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Reference ( gi|2 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACCTGCTGCTGCTAGATTTGCGG--TATACTCGGTTTTCGTTTT-GTA-GCT-CAA--CAGTGTTA-CAAA-ACTAT-----GTA---GGAGT-TCGTGTTTCC-TGG-GCAATTCTTACATGTT--TTCTT-AGATCTTCACATTTG-GGCT--TTTTATGA---TT-CC-CAAGCA--------------------TGCCTTCTC-TT-AACGACCCGTTGT---TTCGTTCGTC-TACAGAC-TTACTTTTGTG-CA---TGATACTGGGAGCATGTA--AATAGT-TGCAGAAA-------ATAC----ATG-T--TTTCTGG-----TTATGTCTG-TT--TTTACT-CTGA-TTTTTC---TCAGC--GC-TGG--CTA---AAACAAGC--CGAAGTAGGATGTA-AAACTTGAGG--------TTTGTATTGTATCATACGAA-TTCGCTGACCGGCC-TAGCTTTCTTTAATTGTTAATC-TCGTT-TTCTAGTACCGGTAGC-TCTA---AGTTGCGGTAAAGTCC--TTGGTCACTCGATCCCGTT-GGCACGTACCA-AGTTTCCCCTTAATCGAT--CCCGGTATTTTGTTCA--AT-A--GATCGGAA-TA-GTAAGCTTCCGTAAGATTCA------TC----ATG-T--TGATCCATGCTTTCT--AAACCTCT---GAT-G-TAGTTTTC---CACACCATCGTA-GAAA------TCTTTCAA--CCC--C-CAAA--T---A-----TCAG-AC-GT-GG--T---TTTGGT-A----GA-C-TAAT-A-GA----TTT---------GCA-------TATATG----CGTCAATGATTTT--TTGCG--GCTGACCAAATC-TA--C---TTTT-AG---ACCTGTA--G-A-GCTTGAGCGT----A---TGT---GTATT-G---TAAT-TGTAAGACCTGCGATA-CATTGGCTTGC-TT----CTCC-A-TAT-AGCTG-GAATTTGAGATA--ATTA---------A--A--CTT--TTGAAACAT-CATT--CAAAGACAA-------ATT-TCG----G-CA--CGG-CG----GCT-----GA--CGTAA--A-GAATCCC-----AAAAT---GGCTGC-AAGTCTAACAT--T-TTC---C-GCC---AAAC--GATGGTA---A-A-TA--AGC-TT-G-GTA---A-CTT-T----GG--TATAT-GCT--AGTGTTTGT-ACTCACGGAA-CCT---G--AGA---TACT-C-----ATTG-TAG-C-TT--G---T-G-G--TA-AG-TAG-TAC--TTTGTGC-GGG--ACG-G-GC-TTGCGTGTCG-C-TAA--CGGT-G-TCG--A-ACTGTGCTGATAAACG-TA-T-C-C-GTGGC-ATGC--GG----TTTA----AACT--CTG-A----TG---TA-AG-----CGG-AATA-G---TTTGCG-AAG---T--GCA---T-TAT--G-GTCTG-TT-GG---CGTA-TGA-GT-GGG-G----ACT-A-GCGGTT-TTCT-ACATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGGA--AAAT--GTCATTTG--AATATCAAACTG----TATACC---TGT-AGCTTCT--AG-ATTTCCTCT--TC---TG--TTCA-TCTTCCGATATTTC-CTCCAGAATTTTAGCAT----ACTCTACAGAATGGTCTTCCTCTTTGTTACG-AAT-TAAG-TCTCT--A--ATAGTG-G-AAAGTCCATTCACA--T---TA-TG-T---T----TCGT-AAT----AAT-TCT-TC--AGAA-TTTCC-A-TT-CACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTGTG-CG---C--GGC-TCTC-ATTGATT-TTAGCTTGGAAC-TCATTCCGATT-TG-TCAC-GGCACC--AAATGT-G-C-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ACG-TTTCA-AAC-GTT-TCGAT-CTTTAGTTTCT
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gi|4                          :                                                                  cgctctgctgtgtttcatctgggattcgtccgatctttaagtggtctcacctatttttgtttgatctccaacctcggaaatagtgtagattctgtttgggggggttgttaaaagtctccaaacttatccttccgtatctctcgagaactgcgatagataacatagctgcgttgtgagaccgccctcatcaaaagagtagtattcttgctgactcccgaaatatgtgcatctctcttctccaccgtcggccgagcgaacacaggtgatgctacgggcagttttcaaaagttacatgtagaccttcgttggacgttagatgtagatgaatcgcatatagcggactgtaggttgcgcatgtgcgtgtcaacctgtgagtaataaagataacagcgacggcttttccA--------------------TGC-TTCTC-TTTAACGACCCGTT-----TTCGTTCATC-TACAGACCTTACTGCTGTG-CA---TGTTA-TGGGATCATGTA--CTTAGT-TGCAAAAA-------ATA-----ATGGT--TTTTTGG-----TTATGTTTG-TT--TTTAC--CTGA-TTTTCC---TCAGC--GC-TGG--CTA---CAA-AAGC--GGAAGAAGG-TGTG-AAGCTTGAGG--------GTTGTATTTTACTATACGAA-TTCGCTGATCGGC--TAGCTT-CTTTGATCGT-AATC-TCGTT-TTC-AATA---GCTTC-TTTA---AGTTGCGGTAAAGTCCA-TTGGTCACTC----CCGTG-GGCATGTACCA-AGTTTTCCTTTG-TCGAT--TCCGGTATTTTGTTCA--AT-AT-GATCGGAACTA-GTAAACTTCCGTAAGATTCA------T-----ATGAT--TGACCCATGCTTTCC--AAACCTCT---GAT-G-TAATTTTC---CATACCATCGAA-GAAA------TCTTTCAA--CTC--C-CTAA--T---A-----TCAG-AC-GTGGG--G---CTTGGT-ACCCTGA-C-TAATAA-GAT---TTT---------GCA-------TATATG----CGTCTATGATTAT--ATGCG--GCTGACCAAACC-TA--CG--TTTTAAG---ACCTGTA--G-A-GCTTGCGCGTA---A---TTT---GTATT-GGGTTATT-TGT-AGACCTGCGATA-CATTGGCTTGC-TT----TTCC-A-TAT-AGCTG-GGATTTGAGATA--ATCA---------A--A--CTT--TTG-AACGT-CATG--CCAAGACAA-------ATTGTCGT---G-CA--CGG-CG----GCT-----GA---G-AA--A-GAATCCC-----AAAAT---GGCTGC-CAGTTTAACATA-T-TTC---C-GCC---AAAC--GATGGTA---A-ATTA--AGCTTT-G-GTA---A-CTTGT----GG--TATAT-GCT--AGCGTTTGT-ACTCACGGAA-CCT---G--AGG---TACT-C-----ATAG-TAG-C-TT--G---TGG-G--TA-AG-TAG-TAC--AATGTGC-GGG--ACG-G-GC-TTTTGTGTCG-A-TAA--TGGCGG-TCG--A-TCTGTGCTGATATACG-TATT-C-C-GTGGC-ATGC--GG----GTTT----AACT--CTA-A----TG---TA-AG-----CGG-AATA-G---TTTGCG-AAGT--T--GCA---C-TAT--G-ATCTG-
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGCTTGCCTT----CTCCCA-TATTAGCTG-GGATTTGAAATA--ATTA---------A--AGCCTT--TTGGAACGT-CATT--CAAAGACAA-------ATTGTCG----TTCA--CAG-CG----GCTT----GA--A--AA--A-AAATCCC-----AAAAT---GGCTGC-CAGTCTAACATAAT-TTC---C-GCC---AAAC--GATGGTA---A-A-TTT-AGC-TTTA-GTA---A-CTTGT----GG--TATAT-GCT--AGCGTTTGT-ACTCACGGGA-CCT---GTTATG---TACT-C-----ATAG-TAG-C-TT--G---T-GAG--TA-AG-TAG-TAC--AATGTAC-GGGAAACG-G-A--TTGTAAGTCG-C-TAA--CAGCGG-TCG--A-ACTGTGCTGACATACGTTATT-C-C-GTGGCAATGCCGGG----TTT-----AACTGCCTA-A----TGTTTTA-AG-----CGG-AATG-T---TTTGCG-AAGGT-C--GCA---CGTAT--G-GTCTG-TTGGG---CGTA-TGA-GTGGGG-G----ACTAA-GCAGTTGTTTT-ACATTGT--GATAATT----GTGGACAGTTATGG---AATT--GTCATTTGATAATATCAAA-TG----TGTA-C---TGTCAGCTTCTG-AT-ATTCCCTCT--TCGT-CG--TTCA-TCTTCCGAT-TTTC-GTCCGAATTTTTAGCATCCA-ACTCT--AGAATGATCTT-CTCTTTGTTGCGCAATATAAGCTTTCCTAA--ATAGTGCG-AAAGTCCATTCACATCT---CACTG-TCTCT----CCGTCAAT----AATCTCT-TC--AGAACTTTTC-ATTT-CACACCTGTTCAACAGCTCT-GTACCCACTCCTCTGTG-CACACC--GGCTTCTC-A-TGATT-TTTGCTTAGAAC-TCGTCCCGATTGTGTTCAC--ACATCCAAAATGTAG-CGG-ATGG--AT-A-----ACGAG-AA------ACGCTTTCC-AAC-GTGATCGATACTTTAGTTTtttagcaatagttagcttcggccgtttgt
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gagatactttgcaagaggtgaggtaTCTG-TT-GGG--CGTA-AGA-GT-GGG-GG---ACT-A-GCGGTA-TT-T-GTATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGGA--AA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATTTTAGCATCCA-ACTCTA--GAATGGTCTTC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAG-CCTTT--ACGA-AGTG-GGAAAGTCCATTCACAATTAAATA-TGGT---TCAAATCGT-AATTTGAAAT-TATGTCCAAGTA-TTTCCTA-TTTCACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTATGACG---CGGGGC-TCTCGAGTGATTATTAGCTAAGAACTTCATTCCAATT-TG-TCACGGGCA-C--AATTAA-G-C-GAATGGCAATAAAAACGACGAG-AAAACAGCGCA-TTTCAGAACTGAT-CCGATACTT---TTTCT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGTGTAG-T-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----GCG-TTTC--AAC-CTT-TCAAT-agtccaagcgtaataaaaacataacaatagtgaatcgttaagtaattgcgttaatcgtaattattacgtcacaattaatacacgcgaaaatacgttgacatgtctatggattgaaagataagactggtcaatattaaaagactcaaagggattagtaaactatttcac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttaaagatgatcaaattaatgattttaaaatgattcacttctttctattttattgttctatctctattacatgtttttttttaaaacattTGT-GGT-G-GTGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ATA-TTTC--AAC-CTT-TCGATACTTTAGTTTCT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtgcatgtttaacttac-G-C-G-ATGG--ATGA-----ACGAG-AAAG----ACG-CTTTC-AAC-GTT-TCGATACTTTAGTTTCTatgcgttccatacaatgtagtcgctaagtagtgacgttagcgtaattattatgttacaataccacgaaaatacgttactgtctttgattgcaagaaaaataaggtaactgattacttaagaaaagaagaaactatttc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gta-C-G-ATGG--ATAA-----ACGAGAAAAG----ACG-TTTCC-AAC-ACT-Tatgcattacatacaatgtgatcgttatgtaatgacgttagcgaaattattacatcacaattaataccgcgaaaatacgttactgtctttgattgcacaaataagatgcttgattaaaatgaagtaactatttca
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): TCGAGACTATAGACAGCTCTGCTACACTGTCAATCAAAAAAATAGTTAGGTTCGTGTCTTCACACGTACAGTCTACTGTTTTCCGTCGGGTGAAGCAGGGTGCTACGGCAGTTTTCAAAGAACATGTGACCTCGTTGGCGTTCGATGTAGATGAATGCATATTAGCGACTGTAGTTGCGATGTGGTGTCACCTGTTAA
Unaligned ( gi|18 ): GACGTTAGCGTAATTATTACGTCACAAAATACCGCGAAAATACGTTTATGTCTTTGATTGCACAAATAAGAAATGAACTAATTATTCGA
Unaligned ( gi|20 ): AAATGCGAACAATAGCTTAGGAAGTTTTTAATATTATTCACACAAG






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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cgctctgctgtgtttcatctgggattcgtccgatctttaagtggtctcacctatttttgtttgatctccaacctcggaaatagtgtagattctgtttgggggggttgttaaaagtctccaaacttatccttccgtatctctcgagaactgcgatagataacatagctgcgttgtgagaccgccctcatcaaaagagtagtattcttgctgactcccgaaatatgtgcatctctcttctccaccgtcggccgagcgaacacaggtgatgctacgggcagttttcaaaagttacatgtagaccttcgttggacgttagatgtagatgaatcgcatatagcggactgtaggttgcgcatgtgcgtgtcaacctgtgagtaataaagataacagcgaGGA--TTTGA-G--ATAAT-----TAA---A--CT--TATT-GAACTG-TCATT--CA-A--AG---ACAAAT-TGTCGTTGAAC-AACC-GG--CGAC-T-----GA--TATAA----GAATCCC-----AAAAA---TGCTGCTCAGTCTAACATCATTT--CCGGCCCAAA---AAC--GATGG--AAAATATTA--GC-TT-GTTACATA---TTT--TGGAAT-ATAT-GCT-GCAGTCATT-ACTCACGCAAGCCTTTCG-TATATCTCCCGC---TAT-TGATAGCA--CTGA-GTTGGT-ACAG-TAGTTACTTTTTCTG-CAGG--ACG-A-G-C-TGTCTGTCGAC-T-ACAGCAGCTCTA--A-ACTGATGACTTGATA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tTGTGGT-G-GTGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ATA-TTT--CAAC-CTT-TCGATACTTTAGTTTCTa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gtgcatgtttaacttacT--GTGGGTTA-AG-TAG-TAT--ATTGTG-CGGG--ACG-GTG-TTGGTATGTCG-C-TAA-GGCGGTGC-AATA-GCTG-TG--CTGATAAACG-TAACTTGT-GT-ATG-CGGG---GTATGATA-TTT--CTGTA----TG---TAGAGAGTTTCAGTAATA-ACATTTTGC-GAAGACTT-GCAACTC-TATGAG-ATCGA-GTGG--GCCGTA-TGACGT-Gatgcgttccatacaatgtagtcgctaagtagtgacgttagcgtaattattatgttacaataccacgaaaatacgttactgtctttgattgcaagaaaaataaggtaactgattacttaagaaaagaagaaactatttc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gagatactttgcaagaggtgaggtaGTAGC-G-ATGG--ATGA-----ACGAG-AAAG----ACG-CTTT-CAAC-GTT-TCGATACTTTAGTTTCT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 C-G-ATGG--ATAA-----ACGAGAAAAG----ACG-TTTC-CAAC-ACT-atgcattacatacaatgtgatcgttatgtaatgacgttagcgaaattattacatcacaattaataccgcgaaaatacgttactgtctttgattgcacaaataagatgcttgattaaaatgaagtaactatttca
gi|16                         :                                                                                                   ACCCGATACTG-TCG-TCTGCGGCTTTTCC-TCGGTTTTC-CTTTCCGC--C---TCAACTT-TTGTA--CA-AATA--CT-A-GTATG----ATGTCG--T-TTTCCTGG-GCAATTCTTGCATGTT--TTCTT-AGATT-----T---ACATTC-GGCTATTT-TGTGAT--TTCC-CAAGCAagttttatggcgttacatacaatgtatcgttaagtaatgacgttagccgtaatctattacgtcaccaataatacgcaaaaaaggttactgtctttgattgcacaataagatacatgtaactgatataagaaatgaagtaactattt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agcgactgtagttgtgcatgtggtgtcAGTGTAGT-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----GCG-TTT--CAAC-CTT-TCAATct
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttaaagatgatcaaattaatgattttaaaatgattcacttctttctattttattgttctatctctattacatgtttttttttaaaacattTCTG-TTGG--G-CGTA-AGA-GTGGGG-G----ACT-AGC-G-GTA-TTTGTATTG-TCG----ATAATTGTGGACAGTT-TGG--AAA--
gi|2                          :                                                                                                   ACCTGCTGCTGCTAGATTTGCGG--TATAC-TCGGTTTTCGTTT--TGTAGC---TCAACAG-TGTTA--CA-AA-A--CT-ATGTAGG----AGTTCG--TGTTTCCTGG-GCAATTCTTACATGTT--TTCTT-AGA-T-----CTTCACATTTGGGCT-TTT-TATGA---TTCC-CAAGCA--------------------TGCCTTCTC-TT-AACGACCCGTTGT---T-TCGTTCGTC-TACAGAC-TTACTTTTGTG-CA---TGATACTGGGAGCATGT---AAATAGT-TGCAGAAA-------ATACAT-G-T----TTTCTGG-----TTATGTCTG-TT--TTTACT-CTGA-TTTTTC---TCAGC--GC-TGG--CTAAA---ACAAGCCG--AAGTA-GGATGTA-AAACTTGAGG--------TTTGTATTGTATCATACGAA-TTCGCTGACCGGCCTA--GCTTTCTTTAATTGTTAA--TCTCG-T-TTTCTA--GTACCGGTAGCTCTAA-GTTGCGGTAAAGTCC-TTG-GTCACT--CGATCCCGTT-GGCACGTACCA-AGTTTCCCCTTAATCGAT--CCCGGTATTTTGTTCAAT-A--GATCGGAA-TAGTAAGCTTCCGTAAGATTCA------TC----ATG--TTGATCCATGCTTTCT--AAACCTCT---GA-TG-TAGTTTTCCAC---ACCATCGTA-GAAA------TCTTTCAA--CCCC-CAAA-T---A-----TCAGA--CGTGGT---TTTGGT-A----GA-C-TAATA-GA---TTT-GCA-------TATATG----CGTCAATGATTTTT----TGCGGCTGACCAAATCTA--CTT-T---T----AG-ACCTGTAG-A-GCTTGAGCGT------A-TGTGTATT-G---TA-------AT-TGTAAGACCTGCGATA-CATTGGCTTGC-TT----CTCC-ATAT-AGCTGGAA--TTTGA-G--ATAAT-----TAA---A--CT--TTTG-AAAC-A-TCATT--CA-A--AG---ACAAAT-T-TCG----GC-A--C-GG--CGGC-T-----GA--CGTAA--A-GAATCCC-----AAAAT---GGCTGC-AAGTCTAACAT--TTT--CC-GCC---A---AAC--GATGG--TAAATA--A--GC-TT-GGTA---A---CTT--TGG--T-ATAT-GCTAGT-GTTTGT-ACTCACGGAA-CCT---G--A--------GA---TAC-TCATTGTA-GCTT--GT-GGT-A-AG-TAG-TAC--TTTGTG-CGGG--ACG-G-G-CTTGCGTGTCG-C-TAACGGT--GTC-G--A-ACTG-TG--CTGATAAACG-TA-TCCGTGGC-ATG-CGGT---TT----AA-ACT--CTG-A----TG---TA-AG-----CGG-AATA-G---TTTGC-GAAG---T-GCA---T-TAT--G-GTCTG-TT-G--G-CGTA-TGA-GT-GGG-G----ACT-AGC-G-GTTTTCTACATTG-TCG----ATAATTGTGGACAGTT-TGGA-AAA--TGTCATTTG--AATATCAAACTG----TATAC---CTGT-AGCTTCT-AG--ATTTCCTCT--T--C-TG--TTCA-TCTTCCGATATTTCCTCCAGAATTTTAGCAT----ACTCTACAGAATGGTCTTCCTCTTTGTTACG-AAT-TAAG-TCTCT--A--ATAGTG-G-AAAGTCCATTCACA--TTA----TG-T-T----T-CGT-AAT----AAT-TCT-TC--AGAA-TTTCC-A-TT-CACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTGTG-CG---C--GGC-TCTC--ATTGATT-TTAGCTTGGAAC-TCATTCCGATT-TG-TCAC-GGCACC--AAATGT-GC-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ACG-TTTC-AAAC-GTT-TCGAT-CTTTAGTTTCT
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tttcctgatttcgtAAG-CCTTT--ACGA-AGTG-GGAAAGTCCATTCACA-ATTAAATATGGT-TCAAAT-CGT-AATTTGAAAT-TATGTCCAAGTA-TTTCCTA-TTTCACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTATGACG---CGGGGC-TCTCGAG-TGATTATTAGCTAAGAACTTCATTCCAATT-TG-TCACGGGCAC----AATTAAGC-GAATGGCAATAAAAACGACGAG-AAAACAGCGCA-TTTCAGAACTGAT-CCGATACTT---TTTCT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCT--AAACCACA---GA-CA-TAGCTTTCCAT---TTTAGCATA-AAAT------TATTTTAAACTTTC-CGTA-TTTGAC----TCAGG--AGCGGGCAGTTCGGC-A--------------AGA---TTTTTCA-------TGAACG----TATTTATAAGCCTG----TGTTTTTGTCCAAATCT-----T-TCA-TTA--AA-AACTGAA------TTGCG-GTTGGATAA-TTTGCATTTG---TT-------ATCTGTAAC-CCAGCAATA-CATTGACTTGC-AT----CACC-AATT-AAATGAGA--TTTCA-A--ATAAT-----TGA---A--TT--TCTGTG--C-GTTTGTT--AACA--AG---TCATTTCTGTCG----AT-A----------GA-T-----CC--CCCAA--ATGAATCCC-----AAAAC---GACTGC-CAGTGTGACA-GATTC--CC-GTCG-AATTTAGC--AATAG--T------TA--GC-TT-agtccaagcgtaataaaaacataacaatagtgaatcgttaagtaattgcgttaatcgtaattattacgtcacaattaatacacgcgaaaatacgttgacatgtctatggattgaaagataagactggtcaatattaaaagactcaaagggattagtaaactatttcac
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): TCGAGACTATAGACAGCTCTGCTACACTGTCAATCAAAAAAATAGTTAGGTTCGTGTCTTCACACGTACAGTCTACTGTTTTCCGTCGGGTGAAGCAGGGTGCTACGGCAGTTTTCAAAGAACATGTGACCTCGTTGGCGTTCGATGTAGATGAATGCATATTAGCGACTGTAGTTGCGATGTGGTGTCACCTGTTAA
Unaligned ( gi|18 ): GACGTTAGCGTAATTATTACGTCACAAAATACCGCGAAAATACGTTTATGTCTTTGATTGCACAAATAAGAAATGAACTAATTATTCGA
Unaligned ( gi|20 ): AAATGCGAACAATAGCTTAGGAAGTTTTTAATATTATTCACACAAG






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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cgctctgctgtgtttcatctgggattcgtccgatctttaagtggtctcacctatttttgtttgatctccaacctcggaaatagtgtagattctgtttgggggggttgttaaaagtctccaaacttatccttccgtatctctcgagaactgcgatagataacatagctgcgttgtgagaccgccctcatcaaaagagtagtattcttgctgactcccgaaatatgtgcatctctcttctccaccgtcggccgagcgaacacaggtgatgctacgggcagttttcaaaagttacatgtagaccttcgttggacgttagatgtagatgaatcgcatatagcggactgtaggttgcgcatgtgcgtgtcaacctgtgagtaataaagataacagcgaGGA--TTTGA--G-ATAAT-----TAAA---CTT--ATT-GAACTGTCATT--CAAA---GACA--A---AT-TGTCGTTGAACAACCGG-CGAC-T-----GA--TATAA----GAATC--CCA----AAAAT--GCTGCTCAGTCTAACATCATTT--CCGGCCCAAAAAC--GATGGAA--AATATTA--GC-TT-GTTACATA---TTT--TGGAAT-ATAT-GCT-GCAGTCATT-ACTCACGCAAGCCTT--TCG---TATATCT-CCCGCTATTGATAGCA--CTGA-GTTGGT-ACAG-TAGTTACTTTTTCTGC-AGG--ACG-A-GC--TGTCTGTCGAC-T-ACAGCAGCTCTAA-A---CTGATGACTTGATA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tTGTGGT-G-GTGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ATA-TTT--CAAC-CTT-TCGATACTTTAGTTTCTa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtgcatgtttaacttacT--GTGGGTTA-AG-TAG-TAT--ATTGTGC-GGG--ACG-GTGT-TGGTATGTCG-C-TAA-GGCGG-TG-CA-ATAGCTG-TG--CTGATAAACG-TAACTTGT-GT-ATG-CGGGGTATGAT---A-TTT--CTGTA----TG---TAGAGAGTTTCAGTAATA-ACATTTTGCG-AAGACTT-G-CAACTC-TATGAG-ATCGA-GTGGGC-CGTA-TGACGT-Gatgcgttccatacaatgtagtcgctaagtagtgacgttagcgtaattattatgttacaataccacgaaaatacgttactgtctttgattgcaagaaaaataaggtaactgattacttaagaaaagaagaaactatttc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gagatactttgcaagaggtgaggtaGTAGC-G-ATGG--ATGA-----ACGAG-AAAG----ACG-CTTT-CAAC-GTT-TCGATACTTTAGTTTCT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C-G-ATGG--ATAA-----ACGAGAAAAG----ACG-TTTC-CAAC-ACT-atgcattacatacaatgtgatcgttatgtaatgacgttagcgaaattattacatcacaattaataccgcgaaaatacgttactgtctttgattgcacaaataagatgcttgattaaaatgaagtaactatttca
gi|16                         :                                                                                                      ACCCGATACTG-TCG-TCTGCGGCTTTTCC-TCGGTTTTCCTTTCCGC-CT-CAACTT-TTGTA--CA-AATA--CT-A-GTATG----ATGTCG--T-TTTCCTGG-GCAATTCTTGCATGTT--TTCTT-AGAT-T---T--ACATTC-GGCTATTTT-GTGA--TTTCC-CAAGCAagttttatggcgttacatacaatgtatcgttaagtaatgacgttagccgtaatctattacgtcaccaataatacgcaaaaaaggttactgtctttgattgcacaataagatacatgtaactgatataagaaatgaagtaactattt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agcgactgtagttgtgcatgtggtgtcAGTGTAGT-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----GCG-TTT--CAAC-CTT-TCAATct
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttaaagatgatcaaattaatgattttaaaatgattcacttctttctattttattgttctatctctattacatgtttttttttaaaacattTCTG-TTGGG--CGTA-AGA-GT-GGG-GG---ACTA-GC-GGT-ATTT-GTATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGG--AAA-
gi|2                          :                                                                                                      ACCTGCTGCTGCTAGATTTGCGG--TATAC-TCGGTTTTCGTTTTGTAGCT-CAACAG-TGTTA--CA-AA-A--CT-ATGTAGG----AGTTCG--TGTTTCCTGG-GCAATTCTTACATGTT--TTCTT-AGAT-C---TTCACATTTGGGCT-TTTT-ATGA--TT-CC-CAAGCA----------------------TGCCTTCTC-TT-AACGACCCGTTGT---TTCGTTCGTC-TACAGAC-TTACTTTTGTG-CA---TGATACTGGGAGCATGT---AAATAGT-TGCAGAAA-------ATACAT-G-T----TTTCTGG-----TTATGTCTG-TT--TTTACT-CTGA-TTTTTC---TCAGC--GC-TGG--CTAAA---ACAAGCCG--AAGTA-GGATGTA-AAACTTGAGG--------TTTGTATTGTATCATACGAA-TTCGCTGACCGGCCTA--GCTTTCTTTAATTGTTAA--TCTCG-T-TTTCTA--GTACCGGTAGCTCTAA-GTTGCGGTAAAGTCC-TTG-GTCACT--CGATCCCGTT-GGCACGTACCA-AGTTTCCCCTTAATCGAT--CCCGGTATTTTGTTCAAT-A--GATCGGAA-TAGTAAGCTTCCGTAAGATTCA------TC----ATG--TTGATCCATGCTTTCT--AAACCTCT---GA-TG-TAGTTTTCCAC---ACCATCGTA-GAAA------TCTTTCAA--CCCC-CAAA-T---A-----TCAGA--CGTGGT---TTTGGTA----GA-C-TAATA-GA---TTT-GCA-------TATATG----CGTCAATGATTTTT----TGCGGCTGACCAAATCTA--C-T-T--TT---A---G-ACCTGTAG-A-GCTTGAGCGT------A-TGTGTATT-G---TA-------AT-TGTAAGACCTGCGATA-CATTGGCTTGC-TT----CTCC-A-TAT-AGCTGGAA--TTTGA--G-ATAAT-----TAAA---CTT--TTG-AAAC-ATCATT--CAAA---GACA--A---AT-T-TCG----GCA--CGG-CGGC-T-----GA--CGTAA--A-GAATC--CCA----AAATG--GCTGC-AAGTCTAACAT--TTT--CC-GCC--AAA-C--GATGGTA--AAT-A-A--GC-TT-GGTA---A---CTT--TGG--T-ATAT-GCTAGT-GTTTGT-ACTCACGGAA-CCTG--AGA---TA---CT-C---------ATTGTAG-CTT--GTGG-T-A-AG-TAG-TAC--TTTGTGC-GGG--ACG-G-GC-TTGCGTGTCG-C-TAACGGTG--TC-GA-A---CTG-TG--CTGATAAACG-TAT-CCGTGGC-ATG-CGGTTT----A---A-ACT--CTG-A----TG---TA-AG-----CGG-AATA-G---TTTGCG-AAG---T-G-CA---T-TAT--G-GTCTG-TTGG---CGTA-TGA-GT-GGG-G----ACTA-GC-GGT-TTTCTACATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGG--AAAAT--GTCATTTG--AATATCAAACTG----TATACC---TGT-AGCTTCT-AG--ATTTCCTCT--TC---TG--TTCA-TCTTCCGATATTTCCTCCAGAATTTTAGCAT----ACTCT-ACAGAATGGTCTTCCTCTTTGTTACG-AAT-TAAG-TCTCT--A--ATAGTG-G-AAAGTCCATTCACA--T---TA-TG-T-T----T-CGT-AAT----AAT-TCT-TC--AGAA-TTTCC-A-TT-CACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTGTG-CG---C--GGC-TCTC-ATTGATT-TTAGCTTGGAAC-TCATTCCGATT-TG-TCAC-GGCACC--AAATGT-GC-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ACG-TTTC-AAAC-GTT-TCGAT-CTTTAGTTTCT
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttcctgatttcgtAAG-CCTTT--ACGA-AGTG-GGAAAGTCCATTCACAATTAAATA-TGGT-TCAAAT-CGT-AATTTGAAAT-TATGTCCAAGTA-TTTCCTA-TTTCACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTATGACG---CGGGGC-TCTCGAGTGATTATTAGCTAAGAACTTCATTCCAATT-TG-TCACGGGCAC----AATTAAGC-GAATGGCAATAAAAACGACGAG-AAAACAGCGCA-TTTCAGAACTGAT-CCGATACTT---TTTCT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCT--AAACCACA---GA-CA-TAGCTTTCCAT---TTTAGCATA-AAAT------TATTTTAAACTTTC-CGTA-TTTGAC----TCAGG--AGCGGGCAGTTCGGCA--------------AGA---TTTTTCA-------TGAACG----TATTTATAAGCCTG----TGTTTTTGTCCAAATCT-----T-TCATT---A--AA-AACTGAA------TTGCG-GTTGGATAA-TTTGCATTTG---TT-------ATCTGTAAC-CCAGCAATA-CATTGACTTGC-AT----CACC-A-ATT-AAATGAGA--TTTCA--A-ATAAT-----TGAA---TTT--CTGTG--C-GTTTGT--TA------ACA--AGTCAT-TTCTGT--------CGA-TAGA-T-----CC--CCCAA--ATGAATC--CCA----AAACG--ACTGC-CAGTGTGACA-GATTC--CC-GTC--GAAagtccaagcgtaataaaaacataacaatagtgaatcgttaagtaattgcgttaatcgtaattattacgtcacaattaatacacgcgaaaatacgttgacatgtctatggattgaaagataagactggtcaatattaaaagactcaaagggattagtaaactatttcac
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): TCGAGACTATAGACAGCTCTGCTACACTGTCAATCAAAAAAATAGTTAGGTTCGTGTCTTCACACGTACAGTCTACTGTTTTCCGTCGGGTGAAGCAGGGTGCTACGGCAGTTTTCAAAGAACATGTGACCTCGTTGGCGTTCGATGTAGATGAATGCATATTAGCGACTGTAGTTGCGATGTGGTGTCACCTGTTAA
Unaligned ( gi|18 ): GACGTTAGCGTAATTATTACGTCACAAAATACCGCGAAAATACGTTTATGTCTTTGATTGCACAAATAAGAAATGAACTAATTATTCGA
Unaligned ( gi|20 ): AAATGCGAACAATAGCTTAGGAAGTTTTTAATATTATTCACACAAG






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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tTGTGGT-G-GTGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ATA-TTT--CAAC-CTT-TCGATACTTTAGTTTCTa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtgcatgtttaacttacT--GTGGGTTA-AG-TAG-TAT--ATTGTGC-GGG--ACG-GTGT-TGGTATGTCG-C-TAA-GGCGG-TG-CA-ATAGCTG-TG--CTGATAAACG-TAACTTGT-GT-ATG-CGGGGTATGAT---A-TTT--CTGTA----TG---TAGAGAGTTTCAGTAATA-ACATTTTGCG-AAGACTT-G-CAACTC-TATGAG-ATCGA-GTGGGC-CGTA-TGACGT-Gatgcgttccatacaatgtagtcgctaagtagtgacgttagcgtaattattatgttacaataccacgaaaatacgttactgtctttgattgcaagaaaaataaggtaactgattacttaagaaaagaagaaactatttc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gagatactttgcaagaggtgaggtaGTAGC-G-ATGG--ATGA-----ACGAG-AAAG----ACG-CTTT-CAAC-GTT-TCGATACTTTAGTTTCT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C-G-ATGG--ATAA-----ACGAGAAAAG----ACG-TTTC-CAAC-ACT-atgcattacatacaatgtgatcgttatgtaatgacgttagcgaaattattacatcacaattaataccgcgaaaatacgttactgtctttgattgcacaaataagatgcttgattaaaatgaagtaactatttca
gi|16                         :                                                                                                      ACCCGATACTG-TCG-TCTGCGGCTTTTCC-TCGGTTTTCCTTTCCGC-CT-CAACTT-TTGTA--CA-AATA--CT-A-GTATG----ATGTCG--T-TTTCCTGG-GCAATTCTTGCATGTT--TTCTT-AGAT-T---T--ACATTC-GGCTATTTT-GTGA--TTTCC-CAAGCAagttttatggcgttacatacaatgtatcgttaagtaatgacgttagccgtaatctattacgtcaccaataatacgcaaaaaaggttactgtctttgattgcacaataagatacatgtaactgatataagaaatgaagtaactattt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agcgactgtagttgtgcatgtggtgtcAGTGTAGT-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----GCG-TTT--CAAC-CTT-TCAATct
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttaaagatgatcaaattaatgattttaaaatgattcacttctttctattttattgttctatctctattacatgtttttttttaaaacattTCTG-TTGGG--CGTA-AGA-GT-GGG-GG---ACTA-GC-GGT-ATTT-GTATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGG--AAA-
gi|2                          :                                                                                                      ACCTGCTGCTGCTAGATTTGCGG--TATAC-TCGGTTTTCGTTTTGTAGCT-CAACAG-TGTTA--CA-AA-A--CT-ATGTAGG----AGTTCG--TGTTTCCTGG-GCAATTCTTACATGTT--TTCTT-AGAT-C---TTCACATTTGGGCT-TTTT-ATGA--TT-CC-CAAGCA----------------------TGCCTTCTC-TT-AACGACCCGTTGT---TTCGTTCGTC-TACAGAC-TTACTTTTGTG-CA---TGATACTGGGAGCATGT---AAATAGT-TGCAGAAA-------ATACAT-G-T----TTTCTGG-----TTATGTCTG-TT--TTTACT-CTGA-TTTTTC---TCAGC--GC-TGG--CTAAA---ACAAGCCG--AAGTA-GGATGTA-AAACTTGAGG--------TTTGTATTGTATCATACGAA-TTCGCTGACCGGCCTA--GCTTTCTTTAATTGTTAA--TCTCG-T-TTTCTA--GTACCGGTAGCTCTAA-GTTGCGGTAAAGTCC-TTG-GTCACT--CGATCCCGTT-GGCACGTACCA-AGTTTCCCCTTAATCGAT--CCCGGTATTTTGTTCAAT-A--GATCGGAA-TAGTAAGCTTCCGTAAGATTCA------TC----ATG--TTGATCCATGCTTTCT--AAACCTCT---GA-TG-TAGTTTTCCAC---ACCATCGTA-GAAA------TCTTTCAA--CCCC-CAAA-T---A-----TCAGA--CGTGGT---TTTGGTA----GA-C-TAATA-GA---TTT-GCA-------TATATG----CGTCAATGATTTTT----TGCGGCTGACCAAATCTA--C-T-T--TT---A---G-ACCTGTAG-A-GCTTGAGCGT------A-TGTGTATT-G---TA-------AT-TGTAAGACCTGCGATA-CATTGGCTTGC-TT----CTCC-A-TAT-AGCTGGAA--TTTGA--G-ATAAT-----TAAA---CTT--TTG-AAAC-ATCATT--CAAA---GACA--A---AT-T-TCG----GCA--CGG-CGGCT-----GA--CGTAA--A-GAATC--CCA----AAATG--GCTGC-AAGTCTAACA-T--TTT--CC-GCC--AAA-C--GATGGTA--AAT-A-A--GC-TT-GGTA---A---CTT--TGG--T-ATAT-GCTAGT-GTTTGT-ACTCACGGAA-CCTG--AGA---TA---CT-C---------ATTGTAG-CTT--GTGG-T-A-AG-TAG-TAC--TTTGTGC-GGG--ACG-G-GC-TTGCGTGTCG-C-TAACGGTG--TC-GA-A---CTG-TG--CTGATAAACG-TAT-CCGTGGC-ATG-CGGTTT----A---A-ACT--CTG-A----TG---TA-AG-----CGG-AATA-G---TTTGCG-AAG---T-G-CA---T-TAT--G-GTCTG-TTGG---CGTA-TGA-GT-GGG-G----ACTA-GC-GGT-TTTCTACATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGG--AAAAT--GTCATTTG--AATATCAAACTG----TATACC---TGT-AGCTTCT-AG--ATTTCCTCT--TC---TG--TTCA-TCTTCCGATATTTCCTCCAGAATTTTAGCAT----ACTCT-ACAGAATGGTCTTCCTCTTTGTTACG-AAT-TAAG-TCTCT--A--ATAGTG-G-AAAGTCCATTCACA--TTA----TG-T-T----T-CGT-AAT----AAT-TCT-TC--AGAA-TTTCC-A-TT-CACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTGTG-CG---C--GGC-TCTC-ATTGATT-TTAGCTTGGAAC-TCATTCCGATT-TG-TCAC-GGCACC--AAATGT-GC-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ACG-TTTC-AAAC-GTT-TCGAT-CTTTAGTTTCT
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttcctgatttcgtAAG-CCTTT--ACGA-AGTG-GGAAAGTCCATTCACA-ATTAAATATGGT-TCAAAT-CGT-AATTTGAAAT-TATGTCCAAGTA-TTTCCTA-TTTCACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTATGACG---CGGGGC-TCTCGAGTGATTATTAGCTAAGAACTTCATTCCAATT-TG-TCACGGGCAC----AATTAAGC-GAATGGCAATAAAAACGACGAG-AAAACAGCGCA-TTTCAGAACTGAT-CCGATACTT---TTTCT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCT--AAACCACA---GA-CA-TAGCTTTCCAT---TTTAGCATA-AAAT------TATTTTAAACTTTC-CGTA-TTTGAC----TCAGG--AGCGGGCAGTTCGGCA--------------AGA---TTTTTCA-------TGAACG----TATTTATAAGCCTG----TGTTTTTGTCCAAATCT-----T-TCATT---A--AA-AACTGAA------TTGCG-GTTGGATAA-TTTGCATTTG---TT-------ATCTGTAAC-CCAGCAATA-CATTGACTTGC-AT----CACC-A-ATT-AAATGAGA--TTTCA--A-ATAAT-----TGAA---TTT--CTGTG--C-GTTTGT--TA------ACA--AGTCAT-TTCTGT--------CGA-TAGAT-----CC--CCCAA--ATGAATC--CCA----AAACG--ACTGC-CAGTGTGACA-G-ATTC--CC-GTC--GAAagtccaagcgtaataaaaacataacaatagtgaatcgttaagtaattgcgttaatcgtaattattacgtcacaattaatacacgcgaaaatacgttgacatgtctatggattgaaagataagactggtcaatattaaaagactcaaagggattagtaaactatttcac
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): TCGAGACTATAGACAGCTCTGCTACACTGTCAATCAAAAAAATAGTTAGGTTCGTGTCTTCACACGTACAGTCTACTGTTTTCCGTCGGGTGAAGCAGGGTGCTACGGCAGTTTTCAAAGAACATGTGACCTCGTTGGCGTTCGATGTAGATGAATGCATATTAGCGACTGTAGTTGCGATGTGGTGTCACCTGTTAA
Unaligned ( gi|18 ): GACGTTAGCGTAATTATTACGTCACAAAATACCGCGAAAATACGTTTATGTCTTTGATTGCACAAATAAGAAATGAACTAATTATTCGA
Unaligned ( gi|20 ): AAATGCGAACAATAGCTTAGGAAGTTTTTAATATTATTCACACAAG






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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tTGTGGT-G-GTGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ATA-TTT--CAAC-CTT-TCGATACTTTAGTTTCTa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtgcatgtttaacttacT--GTGGGTTA-AG-TAG-TAT--ATTGTGC-GGG--ACG-GTGT-TGGTATGTCG-C-TAA-GGCGG-TG-CA-ATAGCTG-TG--CTGATAAACG-TAACTTGT-GT-ATG-CGGGGTATGAT---A-TTT--CTGTA----TG---TAGAGAGTTTCAGTAATA-ACATTTTGCG-AAGACTT-G-CAACTC-TATGAG-ATCGA-GTGGGC-CGTA-TGACGT-Gatgcgttccatacaatgtagtcgctaagtagtgacgttagcgtaattattatgttacaataccacgaaaatacgttactgtctttgattgcaagaaaaataaggtaactgattacttaagaaaagaagaaactatttc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gagatactttgcaagaggtgaggtaGTAGC-G-ATGG--ATGA-----ACGAG-AAAG----ACG-CTTT-CAAC-GTT-TCGATACTTTAGTTTCT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C-G-ATGG--ATAA-----ACGAGAAAAG----ACG-TTTC-CAAC-ACT-atgcattacatacaatgtgatcgttatgtaatgacgttagcgaaattattacatcacaattaataccgcgaaaatacgttactgtctttgattgcacaaataagatgcttgattaaaatgaagtaactatttca
gi|16                         :                                                                                                      ACCCGATACTG-TCG-TCTGCGGCTTTTCC-TCGGTTTTCCTTTCCGC-CT-CAACTT-TTGTA--CA-AATA--CT-A-GTATG----ATGTCG--T-TTTCCTGG-GCAATTCTTGCATGTT--TTCTT-AGAT-T---T--ACATTC-GGCTATTTT-GTGA--TTTCC-CAAGCAagttttatggcgttacatacaatgtatcgttaagtaatgacgttagccgtaatctattacgtcaccaataatacgcaaaaaaggttactgtctttgattgcacaataagatacatgtaactgatataagaaatgaagtaactattt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agcgactgtagttgtgcatgtggtgtcAGTGTAGT-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----GCG-TTT--CAAC-CTT-TCAATct
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttaaagatgatcaaattaatgattttaaaatgattcacttctttctattttattgttctatctctattacatgtttttttttaaaacattTCTG-TTGGG--CGTA-AGA-GT-GGG-GG---ACTA-GC-GGT-ATTT-GTATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGG--AAA-
gi|2                          :                                                                                                      ACCTGCTGCTGCTAGATTTGCGG--TATAC-TCGGTTTTCGTTTTGTAGCT-CAACAG-TGTTA--CA-AA-A--CT-ATGTAGG----AGTTCG--TGTTTCCTGG-GCAATTCTTACATGTT--TTCTT-AGAT-C---TTCACATTTGGGCT-TTTT-ATGA--TT-CC-CAAGCA----------------------TGCCTTCTC-TT-AACGACCCGTTGT---TTCGTTCGTC-TACAGAC-TTACTTTTGTG-CA---TGATACTGGGAGCATGT---AAATAGT-TGCAGAAA-------ATACAT-G-T----TTTCTGG-----TTATGTCTG-TT--TTTACT-CTGA-TTTTTC---TCAGC--GC-TGG--CTAAA---ACAAGCCG--AAGTA-GGATGTA-AAACTTGAGG--------TTTGTATTGTATCATACGAA-TTCGCTGACCGGCCTA--GCTTTCTTTAATTGTTAA--TCTCG-T-TTTCTA--GTACCGGTAGCTCTAA-GTTGCGGTAAAGTCC-TTG-GTCACT--CGATCCCGTT-GGCACGTACCA-AGTTTCCCCTTAATCGAT--CCCGGTATTTTGTTCAAT-A--GATCGGAA-TAGTAAGCTTCCGTAAGATTCA------TC----ATG--TTGATCCATGCTTTCT--AAACCTCT---GA-TG-TAGTTTTCCAC---ACCATCGTA-GAAA------TCTTTCAA--CCCC-CAAA-T---A-----TCAGA--CGTGGT---TTTGGTA----GA-C-TAATA-GA---TTT-GCA-------TATATG----CGTCAATGATTTTT----TGCGGCTGACCAAATCTA--C-T-T--TT---A---G-ACCTGTAG-A-GCTTGAGCGT------A-TGTGTATT-G---TA-------AT-TGTAAGACCTGCGATA-CATTGGCTTGC-TT----CTCC-A-TAT-AGCTGGAA--TTTGA--G-ATAAT-----TAAA---CTT--TTG-AAAC-ATCATT--CAAA---GACA--A---AT-T-TCG----GCA--CGG-CGGCT-----GA--CGTAA--A-GAATC--CCA----AAATG--GCTGC-AAGTCTAACA-T--TTT--CC-GCC--AAA-C--GATGGTA--AAT-A-A--GC-TT-GGTA---A---CTT--TGG--T-ATAT-GCTAGT-GTTTGT-ACTCACGGAA-CCTG--AGA---TA---CT-C---------ATTGTAG-CTT--GTGG-T-A-AG-TAG-TAC--TTTGTGC-GGG--ACG-G-GC-TTGCGTGTCG-C-TAACGGTG--TC-GA-A---CTG-TG--CTGATAAACG-TAT-CCGTGGC-ATG-CGGTTT----A---A-ACT--CTG-A----TG---TA-AG-----CGG-AATA-G---TTTGCG-AAG---T-G-CA---T-TAT--G-GTCTG-TTGG---CGTA-TGA-GT-GGG-G----ACTA-GC-GGT-TTTCTACATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGG--AAAAT--GTCATTTG--AATATCAAACTG----TATACC---TGT-AGCTTCT-AG--ATTTCCTCT--TC---TG--TTCA-TCTTCCGATATTTCCTCCAGAATTTTAGCAT----ACTCT-ACAGAATGGTCTTCCTCTTTGTTACG-AAT-TAAG-TCTCT--A--ATAGTG-G-AAAGTCCATTCACA--T---TA-TG-T-T----T-CGT-AAT----AAT-TCT-TC--AGAA-TTTCC-A-TT-CACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTGTG-CG---C--GGC-TCTC-ATTGATT-TTAGCTTGGAAC-TCATTCCGATT-TG-TCAC-GGCACC--AAATGT-GC-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ACG-TTTC-AAAC-GTT-TCGAT-CTTTAGTTTCT
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttcctgatttcgtAAG-CCTTT--ACGA-AGTG-GGAAAGTCCATTCACAATTAAATA-TGGT-TCAAAT-CGT-AATTTGAAAT-TATGTCCAAGTA-TTTCCTA-TTTCACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTATGACG---CGGGGC-TCTCGAGTGATTATTAGCTAAGAACTTCATTCCAATT-TG-TCACGGGCAC----AATTAAGC-GAATGGCAATAAAAACGACGAG-AAAACAGCGCA-TTTCAGAACTGAT-CCGATACTT---TTTCT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCT--AAACCACA---GA-CA-TAGCTTTCCAT---TTTAGCATA-AAAT------TATTTTAAACTTTC-CGTA-TTTGAC----TCAGG--AGCGGGCAGTTCGGCA--------------AGA---TTTTTCA-------TGAACG----TATTTATAAGCCTG----TGTTTTTGTCCAAATCT-----T-TCATT---A--AA-AACTGAA------TTGCG-GTTGGATAA-TTTGCATTTG---TT-------ATCTGTAAC-CCAGCAATA-CATTGACTTGC-AT----CACC-A-ATT-AAATGAGA--TTTCA--A-ATAAT-----TGAA---TTT--CTGTG--C-GTTTGT--TA------ACA--AGTCAT-TTCTGT--------CGA-TAGAT-----CC--CCCAA--ATGAATC--CCA----AAACG--ACTGC-CAGTGTGACA-G-ATTC--CC-GTC--GAAagtccaagcgtaataaaaacataacaatagtgaatcgttaagtaattgcgttaatcgtaattattacgtcacaattaatacacgcgaaaatacgttgacatgtctatggattgaaagataagactggtcaatattaaaagactcaaagggattagtaaactatttcac
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): TCGAGACTATAGACAGCTCTGCTACACTGTCAATCAAAAAAATAGTTAGGTTCGTGTCTTCACACGTACAGTCTACTGTTTTCCGTCGGGTGAAGCAGGGTGCTACGGCAGTTTTCAAAGAACATGTGACCTCGTTGGCGTTCGATGTAGATGAATGCATATTAGCGACTGTAGTTGCGATGTGGTGTCACCTGTTAA
Unaligned ( gi|18 ): GACGTTAGCGTAATTATTACGTCACAAAATACCGCGAAAATACGTTTATGTCTTTGATTGCACAAATAAGAAATGAACTAATTATTCGA
Unaligned ( gi|20 ): AAATGCGAACAATAGCTTAGGAAGTTTTTAATATTATTCACACAAG






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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tTGTGGT-G-GTGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ATA-TTT--CAAC-CTT-TCGATACTTTAGTTTCTa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtgcatgtttaacttacT--GTGGGTTA-AG-TAG-TAT--ATTGTGC-GGG--ACG-GTGT-TGGTATGTCG-C-TAA-GGCGG-TG-CA-ATAGCTG-TG--CTGATAAACG-TAACTTGT-GT-ATG-CGGGGTATGAT---A-TTT--CTGTA----TG---TAGAGAGTTTCAGTAATA-ACATTTTGCG-AAGACTT-G-CAACTC-TATGAG-ATCGA-GTGGGC-CGTA-TGACGT-Gatgcgttccatacaatgtagtcgctaagtagtgacgttagcgtaattattatgttacaataccacgaaaatacgttactgtctttgattgcaagaaaaataaggtaactgattacttaagaaaagaagaaactatttc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gagatactttgcaagaggtgaggtaGTAGC-G-ATGG--ATGA-----ACGAG-AAAG----ACG-CTTT-CAAC-GTT-TCGATACTTTAGTTTCT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C-G-ATGG--ATAA-----ACGAGAAAAG----ACG-TTTC-CAAC-ACT-atgcattacatacaatgtgatcgttatgtaatgacgttagcgaaattattacatcacaattaataccgcgaaaatacgttactgtctttgattgcacaaataagatgcttgattaaaatgaagtaactatttca
gi|16                         :                                                                                                      ACCCGATACTG-TCG-TCTGCGGCTTTTCC-TCGGTTTTCCTTTCCGC-CT-CAACTT-TTGTA--CA-AATA--CT-A-GTATG----ATGTCG--T-TTTCCTGG-GCAATTCTTGCATGTT--TTCTT-AGAT-T---T--ACATTC-GGCTATTTT-GTGA--TTTCC-CAAGCAagttttatggcgttacatacaatgtatcgttaagtaatgacgttagccgtaatctattacgtcaccaataatacgcaaaaaaggttactgtctttgattgcacaataagatacatgtaactgatataagaaatgaagtaactattt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agcgactgtagttgtgcatgtggtgtcAGTGTAGT-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----GCG-TTT--CAAC-CTT-TCAATct
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttaaagatgatcaaattaatgattttaaaatgattcacttctttctattttattgttctatctctattacatgtttttttttaaaacattTCTG-TTGGG--CGTA-AGA-GT-GGG-GG---ACTA-GC-GGT-ATTT-GTATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGG--AAA-
gi|2                          :                                                                                                      ACCTGCTGCTGCTAGATTTGCGG--TATAC-TCGGTTTTCGTTTTGTAGCT-CAACAG-TGTTA--CA-AA-A--CT-ATGTAGG----AGTTCG--TGTTTCCTGG-GCAATTCTTACATGTT--TTCTT-AGAT-C---TTCACATTTGGGCT-TTTT-ATGA--TT-CC-CAAGCA----------------------TGCCTTCTC-TT-AACGACCCGTTGT---TTCGTTCGTC-TACAGAC-TTACTTTTGTG-CA---TGATACTGGGAGCATGT---AAATAGT-TGCAGAAA-------ATACAT-G-T----TTTCTGG-----TTATGTCTG-TT--TTTACT-CTGA-TTTTTC---TCAGC--GC-TGG--CTAAA---ACAAGCCG--AAGTA-GGATGTA-AAACTTGAGG--------TTTGTATTGTATCATACGAA-TTCGCTGACCGGCCTA--GCTTTCTTTAATTGTTAA--TCTCG-T-TTTCTA--GTACCGGTAGCTCTAA-GTTGCGGTAAAGTCC-TTG-GTCACT--CGATCCCGTT-GGCACGTACCA-AGTTTCCCCTTAATCGAT--CCCGGTATTTTGTTCAAT-A--GATCGGAA-TAGTAAGCTTCCGTAAGATTCA------TC----ATG--TTGATCCATGCTTTCT--AAACCTCT---GA-TG-TAGTTTTCCAC---ACCATCGTA-GAAA------TCTTTCAA--CCCC-CAAA-T---A-----TCAGA--CGTGGT---TTTGGTA----GA-C-TAATA-GA---TTT-GCA-------TATATG----CGTCAATGATTTTT----TGCGGCTGACCAAATCTA--C-T-T--TT---A---G-ACCTGTAG-A-GCTTGAGCGT------A-TGTGTATT-G---TA-------AT-TGTAAGACCTGCGATA-CATTGGCTTGC-TT----CTCC-A-TAT-AGCTGGAA--TTTGA--G-ATAAT-----TAAA---CTT--TTG-AAAC-ATCATT--CAAA---GACA--A---AT-T-TCG----GCA--CGG-CGGCT-----GA--CGTAA--A-GAATC--CCA----AAATG--GCTGC-AAGTCTAACA-T--TTT--CC-GCC--AAA-C--GATGGTA--AAT-A-A--GC-TT-GGTA---A---CTT--TGG--T-ATAT-GCTAGT-GTTTGT-ACTCACGGAA-CCTG--AGA---TA---CT-C---------ATTGTAG-CTT--GTGG-T-A-AG-TAG-TAC--TTTGTGC-GGG--ACG-G-GC-TTGCGTGTCG-C-TAACGGTG--TC-GA-A---CTG-TG--CTGATAAACG-TAT-CCGTGGC-ATG-CGGTTT----A---A-ACT--CTG-A----TG---TA-AG-----CGG-AATA-G---TTTGCG-AAG---T-G-CA---T-TAT--G-GTCTG-TTGG---CGTA-TGA-GT-GGG-G----ACTA-GC-GGT-TTTCTACATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGG--AAAAT--GTCATTTG--AATATCAAACTG----TATACC---TGT-AGCTTCT-AG--ATTTCCTCT--TC---TG--TTCA-TCTTCCGATATTTCCTCCAGAATTTTAGCAT----ACTCT-ACAGAATGGTCTTCCTCTTTGTTACG-AAT-TAAG-TCTCT--A--ATAGTG-G-AAAGTCCATTCACA--TTA----TG-T-T----T-CGT-AAT----AAT-TCT-TC--AGAA-TTTCC-A-TT-CACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTGTG-CG---C--GGC-TCTC-ATTGATT-TTAGCTTGGAAC-TCATTCCGATT-TG-TCAC-GGCACC--AAATGT-GC-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ACG-TTTC-AAAC-GTT-TCGAT-CTTTAGTTTCT
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttcctgatttcgtAAG-CCTTT--ACGA-AGTG-GGAAAGTCCATTCACA-ATTAAATATGGT-TCAAAT-CGT-AATTTGAAAT-TATGTCCAAGTA-TTTCCTA-TTTCACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTATGACG---CGGGGC-TCTCGAGTGATTATTAGCTAAGAACTTCATTCCAATT-TG-TCACGGGCAC----AATTAAGC-GAATGGCAATAAAAACGACGAG-AAAACAGCGCA-TTTCAGAACTGAT-CCGATACTT---TTTCT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCT--AAACCACA---GA-CA-TAGCTTTCCAT---TTTAGCATA-AAAT------TATTTTAAACTTTC-CGTA-TTTGAC----TCAGG--AGCGGGCAGTTCGGCA--------------AGA---TTTTTCA-------TGAACG----TATTTATAAGCCTG----TGTTTTTGTCCAAATCT-----T-TCATT---A--AA-AACTGAA------TTGCG-GTTGGATAA-TTTGCATTTG---TT-------ATCTGTAAC-CCAGCAATA-CATTGACTTGC-AT----CACC-A-ATT-AAATGAGA--TTTCA--A-ATAAT-----TGAA---TTT--CTGTG--C-GTTTGT--TA------ACA--AGTCAT-TTCTGT--------CGA-TAGAT-----CC--CCCAA--ATGAATC--CCA----AAACG--ACTGC-CAGTGTGACA-G-ATTC--CC-GTC--GAAagtccaagcgtaataaaaacataacaatagtgaatcgttaagtaattgcgttaatcgtaattattacgtcacaattaatacacgcgaaaatacgttgacatgtctatggattgaaagataagactggtcaatattaaaagactcaaagggattagtaaactatttcac
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): TCGAGACTATAGACAGCTCTGCTACACTGTCAATCAAAAAAATAGTTAGGTTCGTGTCTTCACACGTACAGTCTACTGTTTTCCGTCGGGTGAAGCAGGGTGCTACGGCAGTTTTCAAAGAACATGTGACCTCGTTGGCGTTCGATGTAGATGAATGCATATTAGCGACTGTAGTTGCGATGTGGTGTCACCTGTTAA
Unaligned ( gi|18 ): GACGTTAGCGTAATTATTACGTCACAAAATACCGCGAAAATACGTTTATGTCTTTGATTGCACAAATAAGAAATGAACTAATTATTCGA
Unaligned ( gi|20 ): AAATGCGAACAATAGCTTAGGAAGTTTTTAATATTATTCACACAAG






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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tTGTGGT-G-GTGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ATA-TTT--CAAC-CTT-TCGATACTTTAGTTTCTa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtgcatgtttaacttacT--GTGGGTTA-AG-TAG-TAT--ATTGTGC-GGG--ACG-GTGT-TGGTATGTCG-C-TAA-GGCGG-TG-CA-ATAGCTG-TG--CTGATAAACG-TAACTTGT-GT-ATG-CGGGGTATGAT---A-TTT--CTGTA----TG---TAGAGAGTTTCAGTAATA-ACATTTTGCG-AAGACTT-G-CAACTC-TATGAG-ATCGA-GTGGGC-CGTA-TGACGT-Gatgcgttccatacaatgtagtcgctaagtagtgacgttagcgtaattattatgttacaataccacgaaaatacgttactgtctttgattgcaagaaaaataaggtaactgattacttaagaaaagaagaaactatttc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gagatactttgcaagaggtgaggtaGTAGC-G-ATGG--ATGA-----ACGAG-AAAG----ACG-CTTT-CAAC-GTT-TCGATACTTTAGTTTCT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C-G-ATGG--ATAA-----ACGAGAAAAG----ACG-TTTC-CAAC-ACT-atgcattacatacaatgtgatcgttatgtaatgacgttagcgaaattattacatcacaattaataccgcgaaaatacgttactgtctttgattgcacaaataagatgcttgattaaaatgaagtaactatttca
gi|16                         :                                                                                                      ACCCGATACTG-TCG-TCTGCGGCTTTTCC-TCGGTTTTCCTTTCCGC-CT-CAACTT-TTGTA--CA-AATA--CT-A-GTATG----ATGTCG--T-TTTCCTGG-GCAATTCTTGCATGTT--TTCTT-AGAT-T---T--ACATTC-GGCTATTTT-GTGA--TTTCC-CAAGCAagttttatggcgttacatacaatgtatcgttaagtaatgacgttagccgtaatctattacgtcaccaataatacgcaaaaaaggttactgtctttgattgcacaataagatacatgtaactgatataagaaatgaagtaactattt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agcgactgtagttgtgcatgtggtgtcAGTGTAGT-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----GCG-TTT--CAAC-CTT-TCAATct
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttaaagatgatcaaattaatgattttaaaatgattcacttctttctattttattgttctatctctattacatgtttttttttaaaacattTCTG-TTGGG--CGTA-AGA-GT-GGG-GG---ACTA-GC-GGT-ATTT-GTATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGG--AAA-
gi|2                          :                                                                                                      ACCTGCTGCTGCTAGATTTGCGG--TATAC-TCGGTTTTCGTTTTGTAGCT-CAACAG-TGTTA--CA-AA-A--CT-ATGTAGG----AGTTCG--TGTTTCCTGG-GCAATTCTTACATGTT--TTCTT-AGAT-C---TTCACATTTGGGCT-TTTT-ATGA--TT-CC-CAAGCA----------------------TGCCTTCTC-TT-AACGACCCGTTGT---TTCGTTCGTC-TACAGAC-TTACTTTTGTG-CA---TGATACTGGGAGCATGT---AAATAGT-TGCAGAAA-------ATACAT-G-T----TTTCTGG-----TTATGTCTG-TT--TTTACT-CTGA-TTTTTC---TCAGC--GC-TGG--CTAAA---ACAAGCCG--AAGTA-GGATGTA-AAACTTGAGG--------TTTGTATTGTATCATACGAA-TTCGCTGACCGGCCTA--GCTTTCTTTAATTGTTAA--TCTCG-T-TTTCTA--GTACCGGTAGCTCTAA-GTTGCGGTAAAGTCC-TTG-GTCACT--CGATCCCGTT-GGCACGTACCA-AGTTTCCCCTTAATCGAT--CCCGGTATTTTGTTCAAT-A--GATCGGAA-TAGTAAGCTTCCGTAAGATTCA------TC----ATG--TTGATCCATGCTTTCT--AAACCTCT---GA-TG-TAGTTTTCCAC---ACCATCGTA-GAAA------TCTTTCAA--CCCC-CAAA-T---A-----TCAGA--CGTGGT---TTTGGTA----GA-C-TAATA-GA---TTT-GCA-------TATATG----CGTCAATGATTTTT----TGCGGCTGACCAAATCTA--C-T-T--TT---A---G-ACCTGTAG-A-GCTTGAGCGT------A-TGTGTATT-G---TA-------AT-TGTAAGACCTGCGATA-CATTGGCTTGC-TT----CTCC-A-TAT-AGCTGGAA--TTTGA--G-ATAAT-----TAAA---CTT--TTG-AAAC-ATCATT--CAAA---GACA--A---AT-T-TCG----GCA--CGG-CGGCT-----GA--CGTAA--A-GAATC--CCA----AAATG--GCTGC-AAGTCTAACA-T--TTT--CC-GCC--AAA-C--GATGGTA--AAT-A-A--GC-TT-GGTA---A---CTT--TGG--T-ATAT-GCTAGT-GTTTGT-ACTCACGGAA-CCTG--AGA---TA---CT-C---------ATTGTAG-CTT--GTGG-T-A-AG-TAG-TAC--TTTGTGC-GGG--ACG-G-GC-TTGCGTGTCG-C-TAACGGTG--TC-GA-A---CTG-TG--CTGATAAACG-TAT-CCGTGGC-ATG-CGGTTT----A---A-ACT--CTG-A----TG---TA-AG-----CGG-AATA-G---TTTGCG-AAG---T-G-CA---T-TAT--G-GTCTG-TTGG---CGTA-TGA-GT-GGG-G----ACTA-GC-GGT-TTTCTACATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGG--AAAAT--GTCATTTG--AATATCAAACTG----TATACC---TGT-AGCTTCT-AG--ATTTCCTCT--TC---TG--TTCA-TCTTCCGATATTTCCTCCAGAATTTTAGCAT----ACTCT-ACAGAATGGTCTTCCTCTTTGTTACG-AAT-TAAG-TCTCT--A--ATAGTG-G-AAAGTCCATTCACA--T---TA-TG-T-T----T-CGT-AAT----AAT-TCT-TC--AGAA-TTTCC-A-TT-CACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTGTG-CG---C--GGC-TCTC-ATTGATT-TTAGCTTGGAAC-TCATTCCGATT-TG-TCAC-GGCACC--AAATGT-GC-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ACG-TTTC-AAAC-GTT-TCGAT-CTTTAGTTTCT
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttcctgatttcgtAAG-CCTTT--ACGA-AGTG-GGAAAGTCCATTCACAATTAAATA-TGGT-TCAAAT-CGT-AATTTGAAAT-TATGTCCAAGTA-TTTCCTA-TTTCACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTATGACG---CGGGGC-TCTCGAGTGATTATTAGCTAAGAACTTCATTCCAATT-TG-TCACGGGCAC----AATTAAGC-GAATGGCAATAAAAACGACGAG-AAAACAGCGCA-TTTCAGAACTGAT-CCGATACTT---TTTCT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCT--AAACCACA---GA-CA-TAGCTTTCCAT---TTTAGCATA-AAAT------TATTTTAAACTTTC-CGTA-TTTGAC----TCAGG--AGCGGGCAGTTCGGCA--------------AGA---TTTTTCA-------TGAACG----TATTTATAAGCCTG----TGTTTTTGTCCAAATCT-----T-TCATT---A--AA-AACTGAA------TTGCG-GTTGGATAA-TTTGCATTTG---TT-------ATCTGTAAC-CCAGCAATA-CATTGACTTGC-AT----CACC-A-ATT-AAATGAGA--TTTCA--A-ATAAT-----TGAA---TTT--CTGTG--C-GTTTGT--TA------ACA--AGTCAT-TTCTGT--------CGA-TAGAT-----CC--CCCAA--ATGAATC--CCA----AAACG--ACTGC-CAGTGTGACA-G-ATTC--CC-GTC--GAAagtccaagcgtaataaaaacataacaatagtgaatcgttaagtaattgcgttaatcgtaattattacgtcacaattaatacacgcgaaaatacgttgacatgtctatggattgaaagataagactggtcaatattaaaagactcaaagggattagtaaactatttcac
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): TCGAGACTATAGACAGCTCTGCTACACTGTCAATCAAAAAAATAGTTAGGTTCGTGTCTTCACACGTACAGTCTACTGTTTTCCGTCGGGTGAAGCAGGGTGCTACGGCAGTTTTCAAAGAACATGTGACCTCGTTGGCGTTCGATGTAGATGAATGCATATTAGCGACTGTAGTTGCGATGTGGTGTCACCTGTTAA
Unaligned ( gi|18 ): GACGTTAGCGTAATTATTACGTCACAAAATACCGCGAAAATACGTTTATGTCTTTGATTGCACAAATAAGAAATGAACTAATTATTCGA
Unaligned ( gi|20 ): AAATGCGAACAATAGCTTAGGAAGTTTTTAATATTATTCACACAAG






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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tTGTGGT-G-GTGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ATA-TTT--CAAC-CTT-TCGATACTTTAGTTTCTa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtgcatgtttaacttacT--GTGGGTTA-AG-TAG-TAT--ATTGTGC-GGG--ACG-GTGT-TGGTATGTCG-C-TAA-GGCGG-TG-CA-ATAGCTG-TG--CTGATAAACG-TAACTTGT-GT-ATG-CGGGGTATGAT---A-TTT--CTGTA----TG---TAGAGAGTTTCAGTAATA-ACATTTTGCG-AAGACTT-G-CAACTC-TATGAG-ATCGA-GTGGGC-CGTA-TGACGT-Gatgcgttccatacaatgtagtcgctaagtagtgacgttagcgtaattattatgttacaataccacgaaaatacgttactgtctttgattgcaagaaaaataaggtaactgattacttaagaaaagaagaaactatttc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gagatactttgcaagaggtgaggtaGTAGC-G-ATGG--ATGA-----ACGAG-AAAG----ACG-CTTT-CAAC-GTT-TCGATACTTTAGTTTCT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C-G-ATGG--ATAA-----ACGAGAAAAG----ACG-TTTC-CAAC-ACT-atgcattacatacaatgtgatcgttatgtaatgacgttagcgaaattattacatcacaattaataccgcgaaaatacgttactgtctttgattgcacaaataagatgcttgattaaaatgaagtaactatttca
gi|16                         :                                                                                                      ACCCGATACTG-TCG-TCTGCGGCTTTTCC-TCGGTTTTCCTTTCCGC-CT-CAACTT-TTGTA--CA-AATA--CT-A-GTATG----ATGTCG--T-TTTCCTGG-GCAATTCTTGCATGTT--TTCTT-AGAT-T---T--ACATTC-GGCTATTTT-GTGA--TTTCC-CAAGCAagttttatggcgttacatacaatgtatcgttaagtaatgacgttagccgtaatctattacgtcaccaataatacgcaaaaaaggttactgtctttgattgcacaataagatacatgtaactgatataagaaatgaagtaactattt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agcgactgtagttgtgcatgtggtgtcAGTGTAGT-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----GCG-TTT--CAAC-CTT-TCAATct
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttaaagatgatcaaattaatgattttaaaatgattcacttctttctattttattgttctatctctattacatgtttttttttaaaacattTCTG-TTGGG--CGTA-AGA-GT-GGG-GG---ACTA-GC-GGT-ATTT-GTATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGG--AAA-
gi|2                          :                                                                                                      ACCTGCTGCTGCTAGATTTGCGG--TATAC-TCGGTTTTCGTTTTGTAGCT-CAACAG-TGTTA--CA-AA-A--CT-ATGTAGG----AGTTCG--TGTTTCCTGG-GCAATTCTTACATGTT--TTCTT-AGAT-C---TTCACATTTGGGCT-TTTT-ATGA--TT-CC-CAAGCA----------------------TGCCTTCTC-TT-AACGACCCGTTGT---TTCGTTCGTC-TACAGAC-TTACTTTTGTG-CA---TGATACTGGGAGCATGT---AAATAGT-TGCAGAAA-------ATACAT-G-T----TTTCTGG-----TTATGTCTG-TT--TTTACT-CTGA-TTTTTC---TCAGC--GC-TGG--CTAAA---ACAAGCCG--AAGTA-GGATGTA-AAACTTGAGG--------TTTGTATTGTATCATACGAA-TTCGCTGACCGGCCTA--GCTTTCTTTAATTGTTAA--TCTCG-T-TTTCTA--GTACCGGTAGCTCTAA-GTTGCGGTAAAGTCC-TTG-GTCACT--CGATCCCGTT-GGCACGTACCA-AGTTTCCCCTTAATCGAT--CCCGGTATTTTGTTCAAT-A--GATCGGAA-TAGTAAGCTTCCGTAAGATTCA------TC----ATG--TTGATCCATGCTTTCT--AAACCTCT---GA-TG-TAGTTTTCCAC---ACCATCGTA-GAAA------TCTTTCAA--CCCC-CAAA-T---A-----TCAGA--CGTGGT---TTTGGTA----GA-C-TAATA-GA---TTT-GCA-------TATATG----CGTCAATGATTTTT----TGCGGCTGACCAAATCTA--C-T-T--TT---A---G-ACCTGTAG-A-GCTTGAGCGT------A-TGTGTATT-G---TA-------AT-TGTAAGACCTGCGATA-CATTGGCTTGC-TT----CTCC-A-TAT-AGCTGGAA--TTTGA--G-ATAAT-----TAAA---CTT--TTG-AAAC-ATCATT--CAAA---GACA--A---AT-T-TCG----GCA--CGG-CGGCT-----GA--CGTAA--A-GAATC--CCA----AAATG--GCTGC-AAGTCTAACA-T--TTT--CC-GCC--AAA-C--GATGGTA--AAT-A-A--GC-TT-GGTA---A---CTT--TGG--T-ATAT-GCTAGT-GTTTGT-ACTCACGGAA-CCTG--AGA---TA---CT-C---------ATTGTAG-CTT--GTGG-T-A-AG-TAG-TAC--TTTGTGC-GGG--ACG-G-GC-TTGCGTGTCG-C-TAACGGTG--TC-GA-A---CTG-TG--CTGATAAACG-TAT-CCGTGGC-ATG-CGGTTT----A---A-ACT--CTG-A----TG---TA-AG-----CGG-AATA-G---TTTGCG-AAG---T-G-CA---T-TAT--G-GTCTG-TTGG---CGTA-TGA-GT-GGG-G----ACTA-GC-GGT-TTTCTACATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGG--AAAAT--GTCATTTG--AATATCAAACTG----TATACC---TGT-AGCTTCT-AG--ATTTCCTCT--TC---TG--TTCA-TCTTCCGATATTTCCTCCAGAATTTTAGCAT----ACTCT-ACAGAATGGTCTTCCTCTTTGTTACG-AAT-TAAG-TCTCT--A--ATAGTG-G-AAAGTCCATTCACA--TTA----TG-T-T----T-CGT-AAT----AAT-TCT-TC--AGAA-TTTCC-A-TT-CACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTGTG-CG---C--GGC-TCTC-ATTGATT-TTAGCTTGGAAC-TCATTCCGATT-TG-TCAC-GGCACC--AAATGT-GC-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ACG-TTTC-AAAC-GTT-TCGAT-CTTTAGTTTCT
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttcctgatttcgtAAG-CCTTT--ACGA-AGTG-GGAAAGTCCATTCACA-ATTAAATATGGT-TCAAAT-CGT-AATTTGAAAT-TATGTCCAAGTA-TTTCCTA-TTTCACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTATGACG---CGGGGC-TCTCGAGTGATTATTAGCTAAGAACTTCATTCCAATT-TG-TCACGGGCAC----AATTAAGC-GAATGGCAATAAAAACGACGAG-AAAACAGCGCA-TTTCAGAACTGAT-CCGATACTT---TTTCT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCT--AAACCACA---GA-CA-TAGCTTTCCAT---TTTAGCATA-AAAT------TATTTTAAACTTTC-CGTA-TTTGAC----TCAGG--AGCGGGCAGTTCGGCA--------------AGA---TTTTTCA-------TGAACG----TATTTATAAGCCTG----TGTTTTTGTCCAAATCT-----T-TCATT---A--AA-AACTGAA------TTGCG-GTTGGATAA-TTTGCATTTG---TT-------ATCTGTAAC-CCAGCAATA-CATTGACTTGC-AT----CACC-A-ATT-AAATGAGA--TTTCA--A-ATAAT-----TGAA---TTT--CTGTG--C-GTTTGT--TA------ACA--AGTCAT-TTCTGT--------CGA-TAGAT-----CC--CCCAA--ATGAATC--CCA----AAACG--ACTGC-CAGTGTGACA-G-ATTC--CC-GTC--GAAagtccaagcgtaataaaaacataacaatagtgaatcgttaagtaattgcgttaatcgtaattattacgtcacaattaatacacgcgaaaatacgttgacatgtctatggattgaaagataagactggtcaatattaaaagactcaaagggattagtaaactatttcac
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): TCGAGACTATAGACAGCTCTGCTACACTGTCAATCAAAAAAATAGTTAGGTTCGTGTCTTCACACGTACAGTCTACTGTTTTCCGTCGGGTGAAGCAGGGTGCTACGGCAGTTTTCAAAGAACATGTGACCTCGTTGGCGTTCGATGTAGATGAATGCATATTAGCGACTGTAGTTGCGATGTGGTGTCACCTGTTAA
Unaligned ( gi|18 ): GACGTTAGCGTAATTATTACGTCACAAAATACCGCGAAAATACGTTTATGTCTTTGATTGCACAAATAAGAAATGAACTAATTATTCGA
Unaligned ( gi|20 ): AAATGCGAACAATAGCTTAGGAAGTTTTTAATATTATTCACACAAG






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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tTGTGGT-G-GTGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ATA-TTT--CAAC-CTT-TCGATACTTTAGTTTCTa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtgcatgtttaacttacT--GTGGGTTA-AG-TAG-TAT--ATTGTGC-GGG--ACG-GTGT-TGGTATGTCG-C-TAA-GGCGG-TG-CA-ATAGCTG-TG--CTGATAAACG-TAACTTGT-GT-ATG-CGGGGTATGAT---A-TTT--CTGTA----TG---TAGAGAGTTTCAGTAATA-ACATTTTGCG-AAGACTT-G-CAACTC-TATGAG-ATCGA-GTGGGC-CGTA-TGACGT-Gatgcgttccatacaatgtagtcgctaagtagtgacgttagcgtaattattatgttacaataccacgaaaatacgttactgtctttgattgcaagaaaaataaggtaactgattacttaagaaaagaagaaactatttc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gagatactttgcaagaggtgaggtaGTAGC-G-ATGG--ATGA-----ACGAG-AAAG----ACG-CTTT-CAAC-GTT-TCGATACTTTAGTTTCT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C-G-ATGG--ATAA-----ACGAGAAAAG----ACG-TTTC-CAAC-ACT-atgcattacatacaatgtgatcgttatgtaatgacgttagcgaaattattacatcacaattaataccgcgaaaatacgttactgtctttgattgcacaaataagatgcttgattaaaatgaagtaactatttca
gi|16                         :                                                                                                      ACCCGATACTG-TCG-TCTGCGGCTTTTCC-TCGGTTTTCCTTTCCGC-CT-CAACTT-TTGTA--CA-AATA--CT-A-GTATG----ATGTCG--T-TTTCCTGG-GCAATTCTTGCATGTT--TTCTT-AGAT-T---T--ACATTC-GGCTATTTT-GTGA--TTTCC-CAAGCAagttttatggcgttacatacaatgtatcgttaagtaatgacgttagccgtaatctattacgtcaccaataatacgcaaaaaaggttactgtctttgattgcacaataagatacatgtaactgatataagaaatgaagtaactattt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agcgactgtagttgtgcatgtggtgtcAGTGTAGT-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----GCG-TTT--CAAC-CTT-TCAATct
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttaaagatgatcaaattaatgattttaaaatgattcacttctttctattttattgttctatctctattacatgtttttttttaaaacattTCTG-TTGGG--CGTA-AGA-GT-GGG-GG---ACTA-GC-GGT-ATTT-GTATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGG--AAA-
gi|2                          :                                                                                                      ACCTGCTGCTGCTAGATTTGCGG--TATAC-TCGGTTTTCGTTTTGTAGCT-CAACAG-TGTTA--CA-AA-A--CT-ATGTAGG----AGTTCG--TGTTTCCTGG-GCAATTCTTACATGTT--TTCTT-AGAT-C---TTCACATTTGGGCT-TTTT-ATGA--TT-CC-CAAGCA----------------------TGCCTTCTC-TT-AACGACCCGTTGT---TTCGTTCGTC-TACAGAC-TTACTTTTGTG-CA---TGATACTGGGAGCATGT---AAATAGT-TGCAGAAA-------ATACAT-G-T----TTTCTGG-----TTATGTCTG-TT--TTTACT-CTGA-TTTTTC---TCAGC--GC-TGG--CTAAA---ACAAGCCG--AAGTA-GGATGTA-AAACTTGAGG--------TTTGTATTGTATCATACGAA-TTCGCTGACCGGCCTA--GCTTTCTTTAATTGTTAA--TCTCG-T-TTTCTA--GTACCGGTAGCTCTAA-GTTGCGGTAAAGTCC-TTG-GTCACT--CGATCCCGTT-GGCACGTACCA-AGTTTCCCCTTAATCGAT--CCCGGTATTTTGTTCAAT-A--GATCGGAA-TAGTAAGCTTCCGTAAGATTCA------TC----ATG--TTGATCCATGCTTTCT--AAACCTCT---GA-TG-TAGTTTTCCAC---ACCATCGTA-GAAA------TCTTTCAA--CCCC-CAAA-T---A-----TCAGA--CGTGGT---TTTGGTA----GA-C-TAATA-GA---TTT-GCA-------TATATG----CGTCAATGATTTTT----TGCGGCTGACCAAATCTA--C-T-T--TT---A---G-ACCTGTAG-A-GCTTGAGCGT------A-TGTGTATT-G---TA-------AT-TGTAAGACCTGCGATA-CATTGGCTTGC-TT----CTCC-A-TAT-AGCTGGAA--TTTGA--G-ATAAT-----TAAA---CTT--TTG-AAAC-ATCATT--CAAA---GACA--A---AT-T-TCG----GCA--CGG-CGGCT-----GA--CGTAA--A-GAATC--CCA----AAATG--GCTGC-AAGTCTAACA-T--TTT--CC-GCC--AAA-C--GATGGTA--AAT-A-A--GC-TT-GGTA---A---CTT--TGG--T-ATAT-GCTAGT-GTTTGT-ACTCACGGAA-CCTG--AGA---TA---CT-C---------ATTGTAG-CTT--GTGG-T-A-AG-TAG-TAC--TTTGTGC-GGG--ACG-G-GC-TTGCGTGTCG-C-TAACGGTG--TC-GA-A---CTG-TG--CTGATAAACG-TAT-CCGTGGC-ATG-CGGTTT----A---A-ACT--CTG-A----TG---TA-AG-----CGG-AATA-G---TTTGCG-AAG---T-G-CA---T-TAT--G-GTCTG-TTGG---CGTA-TGA-GT-GGG-G----ACTA-GC-GGT-TTTCTACATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGG--AAAAT--GTCATTTG--AATATCAAACTG----TATACC---TGT-AGCTTCT-AG--ATTTCCTCT--TC---TG--TTCA-TCTTCCGATATTTCCTCCAGAATTTTAGCAT----ACTCT-ACAGAATGGTCTTCCTCTTTGTTACG-AAT-TAAG-TCTCT--A--ATAGTG-G-AAAGTCCATTCACA--T---TA-TG-T-T----T-CGT-AAT----AAT-TCT-TC--AGAA-TTTCC-A-TT-CACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTGTG-CG---C--GGC-TCTC-ATTGATT-TTAGCTTGGAAC-TCATTCCGATT-TG-TCAC-GGCACC--AAATGT-GC-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ACG-TTTC-AAAC-GTT-TCGAT-CTTTAGTTTCT
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttcctgatttcgtAAG-CCTTT--ACGA-AGTG-GGAAAGTCCATTCACAATTAAATA-TGGT-TCAAAT-CGT-AATTTGAAAT-TATGTCCAAGTA-TTTCCTA-TTTCACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTATGACG---CGGGGC-TCTCGAGTGATTATTAGCTAAGAACTTCATTCCAATT-TG-TCACGGGCAC----AATTAAGC-GAATGGCAATAAAAACGACGAG-AAAACAGCGCA-TTTCAGAACTGAT-CCGATACTT---TTTCT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCT--AAACCACA---GA-CA-TAGCTTTCCAT---TTTAGCATA-AAAT------TATTTTAAACTTTC-CGTA-TTTGAC----TCAGG--AGCGGGCAGTTCGGCA--------------AGA---TTTTTCA-------TGAACG----TATTTATAAGCCTG----TGTTTTTGTCCAAATCT-----T-TCATT---A--AA-AACTGAA------TTGCG-GTTGGATAA-TTTGCATTTG---TT-------ATCTGTAAC-CCAGCAATA-CATTGACTTGC-AT----CACC-A-ATT-AAATGAGA--TTTCA--A-ATAAT-----TGAA---TTT--CTGTG--C-GTTTGT--TA------ACA--AGTCAT-TTCTGT--------CGA-TAGAT-----CC--CCCAA--ATGAATC--CCA----AAACG--ACTGC-CAGTGTGACA-G-ATTC--CC-GTC--GAAagtccaagcgtaataaaaacataacaatagtgaatcgttaagtaattgcgttaatcgtaattattacgtcacaattaatacacgcgaaaatacgttgacatgtctatggattgaaagataagactggtcaatattaaaagactcaaagggattagtaaactatttcac
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): TCGAGACTATAGACAGCTCTGCTACACTGTCAATCAAAAAAATAGTTAGGTTCGTGTCTTCACACGTACAGTCTACTGTTTTCCGTCGGGTGAAGCAGGGTGCTACGGCAGTTTTCAAAGAACATGTGACCTCGTTGGCGTTCGATGTAGATGAATGCATATTAGCGACTGTAGTTGCGATGTGGTGTCACCTGTTAA
Unaligned ( gi|18 ): GACGTTAGCGTAATTATTACGTCACAAAATACCGCGAAAATACGTTTATGTCTTTGATTGCACAAATAAGAAATGAACTAATTATTCGA
Unaligned ( gi|20 ): AAATGCGAACAATAGCTTAGGAAGTTTTTAATATTATTCACACAAG






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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tTGTGGT-G-GTGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ATA-TTT--CAAC-CTT-TCGATACTTTAGTTTCTa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtgcatgtttaacttacT--GTGGGTTA-AG-TAG-TAT--ATTGTGC-GGG--ACG-GTGT-TGGTATGTCG-C-TAA-GGCGG-TG-CA-ATAGCTG-TG--CTGATAAACG-TAACTTGT-GT-ATG-CGGGGTATGAT---A-TTT--CTGTA----TG---TAGAGAGTTTCAGTAATA-ACATTTTGCG-AAGACTT-G-CAACTC-TATGAG-ATCGA-GTGGGC-CGTA-TGACGT-Gatgcgttccatacaatgtagtcgctaagtagtgacgttagcgtaattattatgttacaataccacgaaaatacgttactgtctttgattgcaagaaaaataaggtaactgattacttaagaaaagaagaaactatttc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gagatactttgcaagaggtgaggtaGTAGC-G-ATGG--ATGA-----ACGAG-AAAG----ACG-CTTT-CAAC-GTT-TCGATACTTTAGTTTCT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C-G-ATGG--ATAA-----ACGAGAAAAG----ACG-TTTC-CAAC-ACT-atgcattacatacaatgtgatcgttatgtaatgacgttagcgaaattattacatcacaattaataccgcgaaaatacgttactgtctttgattgcacaaataagatgcttgattaaaatgaagtaactatttca
gi|16                         :                                                                                                      ACCCGATACTG-TCG-TCTGCGGCTTTTCC-TCGGTTTTCCTTTCCGC-CT-CAACTT-TTGTA--CA-AATA--CT-A-GTATG----ATGTCG--T-TTTCCTGG-GCAATTCTTGCATGTT--TTCTT-AGAT-T---T--ACATTC-GGCTATTTT-GTGA--TTTCC-CAAGCAagttttatggcgttacatacaatgtatcgttaagtaatgacgttagccgtaatctattacgtcaccaataatacgcaaaaaaggttactgtctttgattgcacaataagatacatgtaactgatataagaaatgaagtaactattt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agcgactgtagttgtgcatgtggtgtcAGTGTAGT-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----GCG-TTT--CAAC-CTT-TCAATct
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttaaagatgatcaaattaatgattttaaaatgattcacttctttctattttattgttctatctctattacatgtttttttttaaaacattTCTG-TTGGG--CGTA-AGA-GT-GGG-GG---ACTA-GC-GGT-ATTT-GTATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGG--AAA-
gi|2                          :                                                                                                      ACCTGCTGCTGCTAGATTTGCGG--TATAC-TCGGTTTTCGTTTTGTAGCT-CAACAG-TGTTA--CA-AA-A--CT-ATGTAGG----AGTTCG--TGTTTCCTGG-GCAATTCTTACATGTT--TTCTT-AGAT-C---TTCACATTTGGGCT-TTTT-ATGA--TT-CC-CAAGCA----------------------TGCCTTCTC-TT-AACGACCCGTTGT---TTCGTTCGTC-TACAGAC-TTACTTTTGTG-CA---TGATACTGGGAGCATGT---AAATAGT-TGCAGAAA-------ATACAT-G-T----TTTCTGG-----TTATGTCTG-TT--TTTACT-CTGA-TTTTTC---TCAGC--GC-TGG--CTAAA---ACAAGCCG--AAGTA-GGATGTA-AAACTTGAGG--------TTTGTATTGTATCATACGAA-TTCGCTGACCGGCCTA--GCTTTCTTTAATTGTTAA--TCTCG-T-TTTCTA--GTACCGGTAGCTCTAA-GTTGCGGTAAAGTCC-TTG-GTCACT--CGATCCCGTT-GGCACGTACCA-AGTTTCCCCTTAATCGAT--CCCGGTATTTTGTTCAAT-A--GATCGGAA-TAGTAAGCTTCCGTAAGATTCA------TC----ATG--TTGATCCATGCTTTCT--AAACCTCT---GA-TG-TAGTTTTCCAC---ACCATCGTA-GAAA------TCTTTCAA--CCCC-CAAA-T---A-----TCAGA--CGTGGT---TTTGGTA----GA-C-TAATA-GA---TTT-GCA-------TATATG----CGTCAATGATTTTT----TGCGGCTGACCAAATCTA--C-T-T--TT---A---G-ACCTGTAG-A-GCTTGAGCGT------A-TGTGTATT-G---TA-------AT-TGTAAGACCTGCGATA-CATTGGCTTGC-TT----CTCC-A-TAT-AGCTGGAA--TTTGA--G-ATAAT-----TAAA---CTT--TTG-AAAC-ATCATT--CAAA---GACA--A---AT-T-TCG----GCA--CGG-CGGCT-----GA--CGTAA--A-GAATC--CCA----AAATG--GCTGC-AAGTCTAACA-T--TTT--CC-GCC--AAA-C--GATGGTA--AAT-A-A--GC-TT-GGTA---A---CTT--TGG--T-ATAT-GCTAGT-GTTTGT-ACTCACGGAA-CCTG--AGA---TA---CT-C---------ATTGTAG-CTT--GTGG-T-A-AG-TAG-TAC--TTTGTGC-GGG--ACG-G-GC-TTGCGTGTCG-C-TAACGGTG--TC-GA-A---CTG-TG--CTGATAAACG-TAT-CCGTGGC-ATG-CGGTTT----A---A-ACT--CTG-A----TG---TA-AG-----CGG-AATA-G---TTTGCG-AAG---T-G-CA---T-TAT--G-GTCTG-TTGG---CGTA-TGA-GT-GGG-G----ACTA-GC-GGT-TTTCTACATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGG--AAAAT--GTCATTTG--AATATCAAACTG----TATACC---TGT-AGCTTCT-AG--ATTTCCTCT--TC---TG--TTCA-TCTTCCGATATTTCCTCCAGAATTTTAGCAT----ACTCT-ACAGAATGGTCTTCCTCTTTGTTACG-AAT-TAAG-TCTCT--A--ATAGTG-G-AAAGTCCATTCACA--TTA----TG-T-T----T-CGT-AAT----AAT-TCT-TC--AGAA-TTTCC-A-TT-CACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTGTG-CG---C--GGC-TCTC-ATTGATT-TTAGCTTGGAAC-TCATTCCGATT-TG-TCAC-GGCACC--AAATGT-GC-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ACG-TTTC-AAAC-GTT-TCGAT-CTTTAGTTTCT
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCT--AAACCACA---GA-CA-TAGCTTTCCAT---TTTAGCATA-AAAT------TATTTTAAACTTTC-CGTA-TTTGAC----TCAGG--AGCGGGCAGTTCGGCA--------------AGA---TTTTTCA-------TGAACG----TATTTATAAGCCTG----TGTTTTTGTCCAAATCT-----T-TCATT---A--AA-AACTGAA------TTGCG-GTTGGATAA-TTTGCATTTG---TT-------ATCTGTAAC-CCAGCAATA-CATTGACTTGC-AT----CACC-A-ATT-AAATGAGA--TTTCA--A-ATAAT-----TGAA---TTT--CTGTG--C-GTTTGT--TA------ACA--AGTCAT-TTCTGT--------CGA-TAGAT-----CC--CCCAA--ATGAATC--CCA----AAACG--ACTGC-CAGTGTGACA-G-ATTC--CC-GTC--GAAagtccaagcgtaataaaaacataacaatagtgaatcgttaagtaattgcgttaatcgtaattattacgtcacaattaatacacgcgaaaatacgttgacatgtctatggattgaaagataagactggtcaatattaaaagactcaaagggattagtaaactatttcac


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originalCons                  :                                                                                                      ACCCGNTACTG-TCG-TCTGCGGCTTTTCC-TCGGTTTTCTTTTCCGCGCT-CAACTT-TTGTA--CA-AATA--CT-A-GTACG----ATGTCG--T-TTTCCTGG-GCAATTCTTGCATGTT--TTCTT-AGAT-T---T--ACATTCGGGCTATTTT-GTGA--TTTCC-CAAGCAGTC---AAAACA--A------ATGC-TTCTC-TT-AACGACCCGTTGT---TTCGTTCGTC-TACAGACCTTACTTCTGTG-CA---TGATA-TGGGAGCATGT---ACATAGT-TGCAAAAA-------ATACAT-GGT----TTTCTGG-----TTATGTCTG-TT--TTTAC--CTGA-TTTTTC---TCAGC--GC-TGG--CTACA---A-AAGCGG--AAGNA-GG-TGTG-AAACTTGAGG--------TTTGTATTGTATCATACGAA-TTCGCTGACCGGC-TA--GCTT-CTTTGATCGT-AA--TCTCG-T-TTTC-A--ATA---GCTTCTCTAA-GTTGCGGTAAAGTCCGTTG-GTCACT--C-----CGTT-GGCACGTACCA-AGTTTTCCCTTAATCGAT--CCCGGTATTTTGTTCAAT-A-TGATCGGAACTAGTAAGCTTCCGTAAGATTCA------TC----ATG-ATTGACCCATGCTTTCT--AAACCTCT---GA-CG-TAGTTTTCCAT---ACCATCGTA-GAAA------TCTTTCAA--CTCC-CNAA-T---A-----TCAGG--CGTGGG--GTTTGGTA----GA-C-TAATAAGA---TTTTGCA-------TATATG----CGTCTATGATTTTN----TGCGGCTGACCAAATCTA--CGT-T--TT---A--AG-ACCTGTAG-A-GCTTGCGCGT------A-TTTGCATT-G---TA-------AT-TGTAAGACCTGCGATA-CATTGGCTTGC-TT----CTCC-A-TAT-AGCTGGGA--TTTGA--G-ATAAT-----TAAA---CTT--TTG-GAAC-GTCATT--CAAA---GACA--A---AT-TGTCGT---GCA--CGG-CGGCT-----GA--CATAA--A-GAATC--CCA----AAACG--GCTGC-CAGTCTAACA-T-ATTT--CC-GCC--AAAAC--GATGGTA--AAT-NTA--GC-TT-GGTA---A---CTTG-TGG-AT-ATAT-GCTAGC-GTTTGT-ACTCACGGAA-CCTG--AGG---TA---CT-C---------ATAGTAG-CTT--GTGGGT-A-AG-TAG-TAC--ANTGTGC-GGG--ACG-G-GC-TTGTGTGTCG-C-TAACGGCGG-TC-GA-A---CTG-TG--CTGATATACG-TATTCCGTGGC-ATG-CGGGTT----T---A-ACT--CTG-A----TG---TA-AG-----CGG-AATA-G---TTTGCG-AAGG--T-G-CA---C-TAT--G-GTCTG-TTGGG--CGTA-TGA-GT-GGG-G----ACTAAGC-GNT-GTTTTACATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGG--AAA-T--GTCATTTG--AATATCAAA-TG----TATACC---TGTCAGCTTCTGAG--ATTTCCTCT--TCGC-TG--TTCA-TCTTCCGATATTTCNTCCGGAATTTTAGCAT-CCAACTCT-A--GAATGGTCTTCCTCTTTGTTACG-AATATAAG-TCTCT--A--ATAGTG-G-AAAGTCCATTCACA--TTA----TG-T-TC---T-CGT-AAT----AAT-TCT-TC--AGAA-TTTCC-A-TT-CACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTGTG-CG---C--GGC-TCTC-ANTGATT-TTNGCTNGGAAC-TCATTCCGATT-TG-TCAC-GGCACC--AAATGTAGC-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ACG-TTTC-CAAC-GTT-TCGATACTTTAGTTTCT
finalCons                     :                                                                                                      ACCCGNTACTG-TCG-TCTGCGGCTTTTCC-TCGGTTTTCTTTTCCGCGCT-CAACTT-TTGTA--CA-AATA--CT-A-GTACG----ATGTCG--T-TTTCCTGG-GCAATTCTTGCATGTT--TTCTT-AGAT-T---T--ACATTCGGGCTATTTT-GTGA--TTTCC-CAAGCAGTC---AAAACA--A------ATGC-TTCTC-TT-AACGACCCGTTGT---TTCGTTCGTC-TACAGACCTTACTTCTGTG-CA---TGATA-TGGGAGCATGT---ACATAGT-TGCAAAAA-------ATACAT-GGT----TTTCTGG-----TTATGTCTG-TT--TTTAC--CTGA-TTTTTC---TCAGC--GC-TGG--CTACA---A-AAGCGG--AAGNA-GG-TGTG-AAACTTGAGG--------TTTGTATTGTATCATACGAA-TTCGCTGACCGGC-TA--GCTT-CTTTGATCGT-AA--TCTCG-T-TTTC-A--ATA---GCTTCTCTAA-GTTGCGGTAAAGTCCGTTG-GTCACT--C-----CGTT-GGCACGTACCA-AGTTTTCCCTTAATCGAT--CCCGGTATTTTGTTCAAT-AT-GATCGGAACTAGTAAGCTTCCGTAAGATTCAT-----------ATGA-TTGACCCATGCTTTCT--AAACCTCT---GACG--TAGTTTTCCAT---ACCATCGTA-GAAA------TCTTTCAA--CTCC-CNAATA---------TCAGG--CGTGGG--GTTTGGTAGAC------TAATAAGA---TTTTGCA-------TATATG----CGTCTATGATTTTN----TGCGGCTGACCAAATCTACG--T-T--TT---A--AG-ACCTGTAGA--GCTTGCGCGTAGTT------TGCATTCGTAAT-----------TGTAAGACCTGCGATA-CATTGGCTTGC-TT----CTCC-A-TAT-AGCTGGGA--TTTGAG---ATAAT-----TAAA---CTT--TTG-GAAC-GTCATT--CAAA---GACAA-----AT-TGTCGT---GCA--CGG-CGGCTGACATA-------A--A-GAATC--CCA----AAATG--GCTGC-CAGTCTAACA-T-ATTT--CC-GCCA--AAAC--GATGGTA--AATTTA---GC-TT-GGTAA------CTTG-TGGT---ATAT-GCTAGC-GTTTGT-ACTCACGGAA-CCTG--AGG---TA---CT-C---------ATAGTAG-CTT--GTGGGT-A-AG-TAG-TACAA--TGTGC-GGG--ACG-G-GC-TTGTGTGTCG-C-TAACGGCGG-TC-GAA----CTG-TG--CTGATATACG-TATTCCGTGGC-ATG-CGGGTTT-------A-ACT--CTG-A----TG---TA-AG-----CGG-AATAG----TTTGCG-AAGG--T-G-CA---C-TAT--G-GTCTG-TTGGG--CGTA-TGA-GT-GGG-G----ACTA-GC-GNT-GTTTTACATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGG--AAA-T--GTCATTTG--AATATCAAA-TG----TATACC---TGTCAGCTTCTGAG--ATTTCCTCT--TCGC-TG--TTCA-TCTTCCGATATTTCNTCCGGAATTTTAGCAT-CCAACTCT-A--GAATGGTCTTCCTCTTTGTTACG-AATATAAG-TCTCT--A--ATAGTG-G-AAAGTCCATTCACA--TTA----TG-T-TC---T-CGT-AAT----AAT-TCT-TC--AGAA-TTTCC-A-TT-CACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTGTG-CG---C--GGC-TCTC-ANTGATT-TTNGCTNGGAAC-TCATTCCGATT-TG-TCAC-GGCACC--AAATGTAGC-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ACG-TTTC-CAAC-GTT-TCGATACTTTAGTTTCT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): TCGAGACTATAGACAGCTCTGCTACACTGTCAATCAAAAAAATAGTTAGGTTCGTGTCTTCACACGTACAGTCTACTGTTTTCCGTCGGGTGAAGCAGGGTGCTACGGCAGTTTTCAAAGAACATGTGACCTCGTTGGCGTTCGATGTAGATGAATGCATATTAGCGACTGTAGTTGCGATGTGGTGTCACCTGTTAA
Unaligned ( gi|18 ): GACGTTAGCGTAATTATTACGTCACAAAATACCGCGAAAATACGTTTATGTCTTTGATTGCACAAATAAGAAATGAACTAATTATTCGA
Unaligned ( gi|20 ): AAATGCGAACAATAGCTTAGGAAGTTTTTAATATTATTCACACAAG






Alignments
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cgctctgctgtgtttcatctgggattcgtccgatctttaagtggtctcacctatttttgtttgatctccaacctcggaaatagtgtagattctgtttgggggggttgttaaaagtctccaaacttatccttccgtatctctcgagaactgcgatagataacatagctgcgttgtgagaccgccctcatcaaaagagtagtattcttgctgactcccgaaatatgtgcatctctcttctccaccgtcggccgagcgaacacaggtgatgctacgggcagttttcaaaagttacatgtagaccttcgttggacgttagatgtagatgaatcgcatatagcggactgtaggttgcgcatgtgcgtgtcaacctgtgagtaataaagataacagcgaGGA--TTTGA--G-ATAAT-----TAAA---CTT--ATT-GAACTGTCATT--CAAA---GACA--A---AT-TGTCGTTGAACAACCGG-CGAC-T-----GA--TAT-A--A-GAATCCC-----AAAAA---TGCTGCTCAGTCTAACA-TCATTT--CCGGCCCAAAAAC--GATGGAA--A-ATATTA--GC-TT-GTTACATA-TTT-TGGAAT-----ATAT-GC-T-GCAGTCATT-ACTCACGCAAGCCTT--TCG---TATATCT-CCCGCTATTGATAGCA--CTGA-GTTGGT-ACAG-TAGTTACTTTTTCTGC-AGG--ACG-A-GC--TGTCTGTCGAC-T-ACAGCAGCTCTAA-A---CTGATGACTTGATA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tTGTGGT-G-GTGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ATA-TTT--CAAC-CTT-TCGATACTTTAGTTTCTa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtgcatgtttaacttacT--GTGGGTTA-AG-TAG-TAT--ATTGTGC-GGG--ACG-GTGT-TGGTATGTCG-C-TAA-GGCGG-TG-CA-ATAGCTG-TG--CTGATAAACG-TAACTTGT-GT-ATG-CGGGGTATGAT---A-TTT--CTGTA----TG---TAGAGAGTTTCAGTAATA-ACATTTTGCG-AAGACTT-G-CAACTC-TATGAG-ATCGA-GTGGGC-CGTA-TGACGT-Gatgcgttccatacaatgtagtcgctaagtagtgacgttagcgtaattattatgttacaataccacgaaaatacgttactgtctttgattgcaagaaaaataaggtaactgattacttaagaaaagaagaaactatttc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gagatactttgcaagaggtgaggtaGTAGC-G-ATGG--ATGA-----ACGAG-AAAG----ACG-CTTT-CAAC-GTT-TCGATACTTTAGTTTCT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           C-G-ATGG--ATAA-----ACGAGAAAAG----ACG-TTTC-CAAC-ACT-atgcattacatacaatgtgatcgttatgtaatgacgttagcgaaattattacatcacaattaataccgcgaaaatacgttactgtctttgattgcacaaataagatgcttgattaaaatgaagtaactatttca
gi|16                         :                                                                                                      ACCCGATACTG-TCG-TCTGCGGCTTTTCC-TCGGTTTTCCTTTCCGC-CT-CAACTT-TTGTA--CA-AATA--CT-A-GTATG----ATGTCG--T-TTTCCTGG-GCAATTCTTGCATGTT--TTCTT-AGAT-T---T--ACATTC-GGCTATTTT-GTGA--TTTCC-CAAGCAagttttatggcgttacatacaatgtatcgttaagtaatgacgttagccgtaatctattacgtcaccaataatacgcaaaaaaggttactgtctttgattgcacaataagatacatgtaactgatataagaaatgaagtaactattt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         agcgactgtagttgtgcatgtggtgtcAGTGTAGT-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----GCG-TTT--CAAC-CTT-TCAATct
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttaaagatgatcaaattaatgattttaaaatgattcacttctttctattttattgttctatctctattacatgtttttttttaaaacattTCTG-TTGGG--CGTA-AGA-GTGGGG-G----ACT-A-GC-GGT-A-TTTGTATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGG--AAA-
gi|2                          :                                                                                                      ACCTGCTGCTGCTAGATTTGCGG--TATAC-TCGGTTTTCGTTTTGTAGCT-CAACAG-TGTTA--CA-AA-A--CT-ATGTAGG----AGTTCG--TGTTTCCTGG-GCAATTCTTACATGTT--TTCTT-AGAT-C---TTCACATTTGGGCT-TTTT-ATGA--TT-CC-CAAGCA----------------------TGCCTTCTC-TT-AACGACCCGTTGT---TTCGTTCGTC-TACAGAC-TTACTTTTGTG-CA---TGATACTGGGAGCATGT---AAATAGT-TGCAGAAA-------ATACAT-G-T----TTTCTGG-----TTATGTCTG-TT--TTTACT-CTGA-TTTTTC---TCAGC--GC-TGG--CTAAA---ACAAGCCG--AAGTA-GGATGTA-AAACTTGAGG--------TTTGTATTGTATCATACGAA-TTCGCTGACCGGCCTA--GCTTTCTTTAATTGTTAA--TCTCG-T-TTTCTA--GTACCGGTAGCTCTAA-GTTGCGGTAAAGTCC-TTG-GTCACT--CGATCCCGTT-GGCACGTACCA-AGTTTCCCCTTAATCGAT--CCCGGTATTTTGTTCAAT-A--GATCGGAA-TAGTAAGCTTCCGTAAGATTCA-------TCATG--TTGATCCATGCTTTCT--AAACCTCT---GA-TG-TAGTTTTCCAC---ACCATCGTA-GAAA------TCTTTCAA--CCCC-CAAA-T---A-----TCAGA--CGTGGT---TTTGGTA----GA-C-TAATA-GA---TTT-GCA-------TATATG----CGTCAATGATTTTT----TGCGGCTGACCAAATCTA--C-T-T--TT---A---G-ACCTGTAG-A-GCTTGAG--CG--T----A-TGTGTAT--T-G--TAAT-TGTAAGACCTGCGAT-ACATTGGCTTGC-TT----CTCC-A-TAT-AGCTGGAA--TTTGA--G-ATAAT-----TAAA---CTT--TTG-AAAC-ATCATT--CAAA---GACA--A---AT-T-TCG----GCA--CGG-CGGC-T-----GA--CGTAA--A-GAATCCC-----AAAAT---GGCTGC-AAGTCTAACA-T--TTT--CC-GCC--AAA-C--GATGGTA--A-AT-A-A--GC-TT-GGTA---A-CTT-TGG--T-----ATAT-GC-TAGT-GTTTGT-ACTCACGGAA-CCTG--AGA---TA---CT-C---------ATTGTAG-CTT--GTGG-T-A-AG-TAG-TAC--TTTGTGC-GGG--ACG-G-GC-TTGCGTGTCG-C-TAACGGTG--TC-GA-A---CTG-TG--CTGATAAACG-TAT-CCGTGGC-ATG-CGGTTT----A---A-ACT--CTG-A----TG---TA-AG-----CGG-AATA-G---TTTGCG-AAG---T-G-CA---T-TAT--G-GTCTG-TTGG---CGTA-TGA-GT-GGG-G----ACT-A-GC-GGT-TTTCTACATTGT-CGATAATT----GTGGACAGTT-TGG--AAAAT--GTCATTTG--AATATCAAACTG----TATACC---TGT-AGCTTCT-AG--ATTTCCTCT--TC---TG--TTCA-TCTTCCGATATTTCCTCCAGAATTTTAGCAT----ACTCT-ACAGAATGGTCTTCCTCTTTGTTACG-AAT-TAAG-TCTCT--A--ATAGTG-G-AAAGTCCATTCACA--T---TA-TG-T-T----T-CGT-AAT----AAT-TCT-TC--AGAA-TTTCC-A-TT-CACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTGTG-CG---C--GGC-TCTC-ATTGATT-TTAGCTTGGAAC-TCATTCCGATT-TG-TCAC-GGCACC--AAATGT-GC-G-ATGG--ATAA-----ACGAG-AAAG----ACG-TTTC-AAAC-GTT-TCGAT-CTTTAGTTTCT
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tttcctgatttcgtAAG-CCTTT--ACGA-AGTG-GGAAAGTCCATTCACAATTAAATA-TGGT-TCAAAT-CGT-AATTTGAAAT-TATGTCCAAGTA-TTTCCTA-TTTCACA-CGGTTCAACAG-TCTGGTAACCACTCCTCTATGACG---CGGGGC-TCTCGAGTGATTATTAGCTAAGAACTTCATTCCAATT-TG-TCACGGGCAC----AATTAAGC-GAATGGCAATAAAAACGACGAG-AAAACAGCGCA-TTTCAGAACTGAT-CCGATACTT---TTTCT
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): TCGAGACTATAGACAGCTCTGCTACACTGTCAATCAAAAAAATAGTTAGGTTCGTGTCTTCACACGTACAGTCTACTGTTTTCCGTCGGGTGAAGCAGGGTGCTACGGCAGTTTTCAAAGAACATGTGACCTCGTTGGCGTTCGATGTAGATGAATGCATATTAGCGACTGTAGTTGCGATGTGGTGTCACCTGTTAA
Unaligned ( gi|18 ): GACGTTAGCGTAATTATTACGTCACAAAATACCGCGAAAATACGTTTATGTCTTTGATTGCACAAATAAGAAATGAACTAATTATTCGA
Unaligned ( gi|20 ): AAATGCGAACAATAGCTTAGGAAGTTTTTAATATTATTCACACAAG