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lowQualScore : ...... ....... .. .. .. . ... . ...................... . . ... . .... . ................................................................................................................................. .. . . .. .......... . ........................................................................................ ... . . .. ......... ... . . .... . ........ ... . ..... ... .. .. . ... ..... . . ....................................................... . ....... . .. . ............... ..... ..... . .... ......... .......................................................................... ....... . . ... .. ............................................................... . . . .. . ........................................................................................... . . ....... . . .. ... ... . . .. . . ... ...... .
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Reference ( gi|3 ) : CTTTTAT-G-AAATTCGAT------TATC--G--T--C-A---A-CAT----C--------T--------GCAATGT-CGAC-A---A-T----G-TTGACAC----AG-----------A-CG-GA--TAT--T--CGAC----GT---C-T---ACAT-CG--------GT-T--A---TC-ATTT----TC-CT-T--T---G----CAT-GG--T-CAAC--TT--TATC--G-TCGA-CATCG--C----------AATG-TC---------G---------A---------C----------A----------C--GATAC----C-------CG---A-----GG----TCT-A-CAT-CG--T-C-------T---ACA-TCG-TT-A--TTA-TT--------TCT---T-T-----C---AT--G--T-CA---AC---CATCG-TCGA-CATT-CG-CA----AT--T-GT-C--GA-C-A-ATG----GTTG-A---------A-A-CG-------ATA-T--C-G-----A---------G-----T---C-TA-C----AT---------CG-----------T-T---ATC-----A-T--TT------C--T---T-T---CAT--G---T-----CA--A-A-CATT-------G-TCGA-CATC--G--C-------AA--T----------TGT-C--G---AC--A-----CG-------A---------ATA-TC-GA-GTCTA-CATCG--C-TC-T---ACA-T-CG--------T-T--ATC---A-TT--TCCT-TT--C--A--T-G--T----CA--------------------A-CAT-C-------G-T-C--G---A---C-A-T-CGCAAT-G-T---CGAC---A--A-TGTCTA
gi|11 : CTTTCAT-G-----TCAAC-------ATC--G--T--C-G---A-CAT----C-----------------GCAATGT-TGAC-A---A-T----G-TCTACAC----------------------GA--TAT--T---GA-----GT---C-T---ACAT-CGTCTACATCGT-T--A---TC-ATT------C-CT-T--T--------CAT-G---T-CAAC-------ATC--T-TTGA-CATCA--C----------AATG-TCAACAATGTTG---------A---------C----------A----------C--GATA-----T-------CG---A-----G
gi|4 : ttcatgtcgaattccttttatgaattcgatatcgtcaacattgtctacatcgttatcatttCCTTTAT-C-AA-TTTGAT-------ATT--G--T--C-A---A-CAC----C-----------------GCAATGT-TGAC-A-------------TGATA--------------------------------T--CAA-------------------------------GT-T--A---AC-ATTC----GCTCT-T--T---G------------T-CAA-------TATC--G-TTGA-CATCA--C----------AATC-TC---------C---------A---------C----------A----------C--TATAT----C--------G---A-----G-----TTT-A-CAT-AT--T-C-------T---ACA-TTG-TT-A--TTA-T----------CT---T-T-----T---ATAAG--T-AG---AC----ATAA-TCGA-TAT--CG-CA----AT----GT-T--GA-T-G-ATG-----TTG-A-------------CA-------ATA-T--C-T-----A---------G-----T---T-TA-C----AT---------CA-----------T-T---AT-----------TT------C--T---T-C---CAT--G---T-----CC--A---CATT-------G-TCAA-CATT--G-------------------------TGT----A---AC--T-----CT------------------TA-TC-CA-GTTTA-CATCA--T-TG-----GCA-T-TG--------TGT--A-C---A-GT--T--T-GT--C--C--T-G--T----TT--------------------A-CAT-C-------G-T-
gi|5 : atgtcgattccCCTTTAT-A-CAATTTGAT-------ATT--G--T--C-A---A-CAC----C-----------------GCAATGT-TGAC-A-------------TGATA--------------------------------T--CAA-------------------------------GT-T--A---AC-ATTC----GCTCT-T--T---G----T------------C--TA--TATC--G-TTGA-CATCA--C----------AATC-TC---------C---------A---------C----------A----------C--TATAC-------------G---A-----G-----TTT-A-CAT-AT--T-C-------T---ACA-TTG-TT-A--TTA-TC--------T-T---T-T-----A---AT--A--G-TA---GA---CATAA-TCGA-TAT--CG-CA----AT----GT-T---A-T-G-ATG-----TTG-A-------------CA-------ATA-T--C-T-----A---------G-----T---T-TA-C----AT---------CA-----------T-T-------------T--TT------C--T---T-C---CAT--G---T-----CC--A---CATT-------G-TCAA-CATT--G-------------------------TGT----A---AC--T-----CT------------------TA-TC-CA-GTTTA-CATCA--T-TG-----GCA-T-TG--------TGT--A-C---A-GT--T--T-GT--C--C--T-G--T----TT--------------------A-CAT-C-------G-T-t
gi|14 : tcgattccCCTTTAT-C-AA-TTCGAT-------ATC--G--T--C-A---A-CAT----C-----------------GCAATGT-CGAC-A---G-T------TTGATAC----------------------GA--TAT-----CGA-----GT---T-A---ACAT-TG------------------TC--TTC----GC-CT-T--T---G------------T-CAAC-------ATC--T-TCGA-CATTG--C----------AA----------------------------------C----------A----------C--CATAT----T--------G---A-----G-------------------T-T-------T---ACA-TCG-CT-A--TTA-TT--------TCT---T-C-----C---AT--A--T-TA---A----CATCG-TCTA-CA-T-CG-CT----AT--T-AT-tca
gi|9 : cattcatgccctgtcgaccCTTTTAT-G-AA-TTCGAT-------ATC--G--T--C-A---A-CAT----C-----------------GCAATGTTCGAC-A---AAT----G-TTGATACCATTAT-----------A-TC-GAGTTAT--C----AC----GT---T-TGTAACAT-C----------T-T--AA--TC-ATTT----TC-TT-C--C---C----TAT-GA--TTCAACATCT--TAGCAAG-TCGA-C------C----------AATG-TT---------G---------A---------C----------A----------C--GATAT----C-------GGAATA-----GGAATTTTT-A-CATACG--T-TTTTACAAT---ACA-TCG-TT-A---TA-TT--------
gi|16 : tcatgtccagttccCCTTTATTG-A--TTTGAT-------ATC--G--T--T-A---A-CAT----C-----------------GCAATGT-CGAG-A---A-T----G-TTGACAC----------------------GA--T-T--T--CGA-----GT---T-T---ACAT-TGCCAATATCGT-T--A---TC-ATTTC---TC-CT-A--T---G----cagttgacacagatatttgagtctaca
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gi|6 : attcatgatccagttcctAT-GTAAATTCAATA-----TAGT--G--T--C-A---A-CAT----TGTCGACATT--------GCGATGT-CTAC-ATGAA-T----G-TTGACatttat
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gi|4 : tcatgtccagttccatttatctattcaatatcgtcatcatcgcattgttgacaattaatgttcatacgatatcgagttaacatcccccccccctAACTTGAT-------ATCATG--T--C-A---A-CAT-------------T--------GCGGTGT-TGAC-A---A-T----A-Tacgtcatctacatcattattatttcttccatgtccacattgttgacatcgcaatgtcgatggtgttgacaagagatcgagtttacattgatcgttattagttcgtccatgtccatattgtcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtatctctcatcatgtttacatcattcacatcgtcgacatcgcagtgctgcaagtattaggtgcggccccaggttcgaacatgtgtacagtttgttctgtttcacttcaagtcggcatcacccaatgtcgtgcttagcatgtagacgataaaaatcctgacatcgtgttcattttcagtataaccatcatttataccctcacctggtttacacttgtcgcattgcaatgtagtacgatatggaatccagatatcaataattaacaggtaagaggaatttacaaagttgacacaatgtcaattagacatcattatccagtaaacatttgccgaatggtcgacctatgtgaatgattggtaaaaaaggtatacaaaaggtacacaatgctggtcaccgatgtcgatttcgatattgttaatcattgcgaaacgtgaacgatgcagcaagataagaggctaccat
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gi|2 : tcgattcccctttatacaatttgAATTCGAT------T-TC--G--TT-C-A---A-CAT----A-----------------GCAATGT-TGAC-A---AGT----G-TTGATAC----GA-----------A-------------------------T---C-T---A-AT-TA--------GC-A--A---TT-GTCTGTAGCC-CT-T--C----------------T-CAAC-------ATC--G-T--A-CATTG--C----------A-TT-TT---------G-------------------C----------A----------C--GA--------------------A-----TG----TCG-A------G--T---------T---ACA-TCG-TT-A--TTATTT--------TCT---T-C-----C---AT--G--G-CG---CT---CATCG-TCGA-AA---CG-CA----A---A-GT-T--GG-T-ACAT-----ATCA-ATC-------A-A-CG-------AT--T--C-G-----A---------A-----TTGGT-TA-CCT--AT---------CC-----------A-T---GTT-----G-T--CT------C--T---A-T---CGT------T-----C-----A-CATCTCTA---G-TGAA-C-TC--A--T-------GA--T----------T-----------T--A-----CG-------A---------AT-----GA-A---A-CATCG--G-T--T---GAA-T-TG--------TGT--ATC---T-CTTATCCT-TT--TCAA--C-G--T----TC--------------------A-CAT-C-------G-T-C--G---A---C-ATT-CG-AAT-G-TTTGTGAC---G--A-TATaacattcgctctttgtctatatcgttgacatcacaatctccacactatacgagtttacatattctacattgttattatcttttaatagtagacataatcgatatcgcaatgttatgatgttgacaatatctagtttacatcatttttcttccatgtccacattgtcaacattgtgtaactcttatccagtttacatcattggcattgtgtacagtttgtcctgtttacatcgttca
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gi|1 : tccaatgattgatgtttATTCAAT-------ATC--G--T--C-A---T-CAT----C-----------------GCATTGT-TGAC-A---A-TTAATG-TTCATAC----------------------GA--TAT-----CGA-----GT---T-A---ACAT-C--------------------C-CCCC----CC-CC-T--T---G------------T-CAAC-------ATC--G-TCAA-TATTG--C----------GATG-TT---------G---------A---------C----------A----------C--GATAT----C------------A-----AG----TTT-A-CGT-CA--T-C-------T---ACA-TCA-TT-A--TTA-TT--------TCT---T-C-----C---AT--G--T-CC---A----CATTG-TTGA-CA-T-CG-CA----A---T-GT-C--GA-T-G-GT-----GTTG-A---------C-A-AG-------AGA-T--C-G-----A---------G-----T---T-TA-CATTGAT---------CG-----------T-T---ATT-----A-G--TT------C--G---T-C---CAT--G---T-----C---C-A-TATT-------G-TCGA-CNNN--N--N-------NN--N----------NNN-N--N---NN--N-----NN-------N---------NNN-NN-NN-NNNNN-NNNNN--N-NN-N---NNN-N-NN--------N-NNAAGT---A-TC--TCTC-AT--C--A--T-G--TTTA-CATCATTC--------------A-CAT-C-------G-T-C--G---A---C-A-T-CGCAGT-G-C---TG-C---A--A-aacattgtttttcattgatatatttataaatcattgatgccattgtaatgtttgacaatatcaagtttacatttaacagaaatcgagtgccgcttttcctgtttacatcgttca
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gi|11 : ttcatgtcgaattccttttatgaattcgatatcgtcaacattgtctacatcgttatcatttctttcaATT--G--T--T-G---A-CAT-------------T--------GTGATGT-CAAA-G---A-T----G-TTGACAT----GA-----------A-AG-GA---ATGATAACGAT----GT---------AGA--CG--------ATGT--AGACTC-AATA----TC-GT------------------G--T-AGAC-------ATT--G-TCAA-CATTG--C----------GATG-TC---------G---------A---------C----------gtctacacgatattgagtctacatcgtctacatcgttatcattcctttcatgtcaacatctttgacatcacaatgtcaacaatgttgacacgatatcgag
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gi|15 : ctaccgttacattattcagcaggttctttaaATC--G--T--C-G---A-CAT----------------------GCAATGT-CGATGA---A-T----G-TTGATAC----------------------GA--TA---T--CGA-----GT---T-T---ACAT-CG--------GC-T--A----C-ATTgttgacaccgatattgaagtcatacacacgttaattattcttcccatgtacaacacacaacacaacaaaggttatgtattggagagcttgtaactctggatctttataacaatatgcttcctcgcaatttaccagag
gi|24 : cattcatgtcctgttctcctttatttcatttcgatattgtcaacttgcaacattagtaaacctctatttccctattgacatcagttcacATC--G--A--C-G---A-CAT----C-----------------GCAATGT-CAAC-A---A-T----G-TTCACAC----------------------GA--TA---T--CAA-----GT---C-T---ACA
gi|24 : atgtcaacATT--G--T--T-G---A-CAT-------------T--------GCGATGT-CGTC-G---A-T----G-TTGACAac
gi|12 : a--G--T--C-G---A-CAT----C-----------------ACAATGC-CGAC-A---A-T----GTTTGATAT----------------------GA--TAT--C--AGA-----GT---T-T---ACAT-CG--------TT-TACA---TC-GTTT----TA-TT-T--TTTCC----CAT--T--T-CCAC-------ATC--G-TCGA-CATAA--A----------AATG-TT---------G------------------------------A----------T--GATAT----C-------gttcacacgatatcaagtctacaac
gi|14 : ttcgatcctgattcgatatgc--T--C-A---A-TATGGTGT--------T--------GCAATGT-CGAA-G---A-T----G-TTGACAA----AG-----------G-CG-AA--GA------CAAT----GT---T-A---AC-T-CG--------A--T--A---TC-GT-----------------------------A--T-CAA--------ACT--G-TCGA-CATTG--C----------GATG-TT---------G------------------------------A----------C--GATAT----C-------actgtagaacgatgtaaacgtgtcggcacgatattgattgcgtatgcgtacaaattg
gi|6 : cattcatgccctgtcgacccctttatcaattc---A-CAT----C-----------------GCAATGT-CGAC-A---A-T----G-TTGACAC----------------------TA--TAT--T---GA-----AT---T-T---ACAT-C---------GT-T--A---TT-ATTT-------CT-T--C--------CAT--G--T-CCAC-------ATT--G-TCAA-CNNNN--N----------NNNN-NN---------N---------N---------N----------N----------N--NNNNN----N-------NN---N-----NN----NNN-N-NNN-NN--N-N-------N---NNN-NNN-NN-NC-TTA-TC--------CTG---T-T-----T---AC--G--T-CGTTCA----CATCG-TCAA-C-TT-CG-CA----GTGCT-AT-----------ACG----GAT--A---------T-A-CG-------ATA-T--C-G-----A---------A-----T---C-AA-C----ATTG-------CG-----------T------CC-----A-T--TT------gtttacatcgctattatttcttccatattaacatcgtctacatcgctattat
gi|4 : gagttaacattgtctttgtccacatcgtcaacattcatgtagCAATGT-TGAC-A---A-T----G-TGGACAT----GG-----------A-AGAAA--TAA--T---GAT----GTAAAC-T---AGAT------------------------ATT----------------------------G--T-CAAC-------ATC--A-TCAA-CATTG--C----------GATA-TC---------G---------A---------tgtatgcctcttatcctgtt
gi|5 : atgtcgattcccctttatcaatttgatattgtcaacaccgcaatgttgacatgatatcaagttaacattcgctctttgtcaatatcgttgacatcacaatctccacactatatcgagtttacatattctacattgttattatcttttataagtagacataaCAATGT-TGAC-A---A-T----G-TGGACAT----GG-----------A-tgtaactcttatccagtttacatcattggcattgtgtacagtttgtcctgtttacatcgtt
gi|1 : tcgattcccctttatacaatttgatattgtcaacaccgcaatgttgacatgatatcaagttaacattcgctctttgtctatatcgttgacatcacaatctccacactatacgagtttacatattctacattgttattatcttttaatagtagacataatcgatatcgcaatgttatgatgttgacaatatctagtttacatcatttttctGT-CGAC-A---A-T----A-TGGACAT----GG-----------A-CG-AAC-TAA--T---AAC----G------------AT-CA--------ATGT--AAACTC-GATC----TC-TT------------------G--T-CAAC-------ACC--A-TCGA-CATTG--C----------GATG-TC---------A---------A---------C----------A----------tgtaactcttatccagtttacatcattggcattgtgtacagtttgtcctgtttacatcgttca
gi|2 : tcatgtccagttccatttatctattcaatatcgtcatcatcgcattgttgacaattaatgttcatacgatatcgagttaacatccccccccccttgtcaacatcgtcaatattgcgatgttgacacgatatcaagtttacgtcatctacatcattattatttcttccatgtccacat-CG-AA--TA------CGACATGTGT---C-G---ACAT-----------GTGT--A---GC-TTTTG---TC-CT-T--TTT-A----CAT-CG--T-TCAC--AT--T-------CCAA-CATAGGAC----------AATA-TT-----------------------------C----------A----------C--GATAC----T-------CG---A-----A-------TAA-CAT-CG--TGC-------T---GAA-TTG-T-----GTA-TC--------TCA---A-T-----C---CT--G--T-TT---A----CATCGTTCAA-CA-T-CGTCA----A---C-AT-C--A----A-ATG----ATTT-------------A-CG-------ATACT--C-A-----G---------A-----T---C-AA-C----AT---------Cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtatctctcatcatgtttacatcattcacatcgtcgacatcgcagtgctgcaagtattaggtgcggccccaggttcgaacatgtgtacagtttgttctgtttcacttcaagtcggcatcacccaatgtcgtgcttagcatgtagacgataaaaatcctgacatcgtgttcattttcagtataaccatcatttataccctcacctggtttacacttgtcgcattgcaatgtagtacgatatggaatccagatatcaataattaacaggtaagaggaatttacaaagttgacacaatgtcaattagacatcattatccagtaaacatttgccgaatggtcgacctatgtgaatgattggtaaaaaaggtatacaaaaggtacacaatgctggtcaccgatgtcgatttcgatattgttaatcattgcgaaacgtgaacgatgcagcaagataagaggctaccat
gi|11 : tcatgtcattccccatcatcaattcgatttcgttcaacatagcaatgttgacaagtgttgatacgaatctaattagcaattgtctgtagcccttctcaacatcgtacattgcattttgcacgaatgtcgagttacatcgttattattttcttccatggcgctcatcgtcgaaacgcaaagttggtacatatcaatcaacgattcgaattggttacctatccatgttgtctctatcgttcacatctctagtgaactcatgatttacgaatgaaacatcggttgaattgtgtatctcttatccttttcaacgttcacatcgtcgacattcgaatgtttgtgacgatattagatcacatgtcgtcgaattgtgtacctcttattcctgtttaatcgtcgcacatcgcaatgttgtatgagtatcgatcagatccaaataacaagacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttgatcgatgtacagttacacggataagagtacacaattcgacaca-GA--TATCGT--CAACATT-GT---C-T---ACAT-CG---------T-T--A---TC-ATTT-------CT-T--T--------CAT-G---T-CAAC-------ATC--G-TCGA-CATCG--C----------AATG-TT---------G---------A---------C----------AATGTCTACA-C--GATAT----T--------G---A-----G-----TCT-A-CAT-CG--T-C-------T---ACA-TCG-TT-A--TCA-TT--------CCT---T-T-----C---AT--G--T-CA---A----CATCT-TTGA-CA-T-CA-CA----A---T-GT-C--AA-C-A-AT-----GTTG-A---------C-A-CG-------ATA-T--C-G-----A---------G-----aattcgtacaaattgc
gi|15 : ttcatgtcgaattccttttatgaattc-GA--TAT--TGTCAAC----TTG--C-A---ACAT-TA--------GT-A--AACCTCTATTT----CC-CTAT--T---GA---CATCAG--T-TCAC-------ATC--G-TCGA-CAT-G--C----------AATG-TC---------G---------A---------TGAATGTTGATA----------C--GATAT----C--------G---A-----G-----TTT-A-CAT-CG--G-C-------T---ACA-T
gi|6 : cattcatgtcctgttctcctttatttcatttc--------GT-T--A---AC-ATTG----TC--T-T--T---GTCCACAT-CG--T-CAACA-TT--CAT---G-TAGA-CATCG--C----------AATG-TC---------G---------A---------C----------A--------------ATGT----T--------G---A-----CA-----CT-A-TAT-TGAAT-T-------T---ACA-TCG-TT-A--TTA-TT--------TCT---T-C-----C---AT--G--T-CC---A----CATTG-TCAA-CNNN-NN-NN----NN--N-NN-N--NN-N-N-NNN----NNNN-N---------N-N-NN-------NNN-N--N-N-----N---------N-----N---N-NN-N----NN---------NN-----------N-N---CTT-----A-T--CC------T--G---T-T---TAC--G---T-----CGTTC-A-CATC-------G-TCAA-CTTC--G--C-------AG--TGC--------TATAC--GGATAT--A-----CG-----------------ATA-TC-GA-ATCAA-CATTG--C-t
gi|16 : ga---TC-AGTT----TC-CT-T--T---------AT-TG------AT--TTGATATC--G-TTAA-CATCG--C----------AATG-TC---------G---------AGAATGTTGAC----------A----------C--GAT-T----T-------CG---A-----G-----TTT-A-CAT-TG--C-C-------A---ATA-TCG-TT-A--TCA-TT--------TCT---C-C-----T---AT--G--T-CG---Agtccattttgtatgcctcttatcctgtt
gi|9 : attcatgtC-AGTT----CC-CT-T--T--------TAT-GAATT-CGA-------TATC--G-TCAA-CATCG--C----------AATGTTC---------G---------A---------C----------AAATGT-----T--GATAC----CATTATATCG---A-----GT----TAT---CA--CG--T-T-------TGTAACA-TCT-TA-A--TCA-TT--------TTC---T-T-----CCCTAT--GATT-CA---A----CATC---------TT-AG-CA----A-----GT-C--GACC-A-AT-----GTTG-A---------C-A-CG-------ATA-T--C-GGAAT-A---------GGAATTT---T-TA-C----ATA--------CG-----------T-----------------------------T---T-T---TA-------------CA--ATA-CATC-------G-TT-A-TATT-----C-------A---------------GT-T--G---AC--A-----CA-------G---------ATATTT-GA-GTCTA-CA
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gi|12 : ctaccgttacattattcagcaggT-T--T---A----CAT-CG--T-T--C--TA--CAGT--G-TCGA-CATCA--C----------AATG-CC---------G---------A---------C----------AATGTTTGATAT--GATAT----C-------AG---A-----G-----TTT-A-CAT-CG--T-T-------T---ACA-TCG-TT----TTA-TT--------TTT---TCC-----C---AT--T--T-CC---A----CATCG-TCGA-CAT---A-AA----AA--T-GT-T--GA-T-G-AT--------------------A-T-CGC------ATA-T--C-G-----A---------A-----T---C-acacaacacaacaaaggttatgtattggagagcttgtaactctggatctttataacaatatgcttcctcgcaatttaccagag
gi|6 : ttcgatcctG--T-CAAC-------ATT--G-TCGA-CATTG--C----------GATG-TC---------T---------A---------C----------A----------T--GAcgtgtcggcacgatattgattgcgtatgcgtacaaattg
gi|24 : gagttaacattgtctttgtccacatcgtcaacatG--T-CAAC-------ATC--G-ACGA-CATCG--C----------AATG-TC---------AACAATGTTCA---------C----------A----------C--GATAT----C------------A-----AG----TCT-A-CAactatattgaatttacatcgttattatttcttccatgtccacattgtcaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttatcctgtttacgtcgttcacatcgtcaacttcgcagtgctatacggatatacgatatcgaatcaacattgcgtccattttgtatgcctcttatcctgtt
gi|14 : at--T-CAAT--TCGATATC--G-TCAA-CATCG--C----------AATG-TC---------G---------A---------C----------AGTT-------T--GATACGATAT-------CG---A-----G-----TTA-A-CAT-TG--T-C-------T-------TCG-C--------------------CT---T-T-------------G--T-CA---AC----ATCT-TCGA-CATT--G-CA----AC-----------------------------------------A-CC-------ATA-T--T-G-----A---------G-----T---T-TA-C----AT---------CG-----------C-T---ATT-----A-T--TT------C--T---T-C---CAT--A---T-----T---A-A-CATC-------G-TCTA-CATC--G--C-------TA--T----------TAT-ac
gi|13 : cattcatgccctgtcgaccccttta--TATT--G-TCGA-CATCG--CTTTCATCAATGATG-TT---------G---------A---------A----------T----------C--AATA-----T-------CG---A------G----TTA-A-CAT-TGT-T-T-------T---TCA-TTG-AT-A---TA-TT--------T-----------------AT--------A---A-----ATCA-TTGA------TG-CC----AT--T-GT---------A-ATG----TTTG-------------A-CA-------ATA-T--C-A-----A---------G-----T---T-TA-C----AT---------
gi|23 : tccaatgattgatgttttatcga--TATC--G-TCAA-CATCG--C----------AGTG-TG---------A---------A---------C----------A----------ttaacagaaatcgagtgccgcttttcctgtttacatcgttca
gi|11 : ttcatgtccagttccctttatttatttga----------C--GATAT----C-------------------G----TCA-A-CAT-TG--T-C-------T---ACA-TCG-TT-A--TCA-TT--------TCT---T-T-----C---AT--G--T-CA---A----CATCG-TCGA-CA-T-CG-CA----A---T-GT-T--GA-C-A-AT-----GTCT-A---------C-A-CG-------ATA-T--T-G-----AGTCTACATCG-----T---C-TA-C----AT---------CG-----------T-T---ATC-----A-T--TC------C--T---T-T---CAT--G---T-----C---A-A-CATC-------T-TTGA-CATC--A--C-------AA--TGTCAACAA--TGT-T--G---AC--A-----CG-----------------ATA-TC-GA-Gatgttaata
gi|10 : ttcatgtcgaattccttttatgaatt-C-------T---AC---CG-TT-ACATTA-TTCAGCAGGTTCT---T-T-----A---AT--G--T-CA---AC----ATCG-TCGAACAT--CG-CA-----T--T-GT-T--GA-C-A-AT-----GTTG-AC--------A-C-CG-------ATA-T--T-GA----A---------G-----T---CATA-C----ACA--------CG-----------T-TA--ATT-----A-T--TC------T--T---C-C---CAT--G---T-----AC--A-A-CA
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gi|1 : gaT---C-T-----C---TT--G--T-CA---AC----ACCA-TCGA-CATT--G-CG----A---T-GT-C--AA-C-A-ATG----ctatacggatatacgatatcgaatcaacattgcgtccattttgtatgcctcttatcctgtt
gi|11 : tcatgtccagttccatttatctattcaatatcgtcatcatcgcattgttgacaattaatgttcatacgatatcgagttaacatccccccccccttgtcaacatcgtcaatattgcgatgttgacacgatatcaagtttacgtcatctacatcattattatttcttccatgtcca-T-----C---GT--G--T-CA---AC----ATTG-TTGA-CATT--G-TG----AT----GT-C--AA-A-G-ATG-----TTG-ACATGAAAGGA-A-TG-------ATA-A--C-G-----A---------------T---G-TA-G----A----------CG-----------A-T---GTA-----G-A--CT------CAAT---A-T---CGT--G---T------A--G-A-CATT-------G-TCAA-CATT--G--C-------GA-------------TGT-C--G---AC--tcgagtttacattgatcgttattagttcgtccatgtccatattgtcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtatctctcatcatgtttacatcattcacatcgtcgacatcgcagtgctgcaagtattaggtgcggccccaggttcgaacatgtgtacagtttgttctgtttcacttcaagtcggcatcacccaatgtcgtgcttagcatgtagacgataaaaatcctgacatcgtgttcattttcagtataaccatcatttataccctcacctggtttacacttgtcgcattgcaatgtagtacgatatggaatccagatatcaataattaacaggtaagaggaatttacaaagttgacacaatgtcaattagacatcattatccagtaaacatttgccgaatggtcgacctatgtgaatgattggtaaaaaaggtatacaaaaggtacacaatgctggtcaccgatgtcgatttcgatattgttaatcattgcgaaacgtgaacgatgcagcaagataagaggctaccat
gi|12 : ttcatgtcgaattccttttatgaattcgatatcgtcaacattgtctacatcgttatcatttctttcatgtcaacatc-T-----C---AT--A--T-CA---AA---CATTG-TCGG-CATT--G-TG----AT----GT-C--GA-C-A-CTG------TA-G---------A-A-CG-------ATG-T--tatcgag
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gi|24 : cattcatgccctgtcgacccctttatca---AT--G--T-CA---AC----ATCG-ACGA-CAT--CG-CA----AT----GT-C--AA-C-A-ATG-----TTC-A---------C-A-CG-------ATA-T--C-A-----A---------G-----T---C-TA-C----Atgtcttcgcctttgtcaacatcttcgacattgcaacaccatattgagtttacatcgctattatttcttccatattaacatcgtctacatcgctattat
gi|6 : T--G--T-CA---AC----ATTG-TCGA-CATT--G-CG----A---T-GT-C--TA-C---ATGAAT-GTTG-------------A-CG-------ATG-T--G-G-----A---------ac
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gi|15 : tcatgtccagttccatttatctattcaatatcgtcatcatcgcattgttgacaattaatgttcatacgatatcgagttaacatccccccccccttgtcaacatcgtcaatattgcgatgttgacacgatatcaagtttacgtcatctacatcattattatttcttccatgtccacattgttgacatcgcaatgtcgatggtgttgacaagagatcgagtttacattgatcgttattagttcgtccatgtccatattgtcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtatctctcatcatgtttacatcattcacatcgtcgacatcgcagtgctgcaagtattaggtgcggccccaggttcgaacatgtgtacagtttgttctgtttcacttcaagtcggcatcacccaatgtcgtgcttagcatgtagacgataaaaatcctgacatcgtgttcattttcagtataaccatcatttataccctcacctggttt---CATCG-TCGA-CAT---G-CA----AT----GT-C--GA-TGA-ATG-----TTG-A---------T-A-CG-------ATA-T--C-G-----A---------G-----T---T-TA-C----AT---------CG-----------cagcaagataagaggctaccat
gi|7 : cattcatgtcctgttctcctttatttcatttcgatattgtcaacttgcaacattagtaaacctctatttccctattgacatcagttcaATCG-TCAAACATC-GG-CA----AT----GC-G--GA-C-C---------TTG-A---------A-C-T---------TA-T--C-G-----A---------G-----T---C-TA-C----AT---------CGTCTACATTCGTT-T---ATC-----A-T--TT------C--TTAGT-C---CAT--G---C---------A-A-CATC-------GATC-A-CATC--G--C-------AA--TGCGACA----TGT--------AC--A-----CG-----------------ATA-TC-GA-GTTTACCATCGT-C-TC-----ACA-T-CG--------T-T---TT---G-TC--TCCA-TT--C--A--T------------------------------------------------------------C-A-T-CGCAATAG-T---C-AC---C--A-TGgctacatt
gi|14 : attcatgatccagttcctttttatgaattacgatATCG-TCAA-CAT--CG-CA----AT----GT-C--GA-C-A-GT------TTG-A---------T-A-CG-------ATA-T--C-G-----A---------G-----T---T-AA-C----AT---------TG-----------T-C---TTC-----G-C----------C--T---T-T--------G---T-----CA--A---CATC-------T-TCGA-CATT--G--C-------AA-------------------------C--A-----CC-------A----------TA-TT-GA-GTTTA-CATCG--C-T---------------------------ATT---A-TT--TC-T-TC--C--A--T-A--T----TA--------------------A-CAT-C-------G-T-C--T---A---C-A-T-CGCTAT-attgatgacgatattgagttacatcgttacatttattatttat
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Reference ( family-4355 ) : CCTTT-AT-GAAATTCGAT-ATCG--T-C-AACATC-T--------GCAATG-TC--G-A-C-AA-T----GTTGACACAGA----TAT-TCGA-GTC-T----------ACATCG---------G-TT--A--TCATT----T-T--CCT--T--T-C-ATG--TCA----A-C---ATC-------G-TCGACATCG-CGATGTC---------G------A------C----------AC-GATAT-C---CG---A-GG----TTTA-CAT-C---GTC-------T-AC--ATCGT-TA--TTA-TT--------TCTTT-----CAT--GTCAAC----CATCG-TC----G-ACATTCGCAA--TTG-------TCGA-CAATG--GTTGA-NA-CGATATCG-----A--GTC-TAC----AT-CGT-T--ATCAT--TT---CTT-TCATGT-----CA--A-----A-CATC----GTCGACA-TCGCAA---T--------TGTCGACA-----CGA----ATATC-GAGT----CTACA---TCG--C---TCTACA--TCGT-T--ATCATT--TCCT-TTC--ATGT---CA------ACATCG-TCG-ACA-TCGCG------ATGT---CGACG-ATGTCTA
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consensus : CCTTT-AT-GAA-TTCGAT-ATCGT-C-GACATC---G--CAATG-TC--G-A-C-AA-T----G-TTGACAC-----GA-TAT-TCGA-G--------TT-T----------ACATCG--C--T--A---TCGTT----T-------TCCT-TT-------C----A-T-G--TCG----A-C---ATC-------G-TCGACATCG--CAATG-TC---------G------ACAC-GA-TATC---CG---A-GG----TTTA-CAT-C---GT-C-------T-AC--ATCGT-TA--T---T---A-TT--------TC-TT-T-CAT--GT-CA---AC--------CATCG-TC----G-ACATTCGCAA--T--TGTCG-ACGAT--GGT-TGAC--A-C--GATA-TCG-----A----GT---C-TAC----A--T--CGT-T--ATC--ATT------T---C-T--T-TCATGT-----CA--A-----A-CATC-------G-TCG-ACA-TCG-CAA---T--------T-GTCGAC-ACGAATATCGAGT-CT-ACA--TC--GTTCN--AC----ATC----GT----GT----A----TCG-TT--T----C--C---T-T-------T-C--A-T-G---T---CGACA-TCGT-C------------G-ACA-TCG--CAATG-T---CG-AC-AA-TGTCTA
Reference ( family-4355 ) : CCTTT-AT-GAAATTCGAT-ATCGT-C-AACATC---G--CAATG-TC--G-A-C-AA-T----G-TTGACAC-----GA-TAT-TCGA-G--------TT-T----------ACATCG-GT--T--A---TCGTT----T-------TCCT-TT-------C----A-T-G--TCG----A-C---ATC-------G-TCGACATCG--CAATG-TC---------G------ACAC-GA-TATC---CG---A-GG----TTTA-CAT-C---GT-C-------T-AC--ATCGT-TA--T---T---A-TT--------TC-TT-T-CAT--GT-CA---AC--------CATCG-TC----G-ACATTCGCAA--T--TGTCG-ACGAT--GGT-TGAC--A-C--GATA-TCG-----A----GT---C-TAC----A--T--CGT-T--ATC--ATT------T---C-T--T-TCATGT-----CA--A-----A-CATC-------G-TCG-ACA-TCG-CAA---T--------T-GTCGAC-ACGAATATCGAGT-CT-ACA--TC--GCTCT--AC----ATC----GT----GT----A----TCA-TT--T----C--C---T-T-------T-C--A-T-G---T---CNACA-TCGT-C------------G-ACA-TCG--CAATG-T---CG-AC-GA-TGTCTA
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gi|1 : tcatgtccagttccatttatctTTGT-C-AACATC---GT-CAATA-TT--G---C-GA-T----G-TTGACAC-----GA-TAT--CAA-G--------TT-T----------ACGTCA-TC--T--ACA-TCATTATTAT-------TTCT-TC-------C----A-T-G--TCC----A-C---ATT-------G-TTGACATCG--CAATG-TCGATGGTGTTG------ACAA-GA-GAT----CG---A--G----TTTA-CAT-T---G----------------ATCGT-TA--T---T---A-GT--------TC-GT-C-CAT--GT-CC---A---------TATTG-TC----G-ACNNNNNNNN--N--NNNNN-NNNNN--NNN-NNNN--N-N--NNNN-NNN-----N----NN---N-NNN----N--N--NNN-NNAAGT--ATC------T---C-T--CATCATGTTTA--CATCATTC--A-CATC-------G-TCG-ACA-TCG-CAG------------T-GCTG----CAAGTATTAGGTGCG-GCC--CCAGGTTCGA-AC----AT-----GT----GT----ACAGTTTG-TT--C----T--G---T-T-------T-C--A-C-T---T---CAA-----GT-C------------G-GCA-TCACCCAATG-T---CG-ctgcaagtattaggtgcggccccaggttcgaacatgtgtacagtttgttctgtttcacttcaagtcggcatcacccaatgtcgtgcttagcatgtagacgataaaaatcctgacatcgtgttcattttcagtataaccatcatttataccctcacctggtttacacttgtcgcattgcaatgtagtacgatatggaatccagatatcaataattaacaggtaagaggaatttacaaagttgacacaatgtcaattagacatcattatccagtaaacatttgccgaatggtcgacctatgtgaatgattggtaaaaaaggtatacaaaaggtacacaatgctggtcaccgatgtcgatttcgatattgttaatcattgcgaaacgtgaacgatgcagcaagataagaggctaccat
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4355 ) : CCTTT-ATG-AA-TT-CGAT-ATCGT-CGA-CATC---G-CAATG-T-C--G-A-C-AA-T----G-TT------GACAC-----GAT-AT-TCGA----G--------TT----------TA-CA--TC-G--C---T---A---TCGTT----T-------T--CCT-TT----C-------A-T-G---TCG----A-C---ATC-------G-TCG-ACATCG--CAATG-TC---------G------ACAC-GAT----AT----------C---CG---A-GG----TTT--A-CAT-C---G--T-C-------T-AC--ATCGT-TA--TT---A-TT--------TC-TT-T-CAT--GT-CA---AC----CATCG-TC----G-ACATT-CGCAA--T--TGTCG----ACGATGGTTGAC------A-CGATA-TCG-----A--GT---C-T-AC----AT--CGT-T--ATC--ATT------T---CT--T-TCATGT-----CA--A-----A-CATC----G-TCGACA-TCGCAA---T--------T-GT-CG---ACACGAATATCGAGT-CTACA--TC--GT-T--C-NAC----ATCGT----GTA----TC-GTT--T--CCT----T-------T---C--A-TG---TCG---ACA-TCGT-CG-ACA-TCG--CAATG-T---CGAC-AATGTCTA
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gi|1 : tcatgtccagttccatttatctattcaatatcgtcatcatcgcattgttgacaattaatgttcatacgatatcgagttaacatccccccccccT----C-------A-T-----TC-----A-C---ATC-------G-TCG-ACATCG--CAGTG-CT---------G-------CAA-G-T----ATTAGGTGCGGCC---CC---A-GG----TTCGAA-CAT-----G--T-G-------T-AC--A--GT-----TT---G-TTC-------TG-TT-T-CAC--TT-CA---A---------G-TC----G-GCATCACCCAA-----TGTCG--------TGCTTAGCATGTAGA-CGATA-AAA-----A--TC---C-TGAC----AT--CGT-G--TTC--ATT------T---tgcttagcatgtagacgataaaaatcctgacatcgtgttcattttcagtataaccatcatttataccctcacctggtttacacttgtcgcattgcaatgtagtacgatatggaatccagatatcaataattaacaggtaagaggaatttacaaagttgacacaatgtcaattagacatcattatccagtaaacatttgccgaatggtcgacctatgtgaatgattggtaaaaaaggtatacaaaaggtacacaatgctggtcaccgatgtcgatttcgatattgttaatcattgcgaaacgtgaacgatgcagcaagataagaggctaccat
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consensus : CCTTTATN-AA-TT-CGAT-ATCGT-CGA-CATC---G-CAATG-T-C--G-A-C-AA-T----G-TTGACAC-----GAT-AT--TCGA----G--------TT----------TA-CATC-G--C---T---A---TCGTT----T-------T--CCT-TT----C-------A-T-G--TCG----A-C---ATC-------G-TCGACATCG--CAATG-TC---------G------ACA---------C-GATAT----------C---CG---A-GG----TTT--A-CAT-C---G--T-C-------T-AC--A--TCGT-TA--TT---A-TT--------TC-TTT-C-AT--GT-CG----A-C-ATC-------G-TC----G-ACATTCGCAA--T--TGTCG-ACGATGG-----TTGAC--A-CG-----ATA-TCG-AGT---C-TAC----AT--CGT-T--ATC--ATT------T---CT--T-TCA--TG--T-----CA--A-----A-CATC----G-TCGACA-T--CGCAA---T--T-GT-CG---ACACGAATATCGAA-T-CNACA--TC--GT-T---C-G-ACATCGTGTACCGTT--T-----CC--T-T-------T---C--A-TG---T---CG------ACA-TCGT-CG-ACA-TCG--CAATG-T---CGAC-AA-TGTCTA
Reference ( family-4355 ) : CCTTTATN-AA-TT-CGAT-ATCGT-CGA-CATC---G-CAATG-T-C--G-A-C-AA-T----G-TTGACAC-----GAT-AT--TCGA----G--------TT----------TA-CATC-G--C---T---A---TCGTT----T-------T--CCT-TT----C-------A-T-G--TCG----A-C---ATC-------G-TCGACATCG--CAATG-TC---------G------ACA---------C-GATAT----------C---CG---A-GG----TTT--A-CAT-C---G--T-C-------T-AC--A--TCGT-TA--TT---A-TT--------TC-TTT-C-AT--GT-CA----A-C-ATC-------G-TC----G-ACATTCGCAA--T--TGTCG-ACGATGG-----TTGAC--A-CG-----ATA-TCG-AGT---C-TAC----AT--CGT-T--ATC--ATT------T---CT--T-TCA--TG--T-----CA--A-----A-CATC----G-TCGACA-T--CGCAA---T--T-GT-CG---ACACGAATATCGAG-T-CTACA--TC--GT-T---C-G-ACATCGTGTACCGTT--T-----CC--T-T-------T---C--A-TG---T---CG------ACA-TCGT-CG-ACA-TCG--CAATG-T---CGAC-AA-TGTCTA
gi|1 : TCATGTCCAGTT--C-----CA--T-T-------TATCT--A-T----T---CA------ATA-TCGT-CA-TCA-TCG--CATTG-T---TGAC-AA-
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4355 ) : CCTTTATN-AA-TT-CGAT-ATCGT-CGA-CATC---G-CAATG-T-C--GA-C-AA-T----G-TTGACAC-----GAT-AT--TCGA----G--------TT----------TA-CATC-G-C---T---A---TCGTT----T-T--CCTTT----C-------A-T-G--TCGA-C---ATC-------G-TCGACATCG--CAATGTC---------G------ACA---------C-GATAT----------C---CG---A-GG----TTT--A-CAT-CG--T-C-------T-AC--A--TCGT-TA--TT---A-TT--------TC-T-TTC-AT--GTCG----A-C-ATC-------GTC----G-ACATTCGCAA--T--T-GTCG-ACGATGG-----TT--GAC--A-CG-----ATA-TCG-AGT---C-TAC----AT--CGT-----------T--ATC---ATT------T---CT--T-T-CA--T-G--T-----CA--A-----A-CATC----G-TCGACA-T--CGCA--A---T--T--GT-CG---A----CACGAATA-TCGAA-T-CNACA--TC--GT-T---C-G-ACATCGTGTACCGTT--T-----CC--T-T-------T---C--A--TG---T---CG------ACA-TCG-T-CG-ACA-TCG--CAATG-T---CGAC-AA-TGTCTA
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gi|1 : tcatgtccagttccatttatctattcaatatcgtcatcatcgcattgttgacaattaatgttcatacgatatcgagttaacatccccccccccT----C-------A-T----TC-A-C---ATC-------G-TCGACATCG--CAGTGCT---------G-------CA---------A-G-TATTAGGTGCGGCC---CC---A-GG----TTCGAA-CAT--G--T-G-------T-AC--AGTTTGT-T---CT---G-TT--------TCAC-TTC-AA--GTCG----G-C-ATCACCCAATGTC----GTGC-TTAGCA------T-GTAG-ACGATAAAAATCCT--GAC--ATCGTGTTCATT-TTC-AGT---A-TA-----AC--C----------------ATC---ATT------TATACC--C-T-CACCT-GGTT-----TA--C-----A-C-TT----G-TCG-CA-T--TGCA--A------T--GT-AG--------TACG-ATA-TGGAA-T-CCAGA--Ttgcttagcatgtagacgataaaaatcctgacatcgtgttcattttcagtataaccatcatttataccctcacctggtttacacttgtcgcattgcaatgtagtacgatatggaatccagatatcaataattaacaggtaagaggaatttacaaagttgacacaatgtcaattagacatcattatccagtaaacatttgccgaatggtcgacctatgtgaatgattggtaaaaaaggtatacaaaaggtacacaatgctggtcaccgatgtcgatttcgatattgttaatcattgcgaaacgtgaacgatgcagcaagataagaggctaccat
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gi|7 : gagttaacattgtctttgtccacatcgtcaacattcatTTTATG-AA-TTACGAT-ATCGT-CAAACATC---GGCAATG-C-G--GA-C-C---------TTGA-AC-----T-T-AT---CGA----G--------TC----------TA-CATC-GTC---T---ACATTCGTT----TAT--CATTT----CTTAGTCCA-T-G---CAA-C---ATC-------GATC-ACATCG--CAATG-C---------GACATGTACA---------C-GATAT--------------CG---A--G----TTT--ACCAT-CG--T-C-------TCAC--A--TCGT-T---TT---G-TC--------TC-----C-AT---------------TC-------ATC----A-----TCGCAA--T--A-GTC--ACCATGA-----TT--GATG-A-CG-----ATA-TTG-AGT-----TAC----AT--CGT-----------T--A-C---ATT------T---AT--T-tgtatgcctcttatcctgtt
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Reference ( family-4355 ) : CCTTTATN-AA-TT-CGAT-ATCGT-CGA-CATC---G-CAATG-T-C--GA-C-AA-T----G-TTGACAC-----GAT-AT--TCGA----G--------TT----------TA-CATC-G-C---T---A---TCGTT----T-T--CCTTT----C-------A-T-G--TCGA-C---ATC-------G-TCGACATCG--CAATGTC---------G------ACA---------C-GATAT----------C---CG---A-GG----TTT--A-CAT-CG--T-C-------T-AC--A--TCGT-TA--TT---A-TT--------TC-T-TTC-AT--GTCG----A-C-ATC-------GTCG-ACATTCGCAA--T--T-GTCG-ACGA-TGA-----TT--GAC--A-CG-----ATA-TCG-AGT---C-TAC----AT--CGT-----------T--ATC---ATT------T---CT--T-T-CA--T-G--T-----CA--A-----A-CATC----G-TCGACA-T--CGCA--A---T--T--GT-CG---A----CACGAATA-TCGAA-T-CNACA--TC--GT-T---C-G-ACATCGTGTACCGTT--T-----CC--T-T-------T---C--A--TG---T---CG------ACA-TCG-T-CG-ACA-TCG--CAATG-T---CGAC-AA-TGTCTA
gi|1 : TCATGTCCAGTT--C-----CA--T-T-------TATCT--A--T----T---CA------ATA-TCG-T-CA-TCA-TCG--CATTG-T---TGAC-AA-
gi|1 : TTTATC-TA-TT-CAAT-ATCGT-CAT-CATC---G-CATTG-T-T--GA-C-AA-TTAATG-TTCATAC-----GAT-AT---CGA----G--------TT----------AA-CATC-C-C---C---------------------CCCCC----C-------T-T-G--TCAA-C---ATC-------G-TCAATATTG--CGATGTT---------G------ACA---------C-GATAT----------C--------A-AG----TTT--A-CGT-CA--T-C-------T-AC--A--TCAT-TA--TT---A-TT--------TC-T-TCC-AT--GTCC----A-C-ATT-------GTTG-ACA-TCGCAA-----T-GTCG-ATGG-TG------TT--GAC--A-AG-----AGA-TCG-AGT---T-TACATTGAT--CGT-----------T--ATT---AGT------T---CG--T-C-CA--T-G--T-----C---C-----A-TATT----G-TCGACN-N--NNNN--N---N--N--NN-NN---N----NNNNNNNN-NNNNN-N-NNNNN--NN--NN-N---N-N-NNNNNNNNNA-AGTA--T-----CT--C-TCA-----T---C--A--TG---TTTACATCATTCACA-TCG-T-CG-ACA-TCG--CAGTG-C---TG-C-AA-taatgttcatacgatatcgagttaacatccccccccccttgtcaacatcgtcaatattgcgatgttgacacgatatcaagtttacgtcatctacatcattattatttcttccatgtccacattgttgacatcgcaatgtcgatggtgttgacaagagatcgagtttacattgatcgttattagttcgtccatgtccatattgtcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtatctctcatcatgtttacatcattcacatcgtcgacatcgcagtgctgcaagtattaggtgcggccccaggttcgaacatgtgtacagtttgttctgtttcacttcaagtcggcatcacccaatgtcgtgcttagcatgtagacgataaaaatcctgacatcgtgttcattttcagtataaccatcatttataccctcacctggtttacacttgtcgcattgcaatgtagtacgatatggaatccagatatcaataattaacaggtaagaggaatttacaaagttgacacaatgtcaattagacatcattatccagtaaacatttgccgaatggtcgacctatgtgaatgattggtaaaaaaggtatacaaaaggtacacaatgctggtcaccgatgtcgatttcgatattgttaatcattgcgaaacgtgaacgatgcagcaagataagaggctaccat
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gi|1 : tcatgtccagttccatttatctattcaatatcgtcatcatcgcattgttgacaattaatgttcatacgatatcgagttaacatccccccccccttgtcaacatcgtcaatattgcgatgttgacacgatatcaagtttacgtcatctacatcattattatttcttccatgtccacattgttgacatcgcaatgtcgatggtgttgacaagagatcgagtttacattgatcgttattagttcgtccatgtccatattgtcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtatctctcatcatgtttaca-CATC----G-TTCACG-TTTCGCA--A---T--G--AT-TA---A----CA---ATA-TCGAAAT-CGACA--TC--GG-TGACC-A-GCATTGTGTACCTTT--TGTATACC--T-T-------T---T--T--TA---C---CA--------A-TCA-T-TC-ACA-TAG------G-T---CGAC-CA-atcaataattaacaggtaagaggaatttacaaagttgacacaatgtcaattagacatcattatccagtaaacatttgccgaatggtcgacctatgtgaatgattggtaaaaaaggtatacaaaaggtacacaatgctggtcaccgatgtcgatttcgatattgttaatcattgcgaaacgtgaacgatgcagcaagataagaggctaccat
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gi|17 : attcatgttcagtttTCATGTCCTGTT--T-----CC--T-TTA-----T---C--A--TT---T---CG------ATA-TTG-T-CA-ACA-TTG--CAA
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gi|2 : tcatgtcattccccatcatcaattcgatttcgttcaacatagcaatgttgacaagtgttgatacgaatctaattagcaattgtctgtagcccttctcaacatcgtacattgcattttgcacgaatgtcgagttacatcgttattattttcttccatggcgctcatcgtcgaaacgcaaagttggtacatatcaatcaacgattcgaattggttacctatccatgttgtctctatcgttcacatctctagtgaactcatgatttacgaatgaaacatcggttgaattgtgtatctcttatccttttcaacgttcacatcgtcgacattcgaatgtttgtgacgatattagatcacatgtcgtcgaattgtgtacctcttattcctgttta----A-C-ATC-------GTTC-ACATTC-CAACAT--A-G--G-ACAA-T-A-----TT----C--A-CG-----ATACTCG-AAT---A--AC----AT--CGTGCTGAATTGTGT--ATCTCAATCC-----T---GT--T-TACA--TCG--T-----TC--A-----A-CATC----G-TCAACA-T--CAAATGA---T--T--TA-CG---A----TAC------TCAGA-T-CAACA--TCT-GTGT---C-G-A-ATTGTGTACTCTTA-T-----CC--G-T-------G---T--AACTG---T-----------ACA-TCGAT-CA-ACtcgaattcgtacaaattgc
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gi|22 : tcatgtcattccccatcatcaattcgatttcgttcaacatagcaatgttgacaagtgttgatacgaatctaattagcaattgtctgtagcccttctcaacatcgtacattgcattttgcacgaatgtcgagttacatcgttattattttcttccatggcgctcatcgtcgaaacgcaaagttggtacatatcaatcaacgattcgaattggttacctatccatgttgtctctatcgttcacatctctagtgaactcatgatttacgaatgaaacatcggttgaattgtgtatctcttatccttttcaacgttcacatcgtcgacattcgaatgtttgtgacgatattagatcacatgtcgtcgaattgtgtacctcttattcctgtttaatcgtcgcacatcgcaatgttgtatgagtatcgatcagatccaaataacaagacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttgatcgatgtacagttacacggataagagtacacaattcgacacagatgttgatctgagtatcgtaaatcatttgatgttgacgatgttgaacgatgtaaacaggattgagatacacaattcagcacgatgttattcgagtatcgtgaT-CGAT-ATTGT-TGA-CATC---G-CTGTATT-T--AA-T-GA-T----G-TTGATTC-----AAT-A---TCGA----G--------T
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gi|3 : acctcttacccagtttacatCTTTTATG-AAATT-CGATTATCGT-CAA-CATCT--G-CAATG-T-C--GA-C-AA-T----G-TTGACACAGACGGAT-AT--TCGAC---G--------TC----------TA-CATC-GGT---T---A---TCATT----T-T--CCTTTG---C-------A-T-GG-TCAA-CTTTATC-------G-TCGACATCG--CAATGTC---------G------ACA---------C-GATAC----------C---CG---A-GG----TCT--A-CAT-CG--T-C-------T-AC--A--TCGT-TA--TT---A-TT--------TC-T-TTC-AT--GTCA----A-CCATC-------GTCG-ACATTCGCAA--T--T-GTCG-ACAA-TGG-----TT--GAA--A-CG-----ATA-TCG-AGT---C-TAC----AT--CGT-----------T--ATC---ATT------T---CT--T-T-CA--T-G--T-----CA--A-----A-CATT----G-TCGACA-T--CGCA--A---T--T--GT-CG---A----CACGAATA-TCGAG-T-CTACA--TC--GC-T---C-T-ACATCGT-TATCATT--T-----CC--T-T-------T---C--A--TG---T---CA------ACA-TCG-T-CG-ACA-TCG--CAATG-T---CGAC-AA-TGTCTA
gi|4 : CCTTTATC-AA-TT-TGAT-ATTGT-CAA-CACC---G-CAATG-T--------------------TGACAT-----GAT-AT---CAA----G--------TT----------AA-CAT----------------TCGCT----------CTTT----------------G--TCAA-T---ATC-------G-TTGACATCA--CAATCTC---------C------ACA---------C-TATAT----------C----G---A-G-----TTT--A-CAT-AT--T-C-------T-AC--A--TTGT-TA--TT---A-T----------C-T-TTT-ATAAGTAG----A-C-ATA-------ATCG-ATAT-CGCAA--T----GTTG-ATGA-TG------TT--GAC--A--------ATA-TCT-AGT---T-TAC----AT--CAT-----------T--AT------T------T---CT--T-C-CA--T-G--T-----CC--A-------CATT----G-TCAACA-T--TG-----------T--GT--A---A----CTCT--TA-TCCAG-T-TTACA--TC--AT-T-----G-GCATTGTGTACAGTT--T-----G-------------T---C--C--TG---T---TT------ACA-TCG-T-
gi|5 : atgtcgattccCCTTTATACAA-TT-TGAT-ATTGT-CAA-CACC---G-CAATG-T--------------------TGACAT-----GAT-AT---CAA----G--------TT----------AA-CAT----------------TCGCT----------CTTT----------------G--TCTA-T---ATC-------G-TTGACATCA--CAATCTC---------C------ACA---------C-TATA---------------CG---A-G-----TTT--A-CAT-AT--T-C-------T-AC--A--TTGT-TA--TT---A-TC--------T--T-TTA-ATA-GTAG----A-C-ATA-------ATCG-ATAT-CGCAA--T----GTT--ATGA-TG------TT--GAC--A--------ATA-TCT-AGT---T-TAC----AT--CAT-----------T---------TT------T---CT--T-C-CA--T-G--T-----CC--A-------CATT----G-TCAACA-T--TG-----------T--GT--A---A----CTCT--TA-TCCAG-T-TTACA--TC--AT-T-----G-GCATTGTGTACAGTT--T-----G-------------T---C--C--TG---T---TT------ACA-TCG-T-t
gi|6 : tcgattccGA----G--------TT----------AA-CATT-G-------------TCTTT----G-T--CCA------C-------A-TCG--TCAA-C---ATTCAT----G-TAGACATCG--CAATGTC---------G------ACA------------ATGT----------T----G---A-CA----CT---A-TAT-TGAAT-T-------T-AC--A--TCGT-TA--TT---A-TT--------TC-T-TCC-AT--GTCC----A-C-ATT-------GTCA-ACNNNNNNNN--N--N-NNNN-NNNN-NNN-----NN--NNN--N-NN-----NNN-NNN-NNN---N-NNN----NN--NNN-----------N--CTT---ATC------C---TG--T-T-TA--C-G--T-----CGTTC-----A-CATC----G-TCAACT-T--CGCA--G---TGCT--ATACGGATA----TACG-ATA-TCGAA-T-CAACA--TT--GCGT---C----CATTTTGTA-TGCC--T-----CT--T-A-------T---C--C--TG---T---tca
gi|6 : GT-AGA-CATC---G-CAATG-T-C--GA-C-AA-T----G-TTGACAC-----TAT-AT--T-GA----A--------TT----------TA-CATC-G-T---T---A---TTATT----T-----CTTC----C-------A-T-G--TCCA-C---ATT-------G-TCAACNNNN--NNNNNNN---------N------NNN---------N-NNNNN----------N---NN---N-NN----NNN--N-NNN-NN--N-N-------N-NN--N--NNNN-NNC-TT---A-TC--------CT-G-TTT-AC--GTCGTTC-A-C-ATC-------GTCA-AC-TTCGCAG--TGCT-AT---ACG---GA-----T----AT--A-CG-----ATA-TCG-AAT---C-AAC----ATTGCGT---------------CC---ATT------T---t
gi|7 : gagttaacattgtctttgtccacatcgtcaacattcatTTTATG-AA-TTACGAT-ATCGT-CAAACATC---GGCAATG-C-G--GA-C-C---------TTGA-AC-----T-T-AT---CGA----G--------TC----------TA-CATC-GTC---T---ACATTCGTT----TAT--CATTT----CTTAGTCCA-T-G---CAA-C---ATC-------GATC-ACATCG--CAATG-C---------GACATGTACA---------C-GATAT--------------CG---A--G----TTT--ACCAT-CG--T-C-------TCAC--A--TCGT-T---TT---G-TC--------TC-----C-AT---------------TC-------ATCA-----TCGCAA--T--A-GTC--ACCA-TGA-----TT--GATG-A-CG-----ATA-TTG-AGT-----TAC----AT--CGT-----------T--A-C---ATT------T---AT--T-tgtatgcctcttatcctgtt
gi|8 : attcatgatccagttccttACA-T--TGCC--A---T--T---T-TG--------TACGA-TA-TAGAA-T-C-ACA--T---GT-TTT-C-G-ACACTGTGTATC-----------TC--T-T-------G---C--AC-TG---T---TT------ACA-TCG-T-Catttat
gi|9 : cgtacattattgcaatgtcgaatatatgaacaaatgtaatcaggacagaggattcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtTCATGTCCAGTT--C-----CC--T-T-------T---T--A--TGAATT---CG------ATA-TCG-T-CA-ACA-TCG--CAATGTT---CGACAAA-TGTaaagagagaagaggtacacagttttgacaatatgaattaaataattcatgaattca
gi|9 : CTTTTATG-AA-TT-CGAT-ATCGT-CAA-CATC---G-CAATG-TTC--GA-C-AAAT----G-TTGATAC-----CATTATA-TCGA----G--------TTATCACGTTTGTAACATC-T-T---A---A---TCATT----T-T--CTTCC----CT------A-T-GATTCAA-C---ATCTTAGCAAG-TCGAC------CAATGTT---------G------ACA---------C-GATAT----------C---GGAATA-GGAATTTTT--A-CATACG--T-TTTTACAAT-AC--A--TCGT-TA---T---A-TT--------tgataccattatatcgagttatcacgtttgtaacatcttaatcattttcttccctatgattcaacatcttagcaagtcgaccaatgttgacacgatatcggaataggaatttttacatacgtttttacaatacatcgttatattcagttgacacagatatttgagtctaca
gi|9 : tcatgtccagttccT-CAA-CATCTTAG-CAA-G-T-C--GA-CCAA-T----G-TTGACAC-----GAT-AT--CGGA----ATAGGAATTTT----------TA-CA---------T---A----CGTT----T------TTA----C-------A---A--T--A-C---ATC-------G-TT-ATATT---CA--GTT---------G------ACA---------CAGATAT----------T---TG---A--G----TCT--A-CAcagttgacacagatatttgagtctaca
blockSeqs : AC A A T T A A TTA T T CTTGACCGA . T AGACG T TCGT ATAGGAATT ATCACGTTTGT A CGTCTACATTCGTTTATCATTTCTTAGTCCATG C T TTT TTAGCAA A GA TGCAAGTATTAGGTGCGGCCCCAGG CGA C ACGTTTTTACAA C CT GT G ACA GAC T CAGCAGGT AC C AA GTTCA T C ACCCAAT T NN TGTAGACGATAAAAATCCTGACATCGTGTTC C A TGGTT CT TG GCTGAATTGTGTATCTCAATCCTGTTTACATCGTTCAA TCTA A T TT CAACATAGGACAATATTCACGA C A GCG TG CAGGTTCGAAC N AAGTATCTCTCATCATGTTTACATCATTC C C A T GC T CC T TTG A G
blockSeqs : G . . . . A . T G . TCGACAAA . . . . TGT CATTG T . CATCTACATCATTATTATTTCTTCCATG A . . CAT . A CGATGGTGTTGACAAGAGATCGAG T . TGAATT . . . . NC TC . . TG . A GTTC . . TCTA A TT AGTTGGTACATATCAATCAACG C . CAT . A TGTCGAATTGTGTACTCTTATCCGTGTAACTGTA . . . . CAGTGCTATACGGATATACGA . . ACG . CGGTGACCAGC T NTTGTCTTGTTATTTGGATCTGATCG C . . A G . . . G . .
blockSeqs : C . . . . G . . . . CGATGAA . . . . TAT CG T . CGTTTACATCGTTTTATTTTTTCCCATT G . . . . . TGACAATGTCTACACGATATTGAG T . CGTGC . . . . A . . . G . . C . . . . CT NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . NN . . NNAAGTATCTCTCATCATGTTTACATCATTCA . . . . NNNNNNNNNNNNNNNN . . CC . TTAACAGAA C ATCTCAATCCTGTTTACATCGTTCA T . . . G . . . A . .
blockSeqs : C . . . . A . . . . TGACAAG . . . . TC G T . TGCCAATATCGTTATCATTTCTCCTATG C . . . . . TGACACGATATCGGAATAGGAATT T . CGTC . . . . A . . . T . . G . . . . TT TTGTTGACAATGTTGACACCG . . AT . . ATCATTTATACCCTCACCTGGTTTACA . . . . CAATTGTCGACACGAA . . CG . CTGTGTCGA C ACCTTTTGTATACCTTTTTTACCA T . . . C . . . . . .
blockSeqs : T . . . . G . . . . CGACCAA . . . . TT G T . GTGTAGCTTTTGTCCTTTTTACATCG A . . . . . CGACATGTACACGATATCGAG T . CGTT . . . . A . . . T . . A . . . . TT TTGTCGACAATGGTTGAAACG . . TA . . GTATCTCTTATCCTTTTCAACGTTCA . . . . AATGATTTACGATAC . . TT . GTTTTCGAC C ACAGTTTGTTCTGTTTCACTTCA T . . . A . . . . . .
blockSeqs : C . . . . A . . . . CGACAA . . . . TC G A . CGGTTATCATTTTCCTTTGCATGG G . . . . . TGGTACATATCAATCAACGA G . CGTT . . . . A . . . T . . A . . . . NN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . TT . . TTTTCATTGATATATTTATAAAT . . . . AATGTTTGTGACGA . . NN . NNNNNNNN C ATCTCTTATCCTTTTCAACGTTC C . . . A . . . . . .
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blockSeqs : G . . . . A . . . . CGAGAA . . . . TT G T . GCAATTGTCTGTAGCCCTTC G . . . . . TTGATATGATATCAGAG A . CGTC . . . . G . . . T . . G . . . . T TCATCAATGATGTTGAATCA . . CA . . TAATTATTCTTCCCATGTACAA . . . . CAATGATTAACAA . . CT . GTGTCGAC T TCAGTTTCCTTTATTGATTTG C . . . G . . . . . .
blockSeqs : C . . . . G . . . . TAATGA . . . . TC G A . CGTTATTATTTTCTTCCATG A . . . . . CGACACGATACCCGAGG T . ATTC . . . . A . . . T . . A . . . . T TGTCGATGAATGTTGATACG . . CG . . TATCATTTCTTTCATGTCAAA . . . . TAATGTTTGACAA . . TT . CGCTCTAC N CCTGTTTCCTTTATCATTTCG C . . . A . . . . . .
blockSeqs : G . . . . A . . . . GAACAA . . . . T G T . CGTTATCATTTCTTTCATG G . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNN T . ATTC . . . . A . . . T . . C . . . . T TTTGTACGAATTCGAATACG . . CT . . GTAGCTTTTGTCCTTTTTA . . . . CAATTTGTACGAA . . TT . CGGTTGA T CCAGTTCCCTTTATTTATTTG C . . . A . . . . . .
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blockSeqs : . . . . A . . . . CGACAA . . . . T G T . TGTCTTTGTCCACATCG C . . . . . TGCACGAATGTCGAG N . CGTC . . . . A . . . T . . A . . . . T CATAGGACAATATTCACG . . TT . . TATTTCTTCCATGTCCA . . . . CAGTGCTGCAAG . . C . CATTGGC C ACTCTTATCCGTGTAACTGT C . . . C . . . .
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blockSeqs : . . . G . . . . GGACC . . . . T G A . CGTTCTACAGTG T . . . . . CCACACTATACGAG T . CTC . . . . . . . . . . . C . . . . T ATGTTGATGATATCGC . . A . . TGTAACTCT . . . . T GCCGCTTTTCCTGTTT C . . . A
blockSeqs : . . . A . . . . CG . . . . T G A . TCGCTCTTTG A . . . . . CGACAATGTTGACA . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . T TGTTATGATGTTGACA . . T . . T AGCTTTTGTCCTTTTT T . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . T A T . TCGCTCTTTG C . . . . . ACACCATATTGA . . T . . . . . . . . . . . . . . T TTTACGAATGAA . . T ACAGTTTGTCCTGTTT . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . T G T . A . . . . . TAG . . . . . . . . . . . ATGATTTACG . . C ACAGTTTGTCCTGTTT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T G T . A . . . . . . ATCTCTTGCACTGTTT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
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originalCons : CCTTTATN-AA-TT-CGAT-ATCGT-CGA-CATC---G-CAATG-T-C--GA-C-AA-T----G-TTGACAC-----GAT-AT--TCGA----G--------TT----------TA-CATC-G-C---T---A---TCGTT----T-T--CCTTT----C-------A-T-G--TCGA-C---ATC-------G-TCGACATCG--CAATGTC---------G------ACA---------C-GATAT----------C---CG---A-GG----TTT--A-CAT-CG--T-C-------T-AC--A--TCGT-TA--TT---A-TT--------TC-T-TTC-AT--GTCG----A-C-ATC-------GTCG-ACATTCGCAA--T--T-GTCG-ACGA-TGA-----TT--GAC--A-CG-----ATA-TCG-AGT---C-TAC----AT--CGT-----------T--ATC---ATT------T---CT--T-T-CA--T-G--T-----CA--A-----A-CATC----G-TCGACA-T--CGCA--A---T--T--GT-CG---A----CACGAATA-TCGAA-T-CNACA--TC--GT-T---C-G-ACATCGTGTACCGTT--T-----CC--T-T-------T---C--A--TG---T---CG------ACA-TCG-T-CG-ACA-TCG--CAATG-T---CGAC-AA-TGTCTA
finalCons : CCTTTATN-AA-TT-CGAT-ATCGT-CGA-CATC---G-CAATG-T-C--GA-C-AA-T----G-TTGACAC-----GAT-AT--TCGA----G--------TT----------TA-CATC-G-C---T---A---TCGTT----T-T--CCTTT----C-------A-T-G--TCGA-C---ATC-------G-TCGACATCG--CAATGTC---------G------ACA---------C-GATAT----------C---CG---A-GG----TTT--A-CAT-CG--T-C-------T-AC--A--TCGT-TA--TT---A-TT--------TC-T-TTC-AT--GTCG----A-C-ATC-------GTCG-ACATTCGCAATGTCGACGAATGTTGACACG-----------------------ATA-TCG-AGT---C-TAC----AT--CGT-----------T--ATC---ATT------T---CT--T-T-CA--T-G--T-----CA--A-----A-CATC----G-TCGACA-T--CGCAATGTNGCACGA--------------------TA-TCGAA-T-CNACA--TGCGTCGAC--------ATCGTGTACCGTT--T-----CC--T-T-------T---C--A--TG---T---CG------ACA-TCG-T-CG-ACA-TCG--CAATG-T---CGAC-AA-TGTCTA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|20 ): TATAACAGGTATATAGAAGGTACACATGTCGATCACGATTGTTGACTTTCGACTATCGTACATGGCATGGCGATGAACCGACGCA
Unaligned ( gi|21 ): TGAGTTAACATTGTTTTTCATTTATATATAGTTATAAATTATTGATTCCATTGTAATGTTTGACGATATCAAGTTTACATTTAA
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Reference ( family-4355 ) : CCTTTATN-AA-TT-CGAT-ATCGT-CGA-CATC---G-CAATG-T-C--GA-C-AA-T----G-TTGACAC-----GAT-AT--TCGA----G--------TT----------TA-CATCG-C---T---A---TCGTT----T-T--CCTTT----C-------A-T-G--TCGA-C---ATC-------G-TCGACATCG-CAATGTC---------G------ACA---------C-GATAT----------C---CG---A-GG----TTT--A-CAT-CG--TC-------T-AC--A--TCGTTA--TT---A-TT--------TC-T-T-TC-AT--GTCG---A-CATC-------G-TC--G-ACATT-CGCAA-T-G-TCG-ACGA-----AT-GTTGA-C--A-CG-----ATA-TCG-AGT--C-TA-C----AT--CGT-----------T-A-T---C---ATT-T------CTT-T-CA--T-G--T-----CA--A-----A-CATC-------GTCGA-CA-T--C--GC-AA-TG-T--------NG---------C------ACG-ATA-T-CG-AAT----CNACA--T-G-CG-TC-G-A----CATCGTG---------TAC--C--GTT--T-----CC--T-T----T---C--A--TG---T---CG------ACATCG-T-CG-ACA-TCG--CAATG-T---CGAC-AA-TGTCTA
gi|1 : TCATG---------TCC--A--GTT--C-----CA--T-T----TATCT--A--T----T---CA------ATATCG-T-CA-TCA-TCG--CATTG-T---TGAC-AA-
gi|1 : TTTATC-TA-TT-CAAT-ATCGT-CAT-CATC---G-CATTG-T-T--GA-C-AA-TTAATG-TTCATAC-----GAT-AT---CGA----G--------TT----------AA-CATCC-C---C---------------------CCCCC----C-------T-T-G--TCAA-C---ATC-------G-TCAATATTG-CGATGTT---------G------ACA---------C-GATAT----------C--------A-AG----TTT--A-CGT-CA--TC-------T-AC--A--TCATTA--TT---A-TT--------TC-T-T-CC-AT--GTCC---A-CATT-------G-TT--G-ACA-T-CGCAA-T-G-TCG-ATG------GT-GTTGA-C--A-AG-----AGA-TCG-AGT--T-TA-CATTGAT--CGT-----------T-A-T---T---AGT-T------CGT-C-CA--T-G--T-----C---C-----A-TATT-------GTCGA-CN-N--N--NN-NN-NN-N--------NN---------N------NNN-NNN-N-NN-NNN----NNNNN--N-N-NN-NN-N-N----NNNNNNN---------NNN--NAAGTA--T-----CT--C-TCA--T---C--A--TG---TTTACATCATTCACATCG-T-CG-ACA-TCG--CAGTG-C---TG-C-AA-taatgttcatacgatatcgagttaacatccccccccccttgtcaacatcgtcaatattgcgatgttgacacgatatcaagtttacgtcatctacatcattattatttcttccatgtccacattgttgacatcgcaatgtcgatggtgttgacaagagatcgagtttacattgatcgttattagttcgtccatgtccatattgtcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagtatctctcatcatgtttacatcattcacatcgtcgacatcgcagtgctgcaagtattaggtgcggccccaggttcgaacatgtgtacagtttgttctgtttcacttcaagtcggcatcacccaatgtcgtgcttagcatgtagacgataaaaatcctgacatcgtgttcattttcagtataaccatcatttataccctcacctggtttacacttgtcgcattgcaatgtagtacgatatggaatccagatatcaataattaacaggtaagaggaatttacaaagttgacacaatgtcaattagacatcattatccagtaaacatttgccgaatggtcgacctatgtgaatgattggtaaaaaaggtatacaaaaggtacacaatgctggtcaccgatgtcgatttcgatattgttaatcattgcgaaacgtgaacgatgcagcaagataagaggctaccat
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gi|2 : tcatgtcattccccatcatcaattcgatttcgttcaacatagcaatgttgacaagtgttgatacgaatctaattagcaattgtctgtagcccttctcaacatcgtacattgcattttgcacgaatgtcgagttacatcgttattattttcttccatggcgctcatcgtcgaaacgcaaagttggtacatatcaatcaacgattcgaattggttacctatccatgttgtctctatcgttcacatctctagtgaactcatgatttacgaatgaaacatcggttgaattgtgtatctcttatccttttcaacgttcacatcgtcgacattcgaatgtttgtgacgatattagatcacatgtcgtcgaattgtgtacctcttattcctgtttaatcgtcgcacatcgcaatgttgtatgagtatcgatcagatccaaataacaagacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttgatcgatgtacagttacacggataagagtacacaattcgacacagatgttgatctgagtatcgtaaat--GC-AA-T--T--------TG---------T------ACG-AAT-T-CG-AATA---CGACA--T-G-TG-TC-G-A----CAT-GTG---------TAG--C--TTTTGT-----CC--T-T----T---T-----T----------------ACATCG-T-TC-ACA-TTC--CAACA-TA--GGAC-AA-TAT
gi|22 : tcatgtcattccccatcatcaattcgatttcgttcaacatagcaatgttgacaagtgttgatacgaatctaattagcaattgtctgtagcccttctcaacatcgtacattgcattttgcacgaatgtcgagttacatcgttattattttcttccatggcgctcatcgtcgaaacgcaaagttggtacatatcaatcaacgattcgaattggttacctatccatgttgtctctatcgttcacatctctagtgaactcatgatttacgaatgaaacatcggttgaattgtgtatctcttatccttttcaacgttcacatcgtcgacattcgaatgtttgtgacgatattagatcacatgtcgtcgaattgtgtacctcttattcctgtttaatcgtcgcacatcgcaatgttgtatgagtatcgatcagatccaaataacaagacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttgatcgatgtacagttacacggataagagtacacaattcgacacagatgttgatctgagtatcgtaaatcatttgatgttgacgatgttgaacgatgtaaacaggattgagatacacaattcagcacgatgttattcgagtatcgtgaT-CGAT-ATTGT-TGA-CATC---G-CTGTATT-T--AA-T-GA-T----G-TTGATTC-----AAT-A---TCGA----G--------T
gi|23 : agtccaatgatcgaggttttaTCATG---------TCC--A--GTT--C-----CC--T-T----TATTT--A--T----T---TG------ATATCG-T-CA-ACA-TCG--CAGTG-T---GAAC-AA-TGT
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gi|24 : ttcatgtccagttc-AT--GTCA---A-CATC-------G-AC--G-ACAT--CGCAA-T-G-TCA-AC-A-----AT-GTTCA-C--A-CG-----ATA-TCA-AGT--C-TA-C----A
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gi|6 : tcgattccGA----G--------TT----------AA-CATTG-------------TCTTT----G-T--CCA------C-------A-TCG--TCAA-C---ATTCAT----G-TAGACATCG-CAATGTC---------G------ACA------------ATGT----------T----G---A-CA----CT---A-TAT-TGAATT-------T-AC--A--TCGTTA--TT---A-TT--------TC-T-T-CC-AT--GTCC---A-CATT-------G-TC--A-ACNNN-NNNNN-N-N-NNN-NNNN-----NN-NNNNN-N--N-NN-----NNN-NNN-NNN--N-NN-N----NN--NNN-----------N-NCT---T---ATC-C------TGT-T-TA--C-G--T-----CGTTC-----A-CATC-------GTCAA-CT-T--C--GC-AG-TG-CTATACGGATA---------T------ACG-ATA-T-CG-AAT----CAACAT-T-G-CG-TC--------CATTTTG---------TA---T--GCC--T-----CT--T-A----T---C--C--TG---T---tca
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