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lowQualScore                  :        . . .    .  . .    ....  . .  ..     . .  . .   ....    ..........................   .  .  . .      .  .   .     ......... .  . .  . ...   ...     ...   . .  .    .    . .. ... . ... ..............   ..... .. .  ..      .. ..... . . .....  .... . ..... .  .  .... .  . .... ... .  . ...  . . . ...   .........   . ...... . . . .    ................    ... .   . . . . . ...   ... .   .  .      . ..  . ....    .        
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Reference ( gi|5 )            :    AGAA-T-A-CAAA-CA-T-GTAT---CACAA-AA-ATACAT-G-TA-A-ATT---CCAATA--AAAA------------------AACA-TG-TA-TAACAAAA-TA-CAT-GTAAA--A-T----A-AT-A-CA-A---ACA---GTATAACCAAA-A-TA-CATG-TAAATT-ACA--A-A---T-----A-A------AAA-----C--A-TG--TATAAC--A-----A-A-A-----TA-A--G-T-----A-AA-TT----A-CA-A----T---A-CA-A---AC-A-T-G---TATA-AC----CAAA-A------T-A-C-A-TGTAC-GA--TTA-C--A--TACA---A-ACA-T-G-T-A-T-A-CAA---A-ATA-CA-TGTAAA-G--TA-C-GA-AATT-AGAAAAAGA
gi|3                          :    AGAA-TCA-CAAA-CA-TTGTAT---CA--A-AA-ATACAT-G-TA-A-ATT---CCAATA--AAA---------------------CA-TG-TAATAACAAA--TA-CAT-GTAA-----T----A-ATTA-CA-A---ACAT--GTATA--CAAA-A-TA-CATG-TAAATT-ACA--A-T---T-----A-A------AAA-----C--A-TG----TAAC--A-----A-A-A-----TACAT-G-T-----ATAA-TT----A-CA-A----T---A-CA-A---AT---T-G---TATA-ACTGTACATA-A------TAA-C-A-TGTA--AA--TTA-CA-A--TACA---A-ACA-T-GAT-A-TAA-CAA---A-ATA-CA-TGTAAA-G--TA-C-AA-AATTAAGAAAAAG
gi|2                          :    AAAA-T-A-CAAA-CA-T-GTAT---CACAA-AA--TACAT-GCTA-A-ATTT--CCAATA--AAAAGAAACAATAAGAAAAATCAACA-T--TA-AGACAAAA-TA-CAT-GTAAT--A-TTCC-ATAT-A--A-A---ACATT-GTATAAC-AAA-A-TA-CATG-TAAAAT-TCAC-A-A---T-----A-A------AAA-----C--A-TG--TATAAC--A-----AGA-A-----CA-T--G-T-----A-AA-TT----A----A----T---AACATA---AC-A-T-G---TA---AC----AAGA-A------T-A-C-A-TGTAT-AA--T-A-C--AAATACA---A-GAA-T-G-T-A-T-A-CAA---A-ATtagtaat
gi|9                          :  aaAGAA-T-A-CAAA-CA-T-GTAT---CACAA-AA--TACAT-G-TA-A-ATT---CCAATA--AAA--------------------ACA-TG-TA-TAACAAAA-TA-CAT-GT-AA--A-T----A-AT-A-CA-A---ACAT--GTATAA-CAAA-A-TA-CA---TAA--T-GCA--ATA---T-----C-A------AAA-----tctagtaccagcataatacaaattaaagtt
gi|13                         :  aaAGAA-T-A-CAAA-CA-T-GGAT---AACAA-AA--TACAT-G-TA-A-ATT---ACAAT----GCA------------------AACA-TG-TA-T-ACAAAA-TA-CAT-GTAAA--G-T------AT-A-CA-A---Aggaattgtaacataaaccattgatgacaatcaggattgttatcaaaaactaatttttttaataactgtaatacaaaca
gi|1                          :   aAGAAGT-A-CAAAACA-T-GTAT---C-CAA-AA--TACAT-G-TATATATTGGGCTAATG--AAA---------------------CA-TGATA-TAACAAA--TA-CAT-GTAAA--T-T----A-GCGA-AA-A---ACAT--GTATAAACAAA-AATA-CATG-TAAATT-CCA--A-T---TC----A-A------AAA-----C--ACTG---ATAAC--A-----A-A-AC----TACAT-G-T-----A-AA-CT----A-AA-A----T---A-CA-A---AC-A-T-GC--TATATAC----T-AA-A------T-A-CAA-TGTA--AA--TTA-CAGA--TACA---A-ACATT-G-TAA-T-ACCAA---A-ATC-AA-T-TAGATA--TA-C-AACAATTGAGAAAAAGattagaaaaagtattatgactagaaaatttctaactacaacaaagctatggtacatgcaaaaatccacc
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gi|14                         : aaaatAA-T-A-CAAA-CA-T-GTAT---AACAA-AA--TACAT-T-TA-A-ATT---ACAATA--CAAA--------------------CA-TG-TA-TAACAAAA-TA-CAT-GTAAATTA-C----A-AT-A-CATATATACAT--GTATA--CAAA-A-TA-CATG-TAAAGT-ACA--A-AAT-T-----A-G------AAA-----ctgcaacagtattatgac
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gi|16                         :   agaAA-T-A-CAAA-CA-T-GTAT---AAC-A-AA-ATACAT-G-TA-A-ATTA--TCAAT---ACAG------------------AACA-TG-TA-C----AAA-TATCAT-GTAA----------A-GC-A-CA-A---AAA---TTAGAA--AAA-G-TA-aattagaaaaaagattgatga
gi|12                         :       A-T-A-CAAA-CA-T-GTAT---AACAA-AA--TACAT-G-TA-A-ATT---CCAAT----AAA------------------AACA-TG-TA-TAAC-AAA-TA-CAT-GTTAA--A-TTAC-A-AT-A-CA-A---ACA---GTATA--CAAA-A-TA-CATG-TAAAGT-CAA--A-A---TTAGAGA-A------AAG-----T--A--G--TATGACT-A-----G-A-AATTTCTA-A--G-TACAACA-AA-TA----A-CA-A----atatggct
gi|6                          :      gA-T-A--AAA-CAAT-GTAT---CACAA-AA-ACATGT-T-TA-A-ATT---C-AATA--AAAA--------------------C--TG-TA-TAACAAAA-TA-CAT-GT--A--A-T----A-AT---CA-A---ACAT--GTATAA-CAAA-A-----ATG-TAAATTGACA--A-T---T-----A-ACAGATCAAA-----C----TG--TAT-----A-----A-A-T-----TA-A--C-A-----A-AA-TTGTTAA-CA-T----G---A-TA-A---AC-A-T-G----AT---------AAA-A------C-------TGTA--AA--TTA-CATA--TACA---A-ACA-TGG-T-ATT-A-CAAATTA-ATA-TG-TGTAAA-G--TA-C--A-AATTAAGAAAAAGgttaa
gi|7                          :      ag-T-A-CAAA-CA-T-GTATATATATAACAACATACAT-G-TA-A-ATT---ACA--A--ACCA------------------AACATTG-TATTAACAAAA-TA-CAT-GTAAA--T-T----ACAT-A-CA-A---ACAT--GTATTACAAGA-A-TA-CATG-TAAAGT-ACAAGA-A---TTAG--A-A------AAAAGTATT--A-TGACTAGAAC--ATTTCTA-A-A-----TA-T--A-T-----A-AA-TT----A-CA-T----T---AGCA-A---tagtat
gi|12                         :                                                                    atA------------------AACA-TG-TA-TAACAAAA-TA-CAT-GTAAA--T-TCC--A-AT-A-AA-A---ACAT--GTATAAC--AA-A-TA-CATGTTAAATT-AC---A-A---T-----A-C------AAA-----C--A--G--TAT-AC--A-----A-A-A-----TACAT-G-T-----A-AAGTC----A-AA-A----TTAGA-GA-A---AA-G-TAG---TATG-AC----TAGA-A------------A-TTTCT-AA--GTA-C--A---ACA---A-ATA-ttccggaaaggaaatgatgtgatataacgaaacac
gi|9                          :                                                                 gatacA------------------AACA-TG-TA-TCACAAAA-TA-CAT-GTAAA--T-TCC--A-AT-A-AA-A---ACAT--GTATAAC-AAA-A-TA-CATG-TAAAT-------A-A---T-----A-C------AAA-----C--A-TG--TATAAC--A-----A-A-A-----TA-C--A-T-----A-A---T----G-CA-A----T---ATCA-A---Aacaagttaa
gi|13                         :                                                             aaagaatacA------------------AACA-TG-GA-TAACAAAA-TA-CAT-GTAAATTA-C----A-AT-G-CA-A---ACAT--GTATA--CAAA-A-TA-CATG-TAAAGT--------A---T-----A-C------AAA---------------ATTAG--A-----A-A--------A-A--G-T--------A-TT----A-TG-AC---T---A-GA-A---A--A-T-T---TCTA-AC----TACA-A------C-A-A-A-GCTAT-GG---TA-C--A--TGCA---A-AAA-T-aggaattgtaacataaaccattgatgacaatcaggattgttatcaaaaactaatttttttaataactgtaatacaaaca
gi|11                         :                                                              aagaatacA------------------AACA-TG-TA-TAACAAAA-TA-CATGGTAAATTA-C----A-AT-ACCA-A---ACGAATGTATAACAAAA-G-TA-CATG-TAAA-T-ACC--A-A---T-----A-C------AAA-----C--ATTG--TAAAACGAA-----A-G-A-----TACA--G-T-----A-AA-TT----AGCA-A----T---A-CA-A---AC-ATT-G---TATA-TC----AAAG-A------T-A-C-AGTGTAccacc
gi|16                         :                                                              agaaatacA------------------AACA-TG-TA-TAACAAAA-TA-CAT-GTAAATTA-TC---A-AT-A-CAGA---ACAT--GTAC-----AA-A-TATCATG-TAAAGC-ACA--A-AAATT-----A-G------AAA-----agtaacaaaattagaaaaaagattgatga
gi|7                          :                                                                                     aatacATA-TA-TA-TAACAACA-TA-CAT-GTAAATTA-C----A-AA-C-CA-A---ACATT-GTATTAACAAA-A-TA-CATG-TAAATT-AC-----A---T-----A-C------AAA-----C--A-TG--TATTAC--A-----AGA-A-----TACAT-G-T-----A-AA-GT----A-CA-AGAATT---A-GA-A---AA-A-A-GTATTATG-AC----TAGA-ACATTTCT-A-A-A-TATATAAA--TTA-C--A--Taagtaatatggct
gi|9                          :                                                                                                          attacaaacatgtAA--A-G----A-AT-A-CA-A---ACAT--GTATCAC-AAA-A-TA-CATG-TAAATT-CCA--A-----T-----A-A------AAA-----C--A-TG--TATAAC--A-----A-A-A-----TACAT-G-T-----A-AA-T--------A-A----T---A-CA-A---AC-A-T-G---TATA-A-----CAAA-A------T-A-C-A-Ttagcaattccggaaaggaaatgatgtgatataacgaaacac
gi|14                         :                                                                                                                              ----A-AT-A-CA-A---ACAT--GTATAA-CAAA-A-TA-CATT-TAAATT-AC---A-A---T-----A-C------AAA-----C--A-TG--TATAAC--A-----A-A-A-----TACAT-G-T-----A-AA-TT----A-CA-A----T---A-CATATATAC-A-T-G---TATA-------CAAA-A------T-A-C-A-TGTA--------A-A--G--TACA---A-A-A-T---T-A-G-A-AAA---A-GTA-aatgcaatatcaaaaggaattgtaacataaaccattgatgacaatcaggattgttatcaaaaactaatttttttaataactgtaatacaaaca
gi|11                         :                                                                                                                              ----A-AT-A-CA-A---ACAT--GTATAAC-AAA-A-TA-CATGGTAAATT-ACA--A-----T-----A-CC-----AAA-----CGAA-TG--TATAAC--A-----A-A-AG----TACAT-G-T-----A-AA-TA----C-CA-A----T---A-CA-A---AC-A-TTG---TAAA-AC----GAAAGA------T-A-C-A--GTA--AA--TTAGC--AA-TACA---A-ACA-TTG-T-A-T-ATCAA---AGATA-CAGTGTAA--G--TAAC-AA-AATT-AGAAAAAgtatg
gi|16                         :                                                                                                                           aga----A-AT-A-CA-A---ACAT--GTATAAC-AAA-A-TA-CATG-TAAATT-ATC--A-A---T-----ACA------GAA-----C--A-TG--T---AC--A-----A-ATA-----TC-AT-G-T-----A-AA-GC----A-CA-A----agattgatga
gi|12                         :                                                                                                                                   -AT-A-CA-A---ACAT--GTATAAC-AAA-A-TA-CATG-TAAATT--CC--A-A---T-----A-A------AAA-----C--A-TG--TATAAC--A-----A-ATA-----CA-T--GTT-----A-AA-TT----A-CA-A----T---A-CA-A---AC-A---G---TATA-------CAAA-A------T-A-C-A-TGTAaaattagaaaaagtaatatggct
gi|7                          :                                                                                                                                                                              gATT-ACA--A-A---C-----A-T------GTA-----T--A-TA--TATAAC--A-----A-C-A-----TACAT-G-T-----A-AA-TT----A-CA-A----A---C-CA-A---AC-A-TTG---TATT-AA----CAAA-A------T-A-C-A-TGTA--AA--TTA-C--A--TACA---A-ACA-T-G-T-ATT-A-CAAG--A-ATA-CA-TGTAAA-G--TA-C-AAGAATT-AGAAAAAaagtcaaaattagagaaaagtagtatgactagaaatttctaagtacaacaaataacaagttaa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                      --A-A---T-----A-C------AAA-----C--A-TG--TATAAC--A-----A-A-A-----TA-C--A-TTT---A-AA-TT----A-CA-A----T---A-CA-A---AC-A-T-G---TATA-AC-----AAA-A------T-A-C-A-TGTA--AA--TTA-C--AA-TACATATATACA-T-G-T-A-T-A-CAA---A-ATA-CA-TGTAAA-G--TA-C-AA-AATT-AGAAAAAGagtattatgactagaacatttctaaatatataaattacattagcaattccggaaaggaaatgatgtgatataacgaaacac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                      --A-A---T-----A-C------AAA-----C--A-TG--TATCAC--A-----A-A-A-----TACAT-G-T-----A-AA-TT----C-CA-A----T---A-AA-A---AC-A-T-G---TATA-AC-----AAA-A------T-A-C-A-TGTA---A--ATA----A--TACA---A-ACA-T-G-T-A-TAA-CAA---A-ATA-CA-Ttagtatg
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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-328 )      :      AGAA-T-A-CAAA-CA-T-GTATNA-CAAAAATACATG-TA-A-A-TT---CCAATAAAAA------------------AACA-TG-TA-TAACAAAA-TACATGTAA-AAT----AAT-AC-AAACA-TG-TAT-A-----ACCAAAATAC-AT-GTAAATT-ACA-AAT---A------N-AAAC--A-T-GT-A-----TAACA-AAA-TACATGTA-A--A-T-TA-CA-A---T-A------CA-AA---C-A-T---G-TA-----TA-AC----CAAA-ATA-C-ATG-TA-AA--TTA-C--A-----TAC---A-A---A--CA-T-G---T-A-T----A-C--AA---A-ATA-C--A-TGT-AAA-GT-A--C-A-A-AA-TT-AGA---AAAAG
gi|1                          :      AGAAGT-A-CAAAACA-T-GTAT---CCAAAATACATG-TATATA-TTGGGCTAATGAAA---------------------CA-TGATA-TAACAAA--TACATGTAA-ATT----AGCGAA-AAACA-TG-TATAA-----ACAAAAATAC-AT-GTAAATT-CCA-ATTC--A------A-AAAC--ACT-G--A-----TAACA-AAACTACATGTA-A--A-C-TA-AA-A---T-A------CA-AA---C-A-T---GCTA-----TATAC----T-AA-ATA-CAATG-TA-AA--TTA-CAGA-----TAC---A-A---A--CATT-G---TAA-T----ACC--AA---A-ATC-A--A-T-T-AGATAT-A--C-A-ACAA-TTGAGA---AAAAG
gi|1                          :               aAAA-CA-T-GTATAAACAAAAATACATG-TA-A-A-TT---CCAATTCAAA------------------AACACTG--A-TAACAAAACTACATGTAA-ACTAA--AAT-AC-AAACA-TGCTAT-AT----ACT-AAATACAAT-GTAAATT-ACA-GAT---A------C-AAAC--ATT-GTAA-----TACCA-AAA-TCAAT-TA-G--A-TATA-CA-A---C-AATTGAGAA-AA---A-G-TA--G-TA-----TG-AC----TAGA------------A-AA--TTA----G-----TAC---A-A---GT-CA-C----------------C--CA---A-ATA-CAAA-TGT-AAA-GT-tagtatgactagaaaattagtacaagtcacccaaatacaaatgtaaagttaatggtaaaaatcgctaccaacttggcgctttgaggtgttgttcaacaagtcc
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gi|2                          :      AAAA-T-A-CAAA-CA-T-GTATCA-C-AAAATACATGCTA-A-ATTT---CCAATAAAAAGAAACAATAAGAAAAATCAACA-T--TA-AGACAAAA-TACATGTAA-TATTC--CAT-ATAAAACATTG-TAT-A-----A-CAAAATAC-AT-GTAAAAT-TCACAAT---A------A-AAAC--A-T-GT-A-----TAACA-AGA--ACATGTA-A--A-T-T---A-A---TAA------CATAA---C-A-T---G--------TA-AC----AAGA-ATA-C-ATG-TA-TA--ATA-CAAA-----TAC---A-A---G--AA-T-G---T-A-T----A-C--AA---A-ATtaatatggct
gi|3                          :    aaAGAA-TCA-CAAA-CA-TTGTAT---CAAAAATACATG-TA-A-A-TT---CCAATAAAA---------------------CA-TG-TAATAACAAA--TACATGTAATAAT------T-AC-AAACA-TG-TAT-A-------CAAAATAC-AT-GTAAATT-ACA-ATT---A------A-AAAC--A-T-GT-A-------ACA-AAA-TACATGTATA--A-T-TA-CA-A---T-A------CA-AA---T---T---G-TA-----TA-ACTGTACATA-ATAAC-ATG-TA-AA--TTA-C--AA----TAC---A-A---A--CA-T-GA--T-A-T----AAC--AA---A-ATA-C--A-TGT-AAA-GT-A--C-A-A-AA-TTAAGA---AAAAGtctagtaccagcataatacaaattaaagtt
gi|4                          :       GAA-T-ATCAAA-CA-T-GT--TA-TAAAAATA-ATG-TA-A-A-TT---ACAAT-CGAA------------------AGCA-TG-TA-T-ACAATA-TACATGTAA-GATCTACAAT--C-AAACA-TG-TAT-------------ATAC-A----AAATA-GCA-------A------T-GAAC--A-T-GT-A-----TAACA-AAA-TA-ATGTACA--A-T-TA-CAGA---T-A------CA-AA---CTACT---G-TA-----T--AC------AA-ATA-CGATG-TA-AATTTTA-CA-A-----TAC-----A---A--CA-T-G---T-A-T----AGC--AA---A-GTA-C--A-TGT--AA-GT----C-A-A-AA-Ttagtaat
gi|5                          : aaaatAGAA-T-A-CAAA-CA-T-GTATCA-CAAAAATACATG-TA-A-A-TT---CCAATAAAAA------------------AACA-TG-TA-TAACAAAA-TACATGTAA-AAT----AAT-AC-AAACA--G-TAT-A-----ACCAAAATAC-AT-GTAAATT-ACA-AAT---A------A-AAAC--A-T-GT-A-----TAACA-AAA-TA-A-GTA-A--A-T-TA-CA-A---T-A------CA-AA---C-A-T---G-TA-----TA-AC----CAAA-ATA-C-ATG-TACGA--TTA-C--A-----TAC---A-A---A--CA-T-G---T-A-T----A-C--AA---A-ATA-C--A-TGT-AAA-GT-A--C-G-A-AA-TT-AGA---AAAAGctgcaacagtattatgac
gi|6                          :         A-T-A--AAA-CAAT-GTATCA-CAAAAACATGTT-TA-A-A-TT---C-AATAAAAA--------------------C--TG-TA-TAACAAAA-TACATGT---AAT----AAT--C-AAACA-TG-TAT-A-----A-CAAAA----AT-GTAAATTGACA-ATT---AACAGATC-AAAC----T-GT-ATAAATTAACA-AAA-T---TGT-------T-AA-CA-T---G-A------TA-AA---C-A-T---G--A-----T---------AAA-AC-----TG-TA-AA--TTA-CATA-----TAC---A-A---A--CA-TGG---T-ATT----A-C--AAATTA-ATA-T--G-TGT-AAA-GT-A--C-A-A-AT-TA-AGA---AAAAGa
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gi|7                          :                                                                                                                            T-AC-AAACA-TG-TAT-ATATATAACAACATAC-AT-GTAAATT-ACA-AAC----------C-AAAC--ATT-GT-AT----TAACA-AAA-TACATGTA-A--A-T-TA-C--A---T-A------CA-AA---C-A-T---G-TA-----TT-AC----AAGA-ATA-C-ATG-TA-AA--GTA-C--AAGAATTAG---A-A---A--AA-A-G---T-A-TTATGA-CT-AG---A-ACA-T--T-TCT-AAA--T-A--T-ATA-AA-TT-Aagtattatgactagaacatttctaaatatataaattacattagcaattccggaaaggaaatgatgtgatataacgaaacac
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-328 )      :      AGAA-T-A-CAAA-CA-T-GTATCA-CAAAAATACATG-TA-A-A-TT---CCAATAAAAA------------------AACA-TG-TA-TAACAAAA-TACATGTAA-AAT----AAT-AC-AAACA-TG-TAT-A------A-C-AAAATAC-AT-GTAAATT-ACA-AAT---A------C-AAAC--A-T-GT-A-----TAACA-AAA-TACATGTA-A--A-T-TA-CA-A---T-A------CA-AA---C-A-T---G-TA-----TA-AC----CAAA-ATA-C-ATG-TA-AA--TTA-C-A-A----TAC---A-A---A-C-A-T-G---T-A-T----A-C--AA---A-ATA-C--A-TGT-AAA-G--T-AC-A-A-AA-TT-AGA---AAAAG
gi|1                          :      AGAAGT-A-CAAAACA-T-GTATC--C-AAAATACATG-TATATA-TTGGGCTAAT---GA------------------AACA-TGATA-TAAC-AAA-TACATGTAA-ATT----AGCGAA-AAACA-TG-TATAA------A-CAAAAATAC-AT-GTAAATT-CCA-ATTC--A------A-AAAC--ACT-G--A-----TAACA-AAACTACATGTA-A--A-C-TA-AA-A---T-A------CA-AA---C-A-T---GCTA-----TATAC----T-AA-ATA-CAATG-TA-AA--TTA-C-AGA----TAC---A-A---A-C-ATT-G---TAA-T----ACC--AA---A-ATC-A--A-T-T-AGATA--T-AC-A-ACAA-TTGAGA---AAAAG
gi|1                          :               aAAA-CA-T-GTATAAACAAAAATACATG-TA-A-A-TT---CCAATTCAAA------------------AACACTG--A-TAACAAAACTACATGTAA-ACTAA--AAT-AC-AAACA-TGCTAT-AT-----A-C-TAAATACAAT-GTAAATT-ACA-GAT---A------C-AAAC--ATT-GTAA-----TACCA-AAA-TCAAT-TA-G--A-TATA-CA-A---C-AATTGAGAA-AA---A-G-TA--G-TA-----TG-AC----TAGA------------A-AA--TT----A-G----TAC---A-A---GTC-A-C----------------C--CA---A-ATA-CAAA-TGT-AAA-G--T-tagtatgactagaaaattagtacaagtcacccaaatacaaatgtaaagttaatggtaaaaatcgctaccaacttggcgctttgaggtgttgttcaacaagtcc
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gi|2                          :      AAAA-T-A-CAAA-CA-T-GTATCA-C-AAAATACATGCTA-A-ATTT---CCAATAAAAAGAAACAATAAGAAAAATCAACA-T--TA-AGACAAAA-TACATGTAA-TATTC--CAT-ATAAAACATTG-TAT-A------A-C-AAAATAC-AT-GTAAAAT-TCACAAT---A------A-AAAC--A-T-GT-A-----TAACA-AGA--ACATGTA-A--A-T-T---A-A---TAA------CATAA---C-A-T---G--------TA-AC----AAGA-ATA-C-ATG-TA-TA--ATA-CAA-A----TAC---A-A---G-A-A-T-G---T-A-T----A-C--AA---A-ATtaatatggct
gi|3                          :    aaAGAA-TCA-CAAA-CA-TTGTATCA---AAAATACATG-TA-A-A-TT---CCAATAAAA---------------------CA-TG-TAATAACAAA--TACATGTAATAAT------T-AC-AAACA-TG-TAT-A--------C-AAAATAC-AT-GTAAATT-ACA-ATT---A------A-AAAC--A-T-GT-A-------ACA-AAA-TACATGTATA--A-T-TA-CA-A---T-A------CA-AA---T---T---G-TA-----TA-ACTGTACATA-ATAAC-ATG-TA-AA--TTA-C-A-A----TAC---A-A---A-C-A-T-GA--T-A-T----AAC--AA---A-ATA-C--A-TGT-AAA-G--T-AC-A-A-AA-TTAAGA---AAAAGtctagtaccagcataatacaaattaaagtt
gi|4                          :       GAA-T-ATCAAA-CA-T-GT--TA-TAAAAATA-ATG-TA-A-A-TT---ACAAT-CGAA------------------AGCA-TG-TA-T-ACAATA-TACATGTAA-GATCTACAAT--C-AAACA-TG-TAT-AT-----A-C-AAAATA-----GCA---------------A------T-GAAC--A-T-GT-A-----TAACA-AAA-TA-ATGTACA--A-T-TA-CAGA---T-A------CA-AA---CTACT---G-TA-----T--AC------AA-ATA-CGATG-TA-AATTTTA-C-A-A----TAC-----A---A-C-A-T-G---T-A-T----AGC--AA---A-GTA-C--A-TGT--AA-G--T--C-A-A-AA-Ttagtaat
gi|5                          : aaaatAGAA-T-A-CAAA-CA-T-GTATCA-CAAAAATACATG-TA-A-A-TT---CCAATAAAAA------------------AACA-TG-TA-TAACAAAA-TACATGTAA-AAT----AAT-AC-AAACA--G-TAT-A------ACC-AAAATAC-AT-GTAAATT-ACA-AAT---A------A-AAAC--A-T-GT-A-----TAACA-AAA-TA-A-GTA-A--A-T-TA-CA-A---T-A------CA-AA---C-A-T---G-TA-----TA-AC----CAAA-ATA-C-ATG-TACGA--TTA-C---A----TAC---A-A---A-C-A-T-G---T-A-T----A-C--AA---A-ATA-C--A-TGT-AAA-G--T-AC-G-A-AA-TT-AGA---AAAAGctgcaacagtattatgac
gi|6                          :         A-T-A--AAA-CAAT-GTATCA-CAAAAACATGTT-TA-A-A-TT---C-AATAAAAA--------------------C--TG-TA-TAACAAAA-TACATGT---AAT----AAT--C-AAACA-TG-TAT-A------A-C-AAAA----AT-GTAAATTGACA-ATT---AACAGATC-AAAC----T-GT-ATAAATTAACA-AAA-T---TGT-------T-AA-CA-T---G-A------TA-AA---C-A-T---G--A-----T---------AAA-AC-----TG-TA-AA--TTA-C-ATA----TAC---A-A---A-C-A-TGG---T-ATT----A-C--AAATTA-ATA-T--G-TGT-AAA-G--T-AC-A-A-AT-TA-AGA---AAAAGa
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gi|7                          :                                                                                                                            T-AC-AAACA-TG-TAT-ATATATAA-C-AACATAC-AT-GTAAATT-ACA-AAC----------C-AAAC--ATT-GT-AT----TAACA-AAA-TACATGTA-A--A-T-TA-C--A---T-A------CA-AA---C-A-T---G-TA-----TT-AC----AAGA-ATA-C-ATG-TA-AA--GTA-C-A-AGAATTAG---A-A---A-A-A-A-G---T-A-TTATGA-CT-AG---A-ACA-T--T-TCT-AAA----T-AT-ATA-AA-TT-Aagtattatgactagaacatttctaaatatataaattacattagcaattccggaaaggaaatgatgtgatataacgaaacac
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gi|9                          : aaaagAGAA-T-A-CAAA-CA-T-GTATCA-CAAAA-TACATG-TA-A-A-TT---CCAATAAAAA--------------------CA-TG-TA-TAACAAAA-TACATGTAA-A-T----AAT-AC-AAACA-TG-TAT-A------A-C-AAAATAC-AT-tattatactcaagataatttctaactaacaacataatacaaatgt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-328 )      :      AGAA-T-A-CAAA-CA-T-GTATCA-CAAAAATACATG-TA-A-A-TT---CCAATAAAAA------------------AACA-TG-TA-TAACAAAA-TACATGTAA-AAT----AAT-AC-AAACA-TG-TAT-A------A-C-AAAATAC-AT-GTAAATT-ACA-AAT---A------C-AAAC--A-T-GT-A-----TAACA-AAA-TACATGTA-A--A-T-TA-CA-A---T-A------CA-AA---C-A-T---G-TA-----TA-AC----CAAA-ATA-C-ATG-TA-AA--TTA-C-A-A----TAC---A-A---A-C-A-T-G---T-A-T----A-C--AA---A-ATA-C--A-TGT-AAA-G--T-AC-A-A-AA-TT-AGA---AAAAG
gi|1                          :      AGAAGT-A-CAAAACA-T-GTATC--C-AAAATACATG-TATATA-TTGGGCTAAT---GA------------------AACA-TGATA-TAAC-AAA-TACATGTAA-ATT----AGCGAA-AAACA-TG-TATAA------A-CAAAAATAC-AT-GTAAATT-CCA-ATTC--A------A-AAAC--ACT-G--A-----TAACA-AAACTACATGTA-A--A-C-TA-AA-A---T-A------CA-AA---C-A-T---GCTA-----TATAC----T-AA-ATA-CAATG-TA-AA--TTA-C-AGA----TAC---A-A---A-C-ATT-G---TAA-T----ACC--AA---A-ATC-A--A-T-T-AGATA--T-AC-A-ACAA-TTGAGA---AAAAG
gi|1                          :               aAAA-CA-T-GTATAAACAAAAATACATG-TA-A-A-TT---CCAATTCAAA------------------AACACTG--A-TAACAAAACTACATGTAA-ACTAA--AAT-AC-AAACA-TGCTAT-AT-----A-C-TAAATACAAT-GTAAATT-ACA-GAT---A------C-AAAC--ATT-GTAA-----TACCA-AAA-TCAAT-TA-G--A-TATA-CA-A---C-AATTGAGAA-AA---A-G-TA--G-TA-----TG-AC----TAGA------------A-AA--TT----A-G----TAC---A-A---GTC-A-C----------------C--CA---A-ATA-CAAA-TGT-AAA-G--T-tagtatgactagaaaattagtacaagtcacccaaatacaaatgtaaagttaatggtaaaaatcgctaccaacttggcgctttgaggtgttgttcaacaagtcc
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                A-A---T-A------CA-AA---C-A-T---G-TA-----TA-AC-----AAA-ATA-C-ATG-TA-AA--TTATC-A-A----TAC---AGA---A-C-A-T-G---T-A-C----------A---A-ATATC--A-TGT-AAA-G--C-ACAA-A-AA-TT-AGA---AAAAGtagtatg
gi|2                          :      AAAA-T-A-CAAA-CA-T-GTATCA-C-AAAATACATGCTA-A-ATTT---CCAATAAAAAGAAACAATAAGAAAAATCAACA-T--TA-AGACAAAA-TACATGTAA-TATTC--CAT-ATAAAACATTG-TAT-A------A-C-AAAATAC-AT-GTAAAAT-TCACAAT---A------A-AAAC--A-T-GT-A-----TAACA-AGA--ACATGTA-A--A-T-T---A-A---TAA------CATAA---C-A-T---G--------TA-AC----AAGA-ATA-C-ATG-TA-TA--ATA-CAA-A----TAC---A-A---G-A-A-T-G---T-A-T----A-C--AA---A-ATtaatatggct
gi|3                          :    aaAGAA-TCA-CAAA-CA-TTGTATCA---AAAATACATG-TA-A-A-TT---CCAATAAAA---------------------CA-TG-TAATAACAAA--TACATGTAATAAT------T-AC-AAACA-TG-TAT-A--------C-AAAATAC-AT-GTAAATT-ACA-ATT---A------A-AAAC--A-T-GT-A-------ACA-AAA-TACATGTATA--A-T-TA-CA-A---T-A------CA-AA---T---T---G-TA-----TA-ACTGTACATA-ATAAC-ATG-TA-AA--TTA-C-A-A----TAC---A-A---A-C-A-T-GA--T-A-T----AAC--AA---A-ATA-C--A-TGT-AAA-G--T-AC-A-A-AA-TTAAGA---AAAAGtctagtaccagcataatacaaattaaagtt
gi|4                          :       GAA-T-ATCAAA-CA-T-GT--TA-TAAAAATA-ATG-TA-A-A-TT---ACAAT-CGAA------------------AGCA-TG-TA-T-ACAATA-TACATGTAA-GATCTACAAT--C-AAACA-TG-TAT-AT-----A-C-AAAATA-----GCA---------------A------T-GAAC--A-T-GT-A-----TAACA-AAA-TA-ATGTACA--A-T-TA-CAGA---T-A------CA-AA---CTACT---G-TA-----T--AC------AA-ATA-CGATG-TA-AATTTTA-C-A-A----TAC-----A---A-C-A-T-G---T-A-T----AGC--AA---A-GTA-C--A-TGT--AA-G--T--C-A-A-AA-Ttagtaat
gi|5                          : aaaatAGAA-T-A-CAAA-CA-T-GTATCA-CAAAAATACATG-TA-A-A-TT---CCAATAAAAA------------------AACA-TG-TA-TAACAAAA-TACATGTAA-AAT----AAT-AC-AAACA--G-TAT-A------ACC-AAAATAC-AT-GTAAATT-ACA-AAT---A------A-AAAC--A-T-GT-A-----TAACA-AAA-TA-A-GTA-A--A-T-TA-CA-A---T-A------CA-AA---C-A-T---G-TA-----TA-AC----CAAA-ATA-C-ATG-TACGA--TTA-C---A----TAC---A-A---A-C-A-T-G---T-A-T----A-C--AA---A-ATA-C--A-TGT-AAA-G--T-AC-G-A-AA-TT-AGA---AAAAGctgcaacagtattatgac
gi|6                          :         A-T-A--AAA-CAAT-GTATCA-CAAAAACATGTT-TA-A-A-TT---C-AATAAAAA--------------------C--TG-TA-TAACAAAA-TACATGT---AAT----AAT--C-AAACA-TG-TAT-A------A-C-AAAA----AT-GTAAATTGACA-ATT---AACAGATC-AAAC----T-GT-ATAAATTAACA-AAA-T---TGT-------T-AA-CA-T---G-A------TA-AA---C-A-T---G--A-----T---------AAA-AC-----TG-TA-AA--TTA-C-ATA----TAC---A-A---A-C-A-TGG---T-ATT----A-C--AAATTA-ATA-T--G-TGT-AAA-G--T-AC-A-A-AT-TA-AGA---AAAAGa
gi|7                          :                                                                                                                                                                      agATT-ACA-AAC---A------T-GTAT--A-T-AT-A-----TAACA-ACA-TACATGTA-A--A-T-TA-CA-A---A-C------CA-AA---C-ATT---G-TA-----TT-AA----CAAA-ATA-C-ATG-TA-AA--TTA-C---A----TAC---A-A---A-C-A-T-G---T-ATT----A-C--AAG--A-ATA-C--A-TGT-AAA-G--T-AC-A-AGAA-TT-AGA---AAAAtagtat
gi|7                          :                                                                                                                            T-AC-AAACA-TG-TAT-ATATATAA-C-AACATAC-AT-GTAAATT-ACA-AAC----------C-AAAC--ATT-GT-AT----TAACA-AAA-TACATGTA-A--A-T-TA-C--A---T-A------CA-AA---C-A-T---G-TA-----TT-AC----AAGA-ATA-C-ATG-TA-AA--GTA-C-A-AGAATTAG---A-A---A-A-A-A-G---T-A-TTATGA-CT-AG---A-ACA-T--T-TCT-AAA----T-AT-ATA-AA-TT-Aagtattatgactagaacatttctaaatatataaattacattagcaattccggaaaggaaatgatgtgatataacgaaacac
gi|8                          :                                                                                                                                                                            atA-AAT---A------CGAAAC--A-TTGTTA-----TAACAGAAA-TACATGTA-ACAA-T-TAGCA-A---T-GGCC---TA-AT---C-A-TACAG-TAAAAAATA-AGG---CAAA-ATA-C-ATG-TA-AA--TTA-A-A-A----TACCAAA-A---A-C-A-T-GA--T-A-T----A-TCAAA---A-ATA-C--A-TGTAAAA-G--T-AC-A-A-AATTT-AGATATAAAAGcattagcaattccggaaaggaaatgatgtgatataacgaaacac
gi|9                          : aaaagAGAA-T-A-CAAA-CA-T-GTATCA-CAAAA-TACATG-TA-A-A-TT---CCAATAAAAA--------------------CA-TG-TA-TAACAAAA-TACATGTAA-A-T----AAT-AC-AAACA-TG-TAT-A------A-C-AAAATAC-AT-tattatactcaagataatttctaactaacaacataatacaaatgt


blockSeqs                     :          . C T    .  A T      ACA   A      C  . . T  .       TC   GAAACAATAAGAAAAATCAA  C  .  A    A   C         T   CTAC   .  A     T  C   . TATATA C .       A  G       G  AC   AACAGATC        GA T A  A TAAAT     G   G  A     T CA G A  G  G AAT A ATTGAG  T  AAG T T ACA .  AAAAA G   TGTAC   G   A G   T  C  TT   G A T GAAT   CAA T TAT T T T G GTA . T TATGA  CA  ATT G   T AA G   A   . TA A  A T G  T  A   TAT
blockSeqs                     :          . . .    .  . .      CA    A      .  . . .  .       AA   AA                    .  .  .    A   .         .   TAC    .  .     .  .   . T      . .       .  .       .  A    TAGAG           .  T T  T T         .   .  C     C .  . A  .  . .   . GCC     T  .   . C A   .  .     A   GC      .   . .   .  .  .    T . . .      .   G .   . . . . A   . T AT     T   G   .   . .  .   .   . .  .  . . .  .  .   .  
blockSeqs                     :          . . .    .  . .      TA    A      .  . . .  .       AA   AA                    .  .  .    A   .         .   AA     .  .     .  .   . T      . .       .  .       .  A    ACC             .  . .  . .         .   .  C     . .  . .  .  . .   . .       .  .   . T .   .  .     A   T       .   . .   .  .  .    . . . .      .   . .   . . . . A   . . AA     .   .   .   . .  .   .   . .  .  . . .  .  .   .  
blockSeqs                     :          . . .    .  . .      CA    A      .  . . .  .       AA   AG                    .  .  .    A   .         .   TC     .  .     .  .   . .      . .       .  .       .  A    ACG             .  . .  . .         .   .  T     . .  . .  .  . .   . .       .  .   . . .   .  .     A   G       .   . .   .  .  .    . . . .      .   . .   . . . . .   . . AG     .   .   .   . .  .   .   . .  .  . . .  .  .   .  
blockSeqs                     :          . . .    .  . .      CA    A      .  . . .  .       AA   AA                    .  .  .    A   .         .   .      .  .     .  .   . .      . .       .  .       .  A    AC              .  . .  . .         .   .  C     . .  . .  .  . .   . .       .  .   . . .   .  .     G   T       .   . .   .  .  .    . . . .      .   . .   . . . . .   . . A      .   .   .   . .  .   .   . .  .  . . .  .  .   .  
blockSeqs                     :          . . .    .  . .      CA    A      .  . . .  .       AA   .                     .  .  .    A   .         .   .      .  .     .  .   . .      . .       .  .       .  A    AC              .  . .  . .         .   .  C     . .  . .  .  . .   . .       .  .   . . .   .  .     A   C       .   . .   .  .  .    . . . .      .   . .   . . . . .   . . G      .   .   .   . .  .   .   . .  .  . . .  .  .   .  
blockSeqs                     :          . . .    .  . .      C     .      .  . . .  .       C    .                     .  .  .    A   .         .   .      .  .     .  .   . .      . .       .  .       .  A    GC              .  . .  . .         .   .  C     . .  . .  .  . .   . .       .  .   . . .   .  .     A   A       .   . .   .  .  .    . . . .      .   . .   . . . . .   . . A      .   .   .   . .  .   .   . .  .  . . .  .  .   .  
blockSeqs                     :                   .  . .      .     .      .  . . .  .       .    .                     .  .  .    .   .         .   .      .  .     .  .   . .      . .       .  .       .  A    AC              .  . .  . .         .   .  C     . .  . .  .  . .   . .       .  .   . . .   .  .     A   C       .   . .   .  .  .    . . . .      .   . .   . . . . .   . . A      .   .   .   . .  .   .   . .  .  . . .  .  .   .  
blockSeqs                     :                                                                                                                  .   .      .  .     .  .   . .      . .       .  .       .  A    AA              .  . .  . .         .   .  C     . .  . .  .  . .   . .       .  .   . . .   .  .     A   C       .   . .   .  .  .    . . . .      .   . .   . . . . .   . . A      .   .   .   . .  .   .   . .  .  . . .  .  .   .  
blockSeqs                     :                                                                                                                      .      .  .     .  .   . .      . .       .  .       .  .    AA              .  . .  . .         .   .  C     . .  . .  .  . .   . .       .  .   . . .   .  .     A   A       .   . .   .  .  .    . . . .      .   . .   . . . . .   . . A      .   .   .   . .  .   .   . .  .  . . .  .  .   .  
blockSeqs                     :                                                                                                                             .  .     .  .   . .      . .       .  .       .  .    AT              .  . .  . .         .   .  C     . .  . .  .  . .   . .       .  .   . . .   .  .     A   .       .   . .   .  .  .    . . . .      .   . .   . . . . .   . . A      .   .   .   . .  .   .   . .  .  . . .  .  .      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                              .    AA              .  . .  . .         .   .  .     . .  . .  .  . .   . .       .  .   . . .   .  .     T   .       .   . .   .  .  .    . . . .      .   . .   . . . . .   . . A      .   .   .   . .  .   .   . .  .  . . .  .         
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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consensus                     :      AGAA-T-A-CAAA-CA-T-GTATCA-CAAAAATACATG-TA-A-A-TT---CCAATAAAAA------------------AACA-TG-TA-TAACAAAA-TACATGTAA-AAT----AAT-AC-AAACA-TG-TAT-A------A-C-AAAATAC-AT-GTAAATT-ACA-AAT---A------C-AAAC--A-T-GT-A-----TAACA-AAA-TACATGTA-A--A-T-TA-CA-A---T-A------CA-AA---C-A-T---G-TA-----TA-AC----CAAA-ATA-C-ATG-TA-AA--TTA-C-A-A----TAC---A-A---A-C-A-T-G---T-A-T----A-C--AA---A-ATA-C--A-TGT-AAA-G--T-AC-A-A-AA-TT-AGA---AAAAG
Reference ( family-328 )      :      AGAA-T-A-CAAA-CA-T-GTATCA-CAAAAATACATG-TA-A-A-TT---CCAATAAAAA------------------AACA-TG-TA-TAACAAAA-TACATGTAA-AAT----AAT-AC-AAACA-TG-TAT-A------A-C-AAAATAC-AT-GTAAATT-ACA-AAT---A------C-AAAC--A-T-GT-A-----TAACA-AAA-TACATGTA-A--A-T-TA-CA-A---T-A------CA-AA---C-A-T---G-TA-----TA-AC----CAAA-ATA-C-ATG-TA-AA--TTA-C-A-A----TAC---A-A---A-C-A-T-G---T-A-T----A-C--AA---A-ATA-C--A-TGT-AAA-G--T-AC-A-A-AA-TT-AGA---AAAAG
gi|1                          :      AGAAGT-A-CAAAACA-T-GTATC--C-AAAATACATG-TATATA-TTGGGCTAAT---GA------------------AACA-TGATA-TAAC-AAA-TACATGTAA-ATT----AGCGAA-AAACA-TG-TATAA------A-CAAAAATAC-AT-GTAAATT-CCA-ATTC--A------A-AAAC--ACT-G--A-----TAACA-AAACTACATGTA-A--A-C-TA-AA-A---T-A------CA-AA---C-A-T---GCTA-----TATAC----T-AA-ATA-CAATG-TA-AA--TTA-C-AGA----TAC---A-A---A-C-ATT-G---TAA-T----ACC--AA---A-ATC-A--A-T-T-AGATA--T-AC-A-ACAA-TTGAGA---AAAAG
gi|1                          :               aAAA-CA-T-GTATAAACAAAAATACATG-TA-A-A-TT---CCAATTCAAA------------------AACACTG--A-TAACAAAACTACATGTAA-ACTAA--AAT-AC-AAACA-TGCTAT-AT-----A-C-TAAATACAAT-GTAAATT-ACA-GAT---A------C-AAAC--ATT-GTAA-----TACCA-AAA-TCAAT-TA-G--A-TATA-CA-A---C-AATTGAGAA-AA---A-G-TA--G-TA-----TG-AC----TAGA------------A-AA--TT----A-G----TAC---A-A---GTC-A-C----------------C--CA---A-ATA-CAAA-TGT-AAA-G--T-tagtatgactagaaaattagtacaagtcacccaaatacaaatgtaaagttaatggtaaaaatcgctaccaacttggcgctttgaggtgttgttcaacaagtcc
gi|11                         :                                  aagaagtacaaaacatgtatccaaaatacatgtatatattgggctaatgaaacatgatataacaaatacatgtaaattagcgaa----AAT-AC-AAACA-TG-TAT-A------A-C-AAAATAC-ATGGTAAATT-AC--AAT---AC-----C-AAACGAA-T-GT-A-----TAACA-AAAGTACATGTA-A--A-T-AC-CA-A---T-A------CA-AA---C-ATT---G-TA-----AA-AC----GAAAGATA-C-A-G-TA-AA--TTAGC-A-A----TAC---A-A---A-C-ATT-G---T-A-T----ATC--AA---AGATA-C--AGTGT--AA-G--TAAC-A-A-AA-TT-AGA---AAAAtaatggtaaaaatcgctaccaacttggcgctttgaggtgttgttcaacaagtcc
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gi|12                         :        gA-T-A-CAAA-CA-T-GTATAA-CAAAA-TACATG-TA-A-A-TT---CCAAT--AAA------------------AACA-TG-TA-TAAC-AAA-TACATGTTA-AATTAC-AAT-AC-AAACA--G-TAT--------A-C-AAAATAC-AT-GTAAAGT-CAA-AATTAGA------G-AAAA--G-TAGT-A-----TGACT-AGA-AATTTCTA-A--G---TA-CA-A---C-A------AATAA---C-A-A---G-T------TA-Aagtagtatgactagaaatttctaagtacaacaaataacaagttaa
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gi|2                          :      AAAA-T-A-CAAA-CA-T-GTATCA-C-AAAATACATGCTA-A-ATTT---CCAATAAAAAGAAACAATAAGAAAAATCAACA-T--TA-AGACAAAA-TACATGTAA-TATTC--CAT-ATAAAACATTG-TAT-A------A-C-AAAATAC-AT-GTAAAAT-TCACAAT---A------A-AAAC--A-T-GT-A-----TAACA-AGA--ACATGTA-A--A-T-T---A-A---TAA------CATAA---C-A-T---G--------TA-AC----AAGA-ATA-C-ATG-TA-TA--ATA-CAA-A----TAC---A-A---G-A-A-T-G---T-A-T----A-C--AA---A-ATtaatatggct
gi|3                          :    aaAGAA-TCA-CAAA-CA-TTGTATCA---AAAATACATG-TA-A-A-TT---CCAATAAAA---------------------CA-TG-TAATAACAAA--TACATGTAATAAT------T-AC-AAACA-TG-TAT-A--------C-AAAATAC-AT-GTAAATT-ACA-ATT---A------A-AAAC--A-T-GT-A-------ACA-AAA-TACATGTATA--A-T-TA-CA-A---T-A------CA-AA---T---T---G-TA-----TA-ACTGTACATA-ATAAC-ATG-TA-AA--TTA-C-A-A----TAC---A-A---A-C-A-T-GA--T-A-T----AAC--AA---A-ATA-C--A-TGT-AAA-G--T-AC-A-A-AA-TTAAGA---AAAAGtctagtaccagcataatacaaattaaagtt
gi|4                          :       GAA-T-ATCAAA-CA-T-GT--TA-TAAAAATA-ATG-TA-A-A-TT---ACAAT-CGAA------------------AGCA-TG-TA-T-ACAATA-TACATGTAA-GATCTACAAT--C-AAACA-TG-TAT-AT-----A-C-AAAATA-----GCA---------------A------T-GAAC--A-T-GT-A-----TAACA-AAA-TA-ATGTACA--A-T-TA-CAGA---T-A------CA-AA---CTACT---G-TA-----T--AC------AA-ATA-CGATG-TA-AATTTTA-C-A-A----TAC-----A---A-C-A-T-G---T-A-T----AGC--AA---A-GTA-C--A-TGT--AA-G--T--C-A-A-AA-Ttagtaat
gi|5                          : aaaatAGAA-T-A-CAAA-CA-T-GTATCA-CAAAAATACATG-TA-A-A-TT---CCAATAAAAA------------------AACA-TG-TA-TAACAAAA-TACATGTAA-AAT----AAT-AC-AAACA--G-TAT-A------ACC-AAAATAC-AT-GTAAATT-ACA-AAT---A------A-AAAC--A-T-GT-A-----TAACA-AAA-TA-A-GTA-A--A-T-TA-CA-A---T-A------CA-AA---C-A-T---G-TA-----TA-AC----CAAA-ATA-C-ATG-TACGA--TTA-C---A----TAC---A-A---A-C-A-T-G---T-A-T----A-C--AA---A-ATA-C--A-TGT-AAA-G--T-AC-G-A-AA-TT-AGA---AAAAGctgcaacagtattatgac
gi|6                          :         A-T-A--AAA-CAAT-GTATCA-CAAAAACATGTT-TA-A-A-TT---C-AATAAAAA--------------------C--TG-TA-TAACAAAA-TACATGT---AAT----AAT--C-AAACA-TG-TAT-A------A-C-AAAA----AT-GTAAATTGACA-ATT---AACAGATC-AAAC----T-GT-ATAAATTAACA-AAA-T---TGT-------T-AA-CA-T---G-A------TA-AA---C-A-T---G--A-----T---------AAA-AC-----TG-TA-AA--TTA-C-ATA----TAC---A-A---A-C-A-TGG---T-ATT----A-C--AAATTA-ATA-T--G-TGT-AAA-G--T-AC-A-A-AT-TA-AGA---AAAAGa
gi|7                          :                                                                                                                                                                      agATT-ACA-AAC---A------T-GTAT--A-T-AT-A-----TAACA-ACA-TACATGTA-A--A-T-TA-CA-A---A-C------CA-AA---C-ATT---G-TA-----TT-AA----CAAA-ATA-C-ATG-TA-AA--TTA-C---A----TAC---A-A---A-C-A-T-G---T-ATT----A-C--AAG--A-ATA-C--A-TGT-AAA-G--T-AC-A-AGAA-TT-AGA---AAAAtagtat
gi|7                          :                                                                                                                            T-AC-AAACA-TG-TAT-ATATATAA-C-AACATAC-AT-GTAAATT-ACA-AAC----------C-AAAC--ATT-GT-AT----TAACA-AAA-TACATGTA-A--A-T-TA-C--A---T-A------CA-AA---C-A-T---G-TA-----TT-AC----AAGA-ATA-C-ATG-TA-AA--GTA-C-A-AGAATTAG---A-A---A-A-A-A-G---T-A-TTATGA-CT-AG---A-ACA-T--T-TCT-AAA----T-AT-ATA-AA-TT-Aagtattatgactagaacatttctaaatatataaattacattagcaattccggaaaggaaatgatgtgatataacgaaacac
gi|8                          :                                                                                                                                                                            atA-AAT---A------CGAAAC--A-TTGTTA-----TAACAGAAA-TACATGTA-ACAA-T-TAGCA-A---T-GGCC---TA-AT---C-A-TACAG-TAAAAAATA-AGG---CAAA-ATA-C-ATG-TA-AA--TTA-A-A-A----TACCAAA-A---A-C-A-T-GA--T-A-T----A-TCAAA---A-ATA-C--A-TGTAAAA-G--T-AC-A-A-AATTT-AGATATAAAAGcattagcaattccggaaaggaaatgatgtgatataacgaaacac
gi|9                          : aaaagAGAA-T-A-CAAA-CA-T-GTATCA-CAAAA-TACATG-TA-A-A-TT---CCAATAAAAA--------------------CA-TG-TA-TAACAAAA-TACATGTAA-A-T----AAT-AC-AAACA-TG-TAT-A------A-C-AAAATAC-AT-tattatactcaagataatttctaactaacaacataatacaaatgt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): AGGTATAAATTTTTATAAAAAGAATATATTGGTGAACAATACATGTATAAGGAAGACACAAATAAAACATTGTAAAATTACCAATAACAAACATTATAAGAATAATTCAAAATACATTATAGGAGTACAAATTTTAGAAAAGTATTATGACTAAAAATTTTCTAACTAACGACAAAATACAAATATAAA
Unaligned ( gi|15 ): ATACAAAATAGAAAAAGCTTTATGACTAGAAAATTGAAGTAACAGACAAATAACAAAATGTAAAGTTATGTAAATAATCTCAACCAACTTGTGCGCTTGTAATGTGGTCAATAGTC
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