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Reference ( gi|14 )           :         ATACCTCAGA--CTGTTTTTACT--A--TAC-A---A---A---TGT-TAGGTG-AATAC--AT-TTGC
gi|2                          :         ATACCTCAGA--CTGTTTTTACTAAA--TATAA---A---A---TGT-TAAGTG-AATAA--AT-TTGC
gi|10                         :      atcATAACTCAGA--CTGTGTTTACT--G--TAT-A---A---A---TTT-TAAGTG-AATAA--AT-TTGCta
gi|7                          :       ttATACCTCAGAGACTGTTTT-ACT--G--TAT-A---A---A---TGT-TAAGTG-AATAA--AT-TTt
gi|12                         :     aattATACATCAGA--CTGCTTTTACT--G--CAT-A---A---A---TAT-TTGGTG-GATAG--AT-TTGCc
gi|19                         :        tATAACTCAGA--CTGTTTTTACT--A--TAC-A---A---A---TGA-TAGt
gi|1                          :        tATACCTCAGA--CTGTTTTTACT--AATTAT-A---A---A---TATACAGTTG-AATATGAAT-TCGC
gi|13                         :     tattATGCCTCAGA--CTATTTT-ACT--G--TGT-A---A---A---TCT-TAGGTG-AA-AC--Aga
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gi|9                          :      attATACCTCAG---CTGTTTTTACT--AT-TAT-----A---A---TTT-TACGTGTAAT-----T-TTGCtat
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gi|11                         :     ttatttACTTCAGA--CTGTTCTTACT--G--TAC-A---A---A---TGT-TAGGTG-AATA---ATATTGC
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gi|15                         :             CTCAGA--CTGTTTTTACT--A--TAC-A---T---A---TGT-TAGGTG-AATAA--AT-TTGCat
gi|16                         :             tTCAGA--AGGTTTT-ACT--G--AAT-A---T---T---TGT-TAGGTG-AATAA--AT-TTGCaa
gi|17                         :               CAGA--CTGTTTTTACT--G--TAT-A---A---A---TGT-TAGGTG-AATAA--AT-TTtat
gi|18                         :                      TGTTTTTACT--A--TAC-A---A---A---TGT-TAGGTG-AATAG--AT-TTGCat
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|3 ): TATTATTAACCTCAACTGTTTTTACTCATATAATTTTCGTGAAAATTTGCCACTTT






Alignments
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Reference ( family-4295 )     :         ATACCTCAGA--CTGTTTTTAC------T--G--TAT-A-AA---TGT-TAGGTGAATA--AATTTGC
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gi|18                         :                      TGTTTTTAC------T--A--TAC-A-AA---TGT-TAGGTGAATA--GATTTGCat
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gi|8                          :      aattTACCTCAGA--CTGGTTT-AC------T--G--TAT-A-AA---TGG-TAAGTGAATA--AATATGCc
gi|9                          :   ttatttATACCTCAG---CTGTTTTTAC------T--A--T-T-ATAA---TTT-TACGTG--TA--ATTTTGC





Alignments
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consensus                     :         ATACCTCAGA--CTGTTTTTAC------T--G--TAT-A-AA---TGT-TAGGTGAATA--AATTTGC
Reference ( family-4295 )     :         ATACCTCAGA--CTGTTTTTAC------T--G--TAT-A-AA---TGT-TAGGTGAATA--AATTTGC
gi|1                          :         ATACCTCAGA--CTGTTTTTAC------T--AATTAT-A-AA---TATACAGTTGAATATGAATTCGC
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gi|17                         :               CAGA--CTGTTTTTAC------T--G--TAT-A-AA---TGT-TAGGTGAATA--AATTTtat
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Reference ( family-4295 )     :         ATACCTCAGA--CTGTTTTTAC------T--G--TAT-A-AA---TGT-TAGGTGAATA--AATTTGC
gi|1                          :         ATACCTCAGA--CTGTTTTTAC------T--AATTAT-A-AA---TATACAGTTGAATATGAATTCGC
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gi|18                         :                      TGTTTTTAC------T--A--TAC-A-AA---TGT-TAGGTGAATA--GATTTGCat
gi|19                         :         ATAACTCAGA--CTGTTTTTAC------T--A--TAC-A-AA---TGA-TAG
gi|2                          :        tATACCTCAGA--CTGTTTTTAC------TAAA--TATAA-AA---TGT-TAAGTGAATA--AATTTGC
gi|3                          :        atcACCTCA-A--CTGTTTTTAC------TC-A--TAT-A-AT---TTT-C--GTGA--A--AATTTGCta
gi|4                          : tattattaATACCTCAGAGCTTGTTTTTACA-----T--A--TAT-A-A----T-T-TACGTGAATA--AATTCGCcacttt
gi|5                          :        attACCTCAGA--CTGTTTTTACTGTACAT--G--TAT-A-CA---TAT-TAGGTGAATA--AATTTGtat
gi|6                          :           ACCTCAGA--CTGTTTTTAC------TAAA--TAT-A-AAATGTGT-TAAGTGAAT---AATTTGCat
gi|7                          :        aATACCTCAGAGACTGTTTT-AC------T--G--TAT-A-AA---TGT-TAAGTGAATA--AATTTta
gi|8                          :      aattTACCTCAGA--CTGGTTT-AC------T--G--TAT-A-AA---TGG-TAAGTGAATA--AATATGCc
gi|9                          :   ttatttATACCTCAG---CTGTTTTTAC------T--A--T-T-ATAA---TTT-TACGTG--TA--ATTTTGC