lowQualScore                  :                           1                                                                               
lowQualScore                  :          333 2 22 22      4  2 2 2 77777 4 22  4    4444 2    2 2  2  2   2  4    2  666     2   333      
lowQualScore                  :          ... . .. ..      .  . . . ..... . ..  .    .... .    . .  .  .   .  .    .  ...     .   ...      
lowQualScore                  :          555 0 88 88      0  0 0 0 88888 0 88  0    2222 0    0 0  0  0   0  0    0  222     0   999      
consensus                     :     CACCC---T-C--C--CACCCC-TT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGGT
Reference ( gi|14 )           :     CACCC---T-C--C--CACCCC-TT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGGT
gi|13                         :     CACCC---T-C--C--TACCCC-AT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGGT
gi|8                          :     CACCC---T-C--C--CACCCCCTT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----AACGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGG
gi|7                          :    cCACCC---T-C--T--CACCCCCTT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTG-C-TG-CT-GCC-TG-TTTT-TG---TTCTA-TTT---TCAGG
gi|3                          :   ccCACCC---T-C--C--CACCCC-CT-T-T-T-----A-C--TGCGACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTCT-GGGCCTTCTACTTT---TCAGG
gi|5                          :    cCACCC---T-C--C--CACCCC-CT-T-T-TTA---A-C--TG-GACA----A-CGTT-CTTG-CT-GCT-TGTTTTT-GG---TTCTA--TT---TCAGGT
gi|16                         :    cCACCC---T-C--C--AACCCCCTT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-ACT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---
gi|15                         :     CACCC---T-C--C--GACCCC-CT-TAT-T-----A-C--TG-GACA----G-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GA---TTATA-TTT---TCAcaag
gi|12                         :    cCACCC---T-CTCC--CACCCT-AT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-TT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTa
gi|4                          :    cCACTC---T-C--C--CACATC-TT-T-T-TTTTTAA-C--TG-GAAA----A-TGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTTTA-TTT---TCAGGTggcag
gi|2                          :     CACCCATGT-C--C--CACCCC-TT-T-TTT-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TGACT-G-T-TG-TTTT-GG----TCTA-TTTTAATCAGG
gi|10                         :    cCACCC---T-A--C--CACCCCCTT-T-T-T-----A-C--TG-GAAA----C-CGTT-C-TG-AT-GCT-TGTTTTT-GT---TTCTA-TTT---CCAGG
gi|19                         :     CACCC---T-C--C--CACCCCCTT-T-T-T-----A-C-----GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GC--TG-TTTT-TG----TCTA--TT---TCAG
gi|20                         :    cCACCT---T-C--C--CACCCC-TA-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGAT-C-----------TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TC
gi|6                          :  tccCACCC---TTC--C--CACCCT-AT-T-T-T-----AGC--TG-GACA----A-CGTTCC-TG-TT-GCTGTG-TTTTGGG---TTCTA-TTT---GCAcg
gi|11                         :     cACCC---T-C--C--CACCCCCTT-T-T-T-----A-CGTTG-TGCATCATA-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---
gi|17                         :      ACCC---T-C--C--CACCCCCTT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-TATT-C-TG-CT-AGT-TG-TTTT-GT---TTTTA-TTG---TCA
gi|9                          :       CCC---T-C--C--CACCCC-CT-T-T-T-----AAC--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGGa
gi|1                          :    cacCCC---T-C--CACCACCCT-TTCT-T-T-----A-A--TGTGACA----A-CGTA-C-TG-CTGGCT-TG-TGTT-GGTT-TTTTA-CTT---TCA
gi|21                         : ttcccacCC---T-C--C--CTTTTT-TT-T-T-A-----A-C--TG-GA-A----A-TGTT-C-TG-TT-GCT-TG-TTT---G---TTCTA--TT---TCAG
gi|18                         :        CC---T-A--C--CGACCC-TT-T-T-T-----A-C--TG-GAAA----C-CG-T-C-TG-AT-GCT-GT-TTTT-GT---TTCTA-TT





Alignments
lowQualScore                  :                              1                                                                               
lowQualScore                  :             333 1 22 22      3  1 1 1 77777 3 22  3    4444 1    1 1  1  1   1  3    1  666     1   333      
lowQualScore                  :             ... . .. ..      .  . . . ..... . ..  .    .... .    . .  .  .   .  .    .  ...     .   ...      
lowQualScore                  :             333 9 66 66      3  9 9 9 44444 8 66  8    0000 9    9 9  9  9   9  8    9  000     9   777      
consensus                     :        CACCC---T-C--C--CACCCC-TT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGGT
Reference ( family-3147 )     :        CACCC---T-C--C--CACCCC-TT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGGT
gi|1                          :          CCC---T-C--CACCACCCT-TTCT-T-T-----A-A--TGTGACA----A-CGTA-C-TG-CTGGCT-TG-TGTT-GGTT-TTTTA-CTT---TCA
gi|10                         : ttcccacCACCC---T-A--C--CACCCCCTT-T-T-T-----A-C--TG-GAAA----C-CGTT-C-TG-AT-GCT-TGTTTTT-GT---TTCTA-TTT---CCAGG
gi|11                         :         ACCC---T-C--C--CACCCCCTT-T-T-T-----A-CGTTG-TGCATCATA-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---
gi|12                         :        CACCC---T-CTCC--CACCCT-AT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-TT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TT
gi|13                         :       cCACCC---T-C--C--TACCCC-AT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGGTggcag
gi|14                         :        CACCC---T-C--C--CACCCC-TT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGGT
gi|15                         :        CACCC---T-C--C--GACCCC-CT-TAT-T-----A-C--TG-GACA----G-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GA---TTATA-TTT---TCA
gi|16                         :       cCACCC---T-C--C--AACCCCCTT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-ACT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---a
gi|17                         :         ACCC---T-C--C--CACCCCCTT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-TATT-C-TG-CT-AGT-TG-TTTT-GT---TTTTA-TTG---TCAcaag
gi|18                         :           CC---T-A--C--CGACCC-TT-T-T-T-----A-C--TG-GAAA----C-CG-T-C-TG-AT-GCT-GT-TTTT-GT---TTCTA-TTa
gi|19                         :  ccgacaCACCC---T-C--C--CACCCCCTT-T-T-T-----A-C-----GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GC--TG-TTTT-TG----TCTA--TT---TCAGcc
gi|2                          :       cCACCCATGT-C--C--CACCCC-TT-T-TTT-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TGACT-G-T-TG-TTTT-GG----TCTA-TTTTAATCAGG
gi|20                         :       cCACCT---T-C--C--CACCCC-TA-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGAT-C-----------TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TC
gi|21                         :        tccCC---T-C--C--CTTTTT-TT-T-T-A-----A-C--TG-GA-A----A-TGTT-C-TG-TT-GCT-TG-TTT---G---TTCTA--TT---TCAGcg
gi|3                          :        CACCC---T-C--C--CACCCC-CT-T-T-T-----A-C--TGCGACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTCT-GGGCCTTCTACTTT---TCAGG
gi|4                          :       cCACTC---T-C--C--CACATC-TT-T-T-TTTTTAA-C--TG-GAAA----A-TGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTTTA-TTT---TCAGGT
gi|5                          :        CACCC---T-C--C--CACCCC-CT-T-T-TTA---A-C--TG-GACA----A-CGTT-CTTG-CT-GCT-TGTTTTT-GG---TTCTA--TT---TCAGGT
gi|6                          :       cCACCC---TTC--C--CACCCT-AT-T-T-T-----AGC--TG-GACA----A-CGTTCC-TG-TT-GCTGTG-TTTTGGG---TTCTA-TTT---GCA
gi|7                          :       cCACCC---T-C--T--CACCCCCTT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTG-C-TG-CT-GCC-TG-TTTT-TG---TTCTA-TTT---TCAGG
gi|8                          :      ccCACCC---T-C--C--CACCCCCTT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----AACGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGG
gi|9                          :         cCCC---T-C--C--CACCCC-CT-T-T-T-----AAC--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGG





Alignments
lowQualScore                  :                              1                                                                               
lowQualScore                  :             333 1 22 22      3  1 1 1 77777 3 22  3    4444 1    1 1  1  1   1  3    1  666     1   333      
lowQualScore                  :             ... . .. ..      .  . . . ..... . ..  .    .... .    . .  .  .   .  .    .  ...     .   ...      
lowQualScore                  :             333 9 66 66      3  9 9 9 44444 8 66  8    0000 9    9 9  9  9   9  8    9  000     9   777      
consensus                     :        CACCC---T-C--C--CACCCC-TT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGGT
Reference ( family-3147 )     :        CACCC---T-C--C--CACCCC-TT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGGT
gi|1                          :          CCC---T-C--CACCACCCT-TTCT-T-T-----A-A--TGTGACA----A-CGTA-C-TG-CTGGCT-TG-TGTT-GGTT-TTTTA-CTT---TCA
gi|10                         : ttcccacCACCC---T-A--C--CACCCCCTT-T-T-T-----A-C--TG-GAAA----C-CGTT-C-TG-AT-GCT-TGTTTTT-GT---TTCTA-TTT---CCAGG
gi|11                         :         ACCC---T-C--C--CACCCCCTT-T-T-T-----A-CGTTG-TGCATCATA-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---
gi|12                         :        CACCC---T-CTCC--CACCCT-AT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-TT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TT
gi|13                         :       cCACCC---T-C--C--TACCCC-AT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGGTggcag
gi|14                         :        CACCC---T-C--C--CACCCC-TT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGGT
gi|15                         :        CACCC---T-C--C--GACCCC-CT-TAT-T-----A-C--TG-GACA----G-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GA---TTATA-TTT---TCA
gi|16                         :       cCACCC---T-C--C--AACCCCCTT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-ACT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---a
gi|17                         :         ACCC---T-C--C--CACCCCCTT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-TATT-C-TG-CT-AGT-TG-TTTT-GT---TTTTA-TTG---TCAcaag
gi|18                         :           CC---T-A--C--CGACCC-TT-T-T-T-----A-C--TG-GAAA----C-CG-T-C-TG-AT-GCT-GT-TTTT-GT---TTCTA-TTa
gi|19                         :  ccgacaCACCC---T-C--C--CACCCCCTT-T-T-T-----A-C-----GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GC--TG-TTTT-TG----TCTA--TT---TCAGcc
gi|2                          :       cCACCCATGT-C--C--CACCCC-TT-T-TTT-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TGACT-G-T-TG-TTTT-GG----TCTA-TTTTAATCAGG
gi|20                         :       cCACCT---T-C--C--CACCCC-TA-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGAT-C-----------TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TC
gi|21                         :        tccCC---T-C--C--CTTTTT-TT-T-T-A-----A-C--TG-GA-A----A-TGTT-C-TG-TT-GCT-TG-TTT---G---TTCTA--TT---TCAGcg
gi|3                          :        CACCC---T-C--C--CACCCC-CT-T-T-T-----A-C--TGCGACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTCT-GGGCCTTCTACTTT---TCAGG
gi|4                          :       cCACTC---T-C--C--CACATC-TT-T-T-TTTTTAA-C--TG-GAAA----A-TGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTTTA-TTT---TCAGGT
gi|5                          :        CACCC---T-C--C--CACCCC-CT-T-T-TTA---A-C--TG-GACA----A-CGTT-CTTG-CT-GCT-TGTTTTT-GG---TTCTA--TT---TCAGGT
gi|6                          :       cCACCC---TTC--C--CACCCT-AT-T-T-T-----AGC--TG-GACA----A-CGTTCC-TG-TT-GCTGTG-TTTTGGG---TTCTA-TTT---GCA
gi|7                          :       cCACCC---T-C--T--CACCCCCTT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTG-C-TG-CT-GCC-TG-TTTT-TG---TTCTA-TTT---TCAGG
gi|8                          :      ccCACCC---T-C--C--CACCCCCTT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----AACGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGG
gi|9                          :         cCCC---T-C--C--CACCCC-CT-T-T-T-----AAC--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGG


blockSeqs                     :             ATG T TC .       C  . A T TTTTA G GT  C    TCAT A    C T  A  .   G  T    G  GCC     C   TAA
blockSeqs                     :             .   . .  .       C  . . . TA    A .   .    .    .    . .  .  .   .  T    .  .       .   .  
blockSeqs                     :             .   . .  .       C  . . . .     . .   .    .    .    . .  .  .   .  .    .  .       .   .  
blockSeqs                     :             .   . .  .       C  . . . .     . .   .    .    .    . .  .  .   .  .    .  .       .   .  
blockSeqs                     :             .   . .  .       C  . . . .     . .   .    .    .    . .  .  .   .  .    .  .       .   .  
blockSeqs                     :             .   . .  .       C  . . . .     . .   .    .    .    . .  .  .   .  .    .  .       .   .  
blockSeqs                     :             .   . .  .       C  . . . .     . .   .    .    .    . .  .  .   .  .    .  .       .   .  
blockSeqs                     :             .   . .  .       .  . . . .     . .   .    .    .    . .  .  .   .  .    .  .       .   .  
blockSeqs                     :             .   . .  .       .  . . . .     . .   .    .    .    . .  .  .   .  .    .  .       .   .  
blockSeqs                     :             .   . .  .       .  . . . .     . .   .    .    .    . .  .  .   .  .    .  .       .   .  
blockSeqs                     :             .   . .  .       .  . . . .     . .   .    .    .    . .  .  .   .  .    .  .       .   .  
blockSeqs                     :             .   . .  .       .  . . . .     . .   .    .    .    . .  .  .   .  .    .  .       .   .  
blockSeqs                     :             .   . .  .       .  . . . .     . .   .    .    .    . .  .  .   .  .    .  .       .   .  
blockSeqs                     :             .   . .  .       .  . . . .     . .   .    .    .    . .  .  .   .  .    .  .       .   .  
blockSeqs                     :             .   . .  .       .  . . . .     . .   .    .    .    . .  .  .   .  .    .  .       .   .  
blockSeqs                     :             .   . .  .       .  . . . .     . .   .    .    .    . .  .  .   .  .    .  .       .   .  
blockSeqs                     :             .   . .  .       .  . . . .     . .   .    .    .    . .  .  .   .  .    .  .       .   .  
blockSeqs                     :             .   . .  .       .  . . . .     . .   .    .    .    . .  .  .   .  .    .  .       .   .  
blockSeqs                     :             .   . .  .       .  . . . .     . .   .    .    .    . .  .  .   .  .    .  .       .      
blockSeqs                     :             .   . .  .       .  . . . .     . .   .    .    .    . .  .  .   .  .    .  .       .      


blockSeqCons                  :                      **                                                                 ***
originalCons                  :        CACCC---T-C--C--CACCCC-TT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGGT
finalCons                     :        CACCC---T-C--C--CACCCC-TT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGGT





Alignments
lowQualScore                  :                              1                                                                               
lowQualScore                  :             333 1 22 22      3  1 1 1 77777 3 22  3    4444 1    1 1  1  1   1  3    1  666     1   333      
lowQualScore                  :             ... . .. ..      .  . . . ..... . ..  .    .... .    . .  .  .   .  .    .  ...     .   ...      
lowQualScore                  :             333 9 66 66      3  9 9 9 44444 8 66  8    0000 9    9 9  9  9   9  8    9  000     9   777      
consensus                     :        CACCC---T-C--C--CACCCC-TT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGGT
Reference ( family-3147 )     :        CACCC---T-C--C--CACCCC-TT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGGT
gi|1                          :          CCC---T-C--CACCACCCT-TTCT-T-T-----A-A--TGTGACA----A-CGTA-C-TG-CTGGCT-TG-TGTT-GGTT-TTTTA-CTT---TCA
gi|10                         : ttcccacCACCC---T-A--C--CACCCCCTT-T-T-T-----A-C--TG-GAAA----C-CGTT-C-TG-AT-GCT-TGTTTTT-GT---TTCTA-TTT---CCAGG
gi|11                         :         ACCC---T-C--C--CACCCCCTT-T-T-T-----A-CGTTG-TGCATCATA-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---
gi|12                         :        CACCC---T-CTCC--CACCCT-AT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-TT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TT
gi|13                         :       cCACCC---T-C--C--TACCCC-AT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGGTggcag
gi|14                         :        CACCC---T-C--C--CACCCC-TT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGGT
gi|15                         :        CACCC---T-C--C--GACCCC-CT-TAT-T-----A-C--TG-GACA----G-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GA---TTATA-TTT---TCA
gi|16                         :       cCACCC---T-C--C--AACCCCCTT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-ACT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---a
gi|17                         :         ACCC---T-C--C--CACCCCCTT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-TATT-C-TG-CT-AGT-TG-TTTT-GT---TTTTA-TTG---TCAcaag
gi|18                         :           CC---T-A--C--CGACCC-TT-T-T-T-----A-C--TG-GAAA----C-CG-T-C-TG-AT-GCT-GT-TTTT-GT---TTCTA-TTa
gi|19                         :  ccgacaCACCC---T-C--C--CACCCCCTT-T-T-T-----A-C-----GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GC--TG-TTTT-TG----TCTA--TT---TCAGcc
gi|2                          :       cCACCCATGT-C--C--CACCCC-TT-T-TTT-----A-C--TG-GACA----A-CGTT-C-TGACT-G-T-TG-TTTT-GG----TCTA-TTTTAATCAGG
gi|20                         :       cCACCT---T-C--C--CACCCC-TA-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGAT-C-----------TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TC
gi|21                         :        tccCC---T-C--C--CTTTTT-TT-T-T-A-----A-C--TG-GA-A----A-TGTT-C-TG-TT-GCT-TG-TTT---G---TTCTA--TT---TCAGcg
gi|3                          :        CACCC---T-C--C--CACCCC-CT-T-T-T-----A-C--TGCGACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTCT-GGGCCTTCTACTTT---TCAGG
gi|4                          :       cCACTC---T-C--C--CACATC-TT-T-T-TTTTTAA-C--TG-GAAA----A-TGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTTTA-TTT---TCAGGT
gi|5                          :        CACCC---T-C--C--CACCCC-CT-T-T-TTA---A-C--TG-GACA----A-CGTT-CTTG-CT-GCT-TGTTTTT-GG---TTCTA--TT---TCAGGT
gi|6                          :       cCACCC---TTC--C--CACCCT-AT-T-T-T-----AGC--TG-GACA----A-CGTTCC-TG-TT-GCTGTG-TTTTGGG---TTCTA-TTT---GCA
gi|7                          :       cCACCC---T-C--T--CACCCCCTT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----A-CGTG-C-TG-CT-GCC-TG-TTTT-TG---TTCTA-TTT---TCAGG
gi|8                          :      ccCACCC---T-C--C--CACCCCCTT-T-T-T-----A-C--TG-GACA----AACGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGG
gi|9                          :         cCCC---T-C--C--CACCCC-CT-T-T-T-----AAC--TG-GACA----A-CGTT-C-TG-CT-GCT-TG-TTTT-GG---TTCTA-TTT---TCAGG