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Reference ( gi|5 )            :       AACTGCATAATCAAACAATTTAGTT-----TTA--TCACTAA-TTGGGT------CCGCT-AAGGTGTCCTT-CCT-AA-G-AA-TCTAGT-T-AAA----T-CACA---AT-----AA--------------TT---------------CA-AT-AGCAAC-T--ACTAGTCT---C--ACC------CA-CA--G--A----CAATA-GT--AAA--CG-AAT--------CT--AAA-CCC--G-AC-A-ATTGA--CTAAA---A-TCCT-AA-ATA-T---A----TGTA-G-AT-CGTT-TTCCTC-GG-TCCTA-TCTGG
gi|4                          :       AACTGCACAATCAAACAATTT--TTGTAAATTA--T-ACTAA-TTGGGT------C-GCT-TAGGTTTTTTT-CCT-AA-G-AA-TCAAGT-TTAAA----T--A-A---AT-----AAAACTTATTACTTTATT---------------CGGAC-AGTAA--T--ACTAGTCT---C--ACC------AA-GA--G--AG---CGACAAGT--AAA--AG-AACG-------CT--AAA-CTT--G-GC-A-ATTGA--CTAAA---A-TCCT-AA------------------------TGTT-TTCCTCGGG-TCCTA-TCT
gi|1                          : gtaacgAACTACACAATCAAACAATTTTATT-----TCAAAT-ACTAA-TTGGGTACTCCTCCACT-TAGGTTTCCTTTCCT-AAAG-AA-TCAACT----AA----T-CACT---ATTTACCAA--------------TTATTATTTTTCTTTTTCG-AC-A-CAACCT--ACTAGTCT---CTCACT------CC-C---G--A----CGACA-GCC-AAG--GG-AAT--------CTGAAAA-CCCT-G-GC-A-ATTGA--CTAAA---A-CCCT-AACATA-TATGA----TGTA-T-AT-CGTTCTTCCTC-AG-TCCTA-TCTGGt
gi|2                          :  gtaacAACTACAAAATCAAACAATT-AATC-----TTAAAT-AC-AA-TTGAGT------CCGCTTAGGGTTTCCTT-CCT-TA-A-GA-TCAAGT-T-AAA----TTCACA---AT-----AAAACTTATCATTTCTTT---------------CG-AC-AGTCTC-G--ACTAATCT---C--ACT------CA-CC--G--A----CGACA-GTTAAAA--C--AAT--------CT--AAAATCT--G-GC-A-AGT-A--CTAAA---A-CCCT-AA-ATA-T---AG---TATATA-AT-CTTT-CCCTTC-GG-TCCTATTCTG
gi|11                         : gtaacgAACTACATAATCAAACAATTTATTT-----CAA--ATACTAA-TTAGGT------CCGCG-TAGGTTTCCTC-CAT-AA-G-AA-TCAAGT-T-AAA----T-CACA---AT-----AAAAACGTACTAT---TT---------------CC-CTCAGCA------ACTAATCT---C--A---------A-CA--G--AT---CAATA-GT-------C--AAT--------AT--AAA-CTC--A-GC-A-ATGGA--CTGAA---A-
gi|6                          :         gtaacgAATGAAACAATTTATTT-----CAA--ATACTAA-TTGGGT------CCGCT-TAGGT-TCCTT-CTT-AA-G-AA-TCAAGCAT-AAA----T-CACA-----------------------------------------------T-A-TAAC-T--ACTAGTCT---C--ACT------CG-CC--T--A----ACGCA-GT--AAA--AG-AAT--------CT--AAAACCT--G-GC-A-ATTTA--CTAAA---A-CCCT-AA-ATA-T---A----TGTATA-AT-CG-T-TTCCTC-GGTTCCTA-
gi|18                         :   acgacttacacaAATCAAACAATTTATTC-----AAA--TAACTAATTTGGGT------CCACa
gi|3                          :      tgtaacgaaataccAACAATTTA-TT-----TTAG-TCACTAA-TTGGGT------CCGCT-TAGGTTTCCTT-CCTAAA-A-AA-TCAAGT-T-AAA----T-CACA---AT-----AACTT-----------TT---------------CC-TC-AGAAAC-----CT-GTCT---C--AGCAGACGACATCG--G--ATTAGCAATA-GT--CAA--TGTAATAAAAAGAACC--AAA-CCC--G-GC-A-ATTTA--CTTAATATA-TCCTAAA-ATA-T---AACACTGTG-T-AT-CGTT-TTCCTC-GG-TCGTA-
gi|15                         :                   tAACAA-TTGGTTA----CAA--TAATTAT-TTGATT------TCGCT-TAGGTTTCTTT-CCT-AT-GAAA-TCAAGT-T-CAA----T-CATA---AT-----
gi|7                          :                 tttacctATTT--TT-----TTAA-TTACTAA-TTGGGT------TCGCT-TAGTTTTCCTT-CGT-AA-G-AG-TCAAGT-T-AAA----A-AATA---GA-----AA--------------GT---------------AA-AA-AAAAAC---------------C--AAA------CA-CA--GTAA----CCA-A-GT--TAA--C----T--------CA--GAT-CCC--GAAT-A-A-CGA--GTA----------T-GT-GTA-C---A----TGTA-T-AT-CGTT-TTCCTC-GT-TCTTA-CCTGccacttactgtaca
gi|9                          :              gcggtcatgtaaacaacctaatagtA--TAATTAT-TTGAGT------TCGCT-TAGGTTTCCTT-CTT-AA-G-AAATCAAGT-T-CAA----T-TATA---G------------------------------------------AT-GGCA-C-A--ACT--TCTATAC--AAT------AA-CATTA--A----CGTTA-AT--AA---TG-AAA--------CT--AGG-ATA--G-ACTA-AATGT--CTAAA---A-CCCG-AA-ATA-----------------AT--ATT-TTCCTC-GG-TCCTA-TCTG
gi|19                         :                                gctttacctaacaaTAA-TTGGGT------CAGCT-TAGGTTTCCTT-CCT-AA-G-AA-TGAAGT-T--AA----T-CA
gi|17                         :                                             tagA-TTTGAT------TCGCT-TTGGTTTCCTT-CCT-TA-G-AA-ATTAAT-T-CAA----T-TAaca
gi|8                          :                                         tttgcctgacaaatT------CCGCT-TAGGTTTCATT-CCT-AA-G-AA-TC-ACT-T-AAAAAGGT-AAAACTTAT-----AA--------------TTTCTT-----------CG-AC-AGTT-C-TCGACTAGTCT---CG-ACT------CA-CC--G--A----CGACA-GT--AAAAAC--AAT--------CT--AAA-TCCTGG-GC-AGATTGAAACTAAA---C-GCCT-AA-ATAAT---A----TGTA-ATAT-CGTT-T-CCTC-GG-TCCTACTCTt
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): TTTACCCAACAAATGTTCAAAATGATTATAGGAGTTCGCTTGTTTCTTTCCTAAGAAATAAAGTTCAATTGTAGCTAGATTACATACATGTACGTGTAACTTCTATACTATAACATTAGC
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Reference ( family-4730 )     :                                                                                                      AACTACACAA-TCAAACA--ATTT-A-T-T-----T-NA-TN-ACTAA-TTGGGT------CCGCTTAGG-TTTCCTT-CCT-AA-G-AATC-------AAG-T-TAAA--T-CACAA-T-----A--------------A--------------TT---------------C-GACAGCAAC-T--ACTAGTCT-C--ACT--CACN-GA-CGAC--------------AGT--AAACG-AAT--------CT--AAA-CCC--GGC-A-AT--TG--ACTAAA---A-CCCT-AA-AT-AT---A----T------GT-A-N--AT-CGT-T-TTCC--TC-GG-TCCTA-TCTGG
gi|1                          :                                                                                                      AACTACACAA-TCAAACA--ATTTTA-T-T-----T-CA-AATACTAA-TTGGGTACTCCTCCACTTAGG-TTTCCTTTCCT-AAAG-AATC-------AAC-T---AA--T-CACTA-TTTACCA--------------A--------------TTATTATTTTTCTTTTTC-GACA-CAACCT--ACTAGTCT-CTCACT--C-CC-GA-CGAC--------------AGCC-AAGGG-AAT--------CTGAAAA-CCCT-GGC-A-AT--TG--ACTAAA---A-CCCT-AACAT-ATATGA----T------GT-A-T--AT-CGT-TCTTCC--TC-AG-TCCTA-TCTGG
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gi|11                         : caagttaaattacaataaaacccaagaattctctcagcagacgacaccagattaacaaaacaatgtaaaaaaaacaaaaacaaaaaaaaaaccctcatcttAACTACATAA-TCAAACA--ATTT-A-T-T-----T-CA-AATACTAA-TTAGGT------CCGCGTAGG-TTTCCTC-CAT-AA-G-AATC-------AAG-T-TAAA--T-CACAA-T-----A--------------AAAACGTACTATT--TC---------------C-CTCAGCA------ACTAATCT-C--A-----ACA-GATCAAT--------------AGT-----C--AAT--------AT--AAA-CTC--AGC-A-AT--GG--ACTGAA---A-aagataactatgca
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4730 )     :                                                                                                      AACTACACAA-TCAAACA--ATTT-A-TT-T-NA--TA-ACTAA-TTGGGT------CCGCTTAGG-TTTCCTT-CCT-AA-G-AATC-------AAG-T-TAAA--T-CACAA-T-----A--------------A--------------TT---------------C-GACAGCAAC-T--ACTAGTCT-C--ACT--CGCC-GA-CGAC--------------AGT--AAACG-AAT--------CT--AAA-CCC--GGC-A-AT--TG--ACTAAA---A-CCCT-AA-AT-AT---A----TGT------AT--AT-CGT-T-TTCC--TC-GG-TCCTA-TCTGG
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gi|13                         :                                                                                 tcagcagacgatataagaatttaacaatttaaacaaatgaaattttaaataaaacccccatcttgtaaGAGT------TCGCTT--G-TTTCTTT-CCT-AA-GAAATA-------AAG-T-TCAA--T-ataatgattc
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gi|17                         :                                                                                                                    tttacctTTT-G-CC-T-GA--CA-AATA--TTTGAT------TCGCTTTGG-TTTCCTT-CCT-TA-GAAATT-------AA--T-TCAA--T-TAccacttactgtaca
gi|18                         :                                                                                                      AAATAC-CAA-TCAAACA--ATTT-A-TT-CAAA--TA-ACTAATTTGGGT------CCACt
gi|19                         :                                                                                                                                        tgtaacgTAA-TTGGGT------CAGCTTAGG-TTTCCTT-CCT-AA-G-AATG-------AAG-T-T-AA--T-CA
gi|2                          :                                                                                                   tagAACTACAAAA-TCAAACA--ATTA-A-TC-T-TA--AATAC-AA-TTGAGT------CCGCTTAGGGTTTCCTT-CCT-TA-A-GATC-------AAG-T-TAAA--TTCACAA-T-----A--------------AAACTTATCATTTCTTT---------------C-GACAGTCTC-G--ACTAATCT-C--ACT--CACC-GA-CGAC--------------AGTTAAAAC--AAT--------CTA-AAA-TCT--GGC-A-AG--T---ACTAAA---A-CCCT-AA-AT-AT---A-----GT------AT--AT-AATCT-TTCCCTTC-GG-TCCTATTCTGaca
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Reference ( family-4730 )     :                                                                                                      AACTACACAA-TCAAACA--ATTT-A-TT-TNA--TAT-ACTAA-TTGGGT------CCGCTTAGG-TTTCCTT-CCT-AA-G-AATC-------AAG-T-TAAA--T-CACAA-T-----A--------------A--------------TT---------------C-GACAGCAAC-T--ACTAGTCT-C--ACT--CACC-GA-CGAC--------------AGT--AAACG-AAT--------CT--AAA-CCC--GGC-A-AT--TG--ACTAAA---A-CCCT-AA-AT-AT---A----T------GT-AT--AT-CGT-T-TTCC--TC-GG-TCCTA-TCTGG
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gi|11                         : caagttaaattacaataaaacccaagaattctctcagcagacgacaccagattaacaaaacaatgtaaaaaaaacaaaaacaaaaaaaaaaccctcatcttAACTACATAA-TCAAACA--ATTT-A-TT-TCA--AAT-ACTAA-TTAGGT------CCGCGTAGG-TTTCCTC-CAT-AA-G-AATC-------AAG-T-TAAA--T-CACAA-T-----A--------------AAAACGTACTATT--TC---------------C-CTCAGCA------ACTAATCT-C--A-----ACA-GATCAAT--------------AGT-----C--AAT--------AT--AAA-CTC--AGC-A-AT--GG--ACTGAA---A-aagataactatgca
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4730 )     :                                                                                                      AACTACACAA-TCAAACA--ATTT-A-TT-TNAN--A--T-A-CTAA-TTGG-GT------CCGCTTAGG-TTTCCTT-CCT-AA-G-AATC-------AAG-T-TAAA--T-CACAA-T-----A--------------A--------------TT---------------C-GACAGCAAC-T--ACTAGTCT-C--ACT--CACC-GA-CGAC--------------AGT--AAACG-AAT--------CT--AAA-CCC--GGC-A-AT--TG--ACTAAA---A-CCCT-AA-AT-AT---A----T------GT-AT--AT-CGT-T-TTCC--TC-GG-TCCTA-TCTGG
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gi|13                         :                                     tcagcagacgatataagaatttaacaatttaaacaaatgaaattttaaataaaacccccatcttgtaaTACCCAA--CAAA-------T-G-TT-CAAA--A--T-G-ATTA-TAGGAGT------TCGCTT--G-TTTCTTT-CCT-AA-GAAATA-------AAG-T-TCAA--T-ataatgattc
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gi|2                          :                                                                                                      AACTACAAAA-TCAAACA--ATTA-A-TC-TTAA--A--T-A-C-AA-TTGA-GT------CCGCTTAGGGTTTCCTT-CCT-TA-A-GATC-------AAG-T-TAAA--TTCACAA-T-----A--------------AAACTTATCATTTCTTT---------------C-GACAGTCTC-G--ACTAATCT-C--ACT--CACC-GA-CGAC--------------AGTTAAAAC--AAT--------CTA-AAA-TCT--GGC-A-AG--T---ACTAAA---A-CCCT-AA-AT-AT---A-----------GT-AT--AT-AATCT-TTCCCTTC-GG-TCCTATTCTGaca
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4730 )     :                                                                                                      AACTACACAA-TCAAACA--ATTT-ATTTNA--A--AT-A-CTAA-TTGG-GT------CCGCTTAGG-TTTCCTT-CCT-AA-G-AATC-------AAG-T-TAAA--T-CACAA-T-----A--------------A--------------TT---------------C-GACAGCAAC-T--ACTAGTCT-C--ACT--CACC-GA-CGAC--------------AGT--AAACG-AAT--------CT--AAACCC--GGC-A-AT--TG--ACTAAA---A-CCCT-AA-AT-AT---A----T------GT-AT--AT-CGT-T-TTCC--TC-GG-TCCTA-TCTGG
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Reference ( family-4730 )     :                                                                                                      AACTACACAA-TCAAACA--ATTT-AT-TT--CAA--AT-A-CTAA-TT----GGGT------CCGCTTAGG-TTTCCTT-CCT-AA-G-AATC-------AAG-T-TAAA--T-CACAA-T-----A--------------A--------------TT---------------C-GACAGCAAC-T--ACTAGTCT-C--ACT--CACC-GA-CGAC--------------AGT--AAACG-AAT--------CT--AAACCC--GGC-A-AT--TG--ACTAAA---A-CCCT-AA-AT-AT---A----T------GT-AT--AT-CGT-T-TTCC--TC-GG-TCCTA-TCTGG
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gi|13                         :                                                tcagcagacgatataagaatttaacaatttaaacaaatgaaattttaaataaaacccccatcttgtaaAACA--A----ATGTT--CAA--A--A--TGA-TTATAGGAGT------TCGCTT--G-TTTCTTT-CCT-AA-GAAATA-------AAG-T-TCAA--T-ataatgattc
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gi|15                         :                                                                                                                ttctAACA--ATTG-GT-TA--CAA--TA-A-TTAT-TT----GATT------TCGCTTAGG-TTTCTTT-CCT-AT-GAAATC-------AAG-T-TCAA--T-CATAA-T-----aga
gi|17                         :                                                                                                                             tttacct--CAA--AT-A------TT----TGAT------TCGCTTTGG-TTTCCTT-CCT-TA-GAAATT-------AA--T-TCAA--T-TAccacttactgtaca
gi|18                         :                                                                                             tttgcctgaAAATAC-CAA-TCAAACA--ATTT-A--TT--CAA--ATAA-CTAATTT----GGGT------CCACt
gi|19                         :                                                                                                                                     tgtaacgT-A-GTAA-TT----GGGT------CAGCTTAGG-TTTCCTT-CCT-AA-G-AATG-------AAG-T-T-AA--T-CA
gi|2                          :                                                                                                      AACTACAAAA-TCAAACA--ATTA-AT-CT--TAA--AT-A-C-AA-TT----GAGT------CCGCTTAGGGTTTCCTT-CCT-TA-A-GATC-------AAG-T-TAAA--TTCACAA-T-----A--------------AAACTTATCATTTCTTT---------------C-GACAGTCTC-G--ACTAATCT-C--ACT--CACC-GA-CGAC--------------AGTTAAAAC--AAT--------CTA-AAATCT--GGC-A-AG--T---ACTAAA---A-CCCT-AA-AT-AT---A-----------GT-AT--AT-AATCT-TTCCCTTC-GG-TCCTATTCTGaca
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Reference ( family-4730 )     :                                                                                                      AACTACACAA-TCAAACA--ATTT-AT-TT--CAA--AT-A-CTAA-TT----GGGT------CCGCTTAGG-TTTCCTT-CCT-AA-G-AATC-------AAG-T-TAAA--T-CACAA-T-----A--------------A--------------TT---------------C-GACAGCAAC-T--ACTAGTCT-C--ACT--CACC-GA-CGAC--------------AGT--AAACG-AAT--------CT--AAACCC--GGC-A-AT--TG--ACTAAA---A-CCCT-AA-AT-AT---A----T------GT-AT--AT-CGT-T-TTCC--TC-GG-TCCTA-TCTGG
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtaacGT-A-AC--TA--ATTAAG---A-TCCT-GA-AC-AT---A----T------AC-AT--AT-CGT-T-TTCC--TT-GA-TTCTA-TC
gi|11                         : caagttaaattacaataaaacccaagaattctctcagcagacgacaccagattaacaaaacaatgtaaaaaaaacaaaaacaaaaaaaaaaccctcatcttAACTACATAA-TCAAACA--ATTT-AT-TT--CAA--AT-A-CTAA-TT----AGGT------CCGCGTAGG-TTTCCTC-CAT-AA-G-AATC-------AAG-T-TAAA--T-CACAA-T-----A--------------AAAACGTACTATT--TC---------------C-CTCAGCA------ACTAATCT-C--A-----ACA-GATCAAT--------------AGT-----C--AAT--------AT--AAACTC--AGC-A-AT--GG--ACTGAA---A-aagataactatgca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gtaacgCT--GGCTA-AT--TA----TAAG---A-TCCT-GA-AT-AT---A----T------GC-ATGTAT-CGT-C-TTAC--TC-GG-TCCTA-TCTGG
gi|13                         :                                                tcagcagacgatataagaatttaacaatttaaacaaatgaaattttaaataaaacccccatcttgtaaAACA--A----ATGTT--CAA--A--A--TGA-TTATAGGAGT------TCGCTT--G-TTTCTTT-CCT-AA-GAAATA-------AAG-T-TCAA--T-ataatgattc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                              tttaccc--------------TT---------------C-GACAGCAAC-T--ATTAGTCT-C--ACT--CGCC-GA-CGAC--------------AGT--AAAAT-GAT--------CTA-AAACCT--GGC-A-AT--TG--ACTAAA---ACCCCT-AA-AT-AT---A----T-------T-AT--ATCCGT-T-TTCC--TC-GA-T-CTATTCTGtgtagctagattacatacatgtacgtgtaacttctatactataacattagc
gi|15                         :                                                                                                                ttctAACA--ATTG-GT-TA--CAA--TA-A-TTAT-TT----GATT------TCGCTTAGG-TTTCTTT-CCT-AT-GAAATC-------AAG-T-TCAA--T-CATAA-T-----aga
gi|17                         :                                                                                                                             tttacct--CAA--AT-A------TT----TGAT------TCGCTTTGG-TTTCCTT-CCT-TA-GAAATT-------AA--T-TCAA--T-TAccacttactgtaca
gi|18                         :                                                                                             tttgcctgaAAATAC-CAA-TCAAACA--ATTT-A--TT--CAA--ATAA-CTAATTT----GGGT------CCACt
gi|19                         :                                                                                                                                     tgtaacgT-A-GTAA-TT----GGGT------CAGCTTAGG-TTTCCTT-CCT-AA-G-AATG-------AAG-T-T-AA--T-CA
gi|2                          :                                                                                                      AACTACAAAA-TCAAACA--ATTA-AT-CT--TAA--AT-A-C-AA-TT----GAGT------CCGCTTAGGGTTTCCTT-CCT-TA-A-GATC-------AAG-T-TAAA--TTCACAA-T-----A--------------AAACTTATCATTTCTTT---------------C-GACAGTCTC-G--ACTAATCT-C--ACT--CACC-GA-CGAC--------------AGTTAAAAC--AAT--------CTA-AAATCT--GGC-A-AG--T---ACTAAA---A-CCCT-AA-AT-AT---A-----------GT-AT--AT-AATCT-TTCCCTTC-GG-TCCTATTCTGaca
gi|3                          :                                                                                                              gtaacgAACA--ATTT-AT-TT--TAG--TC-A-CTAA-TT----GGGT------CCGCTTAGG-TTTCCTT-CCTAAA-A-AATC-------AAG-T-TAAA--T-CACAA-T-----A--------------ACTT-----------TT---------------C-CTCAGAAAC-----CT-GTCT-C--A-----GCA-GA-CGACATCGGATTAGCAATAGT--CAATGTAATAAAAAGAACC--AAACCC--GGC-A-AT--TT--ACTTAATATA-TCCTAAA-AT-AT---AACACT------GT-GT--AT-CGT-T-TTCC--TC-GG-TCGTA-
gi|4                          :                                                                                                     tAACTGCACAA-TCAAACA--ATTT-TT-GT--AAATTAT-A-CTAA-TT----GGGT------C-GCTTAGG-TTTTTTT-CCT-AA-G-AATC-------AAGTT-TAAA--T--A-AA-T-----AAAACTTATTACTTTA--------------TT---------------CGGACAGTAA--T--ACTAGTCT-C--ACC--AAGA-GAGCGACA-------------AGT--AAAAG-AACG-------CT--AAACTT--GGC-A-AT--TG--ACTAAA---A-TCCT-AA-------------------------------TGT-T-TTCC--TCGGG-TCCTA-TCT
gi|5                          :                                                                                                gtaacgAACTGCATAA-TCAAACA--ATTT-AG-TT--TTA--TC-A-CTAA-TT----GGGT------CCGCTAAGG-TGTCCTT-CCT-AA-G-AATC-------TAG-T-TAAA--T-CACAA-T-----A--------------A--------------TT---------------C-AATAGCAAC-T--ACTAGTCT-C--ACC--CACA-GA-CAAT--------------AGT--AAACG-AAT--------CT--AAACCC--GAC-A-AT--TG--ACTAAA---A-TCCT-AA-AT-AT---A----T------GT-AG--AT-CGT-T-TTCC--TC-GG-TCCTA-TCTGGt
gi|6                          :                                                                                                         TACACAAATGAAACA--ATTT-AT-TT--CAA--AT-A-CTAA-TT----GGGT------CCGCTTAGG--TTCCTT-CTT-AA-G-AATC-------AAG-CATAAA--T-CAC-A-T-----A-----------------------------------------------------TAAC-T--ACTAGTCT-C--ACT--CGCCTAA-CG-C--------------AGT--AAAAG-AAT--------CTA-AAACCT--GGC-A-AT--TT--ACTAAA---A-CCCT-AA-AT-AT---A----T------GT-ATA-AT-CG--T-TTCC--TC-GGTTCCTA-
gi|7                          :                                                                                                   acgactTAAACAA-CCTAATAGTATTT--T-TT--TAA--TT-A-CTAA-TT----GGGT------TCGCTTAGT-TTTCCTT-CGT-AA-G-AGTC-------AAG-T-TAAA-----A-AA-T-----A------------------------------------------------GAAAGTAAA-A--AAAA--------------ACC-AA-ACAC--------------AGT--AACCA-AGT--------T----AACTC--AG----ATCCCG--AATAA---------C-GA-GT-AT---G----TGTACATGT-AT--AT-CGT-T-TTCC--TC-GT-TCTTA-CCTGa
gi|8                          :                                                                                                                                                     gcggtcatgT------CCGCTTAGG-TTTCATT-CCT-AA-G-AATCACTTAAAAAG-G-TAAAACT-TATAATT-----T--------------C--------------TT---------------C-GACAGT-TC-TCGACTAGTCT-CG-ACT--CACC-GA-CGAC--------------AGTAAAAAC--AAT--------CT--AAATCCTGGGC-AGAT--TGAAACTAAA---C-GCCT-AA-ATAAT---A----T------GTAAT--AT-CG--T-TTCC--TC-GG-TCCTACTCT
gi|9                          :                                                                                                                           TTT-AC-CTAACAA--AT-AATTAT-TT----GAGT------TCGCTTAGG-TTTCCTT-CTT-AA-GAAATC-------AAG-T-TCAA--T-TATA--------G--------------A--------------T------------------GGCA-CAAC-T--TCTA---TAC--AATAACATT-AA-CGTT--------------AAT---AATG-AAA--------CT--AGGATA--GACTA-AA--TG--TCTAAA---A-CCCG-AA-AT-A-------------------AT--A----T-T-TTCC--TC-GG-TCCTA-TCTG


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blockSeqs                     :                                                                                                                .       .     AT    .    TA    C    .  .       .              .       .   .  . A    .         . . C  .  .  C  . AACTTTTC                                                  G    T       G   . ACT       C   .    .                AAAAT      GCT               .    . .  .  A        .   C    .  .  .  ATAC                .   .   . .    .   .  .     .
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4730 )     :                                                                                AACTACACAA-TCAAACA--ATTT-AT-TT--CAA--AT-A-CTAA-TT----GGGT------CCGCTTAGG-TTTCCTT-CCT-AA-G-AATC-------AAG-T-TAAA--T-CACAA-T-----A--------------A--------------TT---------------C-GACAGCAAC-T--ACTAGTCT-C--ACT--CACC-GA-------CGAC--------------AG--T----------AA--AAG--AAT-CT--AAACCC--GGC-A-ATTG--ACTAAA---A-CCCT-AA-AT-AT---A----TGT-AT--AT-CGT-T-TTCC--TC-GG-TCCTA-TCTGG
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtaacgCT--GGCTA-ATTA----TAAG---A-TCCT-GA-AT-AT---A----TGC-ATGTAT-CGT-C-TTAC--TC-GG-TCCTA-TCTGG
gi|13                         :                          tcagcagacgatataagaatttaacaatttaaacaaatgaaattttaaataaaacccccatcttgtaaAACA--A----ATGTT--CAA--A--A--TGA-TTATAGGAGT------TCGCTT--G-TTTCTTT-CCT-AA-GAAATA-------AAG-T-TCAA--T-ataatgattc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                        tttaccc--------------TT---------------C-GACAGCAAC-T--ATTAGTCT-C--ACT--CGCC-GA-------CGAC--------------AG--T----------AA--AAT--GAT-CTA-AAACCT--GGC-A-ATTG--ACTAAA---ACCCCT-AA-AT-AT---A----T-T-AT--ATCCGT-T-TTCC--TC-GA-T-CTATTCTGtgtagctagattacatacatgtacgtgtaacttctatactataacattagc
gi|15                         :                                                                                          ttctAACA--ATTG-GT-TA--CAA--TA-A-TTAT-TT----GATT------TCGCTTAGG-TTTCTTT-CCT-AT-GAAATC-------AAG-T-TCAA--T-CATAA-T-----aga
gi|17                         :                                                                                                       tttacct--CAA--AT-A------TT----TGAT------TCGCTTTGG-TTTCCTT-CCT-TA-GAAATT-------AA--T-TCAA--T-TAccacttactgtaca
gi|18                         :                                                                       tttgcctgaAAATAC-CAA-TCAAACA--ATTT-A--TT--CAA--ATAA-CTAATTT----GGGT------CCACt
gi|19                         :                                                                                                               tgtaacgT-A-GTAA-TT----GGGT------CAGCTTAGG-TTTCCTT-CCT-AA-G-AATG-------AAG-T-T-AA--T-CA
gi|2                          :                                                                                AACTACAAAA-TCAAACA--ATTA-AT-CT--TAA--AT-A-C-AA-TT----GAGT------CCGCTTAGGGTTTCCTT-CCT-TA-A-GATC-------AAG-T-TAAA--TTCACAA-T-----A--------------AAACTTATCATTTCTTT---------------C-GACAGTCTC-G--ACTAATCT-C--ACT--CACC-GA-------CGAC--------------AGT-T----------AA--AAC--AAT-CTA-AAATCT--GGC-A-AGT---ACTAAA---A-CCCT-AA-AT-AT---A-----GT-AT--AT-AATCT-TTCCCTTC-GG-TCCTATTCTGaca
gi|3                          :                                                                                        gtaacgAACA--ATTT-AT-TT--TAG--TC-A-CTAA-TT----GGGT------CCGCTTAGG-TTTCCTT-CCTAAA-A-AATC-------AAG-T-TAAA--T-CACAA-T-----A--------------ACTT-----------TT---------------C-CTCAGAAAC-----CT-GTCT-C--A-----GCA-GA-------CGACATCGGATTAGCAATAG--TCAATGTAATAAA--AAG--AA--CC--AAACCC--GGC-A-ATTT--ACTTAATATA-TCCTAAA-AT-AT---AACACTGT-GT--AT-CGT-T-TTCC--TC-GG-TCGTA-
gi|4                          :                                                                               tAACTGCACAA-TCAAACA--ATTT-TT-GT--AAATTAT-A-CTAA-TT----GGGT------C-GCTTAGG-TTTTTTT-CCT-AA-G-AATC-------AAGTT-TAAA--T--A-AA-T-----AAAACTTATTACTTTA--------------TT---------------CGGACAGTAA--T--ACTAGTCT-C--ACC--AAGA-GAG------CGACA-------------AG--T----------AA--AAG--AACGCT--AAACTT--GGC-A-ATTG--ACTAAA---A-TCCT-AA-------------------------TGT-T-TTCC--TCGGG-TCCTA-TCT
gi|5                          :                                                                          gtaacgAACTGCATAA-TCAAACA--ATTT-AG-TT--TTA--TC-A-CTAA-TT----GGGT------CCGCTAAGG-TGTCCTT-CCT-AA-G-AATC-------TAG-T-TAAA--T-CACAA-T-----A--------------A--------------TT---------------C-AATAGCAAC-T--ACTAGTCT-C--ACC--CACA-GA-------CAAT--------------AG--T----------AA--ACG--AAT-CT--AAACCC--GAC-A-ATTG--ACTAAA---A-TCCT-AA-AT-AT---A----TGT-AG--AT-CGT-T-TTCC--TC-GG-TCCTA-TCTGGt
gi|6                          :                                                                                   TACACAAATGAAACA--ATTT-AT-TT--CAA--AT-A-CTAA-TT----GGGT------CCGCTTAGG--TTCCTT-CTT-AA-G-AATC-------AAG-CATAAA--T-CAC-A-T-----A-----------------------------------------------------TAAC-T--ACTAGTCT-C--ACT--CGCCTAA-------CG-C--------------AG--T----------AA--AAG--AAT-CTA-AAACCT--GGC-A-ATTT--ACTAAA---A-CCCT-AA-AT-AT---A----TGT-ATA-AT-CG--T-TTCC--TC-GGTTCCTA-
gi|7                          :                                                                             acgactTAAACAA-CCTAATAGTATTT--T-TT--TAA--TT-A-CTAA-TT----GGGT------TCGCTTAGT-TTTCCTT-CGT-AA-G-AGTC-------AAG-T-TAAA-----A-AA-T-----A------------------------------------------------GAAAGTAAA-A--AAAA--------------ACC-AA-------ACAC--------------AG--T----------AACCAAGTTAAC-TC--AGATCC----C-G-AATA--ACGAG---------T-AT-GT-GT---ACA--TGT-AT--AT-CGT-T-TTCC--TC-GT-TCTTA-CCTGa
gi|8                          :                                                                                                                               gcggtcatgT------CCGCTTAGG-TTTCATT-CCT-AA-G-AATCACTTAAAAAG-G-TAAAACT-TATAATT-----T--------------C--------------TT---------------C-GACAGT-TC-TCGACTAGTCT-CG-ACT--CACC-GA-------CGAC--------------AG--T----------AA--AAAC-AAT-CT--AAATCCTGGGC-AGATTGAAACTAAA---C-GCCT-AA-ATAAT---A----TGTAAT--AT-CG--T-TTCC--TC-GG-TCCTACTCT
gi|9                          :                                                                                                     TTT-AC-CTAACAA--AT-AATTAT-TT----GAGT------TCGCTTAGG-TTTCCTT-CTT-AA-GAAATC-------AAG-T-TCAA--T-TATA--------G--------------A--------------T------------------GGCA-CAAC-T--TCTA---TAC--AATAACATT-AA-------CGTT--------------AA--T-----------A--ATG--AAA-CT--AGGATA--GACTA-AATG--TCTAAA---A-CCCG-AA-AT-A-------------AT--A----T-T-TTCC--TC-GG-TCCTA-TCTG
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): AATAACATTAACGTTAAAAAAGAAACCCGGATCTACCAACCGACTAAATCCGAAATAAATATGTTCCTCCATCTTGCA