lowQualScore : 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1 1 111 1111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111 22222 222222 111 11 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111111111 2222222222 111 33333333333 22222 1111111 1 11 1111 111111111111 22222222 11111111111111 222222 4444444444444444444444444444444444 2222 111111111111111 111 1111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 444 1 2 333 2222 99999999999999999999 33333333333333333333333 33333 11 1
lowQualScore : 77 0 1 000 66 0000000 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8 5555555 3 55 11111 4 4 777777 4 111 11 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 55 444444444444 3 44 6666666666 44 555 3 77777777777 66666 44 1111111 77 6 3 99 77 3 555 6 3 555 11 3 3333 8 3 3 6 3 222222222222 3 3 66666666 55 666 3 55 999999 3 6 55 55 44444444444444 444444 1111111111111111111111111111111111 3333 77 3 3 222222222222222 3 3 7 222 3 88 3 3 55 1111111 3 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 1111 3 3 3 3 55 3 77 3 3 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 55 55 3 4 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 6 999 5 0 111 8888 6 22222222222222222222 88888888888888888888888 3 66666 88 5
lowQualScore : .. . . ... .. ....... ...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... . ....... . .. ..... . . ...... . ... .. ................................................................................................ .. ............ . .. .......... .. ... . ........... ..... .. ....... .. . . .. .. . ... . . ... .. . .... . . . . . ............ . . ........ .. ... . .. ...... . . .. .. .............. ...... .................................. .... .. . . ............... . . . ... . .. . . .. ....... . ............................................................. . .... . . . . .. . .. . . .................................................................................................................................. .. .. . . ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... . ... . . ... .... . .................... ....................... . ..... .. .
lowQualScore : 99 6 4 000 99 8888888 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 9999999 6 00 55555 0 0 000000 0 000 00 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 00 666666666666 3 66 9999999999 66 000 3 55555555555 55555 66 2222222 33 2 1 22 99 3 888 7 3 888 22 3 5555 4 3 3 7 3 333333333333 6 6 44444444 00 444 6 00 000000 6 0 00 00 33333333333333 111111 1111111111111111111111111111111111 8888 99 3 6 111111111111111 6 6 3 777 6 66 6 6 00 8888888 6 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 6 4444 6 6 6 6 00 6 33 6 6 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 00 99 6 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 000 5 0 000 3333 7 33333333333333333333 33333333333333333333333 0 55555 00 0
consensus : GAACAAAA--AAATAGGGCT-TTT---CGACCTC--AAA-G--A--TATTTTTG----AA-AA-AAAA----T-----T------AA--AAAT-AT--TTGCCA-AA--------AA----AAA---AACTA---T-----------------------TAAAA----------AAA----------T-C-AA-T-CGTAAA-------T------GTC---A-TT--TTAAA-AGTA--ATT-T-----G-AT-AG-T--CTA------A-----A---GAGC-G----A-T---------AA--C-T--C--G---T--GAG-A---TG---A---G-ACA-TA------TAAA-TTC----N---AC-C-ATA-GA-T--AC--T----AA-GA-C-AA-GGCATT---CAAAT---------C-TAT--AATC--TCAAT-AAAA--AAATTCAAA-AATTCA--TT-AA-AAAAG-A-----A-T--AAT---G-AA-GAT-A------T-GA---TGC--TGA-A--A-----TT-T-TGA-AAA---CT-------AA---ACG--TT--TCN---AAT-GT---T-AG---AA-AAA--G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-ATAAA--A------A---T--AA---TTTTC-G-----------GTTC--N--TA--TT----T--GT--ATTTT-T--TGTAAA--T-G---TG-A-CAC---T--CC-T-T--CATTTT-CAG-G-G-AT------T--TG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-TA-GCAG--A--T----A-G----A--AGTAG-----GTC----------ACCG---CTG--AC--T-----T-TTTTG---TTTG--T-TT-A----G---A------CA-T-GC-T---AAA-TATA-NT-T-G--C----A--AAGT-TT--C---A-T-C-A---------ACT---TCC--G-----------N-CG--A-G-------AT-T----TG-TGA-AAG-A-TTT--A-GC-TTT-TTT-CGT--AA-------TTC-N-A--TT--TT------C--T-A-----G-A---A-T------------------G-AC-TA-----T-C---AA-AT-T---TA------GA--A--CC-G------GA-A---GTG--AC-AA-AACCG-GA--AGN----GT-------T-A-C---A--GGG--A----TA-------G---GT---AA----TA--AT-GA----T-T------A----GG---ACC-A-TT-AN-T-TCGT-T------TATNAAAA-A--------A----AAG------A---GA--G-A----TA--ACT-C---TT-A-C---A-AAC-T-----------TTTA-G-A--AG-AA--G------AAAT--------NTTT--------A--------------AGCCC-CCAGAAGTC-CCT-TAA-GGG---G-T--N---AAAA---A-ATTG--CA-CT-ACGG-C-C-C--ATATATT-TTTTA-A-TT-TA---ATT-G---G--N-A---CGACT----ATAAAGAT----T--CATN-AATC----ACTAA--A-CGG-TTT----G--AAAATC-----CGATAT---------AAAAAAGTTGAAGC-ATGAAGATTCATAAATCACTAAGATCGGTTTTG--AAAATCCGAT------AT-A-------AA-AAAAGT-----TGAA-G-CCGAAAGA---TTATTNCNATATATTNTAGCCCCTACAGA
Reference ( gi|6 ) : GAACAAAA--AAATAGGGCT-TTT---CGACCTC--AAA-G--A--TATTTTTG----AATAA-AAAA----T-----T------AA--AAAT-AT--TTGCCA-AA--------AA----AAA---AACTA---T-----------------------CAAAA----------CAA----------T-C-AA-T-CGTAAA-------T------GTC---A-TT--TTAAA-AGTA--ATT-T-----C-AT-AG-T--CTA------A-----A---GAAC-G----A-T---------AA--C-T--C--G---T--GAG-A---TG---A---G-ACA-TA------TAAA-TTC----T---AC-C-ATA-GA-T--AC--T----AA-GA-C-AA-GGTATT---CAAATA----C--CCGTGT--AATC--TCAAT-AGAA--AAATTCAAA-AATTCA--TT-AA-AAAAG-A-----A-T--AAT---A-AA-GAT-A------T-GA---TGC--TGA-A--A-----TT-T-TGA-AAA---CT-------AA---ACG--TT--TTT---AAT-GT---T-AG---CG-AAA--G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-ATAAA--A------A---T--AA---TTTTC-G-----------GTTC--C--TA--TT----T--GT--ATGTT-T--TGTAAA--T-G---TG-A-CAC---T--CC-T-T--CATCTT-CAG-G-G-AT------T--TG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-TA-GTAG--A--T----A-G----A--AGTAC-----GTC----------ATTG---CTA--AC--T-----C-TTTTG---CTTG--T-TT-A----G---A------CA-T-GC-T---AAA-TATA-AT-T-G--C----A--AAGT-TT--T---G-T-C-A---------ATT---TCC--G-----------T-CG--A-G-------AT-T----TG-TGA-AAG-A-TTT--A-GC-TTT-TTT-CGT--AC-------TTT-T-A--TT--TT------C--T-A-----G-A---A-T------------------G-AC-TA-----T-C---AA-AT-T---TA------GA--A--CC-G------AA-A---GTG--AC-AA-AACCG-GA--AAA----GT-------T-A-C---A--GGG--A----TA-------G---GT---AA----TA--AT-GA----T-T------A----GG---ACC-A-TT-AG-T-TCAT-T------TATTAAAA----------A----AAG------G---GA--G-A----TA--ACT-C---TT-A-C---A-AAC-T-----------TTTA-G-A--AG-AA--G------AAAT--------ATTC--------A--------------AGCCC-CCAGAAGTC-CCT-CAA-AGG---G-T--G---AAAA---A-GTTG--CA-CC-ACAG-C-C-C--ATATATT-TTTT----TT-TA---ATT-----G--A-A---CGACT---GATAAAGAT----T--CAT--AATC----ACTAA--A-CGG-TTT----G--AAAATC-----CGATAT---------AAAAAAGTTGGAGTGATAAAGATTCATAA-TCACTAA-A-CGGTTT-G--AAAATCCGAT------AT---------AA-AAAAGT-----TGGA-G-TTGAAAGA---TTATTTCGA---ATTCTAGCCCCTACAGA
gi|8 : GAACAAAA--AAATAGGGCT-TTT---CGACCTC--AAA-AGAA--TATTTTTGTG--AA-AA-AAAA----T-----TCTT---AA--AAAT-AT--TTGCAACGA--------AA----AAA---AACTA---TAGAAAAACAAAAAAAAGATTAAACAAAAATT-------CAA----------C-C-AA-T-CGTAAA-------A------GTC---A-AC--TTAAA-AGTA---TT-T-----G-AT-AG-T--CTA------A-----A---GAGCCG----A-T---------AAA-C-T--C--G---T--GAG-A---TG---A---T-ACA-TA------TAAA-TTC--------AT-CGATA-GA-T--AC--T----AA-GAAC-AA-GG-----------------------------------CAAT-T--A--AAATTCAAA-AATTAA--TTTAA-AAAAA-G-----A-T--AAT---GGAA-GAT-A------T-GA---TGC--TGA-CC-A-----TT-T-GAA-AAA---CT-------AAC--ACG--TC--TTTTCCCAT-GT---T-AG---AA-AAACAG---A--AA-T-------A--TA-----C------ACATAAA--A------AA--T--AAATTTTTCC-G-----------GTTC-----TA--TT----T--GTT-ATTTT-T--TGTAAA--T-GCCTTG-A-CAT---T--CT-T-C--AATTTT-CAG-G---AT------T--TG-TCTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-TAAGCAG--A--T----A-G----ACAAGTAG-----GTCC---------ACCGAGCCCG--AC--T-----TGTTTTG----TTG--T-TTTA----G---A------CA-T-GC-T---AAA-TATA-TT-T-G--C----A--AAGT-TT--T-------C-ATATATAAACACT---ACC--T-----------C-CG--A-C-------AT-T----TG-TGA-AAG-A-TTT--A-GC-TTT-TTTTCGT--AA-------ATT-C-AATTT--TT------C--T-A-----G-A-----T------------------G-A--TA-----T-CT--AG-AA-T---TA------GAG-A--CT-G------GA-A---GTG--AC-AA-AACCG-GA--AGT----GT-------T-AAC---A--GGG--AC---TA-------G---GT---AA----TA--AT-GA----T-T------A----GG---ACC-A-TA-AT-T-TTGT-T------TATAAAAAAATAT-----A----AAG------A---GAAGA-A----TAGTACT-C---TT-A-C---ACAACAC-----------TTTAGG-A--AGTAA--G------AA
gi|1 : taaataataaacctagaattccttttttggtctccGAACAAAAGAAAATAGGGCT-TTTTTACGACCTCCAAAA-G--AAATATTTGTG----AA--A-CAAA----T-----TTTCTATGA--AAAT-CT--TTGCCA-AA--------AA----AAcaatctgttaatttctaatattacc
gi|20 : ttctttttgaagtctccGAACAAAA--AGAGAGGGCT-TTT---CGAtctataaagaagaaaaaaaaatatactaggtaagagaaatcaaattgagtttaaaaaaaaagattttcaatcgtaaagtcacttaaaagtaatttgatgagtctaagagcgataactctcgtgagagcttgtataaccatataaattcaacgataagatacctaagacaaggcattaaatattcacaaaaaattaattttaaaaaaaaccgatatcaaatgaagatatagacgctgacattttgaaaaactaaacgttttaaatgttcagaaaaatggaatataaaaatcaataaaaaaaataatttccgtttcactattgatttttttgtaaattgtgaacacttcccttgtcatttcggattaatgtttctggaaaacctcagcagcaatatgaagtaggtcaccctggacttttttgtttgtttagacatcgctaaatattatttgcaccaagttttcatatcacttaactcccgacttgtgaaagatttagctttttcgtaaattcaatttttcatagaactgactatcaaattatatagaaccggaagtgacaaaaaccgtgaagtgttacagggaaaaaaagggggtaaacaaaaataagattttttggttttaaaaaaaaggatggatccaattaattcgtaaaaaagaataaagtgaaagataacctctacttattttattagaaaaattaaggtaatccttttaatttctaatatttcgagtataaagccctccagaatcaccttaaggggctcaaaaaattgcaactacgggcccaatattttcttttagatattaatcggaagcgtgacataagaattcatcaatcactttaatgtttgtaataatgatttccatatactttgaaataattgtgaatttcttttaatcaggggtcattaacgttactcttagttgaaatgattgttcgcgaattaaaaaatatataataaaagttgaacgctgaaagctatt
gi|16 : aagaataactagacctttttgtcactAACAAAA--AAACAGGGCT-TTT---CGACCTC--ATA-G--A--TATTTT--------TAA-AAAATGCTT-----T------AA--AAAA-AT--
gi|5 : gatgcatggaatgaagcatgtcatgtagcaaaataacatttagaaatataattctttttggtctctaCAAAA--AAA-----CTATTT---AAACCAC--AAAAG--A--TATT-----------AA-GAAA----C-----C------AA--AAA--AT--T--CCA-AATCCGTTTTAA----A--------TA---TGCG--------------------TAAAA----------AAG----------T-C-AACT-TACAAA-------T------G--------------AA-AGTA--ATT-TGATAGT-AT-AC-T--CTAAATCCTA-----A---AGGC-G----A-TGGATATTAAAG--C-TTTC--G---T--T-G-A---AG---AATCG-ACA-TACAATACTAAA-TTCAA--C---AC-CGATA-GAAT--AC--TCCTAAATGA-G-AATGGT-CG---CAAAT-----------TAA--AAT---TCAA---AAA--AAATT------ATTTA-----AATAAAGG-A-----A-T--AATTGCA-AA-GAT-AGAAGAAT-GA---TGCATTGA-A--ACATTATT-TATGA-AAGAATCT-------AA----CT--TT--CCG---CAT-ATCCTT-AG---AA-AAA--AAAAG--AA-CGCCACTAA--TA-----C------A-ATAAA--A------AA--T--AAGA-TTTTC-GAAATCTACAGAGTTC--A--TA--TT-------GT--ATTTT-TACTGTAAA--T-G---TGGA-CAT---TT-CC-T-TA-CATTTT-CAG-GCG-AT------T--C---TTC-T-GTCCCGGGTG--A---A-AA--C---AA-TA-GCAG--A--T----A-G----A--GTTAG-----GTC----------ACCG---CTG--GCATT-----T-TTCTGAACTTTG--T-TT-A----G---A------CA-T-GCATATGAAA-T-TA-TT-T-G--C----A--AAGT-TT--C---ATT-C-A---------ACT---TCC--GAACGGAGGATTT-CG--A---------AT-T----TA-TGA-AAG-A-TTT--A-G--TCT-TTT-CGTTAAT-------TTC-A-A--TT--TT------C--C-ATAGCGG-AAACA-T------------------G-ACTTA-----TCC---AA-AT-T---GA------GAACA--CC-GCGGAAAAA-A---GTG--AC--A-AACCG-GA--CGA----GTGTC----T-A-C---A--GGGA-A----TAT------G---GT---AATTCCTAC-AT-G-----T-T------ATTTCGG---ACC-ACTT-AT-A-TTGT-TATAGGATATAAAAATAAGACAATTA----AAG------A---GA--G-A----TA--ACT-C---TT-A-C---A-AAC-A-----------TTTA-G-A--GG-AA--G------AAAT--------CTT
gi|4 : ccgccgaaactcaaacaaaacactagatggcttttcgaccctccaaagagatattttttatagagggaaaagtatgcattcttattaaaatatttgccccaaaaagtCAAAA--AAA-----CTATTT---AAACCAC--AAAAG--A--TATT-----------AA-GAAA----C-----C------AA--AAA--AT--T--CCA-AATCCGTTTTAA----A--------TA---TGCG--------------------TAAAA----------AAG----------T-C-AACT-TACAAA-------T------G--------------AA-AGTA--ATT-TGATAGT-AT-AC-T--CTAAATCCTA-----A---AGGC-G----A-TGGATATTAAAG--C-TTTC--G---T--T-G-A---AG---AATCG-ACA-TACAATACTAAA-TTCAA--C---AC-CGATA-GAAT--AC--TCCTAAATGA-G-AATGGT-CG---CAAAT-----------TAA--AAT---TCAA---AAA--AAATT------ATTTA-----AATAAAGG-A-----A-T--AATTGCA-AA-GAT-AGAAGAAT-GA---TGCATTGA-A--ACATTATT-TATGA-AAGAATCT-------AA----CT--TT--CCG---CAT-ATCCTT-AG---AA-AAA--AAAAG--AA-CGCCACTAA--TA-----C------A-ATAAA--A------AA--T--AAGA-TTTTC-GAAATCTACAGAGTTC--A--TA--TT-------GT--ATTTT-TACTGTAAA--T-G---TGGA-CAT---TT-CC-T-TA-CATTTT-CAG-GCG-AT------T--C---TTC-T-GTCCCGGGTG--A---A-AA--C---AA-TA-GCAG--A--T----A-G----A--GTTAG-----GTC----------ACCG---CTG--GCATT-----T-TTCTGAACTTTG--T-TT-A----G---A------CA-T-GCATATGAAA-T-TA-TT-T-G--C----A--AAGT-TT--C---ATT-C-A---------ACT---TCC--GAACGGAGGATTT-CG--A---------AT-T----TA-TGA-AAG-A-TTT--A-G--TCT-TTT-CGTTAAT-------TTC-A-A--TT--TT------C--C-ATAGCGG-AAACA-T------------------G-ACTTA-----TCC---AA-AT-T---GA------GAACA--CC-GCGGAAAAA-A---GTG--AC--A-AACCG-GA--CGA----GTGTC----T-A-C---A--GGGA-A----TAT------G---GT---AATTCCTAC-AT-G-----T-T------ATTTCGG---ACC-ACTT-AT-A-TTGT-TATAGGATATAAAAATAAGACAATTA----AAG------A---GA--G-AT---TA--ACTCC---TT-A-CTCAG-AAC-T-----------TTTA-G-AG-AG-AA--
gi|7 : ccgccgaaactcaaacaaaacactagatggcttttcgaccctccaaagagatattttttatagagggaaaagtatgcattcttattaaaatatttgccccaaaaagtAAAA--AAATAGGGCT-TTT---TCACCTC--AAA-G--CC-TATTTGT-----AACGA-AAAA----TATCTCT------TA--AATG-AC--TTGCCATAA--------AA----AAG---ACCCA---T-----------------------AAAAAAGCCAGATTCCAAAAAAAAAAATT-C-AA-T-CGTAAA-------A------GTC---C-AC--TTAAA-AGTA--ATTCT-----G-AG-AGAT--CTA------A-----G---AGGC-G----A-T---------AAACCGT--T--G---T--GAG-AAT-CG---A---ATACAATA------TAAA-CTCAAACG---AC-C--TA-GA-T--AC--C----TA-GA---------GCC---CCAGCA----CAGCCGCATTAAACCATTCAAC-GAAATTAAATTTAA-----CCA--CC-AA-CA--G-A-----ACT--AAT---C-GA-AGC-A------T-GA---TGC--TGATC--A-----TT-T-GGGCAAA---CTT------AA---ACG--TTCGTCC---ACTCGT---T-AGAACCACAGA--A---G--AA-TCAG----A--GG-----C------A-ATAAA--A------A---T--AA---CTTTC-G-----------G-TC--A--TGATTT----T--GT--ATTGT-T--TGTAAA--C-G---CG-A-C-C---T--CC-TCT--CATTTTCCAG-G-GAAT------T--CG-TTTC-T-G--------G--ACGGA-AAATC---TA-TA-GCAG--AGTT----A-G----AG-AGTA------GTC----------ACCG---CTG--AC--TTTTGCC-TTTGG---TTTGC-T-TT-AG---G---A------CA-T-GC-T---AAAGTATC-AT-T-G--C-------AAGT-TT--TCC-A-T-CAA---------ACT---TCC--G-----------A-CGGAA-G-------AT-TC---CG-TGACAAGAA-TTT--A-GC-TTT-TTT-CTA--AA-------TTC-A-A--TT--CT------CATC-C-----G-A---A-T------------------GAAC-TAC----T-C---AACAT-T---TA------GA--A--CC-G------GACA---GTG---C-AA-AACCG-GACCAGT----GT-------T-A-C---A--GGG-------TA-------G---GCTA-AA----TA--AT-GA----TCC------A----GG---ACCAA-TC-AA-TCTTGT-T--------TTAACA----------A----AAGATACAAG---GA--G-A----TA--ACT-C---TTAA-CA--A-AAC-TC----------TTTACG-ACCAG-AA--G------TAAT--------CTTtgcaaaatcttttaattctaa
gi|13 : tcttttctggtctgccggaccaGACCTT--AAA-G--A--TATTTTTG----AA-AA-AAAA----T-----TCTT---AA--AAGT-TT--TTGCCA-AA--------AA----AA------CTA---TAA---------------------TAAAA----------AAA----------T-CCAA-T-CATAAA-------T------GTC---AATT--TCAAA-AGTA--ATT-T-----G-AT-AG-T--CTA------A-----A---GAGC-G----A-A---------AA--C-T--C--G---T--GAG-A---TG---A---A-ACA-TT------CAAA-TCC----T---AC-C-ATA-AA-T--AC--T----AA-GA-C-AA-GGCATT---TAAATC----T--CCATGT--AATC--TCAATAAAAA--AAATTCAAA-AATACA--TT-TA-AAAAT-A-----A-T--gttaatttctaatattccag
gi|1 : C--AAA-A--A--AATCTATA----AAGAAGAAAA-----------------AA--AAAT-ATACTAGGTA-AG--------AG----AAATCAAATTGAGTT-----------------------TAAAA----------AAAAAGATTT---T-C-AA-T-CGTAAA--------------GTC---A-CT--T-AAA-AGTA--ATT-T-----G-ATGAG-T--CTA------A---------GAGC-G----A-T---------AA--C-T--CTCG---T--GAG-AGCTTGTATA---A-CCA-TA------TAAA-TTC----A---AC-G-ATAAGA-T--ACC-T----AA-GA-C-AA-GGCATT----AAATA----T------------TC--ACAA-----A--AAATT-----AATT----TT-AA-AAAAA-ACCGATA-TCAAAT---G-AA-GAT-A------TAGA---CGC--TGA-C--A-----TT-T-TGA-AAAA--CT-------AA---ACG--TT--TTA---AAT-GT---TCAG---AA-AAAT-G---G--AA-T-------A--TAAAAATC------A-ATAAA--A------AAAAT--AA---TTTCC-G-----------TTTCA-C--TA--TT----G--AT---TTTT-T--TGTAAA--TTG---TG-AACAC---TTCCC-T-TGTCAT-TT-C---G-G-AT------TAATG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---CT-CA-GCAGCAA--T----ATG----A--AGTAG-----GTC----------ACC----CTGG-AC--T-----T-TTTTG---TTTG--T-TT-A----G---A------CA-TCGC-T---AAA-TATT-AT-TTG--C----ACCAAGT-TT--TCATA-T-C-A---------CTTAACTCC----------------CG--A----------C-T----TG-TGA-AAG-A-TTT--A-GC--TT-TTT-CGT--AA-------ATT-C-AATTT--TT------CA-T-A-----G-A---ACT------------------G-AC-TA-----T-C---AA-AT-TATATA------GA--A--CC-G------GA-A---GTG--ACAAA-AACCGTGA--AGT----GT-------T-A-C---A--GGG--A----AAAAAAGGGG---GTA--AA----CA--AA-AA----T-A------A----G--------A-TT-TT-T-TGGT-T--------TTAAAA----------A----AAA------G---GA--
gi|15 : ttctttttgaagtctccgaacaaaagaaaatagggcttttttacgacctccaaaagaaatatttgtgaaacaaattttctatgaaaatctttgcA-G--A--TATT---A----AAAAA-AAAA----TGTT--T------AG--AAAT-AT--TTGCC-------------A----AAA---CACTA----------------------------AAA------------AA----------TCC-AA-T-CATAAA-------T------TTC---A-TT--TAAAA-AGAT--GTT-T-----G-AT-AG-T--CTA------C-----A---GAGT-G----A-T---------AA--C-T--C--G---T--AAG-A---GG---A---G-ACA-GT------TAAA-TTC----T---AC-C-ATA-GG-A--AC--T----GA-GA-C-AA-GGCATT---TAAATC----T--CCATAT--AATC--TCTAT-Atggatccaattaattcgtaaaaaagaataaagtgaaagataacctctacttattttattagaaaaattaaggtaatccttttaatttctaatatttcgagtataaagccctccagaatcaccttaaggggctcaaaaaattgcaactacgggcccaatattttcttttagatattaatcggaagcgtgacataagaattcatcaatcactttaatgtttgtaataatgatttccatatactttgaaataattgtgaatttcttttaatcaggggtcattaacgttactcttagttgaaatgattgttcgcgaattaaaaaatatataataaaagttgaacgctgaaagctatt
gi|3 : --A--TATTTTTGCTGTAATAA-AAAA----TA----T------AT--AAAG-A--------A-AA--------GA----AAA---AA-------------------------------AAAA----------TG-------------C-AA-T-CGTAAAAT-----T------GTTCAAA-TT--T---A-AGTA--ATT-T-----G-AT-AG-TG-CTA------ACTCACAC--GAGT-G----ACT---------TA--C-T--CA-G---TTCGAG-A---TGG--A---G-AAA-TT------TAAA-TTC--------AC-C-ATT-AA-TT-AC--T----AA-GG-CTAA-GTCATT---CTAATAAACTC--TCACTC--AATT--T-AAC-ATAC--A---TCAAA-AATTCAAATT-AA-AAAAGCA-----A-G--AAT---A-AAAGAT-AA-----T-G----TGC--TGA-A--A-----TA-T-ATA-AAA---CT-------A-----CGGTTC--TTT---AAT-GT---TTAG---AA-AAA--A---G--AA-T-------ACTTA-----CG-----A-ATAAA--ATTAGATA---T--AG---TCGAC-G-----------GTTCATT--TA--TT----TTTGT--AT-TT-T--TGTAAA--T-G---TG-A-CAC---T--CC-TAT--CATTTT--AG-G-G-AT------T--TGGTTTC-T-G--------G--A---ATAA--CGAATAGTA-GCAG--A--T----AAG----A--AATAG-----GTC----------ACCG---CTG--AC--T-------TTTTG---TTCG--T-TT-A----G---A------CA-T-GC-T---GAA-TATA-AT-T-GGCC----A--AAG--TT--C---G-T-C-A---------ATT---TCC--T-----------C-CG--A-GTCACGCAGT-G----TG-TGA-AAG-A-TTT--A-GC-TCG-TTT-CTA--AA-------TTC-A-A--TT--TTCTCCTCC--T-G-----A-A---A-T------------------G-AC-CA-----C-T---AATTT-T---TA------GG--A--CC-G------AA-AACCGTG--A--AA-AACCG-CA--AAGT---GC-------TGA-C---A--GAATTA----TA-------AATCGT---AA----TATTATCGC----T-TTTTTTGA----GC---ACA-A-TTAAA-T-TCAT-T------TA--AAAA----------ATAAGAAG------A---GT--G-A----T---ACT-CTTTTT-A-C---A-AAC-T-----------TTTA-GCA--GG-AA--GAA----AAAT--------ATTT--------AGTGTTCTAAATTTCAGCTT-CCAGAAGTC-CCT-TAA-GGG---G-T--C---AAAATTCA---TG--C--CT-ACGG-C-TGC--ATA-----TTGT----TT-TA---ATT-----GCTC-G---CGTCTTTCGATAAAAAA----TACCCT--AATCAATTATTAAG-A-CAG-TTT----GCAAAAGTC-----CGAT-T---------AAAAAA
gi|10 : cttaaaattatttttgttaaaaaaattgtttaaaatatG----AAAAA-AAAA----G-----A------AA--AAACGATA-TTATTA-AA--------AA----AAAG--AAAT----T-----------------------CAAA------------------------T-C-A-----GTAAA-------TA-----GTC-----TTACTTAAATCGTA--ATT-T-----AGAT-AG-TACTTA------A-----A---GAGC-G----A-T---------AA--C-T--C--GTGTT--GAGTA---TG---A---ATACA-TA------AAAAGTTCAA--G---ACGA-ATA-GATT--ACTAT----AA-GA-C-AA-GG-----------------------------------CAAT-A-AA--ATTTTCAAAGAATTAA--TT-TA-AGAAG-------A-T--AAT---T-GA-GAT-A------T-TGTATTGC--TGA-C--A-----TTGT-TGA-AAA---CT-------AAATGACG--TT--TTC---CATCTT---T-A-----G-AAA--A---A--AG-T-------A--TA-----C------A-ATAAA--AAATAT-A---T--AA---TTTTC-G-----------GTTT--CA-TA--TT----T--TT--GTATTGT--TGTAAA--T-G---TG-A-C-T---T--CC-T-T--CAT-TG-CAGTG-G-AT------TTCTG-TTTCAT-G--------G--A---A-AC--T---TA-TA-GCAG--A--TGTGGA-T----A--ACGACTTTTGGTCACCCGTTCTTATTG---ATATTAC--T-----T-TTTTG---TTTG--T-TT-AATTGA---A------CA-T-GC-T---AAA-TATATTT-T-G--C----A--AAGT-TT--C---A-T-C-A---------ACT---TCC--------------T-CA--C-G-------ACAT----TG-TGG-AAG-A-TTTTAG-GC-CTT-TTT-CGT--AA-------TTC-A-A--TTTCTT------C--T-A-----G-AT--ATT------------------GTACTTA-----T-CCATAA-AT-T---TA------GA--T--C----------A-ACTCGTG--AC-AA-ttaagaaaagtctgtttagagaccgacagaatattattgcaaatatagcccctacagattctaatttctctgtggagattatatttc
gi|9 : aaaaaaaaaaaaaaaaaataaaaaaaaaaaaaaaaagaaagAA-AAAA----T-----T------CTTTAAAT-AT--TTGCCA-AA--------AATATAAAA---AAAGA---T-----------------------TAAAA----------AAAAT--------T-C-AA-TTCGTAAAAAAAAAATAAAAAGGTC---AACT--TTAAA-AGTA--ATC-T-----T-GT-AT-C--TTA------A-----ACAAGAGC-G----A-T---------AA--C-T-----G---T--GAG-A---TG-------T-ACA--A------TAAA-TTC----A---AC-G-ATA-GA-T--ACC-T----AA-GA-A-AT-GG-------CAGAT--------------------------T-A-----AAATTCAAA----T----TT-AA-TAAAA-G-----A-T--AAT---G-AA-GAT-A------T-GA---TGC--TGC-ATTT-----TT-T-TG--AAA---CT-------AA---ACG--TT--CC-----AT-GT---T-AG---AA-AAA--A---G---A-T-------A--TA-----C------A-ATAAAACA------A---TAAAA---TTTTC-G-----------GTTC--TCATA--TT----T--GT--ATTTT-T--TGTAAAT-T-G---TG-A-CAT---T--CC-T-T--CA--TT-CA--G-G-AT------G--TG--TTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T--GCAG--A--T----AGG----A--AGTA------GTC----------ACCG---CTGC-AC--T-------TTTTGT--TTTG--TATT-A----G---A------CA-T-GC-T----AA-TATA-TC-T-G--CA---A--AAGT-TT--C---A-T-C-A---------ACT---TCC--G-----------GAGG--A-G-------AT-TTTTGTG-TGA-AAG-ATTTT--A-GC--TT-TTT-CGT--AA-------TTTCC-A--AA--TT------C--T-A-----GAA---A-T------------------G-AC-TA-----T-C---AA-A------TA------GA--C--CG-G------AACA---GTG--AC-AACAACCG-GA--AAAAGTGGT-------T-A-G---ATGGAG--A----TAG------G---GT---TA----TA--AT-GA----T-T------A----GG---ACC-ATTT-AA-T-TGTT-T------TAAAAAAAT---------A----AAG------A---GA--GTA----TA--ACT-C---TT-A-C---A-AA--T-----------TTTA-G-A-----GA--G------AAAT--------CTTttgcgttagtgacaaaccg
gi|2 : ga--TTAAC-AGTATGATT-T-----G-AT-AG-T--CTA------A-----ATA-GAGC-GGGATA-T---------AA--T-T--C--G---T--GAG-ACCGTG---A---T-ACA-TA------TAAA-ATT----TCAAAC-G-ATA-GA-TGTAC--T----AA-GA-CCAA-GGCATTTTTCAAA-------------GT--A-TG--TCAGA-AGAA--A---TCTAA---TCTA--TG-AA-AAAAT-ACG---A-T--AAT---G-AA-GATGA------T-GAG--CGC--TGA----------CT-T-TGA-ACA---CT-------AA----CG--TT--TTA---AAT-GTGTAT-AG---AATAAA--G---GCGAACT-------A--TAA----CTATTTAA-ACGAA--T------A---T--AT---TTTTC-GTCT--------GTTT--T--CA--TTATTGT--GTTTATTTT-T--TGTAAAACT-G---TG-A-CATCTTT--CCATGT--CATTTT-CAG-C-G-GTGATTTTT--TG-TTTC-TTG--------GTAA---A-AA--C---C--TA-GCAG--A--TG---A-GCTTAG--GGTAC-----ACC----------GCT-----TG--AC--T-----T-TTTTG---TTTG--T-TT-A----GTCTATTTTTTCG-T-AA-T---GAA-TAT---TCT-G--CTCATA--CAGTATTACT---A-TCC-A---------ACC---TCC--------------T-CG--ACA-------AT-T----TGTTGA-AAG-A-TTT--ACGCATTTATTT-CGT--AT-------TTT-TAA--GT--TC------C--T-A-----G-ATTTA-TCTTTGCATATGTTAAATGG-AC-TAGTACTT-A---AA-AT-T---TAGTTTAGGA--AT-CC-G------GG-ATCCGTGTTAT-TA-TATCC-GA--AAA----GTGATATACT-A-C---G--GGA--AAATTTG-------T---GT---AA----AA--AT-GAGCTTT-T------ACT--GGCGCACC-ATTT-AG-A-TCGT-T------TA-TAAAAGAACT-----A----AAG------ATATGA--G-GCATTTA--ACT-C---TT-A-C---C-AAT-TTCTGCCTCCTCTTTA-G-ATTAG-AA--ATCTTTTAAATGCTCTAAGATTC--------A--------------AGCCT-CCAGAAGTC-CCTATAAGAGGGCCG-T--GCATAAAA---ATGATGTCTA-CT-ACGG-T-C-CCAATTTATTATTTTAGA-TT-TG-----T-----G--T-A---CG--T---TATAAAGATAAGGT--CATTAAATC----CCTAACGA-TGG-TTTGATCG--AAAATCGAGCATGATAT---------AAAAttaagtttctaaatatcttcaagcctc
gi|18 : aaatctggtattatgttataataacataatataaataatagaacctacagattcgctcaaaaagtaggcacacAAG-A-----A-T--AAT---G-AA-GAT-A------T-GA---TGC--TGA-A--A-----TT-T-CAA-TAA---CTTACAACAAG---ACG--TG--C-----AAT-GT---T-AG---AA-AAA--G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AGAAA--A------A---T--AA---TTTTC-C-----------GTTC--A--TA--TT----T--GT--ATTTT-tataaggggagaaagcattgaaagacatggaaagagacttatttccaaaatttttatagcgttcctacgcttcctgtaagattgtcttctttcgaggagatgaccatatttc
gi|19 : -GT---T-AG---AA-AAA--G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-ATAAA--A------T---T--AT---TTTTTTG-----------GTTC--A--TA--TT----T--GT--ATTTT-T--TGTAGG--T-G---TG-A-CAC---T--CC-T-T--CATCTT-CAG-G-G-AT------T--TG-
gi|17 : c-----C------A-ATAAA--A------A---T--AA---TTTTC-G-----------GTTC--A--TA--AT----T--GT--GTTTT-T--TGGGAA--T-G---TC-A-CAC---T--CC-T-T--CATCTT-CAG-G-G-AT------T--T--TATC-T-C--------G--A---A-AA--C---TG-TC-GCAG--A--T----A-G----A--AGTAG-----GTC----------TCCG---CTG--AC--T-----T-TTTTG---TTCA--T-T
gi|12 : T----T--GT--ATTTT-T--TGTGAA--T-G---TC-A-CAC---T--CC-T-T--CCTCAT-CAG-G-A-AT------T--TG-TATC-T-C--------G--A---A-AA--C---TG-TA-GCAG--A--T----A-G----A--AGTAG-----GTC----------ACCT---TTG--AC--T-----T-TTGTG---TTTG--T-TT-A----A---A------CA-T-GC-T---AAA-TATA-AT-T-G--G----A--AAGT-TT--C---T-T-T-A---------ACT---TCC--G-----------A-CG--A-G-------AT-T----TG-TGA-AAG-A-TTT--A-GC-ACT-TTT-CAT--ACATGTCAATTC-A-A--TT--TT------C--T-A-----A-A---A-T------------------G-AC-TA-----T-A---AA-AA-T---TA------TA--A--CC-G------GA-A---GTG--TC-AA-AACCG-GA--AGT----GT-------T-A-T---A--GGG--A----TA-------G---AT---TA----CA--AT-GG----A-T------A----GG---ACC-A-CT-
gi|11 : --T-----T-TTTTG---TTTGCCT-TT-A----G---A------CAAT-GC-T---GAA-TA-A-AT-T-G--C----A--AAGT-TT--C---A-TTC-A---------ACT---TCCCCG-----------A-CG--A-G-------AT-T----TG-TGA-AAG-A-TTT--A-GC-TTT-TTT-CGTAAAA-------TTC-C-A--AT--TT------CG-TAA-----A-A---A-T------------------G-A--TAT----T-C---AA-ATAT---TA------GA--AATCCGG------AA-G---GTG--AC-AA-AACCG-GA--AGT----GTA------T-A-CCATG--GGA--A----TA-------G---GTGTAAA----TA--AT-GA----C-T------A----GA-----C-A-TT-AATT-TCATAC------TATAAAAAAAT-------A----AAG------A---GA--G-A----TA--A-T-C---TT-ACC---A-AACTT-----------TTTA-GAA--AG-AAACG------AAAT--------
gi|1 : actT-T------TATTAGAA----------A----AAT------T---AA--G-G----TA--ATC-C---TT-T-T---A-A-T-T-----------TCTA----------------------AT--------ATTTCGAGTATAA--------------AGCCCTCCAGAA-TCACCT-TAA-GGG---GCT--C---AAAA---A-ATTG--CAACT-ACGGGC-C-C--A-ATATT-TTCT----TT-TAGATATTAATCGG--A-AGCGTGAC-----ATAAGAAT----T--CATC-AATC----ACTcctttaacagtttctaatattca
gi|14 : ttctttttgaagtctccgaacaaaagaaaatagggcttttttacgacctccaaaagaaatatttgtgaaacaaattttctatgaaaatctttgccaaaaaaatctataaagaagaaaaaaaaatatactaggtaagagaaatcaaattgagtttaaaaaaaaagattttcaatcgtaaagtcacttaaaagtaatttgatgagtctaagagcgataactctcgtgagagcttgtataaccatataaattcaacgataagatacctaagacaaggcattaaatattcacaaaaaattaattttaaaaaaaaccgatatcaaatgaagatatagacgctgacattttgaaaaactaaacgttttaaatgttcagaaaaatggaatataaaaatcaataaaaaaaataatttccgtttcactattgatttttttgtaaattgtgaacacttcccttgtcatttcggattaatgtttctggaaaacctcagcagcaatatgaagtaggtcaccctggacttttttgtttgtttagacatcgctaaatattatttgcaccaagttttcatatcacttaactcccgacttgtgaaagatttagctttttcgtaaattcaatttttcatagaactgactatcaaattatatagaaccggaagtgacaaaaaccgtgaagtgttacagggaaaaaaagggggtaaacaaaaataagattttttggttttaaaaaaaaggatggatccaattaattcgtaaaaaagaataaagtgaaagataacctctacttat--------------AGCTC-ACAGAAGTC-CTT-AAA-GGG---G-TCCA---AAAA---T-ATTG--CA-CTAACGG-CTC-C--A-ATATT-TCTTACAATTGCA---ATTCGG--G--ATA---TGA------ATAAAGA-----T--CATA-AATC----ACTAA--ATCGGTTTT----G--TAAATC-----CGGCATAAAAATCTAAAAAAAGTTGAAGC--TGAAAATTttaatgtttgtaataatgatttccatatactttgaaataattgtgaatttcttttaatcaggggtcattaacgttactcttagttgaaatgattgttcgcgaattaaaaaatatataataaaagttgaacgctgaaagctatt
gi|14 : ATAAAGAT-CATAAATCACTAA-ATCGGTTTTG--TAAATCCGGC------ATAAAAATCTAAA-AAAAGT-----TGAA-G-CTGAAA-A---TTATTTCTATATATTCTAG-CTCTACAatttctatatattctagctctacatga
gi|3 : agctcacagaagtccttaaaggggtccaaaaatattgcactaacggctccaatatttcttacaattgcaattcgggatatgaAA-TTATTAAGA-CAGTTT-GCAAAAGTCCGATTAAAAAATTA-------AG-AAAAGTCTGTTTAGA-GACCGACAGAATATTATTGCAA---AT-ATAGCCCCTACAGAtga
gi|1 : cttaaaattatttttgttaaaaaaattgtttaaaatatatatttttgctgtaataaaaaatatataaagaaaagaaaaaaaaaatgcaatcgtaaaattgttcaaatttaagtaatttgatagtgctaactcacacgagtgacttactcagttcgagatggagaaatttaaattcaccattaattactaaggctaagtcattctaataaactctcactcaatttaacatacatcaaaaattcaaattaaaaaagcaagaataaaagataatgtgctgaaatatataaaactacggttctttaatgtttagaaaaaagaatacttacgaataaaattagatatagtcgacggttcatttatttttgtatttttgtaaatgtgacactcctatcattttagggatttggtttctggaataacgaatagtagcagataagaaataggtcaccgctgactttttgttcgtttagacatgctgaatataattggccaaagttcgtcaatttcctccgagtcacgcagtgtgtgaaagatttagctcgtttctaaattcaattttctcctcctgaaatgaccactaatttttaggaccgaaaaccgtgaaaaaccgcaaagtgctgacagaattataaatcgtaatattatcgctttttttgagcacaattaaattcatttaaaaaataagaagagtgatactctttttacaaacttttagcaggaagaaaaatatttagtgttctaaatttcagcttccagaagtcccttaaggggtcaaaattcatgcctacggctgcatattgttttaattgctcgcgtctttcgataaaaaataccctaatc--AAAAT---AT------AT---------AATAAAAGT-----TGAACG-CTGAAAG----CTATTttctaatttctctgtggagattatatttc
Alignments
lowQualScore : 11 11 11 22222222222222 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 4444444444444444444444444444 444444444444 111111111 333333333 11111 22222222222222 111111 2222 1111 1111111 111111 9999999999999999999999999999999999999 11111111111111111 1111111111 222 222222 111 11 3333333333 111 1111111 11 1111 1111111 111 1111 11111 2222222 111111111111 2222222222 111 33333333333 11 1111 111111111 22222222 1111 1111111111 11111111111 11111 111 1111 1111 111111111 44444444444444444444444444444444 1111 2222222 1 66666666666666666666666666666666666666666666 1 11111111111 1111111111111111 2222 11 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111 1111 111 11111 11111111111 11 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3333333333 222 11111 2 111 777777777777777777777777777777777777 4444444444 2222 1 2222222 22222 444444444 22 1 333 1 77777777777777777777 333333 222 2 11
lowQualScore : 55 4 11 8 777 99 44 00 55 22222222222222 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 0 3 3 2222222222222222222222222222 3 44 3 3 3 3 222222222222 888888888 0 3 7777 3 333333333 44 22222 555 44 3 99999999999999 3 999999 77 7777 888 0000 3 1111 7777777 6 3 000000 7777 6 44 6 1111111111111111111111111111111111111 55 99999999999999999 0 7 7777777777 3 44 000 3 444444 3 000 00 0000000000 3 7 3 666 3 1111111 00 4444 0000000 3 777 6 0000 44 33333 44 3 7777777 44 222222222222 3 3 44 1111111111 44 333 3 44444444444 3 44 77 44 88 9999999 2 33 88 77 3 555 6 3 555 00 3 1111 3 3 6 3 000000000 44 3 3 44444444 44 555 3 44 666666 3 44 44 0000 3 44 3333333333 3 6 44444444444 3 55555 88 3 555 44 000 77 3 0000 555 999999 3 3 9999999 3 4444 44 0000 44 3 3 99 555 3 555555555 77777777777777777777777777777777 0000 3 3 3 3 44 3 6 3 3 2222222 0 3 1 6 44 33333333333333333333333333333333333333333333 0 6 3 88888888888 3 3 555 3 4444444444444444 7777 77 7777 44 3 3 7 55 88888 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111 777 55 4 2222 55 4 111 4 22222 8 4 99999999999 55 8 8 55 4 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 8 8 8 8 4444444444 8 555 33333 8 8 8 999 0 0 444 999999999999999999999999999999999999 0000000000 8 8 4444 0 5555555 55555 3 000000000 00 0 7 5 444 7 3 99999999999999999999 888888 0 6 333 1 1 3 33 6
lowQualScore : .. . .. . ... .. .. .. .. .............. ................................................................................................................................................................ . . . . ............................ . .. . . . . ............ ......... . . .... . ......... .. ..... ... .. . .............. . ...... .. .... ... .... . .... ....... . . ...... .... . .. . ..................................... .. ................. . . .......... . .. ... . ...... . ... .. .......... . . . ... . ....... .. .... ....... . ... . .... .. ..... .. . ....... .. ............ . . .. .......... .. ... . ........... . .. .. .. .. ....... . .. .. .. . ... . . ... .. . .... . . . . ......... .. . . ........ .. ... . .. ...... . .. .. .... . .. .......... . . ........... . ..... .. . ... .. ... .. . .... ... ...... . . ....... . .... .. .... .. . . .. ... . ......... ................................ .... . . . . .. . . . . ....... . . . . .. ............................................ . . . ........... . . ... . ................ .... .. .... .. . . . .. ..... ................................................................................................................................................................... ...... ... .. . .... .. . ... . ..... . . ........... .. . . .. . ..................................................................... . . . . .......... . ... ..... . . . ... . . ... .................................... .......... . . .... . ....... ..... . ......... .. . . . ... . . .................... ...... . . ... . . . .. .
lowQualScore : 55 7 00 0 000 22 66 44 88 55555555555555 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 6 9 6 6 0000000000000000000000000000 3 66 3 3 3 3 111111111111 444444444 4 3 1111 3 333333333 66 66666 888 66 3 00000000000000 3 222222 99 1111 888 8888 3 1111 7777777 7 3 000000 1111 7 66 7 7777777777777777777777777777777777777 00 11111111111111111 2 3 6666666666 3 66 000 6 555555 6 000 00 2222222222 6 3 6 444 6 8888888 22 1111 7777777 3 555 7 4444 66 00000 66 3 5555555 66 777777777777 1 1 22 1111111111 22 888 1 66666666666 1 22 11 22 55 7777777 9 99 55 33 1 444 2 1 444 44 1 8888 1 1 2 1 222222222 66 3 3 22222222 66 888 3 66 888888 3 66 66 8888 3 66 8888888888 3 7 33333333333 3 00000 55 1 444 22 888 33 1 4444 888 666666 3 3 3333333 3 8888 66 4444 66 3 3 22 888 3 777777777 00000000000000000000000000000000 4444 3 3 3 3 66 3 7 3 3 1111111 0 3 0 7 66 33333333333333333333333333333333333333333333 0 7 3 66666666666 3 3 888 3 5555555555555555 1111 99 9999 66 3 6 3 00 77777 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 555555 000 55 0 5555 55 0 000 0 55555 0 0 00000000000 55 0 0 00 0 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 0 0 0 8888888888 0 000 00000 0 0 0 222 4 8 000 444444444444444444444444444444444444 8888888888 0 8 8888 0 0000000 00000 2 000000000 77 7 3 3 777 3 3 77777777777777777777 333333 7 7 333 0 0 7 00 7
consensus : GAACAAAA--AAATAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--AAA--GA--TATTTT--T----GA-A-AAAAAA----------T-----T-----A---A--AAATAT------TTG--CCA-AA--------AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAA-------T-----C-AA-T-C-GTAAA-------T------GTC---A-TT--TTAAA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----A---GAG-CG----A-T---------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG---A---G-AC-ATA------TAAA--TT----C--AAC--C-ATA-GA-T--AC--T----AA-G-A----C-A----A-G--G-CATT---CAAAT---C----TATAATCTCAA---AA---A--AAAT---TCAAAAATTCA--TTAA-AAAAG----A-----A-T--AAT---GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGA-A--A-----TT-T-TGA-AAA---C-T-------AA-ACG----TT--TCN--AAT-GT---T-AGAA----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AT-AAA--A------A---T--AA---TTTTC-G-----------G-T--TCA-T--A--TT----T--G-T--ATTTTT--TGTAAA--T-G---TG-A-CAC---T--CC-T-T--CATTTT-CAG-G-G-AT------T--TG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T-AGCAG--A--TA-G--A-AG--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-A-TTTG--C----A--AAG-T-TT--C---A-T-C-A-----ACTTCC--G-A-----------C-G--A-G--------ATT----TGT-GA-AAG-A-TTT--A-GC-TTT-TTTCG-T-------AA-TT-CAA-TT--TTC--T------A-----G--------------------A---A---TG-AC-T-A-----T-C---AA-AT-T---T-AG------A-A--C----CGG----A--A----GTGACA--A-AA-CCG-GA--AG----TGT-------T-AC---A-----------GGG--A----TA-G---GT---AA----T----A--AT--GA----T-T-----------------A----GG---A-----CC-A-TT-AN-T-TCG-T-T------TATAAAA-A-------AAT------A---AA------GA---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-T-T-----------T--TA-G-A--AG-AA----G------A-----------------AAT-C--------T-TT--------A--------------AGCCC-CCAGAAGTC-CCT-TAAG-GGG-T-CA-----AAAA-AT---TG--C-ACT-AC-GG-C-C-CATATATT---TTTT--A-AT-T-TAA--TC---G-GNA---CGACT----ATAAAGA-----T----TCA-TNAATCACTAA--A-CGG-TTT----G--AAAATC-----CGATAT---------AAAAAAGTTGGAGC-ATAAAGATTCAT-AATCACTAAGA-CGGTTT-CGAAAATCCG--AT------A------T-AAAAAAAGTC------GAAGCCGAAAGA---TTATTTCGA-ATATTCTAGCCCCTACAGA
Reference ( family-3270 ) : GAACAAAA--AAATAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--AAA--GA--TATTTT--T----GA-A-AAAAAA----------T-----T-----A---A--AAATAT------TTG--CCA-AA--------AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAA-------T-----C-AA-T-C-GTAAA-------T------GTC---A-TT--TTAAA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----A---GAG-CG----A-T---------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG---A---G-AC-ATA------TAAA--TT----C--NAC--C-ATA-GA-T--AC--T----AA-G-A----C-A----A-G--G-CATT---CAAAT---C----TATAATCTCAAT-AAA---A--AAAT---TCAAAAATTCA--TTAA-AAAAG----A-----A-T--AAT---GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGA-A--A-----TT-T-TGA-AAA---C-T-------AA-ACG----TT--TCN--AAT-GT---T-AGAA----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AT-AAA--A------A---T--AA---TTTTC-G-----------G-T--TCN-T--A--TT----T--G-T--ATTTTT--TGTAAA--T-G---TG-A-CAC---T--CC-T-T--CATTTT-CAG-G-G-AT------T--TG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T-AGCAG--A--TA-G--A-AG--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-A-NTTG--C----A--AAG-T-TT--C---A-T-C-A-----ACTTCC--G-N-----------C-G--A-G--------ATT----TGT-GA-AAG-A-TTT--A-GC-TTT-TTTCG-T-------AA-TT-CNA-TT--TTC--T------A-----G--------------------A---A---TG-AC-T-A-----T-C---AA-AT-T---T-AG------A-A--C----CGG----A--A----GTGACA--A-AA-CCG-GA--AG----NGT-------T-AC---A-----------GGG--A----TA-G---GT---AA----T----A--AT--GA----T-T-----------------A----GG---A-----CC-A-TT-AN-T-TCG-T-T------TATNAAA-A-------A--------A---AA------GA---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-T-T-----------T--TA-G-A--AG-AA----G------A-----------------AAT-N--------T-TT--------A--------------AGCCC-CCAGAAGTC-CCT-TAAG-GGG-T-NA-----AAAA-AT---TG--C-ACT-AC-GG-C-C-CATATATT---TTTT--A-AT-T-TAA--TT---G-GNA---CGACT----ATAAAGA-----T----TCA-TNAATCACTAA--A-CGG-TTT----G--AAAATC-----CGATAT---------AAAAAAGTTGAAGC-ATGAAGATTCATAAATCACTAAGATCGGTTT-TGAAAATCCG--AT------A------T-AAAAAAAGTT------GAAGCCGAAAGA---TTATTNCNATATATTNTAGCCCCTACAGA
gi|1 : GAACAAAAGAAAATAG--GGCT-TTTTTACGACCT--CCAAAA--GAAATATTTG--T----GA-A-ACAAAT----------T-----TTCTATG---A--AAATCT------TTG--CC---A--------AA----AAA---ATC-----T--------------A-------------------T---A------AA--G------------AAGA-------
gi|1 : ttctttttgaagtctcc--C--AAA--AA--AATCTA--T----AA-A-GAAGAA----------A-----A-----A---A--AAATATAC----TAG--GTA-AG--------AG----AAATCAAAT-----T--------------GAGT----------------T---T------AA--A------------AAAAAAGATTTT-----C-AA-T-C-GTAAA--------------GTC---A-CT--T-AAA-AGTA--ATT-T-GATGAG-T------------CTAA---------GAG-CG----A-T---------AAC--T--CTCG---T--GAG-AGCTTGTATA---A-CC-ATA------TAAA--TT----C--AAC--G-ATAAGA-T--ACC-T----AA-G-A----C-A----A-G--G-CATT----AAAT------------AT-TCAC---AA---A--AAAT---T----AATT----TTAA-AAAAA----ACCGATA-TCAAAT---GAAGAT-A------TAGA---CGC--TGA-C--A-----TT-T-TGA-AAAA--C-T-------AA-ACG----TT--TTA--AAT-GT---TCAGAA----AA--ATG---G--AA-T-------A--TAAAAATC------A-AT-AAA--A------AAAAT--AA---TTTCC-G-----------T-T--TCACT--A--TT----G--A-T---TTTTT--TGTAAA--TTG---TG-AACAC---TTCCC-T-TGTCATTTC-----G-G-AT------TAATG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---CT-C-AGCAGCAA--TATG--A-AG--TA---------GG-T-CACC-----------CT-GG----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----G---A------CA-TCGC---T---AAA-TATTA-TTTG--C----ACCAAG-T-TT--TCATA-T-C-ACTTA-ACTCCC--G-A-----------C-----------------T----TGT-GA-AAG-A-TTT--A-GC-TTT-TT-CG-T-------AAATT-CAA-TT--TTTCAT------A-----G--------------------A---AC--TG-AC-T-A-----T-C---AA-AT-TATAT-AG------A-A--C----CGG----A--A----GTGACA--A-AAACCGTGA--AG----TGT-------T-AC---AGGGAAAAAAAGGGG--G----TA-A---AC---AA----A----A--ATAAGA----T-TTTTTGGTTTTAAAAAAAA----GG---ATGGATCC-AATT-AA-T-TCG-T-----------AAAA-A-------A--------G---AATAAAGTGA---AA--G-A----TA--ACC-TCT---A-C---T-TAT-T-T-----------TATTA-G-A--AA-AATTAAG------GTAATCCTTTTAATTTCTAAT-A--------T-TTCGAGTATAA--------------AGCCCTCCAGAA-TCACCT-TAAG-GGGCT-CA-----AAAA-AT---TG--CAACT-ACGGG-C-C-CA-ATATTTTCTTTT--AGATAT-TAA--TC---G-GAAGCGTGAC-----ATAAGAA-----T----TCA-TCAATCACTaaaaaaaatatactaggtaagagaaatcaaattgagtttaaaaaaaaagattttcaatcgtaaagtcacttaaaagtaatttgatgagtctaagagcgataactctcgtgagagcttgtataaccatataaattcaacgataagatacctaagacaaggcattaaatattcacaaaaaattaattttaaaaaaaaccgatatcaaatgaagatatagacgctgacattttgaaaaactaaacgttttaaatgttcagaaaaatggaatataaaaatcaataaaaaaaataatttccgtttcactattgatttttttgtaaattgtgaacacttcccttgtcatttcggattaatgtttctggaaaacctcagcagcaatatgaagtaggtcaccctggacttttttgtttgtttagacatcgctaaatattatttgcaccaagttttcatatcacttaactcccgacttgtgaaagatttagctttttcgtaaattcaatttttcatagaactgactatcaaattatatagaaccggaagtgacaaaaaccgtgaagtgttacagggaaaaaaagggggtaaacaaaaataagattttttggttttaaaaaaaaggatggatccaattaattcgtaaaaaagaataaagtgaaagataacctctacttattttattagaaaaattaaggtaatccttttaatttctaatatttcgagtataaagccctccagaatcaccttaaggggctcaaaaaattgcaactacgggcccaatattttcttttagatattaatcggaagcgtgacataagaattcatcaatcactttaatgtttgtaataatgatttccatatactttgaaataattgtgaatttcttttaatcaggggtcattaacgttactcttagttgaaatgattgttcgcgaattaaaaaatatataataaaagttgaacgctgaaagctatt
gi|10 : ttctttttgaagtctccgaacaaaagaaaatagggcttttttacgacctccaaaagaaatatttgtgaaacaaattttctatgaaaatctttgcA-A-AAGAAA----------G-----G-----A---A--AAA-A--------------A-AA--------GA----AAA---AACGATATT--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAAAGAAAT-T-----C-AAAT-CAGTAAA-------TA-----GTC-----TTACTTAAATCGTA--ATT-TAGAT-AG-TAC----------TTAA-----A---GAG-CG----A-T---------AAC--T--C--GTGTT--GAGTA---TG---A---ATAC-ATA------AAAAG-TT----CAAGACG-A-ATA-GATT--ACTAT----AA-G-A----C-A----A-G--G-CAAT---AAAAT-------------TTTCA---------------------AAGAATTAA--TTTA-AGAAG----------A-T--AAT---TGAGAT-A------T-TGTATTGC--TGA-C--A-----TTGT-TGA-AAA---C-T-------AA-ATGACGTTT--TCC--ATC-TT---T-AGAA----AA--A-A---G-----T-------A--TA-----C------A-AT-AAA--AAATAT-A---T--AA---TTTTC-G-----------GTT--TCA-T--ATTTT----T--G-T--A-TTGT--TGTAAA--T-G---TG-A-C-T---T--CC-T-T--CA-TTG-CAGTG-G-AT------TTCTG-TTTCAT-G--------G--A---A-AC--T---TA-T-AGCAG--A--TG-T--G-GA--TAACGACTTTTGG-T-CACCCGTTCTTA---TT-GATATTAC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTAATTGA---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-ATTTTG--C----A--AAG-T-TT--C---A-T-C-A-----ACTTCCT-C-A-----------C-G--A-C--------A-T----TGT-GG-AAG-A-TTTTAG-GC-CTT-TTTCG-T-------AA-TT-CAA-TTTCTTC--T------A-----G--------------------AT--AT--TGTACTT-A-----T-CCATAA-AT-T---T-AG------A-T--C-----------A--ACTC-GTGACA--A-ttaatgtttgtaataatgatttccatatactttgaaataattgtgaatttcttttaatcaggggtcattaacgttactcttagttgaaatgattgttcgcgaattaaaaaatatataataaaagttgaacgctgaaagctatt
gi|11 : aaaaaaaaaaaaaaaaaataaaaaaaaaaaaa--TT-TT---TT--G---TTTGCCT-TTA----G---A------CAAT-GC---T---GAA-TA--A-ATTG--C----A--AAG-T-TT--C---A-TTC-A-----ACTTCCCCG-A-----------C-G--A-G--------ATT----TGT-GA-AAG-A-TTT--A-GC-TTT-TTTCG-TAA-----AA-TT-CCA-AT--TTCG-TA-----A-----A--------------------A---A---TG-A--T-AT----T-C---AA-ATAT---T-AG------A-AATC----CGG----A--AG---GTGACA--A-AA-CCG-GA--AG----TGTA------T-ACCATG-----------GGA--A----TA-G---GTGTAAA----T----A--AT--GA----C-T-----------------A----GA----------C-A-TTAAT-T-TCA-TAC------TATAAAA-A-------AAT------A---AA------GA---GA--G-A----TA--A-T-CTT---ACC---A-AACTT-T-----------T--TA-GAA--AG-AAAC--G------A-----------------AATCC--------T-TT--------A--------------Attgcgttagtgacaaaccg
gi|12 : actT----T--G-T--ATTTTT--TGTGAA--T-G---TC-A-CAC---T--CC-T-T--CCTCAT-CAG-G-A-AT------T--TG-TATC-T-C--------G--A---A-AA--C---TG-T-AGCAG--A--TA-G--A-AG--TA---------GG-T-CACC-------T---TT-G-----AC--TT-TT---GT--G---TTTG--T-TTA----A---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-A-ATTG--G----A--AAG-T-TT--C---T-T-T-A-----ACTTCC--G-A-----------C-G--A-G--------ATT----TGT-GA-AAG-A-TTT--A-GC-ACT-TTTCA-TACATGTCAA-TT-CAA-TT--TTC--T------A-----A--------------------A---A---TG-AC-T-A-----T-A---AA-AA-T---T-AT------A-A--C----CGG----A--A----GTGTCA--A-AA-CCG-GA--AG----TGT-------T-AT---A-----------GGG--A----TA-G---AT---TA----C----A--AT--GG----A-T-----------------A----GG---A-----CC-A-CT-cagtttctaatattca
gi|13 : GACCT--T--AAA--GA--TATTTT--T----GA-A-AAAAAA----------T-----TCTT--A---A--AAGTTT------TTG--CCA-AA--------AA----AA------C-----T--------------A-------------------TAA-T------AA--A------------AAAA-------T-----CCAA-T-C-ATAAA-------T------GTC---AATT--TCAAA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----A---GAG-CG----A-A---------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG---A---A-AC-ATT------CAAA--TC----C--TAC--C-ATA-AA-T--AC--T----AA-G-A----C-A----A-G--G-CATT---TAAAT---CTCCATGTAATCTCAATAAAA---A--AAAT---TCAAAAATACA--TTTA-AAAAT----A-----A-T--
gi|14 : --------------AGCTC-ACAGAAGTC-CTT-AAAG-GGG-TCCA-----AAAATAT---TG--C-ACTAAC-GG-CTC-CA-ATATT---TCTTACA-AT-TGCAA--TTCGGG-ATA---TGA------ATAAAGA----------TCA-TAAATCACTAA--ATCGGTTTT----G--TAAATC-----CGGCATAAAAATCTAAAAAAAGTTGAAGC--TGAAAATT
gi|14 : -ATAAAGAT-CATAAATCACTAA-ATCGGTTT-TGTAAATCCGGCAT------AAAAATCT-AAAAAAAGTT------GAAGCTGAAA-A---TTATTTCTATATATTCTAG-CTCTACAatttctatatattctagctctacatga
gi|15 : agctcacagaagtccttaaaggggtccaaaaatattgcactaacggctccaatatttcttacaattgcaattcgggatatgaA--GA--TATT---------AA-A-AAAAAAATGT------T-----T-----A---G--AAATAT------TTG--CCA-AA--------A-------------------C--------------A-------------------C---T------AA--A------------AAAT-------C-----C-AA-T-C-ATAAA-------T------TTC---A-TT--TAAAA-AGAT--GTT-T-GAT-AG-T------------CTAC-----A---GAG-TG----A-T---------AAC--T--C--G---T--AAG-A---GG---A---G-AC-AGT------TAAA--TT----C--TAC--C-ATA-GG-A--AC--T----GA-G-A----C-A----A-G--G-CATT---TAAAT---CTCCATATAATCTCTAT-Atga
gi|16 : AACAAAA--AAACAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--ATA--GA--TATTTT--T---------AAAAAATGCT------T-----T-----A---A--AAAAAT------
gi|17 : gatgcatggaatgaagcatgtcatgtagcaaaataacatttagaaatataattctttttggtctcta-----C------A-AT-AAA--A------A---T--AA---TTTTC-G-----------G-T--TCA-T--A--AT----T--G-T--GTTTTT--TGGGAA--T-G---TC-A-CAC---T--CC-T-T--CATCTT-CAG-G-G-AT------T--T--TATC-T-C--------G--A---A-AA--C---TG-T-CGCAG--A--TA-G--A-AG--TA---------GG-T-CTCC-------G---CT-G-----AC--TT-TT---TT--G---TTCA--T-T
gi|18 : AAG----A-----A-T--AAT---GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGA-A--A-----TT-T-CAA-TAA---C-TTACAACAAG-ACG----TG----C--AAT-GT---T-AGAA----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AG-AAA--A------A---T--AA---TTTTC-C-----------G-T--TCA-T--A--TT----T--G-T--ATTTT
gi|19 : -GT---T-AGAA----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AT-AAA--A------T---T--AT---TTTTTTG-----------G-T--TCA-T--A--TT----T--G-T--ATTTTT--TGTAGG--T-G---TG-A-CAC---T--CC-T-T--CATCTT-CAG-G-G-AT------T--TG-
gi|2 : c--TTAAC-AGTATGATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----ATA-GAG-CGGGATA-T---------AAT--T--C--G---T--GAG-ACCGTG---A---T-AC-ATA------TAAAATTT----C--AAA--CGATA-GA-TGTAC--T----AA-G-A----CCA----A-G--G-CATTTTTCAAAG--------TATG---TCAG---AA---G--AAAT---CTAA---TCTA--TGAA-AAAAT----ACG---A-T--AAT---GAAGATGA------T-GAG--CGC--TGA----------CT-T-TGA-ACA---C-T-------AA--CG----TT--TTA--AAT-GTGTAT-AGAAT---AA--A-G---GCGAACT-------A--TAA----CTATTTAA-AC-GAA--T------A---T--AT---TTTTC-GTCT--------G-T--TTT-C--A--TTATTGT--G-TTTATTTTT--TGTAAAACT-G---TG-A-CATCTTT--CCATGT--CATTTT-CAG-C-G-GTGATTTTT--TG-TTTC-TTG--------GTAA---A-AA--C---C--T-AGCAG--A--TG------AGCTTA---------GGGTACACC-------G---CTTG-----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----GTCTATTTTTTCG-T-AA---T---GAA-TAT---TCTG--CTCATA--CAG-TATTACT---A-T-CCA-----ACCTCC----T-----------C-G--ACA--------ATT----TGTTGA-AAG-A-TTT--ACGCATTTATTTCG-T-------AT-TT-TTAAGT--TCC--T------A-----GATTTATCTTTGCATATGTTAA---A---TGGAC-T-AGTACTT-A---AA-AT-T---T-AGTTTAGGA-AT-C----CGG----G--ATCC-GTGTTATTA-TA-TCC-GA--AA----AGTGATATACT-AC---G-----------GGA--AAATTTG-T---GT---AA----A----A--AT--GAGCTTT-T-----------------ACT--GGCGCA-----CC-A-TTTAG-A-TCG-T-T------TATAAAA-G-------A--------ACTAAA------GATATGA--G-GCATTTA--ACT-CTT---A-C---C-AAT-T-TCTGCCTCCTCTT--TA-G-ATTAG-AA----ATCTTTTA-----------------AAT-GCTCTAAGAT-TC--------A--------------AGCCT-CCAGAAGTC-CCTATAAGAGGG-C-CGTGCATAAAA-ATGA-TGTCT-ACT-AC-GGTC-C-CA---ATT---TATT--A-TT-T-TAGATTT---GTGTA---CG-TT----ATAAAGA-----TAAGGTCATTAAATCCCTAACGA-TGG-TTTGATCG--AAAATCGAGCATGATAT---------AAAA
gi|20 : aaatctggtattatgttataataacataatataaataatagaacctacagattcgctcaaaaagtaggcacacGAACAAAA--AGAGAG--GGCT-TTT---CGAtataaggggagaaagcattgaaagacatggaaagagacttatttccaaaatttttatagcgttcctacgcttcctgtaagattgtcttctttcgaggagatgaccatatttc
gi|3 : aagaataactagacctttttgtcactCT--T--AAA--AT--TATTTT--T----GTTA-AAAAAA----------T-----T-----GTTTA--AAATATATATTTTTG--CTG-TA--------AT----AAA---AAA-----T--------------A-------------------TA--T------AA--AGAAAAGAAAAAAAAAA-------TG----C-AA-T-C-GTAAAAT-----T------GTTCAAA-TT--T---A-AGTA--ATT-T-GAT-AG-TG-----------CTAACTCACAC--GAG-TG----ACT---------TAC--T--CA-G---TTCGAG-A---TGG--A---G-AA-ATT------TAAA--TT----C---AC--C-ATT-AA-TT-AC--T----AA-G-G----CTA----A-G--T-CATT---CTAAT---------AAACTCTCACT-CAATTTA--ACATACATCAAAAATTCAAATTAA-AAAAGCAAGA-----A-T--AA-----AAGAT-AA-----T-G----TGC--TGA-A--A-----TA-T-ATA-AAA---C-T-------A---CG----GT--TCTTTAAT-GT---TTAGAA----AA--A-A---G--AA-T-------ACTTA-----CG-----A-AT-AAA--ATTAGATA---T--AG---TCGAC-G-----------G-T--TCA-TTTA--TT----TTTG-T--ATTTTT---GTAAA--T-G---TG-A-CAC---T--CC-TAT--CATTTT--AG-G-G-AT------T--TGGTTTC-T-G--------G--A---ATAA--CGAATAGT-AGCAG--A--TAAG--A-AA--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----AC--TT-TT---T---G---TTCG--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---GAA-TAT-A-ATTGGCC----A--AAG-T-T---C---G-T-C-A-----ATTTCC--T-C-----------C-G--A-GTCACGCA-GTG----TGT-GA-AAG-A-TTT--A-GC-TCG-TTTCT-A-------AA-TT-CAA-TT--TTC--TCCTCCTG-----A--------------------A---A---TG-AC-C-A-----C-T---AA-TT-T---TTAG------G-A--C----CGA----A--AACC-GTGA-A--A-AA-CCGCAA--AG----TGC-------TGAC---A-----------GAATTA----TA-AATCGT---AA----T----ATTATC-GC----T-TTTTTTG-----------A----GC---A-----CA-A-TT-AAAT-TCA-T-T------TAAAAAATA-------A--------G---AA------GA---GT--G-A----TA---CT-CTTTTTA-C---A-AAC-T-T-----------T--TA-GCA--GG-AA----GAA----A-----------------AAT-A--------T-TT--------AGTGTTCTAAATTTCAGCTT-CCAGAAGTC-CCT-TAAG-GGG-T-C-------AAA-ATTCATG--C--CT-AC-GG-C-TGCATAT-TG---TTTT--A-A--T-TGC--TC---G-------CGTCTTTCGATAAAAAATACCC----TAA-TCAATTATTAAG-A-CAG-TTT----GCAAAAGTC-----CGAT-T---------AAAAAA
gi|3 : ATCAATTATTAAGA-CAGTTTGCAAAAGTCCG--ATTAAAAAA------TTAAGAAAAGTCTGTTTAGAGACCGACAGAATATTATTGCAA-ATAT---AGCCCCTACAGAttaagaaaagtctgtttagagaccgacagaatattattgcaaatatagcccctacagattctaatttctctgtggagattatatttc
gi|4 : cttaaaattatttttgttaaaaaaattgtttaaaatatatatttttgctgtaataaaaaatatataaagaaaagaaaaaaaaaatgcaatcgtaaaattgttcaaatttaagtaatttgatagtgctaactcacacgagtgacttactcagttcgagatggagaaatttaaattcaccattaattactaaggctaagtcattctaataaactctcactcaatttaacatacatcaaaaattcaaattaaaaaagcaagaataaaagataatgtgctgaaatatataaaactacggttctttaatgtttagaaaaaagaatacttacgaataaaattagatatagtcgacggttcatttatttttgtatttttgtaaatgtgacactcctatcattttagggatttggtttctggaataacgaatagtagcagataagaaataggtcaccgctgactttttgttcgtttagacatgctgaatataattggccaaagttcgtcaatttcctccgagtcacgcagtgtgtgaaagatttagctcgtttctaaattcaattttctcctcctgaaatgaccactaatttttaggaccgaaaaccgtgaaaaaccgcaaagtgctgacagaattataaatcgtaatattatcgctttttttgagcacaattaaattcatttaaaaaataagaagagtgatactctttttacaaacttttagcaggaagaaaaatatttagtgttctaaatttcagcttccagaagtcccttaaggggtcaaaattcatgcctacggctgcatattgttttaattgctcgcgtctttcgataaaaaataccctaAACAAAA--CACTAGATGGCT-TTT---CGACCCTCC--AAA--GAGATATTTT--TTATAGA-G-GGAAAAGTATGCATTCT-----T-----ATT-A--AAATAT------TTGCCCCA-AAAAGTC---AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------TA--A------------Attctaatttctctgtggagattatatttc
gi|4 : ccgccgaaactcaCAAAA--AAA-------CTATTT---AAACCA--C--AAAA-GA--TATT--------------AAGAAA----------C-----C-----A---A--AAA-AT------T----CCA-AATCCGTTTTAA----A-------------T--------------A-------------------TGCGT------AA--A------------AAAG-------T-----C-AACT-T-ACAAA-------T------G--------------AA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-TATACTCTAAATCCTAA-----A---G-G-CG----A-TGGATATTAAAGC--TTTC--G---T--T-G-A---AG---AATCG-AC-ATACAATACTAAA--TT----C--AACACCGATA-GAAT--AC--TCCTAAATG-A----G-A----ATG--GTCG-----CAAAT--------TAAAAT-TCAA---AA---A--AAAT---T-----ATTTA----AATAAAGG----A-----A-T--AATTGCAAAGAT-AGAAGAAT-GA---TGCATTGA-A--ACATTATT-TATGA-AAGAATC-T-------AA--CT----TT--CCG--CAT-ATCCTT-AGAA----AA--A-AAAAG--AA-CGCCACTAA--TA-----C------A-AT-AAA--A------AA--T--AAGA-TTTTC-GAAATCTACAGAG-T--TCA-T--A--TT-------G-T--ATTTTTACTGTAAA--T-G---TGGA-CAT---TT-CC-T-TA-CATTTT-CAG-GCG-AT------T--C---TTC-T-GTCCCGGGTG--A---A-AA--C---AA-T-AGCAG--A--TA-G--A-GT--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----GCATTT-TT---CT--GAACTTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GCA--TATGAAA-T-T-A-TTTG--C----A--AAG-T-TT--C---ATT-C-A-----ACTTCC--GAA-----------CGG--A-GGATTTCGAATT----TAT-GA-AAG-A-TTT--A-G--TCT-TTTCGTT-------AATTT-CAA-TT--TTC--C------ATAGCGG--------------------AAACA---TG-ACTT-A-----TCC---AA-AT-T---G-AG------A-A--CACCGCGGAAAAA--A----GTGAC---A-AA-CCG-GACGAG----TGTC------T-AC---A-----------GGGA-A----TATG---GT---AATTCCT----AC-AT--G-----T-T-----------------ATTTCGG---A-----CC-ACTT-AT-A-TTG-T-TATAGGATATAAAA-AT------AAGACAATTA---AA------GA---GA--G-AT---TA--ACTCCTT---A-CTCAG-AAC-T-T-----------T--TA-G-AG-AG-AATGC-A------A-----------------AAT-C--------T-TT--------ccacaaaagatattaagaaaccaaaaaattccaaatccgttttaaatatgcgtaaaaaagtcaacttacaaatgaaagtaatttgatagtatactctaaatcctaaaggcgatggatattaaagctttcgttgaagaatcgacatacaatactaaattcaacaccgatagaatactcctaaatgagaatggtcgcaaattaaaattcaaaaaaaattatttaaataaaggaataattgcaaagatagaagaatgatgcattgaaacattatttatgaaagaatctaactttccgcatatccttagaaaaaaaaagaacgccactaatacaataaaaaataagattttcgaaatctacagagttcatattgtatttttactgtaaatgtggacatttccttacattttcaggcgattcttctgtcccgggtgaaaacaatagcagatagagttaggtcaccgctggcatttttctgaactttgtttagacatgcatatgaaattatttgcaaagtttcattcaacttccgaacggaggatttcgaatttatgaaagatttagtcttttcgttaatttcaattttccatagcggaaacatgacttatccaaattgagaacaccgcggaaaaaagtgacaaaccggacgagtgtctacagggaatatggtaattcctacatgttatttcggaccacttatattgttataggatataaaaataagacaattaaagagagattaactccttactcagaacttttagagagaatgcaaaatcttttaattctaa
gi|5 : ccgccgaaactcaaacaaaacactagatggcttttcgaccctccaaagagatattttttatagagggaaaagtatgcattcttattaaaatatttgccccaaaaagtAACAAAA--CACTAGATGGCT-TTT---CGACCCTCC--AAA--GAGATATTTT--TTATAGA-G-GGAAAAGTATGCATTCT-----T-----ATT-A--AAATAT------TTGCCCCA-AAAAGTC---AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------TA--A------------Ataattctaa
gi|5 : ccgccgaaactcaCAAAA--AAA-------CTATTT---AAACCA--C--AAAA-GA--TATT--------------AAGAAA----------C-----C-----A---A--AAA-AT------T----CCA-AATCCGTTTTAA----A-------------T--------------A-------------------TGCGT------AA--A------------AAAG-------T-----C-AACT-T-ACAAA-------T------G--------------AA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-TATACTCTAAATCCTAA-----A---G-G-CG----A-TGGATATTAAAGC--TTTC--G---T--T-G-A---AG---AATCG-AC-ATACAATACTAAA--TT----C--AACACCGATA-GAAT--AC--TCCTAAATG-A----G-A----ATG--GTCG-----CAAAT--------TAAAAT-TCAA---AA---A--AAAT---T-----ATTTA----AATAAAGG----A-----A-T--AATTGCAAAGAT-AGAAGAAT-GA---TGCATTGA-A--ACATTATT-TATGA-AAGAATC-T-------AA--CT----TT--CCG--CAT-ATCCTT-AGAA----AA--A-AAAAG--AA-CGCCACTAA--TA-----C------A-AT-AAA--A------AA--T--AAGA-TTTTC-GAAATCTACAGAG-T--TCA-T--A--TT-------G-T--ATTTTTACTGTAAA--T-G---TGGA-CAT---TT-CC-T-TA-CATTTT-CAG-GCG-AT------T--C---TTC-T-GTCCCGGGTG--A---A-AA--C---AA-T-AGCAG--A--TA-G--A-GT--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----GCATTT-TT---CT--GAACTTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GCATATG--AAA-T-T-A-TTTG--C----A--AAG-T-TT--C---A-TTC-A-----ACTTCC--G-AACGGAGGATTTC-G--A----------ATT----TAT-GA-AAG-A-TTT--A-G--TCT-TTTCG-TT------AA-TTTCAA-TT--TTC--C------ATAGCGG--------------------A---AACATG-AC-TTA-----T-CC--AA-AT-T---G-AG------A-A--CACCGCGG----A--AAAAAGTGACA--A-A--CCG-GACGAG----TGTC------T-AC---A-----------GGG--AA---TATG---GT---AA----TTCCTAC-AT--G-----T-T-----------------ATTTCGG---A-----CC-ACTT-AT-A-TTG-T-TATAGGATATAAAA-ATAAGACAATT------A---AA------GA---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-A-T-----------T--TA-G-A--GG-AA----G------A-----------------AAT-C--------T-Tccacaaaagatattaagaaaccaaaaaattccaaatccgttttaaatatgcgtaaaaaagtcaacttacaaatgaaagtaatttgatagtatactctaaatcctaaaggcgatggatattaaagctttcgttgaagaatcgacatacaatactaaattcaacaccgatagaatactcctaaatgagaatggtcgcaaattaaaattcaaaaaaaattatttaaataaaggaataattgcaaagatagaagaatgatgcattgaaacattatttatgaaagaatctaactttccgcatatccttagaaaaaaaaagaacgccactaatacaataaaaaataagattttcgaaatctacagagttcatattgtatttttactgtaaatgtggacatttccttacattttcaggcgattcttctgtcccgggtgaaaacaatagcagatagagttaggtcaccgctggcatttttctgaactttgtttagacatgcatatgaaattatttgcaaagtttcattcaacttccgaacggaggatttcgaatttatgaaagatttagtcttttcgttaatttcaattttccatagcggaaacatgacttatccaaattgagaacaccgcggaaaaaagtgacaaaccggacgagtgtctacagggaatatggtaattcctacatgttatttcggaccacttatattgttataggatataaaaataagacaattaaagagagataactcttacaaacatttagaggaagaaatctt
gi|6 : ccgccgaaactcaaacaaaacactagatggcttttcgaccctccaaagagatattttttatagagggaaaagtatgcattcttattaaaatatttgccccaaaaagtGAACAAAA--AAATAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--AAA--GA--TATTTT--T----GA-ATAAAAAA----------T-----T-----A---A--AAATAT------TTG--CCA-AA--------AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---C------AA--A------------ACAA-------T-----C-AA-T-C-GTAAA-------T------GTC---A-TT--TTAAA-AGTA--ATT-T-CAT-AG-T------------CTAA-----A---GAA-CG----A-T---------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG---A---G-AC-ATA------TAAA--TT----C--TAC--C-ATA-GA-T--AC--T----AA-G-A----C-A----A-G--G-TATT---CAAATACCCG---TGTAATCTCAAT-AGA---A--AAAT---TCAAAAATTCA--TTAA-AAAAG----A-----A-T--AAT---AAAGAT-A------T-GA---TGC--TGA-A--A-----TT-T-TGA-AAA---C-T-------AA-ACG----TT--TTT--AAT-GT---T-AGCG----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AT-AAA--A------A---T--AA---TTTTC-G-----------G-T--TCC-T--A--TT----T--G-T--ATGTTT--TGTAAA--T-G---TG-A-CAC---T--CC-T-T--CATCTT-CAG-G-G-AT------T--TG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T-AGTAG--A--TA-G--A-AG--TA---------CG-T-CATT-------G---CT-A-----AC--TC-TT---TT--G---CTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-A-ATTG--C----A--AAG-T-TT--T---G-T-C-A-----ATTTCC--G-T-----------C-G--A-G--------ATT----TGT-GA-AAG-A-TTT--A-GC-TTT-TTTCG-T-------AC-TT-TTA-TT--TTC--T------A-----G--------------------A---A---TG-AC-T-A-----T-C---AA-AT-T---T-AG------A-A--C----CGA----A--A----GTGACA--A-AA-CCG-GA--AA----AGT-------T-AC---A-----------GGG--A----TA-G---GT---AA----T----A--AT--GA----T-T-----------------A----GG---A-----CC-A-TT-AG-T-TCA-T-T------TATT-AA-A-------A--------A---AA------GG---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-T-T-----------T--TA-G-A--AG-AA----G------A-----------------AAT-A--------T-TC--------A--------------AGCCC-CCAGAAGTC-CCT-CAAA-GGG-T-GA-----AAAA-GT---TG--C-ACC-AC-AG-C-C-CATATATT---TTTT-----T-T-TAA--TT-----GAA---CGACTG---ATAAAGA-----T----TCA-T-AATCACTAA--A-CGG-TTT----G--AAAATC-----CGATAT---------AAAAAAGTTGGAGTGATAAAGATTCAT-AATCACTAAA--CGG-TT-TGAAAATCCG--AT------A------T--AAAAAAGTT------GGAGTTGAAAGA---TTATTTCGA---ATTCTAGCCCCTACAGA
gi|7 : AAAA--AAATAG--GGCT-TTT---TCACCT--C--AAA--GCC-TATTTG--T----AA-C-GAAAAA----------TATCTCT-----T---A--AATGAC------TTG--CCA-TA--------AA----AAA---GAC-----CCATAAAAAAGCCAGA-------------------T---TCCAAAAAA--A------------AAAA-------TT----C-AA-T-C-GTAAA-------A------GTC---C-AC--TTAAA-AGTA--ATTCT-GAG-AGAT------------CTAA-----G---AGG-CG----A-TA--------AACCGT--T--G---T--GAG-AAT-CG---A---ATACAATA------TAAA--CTCAAAC--GAC--C--TA-GA-T--AC--C----TA-G-AGCCCC-AGCACA-GCCG-CATT----AAA----C----CAT----TCAAC-GAA---ATTAAAT---TTAA----CCA--CC---AACAG----A-----ACT--AATC--GAAG-C-A------T-GA---TGC--TGATC--A-----TT-T-GGGCAAA---CTT-------AA-ACG----TTCGTCC--ACTCGT---T-AGAACCACAG--A-A---G--AA-TCAG----A--GG-----C------A-AT-AAA--A------A---T--AA---CTTTC-G-----------G----TCA-T--GATTT----T--G-T--ATTGTT--TGTAAA--C-G---CG-A-C-C---T--CC-TCT--CATTTTCCAG-G-GAAT------T--CG-TTTC-T-G--------G--ACGGA-AAATC---TA-T-AGCAG--AGTTA-G--AGAG--TA----------G-T-CACC-------G---CT-G-----AC--TT-TTGCCTTTGG---TTTGC-T-TTAG---G---A------CA-T-GC---T---AAAGTAT-C-ATTG--C-------AAG-T-TTTCC---A-T-CAA-----ACTTCC--G-A-----------C-GGAA-G--------ATTC---CGT-GACAAGAA-TTT--A-GC-TTT-TTTCT-A-------AA-TT-CAA-TT--CTCATC------C-----G--------------------A---A---TGAAC-T-AC----T-C---AACAT-T---T-AG------A-A--C----CGG----AC-A----GTG-CA--A-AA-CCG-GACCAG----TGT-------T-AC---A-----------GGG-------TA-G---GCTA-AA----T----A--AT--GA----TCC-----------------A----GG---A-----CCAA-TC-AA-TCTTGTT-T------TAACAAA-A-------G--------ATACAA------G----GA--G-A----TA--ACT-CTTA--A-CA--A-AAC-TCT-----------T--TACG-ACCAG-AA----G------T-----------------AAT-C--------T-T
gi|8 : tcttttctggtctgccggaccaGAACAAAA--AAATAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--AAAAGAA--TATTTTTGT----GA-A-AAAAAATTC-------T-----T-----A---A--AAATAT------TTG--CAACGA--------AA----AAA---AAC-----T--------------ATAGAAAAACAAAAAAAAGAT---T------AAACA------------AAAA-------TTCAACC-AA-T-C-GTAAA-------A------GTC---A-AC--TTAAA-AGT---ATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----A---GAGCCG----A-TA--------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG---A---T-AC-ATA------TAAA--TT----C--ATC--G-ATA-GA-T--AC--T----AA-GAA----C-A----A-G--G-C--------AAT---T-----------------------A--AAAT---TCAAAAATTAAT-TTAA-AAAAA----G-----A-T--AATG--GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGACC--A-----TT-T-GAA-AAA---C-T-------AACACGTCT-TT--TCC--CAT-GT---T-AGAA----AAACA-G---A--AA-T-------A--TA-----C------ACATAAAA--A------A---T--AAATTTTTCC-G-----------G-T--TC--T--A--TT----T--GTT--ATTTTT--TGTAAA--T-GCCTTG-A-CAT---T--CT-T-C--AATTTT-CA--G-G-AT------T--TG-TCTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-TAAGCAG--A--TA-GACA-AG--TA---------GG-TCCACC-------GAGCCC-G-----AC--TTGTT---TT--G---TTGT--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-A-TTTG--C----A--AAGTT-TT--C---A-TAT-ATAAACACTACC--T-C-----------C-G--A-C--------ATT----TGT-GA-AAG-A-TTT--A-GCTTTT-TTTCG-TA------AA-TT-CAATTT--TTC--T------A-----G------------------------A---TG-A--T-A-----T-CT--AG-AA-T---T-AG------AGA--C----TGG----A--A----GTGACA--A-AA-CCG-GA--AG----TGT-------TAAC---A-----------GGG--AC---TA-G---GT---AA----T----A--AT--GA----T-T-----------------A----GG---A-----CC-A-TA-AT-T-TTG-T-T------TATAAAA-A-------AATAT----A---AA------GA---GAAGA-A----TAGTACT-CTT---A-C---ACAACAC-T-----------T--TAGG-A--AGTAA----G------AAC---------------AAT-C--------TGTT--------A--------------Agttaatttctaatattccag
gi|9 : taaataataaacctagaattccttttttggtctcc-A-AAAAAA----------T-----T-----C---TTTAAATAT------TTG--CCA-AA--------AATATAAAA---AAA-----G--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAAAT-----T-----C-AA-TTC-GTAAAAAAAAAATAAAAAGGTC---AACT--TTAAA-AGTA--ATC-T-TGT-AT-C------------TTAA-----ACAAGAG-CG----A-T---------AAC--T-----G---T--GAG-A---TG-------T-AC-A-A------TAAA--TT----C--AAC--G-ATA-GA-T--ACC-T----AA-G-A----A-A----T-G--G-CA---------------------GATT------------A--AAAT---TCAAA---T----TTAA-TAAAA----G-----A-T--AAT---GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGC-ATTT-----TT-T-TG--AAA---C-T-------AA-ACG----TT--CC----AT-GT---T-AGAA----AA--A-A---G---A-T-------A--TA-----C------A-AT-AAAACA------A---TAAAA---TTTTC-G-----------G-TTCTCA-T--A--TT----T--G-T--ATTTTT--TGTAAAT-T-G---TG-A-CAT---T--CC-T-T--CA--TT-CA--G-G-AT------G--TG--TTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T--GCAG--A--TAGG--A-AG--TA----------G-T-CACC-------G---CT-GC----AC--TT-TT---TG--T---TTTG--TATTA----G---A------CA-T-GC---T----AA-TAT-A-TCTG--CA---A--AAG-T-TT--C---A-T-C-A-----ACTTCCG-G-A-----------G-G--A-G--------ATTTTTGTGT-GA-AAG-ATTTT--A-GC--TT-TTTCG-T-------AATTT-CCA-AA--TTC--T------A-----GA-------------------A---A---TG-AC-T-A-----T-C---AA-A------T-AG--------A--C----CGG----AACA----GTGACA--ACAA-CCG-GA--AAAAGTGGT-------T-AG---ATG---------GAG--A----TAGG---GT---TA----T----A--AT--GA----T-T-----------------A----GG---A-----CC-ATTT-AA-T-T-G-T-T------T-TAAAA-A-------AAT------A---AA------GA---GA--GTA----TA--ACT-CTT---A-C---A-AA--T-T-----------T--TA-G-A-----GA----G------A-----------------AATCT--------T-TT--------A--------------AGtttctaatattacc
Alignments
lowQualScore : 11 11 11 22222222222222 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 4444444444444444444444444444 444444444444 111111111 333333333 11111 22222222222222 111111 2222222222 1111 1111111 111111 88888888888888888888888888888888888 222222222222222222222 1111111111 222 222222 111 11 22222222 1111 111 1111111 11 1111 1111111 111 1111 11111 2222222 111111111111 2222222222 111 33333333333 11 1111 111111111 22222222 1111 111111111 11111111111 11111 111 1111 11111111111111 4444444444444444444444444444444 1111111 111 55555555555555555555555555555555555555555555 1 11111111111 1111111111111111 3333 111111 1 1111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111111 1 22222222 2222222222222222 1111 111 11111 11111111111 11111 22222 88888888888888888888888888888888888888888888888 2222222222 222 11111 1111 222 888888888888888888888888888888888 4444444444 2222 1 2222222 22222 444444444 111 33333 11 22222 11 1 11 3333 88888888888888888888888888888888888888888 3333333333 1 111 333 111 22222 111
lowQualScore : 55 4 11 8 777 99 44 00 55 22222222222222 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 0 3 3 2222222222222222222222222222 3 44 3 3 3 3 222222222222 888888888 0 3 7777 3 333333333 44 22222 555 44 3 99999999999999 3 999999 77 1111111111 3 1111 7777777 6 3 000000 7777 6 44 6 44444444444444444444444444444444444 3 111111111111111111111 7777777777 3 44 000 3 444444 3 000 00 55555555 3 1111 3 666 3 1111111 00 4444 0000000 3 777 6 0000 44 33333 44 3 7777777 44 222222222222 3 3 5555555555 888 3 44444444444 3 44 44 3 77 88 6666 2 33 88 44 6 555 6 3 555 00 3 1111 3 3 6 3 000000000 44 3 3 44444444 44 555 3 44 666666 3 44 44 0000 3 44 333333333 3 6 44444444444 3 55555 88 3 555 44 000 77 3 0000 555 999999 3 3 9999999 3 333 44 7777 44 3 3 3 99 555 3 88888888888888 6666666666666666666666666666666 3 7777 3 3 3 77 3 6 3 3 7777777 222 77 3 3 44 99999999999999999999999999999999999999999999 0 6 3 88888888888 3 3 66666 4444444444444444 7777 3 2222 44 3 7 7 666666 3 0 7 666 2222 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 000000000 3 4 7 7777 1 44444444 0 55 7777777777777777 4 55 55 777 55 4 2222 55 4 111 4 22222 8 4 99999999999 55 8 8 11111 22222 55 44444444444444444444444444444444444444444444444 8 8 8 8 8888888888 8 555 33333 8 8 999 2222 0 222 666666666666666666666666666666666 0000000000 8 8 4444 0 5555555 55555 3 000000000 777 7 33333 88 11 44444 33 0 66 4444 11111111111111111111111111111111111111111 5555555555 0 0 777 2 555 6 666 11111 666
lowQualScore : .. . .. . ... .. .. .. .. .............. ................................................................................................................................................................ . . . . ............................ . .. . . . . ............ ......... . . .... . ......... .. ..... ... .. . .............. . ...... .. .......... . .... ....... . . ...... .... . .. . ................................... . ..................... .......... . .. ... . ...... . ... .. ........ . .... . ... . ....... .. .... ....... . ... . .... .. ..... .. . ....... .. ............ . . .......... ... . ........... . .. .. . .. .. .... . .. .. .. . ... . . ... .. . .... . . . . ......... .. . . ........ .. ... . .. ...... . .. .. .... . .. ......... . . ........... . ..... .. . ... .. ... .. . .... ... ...... . . ....... . ... .. .... .. . . . .. ... . .............. ............................... . .... . . . .. . . . . ....... ... .. . . .. ............................................ . . . ........... . . ..... ................ .... . .... .. . . . ...... . . . ... .... ............................................................................. ......... . . . .... . ........ . .. ................ . .. .. ... .. . .... .. . ... . ..... . . ........... .. . . ..... ..... .. ............................................... . . . . .......... . ... ..... . . ... .... . ... ................................. .......... . . .... . ....... ..... . ......... ... . ..... .. .. ..... .. . .. .... ......................................... .......... . . ... . ... . ... ..... ...
lowQualScore : 55 7 00 0 000 22 66 44 88 55555555555555 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 6 9 6 6 0000000000000000000000000000 3 66 3 3 3 3 111111111111 444444444 4 3 1111 3 333333333 66 66666 888 66 3 00000000000000 3 222222 99 8888888888 3 1111 7777777 7 3 000000 1111 7 66 7 99999999999999999999999999999999999 6 555555555555555555555 6666666666 3 66 000 6 555555 6 000 00 22222222 6 4444 6 444 6 8888888 22 1111 7777777 3 555 7 4444 66 00000 66 3 5555555 66 777777777777 1 1 3333333333 111 1 66666666666 1 22 22 1 33 55 5555 9 99 55 22 2 444 2 1 444 44 1 8888 1 1 2 1 222222222 66 3 3 22222222 66 888 3 66 888888 3 66 66 8888 3 66 333333333 3 7 33333333333 3 00000 55 1 444 22 888 33 1 4444 888 666666 3 3 3333333 3 888 66 1111 66 3 3 3 22 888 3 22222222222222 5555555555555555555555555555555 3 1111 3 3 3 99 3 7 3 3 5555555 555 99 3 3 66 99999999999999999999999999999999999999999999 0 7 3 66666666666 3 3 22222 5555555555555555 1111 3 5555 66 3 3 3 000000 6 9 3 444 7777 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 999999999 6 5 3 8888 4 44444444 8 55 3333333333333333 0 55 55 000 55 0 5555 55 0 000 0 55555 0 0 00000000000 55 0 0 66666 55555 55 00000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 0 0 8888888888 0 000 00000 0 0 222 6666 8 000 000000000000000000000000000000000 8888888888 0 8 8888 0 0000000 00000 2 000000000 555 3 33333 88 00 55555 88 0 55 0000 88888888888888888888888888888888888888888 5555555555 0 2 555 5 000 5 888 00000 222
consensus : GAACAAAA--AAATAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--AAA--GA--TATTTT--T----GA-A-AAAAAA----------T-----T-----A---A--AAATAT------TTG--CCA-AA--------AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAA-------T-----C-AA-T-C-GTAAA-------T------GTC---A-TT--TTAAA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----A---GAG-CG----A-T---------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG---A---G-AC-ATA------TAAA--TTCA----AC--C-ATA-GA-T--AC--T----AA-G-A----C-A----A-G--G-CATT---CAAAT---C----TATAATCTC---AA---AAAAAAT-TCAAAAATTCA--TTAA-----AAAAG----A-----A-T--AAT---GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGA-AA-----TT-T-T--GA-AAA---C-T-------AA-ACG----TT--TCN--AAT-GT---T-AGAA----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AT-AAAA------A---TAA---TTTTC-G-----------G-TT--C--A-T--A--TT-T--G-T--ATTTTT--TGTAAA--T-G---TG-A-CAC---T--CC-T-T--CATTTT-CAG-G-G-AT------T--TG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T-AGCAG--A--TA-G--A-AG--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-A-TTTG--C----A--AA-G-T-TT--C---A-T-------C-A----ACTTCC--G-A-----------C-G--AG--------ATT-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-TTT-TTTCG-T-------AA---TT--C-AA-TT--TTC--T------A-----G--------------------A---A---TG-AC-T-A-----T-C---AA-AT-T---T-AG------A-A--C----CGG----A-A----GTGACA--A-AA-CCG-GA--A---GTG-T-T-AC---A----GGG--A-----TA-------G---G-T---AA-------T----A--A-------T-GA----T-T---------A----GG---A-----CC-A-TT-AN-T-TCGT-T------TATA--AAAA------A--A------T-AA--AG--A---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-T-T-----------T--TA-G-A--AG-AA-----GA--AA------------T-C----T-TT------------------------AAGCCC-CCAGAAGTC-CCT-TAAG-GGG-T-CA-----AAAA-AT---TG--C-ACT-AC-GGC-C-C--ATATATT---TTTT--AGAT-T-TAA-TCGG--NA---CGACT----ATAAAGA-----T----TCA-TNAATCACTAA--A-CGG-TTT----G--AAAATC-----CGATAT---------AAAA---AAGTTGG-----AGC-AT--AAAGAT----TCAT--AA-TCACTAA-GACGGTTTG--CGAAAATC-----CG--AT------A------T-AAAA-----------AAAG--TT------G-AAGCC---GAAAGAG--TTATTTCNA-ATATTC---TAGC--CCCTACAGA
Reference ( family-3270 ) : GAACAAAA--AAATAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--AAA--GA--TATTTT--T----GA-A-AAAAAA----------T-----T-----A---A--AAATAT------TTG--CCA-AA--------AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAA-------T-----C-AA-T-C-GTAAA-------T------GTC---A-TT--TTAAA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----A---GAG-CG----A-T---------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG---A---G-AC-ATA------TAAA--TTCA----AC--C-ATA-GA-T--AC--T----AA-G-A----C-A----A-G--G-CATT---CAAAT---C----TATAATCTC---AA---AAAAAAT-TCAAAAATTCA--TTAA-----AAAAG----A-----A-T--AAT---GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGA-AA-----TT-T-T--GA-AAA---C-T-------AA-ACG----TT--TCN--AAT-GT---T-AGAA----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AT-AAAA------A---TAA---TTTTC-G-----------G-TT--C--A-T--A--TT-T--G-T--ATTTTT--TGTAAA--T-G---TG-A-CAC---T--CC-T-T--CATTTT-CAG-G-G-AT------T--TG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T-AGCAG--A--TA-G--A-AG--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-A-TTTG--C----A--AA-G-T-TT--C---A-T-------C-A----ACTTCC--G-A-----------C-G--AG--------ATT-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-TTT-TTTCG-T-------AA---TT--C-AA-TT--TTC--T------A-----G--------------------A---A---TG-AC-T-A-----T-C---AA-AT-T---T-AG------A-A--C----CGG----A-A----GTGACA--A-AA-CCG-GA--A---GTG-T-T-AC---A----GGG--A-----TA-------G---G-T---AA-------T----A--A-------T-GA----T-T---------A----GG---A-----CC-A-TT-AN-T-TCGT-T------TATA--AAAA------A--A------T-AA--AG--A---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-T-T-----------T--TA-G-A--AG-AA-----GA--AA------------T-C----T-TT------------------------AAGCCC-CCAGAAGTC-CCT-TAAG-GGG-T-CA-----AAAA-AT---TG--C-ACT-AC-GGC-C-C--ATATATT---TTTT--A-AT-T-TAA-TCGG--NA---CGACT----ATAAAGA-----T----TCA-TNAATCACTAA--A-CGG-TTT----G--AAAATC-----CGATAT---------AAAA---AAGTTGG-----AGC-AT--AAAGAT----TCAT--AA-TCACTAA-GACGGTTT---CGAAAATC-----CG--AT------A------T-AAAA-----------AAAG--TC------G-AAGCC---GAAAGA---TTATTTCGA-ATATTC---TAGC--CCCTACAGA
gi|1 : GAACAAAAGAAAATAG--GGCT-TTTTTACGACCT--CCAAAA--GAAATATTTG--T----GA-A-ACAAAT----------T-----TTCTATG---A--AAATCT------TTG--CC---A--------AA----AAA---ATC-----T--------------A-------------------T---A------AA--G------------AAGA-------
gi|1 : ttctttttgaagtctcc--C--AAA--AA--AATCTA--T----AA-A-GAAGAA----------A-----A-----A---A--AAATATAC----TAG--GTA-AG--------AG----AAATCAAAT-----T--------------GAGT----------------T---T------AA--A------------AAAAAAGATTTT-----C-AA-T-C-GTAAA--------------GTC---A-CT--T-AAA-AGTA--ATT-T-GATGAG-T------------CTAA---------GAG-CG----A-T---------AAC--T--CTCG---T--GAG-AGCTTGTATA---A-CC-ATA------TAAA--TTCA----AC--G-ATAAGA-T--ACC-T----AA-G-A----C-A----A-G--G-CATT----AAAT------------AT-TC---AC---AAAAAAT-T----AATT----TTAA-----AAAAA----ACCGATA-TCAAAT---GAAGAT-A------TAGA---CGC--TGA-CA-----TT-T-T--GA-AAAA--C-T-------AA-ACG----TT--TTA--AAT-GT---TCAGAA----AA--ATG---G--AA-T-------A--TAAAAATC------A-AT-AAAA------AAAATAA---TTTCC-G-----------T-TT--C--ACT--A--TT-G--A-T---TTTTT--TGTAAA--TTG---TG-AACAC---TTCCC-T-TGTCATTTC-----G-G-AT------TAATG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---CT-C-AGCAGCAA--TATG--A-AG--TA---------GG-T-CACC-----------CT-GG----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----G---A------CA-TCGC---T---AAA-TATTA-TTTG--C----ACCAA-G-T-TT--TCATA-T-------C-ACTTAACTCCC--G-A-----------C----------------T-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-TTT-TT-CG-T-------AAA--TT--C-AA-TT--TTTCAT------A-----G--------------------A---AC--TG-AC-T-A-----T-C---AA-AT-TATAT-AG------A-A--C----CGG----A-A----GTGACA--A-AAACCGTGA--A---GTG-T-T-AC---A----GGG--A-----AAAAAAGGGG---G-T---AAACAAAAAT----A--AGATTTTTT-GG----T-TTTAAAAAAAA----GG---ATGGATCC-AATT-AA-T-TCGT---------AAA--AAAG------A--A------T-AA--AGTGA---AA--G-A----TA--ACC-TCT---A-C---T-TAT-T-T-----------TATTA-G-A--AA-AATTAAGGT--AA------------T-C----C-TTTTAATTTCTAATATTTCGAGTATAAAGCCCTCCAGAA-TCACCT-TAAG-GGGCT-CA-----AAAA-AT---TG--CAACT-ACGGGC-C-C--A-ATATTTTCTTTT--AGATAT-TAA-TCGG--AAGCGTGAC-----ATAAGAA-----T----TCA-TCAATCACTaaaaaaaatatactaggtaagagaaatcaaattgagtttaaaaaaaaagattttcaatcgtaaagtcacttaaaagtaatttgatgagtctaagagcgataactctcgtgagagcttgtataaccatataaattcaacgataagatacctaagacaaggcattaaatattcacaaaaaattaattttaaaaaaaaccgatatcaaatgaagatatagacgctgacattttgaaaaactaaacgttttaaatgttcagaaaaatggaatataaaaatcaataaaaaaaataatttccgtttcactattgatttttttgtaaattgtgaacacttcccttgtcatttcggattaatgtttctggaaaacctcagcagcaatatgaagtaggtcaccctggacttttttgtttgtttagacatcgctaaatattatttgcaccaagttttcatatcacttaactcccgacttgtgaaagatttagctttttcgtaaattcaatttttcatagaactgactatcaaattatatagaaccggaagtgacaaaaaccgtgaagtgttacagggaaaaaaagggggtaaacaaaaataagattttttggttttaaaaaaaaggatggatccaattaattcgtaaaaaagaataaagtgaaagataacctctacttattttattagaaaaattaaggtaatccttttaatttctaatatttcgagtataaagccctccagaatcaccttaaggggctcaaaaaattgcaactacgggcccaatattttcttttagatattaatcggaagcgtgacataagaattcatcaatcactttaatgtttgtaataatgatttccatatactttgaaataattgtgaatttcttttaatcaggggtcattaacgttactcttagttgaaatgattgttcgcgaattaaaaaatatataataaaagttgaacgctgaaagctatt
gi|10 : ttctttttgaagtctccgaacaaaagaaaatagggcttttttacgacctccaaaagaaatatttgtgaaacaaattttctatgaaaatctttgcA-A-AAGAAA----------G-----G-----A---A--AAA-A--------------A-AA--------GA----AAA---AACGATATT--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAAAGAAAT-T-----C-AAAT-CAGTAAA-------TA-----GTC-----TTACTTAAATCGTA--ATT-TAGAT-AG-TAC----------TTAA-----A---GAG-CG----A-T---------AAC--T--C--GTGTT--GAGTA---TG---A---ATAC-ATA------AAAAG-TTCAAG--ACG-A-ATA-GATT--ACTAT----AA-G-A----C-A----A-G--G-CAAT---AAAAT-------------TTTC---A--------------AAGAATTAA--TTTA-----AGAAG----------A-T--AAT---TGAGAT-A------T-TGTATTGC--TGA-CA-----TTGT-T--GA-AAA---C-T-------AA-ATGACGTTT--TCC--ATC-TT---T-AGAA----AA--A-A---G-----T-------A--TA-----C------A-AT-AAAAAATAT-A---TAA---TTTTC-G-----------GTTT--C--A-T--ATTTT-T--G-T--A-TTGT--TGTAAA--T-G---TG-A-C-T---T--CC-T-T--CA-TTG-CAGTG-G-AT------TTCTG-TTTCAT-G--------G--A---A-AC--T---TA-T-AGCAG--A--TG-T--G-GA--TAACGACTTTTGG-T-CACCCGTTCTTA---TT-GATATTAC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTAATTGA---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-ATTTTG--C----A--AA-G-T-TT--C---A-T-------C-A----ACTTCCT-C-A-----------C-G--AC--------A-T-T----GT-GG-AAG-ATTTTAG-GC-CTT-TTTCG-T-------AA---TT--C-AA-TTTCTTC--T------A-----G--------------------AT--AT--TGTACTT-A-----T-CCATAA-AT-T---T-AG------A-T--C-----------A-ACTC-GTGACA--A-ttaatgtttgtaataatgatttccatatactttgaaataattgtgaatttcttttaatcaggggtcattaacgttactcttagttgaaatgattgttcgcgaattaaaaaatatataataaaagttgaacgctgaaagctatt
gi|11 : aaaaaaaaaaaaaaaaaataaaaaaaaaaaaa--TT-TT---TT--G---TTTGCCT-TTA----G---A------CAAT-GC---T---GAA-TAA-A-TT-G--C----A--AA-G-T-TT--C---A-TT------C-A----ACTTCCCCG-A-----------C-G--AG--------ATT-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-TTT-TTTCG-T-------AAAATTC--C-AA-TT--TCG--TA-----A-----A--------------------A---A---TG-A--T-AT----T-C---AA-ATAT---T-AG------A-AATC----CGG----A-AG---GTGACA--A-AA-CCG-GA--A---GTG-TAT-ACCATG----GGA--A-----TA-------G---G-TGTAAA-------T----A--A-------T-GA----C-T---------A----GA----------C-A-TTAAT-T-TCATAC------TATA--AAAA------A--A------T-AA--AG--A---GA--G-A----TA--A-T-CTT---ACC---A-AACTT-T-----------T--TA-GAA--AG-AAAC---GA--AA------------TCC----T-TT------------------------AAttgcgttagtgacaaaccg
gi|12 : actT-T--G-T--ATTTTT--TGTGAA--T-G---TC-A-CAC---T--CC-T-T--CCTCAT-CAG-G-A-AT------T--TG-TATC-T-C--------G--A---A-AA--C---TG-T-AGCAG--A--TA-G--A-AG--TA---------GG-T-CACC-------T---TT-G-----AC--TT-TT---GT--G---TTTG--T-TTA----A---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-A-ATTG--G----A--AA-G-T-TT--C---T-T-------T-A----ACTTCC--G-A-----------C-G--AG--------ATT-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-ACT-TTTCA-TACATGTCAA---TT--C-AA-TT--TTC--T------A-----A--------------------A---A---TG-AC-T-A-----T-A---AA-AA-T---T-AT------A-A--C----CGG----A-A----GTGTCA--A-AA-CCG-GA--A---GTG-T-T-AT---A----GGG--A-----TA-------G---A-T---TA-------C----A--A-------T-GG----A-T---------A----GG---A-----CC-A-CT-cagtttctaatattca
gi|13 : GACCT--T--AAA--GA--TATTTT--T----GA-A-AAAAAA----------T-----TCTT--A---A--AAGTTT------TTG--CCA-AA--------AA----AA------C-----T--------------A-------------------TAA-T------AA--A------------AAAA-------T-----CCAA-T-C-ATAAA-------T------GTC---AATT--TCAAA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----A---GAG-CG----A-A---------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG---A---A-AC-ATT------CAAA--TCCT----AC--C-ATA-AA-T--AC--T----AA-G-A----C-A----A-G--G-CATT---TAAAT---CTCCATGTAATCTCAATAA---AAAAAAT-TCAAAAATACA--TTTA-----AAAAT----A-----A-T--
gi|14 : AGCTC-ACAGAAGTC-CTT-AAAG-GGG-TCCA-----AAAATAT---TG--C-ACTAAC-GGCTC-C--A-ATATT---TCTTACA-AT-TGCAATTCGGGATA---TGA------ATAAAGA----------TCA-TAAATCACTAA--ATCGGTTTT----G--TAAATC-----CGGCATAAAAATCTAAAAA---AAGTTGA-----AGC--T--GAAAAT----T
gi|14 : -AT--AAAGAT-----CAT--AAATCACTAA-ATCGGTTT---TGTAAATC-----CGGCAT------AAAAATCT-AAAA-----------AAAG--TT------G-AAGCT---GAAA-A---TTATTTCTATATATTC---TAG---CTCTACAatttctatatattctagctctacatga
gi|15 : agctcacagaagtccttaaaggggtccaaaaatattgcactaacggctccaatatttcttacaattgcaattcgggatatgaA--GA--TATT---------AA-A-AAAAAAATGT------T-----T-----A---G--AAATAT------TTG--CCA-AA--------A-------------------C--------------A-------------------C---T------AA--A------------AAAT-------C-----C-AA-T-C-ATAAA-------T------TTC---A-TT--TAAAA-AGAT--GTT-T-GAT-AG-T------------CTAC-----A---GAG-TG----A-T---------AAC--T--C--G---T--AAG-A---GG---A---G-AC-AGT------TAAA--TTCT----AC--C-ATA-GG-A--AC--T----GA-G-A----C-A----A-G--G-CATT---TAAAT---CTCCATATAATCTC---tga
gi|16 : AACAAAA--AAACAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--ATA--GA--TATTTT--T---------AAAAAATGCT------T-----T-----A---A--AAAAAT------tata
gi|17 : gatgcatggaatgaagcatgtcatgtagcaaaataacatttagaaatataattctttttggtctcta-----C------A-AT-AAAA------A---TAA---TTTTC-G-----------G-TT--C--A-T--A--AT-T--G-T--GTTTTT--TGGGAA--T-G---TC-A-CAC---T--CC-T-T--CATCTT-CAG-G-G-AT------T--T--TATC-T-C--------G--A---A-AA--C---TG-T-CGCAG--A--TA-G--A-AG--TA---------GG-T-CTCC-------G---CT-G-----AC--TT-TT---TT--G---TTCA--T-T
gi|18 : AAG----A-----A-T--AAT---GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGA-AA-----TT-T-C--AA-TAA---C-TTACAACAAG-ACG----TG----C--AAT-GT---T-AGAA----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AG-AAAA------A---TAA---TTTTC-C-----------G-TT--C--A-T--A--TT-T--G-T--ATTTT
gi|19 : -GT---T-AGAA----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AT-AAAA------T---TAT---TTTTTTG-----------G-TT--C--A-T--A--TT-T--G-T--ATTTTT--TGTAGG--T-G---TG-A-CAC---T--CC-T-T--CATCTT-CAG-G-G-AT------T--TG-
gi|2 : c--TTAAC-AGTATGATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----ATA-GAG-CGGGATA-T---------AAT--T--C--G---T--GAG-ACCGTG---A---T-AC-ATA------TAAAATTTCA----AA--CGATA-GA-TGTAC--T----AA-G-A----CCA----A-G--G-CATTTTTCAAAG--------TATG---TC---AG---AAGAAAT-CTAA---TCTA--TGAA-----AAAAT----ACG---A-T--AAT---GAAGATGA------T-GAG--CGC--TGA--------CT-T-T--GA-ACA---C-T-------AA--CG----TT--TTA--AAT-GTGTAT-AGAAT---AA--A-G---GCGAACT-------A--TAA----CTATTTAA-AC-GAAT------A---TAT---TTTTC-GTCT--------G-TTTTC--A-TT-A--TTGT--G-TTTATTTTT--TGTAAAACT-G---TG-A-CATCTTT--CCATGT--CATTTT-CAG-C-G-GTGATTTTT--TG-TTTC-TTG--------GTAA---A-AA--C---C--T-AGCAG--A--TG------AGCTTA---------GGGTACACC-------G---CTTG-----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----GTCTATTTTTTCG-T-AA---T---GAA-TAT---TCTG--CTCATA--CA-G-TATTACT---A-T-------CCA----ACCTCCTCG-A-----------C-A--A----------TT-T----GTTGA-AAG-ATTT--ACGCATTTATTTCG-T-------AT---TT--TTAA-GT--TCC--T------A-----GATTTATCTTTGCATATGTTAA---A---TGGAC-T-AGTACTT-A---AA-AT-T---T-AGTTTAGGA-AT-C----CGG----G-ATCC-GTGTTATTA-TATCCG-AA--AA--GTG-A-T-AT---ACTACGGG--AAAATTTG-------T---G-T---AA-------A----A--A-------T-GAGCTTT-T---------ACT--GGCGCA-----CC-A-TTTAG-A-TCGT-T------TATA--AAAG------A--AC-----T-AA--AG--ATATGA--G-GCATTTA--ACT-CTT---A-C---C-AAT-T-TCTGCCTCCTCTT--TA-G-A--TT-A------GA--AA------------T-C----T-TTTAAATGCTCTAAGATTC-------AAGCCT-CCAGAAGTC-CCTATAAGAGGG-C-CGTGCATAAAA-ATGA-TGTCT-ACT-AC-GGT-C-CCAATTTATTA--TTTT--AGAT-T-T-G-T--G--TA---CG-TT----ATAAAGA-----TAAGGTCATTAAATCCCTAACGA-TGG-TTTGATCG--AAAATCGAGCATGATAT---------AAAATATAAG--GGGAGAAAGC-ATTGAAAGA
gi|2 : aaatctggtattatgttataataacataatataaataatagaacctacagattcgctcaaaaagtaggcacac-AT--AAAGATAAGGTCATTAAA-TCCCTAACGATGGTTTGATCGAAAATCGAGCATG--AT------A------T-AAAATATAAGGGGAGAAAGCATT------GAAAGACATGGAAAGAGACTTATTTCCA-AAATTTTTATAGCGTTCCTACcatggaaagagacttatttccaaaatttttatagcgttcctacgcttcctgtaagattgtcttctttcgaggagatgaccatatttc
gi|20 : aaatctggtattatgttataataacataatataaataatagaacctacagattcgctcaaaaagtaggcacacttaacagtatgatttgatagtctaaatagagcgggatataattcgtgagaccgtgatacatataaaatttcaaacgatagatgtactaagaccaaggcatttttcaaagtatgtcagaagaaatctaatctatgaaaaaatacgataatgaagatgatgagcgctgactttgaacactaacgttttaaatgtgtatagaataaaggcgaactataactatttaaacgaatatatttttcgtctgttttcattattgtgtttattttttgtaaaactgtgacatctttccatgtcattttcagcggtgattttttgtttcttggtaaaaacctagcagatgagcttagggtacaccgcttgacttttttgtttgtttagtctattttttcgtaatgaatattctgctcatacagtattactatccaacctcctcgacaatttgttgaaagatttacgcatttatttcgtatttttaagttcctagatttatctttgcatatgttaaatggactagtacttaaaatttagtttaggaatccgggatccgtgttattatatccgaaaagtgatatactacgggaaaatttgtgtaaaaatgagcttttactggcgcaccatttagatcgtttataaaagaactaaagatatgaggcatttaactcttaccaatttctgcctcctctttagattagaaatcttttaaatgctctaagattcaagcctccagaagtccctataagagggccgtgcataaaaatgatgtctactacggtcccaatttattattttagatttgtgtacgttGAACAAAA--AGAGAG--GGCT-TTT---CGAgcttcctgtaagattgtcttctttcgaggagatgaccatatttc
gi|3 : aagaataactagacctttttgtcactCT--T--AAA--AT--TATTTT--T----GTTA-AAAAAA----------T-----T-----GTTTA--AAATATATATTTTTG--CTG-TA--------AT----AAA---AAA-----T--------------A-------------------TA--T------AA--AGAAAAGAAAAAAAAAA-------TG----C-AA-T-C-GTAAAAT-----T------GTTCAAA-TT--T---A-AGTA--ATT-T-GAT-AG-TG-----------CTAACTCACAC--GAG-TG----ACT---------TAC--T--CA-G---TTCGAG-A---TGG--A---G-AA-ATT------TAAA--TTCA-----C--C-ATT-AA-TT-AC--T----AA-G-G----CTA----A-G--T-CATT---CTAATAAAC----TCTCA-CTC---AATTTAACATACATCAAAAATTCAAATTAA-----AAAAGCAAGA-----A-T--AA-----AAGAT-AA-----T-G----TGC--TGA-AA-----TA-T-A--TA-AAA---C-T-------A---CG----GT--TCTTTAAT-GT---TTAGAA----AA--A-A---G--AA-T-------ACTTA-----CG-----A-AT-AAAATTAGATA---TAG---TCGAC-G-----------G-TT--C--A-TTTA--TT-TTTG-T--ATTTTT---GTAAA--T-G---TG-A-CAC---T--CC-TAT--CATTTT--AG-G-G-AT------T--TGGTTTC-T-G--------G--A---ATAA--CGAATAGT-AGCAG--A--TAAG--A-AA--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----AC--TT-TT---T---G---TTCG--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---GAA-TAT-A-ATTGGCC----A--AA-G-T-T---C---G-T-------C-A----ATTTCC--T-C-----------C-G--AGTCACGCA-GTG-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-TCG-TTTCT-A-------AA---TT--C-AA-TT--TTC--TCCTCCTG-----A--------------------A---A---TG-AC-C-A-----C-T---AA-TT-T---TTAG------G-A--C----CGA----A-AACC-GTGA-A--A-AA-CCGCAA--A---GTG-C-TGAC---A----GAATTA-----TA-------AATCG-T---AA-------T----ATTA-------TCGC----T-TTTTTTG---A----GC---A-----CA-A-TT-AAAT-TCAT-T------TA-----AAA------A--A------T-AAGAAG--A---GT--G-A----TA---CT-CTTTTTA-C---A-AAC-T-T-----------T--TA-GCA--GG-AA-----GA--AAAATATTTAGTGTT-CTAAAT-TT------------------------CAGCTT-CCAGAAGTC-CCT-TAAG-GGG-T-C-------AAA-ATTCATG--C--CT-AC-GGC-TGC--ATAT-TG---TTTT--A-A--T-TGC-TCG--------CGTCTTTCGATAAAAAATACCC----TAA-TCAATTATTAAG-A-CAG-TTT----GCAAAAGTC-----CGAT-T---------AAAA---AA
gi|3 : --AA-TTATTAA-GACAGTTTG--CAAAAGTC-----CG--ATTAAAAAA------TTAAGA-----------AAAG--TCTGTTTAG-AGACC---GACAGAATATTATTGCAA-ATAT------AGC--CCCTACAGAttaagaaaagtctgtttagagaccgacagaatattattgcaaatatagcccctacagattctaatttctctgtggagattatatttc
gi|4 : cttaaaattatttttgttaaaaaaattgtttaaaatatatatttttgctgtaataaaaaatatataaagaaaagaaaaaaaaaatgcaatcgtaaaattgttcaaatttaagtaatttgatagtgctaactcacacgagtgacttactcagttcgagatggagaaatttaaattcaccattaattactaaggctaagtcattctaataaactctcactcaatttaacatacatcaaaaattcaaattaaaaaagcaagaataaaagataatgtgctgaaatatataaaactacggttctttaatgtttagaaaaaagaatacttacgaataaaattagatatagtcgacggttcatttatttttgtatttttgtaaatgtgacactcctatcattttagggatttggtttctggaataacgaatagtagcagataagaaataggtcaccgctgactttttgttcgtttagacatgctgaatataattggccaaagttcgtcaatttcctccgagtcacgcagtgtgtgaaagatttagctcgtttctaaattcaattttctcctcctgaaatgaccactaatttttaggaccgaaaaccgtgaaaaaccgcaaagtgctgacagaattataaatcgtaatattatcgctttttttgagcacaattaaattcatttaaaaaataagaagagtgatactctttttacaaacttttagcaggaagaaaaatatttagtgttctaaatttcagcttccagaagtcccttaaggggtcaaaattcatgcctacggctgcatattgttttaattgctcgcgtctttcgataaaaaataccctaatcAACAAAA--CACTAGATGGCT-TTT---CGACCCTCC--AAA--GAGATATTTT--TTATAGA-G-GGAAAAGTATGCATTCT-----T-----ATT-A--AAATAT------TTGCCCCA-AAAAGTC---AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------TA--A------------Attctaatttctctgtggagattatatttc
gi|4 : ccgccgaaactcaCAAAA--AAA-------CTATTT---AAACCA--C--AAAA-GA--TATT--------------AAGAAA----------C-----C-----A---A--AAA-AT------T----CCA-AATCCGTTTTAA----A-------------T--------------A-------------------TGCGT------AA--A------------AAAG-------T-----C-AACT-T-ACAAA-------T------G--------------AA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-TATACTCTAAATCCTAA-----A---G-G-CG----A-TGGATATTAAAGC--TTTC--G---T--T-G-A---AG---AATCG-AC-ATACAATACTAAA--TTCA----ACACCGATA-GAAT--AC--TCCTAAATG-A----G-A----ATG--GTCG-----CAAAT--------TAAAAT-TC---AA---AAAAAAT-T-----ATTTA----AAT----AAAGG----A-----A-T--AATTGCAAAGAT-AGAAGAAT-GA---TGCATTGA-AACATTATT-TAT--GA-AAGAATC-T-------AA--CT----TT--CCG--CAT-ATCCTT-AGAA----AA--A-AAAAG--AA-CGCCACTAA--TA-----C------A-AT-AAAA------AA--TAAGA-TTTTC-GAAATCTACAGAG-TT--C--A-T--A--TT----G-T--ATTTTTACTGTAAA--T-G---TGGA-CAT---TT-CC-T-TA-CATTTT-CAG-GCG-AT------T--C---TTC-T-GTCCCGGGTG--A---A-AA--C---AA-T-AGCAG--A--TA-G--A-GT--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----GCATTT-TT---CT--GAACTTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GCA--TATGAAA-T-T-A-TTTG--C----A--AA-G-T-TT--C---ATT-------C-A----ACTTCC--GAA-----------CGG--AGGATTTCGAATT-T----AT-GA-AAG-ATTT--A-G--TCT-TTTCGTT-------AAT--TT--C-AA-TT--TTC--C------ATAGCGG--------------------AAACA---TG-ACTT-A-----TCC---AA-AT-T---G-AG------A-A--CACCGCGGAAAAA-A----GTGAC---A-AA-CCG-GACGA---GTG-TCT-AC---A----GGGA-A-----TAT------G---G-T---AATTCC---T----AC-A-------T-G-----T-T---------ATTTCGG---A-----CC-ACTT-AT-A-TTGT-TATAGGATATA--AAAAT-----A--AGACAATT-AA--AG--A---GA--G-AT---TA--ACTCCTT---A-CTCAG-AAC-T-T-----------T--TA-G-AG-AG-AATGC--AA--AA------------T-C----T-TT------------------------ccacaaaagatattaagaaaccaaaaaattccaaatccgttttaaatatgcgtaaaaaagtcaacttacaaatgaaagtaatttgatagtatactctaaatcctaaaggcgatggatattaaagctttcgttgaagaatcgacatacaatactaaattcaacaccgatagaatactcctaaatgagaatggtcgcaaattaaaattcaaaaaaaattatttaaataaaggaataattgcaaagatagaagaatgatgcattgaaacattatttatgaaagaatctaactttccgcatatccttagaaaaaaaaagaacgccactaatacaataaaaaataagattttcgaaatctacagagttcatattgtatttttactgtaaatgtggacatttccttacattttcaggcgattcttctgtcccgggtgaaaacaatagcagatagagttaggtcaccgctggcatttttctgaactttgtttagacatgcatatgaaattatttgcaaagtttcattcaacttccgaacggaggatttcgaatttatgaaagatttagtcttttcgttaatttcaattttccatagcggaaacatgacttatccaaattgagaacaccgcggaaaaaagtgacaaaccggacgagtgtctacagggaatatggtaattcctacatgttatttcggaccacttatattgttataggatataaaaataagacaattaaagagagattaactccttactcagaacttttagagagaatgcaaaatcttttaattctaa
gi|5 : ccgccgaaactcaaacaaaacactagatggcttttcgaccctccaaagagatattttttatagagggaaaagtatgcattcttattaaaatatttgccccaaaaagtAACAAAA--CACTAGATGGCT-TTT---CGACCCTCC--AAA--GAGATATTTT--TTATAGA-G-GGAAAAGTATGCATTCT-----T-----ATT-A--AAATAT------TTGCCCCA-AAAAGTC---AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------TA--A------------Ataattctaa
gi|5 : ccgccgaaactcaCAAAA--AAA-------CTATTT---AAACCA--C--AAAA-GA--TATT--------------AAGAAA----------C-----C-----A---A--AAA-AT------T----CCA-AATCCGTTTTAA----A-------------T--------------A-------------------TGCGT------AA--A------------AAAG-------T-----C-AACT-T-ACAAA-------T------G--------------AA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-TATACTCTAAATCCTAA-----A---G-G-CG----A-TGGATATTAAAGC--TTTC--G---T--T-G-A---AG---AATCG-AC-ATACAATACTAAA--TTCA----ACACCGATA-GAAT--AC--TCCTAAATG-A----G-A----ATG--GTCG-----CAAAT--------TAAAAT-TC---AA---AAAAAAT-T-----ATTTA----AAT----AAAGG----A-----A-T--AATTGCAAAGAT-AGAAGAAT-GA---TGCATTGA-AACATTATT-TAT--GA-AAGAATC-T-------AA--CT----TT--CCG--CAT-ATCCTT-AGAA----AA--A-AAAAG--AA-CGCCACTAA--TA-----C------A-AT-AAAA------AA--TAAGA-TTTTC-GAAATCTACAGAG-TT--C--A-T--A--TT----G-T--ATTTTTACTGTAAA--T-G---TGGA-CAT---TT-CC-T-TA-CATTTT-CAG-GCG-AT------T--C---TTC-T-GTCCCGGGTG--A---A-AA--C---AA-T-AGCAG--A--TA-G--A-GT--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----GCATTT-TT---CT--GAACTTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GCATATG--AAA-T-T-A-TTTG--C----A--AA-G-T-TT--C---A-TT------C-A----ACTTCC--G-AACGGAGGATTTC-G--A---------ATT-T----AT-GA-AAG-ATTT--A-G--TCT-TTTCG-TT------AA---TTT-C-AA-TT--TTC--C------ATAGCGG--------------------A---AACATG-AC-TTA-----T-CC--AA-AT-T---G-AG------A-A--CACCGCGG----A-AAAAAGTGACA--A-A--CCG-GACGA---GTG-TCT-AC---A----GGG--AA----TAT------G---G-T---AA-------TTCCTAC-A-------T-G-----T-T---------ATTTCGG---A-----CC-ACTT-AT-A-TTGT-TATAGGATATA--AAAATAAGACA--A------TTAA--AG--A---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-A-T-----------T--TA-G-A--GG-AA-----GA--AA------------T-C----T-Tccacaaaagatattaagaaaccaaaaaattccaaatccgttttaaatatgcgtaaaaaagtcaacttacaaatgaaagtaatttgatagtatactctaaatcctaaaggcgatggatattaaagctttcgttgaagaatcgacatacaatactaaattcaacaccgatagaatactcctaaatgagaatggtcgcaaattaaaattcaaaaaaaattatttaaataaaggaataattgcaaagatagaagaatgatgcattgaaacattatttatgaaagaatctaactttccgcatatccttagaaaaaaaaagaacgccactaatacaataaaaaataagattttcgaaatctacagagttcatattgtatttttactgtaaatgtggacatttccttacattttcaggcgattcttctgtcccgggtgaaaacaatagcagatagagttaggtcaccgctggcatttttctgaactttgtttagacatgcatatgaaattatttgcaaagtttcattcaacttccgaacggaggatttcgaatttatgaaagatttagtcttttcgttaatttcaattttccatagcggaaacatgacttatccaaattgagaacaccgcggaaaaaagtgacaaaccggacgagtgtctacagggaatatggtaattcctacatgttatttcggaccacttatattgttataggatataaaaataagacaattaaagagagataactcttacaaacatttagaggaagaaatctt
gi|6 : ccgccgaaactcaaacaaaacactagatggcttttcgaccctccaaagagatattttttatagagggaaaagtatgcattcttattaaaatatttgccccaaaaagtGAACAAAA--AAATAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--AAA--GA--TATTTT--T----GA-ATAAAAAA----------T-----T-----A---A--AAATAT------TTG--CCA-AA--------AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---C------AA--A------------ACAA-------T-----C-AA-T-C-GTAAA-------T------GTC---A-TT--TTAAA-AGTA--ATT-T-CAT-AG-T------------CTAA-----A---GAA-CG----A-T---------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG---A---G-AC-ATA------TAAA--TTCT----AC--C-ATA-GA-T--AC--T----AA-G-A----C-A----A-G--G-TATT---CAAATACCCG---TGTAATCTC---AATA-GAAAAAT-TCAAAAATTCA--TTAA-----AAAAG----A-----A-T--AAT---AAAGAT-A------T-GA---TGC--TGA-AA-----TT-T-T--GA-AAA---C-T-------AA-ACG----TT--TTT--AAT-GT---T-AGCG----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AT-AAAA------A---TAA---TTTTC-G-----------G-TT--C--C-T--A--TT-T--G-T--ATGTTT--TGTAAA--T-G---TG-A-CAC---T--CC-T-T--CATCTT-CAG-G-G-AT------T--TG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T-AGTAG--A--TA-G--A-AG--TA---------CG-T-CATT-------G---CT-A-----AC--TC-TT---TT--G---CTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-A-ATTG--C----A--AA-G-T-TT--T---G-T-------C-A----ATTTCC--G-T-----------C-G--AG--------ATT-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-TTT-TTTCG-T-------AC---TT--T-TA-TT--TTC--T------A-----G--------------------A---A---TG-AC-T-A-----T-C---AA-AT-T---T-AG------A-A--C----CGA----A-A----GTGACA--A-AA-CCG-GA--A---AAG-T-T-AC---A----GGG--A-----TA-------G---G-T---AA-------T----A--A-------T-GA----T-T---------A----GG---A-----CC-A-TT-AG-T-TCAT-T------TATT--AAAA------------------AA--AG--G---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-T-T-----------T--TA-G-A--AG-AA-----GA--AA------------T-A----T-TC------------------------AAGCCC-CCAGAAGTC-CCT-CAAA-GGG-T-GA-----AAAA-GT---TG--C-ACC-AC-AGC-C-C--ATATATT---TTTT-----T-T-TAA-TT-G--AA---CGACTG---ATAAAGA-----T----TCA-T-AATCACTAA--A-CGG-TTT----G--AAAATC-----CGATAT---------AAAA---AAGTTGG-----AGTGAT--AAAGAT----TCAT--AA-TCACTAA--ACGGTTT----GAAAATC-----CG--AT------A------T--AAA-----------AAAG--TT------G-GAGTT---GAAAGA---TTATTTCGA---ATTC---TAGC--CCCTACAGA
gi|7 : AAAA--AAATAG--GGCT-TTT---TCACCT--C--AAA--GCC-TATTTG--T----AA-C-GAAAAA----------TATCTCT-----T---A--AATGAC------TTG--CCA-TA--------AA----AAA---GAC-----CCATAAAAAAGCCAGA-------------------T---TCCAAAAAA--A------------AAAA-------TT----C-AA-T-C-GTAAA-------A------GTC---C-AC--TTAAA-AGTA--ATTCT-GAG-AGAT------------CTAA-----G---AGG-CG----A-TA--------AACCGT--T--G---T--GAG-AAT-CG---A---ATACAATA------TAAA--CTCAAACGAC--C--TA-GA-T--AC--C----TA-G-AGCCCC-AGCACA-GCCG-CATT----AAA----C----CAT--TC------A---ACGAAAT-T---AAAT-----TTAACCACCAACAG----A-----ACT--AATC--GAAG-C-A------T-GA---TGC--TGATCA-----TT-T-G--GGCAAA---CTT-------AA-ACG----TTCGTCC--ACTCGT---T-AGAACCACAG--A-A---G--AA-TCAG----A--GG-----C------A-AT-AAAA------A---TAA---CTTTC-G-----------G--T--C--A-T--GATTT-T--G-T--ATTGTT--TGTAAA--C-G---CG-A-C-C---T--CC-TCT--CATTTTCCAG-G-GAAT------T--CG-TTTC-T-G--------G--ACGGA-AAATC---TA-T-AGCAG--AGTTA-G--AGAG--TA----------G-T-CACC-------G---CT-G-----AC--TT-TTGCCTTTGG---TTTGC-T-TTAG---G---A------CA-T-GC---T---AAAGTAT-C-ATTG--C-------AA-G-T-TTTCC---A-T-------CAA----ACTTCC--G-A-----------C-GGAAG--------ATTCC----GT-GACAAGAATTT--A-GC-TTT-TTTCT-A-------AA---TT--C-AA-TT--CTCATC------C-----G--------------------A---A---TGAAC-T-AC----T-C---AACAT-T---T-AG------A-A--C----CGG----ACA----GTG-CA--A-AA-CCG-GACCA---GTG-T-T-AC---A----GGG--------TA-------G---G-CTA-AA-------T----A--A-------T-GA----TCC---------A----GG---A-----CCAA-TC-AA-TCTTGT-T------T-TAACAAAA------G--A------T-AC--AA--G---GA--G-A----TA--ACT-CTTA--A-CA--A-AAC-TCT-----------T--TACG-ACCAG-AA-----GT--AA------------T-C----T-T
gi|8 : tcttttctggtctgccggaccaGAACAAAA--AAATAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--AAAAGAA--TATTTTTGT----GA-A-AAAAAATTC-------T-----T-----A---A--AAATAT------TTG--CAACGA--------AA----AAA---AAC-----T--------------ATAGAAAAACAAAAAAAAGAT---T------AAACA------------AAAA-------TTCAACC-AA-T-C-GTAAA-------A------GTC---A-AC--TTAAA-AGT---ATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----A---GAGCCG----A-TA--------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG---A---T-AC-ATA------TAAA--TTCA----TC--G-ATA-GA-T--AC--T----AA-GAA----C-A----A-G--G-C--------AAT---T-----------------------AAAAT-TCAAAAATTAAT-TTAA-----AAAAA----G-----A-T--AATG--GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGACCA-----TT-T-G--AA-AAA---C-T-------AACACGTCT-TT--TCC--CAT-GT---T-AGAA----AAACA-G---A--AA-T-------A--TA-----C------ACATAAAAA------A---TAAATTTTTCC-G-----------G-TT--C----T--A--TT-T--GTT--ATTTTT--TGTAAA--T-GCCTTG-A-CAT---T--CT-T-C--AATTTT-CA--G-G-AT------T--TG-TCTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-TAAGCAG--A--TA-GACA-AG--TA---------GG-TCCACC-------GAGCCC-G-----AC--TTGTT---TT--G---TTGT--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-A-TTTG--C----A--AA-GTT-TT--C---A-TATATAAAC-ACT--ACCTCC--G-A-----------C--------------ATT-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GCTTTT-TTTCG-TA------AA---TT--C-AATTT--TTC--T------A-----G------------------------A---TG-A--T-A-----T-CT--AG-AA-T---T-AG------AGA--C----TGG----A-A----GTGACA--A-AA-CCG-GA--A---GTG-T-TAAC---A----GGG--AC----TA-------G---G-T---AA-------T----A--A-------T-GA----T-T---------A----GG---A-----CC-A-TA-AT-T-TTGT-T------TATA--AAAA------AATA------T-AA--AG--A---GAAGA-A----TAGTACT-CTT---A-C---ACAACAC-T-----------T--TAGG-A--AGTAA-----GAACAA------------T-C----TGTT------------------------AAgttaatttctaatattccag
gi|9 : taaataataaacctagaattccttttttggtctcc-A-AAAAAA----------T-----T-----C---TTTAAATAT------TTG--CCA-AA--------AATATAAAA---AAA-----G--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAAAT-----T-----C-AA-TTC-GTAAAAAAAAAATAAAAAGGTC---AACT--TTAAA-AGTA--ATC-T-TGT-AT-C------------TTAA-----ACAAGAG-CG----A-T---------AAC--T-----G---T--GAG-A---TG-------T-AC-A-A------TAAA--TTCA----AC--G-ATA-GA-T--ACC-T----AA-G-A----A-A----T-G--G-CA---------------------GATT------------AAAAT-TCAAA---T----TTAA-----TAAAA----G-----A-T--AAT---GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGC-AT-----TT-T-TTTGA-AA----C-T-------AA-ACG----TT--CC----AT-GT---T-AGAA----AA--A-A---G--A--T-------A--TA-----C------A-AT-AAAACA----A---TAAAA-TTTTC-G-----------G-TT--CTCA-T--A--TT-T--G-T--ATTTTT--TGTAAA--TTG---TG-A-CAT---T--CC-T-T--CATT---CAG-G---AT------G--TG-TT-C-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T--GCAG--A--TA-GG-A-AG--TA---------G--T-CACC-------G---CT-GC----AC--TT-TT---TG--T---TTTG--TATTA----G---A------CA-T-GC---T---AA--TAT-A-TCTG--C----A--AAAG-T-TT--C---A-T-------C-A----ACTTCC--GGA-----------G-G--AG--------ATT-TTTGTGT-GA-AAG-ATTTT-A-GC-TTT-TT-CG-T-------AA---TTTCC-AA-AT--T-C--T------A-----G--------------------A---AA--TG-AC-T-A-----T-C---AA-AT-------AG------A----C----CGG----A-ACA--GTGACA--ACAA-CCG-GA--AAAAGTGGT-T-AG---ATG--GAG--A-----TA-------G---GGT---TA-------T----A--A-------T-GA----T-T---------A----GG---A-----CC-ATTT-AA-T-T-GT-T------T-TA--AAAA------A--A------T-AA--AG--A---GA--GTA----TA--ACT-CTT---A-C---A-AA--T-T-----------T--TA-G-A-----GA-----GA--AA------------T-CT---T-TT------------------------AAGtttctaatattacc
Alignments
lowQualScore : 11 11 11 22222222222222 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 4444444444444444444444444444 444444444444 111111111 333333333 11111 22222222222222 111111 2222222222 1111 1111111 111111 88888888888888888888888888888888888 222222222222222222222 1111111111 222 222222 111 11 22222222 1111 111 1111111 11 1111 1111111 111 1111 11111 2222222 111111111111 2222222222 111 33333333333 11 1111 111111111 22222222 1111 111111111 11111111111 11111 111 1111 11111111111111 4444444444444444444444444444444 1111111 111 55555555555555555555555555555555555555555555 1 11111111111 1111111111111111 3333 111111 1 1111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111111 1 22222222 2222222222222222 1111 111 11111 11111111111 11111 22222 88888888888888888888888888888888888888888888888 2222222222 222 11111 1111 222 77777777777777777777777777777777 4444444444 11 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111 1111 11 3333333333333 33333333333 66666666666666666666666666666666666666666 11 222222 111 222222 111 22222 111
lowQualScore : 55 4 11 8 777 99 44 00 55 22222222222222 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 0 3 3 2222222222222222222222222222 3 44 3 3 3 3 222222222222 888888888 0 3 7777 3 333333333 44 22222 555 44 3 99999999999999 3 999999 77 1111111111 3 1111 7777777 6 3 000000 7777 6 44 6 44444444444444444444444444444444444 3 111111111111111111111 7777777777 3 44 000 3 444444 3 000 00 55555555 3 1111 3 666 3 1111111 00 4444 0000000 3 777 6 0000 44 33333 44 3 7777777 44 222222222222 3 3 5555555555 888 3 44444444444 3 44 44 3 77 88 6666 2 33 88 44 6 555 6 3 555 00 3 1111 3 3 6 3 000000000 44 3 3 44444444 44 555 3 44 666666 3 44 44 0000 3 44 333333333 3 6 44444444444 3 55555 88 3 555 44 000 77 3 0000 555 999999 3 3 9999999 3 333 44 7777 44 3 3 3 99 555 3 88888888888888 6666666666666666666666666666666 3 7777 3 3 3 77 3 6 3 3 7777777 222 77 3 3 44 99999999999999999999999999999999999999999999 0 6 3 88888888888 3 3 66666 4444444444444444 7777 3 2222 44 3 7 7 666666 3 0 7 666 2222 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 000000000 3 4 7 7777 1 44444444 0 55 7777777777777777 4 55 55 777 55 4 2222 55 4 111 4 22222 8 4 99999999999 55 8 8 11111 22222 55 44444444444444444444444444444444444444444444444 8 8 8 8 8888888888 8 555 33333 8 8 999 2222 0 222 33333333333333333333333333333333 0000000000 8 8 99 8 8 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 99 77777 2222 99 3333333333333 55555555555 22222222222222222222222222222222222222222 11 333333 8 8 444 0 999999 1 666 11111 666
lowQualScore : .. . .. . ... .. .. .. .. .............. ................................................................................................................................................................ . . . . ............................ . .. . . . . ............ ......... . . .... . ......... .. ..... ... .. . .............. . ...... .. .......... . .... ....... . . ...... .... . .. . ................................... . ..................... .......... . .. ... . ...... . ... .. ........ . .... . ... . ....... .. .... ....... . ... . .... .. ..... .. . ....... .. ............ . . .......... ... . ........... . .. .. . .. .. .... . .. .. .. . ... . . ... .. . .... . . . . ......... .. . . ........ .. ... . .. ...... . .. .. .... . .. ......... . . ........... . ..... .. . ... .. ... .. . .... ... ...... . . ....... . ... .. .... .. . . . .. ... . .............. ............................... . .... . . . .. . . . . ....... ... .. . . .. ............................................ . . . ........... . . ..... ................ .... . .... .. . . . ...... . . . ... .... ............................................................................. ......... . . . .... . ........ . .. ................ . .. .. ... .. . .... .. . ... . ..... . . ........... .. . . ..... ..... .. ............................................... . . . . .......... . ... ..... . . ... .... . ... ................................ .......... . . .. . . ........................................................................... .. ..... .... .. ............. ........... ......................................... .. ...... . . ... . ...... . ... ..... ...
lowQualScore : 55 7 00 0 000 22 66 44 88 55555555555555 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 6 9 6 6 0000000000000000000000000000 3 66 3 3 3 3 111111111111 444444444 4 3 1111 3 333333333 66 66666 888 66 3 00000000000000 3 222222 99 8888888888 3 1111 7777777 7 3 000000 1111 7 66 7 99999999999999999999999999999999999 6 555555555555555555555 6666666666 3 66 000 6 555555 6 000 00 22222222 6 4444 6 444 6 8888888 22 1111 7777777 3 555 7 4444 66 00000 66 3 5555555 66 777777777777 1 1 3333333333 111 1 66666666666 1 22 22 1 33 55 5555 9 99 55 22 2 444 2 1 444 44 1 8888 1 1 2 1 222222222 66 3 3 22222222 66 888 3 66 888888 3 66 66 8888 3 66 333333333 3 7 33333333333 3 00000 55 1 444 22 888 33 1 4444 888 666666 3 3 3333333 3 888 66 1111 66 3 3 3 22 888 3 22222222222222 5555555555555555555555555555555 3 1111 3 3 3 99 3 7 3 3 5555555 555 99 3 3 66 99999999999999999999999999999999999999999999 0 7 3 66666666666 3 3 22222 5555555555555555 1111 3 5555 66 3 3 3 000000 6 9 3 444 7777 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 999999999 6 5 3 8888 4 44444444 8 55 3333333333333333 0 55 55 000 55 0 5555 55 0 000 0 55555 0 0 00000000000 55 0 0 66666 55555 55 00000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 0 0 8888888888 0 000 00000 0 0 222 6666 8 000 22222222222222222222222222222222 8888888888 0 8 00 0 0 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22 88888 0000 00 2222222222222 44444444444 22222222222222222222222222222222222222222 00 000000 0 0 000 8 000000 0 888 00000 222
consensus : GAACAAAA--AAATAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--AAA--GA--TATTTT--T----GA-A-AAAAAA----------T-----T-----A---A--AAATAT------TTG--CCA-AA--------AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAA-------T-----C-AA-T-C-GTAAA-------T------GTC---A-TT--TTAAA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----A---GAG-CG----A-T---------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG---A---G-AC-ATA------TAAA--TTCA----AC--C-ATA-GA-T--AC--T----AA-G-A----C-A----A-G--G-CATT---CAAAT---C----TATAATCTC---AA---AAAAAAT-TCAAAAATTCA--TTAA-----AAAAG----A-----A-T--AAT---GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGA-AA-----TT-T-T--GA-AAA---C-T-------AA-ACG----TT--TCN--AAT-GT---T-AGAA----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AT-AAAA------A---TAA---TTTTC-G-----------G-TT--C--A-T--A--TT-T--G-T--ATTTTT--TGTAAA--T-G---TG-A-CAC---T--CC-T-T--CATTTT-CAG-G-G-AT------T--TG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T-AGCAG--A--TA-G--A-AG--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-A-TTTG--C----A--AA-G-T-TT--C---A-T-------C-A----ACTTCC--G-A-----------C-G--AG--------ATT-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-TTT-TTTCG-T-------AA---TT--C-AA-TT--TTC--T------A-----G--------------------A---A---TG-AC-T-A-----T-C---AA-AT-T---T-AG------A-A--C----CGG----A-A----GTGACA--A-AA-CCG-GA--A---GTG-T-T-AC---A----GGG--A-----TA-------G---G-T---AA-------T----A--A-------T-GA----T-T---------A----GG---A-----CC-A-TT-AN-T-TCGT-T------TATA--AAAA------A--A------T-AA--AG--A---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-T-T-----------T--TA-G-A--AG-AA-----GA--AA------------T-C----T-TT------------------------AAGCCC-CCAGAAGTC-CCT-TAAG-GGG-T-CA-----AAAA-AT---TG--C-ACT-AC-GGC-C-C--ATATATT---TTTTA-GAT-T-TAA-TCGG--NA---CGACT----ATAAAGA-----T----TCA-TNAATCACTAA--A-CGG-TTT----G--AA-AA-----TC-----CGATAT---------A-----AAA---AAGTTG-G-----AGC--------AT--AAAGAT----TCA-T--AA--TCACT--------AA--GACGGTTTG--CG------AAAATC-----CG--AT------A------T-AAAA-----------AAAG--TT------G-AA-GCC---GAAAGAA--T--TATTTCNA-ATATTC---TAGC--CCCTACAGA
Reference ( family-3270 ) : GAACAAAA--AAATAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--AAA--GA--TATTTT--T----GA-A-AAAAAA----------T-----T-----A---A--AAATAT------TTG--CCA-AA--------AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAA-------T-----C-AA-T-C-GTAAA-------T------GTC---A-TT--TTAAA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----A---GAG-CG----A-T---------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG---A---G-AC-ATA------TAAA--TTCA----AC--C-ATA-GA-T--AC--T----AA-G-A----C-A----A-G--G-CATT---CAAAT---C----TATAATCTC---AA---AAAAAAT-TCAAAAATTCA--TTAA-----AAAAG----A-----A-T--AAT---GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGA-AA-----TT-T-T--GA-AAA---C-T-------AA-ACG----TT--TCN--AAT-GT---T-AGAA----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AT-AAAA------A---TAA---TTTTC-G-----------G-TT--C--A-T--A--TT-T--G-T--ATTTTT--TGTAAA--T-G---TG-A-CAC---T--CC-T-T--CATTTT-CAG-G-G-AT------T--TG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T-AGCAG--A--TA-G--A-AG--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-A-TTTG--C----A--AA-G-T-TT--C---A-T-------C-A----ACTTCC--G-A-----------C-G--AG--------ATT-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-TTT-TTTCG-T-------AA---TT--C-AA-TT--TTC--T------A-----G--------------------A---A---TG-AC-T-A-----T-C---AA-AT-T---T-AG------A-A--C----CGG----A-A----GTGACA--A-AA-CCG-GA--A---GTG-T-T-AC---A----GGG--A-----TA-------G---G-T---AA-------T----A--A-------T-GA----T-T---------A----GG---A-----CC-A-TT-AN-T-TCGT-T------TATA--AAAA------A--A------T-AA--AG--A---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-T-T-----------T--TA-G-A--AG-AA-----GA--AA------------T-C----T-TT------------------------AAGCCC-CCAGAAGTC-CCT-TAAG-GGG-T-CA-----AAAA-AT---TG--C-ACT-AC-GGC-C-C--ATATATT---TTTTA-GAT-T-TAA-TCGG--NA---CGACT----ATAAAGA-----T----TCA-TNAATCACTAA--A-CGG-TTT----G--AA-AA-----TC-----CGATAT---------A-----AAA---AAGTTG-G-----AGC--------AT--AAAGAT----TCA-T--AA--TCACT--------AA--GACGGTTTG--CG------AAAATC-----CG--AT------A------T-AAAA-----------AAAG--TT------G-AA-GCC---GAAAGAG--T--TATTTCNA-ATATTC---TAGC--CCCTACAGA
gi|1 : GAACAAAAGAAAATAG--GGCT-TTTTTACGACCT--CCAAAA--GAAATATTTG--T----GA-A-ACAAAT----------T-----TTCTATG---A--AAATCT------TTG--CC---A--------AA----AAA---ATC-----T--------------A-------------------T---A------AA--G------------AAGA-------
gi|1 : ttctttttgaagtctcc--C--AAA--AA--AATCTA--T----AA-A-GAAGAA----------A-----A-----A---A--AAATATAC----TAG--GTA-AG--------AG----AAATCAAAT-----T--------------GAGT----------------T---T------AA--A------------AAAAAAGATTTT-----C-AA-T-C-GTAAA--------------GTC---A-CT--T-AAA-AGTA--ATT-T-GATGAG-T------------CTAA---------GAG-CG----A-T---------AAC--T--CTCG---T--GAG-AGCTTGTATA---A-CC-ATA------TAAA--TTCA----AC--G-ATAAGA-T--ACC-T----AA-G-A----C-A----A-G--G-CATT----AAAT------------AT-TC---AC---AAAAAAT-T----AATT----TTAA-----AAAAA----ACCGATA-TCAAAT---GAAGAT-A------TAGA---CGC--TGA-CA-----TT-T-T--GA-AAAA--C-T-------AA-ACG----TT--TTA--AAT-GT---TCAGAA----AA--ATG---G--AA-T-------A--TAAAAATC------A-AT-AAAA------AAAATAA---TTTCC-G-----------T-TT--C--ACT--A--TT-G--A-T---TTTTT--TGTAAA--TTG---TG-AACAC---TTCCC-T-TGTCATTTC-----G-G-AT------TAATG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---CT-C-AGCAGCAA--TATG--A-AG--TA---------GG-T-CACC-----------CT-GG----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----G---A------CA-TCGC---T---AAA-TATTA-TTTG--C----ACCAA-G-T-TT--TCATA-T-------C-ACTTAACTCCC--G-A-----------C----------------T-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-TTT-TT-CG-T-------AAA--TT--C-AA-TT--TTTCAT------A-----G--------------------A---AC--TG-AC-T-A-----T-C---AA-AT-TATAT-AG------A-A--C----CGG----A-A----GTGACA--A-AAACCGTGA--A---GTG-T-T-AC---A----GGG--A-----AAAAAAGGGG---G-T---AAACAAAAAT----A--AGATTTTTT-GG----T-TTTAAAAAAAA----GG---ATGGATCC-AATT-AA-T-TCGT---------AAA--AAAG------A--A------T-AA--AGTGA---AA--G-A----TA--ACC-TCT---A-C---T-TAT-T-T-----------TATTA-G-A--AA-AATTAAGGT--AA------------T-C----C-TTTTAATTTCTAATATTTCGAGTATAAAGCCCTCCAGAA-TCACCT-TAAG-GGGCT-CA-----AAAA-AT---TG--CAACT-ACGGGC-C-C--A-ATATTTTCTTTTA-GATAT-TAA-TCGG--AAGCGTGAC-----ATAAGAA-----T----TCA-TCAATCACTTT--A-ATG-TTT----GT-AATAATGATTTC-----C-ATAT---------ACTTTGAAA---TAATTGTG-----AATTTCTTTTAAT--CAGGGG----TCATT--AACGTTACTCTTAGTTGAAATGATTGTTCG--CGAATTAAAAAAT----------AT------A------T-AATA-----------AAAG--TT------G-AACGCT---GAAAGaaaaaaaatatactaggtaagagaaatcaaattgagtttaaaaaaaaagattttcaatcgtaaagtcacttaaaagtaatttgatgagtctaagagcgataactctcgtgagagcttgtataaccatataaattcaacgataagatacctaagacaaggcattaaatattcacaaaaaattaattttaaaaaaaaccgatatcaaatgaagatatagacgctgacattttgaaaaactaaacgttttaaatgttcagaaaaatggaatataaaaatcaataaaaaaaataatttccgtttcactattgatttttttgtaaattgtgaacacttcccttgtcatttcggattaatgtttctggaaaacctcagcagcaatatgaagtaggtcaccctggacttttttgtttgtttagacatcgctaaatattatttgcaccaagttttcatatcacttaactcccgacttgtgaaagatttagctttttcgtaaattcaatttttcatagaactgactatcaaattatatagaaccggaagtgacaaaaaccgtgaagtgttacagggaaaaaaagggggtaaacaaaaataagattttttggttttaaaaaaaaggatggatccaattaattcgtaaaaaagaataaagtgaaagataacctctacttattttattagaaaaattaaggtaatccttttaatttctaatatttcgagtataaagccctccagaatcaccttaaggggctcaaaaaattgcaactacgggcccaatattttcttttagatattaatcggaagcgtgacataagaattcatcaatcactttaatgtttgtaataatgatttccatatactttgaaataattgtgaatttcttttaatcaggggtcattaacgttactcttagttgaaatgattgttcgcgaattaaaaaatatataataaaagttgaacgctgaaagctatt
gi|10 : ttctttttgaagtctccgaacaaaagaaaatagggcttttttacgacctccaaaagaaatatttgtgaaacaaattttctatgaaaatctttgcA-A-AAGAAA----------G-----G-----A---A--AAA-A--------------A-AA--------GA----AAA---AACGATATT--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAAAGAAAT-T-----C-AAAT-CAGTAAA-------TA-----GTC-----TTACTTAAATCGTA--ATT-TAGAT-AG-TAC----------TTAA-----A---GAG-CG----A-T---------AAC--T--C--GTGTT--GAGTA---TG---A---ATAC-ATA------AAAAG-TTCAAG--ACG-A-ATA-GATT--ACTAT----AA-G-A----C-A----A-G--G-CAAT---AAAAT-------------TTTC---A--------------AAGAATTAA--TTTA-----AGAAG----------A-T--AAT---TGAGAT-A------T-TGTATTGC--TGA-CA-----TTGT-T--GA-AAA---C-T-------AA-ATGACGTTT--TCC--ATC-TT---T-AGAA----AA--A-A---G-----T-------A--TA-----C------A-AT-AAAAAATAT-A---TAA---TTTTC-G-----------GTTT--C--A-T--ATTTT-T--G-T--A-TTGT--TGTAAA--T-G---TG-A-C-T---T--CC-T-T--CA-TTG-CAGTG-G-AT------TTCTG-TTTCAT-G--------G--A---A-AC--T---TA-T-AGCAG--A--TG-T--G-GA--TAACGACTTTTGG-T-CACCCGTTCTTA---TT-GATATTAC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTAATTGA---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-ATTTTG--C----A--AA-G-T-TT--C---A-T-------C-A----ACTTCCT-C-A-----------C-G--AC--------A-T-T----GT-GG-AAG-ATTTTAG-GC-CTT-TTTCG-T-------AA---TT--C-AA-TTTCTTC--T------A-----G--------------------AT--AT--TGTACTT-A-----T-CCATAA-AT-T---T-AG------A-T--C-----------A-ACTC-GTGACA--A-ctatt
gi|11 : aaaaaaaaaaaaaaaaaataaaaaaaaaaaaa--TT-TT---TT--G---TTTGCCT-TTA----G---A------CAAT-GC---T---GAA-TAA-A-TT-G--C----A--AA-G-T-TT--C---A-TT------C-A----ACTTCCCCG-A-----------C-G--AG--------ATT-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-TTT-TTTCG-T-------AAAATTC--C-AA-TT--TCG--TA-----A-----A--------------------A---A---TG-A--T-AT----T-C---AA-ATAT---T-AG------A-AATC----CGG----A-AG---GTGACA--A-AA-CCG-GA--A---GTG-TAT-ACCATG----GGA--A-----TA-------G---G-TGTAAA-------T----A--A-------T-GA----C-T---------A----GA----------C-A-TTAAT-T-TCATAC------TATA--AAAA------A--A------T-AA--AG--A---GA--G-A----TA--A-T-CTT---ACC---A-AACTT-T-----------T--TA-GAA--AG-AAAC---GA--AA------------TCC----T-TT------------------------AAttgcgttagtgacaaaccg
gi|12 : actT-T--G-T--ATTTTT--TGTGAA--T-G---TC-A-CAC---T--CC-T-T--CCTCAT-CAG-G-A-AT------T--TG-TATC-T-C--------G--A---A-AA--C---TG-T-AGCAG--A--TA-G--A-AG--TA---------GG-T-CACC-------T---TT-G-----AC--TT-TT---GT--G---TTTG--T-TTA----A---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-A-ATTG--G----A--AA-G-T-TT--C---T-T-------T-A----ACTTCC--G-A-----------C-G--AG--------ATT-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-ACT-TTTCA-TACATGTCAA---TT--C-AA-TT--TTC--T------A-----A--------------------A---A---TG-AC-T-A-----T-A---AA-AA-T---T-AT------A-A--C----CGG----A-A----GTGTCA--A-AA-CCG-GA--A---GTG-T-T-AT---A----GGG--A-----TA-------G---A-T---TA-------C----A--A-------T-GG----A-T---------A----GG---A-----CC-A-CT-cagtttctaatattca
gi|13 : GACCT--T--AAA--GA--TATTTT--T----GA-A-AAAAAA----------T-----TCTT--A---A--AAGTTT------TTG--CCA-AA--------AA----AA------C-----T--------------A-------------------TAA-T------AA--A------------AAAA-------T-----CCAA-T-C-ATAAA-------T------GTC---AATT--TCAAA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----A---GAG-CG----A-A---------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG---A---A-AC-ATT------CAAA--TCCT----AC--C-ATA-AA-T--AC--T----AA-G-A----C-A----A-G--G-CATT---TAAAT---CTCCATGTAATCTCAATAA---AAAAAAT-TCAAAAATACA--TTTA-----AAAAT----A-----A-T--
gi|14 : AGCTC-ACAGAAGTC-CTT-AAAG-GGG-TCCA-----AAAATAT---TG--C-ACTAAC-GGCTC-C--A-ATATT---TCTTACAAT-TGCAATTCGGGATA---TGA------ATAAAGA----------TCA-TAAATCACTAA--ATCGGTTTT----G--TA-AA-----TC-----CGGCATAAAAATCTAA-----AAA---AAGTTG-A-----AGC---------T--GAAAAT----T
gi|14 : --------AT--AAAGAT-----CA-T--AAA-TCACT--------AA--ATCGGTTT---TG------TAAATC-----CGGCAT------AAAAATCT-AAAA-----------AAAG--TT------G-AA-GCT---GAA--AA--T--TATTTCTATATATTC---TAG---CTCTACAatttctatatattctagctctacatga
gi|15 : agctcacagaagtccttaaaggggtccaaaaatattgcactaacggctccaatatttcttacaattgcaattcgggatatgaA--GA--TATT---------AA-A-AAAAAAATGT------T-----T-----A---G--AAATAT------TTG--CCA-AA--------A-------------------C--------------A-------------------C---T------AA--A------------AAAT-------C-----C-AA-T-C-ATAAA-------T------TTC---A-TT--TAAAA-AGAT--GTT-T-GAT-AG-T------------CTAC-----A---GAG-TG----A-T---------AAC--T--C--G---T--AAG-A---GG---A---G-AC-AGT------TAAA--TTCT----AC--C-ATA-GG-A--AC--T----GA-G-A----C-A----A-G--G-CATT---TAAAT---CTCCATATAATCTC---tga
gi|16 : AACAAAA--AAACAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--ATA--GA--TATTTT--T---------AAAAAATGCT------T-----T-----A---A--AAAAAT------tata
gi|17 : gatgcatggaatgaagcatgtcatgtagcaaaataacatttagaaatataattctttttggtctcta-----C------A-AT-AAAA------A---TAA---TTTTC-G-----------G-TT--C--A-T--A--AT-T--G-T--GTTTTT--TGGGAA--T-G---TC-A-CAC---T--CC-T-T--CATCTT-CAG-G-G-AT------T--T--TATC-T-C--------G--A---A-AA--C---TG-T-CGCAG--A--TA-G--A-AG--TA---------GG-T-CTCC-------G---CT-G-----AC--TT-TT---TT--G---TTCA--T-T
gi|18 : AAG----A-----A-T--AAT---GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGA-AA-----TT-T-C--AA-TAA---C-TTACAACAAG-ACG----TG----C--AAT-GT---T-AGAA----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AG-AAAA------A---TAA---TTTTC-C-----------G-TT--C--A-T--A--TT-T--G-T--ATTTT
gi|19 : -GT---T-AGAA----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AT-AAAA------T---TAT---TTTTTTG-----------G-TT--C--A-T--A--TT-T--G-T--ATTTTT--TGTAGG--T-G---TG-A-CAC---T--CC-T-T--CATCTT-CAG-G-G-AT------T--TG-
gi|2 : c--TTAAC-AGTATGATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----ATA-GAG-CGGGATA-T---------AAT--T--C--G---T--GAG-ACCGTG---A---T-AC-ATA------TAAAATTTCA----AA--CGATA-GA-TGTAC--T----AA-G-A----CCA----A-G--G-CATTTTTCAAAG--------TATG---TC---AG---AAGAAAT-CTAA---TCTA--TGAA-----AAAAT----ACG---A-T--AAT---GAAGATGA------T-GAG--CGC--TGA--------CT-T-T--GA-ACA---C-T-------AA--CG----TT--TTA--AAT-GTGTAT-AGAAT---AA--A-G---GCGAACT-------A--TAA----CTATTTAA-AC-GAAT------A---TAT---TTTTC-GTCT--------G-TTTTC--A-TT-A--TTGT--G-TTTATTTTT--TGTAAAACT-G---TG-A-CATCTTT--CCATGT--CATTTT-CAG-C-G-GTGATTTTT--TG-TTTC-TTG--------GTAA---A-AA--C---C--T-AGCAG--A--TG------AGCTTA---------GGGTACACC-------G---CTTG-----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----GTCTATTTTTTCG-T-AA---T---GAA-TAT---TCTG--CTCATA--CA-G-TATTACT---A-T-------CCA----ACCTCCTCG-A-----------C-A--A----------TT-T----GTTGA-AAG-ATTT--ACGCATTTATTTCG-T-------AT---TT--TTAA-GT--TCC--T------A-----GATTTATCTTTGCATATGTTAA---A---TGGAC-T-AGTACTT-A---AA-AT-T---T-AGTTTAGGA-AT-C----CGG----G-ATCC-GTGTTATTA-TATCCG-AA--AA--GTG-A-T-AT---ACTACGGG--AAAATTTG-------T---G-T---AA-------A----A--A-------T-GAGCTTT-T---------ACT--GGCGCA-----CC-A-TTTAG-A-TCGT-T------TATA--AAAG------A--AC-----T-AA--AG--ATATGA--G-GCATTTA--ACT-CTT---A-C---C-AAT-T-TCTGCCTCCTCTT--TA-G-A--TT-A------GA--AA------------T-C----T-TTTAAATGCTCTAAGATTC-------AAGCCT-CCAGAAGTC-CCTATAAGAGGG-C-CGTGCATAAAA-ATGA-TGTCT-ACT-AC-GGT-C-CCAATTTATTA--TTTTA-GAT-T-T-G-T--G--TA---CG-TT----ATAAAGA-----TAAGGTCATTAAATCCCTAACGA-TGG-TTTGATCG--AA-AA-----TCGAGCATGATAT---------A-----AAATATAAG--G-GGAGAAAGC--------ATTGAAAGA
gi|2 : aaatctggtattatgttataataacataatataaataatagaacctacagattcgctcaaaaagtaggcacac--------AT--AAAGATAAGGTCA-TTAAA--TCCCT--------AAC-GATGGTTTGATCG------AAAATCGAGCATG--AT------A------T-AAAATATAAGGGGAGAAAGCATT------GAAA-GACATGGAAAGAGACT--TATTTCCA-AAATTTTTATAGCGTTCCTACcatggaaagagacttatttccaaaatttttatagcgttcctacgcttcctgtaagattgtcttctttcgaggagatgaccatatttc
gi|20 : aaatctggtattatgttataataacataatataaataatagaacctacagattcgctcaaaaagtaggcacacttaacagtatgatttgatagtctaaatagagcgggatataattcgtgagaccgtgatacatataaaatttcaaacgatagatgtactaagaccaaggcatttttcaaagtatgtcagaagaaatctaatctatgaaaaaatacgataatgaagatgatgagcgctgactttgaacactaacgttttaaatgtgtatagaataaaggcgaactataactatttaaacgaatatatttttcgtctgttttcattattgtgtttattttttgtaaaactgtgacatctttccatgtcattttcagcggtgattttttgtttcttggtaaaaacctagcagatgagcttagggtacaccgcttgacttttttgtttgtttagtctattttttcgtaatgaatattctgctcatacagtattactatccaacctcctcgacaatttgttgaaagatttacgcatttatttcgtatttttaagttcctagatttatctttgcatatgttaaatggactagtacttaaaatttagtttaggaatccgggatccgtgttattatatccgaaaagtgatatactacgggaaaatttgtgtaaaaatgagcttttactggcgcaccatttagatcgtttataaaagaactaaagatatgaggcatttaactcttaccaatttctgcctcctctttagattagaaatcttttaaatgctctaagattcaagcctccagaagtccctataagagggccgtgcataaaaatgatgtctactacggtcccaatttattattttagatttgtgtacgttGAACAAAA--AGAGAG--GGCT-TTT---CGAgcttcctgtaagattgtcttctttcgaggagatgaccatatttc
gi|3 : aagaataactagacctttttgtcactCT--T--AAA--AT--TATTTT--T----GTTA-AAAAAA----------T-----T-----GTTTA--AAATATATATTTTTG--CTG-TA--------AT----AAA---AAA-----T--------------A-------------------TA--T------AA--AGAAAAGAAAAAAAAAA-------TG----C-AA-T-C-GTAAAAT-----T------GTTCAAA-TT--T---A-AGTA--ATT-T-GAT-AG-TG-----------CTAACTCACAC--GAG-TG----ACT---------TAC--T--CA-G---TTCGAG-A---TGG--A---G-AA-ATT------TAAA--TTCA-----C--C-ATT-AA-TT-AC--T----AA-G-G----CTA----A-G--T-CATT---CTAATAAAC----TCTCA-CTC---AATTTAACATACATCAAAAATTCAAATTAA-----AAAAGCAAGA-----A-T--AA-----AAGAT-AA-----T-G----TGC--TGA-AA-----TA-T-A--TA-AAA---C-T-------A---CG----GT--TCTTTAAT-GT---TTAGAA----AA--A-A---G--AA-T-------ACTTA-----CG-----A-AT-AAAATTAGATA---TAG---TCGAC-G-----------G-TT--C--A-TTTA--TT-TTTG-T--ATTTTT---GTAAA--T-G---TG-A-CAC---T--CC-TAT--CATTTT--AG-G-G-AT------T--TGGTTTC-T-G--------G--A---ATAA--CGAATAGT-AGCAG--A--TAAG--A-AA--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----AC--TT-TT---T---G---TTCG--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---GAA-TAT-A-ATTGGCC----A--AA-G-T-T---C---G-T-------C-A----ATTTCC--T-C-----------C-G--AGTCACGCA-GTG-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-TCG-TTTCT-A-------AA---TT--C-AA-TT--TTC--TCCTCCTG-----A--------------------A---A---TG-AC-C-A-----C-T---AA-TT-T---TTAG------G-A--C----CGA----A-AACC-GTGA-A--A-AA-CCGCAA--A---GTG-C-TGAC---A----GAATTA-----TA-------AATCG-T---AA-------T----ATTA-------TCGC----T-TTTTTTG---A----GC---A-----CA-A-TT-AAAT-TCAT-T------TA-----AAA------A--A------T-AAGAAG--A---GT--G-A----TA---CT-CTTTTTA-C---A-AAC-T-T-----------T--TA-GCA--GG-AA-----GA--AAAATATTTAGTGTT-CTAAAT-TT------------------------CAGCTT-CCAGAAGTC-CCT-TAAG-GGG-T-C-------AAA-ATTCATG--C--CT-AC-GGC-TGC--ATAT-TG---TTTTA-A---T-TGC-TCG--------CGTCTTTCGATAAAAAATACCC----TAA-TCAATTATTAAG-A-CAG-TTT----GCAAA-AG-----TC-----CGAT-T---------A-----AAA---AA
gi|3 : --AA--TTATT--------AA--GACAGTTTG--CA------AAAGTC-----CG--ATTAAAAAA------TTAAGA-----------AAAG--TCTGTTTAG-AG-ACC---GACAGAA--TATTATTGCAA-ATAT------AGC--CCCTACAGAttaagaaaagtctgtttagagaccgacagaatattattgcaaatatagcccctacagattctaatttctctgtggagattatatttc
gi|4 : cttaaaattatttttgttaaaaaaattgtttaaaatatatatttttgctgtaataaaaaatatataaagaaaagaaaaaaaaaatgcaatcgtaaaattgttcaaatttaagtaatttgatagtgctaactcacacgagtgacttactcagttcgagatggagaaatttaaattcaccattaattactaaggctaagtcattctaataaactctcactcaatttaacatacatcaaaaattcaaattaaaaaagcaagaataaaagataatgtgctgaaatatataaaactacggttctttaatgtttagaaaaaagaatacttacgaataaaattagatatagtcgacggttcatttatttttgtatttttgtaaatgtgacactcctatcattttagggatttggtttctggaataacgaatagtagcagataagaaataggtcaccgctgactttttgttcgtttagacatgctgaatataattggccaaagttcgtcaatttcctccgagtcacgcagtgtgtgaaagatttagctcgtttctaaattcaattttctcctcctgaaatgaccactaatttttaggaccgaaaaccgtgaaaaaccgcaaagtgctgacagaattataaatcgtaatattatcgctttttttgagcacaattaaattcatttaaaaaataagaagagtgatactctttttacaaacttttagcaggaagaaaaatatttagtgttctaaatttcagcttccagaagtcccttaaggggtcaaaattcatgcctacggctgcatattgttttaattgctcgcgtctttcgataaaaaataccctaatcAACAAAA--CACTAGATGGCT-TTT---CGACCCTCC--AAA--GAGATATTTT--TTATAGA-G-GGAAAAGTATGCATTCT-----T-----ATT-A--AAATAT------TTGCCCCA-AAAAGTC---AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------TA--A------------Attctaatttctctgtggagattatatttc
gi|4 : ccgccgaaactcaCAAAA--AAA-------CTATTT---AAACCA--C--AAAA-GA--TATT--------------AAGAAA----------C-----C-----A---A--AAA-AT------T----CCA-AATCCGTTTTAA----A-------------T--------------A-------------------TGCGT------AA--A------------AAAG-------T-----C-AACT-T-ACAAA-------T------G--------------AA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-TATACTCTAAATCCTAA-----A---G-G-CG----A-TGGATATTAAAGC--TTTC--G---T--T-G-A---AG---AATCG-AC-ATACAATACTAAA--TTCA----ACACCGATA-GAAT--AC--TCCTAAATG-A----G-A----ATG--GTCG-----CAAAT--------TAAAAT-TC---AA---AAAAAAT-T-----ATTTA----AAT----AAAGG----A-----A-T--AATTGCAAAGAT-AGAAGAAT-GA---TGCATTGA-AACATTATT-TAT--GA-AAGAATC-T-------AA--CT----TT--CCG--CAT-ATCCTT-AGAA----AA--A-AAAAG--AA-CGCCACTAA--TA-----C------A-AT-AAAA------AA--TAAGA-TTTTC-GAAATCTACAGAG-TT--C--A-T--A--TT----G-T--ATTTTTACTGTAAA--T-G---TGGA-CAT---TT-CC-T-TA-CATTTT-CAG-GCG-AT------T--C---TTC-T-GTCCCGGGTG--A---A-AA--C---AA-T-AGCAG--A--TA-G--A-GT--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----GCATTT-TT---CT--GAACTTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GCA--TATGAAA-T-T-A-TTTG--C----A--AA-G-T-TT--C---ATT-------C-A----ACTTCC--GAA-----------CGG--AGGATTTCGAATT-T----AT-GA-AAG-ATTT--A-G--TCT-TTTCGTT-------AAT--TT--C-AA-TT--TTC--C------ATAGCGG--------------------AAACA---TG-ACTT-A-----TCC---AA-AT-T---G-AG------A-A--CACCGCGGAAAAA-A----GTGAC---A-AA-CCG-GACGA---GTG-TCT-AC---A----GGGA-A-----TAT------G---G-T---AATTCC---T----AC-A-------T-G-----T-T---------ATTTCGG---A-----CC-ACTT-AT-A-TTGT-TATAGGATATA--AAAAT-----A--AGACAATT-AA--AG--A---GA--G-AT---TA--ACTCCTT---A-CTCAG-AAC-T-T-----------T--TA-G-AG-AG-AATGC--AA--AA------------T-C----T-TT------------------------ccacaaaagatattaagaaaccaaaaaattccaaatccgttttaaatatgcgtaaaaaagtcaacttacaaatgaaagtaatttgatagtatactctaaatcctaaaggcgatggatattaaagctttcgttgaagaatcgacatacaatactaaattcaacaccgatagaatactcctaaatgagaatggtcgcaaattaaaattcaaaaaaaattatttaaataaaggaataattgcaaagatagaagaatgatgcattgaaacattatttatgaaagaatctaactttccgcatatccttagaaaaaaaaagaacgccactaatacaataaaaaataagattttcgaaatctacagagttcatattgtatttttactgtaaatgtggacatttccttacattttcaggcgattcttctgtcccgggtgaaaacaatagcagatagagttaggtcaccgctggcatttttctgaactttgtttagacatgcatatgaaattatttgcaaagtttcattcaacttccgaacggaggatttcgaatttatgaaagatttagtcttttcgttaatttcaattttccatagcggaaacatgacttatccaaattgagaacaccgcggaaaaaagtgacaaaccggacgagtgtctacagggaatatggtaattcctacatgttatttcggaccacttatattgttataggatataaaaataagacaattaaagagagattaactccttactcagaacttttagagagaatgcaaaatcttttaattctaa
gi|5 : ccgccgaaactcaaacaaaacactagatggcttttcgaccctccaaagagatattttttatagagggaaaagtatgcattcttattaaaatatttgccccaaaaagtAACAAAA--CACTAGATGGCT-TTT---CGACCCTCC--AAA--GAGATATTTT--TTATAGA-G-GGAAAAGTATGCATTCT-----T-----ATT-A--AAATAT------TTGCCCCA-AAAAGTC---AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------TA--A------------Ataattctaa
gi|5 : ccgccgaaactcaCAAAA--AAA-------CTATTT---AAACCA--C--AAAA-GA--TATT--------------AAGAAA----------C-----C-----A---A--AAA-AT------T----CCA-AATCCGTTTTAA----A-------------T--------------A-------------------TGCGT------AA--A------------AAAG-------T-----C-AACT-T-ACAAA-------T------G--------------AA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-TATACTCTAAATCCTAA-----A---G-G-CG----A-TGGATATTAAAGC--TTTC--G---T--T-G-A---AG---AATCG-AC-ATACAATACTAAA--TTCA----ACACCGATA-GAAT--AC--TCCTAAATG-A----G-A----ATG--GTCG-----CAAAT--------TAAAAT-TC---AA---AAAAAAT-T-----ATTTA----AAT----AAAGG----A-----A-T--AATTGCAAAGAT-AGAAGAAT-GA---TGCATTGA-AACATTATT-TAT--GA-AAGAATC-T-------AA--CT----TT--CCG--CAT-ATCCTT-AGAA----AA--A-AAAAG--AA-CGCCACTAA--TA-----C------A-AT-AAAA------AA--TAAGA-TTTTC-GAAATCTACAGAG-TT--C--A-T--A--TT----G-T--ATTTTTACTGTAAA--T-G---TGGA-CAT---TT-CC-T-TA-CATTTT-CAG-GCG-AT------T--C---TTC-T-GTCCCGGGTG--A---A-AA--C---AA-T-AGCAG--A--TA-G--A-GT--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----GCATTT-TT---CT--GAACTTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GCATATG--AAA-T-T-A-TTTG--C----A--AA-G-T-TT--C---A-TT------C-A----ACTTCC--G-AACGGAGGATTTC-G--A---------ATT-T----AT-GA-AAG-ATTT--A-G--TCT-TTTCG-TT------AA---TTT-C-AA-TT--TTC--C------ATAGCGG--------------------A---AACATG-AC-TTA-----T-CC--AA-AT-T---G-AG------A-A--CACCGCGG----A-AAAAAGTGACA--A-A--CCG-GACGA---GTG-TCT-AC---A----GGG--AA----TAT------G---G-T---AA-------TTCCTAC-A-------T-G-----T-T---------ATTTCGG---A-----CC-ACTT-AT-A-TTGT-TATAGGATATA--AAAATAAGACA--A------TTAA--AG--A---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-A-T-----------T--TA-G-A--GG-AA-----GA--AA------------T-C----T-Tccacaaaagatattaagaaaccaaaaaattccaaatccgttttaaatatgcgtaaaaaagtcaacttacaaatgaaagtaatttgatagtatactctaaatcctaaaggcgatggatattaaagctttcgttgaagaatcgacatacaatactaaattcaacaccgatagaatactcctaaatgagaatggtcgcaaattaaaattcaaaaaaaattatttaaataaaggaataattgcaaagatagaagaatgatgcattgaaacattatttatgaaagaatctaactttccgcatatccttagaaaaaaaaagaacgccactaatacaataaaaaataagattttcgaaatctacagagttcatattgtatttttactgtaaatgtggacatttccttacattttcaggcgattcttctgtcccgggtgaaaacaatagcagatagagttaggtcaccgctggcatttttctgaactttgtttagacatgcatatgaaattatttgcaaagtttcattcaacttccgaacggaggatttcgaatttatgaaagatttagtcttttcgttaatttcaattttccatagcggaaacatgacttatccaaattgagaacaccgcggaaaaaagtgacaaaccggacgagtgtctacagggaatatggtaattcctacatgttatttcggaccacttatattgttataggatataaaaataagacaattaaagagagataactcttacaaacatttagaggaagaaatctt
gi|6 : ccgccgaaactcaaacaaaacactagatggcttttcgaccctccaaagagatattttttatagagggaaaagtatgcattcttattaaaatatttgccccaaaaagtGAACAAAA--AAATAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--AAA--GA--TATTTT--T----GA-ATAAAAAA----------T-----T-----A---A--AAATAT------TTG--CCA-AA--------AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---C------AA--A------------ACAA-------T-----C-AA-T-C-GTAAA-------T------GTC---A-TT--TTAAA-AGTA--ATT-T-CAT-AG-T------------CTAA-----A---GAA-CG----A-T---------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG---A---G-AC-ATA------TAAA--TTCT----AC--C-ATA-GA-T--AC--T----AA-G-A----C-A----A-G--G-TATT---CAAATACCCG---TGTAATCTC---AATA-GAAAAAT-TCAAAAATTCA--TTAA-----AAAAG----A-----A-T--AAT---AAAGAT-A------T-GA---TGC--TGA-AA-----TT-T-T--GA-AAA---C-T-------AA-ACG----TT--TTT--AAT-GT---T-AGCG----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AT-AAAA------A---TAA---TTTTC-G-----------G-TT--C--C-T--A--TT-T--G-T--ATGTTT--TGTAAA--T-G---TG-A-CAC---T--CC-T-T--CATCTT-CAG-G-G-AT------T--TG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T-AGTAG--A--TA-G--A-AG--TA---------CG-T-CATT-------G---CT-A-----AC--TC-TT---TT--G---CTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-A-ATTG--C----A--AA-G-T-TT--T---G-T-------C-A----ATTTCC--G-T-----------C-G--AG--------ATT-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-TTT-TTTCG-T-------AC---TT--T-TA-TT--TTC--T------A-----G--------------------A---A---TG-AC-T-A-----T-C---AA-AT-T---T-AG------A-A--C----CGA----A-A----GTGACA--A-AA-CCG-GA--A---AAG-T-T-AC---A----GGG--A-----TA-------G---G-T---AA-------T----A--A-------T-GA----T-T---------A----GG---A-----CC-A-TT-AG-T-TCAT-T------TATT--AAAA------------------AA--AG--G---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-T-T-----------T--TA-G-A--AG-AA-----GA--AA------------T-A----T-TC------------------------AAGCCC-CCAGAAGTC-CCT-CAAA-GGG-T-GA-----AAAA-GT---TG--C-ACC-AC-AGC-C-C--ATATATT---TTTT----T-T-TAA-TT-G--AA---CGACTG---ATAAAGA-----T----TCA-T-AATCACTAA--A-CGG-TTT----G--AA-AA-----TC-----CGATAT---------A-----AAA---AAGTTG-G-----AGTG-------AT--AAAGAT----TCA-T--AA--TCACT--------AA---ACGGTTT----G------AAAATC-----CG--AT------A------T--AAA-----------AAAG--TT------G-GA-GTT---GAAAGA---T--TATTTCGA---ATTC---TAGC--CCCTACAGA
gi|7 : AAAA--AAATAG--GGCT-TTT---TCACCT--C--AAA--GCC-TATTTG--T----AA-C-GAAAAA----------TATCTCT-----T---A--AATGAC------TTG--CCA-TA--------AA----AAA---GAC-----CCATAAAAAAGCCAGA-------------------T---TCCAAAAAA--A------------AAAA-------TT----C-AA-T-C-GTAAA-------A------GTC---C-AC--TTAAA-AGTA--ATTCT-GAG-AGAT------------CTAA-----G---AGG-CG----A-TA--------AACCGT--T--G---T--GAG-AAT-CG---A---ATACAATA------TAAA--CTCAAACGAC--C--TA-GA-T--AC--C----TA-G-AGCCCC-AGCACA-GCCG-CATT----AAA----C----CAT--TC------A---ACGAAAT-T---AAAT-----TTAACCACCAACAG----A-----ACT--AATC--GAAG-C-A------T-GA---TGC--TGATCA-----TT-T-G--GGCAAA---CTT-------AA-ACG----TTCGTCC--ACTCGT---T-AGAACCACAG--A-A---G--AA-TCAG----A--GG-----C------A-AT-AAAA------A---TAA---CTTTC-G-----------G--T--C--A-T--GATTT-T--G-T--ATTGTT--TGTAAA--C-G---CG-A-C-C---T--CC-TCT--CATTTTCCAG-G-GAAT------T--CG-TTTC-T-G--------G--ACGGA-AAATC---TA-T-AGCAG--AGTTA-G--AGAG--TA----------G-T-CACC-------G---CT-G-----AC--TT-TTGCCTTTGG---TTTGC-T-TTAG---G---A------CA-T-GC---T---AAAGTAT-C-ATTG--C-------AA-G-T-TTTCC---A-T-------CAA----ACTTCC--G-A-----------C-GGAAG--------ATTCC----GT-GACAAGAATTT--A-GC-TTT-TTTCT-A-------AA---TT--C-AA-TT--CTCATC------C-----G--------------------A---A---TGAAC-T-AC----T-C---AACAT-T---T-AG------A-A--C----CGG----ACA----GTG-CA--A-AA-CCG-GACCA---GTG-T-T-AC---A----GGG--------TA-------G---G-CTA-AA-------T----A--A-------T-GA----TCC---------A----GG---A-----CCAA-TC-AA-TCTTGT-T------T-TAACAAAA------G--A------T-AC--AA--G---GA--G-A----TA--ACT-CTTA--A-CA--A-AAC-TCT-----------T--TACG-ACCAG-AA-----GT--AA------------T-C----T-T
gi|8 : tcttttctggtctgccggaccaGAACAAAA--AAATAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--AAAAGAA--TATTTTTGT----GA-A-AAAAAATTC-------T-----T-----A---A--AAATAT------TTG--CAACGA--------AA----AAA---AAC-----T--------------ATAGAAAAACAAAAAAAAGAT---T------AAACA------------AAAA-------TTCAACC-AA-T-C-GTAAA-------A------GTC---A-AC--TTAAA-AGT---ATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----A---GAGCCG----A-TA--------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG---A---T-AC-ATA------TAAA--TTCA----TC--G-ATA-GA-T--AC--T----AA-GAA----C-A----A-G--G-C--------AAT---T-----------------------AAAAT-TCAAAAATTAAT-TTAA-----AAAAA----G-----A-T--AATG--GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGACCA-----TT-T-G--AA-AAA---C-T-------AACACGTCT-TT--TCC--CAT-GT---T-AGAA----AAACA-G---A--AA-T-------A--TA-----C------ACATAAAAA------A---TAAATTTTTCC-G-----------G-TT--C----T--A--TT-T--GTT--ATTTTT--TGTAAA--T-GCCTTG-A-CAT---T--CT-T-C--AATTTT-CA--G-G-AT------T--TG-TCTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-TAAGCAG--A--TA-GACA-AG--TA---------GG-TCCACC-------GAGCCC-G-----AC--TTGTT---TT--G---TTGT--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-A-TTTG--C----A--AA-GTT-TT--C---A-TATATAAAC-ACT--ACCTCC--G-A-----------C--------------ATT-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GCTTTT-TTTCG-TA------AA---TT--C-AATTT--TTC--T------A-----G------------------------A---TG-A--T-A-----T-CT--AG-AA-T---T-AG------AGA--C----TGG----A-A----GTGACA--A-AA-CCG-GA--A---GTG-T-TAAC---A----GGG--AC----TA-------G---G-T---AA-------T----A--A-------T-GA----T-T---------A----GG---A-----CC-A-TA-AT-T-TTGT-T------TATA--AAAA------AATA------T-AA--AG--A---GAAGA-A----TAGTACT-CTT---A-C---ACAACAC-T-----------T--TAGG-A--AGTAA-----GAACAA------------T-C----TGTT------------------------AAgttaatttctaatattccag
gi|9 : taaataataaacctagaattccttttttggtctcc-A-AAAAAA----------T-----T-----C---TTTAAATAT------TTG--CCA-AA--------AATATAAAA---AAA-----G--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAAAT-----T-----C-AA-TTC-GTAAAAAAAAAATAAAAAGGTC---AACT--TTAAA-AGTA--ATC-T-TGT-AT-C------------TTAA-----ACAAGAG-CG----A-T---------AAC--T-----G---T--GAG-A---TG-------T-AC-A-A------TAAA--TTCA----AC--G-ATA-GA-T--ACC-T----AA-G-A----A-A----T-G--G-CA---------------------GATT------------AAAAT-TCAAA---T----TTAA-----TAAAA----G-----A-T--AAT---GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGC-AT-----TT-T-TTTGA-AA----C-T-------AA-ACG----TT--CC----AT-GT---T-AGAA----AA--A-A---G--A--T-------A--TA-----C------A-AT-AAAACA----A---TAAAA-TTTTC-G-----------G-TT--CTCA-T--A--TT-T--G-T--ATTTTT--TGTAAA--TTG---TG-A-CAT---T--CC-T-T--CATT---CAG-G---AT------G--TG-TT-C-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T--GCAG--A--TA-GG-A-AG--TA---------G--T-CACC-------G---CT-GC----AC--TT-TT---TG--T---TTTG--TATTA----G---A------CA-T-GC---T---AA--TAT-A-TCTG--C----A--AAAG-T-TT--C---A-T-------C-A----ACTTCC--GGA-----------G-G--AG--------ATT-TTTGTGT-GA-AAG-ATTTT-A-GC-TTT-TT-CG-T-------AA---TTTCC-AA-AT--T-C--T------A-----G--------------------A---AA--TG-AC-T-A-----T-C---AA-AT-------AG------A----C----CGG----A-ACA--GTGACA--ACAA-CCG-GA--AAAAGTGGT-T-AG---ATG--GAG--A-----TA-------G---GGT---TA-------T----A--A-------T-GA----T-T---------A----GG---A-----CC-ATTT-AA-T-T-GT-T------T-TA--AAAA------A--A------T-AA--AG--A---GA--GTA----TA--ACT-CTT---A-C---A-AA--T-T-----------T--TA-G-A-----GA-----GA--AA------------T-CT---T-TT------------------------AAGtttctaatattacc
Alignments
lowQualScore : 11 11 11 22222222222222 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 4444444444444444444444444444 444444444444 111111111 333333333 11111 22222222222222 111111 2222222222 1111 1111111 111111 88888888888888888888888888888888888 222222222222222222222 1111111111 222 222222 111 11 22222222 1111 111 1111111 11 1111 1111111 111 1111 11111 2222222 111111111111 2222222222 111 33333333333 11 1111 111111111 22222222 1111 111111111 11111111111 11111 111 1111 11111111111111 4444444444444444444444444444444 1111111 111 55555555555555555555555555555555555555555555 1 11111111111 1111111111111111 3333 111111 1 1111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111111 1 22222222 2222222222222222 1111 111 11111 11111111111 11111 22222 88888888888888888888888888888888888888888888888 2222222222 222 11111 1111 222 77777777777777777777777777777777 4444444444 11 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111 1111 11 3333333333333 33333333333 66666666666666666666666666666666666666666 11 222222 111 11111 111 22222 111
lowQualScore : 55 4 11 8 777 99 44 00 55 22222222222222 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 0 3 3 2222222222222222222222222222 3 44 3 3 3 3 222222222222 888888888 0 3 7777 3 333333333 44 22222 555 44 3 99999999999999 3 999999 77 1111111111 3 1111 7777777 6 3 000000 7777 6 44 6 44444444444444444444444444444444444 3 111111111111111111111 7777777777 3 44 000 3 444444 3 000 00 55555555 3 1111 3 666 3 1111111 00 4444 0000000 3 777 6 0000 44 33333 44 3 7777777 44 222222222222 3 3 5555555555 888 3 44444444444 3 44 44 3 77 88 6666 2 33 88 44 6 555 6 3 555 00 3 1111 3 3 6 3 000000000 44 3 3 44444444 44 555 3 44 666666 3 44 44 0000 3 44 333333333 3 6 44444444444 3 55555 88 3 555 44 000 77 3 0000 555 999999 3 3 9999999 3 333 44 7777 44 3 3 3 99 555 3 88888888888888 6666666666666666666666666666666 3 7777 3 3 3 77 3 6 3 3 7777777 222 77 3 3 44 99999999999999999999999999999999999999999999 0 6 3 88888888888 3 3 66666 4444444444444444 7777 3 2222 44 3 7 7 666666 3 0 7 666 2222 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 000000000 3 4 7 7777 1 44444444 0 55 7777777777777777 4 55 55 777 55 4 2222 55 4 111 4 22222 8 4 99999999999 55 8 8 11111 22222 55 44444444444444444444444444444444444444444444444 8 8 8 8 8888888888 8 555 33333 8 8 999 2222 0 222 33333333333333333333333333333333 0000000000 8 8 99 8 8 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 99 77777 2222 99 3333333333333 55555555555 22222222222222222222222222222222222222222 11 333333 8 8 444 0 3 88888 1 666 11111 666
lowQualScore : .. . .. . ... .. .. .. .. .............. ................................................................................................................................................................ . . . . ............................ . .. . . . . ............ ......... . . .... . ......... .. ..... ... .. . .............. . ...... .. .......... . .... ....... . . ...... .... . .. . ................................... . ..................... .......... . .. ... . ...... . ... .. ........ . .... . ... . ....... .. .... ....... . ... . .... .. ..... .. . ....... .. ............ . . .......... ... . ........... . .. .. . .. .. .... . .. .. .. . ... . . ... .. . .... . . . . ......... .. . . ........ .. ... . .. ...... . .. .. .... . .. ......... . . ........... . ..... .. . ... .. ... .. . .... ... ...... . . ....... . ... .. .... .. . . . .. ... . .............. ............................... . .... . . . .. . . . . ....... ... .. . . .. ............................................ . . . ........... . . ..... ................ .... . .... .. . . . ...... . . . ... .... ............................................................................. ......... . . . .... . ........ . .. ................ . .. .. ... .. . .... .. . ... . ..... . . ........... .. . . ..... ..... .. ............................................... . . . . .......... . ... ..... . . ... .... . ... ................................ .......... . . .. . . ........................................................................... .. ..... .... .. ............. ........... ......................................... .. ...... . . ... . . ..... . ... ..... ...
lowQualScore : 55 7 00 0 000 22 66 44 88 55555555555555 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 6 9 6 6 0000000000000000000000000000 3 66 3 3 3 3 111111111111 444444444 4 3 1111 3 333333333 66 66666 888 66 3 00000000000000 3 222222 99 8888888888 3 1111 7777777 7 3 000000 1111 7 66 7 99999999999999999999999999999999999 6 555555555555555555555 6666666666 3 66 000 6 555555 6 000 00 22222222 6 4444 6 444 6 8888888 22 1111 7777777 3 555 7 4444 66 00000 66 3 5555555 66 777777777777 1 1 3333333333 111 1 66666666666 1 22 22 1 33 55 5555 9 99 55 22 2 444 2 1 444 44 1 8888 1 1 2 1 222222222 66 3 3 22222222 66 888 3 66 888888 3 66 66 8888 3 66 333333333 3 7 33333333333 3 00000 55 1 444 22 888 33 1 4444 888 666666 3 3 3333333 3 888 66 1111 66 3 3 3 22 888 3 22222222222222 5555555555555555555555555555555 3 1111 3 3 3 99 3 7 3 3 5555555 555 99 3 3 66 99999999999999999999999999999999999999999999 0 7 3 66666666666 3 3 22222 5555555555555555 1111 3 5555 66 3 3 3 000000 6 9 3 444 7777 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 999999999 6 5 3 8888 4 44444444 8 55 3333333333333333 0 55 55 000 55 0 5555 55 0 000 0 55555 0 0 00000000000 55 0 0 66666 55555 55 00000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 0 0 8888888888 0 000 00000 0 0 222 6666 8 000 22222222222222222222222222222222 8888888888 0 8 00 0 0 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22 88888 0000 00 2222222222222 44444444444 22222222222222222222222222222222222222222 00 000000 0 0 000 8 2 55555 0 888 00000 222
consensus : GAACAAAA--AAATAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--AAA--GA--TATTTT--T----GA-A-AAAAAA----------T-----T-----A---A--AAATAT------TTG--CCA-AA--------AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAA-------T-----C-AA-T-C-GTAAA-------T------GTC---A-TT--TTAAA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----A---GAG-CG----A-T---------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG---A---G-AC-ATA------TAAA--TTCA----AC--C-ATA-GA-T--AC--T----AA-G-A----C-A----A-G--G-CATT---CAAAT---C----TATAATCTC---AA---AAAAAAT-TCAAAAATTCA--TTAA-----AAAAG----A-----A-T--AAT---GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGA-AA-----TT-T-T--GA-AAA---C-T-------AA-ACG----TT--TCN--AAT-GT---T-AGAA----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AT-AAAA------A---TAA---TTTTC-G-----------G-TT--C--A-T--A--TT-T--G-T--ATTTTT--TGTAAA--T-G---TG-A-CAC---T--CC-T-T--CATTTT-CAG-G-G-AT------T--TG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T-AGCAG--A--TA-G--A-AG--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-A-TTTG--C----A--AA-G-T-TT--C---A-T-------C-A----ACTTCC--G-A-----------C-G--AG--------ATT-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-TTT-TTTCG-T-------AA---TT--C-AA-TT--TTC--T------A-----G--------------------A---A---TG-AC-T-A-----T-C---AA-AT-T---T-AG------A-A--C----CGG----A-A----GTGACA--A-AA-CCG-GA--A---GTG-T-T-AC---A----GGG--A-----TA-------G---G-T---AA-------T----A--A-------T-GA----T-T---------A----GG---A-----CC-A-TT-AN-T-TCGT-T------TATA--AAAA------A--A------T-AA--AG--A---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-T-T-----------T--TA-G-A--AG-AA-----GA--AA------------T-C----T-TT------------------------AAGCCC-CCAGAAGTC-CCT-TAAG-GGG-T-CA-----AAAA-AT---TG--C-ACT-AC-GGC-C-C--ATATATT---TTTTA-GAT-T-TAA-TCGG--NA---CGACT----ATAAAGA-----T----TCA-TNAATCACTAA--A-CGG-TTT----G--AA-AA-----TC-----CGATAT---------A-----AAA---AAGTTG-G-----AGC--------AT--AAAGAT----TCA-T--AA--TCACT--------AA--GACGGTTTG--CG------AAAATC-----CG--AT------A------T-AAAA-----------AAAG--TT------G-AA-GCC---GAAAGAA--T--TATTTCNA-ATATTC---TAGC--CCCTACAGA
Reference ( family-3270 ) : GAACAAAA--AAATAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--AAA--GA--TATTTT--T----GA-A-AAAAAA----------T-----T-----A---A--AAATAT------TTG--CCA-AA--------AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAA-------T-----C-AA-T-C-GTAAA-------T------GTC---A-TT--TTAAA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----A---GAG-CG----A-T---------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG---A---G-AC-ATA------TAAA--TTCA----AC--C-ATA-GA-T--AC--T----AA-G-A----C-A----A-G--G-CATT---CAAAT---C----TATAATCTC---AA---AAAAAAT-TCAAAAATTCA--TTAA-----AAAAG----A-----A-T--AAT---GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGA-AA-----TT-T-T--GA-AAA---C-T-------AA-ACG----TT--TCN--AAT-GT---T-AGAA----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AT-AAAA------A---TAA---TTTTC-G-----------G-TT--C--A-T--A--TT-T--G-T--ATTTTT--TGTAAA--T-G---TG-A-CAC---T--CC-T-T--CATTTT-CAG-G-G-AT------T--TG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T-AGCAG--A--TA-G--A-AG--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-A-TTTG--C----A--AA-G-T-TT--C---A-T-------C-A----ACTTCC--G-A-----------C-G--AG--------ATT-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-TTT-TTTCG-T-------AA---TT--C-AA-TT--TTC--T------A-----G--------------------A---A---TG-AC-T-A-----T-C---AA-AT-T---T-AG------A-A--C----CGG----A-A----GTGACA--A-AA-CCG-GA--A---GTG-T-T-AC---A----GGG--A-----TA-------G---G-T---AA-------T----A--A-------T-GA----T-T---------A----GG---A-----CC-A-TT-AN-T-TCGT-T------TATA--AAAA------A--A------T-AA--AG--A---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-T-T-----------T--TA-G-A--AG-AA-----GA--AA------------T-C----T-TT------------------------AAGCCC-CCAGAAGTC-CCT-TAAG-GGG-T-CA-----AAAA-AT---TG--C-ACT-AC-GGC-C-C--ATATATT---TTTTA-GAT-T-TAA-TCGG--NA---CGACT----ATAAAGA-----T----TCA-TNAATCACTAA--A-CGG-TTT----G--AA-AA-----TC-----CGATAT---------A-----AAA---AAGTTG-G-----AGC--------AT--AAAGAT----TCA-T--AA--TCACT--------AA--GACGGTTTG--CG------AAAATC-----CG--AT------A------T-AAAA-----------AAAG--TT------G-AA-GCC---GAAAGAA--T--TATTTCNA-ATATTC---TAGC--CCCTACAGA
gi|1 : GAACAAAAGAAAATAG--GGCT-TTTTTACGACCT--CCAAAA--GAAATATTTG--T----GA-A-ACAAAT----------T-----TTCTATG---A--AAATCT------TTG--CC---A--------AA----AAA---ATC-----T--------------A-------------------T---A------AA--G------------AAGA-------
gi|1 : ttctttttgaagtctcc--C--AAA--AA--AATCTA--T----AA-A-GAAGAA----------A-----A-----A---A--AAATATAC----TAG--GTA-AG--------AG----AAATCAAAT-----T--------------GAGT----------------T---T------AA--A------------AAAAAAGATTTT-----C-AA-T-C-GTAAA--------------GTC---A-CT--T-AAA-AGTA--ATT-T-GATGAG-T------------CTAA---------GAG-CG----A-T---------AAC--T--CTCG---T--GAG-AGCTTGTATA---A-CC-ATA------TAAA--TTCA----AC--G-ATAAGA-T--ACC-T----AA-G-A----C-A----A-G--G-CATT----AAAT------------AT-TC---AC---AAAAAAT-T----AATT----TTAA-----AAAAA----ACCGATA-TCAAAT---GAAGAT-A------TAGA---CGC--TGA-CA-----TT-T-T--GA-AAAA--C-T-------AA-ACG----TT--TTA--AAT-GT---TCAGAA----AA--ATG---G--AA-T-------A--TAAAAATC------A-AT-AAAA------AAAATAA---TTTCC-G-----------T-TT--C--ACT--A--TT-G--A-T---TTTTT--TGTAAA--TTG---TG-AACAC---TTCCC-T-TGTCATTTC-----G-G-AT------TAATG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---CT-C-AGCAGCAA--TATG--A-AG--TA---------GG-T-CACC-----------CT-GG----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----G---A------CA-TCGC---T---AAA-TATTA-TTTG--C----ACCAA-G-T-TT--TCATA-T-------C-ACTTAACTCCC--G-A-----------C----------------T-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-TTT-TT-CG-T-------AAA--TT--C-AA-TT--TTTCAT------A-----G--------------------A---AC--TG-AC-T-A-----T-C---AA-AT-TATAT-AG------A-A--C----CGG----A-A----GTGACA--A-AAACCGTGA--A---GTG-T-T-AC---A----GGG--A-----AAAAAAGGGG---G-T---AAACAAAAAT----A--AGATTTTTT-GG----T-TTTAAAAAAAA----GG---ATGGATCC-AATT-AA-T-TCGT---------AAA--AAAG------A--A------T-AA--AGTGA---AA--G-A----TA--ACC-TCT---A-C---T-TAT-T-T-----------TATTA-G-A--AA-AATTAAGGT--AA------------T-C----C-TTTTAATTTCTAATATTTCGAGTATAAAGCCCTCCAGAA-TCACCT-TAAG-GGGCT-CA-----AAAA-AT---TG--CAACT-ACGGGC-C-C--A-ATATTTTCTTTTA-GATAT-TAA-TCGG--AAGCGTGAC-----ATAAGAA-----T----TCA-TCAATCACTTT--A-ATG-TTT----GT-AATAATGATTTC-----C-ATAT---------ACTTTGAAA---TAATTGTG-----AATTTCTTTTAAT--CAGGGG----TCATT--AACGTTACTCTTAGTTGAAATGATTGTTCG--CGAATTAAAAAAT----------AT------A------T-AATA-----------AAAG--TT------G-AACGCT---GAAAGaaaaaaaatatactaggtaagagaaatcaaattgagtttaaaaaaaaagattttcaatcgtaaagtcacttaaaagtaatttgatgagtctaagagcgataactctcgtgagagcttgtataaccatataaattcaacgataagatacctaagacaaggcattaaatattcacaaaaaattaattttaaaaaaaaccgatatcaaatgaagatatagacgctgacattttgaaaaactaaacgttttaaatgttcagaaaaatggaatataaaaatcaataaaaaaaataatttccgtttcactattgatttttttgtaaattgtgaacacttcccttgtcatttcggattaatgtttctggaaaacctcagcagcaatatgaagtaggtcaccctggacttttttgtttgtttagacatcgctaaatattatttgcaccaagttttcatatcacttaactcccgacttgtgaaagatttagctttttcgtaaattcaatttttcatagaactgactatcaaattatatagaaccggaagtgacaaaaaccgtgaagtgttacagggaaaaaaagggggtaaacaaaaataagattttttggttttaaaaaaaaggatggatccaattaattcgtaaaaaagaataaagtgaaagataacctctacttattttattagaaaaattaaggtaatccttttaatttctaatatttcgagtataaagccctccagaatcaccttaaggggctcaaaaaattgcaactacgggcccaatattttcttttagatattaatcggaagcgtgacataagaattcatcaatcactttaatgtttgtaataatgatttccatatactttgaaataattgtgaatttcttttaatcaggggtcattaacgttactcttagttgaaatgattgttcgcgaattaaaaaatatataataaaagttgaacgctgaaagctatt
gi|10 : ttctttttgaagtctccgaacaaaagaaaatagggcttttttacgacctccaaaagaaatatttgtgaaacaaattttctatgaaaatctttgcA-A-AAGAAA----------G-----G-----A---A--AAA-A--------------A-AA--------GA----AAA---AACGATATT--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAAAGAAAT-T-----C-AAAT-CAGTAAA-------TA-----GTC-----TTACTTAAATCGTA--ATT-TAGAT-AG-TAC----------TTAA-----A---GAG-CG----A-T---------AAC--T--C--GTGTT--GAGTA---TG---A---ATAC-ATA------AAAAG-TTCAAG--ACG-A-ATA-GATT--ACTAT----AA-G-A----C-A----A-G--G-CAAT---AAAAT-------------TTTC---A--------------AAGAATTAA--TTTA-----AGAAG----------A-T--AAT---TGAGAT-A------T-TGTATTGC--TGA-CA-----TTGT-T--GA-AAA---C-T-------AA-ATGACGTTT--TCC--ATC-TT---T-AGAA----AA--A-A---G-----T-------A--TA-----C------A-AT-AAAAAATAT-A---TAA---TTTTC-G-----------GTTT--C--A-T--ATTTT-T--G-T--A-TTGT--TGTAAA--T-G---TG-A-C-T---T--CC-T-T--CA-TTG-CAGTG-G-AT------TTCTG-TTTCAT-G--------G--A---A-AC--T---TA-T-AGCAG--A--TG-T--G-GA--TAACGACTTTTGG-T-CACCCGTTCTTA---TT-GATATTAC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTAATTGA---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-ATTTTG--C----A--AA-G-T-TT--C---A-T-------C-A----ACTTCCT-C-A-----------C-G--AC--------A-T-T----GT-GG-AAG-ATTTTAG-GC-CTT-TTTCG-T-------AA---TT--C-AA-TTTCTTC--T------A-----G--------------------AT--AT--TGTACTT-A-----T-CCATAA-AT-T---T-AG------A-T--C-----------A-ACTC-GTGACA--A-ctatt
gi|11 : aaaaaaaaaaaaaaaaaataaaaaaaaaaaaa--TT-TT---TT--G---TTTGCCT-TTA----G---A------CAAT-GC---T---GAA-TAA-A-TT-G--C----A--AA-G-T-TT--C---A-TT------C-A----ACTTCCCCG-A-----------C-G--AG--------ATT-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-TTT-TTTCG-T-------AAAATTC--C-AA-TT--TCG--TA-----A-----A--------------------A---A---TG-A--T-AT----T-C---AA-ATAT---T-AG------A-AATC----CGG----A-AG---GTGACA--A-AA-CCG-GA--A---GTG-TAT-ACCATG----GGA--A-----TA-------G---G-TGTAAA-------T----A--A-------T-GA----C-T---------A----GA----------C-A-TTAAT-T-TCATAC------TATA--AAAA------A--A------T-AA--AG--A---GA--G-A----TA--A-T-CTT---ACC---A-AACTT-T-----------T--TA-GAA--AG-AAAC---GA--AA------------TCC----T-TT------------------------AAttgcgttagtgacaaaccg
gi|12 : actT-T--G-T--ATTTTT--TGTGAA--T-G---TC-A-CAC---T--CC-T-T--CCTCAT-CAG-G-A-AT------T--TG-TATC-T-C--------G--A---A-AA--C---TG-T-AGCAG--A--TA-G--A-AG--TA---------GG-T-CACC-------T---TT-G-----AC--TT-TT---GT--G---TTTG--T-TTA----A---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-A-ATTG--G----A--AA-G-T-TT--C---T-T-------T-A----ACTTCC--G-A-----------C-G--AG--------ATT-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-ACT-TTTCA-TACATGTCAA---TT--C-AA-TT--TTC--T------A-----A--------------------A---A---TG-AC-T-A-----T-A---AA-AA-T---T-AT------A-A--C----CGG----A-A----GTGTCA--A-AA-CCG-GA--A---GTG-T-T-AT---A----GGG--A-----TA-------G---A-T---TA-------C----A--A-------T-GG----A-T---------A----GG---A-----CC-A-CT-cagtttctaatattca
gi|13 : GACCT--T--AAA--GA--TATTTT--T----GA-A-AAAAAA----------T-----TCTT--A---A--AAGTTT------TTG--CCA-AA--------AA----AA------C-----T--------------A-------------------TAA-T------AA--A------------AAAA-------T-----CCAA-T-C-ATAAA-------T------GTC---AATT--TCAAA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----A---GAG-CG----A-A---------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG---A---A-AC-ATT------CAAA--TCCT----AC--C-ATA-AA-T--AC--T----AA-G-A----C-A----A-G--G-CATT---TAAAT---CTCCATGTAATCTCAATAA---AAAAAAT-TCAAAAATACA--TTTA-----AAAAT----A-----A-T--
gi|14 : AGCTC-ACAGAAGTC-CTT-AAAG-GGG-TCCA-----AAAATAT---TG--C-ACTAAC-GGCTC-C--A-ATATT---TCTTACAAT-TGCAATTCGGGATA---TGA------ATAAAGA----------TCA-TAAATCACTAA--ATCGGTTTT----G--TA-AA-----TC-----CGGCATAAAAATCTAA-----AAA---AAGTTG-A-----AGC---------T--GAAAAT----T
gi|14 : --------AT--AAAGAT-----CA-T--AAA-TCACT--------AA--ATCGGTTT---TG------TAAATC-----CGGCAT------AAAAATCT-AAAA-----------AAAG--TT------G-AA-GCT---GAA--AA--T--TATTTCTATATATTC---TAG---CTCTACAatttctatatattctagctctacatga
gi|15 : agctcacagaagtccttaaaggggtccaaaaatattgcactaacggctccaatatttcttacaattgcaattcgggatatgaA--GA--TATT---------AA-A-AAAAAAATGT------T-----T-----A---G--AAATAT------TTG--CCA-AA--------A-------------------C--------------A-------------------C---T------AA--A------------AAAT-------C-----C-AA-T-C-ATAAA-------T------TTC---A-TT--TAAAA-AGAT--GTT-T-GAT-AG-T------------CTAC-----A---GAG-TG----A-T---------AAC--T--C--G---T--AAG-A---GG---A---G-AC-AGT------TAAA--TTCT----AC--C-ATA-GG-A--AC--T----GA-G-A----C-A----A-G--G-CATT---TAAAT---CTCCATATAATCTC---tga
gi|16 : AACAAAA--AAACAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--ATA--GA--TATTTT--T---------AAAAAATGCT------T-----T-----A---A--AAAAAT------tata
gi|17 : gatgcatggaatgaagcatgtcatgtagcaaaataacatttagaaatataattctttttggtctcta-----C------A-AT-AAAA------A---TAA---TTTTC-G-----------G-TT--C--A-T--A--AT-T--G-T--GTTTTT--TGGGAA--T-G---TC-A-CAC---T--CC-T-T--CATCTT-CAG-G-G-AT------T--T--TATC-T-C--------G--A---A-AA--C---TG-T-CGCAG--A--TA-G--A-AG--TA---------GG-T-CTCC-------G---CT-G-----AC--TT-TT---TT--G---TTCA--T-T
gi|18 : AAG----A-----A-T--AAT---GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGA-AA-----TT-T-C--AA-TAA---C-TTACAACAAG-ACG----TG----C--AAT-GT---T-AGAA----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AG-AAAA------A---TAA---TTTTC-C-----------G-TT--C--A-T--A--TT-T--G-T--ATTTT
gi|19 : -GT---T-AGAA----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AT-AAAA------T---TAT---TTTTTTG-----------G-TT--C--A-T--A--TT-T--G-T--ATTTTT--TGTAGG--T-G---TG-A-CAC---T--CC-T-T--CATCTT-CAG-G-G-AT------T--TG-
gi|2 : c--TTAAC-AGTATGATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----ATA-GAG-CGGGATA-T---------AAT--T--C--G---T--GAG-ACCGTG---A---T-AC-ATA------TAAAATTTCA----AA--CGATA-GA-TGTAC--T----AA-G-A----CCA----A-G--G-CATTTTTCAAAG--------TATG---TC---AG---AAGAAAT-CTAA---TCTA--TGAA-----AAAAT----ACG---A-T--AAT---GAAGATGA------T-GAG--CGC--TGA--------CT-T-T--GA-ACA---C-T-------AA--CG----TT--TTA--AAT-GTGTAT-AGAAT---AA--A-G---GCGAACT-------A--TAA----CTATTTAA-AC-GAAT------A---TAT---TTTTC-GTCT--------G-TTTTC--A-TT-A--TTGT--G-TTTATTTTT--TGTAAAACT-G---TG-A-CATCTTT--CCATGT--CATTTT-CAG-C-G-GTGATTTTT--TG-TTTC-TTG--------GTAA---A-AA--C---C--T-AGCAG--A--TG------AGCTTA---------GGGTACACC-------G---CTTG-----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----GTCTATTTTTTCG-T-AA---T---GAA-TAT---TCTG--CTCATA--CA-G-TATTACT---A-T-------CCA----ACCTCCTCG-A-----------C-A--A----------TT-T----GTTGA-AAG-ATTT--ACGCATTTATTTCG-T-------AT---TT--TTAA-GT--TCC--T------A-----GATTTATCTTTGCATATGTTAA---A---TGGAC-T-AGTACTT-A---AA-AT-T---T-AGTTTAGGA-AT-C----CGG----G-ATCC-GTGTTATTA-TATCCG-AA--AA--GTG-A-T-AT---ACTACGGG--AAAATTTG-------T---G-T---AA-------A----A--A-------T-GAGCTTT-T---------ACT--GGCGCA-----CC-A-TTTAG-A-TCGT-T------TATA--AAAG------A--AC-----T-AA--AG--ATATGA--G-GCATTTA--ACT-CTT---A-C---C-AAT-T-TCTGCCTCCTCTT--TA-G-A--TT-A------GA--AA------------T-C----T-TTTAAATGCTCTAAGATTC-------AAGCCT-CCAGAAGTC-CCTATAAGAGGG-C-CGTGCATAAAA-ATGA-TGTCT-ACT-AC-GGT-C-CCAATTTATTA--TTTTA-GAT-T-T-G-T--G--TA---CG-TT----ATAAAGA-----TAAGGTCATTAAATCCCTAACGA-TGG-TTTGATCG--AA-AA-----TCGAGCATGATAT---------A-----AAATATAAG--G-GGAGAAAGC--------ATTGAAAGA
gi|2 : aaatctggtattatgttataataacataatataaataatagaacctacagattcgctcaaaaagtaggcacac--------AT--AAAGATAAGGTCA-TTAAA--TCCCT--------AAC-GATGGTTTGATCG------AAAATCGAGCATG--AT------A------T-AAAATATAAGGGGAGAAAGCATT------GAAA-GACATGGAAAGAGACT--TATTTCCA-AAATTTTTATAGCGTTCCTACcatggaaagagacttatttccaaaatttttatagcgttcctacgcttcctgtaagattgtcttctttcgaggagatgaccatatttc
gi|20 : aaatctggtattatgttataataacataatataaataatagaacctacagattcgctcaaaaagtaggcacacttaacagtatgatttgatagtctaaatagagcgggatataattcgtgagaccgtgatacatataaaatttcaaacgatagatgtactaagaccaaggcatttttcaaagtatgtcagaagaaatctaatctatgaaaaaatacgataatgaagatgatgagcgctgactttgaacactaacgttttaaatgtgtatagaataaaggcgaactataactatttaaacgaatatatttttcgtctgttttcattattgtgtttattttttgtaaaactgtgacatctttccatgtcattttcagcggtgattttttgtttcttggtaaaaacctagcagatgagcttagggtacaccgcttgacttttttgtttgtttagtctattttttcgtaatgaatattctgctcatacagtattactatccaacctcctcgacaatttgttgaaagatttacgcatttatttcgtatttttaagttcctagatttatctttgcatatgttaaatggactagtacttaaaatttagtttaggaatccgggatccgtgttattatatccgaaaagtgatatactacgggaaaatttgtgtaaaaatgagcttttactggcgcaccatttagatcgtttataaaagaactaaagatatgaggcatttaactcttaccaatttctgcctcctctttagattagaaatcttttaaatgctctaagattcaagcctccagaagtccctataagagggccgtgcataaaaatgatgtctactacggtcccaatttattattttagatttgtgtacgttGAACAAAA--AGAGAG--GGCT-TTT---CGAgcttcctgtaagattgtcttctttcgaggagatgaccatatttc
gi|3 : aagaataactagacctttttgtcactCT--T--AAA--AT--TATTTT--T----GTTA-AAAAAA----------T-----T-----GTTTA--AAATATATATTTTTG--CTG-TA--------AT----AAA---AAA-----T--------------A-------------------TA--T------AA--AGAAAAGAAAAAAAAAA-------TG----C-AA-T-C-GTAAAAT-----T------GTTCAAA-TT--T---A-AGTA--ATT-T-GAT-AG-TG-----------CTAACTCACAC--GAG-TG----ACT---------TAC--T--CA-G---TTCGAG-A---TGG--A---G-AA-ATT------TAAA--TTCA-----C--C-ATT-AA-TT-AC--T----AA-G-G----CTA----A-G--T-CATT---CTAATAAAC----TCTCA-CTC---AATTTAACATACATCAAAAATTCAAATTAA-----AAAAGCAAGA-----A-T--AA-----AAGAT-AA-----T-G----TGC--TGA-AA-----TA-T-A--TA-AAA---C-T-------A---CG----GT--TCTTTAAT-GT---TTAGAA----AA--A-A---G--AA-T-------ACTTA-----CG-----A-AT-AAAATTAGATA---TAG---TCGAC-G-----------G-TT--C--A-TTTA--TT-TTTG-T--ATTTTT---GTAAA--T-G---TG-A-CAC---T--CC-TAT--CATTTT--AG-G-G-AT------T--TGGTTTC-T-G--------G--A---ATAA--CGAATAGT-AGCAG--A--TAAG--A-AA--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----AC--TT-TT---T---G---TTCG--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---GAA-TAT-A-ATTGGCC----A--AA-G-T-T---C---G-T-------C-A----ATTTCC--T-C-----------C-G--AGTCACGCA-GTG-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-TCG-TTTCT-A-------AA---TT--C-AA-TT--TTC--TCCTCCTG-----A--------------------A---A---TG-AC-C-A-----C-T---AA-TT-T---TTAG------G-A--C----CGA----A-AACC-GTGA-A--A-AA-CCGCAA--A---GTG-C-TGAC---A----GAATTA-----TA-------AATCG-T---AA-------T----ATTA-------TCGC----T-TTTTTTG---A----GC---A-----CA-A-TT-AAAT-TCAT-T------TA-----AAA------A--A------T-AAGAAG--A---GT--G-A----TA---CT-CTTTTTA-C---A-AAC-T-T-----------T--TA-GCA--GG-AA-----GA--AAAATATTTAGTGTT-CTAAAT-TT------------------------CAGCTT-CCAGAAGTC-CCT-TAAG-GGG-T-C-------AAA-ATTCATG--C--CT-AC-GGC-TGC--ATAT-TG---TTTTA-A---T-TGC-TCG--------CGTCTTTCGATAAAAAATACCC----TAA-TCAATTATTAAG-A-CAG-TTT----GCAAA-AG-----TC-----CGAT-T---------A-----AAA---AA
gi|3 : --AA--TTATT--------AA--GACAGTTTG--CA------AAAGTC-----CG--ATTAAAAAA------TTAAGA-----------AAAG--TCTGTTTAG-AG-ACC---GACAGAA--TATTATTGCAA-ATAT------AGC--CCCTACAGAttaagaaaagtctgtttagagaccgacagaatattattgcaaatatagcccctacagattctaatttctctgtggagattatatttc
gi|4 : cttaaaattatttttgttaaaaaaattgtttaaaatatatatttttgctgtaataaaaaatatataaagaaaagaaaaaaaaaatgcaatcgtaaaattgttcaaatttaagtaatttgatagtgctaactcacacgagtgacttactcagttcgagatggagaaatttaaattcaccattaattactaaggctaagtcattctaataaactctcactcaatttaacatacatcaaaaattcaaattaaaaaagcaagaataaaagataatgtgctgaaatatataaaactacggttctttaatgtttagaaaaaagaatacttacgaataaaattagatatagtcgacggttcatttatttttgtatttttgtaaatgtgacactcctatcattttagggatttggtttctggaataacgaatagtagcagataagaaataggtcaccgctgactttttgttcgtttagacatgctgaatataattggccaaagttcgtcaatttcctccgagtcacgcagtgtgtgaaagatttagctcgtttctaaattcaattttctcctcctgaaatgaccactaatttttaggaccgaaaaccgtgaaaaaccgcaaagtgctgacagaattataaatcgtaatattatcgctttttttgagcacaattaaattcatttaaaaaataagaagagtgatactctttttacaaacttttagcaggaagaaaaatatttagtgttctaaatttcagcttccagaagtcccttaaggggtcaaaattcatgcctacggctgcatattgttttaattgctcgcgtctttcgataaaaaataccctaatcAACAAAA--CACTAGATGGCT-TTT---CGACCCTCC--AAA--GAGATATTTT--TTATAGA-G-GGAAAAGTATGCATTCT-----T-----ATT-A--AAATAT------TTGCCCCA-AAAAGTC---AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------TA--A------------Attctaatttctctgtggagattatatttc
gi|4 : ccgccgaaactcaCAAAA--AAA-------CTATTT---AAACCA--C--AAAA-GA--TATT--------------AAGAAA----------C-----C-----A---A--AAA-AT------T----CCA-AATCCGTTTTAA----A-------------T--------------A-------------------TGCGT------AA--A------------AAAG-------T-----C-AACT-T-ACAAA-------T------G--------------AA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-TATACTCTAAATCCTAA-----A---G-G-CG----A-TGGATATTAAAGC--TTTC--G---T--T-G-A---AG---AATCG-AC-ATACAATACTAAA--TTCA----ACACCGATA-GAAT--AC--TCCTAAATG-A----G-A----ATG--GTCG-----CAAAT--------TAAAAT-TC---AA---AAAAAAT-T-----ATTTA----AAT----AAAGG----A-----A-T--AATTGCAAAGAT-AGAAGAAT-GA---TGCATTGA-AACATTATT-TAT--GA-AAGAATC-T-------AA--CT----TT--CCG--CAT-ATCCTT-AGAA----AA--A-AAAAG--AA-CGCCACTAA--TA-----C------A-AT-AAAA------AA--TAAGA-TTTTC-GAAATCTACAGAG-TT--C--A-T--A--TT----G-T--ATTTTTACTGTAAA--T-G---TGGA-CAT---TT-CC-T-TA-CATTTT-CAG-GCG-AT------T--C---TTC-T-GTCCCGGGTG--A---A-AA--C---AA-T-AGCAG--A--TA-G--A-GT--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----GCATTT-TT---CT--GAACTTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GCA--TATGAAA-T-T-A-TTTG--C----A--AA-G-T-TT--C---ATT-------C-A----ACTTCC--GAA-----------CGG--AGGATTTCGAATT-T----AT-GA-AAG-ATTT--A-G--TCT-TTTCGTT-------AAT--TT--C-AA-TT--TTC--C------ATAGCGG--------------------AAACA---TG-ACTT-A-----TCC---AA-AT-T---G-AG------A-A--CACCGCGGAAAAA-A----GTGAC---A-AA-CCG-GACGA---GTG-TCT-AC---A----GGGA-A-----TAT------G---G-T---AATTCC---T----AC-A-------T-G-----T-T---------ATTTCGG---A-----CC-ACTT-AT-A-TTGT-TATAGGATATA--AAAAT-----A--AGACAATT-AA--AG--A---GA--G-AT---TA--ACTCCTT---A-CTCAG-AAC-T-T-----------T--TA-G-AG-AG-AATGC--AA--AA------------T-C----T-TT------------------------ccacaaaagatattaagaaaccaaaaaattccaaatccgttttaaatatgcgtaaaaaagtcaacttacaaatgaaagtaatttgatagtatactctaaatcctaaaggcgatggatattaaagctttcgttgaagaatcgacatacaatactaaattcaacaccgatagaatactcctaaatgagaatggtcgcaaattaaaattcaaaaaaaattatttaaataaaggaataattgcaaagatagaagaatgatgcattgaaacattatttatgaaagaatctaactttccgcatatccttagaaaaaaaaagaacgccactaatacaataaaaaataagattttcgaaatctacagagttcatattgtatttttactgtaaatgtggacatttccttacattttcaggcgattcttctgtcccgggtgaaaacaatagcagatagagttaggtcaccgctggcatttttctgaactttgtttagacatgcatatgaaattatttgcaaagtttcattcaacttccgaacggaggatttcgaatttatgaaagatttagtcttttcgttaatttcaattttccatagcggaaacatgacttatccaaattgagaacaccgcggaaaaaagtgacaaaccggacgagtgtctacagggaatatggtaattcctacatgttatttcggaccacttatattgttataggatataaaaataagacaattaaagagagattaactccttactcagaacttttagagagaatgcaaaatcttttaattctaa
gi|5 : ccgccgaaactcaaacaaaacactagatggcttttcgaccctccaaagagatattttttatagagggaaaagtatgcattcttattaaaatatttgccccaaaaagtAACAAAA--CACTAGATGGCT-TTT---CGACCCTCC--AAA--GAGATATTTT--TTATAGA-G-GGAAAAGTATGCATTCT-----T-----ATT-A--AAATAT------TTGCCCCA-AAAAGTC---AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------TA--A------------Ataattctaa
gi|5 : ccgccgaaactcaCAAAA--AAA-------CTATTT---AAACCA--C--AAAA-GA--TATT--------------AAGAAA----------C-----C-----A---A--AAA-AT------T----CCA-AATCCGTTTTAA----A-------------T--------------A-------------------TGCGT------AA--A------------AAAG-------T-----C-AACT-T-ACAAA-------T------G--------------AA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-TATACTCTAAATCCTAA-----A---G-G-CG----A-TGGATATTAAAGC--TTTC--G---T--T-G-A---AG---AATCG-AC-ATACAATACTAAA--TTCA----ACACCGATA-GAAT--AC--TCCTAAATG-A----G-A----ATG--GTCG-----CAAAT--------TAAAAT-TC---AA---AAAAAAT-T-----ATTTA----AAT----AAAGG----A-----A-T--AATTGCAAAGAT-AGAAGAAT-GA---TGCATTGA-AACATTATT-TAT--GA-AAGAATC-T-------AA--CT----TT--CCG--CAT-ATCCTT-AGAA----AA--A-AAAAG--AA-CGCCACTAA--TA-----C------A-AT-AAAA------AA--TAAGA-TTTTC-GAAATCTACAGAG-TT--C--A-T--A--TT----G-T--ATTTTTACTGTAAA--T-G---TGGA-CAT---TT-CC-T-TA-CATTTT-CAG-GCG-AT------T--C---TTC-T-GTCCCGGGTG--A---A-AA--C---AA-T-AGCAG--A--TA-G--A-GT--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----GCATTT-TT---CT--GAACTTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GCATATG--AAA-T-T-A-TTTG--C----A--AA-G-T-TT--C---A-TT------C-A----ACTTCC--G-AACGGAGGATTTC-G--A---------ATT-T----AT-GA-AAG-ATTT--A-G--TCT-TTTCG-TT------AA---TTT-C-AA-TT--TTC--C------ATAGCGG--------------------A---AACATG-AC-TTA-----T-CC--AA-AT-T---G-AG------A-A--CACCGCGG----A-AAAAAGTGACA--A-A--CCG-GACGA---GTG-TCT-AC---A----GGG--AA----TAT------G---G-T---AA-------TTCCTAC-A-------T-G-----T-T---------ATTTCGG---A-----CC-ACTT-AT-A-TTGT-TATAGGATATA--AAAATAAGACA--A------TTAA--AG--A---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-A-T-----------T--TA-G-A--GG-AA-----GA--AA------------T-C----T-Tccacaaaagatattaagaaaccaaaaaattccaaatccgttttaaatatgcgtaaaaaagtcaacttacaaatgaaagtaatttgatagtatactctaaatcctaaaggcgatggatattaaagctttcgttgaagaatcgacatacaatactaaattcaacaccgatagaatactcctaaatgagaatggtcgcaaattaaaattcaaaaaaaattatttaaataaaggaataattgcaaagatagaagaatgatgcattgaaacattatttatgaaagaatctaactttccgcatatccttagaaaaaaaaagaacgccactaatacaataaaaaataagattttcgaaatctacagagttcatattgtatttttactgtaaatgtggacatttccttacattttcaggcgattcttctgtcccgggtgaaaacaatagcagatagagttaggtcaccgctggcatttttctgaactttgtttagacatgcatatgaaattatttgcaaagtttcattcaacttccgaacggaggatttcgaatttatgaaagatttagtcttttcgttaatttcaattttccatagcggaaacatgacttatccaaattgagaacaccgcggaaaaaagtgacaaaccggacgagtgtctacagggaatatggtaattcctacatgttatttcggaccacttatattgttataggatataaaaataagacaattaaagagagataactcttacaaacatttagaggaagaaatctt
gi|6 : ccgccgaaactcaaacaaaacactagatggcttttcgaccctccaaagagatattttttatagagggaaaagtatgcattcttattaaaatatttgccccaaaaagtGAACAAAA--AAATAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--AAA--GA--TATTTT--T----GA-ATAAAAAA----------T-----T-----A---A--AAATAT------TTG--CCA-AA--------AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---C------AA--A------------ACAA-------T-----C-AA-T-C-GTAAA-------T------GTC---A-TT--TTAAA-AGTA--ATT-T-CAT-AG-T------------CTAA-----A---GAA-CG----A-T---------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG---A---G-AC-ATA------TAAA--TTCT----AC--C-ATA-GA-T--AC--T----AA-G-A----C-A----A-G--G-TATT---CAAATACCCG---TGTAATCTC---AATA-GAAAAAT-TCAAAAATTCA--TTAA-----AAAAG----A-----A-T--AAT---AAAGAT-A------T-GA---TGC--TGA-AA-----TT-T-T--GA-AAA---C-T-------AA-ACG----TT--TTT--AAT-GT---T-AGCG----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AT-AAAA------A---TAA---TTTTC-G-----------G-TT--C--C-T--A--TT-T--G-T--ATGTTT--TGTAAA--T-G---TG-A-CAC---T--CC-T-T--CATCTT-CAG-G-G-AT------T--TG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T-AGTAG--A--TA-G--A-AG--TA---------CG-T-CATT-------G---CT-A-----AC--TC-TT---TT--G---CTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-A-ATTG--C----A--AA-G-T-TT--T---G-T-------C-A----ATTTCC--G-T-----------C-G--AG--------ATT-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-TTT-TTTCG-T-------AC---TT--T-TA-TT--TTC--T------A-----G--------------------A---A---TG-AC-T-A-----T-C---AA-AT-T---T-AG------A-A--C----CGA----A-A----GTGACA--A-AA-CCG-GA--A---AAG-T-T-AC---A----GGG--A-----TA-------G---G-T---AA-------T----A--A-------T-GA----T-T---------A----GG---A-----CC-A-TT-AG-T-TCAT-T------TATT--AAAA------------------AA--AG--G---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-T-T-----------T--TA-G-A--AG-AA-----GA--AA------------T-A----T-TC------------------------AAGCCC-CCAGAAGTC-CCT-CAAA-GGG-T-GA-----AAAA-GT---TG--C-ACC-AC-AGC-C-C--ATATATT---TTTT----T-T-TAA-TT-G--AA---CGACTG---ATAAAGA-----T----TCA-T-AATCACTAA--A-CGG-TTT----G--AA-AA-----TC-----CGATAT---------A-----AAA---AAGTTG-G-----AGTG-------AT--AAAGAT----TCA-T--AA--TCACT--------AA---ACGGTTT----G------AAAATC-----CG--AT------A------T--AAA-----------AAAG--TT------G-GA-GTT---GAAAG-A--T--TATTTCGA---ATTC---TAGC--CCCTACAGA
gi|7 : AAAA--AAATAG--GGCT-TTT---TCACCT--C--AAA--GCC-TATTTG--T----AA-C-GAAAAA----------TATCTCT-----T---A--AATGAC------TTG--CCA-TA--------AA----AAA---GAC-----CCATAAAAAAGCCAGA-------------------T---TCCAAAAAA--A------------AAAA-------TT----C-AA-T-C-GTAAA-------A------GTC---C-AC--TTAAA-AGTA--ATTCT-GAG-AGAT------------CTAA-----G---AGG-CG----A-TA--------AACCGT--T--G---T--GAG-AAT-CG---A---ATACAATA------TAAA--CTCAAACGAC--C--TA-GA-T--AC--C----TA-G-AGCCCC-AGCACA-GCCG-CATT----AAA----C----CAT--TC------A---ACGAAAT-T---AAAT-----TTAACCACCAACAG----A-----ACT--AATC--GAAG-C-A------T-GA---TGC--TGATCA-----TT-T-G--GGCAAA---CTT-------AA-ACG----TTCGTCC--ACTCGT---T-AGAACCACAG--A-A---G--AA-TCAG----A--GG-----C------A-AT-AAAA------A---TAA---CTTTC-G-----------G--T--C--A-T--GATTT-T--G-T--ATTGTT--TGTAAA--C-G---CG-A-C-C---T--CC-TCT--CATTTTCCAG-G-GAAT------T--CG-TTTC-T-G--------G--ACGGA-AAATC---TA-T-AGCAG--AGTTA-G--AGAG--TA----------G-T-CACC-------G---CT-G-----AC--TT-TTGCCTTTGG---TTTGC-T-TTAG---G---A------CA-T-GC---T---AAAGTAT-C-ATTG--C-------AA-G-T-TTTCC---A-T-------CAA----ACTTCC--G-A-----------C-GGAAG--------ATTCC----GT-GACAAGAATTT--A-GC-TTT-TTTCT-A-------AA---TT--C-AA-TT--CTCATC------C-----G--------------------A---A---TGAAC-T-AC----T-C---AACAT-T---T-AG------A-A--C----CGG----ACA----GTG-CA--A-AA-CCG-GACCA---GTG-T-T-AC---A----GGG--------TA-------G---G-CTA-AA-------T----A--A-------T-GA----TCC---------A----GG---A-----CCAA-TC-AA-TCTTGT-T------T-TAACAAAA------G--A------T-AC--AA--G---GA--G-A----TA--ACT-CTTA--A-CA--A-AAC-TCT-----------T--TACG-ACCAG-AA-----GT--AA------------T-C----T-T
gi|8 : tcttttctggtctgccggaccaGAACAAAA--AAATAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--AAAAGAA--TATTTTTGT----GA-A-AAAAAATTC-------T-----T-----A---A--AAATAT------TTG--CAACGA--------AA----AAA---AAC-----T--------------ATAGAAAAACAAAAAAAAGAT---T------AAACA------------AAAA-------TTCAACC-AA-T-C-GTAAA-------A------GTC---A-AC--TTAAA-AGT---ATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----A---GAGCCG----A-TA--------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG---A---T-AC-ATA------TAAA--TTCA----TC--G-ATA-GA-T--AC--T----AA-GAA----C-A----A-G--G-C--------AAT---T-----------------------AAAAT-TCAAAAATTAAT-TTAA-----AAAAA----G-----A-T--AATG--GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGACCA-----TT-T-G--AA-AAA---C-T-------AACACGTCT-TT--TCC--CAT-GT---T-AGAA----AAACA-G---A--AA-T-------A--TA-----C------ACATAAAAA------A---TAAATTTTTCC-G-----------G-TT--C----T--A--TT-T--GTT--ATTTTT--TGTAAA--T-GCCTTG-A-CAT---T--CT-T-C--AATTTT-CA--G-G-AT------T--TG-TCTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-TAAGCAG--A--TA-GACA-AG--TA---------GG-TCCACC-------GAGCCC-G-----AC--TTGTT---TT--G---TTGT--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-A-TTTG--C----A--AA-GTT-TT--C---A-TATATAAAC-ACT--ACCTCC--G-A-----------C--------------ATT-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GCTTTT-TTTCG-TA------AA---TT--C-AATTT--TTC--T------A-----G------------------------A---TG-A--T-A-----T-CT--AG-AA-T---T-AG------AGA--C----TGG----A-A----GTGACA--A-AA-CCG-GA--A---GTG-T-TAAC---A----GGG--AC----TA-------G---G-T---AA-------T----A--A-------T-GA----T-T---------A----GG---A-----CC-A-TA-AT-T-TTGT-T------TATA--AAAA------AATA------T-AA--AG--A---GAAGA-A----TAGTACT-CTT---A-C---ACAACAC-T-----------T--TAGG-A--AGTAA-----GAACAA------------T-C----TGTT------------------------AAgttaatttctaatattccag
gi|9 : taaataataaacctagaattccttttttggtctcc-A-AAAAAA----------T-----T-----C---TTTAAATAT------TTG--CCA-AA--------AATATAAAA---AAA-----G--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAAAT-----T-----C-AA-TTC-GTAAAAAAAAAATAAAAAGGTC---AACT--TTAAA-AGTA--ATC-T-TGT-AT-C------------TTAA-----ACAAGAG-CG----A-T---------AAC--T-----G---T--GAG-A---TG-------T-AC-A-A------TAAA--TTCA----AC--G-ATA-GA-T--ACC-T----AA-G-A----A-A----T-G--G-CA---------------------GATT------------AAAAT-TCAAA---T----TTAA-----TAAAA----G-----A-T--AAT---GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGC-AT-----TT-T-TTTGA-AA----C-T-------AA-ACG----TT--CC----AT-GT---T-AGAA----AA--A-A---G--A--T-------A--TA-----C------A-AT-AAAACA----A---TAAAA-TTTTC-G-----------G-TT--CTCA-T--A--TT-T--G-T--ATTTTT--TGTAAA--TTG---TG-A-CAT---T--CC-T-T--CATT---CAG-G---AT------G--TG-TT-C-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T--GCAG--A--TA-GG-A-AG--TA---------G--T-CACC-------G---CT-GC----AC--TT-TT---TG--T---TTTG--TATTA----G---A------CA-T-GC---T---AA--TAT-A-TCTG--C----A--AAAG-T-TT--C---A-T-------C-A----ACTTCC--GGA-----------G-G--AG--------ATT-TTTGTGT-GA-AAG-ATTTT-A-GC-TTT-TT-CG-T-------AA---TTTCC-AA-AT--T-C--T------A-----G--------------------A---AA--TG-AC-T-A-----T-C---AA-AT-------AG------A----C----CGG----A-ACA--GTGACA--ACAA-CCG-GA--AAAAGTGGT-T-AG---ATG--GAG--A-----TA-------G---GGT---TA-------T----A--A-------T-GA----T-T---------A----GG---A-----CC-ATTT-AA-T-T-GT-T------T-TA--AAAA------A--A------T-AA--AG--A---GA--GTA----TA--ACT-CTT---A-C---A-AA--T-T-----------T--TA-G-A-----GA-----GA--AA------------T-CT---T-TT------------------------AAGtttctaatattacc
blockSeqs : . C AT A . TC . AG GA TTTTATAGAG TTCTTAAAAATATTTGCAACGAAAAAAAACTATAGAAAAACAAAAAAAAGATTAAACAAAAATTCAAC C A T A AAAAAAATAAAAAGGTCAACTTT T TG C A . A ATACTCTAAATC CTCACAC C GGAT C GGATATTAA CG TTC TGT TC T CCGTGAT A CAATAC AT AACGACC . TGT TCCTA T A GCCCC GCAC T CC T TTTAAATCTCCATGTAATCTCAATAA A CAAAAATTCAAATTAA CAAGA C . TGC G GAAGAA . TAT AT AACATTA G TTT C AAT T TACAACA CA ACGT TCTTT C GTA T CCAC AC AAAA CG C GCCACTA CT ACTATTTA C A TTAGATA ATT T AAATCTACAGA T TT TC . TT TT TTT T TT AC AC T CCT G . CTT T A GT C T C A GATTTTT GG A T TCCCGGGT TA CGG T AT GAATAG A . GT GAC G CT ACGACTTTT G A CGTTCTTA T ATATT AT G GCC TG AAC CC A ATTG TCT TTTTTT A . ATATG G AT GC TCAT . A T A AC . T ATATAAACACT GAACGGAGGATTTCGA C TTGT T C A TA C A A T ACATGTC AAT TC T T TC TAGATTTATCTTTGCATATGTTAAA T T T GTACTTA C A TT TTTAGGAATC AAAA C AAAA TT C T C AAAA G A G CAT CTAC TTATAAATCGTAATATTATCGCTTTTTTTGA CGCA A C A AAT C TATAGGA AC TAAGACAAT T GA . TAT AG T CATT GT C TTT C TCAG T C CTGCCTCCTCT . C A CCAG TGC AC TCTTTTAAATGCTCTAAGATTC . . A A CCGTGCAT T TCA TCTA A . TC CAAT A ACAATTGCAATTCGGGATATGA ATACCC T A CG T T GATCGAAAATCGAGCATGATATAAAATATAAGGGGAGAAAGC TG AAGGT TTA A AACG GATCG GAGCATGATATAAAATATAAGGGGAG CA TGTTTA A . ATG A ACT C AA TTTTA CGT
blockSeqs : . G AT A . TC . A GA TTTTATAGAG TATCTCTTAAATGACTTGCCATAAAAAAGACCCATAAAAAAGCCAGATTCCAAAAAAAAAAATT . C . . ATTGTTCAAATTT . . . . . . ATACTCTAAATC ACAA . . . GGATATTAA . TTC . . . AGAATCG . CAATAC G AGACGA . TT TCCTA T . CC . T . T TTCAAATACCCGTGTAATCTCAATA . CAAAAATTAATTTAA ACG . . TGC . GAAGAA . G AT AACATTA . AT . AAT . . A TCT CGTCC . CCT . T . AAAA . . GCCACTA . CG . . AATATA GA . AAATCTACAGA . . . . T AT GT . . AC . . . G . . T . AT . . C . TTC G . . TCCCGGGT . . . . TA . . . AG . . . . C GAGC . C AT . . . AAC C . G . . . . ATATG . A . . . . . . TC . . TCA GAACGGAGGATTTCGA . . . . . T . T . . T T T . . . CATAGCGGAAACA G T . TCCAT . . T AACACCG . . CTC . . . . CGA . C A . TG AAAATTTGTGTAAAAATGAGCTTTTACT A . C T ATC C TATAGGA . TAAGACAA . . . . . . T . . A . AA A . . . G C GAG AC . AATATTTAGTGTTCTAAATTT . . . . TCCA . GA CA . . TG AT . AATTGCTCGCGTCTTTCG TAAGG . A G . . GTAAATCCGGCATAAAAATCTAAAAAAAGTTGAAGC . T T . AAA GCA CGGCATAAAAATCTAAAA . . . . . A TAT A AT TC C
blockSeqs : . T . . . . . A C TTTGTGAA TTGTTTAAAATATATATTTTTGCTGTAATAAAAAATATATAAAGAAAAGAAAAAAAAAATG . C . . TAGTCTTACTT . . . . . . AC ATA . . . A . CA . . . AGAATCG . . . ACACCG . TT TAT . . CT . . . . TTCTAATAAACTCTCACTCAATTT . CAAAAATACATTTA A . . C . A . . . TCA . AT . . . . A . TCC . CCT . . . A . . CAG . C . . CAA GA . TCT . . . . . . T . . . . . . . . . . . TA . . . . T G . . . . . . . TG . . . GG . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . A . . . . . . . . . CCA TCCGAGTCACGCA . . . . . . . . . . A . . . . . CATAGCGGAAACA A . . TTC . . T AACACCG . . TCC . . . . CGA . C . . . AATATGGTAATTCCTACATGTTATTTC A . T . TT C AC . AATA . . . . . . . . . . . AC . . . . . . AGT . . TCCTTT . . . . TGA . . CA . . C AT . TTTAATTGAACGACTG T . C . . . GAAAATCCGATATAAAAAAGTTGGAGTG . T T . AAG TG CGATTAAAAAATTAAGA . . . . . . T G . . C
blockSeqs : . T . . . . . . . TTTGTTA TTCTTTAAATATTTGCCAAAAATATAAAAAAAGATTAAAAAAAATT . . . . TGTCAATTTC . . . . . . G A . . . A . C . . . ATCGAAT . . . ACACCG . AT CT . . C . . . . TTTTTCAAAGTATGTCAG . CAAAAATTCATTAA A . . G . . . . . CCA . T . . . . A . TTA . . . . . G . . . . C . . AA AA . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . TA . . . . T G . . . . . . . TG . . . T . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . A . . . . . . . . . TCA CCGACGAG . . . . . . . . . . . . . . . . TCCTCCTGAAA . . . TCC . . T AAATC . . ACC . . . . CCA . . . . . AATATGGTAATTCCTACATGTTATTTC A . . . GA T T . AAC . . . . . . . . . . . A . . . . . . AG . . TCTGTT . . . . TC . . C . . C A . AGATTTGTGTACGTT . . . . . . . . . AA G CGATATAAA . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . TTTGAAT GGAAAAAAAAAGAAAAAACGATATTATTAAAAAAAAGAAATT . . . . TTTCATTTA . . . . . . . A . . . . . C . . . TGAAT . . . AACG . AT T . . C . . . . CAAATTAAAATTCAA . AAGAATTAATTTA A . . . . . . . . CA . C . . . . A . CCG . . . . . G . . . . C . . AA . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . CT . . . . T G . . . . . . . AA . . . G . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . A . . . . . . . . . CAA GACGGAAG . . . . . . . . . . . . . . . . TAGATAT . . . TCC . . T AGAC . . CA . . . . AA . . . . . ATAGGTGTAAATAATGACTA A . . . TA T T . AA . . . . . . . . . . . C . . . . . . TT . . TCTTTT .
blockSeqs : . T . . . . . . . TATAAA CCAAAAAATTCCAAATCCGTTTTAAATATGCGTAAAAAAGT . . . . TGTCATTTT . . . . . . . A . . . . . C . . . TGGAG . . . ACC . T T . . C . . . . CAAATTAAAATTCAA . AAATTTAACCACC A . . . . . . . . AA . T . . . . A . CCG . . . . . G . . . . C . . A . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . T . . . . T G . . . . . . . AA . . . G . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . A . . . . . . . . . CA TCACGAC . . . . . . . . . . . . . . . . ATCCGAA . . . CTC . . G ATC . . G . . . . A . . . . . TAGGCTAAATAATGATCCA A . . . TA C T . AA . . . . . . . . . . . A . . . . . . GG . . TCTTT
blockSeqs : . T . . . . . . . TTTGAA CCAAAAAATTCCAAATCCGTTTTAAATATGCGTAAAAAAGT . . . . AGTCCACTT . . . . . . . A . . . . . C . . . TGAA . . . ACC . A T . . G . . . . ATAAAATTTTCA . TAATCTATGAA A . . . . . . . . AA . A . . . . . . TTT . . . . . A . . . . C . . A . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . T . . . . T G . . . . . . . TA . . . G . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . A . . . . . . . . . TA TCGACAA . . . . . . . . . . . . . . . . TAAAAA . . . TCT . . G AAC . . . . . . . A . . . . . ACTAGGTAATAATGATTA A . . . GT T T . GA . . . . . . . . . . . A . . . . . . GG . . TATTC
blockSeqs : . . . . . . . . . TGTAAC TTCTTAAAAGTTTTTGCCAAAAAAACTATAATAAAAAAAT . . . . AGTCAACTT . . . . . . . A . . . . . C . . . GGAG . . . ACC . T T . . G . . . . TTAAACCATTCA . CAAATTTAA A . . . . . . . . AA . T . . . . . . TCC . . . . . G . . . . C . . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . T . . . . T G . . . . . . . TA . . . G . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . C . . . . . . . . . CA GGAGGAG . . . . . . . . . . . . . . . . TAGAAA . . . TA . . T GAC . . . . . . . A . . . . . ATAGGGTTATAATGATTA A . . . TT T T . AA . . . . . . . . . . . A . . . . . . AG . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AAA TTAAAAATATTTGCCAAAAAAAAAACTATCAAAACAAT . . . . TG . . . . . . . A . . . . . T . . . TGAG . . . TCG . T T . . C . . . . AATT . ATTTAAAT G . . . . . . . . AT . G . . . . . . CC . . . . . A . . . . C . . A . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . T . . . . T G . . . . . . . TA . . . G . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . A . . . . . . . . . CA GACGAG . . . . . . . . . . . . . . . . TAAAA . . . CT . . T AAC . . . . . . . A . . . . . ATAGATTACAATGGATA A . . . AT . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . TTT ATGTTTAGAAATATTTGCCAAAACACTAAAAAATC . . . . TG . . . . . . . G . . . . . C . . . TGAT . . . ACG . T C . . C . . . . GATT . ATTTAAAT G . . . . . . . . . . G . . . . . . C . . . . . G . . . . C . . A . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . TA . . . G . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . A . . . . . . . . . CA GTCGAG . . . . . . . . . . . . . . . . TAGAA . . . TC . . T AAC . . . . . . . A . . . . . ATAGGTAATAATGATTA . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . TGT . . . CC . T T . . A . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . A . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . C . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . CA GAC . . . . . . . . . . . . . . . . TAGA . . . TC . . . AC . . . . .
blockSeqs : . . . C . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : ** *** ** ** TGTCANTTT******************* A******** C**** TGAAT********* T****** CAAATTAAAATTCAA******************** A********* ** *** G**** C*********** A********* ** T*** T******** ** G*** G********** ***** A** ** *** CA************ GACGAG************************* *** TAGAAA************************************** TCC******** T**** A******** T******* ** ** ***** TCTTTT***************************************** TCA******* CA*** AT** *** AATTGCGCGCTTG******************* C********* ** AAG********** G********** CGATATAAAAATAAGA*************************
originalCons : GAACAAAA--AAATAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--AAA--GA--TATTTT--T----GA-A-AAAAAA----------T-----T-----A---A--AAATAT------TTG--CCA-AA--------AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAA-------T-----C-AA-T-C-GTAAA-------T------GTC---A-TT--TTAAA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----A---GAG-CG----A-T---------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG---A---G-AC-ATA------TAAA--TTCA----AC--C-ATA-GA-T--AC--T----AA-G-A----C-A----A-G--G-CATT---CAAAT---C----TATAATCTC---AA---AAAAAAT-TCAAAAATTCA--TTAA-----AAAAG----A-----A-T--AAT---GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGA-AA-----TT-T-T--GA-AAA---C-T-------AA-ACG----TT--TCN--AAT-GT---T-AGAA----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AT-AAAA------A---TAA---TTTTC-G-----------G-TT--C--A-T--A--TT-T--G-T--ATTTTT--TGTAAA--T-G---TG-A-CAC---T--CC-T-T--CATTTT-CAG-G-G-AT------T--TG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T-AGCAG--A--TA-G--A-AG--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---AAA-TAT-A-TTTG--C----A--AA-G-T-TT--C---A-T-------C-A----ACTTCC--G-A-----------C-G--AG--------ATT-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-TTT-TTTCG-T-------AA---TT--C-AA-TT--TTC--T------A-----G--------------------A---A---TG-AC-T-A-----T-C---AA-AT-T---T-AG------A-A--C----CGG----A-A----GTGACA--A-AA-CCG-GA--A---GTG-T-T-AC---A----GGG--A-----TA-------G---G-T---AA-------T----A--A-------T-GA----T-T---------A----GG---A-----CC-A-TT-AN-T-TCGT-T------TATA--AAAA------A--A------T-AA--AG--A---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-T-T-----------T--TA-G-A--AG-AA-----GA--AA------------T-C----T-TT------------------------AAGCCC-CCAGAAGTC-CCT-TAAG-GGG-T-CA-----AAAA-AT---TG--C-ACT-AC-GGC-C-C--ATATATT---TTTTA-GAT-T-TAA-TCGG--NA---CGACT----ATAAAGA-----T----TCA-TNAATCACTAA--A-CGG-TTT----G--AA-AA-----TC-----CGATAT---------A-----AAA---AAGTTG-G-----AGC--------AT--AAAGAT----TCA-T--AA--TCACT--------AA--GACGGTTTG--CG------AAAATC-----CG--AT------A------T-AAAA-----------AAAG--TT------G-AA-GCC---GAAAGAA--T--TATTTCNA-ATATTC---TAGC--CCCTACAGA
finalCons : GAACAAAA--AAATAG--GGCT-TTT---CGACCT--C--AAA--GA--TATTTT--T----GA-A-AAAAAA----------T-----T-----A---A--AAATAT------TTG--CCA-AA--------AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAA-------T-----C-AA-T-C-GTAAATGTCANTTT-------------------AAA-AGTA--ATT-T-GAT-AG-T------------CTAAA--------GAG-CG----A-T---------AAC--TC----G---T--GAG-ATGAAT---------AC-ATA------TAAA--TTCA----AC--C-ATA-GA-T--ACT------AA-G-A----C-A----A-G--G-CACAAATTAAAATTCAA--------------------AAAAAAT-TCAAAAATTCA--TTAA-----AAAAGA---------A-T--AAT---GAAGAT-A------T-GA---TGC--TGA-AA-----TT-T-T--GA-AAA---C-T-------AA-ACG----TT--TCN--AAT-GT---T-AGAA----AA--AG----G--AA-T-------A--TAC-----------A-AT-AAAAA---------TAA---TTTTC-G-----------G-TT--C--A-T--A--TT-T--G-T--ATTTTT--TGTAAA--T-G---TG-A-CAC---T--CC-TT---CATTTT-CAG-G-G-ATT--------TG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T-AGCAG--A--TAG---A-AG--TA---------GG-T-CACCG----------CT-G-----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GC---T---AAA-TATA--TTTG--C----A--AA-G-T-TT--C---A-TCA------------ACTTCCGACGAG-------------------------ATT-T----GT-GA-AAG-ATTT--A-GC-TTT-TTTCG-T-------AA---TT--C-AA-TT--TTCTAGAAA--------------------------------------TG-AC-T-ATCC--------AA-AT-TT----AG------A-A--C----CGG----A-A----GTGACA--A-AA-CCG-GA--A---GTG-T-T-AC---A----GGG--A-----TA-------G---G-T---AA-------T----A--A-------T-GA----T-T---------A----GGA--------CC-A-TT-AN-T-TCGTT-------TATA--AAAA------A--A------T-AA--AG--A---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-T-T-----------T--TA-G-A--AG-AA-----GA--AATCTTTT-----------------------------------------AAGCCC-CCAGAAGTC-CCT-TAAG-GGGTCA-------AAAA-AT---TGCA---CT-AC-GGC-C-CAT--ATATT---TTTTAATTGCGCGCTTG-------------------ATAAAGAC---------TCA-TNAATCACTAA--A-CGG-TTT----G--AA-AA-----TC-----CGATAT---------A-----AAA---AAGTTG-G-----AGC--------AT--AAAGAT----TCA-T--AA--TCACTAAG----------ACGGTTTG----------AAAATCCGATATAAAAATAAGA-------------------------AAAG--TT------G-AA-GCC---GAAAGAA--T--TATTTCNA-ATATTC---TAGC--CCCTACAGA
Alignments
lowQualScore : 11 11 111111 22222222222222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 3333333333333333333333 444444444444 111111111 333333333 2222222222 111111 22222222222 111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111111 222 1111111111111 111 11 3333333333333 111 1111111 1111 1111111 111 1111 2222222 111111111111 1111111111 111111 33333333333 1111 111111111 22222222 1111 1111111111 11111111111 11111 111 1111 111 1111 1111111111111111 1111 1111 44444444444444 1111 222222222222222 555555555555555555555555555555 1 111111111 1111 22222222222 11111111 1 1111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111111 1 22222222 33333333333 1111 111 11111 2222222222222 1111 22222 222222222222 77777777777777777777777 2222222222 222 11111 1111 1111 3333333333 11 11 666666666666666666666 4444444444 11 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111 1111 11 3333333333333 2222222 22222 44444444444444444 11 222222 2222222 11111 111 22222 111
lowQualScore : 6 22 8 00 222222 66666666666666 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 0 3 3 4444444444444444444444 66 44 3 3 3 3 222222222222 888888888 0 3 7777 3 333333333 99 88888 555 44 3 1111111111 44 3 999999 77 11111111111 3 3 6 77 999 77 7777 77 3 000000 6 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 7777777777 3 44 000 9999999999999 3 000 00 0000000000000 3 7 3 666 3 1111111 55 4444 0000000 3 555 111 6 555 0000 44 77777 44 3 7777777 44 222222222222 3 6 44 8888888888 44 000000 3 44444444444 3 44 44 3 77 88 2 33 2 33 88 77 3 555 3 3 3 55555 77 3 1111 3 3 6 3 000000000 3 3 3 44444444 44 555 3 44 666666 3 44 44 0000 3 44 3333333333 3 6 44444444444 3 55555 88 3 555 44 000 77 3 0000 555 999999 3 3 6 111 3 333 44 0000 44 3 3 9999999999999999 3 1111 44 2222 33333333333333 0000 3 3 3 3 44 3 6 3 111111111111111 44 3 44 77 444444444444444444444444444444 3 6 0 333333333 3 44 555 3 999999 3 77 4444 66666666666 5555 3 3 66666666 3 0 7 666 2222 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 000000000 3 8 3 7777 1 44444444 0 55 11111111111 55 55 777 55 4 2222 55 4 111 4 22222 6666666666666 55 8 3333 4 22222 55 000000000000 777 4 00000000000000000000000 8 8 8 8 8888888888 8 555 33333 8 8 999 2222 4444 8 5555555555 11 11 000000000000000000000 6666666666 8 8 99 8 8 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 99 77777 2222 99 3333333333333 8 9999999 00000 0 0 11111111111111111 11 333333 1111111 0 3 88888 1 666 11111 666
lowQualScore : . .. . .. ...... .............. .............................................................................................................................................................. . . . . ...................... .. .. . . . . ............ ......... . . .... . ......... .. ..... ... .. . .......... .. . ...... .. ........... . . . .. ... .. .... .. . ...... . .............................................................................. .......... . .. ... ............. . ... .. ............. . . . ... . ....... .. .... ....... . ... ... . ... .... .. ..... .. . ....... .. ............ . . .. .......... .. ...... . ........... . .. .. . .. .. . .. . .. .. .. . ... . . . ..... .. . .... . . . . ......... . . . ........ .. ... . .. ...... . .. .. .... . .. .......... . . ........... . ..... .. . ... .. ... .. . .... ... ...... . . . ... . ... .. .... .. . . ................ . .... .. .... .............. .... . . . . .. . . . ............... .. . .. .. .............................. . . . ......... . .. ... . ...... . .. .... ........... .... . . ........ . . . ... .... ........................................................................ ......... . . . .... . ........ . .. ........... .. .. ... .. . .... .. . ... . ..... ............. .. . .... . ..... .. ............ ... . ....................... . . . . .......... . ... ..... . . ... .... .... . .......... .. .. ..................... .......... . . .. . . ........................................................................... .. ..... .... .. ............. . ....... ..... . . ................. .. ...... ....... . . ..... . ... ..... ...
lowQualScore : 2 22 9 00 999999 88888888888888 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 6 9 6 6 0000000000000000000000 88 66 3 3 3 3 111111111111 444444444 4 3 1111 3 333333333 22 00000 888 66 3 4444444444 66 3 222222 99 88888888888 3 3 7 99 222 99 1111 99 3 000000 7 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 6666666666 3 66 000 2222222222222 6 000 00 2222222222222 6 3 6 444 6 8888888 77 1111 7777777 3 888 777 7 888 4444 66 22222 66 3 5555555 66 777777777777 1 2 22 0000000000 22 000000 1 66666666666 1 22 22 1 33 55 9 99 9 99 55 33 1 444 1 1 1 88888 33 1 8888 1 1 2 1 222222222 1 3 3 22222222 66 888 3 66 888888 3 66 66 8888 3 66 8888888888 3 7 33333333333 3 00000 55 1 444 22 888 33 1 4444 888 666666 3 3 7 777 3 888 66 4444 66 3 3 8888888888888888 3 7777 66 1111 33333333333333 4444 3 3 3 3 66 3 7 3 555555555555555 66 3 66 99 333333333333333333333333333333 3 7 0 444444444 3 77 888 3 666666 3 99 2222 22222222222 2222 3 6 22222222 6 9 3 444 7777 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 999999999 6 2 6 8888 4 44444444 8 55 33333333333 55 55 000 55 0 5555 55 0 000 0 55555 1111111111111 55 0 4444 0 55555 55 555555555555 000 0 66666666666666666666666 0 0 0 0 8888888888 0 000 00000 0 0 222 6666 8888 0 0000000000 00 00 666666666666666666666 6666666666 0 8 00 0 0 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22 88888 0000 00 2222222222222 0 0000000 00000 8 8 44444444444444444 00 000000 0000000 8 2 55555 0 888 00000 222
consensus : GAACAAAAAAATAG--GGCT-TTTCGACCT--CAAA--GA--TATTTT--T----GA-A-AAAAAA----------T-----T---A---A--AAATAT------TTG--CCA-AA--------AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAA-------T-----C-AA-T-C-GTAAA-------T------GTC--AN-TTT-AAAAGTA--ATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----A---GAG-CG----A-T---------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TGAAT--A--C-ATA------TAAA--TTCA----AC--C--ATA-G-A-T--A---C--T----AA--G-A----C-AA-GG-CA-----CAA----AT-------TAA---------A--AT-TCAA--AAAAAATTCAAA-AATTCA--TTAA-----AAAAG----A-----A-T--AAT---GAAGAT------A------T-GA---TGC--TGA-A-----A-----TT-T-TGA-AAA---C-T-------AA-ACG----TT--TCN--AAT-G---T---T-AG---AA----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AT-AAA--A------A---T--A--A---TTTTC-G-----------G-T--T--CA-T--A--TT-T--G-T--ATTTTT--TGTAAA--T-G---T-G-A-CA-C---T--CC-T-T--CATTTT-CAG-G-G-AT------T--TG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T-AGCAG--A--TA-G--A-AG--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GC-T---AAA-TAT-A-TTTG--C----A--AAG-T-TT--C---A-T-------C-A----ACTTC--C--G-AC-G--AG--------ATT----TG-TGA-AAG-A-TTT--A-GC-TTT-TTTCG-T-------A-A---TT--CAA-TT--TTC--TA-----G-------------------A-A--AT-G-AC-TA----TCC--AA-AT-T---T-A------GA-A--C----CGG----A--A---GTG--A-CAA-AA-CCG-G---A--AGT-GT-T-AC---A----GGG--A-----TA-------G---GT---AA-------TA--A-------T-GA----T-T---------A----GG---A-----CC-A-TT-AN-T-TCGT-T------TATA--AAAA-A--A------TAA--AG--A---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-T-----------TT--TA-G-A--AG-AA-----GA--AA------------TCT---T-TT-----------------------AAGCCC-CCAGAAGTC-CCT-TAAG-GGG-T-CA-----AAAA-AT---TG--C-ACT-AC-GGC-C-C--ATATA---TT-TT----------TT--AA--TTG-----CGNGC-----N-TGA-ATAAAGA-----T----TCA-TNAATCACTAA--A-CGG-TTT----G--AA-AA-----TC-----CGATAT---------A-----AAA---AAGTTG-G-----AGC--------AT--AAAGAT----TCA-T--AA--TCACT--------AA--GACGGTTT-G--A----AAATC-----CGATATAAAAT--A--T--AAGA----AAAG--TT------GAA-GCC---GAAAGAA--T--TATTTCNA-ATATTC---TAGC--CCCTACAGA
Reference ( family-3270 ) : GAACAAAAAAATAG--GGCT-TTTCGACCT--CAAA--GA--TATTTT--T----GA-A-AAAAAA----------T-----T---A---A--AAATAT------TTG--CCA-AA--------AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAA-------T-----C-AA-T-C-GTAAA-------T------GTC--AN-TTT-AAAAGTA--ATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----A---GAG-CG----A-T---------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TGAAT--A--C-ATA------TAAA--TTCA----AC--C--ATA-G-A-T--A---C--T----AA--G-A----C-AA-GG-CA-----CAA----AT-------TAA---------A--AT-TCAA--AAAAAATTCAAA-AATTCA--TTAA-----AAAAG----A-----A-T--AAT---GAAGAT------A------T-GA---TGC--TGA-A-----A-----TT-T-TGA-AAA---C-T-------AA-ACG----TT--TCN--AAT-G---T---T-AG---AA----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AT-AAA--A------A---T--A--A---TTTTC-G-----------G-T--T--CA-T--A--TT-T--G-T--ATTTTT--TGTAAA--T-G---T-G-A-CA-C---T--CC-T-T--CATTTT-CAG-G-G-AT------T--TG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T-AGCAG--A--TA-G--A-AG--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GC-T---AAA-TAT-A-TTTG--C----A--AAG-T-TT--C---A-T-------C-A----ACTTC--C--G-AC-G--AG--------ATT----TG-TGA-AAG-A-TTT--A-GC-TTT-TTTCG-T-------A-A---TT--CAA-TT--TTC--TA-----G-------------------A-A--AT-G-AC-TA----TCC--AA-AT-T---T-A------GA-A--C----CGG----A--A---GTG--A-CAA-AA-CCG-G---A--AGT-GT-T-AC---A----GGG--A-----TA-------G---GT---AA-------TA--A-------T-GA----T-T---------A----GG---A-----CC-A-TT-AN-T-TCGT-T------TATA--AAAA-A--A------TAA--AG--A---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-T-----------TT--TA-G-A--AG-AA-----GA--AA------------TCT---T-TT-----------------------AAGCCC-CCAGAAGTC-CCT-TAAG-GGG-T-CA-----AAAA-AT---TG--C-ACT-AC-GGC-C-C--ATATA---TT-TT----------TT--AA--TTG-----CGCGC-----T-TG--ATAAAGA-----C----TCA-TNAATCACTAA--A-CGG-TTT----G--AA-AA-----TC-----CGATAT---------A-----AAA---AAGTTG-G-----AGC--------AT--AAAGAT----TCA-T--AA--TCACT--------AA--GACGGTTT-G--A----AAATC-----CGATATAAAA---A--T--AAGA----AAAG--TT------GAA-GCC---GAAAGAA--T--TATTTCNA-ATATTC---TAGC--CCCTACAGA
gi|1 : --CAAA--AA--AATCTA--T----AA-A-GAAGAA----------A-----A---A---A--AAATATAC----TAG--GTA-AG--------AG----AAATCAAAT-----T--------------GAGT----------------T---T------AA--A------------AAAAAAGATTTT-----C-AA-T-C-GTAAA--------------GTC--AC-TT--AAAAGTA--ATT-T-GATGAG-T------------CTAA---------GAG-CG----A-T---------AAC--T--CTCG---T--GAG-AGCTTGTAT--AACC-ATA------TAAA--TTCA----AC--G--ATAAG-A-T--A---CC-T----AA--G-A----C-AA-GG-CA-------------T-------TAA---------AT-AT-TCAC--AAAAAATT-----AATT----TTAA-----AAAAA----ACCGATA-TCAAAT---GAAGAT------A------TAGA---CGC--TGA-C-----A-----TT-T-TGA-AAAA--C-T-------AA-ACG----TT--TTA--AAT-G---T---TCAG---AA----AA--ATG---G--AA-T-------A--TAAAAATC------A-AT-AAA--A------AAAAT--A--A---TTTCC-G-----------T-T--T--CACT--A--TT-G--A-T---TTTTT--TGTAAA--TTG---T-G-AACA-C---TTCCC-T-TGTCATTTC-----G-G-AT------TAATG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---CT-C-AGCAGCAA--TATG--A-AG--TA---------GG-T-CACC-----------CT-GG----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----G---A------CA-TCGC-T---AAA-TATTA-TTTG--C----ACCAAG-T-TT--TCATA-T-------C-ACTTAACTCC--C--G-AC----------------T----TG-TGA-AAG-A-TTT--A-GC-TTT-TT-CG-T-------A-AA--TT--CAA-TT--TTTCATA-----G-------------------A-A--CT-G-AC-TA----TC---AA-AT-TATAT-A------GA-A--C----CGG----A--A---GTG--A-CAA-AAACCGTG---A--AGT-GT-T-AC---A----GGG--A-----AAAAAAGGGG---GT---AAACAAAAATA--AGATTTTTT-GG----T-TTTAAAAAAAA----GG---ATGGATCC-AATT-AA-T-TCGT---------AAA--AAAG-A--A------TAA--AGTGA---AA--G-A----TA--ACC-TCT---A-C---T-TAT-T-----------TTATTA-G-A--AA-AATTAAGGT--AA------------TCC---T-TTTAATTTCTAATATTTCGAGTATAAAGCCCTCCAGAA-TCACCT-TAAG-GGGCT-CA-----AAAA-AT---TG--CAACT-ACGGGC-C-C--A-ATA---TT-TTCTTTTAGATATT--AA--TCG-----GAAGC-----G-TGACATAAGAA-----T----TCA-TCAATCACTTT--A-ATG-TTT----GT-AATAATGATTTC-----C-ATAT---------ACTTTGAAA---TAATTGTG-----AATTTCTTTTAAT--CAGGGG----TCATT--AACGTTACTCTTAGTTGAAATGATTGTTC-G--C----GAAT---------TAAAAAATATA--T--AATA----AAAG--TT------GAACGCT---GAAAG
gi|10 : ttctttttgaagtctccgaacaaaagaaaatagggcttttttacgacctccaaaagaaatatttgtgaaacaaattttctatgaaaatctttgcA-A-AAGAAA----------G-----G---A---A--AAA-A--------------A-AA--------GA----AAA---AACGATATT--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAAAGAAAT-T-----C-AAAT-CAGTAAA-------TA-----GTCTTAC-TTA-AATCGTA--ATT-TAGAT-AG-TAC----------TTAA-----A---GAG-CG----A-T---------AAC--T--C--GTGTT--GAGTA---TGAAT--A--C-ATA------AAAAG-TTCAAG--ACG-A--ATA-G-ATT--A---CTAT----AA--G-A----C-AA-GG-CA------A--------------TAA---------A--AT-T-----------TTCAAAGAATTAA--TTTA-----AGAAG----------A-T--AAT---TGAGAT------A------T-TGTATTGC--TGA-C-----A-----TTGT-TGA-AAA---C-T-------AA-ATGACGTTT--TCC--ATC-T---T---T-AG---AA----AA--A-A---G-----T-------A--TA-----C------A-AT-AAA--AAATAT-A---T--A--A---TTTTC-G-----------GTT--T--CA-T--ATTTT-T--G-T--A-TTGT--TGTAAA--T-G---T-G-A-C--T---T--CC-T-T--CA-TTG-CAGTG-G-AT------TTCTG-TTTCAT-G--------G--A---A-AC--T---TA-T-AGCAG--A--TG-T--G-GA--TAACGACTTTTGG-T-CACCCGTTCTTA---TT-GATATTAC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTAATTGA---A------CA-T-GC-T---AAA-TAT-ATTTTG--C----A--AAG-T-TT--C---A-T-------C-A----ACTTC--CT-C-AC-G--AC--------A-T----TG-TGG-AAG-A-TTTTAG-GC-CTT-TTTCG-T-------A-A---TT--CAA-TTTCTTC--TA-----G-------------------ATA--TT-GTACTTA----TCCATAA-AT-T---T-A------GA-T--C-----------A--ACTCGTG--A-CAA-ctatt
gi|11 : aaaaaaaaaaaaaaaaaataaaaaaaaaaaaa--TT-TT---TT--G---TTTGCCT-TTA----G---A------CAAT-GC-T---GAA-TAA-A-TT-G--C----A--AAG-T-TT--C---A-TT------C-A----ACTTC--CCCG-AC-G--AG--------ATT----TG-TGA-AAG-A-TTT--A-GC-TTT-TTTCG-T-------A-AAATTC--CAA-TT--TCG--TA-----A-------------------A-A--AT-G-A--TA----TTC--AA-ATAT---T-A------GA-AATC----CGG----A--AG--GTG--A-CAA-AA-CCG-G---A--AGT-GTAT-ACCATG----GGA--A-----TA-------G---GTGTAAA-------TA--A-------T-GA----C-T---------A----GA----------C-A-TTAAT-T-TCATAC------TATA--AAAA-A--A------TAA--AG--A---GA--G-A----TA--A-T-CTT---ACC---A-AACTT-----------TT--TA-GAA--AG-AAAC---GA--AA------------TCC---T-TT-----------------------AAttgcgttagtgacaaaccg
gi|12 : actT-T--G-T--ATTTTT--TGTGAA--T-G---T-C-A-CA-C---T--CC-T-T--CCTCAT-CAG-G-A-AT------T--TG-TATC-T-C--------G--A---A-AA--C---TG-T-AGCAG--A--TA-G--A-AG--TA---------GG-T-CACC-------T---TT-G-----AC--TT-TT---GT--G---TTTG--T-TTA----A---A------CA-T-GC-T---AAA-TAT-A-ATTG--G----A--AAG-T-TT--C---T-T-------T-A----ACTTC--C--G-AC-G--AG--------ATT----TG-TGA-AAG-A-TTT--A-GC-ACT-TTTCA-TACATGTCA-A---TT--CAA-TT--TTC--TA-------------------------A-A--AT-G-AC-TA----TAA--AA-A--T---T-A------TA-A--C----CGG----A--A---GTG--T-CAA-AA-CCG-G---A--AGT-GT-T-AT---A----GGG--A-----TA-------G---AT---TA-------CA--A-------T-GG----A-T---------A----GG---A-----CC-A-CT-cagtttctaatattca
gi|13 : GACCT--TAAA--GA--TATTTT--T----GA-A-AAAAAA----------T-----TCTTA---A--AAGTTT------TTG--CCA-AA--------AA----AA------C-----T--------------A-------------------TAA-T------AA--A------------AAAA-------T-----CCAA-T-C-ATAAA-------T------GTC--AA-TTTCAAAAGTA--ATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----A---GAG-CG----A-A---------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TGAA---A--C-ATT------CAAA--TCCT----AC--C--ATA-A-A-T--A---C--T----AA--G-A----C-AA-GG-CATT---TAA----ATCTCCATGTAATCTC-----A--AT---AA--AAAAAATTCAAA-AATACA--TTTA-----AAAAT----A-----A-T--
gi|14 : AGCTC-ACAGAAGTC-CTT-AAAG-GGG-TCCA-----AAAATAT---TG--C-ACTAAC-GGCTC-C--A-ATA---TT-TC----------TTACAA--TTGCAATTCGGGA-----TATGA-ATAAAGA----------TCA-TAAATCACTAA--ATCGGTTTT----G--TA-AA-----TC-----CGGCATAAAAATCTAA-----AAA---AAGTTG-A-----AGC---------T--GAAAAT----T
gi|14 : --------AT--AAAGAT-----CA-T--AAA-TCACT--------AA--ATCGGTTTTG--T----AAATC-----CGGCATAAAA---A--TCTAAAA----AAAG--TT------GAA-GCT---GAA--AA--T--TATTTCTATATATTC---TAG---CTCTACAatttctatatattctagctctacatga
gi|15 : agctcacagaagtccttaaaggggtccaaaaatattgcactaacggctccaatatttcttacaattgcaattcgggatatgaA--GA--TATT---------AA-A-AAAAAAATGT------T-----T---A---G--AAATAT------TTG--CCA-AA--------A-------------------C--------------A-------------------C---T------AA--A------------AAAT-------C-----C-AA-T-C-ATAAA-------T------TTC--AT-TTA-AAAAGAT--GTT-T-GAT-AG-T------------CTAC-----A---GAG-TG----A-T---------AAC--T--C--G---T--AAG-A----GGAG--A--C-AGT------TAAA--TTCT----AC--C--ATA-G-G-A--A---C--T----GA--G-A----C-AA-GG-CA-----T-------T-------TAA---------A--tga
gi|16 : AACAAAAAAACAG--GGCT-TTTCGACCT--CATA--GA--TATTTT--T---------AAAAAATGCT------T-----T---A---A--AAAAAT------tctccatataatctctata
gi|17 : gatgcatggaatgaagcatgtcatgtagcaaaataacatttagaaatataattctttttggtctcta-----C------A-AT-AAA--A------A---T--A--A---TTTTC-G-----------G-T--T--CA-T--A--AT-T--G-T--GTTTTT--TGGGAA--T-G---T-C-A-CA-C---T--CC-T-T--CATCTT-CAG-G-G-AT------T--T--TATC-T-C--------G--A---A-AA--C---TG-T-CGCAG--A--TA-G--A-AG--TA---------GG-T-CTCC-------G---CT-G-----AC--TT-TT---TT--G---TTCA--T-T
gi|18 : AAG----A-----A-T--AAT---GAAGAT------A------T-GA---TGC--TGA-A-----A-----TT-T-CAA-TAA---C-TTACAACAAG-ACG----TG----C--AAT-G---T---T-AG---AA----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AG-AAA--A------A---T--A--A---TTTTC-C-----------G-T--T--CA-T--A--TT-T--G-T--ATTTT
gi|19 : -G---T---T-AG---AA----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AT-AAA--A------T---T--A--T---TTTTTTG-----------G-T--T--CA-T--A--TT-T--G-T--ATTTTT--TGTAGG--T-G---T-G-A-CA-C---T--CC-T-T--CATCTT-CAG-G-G-AT------T--TG-
gi|2 : cTT-AACAGTATGATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----ATA-GAG-CGGGATA-T---------AAT--T--C--G---T--GAG-ACCGTGA-T--A--C-ATA------TAAAATTTCA----AA--CG-ATA-G-A-TGTA---C--T----AA--G-A----CCAA-GG-CATTTTTCAA----AG-------TA--------------TGTCAG--AAGAAATCTAA----TCTA--TGAA-----AAAAT----ACG---A-T--AAT---GAAGATG-----A------T-GAG--CGC--TGA-------------CT-T-TGA-ACA---C-T-------AA--CG----TT--TTA--AAT-G---TGTAT-AG---AAT---AA--A-G---GCGAACT-------A--TAA----CTATTTAA-AC-GAA--T------A---T--A--T---TTTTC-GTCT--------G-T--TTTCA-TT-A--TTGT--G-TTTATTTTT--TGTAAAACT-G---T-G-A-CA-TCTTT--CCATGT--CATTTT-CAG-C-G-GTGATTTTT--TG-TTTC-TTG--------GTAA---A-AA--C---C--T-AGCAG--A--TG------AGCTTA---------GGGTACACC-------G---CTTG-----AC--TT-TT---TT--G---TTTG--T-TTA----GTCTATTTTTTCG-T-AA-T---GAA-TAT---TCTG--CTCATA--CAG-TATTACT---A-TC------C-A----ACCTCCTC--G-AC-----A--------ATT----TGTTGA-AAG-A-TTT--ACGCATTTATTTCG-T-------ATT---TT--TAA-GT--TCC--TA-----GATTTATCTTTGCATATGTTA-A--ATGG-AC-TAGTACTTA--AA-AT-T---T-AGTTTAGGA-AT-C----CGG----G--ATCCGTGTTATTAT-AT-CCGAA---A--AGT-GA-T-AT---ACTACGGG--AAAATTTG-------T---GT---AA-------AA--A-------T-GAGCTTT-T---------ACT--GGCGCA-----CC-ATTT-AG-A-TCGT-T------TATA--AAAG-A--AC-----TAA--AG--ATATGA--G-GCATTTA--ACT-CTT---A-C---C-AAT-TTCTGCCTCCTCTT--TA-G----AT-TA-----GA--AA------------TCT---T-TTAAATGCTCTAAGATTC-------AAGCCT-CCAGAAGTC-CCTATAAGAGGG-C-CGTGCATAAAA-ATGA-TGTCT-ACT-AC-GGT-C-CCAATTTA---TTATT----------TT--AGATTTG-----TGTAC-----G-TT--ATAAAGA-----TAAGGTCATTAAATCCCTAACGA-TGG-TTTGATCG--AA-AA-----TCGAGCATGATAT---------A-----AAATATAAG--G-GGAGAAAGC--------ATTGAAAGA
gi|2 : aaatctggtattatgttataataacataatataaataatagaacctacagattcgctcaaaaagtaggcacac--------AT--AAAGATAAGGTCA-TTAAA--TCCCT--------AAC-GATGGTTT-G--ATCGAAAATCGAGCATGATATAAAAT--A--T--AAGGGGAGAAAGCATT------GAAAGACATGGAAAGAGACT--TATTTCCA-AAATTTTTATAGCGTTCCTACcatggaaagagacttatttccaaaatttttatagcgttcctacgcttcctgtaagattgtcttctttcgaggagatgaccatatttc
gi|20 : aaatctggtattatgttataataacataatataaataatagaacctacagattcgctcaaaaagtaggcacacttaacagtatgatttgatagtctaaatagagcgggatataattcgtgagaccgtgatacatataaaatttcaaacgatagatgtactaagaccaaggcatttttcaaagtatgtcagaagaaatctaatctatgaaaaaatacgataatgaagatgatgagcgctgactttgaacactaacgttttaaatgtgtatagaataaaggcgaactataactatttaaacgaatatatttttcgtctgttttcattattgtgtttattttttgtaaaactgtgacatctttccatgtcattttcagcggtgattttttgtttcttggtaaaaacctagcagatgagcttagggtacaccgcttgacttttttgtttgtttagtctattttttcgtaatgaatattctgctcatacagtattactatccaacctcctcgacaatttgttgaaagatttacgcatttatttcgtatttttaagttcctagatttatctttgcatatgttaaatggactagtacttaaaatttagtttaggaatccgggatccgtgttattatatccgaaaagtgatatactacgggaaaatttgtgtaaaaatgagcttttactggcgcaccatttagatcgtttataaaagaactaaagatatgaggcatttaactcttaccaatttctgcctcctctttagattagaaatcttttaaatgctctaagattcaagcctccagaagtccctataagagggccgtgcataaaaatgatgtctactacggtcccaatttattattttagatttgtgtacgttGAACAAAAAGAGAG--GGCT-TTTCGAgcttcctgtaagattgtcttctttcgaggagatgaccatatttc
gi|3 : aagaataactagacctttttgtcactCT--TAAA--AT--TATTTT--T----GTTA-AAAAAA----------T-----T---GTTTA--AAATATATATTTTTG--CTG-TA--------AT----AAA---AAA-----T--------------A-------------------TA--T------AA--AGAAAAGAAAAAAAAAA-------TG----C-AA-T-C-GTAAAAT-----T------GTTCAAA-TTT-AA--GTA--ATT-T-GAT-AG-TG-----------CTAACTCACAC--GAG-TG----ACT---------TAC--T--CA-G---TTCGAG-A---TGGAG--A--A-ATT------TAAA--TTCA-----C--C--ATT-A-A-TT-A---C--T----AA--G-G----CTAA-GT-CATT---CTA----AT-------AAACTCTCACTCA--AT-TTAA--CATACAT-CAAA-AATTCAAATTAA-----AAAAGCAAGA-----A-T--AA-----AAGAT------AA-----T-G----TGC--TGA-A-----A-----TA-T-ATA-AAA---C-T-------A---CG----GT--TCTTTAAT-G---T---TTAG---AA----AA--A-A---G--AA-T-------ACTTA-----CG-----A-AT-AAA--ATTAGATA---T--A--G---TCGAC-G-----------G-T--T--CA-TTTA--TT-TTTG-T--ATTTTT---GTAAA--T-G---T-G-A-CA-C---T--CC-TAT--CATTTT--AG-G-G-AT------T--TGGTTTC-T-G--------G--A---ATAA--CGAATAGT-AGCAG--A--TAAG--A-AA--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----AC--TT-TT---T---G---TTCG--T-TTA----G---A------CA-T-GC-T---GAA-TAT-A-ATTGGCC----A--AAG-T-T---C---G-T-------C-A----ATTTC--C--T-CC-G--AGTCACGCA-GTG----TG-TGA-AAG-A-TTT--A-GC-TCG-TTTCT-A-------A-A---TT--CAA-TT--TTC--TCCTCCTG-------------------A-A--AT-G-AC-CA-----CT--AA-TT-T---TTA------GG-A--C----CGA----A--AACCGTG--A--AA-AA-CCGCA---A--AGT-GC-TGAC---A----GAATTA-----TA-------AATCGT---AA-------TATTA-------TCGC----T-TTTTTTG---A----GC---A-----CA-A-TT-AAAT-TCAT-T------TA-----AAA-A--A------TAAGAAG--A---GT--G-A----TA---CT-CTTTTTA-C---A-AAC-T-----------TT--TA-GCA--GG-AA-----GA--AAAATATTTAGTGTTCTAAAT-TT-----------------------CAGCTT-CCAGAAGTC-CCT-TAAG-GGG-T-C-------AAA-ATTCATG--C--CT-AC-GGC-TGC--ATAT----TG-TT----------TT--AA--TTG-----CTCGCGTCTTT-CG--ATAAAAAATACCC----TAA-TCAATTATTAAG-A-CAG-TTT----GCAAA-AG-----TC-----CGAT-T---------A-----AAA---AA
gi|3 : --AA--TTATT--------AA--GACAGTTT-GCAA----AAGTC-----CGAT-TAAAA---AATT--AAGA----AAAG--TCTGTTTAGAG-ACC---GACAGAA--TATTATTGCAA-ATAT------AGC--CCCTACAGAttaagaaaagtctgtttagagaccgacagaatattattgcaaatatagcccctacagattctaatttctctgtggagattatatttc
gi|4 : cttaaaattatttttgttaaaaaaattgtttaaaatatatatttttgctgtaataaaaaatatataaagaaaagaaaaaaaaaatgcaatcgtaaaattgttcaaatttaagtaatttgatagtgctaactcacacgagtgacttactcagttcgagatggagaaatttaaattcaccattaattactaaggctaagtcattctaataaactctcactcaatttaacatacatcaaaaattcaaattaaaaaagcaagaataaaagataatgtgctgaaatatataaaactacggttctttaatgtttagaaaaaagaatacttacgaataaaattagatatagtcgacggttcatttatttttgtatttttgtaaatgtgacactcctatcattttagggatttggtttctggaataacgaatagtagcagataagaaataggtcaccgctgactttttgttcgtttagacatgctgaatataattggccaaagttcgtcaatttcctccgagtcacgcagtgtgtgaaagatttagctcgtttctaaattcaattttctcctcctgaaatgaccactaatttttaggaccgaaaaccgtgaaaaaccgcaaagtgctgacagaattataaatcgtaatattatcgctttttttgagcacaattaaattcatttaaaaaataagaagagtgatactctttttacaaacttttagcaggaagaaaaatatttagtgttctaaatttcagcttccagaagtcccttaaggggtcaaaattcatgcctacggctgcatattgttttaattgctcgcgtctttcgataaaaaataccctaatcAACAAAACACTAGATGGCT-TTTCGACCCTCCAAA--GAGATATTTT--TTATAGA-G-GGAAAAGTATGCATTCT-----T---ATT-A--AAATAT------TTGCCCCA-AAAAGTC---AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------TA--A------------Attctaatttctctgtggagattatatttc
gi|4 : ccgccgaaactcaCAAAAAAA-------CTATTTAAACCA--CAAAA-GA--TATT--------------AAGAAA----------C-----C---A---A--AAA-AT------T----CCA-AATCCGTTTTAA----A-------------T--------------A-------------------TGCGT------AA--A------------AAAG-------T-----C-AACT-T-ACAAA-------T------G------------AAAGTA--ATT-T-GAT-AG-TATACTCTAAATCCTAA-----A---G-G-CG----A-TGGATATTAAAGC--TTTC--G---T--T-G-A---AGAATCGA--C-ATACAATACTAAA--TTCA----ACACCG-ATA-G-AAT--A---C--TCCTAAAT-G-A----G-AATGGTCG-----CAA----AT-------TAA---------A--AT-TCAA--AAAAAATT------ATTTA----AAT----AAAGG----A-----A-T--AATTGCAAAGAT------AGAAGAAT-GA---TGCATTGA-A-----ACATTATT-TATGA-AAGAATC-T-------AA--CT----TT--CCG--CAT-A---TCCTT-AG---AA----AA--A-AAAAG--AA-CGCCACTAA--TA-----C------A-AT-AAA--A------AA--T--A--AGA-TTTTC-GAAATCTACAGAG-T--T--CA-T--A--TT----G-T--ATTTTTACTGTAAA--T-G---T-GGA-CA-T---TT-CC-T-TA-CATTTT-CAG-GCG-AT------T--C---TTC-T-GTCCCGGGTG--A---A-AA--C---AA-T-AGCAG--A--TA-G--A-GT--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----GCATTT-TT---CT--GAACTTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GCATATGAAA-T-T-A-TTTG--C----A--AAG-T-TT--C---ATT-------C-A----ACTTC--C--GAACGG--AGGATTTCGAATT----TA-TGA-AAG-A-TTT--A-G--TCT-TTTCGTT-------A-AT--TT--CAA-TT--TTC--CATAGCGG-------------------A-AACAT-G-ACTTA----TCC--AA-AT-T---G-A------GA-A--CACCGCGGAAAAA--A---GTG--A-C-A-AA-CCG-G---ACGAGT-GTCT-AC---A----GGGA-A-----TAT------G---GT---AATTCC---TAC-A-------T-G-----T-T---------ATTTCGG---A-----CC-ACTT-AT-A-TTGT-TATAGGATATA--AAAATA--AGACAATTAA--AG--A---GA--G-AT---TA--ACTCCTT---A-CTCAG-AAC-T-----------TT--TA-G-AG-AG-AATGC--AA--AA------------TCT---T-TT-----------------------AAccacaaaagatattaagaaaccaaaaaattccaaatccgttttaaatatgcgtaaaaaagtcaacttacaaatgaaagtaatttgatagtatactctaaatcctaaaggcgatggatattaaagctttcgttgaagaatcgacatacaatactaaattcaacaccgatagaatactcctaaatgagaatggtcgcaaattaaaattcaaaaaaaattatttaaataaaggaataattgcaaagatagaagaatgatgcattgaaacattatttatgaaagaatctaactttccgcatatccttagaaaaaaaaagaacgccactaatacaataaaaaataagattttcgaaatctacagagttcatattgtatttttactgtaaatgtggacatttccttacattttcaggcgattcttctgtcccgggtgaaaacaatagcagatagagttaggtcaccgctggcatttttctgaactttgtttagacatgcatatgaaattatttgcaaagtttcattcaacttccgaacggaggatttcgaatttatgaaagatttagtcttttcgttaatttcaattttccatagcggaaacatgacttatccaaattgagaacaccgcggaaaaaagtgacaaaccggacgagtgtctacagggaatatggtaattcctacatgttatttcggaccacttatattgttataggatataaaaataagacaattaaagagagattaactccttactcagaacttttagagagaatgcaaaatcttttaattctaa
gi|5 : ccgccgaaactcaaacaaaacactagatggcttttcgaccctccaaagagatattttttatagagggaaaagtatgcattcttattaaaatatttgccccaaaaagtAACAAAACACTAGATGGCT-TTTCGACCCTCCAAA--GAGATATTTT--TTATAGA-G-GGAAAAGTATGCATTCT-----T---ATT-A--AAATAT------TTGCCCCA-AAAAGTC---AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---T------TA--A------------Attctaa
gi|5 : ccgccgaaactcaCAAAAAAA-------CTATTTAAACCA--CAAAA-GA--TATT--------------AAGAAA----------C-----C---A---A--AAA-AT------T----CCA-AATCCGTTTTAA----A-------------T--------------A-------------------TGCGT------AA--A------------AAAG-------T-----C-AACT-T-ACAAA-------T------G------------AAAGTA--ATT-T-GAT-AG-TATACTCTAAATCCTAA-----A---G-G-CG----A-TGGATATTAAAGCTTT--C--G---T--T-G-A---AGAATCGA--C-ATACAATACTAAA--TTCA----ACA-CCGATA-GAA-T--ACTCC--T----AAATG-A----G-AATGGTCG-----CAA----AT-------TAA---------A--AT-TCAA--AAAAAATT------ATTTA----AAT----AAAGG----A-----A-T--AATTGCAAAGATAGAAGAA------T-GA---TGCATTGA-AACATTA-----TT-TATGA-AAGAATC-T--------A-ACT----TT--CCG--CAT-ATCCT---T-AGAAAAA----AA--A-A---G--AA-CGCCACTAA--TA-----C------A-ATAAAA--A------A---T--AAGA---TTTTC-GAAATCTACAGAG-T--T--CA-T--A---T-T--G-T--ATTTTTACTGTAAA--T-G---TGG-A-CATT---T--CC-T-TA-CATTTT-CAG-GCG-AT------T-----CTTC-T-GTCCCGGGTG--A---A-AA--C---AA-T-AGCAG--A--TA-G--A-GT--TA---------GG-T-CACC-------G---CT-G-----GCATTT-TT---CT--GAACTTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GCATATGAAA-T-T-A-TTTG--C----A--AAG-T-TT--C---ATT-------C-A----ACTTC--C--GAACGG--AGGATTTCGAATT----TA-TGA-AAG-A-TTT--A-G--TCT-TTTCGTT-------A-AT--TT--CAA-TT--TTC--CATAGCGG-------------------A-AACAT-G-ACTTA----TCC--AA-AT-T---G-A------GA-A--CACCGCGGAAAAA--A---GTG--A-C-A-AA-CCG-G---ACGAGT-GTCT-AC---A----GGGA-A-----TAT------G---GT---AATTCC---TAC-A-------T-G-----T-T---------ATTTCGG---A-----CC-ACTT-AT-A-TTGT-TATAGGATATA--AAAATA--AGACAATTAA--AG--A---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-A-----------TT--TA-G-A--GG-AA-----GA--AA------------TCT---T-ccacaaaagatattaagaaaccaaaaaattccaaatccgttttaaatatgcgtaaaaaagtcaacttacaaatgaaagtaatttgatagtatactctaaatcctaaaggcgatggatattaaagctttcgttgaagaatcgacatacaatactaaattcaacaccgatagaatactcctaaatgagaatggtcgcaaattaaaattcaaaaaaaattatttaaataaaggaataattgcaaagatagaagaatgatgcattgaaacattatttatgaaagaatctaactttccgcatatccttagaaaaaaaaagaacgccactaatacaataaaaaataagattttcgaaatctacagagttcatattgtatttttactgtaaatgtggacatttccttacattttcaggcgattcttctgtcccgggtgaaaacaatagcagatagagttaggtcaccgctggcatttttctgaactttgtttagacatgcatatgaaattatttgcaaagtttcattcaacttccgaacggaggatttcgaatttatgaaagatttagtcttttcgttaatttcaattttccatagcggaaacatgacttatccaaattgagaacaccgcggaaaaaagtgacaaaccggacgagtgtctacagggaatatggtaattcctacatgttatttcggaccacttatattgttataggatataaaaataagacaattaaagagagataactcttacaaacatttagaggaagaaatctt
gi|6 : ccgccgaaactcaaacaaaacactagatggcttttcgaccctccaaagagatattttttatagagggaaaagtatgcattcttattaaaatatttgccccaaaaagtGAACAAAAAAATAG--GGCT-TTTCGACCT--CAAA--GA--TATTTT--T----GA-ATAAAAAA----------T-----T---A---A--AAATAT------TTG--CCA-AA--------AA----AAA---AAC-----T--------------A-------------------T---C------AA--A------------ACAA-------T-----C-AA-T-C-GTAAA-------T------GTC--AT-TTT-AAAAGTA--ATT-T-CAT-AG-T------------CTAA-----A---GAA-CG----A-T---------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TGAG---A--C-ATA------TAAA--TTCT----AC--C--ATA-G-A-T--A---C--T----AA--G-A----C-AA-GG-TATT---CAA----ATACCCG--TGT---------A--ATCTCAATAGAAAAATTCAAA-AATTCA--TTAA-----AAAAG----A-----A-T--AAT---AAAGAT------A------T-GA---TGC--TGA-A-----A-----TT-T-TGA-AAA---C-T-------AA-ACG----TT--TTT--AAT-G---T---T-AG---CG----AA--A-G---G--AA-T-------A--TA-----C------A-AT-AAA--A------A---T--A--A---TTTTC-G-----------G-T--T--CC-T--A--TT-T--G-T--ATGTTT--TGTAAA--T-G---T-G-A-CA-C---T--CC-T-T--CATCTT-CAG-G-G-AT------T--TG-TTTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T-AGTAG--A--TA-G--A-AG--TA---------CG-T-CATT-------G---CT-A-----AC--TC-TT---TT--G---CTTG--T-TTA----G---A------CA-T-GC-T---AAA-TAT-A-ATTG--C----A--AAG-T-TT--T---G-T-------C-A----ATTTC--C--G-TC-G--AG--------ATT----TG-TGA-AAG-A-TTT--A-GC-TTT-TTTCG-T-------A-C---TT--TTA-TT--TTC--TA-----G---------------------A--AT-G-AC-TA----T-C--AA-AT-T---T-A------GA-A--C----CGA----A--A---GTG--A-CAA-AA-CCG-G---A--AAA-GT-T-AC---A----GGG--A-----TA-------G---GT---AA-------TA--A-------T-GA----T-T---------A----GG---A-----CC-A-TT-AG-T-TCAT-T------TATT--AAAA------------AA--AG--G---GA--G-A----TA--ACT-CTT---A-C---A-AAC-T-----------TT--TA-G-A--AG-AA-----GA--AA------------TA----T-TC-----------------------AAGCCC-CCAGAAGTC-CCT-CAAA-GGG-T-GA-----AAAA-GT---TG--C-ACC-AC-AGC-C-C--ATATATTTTT-TT----------TT--AA--TTG-----AACGA-----C-TG--ATAAAGA-----T----TCA-T-AATCACTAA--A-CGG-TTT----G--AA-AA-----TC-----CGATAT---------A-----AAA---AAGTTG-G-----AGTG-------AT--AAAGAT----TCA-T--AA--TCACT--------AA---ACGGTTT-G--A----AAATC-----CGATATAA--------------A----AAAG--TT------GGA-GTT---GAAAG-A--T--TATTTCGA---ATTC---TAGC--CCCTACAGA
gi|7 : AAAAAAATAG--GGCT-TTTTCACCT--CAAA--GCC-TATTTG--T----AA-C-GAAAAA----------TATCTCT---T---A--AATGAC------TTG--CCA-TA--------AA----AAA---GAC-----CCATAAAAAAGCCAGA-------------------T---TCCAAAAAA--A------------AAAA-------TT----C-AA-T-C-GTAAA-------A------GTC--CA-CTT-AAAAGTA--ATTCT-GAG-AGAT------------CTAA-----G---AGG-CG----A-TA--------AACCGT--T--G---T--GAG-AAT-CGAAT--A--CAATA------TAAA--CTCAAACGAC--C---TA-G-A-T--A---C--C----TA--G-AGCCCC-A---G-CA-----CAGCCGCAT-------TAA---------ACCAT-TC-A--ACGAAATT---A-AAT-----TTAACCACCAACAG----A-----ACT--AATC--GAAG-C------A------T-GA---TGC--TGATC-----A-----TT-T-GGGCAAA---CTT-------AA-ACG----TTCGTCC--ACTCG---T---T-AG---AACCACAG--A-A---G--AA-TCAG----A--GG-----C------A-AT-AAA--A------A---T--A--A---CTTTC-G-----------G----T--CA-T--GATTT-T--G-T--ATTGTT--TGTAAA--C-G---C-G-A-C--C---T--CC-TCT--CATTTTCCAG-G-GAAT------T--CG-TTTC-T-G--------G--ACGGA-AAATC---TA-T-AGCAG--AGTTA-G--AGAG--TA----------G-T-CACC-------G---CT-G-----AC--TT-TTGCCTTTGG---TTTGC-T-TTAG---G---A------CA-T-GC-T---AAAGTAT-C-ATTG--C-------AAG-T-TTTCC---A-T-------CAA----ACTTC--C--G-AC-GGAAG--------ATTC---CG-TGACAAGAA-TTT--A-GC-TTT-TTTCT-A-------A-A---TT--CAA-TT--CTCA-TC-----C-------------------G-A--AT-GAAC-TA----CTC--AACAT-T---T-A------GA-A--C----CGG----AC-A---GTG----CAA-AA-CCG-G---ACCAGT-GT-T-AC---A----GGG--------TA-------G---GCTA-AA-------TA--A-------T-GA----TCC---------A----GG---A-----CCAA-TC-AA-TCTTGT-T------T-TAACAAAA-G--A------TAC--AA--G---GA--G-A----TA--ACT-CTTA--A-CA--A-AAC-TC----------TT--TACG-ACCAG-AA-----GT--AA------------TCT---TGTT-----------------------AA
gi|8 : tcttttctggtctgccggaccaGAACAAAAAAATAG--GGCT-TTTCGACCT--CAAAAGAA--TATTTTTGT----GA-A-AAAAAATTC-------T-----T---A---A--AAATAT------TTG--CAACGA--------AA----AAA---AAC-----T--------------ATAGAAAAACAAAAAAAAGAT---T------AAACA------------AAAA-------TTCAACC-AA-T-C-GTAAA-------A------GTC--AA-CTT-AAAAGT---ATT-T-GAT-AG-T------------CTAA-----A---GAGCCG----A-TA--------AAC--T--C--G---T--GAG-A---TG-AT--A--C-ATA------TAAA--TTCA----TC--G--ATA-G-A-T--A---C--T----AA--GAA----C-AA-GG-C--------A----AT-------TAA---------A--AT-TC-----AAAAATT-----AAT-----TTAA-----AAAAA----G-----A-T--AATG--GAAGAT------A------T-GA---TGC--TGACC-----A-----TT-T-GAA-AAA---C-T-------AACACGTCT-TT--TCC--CAT-G---T---T-AG---AA----AAACA-G---A--AA-T-------A--TA-----C------ACATAAAA--A------A---T--A--AATTTTTCC-G-----------G-T--T--C--T--A--TT-T--GTT--ATTTTT--TGTAAA--T-GCCTT-G-A-CA-T---T--CT-T-C--AATTTT-CA--G-G-AT------T--TG-TCTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-TAAGCAG--A--TA-GACA-AG--TA---------GG-TCCACC-------GAGCCC-G-----AC--TTGTT---TT--G---TTGT--T-TTA----G---A------CA-T-GC-T---AAA-TAT-A-TTTG--C----A--AAGTT-TT--C---A-TATATAAAC-ACT--ACCTC--C--G-AC--------------ATT----TG-TGA-AAG-A-TTT--A-GCTTTT-TTTCG-TA------A-A---TT--CAATTT--TTC--TA-----G------------------------AT-G-A--TA----TCT--AG-AA-T---T-A------GAGA--C----TGG----A--A---GTG--A-CAA-AA-CCG-G---A--AGT-GT-TAAC---A----GGG--AC----TA-------G---GT---AA-------TA--A-------T-GA----T-T---------A----GG---A-----CC-A-TA-AT-T-TTGT-T------TATA--AAAA-AATA------TAA--AG--A---GAAGA-A----TAGTACT-CTT---A-C---ACAACAC-----------TT--TAGG-A--AGTAA-----GAACAA------------TCT---G-TT-----------------------AAtttctaatattccag
gi|9 : taaataataaacctagaattccttttttggtctcc-A-AAAAAA----------T-----T---C---TTTAAATAT------TTG--CCA-AA--------AATATAAAA---AAA-----G--------------A-------------------T---T------AA--A------------AAAAAT-----T-----C-AA-TTC-GTAAAAAAAAAATAAAAAGGTC--AACTTT-AAAAGTA--ATC-T-TGT-AT-C------------TTAA-----ACAAGAG-CG----A-T---------AAC--T-----G---T--GAG-A---TG--T--A--C-A-A------TAAA--TTCA----AC--G--ATA-G-A-T--AC--C--T----AA--G-A----A-AT-GG--------CAG----AT-------TAA---------A--AT-TC-------AAATTTAA-----------TAA-----AA-------G-----A-T--AAT---GAAGAT------A------T-GA---TGC--TGC-ATT---T-----TT-T-TG--AAA---C-T-------AA-ACG----TT--CC----AT-G---T---T-AG---AA----AA--A-A---G---A-T-------A--TA-----C------A-AT-AAAACA------A---TAAA--A---TTTTC-G-----------G-TTCT--CA-T--A--TT-T--G-T--ATTTTT--TGTAAAT-T-G---T-G-A-CA-T---T--CC-T-T--CA--TT-CA--G-G-AT------G--TG--TTC-T-G--------G--A---A-AA--C---TA-T--GCAG--A--TAGG--A-AG--TA----------G-T-CACC-------G---CT-GC----AC--TT-TT---TG--T---TTTG--TATTA----G---A------CA-T-GC-T----AA-TAT-A-TCTG--CA---A--AAG-T-TT--C---A-T-------C-A----ACTTC--CG-G-AG-G--AG--------ATTTTTGTG-TGA-AAG-ATTTT--A-GC--TT-TTTCG-T-------A-A---TTTCCAA--A--TTC--TA-----G-------------------A-A--AT-G-AC-TA----T-C--AA-A------T-A------G--A--C----CGG----AACA---GTG--A-CAACAA-CCG-GAAAA--AGTGGT-T-AG---ATG--GAG--A-----TAG------G---GT---TA-------TA--A-------T-GA----T-T---------A----GG---A-----CC-ATTT-AA-T-T-GT-T------T-TA--AAAA-A--A------TAA--AG--A---GA--GTA----TA--ACT-CTT---A-C---A-AA--T-----------TT--TA-G-A-----GA-----GA--AA------------TCT---T-TT-----------------------AAGtttctaatattacc