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gi|1                          :        TGCC---TATAC--GCGC--CG---T-ATGAC-GTAACAGTA-AAACA--TTGGC-GTTCGC---A----CT-GAGTGAA---TGAC---GTT--A-CCCTTTTCC---CC---ACA---G--CGT---TTTT-GAG-CTGG-CC-T-GCGAA-AA-TTTCGGA-AATTTT-AA-CAACAATTTCCT-A-CGTC--AACGTTTTT--CAC-TGTTAATATATTC-TTT-AGCT-ACC-ACAGAGAGTTTTG-ATGA--GCTGAA-ACTTTT-AA--CTA----TC-GAATCG-TAATAAG-GCCCCGAATAATAT-TA-CGA--GATATAGGTTAAATCA--TTTTCTT----TTC--AGAAGGTTT-ATA--TCCTAA--TCATTTGTTTTTT-AATTCATTTC--AAATCTTCAAATG-TATTTGGA--TTTT-GTTTTTTCGGTTTT-ATAAATT-AAT-GTACATGTATGA-TTTAAT-AAC-ATAGGA-CTATATACCACTATTAAAC--ATAT-CT--AT-CAACTGTTT-TTGTTTT--AACATTCAT-ATAAA-T----ATG---TAT---CCCCCATGTCG-AAT-CGTTT-CCTT-CAACATTT-AAGATTTTTT---AATATAATTTTTT-AAAA--TTTGATTTTTT-CATGCT---TTTTC---------ATTTTAATAAAAAAAAA--TTAATC-AGTTCAG--TTATTACAT-AGCTAT-A-AAATACTTAGTATT--CAAATTATATTGACGACTGATTCAGC--TATTT---AAAAAAAATCTAGATC-ATGCTT-GGAG-TTCGTCTGGTGCGC-GTGGTTGTAATTTGT-AGGCATGCAAGGTTCTTTTCAATATTCAAAA-GGTAACAATAAAAAAAA------TTAAAAAAA-------------ATTTAAAAACCAGCTAGAACCCCC----------AAAA----AACCTCGAGAAAAC-AGCGAAAGCACTGCCACTACGCAGTCCCGTATTCCGTACGTTGTTGTGGCTTTTTATTGGAGGGGGGG-----CTACTTTAAAACAGCAAATTACAATATGA-CGTTTGCTGGAGAGAGATAA-CAAACATTA-GTTGTA-AACTAGA-GGATT-GTTGTTTACTTTAGTAGCTGT--TTTGCAGTGTCCTACATTTAAATAACAGTTA-TGTAGTAGTGCGAGGTGTCAAGCTGTCCTAATACTTCCTCCTTGCAGGGTGTAACATCGTGTTTTAGTTCTTTTTTAACAAAAACATAAAAAGGGGGATGCCTTGTC--AAAACCCTTCTCCAAAGTGGAGGGGGGGGGCCTTACAATGTAAAA--CCTC-TTCGTAGAAGGGAAGACGTA-TTAAAAAAGTGCGTGTTGGAGATTGGGGGGGG
gi|3                          :  ctctttTGCCCTATAT-CCGACAT--CGCC-TTATGACCGTAACAGTA-A--CGAGTTGCGCGTTCGCT-CAAAAACCTGAG-GAAATACGACACTGTTCGA-TCCTTTCCCGCCCT---ACA---G--CGT---TTT--GAG-CTGG-TTTGCGCGAA-AA-TT-CGGACAATTTTTAA-CA-CA--TTTCT-A-CG-C--AACGTTTT---CAA-TGTTA-TATATTCCTTTTAGCTTAC--ACAGA-AGTTTTT-ATGAA-AGCGATTACTTTT-AAAACTAAAGATC-GAATCGCTAATAGAAGGCACGTAAAATAT-TA-CGATGAATATAGGTTAAATAT---TTTTCT----TTTCAAGAAGGTTT-ATAA-ATCTAA--T-ATTTGTTTTTA-AATTCAATTTCCAAATCTTCAAATGATATTTGGATTTTTTTGTTTTTCCG-TTTATAT-A-TT-AAT-GTACATGTATGGTTTTTAT-AA--ATAGG-ACTA--TACCACTATTAAAC--ATAT-CTTAAT-CTACTGGTA-TT--TTT--AACATTCATAA--AATTT--AATG---TGT---C--C-ATGTCG-AA-TCGTTTTCCTTCCAACATTTTAAGATTTTTTTAAAATATGATTTTTTAAAAA--TTTA---TTTT-TTT-TTCAATCTTTTT---TTAAATTTT-ATTA--AAAAA--TT-ATCAAATTCAGTTTTTTAACACAGGCTATAA-CA-TACT-AGTATTTACAA-TT-TATgggggggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncagaaataatcgatgtagtgtgtgaaagtggcggcttgaatataagtattcttaattgcatatgcaatagaaggaactatgtattggatgtaacccactcacttaagcccccacctgttttcaattctgcgtggcttgtgttaaggcaaatctgcttttccttcaaaaaataagaatgcgttgactgggagtgtaagccgtgtttcaccattatttgcaggataaagcctgcatcttagataatatgtcaactcaaaaaaaataattggtaatatttatttgaaaccgttcttaactttcaaattcaaattatactatcatcactattttggtttatagaacaatttaaagcctgatacgtgtatctaaactcatatatccataatattttttctgtttcccaaaaatagggggggacaaaacagccaattaagccaacatgagggataaaagaaataattcactttgtaaatctacaattgaatgcatacgtacagaat
gi|4                          :   ctcttTGCC---TAT-C---C-C--CGCCAT-ATGAC-GTAACAGTACA--CA--TTGGCCGTT-GCC--A----CT-GAGTGA----TGAC---GTT--AACCCTTTTCC---CCCCCACACCCA--CGT---TTTTTTAG-CTGGGCT-G-GCGAATAA-TT-CGGA-ATTTTT-AAACA-CA--ATTCT-AACG-CCAAACGTTTTTTTCAA-TGTTA-TATATCT-TTTTAGCTTACCGACA-AGAGGTTTTGATGAAAGCTGAA-ACTTTTTAA--CTAA---TCAGAATCGCTAATAGA-GGCACGTACAATATATAACGATGAATATAGGTTAAA-AATCATTTTTTCTTTTTC--GAAAGGTTTCATAA-TCCTAA--T-ATTTGTTTTTT-AATTCAATTTCAAA-TCTTCAA-TGATATTTGGA--TTTTTTGTTTTTCG-TTTA-ATAA-TTAAATGGTACATGTATGA-TTTTATAAAACATAGG-ACTA--TACCACTATT-AAC--ATAT-C-TAATGCAACTGTTT-TT--TTTTAAACATTCATAATAAA-TCTAAATG---TATCGCTCAC-ATGTCGTAAT--GTTTTCCTT-CAACATTTTAAGATTTTTTT-AAATA-AATTTTTTTAAAATTTTTT---TTTT-CA--CT---CTTTTTT---TCCA
gi|14                         :    tcttTGCC---TAT-C--ACGC--CGCC-T-ATGAC-GTAACAGTA-A--CA--TTGG-CGTTCG-C-CA----C-TGAGTGA----TGGG---GTT--A-t
gi|7                          : aactcttTGCC---TAT-C--GTGAGACGCC-T-ATGAC-GTAACAGTA-G--CA--TTTGCT-TTTGCCGCA-------GAATGA----TGAC---GTT--A---CTGGTCC---AC---GCA---G--CATGTACTTTCGA-GTTGA-TC-G-GCGAA-AT-TT-CGGA-ATTTTT-GA-
gi|16                         :    actcTGCC---TAT-C--ACGC--CGCC-T-A
gi|6                          :            agtttaactcttGC--CGCC-T-ATGAC-GTAACAGTA-A--CA--TTGGC-GTTCGCC--A----CT-GAGTGA----TGAC---GTT--A-CCCTTTTCC---CC---ACA---GAGCGT---TTTT-GAG-CTTG-CT-G-GCGAA-AAATT-CGGA-AATTTT-AA-CA-CA--TTTCTTA-CG-C--AACGTTTTT--CAAATGTTA-TATATTC-TTTTAGCTTACC-ACAGAGAGTTTTT-ATGAAAGCTGAT-ACTTTTTAA--CTA----TC-GAATCGCTAATAGA-GGCACGTAAAATAT-TA-CGATGAATATAGGTTAAATCA--TTTTCTT----TTC--AGAAGGTTT-ATAA-TCCTAA--T-ATTTG-TTTTT-AATTCAATTTC-AAATCTTC
gi|15                         :                                      G--GCAATAGTT-G--CA--TT--TCTTTCGCC-GC----CT--AATGA----TGAC---GTT--A-CCCT
gi|13                         :                                     tataaTAACAGTA-G--CA--TTG--CTTTCGCC-AA------TGAATGA----TGAT---GTT--A-CCCTTGTCC---TT---ACA---G--CAC---TTTC--AAGATGA-TT-G-GC
gi|9                          :                                                                        cctaagacaGAATGA----TGAC---GTT--A-CCCTTGTCC---TC---GCA---G--TAC---TCTC-GAG--TGG-ATAG-GCGAA-AA-TT-AGGA-A-TTTT-AA-AA-AAAATTCCT---CG-C--AACGTTTTC--CAA-TGTTT-TATTGTC-TGTTCGCatctgaattcg
gi|17                         :                                                                                                                                                                              ATTTT-AA-CA-CA--TTTCT-A-CG-C--AACGTTTT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGTTAATCA----TTTTCTG---TTC--AGA-GGTTT-ATAAATCCTAAGTT-ATTGGTTTTTTCAAGCCATTTC--AAATCTTCAAATGATATTTGGA--TTTTTTGTCTTTCG-TTTA-ATAA-TT-AA-----------------------AC-ATAGGAAAT----ACCACTATTGAACTAATGTATTTAA--ATACTAGTAATT--TTT--AACATTCAT-A--AA-TT--AATGATACAT---CCAC-ATGTCG-AAT-CGTTTTCCTT-AAACCTTTTTAGATTTTTTATACATATA-TTTTTTTA-----TTTA---TTT---AT-CT---TCTTTTTGGTTTTAATTTTAA-----AAAAACCTTAATC-AATTCAG--TTTTA-CATCAGCTAT-AACA-TATT---------CAA-TTATACTGACGACTGATTCAGCATTATTTAAAAAAAAAAATCTAGATC-ATGCCTAGGAG-TTCGTC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aagT-CAACATTTTAAGATTTTTTT-AAATATAA-TGTTTTATAA--TTTA---TTTTGCAT-CT---TTTTTTT---C---ATTTTAATTAA-AAAAA--ATAATC-AATTCAG--TTTTA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AG-TTATATTGACGACTGATTCAGCATTACTT---AAAAAAAATCTAGATC-ATGCCAAGGAGTTTCGTCTG-TGCGCTGTGG---------TTTAGGCATGCAAGGTTCTCTTCAATATTca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GGTTCTCTTCAATATTCAAAAAGGTAAAAGAAAAAAAAACTCCCCAAAAAAA---ACAAAAAAA-CA-----------AGCTAGA--CCCCCCCTAAAAAA--------AACCACGAGAAAACCAGC-AAAGCACTG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TACGTTGT----GCCCTTTATTGG-GGGGGGGGGGTGCTACTTTAAAATAGCAA-TTACAAGATGAAAGTTTGTTGGAGAGAGAT-AACAAACATT-AGTTGTA
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Reference ( family-3813 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCCTAT---CG-CGC--CGCC-T-ATGAC-GTAACAGTA-A--CA--TTGGCCGTTCGCC-CA----CTTGAGTGA----TGAC---GTT--A-CCCTTTTCC---CC---ACA---G--CGT----TTTC-G-AG-CTGG-CC-G-GCGAA-AA-TTCGGA-AATTTT--AA-C-ACA--TTTCT-A-CG-C--AACGTTTTT--CAA-TGTT-ATATATTC-TTTTAGCTTACC-ACA-GAGAGTTTTTATGAAAGCTGAN-ACTTTTTAA-CTAA---TC-GAATCGCTAATAGA-GGCACGTANAATAT-TA-CGATGAATATAGGTTAAA--TAATTTTTT---TTTC-AGAAGGTTT-ATAA-TCCTAA--T-ATTTGTTTTTTAATTCAATTT-CAAA-TCTTCAAATGATATTTGGA--TTTTTNNTTTTTC-GTTTAAT-A-ATTAA-TG-TACATGTATGA-TTTTATAA--CATAGGAAC--TATACCACTATTAAAC----ATATCTTAAT-CNACTGNTN-T--TTTT--AACATTCATAATAAATT--AATG---TAT-C---CACATGTCG-AA-TCGTTTTCCTT-CAACATTTTAAGATTTTTT-T-AAATATAATTTTTTTAAAA--TTTA---TTT-T-CA-T-CT---TTTT-T-TTTT-AATTTTAATTAA-AAAAATTAATC-AATTCAG--TTTTAACAT-A-GCTAT-ACATAC-TAGTATT--C-AATTATATTGACGACTGATTCAGCATTATTT---AAAAAAAATCTAGATC-ATGCCTAGGAG-TTCGTCTGGTGCGCTGTGGTTGTAATTTNTTAGGCATGCAAGGTTCTCTTCAATATTCAAAAAGGTAANAGNAAAAAAAACTCCCCNNAAAAAAA-ACAAAAAAA-CAATTTAAAAACCAGCTAGAACCCCCCCCTAAAAAAAAAA----AACCNCGAGAAAACCAGCGAAAGCACTGCCACTACGCAGTCCCGTATTCCGTACGTTGTTGTGGCCCTTTATTGGAGGGGGGGGGGTGCTACTTTAAAACAGCAAATTACAANATGAANGTTTGCTGGAGAGAGATAAACAAACATTAAGTTGTA-AACTAG-AGGA-TTGTTGTTTACTTTAGTAGCTG--TTTTGCAGTGTCCTACATTTAAATAACAGTTA-TGTAGTAGTGCGAGGTGTCAAGCTGTCCTAATACTTCCTCCTTGCAGGGTGTAACATCGTGTTTTAGTTCTTTTTTAACAAAAACATAAAAAGGGGGATGCCTTGTC--AAAACCCTTCTCCAAAGTGGAGGGGGGGGGCCTTACAATGTAAAA--CCTC-TTCGTAGAAGGGAAGACGTA-TTAAAAAAGTGCGTGTTGGAGATTGGGGGGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAGAAATAATCGATGTA-GTGTGTGAAAGTGGCGGCTTG-AATATAAGTATTCTTAATTGCATATGCAATA-GAAGGAACTATGTATTGGATG-TAACCCACTCACTTAAGCCCCCACCTGTTTTCAATTCTGCGTGGCTTGTGT-TAAGGCAAATCTGC-TTTTCCTTCAAAAAATAAG-AATGCGTTGA-CTGGGAGTGTAAGCCGTGTTT--CACCATTATTTGCAGGATA-AAG-CCTGCAT--CTTAGAT-AATATGTC-AACTCAAAAAAAATAATTGGTAATATTTATTTGAAACCGTTCTTAACTTTCAAATTCAAATTATACTATCATCACTATTTTGGTTTATAG-AAC-AATTT-AAAGCCTGATACGTGTATCTAAACTCA
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gi|10                         : ctcttttgcctatacgcgccgtatgacgtaacagtaaaacattggcgttcgcactgagtgaatgacgttacccttttccccacagcgtttttgagctggcctgcgaaaatttcggaaattttaacaacaatttcctacgtcaacgtttttcactgttaatatattctttagctaccacagagagttttgatgagctgaaacttttaactatcgaatcgtaataaggccccgaataatattacgagatataggttaaatcattttcttttcagaaggtttatatcctaatcatttgttttttaattcatttcaaatcttcaaatgtatttggattttgttttttcggttttataaattaatgtacatgtatgatttaataacataggactatataccactattaaacatatctatcaactgtttttgttttaacattcatataaatatgtatcccccatgtcgaatcgtttccttcaacatttaagattttttaatataattttttaaaatttgattttttcatgctttttcattttaataaaaaaaaattaatcagttcagttattacatagctataaaatacttagtattcaaattatattgacgactgattcagctatttaaaaaaaatctagatcatgcttggagttcgtctggtgcgcgtggttgtaatttgtaggcatgcaaggttcttttcaatattcaaaaggtaacaataaaaaaaattaaaaaaaatttaaaaaccagctagaacccccaaaaaacctcgagaaaacagcgaaagcactgccactacgcagtcccgtattccgtacgttgttgtggctttttattggagggggggctactttaaaacagcaaattacaatatgacgtttgctggagagagataacaaacattagttgtaaactagaggattgttgtttactttagtagctgttttgcagtgtcctacatttaaataacagttatgtagtagtgcgaggtgtcaagctgtcctaatacttcctccttgcagggtgtaacatcgtgttttagttcttttttaacaaaaacataaaaagggggatgccttgtcaaaacccttctccaaagtggagggggggggccttacaatgtaaaacctcttcgtagaagggaagacgtattaaaaaagtgcgtgttggagattgggggggggggggggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AGTTATATTGACGACTGATTCAGCATTACTT---AAAAAAAATCTAGATC-ATGCCAAGGAGTTTCGTCT-GTGCGCTGTGGT---------TTAGGCATGCAAGGTTCTCTTCAATATTtatatccataatattttttctgtttcccaaaaatagggggggacaaaacagccaattaagccaacatgagggataaaagaaataattcactttgtaaatctacaattgaatgcatacgtacagaat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T-CAACATTTTAAGATTTTTT-T-AAATATAA-TGTTTTATAA--TTTA---TTT-TGCA-T-CT---TTTT-T-TTC---ATTTTAATTAA-AAAAAATAATC-AATTCAG--TTTTA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TACGTTGT----GCCCTTTATTGG-GGGGGGGGGGTGCTACTTTAAAATAGC-AATTACAAGATGAAAGTTTGTTGGAGAGAGAT-AACAAACATT-AGTTGTA-ca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CC-T-AAGAC-ATAACAGTA-G--CA--TTG--CTTTCGCC-AA------TGAATGA----TGAT---GTT--A-CCCTTGTCC---TT---ACA---G--CAC----TTTC-A-AG-ATGA-TT-G-GC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCCTAT---CA-CGC--CGCC-T-ATGAC-GTAACAGTA-A--CA--TTGG-CGTTCG-C-CA----C-TGAGTGA----TGGG---GTT--A-atctgaattcg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aactctt-T-ATAAG-GCAATAGTT-G--CA--TT--TCTTTCGCC-GC----CT--AATGA----TGAC---GTT--A-CCCT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTTT--AA-C-ACA--TTTCT-A-CG-C--AACGTTTT
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Reference ( family-3813 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCCTAT---CG-CGC--CGCC-T-ATGAC-GTAACAGTA-A--CA--TTGGCCGTTCGCC-CA----CTTGAGTGA----TGAC---GTT--A-CCCTTTTCC---CC---ACA---G--CG-T----TTTCG-A-GCTGG-CC-G-GCGAA-AA-TT-CGGA-AATTTT--AA-CA-CA--TTTCT-A-CG-C--AACGTTTTT--CAA-TGTTA-TATATTC-TTTTAGCTTACC-ACA-GAGAGTTTTTATGAAAGCTGAT-ACTTTTTAA-CTAA---TC-GAATCGCTAATAGA-GGCACGTAAAATAT-TA-CGATGAATATAGGTTAAA--TCATTTTCT---TTTC-AGAAGGTTT-ATAA-TCCTAA--T-ATTTGTTTTTTAATTCAATTT-C-AAATCTTCAAATGATATTTGGA--TTTTTGGTTTTTCG-TTTAATA-A-TTAA-TG-TACATGTATGG-TTTTATAA--CATAGGAACTATA--CCACTATTAAAC----ATATCTTAAT-CNACTGGTA-TT--TTT--AACATTCATAATAAATT--AATG---TATC---CAC-ATGTCG-AA-TCGTTTTCCTT-CAACATTTTAAGATTTTTT-T-AAATATAATTTTTTTAAAA--TTTA---TTT-T-CA-T-CT---TTTT-T-TTTT-AATTTTAATTAA-AAAAATTAATC-AATTCAG--TTTTAACATCAGCTATAACATACT-AGTATT--CAA-TTATATTGACGACTGATTCAGCATTATTT---AAAAAAAATCTAGATC-ATGCCTAGGAG-TTCGTCTG-TGCGC-GTGGTTGTAA-TTTTTAGGCATGCAAGGTTCTCTTCAATATTCAAAAAGGTAAAAAAAAAAAAAACT----AAAAAAA-ACAAAAAAA-CAAC-TGAAAACCAGCTAGAACCCCCCCCCAAAAAA--------AACCACGAGAAAACCAGC-AAAGCACTGCCACTACGCAGTCCCGTATTCCGTACGTTGT----GCCCTTTATTGGGGGGGGGG----CTACTTTAAAACAGCAA-TTACAATATGAACGTTTGCTGGAGAGAGAT-AACAAACATT-AGTTGTA-AACTAGAAGGATTTGTTGTTTACTTTAGTANCTGTCTTTTGCAGTGTCCTACATTTANATAACAGTTACTGTANCAGTGNGAGGTGTCAAGCTGTCCTAATACTTCCTCCTTGCAGGGTGTAACATCGTGTTTTAGTTCTTTTTTAACAAAAACATAAAAAGGGGGATGCCTTGTCTAAAAACCCTTCTCCAAAGTGGGGGGGGGGGGCCTTACAATGTAAAAACCCTCATTCGTGGAAGGGAAGACGTATTTAAAAAAGTGCGTGTTGGAGATTGGGGGGGGTGCCGTCCTTCACGAAATGTGATTGACTCATATCTTTCAGCTTTCGTCCATACTGCTCTCAGAAATAATCGGTGTATGTGTGTGAAAGTGGNNGCTTGAAATATAAGTATTCTTAATTGCATATGCAATAGGAAGGAACTATGTATTNGATGTTAGCCCACCCACTTAAGCCCCCACCCGTNTTCAATTCTGCGTGGCTTGTGTGTAAGGCAAATCTGCTTTTTCCTTCAAAAAATAAGAAATGCGTTGATCTGGGAGTGTAAGCCGTGTTTTCCACCATTATTTGCAGGATAGAAGACCTGNATACCTTAGATAAATATGTCAAACTCAAAAAAAANNATTGGTAATATTTATTTGAAACCGTTCTTAACTTTNAAATCCAAATTATACTACCATCACTATNTTNGTTTATAGAAACGAATTTGAAAGCCTGATACGTGTATCTAAACTCA
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gi|10                         : ctcttttgcctatacgcgccgtatgacgtaacagtaaaacattggcgttcgcactgagtgaatgacgttacccttttccccacagcgtttttgagctggcctgcgaaaatttcggaaattttaacaacaatttcctacgtcaacgtttttcactgttaatatattctttagctaccacagagagttttgatgagctgaaacttttaactatcgaatcgtaataaggccccgaataatattacgagatataggttaaatcattttcttttcagaaggtttatatcctaatcatttgttttttaattcatttcaaatcttcaaatgtatttggattttgttttttcggttttataaattaatgtacatgtatgatttaataacataggactatataccactattaaacatatctatcaactgtttttgttttaacattcatataaatatgtatcccccatgtcgaatcgtttccttcaacatttaagattttttaatataattttttaaaatttgattttttcatgctttttcattttaataaaaaaaaattaatcagttcagttattacatagctataaaatacttagtattcaaattatattgacgactgattcagctatttaaaaaaaatctagatcatgcttggagttcgtctggtgcgcgtggttgtaatttgtaggcatgcaaggttcttttcaatattcaaaaggtaacaataaaaaaaattaaaaaaaatttaaaaaccagctagaacccccaaaaaacctcgagaaaacagcgaaagcactgccactacgcagtcccgtattccgtacgttgttgtggctttttattggagggggggctactttaaaacagcaaattacaatatgacgtttgctggagagagataacaaacattagttgtaaactagaggattgttgtttactttagtagctgttttgcagtgtcctacatttaaataacagttatgtagtagtgcgaggtgtcaagctgtcctaatacttcctccttgcagggtgtaacatcgtgttttagttcttttttaacaaaaacataaaaagggggatgccttgtcaaaacccttctccaaagtggagggggggggccttacaatgtaaaacctcttcgtagaagggaagacgtattaaaaaagtgcgtgttggagattgggggggggggggggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAG-TTATATTGACGACTGATTCAGCATTACTT---AAAAAAAATCTAGATC-ATGCCAAGGAGTTTCGTCTG-TGCGCTGTGG---------TTTAGGCATGCAAGGTTCTCTTCAATATTtatatccataatattttttctgtttcccaaaaatagggggggacaaaacagccaattaagccaacatgagggataaaagaaataattcactttgtaaatctacaattgaatgcatacgtacagaat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T-CAACATTTTAAGATTTTTT-T-AAATATAA-TGTTTTATAA--TTTA---TTT-TGCA-T-CT---TTTT-T-TTC---ATTTTAATTAA-AAAAAATAATC-AATTCAG--TTTTA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TACGTTGT----GCCCTTTATTGGGGGGGGGGGGTGCTACTTTAAAATAGCAA-TTACAAGATGAAAGTTTGTTGGAGAGAGAT-AACAAACATT-AGTTGTA-ca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CC-T-AAGAC-ATAACAGTA-G--CA--TTG--CTTTCGCC-AA------TGAATGA----TGAT---GTT--A-CCCTTGTCC---TT---ACA---G--CA-C----TTTCA-A-GATGA-TT-G-GC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCCTAT---CA-CGC--CGCC-T-ATGAC-GTAACAGTA-A--CA--TTGG-CGTTCG-C-CA----C-TGAGTGA----TGGG---GTT--A-atctgaattcg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aactctt-T-ATAAG-GCAATAGTT-G--CA--TT--TCTTTCGCC-GC----CT--AATGA----TGAC---GTT--A-CCCT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATTTT--AA-CA-CA--TTTCT-A-CG-C--AACGTTTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCCTAT---CA-CGC--CGCC-T-ATGG--GTAACAGTA-A--CA--TTGGCCGTTCGCC-CA----CTTGAGTGA----TGAC---GTT--A-CCCTTTTCC---CC---ACA---G--CGTT----TTTTG-AGGCTGG-CT-G-GCGAA-AA-TT-CGGA-AATTTT--AA-CA-CA--TTTCT-A-CG-C--AACGTTTTT--CAA-TGTTA-TATATTC-TTTTAGCTTACC-ACA-TAGAGTTTTTATG-AAGCTGAT-AC-TTTTAA-CT-A---TC-GAATCGCTAATAGA-GGCACGTAAAATAT-TA-CGATGAATATAGGTTAAA--TAAATTTTC---TTTC-AGAAGGTTT-ATAA-TCCTTA--T-ATTTGTTTTTTAATTCATTTT-CAAAATCTTCAAATGATATTTGGA--TTTTTGGTTTTTCG-TTTAATA-A-TTAA-TG-TACATGTATGG-TTTTATAAC-CATAGGAACT-TA--CCACTATTAAAC----ATATCTTAAT-CTACTGGTA-TT--TTT--AACATTCATTATCAATT--AATG---TATT---CAC-ATGTCG-AATTCGTTTTCCTT-CAACATTTTAAGATTTTTT-TAAAATATAATTTTTTTAAAA--TTTA---TTT-T-CA-T-CT---TTTT-T-TTTTCAATTTTAATTAATAAAAATTAATC-AATTCAG--TTTTAACATCAGCTAT-ACATACT-AGTAGT--CAA-TTATATTGACGACTGATTCAGCATTATTT---AAAAAAAATATAGATCTATGCCTAGGAG-TTCGTCTG-TGCGCAGTGGTTGTAATTTTTTAGGCATGCAAGGTTCTCTTCAATATTCAAAAAGGTAAAAAAAAAAAAAAAA----AAAAAAACACAAAAAAACCAACATGAAAACCAGCTAGAACCCCCCCCCAAAAAAAAAACAACAACCAAGAGAAAACCAGC-AAAGCACTG-CACTACGCAGT-CCGTATT-CGTACGTTGT----GCCCTTTATT-GGGGGGGGG----CTACTTTAAAACAGCAA-TTACAATATGAACGTTTGCTCGAGAGAAATAAACAAACATTAAGTTGTACAACTAGAAGGATTTGTTG-TTACTTTAGTACCTGTCTTTTGCAATGTCCTACATTTACATAACAGTTACTGTATCAGTGAGAGGTGTCAAGCTGTCCT-ATACTTCCT-CTTGCAGGGTGTAACATCGTG-TTTAGTTCTTTTTTAAC--AAACATAAAAAGGGGGATGCCTTGTCTAAAAATCCTTCTTCAAAGTGGGAGGGGGGG--CTTACAATGTAAAAACCCTCATTCGTGGAAGGGAAGACGTATTTAAAAAAGTGCGTGTTGGAG-TTGGGGGGGGTGCCGTCCTTCACGAAATGTGATTGACTCATATCTTTCAGCTTTCGTCCATACTGCTCTCAGAAATAAT--GTGTATGTGTGTG-AAGTGGGCGCTTGAAATATAAGTATTCTTAATTGCATATG-AATAGGAAGGAA-TATG---TCGATGTTAGCCCACCCAC-TA---CCCCACCCCTGTTCAATTCTGCGT-GCTTG-GTGTAAGGCAAATCTGCTTTTTCCTTC---AAATAAGAAATGCGTTGATCTGGGAGTGTAAGCCGTGTTTTCCACCATTATTTGCAGGATAGAAGATCTGAATACTTTAGATAAATATGTCAAACTCAAAAAAAAATATTGGTAATATTTATTTG-AACCGTTCTTAACTTTGAAATCCAA--TATAC--CTATCACTATATTTGTTTATAGAAACGAATTTGAAAGCCTGATACGTGTATCT-AACTCA
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Reference ( family-3813 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCCTAT---CG-CGC--CGCC-T-ATGAC-GTAACAGTA-A--CA--TTGGCCGTTCGCC-CA----CTTGAGTGA----TGAC---GTT--A-CCCTTTTCC---CC---ACA---G--CG-T----TTTCG-A-GCTGG-CC-G-GCGAA-AA-TT-CGGA-AATTTT--AA-CA-CA--TTTCT-A-CG-C--AACGTTTTT--CAA-TGTTA-TATATTC-TTTTAGCTTACC-ACA-GAGAGTTTTTATGAAAGCTGAT-ACTTTTTAA-CTAA---TC-GAATCGCTAATAGA-GGCACGTAAAATAT-TA-CGATGAATATAGGTTAAA--TCATTTTCT---TTTC-AGAAGGTTT-ATAA-TCCTAA--T-ATTTGTTTTTTAATTCAATTT-C-AAATCTTCAAATGATATTTGGA--TTTTTGGTTTTTCG-TTTAATA-A-TTAA-TG-TACATGTATGG-TTTTATAA--CATAGGAACTATA--CCACTATTAAAC----ATATCTTAAT-CNACTGGTA-TT--TTT--AACATTCATAATAAATT--AATG---TATC---CAC-ATGTCG-AA-TCGTTTTCCTT-CAACATTTTAAGATTTTTT-T-AAATATAATTTTTTTAAAA--TTTA---TTT-T-CA-T-CT---TTTT-T-TTTT-AATTTTAATTAA-AAAAATTAATC-AATTCAG--TTTTAACATCAGCTATAACATACT-AGTATT--CAA-TTATATTGACGACTGATTCAGCATTATTT---AAAAAAAATCTAGATC-ATGCCTAGGAG-TTCGTCTG-TGCGC-GTGGTTGTAA-TTTTTAGGCATGCAAGGTTCTCTTCAATATTCAAAAAGGTAAAAAAAAAAAAAANT----AAAAAAA-ACAAAAAAA-CAAC-TGAAAACCAGCTAGAACCCCCCCCCAAAAAA--------AACCACGAGAAAACCAGC-AAAGCACTGCCACTACGCAGTCCCGTATTCCGTACGTTGT----GCCCTTTATTGGGGGGGGGG----CTACTTTAAAACAGCAA-TTACAATATGAACGTTTGCTGGAGAGAGAT-AACAAACATT-AGTTGTA-AACTAGAAGGATTTGTTGTTTACTTTAGTANCTGTCTTTTGCAGTGTCCTACATTTANATAACAGTTACTGTANCAGTGNGAGGTGTCAAGCTGTCCTAATACTTCCTCCTTGCAGGGTGTAACATCGTGTTTTAGTTCTTTTTTAACAAAAACATAAAAAGGGGGATGCCTTGTCTAAAAACCCTTCTCCAAAGTGGGGGGGGGGGGCCTTACAATGTAAAAACCCTCATTCGTGGAAGGGAAGACGTATTTAAAAAAGTGCGTGTTGGAGATTGGGGGGGGTGCCGTCCTTCACGAAATGTGATTGACTCATATCTTTCAGCTTTCGTCCATACTGCTCTCAGAAATAATCGGTGTATGTGTGTGAAAGTGGNNGCTTGAAATATAAGTATTCTTAATTGCATATGCAATAGGAAGGAACTATGTATTNGATGTTAGCCCACCCACTTAAGCCCCCACCCGTNTTCAATTCTGCGTGGCTTGTGTGTAAGGCAAATCTGCTTTTTCCTTCAAAAAATAAGAAATGCGTTGATCTGGGAGTGTAAGCCGTGTTTTCCACCATTATTTGCAGGATAGAAGACCTGNATACCTTAGATAAATATGTCAAACTCAAAAAAAANNATTGGTAATATTTATTTGAAACCGTTCTTAACTTTNAAATCCAAATTATACTACCATCACTATNTTNGTTTATAGAAACGAATTTGAAAGCCTGATACGTGTATCTAAACTCA
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gi|10                         : ctcttttgcctatacgcgccgtatgacgtaacagtaaaacattggcgttcgcactgagtgaatgacgttacccttttccccacagcgtttttgagctggcctgcgaaaatttcggaaattttaacaacaatttcctacgtcaacgtttttcactgttaatatattctttagctaccacagagagttttgatgagctgaaacttttaactatcgaatcgtaataaggccccgaataatattacgagatataggttaaatcattttcttttcagaaggtttatatcctaatcatttgttttttaattcatttcaaatcttcaaatgtatttggattttgttttttcggttttataaattaatgtacatgtatgatttaataacataggactatataccactattaaacatatctatcaactgtttttgttttaacattcatataaatatgtatcccccatgtcgaatcgtttccttcaacatttaagattttttaatataattttttaaaatttgattttttcatgctttttcattttaataaaaaaaaattaatcagttcagttattacatagctataaaatacttagtattcaaattatattgacgactgattcagctatttaaaaaaaatctagatcatgcttggagttcgtctggtgcgcgtggttgtaatttgtaggcatgcaaggttcttttcaatattcaaaaggtaacaataaaaaaaattaaaaaaaatttaaaaaccagctagaacccccaaaaaacctcgagaaaacagcgaaagcactgccactacgcagtcccgtattccgtacgttgttgtggctttttattggagggggggctactttaaaacagcaaattacaatatgacgtttgctggagagagataacaaacattagttgtaaactagaggattgttgtttactttagtagctgttttgcagtgtcctacatttaaataacagttatgtagtagtgcgaggtgtcaagctgtcctaatacttcctccttgcagggtgtaacatcgtgttttagttcttttttaacaaaaacataaaaagggggatgccttgtcaaaacccttctccaaagtggagggggggggccttacaatgtaaaacctcttcgtagaagggaagacgtattaaaaaagtgcgtgttggagattgggggggggggggggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAG-TTATATTGACGACTGATTCAGCATTACTT---AAAAAAAATCTAGATC-ATGCCAAGGAGTTTCGTCTG-TGCGCTGTGG---------TTTAGGCATGCAAGGTTCTCTTCAATATTtatatccataatattttttctgtttcccaaaaatagggggggacaaaacagccaattaagccaacatgagggataaaagaaataattcactttgtaaatctacaattgaatgcatacgtacagaat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T-CAACATTTTAAGATTTTTT-T-AAATATAA-TGTTTTATAA--TTTA---TTT-TGCA-T-CT---TTTT-T-TTC---ATTTTAATTAA-AAAAAATAATC-AATTCAG--TTTTA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TACGTTGT----GCCCTTTATTGGGGGGGGGGGGTGCTACTTTAAAATAGCAA-TTACAAGATGAAAGTTTGTTGGAGAGAGAT-AACAAACATT-AGTTGTA-ca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CC-T-AAGAC-ATAACAGTA-G--CA--TTG--CTTTCGCC-AA------TGAATGA----TGAT---GTT--A-CCCTTGTCC---TT---ACA---G--CA-C----TTTCA-A-GATGA-TT-G-GC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCCTAT---CA-CGC--CGCC-T-ATGAC-GTAACAGTA-A--CA--TTGG-CGTTCG-C-CA----C-TGAGTGA----TGGG---GTT--A-atctgaattcg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aactctt-T-ATAAG-GCAATAGTT-G--CA--TT--TCTTTCGCC-GC----CT--AATGA----TGAC---GTT--A-CCCT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATTTT--AA-CA-CA--TTTCT-A-CG-C--AACGTTTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCCTAT---CA-CGC--CGCC-T-ATGG--GTAACAGTA-A--CA--TTGGCCGTTCGCC-CA----CTTGAGTGA----TGAC---GTT--A-CCCTTTTCC---CC---ACA---G--CGTT----TTTTG-AGGCTGG-CT-G-GCGAA-AA-TT-CGGA-AATTTT--AA-CA-CA--TTTCT-A-CG-C--AACGTTTTT--CAA-TGTTA-TATATTC-TTTTAGCTTACC-ACA-TAGAGTTTTTATG-AAGCTGAT-AC-TTTTAA-CT-A---TC-GAATCGCTAATAGA-GGCACGTAAAATAT-TA-CGATGAATATAGGTTAAA--TAAATTTTC---TTTC-AGAAGGTTT-ATAA-TCCTTA--T-ATTTGTTTTTTAATTCATTTT-CAAAATCTTCAAATGATATTTGGA--TTTTTGGTTTTTCG-TTTAATA-A-TTAA-TG-TACATGTATGG-TTTTATAAC-CATAGGAACT-TA--CCACTATTAAAC----ATATCTTAAT-CTACTGGTA-TT--TTT--AACATTCATTATCAATT--AATG---TATT---CAC-ATGTCG-AATTCGTTTTCCTT-CAACATTTTAAGATTTTTT-TAAAATATAATTTTTTTAAAA--TTTA---TTT-T-CA-T-CT---TTTT-T-TTTTCAATTTTAATTAATAAAAATTAATC-AATTCAG--TTTTAACATCAGCTAT-ACATACT-AGTAGT--CAA-TTATATTGACGACTGATTCAGCATTATTT---AAAAAAAATATAGATCTATGCCTAGGAG-TTCGTCTG-TGCGCAGTGGTTGTAATTTTTTAGGCATGCAAGGTTCTCTTCAATATTCAAAAAGGTAAAAAAAAAAAAAAAA----AAAAAAACACAAAAAAACCAACATGAAAACCAGCTAGAACCCCCCCCCAAAAAAAAAACAACAACCAAGAGAAAACCAGC-AAAGCACTG-CACTACGCAGT-CCGTATT-CGTACGTTGT----GCCCTTTATT-GGGGGGGGG----CTACTTTAAAACAGCAA-TTACAATATGAACGTTTGCTCGAGAGAAATAAACAAACATTAAGTTGTACAACTAGAAGGATTTGTTG-TTACTTTAGTACCTGTCTTTTGCAATGTCCTACATTTACATAACAGTTACTGTATCAGTGAGAGGTGTCAAGCTGTCCT-ATACTTCCT-CTTGCAGGGTGTAACATCGTG-TTTAGTTCTTTTTTAAC--AAACATAAAAAGGGGGATGCCTTGTCTAAAAATCCTTCTTCAAAGTGGGAGGGGGGG--CTTACAATGTAAAAACCCTCATTCGTGGAAGGGAAGACGTATTTAAAAAAGTGCGTGTTGGAG-TTGGGGGGGGTGCCGTCCTTCACGAAATGTGATTGACTCATATCTTTCAGCTTTCGTCCATACTGCTCTCAGAAATAAT--GTGTATGTGTGTG-AAGTGGGCGCTTGAAATATAAGTATTCTTAATTGCATATG-AATAGGAAGGAA-TATG---TCGATGTTAGCCCACCCAC-TA---CCCCACCCCTGTTCAATTCTGCGT-GCTTG-GTGTAAGGCAAATCTGCTTTTTCCTTC---AAATAAGAAATGCGTTGATCTGGGAGTGTAAGCCGTGTTTTCCACCATTATTTGCAGGATAGAAGATCTGAATACTTTAGATAAATATGTCAAACTCAAAAAAAAATATTGGTAATATTTATTTG-AACCGTTCTTAACTTTGAAATCCAA--TATAC--CTATCACTATATTTGTTTATAGAAACGAATTTGAAAGCCTGATACGTGTATCT-AACTCA
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Reference ( family-3813 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCCTAT---CG-CGC--CGCC-T-ATGAC-GTAACAGTA-G--CA--TTGGCCGTTCGCC-CA----CTTGAGTGA----TGAC---GTT--A-CCCTTTTCC---CC---ACA---G--CGT----TTTC-G-AG-CTGG-CC-G-GCGAA-AA-TT-CGGA-AATTTT--AA-CA-CA--TTTCT-A-CG-C--AACGTTTTT--CAA-TGTTA-TATATTC-TTTTAGCTTACC-ACA-GAGAGTTTTTATGAAAGCTGAT-ACTTTTTAA-CTAA---TC-GAATCGCTAATAGA-GGCACGTAAAATAT-TA-CGATGAATATAGGTTAAA--TCATTTTCT---TTTCA-GAAGGTTT-ATAA-TCCTAA--T-ATTTGTTTTTTAATTCAATTTC-AAA-TCTTCAAATGATATTTGGATTTTT--GGTTTTTCG-TTTA-ATAA-TT-AAT-GTACATGTATGG-TTTTAT--AAC-ATAGGA-CTATA--CCACTATTAAAC----ATATCTTAAT-CNACTGGTA-TT--TTT--AACATTCATAATAAATT--AATG---TATC---CAC-ATGTCG-AAT-CGTTTTCCTT-CAACATTTTAAGATTTTTTTAAAATATAATTTTTTTAAAA--TTTA---TTT-T-CA-T-CT---TTTT-T-TTTT-AATTTTAATTAA-AAAAATTAATC-AATTCAG--TTTTAACATCAGCTATAACATACT-AGTATT--CAA-TTATATTGACGACTGATTCAGCATTATTT---AAAAAAAATCTAGATC-ATGCCTAGGAG-TTCGTCTG-TGCGC-GTGGTTGTAATTTTT-AGGCATGCAAGGTTCTCTTCAATATTCAAAAAGGTAAAAAAAAAAAAAANT----AAAAAAA-ACAAAAAAAC-AAC-TGAAAACCAGCTAGAACCCCCCCCCAAAAAAAA--------CCACGAGAAAACCAGC-AAAGCACTGCCACTACGCAGTCCCGTATTCCGTACGTTGT----GCCCTTTATTGGGGGGGGGG----CTACTTTAAAACAGCAA-TTACAATATGAACGTTTGCTGGAGAGAGATAA-CAAACATTA-GTTGTA-AACTAGAAGGATTTGTTGTTTACTTTAGTANCTGTCTTTTGCAGTGTCCTACATTTANATAACAGTTACTGTANCAGTGNGAGGTGTCAAGCTGTCCTAATACTTCCTCCTTGCAGGGTGTAACATCGTGTTTTAGTTCTTTTTTAACAAAAACATAAAAAGGGGGATGCCTTGTCTAAAAACCCTTCTCCAAAGTGGGGGGGGGGGGCCTTACAATGTAAAAACCCTCATTCGTGGAAGGGAAGACGTATTTAAAAAAGTGCGTGTTGGAGATTGGGGGGGGTGCCGTCCTTCACGAAATGTGATTGACTCATATCTTTCAGCTTTCGTCCATACTGCTCTCAGAAATAATCGGTGTATGTGTGTGAAAGTGGNNGCTTGAAATATAAGTATTCTTAATTGCATATGCAATAGGAAGGAACTATGTATTNGATGTTAGCCCACCCACTTAAGCCCCCACCCGTNTTCAATTCTGCGTGGCTTGTGTGTAAGGCAAATCTGCTTTTTCCTTCAAAAAATAAGAAATGCGTTGATCTGGGAGTGTAAGCCGTGTTTTCCACCATTATTTGCAGGATAGAAGACCTGNATACCTTAGATAAATATGTCAAACTCAAAAAAAANNATTGGTAATATTTATTTGAAACCGTTCTTAACTTTNAAATCCAAATTATACTACCATCACTATNTTNGTTTATAGAAACGAATTTGAAAGCCTGATACGTGTATCTAAACTCA
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gi|10                         : ctcttttgcctatacgcgccgtatgacgtaacagtaaaacattggcgttcgcactgagtgaatgacgttacccttttccccacagcgtttttgagctggcctgcgaaaatttcggaaattttaacaacaatttcctacgtcaacgtttttcactgttaatatattctttagctaccacagagagttttgatgagctgaaacttttaactatcgaatcgtaataaggccccgaataatattacgagatataggttaaatcattttcttttcagaaggtttatatcctaatcatttgttttttaattcatttcaaatcttcaaatgtatttggattttgttttttcggttttataaattaatgtacatgtatgatttaataacataggactatataccactattaaacatatctatcaactgtttttgttttaacattcatataaatatgtatcccccatgtcgaatcgtttccttcaacatttaagattttttaatataattttttaaaatttgattttttcatgctttttcattttaataaaaaaaaattaatcagttcagttattacatagctataaaatacttagtattcaaattatattgacgactgattcagctatttaaaaaaaatctagatcatgcttggagttcgtctggtgcgcgtggttgtaatttgtaggcatgcaaggttcttttcaatattcaaaaggtaacaataaaaaaaattaaaaaaaatttaaaaaccagctagaacccccaaaaaacctcgagaaaacagcgaaagcactgccactacgcagtcccgtattccgtacgttgttgtggctttttattggagggggggctactttaaaacagcaaattacaatatgacgtttgctggagagagataacaaacattagttgtaaactagaggattgttgtttactttagtagctgttttgcagtgtcctacatttaaataacagttatgtagtagtgcgaggtgtcaagctgtcctaatacttcctccttgcagggtgtaacatcgtgttttagttcttttttaacaaaaacataaaaagggggatgccttgtcaaaacccttctccaaagtggagggggggggccttacaatgtaaaacctcttcgtagaagggaagacgtattaaaaaagtgcgtgttggagattgggggggggggggggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAG-TTATATTGACGACTGATTCAGCATTACTT---AAAAAAAATCTAGATC-ATGCCAAGGAGTTTCGTCTG-TGCGCTGTGG--------TTT-AGGCATGCAAGGTTCTCTTCAATATTtatatccataatattttttctgtttcccaaaaatagggggggacaaaacagccaattaagccaacatgagggataaaagaaataattcactttgtaaatctacaattgaatgcatacgtacagaat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        T-CAACATTTTAAGATTTTTTTAAA-TATAATGTTTT-ATAA--TTTA---TTT-TGCA-T-CT---TTTT-T-TTC---ATTTTAATTAA-AAAAAATAATC-AATTCAG--TTTTA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TACGTTGT----GCCCTTTATTGGGGGGGGGGGGTGCTACTTTAAAATAGCAA-TTACAAGATGAAAGTTTGTTGGAGAGAGATAA-CAAACATTA-GTTGTA-ca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CC-T-AAGAC-ATAACAGTA-G--CA--TTG--CTTTCGCC-AA------TGAATGA----TGAT---GTT--A-CCCTTGTCC---TT---ACA---G--CAC----TTTC-A-AG-ATGA-TT-G-GC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCCTAT---CA-CGC--CGCC-T-ATGAC-GTAACAGTA-A--CA--TTGG-CGTTCG-C-CA----C-TGAGTGA----TGGG---GTT--A-atctgaattcg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aactctt-T-ATAAG-GCAATAGTT-G--CA--TT--TCTTTCGCC-GC----CT--AATGA----TGAC---GTT--A-CCCT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATTTT--AA-CA-CA--TTTCT-A-CG-C--AACGTTTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCCTAT---CA-CGC--CGCC-T-ATGG--GTAACAGTA-A--CA--TTGGCCGTTCGCC-CA----CTTGAGTGA----TGAC---GTT--A-CCCTTTTCC---CC---ACA---G--CGT----TTTTTG-AGGCTGG-CT-G-GCGAA-AA-TT-CGGA-AATTTT--AA-CA-CA--TTTCT-A-CG-C--AACGTTTTT--CAA-TGTTA-TATATTC-TTTTAGCTTACC-ACA-TAGAGTTTTTATGAA-GCTGAT-ACTTTT-AA-CTA----TC-GAATCGCTAATAGA-GGCACGTAAAATAT-TA-CGATGAATATAGGTTAAA--TAAATTTTC---TTTCA-GAAGGTTT-ATAA-TCCTTA--T-ATTTGTTTTTTAATTCATTTTC-AAAATCTTCAAATGATATTTGGATTTTT--GGTTTTTCG-TTTA-ATAA-TT-AAT-GTACATGTATGG-TTTTAT--AACCATAGGAACT-TA--CCACTATTAAAC----ATATCTTAAT-CTACTGGTA-TT--TTT--AACATTCATTATCAATT--AATG---TATT---CAC-ATGTCG-AATTCGTTTTCCTT-CAACATTTTAAGATTTTTTTAAAATATAATTTTTTTAAAA--TTTA---TTT-T-CA-T-CT---TTTT-T-TTTTCAATTTTAATTAATAAAAATTAATC-AATTCAG--TTTTAACATCAGCTATA-CATACT-AGTAGT--CAA-TTATATTGACGACTGATTCAGCATTATTT---AAAAAAAATATAGATCTATGCCTAGGAG-TTCGTCTG-TGCGCAGTGGTTGTAATTTTTTAGGCATGCAAGGTTCTCTTCAATATTCAAAAAGGTAAAAAAAAAAAAAAAA----AAAAAAACACAAAAAAACCAACATGAAAACCAGCTAGAACCCCCCCCCAAAAAAAAAACAACAACCAAGAGAAAACCAGC-AAAGCACTGC-ACTACGCAGTCC-GTATTC-GTACGTTGT----GCCCTTTATTGGGGGGGGG-----CTACTTTAAAACAGCAA-TTACAATATGAACGTTTGCTCGAGAGAAATAAACAAACATTAAGTTGTACAACTAGAAGGATTTGTTGTT-ACTTTAGTACCTGTCTTTTGCAATGTCCTACATTTACATAACAGTTACTGTATCAGTGAGAGGTGTCAAGCTGTCCTA-TACTTCCTC-TTGCAGGGTGTAACATCGTGTTT-AGTTCTTTTTTAACAAA--CATAAAAAGGGGGATGCCTTGTCTAAAAATCCTTCTTCAAAGTGGGAGGGGGGG--CTTACAATGTAAAAACCCTCATTCGTGGAAGGGAAGACGTATTTAAAAAAGTGCGTGTTGGAG-TTGGGGGGGGTGCCGTCCTTCACGAAATGTGATTGACTCATATCTTTCAGCTTTCGTCCATACTGCTCTCAGAAATAAT--GTGTATGTGTGTGAA-GTGGGCGCTTGAAATATAAGTATTCTTAATTGCATATG-AATAGGAAGGAA-TATGT---CGATGTTAGCCCACCCACT--A--CCCCACCCCTGTTCAATTCTGCGTG-CTTG-GTGTAAGGCAAATCTGCTTTTTCCTTCAAA---TAAGAAATGCGTTGATCTGGGAGTGTAAGCCGTGTTTTCCACCATTATTTGCAGGATAGAAGATCTGAATACTTTAGATAAATATGTCAAACTCAAAAAAAAATATTGGTAATATTTATTTG-AACCGTTCTTAACTTTGAAATCCAA--TATAC--CTATCACTATATTTGTTTATAGAAACGAATTTGAAAGCCTGATACGTGTATCT-AACTCA
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GAATGA----TGAC---GTT--A-CCCTTGTCC---TC---GCA---G--TAC----TCTC-G-AG-TGGA-TA-G-GCGAA-AA-TT-AGG--AATTTTAAAA-AA-AA--TTCCT---CG-C--AACGTTTTC--CAA-TGTTT-TATTGTC-TGTTCGC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): AGTTTAACTCTTTGCCTATCACGCCGCCTA