TC-ATT--T-TC-TGT-GT-CAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAAC--AAAC-A-A--TA-AC--ATGCA--A--ACACGCNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNN--NNN-NNNNNNNN---NNNNNNNN-N---NNA-GAGCACAACCACA-C-----A-CAC--ACAC--A---CCCG---------CACTC-G----ACG--CGACCGACC----------------ACAC-ACACAAGAC-AG-CA----CACA-AC-------A
gi|12 : ttactcctacttttctctgAAGACAGACA--CACACA-CAC----AA-CA-CAC-GAACAC-TAAA-CTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAAAT-G-A-GG------AAC-TT-TGT--CC-AA---TATGC--AA-AACATG-AAAC-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTT-G-T-GG-----TA--CAAAAA-CA--TG-C--AAATGAT-ATTT-CTCT--G-ACT-CA--C-ACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAA-C---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAA-TAAC-C-TTA--AATTTT-TCAAT--ACGGA-T-------AA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-ATA--CTTCATATTTTAAAATAT--AAACATCCTTCTTTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAA-TTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCT
gi|13 : cCA-A---A-ACAAACAA-TA----A-CATG--CAG-CA-------CA-AC--AACAGACCAGAAGA----C-A-GA-CA-------------CA-----CATC-AGA-CCGACACCAACAGACGACAC-------ATCA-C-CAC---AGA-AGCAGACAGATA-TGAC-CA-CAG----C--CA-CAC-AA-CAC-TAAA-CTT-GAAA--GT-AA-T-A---AGC---AAA-TAG-C-GA------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-A-CATG-AA-T-AT--AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AAC-TTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CAGATG-C--AAATGA-TATTTTC-----GCAC-TCA--C--CAA--TC----------CCCCAT-T-CT---TGAAAAC---TT--CCG-A---A-TA-A--ATCTT-ACTT---GACT-GATGAC-C-TT----AAATT-TCAATAAAC-GA-T-------AA-A---CAAATATTG-AGTAC-AGA-A--CTTCATA-TTTAA
gi|14 : cC-AAACAC-TAAA--CT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGCCA-AGA-T-GGA-GGCGCAA-A---CC-T----TC-AC---T---CCTGA-AATA--------ATCCAG-G--A-A-TAATGAGATT-GG--AGGAACTACA-AACTTCTG-T-AGAATCATC--CATAAA-CG-TCGTC--CAATGAT-ATTTCTTCATCGCACT------CACAG--CTAGGACAAAAATCTAGC-GACTG--TGAGAACATTTT--CGG-A--CT-TA-AATTATTTGAT-TTCAGGCTAA-TAACGCATTATTAAAATT-TCAAT--AC-G--T-ATTTTGAA-ATGTAAAATATTA-GGTGC-A-
gi|15 : cTTA-A-AGTA-T-GT-C----AA-A-AT-C-T--T-TA---AA----G-CT--ATG----------------------C--TGT----TT-AAAA-A---CG-G--AAGAT-TTT--CC--G-AAT--AA-AAT-G--A-GG--TATC--------A-TA--C---AT--A-G--TTAT---A-----AT--T-ATT---G-----AT----A----ATA---T-G------TC--TTGA-G-A-T---GA--G-T--G-A-A-C-C----A-G-AATTG-tgcaaacaaacattaagatatatattctataagagtaataacacgaaatctttcatatagatagcaat
gi|16 : cagtttcgaatctcataaaaagcactttatctaagcaaagtggcaaccttcatgtattaatacaaaataatcatattgaaatattcaattttttttaaattaaatacatgtatactttttaactttacttccatattagcagatggccaagtatatcggagaccTTA-A-AGGA-C-TT-TGCCAAA-A-AT-T-CA-T-CA----A-C--A-CT--ATAAA-GTA----------------C--TATGCGGTTGAAAA-T---TA-A--AAGAC-TTG--CC-GGTCAT--AA-AAG-G--A-TG--TATC--------A-CA--C---AG--G-G-----G---G-----TT--T-ATC---G-----AA----AAC--CTA---T-GT------C--T----A-A-T---AA--G------G-A-T-T---AG-G-AATGC-A--A--T---C-------TTAA----C--T-C---A-T------T-TGTTTT--CA--G-C--ATG-TCACAAA--CA-A-GAGT-T-AATTCCCCTCCTT-GGTA-A----TT-TG-GAAA-TG-----GAAT-----AAA--AAGTC-C--CAAAA--A--TGGA-c
gi|17 : AAAA-A---TCTG--AAGAC-TTC--GC--G-AAT--AA-AAT----------TATC--------A-CA--CC--AT--G-G---------G-----GT--T-GTC---G-----AA----AA---CTA---T-G-------C--CTGA-A-A-T---AA--A-C--GGA---T-T---AG-A-AAT---G-CA--T---C--------TA-----A--A-CGTGA-T------TGT---TT--CA--G-C--A-G-TCACAAA--CA-A-GAGT-T-A-T-CCCCT--TG-G-TA-A----TT-TT-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AG-TC-CAACTGAA--T--Ttatttatagcctattattctgatcagatcatatagaaa
gi|18 : aaaaaactgcaaaaattcttaaaacaataaattactctatgcggttga-C----AA-A-AT-T-C--T-TA---AA-C--A-CT--ATTAA-ATA-C-C-----TA--TG-C---AG----TTGAAAA-A---TT-G--AAGAC-TTG--C---G-AAT--AA-AAG-G--A-TG--TATC--------A-CA--C---AT--G-G--A--G---G-----TT--T-ATC---G-----AA----A----ACA---T-G------TC--CTGA-A-A-T---AA--A-G--G---A-T-T---AG-A-AATGC-A--A--T---C-------TTA--------A-C---G-TCATTTGT-T---TT--CA--G-C--A-G-TCAC--AAACA-A-GAGT-T-A-TCCCCCA--TT-GGT---A-A-TT-TT-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AT-TC-C-A------------AA-ATG-G--AGTTAA-AG-T-C--TAT-T---A-----------TT--TTG--A-T---TC-AG-A-atagcctaattattctgatcaagaaatcaagttatagaaa
gi|19 : gACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGGA--AAA-T-G-A-GG------AA--CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AGCATT-AA-T-ATC-AG-G--A-A-TGA-GA-ATT-AG--A------ACA-AACTatcaattataga
gi|2 : AAAA-G---TA-ATTATGAT-TTC--ACGCG-AAT--AATAAT-G--A--A--TAACGGT-----A-TA--C---ATC-G-G--C--G---AAGTT-GT--T-ATT---GTGAGTAATAC-A----TTAAAAT-GC-----TC--TTAA-A-AAT---GA--AAC--GGATA-C-C---AA-A-A-TTG-A-TGATT---CGACCCAAT-A-----C--A-C---A-T------T-T---TC--CACAG-C--A-G-TCAACACAACGCA-GAGT-T-A-TTCCCCT--TT-GGTA-AATA-TC-CA-GAAAATC-----GAAT-----AAA--AA-TC-C--CAGAA--T--T--A-ATG-G------AA-AC-A-C----T-G---A-----------CT--TTG--A-T-TACC-AG-A-T-GAAAA-A----A-A--TGA---AG-T------TGTA-TT--CAAATATGAAA-C-T--G--GTATGC--AAT-AGACCAA-G-AGG--AT-C--TTATT----ATATCTAATA-AAAGAA-A-CTTGA-A----GGCCA-GTT----AACGC-GGT-C-AGAACTTC---ATAAGCAA--TCCC-TTGCAAGAT-G---TCTTTAGCTGGATCGTGTTCGC-----T-G--TGTAAAA-AT------------AC--ATT-T-CTAAAAAT-TTAGA-A-T---TCCTCA--C-CAAG-GAC-A-TT----------------TAT--ccgaaaatcagaaataatcacagcacctggaaagtgtaatttatcataatttaagcttacaaatatctataatctgcaatttcgatatccttcatgaccgttacaggcgttgcgtcccacacatgttgtcagggaactattgacactggccggttccatagataaatggt
gi|2 : acgaattctaaatgacaaaaaA-----A--A---------TTTGGTACG--T-C----TGTCATC-CG-TAA-CTCTA-GAT-TAG--CT-ATAATGT--AG-G---GAAA--------CATACTCAACCA-C-ACC--ATCCAA---GGT--A-----GATGTTATGAAGTT--A-AAA--TG-T-AC-C--AAGGT------GAT----A-TAAAT-C-T-TATCACCTAACCACAA---AG-------AAAGGAGAAGCCAG-CAG-A-GGTCTA-C--CTCGTCA---AACGATCAT-T--CTTATTC-CATCC---TGCCAC-------GTCAT-AAT-A---AGGAAGAT-G--GC---T-CTCCATATATACGACAATC-C-ACTAGC-TATCCATCCCAG----GAAAACCCAAAATTTGGA--GTGAAAGAAAAAAC-AGG--T--GAAT-TC-AGGT-ACAATGCTAGTT-A-AAGATGGAGAG-GGGGAGGA-AAGCAGGACAATCTTCATACCCATCCC-CC-C-CC-CA-TAC-tatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatataaaatttggtacgtctgtcatccgtaactctagattagctataatgtagggaaacatactcaaccacaccatccaaggtagatgttatgaagttaaaatgtaccaaggtgatataaatcttatcacctaaccacaaagaaaggagaagccagcagaggtctacctcgtcaaacgatcattcttattccatcctgccacgtcataataaggaagatggctctccatatatacgacaatccactagctatccatcccaggaaaacccaaaatttggagtgaaagaaaaaacaggtgaattcaggtacaatgctagttaaagatggagagggggaggaaagcaggacaatcttcatacccatcccccccccatacaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagtggaaggaaataggaaggaactaacactaatcctcctcccacctatgatgaacgttgtggaaatatgcacaatgtcagcagtgaatgtctgtttgaccaaattactattccgatccatactagatgacccatttcccacctcccttcctatcagaaaaaaacagctggttaaatcgccgcgcccaaacgcgacacgccttgcctgtcgcccatgcttctgtgcggccatactgtccagtcatttatgtttgtacctcttcaataaaaaaatgttttgcgaattgtgctaaaagagtctcgtgcatttattctgtcgtcaattagcaccatataacaacacagcaatgacagagacatatctaacgaggcacgggcagaccctctttcacaaaaagaggcggctcaagtacacgattcaagaacagaccactacaagaccaagggacagatcacagcatcacacatcacaggatagaacagacacaattggtgaaacagcaagaaaaatacctcggataaatacacaacatcctagatcagactagagcagatccgaacaacacaacacagaccagaacatcgtacccgatgacacgagggccacagacagacacacagttcacatacacgacacacacctacagacgcaagcacaggacataaatcatagacaaaagacagacaccaagtatgataatcacatgaggttgaaaaaaatattctaaaagaccacacaaccacaacttgtaatcgtgagaagaggaaaataaagagcgaaactctgtactcaatccaaaagcatgaataatcagaaatgaaattggataacaaacttttgatgatacaaacaatcagaaataatctact
gi|2 : acgaattctaaatgacaaaaaaaaagtaattatgatttcacgcgaataataatgaataacggtatacatcggcgaagttgttattgtgagtaatacattaaaatgctcttaaaaatgaaacggataccaaaattgatgattcgacccaatacacattttccacagcagtcaacacaacgcagagttattcccctttggtaaatatccagaaaatcgaataaaaatcccagaattaatggaaacactgactttgattaccagatgaaaaaaatgaagttgtattcaaatatgaaactggtatgcaatagaccaagaggatcttattatatctaataaaagaaacttgaaggccagttaacgcggtcagaacttcataagcaatcccttgcaagatgtctttagctggatcgtgttcgctgtgtaaaaatacatttctaaaaatttagaattcctcaccaaggacatttattatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatata-TGGA-A-G-----GAAATAGGAAGGAACTAACACTAAT-C---CTC-CTC-CCACC-TATGATG-AAC---GTT--GTGGA--AATATGCACAATGTCA-G-CAGTG-AATGTCTGTTTGACCAAATTACTATT-C-CG-ATCCAT-A-CTAGATGACCC--A-TTTC-CC-ACCTCCCTTCCTATCAGAAA-AA--AACAGCTG-GT--TA--AA-TCG-CCG--CGCCCAAACGCGACACG--CC-TTGCCTG-T-CGCCC-AT-GCTTCTGTGCGGC-CAT-AC-TGTCC-AGTCATTTA-TGTTTGTACCTCT---TCA-AT--AAAAAAA-TGTTTTGCGAATT-GTGCTAAAAGA-G--TCTCGTG-C--ATTTAT-TC-TGTCGTCAATTAGCAC-CATATAACAA-CACAG-C---AATG-ACAGAGAC-ATATCTA-ACG-AGGCACGG--GCAGAC--------------C-CTCTTTCACAA--AAA-GAGGCGGCTCAAGTACACG-ATTCA-A-GAACAGA--C----C-----A-C-T--ACAA--G---ACCAA-G----------------------GGACAGATCAC--AG------CATCACACATCACAGGAT-AGAACAGA-CACA-ATTGGTGAAACAG---CA-AGAAAAAT-A---CCT-CGGATA-A--ATACA-CAAC--ATCCTAGATCAGAC-TAGAG-CA----------GATCCG-------AACAACACA-A--CACA-GACCA-GA-AC-ATC-GTACCCGATGACACGAGGGCC---ACAGACAG--ACACACAGTTC-ACATACAC-GAC---A-CACAC-CTA-CA-------GAC-----GCA----AGC--A----C-AGGA-CA-------------TAAAT--CA-T-AGA-CAAAA--GA-CAGAC---ACCAAGTATGATA-ATCACATGAGGTTGAA-AAAAATA-TT-C-TA-AAA----GACCA-CAC-AACCAC----AACTT-GTAATCGT-GA-G-A---AGAGGAAAA-T-A-A-AGAGCGAAA---CTCTGTACTC-AA---T---CCAAA-AGCATG-AA-TAATC-AG-A--A-A-TGA--A-ATT-GGATA------ACA-AACTTTTGAT-GA-----TA--C--AAA-CA-AT--CAGAAATAATaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagtggaaggaaataggaaggaactaacactaatcctcctcccacctatgatgaacgttgtggaaatatgcacaatgtcagcagtgaatgtctgtttgaccaaattactattccgatccatactagatgacccatttcccacctcccttcctatcagaaaaaaacagctggttaaatcgccgcgcccaaacgcgacacgccttgcctgtcgcccatgcttctgtgcggccatactgtccagtcatttatgtttgtacctcttcaataaaaaaatgttttgcgaattgtgctaaaagagtctcgtgcatttattctgtcgtcaattagcaccatataacaacacagcaatgacagagacatatctaacgaggcacgggcagaccctctttcacaaaaagaggcggctcaagtacacgattcaagaacagaccactacaagaccaagggacagatcacagcatcacacatcacaggatagaacagacacaattggtgaaacagcaagaaaaatacctcggataaatacacaacatcctagatcagactagagcagatccgaacaacacaacacagaccagaacatcgtacccgatgacacgagggccacagacagacacacagttcacatacacgacacacacctacagacgcaagcacaggacataaatcatagacaaaagacagacaccaagtatgataatcacatgaggttgaaaaaaatattctaaaagaccacacaaccacaacttgtaatcgtgagaagaggaaaataaagagcgaaactctgtactcaatccaaaagcatgaataatcagaaatgaaattggataacaaacttttgatgatacaaacaatcagaaataatctact
gi|22 : acgaattctaaatgacaaaaaaaaagtaattatgatttcacgcgaataataatgaataacggtatacatcggcgaagttgttattgtgagtaatacattaaaatgctcttaaaaatgaaacggataccaaaattgatgattcgacccaatacacattttccacagcagtcaacacaacgcagagttattcccctttggtaaatatccagaaaatcgaataaaaatcccagaattaatggaaacactgactttgattaccagatgaaaaaaatgaagttgtattcaaatatgaaactggtatgcaatagaccaagaggatcttattatatctaataaaagaaacttgaaggccagttaacgcggtcagaacttcataagcaatcccttgcaagatgtctttagctggatcgtgttcgctgtgtaaaaatacatttctaaaaatttagaattcctcaccaaggacatttattatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatataaaatttggtacgtctgtcatccgtaactctagattagctataatgtagggaaacatactcaaccacaccatccaaggtagatgttatgaagttaaaatgtaccaaggtgatataaatcttatcacctaaccacaaagaaaggagaagccagcagaggtctacctcgtcaaacgatcattcttattccatcctgccacgtcataataaggaagatggctctccatatatacgacaatccactagctatccatcccaggaaaacccaaaatttggagtgaaagaaaaaacaggtgaattcaggtacaatgctagttaaagatggagagggggaggaaagcaggacaatcttcatacccatcccccccccatacaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagTA---T-GT------C--TTGA-A-A-T---GA--G-C--AGA-A-C-C----A-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAA-TA-----CAAA-C---A-T------T-T---TC--CA--G-C--A-G-TCAC--AAACC-A-GAGTAT-A-TT-CCCT--TG-GTTA-AA-A--T-CA-GAAAAAGAAAATGAATTAACCAAT--AA-TC-A-GCAGAA--T--TGAT-GTG-T--A---AA-ctact
gi|23 : TC-CTT-CCACC-CA--ATG-A-------T--C---C--AG--------ATGT------AGAA-C------------------------T-C-CA-ATC-AT-A-C-----TGCC---C-T--C-AC-AC-TAC-TCCAT--CTGGGA-AT--AA-----ATAC--TTT-AA-TGG-CCG--GG---AAA-G-AA---A--CA-ATGC-TG-C-A-CCA-AT-GCTTCTGCG--GT-A-T-GC-TGTTC-Cct
gi|24 : aaccaagta------T-T---TT--CA--G-C--A-G-TCAC--AAACA-A-AAGT-T-A-TCTCCCT--T--GGT---A-A-TT-TT-GAAAAT------GAAT-----AAA--AG-CC-C-A---AA--A--TGGA-AT--T--A---AA-TC-A-T--A-T-T---A-----------TT--TTG--A-T---TC-AG-A-t
gi|25 : tg-GAGT-T-A-TCCCCCT--TG-GC----A-A-TT-TT-GAAAATG-----AAAT-----AAG--AG-TC-C--CAAAA-----TGAA-atcaattttag
gi|26 : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TA-----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TT---CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TT--TATgcttagacctaccgggtagctattgttttgattcagaatcaaaatta
gi|27 : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TC---AA-A---TA-G--AAGAT-TT---CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TT--TATC--------
gi|3 : TTA-A-AGAAAT-TT-C----AA-C-AT-T-C--TGCG---GA-T--G-CT--ATGAAAGTA-G-CG----CGGCTT-CGGTAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AT-AAT-G--A-TAAGTATC--------A-TA--C----T--G-G--T--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-AGC-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-T------T-T---TC--CA--G-C--AAG-TCACAAAAACC-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTATAA-A-TC-CA-GAAAAAG-----GAAT-----AAA--CA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTGTTA-T-T-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A---GA---AGTT------TGTT-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AATAG----AA-GGAGG--AAAT--TT-TT----ATA---AAAATAAAAGA-A-C-TGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---AATT------------ACA-A-T-T-CT-AAAAT-TT----C-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TG---C-------TA-AAC-A---TT-GCTTTG-C--ATAGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A------------TTTG--ACG--T-C----TG----C-TG-TAA-ATCTAAG-T-TAG--TTTA--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGT---A-AA---TG-T-ACACG-AAGGGA-----GAT----A-TAA-TGC-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCA-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCA--A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCAATTATT-GACA--T-C-ACTCGACTA---ATC--AG----GAA----CAA----TG-A--GTGAAG-------C-AAGAGT--GAAT-T--AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGATAG--AGGA-AATCCT-GTATAAATTTCACAAT-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TAATGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACTCTA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTTATGGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TT-C-TG-C-C-CCCAAT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TG-TTGTA----TAAATCA-AT--AAAAAAT-TG--TTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCCACG--ACGTGCTAA-----------TAC----GAACAGTAGCA-GGTACAAC---AGGACACACA---GCA-GACCAGA--CAG--C-----A-CAG--ACAC--A---ACCGATGA--CTCCAC-TAG----ATC--AGACAGACCAG--AG------CG--ACACAACACACAAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGGTACCG-ATTTCCACCCGACA-ACCACACA-CAGC--A--TCAGCCCATGCACACAC-CAC------CACGA-CCGATCCATTACCGACACACA--CACCTGA-C--GACAC-A-C-ACAC------ACACAA----C---ACAGACAG--CGACA-A---C-GCACACAC-CAC---AGTATAA-CAG-CA-------GACAC--AACA----AGCAGA----CTATGA-CA-------------CAAGATTCA-C-AGAGCAGAC--CA-CAGACT--AC-------GACA-A-CAT---AGATAGAACACTGACATGCAC-CAGCAG----CA-CATCAC-AAACACATAAAACTT-GAAAT-GT-AATT-A---AG----AAA-T-G-A-GG------ATG-CA-TGT--CC-AAAGTT---C--AA-AACATGAAA-C-ATC-AG-A--ATA-TGA-GA-ATT-GG---------ACATAACTGTTG-T-GG-----TACTCGAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTGTCTCG--GCACTTCACGCCACAA--CC----------CCCAGT-G-CTG--TGAAAAC---TTTCCCG-ACTCATTACA--TACCT-TC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTT-AAATATAAGACCAT-CTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CCCAGAGAA--TCTGAGTCT---A--AGAATTTCAAAG--TTCAAGGCCG-ACTATG-TGCTTA
gi|31 : T-ACA-CTAAAAAT--AC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTT
gi|32 : -ACA-CTAAAAATTTCC---AAAAATTCT-A-CCTG--A--AGAATTTC-AAG--TTC-AGGCCGAAC-AT
gi|4 : TTA-A-AGAA-TCTT-C----AA-C-ATAT-C--T-CG---GA-T--G-C---ATGAA-GTA-G-C-----CT--TT-C---AT----TTCAAAA-AC--TA-G--AAGAG-TTT--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TAATC---AT--G-G--C--GTACG-----GG--T-ATTTTGA-----AA----A----TTA---TTGT-----CT--TTAA-A-A-TC--GA--G-C--GAA-----C---AACA-AATTG-AATA--T---T--CC-AAT----------A-C---A-T------TAT---TC--CA--G-C--C-G-TCACAAAG-CA-A-GAGT---A-T-CACCT--TG-TTTA-AA-A-TC----GAAAATG-----AAA-------AA--AA-TCAC-AAGAAA--T--TGAA--TG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-GGGGA-----------AT--TTG--ACT-C-TCCAG-A-T-G--AA-A----A-AAATGC---AATT------T-TG-TT--CAA----GAA-TC-TG-GTAGT-TGA--AAT-G----AA-G-AGG--AC-T--TT-TTT---ATA---AAAA-A---GA-A-CCTGACAA--TGGTCC-A-T----AA-G--GGTGC-TAAAC-TC----TATGCGA--T-CC-T-G--AGAG------CT---ACT--AT----TT--------T-G--T-T---A-TT------------ACA--CT-T-CA-AAAAT-T-----A-T---T--CGA--C-CAAG-GA--A-TT----------------TGT--C-------CA-A--------T-GCTTCG-C--AGGAAT--A-T---GT--CTAC-----TTTATT--A-AATACA---A--A---------TTTG--ACGA-T-CAG--TG----C-TG-TA---TCTA-G-T-TAG--T--A--AC-T--AG-GTTCAAAACTTAAATATATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--ATAAGCGA------GAAGTT--A-AAA--TG-T-ACA----AGGGA-----GAT----AATTA-T-C-TTAGTCCCC---C----A---TA-------AAAGGA--AGCCAGCAAG-A-GGTC-AAC--TGC--CAC--GAC----A--C--CTTA--C--AT-----CGA--C-------GTCAT-A-T-A---AAGGA-AT-G--GC---TTCTCCAT--AA--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AGAGGGGTAA---CAT----TG-AT-GTGAG--------C-AGG--T--GAA---C-AG-T-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GG--AGGA-AG----GA-AATCTT----TAA--TTCACA-C-TC-CA-TACAT--ACC-CCTA-TGGA-A-GGAAGAAAAA--GGAA--ACCTAAC-CTG-T-CGTTCTC-CTTTCCACT--A--GTG-------GTT--G---ATTCGTA--CAC-ATGGCA----AGTA-A------------------------C-C----ATCCAT-A-CTG---GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCA-A-CAGG---AT--A------G-AT--TT--AA-T---CGG--CG---GAA-A--A---A--CC-T-----G-CGC-CCC-A--GCTC---TG--GC-C-T-GC-T-TTC-CATCATTTACTGTTTGTAA--CT--ATCA-AT--AAAAAATATG-TT-GCA---T-GT-CTAAAA-AAG--T----TG-TC-ATT--T-TC-TGT-GATCAATAGCAC-AAC------A-CACAC-C---A-TGAACA-ACACCA-A--TATACA--TGCATTG---CA-GC--------------AAC-------CA---AC--GACGCA-------GACACA-A-------GA-CAGA--CAGA-C-----A-CACCAACACCGA---GCCG--GACTC-CTCC-C-G----AC----GNNNNNNNNN--NN------NN--NNNNNNNNNNNNNN-NN-NN----NNNN-NN-------NNNN---NNNNNNNNNNN-N---NNN-NNNNNN-NNNNNNNN-NNNN--N--NNNNNNNNNNNNNTCCC-GAC------C-CGA-CCGACC----GAC--CACACA--CACC-GC-CC-GACCCGA-C-CGAC------ACAC-A----C---ACAGACAGACCGACA-T---CTCCCCCCCC-CCC---A-CACCA-CA--CA-------GACA---GACA----GACAGA----C-A-GA-TA-------------GA-----CA-C-AGA-CAGAC--CA-CACAC---AC--------ACA-A-AAC---
gi|4 : acataaatattaccaaataaaattattgaaaaatatgttgattcatttaagataactctcttaaataatttatatggttaaacctgggtaactacctttccgtatggcccaaggagggaagagttggaccCGA----CCCGACCGAC----CGAC------C-ACACACAC-CGCCCGA-CCCGA-CCGACA-------CACAC--A-CA----GACAGA----C-C-GA-CATCTCCCCCCCCCCCA-----CA-CCACA-CAGAC------AGAC---A--------GACA-G--AC---AGATAGA-CACAGACA-G-AC-CA-CA-----CA-CA-CAC-AAA-AC-TTAAACTTTGAAAT-GTTAA-TTA---AT----AAA-A-G-A-GG------A---AA-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AT-C-ATC-AG-AGAA-A-TGA-GA-ATTTGG--A------A-A-AACTTCTG-T-GG-----TA--CAAAAAACA---G-C--AAATGAT-ATTT-CTCG---CACT-CA--C-ACAA--CC----------CCCCAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-AA-CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAA-TAAC-C-TTA--AA--TTATCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTGGAGTAC-A-A-AAACTTCATA-TTTAAAGTATAAA--CATC-TTC-T-AT-ACA-CTAAAAAT--CC---AGAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAA----TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTttaaactttgaaatgttaattaataaaagaggaaatgtccaatcaaaacatgatcatcagagaaatgagaatttggaaaaacttctgtggtacaaaaaacagcaaatgatatttctcgcactcacacaaccccccatgctgtgaaaacttccgaacataatacttactgactaataaccttaaattatcaatacgataaaaaaaaatattggagtacaaaaacttcatatttaaagtataaacatcttctatacactaaaaatccagaatttctgacctgaagaatttcaattcaggccgacatgtgctt
gi|5 : acataaatattaccaaataaaattattgaaaaatatgttgattcatttaagataactctcttaaataatttatatggttaaacctgggtaactacctttccgtatggcccaaggagggaagagttggaccttaaagaatcttcaacatatctcggatgcatgaagtagcctttcatttcaaaaactagaagagtttcccgaataaaatgatatatcataatcatggcgtacgggtattttgaaaattattgtctttaaaatcgagcgaacaacaaattgaatattccaatacattattccagccgtcacaaagcaagagtatcaccttgtttaaaatcgaaaatgaaaaaaatcacaagaaattgaatggaaaacacttggggaatttgactctccagatgaaaaaaatgcaattttgttcaagaatctggtagttgaaatgaagaggacttttttataaaaaagaacctgacaatggtccataagggtgctaaactctatgcgatcctgagagctactattttgttattacacttcaaaaattattcgaccaaggaatttgtccaatgcttcgcaggaatatgtctactttattaaatacaaatttgacgatcagtgctgtatctagttagtaactaggttcaaaacttaaatatataacaccaaagtaataagcgagaagttaaaatgtacaagggagataattatcttagtcccccataaaaggaagccagcaagaggtcaactgccacgacaccttacatcgacgtcatataaaggaatggcttctccataagacatcactgataatcagaggggtaacattgatgtgagcaggtgaacagtacagttaaagtaaggggaggaaggaaatctttaattcacactccatacatacccctatggaaggaagaaaaaggaaacctaacctgtcgttctcctttccactagtggttgattcgtacacatggcaagtaaccatccatactgggccatcccactccctccaacaggatagatttaatcggcggaaaaacctgcgccccagctctggcctgctttccatcatttactgtttgtaactatcaataaaaaatatgttgcatgtctaaaaaagttgtcattttctgtgatcaatagcacaacacacaccatgaacaacaccaatatacatgcattgcagcaaccaacgacgcagacacaagacagacagacacaccaacaccgagccggactcctcccgacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccTTA-A-AGAA-T----C----AA-C-AT-TAC--T-CC---GATC--G-AC--ATAAC-GTA-G-CG----CG--TT-C--TAT----TGCAAAA-AAAATA-G--AAGAT-TTC------G-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-GA--C---AT--G-G-----G---A-----GTATT-ATT---G-----AC----A----ATA---T-GA-----TC--TCGA-A-A-----GA--G-C--GAA-T-CGC---TA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAAT-A-----C--A-C---AGT------T-T---TT--CA--G-C--A-G-TT-CAAAAGCA-G-GAGTGT-A-GTCCCCT--TGTAGTA-AA-AAGT-CA-GAAA-TG-----AAAT-----AAA--CG-AC-T-ACAGAT--T--TGAA--TGTG--A---AA-TA-A-C--TCT-G---A-----------AT--TTG--A-T-T-TC-C--A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------GTTA-TT--CAA----GAT-TC-TG-G---TATGA------G----AA-G-AGG--AA-T--TT-T-----ATA---AAAA-AA--GA-A-C-TGA-A---TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---A-ATGCAA--T-CCATTGC-AGAG-T---TAT----CT--AT----TT--CCTGCAT-G--T-T---A-TT------------CTA-ATT-C-CT-AAAAT-TTTA--A-T---T--TCA--CATAAGCGA--A-TT----------------TGT--C-------TA-AA------TT-GCTTTGTC--AAGGAT-----C--GT--CTCT-----CTT-TT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C----TG----C-TG-TTA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGTT-AGTGT-CAAA-----------TA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--AA----GA------GAAGT---A-AA---TG-T-AC-C--AAGGGA-----TATGCTGA-AGA-T-C-T-G----CC---CCA-AG---TT-------AAAGGAGA-GCCAG-CAG-ATGGTC-A-CGTTGCG-CACTTG-C----ATGCG-CCTA--C-TATCTCCATGA--CTCCAAGAGTTAC-A-T-ACCAAAGAA-A--G--GC---TTCTCCATT-AT--GA-A--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAAA---TG-A--GTGAA--------C-AGG--T--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGAG-GAA-AG--AGGA-A-TCTT-A---GAATTTCACA---TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--A-CTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTG-AA----GTTA-G---A--AGT---CAC-ATGT---AGCAGTA-A------------------------T-CGCG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CCCAC-TCCCTCCAT--CAGGGA-AT--AA-----A-GCT-TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-A-GG---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT----AAAAT-TG--TTG-A---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-TTCATT--T-TCTTGT-GT-CAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAAC--AAAC---A--TA-AC--ATGCAC----GCACG---------------CAC----GCACAG--ACA-GACA-AAC---AGAACACA-G---ACA-GACCAGA--CAGA-C-----ATCAC--ACAC--AC--AC--A-CA--C-CCAC-C-C----AGC--CGACCGACC----GA------C---ACACAACACGAGAC-AG-AC---------AC-------AC----------ACACCG-A---CCGACCGACACACCACACATCAG---A---CAGGACACACACACACACACAGAGAGC-AGA-CCGACC----A--GACACACAATTACC-AA-TA-GACA--G-C-AGAC------A---GA----C---AC-----------CA-A---C-ACACACA--CAC---A-C---A-CAG--A-------G-----------------AGA----C-A-GACCC-------------CA-----CA-C--------AC--CA-CACAC---AG-------AATAGA-CAC---AGA------GCAGACA-ACA--CA-C-A----CA-CA-CAC-AAACAC-ACAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGA---AAA-T-G-A-GG------AACTTT-TGT--CC-AA---T---C--AAGAACATG-AA-C--TC-AGAA--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AAC-TTTG-T-GG-----TA--CATAAA-C--ATG-CA-AAATGAATATTTTCT-G--GCAC-TCA---CACAA--CA----------CCCCATAG-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A---ACTT-AC-T---GACCTAATAAC-C-TT----AAATT-TCAAT--AC-GA-TAA----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAA-ATATAAACATCCT---CTATAACATCTAAAAAT--CC---AAATATTCTGA-CCTGCAA--GGAATTTCAAAAGTTTC-AGGCCG-AC-AT--TGCTTA
gi|6 : TTATA-AGAT-T-TTAC----AA-C-AT---C--T-CG---GA-T--G-CTGAATGAA-GTA-GGC-----CG--TT----TAG----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTCTTCC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TAC-TATTTATGCGAAA-TA--C---AT--T-GAAC--GTAGA-----GT--T-ATT---G-----AACTAGA----TTA---T-GT------CAGTTGA-ATA-TTTGGA--G-CTAGAT-A-C-CTACAA-A-AGATC-A-TT--TTCAC--CCCAAATATTCTCC--A-C---A-T------T-T---CA--CA--G-CCAA-G-TCACAAG---C-A-GAGT-TTA-TTTTTCT--TTTGGTA-AA-A-TTTCA----AATG--------------AAA--AA-CC-----AGAA--T--TAAACATG-GTTA---AACAC-A-CCAT-T-A---AGACAACAACTTAT--TAG--A-TAC-TC-AG-AGTAG--AA-ATAGAA-A--TGACATAGTT-------GTA-T---CTA----GAGATC-TGTG--ATATGA--AAT-G----AACG-AGG--CA-TACTT-TTCTCAGTA---AAAACAAAGAAGA-CCTGA-AAGTTGGCCA-G-TTCGGAA-G--GGT-CCTAAAC-TT---ATGTGCAACTT-CC-TTT--GGAG-----TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--C-C---A-TTCATCGT------ACATACT-TTCTCAAAAT-CTTGCTA-TCTAT--TCAGCC-CAAA-GGCAA-TTCTTGTTAATAGCCGCATAT--T-------TACAACCA---TT-GCTTCTTA--AAGGAT--A-T---GT--CTCT-----TTAATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-T-A-ATCTA-G-TGTAG--TTAA--ATGT--AG-G--CATAA--------TA-A-------A-CAACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAG-T--A-AA---TG-TCACAA--AAGGGA-----GA-----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-A-----A-------AAAGGAG-AGCCCAGCAG-A-GGTC-A-C--T--G-CA---GATCTAAAT-CAGCTTA--CTTAT-----TGG-AC-------GTCAG-A-TAA---AAGAA-AT-GGAGC---TTCTCCA-TTAT--G-CA--T-C-ACT-GA-TT---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-AGGGTGGA--------CTCAG-GT--GAATGTC-AGGTGAC------AGTT-ACAAG-T--AAGGTGGAGAGGA-AG--AGGATAATCTT-AT---AATTTCACA-C-TC-CA-TAC-TTAACC-C-TG-TGGATA-G-----AAAA--GGAA--AACAAAC-CTG-T-C---CTC---T-CCACT-TA--GTG-AA----GTTG-G---A--AGT---CA-CA-GCTA--GCAGTAGA------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-CG----GGCCAAAA-T--CACC-AC-TCCTCGCATC-GAGGGACAT--AA-----C-GT--TTA-AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CCGTTGC-TG-C-C-CCC-ATCGCTTCTGTG--GCAC-T-GC-TGTTC-CATCA-TTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-ATAAAAAAAAT-TG--TTGCA---TGGT-CTAAAA-ATG--T----TGTT--ATT--T-TC-TGTGGTCTAATAGCAC-CAT------A-CAC-C-C---AATGAAC--AAAC-A-A--TT-AAA-CTGCATC---GCACG---------------CAC----AGACAG--ACA-GACAAAAC---A-GACACA-A---ACACGACCAGA--CAGA-CCCACAA-CAC--ACAC--ACACACCAC-GC--C-ACAC-C-G----ACCCAAGACAG--CAGGCAAGACAGCCG--ACA-GACACAC-ACAAG-ACGA--CACACAC-------ACACCCGCACGGACACCACA---CCA-CTACCG-AC--CACA-GAGCCAA--CCAGACAGCTCACATGC-ATC------C-CGA-CAGA------GACAACACAGA--CA---GA-CACGACAC-A-CAACAG------ATACGAC---C---ACAG-------GACAGA---C-ACACACACACAC---A-CACGACCAC-CACACGACCGACACCGAACAC---AGCAG-----C-C-GA-CACCCCCCCCC----CA-----CACC-ACA-CAG----CA-CAGAC---A--------GACA----AC---AGAT---ACA-AGACA-GCAC------A----CA-CA-CACAAAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-AAAGAA----AAA-T-G-A-GA------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--NN-NNNNNN-NN-N-NNN-NN-N--N-N-NNN-NN-NTT-------------------TTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-
gi|7 : TTA-A-AGA--T-GT-C----AAAC-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGA--GTA-GGC-----CAA-TT-C--TAT----TCAGAAA-A---TA-G--A-GAT-TTC--C---G-GAT--AA-AAT-G--AGTA--TATC--------A-TA--C---AT--G----C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----AA---TTA---T-GT------C--TTGA-A-T-T---GA--GGC--GAA---C-C---AA-T-AATTG-A-TAA-T---CGTCCCAAATAT----C--AGC---A-T------T-T---TCTCCA--G-C--A-G-TCACTAAAACC-A-GAGT-T-A-TTCTCTT-----GGTA-AT-A-AT-CA-GAAA-TG-----AGAT-----AAA--A---T-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-AAC--T-T-G---A-----------AT--TTG------T-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT-------GTAATT--CAAT---GAAATC----A--GTATGATAAAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT-----TA---AAAA-A---GA-A-CCTGA-A---TGGCCAAG-T----AA-G--GGT-C-TAA-C-TC-----ATGTAA--T-CC-TTG--AA---G---TCT---AC---AT----T---C-----T-G--T-----A-TT------------ACA--CT-T-CT-AA--T-TT------T---T--TCA--CGCAAG-GGT-A-AT----------------TGT--CC------TA-TAC-A---TT-GCTTTGTC--AAGGAT--AATC--AT--CCTC-----TTTATTTAA-AGTA-----T--A---------ATTG--ATG--T-C-G--TG----C-TG-TAA---TTA---T-TAG--T--A--AT-T--AG-GT-CAAAA--------TATA-------ATC-ACC--A---AAAA-GTA--A-----GA------GAA--T--ACAA---TG-T-ACAT--AGGGCA-----GAT----A---A-T---T-AGTCCCC-----A-AA---GA-------AA-GGAGA-GC--AGCGA-C-GGTC-A-C--TGC---A---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA--C-------GT-GC-A-T-A---AAGA---T-G--GC---TT-TCCATTT----GCCA--T-C-A-T-GA-TA---AT---AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AAG-----------------------------T-A-AAG-T--AAGG-GGG-AG---AG--AGGA-AATCT----ATAA--TTCACAAC-TC-CA-TAC-T--ACCTC-TA-TGGA-A-------AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTGGAA----GTT--G---A---GT---CAC--TGT----ACAGTA-A------------------------TGC-CGGATC-A--A-C-----GACC---A-T--C-C--A--TCCCTTCATA---GGGA-AT--A--------GC--TT--AAATGG-CGG---A---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-C---AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATAATTTA-TGTTTGTA---CT---TCA-AT----AAAAT-TG-TTTGC----T-GT-CTAAAA------T----TG-T--CCT--TGTC---T-GTC--ATAG------C------A-CACAC-CTAAAATTATCA-AAAtcagaaata
gi|8 : ctcctacttttctcagcgcagttttcgaatcgtaaaaggcctcatttaagtgcagattggcccaccgttcatataatttacaaaataaacaatattgaaaatattttgatatcctaaatactccttaatatattttatacgtgttactggtaactttactttcgtatgaagggaggtaaattggacA-G-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--GGCT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TTAC--TGT----T-CAAAA-AAG-TA-G--AAGAT-TTC--C-----AATTAAA-AATTG--A-TA--TATC--------AGTAG-C---AT--GTG--C--G---ACATTAGT--TGATT---GC----AA----A----TTA---T-GTGCGATTC--TTGA-A-A-T---GAATG-C--GAA-A-C-C---AA-ATAGTTG-AATA--T---C--TCCAATAC-----C--ATC---A-T------T-T---TTT-CA--G-C--A-G-TCACAAACGCA-ACGAGT-T-A-TTCCCTT-----GGTA-TATA-TT--A-GAAAATT-----AAA-------AA--AA--C-C-ACAGAA--CACGGAA-ATA-G--A---AA-ACCA-C--T-T-G---A------------T--TTG--A-T-T-CC-AGGA-T-G--AATA----A-A--TGA---AGTTGATTAGTGTA-TTGTTAA----GAAATC-TT-G--GTATGA--AAT-G----AA-A-AGA--AT-C--TT-TT----ATA---AGAA-AA--GA-ATCCTGA-AA--ATGCCA-G-T----AA-A--TTT-C-TAAAC-TCATTGTCTGCAA--T-TC-TCT--TGAG-GTATTCTG--ACTTAGT----TT--C-----T-GTTT-T---A-TTTTGTACCCCACCACA-CCTAC-CT-AAGAT-TT----A-T---T--TCAAGC-CAAG-AT--A-AT----------------TGT--TAATGCCATA-ATC-A----T-GCTT-GCCGGAAGCAT--G-TTCGGTTGCTCTCGGTATTTAGC--G-AATATCCTGA--AGACATGAATTTTG--ACGCCT-C-GTCTG----C-TG-TGA-ATCTACG-T-T-T--TT-A--CTG----G-GT-TAACG--------TGTT-------G-C-ATT--A---AACAGATA--C-----GA------G-AGTTTCA-AA---TG-T-----------GA-----GAT------TAA-T-TAT-A----CA---CCA-GATATGA-------AAAAGAGagctgaatagggtcttagattctaagaatagaacgtgagaacaatatgcgtgaactgcaagttatacgttctaaaacagtttaaccaaaacaaacaataacatgcagcacaacaacagaccagaagacagacacacatcagaccgacaccaacagacgacacatcaccacagaagcagacagatatgaccacagccacacaaca
gi|9 : cgctagcttatccatctcctacttttctcgcgaagtgacagttcttttctgtaatcctggcataaaaggcactttcattcaatgctagatgtgccaacccttcatatagtatatgtaccaaataaacatagttaattttgagaaaagtcatatttataatttcatttaaatactctcttaatatatgtatgatgtttaacctctctggtttaaacaccgttattatctaattacggtttctaattataggacgataaaggcagagcgcctattgagattcctaaa-A-AGAA-TGTT-C----AA-CCAT-T-TCAT-CGATGGA-CTGG-CT--AT--A-GTATG-A-----CG--TT-C--TAT----TCCAGAATAC--TA-G--AAGAA-TTC--TC-CG-AAT--AA-AAT-GTGA-TA--TAT---------A-TA--CGACATTGG-G--TTAG---A-----GTA-T-ATT---G-----AA----AAGTGTTA-----GT------C--TGGAGA-A-A---GA--GGC--AGA-A-C-C---AA-T-A--TGTA-TA--TT--C--CCCAAT-A-----C--A-----A-T------T-T---TC--CA--G-C--A-G-TCTCAAAA--C-A-GAGT---A-TTCCCCT--TG-G-TA-AA-A-AT-CA-GAAATTG-----AGAT-----AAA--CA-TC---ACAGAT--T--TGAA--TG-G--A---AATAC-A-C--T-TTG---A-----------AT--TTG--A-T-C--C-AG-ACT-G--AA-A----A-A--TGA---AGTA------TGTA-TT--CAA----GAAATC-CT-G--GTATG---AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----AT----AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AAG-TGGCC--G-T----AA-AGCGGT-C-TAAAC-TC-----ATGCAA--T--C-GTG--ACGA-G---TCT---ACT--AT----TT--CG----TGG--T-T---A-TT-------------CA-ACT-T-CT-AAACTCTT----ATT---T--TCA--C-CAAGAGG--A-TT----------------TTC--C-------TA-AACTA---TTGGCTTTGTC--AAGGACTAA-TC--GT--CTCTTC---TTTATT----AATA-----T--A---------TTTGA-ACG--T-C-A--TG----C-TGCT---ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-C-AAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AG---GT---A-----GA------GAAAGT--A-AA---TG-T-GTACCAGAGGGAGTAGTGAT----A-GAA-T-C---AGTT-----------A---GATCATTACAAAGGAG-AGCCA-GCAGAA-GGTC-ATC--TGCG--A---ACC----ATCC--CTTA--C-TAT-------G-AC-------G-CATGA-C-A---AAGAA-ATCG--GCCGTCTCTCCCTTTAT--GACA--T-C-A
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): CTACTTATTTCTCAGGCGAAGTTATCGGAATCACCGGTAAAAAGAGCCACTTACATAACAATAGCAGATTGGCCACCTCACTGTATACATATTACCAACAAAAATAACAATATTGAAAATATTTTGATCATTTAAATAACTACTCTTAAGTATATTATATGTTAACCCTGGTAACTTTATTATCGTCATTAGCGAGCAAAAGGGAGAAAATTG
Unaligned ( gi|21 ): GCTGCTTCCGCTAACTCTTTCTCAGCGACAGTCTTCGATCTCGGTAAAACAAGGTCATGTCATTCAATGCGCAGATGGCCCGCTTACATATAATATACCAAATAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
Unaligned ( gi|28 ): CCTCTCCTATCTTTTCTCAGCACAGTTTCGATATCCGGTAAACAAGCACTTCATCAATCAGATTGGCCACC
Unaligned ( gi|29 ): TTATATATTAATGTTAATATCCCTGAGTAACTTACTTTGTATGCAAAGGGAGGGGTAAATCTGAGAC
Unaligned ( gi|30 ): AAATGGAATAAAATTCCCAAAATGGAGTTAATGTATATTATTTTGATTCAGAATCAATTATAGAAA
Alignments
lowQualScore : 1111 1111111111111 111 1111111 11111111 333333333333333 111111111 111111111 2222222 1111111111 1111111111111111111111111 11 1111 1111 111111111111 111 22222222 11 1111 1111 1111 111 111 11 222222 11 11111 111111111111111111111111 11111 333333333333 222222 11 11111 33333333333333333333333333333 111111 22222222 11111 1111 333333333333333333 11 11 2222 1111 11 11 11111111 1111111 111 11111 111111 111 2222 11111 1111111 222222222222222222222 11 1 2222222222222222222222 11 333333333333333333 111 11 1 1111 1111 11 333333333333333333 1 111111 111 1 222222222 111 11 11111 1111 22 1111 2222222222222222222 444444444444444444444444444444444444 11111 111 11 222222222222 11 111 111 11 11111111111 11 11 111111 11 111 6666666666666666666666666666666666 111111 222222222 11111111 1 11111 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 11111111 444444444444444444444444444444 3333333333333333333333333333333333333333333333 22222 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 2222222222222222 1 2222 3333333333 111 11 111111111 11111 111111111 22 11 111 33333333 2222222222 11 1 1 111 111111 111 1 11 1 111 111111
lowQualScore : 3 3 3 6 3 6666 3 3 3 3 77 3 555 4444 3 44 3 7777777777777 3 88 6666 33 2 333 2 33 2 4444444 2 33 2 2 33 2 66 55555555 3 77 888 77 3 444444444444444 77 3 222222222 999999999 555 2 6666666 33 2 2 2 777 33 1111111111 2 555 2 2 3 2 6 9999999999999999999999999 6 555 3 888888 5 777 66 33 2 33 5 2 5 44 33 2 555 5 0 99999 2 2 5 2 7777 2 66666 66666 33 2 1111 77777 99 3 44 555 6 3 3 0000 3 666 999999999999 55 55 3 333 3 3 7 4 66 4 9999 4 66 777 11111111 4 00 3333 1 0000 666 66 4 9999 4 4 66 4 66 4 3333 777 8 222 4 4 2 4 777 4 4 9999 4 00 4 4 4 444444 66 4 4 00 66666 888888888888888888888888 4 66 00000 4 555555555555 99 4 4 8 4 666666 777 66 22 8 55555 4 66666666666666666666666666666 5 0 555555 5 888 66 11111111 66 1 99999 0000 444444444444444444 00 00 4 3333 9999 4 4 1111 8 4 4 66 00 66 1 00 4 66 66666666 4444444 4 4 66 777 333 66 55555 222222 9999 4 666 4 4 3333 0 11111 2222222 4 77777 2 3 777777777777777777777 55 77 5 5 5 0 66 4444444444444444444444 66 00 444444444444444444 66 222 777 4 4 66 777 55 00 66 4 4 0 5 888 66 0000 888 5555 5 88 777777777777777777 88888 0 444444 5 5 5 66 5 11 555 777 0 777777777 222 4 4 4 11 5 5 66 4 4 11111 66 66 1 4 4 4 8888 4 4 11 55 4 2222 0000000000000000000 888888888888888888888888888888888888 4 4 4 8 4 4 99999 111 4 55 4 4 8 44 4 55 111111111111 33 4 4 55 777 4 777777 55 4 4 4 4 4 4 4 99 4 4 4 4 4 1 4 888 888 4 222 4 77 1 777 4 4 00000000000 4 55 66 4 4 8 44 4 888888 4 4 777 77 777 66 5 666 4444444444444444444444444444444444 111111 888888888 22222222 5 0 66 55 22222 5 11 66 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 888 55 5 999999999999999999999999999999999999999999999999 0000 6 66666666 0 4 0 444444444444444444444444444444 2 99 2222222222222222222222222222222222222222222222 22222 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 666666 8888888888888888 4 4 8 3 4 1 3 3 3 7 3 666 6666 3 3 3 3 4444444444 3 55 3 666 000 00 3 3 888 3 3 55 3 3 3 3 3 333333333 3 2 4 4 00000 55 2 4 888888888 00 00 444 99999999 66 1111111111 77 999 66 888 66 5 11 5 0 7777 5 5 888 0 2 5 5 888 3 5 66 5 5 888888 5 555 5 777 5 77 1 88 1 1 6 0 5 66 777 3 5 000000 66 5 5 5 5
lowQualScore : . . . . . .... . . . . .. . ... .... . .. . ............. . .. .... .. . ... . .. . ....... . .. . . .. . .. ........ . .. ... .. . ............... .. . ......... ......... ... . ....... .. . . . ... .. .......... . ... . . . . . ......................... . ... . ...... . ... .. .. . .. . . . .. .. . ... . . ..... . . . . .... . ..... ..... .. . .... ..... .. . .. ... . . . .... . ... ............ .. .. . ... . . . . .. . .... . .. ... ........ . .. .... . .... ... .. . .... . . .. . .. . .... ... . ... . . . . ... . . .... . .. . . . ...... .. . . .. ..... ........................ . .. ..... . ............ .. . . . . ...... ... .. .. . ..... . ............................. . . ...... . ... .. ........ .. . ..... .... .................. .. .. . .... .... . . .... . . . .. .. .. . .. . .. ........ ....... . . .. ... ... .. ..... ...... .... . ... . . .... . ..... ....... . ..... . . ..................... .. .. . . . . .. ...................... .. .. .................. .. ... ... . . .. ... .. .. .. . . . . ... .. .... ... .... . .. .................. ..... . ...... . . . .. . .. ... ... . ......... ... . . . .. . . .. . . ..... .. .. . . . . .... . . .. .. . .... ................... .................................... . . . . . . ..... ... . .. . . . .. . .. ............ .. . . .. ... . ...... .. . . . . . . . .. . . . . . . . ... ... . ... . .. . ... . . ........... . .. .. . . . .. . ...... . . ... .. ... .. . ... .................................. ...... ......... ........ . . .. .. ..... . .. .. ......................................................... ... .. . ................................................ .... . ........ . . . .............................. . .. .............................................. ..... ............................................................................................................................. ...... ................ . . . . . . . . . . . ... .... . . . . .......... . .. . ... ... .. . . ... . . .. . . . . . ......... . . . . ..... .. . . ......... .. .. ... ........ .. .......... .. ... .. ... .. . .. . . .... . . ... . . . . ... . . .. . . ...... . ... . ... . .. . .. . . . . . .. ... . . ...... .. . . . .
lowQualScore : 3 3 3 7 1 5555 1 1 1 1 33 1 444 1111 1 22 1 2222222222222 1 55 5555 55 7 777 7 77 7 5555555 7 77 7 7 77 7 33 44444444 1 33 555 33 1 333333333333333 33 1 888888888 888888888 000 9 8888888 99 9 9 9 999 99 8888888888 9 000 9 9 6 9 2 9999999999999999999999999 2 444 1 222222 7 999 88 99 9 99 7 9 1 88 99 7 555 3 5 99999 7 7 3 7 9999 5 77777 77777 77 7 5555 77777 44 3 66 888 7 6 6 1111 6 444 666666666666 00 00 6 666 6 6 3 4 11 4 4444 4 11 888 11111111 4 66 9999 9 9999 222 11 4 4444 4 4 11 4 11 4 9999 888 9 000 4 4 9 4 999 4 4 4444 4 66 4 4 4 000000 11 4 4 66 11111 333333333333333333333333 4 11 33333 4 666666666666 00 4 4 9 4 999999 888 11 22 9 66666 4 33333333333333333333333333333 0 4 999999 0 888 99 22222222 99 4 44444 9999 333333333333333333 66 66 4 4444 4444 4 4 8888 9 4 4 11 88 11 1 66 4 33 11111111 4444444 4 4 11 888 999 11 66666 888888 8888 4 777 4 4 4444 8 11111 3333333 4 11111 9 9 444444444444444444444 66 99 0 0 0 0 99 9999999999999999999999 99 11 222222222222222222 99 444 888 4 4 11 888 66 66 11 4 4 0 0 888 99 6666 888 6666 0 88 222222222222222222 55555 0 444444 0 0 0 99 0 66 888 000 0 000000000 444 4 4 4 99 0 0 44 4 4 11111 11 11 8 4 4 4 0000 0 0 00 55 0 5555 8888888888888888888 000000000000000000000000000000000000 0 0 0 0 0 0 55555 000 0 55 0 0 0 55 0 55 111111111111 55 0 0 55 000 0 555555 55 0 0 0 0 0 0 0 55 0 0 0 0 0 1 4 333 000 4 444 4 22 9 888 4 4 99999999999 4 00 11 4 4 9 11 4 999999 4 4 888 22 111 99 0 444 5555555555555555555555555555555555 111111 444444444 11111111 0 8 99 11 55555 0 99 99 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 000 66 7 222222222222222222222222222222222222222222222222 5555 7 88888888 2 0 8 555555555555555555555555555555 5 22 3333333333333333333333333333333333333333333333 99999 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 666666 0000000000000000 4 4 0 2 0 0 6 6 6 3 6 444 4444 6 6 6 6 2222222222 6 00 6 444 000 00 6 6 555 6 6 00 6 6 6 6 6 111111111 6 6 0 0 00000 55 3 0 666666666 33 11 444 55555555 99 9999999999 00 444 99 888 99 0 99 0 0 6666 0 0 888 4 6 0 0 111 4 0 99 0 0 999999 0 666 0 111 7 99 4 88 0 7 7 0 0 99 555 6 0 222222 99 0 0 0 7
consensus : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-C--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-T------T-T---TC--CA--G-C--A-G-TCACAAAAACN-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTA-AA-A-TT-CA-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------TGTA-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-AAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TGT--C-------TA-AAC-A---TT-GCTTCGTC--AAGGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-TAA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGTT--A-AA---TG-T-ACAC--AAGGGA-----GAT----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCG-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCAT-A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATTTAT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AGG-GT--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGA-AG--AGGA-AATCTT-ATATAAATTTCACA-C-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACT-TA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTCA-GGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAAAAT-TG-TTTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCACCG--GCACGC--------------CAC----GCACAG--ACA-GACACAAC---AGGACACG-A---ACA-GANCAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A---ACCGA-GAC-CCA--C-C-G----ACC--AGACAGACCAG--AA------CG--ACACGACACACGAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGACACCG-A---CCG-CCGACA-ACCACACA-CAGC--A--CCAGACCGCGCACACAC-CAC------C-CGA-CCGACCGA----CGACACACA--CACC-GA-CA-GACACA-C-ACAC------ACACGA----CACAGAC-G-GACA-A---CACACACAC-CACA-CACGA-CAG-CA-------GACAC--AACA----AGCAGA----C-A-GA-CA---------C-A-----CA-CAGA-CAGAC--CA-CAGAC---AC-------GACA-A-CAC---AGATAGAACACAGACA-GCAC-CA-CAA----CA-CA-CAC-AAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-A-GG------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTTTCTCG--GCACTTCA--CCACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAATATAAAAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTA
Reference ( family-511 ) : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-C--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-T------T-T---TC--CA--G-C--A-G-TCACAAAAACN-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTA-AA-A-TT-CA-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------TGTA-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-AAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TGT--C-------TA-AAC-A---TT-GCTTCGTC--AAGGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-TAA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGTT--A-AA---TG-T-ACAC--AAGGGA-----GAT----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCG-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCAT-A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATTTAT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AGG-GT--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGA-AG--AGGA-AATCTT-ATATAAATTTCACA-C-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACT-TA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTCA-GGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAAAAT-TG-TTTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCACCG--GCACGC--------------CAC----GCACAG--ACA-GACACAAC---AGGACACG-A---ACA-GANCAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A---ACCGA-GAC-CCA--C-C-G----ACC--AGACAGACCAG--AA------CG--ACACGACACACGAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGACACCG-A---CCG-CCGACA-ACCACACA-CAGC--A--CCAGACCACGCACACAC-CAC------C-CGA-CCGACCGA----CGACACACA--CACC-GA-CA-GACACA-C-ACAC------ACACGA----CACAGACAGCGACA-A---CACACACAC-CACA-CACGA-CAG-CA-------GACAC--AACA----AGCAGA----C-A-GA-CA---------C-A-----CA-CAGA-CAGAC--CA-CAGAC---AC-------GACA-A-CAC---AGATAGAACACAGACA-GCAC-CA-CAA----CA-CA-CAC-AAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-A-GG------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTTTCTCG--GCACTTCA--CCACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAATATAAAAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTA
gi|1 : TTA-ACAGAA-T-TC-C----AA-C--T-T-C--T-CG---GAAT--G-CT--ATGAA---A-G-CTTCAGCG--TT-CATCAC----TTCAAAA-A---TA-G--AAGATCTTC--CG-CG-AAT--AA-AAT-A--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATTCG-A-----AA----A----TTA---T-GTCT---TG--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-A-TTG-A-TAA-T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-T------T-TC--TC--CA--GGC--A-GATCACAAA--CC-A-GAGT-T-AATTCCCCT--TG-GATA-AA-A-TG-CAAGAAAAGA-----GAAT-----AAACAGA-TC---ACAGAAATT--TGA---TG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------ATGATTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----ACA--TGA---AGTT------GCTA-TTT-CAA----CAAATCATG-G--TTATGA--AAT-G----AA-G-AAGCGAA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGAA-G-CCTGA-AA--TGCGCA-A-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GC-TGCAA--T-CC-TTG--AGAGAG---TCTC--ACT---T----CT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-TAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAT-GA--ATTT----------------TGTCCC-------TA-AAC-ATCTTT-GCTTATTC--AAGGAT--ATTC--GT--CT-T-----ATAATT--ATAATA-----AACA---------TTTG--ACG--TAC-GA-TG----CATG-TAACATCTA-G-T-TAAGCTT-A--ATGCTAAG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACCATA---AA---GTAAGA-----GA------GAAGTT--A-AAAATTGTT-AC-C--A--GGA-----G------A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---G--------AAAGGAG-AGCCCAGCAG-A-GGTC-A-C--T--G-CA---GAC----AT-C--CTTA--C---T-----TG--AC-------CTCAT-A---A---AAGAA-AT----GC---TTCTCCATCTAT--GACA--CGCAACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-AAGGTGAAG-------C-AAGTGTTGAAAT-TCAAGGTGAC------AGTTAA-AAG-T--AAGG-GGGAAG---AG--CAGG-AATCCT-TTATAATTTACACA-T-TCACATTAC-T--ACC-C-T--TGGA-ATG-----AAAA--AG-G--AACTAA--CTG-TGC---TTCGCTT-CCAC--TA--GTG-AA----GTT--A---G--AAT---CA-CATGTAT-GCCAGT--A------------------------T-C-CG-ATC-ATCA-C-----GGCC---A-T----CC-ACGTCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AC-----A-GC--TTTCAA-TTG-CGGACCG---AAA-G-GA---AACCC-TTGC-TGCC-C-CCC-AT-GCTTCT-TGT-GC-C-TAGCATGTTCACATCATGTA-TGTTTGTAAC-CT--ATCAGATA-AAAAAAT-TG-TTTGCA---T--T-CTAAAA-A-G--T----TG-T--TAT--T-TC-TGT-GT-CAATAGCAC-CACCA----A-CACACTC---AAT-AAC--AAAC-A-A--TT-ATACATGCACCACTGT-CG---------------CAC----GCACAG--ACACGACA-AAC---A--ACACA-G---ACA-GAACAGA---AGACC-----A-CACA-ACAC--A---GACG--GAT-CCA--C-C-ACCACACC--AGACACA-CAC--AA------CG--ACTCAACA
gi|1 : ccttcatataatattaccaaaataaacaaatatgaaaaaagttttatgattacattcctaatattatttatcgttaactcctcgagtaattactttccgtattgcaaagggagggctaacacattgagacc-A-CAC---AGCTA-AACACAGACA-CAAC-C--CAATGTACA-CA-CACCAAACAC-TAA--CTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-AAGG------A---CT-TGT--CCCAA---TG--C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-AATGA-GA-AGT-GG--A------ACA-AATCTTTG-T-GG-----TA--CAAAA--CA--TG-C--AAATGAT-ATTTCCTCG---CACT-CA--C-ACAAATCA----------CCCA-T-C-CTG--TGAAAAC---TT--CCGGA--CA-TAGA--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTG--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAAAA---AAAATATTG-AGTACAA-A-A--CTTCATA-TTTAAAATAT-AGAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--AATAGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagatagacacagctaaacacagacacaacccaatgtacacacaccaaacactaacttgaaatgtaataagaaatgaaggacttgtcccaatgcaaaacatgaacatcagaaaatgagaagtggaacaaatctttgtggtacaaaacatgcaaatgatatttcctcgcactcacacaaatcacccatcctgtgaaaacttccggacatagatacttactgactaaataaccttgaaaatttcaatacgataaaaaaaaaatattgagtacaaaacttcatatttaaaatatagaacatccttcttatacactaaaaatccaaaatttctgacctgaatagaatttcaaagttcaggccgacatgtgctta
gi|10 : ccttcatataatattaccaaaataaacaaatatgaaaaaagttttatgattacattcctaatattatttatcgttaactcctcgagtaattactttccgtattgcaaagggagggctaacacattgagaccttaacagaattccaacttctcggaatgctatgaaagcttcagcgttcatcacttcaaaaatagaagatcttccgcgaataaaataatatatcatacatggcgagttattcgaaaattatgtcttgttgaaatgagcgaaaccaaaattgataatccccaattacacatttctccaggcagatcacaaaccagagttaattccccttggataaaatgcaagaaaagagaataaacagatcacagaaatttgatggaaaacacttgaatgattgatctcagatgaaaacatgaagttgctatttcaacaaatcatggttatgaaatgaagaagcgaatttttataaaaaaaagaagcctgaaatgcgcaataagggtctaaactcgctgcaatccttgagagagtctcacttctctgttattacaacttcttaaatttatttcaccaatgaattttgtccctaaacatctttgcttattcaaggatattcgtcttataattataataaacatttgacgtacgatgcatgtaacatctagttaagcttaatgctaaggtcaaaatataacaccataaagtaagagagaagttaaaaattgttaccaggagataatctagtccccccaaagaaaggagagcccagcagaggtcactgcagacatccttacttgacctcataaaagaaatgcttctccatctatgacacgcaactgataatcaggaaacaatgaaggtgaagcaagtgttgaaattcaaggtgacagttaaaagtaagggggaagagcaggaatcctttataatttacacattcacattactacccttggaatgaaaaaggaactaactgtgcttcgcttccactagtgaagttagaatcacatgtatgccagtatccgatcatcacggccatccacgtccctccatacagggaatacagctttcaattgcggaccgaaaggaaacccttgctgccccccatgcttcttgtgcctagcatgttcacatcatgtatgtttgtaacctatcagataaaaaaattgtttgcattctaaaaagttgttatttctgtgtcaatagcaccaccaacacactcaataacaaacaattatacatgcaccactgtcgcacgcacagacacgacaaacaacacagacagaacagaagaccacacaacacagacggatccaccaccacaccagacacacacaacgactcaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagatagTCACG-CCTC-CA-CAC-TC-ACC-C-TC-TAG----G-----ACAA--GCAA----C--AT-CTG-T-C---TTC-CT--CCACT--A--GTC-GATAACGTTTAG---A--AGTT--CACCATGTC----CAGTA-A------------------------T-C-CG-AT--AT-AAC-----GGCC---AAT--C-CC-AC-TCCCTCCATC-AAGGGA-ATTGAA-----G-CCCTTT--AA-TGGGCGG--CG---AAG-G------A--CC-TTGC--G-C-C-----AC-ACTTTTG--------------------CAT-ATTT---GTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAA--T-TG-TT-GCA---T-GT-CTAAAA-A-AGTT----TG-T--TAT--T-TC-TGT-GTC-AATAGCACACAC------AACA-AC-C---AATGAACA-AA-C-A-A--TA-ACA--TGCA-----GCACGC--------------CAT----GCACAG------GACA---------GACACG-A---ACA-GA-CAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A----CCGA-CAC-T-A--C-C-A----ACC-------GACC-G--AA------CG--AC--GACACCCAAC-AG-AAGAGACACAGAC-------AGAC---CACA--CAC-G-A---CCGACCGACA-GACACACA-CA-C--A--CAAGACAGCATACACACACAC------C------------A----CAACAGACA--GACCTGA-CA-GACACA-C-ACAC------AGAAGA----CACA-ACCGAGACA-C---GACCGACAC--ACA-CACGA-C---CA-------CCCAC--AACAC---AGCAGAGAACC-C-GA-CA---------C-A-----CA-CA---CAG----CA-CAGGC---AC--------------------AGATAGA-CACAGACA-GCAC--A--AA----CA-CA-CAC-AA-CAC-TAAA-CTT-GAATT-GT-AAGT-A---AG----AA--T-G-A-GG------AA--CT-TGT--C--AA---T---C--AA-AACATG-AAGC-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACG-AAACTTTG-TGGG-----TA--C-AAAA-C--ATGTC--CAATAA-TATT---TCGC-GCAC-TCA---CACAA--CC----------CCC-AT-C-TTGAACGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--T-CTT-AC-T---GA-TAATAAAC-C-TT-----CATT-TCAAT---C-GAGT-A----AAA-AAG-AAAATATTG-AGTAC---A-A--CTTCATATTTTAAGCTAT---AACATCTTCC-TTATCACA-CTAAAAAT--CCATGAAAATTTCTGA-CCT------AGAATTTCAAAG---TC-AGGCCG-AC-ATGTTGCTTA
gi|11 : taC-------GACAT-A---A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATT-AT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--CTGAA--------C-AGG--T--GAAT-TT-AGGT-AC------AATT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAG-------AGGA-AATCTG-ATA---ATTTCACA-C-TC-AA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CAC-ATGT---AGCAGTA-A------------------------T-T-TG-ATC-AT-A-C-----GGCC---C-T--C-CC-AC-TCCCTATAT--CAGGGC-AT--AA-----G-CT--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATAATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAAAAA-TG--TTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-TC-ATT--T-TC-TGT-GT-CAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAAC--AAAC-A-A--TA-AC--ATGCA--A--ACACGCNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNN--NNN-NNNNNNNN---NNNNNNNN-N---NNA-GAGCACAACCACA-C-----A-CAC--ACAC--A---CCCG-------CA--CTC-G----ACG--CGACCGACC----------------ACAC-ACACAAGAC-AG-CA----CACA-AC-------A
gi|12 : ttactcctacttttctctgAAGACAGACA--CACACA-CAC----AA-CA-CAC-GAACAC-TAAA-CTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAAAT-G-A-GG------AAC-TT-TGT--CC-AA---TATGC--AA-AACATG-AAAC-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTT-G-T-GG-----TA--CAAAAA-CA--TG-C--AAATGAT-ATTT-CTCT--G-ACT-CA--C-ACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAA-C---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAA-TAAC-C-TTA--AATTTT-TCAAT--ACGGA-T-------AA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-ATA--CTTCATATTTTAAAATAT--AAACATCCTTCTTTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAA-TTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCT
gi|13 : cCA-A---AACAAACAA-TA-A-CATG--CAG-CA-------CA-AC--AACAGACCAGAAGA----C-A-GA-CA---------C-A-----CATCAGA-CCGACACCAACAGACGACAC-------ATCA-C-CAC---AGA-AGCAGACAGATA-TGAC-CA-CAG----C--CA-CAC-AA-CAC-TAAA-CTT-GAAA--GT-AA-T-A---AGC---AAA-TAG-C-GA------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-A-CATG-AA-T-AT--AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AAC-TTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CAGATG-C--AAATGA-TATTTTC-----GCAC-TCA--C--CAA--TC----------CCCCAT-T-CT---TGAAAAC---TT--CCG-A---A-TA-A--ATCTT-ACTT---GACT-GATGAC-C-TT----AAATT-TCAATAAAC-GA-T-------AA-A---CAAATATTG-AGTAC-AGA-A--CTTCATA-TTTAA
gi|14 : cC-AAACAC-TAAA--CT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGCCA-AGA-T-GGA-GGCGCAA-A---CC-T----TC-AC---T---CCTGA-AATA--------ATCCAG-G--A-A-TAATGAGATT-GG--AGGAACTACA-AACTTCTG-T-AGAATCATC--CATAAA-CG-TCGTC--CAATGAT-ATTTCTTCATCGCACT------CACAG--CTAGGACAAAAATCTAGC-GACTG--TGAGAACATTTT--CGG-A--CT-TA-AATTATTTGAT-TTCAGGCTAA-TAACGCATTATTAAAATT-TCAAT--AC-G--T-ATTTTGAA-ATGTAAAATATTA-GGTGC-A-
gi|15 : cTTA-A-AGTA-T-GT-C----AA-A-AT-C-T--T-TA---AA----G-CT--ATG----------------------C--TGT----TT-AAAA-A---CG-G--AAGAT-TTT--CC--G-AAT--AA-AAT-G--A-GG--TATC--------A-TA--C---AT--A-G--TTAT---A-----AT--T-ATT---G-----AT----A----ATA---T-G------TC--TTGA-G-A-T---GA--G-T--G-A-A-C-C----A-G-AATTG-tgcaaacaaacattaagatatatattctataagagtaataacacgaaatctttcatatagatagcaat
gi|16 : cagtttcgaatctcataaaaagcactttatctaagcaaagtggcaaccttcatgtattaatacaaaataatcatattgaaatattcaattttttttaaattaaatacatgtatactttttaactttacttccatattagcagatggccaagtatatcggagaccTTA-A-AGGA-C-TT-TGCCAAA-A-AT-T-CA-T-CA----A-C--A-CT--ATAAA-GTA----------------C--TATGCGGTTGAAAA-T---TA-A--AAGAC-TTG--CC-GGTCAT--AA-AAG-G--A-TG--TATC--------A-CA--C---AG--G-G-----G---G-----TT--T-ATC---G-----AA----AAC--CTA---T-GT------C--T----A-A-T---AA--G------G-A-T-T---AG-G-AATGC-A--A--T---C-------TTAA----C--T-C---A-T------T-TGTTTT--CA--G-C--ATG-TCACAAA--CA-A-GAGT-T-AATTCCCCTCCTT-GGTA-A----TT-TG-GAAA-TG-----GAAT-----AAA--AAGTC-C--CAAAA--A--TGGA-c
gi|17 : AAAA-A---TCTG--AAGAC-TTC--GC--G-AAT--AA-AAT----------TATC--------A-CA--CC--AT--G-G---------G-----GT--T-GTC---G-----AA----AA---CTA---T-G-------C--CTGA-A-A-T---AA--A-C--GGA---T-T---AG-A-AAT---G-CA--T---C--------TA-----A--A-CGTGA-T------TGT---TT--CA--G-C--A-G-TCACAAA--CA-A-GAGT-T-A-T-CCCCT--TG-G-TA-A----TT-TT-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AG-TC-CAACTGAA--T--Ttatttatagcctattattctgatcagatcatatagaaa
gi|18 : aaaaaactgcaaaaattcttaaaacaataaattactctatgcggttga-C----AA-A-AT-T-C--T-TA---AA-C--A-CT--ATTAA-ATA-C-C-----TA--TG-C---AG----TTGAAAA-A---TT-G--AAGAC-TTG--C---G-AAT--AA-AAG-G--A-TG--TATC--------A-CA--C---AT--G-G--A--G---G-----TT--T-ATC---G-----AA----A----ACA---T-G------TC--CTGA-A-A-T---AA--A-G--G---A-T-T---AG-A-AATGC-A--A--T---C-------TTA--------A-C---G-TCATTTGT-T---TT--CA--G-C--A-G-TCAC--AAACA-A-GAGT-T-A-TCCCCCA--TT-GGT---A-A-TT-TT-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AT-TC-C-A------------AA-ATG-G--AGTTAA-AG-T-C--TAT-T---A-----------TT--TTG--A-T---TC-AG-A-atagcctaattattctgatcaagaaatcaagttatagaaa
gi|19 : gACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGGA--AAA-T-G-A-GG------AA--CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AGCATT-AA-T-ATC-AG-G--A-A-TGA-GA-ATT-AG--A------ACA-AACTatcaattataga
gi|2 : AAAA-G---TA-ATTATGAT-TTC--ACGCG-AAT--AATAAT-G--A--A--TAACGGT-----A-TA--C---ATC-G-G--C--G---AAGTT-GT--T-ATT---GTGAGTAATAC-A----TTAAAAT-GC-----TC--TTAA-A-AAT---GA--AAC--GGATA-C-C---AA-A-A-TTG-A-TGATT---CGACCCAAT-A-----C--A-C---A-T------T-T---TC--CACAG-C--A-G-TCAACACAACGCA-GAGT-T-A-TTCCCCT--TT-GGTA-AATA-TC-CA-GAAAATC-----GAAT-----AAA--AA-TC-C--CAGAA--T--T--A-ATG-G------AA-AC-A-C----T-G---A-----------CT--TTG--A-T-TACC-AG-A-T-GAAAA-A----A-A--TGA---AG-T------TGTA-TT--CAAATATGAAA-C-T--G--GTATGC--AAT-AGACCAA-G-AGG--AT-C--TTATT----ATATCTAATA-AAAGAA-A-CTTGA-A----GGCCA-GTT----AACGC-GGT-C-AGAACTTC---ATAAGCAA--TCCC-TTGCAAGAT-G---TCTTTAGCTGGATCGTGTTCGC-----T-G--TGTAAAA-AT------------AC--ATT-T-CTAAAAAT-TTAGA-A-T---TCCTCA--C-CAAG-GAC-A-TT----------------TAT--ccgaaaatcagaaataatcacagcacctggaaagtgtaatttatcataatttaagcttacaaatatctataatctgcaatttcgatatccttcatgaccgttacaggcgttgcgtcccacacatgttgtcagggaactattgacactggccggttccatagataaatggt
gi|2 : acgaattctaaatgacaaaaaA-----A--A---------TTTGGTACG--T-C----TGTCATC-CG-TAA-CTCTA-GAT-TAG--CT-ATAATGT--AG-G---GAAA--------CATACTCAACCA-C-ACC--ATCCAA---GGT--A-----GATGTTATGAAGTT--A-AAA--TG-T-AC-C--AAGGT------GAT----A-TAAAT-C-T-TATCACCTAACCACAA---AG-------AAAGGAGAAGCCAG-CAG-A-GGTCTA-C--CTCGTCA---AACGATCAT-T--CTTATTC-CATCC---TGCCAC-------GTCAT-AAT-A---AGGAAGAT-G--GC---T-CTCCATATATACGACAATC-C-ACTAGC-TATCCATCCCAG----GAAAACCCAAAATTTGGA--GTGAAAGAAAAAAC-AGG--T--GAAT-TC-AGGT-ACAATGCTAGTT-A-AAGATGGAGAG-GGGGAGGA-AAGCAGGACAATCTTCATACCCATCCC-CC-C-CC-CA-TAC-tatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatataaaatttggtacgtctgtcatccgtaactctagattagctataatgtagggaaacatactcaaccacaccatccaaggtagatgttatgaagttaaaatgtaccaaggtgatataaatcttatcacctaaccacaaagaaaggagaagccagcagaggtctacctcgtcaaacgatcattcttattccatcctgccacgtcataataaggaagatggctctccatatatacgacaatccactagctatccatcccaggaaaacccaaaatttggagtgaaagaaaaaacaggtgaattcaggtacaatgctagttaaagatggagagggggaggaaagcaggacaatcttcatacccatcccccccccatacaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagtggaaggaaataggaaggaactaacactaatcctcctcccacctatgatgaacgttgtggaaatatgcacaatgtcagcagtgaatgtctgtttgaccaaattactattccgatccatactagatgacccatttcccacctcccttcctatcagaaaaaaacagctggttaaatcgccgcgcccaaacgcgacacgccttgcctgtcgcccatgcttctgtgcggccatactgtccagtcatttatgtttgtacctcttcaataaaaaaatgttttgcgaattgtgctaaaagagtctcgtgcatttattctgtcgtcaattagcaccatataacaacacagcaatgacagagacatatctaacgaggcacgggcagaccctctttcacaaaaagaggcggctcaagtacacgattcaagaacagaccactacaagaccaagggacagatcacagcatcacacatcacaggatagaacagacacaattggtgaaacagcaagaaaaatacctcggataaatacacaacatcctagatcagactagagcagatccgaacaacacaacacagaccagaacatcgtacccgatgacacgagggccacagacagacacacagttcacatacacgacacacacctacagacgcaagcacaggacataaatcatagacaaaagacagacaccaagtatgataatcacatgaggttgaaaaaaatattctaaaagaccacacaaccacaacttgtaatcgtgagaagaggaaaataaagagcgaaactctgtactcaatccaaaagcatgaataatcagaaatgaaattggataacaaacttttgatgatacaaacaatcagaaataatctact
gi|2 : acgaattctaaatgacaaaaaaaaagtaattatgatttcacgcgaataataatgaataacggtatacatcggcgaagttgttattgtgagtaatacattaaaatgctcttaaaaatgaaacggataccaaaattgatgattcgacccaatacacattttccacagcagtcaacacaacgcagagttattcccctttggtaaatatccagaaaatcgaataaaaatcccagaattaatggaaacactgactttgattaccagatgaaaaaaatgaagttgtattcaaatatgaaactggtatgcaatagaccaagaggatcttattatatctaataaaagaaacttgaaggccagttaacgcggtcagaacttcataagcaatcccttgcaagatgtctttagctggatcgtgttcgctgtgtaaaaatacatttctaaaaatttagaattcctcaccaaggacatttattatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatata-TGGA-A-G-----GAAATAGGAAGGAACTAACACTAAT-C---CTC-CTC-CCACC-TATGATG-AAC---GTT--GTGGA--AATATGCACAATGTCA-G-CAGTG-AATGTCTGTTTGACCAAATTACTATT-C-CG-ATCCAT-A-CTAGATGACCC--A-TTTC-CC-ACCTCCCTTCCTATCAGAAA-AA--AACAGCTG-GT--TA--AA-TCG-CCG--CGCCCAAACGCGACACG--CC-TTGCCTG-T-CGCCC-AT-GCTTCTGTGCGGC-CAT-AC-TGTCC-AGTCATTTA-TGTTTGTACCTCT---TCA-AT--AAAAAAA-TGTTTTGCGAATT-GTGCTAAAAGA-G--TCTCGTG-C--ATTTAT-TC-TGTCGTCAATTAGCAC-CATATAACAA-CACAG-C---AATG-ACAGAGAC-ATATCTA-ACG-AGGCACGG--GCAGAC--------------C-CTCTTTCACAA--AAA-GAGGCGGCTCAAGTACACG-ATTCA-A-GAACAGA--C----C-----A-C-T--ACAA--G---ACCAA-G----------------------GGACAGATCAC--AG------CATCACACATCACAGGAT-AGAACAGA-CACA-ATTGGTGAAACAG---CA-AGAAAAAT-A---CCT-CGGATA-A--ATACA-CAAC--ATCCTAGATCAGAC-TAGAG-CA----------GATCCGA---A----CAACACA-A--CACA-GACCA-GA-ACATC-GTACCCGATGACACGAGGGCCACAGACAGACACACAGTTCACATACAC-GACA-CACAC-CTA-CA-------GAC-----GCA----AGC--A----C-AGGA-CA---------T-AAAT--CA-TAGA-CAAAA--GA-CAGAC---ACCAAGTATGATA-ATCACATGAGGTTGAA-AAAAATA-TT-C-TA-AAA----GACCA-CAC-AACCAC----AACTT-GTAATCGT-GA-G-A---AGAGGAAAA-T-A-A-AGAGCGAAA---CTCTGTACTC-AA---T---CCAAA-AGCATG-AA-TAATC-AG-A--A-A-TGA--A-ATT-GGATA------ACA-AACTTTTGAT-GA-----TA--C--AAA-CA-AT--CAGAAATAATaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagtggaaggaaataggaaggaactaacactaatcctcctcccacctatgatgaacgttgtggaaatatgcacaatgtcagcagtgaatgtctgtttgaccaaattactattccgatccatactagatgacccatttcccacctcccttcctatcagaaaaaaacagctggttaaatcgccgcgcccaaacgcgacacgccttgcctgtcgcccatgcttctgtgcggccatactgtccagtcatttatgtttgtacctcttcaataaaaaaatgttttgcgaattgtgctaaaagagtctcgtgcatttattctgtcgtcaattagcaccatataacaacacagcaatgacagagacatatctaacgaggcacgggcagaccctctttcacaaaaagaggcggctcaagtacacgattcaagaacagaccactacaagaccaagggacagatcacagcatcacacatcacaggatagaacagacacaattggtgaaacagcaagaaaaatacctcggataaatacacaacatcctagatcagactagagcagatccgaacaacacaacacagaccagaacatcgtacccgatgacacgagggccacagacagacacacagttcacatacacgacacacacctacagacgcaagcacaggacataaatcatagacaaaagacagacaccaagtatgataatcacatgaggttgaaaaaaatattctaaaagaccacacaaccacaacttgtaatcgtgagaagaggaaaataaagagcgaaactctgtactcaatccaaaagcatgaataatcagaaatgaaattggataacaaacttttgatgatacaaacaatcagaaataatctact
gi|22 : acgaattctaaatgacaaaaaaaaagtaattatgatttcacgcgaataataatgaataacggtatacatcggcgaagttgttattgtgagtaatacattaaaatgctcttaaaaatgaaacggataccaaaattgatgattcgacccaatacacattttccacagcagtcaacacaacgcagagttattcccctttggtaaatatccagaaaatcgaataaaaatcccagaattaatggaaacactgactttgattaccagatgaaaaaaatgaagttgtattcaaatatgaaactggtatgcaatagaccaagaggatcttattatatctaataaaagaaacttgaaggccagttaacgcggtcagaacttcataagcaatcccttgcaagatgtctttagctggatcgtgttcgctgtgtaaaaatacatttctaaaaatttagaattcctcaccaaggacatttattatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatataaaatttggtacgtctgtcatccgtaactctagattagctataatgtagggaaacatactcaaccacaccatccaaggtagatgttatgaagttaaaatgtaccaaggtgatataaatcttatcacctaaccacaaagaaaggagaagccagcagaggtctacctcgtcaaacgatcattcttattccatcctgccacgtcataataaggaagatggctctccatatatacgacaatccactagctatccatcccaggaaaacccaaaatttggagtgaaagaaaaaacaggtgaattcaggtacaatgctagttaaagatggagagggggaggaaagcaggacaatcttcatacccatcccccccccatacaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagTA---T-GT------C--TTGA-A-A-T---GA--G-C--AGA-A-C-C----A-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAA-TA-----CAAA-C---A-T------T-T---TC--CA--G-C--A-G-TCAC--AAACC-A-GAGTAT-A-TT-CCCT--TG-GTTA-AA-A--T-CA-GAAAAAGAAAATGAATTAACCAAT--AA-TC-A-GCAGAA--T--TGAT-GTG-T--A---AA-ctact
gi|23 : TC-CTT-CCACC-CA--ATG-A-------T--C---C--AG--------ATGT------AGAA-C------------------------T-C-CA-ATC-AT-A-C-----TGCC---C-T--C-AC-AC-TAC-TCCAT--CTGGGA-AT--AA-----ATAC--TTT-AA-TGG-CCG--GG---AAA-G-AA---A--CA-ATGC-TG-C-A-CCA-AT-GCTTCTGCG--GT-A-T-GC-TGTTC-Cct
gi|24 : aaccaagta------T-T---TT--CA--G-C--A-G-TCAC--AAACA-A-AAGT-T-A-TCTCCCT--T--GGT---A-A-TT-TT-GAAAAT------GAAT-----AAA--AG-CC-C-A---AA--A--TGGA-AT--T--A---AA-TC-A-T--A-T-T---A-----------TT--TTG--A-T---TC-AG-A-t
gi|25 : tg-GAGT-T-A-TCCCCCT--TG-GC----A-A-TT-TT-GAAAATG-----AAAT-----AAG--AG-TC-C--CAAAA-----TGAA-atcaattttag
gi|26 : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TA-----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TT---CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TT--TATgcttagacctaccgggtagctattgttttgattcagaatcaaaatta
gi|27 : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TC---AA-A---TA-G--AAGAT-TT---CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TT--TATC--------
gi|3 : TTA-A-AGAAAT-TT-C----AA-C-AT-T-C--TGCG---GA-T--G-CT--ATGAAAGTA-G-CG----CGGCTT-CGGTAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AT-AAT-G--A-TAAGTATC--------A-TA--C----T--G-G--T--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-AGC-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-T------T-T---TC--CA--G-C--AAG-TCACAAAAACC-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTATAA-A-TC-CA-GAAAAAG-----GAAT-----AAA--CA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTGTTA-T-T-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A---GA---AGTT------TGTT-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AATAG----AA-GGAGG--AAAT--TT-TT----ATA---AAAATAAAAGA-A-C-TGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---AATT------------ACA-A-T-T-CT-AAAAT-TT----C-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TG---C-------TA-AAC-A---TT-GCTTTG-C--ATAGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A------------TTTG--ACG--T-C----TG----C-TG-TAA-ATCTAAG-T-TAG--TTTA--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGT---A-AA---TG-T-ACACG-AAGGGA-----GAT----A-TAA-TGC-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCA-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCA--A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCAATTATT-GACA--T-C-ACTCGACTA---ATC--AG----GAA----CAA----TG-A--GTGAAG-------C-AAGAGT--GAAT-T--AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGATAG--AGGA-AATCCT-GTATAAATTTCACAAT-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TAATGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACTCTA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTTATGGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TT-C-TG-C-C-CCCAAT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TG-TTGTA----TAAATCA-AT--AAAAAAT-TG--TTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCCACG--ACGTGCTAA-----------TAC----GAACAGTAGCA-GGTACAAC---AGGACACACA---GCA-GACCAGA--CAG--C-----A-CAG--ACAC--A---ACCGATGACTCCA--C-TAG----ATC--AGACAGACCAG--AG------CG--ACACAACACACAAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGGTACCG-ATTTCCACCCGACA-ACCACACA-CAGC--A--TCAGCCCATGCACACAC-CAC------CACGA-CCGATCCATTACCGACACACA--CACCTGA-C--GACACA-C-ACAC------ACACAA----CACAGACAGCGACA-A---CGCACACAC-CACAGTATAA-CAG-CA-------GACAC--AACA----AGCAGA----CTATGA-CA---------C-AAGATTCA-CAGAGCAGAC--CA-CAGACT--AC-------GACA-A-CAT---AGATAGAACACTGACATGCAC-CAGCAG----CA-CATCAC-AAACACATAAAACTT-GAAAT-GT-AATT-A---AG----AAA-T-G-A-GG------ATG-CA-TGT--CC-AAAGTT---C--AA-AACATGAAA-C-ATC-AG-A--ATA-TGA-GA-ATT-GG---------ACATAACTGTTG-T-GG-----TACTCGAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTGTCTCG--GCACTTCACGCCACAA--CC----------CCCAGT-G-CTG--TGAAAAC---TTTCCCG-ACTCATTACA--TACCT-TC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTT-AAATATAAGACCAT-CTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CCCAGAGAA--TCTGAGTCT---A--AGAATTTCAAAG--TTCAAGGCCG-ACTATG-TGCTTA
gi|31 : T-ACA-CTAAAAAT--AC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTT
gi|32 : -ACA-CTAAAAATTTCC---AAAAATTCT-A-CCTG--A--AGAATTTC-AAG--TTC-AGGCCGAAC-AT
gi|4 : TTA-A-AGAA-TCTT-C----AA-C-ATAT-C--T-CG---GA-T--G-C---ATGAA-GTA-G-C-----CT--TT-C---AT----TTCAAAA-AC--TA-G--AAGAG-TTT--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TAATC---AT--G-G--C--GTACG-----GG--T-ATTTTGA-----AA----A----TTA---TTGT-----CT--TTAA-A-A-TC--GA--G-C--GAA-----C---AACA-AATTG-AATA--T---T--CC-AAT----------A-C---A-T------TAT---TC--CA--G-C--C-G-TCACAAAG-CA-A-GAGT---A-T-CACCT--TG-TTTA-AA-A-TC----GAAAATG-----AAA-------AA--AA-TCAC-AAGAAA--T--TGAA--TG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-GGGGA-----------AT--TTG--ACT-C-TCCAG-A-T-G--AA-A----A-AAATGC---AATT------T-TG-TT--CAA----GAA-TC-TG-GTAGT-TGA--AAT-G----AA-G-AGG--AC-T--TT-TTT---ATA---AAAA-A---GA-A-CCTGACAA--TGGTCC-A-T----AA-G--GGTGC-TAAAC-TC----TATGCGA--T-CC-T-G--AGAG------CT---ACT--AT----TT--------T-G--T-T---A-TT------------ACA--CT-T-CA-AAAAT-T-----A-T---T--CGA--C-CAAG-GA--A-TT----------------TGT--C-------CA-A--------T-GCTTCG-C--AGGAAT--A-T---GT--CTAC-----TTTATT--A-AATACA---A--A---------TTTG--ACGA-T-CAG--TG----C-TG-TA---TCTA-G-T-TAG--T--A--AC-T--AG-GTTCAAAACTTAAATATATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--ATAAGCGA------GAAGTT--A-AAA--TG-T-ACA----AGGGA-----GAT----AATTA-T-C-TTAGTCCCC---C----A---TA-------AAAGGA--AGCCAGCAAG-A-GGTC-AAC--TGC--CAC--GAC----A--C--CTTA--C--AT-----CGA--C-------GTCAT-A-T-A---AAGGA-AT-G--GC---TTCTCCAT--AA--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AGAGGGGTAA---CAT----TG-AT-GTGAG--------C-AGG--T--GAA---C-AG-T-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GG--AGGA-AG----GA-AATCTT----TAA--TTCACA-C-TC-CA-TACAT--ACC-CCTA-TGGA-A-GGAAGAAAAA--GGAA--ACCTAAC-CTG-T-CGTTCTC-CTTTCCACT--A--GTG-------GTT--G---ATTCGTA--CAC-ATGGCA----AGTA-A------------------------C-C----ATCCAT-A-CTG---GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCA-A-CAGG---AT--A------G-AT--TT--AA-T---CGG--CG---GAA-A--A---A--CC-T-----G-CGC-CCC-A--GCTC---TG--GC-C-T-GC-T-TTC-CATCATTTACTGTTTGTAA--CT--ATCA-AT--AAAAAATATG-TT-GCA---T-GT-CTAAAA-AAG--T----TG-TC-ATT--T-TC-TGT-GATCAATAGCAC-AAC------A-CACAC-C---A-TGAACA-ACACCA-A--TATACA--TGCATTG---CA-GC--------------AAC-------CA---AC--GACGCA-------GACACA-A-------GA-CAGA--CAGA-C-----A-CACCAACACCGA---GCCG--GAC-TCCTCC-C-G----AC----GNNNNNNNNN--NN------NN--NNNNNNNNNNNNNN-NN-NN----NNNN-NN-------NNNN---NNNNNNNNNNN-N---NNN-NNNNNN-NNNNNNNN-NNNN--N--NNNNNNNNNNNNNTCCC-GAC------C-CGA-CCGACCGA----C--CACACA--CACC-GC-C------------------------CGA----CCC-GAC--CGACA-----CACACACA----------GA-CAGACC-------GACAT--CTCC----CCCCCC----C-C-CA-CA---------CCA-----CA-CAGA-CAGAC------AGAC---A--------GACA----------GATAGA-CACAGACA-G-AC-CA-CA-----CA-CA-CAC-AAA-AC-TTAAACTTTGAAAT-GTTAA-TTA---AT----AAA-A-G-A-GG------A---AA-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AT-C-ATC-AG-AGAA-A-TGA-GA-ATTTGG--A------A-A-AACTTCTG-T-GG-----TA--CAAAAAACA---G-C--AAATGAT-ATTT-CTCG---CACT-CA--C-ACAA--CC----------CCCCAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-AA-CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAA-TAAC-C-TTA--AA--TTATCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTGGAGTAC-A-A-AAACTTCATA-TTTAAAGTATAAA--CATC-TTC-T-AT-ACA-CTAAAAAT--CC---AGAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAA----TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTT
gi|5 : acataaatattaccaaataaaattattgaaaaatatgttgattcatttaagataactctcttaaataatttatatggttaaacctgggtaactacctttccgtatggcccaaggagggaagagttggaccTTA-A-AGAA-T----C----AA-C-AT-TAC--T-CC---GATC--G-AC--ATAAC-GTA-G-CG----CG--TT-C--TAT----TGCAAAA-AAAATA-G--AAGAT-TTC------G-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-GA--C---AT--G-G-----G---A-----GTATT-ATT---G-----AC----A----ATA---T-GA-----TC--TCGA-A-A-----GA--G-C--GAA-T-CGC---TA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAAT-A-----C--A-C---AGT------T-T---TT--CA--G-C--A-G-TT-CAAAAGCA-G-GAGTGT-A-GTCCCCT--TGTAGTA-AA-AAGT-CA-GAAA-TG-----AAAT-----AAA--CG-AC-T-ACAGAT--T--TGAA--TGTG--A---AA-TA-A-C--TCT-G---A-----------AT--TTG--A-T-T-TC-C--A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------GTTA-TT--CAA----GAT-TC-TG-G---TATGA------G----AA-G-AGG--AA-T--TT-T-----ATA---AAAA-AA--GA-A-C-TGA-A---TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---A-ATGCAA--T-CCATTGC-AGAG-T---TAT----CT--AT----TT--CCTGCAT-G--T-T---A-TT------------CTA-ATT-C-CT-AAAAT-TTTA--A-T---T--TCA--CATAAGCGA--A-TT----------------TGT--C-------TA-AA------TT-GCTTTGTC--AAGGAT-----C--GT--CTCT-----CTT-TT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C----TG----C-TG-TTA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGTT-AGTGT-CAAA-----------TA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--AA----GA------GAAGT---A-AA---TG-T-AC-C--AAGGGA-----TATGCTGA-AGA-T-C-T-G----CC---CCA-AG---TT-------AAAGGAGA-GCCAG-CAG-ATGGTC-A-CGTTGCG-CACTTG-C----ATGCG-CCTA--C-TATCTCCATGA--CTCCAAGAGTTAC-A-T-ACCAAAGAA-A--G--GC---TTCTCCATT-AT--GA-A--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAAA---TG-A--GTGAA--------C-AGG--T--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGAG-GAA-AG--AGGA-A-TCTT-A---GAATTTCACA---TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--A-CTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTG-AA----GTTA-G---A--AGT---CAC-ATGT---AGCAGTA-A------------------------T-CGCG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CCCAC-TCCCTCCAT--CAGGGA-AT--AA-----A-GCT-TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-A-GG---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT----AAAAT-TG--TTG-A---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-TTCATT--T-TCTTGT-GT-CAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAAC--AAAC---A--TA-AC--ATGCAC----GCACG---------------CAC----GCACAG--ACA-GACA-AAC---AGAACACA-G---ACA-GACCAGA--CAGA-C-----ATCAC--ACAC--AC--AC--A-CAC-CCA--C-C-C----AGC--CGACCGACC----GA------C---ACACAACACGAGAC-AG-AC---------AC-------AC----------ACACCG-A---CCGACCGACACACCACACATCAG---A---CAGGACACACACACACACACAGAGAGC-AGA-CCGACCA------GACACACAATTACC-AA-TA-GACA-G-C-AGAC------A---GA----CAC---------CA-A---CACACACA--CACA-C---A-CAG--A-------G-----------------AGA----C-A-GACCC---------C-A-----CA-C-------AC--CA-CACAC---AG-------AATAGA-CAC---AGA------GCAGACA-ACA--CA-C-A----CA-CA-CAC-AAACAC-ACAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGA---AAA-T-G-A-GG------AACTTT-TGT--CC-AA---T---C--AAGAACATG-AA-C--TC-AGAA--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AAC-TTTG-T-GG-----TA--CATAAA-C--ATG-CA-AAATGAATATTTTCT-G--GCAC-TCA---CACAA--CA----------CCCCATAG-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A---ACTT-AC-T---GACCTAATAAC-C-TT----AAATT-TCAAT--AC-GA-TAA----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAA-ATATAAACATCCT---CTATAACATCTAAAAAT--CC---AAATATTCTGA-CCTGCAA--GGAATTTCAAAAGTTTC-AGGCCG-AC-AT--TGCTTA
gi|6 : TTATA-AGAT-T-TTAC----AA-C-AT---C--T-CG---GA-T--G-CTGAATGAA-GTA-GGC-----CG--TT----TAG----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTCTTCC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TAC-TATTTATGCGAAA-TA--C---AT--T-GAAC--GTAGA-----GT--T-ATT---G-----AACTAGA----TTA---T-GT------CAGTTGA-ATA-TTTGGA--G-CTAGAT-A-C-CTACAA-A-AGATC-A-TT--TTCAC--CCCAAATATTCTCC--A-C---A-T------T-T---CA--CA--G-CCAA-G-TCACAAG---C-A-GAGT-TTA-TTTTTCT--TTTGGTA-AA-A-TTTCA----AATG--------------AAA--AA-CC-----AGAA--T--TAAACATG-GTTA---AACAC-A-CCAT-T-A---AGACAACAACTTAT--TAG--A-TAC-TC-AG-AGTAG--AA-ATAGAA-A--TGACATAGTT-------GTA-T---CTA----GAGATC-TGTG--ATATGA--AAT-G----AACG-AGG--CA-TACTT-TTCTCAGTA---AAAACAAAGAAGA-CCTGA-AAGTTGGCCA-G-TTCGGAA-G--GGT-CCTAAAC-TT---ATGTGCAACTT-CC-TTT--GGAG-----TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--C-C---A-TTCATCGT------ACATACT-TTCTCAAAAT-CTTGCTA-TCTAT--TCAGCC-CAAA-GGCAA-TTCTTGTTAATAGCCGCATAT--T-------TACAACCA---TT-GCTTCTTA--AAGGAT--A-T---GT--CTCT-----TTAATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-T-A-ATCTA-G-TGTAG--TTAA--ATGT--AG-G--CATAA--------TA-A-------A-CAACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAG-T--A-AA---TG-TCACAA--AAGGGA-----GA-----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-A-----A-------AAAGGAG-AGCCCAGCAG-A-GGTC-A-C--T--G-CA---GATCTAAAT-CAGCTTA--CTTAT-----TGG-AC-------GTCAG-A-TAA---AAGAA-AT-GGAGC---TTCTCCA-TTAT--G-CA--T-C-ACT-GA-TT---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-AGGGTGGA--------CTCAG-GT--GAATGTC-AGGTGAC------AGTT-ACAAG-T--AAGGTGGAGAGGA-AG--AGGATAATCTT-AT---AATTTCACA-C-TC-CA-TAC-TTAACC-C-TG-TGGATA-G-----AAAA--GGAA--AACAAAC-CTG-T-C---CTC---T-CCACT-TA--GTG-AA----GTTG-G---A--AGT---CA-CA-GCTA--GCAGTAGA------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-CG----GGCCAAAA-T--CACC-AC-TCCTCGCATC-GAGGGACAT--AA-----C-GT--TTA-AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CCGTTGC-TG-C-C-CCC-ATCGCTTCTGTG--GCAC-T-GC-TGTTC-CATCA-TTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-ATAAAAAAAAT-TG--TTGCA---TGGT-CTAAAA-ATG--T----TGTT--ATT--T-TC-TGTGGTCTAATAGCAC-CAT------A-CAC-C-C---AATGAAC--AAAC-A-A--TT-AAA-CTGCATC---GCACG---------------CAC----AGACAG--ACA-GACAAAAC---A-GACACA-A---ACACGACCAGA--CAGA-CCCACAA-CAC--ACAC--ACACACCAC-GCC-ACA--C-C-G----ACCCAAGACAG--CAGGCAAGACAGCCG--ACA-GACACAC-ACAAG-ACGA--CACACAC-------ACACCCGCACGGACACCACA---CCA-CTACCG-AC--CACA-GAGCCAA--CCAGACAGCTCACATGC-ATC------C-CGA-CAGA--GA----CAACACAGA--CA---GA-CACGACACA-CAACAG------ATACGAC---CACAG-----GACAGA---CACACACACACACA-CACGACCAC-CACACGACCGACACCGAACAC---AGCAG-----C-C-GA-CACCCCCCCCCC-A-----CACCACA-CAG----CA-CAGAC---A--------GACA----AC---AGAT---ACA-AGACA-GCAC------A----CA-CA-CACAAAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-AAAGAA----AAA-T-G-A-GA------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--NN-NNNNNN-NN-N-NNN-NN-N--N-N-NNN-NN-NTT-------------------TTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-
gi|7 : TTA-A-AGA--T-GT-C----AAAC-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGA--GTA-GGC-----CAA-TT-C--TAT----TCAGAAA-A---TA-G--A-GAT-TTC--C---G-GAT--AA-AAT-G--AGTA--TATC--------A-TA--C---AT--G----C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----AA---TTA---T-GT------C--TTGA-A-T-T---GA--GGC--GAA---C-C---AA-T-AATTG-A-TAA-T---CGTCCCAAATAT----C--AGC---A-T------T-T---TCTCCA--G-C--A-G-TCACTAAAACC-A-GAGT-T-A-TTCTCTT-----GGTA-AT-A-AT-CA-GAAA-TG-----AGAT-----AAA--A---T-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-AAC--T-T-G---A-----------AT--TTG------T-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT-------GTAATT--CAAT---GAAATC----A--GTATGATAAAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT-----TA---AAAA-A---GA-A-CCTGA-A---TGGCCAAG-T----AA-G--GGT-C-TAA-C-TC-----ATGTAA--T-CC-TTG--AA---G---TCT---AC---AT----T---C-----T-G--T-----A-TT------------ACA--CT-T-CT-AA--T-TT------T---T--TCA--CGCAAG-GGT-A-AT----------------TGT--CC------TA-TAC-A---TT-GCTTTGTC--AAGGAT--AATC--AT--CCTC-----TTTATTTAA-AGTA-----T--A---------ATTG--ATG--T-C-G--TG----C-TG-TAA---TTA---T-TAG--T--A--AT-T--AG-GT-CAAAA--------TATA-------ATC-ACC--A---AAAA-GTA--A-----GA------GAA--T--ACAA---TG-T-ACAT--AGGGCA-----GAT----A---A-T---T-AGTCCCC-----A-AA---GA-------AA-GGAGA-GC--AGCGA-C-GGTC-A-C--TGC---A---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA--C-------GT-GC-A-T-A---AAGA---T-G--GC---TT-TCCATTT----GCCA--T-C-A-T-GA-TA---AT---AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AAG-----------------------------T-A-AAG-T--AAGG-GGG-AG---AG--AGGA-AATCT----ATAA--TTCACAAC-TC-CA-TAC-T--ACCTC-TA-TGGA-A-------AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTGGAA----GTT--G---A---GT---CAC--TGT----ACAGTA-A------------------------TGC-CGGATC-A--A-C-----GACC---A-T--C-C--A--TCCCTTCATA---GGGA-AT--A--------GC--TT--AAATGG-CGG---A---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-C---AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATAATTTA-TGTTTGTA---CT---TCA-AT----AAAAT-TG-TTTGC----T-GT-CTAAAA------T----TG-T--CCT--TGTC---T-GTC--ATAG------C------A-CACAC-CTAAAATTATCA-AAAtcagaaata
gi|8 : ctcctacttttctcagcgcagttttcgaatcgtaaaaggcctcatttaagtgcagattggcccaccgttcatataatttacaaaataaacaatattgaaaatattttgatatcctaaatactccttaatatattttatacgtgttactggtaactttactttcgtatgaagggaggtaaattggacA-G-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--GGCT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TTAC--TGT----T-CAAAA-AAG-TA-G--AAGAT-TTC--C-----AATTAAA-AATTG--A-TA--TATC--------AGTAG-C---AT--GTG--C--G---ACATTAGT--TGATT---GC----AA----A----TTA---T-GTGCGATTC--TTGA-A-A-T---GAATG-C--GAA-A-C-C---AA-ATAGTTG-AATA--T---C--TCCAATAC-----C--ATC---A-T------T-T---TTT-CA--G-C--A-G-TCACAAACGCA-ACGAGT-T-A-TTCCCTT-----GGTA-TATA-TT--A-GAAAATT-----AAA-------AA--AA--C-C-ACAGAA--CACGGAA-ATA-G--A---AA-ACCA-C--T-T-G---A------------T--TTG--A-T-T-CC-AGGA-T-G--AATA----A-A--TGA---AGTTGATTAGTGTA-TTGTTAA----GAAATC-TT-G--GTATGA--AAT-G----AA-A-AGA--AT-C--TT-TT----ATA---AGAA-AA--GA-ATCCTGA-AA--ATGCCA-G-T----AA-A--TTT-C-TAAAC-TCATTGTCTGCAA--T-TC-TCT--TGAG-GTATTCTG--ACTTAGT----TT--C-----T-GTTT-T---A-TTTTGTACCCCACCACA-CCTAC-CT-AAGAT-TT----A-T---T--TCAAGC-CAAG-AT--A-AT----------------TGT--TAATGCCATA-ATC-A----T-GCTT-GCCGGAAGCAT--G-TTCGGTTGCTCTCGGTATTTAGC--G-AATATCCTGA--AGACATGAATTTTG--ACGCCT-C-GTCTG----C-TG-TGA-ATCTACG-T-T-T--TT-A--CTG----G-GT-TAACG--------TGTT-------G-C-ATT--A---AACAGATA--C-----GA------G-AGTTTCA-AA---TG-T-----------GA-----GAT------TAA-T-TAT-A----CA---CCA-GATATGA-------AAAAGAGagctgaatagggtcttagattctaagaatagaacgtgagaacaatatgcgtgaactgcaagttatacgttctaaaacagtttaaccaaaacaaacaataacatgcagcacaacaacagaccagaagacagacacacatcagaccgacaccaacagacgacacatcaccacagaagcagacagatatgaccacagccacacaaca
gi|9 : cgctagcttatccatctcctacttttctcgcgaagtgacagttcttttctgtaatcctggcataaaaggcactttcattcaatgctagatgtgccaacccttcatatagtatatgtaccaaataaacatagttaattttgagaaaagtcatatttataatttcatttaaatactctcttaatatatgtatgatgtttaacctctctggtttaaacaccgttattatctaattacggtttctaattataggacgataaaggcagagcgcctattgagattcctaaa-A-AGAA-TGTT-C----AA-CCAT-T-TCAT-CGATGGA-CTGG-CT--AT--A-GTATG-A-----CG--TT-C--TAT----TCCAGAATAC--TA-G--AAGAA-TTC--TC-CG-AAT--AA-AAT-GTGA-TA--TAT---------A-TA--CGACATTGG-G--TTAG---A-----GTA-T-ATT---G-----AA----AAGTGTTA-----GT------C--TGGAGA-A-A---GA--GGC--AGA-A-C-C---AA-T-A--TGTA-TA--TT--C--CCCAAT-A-----C--A-----A-T------T-T---TC--CA--G-C--A-G-TCTCAAAA--C-A-GAGT---A-TTCCCCT--TG-G-TA-AA-A-AT-CA-GAAATTG-----AGAT-----AAA--CA-TC---ACAGAT--T--TGAA--TG-G--A---AATAC-A-C--T-TTG---A-----------AT--TTG--A-T-C--C-AG-ACT-G--AA-A----A-A--TGA---AGTA------TGTA-TT--CAA----GAAATC-CT-G--GTATG---AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----AT----AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AAG-TGGCC--G-T----AA-AGCGGT-C-TAAAC-TC-----ATGCAA--T--C-GTG--ACGA-G---TCT---ACT--AT----TT--CG----TGG--T-T---A-TT-------------CA-ACT-T-CT-AAACTCTT----ATT---T--TCA--C-CAAGAGG--A-TT----------------TTC--C-------TA-AACTA---TTGGCTTTGTC--AAGGACTAA-TC--GT--CTCTTC---TTTATT----AATA-----T--A---------TTTGA-ACG--T-C-A--TG----C-TGCT---ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-C-AAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AG---GT---A-----GA------GAAAGT--A-AA---TG-T-GTACCAGAGGGAGTAGTGAT----A-GAA-T-C---AGTT-----------A---GATCATTACAAAGGAG-AGCCA-GCAGAA-GGTC-ATC--TGCG--A---ACC----ATCC--CTTA--C-TAT-------G-AC-------G-CATGA-C-A---AAGAA-ATCG--GCCGTCTCTCCCTTTAT--GACA--T-C-A
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): CTACTTATTTCTCAGGCGAAGTTATCGGAATCACCGGTAAAAAGAGCCACTTACATAACAATAGCAGATTGGCCACCTCACTGTATACATATTACCAACAAAAATAACAATATTGAAAATATTTTGATCATTTAAATAACTACTCTTAAGTATATTATATGTTAACCCTGGTAACTTTATTATCGTCATTAGCGAGCAAAAGGGAGAAAATTG
Unaligned ( gi|21 ): GCTGCTTCCGCTAACTCTTTCTCAGCGACAGTCTTCGATCTCGGTAAAACAAGGTCATGTCATTCAATGCGCAGATGGCCCGCTTACATATAATATACCAAATAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
Unaligned ( gi|28 ): CCTCTCCTATCTTTTCTCAGCACAGTTTCGATATCCGGTAAACAAGCACTTCATCAATCAGATTGGCCACC
Unaligned ( gi|29 ): TTATATATTAATGTTAATATCCCTGAGTAACTTACTTTGTATGCAAAGGGAGGGGTAAATCTGAGAC
Unaligned ( gi|30 ): AAATGGAATAAAATTCCCAAAATGGAGTTAATGTATATTATTTTGATTCAGAATCAATTATAGAAA
Alignments
lowQualScore : 1111 1111111111111 111 1111111 11111111 333333333333333 111111111 111111111 2222222 1111111111 222222222222222222222222222 111 22 1111 1111 111111111111 111 22222222 11 1111 1111 1111 111 111 11 222222 11 11111 111111111111111111111111 11111 333333333333 222222 11 11111 33333333333333333333333333333 111111 22222222 11111 1111 333333333333333333 11 11 2222 1111 11 11 11111111 1111111 111 11111 111111 111 2222 11111 1111111 222222222222222222222 11 1 2222222222222222222222 11 333333333333333333 111 11 1 1111 1111 11 333333333333333333 1 111111 111 1 222222222 111 11 11111 1111 22 1111 2222222222222222222 444444444444444444444444444444444444 11111 111 11 222222222222 11 111 111 11 11111111111 11 11 111111 11 111 6666666666666666666666666666666666 111111 222222222 11111111 1 11111 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 11111 777777777777777777777777 555555555555555555555555555555 2222 33333333333333 111111 1111111 444444444444444444444444444444444444444 111111 1111111 444444444444444444444444 222222222222222222 1 2222 3333333333 111 11 111111111 11111 111111111 22 11 111 33333333 2222222222 11 1 1 111 111111 111 1 11 1 111 111111
lowQualScore : 3 3 3 6 3 6666 3 3 3 3 77 3 555 4444 3 44 3 7777777777777 3 88 6666 33 2 333 2 33 2 4444444 2 33 2 2 33 2 66 55555555 3 77 888 77 3 444444444444444 77 3 222222222 999999999 555 2 4444444 33 0 2 2 2 777 33 1111111111 2 555 2 2 3 2 6 222222222222222222222222222 555 3 5 222 66 33 2 33 5 2 55 33 2 555 5 0 99999 2 2 9999999999 2 66666 66666 33 2 1111 77777 99 3 44 555 6 3 3 0000 3 666 999999999999 55 55 3 333 3 3 7 4 66 4 9999 4 66 777 11111111 4 00 3333 1 0000 666 66 4 9999 4 4 66 4 66 4 3333 777 8 222 4 4 2 4 777 4 4 9999 4 00 4 4 4 444444 66 4 4 00 66666 888888888888888888888888 4 66 00000 4 555555555555 99 4 4 8 4 666666 777 66 22 8 55555 4 66666666666666666666666666666 5 0 555555 5 888 66 11111111 66 1 99999 0000 444444444444444444 00 00 4 3333 9999 4 4 1111 8 4 4 66 00 66 1 00 4 66 66666666 4444444 4 4 66 777 333 66 55555 222222 9999 4 666 4 4 3333 0 11111 2222222 4 77777 2 3 777777777777777777777 55 77 5 5 5 0 66 4444444444444444444444 66 00 444444444444444444 66 222 777 4 4 66 777 55 00 66 4 4 0 5 888 66 0000 888 5555 5 88 777777777777777777 88888 0 444444 5 5 5 66 5 11 555 777 0 777777777 222 4 4 4 11 5 5 66 4 4 11111 66 66 1 4 4 4 8888 4 4 11 55 4 2222 0000000000000000000 888888888888888888888888888888888888 4 4 4 8 4 4 99999 111 4 55 4 4 8 44 4 55 111111111111 33 4 4 55 777 4 777777 55 4 4 4 4 4 4 4 99 4 4 4 4 4 1 4 888 888 4 222 4 77 1 777 4 4 00000000000 4 55 66 4 4 8 44 4 888888 4 4 777 77 777 66 5 666 4444444444444444444444444444444444 111111 888888888 22222222 5 0 66 55 22222 5 11 66 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 888 55 5 999999999999999999999999999999999999999999999999 0000 0 0 7 11111 8888 0 333333333333333333333333 2 111111111111111111111111111111 0000 3 6 11111111111111 3 666666 5 77 666 8888888 999999 0 111111111111111111111111111111111111111 555555 0 5 7777777 555555555555555555555555 5 0 444 4 666666666666666666 4 4 8 3 4 1 3 3 3 7 3 666 6666 3 3 3 3 4444444444 3 55 3 666 000 00 3 3 888 3 3 55 3 3 3 3 3 333333333 3 2 4 4 00000 55 2 4 888888888 00 00 444 99999999 66 1111111111 77 999 66 888 66 5 11 5 0 7777 5 5 888 0 2 5 5 888 3 5 66 5 5 888888 5 555 5 777 5 77 1 88 1 1 6 0 5 66 777 3 5 000000 66 5 5 5 5
lowQualScore : . . . . . .... . . . . .. . ... .... . .. . ............. . .. .... .. . ... . .. . ....... . .. . . .. . .. ........ . .. ... .. . ............... .. . ......... ......... ... . ....... .. . . . . ... .. .......... . ... . . . . . ........................... ... . . ... .. .. . .. . . .. .. . ... . . ..... . . .......... . ..... ..... .. . .... ..... .. . .. ... . . . .... . ... ............ .. .. . ... . . . . .. . .... . .. ... ........ . .. .... . .... ... .. . .... . . .. . .. . .... ... . ... . . . . ... . . .... . .. . . . ...... .. . . .. ..... ........................ . .. ..... . ............ .. . . . . ...... ... .. .. . ..... . ............................. . . ...... . ... .. ........ .. . ..... .... .................. .. .. . .... .... . . .... . . . .. .. .. . .. . .. ........ ....... . . .. ... ... .. ..... ...... .... . ... . . .... . ..... ....... . ..... . . ..................... .. .. . . . . .. ...................... .. .. .................. .. ... ... . . .. ... .. .. .. . . . . ... .. .... ... .... . .. .................. ..... . ...... . . . .. . .. ... ... . ......... ... . . . .. . . .. . . ..... .. .. . . . . .... . . .. .. . .... ................... .................................... . . . . . . ..... ... . .. . . . .. . .. ............ .. . . .. ... . ...... .. . . . . . . . .. . . . . . . . ... ... . ... . .. . ... . . ........... . .. .. . . . .. . ...... . . ... .. ... .. . ... .................................. ...... ......... ........ . . .. .. ..... . .. .. ......................................................... ... .. . ................................................ .... . . . ..... .... . ........................ . .............................. .... . . .............. . ...... . .. ... ....... ...... . ....................................... ...... . . ....... ........................ . . ... . .................. . . . . . . . . . . . ... .... . . . . .......... . .. . ... ... .. . . ... . . .. . . . . . ......... . . . . ..... .. . . ......... .. .. ... ........ .. .......... .. ... .. ... .. . .. . . .... . . ... . . . . ... . . .. . . ...... . ... . ... . .. . .. . . . . . .. ... . . ...... .. . . . .
lowQualScore : 3 3 3 7 1 5555 1 1 1 1 33 1 444 1111 1 22 1 2222222222222 1 55 5555 55 7 777 7 77 7 5555555 7 77 7 7 77 7 33 44444444 1 33 555 33 1 333333333333333 33 1 888888888 888888888 000 9 4444444 99 8 9 9 9 999 99 8888888888 9 000 9 9 6 9 2 555555555555555555555555555 444 1 7 999 88 99 9 99 7 9 22 99 7 555 3 5 99999 7 7 1111111111 5 77777 77777 77 7 5555 77777 44 3 66 888 7 6 6 1111 6 444 666666666666 00 00 6 666 6 6 3 4 11 4 4444 4 11 888 11111111 4 66 9999 9 9999 222 11 4 4444 4 4 11 4 11 4 9999 888 9 000 4 4 9 4 999 4 4 4444 4 66 4 4 4 000000 11 4 4 66 11111 333333333333333333333333 4 11 33333 4 666666666666 00 4 4 9 4 999999 888 11 22 9 66666 4 33333333333333333333333333333 0 4 999999 0 888 99 22222222 99 4 44444 9999 333333333333333333 66 66 4 4444 4444 4 4 8888 9 4 4 11 88 11 1 66 4 33 11111111 4444444 4 4 11 888 999 11 66666 888888 8888 4 777 4 4 4444 8 11111 3333333 4 11111 9 9 444444444444444444444 66 99 0 0 0 0 99 9999999999999999999999 99 11 222222222222222222 99 444 888 4 4 11 888 66 66 11 4 4 0 0 888 99 6666 888 6666 0 88 222222222222222222 55555 0 444444 0 0 0 99 0 66 888 000 0 000000000 444 4 4 4 99 0 0 44 4 4 11111 11 11 8 4 4 4 0000 0 0 00 55 0 5555 8888888888888888888 000000000000000000000000000000000000 0 0 0 0 0 0 55555 000 0 55 0 0 0 55 0 55 111111111111 55 0 0 55 000 0 555555 55 0 0 0 0 0 0 0 55 0 0 0 0 0 1 4 333 000 4 444 4 22 9 888 4 4 99999999999 4 00 11 4 4 9 11 4 999999 4 4 888 22 111 99 0 444 5555555555555555555555555555555555 111111 444444444 11111111 0 8 99 11 55555 0 99 99 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 000 66 7 222222222222222222222222222222222222222222222222 5555 2 2 0 00000 3333 8 888888888888888888888888 5 888888888888888888888888888888 8888 2 7 99999999999999 0 999999 3 11 999 6666666 666666 3 777777777777777777777777777777777777777 999999 7 7 9999999 666666666666666666666666 0 4 888 4 999999999999999999 4 4 0 2 0 0 6 6 6 3 6 444 4444 6 6 6 6 2222222222 6 00 6 444 000 00 6 6 555 6 6 00 6 6 6 6 6 111111111 6 6 0 0 00000 55 3 0 666666666 33 11 444 55555555 99 9999999999 00 444 99 888 99 0 99 0 0 6666 0 0 888 4 6 0 0 111 4 0 99 0 0 999999 0 666 0 111 7 99 4 88 0 7 7 0 0 99 555 6 0 222222 99 0 0 0 7
consensus : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-C--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-TT-T---TC--CA--G-C--A-G-TCACAAAA-CN-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTA-AA-A-TT-CA-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------TGTA-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-AAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TGT--C-------TA-AAC-A---TT-GCTTCGTC--AAGGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-TAA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGTT--A-AA---TG-T-ACAC--AAGGGA-----GAT----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCG-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCAT-A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATTTAT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AGG-GT--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGA-AG--AGGA-AATCTT-ATATAAATTTCACA-C-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACT-TA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTCA-GGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAAAAT-TG-TTTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCACCG--GCACGC--------------CAC----GCACAG--ACA-GACACAAC---AGGACACG-A---ACA-GANCAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A---ACCGA-GAC-CCA--C-C-G----ACC--AGACAGACCAG--AA------CG--ACACGACACACGAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGACACCG-A---CCG-CCGACA-ACCACACACAGC--A--CCAGACAGCGCACACAC-CACC-CGA-CCGA---A----CAACACACACACC-GA-CA-GACACA-C-ACAC------ACACGA----CACA-GACA--GACA-A-----CACANACACCACA-CACGA-CAG-CA-------GAC--AC--AACA----AGCAGA----C-A-GACA---------C-A-----CA-C----AGA-CAGAC--CA-CAGAC---AC-------GACAA-CAC---AG-ATAGAACACAGA-CA-G-CAC-CA-CA-A----CA-CA-CAC-AAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-A-GG------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTTTCTCG--GCACTTCA--CCACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAATATAAAAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTA
Reference ( family-511 ) : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-C--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-TT-T---TC--CA--G-C--A-G-TCACAAAAACN-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTA-AA-A-TT-CA-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------TGTA-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-AAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TGT--C-------TA-AAC-A---TT-GCTTCGTC--AAGGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-TAA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGTT--A-AA---TG-T-ACAC--AAGGGA-----GAT----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCG-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCAT-A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATTTAT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AGG-GT--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGA-AG--AGGA-AATCTT-ATATAAATTTCACA-C-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACT-TA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTCA-GGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAAAAT-TG-TTTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCACCG--GCACGC--------------CAC----GCACAG--ACA-GACACAAC---AGGACACG-A---ACA-GANCAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A---ACCGA-GAC-CCA--C-C-G----ACC--AGACAGACCAG--AA------CG--ACACGACACACGAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGACACCG-A---CCG-CCGACA-ACCACACACAGC--A--CCAGACCGCGCACACAC-CACC-CGA-CCGACCGA----CGACACACACACC-GA-CA-GACACA-C-ACAC------ACACGA----CACA-GACG--GACA-A-----CACACACACCACA-CACGA-CAG-CA-------GAC--AC--AACA----AGCAGA----C-A-GACA---------C-A-----CA-C----AGA-CAGAC--CA-CAGAC---AC-------GACAA-CAC---AG-ATAGAACACAGA-CA-G-CAC-CA-CA-A----CA-CA-CAC-AAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-A-GG------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTTTCTCG--GCACTTCA--CCACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAATATAAAAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTA
gi|1 : TTA-ACAGAA-T-TC-C----AA-C--T-T-C--T-CG---GAAT--G-CT--ATGAA---A-G-CTTCAGCG--TT-CATCAC----TTCAAAA-A---TA-G--AAGATCTTC--CG-CG-AAT--AA-AAT-A--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATTCG-A-----AA----A----TTA---T-GTCT---TG--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-A-TTG-A-TAA-T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-TT-TC--TC--CA--GGC--A-GATCACAAA--CC-A-GAGT-T-AATTCCCCT--TG-GATA-AA-A-TG-CAAGAAAAGA-----GAAT-----AAACAGA-TC---ACAGAAATT--TGA---TG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------ATGATTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----ACA--TGA---AGTT------GCTA-TTT-CAA----CAAATCATG-G--TTATGA--AAT-G----AA-G-AAGCGAA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGAA-G-CCTGA-AA--TGCGCA-A-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GC-TGCAA--T-CC-TTG--AGAGAG---TCTC--ACT---T----CT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-TAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAT-GA--ATTT----------------TGTCCC-------TA-AAC-ATCTTT-GCTTATTC--AAGGAT--ATTC--GT--CT-T-----ATAATT--ATAATA-----AACA---------TTTG--ACG--TAC-GA-TG----CATG-TAACATCTA-G-T-TAAGCTT-A--ATGCTAAG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACCATA---AA---GTAAGA-----GA------GAAGTT--A-AAAATTGTT-AC-C--A--GGA-----G------A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---G--------AAAGGAG-AGCCCAGCAG-A-GGTC-A-C--T--G-CA---GAC----AT-C--CTTA--C---T-----TG--AC-------CTCAT-A---A---AAGAA-AT----GC---TTCTCCATCTAT--GACA--CGCAACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-AAGGTGAAG-------C-AAGTGTTGAAAT-TCAAGGTGAC------AGTTAA-AAG-T--AAGG-GGGAAG---AG--CAGG-AATCCT-TTATAATTTACACA-T-TCACATTAC-T--ACC-C-T--TGGA-ATG-----AAAA--AG-G--AACTAA--CTG-TGC---TTCGCTT-CCAC--TA--GTG-AA----GTT--A---G--AAT---CA-CATGTAT-GCCAGT--A------------------------T-C-CG-ATC-ATCA-C-----GGCC---A-T----CC-ACGTCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AC-----A-GC--TTTCAA-TTG-CGGACCG---AAA-G-GA---AACCC-TTGC-TGCC-C-CCC-AT-GCTTCT-TGT-GC-C-TAGCATGTTCACATCATGTA-TGTTTGTAAC-CT--ATCAGATA-AAAAAAT-TG-TTTGCA---T--T-CTAAAA-A-G--T----TG-T--TAT--T-TC-TGT-GT-CAATAGCAC-CACCA----A-CACACTC---AAT-AAC--AAAC-A-A--TT-ATACATGCACCACTGT-CG---------------CAC----GCACAG--ACACGACA-AAC---A--ACACA-G---ACA-GAACAGA---AGACC-----A-CACA-ACAC--A---GACG--GAT-CCA--C-C-ACCACACC--AGACACA-CAC--AA------CG--ACTCAACA
gi|1 : ccttcatataatattaccaaaataaacaaatatgaaaaaagttttatgattacattcctaatattatttatcgttaactcctcgagtaattactttccgtattgcaaagggagggctaacacattgagaccA-CAC---AG-CTA-AACACAGA-CA-C-AAC-C--CA-ATGTACA-CA-CACCAAACAC-TAA--CTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-AAGG------A---CT-TGT--CCCAA---TG--C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-AATGA-GA-AGT-GG--A------ACA-AATCTTTG-T-GG-----TA--CAAAA--CA--TG-C--AAATGAT-ATTTCCTCG---CACT-CA--C-ACAAATCA----------CCCA-T-C-CTG--TGAAAAC---TT--CCGGA--CA-TAGA--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTG--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAAAA---AAAATATTG-AGTACAA-A-A--CTTCATA-TTTAAAATAT-AGAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--AATAGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagatagacacagctaaacacagacacaacccaatgtacacacaccaaacactaacttgaaatgtaataagaaatgaaggacttgtcccaatgcaaaacatgaacatcagaaaatgagaagtggaacaaatctttgtggtacaaaacatgcaaatgatatttcctcgcactcacacaaatcacccatcctgtgaaaacttccggacatagatacttactgactaaataaccttgaaaatttcaatacgataaaaaaaaaatattgagtacaaaacttcatatttaaaatatagaacatccttcttatacactaaaaatccaaaatttctgacctgaatagaatttcaaagttcaggccgacatgtgctta
gi|10 : ccttcatataatattaccaaaataaacaaatatgaaaaaagttttatgattacattcctaatattatttatcgttaactcctcgagtaattactttccgtattgcaaagggagggctaacacattgagaccttaacagaattccaacttctcggaatgctatgaaagcttcagcgttcatcacttcaaaaatagaagatcttccgcgaataaaataatatatcatacatggcgagttattcgaaaattatgtcttgttgaaatgagcgaaaccaaaattgataatccccaattacacatttctccaggcagatcacaaaccagagttaattccccttggataaaatgcaagaaaagagaataaacagatcacagaaatttgatggaaaacacttgaatgattgatctcagatgaaaacatgaagttgctatttcaacaaatcatggttatgaaatgaagaagcgaatttttataaaaaaaagaagcctgaaatgcgcaataagggtctaaactcgctgcaatccttgagagagtctcacttctctgttattacaacttcttaaatttatttcaccaatgaattttgtccctaaacatctttgcttattcaaggatattcgtcttataattataataaacatttgacgtacgatgcatgtaacatctagttaagcttaatgctaaggtcaaaatataacaccataaagtaagagagaagttaaaaattgttaccaggagataatctagtccccccaaagaaaggagagcccagcagaggtcactgcagacatccttacttgacctcataaaagaaatgcttctccatctatgacacgcaactgataatcaggaaacaatgaaggtgaagcaagtgttgaaattcaaggtgacagttaaaagtaagggggaagagcaggaatcctttataatttacacattcacattactacccttggaatgaaaaaggaactaactgtgcttcgcttccactagtgaagttagaatcacatgtatgccagtatccgatcatcacggccatccacgtccctccatacagggaatacagctttcaattgcggaccgaaaggaaacccttgctgccccccatgcttcttgtgcctagcatgttcacatcatgtatgtttgtaacctatcagataaaaaaattgtttgcattctaaaaagttgttatttctgtgtcaatagcaccaccaacacactcaataacaaacaattatacatgcaccactgtcgcacgcacagacacgacaaacaacacagacagaacagaagaccacacaacacagacggatccaccaccacaccagacacacacaacgactcaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagatagTCACG-CCTC-CA-CAC-TC-ACC-C-TC-TAG----G-----ACAA--GCAA----C--AT-CTG-T-C---TTC-CT--CCACT--A--GTC-GATAACGTTTAG---A--AGTT--CACCATGTC----CAGTA-A------------------------T-C-CG-AT--AT-AAC-----GGCC---AAT--C-CC-AC-TCCCTCCATC-AAGGGA-ATTGAA-----G-CCCTTT--AA-TGGGCGG--CG---AAG-G------A--CC-TTGC--G-C-C-----AC-ACTTTTG--------------------CAT-ATTT---GTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAA--T-TG-TT-GCA---T-GT-CTAAAA-A-AGTT----TG-T--TAT--T-TC-TGT-GTC-AATAGCACACAC------AACA-AC-C---AATGAACA-AA-C-A-A--TA-ACA--TGCA-----GCACGC--------------CAT----GCACAG------GACA---------GACACG-A---ACA-GA-CAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A----CCGA-CAC-T-A--C-C-A----ACC-------GACC-G--AA------CG--AC--GACACCCAAC-AG-AAGAGACACAGAC-------AGAC---CACA--CAC-G-A---CCGACCGACA-GACACACACA-C--A--CAAGACAGCATACACACACACC------------A----CAACAGACAGACCTGA-CA-GACACA-C-ACAC------AGAAGA----CACA-ACCGA-GACA-C-----GACCGACAC-ACA-CACGA-C---CA-------CCC--AC--AACAC---AGCAGAGAACC-C-GACA---------C-A-----CA-C----A---CAG----CA-CAGGC---AC-------------------AG-ATAGA-CACAGA-CA-G-CAC--A--A-A----CA-CA-CAC-AA-CAC-TAAA-CTT-GAATT-GT-AAGT-A---AG----AA--T-G-A-GG------AA--CT-TGT--C--AA---T---C--AA-AACATG-AAGC-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACG-AAACTTTG-TGGG-----TA--C-AAAA-C--ATGTC--CAATAA-TATT---TCGC-GCAC-TCA---CACAA--CC----------CCC-AT-C-TTGAACGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--T-CTT-AC-T---GA-TAATAAAC-C-TT-----CATT-TCAAT---C-GAGT-A----AAA-AAG-AAAATATTG-AGTAC---A-A--CTTCATATTTTAAGCTAT---AACATCTTCC-TTATCACA-CTAAAAAT--CCATGAAAATTTCTGA-CCT------AGAATTTCAAAG---TC-AGGCCG-AC-ATGTTGCTTA
gi|11 : taC-------GACAT-A---A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATT-AT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--CTGAA--------C-AGG--T--GAAT-TT-AGGT-AC------AATT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAG-------AGGA-AATCTG-ATA---ATTTCACA-C-TC-AA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CAC-ATGT---AGCAGTA-A------------------------T-T-TG-ATC-AT-A-C-----GGCC---C-T--C-CC-AC-TCCCTATAT--CAGGGC-AT--AA-----G-CT--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATAATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAAAAA-TG--TTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-TC-ATT--T-TC-TGT-GT-CAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAAC--AAAC-A-A--TA-AC--ATGCA--A--ACACGCNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNN--NNN-NNNNNNNN---NNNNNNNN-N---NNA-GAGCACAACCACA-C-----A-CAC--ACAC--A---CCCG-------CA--CTC-G----ACG--CGACCGACC----------------ACAC-ACACAAGAC-AG-CA----CACA-AC-------A
gi|12 : ttactcctacttttctctgAAGACAGA-CA---CACACA-CA-C----AA-CA-CAC-GAACAC-TAAA-CTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAAAT-G-A-GG------AAC-TT-TGT--CC-AA---TATGC--AA-AACATG-AAAC-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTT-G-T-GG-----TA--CAAAAA-CA--TG-C--AAATGAT-ATTT-CTCT--G-ACT-CA--C-ACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAA-C---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAA-TAAC-C-TTA--AATTTT-TCAAT--ACGGA-T-------AA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-ATA--CTTCATATTTTAAAATAT--AAACATCCTTCTTTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAA-TTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCT
gi|13 : cCA-A-----AACAAACAATA-A-CATG--CAG-CA-------CA---AC--AACAGACCAGAAGA----C-A-GACA---------C-A-----CATC----AGA-CCGACACCAACAGACGACAC-------ATCAC-CAC---AG-A-AGCAGACAGA-TA-T-GAC-CA-CA-G----C--CA-CAC-AA-CAC-TAAA-CTT-GAAA--GT-AA-T-A---AGC---AAA-TAG-C-GA------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-A-CATG-AA-T-AT--AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AAC-TTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CAGATG-C--AAATGA-TATTTTC-----GCAC-TCA--C--CAA--TC----------CCCCAT-T-CT---TGAAAAC---TT--CCG-A---A-TA-A--ATCTT-ACTT---GACT-GATGAC-C-TT----AAATT-TCAATAAAC-GA-T-------AA-A---CAAATATTG-AGTAC-AGA-A--CTTCATA-TTTAA
gi|14 : cC-AAACAC-TAAA--CT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGCCA-AGA-T-GGA-GGCGCAA-A---CC-T----TC-AC---T---CCTGA-AATA--------ATCCAG-G--A-A-TAATGAGATT-GG--AGGAACTACA-AACTTCTG-T-AGAATCATC--CATAAA-CG-TCGTC--CAATGAT-ATTTCTTCATCGCACT------CACAG--CTAGGACAAAAATCTAGC-GACTG--TGAGAACATTTT--CGG-A--CT-TA-AATTATTTGAT-TTCAGGCTAA-TAACGCATTATTAAAATT-TCAAT--AC-G--T-ATTTTGAA-ATGTAAAATATTA-GGTGC-A-
gi|15 : cTTA-A-AGTA-T-GT-C----AA-A-AT-C-T--T-TA---AA----G-CT--ATG----------------------C--TGT----TT-AAAA-A---CG-G--AAGAT-TTT--CC--G-AAT--AA-AAT-G--A-GG--TATC--------A-TA--C---AT--A-G--TTAT---A-----AT--T-ATT---G-----AT----A----ATA---T-G------TC--TTGA-G-A-T---GA--G-T--G-A-A-C-C----A-G-AATTG-tgcaaacaaacattaagatatatattctataagagtaataacacgaaatctttcatatagatagcaat
gi|16 : cagtttcgaatctcataaaaagcactttatctaagcaaagtggcaaccttcatgtattaatacaaaataatcatattgaaatattcaattttttttaaattaaatacatgtatactttttaactttacttccatattagcagatggccaagtatatcggagaccTTA-A-AGGA-C-TT-TGCCAAA-A-AT-T-CA-T-CA----A-C--A-CT--ATAAA-GTA----------------C--TATGCGGTTGAAAA-T---TA-A--AAGAC-TTG--CC-GGTCAT--AA-AAG-G--A-TG--TATC--------A-CA--C---AG--G-G-----G---G-----TT--T-ATC---G-----AA----AAC--CTA---T-GT------C--T----A-A-T---AA--G------G-A-T-T---AG-G-AATGC-A--A--T---C-------TTAA----C--T-C---A-TT-TGTTTT--CA--G-C--ATG-TCACAAA--CA-A-GAGT-T-AATTCCCCTCCTT-GGTA-A----TT-TG-GAAA-TG-----GAAT-----AAA--AAGTC-C--CAAAA--A--TGGA-c
gi|17 : AAAA-A---TCTG--AAGAC-TTC--GC--G-AAT--AA-AAT----------TATC--------A-CA--CC--AT--G-G---------G-----GT--T-GTC---G-----AA----AA---CTA---T-G-------C--CTGA-A-A-T---AA--A-C--GGA---T-T---AG-A-AAT---G-CA--T---C--------TA-----A--A-CGTGA-TTGT---TT--CA--G-C--A-G-TCACAAA--CA-A-GAGT-T-A-T-CCCCT--TG-G-TA-A----TT-TT-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AG-TC-CAACTGAA--T--Ttatttatagcctattattctgatcagatcatatagaaa
gi|18 : aaaaaactgcaaaaattcttaaaacaataaattactctatgcggttga-C----AA-A-AT-T-C--T-TA---AA-C--A-CT--ATTAA-ATA-C-C-----TA--TG-C---AG----TTGAAAA-A---TT-G--AAGAC-TTG--C---G-AAT--AA-AAG-G--A-TG--TATC--------A-CA--C---AT--G-G--A--G---G-----TT--T-ATC---G-----AA----A----ACA---T-GT-----CC--T-GA-A-A-T---AA--A-G--GA----T-T---AG-A-AATGC-A--A--T---C-------TTAA----C--GTC---A-TT-TGTTTT--CA--G-C--A-G-TCACAAA--CA-A-GAGT-T-A-TCCCCCA--TT-GGTA-A----TT-TT-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AT-TC-C-A------------AA-ATG-G--AGTTAA-AG-T-C--TAT-T---A-----------TT--TTG--A-T---TC-AG-A-atagcctaattattctgatcaagaaatcaagttatagaaa
gi|19 : gACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGGA--AAA-T-G-A-GG------AA--CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AGCATT-AA-T-ATC-AG-G--A-A-TGA-GA-ATT-AG--A------ACA-AACTatcaattataga
gi|2 : AAAA-G---TA-ATTATGAT-TTC--ACGCG-AAT--AATAAT-G--A--A--TAACGGT-----A-TA--C---ATC-G-G--C--G---AAGTT-GT--T-ATT---GTGAGTAATAC-A----TTAAAAT-GC-----TC--TTAA-A-AAT---GA--AAC--GGATA-C-C---AA-A-A-TTG-A-TGATT---CGACCCAAT-A-----C--A-C---A-TT-T---TC--CACAG-C--A-G-TCAACACAACGCA-GAGT-T-A-TTCCCCT--TT-GGTA-AATA-TC-CA-GAAAATC-----GAAT-----AAA--AA-TC-C--CAGAA--T--T--A-ATG-G------AA-AC-A-C----T-G---A-----------CT--TTG--A-T-TACC-AG-A-T-GAAAA-A----A-A--TGA---AG-T------TGTA-TT--CAAATATGAAA-C-T--G--GTATGC--AAT-AGACCAA-G-AGG--AT-C--TTATT----ATATCTAATA-AAAGAA-A-CTTGA-A----GGCCA-GTT----AACGC-GGT-C-AGAACTTC---ATAAGCAA--TCCC-TTGCAAGAT-G---TCTTTAGCTGGATCGTGTTCGC-----T-G--TGTAAAA-AT------------AC--ATT-T-CTAAAAAT-TTAGA-A-T---TCCTCA--C-CAAG-GAC-A-TT----------------TAT--ccgaaaatcagaaataatcacagcacctggaaagtgtaatttatcataatttaagcttacaaatatctataatctgcaatttcgatatccttcatgaccgttacaggcgttgcgtcccacacatgttgtcagggaactattgacactggccggttccatagataaatggt
gi|2 : acgaattctaaatgacaaaaaA-----A--A---------TTTGGTACG--T-C----TGTCATC-CG-TAA-CTCTA-GAT-TAG--CT-ATAATGT--AG-G---GAAA--------CATACTCAACCA-C-ACC--ATCCAA---GGT--A-----GATGTTATGAAGTT--A-AAA--TG-T-AC-C--AAGGT------GAT----A-TAAAT-C-T-TATCACCTAACCACAA---AG-------AAAGGAGAAGCCAG-CAG-A-GGTCTA-C--CTCGTCA---AACGATCAT-T--CTTATTC-CATCC---TGCCAC-------GTCAT-AAT-A---AGGAAGAT-G--GC---T-CTCCATATATACGACAATC-C-ACTAGC-TATCCATCCCAG----GAAAACCCAAAATTTGGA--GTGAAAGAAAAAAC-AGG--T--GAAT-TC-AGGT-ACAATGCTAGTT-A-AAGATGGAGAG-GGGGAGGA-AAGCAGGACAATCTTCATACCCATCCC-CC-C-CC-CA-TAC-tatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatataaaatttggtacgtctgtcatccgtaactctagattagctataatgtagggaaacatactcaaccacaccatccaaggtagatgttatgaagttaaaatgtaccaaggtgatataaatcttatcacctaaccacaaagaaaggagaagccagcagaggtctacctcgtcaaacgatcattcttattccatcctgccacgtcataataaggaagatggctctccatatatacgacaatccactagctatccatcccaggaaaacccaaaatttggagtgaaagaaaaaacaggtgaattcaggtacaatgctagttaaagatggagagggggaggaaagcaggacaatcttcatacccatcccccccccatacaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagtggaaggaaataggaaggaactaacactaatcctcctcccacctatgatgaacgttgtggaaatatgcacaatgtcagcagtgaatgtctgtttgaccaaattactattccgatccatactagatgacccatttcccacctcccttcctatcagaaaaaaacagctggttaaatcgccgcgcccaaacgcgacacgccttgcctgtcgcccatgcttctgtgcggccatactgtccagtcatttatgtttgtacctcttcaataaaaaaatgttttgcgaattgtgctaaaagagtctcgtgcatttattctgtcgtcaattagcaccatataacaacacagcaatgacagagacatatctaacgaggcacgggcagaccctctttcacaaaaagaggcggctcaagtacacgattcaagaacagaccactacaagaccaagggacagatcacagcatcacacatcacaggatagaacagacacaattggtgaaacagcaagaaaaatacctcggataaatacacaacatcctagatcagactagagcagatccgaacaacacaacacagaccagaacatcgtacccgatgacacgagggccacagacagacacacagttcacatacacgacacacacctacagacgcaagcacaggacataaatcatagacaaaagacagacaccaagtatgataatcacatgaggttgaaaaaaatattctaaaagaccacacaaccacaacttgtaatcgtgagaagaggaaaataaagagcgaaactctgtactcaatccaaaagcatgaataatcagaaatgaaattggataacaaacttttgatgatacaaacaatcagaaataatctact
gi|2 : acgaattctaaatgacaaaaaaaaagtaattatgatttcacgcgaataataatgaataacggtatacatcggcgaagttgttattgtgagtaatacattaaaatgctcttaaaaatgaaacggataccaaaattgatgattcgacccaatacacattttccacagcagtcaacacaacgcagagttattcccctttggtaaatatccagaaaatcgaataaaaatcccagaattaatggaaacactgactttgattaccagatgaaaaaaatgaagttgtattcaaatatgaaactggtatgcaatagaccaagaggatcttattatatctaataaaagaaacttgaaggccagttaacgcggtcagaacttcataagcaatcccttgcaagatgtctttagctggatcgtgttcgctgtgtaaaaatacatttctaaaaatttagaattcctcaccaaggacatttattatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatata-TGGA-A-G-----GAAATAGGAAGGAACTAACACTAAT-C---CTC-CTC-CCACC-TATGATG-AAC---GTT--GTGGA--AATATGCACAATGTCA-G-CAGTG-AATGTCTGTTTGACCAAATTACTATT-C-CG-ATCCAT-A-CTAGATGACCC--A-TTTC-CC-ACCTCCCTTCCTATCAGAAA-AA--AACAGCTG-GT--TA--AA-TCG-CCG--CGCCCAAACGCGACACG--CC-TTGCCTG-T-CGCCC-AT-GCTTCTGTGCGGC-CAT-AC-TGTCC-AGTCATTTA-TGTTTGTACCTCT---TCA-AT--AAAAAAA-TGTTTTGCGAATT-GTGCTAAAAGA-G--TCTCGTG-C--ATTTAT-TC-TGTCGTCAATTAGCAC-CATATAACAA-CACAG-C---AATG-ACAGAGAC-ATATCTA-ACG-AGGCACGG--GCAGAC--------------C-CTCTTTCACAA--AAA-GAGGCGGCTCAAGTACACG-ATTCA-A-GAACAGA--C----C-----A-C-T--ACAA--G---ACCAA-G----------------------GGACAGATCAC--AG------CATCACACATCACAGGAT-AGAACAGA-CACA-ATTGGTGAAACAG---CA-AGAAAAAT-A---CCT-CGGATA-A--ATACACAAC--ATCCTAGATCAGAC-TAGAG-CA----GATCCGA---A----CAACACA-ACACA-GACCA-GA-ACATC-GTACCCGATGACACGAGGGCCACA-GACA--GACACACAGTTCACATACACGACA-CACAC-CTA-CA-------GAC-------GCA----AGC--A----C-AGGACA---------T-AAAT--CA-T----AGA-CAAAA--GA-CAGAC---ACCAAGTATGATAATCACATGAG-GTTGAA-AAAAA-TA-T-T-C-TA-AA-A----GACCA-CAC-AACCAC----AACTT-GTAATCGT-GA-G-A---AGAGGAAAA-T-A-A-AGAGCGAAA---CTCTGTACTC-AA---T---CCAAA-AGCATG-AA-TAATC-AG-A--A-A-TGA--A-ATT-GGATA------ACA-AACTTTTGAT-GA-----TA--C--AAA-CA-AT--CAGAAATAATaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagtggaaggaaataggaaggaactaacactaatcctcctcccacctatgatgaacgttgtggaaatatgcacaatgtcagcagtgaatgtctgtttgaccaaattactattccgatccatactagatgacccatttcccacctcccttcctatcagaaaaaaacagctggttaaatcgccgcgcccaaacgcgacacgccttgcctgtcgcccatgcttctgtgcggccatactgtccagtcatttatgtttgtacctcttcaataaaaaaatgttttgcgaattgtgctaaaagagtctcgtgcatttattctgtcgtcaattagcaccatataacaacacagcaatgacagagacatatctaacgaggcacgggcagaccctctttcacaaaaagaggcggctcaagtacacgattcaagaacagaccactacaagaccaagggacagatcacagcatcacacatcacaggatagaacagacacaattggtgaaacagcaagaaaaatacctcggataaatacacaacatcctagatcagactagagcagatccgaacaacacaacacagaccagaacatcgtacccgatgacacgagggccacagacagacacacagttcacatacacgacacacacctacagacgcaagcacaggacataaatcatagacaaaagacagacaccaagtatgataatcacatgaggttgaaaaaaatattctaaaagaccacacaaccacaacttgtaatcgtgagaagaggaaaataaagagcgaaactctgtactcaatccaaaagcatgaataatcagaaatgaaattggataacaaacttttgatgatacaaacaatcagaaataatctact
gi|22 : acgaattctaaatgacaaaaaaaaagtaattatgatttcacgcgaataataatgaataacggtatacatcggcgaagttgttattgtgagtaatacattaaaatgctcttaaaaatgaaacggataccaaaattgatgattcgacccaatacacattttccacagcagtcaacacaacgcagagttattcccctttggtaaatatccagaaaatcgaataaaaatcccagaattaatggaaacactgactttgattaccagatgaaaaaaatgaagttgtattcaaatatgaaactggtatgcaatagaccaagaggatcttattatatctaataaaagaaacttgaaggccagttaacgcggtcagaacttcataagcaatcccttgcaagatgtctttagctggatcgtgttcgctgtgtaaaaatacatttctaaaaatttagaattcctcaccaaggacatttattatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatataaaatttggtacgtctgtcatccgtaactctagattagctataatgtagggaaacatactcaaccacaccatccaaggtagatgttatgaagttaaaatgtaccaaggtgatataaatcttatcacctaaccacaaagaaaggagaagccagcagaggtctacctcgtcaaacgatcattcttattccatcctgccacgtcataataaggaagatggctctccatatatacgacaatccactagctatccatcccaggaaaacccaaaatttggagtgaaagaaaaaacaggtgaattcaggtacaatgctagttaaagatggagagggggaggaaagcaggacaatcttcatacccatcccccccccatacaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagTA---T-GT------C--TTGA-A-A-T---GA--G-C--AGA-A-C-C----A-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAA-TA-----CAAA-C---A-TT-T---TC--CA--G-C--A-G-TCAC--AAACC-A-GAGTAT-A-TT-CCCT--TG-GTTA-AA-A--T-CA-GAAAAAGAAAATGAATTAACCAAT--AA-TC-A-GCAGAA--T--TGAT-GTG-T--A---AA-ctact
gi|23 : TC-CTT-CCACC-CA--ATG-A-------T--C---C--AG--------ATGT------AGAA-C------------------------T-C-CA-ATC-AT-A-C-----TGCC---C-T--C-AC-AC-TAC-TCCAT--CTGGGA-AT--AA-----ATAC--TTT-AA-TGG-CCG--GG---AAA-G-AA---A--CA-ATGC-TG-C-A-CCA-AT-GCTTCTGCG--GT-A-T-GC-TGTTC-Cct
gi|24 : aaccaagtaT-T---TT--CA--G-C--A-G-TCACAAA--CA-A-AAGT-T-A-TCTCCCT--T--GGT---A-A-TT-TT-GAAAAT------GAAT-----AAA--AG-CC-C-A---AA--A--TGGA-AT--T--A---AA-TC-A-T--A-T-T---A-----------TT--TTG--A-T---TC-AG-A-t
gi|25 : tg-GAGT-T-A-TCCCCCT--TG-GC----A-A-TT-TT-GAAAATG-----AAAT-----AAG--AG-TC-C--CAAAA-----TGAA-atcaattttag
gi|26 : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TA-----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TT---CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TT--TATgcttagacctaccgggtagctattgttttgattcagaatcaaaatta
gi|27 : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TC---AA-A---TA-G--AAGAT-TT---CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TT--TATC--------
gi|3 : TTA-A-AGAAAT-TT-C----AA-C-AT-T-C--TGCG---GA-T--G-CT--ATGAAAGTA-G-CG----CGGCTT-CGGTAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AT-AAT-G--A-TAAGTATC--------A-TA--C----T--G-G--T--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-AGC-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-TT-T---TC--CA--G-C--AAG-TCACAAAAACC-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTATAA-A-TC-CA-GAAAAAG-----GAAT-----AAA--CA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTGTTA-T-T-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A---GA---AGTT------TGTT-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AATAG----AA-GGAGG--AAAT--TT-TT----ATA---AAAATAAAAGA-A-C-TGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---AATT------------ACA-A-T-T-CT-AAAAT-TT----C-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TG---C-------TA-AAC-A---TT-GCTTTG-C--ATAGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A------------TTTG--ACG--T-C----TG----C-TG-TAA-ATCTAAG-T-TAG--TTTA--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGT---A-AA---TG-T-ACACG-AAGGGA-----GAT----A-TAA-TGC-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCA-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCA--A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCAATTATT-GACA--T-C-ACTCGACTA---ATC--AG----GAA----CAA----TG-A--GTGAAG-------C-AAGAGT--GAAT-T--AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGATAG--AGGA-AATCCT-GTATAAATTTCACAAT-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TAATGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACTCTA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTTATGGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TT-C-TG-C-C-CCCAAT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TG-TTGTA----TAAATCA-AT--AAAAAAT-TG--TTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCCACG--ACGTGCTAA-----------TAC----GAACAGTAGCA-GGTACAAC---AGGACACACA---GCA-GACCAGA--CAG--C-----A-CAG--ACAC--A---ACCGATGACTCCA--C-TAG----ATC--AGACAGACCAG--AG------CG--ACACAACACACAAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGGTACCG-ATTTCCACCCGACA-ACCACACACAGC--A--TCAGCCCATGCACACAC-CACCACGA-CCGATCCATTACCGACACACACACCTGA-C--GACACA-C-ACAC------ACACAA----CACA-GACAGCGACA-A-----CGCACACACCACAGTATAA-CAG-CA-------GAC--AC--AACA----AGCAGA----CTATGACA---------C-AAGATTCA-C----AGAGCAGAC--CA-CAGACT--AC-------GACAA-CAT---AG-ATAGAACACTGA-CATG-CAC-CAGCA-G----CA-CATCAC-AAACACATAAAACTT-GAAAT-GT-AATT-A---AG----AAA-T-G-A-GG------ATG-CA-TGT--CC-AAAGTT---C--AA-AACATGAAA-C-ATC-AG-A--ATA-TGA-GA-ATT-GG---------ACATAACTGTTG-T-GG-----TACTCGAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTGTCTCG--GCACTTCACGCCACAA--CC----------CCCAGT-G-CTG--TGAAAAC---TTTCCCG-ACTCATTACA--TACCT-TC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTT-AAATATAAGACCAT-CTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CCCAGAGAA--TCTGAGTCT---A--AGAATTTCAAAG--TTCAAGGCCG-ACTATG-TGCTTA
gi|31 : T-ACA-CTAAAAAT--AC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTT
gi|32 : -ACA-CTAAAAATTTCC---AAAAATTCT-A-CCTG--A--AGAATTTC-AAG--TTC-AGGCCGAAC-AT
gi|4 : TTA-A-AGAA-TCTT-C----AA-C-ATAT-C--T-CG---GA-T--G-C---ATGAA-GTA-G-C-----CT--TT-C---AT----TTCAAAA-AC--TA-G--AAGAG-TTT--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TAATC---AT--G-G--C--GTACG-----GG--T-ATTTTGA-----AA----A----TTA---TTGT-----CT--TTAA-A-A-TC--GA--G-C--GAA-----C---AACA-AATTG-AATA--T---T--CC-AAT----------A-C---A-TTAT---TC--CA--G-C--C-G-TCACAAAG-CA-A-GAGT---A-T-CACCT--TG-TTTA-AA-A-TC----GAAAATG-----AAA-------AA--AA-TCAC-AAGAAA--T--TGAA--TG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-GGGGA-----------AT--TTG--ACT-C-TCCAG-A-T-G--AA-A----A-AAATGC---AATT------T-TG-TT--CAA----GAA-TC-TG-GTAGT-TGA--AAT-G----AA-G-AGG--AC-T--TT-TTT---ATA---AAAA-A---GA-A-CCTGACAA--TGGTCC-A-T----AA-G--GGTGC-TAAAC-TC----TATGCGA--T-CC-T-G--AGAG------CT---ACT--AT----TT--------T-G--T-T---A-TT------------ACA--CT-T-CA-AAAAT-T-----A-T---T--CGA--C-CAAG-GA--A-TT----------------TGT--C-------CA-A--------T-GCTTCG-C--AGGAAT--A-T---GT--CTAC-----TTTATT--A-AATACA---A--A---------TTTG--ACGA-T-CAG--TG----C-TG-TA---TCTA-G-T-TAG--T--A--AC-T--AG-GTTCAAAACTTAAATATATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--ATAAGCGA------GAAGTT--A-AAA--TG-T-ACA----AGGGA-----GAT----AATTA-T-C-TTAGTCCCC---C----A---TA-------AAAGGA--AGCCAGCAAG-A-GGTC-AAC--TGC--CAC--GAC----A--C--CTTA--C--AT-----CGA--C-------GTCAT-A-T-A---AAGGA-AT-G--GC---TTCTCCAT--AA--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AGAGGGGTAA---CAT----TG-AT-GTGAG--------C-AGG--T--GAA---C-AG-T-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GG--AGGA-AG----GA-AATCTT----TAA--TTCACA-C-TC-CA-TACAT--ACC-CCTA-TGGA-A-GGAAGAAAAA--GGAA--ACCTAAC-CTG-T-CGTTCTC-CTTTCCACT--A--GTG-------GTT--G---ATTCGTA--CAC-ATGGCA----AGTA-A------------------------C-C----ATCCAT-A-CTG---GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCA-A-CAGG---AT--A------G-AT--TT--AA-T---CGG--CG---GAA-A--A---A--CC-T-----G-CGC-CCC-A--GCTC---TG--GC-C-T-GC-T-TTC-CATCATTTACTGTTTGTAA--CT--ATCA-AT--AAAAAATATG-TT-GCA---T-GT-CTAAAA-AAG--T----TG-TC-ATT--T-TC-TGT-GATCAATAGCAC-AAC------A-CACAC-C---A-TGAACA-ACACCA-A--TATACA--TGCATTG---CA-GC--------------AAC-------CA---AC--GACGCA-------GACACA-A-------GA-CAGA--CAGA-C-----A-CACCAACACCGA---GCCG--GAC-TCCTCC-C-G----AC----GNNNNNNNNN--NN------NN--NNNNNNNNNNNNNN-NN-NN----NNNN-NN-------NNNN---NNNNNNNNNNN-N---NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNN--N--NNNNNNNNNNNNNTCCC-GACC-CGA-CCGACCGA----C--CACACACACC-GC-C------------------------CGA----CCC--GACC--GACA-------CACACACA---------GA-CAGACC-------GAC--AT--CTCC----CCCCCC----C-C-CACA---------CCA-----CA-C----AGA-CAGAC------AGAC---A--------GACA---------G-ATAGA-CACAGA-CA-G--AC-CA-CA------CA-CA-CAC-AAA-AC-TTAAACTTTGAAAT-GTTAA-TTA---AT----AAA-A-G-A-GG------A---AA-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AT-C-ATC-AG-AGAA-A-TGA-GA-ATTTGG--A------A-A-AACTTCTG-T-GG-----TA--CAAAAAACA---G-C--AAATGAT-ATTT-CTCG---CACT-CA--C-ACAA--CC----------CCCCAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-AA-CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAA-TAAC-C-TTA--AA--TTATCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTGGAGTAC-A-A-AAACTTCATA-TTTAAAGTATAAA--CATC-TTC-T-AT-ACA-CTAAAAAT--CC---AGAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAA----TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTT
gi|5 : acataaatattaccaaataaaattattgaaaaatatgttgattcatttaagataactctcttaaataatttatatggttaaacctgggtaactacctttccgtatggcccaaggagggaagagttggaccTTA-A-AGAA-T----C----AA-C-AT-TAC--T-CC---GATC--G-AC--ATAAC-GTA-G-CG----CG--TT-C--TAT----TGCAAAA-AAAATA-G--AAGAT-TTC------G-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-GA--C---AT--G-G-----G---A-----GTATT-ATT---G-----AC----A----ATA---T-GA-----TC--TCGA-A-A-----GA--G-C--GAA-T-CGC---TA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAAT-A-----C--A-C---AGTT-T---TT--CA--G-C--A-G-TT-CAAAAGCA-G-GAGTGT-A-GTCCCCT--TGTAGTA-AA-AAGT-CA-GAAA-TG-----AAAT-----AAA--CG-AC-T-ACAGAT--T--TGAA--TGTG--A---AA-TA-A-C--TCT-G---A-----------AT--TTG--A-T-T-TC-C--A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------GTTA-TT--CAA----GAT-TC-TG-G---TATGA------G----AA-G-AGG--AA-T--TT-T-----ATA---AAAA-AA--GA-A-C-TGA-A---TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---A-ATGCAA--T-CCATTGC-AGAG-T---TAT----CT--AT----TT--CCTGCAT-G--T-T---A-TT------------CTA-ATT-C-CT-AAAAT-TTTA--A-T---T--TCA--CATAAGCGA--A-TT----------------TGT--C-------TA-AA------TT-GCTTTGTC--AAGGAT-----C--GT--CTCT-----CTT-TT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C----TG----C-TG-TTA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGTT-AGTGT-CAAA-----------TA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--AA----GA------GAAGT---A-AA---TG-T-AC-C--AAGGGA-----TATGCTGA-AGA-T-C-T-G----CC---CCA-AG---TT-------AAAGGAGA-GCCAG-CAG-ATGGTC-A-CGTTGCG-CACTTG-C----ATGCG-CCTA--C-TATCTCCATGA--CTCCAAGAGTTAC-A-T-ACCAAAGAA-A--G--GC---TTCTCCATT-AT--GA-A--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAAA---TG-A--GTGAA--------C-AGG--T--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGAG-GAA-AG--AGGA-A-TCTT-A---GAATTTCACA---TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--A-CTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTG-AA----GTTA-G---A--AGT---CAC-ATGT---AGCAGTA-A------------------------T-CGCG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CCCAC-TCCCTCCAT--CAGGGA-AT--AA-----A-GCT-TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-A-GG---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT----AAAAT-TG--TTG-A---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-TTCATT--T-TCTTGT-GT-CAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAAC--AAAC---A--TA-AC--ATGCAC----GCACG---------------CAC----GCACAG--ACA-GACA-AAC---AGAACACA-G---ACA-GACCAGA--CAGA-C-----ATCAC--ACAC--AC--AC--A-CAC-CCA--C-C-C----AGC--CGACCGACC----GA------C---ACACAACACGAGAC-AG-AC---------AC-------AC----------ACACCG-A---CCGACCGACACACCACA-----C--A--TCAGACAGGACACACAC------------------------ACACACACAGA-GAGCA-GAC-------------------CGA----C-CA-GAC--------A-----CACAATTACCA-A-TA-GA-CAG-CA-------GACAGAC--ACCA----A-CACA----C-A-CACA---------C-A-----CA-CAGAGAGA-CAGAC--CC-CACAC---AC-------CAC-A-CAC---AGAATAG-ACACAGAGCA-GACAA-CA-CACA----CA-CA-CAC-AAACAC-ACAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGA---AAA-T-G-A-GG------AACTTT-TGT--CC-AA---T---C--AAGAACATG-AA-C--TC-AGAA--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AAC-TTTG-T-GG-----TA--CATAAA-C--ATG-CA-AAATGAATATTTTCT-G--GCAC-TCA---CACAA--CA----------CCCCATAG-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A---ACTT-AC-T---GACCTAATAAC-C-TT----AAATT-TCAAT--AC-GA-TAA----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAA-ATATAAACATCCT---CTATAACATCTAAAAAT--CC---AAATATTCTGA-CCTGCAA--GGAATTTCAAAAGTTTC-AGGCCG-AC-AT--TGCTTA
gi|6 : TTATA-AGAT-T-TTAC----AA-C-AT---C--T-CG---GA-T--G-CTGAATGAA-GTA-GGC-----CG--TT----TAG----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTCTTCC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TAC-TATTTATGCGAAA-TA--C---AT--T-GAAC--GTAGA-----GT--T-ATT---G-----AACTAGA----TTA---T-GT------CAGTTGA-ATA-TTTGGA--G-CTAGAT-A-C-CTACAA-A-AGATC-A-TT--TTCAC--CCCAAATATTCTCC--A-C---A-TT-T---CA--CA--G-CCAA-G-TCACAAG---C-A-GAGT-TTA-TTTTTCT--TTTGGTA-AA-A-TTTCA----AATG--------------AAA--AA-CC-----AGAA--T--TAAACATG-GTTA---AACAC-A-CCAT-T-A---AGACAACAACTTAT--TAG--A-TAC-TC-AG-AGTAG--AA-ATAGAA-A--TGACATAGTT-------GTA-T---CTA----GAGATC-TGTG--ATATGA--AAT-G----AACG-AGG--CA-TACTT-TTCTCAGTA---AAAACAAAGAAGA-CCTGA-AAGTTGGCCA-G-TTCGGAA-G--GGT-CCTAAAC-TT---ATGTGCAACTT-CC-TTT--GGAG-----TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--C-C---A-TTCATCGT------ACATACT-TTCTCAAAAT-CTTGCTA-TCTAT--TCAGCC-CAAA-GGCAA-TTCTTGTTAATAGCCGCATAT--T-------TACAACCA---TT-GCTTCTTA--AAGGAT--A-T---GT--CTCT-----TTAATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-T-A-ATCTA-G-TGTAG--TTAA--ATGT--AG-G--CATAA--------TA-A-------A-CAACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAG-T--A-AA---TG-TCACAA--AAGGGA-----GA-----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-A-----A-------AAAGGAG-AGCCCAGCAG-A-GGTC-A-C--T--G-CA---GATCTAAAT-CAGCTTA--CTTAT-----TGG-AC-------GTCAG-A-TAA---AAGAA-AT-GGAGC---TTCTCCA-TTAT--G-CA--T-C-ACT-GA-TT---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-AGGGTGGA--------CTCAG-GT--GAATGTC-AGGTGAC------AGTT-ACAAG-T--AAGGTGGAGAGGA-AG--AGGATAATCTT-AT---AATTTCACA-C-TC-CA-TAC-TTAACC-C-TG-TGGATA-G-----AAAA--GGAA--AACAAAC-CTG-T-C---CTC---T-CCACT-TA--GTG-AA----GTTG-G---A--AGT---CA-CA-GCTA--GCAGTAGA------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-CG----GGCCAAAA-T--CACC-AC-TCCTCGCATC-GAGGGACAT--AA-----C-GT--TTA-AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CCGTTGC-TG-C-C-CCC-ATCGCTTCTGTG--GCAC-T-GC-TGTTC-CATCA-TTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-ATAAAAAAAAT-TG--TTGCA---TGGT-CTAAAA-ATG--T----TGTT--ATT--T-TC-TGTGGTCTAATAGCAC-CAT------A-CAC-C-C---AATGAAC--AAAC-A-A--TT-AAA-CTGCATC---GCACG---------------CAC----AGACAG--ACA-GACAAAAC---A-GACACA-A---ACACGACCAGA--CAGA-CCCACAA-CAC--ACAC--ACACACCAC-GCC-ACA--C-C-G----ACCCAAGACAG--CAGGCAAGACAGCCG--ACA-GACACAC-ACAAG-ACGA--CACACAC-------ACACCCGCACGGACACCACA---CCA-CTACCG-AC--CACAGAGCCAA--CCAGACAGCTCACATGC-ATCC-CGA-CAGA--GA----CAACACAGACA---GA-CACGACACA-CAACAG------ATACGAC---CACAGGACA--GAC--A-----CACACACA-CACA-CACGACCAC-CACACGACCGAC--ACCGAACAC---AGCAG-----C-C-GACACCCCCCCCCC-A-----CACC----ACA-CAG----CA-CAGAC---A--------GACA---AC---AG-AT---ACA-AGA-CA-G-CAC-------A----CA-CA-CACAAAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-AAAGAA----AAA-T-G-A-GA------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--NN-NNNNNN-NN-N-NNN-NN-N--N-N-NNN-NN-NTT-------------------TTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-
gi|7 : TTA-A-AGA--T-GT-C----AAAC-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGA--GTA-GGC-----CAA-TT-C--TAT----TCAGAAA-A---TA-G--A-GAT-TTC--C---G-GAT--AA-AAT-G--AGTA--TATC--------A-TA--C---AT--G----C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----AA---TTA---T-GT------C--TTGA-A-T-T---GA--GGC--GAA---C-C---AA-T-AATTG-A-TAA-T---CGTCCCAAATAT----C--AGC---A-TT-T---TCTCCA--G-C--A-G-TCACTAAAACC-A-GAGT-T-A-TTCTCTT-----GGTA-AT-A-AT-CA-GAAA-TG-----AGAT-----AAA--A---T-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-AAC--T-T-G---A-----------AT--TTG------T-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT-------GTAATT--CAAT---GAAATC----A--GTATGATAAAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT-----TA---AAAA-A---GA-A-CCTGA-A---TGGCCAAG-T----AA-G--GGT-C-TAA-C-TC-----ATGTAA--T-CC-TTG--AA---G---TCT---AC---AT----T---C-----T-G--T-----A-TT------------ACA--CT-T-CT-AA--T-TT------T---T--TCA--CGCAAG-GGT-A-AT----------------TGT--CC------TA-TAC-A---TT-GCTTTGTC--AAGGAT--AATC--AT--CCTC-----TTTATTTAA-AGTA-----T--A---------ATTG--ATG--T-C-G--TG----C-TG-TAA---TTA---T-TAG--T--A--AT-T--AG-GT-CAAAA--------TATA-------ATC-ACC--A---AAAA-GTA--A-----GA------GAA--T--ACAA---TG-T-ACAT--AGGGCA-----GAT----A---A-T---T-AGTCCCC-----A-AA---GA-------AA-GGAGA-GC--AGCGA-C-GGTC-A-C--TGC---A---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA--C-------GT-GC-A-T-A---AAGA---T-G--GC---TT-TCCATTT----GCCA--T-C-A-T-GA-TA---AT---AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AAG-----------------------------T-A-AAG-T--AAGG-GGG-AG---AG--AGGA-AATCT----ATAA--TTCACAAC-TC-CA-TAC-T--ACCTC-TA-TGGA-A-------AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTGGAA----GTT--G---A---GT---CAC--TGT----ACAGTA-A------------------------TGC-CGGATC-A--A-C-----GACC---A-T--C-C--A--TCCCTTCATA---GGGA-AT--A--------GC--TT--AAATGG-CGG---A---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-C---AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATAATTTA-TGTTTGTA---CT---TCA-AT----AAAAT-TG-TTTGC----T-GT-CTAAAA------T----TG-T--CCT--TGTC---T-GTC--ATAG------C------A-CACAC-CTAAAATTATCA-AAAtcagaaata
gi|8 : ctcctacttttctcagcgcagttttcgaatcgtaaaaggcctcatttaagtgcagattggcccaccgttcatataatttacaaaataaacaatattgaaaatattttgatatcctaaatactccttaatatattttatacgtgttactggtaactttactttcgtatgaagggaggtaaattggacA-G-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--GGCT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TTAC--TGT----T-CAAAA-AAG-TA-G--AAGAT-TTC--C-----AATTAAA-AATTG--A-TA--TATC--------AGTAG-C---AT--GTG--C--G---ACATTAGT--TGATT---GC----AA----A----TTA---T-GTGCGATTC--TTGA-A-A-T---GAATG-C--GAA-A-C-C---AA-ATAGTTG-AATA--T---C--TCCAATAC-----C--ATC---A-TT-T---TTT-CA--G-C--A-G-TCACAAACGCA-ACGAGT-T-A-TTCCCTT-----GGTA-TATA-TT--A-GAAAATT-----AAA-------AA--AA--C-C-ACAGAA--CACGGAA-ATA-G--A---AA-ACCA-C--T-T-G---A------------T--TTG--A-T-T-CC-AGGA-T-G--AATA----A-A--TGA---AGTTGATTAGTGTA-TTGTTAA----GAAATC-TT-G--GTATGA--AAT-G----AA-A-AGA--AT-C--TT-TT----ATA---AGAA-AA--GA-ATCCTGA-AA--ATGCCA-G-T----AA-A--TTT-C-TAAAC-TCATTGTCTGCAA--T-TC-TCT--TGAG-GTATTCTG--ACTTAGT----TT--C-----T-GTTT-T---A-TTTTGTACCCCACCACA-CCTAC-CT-AAGAT-TT----A-T---T--TCAAGC-CAAG-AT--A-AT----------------TGT--TAATGCCATA-ATC-A----T-GCTT-GCCGGAAGCAT--G-TTCGGTTGCTCTCGGTATTTAGC--G-AATATCCTGA--AGACATGAATTTTG--ACGCCT-C-GTCTG----C-TG-TGA-ATCTACG-T-T-T--TT-A--CTG----G-GT-TAACG--------TGTT-------G-C-ATT--A---AACAGATA--C-----GA------G-AGTTTCA-AA---TG-T-----------GA-----GAT------TAA-T-TAT-A----CA---CCA-GATATGA-------AAAAGAGagctgaatagggtcttagattctaagaatagaacgtgagaacaatatgcgtgaactgcaagttatacgttctaaaacagtttaaccaaaacaaacaataacatgcagcacaacaacagaccagaagacagacacacatcagaccgacaccaacagacgacacatcaccacagaagcagacagatatgaccacagccacacaaca
gi|9 : cgctagcttatccatctcctacttttctcgcgaagtgacagttcttttctgtaatcctggcataaaaggcactttcattcaatgctagatgtgccaacccttcatatagtatatgtaccaaataaacatagttaattttgagaaaagtcatatttataatttcatttaaatactctcttaatatatgtatgatgtttaacctctctggtttaaacaccgttattatctaattacggtttctaattataggacgataaaggcagagcgcctattgagattcctaaa-A-AGAA-TGTT-C----AA-CCAT-T-TCAT-CGATGGA-CTGG-CT--AT--A-GTATG-A-----CG--TT-C--TAT----TCCAGAATAC--TA-G--AAGAA-TTC--TC-CG-AAT--AA-AAT-GTGA-TA--TAT---------A-TA--CGACATTGG-G--TTAG---A-----GTA-T-ATT---G-----AA----AAGTGTTA-----GT------C--TGGAGA-A-A---GA--GGC--AGA-A-C-C---AA-T-A--TGTA-TA--TT--C--CCCAAT-A-----C--A-----A-TT-T---TC--CA--G-C--A-G-TCTCAAAA--C-A-GAGT---A-TTCCCCT--TG-G-TA-AA-A-AT-CA-GAAATTG-----AGAT-----AAA--CA-TC---ACAGAT--T--TGAA--TG-G--A---AATAC-A-C--T-TTG---A-----------AT--TTG--A-T-C--C-AG-ACT-G--AA-A----A-A--TGA---AGTA------TGTA-TT--CAA----GAAATC-CT-G--GTATG---AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----AT----AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AAG-TGGCC--G-T----AA-AGCGGT-C-TAAAC-TC-----ATGCAA--T--C-GTG--ACGA-G---TCT---ACT--AT----TT--CG----TGG--T-T---A-TT-------------CA-ACT-T-CT-AAACTCTT----ATT---T--TCA--C-CAAGAGG--A-TT----------------TTC--C-------TA-AACTA---TTGGCTTTGTC--AAGGACTAA-TC--GT--CTCTTC---TTTATT----AATA-----T--A---------TTTGA-ACG--T-C-A--TG----C-TGCT---ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-C-AAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AG---GT---A-----GA------GAAAGT--A-AA---TG-T-GTACCAGAGGGAGTAGTGAT----A-GAA-T-C---AGTT-----------A---GATCATTACAAAGGAG-AGCCA-GCAGAA-GGTC-ATC--TGCG--A---ACC----ATCC--CTTA--C-TAT-------G-AC-------G-CATGA-C-A---AAGAA-ATCG--GCCGTCTCTCCCTTTAT--GACA--T-C-A
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): CTACTTATTTCTCAGGCGAAGTTATCGGAATCACCGGTAAAAAGAGCCACTTACATAACAATAGCAGATTGGCCACCTCACTGTATACATATTACCAACAAAAATAACAATATTGAAAATATTTTGATCATTTAAATAACTACTCTTAAGTATATTATATGTTAACCCTGGTAACTTTATTATCGTCATTAGCGAGCAAAAGGGAGAAAATTG
Unaligned ( gi|21 ): GCTGCTTCCGCTAACTCTTTCTCAGCGACAGTCTTCGATCTCGGTAAAACAAGGTCATGTCATTCAATGCGCAGATGGCCCGCTTACATATAATATACCAAATAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
Unaligned ( gi|28 ): CCTCTCCTATCTTTTCTCAGCACAGTTTCGATATCCGGTAAACAAGCACTTCATCAATCAGATTGGCCACC
Unaligned ( gi|29 ): TTATATATTAATGTTAATATCCCTGAGTAACTTACTTTGTATGCAAAGGGAGGGGTAAATCTGAGAC
Unaligned ( gi|30 ): AAATGGAATAAAATTCCCAAAATGGAGTTAATGTATATTATTTTGATTCAGAATCAATTATAGAAA
Alignments
lowQualScore : 1111 1111111111111 111 1111111 11111111 333333333333333 111111111 111111111 2222222 1111111111 222222222222222222222222222 111 222 1111 1111 111111111111 111 22222222 11 1111 1111 1111 111 111 11 222222 11 11111 111111111111111111111111 11111 333333333333 222222 11 11111 33333333333333333333333333333 111111 22222222 11111 1111 333333333333333333 11 11 2222 1111 11 11 11111111 1111111 111 11111 111111 111 2222 11111 1111111 222222222222222222222 11 1 2222222222222222222222 11 333333333333333333 111 11 1 1111 1111 11 333333333333333333 1 111111 111 1 222222222 111 11 11111 1111 22 1111 2222222222222222222 444444444444444444444444444444444444 11111 111 11 222222222222 11 111 111 11 11111111111 11 11 111111 11 111 6666666666666666666666666666666666 111111 222222222 11111111 1 11111 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 11111 11 6666666666666666666666 111 1 222222222222222 11111111 2222222222222222 1111 1111 111 1111111 111111 2222 11111111 55555555555555555555 111111 1111111 3333333333333333333 222222222222222222 1 2222 3333333333 111 11 111111111 11111 111111111 22 11 111 33333333 2222222222 11 1 1 111 111111 111 1 11 1 111 111111
lowQualScore : 3 3 3 6 3 6666 3 3 3 3 77 3 555 4444 3 44 3 7777777777777 3 88 6666 33 2 333 2 33 2 4444444 2 33 2 2 33 2 66 55555555 3 77 888 77 3 444444444444444 77 3 222222222 999999999 555 2 4444444 33 0 2 2 2 777 33 1111111111 2 555 2 2 3 2 6 222222222222222222222222222 555 3 5 222 66 33 2 33 5 2 2 2 222 66 2 555 5 0 99999 2 2 5 2 7777 2 66666 66666 33 2 1111 77777 99 3 44 555 6 3 3 0000 3 666 999999999999 55 55 3 333 3 3 7 4 66 4 9999 4 66 777 11111111 4 00 3333 1 0000 666 66 4 9999 4 4 66 4 66 4 3333 777 8 222 4 4 2 4 777 4 4 9999 4 00 4 4 4 444444 66 4 4 00 66666 888888888888888888888888 4 66 00000 4 555555555555 99 4 4 8 4 666666 777 66 22 8 55555 4 66666666666666666666666666666 5 0 555555 5 888 66 11111111 66 1 99999 0000 444444444444444444 00 00 4 3333 9999 4 4 1111 8 4 4 66 00 66 1 00 4 66 66666666 4444444 4 4 66 777 333 66 55555 222222 9999 4 666 4 4 3333 0 11111 2222222 4 77777 2 3 777777777777777777777 55 77 5 5 5 0 66 4444444444444444444444 66 00 444444444444444444 66 222 777 4 4 66 777 55 00 66 4 4 0 5 888 66 0000 888 5555 5 88 777777777777777777 88888 0 444444 5 5 5 66 5 11 555 777 0 777777777 222 4 4 4 11 5 5 66 4 4 11111 66 66 1 4 4 4 8888 4 4 11 55 4 2222 0000000000000000000 888888888888888888888888888888888888 4 4 4 8 4 4 99999 111 4 55 4 4 8 44 4 55 111111111111 33 4 4 55 777 4 777777 55 4 4 4 4 4 4 4 99 4 4 4 4 4 1 4 888 888 4 222 4 77 1 777 4 4 00000000000 4 55 66 4 4 8 44 4 888888 4 4 777 77 777 66 5 666 4444444444444444444444444444444444 111111 888888888 22222222 5 0 66 55 22222 5 11 66 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 888 55 5 999999999999999999999999999999999999999999999999 0000 0 0 7 11111 6 22 6 0000000000000000000000 6 2 888 3 99 3 444444444444444 1 77777777 5 3333333333333333 0000 1 1 1111 5 0 55 222 6666666 000000 2 0000 0 55555555 44444444444444444444 777777 2 5 0000000 5555555555555555555 777 5 0 444 4 666666666666666666 4 4 8 3 4 1 3 3 3 7 3 666 6666 3 3 3 3 4444444444 3 55 3 666 000 00 3 3 888 3 3 55 3 3 3 3 3 333333333 3 2 4 4 00000 55 2 4 888888888 00 00 444 99999999 66 1111111111 77 999 66 888 66 5 11 5 0 7777 5 5 888 0 2 5 5 888 3 5 66 5 5 888888 5 555 5 777 5 77 1 88 1 1 6 0 5 66 777 3 5 000000 66 5 5 5 5
lowQualScore : . . . . . .... . . . . .. . ... .... . .. . ............. . .. .... .. . ... . .. . ....... . .. . . .. . .. ........ . .. ... .. . ............... .. . ......... ......... ... . ....... .. . . . . ... .. .......... . ... . . . . . ........................... ... . . ... .. .. . .. . . . . ... .. . ... . . ..... . . . . .... . ..... ..... .. . .... ..... .. . .. ... . . . .... . ... ............ .. .. . ... . . . . .. . .... . .. ... ........ . .. .... . .... ... .. . .... . . .. . .. . .... ... . ... . . . . ... . . .... . .. . . . ...... .. . . .. ..... ........................ . .. ..... . ............ .. . . . . ...... ... .. .. . ..... . ............................. . . ...... . ... .. ........ .. . ..... .... .................. .. .. . .... .... . . .... . . . .. .. .. . .. . .. ........ ....... . . .. ... ... .. ..... ...... .... . ... . . .... . ..... ....... . ..... . . ..................... .. .. . . . . .. ...................... .. .. .................. .. ... ... . . .. ... .. .. .. . . . . ... .. .... ... .... . .. .................. ..... . ...... . . . .. . .. ... ... . ......... ... . . . .. . . .. . . ..... .. .. . . . . .... . . .. .. . .... ................... .................................... . . . . . . ..... ... . .. . . . .. . .. ............ .. . . .. ... . ...... .. . . . . . . . .. . . . . . . . ... ... . ... . .. . ... . . ........... . .. .. . . . .. . ...... . . ... .. ... .. . ... .................................. ...... ......... ........ . . .. .. ..... . .. .. ......................................................... ... .. . ................................................ .... . . . ..... . .. . ...................... . . ... . .. . ............... . ........ . ................ .... . . .... . . .. ... ....... ...... . .... . ........ .................... ...... . . ....... ................... ... . . ... . .................. . . . . . . . . . . . ... .... . . . . .......... . .. . ... ... .. . . ... . . .. . . . . . ......... . . . . ..... .. . . ......... .. .. ... ........ .. .......... .. ... .. ... .. . .. . . .... . . ... . . . . ... . . .. . . ...... . ... . ... . .. . .. . . . . . .. ... . . ...... .. . . . .
lowQualScore : 3 3 3 7 1 5555 1 1 1 1 33 1 444 1111 1 22 1 2222222222222 1 55 5555 55 7 777 7 77 7 5555555 7 77 7 7 77 7 33 44444444 1 33 555 33 1 333333333333333 33 1 888888888 888888888 000 9 4444444 99 8 9 9 9 999 99 8888888888 9 000 9 9 6 9 2 555555555555555555555555555 444 1 7 999 88 99 9 99 7 9 9 9 777 66 7 555 3 5 99999 7 7 3 7 9999 5 77777 77777 77 7 5555 77777 44 3 66 888 7 6 6 1111 6 444 666666666666 00 00 6 666 6 6 3 4 11 4 4444 4 11 888 11111111 4 66 9999 9 9999 222 11 4 4444 4 4 11 4 11 4 9999 888 9 000 4 4 9 4 999 4 4 4444 4 66 4 4 4 000000 11 4 4 66 11111 333333333333333333333333 4 11 33333 4 666666666666 00 4 4 9 4 999999 888 11 22 9 66666 4 33333333333333333333333333333 0 4 999999 0 888 99 22222222 99 4 44444 9999 333333333333333333 66 66 4 4444 4444 4 4 8888 9 4 4 11 88 11 1 66 4 33 11111111 4444444 4 4 11 888 999 11 66666 888888 8888 4 777 4 4 4444 8 11111 3333333 4 11111 9 9 444444444444444444444 66 99 0 0 0 0 99 9999999999999999999999 99 11 222222222222222222 99 444 888 4 4 11 888 66 66 11 4 4 0 0 888 99 6666 888 6666 0 88 222222222222222222 55555 0 444444 0 0 0 99 0 66 888 000 0 000000000 444 4 4 4 99 0 0 44 4 4 11111 11 11 8 4 4 4 0000 0 0 00 55 0 5555 8888888888888888888 000000000000000000000000000000000000 0 0 0 0 0 0 55555 000 0 55 0 0 0 55 0 55 111111111111 55 0 0 55 000 0 555555 55 0 0 0 0 0 0 0 55 0 0 0 0 0 1 4 333 000 4 444 4 22 9 888 4 4 99999999999 4 00 11 4 4 9 11 4 999999 4 4 888 22 111 99 0 444 5555555555555555555555555555555555 111111 444444444 11111111 0 8 99 11 55555 0 99 99 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 000 66 7 222222222222222222222222222222222222222222222222 5555 2 2 0 00000 7 55 7 5555555555555555555555 7 5 333 3 88 2 222222222222222 0 99999999 7 8888888888888888 6666 0 4 2222 0 2 11 999 2222222 222222 0 6666 2 66666666 99999999999999999999 666666 5 0 9999999 4444444444444444444 888 0 4 888 4 999999999999999999 4 4 0 2 0 0 6 6 6 3 6 444 4444 6 6 6 6 2222222222 6 00 6 444 000 00 6 6 555 6 6 00 6 6 6 6 6 111111111 6 6 0 0 00000 55 3 0 666666666 33 11 444 55555555 99 9999999999 00 444 99 888 99 0 99 0 0 6666 0 0 888 4 6 0 0 111 4 0 99 0 0 999999 0 666 0 111 7 99 4 88 0 7 7 0 0 99 555 6 0 222222 99 0 0 0 7
consensus : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-C--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-TT-T---TC--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA-A-CA-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTA-AA-A-TT-CA-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------TGTA-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-AAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TGT--C-------TA-AAC-A---TT-GCTTCGTC--AAGGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-TAA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGTT--A-AA---TG-T-ACAC--AAGGGA-----GAT----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCG-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCAT-A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATTTAT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AGG-GT--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGA-AG--AGGA-AATCTT-ATATAAATTTCACA-C-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACT-TA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTCA-GGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAAAAT-TG-TTTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCACCG--GCACGC--------------CAC----GCACAG--ACA-GACACAAC---AGGACACG-A---ACA-GANCAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A---ACCGA-GA--C-CCAC-C-G----ACC--AGACAGACCAG--AA------CG--ACACGACACACGAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGACACCG-A---CCG-CCGACA-ACCACACACAGC--A--CCAGA-CAGCGCAC-ACAC-CACC-CGA-CCGA---A----CGA-CACACACACC-GA-CA-GACAC-A-C-ACAC------ACACGA----C---ACA-GAC-A--GA-CA-A-----CA----CACACACCAC---A-CACGA-CAG-CA-------GAC--AC--AACA----AGCAGA----C-A-GACA-------------CA-----CA-C----AGA-CAGAC--CA-CAGAC---AC-------GACAA-CAC---AG-ATAGAACACAGA-CA-G-CAC-CA-CA-A----CA-CA-CAC-AAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-A-GG------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTTTCTCG--GCACTTCA--CCACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAATATAAAAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTA
Reference ( family-511 ) : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-C--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-TT-T---TC--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA-A-CN-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTA-AA-A-TT-CA-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------TGTA-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-AAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TGT--C-------TA-AAC-A---TT-GCTTCGTC--AAGGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-TAA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGTT--A-AA---TG-T-ACAC--AAGGGA-----GAT----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCG-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCAT-A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATTTAT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AGG-GT--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGA-AG--AGGA-AATCTT-ATATAAATTTCACA-C-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACT-TA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTCA-GGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAAAAT-TG-TTTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCACCG--GCACGC--------------CAC----GCACAG--ACA-GACACAAC---AGGACACG-A---ACA-GANCAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A---ACCGA-GA--C-CCAC-C-G----ACC--AGACAGACCAG--AA------CG--ACACGACACACGAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGACACCG-A---CCG-CCGACA-ACCACACACAGC--A--CCAGA-CAGCGCAC-ACAC-CACC-CGA-CCGA---A----CAA-CACACACACC-GA-CA-GACAC-A-C-ACAC------ACACGA----C---ACA-GAC-A--GA-CA-A-----CA----CANACACCAC---A-CACGA-CAG-CA-------GAC--AC--AACA----AGCAGA----C-A-GACA-------------CA-----CA-C----AGA-CAGAC--CA-CAGAC---AC-------GACAA-CAC---AG-ATAGAACACAGA-CA-G-CAC-CA-CA-A----CA-CA-CAC-AAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-A-GG------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTTTCTCG--GCACTTCA--CCACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAATATAAAAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTA
gi|1 : TTA-ACAGAA-T-TC-C----AA-C--T-T-C--T-CG---GAAT--G-CT--ATGAA---A-G-CTTCAGCG--TT-CATCAC----TTCAAAA-A---TA-G--AAGATCTTC--CG-CG-AAT--AA-AAT-A--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATTCG-A-----AA----A----TTA---T-GTCT---TG--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-A-TTG-A-TAA-T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-TT-TC--TC--CA--GGC--A-GATCA-C-AAA---CC-A-GAGT-T-AATTCCCCT--TG-GATA-AA-A-TG-CAAGAAAAGA-----GAAT-----AAACAGA-TC---ACAGAAATT--TGA---TG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------ATGATTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----ACA--TGA---AGTT------GCTA-TTT-CAA----CAAATCATG-G--TTATGA--AAT-G----AA-G-AAGCGAA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGAA-G-CCTGA-AA--TGCGCA-A-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GC-TGCAA--T-CC-TTG--AGAGAG---TCTC--ACT---T----CT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-TAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAT-GA--ATTT----------------TGTCCC-------TA-AAC-ATCTTT-GCTTATTC--AAGGAT--ATTC--GT--CT-T-----ATAATT--ATAATA-----AACA---------TTTG--ACG--TAC-GA-TG----CATG-TAACATCTA-G-T-TAAGCTT-A--ATGCTAAG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACCATA---AA---GTAAGA-----GA------GAAGTT--A-AAAATTGTT-AC-C--A--GGA-----G------A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---G--------AAAGGAG-AGCCCAGCAG-A-GGTC-A-C--T--G-CA---GAC----AT-C--CTTA--C---T-----TG--AC-------CTCAT-A---A---AAGAA-AT----GC---TTCTCCATCTAT--GACA--CGCAACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-AAGGTGAAG-------C-AAGTGTTGAAAT-TCAAGGTGAC------AGTTAA-AAG-T--AAGG-GGGAAG---AG--CAGG-AATCCT-TTATAATTTACACA-T-TCACATTAC-T--ACC-C-T--TGGA-ATG-----AAAA--AG-G--AACTAA--CTG-TGC---TTCGCTT-CCAC--TA--GTG-AA----GTT--A---G--AAT---CA-CATGTAT-GCCAGT--A------------------------T-C-CG-ATC-ATCA-C-----GGCC---A-T----CC-ACGTCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AC-----A-GC--TTTCAA-TTG-CGGACCG---AAA-G-GA---AACCC-TTGC-TGCC-C-CCC-AT-GCTTCT-TGT-GC-C-TAGCATGTTCACATCATGTA-TGTTTGTAAC-CT--ATCAGATA-AAAAAAT-TG-TTTGCA---T--T-CTAAAA-A-G--T----TG-T--TAT--T-TC-TGT-GT-CAATAGCAC-CACCA----A-CACACTC---AAT-AAC--AAAC-A-A--TT-ATACATGCACCACTGT-CG---------------CAC----GCACAG--ACACGACA-AAC---A--ACACA-G---ACA-GAACAGA---AGACC-----A-CACA-ACAC--A---GACG--GA--T-CCAC-C-ACCACACC--AGACACA-CAC--AA------CG--ACTCAACA
gi|1 : ccttcatataatattaccaaaataaacaaatatgaaaaaagttttatgattacattcctaatattatttatcgttaactcctcgagtaattactttccgtattgcaaagggagggctaacacattgagaccA-CAC---AG-CTA-AACACAGA-CA-C-AAC-C--CA-ATGTACA-CA-CACCAAACAC-TAA--CTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-AAGG------A---CT-TGT--CCCAA---TG--C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-AATGA-GA-AGT-GG--A------ACA-AATCTTTG-T-GG-----TA--CAAAA--CA--TG-C--AAATGAT-ATTTCCTCG---CACT-CA--C-ACAAATCA----------CCCA-T-C-CTG--TGAAAAC---TT--CCGGA--CA-TAGA--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTG--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAAAA---AAAATATTG-AGTACAA-A-A--CTTCATA-TTTAAAATAT-AGAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--AATAGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagatagacacagctaaacacagacacaacccaatgtacacacaccaaacactaacttgaaatgtaataagaaatgaaggacttgtcccaatgcaaaacatgaacatcagaaaatgagaagtggaacaaatctttgtggtacaaaacatgcaaatgatatttcctcgcactcacacaaatcacccatcctgtgaaaacttccggacatagatacttactgactaaataaccttgaaaatttcaatacgataaaaaaaaaatattgagtacaaaacttcatatttaaaatatagaacatccttcttatacactaaaaatccaaaatttctgacctgaatagaatttcaaagttcaggccgacatgtgctta
gi|10 : ccttcatataatattaccaaaataaacaaatatgaaaaaagttttatgattacattcctaatattatttatcgttaactcctcgagtaattactttccgtattgcaaagggagggctaacacattgagaccttaacagaattccaacttctcggaatgctatgaaagcttcagcgttcatcacttcaaaaatagaagatcttccgcgaataaaataatatatcatacatggcgagttattcgaaaattatgtcttgttgaaatgagcgaaaccaaaattgataatccccaattacacatttctccaggcagatcacaaaccagagttaattccccttggataaaatgcaagaaaagagaataaacagatcacagaaatttgatggaaaacacttgaatgattgatctcagatgaaaacatgaagttgctatttcaacaaatcatggttatgaaatgaagaagcgaatttttataaaaaaaagaagcctgaaatgcgcaataagggtctaaactcgctgcaatccttgagagagtctcacttctctgttattacaacttcttaaatttatttcaccaatgaattttgtccctaaacatctttgcttattcaaggatattcgtcttataattataataaacatttgacgtacgatgcatgtaacatctagttaagcttaatgctaaggtcaaaatataacaccataaagtaagagagaagttaaaaattgttaccaggagataatctagtccccccaaagaaaggagagcccagcagaggtcactgcagacatccttacttgacctcataaaagaaatgcttctccatctatgacacgcaactgataatcaggaaacaatgaaggtgaagcaagtgttgaaattcaaggtgacagttaaaagtaagggggaagagcaggaatcctttataatttacacattcacattactacccttggaatgaaaaaggaactaactgtgcttcgcttccactagtgaagttagaatcacatgtatgccagtatccgatcatcacggccatccacgtccctccatacagggaatacagctttcaattgcggaccgaaaggaaacccttgctgccccccatgcttcttgtgcctagcatgttcacatcatgtatgtttgtaacctatcagataaaaaaattgtttgcattctaaaaagttgttatttctgtgtcaatagcaccaccaacacactcaataacaaacaattatacatgcaccactgtcgcacgcacagacacgacaaacaacacagacagaacagaagaccacacaacacagacggatccaccaccacaccagacacacacaacgactcaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagatagTCACG-CCTC-CA-CAC-TC-ACC-C-TC-TAG----G-----ACAA--GCAA----C--AT-CTG-T-C---TTC-CT--CCACT--A--GTC-GATAACGTTTAG---A--AGTT--CACCATGTC----CAGTA-A------------------------T-C-CG-AT--AT-AAC-----GGCC---AAT--C-CC-AC-TCCCTCCATC-AAGGGA-ATTGAA-----G-CCCTTT--AA-TGGGCGG--CG---AAG-G------A--CC-TTGC--G-C-C-----AC-ACTTTTG--------------------CAT-ATTT---GTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAA--T-TG-TT-GCA---T-GT-CTAAAA-A-AGTT----TG-T--TAT--T-TC-TGT-GTC-AATAGCACACAC------AACA-AC-C---AATGAACA-AA-C-A-A--TA-ACA--TGCA-----GCACGC--------------CAT----GCACAG------GACA---------GACACG-A---ACA-GA-CAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A----CCGA-CA--C-T-AC-C-A----ACC-------GACC-G--AA------CG--AC--GACACCCAAC-AG-AAGAGACACAGAC-------AGAC---CACA--CAC-G-A---CCGACCGACA-GACACACACA-C--A--CAAGA-CAGCATAC-ACACACACC------------A----CAA-CAGACAGACCTGA-CA-GACAC-A-C-ACAC------AGAAGA----C---ACA-ACCGA--GA-CA-C-----GA----CCGACAC-AC---A-CACGA-C---CA-------CCC--AC--AACAC---AGCAGAGAACC-C-GACA-------------CA-----CA-C----A---CAG----CA-CAGGC---AC-------------------AG-ATAGA-CACAGA-CA-G-CAC--A--A-A----CA-CA-CAC-AA-CAC-TAAA-CTT-GAATT-GT-AAGT-A---AG----AA--T-G-A-GG------AA--CT-TGT--C--AA---T---C--AA-AACATG-AAGC-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACG-AAACTTTG-TGGG-----TA--C-AAAA-C--ATGTC--CAATAA-TATT---TCGC-GCAC-TCA---CACAA--CC----------CCC-AT-C-TTGAACGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--T-CTT-AC-T---GA-TAATAAAC-C-TT-----CATT-TCAAT---C-GAGT-A----AAA-AAG-AAAATATTG-AGTAC---A-A--CTTCATATTTTAAGCTAT---AACATCTTCC-TTATCACA-CTAAAAAT--CCATGAAAATTTCTGA-CCT------AGAATTTCAAAG---TC-AGGCCG-AC-ATGTTGCTTA
gi|11 : taC-------GACAT-A---A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATT-AT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--CTGAA--------C-AGG--T--GAAT-TT-AGGT-AC------AATT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAG-------AGGA-AATCTG-ATA---ATTTCACA-C-TC-AA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CAC-ATGT---AGCAGTA-A------------------------T-T-TG-ATC-AT-A-C-----GGCC---C-T--C-CC-AC-TCCCTATAT--CAGGGC-AT--AA-----G-CT--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATAATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAAAAA-TG--TTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-TC-ATT--T-TC-TGT-GT-CAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAAC--AAAC-A-A--TA-AC--ATGCA--A--ACACGCNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNN--NNN-NNNNNNNN---NNNNNNNN-N---NNA-GAGCACAACCACA-C-----A-CAC--ACAC--A---CCCG---------CACTC-G----ACG--CGACCGACC----------------ACAC-ACACAAGAC-AG-CA----CACA-AC-------A
gi|12 : ttactcctacttttctctgAAGACAGA-CA---CACACA-CA-C----AA-CA-CAC-GAACAC-TAAA-CTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAAAT-G-A-GG------AAC-TT-TGT--CC-AA---TATGC--AA-AACATG-AAAC-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTT-G-T-GG-----TA--CAAAAA-CA--TG-C--AAATGAT-ATTT-CTCT--G-ACT-CA--C-ACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAA-C---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAA-TAAC-C-TTA--AATTTT-TCAAT--ACGGA-T-------AA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-ATA--CTTCATATTTTAAAATAT--AAACATCCTTCTTTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAA-TTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCT
gi|13 : c-CA-A-----AA----CAAACAATA----A-CATG--CAG-CA-------CA---AC--AACAGACCAGAAGA----C-A-GACA-------------CA-----CATC----AGA-CCGACACCAACAGACGACAC-------ATCAC-CAC---AG-A-AGCAGACAGA-TA-T-GAC-CA-CA-G----C--CA-CAC-AA-CAC-TAAA-CTT-GAAA--GT-AA-T-A---AGC---AAA-TAG-C-GA------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-A-CATG-AA-T-AT--AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AAC-TTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CAGATG-C--AAATGA-TATTTTC-----GCAC-TCA--C--CAA--TC----------CCCCAT-T-CT---TGAAAAC---TT--CCG-A---A-TA-A--ATCTT-ACTT---GACT-GATGAC-C-TT----AAATT-TCAATAAAC-GA-T-------AA-A---CAAATATTG-AGTAC-AGA-A--CTTCATA-TTTAA
gi|14 : cC-AAACAC-TAAA--CT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGCCA-AGA-T-GGA-GGCGCAA-A---CC-T----TC-AC---T---CCTGA-AATA--------ATCCAG-G--A-A-TAATGAGATT-GG--AGGAACTACA-AACTTCTG-T-AGAATCATC--CATAAA-CG-TCGTC--CAATGAT-ATTTCTTCATCGCACT------CACAG--CTAGGACAAAAATCTAGC-GACTG--TGAGAACATTTT--CGG-A--CT-TA-AATTATTTGAT-TTCAGGCTAA-TAACGCATTATTAAAATT-TCAAT--AC-G--T-ATTTTGAA-ATGTAAAATATTA-GGTGC-A-
gi|15 : cTTA-A-AGTA-T-GT-C----AA-A-AT-C-T--T-TA---AA----G-CT--ATG----------------------C--TGT----TT-AAAA-A---CG-G--AAGAT-TTT--CC--G-AAT--AA-AAT-G--A-GG--TATC--------A-TA--C---AT--A-G--TTAT---A-----AT--T-ATT---G-----AT----A----ATA---T-G------TC--TTGA-G-A-T---GA--G-T--G-A-A-C-C----A-G-AATTG-tgcaaacaaacattaagatatatattctataagagtaataacacgaaatctttcatatagatagcaat
gi|16 : cagtttcgaatctcataaaaagcactttatctaagcaaagtggcaaccttcatgtattaatacaaaataatcatattgaaatattcaattttttttaaattaaatacatgtatactttttaactttacttccatattagcagatggccaagtatatcggagaccTTA-A-AGGA-C-TT-TGCCAAA-A-AT-T-CA-T-CA----A-C--A-CT--ATAAA-GTA----------------C--TATGCGGTTGAAAA-T---TA-A--AAGAC-TTG--CC-GGTCAT--AA-AAG-G--A-TG--TATC--------A-CA--C---AG--G-G-----G---G-----TT--T-ATC---G-----AA----AAC--CTA---T-GT------C--T----A-A-T---AA--G------G-A-T-T---AG-G-AATGC-A--A--T---C-------TTAA----C--T-C---A-TT-TGTTTT--CA--G-C--ATG-TCA-C-AAA---CA-A-GAGT-T-AATTCCCCTCCTT-GGTA-A----TT-TG-GAAA-TG-----GAAT-----AAA--AAGTC-C--CAAAA--A--TGGA-c
gi|17 : AAAA-A---TCTG--AAGAC-TTC--GC--G-AAT--AA-AAT----------TATC--------A-CA--CC--AT--G-G---------G-----GT--T-GTC---G-----AA----AA---CTA---T-G-------C--CTGA-A-A-T---AA--A-C--GGA---T-T---AG-A-AAT---G-CA--T---C--------TA-----A--A-CGTGA-TTGT---TT--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA---CA-A-GAGT-T-A-T-CCCCT--TG-G-TA-A----TT-TT-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AG-TC-CAACTGAA--T--Ttatttatagcctattattctgatcagatcatatagaaa
gi|18 : aaaaaactgcaaaaattcttaaaacaataaattactctatgcggttga-C----AA-A-AT-T-C--T-TA---AA-C--A-CT--ATTAA-ATA-C-C-----TA--TG-C---AG----TTGAAAA-A---TT-G--AAGAC-TTG--C---G-AAT--AA-AAG-G--A-TG--TATC--------A-CA--C---AT--G-G--A--G---G-----TT--T-ATC---G-----AA----A----ACA---T-GT-----CC--T-GA-A-A-T---AA--A-G--GA----T-T---AG-A-AATGC-A--A--T---C-------TTAA----C--GTC---A-TT-TGTTTT--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA---CA-A-GAGT-T-A-TCCCCCA--TT-GGT---A-A-TT-TT-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AT-TC-C-A------------AA-ATG-G--AGTTAA-AG-T-C--TAT-T---A-----------TT--TTG--A-T---TC-AG-A-atagcctaattattctgatcaagaaatcaagttatagaaa
gi|19 : gACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGGA--AAA-T-G-A-GG------AA--CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AGCATT-AA-T-ATC-AG-G--A-A-TGA-GA-ATT-AG--A------ACA-AACTatcaattataga
gi|2 : AAAA-G---TA-ATTATGAT-TTC--ACGCG-AAT--AATAAT-G--A--A--TAACGGT-----A-TA--C---ATC-G-G--C--G---AAGTT-GT--T-ATT---GTGAGTAATAC-A----TTAAAAT-GC-----TC--TTAA-A-AAT---GA--AAC--GGATA-C-C---AA-A-A-TTG-A-TGATT---CGACCCAAT-A-----C--A-C---A-TT-T---TC--CACAG-C--A-G-TCAAC-ACA-A-CGCA-GAGT-T-A-TTCCCCT--TT-GGTA-AATA-TC-CA-GAAAATC-----GAAT-----AAA--AA-TC-C--CAGAA--T--T--A-ATG-G------AA-AC-A-C----T-G---A-----------CT--TTG--A-T-TACC-AG-A-T-GAAAA-A----A-A--TGA---AG-T------TGTA-TT--CAAATATGAAA-C-T--G--GTATGC--AAT-AGACCAA-G-AGG--AT-C--TTATT----ATATCTAATA-AAAGAA-A-CTTGA-A----GGCCA-GTT----AACGC-GGT-C-AGAACTTC---ATAAGCAA--TCCC-TTGCAAGAT-G---TCTTTAGCTGGATCGTGTTCGC-----T-G--TGTAAAA-AT------------AC--ATT-T-CTAAAAAT-TTAGA-A-T---TCCTCA--C-CAAG-GAC-A-TT----------------TAT--ccgaaaatcagaaataatcacagcacctggaaagtgtaatttatcataatttaagcttacaaatatctataatctgcaatttcgatatccttcatgaccgttacaggcgttgcgtcccacacatgttgtcagggaactattgacactggccggttccatagataaatggt
gi|2 : acgaattctaaatgacaaaaaA-----A--A---------TTTGGTACG--T-C----TGTCATC-CG-TAA-CTCTA-GAT-TAG--CT-ATAATGT--AG-G---GAAA--------CATACTCAACCA-C-ACC--ATCCAA---GGT--A-----GATGTTATGAAGTT--A-AAA--TG-T-AC-C--AAGGT------GAT----A-TAAAT-C-T-TATCACCTAACCACAA---AG-------AAAGGAGAAGCCAG-CAG-A-GGTCTA-C--CTCGTCA---AACGATCAT-T--CTTATTC-CATCC---TGCCAC-------GTCAT-AAT-A---AGGAAGAT-G--GC---T-CTCCATATATACGACAATC-C-ACTAGC-TATCCATCCCAG----GAAAACCCAAAATTTGGA--GTGAAAGAAAAAAC-AGG--T--GAAT-TC-AGGT-ACAATGCTAGTT-A-AAGATGGAGAG-GGGGAGGA-AAGCAGGACAATCTTCATACCCATCCC-CC-C-CC-CA-TAC-tatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatataaaatttggtacgtctgtcatccgtaactctagattagctataatgtagggaaacatactcaaccacaccatccaaggtagatgttatgaagttaaaatgtaccaaggtgatataaatcttatcacctaaccacaaagaaaggagaagccagcagaggtctacctcgtcaaacgatcattcttattccatcctgccacgtcataataaggaagatggctctccatatatacgacaatccactagctatccatcccaggaaaacccaaaatttggagtgaaagaaaaaacaggtgaattcaggtacaatgctagttaaagatggagagggggaggaaagcaggacaatcttcatacccatcccccccccatacaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagtggaaggaaataggaaggaactaacactaatcctcctcccacctatgatgaacgttgtggaaatatgcacaatgtcagcagtgaatgtctgtttgaccaaattactattccgatccatactagatgacccatttcccacctcccttcctatcagaaaaaaacagctggttaaatcgccgcgcccaaacgcgacacgccttgcctgtcgcccatgcttctgtgcggccatactgtccagtcatttatgtttgtacctcttcaataaaaaaatgttttgcgaattgtgctaaaagagtctcgtgcatttattctgtcgtcaattagcaccatataacaacacagcaatgacagagacatatctaacgaggcacgggcagaccctctttcacaaaaagaggcggctcaagtacacgattcaagaacagaccactacaagaccaagggacagatcacagcatcacacatcacaggatagaacagacacaattggtgaaacagcaagaaaaatacctcggataaatacacaacatcctagatcagactagagcagatccgaacaacacaacacagaccagaacatcgtacccgatgacacgagggccacagacagacacacagttcacatacacgacacacacctacagacgcaagcacaggacataaatcatagacaaaagacagacaccaagtatgataatcacatgaggttgaaaaaaatattctaaaagaccacacaaccacaacttgtaatcgtgagaagaggaaaataaagagcgaaactctgtactcaatccaaaagcatgaataatcagaaatgaaattggataacaaacttttgatgatacaaacaatcagaaataatctact
gi|2 : acgaattctaaatgacaaaaaaaaagtaattatgatttcacgcgaataataatgaataacggtatacatcggcgaagttgttattgtgagtaatacattaaaatgctcttaaaaatgaaacggataccaaaattgatgattcgacccaatacacattttccacagcagtcaacacaacgcagagttattcccctttggtaaatatccagaaaatcgaataaaaatcccagaattaatggaaacactgactttgattaccagatgaaaaaaatgaagttgtattcaaatatgaaactggtatgcaatagaccaagaggatcttattatatctaataaaagaaacttgaaggccagttaacgcggtcagaacttcataagcaatcccttgcaagatgtctttagctggatcgtgttcgctgtgtaaaaatacatttctaaaaatttagaattcctcaccaaggacatttattatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatata-TGGA-A-G-----GAAATAGGAAGGAACTAACACTAAT-C---CTC-CTC-CCACC-TATGATG-AAC---GTT--GTGGA--AATATGCACAATGTCA-G-CAGTG-AATGTCTGTTTGACCAAATTACTATT-C-CG-ATCCAT-A-CTAGATGACCC--A-TTTC-CC-ACCTCCCTTCCTATCAGAAA-AA--AACAGCTG-GT--TA--AA-TCG-CCG--CGCCCAAACGCGACACG--CC-TTGCCTG-T-CGCCC-AT-GCTTCTGTGCGGC-CAT-AC-TGTCC-AGTCATTTA-TGTTTGTACCTCT---TCA-AT--AAAAAAA-TGTTTTGCGAATT-GTGCTAAAAGA-G--TCTCGTG-C--ATTTAT-TC-TGTCGTCAATTAGCAC-CATATAACAA-CACAG-C---AATG-ACAGAGAC-ATATCTA-ACG-AGGCACGG--GCAGAC--------------C-CTCTTTCACAA--AAA-GAGGCGGCTCAAGTACACG-ATTCA-A-GAACAGA--C----C-----A-C-T--ACAA--G---ACCAA-G----------------------GGACAGATCAC--AG------CATCACACATCACAGGAT-AGAACAGA-CACA-ATTGGTGAAACAG---CA-AGAAAAAT-A---CCT-CGGATA-A--ATACACAAC--ATCCTAGATCAG---ACTAGAG-CA----GATCCGA---A----CAA-CACA-ACACA-GACCA-GA-AC-ATC-GTACCCGATGACACGAGGGCC---ACA-GAC-A--GA-CACACAGTTCA----CATACACGAC---A-CACAC-CTA-CA-------GAC-------GCA----AGC--A----C-AGGACA-------------TAAAT--CA-T----AGA-CAAAA--GA-CAGAC---ACCAAGTATGATAATCACATGAG-GTTGAA-AAAAA-TA-T-T-C-TA-AA-A----GACCA-CAC-AACCAC----AACTT-GTAATCGT-GA-G-A---AGAGGAAAA-T-A-A-AGAGCGAAA---CTCTGTACTC-AA---T---CCAAA-AGCATG-AA-TAATC-AG-A--A-A-TGA--A-ATT-GGATA------ACA-AACTTTTGAT-GA-----TA--C--AAA-CA-AT--CAGAAATAATaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagtggaaggaaataggaaggaactaacactaatcctcctcccacctatgatgaacgttgtggaaatatgcacaatgtcagcagtgaatgtctgtttgaccaaattactattccgatccatactagatgacccatttcccacctcccttcctatcagaaaaaaacagctggttaaatcgccgcgcccaaacgcgacacgccttgcctgtcgcccatgcttctgtgcggccatactgtccagtcatttatgtttgtacctcttcaataaaaaaatgttttgcgaattgtgctaaaagagtctcgtgcatttattctgtcgtcaattagcaccatataacaacacagcaatgacagagacatatctaacgaggcacgggcagaccctctttcacaaaaagaggcggctcaagtacacgattcaagaacagaccactacaagaccaagggacagatcacagcatcacacatcacaggatagaacagacacaattggtgaaacagcaagaaaaatacctcggataaatacacaacatcctagatcagactagagcagatccgaacaacacaacacagaccagaacatcgtacccgatgacacgagggccacagacagacacacagttcacatacacgacacacacctacagacgcaagcacaggacataaatcatagacaaaagacagacaccaagtatgataatcacatgaggttgaaaaaaatattctaaaagaccacacaaccacaacttgtaatcgtgagaagaggaaaataaagagcgaaactctgtactcaatccaaaagcatgaataatcagaaatgaaattggataacaaacttttgatgatacaaacaatcagaaataatctact
gi|22 : acgaattctaaatgacaaaaaaaaagtaattatgatttcacgcgaataataatgaataacggtatacatcggcgaagttgttattgtgagtaatacattaaaatgctcttaaaaatgaaacggataccaaaattgatgattcgacccaatacacattttccacagcagtcaacacaacgcagagttattcccctttggtaaatatccagaaaatcgaataaaaatcccagaattaatggaaacactgactttgattaccagatgaaaaaaatgaagttgtattcaaatatgaaactggtatgcaatagaccaagaggatcttattatatctaataaaagaaacttgaaggccagttaacgcggtcagaacttcataagcaatcccttgcaagatgtctttagctggatcgtgttcgctgtgtaaaaatacatttctaaaaatttagaattcctcaccaaggacatttattatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatataaaatttggtacgtctgtcatccgtaactctagattagctataatgtagggaaacatactcaaccacaccatccaaggtagatgttatgaagttaaaatgtaccaaggtgatataaatcttatcacctaaccacaaagaaaggagaagccagcagaggtctacctcgtcaaacgatcattcttattccatcctgccacgtcataataaggaagatggctctccatatatacgacaatccactagctatccatcccaggaaaacccaaaatttggagtgaaagaaaaaacaggtgaattcaggtacaatgctagttaaagatggagagggggaggaaagcaggacaatcttcatacccatcccccccccatacaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagTA---T-GT------C--TTGA-A-A-T---GA--G-C--AGA-A-C-C----A-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAA-TA-----CAAA-C---A-TT-T---TC--CA--G-C--A-G-TCA-C--AA-A-CC-A-GAGTAT-A-TT-CCCT--TG-GTTA-AA-A--T-CA-GAAAAAGAAAATGAATTAACCAAT--AA-TC-A-GCAGAA--T--TGAT-GTG-T--A---AA-ctact
gi|23 : TC-CTT-CCACC-CA--ATG-A-------T--C---C--AG--------ATGT------AGAA-C------------------------T-C-CA-ATC-AT-A-C-----TGCC---C-T--C-AC-AC-TAC-TCCAT--CTGGGA-AT--AA-----ATAC--TTT-AA-TGG-CCG--GG---AAA-G-AA---A--CA-ATGC-TG-C-A-CCA-AT-GCTTCTGCG--GT-A-T-GC-TGTTC-Cct
gi|24 : aaccaagtaT-T---TT--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA---CA-A-AAGT-T-A-TCTCCCT--T--GGT---A-A-TT-TT-GAAAAT------GAAT-----AAA--AG-CC-C-A---AA--A--TGGA-AT--T--A---AA-TC-A-T--A-T-T---A-----------TT--TTG--A-T---TC-AG-A-t
gi|25 : tg-GAGT-T-A-TCCCCCT--TG-GC----A-A-TT-TT-GAAAATG-----AAAT-----AAG--AG-TC-C--CAAAA-----TGAA-atcaattttag
gi|26 : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TA-----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TT---CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TT--TATgcttagacctaccgggtagctattgttttgattcagaatcaaaatta
gi|27 : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TC---AA-A---TA-G--AAGAT-TT---CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TT--TATC--------
gi|3 : TTA-A-AGAAAT-TT-C----AA-C-AT-T-C--TGCG---GA-T--G-CT--ATGAAAGTA-G-CG----CGGCTT-CGGTAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AT-AAT-G--A-TAAGTATC--------A-TA--C----T--G-G--T--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-AGC-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-TT-T---TC--CA--G-C--AAG-TCA-C-AAA-AACC-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTATAA-A-TC-CA-GAAAAAG-----GAAT-----AAA--CA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTGTTA-T-T-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A---GA---AGTT------TGTT-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AATAG----AA-GGAGG--AAAT--TT-TT----ATA---AAAATAAAAGA-A-C-TGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---AATT------------ACA-A-T-T-CT-AAAAT-TT----C-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TG---C-------TA-AAC-A---TT-GCTTTG-C--ATAGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A------------TTTG--ACG--T-C----TG----C-TG-TAA-ATCTAAG-T-TAG--TTTA--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGT---A-AA---TG-T-ACACG-AAGGGA-----GAT----A-TAA-TGC-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCA-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCA--A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCAATTATT-GACA--T-C-ACTCGACTA---ATC--AG----GAA----CAA----TG-A--GTGAAG-------C-AAGAGT--GAAT-T--AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGATAG--AGGA-AATCCT-GTATAAATTTCACAAT-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TAATGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACTCTA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTTATGGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TT-C-TG-C-C-CCCAAT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TG-TTGTA----TAAATCA-AT--AAAAAAT-TG--TTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCCACG--ACGTGCTAA-----------TAC----GAACAGTAGCA-GGTACAAC---AGGACACACA---GCA-GACCAGA--CAG--C-----A-CAG--ACAC--A---ACCGATGA--CTCCAC-TAG----ATC--AGACAGACCAG--AG------CG--ACACAACACACAAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGGTACCG-ATTTCCACCCGACA-ACCACACACAGC--A--TCAGC-CCATGCAC-ACAC-CACCACGA-CCGATCCATTACCGA-CACACACACCTGA-C--GACAC-A-C-ACAC------ACACAA----C---ACA-GAC-AGCGA-CA-A-----CG----CACACACCAC---AGTATAA-CAG-CA-------GAC--AC--AACA----AGCAGA----CTATGACA-------------CAAGATTCA-C----AGAGCAGAC--CA-CAGACT--AC-------GACAA-CAT---AG-ATAGAACACTGA-CATG-CAC-CAGCA-G----CA-CATCAC-AAACACATAAAACTT-GAAAT-GT-AATT-A---AG----AAA-T-G-A-GG------ATG-CA-TGT--CC-AAAGTT---C--AA-AACATGAAA-C-ATC-AG-A--ATA-TGA-GA-ATT-GG---------ACATAACTGTTG-T-GG-----TACTCGAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTGTCTCG--GCACTTCACGCCACAA--CC----------CCCAGT-G-CTG--TGAAAAC---TTTCCCG-ACTCATTACA--TACCT-TC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTT-AAATATAAGACCAT-CTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CCCAGAGAA--TCTGAGTCT---A--AGAATTTCAAAG--TTCAAGGCCG-ACTATG-TGCTTA
gi|31 : T-ACA-CTAAAAAT--AC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTT
gi|32 : -ACA-CTAAAAATTTCC---AAAAATTCT-A-CCTG--A--AGAATTTC-AAG--TTC-AGGCCGAAC-AT
gi|4 : TTA-A-AGAA-TCTT-C----AA-C-ATAT-C--T-CG---GA-T--G-C---ATGAA-GTA-G-C-----CT--TT-C---AT----TTCAAAA-AC--TA-G--AAGAG-TTT--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TAATC---AT--G-G--C--GTACG-----GG--T-ATTTTGA-----AA----A----TTA---TTGT-----CT--TTAA-A-A-TC--GA--G-C--GAA-----C---AACA-AATTG-AATA--T---T--CC-AAT----------A-C---A-TTAT---TC--CA--G-C--C-G-TCA-C-AAA-G-CA-A-GAGT---A-T-CACCT--TG-TTTA-AA-A-TC----GAAAATG-----AAA-------AA--AA-TCAC-AAGAAA--T--TGAA--TG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-GGGGA-----------AT--TTG--ACT-C-TCCAG-A-T-G--AA-A----A-AAATGC---AATT------T-TG-TT--CAA----GAA-TC-TG-GTAGT-TGA--AAT-G----AA-G-AGG--AC-T--TT-TTT---ATA---AAAA-A---GA-A-CCTGACAA--TGGTCC-A-T----AA-G--GGTGC-TAAAC-TC----TATGCGA--T-CC-T-G--AGAG------CT---ACT--AT----TT--------T-G--T-T---A-TT------------ACA--CT-T-CA-AAAAT-T-----A-T---T--CGA--C-CAAG-GA--A-TT----------------TGT--C-------CA-A--------T-GCTTCG-C--AGGAAT--A-T---GT--CTAC-----TTTATT--A-AATACA---A--A---------TTTG--ACGA-T-CAG--TG----C-TG-TA---TCTA-G-T-TAG--T--A--AC-T--AG-GTTCAAAACTTAAATATATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--ATAAGCGA------GAAGTT--A-AAA--TG-T-ACA----AGGGA-----GAT----AATTA-T-C-TTAGTCCCC---C----A---TA-------AAAGGA--AGCCAGCAAG-A-GGTC-AAC--TGC--CAC--GAC----A--C--CTTA--C--AT-----CGA--C-------GTCAT-A-T-A---AAGGA-AT-G--GC---TTCTCCAT--AA--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AGAGGGGTAA---CAT----TG-AT-GTGAG--------C-AGG--T--GAA---C-AG-T-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GG--AGGA-AG----GA-AATCTT----TAA--TTCACA-C-TC-CA-TACAT--ACC-CCTA-TGGA-A-GGAAGAAAAA--GGAA--ACCTAAC-CTG-T-CGTTCTC-CTTTCCACT--A--GTG-------GTT--G---ATTCGTA--CAC-ATGGCA----AGTA-A------------------------C-C----ATCCAT-A-CTG---GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCA-A-CAGG---AT--A------G-AT--TT--AA-T---CGG--CG---GAA-A--A---A--CC-T-----G-CGC-CCC-A--GCTC---TG--GC-C-T-GC-T-TTC-CATCATTTACTGTTTGTAA--CT--ATCA-AT--AAAAAATATG-TT-GCA---T-GT-CTAAAA-AAG--T----TG-TC-ATT--T-TC-TGT-GATCAATAGCAC-AAC------A-CACAC-C---A-TGAACA-ACACCA-A--TATACA--TGCATTG---CA-GC--------------AAC-------CA---AC--GACGCA-------GACACA-A-------GA-CAGA--CAGA-C-----A-CACCAACACCGA---GCCG--GACTC-CTCC-C-G----AC----GNNNNNNNNN--NN------NN--NNNNNNNNNNNNNN-NN-NN----NNNN-NN-------NNNN---NNNNNNNNNNN-N---NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNN--N--NNNNN-NNNNNNNN-TCCC-GACC-CGA-CCGA---C----CGACCACACACACC-GC-CC-GACCCGA-C-CGAC------ACAC-A----C---ACA-GAC-A--GACCG-A-----CATCTCCCCCCCCCCC---A-CACCA-CA--CA-------GAC--A---GACA----GACAGA----C-A-GATA-------------GA-----CA-C----AGA-CAGAC--CA-CACAC---AC--------ACAA-AAC---
gi|4 : acataaatattaccaaataaaattattgaaaaatatgttgattcatttaagataactctcttaaataatttatatggttaaacctgggtaactacctttccgtatggcccaaggagggaagagttggaccCGA----CCCGACC-GAC-C--GA-C--------CA----CACACACCGCCCGA-CCCGA-CCGACA-------CAC--AC--A-CA----GACAGA----C-C-GACATCTCCCCCCCCCCCA-----CA-CC---ACA-CAGAC------AGAC---A--------GACAG--AC---AG-ATAGA-CACAGA-CA-G--AC-CA-CA------CA-CA-CAC-AAA-AC-TTAAACTTTGAAAT-GTTAA-TTA---AT----AAA-A-G-A-GG------A---AA-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AT-C-ATC-AG-AGAA-A-TGA-GA-ATTTGG--A------A-A-AACTTCTG-T-GG-----TA--CAAAAAACA---G-C--AAATGAT-ATTT-CTCG---CACT-CA--C-ACAA--CC----------CCCCAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-AA-CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAA-TAAC-C-TTA--AA--TTATCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTGGAGTAC-A-A-AAACTTCATA-TTTAAAGTATAAA--CATC-TTC-T-AT-ACA-CTAAAAAT--CC---AGAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAA----TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTttaaactttgaaatgttaattaataaaagaggaaatgtccaatcaaaacatgatcatcagagaaatgagaatttggaaaaacttctgtggtacaaaaaacagcaaatgatatttctcgcactcacacaaccccccatgctgtgaaaacttccgaacataatacttactgactaataaccttaaattatcaatacgataaaaaaaaatattggagtacaaaaacttcatatttaaagtataaacatcttctatacactaaaaatccagaatttctgacctgaagaatttcaattcaggccgacatgtgctt
gi|5 : acataaatattaccaaataaaattattgaaaaatatgttgattcatttaagataactctcttaaataatttatatggttaaacctgggtaactacctttccgtatggcccaaggagggaagagttggaccttaaagaatcttcaacatatctcggatgcatgaagtagcctttcatttcaaaaactagaagagtttcccgaataaaatgatatatcataatcatggcgtacgggtattttgaaaattattgtctttaaaatcgagcgaacaacaaattgaatattccaatacattattccagccgtcacaaagcaagagtatcaccttgtttaaaatcgaaaatgaaaaaaatcacaagaaattgaatggaaaacacttggggaatttgactctccagatgaaaaaaatgcaattttgttcaagaatctggtagttgaaatgaagaggacttttttataaaaaagaacctgacaatggtccataagggtgctaaactctatgcgatcctgagagctactattttgttattacacttcaaaaattattcgaccaaggaatttgtccaatgcttcgcaggaatatgtctactttattaaatacaaatttgacgatcagtgctgtatctagttagtaactaggttcaaaacttaaatatataacaccaaagtaataagcgagaagttaaaatgtacaagggagataattatcttagtcccccataaaaggaagccagcaagaggtcaactgccacgacaccttacatcgacgtcatataaaggaatggcttctccataagacatcactgataatcagaggggtaacattgatgtgagcaggtgaacagtacagttaaagtaaggggaggaaggaaatctttaattcacactccatacatacccctatggaaggaagaaaaaggaaacctaacctgtcgttctcctttccactagtggttgattcgtacacatggcaagtaaccatccatactgggccatcccactccctccaacaggatagatttaatcggcggaaaaacctgcgccccagctctggcctgctttccatcatttactgtttgtaactatcaataaaaaatatgttgcatgtctaaaaaagttgtcattttctgtgatcaatagcacaacacacaccatgaacaacaccaatatacatgcattgcagcaaccaacgacgcagacacaagacagacagacacaccaacaccgagccggactcctcccgacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccTTA-A-AGAA-T----C----AA-C-AT-TAC--T-CC---GATC--G-AC--ATAAC-GTA-G-CG----CG--TT-C--TAT----TGCAAAA-AAAATA-G--AAGAT-TTC------G-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-GA--C---AT--G-G-----G---A-----GTATT-ATT---G-----AC----A----ATA---T-GA-----TC--TCGA-A-A-----GA--G-C--GAA-T-CGC---TA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAAT-A-----C--A-C---AGTT-T---TT--CA--G-C--A-G-TT--C-AAA-AGCA-G-GAGTGT-A-GTCCCCT--TGTAGTA-AA-AAGT-CA-GAAA-TG-----AAAT-----AAA--CG-AC-T-ACAGAT--T--TGAA--TGTG--A---AA-TA-A-C--TCT-G---A-----------AT--TTG--A-T-T-TC-C--A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------GTTA-TT--CAA----GAT-TC-TG-G---TATGA------G----AA-G-AGG--AA-T--TT-T-----ATA---AAAA-AA--GA-A-C-TGA-A---TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---A-ATGCAA--T-CCATTGC-AGAG-T---TAT----CT--AT----TT--CCTGCAT-G--T-T---A-TT------------CTA-ATT-C-CT-AAAAT-TTTA--A-T---T--TCA--CATAAGCGA--A-TT----------------TGT--C-------TA-AA------TT-GCTTTGTC--AAGGAT-----C--GT--CTCT-----CTT-TT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C----TG----C-TG-TTA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGTT-AGTGT-CAAA-----------TA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--AA----GA------GAAGT---A-AA---TG-T-AC-C--AAGGGA-----TATGCTGA-AGA-T-C-T-G----CC---CCA-AG---TT-------AAAGGAGA-GCCAG-CAG-ATGGTC-A-CGTTGCG-CACTTG-C----ATGCG-CCTA--C-TATCTCCATGA--CTCCAAGAGTTAC-A-T-ACCAAAGAA-A--G--GC---TTCTCCATT-AT--GA-A--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAAA---TG-A--GTGAA--------C-AGG--T--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGAG-GAA-AG--AGGA-A-TCTT-A---GAATTTCACA---TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--A-CTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTG-AA----GTTA-G---A--AGT---CAC-ATGT---AGCAGTA-A------------------------T-CGCG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CCCAC-TCCCTCCAT--CAGGGA-AT--AA-----A-GCT-TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-A-GG---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT----AAAAT-TG--TTG-A---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-TTCATT--T-TCTTGT-GT-CAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAAC--AAAC---A--TA-AC--ATGCAC----GCACG---------------CAC----GCACAG--ACA-GACA-AAC---AGAACACA-G---ACA-GACCAGA--CAGA-C-----ATCAC--ACAC--AC--AC--A-CA--C-CCAC-C-C----AGC--CGACCGACC----GA------C---ACACAACACGAGAC-AG-AC---------AC-------AC----------ACACCG-A---CCGACCGACACACCACA-----C--A--TCAGA-CAGGACAC-ACAC------------------------A-CACACACAGA-GAGCA-GAC--------------------CGA----C----CA-GAC----------A-----CA----CAATTACCA----A-TA-GA-CAG-CA-------GACAGAC--ACCA----A-CACA----C-A-CACA-------------CA-----CA-CAGAGAGA-CAGAC--CC-CACAC---AC-------CAC-A-CAC---AGAATAG-ACACAGAGCA-GACAA-CA-CACA----CA-CA-CAC-AAACAC-ACAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGA---AAA-T-G-A-GG------AACTTT-TGT--CC-AA---T---C--AAGAACATG-AA-C--TC-AGAA--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AAC-TTTG-T-GG-----TA--CATAAA-C--ATG-CA-AAATGAATATTTTCT-G--GCAC-TCA---CACAA--CA----------CCCCATAG-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A---ACTT-AC-T---GACCTAATAAC-C-TT----AAATT-TCAAT--AC-GA-TAA----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAA-ATATAAACATCCT---CTATAACATCTAAAAAT--CC---AAATATTCTGA-CCTGCAA--GGAATTTCAAAAGTTTC-AGGCCG-AC-AT--TGCTTA
gi|6 : TTATA-AGAT-T-TTAC----AA-C-AT---C--T-CG---GA-T--G-CTGAATGAA-GTA-GGC-----CG--TT----TAG----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTCTTCC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TAC-TATTTATGCGAAA-TA--C---AT--T-GAAC--GTAGA-----GT--T-ATT---G-----AACTAGA----TTA---T-GT------CAGTTGA-ATA-TTTGGA--G-CTAGAT-A-C-CTACAA-A-AGATC-A-TT--TTCAC--CCCAAATATTCTCC--A-C---A-TT-T---CA--CA--G-CCAA-G-TCA-C-AAG----C-A-GAGT-TTA-TTTTTCT--TTTGGTA-AA-A-TTTCA----AATG--------------AAA--AA-CC-----AGAA--T--TAAACATG-GTTA---AACAC-A-CCAT-T-A---AGACAACAACTTAT--TAG--A-TAC-TC-AG-AGTAG--AA-ATAGAA-A--TGACATAGTT-------GTA-T---CTA----GAGATC-TGTG--ATATGA--AAT-G----AACG-AGG--CA-TACTT-TTCTCAGTA---AAAACAAAGAAGA-CCTGA-AAGTTGGCCA-G-TTCGGAA-G--GGT-CCTAAAC-TT---ATGTGCAACTT-CC-TTT--GGAG-----TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--C-C---A-TTCATCGT------ACATACT-TTCTCAAAAT-CTTGCTA-TCTAT--TCAGCC-CAAA-GGCAA-TTCTTGTTAATAGCCGCATAT--T-------TACAACCA---TT-GCTTCTTA--AAGGAT--A-T---GT--CTCT-----TTAATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-T-A-ATCTA-G-TGTAG--TTAA--ATGT--AG-G--CATAA--------TA-A-------A-CAACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAG-T--A-AA---TG-TCACAA--AAGGGA-----GA-----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-A-----A-------AAAGGAG-AGCCCAGCAG-A-GGTC-A-C--T--G-CA---GATCTAAAT-CAGCTTA--CTTAT-----TGG-AC-------GTCAG-A-TAA---AAGAA-AT-GGAGC---TTCTCCA-TTAT--G-CA--T-C-ACT-GA-TT---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-AGGGTGGA--------CTCAG-GT--GAATGTC-AGGTGAC------AGTT-ACAAG-T--AAGGTGGAGAGGA-AG--AGGATAATCTT-AT---AATTTCACA-C-TC-CA-TAC-TTAACC-C-TG-TGGATA-G-----AAAA--GGAA--AACAAAC-CTG-T-C---CTC---T-CCACT-TA--GTG-AA----GTTG-G---A--AGT---CA-CA-GCTA--GCAGTAGA------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-CG----GGCCAAAA-T--CACC-AC-TCCTCGCATC-GAGGGACAT--AA-----C-GT--TTA-AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CCGTTGC-TG-C-C-CCC-ATCGCTTCTGTG--GCAC-T-GC-TGTTC-CATCA-TTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-ATAAAAAAAAT-TG--TTGCA---TGGT-CTAAAA-ATG--T----TGTT--ATT--T-TC-TGTGGTCTAATAGCAC-CAT------A-CAC-C-C---AATGAAC--AAAC-A-A--TT-AAA-CTGCATC---GCACG---------------CAC----AGACAG--ACA-GACAAAAC---A-GACACA-A---ACACGACCAGA--CAGA-CCCACAA-CAC--ACAC--ACACACCAC-GC--C-ACAC-C-G----ACCCAAGACAG--CAGGCAAGACAGCCG--ACA-GACACAC-ACAAG-ACGA--CACACAC-------ACACCCGCACGGACACCACA---CCA-CTACCG-AC--CACAGAGCCAA--CCAGA-CAGCTCAC-ATGC-ATCC-CGA-CAGAG--A----CAA-CACAGACA---GA-CACGACAC-A-CAACAG------ATACGAC---C---ACAGGAC-A--GA-C--A-----CA----CACACA-CAC---A-CACGACCAC-CACACGACCGAC--ACCGAACAC---AGCAG-----C-C-GACACCCCCCCCC----CA-----CACC----ACA-CAG----CA-CAGAC---A--------GACA---AC---AG-AT---ACA-AGA-CA-G-CAC-------A----CA-CA-CACAAAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-AAAGAA----AAA-T-G-A-GA------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--NN-NNNNNN-NN-N-NNN-NN-N--N-N-NNN-NN-NTT-------------------TTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-
gi|7 : TTA-A-AGA--T-GT-C----AAAC-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGA--GTA-GGC-----CAA-TT-C--TAT----TCAGAAA-A---TA-G--A-GAT-TTC--C---G-GAT--AA-AAT-G--AGTA--TATC--------A-TA--C---AT--G----C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----AA---TTA---T-GT------C--TTGA-A-T-T---GA--GGC--GAA---C-C---AA-T-AATTG-A-TAA-T---CGTCCCAAATAT----C--AGC---A-TT-T---TCTCCA--G-C--A-G-TCA-CTAAA-A-CC-A-GAGT-T-A-TTCTCTT-----GGTA-AT-A-AT-CA-GAAA-TG-----AGAT-----AAA--A---T-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-AAC--T-T-G---A-----------AT--TTG------T-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT-------GTAATT--CAAT---GAAATC----A--GTATGATAAAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT-----TA---AAAA-A---GA-A-CCTGA-A---TGGCCAAG-T----AA-G--GGT-C-TAA-C-TC-----ATGTAA--T-CC-TTG--AA---G---TCT---AC---AT----T---C-----T-G--T-----A-TT------------ACA--CT-T-CT-AA--T-TT------T---T--TCA--CGCAAG-GGT-A-AT----------------TGT--CC------TA-TAC-A---TT-GCTTTGTC--AAGGAT--AATC--AT--CCTC-----TTTATTTAA-AGTA-----T--A---------ATTG--ATG--T-C-G--TG----C-TG-TAA---TTA---T-TAG--T--A--AT-T--AG-GT-CAAAA--------TATA-------ATC-ACC--A---AAAA-GTA--A-----GA------GAA--T--ACAA---TG-T-ACAT--AGGGCA-----GAT----A---A-T---T-AGTCCCC-----A-AA---GA-------AA-GGAGA-GC--AGCGA-C-GGTC-A-C--TGC---A---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA--C-------GT-GC-A-T-A---AAGA---T-G--GC---TT-TCCATTT----GCCA--T-C-A-T-GA-TA---AT---AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AAG-----------------------------T-A-AAG-T--AAGG-GGG-AG---AG--AGGA-AATCT----ATAA--TTCACAAC-TC-CA-TAC-T--ACCTC-TA-TGGA-A-------AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTGGAA----GTT--G---A---GT---CAC--TGT----ACAGTA-A------------------------TGC-CGGATC-A--A-C-----GACC---A-T--C-C--A--TCCCTTCATA---GGGA-AT--A--------GC--TT--AAATGG-CGG---A---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-C---AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATAATTTA-TGTTTGTA---CT---TCA-AT----AAAAT-TG-TTTGC----T-GT-CTAAAA------T----TG-T--CCT--TGTC---T-GTC--ATAG------C------A-CACAC-CTAAAATTATCA-AAAtcagaaata
gi|8 : ctcctacttttctcagcgcagttttcgaatcgtaaaaggcctcatttaagtgcagattggcccaccgttcatataatttacaaaataaacaatattgaaaatattttgatatcctaaatactccttaatatattttatacgtgttactggtaactttactttcgtatgaagggaggtaaattggacA-G-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--GGCT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TTAC--TGT----T-CAAAA-AAG-TA-G--AAGAT-TTC--C-----AATTAAA-AATTG--A-TA--TATC--------AGTAG-C---AT--GTG--C--G---ACATTAGT--TGATT---GC----AA----A----TTA---T-GTGCGATTC--TTGA-A-A-T---GAATG-C--GAA-A-C-C---AA-ATAGTTG-AATA--T---C--TCCAATAC-----C--ATC---A-TT-T---TTT-CA--G-C--A-G-TCA-C-AAACG-CA-ACGAGT-T-A-TTCCCTT-----GGTA-TATA-TT--A-GAAAATT-----AAA-------AA--AA--C-C-ACAGAA--CACGGAA-ATA-G--A---AA-ACCA-C--T-T-G---A------------T--TTG--A-T-T-CC-AGGA-T-G--AATA----A-A--TGA---AGTTGATTAGTGTA-TTGTTAA----GAAATC-TT-G--GTATGA--AAT-G----AA-A-AGA--AT-C--TT-TT----ATA---AGAA-AA--GA-ATCCTGA-AA--ATGCCA-G-T----AA-A--TTT-C-TAAAC-TCATTGTCTGCAA--T-TC-TCT--TGAG-GTATTCTG--ACTTAGT----TT--C-----T-GTTT-T---A-TTTTGTACCCCACCACA-CCTAC-CT-AAGAT-TT----A-T---T--TCAAGC-CAAG-AT--A-AT----------------TGT--TAATGCCATA-ATC-A----T-GCTT-GCCGGAAGCAT--G-TTCGGTTGCTCTCGGTATTTAGC--G-AATATCCTGA--AGACATGAATTTTG--ACGCCT-C-GTCTG----C-TG-TGA-ATCTACG-T-T-T--TT-A--CTG----G-GT-TAACG--------TGTT-------G-C-ATT--A---AACAGATA--C-----GA------G-AGTTTCA-AA---TG-T-----------GA-----GAT------TAA-T-TAT-A----CA---CCA-GATATGA-------AAAAGAGagctgaatagggtcttagattctaagaatagaacgtgagaacaatatgcgtgaactgcaagttatacgttctaaaacagtttaaccaaaacaaacaataacatgcagcacaacaacagaccagaagacagacacacatcagaccgacaccaacagacgacacatcaccacagaagcagacagatatgaccacagccacacaaca
gi|9 : cgctagcttatccatctcctacttttctcgcgaagtgacagttcttttctgtaatcctggcataaaaggcactttcattcaatgctagatgtgccaacccttcatatagtatatgtaccaaataaacatagttaattttgagaaaagtcatatttataatttcatttaaatactctcttaatatatgtatgatgtttaacctctctggtttaaacaccgttattatctaattacggtttctaattataggacgataaaggcagagcgcctattgagattcctaaa-A-AGAA-TGTT-C----AA-CCAT-T-TCAT-CGATGGA-CTGG-CT--AT--A-GTATG-A-----CG--TT-C--TAT----TCCAGAATAC--TA-G--AAGAA-TTC--TC-CG-AAT--AA-AAT-GTGA-TA--TAT---------A-TA--CGACATTGG-G--TTAG---A-----GTA-T-ATT---G-----AA----AAGTGTTA-----GT------C--TGGAGA-A-A---GA--GGC--AGA-A-C-C---AA-T-A--TGTA-TA--TT--C--CCCAAT-A-----C--A-----A-TT-T---TC--CA--G-C--A-G-TCT-C-AAA-A-C--A-GAGT---A-TTCCCCT--TG-G-TA-AA-A-AT-CA-GAAATTG-----AGAT-----AAA--CA-TC---ACAGAT--T--TGAA--TG-G--A---AATAC-A-C--T-TTG---A-----------AT--TTG--A-T-C--C-AG-ACT-G--AA-A----A-A--TGA---AGTA------TGTA-TT--CAA----GAAATC-CT-G--GTATG---AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----AT----AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AAG-TGGCC--G-T----AA-AGCGGT-C-TAAAC-TC-----ATGCAA--T--C-GTG--ACGA-G---TCT---ACT--AT----TT--CG----TGG--T-T---A-TT-------------CA-ACT-T-CT-AAACTCTT----ATT---T--TCA--C-CAAGAGG--A-TT----------------TTC--C-------TA-AACTA---TTGGCTTTGTC--AAGGACTAA-TC--GT--CTCTTC---TTTATT----AATA-----T--A---------TTTGA-ACG--T-C-A--TG----C-TGCT---ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-C-AAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AG---GT---A-----GA------GAAAGT--A-AA---TG-T-GTACCAGAGGGAGTAGTGAT----A-GAA-T-C---AGTT-----------A---GATCATTACAAAGGAG-AGCCA-GCAGAA-GGTC-ATC--TGCG--A---ACC----ATCC--CTTA--C-TAT-------G-AC-------G-CATGA-C-A---AAGAA-ATCG--GCCGTCTCTCCCTTTAT--GACA--T-C-A
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): CTACTTATTTCTCAGGCGAAGTTATCGGAATCACCGGTAAAAAGAGCCACTTACATAACAATAGCAGATTGGCCACCTCACTGTATACATATTACCAACAAAAATAACAATATTGAAAATATTTTGATCATTTAAATAACTACTCTTAAGTATATTATATGTTAACCCTGGTAACTTTATTATCGTCATTAGCGAGCAAAAGGGAGAAAATTG
Unaligned ( gi|21 ): GCTGCTTCCGCTAACTCTTTCTCAGCGACAGTCTTCGATCTCGGTAAAACAAGGTCATGTCATTCAATGCGCAGATGGCCCGCTTACATATAATATACCAAATAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
Unaligned ( gi|28 ): CCTCTCCTATCTTTTCTCAGCACAGTTTCGATATCCGGTAAACAAGCACTTCATCAATCAGATTGGCCACC
Unaligned ( gi|29 ): TTATATATTAATGTTAATATCCCTGAGTAACTTACTTTGTATGCAAAGGGAGGGGTAAATCTGAGAC
Unaligned ( gi|30 ): AAATGGAATAAAATTCCCAAAATGGAGTTAATGTATATTATTTTGATTCAGAATCAATTATAGAAA
Alignments
lowQualScore : 1111 1111111111111 111 1111111 11111111 333333333333333 111111111 111111111 2222222 1111111111 222222222222222222222222222 111 222 1111 1111 1111 111111111111 111 22222222 11 1111 1111 1111 111 111 11 222222 11 11111 111111111111111111111111 11111 333333333333 222222 11 11111 33333333333333333333333333333 111111 22222222 11111 1111 333333333333333333 11 11 2222 1111 11 11 11111111 1111111 111 11111 111111 111 2222 11111 1111111 222222222222222222222 11 1 2222222222222222222222 11 333333333333333333 111 11 1 1111 1111 11 333333333333333333 1 111111 111 1 222222222 111 11 11111 1111 22 1111 2222222222222222222 444444444444444444444444444444444444 11111 111 11 222222222222 11 111 111 11 11111111111 11 11 111111 11 111 6666666666666666666666666666666666 111111 222222222 11111111 1 11111 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 11111 11 6666666666666666666666 111 1 222222222222222 11111111 22222222222222 111 1111111 22222222 111 11111111 55555555555555555555 111111 1111111 3333333333333333333 222222222222222222 1 2222 3333333333 111 11 111111111 11111 111111111 22 11 111 33333333 2222222222 11 1 1 111 111111 111 1 11 1 111 111111
lowQualScore : 3 3 3 6 3 6666 3 3 3 3 77 3 555 4444 3 44 3 7777777777777 3 88 6666 33 2 333 2 33 2 4444444 2 33 2 2 33 2 66 55555555 3 77 888 77 3 444444444444444 77 3 222222222 999999999 555 2 4444444 33 0 2 2 2 777 33 1111111111 2 555 2 2 3 2 6 222222222222222222222222222 555 3 5 222 66 33 2 33 5 2 2 2 000 888 888 2 0 99999 2 55555 2 0000 66666 66666 33 2 1111 77777 99 3 44 555 6 3 3 0000 3 666 999999999999 55 55 3 333 3 3 7 4 66 4 9999 4 66 777 11111111 4 00 3333 1 0000 666 66 4 9999 4 4 66 4 66 4 3333 777 8 222 4 4 2 4 777 4 4 9999 4 00 4 4 4 444444 66 4 4 00 66666 888888888888888888888888 4 66 00000 4 555555555555 99 4 4 8 4 666666 777 66 22 8 55555 4 66666666666666666666666666666 5 0 555555 5 888 66 11111111 66 1 99999 0000 444444444444444444 00 00 4 3333 9999 4 4 1111 8 4 4 66 00 66 1 00 4 66 66666666 4444444 4 4 66 777 333 66 55555 222222 9999 4 666 4 4 3333 0 11111 2222222 4 77777 2 3 777777777777777777777 55 77 5 5 5 0 66 4444444444444444444444 66 00 444444444444444444 66 222 777 4 4 66 777 55 00 66 4 4 0 5 888 66 0000 888 5555 5 88 777777777777777777 88888 0 444444 5 5 5 66 5 11 555 777 0 777777777 222 4 4 4 11 5 5 66 4 4 11111 66 66 1 4 4 4 8888 4 4 11 55 4 2222 0000000000000000000 888888888888888888888888888888888888 4 4 4 8 4 4 99999 111 4 55 4 4 8 44 4 55 111111111111 33 4 4 55 777 4 777777 55 4 4 4 4 4 4 4 99 4 4 4 4 4 1 4 888 888 4 222 4 77 1 777 4 4 00000000000 4 55 66 4 4 8 44 4 888888 4 4 777 77 777 66 5 666 4444444444444444444444444444444444 111111 888888888 22222222 5 0 66 55 22222 5 11 66 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 888 55 5 999999999999999999999999999999999999999999999999 0000 0 0 7 11111 6 22 6 0000000000000000000000 2 6 2 888 3 99 3 444444444444444 1 77777777 5 5 66 5 66666666666666 2 888 5 44 5 444 6666666 33333333 111 55555555 44444444444444444444 777777 2 5 0000000 5555555555555555555 777 5 0 444 4 666666666666666666 4 4 8 3 4 1 3 3 3 7 3 666 6666 3 3 3 3 4444444444 3 55 3 666 000 00 3 3 888 3 3 55 3 3 3 3 3 333333333 3 2 4 4 00000 55 2 4 888888888 00 00 444 99999999 66 1111111111 77 999 66 888 66 5 11 5 0 7777 5 5 888 0 2 5 5 888 3 5 66 5 5 888888 5 555 5 777 5 77 1 88 1 1 6 0 5 66 777 3 5 000000 66 5 5 5 5
lowQualScore : . . . . . .... . . . . .. . ... .... . .. . ............. . .. .... .. . ... . .. . ....... . .. . . .. . .. ........ . .. ... .. . ............... .. . ......... ......... ... . ....... .. . . . . ... .. .......... . ... . . . . . ........................... ... . . ... .. .. . .. . . . . ... ... ... . . ..... . ..... . .... ..... ..... .. . .... ..... .. . .. ... . . . .... . ... ............ .. .. . ... . . . . .. . .... . .. ... ........ . .. .... . .... ... .. . .... . . .. . .. . .... ... . ... . . . . ... . . .... . .. . . . ...... .. . . .. ..... ........................ . .. ..... . ............ .. . . . . ...... ... .. .. . ..... . ............................. . . ...... . ... .. ........ .. . ..... .... .................. .. .. . .... .... . . .... . . . .. .. .. . .. . .. ........ ....... . . .. ... ... .. ..... ...... .... . ... . . .... . ..... ....... . ..... . . ..................... .. .. . . . . .. ...................... .. .. .................. .. ... ... . . .. ... .. .. .. . . . . ... .. .... ... .... . .. .................. ..... . ...... . . . .. . .. ... ... . ......... ... . . . .. . . .. . . ..... .. .. . . . . .... . . .. .. . .... ................... .................................... . . . . . . ..... ... . .. . . . .. . .. ............ .. . . .. ... . ...... .. . . . . . . . .. . . . . . . . ... ... . ... . .. . ... . . ........... . .. .. . . . .. . ...... . . ... .. ... .. . ... .................................. ...... ......... ........ . . .. .. ..... . .. .. ......................................................... ... .. . ................................................ .... . . . ..... . .. . ...................... . . . ... . .. . ............... . ........ . . .. . .............. . ... . .. . ... ....... ........ ... ........ .................... ...... . . ....... ................... ... . . ... . .................. . . . . . . . . . . . ... .... . . . . .......... . .. . ... ... .. . . ... . . .. . . . . . ......... . . . . ..... .. . . ......... .. .. ... ........ .. .......... .. ... .. ... .. . .. . . .... . . ... . . . . ... . . .. . . ...... . ... . ... . .. . .. . . . . . .. ... . . ...... .. . . . .
lowQualScore : 3 3 3 7 1 5555 1 1 1 1 33 1 444 1111 1 22 1 2222222222222 1 55 5555 55 7 777 7 77 7 5555555 7 77 7 7 77 7 33 44444444 1 33 555 33 1 333333333333333 33 1 888888888 888888888 000 9 4444444 99 8 9 9 9 999 99 8888888888 9 000 9 9 6 9 2 555555555555555555555555555 444 1 7 999 88 99 9 99 7 9 9 9 999 111 222 7 5 99999 7 55555 7 1111 77777 77777 77 7 5555 77777 44 3 66 888 7 6 6 1111 6 444 666666666666 00 00 6 666 6 6 3 4 11 4 4444 4 11 888 11111111 4 66 9999 9 9999 222 11 4 4444 4 4 11 4 11 4 9999 888 9 000 4 4 9 4 999 4 4 4444 4 66 4 4 4 000000 11 4 4 66 11111 333333333333333333333333 4 11 33333 4 666666666666 00 4 4 9 4 999999 888 11 22 9 66666 4 33333333333333333333333333333 0 4 999999 0 888 99 22222222 99 4 44444 9999 333333333333333333 66 66 4 4444 4444 4 4 8888 9 4 4 11 88 11 1 66 4 33 11111111 4444444 4 4 11 888 999 11 66666 888888 8888 4 777 4 4 4444 8 11111 3333333 4 11111 9 9 444444444444444444444 66 99 0 0 0 0 99 9999999999999999999999 99 11 222222222222222222 99 444 888 4 4 11 888 66 66 11 4 4 0 0 888 99 6666 888 6666 0 88 222222222222222222 55555 0 444444 0 0 0 99 0 66 888 000 0 000000000 444 4 4 4 99 0 0 44 4 4 11111 11 11 8 4 4 4 0000 0 0 00 55 0 5555 8888888888888888888 000000000000000000000000000000000000 0 0 0 0 0 0 55555 000 0 55 0 0 0 55 0 55 111111111111 55 0 0 55 000 0 555555 55 0 0 0 0 0 0 0 55 0 0 0 0 0 1 4 333 000 4 444 4 22 9 888 4 4 99999999999 4 00 11 4 4 9 11 4 999999 4 4 888 22 111 99 0 444 5555555555555555555555555555555555 111111 444444444 11111111 0 8 99 11 55555 0 99 99 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 000 66 7 222222222222222222222222222222222222222222222222 5555 2 2 0 00000 7 55 7 5555555555555555555555 2 7 5 333 3 88 2 222222222222222 0 99999999 0 0 99 0 44444444444444 5 888 0 88 0 999 2222222 44444444 111 66666666 99999999999999999999 666666 5 0 9999999 4444444444444444444 888 0 4 888 4 999999999999999999 4 4 0 2 0 0 6 6 6 3 6 444 4444 6 6 6 6 2222222222 6 00 6 444 000 00 6 6 555 6 6 00 6 6 6 6 6 111111111 6 6 0 0 00000 55 3 0 666666666 33 11 444 55555555 99 9999999999 00 444 99 888 99 0 99 0 0 6666 0 0 888 4 6 0 0 111 4 0 99 0 0 999999 0 666 0 111 7 99 4 88 0 7 7 0 0 99 555 6 0 222222 99 0 0 0 7
consensus : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-C--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-TT-T---TC--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA-A-CA-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTA-AA-A-TT-CA-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------TGTA-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-AAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TGT--C-------TA-AAC-A---TT-GCTTCGTC--AAGGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-TAA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGTT--A-AA---TG-T-ACAC--AAGGGA-----GAT----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCG-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCAT-A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATTTAT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AGG-GT--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGA-AG--AGGA-AATCTT-ATATAAATTTCACA-C-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACT-TA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTCA-GGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAAAAT-TG-TTTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCACCG--GCACGC--------------CAC----GCACAG--ACA-GACACAAC---AGGACACG-A---ACA-GANCAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A---ACCGA-GA--C-CCAC-C-G----ACC--AGACAGACCAG--AA------CG--ACACGACACACGAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGACACCG-A---CCG-CCGACA-ACCACACACAGC--A--CCAGA-CAGCGCAC-ACAC-CACC-CGA-CCGA---A----CGA-CACACACACC-GA-CA-GACAC-A-C-ACAC------ACACGA----C---ACA-GAC-A--GA-CA-A-----CA----CACACACCAC---A-CACGA-CAG-CA-------GAC--AC--AACA-AGCAGA----C-A-GACA-------------CA-----CA-C----AGA-CAGAC--CA-CAGAC---AC-------GACAA-CAC---AG-ATAGAACACAGA-CA-G-CAC-CA-CA-A----CA-CA-CAC-AAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-A-GG------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTTTCTCG--GCACTTCA--CCACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAATATAAAAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTA
Reference ( family-511 ) : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-C--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-TT-T---TC--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA-A-CA-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTA-AA-A-TT-CA-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------TGTA-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-AAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TGT--C-------TA-AAC-A---TT-GCTTCGTC--AAGGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-TAA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGTT--A-AA---TG-T-ACAC--AAGGGA-----GAT----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCG-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCAT-A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATTTAT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AGG-GT--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGA-AG--AGGA-AATCTT-ATATAAATTTCACA-C-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACT-TA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTCA-GGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAAAAT-TG-TTTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCACCG--GCACGC--------------CAC----GCACAG--ACA-GACACAAC---AGGACACG-A---ACA-GANCAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A---ACCGA-GA--C-CCAC-C-G----ACC--AGACAGACCAG--AA------CG--ACACGACACACGAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGACACCG-A---CCG-CCGACA-ACCACACACAGC--A--CCAGA-CAGCGCAC-ACAC-CACC-CGA-CCGA---A----CGA-CACACACACC-GA-CA-GACAC-A-C-ACAC------ACACGA----C---ACA-GAC-A--GA-CA-A-----CA----CACACACCAC---A-CACGA-CAG-CA-------GAC--AC--AACA-AGCAGA----C-A-GACA-------------CA-----CA-C----AGA-CAGAC--CA-CAGAC---AC-------GACAA-CAC---AG-ATAGAACACAGA-CA-G-CAC-CA-CA-A----CA-CA-CAC-AAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-A-GG------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTTTCTCG--GCACTTCA--CCACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAATATAAAAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTA
gi|1 : TTA-ACAGAA-T-TC-C----AA-C--T-T-C--T-CG---GAAT--G-CT--ATGAA---A-G-CTTCAGCG--TT-CATCAC----TTCAAAA-A---TA-G--AAGATCTTC--CG-CG-AAT--AA-AAT-A--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATTCG-A-----AA----A----TTA---T-GTCT---TG--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-A-TTG-A-TAA-T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-TT-TC--TC--CA--GGC--A-GATCA-C-AAA-C-CA---GAGT-T-AATTCCCCT--TG-GATA-AA-A-TG-CAAGAAAAGA-----GAAT-----AAACAGA-TC---ACAGAAATT--TGA---TG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------ATGATTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----ACA--TGA---AGTT------GCTA-TTT-CAA----CAAATCATG-G--TTATGA--AAT-G----AA-G-AAGCGAA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGAA-G-CCTGA-AA--TGCGCA-A-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GC-TGCAA--T-CC-TTG--AGAGAG---TCTC--ACT---T----CT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-TAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAT-GA--ATTT----------------TGTCCC-------TA-AAC-ATCTTT-GCTTATTC--AAGGAT--ATTC--GT--CT-T-----ATAATT--ATAATA-----AACA---------TTTG--ACG--TAC-GA-TG----CATG-TAACATCTA-G-T-TAAGCTT-A--ATGCTAAG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACCATA---AA---GTAAGA-----GA------GAAGTT--A-AAAATTGTT-AC-C--A--GGA-----G------A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---G--------AAAGGAG-AGCCCAGCAG-A-GGTC-A-C--T--G-CA---GAC----AT-C--CTTA--C---T-----TG--AC-------CTCAT-A---A---AAGAA-AT----GC---TTCTCCATCTAT--GACA--CGCAACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-AAGGTGAAG-------C-AAGTGTTGAAAT-TCAAGGTGAC------AGTTAA-AAG-T--AAGG-GGGAAG---AG--CAGG-AATCCT-TTATAATTTACACA-T-TCACATTAC-T--ACC-C-T--TGGA-ATG-----AAAA--AG-G--AACTAA--CTG-TGC---TTCGCTT-CCAC--TA--GTG-AA----GTT--A---G--AAT---CA-CATGTAT-GCCAGT--A------------------------T-C-CG-ATC-ATCA-C-----GGCC---A-T----CC-ACGTCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AC-----A-GC--TTTCAA-TTG-CGGACCG---AAA-G-GA---AACCC-TTGC-TGCC-C-CCC-AT-GCTTCT-TGT-GC-C-TAGCATGTTCACATCATGTA-TGTTTGTAAC-CT--ATCAGATA-AAAAAAT-TG-TTTGCA---T--T-CTAAAA-A-G--T----TG-T--TAT--T-TC-TGT-GT-CAATAGCAC-CACCA----A-CACACTC---AAT-AAC--AAAC-A-A--TT-ATACATGCACCACTGT-CG---------------CAC----GCACAG--ACACGACA-AAC---A--ACACA-G---ACA-GAACAGA---AGACC-----A-CACA-ACAC--A---GACG--GA--T-CCAC-C-ACCACACC--AGACACA-CAC--AA------CG--ACTCAACA
gi|1 : ccttcatataatattaccaaaataaacaaatatgaaaaaagttttatgattacattcctaatattatttatcgttaactcctcgagtaattactttccgtattgcaaagggagggctaacacattgagaccA-CAC---AG-CTA-AACACAGA-CA-C-AAC-C--CA-ATGTACA-CA-CACCAAACAC-TAA--CTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-AAGG------A---CT-TGT--CCCAA---TG--C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-AATGA-GA-AGT-GG--A------ACA-AATCTTTG-T-GG-----TA--CAAAA--CA--TG-C--AAATGAT-ATTTCCTCG---CACT-CA--C-ACAAATCA----------CCCA-T-C-CTG--TGAAAAC---TT--CCGGA--CA-TAGA--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTG--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAAAA---AAAATATTG-AGTACAA-A-A--CTTCATA-TTTAAAATAT-AGAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--AATAGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagatagacacagctaaacacagacacaacccaatgtacacacaccaaacactaacttgaaatgtaataagaaatgaaggacttgtcccaatgcaaaacatgaacatcagaaaatgagaagtggaacaaatctttgtggtacaaaacatgcaaatgatatttcctcgcactcacacaaatcacccatcctgtgaaaacttccggacatagatacttactgactaaataaccttgaaaatttcaatacgataaaaaaaaaatattgagtacaaaacttcatatttaaaatatagaacatccttcttatacactaaaaatccaaaatttctgacctgaatagaatttcaaagttcaggccgacatgtgctta
gi|10 : ccttcatataatattaccaaaataaacaaatatgaaaaaagttttatgattacattcctaatattatttatcgttaactcctcgagtaattactttccgtattgcaaagggagggctaacacattgagaccttaacagaattccaacttctcggaatgctatgaaagcttcagcgttcatcacttcaaaaatagaagatcttccgcgaataaaataatatatcatacatggcgagttattcgaaaattatgtcttgttgaaatgagcgaaaccaaaattgataatccccaattacacatttctccaggcagatcacaaaccagagttaattccccttggataaaatgcaagaaaagagaataaacagatcacagaaatttgatggaaaacacttgaatgattgatctcagatgaaaacatgaagttgctatttcaacaaatcatggttatgaaatgaagaagcgaatttttataaaaaaaagaagcctgaaatgcgcaataagggtctaaactcgctgcaatccttgagagagtctcacttctctgttattacaacttcttaaatttatttcaccaatgaattttgtccctaaacatctttgcttattcaaggatattcgtcttataattataataaacatttgacgtacgatgcatgtaacatctagttaagcttaatgctaaggtcaaaatataacaccataaagtaagagagaagttaaaaattgttaccaggagataatctagtccccccaaagaaaggagagcccagcagaggtcactgcagacatccttacttgacctcataaaagaaatgcttctccatctatgacacgcaactgataatcaggaaacaatgaaggtgaagcaagtgttgaaattcaaggtgacagttaaaagtaagggggaagagcaggaatcctttataatttacacattcacattactacccttggaatgaaaaaggaactaactgtgcttcgcttccactagtgaagttagaatcacatgtatgccagtatccgatcatcacggccatccacgtccctccatacagggaatacagctttcaattgcggaccgaaaggaaacccttgctgccccccatgcttcttgtgcctagcatgttcacatcatgtatgtttgtaacctatcagataaaaaaattgtttgcattctaaaaagttgttatttctgtgtcaatagcaccaccaacacactcaataacaaacaattatacatgcaccactgtcgcacgcacagacacgacaaacaacacagacagaacagaagaccacacaacacagacggatccaccaccacaccagacacacacaacgactcaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagatagTCACG-CCTC-CA-CAC-TC-ACC-C-TC-TAG----G-----ACAA--GCAA----C--AT-CTG-T-C---TTC-CT--CCACT--A--GTC-GATAACGTTTAG---A--AGTT--CACCATGTC----CAGTA-A------------------------T-C-CG-AT--AT-AAC-----GGCC---AAT--C-CC-AC-TCCCTCCATC-AAGGGA-ATTGAA-----G-CCCTTT--AA-TGGGCGG--CG---AAG-G------A--CC-TTGC--G-C-C-----AC-ACTTTTG--------------------CAT-ATTT---GTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAA--T-TG-TT-GCA---T-GT-CTAAAA-A-AGTT----TG-T--TAT--T-TC-TGT-GTC-AATAGCACACAC------AACA-AC-C---AATGAACA-AA-C-A-A--TA-ACA--TGCA-----GCACGC--------------CAT----GCACAG------GACA---------GACACG-A---ACA-GA-CAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A----CCGA-CA--C-T-AC-C-A----ACC-------GACC-G--AA------CG--AC--GACACCCAAC-AG-AAGAGACACAGAC-------AGAC---CACA--CAC-G-A---CCGACCGACA-GACACACACA-C--A--CAAGA-CAGCATAC-ACACACACC------------A----CAA-CAGACAGACCTGA-CA-GACAC-A-C-ACAC------AGAAGA----C---ACA-ACCGA--GA-CA-C-----GA----CCGACAC-AC---A-CACGA-C---CA-------CCC--AC--AACACAGCAGAGAACC-C-GACA-------------CA-----CA-C----A---CAG----CA-CAGGC---AC-------------------AG-ATAGA-CACAGA-CA-G-CAC--A--A-A----CA-CA-CAC-AA-CAC-TAAA-CTT-GAATT-GT-AAGT-A---AG----AA--T-G-A-GG------AA--CT-TGT--C--AA---T---C--AA-AACATG-AAGC-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACG-AAACTTTG-TGGG-----TA--C-AAAA-C--ATGTC--CAATAA-TATT---TCGC-GCAC-TCA---CACAA--CC----------CCC-AT-C-TTGAACGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--T-CTT-AC-T---GA-TAATAAAC-C-TT-----CATT-TCAAT---C-GAGT-A----AAA-AAG-AAAATATTG-AGTAC---A-A--CTTCATATTTTAAGCTAT---AACATCTTCC-TTATCACA-CTAAAAAT--CCATGAAAATTTCTGA-CCT------AGAATTTCAAAG---TC-AGGCCG-AC-ATGTTGCTTA
gi|11 : taC-------GACAT-A---A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATT-AT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--CTGAA--------C-AGG--T--GAAT-TT-AGGT-AC------AATT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAG-------AGGA-AATCTG-ATA---ATTTCACA-C-TC-AA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CAC-ATGT---AGCAGTA-A------------------------T-T-TG-ATC-AT-A-C-----GGCC---C-T--C-CC-AC-TCCCTATAT--CAGGGC-AT--AA-----G-CT--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATAATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAAAAA-TG--TTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-TC-ATT--T-TC-TGT-GT-CAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAAC--AAAC-A-A--TA-AC--ATGCA--A--ACACGCNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNN--NNN-NNNNNNNN---NNNNNNNN-N---NNA-GAGCACAACCACA-C-----A-CAC--ACAC--A---CCCG---------CACTC-G----ACG--CGACCGACC----------------ACAC-ACACAAGAC-AG-CA----CACA-AC-------A
gi|12 : ttactcctacttttctctgAAGACAGA-CA---CACACA-CA-C----AA-CA-CAC-GAACAC-TAAA-CTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAAAT-G-A-GG------AAC-TT-TGT--CC-AA---TATGC--AA-AACATG-AAAC-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTT-G-T-GG-----TA--CAAAAA-CA--TG-C--AAATGAT-ATTT-CTCT--G-ACT-CA--C-ACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAA-C---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAA-TAAC-C-TTA--AATTTT-TCAAT--ACGGA-T-------AA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-ATA--CTTCATATTTTAAAATAT--AAACATCCTTCTTTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAA-TTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCT
gi|13 : cA-AAC-A--AA-CA-A-----TA-----ACATGCAGC---A-CA--A-CAA-CA-------GAC--------CA--GAAGA----C-A-GACA-------------CA-----CATC----AGA-CCGACACCAACAGACGACAC-------ATCAC-CAC---AG-A-AGCAGACAGA-TA-T-GAC-CA-CA-G----C--CA-CAC-AA-CAC-TAAA-CTT-GAAA--GT-AA-T-A---AGC---AAA-TAG-C-GA------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-A-CATG-AA-T-AT--AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AAC-TTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CAGATG-C--AAATGA-TATTTTC-----GCAC-TCA--C--CAA--TC----------CCCCAT-T-CT---TGAAAAC---TT--CCG-A---A-TA-A--ATCTT-ACTT---GACT-GATGAC-C-TT----AAATT-TCAATAAAC-GA-T-------AA-A---CAAATATTG-AGTAC-AGA-A--CTTCATA-TTTAA
gi|14 : ccaC-AAACAC-TAAA--CT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGCCA-AGA-T-GGA-GGCGCAA-A---CC-T----TC-AC---T---CCTGA-AATA--------ATCCAG-G--A-A-TAATGAGATT-GG--AGGAACTACA-AACTTCTG-T-AGAATCATC--CATAAA-CG-TCGTC--CAATGAT-ATTTCTTCATCGCACT------CACAG--CTAGGACAAAAATCTAGC-GACTG--TGAGAACATTTT--CGG-A--CT-TA-AATTATTTGAT-TTCAGGCTAA-TAACGCATTATTAAAATT-TCAAT--AC-G--T-ATTTTGAA-ATGTAAAATATTA-GGTGC-A-
gi|15 : cTTA-A-AGTA-T-GT-C----AA-A-AT-C-T--T-TA---AA----G-CT--ATG----------------------C--TGT----TT-AAAA-A---CG-G--AAGAT-TTT--CC--G-AAT--AA-AAT-G--A-GG--TATC--------A-TA--C---AT--A-G--TTAT---A-----AT--T-ATT---G-----AT----A----ATA---T-G------TC--TTGA-G-A-T---GA--G-T--G-A-A-C-C----A-G-AATTG-tgcaaacaaacattaagatatatattctataagagtaataacacgaaatctttcatatagatagcaat
gi|16 : cagtttcgaatctcataaaaagcactttatctaagcaaagtggcaaccttcatgtattaatacaaaataatcatattgaaatattcaattttttttaaattaaatacatgtatactttttaactttacttccatattagcagatggccaagtatatcggagaccTTA-A-AGGA-C-TT-TGCCAAA-A-AT-T-CA-T-CA----A-C--A-CT--ATAAA-GTA----------------C--TATGCGGTTGAAAA-T---TA-A--AAGAC-TTG--CC-GGTCAT--AA-AAG-G--A-TG--TATC--------A-CA--C---AG--G-G-----G---G-----TT--T-ATC---G-----AA----AAC--CTA---T-GT------C--T----A-A-T---AA--G------G-A-T-T---AG-G-AATGC-A--A--T---C-------TTAA----C--T-C---A-TT-TGTTTT--CA--G-C--ATG-TCA-C-AAA---CA-A-GAGT-TAA-TTCCCCTCCTT-GGT---A-A-TT-T--GGAAATG-----GAAT-----AAA--AAGTC-C--CAAAA--A--TGGA-c
gi|17 : AAAA-A---TCTG--AAGAC-TTC--GC--G-AAT--AA-AAT----------TATC--------A-CA--CC--AT--G-G---------G-----GT--T-GTC---G-----AA----AA---CTA---T-G-------C--CTGA-A-A-T---AA--A-C--GGA---T-T---AG-A-AAT---G-CA--T---C--------TA-----A--A-CGTGA-TTGT---TT--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA---CA-A-GAGT-T-A-T-CCCCT--TG-G-TA-A----TT-TT-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AG-TC-CAACTGAA--T--Ttatttatagcctattattctgatcagatcatatagaaa
gi|18 : aaaaaactgcaaaaattcttaaaacaataaattactctatgcggttga-C----AA-A-AT-T-C--T-TA---AA-C--A-CT--ATTAA-ATA-C-C-----TA--TG-C---AG----TTGAAAA-A---TT-G--AAGAC-TTG--C---G-AAT--AA-AAG-G--A-TG--TATC--------A-CA--C---AT--G-G--A--G---G-----TT--T-ATC---G-----AA----A----ACA---T-GT-----CC--T-GA-A-A-T---AA--A-G--GA----T-T---AG-A-AATGC-A--A--T---C-------TTAA----C--GTC---A-TT-TGTTTT--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA---CA-A-GAGT-T-A-TCCCCCA--TT-GGT---A-A-TT-TT-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AT-TC-C-A------------AA-ATG-G--AGTTAA-AG-T-C--TAT-T---A-----------TT--TTG--A-T---TC-AG-A-atagcctaattattctgatcaagaaatcaagttatagaaa
gi|19 : gACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGGA--AAA-T-G-A-GG------AA--CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AGCATT-AA-T-ATC-AG-G--A-A-TGA-GA-ATT-AG--A------ACA-AACTatcaattataga
gi|2 : AAAA-G---TA-ATTATGAT-TTC--ACGCG-AAT--AATAAT-G--A--A--TAACGGT-----A-TA--C---ATC-G-G--C--G---AAGTT-GT--T-ATT---GTGAGTAATAC-A----TTAAAAT-GC-----TC--TTAA-A-AAT---GA--AAC--GGATA-C-C---AA-A-A-TTG-A-TGATT---CGACCCAAT-A-----C--A-C---A-TT-T---TC--CACAG-C--A-G-TCAAC-ACA-A-CGCA-GAGT-T-A-TTCCCCT--TT-GGTA-AATA-TC-CA-GAAAATC-----GAAT-----AAA--AA-TC-C--CAGAA--T--T--A-ATG-G------AA-AC-A-C----T-G---A-----------CT--TTG--A-T-TACC-AG-A-T-GAAAA-A----A-A--TGA---AG-T------TGTA-TT--CAAATATGAAA-C-T--G--GTATGC--AAT-AGACCAA-G-AGG--AT-C--TTATT----ATATCTAATA-AAAGAA-A-CTTGA-A----GGCCA-GTT----AACGC-GGT-C-AGAACTTC---ATAAGCAA--TCCC-TTGCAAGAT-G---TCTTTAGCTGGATCGTGTTCGC-----T-G--TGTAAAA-AT------------AC--ATT-T-CTAAAAAT-TTAGA-A-T---TCCTCA--C-CAAG-GAC-A-TT----------------TAT--ccgaaaatcagaaataatcacagcacctggaaagtgtaatttatcataatttaagcttacaaatatctataatctgcaatttcgatatccttcatgaccgttacaggcgttgcgtcccacacatgttgtcagggaactattgacactggccggttccatagataaatggt
gi|2 : acgaattctaaatgacaaaaaA-----A--A---------TTTGGTACG--T-C----TGTCATC-CG-TAA-CTCTA-GAT-TAG--CT-ATAATGT--AG-G---GAAA--------CATACTCAACCA-C-ACC--ATCCAA---GGT--A-----GATGTTATGAAGTT--A-AAA--TG-T-AC-C--AAGGT------GAT----A-TAAAT-C-T-TATCACCTAACCACAA---AG-------AAAGGAGAAGCCAG-CAG-A-GGTCTA-C--CTCGTCA---AACGATCAT-T--CTTATTC-CATCC---TGCCAC-------GTCAT-AAT-A---AGGAAGAT-G--GC---T-CTCCATATATACGACAATC-C-ACTAGC-TATCCATCCCAG----GAAAACCCAAAATTTGGA--GTGAAAGAAAAAAC-AGG--T--GAAT-TC-AGGT-ACAATGCTAGTT-A-AAGATGGAGAG-GGGGAGGA-AAGCAGGACAATCTTCATACCCATCCC-CC-C-CC-CA-TAC-tatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatataaaatttggtacgtctgtcatccgtaactctagattagctataatgtagggaaacatactcaaccacaccatccaaggtagatgttatgaagttaaaatgtaccaaggtgatataaatcttatcacctaaccacaaagaaaggagaagccagcagaggtctacctcgtcaaacgatcattcttattccatcctgccacgtcataataaggaagatggctctccatatatacgacaatccactagctatccatcccaggaaaacccaaaatttggagtgaaagaaaaaacaggtgaattcaggtacaatgctagttaaagatggagagggggaggaaagcaggacaatcttcatacccatcccccccccatacaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagtggaaggaaataggaaggaactaacactaatcctcctcccacctatgatgaacgttgtggaaatatgcacaatgtcagcagtgaatgtctgtttgaccaaattactattccgatccatactagatgacccatttcccacctcccttcctatcagaaaaaaacagctggttaaatcgccgcgcccaaacgcgacacgccttgcctgtcgcccatgcttctgtgcggccatactgtccagtcatttatgtttgtacctcttcaataaaaaaatgttttgcgaattgtgctaaaagagtctcgtgcatttattctgtcgtcaattagcaccatataacaacacagcaatgacagagacatatctaacgaggcacgggcagaccctctttcacaaaaagaggcggctcaagtacacgattcaagaacagaccactacaagaccaagggacagatcacagcatcacacatcacaggatagaacagacacaattggtgaaacagcaagaaaaatacctcggataaatacacaacatcctagatcagactagagcagatccgaacaacacaacacagaccagaacatcgtacccgatgacacgagggccacagacagacacacagttcacatacacgacacacacctacagacgcaagcacaggacataaatcatagacaaaagacagacaccaagtatgataatcacatgaggttgaaaaaaatattctaaaagaccacacaaccacaacttgtaatcgtgagaagaggaaaataaagagcgaaactctgtactcaatccaaaagcatgaataatcagaaatgaaattggataacaaacttttgatgatacaaacaatcagaaataatctact
gi|2 : acgaattctaaatgacaaaaaaaaagtaattatgatttcacgcgaataataatgaataacggtatacatcggcgaagttgttattgtgagtaatacattaaaatgctcttaaaaatgaaacggataccaaaattgatgattcgacccaatacacattttccacagcagtcaacacaacgcagagttattcccctttggtaaatatccagaaaatcgaataaaaatcccagaattaatggaaacactgactttgattaccagatgaaaaaaatgaagttgtattcaaatatgaaactggtatgcaatagaccaagaggatcttattatatctaataaaagaaacttgaaggccagttaacgcggtcagaacttcataagcaatcccttgcaagatgtctttagctggatcgtgttcgctgtgtaaaaatacatttctaaaaatttagaattcctcaccaaggacatttattatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatata-TGGA-A-G-----GAAATAGGAAGGAACTAACACTAAT-C---CTC-CTC-CCACC-TATGATG-AAC---GTT--GTGGA--AATATGCACAATGTCA-G-CAGTG-AATGTCTGTTTGACCAAATTACTATT-C-CG-ATCCAT-A-CTAGATGACCC--A-TTTC-CC-ACCTCCCTTCCTATCAGAAA-AA--AACAGCTG-GT--TA--AA-TCG-CCG--CGCCCAAACGCGACACG--CC-TTGCCTG-T-CGCCC-AT-GCTTCTGTGCGGC-CAT-AC-TGTCC-AGTCATTTA-TGTTTGTACCTCT---TCA-AT--AAAAAAA-TGTTTTGCGAATT-GTGCTAAAAGA-G--TCTCGTG-C--ATTTAT-TC-TGTCGTCAATTAGCAC-CATATAACAA-CACAG-C---AATG-ACAGAGAC-ATATCTA-ACG-AGGCACGG--GCAGAC--------------C-CTCTTTCACAA--AAA-GAGGCGGCTCAAGTACACG-ATTCA-A-GAACAGA--C----C-----A-C-T--ACAA--G---ACCAA-G----------------------GGACAGATCAC--AG------CATCACACATCACAGGAT-AGAACAGA-CACA-ATTGGTGAAACAG---CA-AGAAAAAT-A---CCT-CGGATA-A--ATACACAAC--ATCCTAGATCAG---ACTAGAG-CA----GATCCGA---A----CAA-CACA-ACACA-GACCA-GA-AC-ATC-GTACCCGATGACACGAGGGCC---ACA-GAC-A--GA-CACACAGTTCA----CATACACGAC---A-CACAC-CTA-CA-------GAC-------GCA-AGC--A----C-AGGACA-------------TAAAT--CA-T----AGA-CAAAA--GA-CAGAC---ACCAAGTATGATAATCACATGAG-GTTGAA-AAAAA-TA-T-T-C-TA-AA-A----GACCA-CAC-AACCAC----AACTT-GTAATCGT-GA-G-A---AGAGGAAAA-T-A-A-AGAGCGAAA---CTCTGTACTC-AA---T---CCAAA-AGCATG-AA-TAATC-AG-A--A-A-TGA--A-ATT-GGATA------ACA-AACTTTTGAT-GA-----TA--C--AAA-CA-AT--CAGAAATAATaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagtggaaggaaataggaaggaactaacactaatcctcctcccacctatgatgaacgttgtggaaatatgcacaatgtcagcagtgaatgtctgtttgaccaaattactattccgatccatactagatgacccatttcccacctcccttcctatcagaaaaaaacagctggttaaatcgccgcgcccaaacgcgacacgccttgcctgtcgcccatgcttctgtgcggccatactgtccagtcatttatgtttgtacctcttcaataaaaaaatgttttgcgaattgtgctaaaagagtctcgtgcatttattctgtcgtcaattagcaccatataacaacacagcaatgacagagacatatctaacgaggcacgggcagaccctctttcacaaaaagaggcggctcaagtacacgattcaagaacagaccactacaagaccaagggacagatcacagcatcacacatcacaggatagaacagacacaattggtgaaacagcaagaaaaatacctcggataaatacacaacatcctagatcagactagagcagatccgaacaacacaacacagaccagaacatcgtacccgatgacacgagggccacagacagacacacagttcacatacacgacacacacctacagacgcaagcacaggacataaatcatagacaaaagacagacaccaagtatgataatcacatgaggttgaaaaaaatattctaaaagaccacacaaccacaacttgtaatcgtgagaagaggaaaataaagagcgaaactctgtactcaatccaaaagcatgaataatcagaaatgaaattggataacaaacttttgatgatacaaacaatcagaaataatctact
gi|22 : acgaattctaaatgacaaaaaaaaagtaattatgatttcacgcgaataataatgaataacggtatacatcggcgaagttgttattgtgagtaatacattaaaatgctcttaaaaatgaaacggataccaaaattgatgattcgacccaatacacattttccacagcagtcaacacaacgcagagttattcccctttggtaaatatccagaaaatcgaataaaaatcccagaattaatggaaacactgactttgattaccagatgaaaaaaatgaagttgtattcaaatatgaaactggtatgcaatagaccaagaggatcttattatatctaataaaagaaacttgaaggccagttaacgcggtcagaacttcataagcaatcccttgcaagatgtctttagctggatcgtgttcgctgtgtaaaaatacatttctaaaaatttagaattcctcaccaaggacatttattatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatataaaatttggtacgtctgtcatccgtaactctagattagctataatgtagggaaacatactcaaccacaccatccaaggtagatgttatgaagttaaaatgtaccaaggtgatataaatcttatcacctaaccacaaagaaaggagaagccagcagaggtctacctcgtcaaacgatcattcttattccatcctgccacgtcataataaggaagatggctctccatatatacgacaatccactagctatccatcccaggaaaacccaaaatttggagtgaaagaaaaaacaggtgaattcaggtacaatgctagttaaagatggagagggggaggaaagcaggacaatcttcatacccatcccccccccatacaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagTA---T-GT------C--TTGA-A-A-T---GA--G-C--AGA-A-C-C----A-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAA-TA-----CAAA-C---A-TT-T---TC--CA--G-C--A-G-TCA-C--AA-A-CC-A-GAGTAT-A-TT-CCCT--TG-GTTA-AA-A--T-CA-GAAAAAGAAAATGAATTAACCAAT--AA-TC-A-GCAGAA--T--TGAT-GTG-T--A---AA-ctact
gi|23 : TC-CTT-CCACC-CA--ATG-A-------T--C---C--AG--------ATGT------AGAA-C------------------------T-C-CA-ATC-AT-A-C-----TGCC---C-T--C-AC-AC-TAC-TCCAT--CTGGGA-AT--AA-----ATAC--TTT-AA-TGG-CCG--GG---AAA-G-AA---A--CA-ATGC-TG-C-A-CCA-AT-GCTTCTGCG--GT-A-T-GC-TGTTC-Cct
gi|24 : aaccaagtaT-T---TT--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA---CA-A-AAGT-T-A-TCTCCCT--T--GGT---A-A-TT-TT-GAAAAT------GAAT-----AAA--AG-CC-C-A---AA--A--TGGA-AT--T--A---AA-TC-A-T--A-T-T---A-----------TT--TTG--A-T---TC-AG-A-t
gi|25 : tg-GAGT-T-A-TCCCCCT--TG-GC----A-A-TT-TT-GAAAATG-----AAAT-----AAG--AG-TC-C--CAAAA-----TGAA-atcaattttag
gi|26 : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TA-----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TT---CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TT--TATgcttagacctaccgggtagctattgttttgattcagaatcaaaatta
gi|27 : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TC---AA-A---TA-G--AAGAT-TT---CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TT--TATC--------
gi|3 : TTA-A-AGAAAT-TT-C----AA-C-AT-T-C--TGCG---GA-T--G-CT--ATGAAAGTA-G-CG----CGGCTT-CGGTAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AT-AAT-G--A-TAAGTATC--------A-TA--C----T--G-G--T--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-AGC-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-TT-T---TC--CA--G-C--AAG-TCA-C-AAA-AACC-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTATAA-A-TC-CA-GAAAAAG-----GAAT-----AAA--CA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTGTTA-T-T-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A---GA---AGTT------TGTT-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AATAG----AA-GGAGG--AAAT--TT-TT----ATA---AAAATAAAAGA-A-C-TGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---AATT------------ACA-A-T-T-CT-AAAAT-TT----C-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TG---C-------TA-AAC-A---TT-GCTTTG-C--ATAGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A------------TTTG--ACG--T-C----TG----C-TG-TAA-ATCTAAG-T-TAG--TTTA--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGT---A-AA---TG-T-ACACG-AAGGGA-----GAT----A-TAA-TGC-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCA-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCA--A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCAATTATT-GACA--T-C-ACTCGACTA---ATC--AG----GAA----CAA----TG-A--GTGAAG-------C-AAGAGT--GAAT-T--AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGATAG--AGGA-AATCCT-GTATAAATTTCACAAT-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TAATGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACTCTA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTTATGGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TT-C-TG-C-C-CCCAAT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TG-TTGTA----TAAATCA-AT--AAAAAAT-TG--TTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCCACG--ACGTGCTAA-----------TAC----GAACAGTAGCA-GGTACAAC---AGGACACACA---GCA-GACCAGA--CAG--C-----A-CAG--ACAC--A---ACCGATGA--CTCCAC-TAG----ATC--AGACAGACCAG--AG------CG--ACACAACACACAAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGGTACCG-ATTTCCACCCGACA-ACCACACACAGC--A--TCAGC-CCATGCAC-ACAC-CACCACGA-CCGATCCATTACCGA-CACACACACCTGA-C--GACAC-A-C-ACAC------ACACAA----C---ACA-GAC-AGCGA-CA-A-----CG----CACACACCAC---AGTATAA-CAG-CA-------GAC--AC--AACA-AGCAGA----CTATGACA-------------CAAGATTCA-C----AGAGCAGAC--CA-CAGACT--AC-------GACAA-CAT---AG-ATAGAACACTGA-CATG-CAC-CAGCA-G----CA-CATCAC-AAACACATAAAACTT-GAAAT-GT-AATT-A---AG----AAA-T-G-A-GG------ATG-CA-TGT--CC-AAAGTT---C--AA-AACATGAAA-C-ATC-AG-A--ATA-TGA-GA-ATT-GG---------ACATAACTGTTG-T-GG-----TACTCGAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTGTCTCG--GCACTTCACGCCACAA--CC----------CCCAGT-G-CTG--TGAAAAC---TTTCCCG-ACTCATTACA--TACCT-TC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTT-AAATATAAGACCAT-CTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CCCAGAGAA--TCTGAGTCT---A--AGAATTTCAAAG--TTCAAGGCCG-ACTATG-TGCTTA
gi|31 : T-ACA-CTAAAAAT--AC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTT
gi|32 : -ACA-CTAAAAATTTCC---AAAAATTCT-A-CCTG--A--AGAATTTC-AAG--TTC-AGGCCGAAC-AT
gi|4 : TTA-A-AGAA-TCTT-C----AA-C-ATAT-C--T-CG---GA-T--G-C---ATGAA-GTA-G-C-----CT--TT-C---AT----TTCAAAA-AC--TA-G--AAGAG-TTT--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TAATC---AT--G-G--C--GTACG-----GG--T-ATTTTGA-----AA----A----TTA---TTGT-----CT--TTAA-A-A-TC--GA--G-C--GAA-----C---AACA-AATTG-AATA--T---T--CC-AAT----------A-C---A-TTAT---TC--CA--G-C--C-G-TCA-C-AAA-G-CA-A-GAGT---A-T-CACCT--TG-TTTA-AA-A-TC----GAAAATG-----AAA-------AA--AA-TCAC-AAGAAA--T--TGAA--TG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-GGGGA-----------AT--TTG--ACT-C-TCCAG-A-T-G--AA-A----A-AAATGC---AATT------T-TG-TT--CAA----GAA-TC-TG-GTAGT-TGA--AAT-G----AA-G-AGG--AC-T--TT-TTT---ATA---AAAA-A---GA-A-CCTGACAA--TGGTCC-A-T----AA-G--GGTGC-TAAAC-TC----TATGCGA--T-CC-T-G--AGAG------CT---ACT--AT----TT--------T-G--T-T---A-TT------------ACA--CT-T-CA-AAAAT-T-----A-T---T--CGA--C-CAAG-GA--A-TT----------------TGT--C-------CA-A--------T-GCTTCG-C--AGGAAT--A-T---GT--CTAC-----TTTATT--A-AATACA---A--A---------TTTG--ACGA-T-CAG--TG----C-TG-TA---TCTA-G-T-TAG--T--A--AC-T--AG-GTTCAAAACTTAAATATATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--ATAAGCGA------GAAGTT--A-AAA--TG-T-ACA----AGGGA-----GAT----AATTA-T-C-TTAGTCCCC---C----A---TA-------AAAGGA--AGCCAGCAAG-A-GGTC-AAC--TGC--CAC--GAC----A--C--CTTA--C--AT-----CGA--C-------GTCAT-A-T-A---AAGGA-AT-G--GC---TTCTCCAT--AA--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AGAGGGGTAA---CAT----TG-AT-GTGAG--------C-AGG--T--GAA---C-AG-T-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GG--AGGA-AG----GA-AATCTT----TAA--TTCACA-C-TC-CA-TACAT--ACC-CCTA-TGGA-A-GGAAGAAAAA--GGAA--ACCTAAC-CTG-T-CGTTCTC-CTTTCCACT--A--GTG-------GTT--G---ATTCGTA--CAC-ATGGCA----AGTA-A------------------------C-C----ATCCAT-A-CTG---GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCA-A-CAGG---AT--A------G-AT--TT--AA-T---CGG--CG---GAA-A--A---A--CC-T-----G-CGC-CCC-A--GCTC---TG--GC-C-T-GC-T-TTC-CATCATTTACTGTTTGTAA--CT--ATCA-AT--AAAAAATATG-TT-GCA---T-GT-CTAAAA-AAG--T----TG-TC-ATT--T-TC-TGT-GATCAATAGCAC-AAC------A-CACAC-C---A-TGAACA-ACACCA-A--TATACA--TGCATTG---CA-GC--------------AAC-------CA---AC--GACGCA-------GACACA-A-------GA-CAGA--CAGA-C-----A-CACCAACACCGA---GCCG--GACTC-CTCC-C-G----AC----GNNNNNNNNN--NN------NN--NNNNNNNNNNNNNN-NN-NN----NNNN-NN-------NNNN---NNNNNNNNNNN-N---NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNN--N--NNNNN-NNNNNNNN-TCCC-GACC-CGA-CCGA---C----CGACCACACACACC-GC-CC-GACCCGA-C-CGAC------ACAC-A----C---ACA-GAC-A--GACCG-A-----CATCTCCCCCCCCCCC---A-CACCA-CA--CA-------GAC--A---GACA-GACAGA----C-A-GATA-------------GA-----CA-C----AGA-CAGAC--CA-CACAC---AC--------ACAA-AAC---
gi|4 : acataaatattaccaaataaaattattgaaaaatatgttgattcatttaagataactctcttaaataatttatatggttaaacctgggtaactacctttccgtatggcccaaggagggaagagttggaccCGA----CCCGACC-GAC-C--GA-C--------CA----CACACACCGCCCGA-CCCGA-CCGACA-------CAC--AC--A-CA-GACAGA----C-C-GACATCTCCCCCCCCCCCA-----CA-CC---ACA-CAGAC------AGAC---A--------GACAG--AC---AG-ATAGA-CACAGA-CA-G--AC-CA-CA------CA-CA-CAC-AAA-AC-TTAAACTTTGAAAT-GTTAA-TTA---AT----AAA-A-G-A-GG------A---AA-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AT-C-ATC-AG-AGAA-A-TGA-GA-ATTTGG--A------A-A-AACTTCTG-T-GG-----TA--CAAAAAACA---G-C--AAATGAT-ATTT-CTCG---CACT-CA--C-ACAA--CC----------CCCCAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-AA-CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAA-TAAC-C-TTA--AA--TTATCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTGGAGTAC-A-A-AAACTTCATA-TTTAAAGTATAAA--CATC-TTC-T-AT-ACA-CTAAAAAT--CC---AGAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAA----TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTttaaactttgaaatgttaattaataaaagaggaaatgtccaatcaaaacatgatcatcagagaaatgagaatttggaaaaacttctgtggtacaaaaaacagcaaatgatatttctcgcactcacacaaccccccatgctgtgaaaacttccgaacataatacttactgactaataaccttaaattatcaatacgataaaaaaaaatattggagtacaaaaacttcatatttaaagtataaacatcttctatacactaaaaatccagaatttctgacctgaagaatttcaattcaggccgacatgtgctt
gi|5 : acataaatattaccaaataaaattattgaaaaatatgttgattcatttaagataactctcttaaataatttatatggttaaacctgggtaactacctttccgtatggcccaaggagggaagagttggaccttaaagaatcttcaacatatctcggatgcatgaagtagcctttcatttcaaaaactagaagagtttcccgaataaaatgatatatcataatcatggcgtacgggtattttgaaaattattgtctttaaaatcgagcgaacaacaaattgaatattccaatacattattccagccgtcacaaagcaagagtatcaccttgtttaaaatcgaaaatgaaaaaaatcacaagaaattgaatggaaaacacttggggaatttgactctccagatgaaaaaaatgcaattttgttcaagaatctggtagttgaaatgaagaggacttttttataaaaaagaacctgacaatggtccataagggtgctaaactctatgcgatcctgagagctactattttgttattacacttcaaaaattattcgaccaaggaatttgtccaatgcttcgcaggaatatgtctactttattaaatacaaatttgacgatcagtgctgtatctagttagtaactaggttcaaaacttaaatatataacaccaaagtaataagcgagaagttaaaatgtacaagggagataattatcttagtcccccataaaaggaagccagcaagaggtcaactgccacgacaccttacatcgacgtcatataaaggaatggcttctccataagacatcactgataatcagaggggtaacattgatgtgagcaggtgaacagtacagttaaagtaaggggaggaaggaaatctttaattcacactccatacatacccctatggaaggaagaaaaaggaaacctaacctgtcgttctcctttccactagtggttgattcgtacacatggcaagtaaccatccatactgggccatcccactccctccaacaggatagatttaatcggcggaaaaacctgcgccccagctctggcctgctttccatcatttactgtttgtaactatcaataaaaaatatgttgcatgtctaaaaaagttgtcattttctgtgatcaatagcacaacacacaccatgaacaacaccaatatacatgcattgcagcaaccaacgacgcagacacaagacagacagacacaccaacaccgagccggactcctcccgacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccTTA-A-AGAA-T----C----AA-C-AT-TAC--T-CC---GATC--G-AC--ATAAC-GTA-G-CG----CG--TT-C--TAT----TGCAAAA-AAAATA-G--AAGAT-TTC------G-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-GA--C---AT--G-G-----G---A-----GTATT-ATT---G-----AC----A----ATA---T-GA-----TC--TCGA-A-A-----GA--G-C--GAA-T-CGC---TA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAAT-A-----C--A-C---AGTT-T---TT--CA--G-C--A-G-TT--C-AAA-AGCA-G-GAGTGT-A-GTCCCCT--TGTAGTA-AA-AAGT-CA-GAAA-TG-----AAAT-----AAA--CG-AC-T-ACAGAT--T--TGAA--TGTG--A---AA-TA-A-C--TCT-G---A-----------AT--TTG--A-T-T-TC-C--A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------GTTA-TT--CAA----GAT-TC-TG-G---TATGA------G----AA-G-AGG--AA-T--TT-T-----ATA---AAAA-AA--GA-A-C-TGA-A---TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---A-ATGCAA--T-CCATTGC-AGAG-T---TAT----CT--AT----TT--CCTGCAT-G--T-T---A-TT------------CTA-ATT-C-CT-AAAAT-TTTA--A-T---T--TCA--CATAAGCGA--A-TT----------------TGT--C-------TA-AA------TT-GCTTTGTC--AAGGAT-----C--GT--CTCT-----CTT-TT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C----TG----C-TG-TTA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGTT-AGTGT-CAAA-----------TA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--AA----GA------GAAGT---A-AA---TG-T-AC-C--AAGGGA-----TATGCTGA-AGA-T-C-T-G----CC---CCA-AG---TT-------AAAGGAGA-GCCAG-CAG-ATGGTC-A-CGTTGCG-CACTTG-C----ATGCG-CCTA--C-TATCTCCATGA--CTCCAAGAGTTAC-A-T-ACCAAAGAA-A--G--GC---TTCTCCATT-AT--GA-A--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAAA---TG-A--GTGAA--------C-AGG--T--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGAG-GAA-AG--AGGA-A-TCTT-A---GAATTTCACA---TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--A-CTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTG-AA----GTTA-G---A--AGT---CAC-ATGT---AGCAGTA-A------------------------T-CGCG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CCCAC-TCCCTCCAT--CAGGGA-AT--AA-----A-GCT-TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-A-GG---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT----AAAAT-TG--TTG-A---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-TTCATT--T-TCTTGT-GT-CAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAAC--AAAC---A--TA-AC--ATGCAC----GCACG---------------CAC----GCACAG--ACA-GACA-AAC---AGAACACA-G---ACA-GACCAGA--CAGA-C-----ATCAC--ACAC--AC--AC--A-CA--C-CCAC-C-C----AGC--CGACCGACC----GA------C---ACACAACACGAGAC-AG-AC---------AC-------AC----------ACACCG-A---CCGACCGACACACCACA-----C--A--TCAGA-CAGGACAC-ACAC------------------------A-CACACACAGA-GAGCA-GAC--------------------CGA----C----CA-GAC-A--CA-CA-A-----T---------TACCA----A-TA-GA-CAG-CA-------GACAGAC--ACCA-A-CACA----C-A-CACA-------------CA-----CA-CAGAGAGA-CAGAC--CC-CACAC---AC-------CAC-A-CAC---AGAATAG-ACACAGAGCA-GACAA-CA-CACA----CA-CA-CAC-AAACAC-ACAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGA---AAA-T-G-A-GG------AACTTT-TGT--CC-AA---T---C--AAGAACATG-AA-C--TC-AGAA--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AAC-TTTG-T-GG-----TA--CATAAA-C--ATG-CA-AAATGAATATTTTCT-G--GCAC-TCA---CACAA--CA----------CCCCATAG-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A---ACTT-AC-T---GACCTAATAAC-C-TT----AAATT-TCAAT--AC-GA-TAA----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAA-ATATAAACATCCT---CTATAACATCTAAAAAT--CC---AAATATTCTGA-CCTGCAA--GGAATTTCAAAAGTTTC-AGGCCG-AC-AT--TGCTTA
gi|6 : TTATA-AGAT-T-TTAC----AA-C-AT---C--T-CG---GA-T--G-CTGAATGAA-GTA-GGC-----CG--TT----TAG----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTCTTCC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TAC-TATTTATGCGAAA-TA--C---AT--T-GAAC--GTAGA-----GT--T-ATT---G-----AACTAGA----TTA---T-GT------CAGTTGA-ATA-TTTGGA--G-CTAGAT-A-C-CTACAA-A-AGATC-A-TT--TTCAC--CCCAAATATTCTCC--A-C---A-TT-T---CA--CA--G-CCAA-G-TCA-C-AAG---CA---GAGT-TTA-TTTTTCT--TTTGGTA-AA-A-TTTCA----AATG--------------AAA--AA-CC-----AGAA--T--TAAACATG-GTTA---AACAC-A-CCAT-T-A---AGACAACAACTTAT--TAG--A-TAC-TC-AG-AGTAG--AA-ATAGAA-A--TGACATAGTT-------GTA-T---CTA----GAGATC-TGTG--ATATGA--AAT-G----AACG-AGG--CA-TACTT-TTCTCAGTA---AAAACAAAGAAGA-CCTGA-AAGTTGGCCA-G-TTCGGAA-G--GGT-CCTAAAC-TT---ATGTGCAACTT-CC-TTT--GGAG-----TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--C-C---A-TTCATCGT------ACATACT-TTCTCAAAAT-CTTGCTA-TCTAT--TCAGCC-CAAA-GGCAA-TTCTTGTTAATAGCCGCATAT--T-------TACAACCA---TT-GCTTCTTA--AAGGAT--A-T---GT--CTCT-----TTAATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-T-A-ATCTA-G-TGTAG--TTAA--ATGT--AG-G--CATAA--------TA-A-------A-CAACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAG-T--A-AA---TG-TCACAA--AAGGGA-----GA-----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-A-----A-------AAAGGAG-AGCCCAGCAG-A-GGTC-A-C--T--G-CA---GATCTAAAT-CAGCTTA--CTTAT-----TGG-AC-------GTCAG-A-TAA---AAGAA-AT-GGAGC---TTCTCCA-TTAT--G-CA--T-C-ACT-GA-TT---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-AGGGTGGA--------CTCAG-GT--GAATGTC-AGGTGAC------AGTT-ACAAG-T--AAGGTGGAGAGGA-AG--AGGATAATCTT-AT---AATTTCACA-C-TC-CA-TAC-TTAACC-C-TG-TGGATA-G-----AAAA--GGAA--AACAAAC-CTG-T-C---CTC---T-CCACT-TA--GTG-AA----GTTG-G---A--AGT---CA-CA-GCTA--GCAGTAGA------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-CG----GGCCAAAA-T--CACC-AC-TCCTCGCATC-GAGGGACAT--AA-----C-GT--TTA-AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CCGTTGC-TG-C-C-CCC-ATCGCTTCTGTG--GCAC-T-GC-TGTTC-CATCA-TTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-ATAAAAAAAAT-TG--TTGCA---TGGT-CTAAAA-ATG--T----TGTT--ATT--T-TC-TGTGGTCTAATAGCAC-CAT------A-CAC-C-C---AATGAAC--AAAC-A-A--TT-AAA-CTGCATC---GCACG---------------CAC----AGACAG--ACA-GACAAAAC---A-GACACA-A---ACACGACCAGA--CAGA-CCCACAA-CAC--ACAC--ACACACCAC-GC--C-ACAC-C-G----ACCCAAGACAG--CAGGCAAGACAGCCG--ACA-GACACAC-ACAAG-ACGA--CACACAC-------ACACCCGCACGGACACCACA---CCA-CTACCG-AC--CACAGAGCCAA--CCAGA-CAGCTCAC-ATGC-ATCC-CGA-CAGAG--A----CAA-CACAGACA---GA-CACGACAC-A-CAACAG------ATACGAC---C---ACAGGAC-A--GA-C--A-----CA----CACACA-CAC---A-CACGACCAC-CACACGACCGAC--ACCGAACACAGCAG-----C-C-GACACCCCCCCCC----CA-----CACC----ACA-CAG----CA-CAGAC---A--------GACA---AC---AG-AT---ACA-AGA-CA-G-CAC-------A----CA-CA-CACAAAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-AAAGAA----AAA-T-G-A-GA------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--NN-NNNNNN-NN-N-NNN-NN-N--N-N-NNN-NN-NTT-------------------TTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-
gi|7 : TTA-A-AGA--T-GT-C----AAAC-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGA--GTA-GGC-----CAA-TT-C--TAT----TCAGAAA-A---TA-G--A-GAT-TTC--C---G-GAT--AA-AAT-G--AGTA--TATC--------A-TA--C---AT--G----C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----AA---TTA---T-GT------C--TTGA-A-T-T---GA--GGC--GAA---C-C---AA-T-AATTG-A-TAA-T---CGTCCCAAATAT----C--AGC---A-TT-T---TCTCCA--G-C--A-G-TCA-CTAAA-A-CC-A-GAGT-T-A-TTCTCTT-----GGTA-AT-A-AT-CA-GAAA-TG-----AGAT-----AAA--A---T-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-AAC--T-T-G---A-----------AT--TTG------T-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT-------GTAATT--CAAT---GAAATC----A--GTATGATAAAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT-----TA---AAAA-A---GA-A-CCTGA-A---TGGCCAAG-T----AA-G--GGT-C-TAA-C-TC-----ATGTAA--T-CC-TTG--AA---G---TCT---AC---AT----T---C-----T-G--T-----A-TT------------ACA--CT-T-CT-AA--T-TT------T---T--TCA--CGCAAG-GGT-A-AT----------------TGT--CC------TA-TAC-A---TT-GCTTTGTC--AAGGAT--AATC--AT--CCTC-----TTTATTTAA-AGTA-----T--A---------ATTG--ATG--T-C-G--TG----C-TG-TAA---TTA---T-TAG--T--A--AT-T--AG-GT-CAAAA--------TATA-------ATC-ACC--A---AAAA-GTA--A-----GA------GAA--T--ACAA---TG-T-ACAT--AGGGCA-----GAT----A---A-T---T-AGTCCCC-----A-AA---GA-------AA-GGAGA-GC--AGCGA-C-GGTC-A-C--TGC---A---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA--C-------GT-GC-A-T-A---AAGA---T-G--GC---TT-TCCATTT----GCCA--T-C-A-T-GA-TA---AT---AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AAG-----------------------------T-A-AAG-T--AAGG-GGG-AG---AG--AGGA-AATCT----ATAA--TTCACAAC-TC-CA-TAC-T--ACCTC-TA-TGGA-A-------AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTGGAA----GTT--G---A---GT---CAC--TGT----ACAGTA-A------------------------TGC-CGGATC-A--A-C-----GACC---A-T--C-C--A--TCCCTTCATA---GGGA-AT--A--------GC--TT--AAATGG-CGG---A---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-C---AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATAATTTA-TGTTTGTA---CT---TCA-AT----AAAAT-TG-TTTGC----T-GT-CTAAAA------T----TG-T--CCT--TGTC---T-GTC--ATAG------C------A-CACAC-CTAAAATTATCA-AAAtcagaaata
gi|8 : ctcctacttttctcagcgcagttttcgaatcgtaaaaggcctcatttaagtgcagattggcccaccgttcatataatttacaaaataaacaatattgaaaatattttgatatcctaaatactccttaatatattttatacgtgttactggtaactttactttcgtatgaagggaggtaaattggacA-G-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--GGCT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TTAC--TGT----T-CAAAA-AAG-TA-G--AAGAT-TTC--C-----AATTAAA-AATTG--A-TA--TATC--------AGTAG-C---AT--GTG--C--G---ACATTAGT--TGATT---GC----AA----A----TTA---T-GTGCGATTC--TTGA-A-A-T---GAATG-C--GAA-A-C-C---AA-ATAGTTG-AATA--T---C--TCCAATAC-----C--ATC---A-TT-T---TTT-CA--G-C--A-G-TCA-C-AAACG-CA-ACGAGT-T-A-TTCCCTT-----GGTA-TATA-TT--A-GAAAATT-----AAA-------AA--AA--C-C-ACAGAA--CACGGAA-ATA-G--A---AA-ACCA-C--T-T-G---A------------T--TTG--A-T-T-CC-AGGA-T-G--AATA----A-A--TGA---AGTTGATTAGTGTA-TTGTTAA----GAAATC-TT-G--GTATGA--AAT-G----AA-A-AGA--AT-C--TT-TT----ATA---AGAA-AA--GA-ATCCTGA-AA--ATGCCA-G-T----AA-A--TTT-C-TAAAC-TCATTGTCTGCAA--T-TC-TCT--TGAG-GTATTCTG--ACTTAGT----TT--C-----T-GTTT-T---A-TTTTGTACCCCACCACA-CCTAC-CT-AAGAT-TT----A-T---T--TCAAGC-CAAG-AT--A-AT----------------TGT--TAATGCCATA-ATC-A----T-GCTT-GCCGGAAGCAT--G-TTCGGTTGCTCTCGGTATTTAGC--G-AATATCCTGA--AGACATGAATTTTG--ACGCCT-C-GTCTG----C-TG-TGA-ATCTACG-T-T-T--TT-A--CTG----G-GT-TAACG--------TGTT-------G-C-ATT--A---AACAGATA--C-----GA------G-AGTTTCA-AA---TG-T-----------GA-----GAT------TAA-T-TAT-A----CA---CCA-GATATGA-------AAAAGAGagctgaatagggtcttagattctaagaatagaacgtgagaacaatatgcgtgaactgcaagttatacgttctaaaacagtttaaccaaaacaaacaataacatgcagcacaacaacagaccagaagacagacacacatcagaccgacaccaacagacgacacatcaccacagaagcagacagatatgaccacagccacacaaca
gi|9 : cgctagcttatccatctcctacttttctcgcgaagtgacagttcttttctgtaatcctggcataaaaggcactttcattcaatgctagatgtgccaacccttcatatagtatatgtaccaaataaacatagttaattttgagaaaagtcatatttataatttcatttaaatactctcttaatatatgtatgatgtttaacctctctggtttaaacaccgttattatctaattacggtttctaattataggacgataaaggcagagcgcctattgagattcctaaa-A-AGAA-TGTT-C----AA-CCAT-T-TCAT-CGATGGA-CTGG-CT--AT--A-GTATG-A-----CG--TT-C--TAT----TCCAGAATAC--TA-G--AAGAA-TTC--TC-CG-AAT--AA-AAT-GTGA-TA--TAT---------A-TA--CGACATTGG-G--TTAG---A-----GTA-T-ATT---G-----AA----AAGTGTTA-----GT------C--TGGAGA-A-A---GA--GGC--AGA-A-C-C---AA-T-A--TGTA-TA--TT--C--CCCAAT-A-----C--A-----A-TT-T---TC--CA--G-C--A-G-TCT-C-AAA-A-CA---GAGT---A-TTCCCCT--TG-G-TA-AA-A-AT-CA-GAAATTG-----AGAT-----AAA--CA-TC---ACAGAT--T--TGAA--TG-G--A---AATAC-A-C--T-TTG---A-----------AT--TTG--A-T-C--C-AG-ACT-G--AA-A----A-A--TGA---AGTA------TGTA-TT--CAA----GAAATC-CT-G--GTATG---AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----AT----AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AAG-TGGCC--G-T----AA-AGCGGT-C-TAAAC-TC-----ATGCAA--T--C-GTG--ACGA-G---TCT---ACT--AT----TT--CG----TGG--T-T---A-TT-------------CA-ACT-T-CT-AAACTCTT----ATT---T--TCA--C-CAAGAGG--A-TT----------------TTC--C-------TA-AACTA---TTGGCTTTGTC--AAGGACTAA-TC--GT--CTCTTC---TTTATT----AATA-----T--A---------TTTGA-ACG--T-C-A--TG----C-TGCT---ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-C-AAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AG---GT---A-----GA------GAAAGT--A-AA---TG-T-GTACCAGAGGGAGTAGTGAT----A-GAA-T-C---AGTT-----------A---GATCATTACAAAGGAG-AGCCA-GCAGAA-GGTC-ATC--TGCG--A---ACC----ATCC--CTTA--C-TAT-------G-AC-------G-CATGA-C-A---AAGAA-ATCG--GCCGTCTCTCCCTTTAT--GACA--T-C-A
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): CTACTTATTTCTCAGGCGAAGTTATCGGAATCACCGGTAAAAAGAGCCACTTACATAACAATAGCAGATTGGCCACCTCACTGTATACATATTACCAACAAAAATAACAATATTGAAAATATTTTGATCATTTAAATAACTACTCTTAAGTATATTATATGTTAACCCTGGTAACTTTATTATCGTCATTAGCGAGCAAAAGGGAGAAAATTG
Unaligned ( gi|21 ): GCTGCTTCCGCTAACTCTTTCTCAGCGACAGTCTTCGATCTCGGTAAAACAAGGTCATGTCATTCAATGCGCAGATGGCCCGCTTACATATAATATACCAAATAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
Unaligned ( gi|28 ): CCTCTCCTATCTTTTCTCAGCACAGTTTCGATATCCGGTAAACAAGCACTTCATCAATCAGATTGGCCACC
Unaligned ( gi|29 ): TTATATATTAATGTTAATATCCCTGAGTAACTTACTTTGTATGCAAAGGGAGGGGTAAATCTGAGAC
Unaligned ( gi|30 ): AAATGGAATAAAATTCCCAAAATGGAGTTAATGTATATTATTTTGATTCAGAATCAATTATAGAAA
Alignments
lowQualScore : 1111 1111111111111 111 1111111 11111111 333333333333333 111111111 111111111 2222222 1111111111 222222222222222222222222222 111 222 1111 1111 1111 111111111111 111 22222222 11 1111 1111 1111 111 111 11 222222 11 11111 111111111111111111111111 11111 333333333333 222222 11 11111 33333333333333333333333333333 111111 22222222 11111 1111 333333333333333333 11 11 2222 1111 11 11 11111111 1111111 111 11111 111111 111 2222 11111 1111111 222222222222222222222 11 1 2222222222222222222222 11 333333333333333333 111 11 1 1111 1111 11 333333333333333333 1 111111 111 1 222222222 111 11 11111 1111 22 1111 2222222222222222222 444444444444444444444444444444444444 11111 111 11 222222222222 11 111 111 11 11111111111 11 11 111111 11 111 6666666666666666666666666666666666 111111 222222222 11111111 1 11111 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 11111 11 6666666666666666666666 111 1 222222222222222 11111111 22222222222222 111 1111111 22222222 111 11111111 55555555555555555555 111111 1111111 3333333333333333333 222222222222222222 1 2222 3333333333 111 11 111111111 11111 111111111 22 11 111 33333333 2222222222 11 1 1 111 111111 111 1 11 1 111 111111
lowQualScore : 3 3 3 6 3 6666 3 3 3 3 77 3 555 4444 3 44 3 7777777777777 3 88 6666 33 2 333 2 33 2 4444444 2 33 2 2 33 2 66 55555555 3 77 888 77 3 444444444444444 77 3 222222222 999999999 555 2 4444444 33 0 2 2 2 777 33 1111111111 2 555 2 2 3 2 6 222222222222222222222222222 555 3 5 222 66 33 2 33 5 2 2 2 000 888 888 2 0 99999 2 55555 2 0000 66666 66666 33 2 1111 77777 99 3 44 555 6 3 3 0000 3 666 999999999999 55 55 3 333 3 3 7 4 66 4 9999 4 66 777 11111111 4 00 3333 1 0000 666 66 4 9999 4 4 66 4 66 4 3333 777 8 222 4 4 2 4 777 4 4 9999 4 00 4 4 4 444444 66 4 4 00 66666 888888888888888888888888 4 66 00000 4 555555555555 99 4 4 8 4 666666 777 66 22 8 55555 4 66666666666666666666666666666 5 0 555555 5 888 66 11111111 66 1 99999 0000 444444444444444444 00 00 4 3333 9999 4 4 1111 8 4 4 66 00 66 1 00 4 66 66666666 4444444 4 4 66 777 333 66 55555 222222 9999 4 666 4 4 3333 0 11111 2222222 4 77777 2 3 777777777777777777777 55 77 5 5 5 0 66 4444444444444444444444 66 00 444444444444444444 66 222 777 4 4 66 777 55 00 66 4 4 0 5 888 66 0000 888 5555 5 88 777777777777777777 88888 0 444444 5 5 5 66 5 11 555 777 0 777777777 222 4 4 4 11 5 5 66 4 4 11111 66 66 1 4 4 4 8888 4 4 11 55 4 2222 0000000000000000000 888888888888888888888888888888888888 4 4 4 8 4 4 99999 111 4 55 4 4 8 44 4 55 111111111111 33 4 4 55 777 4 777777 55 4 4 4 4 4 4 4 99 4 4 4 4 4 1 4 888 888 4 222 4 77 1 777 4 4 00000000000 4 55 66 4 4 8 44 4 888888 4 4 777 77 777 66 5 666 4444444444444444444444444444444444 111111 888888888 22222222 5 0 66 55 22222 5 11 66 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 888 55 5 999999999999999999999999999999999999999999999999 0000 0 0 7 11111 6 22 6 0000000000000000000000 2 6 2 888 3 99 3 444444444444444 1 77777777 5 5 66 5 66666666666666 2 888 5 44 5 444 6666666 33333333 111 55555555 44444444444444444444 777777 2 5 0000000 5555555555555555555 777 5 0 444 4 666666666666666666 4 4 8 3 4 1 3 3 3 7 3 666 6666 3 3 3 3 4444444444 3 55 3 666 000 00 3 3 888 3 3 55 3 3 3 3 3 333333333 3 2 4 4 00000 55 2 4 888888888 00 00 444 99999999 66 1111111111 77 999 66 888 66 5 11 5 0 7777 5 5 888 0 2 5 5 888 3 5 66 5 5 888888 5 555 5 777 5 77 1 88 1 1 6 0 5 66 777 3 5 000000 66 5 5 5 5
lowQualScore : . . . . . .... . . . . .. . ... .... . .. . ............. . .. .... .. . ... . .. . ....... . .. . . .. . .. ........ . .. ... .. . ............... .. . ......... ......... ... . ....... .. . . . . ... .. .......... . ... . . . . . ........................... ... . . ... .. .. . .. . . . . ... ... ... . . ..... . ..... . .... ..... ..... .. . .... ..... .. . .. ... . . . .... . ... ............ .. .. . ... . . . . .. . .... . .. ... ........ . .. .... . .... ... .. . .... . . .. . .. . .... ... . ... . . . . ... . . .... . .. . . . ...... .. . . .. ..... ........................ . .. ..... . ............ .. . . . . ...... ... .. .. . ..... . ............................. . . ...... . ... .. ........ .. . ..... .... .................. .. .. . .... .... . . .... . . . .. .. .. . .. . .. ........ ....... . . .. ... ... .. ..... ...... .... . ... . . .... . ..... ....... . ..... . . ..................... .. .. . . . . .. ...................... .. .. .................. .. ... ... . . .. ... .. .. .. . . . . ... .. .... ... .... . .. .................. ..... . ...... . . . .. . .. ... ... . ......... ... . . . .. . . .. . . ..... .. .. . . . . .... . . .. .. . .... ................... .................................... . . . . . . ..... ... . .. . . . .. . .. ............ .. . . .. ... . ...... .. . . . . . . . .. . . . . . . . ... ... . ... . .. . ... . . ........... . .. .. . . . .. . ...... . . ... .. ... .. . ... .................................. ...... ......... ........ . . .. .. ..... . .. .. ......................................................... ... .. . ................................................ .... . . . ..... . .. . ...................... . . . ... . .. . ............... . ........ . . .. . .............. . ... . .. . ... ....... ........ ... ........ .................... ...... . . ....... ................... ... . . ... . .................. . . . . . . . . . . . ... .... . . . . .......... . .. . ... ... .. . . ... . . .. . . . . . ......... . . . . ..... .. . . ......... .. .. ... ........ .. .......... .. ... .. ... .. . .. . . .... . . ... . . . . ... . . .. . . ...... . ... . ... . .. . .. . . . . . .. ... . . ...... .. . . . .
lowQualScore : 3 3 3 7 1 5555 1 1 1 1 33 1 444 1111 1 22 1 2222222222222 1 55 5555 55 7 777 7 77 7 5555555 7 77 7 7 77 7 33 44444444 1 33 555 33 1 333333333333333 33 1 888888888 888888888 000 9 4444444 99 8 9 9 9 999 99 8888888888 9 000 9 9 6 9 2 555555555555555555555555555 444 1 7 999 88 99 9 99 7 9 9 9 999 111 222 7 5 99999 7 55555 7 1111 77777 77777 77 7 5555 77777 44 3 66 888 7 6 6 1111 6 444 666666666666 00 00 6 666 6 6 3 4 11 4 4444 4 11 888 11111111 4 66 9999 9 9999 222 11 4 4444 4 4 11 4 11 4 9999 888 9 000 4 4 9 4 999 4 4 4444 4 66 4 4 4 000000 11 4 4 66 11111 333333333333333333333333 4 11 33333 4 666666666666 00 4 4 9 4 999999 888 11 22 9 66666 4 33333333333333333333333333333 0 4 999999 0 888 99 22222222 99 4 44444 9999 333333333333333333 66 66 4 4444 4444 4 4 8888 9 4 4 11 88 11 1 66 4 33 11111111 4444444 4 4 11 888 999 11 66666 888888 8888 4 777 4 4 4444 8 11111 3333333 4 11111 9 9 444444444444444444444 66 99 0 0 0 0 99 9999999999999999999999 99 11 222222222222222222 99 444 888 4 4 11 888 66 66 11 4 4 0 0 888 99 6666 888 6666 0 88 222222222222222222 55555 0 444444 0 0 0 99 0 66 888 000 0 000000000 444 4 4 4 99 0 0 44 4 4 11111 11 11 8 4 4 4 0000 0 0 00 55 0 5555 8888888888888888888 000000000000000000000000000000000000 0 0 0 0 0 0 55555 000 0 55 0 0 0 55 0 55 111111111111 55 0 0 55 000 0 555555 55 0 0 0 0 0 0 0 55 0 0 0 0 0 1 4 333 000 4 444 4 22 9 888 4 4 99999999999 4 00 11 4 4 9 11 4 999999 4 4 888 22 111 99 0 444 5555555555555555555555555555555555 111111 444444444 11111111 0 8 99 11 55555 0 99 99 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 000 66 7 222222222222222222222222222222222222222222222222 5555 2 2 0 00000 7 55 7 5555555555555555555555 2 7 5 333 3 88 2 222222222222222 0 99999999 0 0 99 0 44444444444444 5 888 0 88 0 999 2222222 44444444 111 66666666 99999999999999999999 666666 5 0 9999999 4444444444444444444 888 0 4 888 4 999999999999999999 4 4 0 2 0 0 6 6 6 3 6 444 4444 6 6 6 6 2222222222 6 00 6 444 000 00 6 6 555 6 6 00 6 6 6 6 6 111111111 6 6 0 0 00000 55 3 0 666666666 33 11 444 55555555 99 9999999999 00 444 99 888 99 0 99 0 0 6666 0 0 888 4 6 0 0 111 4 0 99 0 0 999999 0 666 0 111 7 99 4 88 0 7 7 0 0 99 555 6 0 222222 99 0 0 0 7
consensus : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-C--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-TT-T---TC--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA-A-CA-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTA-AA-A-TT-CA-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------TGTA-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-AAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TGT--C-------TA-AAC-A---TT-GCTTCGTC--AAGGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-TAA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGTT--A-AA---TG-T-ACAC--AAGGGA-----GAT----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCG-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCAT-A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATTTAT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AGG-GT--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGA-AG--AGGA-AATCTT-ATATAAATTTCACA-C-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACT-TA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTCA-GGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAAAAT-TG-TTTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCACCG--GCACGC--------------CAC----GCACAG--ACA-GACACAAC---AGGACACG-A---ACA-GANCAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A---ACCGA-GA--C-CCAC-C-G----ACC--AGACAGACCAG--AA------CG--ACACGACACACGAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGACACCG-A---CCG-CCGACA-ACCACACACAGC--A--CCAGA-CAGCGCAC-ACAC-CACC-CGA-CCGA---A----CGA-CACACACACC-GA-CA-GACAC-A-C-ACAC------ACACGA----C---ACA-GAC-A--GA-CA-A-----CA----CACACACCAC---A-CACGA-CAG-CA-------GAC--AC--AACA-AGCAGA----C-A-GACA-------------CA-----CA-C----AGA-CAGAC--CA-CAGAC---AC-------GACAA-CAC---AG-ATAGAACACAGA-CA-G-CAC-CA-CA-A----CA-CA-CAC-AAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-A-GG------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTTTCTCG--GCACTTCA--CCACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAATATAAAAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTA
Reference ( family-511 ) : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-C--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-TT-T---TC--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA-A-CA-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTA-AA-A-TT-CA-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------TGTA-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-AAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TGT--C-------TA-AAC-A---TT-GCTTCGTC--AAGGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-TAA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGTT--A-AA---TG-T-ACAC--AAGGGA-----GAT----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCG-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCAT-A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATTTAT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AGG-GT--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGA-AG--AGGA-AATCTT-ATATAAATTTCACA-C-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACT-TA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTCA-GGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAAAAT-TG-TTTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCACCG--GCACGC--------------CAC----GCACAG--ACA-GACACAAC---AGGACACG-A---ACA-GANCAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A---ACCGA-GA--C-CCAC-C-G----ACC--AGACAGACCAG--AA------CG--ACACGACACACGAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGACACCG-A---CCG-CCGACA-ACCACACACAGC--A--CCAGA-CAGCGCAC-ACAC-CACC-CGA-CCGA---A----CGA-CACACACACC-GA-CA-GACAC-A-C-ACAC------ACACGA----C---ACA-GAC-A--GA-CA-A-----CA----CACACACCAC---A-CACGA-CAG-CA-------GAC--AC--AACA-AGCAGA----C-A-GACA-------------CA-----CA-C----AGA-CAGAC--CA-CAGAC---AC-------GACAA-CAC---AG-ATAGAACACAGA-CA-G-CAC-CA-CA-A----CA-CA-CAC-AAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-A-GG------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTTTCTCG--GCACTTCA--CCACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAATATAAAAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTA
gi|1 : TTA-ACAGAA-T-TC-C----AA-C--T-T-C--T-CG---GAAT--G-CT--ATGAA---A-G-CTTCAGCG--TT-CATCAC----TTCAAAA-A---TA-G--AAGATCTTC--CG-CG-AAT--AA-AAT-A--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATTCG-A-----AA----A----TTA---T-GTCT---TG--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-A-TTG-A-TAA-T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-TT-TC--TC--CA--GGC--A-GATCA-C-AAA-C-CA---GAGT-T-AATTCCCCT--TG-GATA-AA-A-TG-CAAGAAAAGA-----GAAT-----AAACAGA-TC---ACAGAAATT--TGA---TG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------ATGATTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----ACA--TGA---AGTT------GCTA-TTT-CAA----CAAATCATG-G--TTATGA--AAT-G----AA-G-AAGCGAA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGAA-G-CCTGA-AA--TGCGCA-A-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GC-TGCAA--T-CC-TTG--AGAGAG---TCTC--ACT---T----CT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-TAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAT-GA--ATTT----------------TGTCCC-------TA-AAC-ATCTTT-GCTTATTC--AAGGAT--ATTC--GT--CT-T-----ATAATT--ATAATA-----AACA---------TTTG--ACG--TAC-GA-TG----CATG-TAACATCTA-G-T-TAAGCTT-A--ATGCTAAG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACCATA---AA---GTAAGA-----GA------GAAGTT--A-AAAATTGTT-AC-C--A--GGA-----G------A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---G--------AAAGGAG-AGCCCAGCAG-A-GGTC-A-C--T--G-CA---GAC----AT-C--CTTA--C---T-----TG--AC-------CTCAT-A---A---AAGAA-AT----GC---TTCTCCATCTAT--GACA--CGCAACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-AAGGTGAAG-------C-AAGTGTTGAAAT-TCAAGGTGAC------AGTTAA-AAG-T--AAGG-GGGAAG---AG--CAGG-AATCCT-TTATAATTTACACA-T-TCACATTAC-T--ACC-C-T--TGGA-ATG-----AAAA--AG-G--AACTAA--CTG-TGC---TTCGCTT-CCAC--TA--GTG-AA----GTT--A---G--AAT---CA-CATGTAT-GCCAGT--A------------------------T-C-CG-ATC-ATCA-C-----GGCC---A-T----CC-ACGTCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AC-----A-GC--TTTCAA-TTG-CGGACCG---AAA-G-GA---AACCC-TTGC-TGCC-C-CCC-AT-GCTTCT-TGT-GC-C-TAGCATGTTCACATCATGTA-TGTTTGTAAC-CT--ATCAGATA-AAAAAAT-TG-TTTGCA---T--T-CTAAAA-A-G--T----TG-T--TAT--T-TC-TGT-GT-CAATAGCAC-CACCA----A-CACACTC---AAT-AAC--AAAC-A-A--TT-ATACATGCACCACTGT-CG---------------CAC----GCACAG--ACACGACA-AAC---A--ACACA-G---ACA-GAACAGA---AGACC-----A-CACA-ACAC--A---GACG--GA--T-CCAC-C-ACCACACC--AGACACA-CAC--AA------CG--ACTCAACA
gi|1 : ccttcatataatattaccaaaataaacaaatatgaaaaaagttttatgattacattcctaatattatttatcgttaactcctcgagtaattactttccgtattgcaaagggagggctaacacattgagaccA-CAC---AG-CTA-AACACAGA-CA-C-AAC-C--CA-ATGTACA-CA-CACCAAACAC-TAA--CTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-AAGG------A---CT-TGT--CCCAA---TG--C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-AATGA-GA-AGT-GG--A------ACA-AATCTTTG-T-GG-----TA--CAAAA--CA--TG-C--AAATGAT-ATTTCCTCG---CACT-CA--C-ACAAATCA----------CCCA-T-C-CTG--TGAAAAC---TT--CCGGA--CA-TAGA--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTG--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAAAA---AAAATATTG-AGTACAA-A-A--CTTCATA-TTTAAAATAT-AGAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--AATAGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagatagacacagctaaacacagacacaacccaatgtacacacaccaaacactaacttgaaatgtaataagaaatgaaggacttgtcccaatgcaaaacatgaacatcagaaaatgagaagtggaacaaatctttgtggtacaaaacatgcaaatgatatttcctcgcactcacacaaatcacccatcctgtgaaaacttccggacatagatacttactgactaaataaccttgaaaatttcaatacgataaaaaaaaaatattgagtacaaaacttcatatttaaaatatagaacatccttcttatacactaaaaatccaaaatttctgacctgaatagaatttcaaagttcaggccgacatgtgctta
gi|10 : ccttcatataatattaccaaaataaacaaatatgaaaaaagttttatgattacattcctaatattatttatcgttaactcctcgagtaattactttccgtattgcaaagggagggctaacacattgagaccttaacagaattccaacttctcggaatgctatgaaagcttcagcgttcatcacttcaaaaatagaagatcttccgcgaataaaataatatatcatacatggcgagttattcgaaaattatgtcttgttgaaatgagcgaaaccaaaattgataatccccaattacacatttctccaggcagatcacaaaccagagttaattccccttggataaaatgcaagaaaagagaataaacagatcacagaaatttgatggaaaacacttgaatgattgatctcagatgaaaacatgaagttgctatttcaacaaatcatggttatgaaatgaagaagcgaatttttataaaaaaaagaagcctgaaatgcgcaataagggtctaaactcgctgcaatccttgagagagtctcacttctctgttattacaacttcttaaatttatttcaccaatgaattttgtccctaaacatctttgcttattcaaggatattcgtcttataattataataaacatttgacgtacgatgcatgtaacatctagttaagcttaatgctaaggtcaaaatataacaccataaagtaagagagaagttaaaaattgttaccaggagataatctagtccccccaaagaaaggagagcccagcagaggtcactgcagacatccttacttgacctcataaaagaaatgcttctccatctatgacacgcaactgataatcaggaaacaatgaaggtgaagcaagtgttgaaattcaaggtgacagttaaaagtaagggggaagagcaggaatcctttataatttacacattcacattactacccttggaatgaaaaaggaactaactgtgcttcgcttccactagtgaagttagaatcacatgtatgccagtatccgatcatcacggccatccacgtccctccatacagggaatacagctttcaattgcggaccgaaaggaaacccttgctgccccccatgcttcttgtgcctagcatgttcacatcatgtatgtttgtaacctatcagataaaaaaattgtttgcattctaaaaagttgttatttctgtgtcaatagcaccaccaacacactcaataacaaacaattatacatgcaccactgtcgcacgcacagacacgacaaacaacacagacagaacagaagaccacacaacacagacggatccaccaccacaccagacacacacaacgactcaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagatagTCACG-CCTC-CA-CAC-TC-ACC-C-TC-TAG----G-----ACAA--GCAA----C--AT-CTG-T-C---TTC-CT--CCACT--A--GTC-GATAACGTTTAG---A--AGTT--CACCATGTC----CAGTA-A------------------------T-C-CG-AT--AT-AAC-----GGCC---AAT--C-CC-AC-TCCCTCCATC-AAGGGA-ATTGAA-----G-CCCTTT--AA-TGGGCGG--CG---AAG-G------A--CC-TTGC--G-C-C-----AC-ACTTTTG--------------------CAT-ATTT---GTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAA--T-TG-TT-GCA---T-GT-CTAAAA-A-AGTT----TG-T--TAT--T-TC-TGT-GTC-AATAGCACACAC------AACA-AC-C---AATGAACA-AA-C-A-A--TA-ACA--TGCA-----GCACGC--------------CAT----GCACAG------GACA---------GACACG-A---ACA-GA-CAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A----CCGA-CA--C-T-AC-C-A----ACC-------GACC-G--AA------CG--AC--GACACCCAAC-AG-AAGAGACACAGAC-------AGAC---CACA--CAC-G-A---CCGACCGACA-GACACACACA-C--A--CAAGA-CAGCATAC-ACACACACC------------A----CAA-CAGACAGACCTGA-CA-GACAC-A-C-ACAC------AGAAGA----C---ACA-ACCGA--GA-CA-C-----GA----CCGACAC-AC---A-CACGA-C---CA-------CCC--AC--AACACAGCAGAGAACC-C-GACA-------------CA-----CA-C----A---CAG----CA-CAGGC---AC-------------------AG-ATAGA-CACAGA-CA-G-CAC--A--A-A----CA-CA-CAC-AA-CAC-TAAA-CTT-GAATT-GT-AAGT-A---AG----AA--T-G-A-GG------AA--CT-TGT--C--AA---T---C--AA-AACATG-AAGC-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACG-AAACTTTG-TGGG-----TA--C-AAAA-C--ATGTC--CAATAA-TATT---TCGC-GCAC-TCA---CACAA--CC----------CCC-AT-C-TTGAACGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--T-CTT-AC-T---GA-TAATAAAC-C-TT-----CATT-TCAAT---C-GAGT-A----AAA-AAG-AAAATATTG-AGTAC---A-A--CTTCATATTTTAAGCTAT---AACATCTTCC-TTATCACA-CTAAAAAT--CCATGAAAATTTCTGA-CCT------AGAATTTCAAAG---TC-AGGCCG-AC-ATGTTGCTTA
gi|11 : taC-------GACAT-A---A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATT-AT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--CTGAA--------C-AGG--T--GAAT-TT-AGGT-AC------AATT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAG-------AGGA-AATCTG-ATA---ATTTCACA-C-TC-AA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CAC-ATGT---AGCAGTA-A------------------------T-T-TG-ATC-AT-A-C-----GGCC---C-T--C-CC-AC-TCCCTATAT--CAGGGC-AT--AA-----G-CT--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATAATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAAAAA-TG--TTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-TC-ATT--T-TC-TGT-GT-CAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAAC--AAAC-A-A--TA-AC--ATGCA--A--ACACGCNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNN--NNN-NNNNNNNN---NNNNNNNN-N---NNA-GAGCACAACCACA-C-----A-CAC--ACAC--A---CCCG---------CACTC-G----ACG--CGACCGACC----------------ACAC-ACACAAGAC-AG-CA----CACA-AC-------A
gi|12 : ttactcctacttttctctgAAGACAGA-CA---CACACA-CA-C----AA-CA-CAC-GAACAC-TAAA-CTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAAAT-G-A-GG------AAC-TT-TGT--CC-AA---TATGC--AA-AACATG-AAAC-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTT-G-T-GG-----TA--CAAAAA-CA--TG-C--AAATGAT-ATTT-CTCT--G-ACT-CA--C-ACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAA-C---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAA-TAAC-C-TTA--AATTTT-TCAAT--ACGGA-T-------AA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-ATA--CTTCATATTTTAAAATAT--AAACATCCTTCTTTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAA-TTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCT
gi|13 : cA-AAC-A--AA-CA-A-----TA-----ACATGCAGC---A-CA--A-CAA-CA-------GAC--------CA--GAAGA----C-A-GACA-------------CA-----CATC----AGA-CCGACACCAACAGACGACAC-------ATCAC-CAC---AG-A-AGCAGACAGA-TA-T-GAC-CA-CA-G----C--CA-CAC-AA-CAC-TAAA-CTT-GAAA--GT-AA-T-A---AGC---AAA-TAG-C-GA------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-A-CATG-AA-T-AT--AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AAC-TTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CAGATG-C--AAATGA-TATTTTC-----GCAC-TCA--C--CAA--TC----------CCCCAT-T-CT---TGAAAAC---TT--CCG-A---A-TA-A--ATCTT-ACTT---GACT-GATGAC-C-TT----AAATT-TCAATAAAC-GA-T-------AA-A---CAAATATTG-AGTAC-AGA-A--CTTCATA-TTTAA
gi|14 : ccaC-AAACAC-TAAA--CT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGCCA-AGA-T-GGA-GGCGCAA-A---CC-T----TC-AC---T---CCTGA-AATA--------ATCCAG-G--A-A-TAATGAGATT-GG--AGGAACTACA-AACTTCTG-T-AGAATCATC--CATAAA-CG-TCGTC--CAATGAT-ATTTCTTCATCGCACT------CACAG--CTAGGACAAAAATCTAGC-GACTG--TGAGAACATTTT--CGG-A--CT-TA-AATTATTTGAT-TTCAGGCTAA-TAACGCATTATTAAAATT-TCAAT--AC-G--T-ATTTTGAA-ATGTAAAATATTA-GGTGC-A-
gi|15 : cTTA-A-AGTA-T-GT-C----AA-A-AT-C-T--T-TA---AA----G-CT--ATG----------------------C--TGT----TT-AAAA-A---CG-G--AAGAT-TTT--CC--G-AAT--AA-AAT-G--A-GG--TATC--------A-TA--C---AT--A-G--TTAT---A-----AT--T-ATT---G-----AT----A----ATA---T-G------TC--TTGA-G-A-T---GA--G-T--G-A-A-C-C----A-G-AATTG-tgcaaacaaacattaagatatatattctataagagtaataacacgaaatctttcatatagatagcaat
gi|16 : cagtttcgaatctcataaaaagcactttatctaagcaaagtggcaaccttcatgtattaatacaaaataatcatattgaaatattcaattttttttaaattaaatacatgtatactttttaactttacttccatattagcagatggccaagtatatcggagaccTTA-A-AGGA-C-TT-TGCCAAA-A-AT-T-CA-T-CA----A-C--A-CT--ATAAA-GTA----------------C--TATGCGGTTGAAAA-T---TA-A--AAGAC-TTG--CC-GGTCAT--AA-AAG-G--A-TG--TATC--------A-CA--C---AG--G-G-----G---G-----TT--T-ATC---G-----AA----AAC--CTA---T-GT------C--T----A-A-T---AA--G------G-A-T-T---AG-G-AATGC-A--A--T---C-------TTAA----C--T-C---A-TT-TGTTTT--CA--G-C--ATG-TCA-C-AAA---CA-A-GAGT-TAA-TTCCCCTCCTT-GGT---A-A-TT-T--GGAAATG-----GAAT-----AAA--AAGTC-C--CAAAA--A--TGGA-c
gi|17 : AAAA-A---TCTG--AAGAC-TTC--GC--G-AAT--AA-AAT----------TATC--------A-CA--CC--AT--G-G---------G-----GT--T-GTC---G-----AA----AA---CTA---T-G-------C--CTGA-A-A-T---AA--A-C--GGA---T-T---AG-A-AAT---G-CA--T---C--------TA-----A--A-CGTGA-TTGT---TT--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA---CA-A-GAGT-T-A-T-CCCCT--TG-G-TA-A----TT-TT-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AG-TC-CAACTGAA--T--Ttatttatagcctattattctgatcagatcatatagaaa
gi|18 : aaaaaactgcaaaaattcttaaaacaataaattactctatgcggttga-C----AA-A-AT-T-C--T-TA---AA-C--A-CT--ATTAA-ATA-C-C-----TA--TG-C---AG----TTGAAAA-A---TT-G--AAGAC-TTG--C---G-AAT--AA-AAG-G--A-TG--TATC--------A-CA--C---AT--G-G--A--G---G-----TT--T-ATC---G-----AA----A----ACA---T-GT-----CC--T-GA-A-A-T---AA--A-G--GA----T-T---AG-A-AATGC-A--A--T---C-------TTAA----C--GTC---A-TT-TGTTTT--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA---CA-A-GAGT-T-A-TCCCCCA--TT-GGT---A-A-TT-TT-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AT-TC-C-A------------AA-ATG-G--AGTTAA-AG-T-C--TAT-T---A-----------TT--TTG--A-T---TC-AG-A-atagcctaattattctgatcaagaaatcaagttatagaaa
gi|19 : gACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGGA--AAA-T-G-A-GG------AA--CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AGCATT-AA-T-ATC-AG-G--A-A-TGA-GA-ATT-AG--A------ACA-AACTatcaattataga
gi|2 : AAAA-G---TA-ATTATGAT-TTC--ACGCG-AAT--AATAAT-G--A--A--TAACGGT-----A-TA--C---ATC-G-G--C--G---AAGTT-GT--T-ATT---GTGAGTAATAC-A----TTAAAAT-GC-----TC--TTAA-A-AAT---GA--AAC--GGATA-C-C---AA-A-A-TTG-A-TGATT---CGACCCAAT-A-----C--A-C---A-TT-T---TC--CACAG-C--A-G-TCAAC-ACA-A-CGCA-GAGT-T-A-TTCCCCT--TT-GGTA-AATA-TC-CA-GAAAATC-----GAAT-----AAA--AA-TC-C--CAGAA--T--T--A-ATG-G------AA-AC-A-C----T-G---A-----------CT--TTG--A-T-TACC-AG-A-T-GAAAA-A----A-A--TGA---AG-T------TGTA-TT--CAAATATGAAA-C-T--G--GTATGC--AAT-AGACCAA-G-AGG--AT-C--TTATT----ATATCTAATA-AAAGAA-A-CTTGA-A----GGCCA-GTT----AACGC-GGT-C-AGAACTTC---ATAAGCAA--TCCC-TTGCAAGAT-G---TCTTTAGCTGGATCGTGTTCGC-----T-G--TGTAAAA-AT------------AC--ATT-T-CTAAAAAT-TTAGA-A-T---TCCTCA--C-CAAG-GAC-A-TT----------------TAT--ccgaaaatcagaaataatcacagcacctggaaagtgtaatttatcataatttaagcttacaaatatctataatctgcaatttcgatatccttcatgaccgttacaggcgttgcgtcccacacatgttgtcagggaactattgacactggccggttccatagataaatggt
gi|2 : acgaattctaaatgacaaaaaA-----A--A---------TTTGGTACG--T-C----TGTCATC-CG-TAA-CTCTA-GAT-TAG--CT-ATAATGT--AG-G---GAAA--------CATACTCAACCA-C-ACC--ATCCAA---GGT--A-----GATGTTATGAAGTT--A-AAA--TG-T-AC-C--AAGGT------GAT----A-TAAAT-C-T-TATCACCTAACCACAA---AG-------AAAGGAGAAGCCAG-CAG-A-GGTCTA-C--CTCGTCA---AACGATCAT-T--CTTATTC-CATCC---TGCCAC-------GTCAT-AAT-A---AGGAAGAT-G--GC---T-CTCCATATATACGACAATC-C-ACTAGC-TATCCATCCCAG----GAAAACCCAAAATTTGGA--GTGAAAGAAAAAAC-AGG--T--GAAT-TC-AGGT-ACAATGCTAGTT-A-AAGATGGAGAG-GGGGAGGA-AAGCAGGACAATCTTCATACCCATCCC-CC-C-CC-CA-TAC-tatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatataaaatttggtacgtctgtcatccgtaactctagattagctataatgtagggaaacatactcaaccacaccatccaaggtagatgttatgaagttaaaatgtaccaaggtgatataaatcttatcacctaaccacaaagaaaggagaagccagcagaggtctacctcgtcaaacgatcattcttattccatcctgccacgtcataataaggaagatggctctccatatatacgacaatccactagctatccatcccaggaaaacccaaaatttggagtgaaagaaaaaacaggtgaattcaggtacaatgctagttaaagatggagagggggaggaaagcaggacaatcttcatacccatcccccccccatacaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagtggaaggaaataggaaggaactaacactaatcctcctcccacctatgatgaacgttgtggaaatatgcacaatgtcagcagtgaatgtctgtttgaccaaattactattccgatccatactagatgacccatttcccacctcccttcctatcagaaaaaaacagctggttaaatcgccgcgcccaaacgcgacacgccttgcctgtcgcccatgcttctgtgcggccatactgtccagtcatttatgtttgtacctcttcaataaaaaaatgttttgcgaattgtgctaaaagagtctcgtgcatttattctgtcgtcaattagcaccatataacaacacagcaatgacagagacatatctaacgaggcacgggcagaccctctttcacaaaaagaggcggctcaagtacacgattcaagaacagaccactacaagaccaagggacagatcacagcatcacacatcacaggatagaacagacacaattggtgaaacagcaagaaaaatacctcggataaatacacaacatcctagatcagactagagcagatccgaacaacacaacacagaccagaacatcgtacccgatgacacgagggccacagacagacacacagttcacatacacgacacacacctacagacgcaagcacaggacataaatcatagacaaaagacagacaccaagtatgataatcacatgaggttgaaaaaaatattctaaaagaccacacaaccacaacttgtaatcgtgagaagaggaaaataaagagcgaaactctgtactcaatccaaaagcatgaataatcagaaatgaaattggataacaaacttttgatgatacaaacaatcagaaataatctact
gi|2 : acgaattctaaatgacaaaaaaaaagtaattatgatttcacgcgaataataatgaataacggtatacatcggcgaagttgttattgtgagtaatacattaaaatgctcttaaaaatgaaacggataccaaaattgatgattcgacccaatacacattttccacagcagtcaacacaacgcagagttattcccctttggtaaatatccagaaaatcgaataaaaatcccagaattaatggaaacactgactttgattaccagatgaaaaaaatgaagttgtattcaaatatgaaactggtatgcaatagaccaagaggatcttattatatctaataaaagaaacttgaaggccagttaacgcggtcagaacttcataagcaatcccttgcaagatgtctttagctggatcgtgttcgctgtgtaaaaatacatttctaaaaatttagaattcctcaccaaggacatttattatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatata-TGGA-A-G-----GAAATAGGAAGGAACTAACACTAAT-C---CTC-CTC-CCACC-TATGATG-AAC---GTT--GTGGA--AATATGCACAATGTCA-G-CAGTG-AATGTCTGTTTGACCAAATTACTATT-C-CG-ATCCAT-A-CTAGATGACCC--A-TTTC-CC-ACCTCCCTTCCTATCAGAAA-AA--AACAGCTG-GT--TA--AA-TCG-CCG--CGCCCAAACGCGACACG--CC-TTGCCTG-T-CGCCC-AT-GCTTCTGTGCGGC-CAT-AC-TGTCC-AGTCATTTA-TGTTTGTACCTCT---TCA-AT--AAAAAAA-TGTTTTGCGAATT-GTGCTAAAAGA-G--TCTCGTG-C--ATTTAT-TC-TGTCGTCAATTAGCAC-CATATAACAA-CACAG-C---AATG-ACAGAGAC-ATATCTA-ACG-AGGCACGG--GCAGAC--------------C-CTCTTTCACAA--AAA-GAGGCGGCTCAAGTACACG-ATTCA-A-GAACAGA--C----C-----A-C-T--ACAA--G---ACCAA-G----------------------GGACAGATCAC--AG------CATCACACATCACAGGAT-AGAACAGA-CACA-ATTGGTGAAACAG---CA-AGAAAAAT-A---CCT-CGGATA-A--ATACACAAC--ATCCTAGATCAG---ACTAGAG-CA----GATCCGA---A----CAA-CACA-ACACA-GACCA-GA-AC-ATC-GTACCCGATGACACGAGGGCC---ACA-GAC-A--GA-CACACAGTTCA----CATACACGAC---A-CACAC-CTA-CA-------GAC-------GCA-AGC--A----C-AGGACA-------------TAAAT--CA-T----AGA-CAAAA--GA-CAGAC---ACCAAGTATGATAATCACATGAG-GTTGAA-AAAAA-TA-T-T-C-TA-AA-A----GACCA-CAC-AACCAC----AACTT-GTAATCGT-GA-G-A---AGAGGAAAA-T-A-A-AGAGCGAAA---CTCTGTACTC-AA---T---CCAAA-AGCATG-AA-TAATC-AG-A--A-A-TGA--A-ATT-GGATA------ACA-AACTTTTGAT-GA-----TA--C--AAA-CA-AT--CAGAAATAATaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagtggaaggaaataggaaggaactaacactaatcctcctcccacctatgatgaacgttgtggaaatatgcacaatgtcagcagtgaatgtctgtttgaccaaattactattccgatccatactagatgacccatttcccacctcccttcctatcagaaaaaaacagctggttaaatcgccgcgcccaaacgcgacacgccttgcctgtcgcccatgcttctgtgcggccatactgtccagtcatttatgtttgtacctcttcaataaaaaaatgttttgcgaattgtgctaaaagagtctcgtgcatttattctgtcgtcaattagcaccatataacaacacagcaatgacagagacatatctaacgaggcacgggcagaccctctttcacaaaaagaggcggctcaagtacacgattcaagaacagaccactacaagaccaagggacagatcacagcatcacacatcacaggatagaacagacacaattggtgaaacagcaagaaaaatacctcggataaatacacaacatcctagatcagactagagcagatccgaacaacacaacacagaccagaacatcgtacccgatgacacgagggccacagacagacacacagttcacatacacgacacacacctacagacgcaagcacaggacataaatcatagacaaaagacagacaccaagtatgataatcacatgaggttgaaaaaaatattctaaaagaccacacaaccacaacttgtaatcgtgagaagaggaaaataaagagcgaaactctgtactcaatccaaaagcatgaataatcagaaatgaaattggataacaaacttttgatgatacaaacaatcagaaataatctact
gi|22 : acgaattctaaatgacaaaaaaaaagtaattatgatttcacgcgaataataatgaataacggtatacatcggcgaagttgttattgtgagtaatacattaaaatgctcttaaaaatgaaacggataccaaaattgatgattcgacccaatacacattttccacagcagtcaacacaacgcagagttattcccctttggtaaatatccagaaaatcgaataaaaatcccagaattaatggaaacactgactttgattaccagatgaaaaaaatgaagttgtattcaaatatgaaactggtatgcaatagaccaagaggatcttattatatctaataaaagaaacttgaaggccagttaacgcggtcagaacttcataagcaatcccttgcaagatgtctttagctggatcgtgttcgctgtgtaaaaatacatttctaaaaatttagaattcctcaccaaggacatttattatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatataaaatttggtacgtctgtcatccgtaactctagattagctataatgtagggaaacatactcaaccacaccatccaaggtagatgttatgaagttaaaatgtaccaaggtgatataaatcttatcacctaaccacaaagaaaggagaagccagcagaggtctacctcgtcaaacgatcattcttattccatcctgccacgtcataataaggaagatggctctccatatatacgacaatccactagctatccatcccaggaaaacccaaaatttggagtgaaagaaaaaacaggtgaattcaggtacaatgctagttaaagatggagagggggaggaaagcaggacaatcttcatacccatcccccccccatacaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagTA---T-GT------C--TTGA-A-A-T---GA--G-C--AGA-A-C-C----A-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAA-TA-----CAAA-C---A-TT-T---TC--CA--G-C--A-G-TCA-C--AA-A-CC-A-GAGTAT-A-TT-CCCT--TG-GTTA-AA-A--T-CA-GAAAAAGAAAATGAATTAACCAAT--AA-TC-A-GCAGAA--T--TGAT-GTG-T--A---AA-ctact
gi|23 : TC-CTT-CCACC-CA--ATG-A-------T--C---C--AG--------ATGT------AGAA-C------------------------T-C-CA-ATC-AT-A-C-----TGCC---C-T--C-AC-AC-TAC-TCCAT--CTGGGA-AT--AA-----ATAC--TTT-AA-TGG-CCG--GG---AAA-G-AA---A--CA-ATGC-TG-C-A-CCA-AT-GCTTCTGCG--GT-A-T-GC-TGTTC-Cct
gi|24 : aaccaagtaT-T---TT--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA---CA-A-AAGT-T-A-TCTCCCT--T--GGT---A-A-TT-TT-GAAAAT------GAAT-----AAA--AG-CC-C-A---AA--A--TGGA-AT--T--A---AA-TC-A-T--A-T-T---A-----------TT--TTG--A-T---TC-AG-A-t
gi|25 : tg-GAGT-T-A-TCCCCCT--TG-GC----A-A-TT-TT-GAAAATG-----AAAT-----AAG--AG-TC-C--CAAAA-----TGAA-atcaattttag
gi|26 : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TA-----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TT---CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TT--TATgcttagacctaccgggtagctattgttttgattcagaatcaaaatta
gi|27 : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TC---AA-A---TA-G--AAGAT-TT---CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TT--TATC--------
gi|3 : TTA-A-AGAAAT-TT-C----AA-C-AT-T-C--TGCG---GA-T--G-CT--ATGAAAGTA-G-CG----CGGCTT-CGGTAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AT-AAT-G--A-TAAGTATC--------A-TA--C----T--G-G--T--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-AGC-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-TT-T---TC--CA--G-C--AAG-TCA-C-AAA-AACC-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTATAA-A-TC-CA-GAAAAAG-----GAAT-----AAA--CA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTGTTA-T-T-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A---GA---AGTT------TGTT-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AATAG----AA-GGAGG--AAAT--TT-TT----ATA---AAAATAAAAGA-A-C-TGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---AATT------------ACA-A-T-T-CT-AAAAT-TT----C-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TG---C-------TA-AAC-A---TT-GCTTTG-C--ATAGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A------------TTTG--ACG--T-C----TG----C-TG-TAA-ATCTAAG-T-TAG--TTTA--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGT---A-AA---TG-T-ACACG-AAGGGA-----GAT----A-TAA-TGC-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCA-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCA--A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCAATTATT-GACA--T-C-ACTCGACTA---ATC--AG----GAA----CAA----TG-A--GTGAAG-------C-AAGAGT--GAAT-T--AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGATAG--AGGA-AATCCT-GTATAAATTTCACAAT-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TAATGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACTCTA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTTATGGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TT-C-TG-C-C-CCCAAT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TG-TTGTA----TAAATCA-AT--AAAAAAT-TG--TTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCCACG--ACGTGCTAA-----------TAC----GAACAGTAGCA-GGTACAAC---AGGACACACA---GCA-GACCAGA--CAG--C-----A-CAG--ACAC--A---ACCGATGA--CTCCAC-TAG----ATC--AGACAGACCAG--AG------CG--ACACAACACACAAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGGTACCG-ATTTCCACCCGACA-ACCACACACAGC--A--TCAGC-CCATGCAC-ACAC-CACCACGA-CCGATCCATTACCGA-CACACACACCTGA-C--GACAC-A-C-ACAC------ACACAA----C---ACA-GAC-AGCGA-CA-A-----CG----CACACACCAC---AGTATAA-CAG-CA-------GAC--AC--AACA-AGCAGA----CTATGACA-------------CAAGATTCA-C----AGAGCAGAC--CA-CAGACT--AC-------GACAA-CAT---AG-ATAGAACACTGA-CATG-CAC-CAGCA-G----CA-CATCAC-AAACACATAAAACTT-GAAAT-GT-AATT-A---AG----AAA-T-G-A-GG------ATG-CA-TGT--CC-AAAGTT---C--AA-AACATGAAA-C-ATC-AG-A--ATA-TGA-GA-ATT-GG---------ACATAACTGTTG-T-GG-----TACTCGAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTGTCTCG--GCACTTCACGCCACAA--CC----------CCCAGT-G-CTG--TGAAAAC---TTTCCCG-ACTCATTACA--TACCT-TC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTT-AAATATAAGACCAT-CTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CCCAGAGAA--TCTGAGTCT---A--AGAATTTCAAAG--TTCAAGGCCG-ACTATG-TGCTTA
gi|31 : T-ACA-CTAAAAAT--AC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTT
gi|32 : -ACA-CTAAAAATTTCC---AAAAATTCT-A-CCTG--A--AGAATTTC-AAG--TTC-AGGCCGAAC-AT
gi|4 : TTA-A-AGAA-TCTT-C----AA-C-ATAT-C--T-CG---GA-T--G-C---ATGAA-GTA-G-C-----CT--TT-C---AT----TTCAAAA-AC--TA-G--AAGAG-TTT--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TAATC---AT--G-G--C--GTACG-----GG--T-ATTTTGA-----AA----A----TTA---TTGT-----CT--TTAA-A-A-TC--GA--G-C--GAA-----C---AACA-AATTG-AATA--T---T--CC-AAT----------A-C---A-TTAT---TC--CA--G-C--C-G-TCA-C-AAA-G-CA-A-GAGT---A-T-CACCT--TG-TTTA-AA-A-TC----GAAAATG-----AAA-------AA--AA-TCAC-AAGAAA--T--TGAA--TG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-GGGGA-----------AT--TTG--ACT-C-TCCAG-A-T-G--AA-A----A-AAATGC---AATT------T-TG-TT--CAA----GAA-TC-TG-GTAGT-TGA--AAT-G----AA-G-AGG--AC-T--TT-TTT---ATA---AAAA-A---GA-A-CCTGACAA--TGGTCC-A-T----AA-G--GGTGC-TAAAC-TC----TATGCGA--T-CC-T-G--AGAG------CT---ACT--AT----TT--------T-G--T-T---A-TT------------ACA--CT-T-CA-AAAAT-T-----A-T---T--CGA--C-CAAG-GA--A-TT----------------TGT--C-------CA-A--------T-GCTTCG-C--AGGAAT--A-T---GT--CTAC-----TTTATT--A-AATACA---A--A---------TTTG--ACGA-T-CAG--TG----C-TG-TA---TCTA-G-T-TAG--T--A--AC-T--AG-GTTCAAAACTTAAATATATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--ATAAGCGA------GAAGTT--A-AAA--TG-T-ACA----AGGGA-----GAT----AATTA-T-C-TTAGTCCCC---C----A---TA-------AAAGGA--AGCCAGCAAG-A-GGTC-AAC--TGC--CAC--GAC----A--C--CTTA--C--AT-----CGA--C-------GTCAT-A-T-A---AAGGA-AT-G--GC---TTCTCCAT--AA--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AGAGGGGTAA---CAT----TG-AT-GTGAG--------C-AGG--T--GAA---C-AG-T-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GG--AGGA-AG----GA-AATCTT----TAA--TTCACA-C-TC-CA-TACAT--ACC-CCTA-TGGA-A-GGAAGAAAAA--GGAA--ACCTAAC-CTG-T-CGTTCTC-CTTTCCACT--A--GTG-------GTT--G---ATTCGTA--CAC-ATGGCA----AGTA-A------------------------C-C----ATCCAT-A-CTG---GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCA-A-CAGG---AT--A------G-AT--TT--AA-T---CGG--CG---GAA-A--A---A--CC-T-----G-CGC-CCC-A--GCTC---TG--GC-C-T-GC-T-TTC-CATCATTTACTGTTTGTAA--CT--ATCA-AT--AAAAAATATG-TT-GCA---T-GT-CTAAAA-AAG--T----TG-TC-ATT--T-TC-TGT-GATCAATAGCAC-AAC------A-CACAC-C---A-TGAACA-ACACCA-A--TATACA--TGCATTG---CA-GC--------------AAC-------CA---AC--GACGCA-------GACACA-A-------GA-CAGA--CAGA-C-----A-CACCAACACCGA---GCCG--GACTC-CTCC-C-G----AC----GNNNNNNNNN--NN------NN--NNNNNNNNNNNNNN-NN-NN----NNNN-NN-------NNNN---NNNNNNNNNNN-N---NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNN--N--NNNNN-NNNNNNNN-TCCC-GACC-CGA-CCGA---C----CGACCACACACACC-GC-CC-GACCCGA-C-CGAC------ACAC-A----C---ACA-GAC-A--GACCG-A-----CATCTCCCCCCCCCCC---A-CACCA-CA--CA-------GAC--A---GACA-GACAGA----C-A-GATA-------------GA-----CA-C----AGA-CAGAC--CA-CACAC---AC--------ACAA-AAC---
gi|4 : acataaatattaccaaataaaattattgaaaaatatgttgattcatttaagataactctcttaaataatttatatggttaaacctgggtaactacctttccgtatggcccaaggagggaagagttggaccCGA----CCCGACC-GAC-C--GA-C--------CA----CACACACCGCCCGA-CCCGA-CCGACA-------CAC--AC--A-CA-GACAGA----C-C-GACATCTCCCCCCCCCCCA-----CA-CC---ACA-CAGAC------AGAC---A--------GACAG--AC---AG-ATAGA-CACAGA-CA-G--AC-CA-CA------CA-CA-CAC-AAA-AC-TTAAACTTTGAAAT-GTTAA-TTA---AT----AAA-A-G-A-GG------A---AA-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AT-C-ATC-AG-AGAA-A-TGA-GA-ATTTGG--A------A-A-AACTTCTG-T-GG-----TA--CAAAAAACA---G-C--AAATGAT-ATTT-CTCG---CACT-CA--C-ACAA--CC----------CCCCAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-AA-CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAA-TAAC-C-TTA--AA--TTATCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTGGAGTAC-A-A-AAACTTCATA-TTTAAAGTATAAA--CATC-TTC-T-AT-ACA-CTAAAAAT--CC---AGAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAA----TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTttaaactttgaaatgttaattaataaaagaggaaatgtccaatcaaaacatgatcatcagagaaatgagaatttggaaaaacttctgtggtacaaaaaacagcaaatgatatttctcgcactcacacaaccccccatgctgtgaaaacttccgaacataatacttactgactaataaccttaaattatcaatacgataaaaaaaaatattggagtacaaaaacttcatatttaaagtataaacatcttctatacactaaaaatccagaatttctgacctgaagaatttcaattcaggccgacatgtgctt
gi|5 : acataaatattaccaaataaaattattgaaaaatatgttgattcatttaagataactctcttaaataatttatatggttaaacctgggtaactacctttccgtatggcccaaggagggaagagttggaccttaaagaatcttcaacatatctcggatgcatgaagtagcctttcatttcaaaaactagaagagtttcccgaataaaatgatatatcataatcatggcgtacgggtattttgaaaattattgtctttaaaatcgagcgaacaacaaattgaatattccaatacattattccagccgtcacaaagcaagagtatcaccttgtttaaaatcgaaaatgaaaaaaatcacaagaaattgaatggaaaacacttggggaatttgactctccagatgaaaaaaatgcaattttgttcaagaatctggtagttgaaatgaagaggacttttttataaaaaagaacctgacaatggtccataagggtgctaaactctatgcgatcctgagagctactattttgttattacacttcaaaaattattcgaccaaggaatttgtccaatgcttcgcaggaatatgtctactttattaaatacaaatttgacgatcagtgctgtatctagttagtaactaggttcaaaacttaaatatataacaccaaagtaataagcgagaagttaaaatgtacaagggagataattatcttagtcccccataaaaggaagccagcaagaggtcaactgccacgacaccttacatcgacgtcatataaaggaatggcttctccataagacatcactgataatcagaggggtaacattgatgtgagcaggtgaacagtacagttaaagtaaggggaggaaggaaatctttaattcacactccatacatacccctatggaaggaagaaaaaggaaacctaacctgtcgttctcctttccactagtggttgattcgtacacatggcaagtaaccatccatactgggccatcccactccctccaacaggatagatttaatcggcggaaaaacctgcgccccagctctggcctgctttccatcatttactgtttgtaactatcaataaaaaatatgttgcatgtctaaaaaagttgtcattttctgtgatcaatagcacaacacacaccatgaacaacaccaatatacatgcattgcagcaaccaacgacgcagacacaagacagacagacacaccaacaccgagccggactcctcccgacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccTTA-A-AGAA-T----C----AA-C-AT-TAC--T-CC---GATC--G-AC--ATAAC-GTA-G-CG----CG--TT-C--TAT----TGCAAAA-AAAATA-G--AAGAT-TTC------G-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-GA--C---AT--G-G-----G---A-----GTATT-ATT---G-----AC----A----ATA---T-GA-----TC--TCGA-A-A-----GA--G-C--GAA-T-CGC---TA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAAT-A-----C--A-C---AGTT-T---TT--CA--G-C--A-G-TT--C-AAA-AGCA-G-GAGTGT-A-GTCCCCT--TGTAGTA-AA-AAGT-CA-GAAA-TG-----AAAT-----AAA--CG-AC-T-ACAGAT--T--TGAA--TGTG--A---AA-TA-A-C--TCT-G---A-----------AT--TTG--A-T-T-TC-C--A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------GTTA-TT--CAA----GAT-TC-TG-G---TATGA------G----AA-G-AGG--AA-T--TT-T-----ATA---AAAA-AA--GA-A-C-TGA-A---TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---A-ATGCAA--T-CCATTGC-AGAG-T---TAT----CT--AT----TT--CCTGCAT-G--T-T---A-TT------------CTA-ATT-C-CT-AAAAT-TTTA--A-T---T--TCA--CATAAGCGA--A-TT----------------TGT--C-------TA-AA------TT-GCTTTGTC--AAGGAT-----C--GT--CTCT-----CTT-TT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C----TG----C-TG-TTA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGTT-AGTGT-CAAA-----------TA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--AA----GA------GAAGT---A-AA---TG-T-AC-C--AAGGGA-----TATGCTGA-AGA-T-C-T-G----CC---CCA-AG---TT-------AAAGGAGA-GCCAG-CAG-ATGGTC-A-CGTTGCG-CACTTG-C----ATGCG-CCTA--C-TATCTCCATGA--CTCCAAGAGTTAC-A-T-ACCAAAGAA-A--G--GC---TTCTCCATT-AT--GA-A--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAAA---TG-A--GTGAA--------C-AGG--T--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGAG-GAA-AG--AGGA-A-TCTT-A---GAATTTCACA---TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--A-CTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTG-AA----GTTA-G---A--AGT---CAC-ATGT---AGCAGTA-A------------------------T-CGCG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CCCAC-TCCCTCCAT--CAGGGA-AT--AA-----A-GCT-TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-A-GG---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT----AAAAT-TG--TTG-A---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-TTCATT--T-TCTTGT-GT-CAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAAC--AAAC---A--TA-AC--ATGCAC----GCACG---------------CAC----GCACAG--ACA-GACA-AAC---AGAACACA-G---ACA-GACCAGA--CAGA-C-----ATCAC--ACAC--AC--AC--A-CA--C-CCAC-C-C----AGC--CGACCGACC----GA------C---ACACAACACGAGAC-AG-AC---------AC-------AC----------ACACCG-A---CCGACCGACACACCACA-----C--A--TCAGA-CAGGACAC-ACAC------------------------A-CACACACAGA-GAGCA-GAC--------------------CGA----C----CA-GAC-A--CA-CA-A-----T---------TACCA----A-TA-GA-CAG-CA-------GACAGAC--ACCA-A-CACA----C-A-CACA-------------CA-----CA-CAGAGAGA-CAGAC--CC-CACAC---AC-------CAC-A-CAC---AGAATAG-ACACAGAGCA-GACAA-CA-CACA----CA-CA-CAC-AAACAC-ACAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AGA---AAA-T-G-A-GG------AACTTT-TGT--CC-AA---T---C--AAGAACATG-AA-C--TC-AGAA--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AAC-TTTG-T-GG-----TA--CATAAA-C--ATG-CA-AAATGAATATTTTCT-G--GCAC-TCA---CACAA--CA----------CCCCATAG-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A---ACTT-AC-T---GACCTAATAAC-C-TT----AAATT-TCAAT--AC-GA-TAA----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAA-ATATAAACATCCT---CTATAACATCTAAAAAT--CC---AAATATTCTGA-CCTGCAA--GGAATTTCAAAAGTTTC-AGGCCG-AC-AT--TGCTTA
gi|6 : TTATA-AGAT-T-TTAC----AA-C-AT---C--T-CG---GA-T--G-CTGAATGAA-GTA-GGC-----CG--TT----TAG----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTCTTCC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TAC-TATTTATGCGAAA-TA--C---AT--T-GAAC--GTAGA-----GT--T-ATT---G-----AACTAGA----TTA---T-GT------CAGTTGA-ATA-TTTGGA--G-CTAGAT-A-C-CTACAA-A-AGATC-A-TT--TTCAC--CCCAAATATTCTCC--A-C---A-TT-T---CA--CA--G-CCAA-G-TCA-C-AAG---CA---GAGT-TTA-TTTTTCT--TTTGGTA-AA-A-TTTCA----AATG--------------AAA--AA-CC-----AGAA--T--TAAACATG-GTTA---AACAC-A-CCAT-T-A---AGACAACAACTTAT--TAG--A-TAC-TC-AG-AGTAG--AA-ATAGAA-A--TGACATAGTT-------GTA-T---CTA----GAGATC-TGTG--ATATGA--AAT-G----AACG-AGG--CA-TACTT-TTCTCAGTA---AAAACAAAGAAGA-CCTGA-AAGTTGGCCA-G-TTCGGAA-G--GGT-CCTAAAC-TT---ATGTGCAACTT-CC-TTT--GGAG-----TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--C-C---A-TTCATCGT------ACATACT-TTCTCAAAAT-CTTGCTA-TCTAT--TCAGCC-CAAA-GGCAA-TTCTTGTTAATAGCCGCATAT--T-------TACAACCA---TT-GCTTCTTA--AAGGAT--A-T---GT--CTCT-----TTAATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-T-A-ATCTA-G-TGTAG--TTAA--ATGT--AG-G--CATAA--------TA-A-------A-CAACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAG-T--A-AA---TG-TCACAA--AAGGGA-----GA-----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-A-----A-------AAAGGAG-AGCCCAGCAG-A-GGTC-A-C--T--G-CA---GATCTAAAT-CAGCTTA--CTTAT-----TGG-AC-------GTCAG-A-TAA---AAGAA-AT-GGAGC---TTCTCCA-TTAT--G-CA--T-C-ACT-GA-TT---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-AGGGTGGA--------CTCAG-GT--GAATGTC-AGGTGAC------AGTT-ACAAG-T--AAGGTGGAGAGGA-AG--AGGATAATCTT-AT---AATTTCACA-C-TC-CA-TAC-TTAACC-C-TG-TGGATA-G-----AAAA--GGAA--AACAAAC-CTG-T-C---CTC---T-CCACT-TA--GTG-AA----GTTG-G---A--AGT---CA-CA-GCTA--GCAGTAGA------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-CG----GGCCAAAA-T--CACC-AC-TCCTCGCATC-GAGGGACAT--AA-----C-GT--TTA-AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CCGTTGC-TG-C-C-CCC-ATCGCTTCTGTG--GCAC-T-GC-TGTTC-CATCA-TTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-ATAAAAAAAAT-TG--TTGCA---TGGT-CTAAAA-ATG--T----TGTT--ATT--T-TC-TGTGGTCTAATAGCAC-CAT------A-CAC-C-C---AATGAAC--AAAC-A-A--TT-AAA-CTGCATC---GCACG---------------CAC----AGACAG--ACA-GACAAAAC---A-GACACA-A---ACACGACCAGA--CAGA-CCCACAA-CAC--ACAC--ACACACCAC-GC--C-ACAC-C-G----ACCCAAGACAG--CAGGCAAGACAGCCG--ACA-GACACAC-ACAAG-ACGA--CACACAC-------ACACCCGCACGGACACCACA---CCA-CTACCG-AC--CACAGAGCCAA--CCAGA-CAGCTCAC-ATGC-ATCC-CGA-CAGAG--A----CAA-CACAGACA---GA-CACGACAC-A-CAACAG------ATACGAC---C---ACAGGAC-A--GA-C--A-----CA----CACACA-CAC---A-CACGACCAC-CACACGACCGAC--ACCGAACACAGCAG-----C-C-GACACCCCCCCCC----CA-----CACC----ACA-CAG----CA-CAGAC---A--------GACA---AC---AG-AT---ACA-AGA-CA-G-CAC-------A----CA-CA-CACAAAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-AAAGAA----AAA-T-G-A-GA------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--NN-NNNNNN-NN-N-NNN-NN-N--N-N-NNN-NN-NTT-------------------TTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-
gi|7 : TTA-A-AGA--T-GT-C----AAAC-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGA--GTA-GGC-----CAA-TT-C--TAT----TCAGAAA-A---TA-G--A-GAT-TTC--C---G-GAT--AA-AAT-G--AGTA--TATC--------A-TA--C---AT--G----C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----AA---TTA---T-GT------C--TTGA-A-T-T---GA--GGC--GAA---C-C---AA-T-AATTG-A-TAA-T---CGTCCCAAATAT----C--AGC---A-TT-T---TCTCCA--G-C--A-G-TCA-CTAAA-A-CC-A-GAGT-T-A-TTCTCTT-----GGTA-AT-A-AT-CA-GAAA-TG-----AGAT-----AAA--A---T-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-AAC--T-T-G---A-----------AT--TTG------T-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT-------GTAATT--CAAT---GAAATC----A--GTATGATAAAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT-----TA---AAAA-A---GA-A-CCTGA-A---TGGCCAAG-T----AA-G--GGT-C-TAA-C-TC-----ATGTAA--T-CC-TTG--AA---G---TCT---AC---AT----T---C-----T-G--T-----A-TT------------ACA--CT-T-CT-AA--T-TT------T---T--TCA--CGCAAG-GGT-A-AT----------------TGT--CC------TA-TAC-A---TT-GCTTTGTC--AAGGAT--AATC--AT--CCTC-----TTTATTTAA-AGTA-----T--A---------ATTG--ATG--T-C-G--TG----C-TG-TAA---TTA---T-TAG--T--A--AT-T--AG-GT-CAAAA--------TATA-------ATC-ACC--A---AAAA-GTA--A-----GA------GAA--T--ACAA---TG-T-ACAT--AGGGCA-----GAT----A---A-T---T-AGTCCCC-----A-AA---GA-------AA-GGAGA-GC--AGCGA-C-GGTC-A-C--TGC---A---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA--C-------GT-GC-A-T-A---AAGA---T-G--GC---TT-TCCATTT----GCCA--T-C-A-T-GA-TA---AT---AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AAG-----------------------------T-A-AAG-T--AAGG-GGG-AG---AG--AGGA-AATCT----ATAA--TTCACAAC-TC-CA-TAC-T--ACCTC-TA-TGGA-A-------AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C----TC-CTT-CCACT--A--GTGGAA----GTT--G---A---GT---CAC--TGT----ACAGTA-A------------------------TGC-CGGATC-A--A-C-----GACC---A-T--C-C--A--TCCCTTCATA---GGGA-AT--A--------GC--TT--AAATGG-CGG---A---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-C---AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATAATTTA-TGTTTGTA---CT---TCA-AT----AAAAT-TG-TTTGC----T-GT-CTAAAA------T----TG-T--CCT--TGTC---T-GTC--ATAG------C------A-CACAC-CTAAAATTATCA-AAAtcagaaata
gi|8 : ctcctacttttctcagcgcagttttcgaatcgtaaaaggcctcatttaagtgcagattggcccaccgttcatataatttacaaaataaacaatattgaaaatattttgatatcctaaatactccttaatatattttatacgtgttactggtaactttactttcgtatgaagggaggtaaattggacA-G-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--GGCT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TTAC--TGT----T-CAAAA-AAG-TA-G--AAGAT-TTC--C-----AATTAAA-AATTG--A-TA--TATC--------AGTAG-C---AT--GTG--C--G---ACATTAGT--TGATT---GC----AA----A----TTA---T-GTGCGATTC--TTGA-A-A-T---GAATG-C--GAA-A-C-C---AA-ATAGTTG-AATA--T---C--TCCAATAC-----C--ATC---A-TT-T---TTT-CA--G-C--A-G-TCA-C-AAACG-CA-ACGAGT-T-A-TTCCCTT-----GGTA-TATA-TT--A-GAAAATT-----AAA-------AA--AA--C-C-ACAGAA--CACGGAA-ATA-G--A---AA-ACCA-C--T-T-G---A------------T--TTG--A-T-T-CC-AGGA-T-G--AATA----A-A--TGA---AGTTGATTAGTGTA-TTGTTAA----GAAATC-TT-G--GTATGA--AAT-G----AA-A-AGA--AT-C--TT-TT----ATA---AGAA-AA--GA-ATCCTGA-AA--ATGCCA-G-T----AA-A--TTT-C-TAAAC-TCATTGTCTGCAA--T-TC-TCT--TGAG-GTATTCTG--ACTTAGT----TT--C-----T-GTTT-T---A-TTTTGTACCCCACCACA-CCTAC-CT-AAGAT-TT----A-T---T--TCAAGC-CAAG-AT--A-AT----------------TGT--TAATGCCATA-ATC-A----T-GCTT-GCCGGAAGCAT--G-TTCGGTTGCTCTCGGTATTTAGC--G-AATATCCTGA--AGACATGAATTTTG--ACGCCT-C-GTCTG----C-TG-TGA-ATCTACG-T-T-T--TT-A--CTG----G-GT-TAACG--------TGTT-------G-C-ATT--A---AACAGATA--C-----GA------G-AGTTTCA-AA---TG-T-----------GA-----GAT------TAA-T-TAT-A----CA---CCA-GATATGA-------AAAAGAGagctgaatagggtcttagattctaagaatagaacgtgagaacaatatgcgtgaactgcaagttatacgttctaaaacagtttaaccaaaacaaacaataacatgcagcacaacaacagaccagaagacagacacacatcagaccgacaccaacagacgacacatcaccacagaagcagacagatatgaccacagccacacaaca
gi|9 : cgctagcttatccatctcctacttttctcgcgaagtgacagttcttttctgtaatcctggcataaaaggcactttcattcaatgctagatgtgccaacccttcatatagtatatgtaccaaataaacatagttaattttgagaaaagtcatatttataatttcatttaaatactctcttaatatatgtatgatgtttaacctctctggtttaaacaccgttattatctaattacggtttctaattataggacgataaaggcagagcgcctattgagattcctaaa-A-AGAA-TGTT-C----AA-CCAT-T-TCAT-CGATGGA-CTGG-CT--AT--A-GTATG-A-----CG--TT-C--TAT----TCCAGAATAC--TA-G--AAGAA-TTC--TC-CG-AAT--AA-AAT-GTGA-TA--TAT---------A-TA--CGACATTGG-G--TTAG---A-----GTA-T-ATT---G-----AA----AAGTGTTA-----GT------C--TGGAGA-A-A---GA--GGC--AGA-A-C-C---AA-T-A--TGTA-TA--TT--C--CCCAAT-A-----C--A-----A-TT-T---TC--CA--G-C--A-G-TCT-C-AAA-A-CA---GAGT---A-TTCCCCT--TG-G-TA-AA-A-AT-CA-GAAATTG-----AGAT-----AAA--CA-TC---ACAGAT--T--TGAA--TG-G--A---AATAC-A-C--T-TTG---A-----------AT--TTG--A-T-C--C-AG-ACT-G--AA-A----A-A--TGA---AGTA------TGTA-TT--CAA----GAAATC-CT-G--GTATG---AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----AT----AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AAG-TGGCC--G-T----AA-AGCGGT-C-TAAAC-TC-----ATGCAA--T--C-GTG--ACGA-G---TCT---ACT--AT----TT--CG----TGG--T-T---A-TT-------------CA-ACT-T-CT-AAACTCTT----ATT---T--TCA--C-CAAGAGG--A-TT----------------TTC--C-------TA-AACTA---TTGGCTTTGTC--AAGGACTAA-TC--GT--CTCTTC---TTTATT----AATA-----T--A---------TTTGA-ACG--T-C-A--TG----C-TGCT---ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-C-AAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AG---GT---A-----GA------GAAAGT--A-AA---TG-T-GTACCAGAGGGAGTAGTGAT----A-GAA-T-C---AGTT-----------A---GATCATTACAAAGGAG-AGCCA-GCAGAA-GGTC-ATC--TGCG--A---ACC----ATCC--CTTA--C-TAT-------G-AC-------G-CATGA-C-A---AAGAA-ATCG--GCCGTCTCTCCCTTTAT--GACA--T-C-A
blockSeqs : T . A C A GCCA A C A A CA G ATG CTG G GA A GCGCGGC A GG GCGG TG T AAA T TT . CTTCCC T TA T T TG G AG TATGCGAA G AT GAC TG T AACGTAGA AT G GTGAGT CTAGA AAA T TGCGATT AG G T A TTG AT ACGGATA G TAC C T A T A TTCACCCCAAATATTCTCCA GTG G G GTT TC CA . CA T . A T AA CA TA . CCTT G AAAT A TCA AAAAT TAACC . G CAA CAC CA T TT GTT C C A CAT T GGG GACAACAACTTA . TT C TA C G G A AA T TAGA . AA CAT GATTAGTG A GT ATAT A TGT TAG TA A GACC C G . A AC A CTCA TCT T AAG G T T C AGT A T TCGG C GC G C T ATTGTC CT C A CA GTAT TTAGCTGGATCGTGTTCGC G TT GTAAA A TTGTACCCCACC TA A T A C TGCTA CTA CC GC A GGCA . CTTGTTAATAGCCGCATATT C CAT G TGT GG GTTCG TG C CGGTA TAA TCCTGAAGACATGAAT GT CC . GTC TCAT . C AAC A A G . TT TA G T T TT CTTAAATA CTCAACC T A . TCC CAG . TAAGC TGTTAT TTTC C A . C ACCA GTAGT GCTGAA A GCT A A TAACCACAAAG AA GG A T T A GT TCGTCAAACGATCATT TT TT CTCCATGACTCCAAGA TG AT CCA G C GA CGT AT AC AT . . A C TCC CC AGGG ACC AATT G GG AGAAAAAACAGGT TGTC G AATGCT . C A GG T GG GAT GCA C TCATACCCA CC . . A TA T C AA T . GAAGA TA GG A A A . GTTC . T CT TG G TAAC GTGGAAATATGCACA CAGCAGTGAATGTCTGTTTGACCAAATTACTAT G G G C . A TAGAT AAA A TT A C C AT C TG ACAGCTGGT T A G . CCC C CGACAC . G C . G G A C CG A A . . . A C CCT AAA . AAA A TT T AAT G G GAGTCTCG T TC TA G T C CA A ATAACA A . TAA AG AT TC T GA AACACGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNN TAGCA CGGCTCAAG GATTCA C G AC A CCACA T CA CG CACACCACGCCACACCGACCCAAGACAGCAGGCAAGACAGCCG ACA AG A AACAGACACAATTGGTGAAACAGCAAGAAAAATACCT CACC A ATC T TG T CACCACGACCGATCCATTAC A C C CCT C AC A ATCGTACCCGATG C GGGCC G . GC C ACACAGTTCA A CCG G CA C CGA CACGACC AGACAC CAG CTAT TCTCCCCCCCCCCCA CAGAG G G ACACCAA ACCAAGTATGATAATC ATG A AAG G TGCACCAGCAG C T A A A A T C T G T AAG AGGA A A G . AGCGAAA C AC . AGT ATG CT G A GC C A GA T . T G T AGGAACT T C A G AATCA CT A A AGATGC TT TT TCG TTCACGCC . AGGACAAAAA AA GA AA ATT TC . CT T C ATTA G T TCA T G A ATT C A AA G G ATTTT . TGT G AG T AA T AA T C T C T TT ATG T G GCAA GT A A T T
blockSeqs : . . . G . . . . . . A . . TC . . . GGCCAA . . . TG . AG . . . CACGC . . . . . . C GGT . G C C . CGACATTA A . TTGA AAGTG . . TC . . . . C . CTAGATA . . . . A . A ATCGTCCCAAATATCAG . . A GTT T . . . A . . . AG AC AT . TGT G ATAA . TT . . . . ACA A A . . . T . . TA . . T . . . AC . . C . . . . . . . TG . . T A TG G . . . . . . . . . T . C AAA . . C . AG . . . . C . . . ATA . . . C G CTATTTCCTGCA . . T . CATCGT A . . C . AGAA . . AG G GAC . TGTTAATGCCA . TAT . CTT . TAATC . A TC A CAAA A A . AG . . . AAA C . . . TA . G . . T . . . . . . AA . A . TT . A . . ACG . AAT . CTT G C CCAGATATGA AA GC . . . T . GCGCACTTGCATGCG . C CCTGCCAC T TA . . . . . TT T . . . C . . . . . A . T GCAAGAGT TTT . . . . . . . GG GA A T TGTATAAA AT . . . C . . C . . . . . A . . . T . . T . . C TAGAAGTTCACC TATGGCAGTAA . . . C . . TG C . . . . . C . . AGCCCT A . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . C . A A . A . T T . . . AAGTT . C . . . G CC . . . . . A CA . . AA CGGGCAGACCCTCTTTC NNN NNNNNN ACAGC . A . A . . . . ACCGATGACTCCACTAGATCAGACAGACCAGAGCG ACA GG . ACGACACACACACACCCGCACGGACACCACACCA ACC G CAA . NN . ATCCCGACAGAGA G . C CA G A A GACCGAC C CCCG . . . . GACATCTC G . . TA . AA . ACCGAA AG CAG CCCCCCCCCCA TC G . AAGA GACACATCACC . . CAG . GACAACACACA . . . A . A . . . T . . CCA . . . . CGCAAA . . . . . CA . . AC . . . . . . . . ATA . T . . . . A . GTCGTC AT TC CG TCAC . . CA AG . . . . A . . TA . . . A . . A T . . . . AA . AG . A . . T AA C T . A . . CAG T . GA . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . . GCGCG . . . TC . C . . . GCCG . . . . . . . . . . . . . CGAAGTT . . GC TACA . . CT . . . . . . CGAAAG . . . . A . . ATTCGACCCAATACA . . . . . . . . . . . . CG A GT . TTT G ATAT . TT . . . . CA T A . . . . . . TC . . C . . . T . . . . . . . . . . TG . . . A TG G . . . . . . . . . . . . AAG . . C . A . . . . . . . . GTA . . . . G GACTTAGTTTC . . T . . A . . . . TAA . . . . CGA . TGTCC . AT . TGT . AATC . C . A AA . . . G . . . TAA . . . . T . G . . T . . . . . . . . . . TT . . . . AA . AT . TAT G C AGATCATTAC A AG . . . . . GCAGATCTAAATCAG . T TGAAC T T . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . CTCAGGT TTC . . . . . . . GG GA A . GATAA AC . . . . . . A . . . . . A . . . C . . C . . . GATTCGTACAC TAGCAGTAGA . . . . . . G . . . . . . A . . AATAC . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . C . . A . A . T T . . . AAGT . C . . . . TC . . . . . A A . . AC ACGACGTGCTAATACGA AAA CAACAG GAAC . C . A . . . . GCCGGACTCCTCCCGACGNNNNNNNNNNNNN NNN CA . ACCACAACACACCACAGGTACCGATTTCCAC NNN N A . GA . GACCCGACCGAC G . C CC . C C ACAACAG C CC . . . . AATA C . . CC . TA . ACAA AG CA CAAGATT CC G . ACCA TACGACAAC . . AAC . CACACACAC . . . C . A . . . . . . GA . . . . AACT . . . . . . . . TA . . . . . . . . A . T . . . . A . AATCAG T GT G TCAC . . AG C . . . . . . . AT . . . A . . A A . . . . A . . . A . . . AT C T . . . . . T . GA . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . . GGCCG . . . TC . C . . . CCCC . . . . . . . . . . . . . CGTACG . . G AAC . . TT . . . . . . GCAGAA . . . . A . . TCCCCAATACAAA . . . . . . . . . . . . A A TT . TG T AAA . CA . . . . AG T G . . . . . . A . . T . . . C . . . . . . . . . . GT . . . A TG A . . . . . . . . . . . . AAG . . C . A . . . . . . . . ATG . . . . T ACTATTTCG . . T . . A . . . . AT . . . . GGT . TGTC . AT . TGT . ATC . C . A AA . . . G . . . GAA . . . . T . G . . T . . . . . . . . . . GT . . . . AT . AT . CT G C CCAAAGA A AG . . . . . GCACAGACATC . T TGGAC T T . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . CAGGT TTC . . . . . . . AG AA A . TAGAA C . . . . . . A . . . . . C . . . C . . T . . . GAAGTCACC AGCAGTAA . . . . . . . . . . . . . A . . AAGCT . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . C . . A . A . T T . . . ATGT . . . . . . CT . . . . . A A . . A TCGCACGCACAG ACA AACAG NNNN . C . A . . . . CACACACCCACCCAGCCGACCGACCGAC ACA NN . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN AC G N . CT . CAGATCCGAA A . G GA . A A ACACAC T C . . . . AACG C . . CG . AG . AGA GA CA TAAAT CC G . ACCA ACACAAA . . AC . TGACCACAG . . . A . A . . . . . . C . . . . AAC . . . . . . . . T . . . . . . . . A . T . . . . G . ATGTC T TT G TCAC . . AG G . . . . . . . TA . . . A . . A A . . . . A . . . A . . . . C T . . . . . A . GA . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . TGACG . . . TC . . . . . TCCC . . . . . . . . . . . . . TTATA . . G AA . . TC . . . . . . CAGAA . . . . A . . TCTCCAATACCAT . . . . . . . . . . . . A A T . TT G AAA . CA . . . . CA T A . . . . . . T . . A . . . T . . . . . . . . . . TG . . . A TT G . . . . . . . . . . . . A . . C . A . . . . . . . . TA . . . . G ACTATTTC . . C . . C . . . . C . . . . AGG . TGTC . T . TG . AT . T . A AA . . . A . . . AA . . . . T . G . . T . . . . . . . . . . T . . . . C . AT . CT G C CCAAGTT A G . . . . . GCGAACCATCC . T CGAC C T . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . CAGGT TT . . . . . . . AG GA A . TATAA C . . . . . . A . . . . . A . . . C . . . . . . AGAAGTCAC AGCAGTAA . . . . . . . . . . . . . C . . AGCT . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . . C . . A . A . . T . . . AGT . . . . . . C . . . . . A A . . A GCACGCCATGC ACA AAACA AGAC . C . A . . . . CCGACACTACCAACCGACCGAACG AC AG . ACACACACACCGACCGA A . A . . . . . . . . . . . . . C . . . . AAT C . . CG . AG . ACA GA CC CA T C . ACCC ACCACAC . . AA . TTCTAAAA . . . A . A . . . . . . A . . . . ATG . . . . . . . . T . . . . . . . . A . T . . . . A . AATGC T T G TCAC . . CA T . . . . . . . TA . . . . . . . A . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . T . GA . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . CCTA . . . GC . . . . . CTCC . . . . . . . . . . . . . TTAGA . . G AA . . AT . . . . . . CGAAT . . . . A . . TCCCCAATTACA . . . . . . . . . . . . G A T . TT C AAA . TT . . . . CA A A . . . . . . T . . A . . . T . . . . . . . . . . T . . . A CT G . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . . . . AA . . . . G ACTATTTC . . T . . A . . . . A . . . . GG . TTCC . A . CG . AT . C . G TA . . . . . . . AA . . . . T . G . . T . . . . . . . . . . T . . . . A . AG . CT G . CCAAA A G . . . . . GCCACGACAC . T TGAC G T . . . . . T . . . . . . . . . . . . . CAGGT C . . . . . . . G . A . TTAA C . . . . . . G . . . . . A . . . . . . . . . . GGAAGTCAC CCAGTAA . . . . . . . . . . . . . A . . AGGC . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . C . . A . A . . T . . . AGT . . . . . . C . . . . . . A . . A CGCACGCACGC AC CA AAAC . . . . . . . . ACCAAGGGACAGATCACAGCATC AG C . C . . . . ACA C . . G . AC . G G CA GA C G . AC AGACAG . . AC . GCACAAA . . . A . A . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . C . . . . . . . . A . T . . . . A . ATGCA T T G TCAC . . CA G . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . A . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . GCCG . . . TC . . . . . TCC . . . . . . . . . . . . . AGG . . G A . . T . . . . . . GCGAA . . . . A . . TTCCCCAATACA . . . . . . . . . . . . A A T . TG G AAA . TT . . . . TA T A . . . . . . T . . A . . . T . . . . . . . . . . G . . . . T G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . ACTATTT . . T . . . . . . . A . . . . GA . TGC . . . GC . C . C . . TA . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . C . A . T . . AAAGA A G . . . . . GCAGACATC . . GAC C C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . CAAG . . . . . . . . . . . . ATAA C . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . GAAGTCAC CAAGTAA . . . . . . . . . . . . . . . . ACGT . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . AGT . . . . . . C . . . . . . . . . A TTGCAGCAAC . . AA . . . . . . . . CCCGCACTCGACGCGACCGACC G . . . . CA C . . . . A . . A CC CA C C . CA AGACA . . AC . GACCACA . . . A . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . C . . . . . . . . A . T . . . . A . ATGC T . . TC . . A G . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . GCCG . . . CA . . . . . CGC . . . . . . . . . . . . . TGA . . G A . . T . . . . . . CGAAA . . . . A . . TCCCCAATACA . . . . . . . . . . . . A A T . TG T AAT . CA . . . . CA T A . . . . . . T . . A . . . C . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . ACATTC . . . . . . . . . . . . . . . AT . A . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . C . . CATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAGTCAC ACAGTAA . . . . . . . . . . . . . . . . GAT . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . C . . . . . . . AC . GCACA . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . C . . . . . . . . A . T . . . . . . AGC
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . GCCT . . . CC . . . . . CCC . . . . . . . . . . . . . CGA . . G A . . T . . . . . . TGAA . . . . G . . TCTTAACGT . . . . . . . . . . . . . A T . TG G AAA . CA . . . . CA T . . . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . . . CCAG AGAAC . . . . . . . . . . . . . . . . GC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . GCCG . . . T . . . . . CCC . . . . . . . . . . . . . GG . . G A . . T . . . . . . CGGA . . . . A . . TCTTAACT . . . . . . . . . . . . . G T . TG G AA . CA . . . . C T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . C . . . . . GC . . . . . . . . . . . . . GA . . G A . . T . . . . . . CGAA . . . . G . . TTCCAATA . . . . . . . . . . . . . A T . TG G A . CA . . . . C T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . CC . . . . . . . . . . . . . G . . G A . . T . . . . . . GGA . . . . . . . TCTAAA . . . . . . . . . . . . . . T . T G A . T . . . . C T
blockSeqs : . . . . . CC . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . . A .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqCons : T*** GCCG********* ** G******** T****** TCCCCAATACA**************** *** A** CA** ** CA** T**** A* ** ** TG** ** A** ATA*** G**** GG*** TGTCC************************ AT**** ATC***** A*** AA**************** G*** AAA* ** ** ** ** T*** *** CT*** CCAAAGA************** GCGGACCATC************ T* T** ** CAGGT************* TTC** GA* TATAA**** A* ** GAAGTCAC*********** AGCAGTAA**************************** ** ** ** ** *** A** T* C* ****** A* A** CGCGCGCACGC*********************** ACA*** CAACAG*** A* ** ACACANACACACACCAGCACGGANAGCACN****************** CACCCGACCGAN********** CA* ACGNAC********* AG* ACA***** GG* CA****** CC**** ACCA*** ANACAAC************ AC* GACCACA*********** *** ATGC***** G** ** CG A** A** AA GA****
originalCons : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-C--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---T-GT-----TC--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-AATTG-A-TA--T---C--CCCAATTA-----C--A-C---A-TT-T---TC--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA-A-CA-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTA-AA-A-TT-CA-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------TGTA-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TC---GTATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-AAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT----------------TGT--C-------TA-AAC-A---TT-GCTTCGTC--AAGGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTATT--A-AATA-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-TAA-ATCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGTT--A-AA---TG-T-ACAC--AAGGGA-----GAT----A-TAA-T-C-T-AGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCG-CA---GAC----AT-C--CTTA--C-TAT-----TGA-AC-------GTCAT-A-T-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATTTAT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAA--------C-AGG-GT--GAAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGA-AG--AGGA-AATCTT-ATATAAATTTCACA-C-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACT-TA--GTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCATGTCA-GGCAGTA-A------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-AT--AAAAAAT-TG-TTTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTCCAATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA-ATGCACCG--GCACGC--------------CAC----GCACAG--ACA-GACACAAC---AGGACACG-A---ACA-GANCAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A---ACCGA-GA--C-CCAC-C-G----ACC--AGACAGACCAG--AA------CG--ACACGACACACGAC-AG-AC----CACA-AC-------ACAC---CACAGACACCG-A---CCG-CCGACA-ACCACACACAGC--A--CCAGA-CAGCGCAC-ACAC-CACC-CGA-CCGA---A----CGA-CACACACACC-GA-CA-GACAC-A-C-ACAC------ACACGA----C---ACA-GAC-A--GA-CA-A-----CA----CACACACCAC---A-CACGA-CAG-CA-------GAC--AC--AACA-AGCAGA----C-A-GACA-------------CA-----CA-C----AGA-CAGAC--CA-CAGAC---AC-------GACAA-CAC---AG-ATAGAACACAGA-CA-G-CAC-CA-CA-A----CA-CA-CAC-AAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-A-GG------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CA-ATG-C--AAATGATTATTTTCTCG--GCACTTCA--CCACAA--CC----------CCCAAT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTAC-A-A-A--CTTCATA-TTTAAAATATAAAAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTA
finalCons : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GAT---G-CT--ATGAA-GTAGCCG---------TT-C--TAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATTG--------AA----A----TTA---T-GT------C--TTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-AATTG-A-TATCCCCAATACA----------------C---A-TT-T---TC--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA-A-CAA--GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTA-AA-A-TTCA--GAAAATG-----GAAT-----AAA--AA-TCCA--CAGAAT----TGAAA-TG-G--A---AA-AC-A-C--T-T-G---A-----------AT--TTG--A-T-C-TC-AG-A-T-G--AA-A----A-A--TGA---AGTT------TGTA-TT--CAA----GAAATCTG--G--GTATGA--AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TCATA---TGCAA--T-CC-TTG--AGAGG----TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-AAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAGGG---A-TTTGTCC------------------------TA-AACAT----T-GCTTCGTC--AAGGATATC-----GT--CTCT-----TTTATTA---AATAAA----------------TTTG--ACG--T-CG---TG----C-TG-TAAA-TCTA-G-T-TAG--TT-A--ATGT--AG-GT-CAAAA--------TATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------GAAGT---A-AA---TG-T-ACAC--AAGGGA-----GAT----A-TAA-TCT---AGTCCCCCCAAAGA--------------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCGGACCATC------------CTTA--CT-AT-----TGA-AC-------GTCAT-AT--A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATTTAT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---ATC--AG----GAAA---CAA----TG-A--GTGAACAGGT-------------GAATTC--AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGA-AG--AGGA-AATCTTATAA----TTTCACA-C-TC-CA-TAC-T--ACC-C-TA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-CTT-CCACT--A--GTG-AA----GTTGAAGTCAC-----------ATGTAGCAGTAA----------------------------T-C-CG-ATC-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGTA---CT--ATCA-ATA--AAAAAT-TGT-TTGCA---T-GT-CTAAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-GTC-AATAGCAC-CAC------A-CACAC-C---AATGAACA-AAAC-A-A--TA-ACA--TGCACGCGCGCACGC-----------------------ACAGACA---GACACAACAG---GACACG-A---ACA-GANCAGA--CAGA-C-----A-CAC--ACAC--A---ACCGA-GA--C-CCAC-C-G----ACC--AGACAGACCAG--AA------CG--ACACGACACACGAC-AGACACANACACACACCAGCACGGANAGCACN------------------CCGACA-ACCACACACAGC--A--CCAGA-CAGCGCAC-ACACCACCCGACCGAN----------CGA-CACACACACA-GA-CA-GACACACGNAC---------ACACGA----C---ACA-GAC-A--GA-CA-A-----CA----CACACACCAC---A-CACGA-CAG-CA-------GACACA-----CAGG-CAGACA------GACA-------------CA-----CACC----AGA-CAGACCA---CAGACANACAAC------------AC---AG-ATAGAC-ACAGA-CAGACCACA-----------CA-CA-CAC-AAACAC-TAAAACTT-GAAAT-GT-AA-T-A---AG----AAA-T-G-A-GG------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AA-C-ATC-AG-A--A-A-TGA-GA-ATT-GG--A------ACA-AACTTTTG-T-GG-----TA--CAAAAA-CATGC-----AAATGATTATTTTCTCGG--CACTTCA--CCACAA--CC----------CCCCGT-G-CTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTG-AGTACA--A-A--CTTCATA-TTTAAAATATAAAAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTGA----AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTA
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): CTACTTATTTCTCAGGCGAAGTTATCGGAATCACCGGTAAAAAGAGCCACTTACATAACAATAGCAGATTGGCCACCTCACTGTATACATATTACCAACAAAAATAACAATATTGAAAATATTTTGATCATTTAAATAACTACTCTTAAGTATATTATATGTTAACCCTGGTAACTTTATTATCGTCATTAGCGAGCAAAAGGGAGAAAATTG
Unaligned ( gi|21 ): GCTGCTTCCGCTAACTCTTTCTCAGCGACAGTCTTCGATCTCGGTAAAACAAGGTCATGTCATTCAATGCGCAGATGGCCCGCTTACATATAATATACCAAATAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
Unaligned ( gi|28 ): CCTCTCCTATCTTTTCTCAGCACAGTTTCGATATCCGGTAAACAAGCACTTCATCAATCAGATTGGCCACC
Unaligned ( gi|29 ): TTATATATTAATGTTAATATCCCTGAGTAACTTACTTTGTATGCAAAGGGAGGGGTAAATCTGAGAC
Unaligned ( gi|30 ): AAATGGAATAAAATTCCCAAAATGGAGTTAATGTATATTATTTTGATTCAGAATCAATTATAGAAA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111 111 1111111 11111111 333333333333333 111111111 111111111 111111 1111111111 1111111111111 222222222222222 111 222 1111 1111 11111111 111111111111 11111 11 22222222 11 1111 1111 111 111 11 222222 11 11111 111111111111111111111111 11111 333333333333 222222 11 11111 4444444444444444444444444 11111111 111111111 22222222 22222 1111111 333333333333333333 11 11 2222 111 1111111 11 11111111 1111111 111 11111 111111 222 2222222 11111 1111111 111 222222222222222222222 11 1 44444444444444444444444 11 333333333333333333 11 11 1 1111 1111 11 222222222222 1111 1 111111 2222222 1 111 111 11 11111 1111 111111 1111 222222222222222 1111111 444444444444444444444444 11111 111 11 11111111111 11 111 111 22 11 111111 22 11 1 1 22222222222222222222222222 111111 222222222 111111 1 11111 11 66666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 3333333333333333333333333333333 11111 222222 55555555555555555555555555555 1111 33333333333333 22222222 1 22 111111111111111 111111 11111 4444444444444 11111 1111 111 111111111 1111111 666666666666666666666 1 2222 3333333333 111 11 111111111 11111 11 1 22 111 44444444444444444444 1 1 2222 111111 111 1111 1 33 1 111 111111
lowQualScore : 3 3 3 6 3 6666 3 3 3 3 77 3 555 8888 3 44 3 7777777777777 3 88 6666 33 2 333 2 33 2 4444444 2 33 2 2 33 2 66 55555555 3 77 888 77 3 444444444444444 77 3 222222222 999999999 777 5 111111 66 0 555 2 2 2 777 33 1111111111 2 555 2 2 3 6666666666666 3 44 222222222222222 555 3 6666 5 222 33 33 2 33 5 2 2 2 000 888 5 5 2 99999 2 55555 2 0000 66666 66666 33 2 1111 77777 55 3 44 555 6 3 3 11111111 999999999999 55 55 3 55555 3 7 4 22 4 9999 4 777 11111111 4 00 3333 0000 666 66 4 9999 4 4 66 9999 4 9999 777 8 222 4 4 2 4 777 4 4 9999 4 00 4 4 4 000000 66 4 4 00 66666 888888888888888888888888 4 66 00000 4 555555555555 66 4 4 8 4 666666 777 66 22 8 55555 4 66 5555555555555555555555555 22222222 4 4 888888 777777777 11111111 66 0 55555 66 8888888 66 666666666666666666 00 00 4 3333 9999 4 4 222 8 4 4 5555555 1 00 4 66 66666666 4444444 4 4 66 777 333 66 55555 222222 4 4 000 4 777 4 3333333 0 11111 6666666 000 2 3 777777777777777777777 22 8 5 5 0 5 66 33333333333333333333333 66 00 444444444444444444 11 88 777 4 4 66 777 444 00 66 4 4 0 5 888 66 0000 5 0000 5 888 88 000000000000 66 0000 88888 0 444444 5 5 5 66 5 1111111 0 66 55 777 4 222 4 4 4 11 5 5 66 4 4 11111 66 66 1 4 4 4 8888 4 4 333333 4 2222 111111111111111 8 4 6666666 4 4 222222222222222222222222 4 4 4 4 4 4 4 99999 111 4 55 4 4 8 44 4 55 77777777777 33 4 4 55 777 444 777 55 4 4 4 4 4 4 4 99 4 4 4 4 4 1 4 4 333 888 4 222 4 22 777 4 4 4 555 66 9999 4 55 66 4 4 8 4 4 4 4 888888 4 4 4 777 22 4 5 11 66 0 0 5 66666666666666666666666666 5 111111 888888888 777777 0 5 0 66 22222 5 11 5 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 66 3 5 5555 11 1 8888888888888888888888888888888 66 6 4 99 0 0 7 11111 6 666666 6 33333333333333333333333333333 6 6 5 5555 77 33333333333333 5 0 11111111 88 66 4 6 66 9999 777 4 777 4 44 4 11 888888888888888 333333 66 55555 777 2222222222222 11111 3333 5 777 222222222 66 4 9999 4 4444444 4 111111111111111111111 4 55 4 4 4 555 6 3 3 3 0 666 6666 3 3 3 3 4444444444 3 55 3 666 000 00 3 3 888 88 3 3 3 3 3 3 333333333 3 2 4 4 00000 55 4 11 5 0 5 22 44 666 44444444444444444444 2 2 66 66 888 66 0 66 5 0 7777 5 5 888 6 6 5 5 7777 5 66 5 5 888888 5 555 5 4444 5 1 11 6 1 88 0 5 66 777 3 5 000000 66 5 5 5 5
lowQualScore : . . . . . .... . . . . .. . ... .... . .. . ............. . .. .... .. . ... . .. . ....... . .. . . .. . .. ........ . .. ... .. . ............... .. . ......... ......... ... . ...... .. . ... . . . ... .. .......... . ... . . . ............. . .. ............... ... . .... . ... .. .. . .. . . . . ... ... . . . ..... . ..... . .... ..... ..... .. . .... ..... .. . .. ... . . . ........ ............ .. .. . ..... . . . .. . .... . ... ........ . .. .... .... ... .. . .... . . .. .... . .... ... . ... . . . . ... . . .... . .. . . . ...... .. . . .. ..... ........................ . .. ..... . ............ .. . . . . ...... ... .. .. . ..... . .. ......................... ........ . . ...... ......... ........ .. . ..... .. ....... .. .................. .. .. . .... .... . . ... . . . ....... . .. . .. ........ ....... . . .. ... ... .. ..... ...... . . ... . ... . ....... . ..... ....... ... . . ..................... .. . . . . . .. ....................... .. .. .................. .. .. ... . . .. ... ... .. .. . . . . ... .. .... . .... . ... .. ............ .. .... ..... . ...... . . . .. . ....... . .. .. ... . ... . . . .. . . .. . . ..... .. .. . . . . .... . . ...... . .... ............... . . ....... . . ........................ . . . . . . . ..... ... . .. . . . .. . .. ........... .. . . .. ... ... ... .. . . . . . . . .. . . . . . . . . ... ... . ... . .. ... . . . ... .. .... . .. .. . . . . . . . ...... . . . ... .. . . .. .. . . . .......................... . ...... ......... ...... . . . .. ..... . .. . ..................................................... .. . . .... .. . ............................... .. . . .. . . . ..... . ...... . ............................. . . . .... .. .............. . . ........ .. .. . . .. .... ... . ... . .. . .. ............... ...... .. ..... ... ............. ..... .... . ... ......... .. . .... . ....... . ..................... . .. . . . ... . . . . . ... .... . . . . .......... . .. . ... ... .. . . ... .. . . . . . . ......... . . . . ..... .. . .. . . . .. .. ... .................... . . .. .. ... .. . .. . . .... . . ... . . . . .... . .. . . ...... . ... . .... . . .. . . .. . . .. ... . . ...... .. . . . .
lowQualScore : 3 3 3 7 1 5555 1 1 1 1 33 1 444 6666 1 22 1 2222222222222 1 55 5555 55 7 777 7 77 7 5555555 7 77 7 7 77 7 33 44444444 1 33 555 33 1 333333333333333 33 1 888888888 888888888 999 7 111111 88 8 000 9 9 9 999 99 8888888888 9 000 9 9 6 9999999999999 1 22 333333333333333 444 1 1111 7 999 99 99 9 99 7 9 9 9 999 111 3 3 7 99999 7 55555 7 1111 77777 77777 77 7 5555 77777 33 3 66 888 7 6 6 11111111 666666666666 00 00 6 55555 6 3 4 22 4 4444 4 888 11111111 4 66 9999 9999 222 11 4 4444 4 4 11 3333 4 4444 888 9 000 4 4 9 4 999 4 4 4444 4 66 4 4 4 000000 11 4 4 66 11111 333333333333333333333333 4 11 33333 4 666666666666 33 4 4 9 4 999999 888 11 22 9 66666 4 11 3333333333333333333333333 44444444 4 4 777777 888888888 99999999 11 1 00000 11 1111111 11 000000000000000000 66 66 4 4444 4444 4 4 777 9 4 4 7777777 1 66 4 33 11111111 4444444 4 4 11 888 999 11 66666 888888 4 4 000 4 888 4 2222222 8 11111 8888888 777 9 9 444444444444444444444 66 5 0 0 0 0 99 99999999999999999999999 99 11 222222222222222222 33 00 888 4 4 11 888 999 66 11 4 4 0 0 888 99 6666 0 6666 0 888 88 888888888888 99 6666 55555 0 444444 0 0 0 99 0 0000000 0 99 11 555 4 444 4 4 4 99 0 0 44 4 4 11111 11 11 8 4 4 4 0000 0 0 000000 0 5555 444444444444444 0 0 3333333 0 0 555555555555555555555555 0 0 0 0 0 0 0 55555 000 0 55 0 0 0 55 0 55 99999999999 55 0 0 55 000 666 000 55 0 0 0 0 0 0 0 55 0 0 0 0 0 1 4 4 999 000 4 444 4 77 888 4 4 4 333 11 4444 4 00 11 4 4 9 4 4 4 4 999999 4 4 4 888 77 4 0 99 99 0 0 0 99999999999999999999999999 0 111111 444444444 222222 8 0 8 44 55555 0 99 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 99 6 0 9999 66 0 5555555555555555555555555555555 88 7 3 22 2 2 0 00000 7 777777 7 33333333333333333333333333333 7 7 7 7777 99 00000000000000 0 2 44444444 99 11 4 1 11 4444 888 4 888 4 88 4 22 999999999999999 444444 11 77777 888 2222222222222 11111 2222 0 444 666666666 11 4 4444 4 4444444 4 000000000000000000000 4 66 4 0 0 888 5 6 6 6 9 444 4444 6 6 6 6 2222222222 6 00 6 444 000 00 6 6 555 66 6 6 6 6 6 6 111111111 6 6 0 0 00000 55 0 99 0 0 0 00 00 444 22222222222222222222 2 0 44 99 888 99 0 99 0 0 6666 0 0 888 5 5 0 0 2222 0 99 0 0 999999 0 666 0 0000 7 4 00 7 7 33 0 0 99 555 6 0 222222 99 0 0 0 7
consensus : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-C--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---TG-T------C--TTG---A-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-AATTG-A-T----A----T-C--CCCAAT----A-----C--A-C---A-T----T-T---TC--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA-A-CA-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTA-AA-A-TT-CA-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T---GA-----------AT--TTG--A-T-C-T-CAG-A-T-G--AA-A----A-ATGA---AGTT------TGTA-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TCA---TATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-AAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT--T------GT------CC---------TAAAC-A---TT-GCT-TCGTC--AA---------GGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTAT--T--A----AAT--A-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-TAA-ATCTA-G-T-TAG--T--T-AATGT--AG-G-TCAAA--------ATATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------G-AAG-T---A-AA---TG-T-ACAC--AAGGGA-----GAT----AT-AAT-C-TAGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCG------GAC---C---AT-C--CTTA--C-TAT-----TG-AAC-------GTCAT-AT-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATTTAT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---AT--CA----GG-AAAC----AA-T---GA--GTG--------AA--CAGG--TG----AAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGA-AG--AGGA-AATC--TT-ATA---ATTT-CACA-C-TC-CA-TAC-T--A-CC-CTA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-C-TTCCAC---T--AGTG-AA----GTT--G---A--AGT---CAC-A-TGT---A-G-C-AGTA-A------------------------T-C-CG-AT-C-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGT-A---CT--ATCA-AT--AAAAAAT-TG-TTTGCA---T-GT-CT-AAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-G-T-C-AA-TAGCACCAC------AC-AC-AC-C---AATGAACA-A-AACA-A--T--A-AC-ATG-CA-CG-CG----CG-C----AC------GC-ACAG--ACA-GACACAAC---AGGACACG-A---ACA-GACCAGACAGA-C-----A-CAC--A-CAC--A---ACCGA-GAC-CCACC-G----ACC--AGACAGACCAG--AA------CG--ACACGAC-ACACGAC-AGAC-ACACACACA-------NACCA---G--CACGGACGNCNNACC-GACA-ACCA--CACACAGC--A--CCAGA-CAG----CGCAC-ACACCAC------C-CGA-CC-G-------ACCGA-C-ACACACACA-GA-CA-GAC--AC-A-CANAC------ACA-CGA----C---ACA-GACA--GA-CGAC--A----CA---CAC-ACCAC---A-CACGA-CAG-CA-------GACAC---ACA-G--GCAGA--C-A---GA---CA-------------CA-----CACCAGA-CAGACCACAGAC-A-GACAACA--CA-G----ATAG-ACACA-------GA-CA-G-A-----C----C------A-CA-CACA-CAC-A-AACAC-TAAAAC-TTGAAAT-G-TAA-TA---AG----AAA-T-G-A-GG------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AA-C-ATC--AG-AA-A-TGA-GA-A-TTGG--A------ACA-AACTTTTG-T-GG-----TA--C-AAAAAC--AT-G-C-AAATGATTATTTTCTCG--GCACTTCA--C-CAC---------AACCCCCCAT-GCTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATT-GAGTAC--A-A-ACTTCATA-TTTAAAATAT--AAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTA
Reference ( family-511 ) : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---TG-T------C--TTG---A-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-AATTG-A-T----A----T-C--CCCAAT----A-----C--A-C---A-T----T-T---TC--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA-A-CA-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTA-AA-A-TT-CA-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T---GA-----------AT--TTG--A-T-C-T-CAG-A-T-G--AA-A----A-ATGA---AGTT------TGTA-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TCA---TATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-AAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT--T------GT------CC---------TAAAC-A---TT-GCT-TCGTC--AA---------GGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTAT--T--A----AAT--A-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-TAA-ATCTA-G-T-TAG--T--T-AATGT--AG-G-TCAAA--------ATATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------G-AAG-T---A-AA---TG-T-ACAC--AAGGGA-----GAT----AT-AAT-C-TAGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCG------GAC---C---AT-C--CTTA--C-TAT-----TG-AAC-------GTCAT-AT-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATTTAT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---AT--CA----GG-AAAC----AA-T---GA--GTG--------AA--CAGG--TG----AAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGA-AG--AGGA-AATC--TT-ATA---ATTT-CACA-C-TC-CA-TAC-T--A-CC-CTA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-C-TTCCAC---T--AGTG-AA----GTT--G---A--AGT---CAC-A-TGT---A-G-C-AGTA-A------------------------T-C-CG-AT-C-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGT-A---CT--ATCA-AT--AAAAAAT-TG-TTTGCA---T-GT-CT-AAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-G-T-C-AA-TAGCACCAC------AC-AC-AC-C---AATGAACA-A-AACA-A--T--A-AC-ATG-CA-CG-CG----CG-C----AC------GC-ACAG--ACA-GACACAAC---AGGACACG-A---ACA-GANCAGACAGA-C-----A-CAC--A-CAC--A---ACCGA-GAC-CCACC-G----ACC--AGACAGACCAG--AA------CG--ACACGAC-ACACGAC-AGAC-ACANACACA-------CACCA---G--CACGGANAGCACNCC-GACA-ACCA--CACACAGC--A--CCAGA-CAG----CGCAC-ACACCAC------C-CGA-CC-G-------ANCGA-C-ACACACACA-GA-CA-GAC--AC-A-CGNAC------ACA-CGA----C---ACA-GACA--GA-CAAC--A----CA---CAC-ACCAC---A-CACGA-CAG-CA-------GACAC---ACA-G--GCAGA--C-A---GA---CA-------------CA-----CACCAGA-CAGACCACAGAC-A-NACAACA--CA-G----ATAG-ACACA-------GA-CA-G-A-----C----C------A-CA-CACA-CAC-A-AACAC-TAAAAC-TTGAAAT-G-TAA-TA---AG----AAA-T-G-A-GG------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AA-C-ATC--AG-AA-A-TGA-GA-A-TTGG--A------ACA-AACTTTTG-T-GG-----TA--C-AAAAAC--AT-G-C-AAATGATTATTTTCTCG--GCACTTCA--C-CAC---------AACCCCCCGT-GCTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATT-GAGTAC--A-A-ACTTCATA-TTTAAAATATAAAAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTA
gi|1 : TTA-ACAGAA-T-TC-C----AA-C--T-T-C--T-CG---GAAT--G-CT--ATGAA---A-G-CTTCAGCG--TT-CATCAC----TTCAAAA-A---TA-G--AAGATCTTC--CG-CG-AAT--AA-AAT-A--A-TA--TATC--------A-TA--C---AT--G-G--C--G---A-----GT--T-ATTCG-A-----AA----A----TTA---TG-T------C--TTGTTGA-A-A-T---GA--G-C--GAA-A-C-C---AA-A-A-TTG-A-T----AA---T-C--CCCAATT---A-----C--A-C---A-T----T-TC--TC--CA--GGC--A-GATCA-C-AAA-C-CA---GAGT-T-AATTCCCCT--TG-GATA-AA-A-TG-CAAGAAAAGA-----GAAT-----AAACAGA-TC---ACAGAAATT--TGA---TG-G--A---AA-AC-A-C--T-T---GA-----------ATGATTG--A-T-C-T-CAG-A-T-G--AA-A----ACATGA---AGTT------GCTA-TTT-CAA----CAAATCATG-G--TTATGA--AAT-G----AA-G-AAGCGAA-T--TT-TT----ATA---AAAA-AAAGAA-G-CCTGA-AA--TGCGCA-A-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TCG---C-TGCAA--T-CC-TTG--AGAGAG---TCTC--ACT---T----CT--C-----T-G--T-T---A-TT------------ACA-ACT-T-CT-TAAAT-TT----A-T---T--TCA--C-CAAT-GA--ATTT--T------GTC-----CC---------TAAAC-ATCTTT-GCT-TATTC--AA---------GGAT--ATTC--GT--CT-T-----ATAAT--T--AT---AAT--A-----AACA---------TTTG--ACG--TAC-GA-TG----CATG-TAACATCTA-G-T-TAAGCT--T-AATGCTAAG-G-TCAAA--------ATATA-------A-C-ACCATA---AA---GTAAGA-----GA------G-AAGTT---A-AAAATTGTT-AC-C--A--GGA-----G------AT-AAT-C-TAGTCCCC---CCA-AA---G--------AAAGGAG-AGCCCAGCAG-A-GGTC-A-C--TGCA------GA----C---AT-C--CTTA--C---T-----TG--AC-------CTCAT-A--A---AAGAA-AT----GC---TTCTCCATCTAT--GACA--CGCAACT-GA-TA---AT--CA----GG-AAAC----AA-T---GAAGGTG--------AAG-CAAG--TGTTGAAAT-TCAAGGTGAC------AGTTAA-AAG-T--AAGG-GGGAAG---AG--CAGG-AATCCTTT-ATA---ATTTACACA-T-TCACATTAC-T--A-CC-CT--TGGA-ATG-----AAAA--AG-G--AACTAA--CTG-TGC---TTCGC-TTCCAC---T--AGTG-AA----GTT--A---G--AAT---CAC-A-TGT---ATGCC-AGT--A------------------------T-C-CG-AT-C-ATCA-C-----GGCC---A-T----CC-ACGTCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AC-----A-GC--TTTCAA-TTG-CGGACCG---AAA-G-GA---AACCC-TTGC-TGCC-C-CCC-AT-GCTTCT-TGT-GC-C-TAGCATGTTCACATCATGTA-TGTTTGT-AAC-CT--ATCAGATA-AAAAAAT-TG-TTTGCA---T--T-CT-AAAA-A-G--T----TG-T--TAT--T-TC-TGT-G-T-C-AA-TAGCACCACCA----AC-AC-ACTC---AAT-AAC--A-AACA-AT-T--ATAC-ATG-CA-C--CACTGTCG-C----AC------GC-ACAG--ACACGACA-AAC---A--ACACA-G---ACA-GAACAGA-AGACC-----A-CACA-A-CAC--A---GACG--GAT-CCACC-ACCACACC--AGACACA-CAC--AA------CG--ACTCAAC-A
gi|1 : ccttcatataatattaccaaaataaacaaatatgaaaaaagttttatgattacattcctaatattatttatcgttaactcctcgagtaattactttccgtattgcaaagggagggctaacacattgagaccACA--CA-G----CTAA-ACACA-------GA-CACA-A-----C----CCAATGTA-CA-CACA-C-C-A-AACAC-TAA--C-TTGAAAT-G-TAA-TA---AG----AAA-T-G-AAGG------A---CT-TGT--CCCAA---TG--C--AA-AACATG-AA-C-ATC--AG-AA-AATGA-GA-A-GTGG--A------ACA-AATCTTTG-T-GG-----TA--C-AAAA-C--AT-G-C-AAATGAT-ATTTCCTCG---CACT-CA--CACA----------AATCACCCAT-CCTG--TGAAAAC---TT--CCGGA--CA-TAGA--TACTT-AC-T---GACTAAATAAC-C-TTG--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAAAA---AAAATATT-GAGTACA-A-A-ACTTCATA-TTTAAAATAT-AGAACATCCTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--AATAGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagatagacacagctaaacacagacacaacccaatgtacacacaccaaacactaacttgaaatgtaataagaaatgaaggacttgtcccaatgcaaaacatgaacatcagaaaatgagaagtggaacaaatctttgtggtacaaaacatgcaaatgatatttcctcgcactcacacaaatcacccatcctgtgaaaacttccggacatagatacttactgactaaataaccttgaaaatttcaatacgataaaaaaaaaatattgagtacaaaacttcatatttaaaatatagaacatccttcttatacactaaaaatccaaaatttctgacctgaatagaatttcaaagttcaggccgacatgtgctta
gi|10 : ccttcatataatattaccaaaataaacaaatatgaaaaaagttttatgattacattcctaatattatttatcgttaactcctcgagtaattactttccgtattgcaaagggagggctaacacattgagaccttaacagaattccaacttctcggaatgctatgaaagcttcagcgttcatcacttcaaaaatagaagatcttccgcgaataaaataatatatcatacatggcgagttattcgaaaattatgtcttgttgaaatgagcgaaaccaaaattgataatccccaattacacatttctccaggcagatcacaaaccagagttaattccccttggataaaatgcaagaaaagagaataaacagatcacagaaatttgatggaaaacacttgaatgattgatctcagatgaaaacatgaagttgctatttcaacaaatcatggttatgaaatgaagaagcgaatttttataaaaaaaagaagcctgaaatgcgcaataagggtctaaactcgctgcaatccttgagagagtctcacttctctgttattacaacttcttaaatttatttcaccaatgaattttgtccctaaacatctttgcttattcaaggatattcgtcttataattataataaacatttgacgtacgatgcatgtaacatctagttaagcttaatgctaaggtcaaaatataacaccataaagtaagagagaagttaaaaattgttaccaggagataatctagtccccccaaagaaaggagagcccagcagaggtcactgcagacatccttacttgacctcataaaagaaatgcttctccatctatgacacgcaactgataatcaggaaacaatgaaggtgaagcaagtgttgaaattcaaggtgacagttaaaagtaagggggaagagcaggaatcctttataatttacacattcacattactacccttggaatgaaaaaggaactaactgtgcttcgcttccactagtgaagttagaatcacatgtatgccagtatccgatcatcacggccatccacgtccctccatacagggaatacagctttcaattgcggaccgaaaggaaacccttgctgccccccatgcttcttgtgcctagcatgttcacatcatgtatgtttgtaacctatcagataaaaaaattgtttgcattctaaaaagttgttatttctgtgtcaatagcaccaccaacacactcaataacaaacaattatacatgcaccactgtcgcacgcacagacacgacaaacaacacagacagaacagaagaccacacaacacagacggatccaccaccacaccagacacacacaacgactcaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagatagT-CACG-CCTC-CA-CAC-TC-A-CC-CTC-TAG----G-----ACAA--GCAA----C--AT-CTG-T-C---TTC-C-T-CCAC---T--AGTC-GATAACGTTTAG---A--AGTT--CACCA-TGT---C---C-AGTA-A------------------------T-C-CG-AT---AT-AAC-----GGCC---AAT--C-CC-AC-TCCCTCCATC-AAGGGA-ATTGAA-----G-CCCTTT--AA-TGGGCGG--CG---AAG-G------A--CC-TTGC--G-C-C-----AC-ACTTTTG--------------------CAT-ATTT---GTTTGT-A---CT--ATCA-AT--AAAA--T-TG-TT-GCA---T-GT-CT-AAAA-A-AGTT----TG-T--TAT--T-TC-TGT-G-T-C-AA-TAGCA-CAC------ACAACAAC-C---AATGAAC--A-AACA-A--T--A-AC-ATG-CA--G-CA----CGCC----AT------GC-ACAG------GACA---------GACACG-A---ACA-GA-CAGACAGA-C-----A-CAC--A-CAC------ACCGA-CA--CTACC-A----ACC-------GACC-G--AA------CG----ACGAC-ACCCAAC-AGA--AGAGACACA-------GA-CA---GACCACACACGACCGACC-GACA-GACA--CACACA-C--A--CAAGA-CAGCATACACAC-ACACCACAACAGAC-AGA-CCTG-------ACAGA-C-ACACACACA-GA--A-GAC--AC-A----AC-------CG-AGA----C---AC--GACC--GA-C-AC--A----CA---CACGACCAC---C-CACAA-CA--CA-------G--------CA-G----AGAACC-C---GA---CA-------------CA-----CAC---A-CAG--CACAG---------GCA--CA-G----ATAG-ACACA-------GA-CA-G------------C------A-CA-AACA-CAC-ACAACAC-T-AAAC-TTGAATT-G-TAAGTA---AG-----AA-T-G-A-GGA-----A---CT-TGT---C-AA---T---C--AA-AACATG-AAGC-ATC--AG-AA-A-TGA-GA-A-TTGG--A------ACG-AAACTTTG-TGGG-----TA--C--AAAAC--AT-GTC-CAATAA-TATT---TCGC-GCAC-TCA----CAC---------AA-CCCCCAT-CTTGAACGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A--T-CTT-AC-T---GA-TAATAAAC-C-TT-----CATT-TCAAT---C-GAGT-A----AAA-AAG-AAAATATT-GAGTAC----A-ACTTCATATTTTAAGCTAT---AACATCTTCC-TTATCACA-CTAAAAAT--CCATGAAAATTTCTGA-CCT------AGAATTTCAAAG---TC-AGGCCG-AC-ATGTTGCTTA
gi|11 : taC-------GACAT-A--A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCATT-AT--GACA--T-C-ACT-GA-TA---AT--CA----GG-AAAC----AA-T---GA--CTG--------AA--CAGG--TG----AAT-TT-AGGT-AC------AATT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAG-------AGGA-AATC--TG-ATA---ATTT-CACA-C-TC-AA-TAC-T--A-CC-CTA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C----TC-C-TTCCAC---T--AGTG-AA----GTT--G---A--AGT---CAC-A-TGT---A-G-C-AGTA-A------------------------T-T-TG-AT-C-AT-A-C-----GGCC---C-T--C-CC-AC-TCCCTATAT--CAGGGC-AT--AA-----G-CT--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATAATTTA-TGTTTGT-A---CT--ATCA-AT--AAAAAAA-TG--TTGCA---T-GT-CT-AAAA-A-G--T----TG-TC-ATT--T-TC-TGT-G-T-C-AA-TAGCACCAC------AC-AC-AC-C---AATGAAC--A-AACA-A--T--A-AC-ATG-CA-AA-CA----CG-C----NN------NN-NNNN--NNN-NNNNNNNN---NNNNNNNN-N---NNN-NNNNNNNNNNN-N-----N-NAG--AGCAC--A---ACC----AC-ACAC-------AC-----ACACACCCG--CACT----CG--ACGCGAC----CGAC----C-ACACACACA-------AGACA---G--CAC
gi|12 : ttactcctacttttctctgA-G----ACAG-ACACA-------CA-CA--------------C------A-CA--ACA-CAC-G-AACAC-TAAA-C-TTGAAAT-G-TAA-TA---AG----AAAAT-G-A-GG------AAC-TT-TGT--CC-AA---TATGC--AA-AACATG-AAAC-ATC--AG-AA-A-TGA-GA-A-TTGG--A------ACA-AACTTT-G-T-GG-----TA--C-AAAAAC--AT-G-C-AAATGAT-ATTT-CTCT--G-ACT-CA--C--AC---------AACCCCCAAT-GCTG--TGAAA-C---TT--CCG-A--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACTAA-TAAC-C-TTA--AATTTT-TCAAT--ACGGA-T-------AA-A---AAAATATT-GAGTAC--A-ATACTTCATATTTTAAAATAT--AAACATCCTTCTTTAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAA-TTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTacaaca
gi|13 : caA-AACA--AA-CAAT--A-----A---CAT-GCAGC---A-CA--A-CAA-CA-------GAC------CA-G--A-AGA--C-A---GA---CA-------------CA-----CATCAGA-CCGAC-ACCAAC-A-GACGACA--CA-TCACCACAG-AAGCA-------GA-CA-G-ATATGAC----C------A-CA-GCCA-CAC-A-A-CAC-TAAA-C-TTGAAA--G-TAA-TA---AGC---AAA-TAG-C-GA------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-A-CATG-AA-T-AT---AG-AA-A-TGA-GA-A-TTGG--A------ACA-AAC-TTTG-T-GG-----TA--C-AAAAACAGAT-G-C-AAATGA-TATTTTC-----GCAC-TCA--C---C---------AATCCCCCAT-TCT---TGAAAAC---TT--CCG-A---A-TA-A--ATCTT-ACTT---GACT-GATGAC-C-TT----AAATT-TCAATAAAC-GA-T-------AA-A---CAAATATT-GAGTAC--AGA-ACTTCATA-TTTAA
gi|14 : ccaC-A-AACAC-TAAA---CTGAAAT-G-TAA-TA---AGCCA-AGA-T-GGA-GGCGCAA-A---CC-T----TC-AC---T---CCTGA-AATA--------ATCC-AG-GA-A-TAATGAGA-TTGG--AGGAACTACA-AACTTCTG-T-AGAATCATC--C-ATAAAC--GTCGTC-CAATGAT-ATTTCTTCATCGCACT-CA--C-AGCTAGGACAAAAATCTAGCG--ACTG--TGAGAACATTTT--CGG-A--CT-TA-AATTATTTGAT-TTCAGGCTAA-TAACGCATTATTAAAATT-TCAAT--AC-G--T-ATTTTGAA-ATGTAAAATATT-AGGTGC--A-
gi|15 : cTTA-A-AGTA-T-GT-C----AA-A-AT-C-T--T-TA---AA----G-CT--ATG----------------------C--TGT----TT-AAAA-A---CG-G--AAGAT-TTT--CC--G-AAT--AA-AAT-G--A-GG--TATC--------A-TA--C---AT--A-G--TTAT---A-----AT--T-ATT---G-----AT----A----ATA---TG-T------C--TTG---A-G-A-T---GA--G-T--G-A-A-C-C----A-G-AATTG-tgcaaacaaacattaagatatatattctataagagtaataacacgaaatctttcatatagatagcaat
gi|16 : cagtttcgaatctcataaaaagcactttatctaagcaaagtggcaaccttcatgtattaatacaaaataatcatattgaaatattcaattttttttaaattaaatacatgtatactttttaactttacttccatattagcagatggccaagtatatcggagaccTTA-A-AGGA-C-TT-TGCCAAA-A-AT-T-CA-T-CA----A-C--A-CT--ATAAA-GTA----------------C--TATGCGGTTGAAAA-T---TA-A--AAGAC-TTG--CC-GGTCAT--AA-AAG-G--A-TG--TATC--------A-CA--C---AG--G-G-----G---G-----TT--T-ATC---G-----AA----AAC--CTA---TG-T------C--T-------A-A-T---AA--G------G-A-T-T---AG-G-AAT-G--------------------CAATCTTAA-----C--T-C---A-T----T-TGTTTT--CA--G-C--ATG-TCA-C-AAA---CA-A-GAGT-TAA-TTCCCCTCCTT-GGT---A-A-TT-T--GGAAATG-----GAAT-----AAA--AAGTC-C--CAAAA--A--TGGA-c
gi|17 : AAAA-A---TCTG--AAGAC-TTC--GC--G-AAT--AA-AAT----------TATC--------A-CA--CC--AT--G-G---------G-----GT--T-GTC---G-----AA----AA---CTA---TG-C------C--T-G---A-A-A-T---AA--A-C--GGA---T-T---AG-A-AAT---G-C----A----T-C-------T----A-----A--A-CGTGA-T----TGT---TT--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA---CA-A-GAGT-T-A-T-CCCCT--TG-G-TA-A----TT-TT-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AG-TC-CAACTGAA--T--Ttatttatagcctattattctgatcagatcatatagaaa
gi|18 : aaaaaactgcaaaaattcttaaaacaataaattactctatgcggttga-C----AA-A-AT-T-C--T-TA---AA-C--A-CT--ATTAA-ATA-C-C-----TA--TG-C---AG----TTGAAAA-A---TT-G--AAGAC-TTG--C---G-AAT--AA-AAG-G--A-TG--TATC--------A-CA--C---AT--G-G--A--G---G-----TT--T-ATC---G-----AA----A----ACA---TG-T------C--CTG---A-A-A-T---AA--A-G--GA----T-T---AG-A-AATGC-A------A----T-C--TT-AAC----G-----T----C---A-T----T-TGTTTT--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA---CA-A-GAGT-T-A-TCCCCCA--TT-GGT---A-A-TT-TT-GAAAATG-----GAAT-----AAA--AT-TC-C-A------------AA-ATG-G--AGTTAA-AG-T-C--TAT---TA-----------TT--TTG--A-T---T-CAG-A-atagcctaattattctgatcaagaaatcaagttatagaaa
gi|19 : gAC-TTGAAAT-G-TAA-TA---AGGA--AAA-T-G-A-GG------AA--CT-TGT--CC-AA---T---C--AA-AGCATT-AA-T-ATC--AG-GA-A-TGA-GA-A-TTAG--A------ACA-AACTatcaattataga
gi|2 : AAAA-G---TA-ATTATGAT-TTC--ACGCG-AAT--AATAAT-G--A--A--TAACGGT-----A-TA--C---ATC-G-G--C--G---AAGTT-GT--T-ATT---GTGAGTAATAC-A----TTAAAATGCT------C--TTA---A-A-AAT---GA--AAC--GGATA-C-C---AA-A-A-TTG-A-T----GAT--T-CGACCCAAT----A-----C--A-C---A-T----T-T---TC--CACAG-C--A-G-TCAAC-ACA-A-CGCA-GAGT-T-A-TTCCCCT--TT-GGTA-AATA-TC-CA-GAAAATC-----GAAT-----AAA--AA-TC-C--CAGAA--T--T--A-ATG-G------AA-AC-A-C----T---GA-----------CT--TTG--A-T-TAC-CAG-A-T-GAAAA-A----A-ATGA---AG-T------TGTA-TT--CAAATATGAAA-C-T--G--GTATGC--AAT-AGACCAA-G-AGG--AT-C--TTATT----ATATCTAATA-AAAGAA-A-CTTGA-A----GGCCA-GTT----AACGC-GGT-C-AGAACTTCA---TAAGCAA--TCCC-TTGCAAGAT-G---TCTTTAGCTGGATCGTGTTCGC-----T-G--TGTAAAA-AT------------AC--ATT-T-CTAAAAAT-TTAGA-A-T---TCCTCA--C-CAAG-GAC-A-TT--TATTATAGC------CC---------TAAAA-A---CT-ATTAGCACT--AAAACGTTTTTGCATGAA-TC--GA--TTCTACA--TATATAGT--ACTAGAAT--ATAA--A--A---------TTTGGTACG--T-C----TGTCATC-CG-TAA-CTCTA-GAT-TAG--CTAT-AATGT--AG-G---GAA--------ACATACTCAACCA-C-ACC--ATCCAA---GGT--A-----GATGTTATG-AAG-TTA-A-AA---TG-T-AC-C--AAGGT------GAT----ATAAAT-C-TTATCACCTAACCACAA---AG-------AAAGGAGAAGCCA-GCAG-A-GGTCTA-C--CTCGTCAAACGAT---C---AT-T--CTTATTC-CATCC---TGCCAC-------GTCATAAT-A---AGGAAGAT-G--GC----TCTCCATATATACGACAATC-C-ACTAGC-TATCCATCCCA----GGAAAACCCAAAA-TTTGGA--GTGAAAGAAAAAA--CAGG--TG----AAT-TC-AGGT-ACAATGCTAGTT-A-AAGATGGAGAG-GGGGAGGA-AAGCAGGACAATC--TTCATACCCATCC-C-CC-C-CC-CA-TAC-ccgaaaatcagaaataatcacagcacctggaaagtgtaatttatcataatttaagcttacaaatatctataatctgcaatttcgatatccttcatgaccgttacaggcgttgcgtcccacacatgttgtcagggaactattgacactggccggttccatagataaatggt
gi|2 : acgaattctaaatgacaaaaa-TGGA-A-G-----GAAATAGGAAGGAACTAACACTAAT-C---CTC-C-TCCCACCTAT--GATG-AAC---GTT--GTGGA--AATATGCAC-AATGTC--A-G-C-AGTG-AATGTCTGTTTGACCAAATTACTATT-C-CG-AT-CCAT-A-CTAGATGACCC--A-TTTC-CC-ACCTCCCTTCCTATCAGAAA-AA--AACAGCTG-GT--TA--AA-TCG-CCG--CGCCCAAACGCGACACG--CC-TTGCCTG-T-CGCCC-AT-GCTTCTGTGCGGC-CAT-AC-TGTCC-AGTCATTTA-TGTTTGT-ACCTCT---TCA-AT--AAAAAAA-TGTTTTGCGAATT-GTGCT-AAAAGA-G--TCTCGTG-C--ATTTAT-TC-TGTCG-T-C-AATTAGCACCATATAACAAC-AC-AG-C---AATG-ACAGA-GACATATCT--A-ACGAGG-CA-CG-GG----CA-G----ACCCTCTTTC-ACAA--AAA-GAGGCGGCTCAAGTACACG-ATTCA-A-GAACAGAC----C-----A-C-T--A-CAA--G---ACCAA-G-------------------GGACAGATCAC--AG------CATCACACATC-ACAGGAT-AGA--ACAGACACAATTGGTGAAACA---G--CAAGAAAAATACCTCGGATA-A--A--TACACAAC--ATCCTAGATCAG-------ACTAGAGCA----------GATCC-G-------AACAA-C-ACA-ACACA-GACCA-GA---AC-ATCGTACCCGATGACA-CGAGGGCC---ACA-GACA--GA-C-AC--A----CAGTTCA----CAT---A-CACGA-CA--CA-------CACCT---ACA-GACGCAAG--C-ACAGGA---CA-------------TA-----AATC--A-TAGACAAAAGAC-A-GACACCAAGTATG----ATAA-TCACATGAGGTTGA-AA-A-AAATATT----CTAAA--A-GA-C-CA-CAC-A-ACCAC----AAC-TTGTAATCG-TGA-GA---AGAGGAAAA-T-A-A-AGAGCGAAA---CTCTGTACTC-AA---T---CCAAA-AGCATG-AA-TAATC--AG-AA-A-TGA--A-A-TTGGATA------ACA-AACTTTTGAT-GA-----TA--C-AAAaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagtggaaggaaataggaaggaactaacactaatcctcctcccacctatgatgaacgttgtggaaatatgcacaatgtcagcagtgaatgtctgtttgaccaaattactattccgatccatactagatgacccatttcccacctcccttcctatcagaaaaaaacagctggttaaatcgccgcgcccaaacgcgacacgccttgcctgtcgcccatgcttctgtgcggccatactgtccagtcatttatgtttgtacctcttcaataaaaaaatgttttgcgaattgtgctaaaagagtctcgtgcatttattctgtcgtcaattagcaccatataacaacacagcaatgacagagacatatctaacgaggcacgggcagaccctctttcacaaaaagaggcggctcaagtacacgattcaagaacagaccactacaagaccaagggacagatcacagcatcacacatcacaggatagaacagacacaattggtgaaacagcaagaaaaatacctcggataaatacacaacatcctagatcagactagagcagatccgaacaacacaacacagaccagaacatcgtacccgatgacacgagggccacagacagacacacagttcacatacacgacacacacctacagacgcaagcacaggacataaatcatagacaaaagacagacaccaagtatgataatcacatgaggttgaaaaaaatattctaaaagaccacacaaccacaacttgtaatcgtgagaagaggaaaataaagagcgaaactctgtactcaatccaaaagcatgaataatcagaaatgaaattggataacaaacttttgatgatacaaacaatcagaaataatctact
gi|22 : acgaattctaaatgacaaaaaaaaagtaattatgatttcacgcgaataataatgaataacggtatacatcggcgaagttgttattgtgagtaatacattaaaatgctcttaaaaatgaaacggataccaaaattgatgattcgacccaatacacattttccacagcagtcaacacaacgcagagttattcccctttggtaaatatccagaaaatcgaataaaaatcccagaattaatggaaacactgactttgattaccagatgaaaaaaatgaagttgtattcaaatatgaaactggtatgcaatagaccaagaggatcttattatatctaataaaagaaacttgaaggccagttaacgcggtcagaacttcataagcaatcccttgcaagatgtctttagctggatcgtgttcgctgtgtaaaaatacatttctaaaaatttagaattcctcaccaaggacatttattatagccctaaaaactattagcactaaaacgtttttgcatgaatcgattctacatatatagtactagaatataaaatttggtacgtctgtcatccgtaactctagattagctataatgtagggaaacatactcaaccacaccatccaaggtagatgttatgaagttaaaatgtaccaaggtgatataaatcttatcacctaaccacaaagaaaggagaagccagcagaggtctacctcgtcaaacgatcattcttattccatcctgccacgtcataataaggaagatggctctccatatatacgacaatccactagctatccatcccaggaaaacccaaaatttggagtgaaagaaaaaacaggtgaattcaggtacaatgctagttaaagatggagagggggaggaaagcaggacaatcttcatacccatcccccccccatacaaaacaaatacaagcggcccaaactaaccccgaatctatagTA---TG-T------C--TTG---A-A-A-T---GA--G-C--AGA-A-C-C----A-A-AATTG-A-T----A----T-C--CCCAAT----A-----CAAA-C---A-T----T-T---TC--CA--G-C--A-G-TCA-C--AA-A-CC-A-GAGTAT-A-TT-CCCT--TG-GTTA-AA-A--T-CA-GAAAAAGAAAATGAATTAACCAAT--AA-TC-A-GCAGAA--T--TGAT-GTG-T--A---AA-caatcagaaataatctact
gi|23 : TC-C-TTCCAC---CC-AATG-A-------T-----------C---CAG-A-TGT---A-G------A-AC-----------------------T-C-CA-AT-C-AT-A-C-----TGCC---C-T--C-AC-AC-TAC-TCCAT--CTGGGA-AT--AA-----ATAC--TTT-AA-TGG-CCG--GG---AAA-G-AA---A--CA-ATGC-TG-C-A-CCA-AT-GCTTCTGCG--GT-A-T-GC-TGTTC-Cct
gi|24 : aaccaagta----T-T---TT--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAA---CA-A-AAGT-T-A-TCTCCCT--T--GGT---A-A-TT-TT-GAAAAT------GAAT-----AAA--AG-CC-C-A---AA--A--TGGA-AT--T--A---AA-TC-A-T--A-T---TA-----------TT--TTG--A-T---T-CAG-A-t
gi|25 : tg-GAGT-T-A-TCCCCCT--TG-GC----A-A-TT-TT-GAAAATG-----AAAT-----AAG--AG-TC-C--CAAAA-----TGAA-atcaattttag
gi|26 : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TA-----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TT---CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TT--TATgcttagacctaccgggtagctattgttttgattcagaatcaaaatta
gi|27 : TTA-A-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TT-C--TAT----TC---AA-A---TA-G--AAGAT-TT---CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TT--TATC--------
gi|3 : TTA-A-AGAAAT-TT-C----AA-C-AT-T-C--TGCG---GA-T--G-CT--ATGAAAGTA-G-CG----CGGCTT-CGGTAT----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTC--CC-CG-AAT--AT-AAT-G--A-TAAGTATC--------A-TA--C----T--G-G--T--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----A----TTA---TG-TT-----C--TTG---A-A-A-T---GA--G-C--GAA-AGC-C---AA-A-AATTG-A-T----A----T-C--CCCAATT---A-----C--A-C---A-T----T-T---TC--CA--G-C--AAG-TCA-C-AAA-AACC-A-GAGT-T-A-TTCCCCT--TG-GGTATAA-A-TC-CA-GAAAAAG-----GAAT-----AAA--CA-TC-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-T---GA-----------AT--TTGTTA-T-T-T-CAG-A-T-G--AA-A----A-A-GA---AGTT------TGTT-TT--CAA----GAAATC-TG-G--GTATGA--AATAG----AA-GGAGG--AAAT--TT-TT----ATA---AAAATAAAAGA-A-C-TGA-AA--TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TCG---TATGCAA--T-CC-TTG--AGAG-G---TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--T-T---AATT------------ACA-A-T-T-CT-AAAAT-TT----C-T---T--TCA--C-CAAG-GG--A-TT--T------G--------C---------TAAAC-A---TT-GCT-TTG-C--AT---------AGAT--A-TC--GT--CTCT-----TTTAT--T--A----AAT--A-----A------------TTTG--ACG--T-C----TG----C-TG-TAA-ATCTAAG-T-TAG--T--TTAATGT--AG-G-TCAAA--------ATATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--A-----GA------G-AAG-T---A-AA---TG-T-ACACG-AAGGGA-----GAT----AT-AATGC-TAGTCCCC---CCA-AA---GA-------AAAGGAGAAGCCAGGCAG-A-GGTC-A-C--TGCACA----GAC-------AT-C--CTTA--C-TAT-----TG-AAC-------GTCA--AT-A---AAGAA-AT-G--GC---TTCTCCAATTATT-GACA--T-C-ACTCGACTA---AT--CA----GG-AA-C----AA-T---GA--GTG--------AAG-CAAGAGTG----AAT-T--AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGGGAGGATAG--AGGA-AATC--CT-GTATAAATTT-CACAAT-TC-CA-TAC-T--A-CC-CTAATGGA-A-G-----AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C---CTC-C-TTCCAC---TCTAGTG-AA----GTT--G---A--AGT---CACCA-TGTTATG-G-C-AGTA-A------------------------T-C-CG-AT-C-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCATA-CAGGGA-AT--AA-----G-GC--TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CC-TT-C-TG-C-C-CCCAAT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TG-TTGT-A----TAAATCA-AT--AAAAAAT-TG--TTGCA---T-GT-CT-AAAA-A-G--T----TG-T--ATT--T-TC-TGT-G-TCC-AA-TAGCACCAC------AC-AC-AC-C---AATGAACA-A-AACA-A--T--A-ACAATGCCA-CGACG----TG-CTAATAC------GA-ACAGTAGCA-GGTACAAC---AGGACACACA---GCA-GACCAGACAG--C-----A-CAG--A-CAC--A---ACCGATGACTCCACTAG----ATC--AGACAGACCAG--AG------CG--ACACAAC-ACACAAC-AGAC--CACA-ACA-------CACCACAGG--TACCGATTTCCACCC-GACA-ACCA--CACACAGC--A--TCAGC-CCA----TGCAC-ACACCAC------CACGA-CC-GATCCATTACCGA-C-ACACACACCTGA-C--GAC--AC-A-CACAC------ACA-CAA----C---ACA-GACAGCGA-CAAC--G----CA---CAC-ACCAC---AGTATAA-CAG-CA-------GACACA--ACA-A--GCAGA--CTAT--GA---CA-------------CAAGATTCA-CAGAGCAGACCACAGACTACGACAACA--TA-G----ATAGAACACT-------GA-CATGCA-----C----C------AGCAGCACATCAC-A-AACACATAAAAC-TTGAAAT-G-TAATTA---AG----AAA-T-G-A-GG------ATG-CA-TGT--CC-AAAGTT---C--AA-AACATGAAA-C-ATC--AG-AATA-TGA-GA-A-TTGG---------ACATAACTGTTG-T-GG-----TACTC-GAAAACA-AT-G-C-AAATGATTATTGTCTCG--GCACTTCACGC-CAC---------AACCCCCAGT-GCTG--TGAAAAC---TTTCCCG-ACTCATTACA--TACCT-TC-T---GACTAAATAAC-C-TTA--AAAATT-TCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATT-GAGTAC--A-A-ACTTCATA-TTT-AAATATAAGACCAT-CTTC-TTAT-ACA-CTAAAAAT--CCCAGAGAA--TCTGAGTCT---A--AGAATTTCAAAG--TTCAAGGCCG-ACTATG-TGCTTA
gi|31 : T-ACA-CTAAAAAT--AC---AAAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAAAG--TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTT
gi|32 : -ACA-CTAAAAATTTCC---AAAAATTCT-A-CCTG--A--AGAATTTC-AAG--TTC-AGGCCGAAC-AT
gi|4 : TTA-A-AGAA-TCTT-C----AA-C-ATAT-C--T-CG---GA-T--G-C---ATGAA-GTA-G-C-----CT--TT-C---AT----TTCAAAA-AC--TA-G--AAGAG-TTT--CC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-TAATC---AT--G-G--C--GTACG-----GG--T-ATTTTGA-----AA----A----TTAT--TG-T------CT-TTA---A-A-A-TC--GA--G-C--GAA-----C---AACA-AATTGAA-T----A----T----TCCAAT-------------A-C---A-T----TAT---TC--CA--G-C--C-G-TCA-C-AAA-G-CA-A-GAG--T-A--TCACCT--TG-TTTA-AA-A-TC----GAAAATG-----AA-------AAA--AA-TCAC-AAGAAA--T--TG-A-ATG-G--A---AA-AC-A-C--T-TGGGGA-----------AT--TTG--ACT-C-TCCAG-A-T-GAAAA-A----A-ATGC---AATT------T-TG-TT--CAA----G-AATC-TG-GTAGT-TGA--AAT-G----AA-G-AGG--ACTT--TT-TT----ATA---AAAA-A---GA-A-CCTGACAA--TGGTCC-A-T----AA-G--GGTGC-TAAAC-TC----TATGCGA--T-CC--TG--AGAG------CT---ACT--AT----TT--------T-G--T-T---A-TT------------AC--ACT-T-C--AAAAA-TT----A-T---T--CGA--C-CAAG-GA--A-TT--T------GT------CC----------AA--------T-GCT-TCG-C--AG---------GAAT--A-T---GT--CTAC-----TTTAT--T--A----AATACA-----A--A---------TTTG--ACGA-T-CAG--TG----C-TG-T---ATCTA-G-T-TAG-----T-AAC-T--AG-GTTCAAAACTTAAATATATA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--ATAAGCGA------G-AAG-TTA-A-AA---TG-T---AC--AAGGGA-----GATA---AT-TAT-CTTAGTCCCC---C----A---TA-------AAAG--GAAGCCAGCAAG-A-GGTCAA-C--TGC-------CACGA-C---A--C--CTTA--C--AT-----CG--AC-------GTCAT-AT-A---AAGGA-AT-G--GC---TTCTCCA--TAA--GACA--T-C-ACT-GA-TA---AT--CAGAGGGG-TAAC----AT-T---GAT-GTG--------AG--CAGG--TG----AA---C-A-GT-AC------AGTT-A-AAG-T--AA---GGGGAGGA-----AGGA-AATC--TT--TA---A-TT-CACA-C-TC-CA-TACAT--ACCC-CTA-TGGA-A-GGAAGAAAAA--GGAA--ACCTAAC-CTG-T-CGTTCTC-CTTTCCAC---T--AGTG-------GTT--G---ATTCGTA--CAC-A-TG------G-CAAGTA-A------------------------C-C----ATCC-AT-A-CTG---GGCC---A-T--C-CC-AC-TCCCTCCA-A-CAGG---AT---A-----G-AT--TT--AA-T---CGG--CG---GAA---AA---A--C-----C-TG-CGC-CCC-A--GCTC---TG--GC-C-T-GC-T-TTC-CATCATTTACTGTTTGTAA---CT--ATCA-AT--AAAAAATATG--TTGCA---T-GT-CTAAAAA-A-G--T----TG-TC-ATT--T-TC-TGT-GAT-C-AA-TAGCACAAC------AC-AC-AC-C----ATGAACA-ACACCA-A--T--ATAC-ATG-CA-T--------TG-C----A-------GCAACCA--AC--GACGCA-------GACACA-------A-GA-CAGACAGA-C-----A-CACCAA-CACCGA---GCCG--GAC-TC-CT-------CC--CGACGNNNNNN--NN------NN--NNNNNNN-NNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNN-------NNNNN---N--NNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNN--NNNNNNNN--N--NNNNN-NNN----NNNNN-TCCCGAC------C-CGA-CC-G-------ACCGACC-ACACACACC-GC-CC-GAC--CCGA-CCGAC------ACA-C-A----C---ACA-GACA--GACCGAC--ATCTCCC---CCC-CCCCC---A-CACCA-CA--CA-------GACAG---ACA-G--ACAGA--C-A---GA---TA-------------GA-----CA-CAGA-CAGACCACACAC-A-CACAAAA--C
gi|4 : acataaatattaccaaataaaattattgaaaaatatgttgattcatttaagataactctcttaaataatttatatggttaaacctgggtaactacctttccgtatggcccaaggagggaagagttggacc-CGA----CCCGACC-GACC--GA-C--C--A----CA---CAC-ACCGCCCGA-CCCGA-CCGACA-------CACAC---ACA-G--ACAGA--C-C---GA---CATCTCCCCCCCCCCCA-----CACCACA-CAG---ACAGAC-A-GACAG-A--CA-G----ATAG-ACACA-------GA-CA-G-A-----C----C------A-CA-CACA-CAC-A-AA-AC-TTAAACTTTGAAAT-GTTAATTA---AT----AAA-A-G-A-GG------A---AA-TGT--CC-AA---T---C--AA-AACATG-AT-C-ATCAGAG-AA-A-TGA-GA-ATTTGG--A------A-A-AACTTCTG-T-GG-----TA--CAAAAAAC--A--G-C-AAATGA-TA-TTTCTC---GCAC-TCA----CAC---------AACCCCCCAT-GCTG--TGAAAAC---TT--CCGAA--CA-TA-A--TACTT-AC-T---GACT-AATAAC-C-TT----AAATTATCAAT--AC-GA-T-A----AAA-A---AAAATATTGGAGTACAAA-A-ACTTCATA-TTTAAAGTAT--AAACAT-CTTC--TAT-ACA-CTAAAAAT--CC---AGAATTTCTGA-CCTG--A--AGAATTTCAA----TTC-AGGCCG-AC-ATG-TGCTTttaaactttgaaatgttaattaataaaagaggaaatgtccaatcaaaacatgatcatcagagaaatgagaatttggaaaaacttctgtggtacaaaaaacagcaaatgatatttctcgcactcacacaaccccccatgctgtgaaaacttccgaacataatacttactgactaataaccttaaattatcaatacgataaaaaaaaatattggagtacaaaaacttcatatttaaagtataaacatcttctatacactaaaaatccagaatttctgacctgaagaatttcaattcaggccgacatgtgctt
gi|5 : acataaatattaccaaataaaattattgaaaaatatgttgattcatttaagataactctcttaaataatttatatggttaaacctgggtaactacctttccgtatggcccaaggagggaagagttggaccttaaagaatcttcaacatatctcggatgcatgaagtagcctttcatttcaaaaactagaagagtttcccgaataaaatgatatatcataatcatggcgtacgggtattttgaaaattattgtctttaaaatcgagcgaacaacaaattgaatattccaatacattattccagccgtcacaaagcaagagtatcaccttgtttaaaatcgaaaatgaaaaaaatcacaagaaattgaatggaaaacacttggggaatttgactctccagatgaaaaaaatgcaattttgttcaagaatctggtagttgaaatgaagaggacttttttataaaaaagaacctgacaatggtccataagggtgctaaactctatgcgatcctgagagctactattttgttattacacttcaaaaattattcgaccaaggaatttgtccaatgcttcgcaggaatatgtctactttattaaatacaaatttgacgatcagtgctgtatctagttagtaactaggttcaaaacttaaatatataacaccaaagtaataagcgagaagttaaaatgtacaagggagataattatcttagtcccccataaaaggaagccagcaagaggtcaactgccacgacaccttacatcgacgtcatataaaggaatggcttctccataagacatcactgataatcagaggggtaacattgatgtgagcaggtgaacagtacagttaaagtaaggggaggaaggaaatctttaattcacactccatacatacccctatggaaggaagaaaaaggaaacctaacctgtcgttctcctttccactagtggttgattcgtacacatggcaagtaaccatccatactgggccatcccactccctccaacaggatagatttaatcggcggaaaaacctgcgccccagctctggcctgctttccatcatttactgtttgtaactatcaataaaaaatatgttgcatgtctaaaaaagttgtcattttctgtgatcaatagcacaacacacaccatgaacaacaccaatatacatgcattgcagcaaccaacgacgcagacacaagacagacagacacaccaacaccgagccggactcctcccgacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccTTA-A-AGAA-T----C----AA-C-AT-TAC--T-CC---GA-TC-G-AC--ATAAC-GTA-G-CG----CG--TT-C--TAT----TGCAAAA-AAAATA-G--AAGAT-TTC------G-AAT--AA-AAT-G--A-TA--TATC--------A-GA--C---AT--G-G-----G---A-----GTATT-ATT---G-----AC----A----ATA---TGAT------C--TCG---A-A-A-----GA--G-C--GAA-T-CGC---TA-A-AATTG-A-T----A----T-C--CCCAAT----A-----C--A-C---AGT----T-T---TT--CA--G-C--A-G-TT--C-AAA-AGCA-G-GAGTGT-A-GTCCCCT--TGTAGTA-AA-AAGT-CA-GAAA-TG-----AAAT-----AAA--CG-AC-T-ACAGAT--T--TGAA--TGTG--A---AA-TA-A-C--TCT---GA-----------AT--TTG--A-T-T-T-CC--A-T-G--AA-A----A-ATGA---AGTT------GTTA-TT--CAA----GAT-TC-TG-G---TATGA------G----AA-G-AGG--AA-T--TT-T-----ATA---AAAA-AA--GA-A-C-TGA-A---TGGCCA-G-T----AA-G--GGT-C-TAAAC-TCA----ATGCAA--T-CCATTGC-AGAG-T---TAT----CT--AT----TT--CCTGCAT-G--T-T---A-TT------------CTA-ATT-C-CT-AAAAT-TTTA--A-T---T--TCA--CATAAGCGA--A-TT--T------GT------C----------TAAA------TT-GCT-TTGTC--AA---------GGAT-----C--GT--CTCT-----CTT-T--T--A----AAT--A-----A--A---------TTTG--ACG--T-C----TG----C-TG-TTA-ATCTA-G-T-TAG--T--T-AATGTT-AGTG-TCAAA-----------TA-------A-C-ACC--A---AA---GTA--AA----GA------G-AAG-T---A-AA---TG-T-AC-C--AAGGGA-----TATGCTGAA-GAT-C-TG----CC---CCA-AG---TT-------AAAGGAGA-GCCAG-CAG-ATGGTC-A-CGTTGCG------CACTTGC---ATGCG-CCTA--C-TATCTCCATG-A-CTCCAAGAGTTAC-AT-ACCAAAGAA-A--G--GC---TTCTCCATT-AT--GA-A--T-C-ACT-GA-TA---AT--CA----GG-AAAC----AAAT---GA--GTG--------AA--CAGG--TG----AAT-TC-AGGT-AC------AGTT-A-AAG-T--AAGG-GGAG-GAA-AG--AGGA-A-TC--TT-AGA---ATTT-CACA---TC-CA-TAC-T--A-CC-CTA-TGGA-A-G-----AAAA--GGAA--A-CTAAC-CTG-T-C----TC-C-TTCCAC---T--AGTG-AA----GTTA-G---A--AGT---CAC-A-TGT---A-G-C-AGTA-A------------------------T-CGCG-AT-C-AT-A-C-----GGCC---A-T--C-CCCAC-TCCCTCCAT--CAGGGA-AT--AA-----A-GCT-TT--AA-TGG-CGG--CG---AAA-A-GG---A--CC-TTGC-TG-C-C-CCC-AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATCATTTA-TGTTTGT-A---CT--ATCA-AT----AAAAT-TG--TTG-A---T-GT-CT-AAAA-A-G--T----TG-TTCATT--T-TCTTGT-G-T-C-AA-TAGCACCAC------AC-AC-AC-C---AATGAAC--A-AAC--A--T--A-AC-ATG-CA-CG-CA----CG-C----AC------GC-ACAG--ACA-GACA-AAC---AGAACACA-G---ACA-GACCAGACAGA-C-----ATCAC--A-CAC--AC--AC--A-CAC-CCAC--------CC--AG-CCGACC-G--AC------CG--ACAC-ACAACACG---AGAC-AGACACACA-------CACCG---A--C-CG--------ACC-GACACACCA--CA-----C--A--TCAGA-CAG----GACAC-ACAC------------------------------A-C-ACACACAGA-GAGCA-GACCGAC---CAGAC------ACA-CAAT---T---ACC-AATA--GA-CAGCAGA----CA---GAC-ACCA----A-CAC-A-CA--CA-------CACAC---ACA-G--AGAGA--C-A---GACCCCA-------------CA-----CACC--A-CA---CACAGA---------------------ATAG-ACACA-------GAGCA-G-A-----CAACAC------A-CA-CACA-CAC-A-AACAC-ACAAAC-TTGAAAT-G-TAA-TA---AGA---AAA-T-G-A-GG------AACTTT-TGT--CC-AA---T---C--AAGAACATG-AA-C--TC--AGAAA-A-TGA-GA-A-TTGG--A------ACA-AAC-TTTG-T-GG-----TA--C-ATAAAC--AT-G-CAAAATGAATATTTTCT-G--GCAC-TCA----CAC---------AACACCCCATAGCTG--TGAAAAC---TT--CCG-A--CA-TA-A---ACTT-AC-T---GACCTAATAAC-C-TT----AAATT-TCAAT--AC-GA-TAA----AAA-A---AAAATATT-GAGTAC--A-A-ACTTCATA-TTTAAAA-ATATAAACATCCT---CTATAACATCTAAAAAT--CC---AAATATTCTGA-CCTGCAA--GGAATTTCAAAAGTTTC-AGGCCG-AC-AT--TGCTTA
gi|6 : TTATA-AGAT-T-TTAC----AA-C-AT---C--T-CG---GA-T--G-CTGAATGAA-GTA-GGC-----CG--TT----TAG----TTCAAAA-A---TA-G--AAGAT-TTCTTCC-CG-AAT--AA-AAT-G--A-TAC-TATTTATGCGAAA-TA--C---AT--T-GAAC--GTAGA-----GT--T-ATT---G-----AACTAGA----TTA---TG-T------CAGTTG---A-ATA-TTTGGA--G-CTAGAT-A-C-CTACAA-A-AGATC-A-TTTTCA----C-C--CCAAAT----ATTCTCC--A-C---A-T----T-T---CA--CA--G-CCAA-G-TCA-C-AAG---CA---GAGT-TTA-TTTTTCT--TTTGGTA-AA-A-TTTCA----AATG--------------AAA--AA-CC-----AGAA--T--TAAACATG-GTTA---AACAC-A-CCAT-T---AAGACAACAACTTAT--TAG--A-TAC-T-CAG-AGTAG--AA-ATAGAA-ATGACATAGTT-------GTA-T---CTA----GAGATC-TGTG--ATATGA--AAT-G----AACG-AGG--CA-TACTT-TTCTCAGTA---AAAACAAAGAAGA-CCTGA-AAGTTGGCCA-G-TTCGGAA-G--GGT-CCTAAAC-TTA---TGTGCAACTT-CC-TTT--GGAG-----TCT---ACT--AT----TT--C-----T-G--C-C---A-TTCATCGT------ACATACT-TTCTCAAAAT-CTTGCTA-TCTAT--TCAGCC-CAAA-GGCAA-TTCTT------GTTAATAGCCGCATATTTACAACC-A---TT-GCT-TCTTA--AA---------GGAT--A-T---GT--CTCT-----TTAAT--T--A----AAT--A-----A--A---------TTTG--ACG--T-C-G--TG----C-TG-T-A-ATCTA-G-TGTAG--T--TAAATGT--AG-G--CATA--------ATA-A-------A-CAACC--A---AA---GTA--A-----GA------G-AAG-T---A-AA---TG-TCACAA--AAGGGA-----GA-----AT-AAT-C-TAGTCCCC---CCA-A-----A-------AAAGGAG-AGCCCAGCAG-A-GGTC-A-C--TGCA------GAT---CTAAAT-CAGCTTA--CTTAT-----TG-GAC-------GTCAG-ATAA---AAGAA-AT-GGAGC---TTCTCCA-TTAT--G-CA--T-C-ACT-GA-TT---AT--CA----GG-AAAC----AA-T---GAGGGTG--------GACTCAGG--TG----AATGTC-AGGTGAC------AGTT-ACAAG-T--AAGGTGGAGAGGA-AG--AGGATAATC--TT-ATA---ATTT-CACA-C-TC-CA-TAC-TTAA-CC-CTG-TGGATA-G-----AAAA--GGAA--AACAAAC-CTG-T-C---CTC----TCCACT--T--AGTG-AA----GTTG-G---A--AGT---CAC-A-GCT---A-G-C-AGTAGA------------------------T-C-CG-AT-C-AT-A-CG----GGCCAAAA-T--CACC-AC-TCCTCGCATC-GAGGGACAT--AA-----C-GT--TTA-AA-TGG-CGG--CG---AAA-G-GA---A--CCGTTGC-TG-C-C-CCC-ATCGCTTCTGTG--GCAC-T-GC-TGTTC-CATCA-TTA-TGTTTGT-A---CT--ATCA-ATAAAAAAAAT-TG--TTGCA---TGGT-CT-AAAA-ATG--T----TGTT--ATT--T-TC-TGTGG-T-CTAA-TAGCACCAT------AC-AC--C-C---AATGAAC--A-AACA-A--TTAA-AC--TG-CATCG-CA----CG-C----AC------AG-ACAG--ACA-GACAAAAC---A-GACACA-A---ACACGACCAGACAGA-CCCACAA-CAC--A-CAC--ACACACCAC-GCC-ACACC-G----ACCCAAGACAG--CAGGCAAGACAGCCG--ACA-GAC-ACAC-ACAAGACGACACACACA-------CACCC---G--CACGGACACCACACC--ACT-ACCGACCACAGAGCCAA--CCAGA-CAG----CTCAC-ATGCATC------C-CGA-CA-G-------A--GA-CAACACAGACA-GA-CACGAC--AC-A-C-AACAG----ATA-CGAC---C---ACAGGACA--GA-C-AC--A----CA---CAC-A-CAC---A-CACGACCAC-CACACGACCGACACCGAACACA--GCAG---C-C---GA---CACCCCCCCCC----CA-----CACCACA-CAG--CACAGAC-A-GACA--A--CA-G----AT---ACA-A-------GA-CA-G------------C------A-CA-CACA-CACAA-AACAC-TAAAAC-TTGAAAT-G-TAA-TAAAGAA----AAA-T-G-A-GA------A---CT-TGT--CC-AA---T---C--NN-NNNNNN-NN-N-NNN--NN-NN-N-NNN-NN-N-TT------------------TTTTG-T-GG-----TA--C-AAAAA
gi|7 : TTA-A-AGA--T-GT-C----AAAC-AT-T-C--T-CG---GA-T--G-CT--ATGA--GTA-GGC-----CAA-TT-C--TAT----TCAGAAA-A---TA-G--A-GAT-TTC--C---G-GAT--AA-AAT-G--AGTA--TATC--------A-TA--C---AT--G----C--G---A-----GT--T-ATT---G-----AA----AA---TTA---TG-T------C--TTG---A-A-T-T---GA--GGC--GAA---C-C---AA-T-AATTG-A-T----AATCGT-C--CCAAAT----AT----C--AGC---A-T----T-T---TCTCCA--G-C--A-G-TCA-CTAAA-A-CC-A-GAGT-T-A-TTCTCTT-----GGTA-AT-A-AT-CA-GAAA-TG-----AGAT-----AAA--A---T-C-ACAGAA--T--TGAA-ATG-G--A---AA-AC-AAC--T-T---GA-----------AT--TTG------T-T-CAG-A-T-G--AA-A----A-ATGA---AGTT-------GTAATT--CAAT---GAAATC----A--GTATGATAAAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT-----TA---AAAA-A---GA-A-CCTGA-A---TGGCCAAG-T----AA-G--GGT-C-TAA-C-TCA---T--GTAA--T-CC-TTG--AA---G---TCT---AC---AT----T---C-----T-G--T-----A-TT------------ACA--CT-T-CT-AA--T-TT------T---T--TCA--CGCAAG-GGT-A-AT--T------GT------CC---------TATAC-A---TT-GCT-TTGTC--AA---------GGAT--AATC--AT--CCTC-----TTTAT--TTAA----AGT--A-----T--A---------ATTG--ATG--T-C-G--TG----C-TG-TAA---TTA---T-TAG--T----AAT-T--AG-G-TCAAA--------ATATA-------ATC-ACC--A---AAAA-GTA--A-----GA------G-AA--T---ACAA---TG-T-ACAT--AGGGCA-----GAT----A---AT---TAGTCCCC-----A-AA---GA-------AA-GGAGA-GC--AGCGA-C-GGTC-A-C--TGCA------GAC-------AT-C--CTTA--C-TAT-----TG-A-C-------GT-GC-AT-A---AAGA---T-G--GC---TT-TCCATTT----GCCA--T-C-A-T-GA-TA---AT---A----GG-AAAC----AA-T---GA--GTG--------AA--CAAG--T------------------------------A-AAG-T--AAGG-GGG-AG---AG--AGGA-AATC--T--ATA---ATT--CACAAC-TC-CA-TAC-T--A-CCTCTA-TGGA-A-------AAAA--GGAA--AACTAAC-CTG-T-C----TC-C-TTCCAC---T--AGTGGAA----GTT--G---A---GT---CAC---TGT---A---C-AGTA-A------------------------TGC-CGGAT-C-A--A-C-----GACC---A-T--C-C--A--TCCCTTCATA---GGGA-AT--A--------GC--TT--AAATGG-CGG---A---AAA-G-GA---A--CC-TTGC-TG-C-C-C---AT-GCTTCTGTG--GC-C-T-GC-TGTTC-CATAATTTA-TGTTTGT-A---CT---TCA-AT----AAAAT-TG-TTTGC----T-GT-CT-AAAA------T----TG-T--CCT--TGTC---T-G-T-C--A-TAG-----C------AC-AC-AC-CTAAAATTATCA-A-AAtcagaaata
gi|7 : ctcctacttttctcagcgcagttttcgaatcgtaaaaggcctcatttaagtgcagattggcccaccgttcatataatttacaaaataaacaatattgaaaatattttgatatcctaaatactccttaatatattttatacgtgttactggtaactttactttcgtatgaagggaggtaaattggacA-GA-CA-GAC--AC-A-CAT-C------AGACCGA----C---ACC-AACA--GA-CGAC--A----CA---T-C-ACCAC---A----GA--AG-CA-------GACAG---ATA-T--GACCA--C-A---GC---CA-------------CA-----CAACAagctgaatagggtcttagattctaagaatagaacgtgagaacaatatgcgtgaactgcaagttatacgttctaaaacagtttaaccaaaacaaacaataacatgcagcacaacaacagaccagaagacagacacacatcagaccgacaccaacagacgacacatcaccacagaagcagacagatatgaccacagccacacaaca
gi|8 : ctcctacttttctcagcgcagttttcgaatcgtaaaaggcctcatttaagtgcagattggcccaccgttcatataatttacaaaataaacaatattgaaaatattttgatatcctaaatactccttaatatattttatacgtgttactggtaactttactttcgtatgaagggaggtaaattggacttaaagatgtcaaacattctcggatgctatgagtaggccaattctattcagaaaatagagatttccggataaaatgagtatatcatacatgcgagttattgaaaattatgtcttgaattgaggcgaaccaataattgataatcgtcccaaatatcagcattttctccagcagtcactaaaaccagagttattctcttggtaataatcagaaatgagataaaatcacagaattgaaatggaaaacaacttgaatttgttcagatgaaaaatgaagttgtaattcaatgaaatcagtatgataaatgaagaggaattttttaaaaaagaacctgaatggccaagtaagggtctaactcatgtaatccttgaagtctacattctgtattacacttctaattttttcacgcaagggtaattgtcctatacattgctttgtcaaggataatcatcctctttatttaaagtataattgatgtcgtgctgtaattattagtaattaggtcaaaatataatcaccaaaaagtaagagaatacaatgtacatagggcagataattagtccccaaagaaaggagagcagcgacggtcactgcagacatccttactattgacgtgcataaagatggctttccatttgccatcatgataataggaaacaatgagtgaacaagtaaagtaagggggagagaggaaatctataattcacaactccatactacctctatggaaaaaaggaaaactaacctgtctccttccactagtggaagttgagtcactgtacagtaatgccggatcaacgaccatccatcccttcatagggaatagcttaaatggcggaaaaggaaccttgctgcccatgcttctgtggcctgctgttccataatttatgtttgtacttcaataaaattgtttgctgtctaaaattgtccttgtctgtcatagcacacacctaaaattatcaaaaagctgaatagggtcttagattctaagaatagaacgtgagaacaatatgcgtgaactgcaagttatacgttctaaaacagtttaaccaaaacaaacaataacatgcagcacaacaacagaccagaA-G-AGAA-T-TT-C----AA-C-AT-T-C--T-CG---GA-T--GGCT--ATGAA-GTA-G-C-----CG--TTAC--TGT----T-CAAAA-AAG-TA-G--AAGAT-TTC--C-----AATTAAA-AATTG--A-TA--TATC--------AGTAG-C---AT--GTG--C--G---ACATTAGT--TGATT---GC----AA----A----TTA---TG-TGCGATTC--TTG---A-A-A-T---GAATG-C--GAA-A-C-C---AA-ATAGTTG-AAT----A----T-C--TCCAAT----A-----C----C---A-TCATTT-T---TT--CA--G-C--A-G-TCA-C-AAACG-CA-ACGAGT-T-A-TTCCCTT-----GGTA-TATA-TT--A-GAAAATT-----AAA-------AA--AA--C-C-ACAGAA--CACGGAA-ATA-G--A---AA-ACCA-C--T-T---GA------------T--TTG--A-T-T-C-CAGGA-T-G--AATA----A-ATGA---AGTTGATTAGTGTA-TTGTTAA----GAAATC-TT-G--GTATGA--AAT-G----AA-A-AGA--AT-C--TT-TT----ATA---AGAA-AA--GA-ATCCTGA-AA--ATGCCA-G-T----AA-A--TTT-C-TAAAC-TCATTGTCTGCAA--T-TC-TCT--TGAG-GTATTCTG--ACTTAGT----TT--C-----T-GTTT-T---A-TTTTGTACCCCACCACA-CCTAC-CT-AAGAT-TT----A-T---T--TCAAGC-CAAG-AT--A-AT--T------GTTAATG-CCA--------TAATC-A----T-GCT-T-GCCGGAA---------GCAT--G-TTCGGTTGCTCTCGGTATTTAG--C--G----AAT--ATCCTGA--AGACATGAATTTTG--ACGCCT-C-GTCTG----C-TG-TGA-ATCTACG-T-T-T--T--T-ACTG----G-G-TTAAC--------GTGTT-------G-C-ATT--A---AACAGATA--C-----GA------G--AG-TTTCA-AA---TG-T-----------GA-----GAT-----T-AAT-TATA----CA---CCA-GATATGA-------AAAAGAG
gi|9 : cgctagcttatccatctcctacttttctcgcgaagtgacagttcttttctgtaatcctggcataaaaggcactttcattcaatgctagatgtgccaacccttcatatagtatatgtaccaaataaacatagttaattttgagaaaagtcatatttataatttcatttaaatactctcttaatatatgtatgatgtttaacctctctggtttaaacaccgttattatctaattacggtttctaattataggacgataaaggcagagcgcctattgagattcctaaa-A-AGAA-TGTT-C----AA-CCAT-T-TCAT-CGATGGA-CTGG-CT--AT--A-GTATG-A-----CG--TT-C--TAT----TCCAGAATAC--TA-G--AAGAA-TTC--TC-CG-AAT--AA-AAT-GTGA-TA--TAT---------A-TA--CGACATTGG-G--TTAG---A-----GTA-T-ATT---G-----AA----AAGTGTTA----G-T------C--TGG---AGA-A-A---GA--GGC--AGA-A-C-C---AA-T-A--TGTA-T----A----TTC--CCCAAT----A-----C--A-----A-T----T-T---TC--CA--G-C--A-G-TCT-C-AAA-A-CA---GAGT---A-TTCCCCT--TG-G-TA-AA-A-AT-CA-GAAATTG-----AGAT-----AAA--CA-TC---ACAGAT--T--TGAA--TG-G--A---AATAC-A-C--T-TT--GA-----------AT--TTG--A-T-C---CAG-ACT-G--AA-A----A-ATGA---AGTA------TGTA-TT--CAA----GAAATC-CT-G--GTATG---AAT-G----AA-G-AGG--AA-T--TT-TT----AT----AAAA-AAAGGA-A-CCTGA-AAG-TGGCC--G-T----AA-AGCGGT-C-TAAAC-TC-----ATGCAA--T--C-GTG--ACGA-G---TCT---ACT--AT----TT--CG----TGG--T-T---A-TT-------------CA-ACT-T-CT-AAACTCTT----ATT---T--TCA--C-CAAGAGG--A-TT--T-------T------CC---------TAAACTA---TTGGCT-TTGTC--AA---------GGACTAA-TC--GT--CTCTTC---TTTAT--T-------AAT--A-----T--A---------TTTGA-ACG--T-C-A--TG----C-TGCT---ATCTA-G-T-TAG--T--T-AATGT--AG-G-TC-AA--------ATATA-------A-C-ACC--A---AG---GT---A-----GA------GAAAG-T---A-AA---TG-T-GTACCAGAGGGAGTAGTGAT----AG-AAT-C--AGTT-----------A---GATCATTACAAAGGAG-AGCCA-GCAGAA-GGTC-ATC--TGCG------AAC---C---ATCC--CTTA--C-TAT--------GAC-------G-CATGAC-A---AAGAA-ATCG--GCCGTCTCTCCCTTTAT--GACA--T-C-A
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): CTACTTATTTCTCAGGCGAAGTTATCGGAATCACCGGTAAAAAGAGCCACTTACATAACAATAGCAGATTGGCCACCTCACTGTATACATATTACCAACAAAAATAACAATATTGAAAATATTTTGATCATTTAAATAACTACTCTTAAGTATATTATATGTTAACCCTGGTAACTTTATTATCGTCATTAGCGAGCAAAAGGGAGAAAATTG
Unaligned ( gi|21 ): GCTGCTTCCGCTAACTCTTTCTCAGCGACAGTCTTCGATCTCGGTAAAACAAGGTCATGTCATTCAATGCGCAGATGGCCCGCTTACATATAATATACCAAATAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
Unaligned ( gi|28 ): CCTCTCCTATCTTTTCTCAGCACAGTTTCGATATCCGGTAAACAAGCACTTCATCAATCAGATTGGCCACC
Unaligned ( gi|29 ): TTATATATTAATGTTAATATCCCTGAGTAACTTACTTTGTATGCAAAGGGAGGGGTAAATCTGAGAC
Unaligned ( gi|30 ): AAATGGAATAAAATTCCCAAAATGGAGTTAATGTATATTATTTTGATTCAGAATCAATTATAGAAA