lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 22222222 111 1111111111111111 444444444444444444444444444444444444444 1111111 111 2222222 7777777 1 6666666666666666666666666666666666666 11111111 111111 11 111111111 11111111111 888888888888 444444444444444444 777777777777 22222 1111111111 2222 1111111111111 888888 3333333 111111 6666666666666666666666666 333333333333333333333333333333 1111111 11111 22222222 666666666666666 1 1 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 333333333333333333333333
lowQualScore : 66 33333333 333 8888888888888888 2 2 99 2 33 333 2 444 1 444 5555 8 222222222222222222222222222222222222222 333 2 0000000 33 2 5555 55 000 2 33 2 5 2 33 4 2222222 9999999 2 2 888 2 3 444 2 2 7777777777777777777777777777777777777 3 11111111 2 2 2 2 33 5 777777 444 444 2 000000 2 33 2 777777 55 3 3 3 555 2 555 444 7777 2 5555 33 33 2 33 111111111 5 33333333333 000000000000 0 88 33 2 2 666666666666666666 2 2 2 2 2 2 33 2 55 2 111111111111 0 888888 22 66 2 11111 7777777777 2 0000 3 2 2 33 2222222222222 111111 888 33 2 2222222 2 111111 2 3 33 9999999999999999999999999 777777777777777777777777777777 3 77 555 3 6666 44 0 3 0000000 7777 7 2 66666 55 3 3 3 6 66666666 9999999999 111111111111111 4 3 7777 1 666 0 3 44 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 3 2 33 999999999999999999999999
lowQualScore : .. ........ ... ................ . . .. . .. ... . ... . ... .... . ....................................... ... . ....... .. . .... .. ... . .. . . . .. . ....... ....... . . ... . . ... . . ..................................... . ........ . . . . .. . ...... ... ... . ...... . .. . ...... .. . . . ... . ... ... .... . .... .. .. . .. ......... . ........... ............ . .. .. . . .................. . . . . . . .. . .. . ............ . ...... .. .. . ..... .......... . .... . . . .. ............. ...... ... .. . ....... . ...... . . .. ......................... .............................. . .. ... . .... .. . . ....... .... . . ..... .. . . . . ........ .......... ............... . . .... . ... . . .. ........................................................................................................................................................ . . . .. ........................
lowQualScore : 99 66666666 000 4444444444444444 5 5 44 5 44 555 7 777 1 777 7777 0 555555555555555555555555555555555555555 666 5 6666666 44 5 3333 99 333 5 44 7 0 4 22 7 3333333 9999999 5 5 111 5 4 444 5 5 7777777777777777777777777777777777777 1 22222222 7 7 5 5 77 3 777777 777 777 7 333333 7 77 7 777777 11 1 1 1 444 9 000 777 0000 7 7777 77 77 7 77 999999999 7 66666666666 555555555555 6 00 99 9 9 666666666666666666 9 7 7 7 7 7 99 9 88 7 888888888888 3 222222 88 55 0 99999 1111111111 7 4444 1 9 9 99 4444444444444 444444 999 99 9 4444444 9 111111 9 1 88 3333333333333333333333333 444444444444444444444444444444 1 33 444 1 5555 66 4 3 8888888 1111 3 8 00000 00 6 6 6 2 33333333 8888888888 555555555555555 2 6 7777 1 444 5 6 55 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 9 9 9 99 444444444444444444444444
consensus : AGGGCTGTGCGGTGCAC--C----GC--GA---TTC-G--------------A-T-GCAC--CG-AT--CC-G-G-AATT---CCAAATTT---CG----ATTC-G------G------T----TC----CAAATTT--AGT---ATCACG-T-GT-------AAACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GT-GTCGG-AATACTTT-----ACTTTTG-ATT-AAAA--C-AATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----ATCTACCGTATGTACTTG--------TGTA-AG--------TT-AT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTAT-GT-CTGCGCAT-C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--T-GAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T---TA-CTA-----------AGCCGACGCGATG-A--ATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCAT-CT----AC------TAG-ACA-C-AAGC-CGATG-C-AAATATCAA--CA-GT-GA-A--N-AGA-----CATGA-A----TGGA--T-CCAA-AAT-TG-AAGTGTGATANTC------TAGACA-CAA---GCC-GATGC-AAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CGGA------CATGAATGGA--T-CCAA-AA--TTG-AA------G-TGTG-ATACACTA-CAC-----A------GTA-CAC----CTTGTGA----C----A--------ATCT--A-----TTATGTT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTGCC-ANTTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-CAGTG---A----CG-----T----ATTTACACTTTTCAT--A----TAT-TTTTT----TTTACATTAAG---TTTGT-TTT-TACCCTTAAAT-A-AGG-AATTA-TGAAG-ATTA-TT--GA--TT---TATTGA-AGCATTACTTCTTAGAGTTTTTTC----CAT-A-GGAAA--GTT-TTGTTTTCAGT------ATCAAT-----T-GAA---TCG-ATTCG------------AA----AAAAAATCGAA-TCGCAG-CATTTTG--AATC----------------------GAAATCGTCCCAGCC
Reference ( gi|1 ) : AGGGCTGTGCGGTGCAC--C----AT--GA---TTC-A--------------A-T-GCAC--CG-AT--CC-A-G-AATT---CCAAATTT---CG----ATTC-G------T------T----TC----CAAATTTTAAGC---ATCATG-T-GT-------AAACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGATGG-TC--TGAG-GT-TTCAG-AATACTTTCAATTACTTTTG-ATT-AAAG--C-AAGGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCTTATGATCTACCGTATGTACTTGACACTACTTGTA-AG--------TT-AT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTAT-CT-CTGCGCAT-C-TTA---TGA-G---AAAACAC---AATT--T-GAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T---TA-CTA-----------AGCCGACGCGATGTAGTATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTTGC-CT----AA------TAG-ACA-C-AAGC-TGATG-C-AAATATCAA--CA-GT-GA-A--G-AGAGTGT-CATGA-A----TGGA--T-CCAA-AA--TG-AAGTGTGATANTA------TAGACA-CAT---GCT-GATGC-AAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CAGA--GTGTCATGAATGGA--T-CCAA-CA--T-G-AA------G-TGTG-ATACACTA-CAC-----A------GTA-CACCTG-CTTGTGA----C----A--------ATCT--T-----TTATGTT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTGCC-AATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-CAGTG---T----CG-----T----ATTTACA----TCAT--A----TAT-TTTTT----TTTACAATAAG---TTTGT-TTT-TACCCTTAAAT-A-AGGTAATTATTGAAGCATTA-TTTAGAGTTTTCCTATTGGCAGCATTAGTTTTTAGAGTTCTCTCCT-TCAT-A-GAAAA--GTT-TTGTTTTCAGTG-----ATCAAT-----T-GAA---TCG-ATTCGGAA-AAAT---AAATCGCAAAAAATCGAA-TTGCAG-CATTTTG--AATC----------------------G-AATCGTCCCAGCC
gi|2 : AGGGCTGTGCGGTGCAC--CGAAAAT--GA---TGC-A--------------
gi|17 : AGGGATGTGCGATTCACTTC----GTTTGA---TTC-G--------------A-T-ACAC---A-AT--CC-G-G-AATT---CCAAATTT---CG----ATTT-G------TTGGCAGT----TT----GAAATTT--AGT---ATCACA-T-GA-------AAACA--AC-AAAACA--AA---CA-GTGG--CAACG-AGACGG-TC--T-----------G-AATACT-----TTACTTATG-ATTAAAAA--C-ACTGGAAAGG---AGGG-CAAGATCATC-TAC------CCGTATGTACccgcgattaacataattcgttcgcgttccgaatgcaccggatccagaattccaattccgattcggttcggtttccaaattagttatcacgtgtaaacaacaaaaaaatggcggcaacggaaacggcgagtggatcgaataaacaagccaatggaaagtaggaacaaataatctaccgtattgtacttgtaaatttattgtgctagcaccgttaaacacatttaggagttcaacaagtatctacattctcggatcttatgaagaaaaccaaatttgaattatcagttcaagtggaacttgctaaattacctcatagccgacgcaagtacagacgagtgggcaaccctgcgacattactctactagaacataaagctgatgcaaaatagtaatagtagatacagactggagaataccaaaatgaatagtgagctgtgatacactatcacaagtacaccctgtgacaatctatattatgttttaaaatttccctaatgaactcaagatttgaatgtgcccaattttgaagcttctaagtcagtgttcgtattcacacatatttttgttttaacattattgaagtattattttagagttttcctcaatgaggaaatttttttcagtatcaatttgaatcggatttcgaaaaaaatcgaaatcgcagcattttggcaatcgaaatcgacaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|15 : gtatatggtacacaactcctaGGGCTGT-CGGTGCAC--C----GA--AAAATTTCGA--------------G-T-GCACCGCG-AT--TC-A-at
gi|21 : GGGCTGTGTGGTGCAC--C----cttcgttcggttcgatgcaccgatccagaattccaaatttcgattcggtcgcgttcaaattagtatcacgtagtaaacaacaaaaattgcgcggcaatgaaacggtctgaggtgtcggaataccaaagcaatggaaagtagaccaaataatctacgtatgaacttgttaaattatgtctacacgttaaaacacattagagttcaacaatttctatctgctgcgcatttcttaaaaaaacacaatttgaatatcagtcaatggactctaaatttactaagcgacgcaaagtacagcgagtggacaactggcgaatttcgtctactagacataagcttgatgccaaatatcaatagtgaaacagacatggatgatccaaaatgaag
gi|14 : GGCTGTGCGGTGCAC--C----gaaaatttcgatcaccgcaattcattgttttatttcgatgcaccgatccagaattccaaatttggatttggttcggttcaaatttagtaatcacgtgtaaaacaacaaacaatcggcaacgagacggtctgaggtgagaaaacacaattttgaa
gi|5 : GGCTGTGCGGTGCAT--C----G---GAAATTTT-G--------------A-T-GCAC--CG------C-G----ATT---C---ACTT---TG-----TTC-T------G------T----TC----AAAATTT--AGT---ATCATG-T-GT-------AAACA--AC-A----A--AT---TG-GCAG--CAACT-TGATGG-TC-------------------ACTTT-----ACTTTTG-AAA-AAAGAAC-AATGGAAAA------GA-CAA-GTCATCT--------ACTGTATGTAC--------A--TGCA-AG--------TT-AT-GCGCT-A-C--A-CCGT------GCAAGTA---T---ATT-A------CGA-GTTCAAG--AAGT-TGAACTTCTTT-GT-CTGCGCAT-C-TTT---TGA-ATTAAGAAAAC---AATT--T-GAGT-ATCG----GTGCA--A--GT-GG--ACTC-----A---TA-CTA-----------AGCCGAC---ATG----ATGTACAG-TGAGTGGACAA--AT-GCAA-ATTTCAT-CT----AC------TAG-ACA-C-AAGT-CGATG-C-AAATATCAA--CA-GT-GA-A--C-AGA-----CATGA-A----TGGA--T-CTAA-AAT-TA-AAGTGTGATAgaaaatttcgatacaccgcgattcacttcgttcgattcgatgcaccgatccggaattccaaatttcgattcggttcggttccagatttagtaccatgtgtaaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctgaggtgttggaatactttacttttgattagagcaaggaaaagtaggacaaatcatctaccgtatgtacttaaaaattatacgctacaccgttcaaacactatattacgagttcaacaagttctatgtctgtgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttccaatggacttatactaagccgacacgatgtacagagagtgtacaactgcaaatgtcatcgtctagacataagctgatgcaaatacggacatgatccaaagttgaagtgtgatg
gi|31 : GGCGGTGTGGTGCAT--C----GA--AAAT-TTC-G--------------A-T-GCACTGCG-AT--TC-ACG----T---C----TTT---CG----ATTC-G------cactacacttgtgacaattaatctgttttcatttcctaatactcaagatttgaatacatgtgcaaattttgaattataagtcaaagacttataaatttacacttctcacatcttttttttttaagtaaagtttttgtttttacccttaaataaaggtattattgaagcattacttagttttttttctcaggagggaagttttcttcagtatgaatcaattcaaaaaatcgaatcgtagtgttttgtatcgaaatctaaccgaatgaatcctgaattgtc
gi|11 : CGATGCAC--C----GC--GA---TTC-ACTTAGTTCATTTCGA-T-GCAC--CG-AT--CT-G-G-AATC---CCAAATTT---TG----ATTCAG------T------TCGG-TT----CAAAATTTA-GT---ATCACA-T-GT-------AAACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--TAACG-AGACGG-TC--TGAG-GT-GTTGG-AATGCTTT-----ACTTTTG-ATT-GAAA--C-AATGGAAAAT---AGGA-CAA-ATCACCT--------ACTGTATGTACTT-----------T------------TT-AT-ACGTA-A-C--A-CCGT------TTAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------ATAT-GT-CTGTGTAT-C-TTA---TGA-A---AAAACGC---AA--------------------TTCA--A--GT-GG--ACTG-----T---TA-CTA-----------AACCGACACG-------ATGCACAG-TGAGTGGACAA--CT-GCAA-CTTTGAT-CT----AC------TAG-ACA-C-AAGC-CGATG-C---------A--CA-GT-GA-A--C-AGA-----CATGA-A----TGGA--T-TCAA-AA--TGCAAGTGTGATAatgcacgggttcaaca
gi|8 : gtgtggtgcaccgaaaatttT--GA---TTC-G--------------G-T-ACAC--CA-AT--TC-G-G-AATT---CCAAATTT---CG----GTTT-G------G------T----TC----AAAATTT--AGT---ATCAAG-T-GT-------AAACA--AC-T----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GT-GTTGG-AACACTTT-----ACTTTTG-ATC-AAAA--C-AATGGGAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT--------ACCGTATGTACTTG----------TA-AG--------TT-AT-GCGCT-A-C--T-CTGT------TTAAGCA---T---ATT-A------TGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTAT-GT-CTGCACAT-C-TTA---TGA-G---AAAACAC---AATT--------------------CA--A--GT-GG--ACTC-----T---TA-CTA-----------AGCCGACGTGATGTA-------CCG-TGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCGT-CT----AC------TAG-ACA-C-AATC-TGATG-C-AAATTTCAA--CA-GT-GA-A--C-AGA-----CATAA-A----TGGA--T-CCAA-AAT-TG-AAGTGTGATcactacacagtacacttgtgacaactaatttatcatgttttaatttcctaataatcaagatttgaatttgccaattttgaattctatgtcagtgac
gi|16 : gctgtgcggtgaccatgcaccaaaaattttgatgcaccgcgattcacttcgttT--GA---TTC-A--------------A-T-GAAT--CA-AT--CT-G-G-AATT---CCAAATTT---TG----ATTCTG------T------TGG--TT----CAAAATTTA-GC---ATCACT-T-GT-------CAACA--AC-A----A--AA---TG-GCAG--CAGCG-AGACGG-TC--TGTG-GT-GTGGG-AATACT-----TTACTTTTG-ATA-AAAT--C-AATGGAAAGG---AGCA-CAA-GTCA---------CTACTGTA----------------TGTA-AG--------TT-AT-GCGCT-A-T--A-CCGT------TTAAGCA---A---ATT-A------GGG-GTTCAAC--AAGT-T------CTAT-tcactacacagtacacttgactagtgacaatttattatgttctaatttcctaatactcaagatttgaatgtgctaagtttgaattctaagtcagtgatgtatatacacttttcaaatctgttttaaaatttacattaagtttttttt
gi|14 : agggctgtgcagtgaaatgaaaattttgatgcaccataatctacttcatt--GA---TTC-G--------------A-T-GCAC--CG-AT--CC-G-G-AATT---CCAAATTT---CG----ATTC-GGT----TCGG---T----TC----CAGATTT--AGT---ACCATG-T-GT-------AAACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GT-GTTGG-AATACTTT-----ACTTTTG-ATT-AGAG--C-AAGGAAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT--------ACCGTATGTACTTAA----------A-AA--------TT-AT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACACTAT---ATT-A------CGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTAT-GT-CTGTGCAT-C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--G-GAAT-ATCA----GTTCC--A--AT-GG--ACTT-----A---TA-CTA-----------AGCCGACACG-------ATGTACAG-AGAGTGTACAA--CT-GCAA-ATGTCAT-CG----TC------TAG-ACA-T-AAGC-TGATG-C-AAATA----------C-GG-A------------CAT----------GA--T-CCAA-AGT-TG-AAGTGTGAT
gi|4 : ggctgtgcggtgcaccgaaaatttcgatacaccgcgattcacttcgttc--GA---TTC-G--------------AGT-GCAC--CG-AT--CC-G-G-AATT---CCAAAATT---CG----ATTC-G------G------T----TCGGTTCAAATT---AGT---ATCATA-T-----------AACT--AC-A----AC-AA---TG-GCG----AACG-AGACGG-TC--TAAG-GTGTTCAGGAATG-------TTACTTTTG-ATT-AAAAA-C-AATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCA-------ATCTACCGTATGTACT-GGCA----------AG--------AT-AT-ACGCT-A-C--A-CC-T------TCAAACA---T---ATT-A------CGATGTTCAGC--AA-T-T------C-AT-GT-CTGCGCAT-C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--G-GAAT-ATCA----GTTCA--A---T-GG--ACTC-----T---TA-CTA-----------AGCCGACACG-------ATGTACAG--GAGTGGACAA--CT-GCAA-ATCTCAT-CG----TC------TTG-ACA-C-AAGC-TAATG-C-AAATATCAA--CA--C-GA-G--C-GGA-----CAT----------GA--T-CCAA-AAT-TG-AAGTGTGg
gi|15 : ctgcggtgcaccgaaaattcggatgcaccgcgatcacttcgttc--GG---TTC-G--------------A-T-GCAC--CG-AT--CC-A-G-AATT---CCAAATTT---CG----ATTC-G------G------TCGCGTT----CAAATT---AGT---ATCACG-TAGT-------AAACA--AC-A----A--AAAT-TGCGCGG--CAATG-AAACGG-TC--TGAG-GT-GTCGG-AATACC-------------------AAAG--C-AATGGAAAGT---AGAC-CAA-AT--------AATCTAC-GTATGAACTTG--------T-TA-AA--------TT-AT-GT-CT-A-C--A-C-GT------TAAAACA---C---ATT-A-------GA-GTTCAAC--AATT-T------CTAT-CTGCTGCGCAT-T-TCT---TAA-A---AAAACAC---AATT--T-GAAT-ATCA----G-TCA--A---T-GG--ACTCTAAATT---TA-CTA-----------AG-CGACGCAA---A----GTACAG-CGAGTGGACAA--CTGGCGA-ATTTCGT-CT----AC------TAG-ACA-T-AAGCTTGATGCC-AAATATCAA--TA-GT-GA-A--ACAGA-----CATGG-A----T-GA--T-CCAA-AA--TG-AAGtatgcactaaactctaaatgtacactctgtgacatttaaattatctattatcttattagttactacactacaagatgtgaatgtgcattttttaaattgctaagtcatgagatcgaagcgcattttatataaatcttttttttaattaagttttgtttacccttaaatacaggaattaattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatccaatcgtagcattttgatcgaaatcgaaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|12 : gggctgtcggtgcaccgaaaaatttcgagtgcaccgcgattcacttcgttc--GA---TTC-G--------------A-T-GCAC--CG-AT--CC-G-G-AATT---CCAAATTT---CG----GTTC-G------G------T----TC----AAAATTT--AGT---ATCATA-T-AT-------AAACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TAAG-GTGTTCAGGAATGTTTT-----ACTTTTG-ATT-AAAA--C-AATGGAAAGT---AGGG-CAA-ATCATCT--------ACCGTATGTACTTG----------TA-AG--------AT-AT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTAT-
gi|20 : gggctgtgcgcgggtgcacgcggaaagcttgtcgggaatggcaccgcggaaatgtgatgcacggcgtactggtcggtc--GG---TTC-G--------------A-T-GCACG-CG-AT--CCCA-GTAATT---C--AATTT---CGTTCGGTTC-G------G------T----TC----CAAATTT--AGT---ATCACGCT-GT-------AAACA--AC-A----A--AAA--TG-GCGG--CAACG-AAACGGTTC--TGAG-GT-GTCGG-AAtgttttttctgcttgtttatttttttctatctgatgaattatattcaccccaatccgcccgcaccaaaatttttatcagttaacatcggactcttagtaagccgacacgatgtacaatgagtggacaactacaaatttcatcgtctagacacaagctaatgcaaatat
gi|23 : ggcttggtgcggtgcaccggaaaatttgcgatgggcaccgcacgattcatgtcgttc--GA---TTG-AG-------------A-T-GCAC--CG-ATTGCC-A-G-AAT----CCAAATTT----G----GTTC-G------T------T-----C----CAAAT----AGT---ACTACG-T-GG-------TAACA--ACAA----A--AA---TG-GCGT--CAAgta
gi|21 : aggtgcgcgtgcaaccgaaagatctcggcagccgcaattcacttgtc---TTC-G--------------A-T-GCAC--CG-AT--CC-A-G-AATT---CCAAATTT---GG----ATTT-G------G------T----TCGGTTCAAATTT--AGTA--ATCACG-T-GTA------AAACA--AC-A----AACAA---T---CGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GT-a
gi|2 : gggctgtgtggtgcaccgaaaatttcgatcaccgcaattcattgttttat-A--------------A-T-GCAC--CGGAT--CC-A-G-AATT---CCAA-TTC---CG----ATTC-GGTTCGGT------T----TC----CAAATT---AGTT--ATCACG-T-GT-------AAACA--AC-A----A--AAAAATG-GCGG--CAACGGAAACGG-C----GAGTGG-ATC-G-AATA-----AAC--------------AAG--CCAATGGAAAGT---AGGAACAA-AT--------AATCTACCGTAT-----TG----TACTTGTA-AA--------TTTATTGTGCT-AGC--A-CCGT------T-AAACA---C---ATTTA------GGA-GTTCAAC--AAGTAT------CTACATT-CT-CGGAT-C-TTA---TGAAG---AAAACCA---AATT--T-GAATTATCA----GTTCA--A--GT-GG--AA-C-----T---TG-CTAAATTACCTCATAGCCGACGCAA--------GTACAGACGAGTGGGCAACCCT-GCGACA--TTACTCT----AC------TAGAACA-TAAAGC-TGATG-CAAAATAGTAA--TA-GTAGATA--C-AGACTG-----GA-------GAA--TACCAA-AA--TG-AATAGTGAgagaaaacacaattttgaa
gi|7 : agggctgtgcggtgcaccgaaaatgatgcaccgcgattaacataattcgttcgcgttccg-A--------------A-TCGCAC--CG-AT--CC-A-G-AATTTTCCTAAATTTTCACG----ATTCCG------G------T----TA----AAAATTT--AGCGCCATCAT--T-GTCGATATGAAACACTAC-A----A--AA---TG-GGGGTGCATCG-AGACGG-TCACTAGGCGT-ATGGT-AATACTTTAAA--A-TTCTGTATT-TA--------TGGATATTTAGAGGA-GAA-GTCATCT----ATC-ACCGTTTGTAC--AA-------TGTAGAGAAATGATCTT-AT--CGCTTA-CTCA-TCGTGTTTTTCCAGGCA---TCTGATT-AT-----CGA-ATTCAACTAAAGT-T------TTAT-GT-CTGCGCATGCATTAATGTAA-T---AAAACACCGAAATTAAT-GAGT-ATAATAAAGTTCATCA--GT-GGGGACTC-----T---TA-CTA-----------AGCCGACACAA-GTAG-----------GAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCAA-CA----AC------TTG-ACAGC-AAGT-TGATG-C-AAATATCAA--CAGGT-GA-T--G-ACAG-AC-CATTC-ACACTTGGAGTT-CCAACCATTTG-AAGTGTGATAgctgtgatacactatcacaagtacaccctgtgacaatctatattatgttttaaaatttccctaatgaactcaagatttgaatgtgcccaattttgaagcttctaagtcagtgttcgtattcacacatatttttgttttaacattattgaagtattattttagagttttcctcaatgaggaaatttttttcagtatcaatttgaatcggatttcgaaaaaaatcgaaatcgcagcattttggcaatcgaaatcgacaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|6 : ctgcttgcagtggcaatcgaaaattttatgagcacatgtttcagcttcgaattcgatttcgcaAGT---ATCATA-T-AT-------AAACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TAAG-GTGTTCAGGAATGTTTT-----ACTTTTG-ATT-AAAA--C-AATGGAAAGT---AGGG-CAA-ATCATCT--------ACCGTATGTACTTG----------TA-AG--------T--AT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTAAGC--AAGT-T------CTAT-GT-CTGCGCAT-C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--G-GAAT-ATCA----GTTAA--A--AT-GG--ACTC-----T---TA-GTA-----------AGCCGACACG-------ATGTACAA-TGAGTGGACAA--CT-ACAA-ATTTCAT-CG----TC------TAG-A-A-C-AAGC-TAATG-C-AAATATCAA--C------A-A--G-CGAGCG-----GACA----T-GA--T-CCAA-AAT-TG-AAGTGTGACGCAC------TAAACA-Ccactagcttgtgacaccttaattgttatgttttacagtttcgctagataatacttgagacgagatatttgaatgtgag
gi|3 : -T-GT-------AAACA--AC-A----A--AA---TA-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GT-GATGG-AATACTTT-----ACTTTTG-ATT-AAAA--C-AATGGAAAGT---AGGA-CAA-AT--------AATCTACCATATGTACT----------TGTA-AG--------TT-AT-ATGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTGT-AT-CTGCACAT-C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--T-GAAT-ATCA----GTTCA--AGTGT-GG--ACTC-----T---TA-CTA-----------AGCCAAC---ATG----ATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCAT-CT----TC------TAG-ACA-C-AAGC-TGATG-C-AAATATCAA--CA-GC-GA-A--C-GGA-----CAT----------GA--T-CCAA-AAT-TG-AAGTGCAATACAC------TAAACA-Ctaaatgtacacttgtgaaattattatctattatgttttaatttcctactactcagatgtgaatgtggcattttttaatgctaagtcagtgacatatttacacttttcatatttttttttacattaagtttgttccccttaaatacaggaatcattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaaccgaatcaaatgaaccctaatcgtcccagcc
gi|10 : agggctgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG-TC--TGAG-GT-GTTGG-AATACTTT-----ACGTTTG-ATT-AAAA--A-CATGGAAATT---AGGA-CAC-ATtaaatgtacacttgtgaaaattaatctattatgttttaatttcctaatactcaagatttgaatgtggcattttttaatgctaagtcagtgacgtatttacacttttcatatcttttttttacatgaagtttttctttaaccttaaataacggaattttttaagcattactttttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaataaaaatcgaattgtagcattttgaatcgaaatcgaaccaaatgaaccctgaatcgtcccagccct
gi|9 : G-TC--TGAG-GT-GTTGG-AATACTTT-----ACGTTTG-ATT-AAAA--A-CATGGAAATT---AGGA-CAC-ATacgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatggcaatttcatctttaaaagacttttagacacaagccgttgcaaatatcaacggacatgaatggatccaaaattgaagtttgataatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|30 : -AATACTTT-----ACTTTTG-ATA-AAAG--C-AATGGAATGT---AGAA-CAA---------ATAATCTACCATATGTACTT--C--------TA-AA--------TT-AT-ATGCT-A-acgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatgacaatttcatctttaaaagacttttagacacaagccgttgcaaatatcaacggacatgaatggatccaaaattgaagtttgataatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|10 : -AT-ACGCT-A-C--AACCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTAT-GT-CGGCGCAT-C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--T-GAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GC--ACTC-----TATATAACTA-----------AGC-GACACGATGTA-------CAG-TGAGTTGACAA--AT-GGCA-ATTTCAT-CTTTAAAAGACTTTTAG-ACA-C-AAGC-CGTTG-C-AAATATCAA--CG-G------------A-----CATGA-A----TGGA--T-CCAA-AAT-TG-AAGTTTGATAATA------CAAA
gi|9 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacac-AT-ACGCT-A-C--AACCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTAT-GT-CGGCGCAT-C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--T-GAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GC--ACTC-----TATATAACTA-----------AGC-GACACGATGTA-------CAG-TGAGTTGACAA--AT-GACA-ATTTCAT-CTTTAAAAGACTTTTAG-ACA-C-AAGC-CGTTG-C-AAATATCAA--CG-G------------A-----CATGA-A----TGGA--T-CCAA-AAT-TG-AAGTTTGATAATA------CAAAatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|32 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacT-A-C--A-CCGT------TCTAACA---T---ATT-ACCATTACGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTAT-GT-CTGCatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|34 : T-C-TTA---TGA-G---AAAACAG---AATT--T-GACA-ATCA----GTTCA--A--GT-GA--A
gi|13 : GA-G---AAAACAC---AATT--TTGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T---TA-CTA-----------AGCTGACGC-ATG------GTACAG-C-AGTGGACAA--CT-GCAA-AATTCGT-CT----AC------TAG-ACA-C-AAAC-TGATG-C-AAA-ATCAA--CG-GT-GA-A--ACAGA-----CATGA-A----TGAA--T-CCAA-AA--AGAAAGTGTGATA
gi|12 : CAA---AATT--T-T--T-ATCA----GTTAA--C--ATCGG--ACTC-----T---TA-GTA-----------AGCCGACACGATGTA-------CAA-TGAGTGGACAA--CT-ACAA-ATTTCAT-CG----TC------TAG-ACA-C-AAGC-TAATG-C-AAATATcactacacagtaacacctgtgacaatcttttatgtttttaatttcctaatactcaaatctgaagtgcccaattttgaattcatatagtcagagttattcttatttactctatacccataatccttttaacaataagtttgttttacccttaaataaagtaattattgaagcattattaagagtttttcctcataaggaaagctttttcagtatcaattgaatcgattcgaaaaaaatcgaatcgcagccattttgaatcaaaatcaaaccgaaacgaattgaccctgaaatcgtcccaaccc
gi|24 : gggctgtgcgcgggtgcacgcggaaagcttgtcgggaatggcaccgcggaaatgtgatgcacggcgtactggtcggtcgattcgatgcaccgatccggaattccaaatttcggttcggttcaaaatttagtatcatatataaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttttacttttgattaaaacaatggaaagtagggcaaatcatctaccgtatgtacttgtaagatatacgctacaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctattgttttttctgcttgtttatttttttctatctgatgaattatattcaccccaatccgcccgcac-C-AAAT-CAATG-C-AAATATCAAAACA-GT-GA-ATTG-CAAA----CATGA-A----TGGG--T-CCAA-AAT-TA-AAGTGTGATA
gi|14 : -A--G-AGAGTGT--ACAA-C----TG-------CAA-A---------TGTCATCGTC------TAGACA-TAA---GCT-GATGC-AAA-T------------------A---CGGA------CAT-----GA--T-CCAA--AGTT-G-AA------G-TGTG-ATcactacacagtacatttgtgacaattaatctatgttttaattttc
gi|4 : ggctgtgcggtgcaccgaaaatttcgatacaccgcgattcacttcgttcgattcgatgcaccgatccggaattccaaatttcgattcggttcggttccagatttagtaccatgtgtaaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctgaggtgttggaatactttacttttgattagagcaaggaaaagtaggacaaatcatctaccgtatgtacttaaaaattatacgctacaccgttcaaacactatattacgagttcaacaagttctatgtctgtgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttccaatggacttatactaagccgacacgatgtacTGTACAGGA-G----TGGA--C----A-AC--TGCAAATCTCATCGTC------TTGACA-CAA---GCT-AATGC-AAA-TATCAA--CA--C-G-A--G---CGGA------CATGA-------T-CCAA-AA--TTG-AA------G-TGTGTATGCACTA-AACTCTAAAT-----GTA-CACTC----TGTGA----C----ATTTAAATTATCT--A-----TTATCTTATT--AG---TTAC-T------AC--ACTACAAG-------ATGTGA----ATGTGCA-TTTTTTA----AA--TTGC-TA-AGT-CA-TGAGAT----CGAAGCGC----ATTT-TA----T-AT--A----AATCTTTTT----TTTA-ATTAAG---TTT-T-GTT-TACCCTTAAAT-ACAGG-AATTA--------------------------ATTGA-AGCATTA---CTTAG-GTTGTTTC-------------AA--GTT-T-GTTT-CAGT------ATCAAT-----T-GA---------TTCG------------AATCGAAAAAAATCCAA-TCGTAG-CATTTTG---ATC----------------------GAAATCGg
gi|6 : ctgcggtgcaccgaaaattcggatgcaccgcgatcacttcgttcgattcgagtgcaccgatccggaattccaaaattcgattcggttcggttcaaattagtatcatataactacaacaatggcgaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttacttttgattaaaaacaatggaaagtaggacaaatcaatctaccgtatgtactggcaagatatacgctacaccttcaaacatattacgatgttcagcaattcatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttcaatggactcttactaagccgacacgaATGA-G----TGGA--C----A-AC--TACAAATTTCATCGTC------TAGA-A-CAA---GCT-AATGC-AAA-TATCAA--CAAGC-G-A--G---CGGA------CATGA-------T-CCAA-AA--TTG-AA------G-TGTG-ACGCACTA-AAC-----ACTAAATGTA-CAC-----TTGTGA----A----ATTATT---ATCT--A-----TTATGTT-TT--AA---TTTC-C----TACT--ACT-CA-G-------ATGTGA----ATGTGGC-ATTTTTT----AA--TG-C-TA-AGT-CAGTG---A----CA-----T----ATTTACA----CTTTTCA----TAT-TTTTT----TTTACATTAAG---TTTGT-TC----CCCTTAAAT-ACAGG-AAT--------CATT------GA--------------AGCATTA---CTTAG-GTTGTTTC-------------AA--GTT-T-GTTT-CAGT------ATCAAT-----T-GA---------TTCG------------AATCGAAAAAAATCGAA-TCGTAG-CATTTTG--AATC----------------------GAAATCGaaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|11 : agtatcatatataaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttttacttttgattaaaacaatggaaagtagggcaaatcatctaccgtatgtacttgtaagtatacgctacaccgttcaaacatattacgagttaagcaagttctatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttaaaatggactcttagtaagccgacacgatgtacaTGA-G----TGGA--C----A-AC--TGCAACTTTGAT-CTAC-----TAGACA-CAA---GCC-GATGC-A-----------CA-GT-G-A--A---CAGA------CATGAATGGA--T-TCAA-AA--T-GCAA------G-TGTG-ATACACTA-CAC-----A------GTA-CA-----CTTGTGA----CAACTA--------ATTT--A-----TCATGTT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--AAT-CAAG-------ATTTGA----ATTTGCC-AATTTTG----AA--TT-C-TA-TGT-CAGTG---aaccgaatcaaatgaaccctaatcgtcccagcc
gi|5 : gtgtggtgcaccgaaaatttcgatgcaccgcgattcacttagttcatttcgatgcaccgatctggaatcccaaattttgattcagttcggttcaaaatttagtatcacatgtaaacaacaaaatggcggtaacgagacggtctgaggtgttggaatgctttacttttgattgaaacaatggaaaataggacaaatcacctactgtatgtactttttatacgtaacaccgtttaaacatattacgagttcagcaagttatatgtctgtgtatcttatgaaaaaacgcaattcaagtggactgttactaaaccgacacgatgcacagTGA-G----TGGA--C----A-AA--TGCAAATTTCAT-CTAC-----TAGACA-CAA---GTC-GATGC-AAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CAGA------CATGAATGGA--T-CTAA-AAT-T-A-AA------G-TGTG-ATACACTA-CA------------------------CTTGTGA----C----A--------AT-T--A-----ATCTGTT-TT--CA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGAATACATGTGCA-AATTTTG----AA--TT-A-TA-AGT-CAAAG---A----CT-----TATAAATTTACACTTCTCAC--A----TCT-TTTTT----TTTTAAGTAAAGTTTTTGT-TTT-TACCCTTAAATAA-AGGT-ATTATTGAAGCATTA-CTT--AGTTTTac
gi|3 : ggctgtgcggtgcatcggaaattttgatgcaccgcgattcactttgttctgttcaaaatttagtatcatgtgtaaacaacaaattggcagcaacttgatggtcactttacttttgaaaaaagaacaatggaaaagacaagtcatctactgtatgtacatgcaagttatgcgctacaccgtgcaagtatattacgagttcaagaagttgaacttctttgtctgcgcatcttttgaattaagaaaacaatttgagtatcggtgcaagtggactcatactaagccgacatgatgtacagGA-G----TGGA--C----A-AC--TGCAAATTTCATCTTC------TAGACA-CAA---GCT-GATGC-AAA-TATCAA--CA-GC-G-A--A---CGGA------CATGA-------T-CCAA-AA--TTG-AA------G-TGCA-ATACACTA-AAC-----ACTAAATGTA-CAC-----TTGTGAAAATT----A--------ATCT--A-----TTATGTT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTGGC-ATTTTTT----AA--TG-C-TA-AGT-CAGTG---A----CG-----T----ATTTACACTTTTCAT--A----T-C-TTTTT----TTTACATGAAG---TTTTT-CTT-TAACCTTAAAT-A-ACGGAATT---------------------TTT--TA-----AGCATTACTTTTT----TTTTC---------------AA--GTT-T-GTTT-CAGT------ATCAAT-----T-GAT---TCG-ATTCG------------AAT----AAAAATCGAA-TTGTAG-CATTTTG--AATC----------------------GAAATCGttttctcaggagggaagttttcttcagtatgaatcaattcaaaaaatcgaatcgtagtgttttgtatcgaaatctaaccgaatgaatcctgaattgtc
gi|2 : agggctgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaaacaacaaaatagcggcaacgagacggtctgaggtgatggaatactttacttttgattaaaacaatggaaagtaggacaaataatctaccatatgtacttgtaagttatatgctacaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctgtatctgcacatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgtggactcttactaagccaacatgatgtacagcTGCGACATTACTCTACTAGA-A-CATAAAGCT-GATGC-AAAATAGTAA--TA-GTAG-AT-A---CAGA--CTG----GA--GAA--TACCAA-AA--T-G-AATAGTGAGCTGTG-ATACACTATCAC-----AA-----GTA-CACCC----TGTGA----C----A--------ATCTA-TA----TTATGTT-TT--AAAATTTCC-C----TAATGAACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTGCCCAATTTTG----AAGCTT-C-TA-AGT-CAGTG---TT---CG-----T----ATTCACA----C-----A----TAT-TTTT----------------------GT-TTT-AAC----------------ATTATTGAAGTATTATTTTAGAGTTTTCCTaaccaaatgaaccctgaatcgtcccagccct
gi|8 : agggctgtgcggtgcaccgaaaatgatgcaccgcgattaacataattcgttcgcgttccgaatgcaccggatccagaattccaattccgattcggttcggtttccaaattagttatcacgtgtaaacaacaaaaaaatggcggcaacggaaacggcgagtggatcgaataaacaagccaatggaaagtaggaacaaataatctaccgtattgtacttgtaaatttattgtgctagcaccgttaaacacatttaggagttcaacaagtatctacattctcggatcttatgaagaaaaccaaatttgaattatcagttcaagtggaacttgctaaattacctcatagccgacgcaagtacagacgagtgggcaaccc------TAGACA-CAA---TCT-GATGC-AAA-TTTCAA--CA-GT-G-A--A---CAGA------CATAAATGGA--T-CCAA-AA--TTG-AA------G-TGTG-ATTCACTA-CAC-----A------GTA-CACTTGACTAGTGA----C----A--------ATTT--A-----TTATGTT-CT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTGCT-AAGTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-CAGTG---A----TG-----T----ATATACACTTTTCAA--A----TCT-GTTTTAAAATTTACATTAAG---TTTTT-TTT-caatgaggaaatttttttcagtatcaatttgaatcggatttcgaaaaaaatcgaaatcgcagcattttggcaatcgaaatcgacaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|15 : gctgtgcggtgaccatgcaccaaaaattttgatgcaccgcgattcacttcgtttgattcggtacaccaattcggaattccaaatttcggtttggttcaaaatttagtatcaagtgtaaacaactaaatggcggcaacgagacggtctgaggtgttggaacactttacttttgatcaaaacaatgggaagtaggacaaatcatctaccgtatgtacttgtaagttatgcgctactctgtttaagcatattatgagttcaacaagttctatgtctgcacatcttatgagaaaacacaattcaagtggactcttactaagccgacgtgatgtaccgtgagtggacaactgcaaatttcgtctac------TAGACA-TAA---GCTTGATGCCAAA-TATCAA--TA-GT-GAA--A---CAGA------CATGGAT-GA--T-CCAA-AA--T-G-AA------G-
gi|13 : gggctgtcggtgcaccgaaaaatttcgagtgcaccgcgattcacttcgttcggttcgatgcaccgatccagaattccaaatttcgattcggtcgcgttcaaattagtatcacgtagtaaacaacaaaaattgcgcggcaatgaaacggtctgaggtgtcggaataccaaagcaatggaaagtagaccaaataatctacgtatgaacttgttaaattatgtctacacgttaaaacacattagagttcaacaatttctatctgctgcgcatttcttaaaaaaacacaatttgaatatcagtcaatggactctaaatttactaagcgacgcaaagtacagcgagtggacaactggcgaatttcgtctac------TAGACA-CAA---ACT-GATGC-AAA--ATCAA--CG-GT-G-A--AA--CAGA------CATGAATGAA--T-CCAA-AA--A-G-AAA-----G-TGTG-ATACACTA-CAC-----A------GTAACACCTG-----TGA----C----A--------ATCT--T-----TTATGTT-TTT-AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAA--------ATCTGA----A-GTGCCCAATTTTG----AA--TT-CATATAGT-CAGAG---TTATTCT-----T----ATTTACT----CTAT--ACCCATAA-TCCTT----TTAACAATAAG---TTTGT-TTT--ACCCTTAAAT-A-AAGTAAT---------------------------TATTGA-AGCATTA---TTAAGAGTTTT-TCCT--CAT-AAGGAAA--GCT-TT---TTCAGT------ATCAAT-----T-GAA---TCG-ATTCGA-----------------AAAAAATCGAA-TCGCAGCCATTTTG--AATC----------------------A-AA
gi|10 : gagaaaacacaattttgaatatcagttcaagtggactcttactaagctgacgcatggtacagcagtggacaactgcaaaattcgtctac------TAGACA-CAA---GCC-GTTGC-AAA-TATCAA--CG-G--------------A------CATGAATGGA--T-CCAA-AA--TTG-AA------G-TTTG-ATA-A-TA-CAA-----AAT----GTA-CAC-----TTGTGA----C----A--------AT----------------------AA---T----C----TATT--A---------------TTTGA----ATGTGTC-ATTTTTTTTTTAA--TG-C-TA-ATTTCAGTG---A----CG-----T----ATTTACACTTTTCAT-------TCT-TTTTT----TTTACATTAAT---TTT-T-TTT-TACCCTTAAAT-A-AAG--------GAA---TTA-TT--GA--------------ACCATTACTT-----AGTTTTTTC-------------AA--GTT-T-GTTT-CAGT------ATCAAT-----T-GAT---TCG-ATTCG------------------AAAAAATCGAA-TCGTAG-CATTTTG--AATC----------------------GAAATCGatcaaaccgaaacgaattgaccctgaaatcgtcccaaccc
gi|9 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacatacgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatggcaatttcatctttaaaagacttt------TAGACA-CAA---GCC-GTTGC-AAA-TATCAA--CG-G--------------A------CATGAATGGA--T-CCAA-AA--TTG-AA------G-TTTG-ATA-A-TA-CAA-----AAT----GTA-CAC-----TTGTGA----C----A--------AT----------------------AA---T----C----TATT--A---------------TTTGA----ATGTGTC-ATTTTTTTTTTAA--TG-C-TA-ATTTCAGTG---A----CG-----T----ATTTACACTTTTCAT-------TCT-TTTTT----TTTACATTAAT---TTT-T-TTT-TACCCTTAAAT-A-AAG--------GAA---TTA-TT--GA--------------ACCATTACTT-----AGTTTTTTC-------------AA--GTT-T-GTTT-CAGT------ATCAAT-----T-GAT---TCG-ATTCG------------------AAAAAATCGAA-TCGTAG-CATTTTG--AATC----------------------GAAATCGaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|7 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacatacgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatgacaatttcatctttaaaagactttGACAGCAA---GTT-GATGC-AAA-TATCAA--CAGGT-G-ATGA---CAGACCAT-TCACACTTGGAGTT-CCAACCATTT-G-AA------G-TGTG-ATACACTA-------------------------G-CTTGTGA----C-------------ACCT--TAATTGTTATGTT-TTACAG---TTTCGCTAGATAAT--ACT-TGAGACGAGATATTTGA----ATGTGaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|24 : ctgcttgcagtggcaatcgaaaattttatgagcacatgtttcagcttcgaattcgatttcgcaaatcgcaccgatccagaattttcctaaattttcacgattccggttaaaaatttagcgccatcattgtcgatatgaaacactacaaaatgggggtgcatcgagacggtcactaggcgtatggtaatactttaaaattctgtatttatggatatttagaggagaagtcatctatcaccgtttgtacaatgtagagaaatgatcttatcgcttactcatcgtgtttttccaggcatctgattatcgaattcaactaaagttttatgtctgcgcatgcattaatgtaataaaacaccgaaattaatgagtataataaagttcatcagtggggactcttactaagccgacacaagtaggagtggacaactgcaaatttcaacaacttATGC-AAA-TATCAAAACA-GT-G-A--ATTGCAAA------CATGAATGGG--T-CCAA-AA--TTA-AA------G-TGTG-ATACACTA-CAC-----A------GTA-CA-----TTTGTGA----C----A--------AT-TAAT-----CTATGTT-TT--AA---TTTT-C----ag
gi|25 : caaatca-----TTATGTT-TT--AA---TTTC-C----CAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTGCA-AATTCTG----AA--TT-C-TA-AGT-CAGTG---A----CG-----T----
gi|29 : ataT-CAATG---A----CG-----A----ATTTACACTTTTTGT--A----TAT-ATTTT----TT-ACAA-AAG---TTTGTGTTTATACCCTTTAAT-A-AAGGAATTATTGAAGCATTttaatactgacgtgtttacacttttcatatcttt
gi|18 : -CAGTG---A----CG-----T----ATATACA----CTTTTCA----TAT-CTTTT----TTTACATTCAG---TTTTT-TTT-TACCCTTAAAT-------------TAAGGAATTA-TT--GA--------------ACCATTACTT-----AGTTTTTTC-------------AA--GTT-T-GTTT-CAGTACCGGTATCAAT-----T-GAT---TCG-ATT--------------AA----AAAAAATCGAA-TCGTAG-CATTTTG--AATC----------------------G-AA
gi|27 : GTAATTATTGAAGTATTA-TTTAGAGTTTACCTatctaaccgactctaacgaaccccgtatcgtcccagc
gi|2 : TATTGA-AGTATTA--TTTTAGAGTTTTC--CT-CAATGA-GGAAA----T-TT-TTTTCAGT------ATCAAT-----TTGAA---TCGGATT----------------TCGAAAAAAATCGAAATCGCAG-CATTTTGGCAATC----------------------GAAATCGcatgagtaaagtttttttcaacatcaattgaatcgatttgaaaaaaatcaaatcgcagcattttgaatcga
gi|27 : agggctgtgcggtgcaccgaaaatgatgcaccgcgattaacataattcgttcgcgttccgaatgcaccggatccagaattccaattccgattcggttcggtttccaaattagttatcacgtgtaaacaacaaaaaaatggcggcaacggaaacggcgagtggatcgaataaacaagccaatggaaagtaggaacaaataatctaccgtattgtacttgtaaatttattgtgctagcaccgttaaacacatttaggagttcaacaagtatctacattctcggatcttatgaagaaaaccaaatttgaattatcagttcaagtggaacttgctaaattacctcatagccgacgcaagtacagacgagtgggcaaccctgcgacattactctactagaacataaagctgatgcaaaatagtaatagtagatacagactggagaataccaaaatgaatagtgagctgtgatacactatcacaagtacaccctgtgacaatctatattatgttttaaaatttccctaatgaactcaagatttgaatgtgcccaattttgaagcttctaagtcagtgttcgtattcacacatatttttgttttaacatTATTGA-AGTATTA---TTTAGAGTT---TACC-TCATGA-GTAAA--GTT-TT--TTTCAAC------ATCAAT-----T-GAA---TCG-ATTTGAAA-AAA----------------ATCAAA-TCGCAG-CATTTTG--AATC----------------------G-acaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|22 : gtaatAGCATTA---CTTATATTTTTTTTTTCTCACGA-GGAAA--GTT-TT--CTTCAGT------ATGAAT-----T-GAA---TT--ATTC--AATAGATTAAAAAGAGAAAAAAATCGTA-CCTCAG-TGTTTTG--AATCAAAATCAAATTGAATGAACCCTG-AATCGTCCCAGCC
gi|26 : GAGTTTTCC----TCATGA-GGAAA--ATT-TT---TTCAGT------ATCAAT-----T-GAA---TCG-ATTTG------------------AAAAAATCGAA-TCGCAT-CATTTTG--AATC----------------------G-AACCG
gi|19 : AT-A-AAAAAAGGTTATTGATT--AGTGTA---ATTAGTCCCTAT-GAAAAGTCT-ATTCAGAA-GATT---AAAT-----AAAATCAAA-TTGCGG-CATTTTG--AATC----------------------GAAATCGaatcgaatggaccctgaatc
gi|5 : tttacacttatttttttttttttttttttttttacatccaagtttctttttttataat-A-GGGAA--GTT-TT--CTTCAGTA----------------T-GAA---TCA-ATTC-------------------AAAAAATCGAA-TCGTAG-TGTTTTG--TATC----------------------G-AAaaccgaatcgaatgaaccctgaatcattccagcc
gi|28 : ggctgtgcggtgcatcggaaattttgatgcaccgcgattcactttgttctgttcaaaatttagtatcatgtgtaaacaacaaattggcagcaacttgatggtcactttacttttgaaaaaagaacaatggaaaagacaagtcatctactgtatgtacatgcaagttatgcgctacaccgtgcaagtatattacgagttcaagaagttgaacttctttgtctgcgcatcttttgaattaagaaaacaatttgagtatcggtgcaagtggactcatactaagccgacatgatgtacagtgagtggacaaatgcaaatttcatctactagacacaagtcgatgcaaatatcaacagtgaacagacatgaatggatctaaaattaaagtgtgatacactacacttgtgacaattaatctgttttcatttcctaatactcaagatttgaatacatgtgcaaattttgaattataagtcaaagacttataaatttacacttctcacatcttttttttttaagtaaagtttttgtttttacccttaaataaaggtattattgaagcattacttagttttttttctcaggT-TTGTTT-CAGT------ATCAAT-----T-GAT---TCA-ATTCGAAA-AAA--------------AAATCGAA-TCGTAG-CATTCTG--AATC----------------------GAAATCGatctaaccgaatgaatcctgaattgtc
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GTGCACCGAAATTTTTGGTGCATCACGATTTATACCATTCGATTCGA
Unaligned ( gi|35 ): GAATGGACCCTGAATCGTCCCAGCCCTACTC
Unaligned ( gi|36 ): ATGAACCCTGAATCGTCCCAGCCCTAA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 33333333333333333 11111111111111 11111 2222222 1111111 1111 2222222222222 3333333333333 11111111 111 11111111111 44444444444 111 2222222222222 11111111111111 111111111 111111 3333333333 22222 22222222222222222 1111111 1111 1111111111111 11111 1 1 7777777777777777777777777777777 77777777777777777777777777777777777 111 111111 33333333333333333333333333333
lowQualScore : 55 22 33333333333333333 22 44444444444444 5 22 44 55 22 22 3 555 33 333 88888 11111 888888 4444 2222222 555 999 333 2 0000000 33 33 4 5555 33 777 2 33 2 2 33 2 5555 2 55555 66 2 2 4444 444 2 2 9999999999999 2 7777777777777 2 00000000 2 2 2 33 5 777777 444 444 2 999999 2 33 2 777777 2 66 2 6666 2 555 444 444 2 5555 33 33 2 33 7777777 000 33333333333 0 88888888888 2 222 33 5 2 2 33 2222222222222 2 5555 2 4 22 2 2 4 1 77777777777777 6666 999999999 333 22 55 22 5555555 8 2 444444444 2 2 2 3 44 6 3 222222 9999 777777 44 3 44 888888 3 3 4444444444 6 33333 6666 00000000000000000 2 2 2 33 555 2 6666 44 3 0000000 6666 6 1 4444 44 3 3 3 5 33 5555555555555 2 888 6666 9999999 88888 6666 9999 44 3 0 3 77777 3 3 6 0 3 9999999999999999999999999999999 3 00000000000000000000000000000000000 4 999 000000 2 2 3 33 66666666666666666666666666666 2 2 33
lowQualScore : .. .. ................. .. .............. . .. .. .. .. .. . ... .. ... ..... ..... ...... .... ....... ... ... ... . ....... .. .. . .... .. ... . .. . . .. . .... . ..... .. . . .... ... . . ............. . ............. . ........ . . . .. . ...... ... ... . ...... . .. . ...... . .. . .... . ... ... ... . .... .. .. . .. ....... ... ........... . ........... . ... .. . . . .. ............. . .... . . .. . . . . .............. .... ......... ... .. .. .. ....... . . ......... . . . . .. . . ...... .... ...... .. . .. ...... . . .......... . ..... .... ................. . . . .. ... . .... .. . ....... .... . . .... .. . . . . .. ............. . ... .... ....... ..... .... .... .. . . . ..... . . . . . ............................... . ................................... . ... ...... . . . .. ............................. . . ..
lowQualScore : 00 99 33333333333333333 55 33333333333333 5 44 33 22 88 99 2 888 55 777 99999 88888 222222 5555 3333333 888 444 333 4 0000000 22 22 7 0000 22 444 4 22 5 2 11 2 8888 1 66666 11 2 4 5555 111 4 4 9999999999999 7 1111111111111 9 44444444 5 4 4 44 0 222222 444 444 5 777777 5 44 5 222222 9 88 9 6666 9 000 777 333 7 7777 77 77 7 77 6666666 000 66666666666 7 55555555555 7 111 44 0 5 5 44 1111111111111 5 3333 5 7 77 4 4 7 0 99999999999999 6666 111111111 555 88 33 88 8888888 0 1 444444444 1 2 9 1 22 2 1 888888 6666 222222 22 1 22 888888 1 1 8888888888 2 66666 5555 44444444444444444 9 9 9 99 000 9 1111 22 1 0000000 5555 2 0 2222 66 3 3 3 7 99 7777777777777 9 999 5555 3333333 44444 5555 6666 22 1 5 1 77777 1 3 7 0 3 0000000000000000000000000000000 1 77777777777777777777777777777777777 2 000 111111 7 7 1 77 11111111111111111111111111111 7 7 77
consensus : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------C--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GT----TC------CAAATTT--AGT---ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-C--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----ATCTACCGTAT-GTACTTG--------TGTA-AG--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAAC---AT---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGCGATG----ATGTA-CAG--CGAGTGGACAA--CT-GC-AA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A---ACGGA----CA-TGAA----TGG---A--T-CCAA--AAT------TG-AAGTGTG-ATACN------CTAGA-CA-CAA-GCCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-GA--A---CGGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC---A------GT-ACAC----CTTGTGA----CA--------A----TC--TAT-TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACACTT-------TTCATATN---TTTTTT----TTTACATT----AAG--T-TTGT-TT-----T-TACCCTTA-AAT-A-A-GG-AATTA--GAA--------------T----TATTGA-AGCATTACTT-----TT-AGAGTTTTT-TC---CA-T-AGGAAAGTTTTGTTTT-----CAGT-ATCAATT-GANTCGA--TTCG-A--------------A------------AAAAAATCG-AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAAATCGTCCCAGCC
Reference ( family-3214 ) : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------C--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GT----TC------CAAATTT--AGT---ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-C--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----ATCTACCGTAT-GTACTTG--------TGTA-AG--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAAC---AT---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGCGATG-A--ATGTA-CAG--CGAGTGGACAA--CT-GC-AA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A---ANAGA----CA-TGAA----TGG---A--T-CCAA--AAT------TG-AAGTGTG-ATANT------CTAGA-CA-CAA-GCCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-GA--A---CGGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC---A------GT-ACAC----CTTGTGA----CA--------A----TC--TAT-TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CCANTTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACACTT-------TTCATATA---TTTTTT----TTTACATT----AAG--T-TTGT-TT-----T-TACCCTTA-AAT-A-A-GG-AATTA-TGAAG-ATTATT--GA-TT----TATTGA-AGCATTACTT----CTT-AGAGTTTTT-TC---CA-T-AGGAAAGTTTTGTTTT-----CAGT-ATCAATT-GAATCGA--TTCG-A--------------A------------AAAAAATCG-AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAAATCGTCCCAGCC
gi|1 : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CA------T--G---A---TT--C--------------AA-T--GCAC--CG-AT--CC--AGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------TT----TC------CAAATTTTAAGC---ATCATG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGATGG-TC--TGAG-GTTT-C--AG-AATACTTTCAATTAC--TTTTG-ATT-AAA--G-CAAGGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCTTATGATCTACCGTAT-GTACTTGACACTACTTGTA-AG--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAAC---AT---ATT-A------CGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTATCT-CTGCGCAT--C-TTA---TGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGCGATGTAGTATGTA-CAG--CGAGTGGACAA--CT-GC-AA-ATTTTG--CCT-------AA---TAG-AC----A-C-AAGC-TGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A---AGAGAGTGTCA-TGAA----TGG---A--T-CCAA--AA-------TG-AAGTGTG-ATANT------ATAGA-CA-CAT-GCTGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-GA--A---CAGAGTGTCATGAA----TGGA--T-CCAA--CA-------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC---A------GT-ACACCTG-CTTGTGA----CA--------A----TC--TTT-TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-T---CGT----ATTTACA-----------TCATATA---TTTTTT----TTTACAAT----AAG--T-TTGT-TT-----T-TACCCTTA-AAT-A-A-GGTAATTATTGAAGCATTATTTAGAGTTTTCCTATTGGCAGCATTAGTT----TTT-AGAGTTCTC-TCCTTCA-T-AGAAAAGTTTTGTTTT-----CAGTGATCAATT-GAATCGA--TTCG-G--------------AAAAATAAATCGCAAAAAATCG-AATTGCAG-CATTTTG--AATCG-AATCGTCCCAGCC
gi|10 : G-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATACTTT-----AC--GTTTG-ATT-AAA--A-ACATGGAAATT---AGGA-CAC-AT
gi|10 : AT-ACGCT-A-C--AACCGT------TCAAAC---AT---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CGGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GC--ACTC-----TATATAACTA-----------AG-CGACACG-------ATGTA-CAG--TGAGTTGACAA--AT-GG-CA-ATTTCA--TCTTTAAAAGACTTTTAG-AC----A-C-AAGC-CGTTG-C-A-AATATCAAC--------------GGA----CA-TGAA----TGG---A--T-CCAA--AAT------TG-AAGTTTG-ATAAT------acgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatggcaatttcatctttaaaagacttttagacacaagccgttgcaaatatcaacggacatgaatggatccaaaattgaagtttgataatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|10 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacT------TTAGA-CA-CAA-GCCGTTGCAAA-TATCAA--C--------------GGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTTTG-ATA-A-TA-CAA---AAT----GT-ACAC-----TTGTGA----CA--------A----T-------------------AA---T----C----TATT--A---------------TTTGA----ATGTG-TCATTTTTTTTTTAA--TG-C-TA-ATTTC--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACACTT-------TTCAT-TC---TTTTTT----TTTACATT----AAT--T-TT-T-TT-----T-TACCCTTA-AAT-A-A-AG--------GAA--------------T----TATTGA-ACCATTACTT----------AGTTTTT-TC------------AAGTTT-GTTT------CAGT-ATCAATT-GATTCGA--TTCG-A--------------A------------AA--AATCG-AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|11 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacatacgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatggcaatttcatctttaaaagactCGATGCAC--CG------C--G---A---TT--CACTTAGTTCATTTCGA-T--GCAC--CG-AT--CT--GGAATC---C-CAAATTT---TG----ATTCAGTTCG------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCACA-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--TAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATGCTTT-----AC--TTTTG-ATT-GAA--A-CAATGGAAAAT---AGGA-CAA-ATC--------ACCTACTGTAT-GTACTT---------T--------------TTAT-ACGTA-A-C--A-CCGT------TTAAAC---AT---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------ATATGT-CTGTGTAT--C-TTA---TGA-A---AAAACGC---AA-------------------TTCA--A--GT-GG--ACTG-----T-T---ACTA-----------AACCGACACG-------ATGCA-CAG--TGAGTGGACAA--CT-GC-AA-CTTTGA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C----------AC-A-GT-G-A---ACAGA----CA-TGAA----TGG---A--T-TCAA--AAT------GC-AAGTGTG-ATACA------CTACA-CA-aacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|11 : gtgtggtgcaccgaaaatttA----CAGTGAG----TGG---A--C-------AAC------TGCAACTTTG-ATCTA------CTAGA-CA-CAA-GCCGATGCA-----------CA-GT-GA--A---CAGA----CATGAA----TGGA--T-TCAA--AAT------GCAAGTGTG-ATACACTA-CAC---A------GT-ACAC-----TTGTGA----CA--------ACTAATT--TAT-CATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--AAT-CAAG-------ATTTGA----ATTTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-TGT-C--AG-------------TG-A---Cgtacacttgtgacaactaatttatcatgttttaatttcctaataatcaagatttgaatttgccaattttgaattctatgtcagtgac
gi|12 : gtgtggtgcaccgaaaatttcgatgcaccgcgattcacttagttcatttcgatgcaccgatctggaatcccaaattttgattcagttcggttcaaaatttagtatcacatgtaaacaacaaaatggcggtaacgagacggtctgaggtgttggaatgctttacttttgattgaaacaatggaaaataggacaaatcacctactgtatgtactttttatacgtaacaccgtttaaacatattacgagttcagcaagttatatgtctgtgtatcttatgaaaaaacgcaattcaagtggactgttactaaaccgacacgatgcT--GCACGGCGTAC--TGGTCGGTC--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----GTTC-----G------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCATA-T-AT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TAAG-GTGT-TCAGG-AATGTTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGG-CAA-ATC--------ATCTACCGTAT-GTACT----------TGTA-AG--------ATAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAAC---AT---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTAT
gi|12 : gggctgtgcgcgggtgcacgcggaaagcttgtcgggaatggcaccgcggaaatgtgaCAA---AATT--TT--T-ATCA----GTTAA--C--ATCGG--ACTC-----T-T---AGTA-----------AGCCGACACGATG-------TA-CAA--TGAGTGGACAA--CT-AC-AA-ATTTCA--TCG-------TC---TAG-AC----A-C-AAGC-TAATG-C-A-AATATtgttttttctgcttgtttatttttttctatctgatgaattatattcaccccaatccgcccgcaccaaaatttttatcagttaacatcggactcttagtaagccgacacgatgtacaatgagtggacaactacaaatttcatcgtctagacacaagctaatgcaaatat
gi|13 : gggctgtgcgcgggtgcacgcggaaagcttgtcgggaatggcaccgcggaaatgtgatgcacggcgtactggtcggtcgattcgatgcaccgatccggaattccaaatttcggttcggttcaaaatttagtatcatatataaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttttacttttgattaaaacaatggaaagtagggcaaatcatctaccgtatgtacttgtaagatatacgctacaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctattgttttttctgcttgtttatttttttctatctgatgaattatattcaccccaatccgcccgcacACAA--TT-TT-GA-ATATCAGTTCA-------AG---TGG-ACTCTTA-CTAAGC-TGACG-C-ATGGTA-CAGC-A-GT-G--------GA----CA---AC----TG----------CAA--AAT------T-----CGTC--TA--------CTAGA-CA-CAA-ACTGATGCAAA--ATCAA--CG-GT-GA--AA--CAGA----CATGAA----TGAA--T-CCAA--AAA------GAAAGTGTG-ATACACTA-CAC---A------GTAACAC----C-TGTGA----CA--------A----TC--TTT-TATGTTT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAA--------ATCTGA----A-GTGCCCAATTTTG----AA--TT-CATATAGT-CAGAG-------------TT-ATT-CTT----ATTTACTCTA-------TACCCATA---ATCCTT----TTAACAAT----AAG--T-TTG--TT-----T-TACCCTTA-AAT-A-A-AG-------TAA---------------T----TATTGA-AGCATTA--------TTAAGAGTTTTT-CCT--CA-TAAGGAAAGCT---TTTT-----CAGT-ATCAATT-GAATCGA--TTCG----------------A------------AAAAAATCG-AATCGCAGCCATTTTG--AATCAAAATC
gi|14 : gagaaaacGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------A--A---AAT-TT--C--------------GA-T--ACAC--CG-aaaccgaaacgaattgaccctgaaatcgtcccaaccc
gi|14 : GCGATTCACTTCGTT----C--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GT----TCGGTTC-CAGATTT--AGT---ACCATG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AGA--G-CAAGGAAAAGT---AGGA-CAA-ATC--------ATCTACCGTAT-GTACT----------TAAA-AA--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACACTAT---ATT-A------CGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTATGT-CTGTGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--GGAAT-ATCA----GTTCC--A--AT-GG--ACTT-----A-T---ACTA-----------AGCCGACACG-------ATGTA-CAG--AGAGTGTACAA--CT-GC-AA-ATGTCA--TCG-------TC---TAG-AC----A-T-AAGC-TGATG-C-A-AAT------------------ACGGA----CA-T---------G---A--T-CCAA--AGT------TG-AAGTGTG-ATcgattcacttcgttcgattcgatgcaccgatccggaattccaaatttcgattcggttcggttccagatttagtaccatgtgtaaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctgaggtgttggaatactttacttttgattagagcaaggaaaagtaggacaaatcatctaccgtatgtacttaaaaattatacgctacaccgttcaaacactatattacgagttcaacaagttctatgtctgtgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttccaatggacttatactaagccgacacgatgtacagagagtgtacaactgcaaatgtcatcgtctagacataagctgatgcaaatacggacatgatccaaagttgaagtgtgatg
gi|15 : ggctgtgcggtgcaccgaaaatttcgatacaccGGGCT--GT-CGGTGCAC--CG------A--A---AAATTT--C--------------GAGT--GCAC--CG------C--G--ATT---C----ACTT---CG-----TTC-----G------GT----TC------g
gi|15 : GCGATTCACTTCGTT----C--G---G---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--AGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GTCGCGTT------CAAATT---AGT---ATCACG-TAGT-------AA--ACA--AC-A----A--AAAT-TGCGCGG--CAATG-AAACGG-TC--TGAG-GTGT-C--GG-AATACC---------------------AAA--G-CAATGGAAAGT---AGAC-CAA-ATAATCT----A-----CGTAT-GAACTTG--------T-TA-AA--------TTAT-GT-CT-A-C--A-C-GT------TAAAAC---AC---ATT-A-------GA-GTTCAAC--AATT-T------CTATCTGCTGCGCATTTC-TTA-----A-A---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----G-TCA--A---T-GG--ACTCTAAATT-T---ACTA-----------AG-CGACGC-----A--AAGTA-CAG--CGAGTGGACAA--CTGGC-GA-ATTTCG--TCT-------AC---TAG-AC----A-T-AAGCTTGATGCC-A-AATATCAAT-A-GT-GAA---ACAGA----CA-TGGA----T-G---A--T-CCAA--AA-------TG-AAGgatgcaccgatccagaattccaaatttcgattcggtcgcgttcaaattagtatcacgtagtaaacaacaaaaattgcgcggcaatgaaacggtctgaggtgtcggaataccaaagcaatggaaagtagaccaaataatctacgtatgaacttgttaaattatgtctacacgttaaaacacattagagttcaacaatttctatctgctgcgcatttcttaaaaaaacacaatttgaatatcagtcaatggactctaaatttactaagcgacgcaaagtacagcgagtggacaactggcgaatttcgtctactagacataagcttgatgccaaatatcaatagtgaaacagacatggatgatccaaaatgaag
gi|16 : gggctgtcggtgcaccgaaaaatttcgagtgcaccAGGGCT--GTGCAGTGAAA--TG------A--A---AAT-TT--T--------------GA-T--GCAC--C
gi|16 : --G---A---TT--C--------------AA-T--GAAT--CA-AT--CT--GGAATT---C-CAAATTT---TG----ATTCTGTT-G------GT----TC------AAAATTT--AGC---ATCACT-T-GT-------CA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCAG--CAGCG-AGACGG-TC--TGTG-GTGT-G--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATA-AAA--T-CAATGGAAAGG---AGCA-CAA-GTCA---------CTACTGTA-----------------TGTA-AG--------TTAT-GCGCT-A-T--A-CCGT------TTAAGC---AA---ATT-A------GGG-GTTCAAC--AAGT-T------CTATataatctacttcatttgattcaatgaatcaatctggaattccaaattttgattctgttggttcaaaatttagcatcacttgtcaacaacaaaatggcagcagcgagacggtctgtggtgtgggaatactttacttttgataaaatcaatggaaaggagcacaagtcactactgtatgtaagttatgcgctataccgtttaagcaaattaggggttcaacaagttctat
gi|17 : agggctgtgcagtgaaatgaaaattttgatgcaccataatctacttcatttAGGGAT--GTGCGATTCACTTCG------TTTG---A---TT--C--------------GA-T--ACAC---A-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTT-----GTTGGCAGT----TT------GAAATTT--AGT---ATCACA-T-GA-------AA--ACA--AC-AAAACA--AA---CA-GTGG--CAACG-AGACGG-TC--T-------------G-AATACTTT-----AC--TTATG-ATTAAAA--A-CACTGGAAAGG---AGGG-CAAGATCATCT----AC---CCGTAT-GTAC
gi|18 : gtatatggtacacaactccta-C--AG-------------TG-A---CGT----ATATACACTT-------TTCATAT-----CTTTT----TTTACATT----CAG--T-TTTT-TT-----T-TACCCTTA-AATTA-A-GG-AATTA-T-------------------------TGA-ACCATTACTT----------AGTTTTT-TC------------AAGTTT-GTTTCAGTACCGGT-ATCAATT-GATTCGA--TT---A--------------A------------AAAAAATCG-AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCat
gi|19 : TTTACACTTATTTTTTTTTTTTTT---TTTTTT----TTTACATCC---AAG--T-TTCT-TT-----T-T----TTATAAT-ATA-AA-AA------AAG-GTTATT--GA-TT-----------AGTGTAA--------TT-AG--------TC---CC-T-ATGAAAAGTCTATT--------------CA----GAA--GA--TT---A--------------A------------ATAAAATCA-AATTGCGG-CATTTTG--AATCGAAATCGtaaccgactctaacgaaccccgtatcgtcccagc
gi|2 : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------A--A---A---AT-----------------GA-T--GCAC--CG------C--G--ATTA--A-CATAATT---CG-----TTC-----GC-----GT----TC------CGAATaaccgaatcgaatgaaccctgaatcattccagcc
gi|2 : --CG------C--G---T---TC--C--------------GAAT--GCAC--CGGAT--CC--AGAATT---C-CAA-TTC---CG----ATTC-----G------GT----TCGGTTTCCAAATT---AGTT--ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AAAAATG-GCGG--CAACGGAAACGG-C----GAGTGGAT-C--G--AATA-------------------AAC-AAG--C-CAATGGAAAGT---AGGAACAA-AT-A-------ATCTACCGTATTGTACTTG--------TA-A-AT--------TTATTGTGCT-AGC--A-CCGT------T-AAAC---AC---ATTTA------GGA-GTTCAAC--AAGTAT------CTACAT-TCTCGGAT--C-TTA---TGAAG---AAAACCA---AATT--TGAATTATCA----GTTCA--A--GT-GG--AA-C-----T-T---GCTAAATTACCTCATAGCCGACGCAA--------GTA-CAGA-CGAGTGGGCAACCCT-GC-GACATTAC---TCT-------AC---TAGAAC----A-TAAAGC-TGATG-CAA-AATAGTAAT-A-GTAG-AT--ACAGA----C--TGGA-----GA---A--TACCAA--AATGAATAGTG-AGCTGTG-ATACA------CTAT--CA-CAA-Ggcaccggatccagaattccaattccgattcggttcggtttccaaattagttatcacgtgtaaacaacaaaaaaatggcggcaacggaaacggcgagtggatcgaataaacaagccaatggaaagtaggaacaaataatctaccgtattgtacttgtaaatttattgtgctagcaccgttaaacacatttaggagttcaacaagtatctacattctcggatcttatgaagaaaaccaaatttgaattatcagttcaagtggaacttgctaaattacctcatagccgacgcaagtacagacgagtgggcaaccctgcgacattactctactagaacataaagctgatgcaaaatagtaatagtagatacagactggagaataccaaaatgaatagtgagctgtgatacactatcacaagtacaccctgtgacaatctatattatgttttaaaatttccctaatgaactcaagatttgaatgtgcccaattttgaagcttctaagtcagtgttcgtattcacacatatttttgttttaacattattgaagtattattttagagttttcctcaatgaggaaatttttttcagtatcaatttgaatcggatttcgaaaaaaatcgaaatcgcagcattttggcaatcgaaatcgacaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|2 : agggctgtgcggtgcaccgaaaatgatgcaccgcgattaacataattcgttTG-A--AT-TATCAGTTCAAGTGGA--A--CTTGCTAA-ATT--A--CCT-----------------C----A-T-A-GC-CGACG-C-A-AGTA------------------CAGA----C---GAG----TGGGCAA--C-CC-------------------TGCG-ACATTACTCTACTAGAACA-TAAAGCTGATGCAAAATAGTAA--TA-GTAGAT-A---CAGA----C-TGGA-----GAA--TACCAA--AATGAATAGTGAGCTGTG-ATACACTATCAC---AA-----GT-ACAC----CCTGTGA----CA--------A----TCTATAT-TATG-TT-TT--AAAATTTCC-C----TAATGAACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTGCCCAATTTTG----AAGCTT-C-TA-AGT-C--AG-------------TGTT---CGT----ATTCACA------------CATATT---TTTGTT----TTAACATTATTGAAG--TATTAT-TTTAGAGT-TTTCCTC--AAT-G-A-GG-AAtacaccctgtgacaatctatattatgttttaaaatttccctaatgaactcaagatttgaatgtgcccaattttgaagcttctaagtcagtgttcgtattcacacatatttttgttttaacattattgaagtattattttagagttttcctcaatgaggaaatttttttcagtatcaatttgaatcggatttcgaaaaaaatcgaaatcgcagcattttggcaatcgaaatcgacaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|2 : agggctgtgcggtgcaccgaaaatgatgcaccgcgattaacataattcgttcgcgttccgaatgcaccggatccagaattccaattccgattcggttcggtttccaaattagttatcacgtgtaaacaacaaaaaaatggcggcaacggaaacggcgagtggatcgaataaacaagccaatggaaagtaggaacaaataatctaccgtattgtacttgtaaatttattgtgctagcaccgttaaacacatttaggagttcaacaagtatctacattctcggatcttatgaagaaaaccaaattT----TATTGA-AGTATTATTT------T-AGAGTTTTCCTC---AA-TGAGGAAA--TTT-TTTT-----CAGT-ATCAATTTGAATCGGATTTCG----------------A------------AAAAAATCGAAATCGCAG-CATTTTGGCAATCGAAATCGatttttttcagtatcaatttgaatcggatttcgaaaaaaatcgaaatcgcagcattttggcaatcgaaatcgacaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|20 : agggctgtgcggtgcaccgaaaatgatgcaccgcgattaacataattcgttcgcgttccgaatgcaccggatccagaattccaattccgattcggttcggtttccaaattagttatcacgtgtaaacaacaaaaaaatggcggcaacggaaacggcgagtggatcgaataaacaagccaatggaaagtaggaacaaataatctaccgtattgtacttgtaaatttattgtgctagcaccgttaaacacatttaggagttcaacaagtatctacattctcggatcttatgaagaaaaccaaatttgaattatcagttcaagtggaacttgctaaattacctcatagccgacgcaagtacagacgagtgggcaaccctgcgacattactctactagaacataaagctgatgcaaaatagtaatagtagatacagactggagaataccaaaatgaatagtgagctgtgatacactatcacaagtacaccctgtgacaatctatattatgttttaaaatttccctaatgaactcaagatttgaatgtgcccaattttgaagcttctaagtcagtgttcgtattcacacatatttttgttttaacaGGCTTGGTGCGGTGCAC--CG---------GAAAA---TTTGC--------------GA-TGGGCAC--CG------C--ACGATT---C----ATGT---CG-----TTC-----G------GT----TC------acaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|20 : ------C--G---G---TT--C--------------GA-T--GCACG-CG-AT--CCCAGTAATT---C---AATTT---CGTTCGGTTC-----G------GT----TC------CAAATTT--AGT---ATCACGCT-GT-------AA--ACA--ACAA----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AAACGGTTC--TGAG-GTGT-C--GG-AAgatgcacgcgatcccagtaattcaatttcgttcggttcggttccaaatttagtatcacgctgtaaacaacaaaaatggcggcaacgaaacggttctgaggtgtcggaagta
gi|21 : ggcttggtgcggtgcaccggaaaatttgcgatgggcaccgcacgattcatgtcgttGGGCT--GTGTGGTGCAC--CG------A--A---AAT-TT--C--------------GA-T--gta
gi|21 : ---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--AGAATT---C-CAAATTT---GG----ATTT-----G------GT----TCGGTT--CAAATTT--AGTA--ATCACG-T-GTA------AA--ACA--AC-A----AACAA---T---CGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTG-----AG-AAAAC--------ACAATTTTG-Acaccgcaattcattgttttatttcgatgcaccgatccagaattccaaatttggatttggttcggttcaaatttagtaatcacgtgtaaaacaacaaacaatcggcaacgagacggtctgaggtgagaaaacacaattttgaa
gi|22 : gggctgtgtggtgcaccgaaaatttcgatcaccgcaattcattgttttat-AGCATTACTTATATTTT-----TTTTT-TCT--CA-CGAGGAAAGTTTT--CTT-----CAGT-ATGAATT-GAATT-A--TTCA-ATAGATTAAAAAGAGA------------AAAAAATCG-TACCTCAG-TGTTTTG--AATCAAAATCa
gi|23 : ------C--G---A---TT--GA-------------GA-T--GCAC--CG-ATTGCC--AGAAT----C-CAAATTT----G----GTTC-----G-------T----TC------CAAAT----AGT---ACTACG-T-GG-------TA--ACA--ACAA----A--AA---TG-GCGT--CAAaaattgaatgaaccctgaatcgtcccagcc
gi|24 : aggtgcgcgtgcaaccgaaagatctcggcagccgcaattcacttgt-CAA-ATCAATGCAAA-TATCAAAACA-GT-GA--ATTGCAAA----CATGAA----TGGG--T-CCAA--AAT------TAAAGTGTG-ATACACTA-CAC---A------GT-ACA-----TTTGTGA----CA--------A----TT--AATCTATG-TT-TT--AA---TTTT-C----a
gi|25 : --TAT-TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----CAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CAAATTCTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AGTGACGTTTAATACTG-A---CGT----GTTTACACTT-------TTCATATC---TTT
gi|26 : aGAGTTTTC-CT---CA-TGAGGAAAATTTT---TT-----CAGT-ATCAATT-GAATCGA--TTTG-----------------------------AAAAAATCG-AATCGCAT-CATTTTG--AATCGAA
gi|27 : T----TATTGA-AGTATTATTT--------AGAGTTTAC-CT---CA-TGAGTAAAGTTTT--TTT-----CAAC-ATCAATT-GAATCGA--TTTG-A--------------A------------AAAAA-TCA-AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAccgaatcgaatggaccctgaatc
gi|28 : gtaaTTTGTTT------CAGT-ATCAATT-GATTCAA--TTCGAA--------------A------------AAAAAATCG-AATCGTAG-CATTCTG--AATCGAAATCG
gi|29 : aaT-C--AA-------------TG-A---CGA----ATTTACACTT-------TTTGTATA----TATTT----TTTACA-A----AAG--T-TTGTGTT-----TATACCCTTT-AATAA-A-GG-AATTATTGAAGCATTaattgaatgaaccctgaatcgtcccagcc
gi|3 : -T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TA-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGA-T--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGA-CAA-AT-A-------ATCTACCATAT-GTACTTG--------T--A-AG--------TTAT-ATGCT-A-C--A-CCGT------TCAAAC---AT---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTGTAT-CTGCACAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--AGTGT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCAAC---ATG----ATGTA-CAG--CGAGTGGACAA--CT-GC-AA-ATTTCA--TCT-------TC---TAG-AC----A-C-AAGC-TGATG-C-A-AATATCAAC-A-GC-G-A---ACGGA----CA-T---------G---A--T-CCAA--AAT------TG-AAGTGCA-ATACA------CTAAA-CA-C
gi|3 : agggctgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAAC-A--T-G-ATGTACAG--------CGAG----TGG---A--C-------AAC------TGCAAATTTC-ATCTT------CTAGA-CA-CAA-GCTGATGCAAA-TATCAA--CA-GC-GA--A---CGGA----CATGA-----------T-CCAA--AAT------TGAAGTGCA-ATACACTA-AAC---ACTAAATGT-ACAC-----TTGTGAAAATTA--------A----TC--TAT-TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-GCATTTTTT----AA--TG-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACACTT-------TTCATAT----CTTTTT----TTTACATG----AAG--T-TTTT-CT-----T-TAACCTTA-AAT-A-ACGG-AATT---------TT-TT----------------A-AGCATTACTT------------TTTTT-TT---CA---AG------TTTG-TTT-----CAGT-ATCAATT-GATTCGA--TTCG-A--------------A------------TAAAAATCG-AATTGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGtaaatgtacacttgtgaaaattaatctattatgttttaatttcctaatactcaagatttgaatgtggcattttttaatgctaagtcagtgacgtatttacacttttcatatcttttttttacatgaagtttttctttaaccttaaataacggaattttttaagcattactttttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaataaaaatcgaattgtagcattttgaatcgaaatcgaaccaaatgaaccctgaatcgtcccagccct
gi|30 : agggctgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaaacaacaaaatagcggcaacgagacggtctgaggtgatggaatactttacttttgattaaaacaatggaaagtaggacaaataatctaccatatgtacttgtaagttatatgctacaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctgtatctgcacatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgtggactcttactaagc-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATA-AAA--G-CAATGGAATGT---AGAA-CAA-AT-A-------ATCTACCATAT-GTACT----------TCTA-AA--------TTAT-ATGCT-A-aaccaaatgaaccctgaatcgtcccagccct
gi|31 : GGCG--GTGTGGTGCAT--CG------A--A---AAT-TT--C--------------GA-T--GCAC--TG------C--G--ATT---CACGTCTTT---CG----ATTC-----G------AT----
gi|32 : T-A-C--A-CCGT------TCTAAC---AT---ATT-ACCATTACGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCgcacgggttcaaca
gi|34 : T--C-TTA---TGA-G---AAAACAG---AATT--TGACA-ATCA----GTTCA--A--GT-GA--A
gi|4 : TGCGGTGCAC--CGA-----A--A---A---TT--CG-------------GA-T--GCACCGCG-AT--C
gi|4 : c------C--G---A---TT--C--------------GAGT--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAAATT---CG----ATTC-----G------GT----TCGGTT--CAAATT---AGT---ATCA---T-AT-------AACTACA--AC-A----A-------TG-GCG----AACG-AGACGG-TC--TAAG-GTGT-TCAGG-AATG--TT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--AACAATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCA-------ATCTACCGTAT-GTACT-G---------GCA-AG--------ATAT-ACGCT-A-C--A-CC-T------TCAAAC---AT---ATT-A------CGATGTTCAGC--AA-T-T------C-ATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--GGAAT-ATCA----GTTCA--A---T-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACACG-------ATGTA-CAG---GAGTGGACAA--CT-GC-AA-ATCTCA--TCG-------TC---TTG-AC----A-C-AAGC-TAATG-C-A-AATATCAAC-A--C-G-A---GCGGA----CA-T---------G---A--T-CCAA--AAT------TG-AAGTGTGTATGCA------CTAAA-Cacttcgttcgattcgagtgcaccgatccggaattccaaaattcgattcggttcggttcaaattagtatcatataactacaacaatggcgaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttacttttgattaaaaacaatggaaagtaggacaaatcaatctaccgtatgtactggcaagatatacgctacaccttcaaacatattacgatgttcagcaattcatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttcaatggactcttactaagccgacacgatgtacaggagtggacaactgcaaatctcatcgtcttgacacaagctaatgcaaatatcaacacgagcggacatgatccaaaattgaagtgtgtatgcactaaactctaaatgtacactctgtgacatttaaattatctattatcttattagttactacactacaagatgtgaatgtgcattttttaaattgctaagtcatgagatcgaagcgcattttatataaatcttttttttaattaagttttgtttacccttaaatacaggaattaattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatccaatcgtagcattttgatcgaaatcgaaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|4 : ctgcggtgcaccgaaaattcggatgcaccgcgatcacttcgttA----CA-GGAG----TGG---A--C-------AAC------TGCAAATCTC-ATCGT------CTTGA-CA-CAA-GCTAATGCAAA-TATCAA--CA--C-GA--G---CGGA----CAT---------GA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTGTATGCACTA-AACTCTAAAT---GT-ACAC----TCTGTGA----CATTTAAATTA----TC--TAT-TATC-TTATT--AG---TTAC-T------AC--ACTACAAG-------ATGTGA----ATGTG-CATTTTTTA----AA--TTGC-TA-AGT-C--A--------------TG-AGATCGA----A---GCGCAT-------TTTATATAAATCTTTTT----TTTA-ATT----AAG--T-TT-T-GT-----T-TACCCTTA-AAT-ACA-GG-AATTA-------------------------ATTGA-AGCATTA-------CTT-AG-GTTGTT-TC------------AAG-TTTG-TTT-----CAGT-ATCAATT-GATTCGA--ATCG----------------A------------AAAAAATCC-AATCGTAG-CATTTTG---ATCGAAATCGtctaaatgtacactctgtgacatttaaattatctattatcttattagttactacactacaagatgtgaatgtgcattttttaaattgctaagtcatgagatcgaagcgcattttatataaatcttttttttaattaagttttgtttacccttaaatacaggaattaattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatccaatcgtagcattttgatcgaaatcgaaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|5 : ctgcggtgcaccgaaaattcggatgcaccgcgatcacttcgttcgattcgagtgcaccgatccggaattccaaaattcgattcggttcggttcaaattagtatcatataactacaacaatggcgaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttacttttgattaaaaacaatggaaagtaggacaaatcaatctaccgtatgtactggcaagatatacgctacaccttcaaacatattacgatgttcagcaattcatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttcaatggactcttactaagccgacacgatgtGGCT--GTGCGGTGCAT--CG---------G---AAATTT--T--------------GA-T--GCAC--CG------C--G--ATT---C----ACTT---TG-----TTC-----T------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCATG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AT---TG-GCAG--CAACT-TGATGG-TC---------------------ACTTT-----AC--TTTTG-AAA-AAAGAA-CAATGGAAAA------GA-CAA-GTCATCT----A----CTGTAT-GTAC--A--------TGCA-AG--------TTAT-GCGCT-A-C--A-CCGT------GCAAGT---AT---ATT-A------CGA-GTTCAAG--AAGT-TGAACTTCTTTGT-CTGCGCAT--C-TTT---TGA-ATTAAGAAAAC---AATT--TGAGT-ATCG----GTGCA--A--GT-GG--ACTC-----A-T---ACTA-----------AGCCGAC---ATG-A---TGTA-CAG--TGAGTGGACAA--AT-GC-AA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGT-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A---ACAGA----CA-TGAA----TGG---A--T-CTAA--AAT------TA-AAGTGTG-ATACA------CTACA-Caaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|5 : -AAGC-CGA---C-ATGATGT--AC-A-GT-G-A---GTGGA----CA---AA----TG----------CAA--A-T------T-------TC-ATCTA------CTAGA-CA-CAA-GTCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-GA--A---CAGA----CATGAA----TGGA--T-CTAA--AAT------TAAAGTGTG-ATACACTA-CA----------------------CTTGTGA----CA--------A----T---TAA-TCTG-TT-TT--CA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGAATACATGTG-CAAATTTTG----AA--TT-A-TA-AGT-C--AA-------------AG-A---CTTATAAATTTACACTT-------CTCACATCT--TTTTTT----TTTAAGTA----AAGTTT-TTGT-TT-----T-TACCCTTA-AAT-A-A-AG-G--TA-------------------T----TATTGA-AGCATTA-------CTT-AGTTTTTTT-TCT--CAGG-AGGGAAGTTT--TCTT-----CAGT-A-----T-GAATCAA--TTC------------------------------AAAAAATCG-AATCGTAG-TGTTTTG--TATCGAAATCttgtgacaattaatctgttttcatttcctaatactcaagatttgaatacatgtgcaaattttgaattataagtcaaagacttataaatttacacttctcacatcttttttttttaagtaaagtttttgtttttacccttaaataaaggtattattgaagcattacttagttttttttctcaggagggaagttttcttcagtatgaatcaattcaaaaaatcgaatcgtagtgttttgtatcgaaatctaaccgaatgaatcctgaattgtc
gi|6 : ggctgtgcggtgcatcggaaattttgatgcaccgcgattcactttgttctgttcaaaatttagtatcatgtgtaaacaacaaattggcagcaacttgatggtcactttacttttgaaaaaagaacaatggaaaagacaagtcatctactgtatgtacatgcaagttatgcgctacaccgtgcaagtatattacgagttcaagaagttgaacttctttgtctgcgcatcttttgaattaagaaaacaatttgagtatcggtgcaagtggactcatact--AGT---ATCATA-T-AT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TAAG-GTGT-TCAGG-AATGTTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGG-CAA-ATCATCT----A----CCGTAT-GTACTTG--------T--A-AG--------T-AT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAAC---AT---ATT-A------CGA-GTTAAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--GGAAT-ATCA----GTTAA--A--AT-GG--ACTC-----T-T---AGTA-----------AGCCGACACG-------ATGTA-CAA--TGAGTGGACAA--CT-AC-AA-ATTTCA--TCG-------TC---TAG-A-----A-C-AAGC-TAATG-C-A-AATATCAACAA-GC-G-A---GCGGA----CA-T---------G---A--T-CCAA--AAT------TG-AAGTGTG-ACGCA------CTAAA-CA-Ctaaccgaatgaatcctgaattgtc
gi|6 : A-TGAG----TGG---A--C-------AAC------TACAAATTTC-ATCGT------CTAGA--A-CAA-GCTAATGCAAA-TATCAA--CAAGC-GA--G---CGGA----CATGA-----------T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ACGCACTA-AAC---ACTAAATGT-ACAC-----TTGTGA----AATTATT---A----TC--TAT-TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TACT--ACT-CA-G-------ATGTGA----ATGTG-GCATTTTTT----AA--TG-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CAT----ATTTACACTT-------TTC--ATA---TTTTTT----TTTACATT----AAG--T-TTGT-TC---------CCCTTA-AAT-ACA-GG-AA----------------------T----CATTGA-AGCATTA-------CTT-AG-GTTGTT-TC------------AAG-TTTG-TTT-----CAGT-ATCAATT-GATTCGA--ATCG----------------A------------AAAAAATCG-AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGtaaatgtacacttgtgaaattattatctattatgttttaatttcctactactcagatgtgaatgtggcattttttaatgctaagtcagtgacatatttacacttttcatatttttttttacattaagtttgttccccttaaatacaggaatcattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaaccgaatcaaatgaaccctaatcgtcccagcc
gi|7 : agtatcatatataaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttttacttttgattaaaacaatggaaagtagggcaaatcatctaccgtatgtacttgtaagtatacgctacaccgttcaaacatattacgagttaagcaagttctatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttaaaatggactcttagtaagccgacacgatgtaca--GCAC--CG-AT--CC--AGAATTTTCC-TAAATTTTCACG----ATTCC----G------GT----TA------AAAATTT--AGCGCCATCAT--T-GTCGATATGAA--ACACTAC-A----A--AA---TG-GGGGTGCATCG-AGACGG-TCACT-AG-GCGTAT--GGTAATACTTT-----AAAATTCTGTATT-TA--------TGGATATTTAGAGGA-GAA-GTCATCT----ATC-ACCGTTT-GTACA-A--------TGTAGAGAAATGATCTTAT--CGCTTA-CTCA-TCGTGTTTTTCCAGGC---ATCTGATT-AT-----CGA-ATTCAACTAAAGT-T------TTATGT-CTGCGCATG-CATTAATGTAA-T---AAAACACCGAAATTAATGAGT-ATAATAAAGTTCATCA--GT-GGGGACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACACAA--------GTA---G---GAGTGGACAA--CT-GC-AA-ATTTCA--ACA-------AC---TTG-AC----AGC-AAGT-TGATG-C-A-AATATCAAC-AGGT-G-ATG-ACAGAC---CA-TTCACACTTGG---AGTT-CCAACCATT------TG-AAGTGTG-ATACA------CTAGaaccgaatcaaatgaaccctaatcgtcccagcc
gi|7 : ctgcttgcagtggcaatcgaaaattttatgagcacatgtttcagcttcgaattcgatttcgcaaatc------CTTGA-CAGCAA-GTTGATGCAAA-TATCAA--CAGGT-GATGA---CAGAC---CATTCACACTTGGAGTT-CCAACCATT------TGAAGTGTG-ATACACTA-GCT---T------GTGACAC----CTT---------A--------A----T---TGT-TATG-TT-TTACAG---TTTCGCTAGATAAT--ACT-TGAGACGAGATATTTGA----ATGTG-cttgtgacaccttaattgttatgttttacagtttcgctagataatacttgagacgagatatttgaatgtgag
gi|8 : ctgcttgcagtggcaatcgaaaattttatgagcacatgtttcagcttcgaattcgatttcgcaaatcgcaccgatccagaattttcctaaattttcacgattccggttaaaaatttagcgccatcattgtcgatatgaaacactacaaaatgggggtgcatcgagacggtcactaggcgtatggtaatactttaaaattctgtatttatggatatttagaggagaagtcatctatcaccgtttgtacaatgtagagaaatgatcttatcgcttactcatcgtgtttttccaggcatctgattatcgaattcaactaaagttttatgtctgcgcatgcattaatgtaataaaacaccgaaattaatgagtataataaagttcatcagtggggactcttactaagccgacacaagtaggagtggacaactgcaaatttcaacaaGCGATTCACTTCG------TTTG---A---TT--C--------------GG-T--ACAC--CA-AT--TC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----GTTT-----G------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCAAG-T-GT-------AA--ACA--AC-T----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AACACTTT-----AC--TTTTG-ATC-AAA--A-CAATGGGAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----A----CCGTAT-GTACTTG--------T--A-AG--------TTAT-GCGCT-A-C--T-CTGT------TTAAGC---AT---ATT-A------TGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTATGT-CTGCACAT--C-TTA---TGA-G---AAAACAC---AATT-------------------CA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGTGATG-------TA-CCG--TGAGTGGACAA--CT-GC-AA-ATTTCG--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AATC-TGATG-C-A-AATTTCAAC-A-GT-G-A---ACAGA----CA-TAAA----TGG---A--T-CCAA--AAT------TG-AAGTGTG-ATTCA------CTACA-CA-ag
gi|8 : gctgtgcggtgaccatgcaccaaaaattttgatgcacc------CTAGA-CA-CAA-TCTGATGCAAA-TTTCAA--CA-GT-GA--A---CAGA----CATAAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATTCACTA-CAC---A------GT-ACACTTGACTAGTGA----CA--------A----TT--TAT-TATG-TT-CT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CTAAGTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---TGT----ATATACACTT-------TTCAAATC---TGTTTTAAAATTTACATT----AAG--T-TTTT-TT-----T-gtacacttgactagtgacaatttattatgttctaatttcctaatactcaagatttgaatgtgctaagtttgaattctaagtcagtgatgtatatacacttttcaaatctgttttaaaatttacattaagtttttttt
gi|9 : gctgtgcggtgaccatgcaccaaaaattttgatgcaccgcgattcacttcgtttgattcggtacaccaattcggaattccaaatttcggtttggttcaaaatttagtatcaagtgtaaacaactaaatggcggcaacgagacggtctgaggtgttggaacactttacttttgatcaaaacaatgggaagtaggacaaatcatctaccgtatgtacttgtaagttatgcgctactctgtttaagcatattatgagttcaacaagttctatgtctgcacatcttatgagaaaacacaattcaagtggactcttactaagccgacgtgatgtaccgtgagtggacaactgcaaatttcgtctaG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATACTTT-----AC--GTTTG-ATT-AAA--A-ACATGGAAATT---AGGA-CAC-AT
gi|9 : AT-ACGCT-A-C--AACCGT------TCAAAC---AT---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CGGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GC--ACTC-----TATATAACTA-----------AG-CGACACG-------ATGTA-CAG--TGAGTTGACAA--AT-GA-CA-ATTTCA--TCTTTAAAAGACTTTTAG-AC----A-C-AAGC-CGTTG-C-A-AATATCAAC--------------GGA----CA-TGAA----TGG---A--T-CCAA--AAT------TG-AAGTTTG-ATAAT------acgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatgacaatttcatctttaaaagacttttagacacaagccgttgcaaatatcaacggacatgaatggatccaaaattgaagtttgataatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|9 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacT------TTAGA-CA-CAA-GCCGTTGCAAA-TATCAA--C--------------GGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTTTG-ATA-A-TA-CAA---AAT----GT-ACAC-----TTGTGA----CA--------A----T-------------------AA---T----C----TATT--A---------------TTTGA----ATGTG-TCATTTTTTTTTTAA--TG-C-TA-ATTTC--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACACTT-------TTCAT-TC---TTTTTT----TTTACATT----AAT--T-TT-T-TT-----T-TACCCTTA-AAT-A-A-AG--------GAA--------------T----TATTGA-ACCATTACTT----------AGTTTTT-TC------------AAGTTT-GTTT------CAGT-ATCAATT-GATTCGA--TTCG-A--------------A------------AA--AATCG-AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GTGCACCGAAATTTTTGGTGCATCACGATTTATACCATTCGATTCGA
Unaligned ( gi|35 ): GAATGGACCCTGAATCGTCCCAGCCCTACTC
Unaligned ( gi|36 ): ATGAACCCTGAATCGTCCCAGCCCTAA
Alignments
lowQualScore : 11 33333333333333333 11111111111111 11111 2222222 1111111 1111 222222222222 3333333333333 11111111 111 11111111111 333333333333 1111111111111 22222222222222222 111111 333333333333 22222 11111111 1111111 1111 1111111111111 111 111111 7777777777 22222222 66666666666666666666666666666666666666666666 11111111111111 3333333333333333 1111111111
lowQualScore : 55 22 33333333333333333 22 44444444444444 5 22 44 55 22 22 3 555 33 333 88888 11111 888888 4444 2222222 555 999 333 2 0000000 33 33 4 5555 33 777 2 33 2 2 33 2 5555 2 55555 66 2 2 4444 444 2 2 1 999999999999 2 7777777777777 2 00000000 2 2 2 33 5 777777 444 444 2 999999 2 33 2 777777 2 66 2 6666 2 555 444 444 2 5555 33 33 2 33 7777777 000 33333333333 0 555555555555 99 33 2 2 33 7777777777777 2 8888 2 4 2 2 2 4 66 2 22 2 2 555 6666 44444444444444444 2 22 555555 6 1 33 444 2 2 2 3 44 6 3 222222 9999 999999 44 3 44 888888 3 3 444444444444 6 33333 6666 88888888 6666 9 66 2 2 33 555 2 6666 44 3 0000000 6666 3 3 1 4444 44 3 3 3 5 33 5555555555555 111 6666 9999999 000000 6666 333 44 9 3 3 3 3 4444444444 33 88888888 2 88888888888888888888888888888888888888888888 55555555555555 33 2 1 33 0000000000000000 444 4444444444 2 33
lowQualScore : .. .. ................. .. .............. . .. .. .. .. .. . ... .. ... ..... ..... ...... .... ....... ... ... ... . ....... .. .. . .... .. ... . .. . . .. . .... . ..... .. . . .... ... . . . ............ . ............. . ........ . . . .. . ...... ... ... . ...... . .. . ...... . .. . .... . ... ... ... . .... .. .. . .. ....... ... ........... . ............ .. .. . . .. ............. . .... . . . . . . .. . .. . . ... .... ................. . .. ...... . . .. ... . . . . .. . . ...... .... ...... .. . .. ...... . . ............ . ..... .... ........ .... . .. . . .. ... . .... .. . ....... .... . . . .... .. . . . . .. ............. ... .... ....... ...... .... ... .. . . . . . .......... .. ........ . ............................................ .............. .. . . .. ................ ... .......... . ..
lowQualScore : 00 99 33333333333333333 55 33333333333333 5 44 33 22 88 99 2 888 55 777 99999 88888 222222 5555 3333333 888 444 333 4 0000000 22 22 7 0000 22 444 4 22 5 2 11 2 8888 1 66666 11 2 4 5555 111 4 4 7 777777777777 7 1111111111111 9 44444444 5 4 4 44 0 222222 444 444 5 777777 5 44 5 222222 9 88 9 6666 9 000 777 333 7 7777 77 77 7 77 6666666 000 66666666666 7 666666666666 88 77 7 7 77 5555555555555 5 8888 5 2 1 1 1 2 44 1 22 1 1 888 2222 55555555555555555 0 88 888888 0 8 55 444 1 2 9 1 22 2 1 888888 6666 222222 22 1 22 888888 1 1 888888888888 2 66666 5555 88888888 5555 1 88 9 9 99 000 9 1111 22 1 0000000 5555 1 3 8 2222 66 3 3 3 7 99 7777777777777 888 5555 3333333 888888 5555 555 22 2 1 1 3 3 5555555555 99 22222222 9 77777777777777777777777777777777777777777777 77777777777777 77 7 9 77 7777777777777777 555 3333333333 7 77
consensus : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------C--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GT----TC------CAAATTT--AGT---ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-C--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----ATCTACCGTAT-GTACTTG--------TGTA-AG--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGC-ATG----ATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ATNCACTAGA-CA-CAA-GCCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-GA--A---CGGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACAC----CTTGTGA----CA--------A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CC-AATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TGA---CGT----ATTTACACTT-------TTCATAT-C---TTTTTT----TTTACATT-AAG--TTTGT-TTT-TACCCTTA-AAT-A-AAG-----GAATTATTGA--AGCATTACTTTTAGAGTTTTT-TC-C--A-T-AGGAA-----AGTTTT----GTT------TT-----CAGTA--------------TCAAT--T-GANTCGA--TTCG-A--------------AAAA--AAATCG----------AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAAATCGTCCCAGCC
Reference ( family-3214 ) : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------C--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GT----TC------CAAATTT--AGT---ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-C--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----ATCTACCGTAT-GTACTTG--------TGTA-AG--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGCGATG----ATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ATACNCTAGA-CA-CAA-GCCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-GA--A---CGGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACAC----CTTGTGA----CA--------A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CC-AATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TGA---CGT----ATTTACACTT-------TTCATAT-N---TTTTTT----TTTACATT-AAG--TTTGT-TTT-TACCCTTA-AAT-A-AGGAATTAGAATTATTGA--AGCATTACTTTTAGAGTTTTT-TC-C--A-T-AGGAA-----AGTTTT----GTT------TT-----CAGTA--------------TCAAT--T-GANTCGA--TTCG-A--------------AAAA--AAATCG----------AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAAATCGTCCCAGCC
gi|1 : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CA------T--G---A---TT--C--------------AA-T--GCAC--CG-AT--CC--AGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------TT----TC------CAAATTTTAAGC---ATCATG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGATGG-TC--TGAG-GTTT-C--AG-AATACTTTCAATTAC--TTTTG-ATT-AAA--G-CAAGGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCTTATGATCTACCGTAT-GTACTTGACACTACTTGTA-AG--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTATCT-CTGCGCAT--C-TTA---TGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGCGATGTAGTATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTTG--CCT-------AA---TAG-AC----A-C-AAGC-TGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--AGAGAGTGTCA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AA-------TG-AAGTGTG-ATANTATAGA-CA-CAT-GCTGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-GA--A---CAGAGTGTCATGAA----TGGA--T-CCAA--CA-------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACACCTG-CTTGTGA----CA--------A----TCTTT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CC-AATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TGT---CGT----ATTTACA-----------TCATAT-A---TTTTTT----TTTACAAT-AAG--TTTGT-TTT-TACCCTTA-AAT-A-AGG--T---AATTATTGA--AGCATTA--TTTAGAG-TTTT-CC-T--A-T-TGGCAGCATTAGTTTTTAGAGTTCTCTCCTT-----CA-TAGAAAAGTTTTGTTTTCAGTGAT-CAATTGA--ATCG-ATTCGG---------AAAAATAAATCGCAAAAAATCGAATTGCAG-CATTTTG--AATCG-AATCGTCCCAGCC
gi|10 : G-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATACTTT-----AC--GTTTG-ATT-AAA--A-ACATGGAAATT---AGGA-CAC-AT
gi|10 : AT-ACGCT-A-C--AACCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CGGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GC--ACTC-----TATATAACTA-----------AG-CGACAC---G----ATGTACAG-TGAGTTGACAA--AT-GGCA-ATTTCA--TCTTTAAAAGACTTTTAG-AC----A-C-AAGC-CGTTG-C-A-AATATC-----------A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTTTG-ATAacgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatggcaatttcatctttaaaagacttttagacacaagccgttgcaaatatcaacggacatgaatggatccaaaattgaagtttgataatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|10 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacTAGA-CA-CAA-GCCGTTGCAAA-TATCAA--C--------------GGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTTTG-ATA-A-TA-CAA-----AAT----GT-ACAC-----TTGTGA----CA--------A----T------------------AA---T----C----TATT--A---------------TTTGA----ATGTG-TC-ATTTTTTTTTTAA--TG-C-TA-ATTTC--AG-------------TGA---CGT----ATTTACACTT-------TTCAT-T-C---TTTTTT----TTTACATT-AAT--TTT-T-TTT-TACCCTTA-AAT-A-AAG-----GAATTATTGA--ACCATTACTT----AGTTTTT-TC------------A-----AGTTT-----GTT------T------CAGTA--------------TCAAT--T-GATTCGA--TTCG-A--------------AAA----AATCG----------AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|11 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacatacgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatggcaatttcatctttaaaagactttCGATGCAC--CG------C--G---A---TT--CACTTAGTTCATTTCGA-T--GCAC--CG-AT--CT--GGAATC---C-CAAATTT---TG----ATTCAGTTCG------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCACA-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--TAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATGCTTT-----AC--TTTTG-ATT-GAA--A-CAATGGAAAAT---AGGA-CAA-ATC--------ACCTACTGTAT-GTACTT---------T--------------TTAT-ACGTA-A-C--A-CCGT------TTAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------ATATGT-CTGTGTAT--C-TTA---TGA-A---AAAACGC---AA-------------------TTCA--A--GT-GG--ACTG-----T-T---ACTA-----------AACCGACAC---G----ATGCACAG-TGAGTGGACAA--CT-GCAA-CTTTGA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C----------AC-A-GT-G-A--ACAGA----CA-TGAA----TGGA--T-TCA-A--AAT------GC-AAGTGTG-ATACACTACA-CA-aacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|11 : gtgtggtgcaccgaaaatttT-------AC---TAA-ACCG--A-C-A----CGATG-C-A---------C-A-GT-G-A--GTGGA----CA-------------------------AC------TGCAACTTTG-ATCTACTAGA-CA-CAA-GCCGATGCA-----------CA-GT-GA--A---CAGA----CATGAA----TGGA--T-TCAA--AAT------GCAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACAC-----TTGTGA----CA--------ACTAATTTAT--CATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--AAT-CAAG-------ATTTGA----ATTTG-CC-AATTTTG----AA--TT-C-TA-TGT-C--AG-------------TGA---Cgtacacttgtgacaactaatttatcatgttttaatttcctaataatcaagatttgaatttgccaattttgaattctatgtcagtgac
gi|12 : gtgtggtgcaccgaaaatttcgatgcaccgcgattcacttagttcatttcgatgcaccgatctggaatcccaaattttgattcagttcggttcaaaatttagtatcacatgtaaacaacaaaatggcggtaacgagacggtctgaggtgttggaatgctttacttttgattgaaacaatggaaaataggacaaatcacctactgtatgtactttttatacgtaacaccgtttaaacatattacgagttcagcaagttatatgtctgtgtatcttatgaaaaaacgcaattcaagtggactgtT--GCACGGCGTAC--TGGTCGGTC--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----GTTC-----G------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCATA-T-AT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TAAG-GTGT-TCAGG-AATGTTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGG-CAA-ATC--------ATCTACCGTAT-GTACT----------TGTA-AG--------ATAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTAT
gi|12 : gggctgtgcgcgggtgcacgcggaaagcttgtcgggaatggcaccgcggaaatgtgaCAA---AATT--TT--T-ATCA----GTTAA--C--ATCGG--ACTC-----T-T---AGTA-----------AGCCGACACGATG-------TACAA-TGAGTGGACAA--CT-ACAA-ATTTCA--TCG-------TC---TAG-AC----A-C-AAGC-TAATG-C-A-AATATtgttttttctgcttgtttatttttttctatctgatgaattatattcaccccaatccgcccgcaccaaaatttttatcagttaacatcggactcttagtaagccgacacgatgtacaatgagtggacaactacaaatttcatcgtctagacacaagctaatgcaaatat
gi|13 : gggctgtgcgcgggtgcacgcggaaagcttgtcgggaatggcaccgcggaaatgtgatgcacggcgtactggtcggtcgattcgatgcaccgatccggaattccaaatttcggttcggttcaaaatttagtatcatatataaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttttacttttgattaaaacaatggaaagtagggcaaatcatctaccgtatgtacttgtaagatatacgctacaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctattgttttttctgcttgtttatttttttctatctgatgaattatattcaccccaatccgcccgcacACAA--TT-TTGA-ATATCAGTTCA-------AG---TGG-ACTCTTA-CTAAGC-TGACG-C-ATGGTA-CAGC-A-GT-G-------GA----CA---AC----TG-------CA-A--AAT------TC---GTCT------ACTAGA-CA-CAA-ACTGATGCAAA--ATCAA--CG-GT-GA--AA--CAGA----CATGAA----TGAA--T-CCAA--AAA------GAAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GTAACAC----C-TGTGA----CA--------A----TCTTT--TATGTTT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAA--------ATCTGA----A-GTGCCC-AATTTTG----AA--TT-CATATAGT-CAGAG-------------TTATT-CTT----ATTTACTCTA-------TACCCAT-A---ATCCTT----TTAACAAT-AAG--TTTG--TTT-TACCCTTA-AAT-A-AAG--T---AATTATTGA--AGCATTA--TTAAGAGTTTTT-CCTC--A-TAAGGAA-----AGCT-------TT------TT-----CAGTA--------------TCAAT--T-GAATCGA--TTCG----------------AAAA--AAATCG----------AATCGCAGCCATTTTG--AATCAAAATC
gi|14 : gagaaaacGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------A--A---AAT-TT--C--------------GA-T--ACAC--CG-aaaccgaaacgaattgaccctgaaatcgtcccaaccc
gi|14 : GCGATTCACTTCGTT----C--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GT----TCGGTTC-CAGATTT--AGT---ACCATG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AGA--G-CAAGGAAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----A----CCGTAT-GTACTTA--------A--A-AA--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACACTAT---ATT-A------CGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTATGT-CTGTGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--GGAAT-ATCA----GTTCC--A--AT-GG--ACTT-----A-T---ACTA-----------AGCCGACACGATG-------TACAG-AGAGTGTACAA--CT-GCAA-ATGTCA--TCG-------TC---TAG-AC----A-T-AAGC-TGATG-C-A-AATA-----------------CGGA----CA-TGA-----------T-CCA-A--AGT------TG-AAGTGTG-ATcgattcacttcgttcgattcgatgcaccgatccggaattccaaatttcgattcggttcggttccagatttagtaccatgtgtaaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctgaggtgttggaatactttacttttgattagagcaaggaaaagtaggacaaatcatctaccgtatgtacttaaaaattatacgctacaccgttcaaacactatattacgagttcaacaagttctatgtctgtgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttccaatggacttatactaagccgacacgatgtacagagagtgtacaactgcaaatgtcatcgtctagacataagctgatgcaaatacggacatgatccaaagttgaagtgtgatg
gi|15 : ggctgtgcggtgcaccgaaaatttcgatacaccGGGCT--GT-CGGTGCAC--CG------A--A---AAATTT--C--------------GAGT--GCAC--CG------C--G--ATT---C----ACTT---CG-----TTC-----G------GT----TC------g
gi|15 : GCGATTCACTTCGTT----C--G---G---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--AGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GTCGCGTT------CAAATT---AGT---ATCACG-TAGT-------AA--ACA--AC-A----A--AAAT-TGCGCGG--CAATG-AAACGG-TC--TGAG-GTGT-C--GG-AATACC---------------------AAA--G-CAATGGAAAGT---AGAC-CAA-ATAATCT----A-----CGTAT-GAACTTG--------T-TA-AA--------TTAT-GT-CT-A-C--A-C-GT------TAAAACA---C---ATT-A-------GA-GTTCAAC--AATT-T------CTATCTGCTGCGCATTTC-TTA-----A-A---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----G-TCA--A---T-GG--ACTCTAAATT-T---ACTA-----------AG-CGACGCAA------A-GTACAG-CGAGTGGACAA--CTGGCGA-ATTTCG--TCT-------AC---TAG-AC----A-T-AAGCTTGATGCC-A-AATATCAAT-A-GT-GAA--ACAGA----CA-TGGA----T-GA--T-CCA-A--AA-------TG-AAGgatgcaccgatccagaattccaaatttcgattcggtcgcgttcaaattagtatcacgtagtaaacaacaaaaattgcgcggcaatgaaacggtctgaggtgtcggaataccaaagcaatggaaagtagaccaaataatctacgtatgaacttgttaaattatgtctacacgttaaaacacattagagttcaacaatttctatctgctgcgcatttcttaaaaaaacacaatttgaatatcagtcaatggactctaaatttactaagcgacgcaaagtacagcgagtggacaactggcgaatttcgtctactagacataagcttgatgccaaatatcaatagtgaaacagacatggatgatccaaaatgaag
gi|16 : gggctgtcggtgcaccgaaaaatttcgagtgcaccAGGGCT--GTGCAGTGAAA--TG------A--A---AAT-TT--T--------------GA-T--GCAC--C
gi|16 : --G---A---TT--C--------------AA-T--GAAT--CA-AT--CT--GGAATT---C-CAAATTT---TG----ATTCTGTT-G------GT----TC------AAAATTT--AGC---ATCACT-T-GT-------CA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCAG--CAGCG-AGACGG-TC--TGTG-GTGT-G--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATA-AAA--T-CAATGGAAAGG---AGCA-CAA-GTCA---------CTACTGTA-----------------TGTA-AG--------TTAT-GCGCT-A-T--A-CCGT------TTAAGCA---A---ATT-A------GGG-GTTCAAC--AAGT-T------CTATataatctacttcatttgattcaatgaatcaatctggaattccaaattttgattctgttggttcaaaatttagcatcacttgtcaacaacaaaatggcagcagcgagacggtctgtggtgtgggaatactttacttttgataaaatcaatggaaaggagcacaagtcactactgtatgtaagttatgcgctataccgtttaagcaaattaggggttcaacaagttctat
gi|17 : agggctgtgcagtgaaatgaaaattttgatgcaccataatctacttcatttAGGGAT--GTGCGATTCACTTCG------TTTG---A---TT--C--------------GA-T--ACAC---A-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTT-----GTTGGCAGT----TT------GAAATTT--AGT---ATCACA-T-GA-------AA--ACA--AC-AAAACA--AA---CA-GTGG--CAACG-AGACGG-TC--T-------------G-AATACTTT-----AC--TTATG-ATTAAAA--A-CACTGGAAAGG---AGGG-CAAGATCATCT----AC---CCGTAT-GTAC
gi|18 : gtatatggtacacaactccta-C--AG-------------TGA---CGT----ATATACACTT-------TTCATAT-C---TTTTTT----T--ACATT-CAG--TTTTT-TTT-TACCCTTA-AATTA-AGGAATTA------TTGA--ACCATTACTT----AGTTTTT-TC------------A-----AGTTT-----GTT------TCAGTACCGGTA--------------TCAAT--T-GATTCGA--TT---A--------------AAAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCat
gi|19 : TTTACACTTATTTTTTTTTTTTT-T---TTTTTT----TTTACATCCAAG--TTTCT-TTT-T----TTATAAT-ATAAAAA--AAGGTTATTGATTAGTGTAA---TTAG--------TC-C--C-T-ATGAA-----AAGTCT----ATT-------------CAG------------------AA----------GA--TT---A--------------AATA--AAATCA----------AATTGCGG-CATTTTG--AATCGAAATCGtaaccgactctaacgaaccccgtatcgtcccagc
gi|2 : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------A--A---A---AT-----------------GA-T--GCAC--CG------C--G--ATTA--A-CATAATT---CG-----TTC-----GC-----GT----TC------CGAATaaccgaatcgaatgaaccctgaatcattccagcc
gi|2 : --CG------C--G---T---TC--C--------------GAAT--GCAC--CGGAT--CC--AGAATT---C-CAA-TTC---CG----ATTC-----G------GT----TCGGTTTCCAAATT---AGTT--ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AAAAATG-GCGG--CAACGGAAACGG-C----GAGTGGAT-C--G--AATA-------------------AAC-AAG--C-CAATGGAAAGT---AGGAACAA-AT-A-------ATCTACCGTATTGTACTTG--------TA-A-AT--------TTATTGTGCT-AGC--A-CCGT------T-AAACA---C---ATTTA------GGA-GTTCAAC--AAGTAT------CTACAT-TCTCGGAT--C-TTA---TGAAG---AAAACCA---AATT--TGAATTATCA----GTTCA--A--GT-GG--AA-C-----T-T---GCTAAATTACCTCATAGCCGACGCAA--------GTACAGACGAGTGGGCAACCCT-GCGACATTAC---TCT-------AC---TAGAAC----A-TAAAGC-TGATG-CAA-AATAGTAAT-A-GTAG-AT-ACAGA----C--TGGA-----GAA--TACCA-A--AATGAATAGTG-AGCTGTG-ATACACTAT--CA-CAA-Ggcaccggatccagaattccaattccgattcggttcggtttccaaattagttatcacgtgtaaacaacaaaaaaatggcggcaacggaaacggcgagtggatcgaataaacaagccaatggaaagtaggaacaaataatctaccgtattgtacttgtaaatttattgtgctagcaccgttaaacacatttaggagttcaacaagtatctacattctcggatcttatgaagaaaaccaaatttgaattatcagttcaagtggaacttgctaaattacctcatagccgacgcaagtacagacgagtgggcaaccctgcgacattactctactagaacataaagctgatgcaaaatagtaatagtagatacagactggagaataccaaaatgaatagtgagctgtgatacactatcacaagtacaccctgtgacaatctatattatgttttaaaatttccctaatgaactcaagatttgaatgtgcccaattttgaagcttctaagtcagtgttcgtattcacacatatttttgttttaacattattgaagtattattttagagttttcctcaatgaggaaatttttttcagtatcaatttgaatcggatttcgaaaaaaatcgaaatcgcagcattttggcaatcgaaatcgacaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|2 : agggctgtgcggtgcaccgaaaatgatgcaccgcgattaacataattcgttCTAGAACA-TAAAGCTGATGCAAAATAGTAA--TA-GTAGAT-A---CAGA----C-TGGA-----GAA--TACCAA--AATGAATAGTGAGCTGTG-ATACACTATCAC-----AA-----GT-ACAC----CCTGTGA----CA--------A----TCTATATTATG-TT-TT--AAAATTTCC-C----TAATGAACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CCCAATTTTG----AAGCTT-C-TA-AGT-C--AG-------------TGTT--CGT----ATTCA--------------CACAT-A---TTT----------------------TTGT-TTT-AAC----------------------ATTATTGA--AGTATTA-TTTTAGAGTTTTCCTC-A--A-TGAGGAA-----A--TTT-----TT------TT-----CAGTA--------------TCAAT--TTGAATCGGATTTCG----------------AAAA--AAATCGA---------AATCGCAG-CATTTTGGCAATCGAAATCGtacaccctgtgacaatctatattatgttttaaaatttccctaatgaactcaagatttgaatgtgcccaattttgaagcttctaagtcagtgttcgtattcacacatatttttgttttaacattattgaagtattattttagagttttcctcaatgaggaaatttttttcagtatcaatttgaatcggatttcgaaaaaaatcgaaatcgcagcattttggcaatcgaaatcgacaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|20 : agggctgtgcggtgcaccgaaaatgatgcaccgcgattaacataattcgttcgcgttccgaatgcaccggatccagaattccaattccgattcggttcggtttccaaattagttatcacgtgtaaacaacaaaaaaatggcggcaacggaaacggcgagtggatcgaataaacaagccaatggaaagtaggaacaaataatctaccgtattgtacttgtaaatttattgtgctagcaccgttaaacacatttaggagttcaacaagtatctacattctcggatcttatgaagaaaaccaaatttgaattatcagttcaagtggaacttgctaaattacctcatagccgacgcaagtacagacgagtgggcaaccctgcgacattactctaGGCTTGGTGCGGTGCAC--CG---------GAAAA---TTTGC--------------GA-TGGGCAC--CG------C--ACGATT---C----ATGT---CG-----TTC-----G------GT----TC------acaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|20 : ------C--G---G---TT--C--------------GA-T--GCACG-CG-AT--CCCAGTAATT---C---AATTT---CGTTCGGTTC-----G------GT----TC------CAAATTT--AGT---ATCACGCT-GT-------AA--ACA--ACAA----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AAACGGTTC--TGAG-GTGT-C--GG-AAgatgcacgcgatcccagtaattcaatttcgttcggttcggttccaaatttagtatcacgctgtaaacaacaaaaatggcggcaacgaaacggttctgaggtgtcggaagta
gi|21 : ggcttggtgcggtgcaccggaaaatttgcgatgggcaccgcacgattcatgtcgttGGGCT--GTGTGGTGCAC--CG------A--A---AAT-TT--C--------------GA-T--gta
gi|21 : ---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--AGAATT---C-CAAATTT---GG----ATTT-----G------GT----TCGGTT--CAAATTT--AGTA--ATCACG-T-GTA------AA--ACA--AC-A----AACAA---T---CGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTG-----AG-AAAAC--------ACAATTTTG-Acaccgcaattcattgttttatttcgatgcaccgatccagaattccaaatttggatttggttcggttcaaatttagtaatcacgtgtaaaacaacaaacaatcggcaacgagacggtctgaggtgagaaaacacaattttgaa
gi|22 : gggctgtgtggtgcaccgaaaatttcgatcaccgcaattcattgttttat--AGCATTACTTATATTTTTTTT-TT-CTCA-CGAGGAA-----AGTTT------TC------TT-----CAGTA--------------TGAAT--T-GAATT-A--TTCA-ATAGATTAAAAAGAGAAAA--AAATCG----------TACCTCAG-TGTTTTG--AATCAAAATCa
gi|23 : ------C--G---A---TT--GA-------------GA-T--GCAC--CG-ATTGCC--AGAAT----C-CAAATTT----G----GTTC-----G-------T----TC------CAAAT----AGT---ACTACG-T-GG-------TA--ACA--ACAA----A--AA---TG-GCGT--CAAaaattgaatgaaccctgaatcgtcccagcc
gi|24 : aggtgcgcgtgcaaccgaaagatctcggcagccgcaattcacttgt-CAA-ATCAATGCAAA-TATCAAAACA-GT-GA--ATTGCAAA----CATGAA----TGGG--T-CCAA--AAT------TAAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACA-----TTTGTGA----CA--------A----TTAATC-TATG-TT-TT--AA---TTTT-C----a
gi|25 : TAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----CAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CA-AATTCTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AGTGACGTTTAATACTGA---CGT----GTTTACACTT-------TTCATAT-C---TTT
gi|26 : aGAGTTTTC-CT-C--A-TGAGGAA-----AATTTT-------------TT-----CAGTA--------------TCAAT--T-GAATCGA--TTTG-A--------------AAA----AATCG----------AATCGCAT-CATTTTG--AATCGAA
gi|27 : AATTATTGA--AGTATTA--TTTAGAGTTTAC-CT-C--A-TGAGTAA-----AGTTTT------T------TT-----CAACA--------------TCAAT--T-GAATCGA--TTTG-A--------------AAAA--AA-TCA----------AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAccgaatcgaatggaccctgaatc
gi|28 : gtTTT----GTT------T------CAGTA--------------TCAAT--T-GATTCAA--TTCGAA--------------AAAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTCTG--AATCGAAATCG
gi|29 : aaT-C--AA-------------TGA---CGA----ATTTACACTT-------TTTGTAT-A----TATTT----TTTACA-A-AAG--TTTGTGTTTATACCCTTT-AAT-A-AAG-----GAATTATTGA--AGCATTaattgaatgaaccctgaatcgtcccagcc
gi|3 : -T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TA-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGA-T--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGA-CAA-AT-A-------ATCTACCATAT-GTACTTG--------T--A-AG--------TTAT-ATGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTGTAT-CTGCACAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--AGTGT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCAAC---ATG----ATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--TCT-------TC---TAG-AC----A-C-AAGC-TGATG-C-A-AATATCAAC-A-GC-G-A--ACGGA----CA-T---------GA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGCA-ATACACTAAA-CA-C
gi|3 : agggctgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAAC-A--T-G-A---TGTA----CAGCGAG----TGGA--C--------AAC------TGCAAATTTC-ATCTTCTAGA-CA-CAA-GCTGATGCAAA-TATCAA--CA-GC-GA--A---CGGA----CATGA-----------T-CCAA--AAT------TGAAGTGCA-ATACACTA-AAC-----ACTAAATGT-ACAC-----TTGTGAAAATTA--------A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-GC-ATTTTTT----AA--TG-C-TA-AGT-C--AG-------------TGA---CGT----ATTTACACTT-------TTCATAT-C----TTTTT----TTTACATG-AAG--TTTTT-CTT-TAACCTTA-AAT-A-ACG-----GAATTTTTTA--AGCATTACTTT-----TTTTT-TC------------A-----AG-TTT----G-T------TT-----CAGTA--------------TCAAT--T-GATTCGA--TTCG-A--------------ATAA--AAATCG----------AATTGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGtaaatgtacacttgtgaaaattaatctattatgttttaatttcctaatactcaagatttgaatgtggcattttttaatgctaagtcagtgacgtatttacacttttcatatcttttttttacatgaagtttttctttaaccttaaataacggaattttttaagcattactttttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaataaaaatcgaattgtagcattttgaatcgaaatcgaaccaaatgaaccctgaatcgtcccagccct
gi|30 : agggctgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaaacaacaaaatagcggcaacgagacggtctgaggtgatggaatactttacttttgattaaaacaatggaaagtaggacaaataatctaccatatgtacttgtaagttatatgctacaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctgtatctgcacatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgtggactcttactaagc-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATA-AAA--G-CAATGGAATGT---AGAA-CAA-AT-A-------ATCTACCATAT-GTACT----------TCTA-AA--------TTAT-ATGCT-A-aaccaaatgaaccctgaatcgtcccagccct
gi|31 : GGCG--GTGTGGTGCAT--CG------A--A---AAT-TT--C--------------GA-T--GCAC--TG------C--G--ATT---CACGTCTTT---CG----ATTC-----G------AT----
gi|32 : T-A-C--A-CCGT------TCTAACA---T---ATT-ACCATTACGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCgcacgggttcaaca
gi|34 : T--C-TTA---TGA-G---AAAACAG---AATT--TGACA-ATCA----GTTCA--A--GT-GA--A
gi|4 : TGCGGTGCAC--CGA-----A--A---A---TT--CG-------------GA-T--GCACCGCG-AT--C
gi|4 : c------C--G---A---TT--C--------------GAGT--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAAATT---CG----ATTC-----G------GT----TCGGTT--CAAATT---AGT---ATCA---T-AT-------AACTACA--AC-A----A-------TG-GCG----AACG-AGACGG-TC--TAAG-GTGT-TCAGG-AATG--TT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--AACAATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCA-------ATCTACCGTAT-GTACT-G---------GCA-AG--------ATAT-ACGCT-A-C--A-CC-T------TCAAACA---T---ATT-A------CGATGTTCAGC--AA-T-T------C-ATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--GGAAT-ATCA----GTTCA--A---T-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACAC---G----ATGTACAG--GAGTGGACAA--CT-GCAA-ATCTCA--TCG-------TC---TTG-AC----A-C-AAGC-TAATG-C-A-AATATCAAC-A--C-G-A--GCGGA----CA-T---------GA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTGTATGCACTAAA-Cacttcgttcgattcgagtgcaccgatccggaattccaaaattcgattcggttcggttcaaattagtatcatataactacaacaatggcgaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttacttttgattaaaaacaatggaaagtaggacaaatcaatctaccgtatgtactggcaagatatacgctacaccttcaaacatattacgatgttcagcaattcatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttcaatggactcttactaagccgacacgatgtacaggagtggacaactgcaaatctcatcgtcttgacacaagctaatgcaaatatcaacacgagcggacatgatccaaaattgaagtgtgtatgcactaaactctaaatgtacactctgtgacatttaaattatctattatcttattagttactacactacaagatgtgaatgtgcattttttaaattgctaagtcatgagatcgaagcgcattttatataaatcttttttttaattaagttttgtttacccttaaatacaggaattaattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatccaatcgtagcattttgatcgaaatcgaaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|4 : ctgcggtgcaccgaaaattcggatgcaccgcgatcacttcgttA----CA-GGAG----TGGA--C--------AAC------TGCAAATCTC-ATCGTCTTGA-CA-CAA-GCTAATGCAAA-TATCAA--CA--C-GA--G---CGGA----CATGA-----------T-CCAA--AAT------TGAAGTGTGTATGCACTA-AACTCTAAAT-----GT-ACAC----TCTGTGA----CATTTAAATTA----TCTAT--TATC-TTATT--AG---TTAC-T------AC--ACTACAAG-------ATGTGA----ATGTG-CA-TTTTTTA----AA--TTGC-TA-AGT-C--A--------------TGAGATCGA----A---GCGCAT-------TTTATAT-AAATCTTTTT----TTTA-ATT-AAG--TTT-T-GTT-TACCCTTA-AAT-ACAGGAATTA-----ATTGA--AGCATTACTT--AG-GTTGTT-TC------------A-----AGTTT-----GTT------T------CAGTA--------------TCAAT--T-GATTCGA--ATCG----------------AAAA--AAATCC----------AATCGTAG-CATTTTG---ATCGAAATCGtctaaatgtacactctgtgacatttaaattatctattatcttattagttactacactacaagatgtgaatgtgcattttttaaattgctaagtcatgagatcgaagcgcattttatataaatcttttttttaattaagttttgtttacccttaaatacaggaattaattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatccaatcgtagcattttgatcgaaatcgaaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|5 : ctgcggtgcaccgaaaattcggatgcaccgcgatcacttcgttcgattcgagtgcaccgatccggaattccaaaattcgattcggttcggttcaaattagtatcatataactacaacaatggcgaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttacttttgattaaaaacaatggaaagtaggacaaatcaatctaccgtatgtactggcaagatatacgctacaccttcaaacatattacgatgttcagcaattcatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttcaatggactcttactaagccgacacgatgtGGCT--GTGCGGTGCAT--CG---------G---AAATTT--T--------------GA-T--GCAC--CG------C--G--ATT---C----ACTT---TG-----TTC-----T------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCATG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AT---TG-GCAG--CAACT-TGATGG-TC---------------------ACTTT-----AC--TTTTG-AAA-AAAGAA-CAATGGAAAA------GA-CAA-GTCATCT----A----CTGTAT-GTAC--A--------TGCA-AG--------TTAT-GCGCT-A-C--A-CCGT------GCAAGTA---T---ATT-A------CGA-GTTCAAG--AAGT-TGAACTTCTTTGT-CTGCGCAT--C-TTT---TGA-ATTAAGAAAAC---AATT--TGAGT-ATCG----GTGCA--A--GT-GG--ACTC-----A-T---ACTA-----------AGCCGAC---ATG----ATGTACAG-TGAGTGGACAA--AT-GCAA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGT-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--ACAGA----CA-TGAA----TGGA--T-CTA-A--AAT------TA-AAGTGTG-ATACACTACA-Caaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|5 : -AAGC-CGA---C-ATGATGT--AC-A-GT-G-A--GTGGA----CA---AA----TG------C---A--AAT------T-------TC-ATCTACTAGA-CA-CAA-GTCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-GA--A---CAGA----CATGAA----TGGA--T-CTAA--AAT------TAAAGTGTG-ATACACTA-CA------------------------CTTGTGA----CA--------A----T-TAA--TCTG-TT-TT--CA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGAATACATGTG-CA-AATTTTG----AA--TT-A-TA-AGT-C--AA-------------AGA---CTTATAAATTTACACTT-------CTCACATCT---TTTTTT----TTTAAGTA-AAGTTTTTGT-TTT-TACCCTTA-AAT-A-AAG-----GTATTATTGA--AGCATTAC--TTAGTTTTTTT-TCTC--AGG-AGGGA-----AGTTT------TC------TT-----CAGTA---------------------T-GAATCAA--TTC------------------AAA--AAATCG----------AATCGTAG-TGTTTTG--TATCGAAATCttgtgacaattaatctgttttcatttcctaatactcaagatttgaatacatgtgcaaattttgaattataagtcaaagacttataaatttacacttctcacatcttttttttttaagtaaagtttttgtttttacccttaaataaaggtattattgaagcattacttagttttttttctcaggagggaagttttcttcagtatgaatcaattcaaaaaatcgaatcgtagtgttttgtatcgaaatctaaccgaatgaatcctgaattgtc
gi|6 : ggctgtgcggtgcatcggaaattttgatgcaccgcgattcactttgttctgttcaaaatttagtatcatgtgtaaacaacaaattggcagcaacttgatggtcactttacttttgaaaaaagaacaatggaaaagacaagtcatctactgtatgtacatgcaagttatgcgctacaccgtgcaagtatattacgagttcaagaagttgaacttctttgtctgcgcatcttttgaattaagaaaacaatttgagtatcggtgcaagtggactcatact--AGT---ATCATA-T-AT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TAAG-GTGT-TCAGG-AATGTTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGG-CAA-ATCATCT----A----CCGTAT-GTACTTG--------T--A-AG--------T-AT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTAAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--GGAAT-ATCA----GTTAA--A--AT-GG--ACTC-----T-T---AGTA-----------AGCCGACAC---G----ATGTACAA-TGAGTGGACAA--CT-ACAA-ATTTCA--TCG-------TC---TAG-A-----A-C-AAGC-TAATG-C-A-AATATCAACAA-GC-G-A--GCGGA----CA-T---------GA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ACGCACTAAA-CA-Ctaaccgaatgaatcctgaattgtc
gi|6 : -AAGC-CGACA-C-G-A-TGT--AC-A-AT-G-A--GTGGA----CA------------A----CTACA--AAT------T-------TC-ATCGTCTAGA--A-CAA-GCTAATGCAAA-TATCAA--CAAGC-GA--G---CGGA----CATGA-----------T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ACGCACTA-AAC-----ACTAAATGT-ACAC-----TTGTGA----AATTATT---A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TACT--ACT-CA-G-------ATGTGA----ATGTG-GC-ATTTTTT----AA--TG-C-TA-AGT-C--AG-------------TGA---CAT----ATTTACACTT-------TTCATA------TTTTTT----TTTACATT-AAG--TTTGT-TC----CCCTTA-AAT-ACAG------GAATCATTGA--AGCATTAC--TTAG-GTTGTT-TC------------A-----AG-TTT----G-T------TT-----CAGTA--------------TCAAT--T-GATTCGA--ATCG----------------AAAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGtaaatgtacacttgtgaaattattatctattatgttttaatttcctactactcagatgtgaatgtggcattttttaatgctaagtcagtgacatatttacacttttcatatttttttttacattaagtttgttccccttaaatacaggaatcattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaaccgaatcaaatgaaccctaatcgtcccagcc
gi|7 : agtatcatatataaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttttacttttgattaaaacaatggaaagtagggcaaatcatctaccgtatgtacttgtaagtatacgctacaccgttcaaacatattacgagttaagcaagttctatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttaaaatggactcttagt--GCAC--CG-AT--CC--AGAATTTTCC-TAAATTTTCACG----ATTCC----G------GT----TA------AAAATTT--AGCGCCATCAT--T-GTCGATATGAA--ACACTAC-A----A--AA---TG-GGGGTGCATCG-AGACGG-TCACT-AG-GCGTAT--GGTAATACTTT-----AAAATTCTGTATT-TA--------TGGATATTTAGAGGA-GAA-GTCATCT----ATC-ACCGTTT-GTACA-A--------TGTAGAGAAATGATCTTAT--CGCTTA-CTCA-TCGTGTTTTTCCAGGCA---TCTGATT-AT-----CGA-ATTCAACTAAAGT-T------TTATGT-CTGCGCATG-CATTAATGTAA-T---AAAACACCGAAATTAATGAGT-ATAATAAAGTTCATCA--GT-GGGGACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACACAA--------GTA--G--GAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--ACA-------AC---TTG-AC----AGC-AAGT-TGATG-C-A-AATATCAAC-AGGT-G-ATGACAGAC---CA-TTCACACTTGGAGTT-CCA-ACCATT------TG-AAGTGTG-ATACACTAGaaccgaatcaaatgaaccctaatcgtcccagcc
gi|7 : ctgcttgcagtggcaatcgaaaattttatgagcacatgtttcagcttcgaattcgatttcgcaaatcCTTGA-CAGCAA-GTTGATGCAAA-TATCAA--CAGGT-GATGA---CAGAC---CATTCACACTTGGAGTT-CCAACCATT------TGAAGTGTG-ATACACTA-GCT-----T------GTGACAC----CTT---------A--------A----T-TGT--TATG-TT-TTACAG---TTTCGCTAGATAAT--ACT-TGAGACGAGATATTTGA----ATGTG-cttgtgacaccttaattgttatgttttacagtttcgctagataatacttgagacgagatatttgaatgtgag
gi|8 : ctgcttgcagtggcaatcgaaaattttatgagcacatgtttcagcttcgaattcgatttcgcaaatcgcaccgatccagaattttcctaaattttcacgattccggttaaaaatttagcgccatcattgtcgatatgaaacactacaaaatgggggtgcatcgagacggtcactaggcgtatggtaatactttaaaattctgtatttatggatatttagaggagaagtcatctatcaccgtttgtacaatgtagagaaatgatcttatcgcttactcatcgtgtttttccaggcatctgattatcgaattcaactaaagttttatgtctgcgcatgcattaatgtaataaaacaccgaaattaatgagtataataaagttcatcagtggggactcttactaagccgacacaagtaggagtggacaactgcaaatttcaacaaGCGATTCACTTCG------TTTG---A---TT--C--------------GG-T--ACAC--CA-AT--TC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----GTTT-----G------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCAAG-T-GT-------AA--ACA--AC-T----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AACACTTT-----AC--TTTTG-ATC-AAA--A-CAATGGGAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----A----CCGTAT-GTACTTG--------T--A-AG--------TTAT-GCGCT-A-C--T-CTGT------TTAAGCA---T---ATT-A------TGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTATGT-CTGCACAT--C-TTA---TGA-G---AAAACAC---AATT-------------------CA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACG---TG----ATGTACCG-TGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCG--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AATC-TGATG-C-A-AATTTCAAC-A-GT-G-A--ACAGA----CA-TAAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ATTCACTACA-CA-ag
gi|8 : gctgtgcggtgaccatgcaccaaaaattttgatgcacc-AAGC-CGACG-T-G-A-TGT--AC-C-GT-G-A--GTGGA----CA---AC----TG-------CA-A--ATT------TC---GTCT------ACTAGA-CA-CAA-TCTGATGCAAA-TTTCAA--CA-GT-GA--A---CAGA----CATAAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATTCACTA-CAC-----A------GT-ACACTTGACTAGTGA----CA--------A----TTTAT--TATG-TT-CT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CT-AAGTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TGA---TGT----ATATACACTT-------TTCAAAT-C---TGTTTTAAAATTTACATT-AAG--TTTTT-TTT-gtacacttgactagtgacaatttattatgttctaatttcctaatactcaagatttgaatgtgctaagtttgaattctaagtcagtgatgtatatacacttttcaaatctgttttaaaatttacattaagtttttttt
gi|9 : gctgtgcggtgaccatgcaccaaaaattttgatgcaccgcgattcacttcgtttgattcggtacaccaattcggaattccaaatttcggtttggttcaaaatttagtatcaagtgtaaacaactaaatggcggcaacgagacggtctgaggtgttggaacactttacttttgatcaaaacaatgggaagtaggacaaatcatctaccgtatgtacttgtaagttatgcgctactctgtttaagcatattatgagttcaacaagttctatgtctgcacatcttatgagaaaacacaattcaagtggactcttactG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATACTTT-----AC--GTTTG-ATT-AAA--A-ACATGGAAATT---AGGA-CAC-AT
gi|9 : AT-ACGCT-A-C--AACCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CGGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GC--ACTC-----TATATAACTA-----------AG-CGACAC---G----ATGTACAG-TGAGTTGACAA--AT-GACA-ATTTCA--TCTTTAAAAGACTTTTAG-AC----A-C-AAGC-CGTTG-C-A-AATATC-----------A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTTTG-ATAacgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatgacaatttcatctttaaaagacttttagacacaagccgttgcaaatatcaacggacatgaatggatccaaaattgaagtttgataatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|9 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacTAGA-CA-CAA-GCCGTTGCAAA-TATCAA--C--------------GGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTTTG-ATA-A-TA-CAA-----AAT----GT-ACAC-----TTGTGA----CA--------A----T------------------AA---T----C----TATT--A---------------TTTGA----ATGTG-TC-ATTTTTTTTTTAA--TG-C-TA-ATTTC--AG-------------TGA---CGT----ATTTACACTT-------TTCAT-T-C---TTTTTT----TTTACATT-AAT--TTT-T-TTT-TACCCTTA-AAT-A-AAG-----GAATTATTGA--ACCATTACTT----AGTTTTT-TC------------A-----AGTTT-----GTT------T------CAGTA--------------TCAAT--T-GATTCGA--TTCG-A--------------AAA----AATCG----------AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GTGCACCGAAATTTTTGGTGCATCACGATTTATACCATTCGATTCGA
Unaligned ( gi|35 ): GAATGGACCCTGAATCGTCCCAGCCCTACTC
Unaligned ( gi|36 ): ATGAACCCTGAATCGTCCCAGCCCTAA
Alignments
lowQualScore : 11 33333333333333333 11111111111111 11111 2222222 1111111 1111 222222222222 3333333333333 11111111 111 11111111111 33333333 1111111111111 111111111111111111 333333333333 22222 11111111 1111111 1111 1111111111111 111 22222222 66666666666666666666666666666666666666666666 11111111111111 3333333333333333 1111111111
lowQualScore : 55 22 33333333333333333 22 44444444444444 5 22 44 55 22 22 3 555 33 333 88888 11111 888888 4444 2222222 555 999 333 2 0000000 33 33 4 5555 33 777 2 33 2 2 33 2 5555 2 55555 66 2 2 4444 444 2 2 1 999999999999 2 7777777777777 2 00000000 2 2 2 33 5 777777 444 444 2 999999 2 33 2 777777 2 66 2 6666 2 555 444 444 2 5555 33 33 2 33 7777777 000 33333333333 0 4 55555555 99 33 2 2 33 7777777777777 2 8888 2 4 2 2 2 4 444 2 22 2 2 555 6666 777777777777777777 2 22 555555 8 1 2 1 2 2 2 3 44 6 3 3 999999 9999 999999 44 3 44 888888 3 3 444444444444 6 33333 6666 88888888 6666 9 66 2 2 33 555 2 6666 44 3 0000000 6666 6 1 4444 44 3 3 3 5 33 5555555555555 2 888 6666 9999999 999999 6666 3 44 000 3 3 3 44 3 33 88888888 2 99999999999999999999999999999999999999999999 55555555555555 2 33 1 33 7777777777777777 33 4444444444 2 33
lowQualScore : .. .. ................. .. .............. . .. .. .. .. .. . ... .. ... ..... ..... ...... .... ....... ... ... ... . ....... .. .. . .... .. ... . .. . . .. . .... . ..... .. . . .... ... . . . ............ . ............. . ........ . . . .. . ...... ... ... . ...... . .. . ...... . .. . .... . ... ... ... . .... .. .. . .. ....... ... ........... . . ........ .. .. . . .. ............. . .... . . . . . . ... . .. . . ... .... .................. . .. ...... . . . . . . . . .. . . . ...... .... ...... .. . .. ...... . . ............ . ..... .... ........ .... . .. . . .. ... . .... .. . ....... .... . . .... .. . . . . .. ............. . ... .... ....... ...... .... . .. ... . . . .. . .. ........ . ............................................ .............. . .. . .. ................ .. .......... . ..
lowQualScore : 00 99 33333333333333333 55 33333333333333 5 44 33 22 88 99 2 888 55 777 99999 88888 222222 5555 3333333 888 444 333 4 0000000 22 22 7 0000 22 444 4 22 5 2 11 2 8888 1 66666 11 2 4 5555 111 4 4 7 777777777777 7 1111111111111 9 44444444 5 4 4 44 0 222222 444 444 5 777777 5 44 5 222222 9 88 9 6666 9 000 777 333 7 7777 77 77 7 77 6666666 000 66666666666 7 5 00000000 88 77 7 7 77 5555555555555 5 8888 5 4 2 2 2 4 222 2 88 2 2 888 2222 000000000000000000 0 88 888888 0 8 1 0 1 2 9 1 22 2 1 1 777777 6666 222222 22 1 22 888888 1 1 888888888888 2 66666 5555 88888888 5555 1 88 9 9 99 000 9 1111 22 1 0000000 5555 2 8 2222 66 3 3 3 7 99 7777777777777 9 999 5555 3333333 444444 5555 1 22 888 1 3 3 22 1 99 11111111 9 33333333333333333333333333333333333333333333 77777777777777 7 77 9 77 2222222222222222 77 3333333333 7 77
consensus : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------C--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GT----TC------CAAATTT--AGT---ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-C--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----ATCTACCGTAT-GTACTTG--------TGTA-AG--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGC-A-G----ATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ATNCACTAGA-CA-CAA-GCCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CGGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACAC----CTTGTGA----CA--------A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACACTT-------TTCATAT---C-TTTTTT----TTTACATT-AAG--TTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--TTA-TTGA--AGCATTACTTTTAGAGTTTT-TTC-C--A-T-AGGAA-----AGTTTT----GTT------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGANTCGA--TTCG-A--------------AAAA--AAATCG----------AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAAATCGTCCCAGCC
Reference ( family-3214 ) : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------C--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GT----TC------CAAATTT--AGT---ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-C--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----ATCTACCGTAT-GTACTTG--------TGTA-AG--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGC-ATG----ATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ATNCACTAGA-CA-CAA-GCCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CGGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACAC----CTTGTGA----CA--------A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACACTT-------TTCATAT---C-TTTTTT----TTTACATT-AAG--TTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--TTA-TTGA--AGCATTACTTTTAGAGTTTT-TTC-C--A-T-AGGAA-----AGTTTT----GTT------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGANTCGA--TTCG-A--------------AAAA--AAATCG----------AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAAATCGTCCCAGCC
gi|1 : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CA------T--G---A---TT--C--------------AA-T--GCAC--CG-AT--CC--AGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------TT----TC------CAAATTTTAAGC---ATCATG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGATGG-TC--TGAG-GTTT-C--AG-AATACTTTCAATTAC--TTTTG-ATT-AAA--G-CAAGGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCTTATGATCTACCGTAT-GTACTTGACACTACTTGTA-AG--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTATCT-CTGCGCAT--C-TTA---TGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGCGATGTAGTATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTTG--CCT-------AA---TAG-AC----A-C-AAGC-TGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--AGAGAGTGTCA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AA-------TG-AAGTGTG-ATANTATAGA-CA-CAT-GCTGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CAGAGTGTCATGAA----TGGA--T-CCAA--CA-------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACACCTG-CTTGTGA----CA--------A----TCTTT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-T---CGT----ATTTACA-----------TCATAT---A-TTTTTT----TTTACAAT-AAG--TTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAGGTAA--TTA-TTGA--AGCATTA--TTTAGAG-TTT-TCC-T--A-T-TGGCAGCATTAGTTTTTAGAGTTCTCTCCT-----TCA-TAGAAAAGTTTTGTTTTCAG-TGATCAATTGA--ATCG-ATTCGG---------AAAAATAAATCGCAAAAAATCGAATTGCAG-CATTTTG--AATCG-AATCGTCCCAGCC
gi|10 : G-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATACTTT-----AC--GTTTG-ATT-AAA--A-ACATGGAAATT---AGGA-CAC-AT
gi|10 : AT-ACGCT-A-C--AACCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CGGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GC--ACTC-----TATATAACTA-----------AG-CGACAC---G----ATGTACAG-TGAGTTGACAA--AT-GGCA-ATTTCA--TCTTTAAAAGACTTTTAG-AC----A-C-AAGC-CGTTG-C-A-AATATC-----------A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTTTG-ATacgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatggcaatttcatctttaaaagacttttagacacaagccgttgcaaatatcaacggacatgaatggatccaaaattgaagtttgataatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|10 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacTAGA-CA-CAA-GCCGTTGCAAA-TATCAA--C---------------GGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTTTG-ATA-A-TA-CAA-----AAT----GT-ACAC-----TTGTGA----CA--------A----T------------------AA---T----C----TATT--A---------------TTTGA----ATGTG-TCATTTTTTTTTTAA--TG-C-TA-ATTTC--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACACTT-------TTCAT-T---C-TTTTTT----TTTACATT-AAT--TTT-T-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--TTA-TTGA--ACCATTACTT----AGTTTT-TTC------------A-----AG-TTT----G-T------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--TTCG-----------------AAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGaatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|11 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacatacgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatggcaatttcatctttaaaagactttCGATGCAC--CG------C--G---A---TT--CACTTAGTTCATTTCGA-T--GCAC--CG-AT--CT--GGAATC---C-CAAATTT---TG----ATTCAGTTCG------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCACA-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--TAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATGCTTT-----AC--TTTTG-ATT-GAA--A-CAATGGAAAAT---AGGA-CAA-ATC--------ACCTACTGTAT-GTACTT---------T--------------TTAT-ACGTA-A-C--A-CCGT------TTAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------ATATGT-CTGTGTAT--C-TTA---TGA-A---AAAACGC---AA-------------------TTCA--A--GT-GG--ACTG-----T-T---ACTA-----------AACCGACAC---G----ATGCACAG-TGAGTGGACAA--CT-GCAA-CTTTGA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C----------AC-A-GT-G-A--ACAGA----CA-TGAA----TGGA--T-TCA-A--AAT------GC-AAGTGTG-ATACACTACA-CA-aacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|11 : gtgtggtgcaccgaaaatttT-------AC---TAA-ACCG--A-C-A----CGATG-C-A---------C-A-GT-G-A--GTGGA----CA-------------------------AC------TGCAACTTTG-ATCTACTAGA-CA-CAA-GCCGATGCA-----------CA-GT-G-A--A---CAGA----CATGAA----TGGA--T-TCAA--AAT------GCAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACAC-----TTGTGA----CA--------ACTAATTTAT--CATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--AAT-CAAG-------ATTTGA----ATTTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-TGT-C--AG-------------TG-A---Cgtacacttgtgacaactaatttatcatgttttaatttcctaataatcaagatttgaatttgccaattttgaattctatgtcagtgac
gi|12 : gtgtggtgcaccgaaaatttcgatgcaccgcgattcacttagttcatttcgatgcaccgatctggaatcccaaattttgattcagttcggttcaaaatttagtatcacatgtaaacaacaaaatggcggtaacgagacggtctgaggtgttggaatgctttacttttgattgaaacaatggaaaataggacaaatcacctactgtatgtactttttatacgtaacaccgtttaaacatattacgagttcagcaagttatatgtctgtgtatcttatgaaaaaacgcaattcaagtggactgtT--GCACGGCGTAC--TGGTCGGTC--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----GTTC-----G------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCATA-T-AT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TAAG-GTGT-TCAGG-AATGTTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGG-CAA-ATC--------ATCTACCGTAT-GTACT----------TGTA-AG--------ATAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTAT
gi|12 : gggctgtgcgcgggtgcacgcggaaagcttgtcgggaatggcaccgcggaaatgtgaCAA---AATT--TT--T-ATCA----GTTAA--C--ATCGG--ACTC-----T-T---AGTA-----------AGCCGACAC---G----ATGTACAA-TGAGTGGACAA--CT-ACAA-ATTTCA--TCG-------TC---TAG-AC----A-C-AAGC-TAATG-C-A-AATATtgttttttctgcttgtttatttttttctatctgatgaattatattcaccccaatccgcccgcaccaaaatttttatcagttaacatcggactcttagtaagccgacacgatgtacaatgagtggacaactacaaatttcatcgtctagacacaagctaatgcaaatat
gi|13 : gggctgtgcgcgggtgcacgcggaaagcttgtcgggaatggcaccgcggaaatgtgatgcacggcgtactggtcggtcgattcgatgcaccgatccggaattccaaatttcggttcggttcaaaatttagtatcatatataaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttttacttttgattaaaacaatggaaagtagggcaaatcatctaccgtatgtacttgtaagatatacgctacaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctattgttttttctgcttgtttatttttttctatctgatgaattatattcaccccaatccgcccgcacACAA--TT-TTGA-ATATCAGTTCA-------AG---TGG-ACTCTTA-CTAAGC-TGACG-C-ATGGTA-CAGC-A-GT-G-------GA----CA---AC----TG-------CA-A--AAT------T-------CG--TCTACTAGA-CA-CAA-ACTGATGCAAA--ATCAA--CG-GT-GAA--A---CAGA----CATGAA----TGAA--T-CCAA--AAA------GAAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GTAACAC----C-TGTGA----CA--------A----TCTTT--TATGTTT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAA--------ATCTGA----A-GTGCCCAATTTTG----AA--TT-CATATAGT-CAGAG-------------TT-ATT-CTT----ATTTACTCTA-------TACCCAT---A-ATCCTT----TTAACAAT-AAG--TTTG--TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGTAA--TTA-TTGA--AGCATTA--TTAAGAGTTTT-TCCTC--A-TAAGGAA-----AGCT-------TT------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGAATCGA--TTCG----------------AAAA--AAATCG----------AATCGCAGCCATTTTG--AATCAAAATC
gi|14 : gagaaaacGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------A--A---AAT-TT--C--------------GA-T--ACAC--CG-aaaccgaaacgaattgaccctgaaatcgtcccaaccc
gi|14 : GCGATTCACTTCGTT----C--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GT----TCGGTTC-CAGATTT--AGT---ACCATG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AGA--G-CAAGGAAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----A----CCGTAT-GTACTTA--------A--A-AA--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACACTAT---ATT-A------CGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTATGT-CTGTGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--GGAAT-ATCA----GTTCC--A--AT-GG--ACTT-----A-T---ACTA-----------AGCCGACAC---G----ATGTACAG-AGAGTGTACAA--CT-GCAA-ATGTCA--TCG-------TC---TAG-AC----A-T-AAGC-TGATG-C-A-AATA-----------------CGGA----CA-TGA-----------T-CCA-A--AGT------TG-AAGTGTG-ATcgattcacttcgttcgattcgatgcaccgatccggaattccaaatttcgattcggttcggttccagatttagtaccatgtgtaaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctgaggtgttggaatactttacttttgattagagcaaggaaaagtaggacaaatcatctaccgtatgtacttaaaaattatacgctacaccgttcaaacactatattacgagttcaacaagttctatgtctgtgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttccaatggacttatactaagccgacacgatgtacagagagtgtacaactgcaaatgtcatcgtctagacataagctgatgcaaatacggacatgatccaaagttgaagtgtgatg
gi|15 : ggctgtgcggtgcaccgaaaatttcgatacaccGGGCT--GT-CGGTGCAC--CG------A--A---AAATTT--C--------------GAGT--GCAC--CG------C--G--ATT---C----ACTT---CG-----TTC-----G------GT----TC------g
gi|15 : GCGATTCACTTCGTT----C--G---G---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--AGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GTCGCGTT------CAAATT---AGT---ATCACG-TAGT-------AA--ACA--AC-A----A--AAAT-TGCGCGG--CAATG-AAACGG-TC--TGAG-GTGT-C--GG-AATACC---------------------AAA--G-CAATGGAAAGT---AGAC-CAA-ATAATCT----A-----CGTAT-GAACTTG--------T-TA-AA--------TTAT-GT-CT-A-C--A-C-GT------TAAAACA---C---ATT-A-------GA-GTTCAAC--AATT-T------CTATCTGCTGCGCATTTC-TTA-----A-A---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----G-TCA--A---T-GG--ACTCTAAATT-T---ACTA-----------AG-CGACGC-A------AAGTACAG-CGAGTGGACAA--CTGGCGA-ATTTCG--TCT-------AC---TAG-AC----A-T-AAGCTTGATGCC-A-AATATCAAT-A-GT-GAA--ACAGA----CA-TGGA----T-GA--T-CCA-A--AA-------TG-AAGgatgcaccgatccagaattccaaatttcgattcggtcgcgttcaaattagtatcacgtagtaaacaacaaaaattgcgcggcaatgaaacggtctgaggtgtcggaataccaaagcaatggaaagtagaccaaataatctacgtatgaacttgttaaattatgtctacacgttaaaacacattagagttcaacaatttctatctgctgcgcatttcttaaaaaaacacaatttgaatatcagtcaatggactctaaatttactaagcgacgcaaagtacagcgagtggacaactggcgaatttcgtctactagacataagcttgatgccaaatatcaatagtgaaacagacatggatgatccaaaatgaag
gi|16 : gggctgtcggtgcaccgaaaaatttcgagtgcaccAGGGCT--GTGCAGTGAAA--TG------A--A---AAT-TT--T--------------GA-T--GCAC--C
gi|16 : --G---A---TT--C--------------AA-T--GAAT--CA-AT--CT--GGAATT---C-CAAATTT---TG----ATTCTGTT-G------GT----TC------AAAATTT--AGC---ATCACT-T-GT-------CA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCAG--CAGCG-AGACGG-TC--TGTG-GTGT-G--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATA-AAA--T-CAATGGAAAGG---AGCA-CAA-GTCA---------CTACTGTA-----------------TGTA-AG--------TTAT-GCGCT-A-T--A-CCGT------TTAAGCA---A---ATT-A------GGG-GTTCAAC--AAGT-T------CTATataatctacttcatttgattcaatgaatcaatctggaattccaaattttgattctgttggttcaaaatttagcatcacttgtcaacaacaaaatggcagcagcgagacggtctgtggtgtgggaatactttacttttgataaaatcaatggaaaggagcacaagtcactactgtatgtaagttatgcgctataccgtttaagcaaattaggggttcaacaagttctat
gi|17 : agggctgtgcagtgaaatgaaaattttgatgcaccataatctacttcatttAGGGAT--GTGCGATTCACTTCG------TTTG---A---TT--C--------------GA-T--ACAC---A-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTT-----GTTGGCAGT----TT------GAAATTT--AGT---ATCACA-T-GA-------AA--ACA--AC-AAAACA--AA---CA-GTGG--CAACG-AGACGG-TC--T-------------G-AATACTTT-----AC--TTATG-ATTAAAA--A-CACTGGAAAGG---AGGG-CAAGATCATCT----AC---CCGTAT-GTAC
gi|18 : gtatatggtacacaactccta-C--AG-------------TG-A---CGT----ATATACACTT-------TTCATAT---C-TTTT------TTTACATT-CAG--TTTTT-TTT-TACCCT-TAA-ATTAAGGAA--TTA-TTGA--ACCATTACTT----AGTTTT-TTC------------A-----AG-TTT----GTT------TCAGTACCGGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--TT---A--------------AAAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCat
gi|19 : TTTACACTTATTTTTTTTTTTTT---T-TTTTTT----TTTACATCCAAG--TTTCT-TTT-T---TTATAATATAAAAAAAGGTTA-TTGATTAGTGTAA---TTAG--------TC-C--C-T-ATGAA-----AAGTCT----ATT-------------CAG------------------AA----------GA--TT---A--------------AATA--AAATCA----------AATTGCGG-CATTTTG--AATCGAAATCGtaaccgactctaacgaaccccgtatcgtcccagc
gi|2 : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------A--A---A---AT-----------------GA-T--GCAC--CG------C--G--ATTA--A-CATAATT---CG-----TTC-----GC-----GT----TC------CGAATaaccgaatcgaatgaaccctgaatcattccagcc
gi|2 : --CG------C--G---T---TC--C--------------GAAT--GCAC--CGGAT--CC--AGAATT---C-CAA-TTC---CG----ATTC-----G------GT----TCGGTTTCCAAATT---AGTT--ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AAAAATG-GCGG--CAACGGAAACGG-C----GAGTGGAT-C--G--AATA-------------------AAC-AAG--C-CAATGGAAAGT---AGGAACAA-AT-A-------ATCTACCGTATTGTACTTG--------TA-A-AT--------TTATTGTGCT-AGC--A-CCGT------T-AAACA---C---ATTTA------GGA-GTTCAAC--AAGTAT------CTACAT-TCTCGGAT--C-TTA---TGAAG---AAAACCA---AATT--TGAATTATCA----GTTCA--A--GT-GG--AA-C-----T-T---GCTAAATTACCTCATAGCCGACGC-A------A-GTACAGACGAGTGGGCAACCCT-GCGACATTAC---TCT-------AC---TAGAAC----A-TAAAGC-TGATG-CAA-AATAGTAAT-A-GTAG-AT-ACAGA----C--TGGA-----GAA--TACCA-A--AATGAATAGTG-AGCTGTG-ATACACTAT--CA-CAA-Ggcaccggatccagaattccaattccgattcggttcggtttccaaattagttatcacgtgtaaacaacaaaaaaatggcggcaacggaaacggcgagtggatcgaataaacaagccaatggaaagtaggaacaaataatctaccgtattgtacttgtaaatttattgtgctagcaccgttaaacacatttaggagttcaacaagtatctacattctcggatcttatgaagaaaaccaaatttgaattatcagttcaagtggaacttgctaaattacctcatagccgacgcaagtacagacgagtgggcaaccctgcgacattactctactagaacataaagctgatgcaaaatagtaatagtagatacagactggagaataccaaaatgaatagtgagctgtgatacactatcacaagtacaccctgtgacaatctatattatgttttaaaatttccctaatgaactcaagatttgaatgtgcccaattttgaagcttctaagtcagtgttcgtattcacacatatttttgttttaacattattgaagtattattttagagttttcctcaatgaggaaatttttttcagtatcaatttgaatcggatttcgaaaaaaatcgaaatcgcagcattttggcaatcgaaatcgacaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|2 : agggctgtgcggtgcaccgaaaatgatgcaccgcgattaacataattcgttTCTACTAGAACA-TAAAGCTGATGCAAAATAGTAA--TA-GTAG-AT-A---CAGA----C-TGGA-----GAA--TACCAA--AATGAATAGTGAGCTGTG-ATACACTATCAC-----AA-----GT-ACAC----CCTGTGA----CA--------A----TCTATATTATG-TT-TT--AAAATTTCC-C----TAATGAACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTGCCCAATTTTG----AAGCTT-C-TA-AGT-C--AG-------------TGTT---CGT----ATTCACA------------CATAT---T-TTTGTT----TTAACATT-A-----TTG--------------AA-GT------A--TTA-T--------------TTTAGAGTTTTCCTC-A--A-TGAGGAA-----A-TTT------TT------T-----TCAGTA--------------TCAATT--TGAATCGGATTTCG----------------AAAA--AAATCGA---------AATCGCAG-CATTTTGGCAATCGAAATCGtacaccctgtgacaatctatattatgttttaaaatttccctaatgaactcaagatttgaatgtgcccaattttgaagcttctaagtcagtgttcgtattcacacatatttttgttttaacattattgaagtattattttagagttttcctcaatgaggaaatttttttcagtatcaatttgaatcggatttcgaaaaaaatcgaaatcgcagcattttggcaatcgaaatcgacaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|20 : agggctgtgcggtgcaccgaaaatgatgcaccgcgattaacataattcgttcgcgttccgaatgcaccggatccagaattccaattccgattcggttcggtttccaaattagttatcacgtgtaaacaacaaaaaaatggcggcaacggaaacggcgagtggatcgaataaacaagccaatggaaagtaggaacaaataatctaccgtattgtacttgtaaatttattgtgctagcaccgttaaacacatttaggagttcaacaagtatctacattctcggatcttatgaagaaaaccaaatttgaattatcagttcaagtggaacttgctaaattacctcatagccgacgcaagtacagacgagtgggcaaccctgcgacattacGGCTTGGTGCGGTGCAC--CG---------GAAAA---TTTGC--------------GA-TGGGCAC--CG------C--ACGATT---C----ATGT---CG-----TTC-----G------GT----TC------acaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|20 : ------C--G---G---TT--C--------------GA-T--GCACG-CG-AT--CCCAGTAATT---C---AATTT---CGTTCGGTTC-----G------GT----TC------CAAATTT--AGT---ATCACGCT-GT-------AA--ACA--ACAA----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AAACGGTTC--TGAG-GTGT-C--GG-AAgatgcacgcgatcccagtaattcaatttcgttcggttcggttccaaatttagtatcacgctgtaaacaacaaaaatggcggcaacgaaacggttctgaggtgtcggaagta
gi|21 : ggcttggtgcggtgcaccggaaaatttgcgatgggcaccgcacgattcatgtcgttGGGCT--GTGTGGTGCAC--CG------A--A---AAT-TT--C--------------GA-T--gta
gi|21 : ---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--AGAATT---C-CAAATTT---GG----ATTT-----G------GT----TCGGTT--CAAATTT--AGTA--ATCACG-T-GTA------AA--ACA--AC-A----AACAA---T---CGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTG-----AG-AAAAC--------ACAATTTTG-Acaccgcaattcattgttttatttcgatgcaccgatccagaattccaaatttggatttggttcggttcaaatttagtaatcacgtgtaaaacaacaaacaatcggcaacgagacggtctgaggtgagaaaacacaattttgaa
gi|22 : gggctgtgtggtgcaccgaaaatttcgatcaccgcaattcattgttttat--AGCATTACTTATATTTTTTT-TTT-CTCA-CGAGGAA-----AGTTTT------C------T-----TCAGTA--------------TGAA-T--TGAATT-A--TTCA-ATAGATTAAAAAGAGAAAA--AAATCG----------TACCTCAG-TGTTTTG--AATCAAAATCa
gi|23 : ------C--G---A---TT--GA-------------GA-T--GCAC--CG-ATTGCC--AGAAT----C-CAAATTT----G----GTTC-----G-------T----TC------CAAAT----AGT---ACTACG-T-GG-------TA--ACA--ACAA----A--AA---TG-GCGT--CAAaaattgaatgaaccctgaatcgtcccagcc
gi|24 : aggtgcgcgtgcaaccgaaagatctcggcagccgcaattcacttgt-CAA-ATCAATGCAAA-TATCAAAACA-GT-G-A--ATTGCAAA----CATGAA----TGGG--T-CCAA--AAT------TAAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACA-----TTTGTGA----CA--------A----TTAATC-TATG-TT-TT--AA---TTTT-C----a
gi|25 : TAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----CAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CAAATTCTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AGTGACGTTTAATACTG-A---CGT----GTTTACACTT-------TTCATAT---C-TTT
gi|26 : aGAGTTTT-CCT-C--A-TGAGGAA-----AATTTT-------------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGAATCGA--TTTG-A--------------AAA----AATCG----------AATCGCAT-CATTTTG--AATCGAA
gi|27 : AA--TTA-TTGA--AGTATTA--TTTAGAGTTTA-CCT-C--A-TGAGTAA-----AGTTTT------T------T-----TCAACA--------------TCAA-T--TGAATCGA--TTTG-A--------------AAAA--AA-TCA----------AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAccgaatcgaatggaccctgaatc
gi|28 : gtTTT----GTT------T------CAGTA--------------TCAA-T--TGATTCAA--TTCGAA--------------AAAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTCTG--AATCGAAATCG
gi|29 : aaT-C--AA-------------TG-A---CGA----ATTTACACTT-------TTTGTAT---A--TATTT----TTTACA-A-AAG--TTTGTGTTTATACCCT-TTA-ATAAAGGAA--TTA-TTGA--AGCATTaattgaatgaaccctgaatcgtcccagcc
gi|3 : -T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TA-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGA-T--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGA-CAA-AT-A-------ATCTACCATAT-GTACTTG--------T--A-AG--------TTAT-ATGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTGTAT-CTGCACAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--AGTGT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCAA--C-ATG----ATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--TCT-------TC---TAG-AC----A-C-AAGC-TGATG-C-A-AATATCAAC-A-GC-G-A--ACGGA----CA-T---------GA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGCA-ATACACTAAA-CA-C
gi|3 : agggctgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAAC-A--T-G-A---TGTA----CAGCGAG----TGGA--C--------AAC------TGCAAATTTC-ATCTTCTAGA-CA-CAA-GCTGATGCAAA-TATCAA--CA-GC-G-A--A---CGGA----CATGA-----------T-CCAA--AAT------TGAAGTGCA-ATACACTA-AAC-----ACTAAATGT-ACAC-----TTGTGAAAATTA--------A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-GCATTTTTT----AA--TG-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACACTT-------TTCATAT---C--TTTTT----TTTACATG-AAG--TTTTT-CTT-TAACCT-TAA-ATAACGGAA--TTT-TTTA--AGCATTACTTT-----TTTT-TTC------------A-----AG-TTT----G-T------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--TTCG-A--------------ATAA--AAATCG----------AATTGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGtaaatgtacacttgtgaaaattaatctattatgttttaatttcctaatactcaagatttgaatgtggcattttttaatgctaagtcagtgacgtatttacacttttcatatcttttttttacatgaagtttttctttaaccttaaataacggaattttttaagcattactttttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaataaaaatcgaattgtagcattttgaatcgaaatcgaaccaaatgaaccctgaatcgtcccagccct
gi|30 : agggctgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaaacaacaaaatagcggcaacgagacggtctgaggtgatggaatactttacttttgattaaaacaatggaaagtaggacaaataatctaccatatgtacttgtaagttatatgctacaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctgtatctgcacatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgtggactcttactaagc-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATA-AAA--G-CAATGGAATGT---AGAA-CAA-AT-A-------ATCTACCATAT-GTACT----------TCTA-AA--------TTAT-ATGCT-A-aaccaaatgaaccctgaatcgtcccagccct
gi|31 : GGCG--GTGTGGTGCAT--CG------A--A---AAT-TT--C--------------GA-T--GCAC--TG------C--G--ATT---CACGTCTTT---CG----ATTC-----G------AT----
gi|32 : T-A-C--A-CCGT------TCTAACA---T---ATT-ACCATTACGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCgcacgggttcaaca
gi|34 : T--C-TTA---TGA-G---AAAACAG---AATT--TGACA-ATCA----GTTCA--A--GT-GA--A
gi|4 : TGCGGTGCAC--CGA-----A--A---A---TT--CG-------------GA-T--GCACCGCG-AT--C
gi|4 : c------C--G---A---TT--C--------------GAGT--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAAATT---CG----ATTC-----G------GT----TCGGTT--CAAATT---AGT---ATCA---T-AT-------AACTACA--AC-A----A-------TG-GCG----AACG-AGACGG-TC--TAAG-GTGT-TCAGG-AATG--TT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--AACAATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCA-------ATCTACCGTAT-GTACT-G---------GCA-AG--------ATAT-ACGCT-A-C--A-CC-T------TCAAACA---T---ATT-A------CGATGTTCAGC--AA-T-T------C-ATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--GGAAT-ATCA----GTTCA--A---T-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACAC---G----ATGTACAG--GAGTGGACAA--CT-GCAA-ATCTCA--TCG-------TC---TTG-AC----A-C-AAGC-TAATG-C-A-AATATCAAC-A--C-G-A--GCGGA----CA-T---------GA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTGTATGCACTAAA-Cacttcgttcgattcgagtgcaccgatccggaattccaaaattcgattcggttcggttcaaattagtatcatataactacaacaatggcgaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttacttttgattaaaaacaatggaaagtaggacaaatcaatctaccgtatgtactggcaagatatacgctacaccttcaaacatattacgatgttcagcaattcatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttcaatggactcttactaagccgacacgatgtacaggagtggacaactgcaaatctcatcgtcttgacacaagctaatgcaaatatcaacacgagcggacatgatccaaaattgaagtgtgtatgcactaaactctaaatgtacactctgtgacatttaaattatctattatcttattagttactacactacaagatgtgaatgtgcattttttaaattgctaagtcatgagatcgaagcgcattttatataaatcttttttttaattaagttttgtttacccttaaatacaggaattaattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatccaatcgtagcattttgatcgaaatcgaaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|4 : ctgcggtgcaccgaaaattcggatgcaccgcgatcacttcgttA----CA-GGAG----TGGA--C--------AAC------TGCAAATCTC-ATCGTCTTGA-CA-CAA-GCTAATGCAAA-TATCAA--CA--C-G-A--G---CGGA----CATGA-----------T-CCAA--AAT------TGAAGTGTGTATGCACTA-AACTCTAAAT-----GT-ACAC----TCTGTGA----CATTTAAATTA----TCTAT--TATC-TTATT--AG---TTAC-T------AC--ACTACAAG-------ATGTGA----ATGTG-CATTTTTTA----AA--TTGC-TA-AGT-C--A--------------TG-AGATCGA----A---GCGCAT-------TTTATATAAAT-CTTTTT----TTTA-ATT-AAG--TTT-T-GTT-TACCCT-TAA-ATACAGGAA--TTAATTGA--AGCATTACTT--AG-GTTGT-TTC------------A-----AGTTT-----GTT------T------CAGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--ATCG----------------AAAA--AAATCC----------AATCGTAG-CATTTTG---ATCGAAATCGtctaaatgtacactctgtgacatttaaattatctattatcttattagttactacactacaagatgtgaatgtgcattttttaaattgctaagtcatgagatcgaagcgcattttatataaatcttttttttaattaagttttgtttacccttaaatacaggaattaattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatccaatcgtagcattttgatcgaaatcgaaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|5 : ctgcggtgcaccgaaaattcggatgcaccgcgatcacttcgttcgattcgagtgcaccgatccggaattccaaaattcgattcggttcggttcaaattagtatcatataactacaacaatggcgaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttacttttgattaaaaacaatggaaagtaggacaaatcaatctaccgtatgtactggcaagatatacgctacaccttcaaacatattacgatgttcagcaattcatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttcaatggactcttactaagccgacacgatgtGGCT--GTGCGGTGCAT--CG---------G---AAATTT--T--------------GA-T--GCAC--CG------C--G--ATT---C----ACTT---TG-----TTC-----T------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCATG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AT---TG-GCAG--CAACT-TGATGG-TC---------------------ACTTT-----AC--TTTTG-AAA-AAAGAA-CAATGGAAAA------GA-CAA-GTCATCT----A----CTGTAT-GTAC--A--------TGCA-AG--------TTAT-GCGCT-A-C--A-CCGT------GCAAGTA---T---ATT-A------CGA-GTTCAAG--AAGT-TGAACTTCTTTGT-CTGCGCAT--C-TTT---TGA-ATTAAGAAAAC---AATT--TGAGT-ATCG----GTGCA--A--GT-GG--ACTC-----A-T---ACTA-----------AGCCGAC---ATG----ATGTACAG-TGAGTGGACAA--AT-GCAA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGT-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--ACAGA----CA-TGAA----TGGA--T-CTA-A--AAT------TA-AAGTGTG-ATACACTACA-Caaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|5 : -AAGC-CGA---C-ATGATGT--AC-A-GT-G-A--GTGGA----CA---AA----TG------C---A--AAT------T-------TC-ATCTACTAGA-CA-CAA-GTCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CAGA----CATGAA----TGGA--T-CTAA--AAT------TAAAGTGTG-ATACACTA-CA------------------------CTTGTGA----CA--------A----T-TAA--TCTG-TT-TT--CA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGAATACATGTG-CAAATTTTG----AA--TT-A-TA-AGT-C--AA-------------AG-A---CTTATAAATTTACACTT-------CTCACAT---CTTTTTTT----TTTAAGTA-AAGTTTTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGTA--TTA-TTGA--AGCATTAC--TTAGTTTTTT-TTCTC--AGG-AGGGA-----AGTTT------TC------T-----TCAGTA----------------------TGAATCAA--TTC------------------AAA--AAATCG----------AATCGTAG-TGTTTTG--TATCGAAATCttgtgacaattaatctgttttcatttcctaatactcaagatttgaatacatgtgcaaattttgaattataagtcaaagacttataaatttacacttctcacatcttttttttttaagtaaagtttttgtttttacccttaaataaaggtattattgaagcattacttagttttttttctcaggagggaagttttcttcagtatgaatcaattcaaaaaatcgaatcgtagtgttttgtatcgaaatctaaccgaatgaatcctgaattgtc
gi|6 : ggctgtgcggtgcatcggaaattttgatgcaccgcgattcactttgttctgttcaaaatttagtatcatgtgtaaacaacaaattggcagcaacttgatggtcactttacttttgaaaaaagaacaatggaaaagacaagtcatctactgtatgtacatgcaagttatgcgctacaccgtgcaagtatattacgagttcaagaagttgaacttctttgtctgcgcatcttttgaattaagaaaacaatttgagtatcggtgcaagtggactcatact--AGT---ATCATA-T-AT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TAAG-GTGT-TCAGG-AATGTTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGG-CAA-ATCATCT----A----CCGTAT-GTACTTG--------T--A-AG--------T-AT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTAAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--GGAAT-ATCA----GTTAA--A--AT-GG--ACTC-----T-T---AGTA-----------AGCCGACAC---G----ATGTACAA-TGAGTGGACAA--CT-ACAA-ATTTCA--TCG-------TC---TAG-A-----A-C-AAGC-TAATG-C-A-AATATCAACAA-GC-G-A--GCGGA----CA-T---------GA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ACGCACTAAA-CA-Ctaaccgaatgaatcctgaattgtc
gi|6 : -AAGC-CGACA-C-G-A-TGT--AC-A-AT-G-A--GTGGA----CA------------A----CTACA--AAT------T-------TC-ATCGTCTAGA--A-CAA-GCTAATGCAAA-TATCAA--CAAGC-G-A--G---CGGA----CATGA-----------T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ACGCACTA-AAC-----ACTAAATGT-ACAC-----TTGTGA----AATTATT---A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TACT--ACT-CA-G-------ATGTGA----ATGTG-GCATTTTTT----AA--TG-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CAT----ATTTACACTT-------TTCATA------TTTTTT----TTTACATT-AAG--TTTGT-TC----CCCT-TAA-ATACAGGAA--TCA-TTGA--AGCATTAC--TTAG-GTTGT-TTC------------A-----AG-TTT----G-T------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--ATCG----------------AAAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGtaaatgtacacttgtgaaattattatctattatgttttaatttcctactactcagatgtgaatgtggcattttttaatgctaagtcagtgacatatttacacttttcatatttttttttacattaagtttgttccccttaaatacaggaatcattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaaccgaatcaaatgaaccctaatcgtcccagcc
gi|7 : agtatcatatataaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttttacttttgattaaaacaatggaaagtagggcaaatcatctaccgtatgtacttgtaagtatacgctacaccgttcaaacatattacgagttaagcaagttctatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttaaaatggactcttagt--GCAC--CG-AT--CC--AGAATTTTCC-TAAATTTTCACG----ATTCC----G------GT----TA------AAAATTT--AGCGCCATCAT--T-GTCGATATGAA--ACACTAC-A----A--AA---TG-GGGGTGCATCG-AGACGG-TCACT-AG-GCGTAT--GGTAATACTTT-----AAAATTCTGTATT-TA--------TGGATATTTAGAGGA-GAA-GTCATCT----ATC-ACCGTTT-GTACA-A--------TGTAGAGAAATGATCTTAT--CGCTTA-CTCA-TCGTGTTTTTCCAGGCA---TCTGATT-AT-----CGA-ATTCAACTAAAGT-T------TTATGT-CTGCGCATG-CATTAATGTAA-T---AAAACACCGAAATTAATGAGT-ATAATAAAGTTCATCA--GT-GGGGACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACAC-A------A-GTA--G--GAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--ACA-------AC---TTG-AC----AGC-AAGT-TGATG-C-A-AATATCAAC-AGGT-G-ATGACAGAC---CA-TTCACACTTGGAGTT-CCA-ACCATT------TG-AAGTGTG-ATACACTAGaaccgaatcaaatgaaccctaatcgtcccagcc
gi|7 : ctgcttgcagtggcaatcgaaaattttatgagcacatgtttcagcttcgaattcgatttcgcaaatcACTTGA-CAGCAA-GTTGATGCAAA-TATCAA--CAGGT-G-ATGA---CAGAC---CATTCACACTTGGAGTT-CCAACCATT------TGAAGTGTG-ATACACTA-GCT-----T------GTGACAC----CTT---------A--------A----T-TGT--TATG-TT-TTACAG---TTTCGCTAGATAAT--ACT-TGAGACGAGATATTTGA----ATGTG-cttgtgacaccttaattgttatgttttacagtttcgctagataatacttgagacgagatatttgaatgtgag
gi|8 : ctgcttgcagtggcaatcgaaaattttatgagcacatgtttcagcttcgaattcgatttcgcaaatcgcaccgatccagaattttcctaaattttcacgattccggttaaaaatttagcgccatcattgtcgatatgaaacactacaaaatgggggtgcatcgagacggtcactaggcgtatggtaatactttaaaattctgtatttatggatatttagaggagaagtcatctatcaccgtttgtacaatgtagagaaatgatcttatcgcttactcatcgtgtttttccaggcatctgattatcgaattcaactaaagttttatgtctgcgcatgcattaatgtaataaaacaccgaaattaatgagtataataaagttcatcagtggggactcttactaagccgacacaagtaggagtggacaactgcaaatttcaacaGCGATTCACTTCG------TTTG---A---TT--C--------------GG-T--ACAC--CA-AT--TC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----GTTT-----G------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCAAG-T-GT-------AA--ACA--AC-T----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AACACTTT-----AC--TTTTG-ATC-AAA--A-CAATGGGAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----A----CCGTAT-GTACTTG--------T--A-AG--------TTAT-GCGCT-A-C--T-CTGT------TTAAGCA---T---ATT-A------TGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTATGT-CTGCACAT--C-TTA---TGA-G---AAAACAC---AATT-------------------CA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACG---TG----ATGTACCG-TGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCG--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AATC-TGATG-C-A-AATTTCAAC-A-GT-G-A--ACAGA----CA-TAAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ATTCACTACA-CA-ag
gi|8 : gctgtgcggtgaccatgcaccaaaaattttgatgcacc----CG-TGAG----TGGA--C--------AAC------TGCAAATTTC-GTCTACTAGA-CA-CAA-TCTGATGCAAA-TTTCAA--CA-GT-G-A--A---CAGA----CATAAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATTCACTA-CAC-----A------GT-ACACTTGACTAGTGA----CA--------A----TTTAT--TATG-TT-CT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CTAAGTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---TGT----ATATACACTT-------TTCAAAT---C-TGTTTTAAAATTTACATT-AAG--TTTTT-TTT-gtacacttgactagtgacaatttattatgttctaatttcctaatactcaagatttgaatgtgctaagtttgaattctaagtcagtgatgtatatacacttttcaaatctgttttaaaatttacattaagtttttttt
gi|9 : gctgtgcggtgaccatgcaccaaaaattttgatgcaccgcgattcacttcgtttgattcggtacaccaattcggaattccaaatttcggtttggttcaaaatttagtatcaagtgtaaacaactaaatggcggcaacgagacggtctgaggtgttggaacactttacttttgatcaaaacaatgggaagtaggacaaatcatctaccgtatgtacttgtaagttatgcgctactctgtttaagcatattatgagttcaacaagttctatgtctgcacatcttatgagaaaacacaattcaagtggactcttactaagccgacgtgatgtacG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATACTTT-----AC--GTTTG-ATT-AAA--A-ACATGGAAATT---AGGA-CAC-AT
gi|9 : AT-ACGCT-A-C--AACCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CGGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GC--ACTC-----TATATAACTA-----------AG-CGACAC---G----ATGTACAG-TGAGTTGACAA--AT-GACA-ATTTCA--TCTTTAAAAGACTTTTAG-AC----A-C-AAGC-CGTTG-C-A-AATATC-----------A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTTTG-ATacgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatgacaatttcatctttaaaagacttttagacacaagccgttgcaaatatcaacggacatgaatggatccaaaattgaagtttgataatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|9 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacTAGA-CA-CAA-GCCGTTGCAAA-TATCAA--C---------------GGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTTTG-ATA-A-TA-CAA-----AAT----GT-ACAC-----TTGTGA----CA--------A----T------------------AA---T----C----TATT--A---------------TTTGA----ATGTG-TCATTTTTTTTTTAA--TG-C-TA-ATTTC--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACACTT-------TTCAT-T---C-TTTTTT----TTTACATT-AAT--TTT-T-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--TTA-TTGA--ACCATTACTT----AGTTTT-TTC------------A-----AG-TTT----G-T------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--TTCG-----------------AAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGaatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GTGCACCGAAATTTTTGGTGCATCACGATTTATACCATTCGATTCGA
Unaligned ( gi|35 ): GAATGGACCCTGAATCGTCCCAGCCCTACTC
Unaligned ( gi|36 ): ATGAACCCTGAATCGTCCCAGCCCTAA
Alignments
lowQualScore : 11 33333333333333333 11111111111111 11111 2222222 1111111 1111 222222222222 3333333333333 11111111 111 11111111111 333333 1111111111111 111111111111111111 333333333333 22222 11111111 1111111 1111 1111111111111 111 22222222 66666666666666666666666666666666666666666666 11111111111111 4444444444444444 1111111111
lowQualScore : 55 22 33333333333333333 22 44444444444444 5 22 44 55 22 22 3 555 33 333 88888 11111 888888 4444 2222222 555 999 333 2 0000000 33 33 4 5555 33 777 2 33 2 2 33 2 5555 2 55555 66 2 2 4444 444 2 2 1 999999999999 2 7777777777777 2 00000000 2 2 2 33 5 777777 444 444 2 999999 2 33 2 777777 2 66 2 6666 2 555 444 444 2 5555 33 33 2 33 7777777 000 33333333333 0 1 333333 2 99 33 2 2 33 7777777777777 2 8888 2 4 2 2 2 4 444 2 22 2 2 555 6666 777777777777777777 2 22 555555 8 1 2 1 2 2 2 3 44 6 3 3 999999 9999 999999 44 3 44 888888 3 3 444444444444 6 33333 6666 88888888 6666 9 66 2 2 33 555 2 6666 44 3 0000000 6666 6 1 4444 44 3 3 3 5 33 5555555555555 2 888 6666 9999999 999999 6666 3 44 000 3 3 3 44 3 33 88888888 2 99999999999999999999999999999999999999999999 55555555555555 2 33 1 33 0000000000000000 33 4444444444 2 33
lowQualScore : .. .. ................. .. .............. . .. .. .. .. .. . ... .. ... ..... ..... ...... .... ....... ... ... ... . ....... .. .. . .... .. ... . .. . . .. . .... . ..... .. . . .... ... . . . ............ . ............. . ........ . . . .. . ...... ... ... . ...... . .. . ...... . .. . .... . ... ... ... . .... .. .. . .. ....... ... ........... . . ...... . .. .. . . .. ............. . .... . . . . . . ... . .. . . ... .... .................. . .. ...... . . . . . . . . .. . . . ...... .... ...... .. . .. ...... . . ............ . ..... .... ........ .... . .. . . .. ... . .... .. . ....... .... . . .... .. . . . . .. ............. . ... .... ....... ...... .... . .. ... . . . .. . .. ........ . ............................................ .............. . .. . .. ................ .. .......... . ..
lowQualScore : 00 99 33333333333333333 55 33333333333333 5 44 33 22 88 99 2 888 55 777 99999 88888 222222 5555 3333333 888 444 333 4 0000000 22 22 7 0000 22 444 4 22 5 2 11 2 8888 1 66666 11 2 4 5555 111 4 4 7 777777777777 7 1111111111111 9 44444444 5 4 4 44 0 222222 444 444 5 777777 5 44 5 222222 9 88 9 6666 9 000 777 333 7 7777 77 77 7 77 6666666 000 66666666666 7 4 111111 9 88 77 7 7 77 5555555555555 5 8888 5 4 2 2 2 4 222 2 88 2 2 888 2222 000000000000000000 0 88 888888 0 8 1 0 1 2 9 1 22 2 1 1 777777 6666 222222 22 1 22 888888 1 1 888888888888 2 66666 5555 88888888 5555 1 88 9 9 99 000 9 1111 22 1 0000000 5555 2 8 2222 66 3 3 3 7 99 7777777777777 9 999 5555 3333333 444444 5555 1 22 888 1 3 3 22 1 99 11111111 9 33333333333333333333333333333333333333333333 77777777777777 7 77 9 77 5555555555555555 77 3333333333 7 77
consensus : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------C--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GT----TC------CAAATTT--AGT---ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-C--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----ATCTACCGTAT-GTACTTG--------TGTA-AG--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGC------G-ATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ATNCACTAGA-CA-CAA-GCCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CGGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACAC----CTTGTGA----CA--------A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACACTT-------TTCATAT---C-TTTTTT----TTTACATT-AAG--TTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--TTA-TTGA--AGCATTACTTTTAGAGTTTT-TTC-C--A-T-AGGAA-----AGTTTT----GTT------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGANTCGA--TTCG-A--------------AAAA--AAATCG----------AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAAATCGTCCCAGCC
Reference ( family-3214 ) : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------C--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GT----TC------CAAATTT--AGT---ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-C--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----ATCTACCGTAT-GTACTTG--------TGTA-AG--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGC-----AG-ATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ATNCACTAGA-CA-CAA-GCCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CGGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACAC----CTTGTGA----CA--------A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACACTT-------TTCATAT---C-TTTTTT----TTTACATT-AAG--TTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--TTA-TTGA--AGCATTACTTTTAGAGTTTT-TTC-C--A-T-AGGAA-----AGTTTT----GTT------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGANTCGA--TTCG-A--------------AAAA--AAATCG----------AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAAATCGTCCCAGCC
gi|1 : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CA------T--G---A---TT--C--------------AA-T--GCAC--CG-AT--CC--AGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------TT----TC------CAAATTTTAAGC---ATCATG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGATGG-TC--TGAG-GTTT-C--AG-AATACTTTCAATTAC--TTTTG-ATT-AAA--G-CAAGGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCTTATGATCTACCGTAT-GTACTTGACACTACTTGTA-AG--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTATCT-CTGCGCAT--C-TTA---TGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGCGATGTAGTATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTTG--CCT-------AA---TAG-AC----A-C-AAGC-TGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--AGAGAGTGTCA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AA-------TG-AAGTGTG-ATANTATAGA-CA-CAT-GCTGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CAGAGTGTCATGAA----TGGA--T-CCAA--CA-------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACACCTG-CTTGTGA----CA--------A----TCTTT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-T---CGT----ATTTACA-----------TCATAT---A-TTTTTT----TTTACAAT-AAG--TTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAGGTAA--TTA-TTGA--AGCATTA--TTTAGAG-TTT-TCC-T--A-T-TGGCAGCATTAGTTTTTAGAGTTCTCTCCT-----TCA-TAGAAAAGTTTTGTTTTCAG-TGATCAATTGA--ATCG-ATTCGG---------AAAAATAAATCGCAAAAAATCGAATTGCAG-CATTTTG--AATCG-AATCGTCCCAGCC
gi|10 : G-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATACTTT-----AC--GTTTG-ATT-AAA--A-ACATGGAAATT---AGGA-CAC-AT
gi|10 : AT-ACGCT-A-C--AACCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CGGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GC--ACTC-----TATATAACTA-----------AG-CGACAC------G-ATGTACAG-TGAGTTGACAA--AT-GGCA-ATTTCA--TCTTTAAAAGACTTTTAG-AC----A-C-AAGC-CGTTG-C-A-AATATC-----------A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTTTG-ATacgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatggcaatttcatctttaaaagacttttagacacaagccgttgcaaatatcaacggacatgaatggatccaaaattgaagtttgataatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|10 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacTAGA-CA-CAA-GCCGTTGCAAA-TATCAA--C---------------GGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTTTG-ATA-A-TA-CAA-----AAT----GT-ACAC-----TTGTGA----CA--------A----T------------------AA---T----C----TATT--A---------------TTTGA----ATGTG-TCATTTTTTTTTTAA--TG-C-TA-ATTTC--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACACTT-------TTCAT-T---C-TTTTTT----TTTACATT-AAT--TTT-T-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--TTA-TTGA--ACCATTACTT----AGTTTT-TTC------------A-----AG-TTT----G-T------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--TTCG-----------------AAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGaatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|11 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacatacgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatggcaatttcatctttaaaagactttCGATGCAC--CG------C--G---A---TT--CACTTAGTTCATTTCGA-T--GCAC--CG-AT--CT--GGAATC---C-CAAATTT---TG----ATTCAGTTCG------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCACA-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--TAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATGCTTT-----AC--TTTTG-ATT-GAA--A-CAATGGAAAAT---AGGA-CAA-ATC--------ACCTACTGTAT-GTACTT---------T--------------TTAT-ACGTA-A-C--A-CCGT------TTAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------ATATGT-CTGTGTAT--C-TTA---TGA-A---AAAACGC---AA-------------------TTCA--A--GT-GG--ACTG-----T-T---ACTA-----------AACCGACAC------G-ATGCACAG-TGAGTGGACAA--CT-GCAA-CTTTGA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C----------AC-A-GT-G-A--ACAGA----CA-TGAA----TGGA--T-TCA-A--AAT------GC-AAGTGTG-ATACACTACA-CA-aacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|11 : gtgtggtgcaccgaaaatttT-------AC---TAA-ACCG--A-C-A----CGATG-C-A---------C-A-GT-G-A--GTGGA----CA-------------------------AC------TGCAACTTTG-ATCTACTAGA-CA-CAA-GCCGATGCA-----------CA-GT-G-A--A---CAGA----CATGAA----TGGA--T-TCAA--AAT------GCAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACAC-----TTGTGA----CA--------ACTAATTTAT--CATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--AAT-CAAG-------ATTTGA----ATTTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-TGT-C--AG-------------TG-A---Cgtacacttgtgacaactaatttatcatgttttaatttcctaataatcaagatttgaatttgccaattttgaattctatgtcagtgac
gi|12 : gtgtggtgcaccgaaaatttcgatgcaccgcgattcacttagttcatttcgatgcaccgatctggaatcccaaattttgattcagttcggttcaaaatttagtatcacatgtaaacaacaaaatggcggtaacgagacggtctgaggtgttggaatgctttacttttgattgaaacaatggaaaataggacaaatcacctactgtatgtactttttatacgtaacaccgtttaaacatattacgagttcagcaagttatatgtctgtgtatcttatgaaaaaacgcaattcaagtggactgtT--GCACGGCGTAC--TGGTCGGTC--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----GTTC-----G------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCATA-T-AT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TAAG-GTGT-TCAGG-AATGTTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGG-CAA-ATC--------ATCTACCGTAT-GTACT----------TGTA-AG--------ATAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTAT
gi|12 : gggctgtgcgcgggtgcacgcggaaagcttgtcgggaatggcaccgcggaaatgtgaCAA---AATT--TT--T-ATCA----GTTAA--C--ATCGG--ACTC-----T-T---AGTA-----------AGCCGACAC------G-ATGTACAA-TGAGTGGACAA--CT-ACAA-ATTTCA--TCG-------TC---TAG-AC----A-C-AAGC-TAATG-C-A-AATATtgttttttctgcttgtttatttttttctatctgatgaattatattcaccccaatccgcccgcaccaaaatttttatcagttaacatcggactcttagtaagccgacacgatgtacaatgagtggacaactacaaatttcatcgtctagacacaagctaatgcaaatat
gi|13 : gggctgtgcgcgggtgcacgcggaaagcttgtcgggaatggcaccgcggaaatgtgatgcacggcgtactggtcggtcgattcgatgcaccgatccggaattccaaatttcggttcggttcaaaatttagtatcatatataaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttttacttttgattaaaacaatggaaagtagggcaaatcatctaccgtatgtacttgtaagatatacgctacaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctattgttttttctgcttgtttatttttttctatctgatgaattatattcaccccaatccgcccgcacACAA--TT-TTGA-ATATCAGTTCA-------AG---TGG-ACTCTTA-CTAAGC-TGACG-C-ATGGTA-CAGC-A-GT-G-------GA----CA---AC----TG-------CA-A--AAT------T-------CG--TCTACTAGA-CA-CAA-ACTGATGCAAA--ATCAA--CG-GT-GAA--A---CAGA----CATGAA----TGAA--T-CCAA--AAA------GAAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GTAACAC----C-TGTGA----CA--------A----TCTTT--TATGTTT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAA--------ATCTGA----A-GTGCCCAATTTTG----AA--TT-CATATAGT-CAGAG-------------TT-ATT-CTT----ATTTACTCTA-------TACCCAT---A-ATCCTT----TTAACAAT-AAG--TTTG--TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGTAA--TTA-TTGA--AGCATTA--TTAAGAGTTTT-TCCTC--A-TAAGGAA-----AGCT-------TT------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGAATCGA--TTCG----------------AAAA--AAATCG----------AATCGCAGCCATTTTG--AATCAAAATC
gi|14 : gagaaaacGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------A--A---AAT-TT--C--------------GA-T--ACAC--CG-aaaccgaaacgaattgaccctgaaatcgtcccaaccc
gi|14 : GCGATTCACTTCGTT----C--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GT----TCGGTTC-CAGATTT--AGT---ACCATG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AGA--G-CAAGGAAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----A----CCGTAT-GTACTTA--------A--A-AA--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACACTAT---ATT-A------CGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTATGT-CTGTGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--GGAAT-ATCA----GTTCC--A--AT-GG--ACTT-----A-T---ACTA-----------AGCCGACAC------G-ATGTACAG-AGAGTGTACAA--CT-GCAA-ATGTCA--TCG-------TC---TAG-AC----A-T-AAGC-TGATG-C-A-AATA-----------------CGGA----CA-TGA-----------T-CCA-A--AGT------TG-AAGTGTG-ATcgattcacttcgttcgattcgatgcaccgatccggaattccaaatttcgattcggttcggttccagatttagtaccatgtgtaaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctgaggtgttggaatactttacttttgattagagcaaggaaaagtaggacaaatcatctaccgtatgtacttaaaaattatacgctacaccgttcaaacactatattacgagttcaacaagttctatgtctgtgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttccaatggacttatactaagccgacacgatgtacagagagtgtacaactgcaaatgtcatcgtctagacataagctgatgcaaatacggacatgatccaaagttgaagtgtgatg
gi|15 : ggctgtgcggtgcaccgaaaatttcgatacaccGGGCT--GT-CGGTGCAC--CG------A--A---AAATTT--C--------------GAGT--GCAC--CG------C--G--ATT---C----ACTT---CG-----TTC-----G------GT----TC------g
gi|15 : GCGATTCACTTCGTT----C--G---G---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--AGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GTCGCGTT------CAAATT---AGT---ATCACG-TAGT-------AA--ACA--AC-A----A--AAAT-TGCGCGG--CAATG-AAACGG-TC--TGAG-GTGT-C--GG-AATACC---------------------AAA--G-CAATGGAAAGT---AGAC-CAA-ATAATCT----A-----CGTAT-GAACTTG--------T-TA-AA--------TTAT-GT-CT-A-C--A-C-GT------TAAAACA---C---ATT-A-------GA-GTTCAAC--AATT-T------CTATCTGCTGCGCATTTC-TTA-----A-A---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----G-TCA--A---T-GG--ACTCTAAATT-T---ACTA-----------AG-CGACGC-----AA-A-GTACAG-CGAGTGGACAA--CTGGCGA-ATTTCG--TCT-------AC---TAG-AC----A-T-AAGCTTGATGCC-A-AATATCAAT-A-GT-GAA--ACAGA----CA-TGGA----T-GA--T-CCA-A--AA-------TG-AAGgatgcaccgatccagaattccaaatttcgattcggtcgcgttcaaattagtatcacgtagtaaacaacaaaaattgcgcggcaatgaaacggtctgaggtgtcggaataccaaagcaatggaaagtagaccaaataatctacgtatgaacttgttaaattatgtctacacgttaaaacacattagagttcaacaatttctatctgctgcgcatttcttaaaaaaacacaatttgaatatcagtcaatggactctaaatttactaagcgacgcaaagtacagcgagtggacaactggcgaatttcgtctactagacataagcttgatgccaaatatcaatagtgaaacagacatggatgatccaaaatgaag
gi|16 : gggctgtcggtgcaccgaaaaatttcgagtgcaccAGGGCT--GTGCAGTGAAA--TG------A--A---AAT-TT--T--------------GA-T--GCAC--C
gi|16 : --G---A---TT--C--------------AA-T--GAAT--CA-AT--CT--GGAATT---C-CAAATTT---TG----ATTCTGTT-G------GT----TC------AAAATTT--AGC---ATCACT-T-GT-------CA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCAG--CAGCG-AGACGG-TC--TGTG-GTGT-G--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATA-AAA--T-CAATGGAAAGG---AGCA-CAA-GTCA---------CTACTGTA-----------------TGTA-AG--------TTAT-GCGCT-A-T--A-CCGT------TTAAGCA---A---ATT-A------GGG-GTTCAAC--AAGT-T------CTATataatctacttcatttgattcaatgaatcaatctggaattccaaattttgattctgttggttcaaaatttagcatcacttgtcaacaacaaaatggcagcagcgagacggtctgtggtgtgggaatactttacttttgataaaatcaatggaaaggagcacaagtcactactgtatgtaagttatgcgctataccgtttaagcaaattaggggttcaacaagttctat
gi|17 : agggctgtgcagtgaaatgaaaattttgatgcaccataatctacttcatttAGGGAT--GTGCGATTCACTTCG------TTTG---A---TT--C--------------GA-T--ACAC---A-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTT-----GTTGGCAGT----TT------GAAATTT--AGT---ATCACA-T-GA-------AA--ACA--AC-AAAACA--AA---CA-GTGG--CAACG-AGACGG-TC--T-------------G-AATACTTT-----AC--TTATG-ATTAAAA--A-CACTGGAAAGG---AGGG-CAAGATCATCT----AC---CCGTAT-GTAC
gi|18 : gtatatggtacacaactccta-C--AG-------------TG-A---CGT----ATATACACTT-------TTCATAT---C-TTTT------TTTACATT-CAG--TTTTT-TTT-TACCCT-TAA-ATTAAGGAA--TTA-TTGA--ACCATTACTT----AGTTTT-TTC------------A-----AG-TTT----GTT------TCAGTACCGGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--TT---A--------------AAAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCat
gi|19 : TTTACACTTATTTTTTTTTTTTT---T-TTTTTT----TTTACATCCAAG--TTTCT-TTT-T---TTATAATATAAAAAAAGGTTA-TTGATTAGTGTAA---TTAG--------TC-C--C-T-ATGAA-----AAGTCT----ATT-------------CAG------------------AA----------GA--TT---A--------------AATA--AAATCA----------AATTGCGG-CATTTTG--AATCGAAATCGtaaccgactctaacgaaccccgtatcgtcccagc
gi|2 : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------A--A---A---AT-----------------GA-T--GCAC--CG------C--G--ATTA--A-CATAATT---CG-----TTC-----GC-----GT----TC------CGAATaaccgaatcgaatgaaccctgaatcattccagcc
gi|2 : --CG------C--G---T---TC--C--------------GAAT--GCAC--CGGAT--CC--AGAATT---C-CAA-TTC---CG----ATTC-----G------GT----TCGGTTTCCAAATT---AGTT--ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AAAAATG-GCGG--CAACGGAAACGG-C----GAGTGGAT-C--G--AATA-------------------AAC-AAG--C-CAATGGAAAGT---AGGAACAA-AT-A-------ATCTACCGTATTGTACTTG--------TA-A-AT--------TTATTGTGCT-AGC--A-CCGT------T-AAACA---C---ATTTA------GGA-GTTCAAC--AAGTAT------CTACAT-TCTCGGAT--C-TTA---TGAAG---AAAACCA---AATT--TGAATTATCA----GTTCA--A--GT-GG--AA-C-----T-T---GCTAAATTACCTCATAGCCGACGC-----AA---GTACAGACGAGTGGGCAACCCT-GCGACATTAC---TCT-------AC---TAGAAC----A-TAAAGC-TGATG-CAA-AATAGTAAT-A-GTAG-AT-ACAGA----C--TGGA-----GAA--TACCA-A--AATGAATAGTG-AGCTGTG-ATACACTAT--CA-CAA-Ggcaccggatccagaattccaattccgattcggttcggtttccaaattagttatcacgtgtaaacaacaaaaaaatggcggcaacggaaacggcgagtggatcgaataaacaagccaatggaaagtaggaacaaataatctaccgtattgtacttgtaaatttattgtgctagcaccgttaaacacatttaggagttcaacaagtatctacattctcggatcttatgaagaaaaccaaatttgaattatcagttcaagtggaacttgctaaattacctcatagccgacgcaagtacagacgagtgggcaaccctgcgacattactctactagaacataaagctgatgcaaaatagtaatagtagatacagactggagaataccaaaatgaatagtgagctgtgatacactatcacaagtacaccctgtgacaatctatattatgttttaaaatttccctaatgaactcaagatttgaatgtgcccaattttgaagcttctaagtcagtgttcgtattcacacatatttttgttttaacattattgaagtattattttagagttttcctcaatgaggaaatttttttcagtatcaatttgaatcggatttcgaaaaaaatcgaaatcgcagcattttggcaatcgaaatcgacaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|2 : agggctgtgcggtgcaccgaaaatgatgcaccgcgattaacataattcgttTCTACTAGAACA-TAAAGCTGATGCAAAATAGTAA--TA-GTAG-AT-A---CAGA----C-TGGA-----GAA--TACCAA--AATGAATAGTGAGCTGTG-ATACACTATCAC-----AA-----GT-ACAC----CCTGTGA----CA--------A----TCTATATTATG-TT-TT--AAAATTTCC-C----TAATGAACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTGCCCAATTTTG----AAGCTT-C-TA-AGT-C--AG-------------TGTT---CGT----ATTCACA------------CATAT---T-TTTGTT----TTAACATT-A-----TTG--------------AA-GT------A--TTA-T--------------TTTAGAGTTTTCCTC-A--A-TGAGGAA-----A-TTT------TT------T-----TCAGTA--------------TCAATT--TGAATCGGATTTCG----------------AAAA--AAATCGA---------AATCGCAG-CATTTTGGCAATCGAAATCGtacaccctgtgacaatctatattatgttttaaaatttccctaatgaactcaagatttgaatgtgcccaattttgaagcttctaagtcagtgttcgtattcacacatatttttgttttaacattattgaagtattattttagagttttcctcaatgaggaaatttttttcagtatcaatttgaatcggatttcgaaaaaaatcgaaatcgcagcattttggcaatcgaaatcgacaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|20 : agggctgtgcggtgcaccgaaaatgatgcaccgcgattaacataattcgttcgcgttccgaatgcaccggatccagaattccaattccgattcggttcggtttccaaattagttatcacgtgtaaacaacaaaaaaatggcggcaacggaaacggcgagtggatcgaataaacaagccaatggaaagtaggaacaaataatctaccgtattgtacttgtaaatttattgtgctagcaccgttaaacacatttaggagttcaacaagtatctacattctcggatcttatgaagaaaaccaaatttgaattatcagttcaagtggaacttgctaaattacctcatagccgacgcaagtacagacgagtgggcaaccctgcgacattacGGCTTGGTGCGGTGCAC--CG---------GAAAA---TTTGC--------------GA-TGGGCAC--CG------C--ACGATT---C----ATGT---CG-----TTC-----G------GT----TC------acaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|20 : ------C--G---G---TT--C--------------GA-T--GCACG-CG-AT--CCCAGTAATT---C---AATTT---CGTTCGGTTC-----G------GT----TC------CAAATTT--AGT---ATCACGCT-GT-------AA--ACA--ACAA----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AAACGGTTC--TGAG-GTGT-C--GG-AAgatgcacgcgatcccagtaattcaatttcgttcggttcggttccaaatttagtatcacgctgtaaacaacaaaaatggcggcaacgaaacggttctgaggtgtcggaagta
gi|21 : ggcttggtgcggtgcaccggaaaatttgcgatgggcaccgcacgattcatgtcgttGGGCT--GTGTGGTGCAC--CG------A--A---AAT-TT--C--------------GA-T--gta
gi|21 : ---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--AGAATT---C-CAAATTT---GG----ATTT-----G------GT----TCGGTT--CAAATTT--AGTA--ATCACG-T-GTA------AA--ACA--AC-A----AACAA---T---CGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTG-----AG-AAAAC--------ACAATTTTG-Acaccgcaattcattgttttatttcgatgcaccgatccagaattccaaatttggatttggttcggttcaaatttagtaatcacgtgtaaaacaacaaacaatcggcaacgagacggtctgaggtgagaaaacacaattttgaa
gi|22 : gggctgtgtggtgcaccgaaaatttcgatcaccgcaattcattgttttat--AGCATTACTTATATTTTTTT-TTT-CTCA-CGAGGAA-----AGTTT------TC------T-----TCAGTA--------------TGAA-T--TGAATT-A--TTCA-ATAGATTAAAAAGAGAAAA--AAATCG----------TACCTCAG-TGTTTTG--AATCAAAATCa
gi|23 : ------C--G---A---TT--GA-------------GA-T--GCAC--CG-ATTGCC--AGAAT----C-CAAATTT----G----GTTC-----G-------T----TC------CAAAT----AGT---ACTACG-T-GG-------TA--ACA--ACAA----A--AA---TG-GCGT--CAAaaattgaatgaaccctgaatcgtcccagcc
gi|24 : aggtgcgcgtgcaaccgaaagatctcggcagccgcaattcacttgt-CAA-ATCAATGCAAA-TATCAAAACA-GT-G-A--ATTGCAAA----CATGAA----TGGG--T-CCAA--AAT------TAAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACA-----TTTGTGA----CA--------A----TTAATC-TATG-TT-TT--AA---TTTT-C----a
gi|25 : TAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----CAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CAAATTCTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AGTGACGTTTAATACTG-A---CGT----GTTTACACTT-------TTCATAT---C-TTT
gi|26 : aGAGTTTT-CCT-C--A-TGAGGAA-----AATTTT-------------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGAATCGA--TTTG-----------------AAA--AAATCG----------AATCGCAT-CATTTTG--AATCGAA
gi|27 : AA--TTA-TTGA--AGTATTA--TTTAGAGTTTA-CCT-C--A-TGAGTAA-----AGTTTT------T------T-----TCAACA--------------TCAA-T--TGAATCGA--TTTG-A--------------AAAA--AA-TCA----------AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAccgaatcgaatggaccctgaatc
gi|28 : gtTTT----GTT------T------CAGTA--------------TCAA-T--TGATTCAA--TTCGAA--------------AAAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTCTG--AATCGAAATCG
gi|29 : aaT-C--AA-------------TG-A---CGA----ATTTACACTT-------TTTGTAT---A--TATTT----TTTACA-A-AAG--TTTGTGTTTATACCCT-TTA-ATAAAGGAA--TTA-TTGA--AGCATTaattgaatgaaccctgaatcgtcccagcc
gi|3 : -T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TA-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGA-T--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGA-CAA-AT-A-------ATCTACCATAT-GTACTTG--------T--A-AG--------TTAT-ATGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTGTAT-CTGCACAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--AGTGT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCAACAT------G-ATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--TCT-------TC---TAG-AC----A-C-AAGC-TGATG-C-A-AATATCAAC-A-GC-G-A--ACGGA----CA-T---------GA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGCA-ATACACTAAA-CA-C
gi|3 : agggctgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAAC-A--T-G-A---TGTA----CAGCGAG----TGGA--C--------AAC------TGCAAATTTC-ATCTTCTAGA-CA-CAA-GCTGATGCAAA-TATCAA--CA-GC-G-A--A---CGGA----CATGA-----------T-CCAA--AAT------TGAAGTGCA-ATACACTA-AAC-----ACTAAATGT-ACAC-----TTGTGAAAATTA--------A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-GCATTTTTT----AA--TG-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACACTT-------TTCATAT---C--TTTTT----TTTACATG-AAG--TTTTT-CTT-TAACCT-TAA-ATAACGGAA--TTT-TTTA--AGCATTACTTT-----TTTT-TTC------------A-----AG-TTT----G-T------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--TTCG-A--------------ATAA--AAATCG----------AATTGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGtaaatgtacacttgtgaaaattaatctattatgttttaatttcctaatactcaagatttgaatgtggcattttttaatgctaagtcagtgacgtatttacacttttcatatcttttttttacatgaagtttttctttaaccttaaataacggaattttttaagcattactttttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaataaaaatcgaattgtagcattttgaatcgaaatcgaaccaaatgaaccctgaatcgtcccagccct
gi|30 : agggctgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaaacaacaaaatagcggcaacgagacggtctgaggtgatggaatactttacttttgattaaaacaatggaaagtaggacaaataatctaccatatgtacttgtaagttatatgctacaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctgtatctgcacatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgtggactcttactaagc-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATA-AAA--G-CAATGGAATGT---AGAA-CAA-AT-A-------ATCTACCATAT-GTACT----------TCTA-AA--------TTAT-ATGCT-A-aaccaaatgaaccctgaatcgtcccagccct
gi|31 : GGCG--GTGTGGTGCAT--CG------A--A---AAT-TT--C--------------GA-T--GCAC--TG------C--G--ATT---CACGTCTTT---CG----ATTC-----G------AT----
gi|32 : T-A-C--A-CCGT------TCTAACA---T---ATT-ACCATTACGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCgcacgggttcaaca
gi|34 : T--C-TTA---TGA-G---AAAACAG---AATT--TGACA-ATCA----GTTCA--A--GT-GA--A
gi|4 : TGCGGTGCAC--CGA-----A--A---A---TT--CG-------------GA-T--GCACCGCG-AT--C
gi|4 : c------C--G---A---TT--C--------------GAGT--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAAATT---CG----ATTC-----G------GT----TCGGTT--CAAATT---AGT---ATCA---T-AT-------AACTACA--AC-A----A-------TG-GCG----AACG-AGACGG-TC--TAAG-GTGT-TCAGG-AATG--TT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--AACAATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCA-------ATCTACCGTAT-GTACT-G---------GCA-AG--------ATAT-ACGCT-A-C--A-CC-T------TCAAACA---T---ATT-A------CGATGTTCAGC--AA-T-T------C-ATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--GGAAT-ATCA----GTTCA--A---T-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACAC------G-ATGTACAG--GAGTGGACAA--CT-GCAA-ATCTCA--TCG-------TC---TTG-AC----A-C-AAGC-TAATG-C-A-AATATCAAC-A--C-G-A--GCGGA----CA-T---------GA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTGTATGCACTAAA-Cacttcgttcgattcgagtgcaccgatccggaattccaaaattcgattcggttcggttcaaattagtatcatataactacaacaatggcgaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttacttttgattaaaaacaatggaaagtaggacaaatcaatctaccgtatgtactggcaagatatacgctacaccttcaaacatattacgatgttcagcaattcatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttcaatggactcttactaagccgacacgatgtacaggagtggacaactgcaaatctcatcgtcttgacacaagctaatgcaaatatcaacacgagcggacatgatccaaaattgaagtgtgtatgcactaaactctaaatgtacactctgtgacatttaaattatctattatcttattagttactacactacaagatgtgaatgtgcattttttaaattgctaagtcatgagatcgaagcgcattttatataaatcttttttttaattaagttttgtttacccttaaatacaggaattaattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatccaatcgtagcattttgatcgaaatcgaaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|4 : ctgcggtgcaccgaaaattcggatgcaccgcgatcacttcgttA----CA-GGAG----TGGA--C--------AAC------TGCAAATCTC-ATCGTCTTGA-CA-CAA-GCTAATGCAAA-TATCAA--CA--C-G-A--G---CGGA----CATGA-----------T-CCAA--AAT------TGAAGTGTGTATGCACTA-AACTCTAAAT-----GT-ACAC----TCTGTGA----CATTTAAATTA----TCTAT--TATC-TTATT--AG---TTAC-T------AC--ACTACAAG-------ATGTGA----ATGTG-CATTTTTTA----AA--TTGC-TA-AGT-C--A--------------TG-AGATCGA----A---GCGCAT-------TTTATATAAAT-CTTTTT----TTTA-ATT-AAG--TTT-T-GTT-TACCCT-TAA-ATACAGGAA--TTAATTGA--AGCATTACTT--AG-GTTGT-TTC------------A-----AGTTT-----GTT------T------CAGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--ATCG----------------AAAA--AAATCC----------AATCGTAG-CATTTTG---ATCGAAATCGtctaaatgtacactctgtgacatttaaattatctattatcttattagttactacactacaagatgtgaatgtgcattttttaaattgctaagtcatgagatcgaagcgcattttatataaatcttttttttaattaagttttgtttacccttaaatacaggaattaattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatccaatcgtagcattttgatcgaaatcgaaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|5 : ctgcggtgcaccgaaaattcggatgcaccgcgatcacttcgttcgattcgagtgcaccgatccggaattccaaaattcgattcggttcggttcaaattagtatcatataactacaacaatggcgaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttacttttgattaaaaacaatggaaagtaggacaaatcaatctaccgtatgtactggcaagatatacgctacaccttcaaacatattacgatgttcagcaattcatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttcaatggactcttactaagccgacacgatgtGGCT--GTGCGGTGCAT--CG---------G---AAATTT--T--------------GA-T--GCAC--CG------C--G--ATT---C----ACTT---TG-----TTC-----T------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCATG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AT---TG-GCAG--CAACT-TGATGG-TC---------------------ACTTT-----AC--TTTTG-AAA-AAAGAA-CAATGGAAAA------GA-CAA-GTCATCT----A----CTGTAT-GTAC--A--------TGCA-AG--------TTAT-GCGCT-A-C--A-CCGT------GCAAGTA---T---ATT-A------CGA-GTTCAAG--AAGT-TGAACTTCTTTGT-CTGCGCAT--C-TTT---TGA-ATTAAGAAAAC---AATT--TGAGT-ATCG----GTGCA--A--GT-GG--ACTC-----A-T---ACTA-----------AGCCGACAT------G-ATGTACAG-TGAGTGGACAA--AT-GCAA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGT-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--ACAGA----CA-TGAA----TGGA--T-CTA-A--AAT------TA-AAGTGTG-ATACACTACA-Caaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|5 : -AAGC-CGA---C-ATGATGT--AC-A-GT-G-A--GTGGA----CA---AA----TG------C---A--AAT------T-------TC-ATCTACTAGA-CA-CAA-GTCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CAGA----CATGAA----TGGA--T-CTAA--AAT------TAAAGTGTG-ATACACTA-CA------------------------CTTGTGA----CA--------A----T-TAA--TCTG-TT-TT--CA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGAATACATGTG-CAAATTTTG----AA--TT-A-TA-AGT-C--AA-------------AG-A---CTTATAAATTTACACTT-------CTCACAT---CTTTTTTT----TTTAAGTA-AAGTTTTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGTA--TTA-TTGA--AGCATTAC--TTAGTTTTTT-TTCTC--AGG-AGGGA-----AGTTT------TC------T-----TCAGTA----------------------TGAATCAA--TTC------------------AAA--AAATCG----------AATCGTAG-TGTTTTG--TATCGAAATCttgtgacaattaatctgttttcatttcctaatactcaagatttgaatacatgtgcaaattttgaattataagtcaaagacttataaatttacacttctcacatcttttttttttaagtaaagtttttgtttttacccttaaataaaggtattattgaagcattacttagttttttttctcaggagggaagttttcttcagtatgaatcaattcaaaaaatcgaatcgtagtgttttgtatcgaaatctaaccgaatgaatcctgaattgtc
gi|6 : ggctgtgcggtgcatcggaaattttgatgcaccgcgattcactttgttctgttcaaaatttagtatcatgtgtaaacaacaaattggcagcaacttgatggtcactttacttttgaaaaaagaacaatggaaaagacaagtcatctactgtatgtacatgcaagttatgcgctacaccgtgcaagtatattacgagttcaagaagttgaacttctttgtctgcgcatcttttgaattaagaaaacaatttgagtatcggtgcaagtggactcatact--AGT---ATCATA-T-AT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TAAG-GTGT-TCAGG-AATGTTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGG-CAA-ATCATCT----A----CCGTAT-GTACTTG--------T--A-AG--------T-AT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTAAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--GGAAT-ATCA----GTTAA--A--AT-GG--ACTC-----T-T---AGTA-----------AGCCGACAC------G-ATGTACAA-TGAGTGGACAA--CT-ACAA-ATTTCA--TCG-------TC---TAG-A-----A-C-AAGC-TAATG-C-A-AATATCAACAA-GC-G-A--GCGGA----CA-T---------GA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ACGCACTAAA-CA-Ctaaccgaatgaatcctgaattgtc
gi|6 : -AAGC-CGACA-C-G-A-TGT--AC-A-AT-G-A--GTGGA----CA------------A----CTACA--AAT------T-------TC-ATCGTCTAGA--A-CAA-GCTAATGCAAA-TATCAA--CAAGC-G-A--G---CGGA----CATGA-----------T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ACGCACTA-AAC-----ACTAAATGT-ACAC-----TTGTGA----AATTATT---A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TACT--ACT-CA-G-------ATGTGA----ATGTG-GCATTTTTT----AA--TG-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CAT----ATTTACACTT-------TTCATA------TTTTTT----TTTACATT-AAG--TTTGT-TC----CCCT-TAA-ATACAGGAA--TCA-TTGA--AGCATTAC--TTAG-GTTGT-TTC------------A-----AG-TTT----G-T------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--ATCG----------------AAAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGtaaatgtacacttgtgaaattattatctattatgttttaatttcctactactcagatgtgaatgtggcattttttaatgctaagtcagtgacatatttacacttttcatatttttttttacattaagtttgttccccttaaatacaggaatcattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaaccgaatcaaatgaaccctaatcgtcccagcc
gi|7 : agtatcatatataaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttttacttttgattaaaacaatggaaagtagggcaaatcatctaccgtatgtacttgtaagtatacgctacaccgttcaaacatattacgagttaagcaagttctatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttaaaatggactcttagt--GCAC--CG-AT--CC--AGAATTTTCC-TAAATTTTCACG----ATTCC----G------GT----TA------AAAATTT--AGCGCCATCAT--T-GTCGATATGAA--ACACTAC-A----A--AA---TG-GGGGTGCATCG-AGACGG-TCACT-AG-GCGTAT--GGTAATACTTT-----AAAATTCTGTATT-TA--------TGGATATTTAGAGGA-GAA-GTCATCT----ATC-ACCGTTT-GTACA-A--------TGTAGAGAAATGATCTTAT--CGCTTA-CTCA-TCGTGTTTTTCCAGGCA---TCTGATT-AT-----CGA-ATTCAACTAAAGT-T------TTATGT-CTGCGCATG-CATTAATGTAA-T---AAAACACCGAAATTAATGAGT-ATAATAAAGTTCATCA--GT-GGGGACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACAC-----AA-GT----AG--GAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--ACA-------AC---TTG-AC----AGC-AAGT-TGATG-C-A-AATATCAAC-AGGT-G-ATGACAGAC---CA-TTCACACTTGGAGTT-CCA-ACCATT------TG-AAGTGTG-ATACACTAGaaccgaatcaaatgaaccctaatcgtcccagcc
gi|7 : ctgcttgcagtggcaatcgaaaattttatgagcacatgtttcagcttcgaattcgatttcgcaaatcACTTGA-CAGCAA-GTTGATGCAAA-TATCAA--CAGGT-G-ATGA---CAGAC---CATTCACACTTGGAGTT-CCAACCATT------TGAAGTGTG-ATACACTA-GCT-----T------GTGACAC----CTT---------A--------A----T-TGT--TATG-TT-TTACAG---TTTCGCTAGATAAT--ACT-TGAGACGAGATATTTGA----ATGTG-cttgtgacaccttaattgttatgttttacagtttcgctagataatacttgagacgagatatttgaatgtgag
gi|8 : ctgcttgcagtggcaatcgaaaattttatgagcacatgtttcagcttcgaattcgatttcgcaaatcgcaccgatccagaattttcctaaattttcacgattccggttaaaaatttagcgccatcattgtcgatatgaaacactacaaaatgggggtgcatcgagacggtcactaggcgtatggtaatactttaaaattctgtatttatggatatttagaggagaagtcatctatcaccgtttgtacaatgtagagaaatgatcttatcgcttactcatcgtgtttttccaggcatctgattatcgaattcaactaaagttttatgtctgcgcatgcattaatgtaataaaacaccgaaattaatgagtataataaagttcatcagtggggactcttactaagccgacacaagtaggagtggacaactgcaaatttcaacaGCGATTCACTTCG------TTTG---A---TT--C--------------GG-T--ACAC--CA-AT--TC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----GTTT-----G------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCAAG-T-GT-------AA--ACA--AC-T----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AACACTTT-----AC--TTTTG-ATC-AAA--A-CAATGGGAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----A----CCGTAT-GTACTTG--------T--A-AG--------TTAT-GCGCT-A-C--T-CTGT------TTAAGCA---T---ATT-A------TGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTATGT-CTGCACAT--C-TTA---TGA-G---AAAACAC---AATT-------------------CA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGT------G-ATGTACCG-TGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCG--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AATC-TGATG-C-A-AATTTCAAC-A-GT-G-A--ACAGA----CA-TAAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ATTCACTACA-CA-ag
gi|8 : gctgtgcggtgaccatgcaccaaaaattttgatgcacc----CG-TGAG----TGGA--C--------AAC------TGCAAATTTC-GTCTACTAGA-CA-CAA-TCTGATGCAAA-TTTCAA--CA-GT-G-A--A---CAGA----CATAAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATTCACTA-CAC-----A------GT-ACACTTGACTAGTGA----CA--------A----TTTAT--TATG-TT-CT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CTAAGTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---TGT----ATATACACTT-------TTCAAAT---C-TGTTTTAAAATTTACATT-AAG--TTTTT-TTT-gtacacttgactagtgacaatttattatgttctaatttcctaatactcaagatttgaatgtgctaagtttgaattctaagtcagtgatgtatatacacttttcaaatctgttttaaaatttacattaagtttttttt
gi|9 : gctgtgcggtgaccatgcaccaaaaattttgatgcaccgcgattcacttcgtttgattcggtacaccaattcggaattccaaatttcggtttggttcaaaatttagtatcaagtgtaaacaactaaatggcggcaacgagacggtctgaggtgttggaacactttacttttgatcaaaacaatgggaagtaggacaaatcatctaccgtatgtacttgtaagttatgcgctactctgtttaagcatattatgagttcaacaagttctatgtctgcacatcttatgagaaaacacaattcaagtggactcttactaagccgacgtgatgtacG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATACTTT-----AC--GTTTG-ATT-AAA--A-ACATGGAAATT---AGGA-CAC-AT
gi|9 : AT-ACGCT-A-C--AACCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CGGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GC--ACTC-----TATATAACTA-----------AG-CGACAC------G-ATGTACAG-TGAGTTGACAA--AT-GACA-ATTTCA--TCTTTAAAAGACTTTTAG-AC----A-C-AAGC-CGTTG-C-A-AATATC-----------A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTTTG-ATacgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatgacaatttcatctttaaaagacttttagacacaagccgttgcaaatatcaacggacatgaatggatccaaaattgaagtttgataatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|9 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacTAGA-CA-CAA-GCCGTTGCAAA-TATCAA--C---------------GGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTTTG-ATA-A-TA-CAA-----AAT----GT-ACAC-----TTGTGA----CA--------A----T------------------AA---T----C----TATT--A---------------TTTGA----ATGTG-TCATTTTTTTTTTAA--TG-C-TA-ATTTC--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACACTT-------TTCAT-T---C-TTTTTT----TTTACATT-AAT--TTT-T-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--TTA-TTGA--ACCATTACTT----AGTTTT-TTC------------A-----AG-TTT----G-T------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--TTCG-----------------AAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGaatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GTGCACCGAAATTTTTGGTGCATCACGATTTATACCATTCGATTCGA
Unaligned ( gi|35 ): GAATGGACCCTGAATCGTCCCAGCCCTACTC
Unaligned ( gi|36 ): ATGAACCCTGAATCGTCCCAGCCCTAA
Alignments
lowQualScore : 11 33333333333333333 11111111111111 11111 2222222 1111111 1111 222222222222 3333333333333 11111111 111 11111111111 1111111111111 111111111111111111 333333333333 22222 11111111 1111111 1111 1111111111111 111 22222222 7777777777777777777777777777777777777 11111111111111 4444444444444444 1111111111
lowQualScore : 55 22 33333333333333333 22 44444444444444 5 22 44 55 22 22 3 555 33 333 88888 11111 888888 4444 2222222 555 999 333 2 0000000 33 33 4 5555 33 777 2 33 2 2 33 2 5555 2 55555 66 2 2 4444 444 2 2 1 999999999999 2 7777777777777 2 00000000 2 2 2 33 5 777777 444 444 2 999999 2 33 2 777777 2 66 2 6666 2 555 444 444 2 5555 33 33 2 33 7777777 000 33333333333 0 1 9999999 99 33 2 2 33 7777777777777 2 8888 2 4 2 2 2 4 444 2 22 2 2 555 6666 777777777777777777 2 22 555555 8 1 2 1 2 2 2 3 44 6 3 3 999999 9999 999999 44 3 44 888888 3 3 444444444444 6 33333 6666 88888888 6666 9 66 2 2 33 555 2 6666 44 3 0000000 6666 6 1 4444 44 3 3 3 5 33 5555555555555 2 888 6666 9999999 999999 6666 3 44 000 3 3 3 44 3 44444444 33 2 3333333333333333333333333333333333333 66666 55555555555555 2 33 1 33 0000000000000000 33 4444444444 2 33
lowQualScore : .. .. ................. .. .............. . .. .. .. .. .. . ... .. ... ..... ..... ...... .... ....... ... ... ... . ....... .. .. . .... .. ... . .. . . .. . .... . ..... .. . . .... ... . . . ............ . ............. . ........ . . . .. . ...... ... ... . ...... . .. . ...... . .. . .... . ... ... ... . .... .. .. . .. ....... ... ........... . . ....... .. .. . . .. ............. . .... . . . . . . ... . .. . . ... .... .................. . .. ...... . . . . . . . . .. . . . ...... .... ...... .. . .. ...... . . ............ . ..... .... ........ .... . .. . . .. ... . .... .. . ....... .... . . .... .. . . . . .. ............. . ... .... ....... ...... .... . .. ... . . . .. . ........ .. . ..................................... ..... .............. . .. . .. ................ .. .......... . ..
lowQualScore : 00 99 33333333333333333 55 33333333333333 5 44 33 22 88 99 2 888 55 777 99999 88888 222222 5555 3333333 888 444 333 4 0000000 22 22 7 0000 22 444 4 22 5 2 11 2 8888 1 66666 11 2 4 5555 111 4 4 7 777777777777 7 1111111111111 9 44444444 5 4 4 44 0 222222 444 444 5 777777 5 44 5 222222 9 88 9 6666 9 000 777 333 7 7777 77 77 7 77 6666666 000 66666666666 7 4 3333333 88 77 7 7 77 5555555555555 5 8888 5 4 2 2 2 4 222 2 88 2 2 888 2222 000000000000000000 0 88 888888 0 8 1 0 1 2 9 1 22 2 1 1 777777 6666 222222 22 1 22 888888 1 1 888888888888 2 66666 5555 88888888 5555 1 88 9 9 99 000 9 1111 22 1 0000000 5555 2 8 2222 66 3 3 3 7 99 7777777777777 9 999 5555 3333333 444444 5555 1 22 888 1 3 3 22 1 55555555 99 9 1111111111111111111111111111111111111 77777 77777777777777 7 77 9 77 5555555555555555 77 3333333333 7 77
consensus : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------C--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GT----TC------CAAATTT--AGT---ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-C--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----ATCTACCGTAT-GTACTTG--------TGTA-AG--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGCG-------ATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ATNCACTAGA-CA-CAA-GCCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CGGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACAC----CTTGTGA----CA--------A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACAC-------TTTTCATAT---C-TTTTTT----TTTACAT-TAAG--TTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--TTA-TTGAAGCATTACTTTTAGAGT--TTT-TTC-C--A-T-AGGAA-----AGTTTT----GTT------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGANTCGA--TTCG-A--------------AAAA--AAATCG----------AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAAATCGTCCCAGCC
Reference ( family-3214 ) : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------C--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GT----TC------CAAATTT--AGT---ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-C--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----ATCTACCGTAT-GTACTTG--------TGTA-AG--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGCG-------ATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ATNCACTAGA-CA-CAA-GCCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CGGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACAC----CTTGTGA----CA--------A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACAC-------TTTTCATAT---C-TTTTTT----TTTACAT-TAAG--TTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--TTA-TTGAAGCATTACTTTTAGAGT--TTT-TTC-C--A-T-AGGAA-----AGTTTT----GTT------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGANTCGA--TTCG-A--------------AAAA--AAATCG----------AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAAATCGTCCCAGCC
gi|1 : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CA------T--G---A---TT--C--------------AA-T--GCAC--CG-AT--CC--AGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------TT----TC------CAAATTTTAAGC---ATCATG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGATGG-TC--TGAG-GTTT-C--AG-AATACTTTCAATTAC--TTTTG-ATT-AAA--G-CAAGGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCTTATGATCTACCGTAT-GTACTTGACACTACTTGTA-AG--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTATCT-CTGCGCAT--C-TTA---TGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGCGATGTAGTATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTTG--CCT-------AA---TAG-AC----A-C-AAGC-TGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--AGAGAGTGTCA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AA-------TG-AAGTGTG-ATANTATAGA-CA-CAT-GCTGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CAGAGTGTCATGAA----TGGA--T-CCAA--CA-------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACACCTG-CTTGTGA----CA--------A----TCTTT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-T---CGT----ATTTACA-----------TCATAT---A-TTTTTT----TTTACAA-TAAG--TTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAGGTAA--TTA-TTGAAGCATTA--TTTAGAG---TTT-TCC-T--A-T-TGGCAGCATTAGTTTTTAGAGTTCTCTCCT-----TCA-TAGAAAAGTTTTGTTTTCAG-TGATCAATTGA--ATCG-ATTCGG---------AAAAATAAATCGCAAAAAATCGAATTGCAG-CATTTTG--AATCG-AATCGTCCCAGCC
gi|10 : G-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATACTTT-----AC--GTTTG-ATT-AAA--A-ACATGGAAATT---AGGA-CAC-AT
gi|10 : AT-ACGCT-A-C--AACCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CGGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GC--ACTC-----TATATAACTA-----------AG-CGACACG-------ATGTACAG-TGAGTTGACAA--AT-GGCA-ATTTCA--TCTTTAAAAGACTTTTAG-AC----A-C-AAGC-CGTTG-C-A-AATATC-----------A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTTTG-ATacgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatggcaatttcatctttaaaagacttttagacacaagccgttgcaaatatcaacggacatgaatggatccaaaattgaagtttgataatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|10 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacTAGA-CA-CAA-GCCGTTGCAAA-TATCAA--C---------------GGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTTTG-ATA-A-TA-CAA-----AAT----GT-ACAC-----TTGTGA----CA--------A----T------------------AA---T----C----TATT--A---------------TTTGA----ATGTG-TCATTTTTTTTTTAA--TG-C-TA-ATTTC--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACAC-------TTTTCAT-T---C-TTTTTT----TTTACAT-TAAT--TTT-T-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--TTA-TTGAACCATTACTT----AGT--TTT-TTC------------A-----AG-TTT----G-T------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--TTCG-----------------AAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGaatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|11 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacatacgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatggcaatttcatctttaaaagactttCGATGCAC--CG------C--G---A---TT--CACTTAGTTCATTTCGA-T--GCAC--CG-AT--CT--GGAATC---C-CAAATTT---TG----ATTCAGTTCG------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCACA-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--TAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATGCTTT-----AC--TTTTG-ATT-GAA--A-CAATGGAAAAT---AGGA-CAA-ATC--------ACCTACTGTAT-GTACTT---------T--------------TTAT-ACGTA-A-C--A-CCGT------TTAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------ATATGT-CTGTGTAT--C-TTA---TGA-A---AAAACGC---AA-------------------TTCA--A--GT-GG--ACTG-----T-T---ACTA-----------AACCGACACG-------ATGCACAG-TGAGTGGACAA--CT-GCAA-CTTTGA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C----------AC-A-GT-G-A--ACAGA----CA-TGAA----TGGA--T-TCA-A--AAT------GC-AAGTGTG-ATACACTACA-CA-aacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|11 : gtgtggtgcaccgaaaatttT-------AC---TAA-ACCG--A-C-A----CGATG-C-A---------C-A-GT-G-A--GTGGA----CA-------------------------AC------TGCAACTTTG-ATCTACTAGA-CA-CAA-GCCGATGCA-----------CA-GT-G-A--A---CAGA----CATGAA----TGGA--T-TCAA--AAT------GCAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACAC-----TTGTGA----CA--------ACTAATTTAT--CATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--AAT-CAAG-------ATTTGA----ATTTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-TGT-C--AG-------------TG-A---Cgtacacttgtgacaactaatttatcatgttttaatttcctaataatcaagatttgaatttgccaattttgaattctatgtcagtgac
gi|12 : gtgtggtgcaccgaaaatttcgatgcaccgcgattcacttagttcatttcgatgcaccgatctggaatcccaaattttgattcagttcggttcaaaatttagtatcacatgtaaacaacaaaatggcggtaacgagacggtctgaggtgttggaatgctttacttttgattgaaacaatggaaaataggacaaatcacctactgtatgtactttttatacgtaacaccgtttaaacatattacgagttcagcaagttatatgtctgtgtatcttatgaaaaaacgcaattcaagtggactgtT--GCACGGCGTAC--TGGTCGGTC--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----GTTC-----G------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCATA-T-AT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TAAG-GTGT-TCAGG-AATGTTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGG-CAA-ATC--------ATCTACCGTAT-GTACT----------TGTA-AG--------ATAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTAT
gi|12 : gggctgtgcgcgggtgcacgcggaaagcttgtcgggaatggcaccgcggaaatgtgaCAA---AATT--TT--T-ATCA----GTTAA--C--ATCGG--ACTC-----T-T---AGTA-----------AGCCGACACG-------ATGTACAA-TGAGTGGACAA--CT-ACAA-ATTTCA--TCG-------TC---TAG-AC----A-C-AAGC-TAATG-C-A-AATATtgttttttctgcttgtttatttttttctatctgatgaattatattcaccccaatccgcccgcaccaaaatttttatcagttaacatcggactcttagtaagccgacacgatgtacaatgagtggacaactacaaatttcatcgtctagacacaagctaatgcaaatat
gi|13 : gggctgtgcgcgggtgcacgcggaaagcttgtcgggaatggcaccgcggaaatgtgatgcacggcgtactggtcggtcgattcgatgcaccgatccggaattccaaatttcggttcggttcaaaatttagtatcatatataaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttttacttttgattaaaacaatggaaagtagggcaaatcatctaccgtatgtacttgtaagatatacgctacaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctattgttttttctgcttgtttatttttttctatctgatgaattatattcaccccaatccgcccgcacACAA--TT-TTGA-ATATCAGTTCA-------AG---TGG-ACTCTTA-CTAAGC-TGACG-C-ATGGTA-CAGC-A-GT-G-------GA----CA---AC----TG-------CA-A--AAT------T-------CG--TCTACTAGA-CA-CAA-ACTGATGCAAA--ATCAA--CG-GT-GAA--A---CAGA----CATGAA----TGAA--T-CCAA--AAA------GAAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GTAACAC----C-TGTGA----CA--------A----TCTTT--TATGTTT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAA--------ATCTGA----A-GTGCCCAATTTTG----AA--TT-CATATAGT-CAGAG-------------TT-ATT-CTT----ATTTACTC-------TATACCCAT---A-ATCCTT----TTAACAA-TAAG--TTTG--TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGTAA--TTA-TTGAAGCATTA--TTAAGAGT--TTT-TCCTC--A-TAAGGAA-----AGCT-------TT------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGAATCGA--TTCG----------------AAAA--AAATCG----------AATCGCAGCCATTTTG--AATCAAAATC
gi|14 : gagaaaacGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------A--A---AAT-TT--C--------------GA-T--ACAC--CG-aaaccgaaacgaattgaccctgaaatcgtcccaaccc
gi|14 : GCGATTCACTTCGTT----C--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GT----TCGGTTC-CAGATTT--AGT---ACCATG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AGA--G-CAAGGAAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----A----CCGTAT-GTACTTA--------A--A-AA--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACACTAT---ATT-A------CGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTATGT-CTGTGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--GGAAT-ATCA----GTTCC--A--AT-GG--ACTT-----A-T---ACTA-----------AGCCGACACG-------ATGTACAG-AGAGTGTACAA--CT-GCAA-ATGTCA--TCG-------TC---TAG-AC----A-T-AAGC-TGATG-C-A-AATA-----------------CGGA----CA-TGA-----------T-CCA-A--AGT------TG-AAGTGTG-ATcgattcacttcgttcgattcgatgcaccgatccggaattccaaatttcgattcggttcggttccagatttagtaccatgtgtaaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctgaggtgttggaatactttacttttgattagagcaaggaaaagtaggacaaatcatctaccgtatgtacttaaaaattatacgctacaccgttcaaacactatattacgagttcaacaagttctatgtctgtgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttccaatggacttatactaagccgacacgatgtacagagagtgtacaactgcaaatgtcatcgtctagacataagctgatgcaaatacggacatgatccaaagttgaagtgtgatg
gi|15 : ggctgtgcggtgcaccgaaaatttcgatacaccGGGCT--GT-CGGTGCAC--CG------A--A---AAATTT--C--------------GAGT--GCAC--CG------C--G--ATT---C----ACTT---CG-----TTC-----G------GT----TC------g
gi|15 : GCGATTCACTTCGTT----C--G---G---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--AGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GTCGCGTT------CAAATT---AGT---ATCACG-TAGT-------AA--ACA--AC-A----A--AAAT-TGCGCGG--CAATG-AAACGG-TC--TGAG-GTGT-C--GG-AATACC---------------------AAA--G-CAATGGAAAGT---AGAC-CAA-ATAATCT----A-----CGTAT-GAACTTG--------T-TA-AA--------TTAT-GT-CT-A-C--A-C-GT------TAAAACA---C---ATT-A-------GA-GTTCAAC--AATT-T------CTATCTGCTGCGCATTTC-TTA-----A-A---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----G-TCA--A---T-GG--ACTCTAAATT-T---ACTA-----------AG-CGACGCA-------AAGTACAG-CGAGTGGACAA--CTGGCGA-ATTTCG--TCT-------AC---TAG-AC----A-T-AAGCTTGATGCC-A-AATATCAAT-A-GT-GAA--ACAGA----CA-TGGA----T-GA--T-CCA-A--AA-------TG-AAGgatgcaccgatccagaattccaaatttcgattcggtcgcgttcaaattagtatcacgtagtaaacaacaaaaattgcgcggcaatgaaacggtctgaggtgtcggaataccaaagcaatggaaagtagaccaaataatctacgtatgaacttgttaaattatgtctacacgttaaaacacattagagttcaacaatttctatctgctgcgcatttcttaaaaaaacacaatttgaatatcagtcaatggactctaaatttactaagcgacgcaaagtacagcgagtggacaactggcgaatttcgtctactagacataagcttgatgccaaatatcaatagtgaaacagacatggatgatccaaaatgaag
gi|16 : gggctgtcggtgcaccgaaaaatttcgagtgcaccAGGGCT--GTGCAGTGAAA--TG------A--A---AAT-TT--T--------------GA-T--GCAC--C
gi|16 : --G---A---TT--C--------------AA-T--GAAT--CA-AT--CT--GGAATT---C-CAAATTT---TG----ATTCTGTT-G------GT----TC------AAAATTT--AGC---ATCACT-T-GT-------CA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCAG--CAGCG-AGACGG-TC--TGTG-GTGT-G--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATA-AAA--T-CAATGGAAAGG---AGCA-CAA-GTCA---------CTACTGTA-----------------TGTA-AG--------TTAT-GCGCT-A-T--A-CCGT------TTAAGCA---A---ATT-A------GGG-GTTCAAC--AAGT-T------CTATataatctacttcatttgattcaatgaatcaatctggaattccaaattttgattctgttggttcaaaatttagcatcacttgtcaacaacaaaatggcagcagcgagacggtctgtggtgtgggaatactttacttttgataaaatcaatggaaaggagcacaagtcactactgtatgtaagttatgcgctataccgtttaagcaaattaggggttcaacaagttctat
gi|17 : agggctgtgcagtgaaatgaaaattttgatgcaccataatctacttcatttAGGGAT--GTGCGATTCACTTCG------TTTG---A---TT--C--------------GA-T--ACAC---A-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTT-----GTTGGCAGT----TT------GAAATTT--AGT---ATCACA-T-GA-------AA--ACA--AC-AAAACA--AA---CA-GTGG--CAACG-AGACGG-TC--T-------------G-AATACTTT-----AC--TTATG-ATTAAAA--A-CACTGGAAAGG---AGGG-CAAGATCATCT----AC---CCGTAT-GTAC
gi|18 : gtatatggtacacaactccta-C--AG-------------TG-A---CGT----ATATACAC-------TTTTCATAT---C-TTTT------TTTACAT-TCAG--TTTTT-TTT-TACCCT-TAA-ATTAAGGAA--TTA-TTGAACCATTACTT----AGT--TTT-TTC------------A-----AG-TTT----GTT------TCAGTACCGGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--TT---A--------------AAAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCat
gi|19 : TTTACACTTATTTTTTTTTTTTT---T-TTTTTT----TTTACATCCAAG--TTTCT-TTT-T---TTATAATATAAAAAAAGGTTA-TTGA----------TTAGTGTAATTA-GTC-C--C-T-ATGAA-----AAGTCT----A--------T-----TCAG------------------AA----------GA--TT---A--------------AATA--AAATCA----------AATTGCGG-CATTTTG--AATCGAAATCGtaaccgactctaacgaaccccgtatcgtcccagc
gi|2 : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------A--A---A---AT-----------------GA-T--GCAC--CG------C--G--ATTA--A-CATAATT---CG-----TTC-----GC-----GT----TC------CGAATaaccgaatcgaatgaaccctgaatcattccagcc
gi|2 : --CG------C--G---T---TC--C--------------GAAT--GCAC--CGGAT--CC--AGAATT---C-CAA-TTC---CG----ATTC-----G------GT----TCGGTTTCCAAATT---AGTT--ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AAAAATG-GCGG--CAACGGAAACGG-C----GAGTGGAT-C--G--AATA-------------------AAC-AAG--C-CAATGGAAAGT---AGGAACAA-AT-A-------ATCTACCGTATTGTACTTG--------TA-A-AT--------TTATTGTGCT-AGC--A-CCGT------T-AAACA---C---ATTTA------GGA-GTTCAAC--AAGTAT------CTACAT-TCTCGGAT--C-TTA---TGAAG---AAAACCA---AATT--TGAATTATCA----GTTCA--A--GT-GG--AA-C-----T-T---GCTAAATTACCTCATAGCCGACGCA-------A-GTACAGACGAGTGGGCAACCCT-GCGACATTAC---TCT-------AC---TAGAAC----A-TAAAGC-TGATG-CAA-AATAGTAAT-A-GTAG-AT-ACAGA----C--TGGA-----GAA--TACCA-A--AATGAATAGTG-AGCTGTG-ATACACTAT--CA-CAA-Ggcaccggatccagaattccaattccgattcggttcggtttccaaattagttatcacgtgtaaacaacaaaaaaatggcggcaacggaaacggcgagtggatcgaataaacaagccaatggaaagtaggaacaaataatctaccgtattgtacttgtaaatttattgtgctagcaccgttaaacacatttaggagttcaacaagtatctacattctcggatcttatgaagaaaaccaaatttgaattatcagttcaagtggaacttgctaaattacctcatagccgacgcaagtacagacgagtgggcaaccctgcgacattactctactagaacataaagctgatgcaaaatagtaatagtagatacagactggagaataccaaaatgaatagtgagctgtgatacactatcacaagtacaccctgtgacaatctatattatgttttaaaatttccctaatgaactcaagatttgaatgtgcccaattttgaagcttctaagtcagtgttcgtattcacacatatttttgttttaacattattgaagtattattttagagttttcctcaatgaggaaatttttttcagtatcaatttgaatcggatttcgaaaaaaatcgaaatcgcagcattttggcaatcgaaatcgacaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|2 : agggctgtgcggtgcaccgaaaatgatgcaccgcgattaacataattcgttTCTACTAGAACA-TAAAGCTGATGCAAAATAGTAA--TA-GTAG-AT-A---CAGA----C-TGGA-----GAA--TACCAA--AATGAATAGTGAGCTGTG-ATACACTATCAC-----AA-----GT-ACAC----CCTGTGA----CA--------A----TCTATATTATG-TT-TT--AAAATTTCC-C----TAATGAACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTGCCCAATTTTG----AAGCTT-C-TA-AGT-C--AG-------------TGTT---CGT----ATTCACA------------CATAT---T-TTTGTT----TTAACAT-TA-----TTG--------------AA-GT------A--TTA-T------------TTTAGAGT--TTTCCTC-A--A-TGAGGAA-----A-TTT------TT------T-----TCAGTA--------------TCAATT--TGAATCGGATTTCG----------------AAAA--AAATCGA---------AATCGCAG-CATTTTGGCAATCGAAATCGtacaccctgtgacaatctatattatgttttaaaatttccctaatgaactcaagatttgaatgtgcccaattttgaagcttctaagtcagtgttcgtattcacacatatttttgttttaacattattgaagtattattttagagttttcctcaatgaggaaatttttttcagtatcaatttgaatcggatttcgaaaaaaatcgaaatcgcagcattttggcaatcgaaatcgacaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|20 : agggctgtgcggtgcaccgaaaatgatgcaccgcgattaacataattcgttcgcgttccgaatgcaccggatccagaattccaattccgattcggttcggtttccaaattagttatcacgtgtaaacaacaaaaaaatggcggcaacggaaacggcgagtggatcgaataaacaagccaatggaaagtaggaacaaataatctaccgtattgtacttgtaaatttattgtgctagcaccgttaaacacatttaggagttcaacaagtatctacattctcggatcttatgaagaaaaccaaatttgaattatcagttcaagtggaacttgctaaattacctcatagccgacgcaagtacagacgagtgggcaaccctgcgacattacGGCTTGGTGCGGTGCAC--CG---------GAAAA---TTTGC--------------GA-TGGGCAC--CG------C--ACGATT---C----ATGT---CG-----TTC-----G------GT----TC------acaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|20 : ------C--G---G---TT--C--------------GA-T--GCACG-CG-AT--CCCAGTAATT---C---AATTT---CGTTCGGTTC-----G------GT----TC------CAAATTT--AGT---ATCACGCT-GT-------AA--ACA--ACAA----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AAACGGTTC--TGAG-GTGT-C--GG-AAgatgcacgcgatcccagtaattcaatttcgttcggttcggttccaaatttagtatcacgctgtaaacaacaaaaatggcggcaacgaaacggttctgaggtgtcggaagta
gi|21 : ggcttggtgcggtgcaccggaaaatttgcgatgggcaccgcacgattcatgtcgttGGGCT--GTGTGGTGCAC--CG------A--A---AAT-TT--C--------------GA-T--gta
gi|21 : ---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--AGAATT---C-CAAATTT---GG----ATTT-----G------GT----TCGGTT--CAAATTT--AGTA--ATCACG-T-GTA------AA--ACA--AC-A----AACAA---T---CGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTG-----AG-AAAAC--------ACAATTTTG-Acaccgcaattcattgttttatttcgatgcaccgatccagaattccaaatttggatttggttcggttcaaatttagtaatcacgtgtaaaacaacaaacaatcggcaacgagacggtctgaggtgagaaaacacaattttgaa
gi|22 : gggctgtgtggtgcaccgaaaatttcgatcaccgcaattcattgttttatAGCATTACTTATATTTT--TTT-TTT-CTCA-CGAGGAA-----AGTTTT------C------T-----TCAGTA--------------TGAA-T--TGAATT-A--TTCA-ATAGATTAAAAAGAGAAAA--AAATCG----------TACCTCAG-TGTTTTG--AATCAAAATCa
gi|23 : ------C--G---A---TT--GA-------------GA-T--GCAC--CG-ATTGCC--AGAAT----C-CAAATTT----G----GTTC-----G-------T----TC------CAAAT----AGT---ACTACG-T-GG-------TA--ACA--ACAA----A--AA---TG-GCGT--CAAaaattgaatgaaccctgaatcgtcccagcc
gi|24 : aggtgcgcgtgcaaccgaaagatctcggcagccgcaattcacttgt-CAA-ATCAATGCAAA-TATCAAAACA-GT-G-A--ATTGCAAA----CATGAA----TGGG--T-CCAA--AAT------TAAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACA-----TTTGTGA----CA--------A----TTAATC-TATG-TT-TT--AA---TTTT-C----a
gi|25 : TAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----CAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CAAATTCTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AGTGACGTTTAATACTG-A---CGT----GTTTACAC-------TTTTCATAT---C-TTT
gi|26 : aGAGT--TTT-CCT-C--A-TGAGGAA-----AATTTT-------------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGAATCGA--TTTG-----------------AAA--AAATCG----------AATCGCAT-CATTTTG--AATCGAA
gi|27 : AA--TTA-TTGAAGTATTA--TTTAGAGT--TTA-CCT-C--A-TGAGTAA-----AGTTTT------T------T-----TCAACA--------------TCAA-T--TGAATCGA--TTTG-A--------------AAAA--AA-TCA----------AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAccgaatcgaatggaccctgaatc
gi|28 : gtTTT----GTT------T------CAGTA--------------TCAA-T--TGATTCAA--TTCGAA--------------AAAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTCTG--AATCGAAATCG
gi|29 : aaT-C--AA-------------TG-A---CGA----ATTTACAC-------TTTTTGTAT---A--TATTT----TTTACA--AAAG--TTTGTGTTTATACCCT-TTA-ATAAAGGAA--TTA-TTGAAGCATTaattgaatgaaccctgaatcgtcccagcc
gi|3 : -T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TA-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGA-T--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGA-CAA-AT-A-------ATCTACCATAT-GTACTTG--------T--A-AG--------TTAT-ATGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTGTAT-CTGCACAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--AGTGT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCAACATG-------ATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--TCT-------TC---TAG-AC----A-C-AAGC-TGATG-C-A-AATATCAAC-A-GC-G-A--ACGGA----CA-T---------GA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGCA-ATACACTAAA-CA-C
gi|3 : agggctgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAAC-A--T-G-A---TGTA----CAGCGAG----TGGA--C--------AAC------TGCAAATTTC-ATCTTCTAGA-CA-CAA-GCTGATGCAAA-TATCAA--CA-GC-G-A--A---CGGA----CATGA-----------T-CCAA--AAT------TGAAGTGCA-ATACACTA-AAC-----ACTAAATGT-ACAC-----TTGTGAAAATTA--------A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-GCATTTTTT----AA--TG-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACAC-------TTTTCATAT---C--TTTTT----TTTACAT-GAAG--TTTTT-CTT-TAACCT-TAA-ATAACGGAA--TTT-TTTAAGCATTACTTT-----T--TTT-TTC------------A-----AG-TTT----G-T------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--TTCG-A--------------ATAA--AAATCG----------AATTGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGtaaatgtacacttgtgaaaattaatctattatgttttaatttcctaatactcaagatttgaatgtggcattttttaatgctaagtcagtgacgtatttacacttttcatatcttttttttacatgaagtttttctttaaccttaaataacggaattttttaagcattactttttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaataaaaatcgaattgtagcattttgaatcgaaatcgaaccaaatgaaccctgaatcgtcccagccct
gi|30 : agggctgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaaacaacaaaatagcggcaacgagacggtctgaggtgatggaatactttacttttgattaaaacaatggaaagtaggacaaataatctaccatatgtacttgtaagttatatgctacaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctgtatctgcacatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgtggactcttactaagc-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATA-AAA--G-CAATGGAATGT---AGAA-CAA-AT-A-------ATCTACCATAT-GTACT----------TCTA-AA--------TTAT-ATGCT-A-aaccaaatgaaccctgaatcgtcccagccct
gi|31 : GGCG--GTGTGGTGCAT--CG------A--A---AAT-TT--C--------------GA-T--GCAC--TG------C--G--ATT---CACGTCTTT---CG----ATTC-----G------AT----
gi|32 : T-A-C--A-CCGT------TCTAACA---T---ATT-ACCATTACGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCgcacgggttcaaca
gi|34 : T--C-TTA---TGA-G---AAAACAG---AATT--TGACA-ATCA----GTTCA--A--GT-GA--A
gi|4 : TGCGGTGCAC--CGA-----A--A---A---TT--CG-------------GA-T--GCACCGCG-AT--C
gi|4 : c------C--G---A---TT--C--------------GAGT--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAAATT---CG----ATTC-----G------GT----TCGGTT--CAAATT---AGT---ATCA---T-AT-------AACTACA--AC-A----A-------TG-GCG----AACG-AGACGG-TC--TAAG-GTGT-TCAGG-AATG--TT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--AACAATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCA-------ATCTACCGTAT-GTACT-G---------GCA-AG--------ATAT-ACGCT-A-C--A-CC-T------TCAAACA---T---ATT-A------CGATGTTCAGC--AA-T-T------C-ATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--GGAAT-ATCA----GTTCA--A---T-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACACG-------ATGTACAG--GAGTGGACAA--CT-GCAA-ATCTCA--TCG-------TC---TTG-AC----A-C-AAGC-TAATG-C-A-AATATCAAC-A--C-G-A--GCGGA----CA-T---------GA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTGTATGCACTAAA-Cacttcgttcgattcgagtgcaccgatccggaattccaaaattcgattcggttcggttcaaattagtatcatataactacaacaatggcgaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttacttttgattaaaaacaatggaaagtaggacaaatcaatctaccgtatgtactggcaagatatacgctacaccttcaaacatattacgatgttcagcaattcatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttcaatggactcttactaagccgacacgatgtacaggagtggacaactgcaaatctcatcgtcttgacacaagctaatgcaaatatcaacacgagcggacatgatccaaaattgaagtgtgtatgcactaaactctaaatgtacactctgtgacatttaaattatctattatcttattagttactacactacaagatgtgaatgtgcattttttaaattgctaagtcatgagatcgaagcgcattttatataaatcttttttttaattaagttttgtttacccttaaatacaggaattaattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatccaatcgtagcattttgatcgaaatcgaaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|4 : ctgcggtgcaccgaaaattcggatgcaccgcgatcacttcgttA----CA-GGAG----TGGA--C--------AAC------TGCAAATCTC-ATCGTCTTGA-CA-CAA-GCTAATGCAAA-TATCAA--CA--C-G-A--G---CGGA----CATGA-----------T-CCAA--AAT------TGAAGTGTGTATGCACTA-AACTCTAAAT-----GT-ACAC----TCTGTGA----CATTTAAATTA----TCTAT--TATC-TTATT--AG---TTAC-T------AC--ACTACAAG-------ATGTGA----ATGTG-CATTTTTTA----AA--TTGC-TA-AGT-C--A--------------TG-AGATCGA----A---GCGC-------ATTTTATATAAAT-CTTTTT----TTTA-AT-TAAG--TTT-T-GTT-TACCCT-TAA-ATACAGGAA--TTAATTGAAGCATTACTT--AG-GT--TGT-TTC------------A-----AGTTT-----GTT------T------CAGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--ATCG----------------AAAA--AAATCC----------AATCGTAG-CATTTTG---ATCGAAATCGtctaaatgtacactctgtgacatttaaattatctattatcttattagttactacactacaagatgtgaatgtgcattttttaaattgctaagtcatgagatcgaagcgcattttatataaatcttttttttaattaagttttgtttacccttaaatacaggaattaattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatccaatcgtagcattttgatcgaaatcgaaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|5 : ctgcggtgcaccgaaaattcggatgcaccgcgatcacttcgttcgattcgagtgcaccgatccggaattccaaaattcgattcggttcggttcaaattagtatcatataactacaacaatggcgaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttacttttgattaaaaacaatggaaagtaggacaaatcaatctaccgtatgtactggcaagatatacgctacaccttcaaacatattacgatgttcagcaattcatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttcaatggactcttactaagccgacacgatgtGGCT--GTGCGGTGCAT--CG---------G---AAATTT--T--------------GA-T--GCAC--CG------C--G--ATT---C----ACTT---TG-----TTC-----T------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCATG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AT---TG-GCAG--CAACT-TGATGG-TC---------------------ACTTT-----AC--TTTTG-AAA-AAAGAA-CAATGGAAAA------GA-CAA-GTCATCT----A----CTGTAT-GTAC--A--------TGCA-AG--------TTAT-GCGCT-A-C--A-CCGT------GCAAGTA---T---ATT-A------CGA-GTTCAAG--AAGT-TGAACTTCTTTGT-CTGCGCAT--C-TTT---TGA-ATTAAGAAAAC---AATT--TGAGT-ATCG----GTGCA--A--GT-GG--ACTC-----A-T---ACTA-----------AGCCGACATG-------ATGTACAG-TGAGTGGACAA--AT-GCAA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGT-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--ACAGA----CA-TGAA----TGGA--T-CTA-A--AAT------TA-AAGTGTG-ATACACTACA-Caaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|5 : -AAGC-CGA---C-ATGATGT--AC-A-GT-G-A--GTGGA----CA---AA----TG------C---A--AAT------T-------TC-ATCTACTAGA-CA-CAA-GTCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CAGA----CATGAA----TGGA--T-CTAA--AAT------TAAAGTGTG-ATACACTA-CA------------------------CTTGTGA----CA--------A----T-TAA--TCTG-TT-TT--CA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGAATACATGTG-CAAATTTTG----AA--TT-A-TA-AGT-C--AA-------------AG-A---CTTATAAATTTACAC-------TTCTCACAT---CTTTTTTT----TTTAAGT-AAAGTTTTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGTA--TTA-TTGAAGCATTAC--TTAGTTT--TTT-TTCTC--AGG-AGGGA-----AGTTT------TC------T-----TCAGTA----------------------TGAATCAA--TTC------------------AAA--AAATCG----------AATCGTAG-TGTTTTG--TATCGAAATCttgtgacaattaatctgttttcatttcctaatactcaagatttgaatacatgtgcaaattttgaattataagtcaaagacttataaatttacacttctcacatcttttttttttaagtaaagtttttgtttttacccttaaataaaggtattattgaagcattacttagttttttttctcaggagggaagttttcttcagtatgaatcaattcaaaaaatcgaatcgtagtgttttgtatcgaaatctaaccgaatgaatcctgaattgtc
gi|6 : ggctgtgcggtgcatcggaaattttgatgcaccgcgattcactttgttctgttcaaaatttagtatcatgtgtaaacaacaaattggcagcaacttgatggtcactttacttttgaaaaaagaacaatggaaaagacaagtcatctactgtatgtacatgcaagttatgcgctacaccgtgcaagtatattacgagttcaagaagttgaacttctttgtctgcgcatcttttgaattaagaaaacaatttgagtatcggtgcaagtggactcatact--AGT---ATCATA-T-AT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TAAG-GTGT-TCAGG-AATGTTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGG-CAA-ATCATCT----A----CCGTAT-GTACTTG--------T--A-AG--------T-AT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTAAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--GGAAT-ATCA----GTTAA--A--AT-GG--ACTC-----T-T---AGTA-----------AGCCGACACG-------ATGTACAA-TGAGTGGACAA--CT-ACAA-ATTTCA--TCG-------TC---TAG-A-----A-C-AAGC-TAATG-C-A-AATATCAACAA-GC-G-A--GCGGA----CA-T---------GA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ACGCACTAAA-CA-Ctaaccgaatgaatcctgaattgtc
gi|6 : -AAGC-CGACA-C-G-A-TGT--AC-A-AT-G-A--GTGGA----CA------------A----CTACA--AAT------T-------TC-ATCGTCTAGA--A-CAA-GCTAATGCAAA-TATCAA--CAAGC-G-A--G---CGGA----CATGA-----------T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ACGCACTA-AAC-----ACTAAATGT-ACAC-----TTGTGA----AATTATT---A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TACT--ACT-CA-G-------ATGTGA----ATGTG-GCATTTTTT----AA--TG-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CAT----ATTTACAC-------TTTTCATA------TTTTTT----TTTACAT-TAAG--TTTGT-TC----CCCT-TAA-ATACAGGAA--TCA-TTGAAGCATTAC--TTAG-GT--TGT-TTC------------A-----AG-TTT----G-T------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--ATCG----------------AAAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGtaaatgtacacttgtgaaattattatctattatgttttaatttcctactactcagatgtgaatgtggcattttttaatgctaagtcagtgacatatttacacttttcatatttttttttacattaagtttgttccccttaaatacaggaatcattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaaccgaatcaaatgaaccctaatcgtcccagcc
gi|7 : agtatcatatataaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttttacttttgattaaaacaatggaaagtagggcaaatcatctaccgtatgtacttgtaagtatacgctacaccgttcaaacatattacgagttaagcaagttctatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttaaaatggactcttagt--GCAC--CG-AT--CC--AGAATTTTCC-TAAATTTTCACG----ATTCC----G------GT----TA------AAAATTT--AGCGCCATCAT--T-GTCGATATGAA--ACACTAC-A----A--AA---TG-GGGGTGCATCG-AGACGG-TCACT-AG-GCGTAT--GGTAATACTTT-----AAAATTCTGTATT-TA--------TGGATATTTAGAGGA-GAA-GTCATCT----ATC-ACCGTTT-GTACA-A--------TGTAGAGAAATGATCTTAT--CGCTTA-CTCA-TCGTGTTTTTCCAGGCA---TCTGATT-AT-----CGA-ATTCAACTAAAGT-T------TTATGT-CTGCGCATG-CATTAATGTAA-T---AAAACACCGAAATTAATGAGT-ATAATAAAGTTCATCA--GT-GGGGACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACACA-------A-GTA--G--GAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--ACA-------AC---TTG-AC----AGC-AAGT-TGATG-C-A-AATATCAAC-AGGT-G-ATGACAGAC---CA-TTCACACTTGGAGTT-CCA-ACCATT------TG-AAGTGTG-ATACACTAGaaccgaatcaaatgaaccctaatcgtcccagcc
gi|7 : ctgcttgcagtggcaatcgaaaattttatgagcacatgtttcagcttcgaattcgatttcgcaaatcACTTGA-CAGCAA-GTTGATGCAAA-TATCAA--CAGGT-G-ATGA---CAGAC---CATTCACACTTGGAGTT-CCAACCATT------TGAAGTGTG-ATACACTA-GCT-----T------GTGACAC----CTT---------A--------A----T-TGT--TATG-TT-TTACAG---TTTCGCTAGATAAT--ACT-TGAGACGAGATATTTGA----ATGTG-cttgtgacaccttaattgttatgttttacagtttcgctagataatacttgagacgagatatttgaatgtgag
gi|8 : ctgcttgcagtggcaatcgaaaattttatgagcacatgtttcagcttcgaattcgatttcgcaaatcgcaccgatccagaattttcctaaattttcacgattccggttaaaaatttagcgccatcattgtcgatatgaaacactacaaaatgggggtgcatcgagacggtcactaggcgtatggtaatactttaaaattctgtatttatggatatttagaggagaagtcatctatcaccgtttgtacaatgtagagaaatgatcttatcgcttactcatcgtgtttttccaggcatctgattatcgaattcaactaaagttttatgtctgcgcatgcattaatgtaataaaacaccgaaattaatgagtataataaagttcatcagtggggactcttactaagccgacacaagtaggagtggacaactgcaaatttcaacaGCGATTCACTTCG------TTTG---A---TT--C--------------GG-T--ACAC--CA-AT--TC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----GTTT-----G------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCAAG-T-GT-------AA--ACA--AC-T----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AACACTTT-----AC--TTTTG-ATC-AAA--A-CAATGGGAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----A----CCGTAT-GTACTTG--------T--A-AG--------TTAT-GCGCT-A-C--T-CTGT------TTAAGCA---T---ATT-A------TGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTATGT-CTGCACAT--C-TTA---TGA-G---AAAACAC---AATT-------------------CA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGTG-------ATGTACCG-TGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCG--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AATC-TGATG-C-A-AATTTCAAC-A-GT-G-A--ACAGA----CA-TAAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ATTCACTACA-CA-ag
gi|8 : gctgtgcggtgaccatgcaccaaaaattttgatgcacc----CG-TGAG----TGGA--C--------AAC------TGCAAATTTC-GTCTACTAGA-CA-CAA-TCTGATGCAAA-TTTCAA--CA-GT-G-A--A---CAGA----CATAAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATTCACTA-CAC-----A------GT-ACACTTGACTAGTGA----CA--------A----TTTAT--TATG-TT-CT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CTAAGTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---TGT----ATATACAC-------TTTTCAAAT---C-TGTTTTAAAATTTACAT-TAAG--TTTTT-TTT-gtacacttgactagtgacaatttattatgttctaatttcctaatactcaagatttgaatgtgctaagtttgaattctaagtcagtgatgtatatacacttttcaaatctgttttaaaatttacattaagtttttttt
gi|9 : gctgtgcggtgaccatgcaccaaaaattttgatgcaccgcgattcacttcgtttgattcggtacaccaattcggaattccaaatttcggtttggttcaaaatttagtatcaagtgtaaacaactaaatggcggcaacgagacggtctgaggtgttggaacactttacttttgatcaaaacaatgggaagtaggacaaatcatctaccgtatgtacttgtaagttatgcgctactctgtttaagcatattatgagttcaacaagttctatgtctgcacatcttatgagaaaacacaattcaagtggactcttactaagccgacgtgatgtacG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATACTTT-----AC--GTTTG-ATT-AAA--A-ACATGGAAATT---AGGA-CAC-AT
gi|9 : AT-ACGCT-A-C--AACCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CGGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GC--ACTC-----TATATAACTA-----------AG-CGACACG-------ATGTACAG-TGAGTTGACAA--AT-GACA-ATTTCA--TCTTTAAAAGACTTTTAG-AC----A-C-AAGC-CGTTG-C-A-AATATC-----------A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTTTG-ATacgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatgacaatttcatctttaaaagacttttagacacaagccgttgcaaatatcaacggacatgaatggatccaaaattgaagtttgataatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|9 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacTAGA-CA-CAA-GCCGTTGCAAA-TATCAA--C---------------GGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTTTG-ATA-A-TA-CAA-----AAT----GT-ACAC-----TTGTGA----CA--------A----T------------------AA---T----C----TATT--A---------------TTTGA----ATGTG-TCATTTTTTTTTTAA--TG-C-TA-ATTTC--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACAC-------TTTTCAT-T---C-TTTTTT----TTTACAT-TAAT--TTT-T-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--TTA-TTGAACCATTACTT----AGT--TTT-TTC------------A-----AG-TTT----G-T------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--TTCG-----------------AAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGaatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GTGCACCGAAATTTTTGGTGCATCACGATTTATACCATTCGATTCGA
Unaligned ( gi|35 ): GAATGGACCCTGAATCGTCCCAGCCCTACTC
Unaligned ( gi|36 ): ATGAACCCTGAATCGTCCCAGCCCTAA
Alignments
lowQualScore : 11 33333333333333333 11111111111111 11111 2222222 1111111 1111 222222222222 3333333333333 11111111 111 11111111111 1111111111111 111111111111111111 333333333333 22222 11111111 1111111 1111 1111111111111 111 22222222 7777777777777777777777777777777777777 11111111111111 4444444444444444 1111111111
lowQualScore : 55 22 33333333333333333 22 44444444444444 5 22 44 55 22 22 3 555 33 333 88888 11111 888888 4444 2222222 555 999 333 2 0000000 33 33 4 5555 33 777 2 33 2 2 33 2 5555 2 55555 66 2 2 4444 444 2 2 1 999999999999 2 7777777777777 2 00000000 2 2 2 33 5 777777 444 444 2 999999 2 33 2 777777 2 66 2 6666 2 555 444 444 2 5555 33 33 2 33 7777777 000 33333333333 0 1 9999999 99 33 2 2 33 7777777777777 2 8888 2 4 2 2 2 4 444 2 22 2 2 555 6666 777777777777777777 2 22 555555 8 1 2 1 2 2 2 3 44 6 3 3 999999 9999 999999 44 3 44 888888 3 3 444444444444 6 33333 6666 88888888 6666 9 66 2 2 33 555 2 6666 44 3 0000000 6666 6 1 4444 44 3 3 3 5 33 5555555555555 2 888 6666 9999999 999999 6666 3 44 000 3 3 3 44 3 44444444 33 2 3333333333333333333333333333333333333 66666 55555555555555 2 33 1 33 0000000000000000 33 4444444444 2 33
lowQualScore : .. .. ................. .. .............. . .. .. .. .. .. . ... .. ... ..... ..... ...... .... ....... ... ... ... . ....... .. .. . .... .. ... . .. . . .. . .... . ..... .. . . .... ... . . . ............ . ............. . ........ . . . .. . ...... ... ... . ...... . .. . ...... . .. . .... . ... ... ... . .... .. .. . .. ....... ... ........... . . ....... .. .. . . .. ............. . .... . . . . . . ... . .. . . ... .... .................. . .. ...... . . . . . . . . .. . . . ...... .... ...... .. . .. ...... . . ............ . ..... .... ........ .... . .. . . .. ... . .... .. . ....... .... . . .... .. . . . . .. ............. . ... .... ....... ...... .... . .. ... . . . .. . ........ .. . ..................................... ..... .............. . .. . .. ................ .. .......... . ..
lowQualScore : 00 99 33333333333333333 55 33333333333333 5 44 33 22 88 99 2 888 55 777 99999 88888 222222 5555 3333333 888 444 333 4 0000000 22 22 7 0000 22 444 4 22 5 2 11 2 8888 1 66666 11 2 4 5555 111 4 4 7 777777777777 7 1111111111111 9 44444444 5 4 4 44 0 222222 444 444 5 777777 5 44 5 222222 9 88 9 6666 9 000 777 333 7 7777 77 77 7 77 6666666 000 66666666666 7 4 3333333 88 77 7 7 77 5555555555555 5 8888 5 4 2 2 2 4 222 2 88 2 2 888 2222 000000000000000000 0 88 888888 0 8 1 0 1 2 9 1 22 2 1 1 777777 6666 222222 22 1 22 888888 1 1 888888888888 2 66666 5555 88888888 5555 1 88 9 9 99 000 9 1111 22 1 0000000 5555 2 8 2222 66 3 3 3 7 99 7777777777777 9 999 5555 3333333 444444 5555 1 22 888 1 3 3 22 1 55555555 99 9 1111111111111111111111111111111111111 77777 77777777777777 7 77 9 77 5555555555555555 77 3333333333 7 77
consensus : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------C--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GT----TC------CAAATTT--AGT---ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-C--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----ATCTACCGTAT-GTACTTG--------TGTA-AG--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGCG-------ATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ATNCACTAGA-CA-CAA-GCCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CGGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACAC----CTTGTGA----CA--------A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACAC-------TTTTCATAT---C-TTTTTT----TTTACAT-TAAG--TTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--TTA-TTGAAGCATTACTTTTAGAGT--TTT-TTC-C--A-T-AGGAA-----AGTTTT----GTT------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGANTCGA--TTCG-A--------------AAAA--AAATCG----------AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAAATCGTCCCAGCC
Reference ( family-3214 ) : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------C--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GT----TC------CAAATTT--AGT---ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-C--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----ATCTACCGTAT-GTACTTG--------TGTA-AG--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGCG-------ATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ATNCACTAGA-CA-CAA-GCCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CGGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACAC----CTTGTGA----CA--------A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACAC-------TTTTCATAT---C-TTTTTT----TTTACAT-TAAG--TTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--TTA-TTGAAGCATTACTTTTAGAGT--TTT-TTC-C--A-T-AGGAA-----AGTTTT----GTT------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGANTCGA--TTCG-A--------------AAAA--AAATCG----------AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAAATCGTCCCAGCC
gi|1 : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CA------T--G---A---TT--C--------------AA-T--GCAC--CG-AT--CC--AGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------TT----TC------CAAATTTTAAGC---ATCATG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGATGG-TC--TGAG-GTTT-C--AG-AATACTTTCAATTAC--TTTTG-ATT-AAA--G-CAAGGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCTTATGATCTACCGTAT-GTACTTGACACTACTTGTA-AG--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTATCT-CTGCGCAT--C-TTA---TGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGCGATGTAGTATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTTG--CCT-------AA---TAG-AC----A-C-AAGC-TGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--AGAGAGTGTCA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AA-------TG-AAGTGTG-ATANTATAGA-CA-CAT-GCTGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CAGAGTGTCATGAA----TGGA--T-CCAA--CA-------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACACCTG-CTTGTGA----CA--------A----TCTTT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-T---CGT----ATTTACA-----------TCATAT---A-TTTTTT----TTTACAA-TAAG--TTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAGGTAA--TTA-TTGAAGCATTA--TTTAGAG---TTT-TCC-T--A-T-TGGCAGCATTAGTTTTTAGAGTTCTCTCCT-----TCA-TAGAAAAGTTTTGTTTTCAG-TGATCAATTGA--ATCG-ATTCGG---------AAAAATAAATCGCAAAAAATCGAATTGCAG-CATTTTG--AATCG-AATCGTCCCAGCC
gi|10 : G-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATACTTT-----AC--GTTTG-ATT-AAA--A-ACATGGAAATT---AGGA-CAC-AT
gi|10 : AT-ACGCT-A-C--AACCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CGGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GC--ACTC-----TATATAACTA-----------AG-CGACACG-------ATGTACAG-TGAGTTGACAA--AT-GGCA-ATTTCA--TCTTTAAAAGACTTTTAG-AC----A-C-AAGC-CGTTG-C-A-AATATC-----------A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTTTG-ATacgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatggcaatttcatctttaaaagacttttagacacaagccgttgcaaatatcaacggacatgaatggatccaaaattgaagtttgataatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|10 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacTAGA-CA-CAA-GCCGTTGCAAA-TATCAA--C---------------GGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTTTG-ATA-A-TA-CAA-----AAT----GT-ACAC-----TTGTGA----CA--------A----T------------------AA---T----C----TATT--A---------------TTTGA----ATGTG-TCATTTTTTTTTTAA--TG-C-TA-ATTTC--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACAC-------TTTTCAT-T---C-TTTTTT----TTTACAT-TAAT--TTT-T-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--TTA-TTGAACCATTACTT----AGT--TTT-TTC------------A-----AG-TTT----G-T------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--TTCG-----------------AAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGaatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|11 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacatacgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatggcaatttcatctttaaaagactttCGATGCAC--CG------C--G---A---TT--CACTTAGTTCATTTCGA-T--GCAC--CG-AT--CT--GGAATC---C-CAAATTT---TG----ATTCAGTTCG------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCACA-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--TAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATGCTTT-----AC--TTTTG-ATT-GAA--A-CAATGGAAAAT---AGGA-CAA-ATC--------ACCTACTGTAT-GTACTT---------T--------------TTAT-ACGTA-A-C--A-CCGT------TTAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------ATATGT-CTGTGTAT--C-TTA---TGA-A---AAAACGC---AA-------------------TTCA--A--GT-GG--ACTG-----T-T---ACTA-----------AACCGACACG-------ATGCACAG-TGAGTGGACAA--CT-GCAA-CTTTGA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C----------AC-A-GT-G-A--ACAGA----CA-TGAA----TGGA--T-TCA-A--AAT------GC-AAGTGTG-ATACACTACA-CA-aacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|11 : gtgtggtgcaccgaaaatttT-------AC---TAA-ACCG--A-C-A----CGATG-C-A---------C-A-GT-G-A--GTGGA----CA-------------------------AC------TGCAACTTTG-ATCTACTAGA-CA-CAA-GCCGATGCA-----------CA-GT-G-A--A---CAGA----CATGAA----TGGA--T-TCAA--AAT------GCAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACAC-----TTGTGA----CA--------ACTAATTTAT--CATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--AAT-CAAG-------ATTTGA----ATTTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-TGT-C--AG-------------TG-A---Cgtacacttgtgacaactaatttatcatgttttaatttcctaataatcaagatttgaatttgccaattttgaattctatgtcagtgac
gi|12 : gtgtggtgcaccgaaaatttcgatgcaccgcgattcacttagttcatttcgatgcaccgatctggaatcccaaattttgattcagttcggttcaaaatttagtatcacatgtaaacaacaaaatggcggtaacgagacggtctgaggtgttggaatgctttacttttgattgaaacaatggaaaataggacaaatcacctactgtatgtactttttatacgtaacaccgtttaaacatattacgagttcagcaagttatatgtctgtgtatcttatgaaaaaacgcaattcaagtggactgtT--GCACGGCGTAC--TGGTCGGTC--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----GTTC-----G------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCATA-T-AT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TAAG-GTGT-TCAGG-AATGTTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGG-CAA-ATC--------ATCTACCGTAT-GTACT----------TGTA-AG--------ATAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTAT
gi|12 : gggctgtgcgcgggtgcacgcggaaagcttgtcgggaatggcaccgcggaaatgtgaCAA---AATT--TT--T-ATCA----GTTAA--C--ATCGG--ACTC-----T-T---AGTA-----------AGCCGACACG-------ATGTACAA-TGAGTGGACAA--CT-ACAA-ATTTCA--TCG-------TC---TAG-AC----A-C-AAGC-TAATG-C-A-AATATtgttttttctgcttgtttatttttttctatctgatgaattatattcaccccaatccgcccgcaccaaaatttttatcagttaacatcggactcttagtaagccgacacgatgtacaatgagtggacaactacaaatttcatcgtctagacacaagctaatgcaaatat
gi|13 : gggctgtgcgcgggtgcacgcggaaagcttgtcgggaatggcaccgcggaaatgtgatgcacggcgtactggtcggtcgattcgatgcaccgatccggaattccaaatttcggttcggttcaaaatttagtatcatatataaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttttacttttgattaaaacaatggaaagtagggcaaatcatctaccgtatgtacttgtaagatatacgctacaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctattgttttttctgcttgtttatttttttctatctgatgaattatattcaccccaatccgcccgcacACAA--TT-TTGA-ATATCAGTTCA-------AG---TGG-ACTCTTA-CTAAGC-TGACG-C-ATGGTA-CAGC-A-GT-G-------GA----CA---AC----TG-------CA-A--AAT------T-------CG--TCTACTAGA-CA-CAA-ACTGATGCAAA--ATCAA--CG-GT-GAA--A---CAGA----CATGAA----TGAA--T-CCAA--AAA------GAAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GTAACAC----C-TGTGA----CA--------A----TCTTT--TATGTTT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAA--------ATCTGA----A-GTGCCCAATTTTG----AA--TT-CATATAGT-CAGAG-------------TT-ATT-CTT----ATTTACTC-------TATACCCAT---A-ATCCTT----TTAACAA-TAAG--TTTG--TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGTAA--TTA-TTGAAGCATTA--TTAAGAGT--TTT-TCCTC--A-TAAGGAA-----AGCT-------TT------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGAATCGA--TTCG----------------AAAA--AAATCG----------AATCGCAGCCATTTTG--AATCAAAATC
gi|14 : gagaaaacGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------A--A---AAT-TT--C--------------GA-T--ACAC--CG-aaaccgaaacgaattgaccctgaaatcgtcccaaccc
gi|14 : GCGATTCACTTCGTT----C--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GT----TCGGTTC-CAGATTT--AGT---ACCATG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AGA--G-CAAGGAAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----A----CCGTAT-GTACTTA--------A--A-AA--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACACTAT---ATT-A------CGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTATGT-CTGTGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--GGAAT-ATCA----GTTCC--A--AT-GG--ACTT-----A-T---ACTA-----------AGCCGACACG-------ATGTACAG-AGAGTGTACAA--CT-GCAA-ATGTCA--TCG-------TC---TAG-AC----A-T-AAGC-TGATG-C-A-AATA-----------------CGGA----CA-TGA-----------T-CCA-A--AGT------TG-AAGTGTG-ATcgattcacttcgttcgattcgatgcaccgatccggaattccaaatttcgattcggttcggttccagatttagtaccatgtgtaaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctgaggtgttggaatactttacttttgattagagcaaggaaaagtaggacaaatcatctaccgtatgtacttaaaaattatacgctacaccgttcaaacactatattacgagttcaacaagttctatgtctgtgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttccaatggacttatactaagccgacacgatgtacagagagtgtacaactgcaaatgtcatcgtctagacataagctgatgcaaatacggacatgatccaaagttgaagtgtgatg
gi|15 : ggctgtgcggtgcaccgaaaatttcgatacaccGGGCT--GT-CGGTGCAC--CG------A--A---AAATTT--C--------------GAGT--GCAC--CG------C--G--ATT---C----ACTT---CG-----TTC-----G------GT----TC------g
gi|15 : GCGATTCACTTCGTT----C--G---G---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--AGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GTCGCGTT------CAAATT---AGT---ATCACG-TAGT-------AA--ACA--AC-A----A--AAAT-TGCGCGG--CAATG-AAACGG-TC--TGAG-GTGT-C--GG-AATACC---------------------AAA--G-CAATGGAAAGT---AGAC-CAA-ATAATCT----A-----CGTAT-GAACTTG--------T-TA-AA--------TTAT-GT-CT-A-C--A-C-GT------TAAAACA---C---ATT-A-------GA-GTTCAAC--AATT-T------CTATCTGCTGCGCATTTC-TTA-----A-A---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----G-TCA--A---T-GG--ACTCTAAATT-T---ACTA-----------AG-CGACGCA-------AAGTACAG-CGAGTGGACAA--CTGGCGA-ATTTCG--TCT-------AC---TAG-AC----A-T-AAGCTTGATGCC-A-AATATCAAT-A-GT-GAA--ACAGA----CA-TGGA----T-GA--T-CCA-A--AA-------TG-AAGgatgcaccgatccagaattccaaatttcgattcggtcgcgttcaaattagtatcacgtagtaaacaacaaaaattgcgcggcaatgaaacggtctgaggtgtcggaataccaaagcaatggaaagtagaccaaataatctacgtatgaacttgttaaattatgtctacacgttaaaacacattagagttcaacaatttctatctgctgcgcatttcttaaaaaaacacaatttgaatatcagtcaatggactctaaatttactaagcgacgcaaagtacagcgagtggacaactggcgaatttcgtctactagacataagcttgatgccaaatatcaatagtgaaacagacatggatgatccaaaatgaag
gi|16 : gggctgtcggtgcaccgaaaaatttcgagtgcaccAGGGCT--GTGCAGTGAAA--TG------A--A---AAT-TT--T--------------GA-T--GCAC--C
gi|16 : --G---A---TT--C--------------AA-T--GAAT--CA-AT--CT--GGAATT---C-CAAATTT---TG----ATTCTGTT-G------GT----TC------AAAATTT--AGC---ATCACT-T-GT-------CA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCAG--CAGCG-AGACGG-TC--TGTG-GTGT-G--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATA-AAA--T-CAATGGAAAGG---AGCA-CAA-GTCA---------CTACTGTA-----------------TGTA-AG--------TTAT-GCGCT-A-T--A-CCGT------TTAAGCA---A---ATT-A------GGG-GTTCAAC--AAGT-T------CTATataatctacttcatttgattcaatgaatcaatctggaattccaaattttgattctgttggttcaaaatttagcatcacttgtcaacaacaaaatggcagcagcgagacggtctgtggtgtgggaatactttacttttgataaaatcaatggaaaggagcacaagtcactactgtatgtaagttatgcgctataccgtttaagcaaattaggggttcaacaagttctat
gi|17 : agggctgtgcagtgaaatgaaaattttgatgcaccataatctacttcatttAGGGAT--GTGCGATTCACTTCG------TTTG---A---TT--C--------------GA-T--ACAC---A-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTT-----GTTGGCAGT----TT------GAAATTT--AGT---ATCACA-T-GA-------AA--ACA--AC-AAAACA--AA---CA-GTGG--CAACG-AGACGG-TC--T-------------G-AATACTTT-----AC--TTATG-ATTAAAA--A-CACTGGAAAGG---AGGG-CAAGATCATCT----AC---CCGTAT-GTAC
gi|18 : gtatatggtacacaactccta-C--AG-------------TG-A---CGT----ATATACAC-------TTTTCATAT---C-TTTT------TTTACAT-TCAG--TTTTT-TTT-TACCCT-TAA-ATTAAGGAA--TTA-TTGAACCATTACTT----AGT--TTT-TTC------------A-----AG-TTT----GTT------TCAGTACCGGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--TT---A--------------AAAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCat
gi|19 : TTTACACTTATTTTTTTTTTTTT---T-TTTTTT----TTTACATCCAAG--TTTCT-TTT-T---TTATAATATAAAAAAAGGTTA-TTGA----------TTAGTGTAATTA-GTC-C--C-T-ATGAA-----AAGTCT----A--------T-----TCAG------------------AA----------GA--TT---A--------------AATA--AAATCA----------AATTGCGG-CATTTTG--AATCGAAATCGtaaccgactctaacgaaccccgtatcgtcccagc
gi|2 : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------A--A---A---AT-----------------GA-T--GCAC--CG------C--G--ATTA--A-CATAATT---CG-----TTC-----GC-----GT----TC------CGAATaaccgaatcgaatgaaccctgaatcattccagcc
gi|2 : --CG------C--G---T---TC--C--------------GAAT--GCAC--CGGAT--CC--AGAATT---C-CAA-TTC---CG----ATTC-----G------GT----TCGGTTTCCAAATT---AGTT--ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AAAAATG-GCGG--CAACGGAAACGG-C----GAGTGGAT-C--G--AATA-------------------AAC-AAG--C-CAATGGAAAGT---AGGAACAA-AT-A-------ATCTACCGTATTGTACTTG--------TA-A-AT--------TTATTGTGCT-AGC--A-CCGT------T-AAACA---C---ATTTA------GGA-GTTCAAC--AAGTAT------CTACAT-TCTCGGAT--C-TTA---TGAAG---AAAACCA---AATT--TGAATTATCA----GTTCA--A--GT-GG--AA-C-----T-T---GCTAAATTACCTCATAGCCGACGCA-------A-GTACAGACGAGTGGGCAACCCT-GCGACATTAC---TCT-------AC---TAGAAC----A-TAAAGC-TGATG-CAA-AATAGTAAT-A-GTAG-AT-ACAGA----C--TGGA-----GAA--TACCA-A--AATGAATAGTG-AGCTGTG-ATACACTAT--CA-CAA-Ggcaccggatccagaattccaattccgattcggttcggtttccaaattagttatcacgtgtaaacaacaaaaaaatggcggcaacggaaacggcgagtggatcgaataaacaagccaatggaaagtaggaacaaataatctaccgtattgtacttgtaaatttattgtgctagcaccgttaaacacatttaggagttcaacaagtatctacattctcggatcttatgaagaaaaccaaatttgaattatcagttcaagtggaacttgctaaattacctcatagccgacgcaagtacagacgagtgggcaaccctgcgacattactctactagaacataaagctgatgcaaaatagtaatagtagatacagactggagaataccaaaatgaatagtgagctgtgatacactatcacaagtacaccctgtgacaatctatattatgttttaaaatttccctaatgaactcaagatttgaatgtgcccaattttgaagcttctaagtcagtgttcgtattcacacatatttttgttttaacattattgaagtattattttagagttttcctcaatgaggaaatttttttcagtatcaatttgaatcggatttcgaaaaaaatcgaaatcgcagcattttggcaatcgaaatcgacaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|2 : agggctgtgcggtgcaccgaaaatgatgcaccgcgattaacataattcgttTCTACTAGAACA-TAAAGCTGATGCAAAATAGTAA--TA-GTAG-AT-A---CAGA----C-TGGA-----GAA--TACCAA--AATGAATAGTGAGCTGTG-ATACACTATCAC-----AA-----GT-ACAC----CCTGTGA----CA--------A----TCTATATTATG-TT-TT--AAAATTTCC-C----TAATGAACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTGCCCAATTTTG----AAGCTT-C-TA-AGT-C--AG-------------TGTT---CGT----ATTCACA------------CATAT---T-TTTGTT----TTAACAT-TA-----TTG--------------AA-GT------A--TTA-T------------TTTAGAGT--TTTCCTC-A--A-TGAGGAA-----A-TTT------TT------T-----TCAGTA--------------TCAATT--TGAATCGGATTTCG----------------AAAA--AAATCGA---------AATCGCAG-CATTTTGGCAATCGAAATCGtacaccctgtgacaatctatattatgttttaaaatttccctaatgaactcaagatttgaatgtgcccaattttgaagcttctaagtcagtgttcgtattcacacatatttttgttttaacattattgaagtattattttagagttttcctcaatgaggaaatttttttcagtatcaatttgaatcggatttcgaaaaaaatcgaaatcgcagcattttggcaatcgaaatcgacaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|20 : agggctgtgcggtgcaccgaaaatgatgcaccgcgattaacataattcgttcgcgttccgaatgcaccggatccagaattccaattccgattcggttcggtttccaaattagttatcacgtgtaaacaacaaaaaaatggcggcaacggaaacggcgagtggatcgaataaacaagccaatggaaagtaggaacaaataatctaccgtattgtacttgtaaatttattgtgctagcaccgttaaacacatttaggagttcaacaagtatctacattctcggatcttatgaagaaaaccaaatttgaattatcagttcaagtggaacttgctaaattacctcatagccgacgcaagtacagacgagtgggcaaccctgcgacattacGGCTTGGTGCGGTGCAC--CG---------GAAAA---TTTGC--------------GA-TGGGCAC--CG------C--ACGATT---C----ATGT---CG-----TTC-----G------GT----TC------acaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|20 : ------C--G---G---TT--C--------------GA-T--GCACG-CG-AT--CCCAGTAATT---C---AATTT---CGTTCGGTTC-----G------GT----TC------CAAATTT--AGT---ATCACGCT-GT-------AA--ACA--ACAA----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AAACGGTTC--TGAG-GTGT-C--GG-AAgatgcacgcgatcccagtaattcaatttcgttcggttcggttccaaatttagtatcacgctgtaaacaacaaaaatggcggcaacgaaacggttctgaggtgtcggaagta
gi|21 : ggcttggtgcggtgcaccggaaaatttgcgatgggcaccgcacgattcatgtcgttGGGCT--GTGTGGTGCAC--CG------A--A---AAT-TT--C--------------GA-T--gta
gi|21 : ---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--AGAATT---C-CAAATTT---GG----ATTT-----G------GT----TCGGTT--CAAATTT--AGTA--ATCACG-T-GTA------AA--ACA--AC-A----AACAA---T---CGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTG-----AG-AAAAC--------ACAATTTTG-Acaccgcaattcattgttttatttcgatgcaccgatccagaattccaaatttggatttggttcggttcaaatttagtaatcacgtgtaaaacaacaaacaatcggcaacgagacggtctgaggtgagaaaacacaattttgaa
gi|22 : gggctgtgtggtgcaccgaaaatttcgatcaccgcaattcattgttttatAGCATTACTTATATTTT--TTT-TTT-CTCA-CGAGGAA-----AGTTTT------C------T-----TCAGTA--------------TGAA-T--TGAATT-A--TTCA-ATAGATTAAAAAGAGAAAA--AAATCG----------TACCTCAG-TGTTTTG--AATCAAAATCa
gi|23 : ------C--G---A---TT--GA-------------GA-T--GCAC--CG-ATTGCC--AGAAT----C-CAAATTT----G----GTTC-----G-------T----TC------CAAAT----AGT---ACTACG-T-GG-------TA--ACA--ACAA----A--AA---TG-GCGT--CAAaaattgaatgaaccctgaatcgtcccagcc
gi|24 : aggtgcgcgtgcaaccgaaagatctcggcagccgcaattcacttgt-CAA-ATCAATGCAAA-TATCAAAACA-GT-G-A--ATTGCAAA----CATGAA----TGGG--T-CCAA--AAT------TAAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACA-----TTTGTGA----CA--------A----TTAATC-TATG-TT-TT--AA---TTTT-C----a
gi|25 : TAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----CAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CAAATTCTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AGTGACGTTTAATACTG-A---CGT----GTTTACAC-------TTTTCATAT---C-TTT
gi|26 : aGAGT--TTT-CCT-C--A-TGAGGAA-----AATTTT-------------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGAATCGA--TTTG-----------------AAA--AAATCG----------AATCGCAT-CATTTTG--AATCGAA
gi|27 : AA--TTA-TTGAAGTATTA--TTTAGAGT--TTA-CCT-C--A-TGAGTAA-----AGTTTT------T------T-----TCAACA--------------TCAA-T--TGAATCGA--TTTG-A--------------AAAA--AA-TCA----------AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAccgaatcgaatggaccctgaatc
gi|28 : gtTTT----GTT------T------CAGTA--------------TCAA-T--TGATTCAA--TTCGAA--------------AAAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTCTG--AATCGAAATCG
gi|29 : aaT-C--AA-------------TG-A---CGA----ATTTACAC-------TTTTTGTAT---A--TATTT----TTTACA--AAAG--TTTGTGTTTATACCCT-TTA-ATAAAGGAA--TTA-TTGAAGCATTaattgaatgaaccctgaatcgtcccagcc
gi|3 : -T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TA-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGA-T--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGA-CAA-AT-A-------ATCTACCATAT-GTACTTG--------T--A-AG--------TTAT-ATGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTGTAT-CTGCACAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--AGTGT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCAACATG-------ATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--TCT-------TC---TAG-AC----A-C-AAGC-TGATG-C-A-AATATCAAC-A-GC-G-A--ACGGA----CA-T---------GA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGCA-ATACACTAAA-CA-C
gi|3 : agggctgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAAC-A--T-G-A---TGTA----CAGCGAG----TGGA--C--------AAC------TGCAAATTTC-ATCTTCTAGA-CA-CAA-GCTGATGCAAA-TATCAA--CA-GC-G-A--A---CGGA----CATGA-----------T-CCAA--AAT------TGAAGTGCA-ATACACTA-AAC-----ACTAAATGT-ACAC-----TTGTGAAAATTA--------A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-GCATTTTTT----AA--TG-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACAC-------TTTTCATAT---C--TTTTT----TTTACAT-GAAG--TTTTT-CTT-TAACCT-TAA-ATAACGGAA--TTT-TTTAAGCATTACTTT-----T--TTT-TTC------------A-----AG-TTT----G-T------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--TTCG-A--------------ATAA--AAATCG----------AATTGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGtaaatgtacacttgtgaaaattaatctattatgttttaatttcctaatactcaagatttgaatgtggcattttttaatgctaagtcagtgacgtatttacacttttcatatcttttttttacatgaagtttttctttaaccttaaataacggaattttttaagcattactttttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaataaaaatcgaattgtagcattttgaatcgaaatcgaaccaaatgaaccctgaatcgtcccagccct
gi|30 : agggctgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaaacaacaaaatagcggcaacgagacggtctgaggtgatggaatactttacttttgattaaaacaatggaaagtaggacaaataatctaccatatgtacttgtaagttatatgctacaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctgtatctgcacatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgtggactcttactaagc-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATA-AAA--G-CAATGGAATGT---AGAA-CAA-AT-A-------ATCTACCATAT-GTACT----------TCTA-AA--------TTAT-ATGCT-A-aaccaaatgaaccctgaatcgtcccagccct
gi|31 : GGCG--GTGTGGTGCAT--CG------A--A---AAT-TT--C--------------GA-T--GCAC--TG------C--G--ATT---CACGTCTTT---CG----ATTC-----G------AT----
gi|32 : T-A-C--A-CCGT------TCTAACA---T---ATT-ACCATTACGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCgcacgggttcaaca
gi|34 : T--C-TTA---TGA-G---AAAACAG---AATT--TGACA-ATCA----GTTCA--A--GT-GA--A
gi|4 : TGCGGTGCAC--CGA-----A--A---A---TT--CG-------------GA-T--GCACCGCG-AT--C
gi|4 : c------C--G---A---TT--C--------------GAGT--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAAATT---CG----ATTC-----G------GT----TCGGTT--CAAATT---AGT---ATCA---T-AT-------AACTACA--AC-A----A-------TG-GCG----AACG-AGACGG-TC--TAAG-GTGT-TCAGG-AATG--TT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--AACAATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCA-------ATCTACCGTAT-GTACT-G---------GCA-AG--------ATAT-ACGCT-A-C--A-CC-T------TCAAACA---T---ATT-A------CGATGTTCAGC--AA-T-T------C-ATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--GGAAT-ATCA----GTTCA--A---T-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACACG-------ATGTACAG--GAGTGGACAA--CT-GCAA-ATCTCA--TCG-------TC---TTG-AC----A-C-AAGC-TAATG-C-A-AATATCAAC-A--C-G-A--GCGGA----CA-T---------GA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTGTATGCACTAAA-Cacttcgttcgattcgagtgcaccgatccggaattccaaaattcgattcggttcggttcaaattagtatcatataactacaacaatggcgaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttacttttgattaaaaacaatggaaagtaggacaaatcaatctaccgtatgtactggcaagatatacgctacaccttcaaacatattacgatgttcagcaattcatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttcaatggactcttactaagccgacacgatgtacaggagtggacaactgcaaatctcatcgtcttgacacaagctaatgcaaatatcaacacgagcggacatgatccaaaattgaagtgtgtatgcactaaactctaaatgtacactctgtgacatttaaattatctattatcttattagttactacactacaagatgtgaatgtgcattttttaaattgctaagtcatgagatcgaagcgcattttatataaatcttttttttaattaagttttgtttacccttaaatacaggaattaattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatccaatcgtagcattttgatcgaaatcgaaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|4 : ctgcggtgcaccgaaaattcggatgcaccgcgatcacttcgttA----CA-GGAG----TGGA--C--------AAC------TGCAAATCTC-ATCGTCTTGA-CA-CAA-GCTAATGCAAA-TATCAA--CA--C-G-A--G---CGGA----CATGA-----------T-CCAA--AAT------TGAAGTGTGTATGCACTA-AACTCTAAAT-----GT-ACAC----TCTGTGA----CATTTAAATTA----TCTAT--TATC-TTATT--AG---TTAC-T------AC--ACTACAAG-------ATGTGA----ATGTG-CATTTTTTA----AA--TTGC-TA-AGT-C--A--------------TG-AGATCGA----A---GCGC-------ATTTTATATAAAT-CTTTTT----TTTA-AT-TAAG--TTT-T-GTT-TACCCT-TAA-ATACAGGAA--TTAATTGAAGCATTACTT--AG-GT--TGT-TTC------------A-----AGTTT-----GTT------T------CAGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--ATCG----------------AAAA--AAATCC----------AATCGTAG-CATTTTG---ATCGAAATCGtctaaatgtacactctgtgacatttaaattatctattatcttattagttactacactacaagatgtgaatgtgcattttttaaattgctaagtcatgagatcgaagcgcattttatataaatcttttttttaattaagttttgtttacccttaaatacaggaattaattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatccaatcgtagcattttgatcgaaatcgaaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|5 : ctgcggtgcaccgaaaattcggatgcaccgcgatcacttcgttcgattcgagtgcaccgatccggaattccaaaattcgattcggttcggttcaaattagtatcatataactacaacaatggcgaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttacttttgattaaaaacaatggaaagtaggacaaatcaatctaccgtatgtactggcaagatatacgctacaccttcaaacatattacgatgttcagcaattcatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttcaatggactcttactaagccgacacgatgtGGCT--GTGCGGTGCAT--CG---------G---AAATTT--T--------------GA-T--GCAC--CG------C--G--ATT---C----ACTT---TG-----TTC-----T------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCATG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AT---TG-GCAG--CAACT-TGATGG-TC---------------------ACTTT-----AC--TTTTG-AAA-AAAGAA-CAATGGAAAA------GA-CAA-GTCATCT----A----CTGTAT-GTAC--A--------TGCA-AG--------TTAT-GCGCT-A-C--A-CCGT------GCAAGTA---T---ATT-A------CGA-GTTCAAG--AAGT-TGAACTTCTTTGT-CTGCGCAT--C-TTT---TGA-ATTAAGAAAAC---AATT--TGAGT-ATCG----GTGCA--A--GT-GG--ACTC-----A-T---ACTA-----------AGCCGACATG-------ATGTACAG-TGAGTGGACAA--AT-GCAA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGT-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--ACAGA----CA-TGAA----TGGA--T-CTA-A--AAT------TA-AAGTGTG-ATACACTACA-Caaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|5 : -AAGC-CGA---C-ATGATGT--AC-A-GT-G-A--GTGGA----CA---AA----TG------C---A--AAT------T-------TC-ATCTACTAGA-CA-CAA-GTCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CAGA----CATGAA----TGGA--T-CTAA--AAT------TAAAGTGTG-ATACACTA-CA------------------------CTTGTGA----CA--------A----T-TAA--TCTG-TT-TT--CA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGAATACATGTG-CAAATTTTG----AA--TT-A-TA-AGT-C--AA-------------AG-A---CTTATAAATTTACAC-------TTCTCACAT---CTTTTTTT----TTTAAGT-AAAGTTTTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGTA--TTA-TTGAAGCATTAC--TTAGTTT--TTT-TTCTC--AGG-AGGGA-----AGTTT------TC------T-----TCAGTA----------------------TGAATCAA--TTC------------------AAA--AAATCG----------AATCGTAG-TGTTTTG--TATCGAAATCttgtgacaattaatctgttttcatttcctaatactcaagatttgaatacatgtgcaaattttgaattataagtcaaagacttataaatttacacttctcacatcttttttttttaagtaaagtttttgtttttacccttaaataaaggtattattgaagcattacttagttttttttctcaggagggaagttttcttcagtatgaatcaattcaaaaaatcgaatcgtagtgttttgtatcgaaatctaaccgaatgaatcctgaattgtc
gi|6 : ggctgtgcggtgcatcggaaattttgatgcaccgcgattcactttgttctgttcaaaatttagtatcatgtgtaaacaacaaattggcagcaacttgatggtcactttacttttgaaaaaagaacaatggaaaagacaagtcatctactgtatgtacatgcaagttatgcgctacaccgtgcaagtatattacgagttcaagaagttgaacttctttgtctgcgcatcttttgaattaagaaaacaatttgagtatcggtgcaagtggactcatact--AGT---ATCATA-T-AT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TAAG-GTGT-TCAGG-AATGTTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGG-CAA-ATCATCT----A----CCGTAT-GTACTTG--------T--A-AG--------T-AT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTAAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--GGAAT-ATCA----GTTAA--A--AT-GG--ACTC-----T-T---AGTA-----------AGCCGACACG-------ATGTACAA-TGAGTGGACAA--CT-ACAA-ATTTCA--TCG-------TC---TAG-A-----A-C-AAGC-TAATG-C-A-AATATCAACAA-GC-G-A--GCGGA----CA-T---------GA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ACGCACTAAA-CA-Ctaaccgaatgaatcctgaattgtc
gi|6 : -AAGC-CGACA-C-G-A-TGT--AC-A-AT-G-A--GTGGA----CA------------A----CTACA--AAT------T-------TC-ATCGTCTAGA--A-CAA-GCTAATGCAAA-TATCAA--CAAGC-G-A--G---CGGA----CATGA-----------T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ACGCACTA-AAC-----ACTAAATGT-ACAC-----TTGTGA----AATTATT---A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TACT--ACT-CA-G-------ATGTGA----ATGTG-GCATTTTTT----AA--TG-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CAT----ATTTACAC-------TTTTCATA------TTTTTT----TTTACAT-TAAG--TTTGT-TC----CCCT-TAA-ATACAGGAA--TCA-TTGAAGCATTAC--TTAG-GT--TGT-TTC------------A-----AG-TTT----G-T------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--ATCG----------------AAAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGtaaatgtacacttgtgaaattattatctattatgttttaatttcctactactcagatgtgaatgtggcattttttaatgctaagtcagtgacatatttacacttttcatatttttttttacattaagtttgttccccttaaatacaggaatcattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaaccgaatcaaatgaaccctaatcgtcccagcc
gi|7 : agtatcatatataaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttttacttttgattaaaacaatggaaagtagggcaaatcatctaccgtatgtacttgtaagtatacgctacaccgttcaaacatattacgagttaagcaagttctatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttaaaatggactcttagt--GCAC--CG-AT--CC--AGAATTTTCC-TAAATTTTCACG----ATTCC----G------GT----TA------AAAATTT--AGCGCCATCAT--T-GTCGATATGAA--ACACTAC-A----A--AA---TG-GGGGTGCATCG-AGACGG-TCACT-AG-GCGTAT--GGTAATACTTT-----AAAATTCTGTATT-TA--------TGGATATTTAGAGGA-GAA-GTCATCT----ATC-ACCGTTT-GTACA-A--------TGTAGAGAAATGATCTTAT--CGCTTA-CTCA-TCGTGTTTTTCCAGGCA---TCTGATT-AT-----CGA-ATTCAACTAAAGT-T------TTATGT-CTGCGCATG-CATTAATGTAA-T---AAAACACCGAAATTAATGAGT-ATAATAAAGTTCATCA--GT-GGGGACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACACA-------A-GTA--G--GAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--ACA-------AC---TTG-AC----AGC-AAGT-TGATG-C-A-AATATCAAC-AGGT-G-ATGACAGAC---CA-TTCACACTTGGAGTT-CCA-ACCATT------TG-AAGTGTG-ATACACTAGaaccgaatcaaatgaaccctaatcgtcccagcc
gi|7 : ctgcttgcagtggcaatcgaaaattttatgagcacatgtttcagcttcgaattcgatttcgcaaatcACTTGA-CAGCAA-GTTGATGCAAA-TATCAA--CAGGT-G-ATGA---CAGAC---CATTCACACTTGGAGTT-CCAACCATT------TGAAGTGTG-ATACACTA-GCT-----T------GTGACAC----CTT---------A--------A----T-TGT--TATG-TT-TTACAG---TTTCGCTAGATAAT--ACT-TGAGACGAGATATTTGA----ATGTG-cttgtgacaccttaattgttatgttttacagtttcgctagataatacttgagacgagatatttgaatgtgag
gi|8 : ctgcttgcagtggcaatcgaaaattttatgagcacatgtttcagcttcgaattcgatttcgcaaatcgcaccgatccagaattttcctaaattttcacgattccggttaaaaatttagcgccatcattgtcgatatgaaacactacaaaatgggggtgcatcgagacggtcactaggcgtatggtaatactttaaaattctgtatttatggatatttagaggagaagtcatctatcaccgtttgtacaatgtagagaaatgatcttatcgcttactcatcgtgtttttccaggcatctgattatcgaattcaactaaagttttatgtctgcgcatgcattaatgtaataaaacaccgaaattaatgagtataataaagttcatcagtggggactcttactaagccgacacaagtaggagtggacaactgcaaatttcaacaGCGATTCACTTCG------TTTG---A---TT--C--------------GG-T--ACAC--CA-AT--TC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----GTTT-----G------GT----TC------AAAATTT--AGT---ATCAAG-T-GT-------AA--ACA--AC-T----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AACACTTT-----AC--TTTTG-ATC-AAA--A-CAATGGGAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----A----CCGTAT-GTACTTG--------T--A-AG--------TTAT-GCGCT-A-C--T-CTGT------TTAAGCA---T---ATT-A------TGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTATGT-CTGCACAT--C-TTA---TGA-G---AAAACAC---AATT-------------------CA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGTG-------ATGTACCG-TGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCG--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AATC-TGATG-C-A-AATTTCAAC-A-GT-G-A--ACAGA----CA-TAAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ATTCACTACA-CA-ag
gi|8 : gctgtgcggtgaccatgcaccaaaaattttgatgcacc----CG-TGAG----TGGA--C--------AAC------TGCAAATTTC-GTCTACTAGA-CA-CAA-TCTGATGCAAA-TTTCAA--CA-GT-G-A--A---CAGA----CATAAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATTCACTA-CAC-----A------GT-ACACTTGACTAGTGA----CA--------A----TTTAT--TATG-TT-CT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CTAAGTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---TGT----ATATACAC-------TTTTCAAAT---C-TGTTTTAAAATTTACAT-TAAG--TTTTT-TTT-gtacacttgactagtgacaatttattatgttctaatttcctaatactcaagatttgaatgtgctaagtttgaattctaagtcagtgatgtatatacacttttcaaatctgttttaaaatttacattaagtttttttt
gi|9 : gctgtgcggtgaccatgcaccaaaaattttgatgcaccgcgattcacttcgtttgattcggtacaccaattcggaattccaaatttcggtttggttcaaaatttagtatcaagtgtaaacaactaaatggcggcaacgagacggtctgaggtgttggaacactttacttttgatcaaaacaatgggaagtaggacaaatcatctaccgtatgtacttgtaagttatgcgctactctgtttaagcatattatgagttcaacaagttctatgtctgcacatcttatgagaaaacacaattcaagtggactcttactaagccgacgtgatgtacG-TC--TGAG-GTGT-T--GG-AATACTTT-----AC--GTTTG-ATT-AAA--A-ACATGGAAATT---AGGA-CAC-AT
gi|9 : AT-ACGCT-A-C--AACCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CGGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GC--ACTC-----TATATAACTA-----------AG-CGACACG-------ATGTACAG-TGAGTTGACAA--AT-GACA-ATTTCA--TCTTTAAAAGACTTTTAG-AC----A-C-AAGC-CGTTG-C-A-AATATC-----------A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTTTG-ATacgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatgacaatttcatctttaaaagacttttagacacaagccgttgcaaatatcaacggacatgaatggatccaaaattgaagtttgataatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|9 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacTAGA-CA-CAA-GCCGTTGCAAA-TATCAA--C---------------GGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTTTG-ATA-A-TA-CAA-----AAT----GT-ACAC-----TTGTGA----CA--------A----T------------------AA---T----C----TATT--A---------------TTTGA----ATGTG-TCATTTTTTTTTTAA--TG-C-TA-ATTTC--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACAC-------TTTTCAT-T---C-TTTTTT----TTTACAT-TAAT--TTT-T-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--TTA-TTGAACCATTACTT----AGT--TTT-TTC------------A-----AG-TTT----G-T------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGATTCGA--TTCG-----------------AAA--AAATCG----------AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGaatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
blockSeqs : TG TT GTCGGTCGA TG ACTTAGTTCATTTC G GG CG GA TG CA G TTC AC TCA TTCGG AGTTC TTGGCA CGCG GGTTTCC T GCC CGC A CGATATG CT CT A AAAC AC AAA C TG G T AC T TCA T . AA T A GAA TAG A G C TCTATCA T TGTT G AAATGATC T T G TC A GTTTTT CTA CTG T CCATTA T TA A GAACTT G TT A ATGT A TTA CGA AAT T TAAA TC GT C GG TAAATT ATA AATTACCTCAT A . AC CC G C GT TTTAAAAGACTTT A TCTT G T T C A T TCA A GG A A TGA C TTCACACTTGGAGTTC C CC GAATAG C T T A A G A A AA A A A ATTG C ACACTT GT A CC GAATAG T T ACTAAAT A TTGAC AAAT TTTAAATT CTAA T AT T A AC AAT G TAGA GA A ACGAGAT ATAC C T TTTT GC G A T T AG TGACGTTTAATAC T GAT ATAA TTATTTT AAATC AAAA C TT GTG A A T GG A CTTATATT AA C CTCACGAGGAAAGTTTTC CAGTA . T . T AT ATAGATTAAAAAGAG . A C GC
blockSeqs : . TT AAAAAT . A A . G A . . G A C . A TGTT C . GGTTCC T T CA . A . . A . . AT . . . . . . TCA . . AA . . AA . . . C ACCTA . TGTA . . . . . . A . . . . T . . . . . G . C . . . T . . . . . . TA ATA . A . T . . . . TTTAAAAGACTTT . CG . A . . . T GTA . G . . TA . TGAATGGATC . . . C G . C . . . . . G . . TGA . AT . . . . . . TCTAAAT G C . TTATT . C C . . . . . . . . . . C A TTTT . . . . T . . . TT . . CTT . . . TT . . . . . TTAAGA . . TCAGGAGGGAAGTTTTC . . . . A . AA . . . .
blockSeqs : . TT AAAAT . G G . . A . . G . C . G C . . GGTTC T A TA . . . . . . . . . . . . . . TCA . . . . . A . . . C ATCTA . ATGC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . TA . . A . T . . . . TAC . . . . . . . . TCA . G . . A . TGAATGGATT . . . C T . C . . . . . . . . TA . AT . . . . . . ACTAAAT . C . . . C . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . CT . . . CT . . . . . TTTAGA . . TCATAAGGAAAGCTTT . . . . T . A . . . .
blockSeqs : . TT TTCGA . . . . . A . . G . C . A . . . GGTTC T . TG . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . A . . . A TCTAC . ATGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . T . . A . T . . . . TAC . . . . . . . . TCA . G . . A . TGGAGAATAC . . . C G . A . . . . . . . . A . AT . . . . . . AAT . T . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . AA . . . TT . . . . . TTTAGA . . CATGAGTAAAGTTTTT . . . . A . A . . . .
blockSeqs : . . TTCGG . . . . . A . . G . C . A . . . A T . CG . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . C ATCTA . TGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . T . . G . A . . . . GTC . . . . . . . . TCA . G . . G . GCGAGTGGAC . . . . G . C . . . . . . . . A . AT . . . . . . AAT . T . . . C . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . CT . . . GT . . . . . CTTAGT . . CCTATGAAAAGTCTA . . . . A . A . . . .
blockSeqs : . . AAAAT . . . . . A . . G . C . A . . . A T . CT . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . G . . . C ATCTA . TAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T . . . . . . A . . G . C . . . . AAG . . . . . . . . TCA . G . . A . TGAATGGATC . . . . G . A . . . . . . . . A . AT . . . . . . AA . C . . . C . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TT . . . GT . . . . . TTAGT . . AATGAGGAAATTTTT . . . . A . A . . . .
blockSeqs : . . TTTGA . . . . . A . . G . C . A . . . C T . CA . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . G . . . C ATCTA . TGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . T . . A . C . . . . GTC . . . . . . . . TCA . G . . A . TAAATGGATC . . . . T . C . . . . . . . . G . AT . . . . . . A . C . . . C . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TT . . . TT . . . . . CTTAG . . CATGAGGAAAATTTT . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . GAAAA . . . . . A . . C . C . A . . . A T . CG . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . . . C ATCTA . TGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T . . . . . . T . . A . T . . . . TAC . . . . . . . . TCA . G . . G . TGAATGGATC . . . . G . G . . . . . . . . A . AT . . . . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . CT . . . T . . . . . CTTAG . . AAGTTTGTT . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . AAAAT . . . . . A . . T . C . A . . . G T . CG . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . A . . . C TCTA . TCT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . G . . . . . . T . . A . T . . . . TAC . . . . . . . . TC . G . . A . TGGATGATC . . . . C . C . . . . . . . . G . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . CT . . . G . . . . . CTTA . . AAGTTTGTT . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . AAAAT . . . . . A . . G . C . G . . . C T . CG . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . C . . . C TCTA . GGC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T . . . . . . A . . A . T . . . . TTC . . . . . . . . CA . G . . G . GGAGTGGAC . . . . G . A . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . CT . . . G . . . . . CTTA . . AAGTTTGT . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . GAAAT . . . . . A . . G . C . A . . . C . . TG . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . A . . . C TCTA . TGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . G . . . . . . T . . A . T . . . . GTC . . . . . . . . TC . A . . G . TGAGTGGAC . . . . G . C . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . T . . . . . CTTT . . AAGTTTGT . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . TTTGA . . . . . A . . G . C . A . . . C . . TA . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . G . . . . TCTA . TGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T . . . . . . T . . G . . . . . . TAC . . . . . . . . T . G . . G . TGATC . . . . G . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T . . . CTTA . . AAGTTTGT . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . AAAA . . . . . A . . G . T . A . . . A . . AG . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . TCTA . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . . . GTC . . . . . . . . T . . . . A . TGATC . . . . G . C . . . . . . . . . . . . . . . . T . . AAGTTTGT . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . CGA . . . . . A . . G . C . G . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . CTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAC . . . . . . . . . . . . . A . TGATC . . . . T . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . AAA . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . TAC . . . . . . . . . . . . . . . AATGC . . . . T . T . .
blockSeqs : . CGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGATC . . . . . . C . .
blockSeqs : CGG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACTG . . . . . . . .
blockSeqs : CGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . .
blockSeqs : CGA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : NAAAN************ T** ***** ATCTA******* TGT********** ******* **** **** C**** CAGAGGAAAGTTTTT********************** ************** ** **************** ** **********
originalCons : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CG------C--G---A---TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GT----TC------CAAATTT--AGT---ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-C--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCATCT----ATCTACCGTAT-GTACTTG--------TGTA-AG--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGCG-------ATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ATNCACTAGA-CA-CAA-GCCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CGGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACAC----CTTGTGA----CA--------A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACAC-------TTTTCATAT---C-TTTTTT----TTTACAT-TAAG--TTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--TTA-TTGAAGCATTACTTTTAGAGT--TTT-TTC-C--A-T-AGGAA-----AGTTTT----GTT------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGANTCGA--TTCG-A--------------AAAA--AAATCG----------AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAAATCGTCCCAGCC
finalCons : AGGGCT--GTGCGGTGCAC--CGNAAAN------------TT--C--------------GA-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATTC-----G------GT----TC------CAAATTT--AGT---ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCGG--CAACG-AGACGG-TC--TGAG-GTGT-C--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGGA-CAA-ATCAATCTA-------CCGTAT-GTACTTGT----------A-AG--------TTAT-ACGCT-A-C--A-CCGT------TCAAACA---T---ATT-A------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CGA-G---AAAACAC---AATT--TGAAT-ATCA----GTTCA--A--GT-GG--ACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGCG-------ATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ATNCACTAGA-CA-CAA-GCCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CGGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACACC----TTGTGA----CA--------A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACAC-------TTTTCATAT---C-TTTTTT----TTTACAT-TAAG--TTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--TTA-TTGAAGCATTACTTTTAGAGT--TTT-TTCCAGAGGAAAGTTTTT----------------------T-----TCAGTA--------------TCAA-T--TGANTCGA--TTCG----------------AAAA--AAATCG----------AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAAATCGTCCCAGCC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GTGCACCGAAATTTTTGGTGCATCACGATTTATACCATTCGATTCGA
Unaligned ( gi|35 ): GAATGGACCCTGAATCGTCCCAGCCCTACTC
Unaligned ( gi|36 ): ATGAACCCTGAATCGTCCCAGCCCTAA
Alignments
lowQualScore : 333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111111111 2222222 1111111 1111 2222222222 111111111111111111111111 111 11111111111 1111111111111 111111111111111111 333333333333 222222222 11111111 1111111 1111 1111111111111 111111 111 33333333333333333333333333 222222222 6666666666666 111111111111111 1111111111111
lowQualScore : 55 777777 555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 22 111111111111 3 33 88 22 22 3333 333 33 333 66666 2 99999 666666 4444 4444444 555 444 5 333 2 0000000 33 33 4 5555 33 777 2 33 2 2 2 2 5555 2 88888 33 2 2 4444 444 2 2 3333333333 444 2 1 2 2 333333333333333333333333 2 0 2 55 777777 444 444 2 999999 2 33 2 777777 2 66 2 6666 2 555 444 444 2 5555 33 33 66 7777777 000 33333333333 0 1 9999999 99 33 2 2 33 7777777777777 2 8888 2 4 2 2 2 4 444 2 22 2 2 555 6666 777777777777777777 2 22 555555 8 1 2 1 2 2 2 3 44 6 3 3 999999 9999 999999 44 3 44 888888 3 3 444444444444 6 000000000 6666 88888888 6666 9 66 2 2 33 555 2 6666 44 3 0000000 6666 6 1 4444 44 3 3 3 5 33 5555555555555 2 888 6666 9999999 222222 6666 3 44 000 3 3 3 44 11111111111111111111111111 3 66 666666666 2222222222222 555 777777 2 2 1 33 666666666666666 3 2 2 33 4444444444444 2 2 33
lowQualScore : .. ...... ................................................... . .. ............ . .. .. .. .. .... ... .. ... ..... . ..... ...... .... ....... ... ... . ... . ....... .. .. . .... .. ... . .. . . . . .... . ..... .. . . .... ... . . .......... ... . . . . ........................ . . . .. ...... ... ... . ...... . .. . ...... . .. . .... . ... ... ... . .... .. .. .. ....... ... ........... . . ....... .. .. . . .. ............. . .... . . . . . . ... . .. . . ... .... .................. . .. ...... . . . . . . . . .. . . . ...... .... ...... .. . .. ...... . . ............ . ......... .... ........ .... . .. . . .. ... . .... .. . ....... .... . . .... .. . . . . .. ............. . ... .... ....... ...... .... . .. ... . . . .. .......................... . .. ......... ............. ... ...... . . . .. ............... . . . .. ............. . . ..
lowQualScore : 00 222222 777777777777777777777777777777777777777777777777777 8 33 000000000000 2 88 22 22 66 1111 777 55 777 44444 1 77777 111111 7777 3333333 888 444 0 333 4 0000000 22 22 7 0000 22 444 4 22 5 2 2 2 8888 1 66666 11 2 4 5555 111 4 4 1111111111 111 4 6 4 4 111111111111111111111111 5 2 4 66 222222 444 444 5 777777 5 44 5 222222 9 88 9 6666 9 000 777 333 7 7777 77 77 33 6666666 000 66666666666 7 4 3333333 88 77 7 7 77 5555555555555 5 8888 5 4 2 2 2 4 222 2 88 2 2 888 2222 000000000000000000 0 88 888888 0 8 1 0 1 2 9 1 22 2 1 1 777777 6666 222222 22 1 22 888888 1 1 888888888888 2 777777777 5555 88888888 5555 1 88 9 9 99 000 9 1111 22 1 0000000 5555 2 8 2222 66 3 3 3 7 99 7777777777777 9 999 5555 3333333 999999 5555 1 22 888 1 3 3 22 99999999999999999999999999 1 88 777777777 5555555555555 999 777777 7 7 9 77 777777777777777 4 7 7 77 7777777777777 7 7 77
consensus : AGGGCT--GTGCGGTG------CA--------------C--C----------------G-AAA------------ATTT--CG------------A-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATT-C-----G------GT----TC------CAAATTT--AG---T-ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCG--GCAACG-AGACGG-TC-TGAG-GTGT-C--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGG-ACAA-ATCA-------ATCT---A-CCGTA-TGTAC-TTG----------T-A-AG--------TTA-TACGC-TA--CACCG------TTCAAACA---T---A-TTA------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CG-AG---AAAACAC---AATT--TGAA-TAT----CAGTTCA--A--GT--GGACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGCGATGTA-------CAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ATNCACTAGA-CA-CAA-GCCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CGGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACAC----CT---TGTGA----CA--------A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACACTT-------TTCATAT---C-TTTTTT----TTTACATT-AAG--TTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--T--------------------------TA-TTGA--AGCATTA-CTTTTAGAGTTTTTTC-C---A--GAGGAAAGTTTN--TTTCA------GT-ATCAA-TTGANTCGA--TTC---------------GAA-A-A--A-------------AATCG-AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAAATCGTCCCAGCC
Reference ( family-3214 ) : AGGGCT--GTGCGGTG------CA--------------C--C----------------G-NAA------------ANTT--CG------------A-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATT-C-----G------GT----TC------CAAATTT--AG---T-ATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCG--GCAACG-AGACGG-TC-TGAG-GTGT-C--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGG-ACAA-ATCA-------ATCT---A-CCGTA-TGTAC-TTG----------T-A-AG--------TTA-TACGC-TA--CACCG------TTCAAACA---T---A-TTA------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CG-AG---AAAACAC---AATT--TGAA-TAT----CAGTTCA--A--GT--GGACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGCGATGTA-------CAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ATNCACTAGA-CA-CAA-GCCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CGGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACAC----CT---TGTGA----CA--------A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACACTT-------TTCATAT---C-TTTTTT----TTTACATT-AAG--TTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--T--------------------------TA-TTGA--AGCATTA-CTTTTAGAGTTTTTTC-C---A--GAGGAAAGTTTT--TTTCA------GT-ATCAA-TTGANTCGA--TTC---------------GAA-A-A--A-------------AATCG-AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAAATCGTCCCAGCC
gi|1 : AGGGCT--GTGCGGTG------CA--------------C--C----------------A-TGA--------------TT--CA------------A-T--GCAC--CG-AT--CC--AGAATT---C-CAAATTT---CG----ATT-C-----G------TT----TC------CAAATTTTAAG---C-ATCATG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCG--GCAACG-AGATGG-TC-TGAG-GTTT-C--AG-AATACTTTCAATTAC--TTTTG-ATT-AAA--G-CAAGGGAAAGT---AGG-ACAA-ATCATCTTATGATCT---A-CCGTA-TGTAC-TTGACACTACTTGT-A-AG--------TTA-TACGC-TA--CACCG------TTCAAACA---T---A-TTA------CGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTATCT-CTGCGCAT--C-TTA---TG-AG---AAAACAC---AATT--TGAA-TAT----CAGTTCA--A--GT--GGACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGCGATGTAGTATGTACAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTTG--CCT-------AA---TAG-AC----A-C-AAGC-TGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--AGAGAGTGTCA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT-------G-AAGTGTG-ATANTATAGA-CA-CAT-GCTGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CAGAGTGTCATGAA----TGGA--T-CCAA--CAT-------GAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACAC----CTGCTTGTGA----CA--------A----TCTTT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-T---CGT----ATTTACA-----------TCATAT---A-TTTTTT----TTTACAAT-AAG--TTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAGGTAA--TTATTGAAGCATTATTTAGAGTTTTCCTA-TTGGC-AGCATTAGTTTTTAGAGTTCTCTC-CTTCA--TAGAAAAGTTTTGTTTTCA------GTGATCAA-TTGAATCGA--TTC---------------GGA-A-A--AATAAATCGCAAAAAATCG-AATTGCAG-CATTTTG--AATCG-AATCGTCCCAGCC
gi|10 : G-TC-TGAG-GTGT-T--GG-AATACTTT-----AC--GTTTG-ATT-AAA--A-ACATGGAAATT---AGG-ACA----CA----------T---A-C-----------------------------G--------CTA-CA---------ACCG------TTCAAACA---T---A-TTA------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CGGCGCAT--C-TTA---CG-AG---AAAACAC---AATT--TGAA-TAT----CAGTTCA--A--GT--GCACTC-----TATATAACTA-----------AG-CGACACGATGTA-------CAG-TGAGTTGACAA--AT-GGCA-ATTTCA--TCTTTAAAAGACTTTTAG-AC----A-C-AAGC-CGTTG-C-A-AATATC-----------A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTTTG-AT
gi|10 : TAGA-CA-CAA-GCCGTTGCAAA-TATCAA--C---------------GGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTTTG-ATA-A-TA-CAA-----AAT----GT-ACAC-----T---TGTGA----CA--------A----T------------------AA---T----C----TATT--A---------------TTTGA----ATGTG-TCATTTTTTTTTTAA--TG-C-TA-ATTTC--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACACTT-------TTCAT-T---C-TTTTTT----TTTACATT-AAT--TTT-T-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--T--------------------------TA-TTGA--ACCATTA-CTT----AGTTTTTTC-------------AAGTTTG--TTTCA------GT-ATCAA-TTGATTCGA--TTC---------------G-A-A-A--A-------------AATCG-AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGaatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|11 : gtctgaggtgttggaatactttacgtttgattaaaaacatggaaattaggacacatacgctacaaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctatgtcggcgcatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgcactctatataactaagcgacacgatgtacagtgagttgacaaatggcaatttcatctttaaaagactttGCGGTG------CA--------------T--C----------------G-AAA------------TTTT--CG------------G-T--GCAC--Caacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
gi|11 : gtgtCGATG------CA--------------C--C----------------G-CGATTCACTTAGTTCATTT--CG------------A-T--GCAC--CG-AT--CT--GGAATC---C-CAAATTT---TG----ATT-CAGTTCG------GT----TC------AAAATTT--AG---T-ATCACA-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCG--GTAACG-AGACGG-TC-TGAG-GTGT-T--GG-AATGCTTT-----AC--TTTTG-ATT-GAA--A-CAATGGAAAAT---AGG-ACAA-ATC--------ACCT---A-CTGTA-TGTAC-TT-----------T-------------TTA-TACGT-AA--CACCG------TTTAAACA---T---A-TTA------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------ATATGT-CTGTGTAT--C-TTA---TG-AA---AAAACGC---AA-------------------TTCA--A--GT--GGACTG-----T-T---ACTA-----------AACCGACACGATGCA-------CAG-TGAGTGGACAA--CT-GCAA-CTTTGA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGC-CGATG-C----------AC-A-GT-G-A--ACAGA----CA-TGAA----TGGA--T-TCA-A--AAT------GC-AAGTGTG-ATACACTACA-CA-gattcacttagttcatttcgatgcaccgatctggaatcccaaattttgattcagttcggttcaaaatttagtatcacatgtaaacaacaaaatggcggtaacgagacggtctgaggtgttggaatgctttacttttgattgaaacaatggaaaataggacaaatcacctactgtatgtactttttatacgtaacaccgtttaaacatattacgagttcagcaagttatatgtctgtgtatcttatgaaaaaacgcaattcaagtggactgttactaaaccgacacgatgcacagtgagtggacaactgcaactttgatctactagacacaagccgatgcacagtgaacagacatgaatggattcaaaatgcaagtgtgatacactacacagtacacttgtgacaactaatttatcatgttttaatttcctaataatcaagatttgaatttgccaattttgaattctatgtcagtgac
gi|11 : gtgtggtgcaccgaaaatttT-------AC---TAA-ACCG--A-C-A----CGATG-C-A---------C-A-GT-G-A--GTGGA----CA-------------------------AC------TGCAACTTTG-ATCTACTAGA-CA-CAA-GCCGATGCA-----------CA-GT-G-A--A---CAGA----CATGAA----TGGA--T-TCAA--AAT------GCAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACAC-----T---TGTGA----CA--------ACTAATTTAT--CATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--AAT-CAAG-------ATTTGA----ATTTG-CCAATTTTG----AA--TT-C-TA-TGT-C--AG-------------TG-A---Cgtacacttgtgacaactaatttatcatgttttaatttcctaataatcaagatttgaatttgccaattttgaattctatgtcagtgac
gi|12 : gtgtggtgcaccgaaaatttcgatgcaccgcgattcacttagttcatttcgatgcaccgatctggaatcccaaattttgattcagttcggttcaaaatttagtatcacatgtaaacaacaaaatggcggtaacgagacggtctgaggtgttggaatgctttacttttgattgaaacaatggaaaataggacaaatcacctactgtatgtactttttatacgtaacaccgtttaaacatattacgagttcagcaagttatatgtctgtgtatcttatgaaaaaacgcaattcaagtggactgtTT--CG------------A-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----GTT-C-----G------GT----TC------AAAATTT--AG---T-ATCATA-T-AT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCG--GCAACG-AGACGG-TC-TAAG-GTGT-TCAGG-AATGTTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGG-GCAA-ATC--------ATCT---A-CCGTA-TGTAC-TTG----------T-A-AG--------ATA-TACGC-TA--CACCG------TTCAAACA---T---A-TTA------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTAT
gi|12 : gggctgtgcgcgggtgcacgcggaaagcttgtcgggaatggcaccgcggaaatgtgatgcacggcgtactggtcggtcgaCAA---AATT--TT---TAT----CAGTTAA--C--ATC-GGACTC-----T-T---AGTA-----------AGCCGACACGATGTA-------CAA-TGAGTGGACAA--CT-ACAA-ATTTCA--TCG-------TC---TAG-AC----A-C-AAGC-TAATG-C-A-AATATtgttttttctgcttgtttatttttttctatctgatgaattatattcaccccaatccgcccgcaccaaaatttttatcagttaacatcggactcttagtaagccgacacgatgtacaatgagtggacaactacaaatttcatcgtctagacacaagctaatgcaaatat
gi|13 : gggctgtgcgcgggtgcacgcggaaagcttgtcgggaatggcaccgcggaaatgtgatgcacggcgtactggtcggtcgattcgatgcaccgatccggaattccaaatttcggttcggttcaaaatttagtatcatatataaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttttacttttgattaaaacaatggaaagtagggcaaatcatctaccgtatgtacttgtaagatatacgctacaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctattgttttttctgcttgtttatttttttctatctgatgaattatattcaccccaatccgcccgcacACAA--TT-TTGA-ATATCAGTTCA-------AG---TGG-ACTCTTA-CTAAGC-TGACG-C-ATGGTA-CAGC-A-GT-G-------GA----CA---AC----TG-------CA-A--AAT------T-------CG--TCTACTAGA-CA-CAA-ACTGATGCAAA--ATCAA--CG-GT-GAA--A---CAGA----CATGAA----TGAA--T-CCAA--AAA------GAAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GTAACAC----C----TGTGA----CA--------A----TCTTT--TATGTTT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAA--------ATCTGA----A-GTGCCCAATTTTG----AA--TT-CATATAGT-CAGAG-------------TT-ATT-CTT----ATTTACTCTA-------TACCCAT---A-ATCCTT----TTAACAAT-AAG--TTTG--TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGTAA--T--------------------------TA-TTGA--AGCATTA---TTAAGAGTTTTTCCTC---AT-AAGGAAAG-CTT--TTTCA------GT-ATCAA-TTGAATCGA--TTC---------------GAA-A-A--A-------------AATCG-AATCGCAGCCATTTTG--AATCAAAATC
gi|14 : gagaaaacGGCT--GTGCGGTG------CA--------------C--C----------------G-AAA------------ATTT--CG------------A-T--ACACCGCG-AT--TC--aaaccgaaacgaattgaccctgaaatcgtcccaaccc
gi|14 : TT--CG------------A-T--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATT-C-----G------GT----TCGGTTC-CAGATTT--AG---T-ACCATG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCG--GCAACG-AGACGG-TC-TGAG-GTGT-T--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AGA--G-CAAGGAAAAGT---AGG-ACAA-ATCA--------TCT---A-CCGTA-TGTAC-TTA----------A-A-AA--------TTA-TACGC-TA--CACCG------TTCAAACACTAT---A-TTA------CGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTATGT-CTGTGCAT--C-TTA---CG-AG---AAAACAC---AATT--GGAA-TAT----CAGTTCC--A--AT--GGACTT-----A-T---ACTA-----------AGCCGACACGATGTA-------CAG-AGAGTGTACAA--CT-GCAA-ATGTCA--TCG-------TC---TAG-AC----A-T-AAGC-TGATG-C-A-AATA-----------------CGGA----CA-TGA-----------T-CCA-A--AGT------TG-AAGTGTG-ATacttcgttcgattcgatgcaccgatccggaattccaaatttcgattcggttcggttccagatttagtaccatgtgtaaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctgaggtgttggaatactttacttttgattagagcaaggaaaagtaggacaaatcatctaccgtatgtacttaaaaattatacgctacaccgttcaaacactatattacgagttcaacaagttctatgtctgtgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttccaatggacttatactaagccgacacgatgtacagagagtgtacaactgcaaatgtcatcgtctagacataagctgatgcaaatacggacatgatccaaagttgaagtgtgatg
gi|15 : ggctgtgcggtgcaccgaaaatttcgatacaccgcgattcacttcgttcgaGGGCT--GT-CGGTG------CA--------------C--C----------------GAAAA------------ATTT--CG------------AGT--GCAC--CG------C--G--ATT---C----ACTT---CG-----TT-C-----G------GT----TC------g
gi|15 : TT--CG------------A-T--GCAC--CG-AT--CC--AGAATT---C-CAAATTT---CG----ATT-C-----G------GTCGCGTT------CAAATT---AG---T-ATCACG-TAGT-------AA--ACA--AC-A----A--AAAT-TGCGCG--GCAATG-AAACGG-TC-TGAG-GTGT-C--GG-AATACC---------------------AAA--G-CAATGGAAAGT---AGA-CCAA-AT-A-------ATCT---A-C-GTA-TGAAC-TTG----------TTA-AA--------TTA-TGT-C-TA--CAC-G------TTAAAACA---C---A-TTA-------GA-GTTCAAC--AATT-T------CTATCTGCTGCGCATTTC-TTA------AA---AAAACAC---AATT--TGAA-TAT----CAG-TCA--A---T--GGACTCTAAATT-T---ACTA-----------AG-CGACGCAAAGTA-------CAG-CGAGTGGACAA--CTGGCGA-ATTTCG--TCT-------AC---TAG-AC----A-T-AAGCTTGATGCC-A-AATATCAAT-A-GT-GAA--ACAGA----CA-TGGA----T-GA--T-CCA-A--AA-------TG-AAGgatgcaccgatccagaattccaaatttcgattcggtcgcgttcaaattagtatcacgtagtaaacaacaaaaattgcgcggcaatgaaacggtctgaggtgtcggaataccaaagcaatggaaagtagaccaaataatctacgtatgaacttgttaaattatgtctacacgttaaaacacattagagttcaacaatttctatctgctgcgcatttcttaaaaaaacacaatttgaatatcagtcaatggactctaaatttactaagcgacgcaaagtacagcgagtggacaactggcgaatttcgtctactagacataagcttgatgccaaatatcaatagtgaaacagacatggatgatccaaaatgaag
gi|16 : gggctgtcggtgcaccgaaaaatttcgagtgcaccgcgattcacttcgttcggAGGGCT--GTGCAGTG------AA--------------A--T----------------G-AAA------------ATTT--TG------------A-T--GCAC--C
gi|16 : TT--CA------------A-T--GAAT--CA-AT--CT--GGAATT---C-CAAATTT---TG----ATT-CTGTT-G------GT----TC------AAAATTT--AG---C-ATCACT-T-GT-------CA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCA--GCAGCG-AGACGG-TC-TGTG-GTGT-G--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATA-AAA--T-CAATGGAAAGG---AGC-ACAA-GTCA---------CT---A-CTGTA--------TG----------T-A-AG--------TTA-TGCGC-TA--TACCG------TTTAAGCA---A---A-TTA------GGG-GTTCAAC--AAGT-T------CTATataatctacttcatttgattcaatgaatcaatctggaattccaaattttgattctgttggttcaaaatttagcatcacttgtcaacaacaaaatggcagcagcgagacggtctgtggtgtgggaatactttacttttgataaaatcaatggaaaggagcacaagtcactactgtatgtaagttatgcgctataccgtttaagcaaattaggggttcaacaagttctat
gi|17 : agggctgtgcagtgaaatgaaaattttgatgcaccataatctacttcatttgaAGGGAT--GTGCGATT------CA--------------CTTC----------------G-TTT------------GATT--CG------------A-T--ACAC---A-AT--CC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----ATT-T-----GTTGGCAGT----TT------GAAATTT--AG---T-ATCACA-T-GA-------AA--ACA--AC-AAAACA--AA---CA-GTG--GCAACG-AGACGG-TC-T-------------G-AATACTTT-----AC--TTATG-ATTAAAA--A-CACTGGAAAGG---AGG-GCAAGATC--------ATCT---ACCCGTA-TGTAC-
gi|18 : gtatatggtacacaactccta-C--AG-------------TG-A---CGT----ATATACACTT-------TTCATAT---C-TTTT------TTTACATT-CAG--TTTTT-TTT-TACCCT-TAA-ATTAAGGAA--T--------------------------TA-TTGA--ACCATTA-CTT----AGTTTTTTC-------------AAGTTTG--TTTCAGTACCGGT-ATCAA-TTGATTCGA--TT----------------AAA-A-A--A-------------AATCG-AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCat
gi|19 : TTTACACTTATTTTTTTTTTTTT---T-TTTTTT----TTTACATCCAAG--TTTCT-TTT-T---TTATAATATAAAAAAAGGT--------------------------TA-TTGATTAGTGTAA----TTAG-------TC-C---C--TATGAAAAGTCT--ATTCA------G-----AA--------GA--TT-----------------AA-ATA--A-------------AATCA-AATTGCGG-CATTTTG--AATCGAAATCGtaaccgactctaacgaaccccgtatcgtcccagc
gi|2 : AGGGCT--GTGCGGTG------CACCGAAAATGATGCAC--C----------------G-CGATTAACAT-----AATT--CGTTCGCGTTCCGAA-T--GCAC--CGGAT--CC--AGAATT---C-CAA-TTC---CG----ATT-C-----G------GT----TCGGTTTCCAAATT---AG---TTATCACG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AAAAATG-GCG--GCAACGGAAACGG-C---GAGTGGAT-C--G--AATA-------------------AAC-AAG--C-CAATGGAAAGT---AGGAACAA-AT-A-------ATCT---A-CCGTATTGTAC-TTG----------T-A-AAT-------TTATTGTGC-TAG-CACCG------TT-AAACA---C---ATTTA------GGA-GTTCAAC--AAGTAT------CTACAT-TCTCGGAT--C-TTA---TGAAG---AAAACCA---AATT--TGAATTAT----CAGTTCA--A--GT--GGAA-C-----T-T---GCTAAATTACCTCATAGCCGACGCAA-GTA-------CAGACGAGTGGGCAACCCT-GCGACATTAC---TCT-------AC---TAGAAC----A-TAAAGC-TGATG-CAA-AATAGTAAT-A-GTAG-AT-ACAGA----C--TGGA-----GAA--TACCA-A--AATGAATAGTG-AGCTGTG-ATACACTAT--CA-CAA-Gaaccgaatcgaatgaaccctgaatcattccagcc
gi|2 : TCTACTAGAACA-TAAAGCTGATGCAAAATAGTAA--TA-GTAG-AT-A---CAGA----C-TGGA-----GAA--TACCAA--AATGAATAGTGAGCTGTG-ATACACTATCAC-----AA-----GT-ACAC----CC---TGTGA----CA--------A----TCTATATTATG-TT-TT--AAAATTTCC-C----TAATGAACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTGCCCAATTTTG----AAGCTT-C-TA-AGT-C--AG-------------TGTT---CGT----ATTCACA------------CATAT---T-TTTGTT----TTAACATT-A-----TTG--------------AA-GT------A--T--------------------------TA-T---------------TTTAGAGTTTTCCT-C---AATGAGGAAA-TTTT--TTTCA------GT-ATCAATTTGAATCGGATTTC---------------GAA-A-A--A-------------AATCGAAATCGCAG-CATTTTGGCAATCGAAATCGtacaccctgtgacaatctatattatgttttaaaatttccctaatgaactcaagatttgaatgtgcccaattttgaagcttctaagtcagtgttcgtattcacacatatttttgttttaacattattgaagtattattttagagttttcctcaatgaggaaatttttttcagtatcaatttgaatcggatttcgaaaaaaatcgaaatcgcagcattttggcaatcgaaatcgacaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|20 : agggctgtgcggtgcaccgaaaatgatgcaccgcgattaacataattcgttcgcgttccgaatgcaccggatccagaattccaattccgattcggttcggtttccaaattagttatcacgtgtaaacaacaaaaaaatggcggcaacggaaacggcgagtggatcgaataaacaagccaatggaaagtaggaacaaataatctaccgtattgtacttgtaaatttattgtgctagcaccgttaaacacatttaggagttcaacaagtatctacattctcggatcttatgaagaaaaccaaatttgaattatcagttcaagtggaacttgctaaattacctcatagccgacgcaagtacagacgagtgggcaaccctgcgacattacGGCTTGGTGCGGTG------CA--------------C--C----------------G-GAA------------AATTTGCG------------A-TGGGCAC--CG------C--ACGATT---C----ATGT---CG-----TT-C-----G------GT----TC------acaccgagaatcgacgaatggaccctgaatcgtcccagcc
gi|20 : TT--CG------------A-T--GCACG-CG-AT--CCCAGTAATT---C---AATTT---CGTTCGGTT-C-----G------GT----TC------CAAATTT--AG---T-ATCACGCT-GT-------AA--ACA--ACAA----A--AA---TG-GCG--GCAACG-AAACGGTTC-TGAG-GTGT-C--GG-AAgatgcacgcgatcccagtaattcaatttcgttcggttcggttccaaatttagtatcacgctgtaaacaacaaaaatggcggcaacgaaacggttctgaggtgtcggaagta
gi|21 : ggcttggtgcggtgcaccggaaaatttgcgatgggcaccgcacgattcatgtcgttcggGGGCT--GTGTGGTG------CA--------------C--CGAAAATTTCGATCACCG-CAATTCATTGTTTT-ATTT--CG------------A-T--GCAC--CG-AT--CC--AGAATT---C-CAAATTT---GG----ATT-T-----G------GT----TCGGTT--CAAATTT--AG---TAATCACG-T-GTA------AA--ACA--AC-A----AACAA---T---CG--GCAACG-AGACGG-TC-TGAG-GTG-----AG-AAAAC--------ACAATTTTG-Agta
gi|22 : --AGCATTA-CTTATATTTTTTTTTT-CTC-AC-GAGGAAAGTTTT--CTTCA------GT-ATGAA-TTGAATT-A--TTCAATAGATTAAAAAGAGAA-A-A--A-------------AATCG-TACCTCAG-TGTTTTG--AATCAAAATCa
gi|23 : G------------A-T--GCAC--CG-ATTGCC--AGAAT----C-CAAATTT----G----GTT-C-----G-------T----TC------CAAAT----AG---T-ACTACG-T-GG-------TA--ACA--ACAA----A--AA---TG-GCG--TCAAaaattgaatgaaccctgaatcgtcccagcc
gi|24 : aggtgcgcgtgcaaccgaaagatctcggcagccgcaattcacttgtcgattga-CAA-ATCAATGCAAA-TATCAAAACA-GT-G-A--ATTGCAAA----CATGAA----TGGG--T-CCAA--AAT------TAAAGTGTG-ATACACTA-CAC-----A------GT-ACA-----TT---TGTGA----CA--------A----TTAATC-TATG-TT-TT--AA---TTTT-C----a
gi|25 : TAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----CAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CAAATTCTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AGTGACGTTTAATACTG-A---CGT----GTTTACACTT-------TTCATAT---C-TTT
gi|26 : aGAGTTTTCCT-C---AT-GAGGAAAATTTT--TT-CA------GT-ATCAA-TTGAATCGA--TTT---------------G-A-A-A--A-------------AATCG-AATCGCAT-CATTTTG--AATCGAA
gi|27 : AA--T--------------------------TA-TTGA--AGTATTA---TTTAGAGTTTACCT-C---AT-GAGTAAAGTTTT--TTTCA------AC-ATCAA-TTGAATCGA--TTT---------------GAA-A-A--A-------------AATCA-AATCGCAG-CATTTTG--AATCGAccgaatcgaatggaccctgaatc
gi|28 : gtAATTTG--TTTCA------GT-ATCAA-TTGATTCAA--TTC---------------GAA-A-AAAA-------------AATCG-AATCGTAG-CATTCTG--AATCGAAATCG
gi|29 : T-C--AA-------------TG-A---CGA----ATTTACACTT-------TTTGTAT---A--TATTT----TTTACA-A-AAG--TTTGTGTTTATACCCT-TTA-ATAAAGGAA--T--------------------------TA-TTGA--AGCATTaattgaatgaaccctgaatcgtcccagcc
gi|3 : -T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TA-GCG--GCAACG-AGACGG-TC-TGAG-GTGA-T--GG-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGG-ACAA-AT-A-------ATCT---A-CCATA-TGTAC-TTG----------T-A-AG--------TTA-TATGC-TA--CACCG------TTCAAACA---T---A-TTA------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTGTAT-CTGCACAT--C-TTA---CG-AG---AAAACAC---AATT--TGAA-TAT----CAGTTCA--AGTGT--GGACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCAACATGATGTA-------CAG-CGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--TCT-------TC---TAG-AC----A-C-AAGC-TGATG-C-A-AATATCAAC-A-GC-G-A--ACGGA----CA-T---------GA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGCA-ATACACTAAA-CA-C
gi|3 : agggctgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAAC-A--T-G-A---TGTA----CAGCGAG----TGGA--C--------AAC------TGCAAATTTC-ATCTTCTAGA-CA-CAA-GCTGATGCAAA-TATCAA--CA-GC-G-A--A---CGGA----CATGA-----------T-CCAA--AAT------TGAAGTGCA-ATACACTA-AAC-----ACTAAATGT-ACAC-----T---TGTGAAAATTA--------A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-GCATTTTTT----AA--TG-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACACTT-------TTCATAT---C--TTTTT----TTTACATG-AAG--TTTTT-CTT-TAACCT-TAA-ATAACGGAA--T--------------------------TT-TTTA--AGCATTA-CTTT-----TTTTTTC-------------AAGTTTG--TTTCA------GT-ATCAA-TTGATTCGA--TTC---------------GAATA-A--A-------------AATCG-AATTGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGtaaatgtacacttgtgaaaattaatctattatgttttaatttcctaatactcaagatttgaatgtggcattttttaatgctaagtcagtgacgtatttacacttttcatatcttttttttacatgaagtttttctttaaccttaaataacggaattttttaagcattactttttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaataaaaatcgaattgtagcattttgaatcgaaatcgaaccaaatgaaccctgaatcgtcccagccct
gi|30 : agggctgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaaacaacaaaatagcggcaacgagacggtctgaggtgatggaatactttacttttgattaaaacaatggaaagtaggacaaataatctaccatatgtacttgtaagttatatgctacaccgttcaaacatattacgagttcagcaagttctgtatctgcacatcttacgagaaaacacaatttgaatatcagttcaagtgtggactcttactaagc-AATACTTT-----AC--TTTTG-ATA-AAA--G-CAATGGAATGT---AGA-ACAA-AT-A-------ATCT---A-CCATA-TGTAC-TTC----------T-A-AA--------TTA-TATGC-TA--aaccaaatgaaccctgaatcgtcccagccct
gi|31 : GGCG--GTGTGGTG------CA--------------T--C----------------G-AAA------------ATTT--CG------------A-T--GCAC--TG------C--G--ATT---CACGTCTTT---CG----ATT-C-----G------AT----
gi|32 : -TA--CACCG------TTCTAACA---T---A-TTACCATTACGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCgcacgggttcaaca
gi|33 : GTGATG------CA--------------C--C----------------A-AAA------------ATTT--CG------------G-T--GCAC--
gi|33 : GTG------CA--------------C--C----------------G-AAA------------TTTT--TG------------G-T--GCATCACG-AT--TT-----ATA---C-CA---TT---CG----ATT-C-----G------gatttataccattcgattcga
gi|34 : T--C-TTA---TG-AG---AAAACAG---AATT--TGAC-AAT----CAGTTCA--A--GT--GAAa
gi|4 : TGCGGTG------CA--------------C--C----------------G-AAA------------ATTC--GG------------A-T--GCACCGCG-AT--C
gi|4 : cTT--CG------------AGT--GCAC--CG-AT--CC--GGAATT---C-CAAAATT---CG----ATT-C-----G------GT----TCGGTT--CAAATT---AG---T-ATCA---T-AT-------AACTACA--AC-A----A-------TG-GCG----AACG-AGACGG-TC-TAAG-GTGT-TCAGG-AATG--TT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--AACAATGGAAAGT---AGG-ACAA-ATCA-------ATCT---A-CCGTA-TGTAC-TGG----------C-A-AG--------ATA-TACGC-TA--CACC-------TTCAAACA---T---A-TTA------CGATGTTCAGC--AA-T-T------C-ATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CG-AG---AAAACAC---AATT--GGAA-TAT----CAGTTCA--A---T--GGACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACACGATGTA-------CAG--GAGTGGACAA--CT-GCAA-ATCTCA--TCG-------TC---TTG-AC----A-C-AAGC-TAATG-C-A-AATATCAAC-A--C-G-A--GCGGA----CA-T---------GA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTGTATGCACTAAA-Cacttcgttcgattcgagtgcaccgatccggaattccaaaattcgattcggttcggttcaaattagtatcatataactacaacaatggcgaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttacttttgattaaaaacaatggaaagtaggacaaatcaatctaccgtatgtactggcaagatatacgctacaccttcaaacatattacgatgttcagcaattcatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttcaatggactcttactaagccgacacgatgtacaggagtggacaactgcaaatctcatcgtcttgacacaagctaatgcaaatatcaacacgagcggacatgatccaaaattgaagtgtgtatgcactaaactctaaatgtacactctgtgacatttaaattatctattatcttattagttactacactacaagatgtgaatgtgcattttttaaattgctaagtcatgagatcgaagcgcattttatataaatcttttttttaattaagttttgtttacccttaaatacaggaattaattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatccaatcgtagcattttgatcgaaatcgaaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|4 : ctgcggtgcaccgaaaattcggatgcaccgcgatcacttcgttcgaA----CA-GGAG----TGGA--C--------AAC------TGCAAATCTC-ATCGTCTTGA-CA-CAA-GCTAATGCAAA-TATCAA--CA--C-G-A--G---CGGA----CATGA-----------T-CCAA--AAT------TGAAGTGTGTATGCACTA-AACTCTAAAT-----GT-ACAC----TC---TGTGA----CATTTAAATTA----TCTAT--TATC-TTATT--AG---TTAC-T------AC--ACTACAAG-------ATGTGA----ATGTG-CATTTTTTA----AA--TTGC-TA-AGT-C--A--------------TG-AGATCGA----A---GCGCAT-------TTTATATAAAT-CTTTTT----TTTA-ATT-AAG--TTT-T-GTT-TACCCT-TAA-ATACAGGAA--T--------------------------TAATTGA--AGCATTA-CTT--AG-GTTGTTTC-------------AAGTTTG--TTTCA------GT-ATCAA-TTGATTCGA--ATC---------------GAA-A-A--A-------------AATCC-AATCGTAG-CATTTTG---ATCGAAATCGtctaaatgtacactctgtgacatttaaattatctattatcttattagttactacactacaagatgtgaatgtgcattttttaaattgctaagtcatgagatcgaagcgcattttatataaatcttttttttaattaagttttgtttacccttaaatacaggaattaattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatccaatcgtagcattttgatcgaaatcgaaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|5 : ctgcggtgcaccgaaaattcggatgcaccgcgatcacttcgttcgattcgagtgcaccgatccggaattccaaaattcgattcggttcggttcaaattagtatcatataactacaacaatggcgaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttacttttgattaaaaacaatggaaagtaggacaaatcaatctaccgtatgtactggcaagatatacgctacaccttcaaacatattacgatgttcagcaattcatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttcaatggactcttactaagccgacacgatgtGGCT--GTGCGGTG------CA--------------T--C----------------G-GAA------------ATTT--TG------------A-T--GCAC--CG------C--G--ATT---C----ACTT---TG-----TT-C-----T------GT----TC------AAAATTT--AG---T-ATCATG-T-GT-------AA--ACA--AC-A----A--AT---TG-GCA--GCAACT-TGATGG-TC--------------------ACTTT-----AC--TTTTG-AAA-AAAGAA-CAATGGAAAA------G-ACAA-GTCA--------TCT---A-CTGTA-TGTAC-ATG----------C-A-AG--------TTA-TGCGC-TA--CACCG------TGCAAGTA---T---A-TTA------CGA-GTTCAAG--AAGT-TGAACTTCTTTGT-CTGCGCAT--C-TTT---TG-AATTAAGAAAAC---AATT--TGAG-TAT----CGGTGCA--A--GT--GGACTC-----A-T---ACTA-----------AGCCGACATGATGTA-------CAG-TGAGTGGACAA--AT-GCAA-ATTTCA--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AAGT-CGATG-C-A-AATATCAAC-A-GT-G-A--ACAGA----CA-TGAA----TGGA--T-CTA-A--AAT------TA-AAGTGTG-ATACACTACA-Caaccgaagaaccctgaatctctccagccc
gi|5 : -AAGC-CGA---C-ATGATGT--AC-A-GT-G-A--GTGGA----CA---AA----TG------C---A--AAT------T-------TC-ATCTACTAGA-CA-CAA-GTCGATGCAAA-TATCAA--CA-GT-G-A--A---CAGA----CATGAA----TGGA--T-CTAA--AAT------TAAAGTGTG-ATACACTA-CA------------------------CT---TGTGA----CA--------A----T-TAA--TCTG-TT-TT--CA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGAATACATGTG-CAAATTTTG----AA--TT-A-TA-AGT-C--AA-------------AG-A---CTTATAAATTTACACTT-------CTCACAT---CTTTTTTT----TTTAAGTA-AAGTTTTTGT-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGTA--T--------------------------TA-TTGA--AGCATTA-C--TTAGTTTTTTTTCTC---AG-GAGGGAAGTTTT--CTTCA------GT-A------TGAATCAA--TTC-----------------A-A-A--A-------------AATCG-AATCGTAG-TGTTTTG--TATCGAAATCttgtgacaattaatctgttttcatttcctaatactcaagatttgaatacatgtgcaaattttgaattataagtcaaagacttataaatttacacttctcacatcttttttttttaagtaaagtttttgtttttacccttaaataaaggtattattgaagcattacttagttttttttctcaggagggaagttttcttcagtatgaatcaattcaaaaaatcgaatcgtagtgttttgtatcgaaatctaaccgaatgaatcctgaattgtc
gi|6 : ggctgtgcggtgcatcggaaattttgatgcaccgcgattcactttgttctgttcaaaatttagtatcatgtgtaaacaacaaattggcagcaacttgatggtcactttacttttgaaaaaagaacaatggaaaagacaagtcatctactgtatgtacatgcaagttatgcgctacaccgtgcaagtatattacgagttcaagaagttgaacttctttgtctgcgcatcttttgaattaagaaaacaatttgagtatcggtgcaagtggactcatact--AG---T-ATCATA-T-AT-------AA--ACA--AC-A----A--AA---TG-GCG--GCAACG-AGACGG-TC-TAAG-GTGT-TCAGG-AATGTTTT-----AC--TTTTG-ATT-AAA--A-CAATGGAAAGT---AGG-GCAA-ATCA--------TCT---A-CCGTA-TGTAC-TTG----------T-A-AG--------T-A-TACGC-TA--CACCG------TTCAAACA---T---A-TTA------CGA-GTTAAGC--AAGT-T------CTATGT-CTGCGCAT--C-TTA---CG-AG---AAAACAC---AATT--GGAA-TAT----CAGTTAA--A--AT--GGACTC-----T-T---AGTA-----------AGCCGACACGATGTA-------CAA-TGAGTGGACAA--CT-ACAA-ATTTCA--TCG-------TC---TAG-A-----A-C-AAGC-TAATG-C-A-AATATCAACAA-GC-G-A--GCGGA----CA-T---------GA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ACGCACTAAA-CA-Ctaaccgaatgaatcctgaattgtc
gi|6 : -AAGC-CGACA-C-G-A-TGT--AC-A-AT-G-A--GTGGA----CA------------A----CTACA--AAT------T-------TC-ATCGTCTAGA--A-CAA-GCTAATGCAAA-TATCAA--CAAGC-G-A--G---CGGA----CATGA-----------T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ACGCACTA-AAC-----ACTAAATGT-ACAC-----T---TGTGA----AATTATT---A----TCTAT--TATG-TT-TT--AA---TTTC-C----TACT--ACT-CA-G-------ATGTGA----ATGTG-GCATTTTTT----AA--TG-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---CAT----ATTTACACTT-------TTCATAT------TTTTT----TTTACATT-AAG--TTTGT-TC----CCCT-TAA-ATACAGGAA--T--------------------------CA-TTGA--AGCATTA-CTT--AG-GTTGTTTC-------------AAGTTTG--TTTCA------GT-ATCAA-TTGATTCGA--ATC---------------GAA-A-A--A-------------AATCG-AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGtaaatgtacacttgtgaaattattatctattatgttttaatttcctactactcagatgtgaatgtggcattttttaatgctaagtcagtgacatatttacacttttcatatttttttttacattaagtttgttccccttaaatacaggaatcattgaagcattacttaggttgtttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgaatcgaaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaaccgaatcaaatgaaccctaatcgtcccagcc
gi|7 : agtatcatatataaacaacaaaatggcggcaacgagacggtctaaggtgttcaggaatgttttacttttgattaaaacaatggaaagtagggcaaatcatctaccgtatgtacttgtaagtatacgctacaccgttcaaacatattacgagttaagcaagttctatgtctgcgcatcttacgagaaaacacaattggaatatcagttaaaatggactcttagt------------ATTT--CGCAA---------A-TC-GCAC--CG-AT--CC--AGAATTTTCC-TAAATTTTCACG----ATTCC-----G------GT----TA------AAAATTT--AGCGCC-ATCAT--T-GTCGATATGAA--ACACTAC-A----A--AA---TG-GGGGTGCATCG-AGACGG-TCACTAG-GCGTAT--GGTAATACTTTAA---AA--TTCTGTATT---------TATGGATATTTAGAGG-AGAA-GTC--------ATCTATCA-CCGTT-TGTACAATG----------T-AGAGAAATGATCTTA-T-CGCTTACTCATCGTGTTTTTCCAGGCA---TCTGA-TTAT-----CGA-ATTCAACTAAAGT-T------TTATGT-CTGCGCATG-CATTAATGTA-AT---AAAACACCGAAATTAATGAG-TATAATAAAGTTCATCA--GTGGGGACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACACAA-GT---------AG--GAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCA--ACA-------AC---TTG-AC----AGC-AAGT-TGATG-C-A-AATATCAAC-AGGT-G-ATGACAGAC---CA-TTCACACTTGGAGTT-CCA-ACCATT------TG-AAGTGTG-ATACACTAGaaccgaatcaaatgaaccctaatcgtcccagcc
gi|7 : ctgcttgcagtggcaatcgaaaattttatgagcacatgtttcagcttcgaattcgACTTGA-CAGCAA-GTTGATGCAAA-TATCAA--CAGGT-G-ATGA---CAGAC---CATTCACACTTGGAGTT-CCAACCATT------TGAAGTGTG-ATACACTA-GCT-----T------GTGACAC----CT---T---------A--------A----T-TGT--TATG-TT-TTACAG---TTTCGCTAGATAAT--ACT-TGAGACGAGATATTTGA----ATGTG-cttgtgacaccttaattgttatgttttacagtttcgctagataatacttgagacgagatatttgaatgtgag
gi|8 : ctgcttgcagtggcaatcgaaaattttatgagcacatgtttcagcttcgaattcgatttcgcaaatcgcaccgatccagaattttcctaaattttcacgattccggttaaaaatttagcgccatcattgtcgatatgaaacactacaaaatgggggtgcatcgagacggtcactaggcgtatggtaatactttaaaattctgtatttatggatatttagaggagaagtcatctatcaccgtttgtacaatgtagagaaatgatcttatcgcttactcatcgtgtttttccaggcatctgattatcgaattcaactaaagttttatgtctgcgcatgcattaatgtaataaaacaccgaaattaatgagtataataaagttcatcagtggggactcttactaagccgacacaagtaggagtggacaactgcaaatttcaacaGCT--GTGCGGTGACCATGCA--------------C--C----------------A-AAA------------ATTT--TG------------A-T--GCAC--CG-ag
gi|8 : TT--CG------------G-T--ACAC--CA-AT--TC--GGAATT---C-CAAATTT---CG----GTT-T-----G------GT----TC------AAAATTT--AG---T-ATCAAG-T-GT-------AA--ACA--AC-T----A--AA---TG-GCG--GCAACG-AGACGG-TC-TGAG-GTGT-T--GG-AACACTTT-----AC--TTTTG-ATC-AAA--A-CAATGGGAAGT---AGG-ACAA-ATCA--------TCT---A-CCGTA-TGTAC-TTG----------T-A-AG--------TTA-TGCGC-TA--CTCTG------TTTAAGCA---T---A-TTA------TGA-GTTCAAC--AAGT-T------CTATGT-CTGCACAT--C-TTA---TG-AG---AAAACAC---AATT-------------------CA--A--GT--GGACTC-----T-T---ACTA-----------AGCCGACGTGATGTA-------CCG-TGAGTGGACAA--CT-GCAA-ATTTCG--TCT-------AC---TAG-AC----A-C-AATC-TGATG-C-A-AATTTCAAC-A-GT-G-A--ACAGA----CA-TAAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTGTG-ATTCACTACA-CA-cgattcacttcgtttgattcggtacaccaattcggaattccaaatttcggtttggttcaaaatttagtatcaagtgtaaacaactaaatggcggcaacgagacggtctgaggtgttggaacactttacttttgatcaaaacaatgggaagtaggacaaatcatctaccgtatgtacttgtaagttatgcgctactctgtttaagcatattatgagttcaacaagttctatgtctgcacatcttatgagaaaacacaattcaagtggactcttactaagccgacgtgatgtaccgtgagtggacaactgcaaatttcgtctactagacacaatctgatgcaaatttcaacagtgaacagacataaatggatccaaaattgaagtgtgattcactacacagtacacttgactagtgacaatttattatgttctaatttcctaatactcaagatttgaatgtgctaagtttgaattctaagtcagtgatgtatatacacttttcaaatctgttttaaaatttacattaagtttttttt
gi|8 : gctgtgcggtgaccatgcaccaaaaattttgatgcaccgcgattcacttcgtttga----CG-TGAG----TGGA--C--------AAC------TGCAAATTTC-GTCTACTAGA-CA-CAA-TCTGATGCAAA-TTTCAA--CA-GT-G-A--A---CAGA----CATAAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTGTG-ATTCACTA-CAC-----A------GT-ACACTTGACT---AGTGA----CA--------A----TTTAT--TATG-TT-CT--AA---TTTC-C----TAAT--ACT-CAAG-------ATTTGA----ATGTG-CTAAGTTTG----AA--TT-C-TA-AGT-C--AG-------------TG-A---TGT----ATATACACTT-------TTCAAAT---C-TGTTTTAAAATTTACATT-AAG--TTTTT-TTT-gtacacttgactagtgacaatttattatgttctaatttcctaatactcaagatttgaatgtgctaagtttgaattctaagtcagtgatgtatatacacttttcaaatctgttttaaaatttacattaagtttttttt
gi|9 : gctgtgcggtgaccatgcaccaaaaattttgatgcaccgcgattcacttcgtttgattcggtacaccaattcggaattccaaatttcggtttggttcaaaatttagtatcaagtgtaaacaactaaatggcggcaacgagacggtctgaggtgttggaacactttacttttgatcaaaacaatgggaagtaggacaaatcatctaccgtatgtacttgtaagttatgcgctactctgtttaagcatattatgagttcaacaagttctatgtctgcacatcttatgagaaaacacaattcaagtggactcttactaagccgacgtgatgtacG-TC-TGAG-GTGT-T--GG-AATACTTT-----AC--GTTTG-ATT-AAA--A-ACATGGAAATT---AGG-ACA----CA----------T---A-C-----------------------------G--------CTA-CA---------ACCG------TTCAAACA---T---A-TTA------CGA-GTTCAGC--AAGT-T------CTATGT-CGGCGCAT--C-TTA---CG-AG---AAAACAC---AATT--TGAA-TAT----CAGTTCA--A--GT--GCACTC-----TATATAACTA-----------AG-CGACACGATGTA-------CAG-TGAGTTGACAA--AT-GACA-ATTTCA--TCTTTAAAAGACTTTTAG-AC----A-C-AAGC-CGTTG-C-A-AATATC-----------A--ACGGA----CA-TGAA----TGGA--T-CCA-A--AAT------TG-AAGTTTG-AT
gi|9 : TAGA-CA-CAA-GCCGTTGCAAA-TATCAA--C---------------GGA----CATGAA----TGGA--T-CCAA--AAT------TGAAGTTTG-ATA-A-TA-CAA-----AAT----GT-ACAC-----T---TGTGA----CA--------A----T------------------AA---T----C----TATT--A---------------TTTGA----ATGTG-TCATTTTTTTTTTAA--TG-C-TA-ATTTC--AG-------------TG-A---CGT----ATTTACACTT-------TTCAT-T---C-TTTTTT----TTTACATT-AAT--TTT-T-TTT-TACCCT-TAA-ATAAAGGAA--T--------------------------TA-TTGA--ACCATTA-CTT----AGTTTTTTC-------------AAGTTTG--TTTCA------GT-ATCAA-TTGATTCGA--TTC---------------G-A-A-A--A-------------AATCG-AATCGTAG-CATTTTG--AATCGAAATCGaatacaaaatgtacacttgtgacaataatctattatttgaatgtgtcattttttttttaatgctaatttcagtgacgtatttacacttttcattctttttttttacattaatttttttttacccttaaataaaggaattattgaaccattacttagttttttcaagtttgtttcagtatcaattgattcgattcgaaaaaatcgaatcgtagcattttgaatcgaaatcgaacgcgaatcgaatgaaccctgatcgtcccagccct
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): GAATGGACCCTGAATCGTCCCAGCCCTACTC
Unaligned ( gi|36 ): ATGAACCCTGAATCGTCCCAGCCCTAA