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gi|30 : ggT-ATTTTC--TT-G--T-G--T-A--T-TGT-A---TC-A-AG--ACA-A-CTTT-A-A-GAGAACa
gi|31 : A---T-TC-ATTTTC--TT-G--T-G--T-A--T-TGT-A---TC-A-AG--ACA-A-GTTT-A-A-
gi|4 : GGGCTCT--T-G-G------GT-C-ATGAA-CT-GAC---T-TC---G-CC--------C---TTTC-GAA-C-A----TATTTT-TT-ATTTTC---T-G--T-G--T-A--T-TGT-AT--TC-A-AG--CAA-A-TTTT-A-A-TAGAACa
gi|5 : tgGGGTTCT--TGA-G------GT-C-CT--A-CT-GAC---C-CC---G-CC--------C----TTC-G-A-C-A----TA---T-TTCATTTTC--TT-GT-T-G--T-A--T-TGT-A---TG-A-A---ACAGA-TTTT-AGA-GAAAACa
gi|6 : ggGGCCTCC--TGA-G------GT-C-CTG-A-CT-GAC---C-GC---C-CC--------G---TTTC-G-T-C-A----TAG--T-TT-ATTTT--------------T-A--A-TTT-AAATTC-A-AGGAACA-A--TTT-A-A-AAGAACa
gi|7 : cggGGGCTCT--TGG-G------GT-C-CTG-A-CT-GAC---C-CC---GACC--------C---TTTC-G-A-C-A----TA---T-TT-ATTTCT--TT-G--T-G--T-A----TGT-A---TC-A-AG--ACA-A-TTTT-A-A-G-GAACa
gi|8 : ggGGGCTCT--TTG-G------GT-CGATG-AGCT-GAC---C-C----G-CC--------C---CTTT-G-A---A----TA---T-T--ATTTTC--TT-G--T-G--T-A--TCTGTAA---TC---AG--AAA-A-CTTT-A-AGGAGA
gi|9 : ggGGCTCT--TGG-G-------T-C-ATG-A-CTTGAC---C-C----G-CA--------C---TTTC-G-A-C-A----AT---T-TT-ATTTT---TT-G--T-G--T-A--T--GT-A---TC-A-AG--ACA-A-TTTT-A-A-GAGAAC
blockSeqs : GT T . G GA T G T TCT G AGC A TTTTGTGG CTT . A A A . TTT A CA CA . CT G CG C AA C A AAT G C GA G T A G G
blockSeqs : . . . . C A . . . . C . . . . . . C . G . A A . A . A . A . T T . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A C . T . . . T . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . A T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . A T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . G C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . A T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
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originalCons : GGGCTCT--TGG-G------GT-C-ATG-A-CT-GAC---C-CC---G-CC--------C---TTTC-G-A-C-A----TA---T-TT-ATTTTC--TT-G--T-G--T-A--T-TGT-A---TC-A-AG--ACA-A-TTTT-A-A-GAGAAC
finalCons : GGGCTCT--TGG-G------GT-C-ATG-A-CT-GAC---C-CC---G-CC--------C---TTTC-G-A-C-A----TA---T-TT-ATTTTC--TT-G--T-G--T-A--T-TGT-A---TC-A-AG--ACA-A-TTTT-A-A-GAGAAC
Alignments
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lowQualScore : .. . ...... . .. . . . ... . ... . ........ ... . . . . .... ... . .. ... . .. . .. . .. . . ... . . .. . . . . .
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consensus : GGGCTCT--TGG-G------GT-C-ATG-A-CT-GAC---C-CC---G-CC--------C---TTTC-G-A-C-A----TA---T-TT-ATTTTC--TT-G--T-G--T-A--T-TGT-A---TC-A-AG--ACA-A-TTTT-A-A-GAGAAC
Reference ( family-4315 ) : GGGCTCT--TGG-G------GT-C-ATG-A-CT-GAC---C-CC---G-CC--------C---TTTC-G-A-C-A----TA---T-TT-ATTTTC--TT-G--T-G--T-A--T-TGT-A---TC-A-AG--ACA-A-TTTT-A-A-GAGAAC
gi|1 : GGGCTCT--TGG-AGTCGACGT-C-ATG-A-CT-GACT--T-CT---G-CC--------C---TTTCAG-A-C-ACTGCTAC--T-TT-ATTTTTCGTTGG--T-G--T-A----TGT-G---TT-A-A
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gi|2 : --TGT-G------GTGC-ATATA-CT-GAC---C-CCAGCG-CG--------C---CTTC-G-A-C-A----TA---T-TT-ATATTC--TT-GA-TGG--T-A--T-TGTAA---TC-A-AG--ACA-A-TTTTAA-A-GAAAACa
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gi|23 : AC---C-CC---G-CC--------C---TTTC-G-G-C-A----T-----------TTTC--TT-G--T-G--T-AT-T-TGT-A---TC---AG--ACA-A-TTTA-G-A-AAGAACa
gi|24 : ga---C-CC---G-CC------------TTTC-A-A-C-A----TA---T-TT-----TT--TT-G--T-T--C-A--T-TGTTA---TC-A-AG--ACA-A-TTTT-A-A-GAGAAC
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gi|26 : a-GAC---C-CC---G-CC--------C---TTTC-G-G-C-A----T-----------TTTC--TT-G--T-G--T-A--T-TGT-A---TC---AG--ACA-A--TTT-A-A-GAGAA
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gi|28 : TTCA-TT-G--T-A--TCA--T-TGT-A---TC-A-AG--ACA-A-TTTT-A-A-GAGAAC
gi|29 : g-ATTTTT--TT-G--T-T--C-A--T-TGT-A---TC-A-AG--ACA-A-TTTT-A-A-GAGAACat
gi|3 : GGGCTCTGTTGGTG------GT-C-ATG-A-CT-GACTCTC-CT---G-CCTTTTGTGGC---CTTC-G-A-C-A----TA---T-TT-ATTTTC--TT-G--T-GCGT-A--T-TGT-A---TC-A-AG--ACA-A-TTTT-A-A-GAGAACa
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gi|7 : cggGGGCTCT--TGG-G------GT-C-CTG-A-CT-GAC---C-CC---GACC--------C---TTTC-G-A-C-A----TA---T-TT-ATTTCT--TT-G--T-G--T-A----TGT-A---TC-A-AG--ACA-A-TTTT-A-A-G-GAACa
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