lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222222 1111 6666666666666666666666 111 5555555555 1111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111 1 1 111 4 111 111111 333333333333333333 11 222222 33333333 1 11 33333 3333333333333333333 111111 11111111111 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 444444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 6 5555555 4444 8888 1 4444444444444444444444 111 6 0 0000000000 5 9 3 88 5555555555 3 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 99999 55555555555 2 5 444 1 5 5 888888 0 2 333 7 9 3 0 88 333 0 3 555555 2 4 444444444444444444 2 11 5 222222 77777777 8 444 2 5 1 55 2 2 22222 44 2 88 2 5 5555555555555555555 5555 5555 444 22 444444 88 33 1 66666666 77777777777 2 2 5 3 2 1 3 999 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6666 2 99999 555555555555555555555555555555555555555555555555555 33 44 5
lowQualScore : . ....... .... .... . ...................... ... . . .......... . . . .. .......... . .............................................................................................................. ..... ........... . . ... . . . ...... . . ... . . . . .. ... . . ...... . . .................. . .. . ...... ........ . ... . . . .. . . ..... .. . .. . . ................... .... .... ... .. ...... .. .. . ........ ........... . . . . . . . ... .............................................................................................................................................................................................................................................................................. .... . ..... ................................................... .. .. .
lowQualScore : 0 5555555 8888 5555 0 5555555555555555555555 999 0 1 2222222222 3 1 5 55 9999999999 6 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111 99999999999 9 0 777 4 7 0 222222 1 9 111 6 9 0 0 77 888 8 1 222222 9 5 777777777777777777 7 22 3 666666 88888888 7 444 5 3 2 44 7 7 33333 77 7 00 7 0 2222222222222222222 7777 7777 444 66 222222 00 44 4 44444444 77777777777 9 9 5 1 9 5 1 444 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111 9 99999 222222222222222222222222222222222222222222222222222 77 33 4
consensus : CAGGGATGGTG-TAATTGAA--A-ATG-TAATTGTA-AT-------ATCTAAA--TGCATTTTNATAAAGTAATTGGATGTATTTGTAATTG---GACTTCGCTTTCAATTA-CAAGTAATTGAA----------T-GT---A-----------------T----TT--------------AAA----GT-T-------TC-AA----------NTACTTTTCAA-------------TTACT--TA-ATT-----CTTTATTCAAACTTA-AA-----AGTTTGAAAA-TGAT---GGAATGAAAGTGT-CTGATAATAATGGTG------TTAGACTGTTTCACTG-TTTGTCATGAGGTGTTTATGCAATAATT-AGATGTCTCATTATGTCTAT-ATA-CTTGATGCAGCA-TGGCCACAGTGCCC-A-GGGC----TAT-AGGT-TTG-TTCAG-GTG-T--G-AACTCCT-----CTCATACCCGAGAACAA---A-GGCACAGGTAGA-AAAA-A-ATAC---C-TGAGTA-AG-AGT-TCACTTC-ATTCA-NATATT-ACATTCAG--AAC----T----CA---ACAT-GACTTAAANTGTA--CTGGATGAATTTCAT-----A-TGC-----T-----A-A-TAAAGG-A-ATCT-GGAAATTTCAAA-G-CC--A----T--TTT----TAG--A-----G--------A-------A--------AAAG-CT--T---GA-A-G-ACGAATC---AAAGCAGG------------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G---------ACA---TTTTGAAA----TA---AACTT----TAG--N-AA-TTGAAATGTAT----ATT-TAAT---TTC-TT-----TT---CAAAGTAA----TTGAGA-G---CAATTACAAT-----T----------G---TC-A---CA-AGGGCGGGG-C----------A--TTCATGTCCTATGGACATA-TTTCTAGTT
Reference ( gi|1 ) : CAAGGATAGTG-CAATTGAA--A-ATG-TAGTTGTA-AT-------ATATAAAAATGCATTTTAATAAAGTAATTGAATGTATTTGAAATTATA-GATTTTGCTTTTAATTA-CAAGTAATTGAA----------T-GT---A-----------------T----TT--------------AAA----GT-T-------TT-AA----------TTACTTTTCAA-------------TTACTAGTAAATT-----CTTTATTCAAACTTA-AA-----AGTTTGAAAA-TGGT---GGAATGAACGTGT-CTGCTAATAATGGTG------TTAGACTGTTTCACTG-TTCGCCATGAGGTGCTAATACAATGATTCAGATACCTCCTTATGTCTAT-ATT-CTCGATGCAGCA-TGACCACAGTGGCC-A-GAAC----GAT-AGGT-TTA-TTCAG-GTG-A--G-AACTCCT-----ATAATACCAGAGAACAA---A-GACACAGGTAGAGAAAA-A-AT-T---C-TGAGTA-AA-AGT-TCACTTC-ATTCA-GATAAT-ACATTCTA--AAC----T----CA---ACAT-AACGTAAATTGTA--CTGGATGAATTTCAT-----A-CGC-----T-----A-A-TAAACG-A-ATCT-GGAAATTTCAAA-A-CC--A----C--TTT----TAA--A-----G--------A-------A--------AAGG-TG--T---GA-A-G-ACAAATC---AAAGCAGA------------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G---------ACA---TTTTGAAA----TA---AACTT----TA---T-AA-TTGAAATGTATACATATT-TAAT---TTCATGG----TT---AAAAGTAA----TTGAGA-G---CAATTACAAT-----T----------G---TC-A---CA-AGAGCGGGG-A----------A--TTCATGTCCTATGGACATA-TTTCTATTT
gi|3 : CAGGGATGGTG-TAATTAAA--ACATG-TAATTATA-ATTAGCTTCATCTAAAA--GCATTTTAATAAAGTAATTGGATATATCTGTAATT----GACTTTGCTTTCAATTA-CAAGTAATTGAA----------T-GT---A-----------------T----TT--------------
gi|18 : aaatgatattaaattcttagtaaatctacattatacacagatatccaacgataattgaatttaatatctcctattatatttcataaagtgatggaaaatgaattgttttacatctgaaaaCAGGGATGGAG-TAATTGTA--A-ATG-TATTAGCT-GT-------ATTTAGA--TACATTTT--TAAAGTCATTGGGTATATATGTAATT----GACTTCGCTTTCAGTTA--AAGTAATTGAA----------T-GT---A-----------------T----TC--------------AAATAC-AT-TAAAAAAGTC-AA----------GCACCTT-CAA-------------TTAC------ATT-----CTTTATTCAAACTTA-AA---------CGAA------T---GGAA-----GTAT-CTGATAGAAATAGTG------TTAGATTGTTGCACTGATTTGTCATGGGGTGTCTATGCAAAAATT-GGATGTCTCtatacattccaaaaggtcaagtacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaattctcctttgcatttgttattcaaacttaaaatatgaaaataatggaatgaaaatgtctgataataatgcttttagactgtttcatgaggtgttaatgcaataattaattatttcattcagtctatatacttgatggagcatggccacagagggctatcaaatgttgttcaggtgtgaactccttgcatacctgagaacaaaggcacaaatagaaaaatacctgagtaagagttcacttcattgagaat
gi|8 : CAGGGATGG-A-TTATTGAAGAA-ATG--AATTGTACAT-------ACATTAA--TTTATTTTTATACAGTAATTGGATGTATCTGTAATTC----ACTTCACTTTCAGTTA-CACGTAATTGAA----------T-GT---A-----------------TAGTGTTTAGATACATTCCAAAAA----GT-CAAGATG-TC-AA----------TTAC-TTTCAA-------------TTAC--ATACATT-----CTTAATTCAAACTT--AA-----AGTTat
gi|15 : atatgtttctacttttgttttttcgttttgcatgaaatcgttcagctgcaagaaatccttgttatttcatattattgtttgcaccagatgatagtcactattatagacaaataaataccaatcacaaccttttttttttatcctaaagtaataattaaatttgaaatacatatttgtgaagacacatgaaatgatatgcgagataatcaatatatttggtacatacatgtacaaggaaaataatcttgaaatacattgctgaatAGGGAT-GTGATGATTGAA--A-ATG-TGATT----AG-------ATCTA------CCTTTGAA--AAGTGAATGGGTATATATG----TATCTGACTTAGCTTTGAGTTC-CATGTAATATAA----------T-GG---A-----------------T----TTTAGTGCAATTA---AAA----GT-T-------TC-AAACATTCTCCATTACAATTTAA-------------TCGCTATTCAATTTCAATCTTTATTGAATTTTA-TA-----ATTCTAAAAA-TAAT---AGAATAAAAATGT-CTGATAATAATGATG------TTAGTCTGTTTGACTG-TTTGTTGTGGAGTGa
gi|24 : ATTGAT--C-ATGATTGCTGTG--T-------ATTTAAAAGTACATTTTTGTAAAGTAAGTGGATGTATTTGTAATT----GACTTTTCTTTCAACTA-TAAGTAATTGAA----------T-GT---ACATTTATTTTTACACTTT----TT--------------AAAAAC-AT-T-------TC-AA----------ATATTTTTCAA-------------T-----ATATATT-----CTTTATTCAAACTCT-AA-----AGTTTGAAAA-TGAT---GGCTAGAAAGTGC-CTtctgtgtcttatgacagtatcactgatggagcattcatagtatcaagggctat
gi|19 : -TAATTGTA-AT----------TAGC--TGCATT--GA-AAAGTATTTGGATGTATTTGCAATTA-A-GATTT-GCTCTCAACTA-GAAGTTATTGAACATTTCTAAAT-GC---A-----------------T----TTTCAA----------AAA----GT-C-------AA-GA----------TTATTTTTTT--------------TTACT-------------CTTCATTCAAAGTTG-AAT----AATTCGAAAA-TGGT---GGAATGAAAGTG---TGGTAATATTGGTA------TTAGATTGCTTTACTC-TTTGTCATGTAGTGTTTAT
gi|26 : caaggatgggaATAAAGTAATTGGATGTATTTGTAATTG----------------ACTA-GAAGTAATTGAA----------T-GT---------------------------T--------------AAA----TT-T-------TA-AA----------ATAGTCCTAAA-------------T-----GCA--TT-----CTTTATTCACACTTG-AA-----TGTTTAAAAA-TGAT---GGAATGAAAGTGT-CTTATCATACTGGTG------TTCTACTGTTTCACTG-TTTGTTATGAGGTGg
gi|36 : ttAAAGTAACTGGATGTATTT---ATGGTT-GACTTAGCTTTTAATTA-TAAGTAATTAAA----------T-GG---A-----------------T----AT--------------AAT----GTAT-------TC-AA----------ATACATTT--A-------------TTAt
gi|31 : gAAAGTAACTGGATGTATTT---ATGGTT-GACTTAGCTTTTAATTA-TAAGTAATTAAA----------T-GG---A-----------------T----AT--------------AAT----GTAT-------TC-AA----------ATACATTT--A-------------TTAaaaagttaaaggtttcaattacttttcat
gi|2 : TTTGCTCTCCATTT-CAAGTAGCTGAA----------TTGT---G-----------------T----TT--------------AAA----AC-T-------TT-AA----------ATACGTTTTAAAAAGGGGATCAAATTAAT--TACACT-----CGTTATCTAAACTTA-AT-----ATTTTGAAAAATAAT---TGGATGAAAGTGT-CAGATAATACTGGTG------TTGGAATGTTTCACTG-TTTGTCATGGGGTGTTTATGCATTAATT-AGATATCTCAGTATGTTTAT-ATA-CTTGATGCAACA-TGGCAACAATACCCTG-GGGC----TAT-AGGT-TTG-TTCAG-GTGTA--A-AAC-CCT-----CTCATACCTGAAAACAA---T-GGCACAGGTAGAAAAAA-A-ATAC---C-TGAGTA-AG-AGT-TCACTTC-ATTCA-GATATT-ACATTCAG--AAC----T----GA---ACAT-TACTAAAAATGTA--CTGGACGAATTTCAT-----GTCAC-----------A-G-AAAATG-C-ATCT-GGAAATTTCAAA-G-CCAAA----T--TTTCAGCTGA--ATTCCTC--------A-------A--------AAAG-CT--C---GA-A-G-AGGAATG---AAAGCAAG------------------C--------------T------T--------------CAGGGT---------CAA----------GTCTTCCAGAGCA---ATTGGAAA----TAAACAACTG----TAGGCT-AA-TTGAAATGTAT--------------------------TT---AAAAAT-A----TTGAGA-G---TGATTTCAAT-----T----------G---TC-A---CA-CGGAT-GGG-C----------A--TTCATGTCCTATTGACaaaagttaaaggtttcaattacttttcatttacaaatgtacattttt
gi|39 : tgccTAATTGGTAAGTAATTGAA----------T-GTTAAA-----------------T----TT--------------GAAAATAGT-C-------CT-AAAAG-------TCACTTTCCAA-------------TTGC------ATT-----CTTTATTCACACTTG-AA-----TGTTTAAA
gi|45 : ----TC--------------AAG----AT-T-------TC-AA----------TTACTTTTCGA-------------TTAC----AA--T-----CTTCATTCAAAATTACAAGACTTAGTTTGAAAA-TGTC---GGAng
gi|28 : ataaaagT--------------AAA----GT-T-------TTCAA----------TTACTTTTCAA-------------TTACT------TT-----CTTTATTCAAAGTTA-TC-----AGTTTAGAAA-TGAT---GGAATGAAAATGT-CTTATAACAATGG-G------TTGAACTGTTT
gi|3 : aaatacattccccaaaaaagATT-----TGTTATTCAAACTTA-AA-----A-TATGAAAA-TAAT---GGAATGAAAATGT-CTGATAATAATGCTT------TTAGACTGTTT-----------CATGAGGTGTTAATGCAATAATT-AATTATTTCATTCAGTCTAT-ATA-CTTGATGGAGCA-TGGCCACAG------A-GGGC----TATCAAATGTTG-TTCAG-GTG-T--G-AACTCCT-----TGCATACCTGAGAACAA---A-GGCACAAATAG---AAA-A-ATAC---C-TGAGTA-AG-AGT-TCACTTC-ATTGA-GAatcaatgggtgtttaatgtttatgcagtaattagatata
gi|14 : aaatgatattaaattcttagtaaatctacattatacacagatatccaacgataattgaatttaatatctcctattatatttcataaagtgatggaaaatgaattgttttacatctgaaaacagggatggtgtaattaaaacatgtaattataattagcttcatctaaaagcattttaataaagtaattggatatatctgtaattgactttgctttcaattacaagtaattgaatgtattttatacattccaaaaggtcaagtacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaattctcctttgcTATTGAAAATT-----------TTTGAAAA-TGAT---GGCATGA-CGTTTTCTGATAATAATGGTA------TAAGAC-GTTTCACTG-TTC---ATCAGGT--TTATACAATTATT-AGATGTCT---------TGT-ATT-T--GATGCAGCA-TGGCTACAGTCTCT-A-GCGC----TAT-AAGC-TTG-ATTAA-GTG-T--C-AACTCCT-----CTCATATCCGAGAACAT---A-GGCACAGGTAGAAAAAT-A-A--C---C-AGAGTA-AG-AGT-GCACTTC-ATTCA-TATATA-ACGTACT-----T----T----TA---A---------AAAGTGTA--CTAGATGAATTTCAT-----A-at
gi|46 : aaattatattataaattatctaaacttataaagctaatta-AA-----AGTTTATAAA-TGGT---GGAATGAAAGCGT-CAGATGATAATGGCG-------------GTTTTACTG-TTTGCCATGAGGag
gi|16 : tTTGAAAA-TGAT---GGCATGA-CGTTTTCTGATAATAATGGTA------TAAGAC-GTTTCACTG-TTC---ATCAGGT--TTATACAATTATT-AGATGTCT---------TGT-ATT-T--GATGCAGCA-TGGCTACAGTCTCT-A-GCGC----TAT-AAGC-TTG-ATTAA-GTG-T--C-AACTCCT-----CTCATATCCGAGAACAT---A-GGCACAGGTAGAAAAAT-A-A--C---C-AGAGTA-AG-AGT-GCACTTC-ATTCA-TATATA-ACGTACT-----T----T----TA---A---------AAAGTGTA--CTAGATGAATTTCAT-----A-
gi|6 : GAAAA-TGATCCGGGAATGAAAAAGT-CGGATAATAATGGTGATGTTGTTAGACTATTTCACTG-GTTGTCATGAGGTGTTAATGCAATGATT-AGACGTCTCCTTATGTCTGT-ATA-CTTTCTGCAGCA-TGACCATAGTACCC-A-GGGC----TAT-ATAT-TTG-TTCAG-ATG-T--G-AACTCCT-----CTCATACCCGAGAACAA---A-GGCATAGGTTGCAAAAATA-AT-------TGAGTA-AG-AGT-TCACTTC-ATTGG-GAT---------------AC----T----CA---ACAT-GACTTAAAATGTA--CTGGACGAATTTCGT-----A-TGC-----C-----A-G-AAAAGG-A-ATCT-GG------CAAA-G-CCATA----T--CTT----TAGT-A-----G--------AATTCCT-A--------AAGA-TGCTT---GA-A-G-ACGAATC---AAAGCAGG------------------CTTTGAGGTCATGTTT------T--------------C--------------CAA----------A---------ACA---TTTTGATA----TA---AACTT----CAG--C-AA-TTGAAATGTAT-TACATT-T--T---TT---------------AAAGTAA----TTGATA-G---C-ATTACAAC-----T----------G---TC-T---CA-CGGGCAAGC-C----------A--TTCATGTCCTACGGACATA-TTTGTAGTTgc
gi|30 : AAT-TGAT---GGAATGAAAGTGT-CAGATAATAATGGTG------TTAGACCGTTTCACTG-TTTGTCATACGGTGTTTGTACAATGATT-AAATGTCTCaattagaaattacatgtaataataatatgtagtcacaattaattgatttgcaaatgtaagttataaaaat
gi|42 : caattcaaggtcgggctattttaattgattaattggatgtatttttT---GAAATAAAAGTGC-CTGATATTTATAGTG------GTGGACTCTTTCACTG-TTT-CTA-GA-GTGTTTATGCAATGAT
gi|20 : attaTAATAGTGGTT------TTAGAATGTGTCACTT-TTTGTCTTGAGTTGTTAATGCATTAATT-AGGTGTCTCATTATGTCTCT-G---CTCAAT--AGC------CACAGTGCTC-T-GA------------GT-TT--------GTG-A--G----TTC---------ATACCTGATAACAATTAA-GGCACCGGTAGA---AA-A-AT-TAC-C-TGAATA-AG-AGT-TTATTT------------GT-ATATTCAA--AAC----T----TT---TT-T-GACGTAAAT-GTA--GTGGGTGAATTTTAT-----A-TGC-----T-----A-A-TAAcggtgcatgtttc
gi|35 : TAGACTGTTTTACTG-TTTCCCAAGAGGCGTTTATACAATAATT-AAATGTCTCATTTTGTCTAT-ATT-ATTGTTGCGACA-TGGCCACAGTACCC-ATGGAT-----AT-AAGT-TCA-TTTGG-CTA-T--G-AACTCCT-----g
gi|5 : TATATCTAT-AGA-CCTGATGCAGCA-TGGCCACAGTGCCA-A-GGGC----TA--AGGT-TTG-TTCAG-ATT-T--G-AACTCCT-----C--ATACT-GAGAACAA---A-GGCACAGGTAGA---AA-A-ATAC---C-TGAGTA-AG-AGT-TTTCTTC-ATTCC-CACATT-ACATTAAG--AAC----TGAGTCA---ACAT-AACTTAAAATTTA--CTGCATGAGTTTCAT-----A-TACATGTAT-----A-AATAAAGG-A-ATCT-GGAAATTTCAAA-G-CA--A----CAGTTT----TAGC-A-----G--------A-------ATTGCCCAAAAAG-CT--C---GA-A-G-ACAAATC---AAAGCAGG------------------C--------------T------TTAAGCTCAAGTTTTC--------------CAT----------G---------ACA---TTTTGAAA----TA---AACTT----TA---GAAA-TTGAAAT------ATATT-TGATTACTTTTTTT----TT---CAAAGTAA----TGGAGA-G---CAATTACAATACAG-T----------GACTTCAA---TA-AGGGCAGGA-C----------A-----ATGCCACATGGGCACA--TTATATTTct
gi|4 : attatagagacatcccattacatgtgTATATCTATTAGA-CCTGATGCAGCA-TGGCCACAGTGCCA-A-GGGC----TA--AGGT-TTG-TTCAGCATT-A--TTAACTCCT-----C--ATACT-GAGAACAA---A-G-TACAGGTAGA--AGA-A-GTAC---C-TG-GTACAG-AGTATTTCTTCCATTCC-CACAATTACATTAAG--AAC----T----GAGTCACAT-AACTTAAATT--A--CTGCATGAGTTTCAT-----A-TAC-----TGTGTTA-A-AAAAGG-ACATCTAGGAAATTTCAAGCA-AC--A----G--TTT----TGC--A-----G--------A-------ATTGCCCAAAAAG-CT--C---GA-A-G-ACAAATC---AAAGCAGGGCTTTAAGCTTCAAGTCTC--------------T------C--------------C--------------CAT----------G---------A-A---TTTTGAAAATTTTA---AACTT----TA---GAAA-TTG-AATATATTTGGATT-TACT---TTT-TTT----TT---CAAAGTAA----TGGAGA-G---CTATTACAATACAG-T----------GACTTC-AATGAA-AGGGCAGGACA----------A--T---TGCCACATGGGCACA--TTATATTTttagctcatttttgaggatttccagatgtttctgagtacataatatattctgcagttggttttcatcagcatattaacataaatttgaagtgaacaacatcatacgcttgtg
gi|7 : gagacatcccattcatgttgATATCTAT-AGTACTGAATGCAGCAATGGCCACAGTGCCA-A-GGGC----TA--AGGT-TT--TTCAG-ATC-TT-G-AACTCCT-----ATACT----GAGAACAA---A-GGCACAGGTAG---AAA-A-ATAC---C-TGAGTA-AAGAGT-TTTCTTC-ATTC-------C-ACATCATAAGAACTGAGT----CA---ACAT-AACTTAAATT-TA--CTGCATGAGTTTCATATTAAA-TGTA----T-----A-A-T-AACG-A-ATCT-GGAAATTTCAAA-AGCC--AACAGT--TTT----TAGTCA-----G--------AATTGCCCA--------AAAG-CT--C---GA-A-GAACAAATC---AAAAGAGG------------------C--------------TTTAAGCT--------------C--------------CAAAGTTTTCCATG---------ACA---TTTTGAAA----TA---AACTTAAAGAA---A-AA-TTGAAACATATATTTGAT-TACT---TTTTT------TTTCAAAAAGTAA-----TGAGA-G---CAATTACAATACAAGT----------GACTTCAA---TA-AGGGCAGGACA----------A--TGCA-----CATGGGCACA-TTttagctcattttgaggattccagaggttctgagtacataatatattctgcagttggtttttcatcagcatcattaacattaaatttgagtgaacaactcatacgcttgtga
gi|34 : GTCTAT-ATA-CCTGATTCAGCA-TGGCCACAGTGCCC-A-GGGC----TCT-AGTT-TTG-TTCAG-GTG-T--G-AACTCTT-----TCCATGCCTGAGTACAA---A-AGCACAGTT----AAAA-A-ATAC---C-CGAGT-------T-TCAATTC-ATTCaataattttagcttcatttttgaggaattccaagatgtttctga
gi|38 : GTTTAT-ATA-TTTGATGCAGCA-TGGCC-CAG-GGCT------------AT-AGGT-TTGTTTCGGTGTG-ACTG-ACCTCCTCTCG-ATCATGTCCGGGAACAA---A-GGCACGGGTAAAAAAAtttta
gi|9 : CTAT-ATA-CTTGATGTAGCA-TGGTCACAATGCCC-A-GGATTGGAGGT-AAAT-TTG-TTCTG-GTG-A------CTCCTCTC--ATATTACCTGAGAATAA---T-GGTATGGGTAGA--AAA-A-AT-T---CCTGAGTA-AA-GTT-TCATTTTTATTGA-GA----------------AC----T----CA---ATATGAATGAAAAT-GTA--CTGGATAAATTTCAT-----G-T-C-----C-----A-A-TAAA---A-ATCT-GGAAATTTCAAA-G-CG--A----A--TTT----TTAGCA-----GAATTCCTCA-------A--------AAAG-TT--T---AA-A-G-GTGAATC---AAAGCAGG------------------T--------------T------T------------------------------AA----------T---------A---------GGGC----CA---TATTT----TA---C--A-TT-AAATGT-T-----TT-TAAT---TGCATTC----TT---CA----AA----TTG-----------TTAC-AT-------------------------------GGGTGGGG-C----------A--TTCATGTCTTATGGACATA-TTTCTAGTT
gi|10 : -CTTGATGCAGCA-TGACTATAGTGCCC-A-TGGC----TAT-AGGT-TTG-TGCTG-GTA----------CCT-----CTCATGCCTGATAACAA---A-GACACGGG--GACAAAA-AGAC-C---C---AGTA-AT-GGT-TTACTTC-ATTCA-GATATT-ACATTCAG--AAC----T----CA---ACAA-GACTTAAAATGTA--CTGAATGAATGTCAT-----G-TCC-----T-----A-G-AAAATG-C-ATCT-GGAAATTTCAAA-G-CC--AAAT-C--TTT----AGC--A-----G--------AATTCCTCA--------AAAA-CC--T---TA-ATG-AAGAATC---AAAGCAGGCTTGGGGGTTAATTAAGTC--------------T------T--------------C--------------CAA----------C---------ACA---TTTGGAAA----TA---AACCC----CAG--T-AA-TCAAATTGTAT--------------------------TT---AAG---AA----TT--------------ACAAT-----T----------G---TC-A---CT-TGGAAGGGG-C----------T--TTCATATCCTGTGGACATA-TTTCTAGTTattattgaaaatagaaaagaaaattaagctacattgtagattattctgctatcaaagaaaagtgatctagttgtgttgcctgcctgcgttagcggaggcg
gi|13 : tgtaT-AAAT-TTA-AGCAG-ATG-T--G-AACTCCTTTGTTATATTACAGGATAACAA---A-AGCACAAATAAAGAAAA-T-AC-C---C--GAGTA-AG-AGT-TCGATCC-ATTCATGA-AAT-ACATTCAA--TAC----T----CA---ACAT-GACTTAAAATGAA--CTGTATCAATGTCAT-----A-CGC-----T-----A-A-T----GTA-ATAT-GGAAATTTGAAA-C-CC--A--------TT----TAA--G-----C--------A-------G--------AATT-CC--T---CA-------AAATCGTTAAAGT---------------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G---------ACA---TTTTGAAA----TA---ATGTT----TAG--T-AA-TTGATATG------TATT-GAAT---TACATTC----TT---CAAAGTAA----TTGAGA-G---CCATTGTAAT-----T----------G------A---CA---------------------------CATGTCCTATTTACATA-c
gi|32 : cttACACCTAAGAACAA---A-GACACAGTT---GAAAA-A-AT-TCAAC-TGGGTA-AG-AGT-TCAATTC-ATTCA-TATCCT-ACATTCAA--AAC----C----CA---ATTT-GACTTTAAATGTA--TAGGGTGAAATTAAT-----A-TGC-----T-----G-A-TAAAGG-A-AT
gi|12 : tcGAAAAA---ATGACACA--TGAAGAAAA-A-ATAC---C-TGACTT-TG-GGT-TCACTTC-A------------ACAT---G--AAT----T----CA---A-----------AT-GTA--CTGGATGAATTTTGC-----A-AGCT----T-----G-A-TAAG-G-A-ATCT-GGAAATTTCAAA-G-CCATA----T--TTT----TAGC-A-----GAATTCCACA-------A--------AAAG-CT--T---GA-A-G-ACAAATC---GAAGCAGG------------------CTTCAAGCTCAAGTTT------T--------------C--------------CAA----------G---------ACA---TTTTGAAA----TG---AAATT----GA---G-AAGTTGAAATGTATTTAAAAC-TA-----TTC--------TT---CAGAGTGA----TTGAGA-G----A-----AAT-----T----------G---TC-A---CA-AAGGCAGGG-C----------A--TTCATGT
gi|37 : TC-ATTCA-TATATT-ACATTCAG--AAC----T----CA---ACAT-GACTGGAAGCACA--CTGAATTA-TTTCGT-----A-AGC-----C-----A-A-TAAAGC-A-ATAT-AGAAATTTCAAA-A-CC--A----T--Tttttagtttccattaatgtttgtgagctgtgatgtg
gi|33 : --AAC----T----CA---ACAT-GACTTAAAATGTA--CTGTATGAAATTCAT-----A-TGC-----T-----A-A-TAAAGG-A-ATAT-AGAATTATCAAA-G--C--A----G--TTT----CAA--A-----G--------------------------------------------------TC---A----AGT------------------C--------------G------T--------------C--------------CAA----------A---------ACA---TTTTGAAA----TA---AAGTT----TAG--T-GA-TTGAAATagcagaattcctcaagtag
gi|29 : cagA---ACAT-ATAG-AAATTGTAAACT------ATTTTGT-----A-CAT-----T-----GTG-TAAAAC-A-GT---GGAAATTTCAAA-G-CC--A----TA-TTT----TAGC-A-----G--------A-------ATTCCTCAAAACG-TC--T---GA-A-A-ACGAATC---AAAGCAGG------------------C--------------C------T--------------C--------------
gi|21 : ataaatattgcatacaagaggtgagag-ATAT-GGAGATTTCAAA-G-CC--G----C--TT------AA--A-----G--------ACGAATC-A--------AAGGATA--TTTCGA-G-G-TCAAGTC--------------------------------------------T------T--------------C--------------CAA----------G---------ACA---TTCTGAAA----TA---AACTT----TA---GGAA-CAGAAATGTAT------T-TG-T---CACATTC----TT---TAAAGTAC----TTGAGA-G---TAATTACAAT-----T----------G---TC-A---CA-AGAAC----------------A--TTCATTTCCTATGGACAAATTTTCTATgaggta
gi|25 : aaggaat--------A-------A--------AAAG-TT--T---GT-A-G-ACGAATC---ATAGCAGG------------------C--------------T------T--------------C--------------AAG----------G---------TCAAGTCTTTCAAA---------AACAT----T---------TTGAAATGTG-AC---------------CGAGG----AT---CAGAGTAA----TTGAAATGTATTAATGGC-AT-----TCTTCCCAGAAG---TC-A---CATGGACCGGGG-GGGGGGGGGGCA--TTCAT-TCCTATGGACTTA-ccaaatgtttacgctataagta
gi|44 : cagaattcctc-------A--------AAGC-T---T---GACA-T-ACAAA-C---AAGGCAGT------------------C--------------T------T--------------C--------------CTA----------A---------ACA---TTTTGAAA----TA---AACTT----TAG--T-AA-TTTGAATGTAa
gi|11 : taaaattcatt--T---GA-A-G-ACAAAAC---AAAACAGG------------------C--------------T------T--------------CAGGGTCAAGTCTTCCAA----------G---------ACA---TTTTGAAG----TA---AATTT----CAG--T-AA-TTGAAATGTAT------T-TAGT---GACATTC----TT---CAAAGTAA----TTGAGA-G---CAATCACAAT-----T----------G---TC-A---CA-TGGGTGGGC-C----------A--TTCACGCCCTATGGACATA-CATGTATTT
gi|23 : aaaatataattactaaagttatctgattagaataccataaaatttactgttcgtgttaaataggcaaataatgacttcaacacgct------------------C--------------T------C--------------C--------------CAA----------A---------GCA---CTTTGAAA----TA---AACTT----CA---G-AAATTGAAATGTAT-----TTGTAA----------A----CT---AAAAGTAA----GTGATA-G---AAATTACAAT-----T----------G---TA-G---CA-AGGACGTGG-C----------A--TTCATGTCCTATGAACATA-TTTCTAGTTctagttttctgttaagcaataatcaaaaggcatcccacattacaggtttggagctgataagttata
gi|27 : -TTGAAGTTTG-ACTTACT-TAATAT-TTCCTGAACTATT---TAAGGTAGACCTTTAAGA-G---CAATTACATT-----T----------G---TC-A---CA-AGGGTGGGT-C----------A--TTCATGTCCTGTGGACATA-TTTCTAGTTattatacattttattttagacatatggtcaataaaaataattcgttctttcatttttaagatatgaatacatgt
gi|50 : GCGTGG-G----------ACTTTCACGTCCTATGGACATA-TTTCTAGTTatcttacacgtacacttatgtgtatttttaaataactcgatctctttattttc
9 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TATGGTTTTACTTTAGATTTGGCTTCTTGCAGTGAACTGATTCCGTGCAAGGAGAATCTTTATTATTCCAATCGTATTTCTCCGACTGTAGTGTAGTCACTGTTAGTCACAATCAATAATCTATAGAAATAAACTGTGTTTATTTATTTTAATGTCATTATCATTTATCAACTTTCAAATACATTTTGGAAAGACACATCAGATGATATGAGAGACTAATCTATACAGAGAAAATGAACTTCAAACA
Unaligned ( gi|22 ): TTAATAAAGAAATATGCATAGATCTGCTGTTGGCATTACTTTCAATCGTACACATGTATTGAAGCAATTGAACGTATCTCATTCCCCCTTTTCGAGGTATTTTTTTTCAATTAGCGAATTTCTTTGATCAACTTTTTTAAAAATGTTTGAAGATGGTGGAGCAAAAGTGCTACGCTATTTCACTGTCCGGGGGTGTTCAA
Unaligned ( gi|40 ): CAAAGCAGGCTTCGATCGTCGAATATTCTATTGACATTTTGAAATAAATTCAGTAATTTGAATGTATTGATTACTATTTATTATTTAAAAT
Unaligned ( gi|41 ): GAAAATGTAATTGCAATTAGCTGCATTTAAATACAATACTATATTAAGTAATGGGTGGTATTTGTAATAGCTGATTTTGCTTTCAATTAC
Unaligned ( gi|43 ): AAATGTACTGGATGAATTTCATTCCCAGAAATTTCAATTAAAATATCGTTAACAGAATTCCTCAGAAAGCTTAAAGACAAATAGG
Unaligned ( gi|47 ): TGCTTTTCAGTTACATTTTGTATTCAAACTAAAGTGTCTGATAACAATGGTT
Unaligned ( gi|48 ): TCTAATTTTGTTCAGGTGTGAGCCCTGTTCATACCCCGAGAACAAAAATA
Unaligned ( gi|49 ): TTTATTGATATAGCTCACTATTTTGTACTCTTAAGAGTAACAGGTACAC
Unaligned ( gi|51 ): TAATTTGTTTACGTACATAGAAAATGAACAAGAATGAT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 3333333333333333 3333333333333 1111111111 111111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111111111111111 1111111 1111 11111 00000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111 111 111111111111
lowQualScore : 6 6 8888 5 7777777777777777 0 1 4 3 77 3 3 3 7777777777777 5 33 1 2222222222 111111111 2 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 3333333333333333 2 333 777777 33 2 0 0 2 1 2 444 55 3 2 2 0000000 2 0 2 44 5555 2 33 33 444 2 666666666 444 2 2 6 333 2 99 4444 2 2 2 2 9999999999 0 2 0 777777777 444 1 0000 3 88888888888 22222 444 1 2 66 2 444 33333333333333333333333333333333333333333333333333 999 2 2 2222222222222 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5555 666 55555 666666 555 777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 66666 22 88888 444 5 444 66666 3 22 1 0 444444444444 2
lowQualScore : . . .... . ................ . . . . .. . . . ............. . .. . .......... ......... . ........................................................................................................................................................................ . ................ . ... ...... .. . . . . . . ... .. . . . ....... . . . .. .... . .. .. ... . ......... ... . . . ... . .. .... . . . . .......... . . . ......... ... . .... . ........... ..... ... . . .. . ... .................................................. ... . . ............. .............................................................................................. .... ... ..... ...... ... ................................................... . ..... .. ..... ... . ... ..... . .. . . ............ .
lowQualScore : 0 7 3333 0 9999999999999999 9 9 5 1 33 1 1 1 2222222222222 1 99 4 5555555555 444444444 9 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9 9999999999999999 2 999 222222 22 4 8 5 4 5 7 777 55 3 7 5 6666666 5 2 5 22 3333 5 22 66 111 4 777777777 111 4 4 4 999 2 22 8888 5 5 5 4 1111111111 7 5 2 111111111 444 8 6666 3 33333333333 00000 666 7 7 33 7 777 66666666666666666666666666666666666666666666666666 777 4 4 9999999999999 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0000 555 99999 555555 111 888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 33333 33 00000 000 3 777 77777 7 55 2 2 444444444444 9
consensus : CAGGGATGGTG-TAATTGAA--A-ATGTAATTGTA-AT-------ATTTAAA--TGCATTTTNAT-A--AAGTAAT-TGGATGTAT-TTGTA-ATT------G--G---ACTTCGCTTTCAAT--TACA----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TT--------------AA------A----------------------G---T--T-------T-C---AAN-T-ACTTTT---CA--A-------------T-TA------C---T--T--A-A-T----------------T-CTTTATTCAAACTT-----A-AA-----A-GTTTGAAAA-TGAT---GGAATGAAAGTGTCTGATAATAATGGTG------TTAGACTGTT--TCACTG-TTTGTCATGAG-GTGTTTATGCAATAATT-AG---ATGTCTCATT-ATGTC-TATA-T-------ACTTGATGCAGCA-TGGCCACAGTGCCC-AGGGCTAT-AGG----T-TTGTTCAG--GTGT-GA---A-CTCCTC----T----CA---T-A-CCCGAGAACAA---A-GGCACAGGTAGA-AAAAAA-T-ACCTGAGT-A-AGAGT-TCACTT-CATTCANAT-ATTACATTCAGAAC----T----CA---ACATGACTT----AAAATGTACTGGATGAATTTCAT-----A-----TGC-----TAA-TAAAGGA-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGC--C--A----T-TTTT--AGC--AG--------A-------A--------AAA---GCTTGA-AG-ACGAATCAAAG-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--TAATTGAAATGT----A---T----AT--TTA--A-----T----TTC--TT------TTC--AAAGTAA----TTGAGAGCAATTACAAT-----TG---TC-A---C-----AAGGGCGGGGCATTCATGTCCTATGGAC-----A------TA-TTTCTAGTT
Reference ( family-309 ) : CAGGGATGGTG-TAATTGAA--A-ATGTAATTGTA-AT-------ATCTAAA--TGCATTTTNAT-A--AAGTAAT-TGGATGTAT-TTGTA-ATT------G--G---ACTTCGCTTTCAAT--TACA----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TT--------------AA------A----------------------G---T--T-------T-C---AAN-T-ACTTTT---CA--A-------------T-TA------C---T--T--A-A-T----------------T-CTTTATTCAAACTT-----A-AA-----A-GTTTGAAAA-TGAT---GGAATGAAAGTGTCTGATAATAATGGTG------TTAGACTGTT--TCACTG-TTTGTCATGAG-GTGTTTATGCAATAATT-AG---ATGTCTCATT-ATGTC-TATA-T-------ACTTGATGCAGCA-TGGCCACAGTGCCC-AGGGCTAT-AGG----T-TTGTTCAG--GTGT-GA---A-CTCCTC----T----CA---T-A-CCCGAGAACAA---A-GGCACAGGTAGA-AAAAAA-T-ACCTGAGT-A-AGAGT-TCACTT-CATTCANAT-ATTACATTCAGAAC----T----CA---ACATGACTT----AAANTGTACTGGATGAATTTCAT-----A-----TGC-----TAA-TAAAGGA-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGC--C--A----T-TTTT--AG---AG--------A-------A--------AAA---GCTTGA-AG-ACGAATCAAAG-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--NAATTGAAATGT----A---T----AT--TTA--A-----T----TTC--TT------TTC--AAAGTAA----TTGAGAGCAATTACAAT-----TG---TC-A---C-----AAGGGCGGGGCATTCATGTCCTATGGAC-----A------TA-TTTCTAGTT
gi|1 : CAAGGATAGTG-CAATTGAA--A-ATGTAGTTGTA-AT-------ATATAAAAATGCATTTTAAT-A--AAGTAAT-TGAATGTAT-TTGAA-ATT------ATAG---ATTTTGCTTTTAAT--TACA----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TT--------------AA------A----------------------G---T--T-------T-T---AAT-T-ACTTTT---CA--A-------------T-TA------C---TAGT--A-AAT----------------T-CTTTATTCAAACTT-----A-AA-----A-GTTTGAAAA-TGGT---GGAATGAACGTGTCTGCTAATAATGGTG------TTAGACTGTT--TCACTG-TTCGCCATGAG-GTGCTAATACAATGATTCAG---ATACCTCCTT-ATGTC-TATA-T-------TCTCGATGCAGCA-TGACCACAGTGGCC-AGAACGAT-AGG----T-TTATTCAG--GTGA-GA---A-CTCCTA----T----AA---T-A-CCAGAGAACAA---A-GACACAGGTAGAGAAAAAA-T--TCTGAGT-A-AAAGT-TCACTT-CATTCAGAT-AATACATTCTAAAC----T----CA---ACATAACGT----AAATTGTACTGGATGAATTTCAT-----A-----CGC-----TAA-TAAACGA-ATCT--GGAAATTTC-A---AAAC--C--A----C-TTTT--AA---AG--------A-------A--------AAG---GTGTGA-AG-ACAAATCAAAG-------------CAGA------------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--A---TAATTGAAATGTATACA---T----AT--TTA--A-----T----TTC--ATGG----TTA--AAAGTAA----TTGAGAGCAATTACAAT-----TG---TC-A---C-----AAGAGCGGGGAATTCATGTCCTATGGAC-----A------TA-TTTCTATTT
gi|10 : TG-T-------ACTTGATGCAGCA-TGACTATAGTGCCC-ATGGCTAT-AGG----T-TTGTGCTG--GTA-----------CCTC----T----CA---T-G-CCTGATAACAA---A-GACACGGG--GA-CAAAAA-G-ACCC-AGT-A-ATGGT-TTACTT-CATTCAGAT-ATTACATTCAGAAC----T----CA---ACAAGACTT----AAAATGTACTGAATGAATGTCAT-----G-----TCC-----TAG-AAAATGC-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGC--CAAA----T-CTTT--AGC--AGAATTCCTCA-------A--------AAA---CCTTAA-TG-AAGAATCAAAG-------------CAGGCTTGGGGGTTAATTAAGTC--------------T------T--------------C--------------CAA----------C----------ACATTTGGAAA----TA---AACC-----C---C--AG--TAATC-AAAT-T----G---T----AT--TT---------------------------------AAG---------------AATTACAAT-----TG---TC-A---C-----TTGGAAGGGGCTTTCATATCCTGTGGAC-----A------TA-TTTCTAGTT
gi|11 : ---GCTTGA-AG-ACAAAACAAAA-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------CAGGGTCAAGTCTTCCAA----------G----------ACATTTTGAAG----TA---AATT-----T---C--AG--TAATTGAAATG---------T----AT--TTA--G-----TGACATTC----------TTC--AAAGTAA----TTGAGAGCAATCACAAT-----TG---TC-A---C-----ATGGGTGGGCCATTCACGCCCTATGGAC-----ATACATGTA-TTTCTAGTTc
gi|12 : aaaatataattactaaagttatctgattagaataccataaaatttactgttcgtgttaaataggcaaataatgacttcaacacGAAAAA---ATGACACATGAAGA-AAAAA--T-ACCTGACT-T-TGGGT-TCACTT-CA------------------------------------ACATGAATT----CAAATGTACTGGATGAATTTTGC-----A-----AGCT----TGA-T-AAGGA-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGC--CATA----T-TTTT--AGC--AGAATTCCACA-------A--------AAA---GCTTGA-AG-ACAAATCGAAG-------------CAGG------------------CTTCAAGCTCAAGTTT------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TG---AAAT-----T---G--AG--AAGTTGAAATGT----A---T----TT--AAA--A-----C----TAT--TC------TTC--AGAGTGA----TTGAGAG-A-----AAT-----TG---TC-A---C-----AAAGGCAGGGCATTCATGTttctgttaagcaataatcaaaaggcatcccacattacaggtttggagctgataagttata
gi|13 : CAG--ATGT-GA---A-CTCCTT----TGTTATA---TTA-CAGGATAACAA---A-AGCACAAATA-A-AGAAAA-T-ACCCGAGT-A-AGAGT-TCGATC-CATTCATGA-AATACATTCAATAC----T----CA---ACATGACTT----AAAATGAACTGTATCAATGTCAT-----A-----CGC-----TAA-T---GTA-ATAT--GGAAATTTG-A---AACC--C--A----T-TT-----A---AG--------C-------A--------GAATT-CCTCAA-AA-TCG--TTAAAG-------------T---------------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TA---ATGT-----T---T--AG--TAATTGATATG---------T----AT--TGA--A-----T----TACATTC------TTC--AAAGTAA----TTGAGAGCCATTGTAAT-----TG------A---C-----A-------------CATGTCCTATTTAC-----A------TA-ttttagtttccattaatgtttgtgagctgtgatgtg
gi|14 : ctttaaatttaagTATTGAAAATT-----------------TTTGAAAA-TGAT---GGCATGACGTTTTCTGATAATAATGGTA------TAAGAC-GTT--TCACTG-TT---CATCAG-GT--TTATACAATTATT-AG---ATGTCT-------------TG-T-------ATTTGATGCAGCA-TGGCTACAGTCTCT-AGCGCTAT-AAG----C-TTGATTAA--GTGT-CA---A-CTCCTC----T----CA---T-A-TCCGAGAACAT---A-GGCACAGGTAGA-AAAATA---ACCAGAGT-A-AGAGT-GCACTT-CATTCATAT-AT----------------------A---ACGT-ACTTTTAAAAAGTGTACTAGATGAATTTCAT-----A-----
gi|15 : aaattatattataaattatctaaacttataaagctaattaAGGGATG-TGATGATTGAA--A-ATGTGATT----AG-------ATCTA------C-CTTTGA--A--AAGTGAA-TGGGTATAT-ATGTA--TC------T--G---ACTTAGCTTTGAGT--TCCA----------TGTAATATAA---------T-GG---A-----------------T----TTTAGTGCAATTA---AA------A----------------------G---T--T-------T-C---AAA-C-A-TTCT---CC--A-------------T-TA------CAATT--T--A-A-TCGCTATTCAATTTCAAT-CTTTATTGAATTTT-----A-TA-----A-TTCTAAAAA-TAAT---AGAATAAAAATGTCTGATAATAATGATG------TTAGTCTGTT--TGACTG-TTTGTTGTGGA-GTGTCT-----------------GTGTC---TT-ATGAC-AGTA-TC------AC-TGATGGAGCA-T--TCATAGTATCA-AGGGCTAT-ag
gi|16 : TTGAAAA-TGAT---GGCATGACGTTTTCTGATAATAATGGTA------TAAGAC-GTT--TCACTG-TT---CATCAG-GT--TTATACAATTATT-AG---ATGTCT-------------TG-T-------ATTTGATGCAGCA-TGGCTACAGTCTCT-AGCGCTAT-AAG----C-TTGATTAA--GTGT-CA---A-CTCCTC----T----CA---T-A-TCCGAGAACAT---A-GGCACAGGTAGA-AAAATA---ACCAGAGT-A-AGAGT-GCACTT-CATTCATAT-AT----------------------A---ACGT-ACTTTTAAAAAGTGTACTAGATGAATTTCAT-----A-----
gi|18 : CAGGGATGGAG-TAATTGTA--A-ATGTATTAGCT-GT-------ATTTAGA--TACATTTT--T-A--AAGTCAT-TGGGTATAT-ATGTA-ATT------G------ACTTCGCTTTCAGT--TA-A----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TC--------------AA------ATAC-------------------A---T--TAAAAAAGT-C---AAG-C-ACCTT----CA--A-------------T-TA------C-----------A-T----------------T-CTTTATTCAAACTT-----A-AA-----C-G------------------AATGGAAGTATCTGATAGAAATAGTG------TTAGATTGTT--GCACTGATTTGTCATGGG-GTGTCTATGCAAAAATT-GG---ATGTCTCATgc
gi|19 : TAATTGTA-AT----------TAGC--TGCATT--GA--A--AAGTATT-TGGATGTAT-TTGCA-ATT------A--A---GATTTGCTCTCAAC--TAGA----------AGTTATTGAA---------C-AT---T-----------------T----CT--------------AA------AT---------------------GCATT--T-------T-C---AAA-A-A---GT---CAAGA-------------T-TATTTTT-T---T--T--T-A-C----------------T-CTTCATTCAAAGTT-----G-AAT----A-ATTCGAAAA-TGGT---GGAATGAAAGTG--TGGTAATATTGGTA------TTAGATTGCT--TTACTC-TTTGTCATGTA-GTGTTTATG
gi|2 : caaggatgggaCTTTGCTCTCCAT--TTCA----------AGTAGCTGAA---------TTGT---G-----------------T----TT--------------AA------A----------------------A---C--T-------T-T---AAA-T-ACGTTT---TA--AAAAGGGGATCAAAT-TA------A---T--T--ACA-C----------------T-CGTTATCTAAACTT-----A-AT-----A-TTTTGAAAAATAAT---TGGATGAAAGTGTCAGATAATACTGGTG------TTGGAATGTT--TCACTG-TTTGTCATGGG-GTGTTTATGCATTAATT-AG---ATATCTCAGT-ATGTT-TATA-T-------ACTTGATGCAACA-TGGCAACAATACCCTGGGGCTAT-AGG----T-TTGTTCAG--GTGT-AA---A-ACCCTC----T----CA---T-A-CCTGAAAACAA---T-GGCACAGGTAGA-AAAAAAAT-ACCTGAGT-A-AGAGT-TCACTT-CATTCAGAT-ATTACATTCAGAAC----T----GA---ACATTACTA----AAAATGTACTGGACGAATTTCAT-----G-----TCA-----CAG-AAAATGC-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGC--C--AAA--T-TTTC--AGCTGAATTCCTC--A-------A--------AAA---GCTCGA-AG-AGGAATGAAAG-------------CAAG------------------C--------------T------T--------------CAGGGT---------CAA----------GTCTTCCAGA-GCAATTGGAAA----TAAACAACT-----G---T--AGGCTAATTGAAATG---------T----AT--TTA-------------------------------AAAAT-A----TTGAGAGTGATTTCAAT-----TG---TC-A---C-----ACGGAT-GGGCATTCATGTCCTATTGAC-----
gi|20 : tgcTAATAGTGGTT------TTAGAATGTG--TCACTT-TTTGTCTTGAG-TTGTTAATGCATTAATT-AG---GTGTCTCATT-ATGTC-TCTG----------CT-----CA--A-TAGCCACAGTGCTC--------T-GAG----T-TTGT------GAGT------------------T----CA---T-A-CCTGATAACAATTAA-GGCACCGGTAGA-AAAAT--T-ACCTGAAT-A-AGAGT-TTATTT--------GT-AT---ATTCAAAAC----T----TT---TT-TGACGT----AAA-TGTAGTGGGTGAATTTTAT-----A-----TGC-----TAA-TAA
gi|21 : AAGGA-ATATATGGAGATTTC-A---AAGC--C-----------------------------------------------------GCTTAA-AG-ACGAATCAAAGGATATTTCGAGGTCAAGT-----------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTCTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--GAACAGAAATGT----A---T----TT--GTC--A-----CA---TTC--TT------T----AAAGTAC----TTGAGAGTAATTACAAT-----TG---TC-A---C-----AA-----GAACATTCATTTCCTATGGAC-----A------AATTTTCTAg
gi|22 : TTAAT-A--AAGAAATATGCATAGAT-CTGCT-GTT------G--G----CATTACTTTCAATCGTACACATGTATTGAAGCAATTGAA---------C-GT---A-----------------T----CT--------------CATTCCCCC----------------------T---T--T-------T-C---GAGGT-ATTTTTTTTCA--A-------------T-TA------G---C--G--A-A-T----------------TTCTTTGATCAA-CTTTTTTAA-AA-----ATGTTTGAAGA-TGGT---GGAGCAAAAGTG-CT-------ACG--------------CTATT--TCACTG-TCCG----GGG-GTGTTCAttccaaatgtttacgctataagta
gi|23 : ------------------C--------------T------C--------------C--------------CAA----------A----------GCACTTTGAAA----TA---AACT-----T---C--AG--AAATTGAAATGT----A---T----TT--GTA--A-----A----CTA---------------AAAGTAA----GTGATAGAAATTACAAT-----TG---TA-G---C-----AAGGACGTGGCATTCATGTCCTATGAAC-----A------TA-TTTCTAGTTa
gi|24 : T-------ATTTAAAAGTACATTTTTGT-A--AAGTAAG-TGGATGTAT-TTGTA-ATT---------G---ACTTTTCTTTCAAC--TATA----------AGTAATTGAA---------T-GT---ACATTTATTTTTACACTTT----TT--------------AA------AAAC-------------------A---T--T-------T-C---AAA-T-ATTTTT---CA--A-------------TATA------T-----------A-T----------------T-CTTTATTCAAACTC-----T-AA-----A-GTTTGAAAA-TGAT---GGCTAGAAAGTGCCTattatacattttattttagacatatggtcaataaaaataattcgttctttcatttttaagatatgaatacatgt
gi|25 : attgatcatgattgctgtg--------A-------A--------AAA---GTTTGT-AG-ACGAATCATAG-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------CAAGGT---------CAA----------GTCTTTCAAAAACATTTTGAAA----TGT--GACCGAGGAT---CAGAG--TAATTGAAATGT----A------------TTA--A-----TGGCATTC--TT------CCC--AGA----------------AGTCACA-------TG----G-A---CCGGGGGGGGGGGGGGCATTCAT-TCCTATGGAC-----T------TA-
gi|26 : cagaattcctcTTAT-A--AAGTAAT-TGGATGTAT-TTGTA-ATT------G------------------AC--TAGA----------AGTAATTGAA---------T-GT---------------------------T--------------AA------A----------------------T---T--T-------T-A---AAA-T-AGTCCT---AA--A-------------T--G------C-----------A-T----------------T-CTTTATTCACACTT-----G-AA-----T-GTTTAAAAA-TGAT---GGAATGAAAGTGTCTTATCATACTGGTG------TTCTACTGTT--TCACTG-TTTGTTATGAG-GTGTa
gi|27 : TTGAAGTTT----GACTT----AC--TTA--A-----TAT--TTC--CTGAACTATTT--AAGGTAGACCTTTAAGAGCAATTACATT-----TG---TC-A---C-----AAGGGTGGGTCATTCATGTCCTGTGGAC-----A------TA-TTTCTAGTT
gi|28 : T--------------AA------A----------------------G---T--T-------TTC---AAT-T-ACTTTT---CA--A-------------T-TA------C---T--T-----------------------T-CTTTATTCAAAGTT-----A-TC-----A-GTTTAGAAA-TGAT---GGAATGAAAATGTCTTATAACAATGG-G------TTGAACTGTTTATCAATG-GGTGTT-TAA---TGTTTATGCAGTAATT-AG---ATATatcttacacgtacacttatgtgtatttttaaataactcgatctctttattttc
gi|29 : aaatacattccccaaaaaagT--GGAAATTTC-A---AAGC--C--A----TATTTT--AGC--AG--------A-------ATTCCTCA-AAAC--GTCTGA-AA-ACGAATCAAAG-------------CAGG------------------C--------------C------T--------------C--------------a
gi|3 : ataaatattgcatacaagaggtgagagaacatatagaaattgtaaactattttgtacattgtgtaaaacagCAGGGATGGTG-TAATTAAA--ACATGTAATTATA-ATTAGCTTCATCTAAA--AGCATTTTAAT-A--AAGTAAT-TGGATATAT-CTGTA-ATT---------G---ACTTTGCTTTCAAT--TACA----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TT--------------gaggta
gi|3 : aaatgatattaaattcttagtaaatctacattatacacagatatccaacgataattgaatttaatatctcctattatatttcataaagtgatggaaaatgaattgttttacatctgaaaaG-TAATTGGA--T-ATAT--CTGTA-ATTG-----ACTT-----TGC-TTTCAATTAC-AAGTAAT-TGAATGTATTTTATACATTCCAAAAG--GTCAAGTACNNNNNNNNN--NNNN----------NNNNNNNNNN---------N-NN---N-----------------N----NN--------------NN------N----------------------N---N--N-------N-N---NNN-N-NNNNNN---NN--A-------------T-TAATTCTCC---T--TTGC-A-T----------------T-TGTTATTCAAACTT-----A-AA-----A--TATGAAAA-TAAT---GGAATGAAAATGTCTGATAATAATGCTT------TTAGACTGTT--TCA-----------TGAG-GTGTTAATGCAATAATT-AA---TTATTTCATT-CAGTC-TATA-T-------ACTTGATGGAGCA-TGGCCACAG------AGGGCTATCAAA----TGTTGTTCAG--GTGT-GA---A-CTCCTT----G----CA---T-A-CCTGAGAACAA---A-GGCACAAATAG---AAAAA-T-ACCTGAGT-A-AGAGT-TCACTT-CATTGAGAtatacattccaaaaggtcaagtacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaattctcctttgcatttgttattcaaacttaaaatatgaaaataatggaatgaaaatgtctgataataatgcttttagactgtttcatgaggtgttaatgcaataattaattatttcattcagtctatatacttgatggagcatggccacagagggctatcaaatgttgttcaggtgtgaactccttgcatacctgagaacaaaggcacaaatagaaaaatacctgagtaagagttcacttcattgagaat
gi|30 : aaatgatattaaattcttagtaaatctacattatacacagatatccaacgataattgaatttaatatctcctattatatttcataaagtgatggaaaatgaattgttttacatctgaaaacagggatggtgtaattaaaacatgtaattataattagcttcatctaaaagcattttaataaaAAT-TGAT---GGAATGAAAGTGTCAGATAATAATGGTG------TTAGACCGTT--TCACTG-TTTGTCATACG-GTGTTTGTACAATGATT-AA---ATGTCTCat
gi|31 : caattcaaggtcgggctattttaattgattaattggatgtattttt-A--AAGTAAC-TGGATGTAT-TTATG-GTT------G------ACTTAGCTTTTAAT--TATA----------AGTAATTAAA---------T-GG---A-----------------T----AT--------------AA------T----------------------G---TA-T-------T-C---AAA-T-ACATTT-------A-------------T-TA------
gi|32 : ----T----CA---C-A-CCTAAGAACAA---A-GACACAGTT-GA-AAAAAT-TCAACTGGGT-A-AGAGT-TCAATT-CATTCATAT-CCTACATTCAAAAC----C----CA---ATTTGACTT----TAAATGTATAGGGTGAAATTAAT-----A-----TGC-----TGA-TAAAGGA-ATaaaagttaaaggtttcaattacttttcatttacaaatgtacattttt
gi|33 : CAGAAC----T----CA---ACATGACTT----AAAATGTACTGTATGAAATTCAT-----A-----TGC-----TAA-TAAAGGA-ATAT--AGAATTATC-A---AAGC----------------------------------------------------A---GTTTCA-A-----AGTCA-----------------AGT------------------C--------------G------T--------------C--------------CAA----------A----------ACATTTTGAAA----TA---AAGT-----T---T--AG--TGATTGAAAT
gi|34 : GTC-TATA-T-------ACCTGATTCAGCA-TGGCCACAGTGCCC-AGGGCTCT-AGT----T-TTGTTCAG--GTGT-GA---A-CTCTTT----C----CA---T-G-CCTGAGTACAA---A-AGCACAGTT----AAAAAA-T-ACCCGAGT-------T-TCAATT-CATTC
gi|35 : TAGACTGTT--TTACTG-TTTCCCAAGAG-GCGTTTATACAATAATT-AA---ATGTCTCATT-TTGTC-TATA-T-------TATTGTTGCGACA-TGGCCACAGTACCC-ATGGATAT-AAG----T-TCATTTGG--CTAT-GA---A-CTCCTC----T----tttta
gi|36 : -A--AAGTAAC-TGGATGTAT-TTATG-GTT------G------ACTTAGCTTTTAAT--TATA----------AGTAATTAAATGGATATAAT-GT---A-----------------T----TC--------------AA------ATACATTTATTAAAAAGTTAAAGG---T--T-------T-C---AAT-T-ACTTTT---CA--
gi|37 : gT-CATTCATAT-ATTACATTCAGAAC----T----CA---ACATGACTG----GAAGCACACTGAATT-ATTTCGT-----A-----AGC-----CAA-TAAAGCA-ATAT--AGAAATTTC-A---AAAC--C--A----T-Tt
gi|38 : GTT-TATA-T-------ATTTGATGCAGCA-TGGCC--------C-AGGGCTAT-AGG----T-TTGTTTCG--GTGT-GACTGACCTCCTCTCGAT----CA---T-G-TCCGGGAACAA---A-GGCACGGGTAAA-AAAAagcagaattcctcaagtag
gi|39 : A----------AGTAATTGAA---------T-GTTAAA-----------------T----TTG-------------AA------A----------------------A---TAGT-------C-CTAAAAG-TCACTTTC---CA--A-------------T-TG------C-----------A-T----------------T-CTTTATTCACACTT-----G-AA-----T-GTTTAAA
gi|4 : taattggt-AG---ACATCCCATTCATGTTGTATA-TCTATTAGACCTGATGCAGCA-TGGCCACAGTGCCA-AGGGCTA--AGG----T-TTGTTCAGCATTAT-TA---A-CTC--C----T----CA---T-A--CTGAGAACAA---A--GTACAGGTAG--AAGAAG-T-ACCTG-GT-ACAGAGTATTTCTTCCATTCCCACAATTACATTAAGAAC----T----GAGTCACATAACTT----AAAT--TACTGCATGAGTTTCAT-----ATACTGTGT-----TAA-AAAAGGACATCTA-GGAAATTTC-----AAGCAAC--A----G-TTTTGCAG---AATTGCCC--A-------A--------AAA---GCTCGA-AG-ACAAATCAAAG-------------CAGGGCTTTAAGCTTCAAGTCTC--------------T------C--------------C--------------CAT----------G----------A-ATTTTGAAAATTTTA---AACT-----T---T--AG--AAATTG-AATAT----A---TTTGGAT--TTA--CT----T----TTT--TT------TTC--AAAGTAA----TGGAGAGCTATTACAATACAG-TGACTTC-AATGA-----AAGGGCAGGACAAT--TGCCACATGGGCACATTA------TA-TTTTTAGCTng
gi|40 : gCAAAG-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------CGATCGT--------CGAATATTCTATTG----------ACATTTTGAAA----TA---AA-T-----T---C--AG--TAATTTGAATGT----A---T-----TGATTACTA-----T----TTA--TTA-----TTT--AAAATcattttgaggattccagaggttctgagtacataatatattctgcagttggtttttcatcagcatcattaacattaaatttgagtgaacaactcatacgcttgtga
gi|41 : GAA--A-ATGTAATTGCA-ATTAGCTGCATTTAAA--TACAATACTAT-ATTAAGTAAT-GGGTGGTAT-TTGTA-ATA------GCTG---ATTTTGCTTTCAAT--TAC
gi|42 : A-TTAT---GAAATAAAAGTGCCTGATATTTATAGTG------GTGGACTCTT--TCACTG-TTTCT----AGAGTGTTTATGCAATGATC-GGTGCATGTTTC
gi|43 : AAATGTACTGGATGAATTTCAT-----------TCC-----CA-----------------GAAATTTC-AATTAAAA--T--A----T-CGTT--AAC--AG--------A-------ATTCCTCAGAAA---GCTTAA-AG-ACAAAT
gi|44 : --------AAA---GCTTGACAT-ACAAA-CAAGG-------------CAGT------------------C--------------T------T--------------C--------------CTA----------A----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--TAATTTGAATGT----A---agg
gi|45 : taaaattcatt----TC--------------AA------G----------------------A---T--T-------T-C---AAT-T-ACTTTT---CG--A-------------T-TA------C---------A-A------------------T-CTTCATTCAAAATT-----ACAAGACTTA-GTTTGAAAA-TGTC---GGA
gi|46 : ataaaag-AA-----A-GTTTATAAA-TGGT---GGAATGAAAGCGTCAGATGATAATGGCG-------------GTT--TTACTG-TTTGCCATGAG-G
gi|47 : t-T-GCTTTT---CA--G-------------T-TA------C-----------A-T----------------T-TTGTATTCAAACTA-----A-AG-----T-GTCTGATAA-CAAT---GG
gi|48 : ----T-TTGTTCAG--GTGT-GA---G-CCCTGT----T----CA---T-ACCCCGAGAACAA---A-tt
gi|5 : tctaatATT-AC---ATGTGT-----ATATC-TATA-G-------ACCTGATGCAGCA-TGGCCACAGTGCCA-AGGGCTA--AGG----T-TTGTTCAG--ATTT-GA---A-CTCCTC----------A---T-A-CT-GAGAACAA---A-GGCACAGGTAGA-AAAA---T-ACCTGAGT-A-AGAGT-TTTCTT-CATTCCCAC-ATTACATTAAGAAC----TGAGTCA---ACATAACTT----AAAATTTACTGCATGAGTTTCAT-----A-----TACATGTATAAATAAAGGA-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGCAAC--A----G-TTTT--AGC--AG--------A-------ATTGCCCAAAAA---GCTCGA-AG-ACAAATCAAAG-------------CAGG------------------C--------------T------TTAAGCTCAAGTTTTC--------------CAT----------G----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--AAATTGAAA--T----A---T----AT--TTG--ATTACTT----TTT--TT------TTC--AAAGTAA----TGGAGAGCAATTACAATACAG-TGACTTCAA---T-----AAGGGCAGGACA---ATGCCACATGGGCACATTA------TA-TTTTTAGCTaata
gi|50 : attatagagacatcccGTGGGACTTTCACGTCCTATGGAC-----A------TA-TTTCTAGTTcatttttgaggatttccagatgtttctgagtacataatatattctgcagttggttttcatcagcatattaacataaatttgaagtgaacaacatcatacgcttgtg
gi|6 : tgcGAAAA-TGATCCGGGAATGAAAAAGTCGGATAATAATGGTGATGTTGTTAGACTATT--TCACTG-GTTGTCATGAG-GTGTTAATGCAATGATT-AG---ACGTCTCCTT-ATGTC-TGTA-T-------ACTTTCTGCAGCA-TGACCATAGTACCC-AGGGCTAT-ATA----T-TTGTTCAG--ATGT-GA---A-CTCCTC----T----CA---T-A-CCCGAGAACAA---A-GGCATAGGTTG--CAAAAA-T-AATTGAGT-A-AGAGT-TCACTT-CATTGGGAT-------------AC----T----CA---ACATGACTT----AAAATGTACTGGACGAATTTCGT-----A-----TGC-----CAG-AAAAGGA-ATCT--GG------C-A---AAGC--CATA----T-CTTT--AGT--AG--------A-------ATTCCT---AAAGATGCTTGA-AG-ACGAATCAAAG-------------CAGG------------------CTTTGAGGTCATGTTT------T--------------C--------------CAA----------A----------ACATTTTGATA----TA---AACT-----T---C--AG--CAATTGAAATGT----A------------TTAC-A-----T---------TT------TTT--AAAGTAA----TTGATAGC-ATTACAAC-----TG---TC-T---C-----ACGGGCAAGCCATTCATGTCCTACGGAC-----A------TA-TTTGTAGTTttcattgg
gi|7 : -ATATC-TATAGT-------ACTGAATGCAGCAATGGCCACAGTGCCA-AGGGCTA--AGG----T-TT-TTCAG--ATCTTGA---A-CTCCT-----------A---T-A-CT-GAGAACAA---A-GGCACAGGTAG---AAAAA-T-ACCTGAGTAA-AGAGT-TTTCTT-CATTC-CAC-ATCATA---AGAACTGAGT----CA---ACATAACTT----AAATT-TACTGCATGAGTTTCATATTAAA-----TGTA----TAA-T-AACGA-ATCT--GGAAATTTCAA---AAGC--C--AACAGT-TTTT--AGTC-AG--------AATTGCCCA--------AAA---GCTCGA-AGAACAAATCAAAA-------------GAGG------------------C--------------TTTAAGCT--------------C--------------CAAAGTTTTCCATG----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----TAAAG--AA--AAATTGAAACAT----A---T----AT--TTG--ATTACTT----TTT--TT------TTCAAAAAGTAA-----TGAGAGCAATTACAATACAAGTGACTTCAA---T-----AAGGGCAGGACA---ATG-CACATGGGC-----A------CA-TTaattagaaattacatgtaataataatatgtagtcacaattaattgatttgcaaatgtaagttataaaaat
gi|8 : CAGGGATGG-A-TTATTGAAGAA-ATG-AATTGTACAT-------ACATTAA--TTTATTTTTAT-A--CAGTAAT-TGGATGTAT-CTGTA-ATT------C------ACTTCACTTTCAGT--TACA----------CGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------TAGTGTTTAGATACATTCCAAAA------A----------------------G---T--CAAGATG-T-C---AAT-T-AC-TTT---CA--A-------------T-TA------C---A--T--ACA-T----------------T-CTTAATTCAAACTT-------AA-----A-GTTaataattttagcttcatttttgaggaattccaagatgtttctga
gi|9 : atatgtttctacttttgttttttcgttttgcatgaaatcgttcagctgcaagaaatccttgttatttcatattattgtttgcaccagatgatagtcactattatagacaaataaataccaatcacaaccttttttttttatcctaaagtaataattaaatttgaaatacatatttgtgaagacacatgaaatgatatgcgagataatcaatatatttggtacatacatgtacaaggaaaataatcttgaaatacattgctgaatC-TATA-T-------ACTTGATGTAGCA-TGGTCACAATGCCC-AGGATTGG-AGGTAAAT-TTGTTCTG--GTG-------A-CTCCTC----T----CATATT-A-CCTGAGAATAA---T-GGTATGGGTAG--AAAAAA-T-TCCTGAGT-A-A-AGT-----TT-CATT-------TT-TATTGAGAAC----T----CA---ATATGAATG----AAAATGTACTGGATAAATTTCAT-----G-----T-C-----CAA-TAAA--A-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGCG-A--A----T-TTTT--AGC--AGAATTCCTCA-------A--------AAA---GTTTAA-AG-GTGAATCAAAG-------------CAGG------------------T--------------T------T------------------------------AA----------T----------A------GGGC----CA---TATT-----T---T--A----CATT-AAATGT--------T-----T--TTA--A-----T----TGCATTC------TTC--A------------------------AAT-----TG---TT-A---C-----ATGGGTGGGGCATTCATGTCTTATGGAC-----A------TA-TTTCTAGTTa
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TATGGTTTTACTTTAGATTTGGCTTCTTGCAGTGAACTGATTCCGTGCAAGGAGAATCTTTATTATTCCAATCGTATTTCTCCGACTGTAGTGTAGTCACTGTTAGTCACAATCAATAATCTATAGAAATAAACTGTGTTTATTTATTTTAATGTCATTATCATTTATCAACTTTCAAATACATTTTGGAAAGACACATCAGATGATATGAGAGACTAATCTATACAGAGAAAATGAACTTCAAACA
Unaligned ( gi|49 ): TTTATTGATATAGCTCACTATTTTGTACTCTTAAGAGTAACAGGTACAC
Unaligned ( gi|51 ): TAATTTGTTTACGTACATAGAAAATGAACAAGAATGAT
Alignments
lowQualScore : 3333333333333333 3333333333333 1111111111 111111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111111111111111 1111111 11111 222222222222 7777777777777777777777777 1111111111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111 111 111111111111
lowQualScore : 6 6 8888 5 5555555555555555 0 1 4 3 77 3 3 3 7777777777777 5 33 1 2222222222 111111111 2 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 3333333333333333 2 333 777777 33 2 0 0 2 1 2 444 55 3 2 2 0000000 2 0 2 44 5555 2 33 33 444 2 666666666 444 2 2 6 333 2 99 4444 2 2 2 2 66 2 1 44 0 5555 888888888 1 66 88888888888 22222 444 1 2 66 2 444 666666666666 2 1111111111111111111111111 666 2 2 2 2222222222222 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5555 666 55555 666666 555 777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 66666 22 88888 444 5 444 66666 3 22 1 0 444444444444 2
lowQualScore : . . .... . ................ . . . . .. . . . ............. . .. . .......... ......... . ........................................................................................................................................................................ . ................ . ... ...... .. . . . . . . ... .. . . . ....... . . . .. .... . .. .. ... . ......... ... . . . ... . .. .... . . . . .. . . .. . .... ......... . .. ........... ..... ... . . .. . ... ............ . ......................... ... . . . ............. .............................................................................................. .... ... ..... ...... ... ................................................... . ..... .. ..... ... . ... ..... . .. . . ............ .
lowQualScore : 0 7 3333 0 2222222222222222 9 9 5 1 33 1 1 1 2222222222222 1 99 4 5555555555 444444444 9 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9 9999999999999999 2 999 222222 22 4 8 5 4 5 7 777 55 3 7 5 6666666 5 2 5 22 3333 5 22 66 111 4 777777777 111 4 4 4 999 2 22 8888 5 5 5 4 11 7 9 88 2 3333 888888888 2 55 33333333333 00000 666 7 7 33 7 777 666666666666 7 5555555555555555555555555 555 4 4 4 9999999999999 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0000 555 99999 555555 666 888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 33333 33 00000 000 3 777 77777 7 55 2 2 444444444444 9
consensus : CAGGGATGGTG-TAATTGAA--A-ATGTAATTGTA-AT-------ATTTAAA--TGCATTTTNAT-A--AAGTAAT-TGGATGTAT-TTGTA-ATT------G--G---ACTTCGCTTTCAAT--TACA----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TT--------------AA------A----------------------G---T--T-------T-C---AAN-T-ACTTTT---CA--A-------------T-TA------C---T--T--A-A-T----------------T-CTTTATTCAAACTT-----A-AA-----A-GTTTGAAAA-TGAT---GGAATGAAAGTGTCTGATAATAATGGTG------TTAGACTGTT--TCACTG-TTTGTCATGAG-GTGTTTATGCAATAATT-AG---ATGTCTCATT-ATGTC-TATA-T-------ACTTGATGCAGCA-TGGCCACAGTGCCC-AGGGCTAT-AGG----T-TTGTTCAG--GTGT-GA---A-CTCCTC----T----CA---T-A-CCCGAGAACAA---A-GGCACAGGTAGA-AAAAAA-T-ACCTGAGT-A-AGAGT-TCACTT-CATTCANAT-ATTACATTCAGAAC----T----CA---ACATGACTTAAAA--TGTACTGGATGAATTTCAT-----A-----TGC-----TAA-TAAAGGA-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGC--C--A----T-TTTTAG-CAG--------A-------A--------AAA---GCTTGA-AG-A-CGAATCAAAG-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--TAATTGAAATGT----A---T----AT--TTA--A-----T----TTC--TT------TTC--AAAGTAA----TTGAGAGCAATTACAAT-----TG---TC-A---C-----AAGGGCGGGGCATTCATGTCCTATGGAC-----A------TA-TTTCTAGTT
Reference ( family-309 ) : CAGGGATGGTG-TAATTGAA--A-ATGTAATTGTA-AT-------ATTTAAA--TGCATTTTNAT-A--AAGTAAT-TGGATGTAT-TTGTA-ATT------G--G---ACTTCGCTTTCAAT--TACA----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TT--------------AA------A----------------------G---T--T-------T-C---AAN-T-ACTTTT---CA--A-------------T-TA------C---T--T--A-A-T----------------T-CTTTATTCAAACTT-----A-AA-----A-GTTTGAAAA-TGAT---GGAATGAAAGTGTCTGATAATAATGGTG------TTAGACTGTT--TCACTG-TTTGTCATGAG-GTGTTTATGCAATAATT-AG---ATGTCTCATT-ATGTC-TATA-T-------ACTTGATGCAGCA-TGGCCACAGTGCCC-AGGGCTAT-AGG----T-TTGTTCAG--GTGT-GA---A-CTCCTC----T----CA---T-A-CCCGAGAACAA---A-GGCACAGGTAGA-AAAAAA-T-ACCTGAGT-A-AGAGT-TCACTT-CATTCANAT-ATTACATTCAGAAC----T----CA---ACATGACTTAAAA--TGTACTGGATGAATTTCAT-----A-----TGC-----TAA-TAAAGGA-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGC--C--A----T-TTTTAG-CAG--------A-------A--------AAA---GCTTGA-AG-A-CGAATCAAAG-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--TAATTGAAATGT----A---T----AT--TTA--A-----T----TTC--TT------TTC--AAAGTAA----TTGAGAGCAATTACAAT-----TG---TC-A---C-----AAGGGCGGGGCATTCATGTCCTATGGAC-----A------TA-TTTCTAGTT
gi|1 : CAAGGATAGTG-CAATTGAA--A-ATGTAGTTGTA-AT-------ATATAAAAATGCATTTTAAT-A--AAGTAAT-TGAATGTAT-TTGAA-ATT------ATAG---ATTTTGCTTTTAAT--TACA----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TT--------------AA------A----------------------G---T--T-------T-T---AAT-T-ACTTTT---CA--A-------------T-TA------C---TAGT--A-AAT----------------T-CTTTATTCAAACTT-----A-AA-----A-GTTTGAAAA-TGGT---GGAATGAACGTGTCTGCTAATAATGGTG------TTAGACTGTT--TCACTG-TTCGCCATGAG-GTGCTAATACAATGATTCAG---ATACCTCCTT-ATGTC-TATA-T-------TCTCGATGCAGCA-TGACCACAGTGGCC-AGAACGAT-AGG----T-TTATTCAG--GTGA-GA---A-CTCCTA----T----AA---T-A-CCAGAGAACAA---A-GACACAGGTAGAGAAAAAA-T--TCTGAGT-A-AAAGT-TCACTT-CATTCAGAT-AATACATTCTAAAC----T----CA---ACATAACGTAAAT--TGTACTGGATGAATTTCAT-----A-----CGC-----TAA-TAAACGA-ATCT--GGAAATTTC-A---AAAC--C--A----C-TTTTAA--AG--------A-------A--------AAG---GTGTGA-AG-A-CAAATCAAAG-------------CAGA------------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--A---TAATTGAAATGTATACA---T----AT--TTA--A-----T----TTC--ATGG----TTA--AAAGTAA----TTGAGAGCAATTACAAT-----TG---TC-A---C-----AAGAGCGGGGAATTCATGTCCTATGGAC-----A------TA-TTTCTATTT
gi|10 : TG-T-------ACTTGATGCAGCA-TGACTATAGTGCCC-ATGGCTAT-AGG----T-TTGTGCTG--GTA-----------CCTC----T----CA---T-G-CCTGATAACAA---A-GACACGGG--GA-CAAAAA-G-ACCC-AGT-A-ATGGT-TTACTT-CATTCAGAT-ATTACATTCAGAAC----T----CA---ACAAGACTTAAAA--TGTACTGAATGAATGTCAT-----G-----TCC-----TAG-AAAATGC-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGC--CAAA----T-CTTTAG-CAGAATTCCTCA-------A--------AAA---CCTTAA-TG-A-AGAATCAAAG-------------CAGGCTTGGGGGTTAATTAAGTC--------------T------T--------------C--------------CAA----------C----------ACATTTGGAAA----TA---AACC-----C---C--AG--TAATC-AAAT-T----G---T----AT--TT---------------------------------AAG---------------AATTACAAT-----TG---TC-A---C-----TTGGAAGGGGCTTTCATATCCTGTGGAC-----A------TA-TTTCTAGTT
gi|11 : ---GCTTGA-AG-A-CAAAACAAAA-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------CAGGGTCAAGTCTTCCAA----------G----------ACATTTTGAAG----TA---AATT-----T---C--AG--TAATTGAAATG---------T----AT--TTA--G-----TGACATTC----------TTC--AAAGTAA----TTGAGAGCAATCACAAT-----TG---TC-A---C-----ATGGGTGGGCCATTCACGCCCTATGGAC-----ATACATGTA-TTTCTAGTTc
gi|12 : aaaatataattactaaagttatctgattagaataccataaaatttactgttcgtgttaaataggcaaataatgacttcaacacGAAAAA---ATGACACATGAAGA-AAAAA--T-ACCTGACT-T-TGGGT-TCACTT-CA------------------------------------ACATGAATTCAAA--TGTACTGGATGAATTTTGC-----A-----AGCT----TGA-T-AAGGA-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGC--CATA----T-TTTTAG-CAGAATTCCACA-------A--------AAA---GCTTGA-AG-A-CAAATCGAAG-------------CAGG------------------CTTCAAGCTCAAGTTT------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TG---AAAT-----T---G--AG--AAGTTGAAATGT----A---T----TT--AAA--A-----C----TAT--TC------TTC--AGAGTGA----TTGAGAG-A-----AAT-----TG---TC-A---C-----AAAGGCAGGGCATTCATGTttctgttaagcaataatcaaaaggcatcccacattacaggtttggagctgataagttata
gi|13 : CAG--ATGT-GA---A-CTCCTT----TGTTATA---TTA-CAGGATAACAA---A-AGCACAAATA-A-AGAAAA-T-ACCCGAGT-A-AGAGT-TCGATC-CATTCATGA-AATACATTCAATAC----T----CA---ACATGACTTAAAA--TGAACTGTATCAATGTCAT-----A-----CGC-----TAA-T---GTA-ATAT--GGAAATTTG-A---AACC--C--A----T-TTA-AG-CAG--------A-------A--------T-----TCCTCA-AA-ATCG--TTAAAG-------------T---------------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TA---ATGT-----T---T--AG--TAATTGATATG---------T----AT--TGA--A-----T----TACATTC------TTC--AAAGTAA----TTGAGAGCCATTGTAAT-----TG------A---C-----A-------------CATGTCCTATTTAC-----A------TA-ttttagtttccattaatgtttgtgagctgtgatgtg
gi|14 : ctttaaatttaagTATTGAAAATT-----------------TTTGAAAA-TGAT---GGCATGACGTTTTCTGATAATAATGGTA------TAAGAC-GTT--TCACTG-TT---CATCAG-GT--TTATACAATTATT-AG---ATGTCT-------------TG-T-------ATTTGATGCAGCA-TGGCTACAGTCTCT-AGCGCTAT-AAG----C-TTGATTAA--GTGT-CA---A-CTCCTC----T----CA---T-A-TCCGAGAACAT---A-GGCACAGGTAGA-AAAATA---ACCAGAGT-A-AGAGT-GCACTT-CATTCATAT-ATAACGT-----AC----T---------------TTTAAAAAGTGTACTAGATGAATTTCAT-----A-----
gi|15 : aaattatattataaattatctaaacttataaagctaattaAGGGATG-TGATGATTGAA--A-ATGTGATT----AG-------ATCTA------C-CTTTGA--A--AAGTGAA-TGGGTATAT-ATGTA--TC------T--G---ACTTAGCTTTGAGT--TCCA----------TGTAATATAA---------T-GG---A-----------------T----TTTAGTGCAATTA---AA------A----------------------G---T--T-------T-C---AAA-C-A-TTCT---CC--A-------------T-TA------CAATT--T--A-A-TCGCTATTCAATTTCAAT-CTTTATTGAATTTT-----A-TA-----A-TTCTAAAAA-TAAT---AGAATAAAAATGTCTGATAATAATGATG------TTAGTCTGTT--TGACTG-TTTGTTGTGGA-GTGTCT-----------------GTGTC---TT-ATGAC-AGTA-TC------AC-TGATGGAGCA-T--TCATAGTATCA-AGGGCTAT-ag
gi|16 : TTGAAAA-TGAT---GGCATGACGTTTTCTGATAATAATGGTA------TAAGAC-GTT--TCACTG-TT---CATCAG-GT--TTATACAATTATT-AG---ATGTCT-------------TG-T-------ATTTGATGCAGCA-TGGCTACAGTCTCT-AGCGCTAT-AAG----C-TTGATTAA--GTGT-CA---A-CTCCTC----T----CA---T-A-TCCGAGAACAT---A-GGCACAGGTAGA-AAAATA---ACCAGAGT-A-AGAGT-GCACTT-CATTCATAT-ATAACGT-----AC----T---------------TTTAAAAAGTGTACTAGATGAATTTCAT-----A-----
gi|18 : CAGGGATGGAG-TAATTGTA--A-ATGTATTAGCT-GT-------ATTTAGA--TACATTTT--T-A--AAGTCAT-TGGGTATAT-ATGTA-ATT------G------ACTTCGCTTTCAGT--TA-A----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TC--------------AA------ATAC-------------------A---T--TAAAAAAGT-C---AAG-C-ACCTT----CA--A-------------T-TA------C-----------A-T----------------T-CTTTATTCAAACTT-----A-AA-----C-G------------------AATGGAAGTATCTGATAGAAATAGTG------TTAGATTGTT--GCACTGATTTGTCATGGG-GTGTCTATGCAAAAATT-GG---ATGTCTCATgc
gi|19 : TAATTGTA-AT----------TAGC--TGCATT--GA--A--AAGTATT-TGGATGTAT-TTGCA-ATT------A--A---GATTTGCTCTCAAC--TAGA----------AGTTATTGAA---------C-AT---T-----------------T----CT--------------AA------AT---------------------GCATT--T-------T-C---AAA-A-A---GT---CAAGA-------------T-TATTTTT-T---T--T--T-A-C----------------T-CTTCATTCAAAGTT-----G-AAT----A-ATTCGAAAA-TGGT---GGAATGAAAGTG--TGGTAATATTGGTA------TTAGATTGCT--TTACTC-TTTGTCATGTA-GTGTTTATG
gi|2 : caaggatgggaCTTTGCTCTCCAT--TTCA----------AGTAGCTGAA---------TTGT---G-----------------T----TT--------------AA------A----------------------A---C--T-------T-T---AAA-T-ACGTTT---TA--AAAAGGGGATCAAAT-TA------A---T--T--ACA-C----------------T-CGTTATCTAAACTT-----A-AT-----A-TTTTGAAAAATAAT---TGGATGAAAGTGTCAGATAATACTGGTG------TTGGAATGTT--TCACTG-TTTGTCATGGG-GTGTTTATGCATTAATT-AG---ATATCTCAGT-ATGTT-TATA-T-------ACTTGATGCAACA-TGGCAACAATACCCTGGGGCTAT-AGG----T-TTGTTCAG--GTGT-AA---A-ACCCTC----T----CA---T-A-CCTGAAAACAA---T-GGCACAGGTAGA-AAAAAAAT-ACCTGAGT-A-AGAGT-TCACTT-CATTCAGAT-ATTACATTCAGAAC----T----GA---ACATTACTAAAAA--TGTACTGGACGAATTTCAT-----G-----TCA-----CAG-AAAATGC-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGC--C--AAA--T-TTTCAG-CTG--------A-------ATTCCTCAAAAA---GCTCGA-AG-A-GGAATGAAAG-------------CAAG------------------C--------------T------T--------------CAGGGT---------CAA----------GTCTTCCAGA-GCAATTGGAAA----TAAACAACT-----G---T--AGGCTAATTGAAATG---------T----AT--TTA-------------------------------AAAAT-A----TTGAGAGTGATTTCAAT-----TG---TC-A---C-----ACGGAT-GGGCATTCATGTCCTATTGAC-----
gi|20 : tgcTAATAGTGGTT------TTAGAATGTG--TCACTT-TTTGTCTTGAG-TTGTTAATGCATTAATT-AG---GTGTCTCATT-ATGTC-TCTG----------CT-----CA--A-TAGCCACAGTGCTC--------T-GAG----T-TTGT------GAGT------------------T----CA---T-A-CCTGATAACAATTAA-GGCACCGGTAGA-AAAAT--T-ACCTGAAT-A-AGAGT-TTATTT--------GT-AT---ATTCAAAAC----T----TT---TT-TGACGTAAA---TGTAGTGGGTGAATTTTAT-----A-----TGC-----TAA-TAA
gi|21 : AAGGA-ATATATGGAGATTTC-A---AAGC--C--------------------------------------------------GCTTAA-AG-A-CGAATCAAAGGATATTTCGAGGTCAAGT-----------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTCTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--GAACAGAAATGT----A---T----TT--GTC--A-----CA---TTC--TT------T----AAAGTAC----TTGAGAGTAATTACAAT-----TG---TC-A---C-----AA-----GAACATTCATTTCCTATGGAC-----A------AATTTTCTAg
gi|22 : TTAAT-A--AAGAAATATGCATAGAT-CTGCT-GTT------G--G----CATTACTTTCAATCGTACACATGTATTGAAGCAATTGAA---------C-GT---A-----------------T----CT--------------CATTCCCCC----------------------T---T--T-------T-C---GAGGT-ATTTTTTTTCA--A-------------T-TA------G---C--G--A-A-T----------------TTCTTTGATCAA-CTTTTTTAA-AA-----ATGTTTGAAGA-TGGT---GGAGCAAAAGTG-CT-------ACG--------------CTATT--TCACTG-TCCG----GGG-GTGTTCAttccaaatgtttacgctataagta
gi|23 : ------------------C--------------T------C--------------C--------------CAA----------A----------GCACTTTGAAA----TA---AACT-----T---C--AG--AAATTGAAATGT----A---T----TT--GTA--A-----A----CTA---------------AAAGTAA----GTGATAGAAATTACAAT-----TG---TA-G---C-----AAGGACGTGGCATTCATGTCCTATGAAC-----A------TA-TTTCTAGTTa
gi|24 : T-------ATTTAAAAGTACATTTTTGT-A--AAGTAAG-TGGATGTAT-TTGTA-ATT---------G---ACTTTTCTTTCAAC--TATA----------AGTAATTGAA---------T-GT---ACATTTATTTTTACACTTT----TT--------------AA------AAAC-------------------A---T--T-------T-C---AAA-T-ATTTTT---CA--A-------------TATA------T-----------A-T----------------T-CTTTATTCAAACTC-----T-AA-----A-GTTTGAAAA-TGAT---GGCTAGAAAGTGCCTattatacattttattttagacatatggtcaataaaaataattcgttctttcatttttaagatatgaatacatgt
gi|25 : attgatcatgattgctgtg--------A-------A--------AAA---GTTTGT-AG-A-CGAATCATAG-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------CAAGGT---------CAA----------GTCTTTCAAAAACATTTTGAAA----TGT--GACCGAGGAT---CAGAG--TAATTGAAATGT----A------------TTA--A-----TGGCATTC--TT------CCC--AGA----------------AGTCACA-------TG----G-A---CCGGGGGGGGGGGGGGCATTCAT-TCCTATGGAC-----T------TA-
gi|26 : cagaattcctcTTAT-A--AAGTAAT-TGGATGTAT-TTGTA-ATT------G------------------AC--TAGA----------AGTAATTGAA---------T-GT---------------------------T--------------AA------A----------------------T---T--T-------T-A---AAA-T-AGTCCT---AA--A-------------T--G------C-----------A-T----------------T-CTTTATTCACACTT-----G-AA-----T-GTTTAAAAA-TGAT---GGAATGAAAGTGTCTTATCATACTGGTG------TTCTACTGTT--TCACTG-TTTGTTATGAG-GTGTa
gi|27 : TTGAAGTTT----GACTT----AC--TTA--A-----TAT--TTC--CTGAACTATTT--AAGGTAGACCTTTAAGAGCAATTACATT-----TG---TC-A---C-----AAGGGTGGGTCATTCATGTCCTGTGGAC-----A------TA-TTTCTAGTT
gi|28 : T--------------AA------A----------------------G---T--T-------TTC---AAT-T-ACTTTT---CA--A-------------T-TA------C---T--T-----------------------T-CTTTATTCAAAGTT-----A-TC-----A-GTTTAGAAA-TGAT---GGAATGAAAATGTCTTATAACAATGG-G------TTGAACTGTTTATCAATG-GGTGTT-TAA---TGTTTATGCAGTAATT-AG---ATATatcttacacgtacacttatgtgtatttttaaataactcgatctctttattttc
gi|29 : aaatacattccccaaaaaagT--GGAAATTTC-A---AAGC--C--A----TATTTTAG-CAG--------A-------ATTCCTCA-AAAC--GTCTGA-AA-A-CGAATCAAAG-------------CAGG------------------C--------------C------T--------------C--------------a
gi|3 : ataaatattgcatacaagaggtgagagaacatatagaaattgtaaactattttgtacattgtgtaaaacagCAGGGATGGTG-TAATTAAA--ACATGTAATTATA-ATTAGCTTCATCTAAA--AGCATTTTAAT-A--AAGTAAT-TGGATATAT-CTGTA-ATT------G------ACTTTGCTTTCAAT--TACA----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TT--------------gaggta
gi|3 : aaatgatattaaattcttagtaaatctacattatacacagatatccaacgataattgaatttaatatctcctattatatttcataaagtgatggaaaatgaattgttttacatctgaaaaG-TAATTGGA--T-ATAT--CTGTA-ATTG-----ACTT-----TGC-TTTCAATTAC-AAGTAAT-TGAATGTATTTTATACATTCCAAAAG--GTCAAGTACNNNNNNNNN--NNNN----------NNNNNNNNNN---------N-NN---N-----------------N----NN--------------NN------N----------------------N---N--N-------N-N---NNN-N-NNNNNN---NN--A-------------T-TAATTCTCC---T--TTGC-A-T----------------T-TGTTATTCAAACTT-----A-AA-----A--TATGAAAA-TAAT---GGAATGAAAATGTCTGATAATAATGCTT------TTAGACTGTT--TCA-----------TGAG-GTGTTAATGCAATAATT-AA---TTATTTCATT-CAGTC-TATA-T-------ACTTGATGGAGCA-TGGCCACAG------AGGGCTATCAAA----TGTTGTTCAG--GTGT-GA---A-CTCCTT----G----CA---T-A-CCTGAGAACAA---A-GGCACAAATAG---AAAAA-T-ACCTGAGT-A-AGAGT-TCACTT-CATTGAGAtatacattccaaaaggtcaagtacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaattctcctttgcatttgttattcaaacttaaaatatgaaaataatggaatgaaaatgtctgataataatgcttttagactgtttcatgaggtgttaatgcaataattaattatttcattcagtctatatacttgatggagcatggccacagagggctatcaaatgttgttcaggtgtgaactccttgcatacctgagaacaaaggcacaaatagaaaaatacctgagtaagagttcacttcattgagaat
gi|30 : aaatgatattaaattcttagtaaatctacattatacacagatatccaacgataattgaatttaatatctcctattatatttcataaagtgatggaaaatgaattgttttacatctgaaaacagggatggtgtaattaaaacatgtaattataattagcttcatctaaaagcattttaataaaAAT-TGAT---GGAATGAAAGTGTCAGATAATAATGGTG------TTAGACCGTT--TCACTG-TTTGTCATACG-GTGTTTGTACAATGATT-AA---ATGTCTCat
gi|31 : caattcaaggtcgggctattttaattgattaattggatgtattttt-A--AAGTAAC-TGGATGTAT-TTATG-GTT------G------ACTTAGCTTTTAAT--TATA----------AGTAATTAAA---------T-GG---A-----------------T----AT--------------AA------T----------------------G---TA-T-------T-C---AAA-T-ACATTT-------A-------------T-TA------
gi|32 : ----T----CA---C-A-CCTAAGAACAA---A-GACACAGTT-GA-AAAAAT-TCAACTGGGT-A-AGAGT-TCAATT-CATTCATAT-CCTACATTCAAAAC----C----CA---ATTTGACTTTAAA--TGTATAGGGTGAAATTAAT-----A-----TGC-----TGA-TAAAGGA-ATaaaagttaaaggtttcaattacttttcatttacaaatgtacattttt
gi|33 : CAGAAC----T----CA---ACATGACTTAAAA--TGTACTGTATGAAATTCAT-----A-----TGC-----TAA-TAAAGGA-ATAT--AGAATTATC-A---AAGC-------------------------------------------------A---GTTTCA-A------AGTCA-----------------AGT------------------C--------------G------T--------------C--------------CAA----------A----------ACATTTTGAAA----TA---AAGT-----T---T--AG--TGATTGAAAT
gi|34 : GTC-TATA-T-------ACCTGATTCAGCA-TGGCCACAGTGCCC-AGGGCTCT-AGT----T-TTGTTCAG--GTGT-GA---A-CTCTTT----C----CA---T-G-CCTGAGTACAA---A-AGCACAGTT----AAAAAA-T-ACCCGAGT-------T-TCAATT-CATTC
gi|35 : TAGACTGTT--TTACTG-TTTCCCAAGAG-GCGTTTATACAATAATT-AA---ATGTCTCATT-TTGTC-TATA-T-------TATTGTTGCGACA-TGGCCACAGTACCC-ATGGATAT-AAG----T-TCATTTGG--CTAT-GA---A-CTCCTC----T----tttta
gi|36 : -A--AAGTAAC-TGGATGTAT-TTATG-GTT------G------ACTTAGCTTTTAAT--TATA----------AGTAATTAAATGGATATAAT-GT---A-----------------T----TC--------------AA------ATACATTTATTAAAAAGTTAAAGG---T--T-------T-C---AAT-T-ACTTTT---CA--
gi|37 : gT-CATTCATAT-ATTACATTCAGAAC----T----CA---ACATGACTGGAAG--CACACTGAATT-ATTTCGT-----A-----AGC-----CAA-TAAAGCA-ATAT--AGAAATTTC-A---AAAC--C--A--------TTAG-CAG--------A-------A--------t
gi|38 : GTT-TATA-T-------ATTTGATGCAGCA-TGGCC--------C-AGGGCTAT-AGG----T-TTGTTTCG--GTGT-GACTGACCTCCTCTCGAT----CA---T-G-TCCGGGAACAA---A-GGCACGGGTAAA-AAAAttcctcaagtag
gi|39 : A----------AGTAATTGAA---------T-GTTAAA-----------------T----TTG-------------AA------A----------------------A---TAGT-------C-CTAAAAG-TCACTTTC---CA--A-------------T-TG------C-----------A-T----------------T-CTTTATTCACACTT-----G-AA-----T-GTTTAAA
gi|4 : taattggt-AG---ACATCCCATTCATGTTGTATA-TCTATTAGACCTGATGCAGCA-TGGCCACAGTGCCA-AGGGCTA--AGG----T-TTGTTCAGCATTAT-TA---A-CTC--C----T----CA---T-A--CTGAGAACAA---A--GTACAGGTAG--AAGAAG-T-ACCTG-GT-ACAGAGTATTTCTTCCATTCCCACAATTACATTAAGAAC----T----GAGTCACATAACTT-AAA--T-TACTGCATGAGTTTCAT-----ATACTGTGT-----TAA-AAAAGGACATCTA-GGAAATTTC-----AAGCAAC--A----G-TTTT-G-CAGAATTGCCCA-------A--------AAA---GCTCGA-AG-A-CAAATCAAAG-------------CAGGGCTTTAAGCTTCAAGTCTC--------------T------C--------------C--------------CAT----------G----------A-ATTTTGAAAATTTTA---AACT-----T---T--AG--AAATTG-AATAT----A---TTTGGAT--TTA--CT----T----TTT--TT------TTC--AAAGTAA----TGGAGAGCTATTACAATACAG-TGACTTC-AATGA-----AAGGGCAGGACAAT--TGCCACATGGGCACATTA------TA-TTTTTAGCTng
gi|40 : gCAAAG-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------CGATCGT--------CGAATATTCTATTG----------ACATTTTGAAA----TA---AA-T-----T---C--AG--TAATTTGAATGT----A---T-----TGATTACTA-----T----TTA--TTA-----TTT--AAAATcattttgaggattccagaggttctgagtacataatatattctgcagttggtttttcatcagcatcattaacattaaatttgagtgaacaactcatacgcttgtga
gi|41 : GAA--A-ATGTAATTGCA-ATTAGCTGCATTTAAA--TACAATACTAT-ATTAAGTAAT-GGGTGGTAT-TTGTA-ATA------GCTG---ATTTTGCTTTCAAT--TAC
gi|42 : A-TTAT---GAAATAAAAGTGCCTGATATTTATAGTG------GTGGACTCTT--TCACTG-TTTCT----AGAGTGTTTATGCAATGATC-GGTGCATGTTTC
gi|43 : AAA--TGTACTGGATGAATTTCAT-----------TCC-----CA-----------------GAAATTTC-AATTAAAA--T--A----T-CGTTAA-CAG--------A-------ATTCCTCAGAAA---GCTTAA-AG-A-CAAAT
gi|44 : --------AAA---GCTTGACAT-A-CAAA-CAAGG-------------CAGT------------------C--------------T------T--------------C--------------CTA----------A----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--TAATTTGAATGT----A---agg
gi|45 : taaaattcatt----TC--------------AA------G----------------------A---T--T-------T-C---AAT-T-ACTTTT---CG--A-------------T-TA------C---------A-A------------------T-CTTCATTCAAAATT-----ACAAGACTTA-GTTTGAAAA-TGTC---GGA
gi|46 : ataaaag-AA-----A-GTTTATAAA-TGGT---GGAATGAAAGCGTCAGATGATAATGGCG-------------GTT--TTACTG-TTTGCCATGAG-G
gi|47 : t-T-GCTTTT---CA--G-------------T-TA------C-----------A-T----------------T-TTGTATTCAAACTA-----A-AG-----T-GTCTGATAA-CAAT---GG
gi|48 : ----T-TTGTTCAG--GTGT-GA---G-CCCTGT----T----CA---T-ACCCCGAGAACAA---A-tt
gi|5 : tctaatATT-AC---ATGTGT-----ATATC-TATA-G-------ACCTGATGCAGCA-TGGCCACAGTGCCA-AGGGCTA--AGG----T-TTGTTCAG--ATTT-GA---A-CTCCTC----------A---T-A-CT-GAGAACAA---A-GGCACAGGTAGA-AAAA---T-ACCTGAGT-A-AGAGT-TTTCTT-CATTCCCAC-ATTACATTAAGAAC----TGAGTCA---ACATAACTTAAAA--TTTACTGCATGAGTTTCAT-----A-----TACATGTATAAATAAAGGA-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGCAAC--A----G-TTTTAG-CAG--------A-------ATTGCCCAAAAA---GCTCGA-AG-A-CAAATCAAAG-------------CAGG------------------C--------------T------TTAAGCTCAAGTTTTC--------------CAT----------G----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--AAATTGAAA--T----A---T----AT--TTG--ATTACTT----TTT--TT------TTC--AAAGTAA----TGGAGAGCAATTACAATACAG-TGACTTCAA---T-----AAGGGCAGGACA---ATGCCACATGGGCACATTA------TA-TTTTTAGCTaata
gi|50 : attatagagacatcccGTGGGACTTTCACGTCCTATGGAC-----A------TA-TTTCTAGTTcatttttgaggatttccagatgtttctgagtacataatatattctgcagttggttttcatcagcatattaacataaatttgaagtgaacaacatcatacgcttgtg
gi|6 : tgcGAAAA-TGATCCGGGAATGAAAAAGTCGGATAATAATGGTGATGTTGTTAGACTATT--TCACTG-GTTGTCATGAG-GTGTTAATGCAATGATT-AG---ACGTCTCCTT-ATGTC-TGTA-T-------ACTTTCTGCAGCA-TGACCATAGTACCC-AGGGCTAT-ATA----T-TTGTTCAG--ATGT-GA---A-CTCCTC----T----CA---T-A-CCCGAGAACAA---A-GGCATAGGTTG--CAAAAA-T-AATTGAGT-A-AGAGT-TCACTT-CATTGGGAT-------------AC----T----CA---ACATGACTTAAAA--TGTACTGGACGAATTTCGT-----A-----TGC-----CAG-AAAAGGA-ATCT--GG------C-A---AAGC--CATA----T-CTTTAG-TAG--------A-------ATTCCT---AAAGATGCTTGA-AG-A-CGAATCAAAG-------------CAGG------------------CTTTGAGGTCATGTTT------T--------------C--------------CAA----------A----------ACATTTTGATA----TA---AACT-----T---C--AG--CAATTGAAATGT----A------------TTAC-A-----T---------TT------TTT--AAAGTAA----TTGATAGC-ATTACAAC-----TG---TC-T---C-----ACGGGCAAGCCATTCATGTCCTACGGAC-----A------TA-TTTGTAGTTttcattgg
gi|7 : -ATATC-TATAGT-------ACTGAATGCAGCAATGGCCACAGTGCCA-AGGGCTA--AGG----T-TT-TTCAG--ATCTTGA---A-CTCCT-----------A---T-A-CT-GAGAACAA---A-GGCACAGGTAG---AAAAA-T-ACCTGAGTAA-AGAGT-TTTCTT-CATTC-CAC-ATCATA---AGAACTGAGT----CA---ACATAACTT-AAA--TTTACTGCATGAGTTTCATATTAAA-----TGTA----TAA-T-AACGA-ATCT--GGAAATTTCAA---AAGC--C--AACAGT-TTTTAGTCAG--------AATTGCCCA--------AAA---GCTCGA-AGAA-CAAATCAAAA-------------GAGG------------------C--------------TTTAAGCT--------------C--------------CAAAGTTTTCCATG----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----TAAAG--AA--AAATTGAAACAT----A---T----AT--TTG--ATTACTT----TTT--TT------TTCAAAAAGTAA-----TGAGAGCAATTACAATACAAGTGACTTCAA---T-----AAGGGCAGGACA---ATG-CACATGGGC-----A------CA-TTaattagaaattacatgtaataataatatgtagtcacaattaattgatttgcaaatgtaagttataaaaat
gi|8 : CAGGGATGG-A-TTATTGAAGAA-ATG-AATTGTACAT-------ACATTAA--TTTATTTTTAT-A--CAGTAAT-TGGATGTAT-CTGTA-ATT---------C---ACTTCACTTTCAGT--TACA----------CGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------TAGTGTTTAGATACATTCCAAAA------A----------------------G---T--CAAGATG-T-C---AAT-T-AC-TTT---CA--A-------------T-TA------C---A--T--ACA-T----------------T-CTTAATTCAAACTT-------AA-----A-GTTaataattttagcttcatttttgaggaattccaagatgtttctga
gi|9 : atatgtttctacttttgttttttcgttttgcatgaaatcgttcagctgcaagaaatccttgttatttcatattattgtttgcaccagatgatagtcactattatagacaaataaataccaatcacaaccttttttttttatcctaaagtaataattaaatttgaaatacatatttgtgaagacacatgaaatgatatgcgagataatcaatatatttggtacatacatgtacaaggaaaataatcttgaaatacattgctgaatC-TATA-T-------ACTTGATGTAGCA-TGGTCACAATGCCC-AGGATTGG-AGGTAAAT-TTGTTCTG--GTG-------A-CTCCTC----T----CATATT-A-CCTGAGAATAA---T-GGTATGGGTAG--AAAAAA-T-TCCTGAGT-A-A-AGT-----TT-CATT-------TT-TATTGAGAAC----T----CA---ATATGAATGAAAA--TGTACTGGATAAATTTCAT-----G-----T-C-----CAA-TAAA--A-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGCG-A--A----T-TTTTAG-CAGAATTCCTCA-------A--------AAA---GTTTAA-AG-G-TGAATCAAAG-------------CAGG------------------T--------------T------T------------------------------AA----------T----------A------GGGC----CA---TATT-----T---T--A----CATT-AAATGT--------T-----T--TTA--A-----T----TGCATTC------TTC--A------------------------AAT-----TG---TT-A---C-----ATGGGTGGGGCATTCATGTCTTATGGAC-----A------TA-TTTCTAGTTa
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TATGGTTTTACTTTAGATTTGGCTTCTTGCAGTGAACTGATTCCGTGCAAGGAGAATCTTTATTATTCCAATCGTATTTCTCCGACTGTAGTGTAGTCACTGTTAGTCACAATCAATAATCTATAGAAATAAACTGTGTTTATTTATTTTAATGTCATTATCATTTATCAACTTTCAAATACATTTTGGAAAGACACATCAGATGATATGAGAGACTAATCTATACAGAGAAAATGAACTTCAAACA
Unaligned ( gi|49 ): TTTATTGATATAGCTCACTATTTTGTACTCTTAAGAGTAACAGGTACAC
Unaligned ( gi|51 ): TAATTTGTTTACGTACATAGAAAATGAACAAGAATGAT
Alignments
lowQualScore : 3333333333333333 3333333333333 1111111111 111111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111111111111111 1111111 11111 222222222222 7777777777777777777777777 1111111111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111 111 111111111111
lowQualScore : 6 6 8888 5 5555555555555555 0 1 4 3 77 3 3 3 7777777777777 5 33 1 2222222222 111111111 2 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 3333333333333333 2 333 777777 33 2 0 0 2 1 2 444 55 3 2 2 0000000 2 0 2 44 5555 2 33 33 444 2 666666666 444 2 2 6 333 2 99 4444 2 2 2 2 66 2 1 44 0 5555 888888888 1 66 88888888888 22222 444 1 2 66 2 444 666666666666 2 1111111111111111111111111 666 2 2 2 2222222222222 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5555 666 55555 666666 555 777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 66666 22 88888 444 5 444 66666 3 22 1 0 444444444444 2
lowQualScore : . . .... . ................ . . . . .. . . . ............. . .. . .......... ......... . ........................................................................................................................................................................ . ................ . ... ...... .. . . . . . . ... .. . . . ....... . . . .. .... . .. .. ... . ......... ... . . . ... . .. .... . . . . .. . . .. . .... ......... . .. ........... ..... ... . . .. . ... ............ . ......................... ... . . . ............. .............................................................................................. .... ... ..... ...... ... ................................................... . ..... .. ..... ... . ... ..... . .. . . ............ .
lowQualScore : 0 7 3333 0 2222222222222222 9 9 5 1 33 1 1 1 2222222222222 1 99 4 5555555555 444444444 9 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9 9999999999999999 2 999 222222 22 4 8 5 4 5 7 777 55 3 7 5 6666666 5 2 5 22 3333 5 22 66 111 4 777777777 111 4 4 4 999 2 22 8888 5 5 5 4 11 7 9 88 2 3333 888888888 2 55 33333333333 00000 666 7 7 33 7 777 666666666666 7 5555555555555555555555555 555 4 4 4 9999999999999 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0000 555 99999 555555 666 888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 33333 33 00000 000 3 777 77777 7 55 2 2 444444444444 9
consensus : CAGGGATGGTG-TAATTGAA--A-ATGTAATTGTA-AT-------ATTTAAA--TGCATTTTNAT-A--AAGTAAT-TGGATGTAT-TTGTA-ATT------G--G---ACTTCGCTTTCAAT--TACA----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TT--------------AA------A----------------------G---T--T-------T-C---AAN-T-ACTTTT---CA--A-------------T-TA------C---T--T--A-A-T----------------T-CTTTATTCAAACTT-----A-AA-----A-GTTTGAAAA-TGAT---GGAATGAAAGTGTCTGATAATAATGGTG------TTAGACTGTT--TCACTG-TTTGTCATGAG-GTGTTTATGCAATAATT-AG---ATGTCTCATT-ATGTC-TATA-T-------ACTTGATGCAGCA-TGGCCACAGTGCCC-AGGGCTAT-AGG----T-TTGTTCAG--GTGT-GA---A-CTCCTC----T----CA---T-A-CCCGAGAACAA---A-GGCACAGGTAGA-AAAAAA-T-ACCTGAGT-A-AGAGT-TCACTT-CATTCANAT-ATTACATTCAGAAC----T----CA---ACATGACTTAAAA--TGTACTGGATGAATTTCAT-----A-----TGC-----TAA-TAAAGGA-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGC--C--A----T-TTTTAG-CAG--------A-------A--------AAA---GCTTGA-AG-A-CGAATCAAAG-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--TAATTGAAATGT----A---T----AT--TTA--A-----T----TTC--TT------TTC--AAAGTAA----TTGAGAGCAATTACAAT-----TG---TC-A---C-----AAGGGCGGGGCATTCATGTCCTATGGAC-----A------TA-TTTCTAGTT
Reference ( family-309 ) : CAGGGATGGTG-TAATTGAA--A-ATGTAATTGTA-AT-------ATTTAAA--TGCATTTTNAT-A--AAGTAAT-TGGATGTAT-TTGTA-ATT------G--G---ACTTCGCTTTCAAT--TACA----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TT--------------AA------A----------------------G---T--T-------T-C---AAN-T-ACTTTT---CA--A-------------T-TA------C---T--T--A-A-T----------------T-CTTTATTCAAACTT-----A-AA-----A-GTTTGAAAA-TGAT---GGAATGAAAGTGTCTGATAATAATGGTG------TTAGACTGTT--TCACTG-TTTGTCATGAG-GTGTTTATGCAATAATT-AG---ATGTCTCATT-ATGTC-TATA-T-------ACTTGATGCAGCA-TGGCCACAGTGCCC-AGGGCTAT-AGG----T-TTGTTCAG--GTGT-GA---A-CTCCTC----T----CA---T-A-CCCGAGAACAA---A-GGCACAGGTAGA-AAAAAA-T-ACCTGAGT-A-AGAGT-TCACTT-CATTCANAT-ATTACATTCAGAAC----T----CA---ACATGACTTAAAA--TGTACTGGATGAATTTCAT-----A-----TGC-----TAA-TAAAGGA-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGC--C--A----T-TTTTAG-CAG--------A-------A--------AAA---GCTTGA-AG-A-CGAATCAAAG-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--TAATTGAAATGT----A---T----AT--TTA--A-----T----TTC--TT------TTC--AAAGTAA----TTGAGAGCAATTACAAT-----TG---TC-A---C-----AAGGGCGGGGCATTCATGTCCTATGGAC-----A------TA-TTTCTAGTT
gi|1 : CAAGGATAGTG-CAATTGAA--A-ATGTAGTTGTA-AT-------ATATAAAAATGCATTTTAAT-A--AAGTAAT-TGAATGTAT-TTGAA-ATT------ATAG---ATTTTGCTTTTAAT--TACA----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TT--------------AA------A----------------------G---T--T-------T-T---AAT-T-ACTTTT---CA--A-------------T-TA------C---TAGT--A-AAT----------------T-CTTTATTCAAACTT-----A-AA-----A-GTTTGAAAA-TGGT---GGAATGAACGTGTCTGCTAATAATGGTG------TTAGACTGTT--TCACTG-TTCGCCATGAG-GTGCTAATACAATGATTCAG---ATACCTCCTT-ATGTC-TATA-T-------TCTCGATGCAGCA-TGACCACAGTGGCC-AGAACGAT-AGG----T-TTATTCAG--GTGA-GA---A-CTCCTA----T----AA---T-A-CCAGAGAACAA---A-GACACAGGTAGAGAAAAAA-T--TCTGAGT-A-AAAGT-TCACTT-CATTCAGAT-AATACATTCTAAAC----T----CA---ACATAACGTAAAT--TGTACTGGATGAATTTCAT-----A-----CGC-----TAA-TAAACGA-ATCT--GGAAATTTC-A---AAAC--C--A----C-TTTTAA--AG--------A-------A--------AAG---GTGTGA-AG-A-CAAATCAAAG-------------CAGA------------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--A---TAATTGAAATGTATACA---T----AT--TTA--A-----T----TTC--ATGG----TTA--AAAGTAA----TTGAGAGCAATTACAAT-----TG---TC-A---C-----AAGAGCGGGGAATTCATGTCCTATGGAC-----A------TA-TTTCTATTT
gi|10 : TG-T-------ACTTGATGCAGCA-TGACTATAGTGCCC-ATGGCTAT-AGG----T-TTGTGCTG--GTA-----------CCTC----T----CA---T-G-CCTGATAACAA---A-GACACGGG--GA-CAAAAA-G-ACCC-AGT-A-ATGGT-TTACTT-CATTCAGAT-ATTACATTCAGAAC----T----CA---ACAAGACTTAAAA--TGTACTGAATGAATGTCAT-----G-----TCC-----TAG-AAAATGC-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGC--CAAA----T-CTTTAG-CAGAATTCCTCA-------A--------AAA---CCTTAA-TG-A-AGAATCAAAG-------------CAGGCTTGGGGGTTAATTAAGTC--------------T------T--------------C--------------CAA----------C----------ACATTTGGAAA----TA---AACC-----C---C--AG--TAATC-AAAT-T----G---T----AT--TT---------------------------------AAG---------------AATTACAAT-----TG---TC-A---C-----TTGGAAGGGGCTTTCATATCCTGTGGAC-----A------TA-TTTCTAGTT
gi|11 : ---GCTTGA-AG-A-CAAAACAAAA-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------CAGGGTCAAGTCTTCCAA----------G----------ACATTTTGAAG----TA---AATT-----T---C--AG--TAATTGAAATG---------T----AT--TTA--G-----TGACATTC----------TTC--AAAGTAA----TTGAGAGCAATCACAAT-----TG---TC-A---C-----ATGGGTGGGCCATTCACGCCCTATGGAC-----ATACATGTA-TTTCTAGTTc
gi|12 : aaaatataattactaaagttatctgattagaataccataaaatttactgttcgtgttaaataggcaaataatgacttcaacacGAAAAA---ATGACACATGAAGA-AAAAA--T-ACCTGACT-T-TGGGT-TCACTT-CA------------------------------------ACATGAATTCAAA--TGTACTGGATGAATTTTGC-----A-----AGCT----TGA-T-AAGGA-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGC--CATA----T-TTTTAG-CAGAATTCCACA-------A--------AAA---GCTTGA-AG-A-CAAATCGAAG-------------CAGG------------------CTTCAAGCTCAAGTTT------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TG---AAAT-----T---G--AG--AAGTTGAAATGT----A---T----TT--AAA--A-----C----TAT--TC------TTC--AGAGTGA----TTGAGAG-A-----AAT-----TG---TC-A---C-----AAAGGCAGGGCATTCATGTttctgttaagcaataatcaaaaggcatcccacattacaggtttggagctgataagttata
gi|13 : CAG--ATGT-GA---A-CTCCTT----TGTTATA---TTA-CAGGATAACAA---A-AGCACAAATA-A-AGAAAA-T-ACCCGAGT-A-AGAGT-TCGATC-CATTCATGA-AATACATTCAATAC----T----CA---ACATGACTTAAAA--TGAACTGTATCAATGTCAT-----A-----CGC-----TAA-T---GTA-ATAT--GGAAATTTG-A---AACC--C--A----T-TTA-AG-CAG--------A-------A--------T-----TCCTCA-AA-ATCG--TTAAAG-------------T---------------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TA---ATGT-----T---T--AG--TAATTGATATG---------T----AT--TGA--A-----T----TACATTC------TTC--AAAGTAA----TTGAGAGCCATTGTAAT-----TG------A---C-----A-------------CATGTCCTATTTAC-----A------TA-ttttagtttccattaatgtttgtgagctgtgatgtg
gi|14 : ctttaaatttaagTATTGAAAATT-----------------TTTGAAAA-TGAT---GGCATGACGTTTTCTGATAATAATGGTA------TAAGAC-GTT--TCACTG-TT---CATCAG-GT--TTATACAATTATT-AG---ATGTCT-------------TG-T-------ATTTGATGCAGCA-TGGCTACAGTCTCT-AGCGCTAT-AAG----C-TTGATTAA--GTGT-CA---A-CTCCTC----T----CA---T-A-TCCGAGAACAT---A-GGCACAGGTAGA-AAAATA---ACCAGAGT-A-AGAGT-GCACTT-CATTCATAT-ATAACGT-----AC----T---------------TTTAAAAAGTGTACTAGATGAATTTCAT-----A-----
gi|15 : aaattatattataaattatctaaacttataaagctaattaAGGGATG-TGATGATTGAA--A-ATGTGATT----AG-------ATCTA------C-CTTTGA--A--AAGTGAA-TGGGTATAT-ATGTA--TC------T--G---ACTTAGCTTTGAGT--TCCA----------TGTAATATAA---------T-GG---A-----------------T----TTTAGTGCAATTA---AA------A----------------------G---T--T-------T-C---AAA-C-A-TTCT---CC--A-------------T-TA------CAATT--T--A-A-TCGCTATTCAATTTCAAT-CTTTATTGAATTTT-----A-TA-----A-TTCTAAAAA-TAAT---AGAATAAAAATGTCTGATAATAATGATG------TTAGTCTGTT--TGACTG-TTTGTTGTGGA-GTGTCT-----------------GTGTC---TT-ATGAC-AGTA-TC------AC-TGATGGAGCA-T--TCATAGTATCA-AGGGCTAT-ag
gi|16 : TTGAAAA-TGAT---GGCATGACGTTTTCTGATAATAATGGTA------TAAGAC-GTT--TCACTG-TT---CATCAG-GT--TTATACAATTATT-AG---ATGTCT-------------TG-T-------ATTTGATGCAGCA-TGGCTACAGTCTCT-AGCGCTAT-AAG----C-TTGATTAA--GTGT-CA---A-CTCCTC----T----CA---T-A-TCCGAGAACAT---A-GGCACAGGTAGA-AAAATA---ACCAGAGT-A-AGAGT-GCACTT-CATTCATAT-ATAACGT-----AC----T---------------TTTAAAAAGTGTACTAGATGAATTTCAT-----A-----
gi|18 : CAGGGATGGAG-TAATTGTA--A-ATGTATTAGCT-GT-------ATTTAGA--TACATTTT--T-A--AAGTCAT-TGGGTATAT-ATGTA-ATT------G------ACTTCGCTTTCAGT--TA-A----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TC--------------AA------ATAC-------------------A---T--TAAAAAAGT-C---AAG-C-ACCTT----CA--A-------------T-TA------C-----------A-T----------------T-CTTTATTCAAACTT-----A-AA-----C-G------------------AATGGAAGTATCTGATAGAAATAGTG------TTAGATTGTT--GCACTGATTTGTCATGGG-GTGTCTATGCAAAAATT-GG---ATGTCTCATgc
gi|19 : TAATTGTA-AT----------TAGC--TGCATT--GA--A--AAGTATT-TGGATGTAT-TTGCA-ATT------A--A---GATTTGCTCTCAAC--TAGA----------AGTTATTGAA---------C-AT---T-----------------T----CT--------------AA------AT---------------------GCATT--T-------T-C---AAA-A-A---GT---CAAGA-------------T-TATTTTT-T---T--T--T-A-C----------------T-CTTCATTCAAAGTT-----G-AAT----A-ATTCGAAAA-TGGT---GGAATGAAAGTG--TGGTAATATTGGTA------TTAGATTGCT--TTACTC-TTTGTCATGTA-GTGTTTATG
gi|2 : caaggatgggaCTTTGCTCTCCAT--TTCA----------AGTAGCTGAA---------TTGT---G-----------------T----TT--------------AA------A----------------------A---C--T-------T-T---AAA-T-ACGTTT---TA--AAAAGGGGATCAAAT-TA------A---T--T--ACA-C----------------T-CGTTATCTAAACTT-----A-AT-----A-TTTTGAAAAATAAT---TGGATGAAAGTGTCAGATAATACTGGTG------TTGGAATGTT--TCACTG-TTTGTCATGGG-GTGTTTATGCATTAATT-AG---ATATCTCAGT-ATGTT-TATA-T-------ACTTGATGCAACA-TGGCAACAATACCCTGGGGCTAT-AGG----T-TTGTTCAG--GTGT-AA---A-ACCCTC----T----CA---T-A-CCTGAAAACAA---T-GGCACAGGTAGA-AAAAAAAT-ACCTGAGT-A-AGAGT-TCACTT-CATTCAGAT-ATTACATTCAGAAC----T----GA---ACATTACTAAAAA--TGTACTGGACGAATTTCAT-----G-----TCA-----CAG-AAAATGC-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGC--C--AAA--T-TTTCAG-CTG--------A-------ATTCCTCAAAAA---GCTCGA-AG-A-GGAATGAAAG-------------CAAG------------------C--------------T------T--------------CAGGGT---------CAA----------GTCTTCCAGA-GCAATTGGAAA----TAAACAACT-----G---T--AGGCTAATTGAAATG---------T----AT--TTA-------------------------------AAAAT-A----TTGAGAGTGATTTCAAT-----TG---TC-A---C-----ACGGAT-GGGCATTCATGTCCTATTGAC-----
gi|20 : tgcTAATAGTGGTT------TTAGAATGTG--TCACTT-TTTGTCTTGAG-TTGTTAATGCATTAATT-AG---GTGTCTCATT-ATGTC-TCTG----------CT-----CA--A-TAGCCACAGTGCTC--------T-GAG----T-TTGT------GAGT------------------T----CA---T-A-CCTGATAACAATTAA-GGCACCGGTAGA-AAAAT--T-ACCTGAAT-A-AGAGT-TTATTT--------GT-AT---ATTCAAAAC----T----TT---TT-TGACGTAAA---TGTAGTGGGTGAATTTTAT-----A-----TGC-----TAA-TAA
gi|21 : AAGGA-ATATATGGAGATTTC-A---AAGC--C--------------------------------------------------GCTTAA-AG-A-CGAATCAAAGGATATTTCGAGGTCAAGT-----------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTCTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--GAACAGAAATGT----A---T----TT--GTC--A-----CA---TTC--TT------T----AAAGTAC----TTGAGAGTAATTACAAT-----TG---TC-A---C-----AA-----GAACATTCATTTCCTATGGAC-----A------AATTTTCTAg
gi|22 : TTAAT-A--AAGAAATATGCATAGAT-CTGCT-GTT------G--G----CATTACTTTCAATCGTACACATGTATTGAAGCAATTGAA---------C-GT---A-----------------T----CT--------------CATTCCCCC----------------------T---T--T-------T-C---GAGGT-ATTTTTTTTCA--A-------------T-TA------G---C--G--A-A-T----------------TTCTTTGATCAA-CTTTTTTAA-AA-----ATGTTTGAAGA-TGGT---GGAGCAAAAGTG-CT-------ACG--------------CTATT--TCACTG-TCCG----GGG-GTGTTCAttccaaatgtttacgctataagta
gi|23 : ------------------C--------------T------C--------------C--------------CAA----------A----------GCACTTTGAAA----TA---AACT-----T---C--AG--AAATTGAAATGT----A---T----TT--GTA--A-----A----CTA---------------AAAGTAA----GTGATAGAAATTACAAT-----TG---TA-G---C-----AAGGACGTGGCATTCATGTCCTATGAAC-----A------TA-TTTCTAGTTa
gi|24 : T-------ATTTAAAAGTACATTTTTGT-A--AAGTAAG-TGGATGTAT-TTGTA-ATT---------G---ACTTTTCTTTCAAC--TATA----------AGTAATTGAA---------T-GT---ACATTTATTTTTACACTTT----TT--------------AA------AAAC-------------------A---T--T-------T-C---AAA-T-ATTTTT---CA--A-------------TATA------T-----------A-T----------------T-CTTTATTCAAACTC-----T-AA-----A-GTTTGAAAA-TGAT---GGCTAGAAAGTGCCTattatacattttattttagacatatggtcaataaaaataattcgttctttcatttttaagatatgaatacatgt
gi|25 : attgatcatgattgctgtg--------A-------A--------AAA---GTTTGT-AG-A-CGAATCATAG-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------CAAGGT---------CAA----------GTCTTTCAAAAACATTTTGAAA----TGT--GACCGAGGAT---CAGAG--TAATTGAAATGT----A------------TTA--A-----TGGCATTC--TT------CCC--AGA----------------AGTCACA-------TG----G-A---CCGGGGGGGGGGGGGGCATTCAT-TCCTATGGAC-----T------TA-
gi|26 : cagaattcctcTTAT-A--AAGTAAT-TGGATGTAT-TTGTA-ATT------G------------------AC--TAGA----------AGTAATTGAA---------T-GT---------------------------T--------------AA------A----------------------T---T--T-------T-A---AAA-T-AGTCCT---AA--A-------------T--G------C-----------A-T----------------T-CTTTATTCACACTT-----G-AA-----T-GTTTAAAAA-TGAT---GGAATGAAAGTGTCTTATCATACTGGTG------TTCTACTGTT--TCACTG-TTTGTTATGAG-GTGTa
gi|27 : TTGAAGTTT----GACTT----AC--TTA--A-----TAT--TTC--CTGAACTATTT--AAGGTAGACCTTTAAGAGCAATTACATT-----TG---TC-A---C-----AAGGGTGGGTCATTCATGTCCTGTGGAC-----A------TA-TTTCTAGTT
gi|28 : T--------------AA------A----------------------G---T--T-------TTC---AAT-T-ACTTTT---CA--A-------------T-TA------C---T--T-----------------------T-CTTTATTCAAAGTT-----A-TC-----A-GTTTAGAAA-TGAT---GGAATGAAAATGTCTTATAACAATGG-G------TTGAACTGTTTATCAATG-GGTGTT-TAA---TGTTTATGCAGTAATT-AG---ATATatcttacacgtacacttatgtgtatttttaaataactcgatctctttattttc
gi|29 : aaatacattccccaaaaaagT--GGAAATTTC-A---AAGC--C--A----TATTTTAG-CAG--------A-------ATTCCTCA-AAAC--GTCTGA-AA-A-CGAATCAAAG-------------CAGG------------------C--------------C------T--------------C--------------a
gi|3 : ataaatattgcatacaagaggtgagagaacatatagaaattgtaaactattttgtacattgtgtaaaacagCAGGGATGGTG-TAATTAAA--ACATGTAATTATA-ATTAGCTTCATCTAAA--AGCATTTTAAT-A--AAGTAAT-TGGATATAT-CTGTA-ATT------G------ACTTTGCTTTCAAT--TACA----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TT--------------gaggta
gi|3 : aaatgatattaaattcttagtaaatctacattatacacagatatccaacgataattgaatttaatatctcctattatatttcataaagtgatggaaaatgaattgttttacatctgaaaaG-TAATTGGA--T-ATAT--CTGTA-ATTG-----ACTT-----TGC-TTTCAATTAC-AAGTAAT-TGAATGTATTTTATACATTCCAAAAG--GTCAAGTACNNNNNNNNN--NNNN----------NNNNNNNNNN---------N-NN---N-----------------N----NN--------------NN------N----------------------N---N--N-------N-N---NNN-N-NNNNNN---NN--A-------------T-TAATTCTCC---T--TTGC-A-T----------------T-TGTTATTCAAACTT-----A-AA-----A--TATGAAAA-TAAT---GGAATGAAAATGTCTGATAATAATGCTT------TTAGACTGTT--TCA-----------TGAG-GTGTTAATGCAATAATT-AA---TTATTTCATT-CAGTC-TATA-T-------ACTTGATGGAGCA-TGGCCACAG------AGGGCTATCAAA----TGTTGTTCAG--GTGT-GA---A-CTCCTT----G----CA---T-A-CCTGAGAACAA---A-GGCACAAATAG---AAAAA-T-ACCTGAGT-A-AGAGT-TCACTT-CATTGAGAtatacattccaaaaggtcaagtacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaattctcctttgcatttgttattcaaacttaaaatatgaaaataatggaatgaaaatgtctgataataatgcttttagactgtttcatgaggtgttaatgcaataattaattatttcattcagtctatatacttgatggagcatggccacagagggctatcaaatgttgttcaggtgtgaactccttgcatacctgagaacaaaggcacaaatagaaaaatacctgagtaagagttcacttcattgagaat
gi|30 : aaatgatattaaattcttagtaaatctacattatacacagatatccaacgataattgaatttaatatctcctattatatttcataaagtgatggaaaatgaattgttttacatctgaaaacagggatggtgtaattaaaacatgtaattataattagcttcatctaaaagcattttaataaaAAT-TGAT---GGAATGAAAGTGTCAGATAATAATGGTG------TTAGACCGTT--TCACTG-TTTGTCATACG-GTGTTTGTACAATGATT-AA---ATGTCTCat
gi|31 : caattcaaggtcgggctattttaattgattaattggatgtattttt-A--AAGTAAC-TGGATGTAT-TTATG-GTT------G------ACTTAGCTTTTAAT--TATA----------AGTAATTAAA---------T-GG---A-----------------T----AT--------------AA------T----------------------G---TA-T-------T-C---AAA-T-ACATTT-------A-------------T-TA------
gi|32 : ----T----CA---C-A-CCTAAGAACAA---A-GACACAGTT-GA-AAAAAT-TCAACTGGGT-A-AGAGT-TCAATT-CATTCATAT-CCTACATTCAAAAC----C----CA---ATTTGACTTTAAA--TGTATAGGGTGAAATTAAT-----A-----TGC-----TGA-TAAAGGA-ATaaaagttaaaggtttcaattacttttcatttacaaatgtacattttt
gi|33 : CAGAAC----T----CA---ACATGACTTAAAA--TGTACTGTATGAAATTCAT-----A-----TGC-----TAA-TAAAGGA-ATAT--AGAATTATC-A---AAGC-------------------------------------------------A---GTTTCA-A------AGTCA-----------------AGT------------------C--------------G------T--------------C--------------CAA----------A----------ACATTTTGAAA----TA---AAGT-----T---T--AG--TGATTGAAAT
gi|34 : GTC-TATA-T-------ACCTGATTCAGCA-TGGCCACAGTGCCC-AGGGCTCT-AGT----T-TTGTTCAG--GTGT-GA---A-CTCTTT----C----CA---T-G-CCTGAGTACAA---A-AGCACAGTT----AAAAAA-T-ACCCGAGT-------T-TCAATT-CATTC
gi|35 : TAGACTGTT--TTACTG-TTTCCCAAGAG-GCGTTTATACAATAATT-AA---ATGTCTCATT-TTGTC-TATA-T-------TATTGTTGCGACA-TGGCCACAGTACCC-ATGGATAT-AAG----T-TCATTTGG--CTAT-GA---A-CTCCTC----T----tttta
gi|36 : -A--AAGTAAC-TGGATGTAT-TTATG-GTT------G------ACTTAGCTTTTAAT--TATA----------AGTAATTAAATGGATATAAT-GT---A-----------------T----TC--------------AA------ATACATTTATTAAAAAGTTAAAGG---T--T-------T-C---AAT-T-ACTTTT---CA--
gi|37 : gT-CATTCATAT-ATTACATTCAGAAC----T----CA---ACATGACTGGAAG--CACACTGAATT-ATTTCGT-----A-----AGC-----CAA-TAAAGCA-ATAT--AGAAATTTC-A---AAAC--C--A--------TTAG-CAG--------A-------A--------t
gi|38 : GTT-TATA-T-------ATTTGATGCAGCA-TGGCC--------C-AGGGCTAT-AGG----T-TTGTTTCG--GTGT-GACTGACCTCCTCTCGAT----CA---T-G-TCCGGGAACAA---A-GGCACGGGTAAA-AAAAttcctcaagtag
gi|39 : A----------AGTAATTGAA---------T-GTTAAA-----------------T----TTG-------------AA------A----------------------A---TAGT-------C-CTAAAAG-TCACTTTC---CA--A-------------T-TG------C-----------A-T----------------T-CTTTATTCACACTT-----G-AA-----T-GTTTAAA
gi|4 : taattggt-AG---ACATCCCATTCATGTTGTATA-TCTATTAGACCTGATGCAGCA-TGGCCACAGTGCCA-AGGGCTA--AGG----T-TTGTTCAGCATTAT-TA---A-CTC--C----T----CA---T-A--CTGAGAACAA---A--GTACAGGTAG--AAGAAG-T-ACCTG-GT-ACAGAGTATTTCTTCCATTCCCACAATTACATTAAGAAC----T----GAGTCACATAACTT-AAA--T-TACTGCATGAGTTTCAT-----ATACTGTGT-----TAA-AAAAGGACATCTA-GGAAATTTC-----AAGCAAC--A----G-TTTT-G-CAGAATTGCCCA-------A--------AAA---GCTCGA-AG-A-CAAATCAAAG-------------CAGGGCTTTAAGCTTCAAGTCTC--------------T------C--------------C--------------CAT----------G----------A-ATTTTGAAAATTTTA---AACT-----T---T--AG--AAATTG-AATAT----A---TTTGGAT--TTA--CT----T----TTT--TT------TTC--AAAGTAA----TGGAGAGCTATTACAATACAG-TGACTTC-AATGA-----AAGGGCAGGACAAT--TGCCACATGGGCACATTA------TA-TTTTTAGCTng
gi|40 : gCAAAG-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------CGATCGT--------CGAATATTCTATTG----------ACATTTTGAAA----TA---AA-T-----T---C--AG--TAATTTGAATGT----A---T-----TGATTACTA-----T----TTA--TTA-----TTT--AAAATcattttgaggattccagaggttctgagtacataatatattctgcagttggtttttcatcagcatcattaacattaaatttgagtgaacaactcatacgcttgtga
gi|41 : GAA--A-ATGTAATTGCA-ATTAGCTGCATTTAAA--TACAATACTAT-ATTAAGTAAT-GGGTGGTAT-TTGTA-ATA------GCTG---ATTTTGCTTTCAAT--TAC
gi|42 : A-TTAT---GAAATAAAAGTGCCTGATATTTATAGTG------GTGGACTCTT--TCACTG-TTTCT----AGAGTGTTTATGCAATGATC-GGTGCATGTTTC
gi|43 : AAA--TGTACTGGATGAATTTCAT-----------TCC-----CA-----------------GAAATTTC-AATTAAAA--T--A----T-CGTTAA-CAG--------A-------ATTCCTCAGAAA---GCTTAA-AG-A-CAAAT
gi|44 : --------AAA---GCTTGACAT-A-CAAA-CAAGG-------------CAGT------------------C--------------T------T--------------C--------------CTA----------A----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--TAATTTGAATGT----A---agg
gi|45 : taaaattcatt----TC--------------AA------G----------------------A---T--T-------T-C---AAT-T-ACTTTT---CG--A-------------T-TA------C---------A-A------------------T-CTTCATTCAAAATT-----ACAAGACTTA-GTTTGAAAA-TGTC---GGA
gi|46 : ataaaag-AA-----A-GTTTATAAA-TGGT---GGAATGAAAGCGTCAGATGATAATGGCG-------------GTT--TTACTG-TTTGCCATGAG-G
gi|47 : t-T-GCTTTT---CA--G-------------T-TA------C-----------A-T----------------T-TTGTATTCAAACTA-----A-AG-----T-GTCTGATAA-CAAT---GG
gi|48 : ----T-TTGTTCAG--GTGT-GA---G-CCCTGT----T----CA---T-ACCCCGAGAACAA---A-tt
gi|5 : tctaatATT-AC---ATGTGT-----ATATC-TATA-G-------ACCTGATGCAGCA-TGGCCACAGTGCCA-AGGGCTA--AGG----T-TTGTTCAG--ATTT-GA---A-CTCCTC----------A---T-A-CT-GAGAACAA---A-GGCACAGGTAGA-AAAA---T-ACCTGAGT-A-AGAGT-TTTCTT-CATTCCCAC-ATTACATTAAGAAC----TGAGTCA---ACATAACTTAAAA--TTTACTGCATGAGTTTCAT-----A-----TACATGTATAAATAAAGGA-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGCAAC--A----G-TTTTAG-CAG--------A-------ATTGCCCAAAAA---GCTCGA-AG-A-CAAATCAAAG-------------CAGG------------------C--------------T------TTAAGCTCAAGTTTTC--------------CAT----------G----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--AAATTGAAA--T----A---T----AT--TTG--ATTACTT----TTT--TT------TTC--AAAGTAA----TGGAGAGCAATTACAATACAG-TGACTTCAA---T-----AAGGGCAGGACA---ATGCCACATGGGCACATTA------TA-TTTTTAGCTaata
gi|50 : attatagagacatcccGTGGGACTTTCACGTCCTATGGAC-----A------TA-TTTCTAGTTcatttttgaggatttccagatgtttctgagtacataatatattctgcagttggttttcatcagcatattaacataaatttgaagtgaacaacatcatacgcttgtg
gi|6 : tgcGAAAA-TGATCCGGGAATGAAAAAGTCGGATAATAATGGTGATGTTGTTAGACTATT--TCACTG-GTTGTCATGAG-GTGTTAATGCAATGATT-AG---ACGTCTCCTT-ATGTC-TGTA-T-------ACTTTCTGCAGCA-TGACCATAGTACCC-AGGGCTAT-ATA----T-TTGTTCAG--ATGT-GA---A-CTCCTC----T----CA---T-A-CCCGAGAACAA---A-GGCATAGGTTG--CAAAAA-T-AATTGAGT-A-AGAGT-TCACTT-CATTGGGAT-------------AC----T----CA---ACATGACTTAAAA--TGTACTGGACGAATTTCGT-----A-----TGC-----CAG-AAAAGGA-ATCT--GG------C-A---AAGC--CATA----T-CTTTAG-TAG--------A-------ATTCCT---AAAGATGCTTGA-AG-A-CGAATCAAAG-------------CAGG------------------CTTTGAGGTCATGTTT------T--------------C--------------CAA----------A----------ACATTTTGATA----TA---AACT-----T---C--AG--CAATTGAAATGT----A------------TTAC-A-----T---------TT------TTT--AAAGTAA----TTGATAGC-ATTACAAC-----TG---TC-T---C-----ACGGGCAAGCCATTCATGTCCTACGGAC-----A------TA-TTTGTAGTTttcattgg
gi|7 : -ATATC-TATAGT-------ACTGAATGCAGCAATGGCCACAGTGCCA-AGGGCTA--AGG----T-TT-TTCAG--ATCTTGA---A-CTCCT-----------A---T-A-CT-GAGAACAA---A-GGCACAGGTAG---AAAAA-T-ACCTGAGTAA-AGAGT-TTTCTT-CATTC-CAC-ATCATA---AGAACTGAGT----CA---ACATAACTT-AAA--TTTACTGCATGAGTTTCATATTAAA-----TGTA----TAA-T-AACGA-ATCT--GGAAATTTCAA---AAGC--C--AACAGT-TTTTAGTCAG--------AATTGCCCA--------AAA---GCTCGA-AGAA-CAAATCAAAA-------------GAGG------------------C--------------TTTAAGCT--------------C--------------CAAAGTTTTCCATG----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----TAAAG--AA--AAATTGAAACAT----A---T----AT--TTG--ATTACTT----TTT--TT------TTCAAAAAGTAA-----TGAGAGCAATTACAATACAAGTGACTTCAA---T-----AAGGGCAGGACA---ATG-CACATGGGC-----A------CA-TTaattagaaattacatgtaataataatatgtagtcacaattaattgatttgcaaatgtaagttataaaaat
gi|8 : CAGGGATGG-A-TTATTGAAGAA-ATG-AATTGTACAT-------ACATTAA--TTTATTTTTAT-A--CAGTAAT-TGGATGTAT-CTGTA-ATT---------C---ACTTCACTTTCAGT--TACA----------CGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------TAGTGTTTAGATACATTCCAAAA------A----------------------G---T--CAAGATG-T-C---AAT-T-AC-TTT---CA--A-------------T-TA------C---A--T--ACA-T----------------T-CTTAATTCAAACTT-------AA-----A-GTTaataattttagcttcatttttgaggaattccaagatgtttctga
gi|9 : atatgtttctacttttgttttttcgttttgcatgaaatcgttcagctgcaagaaatccttgttatttcatattattgtttgcaccagatgatagtcactattatagacaaataaataccaatcacaaccttttttttttatcctaaagtaataattaaatttgaaatacatatttgtgaagacacatgaaatgatatgcgagataatcaatatatttggtacatacatgtacaaggaaaataatcttgaaatacattgctgaatC-TATA-T-------ACTTGATGTAGCA-TGGTCACAATGCCC-AGGATTGG-AGGTAAAT-TTGTTCTG--GTG-------A-CTCCTC----T----CATATT-A-CCTGAGAATAA---T-GGTATGGGTAG--AAAAAA-T-TCCTGAGT-A-A-AGT-----TT-CATT-------TT-TATTGAGAAC----T----CA---ATATGAATGAAAA--TGTACTGGATAAATTTCAT-----G-----T-C-----CAA-TAAA--A-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGCG-A--A----T-TTTTAG-CAGAATTCCTCA-------A--------AAA---GTTTAA-AG-G-TGAATCAAAG-------------CAGG------------------T--------------T------T------------------------------AA----------T----------A------GGGC----CA---TATT-----T---T--A----CATT-AAATGT--------T-----T--TTA--A-----T----TGCATTC------TTC--A------------------------AAT-----TG---TT-A---C-----ATGGGTGGGGCATTCATGTCTTATGGAC-----A------TA-TTTCTAGTTa
blockSeqs : T A GAA C TAGCTTCATCTAAA A G T TT A T C CCAAAAGGTCA A CG C CATGTATTGA TGGATATAA T ATTTTAGTGCAATTAAAAGTTTCAAACATTCTCCATTACAATTTAATCGCTATTCAATTTCAA T TTTTAAAAAT A CCG ATGTTG TA A A T . TGC CA C G G CTATTAG A T TC TAAA G CA TG CTG C TGTTA TAT T C T TTA T A AAT A C A C AG A T TC TGAG GAGTCA A AG ATACTG ATGTA ATA T C AT A ATT CAACAGT T AATTCCTCAA GAT C A T GATATTTCGAGGT CTTGGGGGTTAATTAAGTCTTCCAAC ATTT AAC GAGGA AAAG GCT GACTTACTTAATATTTCCTGAACTATTT ACCTT CA ACAAG ACT A ATG CGGGG T AG G ATACATG T
blockSeqs : A . AC . TAGCTGCATTTAAA A G . C . . . GCTG C . G . . . ATAGTGTTTAGATACATTCCAAAAAGTCAAGATGTCAATTACTTTCAATTACATACAT . ACAAGACTTA . . . . . . T . . CA . . . C . . T . . . G . . TCGAT . . . G . . A TTC . . . . AT . T TC . GAGTC C AG ATTAAA T AA G . A . . CAAAT . AATTCCACAA C . . . . GCTTTAAGCTTCAAGTCTCTCCCATG . T . CAG T ATATTTGATTACTTTTTTTTTCAA T CC ACAG ACT A . . T TG C ACATTA .
blockSeqs : T . A . ATTTAAAAG A A . . . . . TG T . C . . . ACATTTATTTTTACACTTTTTAAAAACATTTCAAATATTTTTCAATATATAT . GAATA . . . . . . A . . CA . . . . . . T . . . C . . T . . . C . . A AG . . . . AT . A TC . CA A . G A AA G . . . . CATAT . AATTCCTCAA . . . . . CTTCGATCGTCGAATATTCTATTG . . . C T ATTTGGATTTACTTTTTTTTTC T TG ACAG ACT . . . A CA G ACATTA .
blockSeqs : . . A . ATTTAGA A T . . . . . AA T . C . . . GTTTAAAACTTTAAATACGTTTTAAAAAGGGGATCAAATTAATTACAC . ATAA . . . . . . A . . CA . . . . . . T . . . C . . T . . . C . . A AT . . . . AT . A TC . CA A . A . TA T . . . . CAAAT . AATTGCCCAA . . . . . CTTTAAGCTCCAAAGTTTTCCATG . . . C A ATATTTGATTACTTTTTTTTTC T TA . . . . . C CG G A .
blockSeqs : . T . ACATTAA A T . . . . . GG T . T . . . ATCTCATTCCCCCTTTTCGAGGTATTTTTTTTCAATTAGCGAAT . AAAC . . . . . . A . . CA . . . . . . T . . . A . . T . . . T . . A AT . . . . AG . T TC . GA A . A . TA G . . . . AACAG . AATTCCTCAG . . . . . CTTCAAGGTCAAGTCTTTCAAAA . . . G T ATTGATTACTATTTATTATTT T AA . . . . . A GG A A .
blockSeqs : A . TGACTT A A . . . . . G T . G . . . TTCTAAATGCATTTTCAAAAAGTCAAGATTATTTTTTTTTAC . AATA . . . . . . A . . CA . . . . . . T . . . G . . T . . . T . . A AT . . . . AG . T TC . TT A . A . TA G . . . . AACAG . AATTGCCCAA . . . . . CTTCAGGGTCAAGTCTTCCAAG . . . T G TATTTAGTGACATTCTTC T CA . . . . . A TG G A .
blockSeqs : . ATCTA . A . . . . . G T . C . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTAATTCTCCTTTGCAT . TAAA . . . . . . A . . CC . . . . . . T . . . G . . T . . . T . . A GT . . . . AT . T TA . CA A . A . TA G . . . . CATAT . AATTCCTCAA . . . . . CTTCAAGCTCAAGTTTTCCAAG . . . T A TATTGAATTACATTCTTC G CT . . . . . G CA G A .
blockSeqs : TAGC . T . . . . . G C . N . . . TAAATTTGAAAATAGTCCTAAAAGTCACTTTCCAATTGCAT . GAAT . . . . . . G . . . . . . . . . T . . . G . . G . . . T . . A AT . . . . AT . T TA . CA T . G . AA G . . . . CATA . AATTCCTCA . . . . . CTTCAGGGTCAAGTCTTCCAGA . . . T T ATTAATGGCATTCTTCCC T CA . . . . . A CA T T .
blockSeqs : T . . . . . G A . T . . . ATTCAAATACATTAAAAAAGTCAAGCACCTTCAATTACAT . ATCA . . . . . . A . . . . . . . . . T . . . G . . T . . . T . . A AT . . . . CC . T TG . CA A . A . AA G . . . . GAAT . AATTGCCCA . . . . . CTTTAAGCTCAAGTTTTCCATG . . . C T ATTTAAAACTATTCTTC T CA . . . . . A TG A A .
blockSeqs : . . . . . . G A . T . . . TAAATTTTAAAATAGTCCTAAATGCAT . AAAA . . . . . . G . . . . . . . . . T . . . T . . C . . . C . . A AT . . . . CC . C . . CA G . A . TA G . . . . CAT . AATTCCT . . . . . CTTTGAGGTCATGTTTTCCAAA . . . T A TTTTAATTGCATTCTTC T A . . . . . A CA A A .
blockSeqs : . . . . . G T . C . . . . GAAT . . . . . . G . . . . . . . . . T . . . G . . T . . . T . . . T . . . . GG . T . . CA A . A . T G . . . . TAT . AA . . . . . TCTTCCAAG . . . T T ATTTGTCACATTCTTT . A . . . . . C CA A A .
blockSeqs : . . . . . C C . C . . . . AAGT . . . . . . . . . . . . . . G . . . G . . T . . . C . . . A . . . . C . . . . CA A . A . T C . . . . CA . AA . . . . . CTTCCAAG . . . C T ATTTGTAAACTA . A . . . . . A TG C A .
blockSeqs : . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . C . . . A . . . . . . . . . . A . A . T . . . . . C . AA . . . . . CTCCCAAA . . . T A ATTACATTTTTT . C . . . . . T T A A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . CGTCCAAA . . . T C GTATTT . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . T . . . . . . . . . G . . . . . . CTTCCTAA . . . C A TATTTA . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTAAT . . . T .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons : TATTTAAA******** G************ A* CAAT******** AATTCCTCAA***************
originalCons : CAGGGATGGTG-TAATTGAA--A-ATGTAATTGTA-AT-------ATTTAAA--TGCATTTTNAT-A--AAGTAAT-TGGATGTAT-TTGTA-ATT------G--G---ACTTCGCTTTCAAT--TACA----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TT--------------AA------A----------------------G---T--T-------T-C---AAN-T-ACTTTT---CA--A-------------T-TA------C---T--T--A-A-T----------------T-CTTTATTCAAACTT-----A-AA-----A-GTTTGAAAA-TGAT---GGAATGAAAGTGTCTGATAATAATGGTG------TTAGACTGTT--TCACTG-TTTGTCATGAG-GTGTTTATGCAATAATT-AG---ATGTCTCATT-ATGTC-TATA-T-------ACTTGATGCAGCA-TGGCCACAGTGCCC-AGGGCTAT-AGG----T-TTGTTCAG--GTGT-GA---A-CTCCTC----T----CA---T-A-CCCGAGAACAA---A-GGCACAGGTAGA-AAAAAA-T-ACCTGAGT-A-AGAGT-TCACTT-CATTCANAT-ATTACATTCAGAAC----T----CA---ACATGACTTAAAA--TGTACTGGATGAATTTCAT-----A-----TGC-----TAA-TAAAGGA-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGC--C--A----T-TTTTAG-CAG--------A-------A--------AAA---GCTTGA-AG-A-CGAATCAAAG-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--TAATTGAAATGT----A---T----AT--TTA--A-----T----TTC--TT------TTC--AAAGTAA----TTGAGAGCAATTACAAT-----TG---TC-A---C-----AAGGGCGGGGCATTCATGTCCTATGGAC-----A------TA-TTTCTAGTT
finalCons : CAGGGATGGTG-TAATTGAA--A-ATGTAATTGTA-ATTATTTAAA--------TGCATTTTNAT-A--AAGTAAT-TGGATGTAT-TTGTA-ATTG------------ACTTCGCTTTCAAT--TACA----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TT--------------AA------A----------------------G---T--T-------T-C---AAN-T-ACTTTT---CA--A-------------T-TA------C---T--T--A-A-T----------------T-CTTTATTCAAACTT-----A-AA-----A-GTTTGAAAA-TGAT---GGAATGAAAGTGTCTGATAATAATGGTG------TTAGACTGTT--TCACTG-TTTGTCATGAG-GTGTTTATGCAATAATT-AG---ATGTCTCATT-ATGTC-TATA-T-------ACTTGATGCAGCA-TGGCCACAGTGCCC-AGGGCTAT-AGG----T-TTGTTCAG--GTGT-GA---A-CTCCTC----T----CA---T-A-CCCGAGAACAA---A-GGCACAGGTAGA-AAAAAA-T-ACCTGAGT-A-AGAGT-TCACTT-CATTCANAT-ATTACATTCAGAAC----T----CA---ACATGACTTAAAA--TGTACTGGATGAATTTCAT-----A-----TGC-----TAA-TAAAGGA-ATCT--GGAAATTTC-A---AAGCCAAT--------TTTTAG-CAGAATTCCTCAA---------------AAA---GCTTGA-AG-A-CGAATCAAAG-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--TAATTGAAATGT----A---T----AT--TTA--A-----T----TTC--TT------TTC--AAAGTAA----TTGAGAGCAATTACAAT-----TG---TC-A---C-----AAGGGCGGGGCATTCATGTCCTATGGAC-----A------TA-TTTCTAGTT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TATGGTTTTACTTTAGATTTGGCTTCTTGCAGTGAACTGATTCCGTGCAAGGAGAATCTTTATTATTCCAATCGTATTTCTCCGACTGTAGTGTAGTCACTGTTAGTCACAATCAATAATCTATAGAAATAAACTGTGTTTATTTATTTTAATGTCATTATCATTTATCAACTTTCAAATACATTTTGGAAAGACACATCAGATGATATGAGAGACTAATCTATACAGAGAAAATGAACTTCAAACA
Unaligned ( gi|49 ): TTTATTGATATAGCTCACTATTTTGTACTCTTAAGAGTAACAGGTACAC
Unaligned ( gi|51 ): TAATTTGTTTACGTACATAGAAAATGAACAAGAATGAT
Alignments
lowQualScore : 4444444444444444444444444444 1111111111 111111111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1111111111111111 1111111 11111111111 1111111 1111111111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111 111 111111111111
lowQualScore : 6 8 8888 3 888 5555555555555555555555555555 4 0 44 3 555 999 8 44 1 3333333333 222222222 3 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2 3333333333333333 2 333 777777 33 2 0 0 2 1 2 444 55 3 2 2 0000000 2 0 2 44 7777 33 33 444 2 999999999 2 666 8 333 2 33 8888 2 2 2 2 77 333 44 0 5555 888888888 66 55555 0 44444444444 444 1 2 66 2 33 33 2 9999999 33 1 2 44 2 2 0 2222222222222 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5555 666 55555 666666 555 777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 66666 22 88888 444 5 444 66666 3 22 1 0 444444444444 2
lowQualScore : . . .... . ... ............................ . . .. . ... ... . .. . .......... ......... . .................................................................................................................................................................. . ................ . ... ...... .. . . . . . . ... .. . . . ....... . . . .. .... .. .. ... . ......... . ... . ... . .. .... . . . . .. ... .. . .... ......... .. ..... . ........... ... . . .. . .. .. . ....... .. . . .. . . . ............. .............................................................................................. .... ... ..... ...... ... ................................................... . ..... .. ..... ... . ... ..... . .. . . ............ .
lowQualScore : 0 0 0000 2 888 4444444444444444444444444444 9 8 66 3 444 666 9 22 4 5555555555 333333333 1 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 9 9999999999999999 2 999 222222 22 4 8 5 4 5 7 777 55 3 7 5 6666666 5 2 5 22 8888 22 66 111 4 444444444 4 555 4 999 2 44 6666 5 5 5 4 77 333 88 2 3333 888888888 55 99999 5 77777777777 666 7 7 33 7 77 77 7 1111111 77 9 5 33 4 4 5 9999999999999 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0000 555 99999 555555 666 888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 33333 33 00000 000 3 777 77777 7 55 2 2 444444444444 9
consensus : CAGGGATGGTG-TAATTGAA--A-ATGTAAT---TGTA-AT-T------A------TCTAAA--TGCATTTTNATA--AAGTAAT-TGGATGTATTTGTAAT---T---GACTTCGCTTTCAAT--TACA----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TT--------------AA------A----------------------G---T--T-------T-C---AAN-T-ACTTTT---CAA-------------T-TAC---T--TA-----A-T----------------T-CTTTATTCAAACTT-----A-AA-----A-GTTTGAAAA-TGAT---GGAATGAAAGTGTCTGATAATAATGGTG------TTAGACTGTT--TCACTG-TTTGTCATGAG-GTGTTTATGCAATAATT-AG---ATGTCTCATT-ATGTC-TATA-T-------ACTTGATGCAGCA-TGGCCACAGTGCCC-AGGGCTAT-AGGT----TTGTTCAGG--TGT-GA---A-CTCCTC----T----CAT-A---CCCGAGAACAA---A-GGCACAGGTAGA-AAAAAA-T-ACCTGAGT-A-AGAGT-TCACTTC-ATTCANATA-TTACATTCAGAAC----T----CA---ACATGACTTAAAA--TGTACTGGATGAATTTCAT-----ATGC-----T-----AA-TAAAGGA-ATCT--GGAAATTTC-AA--AGC--C-A-A---TTT--TTAG-CAGAATTCCTCAAAA-AGCTTGA-AG-ACGAATCAAAG-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--TAATTGAAATGT----A---T----AT--TTA--A-----T----TTC--TT------TTC--AAAGTAA----TTGAGAGCAATTACAAT-----TG---TC-A---C-----AAGGGCGGGGCATTCATGTCCTATGGAC-----A------TA-TTTCTAGTT
Reference ( family-309 ) : CAGGGATGGTG-TAATTGAA--A-ATGTAAT---TGTA-AT-T------A------TTTAAA--TGCATTTTNATA--AAGTAAT-TGGATGTATTTGTAAT---T---GACTTCGCTTTCAAT--TACA----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TT--------------AA------A----------------------G---T--T-------T-C---AAN-T-ACTTTT---CAA-------------T-TAC---T--TA-----A-T----------------T-CTTTATTCAAACTT-----A-AA-----A-GTTTGAAAA-TGAT---GGAATGAAAGTGTCTGATAATAATGGTG------TTAGACTGTT--TCACTG-TTTGTCATGAG-GTGTTTATGCAATAATT-AG---ATGTCTCATT-ATGTC-TATA-T-------ACTTGATGCAGCA-TGGCCACAGTGCCC-AGGGCTAT-AGGT----TTGTTCAGG--TGT-GA---A-CTCCTC----T----CAT-A---CCCGAGAACAA---A-GGCACAGGTAGA-AAAAAA-T-ACCTGAGT-A-AGAGT-TCACTTC-ATTCANATA-TTACATTCAGAAC----T----CA---ACATGACTTAAAA--TGTACTGGATGAATTTCAT-----ATGC-----T-----AA-TAAAGGA-ATCT--GGAAATTTC-AA--AGC--C-A-A---TTT--TTAG-CAGAATTCCTCAAAA-AGCTTGA-AG-ACGAATCAAAG-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--TAATTGAAATGT----A---T----AT--TTA--A-----T----TTC--TT------TTC--AAAGTAA----TTGAGAGCAATTACAAT-----TG---TC-A---C-----AAGGGCGGGGCATTCATGTCCTATGGAC-----A------TA-TTTCTAGTT
gi|1 : CAAGGATAGTG-CAATTGAA--A-ATGTAGT---TGTA-ATAT------A------TAAAAA--TGCATTTTAATA--AAGTAAT-TGAATGTATTTGAAAT---TATAGATTTTGCTTTTAAT--TACA----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TT--------------AA------A----------------------G---T--T-------T-T---AAT-T-ACTTTT---CAA-------------T-TAC---TAGTA-----AAT----------------T-CTTTATTCAAACTT-----A-AA-----A-GTTTGAAAA-TGGT---GGAATGAACGTGTCTGCTAATAATGGTG------TTAGACTGTT--TCACTG-TTCGCCATGAG-GTGCTAATACAATGATTCAG---ATACCTCCTT-ATGTC-TATA-T-------TCTCGATGCAGCA-TGACCACAGTGGCC-AGAACGAT-AGGT----TTATTCAGG--TGA-GA---A-CTCCTA----T----AAT-A---CCAGAGAACAA---A-GACACAGGTAGAGAAAAAA-T--TCTGAGT-A-AAAGT-TCACTTC-ATTCAGATA-ATACATTCTAAAC----T----CA---ACATAACGTAAAT--TGTACTGGATGAATTTCAT-----ACGC-----T-----AA-TAAACGA-ATCT--GGAAATTTC-AA--AAC--C-A-C---TTT--TAA---AG--------AAAA-GGTGTGA-AG-ACAAATCAAAG-------------CAGA------------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--A---TAATTGAAATGTATACA---T----AT--TTA--A-----T----TTC--ATGG----TTA--AAAGTAA----TTGAGAGCAATTACAAT-----TG---TC-A---C-----AAGAGCGGGGAATTCATGTCCTATGGAC-----A------TA-TTTCTATTT
gi|10 : TG-T-------ACTTGATGCAGCA-TGACTATAGTGCCC-ATGGCTAT-AGGT----TTGTGCTGG--TA-----------CCTC----T----CAT-G---CCTGATAACAA---A-GACACGGG--GA-CAAAAA-G-ACCC-AGT-A-ATGGT-TTACTTC-ATTCAGATA-TTACATTCAGAAC----T----CA---ACAAGACTTAAAA--TGTACTGAATGAATGTCAT-----GTCC-----T-----AG-AAAATGC-ATCT--GGAAATTTC-AA--AGC--CAA-A---TCT--TTAG-CAGAATTCCTCAAAA-ACCTTAA-TG-AAGAATCAAAG-------------CAGGCTTGGGGGTTAATTAAGTC--------------T------T--------------C--------------CAA----------C----------ACATTTGGAAA----TA---AACC-----C---C--AG--TAATC-AAAT-T----G---T----AT--TT---------------------------------AAG---------------AATTACAAT-----TG---TC-A---C-----TTGGAAGGGGCTTTCATATCCTGTGGAC-----A------TA-TTTCTAGTT
gi|11 : CTTCAACA-CGCTTGA-AG-ACAAAACAAAA-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------CAGGGTCAAGTCTTCCAA----------G----------ACATTTTGAAG----TA---AATT-----T---C--AG--TAATTGAAATG---------T----AT--TTA--G-----TGACATTC----------TTC--AAAGTAA----TTGAGAGCAATCACAAT-----TG---TC-A---C-----ATGGGTGGGCCATTCACGCCCTATGGAC-----ATACATGTA-TTTCTAGTTc
gi|12 : aaaatataattactaaagttatctgattagaataccataaaatttactgttcgtgttaaataggcaaataatgaGAAAAA---ATGACACATGAAGA-AAAAA--T-ACCTGACT-T-TGGGT-TCACTTC-A------------------------------------ACATGAATTCAAA--TGTACTGGATGAATTTTGC-----AAGCT----T-----GA-T-AAGGA-ATCT--GGAAATTTC-AA--AGC--C-ATA---TTT--TTAG-CAGAATTCCACAAAA-AGCTTGA-AG-ACAAATCGAAG-------------CAGG------------------CTTCAAGCTCAAGTTT------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TG---AAAT-----T---G--AG--AAGTTGAAATGT----A---T----TT--AAA--A-----C----TAT--TC------TTC--AGAGTGA----TTGAGAG-A-----AAT-----TG---TC-A---C-----AAAGGCAGGGCATTCATGTttctgttaagcaataatcaaaaggcatcccacattacaggtttggagctgataagttata
gi|13 : CAGA--TGT-GA---A-CTCCTT----TGTTATATTA---CAGGATAACAA---A-AGCACAAATA-A-AGAAAA-T-ACCCGAGT-A-AGAGT-TCGATCC-ATTCATGAA-ATACATTCAATAC----T----CA---ACATGACTTAAAA--TGAACTGTATCAATGTCAT-----ACGC-----T-----AA-T---GTA-ATAT--GGAAATTTG-AA--ACC--C-A------TT--TAAG-CAGAATTCCTCAAAA----TCG----------TTAAAG-------------T---------------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTTTGAAA----TA---ATGT-----T---T--AG--TAATTGATATG---------T----AT--TGA--A-----T----TACATTC------TTC--AAAGTAA----TTGAGAGCCATTGTAAT-----TG------A---C-----A-------------CATGTCCTATTTAC-----A------TA-ttttagtttccattaatgtttgtgagctgtgatgtg
gi|14 : ctttaaatttaagTATTGAAAATT-----------------TTTGAAAA-TGAT---GGCATGACGTTTTCTGATAATAATGGTA------TAAGAC-GTT--TCACTG-TT---CATCAG-GT--TTATACAATTATT-AG---ATGTCT-------------TG-T-------ATTTGATGCAGCA-TGGCTACAGTCTCT-AGCGCTAT-AAGC----TTGATTAAG--TGT-CA---A-CTCCTC----T----CAT-A---TCCGAGAACAT---A-GGCACAGGTAGA-AAAATA---ACCAGAGT-A-AGAGT-GCACTTC-ATTCATATA-TAACGT-----AC----T---------------TTTAAAAAGTGTACTAGATGAATTTCAT-----A
gi|15 : aaattatattataaattatctaaacttataaagctaattaAGGGATG-TGATGATTGAA--A-ATGTGAT---T--A-G---------A------TCTA------C-CTTTGA-A--AAGTGAA-TGGGTATATATGTATC---T---GACTTAGCTTTGAGT--TCCA----------TGTAATATAA---------T-GG---A-----------------T----TTTAGTGCAATTA---AA------A----------------------G---T--T-------T-C---AAA-C-A-TTCT---CCA-------------T-TACAATT--TA-----A-TCGCTATTCAATTTCAAT-CTTTATTGAATTTT-----A-TA-----A-TTCTAAAAA-TAAT---AGAATAAAAATGTCTGATAATAATGATG------TTAGTCTGTT--TGACTG-TTTGTTGTGGA-GTGTCT-----------------GTGTC---TT-ATGAC-AGTA-TC------AC-TGATGGAGCA-T--TCATAGTATCA-AGGGCTAT-ag
gi|16 : TTGAAAA-TGAT---GGCATGACGTTTTCTGATAATAATGGTA------TAAGAC-GTT--TCACTG-TT---CATCAG-GT--TTATACAATTATT-AG---ATGTCT-------------TG-T-------ATTTGATGCAGCA-TGGCTACAGTCTCT-AGCGCTAT-AAGC----TTGATTAAG--TGT-CA---A-CTCCTC----T----CAT-A---TCCGAGAACAT---A-GGCACAGGTAGA-AAAATA---ACCAGAGT-A-AGAGT-GCACTTC-ATTCATATA-TAACGT-----AC----T---------------TTTAAAAAGTGTACTAGATGAATTTCAT-----A
gi|18 : CAGGGATGGAG-TAATTGTA--A-ATGTATTAGCTGTA------------------TTTAGA--TACATTTT--TA--AAGTCAT-TGGGTATATATGTAAT---T---GACTTCGCTTTCAGT--TA-A----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TC--------------AA------ATAC-------------------A---T--TAAAAAAGT-C---AAG-C-ACCTT----CAA-------------T-TAC-------------A-T----------------T-CTTTATTCAAACTT-----A-AA-----C-G------------------AATGGAAGTATCTGATAGAAATAGTG------TTAGATTGTT--GCACTGATTTGTCATGGG-GTGTCTATGCAAAAATT-GG---ATGTCTCATgc
gi|19 : TAAT---TGTA-AT-T------A------GCT------GCATT--GA-A--AAGTATT-TGGATGTATTTGCAAT---TAA-GATTT-GCTCTCAAC--TAGA----------AGTTATTGAA---------C-AT---T-----------------T----CT--------------AA------AT---------------------GCATT--T-------T-C---AAA-A-AGT------CAAGA-----------T-TAT---T--TTTTTTTA-C----------------T-CTTCATTCAAAGTT-----G-AAT----A-ATTCGAAAA-TGGT---GGAATGAAAGTGT--GGTAATATTGGTA------TTAGATTGCT--TTACTC-TTTGTCATGTA-GTGTTTATG
gi|2 : caaggatggga---T---GCCTTTGCTCTCCAT--TTCA----------AGTAGCTGAA---------TTGT---G-----------------T----TT--------------AA------A----------------------A---C--T-------T-T---AAA-T-ACGTTT---TAAAAAGGGGATCAAAT-TAA---T--TAC----A-C----------------T-CGTTATCTAAACTT-----A-AT-----A-TTTTGAAAAATAAT---TGGATGAAAGTGTCAGATAATACTGGTG------TTGGAATGTT--TCACTG-TTTGTCATGGG-GTGTTTATGCATTAATT-AG---ATATCTCAGT-ATGTT-TATA-T-------ACTTGATGCAACA-TGGCAACAATACCCTGGGGCTAT-AGGT----TTGTTCAGG--TGT-AA---A-ACCCTC----T----CAT-A---CCTGAAAACAA---T-GGCACAGGTAGA-AAAAAAAT-ACCTGAGT-A-AGAGT-TCACTTC-ATTCAGATA-TTACATTCAGAAC----T----GA---ACATTACTAAAAA--TGTACTGGACGAATTTCAT-----GTCA-----C-----AG-AAAATGC-ATCT--GGAAATTTC-AA--AGC--C-A-AA--TTT--TCAG-CTGAATTCCTCAAAA-AGCTCGA-AG-AGGAATGAAAG-------------CAAG------------------C--------------T------T--------------CAGGGT---------CAA----------GTCTTCCAGA-GCAATTGGAAA----TAAACAACT-----G---T--AGGCTAATTGAAATG---------T----AT--TTA-------------------------------AAAAT-A----TTGAGAGTGATTTCAAT-----TG---TC-A---C-----ACGGAT-GGGCATTCATGTCCTATTGAC-----
gi|20 : TAATAGTGGTT------TTAGAATGTG--TCACTT-TTTGTCTTGAG-TTGTTAATGCATTAATT-AG---GTGTCTCATT-ATGTC-TCTG----------CT-----CA--A-TAGCCACAGTGCTC--------T-GAGT----TTGT----G--AGT------------------T----CAT-A---CCTGATAACAATTAA-GGCACCGGTAGA-AAAAT--T-ACCTGAAT-A-AGAGT-TTATTT--------GTA-T---ATTCAAAAC----T----TT---TT-TGACGTAAA---TGTAGTGGGTGAATTTTAT-----ATGC-----T-----AA-TAA
gi|21 : AAGGA-ATATATGGAGATTTC-AA--AGC--C----------------------------------GCTTAA-AG-ACGAATCAAAGGATATTTCGAGGTCAAGT-----------------C--------------T------T--------------C--------------CAA----------G----------ACATTCTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--GAACAGAAATGT----A---T----TT--GTC--A-----CA---TTC--TT------T----AAAGTAC----TTGAGAGTAATTACAAT-----TG---TC-A---C-----AA-----GAACATTCATTTCCTATGGAC-----A------AATTTTCTAg
gi|22 : TTAATA--AAGAAATATGCATAGATCTGCTGT---T---GGCATTACTTTCAATCGTACACATGTATTGAAGCAATTGAA---------C-GT---A-----------------T----CT--------------CATTCCCCC----------------------T---T--T-------T-C---GAGGT-ATTTTTTTTCAA-------------T-TAG---C--GA-----A-T----------------TTCTTTGATCAA-CTTTTTTAA-AA-----ATGTTTGAAGA-TGGT---GGAGCAAAAGTG-CT-------ACG--------------CTATT--TCACTG-TCCG----GGG-GTGTTCAttccaaatgtttacgctataagta
gi|23 : ------------------C--------------T------C--------------C--------------CAA----------A----------GCACTTTGAAA----TA---AACT-----T---C--AG--AAATTGAAATGT----A---T----TT--GTA--A-----A----CTA---------------AAAGTAA----GTGATAGAAATTACAAT-----TG---TA-G---C-----AAGGACGTGGCATTCATGTCCTATGAAC-----A------TA-TTTCTAGTTa
gi|24 : ATTGAT--C-ATG--AT---TGCT-GTGT------A------TTTAAAAGTACATTTTTGTA--AAGTAAG-TGGATGTATTTGTAAT---T---GACTTTTCTTTCAAC--TATA----------AGTAATTGAA---------T-GT---ACATTTATTTTTACACTTT----TT--------------AA------AAAC-------------------A---T--T-------T-C---AAA-T-ATTTTT---CAA-------------TATAT-------------A-T----------------T-CTTTATTCAAACTC-----T-AA-----A-GTTTGAAAA-TGAT---GGCTAGAAAGTGCCTattatacattttattttagacatatggtcaataaaaataattcgttctttcatttttaagatatgaatacatgt
gi|25 : -CAGAATTCCTCAAAA-AGTTTGT-AG-ACGAATCATAG-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------CAAGGT---------CAA----------GTCTTTCAAAAACATTTTGAAA----TGT--GACCGAGGAT---CAGAG--TAATTGAAATGT----A------------TTA--A-----TGGCATTC--TT------CCC--AGA----------------AGTCACA-------TG----G-A---CCGGGGGGGGGGGGGGCATTCAT-TCCTATGGAC-----T------TA-
gi|26 : TTATA--AAGTAAT-TGGATGTATTTGTAAT---T---GACT--------------AGA----------AGTAATTGAA---------T-GT---------------------------T--------------AA------A----------------------T---T--T-------T-A---AAA-T-AGTCCT---AAA-------------T--GC-------------A-T----------------T-CTTTATTCACACTT-----G-AA-----T-GTTTAAAAA-TGAT---GGAATGAAAGTGTCTTATCATACTGGTG------TTCTACTGTT--TCACTG-TTTGTTATGAG-GTGTa
gi|27 : TTGAAGTTT----GACTT----AC--TTA--A-----TAT--TTC--CTGAACTATTT--AAGGTAGACCTTTAAGAGCAATTACATT-----TG---TC-A---C-----AAGGGTGGGTCATTCATGTCCTGTGGAC-----A------TA-TTTCTAGTT
gi|28 : T--------------AA------A----------------------G---T--T-------TTC---AAT-T-ACTTTT---CAA-------------T-TAC---T--T-------------------------T-CTTTATTCAAAGTT-----A-TC-----A-GTTTAGAAA-TGAT---GGAATGAAAATGTCTTATAACAATGG-G------TTGAACTGTTTATCAATG-GGTGTT-TAA---TGTTTATGCAGTAATT-AG---ATATatcttacacgtacacttatgtgtatttttaaataactcgatctctttattttc
gi|29 : aaatacattccccaaaaaagT--GGAAATTTC-AA--AGC--C-A-T---ATT--TTAG-CAGAATTCCTCAAAA-CGTCTGA-AA-ACGAATCAAAG-------------CAGG------------------C--------------C------T--------------C--------------a
gi|3 : ataaatattgcatacaagaggtgagagaacatatagaaattgtaaactattttgtacattgtgtaaaacagCAGGGATGGTG-TAATTAAA--ACATGTAAT---TATA-AT-T------AGCTTCATCTAAA--AGCATTTTAATA--AAGTAAT-TGGATATATCTGTAAT---T---GACTTTGCTTTCAAT--TACA----------AGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------T----TT--------------gaggta
gi|3 : aaatgatattaaattcttagtaaatctacattatacacagatatccaacgataattgaatttaatatctcctattatatttcataaagtgatggaaaatgaattgttttacatctgaaaa-----A-T----------------T-TGTTATTCAAACTT-----A-AA-----A--TATGAAAA-TAAT---GGAATGAAAATGTCTGATAATAATGCTT------TTAGACTGTT--TCA-----------TGAG-GTGTTAATGCAATAATT-AA---TTATTTCATT-CAGTC-TATA-T-------ACTTGATGGAGCA-TGGCCACAG------AGGGCTATCAAATG---TTGTTCAGG--TGT-GA---A-CTCCTT----G----CAT-A---CCTGAGAACAA---A-GGCACAAATAG---AAAAA-T-ACCTGAGT-A-AGAGT-TCACTTC-ATTGAGAtatacattccaaaaggtcaagtacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaattctcctttgcatttgttattcaaacttaaaatatgaaaataatggaatgaaaatgtctgataataatgcttttagactgtttcatgaggtgttaatgcaataattaattatttcattcagtctatatacttgatggagcatggccacagagggctatcaaatgttgttcaggtgtgaactccttgcatacctgagaacaaaggcacaaatagaaaaatacctgagtaagagttcacttcattgagaat
gi|30 : aaatgatattaaattcttagtaaatctacattatacacagatatccaacgataattgaatttaatatctcctattatatttcataaagtgatggaaaatgaattgttttacatctgaaaacagggatggtgtaattaaaacatgtaattataattagcttcatctaaaagcattttaataaagtaattggatatatctgtaattgactttgctttcaattacaagtaattgaatgtattttatacattccaaaaggtcaagtacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaattctcctttgcAAT-TGAT---GGAATGAAAGTGTCAGATAATAATGGTG------TTAGACCGTT--TCACTG-TTTGTCATACG-GTGTTTGTACAATGATT-AA---ATGTCTCat
gi|31 : caattcaaggtcgggctattttaattgattaattggatgtatttttA--AAGTAAC-TGGATGTATTTATGGT---T---GACTTAGCTTTTAAT--TATA----------AGTAATTAAA---------T-GG---A-----------------T----AT--------------AA------T----------------------G---TA-T-------T-C---AAA-T-ACATTT-----A-------------T-TA
gi|32 : ----T----CAC-A---CCTAAGAACAA---A-GACACAGTT-GA-AAAAAT-TCAACTGGGT-A-AGAGT-TCAATTC-ATTCATATC-CTACATTCAAAAC----C----CA---ATTTGACTTTAAA--TGTATAGGGTGAAATTAAT-----ATGC-----T-----GA-TAAAGGA-ATaaaagttaaaggtttcaattacttttcatttacaaatgtacattttt
gi|33 : CAGAAC----T----CA---ACATGACTTAAAA--TGTACTGTATGAAATTCAT-----ATGC-----T-----AA-TAAAGG-----------AAT-----------------A---T----------AGAATTA-TCAAAGCAGTTTCA-A-----AGTCAA-----------------GT------------------C--------------G------T--------------C--------------CAA----------A----------ACATTTTGAAA----TA---AAGT-----T---T--AG--TGATTGAAAT
gi|34 : GTC-TATA-T-------ACCTGATTCAGCA-TGGCCACAGTGCCC-AGGGCTCT-AGTT----TTGTTCAGG--TGT-GA---A-CTCTTT----C----CAT-G---CCTGAGTACAA---A-AGCACAGTT----AAAAAA-T-ACCCGAGT-------T-TCAATTC-ATTC
gi|35 : TAGACTGTT--TTACTG-TTTCCCAAGAG-GCGTTTATACAATAATT-AA---ATGTCTCATT-TTGTC-TATA-T-------TATTGTTGCGACA-TGGCCACAGTACCC-ATGGATAT-AAGT----TCATTTGGC--TAT-GA---A-CTCCTC----T----tttta
gi|36 : A--AAGTAAC-TGGATGTATTTATGGT---T---GACTTAGCTTTTAAT--TATA----------AGTAATTAAATGGATATAAT-GT---A-----------------T----TC--------------AA------ATACATTTATTAAAAAGTTAAAGG---T--T-------T-C---AAT-T-ACTTTT---CA
gi|37 : gTC-ATTCATATA-TTACATTCAGAAC----T----CA---ACATGACTGGAAG--CACACTGAATT-ATTTCGT-----AAGC-----C-----AA-TAAAGCA-ATAT--AGAAATTTC-AA--AAC--C-A----------TTAG-CAGAATTCCTCAAt
gi|38 : GTT-TATA-T-------ATTTGATGCAGCA-TGGCC--------C-AGGGCTAT-AGGT----TTGTTTCGG--TGT-GACTGACCTCCTCTCGAT----CAT-G---TCCGGGAACAA---A-GGCACGGGTAAA-AAAAgtag
gi|39 : A----------AGTAATTGAA---------T-GTTAAA-----------------T----TTG-------------AA------A----------------------A---TAGT-------C-CTAAAAG-TCACTTTC---CAA-------------T-TGC-------------A-T----------------T-CTTTATTCACACTT-----G-AA-----T-GTTTAAA
gi|4 : taattggt-AG---ACATCCCATTCATGTTGTATA-TCTATTAGACCTGATGCAGCA-TGGCCACAGTGCCA-AGGGCTA--AGGT----TTGTTCAGCATTAT-TA---A-CTCCTC----------AT-A---CT-GAGAACAA---A-G-TACAGGTAGA-AGAAG--T-ACCTG-GT-ACAGAGTATTTCTTCCATTCCCACAATTACATTAAGAAC----T----GAGTCACATAACTTAAA---T-TACTGCATGAGTTTCAT-----ATAC-----TGTGTTAA-AAAAGGACATCTA-GGAAATTTC-AA---GCAAC-A-G---TTT--T--G-CAGAATTGCCCAAAA-AGCTCGA-AG-ACAAATCAAAG-------------CAGGGCTTTAAGCTTCAAGTCTC--------------T------C--------------C--------------CAT----------G----------A-ATTTTGAAAATTTTA---AACT-----T---T--AG--AAATTG-AATAT----A---TTTGGAT--TTA--CT----T----TTT--TT------TTC--AAAGTAA----TGGAGAGCTATTACAATACAG-TGACTTC-AATGA-----AAGGGCAGGACAAT--TGCCACATGGGCACATTA------TA-TTTTTAGCTng
gi|40 : gCAAAG-------------CAGG------------------C--------------T------T--------------CGATCGT--------CGAATATTCTATTG----------ACATTTTGAAA----TA---AA-T-----T---C--AG--TAATTTGAATGT----A---T-----TGATTACTA-----T----TTA--TTA-----TTT--AAAATcattttgaggattccagaggttctgagtacataatatattctgcagttggtttttcatcagcatcattaacattaaatttgagtgaacaactcatacgcttgtga
gi|41 : GAA--A-ATGTAAT---TGCA-AT-TAGCTGCA------TTTAAA--TACAATACTATATTAAGTAAT-GGGTGGTATTTGTAATAGCT---GATTTTGCTTTCAAT--TAC
gi|42 : A-TTAT---GAAATAAAAGTGCCTGATATTTATAGTG------GTGGACTCTT--TCACTG-TTTCT----AGAGTGTTTATGCAATGATC-GGTGCATGTTTC
gi|43 : AAA--TGTACTGGATGAATTTCAT------TCC-----C-----A-----------------GAAATTTC-AATTAA-----A-A---TATCGTTAA-CAGAATTCCTCAGAA-AGCTTAA-AG-ACAAAT
gi|44 : AAAATTCATTAAA---GCTTGACAT-ACAAA-CAAGG-------------CAGT------------------C--------------T------T--------------C--------------CTA----------A----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--TAATTTGAATGT----A---agg
gi|45 : t----TC--------------AA------G----------------------A---T--T-------T-C---AAT-T-ACTTTT---CGA-------------T-TAC-------A-----A------------------T-CTTCATTCAAAATT-----ACAAGACTTA-GTTTGAAAA-TGTC---GGA
gi|46 : ataaaag-AA-----A-GTTTATAAA-TGGT---GGAATGAAAGCGTCAGATGATAATGGCG-------------GTT--TTACTG-TTTGCCATGAG-G
gi|47 : t-T-GCTTTT---CAG-------------T-TAC-------------A-T----------------T-TTGTATTCAAACTA-----A-AG-----T-GTCTGATAA-CAAT---GG
gi|48 : T----TTGTTCAGG--TGT-GA---G-CCCTGT----T----CAT-AC--CCCGAGAACAA---A-tt
gi|5 : tctaatATT-AC---ATGTGT-----ATATC-TATA-G-------ACCTGATGCAGCA-TGGCCACAGTGCCA-AGGGCTA--AGGT----TTGTTCAGA--TTT-GA---A-CTCCTC----------AT-A---CT-GAGAACAA---A-GGCACAGGTAGA-AAAA---T-ACCTGAGT-A-AGAGT-TTTCTTC-ATTCCCACA-TTACATTAAGAAC----TGAGTCA---ACATAACTTAAAA--TTTACTGCATGAGTTTCAT-----ATACATGTAT-----AAATAAAGGA-ATCT--GGAAATTTC-AA--AGC--A-ACA---GTT--TTAG-CAGAATTGCCCAAAA-AGCTCGA-AG-ACAAATCAAAG-------------CAGG------------------C--------------T------TTAAGCTCAAGTTTTC--------------CAT----------G----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----T---T--AG--AAATTGAAA--T----A---T----AT--TTG--ATTACTT----TTT--TT------TTC--AAAGTAA----TGGAGAGCAATTACAATACAG-TGACTTCAA---T-----AAGGGCAGGACA---ATGCCACATGGGCACATTA------TA-TTTTTAGCTaata
gi|50 : attatagagacatcccGTGGGACTTTCACGTCCTATGGAC-----A------TA-TTTCTAGTTcatttttgaggatttccagatgtttctgagtacataatatattctgcagttggttttcatcagcatattaacataaatttgaagtgaacaacatcatacgcttgtg
gi|6 : tgcGAAAA-TGATCCGGGAATGAAAAAGTCGGATAATAATGGTGATGTTGTTAGACTATT--TCACTG-GTTGTCATGAG-GTGTTAATGCAATGATT-AG---ACGTCTCCTT-ATGTC-TGTA-T-------ACTTTCTGCAGCA-TGACCATAGTACCC-AGGGCTAT-ATAT----TTGTTCAGA--TGT-GA---A-CTCCTC----T----CAT-A---CCCGAGAACAA---A-GGCATAGGTTG--CAAAAA-T-AATTGAGT-A-AGAGT-TCACTTC-ATTGGGAT-------------AC----T----CA---ACATGACTTAAAA--TGTACTGGACGAATTTCGT-----ATGC-----C-----AG-AAAAGGA-ATCT--GG------C-AA--AGC--C-ATA---TCT--TTAG-TAGAATTCCTAAAGA-TGCTTGA-AG-ACGAATCAAAG-------------CAGG------------------CTTTGAGGTCATGTTT------T--------------C--------------CAA----------A----------ACATTTTGATA----TA---AACT-----T---C--AG--CAATTGAAATGT----A------------TTAC-A-----T---------TT------TTT--AAAGTAA----TTGATAGC-ATTACAAC-----TG---TC-T---C-----ACGGGCAAGCCATTCATGTCCTACGGAC-----A------TA-TTTGTAGTTttcattgg
gi|7 : -ATATC-TATAGT-------ACTGAATGCAGCAATGGCCACAGTGCCA-AGGGCTA--AGGT----TT-TTCAGA--TCTTGA---A-CTCCT-----------AT-A---CT-GAGAACAA---A-GGCACAGGTAG---AAAAA-T-ACCTGAGTAA-AGAGT-TTTCTTC-ATTC-CACA-TCATA---AGAACTGAGT----CA---ACATAACTT-AAA--TTTACTGCATGAGTTTCATATTAAATGTA----T-----AA-T-AACGA-ATCT--GGAAATTTCAAA--AGC--C-A-ACAGTTT--TTAGTCAGAATTGCCC-AAA-AGCTCGA-AGAACAAATCAAAA-------------GAGG------------------C--------------TTTAAGCT--------------C--------------CAAAGTTTTCCATG----------ACATTTTGAAA----TA---AACT-----TAAAG--AA--AAATTGAAACAT----A---T----AT--TTG--ATTACTT----TTT--TT------TTCAAAAAGTAA-----TGAGAGCAATTACAATACAAGTGACTTCAA---T-----AAGGGCAGGACA---ATG-CACATGGGC-----A------CA-TTaattagaaattacatgtaataataatatgtagtcacaattaattgatttgcaaatgtaagttataaaaat
gi|8 : CAGGGATGG-A-TTATTGAAGAA-ATG-AAT---TGTACATAC------A------TT--AA--TTTATTTTTATA--CAGTAAT-TGGATGTATCTGTAAT---T---CACTTCACTTTCAGT--TACA----------CGTAATTGAA---------T-GT---A-----------------TAGTGTTTAGATACATTCCAAAA------A----------------------G---T--CAAGATG-T-C---AAT-T-AC-TTT---CAA-------------T-TAC---A--TAC----A-T----------------T-CTTAATTCAAACTT-------AA-----A-GTTaataattttagcttcatttttgaggaattccaagatgtttctga
gi|9 : atatgtttctacttttgttttttcgttttgcatgaaatcgttcagctgcaagaaatccttgttatttcatattattgtttgcaccagatgatagtcactattatagacaaataaataccaatcacaaccttttttttttatcctaaagtaataattaaatttgaaatacatatttgtgaagacacatgaaatgatatgcgagataatcaatatatttggtacatacatgtacaaggaaaataatcttgaaatacattgctgaatC-TATA-T-------ACTTGATGTAGCA-TGGTCACAATGCCC-AGGATTGG-AGGTAAATTTGTTCTGG--TG-------A-CTCCTC----T----CAT-ATTACCTGAGAATAA---T-GGTATGGGTAGA-AAAAAT-T--CCTGAGT-A-A-AGT-T----TC-ATTT------TTA--TTGAGAAC----T----CA---ATATGAATGAAAA--TGTACTGGATAAATTTCAT-----GT-C-----C-----AA-TAAA--A-ATCT--GGAAATTTC-AA--AGC--G-A-A---TTT--TTAG-CAGAATTCCTCAAAA-AGTTTAA-AG-GTGAATCAAAG-------------CAGG------------------T--------------T------T------------------------------AA----------T----------A------GGGC----CA---TATT-----T---T--A----CATT-AAATGT--------T-----T--TTA--A-----T----TGCATTC------TTC--A------------------------AAT-----TG---TT-A---C-----ATGGGTGGGGCATTCATGTCTTATGGAC-----A------TA-TTTCTAGTTa
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TATGGTTTTACTTTAGATTTGGCTTCTTGCAGTGAACTGATTCCGTGCAAGGAGAATCTTTATTATTCCAATCGTATTTCTCCGACTGTAGTGTAGTCACTGTTAGTCACAATCAATAATCTATAGAAATAAACTGTGTTTATTTATTTTAATGTCATTATCATTTATCAACTTTCAAATACATTTTGGAAAGACACATCAGATGATATGAGAGACTAATCTATACAGAGAAAATGAACTTCAAACA
Unaligned ( gi|49 ): TTTATTGATATAGCTCACTATTTTGTACTCTTAAGAGTAACAGGTACAC
Unaligned ( gi|51 ): TAATTTGTTTACGTACATAGAAAATGAACAAGAATGAT