lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111
lowQualScore : 33333 3 11 1111 22 1 4444444444 11111111 22222222222 4444444444444444444444444 111 11111111 1111111111111 3 2222 22 1 222222222222 444 222 1111 2222222 22 11 3 11111 111 22 333333 1 11 55555555555555555555 2 111 11 22222222 2222222222 1 22222222222222 333333 111 1111111 22222222222222 3333333 222222 222 11111111 1 22222 111111 1 2 11 444444444444444444 4444444444444 1111111 222222 11111111 5555555 1 11111111111 11 111 1 1 1 33333 2222 1 1 1 33333333 1 55555555 44444 3333333 44 1 11 2222 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 222 2 33 4444 000000000000000000000000000 1 111111 5555555555555555555555 1 11 1 2 33333 3333 33 7777777777777777777777 11 999999999999999999999999999999999999999999 111
lowQualScore : 3 3 3 6 44 555 77777 77777 8888 3 3 0 11 6 9999 3 6666 99 77 1 3 6666 999 2222222222 77777 44 3 44 555 11111111 3 11111111111 3 3 44 3333333333333333333333333 555 44 999 3 3 777 11111111 77 6666 6666666666666 6 3 5555 3 44 6 55555 7777 77 44 3 3 6 1 5 000000000000 555 44 888 55 4 0 55 3 000 0000 3 3 8888888 3 3 88 99 00 3 6 555 6 3 6 11111 3 44 3 44 666 3 22 3 88 6 44 6 3 3 3 333333 3 8 888 3 3 3 00 44444444444444444444 3 9 555 44 111 3 555 3 00 77777777 3 3 3 9999999999 3 3 3 3 88 3 8 44 55 7 0 3 11111111111111 55 999999 55 555 4 5555555 3 555 3 88888888888888 555 4444444 8 3 3 7777 3 44 0 3 44 77 3 6 999 555 3 888 666666 3 555 555 22222222 3 3 3 8 9 44 44 3 44 8888888 3 44 3 444 99999 777 3 7 99999 3 000000 3 3 55 666 4 3 99999 3 88 55 3 55 4 8888 888 4 66 6 66 66 5 11 5 999999 4 66 66 4 4 4 666666666666666666 66 4 7777777777777 4444444 4 9999 111111 3 3 00000000 2 4 333 2 2 2 2222222 2 3 00000000000 3 777 88888888 3 66 7 55 0 5 333 0 0 5 0 5 55555 66 5 3333 5 5 0 5 5 0 5 5 7 88888888 1 77 77 5 77 1 6 22 11111111 6 44444 6 7777777 77 6 6 3 99 99 6 55 7777 2 77 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 6 2 888 5 3 6 99 22 1111 6 6 6 3 77 77 5 77 666666666666666666666666666 77 9 1 5 777777 1 5 0 5 5 9999999999999999999999 5 1 00 7 2 8 1 55555 5555 0 22 8 1 3333333333333333333333 99 8 6 6 333333333333333333333333333333333333333333 8 666 4
lowQualScore : . . . . .. ... ..... ..... .... . . . .. . .... . .... .. .. . . .... ... .......... ..... .. . .. ... ........ . ........... . . .. ......................... ... .. ... . . ... ........ .. .... ............. . . .... . .. . ..... .... .. .. . . . . . ............ ... .. ... .. . . .. . ... .... . . ....... . . .. .. .. . . ... . . . ..... . .. . .. ... . .. . .. . .. . . . . ...... . . ... . . . .. .................... . . ... .. ... . ... . .. ........ . . . .......... . . . . .. . . .. .. . . . .............. .. ...... .. ... . ....... . ... . .............. ... ....... . . . .... . .. . . .. .. . . ... ... . ... ...... . ... ... ........ . . . . . .. .. . .. ....... . .. . ... ..... ... . . ..... . ...... . . .. ... . . ..... . .. .. . .. . .... ... . .. . .. .. . .. . ...... . .. .. . . . .................. .. . ............. ....... . .... ...... . . ........ . . ... . . . ....... . . ........... . ... ........ . .. . .. . . ... . . . . . ..... .. . .... . . . . . . . . . ........ . .. .. . .. . . .. ........ . ..... . ....... .. . . . .. .. . .. .... . .. ............................................................................ . . ... . . . .. .. .... . . . . .. .. . .. ........................... .. . . . ...... . . . . . ...................... . . .. . . . . ..... .... . .. . . ...................... .. . . . .......................................... . ... .
lowQualScore : 1 1 1 2 22 000 11111 11111 2222 1 1 2 22 2 2222 1 1111 66 55 8 1 5555 666 8888888888 77777 22 1 22 444 22222222 1 77777777777 1 1 22 5555555555555555555555555 444 22 666 1 1 777 22222222 33 5555 9999999999999 2 1 7777 1 22 9 55555 8888 66 22 1 1 2 2 8 888888888888 888 66 888 00 0 7 55 6 888 0000 6 6 2222222 6 6 22 88 55 3 7 888 7 3 7 77777 3 66 3 66 555 3 00 6 66 7 22 2 1 1 1 777777 1 8 555 1 1 1 44 55555555555555555555 1 3 888 55 222 3 222 1 55 66666666 3 3 3 8888888888 0 3 3 3 88 3 6 66 00 3 9 6 33333333333333 00 666666 00 222 5 7777777 3 888 3 77777777777777 888 5555555 8 3 3 1111 3 66 4 1 22 33 1 2 555 444 1 555 888888 3 888 555 22222222 1 1 1 5 2 66 66 3 55 0000000 3 00 3 111 11111 777 6 3 55555 6 555555 6 6 00 444 5 6 11111 6 55 00 6 55 0 2222 444 4 11 6 11 11 0 99 0 777777 4 11 11 4 4 4 999999999999999999 11 4 4444444444444 4444444 4 4444 555555 1 1 44444444 2 4 999 2 7 7 7777777 9 1 99999999999 3 888 00000000 6 33 3 00 2 0 888 0 0 0 0 0 88888 99 0 5555 0 0 0 0 0 0 0 7 9 11111111 4 99 99 7 99 0 7 00 33333333 7 77777 7 5555555 00 7 7 3 22 22 7 88 2222 5 33 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 5 555 2 5 7 22 77 0000 7 7 7 5 99 99 7 99 444444444444444444444444444 99 0 4 7 333333 4 7 1 7 7 3333333333333333333333 7 6 77 1 9 1 4 33333 4444 8 88 6 4 4444444444444444444444 00 0 0 0 222222222222222222222222222222222222222222 0 888 8
consensus : AGGTG-AAACA-CAA-T-A--TAG---GGC----GCA-----TT-T--C-CA-ATA-CA--G-CA----T-TGTTA----TA--CA--TGGTTTT-C----AA---AAN----TATTATTTTC-----TT--TT-A--ATAC---A--------ATTTA-A-C---A---T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT--A----CGT-----A-NN------A--AGGAC---T--T---CTG-TG-CCAA---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGAA--T--TTAAAAGATAA-TGCCAAAAAAT-G-T-ACCCCAAAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TATG-C-TGTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TCT-G-CTGAAA--TA-AT-GGT-AA--AATTA-TT-CT-ATAT-TTT-CC-TGCC-AT---TGAACAT-AAT-CA-----GA-T--T-T--T-A-AGA-A-TTTTT-TCACAA--ATTA-T--TT-G-G-T-GC--TT--AA-ATTTTT--AG-GA-T-C--GAGT------------A--A----AAAA-CTTT-TG---AAGT-T--TATG-A-A-AA-A-AAATGTTA----A-T-AGG-G---G--C---CACG-TT-AT-ACA-TTTT-TTTCAATG--AAT--TTC-CC-C-C----T---------GTT--TTA-TGTGCCA--AT--TAAAAAATAATGT---C-T-A-C---ATCA-T----T-----T---T---TTTC-----A-TANT-TC-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--AAAA---AAA-TT---GG-G-C--AT-GC---A-ACCC--T-----TT-AA-TTT-AATTT-C--ATCA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-TA-AAAATTAAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-A-----C-G------T-AGTG-T--C---CGT-A-ACCACT-----T-AAATTCTGTG--AAA-TTAG--AA-AGCTCTAT---A--NATAT-CA--TTA-TTTA--AT--TTTTA-GA--TAGA-CATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-ATG-----GTT----G-----T--TTTT-CCCTGN-----TCATC--ACC-------ACT-GT----TTCTC-GGG--TATCATCAC-A-AAT----G-T-G-GTTACGGAC-A---CTAC-AAA-AT-CCTGT-TAGT-GT-CCGTAAC-----C-----TG-TAN-TTTG--A--TC-A-GTTTGAGAAG-CA--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-G-CT-GAT-NT-TTTT--AC-AAAGGTCAG--AGGTTT-GTTC-T-AC-AAGT-TAA-TCAATNTACTTT-AT-TTTTCACCCCTCAT-TT-TGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCCCAA-ATCGCATCA--TTTCC-ATATACAG-CATC-ATTAGCT-GTTACC---A--TCAG--CA-TG-AC-AT--AA--GCAA-TG--CTATT-GANATGGGNAT-TAAGA-CA-GATG-ACAC--ACCACTA--TTTTTTTTCAAT-GTTGAA-GTCAAC-TG------GTGTT-ACA-TT----TAAC-AAAACCT-TGTANGAATTCC--ACTATTTAAG-ATAAGT--TCC-ATCC-CTT-ATAAA--TAACT--T-AA--A-AA-TGT-T-GT-TAGTGTC-CGT--TAACCAAA--AGTTGAAAAACT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAG-AAGGTTGCAGAA---A----A----TTTTC-AAAGCAG-TTTGTTATTTGAAGTTTAATGTAT-TTATAGGTGATT-TATTAGCCAGAAATTCTTTTAGATTA--T-GGT-GG------------TTTTTT--TTTTACTG-CAAGAAATAAAAAAA-AATTACTTTAAAA---AC-CAA-----ANAATTGCCATAG-AATG-TG-T-GGGGAAATTA
Reference ( gi|2 ) : AGGTG-AAACA-CAA-T-A--TAG---GG-----GCA-----TT-T--C-CA-ATAGCA--G-CA----T-TGTTA----TA--CAC-TGGATTT-C----AA---AAT----TA--ATTTTC-----TT--TT-A--ATAC---A--------ATTTA-A-A---A---T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT--A----TGT-----A-AT------A--AGGAC---T--T---CTG-TG-CCAA---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--AT-GAA--T--TTAAAAGATAA-TGCCAAAAAAT-G-T-ACCCCAAAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TATG-AGTGTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TCT-T-CTGAGA--TA-AT-GGTAAA--AATTA-TT-C--ATAT-CTT-AC-TGCC-AT---TGAA-AT-AAT-CA-----GA-T--T-T--T-A-AGA-ATTTTTT-TCACAA--ATTA-T--TT-G-G-T-GC--T---AA-ATGTTT--AG-GA-T-C--GAGTT-----------A--A----AAAA-CTTTATG---AAGT-T--TATG-A-A-AA-A-GAATGTTA----A-T-AGG-G---G--C---CATG-TT-AT-ACA-TTTT-TTTCAATG--AAT--TTC-CC-C-C----T---------GTT--TTAGTAT-CCA--AT--TAAAAAATAATGT---T-T-A-C---ATCA-T----T-----T---T---TTTC-----ACTATT-TC-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--AAAA---AAA-TT---GG-G-C--AT-GC---A-TTCC--T-----TT-AA-TTT-AA-TT-C--ATCA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-CA-AAAATTAAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-A-----C-G------T-AGTG-T--C---CGT-A-ACCACT-----T-AAATTCCATG--AAA-TTAG--AA-AGCTCTAC---A--GATAT-CA--TTATTTTA--AT--TTTTA-GA--TAGA-CATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-ATG-----GTT----G-----T--TTTT-CCCTGT-----TCTTC--ACC-------ACT-GT----TTCTC-A-G--TATCATCAC-A-AAT----G-T-G-GTTACGGAC-A---CTAC-AAA-AT-CCTGTTTAG--GT-CCGGAAC-----C-----TG-TAA-TTTG--A--TC-A-GTTTGAGAAG-CA--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-G-CT-GAT-TA-TTTT--AC-AAAGGTCAG--A-GTTT-GTTC-T-AC-AAGT-TAA-TCAATATACTTT-ATATTTTCACTTCTCA--TT-TGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCTCAA-ATCACATCAGTTTTCCTATATACAG-CATCTATTAGCT-GTTACG---A--TCAGTTCA-TG-AC-AT--AA--GCAA-TG--CTATTAGACATGGGCAT-CAAGATCATGATGCGCATA-ACCATTAGTTTCTTTTTCAATCTTTGAA-GTCAACGTGCCTATCGTGTTGGCA-TT----GAAC-AAAATCT-ATTACGAATT-C--ACTATTTAAACATAATTA-TCC-ATCC-CTT-ATAAA--TAACT--T-AA--A-AT-TGTCT-GT-TAG-GTCACGT--TAACCAAA--AGTTGAAAAACT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAG-AAG--TGCAG-----A----A----TTTTC-AAATCAG-TTTGTTA-TT-AATTTTAATGTAT-TTGTAGGTGATTATATTAGCCA-AAATTCTTTTAGATTA--C-GGT-GG------------TTTTTT--TTTTACTG-CAAGAAATAAAAAAATATTTACTTGAAAA---AT-CAA-----AGAATTGTCATAGAAATG-TG-T-GGGAAAATTA
gi|16 : AGGTG-AAACA-CAA-T-A--TAG---GAC----GCA-----TT-T--C-CA-ATA-CA--G-CA----T-TGTTA----TA--CA--TGGTTTT-C----AA---AAA----TATTATTTTC-----TT--TT-A--ATAC---A--------AGTAA-A-C---A---T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT--A----CGT-----A-TA------A--AAGAC---T--T---CTG-TG-CCAAT--TT--------TT--TT----TT-------------A-T-CT----AGC-ACTA--ATAGAA--T--TT--AAGATAA-TG-CAAAAAAT-G-T-
gi|3 : cGGTG-AA-CA-AAA-T-A--TAG---GG-----CCA-----TTCT--C-CA-ATA-CA--GTCA----T-TGTTA----TAT-CA--TGGATTT-C----AA---AAC----TATTATTTTT-----CT--TT-A--ATAC---A--------ATTTACA-A---A---T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT--A----TGT-----A-TA------A--AGGAA---T--T---CTG-TG-CCAA---TT--------TT--ATGGTTTG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGAA--T--TTAA--GATAA-TGC--AAAAAT-G-T-ACCC--AAAAAGGTCA-----T-----TTT---TTAGTGT--TATG--CTGTTGC--ACTTGG---ACTGC--AACATTTT-TCT-A-CTGAAG--TA-AT-GGT-AA--ATTTA-TT-CT-ATAT-CTTAAC-TGCC-AT---TGAACAT-AAT--A-----GA-T--T-T--TAA-AGA-A--TTTT-TCACAATTATTT-T--TT-G-G-T-GC--TA--AA-ATTTTT--AG-GA-T-C--GGAT---------------A----AAAA-CTTT-TG---AAGT-T--AATGAA-A-AA-A-AAATG-TA----A-T-AGG-G---G--TG--CATGTTT-AT-ACATTTTT-TTTCAATG--AAT--TTC-CCAC-C----T---------GTTTGTTAAT-T-TCA--AT--TAAAAAAT-ATGT---T-T-A-CAATATTA-T----T-----T---T---TTTC-----A-TA-T-TC-AGTCT-AAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGA--AAAA---AAA-TTG--GG-G-CCAAT-GC---A-ACCC--TA----TT-AATTTT-AATTT-C--CTCA--T-G--TTT--T----AAT-GC-CA-AAAATTAAG-A-TT-----TTA-CAAAAA-A-A-----C-G------TAAGTG-T--C---CGT-A-ACCACT-----TAAAATTCC-TG---AA-TTAG--AA-AGCTCTAC---A--GATAT-CA--TTA-TTTA--AT--TTTTA-GA--TAGA-CATT-T----AT-GT--AGATG--C-TGCGA-T-ATG-----G-T----G-----T--TTTT-TCCCGTGA---TCATCAAACC-------ACTCGT----TTCTC-C-GGTTATCATCAC-A-AAT----G-T-G-GTTACGG---A---CTAC-AA-----TCTG-GTAGT-GT-CCGTAAC-----C-----TG-TAT-TTTG--A---A-A-GTTTTTGAAGCCATCGCCTGT-TTT---AAAACA-CT--AT-GCCT-GATATT-TTTT--ACAAAAGGTCAA--G-GTTT-GTTC-TAAC-AAGT-TAATTCAATATACTTT-AT-TTTTTACCCTGCAT-TT-TGAT--GAT--G--G--ACTAATTTGGAAAGCTCAA-ATCACATCA-TTTTCC-ATATACAG-CATC-A-TAG-T-GTTAAC---A--TCAGT--A-TG-AC-AT--AT--CAAA-TG--CTATT-GACATGGGCATCCAAGA--AAGATG-GCATA---CA-TA----TTTTTTCAAT-TTTGAA-GTCAAC--------TGTGTT-GCATTT----AAACAAAAATCT-TGTACAAATTCC--ACTATTT-AACATAATTT-CCC-ATCC---T-ATAAA--CAACT--T-AA--A-ATGTG-------TAGTGTCGCG---TAACCAAA--CGTTG-AAAACT-C--AAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAG-AAGT-TGCAGAA---A----A----TTTTC-AAATCAGTTTTGCTA-TTGAAGTTTAATGTACATGGTAGGTGAT--TATTAGCCAGAAATTCTTTTAGATTA--TGGGT-GT------------TTTTTT--TTTTACTG-CAAGAAAT-AAGAAATA-TTATT--AAAA---AT-CAA-----AGAA-TGCAATAG-AATG-TG-T-GGACAAATT
gi|5 : tacgGGTG-AAACA-CAA-T-A--TAG---GGC----GCA-----TT-T--CTCA-A--ACA--G-CA----T-TGTTA----TA--CA--TGGTTTT-CCAAAAA---AATATGCTA--TTTTTC-----CC--TT-C--ATACTACA--------ATTTA-A-C---A---C-ATTTGTCTTCAT-AGGAAT--AC---TTT-----A-AT------A---GGAC---T--T---CTG-TGGCCAT---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGT-ATTA--ATAGAA--A--TTA---GATT--TGC-AAAAATT-G-T-ACCCCAAAAA-GGTGA----TA-----TTT---TTAGTGT--TATG-C-TGTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TCT-G-CTGAAA--TATATGGGT--A--AATTA-TC-T--ATAT--TT-CC-TGCA-TT---TGAACATAAAT-CA-----GA-T--T-T--T-T-AGA-GAATTTT-TCACAA--ATTA-T--TT-G-G-T-GC--T---TA-TTTTTTTAAG-GA-T-CT-GAGT---------------A----AAAA-CTTT-TG---AATT-C--TATG-A-T-AA-A-AAATA-TA----A-T-AGG-GGT-G--C---CACG-TT-AT-GCA--TTT-TTTCAATGACAAT--TTC-CC-C-C----T---------GTT--TT--TATGGCAAGAT--TAAATA--AATGT---CAA-A-C---ATCA-TTTAAT-----T---T---TTTC-----A-TAAT-TC-AGT-TAAAAT----TACAGT-AT--AAGT-TTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--AAAA---AAA-TTTGCGG-C-C--AT-GC---A-ACCC--TTTTAATT-AA-TTT-CA-TC-C--ACCA--TGG-GTTT--T----AAT-GC-TA-AAA--TAAG-A-TT-----TAA-CAAAAA-A-A-----C-G------T-AGTG-TTCC---CGTAA-ACCACT-----T-AATTCTCGTG--AAA-TTAG--AA-AGCTTTAT---ATTAAT-T-CA--TTATTTGA--TT--TTTTA-GA--TAGA-CATTATC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-TAATG-----G-T----G-----TCGTTTT-CGGTAT------------ACC-------ACT-GTTTTCTTCTC-G-G--TATCATTAC-A-AAT----GCT-G-GTTACGGACAA---CTAC-AAA-AT-CCTG---AGT-GT-CCGTAAC-----C-----TG-TTA-TTTT--T--TC-A-GTTT--GAAGCCA--GTTTGT-TTT---AAACAA-CTAAAT-G-CTCGA--TA-TTTTTGAC-AAAGGTCAGGAG-GTTTGGTTC-TAAC-A--T-TAA-ATACTCTACTTT-ATGTTTCCACCCACAA--TTGTGATCGAAT--GC-A--CTTATTTCGGAAA--CCAA-AT-GTATCA--CTTCC-ATATGCAG-CATC-ATT-GCTGGTTACC---C--TCAG--CA-TG-ACGAT--CA--GCAATTGGCCTATTGGAAATGGGAAT-TAAAA-CA-GATG-ACA-----CACTA--TATTTTTTCAAT-GTTGAA-GTCAAC-TG------GTGTTAACA-TTTCAATAAC-AAAACTT-GTCAAGGATT-C--ACCATTTAAG-ATAAGGT-TCCAATCC-CTT--T--A--TAACTACT-AT--A-AC-TATAT-GTGTAG-TGC-CGT--AAAC---A--AGTTGAAAA--T-TAAAAA--T--TTATTT-TTTCCC-CAGA-AAGT-TGCAG-----AGAATA----TTTTCAAAAGCAG-TTTATTATTT-AAGTTTAATGTAT-
gi|1 : cgGGTGCAAACA-CAA-T-A--TAG---GGC----GCA-----TT-TTTC-CA--TA--A--G-CA----T-TGATA----TAATCAT---GTTTT-G----AA---AAA----TA--TTATTC-----TTCCTT-AGCATAC---A--------ATTTA-A-AC--A---C-ATTCTT-TTCAT-AGGAAT--ACACTTGT-----A-A------------GACATTTAGT---CTG-TG-CCAA---TT--------TT--TG----TG-------------ACT-CT----AAT-ATTA--AT-AGA--TAATTAAATCATT--TGCAAGAAAATAG-T-ACCACCAAAAAGG-CT----TTAGAACTTT---ATAGTGT--TATG-CTTGTTGCTAACT-AGATAACTGCCTAACATTTTGTAT-G-CTGAAAA-TA-G--GGTAAATTAATT--CT-C--ATATGTTT-CC-TGCC-GA---TGAACAT-AAT-CA-----GT-T--TAT--T-A-GGA-ATTCTTGATCACAA--ATTA-T--TT-GCG-T-GC--TTTAAA-ATTTAG--AG-GA-T-CA-GAGGT-----------A--ATAACAGAATCATTTTG---A-GTAT--CATG-A-T-AA-A---AT-TTAT---A-T-AGG-G---GTGC---CAC--TT-GG-GCA-ATGT-TT-CAATG--GAA--TTC-CC-C----------------GTT--TGA-TGG-CCA--AAAATAGAAAATAATGT---C-A-A-C---ATCA-T----T-----TAT-T---TTTC-----ATAATT-TC-CATCTAAAAT----AACAGT-AT--GAATGTTC-G-TT--AC--TC-AT-GGG--AAAA---AAAATT---GG-C-C--AT-GC---A--CCC--T-----TT-TA-TTT-AATTT-C--ACCA--T-G-TTTTAAT----ATT-GC-TA-AAAATTAAG-A-GT-----TTAGC-AAAA-A-AAAAGCC-G------T-AGTG-T--C---CGTCA-GCCACT-----G-AAA-TCTGTGGAAAA-TTAG--AA-AGGCCTTCATTA--CATAT-CA--TTA-TTTA--AT--TTTTAGGA--CAGA-C-TT-TC---AT-GT--AGATGGCC-TGAGA-T-ATGTGGTTGTT----G-----T--TTTC-CTCTGCAATGGTCCAT--ACC-------AC--GT----TTCTC-G-G--TATCATTAC-A-AGT----G-T-G-GTTACGGAC-AACGCTAC--AA-AT-CCTGTTTAGT-GTCCCGTAAC-----C-----TG-TAT-TTTG--ACTTC-A-GTTTGTAAGC-CA--G-CTGT-TTA---CAAACA-CA-ACTCGCCT-GAT-AT-TTTT--AC-AAAGGTCAG--AGGTTT-GTTCTT-ACTAAGT-TAATTCACTCTAC-TT-ATATTTTCAC-CCACA--TTGTGAT---AT--GCAA--ACTAA-TTGGAAAGCCCAAGATCGCATCA--TTTC--ATATGCAG-CATC-AT--GCT-GTTAC----C--TCAG--CATTG-ACAAT--AA--GCTA-TGC-CTATTG---ATGGGAAT-TAAAA-CA-GATGAACA-----CACTA--TTTTTCTTCAAGTGTTG-A-GTCAAC-TG------GTGTTCGT--TT----AAGC-AAAACTT-TGTAGGA--T-C--ACTATTTAAA-ATAA--AGTTC-ATCC-CTTAATAAT--AAACT--T-AA--ATAA-TGTGTAGT---G-GTCCCGTAAAAACCAAA--AGTTG-AAAACTGTAAAACCTC--TTATTTGTTTCTCACAAGAAAG--AGCAG-----A----GAAATTTTTC-AAAGCAG--TTATTATTT-AATT---ATGTA---TATAGGTTGT--TATTAGCCAGAAATTC-TTAAGATTG--C-GGA-TG------------TTTTTTACTTTCACTG-C-AGAAATATAAAAAGA-ATACTTTAACGCCTAC-C----------ATAGTCATAGAATCT-TG---GGGGAAATTA
gi|8 : GGTG-AAACAACAAAT-AGATAG---GG-----GCGCATATTT-T--C-CA-ATACCAA-G-CACAT-T-TGGTAAAATTA--CACATGG-TTT-G----AA---AATAT--TA--ATTTTC-----CT--TT-A--CTAC---A--------ATTTA-A-G-------C-ATTTGT-TTCATGAGGAAT-------TAC-----A-GTTTA---A--AGGAC---T--T---CTG-TG-CCAA---TT--------TTTTGT----TG-------------A-T-ATCATAAGT-ATTA--ATAGAA--A--T---AAGATAT-TGC-AAAAAAT-G-TTACCCCAAAAAGGGTT-----TTAGTA-TTT---TTAGTGT--TATG-C-TGTTGC--ACTTAGA-AA-TGC--AACATTTT-TCT-G-CTGAAA--TA-AT-GGTAA-----TTA-TT-TCTATAT-TTT-CCGTGCTTAT---TGAACAT-AATTCA-----GA-TAGT-T--T-AGAGA---CTTTT-TCA-AA--ATTA-T--TTTG-G-T-GCATT---AA-AT-TTT--AG--A-T-CCTGAGT------------A--A----AAAA-CTTTGTGTTGAAGT-T--TATG-A-T-AA-A-AAATATTA----AAG-AGGTG---G--C---CACG-TTTATTGCA-TTTT-TT-CA--G--AAT--TCC-CC-C-C----G---------TTT--TTTGTGC-CAA--AT----AAAAATAAT-----C-A-A-C---ATCA-T----T-----TAT-T---TTTC-----A-TAAT-TC-AGTCTAAAAT----TACAGT-ATAGTAATGTT-TG-TTTCAC--TCGAT-GGG--AAAA---AAA-TT---GG-G-CC-AT--CGAAA-CCCT--T-----TT-AT-TTT-AA-TT-CTCACCA--T-GGTTTT--T----AATTGC-TA-AA--TTAAG---CT-----TTA-C-AAAA-A-AAAC--C-G------T-AGTG-T--C---CGT-A-A-CACT-----T-GAATTCTGTG--AAAGTTAG--AA-AGCTGTAT---A--CATAT-CA--TTATTTTA------TTTTA-GA--TAGA-CATT------AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-ATG-----GTC----GTTGTTT--TTTT-CCCTGCATGG-TCATT--ACC-------ACT-GT----TTCTCGG-G--TATCAATACAA-AAT----G-T-G-GTTAC-GAC-A---CTAC-AAA-AA-TCTG--TAGT-GT-CCCGTAC-----C-----TGATAT-TTTG--A--TC-A-GTTT--GAAG-CA--GCTTGTCTTT---AAAAAC-CT-AAT-G-CT-GAT-AT-TTTT--AC-AAAGG--AG--AGGTTT-GTTC-T-AC-AAGTCTAA-TCA
gi|13 : GGTG-AAACA-CAA-TTA--AAG---GG-----GCA-----TT----C-CA-ATA-CA--G-CA----T-TGTTA----TA--TA--TGGTTTT-C----AA---A-------------------------TT-G--ATAC---A--------ATTTA-A-C---A---C-ATTTGT-TTCAT-AGGAATACA----TTT-----A---------A--AGGAC---T--T---CTG-TG-CCAAT--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGAA--T--TT--AAGATAT-TG-CAAAAAAT-G-T-ACCCC-AAAAAGGTGA-----T-----ATT---TTAGTGT--TATGCA--GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AATATTTT-TCT-G-CTGAAA--TA-AT-GGT--A--AATTATTT-T--ATAT-TTT-CT-TGCCTATATATGAACAT-GAT-CA-----AA-T--T-T--T-AGAGA-ATTTTctt
gi|15 : acgGGTG-AAACA---A-T-A--CAG---GGC----GCA-----TT-T--C-CA-ATA-CA--G-CA----T-TGTTA----TA--CA--TGGTTTT-C----AA---AAA----TATTATTTTC-----CT--TT-A--CTAC---A--------ATTTA-A-C---A---C-ATTTTT-TTCAT-AGGAAT--A----TAT-----T-TA------A--AGAAC---T--T---CTG-TG-CGAAT--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGT-ATCA--ATAGAA--A--TT--AAGATAT-TGCAAAAAAA--G-T-ACCCC-AAAAAGGTGA----TA-----TTT---TTAGTGT--Tgtgatatgggtgccacgttatacattttttcaattggtcaccccctcccccccccgttttatgccaatgaaaatgtctacatcatttatttttctctacttcaatctgaaattacagtattgatgttctgttatcttcaggacaaaaattgttcgcaggtaac
gi|14 : gGGTG-AAACT-CAA-T-A--TAG---GACAAACGCA-----TTAT--C-CAGATA-CAATG-CAAT--TATGTTA----TAA-CAT-TGGATTTGC----AA---AAA----TATTATTTTC-----TT--TA-A--GTAC---A--------ATTAA-A-AAACA---TAATTTGT-TTCAT-AGGATC--A----CGTTAAAAA-AT------ATCAGT-C---T--TTTCTTG-TG-CCAC---TCAAACCCAATT--GG----TGTTTCTCAGTAAATA-T-CT----AGCAACTAAGATAGAA--T--TTTAAAGATAA-T-CAAAAAAAT-G-T-ACCCC-AAAAAGGTCA----TT-----TTT---
gi|17 : gGGTG-AAACA-CAA-TCA--TAAAATGGTTGTCGCA-----TG-TG-C-CA-ATTACA--GTCAATTTT-CGTTA----TA--C---TG---TT-C----AAGA-AAT----CT--TTTTTC-----TT--TT-A--ATGC---A--------ATTTA-C-T---A---TTATTCAT-TTCAT-GAGGAT--AACC-TAT-----A-AT-----------GAC---T--T---CTG-TG-CCAAATTTT--------TT--GT----TG-------------A-TGCT----AG
gi|27 : GGTG-AAACA-CAA-T-G--TAG---GGC----GCA-----TT-T--C-CA-ATA-CA--G-CA----T-TGTTA----TA--
gi|28 : tcgGGCG-AAACA-CAA-T-A--TAG---GGC----GCA-----TT-T--C-CA-ATA
gi|29 : tatatcgGGTG-AAACA-CAA-T-A--TAG---GGC----GCA-----T
gi|11 : catattacgGTG-AAACA-CAA-T-A--TAG---GGC----GCA-----TT-T--C-CA-ATA-CA--T-CA----T-TGTTA----TA--CA--TGGTTTT-C----AA---AAA----TATTGTTTTC-----TT--TT-A--ATAC---A--------ATTTA-A-C---A---T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT--A----CAT-----A-TA------A--AGGAC---T--T---CTG-TG-CCAA---TT--------TTT-GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGAA--T--TT--AAGATAA-AG-CAAAAAAT-G-T-ACCCCAACAAGGGTTGTTGTTT-----TTT---TTAGCGT--TATG--CTGTTGC--ACTTAGA-AATTGC--AACATTTT-TCT-A-CTGAAA--TA-AT-GGT--A--AATTA-TT-CT-ACAT-TTT-TC-TGCC-AT---TGAACAT-AAT-GA-----GA-T--T-T--T-A-AAG-ATTTTTT-TCACAA--ATTATT--TT-G-G-T-GCT-T---AA-ATTTTC--AG-GA-T-C--GAGT---------------A----AAAA-CCTT-TG---AAG--T--TATG-G-G-AA-A-AAAAG-TA----A-T-AGG-GGT-G--C---CACG-TT-AT-ACA-TTTT-TTT-AATG--GAT--TTT-CCAC-C----T---------GTT--TTTATGT-CAA--AT----AAAAATAATGT---C-T-A-C---ATCA-TTTA-T-----T---T---TTTC-----A-TATT-TC-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-AGG---AAA---AAA-TT---GG-ATC--AT-GC---A-ACCCT-T-----TT-AA-TTT-AATTT-C--ATCA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-CA-AAAATTCAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-ATA-----T-G------T-AGTG-T--C---CGT-A-ACCACT-----T-AAATTCTATG--AAA-TT
gi|7 : tacgaAG---GC-----GCA-----TT-T--C-CA-ATACCAT-G-CAC---T-TGTTA----TA--CAT-GGAATTT-C----AA---AATA---TT--ATTTTC-----TT--TTTA--ATAC---A--------ATTTA-A-C---A---T-ATTTGT-TTCAT-AGG-AT--AC---CGT-----A-TA------A--AGGAC---T--TCC-CTGATG-CCAA---TT--------GT--GT----TG-------------ATT-CT----AGC-ATTA--ATAGAA--T--TT--AAGATAA-TG-CAAAAAAT-GCT-ACCC--AAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TATT-GCTGTT-C--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TCT-A-CTGACAAGTA-AT-GGTTAA--ATTTA-TT-CT-ATAT-CTT-AC-TGCC-A----TGAACAT-AAT-CAT----GATT--T-T--T-A-AGA-A--TTTT-TCAC-A--ATTATT--TT-G-A-T-GCT-T---AA-AT-TTT--AGCGA-TCC--GAGT---------------A----AACA-CTTT-TG---AAGT-T--TATG-A-A-AA-A-AAG---TA----A-TCAGG-GGATG--C---CATG-TT-AT-ACA--TTT-TTTCAATG--AAT--TTCTCC-C-C----T---------GTT--TTA-T-T-CCA--AT--TTAAAAATAATGT---T-TCATC---ATTA-T----T-----T---T---TTTC-----A-TATT-TC-AG-CTAAAA-----TACAGT-AT--GAAT-TTCTGTTT--ACT-TC-ACGGGG--AAAA---AAA-TT---GGCGTC--ATAGC---A-ACCC--T-----TT-AA-TTT-CATTT-C--ATTATGT-G-TTTT--T----AAT-GA-TA-AAAATTAAGAA-TT-----TTA-C-AAAA-A-ACAAAGC-G------T-AGTG-T--C---CGTAA-ACCACT-----T-AAATTCT-TG--AAA-TTAGAAAA-AGCTCTAC---A--TATATGCAACTTAATTTATTAT--TTTTA-GAT-TAGA-CATT-TC---ATCGT--AGATG--CTTGAGATT-ATGT----GTT----------T--TTTC-TCCTGA-----TCATC--ACC-------ACT-GT----TTCTC-AGG--TATCATTCC-A-AAT----G---G-GTTACGGAC-A---CTACAAAA-ATACCTG--TAGT-GT-CCGTAA------C-----TG-TAATTTTG--A--TC-A-TTTTTGAAAG-CA--GCCTGT-TTTA--AAAACACCT-AAT-G-CT-GATATT-TTTT--AC-AAAGGTC----A-GTTT-GTTC-T-AC-AATT-TAA-TCAATATACTTT-ATTTTTTCACCCTTCAT-TT-TGAT--GATTGGC-A--A
gi|10 : -CA----T-TGTTA----TA--CA--TGATTTT-C----AA---AAA----TATTGTTTTC-----TT--TT-A--ATAC---A--------CTTTA-A-C---A---T-ATTT-T-TTCAT-ACGAAT--A----CGT-----A-TA------A--AGGAC---T--T---ATG-TG-CCAA---TT--------TT--TT----CT-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGAA--T--TTAA--GATAA-TGC-AAAAAAT-G-T-GCCCCAAAAA-GGTC-----CT-----TTT---TTAGTGT--TATG-C-TGTTAA--ACTTAGA-AATTGC--AATATTTT-TCT-A-CTGAAA--TA-AT-GGTAAA----TTA-TTAT--ATAT-TTT-CC-TGCC-AT---TGAA--C-AGT-CAATGACGA-T--T-TCTT-A-ACAGAGTTTTC-TCGCAA--ATTA-TGTTT-G-G-TAGC--TTT-AATATTTCT--AG-GA-T-C--GAGT--------------------AAAA-CTGTTTG---AAGT-TGCT-TG-A-ATAATA-AAAT-CTAT---A-T-AGG-G---G--TGCACACG-TT-G--ATA-TCTT-TTTAAATG--ACC--CCC-CC-C-CCCGCT---------GTC--TT-TTATGCCA--GC--TAAAAA-TAATGTCGCT-T---C----TCA-T----T-----T---TATTTTTC-----A-TAAT-TC-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TACTGTTTTG-TT--CCGTTC-ACAGGG--AAAAGGGAAA-TT---GG-G-CC-AT-GC---AACCCC--T-----TT-AA-TTT-AG-TTTC--ATCA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-CA-AAAATTATG-A-TT-----TTA-C-AAAA-ATA-----C-G------T-AGTG-T--C---CGT-A-ACCACT-----T-GAATTCTATG--AAA-TTAG--AA-ATCTCTAT---A--GATAT-CA--TTA-TTTA--AT--TTCTa
gi|19 : A----TA--CAA-AAGGTTT-C----AACACAAT--------ATCTTTAAGAACT--TT-A--ATAC---AGGGTTCTTACCTA-ATA---ATATT-ATTTGT-TTGAT-AGGAAT--A----CAT-----ATATAAATAAA--AGGAC---T--T---CTG-TG-CCAAC--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----
gi|4 : ----AGC-ATCC--ATAGAACAT--TTAAA-GATAACTGC-AAAAAAT-G-TGACCCCAAAAA-TGTCA----TT-----TCTGTGTTAGTGTGTTATG-C-TGTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TCTATACTGAAC--TA-AT--GT-AG--ACTTA-TT-CTAGTAT-TTA-AC-TGCC-AT---TGAACAT-AATCCA-----GA-T--T-T--TCA-AGC-A--TTTT-TCACAA--ATAT-T--TT-G-G-T-GC--TTA-AA-ATCTTTC-AT-GACT-C--GAG-T-----------A--C----AAAA-CGTT-TG---AA---T--TATG-A-A-AA-A-AAATG-TA----A-A-AGG-G---GTAC---AATG-TT-AT-ATC-TTTTCTTCCAATG--AATTGTTC-TCGC-C----TG--------GTT--TTGGTATGCTA--AGA-TAAAAAATAATGT---C-T-A-C---ATCAGT----TTATAGT---T---TTTC-----A-TACTATCGAGCTTAAAATGAGCTA-GGTAAT--TGATCTCCTG-TT--AC--TC-AC-AG----AAA---AAA-TT---GG-C-CATAT-GC---A-CCCTTAT-----TT-AA-TTTCAATTT-C--ATCA--T-G-TTTT--CCCTGAAT-GC-TATAAAAT--AG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-ACG---C-G------T-AGTG-T--CACGCGTCA-ACCAATTCAAAT-AAATTCTAT----AA-TCAG--AACGGCTCTAT---A--GATAT-CA---CA--TTA--ATGATTCTA-GATCTAGATCATA-GCATAAT-GTCGAGAAT--C-TGAGA-A-ATG-----GGTGGTAG-----T--TTTTGCTCTGT-----ATCAC--ACCCCAACCTACT-GT----TTCTC-AGG--TATCATCAC-A-AACG---G-T-ATGTT--GGACAA---CT-C-AAA-AT-CCTG-CCAGT-GT-CCGTAAC-----CT----TG-TAT-TTTG--T--TCAA-GTT---GAAG-CA--GCCTGT-TTTTTAAAAACAGCTAAAT-G-CT-GA---AGTTTT--AC-AAAGGTCAG--G-GTTT-ATTC-T-AC--AGT-TAA-T--ATATACTTTAATATTTTCACCTCTCAATTT-TGAT--GAT--GC-AATACTAATTAGAACAGCCCAA-ATCGCATCA--TATCCACTATACAGCCATCGA-TAGCT-GTTACC---A--TCAG--CA-TGAAT-AT--AACGGCAA-TG--C------ATATGGGCAT-TAAGA--A-GATG-GCAC--ACCATGAATT--TTTTTCACTAATTGAAGGTCAAACTGGCTGTTACATT-ATA-TT----T--T-AAAATCTGAGTATGATTTACCAACTAATTAAG-ATAATT--TCC-ATCCGCTT-ATAAAACCAAGT--TAAA--A-AA-TG--T-G--TAGTGTCCCG---TAACCAAAGCAGTT-ACAAACT-TAAAAC--TGATTA-TT-TTTCTC-CAAG-AAAGTTGCAAGAAATA----A----TGTTC-AAAGCTG--TTGTTA-TTGAAGTTT-GTGTAT-GT-TAGGTGATTATA-TAGCCATAAATCTCTTTAGATTATGT-GGTGGG------------TTTCTTG-TTTTATTGTCTAAATATAGAAAAAAAATTACTT-AACA---CTACAA-----ATTACTATCAT--GAATGTTGTT-GGGGGAATTA
gi|26 : cta----AAC-ATTA--ATAGAA--T--TTAA--GATAA-TG-CAAAACAT-A-T-ACCCCCAAAAA-ATCA----TT-----TTT---TAAGC-----------TGTTGC--ACTT
gi|18 : T--TATG-C-TGTTGC--ACTTAGA-AAATGC--AACATATT-TCT-G-CTGAAA--TA-AT-GGT--A--AATTG-TT-CT-ATAT-TTT-CC-TGTC-AT---TGAACAC-AAT-CA-----GA-T--A-T--T-AGAGA-A--TTTT-TCACCA--ATGA-T--TT-G-GTT-GC--TA--AA-ATTTTC--AG-GA-T-C--GAGT---------------A----AAAA-CTTT
gi|12 : T-TCT-G-CTGAAA--TA-AT-GGTAAA----TCA-TT-CT-ATAT-TTT-CC-TGCC-TT---TGAACAT-AAC-CA-----GA-T--T-T--T-AGAGA-ATTTTT---CACAA--ATTA-T--TTTG-G-T-GC--TT--AC-ATTTTT--AG-GA-T-C--GAGT------------A--A----AAAA-TTTT--G---AAGT-T---ATG-ATA-AA-A-AAATAT-A----A-T-AGG-G---GTGC---TACG-TT-AT-GCA-TTTT-TT-CAATG--ATT--TTTTCC-C-C----T---------GTT--TT--TATGCCA--AA--TAAAATTTA-TGT---C-A-A-C---ATCA-T----T-----TATTT---TTTC-----A-TAAT-TC-AGTCTAAAAG----TACAGT-AT--GAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--GAAA---AAA-TT---GG-G-CC-AT-GC---A-ACCC--T-----TTTAA-TTT-AA-TTTC--ACCA--T-G-TTTT-------AAT-GC-TA-AAAATTAAG-AGTTAAAAATTA-A-AAAAAA-A-----C-G------T-AGTG-T--C---CGT-A-ACCACT-----T-AAATTCTGTG--AAA-TTAG--AA-AGCTTTAT---A--CATAT-CA--TTA-TTTA--AT--TTTTA-GA--TAGA-CATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGT-T-ATG-----GTG----GGGGT-T--TTTT-TCCTGG-----TCATT--ACC-------ACT-GT----TTCTtt
gi|22 : T-AC-TGCC-AT---TGAACAT-AAT-CA-----GA-T--T-T--TGA-GGA-A--TTTT-TCACAAT-TTTG-T--TT-G-G-T-GCT-T---AA-ATCCT----G-AA-T-----------------------A----AAAA-TTT--TG---AAG--T--TATG-A-A-AA-A-AAA
gi|6 : -T--TT-G-G-T-GC--TT--AA-ATTTTC--AG-GA-T-C--GAGTTTTTCAGGATCGAGTA----TAAA-CTTT-TG---AAGT-T---GTA-A-A-AA-ATAAATGT-G----A-T-AGG-A---G--TG--CACG-TA-AT-ACA-TTTT-TT-CATTG--AAT--TTT-CC-CTC----T---------ATT--TTA-TAC-CAA--AT----AAAAATAATGT---C-T-A-C---ATCA-T----T-----T---C---TTTCTTTTTA-TACT-TC-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG---AAA---AAA-TT---GG-GCC--AT-GC---A-ACCT--T-----TT-AA-TTT-AATTT-C--ATCA--T-G--TTT--T----AAT-GCGTA-AAAATT-AG-A-TT-----TTA---AAAA-A-A-----CTG------T-AGTGTT--C---CGT-ATACTACT-----T-AAGATCTATG--AAA-TTAG--GA-AGCTTTAT---A--GATAT-AA--TTA-TTTA--AT--TTCTA-GA--TAGA-CATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-ATG-----GTG----GGTT--T--TTTT-CCCTGG-----TCATT--ACC-------ACT-GT----TTCTC-AGG--TATCATTAC-A-AAC----G-T-A-GTTACAGAC-A---CTAC-AAA-AT-CCTGTT--GT-GT-CCGTAAC-----C-----TG-TAT-TTTG--A--TC-A-GTTT--GAAG-CA--GTCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-G-CT-GAT-AT-TTTT--AC-AAAGGTCAG--AGGTTT-GTTC-T-AC-GAGT-TAT-TCAATCTACTTT-AT-TTTTCAC-CCTCAT-TT-TGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCTTAA-ATTACATCA-TTTTC--ATATACAG-CAT-TATT-GCT-GTTACATGTACCTCAG--CA-TG-AC-ATACAA--GCTA-TG--CTATT-GAAATGGGAAT-TAAAA-CA-GATG-ACAC--ACCAT---TTTTTTTTTCAAT-GTTGAA-GTCAAC-TG------GTGTT-ACA-TT----TAAC-AAAACCT-TGTAGGAATTCC--ACTATTTAAG-ATAAGT--TCC-ATCC-CTA-ATAAA--TAACT--T-AA--AGAA-TG--T-G--TAGTGTC-CG---TAACCAAA--AGTTG-AAAACT-TAAAGC---------TT-TTTCTC-CAAG-AAAGTTGCAG-----A----AAAT-TTTTC-ACAGCAC-TTTGTTA-TTGAATTTCAATGTA---TACAGGCG-TT-TATTAGCCA--------TTTA----------------------------TTTTA--TTTTACTG-CAAGAAATTAAAAAA-AATTACTTTAAAA---A---AACACCTACAAATACC-TAG-AATG-TA-TAGGGAAAAaatgtaaa
gi|23 : t--TT-G-G-T-GC--TT--AA-ATTTTC--AG-GA-T-C--GAGT--------------------AAAA-CCTTTTG---AAGT-T---ATG-A-A-AA-A-AAATGT-A----A-C-CGG-G---GAGC---CAGG-TT-AT-ACA-TTTT-TTTCAATG--A
gi|13 : -AG-A-GAATTTTGTGATA-T-GGG-T---G--C---CACG-TT-AT-ACA--TTT-TTTCAATT--GGT--CAC-CC-C-C----TCCCCCCCCCGTT--TTA-TG--CCA--AT--GAA-----AATGT---C-T-A-C---ATCA-T----TTA---T---T---TTTC-----TCTACT-TC-AATCTGAAAT----TACAGT-AT--TGATGTTCTG-TT--AT--CT-TC-AGG--ACAA---AAA-TT---Gctgttt
gi|24 : acgggtgaaacacaattaaaggggcattccaatacagcattgttatatatggttttcaaattgatacaatttaacacatttgtttcataggaatacatttaaaggacttctgtgccaatttttgttgatctagcattaatagaatttaagatattgcaaaaaatgtaccccaaaaaggtgatattttagtgttatgcagttgcacttagaaactgcaatatttttctgctgaaataatggtaaattattttatattttcttgcctatatatgaacatgatcaaatttt-A-C---ATCA-T----T-----TATTT---TTTC-----A-TACT-TT-AGTCTAAAAT----TACACT-AC--TAATGTTCTG-TA--AC--TC-AC-AGG---AAA---ATA-TT---GG-GCC--AT-GC---A-ACCCT-T-----TT-AA-TTT-AA-TT-ttcgcaggtaac
gi|25 : TCTG-TT--AC--TC-AC-AGGAAAAAA---AAA-TT---GG-GCC--AT-GC---A-ACCC--T-----TT----TTT-TA-TT-T--TTTA--T-T-TTTT--T----GA-----CA-AAAAT
gi|20 : CC--T-----TT-AA-TTT-AT-TTTC--ATCA--T-G-TTCT--T----AAT-GC-TA-AAAATTAAG-G-TT-----TCA-C-AAAA-A-A-----C-AAAACCAT-AGTT-T--C---CGT-T-ACCACT-----T-TAATTCTATG--AAA-TTAG--AA-AGCTCTAT---A--gtagccgaatttaa
gi|9 : gcaaccATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-AAG-----GTG----T-----T--TTTT-CCCTGA-----TCACC--ACC-------ACT-GT----TTCTC-A-GG-TATCATCAC-A-TAT----G-T-G-GTTACGGAC-T---CTAC-AAA-AT-CCTGT--AGT-GT-CCGTAAT-----T-----TG-TAT-TTTG--A--TC-A-GTTTGA--AG-CA--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-G-CT-GAT-AT-TTTT--AC-AAAAGTCAG--AGGTTT-GTTC-C-AC-AAGT-TAA-TCAATTTACTTT-AT-TTTTCAC-CCTCAT-TT-TCAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCCCAA-ATCGCATCA--TTTCC-ATATACAG-CATC-A-TAGCT-G-TATC---A--TCAGT--A-TG-AC-AT--AA--GCAA-TG--CTATT-GACATGGACAT-CAAGA-CA-GAT-TACATGTACCA-TA---TTTTTTTCAAT-TTTGAA-GTC----TG------GTGTT-ACA-TT----TAAC-AAAAGCT-TGTACGAATTCC--ACTATTTAAG-ATAAGT--TCC-ATCC-CTT-ATTTA--TAACT--T-AAAGA-ATATG-------TAGTGTC-CG---TAACCAAA--AGTTGAAAACTT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAG-AAAGTTGCAGAA---A----A----ATTTC-AAAGCAG-TTAGTTA-TTGAAGTTTAAAGTAT-T--TAGGTG-TT-TATTAGCCAGAAATTCTTTAAGATTA--T-GG--GGTGCTTTATTTTTTTTTTT--TTTCACTG-CAAGAAATAAAAAAA-A---ACTT--AAC---AC-CTA-----CAAAT--ACATAG-AATG-TG-T-GGGGAAAATA
gi|7 : ATGATCAA-A-ATT----A-C-A-GTTACGGAC-A---CTAC-AGGTAT-TTT-TGTAGT-GT-CCGTAAC-----C-----C----A-TTTGGAA--TG-ATACCTGAGAAA-CA--G
gi|6 : aggcgcatttccaataccatgcacttgttatacatggaatttcaaaatattattttctttttaatacaatttaacatatttgtttcataggataccgtataaaggacttccctgatgccaattgtgttgattctagcattaatagaatttaagataatgcaaaaaatgctacccaaaaaggtcatttttttagtgttattgctgttcacttagaaactgcaacatttttctactgacaagtaatggttaaatttattctatatcttactgccatgaacataatcatgatttttaagaatttttcacaattattttgatgcttaaattttagcgatccgagtaaacacttttgaagtttatgaaaaaaagtaatcaggggatgccatgttatacattttttcaatgaatttctcccctgttttattccaatttaaaaataatgtttcatcattatttttttcatatttcagctaaaatacagtatgaatttctgtttacttcacggggaaaaaaattggcgtcatagcaaccctttaatttcatttcattatgtgtttttaatgataaaaattaagaattttacaaaaaacaaagcgtagtgtccgtaaaccacttaaattcttgaaattagaaaaagctctacatatatgcaacttaatttattatttttagattagacatttcatcgtagatgcttgagattatgtgttttttctcctgatcatcaccaATCA--A-AAT----A-CAG-GTTACGGAC-A---CAAC-AGG-AT-TTTG--TAGT-GT-CTGTAACTACGTT-----TG-TAA---TG--A--T----ACCTGAGAAA-CA--Gttttgaaagcagcctgttttaaaaacacctaatgctgatattttttacaaaggtcagtttgttctacaatttaatcaatatactttattttttcacccttcattttgatgattggcaaa
gi|3 : ttttggtgcttaaattttcaggatcgagtttttcaggatcgagtataaacttttgaagttgtaaaaaataaatgtgataggagtgcacgtaatacattttttcattgaattttccctctattttataccaaataaaaataatgtctacatcatttctttctttttatacttcagtctaaaattacagtattaatgttctgttactcacgggaaaaaattgggccatgcaaccttttaatttaatttcatcatgttttaatgcgtaaaaattagattttaaaaaaactgtagtgttccgtatactacttaagatctatgaaattaggaagctttatagatataattatttaatttctagatagacatttcatgtagatgctgagatatggtgggtttttttccctggtcattaccaTCA--A-AAT----A-CAG-GTTACGGAC-A---CTAC-CAG-AT---TGT---A--GT-CCGTAAC-----C-----cagtttgaagcagtctgttttaaaacactaatgctgatatttttacaaaggtcagaggtttgttctacgagttattcaatctactttatttttcaccctcattttgatgatgcaactaatttggaaagcttaaattacatcattttcatatacagcattattgctgttacatgtacctcagcatgacatacaagctatgctattgaaatgggaattaaaacagatgacacaccattttttttttcaatgttgaagtcaactggtgttacatttaacaaaaccttgtaggaattccactatttaagataagttccatccctaataaataacttaaagaatgtgtagtgtccgtaaccaaaagttgaaaacttaaagctttttctccaagaaagttgcagaaaatttttcacagcactttgttattgaatttcaatgtatacaggcgtttattagccatttattttattttactgcaagaaattaaaaaaaattactttaaaaaaacacctacaaatacctagaatgtatagggaaaa
gi|12 : tacgggtgaacaaaatatagggccattctccaatacagtcattgttatatcatggatttcaaaactattatttttctttaatacaatttacaaatatttgtttcataggaatatgtataaaggaattctgtgccaattttatggtttgatctagcattaatagaatttaagataatgcaaaaatgtacccaaaaaggtcattttttagtgttatgctgttgcacttggactgcaacatttttctactgaagtaatggtaaatttattctatatcttaactgccattgaacataatagattttaaagaatttttcacaattattttttggtgctaaaatttttaggatcggataaaaacttttgaagttaatgaaaaaaaaatgtaataggggtgcatgtttatacattttttttcaatgaatttcccacctgtttgttaatttcaattaaaaaatatgtttacaatattatttttttcatattcagtctaaattacagtattaatgttctgttactcacggaaaaaaaattggggccaatgcaaccctattaattttaatttcctcatgttttaatgccaaaaattaagattttacaaaaaaacgtaagtgtccgtaaccacttaaaattcctgaattagaaagctctacagatatcattatttaatttttagatagacatttatgtagatgctgcgatatggtgttttttcccgtgatcatcaaaccactcgtttctccggttatcatcacaaatgtTCAC-AGAATTTAAG-T-G-GTTACGGAC-A---CTAC-aagtttttgaagccatcgcctgttttaaaacactatgcctgatattttttacaaaaggtcaaggtttgttctaacaagttaattcaatatactttattttttaccctgcattttgatgatggactaatttggaaagctcaaatcacatcattttccatatacagcatcatagtgttaacatcagtatgacatatcaaatgctattgacatgggcatccaagaaagatggcatacatattttttcaattttgaagtcaactgtgttgcatttaaacaaaaatcttgtacaaattccactatttaacataatttcccatcctataaacaacttaaaatgtgtagtgtcgcgtaaccaaacgttgaaaactcaactttattttttctccaagaagttgcagaaaattttcaaatcagttttgctattgaagtttaatgtacatggtaggtgattattagccagaaattcttttagattatgggtgtttttttttttactgcaagaaataagaaatattattaaaaatcaaagaatgcaatagaatgtgtggacaaatt
gi|9 : ttctgctgaaataatggtaaatcattctatattttcctgcctttgaacataaccagattttagagaatttttcacaaattattttggtgcttacatttttaggatcgagtaaaaaattttgaagttatgataaaaaaatataataggggtgctacgttatgcattttttcaatgattttttcccctgtttttatgccaaataaaatttatgtcaacatcatttattttttcataattcagtctaaaagtacagtatgaatgttctgttactcacggggaaaaaattgggccatgcaacccttttaatttaatttcaccatgttttaatgctaaaaattaagagttaaaaattaaaaaaaaacAC-A-AAT------------TACGGAC-A---CTAC-AGG-AT-TTTG--TAGA-GT-CCGTAAC-----CACATATG-TGA---TG--A--T----ACCTGAGAAA-CA--Gaattagaaagctttatacatatcattatttaatttttagatagacatttcatgtagatgctgagttatggtgggggtttttttcctggtcattaccactgtttct
gi|11 : atttcatgtagatgctgagataaggtgttttttccctgatcaccacca----G-T-G-GTTACGGAC-A---CTAC-Aattttgatcagtttgaagcagcctgttttaaaacactaatgctgatatttttacaaaagtcagaggtttgttccacaagttaatcaatttactttatttttcaccctcattttcatgatgcaactaatttggaaagcccaaatcgcatcatttccatatacagcatcatagctgtatcatcagtatgacataagcaatgctattgacatggacatcaagacagattacatgtaccatatttttttcaattttgaagtctggtgttacatttaacaaaagcttgtacgaattccactatttaagataagttccatcccttatttataacttaaagaatatgtagtgtccgtaaccaaaagttgaaaactttaaaactttattttttctccaagaaagttgcagaaaaatttcaaagcagttagttattgaagtttaaagtatttaggtgtttattagccagaaattctttaagattatggggtgctttattttttttttttttcactgcaagaaataaaaaaaaacttaacacctacaaatacatagaatgtgtggggaaaata
gi|10 : tacgagtgaaacacaatatagggcgcatttccaatacatcattgttatacatggttttcaaaaatattgttttcttttaatacaatttaacatatttgtttcataggaatacatataaaggacttctgtgccaatttttgttgatctagcattaatagaatttaagataaagcaaaaaatgtaccccaacaagggttgttgttttttttagcgttatgctgttgcacttagaaattgcaacatttttctactgaaataatggtaaattattctacatttttctgccattgaacataatgagattttaaagatttttttcacaaattattttggtgcttaaattttcaggatcgagtaaaaacctttgaagttatgggaaaaaaagtaataggggtgccacgttatacatttttttaatggattttccacctgtttttatgtcaaataaaaataatgtctacatcatttattttttcatatttcagtctaaaattacagtattaatgttctgttactcacaggaaaaaattggatcatgcaacccttttaatttaatttcatcatgtttttaatgccaaaaattcagattttacaaaaata----G-T-G-GTTACGGAC-A---CTAC-ttaaattctatgaaatt
gi|21 : cattgttatacatgattttcaaaaatattgttttcttttaatacactttaacatattttttcatacgaatacgtataaaggacttatgtgccaattttttctatctagcattaatagaatttaagataatgcaaaaaatgtgccccaaaaaggtccttttttagtgttatgctgttaaacttagaaattgcaatatttttctactgaaataatggtaaattattatatattttcctgccattgaacagtcaatgacgatttcttaacagagttttctcgcaaattatgtttggtagctttaatatttctaggatcgagtaaaactgtttgaagttgcttgaataataaaatctatataggggtgcacacgttgatatctttttaaatgacccccccccccgctgtcttttatgccagctaaaaataatgtcgcttctcattttatttttcataattcagtctaaaattacagtattactgttttgttccgttcacagggaaaagggaaattgggccatgcaacccctttaatttagtttcatcatgtttttaatgccaaaaattatgattttacaaaaatac-T-G-GCTACGGAC-A---CTAC-ACA-TT-C---TTTAA--GT-ttgaattctatgaaattagaaatctctatagatatcattatttaatttct
gi|5 : aata-G-GTTACGGAC-A---CT-C-AGG-AT-TTTG--TAGTTGT-CCGTAAC-----C-----AG-C-A-TTTG--aaagttgaaaacttaaaactttttttcccaagaaagttgcagagaaatttttaaagcagtttattatttaagtttaatgtat
gi|30 : cgggtgaaacacaatatagggcgcatttctcaaacagcattgttatacatggttttccaaaaaaatatgctatttttcccttcatactacaatttaacacatttgtcttcataggaatactttaataggacttctgtggccatttttgttgatctagtattaatagaaattagatttgcaaaaattgtaccccaaaaaggtgatatttttagtgttatgctgttgcacttagaaactgcaacatttttctgctgaaatatatgggtaaattatctatatttcctgcatttgaacataaatcagatttttagagaatttttcacaaattatttggtgcttatttttttaaggatctgagtaaaaacttttgaattctatgataaaaaatataataggggtgccacgttatgcattttttcaatgacaatttccccctgtttttatggcaagattaaataaatgtcaaacatcatttaattttttcataattcagttaaaattacagtataagtttctgttactcacgggaaaaaaatttgcggccatgcaacccttttaattaatttcatccaccatgggttttaatgctaaaataagatttaacaaaaaaacgtagtgttcccgtaaaccacttaattctcgtgaaattagaaagctttatattaattcattatttgattttttagatagacattatcatgtagatgctgagataatggtgtcgttttcggtataccactgttttcttctcggtatcatta-GTTACGGAC-A---CTAC-AAA-AT-CCTGTtgttattttttcagtttgaagccagtttgttttaaacaactaaatgctcgatatttttgacaaaggtcaggaggtttggttctaacattaaatactctactttatgtttccacccacaattgtgatcgaatgcacttatttcggaaaccaaatgtatcacttccatatgcagcatcattgctggttaccctcagcatgacgatcagcaattggcctattggaaatgggaattaaaacagatgacacactatattttttcaatgttgaagtcaactggtgttaacatttcaataacaaaacttgtcaaggattcaccatttaagataaggttccaatccctttataactactataactatatgtgtagtgccgtaaacaagttgaaaattaaaaatttattttttccccagaaagttgcagagaatattttcaaaagcagtttattatttaagtttaatgtat
gi|21 : AA--TAACT--T-AA--AGAA-TGT---GT--AGTGTC-CGT---AGCCAAA--AGTTG-AAAACT-TAAAAC--T-----TTT-TTTC-C-CAAG-AAAGTTGCAGAGA--A----A----TTTTT-AAAGCAG-TTTATTATTT-AAGTTTAATGTAT-agtgt
Alignments
lowQualScore : 11111 1111 11111111 11111111111111 111 111 11111111 1111111111111 2222 22 11111 1 111 2222222222222222222 11 222 2222222222 11 1 11111111111111 2222222 111 1 1111 2222222222222 11111 1111 1 1111111 333333333333 1 11 111 2222222222222 11111 2222222 1111111 1 11111 2222 222 111 2 111 11111 1 11111 11 1 1111 111111 11 11111111 11 1111 1111 11 11 1 11111111 44444444444 1 2222 1 11111 11 1 1 22222 22 1 4444444444444444444444 11 11 1 22222222222 1111
lowQualScore : 2 2 5 11111 888888888 444 7777 2 2 2 2 77 77 5 7777 2 888888 99 3 44 0 3 555 3 5 44 3 555 2 2 33 00000000 555 2 2 888888 2 2 2 2 66666666666666 2 77777 000 33 2 2 999 00000000 33 6666 5555555555555 2 5 5555 2 33 2 33 3333 66 11 2 2 5 9 4 88888 44444 555 44 3 3 3 44 3 55 3 44 44 3 3 66 1 3 3 3 3 3 3 3 6 555 44 3 333 6 44 3 44 222 44 3 55 777 77 3 33 8 2 2 2 2 66 2 33 1111111111111111111 2 22 8888 5 2 8888 2 8888 77 555 444 3 3 3 000 6 333 3 6666666666 6 3 0 22 3 44 44 6 0 3 77777777777777 3 44 3333333 44 333 1 0000 3 555 44 3333333333333 555 00000 3 4 3 44 3 6666 3 44 66 33 2 2 2 777 555 2 555 33 2 6666 2 99 1 2 555 22 8 2 6666 3 3 44 4444444 3 3 3 6 88888 3 3 3 6 000000000000 44 3 77 555 0 3 3 88888 44 55 44 3 3 55 55 3 1 55 4 55 8 55 4 55 4 00 4 4 111 55 55 4 8 8888888888888 55 00000 4 4 5555555 4 55 3333333 4 8888 1 4 4 4 4 4 33333 4 4 2222 4 4 4 4 4 1 66 4 000 4 4 66 4 222 8 8 4 8 4 55 8 4 55 4 4 4 4 4 4 4 4 1 5 5 0 88 5 66 66 5 66 5 77 5 5 5 5 5 555 5 44444 4 77 5 5 1 00000 5 33 1 3 1 5 66 5 5 7777 0 333333 5 44 5 5 5 99999999 33 7777 4444 33 5 5 1 1 22 5 5 8888 1 888 5 33333333 5 77777777777 66 0 2222 66 3 2 5 22222 33 5 5 444 5 9999 66 11 5 88 5 1 0 44444 6 66 6 6 0 5 9999999999999999999999 55 6 3 00 888 1 1 44444444444 1 1111 6 6 6
lowQualScore : . . . ..... ......... ... .... . . . . .. .. . .... . ...... .. . .. . . ... . . .. . ... . . .. ........ ... . . ...... . . . . .............. . ..... ... .. . . ... ........ .. .... ............. . . .... . .. . .. .... .. .. . . . . . ..... ..... ... .. . . . .. . .. . .. .. . . .. . . . . . . . . . ... .. . ... . .. . .. ... .. . .. ... .. . .. . . . . . .. . .. ................... . .. .... . . .... . .... .. ... ... . . . ... . ... . .......... . . . .. . .. .. . . . .............. . .. ....... .. ... . .... . ... .. ............. ... ..... . . . .. . .... . .. .. .. . . . ... ... . ... .. . .... . .. . . ... .. . . .... . . .. ....... . . . . ..... . . . . ............ .. . .. ... . . . ..... .. .. .. . . .. .. . . .. . .. . .. . .. . .. . . ... .. .. . . ............. .. ..... . . ....... . .. ....... . .... . . . . . . ..... . . .... . . . . . . .. . ... . . .. . ... . . . . . .. . . .. . . . . . . . . . . . . .. . .. .. . .. . .. . . . . . ... . ..... . .. . . . ..... . .. . . . . .. . . .... . ...... . .. . . . ........ .. .... .... .. . . . . .. . . .... . ... . ........ . ........... .. . .... .. . . . ..... .. . . ... . .... .. .. . .. . . . ..... . .. . . . . ...................... .. . . .. ... . . ........... . .... . . .
lowQualScore : 9 9 7 33333 000000000 777 0000 9 9 9 9 33 33 7 9999 9 222222 66 1 22 2 1 444 1 1 22 1 444 9 9 99 44444444 000 9 9 111111 9 9 9 9 11111111111111 9 11111 000 99 9 9 333 44444444 99 1111 7777777777777 9 7 3333 9 99 9 99 3333 44 11 9 9 7 7 6 22222 22222 444 22 3 3 3 66 6 00 3 66 66 3 3 88 6 3 3 3 3 3 1 1 2 444 22 1 888 2 22 1 22 666 22 1 00 888 99 1 99 6 9 9 9 9 88 9 99 3333333333333333333 9 55 9999 0 9 9999 9 9999 22 999 333 1 1 1 444 2 999 1 0000000000 2 1 5 99 1 22 66 7 0 3 55555555555555 3 66 2222222 66 000 5 7777 1 444 22 9999999999999 444 88888 1 0 1 22 1 5555 1 22 88 99 9 9 9 666 000 9 000 99 9 8888 9 00 4 9 000 99 6 9 5555 1 1 22 2222222 1 1 1 7 33333 3 3 3 7 111111111111 66 3 99 888 0 3 3 33333 66 55 66 3 6 00 00 6 0 55 0 55 0 55 0 55 4 66 4 0 000 55 55 0 0 4444444444444 55 00000 0 0 0000000 8 55 0000000 0 5555 0 4 4 4 4 0 55555 0 0 3333 0 4 4 4 4 0 11 4 666 4 4 11 4 222 9 9 4 9 4 44 9 4 66 4 4 4 4 4 4 4 4 0 0 0 0 55 0 99 99 0 99 7 99 7 7 7 7 7 111 7 33333 9 99 7 7 4 44444 7 66 4 0 0 7 44 7 7 6666 7 000000 7 44 7 7 7 33333333 77 9999 0000 33 7 7 0 7 33 7 7 9999 4 666 7 66666666 0 11111111111 99 0 9999 99 2 4 0 88888 22 0 0 666 0 6666 99 99 0 22 5 9 1 55555 7 88 7 7 8 7 2222222222222222222222 88 7 5 22 000 3 5 88888888888 0 2222 7 7 7
consensus : AGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-A-C-G-TA-------TAAAGG-A-----CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAAAAGATAA-TGC-AAAAAAT-G-T-ACCCCAAAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TCTG--CTGA--AA-TA-ATGGT-AAAATT-ATT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-C-A-GAT--T-T--T-A-A--GA-A-TTTTT--TCACAA--ATTA-T--TT-G-G-T-GC-TT--AA-A--TTTTC-AG---------------GA-TC--GAG----TAA-AAAAC--T-TT----TGAAGT-T--TATGA-A-AA-A-AAA-TGTTA-A-T-AGG-G--G---C---CACGTT-AT-ACATTTTTTT-C-AATG--AATT--TC-CC-C-C----T---------G-TTT--TA-TATG-CCA--AN--TAAAAAATAATGTC--T-A-CA---TCA--T----T----T---T---TTTC-----A-TANT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGTA-T--TAATGTTCTGTT--AC--T-C-AC-GGG--AAAA---AAA-TT---G--G-G--C-A-T--GCAACCC-T-T---T-AATTT-AATT-TCAT----CAT-G-T--TTT--T----AAT-GC-TA-AAAATTAAGA-TT-----TTA-C-AAAA-A-A------C-----G--TA-GTGT--C---CGT-A-A-CCACTT-----AAA--TTCT-GTG--AAA-TTAGAA-A--G--CTCTAT-ANATA--T-CA--TTA-TTTA--A-T--TTTTAG-AT--AGA-CATT-TCAT---GT--AGATG--CT-GAGAT-ATG-----GTNG----T--T-----TTT-CCC-TGN------TCATCA--CC-------ACT-GT----TTCTCGGGT-ATCATCAC-AAAT-G-TG-GTTACGGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTG-TT-AGTGT-CC-GTAACC-TG-T-ATTTTGA--TC-AGTTTG-GAAG-C-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GAT-ATTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-AAGT-TAA-T-CAATNTACTTT-A-TATTTTCACCCCTC-ATTTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCCCAA-ATCGCATCA--TTT-CC-A-TATACAG-CATC-ATTAGCT-GTTAC-----CATCAG--CA-TG-AC-ATA--A--GCAA-TG--CTATT-GACATGGGCATC-AAGA-CA-GATG-GCA--C-ACCATTA--TTTTTTTTCAA-T-NTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTT-ACATT----TA--A-CAAAA-TCTT-GT-ACGAATT-CC-ACTATTTAAG-ATAA-NT-TCC-ATCC-C-TT-ATAA-----A--TAACTT-AAAGAATG--TGT-TAGTG--TC-CGT--TAACCAAA--AGTTGAAAAACT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGC-AGA-A--A--A--TTTTC-AAAGCAG-TTTGTTATTTGAAGTTTAATGTAT-TTGTAGG-TGATT-TAT-TAGCCAGAAATTCTTTTAGATTA--C-GGT-GG------------TTTTTT--TTTTACTG-CAAGAAATA-AAAAAA-AATTACTTTAAAAAC--CAA-----ANAATTGTCATAG-AATG-TG-TGGGGAAATTA
Reference ( family-5039 ) : AGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AANTAT--TA-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-A-C-G-TA-------NNAAGG-A-----CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAAAAGATAA-TGCCAAAAAAT-G-T-ACCCCAAAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TCTG--CTGA--AA-TA-ATGGT-AAAATT-ATT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-C-A-GAT--T-T--T-A-A--GA-A-TTTTT--TCACAA--ATTA-T--TT-G-G-T-GC-TT--AA-A--TTTTT-AG---------------GA-TC--GAG----TAA-AAAAC--T-TT----TGAAGT-T--TATGA-A-AA-A-AAA-TGTTA-A-T-AGG-G--G---C---CACGTT-AT-ACATTTTTTT-C-AATG--AATT--TC-CC-C-C----T---------G-TTT--TA-TGTG-CCA--AT--TAAAAAATAATGTC--T-A-CA---TCA--T----T----T---T---TTTC-----A-TANT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGTA-T--TAATGTTCTGTT--AC--T-C-AC-GGG--AAAA---AAA-TT---G--G-G--C-A-T--GCAACCC-T-T---T-AATTT-AATT-TCAT----CAT-G-T--TTT--T----AAT-GC-TA-AAAATTAAGA-TT-----TTA-C-AAAA-A-A------C-----G--TA-GTGT--C---CGT-A-A-CCACTT-----AAA--TTCT-GTG--AAA-TTAGAA-A--G--CTCTAT-ANATA--T-CA--TTA-TTTA--A-T--TTTTAG-AT--AGA-CATT-TCAT---GT--AGATG--CT-GAGAT-ATG-----GTTG----T--T-----TTT-CCC-TGN------TCATCA--CC-------ACT-GT----TTCTCGGGT-ATCATCAC-AAAT-G-TG-GTTACGGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTG-TT-AGTGT-CC-GTAACC-TG-T-ANTTTGA--TC-AGTTTGAGAAG-C-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GAT-NTTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-AAGT-TAA-T-CAATNTACTTT-A-T-TTTTCACCCCTC-ATTTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCCCAA-ATCGCATCA--TTT-CC-A-TATACAG-CATC-ATTAGCT-GTTAC-----CATCAG--CA-TG-AC-ATA--A--GCAA-TG--CTATT-GANATGGGNATT-AAGA-CA-GATG-ACA--C-ACCACTA--TTTTTTTTCAA-T-GTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTT-ACATT----TA--A-CAAAA-CCTT-GT-ANGAATT-CC-ACTATTTAAG-ATAA-GT-TCC-ATCC-C-TT-ATAA-----A--TAACTT-AAA-AATGT-TGT-TAGTG--TC-CGT--TAACCAAA--AGTTGAAAAACT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAGGTTGC-AGA-A--A--A--TTTTC-AAAGCAG-TTTGTTATTTGAAGTTTAATGTAT-TTATAGG-TGATT-TAT-TAGCCAGAAATTCTTTTAGATTA--T-GGT-GG------------TTTTTT--TTTTACTG-CAAGAAATA-AAAAAA-AATTACTTTAAAAAC--CAA-----ANAATTGCCATAG-AATG-TG-TGGGGAAATTA
gi|1 : GGTGCAAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-TTTC-CA--T-A----A--G-CA----T-TG------ATATAATCA-T--G-T-TTTG---AA-AAATAT--TA-TTCT---TCCT-T-AGCATACA--------ATT---TA-AACA----C-ATTCTT-TTCAT-AGGAAT-A-C-ACTT-------GTAAGACA-----TTTAGTC--TG-TG-CCAA---TT--------TT--TG----TG-------------ACT-CT----AAT-ATTA--ATAGATA--ATTAAATCATT--TGCAAGAAAATAG-T-ACCACCAAAAAGG-CT----TTAGAACTTT---ATAGTGT--TAT-G-CTTGTTGCTAACT-AGATAACTGCCTAACATTTTGTATG--CTGA--AAATA-G-GGT-AAATTA-ATT-CTCA-TATGTTTC-C-TGCC-GA---TGAACA--T-AAT-C-A-GTT--TAT--T-A-G--GA-A-TTCTTGATCACAA--ATTA-T--TT-GCG-T-GC-TTTAAA-A--TTTAG-AG---------------GA-TCA-GAGGTAATAACAGAATCAT-TT----TGA-GTAT--CATGA-T-AA-A-A---T-TTATA-T-AGG-G--GTG-C---CAC-TT-GG-GCAATGTTT--C-AATG--GAAT--TC-CC-C----------------G-TTT--GA-TG-G-CCA--AAAATAGAAAATAATGTC--A-A-CA---TCA--T----T----TAT-T---TTTC-----A-TAAT-TTCC-A-TCTAAAAT----AACAGTA-T--GAATGTTC-GTT--AC--T-C-AT-GGG--AAAA---AAAATT---G--G-C--C-A-T--GCA-CCC-T-T---T-TATTT-AATT-TCAC----CAT-G-T--TTTAAT----ATT-GC-TA-AAAATTAAGA-GT-----TTAGC-AAAA-A-AAAAGC-C-----G--TA-GTGT--C---CGTCA-G-CCACTG-----AAA--T-CT-GTGGAAAA-TTAGAA-A--GGCCTTCATTACATA--T-CA--TTA-TTTA--A-T--TTTTAGGAC--AGA-C-TT-TCAT---GT--AGATGGCCT-GAGAT-ATGTGGTTGTTG----T--T-----TTC-CTC-TGCAATGGTCCAT-A--CC-------AC--GT----TTCTCGG-T-ATCATTAC-AAGT-G-TG-GTTACGGAC-AACGCTAC-AAA-T-CCTG-TTTAGTGT-CCCGTAACC-TG-T-ATTTTGACTTC-AGTTTGTAAGC-C-A--GC-TGT-TTA---CAAACA-CA-ACTCGCCT-GAT-ATTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTCTT-A-CTAAGT-TAATT-CACTCTAC-TT-A-TATTTTCACCCA-C-ATTGTGAT---AT--GCAA--ACTAA-TTGGAAAGCCCAAGATCGCATCA--TTT--C-A-TATGCAG-CATC-AT--GCT-GTTAC-----C-TCAG--CATTG-ACAATA--A--GCTA-TGC-CTATT-G--ATGGGAATT-AAAA-CA-GATG-A-A--C-A-CACTA--TTTTTCTTCAAGT-GTTG-A-GTC-AAC-TG------G-TGTT--CGTT----TA--AGCAAAA-CTTT-GT-AGGA----TC-ACTATTTAAA-ATAA-AG-TTC-ATCC-C-TTAATAA-----T--AAACTT-AAATAATG--TG--TAGTGGTCC-CGTAAAAACCAAA--AGTTG-AAAACTGTAAAACCTC--TTATTTGTTTCTCACAAGAAAG-AGC-AGA-G--A--AATTTTTC-AAAGCAG--TTATTATTT--AATT--ATGTA---TATAGGTTG--T-TAT-TAGCCAGAAATTC-TTAAGATTG--C-GGA-TG------------TTTTTTACTTTCACTG-C-AGAAATA-TAAAAA-GAATACTTTAACGCC--T-------ACCATAGTCATAG-AATC-TT-GGGGGAAATTA
gi|10 : -CA----T-TG------TTATA--CA-T--GAT-TTTC---AA-AAATAT--TG-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------CTT---TA-A-CA----T-ATTT-T-TTCAT-ACGAAT-A-C-G-TA-------TAAAGG-A-----CTT---A--TG-TG-CCAA---TT--------TT--TT----CT-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAA--GATAA-TGC-AAAAAAT-G-T-GCCCCAAAAA-GGTC-----CT-----TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTAA--ACTTAGA-AATTGC--AATATTTT-TCTA--CTGA--AA-TA-ATGGT-AAA-TT-ATT-AT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-AT---TGAACAGTC-AAT-G-ACGAT--T-TCTT-A-ACAGA-G-TTTTC--TCGCAA--ATTA-TGTTT-G-G-TAGC-TTT-AATA--TTTCT-AG---------------GA-TC--GAG----TAA-AA--C--TGTT----TGAAGT-TGCT-TGA-ATAATA-AAA-T-CTATA-T-AGG-G--G---TGCACACGTT-G--ATATCTTTTT-A-AATG--ACCC--CC-CC-C-CCCGCT---------G-TCT--TT-TATG-CCA--GC--TAAAAA-TAATGTCGCT-T-C----TCA--T----T----T---TATTTTTC-----A-TAAT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGTA-T--TACTGTTTTGTT--CCGTT-C-ACAGGG--AAAAGGGAAA-TT---G--G-G--CCA-T--GCAACCCCT-T---T-AATTT-AGTT-TCAT----CAT-G-T--TTT--T----AAT-GC-CA-AAAATTATGA-TT-----TTA-C-AAAA-ATA------C-----G--TA-GTGT--C---CGT-A-A-CCACTT-----GAA--TTCT-ATG--AAA-TTAGAA-A--T--CTCTAT-AGATA--T-CA--TTA-TTTA--A-T--TTCT
gi|11 : GTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--T-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TG-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-A-C-A-TA-------TAAAGG-A-----CTT---C--TG-TG-CCAAT--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTT--AAGATAA-AG-CAAAAAAT-G-T-ACCCCAACAAGGGTTGTTGTTT-----TTT---TTAGCGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AATTGC--AACATTTT-TCTA--CTGA--AA-TA-ATGGT--AAATT-ATT-CT-A-CAT-TTTT-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-G-A-GAT--T-T--TAA-A--GA-T-TTTTT--TCACAA--ATTATT--TT-G-G-T-GC-TT--AA-A--TTTTC-AG---------------GA-TC--GAG----T-A-AAAAC--C-TT----TGAAG--T--TATGG-G-AA-A-AAA-AG-TA-A-T-AGG-GGTG---C---CACGTT-AT-ACATTTTTTT---AATG--GATT--TT-CCAC-C----T---------G-TTT--T--TATG-TCA--AA--T-AAAAATAATGTC--T-A-CA---TCA--TTTA-T----T---T---TTTC-----A-TATT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGTA-T--TAATGTTCTGTT--AC--T-C-AC-AGG---AAA---AAA-TT---G--G-AT-C-A-T--GCAACCCTT-T---T-AATTT-AATT-TCAT----CAT-G-T--TTT--T----AAT-GC-CA-AAAATTCAGA-TT-----TTA-C-AAAA-ATA------T-----G--TA-GTGT--C---CGT-A-A-CCACTT-----AAA--TTCT-ATG--AAA-TT
gi|12 : tacgaT-TCTG--CTGA--AA-TA-ATGGT-AAA-TC-ATT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-TT---TGAACA--T-AAC-C-A-GAT--T-T--T-AGA--GA-A-TTTTT---CACAA--ATTA-T--TTTG-G-T-GC-TT--AC-A--TTTTT-AG---------------GA-TC--GAG----TAA-AAAA---T-TT----TGAAGT-T---ATGATA-AA-A-AAA-TAT-A-A-T-AGG-G--GTG-C---TACGTT-AT-GCATTTTTT--C-AATG--ATTT--TTTCC-C-C----T---------G-TTT--T--TATG-CCA--AA--TAAAATTTA-TGTC--A-A-CA---TCA--T----T----TATTT---TTTC-----A-TAAT-T--C-AGTCTAAAAG----TACAGTA-T--GAATGTTCTGTT--AC--T-C-AC-GGG--GAAA---AAA-TT---G--G-G--CCA-T--GCAACCC-T-T---TTAATTT-AATT-TCAC----CAT-G-T--TTT-------AAT-GC-TA-AAAATTAAGAGTTAAAAATTA-A-AAAAAA-A------C-----G--TA-GTGT--C---CGT-A-A-CCACTT-----AAA--TTCT-GTG--AAA-TTAGAA-A--G--CTTTAT-ACATA--T-CA--TTA-TTTA--A-T--TTTTAG-AT--AGA-CATT-TCAT---GT--AGATG--CT-GAGTT-ATG-----GTGGGGGTT--T-----TTT-TCC-TGG------TCATTA--CC-------ACT-GT----TTCT
gi|13 : GGTG-AAACA-CAATTAAAG-----GG---------GCAT---T----C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--TA-T--GGT-TTTC---AA-A--------------------T-T-G--ATACA--------ATT---TA-A-CA----C-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-A-C-A-TT-------TAAAGG-A-----CTT---C--TG-TG-CCAAT--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTT--AAGATAT-TG-CAAAAAAT-G-T-ACCCC-AAAAAGGTGA-----T-----ATT---TTAGTGT--TAT-G-CA-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AATATTTT-TCTG--CTGA--AA-TA-ATGGT--AAATT-ATT-TT-A-TAT-TTTC-T-TGCCTATATATGAACA--T-GAT-C-A-AAT--T-T--T-AGA--GA-A-TTTT
gi|13 : acg-A-T-GGG-T--G---C---CACGTT-AT-ACA-TTTTTT-C-AATT--GGTC--AC-CC-C-C----TCCCCCCCCCG-TTT--TA---TG-CCA--AT--GAA-----AATGTC--T-A-CA---TCA--T----TTA--T---T---TTTCT----C-TACT-T--C-AATCTGAAAT----TACAGTA-T--TGATGTTCTGTT--AT--C-T-TC-AGG--ACAA---AAA-TT---GTTC-G--C-A-G--GTAACgtgatatgggtgccacgttatacattttttcaattggtcaccccctcccccccccgttttatgccaatgaaaatgtctacatcatttatttttctctacttcaatctgaaattacagtattgatgttctgttatcttcaggacaaaaattgttcgcaggtaac
gi|14 : acgggtgaaacacaattaaaggggcattccaatacagcattgttatatatggttttcaaattgatacaatttaacacatttgtttcataggaatacatttaaaggacttctgtgccaatttttgttgatctagcattaatagaatttaagatattgcaaaaaatgtaccccaaaaaggtgatattttagtgttatgcagttgcacttagaaactgcaatatttttctgctgaaataatggtaaattattttatattttcttgcctatatatgaacatgatcaaattttagagaattttgtgatGGTG-AAACT-CAAT-ATAG-----GA----CAAACGCAT---TAT--C-CAGAT-A-C--AATG-CAAT--TATG------TTATAA-CA-TTGGAT-TTGC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CTTT-A-A--GTACA--------ATTAAAAA-A-CA----TAATTTGT-TTCAT-AGGATC-A-C-GTTA-------AAAAAT-ATCAGTCTTTTCT--TG-TG-CCAC---TCAAACCCAATT--GG----TGTTTCTCAGTAAATA-T-CT----AGCAACTAAGATAGA-A--TTTTAAAGATAA-T-CAAAAAAAT-G-T-ACCCC-AAAAAGGTCA----TT-----TTT---
gi|15 : gGGTG-AAACA---AT-ACAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CCTT-T-A--CTACA--------ATT---TA-A-CA----C-ATTTTT-TTCAT-AGGAAT-A-T-A-TT-------TAAAGA-A-----CTT---C--TG-TG-CGAAT--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGT-ATCA--ATAGA-A--ATT--AAGATAT-TGCAAAAAAA--G-T-ACCCC-AAAAAGGTGA----TA-----TTT---TTAGTGT--T
gi|16 : gAGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GA----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------AGT---AA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-A-C-G-TA-------TAAAAG-A-----CTT---C--TG-TG-CCAAT--TT--------TT--TT----TT-------------A-T-CT----AGC-ACTA--ATAGA-A--TTT--AAGATAA-TG-CAAAAAAT-G-T-
gi|17 : cGGTG-AAACA-CAATCATAAAAT--GGTTGTC----GCAT---G-TG-C-CA-ATTA-C--A--GTCAATTTT-CG------TTATA--C--T--G----TTC---AAGAAATCT--T--TTTT---CTTT-T-A--ATGCA--------ATT---TA-C-TA----TTATTCAT-TTCAT-GAGGAT-AAC-C-TA-------T-AATG-A-----CTT---C--TG-TG-CCAAATTTT--------TT--GT----TG-------------A-TGCT----AG
gi|18 : T--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AAATGC--AACATATT-TCTG--CTGA--AA-TA-ATGGT-AAA-TT-GTT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGTC-AT---TGAACA--C-AAT-C-A-GAT--A-T--T-AGA--GA-A--TTTT--TCACCA--ATGA-T--TT-G-GTT-GC-TA--AA-A--TTTTC-AG---------------GA-TC--GAG----T-A-AAAAC--T-TT----T
gi|19 : TT-T-A--ATACAGGGTTCTTACC---TA-A-TAATATT-ATTTGT-TTGAT-AGGAAT-A-C-A-TATATAAATAAAAGG-A-----CTT---C--TG-TG-CCAAC--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----t
gi|2 : atacaaaaggtttcaacacaatatctttaagaacAGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG---------GCAT---T-T--C-CA-AT-AGC--A--G-CA----T-TG------TTATA--CACT--GGA-TTTC---AA-AATTA----A-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-AA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-A-T-G-TA-------ATAAGG-A-----CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--AT-GA-A--TTTAAAAGATAA-TGCCAAAAAAT-G-T-ACCCCAAAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TAT-GAGT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TCTT--CTGA--GA-TA-ATGGTAAAAATT-ATT-C--A-TAT-CTTA-C-TGCC-AT---TGAA-A--T-AAT-C-A-GAT--T-T--T-A-A--GA-ATTTTTT--TCACAA--ATTA-T--TT-G-G-T-GC--T--AA-A--TGTTT-AG---------------GA-TC--GAGT---TAA-AAAAC--T-TTA---TGAAGT-T--TATGA-A-AA-A-GAA-TGTTA-A-T-AGG-G--G---C---CATGTT-AT-ACATTTTTTT-C-AATG--AATT--TC-CC-C-C----T---------G-TTT--TA--GTATCCA--AT--TAAAAAATAATGTT--T-A-CA---TCA--T----T----T---T---TTTC-----ACTATT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGTA-T--TAATGTTCTGTT--AC--T-C-AC-GGG--AAAA---AAA-TT---G--G-G--C-A-T--GCATTCC-T-T---T-AATTT-AA-T-TCAT----CAT-G-T--TTT--T----AAT-GC-CA-AAAATTAAGA-TT-----TTA-C-AAAA-A-A------C-----G--TA-GTGT--C---CGT-A-A-CCACTT-----AAA--TTCC-ATG--AAA-TTAGAA-A--G--CTCTAC-AGATA--T-CA--TTATTTTA--A-T--TTTTAG-AT--AGA-CATT-TCAT---GT--AGATG--CT-GAGAT-ATG-----GTTG----T--T-----TTT-CCC-TGT------TCTTCA--CC-------ACT-GT----TTCTC-AGT-ATCATCAC-AAAT-G-TG-GTTACGGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTGTTT-AG-GT-CC-GGAACC-TG-T-AATTTGA--TC-AGTTTGAGAAG-C-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GAT-TATTTT-ACAAA-GGTCA-GA-GTTT-GTTC-T-A-C-AAGT-TAA-T-CAATATACTTT-A-TATTTTCACTTCTC-A-TTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCTCAA-ATCACATCAGTTTT-CCTA-TATACAG-CATCTATTAGCT-GTTAC-----GATCAGTTCA-TG-AC-ATA--A--GCAA-TG--CTATTAGACATGGGCATC-AAGATCATGATGCGCA--TAACCATTAGTTTCTTTTTCAA-TCTTTGAA-GTC-AACGTGCCTATCG-TGTTGGCATT----GA--A-CAAAA-TCTA-TT-ACGAATT--C-ACTATTTAAACATAA-TTATCC-ATCC-C-TT-ATAA-----A--TAACTT-AAA-ATTGTCTGT-TAG-G--TCACGT--TAACCAAA--AGTTGAAAAACT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAG--TGC-AG-----A--A--TTTTC-AAATCAG-TTTGTTATT--AATTTTAATGTAT-TTGTAGG-TGATTATAT-TAGCCA-AAATTCTTTTAGATTA--C-GGT-GG------------TTTTTT--TTTTACTG-CAAGAAATA-AAAAAATATTTACTTGAAAAAT--CAA-----AGAATTGTCATAGAAATG-TG-TGGGAAAATTA
gi|20 : --GCAACCCCT-T---T-AATTT-ATTT-TCAT----CAT-G-T--TCT--T----AAT-GC-TA-AAAATTAAGG-TT-----TCA-C-AAAA-A-ACAAAACC-----A--TA-GTTT--C---CGT-T-A-CCACTT-----TAA--TTCT-ATG--AAA-TTAGAA-A--G--CTCTAT-A
gi|21 : A-----A--TAACTT-AAAGAATGT--GT--AGTG--TC-CGT---AGCCAAA--AGTTGAAAA-CT-TAAAAC--T--TT---T-TTTC-C-CAAGAAAGTTGC-AGAGA--A--A--TTTTT-AAAGCAG-TTTATTATTT-AAGTTTAATGTAT-
gi|22 : -C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-C-A-GAT--T-T--T-G-A--GG-A-ATTTT--TCACAAT-TTTG-T--TT-G-G-T-GC-TT--AA-A--TCCT--------------------------GAA----TAA-AAA----T-TT----TGAAG--T--TATGA-A-AA-A-AAA-
gi|23 : ta--TT-G-G-T-GC-TT--AA-A--TTTTC-AG---------------GA-TC--GAG----T-A-AAACC--T-TT----TGAAG--T--TATGA-A-AA-A-AAA-TG-TA-A-C-CGG-GGAG---C---CAGGTT-AT-ACATTTTTTT-C-AATG--Aaatgtaaa
gi|24 : -A-CA---TCA--T----T----TATTT---TTTC-----A-TACT-T--T-AGTCTAAAAT----TACACTA-C--TAATGTTCTGTA--AC--T-C-AC-AGG---AAA---ATA-TT---G--G-GC-C-A-T--GCAACCCTT-T---T-AATTT-AATT-ctgttt
gi|25 : TCTGTT--AC--T-C-AC-AGGAAAAAA---AAA-TT---G--G-GC-C-A-T--GCAACCC-T-T---T---TTT-TATT-TT-T----TAT-T-T--TTT--T----GA-----CA-AAAAT
gi|26 : ----AAC-ATTA--ATAGA-A--TTT--AAGATAA-TG-CAAAACAT-A-T-ACCCCCAAAAA-ATCA----TT-----TT----------T--TAA-G-CT-GTTGC--ACTTgtagccgaatttaa
gi|27 : GGTG-AAACA-CAAT-GTAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--
gi|28 : tcgGGCG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-
gi|29 : tatatcgGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---
gi|3 : catattacgGGTG-AA-CA-AAAT-ATAG-----GG----C-----CAT---TCT--C-CA-AT-A-C--A--GTCA----T-TG------TTATAT-CA-T--GGA-TTTC---AA-AACTAT--TA-TTTT---TCTT-T-A--ATACA--------ATT---TACA-AA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-A-T-G-TA-------TAAAGG-A-----ATT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--ATGGTTTG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAA--GATAA-TGC--AAAAAT-G-T-ACCC--AAAAAGGTCA----TT-----TTT---T-AGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTGGA---CTGC--AACATTTT-TCTA--CTGA--AG-TA-ATGGT-AAATTT-ATT-CT-A-TAT-CTTAAC-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT---A-GAT--T-T--T-A-A--AG-A-ATTTT--TCACAATTATTT-T--TT-G-G-T-GC-TA--AA-A--TTTTT-AG---------------GA-TC--GGA----TAA-AAA-C--T-TT----TGAAGT-T--AATGA-A-AA-A-AAAATGT-A-A-T-AGG-G--G---TG--CATGTTTAT-ACATTTTTTTTC-AATG--AATT--TC-CCAC-C----T---------G-TTTGTTA--ATT-TCA--AT--TAAAAAATA-TGTT--T-A-CAATATTA--T----T----T---T---TTTC-----A-TA-T-T--C-AGTCTAAA-T----TACAGTA-T--TAATGTTCTGTT--AC--T-C-AC-GGA--AAAA---AAA-TT---G--G-GGCC-AAT--GCAACCC-TAT---T-AATTTTAATT-TCCT----CAT-G-T--TTT-------AAT-GC-CA-AAAATTAAGA-TT-----TTA-C-AAAA-A-AA-----C-----G--TAAGTGT--C---CGT-A-A-CCACTT-----AAAATTCCT-G-----AA-TTAGAA-A--G--CTCTAC-AGATA--T-CA--TTA-TTTA--A-T--TTTTAG-AT--AGA-CATT-T-AT---GT--AGATG--CT-GCGAT-ATG-----GTGT----T--T-----TTT-CCCGTGA------TCATCAAACC-------ACTCGT----TTCTCCGGTTATCATCAC-AAAT-G-TG-GTTACGGAC------TAC-AA----TCTG-GT-AGTGT-CC-GTAACC-TG-T-ATTTTGA---A-AGTTTTTGAAG-CCATCGCCTGT-TTT---AAAACA-CT-A-T-GCCT-GAT-ATTTTTTACAAAAGGTCA--AGGTTT-GTTC-T-AAC-AAGT-TAA-TTCAATATACTTT-A-T-TTTTTACCCTGC-ATTTTGAT--GAT--G--G--ACTAATTTGGAAAGCTCAA-ATCACATCA--TTTTCC-A-TATACAG-CATC-AT-AG-T-GTTAA-----CATCAG--TA-TG-AC-ATA--T--CAAA-TG--CTATT-GACATGGGCATCCAAGA-AA-GATG-GCA--T-AC----A--TATTTTTTCAA-T-TTTGAA-GTC-AAC-TG--------TGTT-GCATT----TA--AACAAAAATCTT-GT-ACAAATT-CC-ACTATTTAAC-ATAA-TT-TCCCATCC----T-ATAA-----A--CAACTT-AAA-A-----TGTGTAGTG--TCGCGT---AACCAAA--CGTTGAAAA-CT-CAA--C--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAG-TTGC-AGA-A--A--A--TTTTC-AAATCAGTTTTGCTA-TTGAAGTTTAATGTACATGGTAGG-TGA-T-TAT-TAGCCAGAAATTCTTTTAGATTA--TGGGT-GT------------TTTTTT--TTTTACTG-CAAGAAAT--AAGAAA-TATTA--TTAAAAAT--CAA-----AGAA-TGCAATAG-AATG-TG-TGGACAAATT
gi|30 : tacg-GTTACGGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTG--T-AGTGT-
gi|4 : ----AGC-ATCC--ATAGA-ACATTTAAA-GATAACTGC-AAAAAAT-G-TGACCCCAAAAA-TGTCA----TT-----TCTGTGTTAGTGTGTTAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TCTATACTGA--AC-TA-ATG-T-AGACTT-ATT-CT-AGTAT-TTAA-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-CCA-GAT--T-T--TCA-A--GC-A-TTTTT---CACAA--ATAT-T--TT-G-G-T-GC-TT--AA-AATCTTTC-AT---------------GACTC--GAG----TAC-AAAAC--G-TT----TGAA---T--TATGA-A-AA-A-AAA-TGTAA-A---AGG-G--GTA-C---AATGTT-AT-ATCTTTTCTT-CCAATG--AATTGTTC-TCGC-C----T---------GGTTT--TGGTATG-CTA--AGA-TAAAAAATAATGTC--T-A-CA---TCAGTT----TATAGT---T---TTTC-----A-TACTAT--CGAGCTTAAAATGAGCTA-GGTAAT--TGATCTCCTGTT--AC--T-C-AC-AG----AAA---AAA-TT---G--G-C--C-A-TATGCA-CCC-T-TATTT-AATTTCAATT-TCAT----CAT-G-T--TTT--CCCTGAAT-GC-TATAAAAT--AGA-TT-----TTA-C-AAAA-A-A------C-----GCGTA-GTGT--CACGCGTCA-A-CCAATTCAAATAAA--TTCT-AT----AA-TCAGAACG--G--CTCTAT-AGATA--T-CA--C-A-TT-A--A-TGATTCTAG-ATCTAGATCATA-GCATAATGTCGAGAAT--CT-GAGAA-ATG-----GGTGGTAGT--T-----TTTGCTC-TGTA-----TCA-CA--CCCCAACCTACT-GT----TTCTCAGGT-ATCATCAC-AAACGG-TATGTT--GGACAA---CT-C-AAAAT-CCTG-CC-AGTGT-CC-GTAACCTTG-T-ATTTTGT--TCAAGTT---GAAG-C-A--GCCTGT-TTTTTAAAAACAGCTAAAT-GC-T-GA--AGTTTT-ACAAA-GGTCA-G-GGTTT-ATTC-T-A-C--AGT-TAA-T---ATATACTTTAA-TATTTTCACCTCTCAATTTTGAT--GAT--GC-AATACTAATTAGAACAGCCCAA-ATCGCATCA--TAT-CC-ACTATACAGCCATC-GATAGCT-GTTAC-----CATCAG--CA-TGAAT-ATA--ACGGCAA-TG--C------ATATGGGCATT-AAGA--A-GATG-GCA--C-ACCATGA--ATTTTTTTCAC-TAATTGAAGGTCAAAC-TG------GCTGTT-ACATTA---TATTT-TAAAA-TCTGAGT-ATGATTTACCAACTAATTAAG-ATAA-TT-TCC-ATCCGC-TT-ATAA-----AACCAAGTTAAAA-AATG--TG--TAGTG--TC-CCG--TAACCAAAGCAGTT-ACAAACT-TAAAAC--TGATTA-TT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGCAAGA-AATA--A--TGTTC-AAAGCTG--TTGTTA-TTGAAGTTT-GTGTAT-GT-TAGG-TGA-T-TATATAGCCATAAATCTCTTTAGATTATGT-GGTGGG------------TTTCTTG-TTTTATTGTCTAAATATAGAAAAAA-AATTACTT--AACACTACAA-----ATTACTATCAT-G-AATGTTGTTGGGGGAATTA
gi|5 : ctaGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--CTCA-A--A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTCCAAAA-AAATATGCTA-TTTTTCCCTTCAT-A--CTACA--------ATT---TA-A-CA----C-ATTTGTCTTCAT-AGGAAT-A-C-T-TT-------AATAGG-A-----CTT---C--TG-TGGCCAT---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGT-ATTA--ATAGA-A--ATTA---GATT--TGC-AAAAATT-G-T-ACCCCAAAAA-GGTGA----TA-----TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TCTG--CTGA--AA-TATATGGG-TAAATT-A-T-CT-A-TA--TTTC-C-TGCA-TT---TGAACA--TAAAT-C-A-GAT--T-T--T-T-A--GAGA-ATTTT--TCACAA--ATTA-T--TT-G-G-T-GC-TT--AT-T--TTTTTAAG---------------GA-TCT-GAG----T-A-AAAAC--T-TT----TGAATT-C--TATGA-T-AA-A-AAA-TA-TA-A-T-AGG-GGTG---C---CACGTT-AT-GCA-TTTTTT-C-AATGACAATT--TC-CC-C-C----T---------G-TTT--T--TATG-GCAAGAT--TAAATA--AATGTCA-A-A-CA---TCA--TTTAAT----T---T---TTTC-----A-TAAT-T--C-AGT-TAAAAT----TACAGTA-T--AAGT-TTCTGTT--AC--T-C-AC-GGG--AAAA---AAA-TTTGCG--G-C--C-A-T--GCAACCC-T-T---T-TAATT-AATT-TCATCCACCATGG-G--TTT--T----AAT-GC-TA-AAA--TAAGA-TT-----TAA-CAAAAA-A-A------C-----G--TA-GTGTTCC---CGTAA-A-CCACTT------AA--TTCTCGTG--AAA-TTAGAA-A--G--CTTTAT-AT-TAATT-CA--TTA-TTTG--ATT--TTTTAG-AT--AGA-CATTATCAT---GT--AGATG--CT-GAGATAATG-----G-TG----TCGT-----TTT-C----GG------T-AT-A--CC-------ACT-GTTTTCTTCTC-GGT-ATCATTAC-AAAT-GCTG-GTTACGGACAA---CTAC-AAAAT-CCTG----AGTGT-CC-GTAACC-TG-T-TATTTTT--TC-AGTTT--GAAGCC-A--GTTTGT-TTT---AAACAA-CTAAAT-GC-TCGAT-ATTTTTGACAAA-GGTCAGGAGGTTTGGTTC-TAA-C-A--T-TAA-A-TACTCTACTTT-A-TGTTTCCACCCACA-ATTGTGATCGAAT--GC-A--CTTATTTCGGAAA--CCAA-AT-GTATCA--CTT-CC-A-TATGCAG-CATC-ATT-GCTGGTTAC-----CCTCAG--CA-TG-ACGATC--A--GCAATTGGCCTATTGGAAATGGGAATT-AAAA-CA-GATG-ACA------CACTA--TATTTTTTCAA-T-GTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTTAACATTTCAATA--A-CAAAA--CTT-GTCAAGGATT--C-ACCATTTAAG-ATAAGGT-TCCAATCC-CTTT-ATAACTACTA--TAACT----A-TATG--TG--TAGTG---C-CGT--AAAC---A--AGTTGAAAA--T-TAAAAA--T--TTATTT-TTTCCC-C-AGAAAGTTGC-AGA-G--AATA--TTTTCAAAAGCAG-TTTATTATTT-AAGTTTAATGTAT-
gi|6 : cg-T--TT-G-G-T-GC-TT--AA-A--TTTTC-AGGATCGAGTTTTTCAGGA-TC--GAG----TAT-AAA-C--T-TT----TGAAGT-T---GTAA-A-AA-ATAAA-TGT-G-A-T-AGG-A--G---TG--CACGTA-AT-ACATTTTTT--C-ATTG--AATT--TT-CC-CTC----T---------A-TTT--TA-TA---CCA--AA--TAAAAA-TAATGTC--T-A-CA---TCA--T----T----T---C---TTTCTTTTTA-TACT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGTA-T--TAATGTTCTGTT--AC--T-C-AC-GGG--AAAA---AA--TT---G--G-G--CCA-T--GCAACCT-T-T---T-AATTT-AATT-TCAT----CAT-G-T--TTT-------AAT-GCGTA-AAAATTA-GA-TT-----TTA---AAAA-A-A------CT----G--TA-GTGTT-C---CGT-ATA-CTACTT-----AAG--ATCT-ATG--AAA-TTAGGA-A--G--CTTTAT-AGATA--T-AA--TTA-TTTA--A-T--TTCTAG-AT--AGA-CATT-TCAT---GT--AGATG--CT-GAGAT-ATG-----GTGGGTT-T--T-----TTT-CCC-TGG------TCATTA--CC-------ACT-GT----TTCTCAGGT-ATCATTAC-AAAC-G-TA-GTTACAGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTG-TT--GTGT-CC-GTAACC-TG-T-ATTTTGA--TC-AGTTTGA--AG-C-A--GTCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GAT-ATTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-GAGT-TAT-T-CAATCTACTTT-A-T-TTTTCACCC-TC-ATTTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCTTAA-ATTACATCA--TTT-TC-A-TATACAG-CATT-ATT-GCT-GTTACATGTACCTCAG--CA-TG-AC-ATACAA--GCTA-TG--CTATT-GAAATGGGAATT-AAAA-CA-GATG-ACA--C-ACCATT---TTTTTTTTCAA-T-GTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTT-ACATT----TA--A-CAAAA-CCTT-GT-AGGAATT-CC-ACTATTTAAG-ATAA-GT-TCC-ATCC-C-TA-ATAA-----A--TAACTT-AAAGAATG--TG--TAGTG--TC-CG---TAACCAAA--AGTTG-AAAACT-TAAAGC---------TT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGC-AGA-A--A--AT-TTTTC-ACAGCAC-TTTGTTA-TTGAATTTCAATGTA---TACAGG-CG-TT-TAT-TAGCCA--------TTTA----------------------------TTTTA--TTTTACTG-CAAGAAATT-AAAAAA-AATTACTTTAAAAA----AACACCTACAAATACC-TAG-AATG-TA-TAGGGAAA
gi|7 : t-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-CC-AT-G-CAC---T-TG------TTATA--CA-T--GGAATTTC---AA-AA-TAT--TA-TTTT---CTTT-TTA--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGA-T-A-CCG-TA-------TAAAGG-A-----CTT---CCCTGATG-CCAA---TT--------GT--GT----TG-------------A-TTCT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAA--GATAA-TGC-AAAAAAT-GCT-ACCC--AAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TATTG-CT-GTT-C--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TCTA--CTGACAAG-TA-ATGGT-TAAATTTATT-CT-A-TAT-CTTA-C-TGCC-AT----GAACA--T-AAT-C-ATGAT--T-T--TTA-A--GA-A-TTTTT---CACAA---TTA-T--TTTG-A-T-GC-TT--AA-A--TTTT--AGC--------------GA-TCC-GAG----TAA-ACA-C--T-TT----TGAAGT-T--TATGA-A-AA-A-AAG-T---A-A-TCAGG-G--GATGC---CATGTT-AT-ACATTTTTT--C-AATG--AATT--TCTCC-C-C----T---------G-TTT--TA-T-T--CCA--AT--TTAAAAATAATGTT--TCATCA---TTA--T----T----T---T---TTTC-----A-TATT-T--C-AG-CTAAAAT-----ACAGTA-T--GAAT-TTCTGTTT-AC--TTC-AC-GGGG-AAAA---AAA-TT---G--GCGT-C-A-TA-GCAACCC-T-T---T-AATTT-CATT-TCAT----TAT-G-TGTTTT--T----AAT-GA-TA-AAAATTAAGAATT-----TTA-C-AAAA-A-A------CAAAGCG--TA-GTGT--C---CGT-A-AACCACTT-----AAA--TTCT--TG--AAA-TTAGAA-AAAG--CTCTAC-ATATA--TGCAACTTAATTTATTA-T--TTTTAG-ATT-AGA-CATT-TCATC--GT--AGATG--CTTGAGATTATGT----GTT-----T--T-----TTC-TCC-TGA------TCATCA--CC-------ACT-GT----TTCTCAGGT-ATCATTCC-AAAT-G--G-GTTACGGAC-A---CTACAAAAATACCTG--T-AGTGT-CC-GTAA-C-TG-TAATTTTGA--TC-ATTTTTGAAAG-C-A--GCCTGT-TTTA--AAAACACCT-AAT-GC-T-GATATTTTTT-ACAAA-GGTCA----GTTT-GTTC-T-A-C-AATT-TAA-T-CAATATACTTT-ATT-TTTTCACCCTTC-ATTTTGAT--GATTGGC-A--Aa
gi|8 : aGGTG-AAACAACAA--ATAGATAGGGG----C----GCATATTT-T--C-CA-AT-A-CCAA--G-CACAT-T-TGGTAAAATTACA--CA-T--GGT-TT-----GA-AAATAT--TAATTTT---CCTT-T-A--CTACA--------ATT---TA-A--G----C-ATTTGT-TTCATGAGGAATTA-CAG-TT-------TAAAGG-A-----CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TTTTGT----TG-------------A-T-ATCATAAGT-ATTA--ATAGA-A--AT---AAGATAT-TGC-AAAAAAT-G-TTACCCCAAAAAGGGTT-----TTAGTA-TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AA-TGC--AACATTTT-TCTG--CTGA--AA-TA-ATGGT-AA--TT-ATTTCT-A-TAT-TTTC-CGTGCTTAT---TGAACA--T-AATTC-A-GATAGT-T--T-A-G--AG-A-CTTTT--TCA-AA--ATTA-T--TTTG-G-T-GCATT--AA-A--TTTT---A---------------GA-TCCTGAG----TAA-AAAAC--T-TTGTGTTGAAGT-T--TATGA-T-AA-A-AAA-TATTA-AAG-AGGTG--G---C---CACGTTTATTGCATTTTTT--C-A--G--AATT--CC-CC-C-C--------------G-TTT--TT-TGTG-CCA--AA--TAAAAA-TAAT--C--A-A-CA---TCA--T----T----TAT-T---TTTC-----A-TAAT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGTA-TAGTAATGTT-TGTTTCAC--T-CGAT-GGG--AAAA---AAA-TT---G--G-G--CCA-TC-GAAACCC-T-T---T-TATTTTAATTCTCAC----CAT-GGT--TTT--T----AATTGC-TA-AA--TTAAG--CT-----TTA-C-AAAA-A-AAAC---C-----G--TA-GTGT--C---CGT-A-A-C-ACTT-----GAA--TTCT-GTG--AAAGTTAGAA-A--G--CTGTAT-ACATA--T-CA--TTA-TTTT--A-T--TTT-AG-AT--AGA-CATT---AT---GT--AGATG--CT-GAGAT-ATG-----GTCG----T--TGTTTTTTT-CCC-TGCATGG--TCATTA--CC-------ACT-GT----TTCTCGGGT-ATCAATACAAAAT-G-TG-GTTAC-GAC-A---CTAC-AAAAA-TCTG--T-AGTGTCCC-GT-ACC-TGAT-ATTTTGA--TC-AGTTT--GAAG-C-A--GCTTGTCTTT---AAAAAC-CT-AAT-GC-T-GAT-ATTTTT-ACAAA-GG--A-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-AAGTCTAA-T-CAa
gi|9 : ATT-TCAT---GT--AGATG--CT-GAGAT-AAG-----GTGT----T--T-----TTT-CCC-TGA------TCACCA--CC-------ACT-GT----TTCTCAGGT-ATCATCAC-ATAT-G-TG-GTTACGGAC-T---CTAC-AAAAT-CCTG-T--AGTGT-CC-GTAATT-TG-T-ATTTTGA--TC-AGTTTGA--AG-C-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GAT-ATTTTT-ACAAA-AGTCA-GAGGTTT-GTTC-C-A-C-AAGT-TAA-T-CAATTTACTTT-A-T-TTTTCA-CCCTC-ATTTTCAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCCCAA-ATCGCATCA--TTT-CC-A-TATACAG-CATC-A-TAGCT-G-TAT-----CATCAG--TA-TG-AC-ATA--A--GCAA-TG--CTATT-GACATGGACATC-AAGA-CA-GATT-ACATGT-ACCA-TA---TTTTTTTCAA-T-TTTGAA-GT----C-TG------G-TGTT-ACATT----TA--A-CAAAA-GCTT-GT-ACGAATT-CC-ACTATTTAAG-ATAA-GT-TCC-ATCC-C-TT-ATTT-----A--TAACTT-AAAGAATA--TG--TAGTG--TC-CG---TAACCAAA--AGTTGAAAACTT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGC-AGA-A--A--A--ATTTC-AAAGCAG-TTAGTTA-TTGAAGTTTAAAGTAT-T--TAGG-TG-TT-TAT-TAGCCAGAAATTCTTTAAGATTA--T-GG--GGTGCTTTATTTTTTTTTTT--TTTCACTG-CAAGAAATA-AAAAAA-A---ACTT--AACAC--CTA-----CAAAT--ACATAG-AATG-TG-TGGGGAAAATActt
Alignments
lowQualScore : 11111 1111 11111111 111 111 11111111 1111111111111 2222 11111 1 22222222222222222222 11111 2222222222 1 11111111111111 11111 1 1111 2222222222222 11111 1111 1 1111111 333333 1 111 11111 111111 11111 2222222 1111111 1 11111 22 111 111 1 111 11111 1 11111 11 1 1111 11111111 11 11111111 11 1111 1111 11 11 1 11111111 1 222 1 2222 1 11111 11 1 1 22222 22 1 5555555555555555555555 11 11 1 22222222222
lowQualScore : 2 2 5 11111 888888888 444 7777 2 2 2 2 77 77 5 7777 2 888888 99 3 44 0 3 555 3 0 44 3 555 2 2 33 00000000 555 2 2 8888 2 2 2 5 8888 4 9999999 2 9999999 000 33 2 2 999 00000000 33 6666 5555555555555 2 5 5555 2 33 2 33 3333 66 2 2 2 2 5 9 4 88888 44444 555 44 3 3 3 44 3 55 3 44 44 3 3 66 1 3 3 3 3 3 33 2 666666 33 2 666 5 2 33 2 33 999 33 2 77 44 77 5 33 5 2 2 2 2 33 33 2 55555555555555555555 2 2 2 99 999999 2 7777 2 8888 444 66 444 666 2 2 88888 6 333 3 6666666666 6 3 4 99 3 44 44 6 0 3 77777777777777 3 99999 2 44 888 1 0000 3 555 44 3333333333333 555 00000 3 4 3 44 3 6666 3 44 2 33 66 2 5 444 555 2 555 33 2 6666 2 99 1 2 555 22 8 2 6666 44 3 3 4444444 3 3 3 3 3 88888 3 3 3 6 555555 3 44 3 77 555 3 3 88888 44 55 44 3 55 3 55 3 1 55 4 55 4 4 55 4 55 4 4 66 4 4 111 55 55 4 4 4 00000 8888 777777 55 00000 4 4 4 5555555 4 55 3333333 4 8888 1 4 4 8 4 33333 4 4 33 4 4 4 4 8 4 66 8 777 8 66 4 222 8 8 4 8 4 4 8 4 55 4 4 4 4 4 4 4 4 1 5 4 88 5 66 66 5 66 5 77 5 5 5 5 5 555 5 44444 4 77 5 5 1 00000 5 33 1 3 0 5 66 5 5 0000 44444444 5 22 5 5 5 99999999 33 7777 4444 11 5 5 6 33 5 5 6666 1 888 5 33333333 0 66 333 66 0 2222 66 3 2 5 22222 33 5 5 0 5 9999 66 11 5 88 5 1 0 44444 6 66 6 6 0 5 1111111111111111111111 55 6 3 00 888 1 1 44444444444 1 99 0 6 6 6
lowQualScore : . . . ..... ......... ... .... . . . . .. .. . .... . ...... .. . .. . . ... . . .. . ... . . .. ........ ... . . .... . . . . .... . ....... . ....... ... .. . . ... ........ .. .... ............. . . .... . .. . .. .... .. . . . . . . . ..... ..... ... .. . . . .. . .. . .. .. . . .. . . . . . . .. . ...... .. . ... . . .. . .. ... .. . .. .. .. . .. . . . . . .. .. . .................... . . . .. ...... . .... . .... ... .. ... ... . . ..... . ... . .......... . . . .. . .. .. . . . .............. . ..... . .. ... . .... . ... .. ............. ... ..... . . . .. . .... . .. . .. .. . . ... ... . ... .. . .... . .. . . ... .. . . .... .. . . ....... . . . . . ..... . . . . ...... . .. . .. ... . . ..... .. .. .. . .. . .. . . .. . .. . . .. . .. . . .. . . ... .. .. . . . ..... .... ...... .. ..... . . . ....... . .. ....... . .... . . . . . ..... . . .. . . . . . . .. . ... . .. . ... . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . .. . .. .. . .. . .. . . . . . ... . ..... . .. . . . ..... . .. . . . . .. . . .... ........ . .. . . . ........ .. .... .... .. . . . .. . . .... . ... . ........ . .. ... .. . .... .. . . . ..... .. . . . . .... .. .. . .. . . . ..... . .. . . . . ...................... .. . . .. ... . . ........... . .. . . . .
lowQualScore : 9 9 7 33333 000000000 777 0000 9 9 9 9 33 33 7 9999 9 222222 66 1 22 2 1 444 1 5 22 1 444 9 9 99 44444444 000 9 9 9999 9 9 9 7 9999 6 3333333 9 3333333 000 99 9 9 333 44444444 99 1111 7777777777777 9 7 3333 9 99 9 99 3333 44 9 9 9 9 7 7 6 22222 22222 444 22 3 3 3 66 6 00 3 66 66 3 3 88 6 3 3 1 1 1 00 9 333333 99 9 444 7 9 99 9 99 999 99 9 55 22 33 7 77 3 7 7 7 7 77 77 7 88888888888888888888 7 7 7 00 999999 7 1111 7 3333 777 11 999 999 9 9 22222 2 999 1 0000000000 2 1 3 22 1 22 66 7 0 3 55555555555555 3 22222 5 66 999 5 7777 1 444 22 9999999999999 444 88888 1 0 1 22 1 5555 1 22 9 99 88 9 7 777 000 9 000 99 9 8888 9 00 4 9 000 99 6 9 5555 22 1 1 2222222 1 1 1 3 3 33333 3 3 3 7 444444 3 66 3 99 888 3 3 33333 66 55 66 3 00 6 00 6 0 55 0 55 0 0 55 0 55 4 4 11 4 0 000 55 55 0 0 0 00000 5555 999999 55 00000 0 0 0 0000000 8 55 0000000 0 5555 0 4 4 9 0 55555 0 0 44 0 0 4 4 9 4 11 9 444 9 11 4 222 9 9 4 9 4 4 9 4 66 4 4 4 4 4 4 4 4 0 0 5 55 0 99 99 0 99 7 99 7 7 7 7 7 111 7 33333 9 99 7 7 4 44444 7 66 4 0 7 7 44 7 7 4444 66666666 7 44 7 7 7 33333333 77 9999 0000 44 7 7 6 66 7 7 9999 4 666 7 66666666 8 99 888 99 0 9999 99 2 4 0 88888 22 0 0 1 0 6666 99 99 0 22 5 9 1 11111 7 88 7 7 8 7 3333333333333333333333 88 7 5 22 000 3 5 88888888888 0 55 3 7 7 7
consensus : AGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AC-G--TAT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAAAAGATAA-TG-CAA-AAAAT-G-T-ACCCCAAAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TCTG--CTGA--AA-TA-ATGGT-AAAATT-ATT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-C-A-GA-T--T-T--T-A-A--GA-A-TTTTT--TCACAA--ATTA-T--TT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAG----TAA-AAAAC--T-TT----T---GAAGT-T--TATGA-A-AA-A-AAA-TGTTA-A-T-AGG-G---G--C---CACGTT-AT-ACATTTTTTT-C-AATG--AATT--TC-CC-C-C----T---------G-TTT--TA-TATGCCA--AN--TAAAAAATAATGTC--T-A-CA---TCA--T----T----T---T---TTTC-----A-TANT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGTA-T--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--AAAA---AAA-TT---G--G-G--C-A-T--GCAACCC-T-T---T-AATTT-AATT-TCAT----CA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-TA-AAAATTAAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-A------C-G--TA-GTGT--C---CGT-A-ACCACTT-----AAA--TTCT-GTG--AAA-TTAG--AA-AG--CTCTAT-ANATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAG-A-T--AGA-CATT-TCAT---GT--AGATG--C-TGAGA-T-ATG-----G----TGG----T--T-----TTT-C-CC-TGN------TCATCA--CC-------ACT-GT----TTCTCGGGT-ATCATCAC-AAATG-TG-GTTACGGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTG--T-AGTGT-CC-GTAACCT-G-T-ATTTTGA--TCA-GTTTG-GAAGC-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GATA-TTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-AAGT-TAA-T-CAATNTACTTT-ATATTTTCACCCCTC-ATTTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCCCAA-ATCGCATCA--TTT-CC-A-TATACAG-CATC-ATTAGCT-GTTAC-----CATCAG--CA-TG-AC-ATA--A--GCAA-TG--CTATT-GACATGGGCATC-AAGA-CA-GATG-GCA--C-ACCATTA--TTTTTTTTCAA-T-NTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTT-ACATT----TA--A-CAAAA-TCTT-GT-ACGAATT-CC-ACTATTTAAG-ATAA-NT-TCC-ATCC-C-TT-ATAA-----A--TAACTTAAAGAATG--TGT-TAGTG--TC-CGT--TAACCAAA--AGTTGAAAAACT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGC-AGA-A--A--A--TTTTC-AAAGCAG-TTTGTTATTTGAAGTTTAATGTAT-TTGTAGG-TGATT-TAT-TAGCCAGAAATTCTTTTAGATTA--C-GGT-GG------------TTTTTT--TTTTACTG-CAAGAAATA-AAAAAA-AATTACTTTAAAAAC--CAA-----ANAATTGTCATAG-AATG-TG-TGGGGAAATTA
Reference ( family-5039 ) : AGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AC-G--TAT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAAAAGATAA-TG-CAA-AAAAT-G-T-ACCCCAAAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TCTG--CTGA--AA-TA-ATGGT-AAAATT-ATT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-C-A-GA-T--T-T--T-A-A--GA-A-TTTTT--TCACAA--ATTA-T--TT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAG----TAA-AAAAC--T-TT----T---GAAGT-T--TATGA-A-AA-A-AAA-TGTTA-A-T-AGG-G---G--C---CACGTT-AT-ACATTTTTTT-C-AATG--AATT--TC-CC-C-C----T---------G-TTT--TA-TATGCCA--AN--TAAAAAATAATGTC--T-A-CA---TCA--T----T----T---T---TTTC-----A-TANT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGTA-T--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--AAAA---AAA-TT---G--G-G--C-A-T--GCAACCC-T-T---T-AATTT-AATT-TCAT----CA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-TA-AAAATTAAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-A------C-G--TA-GTGT--C---CGT-A-ACCACTT-----AAA--TTCT-GTG--AAA-TTAG--AA-AG--CTCTAT-ANATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAG-A-T--AGA-CATT-TCAT---GT--AGATG--C-TGAGA-T-ATG-----G----TNG----T--T-----TTT-C-CC-TGN------TCATCA--CC-------ACT-GT----TTCTCGGGT-ATCATCAC-AAATG-TG-GTTACGGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTG-TT-AGTGT-CC-GTAACCT-G-T-ATTTTGA--TCA-GTTTG-GAAGC-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GATA-TTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-AAGT-TAA-T-CAATNTACTTT-ATATTTTCACCCCTC-ATTTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCCCAA-ATCGCATCA--TTT-CC-A-TATACAG-CATC-ATTAGCT-GTTAC-----CATCAG--CA-TG-AC-ATA--A--GCAA-TG--CTATT-GACATGGGCATC-AAGA-CA-GATG-GCA--C-ACCATTA--TTTTTTTTCAA-T-NTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTT-ACATT----TA--A-CAAAA-TCTT-GT-ACGAATT-CC-ACTATTTAAG-ATAA-NT-TCC-ATCC-C-TT-ATAA-----A--TAACTTAAAGAATG--TGT-TAGTG--TC-CGT--TAACCAAA--AGTTGAAAAACT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGC-AGA-A--A--A--TTTTC-AAAGCAG-TTTGTTATTTGAAGTTTAATGTAT-TTGTAGG-TGATT-TAT-TAGCCAGAAATTCTTTTAGATTA--C-GGT-GG------------TTTTTT--TTTTACTG-CAAGAAATA-AAAAAA-AATTACTTTAAAAAC--CAA-----ANAATTGTCATAG-AATG-TG-TGGGGAAATTA
gi|1 : GGTGCAAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-TTTC-CA--T-A----A--G-CA----T-TG------ATATAATCA-T--G-T-TTTG---AA-AAATAT--TA-TTCT---TCCT-T-AGCATACA--------ATT---TA-AACA----C-ATTCTT-TTCAT-AGGAAT-AC-ACTTGT-------AA-GACA-------TTTAGTC--TG-TG-CCAA---TT--------TT--TG----TG-------------ACT-CT----AAT-ATTA--ATAGATA--ATTAAATCATT--TG-CAAGAAAATAG-T-ACCACCAAAAAGG-CT----TTAGAACTTT---ATAGTGT--TAT-G-CTTGTTGCTAACT-AGATAACTGCCTAACATTTTGTATG--CTGA--AAATA-G-GGT-AAATTA-ATT-CTCA-TATGTTTC-C-TGCC-GA---TGAACA--T-AAT-C-A-GT-T--TAT--T-A-G--GA-A-TTCTTGATCACAA--ATTA-T--TT-GCG-T-GC-TTTAAAA--T-TTA--G-A---------------G-GA-T-CA-GAGGTAATAACAGAATCAT-TT----T---GA-GTAT--CATGA-T-AA-A-A---T-TTATA-T-AGG-G---GTGC---CAC-TT-GG-GCAATGTTT--C-AATG--GAAT--TC-CC-C----------------G-TTT--GA-TG-GCCA--AAAATAGAAAATAATGTC--A-A-CA---TCA--T----T----TAT-T---TTTC-----A-TAAT-TTCC-A-TCTAAAAT----AACAGTA-T--GAATGTTC-G-TT--AC--TC-AT-GGG--AAAA---AAAATT---G--G-C--C-A-T--GCA-CCC-T-T---T-TATTT-AATT-TCAC----CA--T-G-TTTTAAT----ATT-GC-TA-AAAATTAAG-A-GT-----TTAGC-AAAA-A-AAAAGC-C-G--TA-GTGT--C---CGTCA-GCCACTG-----AAA--T-CT-GTGGAAAA-TTAG--AA-AGGCCTTCATTACATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAGGA-C--AGA-C-TT-TCAT---GT--AGATGGCC-TGAGA-T-ATGTGGTTG----TTG----T--T-----TTC-C-TC-TGCAATGGTCCAT-A--CC-------AC--GT----TTCTCGG-T-ATCATTAC-AAGTG-TG-GTTACGGAC-AACGCTAC-AAA-T-CCTG-TTTAGTGT-CCCGTAACCT-G-T-ATTTTGACTTCA-GTTTG-TAAGCCA--GC-TGT-TTA---CAAACA-CA-ACTCGCCT-GATA-TTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTCTT-A-CTAAGT-TAATT-CACTCTAC-TT-ATATTTTCACCCA-C-ATTGTGAT---AT--GCAA--ACTAA-TTGGAAAGCCCAAGATCGCATCA--TTT--C-A-TATGCAG-CATC-AT--GCT-GTTAC-----C-TCAG--CATTG-ACAATA--A--GCTA-TGC-CTATT-G--ATGGGAATT-AAAA-CA-GATG-A-A--C-A-CACTA--TTTTTCTTCAAGT-GTTG-A-GTC-AAC-TG------G-TGTT--CGTT----TA--AGCAAAA-CTTT-GT-A-GGAT---C-ACTATTTAAA-ATAA-AG-TTC-ATCC-C-TTAATAA-----T--AAACTTAAATAATG--TG--TAGTGGTCC-CGTAAAAACCAAA--AGTTG-AAAACTGTAAAACCTC--TTATTTGTTTCTCACAAGAAAG-AGC-AGA-G--A--AATTTTTC-AAAGCAG--TTATTATTT--AATT--ATGTA---TATAGGTTG--T-TAT-TAGCCAGAAATTC-TTAAGATTG--C-GGA-TG------------TTTTTTACTTTCACTG-C-AGAAATA-TAAAAA-GAATACTTTAACGCC--T-------ACCATAGTCATAG-AATC-TT-GGGGGAAATTA
gi|10 : -CA----T-TG------TTATA--CA-T--GAT-TTTC---AA-AAATAT--TG-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------CTT---TA-A-CA----T-ATTT-T-TTCAT-ACGAAT-AC-G--TAT-------AA-AGGA-------CTT---A--TG-TG-CCAA---TT--------TT--TT----CT-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAA--GATAA-TG-CAA-AAAAT-G-T-GCCCCAAAAA-GGTC-----CT-----TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTAA--ACTTAGA-AATTGC--AATATTTT-TCTA--CTGA--AA-TA-ATGGT-AAA-TT-ATT-AT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-AT---TGAACAGTC-AAT-G-ACGA-T--T-TCTT-A-ACAGA-G-TTTTC--TCGCAA--ATTA-TGTTT-G-G-TAGC-TT--TAA--TATTT--CTA---------------G-GA-T-C--GAG----TAA-AA--C--TGTT----T---GAAGT-TGCT-TGA-ATAATA-AAA-T-CTATA-T-AGG-G---G--TGCACACGTT-G--ATATCTTTTT-A-AATG--ACCC--CC-CC-C-CCCGCT---------G-TCT--TT-TATGCCA--GC--TAAAAA-TAATGTCGCT-T-C----TCA--T----T----T---TATTTTTC-----A-TAAT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGTA-T--TACTGTTTTG-TT--CCGTTC-ACAGGG--AAAAGGGAAA-TT---G--G-G--CCA-T--GCAACCCCT-T---T-AATTT-AGTT-TCAT----CA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-CA-AAAATTATG-A-TT-----TTA-C-AAAA-ATA------C-G--TA-GTGT--C---CGT-A-ACCACTT-----GAA--TTCT-ATG--AAA-TTAG--AA-AT--CTCTAT-AGATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTCT
gi|11 : GTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--T-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TG-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AC-A--TAT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAAT--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTT--AAGATAA-AG-CAA-AAAAT-G-T-ACCCCAACAAGGGTTGTTGTTT-----TTT---TTAGCGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AATTGC--AACATTTT-TCTA--CTGA--AA-TA-ATGGT--AAATT-ATT-CT-A-CAT-TTTT-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-G-A-GA-T--T-T--TAA-A--GA-T-TTTTT--TCACAA--ATTATT--TT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAG----T-A-AAAAC--C-TT----T---GAAG--T--TATGG-G-AA-A-AAA-AG-TA-A-T-AGG-GGT-G--C---CACGTT-AT-ACATTTTTTT---AATG--GATT--TT-CCAC-C----T---------G-TTT--T--TATGTCA--AA--T-AAAAATAATGTC--T-A-CA---TCA--TTTA-T----T---T---TTTC-----A-TATT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGTA-T--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-AGG---AAA---AAA-TT---G--G-AT-C-A-T--GCAACCCTT-T---T-AATTT-AATT-TCAT----CA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-CA-AAAATTCAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-ATA------T-G--TA-GTGT--C---CGT-A-ACCACTT-----AAA--TTCT-ATG--AAA-TT
gi|12 : tacgaT-TCTG--CTGA--AA-TA-ATGGT-AAA-TC-ATT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-TT---TGAACA--T-AAC-C-A-GA-T--T-T--T-AGA--GA-A-TTTTT---CACAA--ATTA-T--TTTG-G-T-GC-TT--ACA--T-TTT--T-A---------------G-GA-T-C--GAG----TAA-AAAA---T-TT----T---GAAGT-T---ATGATA-AA-A-AAA-TAT-A-A-T-AGG-G---GTGC---TACGTT-AT-GCATTTTTT--C-AATG--ATTT--TTTCC-C-C----T---------G-TTT--T--TATGCCA--AA--TAAAATTTA-TGTC--A-A-CA---TCA--T----T----TATTT---TTTC-----A-TAAT-T--C-AGTCTAAAAG----TACAGTA-T--GAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--GAAA---AAA-TT---G--G-G--CCA-T--GCAACCC-T-T---TTAATTT-AATT-TCAC----CA--T-G-TTTT-------AAT-GC-TA-AAAATTAAG-AGTTAAAAATTA-A-AAAAAA-A------C-G--TA-GTGT--C---CGT-A-ACCACTT-----AAA--TTCT-GTG--AAA-TTAG--AA-AG--CTTTAT-ACATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAG-A-T--AGA-CATT-TCAT---GT--AGATG--C-TGAGT-T-ATG-----G----TGGGGGTT--T-----TTT-T-CC-TGG------TCATTA--CC-------ACT-GT----TTCT
gi|13 : GGTG-AAACA-CAATTAAAG-----GG---------GCAT---T----C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--TA-T--GGT-TTTC---AA-A--------------------T-T-G--ATACA--------ATT---TA-A-CA----C-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AC-A--TTT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAAT--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTT--AAGATAT-TG-CAA-AAAAT-G-T-ACCCC-AAAAAGGTGA-----T-----ATT---TTAGTGT--TAT-G-CA-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AATATTTT-TCTG--CTGA--AA-TA-ATGGT--AAATT-ATT-TT-A-TAT-TTTC-T-TGCCTATATATGAACA--T-GAT-C-A-AA-T--T-T--T-AGA--GA-A-TTTT
gi|13 : acg-A-TAT-TTTT-C-TGC-------TGAA-A--T-AAT-----GG-T--------------AA-A-TTATT--TTATA----TTT-T--CT-----T-GC-CT--ATA--T-ATGAAC-A---------------T-GA-T-C--------------AAA---T-TT----TAGAGAATT-T--TGTGA---------------TA---T-GGG-T---G--C---CACGTT-AT-ACA-TTTTTT-C-AATT--GGTC--AC-CC-C-C----TCCCCCCCCCG-TTT-----TATGCCA--AT--GAA-----AATGTC--T-A-CA---TCA--T----TTA--T---T---TTTCT----C-TACT-T--C-AATCTGAAAT----TACAGTA-T--TGATGTTCTG-TT--AT--CT-TC-AGG--ACAA---AAA-TT---GTTC-G--C-A-G--GTAACgtgatatgggtgccacgttatacattttttcaattggtcaccccctcccccccccgttttatgccaatgaaaatgtctacatcatttatttttctctacttcaatctgaaattacagtattgatgttctgttatcttcaggacaaaaattgttcgcaggtaac
gi|14 : acgggtgaaacacaattaaaggggcattccaatacagcattgttatatatggttttcaaattgatacaatttaacacatttgtttcataggaatacatttaaaggacttctgtgccaatttttgttgatctagcattaatagaatttaagatattgcaaaaaatgtaccccaaaaaggtgatattttagtgttatgcagttgcacttagaaactgcaGGTG-AAACT-CAAT-ATAG-----GA----CAAACGCAT---TAT--C-CAGAT-A-C--AATG-CAAT--TATG------TTATAA-CA-TTGGAT-TTGC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CTTT-A-A--GTACA--------ATTAAAAA-A-CA----TAATTTGT-TTCAT-AGGATC-AC-G--T-T-------AA-AAAATATCAGTCTTTTCT--TG-TG-CCAC---TCAAACCCAATT--GG----TGTTTCTCAGTAAATA-T-CT----AGCAACTAAGATAGA-A--TTTTAAAGATAA-TC-AAA-AAAAT-G-T-ACCCC-AAAAAGGTCA----TT-----TTT---
gi|15 : gGGTG-AAACA---AT-ACAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CCTT-T-A--CTACA--------ATT---TA-A-CA----C-ATTTTT-TTCAT-AGGAAT-AT-A--TTT-------AA-AGAA-------CTT---C--TG-TG-CGAAT--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGT-ATCA--ATAGA-A--ATT--AAGATAT-TG-CAA-AAAAA-G-T-ACCCC-AAAAAGGTGA----TA-----TTT---TTAGTGT--T
gi|16 : gAGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GA----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------AGT---AA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AC-G--TAT-------AA-AAGA-------CTT---C--TG-TG-CCAAT--TT--------TT--TT----TT-------------A-T-CT----AGC-ACTA--ATAGA-A--TTT--AAGATAA-TG-CAA-AAAAT-G-T-
gi|17 : cGGTG-AAACA-CAATCATAAAAT--GGTTGTC----GCAT---G-TG-C-CA-ATTA-C--A--GTCAATTTT-CG------TTATA--C--T--G----TTC---AAGAAATCT--T--TTTT---CTTT-T-A--ATGCA--------ATT---TA-C-TAT---T-ATTCAT-TTCAT-GAGGATAAC-C--TAT--------A-ATGA-------CTT---C--TG-TG-CCAAATTTT--------TT--GT----TG-------------A-TGCT----AG
gi|18 : T--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AAATGC--AACATATT-TCTG--CTGA--AA-TA-ATGGT-AAA-TT-GTT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGTC-AT---TGAACA--C-AAT-C-A-GA-T--A-T--T-AGA--GA-A--TTTT--TCACCA--ATGA-T--TT-G-GTT-GC-TA--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAG----T-A-AAAAC--T-TT----T---
gi|19 : TT-T-A--ATACAGGGTTCTTACC---TA-A-TAATATT-ATTTGT-TTGAT-AGGAAT-AC-A--TATATAAATAAA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAAC--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----t
gi|2 : atacaaaaggtttcaacacaatatctttaagaacAGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG---------GCAT---T-T--C-CA-AT-AGC--A--G-CA----T-TG------TTATA--CACT--GGA-TTTC---AA-AATTA----A-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-AA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AT-G--TAA-------TA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--AT-GA-A--TTTAAAAGATAA-TGCCAA-AAAAT-G-T-ACCCCAAAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TAT-GAGT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TCTT--CTGA--GA-TA-ATGGTAAAAATT-ATT-C--A-TAT-CTTA-C-TGCC-AT---TGAA-A--T-AAT-C-A-GA-T--T-T--T-A-A--GA-ATTTTTT--TCACAA--ATTA-T--TT-G-G-T-GC--T--AAA--T-GTT--T-A---------------G-GA-T-C--GAGT---TAA-AAAAC--T-TTA---T---GAAGT-T--TATGA-A-AA-A-GAA-TGTTA-A-T-AGG-G---G--C---CATGTT-AT-ACATTTTTTT-C-AATG--AATT--TC-CC-C-C----T---------G-TTT--TAGTAT-CCA--AT--TAAAAAATAATGTT--T-A-CA---TCA--T----T----T---T---TTTC-----ACTATT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGTA-T--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--AAAA---AAA-TT---G--G-G--C-A-T--GCATTCC-T-T---T-AATTT-AA-T-TCAT----CA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-CA-AAAATTAAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-A------C-G--TA-GTGT--C---CGT-A-ACCACTT-----AAA--TTCC-ATG--AAA-TTAG--AA-AG--CTCTAC-AGATA--T-CA--TT-ATTTTA--A-T--TTTTAG-A-T--AGA-CATT-TCAT---GT--AGATG--C-TGAGA-T-ATG-----G----TTG----T--T-----TTT-C-CC-TGT------TCTTCA--CC-------ACT-GT----TTCTC-AGT-ATCATCAC-AAATG-TG-GTTACGGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTGTTT-AG-GT-CC-GGAACCT-G-T-AATTTGA--TCA-GTTTGAGAAGC-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GATT-ATTTT-ACAAA-GGTCA-GA-GTTT-GTTC-T-A-C-AAGT-TAA-T-CAATATACTTT-ATATTTTCACTTCTC-A-TTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCTCAA-ATCACATCAGTTTT-CCTA-TATACAG-CATCTATTAGCT-GTTAC-----GATCAGTTCA-TG-AC-ATA--A--GCAA-TG--CTATTAGACATGGGCATC-AAGATCATGATGCGCA--TAACCATTAGTTTCTTTTTCAA-TCTTTGAA-GTC-AACGTGCCTATCG-TGTTGGCATT----GA--A-CAAAA-TCTA-TT-ACGAATT--C-ACTATTTAAACATAA-TTATCC-ATCC-C-TT-ATAA-----A--TAACTTAAA-ATTGTCTGT-TAG-G--TCACGT--TAACCAAA--AGTTGAAAAACT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAG--TGC-AG-----A--A--TTTTC-AAATCAG-TTTGTTATT--AATTTTAATGTAT-TTGTAGG-TGATTATAT-TAGCCA-AAATTCTTTTAGATTA--C-GGT-GG------------TTTTTT--TTTTACTG-CAAGAAATA-AAAAAATATTTACTTGAAAAAT--CAA-----AGAATTGTCATAGAAATG-TG-TGGGAAAATTA
gi|20 : --GCAACCCCT-T---T-AATTT-ATTT-TCAT----CA--T-G-TTCT--T----AAT-GC-TA-AAAATTAAG-G-TT-----TCA-C-AAAA-A-ACAAAACC-A--TA-GTTT--C---CGT-T-ACCACTT-----TAA--TTCT-ATG--AAA-TTAG--AA-AG--CTCTAT-A
gi|21 : A-----A--TAACTTAAAGAATG--TGT--AGTG--TC-CGT---AGCCAAA--AGTTGAAAA-CT-TAAAAC--T--TT---T-TTTC-C-CAAGAAAGTTGC-AGAGA--A--A--TTTTT-AAAGCAG-TTTATTATTT-AAGTTTAATGTAT-
gi|22 : -C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-C-A-GA-T--T-T--T-G-A--GG-A-ATTTT--TCACAAT-TTTG-T--TT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-CCT------------------------------GAA----TAA-AAA----T-TT----T---GAAG--T--TATGA-A-AA-A-AAA-
gi|23 : ta--TT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAG----T-A-AAACC--T-TT----T---GAAG--T--TATGA-A-AA-A-AAA-TG-TA-A-C-CGG-GGA-G--C---CAGGTT-AT-ACATTTTTTT-C-AATG--Aaatgtaaa
gi|24 : -A-CA---TCA--T----T----TATTT---TTTC-----A-TACT-T--T-AGTCTAAAAT----TACACTA-C--TAATGTTCTG-TA--AC--TC-AC-AGG---AAA---ATA-TT---G--G-GC-C-A-T--GCAACCCTT-T---T-AATTT-AATT-ctgttt
gi|25 : TCTG-TT--AC--TC-AC-AGGAAAAAA---AAA-TT---G--G-GC-C-A-T--GCAACCC-T-T---T---TTT-TATT-TT-T----TA--T-T-TTTT--T----GA-----CA-AAAAT
gi|26 : ----AAC-ATTA--ATAGA-A--TTTAA--GATAA-TG-CAA-AACAT-A-T-ACCCCCAAAAA-ATCA----TT-----TT----------T--TAA-G-CT-GTTGC--ACTTgtagccgaatttaa
gi|27 : GGTG-AAACA-CAAT-GTAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--
gi|28 : tcgGGCG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-
gi|29 : tatatcgGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---
gi|3 : catattacgGGTG-AA-CA-AAAT-ATAG-----GG----C-----CAT---TCT--C-CA-AT-A-C--A--GTCA----T-TG------TTATAT-CA-T--GGA-TTTC---AA-AACTAT--TA-TTTT---TCTT-T-A--ATACA--------ATT---TACA-AA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AT-G--TAT-------AA-AGGA-------ATT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--ATGGTTTG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAA--GATAA-TG-CAA-AAA-T-G-T-ACCC--AAAAAGGTCA----TT-----TTT---T-AGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTGGA---CTGC--AACATTTT-TCTA--CTGA--AG-TA-ATGGT-AAATTT-ATT-CT-A-TAT-CTTAAC-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT---A-GA-T--T-T--T-A-A--AG-A-ATTTT--TCACAATTATTT-T--TT-G-G-T-GC-TA--AAA--T-TTT--T-A---------------G-GA-T-C--GGA----TAA-AAA-C--T-TT----T---GAAGT-T--AATGA-A-AA-A-AAAATGT-A-A-T-AGG-G---G--TG--CATGTTTAT-ACATTTTTTTTC-AATG--AATT--TC-CCAC-C----T---------G-TTTGTTA--ATTTCA--AT--TAAAAAATA-TGTT--T-A-CAATATTA--T----T----T---T---TTTC-----A-TA-T-T--C-AGTCTAAA-T----TACAGTA-T--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGA--AAAA---AAA-TT---G--G-GGCC-AAT--GCAACCC-TAT---T-AATTTTAATT-TCCT----CA--T-G-TTTT-------AAT-GC-CA-AAAATTAAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-AA-----C-G--TAAGTGT--C---CGT-A-ACCACTT-----AAAATTCCT-G-----AA-TTAG--AA-AG--CTCTAC-AGATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAG-A-T--AGA-CATT-T-AT---GT--AGATG--C-TGCGA-T-ATG-----G----TGT----T--T-----TTT-C-CCGTGA------TCATCAAACC-------ACTCGT----TTCTCCGGTTATCATCAC-AAATG-TG-GTTACGGAC------TAC-AA----TCTG-GT-AGTGT-CC-GTAACCT-G-T-ATTTTGA---AA-GTTTTTGAAGCCATCGCCTGT-TTT---AAAACA-CT-A-T-GCCT-GATA-TTTTTTACAAAAGGTCA--AGGTTT-GTTC-T-AAC-AAGT-TAA-TTCAATATACTTT-AT-TTTTTACCCTGC-ATTTTGAT--GAT--G--G--ACTAATTTGGAAAGCTCAA-ATCACATCA--TTTTCC-A-TATACAG-CATC-AT-AG-T-GTTAA-----CATCAG--TA-TG-AC-ATA--T--CAAA-TG--CTATT-GACATGGGCATCCAAGA-AA-GATG-GCA--T-AC----A--TATTTTTTCAA-T-TTTGAA-GTC-AAC-TG--------TGTT-GCATT----TA--AACAAAAATCTT-GT-ACAAATT-CC-ACTATTTAAC-ATAA-TT-TCCCATCC----T-ATAA-----A--CAACTTAAA--ATG--TGT--AGTG--TCGCGT---AACCAAA--CGTTGAAAA-CT-CAA--C--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAA-GTTGC-AGA-A--A--A--TTTTC-AAATCAGTTTTGCTA-TTGAAGTTTAATGTACATGGTAGG-TGA-T-TAT-TAGCCAGAAATTCTTTTAGATTA--TGGGT-GT------------TTTTTT--TTTTACTG-CAAGAAAT--AAGAAA-TATTA--TTAAAAAT--CAA-----AGAA-TGCAATAG-AATG-TG-TGGACAAATT
gi|30 : tacg-GTTACGGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTG--T-AGTGT-
gi|4 : ----AGC-ATCC--ATAGA-ACATTTAAA-GATAACTG-CAA-AAAAT-G-TGACCCCAAAAA-TGTCA----TT-----TCTGTGTTAGTGTGTTAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TCTATACTGA--AC-TA-ATG-T-AGACTT-ATT-CT-AGTAT-TTAA-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-CCA-GA-T--T-T--TCA-A--GC-A-TTTTT---CACAA--ATAT-T--TT-G-G-T-GC-TT--AAAATC-TTT--C-A---------------T-GACT-C--GAG----TAC-AAAAC--G-TT----T---GAA---T--TATGA-A-AA-A-AAA-TGTAA-A---AGG-G---GTAC---AATGTT-AT-ATCTTTTCTT-CCAATG--AATTGTTC-TCGC-C----T---------GGTTT--TGGTATGCTA--AGA-TAAAAAATAATGTC--T-A-CA---TCAGTT----TATAGT---T---TTTC-----A-TACTAT--CGAGCTTAAAATGAGCTA-GGTAAT--TGATCTCCTG-TT--AC--TC-AC-AG----AAA---AAA-TT---G--G-C--C-A-TATGCA-CCC-T-TATTT-AATTTCAATT-TCAT----CA--T-G-TTTT--CCCTGAAT-GC-TATAAAAT--AG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-A------C-GCGTA-GTGT--CACGCGTCA-ACCAATTCAAATAAA--TTCT-AT----AA-TCAG--AACGG--CTCTAT-AGATA--T-CA--C--A-TT-A--A-TGATTCTAG-A-TCTAGATCATA-GCATAATGTCGAGAAT--C-TGAGA-A-ATG-----GGTGGTAG----T--T-----TTTGC-TC-TGTA-----TCA-CA--CCCCAACCTACT-GT----TTCTCAGGT-ATCATCAC-AAACGGTATGTT--GGAC-AA--CT-C-AAAAT-CCTG-CC-AGTGT-CC-GTAACCTTG-T-ATTTTGT--TCAAGTT---GAAGC-A--GCCTGT-TTTTTAAAAACAGCTAAAT-GC-T-GA-A-GTTTT-ACAAA-GGTCA-G-GGTTT-ATTC-T-A-C--AGT-TAA-T---ATATACTTTAATATTTTCACCTCTCAATTTTGAT--GAT--GC-AATACTAATTAGAACAGCCCAA-ATCGCATCA--TAT-CC-ACTATACAGCCATC-GATAGCT-GTTAC-----CATCAG--CA-TGAAT-ATA--ACGGCAA-TG--C------ATATGGGCATT-AAGA--A-GATG-GCA--C-ACCATGA--ATTTTTTTCAC-TAATTGAAGGTCAAAC-TG------GCTGTT-ACATTA---TATTT-TAAAA-TCTGAGT-ATGATTTACCAACTAATTAAG-ATAA-TT-TCC-ATCCGC-TT-ATAA-----AACCAAGTTAAAAAATG--TG--TAGTG--TC-CCG--TAACCAAAGCAGTT-ACAAACT-TAAAAC--TGATTA-TT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGCAAGA-AATA--A--TGTTC-AAAGCTG--TTGTTA-TTGAAGTTT-GTGTAT-GT-TAGG-TGA-T-TATATAGCCATAAATCTCTTTAGATTATGT-GGTGGG------------TTTCTTG-TTTTATTGTCTAAATATAGAAAAAA-AATTACTT--AACACTACAA-----ATTACTATCAT-G-AATGTTGTTGGGGGAATTA
gi|5 : ctaGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--CTCA-A--A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTCCAAAA-AAATATGCTA-TTTTTCCCTTCAT-A--CTACA--------ATT---TA-A-CA----C-ATTTGTCTTCAT-AGGAAT-AC-T--T-T-------AATAGGA-------CTT---C--TG-TGGCCAT---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGT-ATTA--ATAGA-A--ATTA---GATT--TG-CAA-AAATT-G-T-ACCCCAAAAA-GGTGA----TA-----TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TCTG--CTGA--AA-TATATGGG-TAAATT-A-T-CT-A-TA--TTTC-C-TGCA-TT---TGAACA--TAAAT-C-A-GA-T--T-T--T-T-A--GAGA-ATTTT--TCACAA--ATTA-T--TT-G-G-T-GC-TT--ATT--T-TTT--TAA---------------G-GA-T-CT-GAG----T-A-AAAAC--T-TT----T---GAATT-C--TATGA-T-AA-A-AAA-TA-TA-A-T-AGG-GGT-G--C---CACGTT-AT-GCA-TTTTTT-C-AATGACAATT--TC-CC-C-C----T---------G-TTT--T--TATGGCAAGAT--TAAATA--AATGTCA-A-A-CA---TCA--TTTAAT----T---T---TTTC-----A-TAAT-T--C-AGT-TAAAAT----TACAGTA-T--AAGT-TTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--AAAA---AAA-TTTGCG--G-C--C-A-T--GCAACCC-T-T---T-TAATT-AATT-TCATCCACCA--TGG-GTTT--T----AAT-GC-TA-AAA--TAAG-A-TT-----TAA-CAAAAA-A-A------C-G--TA-GTGTTCC---CGTAA-ACCACTT------AA--TTCTCGTG--AAA-TTAG--AA-AG--CTTTAT-AT-TAATT-CA--TT-A-TTTG--ATT--TTTTAG-A-T--AGA-CATTATCAT---GT--AGATG--C-TGAGA-TAATG-----G----T-G----TCGT-----TTT-C-----GG------T-AT-A--CC-------ACT-GTTTTCTTCTC-GGT-ATCATTAC-AAATGCTG-GTTACGGACAA---CTAC-AAAAT-CCTG----AGTGT-CC-GTAACCT-GTT-ATTTTT---TCA-GTTTG-AAGCC-A--GTTTGT-TTT---AAACAA-CTAAAT-GC-TCGATA-TTTTTGACAAA-GGTCAGGAGGTTTGGTTC-TAA-C-A--T-TAA-A-TACTCTACTTT-ATGTTTCCACCCACA-ATTGTGATCGAAT--GC-A--CTTATTTCGGAAA--CCAA-AT-GTATCA--CTT-CC-A-TATGCAG-CATC-ATT-GCTGGTTAC-----CCTCAG--CA-TG-ACGATC--A--GCAATTGGCCTATTGGAAATGGGAATT-AAAA-CA-GATG-ACA--C-AC---TA--TATTTTTTCAA-T-GTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTTAACATTTCAATA--A-CAAAA--CTT-GTCAAGGATT--C-ACCATTTAAG-ATAAGGT-TCCAATCC-CTTT-ATAACTACTA--TAACT------ATA--TGTGTAGTG---C-CGT--AAAC---A--AGTTGAAAA--T-TAAAAA--T--TTATTT-TTTCCC-C-AGAAAGTTGC-AGA-G--AATA--TTTTCAAAAGCAG-TTTATTATTT-AAGTTTAATGTAT-
gi|6 : cg-T--TT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-AGGATCGAGTTTTTCAG-GA-T-C--GAG----TAT-AAA-C--T-TT----T---GAAGT-T---GTAA-A-AA-ATAAA-TGT-G-A-T-AGG-A---G--TG--CACGTA-AT-ACATTTTTT--C-ATTG--AATT--TT-CC-CTC----T---------A-TTT--TA-TA--CCA--AA--TAAAAA-TAATGTC--T-A-CA---TCA--T----T----T---C---TTTCTTTTTA-TACT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGTA-T--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--AAAA---AA--TT---G--G-G--CCA-T--GCAACCT-T-T---T-AATTT-AATT-TCAT----CA--T-G-TTTT-------AAT-GCGTA-AAAATTA-G-A-TT-----TTA---AAAA-A-A------CTG--TA-GTGTT-C---CGT-ATACTACTT-----AAG--ATCT-ATG--AAA-TTAG--GA-AG--CTTTAT-AGATA--T-AA--TT-A-TTTA--A-T--TTCTAG-A-T--AGA-CATT-TCAT---GT--AGATG--C-TGAGA-T-ATG-----G----TGGGTT-T--T-----TTT-C-CC-TGG------TCATTA--CC-------ACT-GT----TTCTCAGGT-ATCATTAC-AAACG-TA-GTTACAGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTG-TT--GTGT-CC-GTAACCT-G-T-ATTTTGA--TCA-GTTTG--AAGC-A--GTCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GATA-TTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-GAGT-TAT-T-CAATCTACTTT-AT-TTTTCACCC-TC-ATTTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCTTAA-ATTACATCA--TTT-TC-A-TATACAG-CATT-ATT-GCT-GTTACATGTACCTCAG--CA-TG-AC-ATACAA--GCTA-TG--CTATT-GAAATGGGAATT-AAAA-CA-GATG-ACA--C-ACCATT---TTTTTTTTCAA-T-GTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTT-ACATT----TA--A-CAAAA-CCTT-GT-AGGAATT-CC-ACTATTTAAG-ATAA-GT-TCC-ATCC-C-TA-ATAA-----A--TAACTTAAAGAATG--TG--TAGTG--TC-CG---TAACCAAA--AGTTG-AAAACT-TAAAGC---------TT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGC-AGA-A--A--AT-TTTTC-ACAGCAC-TTTGTTA-TTGAATTTCAATGTA---TACAGG-CG-TT-TAT-TAGCCA--------TTTA----------------------------TTTTA--TTTTACTG-CAAGAAATT-AAAAAA-AATTACTTTAAAAA----AACACCTACAAATACC-TAG-AATG-TA-TAGGGAAA
gi|7 : t-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-CC-AT-G-CAC---T-TG------TTATA--CA-T--GGAATTTC---AA-AA-TAT--TA-TTTT---CTTT-TTA--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGA-T-ACCG--TAT-------AA-AGGA-------CTT---CCCTGATG-CCAA---TT--------GT--GT----TG-------------A-TTCT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAA--GATAA-TG-CAA-AAAAT-GCT-ACCC--AAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TATTG-CT-GTT-C--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TCTA--CTGACAAG-TA-ATGGT-TAAATTTATT-CT-A-TAT-CTTA-C-TGCC-A----TGAACA--T-AAT-C-ATGATT--T-T--T-A-A--GA-A--TTTT--TCAC-A--ATTATT--TT-G-A-T-GC-TT--AAA--T-TTT----A---------------GCGA-TCC--GAG----T-A-AACAC--T-TT----T---GAAGT-T--TATGA-A-AA-A-AAG----TA-A-TCAGG-GGATG--C---CATGTT-AT-ACA-TTTTTT-C-AATG--AATT--TCTCC-C-C----T---------G-TTT--TA-T-T-CCA--AT--TTAAAAATAATGTT--TCATCA---TTA--T----T----T---T---TTTC-----A-TATT-T--C-AG-CTAAAA-----TACAGTA-T--GAAT-TTCTGTTT--ACT-TC-ACGGGG--AAAA---AAA-TT---G--GCGT-C-A-TA-GCAACCC-T-T---T-AATTT-CATT-TCAT----TATGT-G-TTTT--T----AAT-GA-TA-AAAATTAAGAA-TT-----TTA-C-AAAA-A-ACAAAG-C-G--TA-GTGT--C---CGTAA-ACCACTT-----AAA--TTCT--TG--AAA-TTAGAAAA-AG--CTCTAC-ATATA--TGCAACTTAA-TTTATTA-T--TTTTAG-ATT--AGA-CATT-TCATC--GT--AGATG--CTTGAGATT-AT------G----TGT----T--T-----TTT-CTCC-TGA------TCATCA--CC-------ACT-GT----TTCTCAGGT-ATCATTCC-AAATG--G-GTTACGGAC-A---CTACAAAAATACCTG--T-AGTGT-CC-GTAA-CT-G-TAATTTTGA--TCATTTTTG-AAAGC-A--GCCTGT-TTTA--AAAACACCT-AAT-GC-T-GATATTTTTT-ACAAA-GGTCA----GTTT-GTTC-T-A-C-AATT-TAA-T-CAATATACTTT-ATTTTTTCACCCTTC-ATTTTGAT--GATTGGC-A--Aa
gi|8 : aGGTG-AAACAACAA--ATAGATAGGGG----C----GCATATTT-T--C-CA-AT-A-CCAA--G-CACAT-T-TGGTAAAATTACA--CA-T--GGT-TT-----GA-AAATAT--TAATTTT---CCTT-T-A--CTACA--------ATT---TA-A--G----C-ATTTGT-TTCATGAGGAATTACAG--TTT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TTTTGT----TG-------------A-T-ATCATAAGT-ATTA--ATAGA-A--AT---AAGATAT-TG-CAA-AAAAT-G-TTACCCCAAAAAGGGTT-----TTAGTA-TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AA-TGC--AACATTTT-TCTG--CTGA--AA-TA-ATGGT-AA--TT-ATTTCT-A-TAT-TTTC-CGTGCTTAT---TGAACA--T-AATTC-A-GA-TAGT-T--T-A-G--AG-A-CTTTT--TCA-AA--ATTA-T--TTTG-G-T-GCATT--AAA--T-TTT--------------------A-GA-T-CCTGAG----TAA-AAAAC--T-TTGTGTT---GAAGT-T--TATGA-T-AA-A-AAA-TATTA-AAG-AGGTG---G--C---CACGTTTATTGCATTTTTT--C-A--G--AATT--CC-CC-C-C--------------G-TTT--TT-TGTGCCA--AA--TAAAAA-TAAT--C--A-A-CA---TCA--T----T----TAT-T---TTTC-----A-TAAT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGTA-TAGTAATGTT-TG-TTTCAC--TCGAT-GGG--AAAA---AAA-TT---G--G-G--CCA-TC-GAAACCC-T-T---T-TATTTTAATTCTCAC----CA--T-GGTTTT--T----AATTGC-TA-AA--TTAAG---CT-----TTA-C-AAAA-A-AAAC---C-G--TA-GTGT--C---CGT-A-AC-ACTT-----GAA--TTCT-GTG--AAAGTTAG--AA-AG--CTGTAT-ACATA--T-CA--TT-A-TTTT--A-T--TTT-AG-A-T--AGA-CATT---AT---GT--AGATG--C-TGAGA-T-ATG-----G----TCG----T--TGTTTTTTT-C-CC-TGCATGG--TCATTA--CC-------ACT-GT----TTCTCGGGT-ATCAATACAAAATG-TG-GTTAC-GAC-A---CTAC-AAAAA-TCTG--T-AGTGTCCC-GT-ACCT-GAT-ATTTTGA--TCA-GTTT--GAAGC-A--GCTTGTCTTT---AAAAAC-CT-AAT-GC-T-GATA-TTTTT-ACAAA-GG--A-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-AAGTCTAA-T-CAa
gi|9 : ATT-TCAT---GT--AGATG--C-TGAGA-T-AAG-----G----TGT----T--T-----TTT-C-CC-TGA------TCACCA--CC-------ACT-GT----TTCTCAGGT-ATCATCAC-ATATG-TG-GTTACGGAC-T---CTAC-AAAAT-CCTG--T-AGTGT-CC-GTAATTT-G-T-ATTTTGA--TCA-GTTT--GAAGC-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GATA-TTTTT-ACAAA-AGTCA-GAGGTTT-GTTC-C-A-C-AAGT-TAA-T-CAATTTACTTT-AT-TTTTCA-CCCTC-ATTTTCAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCCCAA-ATCGCATCA--TTT-CC-A-TATACAG-CATC-A-TAGCT-G-TAT-----CATCAG--TA-TG-AC-ATA--A--GCAA-TG--CTATT-GACATGGACATC-AAGA-CA-GATT-ACATGT-ACCA-TA---TTTTTTTCAA-T-TTTGAA-GT----C-TG------G-TGTT-ACATT----TA--A-CAAAA-GCTT-GT-ACGAATT-CC-ACTATTTAAG-ATAA-GT-TCC-ATCC-C-TT-ATTT-----A--TAACTTAAAGAATA--TG--TAGTG--TC-CG---TAACCAAA--AGTTGAAAACTT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGC-AGA-A--A--A--ATTTC-AAAGCAG-TTAGTTA-TTGAAGTTTAAAGTAT-T--TAGG-TG-TT-TAT-TAGCCAGAAATTCTTTAAGATTA--T-GG--GGTGCTTTATTTTTTTTTTT--TTTCACTG-CAAGAAATA-AAAAAA-A---ACTT--AACAC--CTA-----CAAAT--ACATAG-AATG-TG-TGGGGAAAATActt
Alignments
lowQualScore : 11111 1111 11111111 111 111 11111111 1111111111111 2222 11111 1 11 22222222222222222222 11111 2222222222 11 1 22222222222222 111111 1 1111 22222222222222 11111 22222 111 1111111 444444 1 11 11111 1111111 11111 22222222 1111111 1 11111 11111 111 111 1 111 11111 1 11111 11 1 1111 11111111 11 11111111 11 1111 1111 11 11 1 11111111 1 222 1 2222 1 11111 11 1 1 22222 22 1 5555555555555555555555 11 11 1 22222222222
lowQualScore : 2 2 5 11111 888888888 444 7777 2 2 2 2 77 77 5 7777 2 888888 99 3 44 0 3 555 3 0 44 3 555 2 2 33 00000000 555 2 2 8888 2 2 2 5 8888 4 9999999 2 9999999 000 33 2 2 999 00000000 33 6666 5555555555555 2 5 5555 2 33 2 33 3333 66 2 2 2 2 5 9 4 88888 44444 555 44 3 3 3 44 3 55 3 44 44 3 3 66 1 3 3 3 3 3 33 2 666666 33 2 66 5 2 33 2 33 999 33 2 11 44 77 5 33 5 2 2 2 2 33 33 2 55555555555555555555 2 2 2 99 999999 2 7777 2 8888 444 66 444 666 2 2 99999 6 3 3 3 6666666666 6 3 4 3 00 44 44 6 0 3 00000000000000 999999 2 44 8888 1 0000 3 555 3 55555555555555 555 00000 3 4 3 44 3 6666 3 44 2 33 66 2 5 444 555 2 555 33 2 00000 2 5 666 2 22 8 2 6666 44 3 3 4444444 3 3 3 3 3 88888 3 3 3 6 000000 3 3 77 555 3 3 88888 44 55 44 3 55 3 55 3 1 55 4 55 4 4 55 4 55 4 00 4 4 777 4 55 55 4 4 4 8888 00000 8888888 00000 4 4 4 55555555 4 55 3333333 4 8888 1 4 4 4 4 4 33333 4 4 22222 4 4 4 8 4 66 4 4 777 8 66 4 222 8 8 4 8 4 4 8 4 55 4 4 4 4 4 4 4 4 1 5 4 88 5 66 66 5 66 5 77 5 5 5 5 5 555 5 44444 4 77 5 5 1 00000 5 33 1 3 0 5 66 5 5 0000 44444444 5 22 5 5 5 99999999 33 7777 4444 11 5 5 6 33 5 5 6666 1 888 5 33333333 0 66 333 66 0 2222 66 3 2 5 22222 33 5 5 0 5 9999 66 11 5 88 5 1 0 44444 6 66 6 6 0 5 1111111111111111111111 55 6 3 00 888 1 1 44444444444 1 99 0 6 6 6
lowQualScore : . . . ..... ......... ... .... . . . . .. .. . .... . ...... .. . .. . . ... . . .. . ... . . .. ........ ... . . .... . . . . .... . ....... . ....... ... .. . . ... ........ .. .... ............. . . .... . .. . .. .... .. . . . . . . . ..... ..... ... .. . . . .. . .. . .. .. . . .. . . . . . . .. . ...... .. . .. . . .. . .. ... .. . .. .. .. . .. . . . . . .. .. . .................... . . . .. ...... . .... . .... ... .. ... ... . . ..... . . . . .......... . . . . .. .. .. . . . .............. ...... . .. .... . .... . ... . .............. ... ..... . . . .. . .... . .. . .. .. . . ... ... . ... .. . ..... . . ... . .. . . .... .. . . ....... . . . . . ..... . . . . ...... . . .. ... . . ..... .. .. .. . .. . .. . . .. . .. . . .. . .. . .. . . ... . .. .. . . . .... ..... ....... ..... . . . ........ . .. ....... . .... . . . . . . ..... . . ..... . . . . . .. . . ... . .. . ... . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . .. . .. .. . .. . .. . . . . . ... . ..... . .. . . . ..... . .. . . . . .. . . .... ........ . .. . . . ........ .. .... .... .. . . . .. . . .... . ... . ........ . .. ... .. . .... .. . . . ..... .. . . . . .... .. .. . .. . . . ..... . .. . . . . ...................... .. . . .. ... . . ........... . .. . . . .
lowQualScore : 9 9 7 33333 000000000 777 0000 9 9 9 9 33 33 7 9999 9 222222 66 1 22 2 1 444 1 5 22 1 444 9 9 99 44444444 000 9 9 9999 9 9 9 7 9999 6 3333333 9 3333333 000 99 9 9 333 44444444 99 1111 7777777777777 9 7 3333 9 99 9 99 3333 44 9 9 9 9 7 7 6 22222 22222 444 22 3 3 3 66 6 00 3 66 66 3 3 88 6 3 3 1 1 1 00 9 333333 99 9 44 7 9 99 9 99 999 99 9 00 22 33 7 77 3 7 7 7 7 77 77 7 88888888888888888888 7 7 7 00 999999 7 1111 7 3333 777 11 999 999 9 9 99999 2 1 1 1 0000000000 2 1 3 1 33 22 66 7 0 3 88888888888888 222222 5 66 9999 5 7777 1 444 1 11111111111111 444 88888 1 0 1 22 1 5555 1 22 9 99 88 9 7 777 000 9 000 99 9 77777 9 3 444 9 99 6 9 5555 22 1 1 2222222 1 1 1 3 3 33333 3 3 3 7 000000 3 3 99 888 3 3 33333 66 55 66 3 00 6 00 6 0 55 0 55 0 0 55 0 55 4 66 4 0 000 0 55 55 0 0 0 5555 00000 5555555 00000 0 0 0 00000000 8 55 0000000 0 5555 0 4 4 4 4 0 55555 0 0 44444 0 4 4 9 4 11 4 4 444 9 11 4 222 9 9 4 9 4 4 9 4 66 4 4 4 4 4 4 4 4 0 0 5 55 0 99 99 0 99 7 99 7 7 7 7 7 111 7 33333 9 99 7 7 4 44444 7 66 4 0 7 7 44 7 7 4444 66666666 7 44 7 7 7 33333333 77 9999 0000 44 7 7 6 66 7 7 9999 4 666 7 66666666 8 99 888 99 0 9999 99 2 4 0 88888 22 0 0 1 0 6666 99 99 0 22 5 9 1 11111 7 88 7 7 8 7 3333333333333333333333 88 7 5 22 000 3 5 88888888888 0 55 3 7 7 7
consensus : AGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AC-G--TAT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAAAAGATAA-TG-CAA-AAAAT-G-T-ACCCCAAAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TC--TGCTGA--AA-TA-ATGGT-AAAATT-ATT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-CA-GA-T--T-T--T-A-A--GA-A-TTTTT--TCACAA--ATTA-T--TT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAG----TAA-AAAAC--T-TT----T---GAAGT-T--TATGA-A-AA-A-AAA-TGTTA-A-T-AGG-G---G--C---CACGTT-AT-ACATTTT-TTT-CAATG--AAT--TTC-CC-C-C----T---------GTTT--T-A-TATGCCA--A-N--TAAAAAATAATGTC--T-A-CA---TCA-T----T-----T---T---TTTC-----A-TANT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--AAAA---AAA-TT---G--G-G--C--A-T-GCAACCC---T-TT-AATTT-AATT-TCAT----CA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-TA-AAAATTAAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-A------C-GTA-GTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TAAA--TTCT-GTG--AAA-TTAG--AA-AG--CTCTAT-ANATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAG-A--TAGA-CATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-A----TG-----GTG--G----TT-----TTT-C-CC-TG-N------TCATCA--CC-------ACT-GT----TTCTCGGGT-ATCATCAC-AAAT-G-TG-GTTACGGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTG--T--AGTGT-CC-GTAACC-TG-T-ATTTTGA--TC-A-GTTTG-GAAGC-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GATA-TTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-AAGT-TAA-T-CAATNTACTTT-ATATTTTCACCCCTC-ATTTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCCCAA-ATCGCATCA--TTT-CC-A-TATACAG-CATC-ATTAGCT-GTTAC-----CATCAG--CA-TG-AC-ATA--A--GCAA-TG--CTATT-GACATGGGCATC-AAGA-CA-GATG-GCA--C-ACCATTA--TTTTTTTTCAA-T-NTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTT-ACATT----TA--A-CAAAA-TCTT-GT-ACGAATT-CC-ACTATTTAAG-ATAA-NT-TCC-ATCC-C-TT-ATAA-----A--TAACTTAAAGAATG--TGT-TAGTG--TC-CGT--TAACCAAA--AGTTGAAAAACT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGC-AGA-A--A--A--TTTTC-AAAGCAG-TTTGTTATTTGAAGTTTAATGTAT-TTGTAGG-TGATT-TAT-TAGCCAGAAATTCTTTTAGATTA--C-GGT-GG------------TTTTTT--TTTTACTG-CAAGAAATA-AAAAAA-AATTACTTTAAAAAC--CAA-----ANAATTGTCATAG-AATG-TG-TGGGGAAATTA
Reference ( family-5039 ) : AGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AC-G--TAT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAAAAGATAA-TG-CAA-AAAAT-G-T-ACCCCAAAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TC--TGCTGA--AA-TA-ATGGT-AAAATT-ATT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-CA-GA-T--T-T--T-A-A--GA-A-TTTTT--TCACAA--ATTA-T--TT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAG----TAA-AAAAC--T-TT----T---GAAGT-T--TATGA-A-AA-A-AAA-TGTTA-A-T-AGG-G---G--C---CACGTT-AT-ACATTTT-TTT-CAATG--AAT--TTC-CC-C-C----T---------GTTT--T-A-TATGCCA--A-N--TAAAAAATAATGTC--T-A-CA---TCA-T----T-----T---T---TTTC-----A-TANT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--AAAA---AAA-TT---G--G-G--C--A-T-GCAACCC---T-TT-AATTT-AATT-TCAT----CA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-TA-AAAATTAAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-A------C-GTA-GTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TAAA--TTCT-GTG--AAA-TTAG--AA-AG--CTCTAT-ANATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAG-A--TAGA-CATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-A----TG-----GTG--G----TT-----TTT-C-CC-TG-N------TCATCA--CC-------ACT-GT----TTCTCGGGT-ATCATCAC-AAAT-G-TG-GTTACGGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTG--T--AGTGT-CC-GTAACC-TG-T-ATTTTGA--TC-A-GTTTG-GAAGC-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GATA-TTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-AAGT-TAA-T-CAATNTACTTT-ATATTTTCACCCCTC-ATTTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCCCAA-ATCGCATCA--TTT-CC-A-TATACAG-CATC-ATTAGCT-GTTAC-----CATCAG--CA-TG-AC-ATA--A--GCAA-TG--CTATT-GACATGGGCATC-AAGA-CA-GATG-GCA--C-ACCATTA--TTTTTTTTCAA-T-NTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTT-ACATT----TA--A-CAAAA-TCTT-GT-ACGAATT-CC-ACTATTTAAG-ATAA-NT-TCC-ATCC-C-TT-ATAA-----A--TAACTTAAAGAATG--TGT-TAGTG--TC-CGT--TAACCAAA--AGTTGAAAAACT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGC-AGA-A--A--A--TTTTC-AAAGCAG-TTTGTTATTTGAAGTTTAATGTAT-TTGTAGG-TGATT-TAT-TAGCCAGAAATTCTTTTAGATTA--C-GGT-GG------------TTTTTT--TTTTACTG-CAAGAAATA-AAAAAA-AATTACTTTAAAAAC--CAA-----ANAATTGTCATAG-AATG-TG-TGGGGAAATTA
gi|1 : GGTGCAAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-TTTC-CA--T-A----A--G-CA----T-TG------ATATAATCA-T--G-T-TTTG---AA-AAATAT--TA-TTCT---TCCT-T-AGCATACA--------ATT---TA-AACA----C-ATTCTT-TTCAT-AGGAAT-AC-ACTTGT-------AA-GACA-------TTTAGTC--TG-TG-CCAA---TT--------TT--TG----TG-------------ACT-CT----AAT-ATTA--ATAGATA--ATTAAATCATT--TG-CAAGAAAATAG-T-ACCACCAAAAAGG-CT----TTAGAACTTT---ATAGTGT--TAT-G-CTTGTTGCTAACT-AGATAACTGCCTAACATTTTGTA--TGCTGA--AAATA-G-GGT-AAATTA-ATT-CTCA-TATGTTTC-C-TGCC-GA---TGAACA--T-AAT-CA-GT-T--TAT--T-A-G--GA-A-TTCTTGATCACAA--ATTA-T--TT-GCG-T-GC-TTTAAAA--T-TTA--G-A---------------G-GA-T-CA-GAGGTAATAACAGAATCAT-TT----T---GA-GTAT--CATGA-T-AA-A-A---T-TTATA-T-AGG-G---GTGC---CAC-TT-GG-GCAATGT-TT--CAATG--GAA--TTC-CC-C----------------GTTT--G-A-TG-GCCA--A-AAATAGAAAATAATGTC--A-A-CA---TCA-T----T-----TAT-T---TTTC-----A-TAAT-TTCC-A-TCTAAAAT----AACAGT-AT--GAATGTTC-G-TT--AC--TC-AT-GGG--AAAA---AAAATT---G--G-C--C--A-T-GCA-CCC---T-TT-TATTT-AATT-TCAC----CA--T-G-TTTTAAT----ATT-GC-TA-AAAATTAAG-A-GT-----TTAGC-AAAA-A-AAAAGC-C-GTA-GTGT--C---CGTCA-GCCACT-----GAAA--T-CT-GTGGAAAA-TTAG--AA-AGGCCTTCATTACATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAGGA--CAGA-C-TT-TC---AT-GT--AGATGGCC-TGAGA-T-A----TGTGGTTGTT--G----TT-----TTC-C-TC-TG-CAATGGTCCAT-A--CC-------AC--GT----TTCTCGG-T-ATCATTAC-AAGT-G-TG-GTTACGGAC-AACGCTAC-AAA-T-CCTG--TTTAGTGT-CCCGTAACC-TG-T-ATTTTGACTTC-A-GTTTG-TAAGCCA--GC-TGT-TTA---CAAACA-CA-ACTCGCCT-GATA-TTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTCTT-A-CTAAGT-TAATT-CACTCTAC-TT-ATATTTTCACCCA-C-ATTGTGAT---AT--GCAA--ACTAA-TTGGAAAGCCCAAGATCGCATCA--TTT--C-A-TATGCAG-CATC-AT--GCT-GTTAC-----C-TCAG--CATTG-ACAATA--A--GCTA-TGC-CTATT-G--ATGGGAATT-AAAA-CA-GATG-A-A--C-A-CACTA--TTTTTCTTCAAGT-GTTG-A-GTC-AAC-TG------G-TGTT--CGTT----TA--AGCAAAA-CTTT-GT-A-GGAT---C-ACTATTTAAA-ATAA-AG-TTC-ATCC-C-TTAATAA-----T--AAACTTAAATAATG--TG--TAGTGGTCC-CGTAAAAACCAAA--AGTTG-AAAACTGTAAAACCTC--TTATTTGTTTCTCACAAGAAAG-AGC-AGA-G--A--AATTTTTC-AAAGCAG--TTATTATTT--AATT--ATGTA---TATAGGTTG--T-TAT-TAGCCAGAAATTC-TTAAGATTG--C-GGA-TG------------TTTTTTACTTTCACTG-C-AGAAATA-TAAAAA-GAATACTTTAACGCC--T-------ACCATAGTCATAG-AATC-TT-GGGGGAAATTA
gi|10 : -CA----T-TG------TTATA--CA-T--GAT-TTTC---AA-AAATAT--TG-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------CTT---TA-A-CA----T-ATTT-T-TTCAT-ACGAAT-AC-G--TAT-------AA-AGGA-------CTT---A--TG-TG-CCAA---TT--------TT--TT----CT-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAA--GATAA-TG-CAA-AAAAT-G-T-GCCCCAAAAA-GGTC-----CT-----TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTAA--ACTTAGA-AATTGC--AATATTTT-TC--TACTGA--AA-TA-ATGGT-AAA-TT-ATT-AT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-AT---TGAACAGTC-AAT-GACGA-T--T-TCTT-A-ACAGA-G-TTTTC--TCGCAA--ATTA-TGTTT-G-G-TAGC-TT--TAA--TATTT--CTA---------------G-GA-T-C--GAG----TAA-AA--C--TGTT----T---GAAGT-TGCT-TGA-ATAATA-AAA-T-CTATA-T-AGG-G---G--TGCACACGTT-G--ATATCTT-TTT-AAATG--ACC--CCC-CC-C-CCCGCT---------GTCT--T-T-TATGCCA--G-C--TAAAAA-TAATGTCGCT-T-C----TCA-T----T-----T---TATTTTTC-----A-TAAT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TACTGTTTTG-TT--CCGTTC-ACAGGG--AAAAGGGAAA-TT---G--G-G--CC-A-T-GCAACCCC--T-TT-AATTT-AGTT-TCAT----CA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-CA-AAAATTATG-A-TT-----TTA-C-AAAA-ATA------C-GTA-GTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TGAA--TTCT-ATG--AAA-TTAG--AA-AT--CTCTAT-AGATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTCT
gi|11 : GTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--T-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TG-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AC-A--TAT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAAT--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTT--AAGATAA-AG-CAA-AAAAT-G-T-ACCCCAACAAGGGTTGTTGTTT-----TTT---TTAGCGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AATTGC--AACATTTT-TC--TACTGA--AA-TA-ATGGT--AAATT-ATT-CT-A-CAT-TTTT-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-GA-GA-T--T-T--TAA-A--GA-T-TTTTT--TCACAA--ATTATT--TT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAG----T-A-AAAAC--C-TT----T---GAAG--T--TATGG-G-AA-A-AAA-AG-TA-A-T-AGG-GGT-G--C---CACGTT-AT-ACATTTT-TTT--AATG--GAT--TTT-CCAC-C----T---------GTTT--T---TATGTCA--A-A--T-AAAAATAATGTC--T-A-CA---TCA-TTTA-T-----T---T---TTTC-----A-TATT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-AGG---AAA---AAA-TT---G--G-AT-C--A-T-GCAACCCT--T-TT-AATTT-AATT-TCAT----CA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-CA-AAAATTCAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-ATA------T-GTA-GTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TAAA--TTCT-ATG--AAA-TT
gi|12 : tacgaT-TC--TGCTGA--AA-TA-ATGGT-AAA-TC-ATT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-TT---TGAACA--T-AAC-CA-GA-T--T-T--T-AGA--GA-A-TTTTT---CACAA--ATTA-T--TTTG-G-T-GC-TT--ACA--T-TTT--T-A---------------G-GA-T-C--GAG----TAA-AAAA---T-TT----T---GAAGT-T---ATGATA-AA-A-AAA-TAT-A-A-T-AGG-G---GTGC---TACGTT-AT-GCATTTT-TT--CAATG--ATT--TTTTCC-C-C----T---------GTTT--T---TATGCCA--A-A--TAAAATTTA-TGTC--A-A-CA---TCA-T----T-----TATTT---TTTC-----A-TAAT-T--C-AGTCTAAAAG----TACAGT-AT--GAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--GAAA---AAA-TT---G--G-G--CC-A-T-GCAACCC---T-TTTAATTT-AATT-TCAC----CA--T-G-TTTT-------AAT-GC-TA-AAAATTAAG-AGTTAAAAATTA-A-AAAAAA-A------C-GTA-GTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TAAA--TTCT-GTG--AAA-TTAG--AA-AG--CTTTAT-ACATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAG-A--TAGA-CATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGT-T-A----TG-----GTG--GGGGTTT-----TTT-T-CC-TG-G------TCATTA--CC-------ACT-GT----TTCT
gi|13 : GGTG-AAACA-CAATTAAAG-----GG---------GCAT---T----C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--TA-T--GGT-TTTC---AA-A--------------------T-T-G--ATACA--------ATT---TA-A-CA----C-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AC-A--TTT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAAT--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTT--AAGATAT-TG-CAA-AAAAT-G-T-ACCCC-AAAAAGGTGA-----T-----ATT---TTAGTGT--TAT-G-CA-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AATATTTT-TC--TGCTGA--AA-TA-ATGGT--AAATT-ATT-TT-A-TAT-TTTC-T-TGCCTATATATGAACA--T-GAT-CA-AA-T--T-T--T-AGA--GA-A-TTTT
gi|13 : acg-A-TAT-TTTT-C-TGC-------TGAA-A--T-AAT----GG-T--------------AA-A-TTATT--TTATA----TTT-T--CT-----T-GC-CT--ATA--T-ATGAAC-A---------------T-GA-T-C--------------AAA---T-TT----TAGAGAATT-T--TGTGA---------------TA---T-GGG-T---G--C---CACGTT-AT-ACA-TTT-TTT-CAATT--GGT--CAC-CC-C-C----TCCCCCCCCCGTTT------TATGCCA--A-T--GAA-----AATGTC--T-A-CA---TCA-T----TTA---T---T---TTTCT----C-TACT-T--C-AATCTGAAAT----TACAGT-AT--TGATGTTCTG-TT--AT--CT-TC-AGG--ACAA---AAA-TT---GTTC-G--C--A-G-GTAACgtgatatgggtgccacgttatacattttttcaattggtcaccccctcccccccccgttttatgccaatgaaaatgtctacatcatttatttttctctacttcaatctgaaattacagtattgatgttctgttatcttcaggacaaaaattgttcgcaggtaac
gi|14 : acgggtgaaacacaattaaaggggcattccaatacagcattgttatatatggttttcaaattgatacaatttaacacatttgtttcataggaatacatttaaaggacttctgtgccaatttttgttgatctagcattaatagaatttaagatattgcaaaaaatgtaccccaaaaaggtgatattttagtgttatgcagttgcacttagaaactgcaGGTG-AAACT-CAAT-ATAG-----GA----CAAACGCAT---TAT--C-CAGAT-A-C--AATG-CAAT--TATG------TTATAA-CA-TTGGAT-TTGC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CTTT-A-A--GTACA--------ATTAAAAA-A-CA----TAATTTGT-TTCAT-AGGATC-AC-G--T-T-------AA-AAAATATCAGTCTTTTCT--TG-TG-CCAC---TCAAACCCAATT--GG----TGTTTCTCAGTAAATA-T-CT----AGCAACTAAGATAGA-A--TTTTAAAGATAA-TC-AAA-AAAAT-G-T-ACCCC-AAAAAGGTCA----TT-----TTT---
gi|15 : gGGTG-AAACA---AT-ACAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CCTT-T-A--CTACA--------ATT---TA-A-CA----C-ATTTTT-TTCAT-AGGAAT-AT-A--TTT-------AA-AGAA-------CTT---C--TG-TG-CGAAT--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGT-ATCA--ATAGA-A--ATT--AAGATAT-TG-CAA-AAAAA-G-T-ACCCC-AAAAAGGTGA----TA-----TTT---TTAGTGT--T
gi|16 : gAGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GA----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------AGT---AA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AC-G--TAT-------AA-AAGA-------CTT---C--TG-TG-CCAAT--TT--------TT--TT----TT-------------A-T-CT----AGC-ACTA--ATAGA-A--TTT--AAGATAA-TG-CAA-AAAAT-G-T-
gi|17 : cGGTG-AAACA-CAATCATAAAAT--GGTTGTC----GCAT---G-TG-C-CA-ATTA-C--A--GTCAATTTT-CG------TTATA--C--T--G----TTC---AAGAAATCT--T--TTTT---CTTT-T-A--ATGCA--------ATT---TA-C-TAT---T-ATTCAT-TTCAT-GAGGATAAC-C--TAT--------A-ATGA-------CTT---C--TG-TG-CCAAATTTT--------TT--GT----TG-------------A-TGCT----AG
gi|18 : T--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AAATGC--AACATATT-TC--TGCTGA--AA-TA-ATGGT-AAA-TT-GTT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGTC-AT---TGAACA--C-AAT-CA-GA-T--A-T--T-AGA--GA-A--TTTT--TCACCA--ATGA-T--TT-G-GTT-GC-TA--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAG----T-A-AAAAC--T-TT----T---
gi|19 : TT-T-A--ATACAGGGTTCTTACC---TA-A-TAATATT-ATTTGT-TTGAT-AGGAAT-AC-A--TATATAAATAAA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAAC--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----t
gi|2 : atacaaaaggtttcaacacaatatctttaagaacAGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG---------GCAT---T-T--C-CA-AT-AGC--A--G-CA----T-TG------TTATA--CACT--GGA-TTTC---AA-AATTA----A-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-AA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AT-G--TAA-------TA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--AT-GA-A--TTTAAAAGATAA-TGCCAA-AAAAT-G-T-ACCCCAAAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TAT-GAGT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TC--TTCTGA--GA-TA-ATGGTAAAAATT-ATT-C--A-TAT-CTTA-C-TGCC-AT---TGAA-A--T-AAT-CA-GA-T--T-T--T-A-A--GA-ATTTTTT--TCACAA--ATTA-T--TT-G-G-T-GC--T--AAA--T-GTT--T-A---------------G-GA-T-C--GAGT---TAA-AAAAC--T-TTA---T---GAAGT-T--TATGA-A-AA-A-GAA-TGTTA-A-T-AGG-G---G--C---CATGTT-AT-ACATTTT-TTT-CAATG--AAT--TTC-CC-C-C----T---------GTTT--T-AGTAT-CCA--A-T--TAAAAAATAATGTT--T-A-CA---TCA-T----T-----T---T---TTTC-----ACTATT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--AAAA---AAA-TT---G--G-G--C--A-T-GCATTCC---T-TT-AATTT-AA-T-TCAT----CA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-CA-AAAATTAAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-A------C-GTA-GTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TAAA--TTCC-ATG--AAA-TTAG--AA-AG--CTCTAC-AGATA--T-CA--TT-ATTTTA--A-T--TTTTAG-A--TAGA-CATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-A----TG-----GTT--G----TT-----TTT-C-CC-TG-T------TCTTCA--CC-------ACT-GT----TTCTC-AGT-ATCATCAC-AAAT-G-TG-GTTACGGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTGTTT--AG-GT-CC-GGAACC-TG-T-AATTTGA--TC-A-GTTTGAGAAGC-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GATT-ATTTT-ACAAA-GGTCA-GA-GTTT-GTTC-T-A-C-AAGT-TAA-T-CAATATACTTT-ATATTTTCACTTCTC-A-TTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCTCAA-ATCACATCAGTTTT-CCTA-TATACAG-CATCTATTAGCT-GTTAC-----GATCAGTTCA-TG-AC-ATA--A--GCAA-TG--CTATTAGACATGGGCATC-AAGATCATGATGCGCA--TAACCATTAGTTTCTTTTTCAA-TCTTTGAA-GTC-AACGTGCCTATCG-TGTTGGCATT----GA--A-CAAAA-TCTA-TT-ACGAATT--C-ACTATTTAAACATAA-TTATCC-ATCC-C-TT-ATAA-----A--TAACTTAAA-ATTGTCTGT-TAG-G--TCACGT--TAACCAAA--AGTTGAAAAACT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAG--TGC-AG-----A--A--TTTTC-AAATCAG-TTTGTTATT--AATTTTAATGTAT-TTGTAGG-TGATTATAT-TAGCCA-AAATTCTTTTAGATTA--C-GGT-GG------------TTTTTT--TTTTACTG-CAAGAAATA-AAAAAATATTTACTTGAAAAAT--CAA-----AGAATTGTCATAGAAATG-TG-TGGGAAAATTA
gi|20 : -GCAACCCC--T-TT-AATTT-ATTT-TCAT----CA--T-G-TTCT--T----AAT-GC-TA-AAAATTAAG-G-TT-----TCA-C-AAAA-A-ACAAAACC-ATA-GTTT--C---CGT-T-ACCACT-----TTAA--TTCT-ATG--AAA-TTAG--AA-AG--CTCTAT-A
gi|21 : A-----A--TAACTTAAAGAATG--TGT--AGTG--TC-CGT---AGCCAAA--AGTTGAAAA-CT-TAAAAC--T--TT---T-TTTC-C-CAAGAAAGTTGC-AGAGA--A--A--TTTTT-AAAGCAG-TTTATTATTT-AAGTTTAATGTAT-
gi|22 : -C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-CA-GA-T--T-T--T-G-A--GG-A-ATTTT--TCACAAT-TTTG-T--TT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-CCT------------------------------GAA----TAA-AAA----T-TT----T---GAAG--T--TATGA-A-AA-A-AAA-
gi|23 : ta--TT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAG----T-A-AAACC--T-TT----T---GAAG--T--TATGA-A-AA-A-AAA-TG-TA-A-C-CGG-GGA-G--C---CAGGTT-AT-ACATTTT-TTT-CAATG--Aaatgtaaa
gi|24 : -A-CA---TCA-T----T-----TATTT---TTTC-----A-TACT-T--T-AGTCTAAAAT----TACACT-AC--TAATGTTCTG-TA--AC--TC-AC-AGG---AAA---ATA-TT---G--G-GC-C--A-T-GCAACCCT--T-TT-AATTT-AATT-ctgttt
gi|25 : TCTG-TT--AC--TC-AC-AGGAAAAAA---AAA-TT---G--G-GC-C--A-T-GCAACCC---T-TT---TTT-TATT-TT-T----TA--T-T-TTTT--T----GA-----CA-AAAAT
gi|26 : ----AAC-ATTA--ATAGA-A--TTTAA--GATAA-TG-CAA-AACAT-A-T-ACCCCCAAAAA-ATCA----TT-----TT----------T--TAA-G-CT-GTTGC--ACTTgtagccgaatttaa
gi|27 : GGTG-AAACA-CAAT-GTAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--
gi|28 : tcgGGCG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-
gi|29 : tatatcgGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---
gi|3 : catattacgGGTG-AA-CA-AAAT-ATAG-----GG----C-----CAT---TCT--C-CA-AT-A-C--A--GTCA----T-TG------TTATAT-CA-T--GGA-TTTC---AA-AACTAT--TA-TTTT---TCTT-T-A--ATACA--------ATT---TACA-AA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AT-G--TAT-------AA-AGGA-------ATT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--ATGGTTTG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAA--GATAA-TG-CAA-AAA-T-G-T-ACCC--AAAAAGGTCA----TT-----TTT---T-AGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTGGA---CTGC--AACATTTT-TC--TACTGA--AG-TA-ATGGT-AAATTT-ATT-CT-A-TAT-CTTAAC-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT--A-GA-T--T-T--T-A-A--AG-A-ATTTT--TCACAATTATTT-T--TT-G-G-T-GC-TA--AAA--T-TTT--T-A---------------G-GA-T-C--GGA----TAA-AAA-C--T-TT----T---GAAGT-T--AATGA-A-AA-A-AAAATGT-A-A-T-AGG-G---G--TG--CATGTTTAT-ACATTTT-TTTTCAATG--AAT--TTC-CCAC-C----T---------GTTTGTT-A--ATTTCA--A-T--TAAAAAATA-TGTT--T-A-CAATATTA-T----T-----T---T---TTTC-----A-TA-T-T--C-AGTCTAAA-T----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGA--AAAA---AAA-TT---G--G-GGCC--AAT-GCAACCC---TATT-AATTTTAATT-TCCT----CA--T-G-TTTT-------AAT-GC-CA-AAAATTAAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-AA-----C-GTAAGTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TAAAATTCCT-G-----AA-TTAG--AA-AG--CTCTAC-AGATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAG-A--TAGA-CATT-T----AT-GT--AGATG--C-TGCGA-T-A----TG-----GTG--T----TT-----TTT-C-CCGTG-A------TCATCAAACC-------ACTCGT----TTCTCCGGTTATCATCAC-AAAT-G-TG-GTTACGGAC------TAC-AA--T-CTGG--T--AGTGT-CC-GTAACC-TG-T-ATTTTGA---A-A-GTTTTTGAAGCCATCGCCTGT-TTT---AAAACA-CT-A-T-GCCT-GATA-TTTTTTACAAAAGGTCA--AGGTTT-GTTC-T-AAC-AAGT-TAA-TTCAATATACTTT-AT-TTTTTACCCTGC-ATTTTGAT--GAT--G--G--ACTAATTTGGAAAGCTCAA-ATCACATCA--TTTTCC-A-TATACAG-CATC-AT-AG-T-GTTAA-----CATCAG--TA-TG-AC-ATA--T--CAAA-TG--CTATT-GACATGGGCATCCAAGA-AA-GATG-GCA--T-AC----A--TATTTTTTCAA-T-TTTGAA-GTC-AAC-TG--------TGTT-GCATT----TA--AACAAAAATCTT-GT-ACAAATT-CC-ACTATTTAAC-ATAA-TT-TCCCATCC----T-ATAA-----A--CAACTTAAA--ATG--TGT--AGTG--TCGCGT---AACCAAA--CGTTGAAAA-CT-CAA--C--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAA-GTTGC-AGA-A--A--A--TTTTC-AAATCAGTTTTGCTA-TTGAAGTTTAATGTACATGGTAGG-TGA-T-TAT-TAGCCAGAAATTCTTTTAGATTA--TGGGT-GT------------TTTTTT--TTTTACTG-CAAGAAAT--AAGAAA-TATTA--TTAAAAAT--CAA-----AGAA-TGCAATAG-AATG-TG-TGGACAAATT
gi|30 : tacg-GTTACGGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTG--T--AGTGT-
gi|4 : ----AGC-ATCC--ATAGA-ACATTTAAA-GATAACTG-CAA-AAAAT-G-TGACCCCAAAAA-TGTCA----TT-----TCTGTGTTAGTGTGTTAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TCTATACTGA--AC-TA-AT-GT-AGACTT-ATT-CT-AGTAT-TTAA-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AATCCA-GA-T--T-T--TCA-A--GC-A--TTTT--TCACAA--ATAT-T--TT-G-G-T-GC-TT--AAAATC-TTT--C-A---------------T-GACT-C--GAG----TAC-AAAAC--G-TT----T---GAA---T--TATGA-A-AA-A-AAA-TG-TA-A-A-AGG-G---GTAC---AATGTT-AT-ATCTTTTCTTC-CAATG--AATTGTTC-TCGC-C----TG--------GTTT--TGG-TATGCTA--AGA--TAAAAAATAATGTC--T-A-CA---TCAGT----TTATAGT---T---TTTC-----A-TACTAT--CGAGCTTAAAATGAGCTA-GGTAAT--TGATCTCCTG-TT--AC--TC-AC-AG----AAA---AAA-TT---G--G-C--CATA-T-GC-ACCCTTAT-TT-AATTTCAATT-TCAT----CA--T-G-TTTT--CCCTGAAT-GC-TATAAAAT--AG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-ACG----C-GTA-GTGT--CACGCGTCA-ACCAATTCAAATAAA--TTCT-AT----AA-TCAG--AACGG--CTCTAT-AGATA--T-CA---C-A--TTA--A-TGATTCTAG-ATCTAGATCATA-GCATAAT-GTCGAGAAT--C-TGAGA-A-ATGGGTG-----GTA--G----TT-----TTTGC-TC-TGTA------TCA-CA--CCCCAACCTACT-GT----TTCTCAGGT-ATCATCAC-AAACGG-TATGTT--GGACAA---CT-C-AAAAT-CCTGC-C--AGTGT-CC-GTAACCTTG-T-ATTTTGT--TCAA-GTT---GAAGC-A--GCCTGT-TTTTTAAAAACAGCTAAAT-GC-T-GA-A-GTTTT-ACAAA-GGTCA-G-GGTTT-ATTC-T-A-C--AGT-TAA-T---ATATACTTTAATATTTTCACCTCTCAATTTTGAT--GAT--GC-AATACTAATTAGAACAGCCCAA-ATCGCATCA--TAT-CC-ACTATACAGCCATC-GATAGCT-GTTAC-----CATCAG--CA-TGAAT-ATA--ACGGCAA-TG--C------ATATGGGCATT-AAGA--A-GATG-GCA--C-ACCATGA--ATTTTTTTCAC-TAATTGAAGGTCAAAC-TG------GCTGTT-ACATTA---TATTT-TAAAA-TCTGAGT-ATGATTTACCAACTAATTAAG-ATAA-TT-TCC-ATCCGC-TT-ATAA-----AACCAAGTTAAAAAATG--TG--TAGTG--TC-CCG--TAACCAAAGCAGTT-ACAAACT-TAAAAC--TGATTA-TT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGCAAGA-AATA--A--TGTTC-AAAGCTG--TTGTTA-TTGAAGTTT-GTGTAT-GT-TAGG-TGA-T-TATATAGCCATAAATCTCTTTAGATTATGT-GGTGGG------------TTTCTTG-TTTTATTGTCTAAATATAGAAAAAA-AATTACTT--AACACTACAA-----ATTACTATCAT-G-AATGTTGTTGGGGGAATTA
gi|5 : ctaGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--CTCA-A--A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTCCAAAA-AAATATGCTA-TTTTTCCCTTCAT-A--CTACA--------ATT---TA-A-CA----C-ATTTGTCTTCAT-AGGAAT-AC-T--T-T-------AATAGGA-------CTT---C--TG-TGGCCAT---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGT-ATTA--ATAGA-A--ATTA---GATT--TG-CAA-AAATT-G-T-ACCCCAAAAA-GGTGA----TA-----TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TC--TGCTGA--AA-TATATGGG-TAAATT-A-T-CT-A-TA--TTTC-C-TGCA-TT---TGAACA--TAAAT-CA-GA-T--T-T--T-T-A--GAGA-ATTTT--TCACAA--ATTA-T--TT-G-G-T-GC-TT--ATT--T-TTT--TAA---------------G-GA-T-CT-GAG----T-A-AAAAC--T-TT----T---GAATT-C--TATGA-T-AA-A-AAA-TA-TA-A-T-AGG-GGT-G--C---CACGTT-AT-GCA-TTT-TTT-CAATGACAAT--TTC-CC-C-C----T---------GTTT--T---TATGGCAAGA-T--TAAATA--AATGTCA-A-A-CA---TCA-TTTAAT-----T---T---TTTC-----A-TAAT-T--C-AGT-TAAAAT----TACAGT-AT--AAGT-TTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--AAAA---AAA-TTTGCG--G-C--C--A-T-GCAACCC---T-TT-TAATT-AATT-TCATCCACCA--TGG-GTTT--T----AAT-GC-TA-AAA--TAAG-A-TT-----TAA-CAAAAA-A-A------C-GTA-GTGTTCC---CGTAA-ACCACT-----T-AA--TTCTCGTG--AAA-TTAG--AA-AG--CTTTAT-AT-TAATT-CA--TT-A-TTTG--ATT--TTTTAG-A--TAGA-CATTATC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-TAA----TG-----GTGTCG----TT-----TT-------CG-G------T-AT-A--CC-------ACT-GTTTTCTTCTC-GGT-ATCATTAC-AAAT-GCTG-GTTACGGACAA---CTAC-AAAAT-CCTG-----AGTGT-CC-GTAACC-TGTT-ATTTTT---TC-A-GTTTG-AAGCC-A--GTTTGT-TTT---AAACAA-CTAAAT-GC-TCGATA-TTTTTGACAAA-GGTCAGGAGGTTTGGTTC-TAA-C-A--T-TAA-A-TACTCTACTTT-ATGTTTCCACCCACA-ATTGTGATCGAAT--GC-A--CTTATTTCGGAAA--CCAA-AT-GTATCA--CTT-CC-A-TATGCAG-CATC-ATT-GCTGGTTAC-----CCTCAG--CA-TG-ACGATC--A--GCAATTGGCCTATTGGAAATGGGAATT-AAAA-CA-GATG-ACA--C-AC---TA--TATTTTTTCAA-T-GTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTTAACATTTCAATA--A-CAAAA--CTT-GTCAAGGATT--C-ACCATTTAAG-ATAAGGT-TCCAATCC-CTTT-ATAACTACTA--TAACT------ATA--TGTGTAGTG---C-CGT--AAAC---A--AGTTGAAAA--T-TAAAAA--T--TTATTT-TTTCCC-C-AGAAAGTTGC-AGA-G--AATA--TTTTCAAAAGCAG-TTTATTATTT-AAGTTTAATGTAT-
gi|6 : cg-T--TT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-AGGATCGAGTTTTTCAG-GA-T-C--GAG----TAT-AAA-C--T-TT----T---GAAGT-T---GTAA-A-AA-ATAAA-TGT-G-A-T-AGG-A---G--TG--CACGTA-AT-ACATTTT-TT--CATTG--AAT--TTT-CC-CTC----T---------ATTT--T-A-TA--CCA--A-A--TAAAAA-TAATGTC--T-A-CA---TCA-T----T-----T---C---TTTCTTTTTA-TACT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--AAAA---AA--TT---G--G-G--CC-A-T-GCAACCT---T-TT-AATTT-AATT-TCAT----CA--T-G-TTTT-------AAT-GCGTA-AAAATTA-G-A-TT-----TTA---AAAA-A-A------CTGTA-GTGTT-C---CGT-ATACTACT-----TAAG--ATCT-ATG--AAA-TTAG--GA-AG--CTTTAT-AGATA--T-AA--TT-A-TTTA--A-T--TTCTAG-A--TAGA-CATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-A----TG-----GTG--GGTT-TT-----TTT-C-CC-TG-G------TCATTA--CC-------ACT-GT----TTCTCAGGT-ATCATTAC-AAAC-G-TA-GTTACAGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTG--T--TGTGT-CC-GTAACC-TG-T-ATTTTGA--TC-A-GTTTG--AAGC-A--GTCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GATA-TTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-GAGT-TAT-T-CAATCTACTTT-AT-TTTTCACCC-TC-ATTTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCTTAA-ATTACATCA--TTT-TC-A-TATACAG-CATT-ATT-GCT-GTTACATGTACCTCAG--CA-TG-AC-ATACAA--GCTA-TG--CTATT-GAAATGGGAATT-AAAA-CA-GATG-ACA--C-ACCATT---TTTTTTTTCAA-T-GTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTT-ACATT----TA--A-CAAAA-CCTT-GT-AGGAATT-CC-ACTATTTAAG-ATAA-GT-TCC-ATCC-C-TA-ATAA-----A--TAACTTAAAGAATG--TG--TAGTG--TC-CG---TAACCAAA--AGTTG-AAAACT-TAAAGC---------TT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGC-AGA-A--A--AT-TTTTC-ACAGCAC-TTTGTTA-TTGAATTTCAATGTA---TACAGG-CG-TT-TAT-TAGCCA--------TTTA----------------------------TTTTA--TTTTACTG-CAAGAAATT-AAAAAA-AATTACTTTAAAAA----AACACCTACAAATACC-TAG-AATG-TA-TAGGGAAA
gi|7 : t-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-CC-AT-G-CAC---T-TG------TTATA--CA-T--GGAATTTC---AA-AA-TAT--TA-TTTT---CTTT-TTA--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGA-T-ACCG--TAT-------AA-AGGA-------CTT---CCCTGATG-CCAA---TT--------GT--GT----TG-------------A-TTCT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAA--GATAA-TG-CAA-AAAAT-GCT-ACCC--AAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TATTG-CT-GTT-C--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TC--TACTGACAAG-TA-ATGGT-TAAATTTATT-CT-A-TAT-CTTA-C-TGCC-A----TGAACA--T-AAT-CATGATT--T-T--T-A-A--GA-A--TTTT--TCAC-A--ATTATT--TT-G-A-T-GC-TT--AAA--T-TTT----A---------------GCGA-TCC--GAG----T-A-AACAC--T-TT----T---GAAGT-T--TATGA-A-AA-A-AAG----TA-A-TCAGG-GGATG--C---CATGTT-AT-ACA-TTT-TTT-CAATG--AAT--TTCTCC-C-C----T---------GTTT--T-A-T-T-CCA--A-T--TTAAAAATAATGTT--TCATCA---TTA-T----T-----T---T---TTTC-----A-TATT-T--C-AG-CTAAAA-----TACAGT-AT--GAAT-TTCTGTTT--ACT-TC-ACGGGG--AAAA---AAA-TT---G--GCGT-C--A-TAGCAACCC---T-TT-AATTT-CATT-TCAT----TATGT-G-TTTT--T----AAT-GA-TA-AAAATTAAGAA-TT-----TTA-C-AAAA-A-ACAAAG-C-GTA-GTGT--C---CGTAA-ACCACT-----TAAA--TTCT--TG--AAA-TTAGAAAA-AG--CTCTAC-ATATA--TGCAACTTAA-TTTATTA-T--TTTTAG-AT-TAGA-CATT-TC---ATCGT--AGATG--CTTGAGATT-A----T------GTG--T----TT-----TTT-CTCC-TG-A------TCATCA--CC-------ACT-GT----TTCTCAGGT-ATCATTCC-AAAT-G--G-GTTACGGAC-A---CTACAAAAATACCTG--T--AGTGT-CC-GTAA-C-TG-TAATTTTGA--TC-ATTTTTG-AAAGC-A--GCCTGT-TTTA--AAAACACCT-AAT-GC-T-GATATTTTTT-ACAAA-GGTCA----GTTT-GTTC-T-A-C-AATT-TAA-T-CAATATACTTT-ATTTTTTCACCCTTC-ATTTTGAT--GATTGGC-A--Aa
gi|8 : aGGTG-AAACAACAA--ATAGATAGGGG----C----GCATATTT-T--C-CA-AT-A-CCAA--G-CACAT-T-TGGTAAAATTACA--CA-T--GGT-TT-----GA-AAATAT--TAATTTT---CCTT-T-A--CTACA--------ATT---TA-A--G----C-ATTTGT-TTCATGAGGAATTACAG--TTT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TTTTGT----TG-------------A-T-ATCATAAGT-ATTA--ATAGA-A--AT---AAGATAT-TG-CAA-AAAAT-G-TTACCCCAAAAAGGGTT-----TTAGTA-TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AA-TGC--AACATTTT-TC--TGCTGA--AA-TA-ATGGT-AA--TT-ATTTCT-A-TAT-TTTC-CGTGCTTAT---TGAACA--T-AATTCA-GA-TAGT-T--T-A-G--AG-A-CTTTT--TCA-AA--ATTA-T--TTTG-G-T-GCATT--AAA--T-TTT--------------------A-GA-T-CCTGAG----TAA-AAAAC--T-TTGTGTT---GAAGT-T--TATGA-T-AA-A-AAA-TATTA-AAG-AGGTG---G--C---CACGTTTATTGCATTTT-TT--CA--G--AAT--TCC-CC-C-C--------------GTTT--T-T-TGTGCCA--A-A--TAAAAA-TAAT--C--A-A-CA---TCA-T----T-----TAT-T---TTTC-----A-TAAT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-ATAGTAATGTT-TG-TTTCAC--TCGAT-GGG--AAAA---AAA-TT---G--G-G--CC-A-TCGAAACCC---T-TT-TATTTTAATTCTCAC----CA--T-GGTTTT--T----AATTGC-TA-AA--TTAAG---CT-----TTA-C-AAAA-A-AAAC---C-GTA-GTGT--C---CGT-A-AC-ACT-----TGAA--TTCT-GTG--AAAGTTAG--AA-AG--CTGTAT-ACATA--T-CA--TT-A-TTTT--A-T--TTT-AG-A--TAGA-CATT------AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-A----TG-----GTC--G----TTGTTTTTTT-C-CC-TG-CATGG--TCATTA--CC-------ACT-GT----TTCTCGGGT-ATCAATACAAAAT-G-TG-GTTAC-GAC-A---CTAC-AAAAA-TCTG--T--AGTGTCCC-GT-ACC-TGAT-ATTTTGA--TC-A-GTTT--GAAGC-A--GCTTGTCTTT---AAAAAC-CT-AAT-GC-T-GATA-TTTTT-ACAAA-GG--A-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-AAGTCTAA-T-CAa
gi|9 : ATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-A----AG-----GTG--T----TT-----TTT-C-CC-TG-A------TCACCA--CC-------ACT-GT----TTCTCAGGT-ATCATCAC-ATAT-G-TG-GTTACGGAC-T---CTAC-AAAAT-CCTG--T--AGTGT-CC-GTAATT-TG-T-ATTTTGA--TC-A-GTTT--GAAGC-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GATA-TTTTT-ACAAA-AGTCA-GAGGTTT-GTTC-C-A-C-AAGT-TAA-T-CAATTTACTTT-AT-TTTTCA-CCCTC-ATTTTCAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCCCAA-ATCGCATCA--TTT-CC-A-TATACAG-CATC-A-TAGCT-G-TAT-----CATCAG--TA-TG-AC-ATA--A--GCAA-TG--CTATT-GACATGGACATC-AAGA-CA-GATT-ACATGT-ACCA-TA---TTTTTTTCAA-T-TTTGAA-GT----C-TG------G-TGTT-ACATT----TA--A-CAAAA-GCTT-GT-ACGAATT-CC-ACTATTTAAG-ATAA-GT-TCC-ATCC-C-TT-ATTT-----A--TAACTTAAAGAATA--TG--TAGTG--TC-CG---TAACCAAA--AGTTGAAAACTT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGC-AGA-A--A--A--ATTTC-AAAGCAG-TTAGTTA-TTGAAGTTTAAAGTAT-T--TAGG-TG-TT-TAT-TAGCCAGAAATTCTTTAAGATTA--T-GG--GGTGCTTTATTTTTTTTTTT--TTTCACTG-CAAGAAATA-AAAAAA-A---ACTT--AACAC--CTA-----CAAAT--ACATAG-AATG-TG-TGGGGAAAATActt
Alignments
lowQualScore : 11111 1111 11111111 111 111 11111111 1111111111111 2222 11111 1 11 22222222222222222222 11111 2222222222 11 1 22222222222222 111111 1 1111 22222222222222 11111 22222 111 1111111 444444 1 11 11111 1111111 11111 22222222 1111111 1 11111 11111 111 111 1 111 11111 1 11111 11 1 1111 11111111 11 11111111 11 1111 1111 11 11 1 11111111 1 222 1 2222 1 11111 11 1 1 22222 22 1 5555555555555555555555 11 11 1 22222222222
lowQualScore : 2 2 5 11111 888888888 444 7777 2 2 2 2 77 77 5 7777 2 888888 99 3 44 0 3 555 3 0 44 3 555 2 2 33 00000000 555 2 2 8888 2 2 2 5 8888 4 9999999 2 9999999 000 33 2 2 999 00000000 33 6666 5555555555555 2 5 5555 2 33 2 33 3333 66 2 2 2 2 5 9 4 88888 44444 555 44 3 3 3 44 3 55 3 44 44 3 3 66 1 3 3 3 3 3 33 2 666666 33 2 66 5 2 33 2 33 999 33 2 11 44 77 5 33 5 2 2 2 2 33 33 2 55555555555555555555 2 2 2 99 999999 2 7777 2 8888 444 66 444 666 2 2 99999 6 3 3 3 6666666666 6 3 4 3 00 44 44 6 0 3 00000000000000 999999 2 44 8888 1 0000 3 555 3 55555555555555 555 00000 3 4 3 44 3 6666 3 44 2 33 66 2 5 444 555 2 555 33 2 00000 2 5 666 2 22 8 2 6666 44 3 3 4444444 3 3 3 3 3 88888 3 3 3 6 000000 3 3 77 555 3 3 88888 44 55 44 3 55 3 55 3 1 55 4 55 4 4 55 4 55 4 00 4 4 777 4 55 55 4 4 4 8888 00000 8888888 00000 4 4 4 55555555 4 55 3333333 4 8888 1 4 4 4 4 4 33333 4 4 22222 4 4 4 8 4 66 4 4 777 8 66 4 222 8 8 4 8 4 4 8 4 55 4 4 4 4 4 4 4 4 1 5 4 88 5 66 66 5 66 5 77 5 5 5 5 5 555 5 44444 4 77 5 5 1 00000 5 33 1 3 0 5 66 5 5 0000 44444444 5 22 5 5 5 99999999 33 7777 4444 11 5 5 6 33 5 5 6666 1 888 5 33333333 0 66 333 66 0 2222 66 3 2 5 22222 33 5 5 0 5 9999 66 11 5 88 5 1 0 44444 6 66 6 6 0 5 1111111111111111111111 55 6 3 00 888 1 1 44444444444 1 99 0 6 6 6
lowQualScore : . . . ..... ......... ... .... . . . . .. .. . .... . ...... .. . .. . . ... . . .. . ... . . .. ........ ... . . .... . . . . .... . ....... . ....... ... .. . . ... ........ .. .... ............. . . .... . .. . .. .... .. . . . . . . . ..... ..... ... .. . . . .. . .. . .. .. . . .. . . . . . . .. . ...... .. . .. . . .. . .. ... .. . .. .. .. . .. . . . . . .. .. . .................... . . . .. ...... . .... . .... ... .. ... ... . . ..... . . . . .......... . . . . .. .. .. . . . .............. ...... . .. .... . .... . ... . .............. ... ..... . . . .. . .... . .. . .. .. . . ... ... . ... .. . ..... . . ... . .. . . .... .. . . ....... . . . . . ..... . . . . ...... . . .. ... . . ..... .. .. .. . .. . .. . . .. . .. . . .. . .. . .. . . ... . .. .. . . . .... ..... ....... ..... . . . ........ . .. ....... . .... . . . . . . ..... . . ..... . . . . . .. . . ... . .. . ... . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . .. . .. .. . .. . .. . . . . . ... . ..... . .. . . . ..... . .. . . . . .. . . .... ........ . .. . . . ........ .. .... .... .. . . . .. . . .... . ... . ........ . .. ... .. . .... .. . . . ..... .. . . . . .... .. .. . .. . . . ..... . .. . . . . ...................... .. . . .. ... . . ........... . .. . . . .
lowQualScore : 9 9 7 33333 000000000 777 0000 9 9 9 9 33 33 7 9999 9 222222 66 1 22 2 1 444 1 5 22 1 444 9 9 99 44444444 000 9 9 9999 9 9 9 7 9999 6 3333333 9 3333333 000 99 9 9 333 44444444 99 1111 7777777777777 9 7 3333 9 99 9 99 3333 44 9 9 9 9 7 7 6 22222 22222 444 22 3 3 3 66 6 00 3 66 66 3 3 88 6 3 3 1 1 1 00 9 333333 99 9 44 7 9 99 9 99 999 99 9 00 22 33 7 77 3 7 7 7 7 77 77 7 88888888888888888888 7 7 7 00 999999 7 1111 7 3333 777 11 999 999 9 9 99999 2 1 1 1 0000000000 2 1 3 1 33 22 66 7 0 3 88888888888888 222222 5 66 9999 5 7777 1 444 1 11111111111111 444 88888 1 0 1 22 1 5555 1 22 9 99 88 9 7 777 000 9 000 99 9 77777 9 3 444 9 99 6 9 5555 22 1 1 2222222 1 1 1 3 3 33333 3 3 3 7 000000 3 3 99 888 3 3 33333 66 55 66 3 00 6 00 6 0 55 0 55 0 0 55 0 55 4 66 4 0 000 0 55 55 0 0 0 5555 00000 5555555 00000 0 0 0 00000000 8 55 0000000 0 5555 0 4 4 4 4 0 55555 0 0 44444 0 4 4 9 4 11 4 4 444 9 11 4 222 9 9 4 9 4 4 9 4 66 4 4 4 4 4 4 4 4 0 0 5 55 0 99 99 0 99 7 99 7 7 7 7 7 111 7 33333 9 99 7 7 4 44444 7 66 4 0 7 7 44 7 7 4444 66666666 7 44 7 7 7 33333333 77 9999 0000 44 7 7 6 66 7 7 9999 4 666 7 66666666 8 99 888 99 0 9999 99 2 4 0 88888 22 0 0 1 0 6666 99 99 0 22 5 9 1 11111 7 88 7 7 8 7 3333333333333333333333 88 7 5 22 000 3 5 88888888888 0 55 3 7 7 7
consensus : AGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AC-G--TAT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAAAAGATAA-TG-CAA-AAAAT-G-T-ACCCCAAAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TC--TGCTGA--AA-TA-ATGGT-AAAATT-ATT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-CA-GA-T--T-T--T-A-A--GA-A-TTTTT--TCACAA--ATTA-T--TT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAG----TAA-AAAAC--T-TT----T---GAAGT-T--TATGA-A-AA-A-AAA-TGTTA-A-T-AGG-G---G--C---CACGTT-AT-ACATTTT-TTT-CAATG--AAT--TTC-CC-C-C----T---------GTTT--T-A-TATGCCA--A-N--TAAAAAATAATGTC--T-A-CA---TCA-T----T-----T---T---TTTC-----A-TANT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--AAAA---AAA-TT---G--G-G--C--A-T-GCAACCC---T-TT-AATTT-AATT-TCAT----CA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-TA-AAAATTAAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-A------C-GTA-GTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TAAA--TTCT-GTG--AAA-TTAG--AA-AG--CTCTAT-ANATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAG-A--TAGA-CATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-A----TG-----GTG--G----TT-----TTT-C-CC-TG-N------TCATCA--CC-------ACT-GT----TTCTCGGGT-ATCATCAC-AAAT-G-TG-GTTACGGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTG--T--AGTGT-CC-GTAACC-TG-T-ATTTTGA--TC-A-GTTTG-GAAGC-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GATA-TTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-AAGT-TAA-T-CAATNTACTTT-ATATTTTCACCCCTC-ATTTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCCCAA-ATCGCATCA--TTT-CC-A-TATACAG-CATC-ATTAGCT-GTTAC-----CATCAG--CA-TG-AC-ATA--A--GCAA-TG--CTATT-GACATGGGCATC-AAGA-CA-GATG-GCA--C-ACCATTA--TTTTTTTTCAA-T-NTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTT-ACATT----TA--A-CAAAA-TCTT-GT-ACGAATT-CC-ACTATTTAAG-ATAA-NT-TCC-ATCC-C-TT-ATAA-----A--TAACTTAAAGAATG--TGT-TAGTG--TC-CGT--TAACCAAA--AGTTGAAAAACT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGC-AGA-A--A--A--TTTTC-AAAGCAG-TTTGTTATTTGAAGTTTAATGTAT-TTGTAGG-TGATT-TAT-TAGCCAGAAATTCTTTTAGATTA--C-GGT-GG------------TTTTTT--TTTTACTG-CAAGAAATA-AAAAAA-AATTACTTTAAAAAC--CAA-----ANAATTGTCATAG-AATG-TG-TGGGGAAATTA
Reference ( family-5039 ) : AGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AC-G--TAT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAAAAGATAA-TG-CAA-AAAAT-G-T-ACCCCAAAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TC--TGCTGA--AA-TA-ATGGT-AAAATT-ATT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-CA-GA-T--T-T--T-A-A--GA-A-TTTTT--TCACAA--ATTA-T--TT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAG----TAA-AAAAC--T-TT----T---GAAGT-T--TATGA-A-AA-A-AAA-TGTTA-A-T-AGG-G---G--C---CACGTT-AT-ACATTTT-TTT-CAATG--AAT--TTC-CC-C-C----T---------GTTT--T-A-TATGCCA--A-N--TAAAAAATAATGTC--T-A-CA---TCA-T----T-----T---T---TTTC-----A-TANT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--AAAA---AAA-TT---G--G-G--C--A-T-GCAACCC---T-TT-AATTT-AATT-TCAT----CA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-TA-AAAATTAAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-A------C-GTA-GTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TAAA--TTCT-GTG--AAA-TTAG--AA-AG--CTCTAT-ANATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAG-A--TAGA-CATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-A----TG-----GTG--G----TT-----TTT-C-CC-TG-N------TCATCA--CC-------ACT-GT----TTCTCGGGT-ATCATCAC-AAAT-G-TG-GTTACGGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTG--T--AGTGT-CC-GTAACC-TG-T-ATTTTGA--TC-A-GTTTG-GAAGC-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GATA-TTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-AAGT-TAA-T-CAATNTACTTT-ATATTTTCACCCCTC-ATTTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCCCAA-ATCGCATCA--TTT-CC-A-TATACAG-CATC-ATTAGCT-GTTAC-----CATCAG--CA-TG-AC-ATA--A--GCAA-TG--CTATT-GACATGGGCATC-AAGA-CA-GATG-GCA--C-ACCATTA--TTTTTTTTCAA-T-NTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTT-ACATT----TA--A-CAAAA-TCTT-GT-ACGAATT-CC-ACTATTTAAG-ATAA-NT-TCC-ATCC-C-TT-ATAA-----A--TAACTTAAAGAATG--TGT-TAGTG--TC-CGT--TAACCAAA--AGTTGAAAAACT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGC-AGA-A--A--A--TTTTC-AAAGCAG-TTTGTTATTTGAAGTTTAATGTAT-TTGTAGG-TGATT-TAT-TAGCCAGAAATTCTTTTAGATTA--C-GGT-GG------------TTTTTT--TTTTACTG-CAAGAAATA-AAAAAA-AATTACTTTAAAAAC--CAA-----ANAATTGTCATAG-AATG-TG-TGGGGAAATTA
gi|1 : GGTGCAAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-TTTC-CA--T-A----A--G-CA----T-TG------ATATAATCA-T--G-T-TTTG---AA-AAATAT--TA-TTCT---TCCT-T-AGCATACA--------ATT---TA-AACA----C-ATTCTT-TTCAT-AGGAAT-AC-ACTTGT-------AA-GACA-------TTTAGTC--TG-TG-CCAA---TT--------TT--TG----TG-------------ACT-CT----AAT-ATTA--ATAGATA--ATTAAATCATT--TG-CAAGAAAATAG-T-ACCACCAAAAAGG-CT----TTAGAACTTT---ATAGTGT--TAT-G-CTTGTTGCTAACT-AGATAACTGCCTAACATTTTGTA--TGCTGA--AAATA-G-GGT-AAATTA-ATT-CTCA-TATGTTTC-C-TGCC-GA---TGAACA--T-AAT-CA-GT-T--TAT--T-A-G--GA-A-TTCTTGATCACAA--ATTA-T--TT-GCG-T-GC-TTTAAAA--T-TTA--G-A---------------G-GA-T-CA-GAGGTAATAACAGAATCAT-TT----T---GA-GTAT--CATGA-T-AA-A-A---T-TTATA-T-AGG-G---GTGC---CAC-TT-GG-GCAATGT-TT--CAATG--GAA--TTC-CC-C----------------GTTT--G-A-TG-GCCA--A-AAATAGAAAATAATGTC--A-A-CA---TCA-T----T-----TAT-T---TTTC-----A-TAAT-TTCC-A-TCTAAAAT----AACAGT-AT--GAATGTTC-G-TT--AC--TC-AT-GGG--AAAA---AAAATT---G--G-C--C--A-T-GCA-CCC---T-TT-TATTT-AATT-TCAC----CA--T-G-TTTTAAT----ATT-GC-TA-AAAATTAAG-A-GT-----TTAGC-AAAA-A-AAAAGC-C-GTA-GTGT--C---CGTCA-GCCACT-----GAAA--T-CT-GTGGAAAA-TTAG--AA-AGGCCTTCATTACATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAGGA--CAGA-C-TT-TC---AT-GT--AGATGGCC-TGAGA-T-A----TGTGGTTGTT--G----TT-----TTC-C-TC-TG-CAATGGTCCAT-A--CC-------AC--GT----TTCTCGG-T-ATCATTAC-AAGT-G-TG-GTTACGGAC-AACGCTAC-AAA-T-CCTG--TTTAGTGT-CCCGTAACC-TG-T-ATTTTGACTTC-A-GTTTG-TAAGCCA--GC-TGT-TTA---CAAACA-CA-ACTCGCCT-GATA-TTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTCTT-A-CTAAGT-TAATT-CACTCTAC-TT-ATATTTTCACCCA-C-ATTGTGAT---AT--GCAA--ACTAA-TTGGAAAGCCCAAGATCGCATCA--TTT--C-A-TATGCAG-CATC-AT--GCT-GTTAC-----C-TCAG--CATTG-ACAATA--A--GCTA-TGC-CTATT-G--ATGGGAATT-AAAA-CA-GATG-A-A--C-A-CACTA--TTTTTCTTCAAGT-GTTG-A-GTC-AAC-TG------G-TGTT--CGTT----TA--AGCAAAA-CTTT-GT-A-GGAT---C-ACTATTTAAA-ATAA-AG-TTC-ATCC-C-TTAATAA-----T--AAACTTAAATAATG--TG--TAGTGGTCC-CGTAAAAACCAAA--AGTTG-AAAACTGTAAAACCTC--TTATTTGTTTCTCACAAGAAAG-AGC-AGA-G--A--AATTTTTC-AAAGCAG--TTATTATTT--AATT--ATGTA---TATAGGTTG--T-TAT-TAGCCAGAAATTC-TTAAGATTG--C-GGA-TG------------TTTTTTACTTTCACTG-C-AGAAATA-TAAAAA-GAATACTTTAACGCC--T-------ACCATAGTCATAG-AATC-TT-GGGGGAAATTA
gi|10 : -CA----T-TG------TTATA--CA-T--GAT-TTTC---AA-AAATAT--TG-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------CTT---TA-A-CA----T-ATTT-T-TTCAT-ACGAAT-AC-G--TAT-------AA-AGGA-------CTT---A--TG-TG-CCAA---TT--------TT--TT----CT-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAA--GATAA-TG-CAA-AAAAT-G-T-GCCCCAAAAA-GGTC-----CT-----TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTAA--ACTTAGA-AATTGC--AATATTTT-TC--TACTGA--AA-TA-ATGGT-AAA-TT-ATT-AT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-AT---TGAACAGTC-AAT-GACGA-T--T-TCTT-A-ACAGA-G-TTTTC--TCGCAA--ATTA-TGTTT-G-G-TAGC-TT--TAA--TATTT--CTA---------------G-GA-T-C--GAG----TAA-AA--C--TGTT----T---GAAGT-TGCT-TGA-ATAATA-AAA-T-CTATA-T-AGG-G---G--TGCACACGTT-G--ATATCTT-TTT-AAATG--ACC--CCC-CC-C-CCCGCT---------GTCT--T-T-TATGCCA--G-C--TAAAAA-TAATGTCGCT-T-C----TCA-T----T-----T---TATTTTTC-----A-TAAT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TACTGTTTTG-TT--CCGTTC-ACAGGG--AAAAGGGAAA-TT---G--G-G--CC-A-T-GCAACCCC--T-TT-AATTT-AGTT-TCAT----CA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-CA-AAAATTATG-A-TT-----TTA-C-AAAA-ATA------C-GTA-GTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TGAA--TTCT-ATG--AAA-TTAG--AA-AT--CTCTAT-AGATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTCT
gi|11 : GTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--T-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TG-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AC-A--TAT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAAT--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTT--AAGATAA-AG-CAA-AAAAT-G-T-ACCCCAACAAGGGTTGTTGTTT-----TTT---TTAGCGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AATTGC--AACATTTT-TC--TACTGA--AA-TA-ATGGT--AAATT-ATT-CT-A-CAT-TTTT-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-GA-GA-T--T-T--TAA-A--GA-T-TTTTT--TCACAA--ATTATT--TT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAG----T-A-AAAAC--C-TT----T---GAAG--T--TATGG-G-AA-A-AAA-AG-TA-A-T-AGG-GGT-G--C---CACGTT-AT-ACATTTT-TTT--AATG--GAT--TTT-CCAC-C----T---------GTTT--T---TATGTCA--A-A--T-AAAAATAATGTC--T-A-CA---TCA-TTTA-T-----T---T---TTTC-----A-TATT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-AGG---AAA---AAA-TT---G--G-AT-C--A-T-GCAACCCT--T-TT-AATTT-AATT-TCAT----CA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-CA-AAAATTCAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-ATA------T-GTA-GTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TAAA--TTCT-ATG--AAA-TT
gi|12 : tacgaT-TC--TGCTGA--AA-TA-ATGGT-AAA-TC-ATT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-TT---TGAACA--T-AAC-CA-GA-T--T-T--T-AGA--GA-A-TTTTT---CACAA--ATTA-T--TTTG-G-T-GC-TT--ACA--T-TTT--T-A---------------G-GA-T-C--GAG----TAA-AAAA---T-TT----T---GAAGT-T---ATGATA-AA-A-AAA-TAT-A-A-T-AGG-G---GTGC---TACGTT-AT-GCATTTT-TT--CAATG--ATT--TTTTCC-C-C----T---------GTTT--T---TATGCCA--A-A--TAAAATTTA-TGTC--A-A-CA---TCA-T----T-----TATTT---TTTC-----A-TAAT-T--C-AGTCTAAAAG----TACAGT-AT--GAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--GAAA---AAA-TT---G--G-G--CC-A-T-GCAACCC---T-TTTAATTT-AATT-TCAC----CA--T-G-TTTT-------AAT-GC-TA-AAAATTAAG-AGTTAAAAATTA-A-AAAAAA-A------C-GTA-GTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TAAA--TTCT-GTG--AAA-TTAG--AA-AG--CTTTAT-ACATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAG-A--TAGA-CATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGT-T-A----TG-----GTG--GGGGTTT-----TTT-T-CC-TG-G------TCATTA--CC-------ACT-GT----TTCT
gi|13 : GGTG-AAACA-CAATTAAAG-----GG---------GCAT---T----C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--TA-T--GGT-TTTC---AA-A--------------------T-T-G--ATACA--------ATT---TA-A-CA----C-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AC-A--TTT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAAT--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTT--AAGATAT-TG-CAA-AAAAT-G-T-ACCCC-AAAAAGGTGA-----T-----ATT---TTAGTGT--TAT-G-CA-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AATATTTT-TC--TGCTGA--AA-TA-ATGGT--AAATT-ATT-TT-A-TAT-TTTC-T-TGCCTATATATGAACA--T-GAT-CA-AA-T--T-T--T-AGA--GA-A-TTTT
gi|13 : acg-A-TAT-TTTT-C-TGC-------TGAA-A--T-AAT----GG-T--------------AA-A-TTATT--TTATA----TTT-T--CT-----T-GC-CT--ATA--T-ATGAAC-A---------------T-GA-T-C--------------AAA---T-TT----TAGAGAATT-T--TGTGA---------------TA---T-GGG-T---G--C---CACGTT-AT-ACA-TTT-TTT-CAATT--GGT--CAC-CC-C-C----TCCCCCCCCCGTTT------TATGCCA--A-T--GAA-----AATGTC--T-A-CA---TCA-T----TTA---T---T---TTTCT----C-TACT-T--C-AATCTGAAAT----TACAGT-AT--TGATGTTCTG-TT--AT--CT-TC-AGG--ACAA---AAA-TT---GTTC-G--C--A-G-GTAACgtgatatgggtgccacgttatacattttttcaattggtcaccccctcccccccccgttttatgccaatgaaaatgtctacatcatttatttttctctacttcaatctgaaattacagtattgatgttctgttatcttcaggacaaaaattgttcgcaggtaac
gi|14 : acgggtgaaacacaattaaaggggcattccaatacagcattgttatatatggttttcaaattgatacaatttaacacatttgtttcataggaatacatttaaaggacttctgtgccaatttttgttgatctagcattaatagaatttaagatattgcaaaaaatgtaccccaaaaaggtgatattttagtgttatgcagttgcacttagaaactgcaGGTG-AAACT-CAAT-ATAG-----GA----CAAACGCAT---TAT--C-CAGAT-A-C--AATG-CAAT--TATG------TTATAA-CA-TTGGAT-TTGC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CTTT-A-A--GTACA--------ATTAAAAA-A-CA----TAATTTGT-TTCAT-AGGATC-AC-G--T-T-------AA-AAAATATCAGTCTTTTCT--TG-TG-CCAC---TCAAACCCAATT--GG----TGTTTCTCAGTAAATA-T-CT----AGCAACTAAGATAGA-A--TTTTAAAGATAA-TC-AAA-AAAAT-G-T-ACCCC-AAAAAGGTCA----TT-----TTT---
gi|15 : gGGTG-AAACA---AT-ACAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CCTT-T-A--CTACA--------ATT---TA-A-CA----C-ATTTTT-TTCAT-AGGAAT-AT-A--TTT-------AA-AGAA-------CTT---C--TG-TG-CGAAT--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGT-ATCA--ATAGA-A--ATT--AAGATAT-TG-CAA-AAAAA-G-T-ACCCC-AAAAAGGTGA----TA-----TTT---TTAGTGT--T
gi|16 : gAGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GA----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------AGT---AA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AC-G--TAT-------AA-AAGA-------CTT---C--TG-TG-CCAAT--TT--------TT--TT----TT-------------A-T-CT----AGC-ACTA--ATAGA-A--TTT--AAGATAA-TG-CAA-AAAAT-G-T-
gi|17 : cGGTG-AAACA-CAATCATAAAAT--GGTTGTC----GCAT---G-TG-C-CA-ATTA-C--A--GTCAATTTT-CG------TTATA--C--T--G----TTC---AAGAAATCT--T--TTTT---CTTT-T-A--ATGCA--------ATT---TA-C-TAT---T-ATTCAT-TTCAT-GAGGATAAC-C--TAT--------A-ATGA-------CTT---C--TG-TG-CCAAATTTT--------TT--GT----TG-------------A-TGCT----AG
gi|18 : T--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AAATGC--AACATATT-TC--TGCTGA--AA-TA-ATGGT-AAA-TT-GTT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGTC-AT---TGAACA--C-AAT-CA-GA-T--A-T--T-AGA--GA-A--TTTT--TCACCA--ATGA-T--TT-G-GTT-GC-TA--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAG----T-A-AAAAC--T-TT----T---
gi|19 : TT-T-A--ATACAGGGTTCTTACC---TA-A-TAATATT-ATTTGT-TTGAT-AGGAAT-AC-A--TATATAAATAAA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAAC--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----t
gi|2 : atacaaaaggtttcaacacaatatctttaagaacAGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG---------GCAT---T-T--C-CA-AT-AGC--A--G-CA----T-TG------TTATA--CACT--GGA-TTTC---AA-AATTA----A-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-AA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AT-G--TAA-------TA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--AT-GA-A--TTTAAAAGATAA-TGCCAA-AAAAT-G-T-ACCCCAAAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TAT-GAGT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TC--TTCTGA--GA-TA-ATGGTAAAAATT-ATT-C--A-TAT-CTTA-C-TGCC-AT---TGAA-A--T-AAT-CA-GA-T--T-T--T-A-A--GA-ATTTTTT--TCACAA--ATTA-T--TT-G-G-T-GC--T--AAA--T-GTT--T-A---------------G-GA-T-C--GAGT---TAA-AAAAC--T-TTA---T---GAAGT-T--TATGA-A-AA-A-GAA-TGTTA-A-T-AGG-G---G--C---CATGTT-AT-ACATTTT-TTT-CAATG--AAT--TTC-CC-C-C----T---------GTTT--T-AGTAT-CCA--A-T--TAAAAAATAATGTT--T-A-CA---TCA-T----T-----T---T---TTTC-----ACTATT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--AAAA---AAA-TT---G--G-G--C--A-T-GCATTCC---T-TT-AATTT-AA-T-TCAT----CA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-CA-AAAATTAAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-A------C-GTA-GTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TAAA--TTCC-ATG--AAA-TTAG--AA-AG--CTCTAC-AGATA--T-CA--TT-ATTTTA--A-T--TTTTAG-A--TAGA-CATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-A----TG-----GTT--G----TT-----TTT-C-CC-TG-T------TCTTCA--CC-------ACT-GT----TTCTC-AGT-ATCATCAC-AAAT-G-TG-GTTACGGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTGTTT--AG-GT-CC-GGAACC-TG-T-AATTTGA--TC-A-GTTTGAGAAGC-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GATT-ATTTT-ACAAA-GGTCA-GA-GTTT-GTTC-T-A-C-AAGT-TAA-T-CAATATACTTT-ATATTTTCACTTCTC-A-TTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCTCAA-ATCACATCAGTTTT-CCTA-TATACAG-CATCTATTAGCT-GTTAC-----GATCAGTTCA-TG-AC-ATA--A--GCAA-TG--CTATTAGACATGGGCATC-AAGATCATGATGCGCA--TAACCATTAGTTTCTTTTTCAA-TCTTTGAA-GTC-AACGTGCCTATCG-TGTTGGCATT----GA--A-CAAAA-TCTA-TT-ACGAATT--C-ACTATTTAAACATAA-TTATCC-ATCC-C-TT-ATAA-----A--TAACTTAAA-ATTGTCTGT-TAG-G--TCACGT--TAACCAAA--AGTTGAAAAACT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAG--TGC-AG-----A--A--TTTTC-AAATCAG-TTTGTTATT--AATTTTAATGTAT-TTGTAGG-TGATTATAT-TAGCCA-AAATTCTTTTAGATTA--C-GGT-GG------------TTTTTT--TTTTACTG-CAAGAAATA-AAAAAATATTTACTTGAAAAAT--CAA-----AGAATTGTCATAGAAATG-TG-TGGGAAAATTA
gi|20 : -GCAACCCC--T-TT-AATTT-ATTT-TCAT----CA--T-G-TTCT--T----AAT-GC-TA-AAAATTAAG-G-TT-----TCA-C-AAAA-A-ACAAAACC-ATA-GTTT--C---CGT-T-ACCACT-----TTAA--TTCT-ATG--AAA-TTAG--AA-AG--CTCTAT-A
gi|21 : A-----A--TAACTTAAAGAATG--TGT--AGTG--TC-CGT---AGCCAAA--AGTTGAAAA-CT-TAAAAC--T--TT---T-TTTC-C-CAAGAAAGTTGC-AGAGA--A--A--TTTTT-AAAGCAG-TTTATTATTT-AAGTTTAATGTAT-
gi|22 : -C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-CA-GA-T--T-T--T-G-A--GG-A-ATTTT--TCACAAT-TTTG-T--TT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-CCT------------------------------GAA----TAA-AAA----T-TT----T---GAAG--T--TATGA-A-AA-A-AAA-
gi|23 : ta--TT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAG----T-A-AAACC--T-TT----T---GAAG--T--TATGA-A-AA-A-AAA-TG-TA-A-C-CGG-GGA-G--C---CAGGTT-AT-ACATTTT-TTT-CAATG--Aaatgtaaa
gi|24 : -A-CA---TCA-T----T-----TATTT---TTTC-----A-TACT-T--T-AGTCTAAAAT----TACACT-AC--TAATGTTCTG-TA--AC--TC-AC-AGG---AAA---ATA-TT---G--G-GC-C--A-T-GCAACCCT--T-TT-AATTT-AATT-ctgttt
gi|25 : TCTG-TT--AC--TC-AC-AGGAAAAAA---AAA-TT---G--G-GC-C--A-T-GCAACCC---T-TT---TTT-TATT-TT-T----TA--T-T-TTTT--T----GA-----CA-AAAAT
gi|26 : ----AAC-ATTA--ATAGA-A--TTTAA--GATAA-TG-CAA-AACAT-A-T-ACCCCCAAAAA-ATCA----TT-----TT----------T--TAA-G-CT-GTTGC--ACTTgtagccgaatttaa
gi|27 : GGTG-AAACA-CAAT-GTAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--
gi|28 : tcgGGCG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-
gi|29 : tatatcgGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---
gi|3 : catattacgGGTG-AA-CA-AAAT-ATAG-----GG----C-----CAT---TCT--C-CA-AT-A-C--A--GTCA----T-TG------TTATAT-CA-T--GGA-TTTC---AA-AACTAT--TA-TTTT---TCTT-T-A--ATACA--------ATT---TACA-AA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AT-G--TAT-------AA-AGGA-------ATT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--ATGGTTTG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAA--GATAA-TG-CAA-AAA-T-G-T-ACCC--AAAAAGGTCA----TT-----TTT---T-AGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTGGA---CTGC--AACATTTT-TC--TACTGA--AG-TA-ATGGT-AAATTT-ATT-CT-A-TAT-CTTAAC-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT--A-GA-T--T-T--T-A-A--AG-A-ATTTT--TCACAATTATTT-T--TT-G-G-T-GC-TA--AAA--T-TTT--T-A---------------G-GA-T-C--GGA----TAA-AAA-C--T-TT----T---GAAGT-T--AATGA-A-AA-A-AAAATGT-A-A-T-AGG-G---G--TG--CATGTTTAT-ACATTTT-TTTTCAATG--AAT--TTC-CCAC-C----T---------GTTTGTT-A--ATTTCA--A-T--TAAAAAATA-TGTT--T-A-CAATATTA-T----T-----T---T---TTTC-----A-TA-T-T--C-AGTCTAAA-T----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGA--AAAA---AAA-TT---G--G-GGCC--AAT-GCAACCC---TATT-AATTTTAATT-TCCT----CA--T-G-TTTT-------AAT-GC-CA-AAAATTAAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-AA-----C-GTAAGTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TAAAATTCCT-G-----AA-TTAG--AA-AG--CTCTAC-AGATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAG-A--TAGA-CATT-T----AT-GT--AGATG--C-TGCGA-T-A----TG-----GTG--T----TT-----TTT-C-CCGTG-A------TCATCAAACC-------ACTCGT----TTCTCCGGTTATCATCAC-AAAT-G-TG-GTTACGGAC------TAC-AA--T-CTGG--T--AGTGT-CC-GTAACC-TG-T-ATTTTGA---A-A-GTTTTTGAAGCCATCGCCTGT-TTT---AAAACA-CT-A-T-GCCT-GATA-TTTTTTACAAAAGGTCA--AGGTTT-GTTC-T-AAC-AAGT-TAA-TTCAATATACTTT-AT-TTTTTACCCTGC-ATTTTGAT--GAT--G--G--ACTAATTTGGAAAGCTCAA-ATCACATCA--TTTTCC-A-TATACAG-CATC-AT-AG-T-GTTAA-----CATCAG--TA-TG-AC-ATA--T--CAAA-TG--CTATT-GACATGGGCATCCAAGA-AA-GATG-GCA--T-AC----A--TATTTTTTCAA-T-TTTGAA-GTC-AAC-TG--------TGTT-GCATT----TA--AACAAAAATCTT-GT-ACAAATT-CC-ACTATTTAAC-ATAA-TT-TCCCATCC----T-ATAA-----A--CAACTTAAA--ATG--TGT--AGTG--TCGCGT---AACCAAA--CGTTGAAAA-CT-CAA--C--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAA-GTTGC-AGA-A--A--A--TTTTC-AAATCAGTTTTGCTA-TTGAAGTTTAATGTACATGGTAGG-TGA-T-TAT-TAGCCAGAAATTCTTTTAGATTA--TGGGT-GT------------TTTTTT--TTTTACTG-CAAGAAAT--AAGAAA-TATTA--TTAAAAAT--CAA-----AGAA-TGCAATAG-AATG-TG-TGGACAAATT
gi|30 : tacg-GTTACGGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTG--T--AGTGT-
gi|4 : ----AGC-ATCC--ATAGA-ACATTTAAA-GATAACTG-CAA-AAAAT-G-TGACCCCAAAAA-TGTCA----TT-----TCTGTGTTAGTGTGTTAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TCTATACTGA--AC-TA-AT-GT-AGACTT-ATT-CT-AGTAT-TTAA-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AATCCA-GA-T--T-T--TCA-A--GC-A--TTTT--TCACAA--ATAT-T--TT-G-G-T-GC-TT--AAAATC-TTT--C-A---------------T-GACT-C--GAG----TAC-AAAAC--G-TT----T---GAA---T--TATGA-A-AA-A-AAA-TG-TA-A-A-AGG-G---GTAC---AATGTT-AT-ATCTTTTCTTC-CAATG--AATTGTTC-TCGC-C----TG--------GTTT--TGG-TATGCTA--AGA--TAAAAAATAATGTC--T-A-CA---TCAGT----TTATAGT---T---TTTC-----A-TACTAT--CGAGCTTAAAATGAGCTA-GGTAAT--TGATCTCCTG-TT--AC--TC-AC-AG----AAA---AAA-TT---G--G-C--CATA-T-GC-ACCCTTAT-TT-AATTTCAATT-TCAT----CA--T-G-TTTT--CCCTGAAT-GC-TATAAAAT--AG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-ACG----C-GTA-GTGT--CACGCGTCA-ACCAATTCAAATAAA--TTCT-AT----AA-TCAG--AACGG--CTCTAT-AGATA--T-CA---C-A--TTA--A-TGATTCTAG-ATCTAGATCATA-GCATAAT-GTCGAGAAT--C-TGAGA-A-ATGGGTG-----GTA--G----TT-----TTTGC-TC-TGTA------TCA-CA--CCCCAACCTACT-GT----TTCTCAGGT-ATCATCAC-AAACGG-TATGTT--GGACAA---CT-C-AAAAT-CCTGC-C--AGTGT-CC-GTAACCTTG-T-ATTTTGT--TCAA-GTT---GAAGC-A--GCCTGT-TTTTTAAAAACAGCTAAAT-GC-T-GA-A-GTTTT-ACAAA-GGTCA-G-GGTTT-ATTC-T-A-C--AGT-TAA-T---ATATACTTTAATATTTTCACCTCTCAATTTTGAT--GAT--GC-AATACTAATTAGAACAGCCCAA-ATCGCATCA--TAT-CC-ACTATACAGCCATC-GATAGCT-GTTAC-----CATCAG--CA-TGAAT-ATA--ACGGCAA-TG--C------ATATGGGCATT-AAGA--A-GATG-GCA--C-ACCATGA--ATTTTTTTCAC-TAATTGAAGGTCAAAC-TG------GCTGTT-ACATTA---TATTT-TAAAA-TCTGAGT-ATGATTTACCAACTAATTAAG-ATAA-TT-TCC-ATCCGC-TT-ATAA-----AACCAAGTTAAAAAATG--TG--TAGTG--TC-CCG--TAACCAAAGCAGTT-ACAAACT-TAAAAC--TGATTA-TT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGCAAGA-AATA--A--TGTTC-AAAGCTG--TTGTTA-TTGAAGTTT-GTGTAT-GT-TAGG-TGA-T-TATATAGCCATAAATCTCTTTAGATTATGT-GGTGGG------------TTTCTTG-TTTTATTGTCTAAATATAGAAAAAA-AATTACTT--AACACTACAA-----ATTACTATCAT-G-AATGTTGTTGGGGGAATTA
gi|5 : ctaGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--CTCA-A--A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTCCAAAA-AAATATGCTA-TTTTTCCCTTCAT-A--CTACA--------ATT---TA-A-CA----C-ATTTGTCTTCAT-AGGAAT-AC-T--T-T-------AATAGGA-------CTT---C--TG-TGGCCAT---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGT-ATTA--ATAGA-A--ATTA---GATT--TG-CAA-AAATT-G-T-ACCCCAAAAA-GGTGA----TA-----TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TC--TGCTGA--AA-TATATGGG-TAAATT-A-T-CT-A-TA--TTTC-C-TGCA-TT---TGAACA--TAAAT-CA-GA-T--T-T--T-T-A--GAGA-ATTTT--TCACAA--ATTA-T--TT-G-G-T-GC-TT--ATT--T-TTT--TAA---------------G-GA-T-CT-GAG----T-A-AAAAC--T-TT----T---GAATT-C--TATGA-T-AA-A-AAA-TA-TA-A-T-AGG-GGT-G--C---CACGTT-AT-GCA-TTT-TTT-CAATGACAAT--TTC-CC-C-C----T---------GTTT--T---TATGGCAAGA-T--TAAATA--AATGTCA-A-A-CA---TCA-TTTAAT-----T---T---TTTC-----A-TAAT-T--C-AGT-TAAAAT----TACAGT-AT--AAGT-TTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--AAAA---AAA-TTTGCG--G-C--C--A-T-GCAACCC---T-TT-TAATT-AATT-TCATCCACCA--TGG-GTTT--T----AAT-GC-TA-AAA--TAAG-A-TT-----TAA-CAAAAA-A-A------C-GTA-GTGTTCC---CGTAA-ACCACT-----T-AA--TTCTCGTG--AAA-TTAG--AA-AG--CTTTAT-AT-TAATT-CA--TT-A-TTTG--ATT--TTTTAG-A--TAGA-CATTATC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-TAA----TG-----GTGTCG----TT-----TT-------CG-G------T-AT-A--CC-------ACT-GTTTTCTTCTC-GGT-ATCATTAC-AAAT-GCTG-GTTACGGACAA---CTAC-AAAAT-CCTG-----AGTGT-CC-GTAACC-TGTT-ATTTTT---TC-A-GTTTG-AAGCC-A--GTTTGT-TTT---AAACAA-CTAAAT-GC-TCGATA-TTTTTGACAAA-GGTCAGGAGGTTTGGTTC-TAA-C-A--T-TAA-A-TACTCTACTTT-ATGTTTCCACCCACA-ATTGTGATCGAAT--GC-A--CTTATTTCGGAAA--CCAA-AT-GTATCA--CTT-CC-A-TATGCAG-CATC-ATT-GCTGGTTAC-----CCTCAG--CA-TG-ACGATC--A--GCAATTGGCCTATTGGAAATGGGAATT-AAAA-CA-GATG-ACA--C-AC---TA--TATTTTTTCAA-T-GTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTTAACATTTCAATA--A-CAAAA--CTT-GTCAAGGATT--C-ACCATTTAAG-ATAAGGT-TCCAATCC-CTTT-ATAACTACTA--TAACT------ATA--TGTGTAGTG---C-CGT--AAAC---A--AGTTGAAAA--T-TAAAAA--T--TTATTT-TTTCCC-C-AGAAAGTTGC-AGA-G--AATA--TTTTCAAAAGCAG-TTTATTATTT-AAGTTTAATGTAT-
gi|6 : cg-T--TT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-AGGATCGAGTTTTTCAG-GA-T-C--GAG----TAT-AAA-C--T-TT----T---GAAGT-T---GTAA-A-AA-ATAAA-TGT-G-A-T-AGG-A---G--TG--CACGTA-AT-ACATTTT-TT--CATTG--AAT--TTT-CC-CTC----T---------ATTT--T-A-TA--CCA--A-A--TAAAAA-TAATGTC--T-A-CA---TCA-T----T-----T---C---TTTCTTTTTA-TACT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--AAAA---AA--TT---G--G-G--CC-A-T-GCAACCT---T-TT-AATTT-AATT-TCAT----CA--T-G-TTTT-------AAT-GCGTA-AAAATTA-G-A-TT-----TTA---AAAA-A-A------CTGTA-GTGTT-C---CGT-ATACTACT-----TAAG--ATCT-ATG--AAA-TTAG--GA-AG--CTTTAT-AGATA--T-AA--TT-A-TTTA--A-T--TTCTAG-A--TAGA-CATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-A----TG-----GTG--GGTT-TT-----TTT-C-CC-TG-G------TCATTA--CC-------ACT-GT----TTCTCAGGT-ATCATTAC-AAAC-G-TA-GTTACAGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTG--T--TGTGT-CC-GTAACC-TG-T-ATTTTGA--TC-A-GTTTG--AAGC-A--GTCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GATA-TTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-GAGT-TAT-T-CAATCTACTTT-AT-TTTTCACCC-TC-ATTTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCTTAA-ATTACATCA--TTT-TC-A-TATACAG-CATT-ATT-GCT-GTTACATGTACCTCAG--CA-TG-AC-ATACAA--GCTA-TG--CTATT-GAAATGGGAATT-AAAA-CA-GATG-ACA--C-ACCATT---TTTTTTTTCAA-T-GTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTT-ACATT----TA--A-CAAAA-CCTT-GT-AGGAATT-CC-ACTATTTAAG-ATAA-GT-TCC-ATCC-C-TA-ATAA-----A--TAACTTAAAGAATG--TG--TAGTG--TC-CG---TAACCAAA--AGTTG-AAAACT-TAAAGC---------TT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGC-AGA-A--A--AT-TTTTC-ACAGCAC-TTTGTTA-TTGAATTTCAATGTA---TACAGG-CG-TT-TAT-TAGCCA--------TTTA----------------------------TTTTA--TTTTACTG-CAAGAAATT-AAAAAA-AATTACTTTAAAAA----AACACCTACAAATACC-TAG-AATG-TA-TAGGGAAA
gi|7 : t-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-CC-AT-G-CAC---T-TG------TTATA--CA-T--GGAATTTC---AA-AA-TAT--TA-TTTT---CTTT-TTA--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGA-T-ACCG--TAT-------AA-AGGA-------CTT---CCCTGATG-CCAA---TT--------GT--GT----TG-------------A-TTCT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAA--GATAA-TG-CAA-AAAAT-GCT-ACCC--AAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TATTG-CT-GTT-C--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TC--TACTGACAAG-TA-ATGGT-TAAATTTATT-CT-A-TAT-CTTA-C-TGCC-A----TGAACA--T-AAT-CATGATT--T-T--T-A-A--GA-A--TTTT--TCAC-A--ATTATT--TT-G-A-T-GC-TT--AAA--T-TTT----A---------------GCGA-TCC--GAG----T-A-AACAC--T-TT----T---GAAGT-T--TATGA-A-AA-A-AAG----TA-A-TCAGG-GGATG--C---CATGTT-AT-ACA-TTT-TTT-CAATG--AAT--TTCTCC-C-C----T---------GTTT--T-A-T-T-CCA--A-T--TTAAAAATAATGTT--TCATCA---TTA-T----T-----T---T---TTTC-----A-TATT-T--C-AG-CTAAAA-----TACAGT-AT--GAAT-TTCTGTTT--ACT-TC-ACGGGG--AAAA---AAA-TT---G--GCGT-C--A-TAGCAACCC---T-TT-AATTT-CATT-TCAT----TATGT-G-TTTT--T----AAT-GA-TA-AAAATTAAGAA-TT-----TTA-C-AAAA-A-ACAAAG-C-GTA-GTGT--C---CGTAA-ACCACT-----TAAA--TTCT--TG--AAA-TTAGAAAA-AG--CTCTAC-ATATA--TGCAACTTAA-TTTATTA-T--TTTTAG-AT-TAGA-CATT-TC---ATCGT--AGATG--CTTGAGATT-A----T------GTG--T----TT-----TTT-CTCC-TG-A------TCATCA--CC-------ACT-GT----TTCTCAGGT-ATCATTCC-AAAT-G--G-GTTACGGAC-A---CTACAAAAATACCTG--T--AGTGT-CC-GTAA-C-TG-TAATTTTGA--TC-ATTTTTG-AAAGC-A--GCCTGT-TTTA--AAAACACCT-AAT-GC-T-GATATTTTTT-ACAAA-GGTCA----GTTT-GTTC-T-A-C-AATT-TAA-T-CAATATACTTT-ATTTTTTCACCCTTC-ATTTTGAT--GATTGGC-A--Aa
gi|8 : aGGTG-AAACAACAA--ATAGATAGGGG----C----GCATATTT-T--C-CA-AT-A-CCAA--G-CACAT-T-TGGTAAAATTACA--CA-T--GGT-TT-----GA-AAATAT--TAATTTT---CCTT-T-A--CTACA--------ATT---TA-A--G----C-ATTTGT-TTCATGAGGAATTACAG--TTT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TTTTGT----TG-------------A-T-ATCATAAGT-ATTA--ATAGA-A--AT---AAGATAT-TG-CAA-AAAAT-G-TTACCCCAAAAAGGGTT-----TTAGTA-TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AA-TGC--AACATTTT-TC--TGCTGA--AA-TA-ATGGT-AA--TT-ATTTCT-A-TAT-TTTC-CGTGCTTAT---TGAACA--T-AATTCA-GA-TAGT-T--T-A-G--AG-A-CTTTT--TCA-AA--ATTA-T--TTTG-G-T-GCATT--AAA--T-TTT--------------------A-GA-T-CCTGAG----TAA-AAAAC--T-TTGTGTT---GAAGT-T--TATGA-T-AA-A-AAA-TATTA-AAG-AGGTG---G--C---CACGTTTATTGCATTTT-TT--CA--G--AAT--TCC-CC-C-C--------------GTTT--T-T-TGTGCCA--A-A--TAAAAA-TAAT--C--A-A-CA---TCA-T----T-----TAT-T---TTTC-----A-TAAT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-ATAGTAATGTT-TG-TTTCAC--TCGAT-GGG--AAAA---AAA-TT---G--G-G--CC-A-TCGAAACCC---T-TT-TATTTTAATTCTCAC----CA--T-GGTTTT--T----AATTGC-TA-AA--TTAAG---CT-----TTA-C-AAAA-A-AAAC---C-GTA-GTGT--C---CGT-A-AC-ACT-----TGAA--TTCT-GTG--AAAGTTAG--AA-AG--CTGTAT-ACATA--T-CA--TT-A-TTTT--A-T--TTT-AG-A--TAGA-CATT------AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-A----TG-----GTC--G----TTGTTTTTTT-C-CC-TG-CATGG--TCATTA--CC-------ACT-GT----TTCTCGGGT-ATCAATACAAAAT-G-TG-GTTAC-GAC-A---CTAC-AAAAA-TCTG--T--AGTGTCCC-GT-ACC-TGAT-ATTTTGA--TC-A-GTTT--GAAGC-A--GCTTGTCTTT---AAAAAC-CT-AAT-GC-T-GATA-TTTTT-ACAAA-GG--A-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-AAGTCTAA-T-CAa
gi|9 : ATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-A----AG-----GTG--T----TT-----TTT-C-CC-TG-A------TCACCA--CC-------ACT-GT----TTCTCAGGT-ATCATCAC-ATAT-G-TG-GTTACGGAC-T---CTAC-AAAAT-CCTG--T--AGTGT-CC-GTAATT-TG-T-ATTTTGA--TC-A-GTTT--GAAGC-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GATA-TTTTT-ACAAA-AGTCA-GAGGTTT-GTTC-C-A-C-AAGT-TAA-T-CAATTTACTTT-AT-TTTTCA-CCCTC-ATTTTCAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCCCAA-ATCGCATCA--TTT-CC-A-TATACAG-CATC-A-TAGCT-G-TAT-----CATCAG--TA-TG-AC-ATA--A--GCAA-TG--CTATT-GACATGGACATC-AAGA-CA-GATT-ACATGT-ACCA-TA---TTTTTTTCAA-T-TTTGAA-GT----C-TG------G-TGTT-ACATT----TA--A-CAAAA-GCTT-GT-ACGAATT-CC-ACTATTTAAG-ATAA-GT-TCC-ATCC-C-TT-ATTT-----A--TAACTTAAAGAATA--TG--TAGTG--TC-CG---TAACCAAA--AGTTGAAAACTT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGC-AGA-A--A--A--ATTTC-AAAGCAG-TTAGTTA-TTGAAGTTTAAAGTAT-T--TAGG-TG-TT-TAT-TAGCCAGAAATTCTTTAAGATTA--T-GG--GGTGCTTTATTTTTTTTTTT--TTTCACTG-CAAGAAATA-AAAAAA-A---ACTT--AACAC--CTA-----CAAAT--ACATAG-AATG-TG-TGGGGAAAATActt
blockSeqs : . A T ATAGG CAAAC ATT AT T G T G CA AT T ATTT A GTAAAA A C TG A CAA G GC A TCC A T . GGGTTCTT AAA C . ATAT A C G A CG A ATAAATA T TATCAGT TTC CC A G ATT AAACCCAA TT GGTT TTTCTCAGTAAAT . G CATA A AG . CA TAAA AC C . . C G A G GTTGT AGTA GTG GT T A . . . . . TA CA . T AA A T T . G . AA G TATATA GT A CC C T AG . CT AA CA G TT . TT T GT T . T A A . AT A CAGGATCGAGTTTTTCA C C C CT TTA . AC G GTGT AGA T GCT AT T T TGTT T A C T GTGCA T T T C TT AC TG T A T TCCCCCCCCC GTTA G AG GA A GCT T ATA G TTATAGT ATT TTTTT C A A . G GAGC A AG T TC GT G A AAA GGG . TGC TT C GCC A A TTA A TA T C CCAC TG G G CCCTG T G T A G AAAAA . A A T CAAAAC T A TC ACG C T TCAAA AT CG . G AA C . . G AT G AC A T TT T GA . TC T A ATA C CG . T T A TGGG . GGGGT GTTTT G T G CATGG T AA CCAACCT C TTTC C T A G C T AA A A TTT C . T T A . A T GAG C TC C TTA G A . C C T T A GG G . A A . C . T A A A CT A CG TG . AT . GT T T C C T TTA G ATGTA A TT . A G ACG T GC A C C TC T C TGT CATTAGTT . CT G A G CCTATCG GG TCAA TTT AT A C C AC A C TTA C GC . CTACTA G TC TGT . A TT GC A A . TGA AT . . A AAT AT T A TT T G CATGG . AT A A G T TGGGGTGCTTTATTTTT G T A AG TAT G A AACACCT G TT A T T
blockSeqs : . . C AAT TTGTC . TG . . . . C T T CAT . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . T AG A . . . . . . . T . . . . . T . . . . . AAAA A . . . . T A A A . . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . C . TAT . . TC T . . . . AG . . T . T T . T . . . . . . . AACA . . . T TA . AC . A . T T TA . . ATGT . . . . GATGC T . T . T . . T A . CCGCT TAG G . C T AA . . . TTAATT . T . T . . . . . . . . T . G A . . . . . CAT . C C . A C . . . . . T . . . . . . . . . T CAAAG . . T . A . . . A . . . . . . C . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . GGTT . . . . TA C . . . . A . . . . . AA . . CC . . . A . . . . TTG . . . A C A . . . . G . G . . . . . . . . A . A TG . . . . . . . . . . . . ATA . . A . . . . CAA . . G C . A . . TA CATGAA . AA . . . GC AA A AA T . . C C . . GGT A CT . AAC A . TT . G GT . A A . T AT . . . GA . . . T T G TTTG . A . . T T TGTGGTGGG . . A A TA T A CTACAA G CT . . .
blockSeqs : . . . . C . CT . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . AAA A . . . . . A A A . . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . T . AT . . G . . . . . AG . . T . . . . . . . . . . . . CTA . . . . TA . AC . . . T T G . . TATT . . . . GTGC . . T . T . . . G . TG TGG G . A A TC . . . TTATT . . . A . . . . . . . . . . . G . . . . . CC . . T . A T . . . . . T . . . . . . . . . . AAC . . . . A . . . A . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCG . . . . G C . . . . A . . . . . A . . T . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . A . G CT . . . . . . . . . . . . TA . . A . . . . A . . . T . C . . T CATTT . T . . . G G . A T . . T C . . TT . C . A G . T . . TA . A A . T AT . . . A . . . T T G TGT . A . . G C TGGGTGT . . T T AA T C TCAA T AT . . .
blockSeqs : . . . . C . T . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . AA T . . . . . C A A . . . . . . . . . . . . . . A T . . . . . C . AT . . G . . . . . AG . . T . . . . . . . . . . . . TAA . . . . TA . CC . . . T T A . . TCT . . . . GTGC . . T . T . . . . . T TT G . A A T . . . TTATT . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . TC . . C . A . . . . . . T . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . G . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T C . . . . A . . . . . A . . T . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . C . T AC . . . . . . . . . . . . TT . . C . . . . T . . . A . C . . C CATA . G . . . G A . A C . . A C . . TT . C . A G . T . . T . A C . T AT . . . G . . . T . G TA . T . . . T CGGTGG . . A A AA . A TCAA C T . . .
blockSeqs : . . . . C . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . AA A . . . . . A A A . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . C . TT . . C . . . . . CA . . T . . . . . . . . . . . . CA . . . . TA . AC . . . T T A . . AGT . . . . GAGC . . T . T . . . . . T TA T . T A A . . . TTATT . . . T . . . . . . . . . . . A . . . . . CC . . T . A . . . . . . T . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A T . . . . G . . . . . A . . T . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . C . . TT . . . . . . . . . . . . TT . . C . . . . A . . . A . C . . C TAT . G . . . G A . A G . . G . . . GT . C . A . . T . . T . A . . T A . . . A . . . T . . TT . T . . . . . . . A . A . C CCTA A T . . .
blockSeqs : . . . . C . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . C . . . . . . . . . . . AA T . . . . . A A A . . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . T . AT . . C . . . . . A . . T . . . . . . . . . . . . TA . . . . TA . AC . . . T T A . . TAT . . . . GTAC . . T . T . . . . . T TA G . T A T . . . TTAT . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . CC . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . G C . . . . A . . . . . A . . T . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . CT . . . . . . . . . . . . TA . . A . . . . A . . . C . . . . C AT . T . . . . A . A . . . C . . . GT . . . A . . T . . T . A . . T . . . . A . . . T . .
blockSeqs : . . . . C . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA A . . . . . A A A . . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . C . AT . . C . . . . . A . . A . . . . . . . . . . . . CA . . . . TA . AC . . . T A A . . TGT . . . . GTGC . . T . C . . . . . T TT G . T . T . . . TTAT . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . CC . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . G T . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . A . . T . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA A . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . A . AT . . C . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . TA . . . . TA . AC . . . T T A . . TGT . . . . GTG . . T . T . . . . . T T G . T . T . . . TT . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . CC . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . A C . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA A . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . AT . . C . . . . . A . . A . . . . . . . . . . . . CA . . . . T . C . . . T T T . . TAT . . . . GTG . . T . T . . . . . T T . . A . T . . . TT . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . TC . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA A . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . AT . . C . . . . . T . . C . . . . . . . . . . . . TA . . . . T . A . . . . T A . . TGT . . . . GC . . . . . . . . . . T T . . T . T . . . TT . . . T . . . . . . . . . . . A . . . . . CC . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TT . . C . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . T . A . . . . T A . . T . . . . GC . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . TT . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA T . . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . T . C . . . . . T . . T . . . . GC . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : T*** ** ** G*** *** AA** A* ***** ** ** ** ** ** TA**** AC** T* T* T************* N*** TTAT********** ** CC*** T****** ****** ** ** ** ***** G******* A**** T**** ** G** CT TN* ** CATTA*** A* A*** C* ** T*** T**** ** T* N* CGGGTGG*************** ** TCAA*******
originalCons : AGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AC-G--TAT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAAAAGATAA-TG-CAA-AAAAT-G-T-ACCCCAAAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TC--TGCTGA--AA-TA-ATGGT-AAAATT-ATT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-CA-GA-T--T-T--T-A-A--GA-A-TTTTT--TCACAA--ATTA-T--TT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAG----TAA-AAAAC--T-TT----T---GAAGT-T--TATGA-A-AA-A-AAA-TGTTA-A-T-AGG-G---G--C---CACGTT-AT-ACATTTT-TTT-CAATG--AAT--TTC-CC-C-C----T---------GTTT--T-A-TATGCCA--A-N--TAAAAAATAATGTC--T-A-CA---TCA-T----T-----T---T---TTTC-----A-TANT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--AAAA---AAA-TT---G--G-G--C--A-T-GCAACCC---T-TT-AATTT-AATT-TCAT----CA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-TA-AAAATTAAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-A------C-GTA-GTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TAAA--TTCT-GTG--AAA-TTAG--AA-AG--CTCTAT-ANATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAG-A--TAGA-CATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-A----TG-----GTG--G----TT-----TTT-C-CC-TG-N------TCATCA--CC-------ACT-GT----TTCTCGGGT-ATCATCAC-AAAT-G-TG-GTTACGGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTG--T--AGTGT-CC-GTAACC-TG-T-ATTTTGA--TC-A-GTTTG-GAAGC-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GATA-TTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-AAGT-TAA-T-CAATNTACTTT-ATATTTTCACCCCTC-ATTTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCCCAA-ATCGCATCA--TTT-CC-A-TATACAG-CATC-ATTAGCT-GTTAC-----CATCAG--CA-TG-AC-ATA--A--GCAA-TG--CTATT-GACATGGGCATC-AAGA-CA-GATG-GCA--C-ACCATTA--TTTTTTTTCAA-T-NTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTT-ACATT----TA--A-CAAAA-TCTT-GT-ACGAATT-CC-ACTATTTAAG-ATAA-NT-TCC-ATCC-C-TT-ATAA-----A--TAACTTAAAGAATG--TGT-TAGTG--TC-CGT--TAACCAAA--AGTTGAAAAACT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGC-AGA-A--A--A--TTTTC-AAAGCAG-TTTGTTATTTGAAGTTTAATGTAT-TTGTAGG-TGATT-TAT-TAGCCAGAAATTCTTTTAGATTA--C-GGT-GG------------TTTTTT--TTTTACTG-CAAGAAATA-AAAAAA-AATTACTTTAAAAAC--CAA-----ANAATTGTCATAG-AATG-TG-TGGGGAAATTA
finalCons : AGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---TT---C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-ACG---TAT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTTAA--GATAA-TG-CAA-AAAAT-G-T-ACCCCAAAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TAT-G-CT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TC--TGCTGA--AA-TA-ATGGT-AAAATT-ATT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-CA-GA-T--T-T--T-A-A--GA-A-TTTTT--TCACAA--ATTA-T--TT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAGTA----A-AAAAC--T-TT----T---GAAGT-T--TATGA-A-AA-A-AAA-TGTTA-A-T-AGG-G---G--C---CACGTT-AT-ACATTTT-TTT-CAATG--AAT--TTC-CC-C-CT-------------GTTT--T-A-TATGCCA--AN---TAAAAAATAATGTC--T-A-CA---TCA-TTTAT----------T---TTTC-----A-TANT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGG--AAAA---AAA-TT---G--G-GCC---A-T-GCAACCC---T-TT-AATTT-AATT-TCAT----CA--T-G-TTTTT------AAT-GC-TA-AAAATTAAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-A------C-GTA-GTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TAAA--TTCT-GTG--AAA-TTAG--AA-AG--CTCTAT-ANATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAG-A--TAGA-CATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-A----TG-----GTG--G----TT-----TTT-C-CC-TGG-------TCATCA--CC-------ACT-GT----TTCTCGGGT-ATCATCAC-AAAT-G-TG-GTTACGGACA----CTAC-AAAAT-CCTGT----AGTGT-CC-GTAACC-TG-T-ATTTTGA--TC-A-GTTTG--AAGC-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-GC-T-GATA-TTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-AAGT-TAA-T-CAATNTACTTT-ATATTTTCACCCCTC-ATTTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCCCAA-ATCGCATCA--TTT-CC-A-TATACAG-CATC-ATN-GCT-GTTAC-----CATCAG--CA-TG-AC-ATA--A--GCAA-TG--CTATT-GACATGGGCATC-AAGA-CA-GATG-GCA--C-ACCATTA---TTTTTTTCAA-T-NTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTTA-CATT----TAA---CAAAA-TCTT-GT-ACGAATTC-C-ACTATTTAAG-ATAA-NT-TCC-ATCC-C-TT-ATAA-----A--TAACTTAAAGAATG--TGT-TAGTG--TC-CGT---AACCAAA--AGTTGAAAAACT-TAAAACT----TTATTT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGC-AGA-A--A--A--TTTTC-AAAGCAGT-TTGTTATTTGAAGTTTAATGTAT-TTGTAGG-TGN-T-TAT-TAGCCAGAAATTCTTTTAGATTACGGGTGG---------------TTTTTT--TTTTACTG-CAAGAAATA-AAAAAA-AATTACTTTAAAAATCAA-------ANAATTGTCATAG-AATG-TG-TGGGGAAATTA
Alignments
lowQualScore : 11111 1111 11111111 111 111 11111111 1111111111111 1 11111 11 1111 22222222222222222222 1111 11111 2222222222 11 1 111111111111111 111111 1111 111 1111111 444444 1 11 11111 1111111 11111 22222 1111111 1 11111 11111 11 111 1 1 11111 1 11 1 1 1111 333333333 11 11111111 11 1111 1111 11 11 1 11111111 1 222 1111 1 1 11111 11 1 1 22222 1 22222222222222 111 11111 11 22222222222
lowQualScore : 2 2 5 11111 888888888 444 7777 2 2 2 2 77 77 5 7777 2 888888 99 3 44 0 3 555 3 0 44 3 555 2 2 33 00000000 555 2 2 8888 2 2 2 5 8888 4 9999999 2 9999999 000 33 2 2 999 00000000 33 6666 5555555555555 2 5 5555 2 33 2 33 33 66 22 33 2 2 2 2 5 3 0 88888 44444 555 44 3 3 3 44 3 55 3 44 44 3 3 7 00 3 3 3 3 3 33 2 666666 33 2 66 5 2 77777 3333 2 8 44 3 77 99 5 2 2 2 2 33 33 2 55555555555555555555 2 2 2 99 5555 5555 5555 2 8888 444 66 444 666 2 2 99999 6 3 3 3 6666666666 6 3 4 3 00 44 44 6 0 888888888888888 999999 2 44 8888 1 7 44 3 6 6 3333 555 6 3 3 4 3 44 3 6666 3 44 2 33 66 2 5 0 888 2 2 3 3 44 3 5 2 333 2 22 8 2 6666 44 3 3 4444444 3 3 3 3 3 88888 3 3 3 6 000000 3 3 77 555 3 3 88888 44 55 44 3 55 3 55 3 1 55 4 55 4 4 55 4 55 4 00 4 4 777 4 55 55 4 4 4 8888 00000 8888888 00000 4 4 4 22222 4 4 55 3333333 4 8888 1 4 4 4 4 4 33333 4 4 22222 4 4 4 8 4 66 88 4 8 4 66 4 222 8 8 4 4 4 4 4 8 4 55 4 4 4 4 4 4 4 4 1 5 4 2 22 5 66 66 5 66 5 77 5 5 5 5 1 5 6 5 44444 4 77 5 5 1 77 77 5 33 1 3 0 5 66 5 1 0000 1 000000000 5 22 5 5 5 99999999 33 7777 4444 11 5 5 6 33 5 5 6666 1 888 5 33333333 0 66 333 0000 0 5 888 66 3 2 5 22222 33 5 5 0 5 9999 66 11 5 88 5 1 0 44444 1 99 6 0 5 44444444444444 111 66666 6 3 00 888 3 3 11111111111 1 99 0 6 6 6
lowQualScore : . . . ..... ......... ... .... . . . . .. .. . .... . ...... .. . .. . . ... . . .. . ... . . .. ........ ... . . .... . . . . .... . ....... . ....... ... .. . . ... ........ .. .... ............. . . .... . .. . .. .. .. .. .. . . . . . . . ..... ..... ... .. . . . .. . .. . .. .. . . . .. . . . . . .. . ...... .. . .. . . ..... .... . . .. . .. .. . . . . . .. .. . .................... . . . .. .... .... .... . .... ... .. ... ... . . ..... . . . . .......... . . . . .. .. .. . . ............... ...... . .. .... . . .. . . . .... ... . . . . . .. . .... . .. . .. .. . . . ... . . . . .. . . . ... . .. . . .... .. . . ....... . . . . . ..... . . . . ...... . . .. ... . . ..... .. .. .. . .. . .. . . .. . .. . . .. . .. . .. . . ... . .. .. . . . .... ..... ....... ..... . . . ..... . . .. ....... . .... . . . . . . ..... . . ..... . . . . . .. .. . . . .. . ... . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . .. . .. .. . .. . .. . . . . . . . . ..... . .. . . . .. .. . .. . . . . .. . . .... . ......... . .. . . . ........ .. .... .... .. . . . .. . . .... . ... . ........ . .. ... .... . . ... .. . . . ..... .. . . . . .... .. .. . .. . . . ..... . .. . . . .............. ... ..... . . .. ... . . ........... . .. . . . .
lowQualScore : 9 9 7 33333 000000000 777 0000 9 9 9 9 33 33 7 9999 9 222222 66 1 22 2 1 444 1 5 22 1 444 9 9 99 44444444 000 9 9 9999 9 9 9 7 9999 6 3333333 9 3333333 000 99 9 9 333 44444444 99 1111 7777777777777 9 7 3333 9 99 9 99 99 88 99 99 9 9 9 9 7 5 8 22222 22222 444 22 3 3 3 66 6 00 3 66 66 3 3 6 88 3 3 1 1 1 00 9 333333 99 9 44 7 9 11111 9999 9 1 22 1 33 66 3 7 7 7 7 77 77 7 88888888888888888888 7 7 7 00 7777 1111 5555 7 3333 777 11 999 999 9 9 99999 2 1 1 1 0000000000 2 1 3 1 33 22 66 7 0 333333333333333 222222 5 66 9999 3 4 66 3 2 2 3333 444 2 1 1 0 1 22 1 5555 1 22 9 99 88 9 7 8 999 9 9 1 1 22 1 7 9 666 9 99 6 9 5555 22 1 1 2222222 1 1 1 3 3 33333 3 3 3 7 000000 3 3 99 888 3 3 33333 66 55 66 3 00 6 00 6 0 55 0 55 0 0 55 0 55 4 66 4 0 000 0 55 55 0 0 0 5555 00000 5555555 00000 0 0 0 55555 0 8 55 0000000 0 5555 0 4 4 4 4 0 55555 0 0 44444 0 4 4 9 4 11 33 4 9 4 11 4 222 9 9 4 4 4 4 4 9 4 66 4 4 4 4 4 4 4 4 0 0 5 5 22 0 99 99 0 99 7 99 7 7 7 7 4 7 6 7 33333 9 99 7 7 4 99 99 7 66 4 0 7 7 44 7 4 4444 7 999999999 7 44 7 7 7 33333333 77 9999 0000 44 7 7 6 66 7 7 9999 4 666 7 66666666 8 99 888 9999 0 0 888 99 2 4 0 88888 22 0 0 1 0 6666 99 99 0 22 5 9 1 11111 0 22 7 8 7 22222222222222 222 77777 7 5 22 000 2 2 00000000000 0 55 3 7 7 7
consensus : AGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AC-G--TAT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTT--AA--GATAA-T--GC-AA-AAAAT-G-T-ACCCCAAAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TAT-GC-T-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TC--TGCTGA--AA-TA-ATGGTAAAA-TT-ATT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-CA-GA-T--T--TT-A--AGA-ATTTTT--T-CACAA--ATTA--TTT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAG----T-AA-AAAAC--T-TT----T---GAAGT-T--TATGA-A-AA-A-AAA-TGTTA-A-T-AGG-G---G--C---CACGTT-AT-ACATTTT-TTT-CAATG--AAT--TTC-CC-C----CT---------GTTT--T-A-TATGCCA--A-N--TAAAAAATAATGT--C-TACATCA-TT-TA---TTT---TT-C-A-TANT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGGAAAA---AAA-TTG-G-G-CC--A-T-GCAA-CCC---T-TT-AATTT-AATT-TCAT----CA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-TA-AAAATTAAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-A------C-GTA-GTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TAAA--TTCT-GTG--AAA-TTAG--AA-AG--CTCTAT-ANATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAG-A--TAGA-CATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-A----TG-----GTG--G----TT-----TTT-C-CC-TG-----GTC-ATCA--CC-------ACT-GT----TTCTCGGGT-ATCATCAC-AAAT-G-TG-GTTACGGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTG--T--AGTGT-CC-GTAACC-TG-T-ATTTTGA--TCAGTTT--G-AAG-C-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-G-C-T-GATA-TTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-AAGT-TAA-T-CAATNTACTTT-ATATTTTCACCCCTC-ATTTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCCCAA-ATCGCATCA--TTT-CC-A-TATACAG-CATC-A-TAGCT-GTTAC-----CATCAG--CA-TG-AC-AT--AA--GCAA-TG--CTATT-GACATGGGCATC-AAGA-CA-GATG-GCA--C-ACCATT-A---T-TTTTTTCAA-T-NTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTT-ACATT----TA--A-CAAAA-TCTT-GT-ACGAATT-CC-ACTATTTAAG-ATAA-NT-TCC-ATCC-C-TT-ATAA-----A--TAACTTAAAGAATG--TGT-TAGTG--T-C-CG-T---AACCAAA--AGTTGAAAAACT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGC-AGA-A--A--A--TTTTC-AAAGCAG-TTTGTTATTTGAAGTTTAATGTAT-TTGTAGGTGNT--TAT-TAGCCAGAAATTCTTTTAGATTAC-G-GGT-G----NTTTTT-T-TTTT-----ACTG-CAAGAAATA-AAAAAA-AATTACTTTAAAAAT-CAA-----ANAATTGTCATAG-AATG-TG-TGGGGAAATTA
Reference ( family-5039 ) : AGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AC-G--TAT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTT--AA--GATAA-T--GC-AA-AAAAT-G-T-ACCCCAAAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TAT-GC-T-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TC--TGCTGA--AA-TA-ATGGTAAAA-TT-ATT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-CA-GA-T--T--TT-A--AGA-ATTTTT--T-CACAA--ATTA--TTT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAG----T-AA-AAAAC--T-TT----T---GAAGT-T--TATGA-A-AA-A-AAA-TGTTA-A-T-AGG-G---G--C---CACGTT-AT-ACATTTT-TTT-CAATG--AAT--TTC-CC-C----CT---------GTTT--T-A-TATGCCA--A-N--TAAAAAATAATGT--C-TACATCA-TT-TA---TTT---TT-C-A-TANT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGGAAAA---AAA-TTG-G-G-CC--A-T-GCAA-CCC---T-TT-AATTT-AATT-TCAT----CA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-TA-AAAATTAAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-A------C-GTA-GTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TAAA--TTCT-GTG--AAA-TTAG--AA-AG--CTCTAT-ANATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAG-A--TAGA-CATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-A----TG-----GTG--G----TT-----TTT-C-CC-TG-----GTC-ATCA--CC-------ACT-GT----TTCTCGGGT-ATCATCAC-AAAT-G-TG-GTTACGGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTG--T--AGTGT-CC-GTAACC-TG-T-ATTTTGA--TCAGTTT--G-AAG-C-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-G-C-T-GATA-TTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-AAGT-TAA-T-CAATNTACTTT-ATATTTTCACCCCTC-ATTTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCCCAA-ATCGCATCA--TTT-CC-A-TATACAG-CATC-A-TNGCT-GTTAC-----CATCAG--CA-TG-AC-AT--AA--GCAA-TG--CTATT-GACATGGGCATC-AAGA-CA-GATG-GCA--C-ACCATT-A---T-TTTTTTCAA-T-NTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTT-ACATT----TA--A-CAAAA-TCTT-GT-ACGAATT-CC-ACTATTTAAG-ATAA-NT-TCC-ATCC-C-TT-ATAA-----A--TAACTTAAAGAATG--TGT-TAGTG--T-C-CG-T---AACCAAA--AGTTGAAAAACT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGC-AGA-A--A--A--TTTTC-AAAGCAG-TTTGTTATTTGAAGTTTAATGTAT-TTGTAGGTGNT--TAT-TAGCCAGAAATTCTTTTAGATTAC-G-GGT-G----GTTTTT-T-TTTT-----ACTG-CAAGAAATA-AAAAAA-AATTACTTTAAAAAT-CAA-----ANAATTGTCATAG-AATG-TG-TGGGGAAATTA
gi|1 : GGTGCAAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-TTTC-CA--T-A----A--G-CA----T-TG------ATATAATCA-T--G-T-TTTG---AA-AAATAT--TA-TTCT---TCCT-T-AGCATACA--------ATT---TA-AACA----C-ATTCTT-TTCAT-AGGAAT-AC-ACTTGT-------AA-GACA-------TTTAGTC--TG-TG-CCAA---TT--------TT--TG----TG-------------ACT-CT----AAT-ATTA--ATAGATA--ATT--AA---ATCA-TTTGC-AAGAAAATAG-T-ACCACCAAAAAGG-CT----TTAGAACTTT---ATAGTGT--TAT-GC-TTGTTGCTAACT-AGATAACTGCCTAACATTTTGTA--TGCTGA--AAATA-G-GGTAAAT-TA-ATT-CTCA-TATGTTTC-C-TGCC-GA---TGAACA--T-AAT-CA-GT-T--TA-TT-A--GGA-ATTCTTGAT-CACAA--ATTA--TTT-GCG-T-GC-TTTAAAA--T-TTA--G-A---------------G-GA-T-CA-GAGGTAAT-AACAGAATCAT-TT----T---GA-GTAT--CATGA-T-AA-A-A---T-TTATA-T-AGG-G---GTGC---CAC-TT-GG-GCAATGT-TT--CAATG--GAA--TTC-CC-C---------------GTTT--G-A-TG-GCCA--A-AAATAGAAAATAATGT--C-AACATCA-TT-TA---TTT---TT-C-A-TAAT-TTCC-A-TCTAAAAT----AACAGT-AT--GAATGTTC-G-TT--AC--TC-AT-GGGAAAA---AAA-ATT-G-G-CC--A-T-GCA--CCC---T-TT-TATTT-AATT-TCAC----CA--T-G-TTTTAAT----ATT-GC-TA-AAAATTAAG-A-GT-----TTAGC-AAAA-A-AAAAGC-C-GTA-GTGT--C---CGTCA-GCCACT-----GAAA--T-CT-GTGGAAAA-TTAG--AA-AGGCCTTCATTACATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAGGA--CAGA-C-TT-TC---AT-GT--AGATGGCC-TGAGA-T-A----TGTGGTTGTT--G----TT-----TTC-C-TC-TGCAATGGTCCAT-A--CC-------AC--GT----TTCTCGG-T-ATCATTAC-AAGT-G-TG-GTTACGGAC-AACGCTAC-AAA-T-CCTG--TTTAGTGT-CCCGTAACC-TG-T-ATTTTGACTTCAGTTT--GTAAGCC-A--G-CTGT-TTA---CAAACA-CA-ACTCGCC-T-GATA-TTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTCTT-A-CTAAGT-TAATT-CACTCTAC-TT-ATATTTTCACCCA-C-ATTGTGAT---AT--GCAA--ACTAA-TTGGAAAGCCCAAGATCGCATCA--TTT--C-A-TATGCAG-CATC-A-T-GCT-GTTAC-----C-TCAG--CATTG-ACAAT--AA--GCTA-TGC-CTATT-G--ATGGGAATT-AAAA-CA-GATGAACA--C-ACTAT------T-TTTCTTCAAGT-GTTG-A-GTC-AAC-TG------G-TGTT--CGTT----TA--AGCAAAA-CTTT-GT-A-GGAT---C-ACTATTTAAA-ATAA-AG-TTC-ATCC-C-TTAATAA-----T--AAACTTAAATAATG--TG--TAGTGGTC-C-CG-TAAAAACCAAA--AGTTG-AAAACTGTAAAACCTC--TTATTTGTTTCTCACAAGAAAG-AGC-AGA-G--A--AATTTTTC-AAAGCAG--TTATTATTT--AATT--ATGTA---TATAGGTTGT--TAT-TAGCCAGAAATTC-TTAAGATTGC-G-GAT-G----TTTTTTAC-TTTC-----ACTG-C-AGAAATA-TAAAAA-GAATACTTTAACG---CCT-----ACCATAGTCATAG-AATC-TT-GGGGGAAATTA
gi|10 : -CA----T-TG------TTATA--CA-T--GAT-TTTC---AA-AAATAT--TG-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------CTT---TA-A-CA----T-ATTT-T-TTCAT-ACGAAT-AC-G--TAT-------AA-AGGA-------CTT---A--TG-TG-CCAA---TT--------TT--TT----CT-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTT--AA--GATAA-T--GC-AA-AAAAT-G-T-GCCCC-AAAAAGGTC-----CT-----TTT---TTAGTGT--TAT-GC-T-GTTAA--ACTTAGA-AATTGC--AATATTTT-TC--TACTGA--AA-TA-ATGGT-AAA-TT-ATT-AT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-AT---TGAACAGTC-AAT-GACGA-T--TTCTT-AACAGA-GTTTTC--T-CGCAA--ATTATGTTT-G-G-TAGC-TT--TAA--TATTT--CTA---------------G-GA-T-C--GAG----T----AAAAC--TGTT----T---GAAGT-TGCT-TGA-ATAATA-AAA-T-CTATA-T-AGG-G---G--TGCACACGTT-G--ATATCTT-TTT-AAATG--ACC--CCC-CC-CCCCGCT---------GTCT--T-T-TATGCCA--G-C--T-AAAAATAATGTCGC-TTC-TCATTT-TA---TTT---TT-C-A-TAAT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TACTGTTTTG-TT--CCGTTC-ACAGGGAAAAGGGAAA-TTG-G-G-CC--A-T-GCAACCCC---T-TT-AATTT-AGTT-TCAT----CA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-CA-AAAATTATG-A-TT-----TTA-C-AAAA-ATA------C-GTA-GTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TGAA--TTCT-ATG--AAA-TTAG--AA-AT--CTCTAT-AGATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTCT
gi|11 : GTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--T-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TG-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AC-A--TAT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAAT--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTT--AA--GATAA-A--GC-AA-AAAAT-G-T-ACCCCAACAAGGGTTGTTGTTT-----TTT---TTAGCGT--TAT-GC-T-GTTGC--ACTTAGA-AATTGC--AACATTTT-TC--TACTGA--AA-TA-ATGGT-AAA-TT-ATT-CT-A-CAT-TTTT-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-GA-GA-T--T--TTAA--AGA-TTTTTT--T-CACAA--ATTAT-TTT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAG----T--A-AAAAC--C-TT----T---GAAG--T--TATGG-G-AA-A-AAA-AG-TA-A-T-AGG-GGT-G--C---CACGTT-AT-ACATTTT-TTT--AATG--GAT--TTT-CCAC----CT---------GTTT--T---TATGTCA--A-A--T-AAAAATAATGT--C-TACATCA-TT-TAT--TTT---TT-C-A-TATT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-AGG-AAA---AAA-TTG-G-A-TC--A-T-GCAA-CCCT--T-TT-AATTT-AATT-TCAT----CA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-CA-AAAATTCAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-ATA------T-GTA-GTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TAAA--TTCT-ATG--AAA-TT
gi|12 : tacgaT-TC--TGCTGA--AA-TA-ATGGTAAA--TC-ATT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGCC-TT---TGAACA--T-AAC-CA-GA-T--T--TT-AG-AGA-ATTTTT----CACAA--ATTA--TTTTG-G-T-GC-TT--ACA--T-TTT--T-A---------------G-GA-T-C--GAG----T-AA-AAAA---T-TT----T---GAAGT-T---ATGATA-AA-A-AAA-TAT-A-A-T-AGG-G---GTGC---TACGTT-AT-GCATTTT-TT--CAATG--ATT--TTTTCC-C----CT---------GTTT--T---TATGCCA--A-A--TAAAATTTA-TGT--C-AACATCA-TT-TA---TTT---TTTC-A-TAAT-T--C-AGTCTAAAAG----TACAGT-AT--GAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGGGAAA---AAA-TTG-G-G-CC--A-T-GCAA-CCC---T-TTTAATTT-AATT-TCAC----CA--T-G-TTTT-------AAT-GC-TA-AAAATTAAG-AGTTAAAAATTA-A-AAAAAA-A------C-GTA-GTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TAAA--TTCT-GTG--AAA-TTAG--AA-AG--CTTTAT-ACATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAG-A--TAGA-CATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGT-T-A----TG-----GTG--GGGGTTT-----TTT-T-CC-TG-----GTC-ATTA--CC-------ACT-GT----TTCT
gi|13 : GGTG-AAACA-CAATTAAAG-----GG---------GCAT---T----C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--TA-T--GGT-TTTC---AA-A--------------------T-T-G--ATACA--------ATT---TA-A-CA----C-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AC-A--TTT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAAT--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTT--AA--GATAT-T--GC-AA-AAAAT-G-T-ACCCC-AAAAAGGTGA-----T-----ATT---TTAGTGT--TAT-GC-A-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AATATTTT-TC--TGCTGA--AA-TA-ATGGT-AAA-TT-ATT-TT-A-TAT-TTTC-T-TGCCTATATATGAACA--T-GAT-CA-AA-T--T--TT-AG-AGA-ATTTT
gi|13 : acg-A-TAT-TTTT-C-TGC-------TGAA-A--T-AAT----GG-T------------AA-ATTATT--T-TATA----TTT--TCT-----T-GC-CT--ATA--T-ATGAAC-A---------------T-GA-T-C---------------AAA---T-TT----TAGAGAATT-T--TGTGA---------------TA---T-GGG-T---G--C---CACGTT-AT-ACA-TTT-TTT-CAATT--GGT--CAC-CC-C----CTCCCCCCCCCGTTT------TATGCCA--A-T--GAA-----AATGT--C-TACATCA-TT-TA---TTT---TT-CTC-TACT-T--C-AATCTGAAAT----TACAGT-AT--TGATGTTCTG-TT--AT--CT-TC-AGGACAA---AAA-TTG-gtgatatgggtgccacgttatacattttttcaattggtcaccccctcccccccccgttttatgccaatgaaaatgtctacatcatttatttttctctacttcaatctgaaattacagtattgatgttctgttatcttcaggacaaaaattgttcgcaggtaac
gi|14 : acgggtgaaacacaattaaaggggcattccaatacagcattgttatatatggttttcaaattgatacaatttaacacatttgtttcataggaatacatttaaaggacttctgtgccaatttttgttgatctagcattaatagaatttaagatattgcaaaaaatgtaccccaaaaaggtgatattttagtgttatgcagttgcacttagaaactgcaGGTG-AAACT-CAAT-ATAG-----GA----CAAACGCAT---TAT--C-CAGAT-A-C--AATG-CAAT--TATG------TTATAA-CA-TTGGAT-TTGC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CTTT-A-A--GTACA--------ATTAAAAA-A-CA----TAATTTGT-TTCAT-AGGATC-AC-G--T-T-------AA-AAAATATCAGTCTTTTCT--TG-TG-CCAC---TCAAACCCAATT--GG----TGTTTCTCAGTAAATA-T-CT----AGCAACTAAGATAGA-A--TTTTAAA--GATAA-T--CA-AA-AAAAT-G-T-ACCCC-AAAAAGGTCA----TT-----TTT---ttcgcaggtaac
gi|15 : gGGTG-AAACA---AT-ACAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CCTT-T-A--CTACA--------ATT---TA-A-CA----C-ATTTTT-TTCAT-AGGAAT-AT-A--TTT-------AA-AGAA-------CTT---C--TG-TG-CGAAT--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGT-ATCA--ATAGA-A--ATT--AA--GATAT-T--GC-AA-AAAAA-G-T-ACCCC-AAAAAGGTGA----TA-----TTT---TTAGTGT--T
gi|16 : gAGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GA----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTC---AA-AAATAT--TA-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------AGT---AA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AC-G--TAT-------AA-AAGA-------CTT---C--TG-TG-CCAAT--TT--------TT--TT----TT-------------A-T-CT----AGC-ACTA--ATAGA-A--TTT--AA--GATAA-T--GC-AA-AAAAT-G-T-
gi|17 : cGGTG-AAACA-CAATCATAAAAT--GGTTGTC----GCAT---G-TG-C-CA-ATTA-C--A--GTCAATTTT-CG------TTATA--C--T--G----TTC---AAGAAATCT--T--TTTT---CTTT-T-A--ATGCA--------ATT---TA-C-TAT---T-ATTCAT-TTCAT-GAGGATAAC-C--TAT--------A-ATGA-------CTT---C--TG-TG-CCAAATTTT--------TT--GT----TG-------------A-TGCT----AG
gi|18 : T--TAT-GC-T-GTTGC--ACTTAGA-AAATGC--AACATATT-TC--TGCTGA--AA-TA-ATGGTAAA--TT-GTT-CT-A-TAT-TTTC-C-TGTC-AT---TGAACA--C-AAT-CA-GA-T--A--TT-AG-AGA-A-TTTT--T-CACCA--ATGA--TTT-G-GTT-GC-TA--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAG----T--A-AAAAC--T-TT----T---
gi|19 : TT-T-A--ATACAGGGTTCTTACC---TA-A-TAATATT-ATTTGT-TTGAT-AGGAAT-AC-A--TATATAAATAAA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAAC--TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----t
gi|2 : atacaaaaggtttcaacacaatatctttaagaacAGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG---------GCAT---T-T--C-CA-AT-AGC--A--G-CA----T-TG------TTATA--CACT--GGA-TTTC---AA-AATTA----A-TTTT---CTTT-T-A--ATACA--------ATT---TA-A-AA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AT-G--TAA-------TA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--AT-GA-A--TTT--AAAAGATAA-T--GCCAA-AAAAT-G-T-ACCCCAAAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TAT-GAGT-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TC--TTCTGA--GA-TA-ATGGTAAAAATT-ATT-C--A-TAT-CTTA-C-TGCC-AT---TGAA-A--T-AAT-CA-GA-T--T--TT-A--AGA-ATTTTT--TTCACAA--ATTA--TTT-G-G-T-GC-T---AAA--T-GTT--T-A---------------G-GA-T-C--GAG----TTAA-AAAAC--T-TTA---T---GAAGT-T--TATGA-A-AA-A-GAA-TGTTA-A-T-AGG-G---G--C---CATGTT-AT-ACATTTT-TTT-CAATG--AAT--TTC-CC-C----CT---------GTTT--T-AGTAT-CCA--A-T--TAAAAAATAATGT--T-TACATCA-TT-T-----TT---TT-C-ACTATT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGGAAAA---AAA-TTG-G-G-C---A-T-GCAT-TCC---T-TT-AATTT-AATT--CAT----CA--T-G-TTTT--T----AAT-GC-CA-AAAATTAAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-A------C-GTA-GTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TAAA--TTCC-ATG--AAA-TTAG--AA-AG--CTCTAC-AGATA--T-CA--TT-ATTTTA--A-T--TTTTAG-A--TAGA-CATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-A----TG-----GTT--G----TT-----TTT-C-CC-TG-----TTC-TTCA--CC-------ACT-GT----TTCTC-AGT-ATCATCAC-AAAT-G-TG-GTTACGGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTGTTT--AG-GT-CC-GGAACC-TG-T-AATTTGA--TCAGTTTGAG-AAG-C-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-G-C-T-GATT-ATTTT-ACAAA-GGTCA-GA-GTTT-GTTC-T-A-C-AAGT-TAA-T-CAATATACTTT-ATATTTTCACTTCTC-A-TTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCTCAA-ATCACATCAGTTTT-CCTA-TATACAG-CATCTATTAGCT-GTTAC-----GATCAGTTCA-TG-AC-AT--AA--GCAA-TG--CTATTAGACATGGGCATC-AAGATCATGATGCGCA--TAACCATT-AGTTT-CTTTTTCAA-TCTTTGAA-GTC-AACGTGCCTATCG-TGTTGGCATT----GA--A-CAAAA-TCTA-TT-ACGAATT--C-ACTATTTAAACATAA-TTATCC-ATCC-C-TT-ATAA-----A--TAACTTAAA-ATTGTCTGT-TAG-G--T-CACGTT---AACCAAA--AGTTGAAAAACT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAG--TGC-AG-----A--A--TTTTC-AAATCAG-TTTGTTATT--AATTTTAATGTAT-TTGTAGGTGATTATAT-TAGCCA-AAATTCTTTTAGATTAC---GGT-G----GTTTTT-T-TTTT-----ACTG-CAAGAAATA-AAAAAATATTTACTTGAAAAAT-CAA-----AGAATTGTCATAGAAATG-TG-TGGGAAAATTA
gi|20 : -GCAA-CCCC--T-TT-AATTT-ATTT-TCAT----CA--T-G-TTCT--T----AAT-GC-TA-AAAATTAAG-G-TT-----TCA-C-AAAA-A-ACAAAACC-ATA-GTTT--C---CGT-T-ACCACT-----TTAA--TTCT-ATG--AAA-TTAG--AA-AG--CTCTAT-A
gi|21 : A-----A--TAACTTAAAGAATG--TGT--AGTG--T-C-CG-T---AGCCAAA--AGTTGAAAA-CT-TAAAAC--T--TT---T-TTTC-C-CAAGAAAGTTGC-AGAGA--A--A--TTTTT-AAAGCAG-TTTATTATTT-AAGTTTAATGTAT-
gi|22 : -C-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT-CA-GA-T--T--TT-G--AGG-AATTTT--T-CACAAT-TTTG--TTT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-CCT------------------------------GAA----T-AA-AAA----T-TT----T---GAAG--T--TATGA-A-AA-A-AAA-
gi|23 : taTT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-A---------------G-GA-T-C--GAG----T--A-AAACC--T-TT----T---GAAG--T--TATGA-A-AA-A-AAA-TG-TA-A-C-CGG-GGA-G--C---CAGGTT-AT-ACATTTT-TTT-CAATG--Aaatgtaaa
gi|24 : ACATCA-TT-TA---TTT---TTTC-A-TACT-T--T-AGTCTAAAAT----TACACT-AC--TAATGTTCTG-TA--AC--TC-AC-AGG-AAA---ATA-TTG-G-G-CC--A-T-GCAA-CCCT--T-TT-AATTT-AATT-ctgttt
gi|25 : TCTG-TT--AC--TC-AC-AGGAAAAAA-AAA-TTG-G-G-CC--A-T-GCAA-CCC---T-TT---TTT-TATT-TT-T----TA--T-T-TTTT--T----GA-----CA-AAAAT
gi|26 : ----AAC-ATTA--ATAGA-A--TTT--AA--GATAA-T--GC-AA-AACAT-A-T-ACCCCCAAAAA-ATCA----TT-----TT----------T--TAA-GC-T-GTTGC--ACTTgtagccgaatttaa
gi|27 : GGTG-AAACA-CAAT-GTAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--
gi|28 : tcgGGCG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-
gi|29 : tatatcgGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---
gi|3 : catattacgGGTG-AA-CA-AAAT-ATAG-----GG----C-----CAT---TCT--C-CA-AT-A-C--A--GTCA----T-TG------TTATAT-CA-T--GGA-TTTC---AA-AACTAT--TA-TTTT---TCTT-T-A--ATACA--------ATT---TACA-AA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGAAT-AT-G--TAT-------AA-AGGA-------ATT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TT--ATGGTTTG-------------A-T-CT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTT--AA--GATAA-T--GC-AA-AAA-T-G-T-ACCC--AAAAAGGTCA----TT-----TTT---T-AGTGT--TAT-GC-T-GTTGC--ACTTGGA---CTGC--AACATTTT-TC--TACTGA--AG-TA-ATGGTAAAT-TT-ATT-CT-A-TAT-CTTAAC-TGCC-AT---TGAACA--T-AAT--A-GA-T--T--TT-A--AAG-AATTTT--T-CACAATTATTT--TTT-G-G-T-GC-TA--AAA--T-TTT--T-A---------------G-GA-T-C--GGA----T-AA-AAA-C--T-TT----T---GAAGT-T--AATGA-A-AA-A-AAAATGT-A-A-T-AGG-G---G--TG--CATGTTTAT-ACATTTT-TTTTCAATG--AAT--TTC-CCAC----CT---------GTTTGTT-A--ATTTCA--A-T--TAAAAAATA-TGT--T-TACAATA-TTATT---TTT---TT-C-A-TA-T-T--C-AGTCTAAA-T----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGAAAAA---AAA-TTG-G-GGCC--AAT-GCAA-CCC---TATT-AATTTTAATT-TCCT----CA--T-G-TTTT-------AAT-GC-CA-AAAATTAAG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-AA-----C-GTAAGTGT--C---CGT-A-ACCACT-----TAAAATTCCT-G-----AA-TTAG--AA-AG--CTCTAC-AGATA--T-CA--TT-A-TTTA--A-T--TTTTAG-A--TAGA-CATT-T----AT-GT--AGATG--C-TGCGA-T-A----TG-----GTG--T----TT-----TTT-C-CCGTG-----ATC-ATCAAACC-------ACTCGT----TTCTCCGGTTATCATCAC-AAAT-G-TG-GTTACGGAC------TAC-AA--T-CTGG--T--AGTGT-CC-GTAACC-TG-T-ATTTTGA---AAGTTTTTG-AAG-CCATCGCCTGT-TTT---AAAACA-CT-A-T-G-CCT-GATA-TTTTTTACAAAAGGTCA--AGGTTT-GTTC-T-AAC-AAGT-TAA-TTCAATATACTTT-AT-TTTTTACCCTGC-ATTTTGAT--GAT--G--G--ACTAATTTGGAAAGCTCAA-ATCACATCA--TTTTCC-A-TATACAG-CATC-A-TAG-T-GTTAA-----CATCAG--TA-TG-AC-AT--AT--CAAA-TG--CTATT-GACATGGGCATCCAAGA-AA-GATG-GCA--T-AC-----A---TATTTTTTCAA-T-TTTGAA-GTC-AAC-TG--------TGTT-GCATT----TA--AACAAAAATCTT-GT-ACAAATT-CC-ACTATTTAAC-ATAA-TT-TCCCATCC----T-ATAA-----A--CAACTTAAA--ATG--TGT--AGTG--T-CGCG-T---AACCAAA--CGTTGAAAA-CT-CAA--C--T--TTATTT-TTTCTC-CAAG-AAGTTGC-AGA-A--A--A--TTTTC-AAATCAGTTTTGCTA-TTGAAGTTTAATGTACATGGTAGGTGAT--TAT-TAGCCAGAAATTCTTTTAGATTAT-G-GGT-G----TTTTTT-T-TTTT-----ACTG-CAAGAAAT--AAGAAA-TATTA--TTAAAAAT-CAA-----AGAA-TGCAATAG-AATG-TG-TGGACAAATT
gi|30 : tacg-GTTACGGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTG--T--AGTGT-
gi|4 : ----AGC-ATCC--ATAGA-ACATTT--AAA-GATAACT--GC-AA-AAAAT-G-TGACCCCAAAAA-TGTCA----TT-----TCTGTGTTAGTGTGTTAT-GC-T-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TCTATACTGA--AC-TA-AT-GTAGAC-TT-ATT-CT-AGTAT-TTAA-C-TGCC-AT---TGAACA--T-AATCCA-GA-T--T--TTCA--AGC-A-TTTT--T-CACAA--ATAT--TTT-G-G-T-GC-TT--AAAATC-TTT--C-A---------------T-GACT-C--GAG----T-AC-AAAAC--G-TT----T---GAA---T--TATGA-A-AA-A-AAA-TG-TA-A-A-AGG-G---GTAC---AATGTT-AT-ATCTTTTCTTC-CAATG--AATTGTTC-TCGC----CTG--------GTTT--TGG-TATGCTA--AGA--TAAAAAATAATGT--C-TACATCAGTT-TATAGTTT---TT-C-A-TACTAT--CGAGCTTAAAATGAGCTA-GGTAAT--TGATCTCCTG-TT--AC--TC-AC-AG--AAA---AAA-TT--G-G-CCATA-T-GC-A-CCCTTAT-TT-AATTTCAATT-TCAT----CA--T-G-TTTT--CCCTGAAT-GC-TATAAAAT--AG-A-TT-----TTA-C-AAAA-A-ACG----C-GTA-GTGT--CACGCGTCA-ACCAATTCAAATAAA--TTCT-AT----AA-TCAG--AACGG--CTCTAT-AGATA--T-CA---C-A--TTA--A-TGATTCTAG-ATCTAGATCATA-GCATAAT-GTCGAGAAT--C-TGAGA-A-ATGGGTG-----GTA--G----TT-----TTTGC-TC-TGT----ATC-A-CA--CCCCAACCTACT-GT----TTCTCAGGT-ATCATCAC-AAACGG-TATGTT--GGACAA---CT-C-AAAAT-CCTGC-C--AGTGT-CC-GTAACCTTG-T-ATTTTGT--TCAAGTT--G-AAG-C-A--GCCTGT-TTTTTAAAAACAGCTAAAT-G-C-T-GA-A-GTTTT-ACAAA-GGTCA-G-GGTTT-ATTC-T-A-C--AGT-TAA-T---ATATACTTTAATATTTTCACCTCTCAATTTTGAT--GAT--GC-AATACTAATTAGAACAGCCCAA-ATCGCATCA--TAT-CC-ACTATACAGCCATCGA-TAGCT-GTTAC-----CATCAG--CA-TGAAT-AT--AACGGCAA-TG--C------ATATGGGCATT-AAGA--A-GATG-GCA--C-ACCATGAA---T-TTTTTTCAC-TAATTGAAGGTCAAAC-TG------GCTGTT-ACATTA---TATTT-TAAAA-TCTGAGT-ATGATTTACCAACTAATTAAG-ATAA-TT-TCC-ATCCGC-TT-ATAA-----AACCAAGTTAAAAAATG--TG--TAGTG--TCC-CG-T---AACCAAAGCAGTT-ACAAACT-TAAAAC--TGATTA-TT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGCAAGA-AATA--A--TGTTC-AAAGCTG--TTGTTA-TTGAAGTTT-GTGTAT-GT-TAGGTGAT--TATATAGCCATAAATCTCTTTAGATTAT-GTGGTGG----GTTTCT-TGTTTT-----ATTGTCTAAATATAGAAAAAA-AATTAC-TTAACACTACAA-----ATTACTATCAT-G-AATGTTGTTGGGGGAATTA
gi|5 : ctaGGTG-AAACA-CAAT-ATAG-----GG----C----GCAT---T-T--CTCA-A--A-C--A--G-CA----T-TG------TTATA--CA-T--GGT-TTTCCAAAA-AAATATGCTA-TTTTTCCCTTCAT-A--CTACA--------ATT---TA-A-CA----C-ATTTGTCTTCAT-AGGAAT-AC-T--T-T-------AATAGGA-------CTT---C--TG-TGGCCAT---TT--------TT--GT----TG-------------A-T-CT----AGT-ATTA--ATAGA-A--ATT--A---GATT--T--GC-AA-AAATT-G-T-ACCCCAAAAA-GGTGA----TA-----TTT---TTAGTGT--TAT-GC-T-GTTGC--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TC--TGCTGA--AA-TATATGGGTAAA-TT-A-T-CT-A-TA--TTTC-C-TGCA-TT---TGAACA--TAAAT-CA-GA-T--T--TT-T--AGAGAATTTT--T-CACAA--ATTA--TTT-G-G-T-GC-TT--ATT--T-TTT--TAA---------------G-GA-T-CT-GAG----T--A-AAAAC--T-TT----T---GAATT-C--TATGA-T-AA-A-AAA-TA-TA-A-T-AGG-GGT-G--C---CACGTT-AT-GCA-TTT-TTT-CAATGACAAT--TTC-CC-C----CT---------GTTT--T---TATGGCAAGA-T--TAAATA--AATGT--CAAACATCA-TT-TAAT-TTT---TT-C-A-TAAT-T--C-AGT-TAAAAT----TACAGT-AT--AAGT-TTCTG-TT--AC--TC-AC-GGGAAAA---AAATTTGCG-G-CC--A-T-GCAA-CCC---T-TT-TAATT-AATT-TCATCCACCA--TGG-GTTT--T----AAT-GC-TA-AAA--TAAG-A-TT-----TAA-CAAAAA-A-A------C-GTA-GTGTTCC---CGTAA-ACCACT-----T-AA--TTCTCGTG--AAA-TTAG--AA-AG--CTTTAT-AT-TAATT-CA--TT-A-TTTG--ATT--TTTTAG-A--TAGA-CATTATC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-TAA----TG-----GTGTCG----TT-----TT-------CG-----GT--AT-A--CC-------ACT-GTTTTCTTCTC-GGT-ATCATTAC-AAAT-GCTG-GTTACGGACAA---CTAC-AAAAT-CCTG-----AGTGT-CC-GTAACC-TGTT-ATTTTT---TCAGTTT--G-AAGCC-A--GTTTGT-TTT---AAACAA-CTAAAT-G-C-TCGATA-TTTTTGACAAA-GGTCAGGAGGTTTGGTTC-TAA-C-A--T-TAA-A-TACTCTACTTT-ATGTTTCCACCCACA-ATTGTGATCGAAT--GC-A--CTTATTTCGGAAA--CCAA-AT-GTATCA--CTT-CC-A-TATGCAG-CATC-A-TTGCTGGTTAC-----CCTCAG--CA-TG-ACGAT--CA--GCAATTGGCCTATTGGAAATGGGAATT-AAAA-CA-GATG-ACA--C-ACTA-T-A-----TTTTTTCAA-T-GTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTTAACATTTCAATA--A-CAAAA--CTT-GTCAAGGATT--C-ACCATTTAAG-ATAAGGT-TCCAATCC-CTTT-ATAACTACTA--TAACT------ATA--TGTGTAGTG----C-CG-T---AAAC--A--AGTTGAAAA--T-TAAAAA--T--TTATTT-TTTCCC-C-AGAAAGTTGC-AGA-G--AATA--TTTTCAAAAGCAG-TTTATTATTT-AAGTTTAATGTAT-
gi|6 : cg--TTT-G-G-T-GC-TT--AAA--T-TTT--C-AGGATCGAGTTTTTCAG-GA-T-C--GAG----T-AT-AAA-C--T-TT----T---GAAGT-T---GTAA-A-AA-ATAAA-TGT-G-A-T-AGG-A---G--TG--CACGTA-AT-ACATTTT-TT--CATTG--AAT--TTT-CC-CT---CT---------ATTT--T-A-TA--CCA--A-A--TAAAAA-TAATGT--C-TACATCA-TT-TC---TTTCTTTT-T-A-TACT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-AT--TAATGTTCTG-TT--AC--TC-AC-GGGAAAA---AA--TTG-G-G-CC--A-T-GCAA-CCT---T-TT-AATTT-AATT-TCAT----CA--T-G-TTTT-------AAT-GCGTA-AAAATTA-G-A-TT-----TTA---AAAA-A-A------CTGTA-GTGTT-C---CGT-ATACTACT-----TAAG--ATCT-ATG--AAA-TTAG--GA-AG--CTTTAT-AGATA--T-AA--TT-A-TTTA--A-T--TTCTAG-A--TAGA-CATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-A----TG-----GTG--GGTT-TT-----TTT-C-CC-TG-----GTC-ATTA--CC-------ACT-GT----TTCTCAGGT-ATCATTAC-AAAC-G-TA-GTTACAGAC-A---CTAC-AAAAT-CCTG--T--TGTGT-CC-GTAACC-TG-T-ATTTTGA--TCAGTTT--G-AAG-C-A--GTCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-G-C-T-GATA-TTTTT-ACAAA-GGTCA-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-GAGT-TAT-T-CAATCTACTTT-AT-TTTTCA-CCCTC-ATTTTGAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCTTAA-ATTACATCA--TTT-TC-A-TATACAG-CATT-A-TTGCT-GTTACATGTACCTCAG--CA-TG-AC-ATACAA--GCTA-TG--CTATT-GAAATGGGAATT-AAAA-CA-GATG-ACA--C-ACCATT-T---T-TTTTTTCAA-T-GTTGAA-GTC-AAC-TG------G-TGTT-ACATT----TA--A-CAAAA-CCTT-GT-AGGAATT-CC-ACTATTTAAG-ATAA-GT-TCC-ATCC-C-TA-ATAA-----A--TAACTTAAAGAATG--TG--TAGTG--T-C-CG-T---AACCAAA--AGTTG-AAAACT-TAAAGC---------TT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGC-AGA-A--A--AT-TTTTC-ACAGCAC-TTTGTTA-TTGAATTTCAATGTA---TACAGGCGTT--TAT-TAGCCA--------TTTA--------------------TTTT-A-TTTT-----ACTG-CAAGAAATT-AAAAAA-AATTACTTTAAAAA---AACACCTACAAATACC-TAG-AATG-TA-TAGGGAAA
gi|7 : t-----GG----C----GCAT---T-T--C-CA-AT-A-CC-AT-G-CAC---T-TG------TTATA--CA-T--GGAATTTC---AA-AA-TAT--TA-TTTT---CTTT-TTA--ATACA--------ATT---TA-A-CA----T-ATTTGT-TTCAT-AGGA-T-ACCG--TAT-------AA-AGGA-------CTT---CCCTGATG-CCAA---TT--------GT--GT----TG-------------A-TTCT----AGC-ATTA--ATAGA-A--TTT--AA--GATAA-T--GC-AA-AAAAT-GCT-ACCC--AAAAAGGTCA----TT-----TTT---TTAGTGT--TATTGC-T-GTT-C--ACTTAGA-AACTGC--AACATTTT-TC--TACTGACAAG-TA-ATGGTTAAA-TTTATT-CT-A-TAT-CTTA-C-TGCC-A----TGAACA--T-AAT-CATGATT--T--TT-A--AGA-A-TTTT--T-CAC-A--ATTAT-TTT-G-A-T-GC-TT--AAA--T-TTT----A---------------GCGA-TCC--GAG----T--A-AACAC--T-TT----T---GAAGT-T--TATGA-A-AA-A-AAG----TA-A-TCAGG-GGATG--C---CATGTT-AT-ACA-TTT-TTT-CAATG--AAT--TTCTCC-C----CT---------GTTT--T-A-T-T-CCA--A-T--TTAAAAATAATGT--T-T-CATCA-TTATT---TTT---TT-C-A-TATT-T--C-AG-CTAAAA-----TACAGT-AT--GAAT-TTCTGTTT--ACT-TC-ACGGGGAAAA---AAA-TTG-GCG-TC--A-TAGCAA-CCC---T-TT-AATTT-CATT-TCAT----TATGT-G-TTTT--T----AAT-GA-TA-AAAATTAAGAA-TT-----TTA-C-AAAA-A-ACAAAG-C-GTA-GTGT--C---CGTAA-ACCACT-----TAAA--TTCT--TG--AAA-TTAGAAAA-AG--CTCTAC-ATATA--TGCAACTTAA-TTTATTA-T--TTTTAG-AT-TAGA-CATT-TC---ATCGT--AGATG--CTTGAGATT-A----T------GTG--T----TT-----TTT-CTCC-TG-----ATC-ATCA--CC-------ACT-GT----TTCTCAGGT-ATCATTCC-AAAT-G--G-GTTACGGAC-A---CTACAAAAATACCTG--T--AGTGT-CC-GTAA-C-TG-TAATTTTGA--TCATTTTTGA-AAG-C-A--GCCTGT-TTTA--AAAACACCT-AAT-G-C-T-GATATTTTTT-ACAAA-GGTCA----GTTT-GTTC-T-A-C-AATT-TAA-T-CAATATACTTT-ATTTTTTCACCCTTC-ATTTTGAT--GATTGGC-A--Aa
gi|8 : aGGTG-AAACAACAA--ATAGATAGGGG----C----GCATATTT-T--C-CA-AT-A-CCAA--G-CACAT-T-TGGTAAAATTACA--CA-T--GGT-TT-----GA-AAATAT--TAATTTT---CCTT-T-A--CTACA--------ATT---TA-A--G----C-ATTTGT-TTCATGAGGAATTACAG--TTT-------AA-AGGA-------CTT---C--TG-TG-CCAA---TT--------TTTTGT----TG-------------A-T-ATCATAAGT-ATTA--ATAGA-A--AT---AA--GATAT-T--GC-AA-AAAAT-G-TTACCCCAAAAAGGGTT-----TTAGTA-TTT---TTAGTGT--TAT-GC-T-GTTGC--ACTTAGA-AA-TGC--AACATTTT-TC--TGCTGA--AA-TA-ATGGTAA---TT-ATTTCT-A-TAT-TTTC-CGTGCTTAT---TGAACA--T-AATTCA-GA-TAGT--TT-A--GAG-ACTTTT--T-CA-AA--ATTA--TTTTG-G-T-GCATT--AAA--T-TTT--------------------A-GA-T-CCTGAG----T-AA-AAAAC--T-TTGTGTT---GAAGT-T--TATGA-T-AA-A-AAA-TATTA-AAG-AGGTG---G--C---CACGTTTATTGCATTTT-TT--CA--G--AAT--TCC-CC-C----C----------GTTT--T-T-TGTGCCA--A-A--TAAAAA-TAAT----C-AACATCA-TT-TA---TTT---TT-C-A-TAAT-T--C-AGTCTAAAAT----TACAGT-ATAGTAATGTT-TG-TTTCAC--TCGAT-GGGAAAA---AAA-TTG-G-G-CC--A-TCGAAA-CCC---T-TT-TATTTTAATTCTCAC----CA--T-GGTTTT--T----AATTGC-TA-AA--TTAAG---CT-----TTA-C-AAAA-A-AAAC---C-GTA-GTGT--C---CGT-A-AC-ACT-----TGAA--TTCT-GTG--AAAGTTAG--AA-AG--CTGTAT-ACATA--T-CA--TT-A-TTTT--A-T--TTT-AG-A--TAGA-CATT------AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-A----TG-----GTC--G----TTGTTTTTTT-C-CC-TGCATG-GTC-ATTA--CC-------ACT-GT----TTCTCGGGT-ATCAATACAAAAT-G-TG-GTTAC-GAC-A---CTAC-AAAAA-TCTG--T--AGTGTCCC-GT-ACC-TGAT-ATTTTGA--TCAGTTT--G-AAG-C-A--GCTTGTCTTT---AAAAAC-CT-AAT-G-C-T-GATA-TTTTT-ACAAA-GG--A-GAGGTTT-GTTC-T-A-C-AAGTCTAA-T-CAa
gi|9 : ATT-TC---AT-GT--AGATG--C-TGAGA-T-A----AG-----GTG--T----TT-----TTT-C-CC-TG-----ATC-ACCA--CC-------ACT-GT----TTCTCAGGT-ATCATCAC-ATAT-G-TG-GTTACGGAC-T---CTAC-AAAAT-CCTG--T--AGTGT-CC-GTAATT-TG-T-ATTTTGA--TCAGTTT--G-AAG-C-A--GCCTGT-TTT---AAAACA-CT-AAT-G-C-T-GATA-TTTTT-ACAAA-AGTCA-GAGGTTT-GTTC-C-A-C-AAGT-TAA-T-CAATTTACTTT-AT-TTTTCA-CCCTC-ATTTTCAT--GAT--GC-A--ACTAATTTGGAAAGCCCAA-ATCGCATCA--TTT-CC-A-TATACAG-CATC-A-TAGCT-G-TAT-----CATCAG--TA-TG-AC-AT--AA--GCAA-TG--CTATT-GACATGGACATC-AAGA-CA-GATT-ACATGT-ACCA-T-A---T-TTTTTTCAA-T-TTTGAA-GT----C-TG------G-TGTT-ACATT----TA--A-CAAAA-GCTT-GT-ACGAATT-CC-ACTATTTAAG-ATAA-GT-TCC-ATCC-C-TT-ATTT-----A--TAACTTAAAGAATA--TG--TAGTG--T-C-CG-T---AACCAAA--AGTTGAAAACTT-TAAAAC--T--TTATTT-TTTCTC-CAAGAAAGTTGC-AGA-A--A--A--ATTTC-AAAGCAG-TTAGTTA-TTGAAGTTTAAAGTAT-T--TAGGTGTT--TAT-TAGCCAGAAATTCTTTAAGATTATGG-GGT-GCTTTATTTTT-T-TTTTTTTTCACTG-CAAGAAATA-AAAAAA-A---ACTT--AACAC-CTA-----CAAAT--ACATAG-AATG-TG-TGGGGAAAATActt